参加表妹也是玛丽亚的朋友和本家姐姐马蒂尔德的葬礼时，他们就相爱并决定结婚了，这最初激怒了想把玛丽亚嫁给图斯卡尼大公费迪南多四世的皇帝。玛丽亚婚后把大部分时间花在养育子女上。尽管她的丈夫是巴伐利亚王位的第二继承人，夫妇俩生活一直低调，不参与公务，靠在慕尼黑以南的洛伊茨特滕的大量农田度日。玛丽亚就在那里有了她着名的玫瑰花园。1872年10月19日，玛丽亚成为巴伐利亚的特蕾莎勋章和圣伊丽莎白勋章的女首长。她还获得西班牙的玛丽亚·露易莎王后皇家勋章、奥地利的伊丽莎白一级勋章、巴伐利亚皇冠功绩勋章、1870/