，军事委员会调查统计局局长贺耀组及副局长戴笠联名将此事报告蒋介石。5月24日，蒋中正以「航空委员会主任钱大钧，贪财如命，欺上舞弊，着即免职，交军法执行总监依法惩罪。」下令将钱大钧撤职并由军事法庭审理，为「钱大钧领取特别费案」。军事法庭调阅相关档案后确定宋子文确实曾允诺核拨，因此至多是行政缺失，并不构成贪污，此案最后不了了之。该案的审判官、军令部长徐永昌认为：“实则钱所犯仅蒙蔽或是取巧一项”。不过蒋中正因此案将钱大钧冷冻了2年。民国三十年（1941）7月，钱大钧得到何应钦保荐复出，出任军事委员会运输统制局