国国民党第五届二中全会决议撤销西南执行部与政委会，并改任两广军事长官。因部下余汉谋等被蒋介石收买倒戈，陈济棠因而对前途失望而出走香港。后蒋介石调动部队欲进攻广西，新桂系则动员20万兵力准备应战。同时，蔡廷锴将其十九路军闽变失败的余部送入广西，由区寿年、翁照垣率领，后李宗仁将其整编为国民革命军第四十八军（原第十五军）176师，区任师长。后在全国人民强烈唿吁停止内斗，以及各方政治势力的斡旋下，9月中旬，新桂系与蒋介石达成协议：桂系拥戴蒋中正为全国领袖；在全面抗战开始之时在国民政府领导下出兵抗日；蒋介石允诺不动摇