首届至2004年第六届高交会，均在位于深圳福田中心区深南大道北侧的中国国际高新技术成果交易会展览中心（简称“高交会馆”）举办。高交会馆占地面积约7.7万平方公里，是专门为高交会所建立的临时建筑。该展馆2006年被拆迁至龙岗区奥体新城，原址则用于兴建深圳证券交易所新址及平安金融中心等大厦，相应公交车站“高交会馆”亦被更名为“广电大厦”。自2005年第七届起，高交会改于福田中心区福华三路深圳会展中心举行。