改造期间，金华南站作为分流车站之一，停靠12对经由金温铁路的部分普速列车。
车站结构.
站房.金华南站站房面积5887平方米，其中站房中心主体一层、两侧侧翼两层。车站外立面以中国传统的吉祥图案纹样为创意，东阳木雕展现金华传统文化。售票厅位于站房南侧，设有4个售票窗口，4个自动售票机和3个自动取票机，提供售票、改签、退票等票务服务；候车室位于站房中央，最高聚集人数是400人。站房北侧为出站区域。金华南站客流组织为“下进下出”式：站房与1站台处同一平面，与2-5站