时接驳用的在来线路线上。在2010年九州新干线全线完成后，旅客可以直接搭乘新干线800系，由福冈的博多车站一路通行至九州岛南的鹿儿岛。但是为了应付每两年一个週期的车辆检查，因此在2005年夏季多增添了一个编组（U006），以方便调度。由于需要应付九州新干线全线通车，2009至2011年间又再增设三列新车（称为1000、2000番台），编号分别为U007～U009，三列新车的外观，内饰、ATC等设备都与U006之前的列车有差异。其中U005在2016年时因熊本地震出轨受损严重，而决定报废不再修复。