政府组织在岛上种植树木，目前全岛绝大部分山地被油松林覆盖，由于生境的改变和人类活动的增加，岛上蝮蛇的数量显着减少，据估算现在岛上蝮蛇数量约有1万只左右。每年秋季大黑山岛还是勐禽南迁的重要中继站。从西伯利亚和中国东北南迁的勐禽从辽东半岛入海，向南跨越渤海海峡，南北排列的长山列岛成为他们落脚的中继站，大黑山岛是最接近山东半岛的岛屿之一，生态环境适宜，人类活动相对其他岛屿较少，很多勐禽选择大黑山岛作为登陆前最后的修整地。因此大黑山岛被列为长岛鸟类国家级自然保护区的核心区，同时也是长岛鸟类环志站的重要工组站点，