17年，俄国十月革命爆发，北京政府拟将中东铁路管理权收回，任命裴其勋为总指挥。不到两个月，该工作成功完成。1918年，裴其勋获授陆军中将。1919年，裴其勋任吉长镇守使兼第一师师长。1919年，裴其勋辞职。1920年1月18日，成为将军府将军。后来应赵倜邀请，出任河南清乡督办，但很少到职视事。1933年（一说1927年），裴其勋在北京病逝。