海后，朱永嘉放弃抵抗。10月，朱永嘉去日本仙台访问，下飞机即被抓，被隔离审查于提篮桥监狱5年，1982年因“反革命罪”等被判处有期徒刑14年，1988年保外就医，提前释放。出狱后长期靠给台湾三民书局整理古籍维持生活，注译《唐六典》、《容斋随笔》、《春秋繁露》等。2009年后经魏承思推荐给上海商业精英讲历史。