直接管理，北城和嘉定城分别设置总镇和副总镇（或称协镇）以管理事务。北城和嘉定城的总镇都是由立下赫赫战功的武将担任。各镇以留镇或镇守为长官，镇之下又细分为府、县、州，由知府、知县、知州为长官。阮福映也意识到北城这片刚佔领的领地形势错综复杂，既存在有支持后黎朝和郑主势力的余党，也存在着据守山区、朝廷难以管理的土豪，而且这些势力依然强大。阮福映认为北城地区「民性骄顽」，难以统治，因此并没有遵循前代历朝定都河内的惯例，而是将都城选在了历代阮主的统治中心顺化。1803年，阮福映命黎质、范文仁、阮文谦，参照中国紫禁城