12年10月，美国《国家地理》发表了全绍清拍摄的60幅拉萨照片。这是中国人首次拍摄并向世界介绍西藏。后来他随使者离开西藏出访印度，回国后于1906年到1910年在天津北洋医学堂任解剖学医学教授。在天津，他结识了天津陆军军医学堂副总监伍连德，并教伍连德说北京话。1910年至1911年，中国东三省爆发大规模鼠疫，奉派前往的伍连德向中国全国求援。不久，全绍清等医学防疫专家和医学生赶到疫区，参与防疫工作，3个月控制了疫情。1911年4月，在奉天（今沈阳）召开了国际防疫大会（又称“万国鼠疫大会”)，此为中国举办的首个