不过，在1999年后，维多利亚港水位急速下跌，至2008年才见底。近年，水位重拾升轨，逼近1999年的历史高位。维多利亚港在香港开埠之时颇为广阔，因为当时两岸都是天然的海岸线。在今日北角东部，直到1930年代还是一个海滩，而在1970年代时，即使在筲箕湾的码头，仍然会有人在岸边游泳。然而，随着都市的发展，使污水不断排入海港里，使海港受到极大的污染；加上维多利亚港两岸不断的填海取地，使海港内变得大浪和湍急。1980年代当香港政府草拟香港机场核心计划时，曾建议把海港从维多利亚港外迁到青衣的蓝巴勒海崃或南丫岛