位于中新生代形成的巢湖断陷盆地南部，形成与更新世发育的河谷平原上，距今约一万年，属于河成型湖泊，当时面积约有2000km²。湖区属北亚热带季风气候，年均气温16.1℃。四周分布着银屏山、凤凰山、冶父山、大别山、防虎山等，流域总面积13130km²，其中巢湖闸上面积9130km²，闸下面积4000km²。流域内河流共33条，分别属杭埠河-丰乐河、派河、南淝河-店埠河、柘皋河、白石山河、兆河、裕溪河7大水系，其主要出入河流有9条，分别为合肥市巢湖市、庐江县境内的南淝河、十五里河、派河、柘皋河、双桥河、兆河、白石