票败给中国国民党提名的候选人王庆丰；1998年，游盈隆再次接受民进党征召在花莲县参选立法委员，与脱离民进党参选的新国家连线候选人陈永兴一同落败。游盈隆之研究专业为投票行为，是台湾在民意调查与分析问题研究的学者，民主进步党的民调系统即为其擘画。2000年总统选举，游盈隆担任陈水扁竞选总部副总干事，是陈水扁倚重的民调分析专家之一。2000年陈水扁政府执政之后，游盈隆历任行政院研究发展考核委员会副主任委员、民主进步党中央党部副秘书长，2003年与前总统府秘书长陈师孟负责创办凯达格兰学校并担任副校长，2005年