刑罚免除官职。元志因此忤逆旨意，被降为太尉主簿，很快担任从事中郎。北魏军队南征的时候，魏孝文帝身穿便服观察作战的地方，有支箭射向魏孝文帝，元志用身体遮挡，魏孝文帝得以脱险，元志的眼睛中箭，因此一只眼睛失明。元志代理恒州刺史。魏宣武帝元恪时期，元志出任荆州刺史。永平二年（509年）三月，元志率领七万军队进攻南梁的潺沟，驱赶逼迫当地的蛮人，蛮人纷纷渡过汉江向南梁投降。南梁雍州刺史、吴平侯萧景命令司马朱思远、宁蛮长史曹义宗、中兵参军孟惠俊在潺沟攻击元志，大获全胜，斩获首级一万多，元志长史杜景被俘虏。熙平元年（