变完善。2002年3月，由吴濬哲任执行长。6月，引进北台湾第一部骨骼肌肉震波治疗仪。7月，开办健康运动中心，并获行政院卫生署评鑑核定为地区教学医院。12月，百盛癌症防治中心开幕；台湾本岛首家健保IC卡作业上线。2003年3月，许文宪院长及台北医学大学附设医院团队加入医疗合作。2006年12月，张圣原院长与三军总医院合作转诊医疗。2008年10月，尹长生接任院长。