开市历史在台湾本岛最早，但地质却很年轻。末次冰河期（约2万年前）时海平面下降，台湾一度与亚洲大陆相连。此后海水升降数次，1万年前时嘉南平原又在海面之下。在阿里山邹族传说中，邹族人原居台南海滨，称台南为"Ca’hamu"（札哈木）。17世纪荷兰东印度公司人员抵达时，今台湾西南部仍为成群罗列的洲潟海岸，称为台江内海。潟湖外侧有北线尾与大员等沙洲岛屿，内陆则有原住民赤崁社（Saccan）。台江内海两岸彼此隔海约4公里、深3至14公尺。
荷西时期.在荷兰人到来之前，台南许多地区已