沖毁后，直到20世纪之前，此地要通过淀川都只能靠渡船。在令制国时期本地属于山城国乙训郡，1582年明智光秀在本能寺之变之中于京都杀害织田信长后，丰臣秀吉在六天内完成被称为中国大返还的急行军自备中高松城（位于今天的冈山县冈山市）抵达此地，两军于此展开山崎之战，最终丰臣秀吉取得胜利，丰臣秀吉也因此成为掌握原属织田信长的大部分势力。在江户时代此地分属京都公家、离宫八幡宫及幕府的直属领地，在明治维新后被划入新设立的京都府；1889年实施町村制时，设立了大山崎村，范围即为现在的大山崎町，在1967年，大山崎村