堂在1874年于东京，由巴黎外方传教会所建。7月2日，他们向日本政府购买了900平方米的土地修建天主教堂，并于同年11月22日竣工。自那以后，该教堂成为了在日本、尤其是东京以北地区的传教基地。1877年7月，就任日本北纬宗座代牧区首任主教的，选择该教堂为教座所在地；同年12月，砖造的正式教堂开始修建，于1878年8月15日完工祝圣启用。1891年，日本北纬宗座代牧区升格为东京总教区，该教堂延续为教区的的主教座堂，直到1920年迁至关口教会（东京圣玛利亚主教座堂）为止。1923年，该教堂建物因关东大地震而