经建会(现国发会)也曾于2004年做过「台北都会区休闲游憩铁路暨沿线土地规划利用之研究」，规划从捷运木栅站起，沿途设深坑、枫子林、石碇子埔、姑娘庙等站，最后在菁桐接轨平溪线，但最后都因为种种因素而未成功。本延伸案在2007年交通部运研所、2010年蔡英文市长候选人及2011年蔡英文总统候选人等都提议延伸至深坑，不过因为兴建成本高、台铁态度消极，以及地形过于险峻，地方政府只允诺会评估。2017年，总统蔡英文任内提出之前瞻基础建设计画并未纳入本线延伸计画，让本线延伸案仅止于纸上谈兵。未来若是侯硐双溪区间