港币一亿一千万元，由耀荣富鸿联营公司承建，包括楼高三层，可停泊620部巴士的维修车厂，以及六层高的行政大楼，足以应付沙田及马鞍山区在2000年以后的巴士服务发展需求。新厂房于1988年5月5日平顶，1989年3月11日正式启用。随着永久厂房落成启用后，沙田区的巴士车务便正式脱离荔枝角车厂管辖范围，自立门户。九巴车长训练学校于同年开办，并以沙田车厂为基地。2009年3月1日，所有原由屯门车厂管辖的大埔区及北区车务安排改由沙田车厂负责，同时原屯门车厂之上水分厂及大埔分厂亦改由沙田车厂管辖，沙田车厂正式统一管