盐分增加，导致高蒸发地区土壤表面积累有毒盐。这需要浸出去除这些盐，并且需要一种排水来将盐带走。用盐水或高钠水灌溉可能会由于硷性土壤的形成而破坏土壤结构。
污染物.合成农药是控制农业害虫的最普遍的方法。农药可以通过土壤渗入并进入地下水，以及在食品中徘徊，导致人类死亡。杀虫剂也可以杀死非目标植物，鸟类，鱼类和其他野生动物。使用各种农业化学品，有些是通过使用，误用或无知而变成污染物。农业污染对水质产生巨大影响。农业非点源（NPS）解决方案影响湖泊、河流、湿地、河口和地下水。农业非点源