局虽然还在，但只是傀儡政府。1944年法国解放后，殖民地政府打算与巴黎的新自由法国政府取得联系，还开始准备起义对抗日本人。日本也在1944年制订计划强制解除法军武装并正式接管印度支那，日本情报部门迅速得知法国当局意向。战争局势逐渐变得对日本不利，盟军潜艇经常攻击南海日本船队，1944年下半年还有飞机加入打击行列。这些袭击是由信号情报和远程空中巡逻指引，还有中国沿海及亚洲其他港口观察报告补充。常驻中国的美国陆军航空军第十四航空队反复打击南海地区日本航运，还定期攻击日本占领的中国南部港口和印度支那军事设施。