年，他们发现缈中微子与电中微子的数量比率为理论预言的60%。此一现象称为「大气中微子反常」。1994年，同一团队又发现，这数量比率与天顶角或中微子在地球内部移动距离有关，这意味着中微子振盪。为了增进实验的功能，神冈探测器在1996年被改良提升为超级神冈探测器（Super-K）。1998年，户冢－梶田实验团队在Super-K获得更多精确实验数据，从而总结，数量比率的短缺是因为中微子振盪，即宇宙射线在地球大气层因散射所产生的缈中微子，会在经过地球内部的途中变型为陶中微子。这个发现令人信服地证实了中微子振盪的