堂被禁案，上书康熙皇帝，陈述西洋传教士在办理外交、制造军器等等功绩，恳求弛禁。1692年（康熙三十一年）康熙皇帝诏谕“各处天主堂照旧存留，凡进香供奉之人照常行走，不必禁止”。1705年，反对教宗克勉十一世（1700年－1721年在位）要求中国天主教徒禁绝中国礼仪的禁约。1706年担任耶稣会中国省副省会长，1708年在北京去世。 着有《南先生行述》（1688年印行），《律吕纂要》（？年编注，1936年在北平图书馆发现抄本），《律吕正义》第五卷（1713年北京印行）。澳门凼仔有一条马路以其命名，名为徐日昇寅