Регламент (ЕО) № 45/2001 на Европейския парламент и на Съвета, и по-специално неговите разпоредби, свързани с поверителността и сигурността на обработката, се прилагат към обработката на лични данни от Агенцията, когато тя изпълнява задълженията си по прилагането на настоящия регламент и по-конкретно при управлението на регистъра създаден съгласно настоящия регламент.
Na temelju te uredbe države članice mogu predvidjeti izuzeća i ograničenja s obzirom na pojedina prava i obveze utvrđene u toj direktivi, između ostalog s obzirom na obradu medicinskih i zdravstvenih podataka.