归正会分别开办的4所预科学校：格致书院、鹤龄英华书院、三一书院和寻源书院进行合并，组建而成。最初是租用福州仓山某俄商茶行开课。1919年，福建协和大学在东郊9千米外的魁岐村买下了一块占地1000亩的土地，聘请亨利·墨菲为新校园进行规划设计。新校园背倚鼓山，面临闽江，数年间在山脚和山腰陆续建造了文学院、科学馆（Edwin C. Jones Memorial Science Hall）及大小30座校舍，建筑面积达16万平方米，主要建筑都采用中国古典大屋顶式样。1922年学校迁入新址。1951年，传教士撤