除代表中华民国政府与人民向已故的宋美龄致哀，并向家属颁赠中华民国国旗和褒扬令，也会见纽约州议会议长、纽约市长彭博、纽约市议会议员等人，并参观世界贸易中心遗址、在华尔道夫酒店出席国际人权联盟晚宴，领取第35届国际人权奖以及发表演说。还搭乘游轮夜游哈德逊河与东河，经过联合国总部大楼时，陈水扁指着说，「总有一天台湾可以进去的」。11月2日，陈水扁离开纽约，前往巴拿马。2004年5月，美国在世界卫生大会（WHA）总务委员会中首度发言支持「邀请台湾以参与世界卫生大会」，主张世界卫生组织（WHO）不应涉及政治议题，