巴第同盟击退了腓特烈二世的祖父红胡子腓特烈一世，现在他们发现自己正面对一位更恐怖的腓特烈。1226年，腓特烈二世发给条顿骑士团大团长赫尔曼·冯·萨尔扎一个特许状，准许其征服普鲁士。萨尔扎是腓特烈二世一生中最信赖的顾问之一。1227年性格倔强的格列高利九世当选为教皇，他的后半生都在与腓特烈二世争斗。他命令腓特烈二世立即率领十字军东征。但是腓特烈二世的十字军遇到了瘟疫，以至很快折返。格列高利九世不相信这是事实，他对腓特烈二世处以绝罚。腓特烈二世只好再次出征耶路撒冷。腓特烈二世领导的十字军是十字军东征