一个鹤田谦二参与制作的游戏企划《神罚》也中途取消，设定和画稿等资料在1999年Comic Market上以同人志方式发售。再之后担任新企划《阿倍野桥魔法商店街》的人物原案，并在动画播出之前，2001年开始《月刊Afternoon》上连载同名漫画。期间和庵野秀明建立良好的关系，在2016年庵野秀明执导的电影《正宗哥吉拉》中负责海报和插画，2020年电影《最后的情书》中，庵野秀明扮演电影中的漫画家岸边野宗二郎，电影中岸边野宗二郎创作的画稿都是鹤田谦二的作品。2000年鹤田谦二为梶尾真治的小说《回忆爱玛侬》绘