至2000年代初，每天仅余下一对旅客慢车停靠，而春运时也会有少数临时旅客列车以布吉站到发；随着广深铁路最后一对慢车8443／8444次于2003年停运，布吉站再没有旅客列车停靠。货运方面，布吉站的规模远远小于其他车站；与深圳地区其他铁路货运站相比，包括笋岗站（原深圳北站）、平湖站、平湖南站，布吉站的货运量是四个车站中最少的。截至2007年，布吉站仅办理整车货物发到，到达货物量、发送货物量分别仅为254260吨、10095吨。
改造规划.早于1995年，深圳市政府确定了深圳市中短期铁