溪上游的龙涧发电厂，或延「能高越岭道」步行至南投庐山。入山时需先于铜门村的派出所申请入山证方可准允进入。台14线东端即是沿木瓜溪兴建之公路(现已解编)，筑至「能高越岭道」，日治时期为台湾中部重要的东西交通要道。目前跨越木瓜溪的主要桥樑有5座，由河口至源头分别为台11丙线的东华大桥、台9线的木瓜溪桥、花东线铁路的木瓜溪桥、台9丙线的仁寿桥、联络铜门村的铜门大桥等。