化事业出版社的历史教科书出现「台独运动会让台湾的社会陷入国家认同错乱」等字眼，引发部分教师不满且认为对于日本统治时代的台湾带有强烈偏见。史记文化的历史教科书上又把在叙述中国史方面，以「我国」来阐述中国史，亦引发争议。另外，史记文化事业代表人郑旗生，则被新头壳与网友人肉搜索出她有另一个身份是两岸统合学会执行长，引发网友及台独史观诠释者对去台湾化及大中国思想复辟的质疑。
引发争议的调整内容.部分引发争议的课纲内容调整如下：
历史.历史课纲微调主要分为以下数个部