学校长吉津邦喜代理校长处理校务。1916年4月1日，第一届哑生入学。4月13日任命该校教师平岩繁治先生为首任校长。1922年，由台南州接办，改为「台南州立盲哑学校」。1946年，日治时代结束，更名为「台湾省立台南盲哑学校」。1956年，在台中丰原设立「台湾省立台南盲哑学校丰原分部」（今「国立台中启聪学校」前身）。1962年，奉教育部改名为「台湾省立台南盲聋学校」。1968年台湾实施盲聋分校措施，将原先台南盲聋学校分设为「台湾省立台南启聪学校」、「台湾省立台中启聪学校」、「台湾省立台中启明学校