菲律宾总督巴西里奥·奥古斯丁从马尼拉带走。舰只是在8月13日离开菲律宾海域，并于两天后抵达香港。1898年10月，奥古斯塔皇后号将部分海兵营成员从青岛运送至大沽，由后者接管北京公使馆的防务。1899年9月，舰只根据新出台的《德国海军法》而被重归类为大巡洋舰。在1900年的义和团运动爆发时，它仍然驻守在东亚，并在天津派遣了部分船员加入英国海军上将爱德华·霍巴特·西摩尔麾下的解围部队。而舰只的、海军少校则在行动中阵亡。在日本进行了技术审查后，奥古斯塔皇后于1902年3月6日启程回国。它于返航时与互换舰长，并