后奏请追谥郑成功，并在台湾府城建造专祠，以彰忠义。沈氏书写对联云：「开万古得未曾有之奇，洪荒留此山川，作遗民世界；极一生无可如何之遇，缺憾还诸天地，是创格完人。」沈氏为加强台湾的防御能力，聘请法国工程师帛尔陀（M. Berthault）及鲁富设计二鲲鯓砲台（现亿载金城），设计时参考巴黎外围防御工事。1874年（同治十三年）九月，亿载金城动工。1876年（光绪二年）八月完工，历时两年完成，郑超英参与砲台兴建。砲台主要建材以三合土及红砖为主，其部分砖材取自倾圮之热兰遮城（Zeelandia）。砲台外城门