容器或蓄电池作为动力系统的一部分，但其容量较纯电动车小。车上燃料电池多是以储存的高压氢气加上空气中的氧气发电。多数燃料电池车被视为，因燃料电池发电时只会排放水及热。与内燃机车相比，燃料电池车的主要污染来源为氢气的制造过程，因现今较经济的氢气制造过程需以天然气为原料。