片5000多张、实物13000多件，从战国到当代的各时期海关文物都有。重要藏品有“关”字瓦当、粤海关十两银锭、大龙邮票、1894年《中国灯塔图》、总税务司赫德用过的邮袋、李鸿章写的“津海新关”木匾等等，以及中华人民共和国第一任海关总署署长任命书、见证邓小平南巡的“海关902”艇等。此外，藏品还有海关查获的战国青铜剑、11世纪观音立像、雪豹标本、东北虎皮等走私物品。2007年12月28日，中国海关博物馆广州分馆在广州开馆，馆址位于全国重点文物保护单位粤海关“大钟楼”。