与周边国家里的马来西亚和中华人民共和国有领土纠纷。由于汶莱的国土被马来西亚一分为二，之间的水域谁属，存在着争议的空间。另外，汶莱亦声称拥有砂拉越的主权，不过已经放弃。此外，汶莱与南沙群岛接邻，双方的界线在哪里，还未有定案。中国声称其领土最南端的曾母暗沙，目前由汶莱控制。