侣开放浴室让贫苦和患病的人入浴，入浴开始变得一般化，而温泉在医学上的实用性亦开始被重视。在鎌仓中期，大友赖康在别府温泉设置了温泉奉行一职，有文献记载元寇之役的战伤者曾来到别府温泉治伤。此外，有说战国时代的武田信玄和上杉谦信也特别注意到温泉的功效。在江户时代，贝原益轩、后藤艮山、宇田川榕庵等出版了关于温泉疗法的书籍和称为温泉图鑑的温泉指南，温泉入浴从始渗透到一般平民之中。那时候，一般平民使用的温泉（称为「町人汤」）（汤在日语有温泉的意思）和幕府官吏、代官、藩主等使用的温泉（称为「武士汤」）被明确区分起来。