名为屯马线，屯门站将成为轻铁及屯马线的转乘站，亦是西面总站。日后乘客在屯门站乘搭屯马线前往九龙城、九龙东、沙田及马鞍山一带，可在1或2号月台（往乌溪沙方向）登车前往，并将毋须转乘其他路线就可以直接到达。
屯门南延线.据《铁路发展策略2014》，屯马线将会兴建屯门南延线，由此站向南伸延至屯门码头一带设置屯门南站，届时屯门站将由屯马线新界西端终点站变为中途站。