楚霸王项羽，此外也供奉三闾大夫屈原。到了清朝的时候，才增祀夏禹并奉为主神，但祭典仍以项羽为主。雍正四年（1726年）洲仔尾盐场以新港溪（盐水溪）为界分成洲北场与洲南场，庙宇也从茅屋改为瓦房。干隆四十二年（1777年），在洲南场东南的禹帝庙年久失修，知府蒋元枢捐俸重建，并扩增规模。此事于《重修台郡各建筑图说》有记录，另外《台南州祠庙名鑑》写说此次工程耗费二千圆，耗时约六个月。另外当时所建的庙宇在今址西北的「旧厝地仔」，新化大地震后才在今址重建。禹帝庙在清咸丰十一年（1861年）与日明治三十年（1897年）