述模型均假定繁殖是随机过程，也即对每个个体等概率。自然条件下，繁殖并非完全随机。例如在一些动物种群中，少数占支配地位的雄性可以与所有雌性交配，其他地位较低的雄性没有交配的机会。从漂变的角度来看，这一种群大致等效于一个更小的理想种群。除此之外，近亲繁殖、生命周期、遗传连锁等因素也会对产生后代的随机性造成影响，这就需要用有效种群大小来代替实际种群大小。在同一种群内，不同基因对应的有效种群大小也可能略有不同。对任一实际种群，有效种群大小是指漂变速率与之相等的理想种群的大小。有效种群大小通常小于实际种群大小，主