形丰富且低山、丘陵众多，这使得肥城市境内植物资源较为丰富。根据肥城林业部门于1980年的调查，肥城境内可利用的植物有104个科、450种。其中蕨类植物9种、裸子植物10种、单子叶植物和双子叶植物各有96种和335种。肥城农林资源中，桃、杏、甜瓜、西瓜、颜晚菘、赛川椒都为特产。全市森林覆盖率为41%，其中康汇平原林木覆盖率为21.03%、汶阳平原林木覆盖率为19%，而中部和北部山区的森林覆盖率很高，设于北部山区的牛山国家森林公园森林覆盖率达到97%。平原地区的植被主要为农业植被和落叶阔叶林，山地、丘陵主要为针