匡亚明任党委第一书记。1963年5月，匡亚明调任南京大学校长，吉林大学由刘靖代校长。1964年10月27日至11月1日，召开第六次党员代表大会，陈静波任党委第二书记。
东北人民大学.1966年5月至1976年10月的“十年动乱”中，教学和科研均遭到严重的破坏。吉林大学更名为“东北人民大学”。1966年6月，东北人民大学师生开始“揭发”前校长兼党委书记匡亚明问题。6月初，中央广播电台播放《人民日报》《打倒匡亚明黑帮》的文章。1966年“文化大革命”开始，匡亚明成为全国范围内首