当时美国发生九一一袭击事件，台湾证券交易所以及许多公司均停止市场机能数日，直接重挫国内股市。即使日后市场重新运作，股市机能已大不如前；而数十万名居民不但无法上班，出行亦是一大问题。这些情况导致国内生产总值降低0.2%，相当于194亿新台币（约5亿6000美元）。时任台北市市长马英九事后表示：「台北市政府有疏失，不过市府疏失是建立在交通部中央气象局预报资料无法让市府准确掌握台风规模上。」由于纳莉在北台湾带来的降雨量过于集中，再加上台北市政府在当时採取大量放水，却未料当年末至隔年（2002年）上半年雨量匮乏