底部的缺氧环境，行光合作用以进行初级生产的生物较少，取而代之的是透过将水中丰富的硫化氢转换为硫获取有机物，底部的水质会较顶部混浊。海下水蚀洞的生物组成与海洋类似，其中甲壳类的生物较为丰富，除了桨足纲的生物外（在1979年前被认为已灭绝，现存28种，活化石之一），亦有混足目、的特有种存在；然而部分种类的生物在地理分布上呈现隔离分布，例如桨足纲分布在加勒比海、加那利群岛及澳洲西海岸；分布在夏威夷、阿森松岛和百慕达群岛等地。这样的分布情形被认为可能与特提斯洋的存在相关，但目前没有足够的遗传学证据证明这个猜想。