日本期间，庄蕴宽广泛接触中国同盟会人士，并招募了几批留日军校学生到广西武备学堂(黄埔军校前身)和广西边防军任职。1911年12月4日，江苏、浙江、上海都督于上海会议筹组政府及以五色旗为国旗方案，庄蕴宽与程德全、宋教仁、陈其美、赵凤昌支持採用五色旗。中华民国成立以后，庄蕴宽任代理江苏都督至实任都督、浦口商埠督办。1914年任平政院肃政厅都肃政史、约法会议议员，授少卿，勋三位，二等嘉禾章。1915年袁世凯称帝，庄蕴宽表示反对，并召集肃政史开会议决呈请袁世凯将帝制“迅予取消，以靖人心”。1916年4月至192