1940年（民国29年）3月，临时政府并入汪精卫的南京国民政府，王荫泰任华北政务委员会常务委员兼实业总署督办。1943年（民国32年）11月，任华北政务委员会农务总署督办兼总务厅厅长。1945年（民国34年）2月，接替王克敏任华北政务委员会委员长。日本投降后的1945年（民国34年）12月5日，王荫泰被国民政府以汉奸罪逮捕。1946年（民国35年）10月8日，南京高等法院判决其死刑。1947年（民国36年）12月，最高法院上诉审，减为无期徒刑，收监上海。中华人民共和国建国后，继续关押在上海提篮桥监狱。1