于此转成台铁以及绿线，其后沿着关新路往南，行驶一小段光复路后转进竹科介寿路，并在力行路口转乘橘线并转西进园区一路，再于新安路转西，于国家同步辐射研究中心前转乘橘线，其后转北进入新辟的特二号道路至光复路转西，在东园街转入食品路，再转入公园街接上公竹路至新竹大车站，其后沿着铁路往南至新竹国小，至此为优先兴建的第一阶段。之后转北进四维路接北大路，再转北入东大路，最后行驶一小段经国路，在民权路口设置终点站并与绿线转乘。全线皆採高架轻轨运输系统，第一阶段设置15站共14公里，第二阶段设3站共3.1公里。机厂位于柯子湖