受养成教育。在果阿遇到决心前往远东传教的方济各·沙勿略与萨摩出身的日本翻译弥次郎，对于弗罗伊斯后来的人生与命运产生重大影响。1561年在果阿晋升为司铎，以语言及写作方面的能力见长，从事与各传教地通讯的工作。1563年（31岁）在肥前横濑浦（今长崎县西海市）登陆，开始在日本从事传教工作。学习了日语后，1564年从平户前往京都。1565年1月31日抵达京都，但是对于将军足利义辉与室町幕府威信的旁落感到失望。在混乱的战国时代艰困的在京都、近畿地区负责传教的工作。1569年弗罗伊斯与上洛的天下新霸主织田信长