后来反叛。1572年，古楚汗力图摆脱臣属地位未成。沙皇在1579年派哥萨克首领叶尔马克·齐莫菲叶维奇率800个哥萨克兵对付他。他在楚瓦什山托博尔河下扎营，在1581年营破遂逃亡，1582年10月，激战了三天，叶尔马克打败西伯利亚汗国的军队，佔领了额尔齐斯河边的西伯利亚汗国首都喀什里克，彻底摧毁了这座城市。在1598年逃到巴拉巴草原，被暗杀。这些遗民向准噶尔汗国交毛皮税。