他还荣获普鲁士秩序勋章和马克西米利安艺术和科学勋章。在1902年，他因对糖和嘌呤的合成被授予诺贝尔化学奖。但生活是悲惨的，他的一个儿子在第一次世界大战中阵亡。另一个儿子在25岁时因忍受不了征兵的严厉训练而自杀。费歇尔因此陷入抑郁之中，并于1919年在柏林自杀。费歇尔的长子 Hermann Otto Laurenz Fischer在加州大学伯克利分校任教，从1948年直到他于1960年逝世，他对有机化学和生物化学有一定贡献。