998年9月，为了和它不光彩的历史分开，国民党改名为新国民党，并改换了新的党旗和标志。但是沉重的历史包袱使新国民党难以脱胎换骨，在多元化的南非政坛中，新国民党地位和作用不断下降，既为黑人所不齿，白人也深为失望。1999年大选中沦为第四大党，新国民党只在西开普省与民主党联合执政；2000年6月新国民党与民主党合并组成民主联盟；2001年10月新国民党退出民主联盟，与非国大合作；2004年大选，新国民党惨败，只获得1.65%的选票，并失掉西开普省。