乐院临时停办、成立改组委员会。萧友梅因此在当月辞职，前往莫干山疗养。8月19日，他得到复聘。1931年7月，他写信给中华民国立法院院长邵元冲，要求回复学校的大学建制，之后又多次向教育部提出类似要求，但都没有被采纳。他是抗日救亡歌咏运动的主要成员，九一八事变后写出《从军歌》，是中国最早的抗日救亡主题歌曲之一。此外，1931年9月23日下午萧友梅成立了国立音专抗日救国会，和黄自一起带着师生到浦东、松江为抗日义勇军募捐，募得1089元，并汇给了马占山。抗战期间，萧友梅多方奔走，试图将学校迁往内地以避战火，