次没有《盖特机器人》系列。本作的《魔神皇帝（原创版）》是指出自《超级机械人大战F完结篇》登场的魔神皇帝，而非往后的衍生OVA作品。是次参战源于制作人寺田贵信未能于《V》中实现与铁金刚皇帝G的共演，因此于本作中实现。没有传统机器人登场的《宇宙战舰大和号2199》由于在《V》里参战获得好评，因此本作继续引入类似的作品《冒险少女娜汀亚》（同样没有传统机器人，但有万能变形坦克）。另外在《V》里登场的超级机器人大战原创机体「凶鸟」及「古伦加斯特」同样获得好评，因此就着本作的世界观而得以让「赛巴斯塔」登场。