武力抗日运动，如大嵙崁大烧杀、云林大屠杀、雾社事件、西来庵事件、萧垄事件屠村等，近年随着遗迹陆续出土，使得这些屠杀事件得以公诸于世，如:新化发现三千枯骨，焦吧哖屠村遗骨出土、云林莿桐发现千人冢、澎湖的千人冢、阿公店大烧杀尸骸出土，衣物黑色焦痕清晰可见，萧垄事件走番仔反遗骨安放于佳里港安宫将军府。甚至是归顺式惨案，后藤新平在《日本殖民政策一斑》中描述，当讨伐土匪时，有一个土匪归顺法，说要发给土匪归顺证，将他们全部集中于警察署里，预先下达顺令，使军队同时把他们杀得干干净净。然后假称义军归顺式妄动，一齐杀戮。