12月，印度洋大地震发生后，新加坡武装部队随即开启了搜救行动，前往棉兰、普吉岛、斯里兰卡、马尔代夫等地区为灾民提供援助。 新加坡空军派遣了1500名人员、8架CH-47直升机、4架超级美洲狮直升机、6架C-130运输机及2架福克50前去协助救援。巴耶利峇空军基地当时被用作救援行动的中转站。
第三代空军（2006年至今）.为了对抗非传统安全威胁、提升整体防空能力、以及满足日益增长的组织需求，新加坡空军实施了多项组织改革和转型。2007年1月，新加坡空军对其组织结构进行调整，并组建了