浅井家为防备织田家的来袭，新建长比、苅安两处城砦并交给堀秀村跟樋口直房镇守。但在织田家臣竹中重治的劝诱下，樋口直房接受其策反，并说动堀秀村一同改投织田家。堀秀村也在元龟二年（1571年）2月又劝降浅井家臣岛秀亲改投织田家。同年5月，浅井长政派遣家臣浅井井规进攻鎌刃城，多得横山城守将木下藤吉郎及时驰援，堀秀村顺利击退浅井军（箕浦之战）。天正元年（1573年），在浅井家于小谷城之战灭亡后，堀秀村因功加封坂田郡6万石。但好景不常，在天正二年（1574年）时，越前一向一揆南下攻打近江时，负责防备木目城的樋口