His work in galactic structure, astrophysics and the history of astronomy was of international renown and won him an honorary degree from Harvard University in 1936, as well as the Gold Medal of the Royal Astronomical Society in 1951.
Его работы по изучению структуры Галактики, космофизике и истории астрономии принесли ему международное признание, Паннекук был удостоен почётной степени Гарвардского университета в 1936, а также золотой медали Британского Королевского астрономического общества в 1951.