。《女神异闻录4》允许玩家在战斗中完全控制其他角色，这是由于《女神异闻录3》大部分负面玩家评论是游戏中其他角色只能由很傻的AI控制。由于角色关系和人物对话非常多，主角在学校生活中包含的游戏数据量非常大，以至于曾担心它可能无法装在一张光盘里。过场动画由云雀工作室制作。稻羽市的设计基于富士山旁的一个小镇。根据游戏总监桥野桂的说法，其小镇设计是《女神异闻录4》的开发者们之间充满争议的一个地方，因为每个员工都有属于自己的小镇形象。于是他们开始实地考察以确定稻羽市的设计。稻羽市不是一个有旅游景点的乡村小镇，而是一