编码的实现是设计自己的适合去除原始音频中部分信息的算法（或者是它在频域中的改进的离散余弦变换表示）。在编码过程中，576个时域样本被转换成576个频域样本，如果是瞬变信号就使用192而不是576个采样点，这是限制量化噪声随着随瞬变信号短暂扩散。这是心理声学的研究领域：人类主观声音感知。这样带来的结果就是出现了许多不同的MP3编码器，每种生成的声音品质都不相同。有许多它们的比较结果，这样一个潜在用户很容易选择合适的编码器。需要记住的是高位元率编码表现优秀的编码器（如LAME这个在高位元率广泛使用的编码