阿伊努人的战争中不断取得优势，并取得在北海道南部的立足点。进入明治时代以后，该藩被改名为馆藩。1871年废藩置县，7月14日以其旧领设置馆县。同年9月被馆县废除，与黑石县、斗南县、七户县、八户县一起併入弘前县（后来弘前县改名青森县）。此后该地区设立开拓使，成为北海道领地的一部分。
藩领.另外，虾夷地（今北海道，但不包括北海道南部的渡岛半岛）在江户幕府认可下由松前藩管治，拥有对虾夷地的支配权及贸易权。但东虾夷地（北海道沿太平洋一侧及千岛群岛）、西虾夷地（北海道沿日本海一侧及