对韩国的控制由顾问统治转为日本韩国统监府的统治。11月23日，日本政府公布了协约全文，并将此事通知与韩国有外交关系的各国政府，要它们撤走驻韩外交代表机构。在各国外交使团尚未撤离时，日本就关闭了驻汉城的使馆，成立了统治韩国的新机关——统监府，派枢密院院长伊藤博文为第一任统监，各道的日本领事馆也撤销，成立了统监府的地方机关－理事厅。《日韩保护协约》签订不久，高宗就秘密写信给美、俄、德、法4国首脑，宣布《日韩保护协约》无效。1907年，海牙召开第二届万国和平会议。高宗秘遣秘使带着高宗致俄国沙皇的书信和参加会议