恭出任尚书令。天统二年（566年）四月，高长恭出任司州牧。天统三年（567年），高长恭出任使持节、都督青州诸军事、青州刺史，天统五年（569年），转任瀛州刺史，在任内多次收受贿赂。天统五年十二月庚午（570年1月7日），开府仪同三司高长恭再度出任尚书令。武平元年七月甲寅（570年8月19日），高长恭出任录尚书事。武平二年二月壬寅（571年4月4日），高长恭出任太尉。武平二年三月，北周齐王宇文宪从龙门渡过黄河进攻北齐，北齐派遣太宰段韶、右丞相斛律光和高长恭一起前往防御。三月底，齐军抵达西部边境，进攻柏谷城