建设展厅和园林设施，至1911年基本建成，占地面积23300平方米。最初博物苑附属于通州师范学校，除用于文物标本的收藏、展出外，兼设植物园和动物园。1912年后改称南通博物苑，1927年起又附属于南通学院，1936年起由通州师范学校代管。1938年3月侵华日军占领南通，馆址被改为日军司令部，苑内草坪则沦为马厩，除少量文物被转移外大部分遭到劫毁，至抗战胜利后建筑仍未修复。1951年，由南通市政府修复馆舍并建立南通博物馆，次年改称苏北南通博物馆，1954年又予以撤销并入江苏省博物馆，园林部分则最初用以建设人