因此洪奇昌遭新潮流系除名；2016年大选蔡英文当选总统，新潮流系是支持蔡英文的主干，新潮流系开除洪奇昌「等于蔡英文开除九二共识」；民进党黑箱作业重重，2006年民进党全代会已经决议解散派系，「怎么还有新潮流这个『党中党』」。2016年3月30日，《新新闻》报导，2006年7月民进党全代会通过「解散派系」决议后，新潮流系如同其他派系办公室于当天晚间发布新闻稿宣告解散，但事实上如同其他派系「名亡实存」；2008年民进党重回在野之际，一直都在运作的新潮流系成员开会重整，决定成立台湾新社会智库；台湾新社会智库办