吴祖椿，四川省成都府华阳县人，清朝政治人物、进士出身。光绪三年（1877年），参加丁丑科殿试，登进士二甲第27名。同年五月，改翰林院庶吉士。光绪六年四月，散馆后，授翰林院编修。