gidae"在白垩纪-第三纪灭绝事件中绝灭了，这起事件也导致恐龙的绝灭。通过种系发生学的分析，与原盖龟科最亲近且仍应健在的科为棱皮龟科，而且这两者都是单系群。
分类史.1888年，比利时动物学家乔治·阿尔伯特·布朗热在第九版大英百科全书中发表他个人的动物分类法。他将原盖龟属"Protostega"列于"Sphargidae"这个科下，其对上一级为Athecae亚目。一年多后，卡尔·阿尔弗雷德·冯·奇特尔将整个亚目降为曲颈龟亚目"Cryptodira"的一个科。1994年，日本古