陶宛东部地区于1654年被俄罗斯兼并后，1686年，属于君士坦丁堡普世牧首的基辅都主教区被君士坦丁堡普世牧首划归由莫斯科大牧首管辖。
俄罗斯帝国时期.彼得一世在位时，由于彼得本人并不十分虔信宗教，但因为他希望彷效西欧国家如法国波旁王朝增强皇权，希望把教会控制在政权之下，因此他对教会采取了严厉的控制措施。他将宗主教的权利移至由他控制的神圣宗教会议之下。沙皇掌握了所有主教的任免权。上层社会在他的治下失去了成为神职人员的兴趣，大部分教区神职的父辈也是神职人员，他们没有受到良好的教育并且收