回收土地，以及是车站选址、设计等问题上，引起了香港社会人士的关注与彼此之间的冲突，并发生了撑高铁运动、反高铁运动和香港反高铁拨款警民冲突等事件。就着669亿港元工程费用及菜园村收地问题，由公共专业联盟协调的「新高铁专家组」，提出了一项新方案，表示以锦上路作为香港区总站，无需于菜园村收地，及只需250亿港元费用。
参选立法会.成员司马文于2016年7月18日宣布参选2016年香港立法会选举香港岛选区，而另一成员陈淑庄亦于之后以公民党名义宣布参选2016年立法会选举香港岛地方选区。