车站在鹏城四路道路下面，沿鹏城四路呈南北走向，车站的南北方向位于红荔路与福中一路之间，车站的东侧是深圳少年宫，西侧是深圳书城中心城，4号线月台位于深圳市中心区中轴线以东。少年宫站在2011年清湖站启用以前，是4号线北面总站。在2010年12月28日深圳地铁3号线通车前亦曾为深圳地铁系统中最北的车站（已被双龙站取代）。
车站结构.少年宫站4号线月台的结构共分二层，其中两个同一水平的侧式月台设于下层，而上层则为车站站厅，在站厅可通过一个130米的转线通道（中间设有扶手带）来转乘3号线，