黄直登进士后，立即上疏陈述“隆圣治、保圣躬、敦圣孝、明圣鉴、勤圣学、务圣道”六事，后授漳州府推官。当时漳州尚鬼神之说，其任内毁坏境内各种邪教。监察御史诋毁其，送吏部降至。其在路途即上疏请嘉靖帝早日确定储君，招致嘉靖帝大怒逮捕。后释放，贬为沔阳判官，曾署崇阳县知县，有惠政父丧丁忧，除服后，恰逢杨名、黄宗明下狱，其上疏论救，嘉靖帝大怒，命逮捕下诏狱拷问，后，编戍雷州衞。虽之后释放，久之去世。隆庆初年，赠光禄寺少卿。