下大乱，军师一职再度出现，此一时期，军师之权相当于将军，如：军师中郎将、军师将军等职。而此时这些职务已是正式官名，诸如卢植、蔡瑁、李典、诸葛亮等，皆曾担任过此类职务。在当时，于曹操军中，亦设有军师祭酒、中军师等职，主要担当曹操之幕僚、策士，如：陈琳、荀攸、郭嘉等人。曹魏建国后，设有大将军军师一职，主要为督军之职。如：司马懿与汉军交战之时，朝廷即派辛毗为大将军军师前往督军。两晋时期，「军师」一词为避讳景帝司马师之「师」字，而更名为「军司」，职责同曹魏，主要为督军。
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