惠州西湖与城市相邻，1980年代后惠州市经济的发展使西湖的水质受到了严重的污染，近年来，虽然采取了环湖截污，底泥疏滩，引入新水源等措施，使西湖的污染得到了扼制，但水体的富营养化特征依然明显，水色呈绿色，透明度低，水中缺少大型植物生长，浮游藻类占优势，磷含量高。其中，靠近市区中心地带的南湖营养物累积作用明显高于其它四个湖区，属于内源污染十分严重的湖区。惠州西湖对城市的生态环境影响很大。西湖的湖水在夏季炎热的季节里，对城市热岛强度有显着的减弱作用，西湖和几百米之外的城市区在夏季的最大温差可达到3-4℃。