中国国民党方面的警务处严密监视。1947年10月末，方未艾夫妇离开新疆赴甘肃省，以经商为生。1949年初，包尔汉任新疆省政府主席，派人到兰州找方未艾回新疆工作，被方未艾谢绝。包尔汉的熟人傅希若、文成章、聂福利等人应邀去新疆，都被委以要职。1949年兰州战役后，经中国人民解放军第一野战军政治部主任甘泗淇和第二兵团司令部宣传部长胡友之介绍，方未艾出任甘肃省文联副主席，兼甘肃省中苏友协社会服务部长。后在兰州大学任俄语系教授，并当选为甘肃省、兰州市人民代表。同年，他在兰州结识彭德怀。1950年10月，在西安参加