次被迁移至难波京（位于现在的大坂市）。此后，此地大部分区域仍持续成为皇族相关人员的领地。14世纪后醍醐天皇为推翻镰仓幕府引起元弘之乱，期间后醍醐天皇曾逃至此地，幕府军追击此地后发生笠置山之战并逮捕后醍醐天皇，此后也进一步造成南北朝时代的开始。在江户时代相乐郡的东部区域属于柳生藩、津藩及津藩的支藩－久居藩，西部区域属于淀藩，中间及北部区域则为皇室领地及幕府直属的领地，另有小部分区域属于小泉藩。明治维新后，整个相乐郡随着各藩的改设先后分属京都府、津县、久居县、淀县、柳生县、小泉县，直到1872年初才全数