该殿分隔为数室。根据记载，明朝干清宫有暖阁九间，分为上下两层，共置坐卧之床27张，后妃们得以来此进御。万历帝的郑贵妃为了争当皇太后而搞出的“红丸案”、泰昌妃李选侍争当皇后而移居仁寿殿的“移宫案”，均是在干清宫发生。明朝，干清宫也曾经用作皇帝守丧之处。清朝顺治元年正月重建至顺治二年五月成，为后妃居所。顺治十二年正月照明代规制重建，顺治十三年七月建成，始作皇帝寝宫，因建筑品质低下经雨辄漏，顺治十七年三月放弃使用。康熙八年与太和殿、交泰殿同时重建，因康熙十八年北京地震，康熙十九年再次重建，同时间太和殿等建筑遭