行为管理与贮存的方便，会再分为常用药材（放置于木制的抽屉内）、贵重药材（放于柜台内侧）与易变质的药材（有甜味或怕受潮等，贮放在瓷瓶内）等。植物类包括根部（如芦根）、茎部（如檀香）、外皮（如肉桂与苦楝皮）、叶片（如枇杷叶与紫苏叶）、花朵（如菊花与玫瑰花）与果实种子（如枸杞与八角茴香），此外树脂（如乳香）与菌类（如灵芝与冬虫夏草）也属于植物类药材。动物类包括全体入药（如蜈蚣与海马）、部分入药（如鹿茸与虎骨）、分泌物与排泄物（如麝香）与生、病理产物（如紫河车与牛黄）等。矿石类又称金石类，除磁石与朱砂外，化石（如龙