Тази система за управление позволява също така мониторинг и оптимизиране на експлоатационните показатели на третирането на отпадъците и за тази цел може да включва анализ на материалния поток на съответните компоненти в целия процес на третиране на отпадъците.
Upotreba analize materijalnog toka temeljena je na riziku uzimajući u obzir, na primjer, opasna svojstva otpada, rizik koji otpad predstavlja u smislu sigurnosti postupka, sigurnosti na radu i utjecaja na okoliš, kao i informacije koje su dostavili prethodni posjednici otpada.