相较于东线，西线的植物景观已针阔叶造林地为主，代表性树种为柳杉、台湾杉、台湾铁杉、台湾二叶松、台湾红榨槭、木荷、大叶石栎等。草本植物为台湾杜鹃、五节芒。在大鹿林道西线及东线，有纪录过出现踪迹大型哺乳动物为山羌及台湾猕猴，小型哺乳动物为赤腹松鼠、条纹松鼠、白面鼯鼠、大赤鼯鼠、台湾森鼠、白鼻心、台湾小蹄鼻蝠等，在东线甚至有发现过麝香猫族群出没的踪迹。在林道周边鸟类以山雀科、画眉科数量较多，在东线常见的鸟类有蓝腹鷴、帝雉、金翼白眉、白耳画眉、酒红朱雀、大冠鹫、鸺鹠、灰林鸮、栗背林鶋，西线常见的有黄腹琉