，但最终京都不死鸟以2：4的比分不敌FC东京，无缘天皇杯冠军。在2011年赛季中，久保裕也在日乙联赛出场30次，打入10粒进球并贡献2次助攻；在天皇杯出场3次，打入3粒进球。2012年，久保裕也正式升入京都不死鸟一线队。2月16日，在京都不死鸟对阵磐田喜悦的训练赛中，久保裕也再次完成帽子戏法，帮助京都不死鸟以3：1的比分战胜磐田喜悦。在2012年赛季中，久保裕也在日乙联赛出场20次，打入1粒进球。2013年6月9日，在日乙联赛第18轮京都不死鸟客场对阵熊本深红的比赛中，久保裕也完成职业生涯的第一个帽