请求罢免尚书李孟抃、都督神英，没有得到武宗批准。此后因丧归乡。刘瑾厌恶李钺弹劾其党羽，于是借其他事情罚米五百石输边。刘瑾事败后，恢复官职，出任巩昌府知府，此后改为四川副使。巡抚林俊委託其与副使何珊讨伐流贼方四并获胜，此后赐金加俸，升任陕西按察使，再升右佥都御史、巡抚山西。蒙古入侵白羊口后，李钺猜出其进犯意图，并与延绥援将安国、杭雄击退，此后加俸一级，之后征讨武廷章等叛乱等，召回朝中。
嘉靖年间.明世宗继位后，李钺历任兵部右侍郎、兵部左侍郎，出任总制陕西三边军务。最初抵达固原后就遇到