元年（25年）车师前国已全部吞并了吐鲁番境内诸国，交河城成为吐鲁番第一个政治、经济、文化中心。东汉明帝永平十八年（75年）后，匈奴围攻车师.匈奴与汉朝又反复争夺。戊已校尉随之几经撤回、恢复。东汉安帝延光二年（123年），西域长史班勇率兵五百出屯柳中（今鄯善县鲁克沁），攻克车师。延光三年（124年），复置戊已校尉。魏晋时期，为了躲避中国内地战乱，众多内地的汉族人口移往高昌，与当地土着融合。北凉王族沮渠氏（属于卢水胡人）消灭了车师国，450年建立了汉化的高昌国。高昌国后被柔然压迫而衰弱，其后在北方游牧民族（