比基因组其他部分更高的突变概率， 根据Graves的报道指出，这种概率提高可达4.8倍。 
未来进化方向.Y染色体的退化可能导致其他染色体将其原有基因“接管”，最终会使得Y染色体完全消失，而一个新性别决定系统则会诞生。几种同属的鼠科及仓鼠科的啮齿目动物已经通过下列途径达到Y染色体演化终端：在啮齿目动物之外，黑麂（"Muntiacus crinifrons"）通过融合原有的性染色体和常染色体演化出了新的X染色体和Y染色体。灵长目动物（包括人类）的Y染色体已严重退化这一现象预示着，这