永元元年（499年），母亲去世，起复，受号右将军。江祏兄弟图谋拥立萧宝卷的堂兄始安王萧遥光，请求萧坦之协助。萧坦之认为明帝取武帝后人天下已经不能服众，萧遥光再取代萧宝卷只会让天下更乱，拒绝，告发他们的阴谋，以服丧为理由回家。萧坦之的家在东府城之东，扬州刺史驻地靠近萧遥光的根据地。萧遥光夜间起兵，萧坦之穿着裈衣翻墙逃走，从东冶南渡，间道进入建康。萧坦之受假节平定萧遥光之乱，驻军湘宫寺。萧坦之以平乱之功被任为尚书右仆射、丹阳尹，进爵为临汝县公。萧坦之黑胖无胡须，声音嘶哑，当时人称他为「萧痖」。他强狠专执，