人势力仍然庞大，宋美龄企图阻止李登辉出任国民党代主席但未成功，李登辉于1988年7月接任国民党主席，全面接掌党政军大权。1990年，李登辉当选最后一任由国代选出的总统，同年1991年5月1日，李登辉宣布终止动员戡乱时期，代表着中华民国政府不再否认中华人民共和国政府和中国共产党政权统治中国大陆的合法性。李登辉任内推动民主化与台湾本土化政策，陆续推动六次修宪，1947年在中国大陆选出而一直未改选的国民大会代表在1991年12月31日全部退职。万年国会在1993年1月31日立法院首次全面改选后才正式结果。两岸