年8月14日，林全内阁宣布不再编列预算，预计同年年底前依据〈行政院功能业务与组织调整暂行条例〉先以行政命令将蒙藏委员会停止运作，相关业务改由文化部与行政院大陆委员会承接，预将于年底正式裁撤。8月17日，行政院院会通过《蒙藏委员会组织法》废止案，废止案经立法院审议通过，将由行政院大陆委员会承接蒙藏会的情势蒐整与研判业务（共六员），并和外交部负责与政治相关的部分。同年9月15日，文化部在蒙藏委员会原址成立「蒙藏文化中心」，承接蒙藏委员会文化相关业务与大多数蒙藏会人员，蒙藏委员会官网公告改连往文化部蒙藏文化中心网