人送回琉球，但日本认为琉球人为日本属国人民，日本以保护属国人民为由，向清朝交涉。1872年，日本宣布设立“琉球藩”，成为日本的内藩。正式将琉球纳入日本领土。1874年，日本以保护琉球人为由，派兵数千登陆台湾东岸，攻打台湾南部原住民各部落，史称牡丹社事件。后在英美两国调停下，日本退兵，清朝政府也承认日本此次出兵为「保民之举」，并向日本赔款，间接承认日本拥有琉球王国的宗主权。1875年，日本政府要求琉球藩停止向中国朝贡，并册封原琉球国王为「琉球藩王」。禁止琉球接受满清册封，废除中国年号，改为明治年号