侧对称新建了配殿、钟鼓楼。此次扩建用时六年方告完工。此后，该寺历任札萨克达喇嘛多次小规模修缮该寺。光绪二十五年（1899年），该寺又经较大规模的改扩建，重建了正殿（即大经堂），使正殿结合了汉式和藏式建筑风格，成为二层建筑。此外，还在兴源寺以及相邻的象教寺（建于1670年）周围建起了高大的围墙，从而令兴源寺、象教寺连为一体，形成占地面积2.5万平方米的建筑群。此次改扩建工程用时三年，光绪二十七年（1901年）完工。兴源寺没有转世活佛或唿毕勒罕。兴源寺为首之喇嘛称为锡勒图库伦旗掌印札萨克达喇嘛。该缺向由