因为鹤龙模式标本缺乏牙齿，使得很难与本科其他属做区隔。最近，棘齿龙属在数个研究里，被认为属于畸齿龙科。羊毛龙在1975年以一个下颌而命名，但最近的发现显示羊毛龙（"Lanasaurus"）属于狼鼻龙，使得羊毛龙成为狼鼻龙属的次同物异名。滇中龙一度被认为是亚洲的畸齿龙科恐龙，但已经证实滇中龙化石是原蜥脚下目与中真鳄类化石的嵌合体。约瑟·波拿巴（Jose Bonaparte）一度将南美洲的皮萨诺龙归类于畸齿龙科，但皮萨诺龙现在被认为是更基础的鸟臀目恐龙。相较牠们的不确定种系发生学位置，畸齿龙科的内部物种是较