。建筑工程由知名的右翼团体日本青年社主导，一旁还有座木造的祠。神社完工后是自第二次世界大战结束以来有神主首度登岛。每年青年会在派人登岛为一旁所建的两座灯塔定期保养检测时，顺便举行一年一度的船舶航行安全祈愿祭。2006年青年社将灯塔捐给日本政府，目前由海上保安厅管理。2004年有几位中国的示威者登上钓鱼岛，青年社通报沖绳县警方处理，警方将他们逮捕并做了损毁的纪录。事后青年社将祠重建并竖立了一块刻有「尖阁神社」的石板。祠和石板都是用花岗岩制成。