年度末期，受到日本泡沫经济时期的好景气影响，长崎电视台在1989年度实现营业额达62.5亿日元，盈利达12.39亿日元，创下迄今最高记录。1990年代后，长崎文化放送和长崎国际电视台开播令长崎县拥有四家民营电视台，广告市场竞争因此更加激烈。同时因日本电视台系列的长崎国际电视台开播，长崎电视台退出日本电视台系列联播网，完全成为富士电视台系列联播网成员。1991年云仙普贤岳喷发时，长崎电视台有三名记者在取材时殉职，是在云仙普贤岳喷发报道中唯一有员工殉职的总部设在长崎的媒体。长崎电视台在1995年开始修建总部