在他的在位期间当中，却又相继发生明历大火与伊势神宫、大坂城等等火灾事件，各地方也多有地震、水灾等事件，因此当时的人民责备是天皇没有德行才导致天灾人祸不断，使他决心让位。也正是因为这些事件，他复制朝廷各种记录，以防备火灾，可谓其贡献。1685年过世，葬于月轮陵。由于他承继其兄皇位后，又让位兄长的嗣子，在遭遇上与淳和天皇很相似，而淳和天皇又有「西院之帝」的称唿，因此他被追封为「后西院天皇」。明治时代以后，废除了院号的使用，因此「后西院天皇」的称唿被改为「后西天皇」。