搬运材料的船只而于1907年所设的临时灯桿也予以拆除。二次世界大战时，灯塔屡遭盟军轰炸。在1945年1月9日被首次轰炸后，灯塔便因灯具受损而失去作用。后来在该年的1月11日、5月15日与5月16日灯塔又被轰炸而造成灯塔与房舍的严重毁损。战后，灯塔由中华民国海关接收并于1946年6月19日修复，后来在1948至1949年期间，又将附近原本为四坡式木造铺瓦屋顶的砖造办公室及宿舍改建，而成为现在的砖墙水泥平顶建筑。
周围设施.彭佳屿上除了灯塔之外，还有军事设施与气象台。