消毒时，都会使用消毒剂（传统的氯气或氯胺）。在消毒的过程中，低含量的消毒副产物在消毒剂与水中的有机物相遇时而作出化学反应而产生。而消毒副产物有机会是一种致癌物质，水净化可以是去除消毒副产物和水中带的沙、有机质的悬浮微粒、寄生虫、篮氏贾第鞭毛虫、隐孢子虫、细菌、藻类、病毒及真菌等等，及矿物如钙、二氧化硅及镁等等，和一些有毒性的金属如铅、铜及铬等等。