学期间，土谷成绩并不突出，但一直很热心于学习化学方面的知识。本科毕业后，土谷考入筑波大学大学院（即研究生院）化学系研究科物理有机化学研究室。
加入奥姆真理教.1989年2月，土谷正实因一场车祸患上。在医生的建议下，土谷开始前往水户市的瑜伽教室练习。后来，经过友人介绍，他前往奥姆真理教的道场拜访。以此为契机，土谷开始不断与奥姆真理教接近。1990年6月之后，升入博士不久的土谷正实开始不再到实验室进行研究，而是把时间全花在打零工上、收入悉数捐给奥姆真理教。1991年7月，土谷正实的双亲