脏内的特定代谢酶细胞色素P450-3A4(简称CYP3A4)。所以在使用大环内酯时，都会同时使用相同的酶。若同时使用其他药物则会出现代谢的问题。就如一种称为茶硷，用作治疗哮喘的药物，由于并用的问题，使得茶硷未能完全代谢。当在血液中的浓度上血，很容易会导致痉挛等副作用。另外，因大环内酯亦有引起长QT症的副作用，若在用药时同时使用令QT间期延长的药物时，会令情况更加恶化，可能会造成心率不正常死而死亡。这种药物有第二代抗组织胺药的特非那定，它同时会影响代谢率，是不能与大环内酯同时使用。其他的则有丙戊酸(帝拔癫