肇钧在香港足球明星选举中当选最佳青年球员。直到2017年6月，南华宣佈经重新检视球队近年发展后，决定来届退出港超联转战甲组联赛培育青年球员，而陈肇钧与南华解决合约问题后，离队转会东方龙狮，可是他仅上阵两场后便外借到港超联球会冠忠南区，并在1月14日对杰志的联赛，于63分钟后备入替，首度为南区上阵，结果协助南区以2–2赛和对手，其后他在1月20日对香港飞马的联赛，首度代表南区正选上阵并踢足全场，结果南区同样以2–2赛和对手，直到4月14日作客R&F富力的联赛，终取得加盟后的首个入球，协助南区以2–1胜出。