合、中国芒、、鸟足弁麻（トリアショウマ）、紫斑风铃草（萤袋）、日本蓝盆花、柳兰等花草。其中，「木曾扁柏」与「秋田杉」、「津轻桧」合称『日本三大美林』。现在，林野厅已在此地规划「御岳蕨叶草」与「胡桃岛偃松等」两座植物群落保护林。1910年，植物学者小泉源一在此山发现附子属的御岳附子（"Aconitum metajaponicum" Nakai）。现在是环境省的极危物种。
生药「百草丸」.江户时代本草学研究兴盛，此地是尾张藩採集药草的地点。1716年至1735年（享保年间），本草