任期内最难忘是2014年10月2日雨伞革命期间，与时任香港大学校长马斐森到金钟探望学生，强调当时最担心学生因冲突造成损伤。2017年沈祖尧决定辞任中文大学校长，结束7年中大校长生涯，亦代表香港三大大学校长均先后在该年辞职。2018年1月起校长一职由段崇智接任。
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