联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一。1946年抗战胜利，西南联大解散，清华大学返回北平，冯应美国宾夕法尼亚大学邀请，任客座教授一年，集结其间讲稿出版《中国哲学简史》。1948年回国后仍担任清华大学教授，哲学系主任和文学院院长，后又当选中央研究院首任院士（人文及社会科学组）及中央研究院评议会第三届评议员。
1949-1976年.1949年10月1日中华人民共和国成立，10月5日冯即致信毛泽东自称“过去讲封建哲学，帮了国民党的忙，现在我决心改造思想，学习马克思主义”，毛