2008年任广播事务管理局主席。冯华健多次在重大诉讼中代表香港政府，包括1998年指立法会议事规则违反《基本法》；2004年在领汇事件中代表房屋委员会。2009年他参与在电盈私有化一案中代表小股东，成功阻止电盈私有化。2018年1月，当选第十三届全国政协委员。