数目说法不一。认为18000卷，认为18100卷，认为1000卷，认为虚目1228卷，实为1090卷（这种说法最为认可）。《三洞经书目录》首次提出了按照经书来源分类的方法，这也成为了此后编辑道教经书目录的指导思想。其地位被认为与佛教历史上首次编纂汉译佛教经录《综理众经目录》类似。