多个小的漏斗状漩涡（吸入漩涡）在一个大规模的母漏斗云旁旋转的概念。他的研究和以往所认知的远远不同，并确立了最强烈的龙卷风是由多个涡旋组成的概念。他也进一步确认了小型旋涡会增强热带气旋的概念。第二次世界大战期间藤田哲也居住在原本是胖子原子弹轰炸目标的小仓市，但因为当天多云使轰炸机转移至次要目标长崎市。藤田研究原子弹爆炸破坏程度使他得以了解下击暴流和微下击暴流的机制。 
身后.美国气象学会在2000年1月举办的第80届会员大会期间举办了「剧烈暴风雨之谜研讨会：向藤田哲也的贡献致敬」