合作进行台南都会区大众捷运系统的规画，并于隔年7月完成「台南都会区大众捷运系统可行性研究」，研究结果认为台南都会区具有兴建捷运的需求。在这个过程中，规画起自仁德乡、迄于高铁台南站，长10.74公里、设11站的台南捷运绿线也首度被提出。而为进一步加速台湾省各地的捷运建设，1990年12月29日，行政院正式下达台79交39519号函令，指示办理包括台南都会区在内的四个省辖都会区大众捷运系统的规画作业，台南都会区大众捷运系统的各项规画与建设工作全面启动。其后的20年内，最初由台湾省政府住宅与都市发展局捷运