本始三年（前71年），许平君再度怀孕待产。显命女医淳于衍在经过众太医开方所制成的药丸中混入捣碎的附子药丸，让许平君在分娩后服用，许平君服用后不久毒发，于同年3月1日逝世。此次分娩的婴儿性别、是否存活亦无详细记载。汉宣帝非常悲痛，追封她为“恭哀皇后”，葬于杜陵南园（也称少陵）。值得注意的是，许平君是中国历史上第一位有独立谥号的皇后。许平君“从官车服甚节俭”。许广汉在许平君封后后受封「昌成君」（曾受过宫刑不能封侯），直到刘奭被立为太子后才得以封「平恩侯」。许平君的堂姪女孝成许皇后后来成为她的孙媳，即汉成