类、兽脚类共有的特征，导致科学家们质疑始盗龙的原始程度，以及与其他恐龙之间的关系。在2009年的一个研究，提出始盗龙属于兽脚亚目，演化位置比艾雷拉龙下目衍化，但比腔骨龙原始。始盗龙被认为是最原始的恐龙之一。始盗龙在恐龙的演化位置仍未定，可能属于基础蜥臀目或基础兽脚亚目恐龙。保罗·塞里诺在1993年命名始盗龙时，根据五根据有功能的手指与其他特征，将牠们归类于兽脚亚目。在2011年的曙奔龙命名研究里，提出始盗龙是种基础蜥脚形亚目恐龙，因为牠们有这个演化支的特征。麦可·班顿（Michael Benton）对此