首次参加中华人民共和国卫生部组织的全国44所高等医学院校应届毕业生业务统考，获得全国第十八名、西南地区第一名。1995年4月，时任中共中央政治局委员、常委、国务院副总理李岚清莅临视察遵义医学院。1995年12月，遵义医学院附属医院挂牌成为贵州省首家“三级甲等”医院。1999年5月，重庆医科大学聘任遵义医学院黄燮南等三位教授为药理学兼职博士生导师;10月重庆医科大学与遵义医学院签署联合培养药理学博士协议。2002年6月遵义医学院珠海校区正式成立，9月迎来第一批本科生。2005年1月，经贵州省编制委员会审核同意