签订《马关条约》，割让台湾、澎湖与辽东半岛。明治二十九年（1896年）临时台湾铁道队鑑于清朝所建的铁路蜿蜒迂回，将刘铭传铁路大幅改线。三十四年（1901年）为能有效率的由淡水港运送物资，将刘铭传铁路基隆~台北路段拆除，拆下的路轨用以铺设台北~淡水21.2km的铁路线，命名为淡水线，于8月25日通车。三十五年（1902年）2月1日设立大稻埕车站，6月1日兼办客运，三十六年（1903年）成为淡水线始发车站，四十一年（1908年）迁至清代台北车站旧址。大正四年（1915年）8月17日改大稻埕车站为货运站，客运业务