穗彦发起了叛乱，皇后追随哥哥投火自尽。此后，从丹波迎接日叶酢媛命为继任皇后。同时，以倭姬命执掌天照大神的祭祀，并创立了伊势神宫。日叶酢媛命皇后临终时，接受野见宿祢的建议，将一泥人偶作为自己的替身代替自身下葬，但这只是传说。除此以外，相扑节会的起源故事，天日枪和田道间守的传说也源于此时期。
陵.他葬于菅原伏见东陵（）。此皇陵，比照奈良市尼姑町的宝来山古坟（前方后日元坟，全长227米）来建做。 近铁僵原线的尼姑十字路口站附近。（垂仁天皇陵）