Interoperabilnost bi trebalo uspostaviti uz puno poštovanje pravne stečevine Unije u području temeljnih prava.
Agentúra eu-LISA by mala niesť zodpovednosť za akúkoľvek škodu, ktorú spôsobí v jej úlohe spracovateľa údajov, ak neplnila povinnosti, ktoré jej boli výslovne uložené týmto nariadením, alebo keď konala nad rámec zákonných pokynov členského štátu, ktorý je prevádzkovateľom údajov, alebo v rozpore s nimi.