自于青尼罗河。但是只有在夏季埃塞俄比亚高原上雨季雨水充沛的时候对土壤的侵蚀和运输大，而在其它季节里从埃塞俄比亚注入尼罗河的水比较少。八月末的潮湿季节里青尼罗河的流量往往可以超过每秒5663立方米。
古代河源.过去坦噶尼喀湖通过东非大裂谷注入艾伯特尼罗河，这条支流比现在最长的支流还要长约900英里。但是在中新世里由于维龙加山脉火山爆发将这条河道堵住了。
中下游.在苏丹境内尼罗河与它下游非常不同。从喀土穆北部开始到阿斯旺它流过六个瀑布。从喀土穆北部的第六瀑布开始