0岁时，其父用武士刀划伤他的双腿12次，代表他正式元服。1904年高野五十六毕业于江田岛海军兵学校，不久后以的身份在日进号装甲巡洋舰上参加日俄战争。日本海海战中被俄舰的炮火流弹炸断左手食指与中指。1916年经牧野忠笃子爵介绍，高野五十六过继到旧长冈藩家老山本家，成为山本带刀的义子，此后改名山本五十六。同年，山本五十六毕业于日本（第14期）。1917年（大正6年）1月、因为患伤寒，在疗养中却併发阑尾炎为生命带来的危险，在大手术后恢复后，回到故乡长冈休养到翌年6月左右。担任护士的姪女高野京在这之间照护护