随宋子文带队的中国代表团参加在美国旧金山举行的联合国国际组织会议，并参与起草《联合国宪章》。1945年9月，任合江省政府主席兼中将保安司令，但未接收，留守沈阳并于1947年11月兼任国民政府主席东北行辕政务委员会委员，后任东北剿匪总司令部秘书长。辽沈战役沈阳陷落后吴出逃，1949年春离开上海前往台湾。后任东吴大学法学院教授及第一商业银行研究室研究员。1952年任行政院设计委员。1954年任光复大陆设计研究委员会委员。1960年任总统府参事。在政治以外领域，吴瀚涛还担任过万国道徳总会常务理事、『道徳季刊』