大公会议后，教会的核心逐渐放在各地教区及主教的圣统体系上。许多自治会院区被取消，并以新的教区取代，或是原属于自治会区的辖区被转移到既有的教区名下。今日只有部分在欧洲以及一个在朝鲜的自治会院区被保留。
自治会院区列表.今日保留在宗座年鑑上的自治会院区有11个：注：该自治会院区受到朝鲜政府的打压，以致于多年悬缺。1952年在韩国大邱总教区的倭馆建立会院，现今是以院长担任自治会院区宗座署理的方式运作。