Primjene su im brojne, a koriste se u proizvodnji fluoropolimera i fluoroelastomera, kao površinski aktivne tvari u pjenama za gašenje požara te u proizvodnji tekstila i papira za odbijanje vode, masnoća, ulja i/ili nečistoća.
Den 14 juni 2013 identifierade den medlemsstatskommitté som avses i artikel 76.1 e i förordning (EG) nr 1907/2006 PFOA som ett långlivat, bioackumulerande och toxiskt ämne (PBT) i enlighet med artikel 57 d i den förordningen.