共造成106人死亡或失踪、229人受重伤、421人受轻伤。另有民房全倒10,502栋、半倒25,818栋。公有建筑物则有全倒682间、半倒764间、破损1,905间。以1964年币值计算，单在台南县（今台南市）内民房及其他建筑物因损毁而造型的损失金额逾新台币1.91亿元。是次地震建筑物损毁程度，主要在于地质程度和建筑材料。在地质较为软弱的白河镇（今白河区）、东山乡（今东山区）等地，木造、土埆造和砖造建筑物损坏较严重，而加强砖造和钢筋混凝土造建筑物则损坏不大。但在地质较为坚硬的楠西乡（今楠西区）、玉井乡（