普通」、「困难」三种难度进行，透过无线网路连线进行双人合作，游戏画面分切成双萤幕。在数个武器中选择其中两种可切换并强化一次，新增「勾爪」可进行攀爬与摆盪。另外游戏有40个挑战关卡，当玩家将完成所有关卡后可开启游戏诞生20週年纪念的选单，收录历作简介、《魂斗罗》与《超级魂斗罗》美版游戏、两部漫画、隐藏角色等。
关卡.游戏一共有九关。简单模式下只有七关，一般模式和困难模式有九关。只有在一般模式和困难模式下才能挑战最终的Boss。