国共内战全面爆发，国民政府在新疆省也实行反苏反共策略，原来参加联合政府的“三区”方面人员在1947年撤回，随后在1948年成立了新疆保卫和平民主同盟，直到1949年新疆易帜，“三区”方面与中共中央建立直接联络并合流。
名称.中华民国政府称伊宁事变或伊宁叛乱，并宣称是新疆独立运动、反汉运动，暴动者则自称「十一月革命」。中国共产党在艾力汗·吐烈掌权时期认为「新疆伊犁发生独立运动」，称暴动者为「伊犁当局」、「伊塔阿三区」；在1949年8月与三区方面直接联络后，称三区革命为「中国新民主主义