1905年的修复工作结束后，便立即开始大规模的现代化改造，并一直持续至1907年底。自此，它再重新服役了两年，然后于1909年退役并安置在预备役支队，但在接下来的三年亦有继续参与舰队的训练巡航。当第一次世界大战于1914年8月爆发时，德皇巴巴罗萨号及其姊妹舰再被动员起来，作为第五战列分舰队的海防舰被先后分配至北海及波罗的海服役。该舰在战争期间没有参与任何战斗，并于1915年2月因船员短缺而撤出现役，降格担当次要职能。在1915年的大部分时间里，德皇巴巴罗萨号都被临时用作鱼雷，然后又在威廉港成为一艘收容战俘的