费留学奖学金，成为全国第一位原住民英国留学博士。1998年，马英九当选台北市市长时，孔文吉出任其台北市原住民委员会主委；后来当马英九角逐总统大位时，孔文吉更是其原住民政策白皮书的起草者。因而孔文吉被视为马英九嫡系人马。2004年起，孔文吉代表中国国民党当选第六届（山地原住民）立法委员，并连任至今。
政治生涯.
第六届立法委员（2004－2008）.
借质询之便公然关说.2015年3月10日，孔文吉趁质询时任交通部长陈建宇时，为花东