供奉第一世、第四世哲布尊丹巴的灵殿，还设有历世哲布尊丹巴参谒庆宁寺期间居住的拉布楞。在1937年的蒙古人民共和国的反宗教运动中，该寺主要建筑幸存下来。在执行过程中，寺院被点燃，但只摧毁了部分建筑物，主要部分未被火焚烧。此后该寺继续遭破坏。一些法器以及唐卡被僧众隐藏起来，以防止遭没收。该寺被废弃了50年。1988年起，该寺开始全面重建。 1991年，一位上师访问了庆宁寺，他是出生在鄂尔多斯的洛桑丹增·嘉措贝桑（），曾被迫先后离开印度哲蚌寺和尼泊尔，因为他批评十四世达赖禁止信仰多杰雄登。这位上师应邀出任