麦芽酮糖醇对血糖的影响小，所以成为糖尿病患者替代饮食中糖分的诸多选择之一；由于难以被口腔中的细菌分解，导致蛀牙的风险也低。不过其甜度和供应热量的比例接近蔗糖，对欲以其代替砂糖减少热量摄取者效果不大。异麦芽酮糖醇属于糖醇，不容易被人体消化吸收，此特性如同膳食纤维，可以刺激肠蠕动，但是过量使用可能令人腹痛、胃肠气胀和腹泻。此甜味剂通常和其他更强者混合使用，达到蔗糖一般的效果。异麦芽酮糖醇被美国食品药品监督管理局归为「一般认为安全（GRAS）」；认为其在一般不会有健康危害，所以没有标示一日可接受摄取量。