联合政策委员会同意而行动，其第一次会议于9月10日在五角大楼举办。在协定执行过程中，芝加哥大学冶金实验室和蒙特利尔实验室之间的合作方式曾有过一些问题。1944年2月17日，联合政策委员会的会议上，查德威克提出希望在加拿大建设一个核反应堆，即后来的粉笔河实验室，并为其分配所需资源。英国和加拿大同意为这项工程付出更多代价，而美国方面的态度比较复杂。科南特对重水反应堆感兴趣，但是不愿支持查德威克的提案，因为这项工程对战争起不到什么作用，而美国需要为其提供重水。格罗夫斯则愿意支持这项工程，但是有一些附加的条件。