免疫手术（Immunosurgery）是一种移除一个物体外层细胞的方法。在免疫手术中，材料先放置于能与特定抗原（外层细胞）结合的抗体溶液中，之后，除去未结合的抗体，再加入补体，可诱发细胞溶解，破坏外层细胞。而内层细胞因爲没有对应的抗原，补体无法在这些细胞表面形成膜攻击复合物（MAC），因而细胞也不会被破坏。免疫手术基础被用于分离小鼠以及人的囊胚内细胞群（ICM）细胞。体外培养内细胞群细胞即可取得对生命科学研究有重要价值的胚胎干细胞