Stoga je potrebno utvrditi pravila o upravljanju tim elektroničkim sustavom.
Närmare regler bör anges för systemets gemensamma komponenter (EU-portal för näringsidkare, ett centralt förvaltningssystem för tullbeslut och kundreferenstjänster) och nationella komponenter (nationell portal för näringsidkare och ett nationellt förvaltningssystem för tullbeslut) genom att deras respektive funktioner och sammankopplingar specificeras.