共和党与主战派民主党结成联盟国家联邦党，并在1864年召开代表大会推举总统候选人，史蒂文斯不无勉强地把票投给林肯。他属意在任副总统汉尼巴尔·哈姆林连任，但宾夕法尼亚州代表团最后选择林肯政府青睐的田纳西州战时总督、前州长和联邦参议员、主战派民主党人安德鲁·约翰逊。史蒂文斯对提名约翰逊非常反感：“找不是从他妈叛乱省份出来的人当副总统候选人有那么难吗？”不过他还是为林肯和约翰逊竞选，两人顺利当选，史蒂文斯也再度连任。1865年1月国会得知林肯意图与邦联领导人和谈，史蒂文斯愤怒之极，宣称美国选民如果能再次投票，他