元年（76年）率领十三将士归玉门；公元91年，班超平西域，东汉遂以班超为西域都护，驻龟兹国境内的它干城（今新疆库车附近，其址未详）焉；公元94年，班超斩焉耆王广、尉黎王汎于前都护陈睦驻扎过的乌垒城，又于公元97年派甘英出使罗马帝国，公元102年班超回朝，任尚、段禧接任西域都护；至公元107年7月29日，因西域诸国反，龟兹国人叛白霸和东汉与羌的战争，“朝廷以其险远，难相应赴”，从此废置西域都护，北匈奴重新占领了西域。123年班勇收复西域，改置西域长史府。十六国前凉建兴二十三年（335年）再次设置西域都护，