这两座神社被视为其镇守社。明治时代以前，宇治神社被称为 "下社"、"若宫"，宇治上神社被称为 "上社"、"本宫"，两社合称“宇治离宫明神”、“宇治离宫八幡宫”。明治时代后，宇治神社从宇治上神社分离出来，1911年（明治44年）升格为府社。2018年（平成30年），第21号台风导致神社大鸟居从底部断裂并坍塌。2019 年12月25日，大鸟居重建完成并举行了竣工典礼。
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