，吴越国占领福州后将原王审知故宅略加修缮后改为庙祀，以纪念王审知治理闽国时的德政。北宋开宝九年（976年）宋太宗下诏修复王审知祠，由吴越王钱弘俶委托福州刺史钱昱进行修复工程，并竖立石碑。此后每年都有祀牲醪。此后由北宋至清代，闽王祠五度重修。1601年（明万历二十九年）明神宗下诏鼎建祠宇，敕令春秋祀典，并将闽王祠赐名“忠懿闽王祠”。1662年（康熙元年）再度重修。到了1827年（道光七年）因为祠堂内的宋代石碑崩裂，而祠堂也有破损，因而再次重修。民国初年也曾有修复。1981年，福州市修复闽王祠后将其向外界开放。