5年宣佈托斯卡纳维持中立。好景不常，随着共和派于1799年在佛罗伦斯建立新的政府，斐迪南被迫流亡至维也纳。1801年，伊特鲁里亚王国建立，由波旁王朝的帕尔马支系统治。1807年，拿破崙将伊特鲁里亚王国併入法国，两年后拿破崙重建托斯卡纳，并把妹妹埃莉萨·波拿巴封为女大公。随着拿破崙于1813年10月的莱比钖战役战败、1814年巴黎向第六次反法同盟投降，斐迪南回到托斯卡纳，重新成为大公。1824年，斐迪南逝世，由儿子利奥波多二世继位。
家庭.1790年，刚即位的斐迪南与表妹那不勒斯