阿霉素的急性副作用包括恶心、呕吐和心律不整。它也可引起嗜中性白血球缺乏症（），以及完全的脱发。另一个比较温和的副作用是尿液变色－给药后48小时会将尿液变成鲜艳的红色。当阿霉素的累积剂量达到500-550mg/m²，副作用包括充血性心衰竭（CHF）、扩张型心肌病，甚至死亡的发生风险都显着提高。阿霉素心脏毒性的特点在于粒线体氧化磷酸化导致的剂量依存性下降，阿霉素和铁的相互作用产生的活性氧可以破坏心肌，造成肌原纤维的损失和细胞质的液泡化。此外，部分患者可能发展为「肢端红肿症」 (PPE)，特点为手掌或脚掌上的皮