好协会成立。桑卡拉的继任者布布莱斯·孔波雷在1987年以军事政变上台后，两国的关系依然紧密。1988年9月，孔波雷访问平壤。1980年代后期，双方进行了多次合作，例如朝鲜在库杜古兴建了一个露天剧场，以及双方签署了一项互换产品的贸易协定，布基纳法索提供棉花和矿产，而朝鲜则提供农业机械。冷战结束后，双方的外交活动不再跟以往一样活跃，但有一些合作计划仍然在继续。1998年，北韩在布基纳法索完成了五座小型水库的建设。2009年，当时为联合国安理会非常任理事国的布基纳法索对联合国安理会第1874号决议投了赞成