U skladu s Direktivom 2000/29/EZ mogu se priznati elektronički fitosanitarni certifikati ako su ispunjeni posebni uvjeti koje je utvrdila Komisija.
V smernici 2000/29/ES sa stanovuje, že elektronické rastlinolekárske osvedčenia možno uznať, ak sú splnené špecifické podmienky stanovené Komisiou.