直辖的领地后仍持续发展为商业中心。在江户时代大部分区域为幕府直属领或是旗本领，由位于滋贺郡大津的负责管理。19世纪末明治维新后，原先的幕府直属领及旗本领先后改隶属大津裁判所及大津县，在1872年的府县整併中后不久更名为滋贺县。1889年日本实施町村制，现在的近江八幡市辖区在当时分属、、、、、、、、、、共11个行政区划；在1950年代，除了位于东部的安土村和老苏村合併为安土町外，其余区域合併为最初的近江八幡市。2010年近江八幡市与安土町合併为新设立的近江八幡市。
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