崎骏与铃木敏夫的劝说下，开始进行戒烟。2017年4月里动过手术后，高畑勋身体状况开始出现恶化。到了2018年2月在身体不适的情形下，高畑勋仍有出席参加演讲活动。3月底入院治疗时，已有唿吸困难无法发声的状况。4月5日凌晨1时45分高畑勋因肺癌在东京的帝京大学医学部附属医院去世，享寿82岁。离世后吉卜力工作室在5月15日于吉卜力美术馆举行了高畑勋的追悼会，当天除了他过去于动画界的长期盟友宫崎骏、铃木敏夫、大冢康生、小田部羊一在场外，共来了久石让、押井守、富野由悠季、麦可·度德威特等上千人为他送别。高畑勋