有人文学院、工商管理学院、教育学院、健康科学学院、法学院、社会科学学院、科技学院、人文社科高等研究院、协同创新研究院、应用物理及材料工程研究院、中华医药研究院、微电子研究院，以及荣誉学院和研究生院 ，开办学士、硕士、博士等约130多个学位课程，授课语言以英语为主，部分课程以葡萄牙语、中文或日语授课。该校设有10所书院，包括曹光彪书院、郑裕彤书院、张崑崙书院、蔡继有书院、霍英东珍禧书院、吕志和书院、马万祺罗柏心书院、满珍纪念书院、绍邦书院及何鸿燊东亚书院。澳门大学在2021年泰晤士高等教育世界大学排名30