ICE-3列车上装备空气辅助的空调系统。相较于ICE-1列车的空调系统，它是采用1,1,1,2-四氟乙烷（R134a）作为制冷剂，可使每节车厢节省约500千克的重量。从属于卤代烷烃家族的R134a同样还能避免全球暖化潜势。在空调系统经历了多次故障后，其换热器在2003年夏季的调查中被证实为体积过小，而顶部的进风和出风口布置也不利于交换空气。因此，列车在2003年秋季加装了强化设备，它们采用独特的方框结构，于车辆两端的顶部清晰可见，而原来的空调系统则与密闭的车顶齐平。第二批次的列车在出厂时便已完成空调换装，但