查懋昌，字允言，直隶苏州府长洲县人，太医院籍，明朝政治人物。
生平.顺天府乡试第七十九名。嘉靖二十三年（1544年）登甲辰科进士。
家族.曾祖查文，府同知，赠中大夫布政使司右参政；祖父查恂，累赠中大夫布政使司右参政；父查应臣，训导。母陈氏；继母孙氏、雷氏。