台湾真正大有进展是1949年国共内战后，随着当时中华民国国防部部长白崇禧与军事将领马步芳等知名伊斯兰教徒人士来台定居的2,0000名穆斯林教众，主要来自云南、宁夏、新疆、甘肃等穆斯林分布的省分。这些大都是军人、公务员、教员的穆斯林，主要居住地点分为台北市与高雄市。另外，1954年也有一批自滇缅边区游击部队撤退来台或自行移民的云南穆斯林，聚居在台北中和、永和及中坜龙冈等地，以眷村型态维持本身信仰。1958年中国回教协会在台湾复会，总理国际穆斯林事务。1950年代，在二万多名穆斯林与知名将领白崇禧的