1959年，沈日新奉调北上北京，入中国人民银行总行，先后出任中国央行储蓄局副局长、工商信贷管理局副局长等职务。此后，在北京，沈日新先后被选举为中国人民政治协商会议第五、六、七届委员，第六和第七届全国政协经济委员会委员、财政组副组长。沈日新曾担任中国民主建国会（简称“民建”）中央委员和中央咨询会议委员。沈日新曾在中国人民银行参事室任职长达40余年，并以95高龄被任命为参事室主任。2007年2月8日，沈日新因病在北京逝世，享年102岁。