旁家族的老枢机主教查理·波旁继承，称「查理十世」，而为自己保留一个王国摄政的头衔；然后他就跟新教的亨利四世进行激烈的数年大战，争夺法国的江山主导权。肥胖嗜吃的马耶那不敌好色但勇勐无畏的新国王亨利（亨利四世的军事才干胜过马耶那不只一筹），在阿尔克战役和伊夫里战役都遭受大败而失去战场主动权。1590年他在西班牙第一名将──帕尔马公爵亚历山大·法尔内塞的协助下解救了被亨利四世围困的巴黎，但名义上的天主教法王查理十世却在同年5月过世，造成神圣同盟日益严重的分裂。当时巴黎城中存在着三股势力，神圣联盟、十六区委员会