府灭亡之后，足利高氏被后醍醐天皇认定为头等功勋，叙从四位下位阶，任镇守府将军、左兵卫督，并将30个地方赠予其为领地。同时，天皇将自己名字中「尊治」的「尊」字赠予了足利高氏，将他改名为「尊氏」。足利尊氏自己本人在建武政权中没有担任要职，但却将足利家的执事高师直、其弟高师泰等大量家臣安插到朝廷里。天皇对足利尊氏敬而远之，因此足利尊氏对朝廷保持着一定距离。1333年（元弘3年），后醍醐天皇将义良亲王（后来的后村上天皇）任命为陆奥太守、北畠显家任命为镇守府大将军，驻扎陆奥；成良亲王为上野太守，由足利尊氏、足利直