瓮猪笼草组”。其种加词“"micramphora"”来源于希腊文和拉丁文，“"mikros"”在希腊文意为“小的”，“"amphora"”在拉丁文意为“瓮”，指其体型的矮小。
植物学史.2009年，沃尔克·海因里希、斯图尔特·麦克弗森、托马斯·格罗内迈尔和维克托·阿莫路索对小瓮猪笼草进行了正式描述。该描述发表于斯图尔特·麦克弗森的专着《旧大陆的猪笼草》第2册中。编号为“"V.Amoroso & R.Aspiras" CMUH 00003545”的标本被指定为模式标本，其存放于菲