又于1946年在美国举行按立主教仪式，并获北美圣公会认可，建立云贵教区。回国后，黄奎元到上海。1947年8月，中华圣公会总议会第十届会议决定，设立中华圣公会云贵教区，黄奎元任主教。朱友渔也参加了1947年8月的中华圣公会总议会第十届会议，并在会上提出请吴国桢担任传道部部长，但被会议否决。1947年，黄奎元回到昆明，随即召集了昆明、大理、曲靖、贵阳、遵义各地圣公会圣品和信徒代表在昆明举行中华圣公会云贵教区第一届教区会议，通过了《中华圣公会云贵教区宪法规例》和《中华圣云贵教区公祷书》，宣告中华圣公会云贵教区