2012年3月10日，联赛揭幕战鹿岛鹿角对阵仙台维加泰，柴崎岳在下半场56分钟替换老将本山雅志替补登场，宣告了球队中场核心位置新老交替的开始。10月6日，柴崎岳在对阵FC东京的比赛中取得了个人在职业联赛的首个进球。11月3日，鹿岛鹿角在联赛杯决赛上迎战清水心跳；比赛进行至第73分钟，柴崎岳在禁区内被对方门将放倒，帮助球队赢得一粒点球，之后点球由柴崎岳亲自主罚命中。比赛进入加时赛，第93分钟，柴崎岳在禁区外上演人球分过，创造单刀机会并将球推射入网，帮助球队取胜并成功卫冕联赛杯冠军。赛后，柴崎岳当选赛事最佳球员