监察院在抗战期间西迁重庆。1946年，国民政府还都南京之后，监察院迁到南京市中山北路261号（现105号），与立法院合署办公。
迁台后.监察院目前的办公厅舍位于台北市中正区，位处忠孝东路与中山南路交叉口东南角，北邻行政院及南邻立法院。该建物原为日治时期的台北州厅，由森山松之助设计，于1915年兴建完成。中华民国接管台湾之后，该建物曾为台湾省政府交通处、建设厅、教育厅与主计处办公处，省府南迁后改为监察院院址。1998年7月30日被内政部指定为国定古蹟，于每星期五上午09时至12时、下