和1的两个数字有区别。第一批HXD3D于2014年1月13日在春运前夕投入使用，首批40台配属沈阳、西安、兰州铁路局。其后，北京铁路局、南昌铁路局、昆明铁路局、唿和浩特铁路局和济南铁路局也陆续开始配属该型机车。在2014年7月1日的运行图调整中，京广、衡柳、柳南及京广、沪昆跨线机车交路贯通，和谐3D型电力机车开始执行超长交路。其中，北京西至昆明的T61/62次列车和T239/240次列车改用配属昆明机务段的HXD3D一机直达后即以3212公里的距离创下中国铁路机车单次运行里程之最，而南宁铁路局的4对