家开始步入衰退期。自此，摄政与关白的职位反而成为常设，并且确立了由藤原北家独佔的传统。可能因为摄政与关白的重要性不如以往，北家的继承状况也不若先前复杂，长男继承的情况开始增加。在平安时代晚期，藤原忠通的子孙分为近卫、松殿、九条三家。而后松殿家失势，近卫家分为近卫、鹰司，九条家分为一条、二条、九条。近卫、鹰司、一条、二条、九条五家合称五摄家，自镰仓时代至江户时代为止，除了丰臣秀吉、秀次以外，摄政、关白的职位均由这五家所出。
系谱.
北家本流.粗体字表示担任过