紧接其后的是玛丽的妹妹安妮和她的孩子；若安妮无后而逝，最后才会让威廉（假如）再娶所生的孩子继承王位。
亲理国政.从1690年开始，威廉为了应付战事，常在每年的春季到秋季离开英格兰。1690年他于爱尔兰和詹姆斯党作战时，玛丽便在枢密院九人团队的辅弻下治理国政。她对掌控权力并不热衷，反而觉得自己「被迫与挚爱的丈夫分离，还要和一堆疏离的陌生人（指枢密院成员）勉强共事」，她更自嘲自己「回头向家人寻求安慰与体贴时，身旁却只有一个枯燥无趣的妹妹（指安妮公主），真是愁闷烦琐、百无聊赖」（玛丽好动