立中华民国驻玻利维亚共和国公使馆，并派驻公使。1947年5月10日，公使馆升格为中华民国驻玻利维亚共和国大使馆，并派驻大使。1949年，中华民国政府迁台后，两国继续维持邦交。1985年7月11日，玻利维亚与中华民国断交。两国断交后，双方于首都互设具大使馆性质的代表机构。1990年12月26日，设立中华民国驻玻利维亚商务及领务办事处（西班牙文：），享有与国际组织驻玻利维亚机构同等的地位与待遇。2004年11月11日，更名为驻玻利维亚台湾商务办事处（西班牙文：）。现已关闭，自2009年7月28日