，在伯多禄局长街兴建校舍作为中小学校址，幼稚园仍留在东望洋斜巷五号上课。1997年，加入政府公共学校网；同年开办正规夜中学，为失学少年及在职人士提供升学途径翌年成立圣公会蔡高中学成人培训中心，举办多项实务及专科课程。1998年，澳葡政府拨出位于黑沙环新填海区马揸度博士大马路KL1地段作为兴建中学部新校舍之用；该校舍于1999年落成及启用，而伯多禄局长街校舍则作幼稚园、小学部及夜校部之用。由2008年9月起，小学部也迁到黑沙环校舍上课。1999年起，在中学部推行ISO9000计划。2010年1