十五师师长关麟征、副师长杜聿明率部到定远营驱逐日本特务。1936年他成立阿拉善旗区防司令部，任少将司令。1937年，他成立阿拉善旗保安总队。1938年后，达理扎雅被马鸿逵执行国民政府命令软禁在银川、兰州。软禁期间，他仍保持亲王尊号，并任蒙藏委员会委员、行政院顾问、宁夏省政府委员等职务，获允许过问阿旗旗政。1944年，达理扎雅获准回阿旗。1945年，他任中国国民党第六届中央委员。在他软禁期间，宁夏军阀马鸿逵的势力深入阿旗。抗日战争胜利后，1946年阿拉善旗区防司令部恢复，达理扎雅晋升中将司令。1949年9月2