黄昆辉首次公开表示「台联要符合人民的期待，必须在最短时间人事改组，使组织健全、功能强化才可以！」。并且表达将考虑改动台联的党名。就职次日，黄昆辉就自己的政治理念，曾发表《台联需要大大的改造》一文，阐述对政治局势的观察与期许。2008年，马英九当选中华民国总统后，与马英九会谈，未有台联前任立法委员赖幸媛出任陆委会主委的共识。2012年立法委员选举黄昆辉排名第三，台联得票破百万，得三席不分区立委，但因选罢法规定女性不得低于二分之一，使得黄昆辉礼让给林世嘉而落选，但台联也因此能在立法院组成一个党团运作议事