后（1937－1940年），斯瓦洛夫斯基在理查·斯特劳斯和克劳斯的庇护下返回纳粹德国，他曾参与歌剧《》的剧本创作，把许多较老的歌剧文本翻译成德语，并曾任萨尔茨堡音乐节的艺术顾问（1940－1944年）。1944至1945年1月间，斯瓦洛夫斯基在纳粹占领的波兰克拉科夫担任波兰总督府下属乐团的首席指挥。二战结束后，斯瓦洛夫斯基曾短期被美国军事政府列为针对艺术界人士去纳粹化的“黑名单”。战争的动荡过后，斯瓦洛夫斯基的职业生涯终于逐渐稳定下来，先后担任维也纳交响乐团首席指挥（1946－1947年）、格拉茨歌剧院