1992年，该馆先后迁到劳动人民文化宫、景山服装厂、柏林寺藏经楼办公，其中1992年9月迁入柏林寺藏经楼办公至今。1993年，该馆文物库房迁到柏林寺藏经楼。2002年10月，该馆文物库房迁至六铺炕，这是一座新建的现代化文物库房。 2012年初，中共中央办公厅将党和国家领导人在外交活动中获赠的近万件国际礼品移交中国国家博物馆保管，国际友谊博物馆也被整体划归中国国家博物馆，国际友谊博物馆收藏的近2万件国际礼品移交中国国家博物馆收藏。2006年11月10日，中国国家博物馆主办的《异国瑰宝传友谊——中国国家