亲苏我虾夷也在其住所自焚，此为乙巳之变。
去世.后轻皇子（孝德天皇）与中大兄皇子（天智天皇）先后继位。天智天皇8年（669年）冬十月，中臣鎌足患病。十月十五日，中臣鎌足重病，天智天皇闻其病重，前来探望，并授其，加内大臣，赐姓藤原朝臣。十六日（669年11月14日），藤原鎌足死于淡海的住所，天智天皇为此废朝九日。