留在广州，改去爪哇的雅加达。1841年文惠廉（William Jones Boone）到澳门，1842年迁到厦门，不久被任命为中国主教，1845年7月17日，到达上海，在那里建立总部，并建立了学校和医院。施约瑟博士曾经翻译圣经，担任主教时，创办了上海圣约翰大学。美国圣公会主要在中国中部长江流域传教，后来在汉口和安庆另外成立了两个教区，在汉口对面的武昌开办了文华大学。1890年，美国圣公会在中国建立了43个教堂，大约500名领圣餐的信徒。1912年，美国圣公会在中国建立的教会加入中华圣公会。