首条专利过海路线，但只在平日早上繁忙时间开出固定班次1班（07:00开出），且路线极度迂回（其原因鑑于屯门公路和加士居道往红隧之挤塞问题），经朗屏、新田公路、粉岭公路、吐露港公路、大老山隧道、观塘绕道、东区海底隧道、东区走廊，总站位于上环，路线长度打破368的纪录，成为当时全港最长的专利巴士路线，全程65.1公里。由于369的路线太长，若全日服务毫无经济效益，在城巴居民巴士903R及九巴369服务时间以外，天水围居民如要前往香港岛，便要乘搭轻铁或九铁巴士K2X（来往天瑞及屯门码头，已于2004年2月永久停驶