改革者进行如同对天主教一样的迫害。缘于当局的迫害，许多受洗礼派离开了瑞士到邻国去了。瑞士弟兄会成名于1693年门诺会一个由于在雅各·阿曼和汉斯·赖斯特（Hans Reist）两组之间的分歧而导致的分裂。许多在法国，南德意志，荷兰和北美的门诺会教徒和阿米什人一样起源于瑞士弟兄会。今天的瑞士门诺联合会就可以追溯到瑞士弟兄会。