建集装箱货场，于1990年左右基本完工。截至1990年末南宁站设有一级二场，采用平面调车，有到发线6股（含正线）、编组线4股、存车线3股、公务车线1股、南北牵出线2条、洗车线1股以及交接线2股。1996年年底南宁站开行前往越南河内的国际列车。1997年南昆铁路建成通车，南宁成为西南地区出海通道的货物运输枢纽。不久车站新建3站台以应对不断增加的停靠列车。2000年10月，车站进行外立面改造并扩建候车室。2001年进行站前广场改造。2004年为迎接南博会召开，车站又对站房内部进行重新装修。2010年又对主站