铁路事务的台湾铁道线区司令部也在9月24日废止。队长山根武亮最初将本部设在台北车站附近的民房，11月28日才迁到北门街新事务所。临时台湾铁道队成立后负责掌管军用运输业务，并进行基隆台北路段改筑工程、新竹以南延伸工程与纵贯铁路路线调查等事务，期间在1896年7月5日在不妨碍军事运输的前提下，也开放一般民众使用铁路。后来由于台湾纵贯铁路的兴建有考虑让1896年申请成立的台湾铁道会社来进行，临时台湾铁道队在1897年3月31日停止运作，事务于4月1日开始移交给台湾总督府民政局通信部临时铁道挂。4月22日移