镇江市区隔长江相望，东邻泰州市（海陵区、高港区、兴化市），北部与淮安市（楚州区、金湖县）及盐城市（建湖县）交界，西部与南京市（六合区）以及安徽省天长市交界。扬州市境内水道密布。其中，长江岸线长80.5公里，沿岸自西向东依次为仪征市、邗江区、广陵区和江都区；京杭大运河纵贯全市，由北向南依次行经宝应县、高邮市、江都区、广陵区和邗江区，市境内河道全长143.3公里，并由北向南沟通白马湖、宝应湖、高邮湖、邵伯湖4湖，汇入长江。扬州市最高点为仪征市境内的铜山，海拔149.5米。
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