历史.为了改善新界，特别是元朗一带的治安，警务处处长伊辅于1963年筹备兴建元朗警察总部，以取代旧有的屏山警署。1965年10月20日，伊辅主持元朗警察总部揭幕仪式，元朗警察总部为当时新界总区区内规模最庞大的新式警署，并且统率其下辖的沙田、大埔、八乡、屏山、流浮山和船湾各区的警署。
元朗袭击事件中被指阻止市民报案.2019年反送中运动期间的七二一事件中，天水围警署与元朗警署在市民被大批白衣人袭击期间无故落闸阻止市民报案，成为日后市民质问焦点。
经过.市民