由于没有空气质素的固定标准，导致后湾站的一氧化碳、甲醛、悬浮粒子和氧化物水平均高。在2010年前，麻萨诸塞湾交通局就此事曾作出调整班次、检查列车引擎等行动，但曾表明因财政理由，不会升级车站的通风系统。2010年，马萨诸塞湾交通局决定根据2009年美国复苏与再投资法案拨出300万美元改善大堂的通风设备，并预计2012年完成。虽然马萨诸塞湾交通局强调后湾站的空气质素不存在健康威胁，但据波士顿非牟利研究组织「清新空气工作组」的一名科学家表示，「月台存在着我检测各地空气质素以来最差的空气质素，乘客和在后湾站工作