入新疆，支援维吾尔族反抗新疆省主席金树仁。1933年，归化军等在新疆发动「四·一二政变」，盛世才取代金树仁掌控新疆政权。马仲英趁新疆政局不稳，二次进兵，与盛世才发生激战。马仲英是马麟侄子，马步芳与马步青的堂兄弟，因此蒋对马仲英是否与青马暗中合作有疑虑。陈果夫曾建议蒋密令马步芳进击马仲英，迫使马仲英改路，再令新疆省军予以迎头痛击，一股肃清。但蒋认为「密令马步芳追袭改路似应不妥，盖种族关系、回汉成见未除，恐变化当多，其内容或不如此简单耳」。
孙殿英西进青海.中原大战后，原来被阎锡山任命