。当都督一职出现空缺（例如死亡、或两任都督交替间的空档）时，马尼拉皇家审问院会指派其中人员担任都督。
日本军事佔领时期（1942年-1945年）.1941年12月，日本入侵了属于美国殖民地的菲律宾。1942年，大日本帝国派比岛派遣军司令官，以方便管理佔领地菲律宾。