于1918年7月1日启用，是两端分别为哥本哈根火车总站与东门站的哥本哈根大街铁路隧道部分的一个中途站。1934年5月15日起，哥本哈根市郊铁路开始停靠北门站。为了便于乘客在哥本哈根市郊铁路、国铁、哥本哈根地铁间换乘，新建了连接丹麦国家铁路（包括哥本哈根市郊铁路）部分与哥本哈根地铁部分的地下通道。因此，2000年3月至2002年2月改造期间，哥本哈根市郊铁路站台部分关闭，哥本哈根市郊铁路列车停靠本站时仅开启最前面的4个车门。随着2002年10月19日哥本哈根地铁一期开通，北门站成为了哥本哈根地铁1号线与哥