研究中心之前身，拥有多达589种属于原产物种，仅次于垦丁南仁湖。现今仍保留日治时期创立的药用植物园，专门培育树种、林相调查等研究，保留的植物有许多台湾特有种，面临濒临灭绝程度且为特有种有：台湾原始观音座莲、伊藤氏原始观音座莲、桃实百日青、吕氏菝葜、菱形奴草以及台湾肖楠等。另外，属于稀少物种有：天料木、异叶陵齿蕨、尖叶水丝梨、南投石栎、莲华池桑寄生、日本山茶与柳叶山茶等诸多。