Osim toga, kako bi se osigurala dosljednost njegova djelovanja i time jednakovrijedna zaštita financijskih interesa Unije, organizacijska struktura i unutarnji proces odlučivanja EPPO-a trebali bi središnjem uredu omogućiti da prati, usmjerava i nadzire sve istrage i kazneni progon koje provode delegirani europski tužitelji.
Kolégium by malo prijímať rozhodnutia o strategických záležitostiach vrátane určovania priorít a jednotného postupu Európskej prokuratúry v oblasti vyšetrovania a trestného stíhania, ako aj o všeobecných záležitostiach vyplývajúcich z konkrétnych vecí, napríklad pokiaľ ide o uplatňovanie tohto nariadenia, riadne vykonávanie jednotného postupu Európskej prokuratúry v oblasti vyšetrovania a trestného stíhania alebo zásadné otázky alebo otázky veľkého významu pre rozvoj koherentného jednotného postupu Európskej prokuratúry v oblasti vyšetrovania a trestného stíhania.