将这一情况结合林业系统普遍存在的浮夸风，汇报给林业部党组，建议杜绝此类“假大空”的错误做法。因此她被人戴上了林业部“小彭德怀”、“严重右倾”的帽子，直到1961年帽子才被摘下。1961年起，李万新历任林业部基建局副局长、林产工业司副司长。文革期间，造反派指控李万新是叛徒，理由是1932年她在北平读书时曾被捕。后来造反派又指控她是“假党员”。但她始终未屈服。中共十一届三中全会后，李万新重返工作岗位，1978年到1982年任中国林业科学研究院副院长。当时中国林业科学研究院百废待兴，李万新在一间工棚改成的小平