十三次会议通过了《中华人民共和国学位条例》，并经全国人民代表大会常务委员会委员长叶剑英签署公布，1981年1月1日起施行。吴本厦还参与拟定了《中华人民共和国学位条例暂行实施办法》,为中华人民共和国学位制度的建立和实施做了很多工作。他还参与创建了国务院学位委员会，参与组建了国务院学位委员会学科评议组，参与建立了学位授权审核制度，参与修订、编制了《高等学校和科研机构授予博士和硕士学位的学科、专业目录（试行草案）》。1980年代，吴本厦任国家教委研究生司司长、国务院学位委员会办公室主任（1982年10月至