在岛上偷猎包括野猪和野兔等的动物，一经定罪，偷猎者可能会判罚在骑士团厨房当三年奴隶。在十六、十七世纪中，科米诺岛成为一个用于监禁或流放犯下罪行的骑士的地方。被判犯有轻微罪行的骑士偶尔会被判处去岛上的圣玛丽亚塔去单独执行危险的任务。<br>1798年，法国以拿破仑为统帅，派遣大军远征埃及，当大军途经马耳他时，拿破仑从骑士团手中夺取了战略地位重要的马耳他，科米洛岛也成为法国领土。在法国占领马耳他期间，科米诺岛是一个隔离区，岛上建有隔离医院；同时，该岛也是一个犯人被审判前临时关押的临时监狱。<br>1800