埔族族群进入埔里后，一开始以埔社与眉社的佃田为生，后来依恃其农耕技术较当地族群进步，逐渐获得当地大多土地，当地原居民因此逐渐撤往山区居住。后来，汉人也随着逐渐松弛废除的内山开垦禁令陆续前来开垦居住。1875年，埔里地区之开发大致完成。沙连堡成立于清朝干隆年间，其范围包括今部份水里乡、鱼池乡、国姓乡、埔里镇及仁爱乡一带；而埔里正是水沙连六社的重要地区，当初称为蛤美兰社，亦称埔里社（埔里社）。道光年间，平埔族迁居至该地，并建立三十多个部落。光绪年间，总兵吴光亮建立大埔城。第二次世界大战后，政府在此设立隶