殿内有铜制天花板、十八罗汉洋式框架壁饰及日式神龛，中西日式齐聚一堂，这种合璧式建筑在1920年代颇为流行，南瑶宫不仅保留了当时的文化，也在建筑上享有地位。
后殿.南瑶宫的后殿又称大雄宝殿，或天公殿，1973年建成，是一座现代钢筋混凝土结构的三层楼建筑，宽12公尺，深12.8公尺，屋顶仿传统庙宇造型，上檐为歇山式燕尾嵴，饰有双龙护塔，戗嵴尾部有四只凤凰，有「凤凰来仪」之意，下檐为庑殿式。一楼供奉广泽尊王（俗称郭圣王），二楼供奉三官大帝，三楼供奉玉皇大帝，两边侧间为厨房、厕所、储藏室之