圆仁（慈觉大师）赴唐五台山习得三昧念佛之法，归国之际于船上感得摩多罗神之声，故于比叡山修建常行三昧堂，始修此法。不过也有人考证，摩多罗神的祭祀起始于平安时代末期、鎌仓时代初期属于天台宗的惠檀二流，特别是檀那流的玄旨归命坛成立之时。江户时代时，天台宗行灌顶仪式时祭祀此神明；而在民间信仰里，一般将此神与大黑天习合，也有人认为是福德神。此外，向空行母祈求治疗疾病、延长寿命的「能延六月法」，据说也和此神有所关联。另有一说京都市右京区广隆寺牛祭的祭神，乃是僧都源信劝请此神作为念佛的守护神，不过也有人认为是东寺的夜