风潮，姚文元等公开与其论战，该批判受到毛泽东的重视。文化大革命开始后，时代精神汇合论被列入“黑八论”进行重点批判。周谷城被当作反动学术权威遭到批斗，在北京某中学任教的大女儿也受牵连而被红卫兵打死，另一位女儿也遭迫害死亡。周谷城是中华人民共和国成立后复旦大学首位教务长，在任内经历了1952年高校院系调整，为维护复旦大学教学秩序和对新进人员的妥善安排进行工作。与此同时，他也积极参加并组织学术团体。中华人民共和国建国初期，曾担任中国科学院历史一所学术委员会委员。后又创建了上海市历史学会，并曾先后担任过中国史学