另一方面，在师的层次混合编组歼击、强击、轰炸飞行团，导致各机种之间的协同和后勤保障都很复杂。1941年8月，苏联国防委员会决定改组苏联红军航空兵，航空兵飞行团的飞机由60~63架减为32~33架，1942年又减少到20架。1941年11月1日，苏联国防委员会决定组建夜间歼击与轰炸航空兵团。1942年1月，苏联国防委员会取消了空军集团军。1942年3月，远程航空兵成为直属高统帅部的独立兵种，编有7个轰炸航空兵师、1个运输航空兵师和1个后备航空兵旅。1942年5月，苏联各方面军的航空兵集中受方面军空军集团军