现各种政治和经济危机，在巴尔干的边防线大大削弱。巴尔干的军事地位突显出来，涌现了很多战争英雄、执政官和帝国皇帝。 君士坦丁大帝稳定了局面，之后狄奥多西帝将帝国以亚得里亚海为界，以东为东罗马，以西为西罗马。然而随后发生欧洲民族大迁徙。随着匈人入侵欧洲，北方蛮族以和平或暴力的方式涌入巴尔干。在罗马帝国最后的几十年里，巴尔干地区成为侵略者西进意大利的跳板。这里也成了罗马人、哥特人和匈人签订条约与军事演习的地方。
中世纪.斯拉夫人在6世纪到达半岛，并同化当地人。很快，他们就完全取代了巴尔干