使在其卸任台北市长二十年后，陈水扁在民意调查中依然排行为历任最佳的台北市长。陈水扁在2000年中华民国总统选举，以39.3%得票率当选为中华民国自1948年行宪后首次政党轮替的直接民选总统，结束中国国民党在台湾55年的长期执政，并于就职演说上提出四不一没有；2004年中华民国总统选举，他取得50.11%的得票率，以0.22%差距获得连任。任内推动一边一国、台湾正名运动以及台湾入联运动，在经贸方面则採用「南向政策」的经贸架构。卸任总统后由于涉及龙潭购地案而被判刑20年，三审定谳发监执行，2015年1月