教士指控他们是海盗，要求即刻处刑；于是船只被扣留，船员被囚禁在大坂城。5月12日，五大老之首的徳川家康接见他们。亚当斯向家康解释航海的目的、说明荷兰和英国等新教国与葡萄牙、西班牙等旧教国间的纷争，化解了误会。徳川家康命令船员将Liefde号从豊后驶往江户，但由于严重毁损及腐朽，在半途便沉没了。1605年大部份原来的船员都在平户大名的协助下离开日本。
成为三浦按针.人在江户的亚当斯申请回国，但是直到1613年都没得到批准。家康对于亚当斯的西方知识很感兴趣，并要求他担任外交及贸