学法学院完成从学士到博士学位的课程。时任岭南大学校长的陈序经写信邀请他到广东。1951年，端木正回国就任岭南大学历史政治学系副教授兼代系主任，后转至中山大学法政学系、历史学系副教授。在反右运动中，他从副教授降到图书馆资料室做资料员。在其得到正名后不久文化大革命发生，他被下放到五七干校劳动。1977年北京大学因为师资严重不足，邀请端木正去作法国史系列讲座。商务印书馆邀请端木正给《拿破仑时代》英文版、中文版做校对。文化大革命结束后，他回到中山大学任教历史系与政治系。1980年中山大学重新开办法律系，他出