双钩叶科同时被置于堇菜目。1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法认为应该放在石竹目中，2003年经过修订的APG II 分类法维持1998年的原分类。新近的分子生物学及生物化学实证（见）认为在石竹目的捕食性物种（例如：茅膏菜科、猪笼草属、露叶毛毡苔科及穗叶藤属等）全都属于同一个演化支，尽管这个支序可能并非每一个物种都是捕食性植物。本科与其它石竹目各科的亲缘关系如下（节点有“†”标志的分支表示其自助法支持率介于50-80%之间，无标志者为80%以上）：
分佈.本属物种原