年3月14日，杨树庄通电参加革命，闽系控制的中央海军归附国民革命军。此后奉系控制的渤海舰队与闽系中央海军长期对峙。1927年6月，奉系海军正式吞并渤海舰队，随即进行改组，原渤海舰队改为第二舰队。8月4日，海琛号、肇和号两舰的山东籍水兵哗变，海圻号、镇海号、定海号赶到青岛协助镇压了兵变。1928年12月东北易帜，第一、第二舰队名称互换。因此海琛号编制也随之变成第一舰队。在20年代末期，东北海军为海琛号加装了4门型号不详的75毫米炮，两门高射炮，以及4门机关炮。舷侧鱼雷管则因缺乏鱼雷库存而拆除。