9-21、14-21）不敌赛会头号种子中国选手谌龙，四强止步。同年，克里斯蒂入选印度尼西亚国家羽毛球队的大名单，以第二单打身份出战2016年汤姆斯盃。在小组赛中，他表现出色以3胜0负的佳绩，分别战胜了香港的胡赟、泰国的科希特·佩尔帕达布和印度的阿贾伊·贾亚拉姆，帮助印度尼西亚国家羽毛球队以第一名出线。在半准决赛，乔纳坦·克里斯蒂以（21-14、18-21、21-16）再次战胜了胡赟，挺进四场。在准决赛，尽管他首次失利，以0比2（10-21、16-21）不敌韩国的孙完虎，不过在队友的努力下球队也能闯进决赛