比单子叶植物和真双子叶植物更早分道扬镳，成为单子叶植物、真双子叶植物和金鱼藻目的外类群。APG II分类法中没有亚纲一级的分类，这些植物一般都是包括在木兰类中，其中木兰科仍然被分到木兰目中。传统的分类法都将其列入双子叶植物，但APG 分类法将其和真双子叶植物区分开来，单独列为一个分支。根据摩尔（Moore）等人在2007年的研究，金粟兰目很可能是木兰类植物的最近姐妹旁系群，但由于这分支更早与木兰类各目植物分开，而且形态差异颇大，所以在2009年的APG III分类法之中，金粟兰目继续与木兰类分开并列