投票时，在第一次投票失败后，当民进党国代反映投票无效后，苏南成不待国民党回应，即迳自宣布重新投票，并包裹表决三院院长报告及国代自审预算案，依表决结果通过二读。9月4日，通过三读。此案一过，包括时任总统兼国民党主席李登辉及副总统连战、民进党总统参选人陈水扁都反对通过国代延任案。1999年9月7日，国民党召开考纪会，处分苏南成。同日苏南成向党主席李登辉请辞国大议长以示负责。晚上8点，国民党召开考纪会，正式开除其党籍，并丧失不分区国大代表资格。9月8日上午，苏南成向国民大会请辞国大议长。2001年5月10