全局出纳组组长期间，负责管理秘密情报活动「奉天」与「当阳」等的经费。他利用职务之便，侵吞了相关经费，金额估计为新台币1.9亿元，除了在台湾购置房地产与股票外，也汇至国外进行洗钱。2000年8月，刘冠军在世华银行开户，存入新台币970万元现金，引起法务部调查局洗钱防制中心的注意。经过调查，法务部调查局认为刘冠军的财产来源极为可疑，准备展开逮捕。9月3日，刘冠军利用情报管道潜逃出境。10月26日，《明日报》头版头条引用匿名消息来源，独家报导刘冠军已确定于9月3日持有效的「第三本护照」从中正国际机场出境，并称