鼠毛色有很大区别，牠们的毛色大都是野生大鼠中很少有的突变型，包括肉桂色、浅黄褐色、米色、蓝色，以及巧克力色等，部分宠物大鼠的毛还会出现颜色变化，呈现深浅环纹等图案。宠物大鼠的眼色包括黑色、粉色，以及红色，部分宠物大鼠两边眼睛的颜色不同。一部分实验用大鼠是白化品系，毛色为白色、眼色为红色。培育出的无尾和无毛大鼠面临伦理争议，因为尾巴和毛对大鼠的正常生存具有重要意义，无毛大鼠和无尾大鼠的生存质量相比有尾巴和有毛的大鼠低。
社会性.大鼠是相对具有较强社会性的动物，同一个笼子中最好要有