持的金日成等人开始大力排挤曹晚植。1946年1月4日，金日成在苏联支持下，组织召开了“五道行政局委员会”，会议主题即是推翻曹晚植的反信托议案，金日成一方有16人，而曹晚植的民族阵营一方仅有6人，会后曹晚植被迫辞去了委员长一职，次日被软禁并再次入狱，直至朝鲜战争。这期间曹晚植本有望重获自由：朝鲜战争爆发几天前，北朝鲜副相朴宪永曾强烈要求曹晚植父子来向南韩交换几名共产主义者。对此李承晚要求北方先把曹晚植送来，然而北方坚持同时交换。最终双方没能达成统一意见。
被害.1950年10月1