与CoA反应得到乙醯辅酶A，最后乙醯辅酶A进入柠檬酸循环产生FADH以及NADH。其中，CPT-I的反应是脂肪酸氧化反应的速率决定步骤。在粒线体中借由β-氧化将脂肪酸反应物分解为乙醯辅酶A这种具有两个碳的分子。但是，反应物若是来自奇数碳或是不饱和的脂肪酸，则必须要经过一个些微不同的反应。α-氧化是将无法进行β-氧化的分子氧化的反应方式，而肝细胞的平滑内质网则可以用ω-氧化进行排毒作用：将碳数大于20的大型碳链在仍可控制的情况下进行分解。
控制与调节.血液中的血糖浓度会影响胰