党外编辑作家联谊会的邱义仁、吴乃仁和洪奇昌等人理念契合，因此于民进党建党后加入新潮流系。2002年－2005年，李明宪代表民进党担任第五届立法委员。2002年11月10日，李明宪与民进党立法委员李镇楠合开记者会，质疑工人立法行动委员会（工委会）与劳动人权协会（劳权会）合办的秋斗有政治力介入；他们批评，秋斗游行，表面上是打着失业劳工的名号进行，不过仔细了解之后发现，背后竟然有以台北市市长马英九为首的台北市政府团队加上旧特务的军情势力，勾结统派的中华人民共和国国庆贵宾共同支持进行「国（中国国民党）共（中国共