:::高昌回鹘君主列表.参见：回鹘可汗列表
大元帝国回鹘亦都护.由于察合台汗都哇的进攻，高昌被攻陷，回鹘亦都护内迁到甘肃永昌。
察合台汗国回鹘亦都护.回鹘亦都护迁居甘肃后，高昌当地另立亦都护，受察合台汗国统治。