为"九龙内地段6421"〔K.I.L. 6421〕）建立校舍。在这期间，嘉林边道的校舍便告弃置，同学被安排至九龙邓镜波学校暂时上课。1955年12月9日，新建的学校启用，为表示与上海母校（上海圣芳济书院，即现在的上海北虹中学）的关系，便将学校命名为「圣芳济书院」。至今，学校正门的「九龙内地段6421」地界仍然被保留。而且部份教士仍然执教。
教育精神.修会特别注重教师能否体现修会教育的五大支柱，包括「天主的临在」（Presence）、「简朴卑微」（Simplicity）、「一家人