战斗序列由东京大本营编成，以曾经参加过甲午战争的乃木希典作为司令官。于6月30日，日本陆军把指挥权由东京大本营移交到满洲军总司令部，至此，满洲军之组织如下：满洲军总司令官大山巖元帅陆军大将，总参谋长儿玉源太郎陆军大将。"'第一军"司令官黑木为桢陆军大将。第二军司令官奥保巩陆军大将。第三军司令官乃木希典陆军大将。第四军司令官野津道贯陆军大将。鸭绿江军司令官川村景明陆军大将。于6月8日，第三军司令部到达大连，然后与之前从原第二军中抽出的两个团（第一、第十一师团）合流。