意中华民国政府以观察员身分参加世界卫生大会，同年5月行政院卫生署署长叶金川以「中华台北」的名义接受世界卫生大会的邀请。2017年5月，因蔡英文政府上台后两岸关系恶化，使台湾首次未能取得观察员邀请函，最后经外交管道折冲，取得10张旁听证。另外，2009年H1N1流感大流行在世界卫生组织的疫情通报网页上，中华民国的病人列于「中华台北」项下，与2003年SARS期间中华民国的病人列入中国疫情不同。
2003年.2003年随着SARS疫情爆发，台湾也成为疫区，却因无法参与世界卫生组织WHO