肛门癌（anal cancer）是在的癌症，是位在消化道远端开口处的癌症。肛门癌和更常见的大肠癌是不同的病症。肛门癌一般是在鳞柱交界区附近的肛门鳞状细胞癌，多半和人类乳突病毒感染有关。肛门癌可能是角质化，也可能是非 角质化。其他种类的肛门癌有、淋巴瘤、肉瘤或黑色素瘤。从2004至2010年的资料来看，美国肛门癌的相对五年存活率为65.5%，不过仍和诊断时的癌症情形以及治疗后的反应有关。