辛丑条约》签订后，定居北京并且居住在东交民巷使馆区的欧洲人显着增加，这些侨民要求就近修建教堂以进行宗教活动。经法国籍北京主教樊国梁（Bishop Pierre-Marie-Alphonse Favier）与法国驻华领事协商，法国领事馆将地皮转让，由法国遣使会拨款，法国籍神父高嘉理负责，在现在的位置修建教堂，后期的建筑工作转由法国人斩利国负责。1904年，教堂建筑竣工，正式开堂。开堂后的东交民巷天主堂以在华外国人为主要服务对象，主堂神父和辅助神职人员均为法国籍人士，并归法国教会管理。1949年后，中共