12年5月17日，民国北京政府任命末任阿尔泰办事大臣、旧土尔扈特部郡王帕勒塔（帕拉图）为阿尔泰办事长官，其辖区又称为“阿尔泰区域”，直属于国务院。时值外蒙古独立，外蒙古军队于8月攻陷了科布多城，乘势西进阿尔泰。同时，俄国趁乱直接出兵布尔津一带。新疆督军杨增新将驰援科布多的军队改派往阿尔泰，驻守承化寺、元湖（在今奇台县东北）与拜塔克山（北塔山）及布尔根河一带的察罕通古，后保有阿尔泰大部份地方。民国初年，阿尔泰之蒙古牧地仍置三部十旗，旗名有所变化。阿尔泰乌梁海分为左、右翼二盟，常简称为“乌梁海”。191