因第二任台湾巡抚邵友濂认为县城的位置太靠近内山，县治西移至斗六门，1950年8月重新设置云林县，但作为县名由来的云林坪则被划归为今天的南投县竹山镇云林里，使得「云林」不在云林县境内。
史前时期.在汉人移入以前，云林地区原属平埔族洪雅族侦儿干社（一名猫儿干社）、西螺社、他里雾社、猴闷社、斗六社(一名柴里社)、南社等部落的活动领域。
荷西时期.荷西时期，云林大笨港地区为荷兰东印度公司之海防港口，笨港在17世纪荷兰人所描绘的地图中，称为「Ponkan」。汉人移入始