赞干布时期兴建的镇魔寺有关。吐蕃末期刺杀赞普朗达玛的僧人拉隆·白吉多吉便是该寺的注册僧人，宗教神舞中的“黑帽神供献神饮”舞，便是根据该史事发源于拉隆寺。根据拉隆寺志记载，藏历第三绕迥木猪年（1155年），都松钦巴正式兴建拉隆寺，使其成为洛扎地区知名的噶玛噶举派道场。16世纪中叶，噶举派学者巴卧·祖拉陈瓦对拉隆寺加以修缮，形成了如今的格局。根据拉隆寺志记载，巴卧·祖拉陈瓦按照坛城的形状布置该寺格局，他圆寂之后，寺院开始活佛转世制度。拉隆寺从建寺开始，便经常派僧人赴中国内地朝廷进贡，该寺的大门上也曾悬有明朝