塑性基础研究”课题的首席科学家。2003年当选为中国科学院院士。同年至2008年，出任中国科学院神经科学研究所副所长。2006年起任973计划前沿领域项目“脑的结构与功能可塑性”课题的首席科学家。
荣誉.1990年，郭爱克被中国科学院评为中国科学院有突出贡献的中青年专家。2006年，郭爱克荣获何梁何利基金会科学与技术进步奖和上海市科教党委系统优秀党务工作者荣誉称号。2008年，荣获亚太神经网络协会杰出成就奖。