有争议的是共和派民众攻击天主教教会，神职人员约有7000人被杀害。在国民军起先发动叛乱时，共和派民众逮捕许多国民军将领和右翼保守派民众，将其杀害、狱中服刑的囚犯也在受到虐待后被处决。马德里约有11705人因此而死。共产党员圣地亚哥·卡里略与部属执行了帕拉库埃略斯和阿尔多斯附近的屠杀，数千人罹难（包括妇人与孩童），是战争期间最大规模的屠杀行动，但是由谁负责此行动也有争议。另外，共和军也有对共产党员的处决行动，安德烈·马蒂（André Marty）杀害了5000多名国际纵队的士兵。共产党内的斯大林主义者也杀害了