截至2019年1月，每天有400多班列车在北京南站始发终到。北京南站始发终到的列车多以在京沪高铁运行的高速动车组列车（G字头列车）为主，也有在京津城铁及延伸线运行的本线城际动车组列车（C字头列车）、跨线G字头列车，以及在京沪既有线运行的，往方向的普通动车组列车（经津保铁路）及往上海、南京方向的卧铺动车组列车。
公交.北京南站设计有南北两个公交场站。北广场公交场站位于北广场地下；北广场共分为上下三层，最底层和车站主体地下一层出站口相连，中间层设置公交场站，旅客由通过扶梯直接进入公交站