九师参谋，后又担任师干部教导队队长、作战教育科科长。1931年4月，任九师参谋长，参加赣州战役、漳州战役和水口战役。1933年中央红军再次整编取消军级编制后，耿飚任红一军团二师四团团长。参加历次反围剿战争。1934年10月10日，耿飚所部作为二师先锋参加长征征途，此后参加湘江战役。1935年初，红军进入贵州境内后，耿飚率部在江界渡口强渡乌江，攻占娄山关，为红军主力开辟前进通道。遵义会议后，升任红一军团一师参谋长。继又率部通过彝族地区，抢渡大渡河，夺占泸定桥，随军抵达陕北。1935年11月，率部参加直罗镇