失去后盾，强化对志士的肃清。躲过俗论派肃清的高杉晋作，逃到福冈的平尾山庄投靠野村望东尼，后得知五卿移送之事，返回下关，力促奇兵队决起，但是，被山县狂介以时期尚早为由反对。其他诸队也多持反对的态度。
举兵.在功山寺集结的仅有伊藤俊辅率领的力士队和石川小五郎率领的游撃队共84人。以死为觉悟的高杉留下遗书，向功山寺的三条实美等五卿致意后，为征集物资，袭撃下关新地会所，迫使根来亲祐（根来上总）降伏，佔领当地。之后，由18名（或20名）组成的决死队攻入三田尻的海军局，夺取「丙辰丸」等3只