，皮漱石当选为主席。1958年“大跃进”开始以后，各地基督教活动大大减少，例如，上海的教堂由208所减少到23所，北京的64所教会合并为4所。三自教会在1966年至1976年“文化大革命”期间全面停顿，各地教会关闭，直到“文革”结束。中国基督教三自爱国运动委员会的第二次和第三次全国会议分别于1961年1月和1980年10月召开，中间间隔近20年。中国基督教三自爱国运动委员会至2008年已举行8次全国代表会议。1991年，中国基督教协会加入普世教会协会。
争议.1950年的《