恐任务，1999年5月时成立了反恐特战队（），自此部队的任务分为四大块，即水中爆破（）、特种作战（）、爆炸品处理和反恐，配置于各作战队的队员均接受专门的任务训练。1990年代晚期，韩国海军特战部队的焦点集中于北朝鲜对韩国沿岸的频繁动作，平壤当局动用微型潜艇将特工从这些沿岸区送进韩国国内进行渗透。1996年曾于江陵潜艇渗透事件中出动、1998年时对于在江原道束草市附近海域捕获的北朝鲜玉桂级潜艇进行了修复及研究。由草创期的小规模水中爆破队开始，海军特战部队任务逐渐扩大、规模亦逐渐成长，历年来多次创新组织