武帝时改大司农）、少府。魏晋起，九卿职任转轻，政务转由尚书台诸曹办理。梁武帝在天监七年（508年）改置十二卿：南朝陈基本沿袭梁制，隋朝恢复九卿制度。隋唐五代迄于宋，九卿基本上为迁转之官，位秩很高但没有实际职务。唯宗正一职迄清而不废。明朝，以六部尚书、都察院都御史、大理寺卿、通政使为“大九卿”；太常寺卿、太仆寺卿、光禄寺卿、詹事、翰林学士、鸿胪寺卿、国子监祭酒、上林苑卿、尚宝司卿为“小九卿”。清朝，九卿泛指六部尚书之外的独立官署的长官，但没有明确的范围；另称宗人府府丞、詹事、太常寺卿、太仆寺