厂因主要生产九九式舰上轰炸机，因此只少量生产了133架；大部分的零式水侦由广海军工厂与九州飞机代工，尤其是九州飞机生产了1,237架，实际上为零式水侦的主要生产商。到1945年日本战败时，日本尚存约200架的零式水侦，大部分佈署在海外基地；后来有8架被法国海军缴获用于中南半岛战场。初期型加装机载雷达加装磁异测测器的反潜机型加大载弹量并在机头加上两门向下斜射的20毫米口径机炮，用以攻击美军小型舰艇