八年（1679年），三藩之乱已近尾声，全国形势相对稳定，又第三度开明史馆，大学士徐元文任总裁，大力延览人才；万斯同不愿接受清朝的俸禄，以布衣入局，寓居徐元文家。康熙二十九年，徐元文被劾解职，当时纂修总裁升沉物故，星换星移，在馆者寥寥无几，万斯同则为总裁张玉书、陈廷敬挽留，馆于京师江南会馆。三十三年由王鸿绪继任总裁，万斯同又受聘于王鸿绪。康熙四十一年，万氏卒于王鸿绪家中，明史稿数百卷，落于王鸿绪之手，以公务之余暇夙夜修订。雍正元年（1723年）六月十七日，王鸿绪进呈明史稿310卷，体例均备，七月十八日内阁将之