06年，任中共山西省委常委、山西省军区司令员。2006年10月，在中共山西省第九届委员会第一次全体会议上当选为中共山西省委常委。2010年9月14日，山西省军区召开大会，宣布山西省军区领导班子调整命令，北京军区政治部主任董万才中将宣布中央军委命令，刘云海任山西省军区司令员，免去方文平的山西省军区司令员职务。2010年9月，方文平卸任中共山西省委常委、山西省军区司令员，改任北京军区党委巡视组巡视员。因涉嫌严重违纪，2014年3月中央军委纪委对其立案调查，2014年5月移送军事司法机关依法处理。