中心区域，位于鼓楼区，与南京市中心鼓楼广场相邻，汉口路将鼓楼校区划为南园、北园，南园是学生宿舍生活区，北园是教学科研区，面积近800亩。北园东边的部分是金陵大学旧址，2006年列为第六批全国重点文物保护单位。北园内金陵苑一带为中华传统风格建筑群，其中的北大楼已经成为南京大学的标志性建筑。由于鼓楼校区的空间局限，1993年启用了浦口校区。浦口校区位于长江北岸的浦口区，面积2800亩，背靠龙王山，面临南京高新技术开发区，和江南市中心的鼓楼校区相距18公里。由于交通不便等原因，当时曾经一直存在是否继续建设的争