掌握党政军大权后，于1990年10月7日宣佈成立国家统一委员会。当时设置目的在主导台湾海崃两岸关系的发展，依据「民主、自由、均富」，力促两岸统一，并于1991年2月23日第三次会议上通过了《国家统一纲领》。在1991年，中华民国代表以中华台北之名与中华人民共和国一同加入亚洲太平洋经济合作组织，相当于承认中华人民共和国政府的存在，是现阶段统治中国大陆地区的政府。往后，中华民国政府鑑于两岸政治制度及两地人民生活水准皆存在极大差异、观点不受中共当局尊重，遂对中国的统一不再一厢情愿。李登辉同时进一步推行蒋经国晚年推