发生了对立，最终和平派势力抬头，后龟山天皇登基。后龟山天皇在位9年期间，南朝政权的势力开始衰弱。政令所能到达的地方仅限于大和、河内、和泉、纪伊等行宫周围的几个国，以及九州岛的征西府和四国岛河野氏所控制的地区。其实力与蒸蒸日上的室町幕府不可同日而语。宗良亲王和怀良亲王相继去世后，南朝朝廷失去了威势，南北朝和平统一成为了必然发生的事情。1392年（南朝元中9年、北朝明德3年），室町幕府的和泉纪伊守护大内义弘，开始与南朝方面的吉田宗房和阿野实为交涉两朝统一之事。10月，室町幕府将军足利义满通过神官吉田兼熙