期至日治初期，粪箕窝地区为一街庄，称为「粪箕窝庄」，隶属于竹北二堡。该庄北及东北与波罗汶庄、大湖口庄、羊喜窝庄为邻，东南与大平窝庄、枋藔庄为邻，西南边及西边为坪顶埔庄、番仔湖庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于新竹厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄隶属不变。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「粪箕窝」大字，隶属于新竹州新竹郡湖口庄，大字下有「粪箕窝」、「箕南窝」小字名。战后湖口庄改制为湖口乡，隶属于新竹县，大字亦