站为上海虹桥和南京南，但实际经由京沪高速铁路或经由沪杭高速铁路、宁杭高速铁路运行。另外本线于节假日会加开临时列车，由动车所内闲置车底担当。但当车底非常紧张时会动用CRH1B、CRH1E等等时速在200km/h的动车组列车开行临时动车组列车；同时当沪宁城际铁路线路或车站股道紧张时会将临时开行的动车组列车安排在普速京沪铁路上运行。沪宁城际铁路曾在开通运营初期开行上海至南京的直达列车，且数量在之后历次调图中不断增加。2011年8月28日起开始减少，2013年7月1日开始全部停运。