额勒登保与德楞泰、惠龄、恆瑞四路进攻，十月合围。额勒登保率军攻击了七昼夜，教徒最终不支，窜渡巴河，盘踞遂风寨废堡。额勒登保与德楞泰围之数重，大败敌军，于石穴擒获罗其清。十二月，额勒登保又追逼徐天德、冷天禄于合州。嘉庆四年（1799年）春天，朝廷下诏以勒保为经略大臣，额勒登保与明亮同授职副都统为参赞。三月，追打冷天禄于大竹，听闻萧占国、张长庚由阆州逃窜至营山，遂回军迎击，斩杀萧占国、张长庚，其后再大败射杀冷天禄。旬日之间连殄三头目，叠诏嘉赉，先封二等男爵，再晋升为一等男爵。额勒登保又追剿张子聪，擒斩白莲教