仿、乙酸乙酯和苯；常压下熔点156℃-157℃。青蒿素属于正交晶系，空间群D2-P222，晶胞参数a = 24Å b= 9.4Å c= 6.3Å。其红外光谱具有δ-内酯羰基的吸收（1745cm）和过氧键的吸收（831、881、1115cm）；其质谱具有质荷比为250的峰，对应的物种为分子脱去过氧桥后形成的分子离子。
化学性质.青蒿素是一种内酯，因而可以与盐酸羟胺发生反应，产物遇铁离子显色。虽然青蒿素含有过氧键，但相较于其他的过氧化物，青蒿素化学性质较为稳定，加热到熔点仍不分解。青蒿