菲律宾人权一直都是外间的关注和争议主题。根据美国国务院在2006年3月的国家档案中，菲律宾的保安力量被指要对国内的严重人权滥用事件负责，尽管其国内的民间势力试图加以管制。报告指政府大致上虽然尊重人权，当中有部份保安武装势力仍有进行侵犯人权的行为：至于是哪些势力，不同的来源有不同的说法，有说是菲律宾国民警察内部的势力，亦有说是与军方有关，或当地的地方武装组织和自警团。()这些侵犯人权的行为，主要是以司法外的政治谋杀为主要，还有酷刑、失踪、非法禁锢及罗织罪名。菲律宾自2006年开始废除死刑，但自从2001年前任