Službe Komisije nadležne za istragu čuvaju osobne podatke dok su oni potrebni za istragu, za procjenu potrebe za pokretanjem novih istražnih aktivnosti, tijekom upravnog postupka i tijekom svih naknadnih postupaka sudskog preispitivanja te razdoblja administrativnog čuvanja koje slijedi nakon konačnog zaključenja spisa.
Komisia je zároveň zodpovedná za presadzovanie pravidiel hospodárskej súťaže, čo si vyžaduje, aby včas viedla vyšetrovania a zároveň dodržiavala pravidlá týkajúce sa dôvernosti a služobného tajomstva, ako aj rešpektovala práva jednotlivých strán vyšetrovania na obhajobu a práva jednotlivcov, ktorí požadujú ochranu svojej totožnosti.