祠每年均分别于3月29日青年节及9月3日军人节的春、秋两次国殇中，依《》举行春祭及秋祭。首都忠烈祠由中华民国总统主祭。。
历史沿革.在台湾清治时期即有一些为表彰各种事变中壮烈牺牲的人物所建造「昭忠祠」等建物，从文献记载中得知，于道光二年时，为了祭祀在林爽文之乱等叛乱事件壮烈牺牲之将士官兵、义民甚至是妇女等，由当时的知县吴性诚于台湾府彰化县大西门街捐资建立「忠烈祠」，这是在台湾最早以「忠烈祠」之名称出现的祠庙。 清朝雍正初年，亦有已通令各省设立忠义祠等祠庙，凡已旌表者，设位祠中，