在UNIX平台上的版本，名为GFCE Ultra，图形化终端使用GTK2用户图形界面库以Python语言写成。该版本后来于FCEUX 2.1.3中添加。该模拟器目前已经支持DOS、Linux、Mac OS X、各种Unix平台（如FreeBSD、Solaris和IRIX）、Windows、GP2X、PlayStation、任天堂GameCube、Wii和Pepper Pad。