期仿效宋朝的政治体制，设立了主管行政的三省六部，主管军事的枢密院和主管财政的三司。其中三省的中书省和门下省合称中书门下省，尚书省亦称「尚书都省」。三省长官为尚书令、中书令、侍中，品秩均为从一品，地位仅次虚位三师和三公。尚书令和中书令不常设，多以门下侍中为宰相，加「平章事」衔者亦为宰相。高丽忠烈王时期，将都兵马使改制成「都评议使司」，成员包括佥议府和密直司的高级官员，成为最高权力机关。1280年，元朝为攻打日本在高丽建立征东行省。在王京（今朝鲜开城）设达鲁花赤管理征东事务及监管高丽国政；高丽忠烈王王椹后成