来死于狱中，庄廷鑨被掘墓开棺焚骨。1663年凡作序者、校阅者及刻书、卖书、藏书者均被处死。先后因此狱牵连被杀者共七十余人，被充军边疆者达几百人。康熙自14岁亲政后发生过一宗文字狱案件，即康熙末年的“南山集案”。
南山集案.方孝标曾到云南入吴三桂幕府为官，后来及早投降清朝免死，着有《滇黔纪闻》等书。戴南山见其书，在所着《南山集》中加以引用，结果被仇家御史赵申乔告发认为其着作中有“大逆”语。其实着作中并无真正诋毁清朝的“大逆”之语，只是方书说到南明永历政权未可称为伪朝，戴书提到南明