恩拒绝了金莺、克里夫兰印地安人与纽约洋基等队，接受由多伦多蓝鸟开出的5年4700万的合约。这也超越了马里安诺·李维拉在2001年到2004年的4年4000万合约，成为当时大联盟后援投手的最大合约。2006年7月3日，莱恩二度入选明星赛。7月10日在匹兹堡所举行的明星赛，他在第八局上场，未失分，并为美联获得了胜利。那年球季他获得了生涯新高的38次救援成功，仅次于洛杉矶安那罕天使的法兰西斯科·罗德里奎兹、芝加哥白袜的巴比·强斯两人。2007年5月10日，多伦多蓝鸟宣布莱恩将因Tommy John韧带重建