宣帝时，珠崖山南县反叛，发兵征讨，许多县竟亦叛变，地方连年不稳定。因关东（指首都长安地区）发生天灾，汉无力南下争讨平叛。汉元帝初元三年（前46年）废珠崖郡，放弃该地。三国孙吴赤乌五年（242年），在今广东省雷州半岛复置珠崖郡，下辖原合浦郡的徐闻县、珠官县。晋灭吴后併入合浦郡中。南朝宋元嘉八年（431年）复立珠崖郡，治徐闻，不久又废。以珠官、朱卢属越州。南朝梁在儋耳郡故地重新设置珠崖郡。隋大业三年（607年）在汉朝故地改崖州为珠崖郡。治义伦县。领义伦县（治今海南儋州市西北）、感恩县（治今东方市南）