往圣多明克（海地）镇压黑奴反叛，并与杜桑·卢维杜尔和谈，在5月22日逮捕他。到1802年10月，勒克莱尔写信给拿破崙提倡灭绝战争，他宣称：“必须摧毁所有山上的黑人男人和女人，除了12岁以下的儿童。必须消灭一半平原的黑人。＂但因不适应热病气侯，他染上黄热病，在1802年11月2日病死。他的遗骨在1804年运回法国，并由他的遗孀埋在他的其中一个庄园。