「南京东路站」更名为「南京复兴站」两个特例。部分车站虽在规划阶段已有命名，但仍在正式营运前变更，包括红树林站、明德站、亚东医院站、大桥头站、南港软体园区站、南港展览馆站、信义安和站、台北101/世贸站、台北小巨蛋站。站名译音方面，台北捷运通车时，除淡水站则参考西方各国自荷西时期以来的名称Tamsui写作Tamshui、人名採用其惯用拼法外，皆採用当时惯用的威妥玛拼音或邮政式拼音译写。2003年台北市政府决定改採汉语拼音，花费约1700万元新台币将各站名拼音进行更改，淡水亦被改为Danshui，惟台北因已