马德拉群岛逐渐人口过剩，部分人移民至巴西。直至1668年，葡萄牙王政复古战争结束，葡萄牙独立，亚速尔群岛重新回到独立的葡萄牙的统治。
自由者战争时期.1828年，爆发，又称葡萄牙内战，在亚速尔群岛产生了广泛的反响。1829年，特塞拉岛决定拥护自由派的佩德罗一世和玛丽亚二世，成为葡萄牙自由派的驻地，并且建立了一个摄政会议。后来佩德罗一世在特塞拉岛组织了一支数千人的远征军，前往葡萄牙，最终成功夺取了王位。1868年开始，葡萄牙发行了一套印有“亚速尔”字样的邮票，专用于群岛。1892