始服役，但由于许多前线部队仍继续使用6.5公釐口径的三八式步枪，而且十一式与九六式都已大量生产，所以九九式与这两种较旧的一同使用。这三种武器持续被使用直到战争结束为止。
衍生型.军方为伞兵限量生产了一种九九式衍生型。它拥有可卸式枪托以及向前折起的。要收起时，枪管与枪托自枪身拆下、手枪握把与双脚架折起，而整组部件装入收纳袋。
流行文化.在众多讲述第二次世界大战的中国战场和太平洋战场的电影和电视剧当中都有九九式轻机枪出场，例如:在以二次大战为主题的电脑游戏