帝借此收回了她的玺绶，将她废黜囚禁。宋皇后不久就死在了暴室之中，她的父亲兄弟亦被诛杀。宦官们可怜她，凑钱将她一家的尸体以庶人礼收葬。被杀的人中有曹操的堂妹夫隐强侯宋奇，他可能是宋皇后的兄弟；而时任顿丘令的曹操也因此受到牵连被免职。后来汉灵帝病时梦见汉桓帝对他发怒斥责说：“宋后何罪，听邪佞使绝其命？宋后及悝（渤海王），自诉于天，天帝震怒，罪难救也。”汉灵帝惊惶，羽林左监许永趁机劝他改葬宋皇后和渤海王，恢复他们的名誉，汉灵帝拒绝。不久汉灵帝也去世了。