艰险返回延安。后经朱德介绍，入抗大学习。
抗日战争.抗日战争时期，吴先恩任八路军129师三八五旅供给处军需员，后调任抗大第七队队务主任、抗大第二分校供给部主任、晋察冀军区第四分区供给处处长、晋察冀军区供给部部长、政治委员，参加百团大战。
第二次国共内战.第二次国共内战期间，任晋察冀军区后勤部副司令员、华北军区后勤部参谋长等职。参与组织集宁战役、平绥战役、清风店战役、石家庄战役的后勤保障工作。1949年5月，任湖北军区后勤部部长。
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