与香港队进行友赛，开赛不足5分钟己遭主教练金判坤调离场，休息时受到金帅面责。金判坤向这名唯一在港超联踢正选的前锋发出严厉警告，直言今次的外围赛是他最后证明自己的机会，如其态度不积极，心态依旧未改，不会再考虑选他入伍。在2016年5月23日，卓耀国获香港队征召出战在缅甸仰光举行的银行盃，并于6月6日对缅甸国家队的季军战中，首度于国际A级赛正选登场，可是他在开赛32分钟便因伤被换出，最终香港以0–3落败。直到2017年12月，卓耀国获香港B队教练郭嘉诺给予机会，时隔逾年再度获征召出战第40届省港盃，并在