他在1978年至1983年间曾多次为唐嘉良署任医务卫生署署长一职，期间都临时担任立法局官守议员。在副署长任内，蓝新福主要负责统筹香港公立医院的营运，为了应付不断增长的人口，他积极扩充新界新市镇地区的急症医疗服务，当中包括兴建威尔斯亲王医院、落实扩建仁济医院、粉岭医院和博爱医院、以及着手研究兴建屯门医院和大埔医院等。针对不断发展的东九龙地区，他任内研究扩建灵实医院和落实兴建更多健康院和政府诊所等医疗设施，以应付地区的医疗需要。至于以区域医院为主，再辅以地区性医院和其他老人科、疗养和康复设施的公立医疗服务架