感疫情中的表现备受评论赞赏，在处理2009年人类猪流感疫情和三聚氰胺事件上被外界称赞表现淡定及专业。然而，他亦被批评处事作风官僚及只懂从医学角度看问题，其任内主张大加烟税、只准带十九支烟入境及处理骨灰龛等政策，均引起极大争议，被指使广大烟民及负责执法的香港海关苦不堪言，而日本福岛爆发核危机，他亦被指把关不力，以致含辐射蔬菜流入香港。
特首办主任.2011-12年，梁获委任为第5任行政长官办公室主任，是最年轻、亦是首位从政务职系以外委任的特首办主任。他协助行政长官统筹及指导政府政策，