秦岭细鳞鲑是典型的第四纪冰川陆封残留冷水性鱼类，现为中国国家二级保护野生动物。目前在陕西省和甘肃省都设有保护秦岭细鳞鲑自然保护区。鱼类学者中间对于秦岭细鳞鲑是否为独立的细鳞鲑亚种，观点有一定分歧。近年文献资料表明，秦岭细鳞鲑可被视为细鳞鲑属的一个有效种（而不仅仅为细鳞鲑亚种）；其分布范围不仅限于秦岭：韩国等国外学者将韩国的细鳞鲑种群也归入了秦岭细鳞鲑。此鱼为中国国家重点保护野生动物名录鱼纲15种野生鱼类中，唯一于1949年以后命名的珍稀鱼类；它与樱花钩吻鲑及川陕哲罗鲑类似，是冰川期来自北方、孑遗于东