其内部形成稳定的缺少蛋白质的催化区域。研究人员另发现50S核糖体亚基中的某些核糖体蛋白质位于翻译因子结合位点处，它们的可能被用于与翻译因子产生相互作用。
功能与作用机制.50S核糖体亚基具有催化肽酰转移的活性、防止合成中的肽链被水解、为G蛋白因子（用于辅助转录起始、延伸及终止提供结合位点）并辅助合成后的肽链折叠从而形成蛋白质。
转肽.研究人员利用诱导契合说解释了50S核糖体亚基如何催化肽酰转移反应并防止肽链水解：氨基酰-tRNA进入核糖体A位点，其转运