由于香港是中国的一部份，驻中国内地的经济贸易办事处与驻海外的有分别。驻京办和香港驻内地经济贸易办事处隶属政制及内地事务局，而驻海外经贸办则隶属商务及经济发展局。驻中国内地的香港经济贸易办事处原隶属政制事务局，2007年7月1日决策局重组后划入政制及内地事务局。
职能.办事处的主要职能是为促进当地与香港在经济及贸易上的联系，及加强合作。此外，各经济贸易办事处设有入境事务组，向身处服务范围内的香港居民提供紧急支援服务。为进一步完善网络，自2014年12月以来先后为相关驻内地办事处