水区的面积为56,900平方公里。阿尼加河发源自拉查湖，流入阿尔汉格尔斯克州西南的白海阿尼加湾，在距离河口75公里的地方分流成大阿尼加河和小阿尼加河后再次汇合，形成一个平坦的岛屿。 河流在十月末至十二月初结冰，直至四月中至五月融冰。卡尔戈波雷和阿尼加是位于阿尼加河的城市。