学研究以粒线体DNA序列分析鸭科各物种的亲缘关系，发现在鸭属中，白脸针尾鸭是尖尾鸭、与黄嘴针尾鸭的姊妹群。
生态.白脸针尾鸭分布于加勒比海岛屿、加拉巴哥群岛与南美洲，通常栖息于咸淡水湖（盐度介于海水与淡水间的水域）、河口湿地与红树林沼泽中，在近水草丛中筑巢。全年均可繁殖，一年可产5至12颗蛋，小鸭孵出所需天数尚未确定，但被认为与尖尾鸭相似，为22至24天。孵化后45至60天小鸭长出飞羽。只有雌鸭参与孵蛋与照护幼鸭的工作。白脸针尾鸭的天敌甚多，除了被人类猎捕外，老鼠、狗、笑鸥、黄顶夜