通史教授傅乐成影响，大二时转学至历史系，师事傅乐成教授，从事隋唐史研究，1966年毕业。服役后于1968年入台大历史研究所，1971年毕业于台湾大学历史研究所，8月入成功大学历史系担任讲师，从事台湾史研究。石万寿专长为台湾史，多涉及明郑时期军防及台南古蹟研究，着有多篇论文发表于《台湾文献》、《台湾风物》、《台南文化》等刊物。并参与众多台南古蹟碑记撰写。曾任凤凰城文史协会理事长，协助推广台南文史。此外亦从事原住民平埔族西拉雅族研究及台湾话研究，着有《台湾拜壶民族》、《台语常用语》等书。曾参与编纂完成《永康