立胡安二世的长女布兰卡为女王布兰卡二世，但布兰卡早在与卡斯提尔国王恩里克四世离婚被遣返后便处在她的父亲胡安二世和胞妹莱奥诺尔的监禁之下，这个女王有名无实。加泰罗尼亚人在1462年甚至企图将公国的统治权交给外国的诸侯。为了得到法国的援助，胡安二世不惜割让鲁西永，塞尔达尼两地给法国。1464年，他和莱奥诺尔将亲生长女布兰卡毒杀。布兰卡死后，莱奥诺尔成为纳瓦拉王位继承人，但她支持父亲，没有与他争位。后来他掌握了加泰罗尼亚的统治权，1472年入主巴塞罗那镇压加泰罗尼亚叛乱。1469年，他赞成第二个妻子所生的儿子