究表明，土壤中蠕虫的排泄物是周围的150毫米深度内环境能被植物利用的氮的五倍，磷的七倍，钾的十一倍。每条蠕虫每年可排出4.5千克的排泄物。同时，蠕虫通过挖洞，增加了土壤的多孔性，制造了能用于通风与排水的孔道。
微生物.土壤中的微生物在土壤营养方面也扮演着重要的角色。例如，一些自养或异养的微生物可以固氮。这些细菌有固氮酶可以将空气中的氮气与水化合来制造氨水，又被细菌利用来转化成其他有机化合物。有一些固氮细菌如根瘤菌在豆类植物的根部生长。根瘤菌与豆类植物组成了一种互利共生的关系，以氨水