年7月11日，《更生中心条例》生效，励志更生中心于同年8月1日收纳第一位更生中心所员。同月26日，投诉调查组通过转版审核，取得ISO9001:2000的认证。2002年10月21日，惩教署获得国际惩教及狱政专业协会首个会长荣誉大奖。同年11月1日，香港惩教博物馆开幕。2005年8月8日，青山湾入境事务中心启用。同年12月24日，域多利监狱停止运作。2006年7月14日，励新惩教所职业训练中心启用。同月20日，荔枝角惩教所启用。2008年5月28日，大潭崃惩教所停止运作，励敬惩教所启用。2009年2月