他因而与鄂图曼当局合作，试图遏止西方思想与法国大革命的影响，并唿吁东正教信徒服从鄂图曼帝国。他也相当鼓励教会报纸出版一些能保护东正教信仰免受西方思想污染的刊物。当1821年，希腊独立战争在多瑙河流域爆发时，格里戈里奥与宗教大会也发出诏谕，将亚历山大·伊普斯兰提斯、米开尔·守兹索斯及他们的追随者逐出东正教会。这个强烈反革命的动作让君士坦丁堡的希腊人躲过被大屠杀的命运，但却无法使格里戈里奥免受鄂图曼官方的处分，他于1821年4月10日在大教堂的入口处遭受环首之刑。从鄂图曼的角度来看，格里戈里奥无力确保东正教