，他解除穆沙拉夫陆军参谋长的职务。正在国外的穆沙拉夫搭乘一班商务客机返回巴基斯坦。谢里夫下令封锁卡拉奇机场以防止客机的降落，并令客机降落在，但是穆沙拉夫联络了军队高层的将军们，由他们接管了国家并且推翻了谢里夫的行政机关。穆沙拉夫对政府进行掌控。1999年巴基斯坦政变后，傀儡最高法院依据政变必要性的基础下，确认政变的合法性。在解任了总统、首席大法官、陆军参谋长与海军参谋长之后，纳瓦兹·谢里夫第二任任期也在此结束，为他在1990年代的管治划上句号。2000年，纳瓦兹被送进监狱，由审理，他以劫持胁迫的罪名被判