日战争爆发后，日军没多久就进驻厦门，并查获李妈兜的真实身分为化籍台湾人；李妈兜因此逃离当地转入台湾义勇队，并负责敌后情报工作。1946年，李妈兜回到台湾定居于台南县大内乡曲溪村；此后，他曾尝试开设肉酱及炼乳工厂，但都以失败收场。因此，李妈兜接受友人陈福星安排至高雄湖内大湖甘仔蜜会社担任职员。当时，台湾长官公署及国民党政权的治理导致台湾人民面临经济及生活不安定的情况，他因而察觉到由阶级造成的弱势者压迫。1946年6月，在陈福星的引介下，李妈兜经崔志信介绍结识张志忠，随后加入中国共产党。同年10月，李妈