穆萨开始着手于应付渐趋独立的巴尔干地区基督教附庸，他疏远巴尔干地区的伊斯兰官僚及商人，争取低下阶层的支持。巴尔干地区基督教附庸转而倾向穆罕默德，他是当时奥斯曼帝国军事、宗教及商界领袖。1412年，穆罕默德入侵巴尔干半岛，攻陷索菲亚及尼什，穆萨被杀。穆罕默德一世成为奥斯曼帝国的唯一统治者。穆罕默德一世须面对巴尔干半岛脆弱的政局，原先降服于奥斯曼帝国的塞尔维亚、瓦拉几亚及拜占庭附庸事实上已独立，阿尔巴尼亚各部族已统一为单一国度，波斯尼亚及摩尔多瓦已完全独立，匈牙利仍对巴尔干半岛存有野心，威尼斯控制着爱琴海海岸