督的活动，乃经越南赴云南。当时，云南将军唐继尧以及前云南都督蔡锷策划发动反袁世凯的护国战争，李烈钧参与筹划。12月25日，李烈钧任护国军第2军总司令（第1军总司令为蔡锷，第3军总司令为唐继尧），进军广西省。1916年（民国5年）3月15日，广西将军陆荣廷发表独立宣言，倒向护国军方面。此后，李烈钧协助其进攻广东省。1916年5月李烈钧任军务院抚军。广东将军龙济光遭到李烈钧和陆荣廷夹击，于8月败北，逃往海南岛。1916年6月袁世凯死后，李烈钧军的存在意义消失。讨伐完龙济光后，李烈钧只身赴香港、上海隐退。