处深圳湾北岸；西部宝安区和南山区的珠江口沿岸是珠江三角洲平原的一部分，有大面积的填海陆地，地势也较为平坦。全市的整体地势为东南高，西北低，多数地块属于低丘陵地，并有平缓台地相间。市区东面的梧桐山为深圳最高峰，海拔943.7米，其他山峰有笔架山、马峦山、莲花山、大南山、七娘山、羊台山、塘朗山等。广东省的最大河流珠江流经深圳西部入海，河面宽阔，而其他河流规模都较小，如：深圳河、淡水河、茅洲河、福田河、新洲河、布吉河等。深圳市域内山峦广佈，植被丰盛，农副产品种类丰富。市域内有各种果园1.43万公顷，林地8.1