Ovom se Uredbom ne bi trebala dovoditi u pitanje posebna pravila utvrđena u Zajedničkom stajalištu Vijeća 2005/69/PUP [11] i Odluci Vijeća 2007/533/PUP [12].
Európska prokuratúra by mala najmä zvážiť informovanie úradu OLAF o prípadoch, keď sa nemožno odôvodnene domnievať, že sa pácha alebo bol spáchaný trestný čin, ktorý patrí do právomoci Európskej prokuratúry, ale môže byť vhodné, aby OLAF uskutočnil administratívne vyšetrovanie, alebo keď Európska prokuratúra vec odmietne a je vhodné postúpiť ho úradu OLAF v záujme prijatia nadväzných administratívnych opatrení alebo vymáhania.