将《圣剑传说2》列为史上100大超级任天堂游戏的第8名。在《任天堂力量》杂志2006年“史上200大任天堂游戏”榜单中，游戏位列第86位。在IGN的“100大游戏”榜单中，游戏于2005年位列48，2006年位列49，2007年位列79。在日本杂志《Fami通》2006年的“100大读者票选最喜爱游戏”中，游戏位列第97。《圣剑传说2》在发行当时就体现了影响力，这一影响力持续到了2010年代。比如《Edge》称游戏的环形菜单系统“经常被模仿”，如《邪恶元素的神殿》。游戏的多人合作模式则影响了《末日危城3》。