一次国共合作正式达成，徐谦积极赞成国共合作。1924年10月，冯玉祥发动北京政变，囚禁大总统曹锟，并邀请孙中山北上共商国是。1924年10月，徐谦应冯玉祥邀请到北京参加国事会议，用“基督救国主义”思想劝说“基督将军”冯玉祥。冯玉祥因1924年娶了基督徒李德全为妻，乃改信基督教，并要求其所部士兵信奉基督教。徐谦还用个人名义发表通电，称赞冯玉祥发动北京政变“乃见义勇为之举”，主张解散非法国会，召开和平会议，并认为“前清废帝乃系民国乱犯，应治以国法”。旋受冯玉祥聘任为俄文法政专门学校校长、中俄庚款委员会主席，并协