航导弹潜艇则装备反舰导弹，以攻击航舰战斗群等水面战舰为主。值得注意的是在美俄之外国家并不热衷于建造这种潜艇。
美国的巡航导弹潜艇.西方在六十到上世纪末集中发展两个类型的潜艇-—攻击潜艇和弹道导弹潜艇。虽然美国试图在艇上发射RGM-6飞弹并在1950年代末建造了专用的大比目鱼级潜艇，但因为始终难以解决在水底发射的安全问题，所以服役没有几年就将其改装成了攻击潜艇。不过后来解决了水底发射问题，便是由改装过的鱼雷管，即使是攻击潜艇亦可以发射战斧巡航导弹。美国巡航导弹潜艇也是在近几年