属科研设施（中心）和2个行政部门，另设有咨询委员会和教授会。现有教职员160人、大学院生70人，现任所长为小原一成。
历史沿革.东京大学地震研究所的前身为1892年设立的文部省震灾预防调查会。1925年11月13日，即在1923年关东大地震之后，文部省宣布重组原调查会，在东京大学设立研究所。1994年，为开展新项目研究，决定将该研究所办成附属于东京大学的全国开放型研究所，将原有的18个部门、2个中心和16个观测设施改组合并为4个部门、4个中心和2个观测台站，成为现今的东京大学地震研