。近年的证据显示，非编码DNA可被编码DNA制造出来的蛋白质利用。一项实验发现某些非编码DNA与编码DNA同样重要，因为当植物体内某一段非编码DNA遭受损伤时，会使叶片结构发生显着改变，原因在于某些与叶片结构有关的蛋白质，需要来自非编码DNA片段（内含子）的讯息；还有一些非编码DNA是可以控制基因何时何地表现的基因开关。此外，有些非编码DNA，可能是一些RNA病毒感染后所遗留下来的痕迹。