站之间有在来线直通列车运行。连接函馆山的山麓和山顶，是前往函馆山山顶的主要交通手段之一。函馆市内的巴士在2003年之前由函馆市交通局运营，现在则由运营。函馆市内有一条高速公路。函馆江差自动车道全长约70公里，现在已开通18公里。函馆市辖区内还有函馆新外环状道路和函馆新道两条高规格道路。自函馆出发，有前往札幌等地的高速巴士运行。函馆机场开业于1961年，是北海道第二个机场。在经过三次延长工程之后，现在函馆机场跑道全长达3000米。现在函馆机场运行有前往羽田、成田、 伊丹、中部、新千岁、奥尻、丘珠机场的国内