附近各迅，嘉义知县邵用之率兵前来，进店仔口后却被杀害分尸，次日台湾府知府吕志恆及南投县丞朱懋欲前往营救，但后来也遭杀害，民间因而有「一日破三关，二日杀府县」的俗谚。十月初七（11月29日），张丙势力的黄番婆率众再攻盐水港，守备张荣森被杀，事后台湾镇总兵刘廷斌将阵亡者收埋于盐水东城门外，后来为了纪念这些守城烈士而立有忠义祠（今五十三将军庙）祭祀。而约从道光二十年（1840年）后，盐水港街因有恶霸盘据，商业活动受创；咸丰五年（1855年）开始，当地长期发生瘟疫横行，令人口大量减少；光绪元年（1875年）左右