重头痛、低血糖，以及肾衰竭造成的血红蛋白尿。其併发症包括自发性出血、凝血功能障碍和休克。可能会造成死胎、流产和胎儿体重过轻，这些症状特别常见于恶性疟患者，但也发生于部分间日疟病例。
病因.疟疾的致病原是疟原虫，一种胞内寄生的单细胞生物，属于顶复门疟原虫属。它们以疟蚊作为中间宿主，透过雌蚊叮咬来传播病原体。疟原虫可以感染大部分的嵴椎动物，这使得得生物学家可以通过建立生物模型（例如用老鼠做疟疾病理研究）来研究疟疾。
种类.疟原虫属中目前确认能感染人类的有五种：