两岸海运直航、全面通邮、食品安全管理机制，以及面对世界金融风暴两岸如何应对等问题进行协商。完成签署《海峡两岸空运协议》、《海峡两岸海运协议》、《海峡两岸邮政协议》、《食品安全协议》等四个协议。于2009年4月26日在南京-紫金山庄举行，海协会会长陈云林和海基会董事长江丙坤在南京举行两岸协商谈判，针对共同打击犯罪及司法互助、两岸定期航班、两岸金融合作等议题进行协商。完成签署《海峡两岸金融合作协议》、《海峡两岸空运补充协议》、《海峡两岸共同打击犯罪及司法互助协议》 三项协议。于2009年12月22日