阿里建立了一支新的舰队和一支新的军队。1831年10月31日在他的长子易卜拉欣的带领下，埃及军队对叙利亚的入侵开始了。为了避免国际的反对，对于阿里来说，入侵需要一个借口。最后他以与阿卡的统治者之间的争吵为借口。阿里指责6000名农民逃往阿卡来避免兵役、徭役和税赋，他要求阿卡将这些人遣返埃及。埃及军队在叙利亚长驱直入，遇到了很少的抵抗。在围攻六个月（从1831年11月3日至1832年5月27日）后阿卡被占领。埃及军队进入安那托利亚。1832年12月21日在孔亚战役中易卜拉欣击败了奥斯曼帝国大丞相亲自带领