升左都御史。干隆四十八年（1783年），服母丧，就在家中被提升为兵部尚书。干隆帝南巡，王杰赴行在谢恩，干隆帝说：“你来很好。君臣久别，你应该知道朕挂念你。然而你是儒者，朕不想要将你夺情，可以回去终制。”服丧完毕后，还朝。干隆五十一年（1786年），出任军机大臣、上书房总师傅，教皇子颙琰读书，严加教训，并罚跪罚站。有一次干隆碰见皇子被罚跪，即令站起，并说：“教者天子，不教者天子，君君臣臣乎！”王杰见状答道：“教者尧舜，不教者桀纣，为师之道乎！”次年，拜东阁大学士，管理礼部。台湾、廓尔喀先后平定，两次在紫光阁绘