休斯敦市区也被洪水淹没，对多家医院和商户构成严重破坏，全州共有23人死亡。阿利森沿途一共造成41人丧生，经济损失高达55亿美元（2001年美元，相当于年的美元）。除德克萨斯州以外，受灾最严重的地区分别是路易斯安那州和宾夕法尼亚州东南部。风暴过去后，美国总统乔治·沃克·布什宣布阿利森沿途的75个县成为灾区，以便灾民申请援助。由于风暴造成的灾难性破坏和大量人员伤亡，其名称“阿利森”因此退役，今后永远都不会再在北大西洋热带气旋命名时使用。截至2013年，这仍然是唯一一场未达飓风强度但却导致名称退役的大西洋风暴