机关已由之前的三大部（司令部、政治部、后勤部）改为四部委（参谋部、政治工作部、后勤部、纪委）。2017年增设装备部。2017年改革后，武警总部设置下列职能部门：
警种.经过深化国防和军队改革，武警部队由内卫总队、机动总队、海警总队及院校、科研机构等组成。内卫总队、机动总队、海警总队是武警部队的三个警种。
内卫部队.武警内卫总队是武警部队最主要组成部分，受武警总部的直接领导管理。包括各省、自治区、直辖市武警总队。其主要任务：一是承担固定目标执勤和城市武装