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鱼类.在白垩纪－古近纪界线的上下地层，有大量的有颌鱼类化石，可供科学家研究这些海生嵴椎动物的灭绝模式。在软骨鱼纲中，有接近80%的鲨鱼、鳐目、魟鱼的科存活过这次灭绝事件；在真骨下纲中，只有少于10%的科消失。在南极洲附近的西摩岛，化石纪录显示白垩纪－古近纪界线的上层有大量的硬骨鱼死亡。科学家推论当时的鱼类曾经面临环境变动，而K-T事件应是这次环境变动的主因。但是，海洋与淡水环境，减轻了鱼类所遭受环境变动的影响。
陆地无嵴椎动物.在北美洲的14个地点，开