周易折中》，以期在大变之中稳定心智。1895年（光绪21年）派驻天津监督湘军粮运，可专折奏事。宝箴透过两江总督刘坤一保荐户部候补员外郎毛庆蕃协办粮台事务，扫弊清迂，绩效卓着，刘坤一赞叹：「管理粮运的官员少有比得上的。」清廷战败后，李鸿章与日本签订《马关条约》割地赔款，宝箴痛哭「殆不国矣（无以为国）」，上疏痛心疾首指陈利害得失。李鸿章归国后，暂留天津，宝箴不愿意拜见他，甚至愤而表示「李鸿章一回任直隶，我陈宝箴当天就挂冠求去」，友人为李氏辩解，宝箴回说：「像李公这等勋旧大臣，明知不可战，就该当仁不让上书直谏