2017年12月22日，香港记者协会发表声明，关注《香港01》对六四报道的处理手法。声明指，据记协了解，《香港01》按英国解密档案制作了最少分两天刊登的六四报道，原定于12月21日发表的第二批稿件被搁置；记协表示极度关注，担心因报道涉及政治敏感议题而被自我审查。
高层变动.2018年3月28日，《香港01》出现高层变动，总编辑兼总经理龙景昌3月底离职，于品海出任行政总裁以及暂代总编辑职务，但并无交代龙景昌离职原因。香港记者协会发出声明，对此表示极度关注，忧虑人事安排会影响编採独立。