。新潟市同时拥有机场与港口。新潟机场位于东区阿贺野川河口附近，跑道全长2500米，是日本海沿岸的据点机场之一。现在新潟机场运行有7条日本国内航线和6条国际航线。2015年，新潟机场全年乘客数约有98万人。值得一提的是，新潟机场的第一条国际航线是前往俄罗斯的哈巴罗夫斯克的航线，是日本少数冷战时期运行有前往苏联的定期航班的机场。新潟港坐落于全市东北方，分为主要承担客运业务的新潟西港、以及主要承担货运业务的新潟东港两个港区。新潟东港拥有本州日本海沿岸最大的国际海上货柜中心，新潟西港则运行有前往佐渡岛、北海道、