些传承将其收录与红观音的支分修法，宁玛派推崇为莲花语部，萨迦则具有昆氏与杰冈巴两种马头明王传承，噶举派具有伏藏和新续两种传承，格鲁则承自萨迦杰冈巴和宁玛龙钦（色拉马头札仓主供）两种传承。马头明王的主要功德为：降伏罗剎、鬼神、天龙八部之一切魔障，消无明业障、瘟疫、病苦、免一切恶咒邪法等。修持此本尊法，可获无痛苦之大乐空性成就果位。诸本尊中唯有马头明王在发际上有一或三个马头。此表征为噉食一切众生无明罪障，摧破诸恐而现之形。
日本密教.马头明王为观音在畜生道的化现，故又称「马头观音」