入政府.1990年代初，梁锦松开始担任大学教育资助委员会主席，为期八年。后任教育统筹委员会主席，为语文基准试以至取消学能测验等香港教育制度的改变亲自操刀，他批评学能测验时的一句「高分低能」更予人深刻印象。此外，他曾批评香港教育专业人员协会、教育署和教会办学团体是阻碍教育改革的「三座大山」，引起不少议论。当中教育署在2002年推行高官问责制后已和教育统筹局实行局署合一，而部分教会办学团体则认为法团校董会是为了消灭「大山」的一项政策，当中天主教香港教区已就校本条例进行司法覆核，然而最终遭香港终审法院裁定败诉。