保守派同僚发生冲突，但他并没有移居国外。1866年圣彼得堡审查委员会曾试图指控谢切诺夫散布唯物论和“贬低基督教品德”。
影响.谢切诺夫的工作为动物和人类行为的反射研究以及神经科学奠定了基础。受他的影响，1918年弗拉基米尔·米哈伊诺维奇·别赫捷列夫和弗拉基米尔·尼古拉耶维奇·米亚西谢（Vladimir Nikolayevich Myasishchev）成立了“大脑和心理活动研究所”。