1908年，陈干、刘冠三等人在青岛创办震旦公学，该校成为山东革命党人的机关。1909年秋，清政府勾通德国，查封了震旦公学，陈干回长春。十月，陈干在长春成立山东同乡会，该会内附设山东路矿研究所。1910年春，熊成基奉孙中山、黄兴之命，联络陈干、蒋卫平、商震等，密谋举行反清起义，但因被出卖，熊成基等人在哈尔滨被捕。辛亥革命爆发后，陈干奉命赴浦口联络柏烈武，淮军同山东民军联合成立淮泗讨虏军，陈干被陆军总长黄兴任命为山东民军统领。1912年南京临时政府成立后，陈干获授少将。光复徐州后，陈干所部改编为第三十九混成