始市内也有天主教的组织。从1821年开始波茨坦的天主教徒受柏林的天主教机构管理。第二次世界大战后波茨坦受柏林的主教管理，1994年柏林的主教提升为大主教，波茨坦是这个大主教教省的一部分。现今勃兰登堡州有17.1%的人是德国新教教会；3.1%的人信奉天主教，另外79.8%的人无宗教信仰，与柏林及其他德国地区相比，这里的穆斯林人口十分少。今天波茨坦还有两个犹太教组织，其中一个属于德国犹太人总会（Zentralrat der Juden in Deutschland），它有350名成员，另一个是一个独立的