41分，飞行员向纽约航管中心回报他们在波士顿航管那听见可疑的无线电内容。此段内容是美国航空11号班机上的劫机者原本要向乘客广播，却误传到了航管中心8点47分，塔台第一次收到飞机已被劫机的讯息。异频雷达收发机的密码被更换两次但从来没被关起来过。这让航空交通管制中心可以持续的追踪飞机和飞行记录，包括高度记录。5分钟内，当飞机已完全变换航道和没有回应，塔台里没有人知道有紧急事件。尽管已通报一位乘客打电话给其母亲说他们要去驾驶舱抢回驾驶权，工作人员还是没有介入。8点58分，飞机已朝纽约市并开始在纽泽西上空从