1979年1月，中共上海市委责成使用单位立刻迁出，还补偿3万元给上海市天主教会作修理费。重新修复的天主堂此后开始对外开放，并于1979年11月在教堂被抢救性整理出的两间厅堂内正式恢复正常的宗教活动。1980年圣诞节前夕，徐家汇天主堂完成主体建筑的修缮，张家树主教主持圣诞节大礼弥撒，千余教徒恭与弥撒。1982年8月，两座各重达13吨的十字铁塔架，重新安装到钟楼上，钟楼也修复完毕，但在修复玻璃彩窗时，因玻璃原有的制造者土山湾工艺厂已经不存在，从国外进口开销又过于巨大，只得由神父自己制作，制成的彩色玻璃其色彩质量