白头海鵰较喜欢栖息在海岸、河流、大湖泊附近，因为这些地方有很多鱼类，对牠们来说是极丰富的食物资源。研究显示牠们较喜欢周长超于7英里（11公里）的水源，而面积大于3.8平方英里（10平方公里）的湖泊就最适合要繁殖的白头海鵰。白头海鵰会在较老的松柏或硬木树栖息和筑巢。牠们会选择结构开放和方便捕猎的树木，但选择的树木的高度或种类并不及水源的重要，若环境许可的话，牠们宁可选择在水源附近的大树。白头海鵰对人类的行为极为敏感，也许是因为人类有时对牠们作出骚扰的行动，才会令牠们如此不安。牠们会选择距离少量人类骚