，科学院没有资金来源，而是由志愿者运营。在1993年至1996年之间，纽约卡内基公司和洛克菲勒基金会帮助该组织建立了有效的机构和财务系统。2005年5月，肯尼亚政府对科学院给予了正式承认，并向其提供了总部设在肯尼亚的国际非政府组织的外交特权。它还授权在内罗毕卡伦地区拥有的2公顷（4.9英亩）场地上建设总部。尼日利亚政府提供了500万美元的捐款，用于支付建筑费用。截至2017年，AAS有来自59个非洲国家的396名研究员。2011年2月28日，来自塞内加尔的艾玛杜·拉明·恩迪亚耶（Ahmadou Lami