尼亚第二团并入大陆军，斯科特的中校军衔得以维持。同部分第二团将士在萨福克过冬后，斯科特获第二届大陆会议任命，从1776年8月12日开始出任弗吉尼亚第五团上校，取代辞职的威廉·皮奇（）上校。9月结束前，弗吉尼亚第五团驻扎在汉普顿和朴次茅斯，之后再受命前往新泽西同华盛顿会师，最终于11月前往特伦顿。
费城战役.弗吉尼亚第五团隶属亚当·斯蒂芬（）统率的旅，曾参与12月26日殖民地军队取得胜利的特伦顿战役。接下来第五团又投身1777年1月2日的阿孙平克溪战役，迫使英军轻步兵和黑森佣兵联军向