被多枚炸弹摧毁，站房已无法再继续经营。在4月18日及25日，有100人在对特劳恩施泰因的袭击中死亡，车站范围几乎被完全夷平。另有70人则在4月25日对弗赖拉辛的空袭中遇难，车站大楼及一些相邻的建筑均被摧毁。特劳恩施泰因在1945年5月2日开行了一班运送犹太人囚犯的列车，后者在被送往一处森林后全数遭到枪决。在随后的几天，特劳恩施泰因周边再有大量的桥梁被炸。爆炸迫使特劳恩施泰因的守军投降，并交出城市的守备权。萨尔茨堡也在5月4日和平移交政权。在战事于1945年5月完全结束后，线路的大部分路段仅具备单线运行的能力