骼首先在头部和胸部之间分开，这是为什么许多三叶虫的化石不是缺少头部就是缺少胸部，其实许多化石是三叶虫蜕掉的皮，而不是死去的三叶虫形成的。大多数三叶虫的头部有两个面部缝合来简化蜕皮过程。
感觉器官.许多三叶虫有眼睛，还有可能用来作味觉和嗅觉器官的触角。有些三叶虫是瞎的，可能牠们居住在非常深的海底，那里没有光，因此用不着眼睛。有些（比如蛙形镜眼虫"）有很大的眼睛。三叶虫的眼睛是由方解石（碳酸钙，）组成的。纯的方解石是透明的，有些三叶虫使用单晶的、透明的方解石来组成其每只眼睛的透镜。