鹏此时已思想左倾。1949年周慎源当选师院学生自治会会长，林希鹏担任学生自治会理事，参与学生运动。林希鹏由化学系陈金目吸收加入学工委师院支部，1949年四六事件发生，许多学生于事后逃离学校，周慎源与林希鹏经张志忠指示赴新竹协助简吉在新竹地区发展组织，后陈福星接手新竹区工委会，林希鹏出任台湾省工作委员会新竹海岸地区支部书记，化名老李，周慎源与陈福星发生路线之争一度出走，后与林希鹏联系上而回归省工委。林希鹏担任书记期间接受黎明华指示在新竹、桃园一带推动新农会，并吸收农民加入组织，并将组织发展到观音及新丰等地