为军民共用港，于商港中拨用若干码头使用，其中苏澳港与马公港拥有较完整的军用港埠设施，形同商港内的附属军港。
渔港.台湾沿海各县市均有渔港设立，并依其规模分为第一类渔港、第二类渔港等两大类型，其中以基隆市八斗子渔港、宜兰县南方澳渔港、高雄市兴达渔港、台中市梧栖渔港为最大；其中，兴达渔港号称为东南亚最大远洋渔港，但由于各国实施经济海域管制措施，营运效果不如预期。
概况.渔港管理单位为农委会渔业署，渔港所在地渔会则为实际经营的机构。目前台湾地区共有第