兴会在湖南起义计划，杨乃留在上海，与章行严等密设爱国协会，以为接济，并结合留日各省同，遥为声援。杨和蔡元培、杭辛斋等加以配合。后来起义事泄，他改名“杨守仁”，流亡日本。后来他回到长沙，与黄兴和宋教仁一道。至11月，遂于长沙创立华兴会。1906年，他在东京加入中国同盟会。1907年，他到上海，和于右任等人等创办《神州日报》，并任总主笔，任职80天，以“寒灰”为笔名发表了社论和时评。不久，《神州日报》因火灾而暂停出版。此后，他到欧洲，并于1909年入苏格兰爱伯汀大学学习英语。其间，他会见了流亡伦敦的孙中山，