19名九铁高层人士集体请假有擅离职守之问题；而其余19名管理层则获发警告信，如一年内再犯则解僱。同时黎文熹宣佈为九铁出现严重纪律问题问责而辞去署理行政总裁一职，由曾任新铁路工程高级总监及前工务司的詹伯乐出任署理行政总裁。这次事件后，香港政府加速进行两铁合併，并决定由原地铁公司主导合併。此外，这次事件亦成为曾荫权2007年角逐连任行政长官的选举广告一部分。
香灼玑丑闻.香灼玑是前公民教育委员会主席，也是曾荫权的表哥，曾在2005年获颁发银紫荆星章。在2006年8月，有人揭发香