如特定的基底层物质的缺失会引发表皮溶解水疱症。而在肾小球细胞中，基底层还可以提供过泸网的作用，防止血液中的大分子流入到尿液中。除此之外，基底层还可以作爲信号转导的过程影响细胞在生存、增殖、移动中的过程。
连接作用.基底层同通过整合素作爲锚点（一种具有连接和信号转导作用的跨膜蛋白）与上皮细胞连接。首先膜上整合素先与基底层进行结合，之后可以调节GTPase的活性影响细胞内肌动蛋白的组织。通过募集胞质蛋白形成F-Actin，保障细胞和基底层的稳定连接。
肾小球中的