他兼任公务人员退休抚卹基金管理委员会主任委员。2008年，马英九政府上任，朱武献被特侦组以「涉嫌贪污」展开侦查。特侦组表示，是接获检举，指称朱武献涉嫌利用操盘退抚基金机会收受退佣，涉嫌贪污。后来司法无罪，还其清白。2011年2月24日，朱武献与苏进强担任国家展望文教基金会中国研究中心共同召集人。2015年，朱武献担任全国宗教联合发展基金会董事长。2016年12月3日，下一代幸福联盟号召群众走上台北市凯达格兰大道反对同性婚姻法案，朱武献以全国宗教联合发展基金会董事长身分发言，同性婚姻法案会让家