相似之处以及长江交通重要经济作用等因素，上海市人民政府于1987年1月设立了驻重庆办事处，代表上海市政府协调、处理在川藏地区的有关事务。1997年之前，上海驻渝办曾考虑迁往成都，后因重庆将设直辖市而保留，在成都设立联络处。2005年7月，上海市人民政府驻西藏办事处成立，上海驻重庆办的工作主要联系范围调整为重庆市与四川省。
联系区域.目前，上海市人民政府驻重庆办事处负责联系重庆市与四川省，促进上海与上述地区的经济合作交流，推动在农业、科技、文化、教育、人才、旅游等领域的合作与交流