1999年9月，在朱镕基总理任内，汪洋被调入国务院工作，出任原国家发展计划委员会的副主任。2003年3月，在温家宝接任国务院总理后，汪洋被任命为温家宝内阁中的国务院副秘书长（正部级），负责国务院办公厅的日常工作，并且兼任国家机关党组副书记、国务院三峡工程建设委员会委员等职务。2005年12月24日，汪洋接替黄镇东出任中共重庆市委书记，任职到2007年11月30日。
中央政治局委员.2007年10月，52岁的汪洋在中共十七大上当选为中央委员，并在10月22日的中共十七届一中全