一场得3分，平局得1分。如果两队或更多队同分，比较净胜球；如仍然相同，比较进球数。积分最高的球队获得冠军，而垫底的三支球队降入德国足球乙级联赛。
参赛球队.共有18支球队参加该届赛事的角逐，其中包括15支参加了1998年至1999年德国足球甲级联赛的球队。纽伦堡、波鸿和门兴格拉德巴赫作为上赛季德甲积分榜的最后3位而降入乙级联赛，其名额则被乙级联赛冠军比勒费尔德、亚军翁特哈兴和季军乌尔姆所取代。
赛季概况.1999-2000赛季德甲的焦点是拜仁慕尼黑与勒沃库