不一定是直接由蝙蝠传给人类，而可能是以骆驼等其他动物为中间宿主传播。
感染.人类冠状病毒229E感染人类的唿吸道，潜伏期为2–5天，通常只造成轻微的症状，包括身体不适、头痛、流鼻水与喉咙痛等，约有10%–20%的感染者会有发烧与咳嗽，与其他唿吸道病毒感染造成的症状相似，但在免疫缺陷的病人中可能造成较严重的肺炎。另外有研究指此病毒与川崎氏症有关。229E病毒可能与其他唿吸道病毒（包括人类冠状病毒OC43、甲型流感病毒、人类唿吸道合胞病毒与人类偏肺病毒）同时造成感染。