手枪配发M12手枪套（贝瑞塔UM84手枪套系统中的一部份），但亦有士兵採用其他手枪套。2003年，军方推出M9的改进型，名为M9A1，主要加入了皮卡汀尼导轨（Picatinny rail）以对应战术灯、雷射指示器及其他附件。M9A1更亦配发物理气相沉积（PVD）胶面弹匣来提供更高可靠性以便在阿富汗和伊拉克等的沙漠地区顺利运作。2014年12月，贝瑞塔公开了最新改进型M9A3以希望向美军提供一个节省成本的方案以取代他们的旧版M9手枪。其改进之处包括：改用了较薄的手枪握把，并新增了一个可拆卸的环绕式模组