参加五四运动，当选为天津学生联合会副会长兼执行部长。8月，马骏发动天津当地穆斯林和学生，前往北平天安门进行示威，抗议山东镇守使马良擅杀当地回民领袖马云亭，一度被捕，后在周恩来等人的营救下被释放。1919年9月16日，马骏随同周恩来、邓颖超、郭隆真、刘清扬等人一同发起成立觉悟社。11月10日，马骏当选为全国各界联合会常务理事，在上海宣传革命。当年年底马骏回到天津，领导开展抵制日本商品的运动，次年1月再次入狱，7月18日方才被释放。1922年，马骏受命前往哈尔滨等地秘密开展活动，负责在东北发展中共组织。