1年，本校结束幼稚园原有的学生拨归陈瑞祺永援分校幼稚园。2002年，梁炽才神父离任，江志钊神父接任校监职务。2003年，孔智刚神父离任，郑泰祺神父接任校长职务。2004年，考试制度由四学段改为二学段。管乐团及家长教师会成立。2005年，慈幼会来华百週年庆典及学校命名五週年。参与教青局学校综合评鑑。2006年，容秀芳主任荣休，黎意芬老师接任校务主任职务。增设学生表现评量表。增设医疗室。2007年，增设资讯科技人员、课外活动协调员、阅读推广人员及牧民助理。重整行政大楼。2008年，江