方法很多，除了世界卫生组织制定的标准以外，中国大陆也各个医疗机构对疾病有各自的分类方法，有些分类是根据部位来分，因此很多疾病没有概括进去，如基因病（基因性疾病）、遗传病（遗传性疾病）、性病、食物中毒（食源性疾病）等。
传染病.传染病是一种可以从一个人或其他物种，经过各种途径传染给另一个人或物种的感染症。通常这种疾病可借由直接接触已感染之个体、感染者之体液及排泄物、感染者所污染到的物体，亦可透过饮水、食物、空气或其他载体（vector）而散佈。常见的传染病像肠胃炎、感冒、疟疾等，爱滋