In April 2008, he was moved to the post of deputy Foreign Minister of Georgia, and in November 2010 to Secretary of the National Security Council.
С ноября 2010 года Бокерия занимал пост секретаря Совета национальной безопасности Грузии, от должности освобождён уходящим президентом Саакашвили в ноябре 2013 года.