硷基之间的空隙变大，才能使嵌入剂置入硷基对之间，整体而言，脱氧核醣核酸会因为双螺旋解开而扭曲变形。结构改变会使转录作用与脱氧核醣核酸复制过程受到抑制，进而导致毒害与突变。因此脱氧核醣核酸嵌入剂通常也是致癌物，常见的例子有二醇环氧苯并芘、吖啶、黄麴毒素与溴化乙锭等。但是这些物质也因为能够抑制脱氧核醣核酸的转录与复制，而可应用于化学治疗中，用以抑制癌症细胞的快速生长情形。
生物机能概观.脱氧核醣核酸于真核生物细胞内，通常是以长条状染色体形式存在；在原核生物细胞内则是环状染色体。细胞内的