理因精通易理，被嗣德帝召回京城，命其占卜，后礼遇送归。不久以其老迈，加翰林院着作致仕。嗣德二十一年八月十七日（1868年10月2日），阮文理在家去世。
文学.阮文理擅长作诗，在京城期间与何宗权、都御史潘伯达交往密切，从善王阮福绵审为其文集作序，称赞他为“文学耆旧”。着有《东溪诗集》4卷、《东溪文集》5卷、《自家要语》1卷、《志轩诗草》、《东作阮氏家训》和《寿昌东作阮氏家谱》。