关卡构成.本作是在机械化的波普星上进行冒险，共有6个区域，另加1个最终BOSS战专用区域。除了BOSS关卡外，每个关卡内有数量不等的IC方块，收集到一定数量后即可解除通往BOSS关卡的安全装置。若收集齐区域内的全部IC方块，可开启Ex关卡。Ex关卡的背景音乐多为系列作的重制。另外各区域的首字母串联起来为「PROGRAM」，意思是「程式」。
复制能力.除了系列作的能力外，本作新增了3种能力使用超能力的能力，可以进行超能力电击和瞬间移动等外表是医生的能力，使用绷带、胶囊、实验药