又四处宣示皇恩，收买人心。他尽心为清廷效力，数月之内，即抚定数府。有柯、陈大姓人家，为元末武装陈友谅后裔，二百年来盘踞险阻，不听官差。孙之獬自甘委曲，前往招徕，使其地纳入版图。顺治三年（1646年），江西局势渐稳，孙之獬应召还朝。总兵金声桓劾其擅自为副将高进库、刘一鹏加授总兵衔，孙之獬于十月被革职，永不叙用。
回乡身死.顺治四年（1647年），山东人谢迁举兵抗清，声势浩大。淄川知县刘修己因孙之獬知兵，请其协助城防。然而，当时清廷因惧怕民众叛乱，正在酝酿收缴民间弓矢枪械，虽然尚未