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初期.圣巴多罗买医院由亨利一世国王的宠臣华西亚（1114年逝世后葬于附近的圣巴多罗买大教堂）于1123年创办。亨利八世国王下令解散修道院后，医院运作虽然未受影响，但收入却被削减。亨利八世于1546年12月签署合同，将医院授予伦敦市，从而重新创办圣巴多罗买医院，并于1547年1月的专利特许证赋予其物业和收入。医院的法律名称为「亨利八世基金会伦敦市郊西士美菲贫民院」（），但公众从未使用这名称。医院首任院长是亨利的医生。在此处，17世纪的威廉·哈维研究循环系统，18世纪的和约翰·阿