能观测到氢原子的存在。其在星体表面的数量密度约为。
磁层.1995年至2000年间，伽利略号共6次近距离飞掠过木卫三，发现该卫星有一个独立于木星磁场之外的、长期存在的、其本身所固有的磁矩，其大小估计为，比水星的磁矩大三倍。 其磁偶极子与木卫三自转轴的交角为176°，这意味着其磁极正对着木星磁场。 磁层的北磁极位于轨道平面之下。由这个长期磁矩创造的偶极磁场在木卫三赤道地区的强度为719±2纳特斯拉， 超过了此处的木星磁场强度——后者为120纳特斯拉。木卫三赤道地区的磁场正对着木星磁场