潘光哲、陈瑞麟、张谷铭等学者共同反对教育部将「中华文化基本教材」列为高中必选课程。2014年3月，因支持太阳花学运而在街头开课。2014年4月17日，因反对教育部的课纲微调而出席公听会，会中说出「九趴马」，间接引发国国民党立委陈淑慧和民进党立委何欣纯的口角冲突。
批判儒家.祝平次批评复制儒家政教合一传统的蒋介石自称是讲「以天地万物为一体」之王守仁的信徒，但王守仁却在一夜之间坑杀几千名投降的民间起义士兵，而蒋介石政权一方面在台湾集权统治、夺人性命，一方面又以儒家文化宣扬者自居