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事件.1997年11月，台湾媒体引述外电报导，柬埔寨发表声明指出，已在1963年与中国大陆签署航空协定，因此与台湾在1996年签署的航空协定有重复之虞，必须取消，但顾及台湾观光客与投资人的利益，金边－台北即将通航。对此，中华民国外交部表示，柬埔寨在压力下片面取消航空协定，有违诚信原则，又称与台湾即将通航，纯属子虚乌有。
客运.两国有直航班机，双边航班来往的城市如下（截至2019年11月25日）：