最近的Y染色体，在新石器时代随农耕技术而从近东传入，可能与凯尔特人相关；以及亲缘相对较远的Y染色体，与自末次冰盛期之前就居于本地的欧洲人相关，其中Y染色体与日耳曼人相关；印度次大陆和中亚及高加索还有Y染色体，其中至少佔90%的人居住于印度次大陆，在西孟加拉邦的、安得拉邦海岸的泰卢固人和斯里兰卡的僧伽罗人中有密集出现。学者研究了原始印欧人之前智人的迁徙，有研究称与原始印欧人和闪米特人以及北亚、东亚、东南亚人的共同祖先有关的Y染色体，可能最早出现在印度或其附近；也有说法称可能最早出现在中东或北非。