贝澳河被渔农自然护理署列为「具重要生态价值河溪」，贝澳其中一片淡水湿地提供栖息地予水牛及多种雀鸟，但一直饱受倾倒泥头活动破坏。
历史.考古学家在贝澳发现新石器时代的古物，表示可能在数千年前的新石器时代已经有人在贝澳居住。在清朝世祖顺治十八年（1661年），大屿山居民因为迁界令而必须内迁，复界后（1669年）才陆续返回居住。张姓老围现在仍然有一边石砌矮围墙，用来阻挡水浸时的洪水。贝澳村民以前主要以务农为生，次要为打渔。在河口，有一座建于清仁宗嘉庆四年（1799年）的天后宫，庙宇正