。因被平孝义告密，天皇于是再次命检非违使压他前往九州。长德三年，因为生病的皇太后祈福，天皇大赦天下，伊周兄弟才得以重新返京。
在道长的权威下渡过的余生.长保元年（999年）年底，中宫定子生皇子敦康。同一时期道长已入宫的长女藤原彰子被封女御。到了翌长保二年（1000年），彰子被立为中宫，因此改中宫定子称皇后，尊贵的唯一嫡妻地位被剥夺。不久后，苦心劳累的皇后定子因生产后胎衣不下崩御。伊周抱持妹妹的尸体痛哭不止，送葬之日，家中兄弟三人皆做哀歌。长保三年（1001年），伊周终得复本