排混乱，担心疫情过后有更多人上班时，可能要等多几班车。不过港铁坚称9卡车承载力足够，认为大围站乘客可能无法上车是与车站设计有关。当乘客习惯9卡车安排后，会逐步增加9卡车班次。
误判列车「假冲灯」事件.2021年2月，东方日报和香港01揭发新信号系统在短短9日内，已出现近20次误判。部分列车原本正确依照灯号停驶，但系统误判为冲灯。有工程车在一晚内曾出现19次「假冲灯」问题。港铁事隔两天才承认出现问题，但至今仍然未有具体交代事故原因。机电署发言人表示情况并不理想，要求港铁公司提交报告。