对恭愍王器重的僧人辛旽的腐败，而受到诬陷，被流放。不过在辛旽遭处死后，崔莹被复职并被派去驱赶倭寇和清除残留在济州岛上的元朝军队。崔莹通过与元军的激战，拿下济州岛。 1376年，倭寇佔领高丽公州市。崔莹和其部下李成桂一起打败倭寇夺回公州。14世纪，中国明朝开始崛起，将蒙元击回到蒙古高原，向高丽索要被其侵佔的元代开元路领土。1388年，高丽禑王命李成桂出兵向北扩张，并同时远征辽东。由于得到高丽朝臣和人民的支持，李成桂在威化岛发动了兵变。崔莹与返回的李成桂军队进行了激战，但是不敌。崔莹被流放高阳市，后被李成桂