莫敬宇弃城遁往清朝云南的镇安州避难，以贿赂当地官员，试图借清朝的势力回到高平。1669年，清康熙帝遣李仙根、杨兆杰二人，要求后黎朝归还高平四州（石临、广渊、上琅、下琅）予莫氏，莫敬宇得以回到高平，改名莫元清（一说其子为莫元清）。1673年，中国发生三藩之乱，莫元清在高平公开採用了吴三桂的「昭武」年号，并为吴三桂提供粮草支持。不久三藩之乱被清朝平定，清军进入广西。1677年，郑柞借黎熙宗的名义，以丁文左、阮有登等为将，再次讨伐盘踞高平的莫氏。莫元清兵败，逃往中国广西的龙州。自此以后，莫朝的残余势力彻底被消