日，北京新闻团在北京湖广会馆举行大会追悼宋教仁，陈家鼎主持了此次大会并发表演说，程家柽、孙毓筠、日本人神田正雄、法国人铎尔孟等人也在会上发表了演讲。首届国会开幕后，他拒绝了袁世凯派亲信给予的五十万元“炭敬”。1913年10月6日国会选举中华民国大总统，袁世凯派人包围国会，胁迫议员投票选袁世凯当大总统，但陈家鼎在三次投票中均不畏强权，将票投给“孙文”。他还组织癸丑同志会，联合国会参众两院的国民党议员共同抵抗袁世凯。二次革命失败后，他遭到袁世凯通缉，1913年11月再度流亡日本。1915年末，他被孙中山派回