万延元年（1860年），正邦设置了明亲馆，又曾经在幕末时期担任老中。鸟羽伏见之战时，从京都撤退的幕府军原本希望以淀城作为据点，但是淀藩紧闭城门，未有让幕府军进城。1869年，版籍奉还实施后，正邦就任为，两年后废藩置县，淀藩改组为淀县，在同年11月併入至京都府。
领地.淀藩虽以淀城为藩厅，但是在山城国的领地却并不多。以稻叶氏时期为例，当时淀藩在山城国的领地不过约19,347石，其余领地分别位于摄津、河内、近江、越后和下总，进入幕末后领地变得更加分散。虽然藩政施行因此而变得非常艰难，但