中国抗日战争爆发后，熊斌曾经代理第三战区参谋长。1938年1月，他任军令部次长，1938年5月他兼任战时新闻检查局局长。1941年7月，熊斌任陕西省政府委员兼主席。1941年8月，他兼任陕西省保安司令。1944年3月被免职。1945年8月，他任北平市市长。1946年11月，他任制宪国民大会代表。1947年12月，他任战略顾问委员会委员。1949年，他离开中国大陆到台湾。1952年10月，熊斌退役。
晚年.1957年2月，熊斌任中央银行顾问。1964年11月30日，熊斌在台北