The crater Väisälä on the Moon is named after him, and so are the asteroids 1573 Väisälä and 2804 Yrjö.
Bil je tudi soodkritelj kometa 139P/ Väisälä-Oterma (skupaj z Liisi Oterma), ki je bil prvotno klasificiran kot asteroid z oznako 1939 TN.