通宪一直希望在祖先世代供职的大学寮里取得一个职位。但当时的官职多是世袭的，一般只有藤原家的人才能担任这个职务，而通宪此时的户籍属于高阶氏。因此通宪非常失望，产生了出家的念头。鸟羽上皇得知后，于1143年（康治二年）升其官位为正五位下；翌年又恢复了他藤原氏的户籍，任命他为少纳言，并且让他的儿子俊宪担任文章博士、大学头的职务。但藤原通宪依然决定出家，法号信西。出家后的信西并没有脱离尘世，成为鸟羽法皇的政治顾问，参与了《本朝世纪》的编纂。1155年，近卫天皇死去，朝廷讨论后继天皇的人选问题。当时重仁亲王是