狼疮、干燥综合征、类风湿性关节炎、自体免疫性肝炎、硬皮病、多发性肌炎、皮肌炎，以及多种存在组织破坏的非类风湿症状。除此之外，还有一些症状会与高抗核抗体滴度有关联，包括：爱迪生氏病、特发性血小板减少性紫癜（ITP）、桥本甲状腺炎、自体免疫性溶血性贫血、1型糖尿病以及混合性结缔组织病。
敏感性.下表列出了抗核抗体对多种不同疾病的敏感性，表中的数字为，在某种疾病中能检出特定抗体异常的病例百分比值。某些抗核抗体会在多种不同的疾病中出现，也就是说，其特异性比较差。30%至40%的类风湿性关