至国会第六大党。国新两党在“总量管制”的选举策略下，赖士葆、雷倩及费鸿泰当选立委，吴成典顺利连任、名列不分区的曹寿民也因而当选。2006年直辖市长选举，郝龙斌由国新共推并当选台北市长。同年，新党在台北市提名的4席市议员全垒打，全数当选连任。2008年中华民国立法委员选举中，新党仍与国民党合作，并未单独提名候选人，在全国不分区部分努力争取政党选票，最终得38.6万票（3.95%），重新成为台湾第三大党。2010年中华民国直辖市市长暨市议员选举中，仅在台北市议会获3个席次。2012年中华民国立法委员选举，新