正德十年（1515年），授顺天府府尹。同年以都察院右副都御史，巡抚河南。正德十三年（1518年），晋都察院右副都御史，调抚应天。朱宸濠叛乱，李充嗣死守安庆。升户部右侍郎。正德十六年（1521年），主持疏浚白茆河，新开江口至双庙段三千五百五十六丈。官工部尚书嘉靖元年（1522年）论平宸濠之功，加太子少保。改南京兵部尚书。嘉靖七年（1528年）致仕，同年卒。后来朝廷追赠太子太保，谥康和。
事迹.宁王朱宸濠骑兵谋反后，李充嗣对尚书乔宇说：「都城守御属于公，畿辅则充嗣任之。」自领精