王郎起兵时，更始帝派将领巡行上谷郡，要调动耿况的部队。寇恂和门下掾闵业一起劝耿况说，应该归顺大司马刘秀，并且要和渔阳郡的彭宠结盟，耿况认为他们说的对，便照做了。寇恂回来时，杀死了王郎派来的使者，并且与耿况的儿子耿弇等人一起在广阿追上了刘秀。刘秀拜寇恂为偏将军，号承义侯。后来寇恂多次与邓禹谋议，两人结交很深。
镇守河内.建武元年（25年），光武帝刘秀以河内（今河南焦作）险要富实，欲择诸将守河内，苦于没有人选，便问邓禹。邓禹曰：「寇恂文武备足，有牧民御众之才，非此子莫可使也！」，遂拜寇