的计划中，担任先锋在赞岐及阿波奋战，但信长却于6月2日在本能寺之变中遇害，失去后盾的存保实力大减，同年8月香川亲和进攻香西佳清守备之藤尾城，佳清向长宗我部氏降伏，并与香川氏合流进攻于十河城笼城之城代十河存之（三好义继的弟弟），同时间，存保于入侵阿波的中富川之战中，败于长宗我部及香川总势3万6千的联军，被迫放弃阿波胜瑞城而撤往赞岐，9月自赞岐虎丸城撤退。同年10月再度入侵阿波国茅ヶ冈城，逼迫细川真之自杀。但赞岐的十河城及虎丸城等亦在天正12年（1584年）6月遭到长宗我部元亲攻陷，存保逃亡至大坂的羽柴秀吉处。