，与郡中名士张采、杨廷枢、杨彝、顾梦麟、朱隗等十一人组织复社。崇祯三年（1630年）应天乡试举人。崇祯七年（1634年）中进士，官至礼部主事、吏部郎中。崇祯十年（1637年）薛国观因收受吴昌时的赂金，事发被弹劾免职，最终自尽死。昌时后依附周延儒，崇祯十四年（1641年）二月，经张溥、吴昌时的竭力策划，周延儒任相，昌时为文选郎中。昌时与董廷献狼狈为奸，把持朝政。最后吴昌时用药毒害张溥，“以一剂送入九泉”。亲家徐汧见昌时结怨太多，料定必定遭祸。祁彪佳首劾吴昌时紊制弄权，随意将御史外调。御史蒋拱宸弹劾吴昌