东海道本线热海～静冈间路段与身延线全线的富士运输区。除了客运业务外，在富士车站旅客月台北侧、车站大楼东侧，JR货物在此设有两座间隔一段距离、各拥有两条装卸线的货柜月台，中间夹有近十条车辆调度用的分岔线。除此之外站区内还有通往东芝开利（）富士事业所、日本制纸富士工厂、王子制纸富士工厂与大兴制纸厂、旭化成集团（）工厂群以及住友水泥（）富士服务站等许多不同工厂的专用线。在货运列车的操作上，富士车站也有高速货物列车与专用货物列车停靠。其中高速货物列车分别驶往名古屋货物总站（）、广岛货物总站（）、福冈货物总站