P标准，兼容菲尔·齐默尔曼开发的PGP。2000年，德国联邦经济及科技部资助了31.8万马克，用于移植GnuPG到Microsoft Windows。德国政府于2005年资助开发S/MIME。GnuPG 2.0于2006年11月13日发佈，加入了S/MIME-多用途网际邮件扩充协议（Secure Multipurpose Internet Mail Extensions. RFC 2311）。因为GnuPG 2.0的新的软件架构不支援某些用途，所以1.x与2.0是两个分支版本。