桥面约有10公分的落差，北上桥梁则有56公分的落差，南下桥梁则有20公分的落差。由远处观看玉里大桥，在栏杆上呈现不等高的变形，每年以2至3公分速率仍持续上升当中，此景成为全台湾唯一仅存「会长高」的桥梁，也是全球唯二建造于断层上的桥梁之一，另一座在瑞典。公路总局为养护桥梁，确保行车安全，会进行不定期实施整平工作。此外，中央研究院地球科学研究所在该桥的两端架设监测仪器，目的是为蒐集板块运动的资料，做为学术研究之用。2011年6月，公路总局曾于玉里召开协调会，计画将台9线玉里至富里段的路线进行截弯取直