此同时，菲律宾总统奥斯达多·马卡帕加尔重新提出菲律宾拥有沙巴，其理由是文莱苏丹在1704年将沙巴让与苏禄苏丹国。1966年，菲律宾新总统马可仕放弃这个要求，但这个主张依然是菲律宾与马来西亚关系的争执点。
民族倾轧.1930年代的大萧条及此后的中国抗日战争终止华人向马来亚的移居，稳定马来亚的人口分布比率，终止马来人可能在自己家乡成为少数群体的忧虑。1957年马来亚独立时，马来人人口比例占49%，华人38%，印度人11%。由于马来人直到最近，依然维持较高的出生率，在2000年，马来人的比