市人民政府、上海市高级人民法院管理，行政级别由副厅局级提升为正厅局级，受上海市人民代表大会常务委员会监督并向其报告工作。
管辖.上海海事法院管辖上海市和长江浏河口以下通海水域、江苏省沿海海域的一审海事、海商案件，上诉审由上海市高级人民法院负责。上海海事法院辖区内有上海港、洋山深水港、连云港、洋口港等重要港口。上海海事法院主要受理海商合同、海事侵权、特别程序、海事执行共4大类60多种案件。
机构设置.上海海事法院现有处级内设机构编制14个，实有处级内设机构1