双方在四条附近激战，最终二人被逼自尽。六波罗的追查也波及到了朝廷。资朝・俊基等人被治罪，押解到镰仓。资朝被判流放佐渡岛，俊基被赦免归京，但之后被禁足。另一方面，后醍醐天皇派侧近万里小路宣房带着解释信前往镰仓，说明自己跟这次的事变无关，因而免于责罚。军记物语『太平记』在第一卷记述了正中之变的细节：倒幕的秘密会议是以无礼讲（不拘身份的宴会）的名义进行的。参与计划的土岐赖员在某一天夜里把计划泄露给了自己的妻子，而其岳父斋藤利行正是六波罗探题的奉行，倒幕计划因此流产。另外，西大寺的律宗僧人也参与了倒幕。之后