大航空决定将其多伦多航点定于马尔顿机场。马尔顿机场亦取代多伦多岛机场成为多伦多市的主要机场，并逐步发展成现时的多伦多皮尔逊国际机场。第二次世界大战期间，多伦多岛机场从1940年至1943年借用予挪威流亡政府作皇家挪威空军的训练基地；挪威空军亦于对岸巴佛士街尽头一带设立军营。此外，加拿大皇家空军亦于二战期间在多伦多岛机场训练机师和调度机队。战后多伦多岛机场恢复民航用途。
1950-80年代.到了1952年末，多伦多岛机场累积下来的营运开支连同项目借贷的利息金额合计达75万2千元（