民党右派召开的中国国民党一届四中全会，成为西山会议派成员。黄季陆随即赴上海，协助孙科在上海成立西山会议派的中央党部。1926年3月，西山会议派的中国国民党第二次全国代表大会上，黄季陆当选中央执行委员。1927年（民国16年）1月，黄季陆回四川省，任成都大学教授。同年上海四一二政变，第一次国共合作破裂，黄季陆任四川省清党委员、整理委员、执行委员。1928年，重回广东的中山大学，任广东省党部常务委员兼宣传部长、广州《民国日报》社长。1931年（民国20年）11月，在中国国民党第四次全国代表大会上，当选候补中