例如睡眠或脱水时，尿液中的水分减少，因此尿胆素浓度升高，尿液颜色更深。阻塞性黄疸时，胆汁的胆红素分泌减少，胆红素直接经血液由肾脏排出，尿液颜色更深，但尿胆素浓度不高，无尿胆原，粪便常苍白。深色尿液的原因也可能是其他化学物质，例如许多口服药物，卟啉症产生的卟啉，尿黑酸尿症患者的尿黑酸。