内双沟溪位于台湾北部，属于淡水河水系，为内双溪的支流，流域分佈于台北市士林区最东端。主流发源于人双溪山 (标高655公尺) 北麓之风柜嘴 (标高601公尺)，向西南流至圣人瀑布附近注入内双溪。内双沟溪流域位于阳明山国家公园范围内，设有天溪园生态教育中心。