导致信徒代表质疑其诚意，而爆发管理冲突。出家众因此在1994年3月11日，控告地方政府伪造文书及企图侵佔寺产，并以上任不久、与此事无涉的高雄县县长余政宪作控告代表。同年3月18日，中华佛寺协会为了高雄栖霞精舍与大觉寺的寺产及管理权纠纷，发动佛教界赴立法院请愿，结果大觉寺管理权确定为出家众所有，高雄县政府败诉，延用五十年的行政命令——信徒认定原则及权利地位，做大幅度修改。1997年，圣岳法师接替慈蔼法师担任住持，让寺貌焕然一新，任内先后完成大觉寺天王殿、罗汉殿、圆觉殿、大雄宝殿及二十诸天，但他在201