常从日本进口《台湾青年》杂志给青年学子，以启蒙自主意识；1921年（大正10年）蒋结识雾峰林家的林献堂，并与其他同志者成立台湾文化协会，作为提倡民权之启蒙运动组织，并发表文章《临床讲义》，从医师角度针砭台湾各种「疾病」。1923年（大正12年）蒋因治警事件遭判刑4个月，因为他以台湾议会期成同盟会名义持旗向日本裕仁太子（后为昭和天皇）请愿，为台湾人因政治请愿被拘禁的第一人。1925年他又因反抗总督政令被囚4个月，两次入狱共监禁144天。1926年（昭和元年）蒋渭水在大安医院旁开设文化书局，贩售当代先进