U nekim državama članicama postoji zabrinutost zbog moguće opasnosti od kiselina koje se upotrebljavaju za zakiseljavanje gnojovke.
Separácia môže pomôcť zabrániť preťaženiu pôdy fosforom a rozložiť organickú hmotu a fosfor v tuhej frakcii na polia nachádzajúce sa ďalej od maštalí.