在地与首都亦可能处于不同的城市，例如荷兰的中央政府所在地为海牙，但该国的法定首都却为阿姆斯特丹。或马来西亚的中央政府所在地为布城，但该国的法定首都却为吉隆坡。
中华民国.中华民国建国后，国民政府将中央政府各机关设于南京，并在国家基本法《中华民国训政时期约法》第五条明定南京为中华民国首都。行宪后，宪法虽无首都条文（由于首都的相关条文在制宪时有极大的争议，《中华民国宪法》中并无首都的条文，以『中央政府所在地』来表示。），但中央政府仍设立于南京；而在第二次国共内战期间由于军事上不断的失利