为受二战影响的人提供协助，同时继续蒐证工作。1962年，阿道夫·艾希曼被处死后，维森塔尔重开犹太人档案中心，继续蒐证，把纳粹战犯送上法庭。其中最为人熟知的是协助成功拘捕卡尔·修伯尔鲍尔（Karl Silberbauer）。他是当时拘捕安妮·法兰克的盖世太保军官。根据修伯尔鲍尔的口供，推翻了《安妮的日记》是子虚乌有的指责。他成功找出另外9名在逃纳粹战犯，并以谋杀犹太人的罪名送往西德的法庭受审。他协助拘捕弗兰茨·施坦格尔（Franz Stangl，特雷布林卡灭绝营和索比布尔集中营的指挥官）和赫尔明娜·布劳恩