一生勤奋着书，着有《尚书古文疏证》、《四书释地》、《潜邱札记》、《困学记闻注》、《孟子生逐年月考》、《眷西堂集》等。又曾为顾炎武《日知录》订正错误。其中《尚书古文疏证》八卷，引经据典，确定《古文尚书》为东晋梅赜所伪着。黄宗羲、纪昀、钱大昕、梁启超、胡适等学者皆以为“伪古文《尚书》”的“定案”实归功于若璩，汪中将阎氏列为“国朝六儒”（顾炎武、胡渭、梅文鼎、阎若璩、惠栋、戴震）之一。梁启超说阎若璩“不能不认为近三百年学术解放之第一功臣。”。《四库全书总目提要》称赞他：“引经据古，一一陈其矛盾之故，古文之伪