。6月17日，日本战犯米村春喜、下田次郎行刑。1948年1月28日，百人斩（南京大屠杀）之中的田中军吉、野田岩、向井敏明押赴南京雨花台刑场执行枪决。国府成立战犯法庭，由石美瑜任审判长。12月22日，经过多方求证之后，松井石根因参与南京大屠杀，被东京远东国际军事法庭判处死刑绞死。1949年1月26日，原日本中国派遣军总司令冈村宁次在上海被国府国防部军事法庭宣布无罪，引起全国人民的激愤。中国共产党对此向南京国府提出强烈抗议，得到国内舆论的广泛赞同。1月31日，南京政府遵从东京麦克阿瑟命令，将日本侵华战犯260名