内他曾帮助因参加滦州起义而被捕的冯玉祥获得释放。1912年（民国元年），他任北京总统府警卫军参谋官、左路备补军统领。后他升任警卫军统领兼京畿军政执法处处长。1914年（民国3年），其所属部队改组为陆军第7师，陆建章任该师师长兼豫陕剿匪督办。其后他在陕西省讨伐白朗。同年6月，他继陕西都督张凤翙之后，任威武将军督理陕西军务（陕西将军）。1915年（民国4年）12月，袁世凯称帝，陆表示支持，获封一等伯爵。护国战争爆发，袁世凯取消帝制，陆建章在陕西省的权威丧失。1916年（民国5年）5月9日，其属下陕北镇守