身份被召回长安，任中书侍郎，授同中书门下平章事，为实质宰相，又兼任集贤殿崇文馆大学士，兼修国史。他素日了解吏部侍郎裴遵庆，上奏时多次称赞他，使裴遵庆得迁黄门侍郎、同中书门下平章事。次年（761年）正月，吐蕃遣使来朝请和，宰相郭子仪、萧华、裴遵庆等奉诏在中书省设宴，以为结盟。司农卿严庄诬陷户部侍郎兼御史中丞、度支铸钱盐铁等使兼京兆尹刘晏，萧华也忌恨刘晏，于是于十月贬刘晏为通州刺史。先前八月，当权宦官李辅国想当宰相，肃宗畏惧他，仅仅以缺乏官员支持为由驳回，李辅国便想说服宰相右仆射裴冕推荐自己。肃宗秘密对萧华说，