。汉成帝即位后，匡衡与御史大夫甄谭上疏弹劾石显专权。王尊却上章弹劾匡衡和甄谭，直言丞相、御史以前对石显一味地曲意迎合，实为一党，应一起治罪。匡衡因此提出辞呈，有御史丞劾奏王尊污辱宰相，贬为高陵令，顾全匡衡等面子。王尊赴任数月，因病辞职。后来帝舅大将军王凤召入为谏大夫，再推举为京兆尹。王凤当时辅政，王尊虽为王凤所举，却不亲附凤。又被诬陷免官，吏民很替他惋惜，湖三老公乘兴等上书讼尊，再担任徐州刺史。卒于官。