任香港敎区主敎汤汉于2017年8月1日荣休后，杨鸣章接任香港主教一职。2018年12月24日平安夜，杨鸣章主持平安夜子夜弥撒，并讲道约10分钟，当时精神没异样，这是他去世前最后一次公开露面。同年12月27日，杨鸣章因肝硬化导致肝衰竭，入住山顶嘉诺撒医院治疗，及至2019年1月2日晚上，有消息传出杨鸣章已处于弥留状态，惟遭时任香港教区副主教蔡惠民否认。2019年1月3日，他因肝衰竭去世。香港教区暂由辅理主教夏志诚管辖。杨鸣章离世前任明爱专上学院及明爱白英奇专业学校校董会主席，遗愿是希望该院校能升格