团长共事至2004年。陈中申回忆王团长说：「温文儒雅，宽以待人的王老师。」1996年王正平获国家文艺奖，2000年获亚洲最杰出艺人奖。2004年完成推动乐团转型成音乐总监制，由台北市立国乐团团长转任首任音乐总监。2005年退休后，转任教于台北中国文化大学中国音乐学系专任教授。2009年于台北国家音乐厅举行王正平琵琶独奏音乐会：「全世界最顶尖琵琶大师－－王正平」， 演出【彝族舞曲】、《琵琶行》、《长门怨》、《琵琶随笔》等经典曲目，并改编知名童谣《只要我长大》、《摇篮曲》与《两只老虎》，于音乐会首演《童