而永禄11年（1568年）织田信长奉义辉的弟弟足利义昭上洛。由于「永禄之变」之后前久推戴义荣，而且义昭怀疑前久参与此事。再加上前任关白二条晴良对其落井下石，结果义昭奏请朝廷，将前久流放。
解除关白职务.前久被解除关白职务后，在丹波国赤井直正的帮助下，从京都前往黑井城的下馆居住，此后在第11世本愿寺显如的帮助下移居摄津国的石山本愿寺。此时认显如的长子教如为自己的养子。信长包围网建成之后，受到三好三人众的委託怂恿显如参加了包围网。然而前久对织田信长并没有敌意，他仅仅希望将将军足利义昭和