理完值机手续并取得登机证后，如果所搭乘的航班属那些小型航空公司，则需要在到达登机闸口前至柜台缴纳机场税。从巴蒂穆拉机场出发的机场税大约是每人30,000印尼盾。
地面交通.从巴蒂穆拉国际机场到安汶市中心的交通工具有出租车、Angkot巴士、DAMRI公共汽车和Ojek摩的等，最快捷的交通方式是搭乘Ojek摩的，公交车从上午7点运营到下午7点。搭乘各种交通工具到市区的价格均在10,000印尼盾以上。
国际航线.以前偶而有一些从安汶飞往澳大利亚达尔文机场的国际