为一种在战时生产的粗糙产品，导致了EF13型电力机车较高的故障率和较低的运用率，甚至还被铁路工人讥讽为“用水泥和木材制成的机车”。首台EF13型电力机车于1944年研制成功，在战争期间共试制了7台，并在终战之后继续生产。至1947年随着后继的EF15型电力机车的出现而停产，日立制作所、川崎车辆东京芝浦电气共生产了31台EF13型电力机车。
改造.1948年，EF13型电力机车开始进行战后第一次技术改造，包括恢复安装在简化设计中被省略的高速断路器，更换气动控制式的PS14型受电弓