失去了8X8区块对于运算效率帮助的部分，造成需要运算时间加长，此外8X8区块也可以帮助减少硬体的需求（需要将全影像暂存的位置），JPEG2000就不得不面对这个问题。
JPEG 2000版权专利问题.JPEG 2000存在版权和专利的风险。这也许是目前JPEG 2000技术没有得到广泛应用的原因之一。JPEG 2000标准本身是没有授权费用，但是，因为编码的核心部分的各种算法被大量注册专利，所以一般认为，不太可能避开这些专利费用开发出免授权费的商用编码器。且JPEG 2000是