该含有可将废物转化的生物。氮废物是由硝化细菌（亚硝酸菌属，"Nitrosomonas"）转化。硝化细菌将水中的氨转化成亚硝酸盐（NO）。惟高浓度的亚硝酸盐同样可毒害生物。另一种的细菌（硝化螺旋菌属，"Nitrospira"）会将亚硝酸盐转化成毒性较低的硝酸盐（NO），饲养者再以换水的方式稀释水中硝酸盐的浓度。这个硝化作用的过程是水族嗜好者所熟知的。（硝酸菌，Nitrobacter，以往被认为是将亚硝酸盐转化成硝酸盐的最要角色，市面上亦可购买此细菌，用以加快硝化系统的建立。虽然在生物学上硝酸菌的确与硝化螺旋菌