会对宿主本身造成伤害。因此，临床医生根据宿主抵抗力状态，把感染性微生物分类为“原发性病原体”，或者是“机会性病原体”：
原发性病原体.原发性病原体在正常且健康的宿主体内，或是由于其存在，或者是由于它们的活动，而引起疾病，其固有的病毒性（引起疾病的）在某种程度上，是病原体繁殖和传播的必然结果。人类许多常见的原发性病原体仅会感染人类，但也有许多严重的疾病是人类由从环境中，或者是从非人类的宿主接触到的病原体所引起。
机会性病原体.机会性病原体可对抵抗力低下（免疫缺陷