就在此时，北京军医院向外公布的患者人数低于实际患者人数的真相浮出水面。在国际舆论的强烈压力下，中国政府同意WHO等国际官员介入调查。中国医疗体制过度分散、形式主义严重、缺乏沟通等陈旧的弊端随之暴露。4月下旬，中国政府承认谎报患者人数是医疗制度上的问题，蒋彦永博士揭发了中国政府瞒报疫情的事实。此后，包括北京市长在内的多名官员遭到撤职，SARS的调查及预防系统终于趋向高效和透明。2003年7月5日，WHO宣布SARS疫情平息。此次疫情最终共在全球30个国家造成8,422人感染，916人死亡（致死率11%）。