2年起，纳瓦拉包含首都潘普洛纳在内的大部分领土被斐迪南二世佔领，而他的父母企图在1516年反攻失败后相继过世。因此自1517年起，恩里克只能以贝阿恩为中心控制仅剩的领土，并在莱斯卡举行了盛大的加冕仪式。在此同时，「纳瓦拉国王」的头衔也被斐迪南二世的外孙查理五世宣称持有；不过在法国国王法兰索瓦一世的庇护下，恩里克始终维持了他的统治。在此影响下，恩里克的西班牙语和法语都很流利。1521年六月，法国和纳瓦拉的联军发动，再度出兵试图恢复被查理五世佔领的纳瓦拉领土，不过被击退。1526年，他和法兰索瓦一世孀居的姊姊