后代受隐性、有害的特性影响。这通常会使物种的适应力降低，即近交衰退。要删除导致近交衰退的基因，可透过选择性地杀掉较弱的后代，这就是所谓的遗传清洗。然而有些物种近亲繁殖没事，有些就有很大问题。在植物育种中，近交而生的植物可用来繁殖出杂交的后代，以得到杂种优势。植物的自花授粉是自然的近亲繁殖。近亲繁殖的特点，是因为近亲父母可能是隐性基因只有共同的两个。这里将是显性和隐性的特征，不是在意义上的优势，遗传学的条款。在许多有性繁殖的生物（如染色体异常）每一双遗传因素（2人）的基因。一种是继承他的父亲，另一种是