，没有其他可靠的手段可以确诊。腰椎穿刺也可以用于诊断患者是否患有1型或2型。由于婴儿更易感染脑膜炎，同时相对成年人，感染后更易表现出非典型症状，因此腰椎穿刺诊断脑膜炎是对不明原因发热的婴儿的诊断的例行手续。腰椎穿刺可以用于确诊或排除任何年龄层患者的蛛网膜下腔出血、脑水肿、和许多其他疾病。腰椎穿刺也被应用于检测脑嵴髓液中的恶性肿瘤细胞，例如或。例如，在蛛网膜下腔出血的情况下，脑嵴髓液中的红血球（RBCs）数量若少于10/mm³，则检测结果为阴性。100/mm³以上的红血球数量则代表检测结果为阳性。