国人民解放军第二军医大学、南方医科大学等多所高校的临床教学医院。该医院7次被中国人民解放军总后勤部评为“全军为部队服务先进医院”。中国人民解放军海军总医院先后完成了海河、淮河、黄河抗洪救灾，邢台、唐山、汶川抗震救灾，抗击非典、抵御禽流感，赴柬埔寨、菲律宾开展人道主义救援，及护航行动、联合军演、“和谐使命”系列医疗服务等任务。该医院先后出现了“党的好女儿”冯理达，全国道德模范及南丁格尔奖获得者王文珍、全国抗震救灾英雄集体等先进模范。2000年，中国第一个脑外科手术的医用机器人研制成功，在海军总医院成功