Svaka obrada podataka iz EES-a trebala bi biti proporcionalna ciljevima koje se nastoji ostvariti i potrebna za izvršavanje zadaća nadležnih tijela.
Aby sa umožnilo presné overenie a presná identifikácia zabezpečujúce, že štátny príslušník tretej krajiny už nie je registrovaný s inou totožnosťou alebo s iným cestovným dokladom, a aby sa zaručilo, že za každých okolností budú k dispozícii dostatočné údaje na dosiahnutie cieľov systému vstup/výstup, mali by sa do systému vstup/výstup registrovať štyri odtlačky prstov štátneho príslušníka tretej krajiny oslobodeného od vízovej povinnosti, ak je to fyzicky možné.