，人民困苦，甚至调侃嘉靖年号的含义是「言家家皆净而无财用也」；并指责百官一意媚上，为满足皇帝修道而进贡香料；希望皇帝能重新振作。嘉靖帝读后大为震怒，将疏卷用力甩在地上，，但却因内容句句属实，一看再看，无法反驳，最终心中气愤无法平息，因此把他抓进诏狱。户部司务何以尚发觉嘉靖帝不想杀海瑞，奏请释放，又说自己买了40两名贵香料，献给皇帝修道用。嘉靖帝大怒把何以尚抓起来，予以重责。嘉靖四十五年（1566年）冬，嘉靖帝驾崩，隆庆帝奉遗诏命海瑞出狱，又改任为兵部武库司主事。隆庆元年（1567年）连续升官，历任尚宝司丞、