由对台湾用兵，引起中国之警觉。中国是否应当在日本进犯台湾之时对新疆发起昂贵的远征成为了重要的议题。直隶总督李鸿章为首的一派力主加强海防，以应对未来的日本入侵；陕甘总督左宗棠为首的一派则主张加强边境防御，以应对俄国入侵。最终，清政府在东南沿海，设立福建台湾省巩固领土并发展海军；在西北内地，清政府收复新疆，驱除阿古柏势力，与沙俄斡旋解决伊犁危机，并建立甘肃新疆省加强管制。自1930年代日本入侵中国以来，晚清海防与塞防之争进入学界视野，并被演绎成为不同的抗战主张；后学界对之产生了淮系与湘系利益之争、爱国与