6年3月发生的中山舰事件也引起了国民党排斥中国共产党的疑虑。1926年5月，中国国民党二届二中全会通过谭延闿、蒋介石等9人联名提出的排斥中国共产党的《整理党务案》，将赤色分子排挤出国民党中央领导机关，并打击国民党左派。该提案蒋介石事先取得了苏联顾问鲍罗廷的同意。中共中央和鲍罗廷一样采取了妥协态度。1926年7月，苏联支持下的广州国民政府派国民革命军从广州出师北伐。国民革命军总司令蒋介石到达江西南昌后，与从广州迁到武汉的武汉国民政府及国民党中央逐渐发生矛盾。苏联顾问鲍罗廷及武汉的国民党左派试图阻止手握