由于反复发生的厄尔尼诺洪灾和旱灾，这些沿海文明最终开始衰退。取而代之的是据于内陆安第斯山脉上的蒂亚瓦纳科和瓦里文明，两者的范围覆盖今天秘鲁和玻利维亚。继承它们的是钱凯、和卡哈马卡等城邦，以及奇穆和查查波亚两个帝国。这些文化发展了相对先进的耕作、金银工艺、制陶、冶金和编织技术。大约在公元前700年，他们似乎已发展出社会组织体系，是印加文明的先驱。无论是位于秘鲁和玻利维亚之间的的喀喀湖的蒂亚瓦纳科文明，还是位于今天阿亚库乔附近的瓦里文明，他们都在公元500年和1000年之间发展出庞大的城市聚落和大范围的国家