陨石坑坐落在它的东侧、南面则是克劳修斯陨石坑。而疫沼和秀丽湖则分别位于该陨坑的东面和南面。陨坑中心月面坐标为，直径41.2公里，深度1.34公里。李陨石坑外观轮廓呈圆形，坑壁已受侵蚀并有所磨损，其中东北侧已完全损毁，形成了一处宽阔的裂口，来自湿海的玄武岩熔岩沿该侧涌入坑中并淹没了它的坑底；西南侧外壁上则依附了卫星坑"李 A"。坑底表面相对平坦，除东北部一对小陨坑外，没有其它典型的地貌结构特征。
卫星陨石坑.按惯例，最靠近李陨石坑的卫星坑将在月图上以字母标注在该坑的中心点旁。