短期副作用包括了高血糖水平（尤其是糖尿病患者或使用其他增加血糖的药物，例如是），和盐皮质激素的作用，例如体液潴留。泼尼松的盐皮质激素的作用很轻微，这就是为何除非同时给予更有效的盐皮质激素，否则它不会用于治疗肾上腺功能不全之中。在某些人中，它也可能引起抑郁或是焦虑及抑郁症状。长期副作用包括库兴氏综合症、、躯干体重增加、骨质疏松症、青光眼、白内障、二型糖尿病，及随着剂量减少或停止后出现的抑郁。泼尼松也可导致。
相依性.如服用泼尼松超过７天，便会开始发生肾上腺抑制作用。最终，