区爆发一系列左派叛乱，这些叛乱很大程度上得到民众支持，进而引爆了至1996年方休的瓜地马拉内战。这些叛乱活动团体中最具声势的是，该组织全盛时期有二十七万名成员。绵延36年的内战导致二十万民众葬身战火之中，人权状况严重倒退，大量民众遭到屠杀、强暴，空袭与被消失的情形更是屡见不鲜。历史学家估计这段期间约有93%的反人权案件是由美国所支持军方犯下，此中包含1980年代的玛雅人种族屠杀。