西北侧为巴黎、第戎方向；东侧为瑞士方向；南侧为隆斯勒索涅和里昂方向。三个方向均已完成电气化，且前往西北方向的铁路为复线铁路。因为这个"人"字形的线路，穆沙尔站也大致呈一个三角形，其车站分为两个部分：其中北侧供前往蓬塔尔列站方向的列车停靠；南侧则供前往隆斯勒索涅站方向的列车停靠。这样算下来，穆沙尔站实际上有四个站台，其中最北侧的为岛式站台，其余的为侧式，因此该站共有5个车道。而穆沙尔站的站房则位于"人"字形的夹角之中，靠近北侧，乘客及车辆仅可从东侧进出。类似这种"人"字形布局的铁路车站，在法国还有多处，比如