发源地沙头角不远的深圳南澳，也有一条鹤薮村，同样由刘氏所建，明洪武元年已有记述，粉岭鹤薮村之名或许只是沿用南澳村名。香港日佔时期，鹤薮村曾经是东江纵队港九大队的基地之一，何礼文、戴斯德及谭伟程皆曾居于此。因村落交通不便，不少村屋荒废，其中1996年李泽鉅被张子强绑架，也是匿藏于鹤薮村一个废置鸡场。全盛时期，鹤薮白菜（俗称「学斗白」）与白泥萝卜、八乡老姜、昂平茶叶、南涌莲藕、打鼓岭大顶苦瓜（俗称「雷公凿」）和川龙西洋菜曾经是香港农业特产。今天村内有绿田园基金的总部和农场，周边有鹤薮水塘和鹤薮营地。