393年特尔诺沃陷落，保加利亚最后一任沙皇伊凡·希什曼在尼科波利斯的要塞上支撑大局，直至1395年被奥斯曼人征服，伊凡·希什曼被俘，因此尼科波利斯在这两年间都被视为保加利亚的首都。1396年的尼科波利斯战役也在这里发生，那是中世纪时期最后一次大规模的十字军东征，匈牙利王国国王西吉斯蒙德及法国骑士领导的欧洲基督教联军被奥斯曼帝国巴耶济德一世及其盟友塞尔维亚王国斯特凡·拉扎列维奇击败。在奥斯曼统治下，尼科波利斯发展成重要的军事和行政中心，拥有坚固的要塞，经济、宗教及政治活动蓬勃，直至17至18世纪趋向末落。