后虽听信吕超弟吕邈劝言与其结盟，但吕超还是将其杀了。随后，吕超让位给吕隆，吕隆虽不愿也被逼接受，于是即天王位。吕超官拜使持节、侍中、都督中外诸军事、辅国大将军、司隶校尉、录尚书事，封安定公。吕超又垂涎杨氏美貌，想纳其为妾，惟杨氏不肯并自杀。同年，后秦姚硕德攻凉，吕超等迎战但大败，吕隆只得婴城固守。不久，魏益多煽动人心，打算杀吕隆兄弟，事情泄露后诛杀了三百多家人。其时群臣都求吕隆与后凉修和，吕隆最初不愿，但在吕超劝说下还是请降。神鼎三年（403年），吕隆逼于南凉和北凉的攻击，就派吕超带着珍宝请后秦派军