五月二十七日，迅速任命沈葆桢为「钦差兼办理台湾海防事务大臣」并派遣来台。沈葆桢由船舰兵员随伴，于同年六月十七日到达台湾，显着地强化台湾的防卫力量。不过，沈葆桢的任务非要与日本一战，而是要积极使台湾发展。
中法战争与台湾建省.在中法战争中，清廷于1884年六月授与前直隶陆路提督刘铭传巡抚头衔，使其负责台湾的行政与军务。同年七月，刘铭传到达台湾，因鑑于北部遭受法军攻击的情势，亲自驻守台北。刘铭传就任管辖台湾及福建的福建巡抚时，向朝廷建议台湾与福建分离被採纳，1885年十月台湾成为独立的