仁3年，任权大纳言。治安元年（1021）又进内大臣。后一条天皇在位期间，以赖通同母妹藤原威子为中宫。因威子擅妒，故在整个后一条天皇朝，育有三个女儿的教通不得送女入宫。万寿4年（1028年）年底，教通之父藤原道长薨。一族的氏长者之位由教通之兄赖通继承。长元9年（1036年）后一条天皇无男嗣而驾崩，由东宫皇太弟敦良亲王继位为后朱雀天皇。后朱雀天皇继位前，已与教通同母妹嬉子生有一子亲仁亲王，而嬉子在产后因产褥热薨。长元10年（1037年）亲仁亲王被立为皇太子，教通为东宫傅。后朱雀天皇又续娶教通姐妍子所生的祯子