邀出任上海医学院（今复旦大学医学院）临床内科，热带病学，寄生虫学和实验诊断学的副教授，并兼任科主任。后晋升上海医学院（今复旦大学医学院）教授，出任中山医院（今复旦大学附属中山医院）院长。后入英国伦敦大学热带病研究院（）学习。1933年，获得美国洛克菲勒基金会资助，赴印度，入读英国皇家热带病研究院（位于英属印度加尔各答），后获得热带病学博士学位。1934年，学成回国。解放后，应元岳曾担任第二军医大学教授。1956年，加入中国共产党。1956年，兼任并接管上海同济医院（今同济大学附属同济医院）内科的教学