笛鲷、马鲛、棘䲠、虱目鱼、蓝子鱼、石斑鱼、剑旗鱼，其他海鲜有虾、蟹、鱿、贻贝。印尼全境都吃海鲜，但以摩鹿加群岛和苏拉威西的米纳哈萨尤为特色。烹煮方式通常为煮、炸、烤。Ikan bakar（烤鱼）是一道普遍的海鲜料理。
黄豆制品.豆腐和Tempeh（天贝）是印尼常见的素食蛋白质来源，Tempeh是使用煮熟或蒸熟的黄豆和菌种发酵制作，烹煮方式通常为煎、炒、炸，如Tahu goreng（炸豆腐）和Tempe goreng（炸天贝）。
蔬菜.印尼料理的食材中有许多