Фармакокинетичният анализ при едно от изпитванията е извършен върху деветнадесет пациента, с медиана (диапазон) на индинавир AUC 0- 12hr, Cmax, и Cmin съответно 25421 nM* h (21489- 36236 nM* h), 5758 nM (5056- 674 nM) и 239 (169- 421 nM), Фармакокинетичните параметри във второто изпитване са подобни.
Οι παράμετροι φαρμακοκινητικής στη δεύτερη μελέτη ήταν συγκρίσιμοι.