大的日本蛇类之一，但如果包括日本西南群岛范围的蛇类在内的话，其体型则尚次于黑眉锦蛇（Elaphe taeniura）、王锦蛇（Elaphe carinata）及日本原矛头蝮（"Protobothrops flavoviridis"）。日本锦蛇身体以棕色、青色及橄榄色为主。背鳞为数约有23至25排鳞片，腹鳞则有221至245片，身体两侧的鳞片非常粗糙，有强力的抓缘力，能让日本锦蛇轻易攀上垂直的大树。与一般锦蛇相比，日本锦蛇的头部较呈四角形，当牠们感到受威胁时，会从口中释出一股臭味，以助逃逸。日本锦蛇的幼蛇