正政府为因应地方发展，在南方澳北边兴建小型商港，于1972年6月完工。1969年，行政院决议将苏澳港扩建为基隆港的辅助港，并在1971年12月1日成立基隆港务局苏澳港分局。1974年，苏澳港列入「十大建设」之一；1975年7月，建港工程正式动工。除了建造码头、防波堤等设施，以及疏濬航道之外，并同时进行辟建兰阳隧道等连外道路工程。1978年底，第一期工程完工；1983年6月，第二期工程全部完工。自2012年3月起，随台湾港务公司成立，改由该公司基隆港务分公司苏澳港营运处管理。
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