在2007年、林奈诞辰300周年之际，天皇及皇后两人一同前往瑞典的乌普萨拉祝贺，停留期间还参观了通贝里从日本返国后所任教的乌普萨拉大学。瑞典国王卡尔十六世·古斯塔夫亦曾多次访日，若计入非正式访问可达16次。21世纪后，他分别在2007年、2012年与希尔维亚王后一起赴日。由于卡尔十六世为名誉主席，他还于2013年11月抵达京都参加童军活动。除了王室及皇室成员之外，日本及瑞典的政府首脑也进行过数次互访。瑞典首相英瓦尔·卡尔松和卡尔·比尔特分别于1991年和1993年到日本进行官方访问及参加会议。2004年