台湾的拼音系统争议起源于1990年代末期。1945年台湾结束日治时期之后，早年无论政府或民间皆使用威妥玛拼音（官方标准为大陆时期颁布的国语罗马字，以及其后继承的注音符号第二式），1996年经济建设委员会在国际化的要求下，以内部行政协调方式，决定以注音二式作为统一全国街路译名的版本，交通部并行文各交通单位开始执行。然而当时陈水扁任市长的台北市政府认为注音二式不适合国际化的需求，遂于1998年推出与汉语拼音相似度极高的通用拼音（与2002年推行全国的通用拼音不同，当时的版本仍採用zh、x、q，并以i表示空韵），