质或其他由蛋白质酶所合成的分子。这些蛋白质在粒线体DNA、噬菌体DNA或质粒内被基因编码。细菌会以数量感应来释放这些分子。这些都是寄主发病的近因。
致命病毒.病毒致病因子可以确定有否感染发生及征状的严重程度。病毒一般需要与寄主细胞的受体蛋白质结合。往往寄主细胞蛋白质都会被吞噬，病毒从而进入细胞内。致命病毒如HIV，拥有侵略寄主免疫的能力。HIV会感染辅助型T细胞，减低寄主的免疫反应，引发免疫障碍状态。死亡是因免疫崩溃后的次级感染。一些致病因子可以在感染的过程中授与复制的能力。很多