隶江苏省第三行政督察区。民国三十五年（1946年）12月14日，江苏省将嵊泗列岛划出，建江苏省特别渔区。民国三十八年（1949年）4月，中共华中九地委在南通宣布成立崇明县政府，姚志仁为县长。同年6月2日，中国人民解放军接管县城，崇明县政府隶苏北行政区南通专员公署。同年6月27日，解放军崇明县军事管制委员会成立，林德明为主任委员。1950年7月31日，崇明县政府改为崇明县人民政府，县长仍为姚志仁。1955年12月6日，崇明县人民政府改称崇明县人民委员会。1953年计划经济开始以后，因外省市计划中未包括上海