嘉措认定他是重大威胁，派人对他进行下毒。1705年，拉萨举行默朗木祈愿大法会，拉藏汗将会来拉萨参加这场法会。桑结嘉措计划在拉藏汗与僧侣们会面的时候将其抓获并处决。这受到拉藏汗的经师华秀·俄昂宗哲（后被认定为第一世嘉木样唿图克图）强烈反对。然而，拉藏汗到达卫藏东北的那曲河畔时，突然停了下来，召集和硕特各部族的战士。1705年夏，拉藏汗率领三支部队抵达拉萨城下，其中一支由拉藏汗的妻子次仁扎西率领。桑结嘉措率兵抵抗，大败，损失了400人。五世班禅喇嘛得知消息后前来调停。桑结嘉措意识到败局已定，放弃了抵抗。拉藏