一役后被免去军职，直到1782年才短暂重返大陆军。
晚年.盖茨在美国独立战争后回到维珍尼亚州的种植园。他在1790年出售田产，举家搬到纽约，尝试重过新生。1800年美国总统选举前夕，约翰·亚当斯的美国联邦党与汤玛斯·杰佛逊的民主共和党正在激烈竞争。盖茨在阿龙·伯尔的游说下，代表共和党参与纽约地方议会选举，并且在选举胜出。但此举却令到他与亚当斯、丹尼尔·摩根、及等人的长年友谊彻底破裂。议会任期结束后，盖茨开始低调生活。1806年盖茨因病去世，在纽约三一教堂近华尔街旁的墓地下葬。