On 30 December 1998 he married Angela Merkel (herself a doctor of physics who had once worked in quantum chemistry research), who later became chairwoman of the Christian Democratic Union and on 22 November 2005 first female Chancellor of Germany.
30 декабря 1998 года Зауэр женился на Ангеле Меркель (также доктор химических наук, ранее работала в области исследований квантовой химии), которая позже была избрана председателем Христианско-демократического союза и 22 ноября 2005 года первой женщиной-канцлером Германии.