它兽脚类恐龙相比相当独特，因此将此科分类于个别的似鸟龙下目。似鸟龙下目与似鸟龙科的差异，随者不同研究人员而有不同结果。例如，保罗·塞里诺（Paul Sereno）在1998年将似鸟龙科包含所有的似鸟龙下目恐龙；但他后来将似鸟龙下目扩大范围，成为一个基群演化支，并将先进的似鸟龙科置于似鸟龙下目之内，这个分类法出现在2000年代早期的大部分文献里。似鸟龙科的物种有：似鹅龙、古似鸟龙、似鸸鹋龙、似鸡龙、似鸟龙、中国似鸟龙、似鸵龙；其中似鸵龙与似鸟龙、似鸸鹋龙有较多的相似处，因此这三属过去曾有混淆的分类历史。S