中有15种植物在台湾同属于归化植物，包括赛山蓝、毛莲子草、大花咸丰草、长柄菊、红花野牵牛、垂果瓜、赛刍豆、美洲含羞草、含羞草、赛葵、红花黄细心、光叶鸭舌舅、苦蘵、蒺藜草、牧狼尾草等。本岛东部有一片热带海岸林，其树高可达20公尺，主要以檄树、榄仁树、莲叶桐、葛塔德木、草海桐、白水木、海柠檬、藤蟛蜞菊、长柄菊、长鞍藤、葛蕾草等乔木为主，本岛较高大的植物有椰子、琼亚海棠、太平皮孙木、莲叶恫及榄仁树。。太平岛的陆域植物，其世界分布属于马来西亚植物区系。岛上曾纪录到11种未见于台湾本岛的植物，包括海柠檬、橙花