Konkretno, Komisija je izrazila dvojbe o tome je li se predloženi plan restrukturiranja TRAINOSE-a temeljio na realnim pretpostavkama o budućim uvjetima poslovanja i bi li se njime ponovno uspostavila dugoročna održivost TRAINOSE-a u razumnom roku.
Grécko tvrdilo, že aj keď sa náhrada stanovila ex post, spôsob jej výpočtu zabezpečoval, že jej výška sa bude v najväčšej možnej miere približovať hodnote, ku ktorej by sa dospelo pri výpočte ex ante, a výsledok výpočtu sa približoval odhadu, ktorý je súčasťou obchodného plánu spoločnosti TRAINOSE na rok 2007, na základe údajov z roku 2005.