争议.
马偕医院肩难产.1994年，马偕医院肩难产事件，台湾首宗涉及医疗行为是否属于《消费者保护法》规范领域事件。
跨性别身分.2010年，总院资讯工程师周逸人因其跨性别身分遭院方开除，法官判定院方违反《劳动基准法》。
申请美国签证指定医院.2011年，美国在台协会申请美国签证指定医院，将申请人由内科转诊至精神科。
酒精稀释药剂疏失.2017年，一名早产男婴住院返家后，