新政府的委员兼秘书长。1946年张治中出任新疆省政府主席后，周恩来请张治中清查当年盛世才1942年扣押在新疆的中国共产党方面人员。经刘孟纯具体操作下，130多名被押的中国共产党党员在士兵护送下，分期分批绕过阎锡山警戒区回到延安。1947年6月，麦斯武德接任新疆省政府主席，刘孟纯被免去新疆省政府秘书长的兼职，但仍为新疆省政府委员，同时还兼任新疆省政府宣传委员会主任。此外，他仍任西北行辕秘书长。刘孟纯对新疆省政府一些不利于新疆和平的政策采取了严厉限制，招致不少人攻击。1947年11月、1948年3月，张