2008年9月，马英九总统在会见日本媒体时发表。同时期，立法院院长王金平也在到日本的演讲中提到此事。以处理两国间悬而未决的事情，如：钓鱼台列屿问题（日本名「尖阁诸岛」）、主权问题、渔业交涉、与周边海域资源等共同开发提案。2008年10月，中华民国总统府国家安全会议发表「台日特别伙伴关系」。2009年1月，中华民国外交部宣示2009年这一年是「台日特别伙伴关系促进年」。具体来说主要是提倡自由贸易协定(FTA)到投资保护协定的缔结、工作假期签证制度的导入、台北松山机场与羽田空港之间航空路线的开设、