为消化酶中的胃蛋白酶所水解。低pH也能促使酶前体胃蛋白酶原自我切割活化为胃蛋白酶。食糜离开胃部进入十二指肠以后，其中所含的盐酸便被十二指肠中的碳酸氢钠中和。胃能够保护自己不被强酸腐蚀，这是因为它分泌了一层很厚的黏液，且胰腺在促胰液素的作用下会产生含碳酸氢钠的胰液来缓冲，这样的机制称为粘液－碳酸氢盐屏障。如果没有这些机制，可能会出现胃灼热或胃及十二指肠溃疡等症状。这样的情况下，可使用抗组胺药及质子泵抑制剂等药物抑制胃酸的生成，或者服用抗酸药来中和胃酸。
安全性.浓盐酸（发烟盐酸）会