。而九铁内部亦有一种「理想主义文化」，所有问题都要有待事情解决后，有详细的数据才上报，而有关的员工大多也只会自行解决问题。而上报的时候，即使中层员工没有蓄意隐瞒，但由于资料不清晰，令到即使是管理局的成员也不能即时知道有关运作上的问题。九铁管理局主席田北辰亦指出，这做法已不能符合现今社会对透明度的迫切性要求，即使田氏自从2001年以来担任董事局主席，也未能成功改变这种文化。
管理局主席和行政总裁分拆.自从香港政府于1996年委任杨启彦担任九铁管理局主席兼行政总裁以来，九铁就开始被