一定的遗传学起源，但是后代族裔分化极大。百越的祖先大约于三、四万年前发源于广东一带，而后慢慢扩散开来并与其他部族融合演变成不同的族群，加上地理隔阂及文字发展相对落后，故而形成不同的族群神话起源传说。
遗传研究.由于分子人类学的Y染色体DNA能对人群系统进行精细的分析，已经研究的百越群体显示出遗传发生关系和语言文化类型的差距，这与百越的整体认同和地域分化有关。根据数据的主成分分析得到百越集团系统遗传结构的三个特点：遗传学研究表明，南岛诸民族、汉藏诸民族及侗台诸民族的父系血缘大多源