国交通部是台湾航业的最大股东，占总股份的四分之一左右。截至2017年时，台湾航业自有散货船合计二十二艘，其中包括六艘巴拿马极限型与十三艘轻便极限型船，另有拖船九艘、代营台电两艘，另还有租赁的两艘货柜船用来经营台海两岸航线，还有一艘客轮台华轮航行高雄港与马公港间。散装航运业务佔整体公司营收的六成，货柜则为一成七，客运及港口勤务各佔5%左右，代营业务为10%。
历史.1946年1月，「台湾航业公司筹备处」成立。1946年7月1日，「台湾航业有限公司」成立，资本额为法币一百亿元，总部设于