明清时期，瞿昙寺负责管辖瞿昙寺沟、峰堆沟、高店沟、马哈拉沟、观音堂沟、双塔沟、虎狼沟等7条沟（当地人称“海子”）。清朝初年，当地有“七份佛差，三份县差”的说法，即农民纳差十分，先给瞿昙寺七分，再给县衙门三分，可见瞿昙寺所收民粮很多。清朝雍正年间，因受罗卜藏丹津事件牵连，清朝取消了佛差，命令“粮入大仓，民归县”。瞿昙寺不再享有政教合一的统治权力。此后，瞿昙寺购买了附近将近5000亩土地，将土地租给农民，以地租为主要收入。根据中共乐都县委统战部的统计资料，1954年，该寺“公众占有水地38.5亩，山地37亩，私