后来，林虎、钮永建回到广西省，同广西将军陆荣廷交涉。由此，陆荣廷决定反袁，由林虎同云南的蔡锷、李烈钧联络。1915年12月，云南省爆发护国战争，陆荣廷随后响应。
反孙文的活动.林虎加入了1916年4月岑春煊在肇庆成立的两广护国军都司令部，任护国军第6军军长。其后，随陆荣廷讨伐广东将军龙济光。同年9月，林虎被任命为高雷镇守使。他还曾任广东警备军总参议。1917年，林虎被陆荣廷任命为广东陆军第2军军长。同年11月，应对龙济光的反攻，1918年春，击败龙济光军。林虎因功被任命为肇罗