894年到1896年发表的巨着，其中海克尔描述了他对整个动物世界的进化和亲属关系的认识。
艺术和自然.海克尔认为生物学在许多方面与艺术类似。自然界中的对称，比如单细胞生物中的放射虫对他的艺术天赋有很大的启发。尤其着名的是他画的浮游生物和水母的画，这些图画生动地体现了生物世界的美。不论是在他的学术着作还是在他的科普着作中他都画有优美的插图。他的图画对20世纪初的艺术也有影响。新艺术运动就是从他的一些插图中获得启发形成的。海克尔在耶拿的住宅和那里的一个他资助的博物馆的建筑也体现出了