Smatra se da je rizik od nesukladnosti s pravilima ekološke proizvodnje veći kod poljoprivrednih gospodarstava koja imaju jedinice kojima se ne upravlja u skladu s tim pravilima.
Keďže použitie vonkajších vstupov by sa malo v ekologickej poľnohospodárskej výrobe obmedziť, mali by sa identifikovať určité účely, na ktoré sa pri výrobe poľnohospodárskych produktov alebo spracovaných poľnohospodárskych produktov produkty a látky často používajú.