原本的住民阿伊努人称唿该岛为「」（tonto-mosir，意指「海狮岛」），松前藩在18世纪时将该岛纳入势力范围，并根据爱努语中的岛名直接汉字化为海马岛。 1787年时，法国航海家（Jean-François de La Pérouse）率领探险队在自朝鲜半岛航行至堪察加半岛的途中路过此地，并以队上的工程官（Paul Mérault Monneron）替新发现的小岛命名，因此今日在西方文化圈较常以莫涅龙岛称唿之。二次大战结束后，日本失去库页岛（日方称为「桦太」），海马岛也伴随成为苏联领土。在日本管辖的时代海