捕。羁押长达11个月后，于1964年，以首谋叛乱罪遭判处无期徒刑，褫夺公权终身。在侦讯中惨遭刑求，全部牙齿被打至脱落，造成施明德22岁后就全口假牙。由于政府认为施明德属于危险份子，始终不准施明德担任外役，却因此使施明德有时间倾心研究哲学、史学、国际法、语言学和日文。在1970年代中华民国外交处境恶劣，1971年中华民国的联合国中国代表权可能被中国共产党的中华人民共和国取代，台湾有被北京政府併吞的危机。当时囚禁于台东泰源监狱的独派政治犯，认为有必要进行监狱革命，佔领监狱跟台东电台，宣示台湾人要求独立和反对