疏水效应（）又称疏水性效应，属于非极性分子的一种性质，会使这些分子在水溶液中具有自我聚集（self-associate）的特性。例如油在水中会呈现与水分离的现象。此外这种现象对于蛋白质的型态、不同蛋白质之间的交互作用，以及核酸结构等生化分子也有所影响。例如某些拥有疏水核心（"hydrophobic core"）的蛋白质，会以疏水轴为中心形成卷曲螺旋（coiled-coil）结构。在水中蛋白质折叠时总是倾向于将疏水基团埋藏在分子内部，将亲水基团暴露在外部的现象。蛋白质溶液系统熵值的增加是疏水作用的主要动力