南方马拉维的一系列湖泊，这些湖泊包括全球最古老、最大型和最深的湖泊。许多湖泊是有丰富生物多样性的淡水生态区，而其他的盐硷湖则存有高度特殊的生物体。东非大裂谷的湖泊是以在其中的水域中至少有800种丽鱼物种的进化而闻名的。预计更多物种将被发现。世界自然基金会指定这些湖泊为其重点生态保护区之一。在这篇文章中，主要湖泊被列出，一般是以从北到南的顺序，并且每个湖更详细的文章可以通过名称的链接来访问。