。更新后的E1系在经过几年的使用之后，于2012年7月的改点公告中宣布将于9月29日自定期车班用车的行列中退出，结束其长达18年的定期车班服务。原本以E1系营运的朱鹭号列车退出，上越新干线上的Max朱鹭与Max谷川（）全部改用E4系营运。至于原本东北新干线上以双层的E4系营运的Max山彦号（），也将改以单层的E2系取代，和使用E3系的山形新干线翼号（）列车串挂，以「山彦·翼」（）的车班名称行驶于东北新干线路段。
运用.1994年投入服务时被配置于仙台综合车辆所（现称新干线综合车