机厂与松山车站间的连络线（机厂侧线）正式停用并拆除后该型车暂停使用。
特殊列车.为纪念EMU100即将退出正班车营运，火车驾驶联谊会（通称「火联会」）于2009年8月15日此型列车营运满31週年之际，举办专列活动，行驶台北站和台中站（经海线）。本型车亦曾在2011年3月10日、20日、30日，配合《火车环岛接力─百年车站巡礼》活动担任邮轮式列车。2018年7月28及29日，逢台铁第一代自强号EMU100型40週年，任职实践大学的铁道爱好者张志文以及铁道团体ILLSMP，日前向台铁