大多数被纳粹德国纳入了新建立的犹太人隔都。隔都制度难以为继：截至1941年底，犹太人已经没有任何储蓄可以付给党卫队换取食物，也没有机会赚取自己的储蓄。1942年1月20日在柏林附近举行的万湖会议，纳粹当局为犹太人的彻底种族灭绝制定了新的计划，称为“的最终解决方案”。灭绝计划的代号为莱茵哈德行动。三座秘密灭绝营专门为行动而设立：特雷布林卡灭绝营、贝乌热茨灭绝营和索比布尔集中营。除莱因哈德营外，1942年3月马伊达内克集中营添加了使用齐克隆B的毒气室；奥斯威辛和海乌姆诺等也增加了毒气室等大规模处决的设施。