家破君亡，永矢孤忠，创基业在山穷水尽；复父书，词严义正，千秋大节，享俎豆于舜日尧天。」1890年（光绪十六年）三月，清廷加封巡抚刘铭传兵部尚书衔并帮办海军事务。同年九月，副将刘仁柏因剿抚生番积劳病故，郑超英奉旨接替，担任从二品台湾水师协副将。而隶属台湾镇之下的此官职是台湾清治时期阶段，全台海防军事层级最高的武将，统领水师三营，二千余名水师兵勇。刘铭传曾多次倡议在台湾建立海军，惟清廷以「已有南北洋海军和经费短绌」为由，不予採纳。但自1888年（光绪十四年）起，慈禧太后挪用海军经费重建「颐和园」，历时十年，