系，哪些是相互依存的，哪些是独立的，他们具有什么样的关系，用合理的数学式表示这些关系。根据实际问题选用合适的数学框架（典型的有优化问题，配置问题等等），并具体的应用问题在这个数学框架下表出，并用合适的算法求解数学框架下表出的问题。在这个过程中可能用到计算机模拟和编程，常用的数学工具软件包括MATLAB和Mathematica。
分析结果.最后使用计算结果解释实际问题，并且分析结果的可靠性。这时常需用到各种信息可视化的技巧。
科学应用.数学模型广泛应用在各领