上突然发生奇怪的蓝色光芒，将她抬起后送入“亚特兰蒂斯之心”，这是块保护着城市的强大水晶。女王消失在水晶中，这时城市上空出现圆形屏障，保护着城市最内部的区域。女王的女儿姬坦公主、国王基舍金·内达克都幸存下来，和岛一起沉入海底。一万年后的1914年，史密森尼学会语言学家兼制图师迈罗·戴奇相信自己已经找到《牧羊人之书》，传说这份古老的手稿中藏有亚特兰蒂斯岛的方位。他向博物馆董事会提议搜寻这份手稿但遭到拒绝，之前对亚特兰蒂斯锲而不舍的研究已让他成为众人的笑柄。之后，一位名叫海尔格·辛克莱尔的神秘女子把迈罗介绍给