Mujika deja escrito un inmenso legado en el que cabe tanto creación literaria (poesía, ensayo, novela y relatos) como obras de índole lingüística (diccionarios, estudios de toponimia, teoría literaria …).
Idatzizko ondare oparoa utzi du Mujikak, bai literaturari dagokionez (poesia, saiakera, eleberriak eta narrazioak idatzi zituen), baita hizkuntzalaritzaren esparruan ere (Hiztegigintza, toponimia …).