发钙离子大量流入花粉管细胞内。钙离子内流在1-2分钟内即会造成花粉管生长紊乱，让其停止伸长。随后，花粉粒细胞会启动凋亡进程，DNA开始解体。10-14小时后，花粉粒的细胞即告凋亡。
孢子体自交不亲和性.十字花科、菊科、旋花科、桦木科、石竹科、梧桐科和花荵科植物採用这种自交不亲和性机制。目前，只有十字花科的自交不亲和性机制在分子水平上得到了解释。十字花科实现自交不亲和性的机制被称爲「自花花粉早期逮捕」。十字花科的花粉粒落到柱头上后，柱头上的SRK配体配体即能识别花粉膜上的SCK配