Членове 2—5 от Решение 2006/959/ЕО съдържат разпоредби относно вземането на решения от Съвета по различни въпроси, залегнали в Споразумението, включително определянето на позициите, които следва да се заемат в Съвместния комитет и задълженията на държавите членки по отношение на информацията, по време на временното прилагане на Споразумението.
Kako bi se osigurala bliska suradnja i jedinstvo vanjskog predstavljanja u Zajedničkom odboru, te ne dovodeći u pitanje Ugovore, a posebno članak 16. stavak 1.