017年1月11日，兼任国家预防腐败局局长、中央深化国家监察体制改革试点工作领导小组成员、党组成员兼办公室主任。2月，任中央巡视工作领导小组成员。杨晓渡在担任中央纪委副书记期间，分管的是第2纪检监察室（联系国务院部门和其他相关单位）和第9纪检监察室（联系陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆及新疆生产建设兵团）等。从2014年1月至中共十九大召开为止，在杨晓渡的分管范围内有青海省西宁市委原书记毛小兵、甘肃省人大常委会原副主任陆武成、国家安全部原副部长马建、国家统计局原局长王保安、国台办原副主任龚清概、司法部原政治