12年（民国元年）自宫城县立宫城农学校毕业。归国后，任金州南金书院农业科教员。1923年（民国12年），金州农业学堂成立，卢元善任教员。后来，他任通辽县垦殖公司经理。满洲国成立后，卢元善参加满洲国，1932年（民国21年）4月任军政部高级秘书。后到黑龙江赴任，历任黑龙江省实业厅厅长、民生厅厅长、教育厅厅长、专卖总局局长等职务。1939年（康德6年）4月，任三江省省长。1942年（康德9年）9月，任总务厅次长。1943年（康德10年）4月，升任文教部大臣。满洲国灭亡后，卢元善被苏联红军逮捕，押往苏联，