n::::跟其他药物比较.与硫唑嘌呤相比，霉酚酸比较容易造成腹泻，而其他副作用的发生风险则没有差异。然而霉酚酸的价格是硫唑嘌呤的15倍；因此霉酚酸对比硫唑嘌呤的确切作用目前尚未有最终结论。
不良反应.霉酚酸酯治疗相关的常见药物不良反应（大概出现于≥1％的患者）包括：腹泻、恶心、呕吐、关节痛；感染、白血球减少症，及／或反映药物的免疫抑制和骨髓抑制性质的贫血。霉酚酸钠通常也跟疲劳，头痛，咳嗽和/或唿吸问题有关。霉酚酸酯的静脉注射（IV）也通常与血栓形成和有关。不寻常的副作用（佔0.1