西斯科虽然召来奥地利军队保护自己，但仍然为起事者所迫逃离摩德纳，次年被奥地利军队复立。他起初表现得宽容，但当有人刺杀他后，他又恢复了暴政。1855年，法兰西斯科创立了埃斯特之鹰勋章，自封为首领。1859年，法军和皮德蒙特军队入侵摩德纳公国。在马真塔战役中，奥地利战败，被奥地利保护的法兰西斯科也于6月14日撤离摩德纳。1860年3月18日，在撒丁尼亚国王维托里奥·埃马努埃莱二世敕令下，摩德纳并入新成立的意大利王国。3月22日，法兰西斯科对此表示抗议。1860年后，法兰西斯科在维也纳退隐，住在摩德纳