美颌龙的化石没有保存羽毛、或类似羽毛的痕迹；相反地，同样发现于德国地层的始祖鸟却有羽毛痕迹。所以很多早期科学家都认为美颌龙是没有羽毛的。但是，已知唯一的始祖鸟羽毛，是位在翅膀及尾巴上的较大羽毛，而被推测覆盖身体的较短羽毛却没有被保存下来。冯·休尼指出德国美颌龙标本的下腹保存了化石化的皮肤，但奥斯特伦姆后来推翻这个论点。在2012年，Achim Reisdorf提出美颌龙下腹的皮肤痕迹，其实是尸蜡。在2006年，Karin Peyer宣称在法国美颌龙标本的第13节尾椎处，发现鳞片皮肤痕迹，由小型瘤块鳞片构