机构改革中划满洲为十四省，方正县划归三江省。此后方正县一直隶属三江省至抗日战争胜利。1945年9月3日抗日战争胜利后，方正县初隶属于哈东专区。民国三十六年（1947年）6月5日，《东北新省区方案》公布，方正县划归松江省。1947年8月，哈东专区撤销，由松江省直辖。中华人民共和国成立后，1951年方正县被定为丁等县，1954年8月松江省被并入黑龙江省，方正县划归黑龙江省直辖，1956年3月方正县隶属黑龙江省牡丹江专区，1970年4月方正县划归黑龙江省松花江专区。1991年2月中华人民共和国国务院批准将方正县划