港深西部公路的车流量，到达终点元朗公路后，便继续使用原有公路网络抵达香港各区，而非当初设计。而拟建的10号干线（北大屿山至元朗公路－南北全段）现已改称为11号干线。现时经由深港西部通道到香港的中国大陆车辆能经元朗公路北行到元朗、新界其他地方，或接驳青朗公路（前称3号干线郊野公园段）到市区，或经元朗公路南行到屯门，或接驳屯门公路到市区。为方便通关，深圳湾口岸实行一地两检，整条深圳湾公路大桥——包括行政上属中国大陆的部份——皆交由香港管理，实行香港法律；而大桥属于边境禁区，因此只限获发许可证的车输行驶。