了内战的胜利，但分散于各个山区以及流亡法国的佛朗哥抵抗运动直到1950年代都没有停止。1940年，他与希特勒在沦陷的法国昂代伊举行会晤。希特勒希望他治下的西班牙能够加入轴心国使德军可以进入伊比利亚半岛入侵直布罗陀（即），但他并不能满足佛朗哥所要求的直布罗陀与法属摩洛哥及西非的控制权，于是双方没有达成任何协议。随后，希特勒操控教会，并且将纳粹神秘化等行为也与佛朗哥虔诚的宗教信仰背道而驰。第二次世界大战期间，他名义上保持中立。但于1940年法国陷落后采取了亲轴心国的立场。他曾考虑出兵直布罗陀和安道尔，但因惧