甲辰科进士。历刑部湖广司主事，陞广东司员外郎，署陕西司郎中，万历四十一年（1613年）出爲江西按察司参议。累官浙江参政。万历四十七年（1619年）陞江西按察司副使。天启间，历河南按察使、江西右布政使。天启六年（1626年），本推为巡抚，魏忠贤以其曾为杨涟引荐，削籍为民。崇祯二年，朝廷会推宁夏巡抚，方闻宪时已与元年（1628年）八月卒。
家族.真宪时祖籍浦城，十五世祖（或十二世祖）真德秀，南宋理学家。九世祖迁至松溪县祖墩乡坑口村定居。