899年10月起，凡配置于北部线（北、基、桃、竹一带）的车头，赋予偶数编号，而配置于南部线（南、高一带）者，则赋予奇数编号，皆以购入年代先后顺序编号。在1900年初，已有13辆在北、3辆在南。随着施工进行需求渐增，铁道部多次向日本内地调来中古车，并向英国、日本购入新车，台湾的铁道建设，渐渐步入正轨。
第二次（1905年）.1905年，已修筑五年余的纵贯线南北，即将随着后里庄(今后里)至三叉河(今三义)间竣工而完成衔接，故铁道部于1905年将南奇北偶的编号方式取消。1899年迄1