威廉港并退役，以使得在试航过程中发现的缺陷可以得到修正。这项工作的耗时比原计划更长，因此舰只在当年的大部分时间里都没有运行。在10月21日重新运作后，德皇腓特烈三世号被委任至练习舰队（），在海军中将麾下的第二支队服役。它取代了已于前一天退役的铁甲舰巴登号的位置。德皇腓特烈三世号将在第二支队担任旗舰，受海军少将指挥。在实际加入支队前，德皇腓特烈三世号和通报舰被派去护送威廉二世皇帝的游艇前往英国，由德皇去拜访其祖母维多利亚女王。这些舰只于11月17日离开德国，11月18－20日驻泊在多佛尔，然后于20日继续