1976年，当选为中央研究院院士。11月19日，陈奇禄出任中国国民党副秘书长。1981年－1988年担任行政院文化建设委员会主任委员，同时也担任中华文化复兴运动总会秘书长，至1991年3月27日卸任。2014年10月6日下午3点，陈奇禄因多重器官衰竭于台大医院逝世。