月6日，苏联当局指示哈瑟前往辨识帝国宣传部部长约瑟夫·戈培尔、其妻子玛格达·戈培尔与其六名子女的尸体。哈瑟透过戈培尔右脚上穿戴的铁支架确定了其尸体身份。
监禁与病逝.哈瑟遭苏联俘虏后成为战俘。1945年6月，苏联当局以「担任纳粹德国总理希特勒的私人医生，同时为希特勒政府、纳粹党与亲卫队成员提供治疗」的罪名对哈瑟进行审判，但刑期不详。1950年，哈瑟的结核病越发严重，最终死于狱中；据记载其死亡地点为「布提尔监狱医院」，所指者应该是位于莫斯科特维尔区的布提尔卡监狱。