二部第四课的业务移管机甲本部。开设当初，陆军机甲本部设在东京市麹町区永田町的陆军省内。1941年5月5日的陆军机甲本部业务分掌规定（陆达第30号），内设机构：太平洋戦争开戦前日的1941年12月7日、陆军机甲本部搬迁至东京市牛込区市谷本村町的陆军士官学校旧址し、陆军省も翌週15日に同地へ移転した。1945年（昭和20年）年11月26日、陆军省令第56号陆军机甲本部令廃止。
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