「HX」于塞舌尔航空往返香港及塞舌尔群岛、和往返香港及阿布扎比的航线，而塞舌尔航空亦将附加航空代码「HM」于香港航空往返香港及泰国首都曼谷的直飞航班。2015年，塞舌尔航空取消香港往返塞舌尔及阿布扎比的航线，并将此航线交由阿提哈德航空继续执行，但阿提哈德航空执行的航班不会飞往塞舌尔，只会飞往阿布扎比。
机舱.塞舌尔航空的国际航线机队设有两种客舱：珍珠商务舱（Pearl Class）、经济客舱。
机队.截至2016年7月，塞舌尔航空的机队拥有下列