一分钟平均风速185节（345公里每小时）的颠峰强度，其中心最低气压低至882百帕斯卡。稍后，南施在琉球群岛登陆，并转向偏北方向移动，掠过沖绳县及奄美大岛。之后转向东北方向移动，趋向日本本州一带。9月16日上午9时在室户岬以西登陆，4小时后在兵库县尼崎市与西宫市之间再次登陆。登陆后的南施迅速横过本州，且速度不断加快，达到颠峰移动速度100公里每小时（65英里每小时）或55节。后南施掠过北海道，随后进入鄂霍次克海并减弱为热带风暴，于9月17日受西风槽影响而转变成温带气旋，最后经过堪察加半岛进入白令海。