隧道的开通，青函连络船被废除。函馆铁路交通地位的下降加上国铁分割民营化的裁员导致函馆的铁路相关行业从业者减少。函馆市人口在1985年至1990年之间减少了约1万2千人。1990年代之后，函馆市经济持续向以服务业为主的结构转型。2004年，函馆市和附近的户井町、惠山町、椴法华村、南茅部町合併，市辖区面积大幅增加。翌年函馆市升格为中核市。2016年，随着北海道新干线的开业，函馆和本州之间的铁路交通大幅改善，函馆市进入了新干线时代。
地理.函馆市位于北海道西南部渡岛半岛南端，面积677.