还授权他与印第安人谈判并缔结条约。1803至1809年，他共与印第安人达成十一项条约，为联邦政府取得超过24万平方公里土地，其中包括今印第安纳州南部三分之一和伊利诺伊州大部分领土。1804年，他和奎什奎基（）酋长订立《圣路易斯条约》（），索克族（）和梅斯克瓦基族将今伊利诺伊州西部及密苏里州部分地区割让给联邦政府。许多索克族人对条约和割让土地深感愤慨，特别是黑鹰（），这也成为1812年战争期间他们支持英国的主要原因。哈里森期望1805年的《松鸡场条约》（）能安抚部分印第安人，但前线局势依然紧张。1809年，他