出于乌菲齐美术馆的数学室。它们后来被转移到由利奥波德大公于1775年创建的物理学和自然史博物馆。在洛林大公统治时期，增加了新的科学仪器。1929年，第一次意大利科学史展览在佛罗伦萨举行，突出了科学藏品在意大利的文化遗产中的重要性。随后，在1930年，佛罗伦萨大学建立了科学史研究所及附属博物馆。研究所设在卡斯特拉尼宫，展出美第奇家族和洛林大公收藏的科学仪器。常设展览按照时间顺序和主题安排。。
美第奇收藏.一楼的九个房间展出美第奇家族藏品，从15世纪到18世纪。常设展品包括所有的伽利略