聘为大学生合唱团的成员兼指挥，在他任职期间多次演出成功。施比塔在1863年最终还是为了结业考试放弃了指挥一职，但他依然与合唱团保持联系，直到他去世。1864年7月23日他在波恩完成了他的博士论文。 1864年他定居在爱沙尼亚，并在教堂学校教授希腊语和拉丁语。在与海尔曼的信中他提到，之所以参加高级老师的国家考试，只是为了无论如何能有稳定的生活。在爱沙尼亚的这段日子里，施比塔就已经开始了对巴赫生活及其影响的研究，并于1873年完成了巴赫传记的上部。这部传记的出现引起了很大的轰动，有人评价，这部呈现巴赫生平