排除它们并将它们集中在其他区域来影响细胞质内的核糖体和细胞器等大型结构的分布。
功能.细胞质基质没有单一功能，而是许多个细胞过程的发生位置。 这些过程的例子包括从细胞膜到细胞内部特定位置的信号转送，如导向细胞核，或细胞器。 在有丝分裂中核膜破裂后，细胞质基质也是的许多过程的所在地。细胞质基质的另一个主要功能是将代谢物从其生产地运输到使用它们的地方。 这对于水溶性分子（如氨基酸）来说相对简单，它可以通过细胞质迅速扩散。然而，疏水性分子，如脂肪酸或固醇，可以通过特异性结合蛋白通过细胞质