同父异母的兄弟、艾哈迈德·桑贾尔、等人争夺苏丹位。直接导致了后期帝国的分裂。青年即位的巴尔基雅鲁克加强了对帝国中心地区伊朗的控制，靠着大臣的帮助想办法扩充财源，以维持帝国日益庞大的开支。在位时期迎来了第一批十字军，在交战后，帝国仍得以控制敍利亚省的大马士革、摩苏尔等重镇。虽然他打败了马哈穆德一世、叔叔等人，家族内乱仍然无法有效解决。在与弟弟穆罕默德一世激战五次后，双方于1104年签订合约，巴尔基雅鲁克承认弟弟在北伊拉克、亚塞拜然等地的控制权，苏丹的权威受挫。隔年，劳累的巴尔基雅鲁克在伊朗的博鲁杰尔德