台湾府台湾县澎湖巡检始设置于康熙二十三年（1684年），雍正五年（1727年）时因设立澎湖通判一职而裁撤。该官职隶属台厦道台湾府，为台湾清治时期的地方官员，主管澎湖地区，历十二任。
历任.以下所列者为历任澎湖巡检：