间是每一趟广九直通车发车前的45分钟，并于发车前10分钟停止通关。
站线布置.广州东站设有16条股道和7座旅客站台（12条旅客列车到发线）。原则上，车站1-3站台办理广深铁路、京广铁路长途列车到发，4-5站台（原3站台）办理广九直通车到发，6-8站台（原4-5站台）办理广深和谐号列车到发，9-12站台（原6-7站台）办理京九铁路方向长途列车到发。车站东咽喉设有6条股道，自北向南分别为广深铁路Ⅲ线、Ⅳ线（广深铁路普速）、Ⅰ线、Ⅱ线（广深铁路城际）、客Ⅰ线和客Ⅱ线（石牌客整所出入库线）