世后，1061年教宗选举于1061年9月30日在罗马圣伯多禄锁链堂举行。根据尼古拉二世的教宗诏书《》，主教级枢机是教宗选举的唯一选举人，这在罗马天主教会历史上属首次。一位非枢机和巴塔里亚运动的其中一位发起者安塞尔·莫达·巴乔主教被选为教宗亚历山大二世，而教宗加冕仪式则于1061年10月1日傍晚在圣伯多禄锁链圣殿举行，因为选举的反对者使加冕仪式无法在旧圣伯多禄大教堂举行。
选举过程.巴乔主教有他的朋友、教宗诏书公布的推动者希尔德布兰枢机以及的支持罗贝尔·吉斯卡尔被封为时保护尼古拉二世