反式脂肪或饱和脂肪，都是人们应该避免大量摄取的脂肪酸。由于天然椰子油本身已含有大量对血管有害的饱和脂肪，若仅以天然椰子油不含反式脂肪，便声称天然椰子油比其他未经氢化的植物油健康，这种避重就轻的说法并不成立，多吃椰子油甚至带来反效果。由于椰子油对心脏和血管会造成危害，世界卫生组织、、美国心脏协会等，都把椰子油列入应该避免食用的饱和脂肪之列。椰子油不可作为湿疹等皮肤病患者的保湿剂，皮肤科医生指出，患有湿疹等皮肤病的患者涂上椰子油后，病程不但没有改善，更常会出现恶化的情况，香港有註册中医师也指出，椰子油会