因乌什原为霍集斯驻地，其属下人煽动骚乱；三或因乌什回民与霍罕额尔德尼潜通信息，惩办阿布都里木之后，亲属人等煽动。因此，干隆帝令前往乌什官员查实，又命询问最先归附清朝的伯克额敏和卓，干隆在谕旨中一再强调派伊犁将军明瑞前往处理非专为镇压，而要详察原因。明瑞从伊犁赴乌什前，总理南疆事务大臣纳世通从喀什噶尔赶到乌什临时处置，他对骚乱未予重视，认为北疆的将军明瑞不应插手南疆事务，故数次上折阻止明瑞前来。伊犁将军明瑞仍率兵前往，干隆得知后甚悦，称“甚合朕意”。明瑞于阿克苏与乌什之间安营扎寨，以候消息。干隆察觉到明