240年，慕尼黑也为维特尔斯巴赫所占有，并在1255年的首次中便成为公爵的宫城。自1314年起，巴伐利亚公爵路易四世出任德意志国王、并自1328年起成为神圣罗马皇帝，而慕尼黑作为他的宫城，则通过新增的第二道城廓进行了大规模的扩建。当时，慕尼黑采用了老帝国的主色调——黑色和金色，作为。自14世纪末以来，慕尼黑曾多次发生市民反对公爵的暴动，后者遂将他们的政府所在地从老城堡搬迁至市郊的王宫。由于受到胡斯派的威胁，城防设施于1429年通过增设一道外围城廓而得到加强。1442年，犹太公民被驱逐出城。由此至