表现冷漠，这些因素都可能对他事业不利。1970年辞去宇航员职位后他在弗吉尼亚州兰利研究中心（）继续为航空航天局工作，直到1972年有资格退休。康尼翰后来当上宇航员办公室天空实验室计划主管。他自称曾非正式地获邀担任首次天空实验室任务指令长，结果位置落到阿波罗12号指令长皮特·康拉德手里，让他去当替补指令长，导致他在1971年辞去宇航员职务。所有阿波罗、天空实验室，以及阿波罗-联盟计划的机组人员只有施艾拉等三人没有在任务完成后马上获杰出服务奖章（施艾拉曾因水星和双子座计划任务两次获奖）。为此，航空航天局局长