做为原子核实验时的比对参考物质，使北投石在台湾物理史上具有重大意义。1934年（昭和9年）7月25日晚间，荒胜团队成功完成人工撞击原子核实验。此为亚洲第一次，世界第二次成功实验。领先成功的重要因素之一，就是使用北投石内含有的钋来作比对值。中华民国中央研究院前任院长李远哲就读国立清华大学时的硕士论文〈北投石放射性之研究〉亦以北投石为研究主题。
保护与复育.1933年（昭和8年）11月26日，台湾总督府依据史蹟名胜天然纪念物保存法指定北投石为「天然记念物」。1952年（昭和27