讨伐，并以军监的身分在上野战争中将彰义队赶到寛永寺周围，凭借佐贺藩的阿姆斯特朗大砲以远距离射击的战术瓦解彰义队。明治2年（1869年），因为维新之功而被赐予赏典禄100石。
作为明治新政府的官吏.戊辰战争告一段落后新政府设置江户镇台，江藤被任命为长官之下的6名判事中的会计局判事，负责处理民政、会计，财政及都市事务。7月，明治天皇接受江藤的提议，将江户改名为东京。明治3年（1870年）1月，他回到佐贺担任着座（准家老）并进行藩政改革，其后被召回到中央，同年11月成为太政官中弁。1