形或圆柱形而带扁平的单细胞藻体，由前端小凹陷生出细长鞭毛一条，其运行方式犹如螺旋桨，其推进能使得眼虫向前运动；鞭毛基部附近有红色小点能感光，称眼点；眼虫没有细胞壁，有一层富有弹性的表膜，所以身体可以伸缩变形，少数种类表膜很硬，不能变形。它们主要生活在淡水，也有在湿土表面，在含有有机物较多的水中，生长旺盛时，看上去水成为绿色的一片。这种绿色代表了眼虫大多数种有叶绿体，可以进行光合作用（自养型生物）。也有种类的眼虫是异养型生物，它们靠溶在水中的物质生存。但也有很多种类同时行两种营养方式。眼虫是单细胞生物，