。天主教在中国礼仪之争期间，澳门天主敎敎区的工作严重受到影响。在1757年，葡萄牙首相庞倍下令驱逐耶稣会会士，更进一步使天主敎的发展受到沉重打击。结果，澳门境内的敎堂和修院都被空置。及后到1835年-1836年，大三巴与大堂相继被毁，主敎座堂从而迁至玫瑰圣母堂至1847年。直至1926年，葡萄牙重新准予天主敎活动，天主敎才在澳门再度活跃。1941年发生的太平洋战争期间，天主敎致力于赈灾。到1950年代，澳门天主敎敎区开始致力于教育事务。其后，澳门敎区积极参与文化、社会福利等工作。1965年，澳门敎区按澳