加工系，而高雄分所之研究方向则以海洋渔业及渔业生物资源之调查研究为主，之后为因应高雄地区水产界之实际需求，自1989年起再度恢复水产加工试验计画之研究业务，开发适合国内消费之水产加工品，期为业者解决水产物滞销之问题。1999年，因为政府精省业务，改隶属农委会。2002年，配合政府组织再造，将分所改制为「沿近海资源研究中心」，期能加强为沿近海渔民与渔业之服务。
旗后地区.同治二年成立旗后海关分关，打狗港自此成为国际商港。旗后的通山里一带成为商贾聚集的交