先是由于它们与校旗，校色的颜色一致，（紫荆花为紫色，丁香花分为紫白二色）；其次是由于这两种花都是在校庆日前后盛开。亦有校友曾在校友通讯上建议，定紫荆或丁香为校花。2011年，「99学年度第4次校务会议」决定清华校花为梅花，为了纪念梅贻琦校长而来。且梅竹赛行之多年，梅花已成为清大之精神象征，也用在各种清华纪念品之上。
校区.设有校本部及南大校区等2个校区。2016年11月1日，与国立新竹教育大学合併，国立新竹教育大学改称「国立清华大学南大校区」，教育与学习科技学系、特殊教育学系、