部能专门组建一支护卫兵力；同时，日军当前的护卫制度需要前线护卫部队和运输线护卫部队进行交接，并不适应航运护卫的新形势。1942年（昭和17年）3月27日，海军大臣嶋田繁太郎海军大将发布《特设舰船部队令》，创立特设海上护卫队制度。4月2日，军令部总长永野修身海军大将向昭和天皇上奏战时编制改定，解释预定要设立的海上护卫队。4月10日，海军按照新的战时编制进行大幅度的改组，其中为了保证海上护卫的连贯性，实现护卫指挥的一元化，日军建立了伴随船队进行护卫的护航运输制度，即第一海上护卫队（负责东南亚至日本本土的航线