基本设施设于一楼、月台设于二楼的高架车站。花园车站是山阴本线复线与单线区间的切换点，自本站往京都方向是复线配置，但往园部方向却是单线配置。
车站zh-tw:构造;zh-hk:结构;zh-cn:构造;.岛式月台1面2线的高架车站。同样于1996年3月完成高架化的拥有同样的屋顶特徴。2010年3月完成至为止的复线化，由于没有转辙器和闭塞号志而被定义为「停留所」等级的车站。
使用情况.2017年（平成29年）度1日平均上车人次为3,838人，是京都盆地内