玉山山脉者有十一座，属中央山脉者有十九座。属玉山山脉者註：西峦大山（3081公尺）地理上虽属玉山山脉，但行政上不隶属玉山国家公园辖区。属中央山脉者
水文.河流以八通关及塔塔加鞍部为分水岭，南有荖浓溪、楠梓仙溪、拉库音溪等高屏溪上游之主要支流，高屏溪流域的集水区占国家公园面积39%；北为陈有兰溪、郡大溪及沙里仙溪等浊水溪上游主要支流，占全区20%。发源于中央山脉东侧之乐乐溪及其支流则向东流汇入秀姑峦溪，占全区41%。
气候.本区年平均降雨量约