重修了后殿延座宝殿、中殿通明殿。1990年2月23日，北京市人民政府将“大慈延福宫建筑遗存”公布为北京市文物保护单位。在拆除大慈延福宫主要建筑的时候，宫内尚有天官、地官、水官三官坐像以及文、武侍臣立像12尊。这些神像被迁入当时作为北京市文物局仓库的智化寺。这些神像都是用金丝楠木雕刻而成，妆銮，沥粉贴金。每尊神像腹内均装有用棉帛所制的脏器，并装有《九天应元雷声普化天尊说王枢宝经等经》等数百卷。后来，由于智化寺需要修复，故将这些神像迁至北京东岳庙育德殿内。
建筑.明朝及清朝时，北京