福建漳州和江西建昌，旋被召回京师（南京），以“不能匡正建文帝”为由废为庶人，并囚禁于凤阳，只留下年幼的朱允熙给朱标奉祀，而不久之后朱允熙也于永乐四年死于火灾。溥洽是建文帝主录僧，当时传闻他知道建文帝出逃的事，朱棣遂以其它罪名囚禁溥洽长达十余年，直到姚广孝病危时请求朱棣释放溥洽，溥洽才获释。明成祖即位后，不承认建文帝的正统性，下令销毁建文朝史料，并先后三次修改明太祖实录。成祖还下令作《奉天靖难记》，对懿文太子及建文帝多加诋毁。正统五年，有僧自云南至广西，诡称建文皇帝。随后被逮捕调查，乃是钧州人杨行