在1997年的《广州市城市快速轨道交通线网规划研究（最终报告）》中，为2号线南端终点站，当时本站被称为后滘站，车站位置与现时大致相同。后来在2000年方案中，因应番禺撤市建区，本站成为规划的3号线其中一个中途站；而2号线因改为从南洲南延至广州新客站（现广州南站），不再前往本站。直到2003年方案中，南洲至后滘段被划分为广佛地铁广州段的一部分，同时本站被规划成一个换乘车站。另外，车站在规划之初已经考虑广珠城际铁路的接入，但由于广珠城际铁路沥滘站位于南海心沙岛上，远期才会修建，因此只预留在南站厅设置通道前往