位评定委员会副主任委员。1984年9月，兼任复旦大学研究生院第一任院长。1986年6月，辞去了复旦大学副校长的职务。1986年9月，任国家自然科学基金委员会数学学科评审组成员。1986年10月，任复旦大学数学研究所所长。1988年2月，谷超豪任中国科学技术大学校长。1988年4月，兼任中国科学技术大学研究生院院长。1989年11月，中国科学技术大学非线性科学联合研究组成立，任组长。1989年，谷超豪、郝柏林、郑哲敏等人倡议在国家攀登计划里建立“非线性科学”项目。同年，谷超豪任《辞海》编辑委员会委员兼数学