1940年又改为教育部国学图书馆，并迁至国府路282号（今长江路257号），1941年夏改名国立中央图书馆。抗日战争胜利后，柳诒征追寻藏书，收回馆舍。1952年，国学图书馆和原中央图书馆合并为现在的南京图书馆。1963年翻修陶风楼。1992年列为南京市文物保护单位。鲁迅、顾颉刚、蔡尚思、胡适之、蔡元培、黄宾虹、徐悲鸿等都曾在此住馆阅览。