随着机车数量增加，不久之后宁布尔克、捷克特热博瓦、俄斯特拉发、日利纳、斯皮什新村、科希策等机务段也开始使用E 499.0型电力机车。这些机车经常在不同机务段之间调拨使用，但从1980年代中期以后，E 499.0型电力机车的配属渐趋稳定，主要由摩拉维亚、西里西亚和斯洛伐克地区的机务段运用。E 499.0型电力机车主要担当捷克斯洛伐克国内的快速旅客列车、轻型货物列车的牵引任务，例如普霍夫至布拉格、以及布拉迪斯拉发至科希策的长途旅客列车。1960年代至1980年代末，由于捷克斯洛伐克铁路的新造电力机车数量并无