蓝菌门（学名：），也被称为蓝绿藻，是一类能透过产氧光合作用获取能量的细菌，但有些也能透过异营来获取能量。属于原核生物界。蓝绿藻植物菌门下物种又称蓝细菌、蓝绿菌、蓝藻或蓝绿藻及蓝菌，当中包括蓝鼓藻、蓝球藻等生物。过去曾长期被归于藻类，但实际上蓝菌与真核生物非常不同，例如没有核膜，没有细胞器，其遗传物质DNA也不构成染色体，这些都是细菌的特征，因此现时已被归入细菌域。蓝绿菌在地球上已存在约21亿年，是目前以来发现到的最早的光合放氧生物，对地球表面从无氧的大气环境变为有氧环境起了巨大的作用。通过刺激生物多样性