孙应元（），字仁甫，湖广承天卫人，官籍，明朝政治人物。
生平.湖广乡试第五十二名举人。嘉靖四十一年（1562年）中式壬戌科二甲第六十九名进士。
家族.曾祖孙琳，散官；祖父孙达；父孙经。前母何氏；秦氏。