10月25日台湾由中华民国接管，11月国民政府教育部接收台北帝国大学，易名「国立台北大学」。当时与省立师范学院（台湾师范大学前身）、省立农学院（中兴大学前身）、省立工学院（成功大学前身）并列为台湾省仅有的4所高等教育机构。1945年12月15日，经国民政府行政院院会决议，教育部令国立台北大学正式定名为「国立台湾大学」，同时依中华民国大学制度，将帝大时期各「学部」改称「学院」，并将文政学部划分为文学院及法学院，加上理、医、工、农共6个学院、22学系；1949年，中华民国政府因内战失利从中国大陆撤退至台湾，