核苷酸多樣性

核苷酸多樣性 （ nucleotide diversity ） 是分子遺傳學 （ 分子生物學 ） 中的一個概念 。 該概念用於表徵某一種群中多態性的強弱 。 根井正利和李文雄在1979年引入了一種計算核苷酸多樣性的方法 ： 在從某一種群中取得的多個樣品DNA上隨機取一段序列 ， 將在這些序列上的同一位點鹼基的不同取平均值 ， 即可得核苷酸多樣性的值 。 他們將這個值記爲 「 π 」 。 這種方法用數學公式表示如下 ： xi 、 xj分別代表第i個和第j個序列的對應頻率比如一共擁有5個樣本 ， 那麼xi 、 xj均爲1 / 5 。 πij則爲兩個序列之間不同位點所佔百分比舉個例子來說 ， 假設第i個樣本的序列爲ATTAC ， 第j個樣本的序列爲ATTAT 。 進行比較可知 ， 兩個序列的長度均爲5個鹼基對 ， 其中有一對鹼基對在兩個樣本間是不同的 ， πij爲1 / 5 。 n則爲總樣本數 。 核苷酸多樣性是遺傳變異 （ genetic variation ） 的一個量化值 。 核苷酸多樣性通常與其他衡量種群多樣性的數值有聯繫 ， 同時也和期望雜合度 （ expected heterozygosity ） 有聯繫 。 核苷酸多樣性通常用於衡量種群內或種群間的多樣性 ， 或作物與相關物種間的遺傳變異 。 另外 ， 核苷酸多樣性還可以用於推算進化關係 。 可通過直接比對DNA序列來算出核苷酸多樣性 ， 亦可使用用分子標記得出的數據 （ 比如使用隨機擴增多態性DNA （ RAPD ） 技術或擴增片段長度多態性PCR （ AFLP - PCR ） 得出的數據 ） 推算出 。