Dijelovi ELH-a koji nisu u potpunosti u skladu sa zahtjevima sustava EMAS ne mogu se priznati ekvivalentnima.
Vzhľadom na podstatu systému štruktúrovaného okolo súborov kritérií sa však nevyžaduje, aby bol overovateľ/certifikačný orgán ELH spôsobilý odhaliť ďalšie environmentálne problémy alebo nesúlad, ktoré nie sú súčasťou kritérií.