立委可以坐上主席台，那他也可以，这是他的自由，记者再追问，李彦秀手受伤了，吴愣了一下，答说：「我也不是要攻击她啦，希望李彦秀应好好养伤」，同日下午，吴焜裕针对早上不慎的行为发表声明稿道歉。2017年4月5日，吴焜裕以科幻片的战争武器为例去质询国家中山科学研究院和科技部引发争议。2018年11月14日，吴焜裕痛斥中央研究院利用透过公民科学与大数据精神所做出的「空气盒子检测」，採样设计标准不够严谨，导致取样数据遭受质疑，恐会造成台中民众恐慌，表示「空气盒子检测」之预算一定要删，引起舆论譁然。