内部叛乱.在帝国东部的叛乱，例如“红头”（奇兹尔巴什），在巴耶塞特任内持续多时，而且叛军时常得到波斯沙阿伊斯迈尔一世的支持，他很热衷推广什叶派，以削弱奥斯曼帝国的统治权威。当时奥斯曼帝国在安那托利亚的统治甚至出现危机，巴耶塞特的大维齐尔（宰相）哈德姆·阿里帕夏亦在镇压造反者时被杀。
其它.巴耶塞特在1492年派遣奥斯曼海军到西班牙，把那些被西班牙宗教裁判所驱逐的犹太人安全地送到奥斯曼帝国。犹太人引入新的思路，方法和技巧，对奥斯曼帝国贡献良多，在他统治下也享受