类资源丰富。岛上并有多个特有种，如目前己濒临绝种钓鱼台鼹、诸喜田泽蟹（'）以及钓鱼岛特有的5种蜗牛，其中'以及""已被认为濒危。植物方面，据1950至60年代所进行的调查显示，钓鱼岛主岛上主要分6种植物群落，而主岛和南小岛合计有89科235种蕨类植物和种子植物，然而岛屿缺乏农业价值。而在钓鱼台列屿所在水域，亦是珍稀的龙宫翁戎螺（，俗称「龙宫贝」）的生长水域。1978年，有日本右翼团体为了宣示主权，登上钓鱼台建造灯塔以及从与那国岛运送雌雄山羊各一只到主岛钓鱼台上，到1991年山羊数目已增加达300只以