国总统选举，他取得50.11%的得票率，以0.22%差距获得连任。任内推动一边一国、台湾正名运动以及台湾入联运动，在经贸方面则採用「南向政策」的经贸架构。卸任总统后由于涉及龙潭购地案而被判刑20年，三审定谳发监执行，2015年1月5日核准暂时出狱，保外就医至今。2019年11月，一边一国行动党公佈2020年中华民国立法委员选举不分区立委，陈水扁列为第6顺位；中央选举委员会表示依《选罢法》刑期未执行结束前不得登记为候选人，且曾犯贪污罪定谳者亦不得登记。自2021年1月3日起，每周日于「微微笑全国广播网