由河川及海洋之交会所构成，由陆地来的物质一部分在河流的输送中汇集，经分解成为营养盐，最后被运送到此地。于是河口沼泽地区是营养盐丰富的地区，生物种类组成也相当复杂。河口地带受潮水来回，以及河川水量变化的影响，盐度起伏很大。河口生态系统的基本结构与陆域或海洋生态系统不尽相同。这里的生产者包括浮游植物以及较大的水生植物。大部分的生产者是以残碎物的形式进入此生态系统的食物网中；而残碎物先被分解者（细菌及菌类）分解，再为栖息此地的消费者（软体、节肢动物及鱼类）所利用，而这类消费者又成为鸟类的食物。由于此生态系统的