准噶尔灭族被认为是清王朝实施的针对蒙古族分支准噶尔部的大规模种族灭绝。1755年，由于阿睦尔撒纳叛清，干隆帝对准噶尔部征服。征服行为在臣服于清朝的回部（维吾尔族先民）属臣的协助下，主要由清军满族将领实施。据学者估计，在1755-1757年清军征服期间，50万到80万人，约80%的准噶尔人死亡（其中一部分死于天花）。
历史.清兵佔领西域后，准噶尔下属部落头领时叛时降，反覆无常，使清军损兵折将。干隆皇帝因此认为其“豺狼成性”，下令将叛乱部落尽行剿灭，“永绝根株”。实际上被下令剿灭的只是