在发生空难前，伊斯兰堡贝娜齐尔·布托国际机场塔台已批准飞机可以降落。客机与地面最后一次联系是在它坠毁前的三分钟，飞行高度是海拔2000米。当时，机长通知地面塔台飞机已经失去了控制，飞机的油箱发生了爆炸，随即与地面失去联系并坠毁。有消息指出，出事的波音737-200型客机已经服役28年，是博雅航空公司从南非一家公司租赁的。博雅航空认为，由于飞机降落时，天空中大雨倾盆，雷电交加，飞机的坠毁可能是因为被闪电击中。 
初步调查结果.根据巴方的初步调查结果来看，事发的直接原因可能有两种，