何万有理论也应该是基于一些公理，从这些公理能够演绎出所有观察到的现象。德谟克利特首先提出原子的概念，将所有观察到的自然现象归纳为原子的运动。在古希腊时期，哲学家猜测，人们观察到的自然现象之所以具有显而易见的多样性，完全是因为原子与原子之间的碰撞。在原子论之后，17世纪的机械哲学建议，所有作用力可以最终约化为原子与原子之间的接触力，在那时，原子被想像为微小的固体粒子。17世纪后期，艾萨克·牛顿对于长距离引力的描述意味着并不是所有大自然作用力都源自于物体接触的机制。在《自然哲学的数学原理》这本巨着里，牛