地面积有约5公顷，原本大肚溪出海口仍有云林莞草的分布，被人为垦作鱼塭与农地之用后，高美溼地是台湾中部地区唯一仅存云林莞草之处。大安水蓑衣在大安与清水两地有分布，其中在清水就生长于高美海堤内水池旁，被国际自然资源保育联盟列为濒危等级，现今是以围篱保护。互花米草因其适应力和侵略性极强的特性使得高美溼地面临棘手的溼地陆化的危机。原生于北美洲沿海一带，因其有助于陆化的特性被许多国家引进做为陆化沿海的物种。中国更将沿岸一万多公里的海岸线广植互花米草，导致当地生态、经济面临极大问题，每年花费上亿元的人民币经费进行研究