高雄中学毕业，考进国立台湾大学机械系，大二后降转心理学系就读，并取得学士学位。大学期间，由于受到美丽岛事件的影响，投入改革性质强烈的台大大新社。毕业后入伍服役两年，又考入台大社会学研究所，参加大陆问题研究社活动，并且与林佳龙等人参与「自由之爱」的学生运动（林佳龙与郭正亮皆为美国耶鲁大学政治学博士）。同时郭正亮也以「江迅」作为笔名，于学运社运刊物《南方杂志》担任总编辑。