大部分时间在护级漩涡挣扎，凭借最后一场联赛以 3–0 大胜标准表针，最终以一分压过福建，升上乙组联赛第 10 位，宣告护级成功。元朗于2012–13年球季，罗致董浩然、吴国熙、罗咏麟、燕鸣昊、吴昊鹏、侯庆裕、游锦良、叶志豪、刘志强、陈嘉晋、余浩邦、袁立翔等多名前甲组球员，配合外援球员法比奥、友友、董雅涛，增强球队实力，锐意争取升班重返甲组联赛角逐。2013年1月27日在香港大球场举行的香港足球初级银牌赛决赛，以6-2大胜另一支新界地区球队葵青，首次赢得初级组银牌赛冠军。元朗区议会于2013年2月