。帕竹政权下各宗（汉文史书称爲“寨”）的宗本也被朝廷封为都指挥佥事，如牛儿宗（即内邬宗，在今堆龙德庆县）、领司奔（今仁布县）、公哥儿（今贡嘎县）、答噶尔（今达孜县）等。同时，朝廷也大量册封各派僧人领袖，使其互相牵制，避免帕竹政权一家独大。永乐五年，封噶玛噶举派上师哈立麻（今作得银协巴）为“大宝法王”。永乐十一年（1413年），萨迦派上师贡噶扎西（《明太宗实录》作昆泽思巴）入京朝觐，被封为“大乘法王”。贡噶扎西返藏时，明成祖令帕竹第悉将其佔领了五十余年的萨迦寺归还萨迦派，并派汉官到萨迦举行隆重的交接仪式。