生3906人、教师243人、职工572人、家属1200人登上上海铁路局开出的交大支援大西北的特殊专列，分趟离开上海，赶赴西安。西迁工作启动后，中国国内和国际形势产生变化，交大师生对迁校问题的看法开始分化。这一问题被提交高教部和国务院讨论。国务院总理周恩来在研究形势并听取多方意见后，认为交通大学已经不必全部搬迁，也可以搬迁一部分。但是由于已经搬迁了大部分物资，交大仍按原计划迁校。1957年9月高教部、一机部批复同意交通大学分设上海、西安两地，西安部分设置21个专业，上海部分设置14个专业，两部分为一个