指派前往菲律宾拓殖。他率领5艘船从墨西哥海岸的阿卡普尔科出发，横渡太平洋，于1565年4月到达菲律宾群岛南部的宿务岛，在今宿务市建立第一个西班牙人居民点。后为第一任菲律宾总督（1565～1572）。1569年派远征队去吕宋岛。次年亲自出征，在吕宋废黜梅尼拉王国土王，兴建马尼拉城，该城成为西属东印度群岛的首府和西班牙在东亚的主要贸易港。德莱加斯皮统治菲律宾期间，两度挫败葡萄牙的攻击，镇压了菲律宾人组织不善的抵抗。今菲律宾阿尔拜省首府黎牙实比市即以其姓氏命名。