9年9月26日的一场火灾烧毁了他的天文台、仪器和书籍。他连忙抢修，以赶着观测1680年12月的大彗星（C/1680 V1）。但这次火灾的惊吓损害了他的健康，于1687年生日那天去世。1683年末，为了纪念维也纳保卫战的胜利，他把新创立的一个星座取名盾牌座，拉丁文Scutum Sobiescianum的意思是波兰国王约翰三世的盾牌。赫维留斯的着作都在自己家里印制，并亲自设计了很多版画插图。