当时美国国内也有反对路易斯安那购地的阵营。联邦党极力反对购地案，并认为与英国维持密切关系比和拿破仑友好重要。联邦党辩称购地案是违宪，而且美国付出巨额的代价换来的只是和西班牙一场战争。联邦党并担心西部新公民会威胁美国东岸（）各州政治势力，引发西部农民与新英格兰商贾之间冲突。一批以麻萨诸塞州参议员皮克林为首的联邦党员甚至开始筹备成立一个新北方联盟，并游说时任美国副总统阿龙·伯尔，指他如果能说服纽约州加入新联盟，将推选他为联盟总统。在伯尔的政敌亚历山大·汉密尔顿极力斡旋下，北方分离运动无疾而终。伯尔和汉密尔