耀和妻子柯玉芝的长子，家中有一名妹妹李讳玲和一名弟弟李显扬李显龙的祖母蔡认娘是福建娘惹，母亲祖籍为中国福建省厦门市同安区。根据李光耀的传记，李显龙自5岁就学会爪夷文，一直关注新加坡政务，自1963年以来经常随同父亲到群众大会场地。李在南洋小学、公教中学（）以及国家初级学院受教育。在国家初级学院，他在兼任副教授的指导下学会吹单簧管。1971年，（）颁发总统奖学金以及（）给李显龙，供他在剑桥大学三一学院修读数学。1973年，他荣获资深兰格勒头衔（，指剑桥大学数学尖子生），1974年荣获数学一等荣誉及剑桥