纳根在1978年出生于麻萨诸塞州的塞勒姆。他的父亲是美国海岸防卫队的一员。因弗拉纳根和家人经常搬家，所以他住在塞勒姆的时间并不长；但弗拉纳根仍记得塞勒姆审巫案和其相关话题，而他也对鬼故事和恐怖小说很感兴趣。弗拉纳根一家最后搬到了马里兰州，他也在此就读了陶森大学。他以获得电子媒体与电影及辅修戏剧学士学位的身分毕业。
职业生涯.弗拉纳根在学生时代就已开始拍摄影片，其制作的学生电影多倾向于情景剧。他后来将这些作品称为「不宜公开消费（观赏）」，但仍认为这对他来说都是「不可思议的学习经历。」