真菌修复（Mycoremediation）是一个由美国真菌学家保罗·史塔曼兹创立的新词，是生物修复的一种，意指以真菌来降解环境中的污染物。真菌可分泌酵素到环境中，将许多有机污染物分解成小分子。有些真菌同时还是，可吸收环境中的重金属离子并储存在子实体中，有移除环境中的污染物与重金属的功效。
案例.分解作用是真菌在生态系中所扮演的重要角色之一，由菌丝体往体外分泌酵素达成。木质素和纤维素是植物纤维的两个主要组成部分。许多真菌可体外分泌酸性物质与酵素以分解纤维素与木质素等大分子物质，进行胞