艾滋病蔓延，而受命进行一项有关男同性恋群体的研究，1994年终结。他从20世纪90年代开始便从其研究中意识到中国正在出现一场性革命，并把其总结为生殖革命、性表现的革命、性关系的革命、性行为的革命、社会性别的革命。自1997年起，潘绥铭数度一个人入住红灯区，和“小姐们”吃住一起，做学术研究和考察，后来出版了《存在与荒谬》、《情境与感悟》、《小姐：劳动的权利》等专着。在2000年-2015年期间主持了四次全国总人口随机抽样的性关系与性行为调查，并在1991年至2006年期间主持了五次有关大学生性行为的调查，