政大臣、平定太平天国的名臣沈葆祯为钦差大臣并借饷银200万两为军费以主持台海防务。日本退兵之后，沈葆祯奏请抚垦后山及山区，板桥林家大力帮助。光绪10年（1884年），中法战争波及台湾，清廷派钦差大臣刘铭传以巡抚的身份主持台湾防务，林维源捐助饷20万两银圆，并协助刘铭传帮办台湾防务及出任垦务大臣，一跃为「红顶商人」，再经刘铭传而得与在燕京权倾一时的李鸿章、盛宣怀等人相识。光绪16年（1890年），出任太仆寺正卿。1894年慈禧60岁大寿，一切典仪以干隆27年皇太后七旬庆典办理，用银700万两，户部拨银