钧、郭洪涛、戴季英为代表的左倾路线执行者，认为红二十六军及陕甘边苏区党政军领导干部是“右派”、“托派”、“AB团”，用各种非法手段大搞逼供，以莫须有的罪名在甘泉下寺湾、子长、瓦窑堡等地枪毙、活埋了200多名陕北红军干部和地方党政干部群众；关押了刘志丹、习仲勋、高岗等红二十六军营以上和地方县级以上的领导干部100多人。在陕甘根据地形成了人人自危、互相猜疑的严重局面。在队伍内部，凡是出身于地主、富农家庭的干部，统统列为肃反对象。吴起县、保安县、靖边县一些地方民团乘机颠覆苏区政权。
事变经