经费、军事行动计划、密电码、独立宣言、新宪法草案等，格雷罗再在此期间也设计了巴拿马国旗。1903年11月，在美国海军的配合下，巴拿马爆发了一场几乎不流血的革命，目的是从哥伦比亚独立，哥伦比亚政府立即派兵镇压，11月2日美国下令派四艘军舰开抵科隆市和巴拿马城，控制巴拿马铁路，切断哥伦比亚援军的去路。次日，格雷罗率领反叛者发动政变，逮捕了巴拿马省长和哥伦比亚军队指挥官。11月4日，巴拿马召开了群众大会，宣布巴拿马独立并成立临时政府，格雷罗担任临时总统，6日，美国总统西奥多·罗斯福承认了格雷罗领导的巴拿马政府