政以后，策墨林拉章才重现。但当时未设立拉章札萨，因札萨一职必须由清朝皇帝特许任命，故这时策墨林拉章只设“强佐钦莫”（大总管），其下设有“第羌昂”等职位。策墨林拉章的组织结构与丹杰林拉章并无分别。
策墨林扎仓.策墨林扎仓与丹杰林扎仓相似。僧人数量最初定为170余人；二世策墨林活佛遭罢免后，降为25人；三世策墨林活佛时期又定为75人，据一些老僧人说，僧人大部分是从色拉寺麦扎仓选派。扎仓僧人数量的变化，一定程度上与其“林”的活佛的势力有关。进入该“林”的僧人必须先入色拉寺麦扎仓为僧，