钒原子或铁原子取代。由于氧气具有较强的氧化性，固氮酶可能会被氧气不可逆转地抑制（Fe-S 辅因子被氧化降解）。
非特异性反应.除了能催化将氮气转变为氨气的反应，固氮酶还能催化以下几种反应：另外，在固氮酶中，氢一般作为竞争性抑制剂，CO一般作为非竞争性抑制剂，CS一般作为快速平衡抑制剂。