同的是，苗疆长城的防御目的不是为了抵抗游牧民族的入侵，而是为了隔离生苗（未服从朝廷的苗族）和熟苗（服从朝廷的苗族）以防止生苗造事。长城始建于明朝万历年间（1573年-1620年），由明朝朝廷拨款四万两白银修建而成。明朝末年，苗族暴动，把边墙夷为平地。清朝政府则在边墙旧址上重新建设了新的城墙，继续防止苗民的暴动。
规模与边防.南长城共有1300多座用于屯兵、防御用的由汛堡、碉楼、屯卡、哨台、炮台、关门，仅凤凰县境内就有800多座。当时的驻兵约4000-5000人，最多时曾增到70