站的扩建工程投用后两站间线路产生大量单机及小运转车流，造成铁路运能浪费和对杭州市内交通带来负面影响，同时钱塘江大桥运力已超饱和多年。因此铁道部第四设计院和大桥工程局于1984年8月提出新的杭州枢纽方案，提出珊瑚沙、潭头、四堡和老桥下游4个二桥选址和三墩、半山北和乔司三个编组站选址。浙江省政府、杭州市政府和铁道部于1985年1月12日就四堡桥位和乔司编组站方案达成一致，并于1986年10月纳入铁道部“中取华东”工程项目。
建设.1992年9月，铁道部决定兴建乔司编组站，总投资8亿元。