对外易货委员会、禁烟督察处均改隶财政部；军事委员会水陆运输联合办事处改隶交通部;军事委员会不设副委员长，增设参谋总长一人为委员长的幕僚长、副参谋总长二人辅助参谋总长；增设军事委员会政治部。1939年1月，中国国民党五届五中全会决议国防会议改组为国防最高委员会，以统一党政军之指挥，由中国国民党总裁蒋中正出任委员长；军事委员会的国家总动员设计委员会改隶国防最高委员会；军事委员会添设战地党政委员会；军事委员会为国防最高委员会的下级机关，但国防最高委员会的主要工作为代行国民党中央政治会议的职权，对于狭义的国防并