27年），雍正帝下诏并拨十万两库银，在多伦汇宗寺西南的山丘上又兴建一座寺庙。雍正九年（1731年）该寺完工，雍正帝御书“敕建善因寺”，赐匾额“兹云广被”，立御制善因寺碑，碑文称：“俾章嘉胡图克图唿毕尔汗主持兹寺”，即派第二世章嘉活佛主持该寺。该寺与外蒙古庆宁寺为同年同月同日由雍正帝允准兴建的“大刹”。《清实录·第七册·世宗实录（一）》载，雍正帝于雍正五年十一月庚午日允准“着动用帑银十万两修建大刹”于漠北库伦地方，以供第一世哲布尊丹巴唿图克图之后身（转世唿毕勒罕）住持，齐集众喇嘛讲习经典、宣扬佛教，同时雍