共和国採行三不政策（不接触、不谈判、不妥协），但对于国际上其他国家则採行较宽松的弹性外交，在国际上有限度的接受中华人民共和国存在的事实。外国在自由地区设立「贸易办事处」、中华民国政府在外国设立「台北经济文化办事处」等组织，来代表各自在对方的利益。李登辉政府执政时，曾提出国家统一纲领，三阶段追求海崃两岸重新统一，1996年台海危机导致两岸关系转坏后，于1999年提出特殊两国论，认为中华民国与中华人民共和国的关系为「特殊的国与国关系」。陈水扁政府执政时，提出一边一国，亦提出「一个中国」的新解释，强调尊重