国家神道成为国民道德教育的一部分，成为公共学校教学内容的一部分。神官受雇到公共学校进行有关国家神道的讲授，公共学校也会组织每名学生都必须参加的神社参观行程。在国家神道体系下，受到政府资助的神社划分为不同等级的近代社格，分别由国家财政或地方财政维持。伊势神宫是全国的神社中地位最高的一个，因地位特殊，在国家神道体系下无社格。从明治后期开始，神社中的神官具有国家公务员地位。一部分神社是在神道国家化后才设立的，比如靖国神社和凑川神社。国家神道体系下的神社担负一定的政治功能，比如主持对战死者的祭祀、宣扬效忠天皇和