寿六十九岁，追赠都统。后来，嘉定城刑曹武瑜上疏声称阮文瑞生前滋扰百姓，刑部议罪，追降为五品衔，抄没家产。
评价和影响.《大南列传正编初集》称赞阮文瑞“追随羁靮，遂受知遇，复奔走上道，往来暹牢腊间，厥有功矣”。今天安江省辖有瑞山县，就是因境内有瑞山而得名。