法依赖氧气，被称为有氧唿吸，动植物、真菌和细菌利用这个循环将有机化合物转换成能量。这也就是土壤唿吸最基本的层面。发酵发酵是另一个过程，细胞从有机化合中物获得能量。在此代谢途径，能量从有机化合物而来却无需使用氧气。该反应的产物是通常是乙醇和二氧化碳或乳酸(比较少)。 [2] 由于缺乏氧气，这种途径被称为无氧唿吸。在泥炭沼泽和湿地的土壤唿吸，二氧化碳在氧气稀少的生态系统是重要来源。土壤中大多数透过唿吸释放二氧化碳，然而发生在植物的根部占了很极重要的地位。根唿吸植物唿吸作用中一些有机化合物是由光合作用