化资产保存法》修法后，不再区分为一至三级古蹟，而採用国定、直辖市定、县市定三级。淡水红毛城改为国定古蹟。2001年，虞兆中基金会与中国工程师学会等组织共同发起「寻找台湾十大土木史蹟」活动，而红毛城则在11月30日获选为台湾十大土木史蹟。2002年，行政院文化建设委员会将以红毛城为首的淡水历史建筑群列为首批台湾世界遗产潜力点之一，红毛城管理权则在隔年7月由内政部转交至台北县政府，同时成立台北县政府淡水古蹟园区以负责营运。2004年3月起，红毛城园区开始封园整修，直到2005年11月10日才再度对外开放。在