法院检察处以管辖桃园县。1980年7月1日，院检始分隶。1989年12月24日《法院组织法》修正，改为今名「台湾新竹地方法院检察署」，机关首长首席检察官亦同时改称为检察长。1997年1月9日台湾苗栗地方法院检察署成立，辖区划出。2015年2月9日搬迁至新竹县竹北市现址。2018年2月8日，全国检察署正式去掉「法院」二字，直接命名地方检察署。