由于李登辉发表「中华民国不存在」的谈话引发政治效应，波及到了司法院正副院长与大法官资格审查。城仲模在立法院接受资格审查时，国民党籍立法委员郭添财质询有关出国时的国籍是填写台湾或者是中华民国，他表示：他都是填写中华民国（ROC）。2006年4月5日，苹果日报揭露，于4月2日上午与国立云林科技大学科技法律研究所助理教授王美心进入汽车旅馆70分钟，但城仲模否认双方有非正常关系。4月6日，城仲模请辞大法官以及兼任司法院副院长之职务，晚间陈水扁总统正式批准辞呈。事后，王美心则表示与城不熟识。之后城仲模接下