站房于2010年开工，2015年1月20日建成全面投入使用。2016年5月15日，由单组CRH2A担当，由至D6501次列车到达福州站后，在站内进行重联作业，与另一组CRH2A进行连接作业，而后车次改为D296次由福州继续开往。这种类似于山形新干线翼号列车在福岛站连接山彦号列车后前往东京站的运转方式在中国大陆尚属首次，但属于试验性质，如果切实有效，将来会在全中国铁路系统推广。2016年12月7日，福州站南广场出站口因市政施工等原因暂时封闭，同月28日重新开放。2017年1月6日，地铁1号线福州火车站