乃权将户籍从台湾迁回金门。2007年7月6日，金门县县长李炷烽任命许乃权为金门县政府社会局局长。2008年及2012年，许乃权两次参选立法委员，皆落选。2014年九合一选举，许乃权以无党籍参选金门县县长，仍落选。
间谍案.中国人民解放军退役上尉镇小江于2008年左右来台发展间谍组织，许乃权涉嫌引荐昔日军中部属参与其组织。2014年12月1日，许乃权被收押起诉；许乃权宣称自己无罪且不认识镇小江，其竞选总部总干事林永塘怀疑此案是因选举恩怨遭人报复。2015年9月1日，台北地方法院一