、鲁文·扎特尔迈尔、伊维卡·奥利奇和达尼耶尔·普拉尼奇，此外有汉斯-约尔格·布特退役，以及尼尔斯·彼得森被租借至云达不来梅。布特在7月1日被任命为拜仁慕尼黑青年队的负责人，但他却在8月7日离开这一岗位。在8月9日成为新的继任者。7月2日，俱乐部宣布马蒂亚斯·萨默尔取代担当体育总监，尤普·海因克斯相信2012-13赛季的阵容比前一个赛季的阵容更为强大。拜仁在7月3日开始季前训练。主席卡尔-海因茨·鲁梅尼格表示，本赛季的首要任务是夺取德甲冠军。在季前友谊赛中，拜仁曾相继战胜翁特哈兴、、特伦蒂诺XI和凯泽斯劳