已经开始出现大规模集落。古坟时代前期时，新潟市处于大和王权支配之下，是和人势力和北方势力交流的前线。奈良时代之后，随着律令制的整备，新潟市以阿贺野川为界，北侧被划入越后国沼垂郡，南侧划入越后国蒲原郡。信浓川河口的蒲原津在当时已经是越后国重要的交通要冲。平安时代末期之后，新潟市的领主频繁变更。在南北朝时代，新潟市属于南朝势力较强的地区。至16世纪时，「新潟」这一地名已经出现。16世纪后期时，越后国被上杉氏统一，新潟市亦属于上杉氏统治地区。1598年（庆长3年），上杉景胜被丰臣秀吉下令移封会津地方，此后新潟又进