曾经先后被用作过纽扣厂、电扇厂和同仁堂制药厂的仓库。其间教堂三层高的尖顶钟楼也被拆除。1994年，西堂重新开放，恢复了正常的宗教活动。教堂修复工程由前任主任司铎庞文贤神父 (Fr. Peter PANG Wenxian) 策划，本来希望2006年底圣诞节后动工，不过因为图纸有小问题，需要修整，所以顺延至2007年复活节后开工。 这次修葺工程包括：2007年7月，西直门教堂被北京市西城区政府列为区级文物保护单位。2009年7月19日，北京教区为圣母圣衣堂举行了新堂开堂祝圣仪式（奉献礼）。李山主教开