内部有地方主义趋势、以及省委各部均不健全五个原因，庄文恭向中央政治局请求辞职。1928年5月，辞去候补中央委员，同中共地下党组织失去联系（一说牺牲）。1928年，在上海立信会计师事务所工作。1936年9月，到国民政府中央信托局任职。1949年，解放军攻占上海，在上海市人民政府直接税局、华东军政委员会财政部任副处长。1951年12月，调任北京，出任中央人民政府政务院财政部税务总局会计处处长。1958年，改任商业部财会局会计处处长。1965年11月14日，在北京逝世。