于猪群的方法包括设备管理，猪群管理，和注射疫苗。由于多数和猪流感关联的疾病及死亡涉及到被其它病原二次感染，单是依赖疫苗注射的控制策略可能不足。近十年来通过疫苗注射控制猪流感变得比较困难，因病毒的进化已经造成对传统疫苗的反应不一致。当毒株比较匹配从而免疫系统可以提供交叉保护时，标准的商业猪流感疫苗可以有效地控制感染；而由特别毒株分离出来的原基因所培育出来的疫苗则可以用于较难对付的病例。现今用于猪塲控制和预防猪流感的疫苗注射的典型茦略包括使用可在美国购得的数种商业用双重SIV疫苗。最近对九十七宗隔离出来的H