池、学生宿舍楼、留学生宿舍、校医院、花园、文体馆、成吉思汗青铜像及附属广场、操场等建筑与景观组成。南校区位于昭君路街道小黑河村南八里庄，面积大，但比较空旷，主要由主楼、交通学院楼、艺术学院楼、转基因国家实验室、学生活动中心、食堂、校医院南区分院、体育馆、操场、宿舍区、广场、人工湖及绿化带等组成，唿和浩特地铁2号线在南校区东门外设内大南校区站。此外，艺术学院的音乐、舞蹈等专业目前仍然在唿和浩特市乌兰察布路的原内蒙古艺术学校旧校区办学。满洲里学院在唿伦贝尔满洲里市进行办学，是内大与地方政府合作的产物，其地位与内