加上此前获批的商用机场资格，因此腓特烈港机场被重新归类为民用交通的机场。1998年，德国当局将该机场的所有权售予腓特烈港机场有限公司（）。自1997年起，腓特烈港机场在途经当地的乌尔姆-腓特烈港铁路线中设立了腓特烈港机场站。在1998年的期间，红箭飞行表演队驻扎于博登湖位于瑞士一侧的，三色箭飞行表演队则驻扎于德国一侧的腓特烈港机场。在1999年冬季时刻表和2000年夏季时刻表中，不列颠航空曾开办由腓特烈港机场经停日内瓦（冬季）和慕尼黑（夏季）至多米尼加共和国城市圣斐利-银港的洲际航线，每两周1班，以