，而且我们不会走错误的一步。因此我们不愿意配合当前动作。」9月10日，孙正式就任。9月13日，广州军政府对德宣战。蒋介石撰上对北洋军作战计划及滇粤两军对于闽浙单独作战之计划。孙号召国会议员南下，召开国会非常会议，展开护法运动（亦称“三次革命”），誓师北伐。由于南方军阀本无诚意护法，故不久即酝酿议和。但广州护法政府逐渐由旧桂、滇系军人控制，孙实力有限，甚至「政令不出士敏土厂（大元帅府）」。孙曾尝试发动兵变而未果。1918年5月，军政府改组，实权掌握在军阀手中。军政府以七总裁取代大元帅，领导南方与西南各省。