吴钟峦弱冠成诸生，出入文社四十余年，海内推为名宿。崇祯四年（1631年）拔贡，选授光州教谕。同年秋举乡试。崇祯七年（年）甲戌科进士。授长兴县知县。崇祯十二年（1639年）削籍。崇祯十五年（1642年）任桂林府推官。弘光朝授礼部主事，未上任，南京城破。鲁王起兵，任礼部尚书，往来普陀山，组织抗清。监国鲁六年（1651年）八月，舟山城破。吴钟峦在孔庙捧孔夫子神位自焚殉国。