改称中国人民解放军西北野战军第二纵队独立第六旅。1949年2月，中央军委把独立第六旅统编为中国人民解放军第一野战军二军步兵第六师。在彭德怀、王震指挥下，该部队在第二次国共内战西北战场先后参加运安、宜瓦等十大战役，随后进军陇东、河湟，相继攻占安邑县、咸阳县、天水县、临夏县等16座城市。1949年9月，陈兵嘉峪关，促使新疆和平解放。1949年10月10日，步兵第六师自甘肃省张掖出发，进至酒泉、玉门、敦煌一线待命。不久，王震命步兵第六师师长张仲翰迅速组建一支先遣队，在11月4日到达新疆南北疆分界处的焉耆、库尔