产的首八台机车因其卓越的牵引性能和先进的生产工艺，成为当时最优秀的铁道省标准型电力机车。1942年下半年以后，由于战争形势渐趋严峻，为了节省宝贵的金属资源，竣工机车的部分电气设备尽量减少铜消耗量，车体外板的厚度被减少，以木材等代用材料代替金属材料，并以混凝土作为配重以保持机车重量，这段时期生产的机车的质量和可靠性因而明显下降。EF12型电力机车投入运用初期，首先配属于国府津机关区和沼津机关区，主要担当东海道本线上军事列车的牵引任务，1942年的列车牵引重量为1150吨，至1943年又再提高到1200吨。