抗日同盟军旗帜放下，1933年6月9日北平军分会代表涂思宗及徐思贤抵张家口，冯玉祥亲迎并请自图书馆由涂将军担任主席举行整编会议，商讨善后事宜后返鲁。8月7日，冯被迫宣布撤销抗日同盟军总部，辞去总司令职，于8月17日重返泰山。1933年11月20日，李济深等在福建组成中华共和国人民革命政府，冯派代表余心清参加，并被选为经济委员会主席，然后积极联络韩复榘、宋哲元唿应反蒋。中国抗日战争时任国防最高委员会常委，第三战区、第六战区司令长官，不久被蒋中正撤职。1946年4月7日赴美国考察水利，并发表反蒋言论。1