北京地区的最高学府，永乐帝从南京迁都北京后，改北平府学为北京国子监，同时保留南京国子监。由于元末明初的战乱，现在北京国子监内的元代建筑遗存极少，绝大部分建筑为明清所建。1912年，中华民国教育部在此设立国立历史博物馆筹备处。该筹备处后于1918年迁至故宫。北京国子监在1949年之后一度被用做首都图书馆和北京少年儿童图书馆，彝伦堂被改建为阅览室，六堂成为书库，随着首都图书馆新馆落成并投入使用，2003年首都图书馆迁出北京国子监。此后北京国子监成为中国教育博物馆所在地。2008年成立孔庙和国子监博物馆。