Osobito, ako se u SIS unese novo upozorenje o odbijanju ulaska i boravka ili upozorenje o prijavi izgubljene, ukradene, protupravno korištene ili poništene putne isprave, SIS bi o tome trebao obavijestiti ETIAS.
Ak je cestovné povolenie prepojené s cestovným dokladom, ktorý je v SIS nahlásený ako stratený, odcudzený, zneužitý alebo neplatný, alebo ktorý je v databáze SLTD nahlásený ako stratený, odcudzený alebo neplatný, národná jednotka ETIAS zodpovedného členského štátu by mala súbor žiadosti manuálne spracovať.