真菌病可依照感染的部位分成表浅性感染、皮肤感染、皮下感染与全身性感染。
表浅性感染.表浅性感染（superficial mycoses）的真菌病只侷限在皮肤与毛发的表层，通常不是严重的疾病，但可能造成美容问题。常见的例子包括花斑癣（俗称汗斑），为糠疹马拉色氏霉菌造成，在皮脂腺中生长，发生于胸部、手臂、背部等，造成表皮较浅或红棕色的色斑。造成这种真菌过度活跃的原因包括潮湿的天气与免疫系统较弱时，但此病不会对健康造成重大影响，用药擦拭患部或天气冷时就会自动痊癒。Section::