2条轨道交通线路分为3个层次：第一层次为镇间骨架线路，2、3、4号线跨越两江，连通三镇。第二层次为镇内主干线路，1号线和5号线分别贯穿汉口及武昌镇内的东西方向。第三层次为跨江辅助线路，由6号线，7号线和8号线组成。到2040年，将建成9条地铁干线和3条城市快线，全长约540公里，其中有过江地铁通道7条穿越长江和汉江。届时，有66％的人口和岗位位于地铁站点600米步行半径范围内，全市居民进入武汉市一小时经济圈。至2020年，开通运营里程将接近400公里。远期规划由12条中心城区线路和13条新城区共25条线