行宰相们王抟、孙偓、陆扆害怕韩建，不敢专断政事。八月，昭宗下诏韩建参与议论朝政，韩建上表坚辞，于是作罢。韩建遣李巨川传檄天下诸藩镇，让他们把资粮运到华州行在，协助修缮京城，唐昭宗很重视他的文笔，「即时巨川之名闻于天下」。后来唐昭宗回到长安，特授予李巨川谏议大夫的头衔。901年韩建以判官司马邺为留后，但朱温军逼近，司马邺立刻乞降，司马邺还代表朱温到华州劝降韩建，并恐吓如果不投降，就要攻打韩建，韩建只好派遣时任节度副使的李巨川请降，并欲献给朱温白银三万两。已致仕的宰相张濬劝朱温杀了长期与李茂贞结盟的韩建。朱