马其顿东正教（；拉丁转写：Makedonska Pravoslavna Crkva）是马其顿共和国基督教的主体机构。其最高领导者为奥赫里德和马其顿大主教。该教管辖着马其顿共和国东正教基督徒和马其顿人在世界各地（美国、加拿大、欧洲、澳大利亚和新西兰）的社区团体。第一次世界大战后，马其顿受塞尔维亚政府统治。当时塞维亚政府在整个马其顿采取了很强势的同化政策，比如强迫学校和教堂学习塞尔维亚语言。这种形势在第二次世界大战后得以改变。马其顿地区从塞尔维亚分开，成为南斯拉夫的一个加盟共和国，得到他们自己的自治权和学习