蕃讨平南海、清远诸盗乱。正德初年，任副使，检举揭发总镇中官潘忠二十罪。潘忠则诬陷其其他事情，被逮捕入诏狱。当时刘瑾矫诏，枷之十余日，几乎死去。戍守雁门关，随后释放。因杨一清举荐其才，升任江西右参政，在连河击败华林贼乱，先后跟从陈金平定姚源盗乱，再跟从俞谏击退。当时胡浩三既然接受抚恤后又叛乱，吴廷举前往谕令被逮捕。三个月后，劝胡浩三后被释放。胡浩三果然杀其兄胡浩二，贼军内乱。官军趁胜追击获胜。但吴廷举与副使李梦阳不协，上奏李梦阳侵官，因乞休未批准，坐停一年俸禄。起用为广东右布政使，再次辅佐陈金平定府江贼乱