是2007年9月29日新修订的APG分类法为这两科单独列出一个黄杨目，2009年APG III分类法的黄杨目包括两科：2016年APG IV 分类法将无知果科并入了黄杨科，黄杨目下只剩一科：
种系发生学.黄杨目各科与其它真双子叶植物的亲缘与演化关系如下：