005年9月，夷将·拔路儿出任行政院原住民族委员会副主任委员，2007年5月21日转任行政院原住民族委员会主任委员，2008年5月20日随政党轮替卸任。2007年12月27日，夷将·拔路儿带领行政院原住民族委员会前四任主任委员召开记者会，共同谴责中国国民党2008年中华民国总统选举候选人马英九涉嫌歧视溪洲部落原住民的言论。夷将·拔路儿说，他对「溪洲部落是否安全」仍持保留看法，溪洲部落仍有待正式调查是否安全，但台北县政府对新店溪的整治预计设计脚踏车道和咖啡区，显然台北县政府还有可能有很多规划方向；当记者不