克弗森、托马斯·格罗内迈尔和维克托·阿莫路索对小瓮猪笼草进行了正式描述。该描述发表于斯图尔特·麦克弗森的专着《旧大陆的猪笼草》第2册中。编号为“"V.Amoroso & R.Aspiras" CMUH 00003545”的标本被指定为模式标本，其存放于菲律宾布基农省慕斯万山的棉兰老中央大学植物标本馆中。该标本于2005年1月31日采集于汉密吉伊坦山通往圣伊西德罗的路径上海拔1300米至1600米的地区。因标本馆中的标本无花序结构，所以关于花序的正式描述来源于沃尔克·海因里希于2008年7月22日在模式产