立的黑山人抵制了此次公投，他们认为该次公投的投票环境不够民主，国营媒体过多为亲统一（塞尔维亚）的一方宣传。之后黑山共和国内在独立议题上时有纷争。1996年，米洛·久卡诺维奇政府宣佈和米洛塞维奇掌权的塞尔维亚断绝关系，从此以后黑山自行制定经济政策，改用德国马克（后来德国废除马克，採用欧元，蒙特内哥罗亦改为欧元）。从此塞尔维亚第纳尔在黑山不是法定货币，只能在一些度假村使用。由于和米洛舍维奇掌权的塞尔维亚断绝关系，蒙特内哥罗在接下来的南斯拉夫和科索沃战争中受到损伤并不如塞尔维亚来的大，局势也较塞尔维亚稳定许