同于电视版结局从登场人物内心的世界=精神世界一侧描写，电视版第二十五话出现的好像是被射杀的葛城美里和赤木律子的几帧画面在剧场版有了描写。第25话［Air］的导演是原电视版的副导演鹤卷和哉，剧本出自于总导演庵野秀明之手，但演出之后的作业全面交给鹤卷负责。分镜方面，鹤卷得到了同样是原电视版的副导演摩砂雪、参与了分镜与编剧的樋口真嗣的协助。第26话［真心为你］由总导演庵野秀明本人担任演出，因此这一话充分表现了他个人的风格。甚目喜一与樋口真嗣也参加了分镜的制作。根据绪方惠美所述，影片最后的场景是模拟了庵野导演认