Следва да се прилага бюджетната процедура на Съюза, тъй като става дума за вноска на Съюза и за други субсидии, платими от общия бюджет на Съюза, а одитът на сметките следва да се извършва от Европейската сметна палата.
Agencija bi osobito trebala surađivati s Europskom agencijom za kemikalije osnovanom Uredbom (EZ) br. 1907/2006 Europskog parlamenta i Vijeća na razmjeni informacija o sigurnosti kemijskih tvari, njihovu utjecaju na sigurnost zračnog prometa i povezanim znanstvenim i tehničkim aspektima.