基座设有协康会长沙湾中心（社会福利署辖下的特殊幼儿中心）、仁济医院－香港浸会大学中医教研中心（西九龙）、医院管理局辖下的西九龙普通科门诊诊所。由于长沙湾政府合署兴建前深水埗政府合署已经存在，纵使邻近深水埗站，大楼仍以旁边的长沙湾道而命名。大楼曾受鼠患困扰，不少政府部门文件及电线遭老鼠咬破。2019年10月，时值香港反修例运动，长沙湾政府合署多次遭受示威者破坏。