4月8日由于疾病返回欧洲，向教廷建议将南京教区委托给耶稣会。同年11月13日在那不勒斯去世。1856年，教廷撤销南京教区，改设江南代牧区，托付给法国耶稣会会士，年文思成为首任代牧（法国耶稣会还负责直隶东南代牧区，由郎怀仁任代牧）。在年文思任职的6年中，太平天国破坏了江南除了上海以外所有的天主教传教会。1857年第二次鸦片战争开始，1858年签订了一个条约，但1860年战争再度爆发，战争结束时天主教获得在全中国自由传教的权利。1862年7月31日，年文思主教因霍乱去世。1865年2月2日，郎怀仁主教由直