包含罗马天主教会。数以百计的教会成员被永久驱逐出这个国家，其中还包含主教。古巴政府开始宣导无神论，学者Faria描述古巴政府从官方教育着手，让孩童成为无神论者。并且认为社会主义国家对孩童有更大的责任，而禁止私有学校成立，禁止一切宗教活动，直至1991年苏联解体后，才有限度恢复。卡斯特罗其后更于1998年成功邀请时任教宗若望·保禄二世访问古巴。之后的2011年时任教宗本笃十六世访问古巴。
成立古巴共产党.革命期间，菲德尔·卡斯特罗的许多战友怀有各种不同政治理念，有些是共产主义者，有些