儿子北畠显家任左近卫中将。后醍醐天皇把次子世良亲王托付给北畠亲房教导。然而元德二年（1330年）9月17日，世良亲王突然病逝，北畠亲房因此引咎出家，法号宗玄。元弘2年（1332年）准大臣宣下。元弘三年（1333年），镰仓幕府灭亡，六月，后醍醐天皇回到京都，任命北畠显家为陆奥守，辅佐义良亲王镇守东北地区，亲房也去了陆奥。足利尊氏发动叛乱，南北朝开始，亲房提出“东国经营”，延元三年（北朝历应元年，1338年）前往关东地区，北畠亲房转战关东各地。兴国四年（北朝康永元年，1342年），北畠亲房被迫回归吉野，跟随