在政务院文化教育委员会的指导下展开工作。中央人民政府卫生部作为国家行政机构，对全国范围内的卫生工作进行统一领导和管理。
机构设置.1950年至1951年间，中央人民政府卫生部机关设置为办公厅和4个局室：1952年，中央爱国卫生运动委员会成立，其办公室设在中央人民政府卫生部。