7等位基因分佈与顺性别男性一样，与顺性别女性不同。 发表在国际跨性别主义杂志上的一项双胞胎研究发现，33％的同卵双胞胎都是跨性别双胞胎，而同一家族同时抚养的非同卵双胞胎只有2.6％，而每对中不全然是跨性别，基因不完全相同。环境因素也已经被提出。在大卫·利马的生殖器被意外摧毁之后，试图将其从婴儿时期开始到青春期的尝试失败被认为是对性别认同由养育决定的理论的反驳。Ray Blanchard开发了一种男性至女性性别转换症的分类学，该研究提出了两种截然不同的男性向和女性向病因，这些病因已引起极大争议。Sec