其每年预算仍由国家卫生计生委统一管理。
医疗服务.复旦大学附属儿科医院为国家卫生和计划生育委员会和上海市卫生和计划生育委员会共建共管的公立医院，是上海市24所三级甲等医院之一。复旦大学附属儿科医院与上海交通大学医学院附属的上海市儿童医院、儿童医学中心和新华医院儿科并称为“上海四大儿科医院”，是上海全市儿科最知名的四家医院。儿科医院自2009年复旦大学医院管理研究所设立中国最佳医院排行榜起，始终位于排行榜综合医院排名的全国前50位。排行榜的专科排名中，复旦大学附属儿科医院在小儿内科领