次合并，成立南京市行动委员会，旋遭破坏，9月再次恢复原组织。1931年底建立中共南京特别委员会，次年4月遭破坏，11月建立中共南京特别支部，1934年初改为中共南京市委，8月遭国民党第八次破坏后，一度未恢复。1937年9月，重建中共南京市委，12月侵华日军占领南京前停止。1940年在南京建立支部，1942年初改为中共南京工作委员会，1944年撤销。1942年8月，建立南京小组，1944年6月改为中共南京工作委员会。1945年4月，中共华中分局成工部建立南京工作部，1946年4月改为南京市委。1949