完成。期间，菅原道真失势左迁大宰府，由三统理平转任总编纂。完成后的报告奏章中称编纂者为藤原时平、大藏善行二人。然而根据推测，编纂的实质中心为菅原道真、大藏善行二人。《日本三代实录》是六国史中记载最为详尽的一部，收录了大量诏敕和表奏文。而且每年的节会、祭祀等事情都有记载。卷15以及卷19至卷48部分，也就是贞观十年（868年）和贞观13年（873年）1月至仁和元年（885年）12月期间的写本有省略之处，全文未完成。继《日本三代实录》之后，日本曾试图继续编纂编年体史书。朱雀天皇在承平六年（936年）开设