持「征韩论」的势力逐渐抬头。日本终于1876年的江华岛事件中用大炮和军舰轰开了朝鲜的国门，翌年，日朝双方签订《江华条约》，朝鲜承认日本外交使节可以在汉城驻留，并废除了倭馆。釜山倭馆的200年历史至此结束。
现存的倭馆地名.韩国庆尚北道漆谷郡有倭馆邑，为该郡郡厅所在地。倭馆驿也是京釜线上的一个车站名，位于京釜高速道路交汇处。该地区曾是万历朝鲜战争时期日本军队的兵粮集积场所，故名倭馆邑。