府迁至武昌，1926年12月13日成立武汉临时联席会议。不久后，简照强将南洋大楼主楼借给国民政府作为办公用房。1927年1月1日，武汉国民政府正式在南洋大楼办公。在武汉国民政府进驻期间，南洋大楼的一楼为国民革命军司令部、总政治部、《革命军日报》编辑部、郭沫若等人的居室；二楼为卫兵室和卫兵居室；三楼为会议厅，秘书处，其中的会议厅为武汉临时联席会议和中国国民党二届三中全会的召开地；四楼为海外部、实业部、教育部的办公室；五楼为国民政府副官处，以及宋庆龄、徐谦、谭平山、林伯渠等人的居室。1927年3月下旬，武汉国民