议和，派遣明朝降臣王则尧、张若麟送朱慈烺至吴三桂大营。随后吴三桂以太子为号召，声称要护送太子还京，移檄各地，并使用“义兴”年号。三十日（6月4日），李自成离开北京，逃往西安。五月一日（6月5日），吴三桂带着太子手敕回到北京。次日（6月6日），清朝摄政王多尔衮率领清军抵达北京。吴三桂希望立朱慈烺为明帝，但被摄政王多尔衮拒绝。吴三桂愤而挟持朱慈烺到山西，之后朱慈烺身故于陕西宁家湾。另有说法认为朱慈烺为李自成的大顺军所杀。此外，尚有人认为弘光元年（1645年）太子案中的朱慈烺是真的。南明弘光年间追封为献愍太子