墓遭人为破坏，墓碑被推倒，供桌、墓体等受严重破坏。2010年5月10日，柳哲（中国东方文化研究会副秘书长、中华大族谱协会副秘书长、北京东方文化馆秘书长）撰文唿吁修复该墓，并寻找祁耿寰的后人。此后，祁耿寰分散在全世界各地的后人纷纷与其联系，中国国民党主席马英九也对此表示关注。2011年3月，海淀区人大代表汤焦媛得知后，向海淀区人大建议修复祁耿寰墓地。2011年9月27日，祁耿寰墓地修缮完毕。