定所引进的药用植物当中，不能不提到金鸡纳树。当时台湾深受霍乱与疟疾两种疾病的肆虐，造成人民生病早逝。疟疾是疟原虫引起，以蚊子作为传染媒介。奎宁是药效极广的西洋圣药，可以有效的治疗疟疾，十九世纪时还没有人工合成奎宁的技术，只有热带树的金鸡纳树，树皮可萃取出奎宁成分。金鸡纳树原本生长于秘鲁安地斯山脉的山坡上，在十九世纪，日本明治政府将其视为热带栽培业的一环，在陆续取得小笠原岛、沖绳与台湾后，积极进行试植。台湾日治初期，与其说是官方推动，不如说是田代安定的经验与人脉才是金鸡纳树在台湾沿续的关键。1910年