1914年(大正3年) 6月26日，佐久间左马太于战线视察中， 自断崖坠落而负伤，但6月29日后仍指挥军队持续对原住民发动攻击，直到8月10日トボコ等9个社原住民部落归顺，才结束。隔年1915年(大正4年)5月1日辞职，8月5日过世。 1915年(大正4年)，所有部落几乎归顺，总督府并解除原住民武装、没收枪械，完成武力理蕃阶段，原住民部落政情稳定。同年7月，台湾总督由安东贞美继任，掌管原住民事务、具有军事性质的蕃务本署裁撤，原住民改由一般的警察单位管理， 结束了以武力讨伐原住民的政策， 转到偏向同化治