开基软身二妈最为灵验，也为各地信徒主要迎请巡庄绕境的神像。
沿革.庙方表示该庙是南明永历十五年（1661年，清顺治十八年），佛教临济宗石兴和尚从福建省兴化府莆田县湄洲天后宫分灵妈祖金身来台(今开基大妈)，以茅草建屋，奉祀于干豆（关渡）山区，但是黄富三〈北台首座妈祖庙关渡宫之起源与角色〉一文认为此一说法欠缺历史文献支持。目前就史料《诸罗县志》来说，「干豆门天妃庙」是清康熙五十一年（1712年），大鸡笼社通事赖科鸠众所建于山上；康熙五十四年（1715年）时重修，易茅以瓦，建材自厦门运来