五军作战，参加辽沈战役、平津战役、衡宝战役。战后在中南军区任职，后任总后方勤务部副部长，后方勤务学院院长。1955年被授予中将军衔。1959年洪学智被免职，邱会作接任中国人民解放军总后方勤务部部长，1960年改任中国人民解放军总后勤部部长。“文化大革命”爆发后，受到冲击。1967年1月，邱会作受到总后勤部造反派的冲击，邱会作被抓走接受批斗，遭剃阴阳头，肩胛骨骨膜、肌肉断裂，右肋骨断裂并横出，多次昏厥。后邱派人写密信向林彪求救，林彪亲自下令将邱会作放出。邱会作放出后，刘伯承、聂荣臻、叶剑英三位元帅亲自