国民党主席连战尽速启动立委减半修法。2002年5月，协会与其他团体共同成立了「台湾正名运动联盟」，发出声明并举办游行，向政府施压，要求政府进行台湾正名改革。环保运动上，协会积极参与停建核四运动，每年会员参与游行、与其他团体共同举办记者会以外，也参与林义雄所发起的「核四公投、千里苦行」。在陈水扁连任第二任总统之时，协会也向陈水扁发表声明〈对于阿扁总统520就职演说的期许－我们坚拒四不一没有〉，认爲在陈水扁第一任时，提及四不一没有，协会虽不满意，但受限于当时时空背景，仍勉强接受。但四年后，面对升温的国际