大规模的路线调整，由于当时北段的松山线（西门站－松山站）仍在兴建中，因此新店线列车仍暂时保持与淡水线直通行驶，在中正纪念堂站透过zh-tw:横渡线; zh-hk:渡线; zh-hans:渡线;由新店线轨道换轨驶入淡水线，同时小南门线向南延驶至台电大楼站以补足「北投－台电大楼」取消后的运能。2014年松山线通车，松山新店线全线完工，路线再次进行调整，新店线不再与淡水线直通运行，小南门线也取消独立营运，改成松山线－小南门线－新店线直通行驶。本路线「中正纪念堂－台电大楼」段于2013年7月31日起正式