伊斯兰教，巴基斯坦的国教。穆斯林佔大约96％的人口（1998年人口普查）。巴基斯坦的穆斯林人数在世界上排名第二，仅次于印尼。91％的巴基斯坦人逊尼派，5％人口什叶派(数字介于17万至30万)。
伊斯兰教和巴基斯坦成立运动.基于南亚两个国家不同的宗教（伊斯兰教和印度教）和不同历史背景、文化和社会习俗的基础上，穆斯林诗人和哲学家阿拉马穆罕默德·伊克巴尔于1930年在阿拉哈巴德穆斯林联盟首先提出成立一个穆斯林国家的想法，他建议旁遮普省、信德省、俾路支省和西北边境省应成为巴基斯坦的一部分。