，港方共有三条专利巴士路线（B2、B3及B3X）及一条专线小巴路线（新界专线小巴618线）于傍晚6时起投入服务，，而深圳方面亦有两条巴士路线投入服务（90及机场8线），并将一条现有巴士路线245线迁往深圳湾口岸。另外，由永东直巴管理有限公司营办，往来香港国际机场至深圳湾口岸的「航天新干线」，亦于2007年7月13日起投入服务。从深圳方向前往香港机场的旅客不需步行过关，只需从深圳侧搭乘去香港机场的巴士过关，入关手续可以乘车时办理。由2007年12月26日起，深圳巴士集团增辟一条新线98，往来深圳湾