三天后释放了他，命他代理关东州厅长官。代理关东州厅长官期间，他同苏军合作，为苏军司令官、将校同日本相关机关办理交接事宜，配合苏军方面处理日侨。同年10月上旬，获苏联聘为远东委员会东北经济研究所顾问的高碕达之助（原满洲重工业株式会社总裁）访问别宫秀夫，告知新京日侨的困难处境，请他帮助募集300万日元救济金援助日侨。当时日本政府表示同意在别宫秀夫回到日本后，由日本政府负责偿还募集的救济金。别宫秀夫便在大连的日本人中募集了392万日元交给高碕达之助，并向每位募款人签发了收条。同年10月28日，苏军任命中国人迟子祥