四名子女。子林海峰，1942年出生于上海，续弦洪氏所出，为台湾旅日着名围棋大师。其兄林海涛（长林海峰十二岁），也是日本问题专家，围棋名手。林国珪（父）、林海涛（兄）均为林海峰围棋生涯启蒙导师。有妹林熺，嫁给吴嵩庆，台湾钢铁工业元老，唐荣铁工厂前董事长。有外甥吴兴镛（吴嵩庆子），美国医学家、加州大学医学教授。