动九一八事变，吴闿生返回北京，于保定莲池书院等地继续授徒讲学。 八年抗战期间（1937-1945）吴闿生隐居着述。抗战胜利后，他在北京继续讲授桐城古文义法，直到民国三十八年病逝于北京家中。
学生.他的学生中知名的有贺孔才、于省吾、潘伯鹰、齐燕铭、谢国桢、曾克耑等。