12月18日，海湾航空董事局经过会议商讨后，一致批准这个计划实行，而卡塔尔政府亦于同月退出持有海湾航空。2003年海湾航空开始更换机队颜色，并于6月1日成立附属子公司海湾旅游。11月23日，增设每日直航雅典及每日经新加坡往返悉尼的航班，也成为格兰披治巴林大赛奖的赞助商至2010年。2004年，增设伦敦往返杜拜及马斯喀特，及每日来往阿布扎比与拉斯海玛的服务。同年录得的客量为750万人次，也继续赞助巴林大奖赛。2006年4月27日，巴林和泰国政府签署了一份双边航空运输协议，容许两国之间的航班数目不受