美国海军陆战队所订，军方型号为R5C-1。军用型号装有两个货舱门、加强型地板、液压辅助绞车。由于主要用于货物运输，40把折叠椅成为了仅有的乘客招待设施。测试表明C-46有能力仅使用单引擎的情况下承载大量的货物。如果是空机，则可以在单引擎运行的情况下达到每分钟200-300英尺的爬升率。C-46D于1944-45年间进行了最后的大规模生产，共生产了1,430架，本型使用了单机舱门，主要用于伞降。一架一次性试验用的XC-46B安装了阶梯式挡风玻璃和更大功率的发电机。一小批17架的C-46E与XC-46B有同