环境湿润，风切变也少，风暴有可能进一步强化成飓风。受北面副热带高压嵴出现微弱环节的影响，曼努埃尔起初得以继续保持整体向东北偏北方向移动，但在达到第2波强度高峰后，风暴转向西南方向加速前进。9月15日，气旋以强烈热带风暴标准从米却肯州西南部的阿奎拉（）附近登陆，但美国国家飓风中心在当时的实际操作中以为曼努埃尔的登陆点是在科利马州的曼萨尼约附近。9月16日清晨，环流因受陆地影响而被扰乱，风暴降级成热带低气压，但仍在产生暴雨。当晚，曼努埃尔的下层环流中心在墨西哥西部上空消散。气旋残留沿美国东南部上空的高压嵴边