这场因私菸查缉血案爆发的大规模武装冲突，引发为时数月之久的军事镇压和屠杀，对战后台湾政治、社会和教育影响甚鉅。在二二八事件前，台湾的初中校园里就已出现本省、外省籍教师相互排斥的现象，而外省学生大量转学到台湾也引起家长和学生的不安。军事行动之后国民政府展开清乡，对中学生的屠杀也包含在内，因为学生是二二八事件中最有组织性的群众，除台南女中外，其余初中、高中师生都群起罢课并参与反抗国民政府。如由台湾省立高雄第一中学（今高雄市立高雄高级中学）学生组织的雄中自卫队，除了反抗政府外，还主动维持已陷入无政府状态的市镇治安