民建设银行制定《中央级地质勘探财务管理暂行规定》，黄金部队在地勘财务管理方面按此规定执行，一直延续到1995年底。地质勘探经费有三个来源：一是中央财政预算内地质勘探费；二是中国黄金总公司经费补贴；三是从1986年起，国家建立黄金地质勘查基金，按每1000千克150万元人民币拨付黄金部队承包费。黄金部队的分散地质勘探的特点，使得执勤工作时部队高度分散，基层中队与支队机关距离远：一般都在500公里以上，最远3700公里。1996年财政部颁发《地质勘查单位财务制度》，1997年1月财政部颁发《地质事业单位财务制度