凯霍斯鲁二世攻克迪亚巴克尔附近的地区，他在1239年须面对颇有声望的传道者巴巴·伊沙克领导的暴动。三年后，暴动被压制，但罗姆苏丹国丧失了在克里米亚的立足点，其国家及其军队被削弱。在这种情况下，还要应付更为危险的威胁，那就是正在进行第三次西征的蒙古人。蒙古帝国的军队在1242年攻佔埃尔祖鲁姆。1243年，凯霍斯鲁二世在克塞山战役（克塞山位于钖瓦斯与埃尔津詹之间）大败于蒙古大将拜住。此后，塞尔柱突厥人只得顺从蒙古人，并逐渐沦为蒙古人日后在波斯建立的伊儿汗国的附庸。凯霍斯鲁二世兵败后逃到安塔利亚，在1246年逝