年督修樊口大堤，建民信闸、民生闸，开辟月河，修筑王唐黄堤等堤防工程，三年后工程完工。1922年，吴兆麟被公推为“武昌辛亥首义同志会理事会”主席，并倡议修建武昌首义公园。1923年2月15日，吴兆麟获授将军府将军。晚年，吴兆麟和日知会的老朋友张纯一等人研习佛经，主张“心治即国治”、“心安即国安”。1938年日军攻占武汉后，吴兆麟因长期患有哮喘，故留居武汉，每日读佛经。日军胁迫其出任伪军总司令、湖北省政府首席参议，被吴兆麟拒绝。日本人遂将吴兆麟软禁。1942年10月17日，吴兆麟在武昌因哮喘病逝。重庆国