建设局决定集中火力在2号跑道的建设上，新跑道地点为1号航厦东面的填海土地。工程第二阶段在2号跑道及相关建设完成后展开，在1985年开始建造2号客运大楼，位置为1号航厦南面，而2号客运大楼在1989年完工，1990年11月启用及在1991年6月1日由总理吴作栋主持下正式启用。
扩建工程.机场有一套发展政策，即不断扩建使机场不会有一般机场常出现的拥挤问题，以维持高服务质素。机场原本的总体规划只是计划兴建2个客运大楼，但后来却规定要长期扩建，例如留一块合适大小的土地用作兴建与2号客运大楼