隶属第二行政督察专员公署。1944年12月2日，独山战役爆发，日军攻占独山县城，中国军队、美国盟军在深河桥抗击日军，最终迫使日军败退。1949年11月19日，中国人民解放军攻占独山县，改设为独山专区，独山县隶属独山专区（1952年12月独山专区改称都匀专区）。1956年8月8日，黔南布依族苗族自治州正式建立，独山县隶属黔南布依族苗族自治州。1957年，荔波县，平塘县并入独山县。1961年，三县分离。2013年7月，撤销城关镇、尧梭乡、羊凤乡，设立百泉镇；撤销麻尾镇、黄后乡、董岭乡和尧棒乡，设立麻尾镇