筑举行奠基仪式，由丹麦建筑师（Theophil Hansen）设计。同样由汉森设计的奥地利国会大厦，外观为同一风格。扎皮翁宫的建设工程曾经数次中断。最终在1888年10月20日，扎皮翁宫举行了开幕典礼。
使用.在1896年夏季奥林匹克运动会期间，扎皮翁宫用作击剑场馆。十年后，在1906年夏季奥林匹克运动会中，它作为奥运村使用。1998年至1999年，它用作2004年奥运会组委会；2004年奥运会期间又用作新闻中心。 在此曾发生许多历史事件，包括1981年1月希腊签署正式加入