塞尔柱苏丹击败并被叛军逼迫退位。新的皇帝米海尔七世拒绝承认罗曼努斯与塞尔柱苏丹达成的和平协议，这导致大量突厥人涌入了安纳托利亚。米海尔七世刚登基时科穆宁家族被皇帝疏远了，数年之后阿莱克修斯与他的兄弟又被米海尔七世所任用。此期间阿莱克修斯与他的兄长在色雷斯、伊庇鲁斯和小亚细亚共同抵抗敌军。1074年，由于米海尔七世克扣军费，西方雇佣兵在的领导下在小亚细亚发动叛乱。在米海尔七世派遣的多名将军败于叛军后，他启用伊萨克·科穆宁与阿莱克修斯前去迎战叛军，并通过承认塞尔柱苏丹马立克·沙阿一世对安纳托利亚的征服，换取