，内容函盖台湾境内及境外之物种。依《文化资产保存法》公告之自然纪念物，则包括珍贵稀有植物。依据农委会公布的台湾保育类野生动物物种，计有濒临绝种保育类41种、珍贵稀有保育类123种以及其他应予保育类48种。珍贵稀有植物则有5种。以下依种类分列，台湾特有（亚）种于中文名后以星号标示（特有种：*，特有亚种：**）。
台湾境内.
哺乳类.总计有濒临绝种保育类13种、珍贵稀有保育类26种、其他应予保育类5种。其中陆域哺乳类濒临绝种5种、珍贵稀有7种、其他5种；海域哺