民众时，抵抗却反增。「解放军」更加活跃，巴军中越来越多孟加拉族士兵变节改投地下「孟加拉军」。这些士兵逐渐併入解放军。巴国空运两个步兵师增援并重整兵力。1971年4月17日，孟加拉国临时政府在孟加拉西部的梅黑尔布尔县成立，以身处巴基斯坦囚禁下的谢赫·穆吉布·拉赫曼为总统。佔领军与孟加拉解放军之间的战斗日趋激烈，估计约1000万孟加拉人逃难到印度的阿萨姆邦及西孟加拉邦。
6月至9月.7月，孟加拉划分为11个区，每区有一位司令官，从变节自巴军而改投解放军的军官中挑选，进行游击战及训练