至正二十八年闰七月二十八日（1368年9月10日），徐达率领的军队逼近大都，元顺帝夜半开大都的健德门北奔，率太子爱猷识理答腊、后妃、臣僚等离开大都。八月初二日（1368年9月14日），明朝军队从大都的齐化门攻城而入，元朝正式退出中原，回到北方草原，史称北元。八月初四日（1368年9月16日），元顺帝到达上都。至正二十九年六月十三日（1369年7月16日），明军逼近上都，元顺帝离开上都，当天到达应昌。六月十七日（1369年7月20日），明军将领常遇春攻克上都。元顺帝在上都和应昌曾两次组织兵力试图收复