木户幸一被远东国际军事法庭以战犯之罪名逮捕。为了保住天皇，木石幸一认罪，希望把所有的责任揽下来，并主动交出自己的日记作为证明。木户幸一宣言他为了终结太平洋战争，有处理终战工作，使昭和天皇能顺利颁布终战诏书、自己是反战的、不该被逮捕。此类发言使同为战犯的武藤章和佐藤贤了大怒。大骂木户幸一厚颜无耻。同时，英国法官也不採信木户幸一的话，认为如果天皇真的反战，木石幸一作为臣子也应该全力反战。他被判有罪，在十一国大法官投票表决时，以五票賛成、六票反对而免被判死刑。后判处终身监禁，判决后服刑于东京巢鸭监狱（すがもこうち