26年3月底，方振武率部沿京汉路辗转北上，开到北京附近长辛店、牛栏山。出任国民军第5军军长。这时，由于直、奉的联合进攻，冯玉祥已被迫下野，3月22日国民一军放弃天津，4月15日又由北京撤往南口。方振武率部担任掩护，任务完成后也西撤宣化休整。直奉联军发动晋北战役，方振武为国民军东路副总司令，在天镇、阳高、应县、浑源作战。1926年8月国民军总退却，方部移驻五原县。1926年9月17日五原誓师后，任国民联军第2军军长，并兼任中国国民党国民联军最高特别党部执行委员。国民联军第五军奉命救援被围城的西安，由五原经宁夏