羽长秀并拜领2,000石，并在与柴田胜家的战争中留有随长秀出阵坂本城的纪录。天正13年（1585年）长秀过世，年近六旬的牛一也将家业让与儿子隐居。不过牛一很快就被豊臣秀吉重新起用，于天正17年（1587年）赴任京都南部再度负责寺院的检地，在当年完成山城国加茂六郷的检地。天正18年（1588年）以淀城为据点兼任南山城与近江国浅井郡的代官。大约在同时期的天正19年（1589年）起，留存下来的书信纪录上的属名开始改为牛一，但不清楚是为本能寺丧主或退隐之身而改名。天正20年（1590年）随秀吉一同前往肥前国