布莱克本对路易斯安那州议会进行游说，以期在新奥尔良建立隔离区，保护密西西比河沿岸城市，路易斯安那州同意了这一建议，并授权他筹建这一系统。1854年9月，布莱克本和儿子卡里一同前往费城，希望能让卡里成为名医塞缪尔·D·格罗斯（）的学徒。就在这一期间，纽约州长岛附近的华盛顿堡（）出现黄热病爆发。纽约市市长请求布莱克本帮助治疗病患，他应邀伸出援手，并且拒绝收受报酬。然而到1856年11月回家时，他却发现夫人埃拉患上了水肿、发烧，并且还伴随有神经疾病。虽然有布莱克本的努力挽救，但埃拉的病情还是继续恶化，没能熬到