苏焕智也期担任政治运动及社会运动受害人士的义务辩护律师，并且受施明德与陈菊邀请，于1990年出任台湾人权促进会副会长（会长施明德、秘书长陈菊），苏焕智主要协助义务辩护的案件。1988年5月20日，农民争取农保流血抗争事件，还有廖伟程、王秀惠涉案之独立台湾会案义务律师团总召集人。当时除了苏焕智亦引介了引介一、二十名年轻律师（包括邱晃泉、林永颂、顾立雄、林峯正等律师）加入义务人权辩护行列。1991年，返乡带领台南县民争取设置安定交流道成功，为日后南科设置台南的决定奠下基础。1992年，苏焕智与台南县