国科学技术部批准设立「模拟与混合信号超大规模集成电路国家重点实验室」、「智慧城市物联网国家重点实验室」及「中药质量研究国家重点实验室」三个国家重点实验室。澳门大学设有人文学院、工商管理学院、教育学院、健康科学学院、法学院、社会科学学院、科技学院、人文社科高等研究院、协同创新研究院、应用物理及材料工程研究院、中华医药研究院、微电子研究院，以及荣誉学院和研究生院 ，开办学士、硕士、博士等约130多个学位课程，授课语言以英语为主，部分课程以葡萄牙语、中文或日语授课。该校设有10所书院，包括曹光彪书院、郑裕彤书