898年，他参加了锡安主义运动，参与大会和组织工作。1899年，在苏黎世求学期间，马丁·布伯遇见了未来的妻子、来自慕尼黑的Paula Winkler（一位非犹太人锡安主义作家，后来改信犹太教）。马丁·布伯的锡安主义具有他自己个人的观点，他不同意西奥多·赫茨尔的锡安主义的政治与文化方向。赫茨尔所设想的锡安主义的目标只是建立一个民族国家，没有考虑到犹太文化或宗教的需要。与此相对照，马丁·布伯则认为，锡安主义的潜力在于其社会的和精神的财富。赫茨尔与马丁·布伯终其一生，始终在相互尊敬和争论中，各自朝向自己的目标