明朝嘉靖四年（1525年），仁寿宫失火焚毁。嘉靖十五年（1536年）又拆除大善殿，并在原地兴建慈宁宫，嘉靖十七年（1538年）慈宁宫建成。明朝慈宁宫由主宫区以及宫后的两座独立院落，还有外宫墙内的东、西副宫组成。主、副宫区各建有宫墙。慈宁宫初建时，是明世宗为生母蒋太后而建的寝宫。但蒋太后在此居住不久后便离世，此后慈宁宫成为太皇太后、皇太后或先朝嫔妃的住所。隆庆元年（1567年）、万历二年（1574年），慈宁宫均曾修缮。万历十一年（1583年），慈宁宫正殿遭火灾，万历十三年（1585年）重建慈宁宫正殿并于同