904年2月，本校因学生增加而空间不足，在城隍庙后方（东北侧）开始兴建新校舍。1905年（明治38年）1月15日，举行新校舍落成典礼。同年7月，附设小学科改为凤山寻常高等小学校恆春分教场，其后于1908年独立为恆春寻常高等小学校，并于1911年迁至旧恆春厅舍仓库。（该校于1945年2月遭盟军炸毁）1921年（大正10年）4月，本校改称为恆春第一公学校，并增设二年制简易农校。次年4月，废除简易农校并改设二年制高等科。1923年（大正12年）5月，设立垦丁寮分教场（今垦丁国小）。1933年（昭和8年）