工程完毕之前作为预备编组。在2004年发生的新泻县中越地震发生后，该编组负责临时运用以代替上越新干线脱轨事故中不能使用的K25编组，直到E2系J69编组制造完成为止，此编组于2006年1月11日报废。K31编组的222-35号车厢（10号车厢）被保存在埼玉县埼玉市大宫区的铁路博物馆内。2007年（平成19年）5月9日，K47编组复古涂装登场。同一天恰逢F19编组的回送，严格来说复制原来的涂装是不可能的。此编组于同年6月23日，担当东北新干线开业25周年纪念列车“山彦”931号从大宫开往盛冈，另外于11月