设立国家教育委员会，清华隶属之；1998年，撤销国家教育委员会，恢复教育部，清华隶属之至今。
主要负责人.清华在不同时期主要负责人有不同名称与职权，在清华学堂时期，主要负责人叫做监督，负责校内一切行政，改制为清华学校时，负责人为校长。到了1917年9月，北洋政府为了加强对清华经费的控制，清华逐步推行董事会领导制度，由外交部选任10人担任董事，负责除了教务以外的事物。然而随着董事的权力逐步的增大，与学校师生之间的矛盾逐渐扩大，使得校长人事不稳定，多次更迭。1929年6月29日，教