爆发突然，来势迅勐，外加当时民众对甲肝的传播途径的不了解，因此在上海社会上造成了较大的恐慌。上海本地出现了不敢摸楼梯扶手，有甲肝病人的家庭被孤立的情况；另一方面，由于甲肝疫情，出现了外省市排斥上海人的现象。由于民众缺乏对甲肝预防和治疗的相关知识，认为“板蓝根”可以预防或治疗甲肝，使上海市场板蓝根出现抢购风潮并脱销。
舆论压力.由于疫情严重外加社会恐慌，当时上海市政府特别是卫生防疫部门承受了很大压力，时任上海市副市长谢丽娟和卫生局长王道民受到多方指责和质疑。