Istrage EPPO-a trebali bi u pravilu provoditi delegirani europski tužitelji u državama članicama.
Funkcie prokurátora na príslušných súdoch sa uplatňujú do skončenia konania, čo znamená právoplatné rozhodnutie o tom, či podozrivá alebo obvinená osoba spáchala trestný čin, a to vrátane prípadného uloženia trestu a rozhodnutia o akejkoľvek obžalobe alebo opravnom prostriedku dostupnom pred tým, ako sa také rozhodnutie stane konečným.