和包括金鲁贤在内的一大批神父同时以反革命罪名被捕入狱。1960年，金鲁贤被判处有期徒刑18年。金鲁贤在监狱中度过了18年，又接受劳改9年，在北方从事翻译工作。1982年获释，任畲山修院院长。1985年1月27日，金鲁贤由周村教区宗怀德主礼、汉口教区董光清和南京教区钱惠民襄礼祝圣为上海教区助理主教，为中国天主教爱国会所承认，但没有得到教宗的任命和批准。与他同时祝圣的还有李思德。1988年，张家树去世后，金鲁贤接替了张家树的位置。1989年，信徒在弥撒中恢复为教宗祈祷。2004年，他向罗马教廷请求宽恕，获得