5年回国。1945年3月，郭汝瑰任军政部军务署副署长，国家总动员会议秘书。抗战后期与中共地下党恢复联络。1945年4月，郭汝瑰通过黄埔军校的同学任廉儒（任逖猷），与中共恢复联系。1945年5月和1946年3月，郭汝瑰两次秘密会见中共中央南方局负责人董必武，除了提供有关国民党方面作战指挥调度的最高级情报之外，还要求赴延安，并要求恢复中共党籍。董必武对他说，恢复党籍原则上可以，但需要经过考验才行，并动员他留在国民政府内，为中共提供情报。
国共内战期间.在四年第二次国共内战期间，郭与