被迫返回长崎，兴福寺也被关闭。在长崎的年岁中，东皋心越在宗教、艺术领域十分活跃，以禅学和艺术结交幕府人士，因此再次得到德川光国的帮助，天和元年（1682）东皋先移居长崎皓台寺，同年六月离开长崎，之后寓居于德川光国在水户的别墅中。期间广交各界人士、教授古琴。元禄四年（1691）入住水户岱宗山天德寺（今寿昌山祗园寺），元禄五年（1692）十月于天德寺正式开堂说法。元禄八年（1695）九月圆寂，后来被奉为寿昌山祗园寺和少林山达摩寺的开山祖师。
遗产.他东渡日本时带有古琴五床，其中有