在孔庙后西侧，有一处由近两百座高大石碑组成的碑林，刻着十三册儒家经典。这部石经的蓝本是雍正年间的江苏金坛贡生蒋衡历时12年手书而成。此外，北京孔庙内还生长有很多数百年历史的古树，其中最大的一棵柏树生长在大成殿前石阶下，被称为触奸柏，为元代国子监祭酒许衡所植，已近七百年的历史。相传明朝奸相严嵩代嘉靖皇帝祭孔时，行至树下，被树枝揭掉了他的梁冠，人们便认为柏树有知，能够辨别忠奸，因此称之为“触奸柏”或“辨奸柏”。