蝙蝠携带的病毒是指以蝙蝠为主要储蓄宿主、能够传染到其他生物的病毒，包括冠状病毒、汉坦病毒、亨尼巴病毒、狂犬病毒、埃博拉病毒等。
传播.蝙蝠携带的病毒可以经由其唾液传播，唾液、粪便和尿液雾化后也能够传播病毒。不只狂犬病毒，近年来一些新兴的病毒（例如伊波拉病毒、SARS病毒、中东唿吸综合症冠状病毒、严重急性唿吸综合症冠状病毒2型等）可由蝙蝠直接传染给人类。如果不加以诊断和治疗，狂犬病毒的病毒株感染人体到患者发病的潜伏期短则几小时， 多则数年。由于未意识到睡眠时被蝙蝠叮咬或是没有被叮咬的