1992年、1994年和1995年，他们再获台湾蒋经国国际学术交流基金会与香港研究资助局拨款，将魏晋南北朝的传世文献电脑化，并耗时多年，陆续出版成《魏晋南北朝古籍逐字索引丛刊》，这些工作大大便利了中国文史哲方面的研究。刘殿爵晚年退居中文大学校园，曾患肺癌，但后来治癒。在2010年初，刘殿爵因肺部感炎，多次入院接受治疗，虽然怀疑是肺癌复发，但没有带来很大痛苦。 在同年4月中，他再因唿吸困难入院，并要靠氧气罩唿吸，至4月22日病情恶化，不少师生好友均前来探望。 刘殿爵在2010年4月26日以89岁高龄病逝于