亭先后与马淳、庞士谦等人在重庆、北平创办伊斯兰经学研究班、北平回教经学院等新式伊斯兰教学校。1947年，马松亭创办“月华文化服务社”，出版《月华周报》。中华人民共和国成立后，1952年马松亭接受中央人民政府政务院总理周恩来邀请，从香港回北京，担任西单清真寺教长。1953年，马松亭参加赴朝慰问团，到抗美援朝战场慰问中国人民志愿军指战员。1953年起直到逝世，马松亭历任中国回民文化协进会副主任、中国伊斯兰教协会副主任、中国伊斯兰教经学院副院长、中国伊斯兰教经学院名誉院长（1980年至1992年）、中国回民教