里的淤泥相对较少，沉积物量仅为尼罗河的10%。如同尼罗河一般，每年皆发生洪水，汛期于9月开始，11月达到高峰，在翌年5月结束。而尼日河有相当特殊的内尼日三角洲，该地区的坡度较为平缓，内尼日三角洲多、沼泽、湖泊及湿地，面积约等同比利时，每年的洪水则利于渔业及农业发展。尼日河从几内亚入马利的水量约每年40立方千米，因蒸发及渗流，而至中游河段，尼日进入奈及利亚的水量约每年36立方公里；于塞古及廷巴克图间，由于蒸发及渗流旺盛，而流失了近三分之二的水流，估计一年流失31立方公里的水量，但每年流失量仍有变动。