存心镜藏奂禅师舍利塔。此后寺院几经兴废，其间历史多已不详。至明代初年，为防倭寇，迁海到居民入内地，普陀山宝陀寺观音像也被迁入七塔寺内供奉，因而寺名改为“补陀寺”。明末清初，寺前立七座佛塔，代表禅宗起源，因而得名七塔禅寺。清末，慈运上人任七塔寺住持，传布临济宗，形成“七塔寺法派”。1980年寺院修复开放。目前七塔寺方丈是可祥法师。