师将襟翼角度由最初的30º调至15º，以获得速度，但阻碍了飞机获得升力的可能。飞机爬升至53米，随后因向下气流而下降，撞向跑道尽头，撞击导航设施及一座小山后坠入居民区，而撞击距起飞仅1分钟。机上的115名乘客和11名机组人员全部遇难，乘客中多数为度假的意大利人。 地面亦有45人死亡。
原因.调查表明9646号班机失事的原因是机师执意在恶劣天气下起飞，低估了此条件下起飞的危险性，错判了飞机在恶劣天气下的性能。
事后.截至2013年10月，此次空难仍是古巴最严