七万三千多票当选，成为当届票王。但在2008年，他宣布不再寻求连任，交棒陶君行但失败。郑经翰在立法会期间，曾担任政府帐目委员会成员，以及资讯科技及广播事务委员会主席。他在立法会属于民主派成员，在2005年跟随民主派立场投票否决政改，不过在提名其好友曾荫权参选行政长官问题上，他与民主派出现意见分歧，更被民主派视为特首曾荫权安插在议会的「煲呔针」（意即特首的线眼）。
「领汇」事件.在2004年12月，房屋署在绕过立法会情况下，将香港一百五十个公屋商铺及八万个停车位，注入领汇房地产信