调在研究论坛的角色，是研拟“两岸共同市场”这个经贸机制具体运作的规范与互动模式的研究单位。基金会第一届董事长由萧万长出任，前行政院劳工委员会主任委员詹火生担任基金会顾问，首任执行长为前张荣发基金会国家政策研究中心执行长、毕业于哥伦比亚大学经济学系的张瑞勐博士。
与海基会的区别.海基会是中华民国公设财团法人，是两岸关系的台湾对口单位；共同市场基金会则只锁定两岸共同市场，为研究、推动的议题，因此，性质上是完全不同的两个单位。