酮戊二酸跨过线粒体膜转运到线粒体基质中。
脂肪酸的生物合成.在脂肪酸合成中，它为脂肪酸提供二碳单位，将二碳单位加到延长中的脂肪酸碳链中。丙二酰A是在乙酰辅酶A羧化酶的作用下使乙酰辅酶A羧化而形成的。一分子乙酰辅酶A与一分子碳酸氢盐相结合，其中需要三磷酸腺苷以提供能量。丙二酰辅酶A被一种称作丙二酰辅酶A：酰基载体蛋白转酰基酶（MCAT）用于合成脂肪酸。MCAT负责将丙二酰辅酶A上的丙二酸基团转移到完全酰基载体蛋白（ACP）末尾的硫醇上。
聚酮生物合成.