以植物为宿主而演化成植物病毒，支持此假说的重要证据是许多真菌病毒与某些植物病毒的亲缘关系，比与其他真菌病毒的关系还接近，例如CHV1病毒即与感染植物的关系接近。
专一性.真菌病毒在真菌中相当普遍，在传统上真菌的四大类群：壶菌、接合菌、子囊菌与担子菌中皆有发现，且一株真菌可以同时为两种以上的真菌病毒所感染。一般认为一种真菌病毒在自然界中的宿主，大多侷限于一或数种亲缘关系相当接近、可以进行胞质融合的真菌，但也有部分真菌病毒可以感染亲缘关系较远的数种真菌，并顺利在其胞内复制，例如有些可以