98年），明太祖死，皇太孙朱允炆继位，即为明惠帝。惠帝即位后，即遵照太祖遗训，召方孝孺入京委以重任，先后让他出任翰林侍讲及翰林学士。惠帝敬重方孝孺，读书时每有疑难即向他请教，处理国家大事也会征求他的意见，有时还会让方孝孺批复群臣的奏章。当时宫中纂修《明太祖实录》及《类要》等史籍，皆由方孝孺担任总裁。后定官制，孝孺改为文学博士。惠帝对方孝孺有知遇之恩，使方孝孺十分感激，他也决心竭尽全力辅助惠帝治理天下。 当时各地藩王势力日益增大，惠帝听从兵部尚书齐泰和太常寺卿黄子澄的削藩建议，以加强中央集权。驻守北平的燕