爱沙尼亚共和国总理（）是爱沙尼亚共和国的政府首脑。总理是由爱沙尼亚总统向议会各党派征求意见后提名，并由议会确认。如有不同意见时，议会可以拒绝总统的提名并挑选出自己的候选人。在实践中，由于总理要得到议会的信任才能保持职位，所以总理一般是由执政联盟中最大政党的领袖来担任。