着矢石率先登上敌船，身体数处负伤，腹中一剑，肠子因而外露。华善一手护住伤口，另一手持刀血战，斩二人，伤数人。此时，华善部下陆续登船，俘获敌军百人、船一只。清军主力进而掩杀，获得大胜。战后论功，华善获封云骑尉世职，升太仆寺卿。不久，再升内阁学士兼礼部侍郎。康熙初年，任弘文院学士。康熙九年（1670年），华善出任甘肃巡抚，上疏请求免去逃荒额赋。时逢西和、礼县爆发大型瘟疫，华善开府库赈灾，并以临近春耕为由，令买耕牛以耕种，然而部议却以违例为由问责，但康熙帝宽免了华善。后来，王辅臣反清，率军攻打兰州，游击董正己