如果两段音频文件人们听起来是一样的，即便它们的二进制表示形式不一样，它们的声学指纹也应该是相同的或者非常相似的。（因此，声学指纹从严格意义上讲并不属于——真正的指纹——必须能够区分数据上任何细小的差别。）不同的音频压缩技术（包括：MP3、WMA、Vorbis等）在对音频文件的二进制编码方式上虽然有较大差别，但是却不影响音频文件播放的效果。健壮的声学指纹识别算法应该能够正确的识别出经过压缩的音频文件，甚至在音频质量有明显下降的情况下也能够正确识别。在用于广播监控时，声学指纹识别算法还应能忽略模拟传输对音频