没有战功，后蒙古离开，于是召还回京。次年三月，宣大总督樊继祖被罢免，授翟鹏任兵部右侍郎取代上任。但因投降者称大量入寇，加上崔鹏连乞兵饷，招致皇帝大怒，于是令其革职闲住，并罢免总督官不设。翟鹏仅做了一百天的总督。同年七月，俺答汗再次入犯山西，掠夺太原府、潞安府等。兵部请求恢复设置总督，并起用翟鹏担任故官，令兼督山东、河南军务，巡抚以下并听节制。翟鹏接受命令时，蒙古已经出塞，于是他请求调用陕西、蓟、辽客兵八支，及宣、大三关主兵，兼募土兵进行兵备，并有所斩获。嘉靖二十三年，因总兵官郄永等战功进兵部尚书