大的标本身长65到75公分，体重约为0.5到0.75公斤。果齿龙是已知体型最小的鸟臀目恐龙。棘齿龙与天宇龙是果齿龙的近亲，他们的体型相当，但目前无法得知栅齿龙与天宇龙的化石的死亡年龄。果齿龙有许多类似畸齿龙的特征，前肢短、胫骨长。果齿龙的上颌具有大型犬齿形牙齿，与下颌齿列的空隙互相咬合。棘齿龙的上颌，并不具有大型犬齿形牙齿。与其他畸齿龙科不同，果齿龙的犬齿形牙齿前方，有一颗小型棒状牙齿，并具有牙齿生长替换的迹象。果齿龙的后肢骨头中空，这点与许多小型兽脚类恐龙相同。果齿龙的亲缘关系较接近畸齿龙，而与年代相