同时也受到宿主防御影响，前者除了可导致患者生理不正常运作，但有时却是感染者本身的防御机制反应所致，因此一个疾病的表现和严重程度是同时建构于病原和宿主本身两方面。因此依照宿主本身的防御力，这些病原又可进一步归纳为主要病原或伺机性病原。多数感染症不会造成患者死亡，而致病之微生物最终通常会屈服于宿主的免疫反应，进而被清除或潜伏在宿主体内。这个过程需要免疫机制的参与以杀死或减低病原的活性。但免疫系统对微生物作出的反应常常（但并非全然）是疾病症状的来源，例如发烧、发炎反应、流鼻涕、咳嗽、化脓等，有时这种症状对患者的伤