经信众发起提议以及各界响应，庙方于该年成立重修委员会并动土重建，历时三年多完工。
祭祀与活动.除前后殿主祀关圣帝君、玉皇上帝之外，亦供奉着关平太子、周仓将军、福德正神、马将军、太岁星君、註生娘娘、中坛元帅、三官大帝、五斗星君、东岳大帝、通天教主、文衡圣帝、仓颉夫子、孚佑帝君等神祇。
遶境.每年元宵节（正月十五日）举行神龙大会，麻豆文衡殿神龙阵会于夜晚遶境出巡，炒热麻豆区的元宵夜气氛，沿途民众香案迎接，鞭炮声、烟火声响彻云霄，各项民俗才艺，如民间流传已久的