12月2日，约翰四世开始以国家主权代表的身份，致函埃武拉市政厅宣佈政令。葡萄牙作为一个国家的地位，也从此恢复。葡萄牙随后与西班牙进行历时达28年的光复战争（葡文：）。双方在1668年缔结《里斯本条约》，其中西班牙把葡萄牙原来拥有的领土和海外属地，除了休达（）外，全部归还给葡萄牙。
“恢复独立”与澳门.在葡萄牙与西班牙合併的时期内，双方其实早已协议：葡萄牙海外属地的管理依旧，葡萄牙国旗继续悬挂，原有的贸易也如常进行。而在澳门的葡萄牙人也按照规定，向西班牙国王宣誓效忠，但其自我管理