五世从孙，宣州刺史赠刑部尚书孙会曾孙，工部尚书致仕赠太尉孙公乂孙，中书舍人赠吏部侍郎孙瑝子，母亲是李福的女儿陇西县君夫人。进士出身。早年担任户部巡官。历官中书舍人、刑部侍郎、京兆尹。曾监斩一度称帝后来败亡的秦宗权。大顺元年（890年）八月，唐昭宗讨伐河东节度使李克用，任孙揆为副招讨使、昭义军节度使，李存孝率三百骑兵埋伏在长子谷，孙揆一战即溃，被俘虏，押往太原。李克用劝降孙揆，许以河东副节度。孙揆拒绝投降，大骂李克用：“我天子臣也，怎么能事你这个沙陀小儿！”李克用大怒，将他处以锯刑。锯不行，孙揆骂道：「死狗奴