经文资料遭到毁灭，上海佛教居士林因宗教政治压迫而停止活动，居士林内居住的僧人受到批斗及政治压迫，居住在居士林的格鲁派僧人清定上师受到压迫。文化大革命结束后，上海佛教居士林于1987年初恢复活动。
人事变动.1989年6月，聘请赵朴初居士为上海佛教居士林的名誉林长。1998年2月，在第四次林员代表大会上，邵钟居士当选为林长，胡志文居士当选为总干事长。2004年10月，第五次林员代表大会上，王永平居士当选为林长，邵钟居士当选为名誉林长，聘请郭大栋居士、卢秀清居士为顾问，周富根居士、陈妙