战争战败，与日本签订《马关条约》，割让台湾，叶题鴈与翰林院庶吉士李清琦，举人汪春源、罗秀惠、黄宗鼎等人联合上书都察院代奏光绪帝反对割台。光绪二十三年（1897年）升任户部云南司主事。光绪二十七年（1901年）任户部贵州司员外郎、户部陕西司郎中。次年，任陕西道监察御史。