同时亦导致许多剩余的草地、草甸及河岸湿地被永久清除。城市化土地的比例从1964年的3%增加至1988年的18%，而在1990年代，流域内的土地约有32%被城市化。在城市化的过程中，流域内多地居民赞成把其现居地组建为城市，甚或有新的城市建立，包括圣胡安 - 卡皮斯特拉诺、米申维耶霍、达纳角、尼古湖及拉古纳希尔斯等。随着圣胡安 - 卡皮斯特拉诺东部及地区的持续发展，预计到2050年，流域内约48%的土地将会被城市化。1960年代后期，邻近圣胡安溪河口的达纳角港建成，并在1971年7月投入使用。设于港口附近的