、低血糖和低血钾
抗药性.疟疾的抗药性在21世纪是一个日益严重的问题。目前已知所有的抗疟药都已经出现抗药性，抗药性品系的治疗相当依赖联合疗法，但青蒿素的价格使得开发中国家根本无力负担，且目前已知最有效的青蒿素联合疗法也在柬埔寨和泰国的边界地区出现了抗药性品系，使得此种疟疾难以治疗。使用青蒿素单一药物的疗法30多年来，疟原虫长期暴露于此药物，加上许多患者使用了低于标准的剂量，导致抗药性品系的出现，目前在柬埔寨、缅甸、泰国、越南、寮国都有发现抗青蒿素的品系。
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