时喊「平反六四」，校方也无意制止，但他们没有这样做。典礼期间，校方安排副总理李克强坐上「校监椅」，这亦引起争议，因为校监椅由谁人坐，本身有一套规则。除校监之外，只有校监不在场，由副校监坐上，若副校监也不在场，依序以校长使用，时任校监是曾荫权，副校监李国宝，和校长徐立之。三人同时在场，曾荫权坐在李克强旁，而另一位嘉宾，以鸭巴甸大学校监身份参加典礼的前香港总督卫奕信被安排坐后排位置。校方声称，其他仪式中为主礼嘉宾安排校监椅，以往曾发生过。不过舆论质疑李克强在港大无名无份，亦不是港大校监，却在典礼中坐上校