以涉嫌谋反的罪名把家督丰臣秀次赐死，同时族灭了秀次一家老小。此后丰臣政权自家督丰臣秀次赐死后便出现权力真空，但实际上太阁丰臣秀吉还是实际统治者，直到秀吉公于庆长三年（1598年）病逝。
庆长之役与太阁丰臣秀吉之死.由石田三成、小西行长等人主导的对明和谈，最后以秀吉不满明方提出的条件，全面决裂而告终。庆长2年（1597年），秀吉再度命令日本全国大名出兵讨伐朝鲜，是为庆长之役。这次出兵日军吸取了文禄之役过度深入而败的教训，主力以全罗道为攻击目标，在固定阵地后再向忠清道等朝鲜各地发动进攻