2年起被迫遭到瑞典军队的占领。慕尼黑不得不支付高额赎金和抵押品，以避免城市遭到破坏。而此后不久爆发的瘟疫则造成了三分之一的人口死亡。当1648年战争结束后，这座城市迅速恢复，并在选帝侯（1651－1679年）的治下，以意大利巴洛克风格的面貌示人。为此，宁芬堡宫、戴蒂尼会教堂以及全市首座应运而生。然而，战争带来的影响便是选帝侯的。自1704年起，慕尼黑在西班牙王位继承战争期间曾被占领了数年，因为选帝侯（1679－1726年）是与法国结盟。当地市民和农民在发起的暴动遭到血腥镇压。随着选帝侯结束流放回国，法国的