从2005年起，石之瑜指导的博、硕士论文均属于中国学的知识社群研究计画。学位论文的导生主要来自国立中山大学与国立台湾大学，另有国立政治大学、东吴大学 (台湾)、国防大学 (中华民国)、淡江大学、国立台北艺术大学、国立台湾师范大学、德国杜宾根大学、美国丹佛大学等校。接受指导者除本地学生外，来自韩国、日本、马来西亚、印尼、越南、蒙古、德国、荷兰、美国、大陆与香港等地。
社团.石之瑜长期指导两项社团活动：2016年荣获台大贾斯丁喝水团最佳运动员精神奖，