早到达该群岛的欧洲人是西班牙人，时为16世纪，并于1885年被其佔领。之后在1899年，西班牙人把卡罗林群岛转让给德国，成为德属新几内亚的一部分。第一次世界大战后德国在太平洋的殖民地被安排给予日本作託管地，成为日属南洋诸岛的一部分，第二次世界大战后由美国佔领。1947年，联合国将密克罗尼西亚交美国託管，现今密克罗尼西亚联邦范围为太平洋群岛託管地六区的其中三区（科斯雷于1977年自波纳佩分出成为第四区）。1965年1月成立议会，此后要求自治。1979年，由联合国和美国筹划的「密克罗尼西亚宪法」公投在託