表示，对于教育部控告学生的做法，他认为不恰当，而教育部让警方逮捕记者则是非常可恶，严重侵害新闻自由，暴力也不应施加在记者身上。但这番言论引起不少批评，认为他用言论自由包装来纵容暴力，甚至反问他是否允许其他人闯进其办公室。7月27日，新党前台北市议员李承龙自称是民间网路新闻电视台记者，闯进陈良基办公室要求採访，听到办公室秘书说陈良基不在，且今日行程满档，更说要夜宿办公室等他，直到校警到场，才愿意离开。陈良基事后透过校方发表声明指出，他并非鼓励学生犯法，学生犯错当然应该被处分，但应是交由校规处理在先，不得已