围约9平方公里范围内的遗存进行了初步踏查，确认了东西宽约3.5公里，南北长约5公里，总面积约8.75平方公里的遗址范围。此外，了解了遗址的基本内涵和遗存面貌。2006年6~9月，新疆文物与考古研究所、西北大学文化遗产与考古学研究中心与哈密文物局合作，由王建新教授主持，对以高台为核心的遗存进行了首次发掘，清理高台1座、居址4座、墓葬12座。此外，西大考古队与巴里坤文管所（巴里坤文物局前身）又在东黑沟遗址东约7公里，红山农场的山前冲积扇上发现了规模宏伟的红山口遗址。2007年6~9月，上述三家单位继续合作，由冉