同年闰五月，改翰林院庶吉士。授翰林院编修。此后为候补道，任天津北洋法政学堂总办，并曾任直隶总督陈夔龙的幕僚。中华民国初年，冯国璋任直隶都督时，胡嗣瑗任都督公署秘书长。此后，冯国璋转任江苏都督，他继续在冯国璋手下任职。民国四年（1915年），他任江苏金陵道道尹。冯国璋任江苏将军时，他曾任将军府咨议厅厅长，作为首席幕僚代行政务。民国六年（1917年），参加张勋复辟，任内阁阁丞。后来，被冯国璋免职，此后在杭州西湖建立了五峰草堂开始隐居。民国十一年（1922年）11月25日，溥仪传旨赏胡嗣瑗在紫禁城内骑马。