入19球，成为香港甲组足球联赛华人首席射手。2009年7月6日，陈肇麒首次入选香港足球明星选举的香港足球明星，他今届为南华合共射入19球，在射手榜上位列三甲成为本地华人首席射手，优异表现为球队取得联赛锦标。2009年，陈肇麒与无线电视女艺员李绮雯结伴同游澳门的新闻被广泛报道，揭示两人已经交往半年，成为球圈热话。其后有消息指陈肇麒瞒着李绮雯与其好友模特儿Natalie交往，导致李绮雯与Natalie关系破裂，更要求陈肇麒澄清真相。陈肇麒、李绮雯及Natalie的三角关系令到陈肇麒声名大躁，本来属于体育版的他顿