为戴维·利文斯通一生中从来没有去过巴加莫约，只是在他死后遗体被安放在老教堂的塔楼（现在叫利文斯通大厦）以等待海水涨潮进来时，运送他的身体到桑给巴尔。1886年至1891年间，巴加莫约担任德属东非的德国总部在坦桑尼亚的第一个首都（先由管理，而后转由德意志帝国政府管理）。达累斯萨拉姆于1891年成为殖民地的新首都。巴加莫约是的出生地（1895年）。在第一次世界大战期间，于1916年8月15日，英国的空袭和海上炮击进攻巴加莫约，德国领地被占领、德国驻军被攻陷。1905年，在德意志帝国决定于从达累斯萨拉姆铁