时子的同父异母妹妹平滋子与退位的后白河上皇生下宪仁亲王（后来的高仓天皇）后，平氏一族就开始期望宪仁亲王能够继承天皇之位。这造成了二条天皇的不满，并且因此将平时子及平滋子之兄平时忠处以流刑。反之平清盛逐渐向后白河上皇靠拢。二条天皇急病，临死前传位给年幼的六条天皇，平清盛和后白河上皇联合册立宪仁亲王为皇太子。之后平清盛和后白河上皇之间的关系还延续了一段短暂的蜜月期，同时他的官位也节节高升，从永历元年（1160年）升任正三位参议，应保元年（1161年）升任检非违使别当，永万元年（1165年）升任兵部卿兼权大纳