一般的兽脚类恐龙相反。另外，阿瓦拉慈龙科缺乏腹肋、骨盆结构独特，这些特征造成分类上的争议。角爪龙的手部有小型的骨质突刺，研究人员推论这是退化的第四、第五指。阿瓦拉慈龙科的分类历史相当曲折。在1993年，阿瓦拉慈龙科被认为是无法飞行的鸟类，离侏罗纪的始祖鸟的关系较远，而较接近于现代鸟类。近年来的研究，多认为阿瓦拉慈龙科属于非鸟兽脚亚目恐龙，但牠们在兽脚亚目的分类、演化位置则未定。某些研究人员认为牠们是偷蛋龙类的近亲，某些研究人员则认为牠们属于手盗龙类。从角爪龙的脑壳显示，阿瓦拉慈龙科并不属于鸟类。