立、复建各类理科、文科、管理学科、高新技术专业等类院系，朝综合性大学迈进。
创校时期.清华创校初期，没有区分院系、年级、班级。1911年2月，《清华学堂章程》实行“四四”学制，即高等科与中等科各四年。张伯苓任清华教务长之后，依据学部颁布的癸卯学制，改“五三”学制，即高等科5年、中等科各三年。1916年，周诒春校长正式提出清华改办大学，逐步将废除高等科与中等科。1921年起，分为初级大学（）（学制2年）、高等科（学制3年）、中等科（学制3年）。高等科毕业则相当于美国标准大学二年级