台北出战俄罗斯拉缅斯科耶世界大学生羽毛球锦标赛，帮助球队赢得了团体赛的冠军。同年10月，她与林家佑出战中华台北羽球大师赛，在混双准决赛以0比3（5-11、5-11、5-11）不敌日本强档的垰畑亮太/米元小春。2017年1月，吴玓蓉与许雅晴出战马来西亚羽毛球大师赛，在女双准决赛以1比2（24-22、19-21、11-21）不敌赛会头号种子、泰国的宗功攀·吉迪特拉恭/拉温达·巴宗哉。随后8月，她代表中华台北出战中华民国台北市混合团体，赢得了团体赛和女子双打冠军，亦是本届世大运的双冠王。