于分子生物学在回答演化因果关系重大问题上的意义表示怀疑。各学科的生物学家开始声称他们的重要性和独立性：特奥多修斯·多布然斯基针对分子生物学的挑战给出了他的着名论断，生物学的一切都没有道理，除非放在演化的光芒之下。在1968年之后，这个问题变得更加突出。木村资生的演化中性理论提出至少在分子水平，自然选择并不是演化的唯一途径。而分子演化可能是与形态学完全不同的过程。1960年代起，“分子/形态学悖论”成为分子演化研究的关注点。
生物技术、基因工作和基因组学.19世纪后期之后，通常意义上