则携王公大臣等南逃。1775年，阮福淳册立阮福旸为东宫，以收买人心。阮主辗转逃到了嘉定（今胡志明市），留阮福旸在俱低村（今属岘港市和荣县）抵抗郑军。1776年，阮侣率西山军攻佔嘉定，阮福淳逃到镇边（今边和省）。不久，杜清仁率东山军将阮侣逐出嘉定。随后李才率部反叛西山军，在嘉定拥立阮福旸为新政王，阮福淳则被尊为太上王。1777年，阮岳遣阮惠、阮侣攻打嘉定。李才战败，嘉定失守。阮福淳逃往龙川（今金瓯省）。景兴三十八年九月十八日（1777年10月18日），阮福淳被阮惠的追兵追及杀害，当时阮福淳年仅24岁。