清朝顺治十二年（1655年），从福建漳州至此的临济宗三十二代法裔宗符禅师，重建寺院，将西来庵改名为华林禅寺。首建大雄宝殿，次建楼阁、堂庑、寮室、仓厨，其范围大致为现时的北起兴华大街，南至下九路，东靠新胜街，西邻毓桂坊，正门在长寿西路，占地近三万多平方米。康熙四十年（1701年）增建殿舍，殿内有七层高的舍利塔。道光二十九年（1849年）兴建五百罗汉堂，到咸丰元年（1851年）落成。1907年11月，广州同时成立两大立宪团体——粤商自治会和广东地方自治研究社，其中粤商自治会会址就设于华林寺。民国十三年（1