99學年度大專足球聯賽

99學年度大專足球聯賽爲第6屆大專足球聯賽 。 男子組分爲公開組男生第一級 、 公開組男生第二級和一般男生組 ， 女子組分爲公開組女生第一級 。 本年度公開組男生第一級第七名 、 第八名將降級到來年公開組男生第二級 。 公開組男生第二級冠軍 、 亞軍將升級到來年公開組男生第一級 。 一般男生組冠軍 、 亞軍將來年公開組男生第二級 。