1902年起改为专使。而奥匈帝国则在1896年起于北京设立公使馆，公使馆原址现为中国国际问题研究院的所在地。1900年八国联军之役期间，奥匈帝国为参战国之一。奥匈帝国于1913年10月6日承认中华民国，中华民国当时派出之唯一一任驻奥匈帝国之公使名为沈瑞麟。1917年，因中华民国在第一次世界大战中加入协约国，向身为同盟国的奥匈帝国宣战，中奥断交，直至奥地利第一共和国于1920年建国后两国方重新建立外交关系。1938年，纳粹德国吞併奥地利，中华民国与奥地利再度断交。第二次世界大战后，中华民国和奥地利曾短