寺成为民众集会的场所。1950年，中共土默特旗委在福征寺成立区公所。1952年，中央少数民族慰问团团长彭泽民一行来到福征寺，向福征寺赠送了一面有毛泽东主席亲笔题词“做民族团结的先锋”的锦旗，时任包头市市长郑天翔代表包头市各族人民接待了彭泽民一行。文化大革命中，与其他寺庙一样，福征寺也遭严重破坏，原来近2万平方米的规模仅存不足1/10。1966年，福征寺被第二皮毛厂征用为仓库。中共十一届三中全会后，1981年福征寺退还巴氏家族，再次迎来驻庙喇嘛，重塑在文化大革命期间被破坏的佛像。巴氏家族还成立了福征寺管委