年（1876年）9月兼任玉里家的家令。明治12年（1879年）担任内务权大书记官、明治14年（1881年）担任农商务权大书记官。明治16年（1883年）任静冈县县令。明治17年（1884年）任日本铁道社社长。明治25年（1892年）就任沖绳县知事，在杣山问题上同沖绳本土政治家谢花昇发生严重对立，奈良原繁下令县厅镇压谢花的沖绳俱乐部。奈良原繁在任期间实施强硬的改革政策，因此得到了「琉球王」的绰号。他确立沖绳土地整理法，对沖绳县的土地进行整理。同时他也阻挠支持原琉球王族第二尚氏成为世袭沖绳县知事的公同会运动