期被分入动物或植物界：好动的微生物被分入动物界，有色素的细菌（藻类）被分为植物，有些甚至被同时放入两界。后来，没有细胞核的细菌，终被独立为一界，再后来真菌也因为没有叶绿体，被分出植物界，也成为独立的一界，最后自立为界的是古细菌。然而，最新的基于生物分子的基因研究发现这种分类法又并不十分正确，因此基于RNA结构和运作机制的不同，引入了域作为生物最高的类别。现有的生物被分入原核、古菌与真核三个域。只有在真核生物中还有界的分法。真核域中分六个界：囊泡藻界、古虫界、有孔虫界、真菌界、植物界和动物界。总共十个界：