士团仍然拥有东普鲁士。条顿骑士团国1525年升格为普鲁士公国，1660年波兰丧失了对此地的宗主权。1772年大部分的王室普鲁士地区在第一次瓜分波兰之中合并到普鲁士之内，次年成为了普鲁士的西普鲁士省，例外的是并入东普鲁士省的威米亚地区。1793年第二次瓜分波兰之中，但泽这个汉萨城市已经不能靠本身的财富而存活，所以但泽与另一个汉萨城市托伦一同加入普鲁士的西普鲁士。大波兰的一些地区1772年合并到普鲁士，力斯地区1793年亦合并到西普鲁士。1806年拿破仑战争时期，西普鲁士的南部地区被划分到华沙公国之内。