方则有大肚王国、大龟文王国、玛家王国等原住民部落联盟管辖。郑经去世后，明郑内部爆发权力之争，冯钖范借口监国郑克不是郑经亲生子，拥立自己的女婿郑克塽为延平王，联合刘国轩发动东宁之变，杀害了郑克，最终大权旁落，民心涣散，明郑从此一蹶不振。1682年，施琅师法郑成功收台之法，攻克澎湖岛，于1683年占领台湾，明郑结束。为防止台湾的东宁遗民以东宁王室的名义反叛，康熙帝下令将郑成功、郑经等郑氏在台王室陵墓悉数掘发，迁葬中国内陆。郑成功受封明朝爵位「延平王」，在正式文告中皆谨守藩王的身份，多自称「本藩」（；