攻读博士期间，邓秀新攻克了柑橘原生质体培养及植株再生技术，使中国成为继以色列、日本之后，世界上第三个取得柑橘原生质体再生植株的国家。邓秀新还改进了培养及栽培方法，使再生植株需要的时间比以色列缩短了两个月，大大提高了成活率。该研究成果于1989年获中华人民共和国农业部科技进步一等奖。1987年，邓秀新毕业于华中农业大学，获得博士学位。1987年，邓秀新被派往美国佛罗里达大学柑橘研究及教育中心开展合作研究。在一年的合作研究中，他独立完成了“三倍体胚乳愈伤组织再生成植株并植入大田”等20多个柑橘属间、种间融合