《第4次S》的故事是承接《第2次G》，而非《第2次》。另一重要变动则为一部分角色加上配音，这亦是系列首次加入配音。另外亦追加了3DCG动画、新关卡和BGM，并调整了游戏平衡度。
重制版.1997年，《第4次》的重制版《超级机器人大战F》及《超级机器人大战F完结编》（下称「F」、「F完结编」）发售。但《F》、《F完结编》并非像《第4次S》般的简易移植，是在内容上作出大幅变更、接近一部全新作品。详细请参照《F》的页面。
参战作品.
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