上归后勤副参谋长（隶属于南越联合参谋本部的中央后勤司令部）管辖。
训练.南越海军的训练机构为海军司令部的海军训练局，其他训练中心则位于西贡、芽庄、金兰湾等地。
西贡海军造船厂.西贡海军造船厂佔地约位于西贡河西南岸，距离该江出海口与南中国海海岸的交界处约，号称当时东南亚规模最大的单一工业设施。该基地由法军建造于1863年，作为一处主要的维修和补给站。1969年时该处的从业员共达1,800人，负责各类军用船舰的修缮、检验工作，以使南越海军得以进行海岸巡逻任务。