国政府以汉奸罪起诉并入狱候审。1946年，台籍人士组成的台湾光复致敬团前往中国大陆，经该团成员刻意营救与奔走后，柯政和得以特例出狱，并回北京师范大学继续任教。1949年中华人民共和国建国后，柯丁丑再度遭到解职，赋闲在家。1966年，文化大革命爆发，再度因汉奸身分遭到公审。在刑求迫害中，双目失明并全身瘫痪。之后，并被放逐至宁夏回族自治区。1979年，病逝于该地。
评价.柯丁丑因为二战期间支持日本军方，其音乐成就遭到两岸政府刻意忽略。事实上，他不但应用本身汉文基础，将己身音乐长才贡献于