006年12月效力于北京国安少年队，2007年起进入北京国安青年队。 2009年，侯森进入北京国安一线队名单，担任杨智和张思鹏的替补。2012年初，杨智在第34届省港盃代表广东队的比赛中受伤，侯森暂时成为球队的一号门将。2012年3月6日，他在2012年亚足联冠军联赛小组赛首轮北京国安客场1比2不敌蔚山现代的比赛中首发出场，首次代表北京国安在正式比赛出场。7月份，随着杨智的伤愈复出，他又成为球队的替补门将。2018赛季，由于杨智受伤，池文一到队时间较晚，侯森在该年中超前十轮一直首发登场，但郭全博在第11