His greatest academic fame came from his excavation in 1896 of the papers of the Cairo Geniza, an extraordinary collection of over 100,000 pages of rare Hebrew religious manuscripts and medieval Jewish texts that were preserved at an Egyptian synagogue.
Наибольшую известность в академической среде принесли Шехтеру его исследования в 1896 году Каирской генизы, коллекции из более чем 100 000 страниц редких еврейских религиозных рукописей и средневековых еврейских текстов, сохранившихся в египетской синагоге «Эвен Эзра» в старом Каире.