东郊被保释出狱。当时新疆已被中国国民党接管，他被张治中调去当了秘书，曾随张治中视察新疆监狱。不久周东郊去兰州。
离开新疆.1946年9月1日，《观察》杂志在上海创刊。周东郊是该杂志的“撰稿人”之一。1948年12月，该杂志被中华民国政府查封。1949年夏初，周东郊经人推荐到香港大学任教，全家五口乘飞机到南京。得知母亲和两个儿子周存威和周有威在天津等他，周东郊放弃了去香港，在南京逗留八个月后携全家到达天津。周东郊到天津后，中央人民政府铁道部副部长刘建章（周东郊是他的入党介绍人）安