冯康另一兴趣为二胡，2001年创立医管局中乐团，主要为病人及慈善活动演出。该乐团荣获2010年艺术发展奖「艺术推广奖银奖」。2013年，56岁冯康与医管局约满后不再续约，决定退下火线，离开工作30多年的公营医疗体系，转职中文大学公共衞生学院教授医院行政管理；届时将由时任九龙中医院联网总监、伊利沙伯医院及复康专科及资源中心行政总监熊志添医生接任。
争议.
尸体错调事件.2007年4月11日，威尔斯亲王医院殓房被发现在3月29日将2名已死去病人的尸体错误调换。