多个本土团体至中华民国教育部前抗议，要求中华民国教育部撤换身分特殊的课纲总召王晓波及课纲委员谢大宁，并再加开公听会。民进党则发表声明，要求停止调整高中课纲。2014年1月27日，约有两百位民众至教育部前提议。但12年国教课程审议会最后确定通过，国文及历史、地理、公民共四科课纲的「微调」。修改部分包括将所有「中国」改为「中国大陆」、「荷西治台」改为「荷西入台」、日本统治时期增加「殖民」两字等。2014年1月29日，台南市市长赖清德宣布台南市拒用教育部的最新课纲。2014年2月5日，民进党中常会决议