十八年（1719年）任台湾府诸罗县知县（康熙五十四年到职），任内曾负责主修《诸罗县志》，去职后民众感念其德政，于龙湖巖祭祀其肖像。康熙六十一年（1722年）任台湾县知县。任内周钟瑄颇有治绩，广造粮仓、埤圳，以利农业。雍正二年（1724年）满巡台御史禅济布，弹劾钟瑄「加征耗谷」。雍正七年（1729年）钦差大臣史贻直以贪赃罪判处钟瑄绞刑，后被清世宗赦免。最后官至江宁知府。