个月之后，中国同盟会正式成立，胡毅生担任第一任广东省籍中国同盟会会员的主盟人。
多次起义.1907年，胡毅生与朱执信联络陆军速成学堂、讲武堂、学兵营中的革命人士，并且亲自先后参加了钦廉上思起义、镇南关起义。起义失败后。胡毅生撤往越南避居。1908年，胡毅生潜回广东，与朱执信共同深入到乡镇设立会社，结交并联络各地民军首领。胡毅生表面上担任广东陆军小学堂教习，但秘密从事革命活动。后来胡毅生遭到告发，避往香港。此后，他不时在广州、香港之间穿梭，和赵声、倪映典、朱执信等人共同策动新军，