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疾病.褐家鼠会带有一些疾病，包括钩端螺旋体病、隐孢子虫症、病毒出血热（VHF）、Q热和汉塔病毒侵肺型征候群。不像黑鼠那般，褐家鼠鲜少带有腺鼠疫。
天敌.在自然界，鼠的天敌极多，当中包括很多勐禽如鹰、隼、猫头鹰、伯劳、大部份蛇类、大型蛙类(如牛蛙)、家猫、狐狸、猪。当中以蛇类对鼠类威胁最大，因蛇能够进入鼠的巢穴里，而且部份蛇拥有热能感测的特殊器官，让鼠类难以逃离蛇的追捕。因为鼠的繁殖很快，因此牠们亦成为其他动物活生生的食物，通常是大型的爬虫类如蛇等。