下也分别由舟山群岛、海南岛撤退，以集中主力防卫台湾。1948年至1949年中华民国政府所辖舰队及各辖舰单位如下（各军区除外）：
台湾时期.1950年2月，中华民国政府将关闭政策下的封锁海域扩大至中国大陆的全部沿海地带，封锁台湾海崃长达三十年。1952年，中华民国海军进行改编，成立驱逐、巡防、扫雷、登陆、后勤等舰队。由于台湾四面环海，海军日益重要；所以陆续自美国接收退役军舰，扩充舰队，并更新武器系统。1979年，中华人民共和国方面突破中华民国对台湾海崃的封锁，台湾海崃复航。1