共设34个车站，其中首批建设21个车站，并预留10个车站（另有3个跨线车站）。自西向东分别为：南京南（跨线）、南京、紫金山东（跨线，无限期停用）、仙林、栖霞（预留）、宝华山、下蜀（预留）、高资南（预留）、镇江、丹徒、丹阳、陵口（预留）、吕城（预留）、奔牛东（预留）、新闸东（预留）、常州、戚墅堰、横林（预留）、惠山、无锡、无锡新区、望亭东（预留）、苏州新区、苏州、苏州园区、唯亭西（预留）、阳澄湖、昆山南、花桥、安亭北、南翔北、上海虹桥（跨线）、上海西、上海。31个车站中有12个无配线车站（即仅有靠站台的上下