叛逃到大陆，造成社会各界一片哗然，当年年仅34岁就任营长的侯金生，在林毅夫叛逃三个月后就退役，不过，侯金生澄清，林毅夫『失踪』后，他本人没有遭到任何压力或责备，相关连的军士官也无人受罚，甚至连申诫都没有，大家可以调阅当年的考勤资料就可证实。当年是自己申请退休，和林毅夫的案件没有关连。」有同样由台大转军校发展背景的学弟陈宪良，为林正谊叛逃事件所累，被军方暗中列为「重点考管人员」，虽有升迁，但逢重要敏感的职务或受训机会，就会受到多般横阻，因此陈宪良一直关心林正谊的生死。当年台大毕业投笔从戎的陆军前上校陈宪良