明全新世的气候变化同样很明显，并且呈现一定的周期性。目前全新世气候变化的原因仍在进一步探讨之中。
撞击事件.最近发现了许多件在全新世的陨石事件，地点包括欧洲、印度洋和西伯利亚，例如位于马达加斯加外海现在作为代表的伯克尔坑或是德国的基姆高撞击坑，它们都被认为是撞击的结果。可能由于早期历史上发生的大海啸，戏剧性的影响了人类文化，或许启发了大洪水或类似诺亚方舟的神话故事。此种波浪的沖刷也许和剧烈的天气变化一起作用，造成突然且巨大的侵蚀破坏了陆桥。各式各样的洪水，也包括气候变化和地震断