此新·转让给田口铁道线车站。在该铁道开通后，凤来寺站改名为「凤来寺口站」。在1943年（昭和18年）8月，凤来寺铁道被国有化。车站成为国铁饭田线与田口铁道线的转乘站。而车站名称再改名为现时的「本长篠站」。在1956年（昭和31年）10月，田口铁道被丰桥铁道合併，田口铁道线改名为丰桥铁道田口线。但是随着田口线的使用人次减少，于1968年（昭和43年）9月废止。本长篠站成为国铁饭田线单独车站。在1971年（昭和46年），与多座饭田线车站一样，此站的货物起卸业务终止。在1984年（昭和59年），行李起卸业