并分别在台北和台南设立教会。但作为殖民者的阶层意识，日本圣公会的工作对象是以日本人为主。当时，仅有极少数台湾本地人是圣公会教友。1945年日本人战败以后，日本圣公会也从台湾撤退。
1949年至今.战后，日本教会人员撤离，教堂由长老教会接收，即今台北中山教会和台南南门教会。圣公会台湾教区（简称台湾圣公会）于民国38年（1949年）开始筹备，民国43年（1954年）正式成立及在台湾推展教务，并于该年向政府主管机关登记设立财团法人。台湾圣公会系由中华圣公会各教区来台教友合力创建，并经