辞去了总统的职务，并开始为民选总统制作准备。2005年5月2日，黄金辉由于前列腺癌再发，医治无效病逝。他有一个儿子；黄庆华（）等6个女儿、13个孙子。
第一任民选总统.2016年11月新加坡总统选举制修改宪法，总检察署报告建议李显龙总理决定第一任民选总统从黄金辉任期开始算起。