依2017年《硬骨鱼系统分类》，将本目归属于新鳍亚纲、真骨下纲、骨舌鱼高群、鲱头鱼总群、骨鲱群，独自组成黑头鱼亚群（）。
内部分类.本目可分成2科，共包含33个属，如下：
种系发生学.本亚群是骨鳔亚群的旁系群，与其它真骨下纲的亲缘关系如下：