击世贸中心后的35分钟，加拿大交通部在渥太华启动了应急指挥中心SitCen。SitCen是加拿大交通部的应急指挥中心，最初是为了应对不列颠哥伦比亚沿岸的地震所设置的。在九一一事件前，为了处理1998年1月的北美冰暴灾害、1998年9月2日的瑞士航空111号班机空难等紧急事态，加拿大交通部都曾启动了SitCen。诸如加拿大导航公司、国防部、皇家骑警、国家安全情报局、公民和移民部、海关和税务局也派员参与到SitCen的运作。SitCen的职责之一是保持与加拿大航空运输协会和各地机场的运营方在内的加拿大航空业