编写了大日本史，在水户藩领内自成了水户学学派，因此光圀对水户藩影响亦不少。第三代藩主纲条因为藩内借贷问题严重进行藩政改革，不过因为重税，人民要求将改革罢免执行者松波勘十郎，最后失败告终。1716年，家继急病逝世，纲条有机会成为将军，不过幕府决定由纪州藩的吉宗继任将军。1831年，藩主齐昭大力执行藩政改革，建设藩校弘道馆，积极登用人才，特别是较年轻的一辈，包括户田忠太夫、藤田东湖、安岛带刀等人物、对全领土进行检地以及停止定府制（藩主留守江户城）。幕末时期，先后有樱田门外之变及天狗党之乱。樱田门外之变是藩