尼科陨石坑已被侵蚀，其外观呈多边形状，东南侧带有一处小突角。陨坑边缘轮廓清晰，西侧拥有螺旋般重叠的双层内壁。内侧壁坡较为平整，其中西侧内壁带有阶地状结构且较其它各处更宽厚。坑壁平均高出周边地形920米，内部容积约有610立方千米。碗状的坑底及内侧壁反照率较高，除东、北各一小块区域外，坑内地表崎岖不平。由于内侧壁宽度不均，使得坑底地面偏向东面。坑底西部分布着数道平行的弧形山嵴；中心点以北坐落着一群中央峰和数座分散的山丘。陨坑形成时所熔化的岩浆，在凝固后形成纵横在坑底表面10-15公里宽的网状裂缝。尼科