71年（景兴三十二年）南方爆发西山阮氏兄弟起兵，郑主联合西山军进攻阮主，并在1775年（景兴三十六年）接管其治下的顺化、广南(在越南中、南部)等地。1776年（景兴三十七年），黎贵惇获郑主任命为「顺化督视、协镇抚」，与将领裴世达、阮廷栋等驻守顺化，至同年农历八月，因当地局势未稳，「广南未定、顺化饥饿日甚，盗劫群起，遗民汹汹」，黎郑政权有感难以派员留守，加上黎贵惇因病请回北方，郑主便召回贵惇等人。黎贵惇在顺化任职的经历，使他「熟知地势民情」，黎郑政权于1777年（景兴三十八年）令他「校定顺化兵民租赋额」。