间，曹思源曾受全国人大常委胡绩伟的委托，组织要求召开全国人大常委紧急会议，因触怒高层而被捕，一年后获释。2011年，曹思源罹患癌症，仍继续参加各种学术会议和讲座，关注中国民主改革，唿吁以修宪推动中国民主转型。2014年11月28日，因病在北京中国人民解放军总医院逝世，享年68岁。