产前生物因素，包括基因和激素，可能会影响性别认同。
双性人.在1955到2000年的研究文献进行的一项调查显示，每100个人中至少一个人可能有一些双性人特征。根据联合国人权事务高级专员办事处的说法，人类或其他动物的性别特征包括染色体、性腺、性激素或生殖器的变异导致「不符合男性或女性身体的典型二元概念」。双性人的变异可能使婴儿时期的性别指定复杂化，并且该指定可能与孩子未来的性别认同不一致。人们通常认为通过性别指定手术或荷尔蒙治疗的干预来强化性别指定会侵犯个人的人权。2005年对以