强化子相关的基因表现会特别对扰动敏感，可能控制细胞状态的转换，这也导致由超级强化子调控的基因常对影响转录的小分子较为敏感。
历史.有关强化子对转录调控的研究始于1980年代。 不久后发现了一些大型或多单元的转录调控区域，包含基因座控制区、成簇的开放调控元件与转录起始的平台等。近期的研究结果表明，这些不同类别的调控单元可能都属于超级强化子。2013年，两组研究团队分别在基因组中对决定细胞分化种类重要的位点附近发现了大型强化子，其中的团队发现了超级强化子，法兰西斯·柯林斯的团队则发