不同，是前者是用于在战略上实施二次核打击。所以，弹道导弹核潜艇更注重如何不被发现，而不是攻击其他舰艇的能力。弹道导弹潜艇的最重要的是不被发现。常见的手段包括全艇铺设消声瓦，使用最安静的推进系统和减少各种机器的震动与噪音传递到舰身等等。为了携带与发射弹道导弹以及长时间隐藏于海面下，这些潜艇吨位与尺寸会比其他潜艇大得多。比如说苏俄海军的D-III和D-IV级就比阿库拉级要大，而台风级的体积相当于两艘D-IV或者俄亥俄级，内部甚至有游泳池与健身房的配置。