F13型电力机车开始进行战后第一次技术改造，包括恢复安装在简化设计中被省略的高速断路器，更换气动控制式的PS14型受电弓，将原本位于司机室车顶的头灯前移至机械室短罩的前端，并增加磁场削弱控制的功能。同时在这次改造中，EF13型电力机车亦应用许多在EF58型电力机车上的新型机械设备。1953年至1957年之间，EF13型电力机车进行第二次技术改造。由于第一批共31台的EF58型电力机车全部改装新造的半流线型车体，而剩余的旧箱型结构车体则全部改装到31台EF13型电力机车上，取代原本使用的凸型结构车体。EF