大的神学家安塞姆为坎特伯雷大主教。这导致了君权与教权的长期斗争。与兰法郎克相比，安塞姆更加倾向于支持教皇格利高里改革。威廉和安塞姆在教会问题上分歧极大。英格兰的牧师，由于在优先居住权问题得到了国王的帮助，并没有旗帜鲜明地支持安塞姆。1095年，威廉在北安普敦郡的罗金厄姆召集教士召开了一次集会，本想要罢黜安塞姆但教士们坚持应该将他送回罗马发落。1097年10月，安塞姆遭到驱逐，把在英格兰的遭遇向当时的教皇乌尔班二世做了汇报。乌尔班是一位老练变通的教皇，他并不想扩大他和君主之间的矛盾。当时日尔曼的皇帝支持一位僭