年（1908年）出生于湖南汉寿，1912年春全家搬到苏州定居。吴兆基12岁左右开始受父亲吴兰荪的影响学习古琴，后来又师从吴浸阳。吴兆基曾加入今虞琴社，1950和1960年代在苏州怡园、网师园和苏州公园教授古琴和太极拳。1984年随苏州市的代表团前往意大利。1986年与徐中伟、叶名佩在苏州成立吴门琴社，定期于怡园等地举行雅集。