一度考虑挂拍，但在港队教练李惠芬的鼓励下放弃了退役念头；并在随后的2005年世界乒乓球锦标赛打进女单四强，又在亚锦赛赢得女单冠军。2008年，林菱来港已经六年，但因未拿到香港的永久居留权，一度未能符合参加北京奥运会的资格；但在香港奥委会会长霍震霆亲赴洛桑向国际奥林匹克委员会主席雅克·罗格求情下，她最终才得以赶及出战奥运。2009年，林菱代表香港出战东亚运动会，一举赢得女子团体金牌 和女子双打（伙拍：张瑞）铜牌。林菱原打算在东亚运后退役，返回家乡福建，到厦门大学攻读中文系学士学位；但最终决定押后退役时