者所宣称的有神论现实主义（批评者称之为“超自然主义方法论”，即相信超自然的神祇）来替代科学中的自然主义方法论。 智能设计假说支持者认为，自然主义无法解释某些现象，而超自然的解释简单并且直观地解释宇宙和生命的起源。该理论支持者说，智能设计假说的证据以不可化约的复杂性和特殊复杂性的形式存在，而这些特性均不可被自然法则所解释。该理论支持者也从固守宗教中立原则上要求在学校同时教授演化论和智能设计论，声称仅仅教演化论是对创造论信仰的歧视。教授两种理论，容忍宗教信仰的可能性，不会让政府真的提倡这种信仰。许多智能设计