未能与联邦东部的居民东正教徒联合，而这也一定程度上促成了新教的衰落。波兰天主教会自然不会丢失良机，他们试图与东正教结盟，尽管其目的是为了让那些东正教徒屈服于教皇（教皇请求使东西教会大分裂压制在可控范围之内）和联邦的天主教权力中心。因为当时正处在联邦和奥斯曼帝国间冲突加剧，而东正教主教仍遵从君士坦丁堡牧区的指示，也因为近年来的发展，莫斯科牧区在1589年成立，东正教会当时被认为是会危害到国家安全的威胁。莫斯科牧区当时宣称对波兰立陶宛联邦的东正教徒享有宗教裁判权，此事态使联邦的很多东正教徒人心不安，诱使他们接受