En su carrera como tecnico Valverde ha dirigido al Athletic Club (2003-2005), Espanyol (2006-2008) Olympiacos (2008-2009 y 2010-2012) y Villarreal (2009-2010).
Athleticeko jokalaria eta entrenatzaile izateaz gain, Valverdek Espanyol (2006-2008) Olinpiakos (2008-2009 eta 2010-2012), eta Vila-real (2009-2010) zuzendu ditu.