西哥海岸85公里处风速增强到每小时185公里，成为2006年太平洋飓风季的第六场大型飓风。飓风莱恩还在继续增强，14公里宽的风眼周围由非常强烈的深层对流环绕，风暴在9月16日中午达到风速每小时205公里的最高强度。之后风暴意外转朝东北方向前进，于协调世界时16日晚上19点15分在锡那罗亚州一片人烟稀少的区域登陆，具体位置在该州埃尔多拉多（）东南方向约32公里。莱恩因此成为继2002年飓风肯纳后袭击墨西哥的最强飓风。墨西哥的山区地形和逐渐加强的西南偏西方向风切变共同作用，令风暴强度急剧减弱，最终于9月17