庙与台湾大天后宫均在雍正四年（1726年），获得清廷颁赐「神昭海表」匾额，且自此凡是初到台湾的文武官员照例都会到大天后宫行展谒礼。雍正年间爆发的大甲西社抗清事件结束后，大天后宫又在雍正十一年（1733年）获颁「钖福安澜」匾。干隆年间大天后宫屡有修建，干隆二年（1737年），大天后宫被敕封为「护国庇民妙灵昭应宏仁普济福祐群生天后庙」后，干隆五年（1740年）镇标游击石良臣增建后殿左右厅，并在右厅奉祀总镇张玉麟。干隆三十年（1765年）知府蒋允焄重修并增设官厅以让致祭的文武官员有更衣之处，十年后（1775年