2000年的选举中，山口再次出选东京都第17区，而且再度对阵自民党的平泽胜荣。但此时公明党却已加入自民党的执政联盟，因此这次选举被认为是少有的执政党之间的对决而备受关注。而在选举前，平泽就一直反对自公两党联合执政，选举中平泽更不断痛批公明党及其母体创价学会，而山口也决意要雪耻4年前的败绩。但在激烈的选战过后，山口最终还是败于平泽胜荣，而这也成为自公联合后迄今为止唯一的一次选战对决。
重返国会.2001年山口改为参加参议院选举，终于在东京都选举区中获胜，其后于第21届参议院议员选