司成立，以古达为特许公司初始之总部，后于1883年将总部迁往山打根。1885年，英国、西班牙和德国签订了，承认西班牙在苏禄群岛的主权，以交换西班牙放弃对北婆罗洲的主张。1888年，北婆罗洲成为英国的保护领。
日本佔领时期.第二次世界大战期间，日军于1942年1月1日登陆纳闽，并继续入侵北婆罗洲的其他地区。1942年到1945年，日本军队佔领马来亚、北婆罗洲和砂拉越，连同这座岛屿的大部分地区。日军完全占领沙巴后，当地人组织了抗日组织“神山游击队”，由郭益南（Albert Kwok）建