一恐怖袭击后，法里德·扎卡利亚曾在《新闻週刊》发表文章——《他们爲什么恨我们？》（Why They Hate Us?）。他在文章中认为，伊斯兰极端主义的根源来自于阿拉伯世界对于长期专政体制的失败，并开始尝试西方式的维新体制，产生了一个反宗教、暴利和日益全球化的社会，而一些民族主义者希望保留更多属于他们传统上的自由。扎卡利亚在2003年的伊拉克战争初期曾採取支持的态度，他曾表示“伊拉克是一个危险的地方，乱的就像一锅粥一样，美国在那里参与其中是一件好事”。当美军佔领伊拉克后，他经常在传媒上发表评论，谴责萨达