财政建立在盐、棉花、番薯等作物上。开发盐田之故盐成为特产，并且奖励种植棉花。1805年第7代松平定刚建设了藩校前身的讲书场，1807年扩充为藩校克明馆。1863年第10代藩主松平定法改革军队为洋式，并在沿岸建造砲台。之后积极的参与时政，长期派兵驻扎于京都，尽可能的周旋于幕府与勤王派间。1865年的第二次长州征伐时，本藩决定加入朝廷侧，并在1868年鸟羽伏见之战最早派兵进京保护京都御所。戊辰战争时藩兵的一部分成为官军，转战奥洲战场。今治藩的宗家为邻藩的伊予松山藩，两者皆为将军家的亲戚，在鸟羽伏见之战前