10多天后的4月8日，他在石川县穴水町的路上被逮捕，当时怀疑他正在偷窃放置在路上的自行车而以盗窃罪被捕。被捕初期，他拒不合作，在狱中进行绝食，还宣扬「警察和奥姆真理教的战争」。控方最初也因他曾犯有杀人、绑架、监禁等罪行而指控他为「杀人机器」，请求判处死刑。后来他全面交代犯罪事实，使地下铁沙林事件的具体经过得以公诸于众，还协助指证麻原彰晃。他本人也表示对自己的所作作为感到惭愧，令控方主动改为请求判处终身监禁。1998年5月，东京地裁判处他无期徒刑（其它4名与他一起执行地下铁沙林袭击任务的人都判处了死刑）。