要是获得崴学院所拥有的大量土地，帝国学院于2005年12月6日宣布崴校区吸引了10亿英镑的投资，将被建成一个世界级能容纳12500人的生物燃料研究中心。2002年，维持了几十年的宪制学院系统被废除，而采用了新的院系制度。2002年，帝国理工和伦敦大学学院商讨合併，但在伦敦大学学院员工及学生反对下，计划于一个月后中止了。2005年底，学院宣布将合并物理科学院（Faculty of Physical Sciences）和生命科学院（Faculty of Life Sciences）组成新的自然科学院