属于马其顿，直至公元前168年彼得那战役后独立为止。维斯帕先在公元70年结束了萨莫色雷斯的独立，并把她纳入了罗马帝国的领土。
后罗马时代.拜占庭帝国管辖着萨莫色雷斯至1204年，后来则由威尼斯人佔领并管治至1355年，被一热那亚家族赶出为止。鄂图曼于1457年征服了萨莫色雷斯，因此以土耳其语改称为"Semadirek"。在1913年巴尔干战争后，萨莫色雷斯重新回到了希腊的统治之中。
现代.在二战期间，保加利亚曾佔领萨莫色雷斯，于战败后归还。现