生数个褪绿或淡黄色小点，随着病原菌的发展逐渐扩大，并产生橘黄色的夏孢子堆，后期病斑常会互相癒合且开始转变为褐化之病斑，并造成叶片提早落叶。咖啡驼孢锈菌的菌丝呈棍状，尖端带有许多侧生短柄(pedicels)，并在短柄上产生丛生的夏孢子，带有夏孢子堆的菌丝体呈橙黄色粉末状。夏孢子略呈肾形，具半边刺，在且仅在凸起面上有许多小刺，夏孢子大小约26–40×18-28 µm，具有透明至浅黄色的透明细胞壁，厚度约1–2 µm。冬孢子堆(Telia)呈浅黄色，冬孢子略呈球形，直径26–40×20–30 µm，细胞壁呈透