亲离的詹姆斯二世只好逃亡法国，期待借法军之力以卷土重来。1689年，国会宣布威廉三世和他的妻子玛丽二世为英国国王和女王。约翰·丘吉尔被封为马尔博罗伯爵。
与威廉三世的冲突.
威廉的将军.约翰·丘吉尔因为在光荣革命中替威廉三世立下大功，受到国王一定程度的器重，任命他重新组建整个英格兰的陆军(不包括爱尔兰和苏格兰)。随着英国议会在1689年批准英军加入反法的大同盟战争（1688-1697年），邱吉尔先是在1689年被派遣至西属尼德兰，率领八千英国兵，担任荷兰陆军主