北派与小北派。朋党们不断攫取利益，导致朝廷风气败坏，而且朝政紊乱。例如党人在丁酉再乱前夕施加压力迫他罢黜抗倭名将李舜臣，只因为李舜臣与南人领袖柳成龙相善，导致朝鲜水军几乎全军覆没。宣祖二十五年（1592），日本丰臣秀吉发动了对朝鲜的侵略战争，史称万历朝鲜之役。此战中朝鲜军队一触即溃，宣祖逃往义州，甚至说出「与其死于贼手, 无宁死于父母之国」。最后依靠明军的援助才最终击退日军，朝鲜长期感念在心，称之为“再造”。朝鲜损失惨重，军队阵亡7万人以上；人口减少约200万，大多死于战火；战后的土地数量从战前的170