植物标本室研究香港的植物，并利用本土植物改善郊野环境，现时渔护署已採集超过100种本土品种的种子在苗圃培育成树苗作植林之用，其中如润楠 、裂斗锥栗及木荷等已成功用作植林。香港植物标本室成立于1878年，位于长沙湾政府合署7楼，藏有约41,000个植物标本，主要是本土的维管束植物，亦有华南地区及东南亚国家的标本，馆藏标本中有200多个模式标本。原为荒废梯田的城门标本林佔地4公顷，于1970年代初已开始种植，现已收集共约300多个本地或华南地区土生的植物品种。
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