科学家来到该院，调查矿产和地质状况，考察民族习俗，采集川西南、川西北地区的动植物标本，培育和引进果木蔬畜。抗日战争时期，内迁的中央地质调查所落户北碚的中国西部科学院。1943年夏，中国自行研制的首台机械记录式水平向地震仪问世，这是由中央地质调查所的李善邦研制的。1943年6月22日晨，该地震仪记录了成都附近一次地震。此后，李善邦在重庆北碚建造了中国抗日战争时期唯一的地震台，到抗日战争结束时共记录地震109次。1939年，中国第一具恐龙化石骨架在云南省禄丰县沙湾东山坡出土，杨钟健将其定名为许氏禄丰龙。