重点实验室9个，总后卫生部重点实验室1个，上海市重点实验室15个，上海市工程研究中心4个，教育部人文社会科学重点研究基地9个。学校还拥有中山医院、华山医院等6家直属附属医院和一批非直属附属医院。
历史.1903年2月27日，法国天主教会在徐家汇观象台旧址创办震旦学院。1905年由于法国教会对震旦学院的干涉废除学生自治，引发学生集体退学，创校人马相伯率学校中国师生另办新学校。根据于右任的提议，马相伯从《尚书大传·虞夏传》“日月光华，旦复旦兮”中撷取“复旦”二字命名，改校名为“复旦公学