舰队便拥有了两个同质的四舰编组分舰队。这两个分舰队于1895年春季共同巡航驶往奥克尼和设得兰群岛。1895年6月21日，经过八年的开凿，威廉皇帝运河正式通航。为此，巴登号及其三艘姊妹舰连同其它数十艘军舰出席了盛大的典礼，几个主要的海军大国也派出舰队参加海上阅兵。1895年的秋季演习由第一和第二总队在北海模拟了一场公海战斗，接着又在波罗的海与舰队余部展开联合演练。自1896年起，巴登号开始在基尔帝国船厂的旱坞接受全面的现代化改造。舰上原有的锻铁加柚木装甲被新的克虏伯所取代；四个烟囱被集成至单个大烟囱，并安