院已成了废墟。重建持续了一个多世纪。一系列不祥的事件导致了修道院的危机，在17世纪，由于1768年的地震，摧毁了圣殿的圆顶。圆顶由彼得罗·卡洛·博尔博尼重建于1773年至1774年之间，并由朱塞佩·米兰尼 装饰。1796年，在拿破仑·波拿巴的法国革命军占领意大利期间，取缔了修道院。修士被驱逐，修道院里的东西被卖光了。圣殿交给方济各会管理，直到他们在1810年也被取缔，改由教区神父管理。在意大利恢复统治后，修道院的土地在1814年由其现任主人森普里尼伯爵归还给庇护七世，他是该市的本地人。教宗在1819