有民国99年国防部与内政部共同订定《国军协助灾害防救办法》，规范国军单位需接受地方首长指挥，协助救灾，而毋需总统直接下令动员。
政治影响.2009年9月7日下午在救灾一个月举行之记者会中，台湾最高行政机关首长－中华民国行政院长刘兆玄宣佈于9月10日起辞职，内阁亦同时总辞。当天半小时后总统府召开记者会，宣佈将由吴敦义与朱立伦接任正副阁揆。。曾获得诺贝尔和平奖的第十四世达赖喇嘛则于8月30日至9月4日应民进党南部七县市首长邀请访台，赴灾区抚慰灾民。2009年8月17日时任行政院