S obzirom na to da postoje alternativni postupci za pasterizaciju, kojima se postiže sličan baktericidni učinak, kriterij sigurnosti hrane za salmonelu i kriterij higijene procesa za bakteriju E. coli za nepasterizirane sokove od voća i povrća (gotova hrana) ne bi se trebali primjenjivati na sokove od voća i povrća (gotova hrana) podvrgnute baktericidnom postupku čiji je učinak na bakteriju E. coli i salmonelu sličan pasterizaciji.
Under en övergångsperiod bör nuvarande alternativa metoder kunna fortsätta att användas i syfte att ge livsmedelsföretagare tillräckligt med tid att anpassa sina metoder, eftersom vissa certifikat för alternativa metoder baserade på den tidigare standarden ISO 16140:2003 fortfarande kan vara giltiga fram till slutet av 2021.