1744年（干隆九年）他到达澳门，并于次年被干隆帝召至北京。1747年（干隆十二年），在郎世宁推荐下干隆帝任命他为圆明园“大水法”（喷水池）设计者。喷泉建成后干隆帝对他十分欣赏，还曾与他作过数次长谈，同时向他询问天文地理方面的问题。干隆帝平定准噶尔与回部后，又派蒋友仁主持《皇舆全图》的绘制。他在国子监算学总教习何国宗等人的帮助下，对康熙《皇舆全览图》进行补充后，于1760年（干隆二十五年）完成《皇舆全图》。此后又将此图用铜版印出104片。1772年（干隆三十七年）蒋友仁向干隆帝引见刚来华的传教士潘廷