。元帝下诏回复他父亲的名誉，嗣爵建昌伯。任中书郎、黄门侍郎。会稽王司马昱辅政，召高崧为抚军司马。当时征西大将军桓温北伐，军队进驻武昌，司马昱对他猜忌。高崧为司马昱起草书信致桓温，阻止北伐，劝桓温还镇。高崧担任骑都尉，转任谢尚属下镇西长史。累进侍中，晋哀帝信方士之言，断谷饵药求长生，高崧力谏不听，哀帝中毒而亡。高崧后因公事免官。366年（太和元年）八月廿二日，于家中去世。
家庭.
妻.会稽谢氏（？ - 355年12月7日）
子.高耆（散