在此期间，丁颖积极从事水稻科研与教学工作，取得大量成果，其中以丁颖在1936年用印度野生稻和广东栽培稻“早银占”杂交而成的“千粒穗”最为重要。1938年，日军侵入广州，中山大学除南路稻作育种场外的科研基地均遭破坏，部分教职工惨遭杀害。抗日战争期间，中山大学数次易址办学，丁颖随校辗转关山，历尽艰辛。1940年7月，中山大学从云南澄江迁到粤北韶关，各个学院分散各地办学。丁颖临危受命，出任院长，带领农学院院师生迁到韶关附近的湖南宜章县粟源堡继续办学。1945年8月，抗战胜利，丁颖随中山大学迁回广州。解放前夕，