瑞典国旗的历史可追溯至16世纪，相信源自瑞典的国家纹章。纹章的底色为蓝色，上绘有三个黄色皇冠。1569年约翰三世採用此国旗。在此之前此旗曾在约翰的封地（现芬兰西南部）中使用。
在瑞典以外的使用.原属瑞典在美殖民地「新瑞典」的两座美国城市——费城和威尔明顿的市旗以瑞典国旗的用色为底，再镶入各自的市徽，彰显其与瑞典的渊源。此外，阿根廷足球俱乐部博卡青年的球衣色彩採用与瑞典国旗一致的蓝黄两色，这一举动源于1906年，当时博卡青年队将球衣颜色从之前的黑白改为第一艘驶入博卡区港口的轮船所悬