政府发动南京地方教会的裴宏恩、任定一、傅保罗、张西吉等信徒，控诉雷志伯、季永同、丁荣施、马宗符等长老把持教会，女信徒在教会中说话要蒙头，不许男女信徒一起谈天等，并刊登在《新华日报》上。同年年底，北方一处较大的地方教会——青岛地方教会的张子洁长老以“反革命罪”被捕。1951年底，倪柝声向政府控告三自革新委员会在进行控诉运动时，出现以现代派打击“属灵派”的问题。
三反五反运动.1950年，中华人民共和国政府下令将倪柝声经营的中国生化制药厂并入沈阳东北制药总厂，倪柝声担任工厂管理