国水利水电科学研究院小区东侧，采用明挖法施工。车站长209.2米、宽23.7米，规划共有四层。其中站台层设有一座岛式站台，为三跨矩形框架结构，宽14.06米。
出入口.这个地铁站一共有8个出口：
封站.在六四清场中，木樨地是死伤较为严重的地区之一。木樨地站也多次在6月4日附近被封站处理。历年6月封站记录：关于封站，异议人士胡佳在推特上发表看法，认为此举是要阻止天安门母亲成员到该处拜祭六四遇难的子女。