Службата провежда също административни разследвания в рамките на институциите, органите, службите и агенциите, създадени от или на основание на Договорите.
U tu svrhu primjenjuje istražne ovlasti koje su dodijeljene Komisiji odgovarajućim aktima Unije u državama članicama te u trećim zemljama i u prostorijama međunarodnih organizacija u skladu sa sporazumima o suradnji i uzajamnoj pomoći te drugim pravnim instrumentima koji su na snazi.