和平纪念碑之后，决定回来做景观设计；2004年，郑自才取得「阿里山隙顶地区及十字路据点游憩服务设施工程」设计权，是他最后一个景观设计作品。1995年，郑自才争取列入民进党全国不分区立法委员名单，但新潮流系改支持陈唐山，福利国连线也不支持郑自才，只有新世纪国会办公室支持郑自才，再加上提名委员会以「不具专家学者资格」为由排除郑自才，最后郑自才并未列入不分区立委名单；郑自才自认在民进党内属海归派，海归派与本土派有利益冲突，再加上提名委员会说他「不具专家学者资格」令他不服，从此他不再参政、不再参加民进党活动。199