京仍加「南京」字，之后成为定制。景泰年间，吏部曾经设置两名尚书。天顺初年，恢复定制，改为一名。因为吏部尚书作为百官表率，并决定庶官进退，已经在关键地区选定官员，其礼数是其他官员无法比拟的。永年初年，明成祖选拔翰林院官员直接进入内阁。之后的明朝首辅、大学士杨士奇等加至太子三孤并兼尚书衔，然而品叙仍然列于吏部尚书蹇义、户部尚书夏原吉之下。景泰年间，左都御史王文升任吏部尚书兼翰林院大学士、进入内阁，其班位仍然以原衔为序次。弘治六年，明孝宗设宴，大学士丘濬以太子太保、礼部尚书的身份位居太子太保、吏部尚书王恕之上