国民政府军事委员会京沪行动总队南京指挥部，接管汪精卫政权，开始搜捕汪精卫政权要人。由于办事凌厉，指挥部同汪精卫政权的国民政府主席陈公博的卫士团发生了冲突，日军请周镐来到司令部商谈接管事宜，周镐一来便被扣押，其部下被解散。南京指挥部前后仅存在了三天。经戴笠协调，周镐很快获释。但是此后他被转至上海，继续关押审查，罪名是贪污。这是由于周镐知道的事情太多，特别是周佛海与重庆方面往来的秘密，触动了国民党方面某些权势的利益。1945年9月30日，报纸上刊登消息称，周佛海等一行人被戴笠送往重庆，软禁于白公馆。周镐