年任期内，先后遇上2001年的美国911事件及2003年沙士疫症，影响旅客对航空交通安全的信心。911事件发生后，机场要实施更严格的保安检查，以避免恐怖份子乘虚而入。而2003年香港面对沙士疫症，旅客数目瞬间大幅减少。而期间香港国际机场连续5年获Skytrax选为「全球最佳机场」。2006年6月，彭定中决定在第二个3年期合约期满后不再寻求续约而离任。行政总裁职务由许汉忠接任，2007年2月1日起生效。离任机场管理局后，彭定中加入嘉里集团，担任嘉里集团郭氏基金会总裁、南华早报集团非执行董事兼董事会