夺得日职联首阶段冠军，进入总决赛阶段迎战鹿岛鹿角，首回合在主场赛和零比零，次回合在国立竞技场以零比三落败屈居亚军。2001年赛季明显状态下滑，阿迪列斯宣佈季中离队只能在中游中浮浮沉沉。岂料，球队在日本联赛盃有惊喜表现，决赛以十二码击溃当时拥有中山雅史、服部年宏、名波浩及奥大介的劲旅磐田山叶首夺冠军。
黄金一代（2003年－2004年）.在横滨水手球会历史上，2003年绝对是最重要的一年之一，前年协助札幌冈萨多升上J1的总教练冈田武史成为横滨水手新一任领队，柳想铁、松田直树、上野良治