台铁纵贯线是台湾西部南北铁路干线，大致以东北—西南走向经过九芎林地区中部略偏西北地带。境内未设站，东北侧最近的是林内车站，属三等站，停靠少部分莒光号、区间快车，及全部区间车；西南侧最近的是石榴车站，属招唿站，仅停靠区间车。由此等可前往台铁沿线各站。国道3号又称「福尔摩沙高速公路」，是贯穿台湾西部的两条纵向高速公路之一，大致以东北—西南走向绕大弯转西北微北—东南微南走向经过本地区北部、中部偏西及南部。境内与省道台3线交会处设有斗六交流道。由此可快速前往台湾南北各地。省道台3线（大同路、石榴路）俗称「内