气候分类法，圣克利门蒂属于地中海式气候，该地区全年平均气温为。全年最温暖的时间为8月，平均气温为，最冷的时间为12月，平均气温为。2010年年降水量为，光照时间为310天。
交通.5号州际公路加利福尼亚州段穿城而过。曾倡议将米申维耶霍（位于圣克利门蒂北偏西）连接进橙县-圣地亚哥县县际公路，该倡议计划沿着圣克利门蒂东侧穿过将公路连接至5号州际公路。但加州海岸委员会拒绝了这项提议，拒绝原因为该公路穿过州立公园、濒危物种栖息地以及美国原住民考古遗址，并可能会影响河流流势进而影响游客的冲浪