第6条规定佔领军于该条约生效后90天内退出「所有的」佔领地区，没有佔领就没有佔领权；台湾民政府与美国台湾政府都主张美国是台湾的主要佔领国，但他们都没有美国的授权书，「就等于美国不承认他们」。2015年6月15日，张继昭说，《台湾关系法》是美国国会制定的国内法，美国国会没有行政权，现在的美国只能承认「台湾治理当局」（governing authorities on Taiwan）、不能同时承认其他政治实体，美国国会当然不会授权任何团体在台湾治理当局之外组织政府，所以美国不可能承认台湾民政府或美国台湾政府。