制满洲都统和蒙古都统及六部满尚书和蒙古尚书成为议政大臣。他们还决定授予议政王大臣会议成员掌管理藩院的资格，此前顺治帝迫于武力，将理藩院从礼部独立出来。到了1662年，议政王大臣会议成员被裁减至31名，这些成员主要是有着丰富军事和民政经验的满洲领袖。康熙帝在1669年后将鳌拜派系的许多官僚改革废除，但继续依靠议政王大臣会议，在各种各样的军事和民事事项上，特别是那些过于敏感或过于复杂的事项，他会绕过正式官僚机构，来咨询过这群顾问。皇帝允许左都御史压制议政王大臣会议，此后在1681年镇压三藩之乱，恢复控制全国