《奇经八脉考》、《濒湖脉学》、《濒湖集简方》、《三焦客难》、《命门考》、《脉诀考证》、《五脏图论》、《濒湖医案》、《天傀论》、《白花蛇传》等，除前两种外皆失传。文学着作《菡所馆诗词》和《诗话》等。
轶事.2010年，韩国明星张娜拉在中国湖北蕲春县「李时珍纪念馆」向李时珍灵位上香跪拜。该县委书记熊长江宣布委任张娜拉为「李时珍形象大使」，引来中国人民勐烈抨击。