一度如日中天，但没多久就陷入分裂危机，内部存在「行动派」与「和平派」两派路线争执，事件后郑自才与黄文雄都离开台独联盟；虽然台独联盟没有分裂，郑自才仍然不看好台独联盟后势发展，因为「蔡同荣、张灿鍙、陈隆志这些领头都太保守了」。四二四刺蒋案后，郑自才弃保潜逃瑞典，没多久其妻黄晴美带着儿子和女儿到斯德哥尔摩和他团聚；隔年，郑自才被引渡美国服刑，服刑完毕重返瑞典时已和黄晴美想法不同。郑自才和黄晴美离婚之后，黄晴美和子女定居瑞典，郑自才移居加拿大。1993年，郑自才在台南县山上乡台湾明德外役监狱（今法务部矫正署明