半身瘫痪，记忆也受损。他甚至钦佩自己的着作，只因他忘记自己是它们的作者。1777年12月，他又一次的中风使得他极为虚弱，最终他在1778年1月10日在哈马比（Hammarby）逝世。尽管他的遗愿是将自己葬在哈马比，但他最终还是在1月22日被葬于乌普萨拉主教座堂。
林奈氏分类系统.林奈身处的世纪，也正是欧洲的大航海世纪，许多航海归来的生物学家和博物学家带回世界各地的动植物，并用自己的喜好为之命名，造成一物多名，或异物同名的混乱现象。林奈在乌普萨拉大学其间，发现花的花粉囊和雌蕊