皇子司马晏为吴王，以丹杨、吴兴、吴三郡为国。晋成帝咸和元年（326年），封司马岳为吴王。咸和二年（327年），徙封琅邪王司马昱为会稽王，吴王司马岳为琅邪王，吴国成为琅邪国的支郡。咸和九年（334年），析桐庐县复置新城县。晋孝武帝时，改富春县为富阳县。桓玄永始元年（403年），降琅邪王司马德文为石阳县开国公，改吴国为吴郡。元兴三年（404年），晋室匡复，改吴郡为吴国。义熙十四年（418年），琅邪王司马德文即皇帝位，国除，改吴国为吴郡。宋孝武帝大明七年（463年），改隶南徐州。次年复归扬州。南梁太清三年