选区（与长门国一致），当选为国会众议院议员。在当选议员后，安倍随即加入了当年父亲安倍晋太郎任会长的派系清和政策研究会，并于1997年成为自民党的青年局长，与此同时，安倍也是当时意欲竞逐自民党总裁的小泉纯一郎选举对策的中坚人物。2000年，清和会领袖森喜朗获任内阁总理大臣并受邀组阁，安倍晋三随即获任命为内阁官房副长官，一年后小泉纯一郎继任首相，安倍得到留任。并在官房副长官任内，安倍陪同小泉首相远赴朝鲜访问，在对待朝鲜的绑架问题时，安倍始终坚持对朝强硬的态度，并得到了党内相当一部分议员的支持。2003年9月