。1948年，热带医学研究所奉教育部核准成立，为医学院奉准成立的五个研究所之一。1951年8月，原热带医学研究所改为公共卫生学研究所，隶属于医学院。1972年正式成立大学部公共卫生学系。1993年，为了促进台湾公共卫生界的研究能量，以及协助政府解决公共卫生问题，将公卫系与公卫研究所扩编成立「公共卫生学院」，是台湾第一个创设公卫学院的大学。后来陆续成立职业医学与工业卫生研究所、 流行病学研究所、医疗机构管理研究所、环境卫生研究所、预防医学研究所及卫生政策与管理研究所（原公共卫生研究所）共一系六所，皆有硕士