动物学家 Fred Baker 和其他两位同事领导的一个委员会创办了一家独立的生物实验室，名为圣迭戈海洋生物学协会(Marine Biological Association of San Diego)，这就是斯克里普斯海洋研究所的前身。加利福尼亚大学动物学教授 William Emerson Ritter 受聘领导这个协会，本地慈善家 E. W. Scripps 和他的姐姐 Ellen Browning Scripps 在最初十年为协会提供了完全资助。 协会起初位于科罗纳多酒店的船屋里，1905年来到拉霍