Uzimanje u obzir subvencija u naknadama za obavljanje javne usluge koje dodjeljuju jedinice javne uprave nositeljice projekta analizira se kroz pojedinačne slučajeve navedenih naknada, a ne analizu subvencija.
V článku 41 CT2 sa okrem iného vymedzujú záväzky prevádzkovateľa súvisiace s majetkom, ktoré sa predovšetkým pretavujú do záväzku využívať celý majetok, záväzku vykonávať servis a údržbu majetku vyhradeného na vykonávanie verejnej dopravnej služby, ako aj do záväzku zostaviť plán investícií do vozového parku počas doby platnosti zmluvy, prostredníctvom ktorého bude možné najmä z bezpečnostných dôvodov zabezpečiť spoľahlivosť a dostupnosť vozidiel a optimalizáciu nákladov na servis a údržbu, pričom priemerný vek vozového parku neprekročí sedem rokov.