室法令（行政命令）于1551年5月12日成立，这使得它成为在美洲正式成立的最古老的大学，同时也是世界上最古老的大学之一。学术上，圣马科斯大学在秘鲁国内数一数二。圣马尔科斯大学在6个学术领域下分成20个学院，有60个专业学术学科。所有学院均提供本科和研究生学位。在校学生主体由从全国来的超过30000本科生和4000研究生以及一些国际学生组成。圣马尔科斯大学也有一些政府以下的事业单位如圣马科斯文化中心和利马国家历史博物馆。
历史.国立圣马尔科斯大学于1551年5月12日创建，为美洲