各个牧首区的纷争，由其是罗马和君士坦丁堡，使五大牧首不能成为有效的管治实体。7世纪亚历山大、耶路撒冷和安条克被伊斯兰征服，使君士坦丁堡成为东方唯一的权威，此后「五大牧首区」的概念只剩下象征意义。东方教会磨擦，以东西教会大分裂告终，和帝国之外的大型独立的都主教座在保加利亚、塞尔维亚和俄罗斯的兴起，使帝国内的古老主教座变得不重要。