校开幕典礼当日，校方邀请时任教廷驻华公使高理耀总主教主持仪式。黄大仙天主教小学其后分别在1983年及1986年推行小五、小六班级图书馆计划和活动教学。在1998年成立家长教师会。及至2002年9月，校方决定下午校于原址实行全日制上学模式。而上午校则迁往钻石山蒲岗村道，并易名为「慈云山天主教小学」。该校后来于2006年增设「圣母山」及「学生活动中心」。其校友会于翌年成立；另外，校园内的「祈祷室」及校园电视台在2014年才出现。同年3月亦正式组成法团校董会，实施校本管理政策。
毗邻建筑.