得叔父村上天皇保护。应和元年（961年）在宫中承香殿举行笄礼仪式，叙三品。应和3年（963年），入皇太子宪平亲王（冷泉天皇）后宫。康保4年（967年）冷泉天皇即位，立昌子内亲王为中宫。冷泉天皇在位2年后退位。昌子内亲王在天禄4年（973年）立皇太后。宽和2年（986年）晋太皇太后。长保元年（1000年）去世，享年50岁。根据记载，冷泉天皇有精神异常的问题，时常发狂颠乱，但昌子内亲王应对得体，贤淑温柔，有统领后宫之能。昌子内亲王由于资建了北岩仓山大云寺观音院，因而有“观音院太后”的别称。昌子内亲王终生