4页以后的内容部份被撕去，有传言谓他在被囚期间曾经游说曾国藩反清自立但未遂。1864年8月7日，被曾国藩下令处刑于江宁，免凌迟，处以斩首，终年40岁。在临刑前，李秀成毫无戚容，谈笑自若，并写有十句绝命诗叙其尽忠之意。李鸿章写信予曾国藩，表示在阅览完《李秀成自述》后，也感动赞誉李秀成是「英雄人物」。
其他.今苏州尚存太平天国忠王府旧址。李秀成从苏州撤退到南京以前，将天王洪秀全赐予他的佩剑交给堂弟侍王李世贤。1864年，李世贤在溧阳战败，此剑落入查理·戈登手中。戈登将此剑赠予维多利