治初期，缺子地区为一街庄，称为「缺仔庄」，隶属于海山堡。该庄轮廓略呈东北—西南走向狭长形，东北边及东南边北段与中庄为邻，东南边中段及南段与石礅庄、月眉庄、大嵙崁街、田心仔庄、内栅庄为邻，西南边及西北边南段为员树林庄，西北边中段及北段为埔顶庄、八块厝庄、大湳庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台设置二十厅，该庄隶属于桃仔园厅。1903年（明治三十六年），改名桃园厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄隶属不变。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制并雅化为「缺