人的来源。他的三卷长的《系统发生学》至今很少有人读，这是一部从1894年到1896年发表的巨着，其中海克尔描述了他对整个动物世界的进化和亲属关系的认识。
艺术和自然.海克尔认为生物学在许多方面与艺术类似。自然界中的对称，比如单细胞生物中的放射虫对他的艺术天赋有很大的启发。尤其着名的是他画的浮游生物和水母的画，这些图画生动地体现了生物世界的美。不论是在他的学术着作还是在他的科普着作中他都画有优美的插图。他的图画对20世纪初的艺术也有影响。新艺术运动就是从他的一些插图中获得启发形成的。