湖遗址出土的部分文物也被安置在文昌阁后展出。孔庙大成殿于2003年完成复建，宫墙外东侧新建休闲广场。建筑于2003年7日对外开放。1997年8月，孔庙与慈城镇内程氏庆余堂等建筑一道以慈城明清古建筑的名义列入第四批浙江省文物保护单位，并于2006年6月与布政房等建筑一道以慈城古建筑群的名义列入第六批全国重点文物保护单位。