左宗棠正挥师规复浙江全省，因军饷逐渐匮乏，与两江总督曾国藩筹议将浙江产盐运往江西销售以资转运粮饷，于玉山县设局转运，玉山上控广信府下通衢州府，是浙江入江西第一门户，冲疲要地，特别檄令绍灏前往办理玉山转运总局。三年（1864年）四月，李鸿章收复苏州府、常州府，即禀请交卸转运局事务，自江西返回江苏。经过兵乱，房舍田园残破萧条，尸体遗骸堆叠，绍灏巡视屋宇以及妻子娘家的基址，又下乡祭扫祖坟、堆土植树。服阙，仍回浙江任职。在全浙肃清案内，得到督抚从优保举，但绍灏以在左宗棠幕府不久，坚决推辞，于是最终只保举于本班尽先