(all-vs-all).Hi-C使用了高通量测序的方法，理论上它能够捕捉到所有的染色体交联。
生物学意义.3C方法已经从很多方法帮助了科学家更加深入的了解细胞核结构和基因调控，包括染色体新结构特征的发现，染色质环，以及对转录调控机制（破坏可能导致疾病）的理解增加。3C方法已经证明调控元件与其调控的基因在空间上接近的重要性。例如，在表达球蛋白基因的组织中，β-球蛋白基因座控制区与这些基因形成环。在没有表达基因的组织中没有发现该环。 这项技术进一步帮助了模式生物和人类染色体的