主要依靠宿主细胞的能量生长繁殖，他们尤其需要在脱离宿主细胞时难以获取的营养物质。兼性细胞内寄生物嗜肺军团菌（"Legionella pneumophila"）目前是研究细胞内寄生物获取宿主细胞营养的标准研究模型。目前的研究表明，嗜肺军团菌通过促进宿主细胞蛋白自我分解或通过蛋白酶体分解，将这些蛋白质变为氨基酸。嗜肺军团菌可以用这些氨基酸作为碳源和主要的能量来源。
敏感性.T细胞功能受损的人群（如AIDS患者）较难清除侵入体内的病原性细胞内寄生物。