分治葡萄牙性质的《枫丹白露条约》，戈多伊获封阿尔加维亲王，统治葡萄牙南部的“阿尔加维亲王国”。因拿破仑·波拿巴希望令其兄约瑟夫继承西班牙王位，西国国内出现暴动。1808年3月，法军入侵西班牙，戈多伊、卡洛斯四世和玛丽亚·路易莎王后一同出逃，居于法国。费尔南多七世率波旁王室复辟后，禁止戈多伊回国，并没收其财产，至1844年才解除该禁令。1847年，伊莎贝拉二世宣布恢复其头衔，并归还其被没收的部分财产。1851年，戈多伊于巴黎逝世。