三届行政长官选举，结果曾荫权以649票成功连任。2012年，曾经出任行政会议召集人的梁振英在第四届行政长官选举中，以689票击败对手唐英年和何俊仁，当选行政长官。2017年，曾经出任政务司司长的林郑月娥在第五届行政长官选举中，以777票击败对手曾俊华和胡国兴，当选行政长官。行政长官董建华于2002年7月1日实施主要官员问责制，除行政长官及行政会议外，香港政府由三层架构组成：第一层是司长，即政务司司长、财政司司长和律政司司长，均是行政长官的首席顾问，负责制订香港政府最主要的政策；第二层是决策局，负责制订、