5亿1800万年前的抚仙湖虫是否属于螯肢亚门激起了争论。另一个寒武纪的原先被分类到（Aglaspidida）中，但有可能是属于板足鲎目。若这些任何一种是与螯肢亚门有关，化石断层最少也有4300万年。已知最古老的板足鲎目可以追溯至4亿6700万年前的奥陶纪。已知最古老的蛛形纲是"Palaeotarbus jerami"，源自4亿2000万年前的志留纪。牠们拥有三角形的头胸部及有节的腹部，有八对脚及一对须肢。3亿9300万年前泥盆纪的"是最早拥有生产丝器官的，但却没有喷丝板，故并非真正的蜘蛛。有几种