十分愤恨。吏部两度拟定提学皆不用，任山东青州兵备副使。其父王忬在职守上，因滦河决堤事而被严嵩下狱。王世贞与其弟王世懋每天在严嵩门外自罚，请求宽免，然而朝中无人敢为王忬说清。王忬最终在西市处决。隆庆元年（1567年）八月，王世贞伏阙为父辩冤，又得大学士徐阶相助，王忬平反，追复官职。隆庆二年（1568年），王世贞起补河南按察司副使，兵备大名，隆庆三年（1569年）擢浙江布政使司左参政，分守杭嘉湖。隆庆四年（1570年）履山西按察使，十月底丁母忧。万历元年（1573年）起复，除湖广按察使，九月改广西右布政