北盆地与林口台地交界处产生山子脚断层（位置约由关渡延伸至树林）。六万年前造山运动趋缓，中央的地层顺着断层向下滑动成为台北盆地；西侧地层相对抬高，形成林口台地，原新店溪河口消失，河水在新庄形成湖泊，或向北沿观音山入海。台北盆地出现后地势突然降低，加强淡水河上游的侵蚀力量，河水不断向源侵蚀切穿山谷，与大汉溪和基隆河连接，造成河川袭夺。一万年前受全球暖化影响，冰山融化造成海平面上升，海水由关渡一带倒灌入台北盆地，形成台北湖，同时原先的河流仍不断注入，使湖水呈半咸水性。此时台北盆地内泥沙大量沉积，由下而上堆