1945–46年香港甲组足球联赛是香港甲组足球联赛经过二次世界大战停顿后，于1946年初复办，战后第一届甲组联赛共有 10 队参加，除了南华、东方与光华三支华人球队外，其余七队均是英军球队。这届联赛只进行了单循环比赛，由空军赢得联赛冠军，亦是英军球队最后一次夺得香港甲组足球联赛冠军，亚军是第44营金冕多，华人球队则以东方成绩最好，获得季军。
联赛榜.若果有部分球队于联赛榜中取得相同分数，则根据有关球会的对赛成绩决定。而对赛成绩相同之排名方法，则根据下列次序排名：# 有关赛事的分