禅寺」和曹洞宗的「曹洞宗大本山台北别院」（东和寺）最为重要，两宗派除了在台湾布教，也积极从事社会、教育等事业。两宗派在战后撤出台湾，但是至今仍持续与昔日有缘之寺庙进行交流。其中，临济宗日僧东海亮道法师感念其曾在台湾布教的恩师东海宜诚法师，促成了「台湾三十三观音灵场」的创设。
二十世纪中叶.太平洋战争与第二次国共内战后，随着中华民国国民政府迁移到台湾的外省移民，再度将中国大陆的禅宗带入台湾，改由来自中国大陆的和尚传扬（净土宗亦于此时始中国大陆入台）。如：百丈山力行禅寺、十方禅林、法鼓