被任命为东省铁路护路军副司令。翌年，升任总司令，并兼任依兰地区警备司令。1934年（康德元年）7月，任第4军管区司令官兼北满铁路护路军总司令。翌年，改任第1军管区司令官，获授陆军上将衔。1937年（康德4年）3月，兼任奉天地区警备司令部司令官，7月兼任三江省省长。1939年（康德6年）4月，于琛澂被任命为治安部大臣，升陆军上将。然而，他后来因过度饮酒而在关东军高官面前失态。因此，他于1942年（康德9年）9月被罢免。1944年（康德11年），于琛澂病逝。享年58岁。