日本二十六圣人是1597年2月5日（庆长2年12月19日）丰臣秀吉下令在长崎处决26名天主教徒，此事件后来被称作「二十六人的殉教」，这4位西班牙籍传教士、1位墨西哥籍（当时称为「新西班牙」）修士、1位葡萄牙籍修士、20位日本籍信徒（含3名未成年者）被追封为圣人，遂以「日本二十六圣人」称之。
事件始末.十六世纪末叶相继发生信奉天主教的吉利支丹大名与吉利支丹烧燬本地寺庙和神社并迫害僧侣的事件；相对的，各地信奉佛教或神道的大名迫害吉利支丹的事情也时有所闻。此外，葡萄牙商人将日本人当作奴隶