升迁至工部郎中。康熙六年（1667年），升任左副都御史，七年（1668年），出任山西陕西总督，逢陕西饥荒，平凉、临洮、巩昌、西安、延安、凤翔、汉中、兴安等地多逋赋，民众为此困扰，莫洛奏请豁免，又清釐加派、火耗等相关政策的弊端。八年（1669年），辅政大臣鳌拜倒台，有司以莫洛依附鳌拜，请求逮捕，康熙帝认为莫洛有能力，应留任。但次年（1670年），莫洛仍因此去职，陕西民众挽留，同时，甘肃巡抚刘斗同，提督张勇、柏永馥等上疏说莫洛清正，在官有善政，乞求其留任以慰民望。康熙帝答复，“简用督抚，原以绥辑地方，爱养百姓。