理论。p值相关的方法的问题是，p值是常规的0.01或0.05，而非生物学意义。WGCNA是建立和分析加权基因共表达网络的一个框架。WGCNA方法会选择出根据无尺度拓扑的基因共表达网络选择阈值。这种方法会建立出几个阈值的网络，选择出其中满足无尺度网络拓扑的网络。而且，WGCNA方法会建立出一个所有可能的边都出现在网络中的加权网络，但是每个边有一个权重，显示出此边共表达关系的显着性。