太原战役结束后，他入城后迅速组建生产自救委员会，并任主任，开始恢复战后的粮食供给、失业和生活救济。他还兼任山西公学第一任校长。同时他还是中共太原市委常委、太原市军事管制委员会委员。1949年8月，中共山西省委、山西省人民政府成立。裴丽生被任命为山西省人民政府副主席兼省委常委。1950年3月，担任山西省人民政府第一副主席。同年9月，省委书记兼省人民政府主席程子华奉调入京，裴丽生担任山西省委书记兼省人民政府主席。1952年4月，当选为山西省政治协商会议主席，兼省财政经济委员会主任。1953年3月起，任华北行