为美以美会（1939年更名卫理公会），总部设于福州仓山天安堂。1949年福建省基督新教信徒超过10万。目前福建省基督新教信徒人数为68万，其中福州市超过20万人，而其中福清市约有10万人。有不少着名的中国教会领袖来自于福建省，例如宋尚节、倪柝声和王载。
江苏.太平天国时，曾有若干传教士前来访问，但是新教在江苏省的永久性传教事业开始于1867年（不含上海市）内地会传教士童跟福（G.Duncan）进入南京（后来转交给新来的其他差会），次年戴德生亲赴扬州，而引发扬州教案，1868