正式使用，取代因地震及被海水所浸坏的第一代木站舍，两代站舍均设于站务员室及候车室，并设有自动售票机及对应Suica咭的感应器。车站现时由矢本站所管理，并由JR东日本子公司「」的职员负责站务事宜。而当第2代站舍启用前，则以临时撘建的站舍替代。设有岛式月台1座，可提供1面2线的配置，有效长度为4辆。其中2号月台为主线、1号月台为避线。现时约半数的上、下行快速列车均在本站进行交换。
其他.现时JR东日本于磐越东线同样设有赤井站，开业时间比本站为早，但早于营运的时代，本站已採用