有六种不同的主机颜色，不过部分特殊颜色曾只于特定地区销售。例如，曾为日本限定，而红色曾只有欧美玩家才可以入手；北美版本的蓝色任天堂DSi与日版也有些微色调差异。此外，任天堂还曾发售许多特别涂装版及同捆版本的任天堂DSi，并曾与《逆转检事》及《最终幻想水晶编年史 时之回声》等第三方游戏合作。
任天堂DSi LL.任天堂DSi LL为任天堂DSi的大萤幕版本。据时任任天堂社长岩田聪在任天堂DSi LL的发表会上表示，「在（任天堂DSi LL）之前，我们因为成本及技术的限制，无法进一步将