不手软，对反对党和异议者也一向出手狠辣。李光耀采取了相当不民主的手段对付政治反对者，包括新加坡建国后早期的共产党人和后来的政治异议人士。为争取华人支持，李光耀最初与马来亚共产党合作，人民行动党的创始成员中就有当时的马共人士，包括深孚众望的左翼政治活动家林清祥。李光耀也曾担任左翼工会的法律顾问。但李光耀后来和林清祥等人反目成仇。李光耀利用《》（新加坡的《内部安全法令》授予政府在必要时“不经审判”即得以“无限期拘禁”危害国家安全的人士），采取不经正当程序和公开审判的方式，将数百共产党人抓捕入拘留营。林清祥被逮捕