系統發生學

系統 - { } - 發生學 （ φυλογένεση ； φύλο ， 現代希臘語 ： fílo — — 種系 、 宗族 ； γεννήση ， 現代希臘語 ： jénnissi — — 起源 ， 血統 。 phylogenetics ） ， 又稱種系 - { } - 發生學 、 譜系發生學 ， 簡稱譜系學或發生學 ， 是研究及推理生物個體或群體 （ 例如物種或種群 ） 間演化史及關係的科學方法 ， 屬於系統分類學的一部分 。 系統 - { } - 發生學的推理方法 ， 通常在性狀演變的特定模型下 ， 評估可觀察到的遺傳性狀 （ 例如DNA序列或生物形態 ） 來 “ 假定 ” 這些生物間的關係 。 這種分析推理方法的結果 ， 就是 系統發生 （ 英語 ： phylogeny ， 也稱爲 系統發生樹 phylogenetic tree ） — — 可顯示一群生物演化史的關係圖解假說 。 系統發生樹的尖端可以是生物體或化石 ， 且代表演化譜系中的現今生物或 “ 末端 ” 生物 。 利用系統 - { } - 發生學來分析種系的基本原則是 ： 兩個演化支具有 “ 相同的性狀狀態 ” 是它們對於 “ 共有祖先同一狀態 ” 的保留 ； 而現存生物的性狀就是演化史的紀錄 ， 可作爲重建演化史的依據 。 由系統發生分析的原則 ， 建構了支序分類學的基本邏輯 ； 而系統發生分析已成爲理解生物多樣性 、 演化 、 生態學和基因組的核心 。 系統 - { } - 發生學這個概念不單止用於生物種系的發生與發展 ， 還會用在系統分類學各個層面的分類單元上面 。 它也會被用到某一性狀在種系發生過程中的演化這一方面 。 注 ： 生物分類學是生物的識別 、 命名和分類 ， 它通常由系統發生學提供豐富的信息 ， 但兩者仍然是在方法論和邏輯上不同的學科 。