官议决迎皇太子继位，即晋孝武帝。太皇太后褚蒜子当时下令由桓温依周公居摄的先例代幼主执政，然而王彪之以桓温必当辞让而影响朝廷运作为理由不奉绍令，封还给太皇太后，此令最终亦没有实行。宁康元年（373年），桓温患病，并表示想获授九钖。王彪之却与谢安联手拖延袁宏撰写赐九钖的诏文，终令文章在桓温于当年死时仍未完成，桓温亦因而未能获得九钖。
晚年掌政.桓温死后两个月，王彪之升任尚书令，与谢安一同掌政。当时谢安亦称许其能力，说：「朝中大事，众人不能议决的，问王彪之就必能有个结果。」后王彪之以