A、mRNA的加帽作用，以及蛋白质的紧密结合（病毒的外套膜相当于真核生物的组织蛋白）。理论的其中一个版本认为，吞噬作用形成了早期的细胞「掠食者」，并因此演化出细胞核。也有理论认为真核生物起源于受到痘病毒感染的古菌；因为观察显示，现代痘病毒与真核生物的DNA聚合酶具相似性。此外，病毒性真核生物起源假说，也可与部分性别相关演化问题有关。一项近期研究显示，传统上类似于内共生学说的观点，不足以有效地解释真核生物细胞核的起源。新模型称作「外膜假说」（exomembrane hypothesis），认为细胞核是起源