自己的家乡设立学堂以及在不同的学堂和书院教书。光绪二十四年（1898年），经宋恕推荐赴上海，在叶翰创办的上海速成教习学堂任教。同年，和陈虬、汪康年、蔡元培等人组织保浙会。光绪二十六年（1900年），应杨文莹的邀请，赴杭州任教于养正书塾（1901年更名杭州府中学堂），其间学生有汤尔和、马叙伦等人。光绪二十八年（1902年）杭州发生学潮、马叙伦等人被开除后，陈黻宸辞职离开杭州，赴上海应赵祖德之聘主编《新世界学报》，写了许多深受瞩目的文章，受到梁启超的赞扬。光绪二十九年（1903年），陈黻宸中进士，受聘赴北京