017年8月，伊斯干达·祖卡奈因·再努丁代表马来西亚参加本国举办的东南亚运动会羽毛球比赛，助马来西亚队赢得男子团体银牌。同年9月，他出战比利时羽毛球国际赛，在男单准决赛以0比2（22-24、16-21）不敌日本名将的桃田贤斗。同年11月，他出战马来西亚羽毛球国际挑战赛，在男单决赛以2比0（21-11、21-13）轻取晚辈的梁峻豪，赢得国际赛男单冠军。2018年1月，伊斯干达·祖卡奈因·再努丁出战印度羽毛球公开赛，在男单准决赛以1比2（21-18、10-21、19-21）不敌赛会4号种子、中国的石宇奇。同