整备和改革，并限制了管领在幕府中的兵权。在外交上，足利义教恢复了勘合贸易，将对明朝贸易的权力牢牢抓在将军手里，强化了幕府的权力。朝廷将年号正长改为永享的时候，关东地区的镰仓公方足利持氏拒绝改元，并继续使用正长年号。义教欲发兵讨伐，但遭到关东管领上杉宪实的强烈反对，不得不放弃了这个计划，改为下令讨伐九州的大内盛见。大内盛见被少贰氏、大友氏围攻，败死；其侄大内持世嗣位，借山名氏之手击破了涩川氏、少贰氏和大友氏，佔据了九州。
与延历寺的抗争.足利义教在还俗之后，试图让弟弟义承继任