承总统之令综理府内事务，并指挥、监督所属职员；此外，总统府还设有由总统任命的资政、国策顾问和战略顾问等职务，得向总统提供国家大计、战略及有关国防事项之意见。目前总统府下设有3局、3室，另有中央研究院、国史馆及国父陵园管理委员会为总统府之附属机关。国家安全会议（通称国安会）为中华民国总统决定国防、外交、两岸关系及国家重大变故等与国家安全有关大政方针之谘询机关，前身为1952年设立的国防会议，在1966年3月《临时条款》第三次修订后改设动员戡乱时期国家安全会议，至1991年依《宪法增修条文》规定改组为国家安