室友为黄彰辉，每周日一大早，林朝棨与室友等人到附近的板桥教会做礼拜，并协助康清涂传道师牧会。1934年3月底，林朝棨以《台中州丰原郡第三纪初期和冰河期生成之地层学研究》毕业论文得台北帝国大学理学士学位，留校担任副手一年。1934年4月10日，林朝棨在台南太平境教会与吴嫣嫣小姐结婚，典礼由巴克礼牧师主持。1935年，林朝棨于台阳矿业株式会社担任地质师，对当时的矿业资源及地质进行详细的探勘工作，相关的论文发表迄今仍是重要文献。
中年经历.第二次世界大战期间，日本海军省为开发南洋资源