Когато действа по своя инициатива, Евроюст може да играе по-активна роля за координиране на случаите, например чрез подпомагане на националните органи при извършваните от тях разследвания и действия по наказателно преследване.
Takvi slučajevi mogu uključivati istrage i kazneni progon koji pogađaju samo jednu državu članicu i treću zemlju ako je s tom trećom zemljom sklopljen sporazum ili ako može postojati posebna potreba za uključivanjem Eurojusta.