入京都东本愿寺的教师学校。第二年被选为东本愿寺国内留学生到东京。入学东京帝国大学，进修该校文学部哲学科。1885年毕业后开始着书。以位于中野区自己修建的哲学堂（现东京都中野区立哲学堂公园）为据点，进行全国的巡回讲演。到62岁时在游说地关东州大连（今中国大连市）猝死爲止，在爲传达哲学和宗教的知识的同时，也以鼓吹社会大众消除迷信为目的四处奔走。
妖怪研究的先驱者.身为知名哲学家的井上圆了，也以近代妖怪研究的创始者闻名。他在《妖怪学》和《妖怪学讲义》中深入考察了不同的妖怪，对实际存在的妖