6年时伴随当时的路线高架化工程，东舞鹤车站也一同改建成为今日的高架车站型式。至于原本等支线撤除之后留下的停车侧线，则在车站改建的同时一併拆除，并打算用来作为高层住宅大楼的用地。
车站构造.东舞鹤车站为高架车站设计，站内配有岛式月台一座与两条乘车线。东舞鹤车站同时是舞鹤线与小滨线两条铁路线的终点站，在这里两条路线的轨道虽然是互通的，但实际上除了小滨线的末班车会直通运行至西舞鹤车站过夜停放，作为隔天的首班车开往敦贺车站。其他班次列车并不从舞鹤线直通运行进入小滨线。由于这缘故，同一条