追溯至这两条线的开通时期，当时它们仍是经由穿越伊萨尔河并继续通往，而经由戴森霍芬通往霍尔茨基兴的分支也仍然使用S2（而不是如今的S3）线的编号。2014年以前，在上以内燃动力运行的A线（），同样也是快铁网络的组成部分。它在S2线中从达豪开始并开往阿尔托明斯特。作为5.2亿欧元扩建计划的一部分，它于2014年12月完成电气化改造并作为翼位路段被集成至S2线。在德国铁路的中，慕尼黑快铁的线路编号使用999.1至999.8的区间。2013年以前，S20和S27线在行车大纲的线路编号被标注为999.20，A