天主教爱沙尼亚宗座署理区 （）是爱沙尼亚一个罗马天主教宗座署理区，直属教廷。范围包括爱沙尼亚全境，教座位于塔林。2011年有教友5,745人（估辖区人口0.4%）、九个堂区、十五名司铎。现任宗座署理为菲利普‧若尔丹。天主教在1227年传入爱沙尼亚，1561年由于宗教改革，公开弥撒被禁止至1786年。1924年11月1日建立宗座署理区。1942年至1992年，由于苏联佔领关系，署理一职悬空。