洋基任命乔·托瑞为总教练，当时并没有人看好洋基的任命，但托瑞在这一年带领洋基队拿下分区冠军，并在季后赛一路过关斩将进入世界大赛，以4：2打败亚特兰大勇士队，拿下世界大赛奖盃。1997年洋基队以外卡身份进入季后赛，但在第一轮美国联盟分区赛以2:3不敌克里夫兰印地安人。1998年，投手David Wells投出队史上第一次正规球季内的完全比赛。同年洋基创下季赛114胜的美联最高纪录，并击败圣地牙哥教士成为世界冠军。1999年，名投大卫孔恩（David Cone）在季赛中投出大联盟史上第15场完全比赛，也