悸病，遂告病辞职。孝武帝却按其病况需要提供名医和上好药物去治他的病，终于将他治好了。大明二年（458年），何偃去世，享年四十六岁。孝武帝追赠他散骑常侍、金紫光禄大夫，并谥为靖子。何偃好谈玄学，曾为《庄子·逍遥篇》作注。
子女.何戢，何偃子，娶山阴公主刘楚玉，在南齐官至吏部尚书，加骁骑将军。