长人选。当时民进党有五人参与党团初选，分别是：沈富雄、洪奇昌、柯建铭、许荣淑、蔡同荣。当时总统陈水扁属意洪奇昌参选。结果洪奇昌在初选中以一票之差险胜而出线，成为民进党的副院长候选人。同时，国民党在亲民党的支持下，推出江丙坤为副院长的人选。结果，王金平高票连任立法院院长。江丙坤与洪奇昌竞逐副院长职位。第一轮投票江丙坤以111比108票略胜洪奇昌，但未过半，三个小时后进行第二轮投票，江丙坤才以115比106胜出。
十一寇事件.洪奇昌于2006年底与民进党内其余十名立法委员共同遭