所所长、公卫学院院长；进入公部门后，曾担任卫生署署长、国科会主委、中研院副院长等职，并因担任卫生署署长期间成功抗击台湾的SARS疫情而为人所知。2015年11月16日，陈建仁请辞中研院副院长职位，宣布与民主进步党主席蔡英文跨党派（民、无）搭档参选中华民国第14届正副总统，并于2016年1月16日当选，成为中华民国行宪后首位无党籍副总统。2020年5月，卸任副总统前宣佈任期届满后将获邀回任中研院基因体研究中心特聘研究员，因再任公职依法放弃《卸任总统副总统礼遇条例》的礼遇，但其身份敏感故依《特种勤务条例》继续给