相关埤圳纳入政府管辖并由政府出资改良。大正九年（1920年）9月时，原先的官设埤圳在全台行政区画改制时也移交给各地州政府管理。而嘉义、台南两厅为了要改善灌溉与排水设备，于该年8月由该地区受益者组成了「公共埤圳嘉南大圳组合」要兴建嘉南大圳。该项工程由八田与一担任总工程师，于昭和五年（1930年）完工，初任管理人为永山止米郎。而最初嘉南大圳组合事务所设在嘉义郡嘉义街，于昭和十五年（1940年）才在台南警察署南边，由住谷茂夫设计新办公厅舍。二次大战后该建筑物改为嘉南农田水利会，于民国八十七年（1998年）