，其他则设立县。此时各藩则持续推动改革，强化财政体制，以应付战事所造成的负债。对于体制上，各藩分成郡县和封建两派，双方势均力敌而毫无结论。之后在藩阀指导下，1869年6月「萨长土肥」四藩联合上书朝廷，要求将领地还给朝廷，随后其他藩纷纷上书支持，于是推动版籍奉还。维新政府将各藩主任命为藩知事，代为管理，因此其直辖领大体没变。「废藩置县」政策，将日本划分为1都3府1道72县。
改革内容.
司法.在司法方面，仿傚当时先进国家的制度，分别于1882年订立法式刑法；