莲华生另一个重要的贡献，是他吸取了许多西藏传有的传统与信仰的元素，加入印度佛教之中，使得佛教信仰得以在西藏生根，建立了独特的藏传佛教风格。当时唐朝禅师摩诃衍，藏文称其为「和尚」（Hva-san）或「大乘和尚」（Mahāyāna Hva-san）入藏宏扬禅宗，后与莲花戒辩论，史称“顿渐之争”、「桑耶论诤」或「西藏诤论」。大乘和尚所倡论点是，成佛之道应通过个人突发的顿悟，此顿悟来源于摒除包括善恶在内的一切思考。莲花戒认为任何人都不可能全部摒除思考，要求自己不作任何思考的本身就是一种思考；他坚持只有经过逐渐的修