任北伐，潘文璘和吴文楚以参赞军务的身份随军，监视武文任的举动。武文任将阮有整擒杀后，图谋割据北河自立。二人将此事报告给阮惠。阮惠率军突袭昇龙，杀死武文任，任命吴文楚留守昇龙，潘文璘、武文勇、阮文雪、吴时任留下辅佐他。1788年，清军以复辟后黎朝为名入侵安南。潘文璘在月德江（今梂江）阻击清军，战败逃回。吴文楚封锁了战败的消息，西山军顺利撤往三叠山，并由阮文雪向在富春（今顺化）的阮惠告急。阮惠兵至三叠山，与吴文楚、潘文璘会合后，阮惠亲率主力部队直攻昇龙，吴文楚、潘文璘担任先锋。阮惠为了防备旧阮的阮福映复