240年，神圣罗马帝国的腓特烈二世下令，医师和药剂师分开为不同的职业。在1317年，一间方济各会修道院内的药房成立（位于今日克罗地亚杜布罗夫尼克）。。爱沙尼亚塔林的最晚应该是在1422年开业，是世上历史最久，仍继续在原址营运的药房。比利时城市布鲁日的市议会在1683年通过法律，禁止医生为患者配药，药学开始走向专业化。据称，最古老的药房在1221年成立于义大利佛罗伦斯的新圣母大殿，原址现有一座香水博物馆。在中世纪成立的，位于普奇塞达附近的利维亚（一块属于西班牙的飞地，被法国领土包围），现在则是一座