03年疾病爆发期间，人们在一些大猩猩及黑猩猩的尸体中，发现伊波拉病毒（模式种）的构成物。可此病对灵长动物的杀伤力高，故他们作为天然宿主的机会微乎其微。一项于2002-03年、涉及1,030只动物的实验显示，679只加蓬及刚果蝙蝠中的13只，带有模式种的核糖核酸片段。专家另也于孟加拉国的果蝠身上，找到针对模式种及雷斯顿种的抗体，故伊波拉病原体亦可能存在于亚洲。
传播途径.虽只是一知半解，但专家相信与带病动物或尸体的直接接触为指示病例出现之因。除了蝙蝠本身，黑猩猩、大猩猩、羚羊等野生动物