出青年科学基金项目、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金重点项目、国家重点研发计划项目等国家级项目多项。1999年获首届全国优秀博士论文奖，2005年入选中国科学院“百人计划”，2009年入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选。主要学术兼职有：中国植物学会副理事长兼秘书长，Molecular Phylogenetics and Evolution副主编，Plant Biology等刊物编委。