设立甘肃省，而在雍正二年时，成立甘肃省甘州府，管辖了张掖、山丹、高台等三个县。到了雍正七年，因为甘肃省在甘州府西北邻近地区另设「肃州直隶州」。按清朝制度，直隶州须管县份，所以又割甘州府之高台县给「肃州直隶州」管辖，所以此后甘州府只剩张掖县、山丹县。但到了干隆年间，甘州府又另外增置抚彝厅(编制上属散厅，今甘肃省张掖市临泽县)。所以清朝干隆以后的甘肃省甘州府，共管了两县一厅。根据《清史稿》相关记载：甘州府，编制是「冲，繁，疲」，同时也是甘肃省甘凉道的治所。到了民国时期，全国普遍「废府改县」，甘州府于是被