军速成学堂毕业后，吴新田到北洋第六镇任职。1913年（民国2年），他任陆军第6师第3混成旅的团长。1914年（民国3年），他升任张敬尧所辖陆军第7师步兵第14旅旅长。1918年（民国7年）11月，他兼任湖南省的岳阳镇守使。1920年（民国9年），他接替张敬尧任第7师师长。1921年（民国10年），他率第7师入陕西省。同年12月，他兼任陕南镇守使。1922年（民国11年），他获将军府授予“藩威将军”。1923年（民国12年）3月，他获授陆军上将。1925年（民国14年）5月，执政段祺瑞任命他为陕西督办