在2009年签署了数项有关航空旅行和有关中小企业的协议。2011年2月，叙利亚－马来西亚商业理事会成立，该会旨在帮助发展两国之间的贸易来往，在该会成立一个月后，叙利亚内战爆发。
接收难民.2015年10月，时任马来西亚首相纳吉·阿都拉萨宣布将接收至少3,000名叙利亚难民在马来西亚定居，此举让马来西亚成为最早协助接收叙利亚难民的以穆斯林为主的国家之一。2015年12月11日，第一批叙利亚难民乘坐从土耳其伊斯坦布尔到吉隆坡国际机场的航班抵达吉隆坡。2016年5月，第二批68名叙利亚难