.大部份的松柏门植物是雌雄同株的，但也有一些是雌雄混株或雌雄异株的；所有的松柏门植物都是风力授粉。松柏门植物的种子会被包在一个称为孢子叶球的毬果之中。毬果成熟要花四个月至三年的时间，且大小由2公釐至60公分长的都有。松科、南洋杉科、金松科和大部份的柏科，其毬果皆是木质的。当毬果成熟时，毬果的果皮会打开来，使种子可以掉出，且由风力传播。一些冷杉属和雪松属植物，其毬果会裂开来释放种子。另外，有些松属植物会产生松子，可以经由鸟类（主要是星鸦和松鸦）来传播。成熟的毬果可能持续留在植物上一段不同的时间后才掉落地