5年，动画版本从大山版过渡到水田版，声优阵容和画风皆有巨大的改变，由于工作人员太过忙碌，为了因应变化并给活跃多时的电影制作团队休息，该年便暂停推出，这也是哆啦A梦电影仅此一次的中断。自2006年《大雄的恐龙2006》开始，以水田山葵为首的新声优阵容接替大山羡代为电影配音，此后持续推出。此时期除了新的大长篇之外，也重制了几部旧作（目前共6部）。
主篇电影.
水田山葵版（2006—）.※片名标粗体，表示重制版。
3D电影.2014年3D电影