自1937年中日战争爆发后也日益严峻，任内他除了反对港府计划开征入息税外，又批评港府于1940年设立的移民局扰民，并多番促请港府平抑物价。1941年12月香港沦陷后，谭雅士先后被日治政府强迫担任香港善后处理委员会委员和华民各界协议会委员；1945年香港重光后，谭雅士虽然淡出政坛，但获港府委任为儿童法庭、绅士法庭和交通法庭法官，后来又任中央裁判司署裁判司等职，1949年更与罗显胜成为首批获委任为常任裁判司的华人。1951年辞任裁判司后，他重新开展私人执业，至1960年退休。谭雅士是香港首位华人首席按察