分子系統發生學

分子系統發生學 （ Molecular phylogenetics ） 是分析遺傳分子差異 （ 主要是DNA序列 ） 的系統發生學的一個分支 ， 以獲得有機體進化關係的信息 。 分子系統發生學分析的結果在系統發生樹 ( phylogenetic tree ) 中表達 。 分子系統發生學是分子系統分類學的一個方面 ， 更廣泛的術語還包括在生物分類學和生物地理學中使用分子數據 。 分子系統發生學和分子演化相關 。 分子進化是在生命樹 （ 進化 ） 的各個分支中在分子水平 （ 基因 ， 蛋白質等 ） 上選擇性變化 （ 突變 ） 的過程 。 分子系統發育學推斷由於分子進化而產生的進化關係 ， 並導致系統發育樹的構建 。 根據1870年代Haeckel所知的信息 ， 右邊顯示的圖描繪了生命系統樹作爲最早的詳細樹木之一 。 分子系統發生學的出現 ， 很可能會改變大衆對舊有動物分類的認識 。 舉例說 ： 傳統上鱗翅目物種皆二分爲蛾跟蝴蝶兩大分支 ， 但研究認爲其實所有蝶類皆應歸類到鳳蝶總科去 ， 而鳳蝶總科又是鱗翅目之中 、 有喙亞目之中 、 真鱗翅類之中 、 真異脈類之中 、 雙孔亞目之中 、 短突雙孔類之中 、 螟蛾類中的一個演化支 。 類似的改變還有齧蟲總目的合併 ， 以及白蟻被合併進蜚廉目的例子 。