后，他协助自己的兄弟在母亲的家中设立一所给年轻女性就读的学校，这是在他于切尔姆斯福德 设立自己的学校以后的事；当爱默生的兄弟前往哥廷根读神学时，爱默生负责主持这所学校。之后数年，爱默生都过着担任校长的日子，然后进了哈佛大学神学院，并于1829年以一位论派牧师的形象崭露头角。1832年，一次与教会干事关于圣餐服务的管理权争执及关于公众祈祷的疑虑让他辞职了。他的第一任妻子是埃伦·塔克，她在二十岁时因罹患肺结核于1831年2月8日过世。爱默生是查尔斯·爱默生（Charles Wesley Emerson）