是死罪，但由于江藤的见识而受到高度评价，佐贺藩第10代藩主锅岛直正遂直接裁断永蛰居（无期谨慎）较轻的处分。蛰居后，他担任寺子屋老师，并持续与同伙们秘密交流，以及针对幕府的长州征伐（幕长战争）的出兵问题向佐贺藩第10代藩主锅岛直正提出建议等政治活动。德川庆喜进行大政奉还结束德川幕府，庆应3年（1867年）的12月，江藤新平被解除蛰居并恢复郡目付的身分。萨摩藩及长州藩与公家岩仓具视合作，于庆应3年12月9日（1868年1月3日）发布王政复古的大号令，新政府因此诞生，江藤新平也与副岛种臣一起被派遣到京都，代表