3年（1994年）5月30日，紫竹寺以书院之名成立「财团法人高雄市私立萃文书院社会福利慈善事业基金会」，从事老人养护及日间照顾、居家服务、儿少服务等社会福利事业。
祭祀.书院于创始之初主祀文昌帝君，战后向政府办理寺庙登记时则改以孔子为主神，从祀文昌帝君；民国72年（1983年）登记宗教别为儒教。