，推翻卡斯泰洛-麦略尔伯爵的统治，并把阿方索六世流放到亚速尔群岛达7年之久。佩德罗以摄政亲王的名义对葡萄牙进行统治，恢复了贵族的权利。经过一些所谓的调查，证明了阿方索六世没有生殖能力，于是解除了阿方索六世与玛丽-法兰索瓦丝-伊莉莎白的婚姻。1668年佩德罗亲王娶了玛丽-法兰索瓦丝-伊莉莎白为妻。同年，葡萄牙与西班牙签署和约，完全承认葡萄牙的独立，保持其边界和领土不变。虚弱的阿方索六世最终于1683年在辛特拉去世，佩德罗遂正式成为葡萄牙国王，即佩德罗二世。