920年再次改制，此区长短树庄改为大字。根据《后壁香火》记载，清代「长苑树庄」属台南府诸罗县「下茄苳北堡」，清末以「长短树庄」之名通行，而「长短树庄」的范围就包括顶长里（旧称「顶长短树」）、仕安里（旧称「下长短树」）、平安里（旧称「药店口」）。2010年台南县市合併行政区划改制后村更名为里。2018年，配合台南市府里邻整併计画，顶长、仕安、平安三里合併为一里，并命名为「长短树里」。
分区.
顶长短树.顶长短树庄的居民姓氏以萧姓为主，居民多来自泉州府安溪县及晋江