的维吾尔人发动起义对抗第36师，回族军队镇压了维吾尔族叛乱分子，处决了100人，并把维吾尔族起义首领的家人当作人质。且末县的骆驼曾被第36师征用。
抗日战争.1937年夏天，第36师改组为步兵师，接受德国教官训练，并投入到淞沪会战和南京保卫战中。1942年，李志鹏率领第36师作为中国远征军的一部分被派往缅甸，以保护滇缅公路并营救英军。它在中国从缅甸撤退中发挥了关键作用，并成功阻止了日本第56师团在1942年的萨尔温江战役中的推进。