001年5月7日起运作，取代了此前的香港工业邨公司、香港工业科技中心公司及临时香港科学园有限公司，其主要服务是用一站协作式支援「以科技为本」的公司和活动。现时，该公司管理自行兴建的香港科学园，与及之前由其他公司管理的香港科技中心（即现时创新中心）和三个工业邨。香港科技园公司总部原本位于新界白石角香港科学园科技大道西2号生物资讯中心8楼，已于2019年1月21日迁往科技大道东5号5E大楼5楼。
历史.2014年7月11日，香港科技园公司发行合共17.07亿港元各类有担保票