关于细菌孢子阶段的报告，进而发现了“杆状体”的生命周期。科赫鉴定了致病物的孢子，并将其注射到动物体内，由此复现了炭疽病的发病过程。这是当时和的一大突破。巴斯德的团队补充了细菌的生态学研究，并确认孢子在自然界中的生态学角色。科赫则在1878年发表了一篇关于伤口细菌病理学的里程碑式的论着《关于伤口感染病人的病因学研究》（）。1881年，科赫又报告发现了结核杆菌（当时称其为“瘤状属杆菌”（"tubercle bacillus"）），强化了自己先前的学说和整个细菌论的历史地位。几年后，科赫和总结出了着名的柯霍氏