等方面存在着不少区别。例如马祖话称「我」为「」，称「我们」为「」。而在中国福州市区通行的福州话中，称「我」为「」，称「我们」为「」。又如马祖话称「舌头」为「舌囝」（），福州话说「喙舌」（）；称「中间」为「当当中」（），福州话说「台台中」（）；称「除夕」为「廿九暝」（，同台湾闽南话），福州话则称为「三十暝晡」（）。也有词汇相同但词义不同的词汇。例如：「过身」（）一词在马祖话中意思是「逝世」（与台湾闽南语中同义），但在对岸的福州话中却是「时过境迁」的意思，「过世」（）才是「逝世」的意思。马祖人称「爷