担任云南省人民政府党组成员、省长助理，分管军工、机械和电子工业及省人民政府的其他专项工作。他根据实际情况，创造性提出了发展“小型巨人”企业的工业发展思路，即发展具备竞争力的精专小企业，这一思路取得了良好的实效。1997年12月，张春贤调回北京，任中华人民共和国交通部党组成员。1998年出任交通部副部长时，其干部履历中已多了“善于解决复杂棘手问题”的评语。1998年至2002年，任交通部副部长、党组成员。其间，1998年至2002年哈尔滨工业大学管理科学与工程专业在职研究生学习，获管理学硕士学位；2000年9