主席的蒋中正向被誉为土耳其国父的凯末尔赠送一张亲笔签名照，照片至今仍存于内。1938年以立法委员王曾善为首的穆斯林人士组成的「中国回教近东访问团」，虽经日本造谣妨碍，最终还是来到土耳其，揭露日本侵略中国的事实。1949年，中华人民共和国成立，许多东突厥斯坦独立运动领袖如穆罕默德·伊敏与买买提明·艾孜来提等均陆续流亡至土耳其，伊斯坦堡政府还在艾沙·玉素甫·阿布甫泰肯过世后以其名字命名一座公园以示纪念。如今在土耳其的维吾尔裔已超过五万人，不少维吾尔人携家带眷从中国辗转移居土耳其，土耳其成了这些人的第二家乡。