国国内主要负责监狱（特别是集中营）的看守及管理的警卫部队所组成的另一支武装部队，就是所谓的亲卫队骷髅总队，其指挥官为西奥多·艾克。由于特别机动部队的扩张使得希姆莱的可用兵力愈来愈少，因此他就将原本负责集中营工作的亲卫队骷髅总队中的精英分子独立出来，在达豪（Dachau）改编为一个分队，由原先的指挥官艾凯指挥。到了1939年10月16日，亲卫队骷髅总队已经有3个旗队，兵力约6,500人，其后以此3个旗队为核心，成立了亲卫队骷髅师（SS-Division Totenkopf）。
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