国民政府时代.第二阶段北伐结束后，南京国民政府因军队裁撤问题与各地实力较强的军阀冲突日益浮现，在1929年（民国18年），蒋中正与冯玉祥的矛盾因军队编遣问题台面化，1929年5月蒋冯战争爆发。原本为冯玉祥系统的石友三在部队开向许昌之际接受蒋中正代理人钱大钧以500万元买通，在5月22日与冯玉祥的另一位重要部属韩复榘通电支持蒋，反对冯玉祥，由于主要将领反水的结果冯玉祥战力大减，决定通电下野，路经山西省遭阎钖山软禁。做为报酬，石友三从师长晋升为讨逆军第13路总指挥，1929年10月石友三被任命为安徽省政府主席