治元年（1862年），改调海关税务司。迁到宁波，常捷军组建后任帮统，收复郡城，攻打太平军有功。当清朝官军攻击慈谿，日意格派遣法国籍士兵前往策应。与清军攻陷余姚的四个​​门镇，遂与前护提督陈世章勒兵往讨，一个多月后，攻势直达上虞。平定浙江太平军后，受左宗棠之命与德克碑一同仿造小轮船。同治五年（1866年），左宗棠创办福州船政局，充任正监督，度地募工，殚心所事；筹设绘事院、小铁厂。同治七年（1868年），加提督衔，赏花翎。同治十三年（1874年），以船政敎导的功劳而获赏银币。牡丹社事件发生后，