足协杯决赛，将会面对上赛季相同的对手——贵州茅台俱乐部。12月1日，足协杯决赛首回合比赛在贵阳市奥林匹克体育中心举行，比赛中恒大外援埃尔克森因报复性动作被红牌罚下，最终广州恒大以0比2的比分不敌贵州茅台。12月7日，足协杯决赛次回合比赛在广州天河体育场举行，在两名外援埃尔克森和穆里奇停赛的情况下，广州恒大以2比1的比分战胜贵州茅台，但两回合总比分2比3不敌对手，屈居亚军，未能完成三冠王的伟业，而孔卡在中国的谢幕战中则获得2013年中国足协杯的最有价值球员。12月14日，广州恒大在摩洛哥阿加迪尔举