上表求松弛盐禁，甄琛听从，参八座议事，弹劾的多为小吏，不能纠察权贵。转任侍中，奉迎权贵赵脩。赵脩死后，被弹劾免官归本郡。后恢复官职为散骑常侍，领给事黄门侍郎，定州大中正。受宣武帝宠信。转任河南尹，建议以羽林巡察诸坊巷，于是为定制。魏孝明帝初年，因为他依附高肇，出任营州刺史。后来转任定州刺史，他为政严苛，被人讥议。因为和崔光关系好，转任侍中。正光五年（524年）甄琛去世，谥号孝穆。其子甄侃、甄楷。