政院长张俊雄于2007年6月16日宣布成立。于2007年9月29日正式成立运作。主要提供单一窗口以加强服务东部地区。促进东西均衡发展，协调地方重大建设事项之推动。
人事任用制度争议.2010年9月，民进党立委陈亭妃针对南部、中部、东部三个联合服务中心的人事任用制度提出质疑，指出三个单位聘任人员平均年薪破百万，显然过高，是「酬庸的盲肠机关」、「没有任何实质作用」、「只是政府拿来酬庸过气政治人物，顺便进行绑桩、分配行政资源的白手套罢了」；有沦为「黑官」之虞。对此，考试院官员表示当时