已从北平迁至南京的师生继续迁移，经湖北、湖南、贵州各省而抵四川，到自贡自流井静宁寺复校。此后他辞职，重新投入研究工作。1940年任中国地理研究所研究员兼海洋组主任。1942年，率领中国地理学会海洋组专家考察福建省沿海地区，以调查战略资源。1944年应陈仪做主任委员的台湾调查委员会聘，11月1日兼任台湾调查委员会专门委员。1945年末与东北帝国大学校友陈建功、苏步青2理学博士及同样留日的蔡邦华、陆志鸿与国民政府特派员罗宗洛共6位教授到台湾，与杜聪明、林茂生同接收台北帝国大学。台湾行政长官公署11月成立国立