并亲自担任军事总指挥。墨西哥将军暨独裁者安东尼奥·洛佩斯·德·桑塔·安纳率军7000人前来镇压独立运动，休斯敦则命令他手下200多名组成复杂的部队暂时先撤退到阿拉莫固守，不久后被人数大占优的墨西哥军队包围。阿拉莫城中当时的指挥是27岁的威廉·塔拉维斯中校、40岁的冒险家詹姆斯·鲍文和50岁的战争英雄及政治家大卫·克拉克，经过13天伤亡惨重的阿拉莫战役，墨西哥军队终于占领了阿拉莫，所有男性抵抗者均被处死，妇女和儿童得到赦免。三週后，以「记住阿拉莫」（Remember the Alamo!）为战斗口号的