“万历三大征”军事指挥，明朝人瞿九思在《万历武功录》中评价说：“唐宋以来一大伟绩”，由此可见万历帝并非对朝政懈怠。学者常认为是由于国本之争，神宗被群臣所迫，不能立自己爱子朱常洵为储君，连选择太子的皇帝权力也失去，因而以这种方式向朝臣们示威、抗议。史学家曹国庆认为万历帝患有龋齿、牙周病和氟牙症等多种牙科疾病，颌骨发育不良，面部凹陷而左右两侧不对称。学者樊树志认为神宗疾病缠身。1958年，北京定陵的地宫被打开，万历帝尸骨“背微陀，腿部残疾”。右腿明显比左腿短。吴晗曾怀疑万历帝因身体不好吸鸦片。北洋大将吴佩孚