兰半岛南部和北德低地的北部，介于东边的波罗的海和西边的北海之间。石勒苏益格-荷尔斯泰因的北面是丹麦，东南是梅克伦堡-前波美拉尼亚，南面是下萨克森和汉堡。石勒苏益格-荷尔斯泰因的海岸线占欧洲海岸线总长度的3.2%。从西向东石勒苏益格-荷尔斯泰因的地形为沼泽、平原和石勒苏益格-荷尔斯泰因丘陵，境内最大的河是艾德河，最高点本克斯山只有168米高。东岸丘陵所组成的众多半岛造成了许多海湾。这里还有许多湖泊，特别是荷尔斯泰因的东部的劳恩堡被称为荷尔斯泰因施韦茨。德国唯一位于公海的的岛屿黑尔戈兰岛坐落在北海之中。东海