日军对平民的屠杀达到高峰；直到2月23日美军夺回，据知死亡的菲律宾人总数达100,000人以上，平均每天有3,000人遇害。死亡的100,000人中，哪些是日军直接屠杀的、哪些是双方交火中死亡，已难以判定，因为美军的炮火同样把街道化为灰烬。战后远东国际军事法庭裁定：日军曾在圣保罗大学一次杀害994名菲律宾儿童；1945年2月4日至2月10日，日军在巴石河南岸肆意姦淫屠杀，烧毁了教堂和图书馆，烧死避难所的3,000名难民；1945年2月5日，日军勒令城中男女分开排列街上，将男子用机关枪射杀，将女子肆意强姦