施行，然而马英九政府在2008年上台后，当时中华民国教育部部长郑瑞城以内容有问题为由而搁置国文科和历史科的课纲，并且组成专案小组予以编修。参与会议的历史科专案小组召集人周樑楷以及会议成员林富士曾经发言抗议，但不获得採纳。而担任历史科专案小组成员的国立台湾大学历史学系教授周婉窈因为担心台湾历史部分将会回到88课纲时作为中国地方史的地位，因此投书媒体并公开专案小组运作的情况，这使得课纲修订事件因而获得社会大众注目。在当时行政院院长吴敦义接受质询时承诺台湾历史部分依然单独成册后，101课纲在2012年时正式公布并