入侵波兰的前一天，柯尼斯堡号于8月31日在波罗的海发现了波兰驱逐舰和。在敌对行动开始时，它和其它几艘德国巡洋舰在北海布设了一个防御雷区。然后它驶入波罗的海展开训练演习。于1939年6月至9月担任该舰的舰长。同年末，舰只在船体上安装了一副用于抵御磁性水雷的消磁线圈。柯尼斯堡号于1940年3月重返现役，当时它被分配至攻击挪威的入侵部队。
威悉演习行动.入侵挪威的行动于1940年4月初发起。柯尼斯堡号被分配至第3集群，并担负着将的600名士兵从威廉港运送至挪威卑尔根的任务。第3集群还包括