败给费德勒。10月份，乔科维奇在奥地利维也纳公开赛夺得本赛季第五冠，也是职业生涯单打第七冠，于决赛中击败斯坦尼斯拉斯·瓦林卡。随后在马德里大师赛中打入四强，最后不敌阿根廷球员大卫·纳尔班迪安。此战过后，乔科维奇的排名再创新高，来到了世界第三，成为年终大师盃的八个球员之一，但在小组赛中即被淘汰。随后，他获得了塞尔维亚颁发的国家最佳运动员头衔。年末乔科维奇代表塞尔维亚国家队打败澳大利亚队，顺利打进2008年戴维斯盃世界组。2008年年初与俄罗斯队的第一轮比赛中，突然遭受流行性感冒侵袭，不得不退出单打项目