月13日被列入第二批浙江省文物保护单位，当时归为“古建筑及历史纪念物”。文化大革命后，因部分建筑遭到破坏，1981年5月6日重新公布时，归为“历代名人纪念建筑及墓葬”。2006年，白云庄与黄宗羲墓、万斯同墓和全祖望墓一起作为浙东学派史迹被列入第六批全国重点文物保护单位。1990年成立的白云庄文保站负责白云庄的保护工作，文物保护范围东、南至河道，西、北至白云庄围墙，且要求周边住宅小区靠白云庄一侧的风格与白云庄保持一致。1986年，为纪念黄宗羲逝世290周年，白云庄设置陈列室，其中墓庄按黄宗羲讲学时的形式进