政府无力整治乱局，决定再次将权力交回军方；而军方又因缺乏政治经验，常常因对局部冲突等问题处理的分歧而引起派系纷争，使得南越政局动盪。当权者决定变更政治制度，改为总统制共和国家，由总统掌握实权。此制度随着1967年宪法的通过而定型，此后政府基本由阮文绍和阮高祺掌控。阮高祺出身于空军，喜爱西方文化，背后有着美国及其盟友的支持，但自1966年起，西方人士便开始怀疑阮高祺的政治才能；而他作为一名独断的领袖，也自然招致国民的不满。1967年，南越依新宪法举行总统选举，获得军方支持的阮文绍当选，而他当选后继续实行高压政