记、水手等乘组员，多数是日本人。在初期对于不熟悉的海域，通常会雇用熟悉海况的明国人作为航海士、甚至是葡萄牙人、英国人、荷兰人等。乘组员大约有200人左右。
贸易品.令人意外的是，前往东南亚贸易的朱印船进口的大多是明国产的生丝和绢织物。日本古代也有产绢，但是品质较差。太平之世的到来使得制作高级衣料的生丝需求大增。但是自1549年勘合贸易断绝后，受到倭寇所苦的明国禁止日本船入港，明国的商船也被禁止渡航日本，致使日本无法获得明国产的生丝与绢织物。1598年朝鲜之役后双方关系更加恶劣，而透