的高山带有、、、、、牛皮杜鹃、笃斯越橘（黑豆木）、越橘（苔桃）、、、、偃松、、深山榛木（ミヤマハンノキ）等植物与（岩桔梗）、多花繁缕（岩爪草）、、、、驹草（奇妙荷包牡丹）、鹿蹄草叶白珠（白玉木）、、高山龙胆（当药龙胆）、伏毛银莲花（白山一花）、、、、等高山植物。其中，日本特有种御蓼即是在御岳山上发现。另外，山上还可见到里白七竃与高岭七竃的杂交种御岳七灶（"Sorbus" x "yokouchii" M.Mizush. ex T.Shimizu）。山顶南侧现在由于有火山活动，植物稀少，北侧则有较为丰富的植物相