市政府再遭冲击，故采取相应措施，5月28日制定逮捕中共地下党名单，5月31日夜由警卫部队开赴武汉大学、华中大学缉捕中共地下党。
经过.因中共地下党煽动学潮，武汉警备司令部多次举行秘密会议，于5月28日审定了逮捕中共地下党师生的黑名单，31日晚部署了具体行动计划，企图将中共师生头目一网打尽。6月1日凌晨3时，武汉行辕和武汉警备司令部，纠集第71旅、82旅、宪兵12团、汉口警察总署、武昌警察总署及警备司令部稽查一处的军、警、宪、特两千人分乘8辆汽车，全副武装包围了武大。一部分兵力在通往