收的车站也参差不齐，部分车站年久失修情况堪忧，另一些则是在铁路客运鼎盛年代建立的联合车站，虽然气势宏伟，但维护耗资不菲。此外，随着客运班次、旅客流量减少，庞大的车站以全无必要，美铁接手后随即开始车站的整理。在芝加哥，原有七大总站（联合车站、西北车站、拉塞尔街车站、朗道夫街车站、迪尔伯恩车站、大中央车站和中央车站）的所有城际列车被整合到联合车站始发终到。在纽约市，由于缺乏联络道，美铁同时使用宾州车站到发前往新泽西州的列车，大中央车站到发前往上纽约州的列车。直至1991年帝国联络线的竣工，所有城际列车改由宾州车