站与APM线的妇儿中心站、花城大道站一样，与花城广场地下空间（花城汇购物中心）合建。
站厅.黄埔大道站站厅的的付费区位于站厅北侧，付费区内设有一部扶手电梯以及楼梯连接站厅与站台。站厅设有多部售票机以及客服中心。同时设有一台中国银行的自动柜员机供乘客使用；与APM线除首末站等沿线车站一样，本站没有设置商店。
月台.本站设有一个岛式月台，位于花城广场中轴线的地底。
出入口.黄埔大道站仅设有一个A出入口，位于花城汇购物广场北边的风情