分教场（今云林县斗南镇重光国民小学）。1938年（昭和13年）迁至现址，1941年配合皇民化运动中进一步的日台共学制度，改制为斗南国民学校。1945年，台湾光复，台南县政府于是年11月派黄容接收此校并代理校长，次年6月派林玉泉为校长。1955年，云林县政府指定此校为办理示范工作学校。1958年分出今云林县斗南镇文安国民小学为新独立学校，1961年分出今云林县斗南镇侨真国民小学为新独立学校。1968年因九年国教实施，改制为斗南国民小学。1993年开办营养午餐。