在2008年被 IUCN 评估为「极危」（CR）等级。2010年台湾的白海豚数量估计只剩不到一百头，在中华民国政府兴建八轻计划之下，处境堪忧。学术团队指云林六轻附近海域水质酸化、船只噪音等问题，都会危及白海豚的生存。中央研究院生物多样性研究中心、台湾蛮野心足生态协会和台湾妈祖鱼保育联盟举办研讨会邀请国际鲸豚保育学者发表相关研究，会议结论为台湾白海豚面临栖息地消失、水下的噪音、淡水流量减少、污染及渔业误捕等五大威胁。学者唿吁政府将白海豚栖息地划定为海洋保育区，制订强制禁止在白海豚栖地内使用三层网、刺网和拖网等