本政策上制定推动的时程分为三阶段，第一阶段为1995年至1997年，第二阶段为1997年至2000年，第三阶段则从2000年开始；三阶段的目标分别是改善台湾经济体质、调整经济结构，并在2000年成为亚太营运中心后继续巩固这个地位。但由于之后的2000年中华民国总统选举和国际情势的变化，该计划的推动并未如预期中顺利。2000年陈水扁政府执政后，搁置亚太营运中心计画，改为推动建设台湾成为「绿色硅岛」，因此亚太营运中心计画在2000年后就不再是中华民国经济政策的主轴，但绿色硅岛关键的两兆双星政策最终并未获得成