生署（Medical and Health Department）成立于1939年，首长为医务卫生总监。1953年7月1日，非紧急救护服务由香港消防队 (H.K.F.B.)接管；1968年起所有政府救护车都归拨香港消防事务处管理，而救护总区就成为了纪律部队的一份子。1989年4月1日，医务卫生署重组成医院事务署及衞生署两个部门；衞生署并接管文康市政科部份卫生工作。1990年，医院管理局成立，负责管理全香港公立医院。2012年4月9日，世界衞生组织委託香港衞生署成立全球首间控烟及烟瘾治疗合作中