2015年亚洲杯日本国家队止步八强赛，本田圭佑小组赛打入3球（包括2粒点球），被选入小组赛最佳十一人。
2018年世界盃.2018年世界杯，本田圭佑入选日本队参赛名单。6月19日，小组赛H组首轮第1场比赛日本以2：1的比分战胜哥伦比亚，本田替补出场并凭借角球助攻帮助大迫勇也头球破门。6月24日，小组赛第2场比赛，日本队迎战塞内加尔，本田在下半场替补出场并在比赛第78分钟攻入一球，帮助球队扳平比分。这是本田圭佑连续第三届在世界杯赛场上取得进球，由此本田也成为世界杯历史上进球数最多的亚