籍回锅参选2016年立委，虽获柯文哲及亲民党方面支持，但仍失利落选。
400万事件.2015年希望参选台中市第2选区区域立委，与颜宽恒竞争党内提名。4月19日纪国栋在最后期限缴清责任金和党团动员未到罚款4百多万元，国民党发言人杨伟中表示会在下周对纪国栋和颜宽恒进行民调；然而国民党未对2人进行民调遂于28日国民党在台中市第2选区征召颜宽恒，400万罚金可谓「白缴」。当时有消息指出，纪国栋争取台中市第二选举区立委国民党提名失利后，党中央原有意征召纪国栋参选台中市第七选举区（大里、太平）