Ekološka akvakultura trebala bi se temeljiti na uzgoju mlađi koja potječe iz ekoloških proizvodnih jedinica.
S cieľom zabezpečiť kvalitu, vysledovateľnosť, dodržiavanie súladu s týmto nariadením a prispôsobenie sa technickému vývoju by sa mala na Komisiu delegovať právomoc prijímať určité akty, pokiaľ ide o krmivo pre živočíchy akvakultúry a veterinárnu liečbu týchto živočíchov a o podrobné podmienky týkajúce sa riadenia chovu generačných rýb, šľachtenia a produkcie mladých jedincov.