年1月5日选出管中闵为台大第12届新任校长后 ，蔡英文政府的教育部指出此案有严重瑕疵，拒绝发给聘书，但教育部的作为亦遭到各界大力质疑，衍生出一连串关于校长遴选制度以及学术自主的争议。因此争议延烧，一年内先后有潘文忠、吴茂昆和叶俊荣三任教育部长为此下台，潘文忠部长事后回任。2018年12月24日，教育部长叶俊荣宣布对台大校长遴选委员会的决议「勉予同意」，但要请台大提检讨报告，2019年1月8日管中闵正式上任，结束台大354天校长遴选争议（2018年1月5日 - 2018年12月24日）及565天无正式校长