瓦会议的决议，越南实行南北分治。1955年，越南共和国（南越）政府成立，将前越南自由邦陆军收编。此时，阮文绍已经是一名中校了。而后，他历任陆军军官学校校长、步兵第1师师长、步兵第5师师长。并因在1963年参与推翻总统吴廷琰的军事政变而晋升为准将。在杨文明、阮庆相继执政的两年中，阮文绍被任命为陆军第4军军长、总参谋长，而后被提升为陆军中将并担任国防部长。1965年6月，阮庆被迫下台，阮文绍被军事强人们推选为军事革新会议的首领，并成为国家领导委员会主席，换言之，就是国家元首。
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