孝同，美国阿波罗登月计画工程技术总设计师、美国火星探测计画工程技术负责人；朱光亚，核物理学家，中国工程院首任院长；夏培肃，中国计算机科学的先行者，中国第一台通用数字电子计算机的研制主持人；冯元桢，生物力学的创始人；冯康，计算数学家，有限元方法的创始人；陈德亮，气候学家，国际科联（国际科学理事会）执行主任；等等。更多南大知名校友见：南京大学知名校友列表。
南京大学亲缘学校.在近代的历史变迁中，南京大学和多所院校成为了同源大学，具有亲缘关系。国立中央大学、东南大学、河海大学、南京师范