对于核废料的长期储存和处理以及减少排放不利。在再处理工厂中，许多提取和分离裂变产物的过程和工艺主要针对阳离子，比如铯-137和锶-90，类似高锝酸盐的放射性阴离子则畅通无阻。在现有的陆地埋藏方案中，最大的问题是水污染。高锝酸盐和碘离子（）溶解性好，不易被土壤、岩石和矿物吸附，很有可能随水迁移。比较而言，钚、铀和铯更容易被土壤吸附。通过某些微生物活动，锝可以在一些环境富集，比如在湖底沉积物中。因此，锝的环境化学是相当活跃的研究领域。还有一种处理方式是核嬗变。欧洲核子研究组织（CERN）已经证明锝-99的嬗