科内似鲸龙与简棘龙更近缘，而离鲸龙较远，从而支持了此分类理论。相反的是，1956年阿尔弗雷德·罗默将似鲸龙和鲸龙视为异名，但后续对该属的研究并未遵循此理论。1978年，大卫·柏曼（David S. Berman）和麦金托什将似鲸龙及其他许多属分类至梁龙科，包括梁龙、迷惑龙、重龙、马门溪龙、叉龙、纳摩盖吐龙。如同该科其他成员，似鲸龙拥有翼状横突、向前后突出的分叉人字骨、尾部呈鞭状、肱骨为股骨长度的三分之二、缺乏、第三和第四跖骨最长、第一跖骨底部后角有一个突起。这个分类将使得来自卡洛维阶的似鲸龙成为最古老的