949年后，车站等级上升为四等站。镇江南站的改建工程于1974年开工，投资444万元。1976年车站停办客运业务。镇江南站的改建工程1977年建成投产，称为南门货站。南门货站下辖南货场和西货场。西货场位于南货场正北叉出的原沪宁铁路旧线上，分为位于原镇江客站的零担区和位于长江边码头的江边区两部分。之后又修建了连接南门货场的焦化厂线和南山线等数条专用线。1990年，通往大港的地方铁路动工。2003年，由于车站站场叉出的沪宁铁路旧线将镇江镇区分割，严重影响当地交通。在经过当地政府和上海铁路局谈判后，将原为