教义，也是喇嘛演说及辩论之所；曼巴扎仓为医学部，为传授医学、培养藏医医务人员的地方；卓德巴扎仓为教义学部，专授藏传佛教教义、教规、教史。1941年，准格尔召有喇嘛820人。1955年，有喇嘛100人。清朝至中华民国时，准格尔召有召地52000亩。文化大革命中，准格尔召的建筑及佛像受到严重破坏，仅存大经堂、释迦牟尼殿、弥勒佛殿、莲花生殿、舍俐庙、经学院、明王殿、五大神殿、王爷府邸、活佛府邸等十多处建筑。1980年后，为落实宗教政策，政府拨款重点修复了大经堂、释迦牟尼殿、弥勒佛殿、莲花生殿，该召庙重新成为准