宗四十六年六月八日，于庆德宫隆福殿升遐，享年60岁，庙号肃宗（숙종），谥号「显义光伦睿圣英烈裕谟永运洪仁峻德配天合道启休笃庆正中协极神毅大勋章文宪武敬明元孝大王」（清朝赐谥僖顺王），葬于高阳明陵。
评价.一些西方学者把肃宗比拟为英国雄才大略的亨利八世，两者都有治国才干，但同样因为妻妾的问题而引发政治分裂。