目标是为了2009年的中华人民共和国第十一届全运会。杭州三超足球俱乐部旨在振兴浙江足球，改变浙江足球历史。俱乐部自成立以来，依照“企业化管理，规范化运作”的发展要求，努力探索以市场经济运作职业足球，大力发展足球产业的道路。2009年，在球队肩负全运会的基础上，继续征战中乙联赛，止步于半决赛，未获得中甲资格。2010年初由于队中众多球员上调至杭州绿城而未有参加级联赛。