对抗红色高棉势力，因应日渐升高的柬埔寨内战，双方密切的交流也使得1974年底高棉共和国政府在中华民国新任代表孔令晟抵任时重新考虑加速因美国反对迟未与中华民国建交的时程，然而当时政府军因美军撤离而战事告急，中华民国方面亦已无强烈意愿且末代驻高棉代表团团长孔令晟于金边政权瓦解前的1975年4月2日片面撤离，双方关系已实质结束。两周后的17日，红色高棉攻陷金边，隔年建立柬埔寨民主共和国，双方交流正式全面中断。5月，中华民国外交部宣布驻高棉共和国代表团已于4月17日撤离关闭。1990年代，柬埔寨王国恢复后，中华