494年将自己的私生女阿拉贡的珊莎许配给教宗最小的私生子乔佛里·波吉亚，于同年5月，由前同时也是教宗姪子的加冕为""西西里国王（Rex Siciliae）""，以确保他统治的正当性。然而法国国王并没有因为阿方索的统治权有着教宗的支持而打消念头，他在韦内雷港击败佛罗伦斯和阿方索的弟弟费德里科所带领的那不勒斯军队后，于1495年初接近那不勒斯。
死亡.在法军逼近的同时，阿方索在一系列的征兆，特别是一些不寻常的梦境给吓坏了后，将王位传给他的儿子斐迪南二世，自己便逃去西西里岛的一个修道