产党游击队。印尼非正规武装力量入侵砂拉越，但被马来西亚和大英国协军队抵挡住。这个“冲突时期一直延续到1965年印尼爆发军事政变，苏卡诺下台，印尼共产党被摧毁为止。苏卡诺的继任者苏哈托改善马印关系。与此同时，菲律宾总统奥斯达多·马卡帕加尔重新提出菲律宾拥有沙巴，其理由是文莱苏丹在1704年将沙巴让与苏禄苏丹国。1966年，菲律宾新总统马可仕放弃这个要求，但这个主张依然是菲律宾与马来西亚关系的争执点。
民族倾轧.1930年代的大萧条及此后的中国抗日战争终止华人向马来亚的移居，稳定马来亚的