息后，正式取代文仙尼成为国际米兰新主帅，并成为意大利足球甲级联赛历史上最高薪及当时意甲唯一一位外籍教练。2009年5月17日，在穆里尼奥领导之下，国际米兰提前三轮获得2008/2009年度意甲联赛冠军。翌年，穆里尼奥又带领国际米兰成为意甲联赛冠军、意大利盃冠军。他更带领国际米兰于16强以2:1及1:0击败在老对手安切洛蒂的带领下的前僱主——英超冠军切尔西；再于8强里两回合均以1:0击退俄超盟主莫斯科中央陆军；至4强则面对巴塞罗那，穆里尼奥不但在主场反胜3:1，更在鲁营球场于大部份时间只剩十人应战的情况下