以与普通列车识别。初期E331系是以「千叶Destination Campaign」的特别列车名义运行。活动于同年4月30日完结后，JR东日本千叶支社以改良部件为由，让E331系暂时停驶，车辆停在幕张车辆中心。同年10月，川崎制造的7辆列车被运回位于兵库的工厂更换部件，同月27日运回幕张车辆中心。而东急制造的7辆列车完成更换部件，运回幕张车辆中心。经过改良后，于2008年（平成20年）12月再次进行试车，同年12月23日重新投入服务。但2009年5月再度停驶，直到2010年4月3日重新上线服务。