获全国科展地球科学类第一名，同年庆祝60年校庆，时任总统李登辉视察兰女校园2000年改隶教育部，并改为现名之「国立兰阳女子高级中学」。2003年经教育部通过设立语文资优班。2007年8月1日，由曹学仁接任校长，并获得国科会高瞻计画补助，成立宜兰县唯一高瞻计画数理实验班。2008年，庆祝70週年校庆，时任总统马英九视察兰阳女中校园。2009年，科学教育大楼完工，兰女校方将旧科学馆的设备放置此，并设立星象馆，是目前宜兰地区天文设备最先进的高中院校。2015年7月，由兰阳女中及宜中等校教师