第3飞行师团（）是日本帝国陆军所属的航空师团之一。前身为1939年组建的第3飞行集团，1942年改组为第3飞行师团，军事编号3FD，为1941年日本正式对美国宣战后在中国战场的主要空中作战部队。
组织沿革.日本帝国陆军在中国大陆的空军部队分成两个单位，一个是关东军所属的关东军飞行队（1935年扩编为关东军飞行集团，后改组为第二飞行团），大部分的陆军航空队是直属在1936年成立于东京之下；随着1937年中国事变战事白热化，战力需求孔急，全由东京遥控指挥已不务实；在1937年7月15日