分泌下降使保护性粘液减少，胃粘膜逐步萎缩。而胃手术后的胆汁、胰液和肠液的反流更损害胃粘膜，形成慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生和不典型增生。胃酸减少有利于细菌在胃内的繁殖。细菌毒素及胆汁被细菌分解的代谢产物，可有促癌作用。而含硝酸盐还原酶的细菌更能促进致癌物亚硝胺的合成。在这些促癌物的作用下，胃粘膜可能癌变。胃手术后的疤痕甚至不吸收缝线的刺激，亦可能是残胃癌发生的因素之一但成因可能较小。总之胃手术改变了胃的正常生理，更多地暴露于致癌、促癌物的作用之下，当机体免疫功能低下时残胃癌即可发生。这也导引了一个观点