亞硫酸鹽定序

亞硫酸鹽定序 （ 英語 ： bisulfite sequencing ） 是一種利用亞硫酸鹽處理 ， 測定DNA甲基化情形的方法 。 DNA甲基化是最早被發現的表觀遺傳標記 ， 也是被研究最爲深入的表觀遺傳改變 。 原理在於亞硫酸鹽可使DNA上的胞嘧啶 （ C ） 轉變爲尿嘧啶 （ U ） ， 同時已受甲基化的5 - 甲基胞嘧啶則不受影響 。 如此一來 ， 就可以使實驗者得知DNA序列上甲基化的情形 ( Figure 2 ) 。 對動物而言 ， DNA甲基化主要是指對CpG位點中胞嘧啶的五號碳上增加一個甲基的過程 。 DNA位點的甲基化可能對該基因的轉錄活性起到抑制作用 。 使用亞硫酸鹽處理DNA會將胞嘧啶殘基轉化成尿嘧啶 ， 但被甲基化的胞嘧啶殘基則不受影響 ； 因此 ， 被亞硫酸鹽處理後的DNA片段只保留甲基化的胞嘧啶 。 基於此原理 ， 亞硫酸鹽能在單個核苷酸水平上揭示DNA的甲基化情況 。 有多種檢測方法可以實現對亞硫酸鹽處理後DNA序列的分析 ， 分析的實際問題就是亞硫酸鹽使鹼基從C到U最終到T造成的區別 （ Figure 1 ） 。