肖尼县（，简称SN）是美国堪萨斯州东北部的一个县，堪萨斯河把县分成南北两部份。面积1,441平方公里。根据美国2000年人口普查，共有人口169,871人。县治托皮卡 (Topeka)也是州的首府。成立于1855年8月25日。本县纪念一支印第安人。