哈珀于2002年3月当选新任加拿大联盟党魁为止；民主代表党团大部分成员重返加拿大联盟，该组织与进步保守党的合作关系遂告终结。纵然克拉克的个人支持度不俗，他未能重建进步保守党在国内的广泛支持。他于2002年8月宣佈辞任党魁，但留任至新党魁就任为止。彼得·麦凯于2003年5月当选新任党魁，而进步保守党和加拿大联盟高层则在往后数个月就合併事宜磋商。麦凯于同年10月16日与哈珀共同宣佈达成协议，将两党合併成新的加拿大保守党。克拉克视此为加拿大联盟吞併进步保守党，又质疑新成立的保守党能否在全国建立广泛支持以抗衡自