参议院与日本内阁的关联程度相对更弱。在实际运作中，日本法律尽管规定首相（内阁总理大臣）需从国会议员中指定，但过去完全都是由众议院议员选出，至今尚未从参议员中产生过任何一位首相。此外，具备中立仲裁性质的行政监视委员会也设置于参议院内。对于首相指名，法律规定由两院共同进行，当两院作出不同决议时，应召开，但即使如此仍无法达成一致意见的，或者参议院在众议院通过决议后一定时间内无法通过决议的，众议院的决议将正式成为国会决议（众议院优越）。这一原则同样适用于财政预算的决议和条约的批准等程序。财政预算一般先在众议