由妇产科医师Hon and Lee发现并在临床上运用,判断胎儿是否健康,因为在胎儿窘迫发生之前,心跳间隔的差异是最早出现变化的参数。过去二十年已有不少文献显示自律神经系统的调控与心血管疾病相关的死亡率有显着的关系，例如心因性猝死、高血压、出血性休克、败血性休克等。心率变异分析亦被发现可作为预测发生心肌梗塞后的死亡率的指标及预测末期肝癌病患的预后。
标准化.有鑑于心率变异分析以及其与相关疾病的指标的研究逐渐受到重视，为使量测方式能够趋于一致，欧洲心脏医学会与北美节律与电生理医学会成立