In 1899 Quezon cut short his law studies at the University of Santo Tomas in Manila, to participate in the struggle for independence against the United States, led by Emilio Aguinaldo. During the Philippine-American War he was an ayuda-de-campo to Emilio Aguinaldo.[2] He rose to the rank of Major and fought in the Bataan sector. However, after Aguinaldo was captured in 1901, Quezón returned to the university and passed the bar examinations in 1903, achieving a fourth place.
Noong dumating si Miguel Lopez de Legazpi at ang kaniyang mga tauhan sa Cebu noong 1565, isa sa mga sundalo ang nakatuklas ng isang kahon na may imahen ni Santo Niño. Ito ay napapaligiran ng bulaklak at mga pigurin ng mga anito. Ayon sa mga mananalaysay, ang mga pagbabago, mula sa pagsayaw ng Sinulog, sa pagsamba sa mga anito hanggang sa pagbubunyi kay Santo Niño ay naganap sa loob ng 44 na taon sa pagitan ng pagdating ni Magellan at Legazpi.