（昭和15年）6月17日改制为「善化街」，设「街役场」。1945年8月14日，日本昭和天皇发表《终战诏书》接受波茨坦公告，大日本帝国无条件投降，日本由同盟国军事佔领，而盟军最高统帅麦克阿瑟元帅发布《一般命令第一号》，命令在台日军向蒋介石将军投降。中华民国政府台湾省行政长官公署于1946年（民国35年）1月20日依《台湾省乡镇组织规程》改为「善化镇」，设「镇公所」，管辖20个「里」、243个「邻」。 2010年12月25日台南县市合併升格为直辖市，善化镇因而改制为「台南市善化区」，原镇公所改为「区公所」。