亚门最初只是掠食者，但后来分化出多种觅食策略，包括掠食、寄生、植食性、食腐性及腐生性。虽然盲蛛目可以消化固体食物，但其他螯肢亚门的食道太窄，一般只会用螯肢及消化酶将食物液化。陆生的螯肢亚门为了保存水份只会排泄固体。陆生的螯肢亚门一般都是体内受精，而水生的鲎则是体外受精的。掠食性的物种会採取一种很小心的求偶方法，以避免雄性在交配前被雌性吃掉。大部份物种在孵化后都会像成体，但所有蝎子及一些螨都会将卵保存在其体内，直至幼体出生。大部份螯肢亚门的幼体都是自行觅食的，但雌性的蝎子及一些蜘蛛是会保护及餵饲幼体的。螯