父亲康熙帝“圣祖仁皇帝荐福”而建，地处畅春园东北角，紧邻清溪书屋，康熙帝晚年经常在清溪书屋宴寝，并且在清溪书屋。恩佑寺原先有三进院落，山门坐西朝东，面临大道（即今颐和园路），山门额书“敬建恩佑寺”，山门内横跨三座石桥。正殿面阔五间，供三世佛（释迦牟尼、药师佛、无量寿佛）。《日下旧闻考》记载：“二层山门额曰龙象庄严。正殿额曰心源统贯。皆世宗（雍正）御书。殿内龛额曰宝地昙霏。联曰：万有拥祥轮，净因资福；三乘参慧镜，香届超尘。皆皇上（干隆）御书。”清朝雍正四年三月十五日，雍正帝诣恩佑寺行礼，三日后又一次行礼，