随着此次对日战争（即弘安之战）的再次失败，忽必烈下令解散征东行省。1287年元朝再次设立征东行省，并由高丽国王兼任征东行省丞相。后来元成宗年间再次废除征东行省，不过到了14世纪上半叶再度恢复，直到元朝灭亡。 1231年，蒙古军进攻高丽；1258年，崔氏政权垮台，国王投降蒙古，双方达成和平协议。高丽成为元朝附庸国，保留国家自治权和自身文化。不服投降蒙古的三别抄义军发动抗蒙古战争，战争直至1273年才结束。1280年，元朝为了东征日本，在朝鲜半岛设置征东行省（又称日本行省或征日本行省），在高丽首都开城派