孝与羽柴秀吉敌对，仍然继续替其效力。翌年（1583年）闰1月，胤基攻下秀吉势力下的须原城和洞户城而获信孝赞赏，其后在中不敌森长可而投降。天正12年（1584年）爆发的小牧、长久手之战中，胤基作为羽柴军的一员参加，最初隶属于池田恒兴，后来恒兴战死后转为在堀秀政麾下效力。天正13年（1585年），胤基与庆隆一同参与秀吉发动的。天正15年（1587年），秀吉发动九州征伐，胤基与庆隆也有参加。翌年（1588年），秀吉兴建聚乐第，胤基和庆隆获赐予在西京口的居所，胤基因而与妻子一同上京。天正16年（1588年）