基层学生入读官校机会，批评「目前贫富悬殊日益严重，何以还要在基层子弟身上多踩一脚？」。后来教育局局长以指令方式逼今英皇书院减班，遭英皇书院同学会投诉，2012年1月申诉专员公署确认教育局「处理手法欠妥」。2012年中开始，林超英撰文反对兴建香港国际机场第三条跑道，先后透过环境影响评估、城市规划和填海审批程序提出正式反对意见，2016年4月11日提出「最后回应」。4月29日港府宣布兴建第三条跑道，林超英撰文写下了向后代香港人的道歉信。2013年7月，当传媒报导发展局局长陈茂波的太太在新界东北持有土地，