最高法院于2000年9月22日判处卓长仁、姜洪军死刑，施小宁无期徒刑确定。高东萍于判决确定后极力营救卓长仁，后经监察院同意重新调查此一案件，法务部罕见地于当时暂缓两人死刑执行。后因监察院历经八个月调查后仍未能找出足以改变判决结果的新事证，时任法务部部长陈定南于2001年8月9日批准卓姜两人死刑执行令，翌日晚间两人于台北看守所执行枪决，卓长仁时年53岁、姜洪军时年41岁。