6年首次在中国广东的养殖鹅中明确发现。1997年在香港养禽场及鲜活市场爆发H5N1禽流感。当局迅速扑杀全港的130万鸡只，消灭了疫情。当年首次发现人类感染H5N1病毒的病例。同年在广东的饲养鹅中也检测到相同病毒。1999年以后，通过检测香港禽类的血液样品、笼具拭子、粪便样品，发现该病毒仍时常出现。1999年至2001年间，鸭与鹅中检测到H5N1病毒的机率上升。香港科学家管轶的研究小组发现，病毒在2000年后期从其他水禽的流感病毒中，获得了新的基因。2001年5月，大韩民国在从中国大陆进口的鸭肉中