虫门生物的尺寸变化很大。许多仅10-20 μm，但也有很大尺寸的原生生物品种，如着名的大变形虫（"Amoeba proteus"），达到800 μm长，并且由于它的可观的尺寸成为了用于研究的有代表性的细胞。多核变形虫，如卓变形虫属（"Chaos"）与多核变形虫属（"Pelomyxa"）可达数毫米长，而某些黏菌面积可达数平方英尺（接近1平方米）。
分类.根据种系发生学，变形虫是动物与真菌的姐妹群，源自共同的祖先单鞭毛生物（Unikonta）：变形虫门根据种系发生学可分为三个亚门。