大选，败给了民族解放党候选人何塞·玛丽亚·菲格雷斯。在1998年2月1日举行的全国大选中，罗德里格斯再次作为基督教社会团结党候选人参加竞选，战胜民族解放党候选人何塞·米格尔·科拉莱斯，当选为哥斯达黎加第五十任总统，2002年卸任。2004年6月7日在基多举行的美洲国家组织第34届大会上，罗德里格斯被一致推选为该组织新秘书长，接替现任秘书长哥伦比亚前总统加维里亚的职务。10月因多次收受贿赂而宣布辞职，15日由华盛顿回到圣何塞接受司法部门对他的调查。哥斯达黎加司法部门当即在机场逮捕了罗德里格斯。首先被软禁在