出104名运动员参加2016年8月5日至8月21日在巴西里约热内卢举行的第三十一届奥林匹克运动会。
田径.捷克在田径项目上获得以下资格（每个小项最多三名来自同一代表团的运动员参赛）：
羽毛球.根据羽毛球世界联合会于2016年5月5日公布的奥运排名，捷克有两名羽毛球运动员获得奥运参赛资格。
皮划艇.
激流.捷克在2015年世界皮划艇激流锦标赛上获得了所有的四个奥运席位，实现满额参赛。
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