任委员、光复会副会长（其妻尹锐志为会长）、军事委员会法制处处长、中国童子军理事会副理事长等。1946年，周亚卫在重庆退役。1948年，被陈仪聘为浙江省政府顾问，并担任浙江省设计考核委员会主委。中华人民共和国成立后，周亚卫于1950年出任中央人民政府人民革命军事委员会高级军训部研究室主任。后又任北京文史馆馆员、第二至四届全国政协委员。1976年8月12日，周亚卫在北京逝世，终年87岁。