世民发动玄武门之变，杀死李婉顺的父亲皇太子李建成及四叔齐王李元吉，对唐高祖声称二人作乱伏诛，迫使唐高祖追废李建成、李元吉为庶人，并下诏以秦王处分军国事。李建成的五个儿子即李婉顺的兄弟们皆被诛杀，并除宗籍，李元吉的五个儿子亦然。李世民不久被立为皇太子，入住东宫。虽然政变中李建成、李元吉的女性亲属与后代并没有因血统被杀，但史书中没有李建成、李元吉妻妾、女儿在此后处境的明确记载。她的嫡母太子妃郑观音在唐高宗时期死于长安皇宫，而四叔李元吉女儿李令的墓志则提及唐太宗对李令“恩加鞠养”。李婉顺可能如同她们一样，在玄武门