S obzirom na postojeću međuovisnost sigurnosti i zaštite u civilnom zračnom prometu, Agencija bi trebala sudjelovati u suradnji u pogledu područja zaštite zračnog prometa, uključujući kibersigurnost.
Agentúra by takisto mala pomáhať Komisii pri vykonávaní práva Únie v iných technických oblastiach regulácie civilného letectva, ako sú napríklad bezpečnostná ochrana alebo jednotné európske nebo, v ktorých má agentúra príslušné odborné znalosti.