木志」中，就曾建议日本政府将本区列为天然纪念林。1987年台盐实业公司于好美寮湿地进行开发机械盐滩，在红树林中间设立土堤，将红树林砍除约三分之一，现今堤外的红树林今多已枯死，堤内残留的红树林仅剩25公顷，目前主要的植物多为海茄苳，再混杂着少数的苦林盘、苦槛蓝、冬青菊、滨水菜等其他植物。为了保留该地原有的溼地景观，行政院于1987年1月23日台76内字第1616号函核定实施「台湾沿海地区自然环境保护计画（北海岸、北门、尖山、九棚、好美寮）」，划设「好美寮自然保护区」 。