融合使所有灵魂合而为一，这是达到他的最终目的——与碇唯重逢的唯一手段。真嗣看到贰号机的尸骸后情绪当场崩溃，初号机随即展开赤红的十字架之翼，并唤回插在月球的朗基努斯之枪；随后，SEELE以初号机为媒介开始人类补完的仪式，飞行中的量产机与初号机组合为卡巴拉生命树图案，引发第三次冲击。此时试图发动补完计画的碇源堂被绫波零拒绝，绫波零吸收了碇源堂右手中的亚当并回归莉莉丝本体；之后莉莉丝转化为绫波的面容，并不断变大，最终出现在真嗣面前。朗基努斯之枪插进初号机的核心，将它转化为象征生命胚胎的生命之树。人类补完开始，