政府因该校学生参加革命活动而下令取消该校官费制，并增设初中部。1925年6月，专科第二班毕业，此后仅有合并中学一班，因经费困难未招新生。1927年6月，中学四班毕业，专门预科因经费困难无法开办，学校完全停顿两年。自学校创办后至1928年前，李大钊、赵世炎、邓中夏、韩麟符、李渤海等中国共产党领导人曾来校任教并开展革命活动，培养出第一批少数民族中共党员，建立了第一个少数民族党支部，编辑了第一本少数民族革命刊物《蒙古农民》。学生中有后来的中华人民共和国副主席乌兰夫、诗人郭小川、传记文学家巴彦布、国家民委副主任