、副主委应由委员互选；但主委苏蘅、张时中、魏学文及刘崇坚等4委员则同意由政院任命。陈正仓等3位委员还发表不同意见书，认为独立机关若丧失独立性，公正性会被质疑，由行政院长任命主委、副主委，时任执政党就有机会透过监理媒体的独立机关来影响媒体。民主进步党立委管碧玲质疑，过去NCC主委是委员互推，较具独立性，现在主委由行政院长指定对独立性确有损伤。
其他事件.
重要准驳案与法案.2009年8月13日，壹传媒传讯网股份有限公司（后更名为：壹传媒电视广播股份有限公司）申