6年立法会就医委会的改革议题上，陈沛然亦代表公共医疗医生协会提出改革意见。2016年7月23日，陈沛然宣佈参选2016年香港立法会选举，表示倘若当选，最大的目标是重启医委会改革。2016年9月4日的立法会选举中，陈沛然战胜前民建联成员、建制派的黄以谦，当选立法会议员，是会内唯一中间派议员。
政治立场.陈沛然自认政治立场「偏黄」，他反对梁振英连任，也反对「袋住先」方案，但却不愿意「被泛民」，定义自己为中间派，这是因为在医学界选民中，多数为建制派。他表示若在医疗政策上有不义方案