列上含有两个非转译RNA基因，分别是Xist与Tsix，此两者参与了去活化作用。此外，XIC上含有一些结合位置，分别可供一些已知和未知调控蛋白（regulatory protein）结合。
Xist与Tsix基因.Xist基因会转录出RNA分子，且此RNA将不会转译成蛋白质，Xist是X去活化的主要影响因子，失活的X染色体外围会被XistRNA包覆，而Xa则没有这种现象。Xist是唯一会由Xi表现的基因，缺乏Xist基因的X染色体将无法去活化。而若以人工方式将Xist基因表现于其他