，于人止关附近与北侧流来之东眼溪会合，始称眉溪，续流经枫树林、狮子头、九芎林、蜈蚣崙，进入埔里盆地后绕行盆地北部，于盆地西部之向善附近与南港溪合流。随后即西行出盆地而进入山区，经数个大曲流后，至北山坑汇集北坑溪后转向西北，流经大石股、清德，于柑子林会合北港溪后，改称乌溪。名称为南港溪之本流上游则为东光溪（木屐囒溪），发源于水社大山北侧，向北流经顶城、东光、长尾寮，于外加道坑附近与大林溪合流后，始称南港溪，由外加道坑开始沿溪地形形成崃谷，经过牛洞，来到水头便渐渐失去崃谷景观，由鱼池盆地进入埔里盆地后向西北