板垣晋升陆军大将，调任日本朝鲜军司令。1943年任军事参议官。1945年2月1日，复兼任第17方面军司令官。同年4月7日，在第二次世界大战即将结束，日本面临败亡之际，1945年4月板垣接替土肥原贤二大将任第7方面军司令官，司令部设于新加坡，指挥日军在荷属东印度和马来亚等地日军作战。8月15日，日本宣布无条件投降。9月间，板垣率第7方面军在新加坡向英军投降。1945年日本战败后，板垣征四郎被远东国际军事法庭定为甲级战犯，并被判处死刑。1948年12月23日，板垣征四郎在东京都丰岛区池袋巢鸭监狱内被处以绞刑