中心的都市，在经济上有所发展。鎌仓时代因政权转移到鎌仓，相对其政治色彩日渐薄弱，而逐渐转型成经济城市。室町时代因为室町幕府位于京都，其政治色彩又开始复甦，另一方面为发展经济，还衍生出所谓的「町众」阶层，是一种由富商及市绅所组成的自治团体。在开启日本战国时代的应仁之乱中，京都几乎被烧尽。此后被卷入战乱中，一时衰弱下来。这时候的京都，分为上京和下京。在这之后，在织田信长和丰臣秀吉的保护以及「町众」的支持下，又逐渐复兴。特别是丰臣秀吉对都城进行了大规模的改造，对散落在各处的寺院进行建设，现在在京都的都市构造中