两年的1596年宣佈破产。1609年尼德兰也发生革命从西班牙独立出去。在三十年战争期间欧洲一片反哈布斯堡的浪潮中，西班牙面临不断的挫败，让首相奥利瓦雷斯公爵的雄心壮志灰飞烟灭；葡萄牙终于在1640年发动恢复独立活动。同年12月1日，葡萄牙枢密院立先王曼努埃尔一世的玄孙，布拉干萨公爵约翰为葡萄牙王若昂四世。葡萄牙恢复独立，哈布斯堡王室也结束了对葡萄牙达60年，历3代君主的管治。
西班牙王位继承战争.1700年，西班牙国王卡洛斯二世的去世，结束了哈布斯堡家族对西班牙历5代的统治