宾夕法尼亚大学任教。之后琼斯被聘任为加州大学伯克利分校数学教授。琼斯在扭结多项式上的研究成果现被称为琼斯多项式。但这项研究源自于一个从未有人预料到的来自冯·诺依曼代数的分析学分支，这个分支之前被大多数人认为在阿兰·科纳的研究下已被完善。琼斯多项式为扭结理论的数个经典问题以及一些低维拓扑学问题都提供了答案。2011年开始琼斯在范德堡大学担任数学教授。 此外他还在他从1985年就开始任教的加州大学伯克利分校保留着退休教授的名号。 琼斯还是新西兰奥克兰大学的知名校友教授。琼斯还于1992年被选为世界扭