与纽约联合国总部抗议，并向日本法院提出控告小泉首相参拜违宪，并要求日本政府与靖国神社将台湾原住民从中除名。2005年9月30日，大坂高等法院二审宣判原告败诉但认定小泉首相违反日本宪法20条。2009年8月11日，率领台湾原住民「还我祖灵队」赴日本靖国神社。2009年8月20日，中共中央总书记胡锦涛接见高金素梅，称赞其为台湾原住民进行的斗争。胡锦涛会见时说：「台湾少数民族同胞是中华民族大家庭的重要成员，长期以来，为抵御外来侵略，捍卫民族尊严，进行了不屈不挠的斗争。」2016年6月14日，质询行政院