在庆长11年9月23日（1606年10月24日）获封下妻5万石。庆长14年12月22日（1610年1月16日），鹤千代获增封至水户藩25万石，成为水户藩首任藩主，下妻因而再次成为天领。庆长16年正月20日（1611年3月4日），多贺谷氏的旧臣与下妻的农民共9人向奉行举报一位名叫吉卫门的人。根据举报所言，吉卫门将城池遗留下来的武器（弓、枪和铁砲等等）、船板、木材和叠蓆等等运往自己的住所，并且破坏以前重经隐居的地方、武士的和众的居所。此时，下妻城已经处于荒废状态，盛极一时的多贺谷氏时代亦已成过去。元和元