芜湖至宣城段和宣杭铁路完成电气化改造，合肥机务段的东风4D型机车退出合肥—芜湖—杭州的图定客运交路，部分机车分别被封存于芜湖东运用车间及淮南西运用车间等地。2020年5月，部分封存机车重新启用并调拨到唿和浩特局集团公司和成都局集团公司。南昌铁路局南昌机务段、向塘机务段、鹰潭机务段均配属或曾经配属东风4D型准高速客运机车。2001年，为配合全国铁路第四次大提速的实施，南昌机务段配属首批35台东风4D型准高速客运机车，投入京九铁路和浙赣铁路运用，担当南昌至株洲、金华西、龙川间的客运牵引任务，至2004年配属