了巩固地位及自身利益，千方百计巴结讨好太子李建成、李元吉，陷害诋毁李世民，而且深怕唐高祖去世后，李元亨无依无靠，因此生母尹德妃与李建成、李元吉通姦，希望李建成、李元吉能关照自己的儿子。贞观二年（628年），任命为散骑常侍、金州（治所在今陕西安康）刺史。唐太宗作为兄长，思虑弟弟年幼，派遣使者察看弟弟的状况，赐与金杯。贞观六年六月十日（632年7月2日），李元亨去世，年仅十四岁，十二月十一日（633年1月26日）下葬。无子，封国除。