蛋白和肌红蛋白中的铁原子就和卟啉环中的氮配位键结；而叶绿素中的二氢卟吩环中央有镁原子。上述的化合物是生物学研究的对象，但都不是有机金属配合物。甲钴胺（一种维生素B12）中含有钴和甲基的键结，是生物学中少见的有机金属配合物。有关这类配合物的研究会列在生物有机金属化学的领域中。在这种化合物中会出现典型的阴离子离域结构，阴离子由其他电负度比碳更强的原子所共享，这样的情形可能会随着阴离子基团的特性、金属离子或是介质所影响。若没有结构上的证据说明有金属及碳的键结，这种的化合物不会被视为有机金属配合物。Sect