，与教宗对立导致了教会第一次分裂（阿迦修分裂）。查士丁一世则是一位虔诚的正教会信徒，他通过普世牧首约翰二世修复与罗马公教会的关系， 最终于519年3月底结束教会分裂状态，此后查士丁统治时期教会基本保持着相对和平稳定的状态。在525年查士丁一世废除了禁止宫廷官员与底层人民通婚的法律，这可能是查士丁尼在背后推动的，而狄奥多拉也因此被允许与查士丁尼结婚。在查士丁一世统治的最后几年，帝国与周边国家冲突不断。在意大利半岛，东哥特国王狄奥多里克怀疑帝国对其图谋不轨，在国内迫害亲罗马派，甚至以暗通帝国谋反为名通过罗马