冀军区第十一军分区，黄寿发担任司令员（肖文玖担任政委）。1944年，升任冀中军区副参谋长。1945年，担任冀中军区第9军分区司令员。
第二次国共内战.第二次国共内战期间，任晋察冀军区第二野战军冀中纵队副司令员。1946年，调任冀中军区参谋长。1946年秋，黄寿发与他小孩的保姆单洁英有染，进而与妻子何茵关系恶化。黄寿发曾授意其警卫员边振海打死何茵，边振海当予拒绝反被训斥并要挟。1947年农历正月初二，他在河间黑马张庄，以手枪杀害其妻何茵，何茵连中三枪，当即身死，时已怀孕数月。遵聂荣臻