圣经》前四章中引用的神灵干预和奇迹干预的部分删除了，从而产生了该着作。在杰斐逊的圣经中，没有记载福音故事的开始和结束。没有关于天使的报喜，出生于处女或天使出现在牧羊人面前的故事，甚至没有提到复活。 以色列希伯来大学历史系教授尤瓦尔·赫拉利在其名着《未来简史》第3章人类的特殊之处“生命的等式”一节指出， 但在过去几个世纪里，科学家并没有找到任何实证证据证明神的存在，反而对闪电、下雨和生命的起源有了更详细的解释。因此，现在除了几个哲学子领域之外，在经过同行评议的科学期刊上，已经不会出现真心相信神存在的文章。