克雷数学研究所（Clay Mathematics Institute,简称CMI）是非营利私人机构，总部在新罕布什尔州彼得堡。机构的目的在于促进和传播数学知识。它给予有潜质的数学家各种奖项和资助。它在1998年由商人兰顿·克雷（Landon T. Clay）和哈佛大学数学家亚瑟·杰夫（Arthur Jaffe）创立，兰顿·克雷资助。
千禧年大奖难题.克雷数学研究所最为人熟知是它在2000年5月24日公佈的千禧年大奖难题。这七道问题被研究所认为是「重要的经典问题，经许多年仍未解决。」