中国民航局进行重组，将其业务部门分拆为4个主要的航空公司，其中民航广州管理局下辖「中国南方航空公司」，并于1991年2月1日正式挂牌成立，作为民航广州管理局在进行业务经营活动时对外使用的名称。期间公司逐渐开展了对外交流及拓展业务：1990年，南航与香港和记黄埔、美国洛克希德共同组建了「广州飞机维修工程公司」（GAMECO）；至1991年，南航共有38架波音飞机飞往90个国内航点及12个国际航点，年发送旅客量达600万人次。
体制改革.1992年12月20日，中国民用航空局实施体制改