还地请降。不久，阿尔泰授武英殿大学士，仍领总督。三十六年（1771年），召还京师，入阁处理政务。此后，又奉令出任总督。金川土司头目索诺木攻革布什咱，僧格桑也同时围攻达木巴宗并入侵明正土司。阿尔泰上疏力主兵力城下震慑后安抚，而干隆帝决意用兵，令定边右副将军温福视师，侍郎桂林为副，发谕旨怒斥阿尔泰苟且偷安，夺大学士、总督，留军中治饷，以桂林代为总督。清军攻克约咱后，干隆帝因阿尔泰铸造大炮有功，予散秩大臣衔。干隆三十七年（1772年），阿尔泰与总兵宋元俊弹劾桂林讳败为胜，干隆帝于是罢免桂林，随即任命阿尔泰代理