989年6月，乌兹别克族极端分子在费尔干纳谷地对麦斯赫特土耳其人实施大规模屠杀。据统计，有97人死亡，1,000多人受伤，752栋房屋被烧毁。而在大屠杀之前，约有100000麦斯赫特土耳其人居住在乌兹别克斯坦。
事后.莫斯科和塔什干当局迅速声称，骚乱是由黑手党、戈尔巴乔夫的政治敌人或乌兹别克民族主义者策划的。在此事件之后，大约70,000名麦斯赫特土耳其人前往阿塞拜疆，其余的流向了俄罗斯各个地区（特别是克拉斯诺达尔边疆区）、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦和乌克兰。许多布哈拉犹太人