En octubre de 2008 Garzón accedió a investigar los crímenes ocurridos durante la Guerra Civil y el franquismo, pero la Fiscalía de la Audiencia Nacional interpuso un recurso al considerar que el juez carecía de competencia.
2008ko urrian Gerra Zibileko eta Frankismoko krimenak ikertzea erabaki zuen Garzonek, baina Auzitegi Nazionaleko fiskaltzak helegitea aurkeztu zuen, epaileak horretarako eskumenik ez zuela argudiatuta.