El comite Ejecutivo esta formado por los patronos del museo: La DIPUTACION Foral de Alava, como patrono principal, los gobiernos central y vasco y Ayuntamiento de Vitoria.
Batzorde betearazlea museoko nagusiek osatzen dute: Arabako Foru Aldundiak, zaindari nagusi bezala, Espainiako Gobernua, Eusko Jaurlaritza eta Gasteizko Udala.