906年跟随徐世昌任东三省总督，调防至吉林省吉林市、长春、宁安、延吉及奉天省锦州等处地。该镇是袁世凯北洋系嫡系部队。历任统制有段祺瑞、曹锟。辖第5协和第6协。辛亥革命时期，第5协统领卢永祥，第6协统领陈文运。民国后第三镇改名陆军第三师。1904年，张绍曾曾任炮兵第三标标统。1906年，吴佩孚曾任炮兵第三标第一营管带。1918年吴佩孚升任师长、萧耀南任总参议。1911年，该镇攻打山西革命军。1912年初调防北京，1912年2月29日，该部队第5协第9标率先发生“北京兵变”。