。第5航空队与前四个航空队不同，是在二战爆发之后的1940年4月12日才在汉堡创立的。因应纳粹德国在4月9日发动的威瑟演习作战，因此在编成不久后的4月24日移往奥斯陆，参与挪威境内的战斗。当北欧的战斗在6月结束后本部队投入不列颠空战，负责由挪威与丹麦长距离攻击英国东北部的任务。之后则负责北欧的防空工作与巴伦支海、挪威海和大西洋的哨戒、船团攻击。由于将战力调往其他重要战线，于1944年9月16日解散。