团于1988年由斜里町公所成立，最初名称为「自然主题知床管理财团」，活动范围也仅限于知床半岛的西半侧属斜里町的辖区内，2003年更名为「知床财团」；2006年罗臼町也加入知床财团的经营，使财团的活动范围扩及整个知床半岛。财团也接受政府委託经营管理知床国立公园内的游客设施，包括知床自然中心、知床五湖野外小屋（含知床五湖园区内步道设施）、罗臼旅客中心、罗臼野外小屋。