宪法和宪制案件的诉案。其次是上诉庭，两个高等法庭（一个在马来西亚半岛，一个在东马）。各个司法管辖区的下属法院包括仲裁法庭，裁判法庭和儿童法庭。此外，马来西亚还设有两个特别法庭，分别是负责审理由皇室提起或反对的所有案件，以及负责审理所有触犯穆斯林事务法的穆斯林的案件。
州政府.州政府的运作则需奉行立法权和行政权分立。
立法权.马来西亚的13个每州政府都是依据各州的州宪法建立和运作。每个州都有一个基于一院制的州立法议会。州议会由作为州统治者（苏丹或拉惹或州元首