市径流也会提升地表水温度。热污染也可以指水库底层向温暖的河流排放冷水造成的问题。
水污染物流动和化学反应.大多数水污染物最终经河流汇入大海。通过水文运送模型的研究发现在一些地方污染影响到离出海口一百英里开外的地方。先进的计算机模拟如雨洪管理模式或动态溪流模拟评估模式在世界许多地方得到应用，用以评估水体污染。作为指标，滤食动物，如桡脚类生物被用于研究纽约海湾污染。毒素最高的地方并非哈德逊河口，而是向南开外挂，因为掺入浮游生物组织需要几天时间。哈德逊河排污因科里奥利力沿海岸向南流出