改封至位于周防国最东侧的岩国，石高也减至3万石。此后虽然江户幕府将吉川氏视为外样大名，但吉川氏始终自认为毛利氏的家臣。19世纪江户幕府结束后，新政府在1868年正式承认岩国领为独立的藩，虽然当时岩国领领主已于1867年3月20日过世，但在长州藩藩主毛利敬亲的安排下隐匿了此事，因此当时新政府依然承认吉川经干为岩国藩藩主，直到1869年2月9日吉川氏才以吉川经干隐居的名义将家督让与长男。1871年废藩置县后，岩国藩被改设为岩国县，但在同年底的第一次府县整併中，岩国县又被併入山口县，而吉川氏也成为华族。