实际每日开行动车组列车44.5对。
列车.宁杭高速铁路线上运营列车以和谐号CRH380B系列动车组为主，另有和谐号CRH1系列、CRH2系列、CRH380A系列、CRH380C系列动车组参与运营。2015年7月1日起和谐号CRH380D型动车组加入运营。2017年11月21日起复兴号CR400BF型动车组加入运营。
车站.宁杭客运专线全线由北向南共设南京南、江宁、句容西、溧水、瓦屋山、溧阳、宜兴、长兴、湖州、德清和杭州东合计11座车站，其中南京南站和杭州东