顺治十五年，跟从卓卜特攻下贵州，从都匀抵达盘江，攻破李定国防线，后官升二等轻车都尉。康熙二年，跟从靖西将军穆里玛，攻克李自成馀党李来亨等镇守的湖北茅麓山。凯旋回朝后，康熙三年，授江宁协领。
三藩之乱.康熙十三年，三藩之乱爆发，吴三桂攻陷湖南。莽依图跟随镇南将军尼雅翰进攻岳州，在七里桥获胜。康熙十四年，吴三桂联合广西总兵马雄叛变，广东十座州府就失去四个。尚可喜请求朝廷出兵，康熙帝命尼雅翰率师赴广东，莽依图署江宁副都统，在肇庆驻兵。部队刚抵达广东，尚可喜之子尚之信已经叛节联合吴三桂。康