1月，清华大学交叉信息研究院姚期智教授宣布研制出世界上第一个量子路由器并在实验室成功演示。3月，薛其坤院士发现量子反常霍尔效应，被杨振宁认为是第一次从中国实验室里发表的诺贝尔奖级的物理学论文。2001年4月29日是清华大学90周年校庆日，海峡两岸的北京清华和新竹清华首次合办校庆。4月22日，北京清华校长王大中率团访问台湾，26日，新竹清华校长刘炯朗率团访问北京。此外，两校之间还举行学生排球友谊赛等诸多庆祝活动。清华的九十周年建校大会在新建成的综合体育馆举行，中共中央总书记、国家主席江泽民、国务院总理朱镕