15世纪开始的战国时代后，为了抵抗外来势力，甚至成为，16世纪末，也受到织田信长的承认，与堺一样的成为一个自治都市，并得到「海之堺」、「陆之今井」的称号。后来在堺发展的着名商人今井宗久也正是出身于此。江户时代此区域分属幕府、旗本、的领地；19世纪末明治维新后，这些区域曾先后隶属奈良县、高取县、堺县、大坂府，直到1887年重新恢复设置奈良县后，才再次隶属奈良县。1889年日本实施町村制，现在的橿原市辖区在当时分属、、、、、、、共八个行政区划。在1950年代的昭和大合併期间，这八个行政区划整併为现在的橿