了严重的心脏疾病，起初他向公众隐瞒了这点，继续履行参议院议长职责，但在一次结束会议的讲话后差点崩溃。他陪同总统前往汉纳位于乔治亚州托马斯县县城托马斯维尔的家中过冬，但很快因染上流感而返回哥伦比亚特区。1899年4月，霍巴特的疾病已是众所周知，但汉纳还是向报纸保证霍巴特会是1900年大选的副总统候选人：“除了死亡和地震，没有任何事情能够阻止副总统霍巴特再次获得提名。”副总统在自己的故乡朗布兰奇租了一套房，之后又住进新泽西州海岸一个高档度假村。医生给出的建议是彻底的休息，霍巴特于是养了两条宠物鱼聊以自娱，给其中