立法局会议厅在1989年动工拆卸，改建为中座新翼，1991年完工，设计与物料与中座几乎完全一致，中座则加建低座作为行政局会议厅。1980年代末，中区政府合署渐见不敷应用，建筑署曾建议拆卸中座及东座重建为公园，西座则翻新为政府及私人办公室，花园道停车场及拱北行则重新发展为低密度商业中心，但因财政问题而未有落实。最终花园道停车场、拱北行及希尔顿酒店重建为长江集团中心，于1999年落成。香港主权移交后，中区政府合署继续作为政府总部，中座正门在1997年7月1日凌晨挂上中华人民共和国国徽及香港特别行政区区徽，取