神鬼认证：神鬼疑云》基本上收到大多正面的评价，全球票房288,500,217美元，唯一小有争议的便是导演保罗·葛林葛瑞斯独有的手摇式摄影运镜风格，这种风格导致难以看清楚动作戏中的动作，而这一个小争议也延续至了本片的续集《神鬼认证：最后通牒》。本片在烂番茄拥有81%的新鲜度，IMDb则有7.8的分数，基本上都是相当不错的评价。
与小说不同之处.《神鬼认证：神鬼疑云》与原着小说有许多差别，剧情也是从此集逐渐偏离原着小说，但是主线上的概念则是与小说大同小异，仍然与前做秉持着尊重原着的