。目前一般认为有颚类是蛛形类演化支的姐妹群（包括真节肢动物的其余部分－螯肢亚门和三叶形亚门）；但有的生物学家认为有颚类是人为的多系群，所包括的类群之间没有亲缘关系。有颚类是体型最大和最具有多样性的节肢动物群。
系统分类学.分子系统发生学研究表明，昆虫和其他六足动物从甲壳动物中进化出来，因此甲壳类动物不构成单系群。现存的节肢动物的亲缘关系如演化支树状图所示: