时明军准备发动攻势的威胁下，双方开始交涉，最后请荷兰人退出澎湖转至当时非明朝领土的台员。1632年，荷兰人于岛上筑城并取名热兰遮城。1662年延平王郑成功赶走荷兰人，设「东都」于赤崁，乃以故乡「安平」命名。德国史学家路德维格·里斯研究荷兰史料后表示，荷兰人透过这些汉人为通译，与平埔住民沟通，并把汉人的「大湾」或「大员（tâi-uân）」转写为Tayouan。「大员」，亦为最早出现在中文文献上的「台湾」原始文字的前身。然而，早期荷兰古地图却清楚标示「大员」（Tayouan）在台江内海，因此不可能为原住