一度从单檐被改为双檐结构，中华人民共和国成立后又再次还原为单檐。在大跃进和文化大革命期间，大殿多次遭受破坏，陈设和构件多次被毁坏，于1982年重新修缮完成，于1987年随真如寺一同修缮完毕，并且对外开放。1996年11月20日，真如寺大殿被国务院公布为第四批全国重点文物保护单位。
历史.真如寺大殿为真如寺的主要建筑，始建于元代延祐七年（1320年），曾于明洪武年间、弘治年间、崇祯年间进行过三次大修。清咸丰十年（1860年），真如寺在兵乱中被毁，光绪十一年（1895年）僧念伦募捐重建