后清盛与信西（藤原通宪）联手扩张其权力的企图让藤原信赖与源义朝大为不满，两人于是举兵对抗之。这就是发生于平治元年（1159年）的平治之乱。这场乱事最后由平清盛获得胜利，源义朝被其诛杀，以源义朝长子源义平为首的许多源氏族人均被处死，被捕的义朝三男源赖朝则被处以流放至伊豆国之刑罚。自此，平清盛打下了武家政权的基础。然而，平清盛的势力扩张，让以后白河法皇（嘉应元年（1169年）出家的后白河天皇）为首的院政势力为之感到不满，也逐渐加深双方之间的对立。
鹿谷阴谋事件.治承元年（1