之后加缀“斗争派”（Perjuangan）来区分她的派系，又称民主斗争党，梅加瓦蒂成为主席，并在1999年被提名参加印尼总统选举。在1999年的大选中，斗争派民主党获得33%的选票，成为议会第一大党，但未获得绝对多数。梅加瓦蒂在与（PKB）的阿卜杜拉赫曼·瓦希德竞选总统失败后，再次参加竞选副总统，并以396票当选。2001年7月23日，印尼人民协商会议特别会议以渎职罪罢免瓦希德总统职务，梅加瓦蒂接任总统。2004年，选民对斗争派民主党和梅加瓦蒂总统的所取得的成绩感到失望，在立法选举中，斗争派民主党只