开行前往第戎、里昂、贝尔福、等地的区域列车。2018年，该站累计发送旅客数量达194.8万人次。贝桑松-弗朗什-孔泰TGV站，一般简称为“贝桑松高铁站”，位于贝桑松北部的莱欧松境内，是法国18个运营中的高铁车站之一，该铁路主要停靠长途高速列车，可通达巴黎、里昂、马赛、蒙彼利埃、斯特拉斯堡、米卢斯、卢森堡、法兰克福、弗赖堡、梅斯等地，每天早上还有一班途径巴黎戴高乐机场前往里尔的直达高铁列车。2018年，该站累计发送旅客数量64.1万人次。除此之外，贝桑松市区东南部还有一个小型的铁路乘降所——，位于上，