1980年代之后保护措施不断加强，但偷猎或误猎现象仍时有发生，许多白鱀豚不敌人类先进的捕捞设备，葬身于此。三峡大坝修建于长江的上游出口处，不在白鱀豚的栖息范围内，没有对白鱀豚产生直接的影响。因为约50%的白鱀豚是在由湖北省石首县长江流域的弯曲河段与武汉市上游弯曲分汉河段组成的大回水区中栖息。当三峡水库在长江上游蓄水时，这个大回水区会向长江上游方向移动，灵敏的白鱀豚豚群也会同样的跟着向上游移动；当三峡水库在长江上游泄水时，大回水区的河床受到冲刷，大回水区会向长江下游方向移动，豚群也会同样的跟着向下游移动。