在另间游戏商Rocket Science Games处理一些游戏设计的部份。之后1997年强纳森·艾克利与同仁赖利·艾亨所合力创作的《猴岛的诅咒》，是他首次担任主要游戏负责开发者、以及剧本编写的作品。离开LucasArts后强纳森·艾克利前往华特迪士尼幻想工程就职，为华特迪士尼世界乐园里设计娱乐设施。之后2012年强纳森·艾克利则与先前在《猴岛的诅咒》里合作的同仁赖利·艾亨，一同设计园区的互动游戏「神奇王国魔法师」（Sorcerers of the Magic Kingdom）。