Prihodi Agencije Europske unije za željeznice (dalje u tekstu „Agencija”) sastoje se od doprinosa Unije te pristojbi i naknada koje podnositelji zahtjeva za izdavanje potvrda, odobrenja i odluka o odobrenju plaćaju za njihovu obradu, za postupanje sa žalbama te druge usluge koje pruža Agencija u skladu s člankom 64.
Príjmy Železničnej agentúry Európskej únie (ďalej len „agentúra“) pozostávajú z príspevku Únie a poplatkov a platieb hradených žiadateľmi za spracúvanie žiadostí o osvedčenia, povolenia a rozhodnutia o schválení, riešenie odvolaní a iné služby poskytované agentúrou v súlade s článkom 64 nariadenia (EÚ) 2016/796.