仲英部的首战中，归化军被击败，死伤惨重，后有大量装备支援到达后，马仲英部被归化军在头屯河战役中败退。在此次战役中阵亡的79名归化军官兵现在葬于乌鲁木齐市东山生态园并立有苏军无名战士纪念碑。“归化军总指挥部”成立后，总指挥别克迭耶夫率兵追击马仲英，二月攻克昌吉，三月六日攻克达坂城，三月八日进入吐鲁番。并在焉耆、库车、阿克苏地区一直战胜溃兵，五月上旬在巴楚决战中再次击败马仲英部，马仲英逃往喀什，归化军等部追击至喀什时，马仲英逃亡苏联，其部由马虎山率领撤退至和阗，归化军追至和阗后盛世才认为马仲英余部已无威胁停止继