期间，钟炳昌受到排挤，但他排除极“左”思潮干扰，为国防“大三线”建设作出重要贡献。2000年9月，经中共中央组织部批准，按中央国家机关部长级待遇。钟炳昌1955年被授予少将军衔。获八一勋章、独立自由勋章、解放勋章。2017年9月17日，钟炳昌在北京医院病逝，享年102岁。2017年9月25日，遗体告别仪式在北京市八宝山革命公墓东大厅举行。