福井县于1964年在足羽山上建立了“惜别”碑，碑名出自藤野赠鲁迅照片上的亲笔题名。1980年，在藤野的出生地芦原下番，建立了由鲁迅之子周海婴书写的“藤野严九郎碑”。1983年5月18日，因有鲁迅与藤野的渊源关系，藤野的家乡芦原町（现芦原市）与鲁迅的家乡绍兴市结为友好城市。1984年7月，藤野的故居被修复改造成藤野严九郎纪念馆。后来还建立了芦原国际交流中心。日本东北大学设立了“东北大学藤野先生奖”。《藤野先生》是中日两国的中学语文课课文，这使藤野的名字在中日两国广为人知。1970年代以来，竹内好翻译的《藤