Chauvenet held his mathematics position at the Academy until 1853 when he became professor of astronomy, navigation and surveying there. Yale offered him a professorship in mathematics in 1855 but he declined, then again in 1859 they offered him the chair of astronomy and natural philosophy and again he declined.
Chauvenet gaganapin ang kanyang posisyon at matematika ang Academy hanggang 1853 kung kailan siya ay naging propesor ng astronomy, navigation at pagtilingin doon. Yale inaalok sa kanya ng isang pagkapropesor sa matematika sa 1855 ngunit siya ay tinanggihan, at pagkatapos ay muli sa 1859 sila na inalay sa kanya ang chair ng astronomy, at natural na pilosopiya at muli siya tinanggihan.