Mogućnost usporedbe latentnog otiska prstiju s podacima o otiscima prstiju pohranjenima u EES-u u slučajevima u kojima postoje opravdani razlozi za vjerovanje da bi počinitelj ili žrtva mogli biti registrirani u EES-u potrebna je kako bi imenovana tijela država članica mogla sprečavati, otkrivati ili istraživati kaznena djela terorizma ili druga teška kaznena djela kada su, na primjer, latentni otisci prstiju jedini dokaz s mjesta zločina.
Okrem toho by sa mal prístup do systému vstup/výstup na účely identifikácie neznámych podozrivých osôb, páchateľov alebo obetí teroristických trestných činov alebo iných závažných trestných činov povoliť len za podmienky, že sa uskutočnilo vyhľadávanie vo vnútroštátnych databázach členských štátov a v plnom rozsahu sa uskutočnilo vyhľadávanie automatizovanými systémami identifikácie odtlačkov prstov všetkých ostatných členských štátov podľa rozhodnutia Rady 2008/615/SVV [12] alebo sa vyhľadávanie v plnom rozsahu neuskutočnilo do dvoch dní odo dňa, keď sa začalo.