Por otro lado, Amnistía Internacional considera necesario "avanzar sustancialmente en la investigación de otro tipo de crímenes de grupos armados en el marco de la guerra sucia, por ejemplo el GAL", así como en el reconocimiento "de las víctimas de la tortura y malos tratos que han ocurrido en cincuenta años de lucha antiterrorista en el País Vasco y Navarra".
Agenda bateratu horren helburu nagusiak hauek izango lirateke: Batetik, argitu gabe geratu diren ETAren atentatuak argitzea; bestetik, gerra zikina egin zuten talde armatuek, tarten GALek, egindako krimenak ikertzea; eta hirugarrenik, terrorismoaren borrokaren baitan azken 50 urteotan Euskal Herrian torturak eta tratu txarrak pairatu dituzten pertsonak biktimatzat aitortzea.