溴化作用发生在甲基和甲基的邻位碳-氢上，生成4-甲基-2-氨基-5-溴嘧啶和4-溴甲基-2-氨基-5-溴嘧啶。以溴代物为底物，可以合成一系列的取代嘧啶。如果要让溴化作用只发生在甲基上，那么可以将氨基进行保护，然后反应。例如，2-氨基-4-甲基嘧啶和乙酸酐反应，氨基转化为乙酰胺基，再于NBS于四氯化碳中回流，甲基上的氢被溴取代，此时进行脱保护即得4-溴甲基-2-氨基吡啶。如果需要进一步反应，也可在反应中脱保护，如和2,7-二萘酚在碳酸钾、碘化钾的作用下，于丙酮中回流，可得到2,7-二(2-氨基嘧啶-4-基