沙士疫症期间，天恩邨其中4座楼宇被香港政府用作为医护人员的临时宿舍；2004年由中转房屋改为公屋出租。九广西铁（现称港铁西铁线）及九广轻铁（现称轻铁）的第四期支线于2003年末通车，天水围区内及对外交通都大为改善。2006年位于天水围新市镇东北的香港湿地公园正式开幕，为区内增加一个新的旅游景点。2012年2月1日，屏山天水围体育馆投入服务，为天水围第四座由康乐及文化事务署管理的体育馆。2017年1月9日起，天水围天坛街的天水围医院分阶段投入服务。2018年3月21日起，急症室于每天上午8时至下午8时