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西班牙内战.舍尔将军号的首次任务为1936年7月，被派到西班牙疏散被西班牙内战卷入的德国平民。它还暗中监视载满武器、援助共和政府的苏联船队以及保护运输武器给国民军的德国船只。1937年5月31日，舍尔将军号砲轰了共和军于阿尔梅里亚的军事设施，以报2天前共和军飞机轰炸其姊妹舰德国号之仇。到了1938年6月末，它已结束了8次的部署任务。在接近部署于西班牙的任务结束前，舍尔将军号于1938年4月被作为一个投票所，专给就读于罗马的圣玛利亚灵魂之母堂（Santa Maria dell