8月1日，蒙疆联合委员会改组，增加总务、产业、保安、财政、民生和交通六个部，杜运宇兼任民生部长和交通部长。1939年9月1日蒙疆联合自治政府成立，杜运宇任产业部长。此后他历任司法委员会长官（后改司法部长）、经济部长。1945年日本投降后，他于同年被国民政府逮捕。1960年，他死于监管之中。