藤原北家的关连也更加紧密。1030年，源赖信接替平直方，开始平定平忠常的叛乱。至1031年乱平，杀平忠常。经此事件，原属平忠常的坂东平氏的势力范围，多落入源赖信之手，可说是后来清和源氏一族在东国一代称霸的重大资本。1051-1062年，源赖义与源义家父子与出羽清原氏联手，击败奥州的安倍氏，此称为前九年之役。1083-1087年，源义家介入出羽清原氏的纷争之中，协助藤原清衡击败异父弟清原家衡，此称为后三年之役。后三年之役结束后，朝廷认为此役系清原氏私斗，因而不予奖赏，义家于是自散家财赏有功者，自是其威