Kako bi se isključila sustavna pretraživanja, podatke pohranjene u središnjem sustavu ETIAS-a trebalo bi obrađivati samo u posebnim slučajevima i samo kada je to potrebno u svrhu sprečavanja, otkrivanja ili istrage kaznenih djela terorizma ili drugih teških kaznenih djela.
Po uplynutí doby platnosti by sa údaje mali uchovávať len s výslovným súhlasom žiadateľa a len na účely uľahčenia novej žiadosti ETIAS.