堡级战列舰陆续入役，四艘萨克森级铁甲舰于1894－1895年的冬季巡航之前被转移到第二分舰队。至此，秋季演习舰队便拥有了两个同质的四舰编组分舰队。这两个分舰队于1895年春季共同巡航驶往奥克尼和设得兰群岛。1895年7月21日，巴伐利亚号参与了大规模的海上阅兵，以庆祝威廉皇帝运河正式通航。1895年的秋季演习由第一和第二分舰队在北海模拟了一场公海战斗，接着又在波罗的海与舰队余部展开联合演练。1895年的演习结束后，巴伐利亚号被带到但泽的旱坞进行现代化改造，成为同级中接受重建的第一艘舰。舰上原有的锻铁加柚