За да се гарантира пълната самостоятелност и независимост на Агенцията, тя следва да получи самостоятелен бюджет, финансиран основно с вноската на Съюза и с таксите и плащанията на ползвателите на Европейската система за авиационна безопасност.
Nadalje, ako bi takvi nacrti pravila mogli imati važne društvene posljedice, Agencija bi se trebala na odgovarajući način savjetovati s dionicima, između ostalog sa socijalnim partnerima u Uniji.