闭园过后，一伙僱佣兵来到弃置的上，从潟湖中打捞出死于水下的帝王暴龙的一块骨骼样本以获得其DNA。过程中，队伍受暴龙以及湖中的沧龙袭击，但还是成功获取样本撤退；而沧龙借由没关的闸门逃入大海。三年后，岛上休眠火山重新活跃面临随时爆发，使自由生存的恐龙再次面临灭绝危机。美国参议院举行听证会裁决是否要拯救岛上恐龙，而伊恩·马康姆认为要让恐龙伴随着岛屿共同毁灭，由此纠正约翰·哈蒙德复活恐龙的过错，因此表决结果为将不会做出行动。前乐园营运主管克莱儿·戴宁成立「恐龙保护团体」以拯救岛上的恐龙，偶然受到传唤而来到北加州的庄