缺乏适当的水下母舰支援的情况下，欲运用此类小艇执行特种作战之难度明显困难。再者，本型小艇所携带之水雷并不适合对港湾设备进行攻击，因此虽然此型小艇中华民国政府曾计画使用于国光计画之中，但事实上这七艘潜爆艇成军后并无战绩。本艇队最后于1970年併入海军水中爆破大队，改称海昌中队。由于装备老化等因素，最后于1973年解散。虽然本支部队与后续之潜舰部队无直接之血缘关系，但因为本案之故，国府日后再向COS.MO.S订购另外两艘微型潜艇(武昌计画)，成为海军第一代潜艇部队之海蛟艇与海龙艇。