指政府提出的方案无法符合《基本法》，并提出替代方案，按「乘客出发地」分别设出入境检查于深圳福田站及香港西九站。10月2日，行政长官林郑月娥表示政府于10月25日的立法会会议，就高铁一地两检提出无约束力政府议案。民主党和公民党表明反对。此外，尹兆坚和莫乃光原本打算在10月18日的大会上，就一地两检提出口头质询，但立会秘书处称政府已提出相关动议，主席梁君彦很大机会拒绝要求。民主派批评政府开坏先例，损害市民知情权。10月6日，运输及房屋局局长陈帆提交10月25日向立法会发言「拟稿」，批评一地两检关注组提出