9月，柯蒂斯被任命为密苏里州地区的司令。但是在柯蒂斯因其废奴主义观点而与密苏里州州长发生争吵，林肯不得不将他调离，任命他为堪萨斯和印第安领地司令。1864年，柯蒂斯回到密苏里州，将自己的堪萨斯部队集结，成立了，与密苏里的骑兵部队一起在10月23日的西港战役中打败了入侵密苏里的联盟军，迫使联盟军撤退。
晚年.1865年末，他回到艾奥瓦州，在那里加入了太平洋联合铁路公司，直到次年在艾奥瓦州康瑟尔布拉夫斯去世。他被安葬在基奥卡克的奥克兰公墓。