不以异戊二烯作起始原料，而是以活化的形式参与合成，即焦磷酸异戊烯酯（IPP）和二甲烯丙基焦磷酸（DMAPP）。IPP和DMAPP有两种生物合成的途径：发生在胞浆中的甲羟戊酸途径与质体中的非甲羟戊酸途径。前者中，两分子乙酰辅酶A通过克莱森缩合反应生成乙酰乙酰辅酶A，再与另一分子乙酰辅酶A发生羟醛缩合，还原水解，得到萜类的合成前体甲戊二羟酸（3-甲基-3,5-二羟基戊酸）。而后经过甲羟戊酸激酶（MVK）和磷酸甲羟戊酸激酶（PMVK）的作用，再经过失磷酸和脱羧得到焦磷酸异戊烯酯，异构化生成二甲烯丙基焦磷酸。后者中