中的两股核苷酸互以相反方向排列，这种排列方式称为反平行。脱氧核醣核酸链上互不对称的两末端一边叫做5'端，另一边则称3'端。脱氧核醣核酸与RNA最主要的差异之一，在于组成糖分子的不同，DNA为2-脱氧核醣，RNA则为核醣。两股脱氧核醣核酸长链上的硷基以氢键相互吸引，使双螺旋形态得以维持。这些硷基可分为两大类，以5角及6角杂环化合物组合而成的一类称为嘌呤；只有一个6角杂环的则称为嘧啶。组成脱氧核醣核酸的硷基，分别是腺嘌呤（adenine，缩写A）、胞嘧啶（cytosine，C）、鸟嘌呤（guanine，G）