源自CHO-K1细胞的细胞系的基因组可能曾有着大规模的染色体重新排列，甚至已知它的克隆群体也可以分化为异质亚族群（heterogeneous subpopulations）。据报导，CHO-K1细胞的染色体计数各有不同，可能是因为它的基因组不稳定。有研究就在CHO-K1细胞中发现了21条染色体，并且在在CHO-K1细胞的基因组中，鑑定出与大多数人类硫酸乙酰肝素葡糖胺O-磺基转移酶（human heparan sulfate glucosamine O-sulfotransferases）的同源物，鑑定结