记鸦片战争期间，福建水师的战船都被租给商人贩运大米。陕西道监察御史杜彦士指出：“夷船所以停泊无忌者，由于水师员弁收受陋规，每船得洋四百圆、六百圆不等。船上烟土，皆营弁包庇贩卖。”绿营丧失作战能力，“无事则游手恣睢，有事则雇无赖之人代充”，上阵一触即溃。江忠源总结绿营的弊端时说：“其弊在兵不用命，将不知兵，兵与将不相习，将与将又各不相干，遂至溃烂，不可收拾。”自此大清朝廷逐渐依赖如湘勇和淮勇等乡勇，且同治年间开始多次裁减绿营，致使绿营的重要性逐渐减弱。百日维新时朝廷新编全西式训练的新军，自此绿营便等同名存实亡