士假台北市中山堂光复厅举办欢送会，中日文化经济协会、全省各级农会、林产管理局、云林县长林金生、在台学生代表等致送纪念品，包括锦旗、签名册、镜框等富有纪念性之物。 台湾省政府为感谢他对台湾农业无可替代的贡献，由台湾省议会动议每年寄送蓬莱米一千两百公斤到日本芝浦，直到过世为止。矶永吉为感谢台湾省政府所给予之优遇，8月14日亦赠新台币二万元，以每年之利息半充台湾省政府农林厅稻作多收竞赛第一名优胜者副奖，半充台大及台中农学院农艺系优秀学生奖学金。8月28日下午四时，偕同夫人搭乘民航公司班机飞返日本。归国后定居山