赖家即将军位。由于源赖家缺乏统治御家人的能力，又依靠外戚比企氏，引起有力御家人北条氏的不满。1203年，北条政子与北条时政共同废黜了赖家，拥立实朝为将军，北条氏自称“执权”。1219年，北条义时唆使赖家遗子公晓暗杀实朝，随后借此杀害公晓，源氏家族绝嗣，北条政子成为最高统治者，并拥立与源氏有血缘关系的藤原赖经为将军。1221年，朝廷集结武士和畿内寺院僧兵，讨伐北条氏，史称承久之乱，但以失败告终，后鸟羽上皇院政被废止，后鸟羽、土御门、顺德三位上皇被流放。承久之乱后，公家政权开始衰落，武士阶层得到了前所未有的