1998年任江苏省轻工厅副厅长。2001年调任无锡市副市长。2003年3月5日至2011年5月5日任无锡市市长，担任市长一职长达8年又两个月，并在2008年当选全国人大代表。2011年4月18日至2011年12月22日，任无锡市委书记，然而仅过却由黄莉新接任。2012年2月，出任江苏省供销合作社副主任、党组成员（正厅级）。经查，毛小平涉嫌严重违纪，先后收受各种贿赂折合人民币57.7万。同时，毛小平严重道德败坏，与多名女性“通奸”。于2012年2月29日宣布，开除党籍。