宋之交袭庆府仙源县（今山东省曲阜市）人。孔子四十八代孙，孔宜玄孙，孔延泽曾孙，孔宗愿之孙，孔若蒙长子。崇宁三年（1104年）十二月宋徽宗让他袭封衍圣公，直秘书阁，管勾祀事。宣和三年（1121年）转通直郎，除直秘阁，赐绯章服，并许就任关陞。靖康之变后，建炎二年（1128年）冬，孔端友随宋高宗南渡，先赴扬州陪位，高宗在扬州郊祀孔子，召孔端友及其从父孔传（孔若古）等侍祀。建炎三年（1129年）二月，金兵再次南下，高宗仓皇南渡，孔端友、孔传等奉孔子及亓官夫人楷木像，扈跸南迁。建炎四年（1130年）奉旨定居浙江衢