来赵光祖认为中宗反正的功臣过份滥封，要求削去部份“靖国功臣”的封号，史称“伪勋削除案”。1519年中宗写信予洪景舟，表示有意除去赵光祖。1519年（中宗14年）农历十一月十五，洪景舟等人取得中宗诏书后派人捉拿了赵光祖及一些士林派官员（己卯士祸）。多次士祸后，士林派退到农村，通过书院与乡约传播他们的理念。
朋党政治展开.宣祖即位后积极起用士林，勋旧派不再有影响力。由于官职数目与学派理念不同外加个人恩怨，士林遂分为不同的朋党。1575年士林派分裂为东人党（主理说）与西人党（主气説）