本科从2005年的《布歇特和洛克罗伊的腹足类分类》开始被归到玉黍螺类支序。在这之前，本科原是觿螺科之下的一个亚科。
分类.溪螺科原为溪螺亚科，旧属麂眼螺总科。2013年的新分类，所有淡水螺的分类单元从麂眼螺总科独立出来成为截螺总科，本科亦成为了截螺总科的成员。2017年《布歇特等人的腹足类分类》依从这个修订。
亚科.根据2005年《布歇特和洛克罗伊的腹足类分类》，本科包括三个亚科：