It belongs to the "uarnacoides" species complex, along with "H. chaophraya", "H. hortlei", "H. lobistoma", "H. pastinacoides", and "H. uarnacoides".
"Himantura granulata" принадлежит к , в который также входят "H. chaophraya", "H. hortlei", "H. lobistoma", "H. pastinacoides" и "H. uarnacoides".