月5日，行政院副祕书长何佩珊邀民进党立委讨论法案，赖清德不愿加入政府机关管控机制，立委坚持加入政府机关管控机制，赖清德妥协。民进党立委指出，「原本的行政院版是赖清德坚持的产物！」2017年11月9日，行政院会议通过《劳动基准法》部分条文修正草案，送立法院审查。各工会与劳工团体聚集于行政院大门，反对《劳动基准法》修恶、松绑七休一等制度。赖清德强调，一例一休实施以来「企业反映经营困难」，劳工也丧失加班机会，政府面对这些问题不该继续「视而不见」，秉持蔡英文「既保障劳工权益，也给予资方经营弹性」的指示进行修法。