九日辰时出生；干隆三十五年（1770年）赐二品冠服。《孔府档案选》收录干隆三十二年（1767年）孔昭焕进京觐见答词的底稿，其文记载：「长子宪允年十二岁，聘定于敏中之女，正在读《诗经》，并且已从浙江庚辰科举人沈启震一起读书。」干隆三十六年（1771年），干隆帝命孔宪允改为今名。干隆三十七年（1772年），娶文华殿大学士兼户部尚书于敏中第三女。同年十一月二十日，孔昭焕专折奏呈干隆帝闻知，干隆帝朱批赞誉「汝子颇可成人，朕为汝喜」。同年十二月初二日，孔宪培入宫叩请圣安，蒙恩赐貂皮、大缎等各件；十二月十九日，谕准孔宪