月批准其病假两个月，奉天省财政厅政务暂委王永江代理。同时，王树翰辞去兼任的烟酒专卖局长职务。1917年12月，王树翰调往黑龙江省，任龙江道道尹。1919年，吉林督军孟恩远起兵抗奉。1919年7月，张作霖派鲍贵卿转任吉林督军取代之，以亲信第27师师长孙烈臣接替鲍贵卿任黑龙江督军兼任省长，并助鲍贵卿进军讨伐孟恩远。在鲍贵卿和孙烈臣交接前，王树翰暂时护理黑龙江督军兼省长。1920年，王树翰出任黑龙江省财政厅厅长。1921年5月，孙烈臣调任吉林督军，王树翰随其到吉林，任吉林省财政厅厅长。1921年7月，任吉