山做屏障，此外清初的台湾防务着重于「海防」，故选择较靠近海边的兴隆庄为县治。而虽然选择兴隆庄为县治，但设县初期仅在莲池潭畔建立文庙，知县等官员办公实际上是在接近府城的土墼埕凤山县行署（公馆）。直到康熙四十三年（1704年）「奉文归治」，当时的凤山县知县宋永清才在兴隆庄修筑县署等设施。但随着埤头街的发展，及兴隆庄分别在朱一贵事件（1721年）、林爽文事件（1786年）两次陷落等因素，县治遂迁往埤头街。后来因为蔡牵势力攻陷新城等事件，将军赛沖阿提议将县治迁回兴隆庄。嘉庆十二年（1807年），嘉庆帝同意赛沖阿