林医官院共同派医官赴灾区送药；有时御药院掌礼文兼受行典礼及贡举之事；御药院和尚药局共同负责御药的供奉。御药院之设立，使得北宋全国性药材管理工作获得加强，这与设立翰林医官院同样是北宋医药管理机构改革的成果。金朝宫廷内设有尚药局、御药院，其中尚药局隶属宣徽院。金朝攻占北宋汴京，掳回宋徽宗、宋钦宗的同时，还掳回北宋宫廷的诸科医生数百人，还有不少医书及药品，其中仅北宋太医局的灵宝丹便有28700贴。元朝初期，随着贡来的药品增多，遂在至元六年设立御药院，负责管理药品制作及储存，“秩从五品，掌授各路乡贡，诸蕃进