陈毅任代理军长，同政治委员刘少奇等将华中9万兵力整编为7个师和1个独立旅。陈毅先后发表《论建军工作》、《论军事建设》，总结经验教训，领导部队整训，推动部队以加强中共领导为中心环节的全面建设。1941年2月，国民革命军李长江部投奔汪精卫，陈毅组织指挥讨伐李长江战役，攻占泰州，歼李长江部5000余人。7月，领导盐阜苏中战役，反击日军扫荡，歼3800余人。10月，组织指挥程道口战役。1942年春，刘少奇返延安后，陈毅代理军委分会书记，全面贯彻中共中央的方针，领导新四军坚持华中敌后抗战，指挥各部挫败日伪军的扫荡、