。双方冲突升级，刚果政府于9月6日对全国保卫人民大会展开大规模战争。2008年，在苏丹尼·马肯加的指挥下，全国保卫人民大会在北基伍省的Kiwandja镇屠杀67名平民，联合国人权委员会发言人纳维·皮莱指控马肯加犯有战争罪。2009年1月初，博斯科·恩塔甘达宣布接替洛朗·恩孔达，1月16日，他出现在新闻发布会上。1月22日，洛朗·恩孔达在逃入卢旺达时被捕。刚果总统约瑟夫·卡比拉跟卢旺达总统保罗·卡加梅达成协议，允许卢旺达军队在刚果境内打击激进分子以换取卢旺达向刚果移交洛朗·恩孔达。2009年3月，