樟树滩命名，起源于大埔滘内的干坑和大埔滘自然护理区长沥尾（大埔尾坑）一带，经樟树滩路、樟树滩、坡面（大埔尾坑正式流入樟树滩坑）和白石角，在博研路近中文大学扩展区转为暗渠（2012年博研路天桥建成前暗渠并不存在），在科城路一带流入吐露港。樟树滩坑亦是樟树滩村和大埔尾村的天然分界。