多样性是巨大的。 例如，在植物中可能产生多达200,000种不同的小分子，尽管并非所有这些小分子都存在于同一物种或单一细胞中 。 单个细胞中代谢产物数量的估计预测不到1000个，例如大肠杆菌和面包酵母。
水.细胞质基质的大部分是水，占典型细胞总体积的70％左右。 细胞内液的pH值为7.4 。 而人体细胞质基质pH值范围在7.0-7.4之间，如果细胞生长则通常更高。 细胞质基质的粘度与纯水大致相同，尽管小分子通过这种液体的扩散作用比纯水慢四倍，这主要是由于细胞质基质中大量高分子的碰撞