德涅斯特河沿岸宣布独立；随后成立德涅斯特河沿岸摩尔达维亚共和国。1991年5月23日，改称为“摩尔多瓦共和国”。8月27日，摩尔多瓦共和国宣布独立。
独立后.1992年，爆发德涅斯特河沿岸战争，最终摩尔多瓦共和国战败，德涅斯特河沿岸维持独立。1994年3月，公民投票以压倒性的票数支持维持独立主权国家的地位，反对与罗马尼亚再统一。2009年7月，摩尔多瓦共和国共产党人党选举失利。2016年2月17日，罗马尼亚支持摩尔多瓦加入欧盟进程。