药能降低罹患子宫内膜异位症的机率，大量的运动以及避免饮用大量酒精饮料也同样有预防效果。目前没有针对此症而开发的特效药，但有多项医疗方法可改善症状 。上述提到的方法包括有使用止痛药、贺尔蒙药物或透过手术来达到帮助病人的目的。推荐患者服用的止痛药通常为例如萘普生类的非类固醇类抗发炎药。连续使用避孕药中的活性成分或装设子宫内避孕器都视为对抗子宫内膜异位症的有效方法。能多少协助因罹患此疾病而不孕的妇女怀孕。对于症状无法借由药物来控制的病患，只能考虑进行手术了。2015年，全球估计有1080万人罹患子宫内膜异位症。