万历七年（1579年）与张居正公子状元张懋修同举己卯科湖广乡试举人，两人相识最厚，二十九年（1601年）辛丑科进士，官户部云南司主事。三十九年京察以浮躁去职。黄建衷与梅国桢的冲突，黄因爱慕其女儿梅澹然，却反被梅氏骗走爱妾，黄羞赧不敢言，为乡里所诮。沈德符《万历野获编》卷23记载：麻城人黄取吾（建衷），素负时名，早登公车，风流自命。时同邑梅衡湘司马长女，嫠居有才色。结庵事佛，颇于宗门有悟入处，即李卓吾所称澹然师者是也。黄心欲挑之，苦无计。其爱妾亦姝丽能文，乃使诡称弟子，学禅于澹然。稍久亦喜其慧黠，甚眷念之