加省后，他已经成为一名受过良好教育、能说多种语言的知识分子，备受尊敬。不过早年的他在他家乡以外的地区仍旧默默无闻。乔托迪亚回国后成为一名公务员，后为外交官，曾任中非驻苏丹共和国城市尼亚拉的领事。在中非共和国内战中，他担任反政府武装的领导人，是争取团结民主力量联盟主席和解放中非共和国爱国行动小组组长。内战期间，乔托迪亚避居邻国贝宁共和国经济首都科托努。2006年11月20日，在弗朗索瓦·博齐泽政府的授意下，贝宁武装部队未经审判就逮捕了他和他的发言人阿巴卡尔·萨邦。他们同意参加与中非共和国政府的和谈后，