，曹爽被灭族，钟毓又被征命，入朝任御史中丞、侍中廷尉。嘉平六年（254年），中书令李丰预谋杀司马师，先被司马师所杀。之后苏铄、乐敦、刘贤以及夏侯玄都被送交廷尉。廷尉钟毓奏：「丰等谋迫胁至尊，擅诛冢宰，大逆无道，请论如法。」最后五个人都被判夷三族。正元二年（255年），毌丘俭和文钦叛变（毌丘俭文钦之乱），钟毓持节到扬州和豫州颁行赦令，通知士兵，回朝后任尚书。甘露二年（257年），征东大将军诸葛诞据守寿春投降东吴，大将军司马昭打算亲自讨伐。此时东吴将领孙壹前来投降魏国，有人因此认为东吴内部又有纷争，