。光绪三十一年，被骋为京师大学堂教习，光绪三十三年，征为礼部礼学馆总纂，其所着《契文举例》是第一部研究甲骨文的着作。与俞樾、黄以周合称“清末三先生”。有“晚清经学后殿”、“朴学大师”之誉，章太炎赞誉他“三百年绝等双”。光绪元年，三应春闱不第，遂埋首读书，光绪三十四年五月二十二日（1908年6月20日），以病卒于家，终年六十一岁。
着述.孙诒让一生共着述三十五部，1873年孙诒让始治墨学，有感于国家危难、吏政不修，以“墨子强本节用，劳心苦志，该综道艺，应变持危，其学足以裨今之时局。”