使用，作为治疗骨盆腔炎、心内膜炎与细菌性阴道炎的药物。在对抗麦地那龙线虫病、、阴道滴虫，和阿米巴病上更有显着效果。针对首次发病的轻中度困难梭状芽孢桿菌结肠炎患者，此药更是第一优先药物。甲硝唑可借由口服、制成乳膏，或经静脉注射来进行治疗。常见的副作用包含恶心、口腔金属味感、失去食慾还有头痛，少数病患则可能会癫痫发作或产生药物过敏。对于怀孕初期的孕妇，不应给予甲硝唑，但若是到了怀孕后期则没有这个顾忌。特别注意的是，正在哺乳的妇女也不建议使用。甲硝唑首先在1960年的法国开始被广泛使用 ，它同时也名列世界卫生