（1945年）抗战结束后，安徽省政府迁至合肥县，皖南行政公署已无存在的必要，因此皖南行政公署于1945年11月15日正式结束。民国37年（1948年）12月4日，安徽省政府南迁怀宁县安庆城。安徽省政府鉴于长江以北不少地区已入中国人民解放军之手，因应国共内战情势，决定重设皖南行政公署；因此在宣城正式成立皖南行政公署，主任为张义纯，旋迁屯溪镇。民国38年（1949年）2月，张义纯任安徽省政府主席。3月2日，皖南行政公署併入迁驻屯溪镇的安徽省政府。
管辖机构.皖南行政公署成立之初，下