轮大殿、金刚亥母殿以外的几乎全部殿堂，抢走了大批财物。当时，上桌特·图斯都布、道尼尔·巴拉丹勒格都布等人率部分喇嘛冲入火海，将六世达赖肉身、金刚亥母像、《甘珠尔》抢救出来，搬至山崖险要处隐藏。此后，因殿堂被烧，六世达赖肉身等被送至衙门医药殿暂时供奉。清朝光绪年间，该寺获得修复。第五世迭斯尔德活佛主持该寺时期，主持新建了大经堂，扩建并修缮了六世达赖仓央嘉措的灵塔大殿“黄楼庙”，还派出大批喇嘛赴西藏学经，使广宗寺达到鼎盛时期，但末期又开始衰败趋势。第五世迭斯尔德活佛圆寂后，阿拉善旗政府很快便开始抓喇嘛当兵，