立于1962年，涵盖范围包括云林县、嘉义市、嘉义县等县市，横跨闽南人聚集的嘉南平原地带和邹族聚集的阿里山山区。目前教区主教悬缺，教区内共有约60位神父及60位修女服务。
沿革.1913年，台湾当时为日治时代中期，教廷将台湾由厦门代牧区独立出来，成立独立管区台湾监牧区。1949年12月31日，教廷将台湾的天主教会划为台北监牧区、高雄监牧区两大管区，台湾东部分属两个监牧区管辖。1952年8月7日，台湾的圣统制度正式建立，圣座将西部平原地带的云林县、嘉义县（市）、台南市、台南县、澎湖县等