复杂，而且也深深影响着病原的长期演化，由于微生物和宿主之间的共同演化出新病原需要时间，在一般情况下，病原要找上先锋的攻击目标并非易事，通常需要直接地破坏环境平衡，或是借生态变化，引发物种迁徙，甚至人为消灭之病原，可由实验室演化后释出。通常首次流行时，由于医疗、公共卫生经验不足，死亡率将最为严重，但若是快速致死的疾病，宿主很可能在病原开始蔓延之前死亡，而毒力对宿主生理运作的改变，也将影响传播的结果，例如唿吸道感染可促使患者将病原咳至空气散佈，霍乱则可借由爆炸性的腹泻增加分布的面积。
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