也纳，奥地利人扯下使馆的三色旗后，以离职迫使奥地利屈服。1798年8月16日，贝尔纳多特与德茜蕾·克拉里（1777年～1860年）结婚。德茜蕾是马赛一位丝绸商人的女儿，拿破崙的前任情人，她的姐姐茱莉·克拉里（Julie Clary）是拿破仑长兄约瑟夫·波拿巴的妻子。7月2日至9月14日，贝尔纳多特任法国陆军部长，展现出极大的才能。在此期间他与波拿巴党保持距离，并拒绝为拿破仑在1799年11月发动的雾月政变提供帮助。1800年1月，他被任命为参议员。1800年4月至8月18日，他在旺代担任西方军团司令。