庙庄境内改隶属于台南厅，境内的外新丰里及保东里隶属关帝庙支厅，崇德西里隶属车路墘支厅。1903年3月，车路墘支厅废止，併入台南厅直辖与关帝厅庙支厅。1904年3月，台南厅实施街庄整併，关庙地区整併为8个街庄，成为日后大字的雏形。1920年9月1日，原堡里之行政区废除，街庄改为大字；外新丰里之关帝庙街、新埔庄、五甲庄、深坑仔庄，崇德西里之龟洞庄、布袋尾庄，保东里之埤仔头庄、下湖庄等8个街庄合併为「关庙庄」，「关帝庙」改称「关庙」，街庄名称的「仔」改为「子」；辖域内分为关庙、新埔、五甲、深坑子、龟洞、布袋尾