民国抗日战争后，1945年清真寺重修，并更名为沪西清真寺，主持重修者包括中国驻埃及公使馆秘书马天英（山东回族）。文革上海期间此寺庙遭遇不详，1979年才得以恢复宗教工作。1990年，清真寺因药水弄（西康路）区域旧区改造而搬迁，今址位于中华人民共和国上海市普陀区常德路。1992年4月，搬迁后重建的清真寺落成，名称仍为沪西清真寺。
历任教长.历任教长有马少山、马国兴、撒焕亭、买俊三、王笃生、张朝真、马人斌、沙春华。1992年起，白润生任沪西清真寺教长，杨振华任该寺管理委员会主任。