HMG-CoA被锚定在内质网膜上，且长期以来被认为拥有7个跨膜结构域，而其活性位点则位于蛋白质C端结构域中。但后来的研究表明HMG-CoA还原酶其实拥有8个跨膜结构域。人类表达HMG-CoA还原酶的基因位于5号染色体长臂上（5q13.3-14）。其他动物、植物和细菌也拥有具有类似作用的相关酶类。
反应.在甲羟戊酸途径中，HMG-CoA还原酶负责将3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A（HMG-CoA）催化转化为甲羟戊酸: