六四天安门事件前后，因同情学生运动，胡启立与阎明复、芮杏文等中共高级领导，随总书记赵紫阳下台。胡启立被免去政治局委员、常委，中央书记处书记的职务，但仍保留中央委员会委员资格。
再度复出.1991年，胡启立复出工作，被安排到原机械电子工业部，担任排名最后的副部长。1993年3月，出任恢复设立的电子工业部部长。在任部长期间，胡启立倡导对中国电信业进行改革，积极推动中国联通的成立，引入竞争，最终促使邮政和电信于1998年分离。1998年3月举行的中国人民政治协商会议第九届全国委员会第