万一家督不立，恐怕会沾污阁下的人缘」（），于是秀吉允许秀治的袭封。庆长3年（1598年），因为秀吉的命令，上杉景胜移封至会津，而秀治则移往越后。越后45万石由一族和与力统治，春日山城由秀治、藏王堂城由秀治的弟弟亲良、坂户城由直政的次男直寄、三条城由直政（城代是嫡男直清）、新发田城由沟口秀胜、本庄城由村上义明（后来地名改为村上）各自管治。
与上杉氏暗斗.在秀吉命令大名换国之际，年贡米只征收一半，其余一半留给后来的领主，上杉氏和堀氏亦同样。不过因为直江兼续和石田三成的谋议，年贡米被全数