西班牙和意大利等国的沿海村镇深受其扰，居民纷纷迁往内陆，直到19世纪才有人返回定居。17世纪末，欧洲各国的海军逐渐崛起，开始驱逐北非沿岸的巴巴里海盗，使得海盗活动开始减少。但未受到海军保护的海岸和船只依然不时受到巴巴里海盗的侵扰。19世纪初，发生了第一次巴巴里战争和第二次巴巴里战争，此后，经过维也纳会议的协商，欧洲各国开始共同打击巴巴里海盗，并取得了显着成效。1830年，随着法国占领阿尔及尔，巴巴里海盗失去了活动的根据地，被彻底剿灭了。