等感染的机制，黑殭菌也演化各种机制加以反制，例如分泌抑制昆虫免疫细胞的环形多肽黑殭菌素（destruxin）。黑殭菌与昆虫的共演化造成黑殭菌产生大量变种，以分别适应不同种昆虫宿主的免疫机制。
应用.黑殭菌与其他过去被归为本种的黑殭菌属真菌共可感染超过200种昆虫，可用作生物农药以控制蝗虫、蓟马、白蚁、小菜蛾、蟑螂、金龟子等害虫，还可以杀死孑孓，有助控制疟疾的传播。黑殭菌不会感染人类与其他嵴椎动物，在农业上作为杀虫剂、杀螨剂使用相对安全。华盛顿州立大学的研究团队与真菌学家保罗·史