16年3月，网络上逐渐曝出南开大学津南校区廊桥沉降、建筑表面返碱、石材脱落等建筑质量问题，引发在校师生及校友的关注与讨论。4月，校方开始组织检修整改。2016年10月，“木斋馆、秀山堂、思源堂复建奠基仪式”在南开大学津南校区举行，秀山堂将与木斋馆、思源堂等三座南开大学校史上重要的历史建筑在南开大学津南校区复建。
学院设置.根据规划，南开大学在八里台本部不拥有独立楼宇的学院将陆续搬迁至津南校区。历史学院、哲学院、法学院、周恩来政府管理学院、马克思主义教育学院、计算机学院、人工智能