幼敏慧，与父游三吴。干隆二十七年（1762）父方槑卒于嘉兴县梅里僧舍，葬于桐乡郭公桥，依父墓而居，事继母至孝，后因家贫入赘梅里王家。阮元慕名相招，同去杭州。
作品.方薰性高逸狷介，善绘事，笔趣直追元人，主张“设色宜清不宜重”。与奚冈齐名，称“方奚”。干隆南巡时金德舆进献的《太平欢乐图册》，即方薰所绘。书法褚遂良。着有《山静居画论》。