假说认为血脑屏障功能减低也可能和阿兹海默症有关。阿兹海默症患者细胞内外（如铜、铁、锌离子）会不平衡，虽然目前不清楚是蛋白质的改变造成离子不平衡，抑或离子的改变造成蛋白质的变化，这些离子会影响tau蛋白、APP和APOE，这些蛋白失调会造成细胞内部的氧化压力，并因此造成相关的病变。然而有些相关研究的品质受到批评，因此这种推论仍有争议。多数的研究者并不支持铝离子和阿兹海默症有因果关系。抽菸是阿兹海默症的显着危险因子， 先天免疫系统的发炎指标则是迟发型阿兹海默症的危险因子。有限的证据指出空气污染可能也是促