吴、孙二人的剩余地盘（安徽北部及江苏北部），吴、孙只能投靠奉系。1927年（民国十六年）5月，已迁移南京的国民政府继续推进北伐。至6月，国民革命军攻入河南，奉军败走河北、山东，吴佩孚残部被歼灭，从此一蹶不振。张作霖则在北京成立中华民国军政府（史称安国军政府），将各省所辖北洋军统称安国军，自任中华民国安国陆海军大元帅，统一指挥抗击国民革命军。此时期国民党先后陷入宁汉分裂及国共决裂等政争，爆发清党和中共南昌起事。7月，张宗昌的安国军（直鲁联军）接连夺回临城和徐州；8月，孙传芳乘势率安国军（奉军和五省联军）沿