与中国科学院合办有深圳先进技术研究院，并独资拥有香港中文大学深圳研究院（该研究院除负责进行科学研究外，亦开办深圳EMBA课程，但该课程招生仍由沙田校园负责）。
人文学科的研究所.
法国远东学院香港中心.法国远东学院（法语：École française d'Extrême-Orient，简称EFEO）是法国一所专门研究南亚、东南亚和东亚文明的国家机构，研究范围涉及历史学、人类学、民俗学、考古学、艺术、文献学等。法国远东学院有两项成果最引人注目。第一是对柬埔寨吴