大学（Chengchi）的「治」在威妥玛拼音应为chih，而非chi。少数几个在中华民国政府迁台前便已存在的大学则使用邮政式拼音，像是清华大学（Tsing Hua）、东吴大学（Soochow，苏州）。有些大学的名称使用地方方言，像是採用台湾闽南语拼音的淡江大学（Tamkang）、粤语（广州话）拼音的国立中山大学（Sun Yat-sen，孙逸仙）、德明财经科技大学（Takming）。因国民中小学与高中隶属地方政府的管辖范围内，他们遵从各地县市政府所选用的拼音方式，曾选择通用拼音，现逐步换至汉语拼音。