当时的英国女王伊丽莎白一世迫害非国教派别，罗伯特·布朗被囚禁，不少公理会成员逃亡荷兰。1620年，102名流亡者乘五月花号帆船抵达北美新英格兰地区。其后，新英格兰地区建立了6个以公理会为官方宗教的殖民地，分别是在麻省、康涅狄格、新罕布夏、佛蒙特、缅因、罗得岛。进入20世纪，公理会的影响力急剧下降。1961年美国公理会与福音归正会合并为美国联合基督教会。信徒只有1,296,652人。比19世纪以前的黄金时代已经下降很多。有部份没有加入美国联合基督教会的公理宗堂会，另组成 (NACCC)及 (CCCC)。