Upravljanje sustavom EMAS počiva na zakonodavnom aktu (Uredbi EU-a), uključuje tijela koja imenuju državne vlasti, a verifikaciju obvezno mora vršiti procjenitelj koji ima akreditaciju ili dozvolu.
Akreditáciu alebo licencie overovateľom EMAS poskytujú správne orgány vymenované vládami, ktoré vykonávajú aj dohľad nad nimi, v súlade s požiadavkami nariadenia o EMAS a/alebo normy ISO 17021,