初期，三合地区为一街庄，称为「三合庄」，隶属于大坵田堡。该庄西北一小段与大墩仔庄为界，北及东北与竹围仔庄为邻，东及东南与湳仔庄为邻，南边为过港庄，西南边为土库庄，西边为石庙仔庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于斗六厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「大墩仔区」，隶属于斗六厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，大墩仔区改隶属于嘉义厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「三合」大字，隶属于台南州虎尾