水稻基因组（英语：Rice genome）是水稻（"Oryza sativa"）的基因组。共组成12个染色体。大约含有4亿3千万个DNA硷基对（以氢键相结合的两个含氮硷基），其中的一些硷基对，组成了约38000个基因，这个数字约是人类基因数目的1.7倍。来自11个国家的团队，在国际水稻基因组定序计划中调查水稻与一些栽培亚种的基因组DNA序列，在2005年8月发表了初步的结果。