清治末期，番子寮地区为一街庄，称为「蕃仔藔庄」，隶属于苗栗三堡。该庄北与庄尾庄为邻，东与外水尾庄、内水尾庄为邻，南边一小段与六块厝庄为界，西边为后厝仔庄，西北边一小段与牛埔庄为界。1901年（日明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于苗栗厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「大甲区」，仍隶属于苗栗厅。1909年（明治四十二年）10月，全台二十厅合併为十二厅，苗栗厅废止，大甲区改隶属于台中厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，该庄改制并雅化为「番子寮」大字，隶属于台中州大甲