基于玩家选择的结局被标记为“秩序”和“混乱”两种。这是为了反思两者在传统上的描述方式。根据冈田口司的说法，这旨在让玩家产生疑惑，“秩序”是否理想而“混乱”又是否邪恶。关于主人公的一个失去手臂的场景，有争议的认为，这是收到了好莱坞电影《星际大战》电影《帝国大反击》中桥段的引用。为了致敬小说原着作者西古史，伊藤龙太郎在游戏的最后阶段添加了小说主角的名字。
发行.《女神转生II》由南梦宫于1990年四月六日在FC平台上发行，游戏载体是4兆位卡带。游戏也被移植到了手机上，NTT DoCoM