统治很快瓦解，而美第奇家族重新夺回权力的同时，教会的清算运动却仍然持续着。在1542年罗马天主教和东正教的宗教法庭成形，几年后一份禁书目录出现，查禁了大量文艺复兴时代的作品。对于文艺复兴结束同样影响甚巨的原因，是许多来自于国外的侵略造成了数十年的意大利战争，破坏了原本稳定的局势。战争是由西元1494年法国入侵义大利北部的广大地区开始，并终结了当地许多独立的城邦。最大的损害则是在1527年5月6日发生的，当时西班牙与神圣罗马帝国的部队洗劫了罗马，也终止了教宗身为文艺复兴艺术与建筑最大赞助者的工作。有许