东征作战结束后，该军将粤军张和旅与余鹰扬团合编为独立第二师；将黄埔军校教导团扩编为教导师。此时，该军下辖：第一师，何应钦兼任师长；第二师，王懋功兼任师；第三师，谭曙卿代师长；独立第二师，冯轶裴任师长；教导师，王柏龄任师长。
国民革命军北伐时期.1926年1月，蒋介石辞去该军军长职，何应钦继任军长，王柏龄任副军长，蒋伯诚任参谋长，周恩来任政治部主任。此时，该军下辖第一、第二、第三师编制不变；独立第二师改编为第十四师，教导师改编为第二十师。钱大钧接任第一师师长。2月26日，第二师师长王