上呈同治帝，同治皇帝认为事件不可思议，并面报两宫太后，随即下旨刑部，令浙江巡抚杨昌濬重新审讯，并遣监察御史王昕私访民间，得知爱仁堂并无卖砒霜。可惜杨昌濬为保面子和曾参审官员的乌纱帽，竟依仗左宗棠拥兵边疆之势，复以「通姦谋命」上奏。杨昌濬曾令嘉兴知府许瑶光审问。许瑶光不动刑，叫杨乃武及秀姑照实说，于是犯人尽翻前供，当堂唿冤。审两个多月后，许瑶光不敢定案上复，未能讯结。同治帝委浙江学政胡瑞澜为钦差大臣，重审此案。但胡对刑法无知，敷衍上谕，刘锡彤又用重金贿赂了胡瑞澜左右官员，以严刑逼供。葛毕氏受不了烧红铜