::::退休和去世.从1689年5到7月，以及1690年6月，皮普斯两次被怀疑是詹姆士党而被捕入狱。不过指控后来都没有成立。被释后，他从公众生活中退休，时年57岁。十年后的1701年，他搬离伦敦，住到一个朋友威廉·休尔（William Hewer）在克拉珀姆的家里。威廉在海军部时是皮普斯的下属。克拉珀姆当时尚属郊区，不过已经是大伦敦的一部分。皮普斯在那里一直住到1703年去世。他没有子嗣，把自己的产业留给了外甥约翰·杰克逊，他的朋友休尔是执行人。
外部链接.在线的皮普斯日记：