在慢乐章演奏得更慢些，在末乐章军乐部分又更快些，并做了一些其它修改，例如将第一乐章的“回原速”推迟。但一些本真主义指挥还是忠实于贝多芬的原意，褒贬不一。后人对配器也有修改，来降低演奏难度，或音响更爲流畅。如对圆号与小号的一些处理，避免了过大的跳跃；对长笛和小提琴的处理，取消了别扭的行进。古斯塔夫·马勒对该作品进行的配器修改相对着名。他使一些管乐部分增加了一倍，以和现代的大规模弦乐队相协调。他认爲贝多芬如果在现代，亦会做此处理。