在进入朝枚之年后表示：“我无惧死亡，那肯定就像睡长觉般美妙”。她淡出表演后不久身体便迅速恶化，曾于1993年3月因衰竭入院。1996年冬，她因肺炎住院治疗。1997年时她已非常虚弱，进食很少，也极少开口说话，人们担心她很快就会去世。赫本在生命最后几年出现痴呆症状。2003年5月，她的颈部出现迅速蔓延的肿瘤，但因风险太大决定不予治疗。2003年6月29日，凯瑟琳·霍顿·赫本在芬威克的家中因心脏停搏与世长辞，此时她的96岁生日刚过去一个多月。赫本的遗体葬在哈特福雪松山公墓，现场根据她的遗愿没有举办追悼仪式。