1月，他转到了第1潜艇舰队服务，成为潜水者号潜艇（Plunger）的舰长。此时的美国海军潜艇技术仅刚起步不久，该舰也为美国海军最早的一级潜艇。尼米兹和当时大部分的军官一样，希望于战舰上服役，对于被派到潜艇一事相当失望，他形容潜艇是「儒勒·凡尔纳的幻想与座头鲸的结合产物。」1910年2月2日，尼米兹转至真鲷号潜艇（Snapper）担任舰长。1911年10月10日，尼米兹跳过中尉，直接晋升为上尉，同时被任命为第3潜艇舰队与独角鲸号潜艇（Narwhal）的指挥官。尼米兹也开始研究潜艇动力的设计，他为美国海军引入较