广泛的贸易，征服宫古、八重山、与那国等岛，迎来了第二尚氏王朝的全盛期。至1537年，其继任者尚清王攻取奄美群岛，奠定琉球“三省三十六岛”的版图。1609年，萨摩藩在德川幕府的许可下发兵侵略琉球，将尚宁王及众多王公大臣掳至鹿儿岛城，史称「己酉倭乱」。在明朝的交涉下，萨摩藩释放了琉球君臣，但强迫尚宁王签订《掟十五条》，承认琉球臣属于萨摩藩，又强佔了奄美群岛。从此，琉球成为萨摩藩的附庸国，但仍旧向中国朝贡。萨摩藩强迫琉球断绝与东南亚、朝鲜以及日本其他藩的贸易，财政极度困难，后来琉球先后提拔了向象贤（羽地王子朝