等项月折》记载，慈宁宫佛堂月例用檀定香二十五束，每束银四分用银一两。慈宁宫内永庆宫供佛、彩画和天花板等项用水胶一斤十一两六钱，每斤银二分用银三分四厘五毫。干隆三十六年（1771年）时，干隆帝的生母崇庆皇太后80岁大寿后一度由寿康宫入居慈宁宫六年，并有皇考裕贵太妃随住。干隆四十二年崇庆皇太后逝世。
民国以后.故宫博物院成立后，于1932年将慈宁宫大殿的格扇换成玻璃窗。1951年，将东、西庑改做室内灰顶，并且增开桶子门，将徽音左门、徽音右门的风门改做玻璃门；南群房室内改做灰顶，改做玻璃