ys溪，流经德克萨斯医疗中心；白橡溪，流经Heights及靠近西北地区；Sims溪，流经休斯敦南部和休士顿下城，向东流入经人工扩宽挖深的休士顿船舶航道（Houston Ship Channel），然后注入盖维斯顿湾（Galveston Bay），直通往墨西哥湾。休斯敦市区很平，经常泛洪水。这个城市海拔仅50英尺（15公尺）。休士顿高地是全市最高的地方。城市曾经依赖地下水作为供水来源，但地层下陷的问题迫使休士顿转利用如休士顿湖之类的地面水源。
地质.休士顿的地质包含部分的缸瓦土，