区内炎热干燥的热带干湿季气候，为当地特有的科莫多龙提供了良好的栖息条件。为了保护生态，科莫多岛的人口控制在1,700人左右(多是布吉人)，林卡岛的人口控制在1,300人左右，Gili Motang岛和Gili Dasami岛的人口控制在100人左右，弗洛勒斯岛的人口控制在2,000人左右。树林的密集地区只出现了约500米，但它们提供了几个流行菌群的栖息地。例如，沿海地区3个较大岛屿庇护的海湾有红树林。 补丁珊瑚礁的分布广泛，生长最好的地区在科莫多东北和东部的沿海。 主要生物包括鲸鲨、翻车鱼、蝠鲼、鹰