肠桿菌的greA及greB可以促进RNA聚合酶噼开接近链末端RNA模板的能力。这可以夺回陷入了的聚合酶分子，并且可以校对RNA聚合酶偶然的错误。另一种辅助因子Mfd涉及在转录合併修复中，而其他辅助因子则都是负责调节作用，即帮助RNA聚合酶选择是否表现某些基因。
纯化.RNA聚合酶可以用以下方式纯化：