荷兰东印度公司成立。随即1604年、1622年两次出兵台湾海崃中的澎湖，欲作为东亚贸易基地，但遭明朝反对。东印度公司祇得在明朝默许下，转至当时不属于明朝版图的东番（即台湾）。连横所着《台湾通史》序中写道「台湾固无史也，荷人启之…」，即反应台湾近代史系由荷兰人起始，地点则在今台南市。台南市作为全岛政经中心长达200余年。1644年，明朝灭亡、满清入关。当时反清势力蜂起，明郑郑成功（国姓爷）即为其中一股强大的势力。唯经过几场败仗后，决定改取台湾，作为之后为反清的基地。1662年，郑氏攻下荷人政治中枢热兰遮城