丹后国成为一色氏的势力范围，16世纪末织田信长派长冈藤孝进攻丹后国后，一色氏臣服于织田信长，虽然丹后国南半部成为长冈藤孝的领地，但位于北半部的此区域仍属一色氏所辖。1582年一色氏在本能寺之变后加入明智光秀一方，于明智光秀战败后随之一同灭亡。1600年关原之战后，京极高知领有整个丹后国，但在1622年京极高知过世后，将丹后国划为三分，交给三位儿子分别成立、和峰山藩；此后现在京丹波市的南部区域属于峰山藩，北部属于宫津藩，西部属于幕府直辖领，设有久美滨代官所。在江户时代结束后，这些区域曾先后分属府中裁判所、