形势不利，1942年至1945年，资源委员会新办企业仅十多家。1940年（民国29年）5月，钱昌照升任资源委员会（当时移交国民政府经济部管理）副主任委员。1941年（民国30年）9月，任行政院全国水利委员会委员。1945年（民国34年）5月，当选中国国民党第六届候补中央执行委员。1946年（民国35年）5月，銭昌照升任资源委员会主任委员。1946年6月，兼任国民政府最高经济委员会委员。同年10月，资源委员会改为直属行政院，銭昌照由主任委员改为委员长。1947年（民国36年）4月23日，国民政府准免资