山阮氏平定南方后，将矛头指向北方的郑氏的统治者，1782年，郑氏统治者郑森逝世后，两名儿子郑棕与郑檊争权，结果郑棕取胜，并杀害支持郑檊的大臣。其中一个支持郑檊的郑氏重臣阮有整南投西山朝，令阮氏兄弟动悉郑氏的虚实，1786年，西山大军北伐直捣昇龙，郑氏领袖郑棕兵败被俘，后来自杀。西山阮氏一统分裂多年的越南，后来阮惠更废掉黎朝皇帝，自立为帝。郑阮纷争也在西山朝建立后结束。