2013年2月18日，他先后在抗议中国内地民运人士李旺阳「被自杀」及在元旦游行中展示涂污的中国国旗、香港区旗及焚烧国旗，被裁定4项侮辱国旗及区旗罪成立，判囚9个月。他当日在法院外戴上写有「我非常荣幸第三次入狱」的綵带。2015年7月1日，古思尧在金紫荆广场以焚烧区旗，并在2016年的提讯后于东区裁判法院门外祝酒以预祝自己第五次入狱。2018年3月27日，古思尧在东区裁判法院被裁定涉于2017年7月15日悼念刘晓波的烛光游行及10月1日国庆游行时倒置及涂污中国国旗，以及在2018年1月1日元旦游行中涂