二年（1424年）与李在、夏芷合作《归去来兮图》卷。正统十三年（1448年），广东爆发黄萧养、符南蛇起义，次年六月，义军围攻广州。两广总兵张安和都指挥使王清前来镇压，均被消灭。正统十四年（1449年）至景泰元年（1450年），马轼以天文生的身份随都督董兴征广东。由于黄萧养“聚舟千余艘，势甚炽”，董兴以征兵尚未齐集为由，请求等待，实质是犹豫观望，欲请朝廷增兵。这时，随行的天文生马轼建议，征调狼兵，速战速决，打败黄萧养，平定叛乱。马轼也因此由天文生提升为漏刻博士。漏刻博士为钦天监属官，从九品。明代宗即位