堀秀村因功加封坂田郡6万石。但好景不常，在天正二年（1574年）时，越前一向一揆南下攻打近江时，樋口直房奉命负责防备木目城，但因为近江、敦贺援兵来不及赶到，所以樋口直房便开城向一向一揆的将领下间赖照请降。樋口直房将城池交给一向一揆后，便带着妻子逃往甲贺郡，此举被织田信长怀疑跟一向一揆内通，命令羽柴秀吉逮捕樋口夫妇并处死，其首级也被送往长岛让织田信长检视。而堀秀村作为樋口直房的主君，也遭到织田信长连坐处罚，没收领地放逐。