。日本空中自卫队的F-104J服役至1986年退役，其空中拦截之任务由F-15J所取代。除役后的飞机在90年代作为无人机和靶机的研究题材，共14架被改为UF-104JA靶机。F-104J/DJ在日本除役后，部分机体及发动机由美国以海外军售名义交给中华民国空军使用，这批F-104系列是1980年代后期中华民国接收到机龄最年轻的F-104系列，但因为零件规格特殊，及原本机务状态不佳等问题，此批F-104J在几次事故之后，不到10年就将其全数除役。
F-104N.F-104N是洛克希