天白日满地红旗，并就任新疆省主席。在民族和宗教的政策上，杨採用了怀柔牵制的政策以防止了动乱。一方面以对各族上层王公的笼络支持，并使其中各集团互相牵制，少数民族之间、回汉之间也尽量使之互相牵制，在宗教方面，以不干涉一般性宗教活动为原则，但加强了政府对清真寺、伊斯兰经学院的管理，希望维持当地伊斯兰教现状，用宗教来协助社会秩序的维持，并防止外来的宗教力量进入影响。
外交.新疆的地理位置使其成为清末以来英国与俄国争夺侵略的对象。民国初年，中国北洋政府因军阀混战而无暇顾及新疆、外蒙古、西