后上位时出过谋划，对他很是赏识，擢拜他为并州长史。长寿年间（692年），其兄崔神基被任为宰相，为相月余，为酷吏所陷害，下狱当死，崔神庆奔赴京城向武后求情，并据理力争，最终崔神基被免死流放，而崔神庆亦被牵连贬为歙州司马。长安年间（701—704年），累转户部侍郎，后转太子右庶子，赐爵魏县开国子，与太子詹事祝钦明每日于东宫陪中宗李显侍读。后历任司刑、司礼二卿。705年，唐中宗即位，崔神庆因依附张昌宗兄弟，被贬流放钦州（在今广西壮族自治区境），不久去世，年七十余岁。次年，敬晖等五王被逐出朝堂，因张昌宗兄弟原因