宇也开始着手整备与复建。不过到了昭和20年（1945年）因受到太平洋战争的影响，增上寺一带遭受到空袭，所有的复兴重建都在一瞬间被摧毁。战争结束后的昭和27年（1952年），设立的临时本堂。并在昭和46年开始（1971年）历经约四年的时间，花费约35亿日圆重新建造了新的本殿。平成元年（1989年）4月，为纪念圣聪上人550回忌，将开山堂重建为现在的慈云阁。
德川家灵庙.原本在寺领之内建有台德院灵庙祭祀德川秀忠、崇源院灵庙祭祀德川秀忠的夫人（德川家光之母）、文昭院灵