后宫面临标售拆除的危机。宫本延人得知后介入此一标售案，最后得以保全大天后宫。
战后发展.二次大战后，海崃两岸恢复往来，大天后宫在民国三十六年（1947年）便组团前往湄洲天后宫进香，并重新举办迎妈祖活动。但是由于当时的政治环境与国民政府不鼓励迷信拜拜、厉行节约等政策，府城迎妈祖并未每年举行，而是偶尔会利用像「恭祝蒋总统就职」、声援「西藏反共」等事件作理由来举办遶境。民国四十四年（1955年）北港朝天宫与大天后宫重新接触，欲重修旧好，次年（1956年）2月26日（正月十五）将北港的