合台汗国领地，后设宣慰使元帅府，改名五端城。察合台汗国灭亡后，属叶尔羌汗国。1680年，准噶尔汗国控制了于阗。1757年，清朝灭准噶尔汗国，干隆二十四年（公元1759年），设和阗办事大臣，受叶尔羌办事大臣节制。20世纪80年代，考古学者王炳华等人在尼雅遗址进行考古工作，发掘出大量文物，为西域故国历史研究揭开新一页。
地理.和田地处塔里木盆地西南部、玉龙喀什河畔的绿洲内，邻近喀拉喀什河。其北为塔克拉玛干沙漠，其南为昆仑山脉。和田市地形南高北低，是喀拉喀什河与玉龙喀什河的冲积平原。