贸易受到了冲击。虽然朝鲜禁止向日本人传授种植人参的方法，但后来日本国内仍旧成功栽培了人参。另一方面，日本国内银产量锐减，银的输出被禁止，铜和金成为主要输出品。因此在18世纪以后，倭馆贸易就衰退了。
倭馆的废止.1867年，对马藩家老来到釜山倭馆，向兴宣大院君通告了江户幕府垮台、明治政府成立一事。因江户时代对朝通交时幕府将军皆称「日本国大君」或「日本国王」，朝鲜以「日本新掌权者自称天皇」的理由拒绝接受国书。1871年，日本废藩置县，对马藩被废除，对朝鲜的外交权由外务省接收。1872年