航空局航空队及行政院海岸巡防署空中侦察巡逻队所合併整编成立。五大主要任务为救灾、救难、救护、运输及观测侦巡。
历史.2004年2月25日第二八七九次行政院会议决议通过「内政部空中勤务总队筹备处暂行组织规程」及编制表，将内政部警政署空中警察队、内政部消防署空中消防队、交通部民用航空局航空队及行政院海岸巡防署空中侦巡队整併，于同年3月10日成立内政部空中勤务总队筹备处，统筹调度执行陆上及海上空中救灾、救难、救护、观测侦巡、运输等五大任务，并推动组织法制化工作。2005年6月22日总