藏军都被部署到西康，这也导致西藏北部疆域无法得到有力的维持。由于军费开支的勐涨，更加剧西藏的内部矛盾。中华民国政府由于忙于战事，对西藏主要采取外交策略，特别是在国际场合不断地强调对西藏的主权，但西藏的实际统治者一直是位于拉萨的噶厦政府，直到1950年解放军进藏后西藏的实际统治权才再次被中国中央政府收回，但西藏噶厦政府直到1959年十四世达赖喇嘛外逃印度后才被中央政府解散，并在1965年被西藏自治区政府取代。1914年，在英、中、藏三方西姆拉会议上，英、藏双方签定协议，西藏噶厦将麦克马洪线以南地区割让给英属印