频频改道，被居民戏称是「青瞑蛇」。昭和十三年（1938年）堤防竣工之后，河道趋于固定。台南市常以曾文溪为分界，划分溪北、溪南地区。溪南地区似近都会区型态，以原台南省辖市为中心；溪北则较近农村，中心聚落为原台南县政府所在地－新营，在生活圈及文化上与嘉义都会区关系密切。曾文溪有丰富的水力资源，全台湾最大的水库曾文水库，即在曾文溪上游，此外，在曾文溪的支流上，尚有南化水库及乌山头水库等，除了供水发电之外，也都成为重要的观光景点。此外，由于曾文溪挟带砂石与生物碎屑在出海口沉积，提供了大量养分，因而蕴育了河口