发生动盪，此时八户政荣选择支持石川高信之子南部信直。之后经由北信爱的劝说，放下身段全力辅佐南部信直，成为与北信爱同为南部信直最重要的左右手。1590年，丰臣秀吉要求全国大名参加小田原征伐，深受信直信任的政荣便于信直出征期间负责留守三户南部氏的本据地三户城。据闻政荣有患眼疾而失明。