开幕同时，一畑电气铁道也北松江线通过园区前方的路段设立了松江花鸟园车站。2006年导入后，由松江市政府指定加茂公司为管理者负责营运。营运第一年的入园人数约有36万人，但隔年起开始降至约20万人，但后来先是受到禽流感的影响，2011年日本又遭到311大地震的，让2011年当年结算的入园人数更急速下滑到15万人不到。此后加茂公司的营运状况持续恶化，到2015年3月时累积负债已达到5.5亿日圆，因而宣布破产。之后由松江市政府以7,500万日圆将属于加茂公司的建物及设备买下，并在4月将松江花鸟园交由一畑