领行政院行动中共有61人因为侵入行政院而遭到警方逮捕，其中有26人在经过问讯后释回，另外还有35人则转交由检察官进行复讯。检察官讯后谕令18人限制住居，3人无保请回，13人获2万元到3万元交保。被警方视为佔领行政院主导人魏扬在3月24日凌晨随即遭到台北市政府警察局刑事警察大队特勤中队逮捕，之后在下午台湾台北地方法院检察署以妨害公务等6项罪嫌并且有串供疑虑而向台湾台北地方法院声请羁押。但之后由于立法院的学生代表召开记者会表示魏扬并非策画佔领行政院者，而是在佔领后到场协助场内学生维持秩序；此外亦有魏扬友人于社群