由时报》撰文，认为由于过去台湾亲日反中的气氛，日本给予台湾许多实质利益，例如大量的日本观光客、双方的商业合作、日本给予台商的技术转移等，此次事件会让日本民间对台日友好有所疑虑，减少台湾获得这些实际利益的机会；最糟糕的情况是造成台美日无法成为军事同盟。而林浊水则撰文表示马英九对美日的作为失去美日的信任，可是马英九对中国的软弱态度无法争取经济利益，是外交的全面失败。