为元帅，开始了护法战争。1918年4月10日通过《中华民国军政府组织大纲修正案》，该大元帅被七总裁代替，迫使孙中山辞去大元帅，离开广州赴上海。1920年11月，孙中山回到陈炯明控制下的广州。1921年4月，部分国会议员在广州再次召开国会非常会议（议长林森，副议长王正廷），选举孙中山为非常大总统。1922年6月陈炯明驱逐孙中山。大部分议员也离开广州赴天津、北京。
国会第二次复会.1922年4月爆发第一次直奉战争，直系曹锟吴佩孚控制北京中央政府，提出“恢复法统”，于8月1日重新恢复