丽国力开始削弱。
与蒙古.1231年蒙古军进攻高丽，高丽王室从松都（今开城）迁往江华岛，其后蒙古数征高丽，进行掳掠，但仍对江华岛没有办法。高丽三别抄义军抵抗蒙古和元朝军队至1273年。蒙古入侵高丽期间，高丽大藏经被蒙古人破坏。高丽高宗下令重新修复大藏经，以期待佛祖能够保佑高丽的平安。高丽内部对蒙古的入侵存在两派。文派反对与蒙古交战，而以崔氏家族为首的武派则坚持继续抗蒙。1258年崔氏政权首领被文派杀害后，蒙古与高丽达成和平协议，同意保留高丽的国家主体，高丽首都则迁回开城。忽必烈