，包含了最亲近有胚植物的亲戚。因为排除了有胚植物，轮藻门是个併系群（然而有时会限定成单纯只有轮藻目，其为单系群）。藻体构造较复杂，有类似根、茎、叶的分化，大小约为10－50厘米，外形很像金鱼藻；“茎”节上轮生侧“枝”，“枝”上具有“叶”的生殖器官；有性生殖为卵式生殖；卵囊生于“叶”腋中，通常呈卵形，外有5个螺旋状缠绕的管细胞，在顶端形成5个冠细胞，卵囊初为绿色，成熟时为深褐色；球形精子囊生于卵囊下面，外有8个盾形细胞，初为绿色，成熟后为橘红色。轮藻门中相对复杂的种类具有较为复杂的生殖结构：产生精子的