长懋的父亲萧赜生他时年龄还不到二十岁，他的祖父萧道成十分喜爱这名孙儿。萧长懋姿容丰润，小名叫做「白泽」。刘宋元徽末年，萧长懋跟随父亲萧赜待在郢州，萧赜回到盆城镇守拒挡沈攸之的反叛期间，便让萧长懋慰劳并接待将帅，并让他参与军旅的工作。朝廷任命萧长懋为秘书郎，他没去到任。后来又授他为辅国将军，迁任晋熙王刘燮的抚军主簿。沈攸之发起的叛乱平息后，萧赜便命他回到都城，由于萧道成当时正值创建霸业之际，因此对自己这名嫡孙特别留意，对萧长懋说：「你这一回来，我的事情也就办妥了。」之后安排他住在府第的东斋，让他和文武宾客