，日军于1942年1月1日登陆纳闽，并继续入侵北婆罗洲的其他地区。1942年到1945年，日本军队佔领马来亚、北婆罗洲和砂拉越，连同这座岛屿的大部分地区。日军完全占领沙巴后，当地人组织了抗日组织“神山游击队”，由郭益南（Albert Kwok）建立；而在古达，另一支游击队由敦姆斯达法（Tun Datu Mustapha）建立。1943年10月10日，郭益南的部队开始与日军交战。亚庇市的亚庇国际机场正对面有一座Petagas战争纪念碑。盟军的轰炸摧毁了大多数城镇，山打根被夷为平地。山打根曾有一座由日本人所