l7年回国到广州，任中华民国军政府海军陆战队司令，参加孙文发动的护法战争。1921年10月孙中山图谋北伐，方振武率部随许崇智出师北江，旋因陈炯明叛变，北伐失败，方振武率部打着北伐旗号，由江西进入皖南，陷入困境。在无奈情况下，准备赴浙江投奔卢永祥，但在浙西开化被卢永祥缴械遣散。引退赴上海。1924年9月初齐卢之战（江浙战争）爆发时，方振武再次投奔卢永祥，被派为别动队司令，拨归杨化昭司令指挥，杨又将其拨给第一支队司令张义纯指挥，率部600人主要为安徽在沪的流亡人员与失业工人组成，在浏河嘉定一带做策应和联络。