收东三省条约》，拒绝自金州、牛庄等地撤军，企图永久性占领中国东北。消息传来，东京的中国留学生掀起拒俄运动，成立拒俄义勇队，后来改组为军国民教育会，由拒俄转为反清革命。胡毅生参加了军国民教育会。在日本期间，胡毅生还加入了兴中会。1903年8月，孙中山自越南河内抵达日本横滨。胡毅生得知后，随即与同乡伍嘉杰赴山下町的孙中山寓所拜访，表示愿意随孙中山为革命效力。胡毅生协助孙中山筹办东京青山军事训练班，自己也宣誓入班接受训练，并且一度兼任数学教员。后来，青山军事训练班解散，胡毅生受到刺激。1904年，胡毅生应