威尔逊担任，下设教务、斋务两处，并迁回干河沿。西课楼悬匾额“博文约礼”，纪念包文；东课楼悬匾额“教泽宏施”，纪念文怀恩。1921年，金陵大学迁入鼓楼新校区，留下很多理化实验仪器，汇文书院钟楼、东课楼、礼拜堂、口子楼等原建筑群交由金陵中学使用至今。受五四运动影响，1922年-1927年，中国爆发了一场非基督教运动及由此引发的收回教育权运动，使在华基督教势力受到严重挑战。金大附中在收回教育权运动中没有受到大规模直接的冲击，但宗教活动渐渐地只能在凌晨或黑夜进行，参加礼拜的人数不及过去的1/10。在运动的影响下