于清朝初年。如今该庙正面在新壁街41号，后门在明光胡同6号。该庙是北京城内现存的主祀吕洞宾的规模最大、等级最高的道教官观。1941年，吕祖阁成为华北道教总会会址。中华人民共和国成立后，吕祖阁归中华人民共和国水利部所有。1984年，吕祖阁被列为北京市文物保护单位。 
建筑.吕祖阁坐北朝南，主要建筑依次为山门、钟鼓楼、前殿、中殿、后殿等。 
庙会.每月初一、十五，吕祖阁开庙两天。每年四月十四日为吕祖诞辰，吕祖阁开放一天。吕祖阁早年香火兴盛。庙内设有“孚