全民电视公司举办「跨世纪国家走向系列辩论会」，沈富雄与郭正亮说修正台独党纲是民进党诚实面对自己的作法，林浊水与邱义仁反对修改台独党纲。1999年1月21日，陈水扁接受《联合报》专访时说：「民进党没有台独党纲，只有『公投台独党纲』。」2000年，陈昭南向民进党提案废除台独党纲，因党内争议太大，被总统陈水扁及民进党主席林义雄劝说撤案。
其他相关决议立场之演进.民进党在更多地参选台湾各地公职、更多参与台湾事务之后，至1990年代末，党纲已与环境不能完全相适应，特别是当时该党即将提