Osim toga, novom prijetnjom javnom poretku ili unutarnjoj sigurnosti ponovno se pokreće primjena pravila (te i novi izračun trajanja razdoblja nadzora).
V článku 29 Kódexu schengenských hraníc sa uvádza osobitný postup, ktorý umožňuje obnoviť kontrolu vnútorných hraníc na obdobie až dvoch rokov, ak je ohrozené celkové fungovanie priestoru bez kontroly vnútorných hraníc v dôsledku trvalých závažných nedostatkov týkajúcich sa kontroly vonkajších hraníc zistených počas schengenského hodnotenia.