，他来到这个世界的理由是为了回收他所挖掘到的太古遗产（平行次元中的高度文明的遗产）「宝石种子」。奈叶为了保护可能因为宝石种子暴走被破坏的城镇，决定代替尤诺出面回收。不料，这却只是一连串事件的开端。他们遇见，与他们一样目的，因为回收宝石种子而出现的谜样金发魔法少女到底是……