早期，在穆罕默德·阿里帕夏统治下，他们的地位得到了极大的改善。他废除了吉兹亚（对非穆斯林征税）并允许埃及人（科普特人）加入军队。1854年至1861年的教皇西里尔四世，对教会进行了改革，并鼓励更广泛的科普特人参与埃及事务。于1863至1879年执政的伊斯梅尔帕夏进一步提升了科普特人的地位。他任命他们为埃及法院的法官，并授予他们政治权利和政府代表权，此外，科普特人也在商业活动中得以蓬勃发展。一些科普特人参加了埃及民族独立运动，并佔据了许多有影响力的职位。其中两个显着的成就包括：于1910年成立科普特博物馆