万人分配一所高中职，为全台湾最高。知名的有国立成功大学一所顶尖综合大学和位于归仁的国立阳明交通大学光电学院。还有长荣大学、真理大学（麻豆校区）、康宁大学、中信金融管理学院、崑山科技大学、嘉南药理大学、国立台南大学、台南应用科技大学、国立台南艺术大学、远东科技大学、中华医事科技大学、南台科技大学、国立台南护理专科学校、敏惠医护管理专科学校共18所大专院校。其他公立教育机构计有高级中学及职业学校52所、国民中学58所、国民小学209所。而台南一中、台南女中、台南二中、家齐高中四所高中则俗称为「台南四省中」。另有