子孙号称“和卓”，主要分为黑山派和白山派两个敌对的支系。明代中期，黑山派和卓得到叶尔羌汗国王室的支持，成为西域天山南路的伊斯兰宗教领袖。明末清初，白山派领袖玛木特·玉素布从中亚来到喀什噶尔（今喀什市）传教，被叶尔羌汗和黑山派驱逐。玛木特·玉素布之子伊达雅图勒拉和卓逃往甘肃河州（今临夏市），辗转来到西藏，寻求第巴桑结嘉措和蒙古准噶尔部的支持。清康熙十九年（1680年），在伊达雅图勒拉的协助下，准噶尔汗噶尔丹进兵叶尔羌，废黜了叶尔羌汗伊思玛业勒，扶植伊思玛业勒之侄阿卜都里什特即位。伊达雅图勒拉驱逐了叶尔羌的黑山