艰苦的路径返回波斯。亚历山大经历很大痛苦横渡沙漠，于前324年返回波斯。
最后几年.亚历山大发觉不少他的总督和地方军事长官趁着自己远征印度时胡作非为，他在前往苏萨的沿路上处死数个官员杀鸡儆猴。在他返回波斯时，亚历山大也发现帕萨尔加德居鲁士大帝的陵墓遭到洗劫，他迅速命令他的建筑师阿里斯托布鲁斯把陵墓修回原状，还把陵墓的守卫严加审问试图抓住盗墓的匪徒。亚历山大相当欣赏居鲁士，他幼年时读过色诺芬所着的《居鲁士的教育》，提到居鲁士在战场上的英勇事蹟以及当上国王后的统治风格和立法情形。