广东省委划为粤北和粤南两个省委，张文彬任粤北省委书记。10月，成立中共南方工作委员会，任南委副书记兼组织部长。1941年12月，香港沦陷，与廖承志等人制定抢救文化人士方案和措施，全力以赴进行抢救文化人工作。1942年6月6日，向东江撤离途中，遭遇叛徒郭潜及所带领的特务被捕。1944年8月26日，在江西泰和县马家洲国民党监狱中病逝，终年34岁。2011年8月1日，珠江电影集团、韶关市金宏文化发展有限公司联合出品的建党90周年献礼片《战时省委》公映。