编造的无稽之谈，受不了队友异样眼光看待的乔纳斯则离队搬到泰国生活。五年后，亿万富翁杰克·莫里斯来到他投资创立的深海研究基地「玛纳一号」上参观，在张敏威博士和其女儿苏茵的带领下观摩一艘三人起源号，进行人类史上首次下潜至马里亚纳海沟深处，穿过海床底部由硫化氢围绕的温跃层下方进行探索。但任务期间，起源号受到不明大型生物撞击而失联，驾驶员萝莉喊出该生物可能是她的前夫乔纳斯提及过的同一种生物。为了拯救起源号，研究站长麦克和张敏威前往泰国召唤具经验的乔纳斯回来执行搜救。与海勒同样不相信乔纳斯的苏茵，亲自开潜艇下潜准