度侵袭沿海，于是会谢琰以本官领会稽内史、都督五郡军事。
轻敌遇害.谢琰无论资历和名望都在会稽都非常高，当时议论的人都认为他必定能安定当地。而谢琰亦轻敌，到郡后既不安抚士民，亦不修整武备。当时有将领向其进谏，但谢琰不以为然说道：「苻坚百万，尚送死淮南，况孙恩奔衄归海，何能复出」不肯听从。隆安四年（400年）五月，孙恩率部众出浃口（今浙江镇海），攻余姚，破上虞，抵山阴县北之邢浦，谢琰初遣参军刘宣之击退孙恩，但不久孙恩又再进邢浦，上党太守张虔硕战败，孙恩于是一直向会稽进发。当时人心惊