8-21）不敌队友的约金·费舍尔·尼尔森/克里斯汀娜·彼德森，赢得亚军。2016年1月，卡斯腾·摩根森与玛蒂亚斯·鲍伊出战印度羽毛球黄金大奖赛，在男双准决赛以0比2（16-21、18-21）不敌马来西亚强档的吴蔚昇/陈蔚强。同年2月，他代表丹麦参加俄罗斯喀山举办的欧洲男子羽毛球团体锦标赛期间，因右脑动脉瘤破裂而进行开颅手术；手术非常成功，他在手术一周后便可下地行走。3月3日，摩根森在手术十多天后从喀山的医院返回到家乡哥本哈根，而他的夫人和爱子也陪伴在身旁，一家人共度难关。同年7月，他与玛蒂亚斯·鲍伊出战