地表水考核断面水环境质量相对较差(从倒数第1名至倒数第30名)。发展中国家面临着严峻的水污染问题，发达国家也头疼不已。例如，美国最新水质报告称，受调查的溪流中的44%，湖泊中的64%，湾与江口的30%受到污染。
分类.地表水和地下水虽然彼此联系，但常常分开研究和管理。地表水流过土壤成为地下水，反之，地下水可以补给地表水。根据来源可以将地表水污染源分为两类。
点源污染.点源水污染指进入水体的污染物来自单个确定来源，如水管或沟渠。这类例子有污水处理排放、工厂排