两者能不能形成子实体，可以透过生物物种概念（biological species concepts）以两者能不能成功交配、交配产生的子代有没有生殖能力来判断它们是不是同一物种 。主要的生物类群早期都是以有性生殖特化的结构与孢子差异来描述、区分的，例如产生子囊的子囊菌门与产生担子的担子菌门。有一些物种还有交配型之分，必须不同交配型的两个体才可以交配（heterothallic），其他物种则可以和所有个体交配，甚至自交产生孢子（homothallic）。许多真菌的生活史均存在单倍体与二倍体的时期，真菌进行有