（取代福田口岸站），但深圳地铁12号线全线通车后左炮台站将取代本站成为深圳地铁系统中最南的车站。2009年6月15日，蛇口港站实现主体结构封顶。
车站结构.蛇口港站是一个地下两层10米岛式月台车站，总建筑面积为10,550平方米。
楼层.蛇口港站的结构共分两层，其中一个岛式月台设于下层，而上层则为车站大堂。车站设有两条轨道。