2016年夏季奥林匹克运动会轻艇男子1000公尺双人爱斯基摩艇比赛于2016年8月17日至18日在巴西里约热内卢罗德里戈·弗雷塔斯潟湖举行。德国队的Max Rendschmidt和Marcus Gross在决赛中以3分10秒781的成绩收获一枚金牌，塞尔维亚队的马尔科·托米切维奇和米伦科·佐里奇以将近0.2秒的微弱劣势摘得亚军，澳大利亚队的Ken Wallace和Lachlan Tame获得铜牌。
比赛形式.此次比赛分为预赛、半决赛和决赛。预赛中每组最先到达终点的队伍直接晋级决