校计划中，方润华小学所设计之理念、课程、配套及支援均备受赞赏，因此最终获得办学权。由于同时得到方润华先生捐赠100万元，故此学校沿用中华基督教会方润华小学之名。办学团体为中华基督教会香港区会。该小学原于1993年在现址创校，取代于1966年成立、位于观塘秀茂坪下邨第17A座、与第16座相连的（1992年重建，其主要安置屋邨为天耀邨）中华基督教会基秀小学。其后因为收生人数不足而被「杀校」，于2012年9月停办，变成空置校舍。然而，随着元朗区跨境学童需求增加，校舍于2015年「复活」，由原办学团体以原有