并期待三通政策，社会舆情对此有反对意见，忧心产业西进将严重影响台湾经济。政治方面，在1999年时，时任中华民国总统李登辉提出「两国论」，两岸关系急冻，海基会与海协会的协商谈判因此中断达九年。纵然政治关系冷冻，两岸贸易依存度却逐年增长。2001年开启小三通，实现小规模的通商、通航和通邮。2003年起，中国大陆成为台湾最大的贸易伙伴，截至2008年，中国大陆已经稳居台湾第一大贸易伙伴、第一大出口对象以及最大顺差来源。2008年，国民党重新执政，两岸气氛改善，当年6月12日，海基、海协两会在北京举行协商谈