晚年的出口王仁三郎退隐于绫部，以美术和制作陶器自娱。1948年1月19日逝世，享年76岁。葬于绫部的天王平。
其他.日本美术工艺社的主干事加藤义一郎对出口王仁三郎自制的工艺品作出了很高的评价。植芝盛平所创立的合气道受到了其大本教的深远影响。此外，相传出口王仁三郎曾准确地预言了关东大地震的发生；在1942年假释出狱之际，曾高声喊道：「我出来之日就是日本战败的开始！」（）而在1945年广岛原子弹爆炸之前，出口王仁三郎也预言广岛的末日即将到来，劝诫广岛的居民立即疏散。（原文：）