常委、市委商业外经外贸部部长、北京市体制改革委员会副主任。其间，陈元发起组建北京青年经济工作者协会，制定了北京发展战略研究计划，承担了国家“七五”计划重点科研项目“中国社会主义经济运行”课题。陈元较早认识到金融的重要，其主持的西城区金融区规划成为如今的金融街的蓝图。1987年中国共产党第十三次全国代表大会实行差额选举，陈元落选党代表。1988年至1998年，任中国人民银行副行长。1989年，兼任中国人民银行党组成员；1995年，升任中国人民银行党组副书记。在中国人民银行任职期间，陈元开创了中国现代化金融