得国家联盟冠军后，克莱门斯在世界大赛第一战出战芝加哥白袜队时仅投两局便因肌腱受伤退场。这个系列战太空人队被白袜队横扫出局。2005年球季后，太空人队拒绝克莱门斯的薪资仲裁，同时德州游骑兵队、红袜队及洋基队表明签下克莱门斯的意愿，但克莱门斯暗示在代表美国队参加2006年的世界棒球经典赛后可能退休，但克莱门斯从未正式发表退休声明。2006年5月31日，克莱门斯再次与太空人队签下新约（2200万美元，史上最高的一年合约）。6月22日，克莱门斯正式重返球场，但在面对双城队的超级新人Francisco Liria