Агенцията следва не само да може да извършва наблюдение на научноизследователските дейности, свързани с оперативното управление на системите, но и да може да допринася за прилагането на съответните части от Рамковата програма на Европейския съюз за научни изследвания и иновации, когато Комисията ѝ делегира съответните правомощия.
Mogući primjeri takvih sustava mogli bi biti centralizirani sustav za utvrđivanje država članica koje imaju podatke o osuđujući presudama protiv državljana trećih zemalja i osoba bez državljanstva za dopunu i potporu Europskom informacijskom sustavu kaznene evidencije (sustav ECRIS-TCN) ili računalni sustav za prekograničnu komunikaciju u građanskim i kaznenim postupcima (e-CODEX).