始筹备设立，西藏噶厦、昌都地区人民解放委员会、班禅堪布会议厅委员会均改归其领导；此后，西藏噶厦、昌都地区人民解放委员会、班禅堪布会议厅委员会仍然均在运转，昌都地区也改由西藏自治区筹备委员会控制，从而正式归属西藏。因为安多、康区等地（中国自清朝起划入青海省、甘肃省、四川省、云南省的藏区）不属于西藏噶厦的控制范围，同时也不包括在《关于和平解放西藏办法的协议》中，均未受到协议中西藏改革需噶厦主动进行这一条款的约束，1955年12月，四川省凉山地区共党入乡即将展开时，当地爆发了部分彝族和藏族人抗拒的大规模武装骚