蛙嘴龙拥有短头部，针状牙齿适合捕抓昆虫。虽然蛙嘴龙传统上被分类于长尾巴的喙嘴翼龙亚目，但牠们的尾巴相当地短，使得牠们从树上飞下捕抓猎物时有更高机动性。杜特莱因根据尾巴痕迹外形，提出蛙嘴龙的尾巴较短，形状类似现代鸟类的尾综骨。蛙嘴龙的第五脚趾延长、颈部短、掌骨短…等特征，类似典型的喙嘴翼龙科。蛙嘴龙的身长约为9公分，翼展宽约50公分，体重可能只有数公克。在2008年，古生物学家马克·维顿（Mark Paul Witton）重新估计蛙嘴龙的翼展约35公分，体重约40公分。在1975年，彼得·沃尔赫费尔（Pete