人類微生物組計劃

Infobox project | abbreviation = HMP | native_name = | logo = Human Microbiome Project logo.jpg | image = | caption = 人類微生物組計劃的Logo | motto = | type = | owner = 美國國立衛生研究院 | country = | key_people = | launched = | launch_place = | closed = | budget = | website = 人類微生物組計劃 ( 縮寫 ： HMP ） 是美國國立衛生研究院 ( NIH ) 於2008年發起的一項旨在鑑定與闡明和人類健康與疾病相關的微生物 （ 人類微生物組 ） 功能的計劃 。 於2007年啓動 ， 第一階段 ( HMP1 ) 專注於識別和表徵人類微生物群 。 第二階段被稱爲 “ 綜合人類微生物組計劃 ” ( iHMP ) ， 於 2014 年啓動 ， 旨在產生資源來表徵微生物組並闡明微生物在健康和疾病狀態中的作用 。 從 2007 年到 2016 年 ， 該計劃從NIH基金獲得了 $1.7 億美元的資金 。 人類微生物組計劃的重要組成部分是微生物群落表徵的獨立於培養的方法 ， 例如宏基因組學 （ 它爲單個微生物群落提供了廣泛的遺傳視角 ） ， 以及廣泛的全基因組測序 （ 它爲某些微生物群落提供了 “ 深入 ” 的遺傳視角 ） 給定微生物群落的各個方面 ， 即單個細菌種類 ） 。 後者作爲參考基因組序列 — — 目前計劃使用 3000 個這樣的單個細菌分離物序列 — — 用於在隨後的宏基因組分析中進行比較 。 該項目還資助了對人類受試者通過聚合酶鏈反應擴增的細菌16S 核糖體RNA序列進行深度測序 。