庙附近的公园预定地内，原址则规划为建地。1995年农历过年前，淡海新市镇第一期示范区除淡水太子庙、大营公庙等庙宇外，其他建物已被夷平。被拆的公司田溪桥的一块石板曾放在此庙内，后由营造商林昆志经由允杯取回，物归原处。1998年11月3日晚上，电影《条子阿不拉》的摄影团队在此庙前面拍摄大型爆破场景。次年，庙一旁的淡海新市镇第一期国宅新大楼完工后，庙方发现庙门正好被大楼挡住，几经商议后决定转向南面正对新市镇公园的方向，于是委由嘉义一名王姓工程业者移庙，于该年6月5日下午3时正式移向，淡水镇长郭哲道、立委郭素春