日本科学家转基因透明斑马鱼品系得到可以在高强度脑活动时放出可见发光的品系，使得斑马鱼对外界刺激的反应可以被记录精确到特定的大脑发光区域。
环境监测.2007年1月，复旦大学研究人员修改了斑马鱼的基因，使得其能够用于探测水体中的雌激素污染，这一污染被认为与男性不育有关。研究人员克隆了对雌激素敏感的基因，将之注入斑马鱼的受精卵中，得到的转基因鱼会在感知污染时变绿。
RNA剪接.2015年，美国布朗大学的研究人员发现，10%的斑马鱼基因并不依赖于蛋白质来启动RN