八个孢子是在胞质融合与发生后，经由一次减数分裂与一次有丝分裂所产生，其中减数分裂使双倍体的细胞核分裂为四个单倍体的细胞核，这四个细胞核再各自进行有丝分裂而形成八个细胞核，并分别为子囊中的分泌物所包覆，因此一个子囊通常有八个子囊孢子，但此数目仍有例外，如冬虫夏草的子囊可有多达20-60枚子囊孢子，酵母菌的子囊通常只有1-4枚子囊孢子，块菌的子囊也通常只有四枚子囊孢子。酿酒酵母在与醋酸盐囊孢琼脂（acetate ascospore agar）上培养时会形成子囊孢子，其子囊呈圆形，不同于子囊菌典型的长形子囊，