单程票价2元，而使用南京“金陵通”公交卡可享受1元票价优惠。乘客可以将自行车等车辆带上轮渡，车辆交费同行人。由于南京长江大桥能力已趋饱和，而中山码头运输能力长期闲置，有江苏省政协委员建议进一步降低轮渡票价甚至免费运输，以缓解大桥交通压力。2008年南京市还规划了三条水上巴士线路，包括中山码头 — 明发滨江新城码头、中山码头 — 江浦二水厂码头、中山码头 — 浦口码头，其中第一条线路预计于2009年内开通，可望提升中山码头的吸引力。
集体江祭.自2004年起，南京市殡葬管理部门每