巴士路线调整于2011年6月12日实施，亦是本计划中最后一阶段及同时牵涉最多巴士路线的阶段。是次调整主要内容包括分流各条途经新世纪酒店站的巴士路线、将原来的「澳大接驳专线」正式编定为37路线并调整原有路线、新增一条往返青洲及黑沙环的循环线—27路线并调整23路线返回青洲的路线、调整2条路线途径新设的筷子基社屋站，以及将2条夜间巴士路线总站迁移至沙梨头北街/筷子基北湾。