民党、次世代之党等党派的推荐，再次参加知事选举，谋求连任。但却被翁长雄志击败，从而失去第三次连任的机会。
对沖绳县内美军基地问题的立场.仲井真弘多初当选知事时，对于驻沖绳县美军问题延续前任知事稻岭惠一的政策，反对日美政府提出将普天间飞行场迁移至县内名护市施瓦布军营的方案，但主张在当地居民可以接受的情况下容许将该基地移到冲绳县内新址。2008年2月11日发生驻沖绳美军涉嫌强姦当地一名14岁、就读初中三年级女学生的事件，仲井真弘多对事件表示「强烈愤慨」，但他指事件不会对沖绳普天间美军基地