外回廊绘有释迦牟尼像1000多尊；第二层是护法神殿，四壁绘护法神像；第三层是该寺主体建筑，主供高120厘米的强巴佛镀金像，左右两侧供奉镀金佛像数尊，分别放置在18个佛龛中。佛殿与回廊的壁画是该寺壁画的精华。16世纪后，该寺势力逐渐衰弱，一度被本地的格鲁派桑丹林寺管辖，该寺寺主也由桑丹林寺委派，桑丹林寺嘎钦·益西坚赞曾任强准祖拉康寺主。如今的强准祖拉康是1986年重修，21世纪初有喇嘛4人。2015年4月25日，尼泊尔发生强烈地震，强准祖拉康受到波及。