战争爆发后，两地先后停办。1949年中华人民共和国成立后，广州的培灵会停止举办，而香港的培灵会则于1945年日本投降后复办。早期曾在港九培灵研经会讲道的着名讲者，包括王明道、胡恩德、滕近辉、王永信、陈终道等。创办初期，培灵研经会于香港岛般含道的礼贤会举行，其后先后改为中环铁岗圣保罗堂、西营盘救恩堂、湾仔循道会及九龙城士他令道浸信会。战后因九龙循道会于加士居道的新堂落成，曾安排8月1日至8日先于湾仔循道会，11日至18日于九龙循道会举行，「港九培灵研经会」因而得名。1972年起，受林子丰邀请，港九培灵