他升任集团军高炮旅旅长。
逐级晋升.1994年10月，王宁离开第十二集团军，来到福建的陆军第三十一集团军任职，先后担任防空旅旅长、集团军副参谋长、九十一师师长。此后，王宁的仕途进入了快车道。2003年12月，48岁的王宁升任上海警备区参谋长，跻身副军级干部行列。他在担任上海警备区参谋长期间，组织导演了“04-10”城市防空作战演习和“东方-2004”、“东方-2005”两次国防动员演习。曾4次被集团军评为军事训练先进个人，1次被南京军区评为军事训练先进个人。2005年，晋升为少将军