1920年台湾地方改制，取「南庄街」及「新化南里」之名，併称为「南化」，设置「南化庄」，划归台南州新化郡管辖。战后改设台南县南化乡，2010年12月25日改称南化区。
现况.南化区幅员极阔，面积与省辖市时代的台南市差不多。但由于全区几乎尽为山区，人口仅约原台南市之1%，人口密度居台南市最低。观光景点以南化水库最具代表。