9年）8月1日遭到东常庆的嫡子东常尧暗杀，由年轻的胤后继承家督之位，由祖父远藤胤好担任后见。同年同月，叔父远藤盛数消灭，并且成为八幡城主，胤俊获盛数在永禄年间（1558年 - 1570年）赠予郡上郡西北作为领地。其后，永禄2年（1559年）8月14日，斋藤义龙写信要求胤俊和盛数共同管治郡上郡。胤俊与盛数平分所领，两家自此称为「两远藤」。永禄5年（1562年），盛数死去，由其子年仅13岁的远藤庆隆继任。永禄7年（1564年），竹中重治佔领稻叶山城，胤俊趁乱进佔庆隆的居城八幡城。然而，庆隆移至苅安城（现郡上