鲁番在清军征伐准噶尔的过程中倒戈归附。唐努乌梁海、阿尔泰乌梁海、新疆回部等经朝廷派员招抚后归附，不久反叛，后又被平定。对于蒙古察哈尔部、准噶尔部，则是以武力征服。
政治制度.蒙古实行盟旗制和札萨克制。新疆回部实行伯克制。西藏设立噶厦管理各地事务，并沿袭帕木竹巴以来的宗谿制。布特哈打牲部落实行与满洲相同的八旗制度。
区域划分.在地理上，藩部包括蒙古、新疆、青海、西藏以及黑龙江的打牲部落。《清史稿》云：“自松花、黑龙诸江，迤逦而西，绝大漠，亘金山，疆丁