与捷克斯洛伐克的建交日，即1949年10月6日为建交日。翌年10月，时任中华人民共和国外交部副部长戴秉国与时任捷克外交部副部长签署换文协议，确认中华人民共和国和捷克斯洛伐克在天鹅绒分离之前所签署之条约和协定继续有效。1995年6月，时任中华民国行政院院长连战应邀访问捷克，以及同年10月捷克支持中华民国重返联合国二事，导致中华人民共和国和捷克关系再度恶化，中华人民共和国随即暂停了中华人民共和国与捷克之间副部长级以上官员的来往。同年年底，时任捷克总理瓦茨拉夫·克劳斯公开表示支持一个中国原则，两国关系才回复正常。