菲律宾本地华人之中，不论其已否菲化（加入菲律宾国籍），百分之八、九十以上属闽南裔；闽南籍华人中，以原属泉州府的三邑（晋江县、惠安县、南安县）最多，大部份居住在吕宋岛，尤其是大马尼拉地区，所经营的工商业和文教事业，也以在大马尼拉地区的最为发达。原属泉州府同安县（今厦门市和金门县）、漳州府龙溪县、海澄县（今合併为龙海市）等，大多数在中部维萨亚斯地区的宿雾等地，和棉兰老岛各处。在1603年第一次吕宋大屠杀中，位于马尼拉的华人区（Parian de los Sangleyes）大约有2万名华人遭到屠杀，大部分是潮州