起改用新型的681系或683系后，升格为特急班次。2007年3月17日，东日本旅客铁道（JR东日本）和东海旅客铁道（JR东海）营运的东海道本线特急列车「东海」停止服务后，琵琶湖特快成为东海道本线内唯一在日间行驶的特急班次。米原站 - 彦根站 -近江八幡站- 野洲站 - 守山站 - 草津站 - 石山站 - 大津站 - 山科站 - 京都站 - 新大坂站 - 大坂站京都列车区