榜的诸多优势在推出后仅数年后便消耗殆尽。1986年中，容量超越软碟的卡带研发成功，并于该年7月发售的游戏《大盗五佑卫门》中首次应用；在内建电池备份技术出现后，即时存档机能也不再专属于软碟；同时，卡带的制造成本也逐渐下降。1989年后，家用游戏机迈入16位元时代；FC磁碟机面对超级任天堂及Mega Drive等画面表现更丰富、游戏阵容更坚强的次世代游戏机无力竞争，遂逐渐淡出市场。1992年12月，最后一款官方授权游戏《DISK城》发售；1993年，零售商通路软碟改写服务中止；2003年9月，任天堂官方软碟