五日市线是JR东日本在多摩地方的东西方向路线；八高线、武藏野线则是南北方向路线。东京都有东京、品川、上野三个新干线车站，东京站是东海道·山阳新干线、东北·北海道新干线、秋田新干线、山形新干线、上越新干线、北陆新干线的起点。JR东海将品川站作为修建中的中央新干线的起点。关东地方的9家大手私铁公司中，小田急电铁、京王电铁、京滨急行电铁、京成电铁、西武铁道、东急电铁、东武铁道、东京地下铁在东京都内有自公司的路线。2019年11月30日相铁·JR直通线通车后，相模铁道亦开始有列车直通至东京都心，令关东全部大手私铁