入对肌母细胞融合和成肌至关重要的功能丧失基因，可以控制着C2C12细胞形成肌肉的速率。在存在着肿瘤坏死因子-α的情况下，C2C12细胞中会丢失蛋白，特别是肌球蛋白重链蛋白（ myosin heavy chain protein）。C2C12细胞用于阐明在S期发生的失活X染色体的复制，并且受到表观遗传的调控。C2C12细胞因其高分裂率而可应用于细胞週期的研究。