2003年以来一直受到迫害。其中包括绑架和杀害其宗教领袖。如果他们不放弃他们的家庭和企业，他们会受到暴力和死亡的威胁。并炸掉或破坏其教堂和其它宗教场所。而这一切都是因为伊拉克国内的反基督教情绪不断上升有关。
与普世教会关系.东方亚述教会近年来和天主教的关系有所改善。教宗若望·保禄二世和东方亚述教会牧首丁克哈四世·康翰昂尼亚，于1994年更签署一份共同的基督徒宣言。于2001年7月20日，教廷发放了一件文件，与东方亚述教会，定立名为"加色丁礼天主教会与东方亚述教会之间的圣体圣亊入门指