966年文化大革命爆发后，罗青长一度受到冲击，被打成“黑孔（原中共中央调查部部长孔原）集团黑干将”遭到关押，后又被康生打成“反革命集团”。但由于罗青长的工作较为特殊，故罗青长受到周恩来的保护，其业务领导地位基本未中断。1952年起，罗青长兼任中央对台工作领导小组办公室主任，在总理周恩来的领导下长期负责对台湾工作。1975年9月4日，病中的周恩来见《参考消息》转载的《访蒋经国旧部蔡省三》一文，随即批示：“请罗青长、家栋对蔡省三的4篇评论的真实情况进行分析，最好找王昆仑、于右任的女婿屈武等人，弄清真相，以便