，高雄市公共车船管理处实施棋盘式公车路线，所有路线重新配置。2004年7月26日，高雄市公共车船管理处，将公共、观光渡轮业务交由高雄市轮船股份有限公司承接，并更名为高雄市公共汽车管理处，专注于公车业务。2005年9月，高雄市市区公车引入Taiwan Money电子票证系统，进行试营运，并于2007年6月正式营运；2007年12月，引入一卡通电子票证系统。2005年11月起，由于高雄市公共汽车管理处亏损严重且运力不足，开始缩减经营规模，先后委託高雄客运、东南客运代驶部分营运路线。2007年12月1