财政上的困难，转而以「结合捷运红线与台铁内湾支线改善」作为优先方案。主要为改善既有新竹＝竹中间的内湾线路线，予以高架化并增设车站，并且自竹中车站兴建新路线，沿高铁轨道跨越头前溪直抵高铁新竹站。六家线于2011年完工后，已移转给台铁经营，行驶往返新竹经竹中至六家的直通通勤列车，已由铁路改建工程局施工完成。工程费用方面：土木工程建设经费为新台币57.15亿，增购电联车12辆约为新台币6亿元。若包括新竹＝竹中间路线，总长为高架段9.92公里、地面段1.36公里。
车站列表.六