Uredbe (EZ) br. 1224/2009 Komisija može u dogovoru s predmetnim državama članicama donijeti posebne programe kontrole i inspekcije za određene vrste ribolova i morske bazene.
Komisia pre viacero morských oblastí prijala špecifické kontrolné a inšpekčné programy, ktoré členské štáty vykonávajú prostredníctvom plánov spoločného nasadenia spolu s Európskou agentúrou pre kontrolu rybárstva (EFCA), ktorá zaisťuje prevádzkovú koordináciu inšpekčných činností v tomto rámci.