预备干部训练团第一总队少将副总队长，移驻至福建漳州龙溪县。同年6月，其辞去副总队长搭乘军舰抵达高雄。
在台生涯.1949年7月，就职台中第二中学校长。1950年7月，调为台北成功中学校长，任内提出「爱国家、求进步」的口号，并推动军训与童子军教育。1956年6月，奉令筹设台湾省训练团；6月30日，受命为教育长，负责训练省政府干部。1964年4月，潘振球就任台湾省政府委员兼教育厅厅长。1967年，蒋中正决定全面延长国民教育的年限为九年，潘振球只有一年的时间准备，目标是增加140多所国中