天兴二年（1233年），下蔡陷于南宋，州治迁至蒙城，不久蒙城亦陷于南宋，南宋改寿州为寿春府。
明清.吴元年（1367年），降寿春府复置寿州，属江南行中书省临濠府，治寿春（今安徽省寿县），领五县：寿春、安丰、下蔡、霍丘、蒙城。明朝洪武二年（1369年），寿州直隶于中书省。洪武四年（1371年），寿州还属临濠府，省附郭寿春县及安丰、下蔡二县入本州。至此，寿州领二县：霍丘、蒙城。洪武六年（1373年），改临濠府为中立府，寿州仍属之。洪武七年（1374年），改中立府为凤阳府，寿州仍属之。