朱邦桢是万历十九年（1591年）的举人，三十二年（1606年）成进士，获授新淦知县，提出容许船户解除当地民困，擒拿大盗数十人，又修建便民仓、凿桂湖便利民众。同时他和当地诸生谈论经义，着有《金川会课集》，之后迁任大理寺右评事；三十九年升右寺副，四十一年升夔州知府，四十八年升广西副使，本年养病。弘光年间出任广西副使，南京失陷后与申绍芳、郭忠宁同期去世。