成为台湾省营事业机构。因战火影响，营运客车车厢从战前497辆减少至1945年时的428辆（2万5701位）。竹东支线于战后恢复兴建，新竹至竹东间于1946年10月15日完工通车，竹东至内湾间于1951年9月11日完工通车，新竹至内湾全线通车营运，改称为内湾线。台北铁道公司与其所经营的新店线于1949年6月1日被台铁收购合併。1950年9月20日西部干线1次成功号、2次铭传号对号特快正式行驶，为台铁为特快列车取名之滥觞。战后复建完成后，台铁利用美援更新车辆与提升路线等级，于1960年分别向日本和美国购入R