入一个虚拟专用校网，由邻近出入境管制站四个地区（北区、元朗区、屯门区及大埔区）的八个校网的学校提供学位。而港珠澳大桥落成后，东涌新市镇的学校亦正式提供学位到此虚拟校网，服务居住在珠海及澳门的学生。而在2013年到2019年间，此专用校网更包括黄大仙区、葵青区学校。
校网失衡.因应学童数量变动，校网亦有所变动。2006至07学年起，其中13个小一校网合併成6个，使校网由44个减至37个。包括把薄扶林第17校网合併到香港仔第18校网，土瓜湾第36校网合併到何文田第34校网，石硖尾第38