在外交上的“软弱”，批判伊朗核协议、恢复与古巴邦交以及在对伊斯兰国、朝鲜、俄罗斯和中国太过柔性。2016年，唐纳德·川普赢得总统选举后，与共和党右派同一阵线的博尔顿被认为是其组建新内阁的国务卿人选之一。2018年3月23日，总统川普指派波顿为总统国家安全事务助理。2019年5月，中华民国国家安全会议秘书长李大维访问美国，与美国国家安全事务助理波顿会晤，创下自1979年中华民国与美国断交后首例。相对于总统唐纳德·川普，博尔顿对中国，朝鲜、伊朗、阿富汗、俄罗斯等美国宿敌政权的态度上更为强硬，两人逐渐