lost+found"目录中。系统管理员在认为文件系统出现问题时可以手动运行fsck。运行fsck时分区一般处于卸载或只读方式挂载状态下。FreeBSD使用的UFS2文件系统会在后台运行fsck，在访问磁盘前不需要等待fsck结束。以ZFS和Btrfs为首的写入时复制文件系统旨在避免大部分文件系统损坏的原因，因此没有传统的"fsck"工具。Btrfs和ZFS使用来检查和修复错误。
示例.检查挂载到/usr上的分区fsck /usr检查使用JFS文件系统的软件RAID