13年1月23日，学校突然宣布上调学费，引起澳门社会各界质疑。（请参见澳门科技大学学费风波）于2月1日校监廖泽云在接受媒体採访回应后，此风波告一段落。2014年11月，澳门科技大学——中国科学院月球与行星科学实验室成立。2016年12月，诺贝尔生理学或医学奖得主厄温·内尔在澳门科技大学成立“厄温·内尔博士生物物理与中医药研究室”，该研究室为澳门首个诺贝尔奖得主实验室；厄温·内尔博士并应邀加入澳门科技大学作特聘教授。2016年，美国汤森路透集团公布了2016年度全球高被引科学家名单“Highly