大选后，任三军总参谋长。
军事政变.1962年3月2日，奈温发动军事政变，宣布缅甸国防军接管政权，推翻吴努，任命自己为缅甸联邦革命委员会主席兼国防部长、参谋总长。同年7月，奈温创建缅甸社会主义纲领党，并任主席。此后作为缅甸唯一执政党，一直是缅甸党政军最高领导人。缅甸开始实行所谓“缅甸式社会主义”，并倒向苏联，同时加大镇压亲华的缅甸共产党的力度。在1960年代，缅甸曾出现大规模的排华活动。1972年4月，奈温军政府宣布「还政于民」，奈温本人退出军职。1974年1月，实行新宪法