存在，不认同德国或欧盟方面的主张，故双方经常因此而有不小的争论。
经济.每年轮流在对方首都举办「台德民间经济合作会议」，至2016年已举办第16届。
贸易.德国是中华民国在欧洲最大的贸易伙伴。中华民国对外贸易发展协会（外贸协会）于德国第3大城慕尼黑、第7大城杜塞道夫设立台湾贸易中心。经济部国际贸易局则在首都与第1大城柏林设立驻德国代表处经济组、第5大城设立驻法兰克福办事处经济组。2019年，德国是中华民国第9大贸易伙伴、第7大进口伙伴、第9大出口伙伴，