且港独是可行并有其理据。又指出中共政权并不合法，因它并非从合法渠道选出，亦不尊重人权，质疑它没资格管治香港。林荣基认为中国即使再历三千年也不会变，劝人不要打算改变它，有条件的人应该离开，像他一样没打算离开的人就应抗争。2017年1月7日，林荣基在《众新闻》的专访中，再次表示对港独的看法。他表示，「港独，到2047也不可能发生，因地域、经济、资源等各种限制，令香港无法自主。它是一个伪命题，却可以成为香港人争取落实真一国两制、保住自由思想的筹码。大陆最怕就是你多讲，将港独思潮蔓延影响台湾、新疆、西藏等。」