是否够稳定到可视为分子，在本质上是操作性的定义。在哲学上，分子不是一个基本实体（相反的，基本粒子就是基本实体），分子的概念可以视为是化学家在陈述世界上原子之间作用力强度的一种叙述方式。
分子光谱学.分子光谱学是处理分子和带有已知能量（依照普朗克关系式，也可以表示为频率）的探测信号（或粒子）作用时，产生的频谱。可以由分子吸收光谱或发射光谱来分析其能量交换，进而分析分子的量子化能阶。当像中子或电子等粒子或是高能的X光和一般规则排列的分子（如晶体）作用时，光谱学的研究一般不会指其绕射的现