月天文研究所东归南京，将部分财产设备留下，成立凤凰山天文台，作为天文研究所与云南大学的共管机构，由云南大学教授王士魁兼任天文台主任。但由于经济问题，天文研究所派出的职员辞职，双方共管名存实亡。1949年，中华人民共和国政府接管南京的天文研究所后，改名紫金山天文台，紫金山天文台在1950年联系云南大学，恢复对凤凰山天文台分支机构的共管，10月更名昆明天文工作站。1958年，主任王士魁被划为“资产阶级右派分子”，紫金山天文台停发其津贴，由中国科学院云南分院指派管理人员赴天文台工作，至此昆明天文工作站与云南大学脱