用尽的状况下，织田军在石部城邻近更有11座付城封锁对外道路，六角义贤、义治父子见大势不妙在4月13日决定趁雨夜退出石部城，以家臣石部下野守父子为殿军冲出城门，趁乱逃出织田军的包围。在六角父子逃亡后，石部城遭到佐久间父子佔领，，六角父子战后流亡至甲斐依附武田胜赖，家臣山中长俊则投降织田家，成为柴田胜家的家臣，拥有3千石领地。