任中央金融工委副书记；2001年11月出任国家经贸委副主任。2003年4月，在温家宝内阁中担任国家税务总局局长。在他执掌国家税务总局的4年中，中国年税收收入几乎翻了一番，平均年税收增长幅度达到15.5%，远远超过了国内生产总值的增长速度。2003年，中国税收收入更是突破了2万亿元大关。2007年8月30日，第十届全国人民代表大会常务委员会第二十九次会议任命谢旭人为财政部部长。2010年4月10日，中国财政学会2010年会暨第18次全国财政理论讨论会于北京召开，会上谢旭人当选为中国财政学会第八届理事会