货柜码头建成前，香港的货运业务主要集中在尖沙咀九龙仓码头。随着美国于1950年代发明标准尺寸货柜，1969年，有报告指出应该将葵涌建设为香港的专用货柜港，葵涌货柜港的首三个码头于1970年开始兴建，适逢香港政府扩展荃湾新市镇，因此货柜码头就选址于下葵涌醉酒湾的填海地上兴建。1991-92年，政府开始规划兴建位于青衣南部的九号货柜码头，但立法局就批出模式有所分歧。最后，政府决定以一贯公开招标方式批出，并由当时已有的两家营运公司中标。2003年，货柜码头的范围扩展至青衣南部，因此有了葵青货柜码头此名称。