2日在纽约亨廷顿因自然原因去世，享年90岁。 她从未结婚或生过孩子。
遗产.2005年5月4日，美国邮政局发行了“美国科学家”纪念邮票系列，这是一套四枚37美分的自粘邮票，採用几种配置。 描绘的科学家是巴巴拉·麦克林托克，约翰·冯·诺伊曼，乔赛亚·威拉德·吉布斯，和理查德·费曼。 麦克林托克还在1989年瑞典出版的四邮票杂志上被作过专题报导，其中展示了八位获得诺贝尔奖的遗传学家的工作。康奈尔大学的一栋小楼和冷泉港实验室的一栋实验楼以她的名字来命名。 在柏林新的“ Adlershof