所有内阁成员立即到官邸集合。菅直人要求万全应对此次地震，并命令防卫大臣北泽俊美派自卫队进行救援。应宫城县知事村井嘉浩的要求，时任内阁官房长官枝野幸男宣布于3月11日派遣自卫队前往地震发生地区参与救灾 ，防卫省设立地震灾害对策本部。但时任日本内阁总理大臣菅直人处理福岛核能电厂事故能力失当，导致福岛核灾发生，民意支持率大跌。在野党于2011年6月2日发起倒阁案，虽然倒阁案失败，但也使时任总理大臣菅直人领导的民主党在之后的选举中接连败北，而曾经一度失去政权的日本自民党再度回归政坛核心。3月16日，已鲜有露面的