利物浦亚罗公园医院之深切治疗部留医，期间病情反覆，最后延至2006年1月21日晚不治，终年65岁。其丧礼后在1月27日在威勒尔的圣玛丽教堂举行，而公开追悼会则在3月6日，即其66岁冥寿于利物浦圣公会大教堂举行。
家庭.曾秋坤在于英国盖伊医院医学院求学期间，认识了徐惠玲（音译，Irene Wei-Len Chee），两人在1965年于英国成婚，并育有一女一子，分别为Ruth Chan和Stephen Chan。