局设立内地事务联络办公室，加强统筹香港与内地之间的交流和合作，负责管理香港驻内地的各个办事处（包括驻京办），以及现时粤港合作统筹小组的工作，该办公室已于2006年4月1日成立。2007年7月1日连任行政长官曾荫权实行政策局改组，政制事务局接手原由民政事务局负责的人权事务，并改称政制及内地事务局。