靠近上颌窦，因此若有任何疾病（例如牙齿部份发炎），也可能会造成其他临床问题。临床问题包括继发性鼻窦炎，也就是因为其他问题（例如邻近的牙齿发炎）造成的鼻窦感染。这类症状可以用药物治疗，这类药物会让鼻窦血管收缩，减少炎症，其他的治疗方式包括鼻沖洗或是皮质类固醇。
癌症.鼻窦的恶性肿瘤约佔所有肿瘤中的0.2%。鼻窦的恶性肿瘤中有80%是来自上颌窦，男性比女性容易受影响。鼻窦恶性肿瘤常出现在年龄40岁到70岁的人当中。其中癌又比肉瘤要常见。很少有转移型病变。蝶窦和额窦的赘生物则相当罕见