也显示出自身的具有等用于通用图灵机的计算能力(或者说是“图灵完全”的)。这种计算模型比起DNA运算有些关键优势。打个比方，如果说DNA由4块积木砌成（4种碱基），多肽就用了20块积木砌成（20种氨基酸）。肽-抗体相互作用也在相互识别及链接上比一条单链DNA及其互补链更加灵活。但是与DNA运算不同的是，这种模型还没用实现现实中的利用。 主要的限制是该模型所需的单克隆抗体的有效性。