光神父担任教区首任主教。1970年，圣座又将澎湖县划出台南教区，独立设置澎湖宗座署理区，为圣座直属的教会管区，1991年澎湖县回归台南教区管辖。
堂区.台南教区共管辖47个堂区、13个兼管区（非独立堂区），整个教区另划分为五个总铎区，每个总铎区由区内各堂区主任司铎之中选出一位总铎，以利于教务管理，并作为各堂区与教区之间的连系桥樑。
教区各单位.
教区办事处.台南教区的最高统辖机构称为「教区办事处」，本部位于台南市东区长荣路二