玉祥部的全权代表到南京，任国民革命军总部上将高级参谋。1927年12月，他兼任湖北省政府委员。后来熊斌作为冯玉祥部驻南京国民政府代表，历任国民政府军事委员会委员、东北特别委员会委员、国民政府军事各部编制起草委员会副主席、军政部航空署长等职务。1930年中原大战中，他任冯玉祥部前敌总司令部参谋长。九·一八事变之后，熊斌改任南京国民政府参谋本部总务厅长。1933年，他到河北帮助何应钦处理华北事务。1933年5月31日，他作为国民政府军事委员会北平分会总参议，任首席代表，和日本首席代表冈村宁次签订《塘沽协定》