权力是不容置疑的。然而，扩张政策为印加带来了问题。很多被印加征服的地区仍然保留自己的文化身份，对印加君主来说，是难以驾驭的臣民。辽阔的版图、崎岖的地形、落后的技术也增加了管理印加的困难。瓦伊纳·卡帕克的儿子对印加历史也产生了极大影响力。瓦斯卡尔和阿塔瓦尔帕，是他最具影响力的儿子。瓦斯卡尔为皇后钦查·奥克略所出，是合法儿子。而阿塔瓦尔帕，则为基多一名公主所出，是非法儿子。两人在印加末年扮演了重要角色。在瓦斯卡尔和阿塔瓦尔帕之间因为继位问题爆发的内战，对西班牙人皮泽洛极其有利。阿塔瓦尔帕曾随父亲到北方征