士林北投区得票也败给柯文哲，几经波折后，终于愿意依公职人员选举罢免法第69条规定提出验票。但又于隔日表示因验票旷日废时，决定撤销验票声请。2018年12月11日，丁守中以中央选举委员会未妥善规划，导致史上首次未投完票即开票，对此影响选举为由，向台湾台北地方法院提出选举无效之诉讼。2018年12月13日，台湾台北地方法院公布重新验票结果，柯文哲获58万663票，丁守中拿到57万7096票，丁输柯3567票，较原先开票结果多输了313票。2019年5月10日，台湾台北地方法院判决「原告丁守中之诉驳回」，