利尼茨基起义中积极镇压哥萨克。他参与了1651年的别列斯特赫科战役与1652年的巴托赫战役。他在巴托赫战役联邦军队战败后曾死里逃生。据称他藏在干草堆里，亲眼目睹被哥萨克俘虏的几千波兰人惨遭杀戮；这样的经历让他相信与联邦的敌人妥协是不可能的。在卡尔十世·古斯塔夫于1655年入侵波兰时，恰尔涅茨基因保卫克拉科夫而声名远扬。他率领游击队员与卡尔十世的瑞军作战，而他的游击队员也被证实对瑞军的巨大火力与极高机动性很有效。恰尔涅茨基曾经多次大败瑞军，而极为着名的则是在1656年于亚罗斯瓦夫与科杰尼采取得的胜利，但也