（13,696平方公尺，约两个标准足球场大小），由一条桥连接长崎市内。岛上包括商馆长宅、商馆员宅、仓库、炊事场、浴室、家畜小屋、日本官员守候室等数十栋建筑以及菜园等。
人事组织.平常留守在荷兰商馆的人员有：商馆长官（日本人称为甲比丹）、次席、仓库长、书记官、商馆医、厨师、木匠、锻治、召使（黒人）等约15人左右居住。荷兰商馆被置于长崎奉行的管辖之下，长崎町年寄之下的乙名与荷兰人直接交涉。出岛乙名是出岛的负责人，负责监视荷兰人、商品的卸货、货款支付、日本人的出入、荷兰人的日用品购买等等