兵部尚书、判度支。又转吏部尚书，负责选官工作，据记载，他在任上公平、能干。咸通末年，他再任兵部尚书、判度支。十四年（873年）四月，在吏部侍郎任上为兵部侍郎、同平章事。累迁中书侍郎，兼户部、兵部尚书。
唐僖宗年间.唐懿宗驾崩、唐僖宗继位后，十月，时任尚书左仆射的萧仿被改任门下侍郎，授同中书门下平章事，成为实质宰相，十五年（874年）正月兼右仆射，十一月兼司空、弘文馆大学士、太清宫使，封兰陵郡侯。在相位期间，在同僚宰相崔彦昭协助下改革弊政，颇有成效。用司封郎中王凝协助自己判版籍（户口