当时雷根斯堡主教兼任院长。975年，沃尔夫冈主教放弃了院长的位置，并使修院独立于教区，他是最早这样做的德国主教之一，此后这种做法得到推广。1295年，拿骚的阿道夫授予该修道院以帝国修道院（"reichsunmittelbar"）的独立地位，直属于神圣罗马帝国皇帝。1731年，院长获得帝国选帝侯身份（"Reichsfürsten"），随后聘请阿桑兄弟将曾被多次烧坏和修缮的修道院教堂改建为宏伟的巴洛克建筑。1803年，圣埃梅拉姆隐修院和帝国自由城市雷根斯堡，雷根斯堡主教辖区，以及其他两个帝国修道院（