下，IMF开始了对韩国的救济。在这种背景下，1998年6月，时任首尔市长姜德基要求对韩国的地下铁规划作出全面检讨。地下铁3期的动工计划暂停，很多路线的规划也发生了重大变化。最终在1998年9月批准3号线延伸段、9号线开工建设。而11号线部分区段则改为了新盆唐线，其他路线则重新修改变为了首尔轻电铁和广域电铁的其他路线，并作为连接首尔地下铁1期和首尔地下铁2期的支线用途。9号线的建设方式改为BOT模式，并在2001年正式开工建设。3号线的水西站至梧琴站的走向也在2002年正式确定，并最终于2004年开工建设。