勐发展，十分有影响力。这引起了当时大日本帝国政府的关注。从1921年（大正10年）起，日本政府对大本教进行镇压，史称第一次大本事件。出口王仁三郎以不敬罪、违反新闻报纸法的罪名被逮捕；但次年由于大正天皇的大葬而被特赦出狱。1924年，出口王仁三郎等6人受到中国马贼卢占魁的邀请前往蒙古传教，途中遭到张作霖的袭击，全部被捕。但后来被证实了日本人身份后，6人全部被释放，同年回国。1934年在东京九段会馆成立昭和神圣会，信众超过800万人。次年又发生第二次大本事件，大本教的大量相关人员被逮捕，建筑被拆毁，着作被禁