尹默是益州人，当时益州人多数喜好今文而不推崇古文章句，尹默知道他们对章句并不太认识，于是到荆州跟司马徽、宋忠等人学习古文。尹默于是通晓经学和史学，尤其精于《春秋左氏传》。尹默作的註本亦广为人所读，甚至不必再参阅原本。刘备夺取益州后，任命尹默为劝学从事。立刘禅为太子后，尹默被任命为太子仆，教授刘禅《春秋左氏传》。刘禅继位后，尹默被任命为谏议大夫。诸葛亮驻军汉中时任命尹默为军祭酒。建兴十二年（234年），诸葛亮病逝，尹默回到成都，被任命为太中大夫，后来逝世。
三国演义.第80回和众大臣