被打败后，苏格兰被新模范军占领以肃清和解誓约派，政权也改由教会派控制。克伦威尔在1648年十二月肃清英格兰国会内长老派议员，更于次年一月在未曾通知苏格兰国会的情况下处决查理一世，前者被苏格兰视作背叛同盟，后者更被视作对君权神授的亵渎。苏格兰国会遂而拥戴查理二世为苏格兰和大不列颠国王，并承诺查理二世会复获英格兰的王位。1649年至1651年的中苏格兰败北，标记着誓约派势力的瓦解，苏格兰也因而併入克伦威尔领导的英格兰联邦。1652年的《》及1654年4月12日的《护国公有关英格兰和苏格兰联合条例》（An Ord