而孤住一掷，发动太平洋战争，国力消耗甚鉅，人力物力罗掘俱穷，需要台湾及台湾原住民的协助。然而要台湾同心协力，实非台人完全日本人化不可。因此，除了取消原来允许的社会运动外，乃由同化政策更进一步，积极从精神上企图消灭台湾原住民的民族意识，生活上脱离汉民族或南岛民族样式与色彩，全力进行所谓皇民化运动，大倡台人全面日本化，并全面动员台人参加其战时工作，一直持续到1945年二次大战结束、台湾转交国民党政权管治为止。本时期可以称为皇民化时期，是「内地化」的极端形式。皇民化运动系分成二阶段进行。第一阶段是1936年底