收藏。冈本氏返回日本后，亦于昭和34年（1959年）将3400件藏品捐赠给福冈驻在员事务所，其后这些标本被移转至筑波市的地质调査所地质标本馆收藏，藏书则转赠末野悌六。
立碑纪念.基于冈本氏对矿物研究的卓越贡献，日本鉱物学会于昭和14年（1939年）组织「冈本翁颂德碑建设会」募得682日圆，并选择一块高105公分、宽70公分、产于日本的帽状辉长岩为碑，由工学博士若林野一郎撰文，曾任台北州知事之高田富藏书写碑题，刻成于昭和15年（1940年）。石碑原预定立于发现北投石的北投公园