又占据主导地位。三大因素指的是“隆”（气，主唿吸）、“赤巴”（火，主热能）、“培根”（水和土，主体液）。三大因素若有余或不足，人体就会出现疾病；将三因调整至平衡、协调状态，就可治愈疾病。在诊断时，藏医采用望诊、问诊、切诊和尿诊等方法。在治疗时，常用饮食疗法和药物疗法，兼有艾灸、放血、药浴等疗法。藏医将药物分为动物类、石类、树类等13类，认为药物受五行（土水火风空）影响而具备六味、八性、十七效中的若干种，进而对症下药。受气候环境影响，藏药中矿物药和动物药约占一半以上比例，剂型也以丸剂为主，少用汤剂。