日战争爆发后，他随司法院迁到重庆，曾拜缙云寺方丈释印光为师，研习佛学，印光赐他法号“慧杰”。1942年他因为父亲奔丧而回到故乡沔阳，曾经在沔阳组织游击自卫军抗击日军，和新四军多有交往。1944年冬，汉沔中心县成立参议会，杨时杰应邀参加。抗日战争胜利后，国民政府还都南京，他未返回南京司法院任职。1946年，他举家从家乡迁居武昌。中华人民共和国成立后，杨时杰被聘为湖北省文史研究馆馆员。1953年，他被特邀为湖北省政协委员。1956年秋，杨时杰因脑溢血逝世，享年75岁。