些基因在每个内含子的尾端有着AC和TG碱基对的重复序列。在3'剪接位置(3' splicing site，简称3'ss)上，腺嘌呤（A）和胞嘧啶（C）交替重复 ；在5'剪接位置(5' splicing site，简称5'ss)上，互补的胸腺嘧啶（T）和鸟嘌呤（G）同样交替重复。研究人员发现，斑马鱼对U2AF2蛋白的依赖比人类更小，而这一蛋白对RNA剪接的发生是必需的。这种在内含子周围重复碱基对以改变RNA的模式在真骨类中曾发现过，但在四足类中未曾发现过。这表明四足类中的某一进化可能导致了人类与斑马鱼在对U2