未归顺郑氏王朝，甚至顽强抵抗郑军，导致郑成功等人认为他们受到荷兰的煽动。1661年郑成功取得部分台湾统治权。由于实施「兵农合一」政策，派遣郑军分赴各地屯垦，侵害到原住民族的活动空间，导致郑氏王朝和大肚王国发生数次武装冲突。郑氏政权灭亡后，1722年（康熙六十一年），出任巡台御史的黄叔璥在其《台海使槎录》一书中记载：「大肚山形，远望如百雉高城，昔有番长名大眉。」虽寥寥数语，却说明17世纪的台湾中部确实有一个超部落的王国。1731年（雍正九年），清廷官吏对原住民族指派劳役过多，引起原住民族群起反抗，发生大甲