当时林内地区隶属斗六门，多少亦受波及。清朝时期规划县治区，本乡东南部约三分二之面积隶属斗六堡，包括林内庄、咬狗庄与九芎林庄；西北部约三分之一面积则隶属溪洲堡，包括乌涂仔庄全部与新庄仔庄的东半部。
日治时期.1895年4月（清光绪二十一年三月，日本明治二十八年四月），清朝和日本签订《马关条约》，将台湾割让予日本。5月底，台湾军民起而反抗日军接管，爆发乙未战争，至11月中旬始宣告平定。在乙未战争中，抗日义军曾于8月27日八卦山之役结束后，撤守云林县。在斗六与日军近卫师团进行遭遇