李登辉助选，从此于政治上崭露头角。2002年接任智库台湾综合研究院副院长，并为民主进步党籍台北市长候选人李应元站台。2005年代表台湾团结联盟参选国大代表，排名第一顺位当选，并为国大11人「主席团」成员；这是李安妮第一次参选公职并当选。2008年立法委员选举时，台联提名李安妮为该党不分区立法委员第15名，台联于该次选举之政党票未达到5%得票率门槛，无分配不分区立委资格。李安妮长期关注台湾妇女运动与妇女政策，在许多妇运刊物经常可看到李安妮的研究报告，李安妮的研究专长包括：妇女与两性研究、性别与社会