年11月11日的总统大选竞选中，以选举舞弊的方式连任成功，成为菲律宾史上第一位连任成功的总统。1960年代末期，由于不平等的加剧、暴力、和马科斯的任人唯亲，菲律宾在政治、经济、社会都出现混乱。并且在1969年出现了反政府的军事力量新人民军，并且与菲律宾共产党合作，成为菲共的游击组织，宣布以武装革命推翻政府，实施社会主义。1970年代随着学生运动的兴起、菲共新人民军的扩大做乱，在1970年1月爆发流血冲突，抗议的学生甚至企图冲进总统府马拉坎南宫与军警发生冲突。加上菲律宾南部民答那峨岛上伊斯兰教分离主义