后参与藤原纯友谋反后的余党平定工作。969年，源满仲告发源高明连同橘繁延、藤原千晴等密谋废立，引发安和之变，导致源高明、藤原千晴等从朝廷失势流放。事后清和源氏在京都的势力大增，其与藤原北家的关连也更加紧密。1030年，源赖信接替平直方，开始平定平忠常的叛乱。至1031年乱平，杀平忠常。经此事件，原属平忠常的坂东平氏的势力范围，多落入源赖信之手，可说是后来清和源氏一族在东国一代称霸的重大资本。1051-1062年，源赖义与源义家父子与出羽清原氏联手，击败奥州的安倍氏，此称为前九年之役。1083-1