磺胺嘧啶的血脑屏障透过率高，也用于治疗流行性脑炎。临床上，会併用磺胺嘧啶与乙胺嘧啶（pyrimethamine），以治疗弓形虫的感染症。
作用机转.磺胺嘧啶会抑制酵素。
副作用.磺胺嘧啶的副作用包括恶心、食欲不振和头晕。