港龙航空、马来西亚航空、澳门航空、越南航空、厦门航空等航空公司均已开通了飞往高雄的国际航线。目前除了有飞往全台各主要机场的航线外，亦有飞往东京、首尔、济州岛、香港、澳门、曼谷、吉隆坡、胡志明市、新加坡等城市或地区的国际定期客运航线，以及飞往洛杉矶、安克拉治、大坂等城市或地区的货运航线。同时有一些飞往特定地点的载客包机航班。由于小港机场跑道长度仅3,150公尺，无法起降空中巴士A380型飞机及满载的波音747型全货机，机场总面积仅有桃园国际机场的五分之一，又邻近市区，有凌晨零时起至六时止无法起降的限制