799年4月政府发出了对他的逮捕令，他逃脱了，到法国希望求得军事援助。次年3月，他开始准备另一次起义。
1803年起义.回到爱尔兰后，埃米特与托马斯·罗素与詹姆斯·霍普着手准备新的起义。他开始制造武器和炸药，甚至改进了矛，使之与铰链配合能够隐藏于披风之下。与1798年起义不同，保密工作做得很好，但武器库的一次意外爆炸炸死了一个人，迫使埃米特提前起义的日期。埃米特没能接受迈克尔·德怀尔的威克洛义军的帮助，基尔代尔义军有许多虽然来了，但没能得到许诺的武器后离开，不过起义还是在180