清河改名河清，出仕唐朝，担任秘书监之职。天平宝字3年（759年），日本以高元度为迎入唐大使使，从渤海国进入唐朝。然而当时唐朝处于安史之乱的骚乱状态下，唐朝以路途危险为由，不许清河归国。天平宝字7年（763年），日本遥封清河为常陆守，次年叙从三位。宝龟8年（777年），日本再派遣唐使入唐，藤原清河随使团欲归国，然而却于次年客死于唐朝。唐朝追赠其为路州大都督；日本追赠其为从一位。藤原清河在唐朝期间，娶唐女为妻，生下一女喜娘。喜娘随遣唐使团来到日本。