的最后一部电影版。本作以「捕获启动！拜託你了，神奇宝贝！」作为标语。
剧情简介.由杜勋顿所带领的海盗集团，在海中取得有「苍海的王子」之称的玛纳霏的蛋，企图用以不法之事。但随即被从中卧底的神奇宝贝保育家杰克·渥卡所夺走。之后，小智等人在旅途中因缺乏水源，而与一群为「水之民」后代的马戏团家族结识。当晚小遥梦见一座神殿。后经广美的解说，众人方知他们正在替杰克保管玛纳霏的蛋，而那神殿正是牠的故乡，名为亚克夏。随后，杜勋顿等人闻讯前来想把蛋抢回。在混乱之中，玛纳霏在小遥手中孵化了。大