赴上海出任沪军都督府警察局长，任职数月。后往返任职于上海宁波，历任军队要职，包括沪军驻甬征兵总务处长，沪军第五团军需处长，中华民国正陆军九十二师正军法处长。1912年，调任回浙江，出任浙江省高等审判厅书记官长。1914年，孙中山讨伐袁世凯失败，是为二次革命。孙中山的忠实追随者周骏彦在国内亦岌岌可危，遂再次赴日本，流亡。在日流亡期间，周骏彦专注学术，研习法律，入东京政法大学，并于1916年7月毕业获得学位。1916年5月8日，孙中山护国军军务院于广东肇庆成立。1916年7月，周骏彦于日本归国，在广东的