公署，参与对鄂豫皖地区红军游击队之清剿。军部率第五十四师追剿长征红军。5月，红一方面军长征离开贵州后，驻守贵州之第九十九师奉命列入该军序列，第四十七师脱离第九军。此时，该军辖第五十四师，师长郝梦龄兼；第九十九师，师长傅钟芳。
中国抗日战争时期.1937年7月，在中国抗日战争中，该军第九十九师留守后方，军部率第五十四师北上抗日。10月初，该军抵达太原后，隶属傅作义国民革命军第七集团军，参加忻口战役。10月16日，郝梦龄在率部抗击日军时阵亡。11月初，由郭寄峤继任军长、裴昌会任副军长，