绿方面，中华民国政府人事变换举动引发泛绿阵营不满，认为泛蓝阵营趁机撤换具有亲绿背景的许世楷，并且把他当代罪羔羊来掩盖政府无能；民进党主席蔡英文则表示国民党政府对事件一开始无作为，但其后行事又太过火，反应政府处事不沉稳。东吴大学政治系副教授罗致政在《自由时报》撰文，认为由于过去台湾亲日反中的气氛，日本给予台湾许多实质利益，例如大量的日本观光客、双方的商业合作、日本给予台商的技术转移等，此次事件会让日本民间对台日友好有所疑虑，减少台湾获得这些实际利益的机会；最糟糕的情况是造成台美日无法成为军事同盟。而林浊水