支持下，南高与东大附属学校推动基础教育现代化，从而促成了中国整个现代教育体系的形成。其中，有教育科俞子夷主持南京高等师范学校附属小学，推行新教育，试行设计教学法；有廖世承主持附属中学，试行现代中学教学法，开创中国“六三三制”中小学学制。此外，尚有教育科陈鹤琴主持“国立东南大学教育科实验幼稚园”鼓楼幼稚园；鼓楼幼稚园为中国最早的幼稚教育实验中心，其创设的教学体系后来在全国推广，开创发展了中国的幼稚教育事业。在郭秉文的执掌下，南高、东大从基础教育到高等教育的系统试验革新，酝酿了壬戌学制，奠定了中国现代教育体系的