石是由一些微生物，尤其是蓝绿菌（旧称蓝绿藻）所黏结堆砌而成，不过事实上古代的叠层石只有少数含有微生物化石。关于如何有效辨识生物性与非生物叠层石，是地质学的研究对象之一。地球上有许多形成于前寒武纪的叠层石，其中较早的（如太古元）可能是单细胞蓝菌聚落所遗留的化石；较晚的（如显生元）则可能为真核绿藻的早期型态。而澳洲西部最古老的蓝绿菌叠层石为35亿年。现代叠层石主要可见于盐湖或潟湖当中，这些极端地带较缺乏动物的觅食，例如澳洲西部的鲨鱼湾。此外位于墨西哥北部沙漠的，也有发现一些处于淡水之中的叠层石。Sect