0比50的僵局，副总统斯皮罗·阿格纽这时投下决定性的反对票，法案因此未获通过。库珀接下来和密歇根州参议员菲利普·哈特（）一起提出库珀－哈特修正案，该修正案允许研究和开发反弹道导弹，但禁止部署美国反弹道导弹系统。该项措施以3票之差未能通过，但提高了国会对国防部预算的审查力度，致使资金减少，加快美国与苏联展开战略武器限制谈判。这次谈判前，库珀一度担任尼克松总统的顾问。1969至1970年，库珀与参议员弗兰克·丘奇合作制订了一系列修正案，旨在制止越战的进一步升级。1969年12月15日，国会批准了其中一项修正案