腐败无能深感不满。1799年，拿破崙从埃及返国，并连同富歇和塔列朗密谋政变。同年11月9日，拿破崙军队控制督政府，迫使督政辞职，将法国议会和元老院解散，夺取议会大权，并宣布执政府成立，督政府正式灭亡。
执政府.执政府成立后，由西哀士、拿破崙、迪科任临时执政，西哀士并起草新的宪法，但为拿破崙所破坏。拿破崙担任第一执政，掌握了全国最高的权力，并开始实行了一连串的改革措施。政治上他重划地方行政以加强中央对地方的控制并全力镇压保皇党的势力，解决自法国大革命以来动盪的局面，而财政方面则整顿财