所在地下关市境内早已存在另一个下关车站，因此根据新干线车站的命名惯例，在城市名称前加上「新」字作为新干线车站名。为了训练新干线乘务员在面对突然状况时的反应，JR西日本在新下关车站内设置了专用的训练设施，新下关新干线乘务员训练中心（）。从下关沿着山阴本线经长门市行驶至萩市的观光列车也是从本站发车。