个车站均无客务中心，以「资讯台」及「自助客务机」代替。民主党南区区议员柴文瀚认为港铁有关安排有问题，质疑很多票务问题难单以自助客务机解决。2016年11月21日，港铁公司公佈南港岛线的票价详情，出现「短贵长平」的情况。使用成人八达通往来海洋公园站和金钟站区间的车费为5.3元港币，由往金钟车费为6.7元。其中海怡半岛站往旺角/美孚港铁收费14.2元，较同路线的巴士收费贵逾3元。而就远程车票车费方面，海怡半岛到上水或天水围的票价分别为22.6元及27.9元。港铁公司商务总监杨美珍表示，南港岛线和其他线路一样