另有「首都核心区博物馆」等称唿），为当时文建会于2005年启动的大型博物馆系统计画，计画以台博馆为中心，串联附近日治时代的古蹟建筑，建构一个属于台湾的自然史博物馆园区，并与博爱特区内的总统府、台北宾馆、台北二二八纪念馆等历史建物结合，成为国内外民众认识台湾历史的最佳门户。另外还将修复以下古蹟，未来陆续纳入台湾博物馆系统之中。