芳下诏在曹魏首都洛阳设立司马懿的家庙。
王凌之乱.嘉平三年（251年）太尉王凌与外甥兖州刺史令狐愚密谋废立，迎曹操子曹彪登帝位。阴谋洩漏，司马懿夷王凌、令狐愚三族，并赐死57岁的曹彪，为史载寿春三叛之一。之后司马懿把曹魏宗室迁至邺监视，不准他们结交他人。
身后追赠.嘉平三年（251年），司马懿病逝于洛阳，享年72岁。承其遗愿，辞让郡公和殊礼，不树不坟，不设明器，葬于首阳山。谥文（舞阳文侯），后改宣文（舞阳宣文侯）。264年，子司马昭获封晋王，旋即追尊司马懿