时亦令乙组联赛等低组别联赛步向衰落，收费乙组赛事更成绝响。2002年，香港丙组（地区）足球联赛成立，为香港足球注入新动力。随着地区足球的发展，愈来愈多地区球会透过香港丙组（地区）足球联赛升上乙组联赛，地区球会的加入令乙组联赛受到地区球迷的关注。2009–10年乙组联赛升级关键战由屯门对安华更吸引大量屯门球迷支持。2011–12年更有一半球队是地区球会。
联赛改制.2014–15年球季，因为香港超级联赛成立，原有香港丙组足球联赛升格为香港乙组联赛，而升格后的第一届香港乙组联赛一共