八幡山城受带连带影响遭到废除。在江户时代大部分区域为幕府直属及旗本，另有部分区域分属、、、仙台藩、、尾张藩、淀藩、、、、、丸龟藩、、峰山藩，其中也有属于门迹、公家、寺社的领地，而此地的幕府直属领及旗本领则是由位于滋贺郡大津的负责管理。19世纪末明治维新后，原先的幕府直属领及旗本领先后改隶属大津裁判所及大津县，其他原本属于各藩的区域则在1871年实施废藩置县后，改隶属郡山县、西大路县、川越县、水口县、宫川县、名古屋县、淀县、宫津县、山上县、前桥县、伯太县、峰山县；不过在仅四个月之后的府县整併中，郡内全