种马所.1937年在花莲吉野设立种马所，现址为畜产试验所花莲繁殖场。
种马牧场.1940年在台南新化设立种马牧场，除了提供马匹作为运输用途，主要提供日本本国马匹汰换、以及战场骑乘及运输使用。现址为农委会畜产试验所。
棉作指导所.为确保日本帝国棉花供应，1937年在台南设立棉作指导所，负责棉花种子培育，相关耕作与病虫害调查，1940年设立东部棉作指导所。
热带特用树种栽培事务所.1930年1月设立，19