站与APM线的黄埔大道站、花城大道站一样，与花城广场地下空间（花城汇购物中心）合建。
站厅.妇儿中心站的站厅付费区设于站厅南侧，付费区内设有一部扶手电梯以及楼梯连接站厅与站台。站厅设有多部售票机以及客服中心。同时设有一台自动贩卖机供乘客使用；与APM线除首末站等沿线车站一样，本站没有设置商店。
月台.本站设有一个岛式月台，位于花城广场中轴线的地底。另外，月台南端设有一条单渡线，当APM线北段出现故障时，往林和西站的列车将会通过此存车线折返，以本站为临