加苏中反清乡作战。1945年，出任苏中军区副政委兼政治部主任。
国共内战时期.1945年10月，担任华中野战军第七纵队司令员兼政治委员。1946年6月任第七纵队兼苏中军区政治委员，参与苏中战役。华东解放军主力北撤山东后，担任华东野战军十一纵队政委、华中指挥所副政委兼政治部主任，坚持苏中地区的游击战争。1948年2月，华东野战军第二纵队司令员韦国清率部南下，进入苏北。随后组建华东野战军苏北兵团，韦国清任司令员、陈丕显任政治委员，姬鹏飞任副政委兼政治部主任。3月，率部进攻益林，歼灭国军