三保车站的特定地方交通线——清水港线（原东海道本线货物支线）存在。除此之外，在2002年之前清水车站的站区内也曾设置有隶属于日本货物铁道（JR货物）的货运车站，在废站之前主要都是作为车携货运（）的收发点用途。距离清水车站最近的铁路车站，是静冈铁道静冈清水线的终点站、新清水车站。两站间约有10分钟左右的徒步距离，如搭乘接驳公车则仅需3分钟即可到达。1926年到1964年之间，在清水车站与隔邻的兴津车站间、距离清水2.3公里处，曾存在一个只有在夏天期间配合海水浴场的开放才会营业的临时车站、袖师车站。不过