水蛇座的形状不规则，东南与山案座相邻，东靠波江座，东北接时钟座和网罟座，北临凤凰座，西北与西侧挨杜鹃座，南面连接南极座。拉卡伊将水蛇座的尾巴缩短，多余空间分给南极座。水蛇座占据243平方度夜空，占0.589%，在88个现代星座排名第61。1922年，国际天文联会确定以三字母缩写“”代表水蛇座。比利时天文学家尤金·德尔波特1930年正式划分星座边界，水蛇座呈12条边组成的多边形。星座在赤道坐标系统的赤经位于至，赤纬在−57.85°到−82.06°之间。水蛇座离南天极很近，北纬30度线以北均不可见，南纬50度线