写磁片资料时必须接触碟片，而不是像硬碟那样悬空读写，因此软碟已经难以满足大量和高速的资料储存，而且软碟的储存稳定性也较差，一张正常的软碟，容易受到外界环境影响，如受热、受潮、多次读写，均使之寿命减少。后来虽然有很多升级产品如zip Drive、及Jaz Drive等，但是都难以同时解决相容性和速度容量两者直接的矛盾。随着光碟、USB随身碟、移动硬碟等移动储存介面的应用，5.25英寸及8英寸的软碟已极为罕见，3.5英寸的软碟使用也渐被淘汰。
由盛行到被淘汰.3.5吋软碟在1980至1