外，深圳地铁与香港的港铁东铁线均连接到深圳市与香港边界的两个铁路口岸——罗湖口岸和福田口岸，乘客乘坐深圳地铁抵达这两个口岸并完成通关手续后，可转乘落马洲站及罗湖站（港铁）的港铁东铁线前往红磡站（未来终点站为金钟站）沿途各站。深圳市的六大交通枢纽——深圳北站、前海湾、福田、机场、布吉（深圳东站）和深圳坪山，设计上都有地铁连接，除深圳坪山站因地铁16号线（前地铁12号线）仍未建成外，其余枢纽均有地铁通达。
结构和形式.深圳地铁现有车站155个（换乘站重复计算），包括122座地下站、