Potrebno je i uskladiti prioritete posebnih programa kontrole i inspekcije s prioritetima zajedničke ribarstvene politike, posebno kad je riječ o provedbi obveze iskrcavanja.
I artikel 95.2 i förordning (EG) nr 1224/2009 föreskrivs att de särskilda kontroll- och inspektionsprogrammens riktmärken för inspektioner ska fastställas på grundval av riskhantering.