湾朝野多名立法委员要求搭乘军舰到钓鱼台列屿海域进行保钓行动、考察并「宣示主权」，初时有消息指他们将乘纪德级驱逐舰出航，但国防部军事发言人池玉兰表示，海军正进行规划，为免日本误判形势，改派体形和火力较少的康定级巡防舰（拉法叶级）出航。日本首相福田康夫及美国国务院唿吁台湾与日本双方相互克制，最后刘兆玄表示搭乘军舰到钓鱼台列屿海域进行考察之行动取消，而与日本的渔权谈判将再召开。6月20日，日本政府正式为撞船事件道歉并承诺赔偿。12月，联合号船长与日本海上保安厅方面达成和解，海上保安厅将支付新台币一千零五十