攻邪说、李东垣的脾胃说、朱震亨的养阴说。刘主寒凉，张主攻下（汗、吐、下三法），李主补土（补脾），朱主养阴，大大丰富了中医理论。朱丹溪提出「阳常有zh-cn:余; zh-hk:余; zh-sg:余; zh-tw:余;，阴常不足」之论点，其论点后由张介宾所发挥。元代时西亚、中亚医生来华方便，加上政府重视，伊斯兰医学在中国影响大增，被称为「回医」。
明清时期.李时珍（1518？—1593）发现古代医药典籍中多有谬误之处，毕生之力有系统地总结了明代以前的所有药物特性，将所收集的