管理局营运（管理局同时还管理拉瓜地亚机场、zh-hans:纽瓦克自由国际机场; zh-hant:纽华克自由国际机场;等大纽约都会区的机场）。机场内有超过90间航空公司营运。甘迺迪国际机场是捷蓝航空的枢纽机场，也是美国航空和达美航空主要国际航班的枢纽机场。甘迺迪国际机场是美国航空第四个枢纽机场和达美航空第五个枢纽机场。过去，这机场是美国东方航空、国家航空、泛美航空和环球航空的枢纽机场。跑道13R-31L是北美地区第三长的商用跑道。一共有6个客运大楼。按照2018年客运吞吐量，该机场在全球最繁忙机场中排