为兼顾感性及理性，台湾民政府与台湾法理自治学院之运作必须有所区隔、分别运作，台湾民政府「国安参谋联席会」作成建议：2015年12月9日，中华民国内政部部长陈威仁在立法院内政委员会表示内政部尊重台湾民政府的言论自由与集会结社自由，只要台湾民政府不伤害公众利益，内政部不会干涉；但民众花钱向台湾民政府申请的身分证与车牌都无效，台湾民政府身分证只属于团体内部证明文件而已，内政部会提醒民众不要受骗；如果有人因参加台湾民政府而被骗，内政部接获检举就会处理。2015年12月25日，台湾民政府秘书长夫人林梓安（林志昇之