费雷拉于1650年在长崎逝世。根据记载，费雷拉在临终前回复天主教信仰，并因此遭江户幕府刑求，最终以殉道者的身份去世。
大众文化.日本作家远藤周作的着作《沉默》即描述了费雷拉叛教后的故事。1971年的电影《沉默》中由日本演员丹波哲郎饰演克里斯多夫·费雷拉；在2016年的同名电影中则由美国演员连恩·尼逊饰演费雷拉。在1996年的葡萄牙戏剧电影《》，由演员饰演费雷拉。