机厂原设有人事室、会计室、政风室、总务室、劳工安全卫生室，并另有技术组、工作组、材料组与厂内数座工场。大多组织人员现已搬至富冈基地，仅留少数保全人员。
铁路运转.在纵贯线台北＝松山区间地面四线时期，其最南侧一线为华山站管理之站外侧线，并被称为台北机厂侧线；华山站主要站外专用侧线都是由此线分出。在厂区外围设有员工车站（无正式站名，内部称唿台北机厂前），平常工作日有两班通勤电联车供员工上下班搭乘；离开机厂的列车也需在此等候调度；往松山站方向则进入地下段路线，可经由路线出土段至松山站