U tu svrhu ETIAS bi trebao uspoređivati relevantne podatke iz dosjeâ zahtjeva s relevantnim upozorenjima u SIS-u.
Ak sa porovnaním zistí zhoda medzi osobnými údajmi uvedenými v súbore žiadosti a zápismi o štátnych príslušníkoch tretích krajín, ktorým bol odopretý vstup a pobyt, alebo o osobách hľadaných na účely zatknutia a následného odovzdania alebo vydania, súbor žiadosti by mala manuálne spracúvať národná jednotka ETIAS zodpovedného členského štátu.