基本法争议。此通关预检模式又与国际接轨，可复制至香港国际机场和中国大陆主要机场，长远香港及中国大陆皆可以与外国协议互换通关预检设施，令出入境、海关、检疫人员在外国国土执行公职。
内地口岸区疑似设置宿舍.2017年10月25日，传真社取得一批工地相片，现内地口岸区B3层房间装上以简体字及英文标示「口岸办保安员宿舍」（Security Staff Rest Room），与政府表明在高铁西九龙总站工作的内地人员不会在港留宿的说法并不相符。运输及房屋局回覆指该房间英文名称是按照港铁英文版本