奥博特在肯尼亚参与了当地的独立运动。1956年他回到乌干达后，随即加入国家大会党，并在1957年获选为立法议会议员。1959年，国家大会党分裂成两派，其中一派由奥博特领导，与乌干达人民联盟合并成乌干达人民大会党。担任反对党总裁数年后，奥博特与布干达君主主义政党卡巴卡耶卡党（）结成联盟，在1961年获选为总理。1962年4月25日，奥博特正式上任，当时的乌干达总督是沃尔特·库茨。翌年，奥博特罢免国家元首伊丽莎白二世，布干达国王穆特萨二世成为总统，奥博特出任执行总理。奥博特出任总理期间，曾与后来成为乌干