身后.在废黜了仓央嘉措之后，拉藏汗另立了一位25岁的僧侣阿旺伊西嘉措为新的六世达赖喇嘛，但其地位普遍不被藏族人和蒙古人认可。1717年拉藏汗兵败被杀后，这位「六世达赖」也随即被废黜。随后，格桑嘉措被认定为仓央嘉措的转世，为第七世达赖喇嘛。五世至十三世达赖喇嘛的遗体都被葬于布达拉宫灵塔中供人瞻仰，唯有六世达赖喇嘛没有自己的灵塔。
文学创作.仓央嘉措的诗作在青藏高原间流传甚广，其内容多为描写爱情之作，因此常被汉人称为「情歌」。在《仓央嘉措诗歌》（）的所有汉