太平军出城迎击也被击败，于是坚守不出。直到2月28日，左宗棠收复汤溪、龙游，武义势力孤危，林文察令林朝安发动夜袭，一举破城，得以顺利收复武义。5月25日，林文察正式赴福建福甯镇总兵一职。
平定戴潮春事件.1863年9月10日，闽浙总督左宗棠命林文察返台，讨伐已起事两年的戴潮春事件，而此时台湾兵备道丁曰健已抵达台北，准备南下作战。11月24日林文察自安平登陆，12月2日抵达嘉义，惩劝当地两百数十庄向清军投降，并与护理水师提督曾元福会师商议战略。商讨结果，他决定先疏通嘉义与彰化交界处的