甲醇钠可作为强碱发生很多反应，如羟醛反应、克莱森缩合反应、Horner-Wadsworth-Emmons反应等，用以提供强碱性甲氧基负离子CHO，夺取化合物中的活泼氢。在威廉姆逊合成法中，甲醇钠与氯代烃反应，氯离子离去，产物为甲基醚：甲醇钠也可用于生物柴油的制造中。储存时，甲醇钠逐渐被空气中的水分分解变质，使用时需要注意。