Životinje iz ekološke akvakulture za uzgoj nisu uvijek dostupne u dovoljnoj količini i kvaliteti kako bi se zadovoljile potrebe subjekata koji proizvode životinje iz akvakulture.
Prevádzkovatelia, ktorí vyrábajú potraviny alebo krmivá v ekologickej poľnohospodárskej výrobe, by mali dodržiavať vhodné postupy na základe systematického určovania kritických krokov pri spracúvaní s cieľom zabezpečiť, aby spracované produkty boli v súlade s pravidlami ekologickej poľnohospodárskej výroby.