肃省临时参议会纠弹。奉马安良的指示，马麒派人杀害临时参议会议长李镜清，对此甘肃都督赵惟熙未作处理。同年8月，马麒被北京政府任命为西宁镇总兵，后升任青海蒙番宣慰使。
确立青海统治权.1914年（民国3年），四川与青海就青海南部与四川省交界的玉树、昂欠两地的归属产生纠纷。了解到当地的藏族人不希望归属四川省后，马麒向北京政府提出勘定界线的要求。政府派忠武军统领周务学等人赴玉树调查，结果，两地归属青海，川军撤退。由此，马麒在青海西部、南部形成势力范围成为可能，被任命为玉树驻防司令。19