又因为李君羡时任“左武卫将军”、值“玄武门”、封“武连县公”、为“武安人”；官邑属县皆有“武”字，开始猜忌他。不久，派他出京任华州刺史。贞观二十二年（648年），御史弹劾李君羡与妖僧道信暗中勾结，将图谋不轨，唐太宗下诏诛杀了他。于七月壬辰处决李君羡。天授二年（691年），他的家属向当时的皇帝武则天诉冤，武则天为了证明自己有天命，下诏追复李君羡官爵，以礼改葬。