椎穿刺获取脑嵴液，可以从中测出细胞的数量及脂肪与葡萄糖的份量。这些资料本身已经对诊断蛛网膜下腔出血及中枢神经系统的感染，如脑膜炎等，有所帮助。再者，脑嵴液的培植测试可以获得产生感染的微生物。若使用尖端的技术，如侦测寡克隆区，可以确定正在发炎的情况（如多发性硬化症）。β-2转铁蛋白的分析是高度独特及敏锐于侦测脑嵴液外漏。腰椎穿刺亦可以用作量度在某些脑水肿的种类下会增加的颅内压。