替丁以外，H受体阻抗剂都有良好的耐受性。偶见不良反应有低血压；罕见副作用有：头痛、疲劳、晕眩、意识不清、腹泻、便祕、红疹等。除此之外，西咪替丁可能还会造成男性女乳症、性慾丧失、阳痿，但这些副作用在停止服用药物之后就会消失。于2007年，有一个关于非裔美国人的中指出，长期使用H受体阻抗剂会造成认知能力下降。
交互作用.药代动力学的研究显示，西咪替丁会干扰经由细胞色素P450路径代谢的物质。更准确的来说，西咪替丁会抑制P450这个代谢系统的酵素，像是CYP1A2、CYP1A2、CY