学创建之初就已经成立文政与理农两学部（学院），文政学部下置哲学、史学、文学及政学四科，1945年台湾由中华民国接管后设为哲学系，并在台湾最设立哲学研究所。各个学校的哲学系所修习的科目不尽相同，但大多都有个人修养 ﹑逻辑学（理则学）、伦理学、知识论、形上学、美学、中国哲学史、西洋哲学史...等。中国大陆现因共产党统治的关系，都会特别修习的马克思主义哲学。