厂迁台。迁台后四兵工厂成为44厂、60厂、61厂、26厂等。1949年8月1日，蒋中正总裁办公室在台北正式成立，设有九组一会：第三组掌管军事，副组长即为唐君铂。唐后昇任兵工署署长。1955年升中将。1955年6月，任陆军指挥参谋学校校长，1956年任国防部常务次长，1958年任国防部后勤参谋次长，1959年任陆军供应司令。1963年入实践学社高级兵学研究班受训。
中山科学研究院.蒋中正派唐君铂出席1963年在奥地利维也纳召开的「国际原子能总署」年会。表面上是出席原子能总署年会，其