享寿74岁。柏林大学并为克拉普罗特举行了隆重的葬礼。汤姆逊对克拉普罗特的评价是：
家庭.克拉普罗特与勒克曼于1779年结婚。当时克拉普罗特36岁，而勒克曼仅18岁。他们一共生下了四个孩子，其中长男朱利斯·克拉普罗特是着名的语言学家、历史学家、人种学家、东方学家和探险家。他曾与法国汉学家暨法兰西学院首位汉学讲席雷暮沙一起用批评的方法将东亚学基础研究科学化。