中杨所修经忠贤授意，力荐其贤能，由员外郎升太仆寺少卿，后来，连忠贤亦对其生厌，天启六年（1626年）正月，因给事中潘士闻弹劾，忠贤责其败群，削籍。临行，曹钦程仍在魏忠贤面前顿首，称：“君臣之义已绝，父子之恩难忘。”啜泣而去。天启七年（1627年），明熹宗驾崩，魏忠贤被诛，曹钦程入逆案首等，论死，下狱多年，家人不送饮食，曹钦程靠抢夺其他囚犯剩饭，日日醉饱。崇祯十七年（1644年），李自成陷京师，钦程带头破狱出降。自成败，随之西走，不知所终。弘光朝，定从贼案，钦程列首等。