孔子鸟科（学名：）是中国下白垩纪的一科原始鸟类，由4个属组成，化石形成于1亿3100万－1亿2000万年前。
分类.孔子鸟目共有1科4属5种被确认，而锦州鸟的有效性仍有争议，另有数个属可能也属于孔子鸟目。在已知的孔子鸟类中，郑氏始孔子鸟是生存年代最早者。孔子鸟科由侯连海等人（Hou "et al."）于1995年命名，包含模式属孔子鸟属，并被划分至鸟纲孔子鸟目。这一类群由Chiappe于1999年给出了种系发生学定义，他将基于节点的分支孔子鸟科（Confuciusornithi