日本二战投降，李登辉恢复汉姓，也恢复学生身分，决定从东京回台北。李登辉在1946年1月从九州搭乘客货轮米山丸（Yone Yama Maru）随同高座少年工返回台湾，进入由台北帝国大学改组而成的国立台湾大学就读。他搭上美军货轮「自由轮」扺达基隆港，甲板上台湾人批评国军装备破旧，疲累不堪，仪态体格差，军容完全不如威武剽悍的日军；他突然插话对大家说：「国军在这样差的装备条件下能打赢日本人，是一件非常了不起的事，我们要用敬佩的眼光来看他们才是啊。」1946年9月，本省人创办的台湾的第一所私立大学「延平学院」成立