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隐岐群岛.隐岐群岛上最初曾设置海士郡、知夫郡、周吉郡、稳地郡四郡，并设置郡役所负责行政之管理；直到1889年废除四郡，设置隠岐岛厅，隶属岛根县管辖。
吐噶喇群岛及奄美群岛.在设置鹿儿岛县后，奄美群岛就属于县府直接统治，而岛厅之下的地方行政单位则是延续过去琉球王国施行的间切，替代町村的设置。
沖绳县.明治时代最初沖绳县仍延续琉球王国时期的行政，施行间切制。