94年，将法亚贸易促进会、旅游签证组、法国在台协会三机构合署办公，统称为法国在台协会。
事件.1997年10月16日，位于台湾基隆市的法国公墓，由于市民的需求并在中华民国外交部的协调下，实质管辖的法国在台协会同意开放，且交由基隆市政府管理。后开辟为清法战争纪念园区。2020年1月13日，中华民国总统与立委选举结束后，法国在台协会于Facebook发表声明「诚挚热烈地祝贺蔡英文博士连任总统，以及所有台湾人顺利圆满地完成民主选举，法国在台协会有坚定的意志与所有当选人合作加强台法关系