10月18日至19日，富兰克林号的第四分队与第一分队空袭了马尼拉等地。10月20日，美军发动雷伊泰岛战役，开始登陆独鲁万市，而麦克阿瑟则在当日下午登上滩头，宣告自己重返菲律宾。此时小泽治三郎命舰队阻止美军登陆，并以自身航空母舰为饵，引开美军舰队，由栗田健男的第二舰队到雷伊泰攻击美军登陆部队，并因此引发雷伊泰湾海战。
雷伊泰湾海战.10月21日，富兰克林号的第四分队与第一分队正在外海补油，而第二及第三分队则继续空袭菲律宾。当时美日海战近在眉睫，但美军的第一分队在补油后却离开菲律宾