无缘参加这场在伦敦温布利球场进行的欧冠决赛。克洛普在其后又表示，多特蒙德根本没有机会说服格策留在阵中，因为“它是佩普·瓜迪奥拉的最爱”。在韧带伤病康复后，格策于2013年8月24日对阵纽伦堡的比赛中（第3轮）完成了代表拜仁的德甲首秀。而在6天后对阵切尔西的欧洲超级杯中，他也于第71分钟替换托马斯·穆勒登场，但在期间又被拉美利斯侵犯受伤。这一次他遭遇了左脚脚踝关节囊撕裂，需要再度缺阵。同年10月19日，他在对阵美因茨05的比赛中于下半场替补复出，并随之参与了3个入球，从而帮助球队在0比1落后的局面下以4比