向国饫肥的南乡外浦。12岁进入龙源寺，拜临济宗僧人一翁玄心为师，法名玄昌，学习禅和儒学。后来又跟随来自明朝僧人的江夏友贤学习五经和周易。他在章句和训诂方面非常优秀。15岁时前往京都东福寺龙吟庵，成为熙春龙喜的法嗣。1602年（庆长七年），萨摩藩藩主岛津家久创建大龙寺，邀请南浦文之担任开山住持。翌年家久拜见德川家康时，在家康的推荐下，南浦文之为建长寺举行了上堂秉拂的仪式。后水尾天皇闻其学识渊博，将其召入宫中讲解四书。因南浦文之精通章句，深得岛津义久、义弘、家久等人的信赖。他为萨摩藩撰写对明朝、琉球、吕