1769年，格梅林成为了蒂宾根大学的医学副教授。1773年，他成为哥廷根大学的哲学教授和医学副教授。1778年，他成为医学正教授，并兼任化学、植物学和矿物学教授。格梅林后来出版了若干本关于化学、制药科学、矿物学和植物学的教科书。他还整理完善了卡尔·林奈的着作《自然系统》，于1788年和1789年发布了第13版。该版本涵盖了对许多新物种的描述和用二名法的科学命名，包括之前英国鸟类学家约翰·莱瑟姆在其着作《鸟类概论》中未用二名法命名的鸟类。格梅林的版本是超过290种鸟类以及许多蝴蝶物种的规范缩写标准。