来-玻里尼西亚语族以「西部马来-玻里尼西亚语族」（Hesperonesian）和「中-东部马来-玻里尼西亚语族」分类；但因「西部」只有地理上的关连，到最近这种分类已不再使用。
与台湾南岛语的关系.马来-玻里尼西亚语族语言与东台湾南岛语族有许多共同的音韵及词汇创新，如 *t, *C 合併为 /t/、*n, *N 合併为 /n/、*S 转为 /h/，以及 *lima "五"。 然而，没有任何一支台湾南岛语能与马来-玻里尼西亚语族有直接的连系。
内部分类.马来-