使他们重新评估蔡英文等民主进步党内每个「斗争与谈判的对手」。同年的立法委员选举，她接受民主进步党提名为政党不分区立法委员第六名候选人。12月11日，当选民主进步党籍不分区立法委员。2005年2月11日，正式就任民主进步党不分区立法委员，除了加入立法院财政委员会，还担任民主进步党立法院党团副总召集人。2005年初，陈水扁准备接受「九二精神」来重启海崃两岸谈判时，国务院台湾事务办公室亦十分关注蔡英文的意向。不过到了2006年，蔡英文则是受民主进步党中央党部的提名，被延揽进入苏贞昌内阁，并任命其担任行政院