最终在2010年5月8日，拜仁慕尼黑以3-1击败了柏林赫塔队以后顺利获得德甲联赛冠军,而云高尔也成为了历史上第一个获得德甲联赛冠军的荷兰籍主教练。同时在德国杯中，拜仁也一路杀入决赛，最终在决战4-0大胜不莱梅，完成了赛季双冠。在2009/10赛季的欧冠比赛中，拜仁的表现也十分出色，在和曼联的四分之一决赛中，拜仁在两回合和对手4-4战平，依靠客场进球数多的优势晋级四强。在对阵里昂的半决赛中则两回合4-0淘汰对手晋级决赛。但是在决赛中，因为缺少了核心球员里贝里，云高尔的球队以0-2的比分输给了由他的昔日助手