用是在1963年10月20日，埃及海军两艘苏联提供的科马级飞弹快艇以冥河反舰飞弹击沉以色列的艾略特号驱逐舰。自此以后飞弹快艇在局部战争中得到广泛运用，战果显赫，为越来越多的国家所重视。以色列后来吸取了此一战役的惨痛教训，发展出了毒蜂级飞弹快艇与其搭载的天使飞弹，并于赎罪日战争成功反击埃及海军。近年低可侦测性技术开始大幅应用在舰艇上，新开发的飞弹快艇多数也开始採用斜角设计与吸收雷达波材料。由于飞弹快艇重视速度，因此不少开始採用双体船、气垫船、水翼船等高速船船体设计。国际上的主流飞弹快艇，包含了的中华民