巴开办由红磡码头往昂坪宝莲寺的1R假日特别路线，成为屿巴第一条在大屿山以外作为起讫点的巴士路线。2002年1月2日，因应香港迪士尼乐园动工兴建，屿巴开办P1线来往青衣机铁站与香港迪士尼乐园建筑工地及36P线来往东涌地铁站与香港迪士尼乐园建筑工地。因应地铁迪士尼线启用，此路线于2005年8月21日取消服务。2007年初，因应深圳湾口岸即将落成启用，运输署公开招标两条往来深圳湾口岸至屯门、元朗的巴士路线，并于2007年6月23日宣佈，屿巴投得往来深圳湾口岸至元朗的巴士路线，编号为B2，于2007年7月1