于中国历史最着名的理论是「唐宋变革期」（或称「唐宋变革论」、「唐宋变革」）：在内藤湖南眼里，中国历史从中古转变为近世，是一大变革，这变革把唐宋分割，故后来以「唐宋变革」称之。他认为中国历史分期以秦汉以前为「上古」，东汉到西晋为「第一过渡期」，五胡十六国到唐朝中叶为「中世」，唐朝后期到五代十国为「第二过渡期」，宋朝以后则为「近世」。此时代区分论曾遭到多方批评，议论尤其在日本国内于战后越来越炽，然最终他的理论被之后的日本学者所继承，成为日本人研究中国历史的基本观念。此外，除以中国为开展的「东洋史」外，在日本历史