此番东征意义职责重大，致操劳过度，加上前线战事先盛后衰，压力倍增，岑终染病不治，遽逝于幽州（今中国北京市）军中。享年五十一岁。唐太宗闻讯，非常悲恸，追赠岑文本为侍中、赐陪葬昭陵。谥号宪。岑文本有子岑长倩（实为其兄岑文叔子，即岑文本侄）及孙岑羲相继拜相。