，碑上刻文却指建庙年代为1749年（清干隆14年），两相差距11年，但较符合《彰化县志》「干隆中」的记载。卓克华2006年出版的《寺庙与台湾开发史》一书中，另摘录有一则南瑶宫较为传奇的建庙缘起：
修缮风波.南瑶宫在十八世纪清朝干隆年间曾经两度修缮，1802年（嘉庆7年）再倡重建，扩大庙基五倍。到了日治时期，「终感湫隘为不便」，由于香火旺盛，庙宇空间又嫌狭窄，遂成立「南瑶宫改筑会」，耗资六万日圆，于1916年完成改建，成为一座混合中西日式风格的庙宇，不过「信徒排斥这种非台湾传统寺庙