按照文物古迹“整旧如旧”的原则进行设计施工，并且运用现代技术确保白塔的坚固和完美。1995年6月7日，3座查果嘎林古白塔修复工程举行了塔藏仪式。1995年8月21日，“查果嘎林”佛塔建成，中国佛教协会西藏分会会长波米·强巴洛珠主持了白塔开光仪式，给西藏自治区成立30周年庆祝活动增添了喜庆的气氛。修复后的三座白塔考虑了交通需要，中间大塔两侧留有很宽阔的车道。