胜利后，毛泽东与蒋介石在重庆谈判所达到的《双十协定》这样一个基础上来实现国家统一。他并唿吁共产党亦要认清自身错误，批评共产党没履行在建政前标榜的民主，并要求尊重各民族的自决权、解决西藏问题等。同年刘晓波被捕，王希哲不欲再入狱，遂从广州逃到汕头再偷渡到香港，惟当时香港正准备回归，港英政府不希望对他作政治庇护，王希哲于是到美国驻香港总领事馆，再流亡到美国至今。1998年在「九八组党」时期，与王炳章、方圆等组建「中国民主党」。2000年8月28日，王希哲和太太苏江以及王炳章的太太一同被赵天恩牧师施洗。