一天，清军死伤数量各文献记载自万余人至十万不等。但终因力量悬殊，粮食罄尽，城破后，汉人降清将领李成栋倡议屠城，被杀人数各文献记载自万余人至数十万人不等，据说后来全城只有五十三个人幸免。
睢州.顺治二年（1645年），南明睢州（今睢县）总兵许定国用计杀害高杰后逃往黄河北岸降清，高杰部下为了洩愤报仇而在睢州一带大肆屠杀，「杀掠无虚日」，导致「睢旁近二百里殆尽」。
常熟.清代小说《海角遗编》（又名《七峰遗编》，作者真实姓名未知）写道，在顺治二年，清军先后占领苏州