民众的投诉之后，也会开始进行调查，并且常常在议会中揭发官员贪污的行为。也因为如此，石延汉和郭昭文对杨元丁都怀恨在心，而二二八事件的发生，也提供了他们报复的机会（根据杨元丁之子杨光汉在《基隆雨港二二八》中所述）。
二二八期间.二二八事件时，杨元丁参与并组织了基隆的二二八事件处理委员会，希望可以迅速的弭平动乱，并且也向各地的粮商招募粮食，提供基隆民众使用。但是过没几天，国军自基隆港登入，台湾情势转变，有人劝杨元丁要避避风头，而杨元丁也告诉家人要出门去避几天，但是这一避，杨元丁就再也没回