炎.由于自噬随着年龄的增长而下降，是骨关节炎的主要危险因素，因此自噬在该疾病发展中的作用得到重视。在人类和小鼠的关节软骨中，参与自噬的蛋白质都随着年龄的增长而减少。经培养的软骨外植体，其机械损伤也会减少自噬蛋白。自噬在正常的软骨中会不断被激活，但会随着年龄的增长而受到损害，并且先于软骨细胞死亡和出现结构受到破坏的现象。因此，自噬参与了关节的正常保护过程。
炎症性肠病.炎症性肠病（inflammatory bowel disease）是由易感基因、环境和免疫系统之间一系列的相互作用