业捕捞，以维持当地居民生活，其余区域均禁止商业渔业捕捞。菲尼克斯群岛保护区的有514种，其中包括几种新物种。菲尼克斯群岛保护区中的五个岛屿，目前已被国际鸟类保护组织指定为重要鸟类保护区。许多海鸟在迁徙过程中会经过此地，包括来自澳洲与纽西兰的、，以及濒危物种。
岛屿恢复与生物安全计划.菲尼克斯群岛保护区过去曾有些被人类带进来的非原生物种，对原生的海鸟与植物造成危害，特别是海鸟的蛋与幼鸟受到侵害，改变岛屿的生态。已进入这些岛屿的非原生物种包括亚洲家鼠、穴兔、猫、蚂蚁、猪、狗，以及马