开始把研究方向由西方近代史转到了晚清中西外交和政治史。 1899年，矢野仁一从东京帝国大学研究生毕业后，任职早稻田大学文学部讲师。1912年，在京都帝国大学东洋史学第二讲座教授桑原骘藏的推荐下，就任京都帝国大学东洋史学讲座副教授。1918年，矢野仁一前往美国留学，专攻晚清中西方外交和政治史研究。1920年，矢野仁一博士回国后成为京都帝国大学东洋史学第三讲座教授，在1932年退休。1970年1月2日，矢野仁一逝世，享耆寿97岁。
与日本军部的关系.矢野仁一秉持近代日本之「大陆政策」，