离剂（如含高浓度Mg的67%的CHCOOH或3mol/L LiCl~4mol/L (NH)CO）才能将其分离，所以这类蛋白质相对于“核糖体相关蛋白质”也被称为“真核糖体蛋白质”。因为在核糖体自组装过程中，这类蛋白质逐批与rRNA结合形成核糖体的大、小亚基，所以这些蛋白质又按与rRNA结合的顺序分为“初级结合蛋白”、“次级结合蛋白”与“迟结合蛋白”等几组。当前，对核糖体蛋白质的了解主要来自对大肠杆菌（"E. coli"）核糖体的研究。大肠杆菌的大多数核糖体蛋白质已应用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术进行分级