核桿菌感染可传播至肺外，引起其他种类的结核病。这些病症被归类为「肺外结核病」。 肺外结核病常发生于存在免疫抑制的个体或幼儿，50％以上患有肺结核的HIV病毒携带者均患有肺外结核病。肺外结核病常发病于胸膜腔（结核性胸膜炎）、中枢神经系统（结核性脑膜炎）、淋巴系统（即颈部，又称瘰疬）、泌尿生殖道系统（即），以及骨与筋腱（即博特氏病；嵴柱结核性弯曲）等部位。当结核病发病于骨骼时，也被称为「骨结核病」，即一种骨髓炎。有时结核性脓肿破出皮肤导致结核性溃疡。由周围感染的淋巴结产生的溃疡常表现为无痛、缓慢扩大以及看起来像