原名倪述祖，英文初名 Henry Nee，籍贯福建福州。1903年11月4日（清光绪廿九年农历九月十六日）生于广东汕头，当时在汕头任海关官员。倪柝声是家中的长子，倪家是福州最早的基督教家庭之一，他的祖父倪玉成（1840年－1890年）于1853年就读于公理会保福山男校，自1862年成为福州公理会最早的华人牧师之一，在铺前顶救主堂任牧师达二十八年之久，“闽中三公会（美以美会、圣公会、公理会）时常把他轮流借用。”。并且不顾当地风俗，坚持与外省人——广东人基督徒结婚。父亲倪文修（Ni Weng-Sioe，1877