得不北返与新四军第5师、王树声的河南军区部队会合。1945年，王首道当选中共第七届中央候补委员。
第二次国共内战时期.1945年10月，王首道任中共中央中原局常委、中原军区副政治委员兼政治部主任。1946年4月，王首道调任军事调处执行部沈阳二十七执行小组中共代表。1946年8月，王首道任东北行政委员会财经委员会主任，后任经济委员会主任，后又担任中共中央东北局委员、东北局财经办事处主任、东北局财经委员会委员。参与组建财政和生产管理机构，逐步统一财政，建立财经制度，整顿财经纪律。同时，