DNA结合后吸收与发射光谱的现象，与DNA的结合会使DAPI分子因位向限制导致几何弹性降低，且周围环境的极性甚低会导致DAPI分子的极性降低。
用途.除了用于分析荧光显微法以外，DAPI也经常在细胞培养中被用于追踪侵染的支原体或病毒。在培养基上培养的支原体或病毒颗粒被DAPI染色后会发出荧光而易于追踪。DAPI也经常在流式细胞术中用于区分不同细胞周期时相的细胞。
活细胞安全性.
毒性.DAPI可用于固定细胞染色，但是因为活细胞染色