978年发现台东长滨文化遗址，为台湾考古学上第一个旧石器时代的遗址。后来又发现十三行遗址、番仔园遗址、鹅鸾鼻遗址等重要新石器时代遗址。1968年，台湾渔船在东沙群岛附近捞获翁戎螺，此为台湾首次发现。1969年又捞获三枚活体。林朝棨教授鑑定后确认为龙宫翁戎螺。1970年成立中华民国贝类学会，系统化推广贝类学，至今该学会仍进行贝类中文订名与台湾贝类图鑑编纂。1977年从台大退休前，林朝棨编写了《台湾地形》、《台湾地质》、《中山自然科学大辞典》的《地球科学》等集大成的着作， 对台湾地质学界有重大贡献。