由立法院行使之，导致位阶与立法院相同的考试院与监察院委员与正副副院长人事同意权、年度预算，皆须经由立法院审核行使之，导致日后各院人事同意权成为立法院执政党与在野党政治斗争的争议之一。2004年底，陈水扁总统提名之监察院正副院长人选与监察委员遭到以中国国民党为首的泛蓝杯葛，于立法院程序委员会冻结而无法排入议事程序，导致监察院正副院长与监察委员处于缺位状态长达三年半。2007年8月15日司法院大法官公布释字第632号解释，认定立法院不将此案排入议事程序已经牴触宪法，要求立法院进行适当处理。由于部分被提名者已