通初期暂不支持乘坐11号线的商务车厢。2019年3月30日，11号线的商务车厢开始支持扫码支付乘车，乘客在11号线车站站台核准机处刷码核准后即可乘坐。
银联闪付和交通联合卡.2018年12月28日，深圳地铁集团在部分车站推出银联闪付过闸服务，之后于2019年3月1日全线支持。同时，带有交通联合标志的全国交通一卡通亦可在深圳地铁使用（但无法享受任何乘车优惠，计价与普通单程票相同）。乘客也可以使用银联IC卡闪付，或是Apple Pay等绑定了银联卡的手机，通过印有“银联闪付”字样的红色