此次改造中，对于拆迁区域内的佑圣寺进行迁建，保留观音寺，两座寺院均位于永定门公园内；天坛西门入口处的值房也获得保留。天坛西坛墙复建工程于2003年7月10日正式启动，此后又进行了先农坛东坛墙复建工程。永定门城楼复建工程于2003年启动，2005年中华人民共和国国庆节前完工。复建的永定门城楼位于永定门公园南端，永定门桥东、西两座桥之间。