第一方庭于1621年和1630年完工，它包括礼堂、小教堂和院长宿舍。1630年代里第二方庭开始建造，但是英国内战中断了它的建筑，这座方庭一直到1712年左右才完工。20世纪里又建造了第三方庭，其中包括科学实验室（目前关闭）、本科生图书馆和其它学生宿舍以及院士宿舍。除了这个主建筑外耶稣学院在牛津市的东部和北部还有学生宿舍和一座体育场。小教堂是1621年正式启用的，1636年扩建。1864年对它进行了一次巨大的改建。对这次改建的评论不一，有支持者也有批评者。1921年至1925年任院长的哈迪称这次改建为“计