之后，源于少昊玄鸟氏的商部落崛起，并最终推翻了夏朝，占据了中原。商代任用同出玄鸟氏的秦部落等统御各方。与人方等东夷方国关系也较夏融洽。商亳还曾迁至少昊曾经的都城奄（今山东曲阜）。后期商对东夷连续作战，消耗了大量国力，并最终被周人乘虚而入，夺取了中原。秦部落祖先蜚廉、恶来也被周武王杀害。有虞氏（妫姓）是中国古代五帝之一舜帝所建虞朝的名称。中商时期，夷商关系恶化，仲丁继位后，发生了与蓝夷的战争。商朝自商王中丁后，连续发生王位纷争，又屡次迁都，历经了九世之乱，其中祖乙曾将商都迁至庇（山东郓城），南庚又迁到奄