个6角杂环的则称为嘧啶。组成脱氧核醣核酸的硷基，分别是腺嘌呤（adenine，缩写A）、胞嘧啶（cytosine，C）、鸟嘌呤（guanine，G）与胸腺嘧啶（thymine，T）。硷基、糖类分子与磷酸三者结合之后，便成为完整的核苷酸。还有一种硷基称为尿嘧啶（uracil，U），此种硷基比胸腺嘧啶少了一个位于环上的甲基，一般出现在RNA分子中，角色相当于脱氧核醣核酸里的胸腺嘧啶。通常在脱氧核醣核酸中，它会作为胞嘧啶的分解产物，或是CpG岛中还未经甲基化的胞嘧啶突变产物。少见的例外发现于一种称为PBS1的细菌