政企不分、改革滞后的状态，以及数起重大安全事故和腐败大案亦令刘志军备受争议 。2008年中国雪灾期间，京广铁路南段运输瘫痪，20万人滞留广州火车站；2008年4月28日，胶济铁路发生列车相撞事故，导致72人死亡，刘志军被记过处分。此外，刘志军与其弟刘志祥的裙带关系备受质疑。刘志祥曾任汉口火车站站长、武汉铁路分局副局长等职，2011年4月因故意伤害罪、贪污罪、受贿罪、巨额财产来源不明罪被宜昌市中级人民法院判处死缓，并处没收财产人民币100万元。为了实现高速铁路网的建设，刘志军在建设工期、建设资金上抓得