全香港7所美沙酮诊所当值的2百多名兼职人员的每月工作时间最多达25更，每更达至8至9小时，工作时间符合「四一八」规定。故此，有队员于2012年6月11月成立香港医疗辅助队队员协会，以争取队员享有合理待遇。同年6月26日，香港医疗辅助队队员协会第一届理事会产生。
反应.医疗辅助队回应表示，医疗辅助队为志愿部队，乃是根据《辅助队薪酬及津贴条例》的规定去支付薪酬以及发配津贴。理事长陈衞聪表示，医疗辅助队分为全职及兼职志愿人员，前者享有香港公务员薪酬福利，而后者人数则佔多数，有时薪及强