演行列。、克里斯·奥多德、鲁伯特·艾瑞特、金·迪肯斯与茱蒂·丹契于3月12日签约参演该片。该片曾打算于2014年8月在伦敦拍摄。2015年2月17日，《》透露，电影部分的场景可能将在伦敦拍摄。主要拍摄始于2015年2月24日，地点位在。该片也将在佛罗里达州的希尔斯波罗县与皮尼拉斯县进行持续两週的拍摄。《怪奇孤儿院》为提姆·波顿第二部在坦帕湾地区拍摄的电影，第一部为于1989年拍摄的《剪刀手爱德华》。后来剧组移至英国的康沃尔郡和黑潭。孤儿院在比利时安特卫普的一栋哥德式房屋取景，而部分内景则在伦敦的摄影棚拍