12月6日，专任中共青海省委副书记兼政法委书记、省委党校校长。2014年5月14日，时任中共西宁市委书记毛小兵落马后，王建军兼任中共西宁市委书记、西宁（国家级）经济技术开发区党工委书记，直至2015年5月10日。2016年12月19日，王建军任青海省人民政府副省长、代理省长。2017年1月20日，当选青海省省长。2017年10月14日，被递补为中央委员。2018年3月21日，王建军任中共青海省委书记。2018年2月24日，当选为第十三届全国人大代表。2018年8月7日，青海省第十三届人民代表大会常务