朝廷按例赐宴，徐显卿奉命陪同。九月，神宗亲自查验陵寝建设，见工程次第开展，徐显卿因功加级得赏。十月，徐显卿转任吏部右侍郎。
致仕.万历十七年（1589年）二月，南京云南道御史方万策、江西道御史林可成等人，交章弹劾徐显卿，称其排挤张位、沈一贯、李长春、韩世能等人，又指责其勾结富商，谄媚太监，行为不端，收受贿赂。朝廷命下吏部调查。徐显卿上疏抗辩不成，遂连上三疏请求致仕，获准。徐显卿因其弟显宰死于非命，举家徙居宜兴县。曾创建义仓，并带头捐金五百。万历三十年（1602年）十月，卒于家。