，总督一职由新加坡自治邦元首取代，元首从此取得总理任命权，可委任最能指挥立法议会的人担任总理，并在总理建议下委任内阁其他部长。1959年大选，人民行动党横扫立法议会51席的43席夺得执政权，李光耀成爲新加坡自治邦唯一一任总理。新加坡后来在1963年加入马来西亚，再于1965年独立，新加坡政府的行政机关继续维持运作。内阁包括总理和各部部长所辖的总理公署、社会及家庭发展部 、、国防部、教育部、环境及水源部、财政部、外交部、卫生部、内政部、通讯及新闻部、律政部、人力部、国家发展部、贸易和工业部和交通部。