南郡洛阳县（今河南省洛阳市）人。房恭懿之父房谟，官至北齐吏部尚书。房恭懿性情沉深，有器量，心胸开阔适合从政。在北齐出仕开府参军事，历任平恩县令、济阴郡太守，都有能干的名声。北齐灭亡，不得升迁。尉迟迥之乱，房恭懿参与，尉迟迥兵败，房恭懿被废于家。隋文帝开皇初年，吏部尚书苏威推荐他，授任新丰县令，政绩是三辅地区最好的。文帝听闻于是嘉赏，赐织物四百段，房恭懿以所得赏赐分给穷人。不久，再赐米三百石，房恭懿又用来赈济穷人。文帝听说制止了。当雍州所属县令每月初一朝谒天子时，文帝见到房恭懿，一定把他叫到坐榻前，向他征