赛补时的93分钟才被否定升级的权利。但努力最终没有白费，于2004年在尤尔根·克洛普（Jürgen Klopp）带领下升级德甲，在顶级联赛中逗留三个球季。美因茨于2004/05球季比赛成绩上有了很大的突破，经由欧洲足协的“公平竞技榜”而获得了参加欧洲足协盃的机会。在2008-09赛季的德乙联赛中，美因茨获得第2位，直接升入2009-10赛季的德甲联赛。
主场球场.美因茨05的主场于2011年7月3日正式迁至可容33,500人的欧宝竞技场。而此前使用的布鲁赫路体育场（Stadio