ebook发表帖文表示，位于旺角承印大纪元的新时代印刷厂在凌晨约4时遭「黑衣人」纵火。大纪元时报怀疑是中共所为，但没有给出任何证据。荃湾警署就事件开展调查。
该报技术总监遭袭.2006年2月8日，《大纪元时报》网络技术总监李渊在美国亚特兰大郊区的家中遭到不明身份的人袭击，李渊告诉记者，当天中午有2名谎称是送水的亚裔男子闯入他的家中，他们蒙住他的眼睛并加以殴打。李渊回忆说，袭击者在殴打他的时候用普通话问他保险箱在什么地方，并在住宅内翻了约半小时，两部手提电脑和外接-{zh-tw:硬碟