系调整，衍生出南京大学、南京工学院、南京农学院、南京师范学院等多所院校。经过多年的发展，截至2011年，南京普通高等学校（不含军队所属院校）共有53所，在校本专科学生71.57万人，在校研究生9.28万人。有南京大学、东南大学2所“一流大学建设高校”，河海大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京农业大学、南京师范大学、中国药科大学、南京邮电大学、南京信息工程大学等10所“一流学科建设高校”，以及南京工业大学等7所江苏省属重点高校，是除北京、上海外，“双一流”建设高校最多的城市。南京高等教育毛入学率为57.