成为1970年代以来，除毛泽东以外唯一一位遗体得以保存的党和国家领导人。十世班禅的突然去世引发了许多传言和猜测。西藏司政洛桑森格表示：「51岁的十世班禅仁波切在西藏日喀则扎西伦布寺的德庆格桑颇彰新宫，不明不白地突然圆寂。」第八世阿嘉唿图克图阿嘉·洛桑图旦·久美嘉措（阿嘉仁波切）于其自传《顺水逆风》（Surviving the Dragon）中表示当时人们对班禅大师于1989年「突然离去」，早就疑惑重重。中国持不同政见者袁红冰在2011年宣称十世班禅死于政治暗杀；2013年，他与藏汉双语诗人、藏学研究者安