A number of rivers empty into the gulf, most notably the Mississippi River and Rio Grande in the northern gulf, and the Grijalva and Usumacinta rivers in the southern gulf.
При этом происходит и постепенное обмеление северной части залива вследствие наносной деятельности рек, впадающих с северной стороны (в первую очередь реки Миссисипи).