抗原（当病原体很少时）限制了免疫反应，自体免疫让免疫系统可以快速反应。斯坦芳诺娃等人在 2002 年的研究中，为只表现一种（MHC class II）分子（H-2）的老鼠注射一种能与 MHC class II 结合的 anti-MHC class II抗体，并暂时阻止 CD4+ T细胞（辅助型T细胞）与 MHC 间的交互作用。在 anti-MHC 注射后 36 小时取出老鼠的 CD4+ T 细胞（之前未接触任何抗原），发现这些 T 细胞对鸽子细胞色素c 胜肽抗原的反应性减弱。反应性包括 的磷酸化、T细胞的