校的羽毛球教练认为吉新鹏是好苗子，而说服他的父母让他在放学后接受专业训练。1989年，吉新鹏刚升读初中，适逢厦门准备成立专业羽毛球队，向全国各地招生，吉新鹏成了从沙市选来的3名队员之一，从那时起他一直在厦门进行训练。1996年2月，吉新鹏被国家队总教练李永波调入中国国家队二队，也是二队的第一批队员。进入国家队后，吉新鹏因为心理素质不成熟而不受重用，进入一队后仍然默默无闻。1998年，汤仙虎受李永波之邀执教国家队男单，吉新鹏开始接受汤仙虎指导。
雪梨奥运夺金.吉新鹏直到2000年雪梨