汉末年，洛阳被董卓纵火烧毁后，汉献帝曾一度迁回长安城居住，曹操迎献帝于许昌后，长安成为留都，后成为曹魏与蜀汉的军事前线。诸葛亮北伐一直希望夺得长安，但长安一直由曹魏控制。西晋末年、前赵、前秦、后秦、西魏、北周等政权亦将首都设于长安城。十六国政权前赵、前秦、后秦在原长安城的东北部还建设了新宫，位置在今楼阁台一带。考古工作在宣平门北发现了东西两宫遗迹，每边长约1000米。而“讲武殿”则有可能是北周宫殿正武殿的遗迹。
废弃.长安在几百年使用后，年久失修。城中宫宇朽蠹，供水、排水严重不