食用蕈有些是野外採集的，有些则是商业种植的。西方最常食用的蕈类是洋菇，用在沙拉、汤品与许多其他料理中。许多在亚洲常被种植、食用的蕈类，例如草菇、平菇与金针菇也渐渐传到西方。许多其他种蕈类可由野外採集来食用或贩卖，包括松乳菇、羊肚菌、鸡油菇、松露、与美味牛肝菌等，有些种类在市场上的价格十分高昂，通常是特殊料理中的食材。生产某些种起司时需要把特定真菌加到凝乳中，以产生特殊的风味或口感，例如斯蒂尔顿芝士与罗克福干酪上的蓝色纹路便是造成的。用于制造起司的真菌都是无毒的，但起司成熟或贮藏时，可能有其他种类的真菌