1942年，校名中移除了“霍赫音乐学院”，因为霍赫音乐学院的赞助人在遗嘱中说明校名不得更改，国立音乐学院（Staatliche Hochschule für Musik）从此分割出来，独立发展。二战尾声时，两所学校都先后关闭，曾在霍赫音乐学院任教的管风琴家赫尔穆特·瓦尔哈主持了国立音乐学院的重建。学校初期财政困难，直到1956年才拥有自己的建筑，接管黑森广播公司建于1933年的广播大楼。