1845年，南方的浸礼会主要由于奴隶制的问题放弃对三年大会的支持，另外组成美南浸信会（SBC）。美南浸信会采取较为集中的机构来派遣传教士以及组织慈善事业，而大部分北方教会继续采取松散联盟的方式，直到1907年才形成统一的组织。美北浸礼会的发展不及美南浸信会，可能是由于所在地区人口在下降，以及对于共同利益超过教派认同。直到1970年代初，一些美北浸礼会神学院才如同美南浸信会讲授前述知识。1907年5月17日，美北浸礼会（Northern Baptist Convention）在华盛顿成立。1950年更