客运、首都客运、亚联客运、日豪客运，到其他县市相当的方便。目前国道客运皆已全数移至2016年启用的新竹转运站内营运，改善以往火车站前的交通混乱。新竹科学工业园区有免费专车维持园区内的大众运输。
自行车.新竹市拥有的新竹市公共自行车租赁系统为YouBike微笑单车，2016年5月启用，截至2017年6月8日共有37个站点。
海运.新竹市现有渔港包括新竹渔港与海山渔港，无工商业货物运输，主要功能为近海渔业及观光游憩。争取新竹港规划为「观光科技港」，已完成