柔佛苏丹在这段时期被称为「柔佛和彭亨之王」。1639年柔佛与荷兰人订立协约，共同反对葡萄牙人。1641年，柔佛与荷兰联手击败葡属马六甲后，获得荷兰承认在马来半岛上的宗主权，在统治下，柔佛国势达到建立以来，最强盛的时期。1673年，苏门答腊岛上一个小国占碑出兵攻打柔佛，导致柔佛苏丹国的政权名存实亡，并走向中落。占碑原是苏门答腊岛东部一个胡椒港口，素来是柔佛的咐属国之一。柔佛苏丹原计划为其王子和占卑公主联姻，但后来因为柔佛内部权力斗争，而取消和占碑的亲事。不忍受此耻辱的占碑在1673年发动攻打柔佛的占碑战争