已修行至「无余涅槃境界」，然而，原始佛教即使解决自己内心的困扰，却无法解决现实生活与家人的问题。此时他因缘际会来到教堂，感受冥冥之中有神灵之力召唤，于是改而信仰基督教。宋泽莱的转变与把对信仰的见解进行写作的方式，引起宗教界的争议，也因评论当代佛学大师（星云、印顺、昭慧等），遭到批评。台罗拼音2006年，行政院教育部推出「台湾闽南语罗马字拼音方案」，此案引起部分学界人士反弹，宋泽莱时任教育部国语推行会委员，对此案表达支持态度。