时信浓是重要的军马产地，并且是东山道的必经之地，军事地位十分重要。随着佛教的普及，善光寺等名剎亦创建于这一时期。平安时代中期之后，武士阶级开始兴起并成为信浓国新的支配者。木曾义仲即起兵于信浓国。鎌仓时代时，北条氏、比企氏曾就信浓国的支配权展开激烈争夺。承久之乱后，北条氏成为信浓国的统治者。在室町幕府时期，信浓国是众多中小势力混战的地区，最终呈现南部的小笠原氏、北部的村上氏及众多中小势力并存的局面。信浓国缺乏强力大名这一局势给了外部势力可乘之机。甲斐国的武田氏自16世纪中期开始攻入信浓国并成功佔领信浓全境