1399年），董伦等初修此书。靖难之役后，解缙等于永乐元年（1403年）奉旨重修，九年（1411年），在姚广孝和夏原吉监修之下，胡广等复修，至十六年（1418年）书成。该书原起元至正辛卯（1351年），讫洪武三十一年戊寅（1398年），首尾四十八年。万历时，在杨天民等人的请求下，附建文帝事迹于后。
争议.《明太祖实录》在建文帝时即有修改，燕王朱棣靖难之变登位后重修的《明太祖实录》，长久以来被后人认为隐去很多史实，其中一点就是朱棣的生母问题。实录中称朱棣乃马皇后所生，因而为明太祖