清朝採行锁国政策，台湾本来与日荷西英等外国的频繁贸易，也相同中断，而此阶段台湾所有贸易均来自国内各省。十九世纪中叶，中国国力日衰，锁国政策遭到西方列强挑战。多次战败后，中国签订多款通商条约。而与台湾有关的有：1858年之「天津条约」；规定台湾开放淡水及安平港为通商口岸、1863年，鸡笼（今基隆）正式开港、1864年：打狗（今高雄）正式开港。这些外交条约除了规范通商口岸开设相关事务外，也设置了如打狗领事馆等驻台外交机构，也出现洋行、帮办。1867年，美国驻厦门领事李仙得与平埔族族长卓杞笃缔结《灾难救助条约》，