（1048年），县令林肇将文庙迁移到县衙东南一里的现址，并聘请杜醇担任指导，鄞县县令王安石作记。南宋淳熙四年（1177年），节度推官宋南强主持维修大成殿，并建设文庙各建筑，至淳熙八年（1181年）落成。元世祖至元十八年（1281年），县尹富德庸增建仪门，元贞二年（1296年）焚毁，主簿皇甫涖重建。至大三年（1310年），儒宿茅洙建养蒙堂。据《延祐四明志》载，当时的慈溪县文庙共有礼殿、讲堂、斋庑等建筑九十八间。明洪武三年（1370年），开设县学。洪武三十一年（1398年），典史余琯在明伦堂后兴建梯云亭，新