周寿宪在家中上吊自杀身亡。之后，北京清华大学计算机系在系史中数次错误的记录了1956年当时没有任何计算机专业知识背景的清华大学教务处生产实习科科长凌瑞骥负责筹建清华大学电子计算机专业。文化大革命结束后，清华大学在大礼堂为周寿宪召开了追悼会，朱光亚、夏培肃等人以及清华大学计算机系师生均参加。