六个部分，分别是“踏进文明的门槛”、“列入中国版图”、“于阗的文化艺术”、“佛教圣地的辉煌”、“大宝于阗国”以及“伊斯兰手工艺”。因为和田地区在历史上是皮山、于阗、渠勒、精绝诸国的国土，超过156处历史遗迹在和田地区被发现。桑株岩画、山普拉古墓群、热瓦克佛寺遗址、麻扎塔格戍堡址、尼雅遗址、喀拉墩遗址、圆沙古城以及丹丹乌里克遗址等地出土的部分文物珍藏在了和田博物馆。
博物馆馆藏展品.和田博物馆馆藏文物超过9499件其中549件珍贵文物以及国家一级文物54件。一块有和田羊脂白玉雕刻的玉