加尼牙孜率领三四千人来到疏附，就任总统。和加尼牙孜上任后，立即召开会议，决定派外交部长喀司木加纳阿吉向苏联购买武器，并遣使赴阿富汗、土耳其、印度等国，寻求外界的承认。然而，和加尼牙孜的总统生涯十分短暂。2月6日，马仲英的先遣队马福元与马占仓、喀什行政长马绍武联合，攻下了疏附城，东突厥斯坦政权随即瓦解，官员四散而逃。和加尼牙孜逃往乌恰县，沙比提逃往莎车县，伊敏逃回和阗。
加入盛世才政府.和加尼牙孜在乌恰县时，苏联派人来到中苏边界处的伊尔克什坦与其交涉，要求和加尼牙孜遵守与盛世才订立的