U Komunikaciji Komisije od 29. travnja 2013. o strateškim smjernicama za održivi razvoj akvakulture u EU-u ističu se glavni izazovi s kojima se suočava akvakultura u Uniji i njezin potencijal za rast.
Vzhľadom na rastúci záujem spotrebiteľov o ekologické produkty akvakultúry živočíchov je pravdepodobný ďalší nárast počtu akvakultúrnych jednotiek prechádzajúcich na ekologickú poľnohospodársku výrobu.