行政命令的执行。即叶向高所说的“大臣者，小臣之纲。今六卿止赵焕一人，而都御史十年不补，弹压无人，人心何由戢？”但叶向高所疏基本都未被神宗回复，“然其言大抵格不用，所救正十二三而已”。
福王就藩事件.明神宗一直宠爱恭恪皇贵妃之子朱常洵，在各方压力下才立长子朱常洛为太子，封朱常洵为福王。但万历将福王长期留在京师，却有五年不给太子指派讲官，使得朝野议论纷纷。万历四十年（1612年）南京各道御史上疏：“台省空虚，诸务废堕，上深居二十余年，未尝一接见大臣，天下将有陆沉之忧。” 而叶向高说：“