关系。相反，一些非致病微生物群可以通过它们产生的代谢物如三甲胺损害人类宿主。某些微生物群执行已知对人类宿主有用的任务; 大多数常居微生物的作用还不太清楚。 那些预期存在，并且在正常情况下不引起疾病的，有时被认为是“正常菌群”或“正常微生物群”。人类微生物组计划开展了人类微生物群基因组测序项目，特别关注通常栖息在皮肤，口腔，鼻子，消化道和阴道的微生物群落。在2012年发布了初步结果时它达到了一个里程碑结果。
研究.阐明人类微生物组的问题基本上是鉴定包括细菌，真核生物和病毒的微生物