状病毒HKU17（SpCoV HKU17）和鹌鹑冠状病毒HKU30（QuaCoV UAE-HKU30）的复制酶保守区域的胺基酸序列相似度高于90%，显示三种病毒应为同一物种的不同亚种。
研究历史.猪丁型冠状病毒最早于2012年在香港的一次动物冠状病毒检测中在猪的粪便样本中被发现，当时尚不知其感染所造成的症状。2014年2月，美国俄亥俄州的一处养猪场爆发猪只痢疾的疫情，于粪便样本中又发现了猪丁型冠状病毒，同年此病毒的基因组完成。随后猪丁型冠状病毒又多次在亚洲与北美洲的猪只痢疾疫情中被