征在于其鞭毛细胞，如大多数动物的精子和壶菌门的孢子，都有单一个位于后侧的鞭毛在推动它们。这也是此一类群名称的由来。相对地，其他真核生物的鞭毛细胞是由一个或更多个位于前侧的鞭毛包推动的。
历史.动物和真菌之间亲近的关系是汤玛斯·卡弗利尔-史密斯于1987年首先提出来的，并在之后的基因研究中得到了证实。早期的种系发生学将真菌放在植物和其他有平滑嵴粒线体的类群附近，但其地位是变动的。汤玛斯·卡弗利尔-史密斯和施特希曼主张单鞭毛真核生物如后鞭毛生物和变形虫门一起组成了称之为单鞭毛生物的类群