为两队伍：第一队伍任务委任于太平洋舰队；第二队伍任务委任于大西洋舰队。这两支队伍一开始主要是被开发来执行非常规战争、反游击战以及秘密行动，活动范围主要是清水以及浊水的环境。在1963年越战首度派遣时，组成人员来自于三栖特战队第一队伍，他们被派遣驻扎在越南岘港市，而他们则是听令于中央情报局的指挥。1964年，海豹部队由越南战区部队中的CINC（Commander-in-Chief）所管辖。1967年，决策者越来越意识到特别行动的需要，于是将海军作战支援大队（Naval Operations Support