预备役总队又加入了海军中将麾下的第二分舰队，并由铁甲舰担任旗舰。由于发动机故障，埃吉尔号只得推迟参加秋季演习。之后，这艘岸防舰于9月中旬被发配回波罗的海预备役总队。它于10月又在东普鲁士沿岸展开了一次训练巡航。1902年4月，埃吉尔号与哈根号一同在基尔湾进行了鱼雷射击演练。5月，该舰在波罗的海展开了几次训练巡航后，又于6月巡航前往拉尔维克。6月30日，舰只在但泽退役。自1903年2月起，对埃吉尔号展开了与同级其它姊妹舰类似的重建。舰只的舯部被切割并延长了近8.4米、达到86.15米，排水量也相应增至43