所小学，此为日本现代小学教育制度之开始。2018年时，京都市内共有115所zh-hans:幼儿园; zh-hant:幼儿园; zh-tw:幼稚园; zh-hk:幼稚园; zh-mo:幼稚园; zh-sg:幼稚园;、31所（）、174所小学、93所初中和53所高中。京都市内共有38所大学。2009年，在京都就读的大学生多达13万9237人，在日本所有都市中位列第二位，学生佔总人口的比例则高居政令指定都市首位。1886年帝国大学令颁发之后，日本第二个帝国大学—京都帝国大学即设在京都。同时民间相继创办