地点设置于奉天省辽源县，6月1日开始办公。其下管辖科尔沁左翼前旗、科尔沁左翼中旗、科尔沁左翼后旗、科尔沁右翼前旗、科尔沁右翼中旗、科尔沁右翼后旗、扎赉特旗，共计7个旗。1934年（康德元年）12月1日，改为兴安南省，管辖库伦旗、科尔沁左翼前旗、科尔沁左翼中旗、科尔沁左翼后旗、科尔沁右翼前旗、科尔沁右翼中旗、科尔沁右翼后旗、扎赉特旗、通辽县。1935年（康德二年）9月1日，省公署转移到王爷府（后改称兴安，今乌兰浩特市）。1944年（康德十年）10月1日，伴随着设置兴安总省，兴安南省公署改制为总省的派出机关