同年升上仪同三司，以本官代理肆州刺史，又升任仪同三师。干明元年（560年），高长恭出任领左右大将军，增加食邑一千户，当年三月壬申（560年5月1日），高长恭被封为兰陵郡王。皇建元年（560年），高长恭增加食邑总计一千五百户，转任中领军，加开府仪同三司。齐武成帝高湛登基，高长恭出任使持节、都督并州诸军事、并州刺史，其余官职如故。太宁二年（562年），高长恭别封鉅鹿郡开国公，食邑一千户，晋升领军将军。突厥攻入晋阳，高长恭尽力反击。
邙山之战.河清三年（564年）十一月，北周进攻洛阳，十