斯林本身也面临被其他宗教同化的窘境。因为地理上的孤立、文化习惯差异加上与伊斯兰国家来往并不如欧美热络，在台湾除了来自东南亚、南亚和西亚的新住民或外籍人士外，台湾本地信奉的伊斯兰教的人数仍远不如本土的佛教与道教。2007年透过印尼穆斯林串联成立台湾印尼穆斯林之家。
2010年代.由于回教教义规定穆斯林所食用的肉类（如牛、羊、鸡、鱼），在宰杀前要经教士诵经，将牲畜当作给真主的献礼，以保证食用上的清洁；但台湾整体的消费生态却鲜少提供经由伊斯兰教士认可的食用肉品（特别是乡下地区，比起都