但球队第二年就取得乙级联赛冠军重回甲级行列。康塞普西翁体育在1999年再次出现在国际舞台上，球队参加南美足协杯但是在半决赛中被阿根廷球队科尔多巴塔勒雷斯所击败，球队对此非常失望。2001年又一届的南美解放者杯中，球队相继击败了阿根廷的圣洛伦佐和玻利维亚的约格·威斯特曼，但在16强中被罗马里奥领衔的瓦斯科·达伽马所淘汰。2002年球队联赛排16支球队倒数第二再次降入乙级联赛，直到2004年再次升回甲级行列。2006年球队由于债务和拖欠球员工资可能不法参加整年度的职业联赛。俱乐部将被勒令降级，但