吖啶橙呈橙色，粉末状。溶于水、乙醇。溶液为橙黄色带绿色荧光。pH值为8.4～10.4则无荧光。能镶嵌于两个相邻的碱基对之间，使部分双螺旋DNA松开，该两个碱基对的距离拉大一倍。这样的DNA复制过程中，会使DNA链增加或缺失一个碱基，造成移码突变。
定义.可与核酸亲和的荧光活体染料。荧光显微镜下核呈绿色，细胞质呈黄色。
主要用途.用作荧光指示剂，肿瘤细胞及细菌、核酸染色剂及移码突变的诱变剂。吖啶橙是一种荧光色素，吖啶橙激发滤光片波长488nm。阻断滤光片波