立「陆军台湾区临时铁道队」作为过渡；而后台湾总督府成立，铁道建设政策暂定由民间主导。这时台湾铁路共配置有机车8辆，客车20辆，货车26辆。在台湾铁道株式会社、台北铁道会社等民间业者相继募款失败后，台湾主要铁路干线之兴筑于1899年转由官方主导，台湾总督府交通局铁道部于同年成立，计画全面兴建西部纵贯铁路。
1901年至1945年.进入20世纪，铁道部继续扩建台湾铁路。台湾的第一条支线铁路淡水线于1901年通车，主要服务淡水港与台北之间的客货运。除了修建纵贯线外，台湾南部的铁路也得到进