色则象征着守护柔佛的勇士，蓝底则象征柔佛政府。
变体.
县旗.柔佛有10个县，每个都有自己的县旗。这些县旗于2015年3月3日推出。即使新邦令金还不是柔佛的一个县，不过新邦令金县议会已有自己的县旗。新山市政厅也有自己的旗帜。
旧州旗.柔佛州旗的历史可追溯至18世纪50年代。1855年至1865年期间的州旗也被现今属于印尼的Trumong采用。