Obrada osobnih podataka, a posebno medicinskih i zdravstvenih podataka, uključenih u bazu podataka uspostavljenu u skladu s ovom Uredbom, potrebna je kako bi se omogućila djelotvorna suradnja među državama članicama u području certifikacije i nadzora zdravstvene sposobnosti pilota.
Agentúra bola zriadená nariadením Európskeho parlamentu a Rady (ES) č. 1592/2002 v rámci existujúcej inštitucionálnej štruktúry a rovnováhy právomocí Únie, je nezávislá vo vzťahu k technickým záležitostiam a je právne, administratívne a finančne nezávislá.