两国都在战争时期肆意杀害被己方单方面认为是间谍的中国公民，激起了当时中国民众的强烈愤怒，鲁迅更指出他本人是由于看到日军残杀中国公民时国人的麻木感而弃医从文。日俄战争最直接的后果是日本对南满（中国东北南部）的控制及稳固对朝鲜的统治。关东州租借地（旅顺、大连）以及东清铁路长春以南段（后来的南满铁路）均由日本控制，“关东军”在内满洲开始驻扎。日本成为近代第一个通过大规模战争打败欧洲白种人殖民者的黄种人国家，达成修改幕末以来不平等条约的目标。然而，《朴资茅斯条约》承认俄国在库页岛北部的权利，内容远低于一些日本民