其孔径用于估计大分子的尺寸。SEC因为能够为聚合物提供良好的（Mw）结果，被广泛使用作方法。
应用.凝胶过滤色谱法主要用于分离蛋白质和其他水溶性聚合物。凝胶渗透色谱法则用于分析有机可溶性聚合物的分子量分布。不同于上述两种技术，凝胶电泳根据分子的电荷使用电场将分子“拉”或“推”过凝胶。溶质保留在孔中的时间长短取决于孔的大小。较大的溶质将获得较小的体积，反之亦然。因此，与较大的溶质相比，较小的溶质将在孔内保留更久。尺寸排阻色谱法的另一种用途是检查水中天然有机物的稳定性和特征。Mar