起之后这项阻碍依然存在，而某些真菌类群中，用以辨认物种的rDNA序列演化相当快速，更加剧了辨认的难度。形成兰菌根的真菌种类也受兰花生长环境影响，一项研究分析留尼旺岛上的兰科植物与共生真菌的类群，发现地生兰（生长在土壤中者）常与的真菌形成兰菌根，而附生兰（附生于其他植物者）则较常与的真菌形成菌根，另外附生兰与真菌的专一性较地生兰为高，这可能是因为它们生长的环境常缺乏水分与无机盐，使兰菌根的重要性相对增加，形成较大的选汰压力，且附生兰通常仍有行光合作用的能力，使整体共生关系更偏向互利共生，即真菌提供植物水分与无