独立自号陕西护国军总司令，与胡景翼合作击溃了陆建章之子陆承武率领的陕西第一混成旅，陆承武亦被俘虏。作为爱子安危的交换条件，陆建章主动将其权利让渡给陈树藩。陈树藩由此创立“陕军”，胡景翼则借此取得陕西督军之位，西北军此时为双头领导之局。1918年，中国国民党元老、书法家于右任在孙中山的指示下由胡景翼协助回到陕西组织成立“靖国军”，手下有樊钟秀、杨虎城等将领。这导致身为安徽派却与北京政府关系密切的陈树藩不安，两方多次发生冲突。为此1919年皖系军阀控制的北洋政府派徐树铮出兵西北解决问题，其手下的军队改称“西