殖成功，并且知道它是「II型转座子」，更清楚的了解其相关的机制。1971年，麦克林托克从美国总统尼克松（Richard Nixon）获得了美国国家科学奖章。 1973年，以她的名字命名了冷泉港实验室的一幢建筑物。 1981年，她成为麦克阿瑟基金会麦克阿瑟奖的第一个获得者，每年获得60,000美元，为期5年，获得了拉斯克基础医学研究奖，沃尔夫医学奖 和托马斯·亨特·摩尔根奖章（与马库斯·罗兹（Marcus Rhodes））。 1982年，麦克林托克因研究改变遗传信息和控制其遗传表达而获得哥伦比亚大学奖。