醉而睡过头，未能赴约，捡回一条命。二二六事件后于陆军重组时回归原队并就任军团长。中日战争爆发后则回复到其原先专攻中国事务的职责，直到终战前都在中国并担任参谋长、司令官一类的职务。
驻蒙军司令时期.根本博于1944年11月就任为驻蒙军司令。隔年8月日苏战争爆发，苏军开始进攻满州国。该月15号日本投降后，苏联红军继续进攻日军，根本博于是令日军守备队还击。在几度尝试与苏军进行停火谈判的过程中，曾对苏军进行白刃战并抵挡令八路军的进攻。8月19日与苏军展开了长达三天三夜的血战。因此日军自8月