尼亚较为强大，安条克则基本上成为其附庸。此时蒙古人的征服大军在旭烈兀率领下，终于来到西亚。博希蒙德六世因其岳父亚美尼亚国王的关系，与蒙古人关系融洽；他甚至率领十字军去与旭烈兀协同作战,如参与巴格达之战 (1258年)。但是在1260年，埃及马木路克将领拜巴尔在阿音札鲁特战役中打败了旭烈兀的先锋部队，把蒙古人挡在了埃及之外，不久更将他们赶出叙利亚。拜巴尔不久自立为埃及苏丹，开始致力于扫平整个叙利亚。1268年，拜巴尔终于征服安条克公国，整个北叙利亚此后均落入他的手里。1291年，随着阿卡的陷落，所有十字军国家