院成立，赵琛任推事兼院长，任内参与审理了汉奸溥侗、殷汝耕、王荫泰、梅思平、周佛海、林柏生等案。1948年12月，赵琛任司法行政部政务次长。12月29日，赵琛代理司法行政部务。1949年4月，赵琛改任广州大学、岭南大学教授。1949年9月赴台湾，任国立台湾大学、陆军大学、军法学校、政工干校教授。1951年1月，任行政院设计委员会委员兼司法组召集人。1952年，任最高法院检察署检察长。1969年，赵琛逝世。