长江江水倒灌，淹浸城门，吕据下令准备大船防备灾害，被孙权派出的使者看见并报告。孙权嘉奖吕据，拜他为盪魏将军。孙权病危时，以吕据为太子右都督。孙亮继位后，拜右将军。建兴元年（252年），曹魏出兵攻打东兴，吕据领军抵抗又有功。次年（253年），孙峻杀死诸葛恪专政，吕据获迁任骠骑将军，平西宫事。五凤二年（255年），假节，与孙峻等攻击寿春，失败撤军，中途遇到魏将曹珍，在高亭破之。
自杀.太平元年（256年），吕据领军攻打曹魏，还未到淮河就听到孙峻逝世的消息，堂弟孙綝取代他的位置专