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调节免疫.免疫细胞中的丙胺酸胺肽酶还有些与其蛋白酶活性无关的功能，包括促进吞噬作用、与其他受体结合以参与讯息传递、或本身即作为讯息传递的受体。丙胺酸胺肽酶可活化单核球与巨噬细胞等吞噬细胞，γ-干扰素、脂多糖、、IL-4和TGF-β均可增加吞噬细胞中丙胺酸胺基肽酶的表现，膜上的丙胺酸胺基肽酶被其他蛋白酶切割后可脱离细胞，形成sCD13，后者可与吞噬细胞的G蛋白偶联受体结合以启动许多下游的讯息传递路径，活化免疫反应，另外丙胺酸胺肽酶还可与这两种细胞膜上的互动，促进吞噬作用进行；树突