起前往葡萄牙，之后大部分生命都在这里度过，再也没有返回巴西。巴西政府以玛丽亚·阿梅利亚不是在该国出生为由拒绝认可她的帝国皇室身份，但她的哥哥佩德罗二世1840年宣告成年后插手干预，成功为妹妹取得政界认可。1852年初，玛丽亚·阿梅利亚同奥地利大公马克西米利安订婚，但却在成婚前感染肺结核，被送到葡萄牙马德拉岛小镇丰沙尔。虽然当地以气候有利于健康闻名，但公主的健康状况持续恶化，于1853年2月4日去世，遗体送回葡萄牙本土并葬在布拉干萨先贤祠，近130年后，她的遗骨又回归巴西。她的母亲为纪念女儿而出资在丰沙尔