自成大败，遁走商洛。进位为左都督。崇祯十四年（1642年），参与松锦之战，清军偷袭明军笔架山粮草得逞，明军辎重尽失，更无斗志。诸将趁夜突围，死伤甚惨。曹变蛟则放弃突围，突袭清军大营，身被两创仍拼死向前，直入大帐中，清军猝不及防，皇太极本人拔刀抵抗。遏必隆与锡翰偕同辅国公额克亲合力抵御，变蛟受伤撤离。崇祯十五年正月，明军副将夏承德遣人密约降清，以为内应。二月十八日夜晚，夏承德开城门，清军由南城墙登梯而入，松山城陷。洪承畴与曹变蛟与辽东总兵王廷臣、巡抚邱民仰皆被俘。与4000名明军俘虏被皇太极处决，仅洪承畴