冯仲云赴汤原，同中共汤原中心县委负责人共同创建中国工农红军第二十三军汤原游击队，该游击队是日后东北抗日联军第六军的前身。1934年春，赴绥芬河安城设国际交通站，并作为中共满洲省委代表巡视牡丹江、安达、朱江等地。1935年1月，东北人民革命军第三军成立，赵尚志为军长，冯仲云为政治部主任兼中共朱江县委宣传部长，成为该县委全面工作的实际负责人。第三军主力转移后，他率第三军、青年义勇军各一部，在珠河、苇河地区坚持斗争。1935年7月，他返回哈尔滨担任中共满洲省委秘书长，负责中共满洲省委机关报《东北民众报》、理论刊物