石、厚壳桂、青枫、山樱花、水麻、高山倒提壶、火炭母草、台湾何首乌，多属于暖带林植物；公路沿线则有以台湾赤杨为主次生林，分佈两旁之崩塌地，部分地区则为柳杉为主的人工林。林中植物的物种相当丰富，有採集记录的维管束植物就至少有145科440属898种，其中以蔷薇科、菊科与兰科种数较多。此外，鳞毛蕨科、水龙骨等蕨类植物在当地多雨、潮湿的气候环境下数量也相当繁多。
动物.在思源垭口地区的溪流沿岸有发现4种蛙类，依照估计的族群数量排列，依序为：蟾蜍科的盘古蟾蜍、赤蛙科的梭德氏赤蛙、同属赤蛙科的