Su trabajo está representado en destacadas colecciones particulares y públicas de organizaciones como el Artium Museo de Arte Contemporáneo de Vitoria, el MACBA Museu d 'Art Contemporani de Barcelona, el European Central Bank de Frankfurt, Elm CAPC Musée d' Art Contemporain de Burdeos, la Colección Fundación Cajamadrid o la de la Fundación Coca-Cola.
Pep Aguten lana honako erakundeen bilduma partikular eta publiko gailenetan erakutsi dute: Gasteizko Artium, Arte Garaikidearen Museoa; Bartzelonako MACBA Museu d 'Art Contemporani; Frankfurteko European Central Bank; Bordeleko CAPC Musée d' Art Contemporain; Cajamadrid Fundazioa Bilduma edo Coca cola Fundazioaren Bilduma.