.1920年，余日宣转任清华学校政治学教授，他和美国教授魁格雷（明尼苏达大学政治学教授）也是清华大学首批政治学教师。1926年秋，清华大学政治学系成立，余日宣担任第一任系主任，当时该系教授有钱端升、郑麐、刘师舜等人。1928年6月，奉军退出北京，校长温应星向外交部请辞，余日宣随即被北京政府外交部派为清华学校代理校长。同月，清华学校由南京国民政府接管，指派梅贻琦做校务代理，余日宣遂不再代理校长。1928年8月，罗家伦任清华大学校长，同时余日宣任教务长。1928年国立清华大学成立后，同为留美归国学者的余日宣、