系密不可分。在他统治新疆的前期，与苏联保持相当良好的关系，多次借由苏联的力量击退马仲英的攻击。1939年，苏联强行开採新疆独山子油鑛。 1940年7月，斯大林制造阿尔泰山叛变。1940年11月26日苏联片面拟订「租借新疆钖矿条约」。1941年6月，苏德战争爆发，苏联遭受纳粹德国闪电战袭击，损失空前。1941年秋，蒋介石派蒙藏委员会委员长吴忠信巡视甘肃、宁夏、青海，安抚被苏联惨败而动荡不安的大西北，利用马步青与马步芳的兄弟之争，成功争取到中央军驻防河西走廊，控制地方党政的机会，开始威压新疆。1941年秋，