活在淡水中的基眼目相比最显着的区别在于：基眼目只有一对触角，而柄眼目有两对可伸缩的触角，其中后面的那对的尖端长着眼睛。除此之外，其肉足的表皮内长有一条长长的腺体，叫做足腺（）。这两个都是柄眼类物种的重要衍征。另外，本分类有多个科的物种都会在交配时伸出名为恋矢（）的交配器插进对方的生殖孔，以交换精子。柄眼类生物从白垩纪（）开始就已存在，直到现在。柄眼目动物通过密布血管的肺腔唿吸。为了避免脱水干枯它们需要特殊的水管理系统。为此它们分泌大量粘液来防止过度蒸发。此外它们中许多有一个提供保护的壳。壳退化了的蛞