数完整的海洋珊瑚群岛生态系统。菲尼克斯群岛保护区地处偏远，人烟罕至，提供全球稀有物种与生态系统完整保留机会。菲尼克斯群岛保护区有八个环礁岛和两处暗礁，包括拉瓦基环礁、恩德伯环礁、尼库马罗罗环礁、麦基恩环礁、曼拉环礁、伯尼环礁、阿巴里灵阿环礁，以及奥罗纳环礁，另外有与两处暗礁。其中只有在阿巴里灵阿环礁约有25人居住，包括政府僱员及其家人，其余岛屿均无人居住。菲尼克斯群岛保护区的面积相当于美国加州，但其大部分区域均为海洋，陆地面积仅有25平方公里。海域平均深度约为4,000公尺，最深处达6,147公尺。