馆的法令，随后捐赠了收藏的600本书，且在该法令说道：1822年9月17日，图书馆建筑兴建完工，最初馆藏约有11,000本书籍，主要来自耶稣会图书馆和私人捐赠的书籍。但在1823至1824年间的巩固独立战争中，图书馆失去了大部分馆藏。后于1879年硝石战争爆发后，智利军队进入利马，洗劫了秘鲁各机构，其中也包括国家图书馆，导致图书馆失去大量馆藏。1943年5月10日，图书馆发生大火，烧毁了几乎全部的馆藏，灾后秘鲁政府任命历史学家为图书馆馆长，他因致力于重建图书馆的各项事务，而被尊称「秘鲁图书馆之父」，