建国105年以来第一位女性总统，也是亚洲首位非出身政治世家的女性国家元首。随后，由立法院院长苏嘉全授予其「中华民国国玺」。蔡英文首次进入总统办公室后即签署林全接任行政院院长的任命令。
内政.蔡英文视台湾为一个民主国家，她批评美国联邦政府自1979年后不公平地将台湾定义为政治实体，导致台湾内部有「不同的中国观」。她于2016年8月1日原住民族日针对日治时期的皇民化运动政策，以及战后中华民国的方针，代表政府向台湾原住民族道歉。行政院在同年8月31日成立不当党产处理委员会，调查并没收中国