部沦陷区汪精卫傀儡政权的首都。汪兆铭政权的江苏省省会设在苏州，民国33年（1944年）曾以徐州为中心设立了淮海省。抗战期间，中共的新四军则在江苏北部的农村地区立足，在盐城设立军部。到民国34年（1945年）战争结束时，新四军攻佔了清江浦（淮阴），作为苏皖边区政府的首府。
全面内战.战后，国民政府从重庆还都南京，而中共控制了部分苏北地区。11月30日，在淮安成立苏皖边区政府。不久，国民政府与立足东北与华北的中国共产党爆发战争。民国35年（1946年）7月，国军为保卫首都南京侧翼安全，