次年乌斯曼再度发动柯尔克孜族叛乱埋下伏笔。同年马仲英入侵新疆。1933年初，新疆遍地是反对金树仁的暴动，南疆也陷入动荡。马绍武部下只有回队武装步骑4个营共千余人维护喀什回汉二城和莎车、叶城等县的秩序，面临来自甘肃、逼近阿克苏、切断喀什与迪化联系的铁木尔伯克统领的维吾尔族和马占仓统领的回族军队，突厥族穆斯林也因不满金树仁而起义。2月，喀什驻军师长金树智暴病身亡，金树仁电令马绍武为喀什区行政长兼任南疆“剿匪司令”。23日，喀什城所有的建筑为庆祝马绍武上任而悬挂了南京国民政府的旗帜，衙门口还鸣放了礼炮。和田爆