子，窦庠之弟。元和二年（807年）王源榜进士。袁滋镇守襄阳，特聘窦巩为掌书记，宝历元年（825年）入京拜侍御史，再转司勋员外郎、刑部郎中。与元稹深交，稹观察浙东时，奏为副使兼御史中丞，时有唱酬。大和四年（830年）正月，元稹移武昌军节度使，巩亦随至武昌。大和五年，元稹卒于任上，窦巩回长安，途中染疾，卒于私第。