议销毁名册以安众心，而督府师爷张梅生力劝瑞澂按名捕之，瑞澂听张的意见，获三十二人，斩杀彭楚藩、刘复基、杨洪胜三人，于是军心骚动，翌日爆发武昌起义，瑞澂弃城而走，清廷革除其职，但仍命令其权摄总督事，以图戴罪立功。朝廷令陆军大臣廕昌督师讨伐，萨镇冰率兵舰、程允和率水师援之，但瑞澂已乘兵舰从汉口，经过芜湖、九江、逃到上海。不久闻听清朝政府欲治其罪，遂再逃日本。1912年，中华民国成立，清帝退位后，返回上海。瑞澂在上海居住四年，1915年病卒。