各城市向亚历山大投降，其中包含最大的城市巴比伦城。而大流士则逃往更东方米底亚的埃克巴坦那召集败兵，并且希望能再度组建一支新的军队。
波斯.从巴比伦出发，亚历山大接着朝阿契美尼德王朝另一个首都苏萨进军，并夺取该地的财宝。随后他派帕曼纽率领一半的军队沿着波斯御道朝波斯帝国礼仪上的首都波斯波利斯前进，自己则率领另一半军队经札格罗斯山区波斯门分头前去波斯波利斯。然而波斯门此时已被波斯将军阿尔塔巴左斯领军封锁，迫使亚历山大强行突破关口，抢先在波斯波利斯的波斯驻军掠夺当地财库前先到达该城。