，兼山东军区政治部主任，协助罗荣桓领导山东根据地的斗争，粉碎日军扫荡，并争取了四支伪军部队参加八路军。萧华还领导了山东地区的整风运动、精兵简政、开展“铁的模范党军活动”等项工作。
第二次国共内战时期.抗战胜利后，萧华率部渡海抢占东北，开辟南满根据地，任东满人民自卫军司令员兼政委。1946年1月，任东北民主联军辽东军区司令员兼政委和中共辽东省委书记。1946年4月，指挥本溪保卫战，但最终放弃本溪；5月，指挥鞍海战役，迫使国军184师师长潘朔端率部倒戈；10月，指挥新开岭战役，歼灭国军