船捕捞银鱼者日均产量超过1000斤，高产的达2000斤，已接近历史最高水平。在禁渔的同时，推进人工养殖，目前仅居巢区就已建成生态养殖基地6.8万亩。
湿地.巢湖是长江中下游地区的重要湿地，已被列为国家重要湿地，生活有鸟类等多种野生动物。2008年至2009年在湖区的调查共发现鸟类15目33科103种，其中属于国家Ⅱ级重点保护的鸟类3种，安徽省地方重点保护鸟类33种。由于水土流失、围垦及人类的生产活动使巢湖湿地迅速减少，从1955年到1985年的三十年间，巢湖周围的湿地减少了近2