诸臣议者九十一人当署名，王直有难色，陈循持笔强求，不得不连署，于是皇太子更换。王直遂兼任太子太师。王直顿足长叹惭愧。不久明景帝之子去世，王直、胡濙等大臣请求恢复沂王为皇太子，并推举商辂草疏。提议未呈上时，石亨、徐有贞等人发动夺门之变，迎明英宗复帝位，并杀王文等人。疏草留在姚夔居所，尝出示给郎中陆昶，叹道：「是疏不及进，天也。」王直遂乞休，明英宗赐玺书、金绮、楮币，给驿归。
晚年.王直为人仪观甚伟，性情庄重，不茍言笑。在翰林二十余年，古代言编纂纪注之事均多出自他手。其与金溪王英齐名，