至一整天都在内，人们都不知他和皇帝说了甚么。后文成帝以高允为中书令，兼着作，又以本官转太常卿，再解太常卿而以本官领秘书监，进爵为梁城侯，加左将军。
光宠四世.和平六年（465年），文成帝去世，献文帝即位。天安元年（466年），冯太后诛杀了专擅的丞相乙浑，并选任高允入禁中参与裁决朝政，又命高允与中书省及秘书省商议于郡国中设立学校事宜。高允终上奏方案：大郡设博士两人、助教四人、学生一百人 ；次郡设博士及助教各两人、学生八十人；中郡设博士一人、助教两人、学生六十人；下郡设博士及助教各一人