2日17时30分，会议举行地西斯廷小堂的烟囱冒出白烟，表示枢机团已选出新教宗，当选者为意大利籍枢机尤金·玛利亚·朱塞佩·乔凡尼·派契利，并取为「庇护」。
背景.1939年2月10日，庇护十一世于梵蒂冈宗座宫离世，终年81岁。庇护十一世离世19天后，1939年教宗选举秘密会议于1939年3月1日正式开始。根据规定，枢机团团长Gennaro Granito Pignatelli di Belmonte枢机在自己不当选的前提下，将在选举结束时询问当选教宗是否接受选举结果以及其教宗名号