永乐元年（1403年） 住持仁山毅禅师带领僧众修复香严寺。先在下寺修建门堂屋宇，而后动工修建上寺，但没有修到一半禅师便圆寂。永乐十一年（1413年） 明成祖批准在修建武当“太和山宫观”的同时，为太虚禅师修建香严寺。九年后，寺院建成；寺内的匾额由驸马都尉沐听题写。成化二十三年（1487年） 明宪宗赐香严寺新名“显通禅寺”，同时赐如意为香严寺住持。万历二十八年（1600年）夏末暴雨泛滥，丹江和淅水同时暴涨，将下寺山门、鼓楼、殿堂、屋宇淹没，四大天王、韦驮及十八罗汉佛像也随之消失。崇祯十七年（1