真佛宗的最高行政组织名为「世界真佛宗宗务委员会」，简称为宗委会，由卢胜彦在1997年创立，负责真佛宗的行政、财政、人事管理等事务。《当代台湾新兴宗教的信仰体系及其「可信性」：五个新兴宗教团体的考察》指出，真佛宗的制度比照了西藏密宗，并建立教主的宗教权威以及修行次第系统；该论文引用了学者詹姆斯·博尔赫和理查德·弗朗西斯·柯蒂斯的「四象限分类」，把新兴宗教分类为「经验相关性高而逻辑整合紧密」、「经验相关性高而逻辑整合疏松」、「经验相关性低而逻辑整合紧密」、「经验相关性低而逻辑整合疏松」四大象限，并认为真佛