-2004赛季中取得第五名，在2007-2008赛季中，球队在联赛中排名第2，但是由于队内球员官秀昌的外籍身份导致球队违反CBA引进外援规定被罚出季后赛。近年来一直是CBA联赛中的豪强，但连续三次在总决赛中败给广东队，2011-12赛季中国男篮主教练鲍勃·邓华德担任球队主教练，但球队战绩一般，邓华德中途下课，新疆再次在季后赛半决赛中败给广东。2016年10月在湖南举行的亚洲冠军球会篮球盃赛，凭出色表现，拿了第25届总冠军。2017年4月，新疆喀什古城队最终以4:0战胜广东东莞银行队夺得2016-17