973年，该次维修工程宣布竣工。1997年3月8日，四门塔内的香积阿閦佛佛头被盗，后经调查发现犯罪分子早在盗走佛头前5个月就破坏了佛像。此后，参与盗窃的4名犯罪分子先后于1999年、2001年和2007年先后被抓捕归案，而失窃的佛头则于2002年由台湾法鼓山佛教基金会交还给济南文物保护协会，并于当年12月21日重新安放回佛身上。2011年4月，国家文物局批准了《四门塔、唐代台基等建筑维修保护方案》，2012年2月8日正式启动四门塔古建筑文物修缮工程。