但仍没有充份了解氢化脂肪的生物化学性质，对氢化脂肪进入胎儿脑组织、细胞膜和动脉的机理知之甚少；不过统计学认为若能淘汰人造反式脂肪，很可能减少许多疾病及死亡。许多临床研究及大规模的统计认为反式脂肪酸/氢化脂肪很可能和代谢症候群（肥胖症、糖尿病、痛风、高血压、脑心血管疾病）甚至忧郁症及不孕症有关。而在牛肉、羊肉和乳制品（在反刍动物的胃发酵制成）自然地存在的反式脂肪酸，风险很可能低于人造反式脂肪。人的新陈代谢要求的一些基本脂肪酸被加氢过程毁坏。这也许是特别令人关注的是被认为是在典型西方饮食短缺的奥米加3脂