侯一元，字应干，号之川，陕西秦安县兴国镇人。明朝政治人物。
生平.正德九年（1514年）登进士，授工部都水司主事。后改礼部主事、升兵部员外郎、兵部郎中、礼部精膳司郎中。因与同僚不合离职。此后再次起用为吏部郎中，一年后卒于任。