下待了将近两年之后，卢永根返回香港，进入港侨中学读初中。1945年8月，日军宣布投降，国民党军队进驻香港。然而，国民党军队在香港的种种行为，让年少的卢永根感到非常失望。初中读了一段时间后，卢永根没有遵照父亲卢国棉的意愿继续在英文书院读书，自己选择了转去岭英中学上学。在岭英中学，卢永根遇到了身为中共成员的语文老师林莽中（萧野），并被介绍到香港培侨中学读高中。1946年，卢永根进入香港培侨中学读高中，在这里卢永根积极参加学生运动，当选为香港培侨中学学生自治会主席。1947年12月，卢永根加入了中共地下组织的领导