第二次段祺瑞内阁成立于民国6年（1917年）7月17日，结束于同年11月22日。张勋复辟被段祺瑞的讨逆军击败之后，段祺瑞重新出任国务总理；而黎元洪大总统则通电不复任大总统，由副总统冯国璋代理大总统职务。此时西南各省对于段祺瑞已经十分不满，段祺瑞主张「武力统一」中国，对湖南（护法军政府）和四川（西南军阀）积极用兵，也乘机扩大皖系的势力。而冯国璋则主张「和平统一」。两人对此的分歧越来越大，出现「第二次府院之争」。段祺瑞的出兵在川、湘都遭遇失败，而冯国璋又暗中联合各地军阀对抗段祺瑞，直系的曹锟、李纯、