物学家利安纳度·萨尔加多（Leonardo Salgado）及约瑟·波拿巴（Jose Bonaparte）所命名，因为牠的化石是在阿根廷内乌肯省的La Amarga崃谷被发现。La Amarga亦是一个附近村庄及发现化石的地层的名字。阿马加龙的名字是由西班牙语的「苦味」而来。这个属下有一个种，学名是卡氏阿马加龙（"A. cazaui"），是为纪念发现化石位置的Luis Cazau博士，他是一间石油公司的地质学家。发现化石的位置是在La Amarga地层的底部，被估计是在白垩纪的巴列姆阶至阿普第阶早期，距