合性大学改为文理并重的全国重点大学。1978年后，逐步恢复工科、商科等撤销的科系。1980年以后，南开大学在文科重点增设了以经管类为主的应用性专业，并在此基础上于1983年恢复了经济学院，在理科重点增设了交叉、边缘和高新科技类专业。1990年代后，天津对外贸易学院和中国旅游管理干部学院先后并入南开大学。2015年，津南校区落成，与本部八里台校区、泰达校区形成“一校三区”格局，同年，原天津市第四医院整建制并入，作为南开大学附属医院。截止2018年，南开大学有26个专业学院，学科覆盖文、史、哲、经、管、法、理、