为血管紧张素转化酶（ACE）第一个被发现的，ACE2的基因位于人类基因组中的X染色体，包括18个外显子，编码的蛋白由805个胺基酸组成，与ACE的胺基酸序列相似度为42%，是一个带有锌离子的金属蛋白，属（第一型膜蛋白），其N端结构域为一M2多肽酶，位于细胞膜外侧；C端则与另一种名为collectrin的蛋白同源，包括疏水的跨膜结构域和一个结构域，位于细胞内。ACE2因有跨膜区域而造成其结构测定的困难，过去仅知其N端多肽酶的结构，直到2020年科学家才用低温电子显微镜测出了与另一蛋白结合状态的完整ACE2