各个寺院，并且为南楚宏坛寺制订了格鲁派寺庙共同奉行的清规，使该寺成了其他寺院的模范，人称“贡唐三寺”。晚年，他一直驻锡贡唐寺，被僧俗尊称为“赤钦·贡唐喇嘛”。根登彭措任甘丹赤巴期间，发生了第巴桑吉嘉措遇害，六世达赖喇嘛被废黜送往北京等重大政治事件。哲蚌寺果莽扎仓的僧众还发动骚乱。藏王拉藏汗希望根登彭措出任果莽扎仓堪布，以稳定局势，但被根登彭措拒绝。不久，就连拉藏汗也被准噶尔部杀害。1720年，根登彭措稳定拉萨局势，率三大寺僧众到那曲河畔迎接七世达赖喇嘛入西藏坐床，被誉为“吾德合色江苏木吉达布”（意为“三