藤内阁受到极大谴责，最终领导内阁的伊藤博文（同时也是《马关条约》日方缔约代表）被迫于1896年（明治29年）8月辞去内阁总理大臣一职，由黑田清隆临时代理；后由曾筹组第一次松方内阁、担任第二次伊藤内阁大藏大臣（1895年8月辞任）的松方正义继任组阁。在经明治天皇同意任命后，松方于1896年9月再度就任为内阁总理大臣。1897年12月，因增税法案问题，使松方内阁与国会关系骤降，同时内阁成员对于是否要为台湾统治腐败弹劾时任台湾总督乃木希典一事也意见分歧，导致以党魁大隈重信为首的数名阁员退任。松方不堪负荷，遂在