战斗人员在两次车臣战争中死亡或失踪，包括3至4万车臣人及约10万俄罗斯人。已死的叛军领导人马斯哈多夫一再宣称两次战争导致约20万车臣族人死亡。这些宣称未获独立第三方核实。俄国人权组织「纪念」于2007年指从1999年起有多达25000平民死亡或失踪。国际特赦组织2007年的一份报告指从1999年起有多达25000平民于第二次战争中被杀，又提及「纪念」估计车臣有3000至5000人在1999年或以后失踪。
地雷.车臣是全世界最受地雷影响的地区。从1999年起，地雷被战争双方广泛使用。