1923年在混凝土外铺上防水沥青，但在其上却长出苔藓和霉菌，此段时期修复工程相当不顺利。之后因二战与韩战局势动盪，修复工程因而暂停。1961年起，朴正熙总统下令进行修复，由大韩民国文化财产管理局（现）执行。此次修复记取过去经验，利用机械系统控制温度和湿度。现在游客只能透过只能在前厅，透过玻璃墙观看石窟庵的内部。玻璃墙是为了保护石窟，避免游客带来温度与湿度的变化。另外，对于许多历史学家而言，目前在石窟庵前方设置了一座木制建筑前堂，为一个引起争论的话题。他们相信石窟庵最初没有这样的结构，阻挡人们在石窟庵内远