国王或女王必须是该教会的成员并兼任教会最高领袖，但非行政首长。教会行政主管为丹麦宗教事务部长，而宗教领袖则是由十位来自丹麦本土、一位来自格陵兰的主教组成的主教团。然而虽然丹麦有国家教会，但是其存在并不会限制其他宗教团体的存在，除君王有信仰限制外，国民有宗教自由，政府并不强制国民信仰路德宗。
组织架构.丹麦国教会由十一个教区组成，除了十个丹麦本土教区外尚有一个格陵兰教区，2007年7月29日则包括了法罗群岛教区，但随该教区独立成为法罗群岛国教会而除外。十一个教区主教中没有总主教。