免权力过大，与现代国家军队概念相同。五军都督府的成立是为制肘将帅拥兵自重，但亦因此削弱军事力量，使武将、士卒的社会政治地位日益低微。军事日益衰败。《明史‧兵制》称：“积轻积弱，重以隐占、虚冒诸弊，至举天下之兵，不足以任战守，而明遂亡矣”。明代中叶以后，卫所制受到破坏，五军都督府的职权渐被兵部取代。
配置.各都督府，都督初间以公、侯、伯为之，可参与军国大事；后率以公、侯、伯署府事，同知、佥事参赞军事。其属有：