后，陈霸先镇守朱方，杜稜监义兴琅邪二郡。555年（承圣四年）陈霸先讨伐王僧辩，召杜稜、侯安都前来商议，杜稜反对起兵杀害王僧辩。陈霸先害怕杜稜泄露计划漏，用手巾将杜稜闷倒，幽闭于别室。陈霸先攻打王僧辩，让杜稜同行。同年（绍泰元年），陈霸先讨杜龛，命杜稜、侯安都留守建康。徐嗣徽、任约率北齐军渡长江，进攻建康，杜稜、侯安都防战。556年（绍泰二年），以功被任命为通直散骑常侍、右卫将军、丹阳尹。557年（永定元年），南陈建国，杜稜加侍中、忠武将军。转任中领军。559年（永定三年），武帝陈霸先去世，杜稜掌握建康禁