1982年8月大学毕业后，他被分配到浙江省地质勘查局第三地质大队一分队工作。1983年8月，孙金龙进入武汉地质学院北京研究生院掘进工程专业攻读硕士研究生学位，1986年4月加入中国共产党。1986年8月，孙金龙研究生毕业，获得工学硕士学位，被分配到辽宁省地质矿产勘查局坑探工程大队担任技术负责人，后来任该工程大队副大队长。1989年7月任大队长兼党委书记、总工程师。其间，1990年被评为“全国劳动模范”（中华全国总工会评选）、“辽宁省劳动模范”。1991年7月至1993年2月，孙金龙任中国地质工程公司