任教授。1952年至1962年，他又在澳洲国立大学（ANU）任教授。1963年，埃克尔斯获得诺贝尔生理学或医学奖和。1966年，埃克尔斯移居美国。1968年起在纽约州立大学布法罗分校任教直至1975年退休。退休后，埃克尔斯移居瑞士。1997年，在瑞士洛迦诺逝世。