圣克利门蒂的坐标为 (33.437828, −117.620397)。据美国人口调查局数据显示，该城市总面积为，其中为陆地面积，(3.89%)为水域面积。圣克利门蒂西北部与圣胡安 - 卡皮斯特拉诺市相邻。
气候.根据柯本气候分类法，圣克利门蒂属于地中海式气候，该地区全年平均气温为。全年最温暖的时间为8月，平均气温为，最冷的时间为12月，平均气温为。2010年年降水量为，光照时间为310天。
交通.5号州际公路加利福尼亚州段穿城而过。曾倡议将米申维耶霍