天庆元年（1111年），知黄龙府事，改东北路统军使。因女真完颜阿骨打部势渐崛起，屡上疏请增兵严加边备，天祚帝皆不以为然。天庆四年（1114年），女真兵攻宁江州（今吉林省扶余市东南石头城子），萧兀纳战败，引三百骑弃城渡混同江（今松花江），大败于出河店（今黑龙江省肇源县西南），十一月，再与萧敌里于长泺拒金兵，兵败免官。天庆五年（1115年），又授上京留守，耶律章奴叛攻京城，萧兀纳以死拒战，守京城有功，以功授元帅，官至契丹都宫使。天庆八年（1118年）十一月，因病在官任上去世，年七十岁。