联内部重新划分行政区划之后，中亚的居民开始了一次新的民族界定。在这次界定之中，这些人自己界定自己为吉尔吉斯人、哈萨克人或者土库曼人。而不是像以前那样依照宗教信仰和所指地区来界定。那些被界定为吉尔吉斯人的人主要以游牧为生，而乌兹别克人则为定居民族。在苏联解体后，吉尔吉斯斯坦总统阿斯卡尔·阿卡耶夫打压吉尔吉斯人的民族主义活动，支持泛伊斯兰和泛突厥主义，直到在2005年郁金香革命期间阿卡耶夫被推翻。
1990年暴力冲突.1990年6月，在奥什发生了吉尔吉斯人和乌兹别克人的暴力冲突。一