关于rRNA转录、加工成熟的具体位置仍具争议。一种说法认爲，rRNA在纤维中心和致密纤维组分的交界点转录，并在致密纤维组分、颗粒组分中加工成熟。核糖体亚基则在颗粒组分中组装完成。除了上述功能之外，最近的研究表明，核仁亦会参与mRNA的转运与降解、信号识别颗粒（signal recognition particle，缩写爲SRP）的组装、细胞对压力的应激反应等过程。
週期性变化.核仁会随细胞週期的进行发生週期性的解构与重建。有丝分裂前期，rRNA合成停止，核仁缩小、消失，又在有丝