民国总统陈水扁就任未久，巡视总统府各单位时亲眼目睹两枚国玺，特嘱总统府监印官妥善保管。
使用方式.两方国玺字体用阳文篆字。出于保护印玺需要，加上玺面较一般印信更大，要盖印的时候，不是把国玺拿起来盖在纸上，而是先把国玺固定起来涂上印泥、再把文件放在国玺上加印。