代谢中间产物（英语：Metabolic intermediates）是指代谢途径中的中间产物。虽然这些中间产物通常对于细胞功能的影响相对较小，但他们可能在酵素的别构调节上，扮演重要的角色。
临床意义.有些中间产物在测量代谢速率上扮演重要角色（例如和）。如果身体有异状，由于代谢中间产物在浓度和产物上可能会有所差异（例如）。有些研究人员便以此研发新治疗法。