被押在日军上海派遣军宪兵队本部拘留所。日军不允许他与家人见面，甚至连书信往来也不允许。1932年11月18日，日军通过“大洋丸”邮船将尹奉吉押送往神户，后换乘快艇押往大坂的一所监狱。该监狱位于白川义则任师长时曾管辖的区域。12月18日，尹奉吉被押往位于石川县金泽市的植田谦吉第九师团法务部拘留所。12月19日，尹奉吉被日军枪决。
葬礼与纪念.
葬礼.1945年8月15日韩国光复后，金九于11月23日回国，后会见了尹奉吉的遗属。1946年4月26日，金九出席了礼山