入「古史」类，与《逸周书》、《国语》、《战国策》、《竹书纪年》、《穆天子传》、《世本》等书併入一类。不过，由于该书成书年代久远，所记事物难以求证，又多奇怪神异之处，故司马迁写《史记》时也认为：“至《禹本纪》，《山经》所有怪物，余不敢言之也。”。明人胡应麟见其书「无论其事及其文，与典谟、《禹贡》迥不类也」，「怪诞之词，圣人所不道」，不相信其为地理书，而谓之为「古今语怪之祖」。清人修四库全书，在《四库全书总目提要》中认为「书中序述山水，多参以神怪」，「案以耳目所及，百不一真」，「核实定名，实则小说之最古耳。