1987年，当原任团长安华决定竞选巫统副主席时，纳吉被选为巫青团代团长。同年纳吉在吉隆坡甘榜峇鲁的巫青团集会中，发表了“以华人的血洗马来人的短剑”言论，导致种族关系非常紧张。紧张局势很快引发对种族骚乱的恐惧，最终导致一个大型逮捕扣留的安全行动，称为“茅草行动” 。随着马哈迪成立“新”巫统及1988年的宪法危机，纳吉于1988年当选巫青团长。1993年，当安华决定竞选巫统署理主席时，纳吉成功当选巫统副主席。纳吉也在1993年，1996年及2004年成功捍卫此职。
资深部门.