，数十万人上街头抗议。最后使的刘兆玄内阁的支持率在2008年11月仅剩34 ％（由《联合报》进行的民意调查）。但讽刺的是，仅在林芳郁下台后一周内，他所提出的三聚氰胺容许值2.5 ppm 已为欧盟等国际认可，成为世界公认的容许值。2009年8月8日，中度台风莫拉克袭卷台湾，山区遭惊人雨量引发的土石流摧毁多处地区民宅，死亡及失踪人数难以统计，而平地淹水更使农、渔、畜产业损失预估超出二百亿新台币，此即为台湾史上近五十年来最大规模的天灾八八水灾。然而刘兆玄内阁中出现延误救灾、且许多阁员失言行为的争议。而刘兆玄本人