六军团指挥参与没落行动，任务是攻击日本九州，并在日本投降后进行佔领工作，这时候第九军下辖第77步兵师、第81步兵师、第98步兵师等总共79,000名士兵。但在投下两颗原子弹之后，日本于1945年8月投降，第九军也取消攻击计画。日本投降后，第九军成为北海道的佔领军，1945年10月前往札幌市进行佔领工作，接下来的几年都在监督与执行扣押日本军事物资及设施，解除日本武装。第九军的职责还包括处理归国的日本人、产业转换。随着佔领工作完成，越来越多美军部队返国，佔领军规模开始缩小。1950年，第六军团离开日本，