Brevet FR2770538A1 — publié le 19990507

La présente invention concerne un procédé de détection et d'identification et/ou quantification d'une activité enzymatique de type désaminase dans un milieu de culture pour micro-organismes, les composés et agents de détection adaptés à ce procédé, le procédé de préparation de ces composés et agents de détection, ainsi que les milieux de culture pour mettre en oeuvre ledit procédé. La détection et l'identification des micro-organismes sont très importantes notamment en médecine, dans l'industrie agro-alimentaire, pour le contrôle de l'environnement (eau...). Les micro-organismes peuvent être recherchés pour leur pathogénicité, comme indicateurs de contamination, pour le suivi de procédés de fabrication et autre. Les techniques de détection et d'identification des micro-organismes sont actuellement basées sur la recherche de séquences nucléotidiques caractéristiques, la recherche d'antigènes ou d'anticorps, la culture en milieu sélectif ou non, ou encore sur la recherche d'activités métaboliques et notamment enzymatiques (par exemple activités osidases, estérases, peptidases, oxydases, etc...). Le plus souvent les procédés de détection et d'identification et/ou quantification des micro-organismes associent plusieurs de ces techniques. La culture est ainsi utilisée pour multiplier et sélectionner les micro-organismes recherchés. Afin de simplifier leur détection, il a été proposé de mettre en évidence des activités biochimiques en introduisant des molécules produisant une coloration ou une fluorescence, directement dans le milieu de culture. De tels milieux sont appelés milieux de détection. Les activités biochimiques peuvent être mises en évidence par diverses méthodes telles que -la modification physico-chimique du milieu changement de pH en présence d'un indicateur coloré, ou fluorescent (méthyl-umbelliférone,...), -le changement du potentiel rédox révélé à l'aide d'un indicateur coloré (sels de tétrazolium, ...) ou fluorescent (EPO-424 293), -l'hydrolyse de molécules libérant un composé coloré ou fluorescent (indoxyle, naphtol, coumarine...), -la réaction d'une molécule produite par les microorganismes avec un composé présent dans le milieu et résultant en une coloration (détection d'indole, James et al., 1986). On sait que les milieux gélifiés (ou solides) sont particulièrement bien adaptés à la culture et à l'isolement des micro-organismes à partir d'un prélèvement, ainsi qu'à la détection de micro-organismes "cibles" au sein d'un mélange de taxa de micro-organismes. On connaît un procédé de différenciation des bactéries du groupe Proteus des autres entérobactéries (Sverre Dick Henriksen, State Institute for Public Health, Bacteriological Department, Oslo, Norway, 6 juin 1950) . Ce procédé met en oeuvre une quantité égale, en milieu gélosé, de D- et Lphénylalanine en présence de sel de fer. La réaction colorée verte obtenue, en comparaison avec le test de l'uréase, bien que positive pour identifier le groupe Proteus, est présentée comme étant un test lourd à mettre en oeuvre. Malgré tous les tests biochimiques actuellement sur le marché, il s'avère qu'on ne dispose pas actuellement de moyens particulièrement bien adaptés et faciles à mettre en oeuvre, notamment en milieu gélosé, pour détecter et identifier et/ou quantifier dans une culture plurimicrobienne une activité enzymatique de type désaminase de micro-organismes. La présente invention se propose donc de résoudre ce problème. Un premier objet de l'invention est un procédé de détection et d'identification et/ou quantification d'une activité enzymatique de type désaminase de micro-organisme, selon lequel on met en contact un inoculum susceptible de contenir un micro-organisme ayant une activité désaminase avec un milieu de culture pour micro-organismes, le milieu de culture comprenant au moins un agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré avec un agent révélateur, une activité enzymatique de type désaminase, ledit agent de détection comprenant au moins un composé de formule (I) générale suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-kéto acide produit par la désamination de l'acide-aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X. On entend par " groupement limitant la diffusion - tout groupement de type hydrophobe limitant la diffusion dans un milieu hydrophile, ou - tout groupement permettant de s' associer, par des liaisons faibles, notamment hydrophobes, ou de se lier, par une ou des liaisons covalentes, notamment thiol, aux constituants des cellules des micro-organismes, tels que la paroi, la membrane, les protéines....... A titre de test définissant les groupements limitant la diffusion, on inoccule en spot au centre de deux boîtes de pétri respectivement un L-acide-aminé cyclique et un agent de détection correspondant selon l'invention. On mesure les diamêtres de la diffusion des a-céto-acide produits par l'activité enzymatique de type désaminase de l'inocculat. Le diamètre de diffusion de l'agent de détection selon l'invention doit être inférieur à celui du L-acide-aminé cyclique, il sera alors considéré que l'agent de détection limite la diffusion de l'a-céto-acide produit par la désamination du L-acide-aminé. On entend par " reste R insaturé cyclique ou hétérocyclique " d'un L-acide-aminé cyclique, les restes R tels que indole, phényle, hydroxy-phényle et imidazole, pouvant subir une réaction de substitution par le groupement X. Ces acides-aminés comprenant les acides-aminés naturels ou synthétiques, ou modifiés, notamment par substitution. On entend par " groupement n'interférant pas avec la fonction du groupement X ", tout groupement qui n'empêche pas le groupement X de limiter la diffusion de l'a-céto-acide. Dans le procédé selon l'invention, l'ajout d'au moins un agent de détection dans des concentrations adaptées n'inhibe pas la multiplication des micro-organismes dans les milieux de culture appropriés. On peut donc utiliser l'agent de détection en l'ajoutant au milieu de culture des micro-organismes avant le début de la culture ou en début de culture. L'un des avantages importants du procédé utilisant des agents de détection selon l'invention est qu'en présence d'une activité enzymatique de type désaminase, il donne, après ajout d'un agent révélateur, des produits colorés qui ne diffusent pas dans le milieu, notamment dans un milieu gélifié. Le procédé selon l'invention peut donc avantageusement être utilisé en milieu gélifié. Il peut aussi, bien entendu, être utilisé en milieu liquide ou sur support solide en l'absence de gélifiant. Le procédé selon l'invention permet, en milieu plurimicrobien, de détecter et identifier, voir même quantifier les micro-organismes ayant une activité enzymatique de type désaminase, ceci sans interférer avec la détection d'autres micro-organismes. Au contraire, le procédé selon l'invention, permet, par le jeu des réactions enzymatiques produites, de révéler de manière distincte, par des couleurs définissant le type de micro-organisme, le ou les micro-organismes présents dans le milieu. Le procédé selon l'invention apporte donc l'avantage, outre de détecter et d'identifier une activité enzymatique de type désaminase dans un milieu de culture, de permettre une mise en oeuvre simple et peu coûteuse. Dans un mode de réalisation préférentiel selon l'invention, l'agent révélateur est un sel de cation. Le sel de cation, permettant de mettre en évidence l'agent de détection par formation d'un produit coloré, peut être ajouté au milieu de culture en même temps que l'agent de détection, ou bien après la mise en culture des microorganismes. En effet, l'homme du métier saura déterminer, selon le milieu de culture utilisé, si il est plus avantageux, ou si il est préférable d'ajouter le sel de cation en même temps que l'agent de détection, ou après la mise en culture des microorganismes. On préfère toutefois, notamment en milieu gélosé, ajouter l'agent révélateur au milieu de culture en même temps que l'agent de détection. Les micro-organismes détectés et identifiés et/ou quantifiés par l'activité enzymatique de type désaminase selon le procédé de l'invention appartiennent notamment au groupe Proteus. Dans un mode de réalisation très préférentiel selon l'invention, on ajoute également audit milieu de culture au moins un autre agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré ou fluorescent, une activité enzymatique différente de celle mise en évidence par le composé de formule générale (I). Il peut s'agir par exemple d'une activité estérase, osidase ou peptidase. On peut ainsi obtenir des informations supplémentaires, en liaison avec une absence de coloration (ou de fluorescence) ou en liaison avec une coloration modifiée par rapport à la coloration obtenue avec un seul substrat enzymatique. L'autre agent de détection choisi aura des propriétés différentes de celles des agents de détection de formule (I) selon l'invention. Par exemple, on choisira un autre agent de détection capable de donner un produit réactionnel ayant une couleur différente de la couleur obtenue avec les agents de détection de formule (I) . L'autre agent de détection (ou second agent de détection) permettra donc de révéler, grâce à sa couleur propre, ou grâce à sa fluorescence, la présence d'une activité enzymatique dont il est spécifique. Si l'activité enzymatique de type désaminase détectable par les agent de détection de formule (I) selon l'invention est également présente, et révélable par une couleur caractéristique, on obtiendra une coloration modifiée, différente de ladite couleur caractéristique et différente aussi de ladite couleur propre donnée par le second agent de détection. Des exemples d'utilisation de plusieurs agents de détection dans le même milieu de culture sont donnés dans les exemples qui suivent. Bien entendu, les résultats peuvent varier avec d'une part le choix de l'agent de détection selon l'invention que l'on utilise, le second (ou plus) agent de détection utilisé et les différents micro-organismes présents dans le milieu de culture. Les autres agents de détection servant à mettre en évidence des activités enzymatiques différentes sont notamment, mais non exclusivement, des dérivés d'indoxyle, de coumarine, de résorufine, de naphtol, de naphtylamine, de nitrophénol, de nitroaniline, de rhodamine, d'hydroxyquinoléine, de fluorescéine, etc... Parmi ces autres agents de détection qui peuvent être utilisés en association avec les agents de détection selon l'invention, on peut citer notamment le 5-bromo-4-chloro-3indolyl-B-D-glucuronide, le 6-chloro-3-indolyl-B-D-glucoside, la L-alanine-7-amino-4-méthyl-coumarine, le 4-méthylumbelliféryl-N-acétyl-ss-D-galactosami-nide, le résorufine-ss-D- galactoside, le sulfate de B-naphtyle, le naphtol AS-BI ss-D- galactoside, le L-alanine B-naphtylamide, l'O-nitrophénol-B-D- galactoside, le carboxybenzoyle-L-arginine-p-nitroanilide, la rhodamine 110 bis-(L-leucine amide), et le diacétate de fluorescéine. Un second objet de 1 invention sont les composés ayant la formule générale (I) suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-céto acide produit par la désamination de l'acide-aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X, à l'exception des composés im-benzyl-L-histidine, 1 et 3méthyl-L-histidine, O-benzyl-L-tyrosine, O-carboxybenzoyle-Ltyrosine, O-dansyl-L-tyrosine, O-méthyl-L-tyrosine et 1-, 4-, 5-, 6- et 7-méthyl-L-tryptophane. Un troisième objet selon l'invention est un agent de détection comprenant au moins un composé de formule générale (I) suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-céto acide produit par la désamination de l'acide-aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X. Dans un mode de réalisation préférentiel, l'agent de détection comprend au moins un composé de formule générale (I) suivante: dans laquelle: n est égale à 1 et X est choisi parmi les groupements hydrophobes. Dans un mode de réalisation encore plus préféré, l'agent de détection comprend au moins un composé de formule générale (I) suivante: dans laquelle: n est égale à 1 et X est choisi parmi le méthyle, le benzyle, le carboxybenzoyle, le dansyl, le naphtalènesulfonyle, le toluène-sulfonyle, le N-ind-mésitylène-sulfonyle. On préfère encore plus particulièrement que X soit choisi parmi le naphtalène-sulfonyle, le toluène-sulfonyle, le N-ind-mésitylène-sulfonyle. Parmi les composés synthétisés, les meilleurs résultats ont été obtenus avec le O-naphtalène-sulfonyl-L-tyrosine, le Otoluène-sulfonyl-L-tyrosine et le N-ind-mésitylène-2-sulphonyl L-tryptophane. Grâce à ces composés, il a été possible de développer un milieu de culture gélosé permettant de détecter une colonie exprimant une activité enzymatique de type désaminase, y compris au sein de culture pluri-microbienne. De plus, la coloration brune obtenue par ces composés, reste au voisinage de la colonie désaminase+, et n'affecte pas l'aspect des colonies désaminase- même proches. Comme exemple d'agent de détection particulièrement préférés en milieu gélosé, on peut citer: - le O-naphtalène-sulfonyl-tyrosine. - le 4-O-toluène-sulfonyl-L-tyrosine. - le N-toluène-sulfonyle-L-histidine. On préfère particulièrement également, en milieu liquide, utiliser le N-toluène-sulfonyl-L-histidine. Un quatrième objet selon l'invention est le procédé de préparation des composés et des agents de détection selon l'invention de formule générale (I) telle que définie respectivement précédemment, comprenant les étapes suivantes: (a) - formylation du reste R, (b) - addition d'un sel de X sur le reste R formylé selon (a), (c) - déformylation reste R substitué selon (b). Un cinquième objet selon l'invention est un milieu de culture de micro-organismes comprenant, outre les ingrédients nécessaires à la culture desdits micro-organismes, au moins un agent de détection tel que défini précédemment. Les agents de détection de formule X-L-acide-aminé cyclique sont utilisés à des concentrations pondérales suffisantes pour donner des réactions colorées observables. Ces concentrations peuvent être déterminées par des expériences de routine par l'homme du métier. Dans un mode de réalisation préférentiel, la concentration pondérale du ou des agents de détection dans le milieu de culture est comprises entre 0,025 et 5 g/l de milieu de culture. Dans un mode de réalisation très préférentiel, la concentration pondérale du ou des agents de détection dans le milieu de culture est comprises entre 0,1 et 2 g/l, de préférence entre 0,3 et 0,6 g/l. Dans un autre mode de réalisation préférentiel, le milieu de culture comprend également un agent révélateur, de préférence un sel de cation, par exemple du citrate de fer ammoniacal. La concentration de l'agent révélateur n'est pas limitante, elle peut être inférieure, égale ou supérieure à celle de l'agent de détection de formule (I). Dans un autre mode préférentiel de réalisation selon l'invention, le milieu de culture est sous forme gélosé. Dans un mode de réalisation très préférentiel selon l'invention, le milieu de culture comprend également au moins un autre agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré ou fluorescent, une activité enzymatique différente de celle mise en évidence par le composé de formule générale (I). Comme exemple de milieu gélosé, on peut incorporer du O-toluène-sulfonyl-L-tyrosine à 0,5 g/l et du citrate de fer à 0,5 g/l au milieu de culture, dans le milieu suivant Extrait coeur-cervelle .................. 5 g/l bio-Soyase ............................... 5 g/l Tampon Tris .............................. 1 g/l Phosphate monopotassique ................ 1 g/l Agar .................................... 17,5 g/l, milieu que l'on peut inocculer avec différents microorganismes à Gram négatif ou à Gram positif. Seules les souches appartenant au groupe Proteus forment des colonies brunes après 18 à 24 heures d'incubation. Les souches n'appartenant pas au groupe Proteus forment des colonies qui conservent l'aspect qu'elles ont sur le même milieu dépourvu de O-toluène-sulfonyl L-tyrosine. Les caractéristiques et avantages de l'invention sont illustrés par les exemples suivants. Exemple 1 Synthèse du 2-O-naphtalène-sulfonyl-L-tyrosine Synthèse de N-formyl-L-tyrosine. La L-tyrosine (60 g; 0,33 mole) a été dissoute dans de l'acide formique 98% (400 ml) et refroidie à 10 C. L'anhydride acétique (192 ml; 1,73 mole) a été ajoutée en quatre parties pendant cinq minutes tout en maintenant une température de 10 C. Le mélange a ensuite été agité pendant 60 mn à 10 C et maintenu ensuite à température ambiante pendant 30mn. De l'eau (192 ml) a été ajoutée sous agitation à 10-15 C pendant 30 mn et ensuite le mélange a été soumis à évaporation jusqu'à l'obtention d'un résidu sec sous pression réduite à 70 C. Le solide huileux résiduel a été dissout dans un volume minimal d'eau bouillante et ensuite refroidi pour produire de fins cristaux blancs de N-formyl-L-tyrosine(60,6g ; 88%). Synthèse de N-formyl-O-(2-naphthalène-sulphonyl)tyrosine. Procédé A Le N-formyl-L-tyrosine (14,0 g; 0,0668 mole) a été dissout dans de l'acétone (250 ml) et la solution a été diluée avec de l'eau (190 ml). Le pH a été ajusté à 9,7 par addition d'une solution carbonate de sodium saturé et une solution de chlorure de naphthalène-2-sulphonyle (15 g; 0,0668 mole) dans de l'acétone (42 ml) ensuite a été ajouté goutte à goutte pendant 20 mn à température ambiante tout en maintenant le pH à 9,7 par l'addition de solution de carbonate de sodium. Le mélange à été agité pendant 60 mn et mis au repos pendant 12 heures, après quoi l'acétone a été en grande partie évaporée sous une pression réduite à 500C. La solution résiduelle a été refroidie à 5"C et ensuite extraite avec de l'éther (2x50 mi) La phase aqueuse a ensuite été acidifiée jusqu'à l'obtention d'un pH de 3,5 produisant un précipité blanc dense qui a été recueilli par filtration et séché dans une étuve sous vide à 600C pour donner un solide blanc (24,57 g; 92%). Déformylation Le N-formyl-O-(2-naphthalène-sulphonyl)-tyrosine (24,57 g; 0,0615 mole) a été remis en suspension dans de l'acétone (105 ml) et ajouté en petite quantité à un mélange de reflux d'acide chlorhydrique concentré (240 ml) et d'eau (240 ml). Le mélange a été chauffé sous reflux pendant 3 heures et ensuite versé dans de l'eau (750ml) sous agitation et refroidissement à 10 C. Le pH a été ajusté à 3,5 et le précipité blanc dense résultant a été récupéré par filtration et séché dans une étuve sous vide à 50"C pour donner une poudre blanche propre (21,25 g; 94%). Le produit pourrait encore être purifié par une solution d'hydroxyde de sodium aqueux et l'addition d'acide. Le rendement du produit sec était de 79%. Le rendement total obtenu à partir de L-tyrosine est de 64%. Exemple 2 Synthèse du 4-O-tosyl-L-tyrosine La synthèse du 4-O-toluène-sulfonyl-L-tyrosine a été effectuée selon deux procédés suivants Procédé A. Le composé a été préparé conformément au procédé décrit dans l'exemple 1 mais en substituant le chlorure de naphathalène-2-sulfonyle par l'équivalent molaire de chlorure de toluène-sulfonyle. Le rendement total en produit était de 56%. Procédé B. Du pentahydrate de sulfate de cuivre (5 g; 20 mmol) a été dissout dans de l'eau (100 ml) sous agitation et une solution d'hydroxyde de potassium (2,25 g; 40 mmole) dans de l'eau a été ajoutée en continu. Après 15 mn, la suspension a été mise à reposer, filtrée et le résidu a été lavé avec une petite quantité d'eau et ensuite partiellement séché pour produire un " résidu bleu ". La L-tyrosine (7,2 g; 40 mmole) a été remise en suspension dans de l'eau (100 ml) et de l'hydroxyde de potassium aqueux (3,36 g; 60 mmole) a été ajouté. A cette solution chaude a été ajouté de l'hydroxyde de cuivre préparé ci-dessus. La solution résultante bleue foncée du complexe de cuivre a été acidifié soigneusement jusqu'à pH 8. Le précipité pourpre qui s'est formé progressivement a été isolé par filtration, lavé avec de l'eau et du méthanol et séché à l'air pour donner 7,4 g de complexe. Celui-ci a été remis en suspension dans du méthanol (80 ml) et à une solution de carbonate de sodium (3,7 g; 35 mmole) a été ajouté avec agitation. Le complexe de cuivre qui était seulement dissout a nécessité l'utilisation de méthanol pour le clarifier. A la solution agitée, filtrée a été ajouté de façon graduelle une solution de chlorure de 4-toluène-sulphonyle (6,55 g; 35 mmole) dans du méthanol (60 ml). Le pH a été maintenu entre 9 et 11 par l'addition périodique de carbonate de sodium aqueux. Après 2 heures la suspension a été filtrée et le résidu a été lavé avec du méthanol. Les étapes de lavage et de filtration ont été combinées et la suspension a été soumise à évaporation à 45"C pour enlever le méthanol. Le solide bleu résultant a été décomposé par agitation vigoureuse avec de l'acide chlorhydrique (15 ml) et de la glace (30 g). Le solide vert pale a été enlevé et dissout directement dans de l'eau chaude (100 à 120 ml). Un refroidissement et un ajustement du pH à 7,5 ont produit une grande quantité d'un précipité blanc. Celui-ci a été enlevé par filtration. Le résidu a été redissout dans un volume similaire d'eau chaude contenant de l'EDTA (300 mg) pour enlever les traces d'ions cupriques et le pH a été ajusté de nouveau à 7,5. Le produit a été isolé sous la forme d'un solide blanc argenté après filtration et séchage (6,1 g; 52%). Exemple 3 Synthèse de O-mésitoyl-L-tyrosine La N-a-t-BOC-L-tyrosine (2,81 g; 10 mmole) a été dissoute dans de la pyridine anhydride (15 ml). A cette solution a été ajouté lentement du chlorure de 2,4-6 triméthylbenzoyle (1, 92 g; 10,5 mmole). La température a été maintenue entre 15"C et 250C. Après agitation pendant 30 mn, le mélange réactionnel a été versé sur de l'eau glacée. Le solide poisseux a été soumis à une extraction dans du dichlorométhane (2x50 ml) et la couche organique a été lavée avec de l'eau (3x50 ml) et séchée sur du sulfate de magnesium anhydre. L'évaporation du solvant à conduit à l'obtention d'un solide vitreux qui cristallisait lentement. Le produit a été déprotégé en le dissolvant dans une petite quantité d'acétate d'éthyle et par addition d'une solution de chlorure d'hydrogène (3 M) dans de l'acétate d'éthyle (5 ml). La solution agitée graduellement se déposait sous la forme d'un solide blanc. Une précipitation maximale a été obtenue par l'addition de diethyl éther (30 ml). Le produit a été enlevé par filtration sous vide, lavé avec de l'éther et séché dans un déssiccateur sous vide (2,5 g; 69e). Exemple 4 Synthèse de N-in-mésitylène-2-sulphonyl-L-tryptophane Le N-a-t-BOC-N-in-mésitylène-2-sulphonyl-L-tryptophane, (1,0 g; 1,5 mmole) a été mis en suspension dans de l'acétate d'éthyle (5 ml) et une solution de chlorure d'hydrogène (3 M) dans de l'acétate d'éthyle (2,5 ml) a été ajoutée à la solution agitée. Un précipité blanc s'est formé rapidement et s'est intensifié en même temps que l'agitation. Après 2 heures, la suspension a été filtrée et le résidu a été lavé avec de l'éther, séché et stocké. Bien que la chromatographie en couche mince montrait seulement un composant (sous visualisation par ultraviolet), le produit était probablement contaminé avec du chlorure de dicyclohexylammonium. Aucun essai n' a été effectué pour enlever ce contaminant et le produit a été utilisé tel que pour être testé. Le rendement était de 0,68 g. Exemple 5 Synthèse de N-im-(4-toluène-sulphonyl)-L-hyistidine La N-a-t-BOC-N-im-tosyl-L-histidine (1,0 g; 2,44 mmole) a eté dissoute dans une solution de chlorure d'hydrogène (3 M) dans de l'acétate d'éthyle (5 ml). Après agitation pendant 2 heures, le composé a été isolé sous la forme d'un sel d'hydrochlorure comme décrit dans l'exemple 4 et donnait un solide blanc (0,64 g; 76 %). De la même manière, le O-(2,6-dichlorobenzyl)-L- tyrosine, le N-im-benzyloxycarbonyl-L-histidine, et la Nxbenzyloxymethyl-L-histidine ont été préparés par des protections d'intermédiaire commercialement disponibles pour la synthèse des peptides. Des essais ont été réalisés pour illustrer l'intérêt des composés de formule (I) selon l'invention pour la détection des bactéries du genre Proteus sur des milieux gélifiés. Exemple 6 Deux milieux ont été préparés selon les techniques habituelles. Ils ont la même composition à l'exception de l'agent de détection utilisé pour la mise en évidence de l'activité enzymatique de type désaminase. La composition des Milieux I et II pour un litre de milieu final est la suivante Extrait coeur-cervelle (bioMérieux) 5 g/l bio-Soyase (bioMérieux) ................. 5 g/l Tampon Tris (Prolabo) .................... 1 g/l Phosphate monopotassique (Merck) ........ 1 g/l Agar (bioMérieux) ...................... 17,5 g/l Citrate de fer ammoniacal (Sigma) ....... 0,5 g/l Le pH des milieux a été ajusté aux environs de 7,2. Dans le Milieu I, l'agent de détection de l'activité enzymatique de type désaminase utilisé est l'acide-aminé naturel L-Tyrosine à 1,5 g/l; dans le Milieu II l'agent de détection de l'activité enzymatique de type désaminase utilisé est le 4-O-toluène-sulfonyl-L-tyrosine à 0,5 g/l. Sur ces deux milieux, 12 souches de bactéries ont été directement cultivées en boîte de Pétri. Les souches provenant de la collection de la demanderesse, appartiennent aux espèces suivantes : Escherichia coli (2 souches), Enterobacter cloacae (1 souche), Klebsiella pneumoniae (1 souche), Morganella morgandi (2 souche), Proteus mirabilis (2 souches), Proteus vulgaris (2 souches), Enterococcus faecalis. (1 souche), staphylococcus saprophyticus. (1 souche) . De plus un mélange d'une souche d'E. coli et d'une souche de P. mirabilis a également été cultivé en boîte de Pétri. Les boîtes ont été incubées à 37"C pendant 48 heures. Les colonies formées ont été examinées visuellement, respectivement après 24 et 48 heures d'incubation selon les interprétations suivantes - les colonies brunes correspondent à des souches produisant une désaminase appartenant a priori au groupe Proteus (ici représentée par les espèces : M. morganii, P. mirabilis, P. vulgaris) - les colonies blanches correspondent aux souches ne produisant pas l'enzyme précitée, elles appartiennent donc à d'autres espèces de bactéries qui seront alors à identifier à l'aide des techniques habituelles ; - la diffusion du précipité brun autour de la colonie est appréciée selon une échelle semi-quantitative (nulle, faible, forte) Les résultats sont présentés dans le tableau I ciaprès TABLEAU I à à 24 heures à 48 heures Colonies @ Diffusion Colonies Diffusion Espèces Milieu brunes Nulle Faible Forte brunes Nulle Faible Forte E. coli I -* - - - - - - (2 souches) II - - - - - - - E. cloacae I - - - - - - - - (1 souche) Il - - - - - - - - K. pneumoniae I - - - - I - 1 (1 souche) II - - - - - - - - M. morganii I 2 - - 2 2 - - 2 (2 souches) II 2 2 - - 2 2 - P. mirabilis I 2 - - 2 2 - - 2 (2 souches) II 2 2 - - 2 2 - P. vulgaris I 2 - - 2 2 - - 2 (2 souches) II 2 2 - - 2 2 - E. faecalis I C (1 souche) II - - - - - - - S. saprophyticus I - - - - - - - - (1 souche) II - - - - - - - * : nombre de souches , "-" = - 0 Comme cela ressort du tableau I ci-dessus, le procédé selon l'invention permet une détection des bactéries du groupe Proteus. En effet pour la culture sur le Milieu I, on ne distingue qu'un type de colonies brun-translucide sur fond d'un milieu orangé, alors que sur le milieu II selon l'invention il ressort deux types de colonies : les unes brunes et les autres translucides sur fond d'un milieu incolore à brun au voisinage des colonies colorées. Exemple 7 Bien que le procédé selon l'invention soit plus avantageusement adapté à la détection d'une activité enzymatique de type désaminase en milieu gélifié ou sur support solide, il peut également être utilisé en milieu liquide. Deux milieux ont été préparés selon les techniques habituelles. Ils ont la même composition à l'exception de l'agent de détection utilisé pour révéler l'activité enzymatique de type désaminase. La composition des Milieux III et IV pour un litre de milieu final est la suivante Extrait coeur-cervelle (bioMérieux) ..... 5 g/l bio-Soyase (bioMérieux) ................. 5 g/l Tampon Tris (Sigma) ...................... 1 g/l Phosphate monopotassique (Merck) ........ 1 g/l Citrate de fer ammoniacal (Sigma) ....... 0,5 g/l Le pH des milieux a été ajusté aux environs de 7,2. Dans le Milieu III, l'agent de détection de l'activité enzymatique de type désaminase utilisé est l'acide-aminé naturel L-histidine à 1,5 g/l ; dans le Milieu IV l'agent de détection de l'activité enzymatique de type désaminase utilisé est le de N-toluène-sulfonyle-L-histidine à 0,5g/l. Les milieux ont été répartis stérilement en tube à essai. Ces deux milieux ont été inoculés avec les 12 souches de bactéries décrites dans l'exemple 6. Les tubes ont été incubés pendant 48 heures à 37 C et examinés visuellement après 48 heures selon l'interprétation suivante - le brunissement du tube traduit la présence d'une activité enzymatique de type désaminase et donc d'une bactérie du groupe Proteus, - l'absence de brunissement signifie l'absence de bactérie du groupe Proteus. Les résultats sont présentés dans le tableau II ciaprès TABLEAU II Brunissement du milieu à 48 heures Espèces Milieu Fort Faible Nul E. coli III - 2 (2 souches) IV - 2 E. cloacae III - 1 (1 souche) IV - - 1 K. pneumoniae III 1 i (1 souche) IV - - 1 M. morganii III 1 1 (2 souches) IV 2 - P. mirabilis III 2 - (2 souches) IV 2 - P. vulgarts m 2 - (2 souches) IV 2 - E. faecalis III 1 - (1 souche) IV - - 1 S. saprophyticus III - - 1 (1 souche) W - - 1 : : nombre de souches "-" = 0 Comme cela ressort du tableau II ci-dessus, en milieu liquide, l'agent de détection selon l'invention permet comme la L-histidine de différencier les bactéries appartenant au groupe Proteus de celles n'y appartenant pas, avec une sensibilité et une spécificité élevée après 48 heures. Exemple 8 Des essais ont également été entrepris pour tester la possibilité de détecter simultanément une activité enzymatique de type désaminase selon l'invention ainsi qu'une autre activité enzymatique. Pour cela trois milieux ont été préparés selon les techniques habituelles. Le premier (Milieu V) correspond au Milieu II de l'exemple 6 dans lequel le 4-O-toluène-sulfonyle L-tyrosine a été remplacé par du 4-O-dansyl-L-tyrosine à la même concentration, le deuxième (Milieu VI) correspond à ce même milieu mais avec du 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-B-Dglucoside à 0,1 g/l à la place du substrat de désaminase et le troisième (Milieu VII) correspond au milieu VI additionné de 4 O-dansyl-L-tyrosine à 0,5 g/l. Sur ces trois milieux, les 12 souches de bactéries décrites dans l'exemple 6 ont été directement cultivées en boîte de Pétri. De plus un mélange d'une souche d'K. pneumoniae et d'une souche de P. mirabilis a également été cultivé en boîte de Pétri. Les boîtes ont été incubées à 37"C pendant 24 heures. Les colonies formées ont été examinées visuellement, après 24 heures d'incubation selon les interprétations suivantes - les colonies brunes correspondent à des souches produisant une désaminase appartenant a priori au groupe Proteus (ici représentée par les espèces : M. morganii, P. mirabilis, P. vulgaris) - les colonies bleues correspondent aux souches exprimant une activité ss-D-glucosidase et hydrolysant le 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-B-D-glucoside ; - les colonies blanches correspondent aux souches ne produisant pas les enzymes précitées. Les résultats sont présentés dans le tableau III ciaprès TABLEAU III 24 Heures Coloration des colonies Espèces Milieu Incolore Bleue Brun-Bleu Brune V 2 E. coli VI 2 - - (2 couches) VII 1 - - 1 V 1- - - E. cloacae VI - 1 (1 souche) VII - 1 - V 1 - - K. pneumoniae VI - 1 - (1 souche) @ VII - 1 V - - - 2 M. morganii VI 2 - - 2 (2 souches) VII - - - 2 V - - - 2 P. mirabilis VI 2 - - (2 souches) VII - - - 2 V - - - 2 P. vulgaris VI - 2 (2 souches) VII @ - 2 V 1 E. faecalis VI 1 1 - - (1 souche) @ VII - 1 - V 1 - - S. saprophyticus vI 1 - - (1 souche) VII 1 - - * : nombre de souches, "-" = 0 Comme cela ressort du tableau III ci-dessus, le procédé selon l'invention permet une détection des bactéries du groupe Proteus et n'interfère pas avec la détection des colonies Bglucosidase#, y compris en mélange. En effet pour la culture du mélange de K. pneumoniae et de P. mirabilis, sur le Milieu VII, on distingue parfaitement les deux types de colonies, les unes brunes et les autres bleues. Par ailleurs si une bactérie exprime simultanément les deux activités enzymatiques (ss-glucosidase et désaminase) cela se traduit par la formation de colonies ayant une couleur résultant d'un mélange de bleu et de brun, comme c'est le cas pour une souche de P. vulgaris sur le milieu VII. Exemple 9 Le procédé et composés selon l'invention sont notamment parfaitement adaptés à l'isolement et à l'identification des micro-organismes urinaires. Le milieu VIII a été développé pour cette application, il a la composition suivante Extrait coeur-cervelle (bioMérieux) ...... 5 g/l bio-Soyase (bioMérieux) .................. 5 g/l Tampon Tris (Sigma) ....................... 1 g/l Phosphate monopotassique (Merck) ......... 1 g/l Citrate de fer ammoniacal (Sigma) ........ 0,5 g/l 4-O-toluène-sulfonyle-L-tyrosine ......... 0,4 g/l 5-bromo-4-chloro-3-indol yl-ss-D-glucoside (Biosynth) .............. 0,06 g/l 6-chloro-3-indolyl-ss-D-glucuronide (Biosynth) 0, 25 g/l Méthyl-ss-D-glucuronide (Sigma) ............ 0,1g/l Le pH des milieux a été ajusté aux environs de 7,2. Sur ce milieu, 25 souches de bactéries ont été directement cultivées en boîte de Pétri. Les souches provenant de la collection de la demanderesse, appartiennent aux espèces suivantes : E. coli (3 souches), Citrobacter diversus (2 souches), E. cloacae (2 souches), K. pneumoniae (2 souches), M. morganii (2 souches), P. mirabilis (3 souches), P. vulgaris (2 souches), E. faecalis. (2 souches), Staphylococcus aureus (2 souches), S. saprophyticus. (3 souches), Candida aibicans (2 souches). De plus un mélange d'une souche d'E. coli, d'une souche de K. pneumoniae et d'une souche de P. mirabilis a également été cultivé en boîte de Pétri. Les boîtes ont été incubées à 370C pendant 48 heures. Les colonies formées ont été examinées visuellement, respectivement après 24 et 48 heures d'incubation selon les interprétations suivantes - les colonies brunes correspondent à des souches produisant une désaminase appartenant a priori au groupe Proteus (ici représentée par les espèces : M. morganii, P. mirabilis, P. vulgaris) - les colonies rose-tyrien correspondent à des souches produisant une ss-D-glucuronidase appartenant a priori à l'espèce E. coli ; - les colonies bleues correspondent à des souches produisant une B-D-glucosidase, appartenant a priori soit au groupe des Klebsiella/Enterobacter/Serratia soit au genre Enterococcus - les colonies blanches correspondent aux souches ne produisant pas les enzymes précitées, elles appartiennent donc à d'autres espèces de bactéries ou de levures qui seront alors à identifier à l'aide des techniques habituelles. Les résultats sont présentés dans le tableau IV ciaprès TABLEAU IV 48 Heures Coloration des colonies Coloration des colonies Espèces Milieu Inco- Brune Gris- Bleu @ Rose- Inco- Brune Gris- Bleue Rose lore Vert # tyrien lore Vert tyrien E. coli (3 souches) VIII - - - - 3 - - - - 3 c. diversus VIII - - - 2 - - - - 2 (2 souches) E. cloacae VIII - - - 2 - - - - 2 (2 souches) K. pneumoniae VIII - - - 2 - - - - 2 (2 souches) M. morganii vm - 2 - - @ - 2 - (2 souches) P. mirabilis VIII - 3 - - - - 3 - (3 souches) P. vulgaris VIII - - 2 - - - - 2 (2 souches) E. faecalis VIII - - - 2 - - - - 2 (2 souches) S. aureus VIII 2 - - - - 2 - - - (2 souches) s. saprophyticus VIII 2 - - - - 2 - - - (3 souches) C. albicans VIII 2 - - - - 2 - - - (2 souches) Mélange VIII - 1 - 1 1 - 1 - 1 1 Plurimicrobien (3 souches) * : nombre de souches "-" = 0 Comme cela ressort du tableau IV ci-dessus, le procédé selon l'invention permet une détection des principales bactéries urinaires y compris en mélange. En effet il est possible sur le milieu VIII de détecter quatre types de colonies différents (incolore, rose-tyrien, bleu et brun), même dans le cas de culture plurimicrobienne. Un tel milieu est particulièrement utile puisqu'il permet, dès l'isolement, de détecter la très grande majorité des micro-organismes urinaires simplifiant de ce fait et l'identification, et l'analyse des échantillons les plus complexes, apportant donc simultanément un gain dans la qualité de l'analyse et dans son coût. REVENDICATIONS 1. Procédé de détection et d'identification et/ou quantification d'une activité enzymatique de type désaminase de micro-organisme, selon lequel on met en contact un inoculum susceptible de contenir un micro-organisme ayant une activité désaminase avec un milieu de culture pour micro-organismes, caractérisé en ce que le milieu de culture comprend au moins un agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré avec un agent révélateur, une activité enzymatique de type désaminase, ledit agent de détection comprenant au moins un composé de formule (I) générale suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-kéto acide produit par la désamination de l'acide aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X. 2. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'agent révélateur est un sel de cation. 3. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'agent révélateur est ajouté au milieu de culture en même temps que l'agent de détection. 4. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'agent révélateur est ajouté au milieu de culture après la mise en culture des micro-organismes. 5. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce les micro-organismes détectés et identifiés et/ou quantifiés par l'activité enzymatique de type désaminase appartiennent au genre Proteus. 6. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'on ajoute également audit milieu de culture au moins un autre agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré ou fluorescent, une activité enzymatique différente de celle mise en évidence par le composé de formule générale (I). 7. Composé ayant la formule générale (I) suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-kéto acide produit par la désamination de l'acide-aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X, à l'exception des composés im-benzyl-L-histidine, 1 et 3méthyl-L-histidine, O-benzyl-L-tyrosine, O-carboxybenzoyle-Ltyrosine, O-dansyl-L-tyrosine, O-méthyl-L-tyrosine et 1-, 4-, 5-, 6- et 7-méthyl-L-tryptophane. 8. Agent de détection comprenant au moins un composé de formule générale (I) suivante: dans laquelle: - R représente un reste insaturé cyclique ou hétérocyclique d'un L-acide-aminé cyclique, - X représente un groupement limitant la diffusion de l'a-kéto acide produit par la désamination de l'acide-aminé cyclique, - n est un nombre entier compris entre 1 et 3, le composé de formule (I) pouvant être substitué par différents groupements n'interférant pas avec la fonction du groupement X. 10. Agent de détection selon les revendications 8 et 9, caractérisé en ce que X est choisi parmi le naphtalènesulfonyle, le tosyl-sulfonyle, le N-ind-mésitylène-sulfonyle. 11. Agent de détection selon la revendication 9, caractérisé en ce qu'il est le O-(2-naphtalène-sulfonyl)tyrosine - 12. Agent de détection selon la revendication 9, caractérisé en ce qu'il est le 4-O-toluène-sulfonyl-L-tyrosine. 13. Agent de détection selon la revendication 9, caractérisé en ce qu'il est le N-toluène-sulfonyl-L-histidine. 14. Procédé de préparation des composés selon la revendication 7 et des agents de détection selon la revendication 8, comprenant les étapes suivantes: (a) - formylation du reste R, (b) - addition d'un sel de X sur le reste R formylé selon (a), (c) - déformylation du reste R substitué selon (b). 15. Milieu de culture de micro-organismes comprenant, outre les ingrédients nécessaires à la culture desdits microorganismes, au moins un agent de détection selon l'une quelconque des revendications 8 à 13. 16. Milieu de culture selon la revendication 15, caractérisé en ce que la concentration pondérale du ou des agents de détection est comprise entre 0,025 et 5 g/l de milieu de culture. 17. Milieu de culture selon les revendications 15 et 16, caractérisé en ce que concentration pondérale du ou des agents de détection est comprise entre 0,1 et 2 g/l, de préférence entre 0,3 et 0,6 g/l. 18. Milieu de culture selon la revendication 15, caractérisé en ce qu' il comprend également un agent révélateur, de préférence un sel de cation, par exemple du citrate de fer ammoniacal. 19. Milieu de culture selon la revendication 15, caractérisé en ce qu'il est sous forme gélosé. 20. Milieu de culture selon les revendications 15 à 19, caractérisé en ce qu' il comprend également au moins un autre 19. Milieu de culture selon la revendication 15, caractérisé en ce qu'il est sous forme gélosé. 20. Milieu de culture selon les revendications 15 à 19, caractérisé en ce qu'il comprend également au moins un autre agent de détection permettant de mettre en évidence, par formation d'un produit coloré ou fluorescent, une activité enzymatique différente de celle mise en évidence par le composé de formule générale (I).