林爽文事件中力守孤城嘉义近半年，以功封一等义勇伯。福康安入城时，柴大纪未执“橐鞬之仪”。被福康安上参疏议纪「听任兵丁开赌寓娼，贩卖私盐」、「令其每月缴钱」，又说林爽文起事完全是柴大纪「平日废弛贪黯，积渐酿成」。遭槛至京处决。其子柴际甲发配至伊犁为奴。《清史稿》有传。