1997年香港主权移交后，曾荫权过渡成为香港特别行政区政府官员，只是职称稍作更改。在亚洲金融风暴爆发初期，曾荫权曾经同意增加公务员的薪酬，然而不久后又被调低，一直维持至1997年的水平。亚洲金融风暴期间，曾荫权与香港金融管理局总裁任志刚联手抵抗投机者狙击港元的行动，获前美国联储局主席格林斯潘和主要狙击者索罗斯称许。
政务司司长.2001年5月1日，陈方安生以私人理由，辞去政务司司长一职。时任行政长官董建华于是以曾荫权接替政务司司长。至于财政司司长则由梁锦松接任。董建华在2002