终得以降服神保长职。康胤将长尾一族的长尾景直收为养子，巩固了和上杉氏的关系。然而在与神保氏关系匪浅的能登畠山氏的仲介下，神保氏确认了对中郡（妇负・射水郡）的支配权。康胤的不满被置之不理。另一方面谦信对康胤非常信任，关东出阵中期间甚至任命康胤留守居城春日山城。然而永禄11年（1568年）7月、康胤受到甲斐武田氏的蛊惑，反叛了上杉氏。永禄12年8月，被康胤背叛的上杉谦信出征越中，包围了松仓城，但因为城防坚固久攻不下，10月解围撤军。随后在三木良赖的仲介下与上杉氏和睦，也曾为谦信派兵支援大坂本愿寺。元龟3