受河流沖刷，使桥墩覆土更浅，危及桥梁与行车安全，甚而发生桥梁遭洪水沖毁导致路线中断之事故，因此，台铁局决定改建这些老旧桥梁。该局计画重建的桥梁，除了已重建完成、或已局部改建、或将来另有重大路线工程计画需配合重建者之外，计罗列出29座桥梁，分别纳入「五大桥梁重建工程」及「铁路沿线老旧桥梁重建工程」两项计画。其中二水至林内间浊水溪桥的改建，属于「铁路沿线老旧桥梁重建工程」项目，是为第三代浊水溪桥。第三代桥建造于原第一代桥上游侧，由台铁嘉义工务段设计、兴福营造有限公司承包，下部结构为长圆形开口沉箱基础