凭此功绩在元和2年（1616年）增封至上野高崎藩5万石。元和3年（1617年），康长获增封至信浓松本藩7万石。元和9年（1623年），康长成为德川家光的护卫，驻守于江户城西之丸。宽永元年（1624年），康长病倒，但是不久康复，再度出仕，并且获得德川秀忠和家光赐予茶壶雾崎和行光的短刀作为贺礼。康长在松本藩内重新组织家臣团，并且建造城下町，同时兴建让和足轻一同居住，此外还将豪族较多的信浓的地方知行废除，改行。另外，他将藩内领地划分为15组行政区。宽永3年（1626年）开始，康长花了总共5年时间执行惣