命为首任驻夏威夷商董，陈芳的宅邸成了华商董事会驻地。1880年3月，华商董事会正式成立。1881年，华商董事会改为中国驻檀香山领事馆，陈芳被任命为首任领事（当时陈芳已辞去夏威夷王国枢密院议员一职）。任内，陈芳积极改善华人在夏威夷的待遇。1881年，卡拉卡瓦国王访问中国，同李鸿章在天津举行了会谈。李鸿章问卡拉卡瓦：“中国前派有领事陈国芬驻岛，人尚妥当否？”卡拉卡瓦回答：“陈国芬久在敝岛，情形极熟，人亦公正。”
退休归国.陈芳在卡拉卡瓦国王统治时期位高权重，生意顺利。但是，他也遇到