本笃十六世继任。本笃十六世较为强调圣统制，与中国天主教爱国会方面矛盾加深。2006年4月，与中华人民共和国政府政治立场迥异的香港教区陈日君被擢升为司铎级枢机，陈日君也就中梵建交问题发表令中方不悦的言论，导致中梵双方关系再度紧张。2006年，中国天主教爱国会方面不顾梵蒂冈的反对，三次祝圣。例如2006年4月30日，昆明教区马英林主教祝圣，但梵蒂冈以牧灵经验不够而未承认。中国天主教爱国会副主席刘柏年称，中国大陆97个教区中，46个没有主教，中梵谈判可能要花五、六十年，中国教会不能一直等待。刘柏年还称，梵