This certainly did not help his relations with Berthelot, as one might imagine, and the bad news for Duhem was that Berthelot became French Minister of Education in 1886. Duhem meanwhile worked on a second thesis, this time wisely choosing a mathematical topic which was less likely to be affected by the fate of his first thesis.
Tiyak na ito ay hindi makatulong sa kanyang relasyon sa Berthelot, bilang isang maaaring magpalagay, at ang masamang balita para sa Duhem ay na Berthelot naging French Ministro ng Edukasyon sa 1886. Duhem samantala ay nagtrabaho sa isang pangalawang tesis, oras na ito wisely pagpili ng isang matematiko na paksa ay mas mababa sa maaapektuhan ng mga tadhana ng kanyang unang sanaysay.