1959年，新安江水电站建成蓄水，淹没区涉及建德县、淳安县、遂安县、歙县。淹没2座县城，8个镇，39个乡，1377个自然村，255家企业，270268间房屋，307 838亩耕地，林地10万亩。289951人离别故土，移往浙、赣（18个县10.2万人）、皖各地。淳安县比较平坦的地方全部淹没，剩下了比较高的山地，现在的淳安县城千岛湖镇也是建立在山顶上。
水下遗迹.淳安自古便是交通要道，且这一地区土地肥沃，所以在古代这一地区经济发达，人口稠密。1959年水库建成后，将淳安，遂安两座县城