爆发后，日本全力进攻印尼意图夺取石油资源；因此印度尼西亚成为盟军与日本交战的重点。印度尼西亚于1949年12月27日脱离荷兰正式宣布独立，印度尼西亚虽然签署了旧金山和约；却没有批准和约。1958年1月20日双方于雅加达签署了日本国与印度尼西亚共和国和平条约，第一条确认两国战争状态的正式结束；第四条A款日本同意无偿提供印度尼西亚政府相当两亿两千三百零八万美元的日本国生产品以及劳务。由于朝鲜民主主义人民共和国与大韩民国也因为朝鲜半岛唯一合法政府的代表权问题，未签署旧金山和约。直至1965年6月22日，韩