东京证券交易所的交易楼层于1999年4月30日关闭，全部改为电子交易，而新的TSE Arrows（）于2000年5月9日启用。东京证券交易所是全球第二大的证券交易所，但是却不是一个大的国际融资中心，在东京证交所股票上市的海外企业相当少，基本上以日本的企业为主，而纽约等其他国际性的证券交易所，则有相当大数量的外国企业。2000年，广岛证券交易所及新潟证券交易所併入东京证券交易所。2012年11月20日，东京证券交易所、大坂证券交易所交易所两大证券交易所共同召开记者会，宣告两家证交所将于2013年1月1