当选为州长，这是他四届任期中的第一届。他被普遍认为是他所在州杰斐逊派民主共和党的领袖，杰斐逊派反对联邦党。与其他一些民主共和党人不同，亚当斯支持镇压1794年的威士忌暴乱，理由与他反对谢斯叛乱的理由相同。和其他民主共和党人一样，他在1796年公开反对《杰伊条约》，这一立场在一个日益拥护联邦主义的州招致了批评。在那一年的美国总统选举中，弗吉尼亚州的民主共和党人投了15张选举人票给亚当斯，试图让他成为杰斐逊的副总统，但联邦党人约翰·亚当斯赢得了选举，杰斐逊成为了副总统。亚当斯兄弟俩一直是朋友，但当杰斐逊在180