，屋顶举折甚陡，翼角有明显的起翘，具有宋代建筑风格。其他建筑为历代增修。宝华阁上檐正中有孔，据传每逢甲子年的中秋之夜，月光透过圆孔，直射殿中佛像，从额头至脐处而止，这一景观被称为“曹溪印月”。1999年8月，云南佛学院定址于曹溪寺北面。2006年被国务院公布为国家级重点文物保护单位。