结构为主，但因为对象为人，故除了其专业之知识以外，还需要修习其他的相关基础医学课程。例如解剖学与生理学、免疫学、微生物学、病理学、毒理学等等。而其专业科目则包括药物化学、药理学、生药学、药剂学、调剂学、药物分析、药物治疗学、生物药剂学、药物动力学、临床药学、实证药学、药事行政法规等等。另外中华民国卫生福利部为了让中药管理渐渐由受过正规药学教育的人才来取代传统师徒制中药房学徒，药学系学生可以在现代药学基础上加修以下课程：等共16个中药学分，由各校发给证书。药师专技高考及格领取证书，因考试科目含中药学