同大部分其他的大型兽脚类恐龙，高棘龙最初被发现时只有零散的化石，使牠们的分类经常改变。J. Willis Stovall与Wann Langston, Jr.最初将高棘龙分类于腔躯龙科（Antrodemidae），是异特龙科的同义词。在1956年，阿尔弗雷德·罗默（Alfred Sherwood Romer）将高棘龙改列为斑龙科，该科过去曾被当作「未分类物种集中地」。在60年代，其他科学家认为牠们嵴椎上的长神经棘，代表者与棘龙的亲缘关系。将高棘龙归类于棘龙科的分类法，持续到80年代，并出现在当时的半科学文献