未确认记录到绿猪笼草的自然杂交种。虽然迪纳加特岛还存在其他5种猪笼草物种（贝里猪笼草、美林猪笼草、棉兰老岛猪笼草、奇异猪笼草及宝特瓶猪笼草），但这些物种都存在于该岛的内陆地区，并不与绿猪笼草存在于同一地区。绿猪笼草的自然杂交种能存在于萨马岛，其在此与美林猪笼草与广义翼状猪笼草同域分布。
相关物种.绿猪笼草与翼状猪笼草组的物种之间存在着密切的近缘关系，其中包括翼状猪笼草、塞西尔猪笼草、柯普兰猪笼草、绝灭猪笼草、小花猪笼草、汉密吉伊坦山猪笼草、奇坦兰山猪笼草、仓田猪笼草、莱特岛猪笼草、