赵熊诏之父左都御史赵申乔得此机会，参名世「为书狂悖」，戴名世因此文字狱而被康熙帝处决于菜市口法场，史称“南山案”。雍正帝对此事发表评论：「虽皆非臣子之所宜言，实无悖逆之语，当时刑部复旨，亦未谓此外更有违碍之词，故亦以为冤。」戴名世后归葬故里，墓碑不书本名，曰“戴南山墓”。
着作.后世戴均衡搜集戴名世遗篇，编为《戴南山先生全集》，并于《南山集目录序》称：“余读先生之文，见其境象，如太空之浮云，变化无迹；又如飞仙御风，莫窥行止。谓其可直追庄周、李白、司马子长；……足与望溪齐名”。