高能量的光子，通常在紫外光(UV)的波长范围内，破坏了分子，形成正价离子与一个电子。从GC气态色谱仪管柱上所沖洗下来的化合物在吸收高能量的UV光后会被离子化。紫外光会激发分子,导致分子暂时性的失去电子而形成带正电的离子。气体分子变成带电的离子后会产生一股电流，这股电流就是检测仪所侦测到的讯号的输出方式。反应物浓度越高会解离成更多离子，产生更大的电流，因此讯号强度越强。电流会被放大并且在安培计上被检测出来。普遍认为离子在通过检测后会重新组合成原来的分子，然而，只有一小部分会重新结合成原本的分子。因此，实际