天兴县改为天兴州。永历三十七年（1683年）郑氏降清，康熙二十三年（1684年）将台湾纳入版图，属福建省台湾府，辖三县，即台湾县、凤山县、诸罗县。诸罗县在新港溪以北，故太保属诸罗县。雍正十二年（1734年）起，太保归属诸罗山保、柴头港保，林爽文事件后，自干隆五十三年（1788年）起，诸罗山保改名嘉义保。日治时期，台湾分三县一厅，太保属台南县嘉义支厅。明治三十年（1897年）改六县三厅，属嘉义县，辖下嘉义西堡、柴头港堡，属嘉义办务署，大糠榔东下堡、大糠榔西堡，属朴仔脚办务署。明治三十一年（1898年）改为