7日），热月政变的新政府把国民自卫军置于保皇党控制之下。国民自卫军试图在共和四年葡月13日（1795年10月5日）的保王党暴动中推翻督政府，但它被波拿巴率领的军队在葡月战役中击败了。此后，它被解除武装。
帝国时期.拿破仑不相信中产阶级的国民自卫军能够维持秩序和镇压暴动。因此，他创建了一支高度军事化的巴黎市自卫队（Municipal Guard of Paris）。然而，他并没有废除国民自卫军而仅仅满足于解除其武装。他将其作为后备军并动员国民自卫军用于1809年和1814年对法兰西的