方面都官从事程衞却入中护军的军营收捕羊琇属官，并从他们口中得知羊琇所犯的种种罪行，告诉刘毅并由刘毅再上奏。晋武帝逼不得已，只好免去羊琇官职。
未至公辅.任司隶校尉六年后，刘毅于太康五年（284年）迁任尚书左仆射，任内提议废除九品中正制，指九品中正制有八项损政的弊端，直指其「毁风败俗，无益于化，古今之失，莫大于此」虽然刘毅上奏后获得嘉奖的诏书，然而九品中正制始终都没有被废除。刘毅亦尽心于公事，可以整夜一直在处理公事，还一直坐到天亮等朝会开始，而言辞亦直率恳，不会退缩委婉，于是得到朝野