白两色是耶稣十二宗徒之长圣伯多禄的两把钥匙的颜色，代表了两种最珍贵的金属：金与银。教宗的牧徽则是至高无上地位的象征。旗上的金黄和银白色是自1808年2月以来宗座瑞士近卫队帽徽的颜色。教宗良十二世于1825年订定这面旗帜。1929年2月11日，义大利与教宗庇护十一世签订《拉特朗条约》。教宗正式承认教宗国的灭亡，另建梵蒂冈城国。梵蒂冈国旗是以早期的教宗国国旗为蓝本。
国旗格式.国旗以两条竖条组成，旗桿侧是金色或黄色，另一侧是白色，白色中央有呈交叉状的圣彼得的与三重冕。交叉的钥匙是由