EPPO bi svoju nadležnost trebao izvršavati što sveobuhvatnije kako bi se njegove istrage i kazneni progon mogli proširiti na kaznena djela počinjena izvan državnog područja država članica.
Vo vnútornom rokovacom poriadku Európskej prokuratúry by sa mali stanoviť príslušné právomoci a postup pre prípady, keď sú za danú vec, ktorá sa má spojiť, zodpovedné rôzne stále komory.