球形，当年生枝为红褐色，表面有黄褐色及灰褐色柔毛，2年生枝无毛。纤细针叶5针1束，长9至17厘米，叶两面都具气孔线，边缘有细齿，横切面面呈三角形，叶边有3至5条树脂道，叶鞘早落。成熟球果为圆柱状椭圆形，长约9厘米，直径约6厘米，鳞盾隆起，鳞脐被生。黑色的种子为长椭圆形或倒卵圆形，种翅长约1.6厘米，具有黑色纵纹。花期4至5月，球果翌年9至10月成熟。巧家五针松种子品质较差，发芽势弱，针叶出现时间晚于其它松树，前4年生长缓慢，4年生后生长开始加速，20年生时生长速度超过了云南松。
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