79年1月，臧伯平调任教育部副部长后，杨石先复任南开大学校长。1981年10月至1986年1月，经济学家滕维藻出任南开大学第五任校长。1986年1月至1995年8月，中科院院士、物理学家母国光任南开大学第六任校长。1995年8月至2006年5月，数学家侯自新任南开大学第七任校长。2006年5月至2011年1月，中科院院士、生物学家饶子和担任南开大学第八任校长。2011年1月至2018年1月，龚克担任南开大学第九任校长。2018年1月起，中国工程院院士、免疫学家曹雪涛担任南开大学第十任校长。2016年9月