区第一座拥有国际航线的国内机场。场站目前由军方管理，包含了军用的中华民国空军台南基地和民用的交通部民用航空局台南航空站（Tainan Airport），同时也是航空器维修商亚洲航空总部与维修基地，面积约5.57平方公里（557公顷），因此越南战争期间是美国空军军机转移的重要维修基地之一，也曾是驻台美军的军用机场。航空场站区域主要位于台南市的南区的东南部以及仁德区西北部的交界地带。台南机场紧临台南市南区、高雄市北端，到台南市中心的台南车站周边仅6公里。现民用航空方面，有立荣航空、华信航空、中华航空、越捷航