佔中示威真的发生时，教会亦阻挡不到，并说在最极端的情况下，教会不会排除支持佔中。杨此番言论就被香港左派报章文汇报抨击，指他鼓吹犯法。杨最后于翌日就事件澄清，说教会并非表态支持公民抗命，而教会亦不希望卷入政治角力。随后，曾经批评杨的文汇报则刊登由刘梦熊撰写的文章，赞赏杨的澄清。2014年，在佔中示威发生前2个月，杨鸣章被问及如果有天主教徒因为佔中而被警方拘捕，教区会怎样处理。杨回应时以人家儿子因为吸毒被捕来做比喻，说他会想办法帮助。虽然杨曾澄清他无意用吸毒来比喻佔中人士，但杨的言论依然遭到非议。