多维科·扎科尼都是他的门客。1580年，查理二世将安达卢西亚的马带到斯洛文尼亚的利皮查以培养出新种的利比扎马。1585年，查理二世创立了以他命名的卡尔·弗朗岑斯大学。1590年，查理二世于格拉茨逝世。由其长子斐迪南继承爵位，斐迪南就是日后的神圣罗马帝国皇帝斐迪南二世（即奥地利大公斐迪南三世）。1619年奥地利全部领地在斐迪南三世的治下统一。
家庭.1571年，卡尔二世与巴伐利亚公爵阿尔布雷希特五世的女儿玛丽亚·安娜结婚，两人共有5子9女：