练……观此一书，则贼中不为无人」。洪仁玕虽获任为军师，但他的实际权力不大，在1861年初开始失势，权力被削弱；而太平天国当时的客观环境亦没有机会让他认真推行《资政新篇》内的主张，最终《资政新篇》仍是纸上谈兵。军事上，洪仁玕曾参与1860年太平军二破江南大营的策划，后来又建议分兵两路合取武汉以解安庆之围，但功败垂成。洪仁玕亦曾亲自带兵出战。1864年7月天京陷落时，洪仁玕正在浙江湖州。8月洪仁玕伴随幼天王从湖州出走，计划进入江西会合其他太平军，再北上中原发展。在清军穷追不舍下，10月9日洪仁玕在江