N2）等四种辅助蛋白（在大鼠涎泪腺炎病毒中的名称为NS2、15k、12.6k与7b；在龙泉罗赛鼠冠状病毒中的名称则为2a、5a、5b与N2），其基因顺序为1ab－2a－HE－S－4－5a－E－M－N－I，其中5a与5b蛋白是由同一个mRNA编码，I的开放阅读框位于衣壳蛋白N的开放阅读框之中。这些辅助蛋白可能具有对抗宿主免疫反应的功能，辅助蛋白NS2（由2a基因编码）有2′,5′磷酸二酯酶的功能，可将细胞中的2′,5′-寡腺苷酸（2′,5′-oligoadenylate）降解，避免其活化细胞中的而启动分解病毒