此外，优化编译器都以高层次的中间表示（Intermediate Representation）优化程式 － 包括Open64编译器的WHIRL、IBM XL编译器的Wcode。
数学函数库.超级计算机主要执行科学运算等拥有大量向量及矩阵浮点计算的程式，因此优化常用的数学函数会提高运算效能。BLAS函数库使向量及矩阵浮点计算效能大大提高，而优佳化数学函数库则提高三角函数及平方根等数学运算。
平行档案系统.平行档案系统属于分散式档案系统的一类，支援多客户端节