政府拨款2042万，拨材料折价2313万元，湖南分担477万元，广西分担354万元。广西负担的路款在省内发行铁路公债解决。民国27年（1938年）10月1日，在湖南衡阳衡桂段工程处改组为湘桂铁路股份有限公司衡桂段管理局，直属湘桂铁路理事会，管理湘桂铁路衡阳西—桂林北段的运输业务；桂柳段总工程司室、柳南段工程处合并为桂南工程局，局址设南宁，负责桂林至柳州、柳州至南宁两段施工。1939年10月，南镇段工程监督处成立运输处，接收管理该段镇南关至宁明已铺轨路段并办理运输业务。1939年11月，日军在北海登陆，侵犯广