参加第一次长沙会战谋划，11月，又赴桂南前线参与桂南会战谋划。1940 年春赴柳州任军事委员会桂林办公厅(主任李济深，副主任林蔚)总顾问。1941年1月皖南事变后，何遂获知八路军重庆办事处经费困难，便到重庆曾家岩周公馆面见董必武援以钱款。后来，董必武、叶剑英将延安生产的毛毯和衣料送给何遂作为回赠。1941年9月，参与第二次长沙会战的谋划。11月中旬，参加蒋介石主持的第三次南岳军事会议。1942年3月，在重庆参加国民政府立法院全体会议，通过《国家总动员法》；12月，参加立法院例行会议，通过“公务员不得直接或间