广州刺史王矩当时上表让虞潭领庐陵太守，成功绥抚当地受战乱影响灾民。虞潭后亦协助消灭陈敏进攻江州的主力陈恢，因转南康太守，进爵东乡侯。永嘉五年（311年），因江州刺史华轶不受当时承制行事的晋元帝命令，令晋元帝下令讨伐，虞潭亦受命进攻，但到庐陵时华轶已被周访击败被杀害。但同时，当年正月爆发的杜弢之乱仍未平定，新任江州刺史衞展于是上表让虞潭加领安成太守以作抵抗。杜弢之乱在建兴三年（315年）被平定后，时任丞相的晋元帝召命他为丞相军谘祭酒，转琅琊国中尉。东晋建立后，虞潭先后任屯骑校尉、右衞将军及宗正卿。王敦