争议.萧平实认为对于藏传佛教的批评是对佛法法义的辩正，绝非自身偏见或对显密法师的批评。2012年，萧平实因斥责达赖14世于2009年来台湾，为莫拉克风灾受灾者办理祈福法会的举动，实乃利用时机敛财，而被告上法庭；同年8月，台湾台北地方法院刑事判决101年度自更（一）字第一号判处萧平实触犯散布文字诽谤罪，处拘役55日，如易科罚金，以新台币一千元折算一日。根据大陆学者陈兵教授、邓子美教授所着的《二十世纪中国佛教》之评论，在第357页的内容中，认为萧平实及正觉同修会的修行体系根据经教