开中学成为当时华西的着名学府，南开精神也继续在后方发扬。同时，重庆南开中学成为南开大学、天津南开中学等南开学校的临时活动场所。1939年，南开大学经济研究所自天津辗转南迁后在重庆南开中学校园内内恢复成立，至1946年冬季迁回天津。1942年10月，美国总统特使威尔基来华，特到学校参观，曾倍加称赞。校友周恩来经常莅校，看望师长，并多次在学校午晴堂演讲。1945年10月国共和谈中，周恩来曾陪同毛泽东、王若飞来到校园内的津南村拜望张伯苓和柳亚子先生。1945年抗日战争胜利，天津南开各校相继复校，至此，南开