代藩主松平定英时的享保大饥荒造成3,500人以上的领民饿死，而死者中一名藩士也没有。也因此江户幕府认为藩主不爱护领民，而下了警告处分。虽然处于财政困难，十二代藩主松平胜喜还是在1854年修复了于1784年因落雷而烧毁的松山城天守。幕末时由于身为亲藩大名而为幕府方，在长州征伐时担任先锋，也因此陷入严重财政困难。十四代藩主松平定昭就任藩主后担任老中（于大政奉还后辞职）。1868年鸟羽伏见之战幕府军成为叛军，伊予松山藩因于财政困难中仍对朝廷献上十五万两，藩主也由原先松平胜成回复为原先的松平定昭。之后，明治