庵事件等民众反抗，台湾人受株连者颇多。1923年派任第9任总督，当时宰相山本权兵卫原打算推举山梨半造为台湾总督，然而田健治郎以熟悉台湾事务为由大力推荐内田嘉吉，首相才放弃原先想法。其任内发生压迫台湾议会设置请愿运动，检举台湾议会期成同盟会会员，引起治警事件。逮捕台湾智识份子，就任未满一年，因民政党内阁成立，山本权兵卫内阁垮台而撤职。内田嘉吉是唯一担任过民政长官与台湾总督的官僚。台湾文学家陈虚谷先生于《应社诗荟》〈内田总督撤职有感〉有诗评之云：「来是堂堂去杳然，此时心事亦堪怜，也应舟出基隆港，感慨荣枯