毁坏，他的面部也受伤留下深深的疤痕。1895年2月10日，薛承恩病逝于福州。1912年，他的妻子所写关于他在中国传教事业的书“An Epic of the East”出版。
译作.《天文图说》、《圣经图说》和《卫斯理传》等，由黄乃裳协助翻译。