座大满贯单打锦标（法国公开赛、美国公开赛）在内的十项ATP单打赛事冠军，10月，生涯第三度登上世界第一，并且他在生涯第三度确定年终第一位置。2013年，澳洲公开赛，因肠胃病毒感染退出比赛。2月，纳达尔结束长达七个月的养伤期，在南美洲红土赛中复出。法国公开赛第八度进入决赛后，以6–3、6–2、6–3击败费雷尔而卫冕成功，拿下第八座冠军与第十二座大满贯，成为职业网坛史上首位在一个大满贯赛中八度封王的球员。不过于该年温布顿锦标赛的第一轮出局，以6–7、6–7、4–6爆冷败给世界排名135位的比利时选手史提夫·