不少日本古代建物採用日本扁柏。位于三重县伊势市的伊势神宫曾于18世纪至20世纪1960年代拥有专属的扁柏森林，以做为其式年迁宫时更新木材的来源之用，因木材质地良好，伊势神宫换下来的木材仍可移给其他神社使用。除了做为建筑的木材，因其浓郁的香气，还可提炼精油。