萨迦寺有密切关系。当年该寺建筑规模庞大，还曾供奉与哲蚌寺密院大威德像同样大小的本尊像。第七世和第八世德木活佛同样担任过摄政职务，丹杰林扎仓和拉章也由此而空前繁荣。但第八世德木活佛据称预谋暗害十三世达赖，第九世德木活佛的管家降久（降曲占堆）联合川军对战噶厦。丹杰林寺在复杂而尖锐的政治斗争中遭到两次大规模洗劫。西藏民主改革前，该寺已经名存实亡，残存的三层高的“丹吉林角”，也在失势时被瓜分，底层被分给哲蚌寺洛色林“工布康村扎仓”（德木活佛在哲蚌寺的驻锡地），二层及三层被分给桑耶寺经管至今。在文化大革命期间