他来华后便成立了天主教中华全国教务协进会，通过该机构行使权力。在第二次国共内战的形势下，黎培里多次发出命令及指示，要求中国天主教徒执行圣职部的反共命令。因为反共立场一致，黎培里和中国国民党的国民政府（1948年行宪后改为中华民国政府）“颇能相得”。天主教南京总教区总主教于斌在第二次国共内战中积极支持蒋介石政府，甚至因此被中共方面列为内战战争罪犯；日后，教宗庇护十二世曾抱怨于斌“同蒋政权走得太近”。1948年3月8日，教宗庇护十二世发布通谕称：在中国共产党统治下的中国地区，司铎可暂时不守教会的除独身主义以