第一师兼苏中军区政治委员，10月调任新四军政治部主任。1943年2月，谭震林担任新四军第二师兼淮南军区政治委员，与罗炳辉领导淮南新四军反击日军扫荡，并扩大根据地。1945年，谭震林当选中共第七届中央委员。
第二次国共内战时期.中日战争结束后，中共部队战略调整，新四军主力进入山东。11月宣布正式成立成立华中分局，谭震林为副书记，华中留下的新四军合并成华中军区，谭震林任华中军区副政委兼政治部主任、华中野战军政委。第二次国共内战爆发后，谭震林同粟裕指挥苏中战役，获得七战七捷的重大胜利。1