朱芹，四川富顺县人，明朝政治人物。万历十七年（1589年）己丑科三甲进士。万历三十九年（1611年）担任广东惠州府知府。万历四十三年（1615年）去职。历官云南水利道佥事，升贵州左布政使。在云南任职期间，曾治理滇池水域。