2001年，海航兼併了山西航空、长安航空和中国新华航空。在2003年成立一家经营货运业务的扬子江快运。2004年，海航集团向民航总局申请发起重新组建旗下的航空企业，组建中国新华航空集团。新华航空的营运基地将设在北京首都国际机场。2005年，收购了中富航空的45%股权。2005年1月28日，中国政府代表六家中国的航空公司向中国航空器材进出口集团公司宣布订购60架波音787，作价72亿美元；买者包括中国国际航空公司、中国东方航空公司、中国南方航空公司、海南航空公司、上海航空公司及厦门航空公司（后来中国