菌丛组成是不同的，证据显示肠道菌丛可以影响代谢能力。正常体重者与肥胖者有明显的代谢能力差异，因此推测从肠道中吸收热量的能力可能会影响肥胖的发生，但目前还不确定这些差异是否会直接造成肥胖，或者这些其实是肥胖造成的结果。在人类与其他数种动物身上也能观察到病毒与肥胖的关联，但还不清楚这与肥胖率的上升是否有关。
病理生理学.肥胖的发生与维持有许多种可能的病理生理机转，但这个研究领域一直乏人问津，在1994年时，弗莱德曼（）的研究团队才发现瘦素基因。弗莱德曼的研究团队认为瘦素是影响饱足感