一个祖先。盾叶猪笼草与巴拉望岛特有的阿滕伯勒猪笼草、迪安猪笼草、曼塔灵阿汉山猪笼草和惊奇猪笼草之间存在着最为密切的近缘关系。可基于特殊颜色的叶片、营养组织上覆盖的发达毛被和笼蔓与叶片的盾形衔接处将盾形猪笼草从这些猪笼草区分开来。其也与婆罗洲特有的马来王猪笼草之间存在着相似性，其也只生长于超基性土壤中，而马来王猪笼草被认为与巴拉望岛的其他猪笼草属物种间存在着较密切的近缘关系。
自然杂交种.盾叶猪笼草的自然杂交种尚未被确认，但汉密吉伊坦山存在部分可能为其与汉密吉伊坦山猪笼草、小瓮猪