有亲眼见到贝卡利猪笼草的模式标本，但他在其专着《荷属东印度群岛的猪笼草科植物》中，仍将这个类群归入了奇异猪笼草。2000年，简·斯洛尔和C·奈比重新研究了贝卡利猪笼草的模式标本，并意到其与奇异猪笼草有着显着的差别，并认为应将其恢复为一个独立的物种。查尔斯·克拉克也赞同贝卡利猪笼草独立于奇异猪笼草和苏门答腊猪笼草，但其也指出，若贝卡利猪笼草被发现与长叶猪笼草是同一个物种，那么后者将是前者的同物异名。因为贝卡利猪笼草的模式标本只是由3张叶片和3个破碎的捕虫笼（2个下位笼和1个上位笼）组成的，且叶片与茎是被分开的