会港澳教区第八任主教白约翰会督主持献校礼和时任教育司宪简乃杰爵士主持揭幕仪式。在创校初年，圣公会基荣小学的上、下午部开办共二十八班小一至小四年级，1970年再扩展至合共四十八班。后来在2006年9月，该校的上午部留在现址开办全日制小学。而下午校则与圣公会圣多马小学的下午部合併成为圣公会圣安德烈小学。2018年，圣公会基荣小学邀请前中国乒乓球国家队队员沈文担任教练，培训学校的乒乓球校队。