可使航天器在关键事件点能实现自主无线电导航，如轨道插入或着陆，有望节省新的任务运行成本，提高深空导航精度，使跟踪网络得到更有效的利用，并大大减轻地面的支持操作。它在深空领域的应用包括：
原理与开发.20多年来，美国宇航局喷气推进实验室的工程师一直在稳步改进汞离子阱原子钟，并将其小型化。深空原子钟技术利用汞离子在40.5吉赫频率下超精细跃迁的特性，有效地将石英振荡器的频率输出“引导”为接近恒定的值。深空原子钟通过在陷阱中用电场限制汞离子，并施加磁场和屏蔽保护它们来实现这一点。