实验小鼠的嵴椎节段组成是C7 T13 L6 S4 C28，有13对肋骨。消化系统方面，实验小鼠的牙齿由一对终身不断生长，需不断进行磨牙的门齿和3对臼齿组成。实验小鼠的消化道与人相似，从口到肛依次为食道、胃、小肠（十二指肠、空肠、回肠）、大肠（盲肠，结肠和直肠），但没有阑尾结构。实验小鼠的胃是单室胃，分为不具备腺体功能和具有腺体功能的两部分，中间由一个界限嵴分隔，胃不具备腺体功能的部分由扁平上皮细胞被覆。实验小鼠的胃容量较小（1-1.5毫升），因此实验小鼠的饥饿耐受能力相对较弱。实验小鼠的肝分为四个叶：肝左叶