建为跨站式站房、以及在车站周边进行工程，整个规划名为「村上站周边城市规划」。在2015年（平成27年）3月25日有了一个基本构想。该计划预计需时10年，而今后的工程和计划法等有待继续讨论和研究。
中性区.在此站至间岛站之间设有中性区。因此羽越本线直流电动列车最北只能到达此站。特急「稻穗」、货物列车、临时快速「」（使用柴油混合动力车辆），以上使用才可直通至以北地区。而没有一般型交直流电动列车。因此，此站前往鼠关、酒田方向的普通列车只能够使用柴油列车运行。在车辆运用方面，从新发田方