依然坚定时再辞职；然而，指原在移籍后无论是自身的成就，还是整个HKT48的表现都大幅长进，因此请辞的想法也随之消散。虽然遭遇热恋报导的骚动，由指原自己策画的偶像音乐活动《指原莉乃制作「第一届小指祭～偶像临时总会～」》仍如期在2012年6月25日于日本武道馆举行。7月5日，在HKT48剧场公演《Team H 1st Stage「手牵手」》作加入HKT48后的第一次演出，并在同日宣佈所属分队为Team H。7月23日，最后一次在AKB48剧场举行与原所属分队AKB48 Team A及HKT48 Team