及裁决云林、嘉义、台南三个地方法院第一审民事、刑事上诉及抗告案件。高雄高等行政法院在台南亦设有台南庭，座落于中西区，採巡回庭方式，审理嘉义、台南地区一般行政诉讼及第二审简易行政诉讼程序及交通裁决案件。
检察机关.台湾高等检察署台南检察分署座落于中西区，为台湾高等检察署的分署，办理云林、嘉义县市、台南四县市提起上诉之刑事案件等。台湾台南地方检察署署本部座落于安平区，辖台南市全境。另于新营区设有检察官办公室，处理溪北地区检察事务。
经济.台南市二级产