蔡锷、唐继尧等留学日本的学生，创设云南陆军讲武堂，为新军的创设及强化作出了贡献。此外，他还参与同英国等诸国就领土问题进行交涉，并作为总督、巡抚的代表奏请清朝朝廷施行宪政。李经羲在以上内政改革等方面抱持开明态度，对镇压革命派也并不积极。其手下的蔡锷、唐继尧等新军军人为革命派倾倒。1911年（宣统3年）10月29日夜，革命派发动昆明重九起义。李经羲被俘虏，但在蔡锷的指示下获得释放，逃往上海。
北洋时期.1913年（民国2年）2月，王芝祥、于右任等人在北京组织国事维持会，李经羲参加。