仲孚对地方吏民说：「贼军虽然精锐地乘胜追击，但他们其实是乌合之众，容易离散。现在若果收起船舰，凿开长岗埭，让洪水阻挡他们的路径，留下数天，官军一定来到，则大事会成功了。」王敬则军队来到，正值河流干涸，果然停留不能前进，最终败亡。朝廷以丘仲孚拒守有功，迁职山阴县令，任内得到赞许，百姓为他作下歌谣：「二傅沈刘，不如一丘。」说明之前傅琰、傅翙父子、沈宪、刘玄明相继担任山阴县令，都有政绩，但丘仲孚政绩超过他们。南齐末年政治混乱，丘仲孚贪赃纳贿被告发，将被收入监牢，不过他逃脱，前往京师，适逢朝廷大赦，因此不被治罪