鳃裂和板状结构等构造在已知的节肢动物中是前所未见的，因此，中国古生物学家舒德干等人在 2001 年创立许多新的分类阶层，如古虫动物门、古虫科等，并将这些分类阶层归类于后口动物总门，但西班牙古生物学家 Patricio Domínguez Alonso 与英国古生物学家 Richard P.S. Jefferies 认为古虫应属于尾索动物，另一位英国古生物学家 Nicholas J. Butterfield 则认为古虫应仍属于节肢动物。