前，队中2011赛季的两名主力王云龙与艾迪·弗朗西斯分别转会至江苏舜天与大连阿尔滨。球队也再一次喊出了冲超口号。
联赛.上海东亚在2012年中甲联赛上半程势不可挡，十五轮过后，东亚队取得11胜3平1负的骄人战绩，以领先第二名湖南浏阳河七分的优势获得半程冠军。然而此时，在申花投资人朱骏的请求和上海市体育局的劝说下，上海东亚将后防核心柏佳骏租借到陷入困境的同城球队上海申花直至2012赛季末。失去后防大将的上海东亚一度成绩低迷，但好在众多冲超竞争对手也在此阶段相继失分，东亚仍然保住了第一