台南县邻近的台南市（省辖市时代）灾情，并不若南县严重，其灾害多为区域淹水。由于迁移住户及时，且抽水站及相关排水系统发挥作用，无重大灾害亦无人伤亡。另外，同样位于台湾南部的嘉义县，因为八掌溪与朴子溪多处堤防溃决，朴子市各地多处积水。而沿海低洼地区，如东石、布袋、义竹也造成多处地方严重积水，使得联外道路一度中断。除此，嘉义地区最严重的灾区就属阿里山乡、梅山乡的太和村、瑞峰村和瑞里村，以及竹崎乡奋起湖等地区。这些地区对外桥樑、道路中断，当地居民房屋也多处毁坏。其中，阿里山高山铁路受创极为严重，预计至少要修复