江而下，八月，抵达宜兴，避居芙蓉山养病。次年，嫁长女与崑山朱氏。万历十年（1582年）底，沿陆路北上，冒雪还朝。十二月，补翰林院侍读。万历十二年（1584年）二月，詹事府坊局掌印官空缺，徐显卿升任左春坊左谕德兼翰林院侍读，掌管本坊印信。十一月，升任国子监祭酒。万历十三年（1585年）二月，充任经筵讲官。四月十六日，神宗布袍步行前往天坛祷雨，百官遂从，显卿以祭酒导驾前驱。十月，改任詹事府少詹事，充日讲官。万历十四年（1586年）五月，充《大明会典》纂修官。六月，升任詹事府詹事兼翰林院侍读学士，并掌院事。