2006年中华民国直辖市市长暨市议员选举是中华民国的直辖市（台北市及高雄市）之市长及市议员进行全面改选的选举。该次选举订于12月9日投票。在此之前，候选人使出浑身解数，希望集中选票，谋求胜选。这场选举是2005年中华民国县市长、县市议员暨乡镇市长选举以后，台湾政坛再一次受到关注的选举，最后中国国民党及民主进步党分别保住各自执政的北高两市。
概论.各直辖市之市长选举当选者及次高票者之名单：各直辖市之市议员选举席次：
台北市.
政党初选.