指定金融机关（）是日本地方公共团体指定进行公款收支业务的金融机关。指定金融机关由单一金融机关出任，并须通过议会决议（地方自治法第235条、同施行令第168条）。
概要.都道府县必须设有指定金融机关（施行令第168条第1项），市町村（含特别区）必要时也可指定（施行令第168条第2项）。指定金融机关多由银行担任，但地方的市町村则多选择当地悠久的与农业协同组合（或地域农协的信用事业部门，也就是所谓的）。1个地方公共团体的指定金融机关以1间为限，但可选择复数金融机关实施1或2年的轮替指定制