二级结构（）在生物化学及结构生物学中，是指一个生物大分子，如蛋白质及核酸（DNA或RNA），局部区段的三维通式。然而它并不描述任何特定的原子位置（在三级结构中描述）。二级结构是由生物大分子在原子分辨率结构中所观察到的氢键来定义的。蛋白质的二级结构通常是以主链中氨基之间的氢键模式来定义〈与主链－侧链间以及侧链－侧链间的氢键无关〉，亦即DSSP的定义。而核酸的二级结构是以硷基之间的氢键来定义。 在二级结构中，特定的氢键模式往往伴随着其他一些结构特征；但如果只考虑这些结构特征而忽略氢键本身，则会导致所定义