（1852年），以直隶总督协办大学士，九月授为文渊阁大学士，留任总督。咸丰三年（1853年）为钦差大臣，节制黄河南北军队，阻止太平天国北伐。太平军打到临洺关，讷尔经额逃到广平府。太平军进逼京畿，讷尔经额被下狱问罪。五年（1855年）出狱戍边，次年回京守清慕陵。