这次流行病，足足相当于当时伦敦人口的五分之一。该次的疾病后来被确认为是淋巴腺鼠疫，一种由鼠疫桿菌造成并以跳蚤为载体的细菌感染。伦敦大瘟疫与1347年至1353年期间侵袭全欧洲，并导致最少7,500万人死亡的黑死病相比规模要小得多，这场前后扰攘大约一年的流行病被人们形容为大灾难的原因，很大程度是由于它已经是英国本土最后一次广泛蔓延的鼠疫，之后随着英国政府着手改善地区卫生条件，鼠疫对英国民众的威胁也逐渐消失。
爆发经过.伦敦大瘟疫是英国本土最后一次大型的鼠疫传播，此前在1636年及16