日中共解放军进入镇江县，江苏省政府迁至崇明县。6月又迁至嵊泗列岛（1949年9月3日改置为嵊泗县）。
特设机构.抗日战争期间，民国32年（1943年）1月28日设置江南行政公署（一作1939年1月1日置），行署驻今安徽省黄山市屯溪区附近的梅林，代行江苏省政府职权，管理长江以南地区；2月16日设置徐州行政公署（一作1939年3月4日置），行署驻地不详，代行江苏省政府职权，管理长江以北地区；12月，又以长江以北盐城、宝应以东地方设置江苏特别行政区，直隶重庆国民政府。民国34年（1945