元（小学+初中）、黄埔开元（小学+初中+高中）、增城应元（初中）和南沙天元（初中+高中）四所公办学校。习惯上将教育集团内各校统称为“大二中”或“二中系学校”。
广东教育六校联盟.2005年，学校与中山纪念中学、珠海市第一中学、东莞中学、深圳实验学校及惠州市第一中学共同结成“广东教育六校联盟”。六校之间通过联考联改、课堂同课异构、主题研讨等方式加强合作，共享教育资源。
清远二中.2014年开始，广州二中开始对口帮扶清远市第二中学。该校开设有“广州二中实验班”