国基督教协进会干事和中华基督教教育协会干事。1941年任中华全国基督教协进会副总干事，次年又升任总干事。1948年被卫理公会按立为牧师。吴高梓亦曾担任中华基督教会旅沪闽人堂的义务牧师。旅沪闽人堂是旅沪福州籍基督徒自设的闽语礼拜堂，借南苏州路107号新天安堂礼拜。1950年，吴高梓成为《三自宣言》的40名发起人之一。1950年12月20日，在上海基督教抗美援朝爱国行动大会上，根据吴高梓的提议，成立了“上海基督教团体抗美援朝委员会” 。从1950年起，吴高梓开始担任中华全国基督教协进会会长和中华基督教卫