后，浦通修受到了不公正对待。1960年4月，担任军委总政治部八一杂志社副总编辑。1961年8月，担任防化兵学院政治部主任。1964年，担任中华人民共和国粮食部党组成员、政治部主任。文化大革命中，1967年9月，国务院决定向各部委派出军代表。中国人民解放军总后勤部营房部副部长樊省轩在9月20日进驻粮食部任军代表，副军代表由翟梦僧担任。在清查五一六运动中，1970年至1971年，粮食部在军代表樊省轩的领导下，制造了一个以朱相远（原粮食部科学研究设计院绵阳所技术员）、廖祝南（原粮食部办公厅办事员）为“黑头目”