数十年，“阐发幽微，不愧父师之说”，“往往发明先儒之所未及”。学者称九峰先生。朱熹晚年命蔡沈撰《书集传》。他用邵雍《皇极经世》所谓“先天数学”讲《尚书•洪范》，认为天地、人物皆由数所派生，“天地之所以肇者数也，人物之所以生者数也，万事之所以失得者数也。”绍定三年（1230年）去世。
作品.有《蔡九峰集》。
家庭.有子蔡模、蔡杭、蔡权。
追赠.宝祐三年（1255年）八月二日，赠太子少师，正室翁氏赠宜春郡夫人，继室刘氏赠齐安郡夫人。宝