飞马，并在以1–1赛和杰志的联赛，首度登场，即在开赛仅5分钟，便取得加盟首个入球，随后中村祐人于同年2月7日作客和富大埔的联赛，与新加盟球会的前日本国脚冈野雅行同时正选登场，组成飞马前锋组合，被球迷命名为日本孖宝，而最终中村祐人再次为球队先开记录，及后冈野雅行亦在赛事末段攻入一球，协助天水围飞马以2–2打成平手。中村祐人全季为天水围飞马上阵12场取得7个入球。2009年球季结束后，中村祐人拒绝与天水围飞马续约，转会葡萄牙甲组联赛球会朴迪莫伦斯，到2010年，天水围飞马为准备在2011年首度参与亚协盃，所