于MALDI质谱分析的基质都是有机化合物。
应用.
生物化学.在蛋白质组学中，MALDI用于快速鉴定通过凝胶电泳分离的蛋白质：SDS-PAGE，，亲和层析，强/弱离子交换，同位素编码蛋白标记（ICPL）和双向电泳。 是MALDI-TOF质谱仪最流行的分析应用。 MALDI TOF / TOF质谱仪用于揭示肽的氨基酸序列，使用源后衰变或高能（进一步使用参见质谱法）。
有机化学.一些合成大分子，例如索烃和轮烷，树状物和超支化聚合物，以及其