到1999年后改建为完全接通。大堂内有不同类型的商店，如便利店、零食店、面包糕饼店、凉茶专卖店及外卖寿司店等。同时设有自助服务设施：包括自动柜员机、自动售卖机以及香港邮政邮箱。大堂非付费区设有「会员服务站」，供乘客享用港铁友礼会的会员优惠。在互联网服务上，粉岭站大堂及月台均设有由电讯盈科提供的Wi-Fi热点，乘客可在候车时以Wi-Fi功能的电子器材连接互联网。
月台.粉岭站设有2个侧式月台，位于地面，不设月台幕门。粉岭站月台中央设有扶手电梯通往大堂，月台两旁均设有紧急出口