于1998年6月21日由香港特别行政区第一任行政长官董建华主持开幕仪式，并于翌日正式运作，而机场快线则于同年7月6日连同新香港国际机场一併启用。通车初期，东涌线使用7卡载客车卡，机场快线则使用6卡载客车卡和1卡行李车卡，列车车厢由西班牙CAF及德国ADtranz共同制造。现时东涌线及机场快线的车厢分别于2003年和2005年增至8卡，前者于2006年增设由南韩Rotem株式会社制造的列车车厢，后者则以7+1的模式运作。
青衣至大屿山干线.青衣至大屿山干线现称青屿干线，是目前唯一连接