的1000系20番台（第27编成）开始变更为现今的橘黄色，故实际上有8种配色的列车存在。后来米黄配色的1000系车体（第6・13编成）也在2010年春季将配色变更为橘黄，最后又回到7种配色的状况。这种彩色涂装的列车，即便是在同为京王电铁所经营的主要铁道京王线中也没有被採用，是为井之头线独有的配色。1000系与3000系的车厢长度以及车门数量不同（1000系为20m级4门车厢，3000系为18.5m级3门车厢）的关系，起终点站的涩谷站与吉祥寺站月台曾经都有乘车位置的告示。涩谷站在1000系的乘车位置地面埋