争时，法军进犯台湾淡水，俗称「西仔反」，善信迎去了此尊神像，焚香祷告，居然击退法军，这尊神像引发了艋舺与淡水两派信徒之间的纷争。艋舺方面说，这尊神像是艋舺祖师庙的神像，是淡水善信借去祈福，以抵抗法军的。淡水方面，则说此神像本是淡水信徒所有，是因为淡水无祖师庙，而寄放于艋舺祖师庙奉祀的。在两派纷争的结果之下，日治时期经官府协调，由艋舺与淡水二庙轮流奉祀。另一方面，落鼻祖师由于全身均是沈香木所雕成，沈香木在中药学来说，具有许多实质的疗效，因此又被称为「药祖祖师」，有着许多治病的神蹟流传。最后，值得注意的是，