菲律宾人非常宽大而遭到撤职，被半拘留在日本本土。1945年12月19日，二次大战结束后，麦克阿瑟元帅将本间送往马尼拉的法庭接受审判，被认定为乙级战犯，1946年2月11日本间被追究在菲律宾攻防战期间涉嫌巴丹死亡行军的责任，被判处死刑。同年4月3日在马尼拉郊外遭枪决死亡。
其他.
处刑方式.有别于其他战犯多以绞刑处刑，本间雅晴是以枪决方式处刑。这件事由当时负责审判的五人小组之一的将军在1971年的一次访问中回顾：「..我只能在他的处刑方式上提出以像士兵般被