腔金属味感、失去食慾还有头痛，少数病患则可能会癫痫发作或产生药物过敏。对于怀孕初期的孕妇，不应给予甲硝唑，但若是到了怀孕后期则没有这个顾忌。特别注意的是，正在哺乳的妇女也不建议使用。甲硝唑首先在1960年的法国开始被广泛使用 ，它同时也名列世界卫生组织基本药物标准清单中。更是基础医疗上必备的药物，在世界上大部分的国家都能轻易取得。此药物的价格十分低廉，每颗平均价格介于0.01到0.1美元间。在美国，十天的疗程大约需花费26美元，美国食品和药物管理局建议它仅在必要时使用，因为它已被证明在小鼠和大鼠中是致癌的