落叶林构成森林的三分之一，松柏则因重新造林而增加，云杉及冷杉为高山地区主要林相，松及落叶松多生长于砂质土壤。另存在多种蕨类、花、真菌、苔藓类。主要野生动物包括鹿、野猪、、狐、獾、野兔、河狸。德国国家公园包括石勒苏益格-荷尔斯泰因瓦登海国家公园、亚斯蒙德国家公园、西波美拉尼亚潟湖地区国家公园、米利茨国家公园、下奥得河河谷国家公园、哈尔茨国家公园、萨克森小瑞士国家公园、巴伐利亚森林国家公园等。德国境内共有超过400家动物园及动物公园，数量居世界之冠。柏林动物园为德国历史最悠久的动物园，展示物种超过1,500