因此这座教堂被视为威尼斯的黑死病教堂之一，用来平息天主的惩罚。自1506年开始，由建筑师Antonio Abbondi监督，进行了许多的调整和扩建，这座教堂形成目前的外观。1548年扩建完成，这座教堂终于在1562年祝圣。它只有一个中央走道，平面为拉丁十字。它有一个中庭，其上是一个凸起的唱经楼，最后的高潮是一个小穹顶下面的圣所 这座教堂的建筑风格为文艺复兴。1867年进行了一项修复工程。
外观.圣塞巴斯弟盎教堂的立面很普通，在三角墙的顶部，是被箭所伤的圣塞巴斯弟盎像。靠近门口的