5S rDNA存在于串联重复基因中（大约有200-300个真5S rDNA，且另有许多分散的假基因），人类的最大的一个位于1号染色体长臂41号带-42号带上。5S rDNA与其余三种80S核糖体的rRNA的基因不同，该基因并不位于核仁组织区，且由RNA聚合酶III所转录。
5.8S rRNA.5.8S rRNA的相对分子质量约为40 kDa，长度约为160 nt。也存在于古菌细胞中。核糖体中的5.8S rRNA被认为起到辅助核糖体易位的作用。5.8S rRNA可以用作探测m