五年（210年），步骘到交州出任交州刺史，交趾太守士燮向东吴归附，孙权征召薛综为五官中郎将，先后就任合浦和交趾太守。延康元年（220年），吕岱代替步骘任交州刺史，薛综随同吕岱讨伐当时数个作乱的贼匪兵团，平定交州全境，又进攻九真。战事完结后任谒者仆射。黄龙三年（231年），孙权任命建昌侯孙虑当镇军大将军，驻屯半州，同时任命薛综为镇军长史，对外掌军众之事，对内以书教授孙虑。嘉禾元年（232年），孙虑逝世，薛综转任贼曹尚书，后任尚书仆射。赤乌三年（240年），转任选曹尚书。赤乌五年（242年），加任太子少