形成的准备阶段，胚胎会形成远近轴（proximal-distal axis）以及前后轴（anterior-posterior axis），不对称性也随这两个轴的发生而出现。胚胎的卵圆筒形成标志着远近轴的形成：近端的胚胎外组织会形成胎盘样组织，而远端则是上胚层。骨塑型蛋白（BMP）、成纤维细胞生长因子（FGF）、、Wnt等信号分子介导的信号转导途径参与了这一过程。内脏内胚层包围表皮。远端内脏内胚层（DVE）会迁移到胚胎的前部，形成前内脏内胚层（AVE），打破前后对称性。上述过程受Nodal信号通路的调控。