清康熙26年（1687年），杨姓先民建祠供奉土地公，当时四周一片荒芜，居民每逢五谷丰收，就会举行祭典祭祀土地公。道光元年（1824年），自左营元帝庙迎奉天上圣母、福德正神、玄天三上帝，和原本的土地公庙合祀。当时建筑简陋庙宇，并定名慈德宫。日治时期昭和十六年（1941年），慈德宫被日本政府下令拆除，改为「农事实行组合事务所」，之后又改为「防卫团支部」。慈德宫少数神尊被信徒冒险请回家，其他神尊被强制移至大岗山超峰寺。战后，信徒重修慈德宫，增建拜亭和两厢，并将疏散到信徒家中的神尊和移到大岗山的神尊迎回