水同知改为直隶州、噶玛兰改为县、竹堑增设一县，原本清廷有意试办，但因牡丹社事件而搁置。而后台湾海防钦差大臣沈葆桢在同治十三年十二月廿三日（1875年1月30日）上奏〈请琅筑城设官折〉，请求在琅（今恆春镇）建城设官。
析分台北府.光绪元年正月十二日（1875年2月17日），清廷决定依照沈葆桢所上之奏折，设置「恆春县」。而后沈葆桢认为台湾北部有增设府县的必要，于同年六月十八日（1875年7月20日）奏〈台北拟建一府三县折〉、〈请改驻南北路同知片〉提议将海防兼南路理番同知（驻府城）移驻卑