U Odluci o pokretanju postupka Komisija je izrazila dvojbe o tome mogu li se, bez potpunih informacija o aktima o povjeravanju i metodama nadoknade, mjere 1. i 3. smatrati spojivima s unutarnjim tržištem u skladu s Uredbom (EZ) br. 1370/2007.
Grekland hävdade därför att det inte finns risk för internalisering av tidigare ineffektivitet i verksamheten och att ersättningen inte överskrider det belopp som behövs för att täcka alla kostnader minus relevanta intäkter, utan att räkna med eventuell rimlig vinst som Trainose skulle ha rätt till.