权被转让给上海广电集团和上海文广集团两家大型国有企业以及黄浦区国有资产总公司，由广电集团总裁王成明出任董事长。执掌了俱乐部事务八年之久的郁知非离开了足球界，新申花俱乐部也一改过去五年中聘用外教的作法，尝试任用了多名中国教练，包括1995年率队夺冠的主帅徐根宝、之前多年出任助理教练的吴金贵、前八一队主帅贾秀全等。同时申思、祁宏、吴承瑛等多名绝对主力先后转会离开，虽然吸收了上海有线02的多名年轻球员，不过球队的风格打法与之前相比仍出现了非常大的转变。俱乐部在2003年在本土“学院派”主帅吴金贵率领下，凭借多