化工程，耗资1千万元为每个车站加上主色调及花卉图案，配以车站所处地区的着名地标作为墙身背景。而月台柱上会加上书法字，使乘客更容易辨认所身处的车站。中期美化工程于2008年12月完成，为日后以「融入大自然」的大型翻新工程的前奏。港铁已率先在旺角东站、沙田站及大埔墟站进行小型的改善工程，其中旺角东站在2009年完成。于2015年底亦已翻新上水站及粉岭站，而火炭站则将于2016年年底完成翻新。
增设地面至大堂升降机工程.港铁公司会于多个港铁车站增设连接地面至大堂的升降机，方便乘客进出