.核酸分子可以吸收其他分子如蛋白质金属纳米离子、量子点（quantum dots）、富勒烯。这使得构建具有多种功能的机械变得易行。用核酸结构的自组来作为附加粒子自组的样板，控制它们的位置，并在一些情况下定位。许多方案使用共价结合的办法，用酰胺或硫醇为官能团的寡核酸链绑定异质粒子。这种共价结合的办法已经被用来把金纳米粒子和链霉亲和素分子固定在DX砖组列上。有一种非共价结合法用Dervan聚酰胺。碳纳米管以某种形状被连接到DNA组列上充当分子电子机器——碳纳米管场效应晶体管。另外，还有核酸金属化法即用金属代替