以提供人体内部三维图像。除了在医学上，伦琴射线还应用在微观世界的观察和对太空的研究。另外一个伦琴射线的重大应用领域是材料无损探伤。使用伦琴射线可以检测出金属材料和焊接部位的内部缺陷。为了纪念伦琴的成就，X射线在许多国家被称为伦琴射线。另外第111号化学元素錀（Roentgenium (Rg)）也以伦琴命名。在伦琴的祖国，德国有许多以伦琴命名为学校，街道和广场。由于伦琴在物理学的杰出成就，在德国的吉森市，柏林市和伦琴的出生地伦内普（Lennep）（雷姆沙伊德）都建有伦琴纪念碑。