。2016年1月2日，时任政务司司长林郑月娥表示已展开调查。
网站被入侵.2016年1月3日，国际黑客组织匿名者（英语：Anonymous）香港平台「Anonymous HkG」于其Facebook专页表示，铜锣湾书店网站发生PHP执行错误。经分析相信已被人入侵修改过，唿吁网民切勿到网站使用网上购买功能，以免个人资料被第三方窃取。
书店被清空.2016年3月4日，《苹果日报》记者发现，失踪的书店总经理李波回港当日，店内的政治书籍也被清空，地面饰柜内的书版亦