时裁撤三司，职权归户部和工部。南宋时兵役军费繁重，故又增设总领所作为户部的派出机构，专门负责数路或一路各军之钱粮征收供应，并参预军政。总领所共四处，分别为：总领所长官称「总领某处等路财赋军马钱粮」，简称总领。中央行政执行机构方面，宋朝早期，六部九寺五监被一些新设一些机构取代职权，如审官院与流内铨分别代行吏部考校京朝官和选人的职权，枢密院和三班院代行兵部考校武官的职权，太常礼院和礼仪院代行礼部与太常寺的礼仪之权，三司代行户、工部及司农太府两寺的大部分职权，审刑院代行刑部复审大理寺所定案牍之事等。直到元丰