15日正午，在五岛列岛附近海域，美海军潜艇“皇后鱼”号（SS-393）趁飞机警戒不备时混入船队中，并向“秋津丸”发射了两枚鱼雷。11时53分，鱼雷命中本舰左舷艉部并引爆其后部弹药库。中雷后本舰迅速向左倾覆沉没，共计2326人阵亡。沉没地点位于五岛列岛福江岛西北约40km海域（北纬33度17分，东经128度11分）。部分幸存者被驱逐舰“㭴”号救起后转移到“神州丸”上。
构造及应用.
登陆装备.包括“秋津丸”在内的量产型“特种船”，船体内都设有装载大发动艇等登陆