Uredbe o EFSU-u predviđa da, nakon otvorenog i transparentnog postupka odabira u skladu s postupcima EIB-a, Upravljački odbor odabire kandidata za mjesto glavnog direktora i za mjesto zamjenika glavnog direktora, i zahtijeva da se Europski parlament i Vijeće obavješćuju pravovremeno i u svim fazama postupka odabira podložno strogim zahtjevima povjerljivosti.
Efter en utfrågning av den kandidat som valts för respektive befattning och efter Europaparlamentets godkännande ska den verkställande direktören och den biträdande verkställande direktören utses av EIB:s ordförande för en period på tre år som kan förnyas en gång.