The primary assays used in ENCODE are ChIP-seq, DNase I Hypersensitivity, RNA-seq, and assays of DNA methylation.
Основными биологическими испытаниями, используемыми в ENCODE являются ChIP-seq, поиск ДНКазаI-гиперчувствительных областей, RNA-seq и исследование метилирования ДНК.