摩尔多瓦位于欧洲东南部，在西部和罗马尼亚接壤，在东部和南部和乌克兰接壤。摩尔多瓦领土的大部份地区位于两条河流之间——普鲁特河和德涅斯特河。摩尔多瓦的北部地区地势较高，大多数地区都是丘陵。摩尔多瓦的国土面积是33,843平方公里。摩尔多瓦大多数地区的土壤都是黑土，许多都被开垦进行农业。WWF将摩尔多瓦分为三个自然区。