Приложимите за Агенцията финансови правила се приемат от Управителния съвет след консултации с Комисията.
Na svaki projekt povezan s nekretninama koji bi vjerojatno mogao imati znatne posljedice za proračun Agencije primjenjuje se Delegirana uredba Komisije (EU) br. 1271/2013.