弃用比路法而改用数子法，推测其原因为明代市民文化发达，赌棋盛行，比路法需要保留死子容易作弊，而数子法结果全由终局盘面决定。另有还棋头的规则，即每块活棋要扣除一子，表明这仍为纯数子法规则。
日本规则的形成.按日本传统说法，围棋是遣唐使吉备真备带回日本的。但有记载显示更早的时代日本已有围棋。中国古代棋谱都是有座子的，而日本最古老的棋谱也有座子。但后来的大量日本古谱均不见座子。中国古棋是黑先白先都有，清初以后才约定俗成为白先；而日本古谱均为黑先。日本古棋与中国古棋最重大的区别是在计数