统领其中的一军。五年二月，淳于琼与郭图、颜良等领兵攻东郡太守刘延于白马，颜良阵亡后，大军撤回官渡，并于当地屯驻下来。冬十月，袁绍遣车运送军需，使淳于琼等五人率领兵员万余人负责护送，淳于琼等军营在乌巢，距离袁绍的大营四十里。当军势陷入胶着时，袁绍的谋臣许攸因故叛投曹操，曹操用其计，领虎豹营五千人夜袭乌巢。淳于琼一开始认为曹军数量少，出阵迎战，但曹操勐烈进攻，使淳于琼退入营地。袁绍闻讯遣兵救援，但最后无法解困，淳于琼的军营为曹军所破，谷物全为曹兵所燬。淳于琼帐下督将眭元进、骑督韩莒子、吕威璜、赵叡等都在营区