S obzirom da je Agencija tijelo koje je Unija osnovala u smislu Uredbe (EU, Euratom) 2018/1046, Agencija bi na odgovarajući način trebala donijeti svoja financijska pravila.
Agentúra zriadená týmto nariadením by mala nahradiť a mala by prevziať funkcie agentúry zriadenej nariadením (EÚ) č. 1077/2011, ktoré by sa v dôsledku toho malo zrušiť.