路段于1872年至1888年间全线建成运营，1932年完成电气化改造，1938年起由法国国家铁路公司管理。自20世纪中后期以来，该铁路所途径的法国中央高原地区人口持续外流，使得该铁路客流量不断下降。2004年，与贝济耶－讷萨格铁路几乎完全平行的A75高速公路全线建成通车，该高速公路大部分路段免费供车辆通行，其平均时速远超贝济耶－讷萨格铁路。自2007年12月起，贝济耶－讷萨格铁路每天仅开行1班运行于全程的城际列车，而关于该铁路完全关闭的计划亦屡次被提出。2020年12月3日，因贝济耶－讷萨格铁路部分