器官是鳃耙的独特变异，可以阻止任何大于2至3公厘的物体通过，液体则会被排出。任何被鳃条之间的过泸器官所阻塞的物体会被鲸鲨吞下去。人类曾观察到鲸鲨出现「咳嗽」的行为，推测这是牠们清理累积在鳃耙中的食物的方式。鲸鲨会聚集在贝里斯加勒比地区海域的礁石区来捕食巴西笛鲷所产下的卵，这些卵会在5至7月的满月至弦月之间出现在该海域。鲸鲨是一种活跃的泸食生物，靠着嗅觉来攻击浮游生物或鱼类这些目标。牠们在觅食时不需要向前游泳，人类经常观察到鲸鲨借着身体上下摆动着来吸入与排出海水，吞食其中的动物。这种行为与姥鲨完全相反，因