长链骨架；另一部分称为硷基，可使成对的两条脱氧核醣核酸相互结合。所谓核苷酸，是指一个核苷加上一个或多个磷酸基团，核苷则是指一个硷基加上一个糖类分子。脱氧核醣核酸骨架是由磷酸与醣类基团交互排列而成。组成脱氧核醣核酸的糖类分子为环状的2-脱氧核醣，属于五碳糖的一种。磷酸基团上的两个氧原子分别接在五碳糖的3号及5号碳原子上，形成磷酸双酯键。这种两侧不对称的共价键位置，使每一条脱氧核醣核酸长链皆具方向性。双螺旋中的两股核苷酸互以相反方向排列，这种排列方式称为反平行。脱氧核醣核酸链上互不对称的两末端一边叫做5'端