原角龙血缘与其他角龙类接近，但因为够原始可独立成立一科，甚至可成立亚目。稍晚，原角龙科的范围扩张为：所有比鹦鹉嘴龙科先进，而比角龙科原始的角龙类。在1998年，保罗·塞里诺（Paul Sereno）将原角龙科定义为：所有血缘接近原角龙，而较三角龙远的冠饰角龙类所构成的基群演化支。塞里诺的定义使原角龙科成为单系群，但可能不包含某些传统上被认为是原角龙科的恐龙，例如纤角龙、蒙大拿角龙。以上两者现在常被分类于纤角龙科，该科大部分发现于北美洲。塞里诺在2000年将三属列入原角龙科：原角龙（"Protocerat