合计共3面5线。横滨线主要使用1－3号月台，相模线主要使用4、5号月台。但因直通运转的因素，茅崎方向往八王子的列车在5号月台发车。月台的相模原、南桥本侧有连络通道，并设有电梯与电扶梯。由于在JR集团的路线中还有另一个远在关西地区和歌山县，属西日本旅客铁道（JR西日本）和歌山线的桥本车站，为了作为区别，在长途列车的车票上，会以「（横）桥本」的方式代表本站，其中「横」字是本站所属的横滨线之意。
月台配置.以北边的侧式月台为1号月台。（来源：JR东日本:车站构内图）S