与鸟类研究者使用亲缘分支分类法研究，认为鸟类从类似伶盗龙的衍化兽脚亚目恐龙演化而来。早期的兽脚亚目可能都是恆温动物，并进化出简易的纤细羽毛作保暖之用，而这些羽毛后来变得更大及复杂，适合空气动力用途。这种说法一般都有化石证据支持（参有羽毛恐龙）。此阵营的科学家们通常认为长鳞龙是奇怪的双孔亚纲动物，有特别的鳞片，不明的头颅骨特征，而其他类似鸟的特征也被误释，这些特征同样可见于跟鸟类无关的物种，这是适应树栖生活的后果，可见于现代树栖动物变色龙，并非鸟类演化的成份。然而，少数科学家则指出鸟类是从像蜥蜴的变温动物