部、国际商学部和理学部使用。横滨市立大学的YCU广场即位于该校区内。除主教学楼、理学系研究楼和文科系研究楼外，校区内另设有食堂、学术情报中心、2座体育场和3栋学生社团专用楼等设施。
福浦校区.金泽八景校区位于神奈川县横浜市金泽区福浦3-9。由医学部使用。除基础研究楼、临床研究楼、实习楼、医学情报中心、动物实验中心等设施外，横滨市立大学附属医院即位于该校区内。
鹤见校区.鹤见校区位于神奈川县横浜市鹤见区末广町1-7-29，由学部改组前的国际综合科学部