排毒效能遭到抑制，进而导致废物累积。
Tau蛋白假说.Tau蛋白假说认为Tau蛋白异常是引起阿兹海默症病情发展的主因。在这个模型中，的Tau蛋白会开始与其他Tau蛋白质配对结合，结果在神经细胞中形成了。在这种情形下，神经细胞内的微管开始瓦解并导致由细胞骨架构成的运送系统崩坏，这将造成神经细胞之间的化学讯息沟通失效，接着导致神经细胞死亡。
其他假说.新生血管假说认为血脑屏障功能减低也可能和阿兹海默症有关。阿兹海默症患者细胞内外（如铜、铁、锌离子）会不平衡