于三亿年前的古生代已有大量动物活动，使当地拥有不少化石。区内的黄地峒曾发现三万年前旧石器时代晚期文物，到了距今七千三百多年前的新石器时代中期，吐露港的丫洲岛也已经有先民活动；到了前3千年的新石器时代晚期，元洲仔，盐田仔等地也有人类活动，留下了当时的陶器及石器的碎片。 公元963年的五代十国时期，统治两广的南汉置媚川都，今香港、深圳等地属之，在大埔海（即今吐露港）採集珍珠，多聚集于今元洲仔一带，到了宋朝时为巅峰，与广东合浦（即今日广西北海市合浦县）齐名，政府官员招募了数千名乡民在此採珠，也派驻士兵驻守于此