有近300个分支局和200多个办事处。质检总局对出入境检验检疫机构实施垂直管理。
中央纪委驻国家质量监督检验检疫总局纪检组.中央纪委驻国家质量监督检验检疫总局纪检组（监察部驻国家质量监督检验检疫总局监察局）是中央纪委监察部派驻机构。2016年撤销，改由中央纪委驻国家工商行政管理总局纪检组综合监督。