天主教库斯科总教区（），是罗马天主教会以秘鲁古城库斯科为中心的一个总主教区。包括库斯科大区八个省，下辖一个教区、两个自治监督区。1536年5月6日升为教区，受辖于塞维利亚总教区。1943年5月23日升为总教区。现任总主教为若望·乌加特·佩雷兹。2006年有教友1,420,000名，佔辖区总人口达96.5%。由138名司铎名管理七十六个堂区。