战斗期间，阿克苏方面还先后两次将监狱中关押的亲三区革命政权的人犯成批屠杀，其中包括阿巴索夫的弟弟斯依提·阿巴索夫（Siyiti Abbas）及知名的维吾尔族诗人黎·穆塔里甫。9月中旬，阿巴索夫重新包围阿克苏，这次有苏联顾问纳斯洛夫（Nasyrov）及艾力汗·吐烈之子的增援。但经过数周无望的战斗后，民族军在10月6日被迫撤走。6天之后，临时政府派出人员作为“三区”方面代表与国民政府中央在迪化开始和谈。1945年10月14日，国民政府代表张治中到达新疆。1945年10月17日，伊宁“三区”方面派出阿合买提江