初，英格兰国王查尔斯二世开始采取措施重组新英格兰殖民地。查尔斯打算精简各殖民地的管理机构，将殖民地集中管理，但由于清教徒统治者拒绝遵从国王指令在殖民地内改革，马萨诸塞湾殖民地的特许状于1684年遭到撤销。1685年查尔斯二世去世后，继位的罗马天主教徒詹姆斯二世继承兄长的遗志，最终建立了新英格兰自治领。1686年，纽约前任总督埃德蒙·安德罗斯爵士获命成为自治领总督。该自治领包括马萨诸塞湾殖民地、普利茅斯殖民地、康涅狄格殖民地、新罕布什尔省和罗德岛殖民地及普罗维登斯庄园。1688年，自治领的管辖范围扩张到纽