由旧贵族流言诬陷朴定阳、尹致昊要建立民主共和国，成为正、副总统，谣言的传播，高宗决定立即逮捕尹致昊等独立协会领导人，万民共同会被迫解散。这导致尹致昊领导的独立协会运动被强制终止。失败返回的弹压独立协会，改革人士的逮捕，刑罚民众接受无论是判断人物，让他对皇帝的不忠，尹致昊对启蒙的民众对象未能改变改造的想法失望。他在法务大臣父亲的劝告下任德源（今朝鲜元山）监理兼德源府尹，尹致昊在元山做了1年多府尹以后，又于1900年6月25日调任三和（今朝鲜南浦）监理兼三和府尹。1901年7月24日再度被任命为德源监理兼德源