王国发生数次武装冲突。1683年明郑王朝灭亡后，清康熙61年（1722年）出任巡台御史的黄叔璥在他的《台海使槎录》一书中，有这样的记载：「大肚山形，远望如百雉高城，昔有番长名大眉。」虽然寥寥数语，却说明17世纪的台湾中部确实有一个「超部落」的王国。清雍正9年（1731年），清廷官吏对原住民指派劳役过多，引起原住民群起反抗，发生大甲西社抗清事件，翌年遭镇压，各族人陆续逃离原居地，迁往埔里（南投县北部）一带，大肚王国终告瓦解。
荷西时期.荷兰统治时期自1624年登陆大员（今台南安平