大规模的汉人开垦发生于干隆年间，大崙脚庄也在此时发展成大崙脚街。干隆24年（1757年），福建人郭六才等人至大崙脚招佃开垦。干隆二十六年（1761年）置斗六门巡检，道光十五年（1835年）改为斗六门县丞。同治元年（1862年）九月，斗六门为戴潮春所攻陷，戴潮春旋将根据地由四张犁转移到此处，直至同治二年年末才由清军夺回。光绪十三年（1887年）八月正式建立台湾省，之前台湾曾经由福建省管辖，当时新任台湾巡抚刘铭传会同闽浙总督杨昌濬一起上奏给光绪帝的《台湾郡县添改撤裁折》提到：“伏查台湾疆域，南北