，以数万票之差败于苏贞昌的高票连任，也让民进党首度在北县拿下过半选票，这些选举结果使新党遭受重大挫败，仅在金门县获选一席立委及县长，退居为台湾第五大党。新党决议进行改革，将主力放在复数选区的县市议会，不再单独投入单一选区的行政首长选举。2002年中华民国直辖市市长暨市议员选举，在台北市各选区各提一议员候选人，选上5席，重新在台湾基层有了力量。2003年，新党修改党章，成为刚性政党。2003年6月9日，郁慕明以98.82%的得票率当选新党自建党以来的第一个由党员直接选举产生的党主席。2004年中华民国立法