科·赫梅斯麾下，巴普蒂斯唐在他的首个赛季很快成为球队的常规首选。2012年11月3日，他两度助攻皮蒂帮球队2–1 客场击败马拉加， 在下一个比赛日他打进个人赛季第五球, 球队主场3–2击败塞尔塔。2013年1月,冬季转会窗开启，巴普蒂斯唐与前往诸如利物浦, 曼联, 女王公园巡游者, 利兹联以及布莱顿等球队的传言相联系, 但并未成行。2月14日, 他在经过几周休赛后的第二场比赛中他肌肉受伤。 随后他在球队主场2-1击败马德里竞技的比赛中打进制胜球， 但在四月他被又一次锁骨伤势所击倒,令他赛季提前报销。