Opća pravila poglavlja ove Uredbe o obradi operativnih osobnih podataka trebala bi se primjenjivati ne dovodeći u pitanje posebna pravila koja se primjenjuju na obradu operativnih osobnih podataka u tijelima, uredima i agencijama Unije pri izvršavanju aktivnosti obuhvaćenih područjem primjene poglavlja 4. ili poglavlja 5. glave V. trećeg dijela UFEU-a.
Nemala by sa však uplatňovať na Europol alebo Európsku prokuratúru, kým nedôjde k zmene právnych aktov o zriadení Europolu a Európskej prokuratúry tak, aby sa na ne mohla uplatňovať upravená kapitola tohto nariadenia o spracúvaní operačných osobných údajov.