府修复为止，磺溪书院经历了各种不同的天灾与人祸摧残，但是因为书院的成立，带给了台中市、彰化县一带的文化教育有很深的影响。
结构.磺溪书院内祭拜有五尊神明文昌帝君、孚佑帝君、文衡帝君、朱衣星君与魁斗星君，合称为「五文昌」，是古时科举时代掌管所有考试的神明。内设有大殿与拜殿，所以俗称文昌祠或文昌庙，建筑的样式属于传统的闽南式合院型态，是一间结合学堂与庙宇的四合院。建筑材料的使用除了红砖瓦片之外，还有泉州白（花岗岩）、青石等石材搭配福杉等建造而成。门厅比地面高出三阶，讲堂则高出五阶。