区政府重修古井遗迹，留存的钱王井已经被列入市级文物保护点。2009年，杭州市政府发布了《百井坊巷地区有机更新城市设计》，提出要将百井坊巷地区建成“以商业、商务为核心，结合居住、配套文化为一体的综合功能区”。百井坊附近还有司徒雷登故居、杭州天主教堂、天水堂、钱王井等历史景观。
街区改造.2009年12月，百井坊开始了拆迁改造工作，前后共投资了60多亿元，迁移1000多户居民，其拆迁政策也被称为“史上最优惠”，但出台后仍受到本地人为主的居民反对。许多居民认为认为拆迁是以文物保护名义