妻杨氏是故尚书杨兆之女，贤惠有智，帮助丈夫死守，每天准备牛酒犒军。哱拜养子伪右参将哱云最骁勇，引河套部落首领着力兔一同急攻。萧如薰在南关设伏，佯装战败，诱叛军入内，射死哱云，其余众败逃。萧如薰又袭击着力兔的营寨，收获很多人畜。着力兔愤恨，又来攻，被副总兵麻贵所退，平虏城得以保全。起初万历帝听闻萧如薰以孤城抵抗叛军，大喜，厚赐银币，升副总兵。六月，萧如薰以都督佥事受任代董一奎为宁夏总兵官，尽统延绥、甘肃、固原诸援军。秋季，与提督陕西讨逆军务总兵官李如松等共击叛军，佯装攻北关，实为诱敌，秘密以精兵袭南关，攀云梯