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分类与演化关系.在1959年，南漳龙被命名时，被归类于鳍龙超目的一属。在1972年，中国古生物学家杨钟健、董枝明建立湖北鳄亚目（Hupehsuchia），当时是槽齿目的一个亚目，槽齿目当时包含二叠纪晚期到三叠纪的多样性早期主龙类；目前被视为是个原始主龙类的并系群集合，槽齿目已不常被科学文献引用。在当时，湖北鳄亚目被认为是多群三叠纪爬行动物的近亲。鼻骨与前额骨之间的洞孔，原本被认为是眶前孔，因此湖北鳄亚目当时被归类于主龙类；但是主龙类的眶前孔是位于上颌骨、泪骨之间，而非鼻骨与前额