舰队停泊在莫东的安全港口之中，避免交战。而同盟各国则面临巨大的军费开支和难以弥合的内部分歧。1572年5月1日，同盟的积极倡导者庇护五世去世，进一步加剧同盟内部的分歧。在1573年，唐胡安率领西班牙舰队占领了突尼斯，但威尼斯却离开了同盟。对达尔马提亚和弗留利遭受入侵的担忧，以及减小损失并恢复与鄂图曼贸易的愿望促使威尼斯人与鄂图曼人单独媾和。1573年3月7日，威尼斯与鄂图曼签订和约。尽管获得了勒班陀战役的胜利，但威尼斯却必须承认鄂图曼对塞浦路斯的统治并支付300,000达克特赔款。自和约后威尼斯与鄂图曼一直