斯基转投当时仍身处地区联赛的拜仁慕尼黑。至1965年，凭借由门将塞普·迈尔、防守球员、维尔纳·奥尔克、弗朗茨·贝肯鲍尔、、以及攻击手、、盖德·穆勒和组成的豪华阵容，柴可夫斯基成功率领拜仁升入德甲联赛。他在那里一直担任主教练至1968年，期间曾两次夺得德国足协杯冠军，并于1967年赢得了欧洲优胜者杯冠军，这也是拜仁的首座欧战奖杯。在1968-69赛季，柴可夫斯基出任汉诺威96主教练，从1970年1月至7月则执掌奥芬巴赫踢球者。他率领后者夺得了冠军，并在升级附加赛中相继战胜波鸿、、沃尔夫斯堡和皮尔马森斯之后