学生中创办药学会，获得了东京帝国大学及东京周边地区的学校如东京药学专门学校、千叶医科大学的药科留学生的支持。1907年秋，王焕文作为召集人酝酿创建中国药学会。光绪34 年（1908年）夏，王焕文归国探亲，转赴北京郊区采集矿物“硵子”（即碳酸钠）及药用真菌“茯苓”标本。同年秋，经一年多筹备后，王焕文向27位创会成员发出邀请，在东京水道桥明乐园（疑为“后乐园”之误）的一家中华料理店召开了中华药学会（中国药学会的前身）成立大会。27位创始会员中，与会者有20位，其余7位未能到会。会上，王焕文当选该会第一任会长