行的副经理被暗杀，官方却认为他是意外死亡，不过警方怀疑是E.V.I.L Inc.的残余势力所为。后来在城内的一银行被行劫，而一捷运建筑地盘也被袭击，看来E.V.I.L Inc.重生了。
操作.《VR战警2》的玩法大致上与前作《VR战警》是相同的，不过《VR战警2》可供玩家于中途选择两不同地方，不过最后都会于同一地方汇合攻打BOSS。另外《VR战警2》也新加了一关，新关卡必须要完成所有关卡，杀掉第三关（Railline Shootout）的BOSS（Garse Bradley）才可玩