中，研究人员已经建立了炎症研究的斑马鱼模型以及相关处理机制，使得研究人员能对炎症的遗传控制机制进行细化研究，并且有可能以此识别有潜力的新药物。斑马鱼在研究嵴椎动物的固有免疫方面是广泛使用的模式生物（固有免疫能够在受精后28～30小时内进行吞噬作用，吞噬作用是免疫反应的重要一环）。与之对比，适应性免疫（也称特异性免疫、获得性免疫、后天性免疫）在受精后至少四周才能在功能上达到成熟状态。
传染病.由于人类和斑马鱼的免疫系统保守性较强、相对一致性高，许多人类传染病可以在斑马鱼上模拟。斑