宗教信徒（如胡格诺教徒，天主教徒）采取宽容开放政策，鼓励宗教自由，也是他内政的特色之一。在柏林的弗里德里克花园（Forum Fridericianum）里，一座新教教堂和一座天主教教堂并排而立，可算得上18世纪独一无二的景致。腓特烈甚至说过如果土耳其人到柏林定居，可为他们修建清真寺，后来还说：「纵然各行各路，但人人都有机会升上天国！」（“Jeder soll nach seiner Façon selig werden”）。但是对犹太人，腓特烈二世却是一字不漏的继承了其前任各君王的政策，一面歧视，一面利用，