其短波讯号穿透力极强，是台湾的重要国家安全战略资源，也涉及台海两岸「电波战」。中华人民共和国当局一直希望取得分台的短波天线方位，试图更有效干扰、盖台，封锁台湾对中国大陆的广播讯号。2007年，行政院新闻局同意天马电台迁台计画，但后续迁台计画一直未编列预算执行；立法委员陈亭妃多次在立法院教育及文化委员会通过主决议「台南分台整併迁台计画将于民国102年底前完成」，行政院新闻局同意正式编入民国100年（2011年）度预算。2010年1月14日，央广在台南市安南区本渊寮朝兴宫举行台南分台整倂迁台说明会，央广