闸右侧进水，沿郭洲头东侧至角美镇沙洲村东南，跨中港进入紫泥镇浒茂洲和乌礁洲两岛的渠道，全长25千米，引水流量8立方米每秒，主要用于灌溉两地农田2500公顷。右干渠起自龙海市榜山镇长州村马崎自然村东南，南港桥闸右侧上游约1千米处的马崎取水泵站，向西至漳州市龙文区蓝田街道蔡坂村以南西溪桥闸上游，全长5千米，引水流量10立方米每秒，除灌溉沿岸农田外，主要为旱时向西溪引水系统补充供水。