由「小圈子选举」产生，缺乏人民的授权和认受性，在这个情况之下赋予行政长官过大权力，只会方便政府委任大量亲信进入校董会，掌控大学人事任命，干预院校的施政，严重损害学术自由和院校自主。而且，行政长官行使权力时，亦不受师生及公众监察。身兼港大校董的香港教育专业人员协会和香港立法会议员叶建源及教协会秘书黄碧云议员分别曾就梁振英涉嫌删减港大名誉博士名单一事去信港大名誉学位委员会，但港大校方代表副校监李国宝撰写的覆函，竟以「保密」为由而拒绝回覆 ，被认为行政长官运用权力的过程纯属黑箱作业。