5年，仓央嘉措被认定为转世灵童，并在1688年被认定为五世达赖喇嘛的转世。仓央嘉措被带到囊噶孜加，桑结嘉措委派指定的师傅对他加以教导。1697年，仓央嘉措被接到拉萨。就在途中，他与一位年轻女友同床共枕。作为对严苛的格鲁派僧戒的反叛，而且他最终成为一个酗酒者。与此同时，桑结嘉措正式对外宣布五世达赖的死讯，并派官员夏仲·阿旺雄努出使清朝，向康熙帝报告。1698年，拜第五世班禅喇嘛为师，剃度受戒，取法名罗桑仁钦仓央嘉措。10月，举行坐床仪式，仓央嘉措正式成为第六世达赖喇嘛。不过，实权一直控制在桑结嘉措手中