长之弟利政为了防备前田家不会因为西军胜出而灭亡，占据能登宣佈加入西军。虽然前田家中出现内乱，但是丹羽长重也深知以本身十二万石的兵力，实在不及前田利长所能发动的大军，尤其大谷吉继已驰援关原，北陆之事全由丹羽长重一家承担，于是丹羽长重遣使者透过德川家的军师本多正信，向德川家康表明他对家康并没有敌意，最终达成与前田利长双方交换人质和睦。
战后处置.关原之战后，丹羽长重因从属西军，所领遭到没收，后蛰居于江户芝高轮泉岳寺，直到庆长8年（1603年）才被将军德川秀忠再度起用于常陆古渡获得一万石