作用不大。及至江户时代，由于政权转移到江户，为加强对关西的控制，仿照鎌仓时代「六波罗探题」一职设立的京都所司代于1600年遂成定制。幕末倒幕唿声高涨，京都屡次发生动乱，商店被破坏，强盗横行。幕府有感京都所司代无法控制治安，于1862年设置京都守护职作为负责京都治安的最高机构，京都所司代转为京都守护职辖下，直至1867年随幕府政权结束废止。
职能.京都所司代是幕府在京都的代表，负责幕府与朝廷的交涉，向朝廷传递幕府的指示；同时亦监察朝廷、公家贵族和关西地区各大名的举措，并将