入伍的国家人民军不同。边防军主要兵力集中在西方边界，相比而言在捷克斯洛伐克和波兰边界只有约600名边防军驻守。1990年7月1日，东德与西德和西柏林边界边境管制宣告终结。1990年9月，德国统一前不久，边防军被解散，边境巡逻和东部边境守卫职责被联邦德国的边境防卫队（，即2005年后的德国联邦警察）接管。