组在广深铁路以180公里/小时的最高运营速度开始载客试营运，每天担当2对来往深圳和广州东的广深城际列车，成为中国第一列时速200公里的商业营运列车。然而，由于动力车采用了四台1000千瓦的脉流牵引电动机，以提高电压和电流的方法来提高电机转速。基于直流电动机的技术限制，电机的各项性能指标已接近或超过临界值，导致牵引电机可靠性较差，机车耗电量大。列车投入商业运营后故障率很高，列车在广深铁路运用一年期间的总停运时间长达几个月，只能作为备用车使用。至2002年中，DDJ1型电力动车组停运，并封存于广州车辆段石牌