兴南客运新化站是台南市政府规划的大台南公车转运站，位于台南市新化区中山路211号，邻近新化老街，经台南市政府补助兴南客运进行改善工程，于2014年2月22日重新启用。本站为行驶台南市区往来山区、及南科地区的绿干支线主要转运中枢。 
乘车月台.新化站的月台并没有编号，原则上最多停4辆公车，从候车处看最右边通常是绿干线往台南转运站方向，右2位通常是绿干线往玉井站方向，左边其余2个位置为绿支线的乘车处，如绿干线多班进站时，则左边2位原绿支线位置会让绿干线优先停放以利方便上下客。