包括复建慧香阁、东西禅房，修缮工程包括修缮天王殿、垂花门、大殿、东西配房、东西配殿、东西碑亭、塔台、御路、庭院、外管线等等。新建及修缮房屋总计110间（其中修缮36间，新建74间）、构筑物3座，总建筑面积3484平方米。在此次复建修缮工程中，中国藏语系高级佛学院的领导班子坚持“保护重于修缮”的理念。比如，中国藏语系高级佛学院有关负责人发现慧香阁的老台基为清朝干隆年间的原物，便同文物部门联系，最后使老台基获得保留，西黄寺工程项目组为此在慧香阁前立下一块石碑，碑文称慧香阁是21世纪建筑，但慧香阁的台基为干隆