阀部队改编为革命军队，以便集中指挥。7月11日，国民党中央政治委员会决定接纳巴甫洛夫的建议，成立军事委员会，并聘请巴甫洛夫为该委员会的军事顾问。 1924年7月18日，巴甫洛夫偕同其他苏联军事顾问及航空局飞机师数人乘坐广九列车赴增城考察前线情况。当晚，在东江石龙河面电船上勘察时，巴甫洛夫失足落水溺亡。8月4日黄埔军校举行追悼大会，孙中山与宋庆龄由大本营乘江固舰又亲往参加，称他为“俄国为中国自由而捐躯的第一位先烈”，并手书“急邻之难”条幅以志哀悼。 1924年12月20日在莫斯科下葬于瓦甘科沃公墓。继任者为布