访罗马和教廷，出席教宗若望保禄二世的葬礼。但与马其顿、瑙鲁、利比里亚、多米尼克、格林纳达、塞内加尔、乍得、哥斯达黎加、马拉维九国断交，邦交国降至23国。马英九政府时期，2013年11月与冈比亚断交。马总统任内两度访问新加坡，并与中国大陆领导人、中共中央总书记习近平会面，是66年来首度两岸领导人会面。蔡英文政府时期，蔡总统于2016年12月初与美国总统当选人唐纳·川普进行通话，是中美断交以来的首例。随后发生与圣多美普林西比断交，次年6月又与巴拿马断交。2018年5月1日与多明尼加共和国断交，当月24日