席、中央军委主席胡锦涛来到北京航天飞行控制中心，同正在天宫一号进行科学实验的神舟九号航天员景海鹏、刘旺、刘洋通话。2013年6月24日，中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平来到北京航天飞行控制中心，同正在天宫一号执行任务的神舟十号航天员聂海胜、张晓光、王亚平通话。2013年12月15日，中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平，中共中央政治局常委、国务院总理李克强来到北京航天飞行控制中心观看嫦娥三号着陆器、巡视器互拍成像。在深化国防和军队改革中，2015年底由中国人民解放军总装备部转隶新组建