.学校实行学部制，根据成立沈阳育才教育集团后所提出规划方案，依据与学校关系，将各学部分为核心层，紧密层与松散层。
核心层.核心层即沈阳育才学校，行政关系上隶属于沈阳市教育局。其中初中部位于中山公园校区，东关模范小学位于沈阳市大东区原奉天省官立东关模范两等小学旧址旁，其他部门均在浑南新区高功路校区。
松散层.包括通过教育服务委托管理的方式进行管理的部门，其中沈阳育才学校的角色或可理解为受业主聘请授权的管理方及合作方:
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