台币1万元作为赔偿准备金，大有巴士董事长吴东瀛因此被台北地检署依《劳动基准法》起诉。2006年，大有巴士因出车率低、肇事率偏高、车况不理想、脱班情况严重及服务态度恶劣等而在2006年第一期「台北市联营公车服务评鑑」中获得丙等，被台北市政府交通局扣最高公里营收路线「信义干线」(现为88路线)的车额10辆，为期3个月，并由首都客运接驶部分班次营运至2007年3月31日止。2007年5月，大有巴士无法继续经营旗下全部的营运路线，释出台北市联营公车路线203、205、279、284、286及捷运接驳公车蓝1