长为管领细川氏的重臣，拥有阿波及山城等领地。1532年元长被细川晴元借一向宗之力杀害。时长庆年幼，因木泽长政的推荐而成为细川晴元的部属。三好长庆勇勐与冷酷都过于其父，1539年不满未获分配父亲死前的领地，率领两千五百人进入京都，最终成功，当时的将军足利义晴因惧怖长庆而逃往近江，细川晴元寻找六角定赖协助调解成功，成为摄津守护代及越水城主。之后三好长庆又击败木泽长政、游佐长教等敌对势力，而成为细川晴元最为信任的重臣。1548年（天文17年）细川氏纲叛变，长庆对内与三好政长对立。1549年将晴元和将军足利