爆发后，中国国民党和中国共产党展开了第二次合作。中共方面发表《中共中央为公布国共合作宣言》、《中共中央发出关于南方各游击区域工作的指示》，同意改变中国工农红军的番号，编入国民革命军，9月23日蒋介石在庐山发表讲话接受了中共的合法地位。9月28日，国民政府军事委员会任命叶挺为新四军军长。10月南方八省的红军和游击队正式接受改编。中共起初对任命叶挺持保留态度，11月6日毛泽东会见叶挺，同意了军长任命，并任项英为副军长，暂驻武汉。据当年军医处处长沈其震回忆，10月他和叶挺来到汉口日租界时，日本人已撤走，房屋已贴满