和扁桃体等，其中以肺及肝最为严重；极少侵犯中枢神经系统及肾上腺等内分泌腺。主要临床表现为发热，体温可高达40℃，浅表淋巴结及肝脾肿大，可有脓肿形成及溶骨性损害。健康人有可能染上马尔尼菲篮状菌病，但是免疫力低下的人更容易遭到侵犯。特别是近年来随着艾滋病感染人数的增加，马尔尼菲篮状菌病的患者也随之增多。