因为鹦鹉嘴龙已发现了数百个化石标本，而大部分其他恐龙标本远少于这个数目，许多甚至只发现单一标本。因为众多的化石，古动物学家能更完整地研究鹦鹉嘴龙的不同差异，进而造成更多的有效种。目前已发现超过400个鹦鹉嘴龙标本，发现于中国、蒙古国、俄罗斯，可能还有泰国。古动物学家主要根据头颅骨、牙齿的不同差异，或者是採用骨盆的特征，来建立、鑑定鹦鹉嘴龙的不同种。部分物种由于化石材料的残缺或不齐全，并没有体型的估计值，但可借由比较不同种的头颅骨、股骨长度，来估算大致的身长。就目前的18个已命名种中，模式种蒙古鹦鹉嘴