武装冲突，涉及巴基斯坦塔利班运动、伊斯兰军、执行先知法典运动、盖达组织等武装组织，以及有组织的犯罪。冲突始于2004年，源于巴基斯坦陆军在瓦济里斯坦山区（位于联邦直辖部落地区）搜索盖达组织战士而造成的紧张局势升级为武装抵抗。巴方的行动被认为是对国际反恐战争的贡献。2008年至2010年巴基斯坦军方和与阿拉伯武装分子结盟的中亚激进组织间爆发更多冲突。外籍武装分子得到西面阿富汗战争的巴基斯坦非军人老兵加入，随后成立了巴基斯坦塔利班运动及伊斯兰军等其他好战组织。1992年成立的执行先知法典运动与巴基斯坦塔利班