通勤车流造成阻塞，国道三号的选线皆刻意避开部分人口稠密的都会区并经过许多原本低度开发的乡村地带。国道三号从北部开始分别在汐止系统交流道（新北市汐止区）、新竹系统交流道（新竹县宝山乡）与彰化系统交流道（彰化县彰化市）与国道一号（中山高速公路）交会，其中汐止到新竹的路段是行走较内陆的山区乡镇，新竹到彰化则是经由滨海地区，彰化以南的路段都是沿山区行走，直到南端的林边为止都採取与中山高平行的路线；相对于原本中山高较为直线的规划，国道三号因适应地形与避开人口已非常密集的市镇，路线迂回较明显，沿途大量使用高架桥与隧