三年（900年）兼户部尚书，再度拜相。封吴郡开国公。九月，转为门下侍郎，监修国史。天复元年（901年）特进，兼兵部尚书。天祐二年（905年）朱全忠逼昭宗迁居洛阳，任吏部尚书，崔胤执政，被贬沂王傅、分司东都。昭宗被弒后再贬濮州（今山东鄄城东北）司户参军，被杀于白马驿（今河南滑县），史称白马之祸，同死者还有左仆射裴枢、新除清海军节度使独孤损、右仆射崔远、工部尚书王溥等。陆扆工书法，擅长正楷，笔劲有古风，收录于《宣和书谱》。陆扆兄弟三人时称三陆，其诗有“今秋已约天台月”之句广为吟咏。着有《陆扆集》7卷