史.在令制国时代属于播磨国，最初属于神崎郡一部分，但后来被分割为神东郡及神西郡两郡。19世纪末江户时代结束之际，神东郡主要属于姬路藩，另有少部分地区为和幕府领地。随着1868年幕府的结束及接着实施的废藩置县政策，曾分别先后隶属兵库裁判所、兵库县、生野县、姬路县、鸟取县，1871年全数被整併到饰磨县内，1876年再次整併后属于兵库县。1879年实施，正式的设置了近代的行政区划「神东郡」，但是与神西郡共同设置「神东神西郡役所」，郡役所设于神西郡屋形村（位于现在的市川町），直到1896年两郡直接合併为神