气公司共生产了40台U50C型柴油机车，全部交付联合太平洋铁路使用，机车编号为5000～5039。然而，实际运用证明了U50C型柴油机车是一款失败的产品，虽然其整备重量已经比U50型柴油机车大幅减轻，但由于设计上的缺陷导致各种故障频生，例如因为全车采用了铝质电线取代铜质电线以节省成本，导致经常发生因电流过大使导线过热的火灾事故；从燃气轮机车拆下来的三轴转向架亦难以承担车体重量，导致转向架铸钢构架容易发生疲劳开裂；其他问题包括冷却水管路泄漏、制动电阻带过热融化、柴油机燃油供给压力过低等等。相比之下，同属通