98型缸内直喷涡轮增压柴油引擎；后来2008年舍弃此引擎，改採146匹马力的RF 2007型涡轮增压柴油引擎。因应全球各地不同的道路状况与国情，日本国内搭载新开发直列四缸DOHC的MZR引擎，区分成2.0L的LF-DE型和2.3L的L3-VE型二种。美国地区装载了3.0L V型六缸的引擎，搭配五速手排或五速手自排的变速箱。欧洲与澳洲地区则搭载了2.0L直列四缸涡轮增压RF 2007型柴油引擎，搭配六速手排变速，更达到省油节能的效果。马自达6的性能版在日本称为「マツダスピード アテンザ」（Mazdasp