名于1995年冷冻的儿童鼻咽拭子样本中找到HCoV-HKU1，使得HCoV-HKU1的记录提前到1995年，并且研究人员通过进化树分析认为病毒早期可能存在其它分支 。
基因组.人类冠状病毒HKU1的基因组约长30000nt，其GC含量仅32%，是冠状病毒中GC比最低者。其基因组编码冠状病毒皆有的复制酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）与衣壳蛋白（N）等四种结构蛋白，此外还有（HE）与ORF4和ORF8两个开放阅读框编码辅助蛋白，其基因顺序为1ab-HE-S