地穿透身体内所有的组织，当中亦包括脑部。在脑膜没有发炎的情况下，其在脑部及脑嵴液的浓度可以达至30-50%；若在脑膜发炎下，其浓度可以提升至89%。
不良影响.
再生不良性贫血.氯霉素最严重的副作用是再生不良性贫血。 这种影响很少出现，但却足以致命，因现时仍未能准确预测这种副作用的出现及提供适当治疗。贫血一般会在氯霉素治疗完成后几星期，甚至几个月后出现，相信是遗传的因素。 虽然现时未知如何监测再生不良性贫血的出现，但仍有建议在氯霉素治疗期间，每星期检查血常规两