效率很高，但却专一性却不高，即先天免疫无法精确针对入侵物质的种类而回以特殊的反应。另外一方面，有颌嵴椎动物的后天免疫系统则具有高度的专一性，能够区分几乎所有种类的入侵物质。相较于先天免疫系统以吞噬细胞为基础，后天免疫系统奠基于淋巴细胞。淋巴细胞能够分泌「抗体」（一种保护性蛋白质）来标记入侵物质，以便进行后续的清除程序。另外，抗体还能和病原体结合，使其丧失感染细胞的能力。吞噬细胞，尤其是树突状细胞以及巨噬细胞，能够通过抗原呈递（antigen presentation）的进程刺激吞噬细胞产生抗体。Sect