显然带来了一些核安全和扩散上的问题：如果有人掌握了聚变反应，他们也许就可以用无法制造原子弹的核材料（比如贫化铀和反应堆级钚）制造热核武器。另外一些聚变反应产生的中子能量较低。比如氘−氘（DD）聚变有50％的几率生成一个2.45兆电子伏特的中子和一个氦-3核；还有50％的几率生成氚核和一个质子。氘−氦−3（D-He）聚变不生成中子。