萧万长不赞同总统府授意出任外交部长的人选驻英代表简又新，胡被任命为外交部长至1999年，期间参与处理“两国论”。1999年，921大地震发生时，正当世界各国迅速派遣搜救人员并提供技术和财务援助时，中共却阻挠这些国际救难队和救援物资抵台湾。胡志强表示俄罗斯的救难队921当天要从莫斯科经蒙古飞越中共领空驰台救援，却遭中共阻挠拒不提供俄方申请的航道，迫使搜救队飞机辗转在西伯利亚的伊尔库斯克与伯力加油，因绕道日本而晚了12小时抵台（22日下午四时），延误不少救灾的黄金时机。胡志强表示中共在台湾发生大地震期间，仍