只于平日早上行走，方便天水围居民更快往港岛上班。配合天华邨及天颂苑入伙，于2000年2月28日绕经。于本线服务时间内，969号线将不绕经天葵路及天龙路。2001年12月17日，本路线改经七号干线天桥（现为四号干线）及毕打街隧道，与城巴969A线分流了前往上环、中区、金钟、湾仔及铜锣湾的乘客。2006年5月22日，969A线的最后两班会改由本线提供，并加停中上环。
过海隧道巴士N969线.1998年8月10日起投入服务，在城巴967及969号线收车后继续提供往来天水围至港岛的服务。2