不同于标准二十种的氨基酸在翻译过程中被掺入蛋白质中：除了用于蛋白质合成的那些之外，其他生物学上重要的氨基酸包括肉毒碱（用于细胞内的脂类转运），鸟氨酸，GABA，和牛磺酸。
蛋白质结构.形成蛋白质的特定系列氨基酸被称为蛋白质一级结构(Protein primary structure)。 该序列由个体的遗传构成决定。 它规定了沿线性多肽“骨架”的侧链基团的顺序。蛋白具有两种类型的由沿着主链氢键的特定模式定义的局部结构的良好分类，频繁出现的元素组成：α螺旋和β折叠。 它们的数