后，李儁遭到政府的迫害，“自是被嫌疑目，囚放无常”。然而他依然不屈不挠，与原独立协会运动参与者李商在、闵泳焕、李相卨、李东辉、梁起铎等人秘密结社，并于1902年暗中成立了改革党，企图推进国家政治的改革。
救国运动.1904年，日俄战争爆发，日本控制了大韩帝国政府，签订了《日韩议定书》；后来又出笼了亲日组织“一进会”，李儁对此十分愤慨，组建了“共进会”与之对抗。1905年1月，李儁被逮捕，并被流放到黄海道铁岛。一个月后在闵泳焕的周旋下被释放。1905年5月，他又组建了宪政研究会，在政