刘国轩集溃勇从澎湖吼门水道逃窜。刘国轩战败消息一出，郑氏王朝内部无心抵抗清军，未久延平郡王郑克塽率众薙发降清，南明东宁王国自此覆亡，结束在台湾22年统治。
战前情势.
三藩之乱.三藩之乱时期，入主中原不久的清朝因根基不稳，且与南明各地势力战火不断，因此对割据闽台一方的明郑王朝基本采取和谈为主的策略。康熙六年（1667）清廷曾派总兵孔元章赴台湾招抚。并答应若郑经归顺，可封“八闽王”并继续统领闽台属地，但郑经拒绝。康熙八年（1669年），康熙帝除去鳌拜开始亲政