囚办公室多日后拍板定案指示军方（宪兵）和警察攻坚冲入杂志社者正包括郝龙斌的父亲——当时已出任参谋总长七年多而权势如日中天、接受《远见杂志》访问时自称「觉得目前（与甫继任总统的李登辉、财经背景的行政院长俞国华、中国国民党秘书长李焕）配合协调得还蛮好的」的郝柏村。并未加入民进党的郑南榕生前常以政论文字抨击「军头郝柏村」的党军意识、强人干政、任期一再延长破坏军中体制而甚遭掌权的党政军特高层忌惮。当时只能在记者会上吁请媒体「公正报导」这起事件的叶菊兰则因郑南榕为「百分之百不打折的言论自由」殉道而由广告界投身政治