似，银杏被放入松柏类的紫杉科（Taxaceae）。1896年，日本东京大学的植物学家平濑作五郎（）发现了银杏具有多鞭毛的游动小孢子，而与松柏类的无鞭毛小孢子明显不同，显示出银杏在进化上的特殊的地位。此后，银杏长期被归于裸子植物。但随着大量化石的发现和分子生物学的发展，人们发现裸子植物并不是一个单系群，一般把各类裸子植物都被提升到门的分类阶元。由此，银杏类植物也被提升为银杏门。
分类.
形态属分类.银杏类化石的极为庞杂，大部分是营养器官，只有很少的化石是繁殖器官