华民国维新政府成立，王子惠被任命为实业部部长。同年12月，访问日本。1939年6月初，王子惠辞去了实业部长职务。关于这一点，孔祥熙的亲信贾存德回忆称，王子惠通过贾存德与孔祥熙加深了联系，辞去实业部长职务是受孔祥熙指示。此后，王子惠作为孔祥熙的代理人在东京乃至日本从事秘密和平工作。王子惠原与畑俊六关系密切。1940年（民国29年）4月，王子惠与板垣征四郎交涉，板垣征四郎提出具体的和平案5项。结果交涉于1940年（民国29年）破裂。但是，就王子惠的和平工作，贾存德记述的交涉详细过程及时间等等存在许多不明的疑