末期，随着日本军国主义的南进政策，日治政府开始推展「工业化台湾」的策略。开始研发的制糖相关产业，诸如无水酒精、纸浆原料及酵母等副产品，原来的单纯的食品加工业开始转变为「甘蔗化学工业」。昭和19年（1944年），凤山小港成立东亚制纸株式会社，原计画利用台湾制糖会社后壁林厂提供的蔗渣为原料制造牛皮纸，但因二战遭盟军轰炸，故最后并未能正式动工。二战后，由于台湾政府南糖北米的政策，砂糖出口仍继续为当时的台湾赚取巨额的外汇，对稳定战后的台湾经济深具意义，一直到1963年，蔗糖始终是外销产品的第一位。但1960年代