明宪宗点头同意。同年冬，遂立朱祐樘为皇太子。当时，宪宗召见皇子留在宫中，而其母纪氏仍在西内。商辂担心万贵妃加害纪氏，却又难以直言，于是和同官上疏称，皇子母子亦就近居住，而请纪氏迁入西六宫、永寿宫，封纪氏为妃。又过一个月，纪妃病终。商辂亦请礼宜从厚，并命司礼监奉皇子、问视、制衰服行礼。当时，宪宗欲恢复郕王位号，命廷臣商议。商辂极言明景帝有社稷功，应当恢复位号，宪宗于是意决。宪宗还在建玉皇阁于皇宫之北，命内臣执事，礼与郊祀等，商辂则请罢免。此外，太监汪直掌管西厂，屡次制造冤案。商辂率领同官陈十一罪，与宪宗对