年至1940年5月，马吉在南京下关挹江门外的道胜堂教堂传教。南京大屠杀期间，马吉牧师担任国际红十字会南京委员会主席以及南京安全区国际委员会委员。马吉牧师曾参与救助中国难民，并拍摄了日本军人屠杀中国人的纪录片。1946年，马吉牧师曾经在日本东京设立的远东国际军事法庭上为日军南京大屠杀作证，称“日军到处杀害中国人”，但是当被问及“是你亲眼看到的吗？”时，马吉牧师回答称：“我亲眼看见的只有一起”。但基本上他所记录的所有事件都是由当事人亲自讲述的，例如夏淑琴的事件就是。张纯如《The rape of Nanking