1945年5月末，大殿毁于台北大空袭。1927年恭奉于殿中的黄土水作品《释迦出山像》遭毁。
战后时期.庙址为广州街211号。曾为国军宿舍、国文国语讲习所等，1951年指定为名胜古蹟。1953年，仕绅黄启瑞、黄玉对、黄崇西、周百鍊等发动重修大殿，由黄启瑞、黄玉对分任筹备委员会正副主任委员。此次为王世南掌稿尺，因他为为王益顺姪孙，图稿相传，所以大致维持原貌及规制。其飞檐上装饰八仙过海、圣兽飞禽等栩等剪黏，《三国演义》、《封神榜》、唐明皇游月宫等历史故事都是檐下彩绘的素材，殿顶斗拱是