1999年，史塔格尔因病住院三个礼拜，不过病因并未公开。后来史塔格尔罹患了肾脏分面的疾病，2001年4月9日，史塔格尔因为中风去世，享年61岁。他在晚年饱受高血压与心脏病所苦，他还在去世前两年动刀割除部分的肠子。而海盗队在史塔格尔去世前两天在主场PNC球场放置了一座比真人还大的史塔格尔塑像。
纪念.1982年9月6日，海盗队宣布永久退休史塔格尔的8号球衣。1999年，他被The Sporting News评为棒球史上百大杰出球员的第81名。他曾于1994年的明星赛担任开球嘉宾。