合流、神佛习合等，加上与民间信仰、巫觋宗教合流，因此寺庙的名称、性质多变，甚至同一间寺庙同时具备多种性质。
建筑.除了一些单体式且不设前院的寺庙外，一般都有一个独立的门为入口，如神道坊（寺庙牌坊）、山门、鸟居等，也代表进入寺庙或结界范围。入门之后为神道，可通往参拜之处。寺庙的主体建筑称为「殿」，「殿」本指帝王居所，后来也指供奉神佛的屋宇如大雄宝殿，有些则称为「堂」如日本法隆寺金堂。规模较大的寺庙常有多个不同的殿或堂。有些寺庙周围会有，有守护寺庙的神圣意义，也有些是作为风水林