于走入明朝灭亡的末路。太平军灭后已有废除厘金之议，同治三年（1864年），左副都御史全庆、曾国藩多次奏请朝廷尽快裁撤。1898年6月总理衙门接受御史陈其璋的建议，奏准“与各国开议酌加进口税，停收厘金”的建议。但因改益过巨，遭到湖广总督官文、两广总督郭嵩焘等地方疆吏的反对，政府难以放弃，“只宜严禁重科，万不可骤议裁撤”。征厘的关卡和货品名目不断增加，1903年，各省厘金收入约为白银1170多万两，1911年，厘金收入更高达白银4318万多两。直至1931年1月国民政府才在强大压力下废除此行之八十余年的弊政