派总理各国事务大臣恆祺开展谈判。葡萄牙使臣基玛良士在调停人法国公使的协助与支持下，于8月8日在总理衙门与恆祺画押。其后，清政府钦差大臣崇厚也在条约中画押确认，草签《中葡和好贸易条约》的日期为1862年8月13日。直至1864年，清政府总理各国事务大臣薛焕在换约前奉命审视条约，才发现其内容有损中国对澳门之主权。《中葡和好贸易条约》第九款订明“由大清国大皇帝仍任凭设立官员驻扎澳门，办理通商贸易事务，并稽查遵守章程，但此等官员应系或旗、或汉四五品人员，其职任事权得以自由之处，均与英、法、美诸国领事等官驻札澳门