队参谋。1917年任第三特务舰队参谋以及驱逐舰如月号舰长。1918年12月1日入海军大学甲种班18期，1920年海大甲种班18期毕业，成绩排名次席，12月晋升海军少佐，任驱逐舰枞号舰长。1921年11月1日任第一水雷战队参谋。1922年12月1日调军令部第一班第一课任参谋，1923年11月10日任海军大学教官。1924年12月晋升海军中佐，任海战要务令改正委员会委员。1925年到1926年，南云奉派至欧洲与美国考察各国海军战术与装备。回国后历任砲舰嵯峨号与宇治号舰长，1927年到1929年则出任海军大学