抑郁成疾。一年多之后在怀孕时，患病去世。葬于广宁门（亦称彰义门）外周氏宅旁。吴伟业作《思陵长公主挽诗》：「贵主媺音美，前朝典命光，鸿文垂远近，哀诛着兴亡……」
金庸小说.民间相传长平公主于明亡后出家为尼，并学得一身武艺，并进行反清复明，收了吕四娘等人为徒，但此传说纯属虚构。而金庸小说《碧血剑》的阿九、《鹿鼎记》中的九难， 为金庸小说武功绝顶高手之一。在梁羽生小说《江湖三女侠》的独臂神尼亦是以此传说为原型。阿九在首次出场是在《碧血剑》，当时她十六七来岁，容貌绝美（连温青青也说