得交通是制约长崎县发展的原因之一。长崎县在1960年代开始兴建离岛机场和离岛桥樑，使得离岛地区的交通有很大改善。长崎县在20世纪后半发生过两次大洪水。1957年的的降水量达976毫米，导致683人遇难。1982年的的降水量达572毫米，导致294人遇难。平成时代之后，长崎县先后完成了西九州自动车道、长崎自动车道、生月大桥、、、女神大桥等大型工程，县内交通有进一步改善。但另一方面，长崎县亦面临重工业萧条、离岛地区人口逐渐减少等严峻课题。
地理.长崎县位于九州西北部，东西宽213公里，