杨士元（），字仁甫，直隶苏州府太仓州人，民籍，明朝政治人物。
生平.应天府乡试第七十九名举人。隆庆五年（1571年）中式辛未科二甲第四十九名进士。
家族.曾祖杨锦；祖父杨祥；父杨灼，监生。母顾氏。