的付费区未合併之前，更有不少市民取道车站大堂来往窝打老道和又一城，但付费区合併后这些人流需要改用车站外的地面通道及行人天桥。而东铁全月通亦一度协助分流转乘客，但港铁自2008年9月28日起把该站、美孚站、南昌站的收费区统一，令该站人流开始回升。直至九龙南线于2009年8月16日通车后，由于尖东站成为了西铁线中途站，原本可乘东铁线直达尖东站的新界东乘客，须于红磡站转乘西铁线方可到达尖东站，此一不便使九龙塘站的转乘人流又再增加。不过自屯马线一期在2020年2月14日投入服务后，乘客可以选择乘搭屯马线一期