1995年拍摄《我》剧集时被指与男主角江华交往。当时江华已婚，妻子为麦洁文。因此邓萃雯介入江华和麦洁文婚姻当第三者，后自动退出。1998年，邓萃雯和演员郑敬基交往，她表示郑对她很好，但一年后都是以分手收场。2019年，邓萃雯被爆与新加坡艺人好友陈洁仪传出绯闻。后两人出来澄清，说只是闺蜜。
其他.2013年3月4日，邓萃雯表示当时拍摄《金枝慾孽（贰）》因压力大而患上自主神经失调，其后邓萃雯趁假期在家中休息，现已完全康复。曾与邓萃雯合作的好友林保怡和前度男友郑敬基也纷纷评论。