9年秋，毛泽东坐车自延安到真武洞参加中共中央西北局的一个会议。途经中央军委二局驻地时，因汽车陷入河中，毛泽东决定在中央军委二局驻地过夜。当晚毛泽东与戴镜元谈话。次日上午，毛泽东看望了中央军委二局全体同志。
第二次国共内战.第二次国共内战时期，戴镜元任中央军委二局代局长、局长兼政治委员、二局党委书记，中央后方委员会委员。参加了中原突围、进军大别山、辽沈战役、淮海战役、平津战役、渡江战役、进军西南等战役战斗的情报保障任务。1945年冬，东北民主联军发起本溪保卫战。本溪战役结束后，戴