华大学无线电科学系真空超高频技术专业，因为当时国家在这方面需要最优秀人才。南仁东起初耿耿于怀，从学校跑回家，结果被做工程师的父亲一通训斥，第二天就回到学校上学。在清华，“全校绘画大赛，前二十名才有资格获奖，南仁东是为数不多的非绘画专业得奖的学生。”周恩来总理到清华视察调研，会见学生代表，南仁东不仅是代表之一，还被周总理点名发言。1968年于清华大学无线电系毕业。1968年11月毕业分配进入吉林省通化市无线电厂工作。南仁东先是下放到在小金工车间做学徒锻炼。来到厂里不过两个月的南仁东就为工厂画了一张巨幅