城市及境外的首尔和吉隆坡出发的航班。2013年1月30日，南航在国内首次推出微信值机业务。2014年8月12日起，凡乘坐南航国内航班从广州白云国际机场始发，且没有托运行李的旅客，可提前办理网络值机并选定座位，到达机场后直接到机场各国内安检通道使用二代身份证，即可通过安检登机，无需前往机场登机柜台兑换登机牌。未来，南航还计划在上海虹桥、浦东、深圳、成都、西安、昆明、北京等机场推广此项服务。
南航明珠俱乐部.南航的飞行常客奖励计划是南航明珠俱乐部（"Sky Pearl Club"）