外还有α,β-型的新海藻糖和β,β-型的异海藻糖两种异构体，但在自然界中很少见。生物合成海藻糖是为了储存能量和吸收水分，用来对抗冰冻和缺水。从稀乙醇中析出的海藻糖二水物为无色或白色斜方晶系双榍状结晶，有甜味。用作食品添加剂（保水）和甜味剂，甜度相当于蔗糖的45％。由于不属于还原性糖，因此与氨基酸和蛋白质共热时不会发生美拉德反应褐变。
醣基海藻糖.醣基海藻糖(Glycosyl trehalose)为醣基化的海藻糖。
合成.1994年，日本林原（HAYAS