运会中，无法代表各自国家的难民无法获得参赛资格。2016年3月2日，国际奥委会确认了建立难民奥林匹克运动员特殊队的最终计划。43名经认定可能符合资格的难民运动员中有10位入选该队。
独立运动员.2015年10月，由于干预体育，科威特政府被国际奥林匹克委员会禁赛，7名科威特运动员只能以独立奥会运动员的身分参加奥运，队旗为奥林匹克旗帜。俄罗斯田径选手无缘参加本次奥运，因为该国涉及2015年8月所发生的国际田径总会大量资料外洩，国际田径总会包庇了多达1/7的选手可能使用禁药的丑闻。外