组织剩余成员潜入山中进行长期抗争，当局为了彻底瓦解共产党在台势力，1950年11月，政府改採由下而上，抽丝剥茧，说服与拢络，发布「共匪及附匪份子自首办法」，钟全如、邱捷昌供出了由邱连球领导的组织关系，邱连球以自首不诚遭到改判死刑，1953年5月20日于马场町执行枪决。
纪念.2013年10月，北京西山国家森林公园的无名英雄广场上立有无名英雄纪念碑，为纪念来台湾在1950年代被处决的隐避战线烈士而设立。邱连球的姓名铭刻于纪念碑上。
平反.2019年2月27日