“黑金之父”是否妥当仍待历史评论。在选举之前30多天，台湾的企业界人士，因负债数百亿台币遭到台湾法院通缉的陈由豪在香港表示，曾经以政治献金方式资助国、民两党。3月1日，陈由豪又公开指控时任总统陈水扁，宣称他曾经亲自到时任总统陈水扁家中，送给第一夫人吴淑珍600万现金。他还称，时任总统陈水扁一共收受至少1400万有记录的政治献金。但是诸多指控，都未能提出更为明确的证据。而台湾的检调机关也持续要求陈由豪回国说明，但陈由豪却一直避不回应。由于陈由豪只透过媒体提出指控，因此也受到泛绿阵营普遍怀疑可能是泛蓝阵营在