子系统之间有相互作用。子系统可能的状态数是p，那么传递矩阵W的维度为pxp，而矩阵元素的大小与各状态的统计权重有关。传递矩阵法是一些统计力学模型精确解的关键。例如和解释溶液中线形高分子的，蛋白质-DNA结合模型的传递矩阵法解，以及物理学史上着名的拉斯·昂萨格给出的二维易辛模型解析解。