刚刚50岁。
执掌北大.2009年，王恩哥回到北京大学，担任物理学院院长、北京大学教授。2011年1月，王恩哥升任北京大学副校长、教务长。2012年6月，王恩哥被任命为北京大学常务副校长。2013年3月22日，王恩哥接替退休的周其凤，成为北京大学校长（副部长级）。2015年2月15日，王恩哥不再担任北京大学校长，转往中国科学院任职。任北京大学常务副校长时，王恩哥提出“小班课教学”概念，在北大全校试点推行教学改革。在北京大学校长任上，王恩哥于2014年5月4日宣布启动燕京学堂项目，此