庄士元（），字君聘，号仁山，福建泉州府晋江县人，明朝政治人物。
生平.福建乡试第五十四名举人。嘉靖三十二年（1553年）中式癸丑科二甲第十六名进士。授广德州知州。转刑部员外郎。官至刑部郎中。典刑广东，积劳卒于化州。
家族.曾祖庄宜晟；祖父庄晋阳，知县；父庄敬，母林氏。