书至１０余万卷，与山东聊城杨以增“海源阁”藏书并列，时有“南瞿北杨”之称。学人可入书斋参阅，但不许外借，内设有读者阅书室，还有提供茶水膳食。有《续海虞文苑诗苑稿》、《续金石萃编稿》、《集古印谱》、《铁琴铜剑楼词稿》等。有子瞿秉渊、瞿秉浚都是藏书家。其孙瞿启甲撰有《铁琴铜剑楼藏书目录》。