军政体制，进而侵犯了中华民国总统的统帅权。另外叶菊兰还多次揭发政府官员的贪腐作为，例如在1991年7月5日时便以书面方式质询中山高速公路汐止五股段高架桥拓宽工程第十八标案，进而引发中国国民党内部斗争。同时她也努力推动有关释放政治犯、平反二二八事件及取消黑名单等事宜，并且积极要求政府解决教育、雏妓和妇女等弱势团体之问题，这也让她多次被社会运动团体评鑑为优良立法委员。2000年民主进步党执政并且成立陈水扁政府后，叶菊兰先后受邀担任中华民国交通部部长、中华民国客家委员会主任委员、行政院副院长以及国民大会主席团主席