民国二十六年（1937年），日军侵入山阴县前夕，阎鸿举避往太原，此后辗转于陕西、甘肃的汉中、宝鸡、天水一带，参加抗日战地服务团第六团。后因病乘飞机转赴越南河内，民国三十年（1941年）2月坐船经天津回到山阴县。回到山阴县后，日本扶植的山西省省长苏体仁、大同的田汝弼等人多次劝其出山任职，均被阎鸿举拒绝。阎鸿举一直闲居在果园家中。民国三十四年（1945年）10月间，阎鸿举因病逝世，享年66岁。