授二项巡抚。保大十六年（1940年9月29日），升一项巡抚，署北宁总督。保大十七年十二月二十日（1943年1月25日），升二项总督，仍领北宁总督。保大十九年正月十五日（1944年2月8日），调任太平总督。1945年3月，保大帝宣佈“越南独立”，成立越南帝国。4月28日，保大帝任命潘继遂为北圻经略使，接替北圻统使的职责，统管北圻。但潘继遂很快认识到，日本人在越南的统治比法国人更苛刻。为此，他与日本侵略者採取了消极的不合作态度，并暗中鼓励儿子潘继安与学校的越盟成员接触。1945年7月，潘继遂请求辞去