为因应2019冠状病毒病（COVID-19），而在全国实施「2019冠状病毒病马来西亚行动管制令」的防范措施。同年5月22日，马来西亚总审计长聂阿兹曼感染新冠肺炎，导致一起参加会议的慕尤丁等其他官员都必须居家隔离14天。9月18日沙巴州选举期间，慕尤丁在亚庇向选民强调，国盟政府已成功抗击新冠病毒疫情、证明治国能力；卫生部在沙巴州选举后曾建议从当地返回的民众须隔离，国防部则宣布曾前往沙巴投票的人士，在返回西马半岛时不必接受强制隔离14天的措施。9月26日选举结束后，马来西亚新冠肺炎确诊病例增加，大多数新增病例