10月31日，第十一届全国人大常委会第十一次会议在闭幕前决定，袁贵仁接替周济出任教育部部长。2016年6月30日，袁贵仁卸任，陈宝生接掌教育部。2016年8月31日被增补为第十二届全国政协委员，并担任政协外事委员会副主任。2018年1月，当选第十三届全国政协委员。2018年3月16日，政协第十三届全国委员会常务委员会第一次会议通过，袁贵仁任教科卫体委员会主任。
争议言论.2015年1月29日，据中国官方媒体报道，袁贵仁在出席教育部学习贯彻《关于进一步加强和改进新形势下高校宣传思