发生起义，常安城一度毁于战火。至东汉光武帝刘秀定都雒阳，长安改作西京，失去了原来的全国政治文化中心地位，但仍是丝绸之路上极其重要的城市。及至汉末，汉献帝曾迁都回长安。西晋末年，晋愍帝在此短暂建都。此后长安几度又成为战争频发地，十六国时期的前赵、前秦、后秦、南北朝时期的西魏、北周等政权也都将首都设在这里。
相关遗址.目前汉长安城相关的遗址主要为：汉长安城遗址，汉阳陵在内的西汉十一座巨型帝陵（一般仅仅封土边长就有两百米左右），霍去病墓，甘泉宫遗址，司马迁墓和祠，京师仓遗址，良周遗址