与李茂贞和华州镇国军节度使韩建支持王珙继任河中节度使不果，与李茂贞、韩建一同逼宫。王行瑜、李茂贞的军队都是身经百战的边军，昭宗不是对手，于是为三帅所迫，杀宦官西门君遂及宰相杜让能，赐王行瑜铁券。干宁二年（895年）王行瑜以侍中兼中书令擅权，要求担任尚书令，韦昭度密奏：“太宗以尚书令执政，遂登大位，自是不以授人臣。惟郭子仪以大功拜尚书令，终身避让。行瑜安可轻议！”于是帝命李磎（一作李谿）为相，加王行瑜尚父。王行瑜得知内情，大恨，联合李茂贞、韩建，杀韦昭度、李磎，谋废昭宗。李克用率军南下勤王，十一月，李罕之