大力赞助艺术和科学，创立了格林尼治皇家天文台，并支持皇家科学会的成立，其成员包括知名的罗伯特·胡克、波义耳，以及艾萨克·牛顿。查理对科学的支持，间接促成英国科学革命的开花结果：牛顿于1687年发表 《自然哲学的数学原理》。查理也拔擢深具才干的建筑师克里斯多佛·雷恩，命其为伦敦重建的总策画人；1682年为了让退役士兵有家可归，他也命雷恩建造知名的切尔西皇家医院。为了增加国家的收入，并促进英国的海外殖民与商贸，查理二世继续推行重商主义，鼓励贸易特许公司的设立与扩大。1660年查理设立皇家非洲公司并授与特许状