由于德国人夺去了土着居民的土地和牲畜，1904年，西南非洲爆发反对德国统治的，约150名德国移民被杀。为了报复，曾镇压义和团运动的将军颁布了臭名昭着的“灭绝令”（Vernichtungsbefehl），要把所有赫雷罗人斩尽杀绝。至1907年战争停止时，赫雷罗人的数量已经从8万下降到1.5万。纳马人的数量从2万下降到1万。德国方面有1749名军人和侨民死亡。被镇压后，大量土地被德国征用，随后卖给德国农场主。1912年，在吕德里茨和波蒙那发现了钻石，大量德国移民来到西南非洲。第一次世界大战爆发后，南非路易斯