万历四十三年（1615年）中秀才，万历四十六年（1618年）中举人。天启二年（1622年）登壬戌科进士。七年，分校顺天府乡试，录取史可法等六人。郭都贤在吏部为官时，洪承畴被弹劾而罢免，郭都贤极力为洪承畴辩诬，要起用洪承畴。洪承畴视郭都贤为恩师。崇祯十五年（1642年）出任江西巡抚，当时张献忠已入境内，敌兵充斥。都贤昼夜日夜修理防御工事，并把所有幕僚的薪资都捐献给军队。左良玉驻兵九江，军纪败坏，抢劫百姓，于是郭都贤命左良玉离开，自己募兵抵抗张献忠。当时有人阻挠他，于是他辞官隐居庐山。崇祯十七年（