男性生殖器某部位可能有疾病，可以用确认。阴囊超音波可以检测到的体征，而这和精子发生受损有关，其发生睾丸癌的风险也比较高。阴囊超音波也可以检查到疑似恶性肿瘤的睪丸病变。睾丸血管化减少是睾丸扭转的特征。而充血可能是附睾炎，也可能是其他恶性病变，例如淋巴瘤及白血病。若是精索静脉曲张时，而触诊不可靠，或是在手术后检测复发或持续时间时，可以用都普勒检查评估是否有静脉曲张，不过目前还不确定检测并治疗精索静脉曲张对改善不育是否有帮助。附睾头部或是尾部的扩张表示男性生殖道的堵塞或是发炎。这些异常，以及附睾纹理的异常，也