员由院长、总干事、各所所长兼任，另有聘任评议员）。他和物理学研究所丁燮林（丁西林）所长与蔡元培院长关系密切，1937年芦沟桥事变后，陪蔡先生离开上海，11月27日到达英属香港的就是这2位研究员兼所长。1938年到1945年间在上海法租界里的国立北平研究院上海药物研究所（现在中国科学院上海药物研究所）做研究工作，历任特聘客座研究员、代理所长。搬到昆明的中央研究院化学研究所由时任中研院总干事任鸿隽兼所长。1940年3月9日蔡院长病逝英属香港，庄在同年3月13日当选由评议会第1届评议员选出的第2届