世杰随蒋介石往台湾。1950年3月20日，特任王世杰为总统府秘书长。1952年10月，任中国国民党第七届中央评议委员（第8至12届连任）。1958年7月，任行政院政务委员。此外，他几度出席联合国大会担任中国代表。1962年4月，任中央研究院院长；中央研究院院长任内，兼任国立故宫中央博物院共同理事会常务理事、国立故宫博物院管理委员会常务委员、中华文化复兴运动推行委员会常务委员。1970年4月，辞去中央研究院院长，改任总统府资政。1981年4月21日，王世杰在台北市病逝。享年91岁（