出有6,891亿日元，略有实现财政盈余。但长崎县的财政力指数只有0.32，远低于日本平均水准。长崎县的佐世保港是日本最重要的军港之一，不仅海上自卫队设有基地，美国海军也有佐世保海军基地。是海上自卫队的地方自卫队之一，主要任务是警戒监视对马海峡和防卫琉球群岛。
经济.2014年代，长崎县的县内生产总值有43,103亿日元。人均县民所得有235.2万日元，相当于日本平均值的82%。就产业构造来看，第一产业佔长崎县经济总量的2.6%、第二产业佔16.2%、第三产业佔80.1%。长崎县