除龙云的省长职务。10月6日，龙云被国民革命军移交飞赴成都出任“军事参议院院长”的虚职，由当时伞兵第6队与第9队担任仪队，伞兵副司令张绪滋亲任仪队队长，组成300人的仪队到机场恭送龙云赴成都上任，云南的治权则转交到他的亲信卢汉手中。1946年5月，国民政府还都南京，龙云也跟随政府至南京，并被软禁在中央路156号洋房居住。而后军事参议院取消，龙云被任命为新成立的战略顾问委员会副主任。1948年12月8日，在陈纳德等人帮助下，龙云乘C-47运输机从南京到达广州，并乘船到达英属香港，结束了三年两个月的软禁生活