蛋白之升高，因此可作为临床参考。例如80%~90%的肝细胞癌病人，其血液中α-胎儿蛋白有升高之现象，故在肝病甚为流行的区域(如台湾)，利用α-胎儿蛋白及超声波作为高危险群病人筛检方式，成效不错。再如肝硬化病人当中有些合併有α-胎儿蛋白之升高，其可能代表肝细胞再生的持续进行但若持续地上升﹐则须积极追纵，找出可能的恶性变化。此外，急慢性肝炎患者，其血中α-胎儿蛋白常随着肝细胞坏死后之再生而升高。其高峰往往在转氨基的高峰之后；其升高程度间接地反应肝细胞坏死后的再生能力，也因此常被利用作为病理变化及病程预后之参考。