阴道的过度狭窄，甚至仅见留有一小孔隙，常造成男女之间上性交困难，这与阴道增生膈膜不同的是，阴道中央在胚胎发育时增生出来的膈膜，这种闭锁现象有如处女膜，可借由手术切除即可恢复正常功能。阴道缺失在临床上有「盲阴道」、「先天性无阴道」二种：前者是有发育完整的阴道口，唯阴道长度短小，发育时未能与子宫接合，造成阴道失去原本的功能；后者是完全没有发育阴道，使患者在先天上就具有生理结构不存在阴道，通常患者仍保有外观上正常阴道口，少数在先天发育上没有阴道口，也由于卵巢、输卵管、子宫等功能皆为正常，患者可透过手术加装人工阴道