2月2日改造完毕，同时第二组EMU302也进厂开始改造。第三组EMU306则于同年12月26进厂改造，第四组EMU308于2009年进行改造。2010年，已有EMU301、EMU302、EMU306以及EMU308四组车已改造完成，但后来因与DR3000型柴联车改造案撞期加上改造工厂南迁南州，且改造车组的DI系统运作不稳定，使得最后四组车(EMU303、EMU304、EMU305以及EMU307)改造作业被迫暂时中断。2011年，因DR3000型柴联车改造案已完成，使得最后四组的车改造作业得以恢复进