异构酶（）是一种催化同分异构体转换的酶。异构酶因而催化以下的反应：
命名.异构酶是以「(底物)异构酶」这种格式来命名，如脂酰辅酶A脱氢酶。或是以「(底物)(异构酶种类)」来命名，如磷酸葡萄糖变位酶。
分类.异构酶在EC编号中分类为EC5，并再细分为6个子类：