这类佛学院主修巴利语系佛教；也有教导三乘教法的佛学院，如泰国国际佛教大学。藏地最有名的佛学院是色达县喇荣寺五明佛学院。汉地，大陆地区最有名的高级佛教学府是中国佛学院，一些名山名寺也都有佛学院，如普陀山佛学院；台湾地区佛教四大山头各有自己的佛学院，像佛光山丛林学院。另外，在全球其他地区也开设有很多佛学院，一大来源是当地的佛教僧团的办学事业，另一大来源是外来僧团在此办学，如宣化上人开万佛城，以及佛光山在美国、马来西亚、日本、菲律宾、非洲、澳洲、巴西等国家都设有学部，这类学校则教导三乘教法，不分高低，圆融教学。