A46M 125毫米滑膛砲，与T-80主战坦克用的一样，它不需任何修改就能装入T-90砲塔；能发射尾翼稳定脱壳穿甲弹（APFSDS）、尾翼稳定破甲弹（HEAT-FS）、高爆破片杀伤榴弹（HE-FRAG）、9M119M“反射”式（AT-11“狙击手”）反坦克导弹；9M119反坦克导弹是一种砲管发射的半主动寻的激光驾束制导导弹，带有空心成形装药的聚能高爆弹头，有效射程100m~5km；也能锁定直昇机等低空目标。T-90A升级为2A46M-5型125毫米滑膛炮。T-90的电动装弹机可预装分装式待发弹药22发，