Después y hasta el año 2000, Gandarias continuó en la UPV como profesor emérito y en los últimos años ejerció como presidente de la Real Academia de Medicina del País Vasco.
Ondoren eta 2000 urtera arte, Gandariasek EHUn jarraitu zuen irakasle emeritu bezala eta azken urteetan Euskadiko Medikuntza Akademiako presidentea izan da.