26年7月1日，军事委员会颁布北伐部队动员令，北伐战争正式开始。1926年7月7日公布《国民革命军总司令部组织大纲》，规定“凡国民政府所属军民财政各部机关，均须受总司令之指挥，秉承其意旨办理各事”，国民政府变成总司令部的后勤机关。1926年7月14日，李济深任国民革命军总参谋长，钮永建为总参议，邓演达为国民革命军总政治部主任。国民革命军总司令部统辖陆海空军实施北伐。1927年2月21日，国民党中央和国民政府正式在武汉办公。1927年3月10日，中国国民党在武汉召开二届三中全会，全会决定把一切军事大权集中