1975年，由于广岛原爆诱发的慢性粒细胞白血病，冈崎在访美途中去世，享年44岁。其研究事业由妻子冈崎恒子（名大教授）赓续。在教科书中，冈崎片段被誉为「日本分子生物学的金字塔」。
冈崎恆子＆令治奖.为纪念冈崎夫妇的贡献，名古屋大学理学部于2015年首度颁发「冈崎恒子＆令治奖」（Tsuneko & Reiji Okazaki Award）。获奖人为哈佛大学暨麻省理工学院的张锋博士。