首作之后，为动画全系列的完结篇。时间是在《超级枪弹辩驳2 再会了绝望学园》之后。而游戏版开发制作中，并以枪弹辩驳系列的世界观下完全正统的续篇，初代《枪弹辩驳》的倖存者成长后登场。《枪弹辩驳3》将会以全新的原创剧情，为「希望之峰学园」一系列的争斗画下休止符，小高和刚也写了「完全不同的2个3（まったく别の2つの3）」。《未来篇》描绘系列游戏第2作《超级枪弹辩驳2》之后，枪弹辩驳的生还者和其他未来机关的同事的全新故事，是『希望峰学园系列』的完结篇。《绝望篇》作为系列游戏第2作《超级枪弹辩驳2》的前传，