责管理维护，密苏里河，密西西比河均可通航，但主要的运输集中在密西西比河。圣路易斯的密西西比河岸全长19.3英里，港务局年吞吐量达3200万公吨，按吨公里计算是美国第二繁忙的内河港口，也是全美吞吐量第三大的内河港口。全市沿河共设有大小100多个停靠点可用于驳船装卸，并且有16个大型公共装卸场。此外，港务局亦装备数艘小艇用于救援任务。