999年香港区议会选举，林健文加入民主党在同区参选，惜未能成功。2003年2月9日，九龙城区议会海心选区进行补选，事缘原区议员麦劲麟于2002年11月因急性肝炎去世，议席悬空，遂需进行补选。林健文在党友陈家伟之鼓励下离开竞逐多年的黄埔西选区，继续以民主党候选人的身份与5名候选人混战，由于有同属民主派的民协成员任国栋竞争下，最终建制派背景民建联所属、报称为旅行社业务经理的潘国华以1,012当选，林健文紧随其后，只得721票，任国栋则取得469票。然而，林健文于同一年的11月，2003年区议会选举胜出，