杰林巴等等，孜珠山上有他们以及莲花生修行的山洞，还有在石壁上留下的手印及脚印。孜珠山有代表六道轮回的绕山隧道，许多藏民到此朝拜。如今，孜珠寺已经建成了四大学院即内明学院、扎仓学院、辩论学院、禅修学院。
尼泊尔的孜珠寺.位于尼泊尔境内的新孜珠寺（Triten Norbutse）是孜珠寺在文化大革命之前及期间遭毁后兴建的。