方派遣军任第19军参谋长，在印尼安汶岛地区守备任务。1944年2月调到中国派遣军任第13军参谋长，驻在华东地区江苏上海，同年6月晋升陆军中将，12月调任第39师团长（隶属于第34军），在湖北作战。1945年7月第39师团调往中国东北地区转隶属关东军编入第30军，1945年8月23日在四平被苏联军队俘获。1950年7月被移交中华人民共和国，关押在抚顺战犯管理所。1956年成立中华人民共和国最高人民法院特别军事法庭，在沈阳公开审判时，佐佐真之助承认“犯下了滔天的罪行”，被判处16年徒刑。1959年因患胃癌病