。9月29日，日军集结了一万多人发动攻势。10月5日，日军攻陷莿桐巷（今莿桐）。10月6日，日军于西螺跟义军廖三聘七崁廖琛交战，屡攻不下，最后火攻西螺街，义军撤退。10月7日日军进攻他里雾街（今斗南），击败黑旗军王德标。右侧支队进攻土库，受黑旗军福字营吴玉山及义军抵抗，屡攻不下，最后放火烧毁土库庄。左侧支队进攻斗六街，黑旗军萧三发、义军领袖徐骧、简成功、简精华等抵抗，但因火力悬殊不敌。当日云林县县治斗六失陷，各部队退往大莆林（今大林）。同日，义军与日军在施瓜寮与牛尫湾庄发生战斗。隔日，日军进攻大蒲林、兴化庄