威尔斯航空放弃所有普利茅夫航线，集中营运受旅客欢迎的航线。由于廉价航空公司的激烈竞争和成本不断上升，在2006年4月23日，威尔斯航空终止所有客运业务，改为营运包机和货运业务，约80人因而失业。
机队.威尔斯航空原本採用多尼尔228，后改用ATR 42，在2006年的机队如下：