称一直使用到1947年（昭和22年）。1947年，日本公佈新的宪法，博物馆由文部省接管，并改名为“国立博物馆奈良分馆”，1952年（昭和27年）才开始使用“奈良国立博物馆”这个名称。1950年主管的机构是当时的文化遗产保护委员会，1968年交由日本文化厅，2001年由独立行政法人国立博物馆接手，2007年（平成19年）起至今归国立文化遗产机构管理。这期间，1973年，由设计的新馆落成，并与新馆揭牌正仓院展。新馆和本馆之间有一条地下通道相连，1997年同样是吉村顺三负责设计的东馆也正式落成，之前的新馆