属最早于1916年由德国植物学家罗柏特·皮尔格依据建立的，并以种的名义置于罗汉松属（）之下，后又被移至三尖杉属（）（或称粗榧属），之后独立出来为穗花杉属，1926年皮尔格根据雄株毬果的复合性将穗花杉属与三尖杉属一同併入三尖杉科（），同科的还有台湾粗榧、日本榧树等，1931年，另一日本学者工藤祐舜观察雌株毬果后认为它不应放在三尖杉科而应成立新科穗花杉科或是作为红豆杉科的亚科或族，所以与另一日本植物学家山本由松一同建议成立穗花杉科，然而，另一日本植物学家小泉源一认为这是完全不必要的，他认为穗花杉属与三尖杉属仍有