阿拉乌丁·阿即思多次宣布独立，在接下来数年屡次率部与桑贾尔交战。1141年，在承认阿即思为花剌子模的合法统治者后，桑贾尔偕同妹夫，卡库伊德王朝的一齐进攻西辽，在卡特万之战中大败，加尔夏斯二世被杀，桑贾尔仅得以率十五名马夫逃走。此战使塞尔柱从此失去了锡尔河一带的领地，阿即思也趁此时再度反叛，与花剌子模的纷争使帝国重新陷入动盪之中。1153年，来自Khuttal和巴克特里亚的乌古斯人擒获桑贾尔，将其囚禁直至1156年。在其被抓期间，这些乌古斯人攻陷了内沙布尔，杀害了沙斐仪派法学家穆罕默德·伊本·叶海亚。