联邦的君主瓦迪斯瓦夫二世·雅盖沃（Władysław II Jagiełło）规定全帝国的人民都要信仰天主教，到了16世纪，天主教在立陶宛变得兴盛，并影响到白俄罗斯西北部，但东正教会仍然在白俄罗斯占主导地位。16世纪，白俄罗斯基督信仰开始出现改变：宗教改革始于天主教会，而东正教则出现异端。从16世纪中叶开始，波兰立陶宛联邦的立陶宛地区开始传播新教思想，其中包括现在白俄罗斯地区。白俄罗斯的第一个新教礼拜堂是在布雷斯特由波兰-立陶宛联邦贵族Mikołaj Radziwiłł创建的。由于波兰的反宗教改革，新教