后，随后由于日军沿长江一线步步紧逼，师生们徒步经贵州入滇。据昆明云师大本部（西南联大旧址）内的「国立西南联合大学纪念碑」记载：1946年5月4日举行结业典礼，7月31日宣布结束。最初，学校沿袭长沙临大建制，由清华大学校长梅贻琦、北京大学校长蒋梦麟和南开大学校长张伯苓组成常务委员会共同管理校务。1938年12月21日，第98次常委会决议，决定由三校校长轮任常务委员会主席，任期一年，本学年由清华校长梅贻琦担任。后因蒋梦麟、张伯苓均在重庆任职，只有梅贻琦长期留于昆明，故没有实施轮任制度，一直由梅贻琦任