莫耶开始约会，2009年两人宣佈订婚。2010年8月21日，两人于加州成婚。2010年，在一个支持LGBT平权运动的广告中，派昆公开其双性恋者的身分。在2012年诞下了一对龙凤胎。2017年，艾伦·佩姬于个人脸书上发表长文，指控电影导演布莱特·拉特纳在合作电影《X战警：最后战役》期间，对她公开言语性骚扰。安娜·派昆在推特声援：「我当时也在场，我支持妳。」表明也在现场的她，当时同样不知所措。