名的有《般若波罗蜜多心经释》，他也曾为《稻秆经》作了注疏。受到藏王的请託，莲华戒大师又作了三篇着作，作为佛教的入门指引，合称《修次三篇》，简介了修行者如何由发菩提心开始，次第修行直至解脱成佛的方法，这是藏传佛教修行道次第论的开端。其中《修次初篇》，宋施护汉译为《广释菩提心论》。