事法院和最高军事法院。目前中华民国所有的军事法院皆归国防部管理监督，而非由司法院来加以管理监督，就此一直都有破坏宪法五权分立的疑义，司法院大法官于《释字436号解释》中亦认为：「...军事审判机关所行使者，亦属国家刑罚权之一种，其发动与运作，必须符合正当法律程序之最低要求，包括独立、公正之审判机关与程序，并不得违背宪法第七十七条、第八十条等有关司法权建制之宪政原理，亦应遵守宪法第二十三条之比例原则。本于宪法保障人身自由、人民诉讼权利及第七十七条之意旨，在平时经终审军事审判机关宣告有期徒刑以上之案件，应许被告