一，承担其中7对直达旅客列车牵引任务，武昌南机务段开始配属韶山9型机车。2006年，随着京沪铁路、沪昆铁路两条干线的电气化改造先后完工，上海铁路局上海机务段、济南铁路局济南机务段、南昌铁路局南昌机务段也配属了韶山9型电力机车。2008年，京九直通车及沪九直通车（本型号机车主要负责牵引广州东站至北京西站或上海站区段、而广州东站至红磡站区段主要则由韶山8型电力机车负责牵引）改由广铁广段、京局京段或上局沪段的本型机车（改进型）牵引。而自2017及2019年起，沪九直通车/京九直通车在九广铁路以外牵引机车再全面升级