国立台湾史前文化博物馆南科考古馆（简称南科考古馆）是位于南部科学工业园区管理局旁的史前博物馆，佔地约2.44公顷，目的是保存、展示南科考古遗址出土的文物。建筑由姚仁喜设计兴建，为地下1层、地上4层的建筑物，楼地板面积1万9,000平方公尺。