地表下沉，逐渐形成南高北低的态势，在风水上是不祥的征兆。洪武二十四年（1391年），明太祖派遣太子朱标考察关中地区，为迁都西安作准备。然而第二年朱标病逝，沉重打击了明太祖，加上年事已高令其不愿再劳师动众地更换京师。
迁都北京.靖难之役后的永乐元年（1403年），礼部尚书李至刚等奏称，因燕京是永乐帝“龙兴之地”，应当效仿明太祖对凤阳的做法，立为陪都。永乐帝于是大力擢升燕京北平府的地位，以北平为北京，改北平府为顺天府，称为“行在”。同时开始迁发人民以充实北京；被强令迁入北京的有各地流民