撒纳，准噶尔汗国就此灭国，清朝将新疆正式纳入版图之内。陕甘总督杨应琚以“西陲平定，幅员广大，陕西甘肃非一总督所能兼理”为由，奏请陕西、四川总督合并为川陕总督，另设单独的甘肃总督。
形成定制.干隆二十五年（1760年），干隆帝认为“新开各处，俱有大臣驻扎，无须更设道员”，令照旧统辖，将甘肃、川陕总督复设为陕甘、四川总督。至此，四川总督成为定制，至清末再无重大调整。宣统三年（1911年），川滇边务大臣赵尔丰接替其兄长赵尔巽，署理四川总督，到任不久镇压保路运动，激起民