进行启扉、启帏、瘗毛血、迎神、上香礼、初献礼、亚献礼、终献礼、饮福受胙、送神、望燎等祀礼。此庙过去为县辖市的嘉义市与其余嘉义县乡镇共祀。1982年，嘉义市升格省辖市，以许世贤为市长。该年许世贤以市长身分担任祭孔的女主祭官，开创女性主祭官的先例。至于嘉义县县市分家后，缺乏适当场所，祭孔仪式中断，全县仅新港乡继续保留祭孔仪式，直到县长陈明文上任后恢复全县性祭孔典礼。因嘉义县无孔庙，陈明文就在新港乡的文昌国小文昌祠举行祀典。2005年起，教师节举办祭孔释奠祭典前，镇南圣神宫的孔子像会乘轿遶境嘉义市区，然后