，前殿后阁」的三合院，有三进两厢，也是全台唯一有泮宫石坊的文庙。右庙的第一进为大成门，清朝时左右设有名宦祠与乡贤祠，第二进是大成殿，供奉孔子牌位。第三进是崇圣祠。左学为明伦堂和文昌阁，堂前原有两廊，分列六艺斋、后建教官廨舍及斋厨，东边建朱子祠，朱子祠在日治时期毁坏。台南孔庙櫺星门遗构于2013年时，因大成门前一棵百岁榕树病枯倒塌而意外重见天日。
大成坊.大成坊有东、西两座，外貌几乎一致，下方是双十字型承重墙，墙顶用燕尾收头，再以木构造支撑悬山式燕尾屋顶。东大成坊是台南孔庙的主入口，始