赐“清执”二字，毕生崇拜袁崇焕。崇祯四年（1631年），以都察院右副都御史，巡抚山东。崇祯五年（1632年），孔有德吴桥兵变，广东道御史宋贤抨击余大成毫无作为，只知「持斋戒杀，闭户诵经」，余大成因「不禁叛乱，而禁杀生」，被讥为「白莲都院」。孔有德攻佔登州，余大成、孙元化逃回北京，朝廷将孙元化处死，余大成充军电白。崇祯八年（1635年）往广东电白，迂道至东莞，祭袁督师。余大成见梁廷栋说：“兵临城下，而自坏万里长城，岂计乎？”梁廷栋不悦，称：“此上意也。”。因大赦还乡，卒于家中。
家