但黄在第三战区整顿纪律，颇不容于当时官僚，顾祝同一方面是讨厌他，另一方面是看重他的才华。1944年，调任国民革命军第二十五军军长。
练兵.第二十五军是新组建部队，同时具有奉军、川军与中央军的背景。在皖南事变中，第二十五军是围剿新四军的主力，与共产党仇恨极深，同时，黄作为第三战区参谋长，本身即参与策画皖南事变。黄所接任的第二十五军，面临着国民革命军普遍的贪腐严重，军纪松弛，外强中干，色厉内荏，一触即溃的问题。黄从就任伊始，即大刀阔斧的对第二十五军进行整饬，严肃军纪，加强训练，因为黄能