东京大学大学院理学部研究科附属植物园（とうきょうだいがくだいがくいんりがくけいけんきゅうかふぞくしょくぶつえん），一般称为小石川植物园（こいしかわしょくぶつえん），是日本东京大学附属的一个植物研究机构 。位于东京都文京区小石川（こいしかわ）。该园原先是德川幕府所设置的御用医学药草园，自明治维新起，是日本现代植物学研究的发源地。同时，也是台湾本土植物研究工作上最重要的植物园。小石川植物园中除科学代表性的活体蒐藏之外，相关的图书、仪器亦非常完备，并有一座全日本典藏量最丰富的标本馆，蒐藏的标本高达 170 万