水河与基隆河氾滥问题。1954年，奉调为陆军总司令，并兼台湾防卫总司令。取代孙立人。1957年7月，黄杰奉调总统府参军长。1958年8月，奉调为台湾警备总司令。1960年7月，奉命晋任为陆军一级上将。1962年12月，黄杰奉命调任台湾省政府主席，至1969年7月离职，在任时间，达6年7个月。黄杰在省府服务，时间较长，重要施政颇多，比较显着有：办理治山与防洪、实施九年国民教育、筹建曾文水库、推行社区发展、开辟高雄第二港口、策定台中新港、修筑东部产业道路、兴建澎湖跨海大桥、兴建南部横贯公路等