子与反密码子没有正确配对时，eIF1可以抑制GTP的水解，当密码子的识别完成后，eIF1的抑制作用被减弱，并且实验发现eIF1的抑制作用的减弱需要精确的AUG的配对，而其它例如UUG或CAA的识别并没有类似功能。
结构.eIF1结构属于α+β型折叠，包含了一个由5个β链组成的β折叠片和两个α螺旋组成的结构域，其N末端为一段较长的无结构区域。eIF1被发现能够以不同的蛋白质表面与40S核糖体亚基以及eIF2、eIF3和eIF5结合。