亚美尼亚国内的反阿塞拜疆情绪主要是源于之间关于纳戈尔诺-卡拉巴赫的未解决领土冲突。由于领土冲突目前仍未有令人满意的解决方案，愈益激进，反阿塞拜疆情绪亦进一步深化。非政府组织人权观察认为沙俄和苏联以抨击某一个民族来巩固中央统治，这正是两国冲突的起源。
背景.在早期，由于奥斯曼帝国推行反亚美尼亚政策，外高加索的亚美尼亚人视阿塞拜疆人与其平等。1905年8月，有亚美尼亚的民族主义者发表宣言，唿吁从「圣地亚美尼亚」驱逐突厥人，引致暴力事件，造成数百名阿塞拜疆人在舒沙死亡。纳戈尔诺-卡拉