留下子嗣便去世了，埃斯特家族的直系后裔就此断绝，继承权来到阿方索一世的另一位孙子，同时也是阿方索二世的表弟的切萨雷·埃斯特手上，但这个继承权是经由鲁道夫二世的承认而非罗马教宗所承认，因此费拉拉被教宗国经由武力纳入其领土，虽然如此，埃斯特家族仍保有摩德纳和雷焦的统治权。