5年苏贞昌担任党主席时，曾任民进党副秘书长、内政部政务次长等职。颜万进于其民进党中国事务部主任任内，在1998年2月举办「中国政策大辩论」。在该会中，民进党主席许信良强调「大胆西进」，但未受到党内菁英的支持。2000年总统大选，颜万进曾参与撰写陈水扁总统两岸政策白皮书，并担任陈水扁总统竞选总部战情部主任，参与各项决策。陈水扁当选以后，民进党中国事务部于颜万进主任任内开始出版《中国事务》季刊。
所属派系.在派系上，一般认为颜万进属于新潮流系，颜万进并曾担任该派系领导集体「政协