以及后来的内部动荡，原尼西亚帝国时期的安纳托利亚西部后来逐渐被突厥人侵占。1282年米海尔八世去世后，随着帝国军事实力下降，突厥人逐渐从劫掠者变成了永久移民，并且在新占领的原拜占庭领土上建立了许多当时仍从属于罗姆苏丹的安纳托利亚侯国。即使后来的皇帝安德洛尼卡二世采取了一些努力试图阻止突厥人对帝国仅存的安纳托利亚领地的进一步侵蚀，但由于帝国陷入两安德洛尼卡内战等原因，他没有成功。到了1300年时，原尼西亚时期的所有安纳托利亚领土几乎完全被突厥人侵占，仅剩黑海海峡对岸一块狭长的领地的几个大城市仍在帝国掌控之下。