前已有先住民生活。宋代时，「澎湖」一名正式见于史书及地方志，最早有汉人居住澎湖记载始自南宋，在南宋理宗宝庆元年（西元1225年）宗室赵汝适着「诸蕃志」中记述澎湖「泉有海岛曰彭湖，隶晋江县」。西元1281年，元代在澎湖设置巡检司，延续至明代。郑成功攻台之役中，郑成功军队以澎湖群岛为基地击败了荷兰人。至清代（西元1727年）设立澎湖厅，隶属福建省。清末因1895年4月甲午战争战败后，连同台湾和辽东半岛割让予日本，惟澎湖早已于同年3月的澎湖之役中落入日军之手。1920年，日本政府改澎湖郡併入高雄州，后复改