权威大大的坠落，成为庆应3年（1867年）11月大政奉还的巨大转捩点，但是晋作自己却在此时患了肺结核，于是不得不在樱山展开疗养生活。同年的5月17日（庆应3年4月14日），还未见到大政奉还的高杉过世，得年27岁。临终时有父母和妻儿在身旁陪他，并且据说和山县狂介、等人也在高杉临死前和他见过面，但根据田中残余的日记来看，他那时人正在京都，所以详情不明。高杉之墓位于现在的山口县下关市。后来因为木户孝允和大村益次郎等人的要求，于是高杉和吉田松阴、久坂玄瑞、坂本龙马及中冈慎太郎等人，一起被迎接进入现在的靖国神社受