亚目被认为是并系群集合，所以是无效名称。有些研究人员，例如嘉克斯·高斯特（Jacques Gauthier）与凯文·帕迪恩（Kevin Padian），曾经尝试以亲缘分支分类法将伪鳄亚目定义，成为鳄鱼祖先与其后代（包括鳄鱼，使得伪鳄类这名词有些古怪）的单系群。这些定义包括：「鳄鱼，与所有血缘较亲近于鳄鱼，而较不亲近鸟类的主龙类」（高斯特与帕迪恩）、「仅存的鳄鱼，与所有血缘较亲近于鳄鱼，而较不亲近于鸟类的主龙类」（高斯特, 1986）、还有近年的「主龙类中包括鳄鱼而不包含鸟类的最大演化支」（赛里诺, 2005