包括免疫原性在内的其他特性仍保留。若类毒素用来作为疫苗接种，会产生免疫反应，免疫系统会记忆类毒素的分子特性，但因为毒性较弱，比较不会造成对应的病症。在国际医疗文献中，这种制备法会称为anatoxin或anatoxine。有类毒素可以预防白喉、破伤风及肉毒桿菌中毒。类毒素用来作为疫苗的原因是会引发对原始毒素的免疫反应，或是增加抗体的反应（因为类毒素标记和毒素标记都会保留下来）。例如破伤风类毒素是由破伤风梭菌分泌的所制备。像百白破疫苗中就有破伤风类毒素。肉毒桿菌毒素是由肉毒桿菌产生，后者会产生致命的肉毒桿菌