球季里，球队从未以败多胜少的战绩结束球季。
1986年—1999年：最低点和复甦.在总教练Roger Craig、和他的独特口头禅"Humm Baby"的带领下，巨人队在1986年球季赢得了83场比赛，更于1987年赢得国家联盟西区冠军，不过球队在奋战七场后联盟冠军赛败给了圣路易红雀队。虽然比赛输了，但巨人队外野手Jeffrey Leonard因为表现突出而获选为联盟冠军赛最有价值球员。
1989年.在启用多达15名先发投手后，也在明星投手Rick Reu