迫急，不能容物，又不能藏蓄需忍，有所忤触之立碎。每张目怒视，恶声继之，即左右皆为之辟易”，与徐阶相抗，竟至相互攻讦，后为胡应嘉、欧阳一敬所逼退。隆庆二年（1568年）七月，徐阶退休归乡，隔年冬天，张居正与李芳等奏请复起高拱，以内阁兼吏部尚书领吏部事，尽改徐阶旧制，“授诸司以籍，使署贤否，志爵里姓氏”，有官员被黜，高拱必亲“告以故”，黜者“无不慑服”。
政绩.隆庆四年（1570年）俺答汗之孙把汗那吉来降，高拱和张居正采纳宣大总督王崇古建议，先授予其指挥使官衔，乘机与俺答达成封贡互市协