统四年（1439年），丽正门更名为正阳门。正阳门建成时四面设门，但仅皇帝才能出正阳门南门，其他人只能走东西月墙上的侧门。万历三十八年（1610年）时，正阳门的箭楼被焚毁。天启年间，正阳门瓮城内兴建了两座庙宇，正阳门东侧的一座为观音大士庙，西侧的为关帝庙。清朝干隆四十五年（1779年），正阳门箭楼再次被焚毁，道光二十九年（1849年）第三次被焚毁。光绪二十六年（1900年），箭楼被义和团火烧老德记洋药房波及而受损，当年正阳门箭楼被八国联军用火炮击毁，城楼则被击损。当年9月，八国联军中英军的印度兵在正阳门城楼内