69年3月，麦克迪维特的团队首次测试了登月舱，证明了其独立飞行的能力。1969年5月，麦克迪维特开始担任登月计划的负责人，负责研究对月球的探索并带领团队对航天器进行调整。8月，他成为阿波罗航天器计划主任，负责阿波罗12号、13号、14号、15号以及16号。麦克迪维特原本将担任阿波罗14号的登月舱驾驶员随艾伦·谢泼德一道登月，但麦克迪维特与谢泼德的矛盾以及禁止尤金·塞尔南执行任务的尝试使他失去了这次机会，并从航天器计划主任的位置上辞职。美国航天史上只有五位宇航员首次进入太空便担任指令长，麦克迪维特是第