1895年4月，清廷因甲午战争战败而签订马关条约，割让台湾予日本。消息传至台湾后，台湾人成立台湾民主国，各地皆起兵响应抗日，傅德生亦召集乡勇筹备守卫乡里。5月29日，日军近卫师团登陆澳底，乙未战争遂起。6月中旬，台北城失陷，傅德生率军北上，于杨梅、湖口和新竹一带与日军激战，其后并参与八卦山战役。