航空.市中心距离苏南硕放国际机场32公里，上海虹桥国际机场76公里、上海浦东国际机场120公里。
铁路.2020年7月建成的沪苏通铁路在常熟市境内设常熟站，而预计2022年建成的苏南沿江铁路也将引入该站。除此之外，规划中的通苏嘉甬铁路拟设常熟西站。
港口.常熟港区于1995年10月被国务院批准为一类对外开放口岸，已发展成中国主要的进口纸浆集散地和全国第二大钢材进出口集散地。常熟港区是货物种类较为固定的现代化中型港口。2002年，成为苏州港的一部分。S