。校训“求是”即是由他提出，校歌亦是他请着名国学家马一浮作词、音乐家应尚能谱曲作成。1945年国民党六大召开前夕，列入朱家骅与陈立夫联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一。1948年选聘为中央研究院院士。1949年，蒋中正撤离上海，从舟山派蒋经国到上海去请当时浙江大学校长竺可桢到台湾遭拒。10月16日，任中国科学院副院长，筹建中国科学院地理研究所。
晚年.1955年，当选为中国科学院院士。1974年2月7日，因肺病在北京逝世。竺可桢被公认为中国气象、地理学界的「一代宗师