肉食鱼饲料。黑青斑河鲀等多种鲀类可食用水族缸中水草上附着的难以发觉的小型螺类，有助于保持鱼缸洁净。
生物学研究.黑青斑河鲀是拥有已知最小基因组的嵴椎动物，仅约340兆碱基对（约为人类基因组大小的十分之一）。其基因组相当缺乏内含子与基因间序列，基因间距非常压缩。因此和另一种基因组稍大的河鲀红鳍多纪鲀一同被选为遗传学和基因组学研究的模式生物。其基因组草图于2004年发布。
疾病.黑青斑河鲀可能患一般鱼类共有的白点病，此时鱼体外观可看到很多白色点状附着物。若