省任左司郎中。他仗着唐高宗恩宠，多行不法，欺压同僚，遭到侍御史狄仁杰弹劾。高宗本想放过他，但狄仁杰坚持己见，指出唐朝并不缺少和王本立一样才干的人；高宗让步了，同意处罚王本立。683年，东突厥可汗骨咄禄袭击邻近的单于都护府，俘杀司马张行师。此时王本立任胜州都督，高宗命他和夏州都督李崇义一同防御东突厥进攻，但史书没有记载下文如何。
唐睿宗年间.就在683年，唐高宗驾崩，太子李哲继位为唐中宗，但武皇后（即后来的武则天）以太后摄政，掌握实权。684年春，中宗表现出独立执政的迹象，被武后