由蒋介石亲自下命，对孙立人及其部属进行整肃，以巩固其个人权力；蒋经国也被认为可能牵涉其中。也有人认为美国与此事也有关连。但是对于孙立人是否有军事政变的意图及行动，目前仍有争议。根据美国国务院档案。1950年1月3日，美国陆军部收到驻台北大使馆武官曼宁上尉（Captain Manning）所拍发的一封极机密电报，内容称，孙立人告诉他，蒋介石已经知道孙立人欲发动政变的计画，但孙告诉蒋，此乃共产党的造谣。这份记录是美国官方文件中最早对孙立人可能军事政变的记录。5月3日，国务院政策计画局局长保罗·尼采，