必要外闯，于是便拒绝了邀请。1998年，18岁的他获当时香港代表队的巴西籍教练彭利莱赏识，征召他入选香港队，参与在曼谷举行的第13届亚洲运动会。其后，他在随香港队到新加坡参与狮城盃的赛后又有新加坡球会邀请加盟，但那时朱兆基觉得香港队比赛都能击败新加坡和马来西亚，所以他又拒绝外闯机会。2010年，他获得香港代表队重召，并在同年11月以正选身份代表香港出席对巴拉圭国家队的国际友谊赛赛事。
教练生涯.2015年7月，朱兆基与刚刚挂靴的梁志荣组成双教练组合，共同执教以青春班为主