孙继祖，中国清朝官员，本籍中国浙江。孙继祖于1877年（光绪3年）接替孙寿铭，于台湾担任台湾府台湾县知县。管辖约今台湾南部之嘉义县、嘉义市、台南县、市全境及高雄县部份区域。该区域面积约为4500平方公里，也是清治时期台湾岛之汉人集中地所在。