为国家重点实验室。实验室的研究目标为海洋及相邻陆区的环境演变与海底资源，设有“古海洋学与古环境研究”、“大陆边缘演化与海洋沉积学研究”、“海底资源研究”、“深海生物地球化学研究”与“海底过程与观测研究”五个主要研究方向。实验室主任为海洋地质学家翦知愍。