派出机关，政策制定与人事任命权均由中央掌握；省议会则改制为省谘议会，成为谘询机关，失去原有立法机关的功能。至于原属省政府管辖的县、市等地方各级政府则改由中央政府直接管辖，并以内政部为主要监理机关，各县、市仅在行政区划上仍隶属于省。2018年，行政院院长赖清德进一步决议省级机关去任务化、预算归零，所存省级行政组织及业务完全移交中央政府。2018年7月1日，台湾省政府及省谘议会之行政组织及业务移交予国家发展委员会；2018年12月31日，福建省政府之行政组织及业务由行政院金马联合服务中心接收。至此中华民国政府实