委副书记、研究生工作组组长、系党委副书记。2002年3月任化学系主任。2008年1月任理学院副院长，同年10月任校学术委员会副主任。2009年12月任清华大学副校长。2013年当选中科院院士，2014年任党委常务副书记。2015年3月26日被任命为清华大学校长。2018年2月24日，当选为第十三届全国人大代表。2020年2月10日，国务院任免国家工作人员，任命邱勇、莫则尧为中国工程物理研究院副院长。
争议.
会见“山寨罗”乌龙事件.2016年2月1