共和国国旗（、爱沙尼亚语：）是苏联加盟共和国爱沙尼亚苏维埃社会主义共和国使用的国旗。最后一个版本启用于1953年2月6日。最初的国旗左上角为镰刀和锤子，上方以无衬线体书有ENSV （共和国的爱沙尼亚语缩写）。第二个版本仿照苏联国旗，但在下方加上象征波罗的海的蓝白波纹，佔旗高三分之一。与拉脱维亚国旗不同，波纹图案较尖，而且图案以下尚有六分之一的红色旗底。