龙头颅骨一起被发现，所以理查·欧文（Richard Owen）在命名花君龙时，认为牠是一种恐龙。后来在1912年，罗伯特·布鲁姆（Robert Broom）将其中的恐龙骨骸区别开来，并在1929年由法兰兹·诺普乔（Franz Nopcsa）建立为新属，剑龙科的似花君龙。