。1964年以前，石马河下游于东莞桥头镇陈屋边折向西，在今企石镇汇入东江。1964年续建潼湖整治工程，堵塞企石河，从企石上移河口14千米，经新开河入东江。同时建设石马河供水工程，取水东江，拦河筑坝，建一系列大型泵站，逐级提升水位，使石马河由北向南倒流入深圳水库。1965年投入使用，向深圳和香港供水。20世纪80年代以来，随着石马河流域经济的发展，生活和工业废水大量排入，使水质恶化。粤港两地政府实施供水工程第四期改造，采用供水管道，使供水渠与河道分离，2003年6月管道全线通水，石马河恢复天然流向。