语和尼夫赫语所共用的词汇事实上是一种外来词的应用；阿伊努语和日语之间也有类似的共用词汇。另外还有学者发表阿伊努语和日语及阿尔泰语系关系的论述，但并没有获得其它专家的支持。近年来，以日语学家村山七郎为首的学者们，试图借由字汇和文化的比较来建立起阿伊努语和南岛语系的关系。Alexander Vovin也曾发表证据证明阿伊努语和南岛语系的关系，但之后他承认那是一个不成熟的假设。也有人说他们语言与因纽特语有关。
现状.北海道、库页岛（桦太）和千岛列岛等地区中，阿伊努语在库页岛、千岛列岛已完