禄11年（1698年），在第5代将军德川纲吉的时候，相当于现在的上野公园大喷水池的地方，宽永寺的正殿上的中堂建造完成。现在上野公园的区域就位在原本宽永寺的范围内。在极盛时期，寺庙面积甚至是现在上野公园的2倍。
上野战争.日本文学专家爱德华·山第斯笛卡（Edward Seidensticker）曾在书中描述宽永寺的在战争遭受破坏的过程。在戊辰战争中，拥护天皇的军队佔领大部分的东京及江户城后，虽然大部分的德川军队纷纷投降，但是有一支驻守在上野的军队仍然打算抵抗到底。这支军队大约