治初期，匏子寮地区为一街庄，称为「匏仔藔庄」，隶属于北投堡。该庄北与牛屎崎庄、北势湳庄为邻，东与南埔庄、坪顶庄为邻，南边为营盘口庄，西南边及西边南段为山脚庄，西边北段为草鞋墩庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于南投厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「草鞋墩区」，隶属于南投厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，草鞋墩区仍隶属于南投厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制并雅化为「匏子寮」大字，隶属于台