游戏另有势力冲突系统，玩家可支持斯巴达或雅典的任一方，双方将进行征服战；以目前所知，在此战斗系统中的影响不会对故事造成任何影响。
设定.游戏设定于距《刺客信条：起源》故事发生前四百年的公元前431年，讲述了古希腊城邦之间的伯罗奔尼撒战争的秘密虚构历史。玩家扮演一名雇佣兵，可帮助以雅典为首的提洛同盟或以斯巴达为首的伯罗奔尼撒联盟。和系列之前的游戏一样，《奥德赛》同样拥有现代故事线，继续《刺客信条：起源》蕾拉·哈桑的故事。本作中出现许多真实的历史人物，如：出场的其他历史人物包括