由1907年成立的台湾守备队扩充而成，而更早之前则为1896年编成的台湾守备混成旅团，而这阶段的军事统领，皆由台湾总督兼任。台湾军主官为台湾军司令官，而组织下辖台湾守备队（台北）、台湾步兵第一联队（台北）、台湾步兵第二联队（台南）、台湾步兵第三联队（台中）、台湾山砲兵大队（台北）、基隆重砲兵大队（基隆）、马公重砲兵大队（马公）、飞行第八联队（屏东）、太平洋战争爆发后，于昭和19年 (1944年) 扩充改组为「第十方面军」，统辖沖绳、台湾、澎湖的防卫作战任务。后期扩编为第十方面军的台湾军军事持久防卫战