除北部边界地带为大坪溪主流集水区外，其余均属大坪溪左岸两条支流小南坑溪、大南坑溪的流域范围。
历史.台湾清治末期至日治初期，南坑地区为一街庄，称为「南坑庄」，隶属于竹北一堡。该庄北边西段与南埔庄为邻，北边东段、东边及南边东段与大坪庄为邻，南边西段为藤坪庄，西边为石硬仔庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于新竹厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄隶属不变。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「南坑」