石一般漂浮在海水上层，下面经常是极其缺氧区域，没有生物。菊石死后，沉到海底，逐渐埋没。细菌分解遗体时候，把附近水中性质变化，降低矿物质溶解度，尤其是磷酸盐和碳酸盐。
化石.菊石化石上面有一圈一圈的矿物质，因此保存很多高质标本。在欧洲的中世纪时期，某些菊石的外壳化石被人们视为盘曲、石化的无头蛇，称为蛇石，例如指菊石等，商人们会在菊石的开口刻上蛇的头后卖给旅者。