Aktivnosti PPEU-a koordiniraju se s aktivnostima delegacija Unije i Komisije.
OZEÚ úzko spolupracuje s orgánmi zúčastnených štátov, OSN, AÚ, IGAD, inými národnými regionálnymi a medzinárodnými zainteresovanými stranami, ako aj s občianskou spoločnosťou v regióne.