礼塔、礼拜殿组成。中华民国年间，院落曾被改成文化活动室。乌孜别克清真寺采用伊斯兰建筑风格，为土木结构，四面使用青砖打底，倾斜的屋顶上覆盖着铁皮，屋檐装饰有木制雕花。如今，在礼拜之时，乌孜别克清真寺有乌孜别克族的教长。但其他时候，清真寺内很少有乌孜别克族人。紧邻乌孜别克清真寺，是伊宁市第五中学，其校址原先是一所乌孜别克学校。乌孜别克学校后来因乌孜别克族学生太少而停办。校址经过演变，成为伊宁市第五中学的校园。该校址从外观上已没有乌孜别克族的痕迹。