的闽西南红军改编为新四军二支队，并任新四军第二支队副司令员，部队北上。谭震林随即调任第三支队副司令员，指挥马家园战斗，开辟了皖南抗日根据地。1939年，谭震林指挥了繁昌保卫战。1940年，谭震林任江南抗日义勇军司令员兼政委，创建东路抗日游击根椐地。皖南事变后，谭震林任新四军第六师师长兼政治委员，苏南区党委书记，向日军主动出击八十余次。1941年11月，由于日军发动“清乡”，新四军无法立足，谭震林率第六师师部和第十八旅向江北转移，进入江都、宝应、高邮地区。所部十六旅遭偷袭后，谭震林返回苏南兼任十六旅旅长，