型和MCV-4型。MCV-1型是人类感染最普遍的；MCV-2型常见于成人主要通过性传播。 PCR技术可帮助确定并区分引起病变的是哪一种类型的MCV。
基因组.基因组为不分段的单分子线性双链DNA，由180000–200000个核苷酸组成。不同核苷酸之间通过共价键连接两端边缘以及重复复杂的序列。其中有160个基因已被确定。
动物病毒.有一种动物病毒可以使马和驴患上与传染性软疣类似的疾病。 DNA研究表明，该病毒与MCV是密切相关的。