Elements of "Metroid Prime" have appeared in other games, such as "Super Smash Bros. Brawl" in which the frigate "Orpheon" is a playable stage, featuring the Parasite Queen in the background and several music tracks from "Metroid Prime" as background music.
Некоторые элементы из "Metroid Prime" появлялись и в других играх, например, в "Super Smash Bros. Brawl": там в списке играбельных уровней доступен Фрегат Орфеон, на заднем фоне уровня можно увидеть Королеву Паразитов, а в качестве музыки используются несколько треков из "Prime".