直到1912年成都、重庆的军政府合并，民政长张培爵商请同志军郭书池部护送周善培离开四川。抵达上海后，周善培得朋友张謇等人照顾，在梵皇渡路安顿。
民国经历.此后，周善培曾经参与护国运动，讨伐袁世凯。护国战争结束后，周善培任大总统黎元洪的顾问，并于1916年11月同李根源、谷钟秀、张耀曾、杨永泰等在北京发起“政学会”，此即“旧政学系”的由来。1922年春，周善培代表段祺瑞南下促成孙中山、张作霖、段祺瑞组成倒直的“三角同盟”。《中华民国史事日志》载，1922年3月20日，“伍朝枢偕张作霖