中心一号大楼因为分配给办公室和其他设施的楼层较少（顶多70层），引起了一些争议。楼层限制是西弗史丹提出的主张，他担心高的楼层可能出意外，或成为恐怖份子攻击的目标。重新设计后，世界贸易中心一号大楼定为82层，比原设计多，但仍远少于同级的高楼（连矮它一截的帝国大厦都有102层）。此外有一些建筑师不以现有的高度为满足，他们主张基于费用和工程技术等考虑，建高一点反而会更安全。其他反对世界贸易中心一号大楼方案的人士认为，原始设计置于塔顶的桁架和天线是为了遮掩真相，它的可用楼层比以前的双塔更少，结果可能重建后反而比