KEK，是沿用原来的高能物理研究所的略称。同时，原来的高能物理研究所，是日本最早提供全球资讯网服务的公开机构。身为原高能物理研究所教授、基本粒子原子核研究所所长、历任高能加速器研究机构理事、高能加速器研究机名誉教授（2009年1月为特别荣誉教授）的小林诚，在该机构的贝尔实验数据的支持下，得到2008年的诺贝尔物理学奖。
组织架构.由以下四大单位所组成：