获岛津赏识，在36年转到导演部，在他的《浅草之灯》、《朱与线》和《哥哥与妹妹》中任助理导演，岛津对日常生活的细致观察和对演员的处理方法都深深地影响着木下惠介。1939年，他转任师兄吉村公三郎的助理导演，协助后者拍成名作《暖流》，又为他的《五人的兄妹》编写剧本。1940年木下惠介被召入伍到中国参军，但翌年即因患肺积水返国复员。1943年，获松竹的厂长城户四郎提昇为导演，拍摄首作《热闹的港口》，改编自菊田一夫的同名作，描写两名骗子怎样被爱情、爱国心和纯真的人情所感化而择善去恶。黑泽明同年也为东宝拍摄处女作《姿三