兴皇法朗去世时，嘱付茅山大明法师继续领导其门下学众，茅山明法师「即日辞朗，领门人入茅山，终身不出」。他的门人，如慧暠、慧稜、法敏等都是杰出人才，牛头宗的创始者法融也出于他门下。另一个门人智锴大师隐居庐山大林寺，二十年不下山，智锴曾从智顗，兼习天台教义，禅宗四祖道信曾经居于大林寺十年，之后道信改变菩提达摩以《楞伽经》印心的传统，改以《般若经》教学，不能说没有受到三论宗的影响。唐朝中叶之后，在中国的三论宗衰微，被併入天台宗。但经高丽僧慧灌，传入日本，成为日本重要佛教宗派之一。
三论