任监察御史，弹劾四川巡抚王维章贪污劣行，请求召还给事中章正宸，未得接纳。不久巡按云南，回朝时说：「陛下提议再征一年税收，民力已枯竭，讨贼大臣懈怠涣散，浪费百万金钱。」崇祯帝采纳，命兵部飞骑要求熊文灿进攻，但张献忠已反叛；其后因论事迁任浙江按察使，再陞任江西巡抚。张凤翮为人倜傥，曾说：「不先在家乡立功，怎能在天下立功？」故此发迹后开建城东新堰，又修筑南乐义堡，并建议实行丁随粮行。到崇祯十五年（1642年）迁浙江右参政，惟未任而罢官；李自成攻陷城固，威胁他出仕，他拒绝而被杀。