时间赛和0–0，最终需要互射12码定胜负，结果香港飞马以总比数4–3晋级。2017年2月20日，在季内任何赛事都不能倒戈的陈肇麒于香港飞马作客南华的联赛正选上阵，并交出一个助攻协助香港飞马以2–0胜出，不过赛后香港飞马被指违返双方转会协议，而球队总领队奇云邦特坦言自己知道两间球会有合约条款，但不知是否白纸黑字，亦否认藐视合约或不尊重对方，只是做了作为领队应做的事，就是派出最好的球员出赛。2017年3月19日，陈肇麒于香港飞马以3–1击败R&F富力的联赛取得加盟后的首个入球。由于球队外援迪亚高因踢法不适合球队