回国后，便开始巩固领地内的治安与建设，以及欲在盛冈建筑新居城。由于领地在九户政实之乱后有再做调整，变得与伊达氏的领地有衔接，信直知道伊达政宗是个狡猾的野心家，所以才将新居城的地点定在盛冈以防伊达政宗的侵略，而在1600年关原之战时期，伊达政宗也的确煽动和贺忠亲在南部领地内引起岩崎一揆的行动来看，证明信直的顾虑是正确的。1598年，丰臣秀吉去世后，开始接近德川家康。1599年，盛冈城开始动工，同年10月5日于福冈城病死，享年54岁，法名「常往院殿前光录大夫江山心公大居士」，墓所于青森县三户郡南部町的三光院