月台和入境大堂不相通，乘客必须利用扶手电梯绕经位于L3的票务大堂方能前往月台。
大堂.落马洲站/管制站设三个主要大堂，分别为离境大堂（L1／D）、入境大堂（L2／A）和票务大堂（L3／T），三个大堂均设有车站商店、免税店以及自动柜员机。2017年12月起，车站大堂的其中一台自动售票机开始提供支付宝（包括内地版和支付宝HK）和微信支付购票服务。另外，本站离境大堂收费区内设有自动饮料售卖机，售卖机由港铁引入，为香港可口可乐太古汽水厂资产，平日会提供冷饮，冬季更会售卖热饮。尽管此设施