防人员在同一所大楼内进行检查工作；双方人员分别在不同但相近的地点，替旅客办理检查工作，但不会只由任何一方负责。这样的安排可以节省通关时间，过境旅客只需要下车一次，进行两次检查然后上车离开，省下一次上车及下车手续。深圳湾口岸联检大楼深港两方整体的食水及燃气供应分别由深圳市自来水（集团）有限公司和深圳市燃气集团提供（而港方燃气则採用中央石油气）；渠务方面由深圳市水务局负责，但港方部份之渠盖及渠道由香港政府提供及管理；电力方面联检大楼深方部份由广东电网公司深圳供电局提供，港方部份则由香港中华电力提供（然而地底