全部为替补，中锋还一度由左护锋来作替代，最后也仅以8胜结束球季，无缘季后赛；2015年休赛季期间，更是全联盟人员流失最为严重的队伍，没有之一。明星线卫宣佈退役、老将跑卫离队、而外接手去了奥克兰突击者、全明星护锋麦克．尤菩提Mike Iupati也远走亚特兰大猎鹰、全明星防守截锋也退休了，这使得49人队最终以5胜结束2015年赛季；2016年赛季，整个赛季气氛低迷不说，又在季前热身赛对绿湾包装工时发生了四分卫卡佩尼克的「国歌风波」事件，让49人队整季都处于一种动盪不安的局势中，最后也仅完成对洛杉矶公羊队的主客