元年（1621年）中举人，五年（1625年）成进士，获授临淄知县。当地人民剽悍，同时粮食歉收，多人因此以偷窃为业，他得知后每次捕获贼人总以严刑处置，人们都不敢再犯事。临淄长期干旱，他在烈日穿着囚衣步行祷告，在祭坛自疏罪状哭泣，雨水立刻降下；其时他也代理寿光县县事，寿光居民来到临淄请他到当地代祷，很快寿光也下雨，士民都感悦。五年后耿胤楼陞任兵部车驾司主事，迁官吏部考功司员外郎，到崇祯九年（1636年）乞假归乡。十一年（1638年）灵寿城陷，他不屈而殉难难，儿子耿参从也因此战死，朝廷得知后事追赠光禄寺少卿，