种称为"Botryopteris antiqua"的蕨类化石上，是担子菌最早的化石纪录，宾夕法尼亚纪（距今约3亿年前）亦有发现含有扣子体的菌丝化石，此化石的真菌被独立成一个新的属，命名为"Palaeancistrus martinii"，形态与现生的一些腐生真菌类似。