根新主场，可容 25,000 人的JJB运动场开幕，曼联成为首支到访的球队。韦根在新球季保持廿四战不败，以乙组榜首迈进千禧年（2000年），季末打入升级附加赛，zh-hans:半决赛; zh-hk:准决赛;两回合淘汰zh-hans:米尔沃尔; zh-hk:米禾尔;，但决赛在加时后以 2–3 不敌zh-hans:吉林汉姆; zh-hk:基宁咸;。2000–01年韦根三换领队，首先是（Bruce Rioch）为球队打好基础后在2月离队，前队员及教练（Colin Greenall）暂代