和着作.翁独健以蒙元史研究工作着名。主要着作有《斡脱杂考》、《蒙古时代的法典编纂》、《元典章译语集释》等，主编有《蒙古族简史》。他还曾参与编纂《中国历史小丛书》、《辞海》民族分册、《中国历史地图集》、《中国大百科全书·民族卷》、《全元诗》等书籍，主持《元史》的标点和校勘。
轶事.翁独健在燕京大学求学期间，与其同寝室者为吴世昌，后亦成着名学者。因翁独健腿疾，而吴世昌一目失明，有同学邓嗣禹戏作对联一副：“只眼观天下，独脚跳龙门”，横批“盲跛相助”，取自《左传》。这副对联当时在燕京流传