留下当时就读中学五年级素木得一，以及其下1弟4妹，但没有遗产。困顿的家计使素木得一打消赴东京习医的计画，改就读札幌农学校，在预科期间以兼职教授数学贴补学费；而后则依靠优异成绩，获本科公费生资格，得以在免学费并领取补助金的情况下继续学业。最初素木有意攻读食品化学，但经过与大岛金次郎教授讨论之后，改向昆虫学权威松村松年学习昆虫学，着手直翅目昆虫的分类。1906年7月毕业后，素木得一先留校担任助教授，但因为讲授的课程矿物结晶学、森林动物学、农产制造学等皆与其专长无关，加上指导教授松村松年对当时台湾总督府农事试验场