央政治学校（今政治大学前身）时相识，于1944年结婚，隔年生下马以南。马以南为家中长女，为马英九的大姐。1945年底，马鹤凌与秦厚修赴台湾，负责接收工作。直到1947年，才返回湖南。马以南这段时间托付给湖南宁乡外婆家，由外婆带大。1948年第二次国共内战爆发，马鹤凌带着秦厚修与长女马以南先到台湾。1949年，马鹤凌、秦厚修与马以南又到达香港，等待把全家接出来。1952年，马鹤凌带着全家，又由香港移居台湾。马以南此后在台湾长大，中学就读北一女中，大学先考取台湾大学外文系，后转学植物病理与微生物学系