武藤友益取回人质，将城馆破坏后，于5月6日返回京都。同年9月也参加志贺之阵，兵力约300至400人，期间乘隙向宇佐山城及滋贺郡等周围的土豪进行怀柔政策。元龟 2年（1571年），三好三人众于石山本愿寺举兵之际，光秀随同信长于摄津国出阵，因功被分封到近江国滋贺郡5万石，并筑起坂本城。天正3年（1575年）赐姓惟任，官至从五位下日向守。
一国之主.明智光秀成为城主后，参加天正3年（1575年）的高屋城之战、长篠之战，以及越前一向一揆歼灭战。肃清内乱再被任命攻打丹波国，包围黑井城时，