达到北马其顿和希腊的国境，最后流入爱琴海。发达河谷几乎都由丘陵和山地构成。斯科普里市区东西宽23公里，南北长9公里。平均海拔有225米。斯科普里市区面积有1,854平方公里。
气候.按照柯本气候分类法，斯科普里在气候上属于副热带湿润气候（Cfa）区，靠近和湿润大陆性气候的交界处。斯科普里位于其西北部普罗莱蒂耶山脉的雨影区，降水较少，其降水量只有与其同纬度的亚得里亚海沿岸地区降水量的四分之一。夏季潮湿炎热，冬季寒冷且颇潮湿，常有降雪。夏季气温经常超过31°C，有时会超过40°C。春季