内区域划为东省特别区，接管哈尔滨及铁路沿线的市政权。1924年中央政府批准东省特别区为与省并行的特别行政区。1924年5月31日，《中苏解决悬案大纲协定》在北京签订。至此，中东路已经不涉及中国主权问题，而是一个中苏共管的经济资产。1929年因中东路事件，苏联重拾铁路所有权和运营权。1931年九一八事变后，日军侵占黑龙江省，控制除了中东铁路以外的黑龙江地区各铁路。1932年，满洲国成立，中东铁路改由苏联与满洲国合营，更名为北满铁路，而南满铁路改归满洲国管辖，但在1933年2月满洲国又同满铁订立委托