用作治疗痢疾及腹泻。在传统中医药，藿香蓟可用作治疗「感冒发热、咽喉肿痛，咯血，衄血，崩漏，脘腹疼痛，风湿痹痛」或治疗中耳炎、外伤出血等症。本物种亦可用作植物农药，可毒杀昆虫及。
毒性.本物种具肝毒性，不慎误服可引致肝脏及导致赘生物形成。在埃塞俄比亚曾发生过因为谷物中混杂有本物种而造成的集体中毒事件。本植物含有及等吡咯里西啶。
野草风险.在野外，本物种常会发展成野草。在非洲、澳大利亚、东南亚及美国，本物种被视为入侵性野草。在亚洲其他稻米种植地区，本物种的泛