设施大多受损，但岛上的守军为了掩护苏格兰营从深水埗往九龙半岛后撤，在11日中午仍以1号炮台不断炮轰在荔枝角的日军第230联队，直至下午3时接到司令部的撤退命令，炮台的守军开始炸毁各门火炮和破坏岛上设施，并带走可搬动的设备乘船撤退，于12日凌晨1时许抵达香港岛。昂船洲之后被日军佔领，日军在佔领香港期间对岛上设施有所扩建，并且在岛上建立了无线电接收设备作为军事用途，扩大日本公共传媒机构日本放送协会在海外的广播接收范围。岛上恬静的环境及舒适的海滩亦成为了日军休闲及娱乐的地方。
战后时期