华南化工学院均被评为全国重点大学。但随后的“新跃进”继续出现了大办教育的高潮。1961年，中共进一步提出“调整、巩固、充实、提高”方针，开始纠正各种失误，并发布“高教六十条”，整顿全国高等院校，一系列措施使华工的教学质量得到提高；同年，华工开始接收蒙古、北越等国的留学生。1962年，韶关和湛江两所分院被撤销；同年8月，华南工学院和华南化工学院重新合并为华南工学院。1966年6月，文化大革命爆发，华工的教学科研工作几乎全部停止，新生招收也被迫暂停。华工校内成立了多个红卫兵组织，其中造反派组织“华工红旗”曾