分别兴建了新的大堂及地底行人隧道，以接驳现时荃湾线的美孚站及尖沙咀站。美孚站的转乘通道（D出口）于2003年九广西铁通车时同时启用，乘客可直接使用该行人通道步行至荃湾线的美孚站。上述转乘通道在两铁合併后的2008年9月28日起无须出入闸转乘两线；而连接尖东站与尖沙咀站的转乘通道（即F、G出口），G出口于2004年10月24日与九广东铁（现东铁线）尖沙咀支线通车时一同启用，连接尖东站么地道行人隧道。F出口则在2005年3月30日启用，连接尖东站中间道行人隧道。不过，港铁（前地铁）公司在2009年8月16日把尖