随后他返回德国，在卡尔斯鲁厄理工学院担任助教，后升任助理教授，研究放射现象。1917年接管慕尼黑大学物理化学系，1932年成为由洛克菲勒基金会创立的物理化学研究所所长，但迫于纳粹迫害的加剧于1935年离开德国，在剑桥短暂停留后赴美国密歇根州安娜堡，在密歇根大学执教至七十岁退休，继续研究工作直至1975年5月18日逝世。
科学工作.在欧内斯特·卢瑟福实验室期间，法扬斯与亨利·莫塞莱一道研究元素週期表中放射性行的性质，测定了铀-锕行元素与钍元素各核素的半衰期，并发现放射性行中元素电化学