林首领马化龙。马化龙被围在金积堡16个月直至于十年（1871年）3月投降。左宗棠判处马化龙及其部下八十多名官员凌迟处死。数千穆斯林被流放到中国的不同地区。尽管屡蒙大赦，很多穆斯林继续抵抗直至甘肃肃州陷落。十二年（1873年）叛乱失败，导致一些回民移民到俄罗斯。他们的后代继续居住在哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦和吉尔吉斯斯坦的边境地区。河湟起义（1895年—1896年）是第二起反清的回族动乱。他们被忠于朝廷的穆斯林军队击败。
义和团运动.义和团运动（1899年11月—1901年9月7日