明朝伊斯兰教，是指明朝时期中国的伊斯兰教的发展和正式中国化的情况。元代的色目人留下成为回族，他们多数改了汉姓与接受中国文化，他们也不再出海贸易。
背景.明朝初期由于海禁封国，中国的穆斯林在很长一段时间内与伊斯兰世界隔绝、独立发展，原本以回鹘后代、畏兀儿等少数民族为主体的穆斯林群体，逐渐和接受了伊斯兰教的汉族人、滞留中国的阿拉伯客商后代等等不同民族来源的穆斯林通婚，融合成了一个以宗教为纽带的民族——回族。
本地化与民族政策.虽然明朝政府不干涉穆斯林的宗教自由