中央政府为香港另组临时立法会，单与其他民主派议员被迫「落车」。1998年香港立法会选举及2000年香港立法会选举，单仲偕改以资讯科技界功能组别，成功当选立法会议员。2003年，单仲偕放弃争取连任葵青区议员，让当时在2000年香港立法会选举落选的李永达参选。2004年香港立法会选举，单成功连任立法会资讯科技界议员。单仲偕虽是民主党成员，但他可以自由到中国出席业界会议，而不像其他民主派议员般被没收回乡证及禁止入境。2008年香港立法会选举，单仲偕不再竞逐连任立法会资讯科技界议员。2008