表示支持蒙古入联合国。。但因随后的北塔山事件而交恶，1947年7月28日，国民政府因为蒙古军队入侵新疆而改变立场，反对外蒙古加入联合国。中华人民共和国成立之初由于外蒙古有苏联在背后的支持，而对蒙古予以承认，而中华民国政府迁台之后认为苏联违背当初不援助中国共产党等三项原则，于1953年取消承认外蒙独立（在联合国的控苏案，并曾行使否决权阻止外蒙加入联合国），并宣称一直对外蒙古有主权，但1961年在苏联压力下放弃表决，使蒙古得以加入联合国。直到1990年代方与蒙古建立非官方的联系关系。2000年中华民国总统选举由