核苷酸多样性（nucleotide diversity）是分子遗传学（分子生物学）中的一个概念。该概念用于表征某一种群中多态性的强弱。Nei和Li在1979年引入了一种计算核苷酸多样性的方法：在从某一种群中取得的多个样品DNA上随机取一段序列，将在这些序列上的同一位点硷基的不同取平均值，即可得核苷酸多样性的值。他们将这个值记爲「"π"」。这种方法用数学公式表示如下："x" 、"x"分别代表第i个和第j个序列的对应频率。"π"则爲两个序列之间不同位点所佔百分比。n则爲总样本数。核苷酸多样性是（