台湾银行上海分行正式获中央银行指派为在中国大陆地区唯一一家新台币清算行，为中国大陆地区提供新台币之结算及清算服务，两岸货币清算机制正式启动。2013年1月9日获台湾央行发行局许可于台湾地区与大陆地区间进出口新台币钞券，2013年2月4日获大陆的国家外汇管理局核准上海分行办理调运外币现钞进出境业务，于当日立即安排运出一批新台币现钞至上海地区。2013年2月6日，台银（台澎金马各分行）人民币业务正式开办，推出个人及公司、商业、团体之人民币存款、兑款及汇款服务。
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