在1615年实施一国一城令后一度遭到废城，但在1639年又以作为加贺藩第2代藩主前田利常隐居住所，再度重建小松城。在19世纪末江户时代结束前，现在的小松市辖区大多为加贺藩的领地，不过在西部仍有小部分区域属于加贺藩的支藩，南部部分区域则为幕府直属领。明治维新后，属于幕府的领地划入本保县，实施废藩置县后原属加贺藩和大圣寺藩的区域则改设为金泽县和大圣寺县，在1871年的第一次府县整併后大圣寺县被併入金泽县，本保县则被併入福井县，当时的福井县在1872年旋即更名为足羽县，金泽县也在同一年更名为石川县，而足羽县内