行政职能以及各种政治活动被逐渐削弱，其业务被置于关东军司令部的监管之下。满洲国建立后，原由满铁经营之学校、医院、大学改由满洲国国家经营。满洲重工业开发株式会社取代满铁地位，满铁职责受到限缩。1932年8月7日，关东军司令官本庄繁与满国务总理郑孝胥签订《满洲国铁路、港湾、航路、航空及新线修建管理协定》，规定：「满洲国将铁路、港湾、水路经营及敷设委托于满铁。」满铁获得除中苏合办之中东铁路（满洲里至绥芬河）以外之东北所有铁路之经营权。1937年1月27日，南满铁道株式会社与日华北驻屯军商定开发华北