于徐汇区，是原上海医科大学校址。占地192,123平方米，合288亩，位于医学院路138号。是基础医学院、公共卫生学院、护理学院的所在地。枫林校区的功能定位是医学学科相关院系和本科生教学。
张江校区.张江校区坐落于浦东新区张江高科技园区。占地228,176平方米，合342亩，位于张衡路825号。是微电子学院、计算机科学技术学院、软件学院、药学院的所在地。张江校区的定位是以产学研前沿相关的学科为主。为了积极对接上海具有全球影响力的科技创新中心建设，加快建设中国特色世界一流大学步伐