地质学家被任命为首任馆长。在他的组织下，牛津的天文、几何、实验物理、矿物学、化学、地理学、动物学、解剖学、生理学和医学诸系相继搬入此处。1860年博物馆正式对外开放。博物馆完成后，许多实验室都在大学博物馆创建后，于馆址週边设立，如于1870年建立的，比剑桥大学卡文迪什实验室成立还来的早的。1885－1886年，博物馆的东面增添了一座新建筑，由托马斯·纽曼·迪恩之子托马斯·曼利·迪恩设计，用于保存奥古斯图斯·皮特·里维斯将军的种族学标本，即今日的皮特·里维斯博物馆。按照19世纪的思维，神所造之物是自然史研