当年轨道交通三号线（原称明珠线）通车运营，区内共设有东宝兴路、虹口足球场、赤峰路、汶水东路和江湾镇站。2005年12月，轨道交通四号线通车，在境内途径海伦路、临平路、大连路和杨树浦路。2006年10月，因3号线汶水东路站位于大柏树地区，同时为了与1号线汶水路站增加区分度，汶水东路站更名为大柏树站。2007年12月29日，三线两段中的轨道交通八号线正式通车，在境内设有虹口足球场、曲阳路和四平路等三个站点。其中虹口足球场站与三号线实现换乘。2010年4月，中国首条无人驾驶的全自动轨道交通线，轨道交通10号线