不巧立名目，以各种方式横征暴敛。清政府始终未能完全将厘金正式纳入财政体系，“各省厘金实收之数，竟数倍于报部之数”。厘金虽是清季之一大弊政，但“病商而不病农”，清朝终免于走入明朝灭亡的末路。太平军灭后已有废除厘金之议，同治三年（1864年），左副都御史全庆、曾国藩多次奏请朝廷尽快裁撤。1898年6月总理衙门接受御史陈其璋的建议，奏准“与各国开议酌加进口税，停收厘金”的建议。但因改益过巨，遭到湖广总督官文、两广总督郭嵩焘等地方疆吏的反对，政府难以放弃，“只宜严禁重科，万不可骤议裁撤”。征厘的关卡和货品名目不