迁骠骑将军、开府，恢复长沙王封号和封国。
诛杀齐王.大司马司马冏掌权后，渐渐变得专横，引起司马乂不满，曾在拜祭皇陵时向司马颖提议起兵讨伐司马冏，以保天下。太安元年（302年），河间王司马颙听从李含的计谋，指令司马乂讨伐司马冏。司马冏于是遣将董艾攻击司马乂，司马乂于是统领亲兵一百多人，赶赴皇宫，奉天子命攻大司马府。连战三日，司马冏战败，被斩杀，他二千多个党羽亦被诛杀。惠帝任命司马乂为骠骑大将军，都督中外诸军事。司马乂虽在朝廷身居要职，但事无巨细，都谘询在邺城的大将军司马颖。Sec