抗日战争结束后，牟中珩任第2绥靖区副司令官。1948年（民国37年）9月，他在济南战役中败给中国人民解放军而被俘虏。中华人民共和国建国后，他长期接受思想改造，1966年4月获得特赦。特赦后他任中国人民政治协商会议全国文史专员，1975年5月，他任政协山东省秘书处专员。1977年12月，他任政协山东省委员会委员，翌年当选该委员会第4届常务委员。1980年，他加入中国国民党革命委员会（民革）。1981年3月12日，牟中珩因食道癌逝世。享年84岁。