被照射特定波长（或波段）的光，其被吸收，导致它们发出更长波长的光（例如，和被吸收的光不同的颜色）。通过使用光谱发射滤片，该照明光被从弱得多的发射荧光中分离出来。近年来在生物学研究中，荧光标签被广泛地使用来标定生物分子，使荧光显微镜变得更加重要。它以水银灯或为光源，搭配具，泸片组的光学仪器。目前被普遍使用的荧光显微镜，是属于落射荧光显微镜(Epi-Fluorescence Microscopes，见右图)，是指激发光的来源和观察的位置(接目镜)，皆位于样品的同方，通过相同的光路。这些显微镜被广泛应用于