中央身兼数职（兼任日本内阁陆军大臣、军务大臣、文部大臣等职位），更领兵参与日俄战争，因此在台湾的时间很短。实际在台湾负责政务的人是民政长官后藤新平，被称为「儿玉、后藤时代」。1903年（明治36年），儿玉中将后继田村怡与造为陆军参谋次长（参谋总长为大山巖），日俄战争中儿玉源太郎升为大将调为满州军总参谋长，在203高地争夺战中支援乃木希典大将为战场总指挥。1906年（明治39年），儿玉源太郎奉调回国，任命其任职中国东北「南满铁道株式会社创立委员长」。上任之后，儿玉源太郎制定了对中国东北移民50万的计画