朱一贵称王直到沟尾庄被擒，为时亦尚不到二个月，因此民间遂有歌谣传唱：「头戴明朝帽，身穿清朝衣；五月称永和，六月还康熙」。此诗据说是内门乡人流传的打油诗，亦刻于高雄内门区朱一贵文化园区朱一贵雕像底座右侧。清军亦借此事展开扫荡，彻底拔除南明残余军队，直到世宗雍正元年（1723年）才恢复宁静。
事件后续.朱一贵和直到九月投降清军的杜君英俱于十月押解北京。朱一贵被捕时面对平乱之福建水师提督施世骠（施琅之子，施世纶之弟）、清国官员蓝廷珍，犹昂然自立，自称孤家，并以反满的言论痛斥清吏道：我复兴