冲突中官府偏袒老教而煽动起事。于河州之役中杀死支援之杨士玑，起义军分兵从小道绕过清军勒尔谨部，直取甘肃首府兰州。兰州城只有八百守兵，一日交战，便损兵三百，甘肃官吏惊恐。干隆皇帝恐兰州不保，遂命尚书和珅等为钦差由京城赴甘肃，又命军机大臣阿桂督师，速调陕西、四川、新疆等地援军进剿。合共十几万军队入甘肃支援。十日后，巴彦岱率三万大军到达兰州城下，撤了陕甘总督勒尔谨的职，暂任陕甘地区军事指挥，组织军队反击叛乱军。李侍尧到达后正式接任陕甘总督，只用四万军队把十万起义军打得溃败，分五路进军循化。二十日后，和珅军到达甘肃