得厦门战役胜利，声威复振。
清军动态.1661年2月5日，清顺治帝崩，皇三子玄烨继位。郑氏降将黄梧向清廷建议“平贼五策”，内容包括长达20年的迁界令，自山东至广东沿海廿里，断绝郑成功的经贸财源；毁沿海船只，寸板不许下水；同时斩成功之父郑芝龙于宁古塔（今黑龙江省牡丹江市）流徙处，（一说斩于北京菜市口，即今府学胡同西口，元代以来的刑场）；挖郑氏祖坟；移驻投诚官兵，分垦荒地。
退守厦门与金门.1661年5月25日，因南京之役大败，郑成功只好退守厦门与金门。