管江苏（含今日上海）、安徽和江西三省的军民政务。由于清初江苏和安徽两省辖地同属江南省，因为初时该总督管辖的是江南和江西的政务，因此号两江总督。两江总督厘治军民，查举官吏，修饬封疆，在当时全国所设总督中，唯一掌管三省，是管辖省份最多的总督，政治地位仅次于直隶总督。
总督部院.总督部院设在江宁城中部汉府街明代的汉王（成祖次子）府内。1853年－1864年洪秀全将这里扩建成金碧辉煌的天王府。1864年天王府被毁后，曾国藩在此按照礼制要求重建了两江总督部院。1909年南京城内穿城而过的宁