::1937至1949年.1937年7月，日本开始占领华北，桑志华的采掘工作被迫中断。日军占领天津后，1938年年底，桑志华返回法国，北疆博物院也基本停止了采掘与研究工作，罗学宾继任北疆博物院院长一职。1939年6月，日军封锁天津英、法租界，8月，天津遭受水灾，天津市区被淹，北疆博物院被淹没达1米。1940年6月，趁日军解除对天津英、法租界封锁之际，部分工作人员携带部分藏品转移至北平使馆区，以建立私立北平地质生物研究所。在崇德堂图书馆及工商学院任职的法籍耶稣会士盖斯杰留守北疆博物院，北疆博物院的南楼清