有两个种："A. scagliai"、"A. subsulcatus"。在2002年，史宾赛·卢卡斯（Spencer G. Lucas）将体形较大的种，归类于锹鳞龙的"S. robertsoni"，较小的种则归类于"S. wellesi"。一些发现于美国的化石，生存同年也是三叠纪晚期，原本是独立属"Calyptosuchus"，曾被改归类成锹鳞龙的第三个种"S. wellesi"。大部分研究认为锹鳞龙、"Calyptosuchus"是两个单系源，是两个有效的独立属。