时大同孤零零地隔离于塞外，负责按察山西的官员无法按时抵达，于谦遂上疏另外设立御史管理，始为大同巡抚建制。此外，他还建议全部强取边疆官员私自开垦的田地为官屯，用其资助边防用度。他的威望惠德因此到处传播，太行一带的盗贼都纷纷避开藏匿。于谦任职九年后，正统十三年（1448年），升迁为兵部左侍郎，享受二品俸禄。英宗初期，三杨（杨士奇、杨荣、杨溥）主持朝政，很器重于谦。于谦所奏请的内容，上午呈报下午就获批复许可，此均为三杨所主持。而于谦每次到京师议事，均是空着口袋，各权贵因无法索贿而心生怨