龙类恐龙。但根据中生代的鸟类化石记录，鸟类应该起源于欧亚大陆，而非北美洲。在20世纪的大部份时间，马什的分类遭到质疑，但由于化石过少，很少遭到研究。在1986年，约翰·奥斯特伦姆（John Ostrom）提出化石翼龙属于翼龙类。化石翼龙有可能属于翼手龙亚目，但因为化石过少，奥斯特伦姆无法确定其分类，只能列为翼龙目的分类未定属。至于牙齿化石，奥斯特伦姆认为牙齿是属于某种鳄形超目。但化石翼龙的化石过于零碎，无法建立出足够的鑑定特征，目前的状态为疑名。