却是隶属于二战时期纳粹德国旗下，协助希特勒的科学家团队。根据神话，九头蛇被斩掉一个头，会在同一个地方长出新的两个头来，由此不息，而九头蛇军团则表示如同九头蛇一般生生不息，一个头目被做掉后，又会重新出现新的头目。二战时期，曾被美国队长摧毁其中一个头目红骷髅。二战胜利后，当人们以为九头蛇军团也随着纳粹一般走入坟墓时，实际上九头蛇军团却以让人意想不到的方式渗透入战后成立的神盾局至今。