于车站北侧、东侧的彩虹大道和通城大道为快速路。杭州南站东、西广场均设有停车站，目前由于东广场未全部完工，仅开放西广场停车场。
地铁.杭州地铁5号线火车南站位于杭州南站东广场地下，于2020年6月30日开通，也是规划中的杭州地铁11号线的换乘站。根据乘车安排，旅客国铁转地铁无需二次安检。
公交.杭州南站的东、西广场均设有公交场站。东广场为主要公交换乘站，有300、328、711、711B、720、726、747、731、736和743共11条始发公交，其