荀子地位不如孟子终于定案，韩愈的道统系谱，只有孟子而没有荀子，他认为荀子「大醇而小疵」，但仍不失为圣人之徒。1084年，宋神宗下令孟子可以「配享」孔庙，荀子、扬雄及韩愈三人则从祀孔庙；孟子封「邹国公」，而荀子只封「兰陵伯」。宋代以后荀子地位更低，受程朱理学严厉批评。宋明理学尊奉孟子之「纯」，而批评荀子「驳杂」和倾向法家。荀子的思想常拿来与孟子比较，荀子不同之处，通常被视为异端或非正统。理学主张性善论，不少儒者如程颐、胡瑗、黄百家都批评荀子的性恶说，程颐认为圣人之道失传于荀子，「一句性恶，大本已失」。朱熹