院班长联席会议决议成立护校委员会，提出“恢复交通大学校名，增加办学经费”的要求。1955年，中华人民共和国国务院决定将交通大学迁往西安。1956年交通大学开始西迁。1956年，由于形势的变化，上海市委和市政府以及社会人士都感到上海仍需要一所类似交通大学的综合性工科大学。出于上海人民对交通大学的深厚感情，校名仍沿用交大建校之初时用过的“南洋”名称。南洋工学院以交大师资为班底组成，交大名教授陈石英出任筹备中的上海南洋工学院院长。1957年4月，上海南洋工学院并入上海交通大学。