然而如同所有的含抗生素药物，如果滥用含抗生素眼药水，将破坏眼睛的菌种生态。
类固醇眼药水.含有类固醇成份的眼药水有极强的消炎效果，但有升高眼压的副作用，若长期使用可能对视神经造成永久损害，导致青光眼；甚至造成全身性的疾病，例如高血压、糖尿病、骨质疏松。
人工泪液.人工泪液是模仿泪液成份作出的滋润用眼药水，用于舒缓眼睛酸涩与疲劳的不适感。隐形眼镜的配戴者也常使用人工泪液保持眼睛表面的溼润，但配戴隐形眼镜者，须选择没有含防腐剂的人工泪液。且人工泪液会因外来泪