荣誉.为纪念缪尔的命名，包括两条缪尔小径(分别在加利福尼亚州和田纳西州)、(保护地)、缪尔小径附近的缪尔山、、、圣地牙哥加利福尼亚大学的、苏格兰邓巴的、东洛锡安的，还有128523号Johnmuir小行星。2005年发行的加州25美分纪年币，刻着约翰·缪尔的形象，还有加州神鹫，以及约塞米蒂国家公园的Half Dome大岩壁。在的Lilly勋章的背面，刻有缪尔的一段名言。还有加州Shasta山的缪尔峰，旧金山附近的缪尔树林。2006年12月6日，加州州长施瓦辛格及其夫人玛丽亚·施莱