嵌合体争议.与其他驰龙科恐龙比较，阿基里斯龙的骨盆带有蜥臀目的祖征。例如耻骨是直立并且有大的底部，这却与大部份驰龙科有小型的底部不同。此外，耻骨与坐骨同是指向后方，这种情况可见于无关联的鸟盘目恐龙及鸟类。由于上述的不同，使得有学者认为阿基里斯龙是古生物学上的一个嵌合体。但是，其他研究却反对这种说法。他们认为阿基里斯龙的化石只是半脱离，纵然将上述的分别计算在内，在分支系统学分析中明显地仍是属于驰龙科的。