而托勒密的舰队仍是相当强大，尽管于公元前259年，罗德岛的舰队曾在以弗所附近击败一支埃及海军分队。因为大部份关于第二次叙利亚战争的资料均已遗失，对科斯岛战役发生的年代不是很确定。时间主要是从战役当年曾举办地崃运动会所推得出来的。两军相遇在东爱琴海的科斯岛附近，战争详细不清楚，已知安提柯二世亲自率领马其顿舰队，且埃及的舰队几乎是他的两倍。尽管如此，在安提柯付出惨烈的代价后嬴得这场胜利。战后，安提柯在许多方法庆祝这场胜利，更在爱琴海的新领土建造纪念物。此战使托勒密王朝丧失许多爱琴海岛屿，使第一次叙利亚战