制站过境转乘穿梭巴士前往港珠澳大桥澳门口岸与港珠澳大桥广东珠海口岸。由九龙巴士营运的76K、276B及N73（后者通宵服务）提供往来位于香港新田的落马洲公共交通转车站与北区及元朗区的专营巴士服务，供乘客于落马洲转乘皇岗口岸—落马洲过境穿梭巴士服务前往深圳皇岗。经文锦渡或沙头角出入境的乘客只能利用过境穿梭巴士出入境。经港珠澳大桥出入境的乘客只能利用过境穿梭巴士出入境。经深圳湾出入境的乘客可乘城巴B3、B3A或B3X以及屿巴B2或B2P来往屯门、天水围及元朗。经港铁东铁线落马洲站出入境的乘客可