在2008年，邢立达等人研究巨刺龙的皮肤痕迹，这块皮肤痕迹面积约414平方公分，排列模式为中间为一块五角形鳞片、周围是13到14块六角形鳞片，每块鳞片的直径约5.7到9.2公厘。最近的研究显示巨刺龙是剑龙亚目中最基础的物种。彭光照等人将巨刺龙归类于华阳龙科。