新干线受到沿线的反对运动，工程难以进行，1986年宣布计画取消。第1、第2航厦下方的新干线路线与车站转由在来线使用。1991年，JR东日本与京成电铁的第二代成田机场站（本站）开业，翌年1992年机场第2大楼站开业。初代成田机场站改称东成田站，路线命名为东成田线。
车站结构.本站位于成田机场第1航厦的地下1楼，为地下车站。由于车站外就是成田国际机场，为了避免恐怖袭击，通过剪票闸机后就是机场的保安检查站，所有乘客及其行李均需接受检查。但在2010年10月再国际化的羽田机场激烈竞争下