成为继任政府的元首，当时邓尼茨的指挥部正设在弗伦斯堡，所以这个继任政府历史上被称为弗伦斯堡政府。邓尼茨继任后，由于害怕苏联的报复，力图使德国向英国和美国投降，5月6日，继任政府召开第一次会议，邓尼茨下令阿尔弗雷德·约德尔在兰斯向同盟国的代表签署了无条件投降书，5月7日指使威廉·凯特尔在柏林向苏联签署了第二份投降书。丘吉尔在宣告战争胜利时，事实上承认了弗伦斯堡政府和邓尼茨的元首地位，但苏联明确反对，宣布为“邓尼茨帮”，5月23日，英国代表抵达弗伦斯堡宣布艾森豪威尔的命令，解散弗伦斯堡政府并逮捕其成员，