瑜亦相信关中，唯开票结果是却是四比六，由周清玉当选。由于周清玉任内和县议会关系恶劣，民进党县党部主委郑银添在1993年县长选举支持国民党提名、时任法官的阮刚勐，阮亦在六万多票的差距下胜出，且于1997年县长选举时顺利连任，以约五千票之差击败民进党提名的翁金珠。在2001年县长选举，泛蓝分裂。尽管时任副县长的卓伯源有意参选，然国民党却空降提名曾任法务部部长的叶金凤参选。另一方面，亲民党提名时任立法委员的陈朝容的夫人郑秀珠（陈则于同时举行的立委选举与郑搭挡参选）。民进党则提名翁金珠卷土再战。结果翁获得近五成