外国语学校在本部之外开办了三个分校，分别是南京外国语学校仙林分校（民办）、南京外国语学校河西分校（公办）和南京浦口外国语学校（民办）。以上三个分校均拥有独立的教学楼、教学机构和领导班子。
历史.1963年， 南京外国语学校在总理周恩来的提议下，与北京、武汉、重庆、长春等城市的8所外国语学校一起创立。江苏省教育厅受国务院、教育部的委托，在南京筹办了南京外国语学校。2003年秋季，南京外国语学校创办并仙林分校正式开始招生。2012年，南京外国语学校创办河西分校和南京市浦口外国语学