Alfred Chastel de Boinville）经手，兴建资金大部份是来自在东京居住的外国人捐助所得。教堂建成自初期就为日语信众和英语信众共同使用，也是培训圣职人员重地。教堂于1894年由使命教会成自治教会，并由担任主任牧师。初代红砖建筑于同年东京地震中损坏，嗣后重建之建物又于1944年东京大空袭中烧燬。现今的圣安得烈堂为战后重建，也是日本圣公会东京教区座堂。1886年，爱德华·别克司蒂（Edward Bickersteth）前往东京出任日本圣公会主教，留日共计11年。别克司蒂主教于1888年