席次，后来他亦退出自由党，政治立场亦由亲建制派转为温和。失去立法会席次后，他淡出香港政坛，间中替商业电台主持节目，直至2005年被「封咪」。李于1998年至2008年担任全国人大代表。2003年政府搁置国家安全条例草案（廿三条）后，他以「血洗中环」形容若政府在当年7月9日二读三读该草案，场外将不免出现非常混乱的情况，甚至暴力冲突。李曾长期担任香港电台论政节目《议事论事》的节目主持，主要负责访问嘉宾，2018年荣休。2013年4月24日，李鹏飞参与由前政务司司长陈方安生牵头成立的组织「香港