4年，金日成离世后被委任为治葬委员会成员。金正日当上最高领导人人后，金时学依然得到器重。1996年，被起用为劳动党申诉室室长。1998年，除继续出任党中央委员和部长外，还被推举为责任秘书。2003年，担任代议员资格审查委员会委员。次年，被委派到金日成高级党校当校长。2010年，先后离任党校校长及党中央委员。金时学至少育有一子，名为金景俊，于金日成综合大学毕业。