交流长期障碍的重要机会，期待两岸能在交通运输、扩大通邮及其他形式合作的协商达成实质具体进展，促进两岸人员、货物和资金的流动。泛绿阵营基于一贯反对「亲中」的政治立场，加上近月来发生的三鹿奶粉污染事件，对陈云林访台表示反对的态度。11月3日，民进党主席蔡英文发表向台湾人民报告：我们为什么不欢迎陈云林一文，提出民进党不欢迎陈云林的理由：会后，林浊水批评马英九牺牲台湾主权、并无换来实质经济利益，三通协议内容有太多看得到吃不到的假利多，而且对台湾来说有许多真利空。