1976年获得正式命名前，该陨坑被称为卫星坑"邦普朗环形山 E"(所谓的"卫星坑标记法"：以所靠近的主坑名+字母来命名)。柯伊伯陨石坑东南(月面坐标)是1964年7月31日徘徊者7号探测器的坠落点， 它是美国首艘拍摄到月球表面照片的空间探测器，杰拉德·柯伊伯曾是徘徊者计划项目科学家之一。在1973年他去世后，该陨石坑被以他的名字命名。