白莲教有染，图谋不轨。徐光启上书辩护不果，其称：「然臣累年以来，因与讲究考求，知此诸臣最真最确，不止踪迹心事一无可疑，实皆圣贤之徒也。」，七月王丰肃、谢务禄（Alvarus de Semedo后改名曾德昭）等外国传教士在南京被逮捕，后被押解澳门。十二月庞迪我、熊三拔等人从北京被押解澳门。