朝则以不干涉荷属东印度公司之台湾事务为条件复设此单位。1625年（明天启五年）彭湖游升格为彭湖标，所驻主官把总则升格为游击。而文献记载曾在任者的彭湖游把总有洪调元与顾兴隆等等。
荷西时期.17世纪之前的元明两朝虽于澎湖群岛设巡检、彭湖游，不过仍未于台湾本岛设置军事力量。即使1624年控制台湾西南部的荷兰东印度公司，于台湾的军事力量都未臻于成熟。1624年，荷人佔领台湾大员，展开以经贸为主的台湾经营。为力求节省行政经费，此阶段之荷治时期，地方不设行政官吏，驻台的荷兰官