方、第二与第三掌骨固定、肱骨有较宽的末端，跟髁状突之间有小分隔、肠骨的短肌窝往坐骨脚延伸。 马普龙与南方巨兽龙的差异还有：颈椎的骨骺呈圆椎状且微弯、第一颈椎的后关节突在中间连接、颈椎中央有较小的前嵴板、颈椎神经棘的后缘锐利、神经棘高而宽、坐骨干弯曲、腓骨较修长。
系统发生学.在2006年，科里亚与柯尔的亲缘分支分类法研究显示马普龙属于鲨齿龙科，而马普龙股骨上的结构物显示牠们与南方巨兽龙的关系较近，而离鲨齿龙较远。科里亚与柯尔根据这层关系，提出一个新的单系群分类，南方巨兽龙亚科；