971年因外销导向政策，台南县制造业产值的比例已凌驾农业。2008年资料显示，该县总就业人口仅9.8%从事农林渔牧业，而工业（含制造业）与服务业各约45%，代表已转型成为工业为主的行政区。1990年代后期起，南部科学工业园区在县境内设立，乃成为电子、电机等高科技制造业的重镇。台南县政府在多年以前曾计画引进炼钢、石化等重工业，其中最着名的开发案就是滨南工业区；但该开发案近年已因环境保护和观光考量，加上预算问题而遭搁置。2009年改在沿海地带成立台江国家公园。
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