1947年，国共内战全面爆发，政府发佈动员戡乱令。苏联支持下，外蒙军队入侵新疆。因台湾省行政长官公署施政错误等因素，台湾爆发二二八事件。1948年9月，与外蒙战争结束。
台湾时期.1948年8月起，政府陆续组织军队、文物、黄金、外汇及民众迁往台湾。1949年1月，发生太平轮沉没事件，5月，陈诚宣佈台湾戒严，10月1日，中国共产党在北平成立中华人民共和国中央人民政府，并将北平改名为北京。国军在金门的古宁头战役中获胜。12月7日，中央政府迁至台北，是月，失去广西、四川。1950年韩战爆