金融风暴中经济遭受重创，引发大规模对「新秩序」政策的不满，并引发大规模「黑色五月暴动」，大学生示威抗议、对苏哈托表达不满，遭军警开枪镇压，触发暴乱。在动乱中，暴徒焚烧抢掠华人商店住所，有百计华裔妇女被强暴，逾千人死亡。据不完全统计，暴乱期间，仅印尼首都雅加达就有5000多家华人工厂店铺、房屋住宅被烧毁，约170名华人妇女被强暴，近1200名华人被屠杀，同时发生在梭罗、巨港、楠榜、泗水、棉兰等地的类似暴乱亦造成华人生命财产损失。苏哈托被迫于1998年5月下台，结束32年执政。
卸任之后