外，东京城市航空总站有往羽田机场及成田机场的机场接驳巴士。
站名由来.开业前是使用当地地名「砺殻町」作为临时站名。但由于车站有部份用地属于日本桥箱崎町，加上直通该地的，因此当地居民要求将站名改为「箱崎」。最后，本站选择以附近的水天宫作为正式站名。该站名也曾做为都电的车站名。