当时冤案、错案、假案的发生从无停止。后因警总在裁撤时大量销毁档案，让当时因奖金而发生的案子有多少，难以考究。根据中华民国法务部向立法院所提之一份报告的资料显示，戒严时期，军事法庭受理的政治案件29407件，官方最保守估计的无辜被害者约14万人。根据司法院透露，政治案件约6、7万件，如以每案平均3人计算，受军事审判的政治受难人，应当在20万人以上，他们就是「白色恐怖」的最直接牺牲者。其中，1960年那一年，执政当局将12万6875人列为「行踪不明」人口而予以撤籍。由此推论，当时受迫害致死的人数应极为庞大。