亲印尼民兵部队，以及一些印度尼西亚的军人对东帝汶发起了报复性的暴力和恐怖袭击。大约1400名东帝汶人被杀，三十万人被迫以难民身份逃往印尼西帝汶。全东帝汶绝大多数的基础设施，包括住房、灌溉系统、供水系统、学校以及几乎所有的供电网络均被破坏。对此事件，诺姆·乔姆斯基描述到：“在短短一个月的军事行动中，近2000人被杀害，数百名妇女和孩童被强奸，四分之三的人口被迫流亡，75%的基础设施被摧毁。”
国际部队.葡萄牙、澳大利亚、美国和其他国家的积极分子不断向政府施压要求采取行动。最终美国总统