目包含数学、物理、化学、生物、地球科学、资讯科学六科。由于学科能力竞赛的选手由各学校依分配名额推介，因此在中等教育圈中具有各高中间相互比较的意味。每年竞赛成果均为媒体所关注。学科能力竞赛分为三阶段：校内初赛、各大区复赛、全国决赛。大区复赛测验由教育部国民及学前教育署、台北市政府教育局、新北市政府教育局、台中市政府教育局、高雄市政府教育局办理，内容约为高中三年级至大学一、二年级难度；全国决赛由教育部主办，大约等同各科奥林匹亚竞赛难度。学科能力竞赛从校内初赛到各科目全国决赛结束，前后时距约为三个月 。由于台