宗教和母性的意象，例如犹太密教中的卡巴拉（Kabbalah）、生命树、基督宗教中的十字架、SEELE标志中智慧之果和蛇、展开12只光之翼的初号机（象征犹太传说（非圣经正典）中拥有六对翅膀的光辉使者萨麦尔，所谓的萨麦尔等于撒旦之说只是伪典中杜撰的），以及葛城美里和绫波丽（都有母性的象征）的形象。
其它版本MV.除了片头动画，还有两个官方版本的《残酷天使的行动纲领》的MV，分别是《新世纪福音战士》副监督摩砂雪剪辑版本的《残酷天使的行动纲领》和PS2游戏《新世纪福音战士2》片头动画的《残