Ako nacionalna jedinica ETIAS-a odgovorne države članice smatra potrebnim da granična tijela dodatno ispitaju pojedine aspekte zahtjeva za odobrenje putovanja trebala bi, uz odobrenje putovanja koje izdaje, moći staviti oznaku, preporučujući kontrolu druge linije na graničnom prijelazu.
Keďže platné cestovné povolenie je podmienkou pre vstup a pobyt pre určité kategórie štátnych príslušníkov tretích krajín, imigračné orgány členských štátov by mali mať možnosť nahliadať do centrálneho systému ETIAS, ak sa predtým uskutočnilo vyhľadávanie v systéme EES a týmto vyhľadávaním sa ukázalo, že systém EES neobsahuje žiadny záznam o vstupe zodpovedajúci prítomnosti štátneho príslušníka tretej krajiny na území členských štátov.