燕鸟在人类学术历史曾被蒙上阴影：牠前半身的鸟类化石，被加上一条小盗龙的尾巴，伪造成古盗龙。当这事被揭发后，鸟类的前半身被描述为"Archaeovolans repatriatus"，但后来发现那是燕鸟的异名。2006年就早期鸟类关系的研究发现燕鸟、义县鸟及松岭鸟是一个单系群，由于松岭鸟是最先被描述的，故将之命名为松岭鸟科。燕鸟目（又称松岭鸟目）也被建立来界定与其他早期今鸟亚纲（如甘肃鸟）不同的独特性。另亦有指燕鸟其实是松岭鸟的异名。