倭寇，斩一千余人。同年在海上大陈岛擒获通倭首领林碧川。嘉靖三十五年（1556年），胡宗宪接替张经总督闽浙军务，擢卢镗为协守江浙副总兵。他领兵在彭溪击败倭寇，擒获大隅的倭寇首领辛五郎，押赴京师处死。卢镗又追随胡宗宪，多次参与对徐海、陈东、麻叶的战斗并立功。嘉靖三十八年（1559年），卢镗与浙江副总兵刘显大破倭寇于刘家庄。不久王直被迫向胡宗宪投降，卢镗因功升任都督同知。嘉靖四十四年（1565年），胡宗宪遭到弹劾而下狱后，卢镗被当作胡宗宪的同党，以抗倭督师不力、作战失利等八个罪名被逮捕下狱。后被赦免归家。万历