区内的黄地峒曾发现旧石器时代文物古迹，两汉时期，区内的滘西洲已有居民（曾出土过两汉文物）；宋时西贡有海关，佛堂门有南宋刻石。清朝初期迁界时，西贡这个地域范围曾短暂归併入东莞县，但不久重设新安县，此地亦重归新安县官富司的管辖。1850年代起，西方传教士因为西贡地理方便，能取道大鹏湾进入昔日的宝安县内陆，同时可以协助零散村落对抗大族，而沿山路到区内不同乡村传教。过程中兴建了不少天主教小堂，部份已有过百年历史，并且评级为历史建筑。1898年英国租借新界，并设南约、北约两个理民府管理新界。1942年