Uredbe o kontroli, ovisno o težini dotičnog prekršaja koju utvrđuje nadležno tijelo države članice zastave uzimajući u obzir kriterije kao što su vrsta štete, njezina vrijednost, ekonomski položaj počinitelja prekršaja i opseg prekršaja ili njegovo ponavljanje.
Komisia môže zamietnuť, pozastaviť alebo odňať oprávnenie vydané rybárskemu plavidlu tretej krajiny v prípadoch zásadnej zmeny okolností alebo v prípadoch vážneho ohrozenia udržateľného využívania morských biologických zdrojov, hospodárenia s nimi a ich ochrany, alebo keď je to nevyhnutné na zamedzenie NNN rybolovu alebo na jeho zastavenie, alebo v prípadoch, keď sa Únia rozhodla pozastaviť alebo prerušiť styky s dotknutou treťou krajinou.