推进一系列“去中国化”、“去蒋化”等台湾本土化运动。2001年，马祖、金门和马尾、厦门之间实现了通商、通航和通邮。2001年5月，陈水扁出访瓜地马拉时抛出了关于两岸关系的“新五不政策”。2002年8月2日，陈水扁在“世界台湾同乡会”上透过视讯会议提出“一边一国”，指台湾、中国不属同一国家。2004年2月22日陈水扁称，大陆以496颗导弹对准台湾，每6天还增加一颗。因此，台湾举办228百万人手牵手护台湾活动，反对中国大陆部署针对台湾的飞弹设施。2005年3月，陈水扁总统对欧洲议会议员及新闻媒体表示，做不到