交通部中央气象局台湾南区气象中心为交通部中央气象局附属一等气象测报机构。
历史沿革.为提昇台湾南部地区气象服务品质、并加强台湾南部地区地震及气象监测能力，交通部中央气象局决定于台南气象站原址兴建「交通部中央气象局台湾南区气象中心」，台南气象站观测业务于民国87年5月1日配合暂时搬迁至台南县永康市盐行之气象站。同年在台南市原址兴建一栋地下二层、地上七层的台湾南区气象中心，这所兼具气象教育功能的气象中心于民国90年3月16日成立、同年11月16日正式启用。