的齐化门攻城而入，元朝正式退出中原，回到北方草原，史称北元。八月初四日（1368年9月16日），元顺帝到达上都。至正二十九年六月十三日（1369年7月16日），明军逼近上都，元顺帝离开上都，当天到达应昌。六月十七日（1369年7月20日），明军将领常遇春攻克上都。元顺帝在上都和应昌曾两次组织兵力试图收复大都，但都被明朝军队击败。
驾崩.庚戌狗年元顺帝至正三十年、明太祖洪武三年四月二十八日（1370年5月23日），顺帝因痢疾崩于应昌，享年50岁。死后得谥号顺帝，蒙古语称“乌哈