时，北京市第三中级人民法院内设机构27个，政法专项编制人员550人。
管辖.本法院的辖区包括北京市朝阳区、通州区、顺义区、怀柔区、平谷区、密云区等六个区。本法院成立后，商标确权类第一审知识产权行政案件、涉及住所地在西城区的国家部委的第一审行政案件，仍由北京市第一中级人民法院审理；刑事减刑、假释案件仍按照原北京市第一中级人民法院、北京市第二中级人民法院管辖范围审理（原来北京市第一中级人民法院管辖西城区、海淀区、石景山区、门头沟区、房山区、昌平区、大兴区、延庆县；北京市第二中级人民