奖励计划是南航明珠俱乐部（"Sky Pearl Club"）。明珠俱乐部会员除了在南航和天合联盟会员航空的航班上累积和兑换里程，还可在四川航空（航空合作伙伴）的航班上累积和兑换里程，所累积里程均可记入明珠精英会员升级里程和航段中。此外，明珠俱乐部还与其他酒店、汽车租赁、信用卡、电信公司等合作，提供里程兑换及增值服务。南航亦在各主要的大中型机场设立了贵宾休息室，提供阅读室、健身室、浴室、酒吧及餐厅等设施。在与南航签有贵宾休息室使用协议的机场，乘客若是明珠金、银卡会员或者持有头等舱机票、公务舱机票，即可使用