与美国航空之间有联程机票的协议，因此国泰航空可以出售香港经纽约至圣胡安的转机机票，当中包括了代售美国航空的纽约-圣胡安机票，以及国泰航空本身的香港-纽约机票。联程机票不同于代码共享协议，代售机票的航空公司不会在代售航班上挂上自己的编号。也就是说，在美国航空的纽约-圣胡安一程的航班当中，并不会挂上国泰航空的编号。与此同时，部分航空公司能够提供行李直挂及发行联程登机证的安排，让乘客在转机机场中，不需重新办理领取行李及领取登机证的手续，便能直接转机，以缩短转机时间。否则的话，旅客便须在转机机场重办所有手续