倒塌或受损，单在花莲就有561间房屋倒塌和逾1,831间房屋受损，并有四人罹难。而台东县部份则因大雨造成太平溪上游太巴六九溪的台电太平发电厂遭到爆发的山洪沖毁并掩埋，后台电亦放弃该水力发电厂不再修复。受妮娜影响，各地航班、火车和公共汽车均暂停服务，但台北松山机场的国际航班服务却仍然维持。受台湾地形影响，妮娜在中国大陆登陆前已减弱为热带风暴，并以110公里每小时的风力登陆福建晋江，然而对福建的影响却不大。不过，妮娜在内陆却受到南下的冷空气影响，为河南等地带来暴雨。录得逾400毫米雨量的区域达19,41