工程期间称为「西港岛线」）启用时，将会由上下两个侧式月台构成，港岛线的路轨会先置在车站月台的北面（月台设计已经计算南港岛线（西段）的转车流量）；当南港岛线（西段）兴建时，才把南港岛线（西段）的路轨加建在月台的南面，成为两层的岛式月台设计，使车站成为诸如北角站的顺方向跨月台转车站。然而，由于南港岛线西段的兴建时间尚未明朗，因此地铁公司在2006年8月发表的修订建议方案中，放弃上述跨月台转车的设计，以求使兴建西港岛线的成本略为下降。
出入口.香港大学站设有6个出入口，而当中A出入口和C