7年5月，苏州站一切货运业务全部迁至苏州西站办理。该站房一直使用至今，但是由于苏州经济的飞速发展，苏州站的客运规模已经突破每年1000万人次，2005年旅客发送量达到1142万人次，2006年达到1191万人次，2011年达到1429万人次，客运量位居华东地区前5，但车站等级仍为一等站。由于苏州站的规模已经不能适应苏州经济的发展，所以苏州市政府启动苏州火车站地区综合改造工程。
2009年至今.由于历史原因，苏州火车站地区长期处于设施较为落后、地区功能混乱、环境脏乱差严重的状态。整个