阔尔殿35间，药王殿41间，苏布尔嘎殿59间，日格尼殿35间，阿木尼殿19间，阿鲁庙23间，德勒和庙19间，辩经殿35间，葛根拉布隆80间，第巴喇嘛拉布隆34间，卫藏喇嘛拉布隆29间，各庙仓113间。中华人民共和国成立前，该寺僧人为 370余名。文化大革命期间，福因寺再度遭到破坏。直到1982年，该寺开始修复。到2000年代，该寺有大小庙宇15座，建筑物一百多栋，设有亭、堂、殿、阁。主庙旁有高达10米的白塔。各庙以及僧房、吉萨（仓库）共计1498间，占地面积0.3平方公里。