採计的科目大致相同，所以有所谓「类组」（其实类组为传统联考规定的考试科目，但因大家习以为常，所以就沿用下来）来作为系院的分类，它们分别常採计以下科目：「类组」只是传统学生在选择考试科目的参考依据而已。此外，自然组学生还常常会跨考社会组的数学乙，或是历史与地理，以期在选填志愿时能有更大的弹性。另有艺术科系，採计国文、英文、术科或国文、英文、历史、术科等，视各系而定。
争议.除了特种身分学生成绩优待（详见特种身分学生成绩优待页面），及收费问题的争议外，指定科目考试还有以下争议