原生菌类,如黏菌(slime molds) 和水霉菌 (water molds)，他们的外表特征与真菌界的成员相似，且皆为异营，储藏肝醣，细胞壁含纤维素与几丁质 (chitin)，因此有些分类学家仍将黏菌与水霉归在真菌界。但他们与真菌界的成员的关系并不密切，如他们有游走细胞 (swimming cells)，具鞭毛; 或行变形虫运动，而与菌类不同 ; 黏菌有吞噬作用，吞入固体食物，而菌类则分泌酵素，将食物分解而行吸收。此外，有些水霉会储藏一种碳水化合物一mycolaminarin，此物质很像褐藻中的储藏物