元帅首领制为七总裁合议制，以西南各省军阀首领为总裁，架空孙中山。孙中山于5月4日辞职，第一次护法运动失败。旧桂系意欲进一步控制广东，与孙中山分歧日深。1918年2月26日，海军部长程壁光被刺杀，桂系与孙均有嫌疑。1918年5月，桂军诱骗驻粤滇军首领张开儒接洽公务，趁机将其逮捕，并枪毙滇陆军次长崔文藻，此举剪除了滇军在广东之势力。孙中山离粤，护法战争破产。
两次粤桂战争及消亡.1920年，孙中山指挥驻于闽南漳州的粤军陈炯明、许崇智等部，进攻旧桂系，第一次粤桂战争爆发，双方激战至1