胜利后，应邀到美国加州大学柏克莱分校进行学术交流一年。1946年冬回国续任北京大学植物系主任。1949年中华人民共和国成立后，续任原职。1952年北京各大学院系调整后，续任合併后的北京大学生物系主任。他曾当选为北京市人大代表、北京市政协委员。文化大革命时期遭受迫害，其妻崔之兰是动物形态学家，崔之兰先被作为资产阶级反动学术权威斗争，后来又被指控为恶毒攻击江青。年近七十的她和丈夫在家门前被斗争，脸上涂了浆煳和墨汁，身上挂了黑牌，还有人揪他们的头发进行辱骂。有一次被长距离游斗，她低头弯腰行走，鼻子流血洒了