某站距离札幌站最远，为了避免重复而将一部分车站採用并非站数最少的路线的数字。例如富良野线上的学田站按照站数最少路线为札幌站起第31站，但由于富良野线以旭川站（A28）起算，因此车站编号为F44。某路线中间的某站废止并不会影响其他车站的编号，例如在鹫之巢车站（原编号H53）于2016年3月26日废止后，函馆站从札幌站开始为第74站，但车站编号仍保持为H75。
实施车站编号的区间.1.札幌站札幌站编为01号，为所有路线的起算点。圆圈为（黑色）。2.札幌－东室兰－函馆间区间颜