态学研究分析，森林砍伐会抑制小熊猫的种群扩散，加剧自然种群的分化，导致现存野生群体的严重分裂。在尼泊尔的中，四类不同种群的30多只动物须与人类共享资源，然而面积中只有6%的区域适合作小熊猫的栖息地。另外，尽管就食物而言，小熊猫和家畜的直接竞争并不严重，但家畜的践踏会抑制竹子的生长。相互之间拥有较少交流机会的小群体动物会面临着近亲繁殖、遗传多样性降低甚至是灭绝的危险。此外，为了农业（包括为在山坡上修筑梯田）和获得木柴而进行皆伐也移除了可供雌性小熊猫筑巢的老树，并降低了某些竹子的再生能力。在中国西南地区