渔港机能外，又具有地区性商港的功能。清代中叶以后，由于安平港淤浅，以致于「海泊往来遂不赴鹿耳，而趋打狗」，遂使打狗的商业活动渐居重要性。清朝曾经于兴隆庄（今左营）兴筑「凤山县城」，在林爽文事件时城池遭攻破，因此于干隆53年（1788年）迁至埤头街（今凤山），兴筑另一座「凤山县城」俗称「新城」，在经过多次迁移后，最后官府决定将县治定在埤头街，便作为凤山县的县治所在地；随着渔业逐渐发达，近海区域也逐渐出现零散的小型聚落。港口（当时称为「打狗港」）最初于1680年代左右开港，到了清领末期亦对外开放成为通商口岸