牟宗三以及徐复观则为协助创办该校的委员会成员。现时该校由新亚教育文化有限公司主办。2007年按《香港教育条例》成立法团校董会，以促进校政有效地发展。于1970年代，汉学家及中华民国中央研究院院士余英时、已故教育家吴俊升与沈亦珍、已故历史学家孙国栋、严耕望与唐君毅、香港中文大学哲学系荣休教授唐端正、岭南大学前校长陈佐舜、已故新亚书院前院长梅贻宝及黄国芳、语言学家兼西密歇根大学常务副校长黎天睦等曾为校董会成员。香港投资银行家及资深传媒人香树辉曾是该校的校董。
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