陈桥兵变后，宋太祖告诉王继恩说：“早来前殿指挥一事，偶有误失，史官必书之，故不乐也。”（读书镜）《宋史》说宋太祖驾崩时，宋皇后（952年－995年）急令王继恩召太子赵德芳（959年－981年）入宫，王继恩却拿着遗诏去找晋王赵光义。后来赵光义继位，即宋太宗，但许多人相信有“斧声烛影”之谋篡疑案，认为是赵光义谋杀宋太祖，因而即位。宋太宗淳化四年（993年）王小波和李顺叛宋，王继恩、雷有终帅兵讨之。淳化四年（993年），李顺陷成都时，继恩任剑南西川治安使征讨之，屠杀三万人。宋太宗去世后，与参知政事李昌