与诱降、招抚并用的情况下投奔后金。青海的和硕特部、西藏达赖喇嘛起初是朝觐、入贡并接受册封，后来才接受清朝的统治。外蒙古喀尔喀三汗、卫拉特蒙古杜尔伯特部 (绰罗斯氏)、旧土尔扈特部则是举族前来归附清朝。新疆哈密与吐鲁番在清军征伐准噶尔的过程中倒戈归附。唐努乌梁海、阿尔泰乌梁海、新疆回部等经朝廷派员招抚后归附，不久反叛，后又被平定。对于蒙古察哈尔部、准噶尔部，则是以武力征服。
政治制度.蒙古实行盟旗制和札萨克制。新疆回部实行伯克制。西藏设立噶厦管理各地事务，并沿袭帕木竹巴以来的宗谿制。