Като лидер на Божията армия за съпротива Kony разработва и прилага стратегия на армията, в това число периодични нареждания за извършване на нападения и жестокости спрямо цивилното население.
Kony je izdao trajnu naredbu pobunjeničkim borcima da pljačkaju dijamante i zlato od rudara obrtnika u istočnoj Srednjoafričkoj Republici.