教上的联合也遭到英格兰教会中佔多数的主教制支持者和要求教会改行会众制的独立派支持者（Independents）如新模范军领袖奥利华·克伦威尔等人的反对。长老派在政治上较爲保守（同意君权神授，与保王党相近），与保王党相比更爲担心独立派和其他激进派别如平等派（Levellers）对苏格兰宗教事务的影响──长老派与保王党只是对教权是否独立于政权之外有不同立场。结果当查理一世在1646年投降时，部分长老派支持者──称作和解誓约派（Engagers）──转而与保王党联盟（条件是在英格兰试行长老制三年），试图协助查