出处、功效及主治病症，分门别类。为配合国际保育，庙方也将古签中的保育类动物药材去除，改以其他中药材代之。后殿前摆放两座习字炉，为清治时期习字炉的复原品，见证当年树人书院历史。殿内供奉的神农大帝为半裸、着草裙的原始人造型，据说日军进入时还吓得以为是《桃太郎》中的「鬼」。后殿曾奉祀妈祖，后迁祀于大稻埕慈圣宫。殿内有一牌位专为分类械斗牺牲者而设。大雄宝殿内奉祀释迦牟尼佛。庙后面原有乞丐寮，系清官府为让乞丐们过自治生活而设，据说这群乞丐曾集众之智挽救大龙峒免受械斗中敌对群众突袭。
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