979年4月底已被派任驻南非及赖索托大使的末代驻华兼使葛钖迪离任后便常驻南非，教廷亦未再指派新任驻华大使，40余年来虽仍维持大使级外交关系并保留双方使馆及往来，但仅由最低层级的参赞衔临时代办常驻台北至今。而教廷作为国际组织的观察员，大致上不涉入个别国家的世俗议题；在中华民国邦交国联合递函时，教廷通常会依例派员陪同而未参与连署或发言。1984年，教宗若望保禄二世将万金天主堂列为宗座圣殿。1998年1月18日，教廷宣布擢升天主教高雄教区主教单国玺为枢机，2月21日于梵蒂冈接受教宗晋封，成为第一位以台湾主