2006年巴西足球甲级联赛由2006年4月15日开始，至2006年12月3日结束。圣保罗于11月20日倒数第三轮联赛和帕拉拿赛和后成为这一年的冠军，这是圣保罗第四个联赛冠军。
升班.这一年从巴西足球乙级联赛升班的有：
降班.这一年降至巴西足球乙级联赛的有：