于2001年1月获晋升为入境事务处副处长，于2002年7月至2008年4月担任入境事务处处长。2008年至2010年年度，黎栋国担任母校玛利诺神父教会学校校友会主席。2009年10月22日，黎栋国获委任为保安局副局长，于2012年7月1日起接替李少光担任保安局局长。2018年1月，黎栋国获选为第13届港区全国政协委员。2018年8月，加入新民党任常务副主席。
争议.
「酒后强姦论」.黎栋国于2013年5月14日出席扑灭罪行委员会记者会上谈及近期