普通法院体系按照正常诉讼程序，依序为：专业法院：除一般普通法院外，为因应专业案件，得视情况设置专业法院。目前有台湾高雄少年法院，负责审理高雄县市儿童及少年触犯刑罚法律事件，其位阶等同地方法院。依据《智慧财产法院组织法》于2008年7月1日成立的智慧财产法院，负责审理智慧财产案件，其案件包含第一、二审之民事、刑事智慧财产案件与第一审之行政智慧财产案件。
行政法院.行政诉讼由行政法院管辖，採二级二审制：为配合司法院规划将行政诉讼由现行二级二审改为三级二审，于地方法院设立行政诉