不过岛上同时保留原有生态，喜灵洲惩教所亦开辟花园供犯人种植和饲养从香港海关充公而来的走私动物，让岛上增加自然气息。同时，喜灵洲也因同时拥有几间戒毒所之故，变成香港一个知名的禁毒教育场地，不少学生透过「绿岛计划」来这里接收禁毒知识。2014年，港府在行政长官施政报告中提出发展东大屿都会方案，在喜灵洲避风塘位置填海最多200公顷。若方案落实，岛上的惩教设施或需迁移，将为岛上原有生态带来改变。