并且使用更多石材，改为木色线条设计，又将名为「蝌蚪机群」的艺术品悬挂在天花下，9条蝌蚪有如行驶中的东铁线列车般。与此同时，车站引入更多自然光，降低乘客对车站原有建筑物料──金属的感受。二楼改以蓝色玻璃造出天花波浪，让乘客彷彿置身于海洋。此外，亦有兴建更多商店，部份售票机改为入墙式、重置客务中心（包括降低柜台，方便伤残人士）及加建洗手间，以腾出更多的大堂空间；B出入口亦有改建，整个工程于2012年1月26日竣工。
旺角东站有车站助理督导员阻止铁路迷拍摄事件.在2019年6月26日，有