明表示「『特殊的国与国关系』既是符合现实的，也是富有创造力的说法。在相近的历史与文化脉络下，『特殊的国与国关系』更是可以不断加以丰富的开放性思考，作为建立双边和平架构的基础」。部分独派更赞扬李登辉不只为「民主之父」，更是「台湾国父」。同年民进党发表台湾前途决议文以承认中华民国的两国论为基调，作为日后的执政基础。国民党在李登辉执政时期，多半支持「两国论」，例如连战曾表示：「我们提出『特殊国与国关系论』的主张是基于维护国家尊严、保障人民权益的考量。也是表达台湾两千三百万人民的心声。这是攸关国家发展大是大非的