着与法国谈判的进展顺利并最终签署莫特方丹条约，亚当斯总统认为陆军已经没有必要，在他的推动下，美国国会于1800年6月通过了解散陆军的决定，汉密尔顿的陆军职位也于1800年6月15日结束。在解散陆军过程中，遭到了效忠于汉密尔顿的蒂莫西·皮克林国务卿和詹姆斯·麦克亨利战争部长的抵制，于是亚当斯在1800年5月解除了他们的职务。经过陆军的组建与撤销，汉密尔顿与亚当斯关系愈加疏远，并导致联邦党最终解散。而亚当斯也在1800总统大选中败给了杰斐逊。
决斗身亡.1804年美国总统选举前夕，