两地交流频繁，开行京九直通车的计划被北京铁路局上报中华人民共和国铁道部。1996年8月铁道部专门成立了工作组，与香港九广铁路公司多次商谈。1997年3月26日，时任铁道部部长韩杼滨签发了《关于开行北京、上海—九龙直通旅客列车有关问题的请示》，并正式呈报国务院，并制定了《北京、上海-九龙直通旅客列车办法》（铁外函【1997】28号文件）和《＜北京、上海-九龙直通旅客列车办法＞实施细则》（铁外函【1997】70号文件）。国务院迅速批准方案，并要求北京铁路局全力以赴，确保在1997年7月1日香港回归之前开通京九直