斯大学学历于1687年6月18日起，正式获教宗本笃六世认可。在早年16至19世纪，圣卡洛斯大学提供法律、礼拜法、理论学、哲学、医学、以及美洲印地安语的研究与课程。20世纪时，产出许多瓜地马拉杰出的文学作家，其中包括1967年的诺贝尔奖得主米格尔·安赫尔·阿斯图里亚斯。在压迫期间(1962-1996)与瓜地马拉内战(1960s-1995)期间，圣卡洛斯大学为人民对抗军政府的最前线。圣卡洛斯大学提供科学与人文学科的课程与研究，包含大学部与研究所。现在圣卡洛斯大学在瓜地马拉全境设有许多分校。Sec