西斯科带着儿子和艾莉·戴克斯一起返回深空九号。2375年，卡达西境内出现了由前卡达西领导人达玛（Damar）领导的反对自治同盟的抵抗组织。西斯科派奇拉·尼瑞斯前往卡达西协助抵抗军作战，同时自己和罗斯中将一起指挥反攻。最终在2375年下半年，联军击败自治同盟舰队并反攻至卡达西主星，经过欧多和自治同盟变形人首领的协商，后者同意有条件投降。不久参战各方在深空九号签订贝久合约，自治同盟所有武装退回第三象限，自治同盟战争结束。
失踪.就在战争胜利之时，杜卡特蛊惑贝久宗教领袖文·阿达米潜入了