台南府城打石街（后台南市公园路和民权路交叉口附近）一个商人家庭。他在童年时即对绘画表现出天赋和兴趣。11岁时，潘联科自台南第二公学校就读；该校当时校舍设在台南水仙宫之内。14岁时，潘联科自台南第二公学校退学，并开始自学书画与汉文，且经常观摩家里附近中国大陆传统工艺匠师工作。1909年，潘联科在开基三官庙旁开设「春源画室」，以裱画及绘画为业。
创业时期.1910年前后，潘联科受八吉境五帝庙邀请为其重新施作壁画；当时，台南三山国王庙也在进行整修工程，潘联科前往观摩并向该庙聘请之