U-39的值更军官，于1917年2月至10月在海上巡弋作战，表现优良。1918年2月，担任潜艇UC-25的艇长，击沉5艘运输船，获得骑士铁十字勋章；7月，又担任UB-68潜艇的艇长，在10月4日时袭击英国的地中海商船团时，被护航舰重创了潜艇，之后在英国约克郡被俘了10个月。
战间期.第一次世界大战于1918年11月11日结束，但1919年7月邓尼茨才被释放，他留在英国，直到1920年才返回德国，再次加入德国海军。在《凡尔赛条约》的限制之下，德国仅能拥有规模非常小的海军，不能拥有潜艇