编制历法和疾病治疗，纯粹的自然科学研究慢慢开始兴起。当时从事科学研究的人，通常不被称作「科学家」，而被视为科学上的哲学家。最早期的科学哲学家起源于古希腊，一般称他们为前苏格拉底哲学家。他们对于神话中问题：「宇宙是从何而来？」提供了完整的回答。哲学家泰勒斯（前640-546年），又被称为“科学之父”，是第一个尝试用理性思维来解释自然现象，如陆地浮在水上及地震是由水面搅动引起的（而不是海神引起的）。他的学生毕达哥拉斯创立了毕达哥拉斯主义，他对数学的原理进行了研究，并且是第一个提出大地是球体。留基伯率先提出了