作系统的文件系统层次结构标准在1994年2月14日发布。 后续的修正版本分别在1994年10月9日和1995年3月28日发布。在1996年初， 开发一个更加全面的、不仅解决Linux，而且解决其他类Unix系统目录层次结构问题的FSSTND的计划在BSD开发社区成员的协助下正式被采纳。因此，计划重点解决在类Unix系统上普遍存在的问题。 为了适应标准范围的扩充，标准的名称修改为文件系统层次结构标准。
目录结构.在FHS中，所有的文件和目录都出现在根目录"/"下，即使他们存储在不