附苏联的盛世才指控与和加尼牙孜、马虎山同为“法西斯-托派”一员及其他罪名，在约瑟夫·斯大林的大清洗的同时，这些也被盛世才作为借口在新疆实施自己的大清洗。马绍武的家属也被迁往伊犁，关进集中营。在盛世才命令下，马绍武被杀。1944年盛世才离开新疆，吴忠信进入新疆主政并释放被盛世才滥捕的人员时，马绍武的家属才知道马绍武早已死去。同狱难友将马绍武生前所写的一首诗转交给马绍武的家属（现原诗已不存）。据知情者回忆，诗中多激愤之词，让后人不要为官。
后事.2006年，安托尼·加诺特被马绍