有三个州的军队还继续为赫尔维蒂共和国战斗。6月25日督政府迫使奥克斯辞职，因为他被看作是法国派的。督政府希望通过这个措施在最后关头还能从法国和奥地利获得中立。但是8月13日法国又开始占上风。马赛纳将军开始反攻，在四天内把奥地利军队逐出瑞士东部，并占领圣哥达山口。奥地利军队计划通过决战来消灭马赛纳。俄国将军亚历山大·瓦西里耶维奇·苏沃洛夫和亚历山大·科萨科夫从南北两面向瑞士进军，冯·霍策在东面等候俄军的到达，然后俟机进攻。但是马赛那通过反攻打破了同盟的计划。8月25日冯·霍策在谢尼斯被击败，26日科萨科夫在第