求顾全大局再上密折主张不应拖延：「刑赏大政，不可为谬悠之议所挠，今欲平贼，而先庇逃帅，何以作中兴将士之气？」刑部审讯时，桂清提出一份薛焕等人具名之公禀，请其退到苏州，以保饷源重地，作为其本不欲弃地的证明。公禀出于当时或事后伪造已无从查究，朝廷命两江总督曾国藩查核具奏。曾国藩认为守土之责与公禀无关，覆奏：「疆吏以城守为大节，不当以僚属一言为进止；大臣以心迹为罪状，不必以公禀有无为权衡。」大学士六部九卿翰詹科道议覆，由刑部主稿，六月十三日，余光倬疏奏：「已革两江总督何桂清身膺疆寄，受国厚恩，岂不知军旅之事，