由于有多名反修例人士破坏九龙湾站出入口的铁闸，并进入站内不肯离开，因此职员报警安排列车接载警员前往九龙湾站。其后反修例人士在站外涂鸦及悬挂宣传品。列车服务于晚上11时45分回复正常。2019年8月31日港岛及九龙区多处示威，港铁指九龙湾站、太子站和旺角站内大量设施被多名反修例人士破坏，需时清理和修复，港铁于9月1日清晨宣布车站封闭，有乘客不清楚关站安排，感到不便。同日下午4时10分车站重开。10月1日，九龙湾站再遭到破坏，一度关闭。
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