政府、市政协、市监察委五套班子。此外，还设有司法机构肥城市人民法院和人民检察院。肥城市境内共有八个合法政党，包括执政党中国共产党和除台湾民主自治同盟外的七个民主党派。至2017年，肥城市境内民主党派共有党员69人，其中中国民主同盟、中国民主建国会、九三学社和中国致公党在肥城市境内设有党组织。中国共产党肥城市委员会为中国共产党在肥城市设置的党委组织，其前身为1927年北伐战争期间在肥城县设立的党支部。1938年，中共肥城县县委成立。2002年肥城市委共设置7个工作部门和2个部门管理机构，核定编制人数为14