批国民党撤退人员登上招商局海轮开往塘沽。1948年11月24日，蒋介石下令撤销秦葫港口司令部，在秦皇岛的司令部机关和直辖部队部分剩余官兵撤往塘沽港。
1949年.1949年春，局势逆转，国军失守华北，何世礼奉调回广东，以国防部联合后勤司令部副总司令并代理总司令，顺利完成负责运送华南国军补给及转运；是年秋，啣命转赴台湾，8月任「东南补给区司令部」中将司令。何世礼节驻漳州、厦门，供应转进台湾60万大军粮秣营舍，兼任新成立之台湾基隆港口司令一职，抓住一切可以使用的船只向台湾抢运物资。