组」之名。
发展.文久三年（1863年）九月，近藤派肃清了芹泽派，控制了新选组，近藤勇成为领导人（称为“局长”）。元治元年（1864年）六月五日新选组在池田屋事件中重创了京都倒幕派的力量。新选组在七月的禁门之变中，协助幕府击退长州藩的倒幕派进攻。这两次事件使新选组得到朝廷、幕府和会津藩赏赐二百多两黄金。同年九月，新选组进行第二次招募队员，队员增至超过二百人，驻地从壬生村迁移到西本愿寺（京都市下京区）。庆应三年（1867年）三月，新选组的伊东甲子太郎一派受命成为孝明天皇的御陵卫士