兰西的内部问题严重到他已无力挽救。1361年，年仅15岁的勃艮第公爵菲利普一世骤逝而没有留下继承人，成为卡佩王朝在勃艮第公国的末代领主。约翰二世为了确保勃艮第公国忠于王室，重新将这块领土分配给么子—勇敢的菲利普，并且请求神圣罗马帝国授予勃艮第法兰琪-康堤地区。同属卡佩王朝的纳瓦拉国王查理二世想宣称勃艮第公国的继承权，造成纳瓦拉国王与法王发生冲突，直到1364年科谢雷战役，查理二世的战败确立瓦卢瓦─勃艮地王朝的统治。勃艮第公国在接下来100多年不断扩张，并在路易十一世重新兼併前成为法兰西背后的一根芒刺。