Primjene su im brojne, a koriste se u proizvodnji fluoropolimera i fluoroelastomera, kao površinski aktivne tvari u pjenama za gašenje požara te u proizvodnji tekstila i papira za odbijanje vode, masnoća, ulja i/ili nečistoća.
Dňa 14. júna 2013 výbor členských štátov, na ktorý sa odkazuje v článku 76 ods. 1 písm. e) nariadenia (ES) č. 1907/2006, určil PFOA ako látku, ktorá je perzistentná, bioakumulatívna a toxická (ďalej len „PBT“) v súlade s článkom 57 písm. d) tohto nariadenia.