式上还继续实行式部省试，但除了文章试之外的诸科都已没落。考生皆由权贵推荐，应考者几乎是无条件及第，且不及第者可以改判及第，科举制至此已完全异化。1177年，大学寮被大火焚毁，之后再未重建，贡举制度亦废除。
江户时代的学问吟味.江户时代虽然已经废除贡举制度，但到后期有一种形式及内容近似科举的人才考核制度，称为学问吟味，具备了与科举考试相互一致的内涵，因此被称为「江户版的科举制度」。当时日本把朱子学视为「正学」，也把它作为学问吟味的主要考核范围，这是以德川幕府征夷大将军的旗本、御家人子