治七年（1868年），调浙江巡抚，再署湖广总督，不久正式授职。光绪元年（1875年），调四川。次年，又督湖广。瀚章在湖广任职最长，先后任职四次，都与其弟李鸿章交替，其母常年居住在武昌官所，人以为荣。不久，因丁忧离职，居家六年，再起用为漕运总督。不久，移两广总督。闱姓，是一种广东流行的赌博，由赌场贩卖彩券，供乡民签赌，猜科举上榜者的姓名，广东原有闱姓捐，其中四成用于军饷，被巡抚马丕瑶革除。清国日本甲午战争爆发，瀚章请求恢复收缴，以备海防，结果舆论大哗，于是以病归。光绪二十五年（1899年）卒，谥勤恪。