980年正式宣佈为「自治、自养、自传」之三自教会。在这一段时期里，陆续参与并成为世界基督教会联合会、亚洲基督教协会及香港基督教协进会的会员。
事工.
堂会发展.截至2003年10月，中华基督教会香港于香港及澳门共有61堂会（包括粤语、普通话、闽南语、海南语及潮语堂会）；共计有牧师60位，宣教师91位，教友约30,000人。
社会服务.自1999年起，因应社会所需，区会设立了「社会服务部福利金」，以支援遇有经济困难或失业的教友。此外，亦