生铁五百斤铸造了一口中式大钟，挂在钟楼。明熹宗赐寺名“秘宝寺”（蒙古语“尼古察额尔德尼·苏莫”）。后来，台吉东日布的后代以及准格尔召的喇嘛继续扩建该寺。清朝康熙年间，赐寺名“宝堂寺”（蒙古语“额尔德尼·布日社森·苏莫”）。干隆元年（1736年），被确定为度牒寺院，编制度牒喇嘛40名。《白银镜鉴——准格尔召庙志》记载，癸酉年（1633年），蒙古林丹汗西退进入“秘宝寺”。据说，1741年（辛酉年），六世达赖曾瞻仰庙容，并派贡楚克朝尼玛为第一任住持。同年，开始举办“雅尼会”，成为常规。1748年（干隆十三