花的普及使得染料需求增加，德岛藩特产蓼蓝（蓝色的染料）产业快速发展。德岛成为吉野川流域生产的蓼蓝的集散地，带动城市规模扩大。1871年废藩置县之后，德岛县取代德岛藩，德岛成为新设立的德岛县的县厅所在地，但由于当时德岛属于名东郡，德岛县在同年被更名为名东县；然而在1876年，名东县被废除，现在的德岛县区域被併入高知县，使得德岛也一度失去县厅地位。由于两县合併引发地方巨大反弹，1880年重新设立了现在的德岛县，德岛亦再次成为县厅所在地。1889年，德岛成为日本第一批实施市制的城市，德岛市正式诞生，当时的