Mogućnošću uporabe pravnih instrumenata o uzajamnom priznavanju ili prekograničnoj suradnji, koja je predviđena u ovoj Uredbi, ne bi se trebala zamijeniti posebna pravila o prekograničnim istragama u skladu s ovom Uredbom.
Týmto nariadením sa od Európskej prokuratúry vyžaduje výkon funkcií prokurátora, čo zahŕňa prijímanie rozhodnutí o podaní obžaloby proti podozrivej alebo obvinenej osobe a voľbu členského štátu, ktorého súdy budú mať právomoc v trestnom konaní.