其再三请求归还后，得到批准；但未离开时，恰逢土鲁番佔据哈密，逮捕忠顺王速檀拜牙郎离去，并索要金币。总制邓璋、甘肃巡抚赵鑑等上报，请求派遣大臣经略。大学士杨廷和等一同举荐彭泽。彭泽因为久居战场早已生厌，请求归乡引病辞职，并推举邓璋、咸宁侯仇钺可继任。明武宗下诏书慰问勉励，方才赴任陕甘总督。为抵达后事平，遂归还处理都察院事。当初，兵部尚书一职位缺，廷臣举荐彭泽，但王琼得到，且私下诋毁彭泽。言官多弹劾王琼，于是两人有矛盾。彭泽又时常辱骂钱宁，王琼告诉钱宁，但钱未听信。王琼于是邀请彭泽喝酒，并在屏间藏匿钱宁，挑