1939年时，再达到700人。容量与实际收容人数变化如下：疗养院初期採强制隔离、禁婚之管理。地址为「台北州新庄郡新庄街顶坡角字顶坡角145番地」。院区横跨台北州新庄郡新庄街大字埤角及新竹州桃园郡龟山庄大字塔寮坑（今称回龙地区，行政区属于新庄区及龟山区），最初名为台湾总督府癞病疗养乐生院。后来改採不禁婚政策，但须结扎。日治时期，乐生院在今中山路一侧设有铁丝网，防止院民逃跑或是路人擅入，在今中山堂和指导所的中间设有围墙和铁门，是区隔医护人员和病友的界线。根据乐生院民的描述，最初期的医生为日本