1645年归顺荷兰，后来竹堑社也归顺荷兰后，荷兰人还致力排解双方的纷争。荷印公司于1654年统计竹堑社计有149户，523人。竹堑社当时分布于新竹香山、盐水港一带，与其他部落的酋长每年集会一次，向荷印公司殖民当局报告各部落的现况。1661年（南明桂王永历十五年），郑军统帅郑成功接受荷印度公司通译何斌的建议，挥军进攻大员（台湾）；郑将杨祖率领左先锋镇部队，于新港仔以及竹堑社一带登陆进行屯垦。几个月后，台湾中部的原住民部落联盟大肚王国起兵击败屯田于此的郑军，杨祖受伤率军退回大员。1681年，郑军为了抵抗清军