内胚层（Endoderm）是胚胎中最内的一胚层。在绘图中，内胚层传统上用黄色表示。它会形成以下器官的表皮：
语源学.内胚层一词是源于："to enteron"（希腊语）＝肠，其实是“内”之意。"to derma"（希腊语）＝皮内胚层和植物的内皮容易混淆。