U travnju 2013.
Z prvého hodnotenia činnosti agentúry vykonaného na základe nezávislého externého hodnotenia v období rokov 2015 – 2016 vyplýva, že agentúra účinne zabezpečuje prevádzkové riadenie rozsiahlych informačných systémov a vykonáva iné úlohy, ktoré jej boli zverené, ale že je zároveň potrebné uskutočniť v nariadení (EÚ) č. 1077/2011 viacero zmien, ako napríklad presun úloh súvisiacich s komunikačnou infraštruktúrou, ktoré si ponechala Komisia, na agentúru.