。耿炳文被罢免职务，赋闲在家。刑部尚书郑赐、御史陈瑛在永乐元年（1403年）弹劾耿炳文「衣服器皿有龙凤饰，玉带用红鞓，僭妄不道」，耿炳文上吊自杀，终年七十岁。耿炳文的三个儿子前军都督佥事耿璇、后军都督佥事耿瓛、尚宝司卿耿瑄也都受到牵连被杀。但是，根据顾诚在《靖难之役和耿炳文、沐晟家族——婚姻关系在封建政治中作用之一例》一文中的考证出耿炳文在靖难之役中于真定死难，这种说法并没有得到史学界的认可。
家庭.炳文长子耿璇是懿文太子朱标长女江都公主的驸马。他和兄弟耿瓛（后军都督佥事）、耿