负责缉捕海盗。明代，建筑墩台和汎房，分别派兵驻守。明武宗正德九年（1514年），葡萄牙王国佔领当时属东莞县的屯门，并在当地设立营寨。正德十六年（1521年），广东海道副使汪鈜在海战中击败葡人，重夺屯门。史称「屯门海战」。清朝则设有屯门寨、墩台，清末改属新安县。1866年（清同治七年）的《新安县全图》，当时的屯门被标为「田门」、青山被标为「清山」；而一张1868年的英国政府新安地图上屯门当时叫「团门」，内有「黄家围」、「青甎围」、「清山」。（现称：皇家围、青砖围、青山）
英国殖民地时期