科摩罗足球协会是专门管辖科摩罗足球事务的组织。科摩罗足球协会成立于1979年，却迟在2005年才加入国际足协。此外，它还是非洲足协、南非洲足球协会议会和阿拉伯足球协会联会的成员之一。