药师堂站（）是位于秋田县由利本庄市药师堂，由利高原铁道的鸟海山麓线车站。
车站构造.此站是地面车站，设有1面1线的单式月台。此站是无人车站。车站西边设有羽越本线路线，在此站与羽后本庄之间并行。在车站南边设有平交道，当中羽越线的平交道名为矢岛街道平交道，鸟海山麓线平交道名为药师道平交道。随着第一代车站大楼老化，已于2009年8月拆毁，同年10月新建车站大楼，大楼设有无障碍设施。