巴拿马鹿鼠属（Isthmomys），哺乳纲、囓齿目、仓鼠科的一属，而与巴拿马鹿鼠属（黄鹿鼠）同科的动物尚有鳞尾原鼠属（鳞尾原鼠）、大长爪鼠属（巴拉圭长爪鼠）、智利鼠属（智利鼠）、渔鼠属（特威德渔鼠）等之数种哺乳动物。