肇源于慈照宫雕刻保生大帝神像奉祀时，神像较慈济宫保生大帝神像高大，雕刻后学甲寮庄内事故纷传，经庄内大老请示神意后，将慈济宫原祀旧四大帝与慈照宫神像交换，现今慈济宫内旧四大帝神像实为当年慈照宫开基神像。
旧三大帝神像由来.据台南佳里区番仔寮应元宫当地耆老流传，学甲慈济宫内所奉祀旧三大帝即为番仔寮应元宫二大帝。相传学甲慈济宫旧三大帝与应元宫二大帝同时送往一家佛具店剃面整饰，学甲慈济宫主事人员见店内司傅为神像于水桶内退神洗涤时，应元宫神像因水面浮力反弹至桶外，误为神蹟显示，遂与店内商量，