流域面积广达1790.46平方公里，平均坡度为1:34。可算是台湾东部第一大河川，也是形成花东纵谷沖积扇的主要河流。主要支流有富源溪、红叶溪、丰坪溪、卓溪和乐乐溪。下游河口建有长虹桥。最着名的景点是河床中的巨大白石，称为漱玉奇景。潄玉奇石是石灰岩，由堆积在海上的生物碎屑、化石、珊瑚礁所组成，过去这个区域也是海水温度较为温暖的火山岛弧地区，受到板块挤压和地壳变动，这些火山岛和珊瑚礁被抬升出水面，形成形状各异的巨石景观。秀姑峦溪在1981年左右开始发展泛舟活动，目前依然是台湾泛舟最兴盛的区域。多