在1948年九龙城事件时一度拟改为中国驻香港总领事及设立中华民国驻港总领事馆在九龙城未成；及后中华民国政府撤退至台湾，以及英国政府为保英国继续香港的统治，同时转而承认北京的中华人民共和国政府，使该职位和驻港机构在1950年1月7日撤销。自1956年双十暴动，中华民国政府机构不能以官方名义于香港出现，只能以「中华旅行社」之商业机构名义运作（相对之中国大陆于香港之签证机构为中国旅行社），其负责人为总经理，此模式一直维持至香港回归后。1997年7月1日，「行政院大陆委员会香港事务局」成立，将原有政府驻港机