上层的旧金山轻轨路线在市场街地铁隧道西南端接上更古老的双峰隧道，而东北端则从地下爬升至地表，接上内河码头周边的路上轻轨。内河码头隧道口（Embarcadero portal）启用于1998年，并非隧道原始的一部分，目前由N线及T线使用。K线、L线、M线与T线等轻轨路线走完隧道全程，直接衔接双峰隧道；J线与T线则从位于教堂街与杜伯斯交叉口附近的杜伯斯隧道口（Duboce portal）离开隧道。
市场街地铁所设车站.地铁隧道中共有7座车站，BART使用其中4座；7座中有5座由旧金山轻