任武威郡太守，武威当诸郡路道咽喉，民夷杂处，多次有兵灾。毌丘兴到任，内抚吏民，怀柔羌、胡，使他们为官府所用。黄华、张进开始计划作乱，扇动左右，毌丘兴不顾危难，为将校百姓夷族分析祸福，说着哭了出来。当时男女上万，非常感动，发誓效命。于是毌丘兴率精兵到张掖郡，济拔领太守杜通、西海郡太守张睦。张掖番和、骊靬二县吏民和郡里的杂胡归顺毌丘兴，毌丘兴加以安抚，使他们尽力农业。治理的名声仅次于金城郡太守苏则。因为讨贼张进及叛胡有功，封高阳乡侯。入为将作大匠。其子毌丘俭继承父亲的爵位高阳乡侯。