内务部主管的国内移民工作划归中华人民共和国农垦部管理，内务部遂撤销了移民司。1959年6月20日，第二届全国人大常委会第四次会议批准了关于撤销国务院人事局的建议，其相关工作改由内务部管理，内务部因此新成立了政府机关人事局。1968年12月，在文化大革命的背景下，中共中央批准了内务部军代表的报告，撤销内务部，将其主管的优抚、救济、行政区划等工作，分别交由财政部、公安部负责。1970年6月22日，中共中央发文，批准国务院精简机构方案，内务部在机构改革中被撤销。
机构设置.中