能量存储是一个挑战。肝脏是深海鱼的重要能量储存器官。深海蜥鱼科等鱼类具有巨大而富含脂质的肝脏，鼠尾鳕科薄鳞突吻鳕的肝脏也富含脂质和糖原，据估计它可以在绝食的情况下维持180天的生命。由于脂质的比重低于海水，在肝脏中储存大量脂肪也有助于确保浮力。对于角鲨目刺鲨科、灯笼棘鲛科等没有鳔的软骨鱼，肝脏的质量或可达体重的25％。
体色.在具有较多光照的中层带生活的鱼类中发现了体表银化的拟态现象。褶胸鱼科成员具有几毫米厚的扁平表皮，表面呈现铝箔般的亮银色。它们的体表规则排列着微小鸟嘌呤晶体