域研究，前往潮州研究热带医学，并逐渐淡出组织活动。
身死马场町.1949年8月，光明报被缴获，光明报组织曝光多人遭到逮捕，省工委基隆工委案遭破获，当时国民政府实施土地改革以致地下党活动无法有效进行，1950年，中共在台组织高层蔡孝干变节供出大批人员名单，导致中国共产党在台组织瓦解，同年省工委台大法学院支部陆续遭破获，叶盛吉遭到成员供出，1950年5月29日在潮州热带医学研究所遭逮捕，1950年11月29日，台湾省保安处宣判死刑后即刻送台北市马场町枪决，同时遭枪决者包含共产党台湾地下