跨山梨县南都留郡富士河口湖町及南巨摩郡身延町。深度为五湖中最深，达121.6公尺，面积则是第三大，达4.7平方公里，水面标高为海拔900公尺。与富士五湖的西湖、精进湖拥有同一水脉，过去可能是同一湖泊。
其他.1984年发行的五千日圆纸币，与2004年11月改版的一千日圆纸币中，背面所印富士山下的湖面为本栖湖，由摄影家冈田红阳的作品「湖畔之春」（）制作而成。