在一场短暂的对峙之后逮捕米洛舍维奇，以国内法对其控罪。2001年6月，南斯拉夫宣布可以把本国公民送交国际战争罪法庭送交海牙国际法庭，一周内，米洛舍维奇被送交海牙，成了历史上第一个被送上国际战争罪法庭的前国家元首。2002年10月2日克罗地亚总统斯捷潘·梅西奇出席海牙法庭作证，指控米洛塞维奇挑起战争威胁。2005年6月1日，海牙国际刑事法庭播放一部斯雷布雷尼察大屠杀的录像短片，试图向法官证明米洛舍维奇确实在波士尼亚战争中犯下有种族灭绝的罪行。
争议离世.
狱中