6月10日西北行营主任兼新疆省主席张治中释放了被盛世才关押的新疆中共人员，方子翼等人7月11日抵达延安。8月29日成立八路军总部航空队，任队长，严镇任指导员，9月20日经晋绥、太行、冀南、渤海、胶东、大连、北朝鲜，1947年1月底到达合江省东安的东北民主联军航空学校。任飞行一大队政委。1947年5月方子翼恢复飞行后，任飞行主任教员、飞行训练处科长。中华人民共和国成立后，1949年11月5日任位于济南的空军第5航空学校校长。1950年6月18日到南京任空军第四混成旅第11团团长，张百春任政委，下辖3个飞行