39年汪精卫政权成立后，李任“伪中国国民党中央执行委员会特务委员会特工总部”（几乎全盘复制了中统“特工总部”的模式，俗称“极司非尔路76号”）副主任兼警卫总队队长。不久，李先设计挤走另一副主任唐惠民，又在与丁默邨的倾轧中获胜，出任警政部次长，由于部长由周佛海兼任，实际大权全掌握于李手中。李其后升任特工总部主任、警政部长等职。同时，他还担任了汪精卫政府的清乡委员会秘书长、“剿共救国特工总部”负责人，负责在江苏地区的清乡活动。1942年，李又兼任江苏省政府主席，权倾一时。在汪精卫政权任职期间，对国民党中统和