依赖性的方法（oxygen-independent methods）杀死微生物，不过这类方法不如氧依赖性的方法有效。非氧依赖性胞内杀灭方法有四种主要的类型：第一种使用带电蛋白破坏细菌的质膜；第二种使用溶酶体，溶酶体中的酶能够破坏细菌的细胞壁；第三种使用乳铁蛋白，乳铁蛋白存在于嗜中性球的颗粒中，它能从细菌胞内移除其生存必须的铁元素；第四种使用蛋白酶和水解酶，它们能消化细菌残骸的蛋白质。
细胞外杀灭.干扰素-γ（旧称巨噬细胞活化因子）能够诱导巨噬细胞产生并释放一氧化氮以杀灭周围的微生物