2005年，丹尼·格林进入北卡罗来纳大学教堂山分校，并代表北卡罗来纳大学教堂山分校柏油脚跟队参加比赛。在大一赛季中，作为一名优秀的第六人，格林主要以替补球员身分出场。之后他在大二赛季场均能取得5.2分和2.8篮板，但时任体育教师的父亲因卷入一桩严重的毒品案件而遭受了牢狱之灾。格林承受着巨大的压力，且几乎退队，他也认真考虑过转学的问题，但最终在球队教练罗伊·威廉斯（Roy Williams）的苦劝下留了下来。格林在接下来的两个赛季中逐渐改善他的缺点，表现亦持续进步。格林在大三赛季场均出场22.3分钟，