肺外科、听力学科、弱智科、临床肿瘤科、脑神经外科、妇产科、牙科、眼科、皮肤科、矫形及创伤科（骨科）、儿童及青少年科、耳鼻喉科、内科及老人科、肾科、外科和核子医学、功能性神经外科丶小儿神经外科。其他医疗服务包括：营养膳食、药剂服务、物理治疗、职业治疗、义肢修复矫正服务、言语障碍治疗、听力治疗、足病诊疗、视力及临床心理服务。医院也设立病人支援服务，由义工或团体提供，服务单位包括：屯门医院社区服务中心、香港红十字会辅助行动器材租借及图书服务、香港红十字会医院学校、基督教院牧部、天主教牧灵部和佛教觉醒心灵关