但后来到了嘉靖二年（1523年）爆发了宁波之乱，加上稍早时，葡萄牙人入侵发生了屯门之战与西草湾之战，此后沿海治安多次陷入危机。明廷以此中断一切对外贸易，中日贸易从业者生计大受打击，遂成海盗。倭寇并不是只有日本人，最知名的当是中国人汪直。经过名将胡宗宪、戚继光与俞大猷的努力，倭寇问题在嘉靖末年基本被解决。
影响.不管是北虏还是南倭都在当时明朝的南北边疆地区造成了嘉靖年间的边疆危机，但是都到了隆庆时期明朝通过开放海禁、“俺答封贡”使一直困绕明朝的“北虏南倭”问题得到基本解决。