站厅北侧被划分为收费区，以方便乘客进出。两线站厅的收费区内各自设有多组扶手电梯、楼梯以及1台专用电梯供乘客来往不同线路的月台。车站所有商店均设于两个站厅的非收费区，分别有便利店、面包糕饼店、时装店等；自助服务设施设有自动售卖机、好易自助服务机以及中国建设银行自动柜员机。
月台.2号线、7号线各自设有一个岛式月台，位于规划广州南站区域地下空间，均位于地下二层。本站的公共洗手间设于7号线站厅往谢村方向的一端。
出入口.石壁站在开通初期设有2个出入口，后