命为佛罗伦萨总教区正权总主教。2011年11月5日，一名男子在总主教办公室外，开枪打伤了总主教秘书腹部，并企图暗杀总主教。贝托里总主教和目击者表示，枪手说了句指了指他的枪支，但总主教无法理解他的意图。2012年2月18日，被时任教宗本笃十六世任为司铎级枢机，领科尔索大道圣玛策禄堂区司铎衔。2014年5月17日，任宗座平信徒理事会的成员。