盛情所感动，于隔年以61岁的高龄到藏宏法，其弟子仲敦巴建「热振寺」，由此而传出藏传佛教的「噶当派」。此外，藏传佛教的其他教派也在这段时期陆陆续续地形成，如白教（噶举派）、花教（萨迦派）、红教（宁玛派）等。整体而言，「西藏分裂时期在政治上是各自为政，在文化上却是一个百家争鸣的时代，各种学说、各种教派纷纷形成。对西藏未来的历史产生巨大的影响。佛教也是在这一时期成为主导整个西藏的宗教」。
各教派统治时期.从1264年元世祖忽必烈设置总制院（后改为宣政院）并由萨迦派任其职以统治整个西藏