一些较为古老的洞穴内，稻大鼠则是与已灭绝的卡氏犰狳一同被发现，估计当时的气候较为温暖。可能于第四纪时的温暖气候，帮助稻大鼠向北扩展；而当气候变得寒冷时，一些群落则因玉米种植而得而存活。稻大鼠在塔毛利帕斯州及德克萨斯州南部的分佈地与库氏稻鼠邻接，而在凯内迪县、威拉西县及卡梅伦县，并塔毛利帕斯州东北部牠们两者并存。在实验环境下，两者并不能杂交，而基因分析亦没有发现基因流或野生混种。相对于库氏稻鼠，稻大鼠在群落内的遗传变异较低，而在群落间的则较高，这可能是因牠们的群落在近岸地区较成孤立所致。稻大鼠栖息在多