马达加斯加足球协会是专门管辖马达加斯加足球事务的组织。马达加斯加足球协会成立于1961年，并在翌年才加入国际足协。此外，它还是非洲足协和南非洲足球协会议会的成员之一。马达加斯加足球协会曾在2008年3月19日至5月19日期间被国际足协制裁。