宽椭圆形，长于上萼片，长于或等于下唇，顶端钝形或3浅裂，具橙黄色细毛；下唇大，圆形，顶端圆形或微凹；喉凸隆起呈浅囊状；距为圆筒状或细圆锥形，长5至7毫米，顶端钝或近急尖，与下唇平行或锐角，与下唇近等。雄蕊无毛，花丝线形；药室汇合。子房球形，直径约2毫米；花柱短；柱头卵形，下唇为圆形，反卷，上唇小，正三角形，两唇边缘呈流苏状。花期为6月至9月。异枝狸藻的蒴果为球形，2瓣裂，花萼宿存。种子细小，无胚乳。果期为8月至10月。染色体数为2n=44。
生态关系.异枝狸藻生长于沼泽或池塘中