Direktive 98/41/EZ državama članicama dopušta se da od Komisije zatraže odstupanje od tog zahtjeva.
Den 18 maj 2016 inkom Republiken Kroatien med sitt svar och ändrade sin begäran om undantag avseende följande rutter: Rutterna Zadar–Ist och Zadar–Olib på färjelinjen ”Zadar–Premuda/Mali Lošinj”, rutterna Split–Hvar, Hvar–Prigradica och Hvar–Korčula på höghastighetslinjen ”Korčula–(Prigradica)–Hvar–Split”, rutterna Zadar–Ist och Zapuntel–Zadar på höghastighetslinjen ”Ist–Molat–Zadar”, rutten Split–Bol på höghastighetslinjen ”Jelsa–Bol–Split”, rutten Split–Hvar på höghastighetslinjen ”Split–(Milna)–Hvar”, rutten Split–Hvar på höghastighetslinjen ”Lastovo–Vela Luka–Hvar–Split”, rutten Rijeka–Rab på höghastighetslinjen ”Novalja–Rab–Rijeka”, rutten Split–Vela Luka på färjelinjen ”Lastovo–Vela Luka–Split”, rutten Split–Stari Grad på färjelinjen ”Split–Stari Grad”, rutten Vis–Split på färjelinjen ”Vis–Split, rutterna Mali Lošinj–Cres och Cres–Rijeka på höghastighetslinjen” Mali Lošinj–Ilovik–Susak–Unije–Martinšćica–Cres–Rijeka”, rutten Premuda–Zadar på höghastighetslinjen Olib–Silba–Premuda–Zadar”, rutterna Vis–Split och Hvar–Split på höghastighetslinjen ”Vis–Hvar–Split”, rutterna Dubrovnik–Sobra och Korčula–Lastovo på höghastighetslinjen ”Dubrovnik–Šipanska luka–Sobra–Polače–Korčula–Lastovo”.