1499年），敏政总裁会试，他对唐寅的文章大为赏识，但有传闻与唐寅一同赴考的江阴富人徐经贿其家童，得试题。程敏政与徐经、唐寅等一同下狱，李东阳复阅后发现程敏政称赞的卷子其实不是唐寅和徐经的。后来革职归乡，不久发痈卒，有史家认为是官场的权力斗争所致。后赠礼部尚书。
着作.其弟子李讯称之“一代人豪也。文翰虽其余事，而抱负之宏、造诣之邃，盖将于是乎征。如万言应事一策，敷匡时之大略；宋纪受终一考，订千古之大疑；续修宋、元鉴，谨严得《春秋》之大旨；附注《心经》，考合朱、陆之道，则又深探理学之