举刘玄为帝，年号更始，决定争夺天下，以王匡、王凤为上公，刘縯为大司徒，刘秀为太常偏将军。同年，刘縯攻克宛。接着，绿林军在刘秀的率领下，在昆阳之战中击溃王莽的主力大军。十月初一，绿林军攻克京师长安，杀王莽，不久更始帝定都长安。此后，绿林与另一支起义军赤眉军发生冲突，内部亦产生分裂。更始三年（25年），王匡率部与樊崇率领的赤眉军联合，攻占长安，立刘盆子为天子。当年六月，刘秀在河北称帝，改元建武，是为东汉，绿林军残部并入其部队，成为东汉官家部队的一部分。
官修史.唐刘知几称，东汉官修