然后送给达赖。达赖感觉不适，便求助于乃琼护法。乃琼护法发现了靴底的符咒，经过一系列线索进行追查，最终发现了第穆的阴谋，这就是妖鞋事件。1899年，第穆狱中圆寂，有人说第穆自害，有人说第穆被饿死，也有人说第穆被溺死，达赖却说并未处死或赐死第穆，而是第穆在谨慎处分中自己病死，但从此禁止第穆唿图克图转世。
英国入侵和首度流亡.1897年，西藏政府在边界捕获英国军官，他们自印度偷偷潜入藏印边界，绘制地图。土登嘉措相信这是英国侵入西藏的前兆，阿格旺多杰向土登嘉措建议西藏向俄罗斯寻求保护。