水母（Mastigias papua）、共生曲海绵（Sigmadocia symbiotica）、黑角珊瑚、阿拉伯宝螺、管虫（Protula magnifica）、细纹爱洁蟹、杂色角孔海胆（Salmacis sphaeroides）及方柱翼手参等海洋无嵴椎动物。 红树主要生长于海下湾主河口，是海下湾海岸公园最大的群落，约佔0.53公顷，此外，沿公园岸边亦有较细小的红树群落。香港现有记录的8种真红树中，有6种可以在这里找到，包括秋茄（水笔仔）、桐花树、海漆、海榄雌（白骨壤）、木榄及榄李。