在旧新约全书日语文本的翻译工作中也担负了重要的角色。同时，1863年（文久3年）于横滨开设平文塾，期盼基督教主义教育能在日本生根。此后，平文塾与其他的新教各派的宣道学校合併，1887年（明治20年）赫本投自己的财产东京都港区白金作为明治学院（现·明治学院大学·同高级中学）合併，为明治学院第一代总理就任了。从平文塾到明治学院辈出了从的教育活动，支撑了高桥是清、林董、岛崎藤村等明治期日本的许多人材。在日本停留了33年之后，1892年秋天返回美国，1911年去世。