炸后，单计福国化工厂的损失，估计约有8,000万元。然而，因爆炸波及范围广阔，总计新竹工业区内共有46家厂商因受到波及而停工，工业区外有数十户民宅也受到波及，另有超过50辆汽车与机车损毁，总损失金额高达5亿元以上。其中，晶扬科技主张工厂内有4,000多片晶圆因爆炸受到火损而要求产险公司理赔。然而产险公司不予理赔，因此晶扬科技委託学术单位实验，证实福国化工爆炸时，厂内的晶圆片也受爆炸蒸气的影响而发生闪燃导致晶圆受损，并提告。台北地方法院採信晶扬科技的实验结果，并判决产险公司应赔偿晶扬科技新台币8,700万元。