有员工而言是糟糕的一天。秘书处死后被放入橡木棺材内并安葬于克莱伯恩农场，在其父亲勇者帝王之墓的附近。此外，传统上胜出赛事的竞赛马在死后只会埋葬牠们的头部、心脏及马蹄，而秘书处则获全尸埋葬，是一种罕见的荣誉。在秘书处离世后，负责进行尸体解剖的兽医是肯塔基大学首席病理学家托马斯·索威泽克（Thomas Swerczek），他在解剖时未为秘书处心脏进行称重，但表示：「我们都惊呆了，站在那里一动不动。我们无法相信，秘书处的心脏很完美，并未出现任何问题。这个心脏就犹如一个巨大的引擎」。后来，索威泽克为1993年去