5年国民政府接收台湾之后，青年党即派党员前来扩展势力，最有名者即是李万居和郭雨新。1949年后中国青年党迁台，并且重新于台湾建立和发展党组织，包括宜兰县的郭雨新、游钖堃，云林县的李万居、苏东启、苏洪月娇，台南县的郭秋煌，高雄市的李源栈，台东县的黄顺兴等党外人士都曾以青年党身份参与并且当选。郭雨新的助理陈菊也成为党外着名的联络人士，台大历史系周婉窈教授的父亲以及二哥周弘宪也曾是青年党员。1949年虽然青年党迁往台湾，党主席曾琦却在1950年于美国过世。其后代主席李璜亦未至台湾，导致党内长期分裂。在这段期间