自行发动调查。其结果与总统府方面极为不同，监察院报告认为孙立人案子虚乌有。但该报告由于过于敏感，事后马上被列为机密封存，于2001年才重见天日。随后孙立人由于九人小组报告，遭国防部管束行动于台中市长达33年。1957年监察院因军公教待遇问题通过纠正行政院，但行政院逾期答覆后，监察院又决议约询行政院院长，又遭到俞鸿钧拒绝。监察院于是通过弹劾，将俞鸿钧送司法院公务员惩戒委员会议处。司法院公惩会最后也议决记俞鸿钧申诫一次。此一惩处虽属轻微，但对行政院声望打击甚大，俞鸿钧随后辞职，由副总统陈诚兼任行政院院长。总