十三年（649年）唐高宗李治即位，拔擢敬宗为礼部尚书，敬宗与李义府等支持武皇后，帮助她放逐褚遂良，赐死长孙无忌。显庆元年（656年）加太子宾客，官拜侍中。显庆三年（658年）进封郡公，又代李义府为中书令。显庆四年（659年）洛阳人李奉节状告太子洗马韦季方和监察御使李巢朋比为奸，唐高宗派许敬宗审理此案。龙朔二年（662年）任右相，加光禄大夫。三年（663年），拜太子少师。麟德元年（664年）进谗言，害死宰相上官仪与废太子李忠。许敬宗卒于唐高宗咸亨三年（672年），享年八十一岁，谥曰恭。着《文馆词林》。