09年2月20日，皇帝奥托四世批准条顿骑士团建造。条顿骑士团设于对面的圣伊撒伯尔医院（St. Elisabeth-Hospital）。宗教改革期间，圣雅各堂成为一座路德会教堂。三十年战争后，1648年根据威斯特伐利亚和约返还给条顿骑士团。1806年，巴伐利亚王国世俗化，没收条顿骑士团的所有建筑物。1810年，圣雅各堂成为该市第三座新教本堂区教堂。