2005-2006年度收入达48.3亿先令。2006年3月，公司获得2005年“非洲年度航空公司”，是七年来第五次获此殊荣。2006年（2006年4月-2007年3月）发送旅客人数创下新高，达260万人。2007年9月4日，肯尼亚航空公司正式加入天合联盟，成为非洲第二家加入航空联盟的航空公司。公司目前的控股情况：肯尼亚民众私人股份（30.94%）、荷兰皇家航空（26%）、肯尼亚政府（23%）、肯尼亚公共投资人（14.2%）、外国公共投资人（4.47%）、外国民众私人股份（1.39%）。2007年3