当巴西帝国于1822年9月7日宣布独立之后仍继续与葡萄牙军队作战，直到葡军于1823年7月2日投降。7月2日因此成为巴伊亚独立日，并被列为州定假日之一。独立后巴伊亚领地改称，范围大致与领地时期相同。1827年佩德罗一世为了惩罚支持运动，将该省西部、圣弗朗西斯科河左岸一部分的土地划给巴伊亚省，使得巴伊亚省所辖的范围增加了约15万平方公里。1889年，巴西皇帝佩德罗二世被驱逐出境，巴西合众国，境内所有省改称为州。巴伊亚州下辖10个、34个及417个市镇，市镇数量为巴西各州中的第4名；萨尔瓦多是巴伊亚州首府及