国会非常会议对段祺瑞临时政府的不合法地位及段祺瑞在善后会议之后召开国民代表会议的企图都进行了揭露。议员阎秉真等32人曾在国会非常会议提案要求重组临时政府。国会非常会议还称，国民会议组织法不应该由官僚性质的善后会议制定，而应当由民意机关制定。这些意见同国民会议运动不谋而合。