，他随交大师生迁回上海，并参与组建了临时校务委员会。1949年，出任交通大学教务长、校教授会主席。中华人民共和国成立后，曹鹤荪于1952年被调往哈尔滨军事工程学院任教，并出任科学教育部教务处处长。1960年起任院教务部副部长，1964年出任部长。文化大革命期间，他被打成“执行资产阶级办学路线的反动学术权威总代表”，受到批斗。文革结束后，他于1978年起出任国防科技大学副校长。1985年当选国际宇航科学院院士。此外，他还曾担任第三、五届全国人大代表，第六届全国政协常委，第四届湖南省政协副主席，中国力学学会