418年藏历6月2日动工兴建，1425年藏历2月14日竣工。该寺为三层平顶藏式建筑，平面为坛城模型，由大殿、法王殿、护法神殿、金刚界殿、罗汉殿、道果殿、无量宫殿、转经回廊等建筑组成。1904年第二次英国侵藏战争中，英军攻占江孜宗山后，又攻占白居寺。据路透社特派员亨利·纽曼报导，英军在江孜市场中购买江孜地毯，白居寺的喇嘛也将寺中佛像、幢幡拿来卖给英军。中国大陆称占领白居寺的英军，抢劫了该寺大量文物、藏经等等，并且将佛堂改为食堂，在转经筒上钉钉子改为食品输送带。经过战斗，英军占领了整个江孜。1957年2月