招生不再由组织保送，一律参加全国统考。1962年6月18日，周恩来第二次视察学院。1962年6月，学院专业从64个调整为45个，同时修订了教学大纲，学制分为五年、六年两种。1962年12月，罗瑞卿在中央军委办公会议上向军事工程学院院长刘居英传达了叶剑英、陈毅、罗荣桓、刘伯承四位元帅对学院的指示。1963年9月1日，军事工程学院庆祝建院十周年，三总部领导张爱萍、李聚奎、徐立清来院参加庆祝活动。1964年2月21日，军事工程学院党委下达学习郭兴福教学法的指示，并且树立了军事工程学院学习郭兴福教学法的先进典型