国革命，惠州革命遂告失败。1900年1月24日，杨衢云辞去兴中会会长职务，让位给孙中山，之后，兴中会多次发动起义，均以失败告终。
与华兴会、光复会和其他各会合併.1905年7月30日，兴中会与华兴会、光复会和其他各会合併为同盟会，孙中山成为同盟会总理。孙中山从此掌控党的最高权力。