封为汉城府尹，曾起兵反叛，最后被平，而西人党有参与仁祖反正的勋西派与没有参与的清西派，两派互相对立。仁祖二年（1624年），将军李适发动叛变，废掉仁祖，以其叔兴安君李瑅为新君，史称李适之乱。三日后，李适兵败被杀，兴安君亦被杀，仁祖复位。仁祖在位时，后金与明朝不断发生战争，朝鲜也卷入战争当中。仁祖登位后掌权的西人党却支持宗主国明朝对抗满清，满清面对明朝与朝鲜的夹击，决定向较弱的朝鲜开刀。清天聪元年（1627年）皇太极与贝勒阿敏亲自领兵入侵朝鲜，史称丁卯胡乱，朝鲜军队不敌清兵，仁祖与群臣逃往江华岛，结果朝