后，担任红二十五军政治部组织、宣传、文印科科长，参与长征。到达陕北后，任红十五军团政治部敌工部科长、红七十八师政治部宣传科科长。1936年11月起，任红三十一军司令部机要科科长、作战科副科长，红三十一军干部大队长兼政委、援西军机要科科长。歌曲《三大纪律八项注意》即由刘华清与程坦改编而成。
抗日战争.1937年后，刘华清担任八路军129师司令部秘书主任，参加了七亘村战斗、长生口战斗、神头岭战斗、响堂铺战斗、晋东南反九路围攻战役。1938年1月，护送邓小平到八路军129师上任。19