1867年）被任为船政总理大臣，任内对中国的现代航海事业及洋务运动皆贡献甚大。沈葆桢除了在马尾兴建船坞，制造现代船舰以装备福建水师（同时更供应北洋海军、南洋海军其他舰队），更非常着重人材培养，建立了中国首家海军学校福建船政学堂，训练之人材中不少成为日后北洋水师与洋务实业的中坚。
台湾海防钦差大臣.
牡丹社事件.同治十三年（1874年）5月，牡丹社事件爆发，日军攻打台湾恆春，清廷闻讯后派遣时任福建船政大臣的沈葆桢，紧急前往台湾筹办防务。不久之后，清廷获知日军已登