、《封神演义》等作品支撑整个週刊的销售量，成为这个时期的代表作。另一方面《游戏王》（1996年～2004年）《ONE PIECE》（1997年～）、《猎人》（1998年～）、《棋魂》（1999年～2003年）、《网球王子》（1999年～2008年）、《火影忍者》（1999年～2014年）等热门少年漫画开始连载。这些作品成为2000年代的Jump週刊的代表性漫画。
2000年代.在这时期开始里面所有作品故事、题材及内容丰富，角色画风开始走唯美路线，在传统热血外追加更多恋爱和女性元素。