Tijekom postupka odabira direktoru pomaže Odbor za odabir koji se sastoji od najmanje četiriju članova: direktora, jednog predstavnika Predsjedništva i dvaju predstavnika Europske komisije.
V osobitných prípadoch, najmä ak ide o výberové konanie expertov, môže byť na návrh Európskej komisie vymenovaný aj jeden ďalší externý člen.