s）是当复制、删除或反转录转移造成两个不同的编码序列嵌合在一起，而形成新的基因序列。嵌合基因常造成调节过程的改变，并可能重新排列蛋白质域来产生新的功能。直接形成机制已在酵母菌、稻米、以及人类中发现。直接形成可以从已经低度表现的可转录序列形成，终止密码子突变成其他密码子或是发生框架转移突变（frameshift mutation）时，则会形成延长的蛋白质，包含原本属于非编码序列的部份。招收非编码DNA是另一个直接形成新基因的机制。例如有果蝇（"Drosophila melanogaster"）的基因体