乌坵地区设乡，指定由金门县代管，此时金门县共辖有金城镇、金沙镇、金宁乡、金湖乡、金山乡、烈屿乡、乌坵乡等二镇五乡。民国48年（1959年）增设金琼乡，并改金湖为镇。民国54年（1965年）9月，撤置金山乡及金琼乡。民国45年（1956年）7月，因为金马地区实施战地军政指挥，福建省政府虚级化并迁至台湾省台北县新店镇（今新北市新店区）办公。民国47年（1958年）8月23日－10月5日，中华人民共和国声称「声援中东人民的反侵略斗争」，于金门爆发八二三砲战。民国68年（1979年），美国与中华人民共和国建