剥兵丁，复任科敛”的事件，后壁昌又任福州将军。道光二十三年（1843年），壁昌升任两江总督。因当时正值清朝战败，签署《南京条约》后，所以壁昌为了加强海防，便奏请增设福山镇水师总兵。随后他又在五龙山、北固山以及圌山关、鹅鼻嘴等地修筑炮台炮堤。任职期间，御史刘良驹曾奏请清廷将北方商贩凭票运销食盐的制度向南推行。壁昌上疏以“淮南地广引多，价昂课重，行销之不齐，堵缉之难易，与淮北迥别”等理由反对，最终清廷接受了他的意见，票盐制未在淮南推行。
晚年.道光二十七年（1847年），壁昌进京觐