建省后的台湾省正式名称亦称为福建台湾省。1887年，台湾巡抚更名为福建台湾巡抚。台湾巡抚或福建台湾巡抚总管台湾军政。在官职上，台湾属巡抚官衔，品等为正二品或从二品。在官饷方面，以首任巡抚刘铭传为例：年薪约为白银155两，养廉银则为一万两，与升格前的按察使衔台湾道道员薪津相距甚大，而当时工人差役一年薪饷则约为二、三十两左右。
台湾民主国.由于甲午战争（1894年—1895年）的失败，清廷被迫签订马关条约，将台湾和澎湖割让给日本。1895年5月23日台湾仕绅祖「台湾民主国」唐景崧被