越来越严重，针对华人的屠杀时有发生。印尼华人的身份证上标记“WNI”（Warga Negara Indonesia，印度尼西亚公民）而不是像原住民的身份证上只写“印度尼西亚人”，这作为印尼华人的一种婉转的标记。这让官员更容易向他们索要贿赂，类似希特勒要犹太人佩戴犹太教六芒星。即使是本地出生的或者在印尼生活了很多代的华人也必须持声明他们放弃中国国籍的证明。这些高度歧视的法律被华人认为是政府在努力的进行文化灭绝。一些印尼华人无法忍受逃走了，新客回到中国大陆，结果在文化大革命中却遭遇打压，一些峇峇娘惹去了荷兰。