国总统副总统及立法委员选举空前挫败，党主席朱立伦及败选立委的副主席郝龙斌请辞，并于1月18日代理党主席一职，成为首位女性党主席（代理）。同月26日，託时任行政院副秘书长徐中雄领表登记参选党主席，最后获得不足三分之一的得票，以第二高票败给了前立法院副院长洪秀柱。2018年，黄敏惠再度参选嘉义市市长一职。她以「拚经济」、「勇敢向前行，嘉义一定赢」、「正派！廉能！断黑金！」等口号做为竞选主轴，提倡将嘉义市打造成台湾西部新都心。在泛蓝分裂、对手抨击「回锅肉」及无党公职资源下，最终于11月24日的市长选举中，以2