责处理和管辖西藏地区的军政事务。宣慰使司下面则辖有管理民政的万户府、千户所。此后八思巴的继承者也获得了同样的权力。通过西藏帝师与元帝间的檀越和册封关系，西藏成为当时整个蒙古帝国（即大元帝国再加上四大汗国）的一部分。但是八思巴及其继承者的这种权利受到元中央朝廷、宣政院的管辖。除了万户府，元朝也有亲王出镇吐蕃（如奥鲁赤）。对于西藏历史而言，西藏结束自877年开始的分裂局面、再次出现统一的政权始于1264年的总制院。
历史.1271年，忽必烈建国号为大元，建号元朝，而忽必烈即为元世祖