三年后圣桑离开了妻子，然二人并无正式离婚。据说圣桑后来牵涉入同性恋的关系中，由于他曾于公开场合被受指责，他以自己为效法古希腊少年爱作反驳。（法："Je ne suis pas homosexuel, je suis pédéraste!"；中译：我不是同性恋，我是娈童癖！）现代研究者认为这些传闻并无实据。
后期.圣桑于1886年完成着名的《动物狂欢节》（又译《动物嘉年华》）及《第三交响曲》，并以此献给当年逝世的好友李斯特。同年，圣桑被解除音乐社团的会籍。两年后他的母亲逝世，为免睹物