Europski nadzornik za zaštitu podataka i nadzorna tijela trebali bi međusobno surađivati u pogledu praćenja EES-a.
Po uvedení systému vstup/výstup do prevádzky by sa mal zmeniť Dohovor, ktorým sa vykonáva Schengenská dohoda zo 14. júna 1985 uzatvorená medzi vládami štátov hospodárskej únie Beneluxu, Spolkovej republiky Nemecko a Francúzskej republiky o postupnom zrušení kontrol na ich spoločných hraniciach [17] (ďalej len „Dohovor, ktorým sa vykonáva Schengenská dohoda“), so zreteľom na dvojstranné dohody uzavreté medzi členskými štátmi a dĺžku oprávneného pobytu štátnych príslušníkov tretích krajín oslobodených od vízovej povinnosti nad 90 dní v rámci akéhokoľvek 180-dňového obdobia.