Na dokumente koji su u posjedu Agencije primjenjuje se Uredba (EZ) br. 1049/2001.
Europaparlamentet ska före den 15 maj år n + 2, på rekommendation av rådet, som ska fatta beslut med kvalificerad majoritet, besluta om att bevilja byråns verkställande direktör ansvarsfrihet för budgetens genomförande under budgetår n.