逝世和影响.1839年，身体急剧恶化的麦克雪利获许辞职，约瑟夫·洛佩兹继任乔治城学院校长。同年11月麦克雪利卧床不起，最后在12月18日与世长辞，年仅40岁。副省级会长弗朗西斯·齐泽罗辛斯基（）代理省级会长职务。医生因死因不明验尸，结果在他胃部发现引起剧痛的肿瘤。麦克雪利的遗体葬在乔治城学院耶稣会社区公墓。2015年，乔治城大学的麦克雪利大堂因学生抗议示威临时更名纪念堂，抗议原因是1838年出售奴隶一事。2017年，校长约翰·J·德吉奥亚宣布纪念堂更名安妮·玛丽·贝克拉夫特（