克斯·帕塔塞当选总统。2003年3月，前武装部队参谋长弗朗索瓦·博齐泽的部队攻入首都班基，帕塔塞政府被推翻，博齐泽自立为总统。博齐泽在2005年总统选举中胜出。曾经接待流亡的海地总统阿里斯蒂德。原订于2010年4月的总统选举被无限延期。近年常遭受圣主抵抗军的侵扰，联合国安理会、周边各国和美国协助其打击叛军。2013年，主要由穆斯林组成的塞雷卡武装联盟推翻弗朗索瓦·博齐泽政权，米歇尔·乔托迪亚成为总统。新政府未能制止塞雷卡成员对基督徒平民的暴行，导致基督徒组织民兵反抗及袭击穆斯林报复，国家陷入基督徒与穆斯