同于健康细胞，具有不规则的形状和大小。它们具有巨大的细胞核、突出的核仁及非典型着色的细胞质。核糖体和信使核糖核酸在细胞质中积累，有膜胞器的形状、大小和也会发生变化，有些细胞器变得比正常更大、更小或不存在。HAP1细胞衍生自白血病细胞，而白血病细胞从骨髓中突变的髓样细胞发育而来。健康的骨髓细胞可产生红细胞、血小板和白血球（淋巴细胞除外）。为了使CML发育而形成BCR-ABL融合基因，将髓样细胞转变为CML细胞。
科研用途.HAP1细胞因具有单倍体特性而在生物医学研究和基因实验中非常有