菌叶绿素（英文bacteriochlorophyll，简写BChl）是存在于多种细菌中的光合色素。它们和植物、真核藻类和蓝藻中的叶绿素结构上类似。含有菌绿素的细菌能进行光合作用，但不产生氧气。不同类群的细菌具有不同种类的菌绿素：菌绿素a，b和g是细菌二氢卟酚，这意味着它们的分子具有含两个吡咯环（B和D）的细菌二氢卟酚大环。 菌绿素c，d，e和f是二氢卟酚，这意味着它们的分子具有二氢卟酚大环以及一个吡咯环（D）。