8月25日，英军再次出现在厦门海域，通牒“限期交出厦门”。1841年8月26日下午1时，英国侵华舰队向厦门发动进攻。同日，英军武装占据了鼓浪屿。对于道署是否在战争中就已经损毁，中英双方记载不同。在1841年农历七月二日，亲自指挥厦门保卫战的闽浙总督颜伯焘奏称，厦门沦陷前，他与时任兴泉永道的刘耀椿“俱怀带印信，分路攻击。”颜伯焘称包括兴泉永道署在内的厦门诸官署，均被英军炮火击中，烧成灰烬。 过后，钦差大臣怡良，奉旨密查厦门保卫战经过及损失。1841年农历十月二十二日，怡良奏称：英军登陆后、尚未进入厦门城内