后，中央人民政府卫生部在小汤山镇成立卫生部小汤山疗养院，属国家级温泉疗养区。1958年，卫生部小汤山疗养院与解放军第一二三疗养院、解放军华北军区第一〇七疗养院、全国总工会小汤山温泉疗养院合并组建北京小汤山疗养院，由中国人民解放军总后勤部管理，属康复疗养院。1982年，更名为北京市康复中心，划归北京市卫生局管理。1985年，更名为北京市小汤山康复医院。1988年，增挂北京小汤山医院院牌。
设施.北京小汤山医院目前重点发展康复医疗，主要集中在中枢与周围神经损伤、骨与骨关节疾病、