当年正逢疟疾传染本岛各地，新店村住民萧新添受九天玄女託梦，上山求取仙水奇蹟治好全家人的疟疾，村民口耳相传神泉治病的消息，致使求水之人络绎不绝，便搭建能遮蔽风雨的临时仙水亭，亦即协灵宫的前身。民国四十年（西元1951年）临时搭盖的仙水亭拆除改建为奉祀九天玄女的协灵宫。当时经费筹措不易，前主任委员王裕均先生带头捐出三女的聘金凑数，也鲜为外人知道。上山之路崎岖难行，在这长达四公里弯曲的坡道上，建庙筑路的砖瓦石材、木料，必须以人力搬运上山，建庙实在艰苦，幸得信徒共扶持才有如今规模。民国七十五年（西元1986年）