日本败北后，杜锡钧遭到蒋介石的国民政府戴笠军统的逮捕，审查一个月后无罪释放。因其在参加汪精卫政权前曾让夫人辗转香港取得国民政府同意打入汪伪政权，并在衣物里缝入国民政府抗日委员会证书带回天津。在为日本和汪精卫政权工作期间为国民政府和共产党输送各种情报致使日伪军的很多重要作战行动失败。1951年8月，杜锡钧遭到再度逮捕，并被北京市军管会判处死刑，立即执行。终年69。