质与肝糖等营养物质，目前尚不知兰花是否有机制刺激菌核的形成，以提升真菌对其的营养价值。兰菌根中，真菌进入兰花的机制又可细分为tolypophagy与ptyophagy两种，大多数兰菌根都属于前者，即菌丝形成卷曲状的菌丝团后再被分解，天麻属等少数绝对菌异营的植物则属后者，ptyophagy的兰菌根中，根部皮层细胞的外侧也会有菌丝团的形成，不过菌丝深入皮层内部时，在不形成菌丝团的情况下，菌丝顶端会被分解，其细胞质则喷出而被植物吸收。刚被菌丝入侵的兰花细胞通常有大颗的淀粉粒，而已有崩解的菌丝团的细胞则阙如