时、桑折景长等重臣支持并把稙宗幽禁在西山城。但是之后成功逃离西山城的稙宗向晴宗出兵，把南奥羽全域卷入的天文之乱爆发。实元属于稙宗方并在信达地方奋战，不过最后这次乱事以晴宗方的胜利告终，实元向晴宗降伏并被赦免。同时因为反对入嗣越后的派系抗争胜利，实元入嗣上杉氏的政策被取消。晴宗在天文之乱后把居城迁到米泽城，娶了晴宗的二女（镜清院）并成为大森城城主的实元代替晴宗负责统治信达地方。根据延宝7年（1679年）的「御知行被下置御帐」记载，当时实元的所领是信夫郡内31条村、名取郡内2条村（『仙台藩家臣录』 佐佐久编