天皇在位前的时代只以神话形式流传，但传说有指天皇是彦波潋武鸬鹚草葺不合尊和其叔母玉依姬所生的。虽然阙史八代的资料正确性存有疑问，但记载指孝安天皇跟其侄女押媛性交，生下了孝灵天皇。此外也有继母子结婚的记录，孝灵天皇的儿子孝元天皇之皇妃伊香色谜命在嫁给继子开化天皇后，产下崇神天皇。大冢光先排除想开化天皇成为孝元天皇的后继者的可能性，并以上述事实推测开化天皇很可能是伊香色谜命的真正儿子。《日本书纪》指出苏我稻目之女苏我小姊君嫁给了第29代天皇钦明天皇为次妃，生下了穴穗部间人皇女，她后来成为了第31代天皇用明天