4月底，经陈昌吉通过中共党组织安排，黄源离开上海。1941年5月，黄源抵达苏北的新四军军部，受到军长陈毅欢迎。1941年抵达苏北后，黄源历任中共中央华东局宣传部出版科科长、华东鲁迅艺术分院教导主任、《江淮报》副总编辑、浙东行署委员兼文教处处长、中共中央华中分局文协主任、华东大学文学院院长。1949年5月后，历任上海军管会文艺处副处长，华东军政委员会文化部党组书记兼副部长、中共中央华东局宣传部文艺处处长，华东文协主席、党组书记，中共浙江省委文教部、宣传部副部长，浙江省文化局局长、党组书记，中共浙江省委