99年），杨寿枏回到家乡葬亲。他出钱捐内阁中书，但由于光绪二十六年（1900年）义和团事件发生，被迫暂不赴北京。其三伯父杨宗瀚当时正在无锡筹建业勤纱厂，杨寿枏佐理厂务。光绪二十七年（1901年）《辛丑条约》签订后，八国联军退出北京，杨寿枏到北京就任内阁中书。光绪二十八年（1902年），他入大学士孙家鼐幕府，负责奏章。光绪二十九年（1903年），清政府设立商部，杨寿枏应商部考试获得录取，分补保惠司主事。光绪三十一年（1905年），调补平均司。同年七月，清政府派出使各国考察政治大臣赴各国考察宪政，杨寿枏