再度建立以后，最初的国旗左上角为红色五角星和锤子与镰刀，上方以无衬线体书有LIETUVOS TSR（共和国的立陶宛语缩写）。第二个版本为三色旗样式，基于苏联国旗，左上角维持红色五角星和锤子与镰刀的图案，但在下方加上白绿二色的横条。三色的比例为8:1:3。绿色象征温暖的大自然，白色代表纯洁。1989年3月20日，立陶宛从苏联独立，恢复使用三色旗。目前，立陶宛苏维埃社会主义共和国国旗在立陶宛境内被禁止公开展示，同时被禁止的还有苏联国旗、红色五角星及锤子与镰刀等标志。