辛亥革命爆发，1912年1月1日（民国元年）孙中山在南京宣佈成立中华民国，出任临时大总统，以南京为中华民国首都。2月溥仪在北京宣佈退位，孙中山在南京辞去临时大总统一职，由袁世凯继任，为防止袁世凯阔权，孙中山颁布中华民国临时约法以为规范。同年，改江宁府为南京府。北洋军阀混战期间，南京曾为军阀孙传芳的大本营，成为号令华东诸省的中心，1926年冬，北伐的国民革命军击败孙传芳部队，取回南京。1927年（民国16年），中华民国奠都南京，同年置南京特别市。1929年（民国18年）6月1日，安葬孙中山于南京中山陵，置