为愤恨，何桂清到达后，驻扎于浒墅关，江苏巡抚徐有壬拒绝打开城门，并弹劾何桂清「弃城丧师」及亲兵在途中焚掠的罪行。和春四月十三日，苏州城沦陷，徐有壬于巷战战死殉节，遗疏再弹劾何桂清多条罪状。朝廷降谕将何桂清革职解京审讯。何桂清逃至常熟县，託言借外兵，逃进上海租界。何桂清统领十余万清军弃城潜逃，导致常州、常熟、苏州皆失守，咸丰帝上谕革职，捕送北京审讯。然凑巧遇英法联军之役，咸丰帝避难热河，何案搁置两年。期间王有龄及江苏巡抚薛焕等相继上疏乞恩，未获允准。 同治元年（1862年），言官交章弹劾何桂清，于是恭亲王