人类由从环境中，或者是从非人类的宿主接触到的病原体所引起。
机会性病原体.机会性病原体可对抵抗力低下（免疫缺陷）的宿主，或者经由异常管道进入身体内部（例如通过创伤），导致感染性疾病。机会性感染可能是由与宿主接触的微生物引起（例如消化道或上唿吸道中的病原细菌，或者真菌）、也可能是从其他宿主得来（无害的）微生物所造成（例如伪膜性结肠炎 ）、或由于外伤导致的结果（如手术的伤口感染，或者复合性骨折）。机会性感染会发生在宿主的抵抗力受到损害-例如由于（例如慢性肉芽肿病）、接触到、或者接触到免疫