Esta pregunta puede entrañar algo más de dificultad, pues el caso clínico que nos presentan es muy vago. Una adolescente con retraso puberal y talla baja; nada más. Con esa información podría tener varias patologías de base genética, pero esto es el MIR y además nos dicen que la paciente no tiene discapacidad intelectual. En el MIR, una adolescente con retraso puberal y talla baja debe ser un Turner mientras no se demuestre lo contrario (hubo dos preguntas en el año 2017). Por tanto, si ésa es nuestra primera sospecha diagnóstica, la prueba HABITUAL (como dice el enunciado) para el diagnóstico debe ser un cariotipo convencional (fórmula: 45, X0). También se puede diagnosticar un Turner con un FISH (sólo habría una señal para el X en vez de las dos que tienen habitualmente las mujeres) o con un array. Sin embargo, tanto el array, como el NGS lo reservamos habitualmente para pacientes con cuadros clínicos no evidentes, discapacidad intelectual, o sospecha de algún síndrome genético que precise de estas pruebas concretas (por ejemplo, un array para diagnósticar un síndrome de deleción 22q11 o un panel NGS para diagnosticar un síndrome de Noonan).

Esta pregunta puede entrañar algo más de dificultad, pues el caso clínico que nos presentan es muy vago. Una adolescente con retraso puberal y talla baja; nada más. Con esa información podría tener varias patologías de base genética, pero esto es el MIR y además nos dicen que la paciente no tiene discapacidad intelectual. En el MIR, una adolescente con retraso puberal y talla baja debe ser un Turner mientras no se demuestre lo contrario (hubo dos preguntas en el año 2017). [HIDDEN] la prueba [HIDDEN] para el diagnóstico debe ser un cariotipo convencional (fórmula: 45, X0). También se puede diagnosticar un Turner con un FISH (sólo habría una señal para el X en vez de las dos que tienen habitualmente las mujeres) o con un array. Sin embargo, tanto el array, como el NGS lo reservamos habitualmente para pacientes con cuadros clínicos no evidentes, discapacidad intelectual, o sospecha de algún síndrome genético que precise de estas pruebas concretas (por ejemplo, un array para diagnósticar un síndrome de deleción 22q11 o un panel NGS para diagnosticar un síndrome de Noonan).

Mujer de 15 años que presenta un retraso en la menarquia y una talla baja. No tiene discapacidad intelectual. ¿Cuál de las siguientes pruebas genéticas se utilizaría habitualmente para el diagnóstico de esta paciente?:

Detección de Treponema pallidum subespecie pallidum para el diagnóstico de sífilis congénita mediante reacción en cadena de la polimerasa anidada.

Introducción. La sífilis es una enfermedad producida por Treponema pallidum subespecie pallidum cuya incidencia mundial es de 12 millones de casos por año, aproximadamente; de estos, más de dos millones se presentan en mujeres gestantes, siendo la sífilis congénita la complicación más grave de esta infección en el embarazo.Objetivo. Detectar la presencia de T. pallidum subespecie pallidum en muestras clínicas para el diagnóstico de sífilis congénita mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada y determinar su concordancia con las pruebas serológicas.Materiales y métodos. Mediante PCR convencional y anidada, se amplificaron tres genes diana (polA, 16S ADNr y TpN47) y se confirmaron los productos de amplificación de los genes TpN47 y polA por secuenciación. Las pruebas serológicas empleadas fueron la VDRL (Venereal Disease Research Laboratory), la de reagina plasmática rápida (Rapid Plasma Reagin, RPR) y la de aglutinación de partículas para Treponema pallidum (Treponema pallidum Particle Agglutination Assay, TPPA).Resultados. La sensibilidad para la PCR convencional fue de 52 pg y, para la PCR anidada, de 0,52 pg. La especificidad con los iniciadores TpN47 y polA fue de 100 %; los resultados de la secuenciación mostraron una identidad de 97 % con T. pallidum. En 70 % de las muestras, los resultados de las pruebas serológicas y la PCR anidada concordaron.Conclusión. El gen TpN47 resultó ser el mejor blanco molecular para la identificación de T. pallidum. La PCR anidada se presenta como una alternativa de diagnóstico molecular promisoria para el diagnóstico de sífilis congénita.

Low Referral Rates for Genetic Assessment of Patients With Multiple Adenomas in United Kingdom Bowel Cancer Screening Programs.

Approximately 1 in 20 cases of colorectal cancer are caused by monogenic syndromes. Published guidelines recommend that patients with 10 or more adenomas be referred for genetic testing, based on evidence that colorectal cancer risk is associated with adenoma multiplicity. The aim of this study was to determine adherence to guidelines on referral for genetic screening in patients with 10 or more adenomas. A cross-sectional study was performed of prospectively collected data from the UK Bowel Cancer Screening Programme between May 2007 and June 2018. Only histologically confirmed adenomas were included. Clinicopathological data were recorded from patient records, and referrals to clinical genetics services were ascertained. Data were obtained from 3 centers in London, United Kingdom. A total of 17,450 subjects underwent colonoscopy following an abnormal fecal occult blood test. We quantified patients with 10 or more adenomas and the proportion referred for genetic screening. The adenoma detection rate was 50.6% among 17,450 patients who underwent colonoscopy (8831 had 1 or more adenomas). Three hundred forty-seven patients (2.0%) had 10 or more adenomas. Patients with 10 or more adenomas were more likely to be male than those with fewer than 10 adenomas (76.9% vs 53.4%; p < 0.0001). A family history was collected in 37.8% of the multiple adenoma population. Of 347 patients with 10 or more adenomas, 28 (8.1%) were referred for genetic assessment. All 3 screening centers were in a single city. No genetic outcome data were available to permit analysis of actual rates of inherited cancer syndromes in this population. In this study, almost 1 in 50 patients had 10 or more adenomas. Despite guidelines advising genetic testing in this group, referral rates are low. A referral pathway and management strategies should be established to address this patient population. See Video Abstract at http://links.lww.com/DCR/B630. ANTECEDENTES:Aproximadamente uno de cada veinte casos de cáncer colorrectal son causados por síndromes monogénicos. Las pautas publicadas recomiendan que los pacientes con diez o más adenomas sean derivados para pruebas genéticas, basándose en la evidencia de que el riesgo de cáncer colorrectal está asociado con la multiplicidad de adenomas.OBJETIVO:El objetivo de este estudio fue determinar la adherencia a las guías de derivación para cribado genético en pacientes con diez o más adenomas.DISEÑO:Se realizó un estudio transversal de datos recolectados prospectivamente del Programa de Detección de Cáncer de Intestino del Reino Unido entre mayo de 2007 y junio de 2018. Solo se incluyeron los adenomas confirmados histológicamente. Los datos clínico-patológicos se registraron a partir de los registros de los pacientes y se determinaron las derivaciones a los servicios de genética clínica.AJUSTE ENTORNO CLINICO:Los datos se obtuvieron de tres centros en Londres, Reino Unido.PACIENTES:Un total de 17.450 17450 sujetos pacientes se sometieron a una colonoscopia después de una prueba de sangre oculta en heces anormal positiva.PRINCIPALES MEDIDAS DE RESULTADO VOLARACION:cuantificamos los pacientes con diez o más adenomas y la proporción remitida para cribado genético.RESULTADOS:La tasa de detección de adenomas fue del 50,6% entre 17.450 17450 pacientes que se sometieron a colonoscopia (8.831 8831 tenían uno o más adenomas). 347 pacientes (2,0%) tenían 10 o más adenomas. Los pacientes con 10 o más adenomas tenían más probabilidades de ser hombres que aquellos con menos de 10 adenomas (76,9% frente versus a 53,4%; p <0,0001). Se recogieron antecedentes familiares en el 37,8% de la población de adenomas múltiples. De 347 pacientes con 10 o más adenomas, 28 (8,1%) fueron remitidos para evaluación genética.LIMITACIONES:Los tres centros de detección se encontraban en una sola ciudad. No se disponía de datos de resultados genéticos que permitieran el análisis de las tasas reales de síndromes de cáncer hereditario en esta población.CONCLUSIONES:En este estudio, casi uno de cada cincuenta pacientes tenía diez o más adenomas. A pesar de las pautas que recomiendan las pruebas genéticas en este grupo, las tasas de derivación son bajas. Se debe establecer una vía de derivación y estrategias de manejo para abordar esta población de pacientes. Consulte Video Resumen en http://links.lww.com/DCR/B630.

[Not Available].

Introducción: la desnutrición intrahospitalaria se ha descrito hace más de 70 años como un problema frecuente. En México se reportan cifras de entre el 20% al 50%; sin embargo no se ha estudiado su prevalencia ni su asociación con la morbilidad y mortalidad hospitalaria.Objetivos: evaluar el estado nutricional y su relación con la morbimortalidad hospitalaria en pacientes mexicanos.Métodos: cohorte prospectiva de pacientes que ingresaron en un hospital de referencia para una estancia hospitalaria mayor de 5 días. Se capturó peso, talla, índice de masa corporal (IMC), estado nutricional de acuerdo con la valoración global subjetiva (VGS) a su ingreso y egreso hospitalario, así como diagnóstico médico, complicaciones y mortalidad. Los datos fueron analizados mediante la prueba T de Student, prueba Chi-cuadrado y prueba Exacta de Fisher.Resultados: se incluyeron 610 pacientes en total, con un promedio de edad de 50,8 ± 17,32 años, 267 mujeres (43,8%) y 343 hombres (56,2%). Del total, 154 fueron catalogados con sospecha de desnutrición o desnutrición (pacientes expuestos, 25,2%) y 456 bien nutridos (pacientes no expuestos, 74,8%), con una relación de 1 a 3. La morbilidad total de la cohorte tuvo un RR = 2,70, IC 95 % (2,06-3,55) y la mortalidad con un RR = 2,64, IC 95% (1,74-4,0), siendo ambas estadísticamente significativas (p = 0,001).Conclusiones: el diagnóstico de desnutrición al ingreso hospitalario constituye un factor de riesgo para el desarrollo de complicaciones y mortalidad. Este padecimiento al ingreso en comparación con el paciente que no presenta desnutrición incrementó el riesgo de mortalidad hasta en 2.64 veces.

[Fish and chips].

Academic hospital laboratories should offer patients the possibility to have the most accurate diagnosis by the development of new analyses, such as molecular biology tests including FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) and chips (microarrays,...). The purpose of this article is to describe the principles and the potential applications of these techniques.

[Rett syndrome: report of a new pathogenic variant and review of the literature regarding two clinical cases.]

El síndrome de Rett es un trastorno del neurodesarrollo con una frecuencia estimada de 1/10,000 recién nacidos vivos, el cual se presenta con un modelo de herencia ligado al cromosoma X. Las variantes patogénicas en el gen MECP2, el cual codifica para una proteína que participa en el desarrollo y la diferenciación del sistema nervioso central, causan este síndrome. El objetivo de este trabajo fue describir dos casos de síndrome de Rett, uno de ellos con una nueva variante del gen MECP2. El primer caso se trata de una paciente de 5 años con microcefalia y regresión del neurodesarrollo desde los 3 años. Clínicamente se diagnosticó de síndrome de Rett en estadio III. Se realizó la secuenciación del gen MECP2 y se identificó una variante probablemente patogénica en estado heterocigoto, c.606delC (p.Thr203Argfs*7), que no ha sido reportada previamente. El segundo caso es una paciente de 17 años, referida por discapacidad intelectual grave, que se encontró clínicamente en estadio IV. Se realizó la secuenciación de MECP2 y se identificó una variante patogénica [c.880C>T(p.Arg294*)] ya descrita previamente. El diagnóstico clínico de síndrome de Rett se llevó a cabo con criterios establecidos. La confirmación diagnóstica fue mediante la secuenciación de MECP2. Para el correcto abordaje de los trastornos del neurodesarrollo es primordial conocer el fenotipo de síndrome de Rett, así como optar por el análisis molecular para la confirmación del diagnóstico. Los pacientes con síndrome de Rett requieren un seguimiento interdisciplinario para disminuir el impacto de las complicaciones. Rett syndrome is an X-linked neurodevelopmental disorder with an estimated frequency of 1/10,000 live births caused by hetereozygous pathogenic variants in the MECP2 gene, whose protein participates in the development and differentiation of the central nervous system. This study aimed to describe two cases with Rett syndrome diagnosis, one of them with a new variant of the MECP2 gene. We first describe the case of a 5-year-old female with microcephaly and neurodevelopmental regression starting at 3 years old, clinically corresponding to stage III Rett syndrome. Sequencing of the MECP2 gene identified a heterozygous likely pathogenic variant [c.606delC (p.Thr203Argfs*7)] not reported previously. The second case is a 17-year-old female, referred due to severe intellectual disability, clinically found on stage IV. MECP2 sequencing was performed identifying a pathogenic variant previously described [c.880C> T (p.Arg294 *)]. Rett syndrome clinical diagnosis was carried out based on established criteria. MECP2 sequencing confirmed the diagnosis. For neurodevelopmental disorders approach, it is essential to know the phenotype of Rett syndrome and select the molecular tool for the diagnosis. Patients with Rett syndrome require interdisciplinary follow-up for reducing the impact of complications.

[Mixed clinical phenotype of deletion and duplication of the Sotos syndrome region: 5q35.2-q35.3 microdeletion detected by CGH array].

Introducción: El síndrome de Sotos es una enfermedad hereditaria caracterizada por el sobrecrecimiento prenatal y posnatal, con edad ósea avanzada, facies característica y retraso del desarrollo. Caso clínico: Se reporta el caso de un paciente con síndrome de Sotos y manifestaciones clínicas no descritas previamente, diagnosticado por microarreglos de hibridación genómica comparativa. Se detectó la duplicación de un gen y la deleción de 43 genes, entre los que se encuentran NSD1, gen asociado al síndrome de Sotos. La pérdida y la ganancia de estos otros genes pueden explicar las características atípicas en este paciente. Conclusiones: Por las características atípicas, el microarreglo de hibridación genómica comparativa fue una herramienta útil para el diagnóstico. Las alteraciones cromosómicas encontradas en este paciente demuestran la heterogeneidad clínica de las enfermedades genómicas.

[The use of molecular cytogenetic and cytogenetic techniques for the diagnosis of Prader-Willi and Angelman syndrome].

We examined 30 patients with a presumptive diagnosis of Prader-Willi and Angelman syndromes. In four patients, 15q11.2-q13 deletions were identified by cytogenetic techniques. The FISH method was used to study eight patients, in five of them microdeletions were also confirmed. High-resolution comparative genomic hybridization (CGH) and comparative genomic hybridization using DNA microarrays (array CGH) allowed to find 15q11.2-q13 deletions in five patients. These cases demonstrate the need for high-resolution post-genomic technologies (array CGH - molecular karyotyping) in the combination with classical cytogenetic and molecular cytogenetic techniques.

Sessile Serrated Polyposis: Not an Inherited Syndrome?

Researchers are searching in vain for a coherent genetic explanation for serrated polyposis. We hypothesize that there is no consistent monogenetic inheritance. The purpose of this study was to describe the serrated polyposis phenotype, assessing features of mendelian inheritance, and to compare these features with patients with a solitary sessile serrated lesion. This was a retrospective review of a prospectively maintained database comparing patients with serrated polyposis versus solitary sessile serrated lesions. The study was conducted at a single-institution tertiary referral center. Patients with serrated polyposis meeting World Health Organization criteria type I (≥5 serrated polyps proximal to the sigmoid, ≥2 of which are ≥10 mm in diameter) and isolated sessile serrated lesions were included MAIN OUTCOME MEASURES:: Disease phenotype was the main outcome measured. A total of 46 serrated polyposis patients were identified. Median age of first sessile serrated lesion was 66 years (interquartile range, 42-70 y). A total of 60.3% were current or past smokers (mean = 38.6 packs per year). Serrated polyposis patients had a higher number of all types of polyps (26.3 vs 4.4) and a higher rate of high-grade dysplasia (19.6% vs 3.7%) compared with patients with a solitary sessile serrated lesion. A total of 36.2% of patients had personal history of noncolorectal cancers, including skin, prostate, breast, thyroid, and renal cell cancers and leukemia. In addition, 32.6% had a family history of colorectal cancer in first- or second-degree relatives; these cancers were not young age of onset. Breast and prostate cancers were also common (family history of any cancer, 83.0%). Ten patients underwent genetic testing: 4 had negative panels, 1 had a pathogenic variant in MSH2, 1 an IVS7 deletion in PTEN, 2 negative APC sequencing (1 negative MYH), and 1 a pathogenic variant in Chek2. RNF4 was not sequenced. Genetic analysis was performed on a subset of patients. The rate of associated cancers suggests an underlying genetic predisposition to disordered growth, but serrated polyposis does not have typical features of dominant inheritance. The association with smoking suggests that familial/environmental factors play a role. See Video Abstract at http://links.lww.com/DCR/B84. POLIPOSIS SERRADA SÉSIL: ¿NO ES UN SÍNDROME HEREDITARIO?: Los investigadores están buscando en vano una explicación genética coherente para la póliposis serrados. Suponemos que no existe una herencia monogenética consistente.1) Describir el fenotipo de póliposis serrada, evaluando las características de la herencia mendeliana, 2) comparar estas características con pacientes con una lesión serrada sésil solitaria.Revisión retrospectiva de una base de datos mantenida prospectivamente que compara pacientes con póliposis serrada versus lesiones serradas sésiles solitarias.Institución única, centro de referencia terciario.Pacientes con póliposis serrada que cumplen con los Criterios de la Organización Mundial de la Salud Tipo I (≥ 5 pólipos serrados proximales al sigmoideo, ≥2 de los cuales tienen ≥10 mm de diámetro) y lesiones serradas sésiles aisladas.Fenotipo de la enfermedad.Se identificaron un total de 46 pacientes con póliposis serrada. La edad mediana de la primera lesión serrada sésil fue de 66 años (RIC: 42-70 años). El 60.3% eran fumadores actuales o pasados (medio 38.6 paquetes / año). Los pacientes con póliposis serrada tuvieron un mayor número de todos los tipos de pólipos (26.3 versus 4.4) y una mayor tasa de displasia de alto grado (19.6% versus 3.7%) en comparación con los pacientes con una lesión serrada sésil solitaria. El 36.2% de los pacientes tenían antecedentes personales de cánceres no colorectales, incluyendo los cánceres de piel, próstata, mama, tiroides, células renales y leucemia. El 32.6% tenía antecedentes familiares de cáncer colorectal en familiares de primer o segundo grado; estos cánceres no eran de inicio de edad temprana. El cáncer de mama y próstata también fue frecuente (antecedentes familiares de cualquier tipo de cáncer: 83.0%). 10 pacientes se sometieron a pruebas genéticas: 4 tenían paneles negativos, 1 tenía una variante patogénica en MSH2, 1 una eliminación IVS7 en PTEN, 2 secuenciación APC negativa (1 MYH negativa) y 1 variante patogénica en Chek2.RNF4 no fue secuenciado. El análisis genético se realizó en un subconjunto de pacientes.La tasa de cánceres asociados sugiere una predisposición genética subyacente al crecimiento desordenado, pero la póliposis serrada no tiene características típicas de herencia dominante. La asociación con el tabaquismo sugiere que los factores familiares / ambientales juegan un papel. Consulte Video Resumen en http://links.lww.com/DCR/B84. (Traducción-Dr. Yesenia Rojas-Khalil).

Recommendations for the use of microarrays in prenatal diagnosis.

Microarray technology, recently implemented in international prenatal diagnosis systems, has become one of the main techniques in this field in terms of detection rate and objectivity of the results. This guideline attempts to provide background information on this technology, including technical and diagnostic aspects to be considered. Specifically, this guideline defines: the different prenatal sample types to be used, as well as their characteristics (chorionic villi samples, amniotic fluid, fetal cord blood or miscarriage tissue material); variant reporting policies (including variants of uncertain significance) to be considered in informed consents and prenatal microarray reports; microarray limitations inherent to the technique and which must be taken into account when recommending microarray testing for diagnosis; a detailed clinical algorithm recommending the use of microarray testing and its introduction into routine clinical practice within the context of other genetic tests, including pregnancies in families with a genetic history or specific syndrome suspicion, first trimester increased nuchal translucency or second trimester heart malformation and ultrasound findings not related to a known or specific syndrome. This guideline has been coordinated by the Spanish Association for Prenatal Diagnosis (AEDP, «Asociación Española de Diagnóstico Prenatal»), the Spanish Human Genetics Association (AEGH, «Asociación Española de Genética Humana») and the Spanish Society of Clinical Genetics and Dysmorphology (SEGCyD, «Sociedad Española de Genética Clínica y Dismorfología»).

Inyección Intraarticular Única de Ácido Hialurónico en la Artrosis de Rodilla: Estudio Multicéntrico Prospectivo Abierto (ART-ONE 75) mediante Comparación Post-Hoc con Placebo.

La viscosuplementación del líquido sinovial mediante la inyección intraarticular (IA) de ácido hialurónico (AH) es un tratamiento sintomático ampliamente utilizado en la artrosis de rodilla (AR). Además de los productos diseñados para realizar inyecciones múltiples (normalmente de 3 a 5 inyecciones, en intervalos de 1 semana), se presta especial atención a los productos de una única inyección, ya que ofrecen ventajas específicas, como son un menor número de visitas al médico y de intervenciones invasivas con sus riesgos asociados. Sin embargo, aún existen dudas sobre la eficacia de estas inyecciones únicas, en comparación con los regímenes de inyecciones múltiples. Se realizó un estudio multicéntrico, abierto, prospectivo, post-mercado (ART-ONE 75) con el producto de inyección única ARTHRUM 2,5% (3 ml, 75 mg AH), en 214 pacientes que sufrían de AR. Los pacientes fueron seguidos en D30, D60, D120 y D180 (días). El perfil promedio de los pacientes en el momento de la inclusión fue de 62,9 años, 56% mujeres, grados I-III de Kellgren-Lawrence (46% KL III), IMC de 27,2 kg/m<sup2</sup y 4 años desde el diagnóstico de AR. Se realizó una comparación post-hoc con una inyección IA única de placebo (326 pacientes, agrupados de 3 estudios ECA), que proporcionaron un perfil de paciente similar. el criterio principal fue la variación desde el inicio de la puntuación de la escala WOMAC A (dolor, escala 0-100) en D60, que se redujo en 28,9 (17,4) para la población por intención de tratar (ITT, por sus siglas en inglés) (199 pacientes), 28,0 (17,8) para la población por protocolo (PP) en la inclusión (175 pacientes), y en 27,7 (16,8) para la población PP al finalizar (143 pacientes).Los criterios secundarios y accesorios incluyeron WOMAC A en otras ocasiones, WOMAC B (rigidez), WOMAC C (función), calidad de vida y discapacidad en cada momento de seguimiento. Todos los índices mejoraron significativamente y continuaron mejorando al final del estudio. La evaluación terapéutica en D180 mostró que más del 75% de los pacientes se encontraban satisfechos con la reducción del dolor, la mejora de la movilidad, y la reducción de analgésicos y AINE. El porcentaje de pacientes definidos como respondedores de OMERACT-OARSI fue superior al 86%, a partir de D60 y en adelante. La tolerancia general fue buena, sin que ocurriera ningún evento adverso grave. El resultado de la comparación post-hoc para la escala WOMAC A mostró un tamaño del efecto [IC 95%] desde TE = 0,33 [0,15; 0,51] en D60 a TE = 0,65 [0,45; 0,85] en D180 (p <0,001), frente a la inyección de placebo (solución salina), lo cual es un resultado clínicamente relevante a favor de ARTHRUM 2,5%. El presente estudio confirma la eficacia clínica de una única inyección IA de 3 ml de solución de AH conteniendo 75 mg de AH nativo de alto PM (> 2 MDa).

[Indications for treatment in invasive ductal carcinoma of the breast with Herceptin from the aspect of laboratory diagnosis--study of the ERBB-2 protein and determination of the number of copies of the ERBB2 gene. Review].

Overexpression of the ERBB-2 protein has become a target of the anti-neoplastic treatment in patients with invasive duct carcinomas of the breast with a monoclonal antibody trastuzumab (Herceptin, Genentech). From this reason the immunohistochemical (IHC) evaluation of ERBB-2 protein expression is crucial. However, there are patients in whom the IHC investigation is biased by a subjective evaluation among cases considered negative (in the range of 1+) and positive (2+), and among cases considered positive 2+ and 3+. In such cases it is advisable to complement the IHC investigation by detection of copy numbers of the ERBB2 gene with fluorescence in situ hybridization (FISH). The overexpression of the protein is caused by the gene amplification in a majority of cases. The patients, whose carcinomas show overexpression of the ERBB-2 protein and the overexpression is caused by a significant gene amplification, profit from the Herceptin therapy. In this review we focus also on the methodology of FISH in paraffin sections and tissue imprints with respect to the detection of copy numbers of chromosome 17 and the ERBB2 gene.

How Soon Should Patients With Colon Cancer Undergo Definitive Resection?

Timing of surgery has been shown to affect outcomes in many forms of cancer, but definitive national data do not exist to determine the effect of time to surgery on survival in colon cancer. This study aimed to determine whether a delay in definitive surgery in colon cancer significantly affects survival. A retrospective cohort study using 2 independent population-based databases, The Surveillance, Epidemiology, and End Results Medicare-linked database and the National Cancer Database, was performed. All patients had American Joint Committee on Cancer stage 1 through 3 colon cancer. Patients were more than 18 years of age in the National Cancer Database cohort and older than 66 years of age in the Medicare cohort. Patients had a minimum of 3 years of follow-up. The main outcome was overall survival as a function of time between diagnosis and surgery in 4 intervals (1-2, 3-4, 5-6, >6 weeks). The Medicare cohort demonstrated an adjusted 5-year survival of 8% to 14% higher in patients with a surgical delay between 3 and 6 weeks, with significantly lower hazard ratios in that interval. The National Cancer Database cohort demonstrated an adjusted 5-year survival of 9% to 16% higher in patients with surgery 3 to 6 weeks after diagnosis, with comparatively similar improvements in survival hazard. Because this was a retrospective study of administrative databases, with Medicare data limited to billing data, the causality of outcomes must be interpreted with caution. The ideal timing of definitive resection in colon cancer is between 3 and 6 weeks after initial diagnosis. All efforts should be made for patients to obtain definitive surgery within this interval to achieve a modest but significant improvement in overall survival. See Video Abstract at http://links.lww.com/DCR/B76. ¿CUÁNDO DEBEN SOMETERSE LOS PACIENTES CON CÁNCER DE COLON A UNA RESECCIÓN DEFINITIVA?: Se ha demostrado que el momento de la cirugía afecta los resultados en muchas formas de cáncer, pero no existen datos nacionales definitivos para determinar el efecto del tiempo hasta la cirugía en la supervivencia en el cáncer de colon.Determinar si un retraso en la cirugía definitiva en el cáncer de colon afecta significativamente la supervivencia.Un estudio de cohorte retrospectivo que utiliza dos bases de datos independientes basadas en la población; Se realizó la base de datos vinculada a la vigilancia, la epidemiología y los resultados finales y la base de datos nacional del cáncer.Pacientes con cáncer de colon en estadíos 1 a 3 del Comité Estadounidense Conjunto sobre el Cáncer. Los pacientes tenían más de 18 años en la cohorte de la National Cancer Database y más de 66 años en la cohorte de Medicare. Los pacientes tuvieron un mínimo de 3 años de seguimiento.El resultado principal fue la supervivencia general en función del tiempo entre el diagnóstico y la cirugía en 4 intervalos (1-2, 3-4, 5-6, y mas de 6 semanas).La cohorte de Medicare demostró una supervivencia ajustada de 5 años de 8 a 14% más en pacientes con un retraso quirúrgico entre 3 a 6 semanas, con razones de riesgo significativamente más bajas en ese intervalo. La cohorte de la National Cancer Database demostró una supervivencia ajustada a 5 años de 9 a 16% más en pacientes con cirugía de 3 a 6 semanas después del diagnóstico, con mejoras comparativamente similares en el riesgo de supervivencia.Dado que este fue un estudio retrospectivo de bases de datos administrativas, con datos de Medicare limitados a datos de facturación, la causalidad de los resultados debe interpretarse con precaución.El momento ideal para la resección definitiva en el cáncer de colon es entre tres y seis semanas después del diagnóstico inicial. Se deben hacer todos los esfuerzos para que los pacientes obtengan una cirugía definitiva dentro de este intervalo para lograr una mejora modesta pero significativa en la supervivencia general. Consulte Video Resumen en http://links.lww.com/DCR/B76.

[Contribution of chromosomal microarray analysis by a multidisciplinary prenatal diagnosis center].

Chromosomal analysis by array CGH is a cytogenetic technique that has opened its application to prenatal diagnosis in recent years. The main objective of the study was to analyze the contribution for couples using chromosomal analysis by array CGH in a CPDPN. A retrospective cohort study was conducted in 2015 in a CPDPN. All the patients with array CGH analysis were included in the study. The analysis indications were CN≥3.5mm, ultrasound signs, intra-uterine growth retardation and fetal deaths. Data were collected in the prenatal diagnosis and genetic records. In total, 155 patients underwent analysis by array CGH, which corresponds to 36% of patients with invasive sampling indication. Fifteen CGH analysis were positive which represents 9.6% of indications. None of those diagnoses was possible with standard karyotype. These positive results have changed the outcome of pregnancy and what to do for a future pregnancy in 54% of cases. Array CGH enables a diagnostic gain despite a delicate interpretation and changes taking care of patients in future pregnancies. These results should be confirmed in a prospective multicenter study.

Application of Multigene Panel Testing in Patients With High Risk for Hereditary Colorectal Cancer: A Descriptive Report Focused on Genotype-Phenotype Correlation.

The genetic test solely based on the clinical features of hereditary colorectal cancer has limitations in clinical practice. This study aimed to analyze the results of comprehensive multigene panel tests based on clinical findings. This was a cross-sectional study based on a prospectively compiled database. The study was conducted at a tertiary hospital. A total of 381 patients with high risk for hereditary colorectal cancer syndromes were enrolled between March 2014 and December 2019. The primary outcome was to describe the mutational spectrum based on genotype-phenotype concordance and discordance. Germline mutations were identified in 89 patients for polyposis hereditary colorectal cancer genes (76 in APC; 4 in PTEN; 4 in STK11; 3 in BMPR1A; 1 in POLE; 1 in POLD1), 89 patients for nonpolyposis hereditary colorectal cancer genes (41 in MLH1; 40 in MSH2; 6 in MSH6; and 2 in PMS2), and 12 patients for other cancer predisposition genes (1 in ATM; 2 in BRCA1; 1 in BRCA2; 1 in BRIP1; 1 in MLH3; 1 in NBN; 1 in PMS1; 1 in PTCH1; 1 in TP53; and 2 in monoallelic MUTYH). If we had used direct sequencing tests of 1 or 2 major genes based on phenotype, 48 (25.3%) of 190 mutations would not have been detected due to technical differences (12.1%), less frequent genotype (4.2%), unclear phenotype (3.7%), and genotype-phenotype discordance (4.7%). The genotype-phenotype discordance is probably linked to compound heterozygote, less distinctive phenotype, and insufficient information for colorectal cancer risk. This study included a small number of patients with insufficient follow-up duration. A comprehensive multigene panel is expected to identify more genetic mutations than phenotype-based direct sequencing, with special utility for unclear phenotype or genotype-phenotype discordance. See Video Abstract at http://links.lww.com/DCR/B844. ANTECEDENTES:La prueba genética basada únicamente en la característica clínica del cáncer colorrectal hereditario tiene limitaciones en la práctica clínica.OBJETIVO:Este estudio tuvo como objetivo analizar el resultado de pruebas integrales de panel multigénico basadas en hallazgos clínicos.DISEÑO:Este fue un estudio transversal basado en una base de datos recopilada prospectivamente.AJUSTE:El estudio se realizó en un hospital terciario.PACIENTES:Se inscribió un total de 381 pacientes con alto riesgo de síndromes de cáncer colorrectal hereditario entre marzo del 2014 y diciembre del 2019.PRINCIPALES MEDIDAS DE RESULTADO:El resultado principal fue describir el espectro mutacional basado en la concordancia y discordancia genotipo-fenotipo.RESULTADOS:Se identificaron mutaciones de la línea germinal en 89 pacientes para genes de cáncer colorrectal hereditario con poliposis (76 en APC; 4 en PTEN; 4 en STK11; 3 en BMPR1A; 1 en POLE; 1 en POLD1), 89 pacientes para genes de CCR hereditario sin poliposis (41 en MLH1; 40 en MSH2; 6 en MSH6; y 2 en PMS2) y 12 pacientes por otro gen de predisposición al cáncer (1 en ATM; 2 en BRCA1; 1 en BRCA2; 1 en BRIP1; 1 en MLH3; 1 en NBN; 1 en PMS1; 1 en PTCH1; 1 en TP53; y 2 en MUTYH monoalélico). Si hubiéramos utilizado pruebas de secuenciación directa de uno o dos genes principales basados en el fenotipo, 48 (25,3%) de 190 mutaciones no se habrían detectado debido a diferencias técnicas (12,1%), genotipo menos frecuente (4,2%), fenotipo poco claro (3,7%) y discordancia genotipo-fenotipo (4,7%). La discordancia genotipo-fenotipo probablemente esté relacionada con el heterocigoto compuesto, el fenotipo menos distintivo y la información insuficiente para el riesgo de cáncer colorrectal.LIMITACIONES:Este estudio incluyó una pequeña cantidad de pacientes con una duración de seguimiento insuficiente.CONCLUSIONES:Se espera que un panel multigénico completo identifique más mutaciones genéticas que la secuenciación directa basada en el fenotipo, con especial utilidad para la discordancia de fenotipo o genotipo-fenotipo poco clara. Consulte Video Resumen en http://links.lww.com/DCR/B844. Traducción- Dr. Francisco M. Abarca-Rendon).

[Genetics applied to clinical practice in neurodevelopmental disorders].

The medical literature contains a wide body of evidence supporting genetic involvement in neurodevelopmental disorders. Advances made in genetics and technology have increased the diagnostic cost-effectiveness of current studies from 3-5% to 30-40% in patients with intellectual disability or autism spectrum disorders. In this regard, chromosomal microarray studies display greater diagnostic power than conventional techniques (karyotype, subtelomeric analyses, etc.). The latest protocols in the biomedical field of the genetic study of these disorders cite chromosomal microarrays as the first-line analysis, while also recommending other specific studies depending on the patient's clinical features (fragile X syndrome, PTEN mutation, etc.). In the evaluation of other neurodevelopmental disorders (attention deficit hyperactivity disorder, learning disorders, etc.), the number of genetic tests carried out is limited and conditioned by the clinical characteristics or the patient's familial or personal history. Even in these situations, there are no genetic referral or evaluation protocols.

[Hallazgos clínicos y epidemiológicos en la neurofibromatosis tipo 1 y el complejo esclerosis tuberosa en una serie de pacientes pediátricos].

La neurofibromatosis tipo 1 (NF1) es una entidad genética con una incidencia de 1 entre 2,500 a 3,500 nacimientos. Por su parte, el complejo esclerosis tuberosa (CET) presenta una incidencia de 1 entre 6,000 a 10,000 nacimientos. Ambas entidades neurocutáneas cursan con un patrón de herencia autosómico dominante, expresividad variable y la morbimortalidad se encuentra asociada a complicaciones multisistémicas. El objetivo de este trabajo fue exponer las características clínicas y epidemiológicas de una serie de pacientes pediátricos con diagnóstico de NF1 y CET atendidos en la Unidad de Genética Médica de la Universidad de Los Andes. Este trabajo corresponde a una serie de casos de pacientes menores de 16 años atendidos en un período de 11 años, que cumplan con los criterios diagnósticos de NF1 y CET según los consensos para cada entidad. Se estudiaron 89 pacientes, 73 con NF1 y 16 con CET. Presentaron dos criterios para NF1, 58 (79.45%) pacientes, y las máculas café con leche fueron las más frecuentes y presentes en todos los casos; 10 pacientes (62.50 %) presentaron dos criterios mayores para el CET, y las máculas hipocrómicas estuvieron igualmente presentes en todos los casos. Este estudio muestra la forma de presentación clínica de las dos entidades neurocutáneas más frecuentes. Se discuten los criterios diagnósticos con el objeto de identificarlos a edades más tempranas y poder brindar una evaluación médica interdisciplinaria, tratamiento y un oportuno asesoramiento genético familiar. Neurofibromatosis type 1 (NF1) is a genetic entity with an incidence of 1 in 2,500 to 3,500 births. Tuberous sclerosis complex (TSC) has an incidence between 1 in 6,000 to 10,000 births. Both neurocutaneous entities present an autosomal dominant inheritance pattern, variable expressivity and their morbidity and mortality is associated with multisystemic complications. The aim of this study was to present the clinical and epidemiological characteristics of a series of pediatric patients diagnosed with NF1 and TSC, who were treated in the Medical Genetics Unit of the Universidad of Los Andes. This work corresponds to a series of cases of patients under 16 years of age served in a period of 11 years, who met the diagnostic criteria of NF1 and CET according to the consensus for each entity. We studied 89 patients, 73 with NF1 and 16 with TSC. 58 (79.45%) of the patients presented two criteria for NF1, with café-au-lait macules being the most frequent and present in all cases. 10 (62.50%) of the patients presented two major criteria for TSC; hypochromic macules were equally present in all cases. This study shows the clinical presentation of the two most frequent neurocutaneous entities. Diagnostic criteria are discussed in order to perform them at younger ages and to provide an interdisciplinary medical evaluation, treatment and timely family genetic counseling.

Rubén Moreno Palanques

Gene therapy: Protocols and patient register. Moreno-Palanques, R. F. In: Gene Therapy. Bilbao: Fundación BBV, 133-187, 1995. El Sistema Nacional de Salud en la nueva etapa de descentralización plena. Moreno Palanques, RF. Presupuesto y Gasto Público, 28: 117-121, 2002. (Madrid: Instituto de Estudios Fiscales, Ministerio de Economía y Hacienda) La financiación de la asistencia sanitaria prestada a través del INSALUD. Moreno Palanques, RF. Presupuesto y Gasto Público, 25: 139-147, 2001 (Madrid: Instituto de Estudios Fiscales, Ministerio de Economía y Hacienda) El papel del Ministerio de Sanidad y Consumo ante la descentralización plena de la Gestón Sanitaria. Moreno Palanques, R.F. Revista de Administración Sanitaria, IV (16): 15-27 (2000)

Single-dose systemic methotrexate vs expectant management for treatment of tubal ectopic pregnancy: a placebo-controlled randomized trial.

Methotrexate is used routinely worldwide for the medical treatment of clinically stable women with a tubal ectopic pregnancy. This is despite the lack of robust evidence to show its superior effectiveness over expectant management. The aim of our multicenter randomized controlled trial was to compare success rates of methotrexate against placebo for the conservative treatment of tubal ectopic pregnancy. This study took place in two early-pregnancy units in the UK between August 2005 and June 2014. Inclusion criteria were clinically stable women with a conclusive ultrasound diagnosis of a tubal ectopic pregnancy, presenting with a low serum beta human chorionic gonadotropin (β-hCG) level of < 1500 IU/L. Women were assigned randomly to a single systemic injection of either 50 mg/m<sup2</sup methotrexate or placebo. The primary outcome was a binary indicator for success of conservative management, defined as resolution of clinical symptoms and decline of serum β-hCG to < 20 IU/L or a negative urine pregnancy test without the need for any additional medical intervention. An intention-to-treat analysis was followed. We recruited a total of 80 women, 42 of whom were assigned to methotrexate and 38 to placebo. The arms of the study were matched in terms of age, ethnicity, obstetric history, pregnancy characteristics and serum levels of β-hCG and progesterone. The rates of success were similar for the two study arms: 83% with methotrexate and 76% with placebo. On univariate analysis, this difference was not statistically significant (χ<sup2</sup (1 degree of freedom) = 0.53; P = 0.47). On multivariate logistic regression, the serum level of β-hCG was the only covariate found to be significantly associated with outcome. The odds of failure increased by 0.15% for each unit increase in β-hCG (odds ratio, 1.0015 (95% CI, 1.0002-1.003); P = 0.02). In 14 women presenting with serum β-hCG of 1000-1500 IU/L, the success rate was 33% in those managed expectantly compared with 62% in those receiving methotrexate. This difference was not statistically significant and a larger sample size would be needed to give sufficient power to detect a difference in the subgroup of women with higher β-hCG. In women with successful conservative treatment, there was no significant difference in median β-hCG resolution times between study arms (17.5 (interquartile range (IQR), 14-28.0) days (n = 30) in the methotrexate group vs 14 (IQR, 7-29.5) days (n = 25) in the placebo group; P = 0.73). The results of our study do not support the routine use of methotrexate for the treatment of clinically stable women diagnosed with tubal ectopic pregnancy presenting with low serum β-hCG (< 1500 IU/L). Further work is required to identify a subgroup of women with tubal ectopic pregnancy and β-hCG ≥ 1500 IU/L in whom methotrexate may offer a safe and cost-effective alternative to surgery. Copyright © 2016 ISUOG. Published by John Wiley & Sons Ltd. Comparación entre una sola dosis de metotrexate sistémico y la conducta expectante en el tratamiento de casos de embarazo ectópico tubárico: un ensayo aleatorio controlado con placebo RESUMEN OBJETIVO: El metotrexate se utiliza de modo rutinario en todo el mundo para el tratamiento de las mujeres clínicamente estables con un embarazo ectópico tubárico. Esto sucede a pesar de la falta de evidencia rigurosa que demuestre que su eficacia es superior a la conducta expectante. El objetivo de este ensayo controlado aleatorio multicéntrico fue comparar las tasas de éxito del metotrexate con las de un placebo para el tratamiento cauteloso del embarazo ectópico tubárico. MÉTODOS: Este estudio se llevó a cabo en dos clínicas de control de gestación temprana en el Reino Unido entre agosto de 2005 y junio de 2014. Los criterios de inclusión fueron mujeres clínicamente estables con un diagnóstico ecográfico concluyente de embarazo ectópico tubárico, las cuáles presentaban una concentración sérica baja de la β hormona coriónica gonadotrópica (β-hCG) inferior a 1500 UI/L. Las mujeres fueron asignadas aleatoriamente a una sola inyección sistémica de 50 mg/m2 de metotrexate o a placebo. El resultado primario fue un indicador binario del éxito del tratamiento conservador, definido como la resolución de los síntomas clínicos y la disminución en el suero de la β-hCG a <20 UI/L o una prueba de embarazo negativa en orina sin la necesidad de ninguna intervención médica adicional. Se hizo un análisis por intención de tratar. Se reclutó un total de 80 mujeres; a 42 de ellas se les asignó el metotrexate y a 38 el placebo. Los grupos del estudio se realizaron en función de la edad, el origen étnico, los antecedentes obstétricos, las características del embarazo y los niveles séricos de la β-hCG y la progesterona. Las tasas de éxito fueron similares para los dos grupos de estudio: 83% con metotrexate y 76% con placebo. En el análisis univariante, esta diferencia no fue estadísticamente significativa (χ2 (1 grado de libertad) = 0,53; P = 0,47). En la regresión logística multivariante, el nivel sérico de la β-hCG fue la única covariable que se encontró significativamente asociada con el resultado. Las probabilidades de fracaso aumentaron en un 0,15% por cada unidad de aumento de la β-hCG (cociente de probabilidad 1,0015 (IC 95%, 1,0002-1,003); P = 0,02). La tasa de éxito en las 14 mujeres con un nivel sérico de la β-hCG de 1000-1500 UI/L fue del 33% en las tratadas con conducta expectante frente al 62% en las que recibieron metotrexate. Esta diferencia no fue estadísticamente significativa, por lo que se necesitaría un tamaño de muestra mayor, lo suficiente como para poder detectar diferencias en el subgrupo de mujeres con una β-hCG más elevada. En las mujeres en las que el tratamiento conservador tuvo éxito, no hubo una diferencia significativa en la mediana de los tiempos de resolución de la ß-hCG entre los grupos del estudio (17,5 (amplitud intercuartílica (IQR), 14-28,0) días (n = 30) en el grupo de metotrexate frente a 14 (IQR, 7-29.5) días (n = 25) en el grupo de placebo; P = 0,73). Los resultados de este estudio no apoyan el uso rutinario de metotrexate para el tratamiento de las mujeres clínicamente estables diagnosticadas con un embarazo ectópico tubárico que presenta un nivel sérico bajo la β-hCG (<1500 UI/L). Serán necesarios estudios adicionales para identificar un subgrupo de mujeres con embarazo ectópico tubárico y β-hCG ≥1500 UI/L para quienes el metotrexate puede ofrecer una alternativa segura y rentable en comparación con la cirugía. : : ,,。。 : 2005820146,2。,,β(beta human chorionic gonadotropin,β-hCG)<1500 IU/L。,(50 mg/m<sup2</sup )。,β-hCG<20 IU/L,。。 : 80,42,38。2、、、β-hCG。2:83%,76%。,[χ<sup2</sup (1)=0.53;P=0.47]。logistic,β-hCG。β-hCG,0.15%[,1.0015(95% CI,1.0002~1.003);P=0.02]。14β-hCG1000~1500 IU/L,33%,62%。,β-hCG。,2β-hCG(P=0.73),17.5[(interquartile range,IQR),14~28.0](n=30),14 (IQR,7~29.5)(n=25)。 : 、、β-hCG(<1500 IU/L)。,β-hCG>1500 IU/L、。.

[New technologies for genome analysis: Which use in prenatal diagnosis].

Array-CGH emergence allowed important diagnosis progress, and a better care of patients in postnatal. So, there is a great temptation to use it also in prenatal diagnosis. The point of view objective is to make a rapid overview of cytogenetic diagnosis evolution during the last 50 years, and to show all questions raised by the use of array-CGH, and problems that could arise in prenatal diagnosis. While array-CGH just comes in genetic laboratories, new diagnosis approaches emerged like whole genome sequencing or non-invasive prenatal diagnosis. The 2nd objective will be to review all these techniques for a probably close future.

Shortening in the Tp-e/QTc ratio after angioplasty in patients with acute coronary syndrome.

La dispersión transmural de la repolarización ventricular (DTMRV) es un factor de riesgo para muerte en pacientes con síndrome isquémico coronario agudo (SICA). Con el objetivo de conocer el efecto de la realización de angioplastia sobre la DTMRV, se estudió la relación Tp-f/QTc en pacientes con SICA sometidos a angioplastia. Se diseñó un estudio observacional, retrospectivo y descriptivo. Se incluyeron 150 pacientes (N = 150) con diagnóstico de SICA. Se valoró la relación Tp-f/QTc inicial y se evaluó su acortamiento posangioplastia. Como objetivo secundario, se comparó la asociación de dichos cambios en la relación Tp-f/QTc con la mortalidad cardiovascular y los eventos adversos cardiovasculares. El promedio en la relación Tp-f/QTc inicial fue de 0.2529, mientras que posangioplastia fue de 0.2397. Por medio de prueba de rangos de Wilcoxon se evidenció un descenso significativo en la relación Tp-f/QTc posterior a la angioplastia, con un valor Z de -2.051 y una p < 0.04. En el análisis secundario se encontró que una Tp-f/QTc ≥ 0.29 posangioplastia es factor de riesgo para presentación de los siguientes eventos adversos: muerte intrahospitalaria (7.4 vs 0%; p < 0.003), nuevo SICA en seguimiento a 1 año (25.9 vs. 18.5%; p < 0.006) y reintervención en seguimiento a 1 año (29.6 vs. 15.0%; p < 0.002). Existe un acortamiento significativo en la relación Tp-f/QTc posangioplastia en pacientes con SICA. Esta medida de la DTMRV puede servir como un predictor de muerte intrahospitalaria, eventos cardiovasculares y reintervención a 1 año en pacientes con SICA tratados con angioplastia. Transmural Dispersion of Repolarization (TDR) is a Risk factor for Death in patients with Acute Coronary Syndrome (ACS). In order to know the effect of angioplasty on TDR, the Tp-e/QTc ratio was studied in patients with ACS undergoing angioplasty. An observational, retrospective and descriptive study was designed. 150 patients (N = 150) with diagnosis of ACS were included. The initial Tp-e/QTc ratio was assessed and then its post-angioplasty shortening was evaluated. As a secondary objective, we compared the association of these Tp-e/QTc ratio changes with cardiovascular mortality and cardiovascular adverse events. The average in the initial Tp-e/QTc ratio was 0.2529, while post-angioplasty was 0.2397. Through a Wilcoxon rage test, a significant decrease in the Tp-e/QTc ratio after angioplasty was observed, with a Z value of −2.051 and p < 0.04. In the secondary analysis, it was found that a Tp-e/QTc ≥ 0.29 post-angioplasty is a risk factor for presenting the following adverse events: in-hospital death (7.4 vs. 0%; p < 0.003), new ACS in 1-year follow-up (25.9 vs. 18.5%; p < 0.006), and reintervention in 1-year follow up (29.6 vs. 15%; p < 0.002). There is a significant shortening in the Tp-e/QTc ratio post-angioplasty in patients with ACS. This measure of TDR can serve as a predictor of in-hospital death, cardiovascular events and 1-year reintervention in patients with ACS treated initially by angioplasty.

[Comparative genomic hybridisation as a first option in genetic diagnosis: 1,000 cases and a cost-benefit analysis].

Conventional cytogenetics diagnoses 3-5% of patients with unexplained developmental delay/intellectual disability and/or multiple congenital anomalies. The Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification increases diagnostic rates from between 2.4 to 5.8%. Currently the comparative genomic hybridisation array or aCGH is the highest performing diagnostic tool in patients with developmental delay/intellectual disability, congenital anomalies and autism spectrum disorders. Our aim is to evaluate the efficiency of the use of aCGH as first-line test in these and other indications (epilepsy, short stature). A total of 1000 patients referred due to one or more of the abovementioned disorders were analysed by aCGH. Pathogenic genomic imbalances were detected in 14% of the cases, with a variable distribution of diagnosis according to the phenotypes: 18.9% of patients with developmental delay/intellectual disability; 13.7% of multiple congenital anomalies, 9.76% of psychiatric pathologies, 7.02% of patients with epilepsy, and 13.3% of patients with short stature. Within the multiple congenital anomalies, central nervous system abnormalities and congenital heart diseases accounted for 14.9% and 10.6% of diagnoses, respectively. Among the psychiatric disorders, patients with autism spectrum disorders accounted for 8.9% of the diagnoses. Our results demonstrate the effectiveness and efficiency of the use of aCGH as the first line test in genetic diagnosis of patients suspected of genomic imbalances, supporting its inclusion within the National Health System.

Introducción. El citomegalovirus es la causa más frecuente de infección en pacientes con trasplante renal. Existen dos estrategias de similar efectividad para prevenirlo: la profilaxis universal con valganciclovir durante 90 días o el tratamiento anticipado verificando la carga viral semanal y aplicándolo solo si esta es positiva.Objetivo. Determinar cuál de estas dos estrategias sería más costo-efectiva en pacientes de riesgo intermedio en Colombia.Materiales y métodos. Se diseñó un árbol de decisiones bajo la perspectiva del tercer pagador considerando únicamente los costos médicos directos en pesos colombianos (COP) del 2014 durante un periodo de un año en una población de pacientes con riesgo intermedio para citomegalovirus (donante positivo y receptor positivo, o donante negativo y receptor positivo). Las probabilidades de transición se extrajeron de los estudios clínicos y se validaron con expertos mediante el método Delphi.Los costos de los procedimientos se basaron en el manual tarifario ISS 2001, con un incremento del 33 % a partir del índice de precios al consumidor (IPC) en salud de 2014, en tanto que los de los medicamentos se extrajeron de las circulares del Ministerio de Salud y del Sistema de Información de Medicamentos (Sismed).Resultados. La profilaxis universal con valganciclovir resultó ser menos costosa y se asoció con una menor probabilidad de infección. El costo promedio del primer año de tratamiento anticipado sería de COP$ 30'961.290, mientras que el universal sería de COP$ 29'967.834, es decir, un costo 'incremental' de COP$ 993.456.Conclusiones. Para los pacientes de riesgo intermedio con trasplante renal en Colombia, la profilaxis universal es la mejor estrategia por ser menos costosa y reducir el riesgo de infección.

[Application of modified comparative genomic hybridization in the genetic analysis of 5 lymphoid neoplasms].

To analyze the utility of performing modified comparative genomic hybridization (mCGH) as a complementary technique to conventional cytogenetic techniques in the genetic analysis of lymphoid neoplasms. Modified comparative genomic hybridization and subsequent FISH techniques were performed in 5 lymphoid neoplasms cases diagnosed in Fundación Jiménez Díaz. The latter was done in order to confirm the results obtained with mCGH. Gains of chromosomal regions not detected with conventional cytogenetic techniques were detected by mCGH. A good correlation in the results obtained between conventional cytogenetic and mCGH techniques was observed. Nevertheless, mCGH enables the detection and subsequent identification of gains of genetic sequences undetectable with cytogenetic techniques with possible diagnostic and prognostic value.

Sentido de coherencia y mapa de activos para la salud en jóvenes presos de la Comunidad Valenciana en España.

Estudio realizado desde el enfoque de la salutogénesis que pretende determinar el sentido de coherencia (SOC) en jóvenes presos de la Comunidad Valenciana en España y elaborar un mapa de activos para la salud dirigido a promover la salud en esta población. Se utilizó el test "SOC-13" y un cuestionario de preguntas abiertas elaborado ad hoc, el cual autocompletaron los internos de 18 a 22 años de edad, de los tres centros penitenciarios de la región. Participaron 124 jóvenes varones (ya que no había ninguna mujer) y se recogieron variables sociodemográficas y penitenciarias. En el análisis cuantitativo, las variables categóricas se expresaron como frecuencias absolutas y relativas; y las cuantitativas, mediante medias con intervalos de confianza (IC) al 95%. Se realizó un estudio comparativo bivariante, utilizando las siguientes pruebas: Student t-test, análisis de variación (ANOVA), Wilcoxon y Ji-cuadrado. Del cuestionario de preguntas abiertas, se realizó un análisis cualitativo descriptivo temático de los activos identificados, clasificándolos en: internos (recursos personales, en relación con los demás y capacidad para realizar comportamientos saludables) y externos (personas, grupos, instituciones y espacios físicos, situados tanto dentro como fuera de prisión). La edad media fue de 21,1 años (IC 95%: 20,8-21,3); y el SOC de 52,4 (IC 95%: 50,5-54,3), de entre un valor mínimo de 13 y máximo de 91 para la prueba. Los internos del centro penitenciario que ofrecía más actividades escolares y deportivas obtuvieron una puntuación mayor en la dimensión de significatividad del SOC ( p = 0,024), y los internos inmigrantes presentaron un SOC superior ( p = 0,037) a los españoles, en los tres centros. Los jóvenes identificaron los activos internos que cualitativamente se vinculan con las dimensiones de comprensibilidad, manejabilidad y significatividad del SOC; y los activos externos, sobre todo los amigos, familiares y espacios relacionados con la actividad físico-deportiva, tanto dentro como fuera de prisión. Estos activos y sus interrelaciones podrían incorporarse al diseño de futuras intervenciones de promoción de la salud.

[A preliminary study to assess the value of the DNA chips SpectralChip to detect subtle constitutional chromosome imbalances].

Comparative genomic hybridization on a microarray (microarray-CGH) allows to detect genomic chromosome imbalances. In order to assess its value to detect small chromosome imbalances observed in a clinical setting, using a DNA chip available commercially (Spectral Genomics, Houston, Texas, USA), we studied the DNA of 9 patients carrying a well characterized chromosome imbalance and the DNA of 11 patients where cytogenetic techniques such as high resolution banding karyotype, FISH using subtelomeric probes and comparative genomic hybridization on metaphase chromosomes conclude to a normal and/or balanced karyotype. A result was obtained for 19/20 patients. Failure of hybridization was observed for one patient. For all the other cases the sex of patients was correctly identified. Microarray-CGH was able to correctly diagnose the chromosome imbalance in 6/8 patients carrying such a defect i.e 9/11 imbalances (deletion or duplication) were detected. No chromosome imbalance was observed in 11 patients considered normal and/or balanced using cytogenetic techniques. Several clones were found to be polymorphic and required FISH studies to eliminate duplication or deletion. In conclusion, we think that this commercially available DNA chip might be useful to screen for chromosome imbalances. However, technical improvements are still necessary before using it in a clinical setting. Also, further studies are necessary to assess its sensitivity and specificity.

Clinical validation of the isothermal RT-LAMP test for rapid diagnosis of SARS-CoV-2

Introducción. Desde el primer reporte en la provincia de Wuhan (China) en el año 2019, el SARS-CoV-2 se ha diseminado por todo el mundo, provocando un enorme impacto en la salud pública. Para su diagnóstico, la Organización Mundial de la Salud ha incentivado el desarrollo de pruebas rápidas, de simple ejecución, sensibles y específicas, que complementan la RT-qPCR como prueba de referencia. La prueba RT-LAMP ha mostrado ser una excelente alternativa para la detección del SARS-CoV-2 en diferentes biofluidos. Validar la técnica RT-LAMP colorimétrica en muestras de hisopado nasofaríngeo previamente confirmadas por RT-qPCR, usando el protocolo Charité, Berlín, Alemania. Materiales y métodos. Un total de 153 muestras de hisopado nasofaríngeo de individuos con sospecha de COVID-19 se sometieron a RT-qPCR y RT-LAMP, usando un estuche comercial colorimétrico (NEB, Germany). La RT-LAMP se practicó con las muestras de ARN extraídas del hisopado nasofaríngeo y con muestras crudas sin previa extracción de ARN. El resultado fue evaluado por un simple cambio de color en la reacción. La sensibilidad y especificidad de la técnica RT-LAMP para detectar el gen N del SARS-CoV-2 mediante un set de cebadores previamente reportados (set de Broughton), arrojó valores de 0,97 (0,85-1,00) y 0,81 (0,65-0,92), respectivamente, con un intervalo de confianza del 95%. Otro set de cebadores dirigidos contra otra región del mismo gen (set de Lalli) arrojó valores de sensibilidad y especificidad de 0,96 (0,78-1,00) y 0,77 (0,55-0,92), respectivamente. Sin previa extracción de ARN, se encontró que la sensibilidad fue del 0,95 (0,74-1,00) y la especificidad del 0,88 (0,64-0,99). Estos resultados evidencian que la técnica RT-LAMP podría considerarse una prueba diagnóstica rápida, de fácil ejecución, libre de equipos sofisticados, sensible y específica, para el diagnóstico del SARS-CoV-2 en muestras de hisopados nasofaríngeos.

[A FISH analysis in one day. Experience in evaluating HER2 gene status by means of a new HER2 IQFISH pharmdx kit].

Determination of the HER2 status of tumor cells in stomach and breast cancer is a routine diagnostic method. Immunohistochemical study is sufficient for its evaluation in most cases. However, a specifying molecular genetic study using the FISH technique is performed when borderline results are obtained. The paper describes the new procedure IQFISH that allows the results to be obtained in one working day.

Prediction of Poor Response to Neoadjuvant Chemoradiation in Patients With Rectal Cancer Using a DNA Repair Deregulation Score: Picking the Losers Instead of the Winners.

Patients with rectal cancer may undergo neoadjuvant chemoradiation even in early stages in an attempt to achieve complete clinical response and undergo organ preservation. However, prediction of tumor response is unavailable. In this setting, accurate identification of poor responders could spare patients with early stage disease from potentially unnecessary chemoradiation. This study focused on development/test of a score based on DNA repair gene expression to predict response to neoadjuvant chemoradiation in patients with rectal cancer. Pretreatment biopsy samples from patients with rectal cancer undergoing neoadjuvant chemoradiation were collected and underwent gene expression analysis using RNA-Seq (test cohort). A score was constructed using 8 differentially expressed DNA repair genes between good (complete clinical) and poor responders (incomplete clinical) to treatment. The score was validated in 2 independent cohorts of patients undergoing similar treatment strategies and using quantitative polymerase chain reaction and microarray gene expression data. This was a retrospective analysis of gene expression data from 3 independent institutions. Patients with rectal cancer undergoing neoadjuvant chemoradiation (50.4-54.0 Gy and 5-fluorouracil-based chemotherapy) were eligible. Patients with complete clinical response, complete pathological response, or ≤10% residual cancer cells were considered good responders. Patients with >10% residual cancer cells were considered poor responders. The test cohort included 25 patients (16 poor responders). Validation cohort 1 included 28 patients (18 poor responders), and validation cohort 2 included 46 patients (22 poor responders). Response was correlated with the DNA repair score calculated using the expression levels of 8 DNA repair genes. DNA repair score sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were determined in test and validation cohorts. Poor responders had significantly lower DNA repair scores when compared with good responders across all 3 cohorts, regardless of the gene expression platform used. A low score correctly predicted poor response in 93%, 90%, and 71% in test, validation 1, and validation 2 cohorts. This study was limited by its small sample size, different gene expression platforms, and treatment regimens across different cohorts used. A DNA repair gene score may predict patients likely to have poor response to chemoradiation. This score may be a relevant tool to be investigated in future studies focused on chemoradiation used in the context of organ preservation. See Video Abstract at http://links.lww.com/DCR/B104. PREDICCIÓN DE RESPUESTA DEFICIENTE A LA RADIO-QUIMIOTERAPIA NEOADYUVANTE EN PACIENTES CON CÁNCER RECTAL UTILIZANDO UNA PUNTUACIÓN DE DESREGULACIÓN DE REPARACIÓN DE ADN: ESCOGER LOS PERDEDORES EN LUGAR DE LOS GANADORES: Los pacientes con cáncer rectal pueden someterse a radio-quimioterapia neoadyuvante incluso en estadios tempranos en el intento por lograr una respuesta clínica completa y permitir una preservación de órgano. Sin embargo, aun no existen herramientas disponible para la prediccion de la respuesta tumoral al tratamiento. En este contexto, la identificación precisa de los tumores con mala respuesta al tratamiento podría evitar que los pacientes con enfermedad en estadio temprano sean sometidos a radio-quimioterapia potencialmente innecesaria.Desarrollo / testeo de una puntuación basada en la expresión genes reparadores del ADN para predecir la respuesta a la nCRT en pacientes con cáncer rectal.Se recogieron muestras de biopsia de pre-tratamiento de pacientes con cáncer rectal sometidos a radio-quimioterapia neoadyuvante y se les realizó un análisis de expresión génica utilizando RNAseq (cohorte de prueba). Se construyó una puntuación utilizando 8 genes de reparación de ADN expresados diferencialmente entre buenos (respuesta clinica completa) y pobres respondedores (respuesta clinica incompleta) al tratamiento. La puntuación se validó en 2 cohortes independientes de pacientes sometidos a estrategias de tratamiento similares y utilizando qPCR y datos de expresión de genes en chips ADN (biotecnología -microarrays).Análisis retrospectivo de los datos de expresión génica de 3 instituciones independientes.Fueron incluidos aquellos pacientes con cáncer rectal sometidos a radio-quimioterapia neoadyuvante (50,4-54 Gy y quimioterapia basada en 5FU). Los pacientes con respuesta clínica completa, respuesta patológica completa o ≤10% de células cancerosas residuales se consideraron buenos respondedores. Los pacientes con> 10% de células cancerosas residuales se consideraron de respuesta deficiente. La cohorte de prueba incluyó a 25 pacientes (16 respondedores pobres). La cohorte de validación n. ° 1 incluyó a 28 pacientes (18 respondedores pobres) y la cohorte de validación n. ° 2 incluyó a 46 pacientes (22 respondedores pobres).La respuesta se correlacionó con la puntuación de reparación de ADN calculada utilizando los niveles de expresión de 8 genes de reparación de ADN. La sensibilidad del puntaje de reparación del ADN, la especificidad, los valores predictivos positivos y negativos se determinaron en las cohortes de prueba y validación.Los malos respondedores tuvieron puntuaciones de reparación de ADN significativamente más bajas en comparación con los buenos respondedores en las 3 cohortes, independientemente de la plataforma de expresión génica utilizada. Una puntuación baja predijo correctamente una respuesta pobre en el 93%, 90% y 71% en las cohortes de prueba, validación n. ° 1 y validación n. ° 2, respectivamente.Pequeño tamaño de la muestra, diferentes plataformas de expresión génica y regímenes de tratamiento en diferentes cohortes utilizadas.La puntuacion basada en genes de reparación del ADN puede predecir los pacientes con respuesta pobre a la radio-quimioterapia. Esta puntuación puede ser una herramienta relevante para investigar en futuros estudios centrados en la radio-quimioterapia utilizada en el contexto de la preservación de órganos. Consulte Video Resumen en http://links.lww.com/DCR/B104. (Traducción-Dr. Xavier Delgadillo and Dr. Laura Melina Fernandez).

[Analysis of cytogenetic abnormalities in squamous cell carcinoma by array comparative genomic hybridization].

Few conventional cytogenetic studies of squamous cell carcinoma (SCC) have been performed to date. The introduction of cytogenetic techniques such as comparative genomic hybridization (CGH) has resolved some of the problems associated with conventional cytogenetics. The aim of this study was to analyze the presence of genetic abnormalities in a series of patients with SCC using the technique of array CGH. The study included 8 patients (7 men and 1 woman; mean age, 75 years) diagnosed with primary SCC. DNA was extracted from frozen tissue and analyzed by array CGH. All cases had genetic alterations, with gains more frequent than losses. The chromosomal regions with gains, in descending order of frequency, were as follows: 5p15.2, 9q31.3-q33.2, 13q, 18q22, 1p21-p22, 1q24-q25, 3p13, 4q33-q34 (HMGB2, SAP30), 20p12.2 (JAG1), 21q21.1, and Xq21.33. The region 9p13.1-p13.3 was the only one to display recurrent loss. No correlation was observed between the presence of gains or losses and the clinical and pathological characteristics of the tumors. This is the first study to use the technique of array CGH to analyze genetic alterations in SCC. The finding of certain previously described aberrations (gain of 5p) suggests the existence of recurrent abnormalities. Likewise, the observation of alterations in small regions of chromosome 1 highlights the sensitivity of the technique to detect small changes. Application of the technique to a larger series of cases will provide greater insight into the genetic abnormalities implicated in the process of tumorigenesis in SCC.

[Not Available].

Introducción y objetivos: la evolución que ha experimentado en los últimos años la sociedad española ha originado una serie de cambios sociológicos y/o culturales que afectan claramente a los hábitos y preferencias alimentarias. El objetivo del presente trabajo ha sido evaluar la adherencia a la dieta mediterránea (DM) de la población universitaria en la ciudad de Murcia y la calidad de su desayuno, estableciendo la relación existente entre estas dos variables entre sí, y otras variables sociológicas analizadas.Métodos: se evaluó la adherencia a la DM en una muestra de 312 estudiantes mediante el test KIDMED, cuestionario de 16 preguntas. La calidad del desayuno fue determinada en función de la ingesta de los distintos grupos de alimentos (lácteos, cereales y frutas), de forma que se establecieron las siguientes categorías de calidad: pésima, mala, regular y buena. De cada encuestado se registraron los datos personales, lugar de origen, zona geográfica y tipo de residencia, sexo, edad, titulación universitaria, curso y las variables antropométricas (peso, altura, perímetro de cintura y cadera).Resultados: la muestra estuvo formada por 238 mujeres y 74 hombres todos ellos estudiantes universitarios de distintos títulos de grado. El 7,85% de los universitarios mostró una baja adherencia a la DM, el 48,4% media y el 43,8% alta. Los estudiantes de grado en Educación Primaria mostraron una mayor adherencia media a la DM; los estudiantes de grado en Enfermería tomaron más de una ración de verdura al día; y los de Ciencia y Tecnología de los Alimentos consumían una pieza de fruta al día. Teniendo en cuenta el sexo de los participantes, el 37,8% de las mujeres tomaban más de una verdura diaria y el 91,5% desayunaba bollería industrial; mientras que el 54,1% de los hombres tomaban frutos secos (al menos 2 o 3 veces por semana) y el 74,5% desayunaba todos los días. El 1,15% de los estudiantes mostró una calidad del desayuno pésima, el 17,65% mala, el 60,65% regular y el 20,45% buena, coincidiendo la buena calidad con el consumo de fruta en esta comida. Además, se observó una asociación significativa entre el tiempo y la calidad del desayuno, ya que aquellos estudiantes que dedicaban más de diez minutos a desayunar tomaban un desayuno de buena calidad.Conclusión: en este estudio se ha visto que la calidad del desayuno está estrechamente relacionada con el grado de adherencia al patrón dietético mediterráneo.

[Diagnosis of HER2 gene amplification in breast carcinoma].

Amplification of the HER2 gene, mapping to 17q21.1, is present in about 20 % of breast carcinomas. Amplification leads to an overexpression of the protein that made it possible to develop a targeted therapy by the monoclonal antibody trastuzumab (Herceptin). A good response to the treatment requires a stringent assessment of the gene status in tumours; only patients whose tumour shows a high expression of the protein or an amplification of the gene are eligible. Cases with intermediate level expression are checked by in situ hybridization, mainly by FISH, to identify amplifications in this subset of tumours. Results are sometimes difficult to interpret due to the frequent aneuploidy of the tumours. Moreover, copy number cut-offs of the gene for defining an amplification are variable according to the studies. A tumour is considered now as amplified when showing more than six HER2 copies per nucleus, or a ratio HER2 to centromere 17 greater than 2.2. The phenomenon of HER2 amplification in breast cancers is discussed in this paper, and distinguished from gene overrepresentation. It is recommended that tumours showing six to seven copies of HER2 are assessed with a kit including the centromere 17. Clusters of signals are characteristic of amplifications. The process designed for the assessment of HER2 is a model of strategies that will be used for the evaluation of markers involved in future targeted therapies.

Evaluación del desempeño diagnóstico del Índice de Riesgo de Malignidad II en mujeres con diagnóstico de masa anexial en un hospital de tercer nivel.

Evaluar la exactitud diagnóstica del Índice de Riesgo de Malignidad II (IRM II) en 100 pacientes con diagnóstico de masa anexial. En una muestra de 100 pacientes con diagnóstico de masa anexial se cuantificaron variables demográficas y se aplicó el IRM II. Mediante una tabla 2 × 2 se obtuvieron la sensibilidad, la especificidad, el valor predictivo positivo, el valor predictivo negativo y la exactitud diagnóstica, y se compararon con el resultado histopatológico. El IRM II con resultado positivo se presentó en el 73.1% (52 pacientes) de los casos con resultado histopatológico maligno y en el 26.9% de aquellos con resultado histopatológico benigno. Presenta una sensibilidad en la prueba del 73.1%, una especificidad del 70.8%, un valor predictivo positivo del 73.2% y un valor predictivo negativo del 70.8%. La exactitud diagnóstica es del 72%. El IRM II es una herramienta de cribaje con aceptable desempeño diagnóstico para normar la conducta, como referir a un centro especializado o solicitar estudios más específicos en pacientes con diagnóstico de masa anexial por sospecha de malignidad. Evaluate the usefulness of the Malignancy Risk Index II (MRI II) using diagnostic accuracy variables in 100 patients diagnosed with adnexal mass. In a sample of 100 patients with a diagnosis of adnexal mass, demographic variables were quantified and MRI II was applied. The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, and diagnostic accuracy were obtained using a 2 × 2 table and compared with the histopathological result. MRI II with positive result was presented in 73.1% (52 patients) with malignant histopathological result and in 26.9% of patients with benign histopathological result. It presents a sensitivity in the test of 73.1%, a specificity of 70.8%, positive and negative predictive value of 73.2 and 70.8%, respectively. Diagnostic accuracy of 72%. MRI II is a screening tool with acceptable diagnostic performance to regulate behavior, such as referring to a specialized center or requesting more specific studies in patients diagnosed with adnexal mass due to suspected malignancy.