被贬窜新州。梁焘升任御史中丞。邓润甫被任命为吏部尚书，梁焘论邓润甫怯懦邪佞没有建树，不应提升。后没有得到采纳。改梁焘任权户部尚书，不受命，以龙图阁直学士知郑州。十天后，入朝任权礼部尚书，为翰林学士。元祐七年(1092)，被授任尚书右丞，转任尚书左丞。蔡京为蜀州帅臣，梁焘说：“元丰时的侍从，可以任用的很多，只有蔡京轻薄险恶贪心固执，不能任用。”又与同事议论夏国边界，意见不能协调，于是乞求去职。哲宗派亲信大臣询问他之所以去职的意思，而且令他密访人才。梁焘说“：对我信任不笃深，说话又不被采纳，而向我询问人才进