U pogledu ocjene postojanja prednosti Komisija nije utvrdila pravilan protučinjenični scenarij za utvrđivanje takve prednosti koji se mora temeljiti na nacionalnim poreznim pravilima kojima se uređuje samo tretman društava s irskim podružnicama koja nisu porezno rezidentna (odnosno na odjeljku 25. zakona TCA iz 1997.), a ne na načelima OECD-a koja nemaju snagu zakona u Irskoj.
A nakoniec sa spoločnosť Apple domnieva, že presadzovanie pravidiel štátnej pomoci nie je vhodným nástrojom na dosiahnutie harmonizácie vnútroštátnych právnych predpisov týkajúcich sa zdaňovania podnikov, čo by údajne Komisia dosiahla, ak by žiadala od členských štátov dodržiavanie noriem, ako je princíp nezávislého vzťahu, ktoré sú daňovým systémom niektorých členských štátov cudzie, v dôsledku čoho by záväzné stanoviská týchto členských štátov mohli viesť k zisteniu štátnej pomoci.