In 1960, the Museum and Museum Gardens were given in trust to York City Council, the successor of which, the City of York Council, set up the York Museums Trust in 2002 to manage the York Castle Museum, York Art Gallery, the Yorkshire Museum and the Museum Gardens.
Начиная с 2002 года Йоркширский музей, наряду с музеем Йоркского замка ("York Castle Museum"), Йоркской картинной галереей ("York Art Gallery") и Музейным садом входит в и управляется Йоркским музейным трестом ("York Museums Trust").