物叫“生物修复剂”（bioremediators）。然而并不是所有的污染物都能用微生物的生物修复来简单处理。例如像镉和铅这样的重金属就不能轻易地被微生物吸收或捕获。但是最近有实验指出鱼骨能一定程度地从污染土壤中吸收到铅。科学家已经证实了骨炭能对小量的镉、铜、铅和锌进行生物修复。而最近的一个批量实验指出海洋微海藻可用于移除制革厂污水中的污染物（硝酸盐、硅酸盐、铬和硫化物）。食物链若有着像汞这样的金属同化可能会让整个系统变壤。在这种情况下使用植物修复是有用的，因为自然植物或转基因植物能够把这些毒素透过生物累