中线走线被大幅修改。2009年5月21日，香港多份报章报导港铁推出马头围至启德一段走线之修订方案，此站将改设于马头涌世运道对出的启德新发展区边陲（约于旧启德机场原址之临时停车场），而车站出入口将接驳北帝街、太子道西、亚皆老街及真善美村一带。新走线更靠近马头围及九龙城旧区，方便更多区内市民使用此站乘搭屯马线前往九龙、新界各地。
车站命名.此站原计划名为「土瓜湾站」，由于取消启德发展区填海计划，沙中线走线被大幅修改，车站位置改为位于马头涌，完全偏离土瓜湾，被区内人士指出以土瓜湾命名将会