下方，施工单位进行过帷幕灌浆，但设计图资并无法明确显示是否为坝体全面灌浆，抑或是仅局部施作帷幕灌浆，且图资显示灌浆孔仅凿深10公尺，未能贯穿上层玄武岩达到水密性较佳的沉积岩层，加上柱状玄武岩发达的节理特性，可能导致灌浆失效的状况。2000年8月强烈台风碧利斯过境台湾，也为澎湖地区降下丰沛雨量，小池水库因而达到满水位开始自由溢流，中央地质调查所人员利用此次机会进行坝体渗漏观察，发现大坝下游临海侧多处漏水，甚至大到已可听见水流声，与大坝接穰的海滩在退潮时也可见清晰的渗漏水蚀刻痕迹，预估每日漏水量达到800立