集团中营运规模最庞大的公司，在东京首都圈拥有庞大的铁路运输路网。JR东日本在1987年（昭和62年）4月1日随着日本国铁的分拆与民营化而成立，主要经营原日本国铁在东北与关东地方全域、甲信越地方大部分地区、以及静冈县部分地区的在来线客运业务，并负责经营本州东部的新干线路线。其企业代表色是绿色。截至2015年10月1日，其营运路线长度达7,458.2公里，是JR集团各公司中最长的，每日平均乘客数达1,659万人次（2010年度）。除了铁路运输的本业之外，车站内的商业设施、以及以Suica为首的也是其重要收入