，维吉尼亚州西北部的居民因为拒绝脱离联邦政府，最终脱离维吉尼亚州，并宣佈将逐步废除奴隶制度，该州于1863年正式以西维吉尼亚州的名义加入联邦。除维吉尼亚州之外，其他南方各州也曾零星发生类似的反独立运动，不过都被南方邦联以军事戒严的方式弭平。另一方面，新墨西哥州虽然效忠联邦政府，但是该州南方各郡县决议脱离联邦，并以亚利桑那领地的名义加入南方邦联。虽然新墨西哥州从未宣布脱离联邦政府，但是南方邦联宣称拥有新墨西哥州的主权，并曾于1862年3月13日至4月6日间，短暂地佔领其首府圣菲，不过南方邦联并未进而筹组新墨西