赛结束后，她又被安排回到青年队集训；种种挫败的经历令她对个人前途深感迷茫，曾想过进不了二队，就回去读书。然而，没抱太大期望的她却在12月收到通知，正式入选国家二队。她在国家二队期间，曾代表中国参加2006年世界青年羽毛球锦标赛，并夺得女双冠军（伙拍王晓理）及混合团体亚军；至2008年北京奥运会结束后，便被提升进国家一队。
2008年.北京奥运会后，刚晋升到国家一队的马晋顶替退役的高崚，成为老将郑波的新混双拍档，这对新组合首次出战11月举行的中国公开赛。在比赛之前，马晋和郑波仅合