而吸引多家欧洲主要球会注意。在2000年1月，意甲劲旅国际米兰以1600万欧元的价格击败竞争对手皇家马德里将科尔多巴签下。加盟国际米兰后，科尔多巴迅速成为主力球员。他与马特拉齐的后防搭档配合默契，成为球队中坚。2005年的意大利杯上，他顶替正在代表阿根廷参加联合会杯的萨内蒂成为球队队长，并在之后开始担任球队的副队长。随着年龄的增大，科尔多巴已成为了球队的替补。2008年6月9日，科尔多巴将自己与国际米兰的合同延长到2012年6月30日，确定了自己将在国际米兰结束自己的职业生涯。科尔多巴在国际米兰