氧气中稳定同位素（stable isotope）的比例去重组古代气候，另一方面也可以利用测定碳中稳定同位素（stable isotope）的比例去重组碳循环的历史及古海洋生产力；参看δ18O及δ13C。浮游有孔虫门生物化石记录的地理模式亦可以用作重组古代洋流情况。因为部分有孔虫门生物只可以在特定环境中找到，它们可以用作找出每种古代海洋沉积物所沉积的环境。
气候及环境的生物指示剂.基于对于生物地层学有价值的同样原因，活有孔虫门生物的集合物亦被利用作为海岸地区的生物指示剂（bioind