日渐稳固。皇帝取得的一系列军事胜利，尤其是在1137年－1138年的叙利亚战斗中，迫使安条克公国臣服帝国，大大提高了他在贵族、官僚和人民心中的地位；结果伊萨克在国内的支持者越来越少。因此伊萨克只能寻求与哥哥和解，1138年春天，伊萨克与长子约翰来到正从安条克返回的帝国军队中，见到了约翰二世。皇帝欣然原谅了他，与他一起回到君士坦丁堡，尼基塔斯·霍尼亚提斯记载“兄弟和解比战争胜利更让皇帝高兴”。但1139年，伊萨克的长子约翰叛逃到突厥人那里，不久之后，伊萨克被流放到以加防备。1143年4月，约翰二世去世，他