规程时，纳入正式编制，更名为研究发展处），是台湾各大学中第一个研究发展行政单位，下设各研究中心。1983年为配合推动国防科技发展，与中山科学院合作成立自强科学研究中心，为推动跨院所系的教学与研究，成立校内原子科学技术发展中心及科学仪器中心。1984年依行政院「加强培育及延揽高级科技人才方案」，成立材料科学中心，为全台大学中四大重点科技中心之一。之后陆续成立电脑与通讯科技研发中心（1994年）、积体电路设计技术研发中心（2000年）、奈米与微系统科技中心（2001年）、脑科学研究中心（2002年）、当代中国研