944至1945年1月间，斯瓦洛夫斯基在纳粹占领的波兰克拉科夫担任波兰总督府下属乐团的首席指挥。二战结束后，斯瓦洛夫斯基曾短期被美国军事政府列为针对艺术界人士去纳粹化的“黑名单”。战争的动荡过后，斯瓦洛夫斯基的职业生涯终于逐渐稳定下来，先后担任维也纳交响乐团首席指挥（1946－1947年）、格拉茨歌剧院总监（1947－1950年）、首席指挥（1957－1959年）。1946年起，斯瓦洛夫斯基在维也纳音乐与表演艺术大学担任指挥系教授，培养出了一大批杰出的指挥家，包括：克劳迪奥·阿巴多、费舍尔·伊万、马里斯