为避免检举及官方取缔，清代台湾斋教传布皆由教友私下宣教，形式低调不彰。
日治时期.初期（1895年至1914年）日治初期，台湾总督府对传统宗教先採取宽松的态度，是故斋教组织、传教方式仍延续清朝旧惯，维持隐密的性质。不过因应日本佛教积极传入，台湾斋教人士对此有所反思，自行提出「宗教改革」，其中代表人物为先天道的黄玉阶。黄氏在1908年－1910年（明治41年至43年）间拟定「本岛人宗教会规则草案」，草案中彰显联合斋教及其他民间宗教的企图，影响甚广。1912年（大正元年），以台南为