中教育大学）的好友洪炎秋之邀，担任该校教务主任之职。1947年1 月，改任教于台湾大学地质系，戮力将日治时期的日文地质文献翻译成中文，使得学术承传不致于中断。在台湾大学任教期间，林朝棨曾两度被借调至政府部门任事。1949年及1952年4月两次借调至台湾省政府建设厅任专务委员兼矿物科长。在台大期间他也开始探勘台湾全岛及澎湖群岛之「第四纪」地层，从此奠定台湾「第四纪」地质学研究的基础，为其一生最重要的研究成果。终战之初，台湾受国语教育的地质系学生尚未毕业，因此，石油公司、电力公司有技术方面的问题常需要林朝棨