率云贵兵攻佔安南的山西。翌年春，清朝大军遭到西山军阮惠的偷袭，大败退回境内。乌大经知孙士毅战败，也率云贵兵退回境内，全师而返。不久因母亲逝世，辞去官职回乡守孝。后任甘肃提督，又调任云南提督。1799年（嘉庆四年），僧铜金与孟连土司勾结野倮、蔓延勐勐及缅甸的贡榜王朝，发动叛乱。乌大经与总兵苏尔相一起率军围剿，连破缅甸边境数寨。次年，云贵总督书麟视察，採纳乌大经的计策夹击叛军，成功平叛。1802年（嘉庆七年）入京朝见。恰巧此时云南维西的傈僳族发动叛乱。乌大经立即回到云南，与总兵书成一起围剿，擒其首领恆乍