光反应的电子传递链有关。质体醌被还原（得到叶绿体基质中的两个质子（H），并与来自光系统 II的两个电子（e）相结合），形成质体酚。它承载质子进入类囊体盘腔，电子于此通过电子传递链进入细胞色素"b""f"蛋白质复合体。前缀"plasto-"意为质体或叶绿体，反映了其在细胞中的位置。它的结构为一个2,3-二甲基-1,4-苯醌分子，侧链有9个异戊二烯基单元。
衍生物.一些设计可以穿透细胞膜的衍生物（SkQ1：质体醌基癸基三苯基鏻，SkQR1：含有罗丹明的SkQ1类似物，SkQ3）