胡毅生参加广州民选市长竞选，因为舞弊案发而未能当选。此后，胡毅生逐渐失意，与朱卓文靠近，依靠包揽捐务、沙田等为生。1925年8月，廖仲恺遇刺身亡，胡毅生被怀疑为主谋之一，逃离广州，被广州国民政府下令通缉，后来胡毅生避居香港。1926年，胡毅生皈依佛教密宗。
晚年.中国抗日战争时期，胡毅生到重庆，历任国民政府委员、国民政府国史馆筹备委员等闲职。抗日战争胜利后，胡毅生回到广东，历任制宪国民大会代表、国民政府顾问、总统府顾问。
逝世.1957年11月，胡