，民政部（原民政局）被废除，军事部份也改由直属日本内阁的台湾军司令官负责。一般而言，台湾总督府的行政组织分为直属部局、所辖官署与地方行政三大部门。不管1896年发布的《六三法》及后来1906年《三一法》或1921年《法三号》，台湾日治时期的地方政体皆採委任立法制度，总督府为当然之中央机关。而一般政策形成过程，通常是由总督府的技术官僚制定法律政策后，即授权台湾总督以「总督府令」命总督府各级单位、所辖官署或地方政府执行政策。也因此，总督府辖下机关、尤其是地方行政机关的政策实行深具人治色彩，所有行政官员皆只以执行