当时幕府在端午节也有相关仪式，也有使用药玉，如的《帘中旧记》就记载足利义政时幕府端午有使用药玉。神社继续有端午祭典，以五色粽为祭品前代盛行的打石战游戏到这段时期，在一些情况下已发展为成年男性之间具有实战性质的武斗，称为菖蒲合战（）。战况激烈者甚至用到刀剑火器，常导致血流漂柞、死伤遍野的惨状；又由于端午杀人无罪，有些人就趁机杀人报私仇，因此菖蒲合战也是解决人际矛盾的一种手段。江户时代日本端午节延续尚武之风，人们在屋外继续挂军旗、陈兵器。挂军旗在这时代演变成挂鲤鱼旗和，是出于鲤跃龙门的中国传说，又因为鲤鱼离