The system came under early fire for initial struggles, most significantly data uncertainties regarding emission levels which led to the over-allocation of emission permits and a carbon price collapse in April 2006.
Ang sistema ay dumating sa ilalim ng maaga sunog para sa paunang mga struggles, pinaka makabuluhang ng data uncertainties tungkol sa mga antas ng pagpapalabas na kung saan humantong sa over-laang-gugulin ng mga permit sa pagpapalabas at isang carbon pagbagsak ng presyo sa buwan ng Abril 2006.