逝世，享年47岁。11月29日举行敛葬之仪（皇族丧礼），在落合斋场进行火葬，埋葬于丰岛冈墓地。丧礼动员了学习院初等科、中等科的学生。另外，因为世界盃足球赛的影响，一般民众与足球迷也特别关注。宪仁亲王生前所担务的众多职位，主要由久子妃继承，例如日本足球协会的名誉总裁一职。此外，自宪仁亲王骤逝以来，厚生劳动省和消防厅针对心室颤动採取相关对应措施。逝世两年后，2004年开始推广、普及自动体外心脏去颤器（AED）的使用，去颤以于紧急时刻即时治疗。