置新型双防反应装甲，改进型99A坦克炮塔反应式装甲经过重新设计，进一步强化了防护能力，中国军方宣称99A式正面可抵御美军M1A2坦克M256滑膛炮或德国豹2A6的加长版55倍径120mm炮发射的M829A4和DM53/63贫铀穿甲弹的攻击，并有能力抵御标枪飞弹、长钉式飞弹等第三代反坦克导弹的轰击。炮塔后部还有一部高能量的激光压制系统，可干扰敌方来袭反坦克导弹，烧毁敌方坦克的瞄准器或使敌方步兵致盲，但这种装置仍有争议。99充分吸收了85外贸坦克的开发经验，其自动灭火设备对火源的反应时间在0.1秒以内。Se