并于9月16日晚间开始侵袭且滞留台湾本岛长达49小时又20分钟，为当地带来强降雨而导致九一七水灾，为台北都会区造成继2000年象神之后最严重的淹水灾害，同时亦刷新各地测站雨量纪录，共造成94人罹难、10人失踪、经济损失高达300亿新台币（当时折合美元约8.66亿）。自台湾出海后进入台湾海崃南部、南海北部一带，受副热带高压势力影响而往西行，直扑华南地区并在当地引致零星灾害，有3人罹难与3人失踪，经济损失达6000万人民币（当时折合美元约725万）。纳莉最终深入内陆而受地形影响，9月21日在广西消散。值