乱后，雍正帝又在西宁与拉萨分置办事大臣与驻藏大臣以控管青藏地区。
郡王摄政时期初设驻藏大臣（1720-1750）.1724年，清军击败准噶尔。1727年（雍正五年）正月，清世宗派遣内阁学士僧格、副都统马喇驻拉萨，“与达赖喇嘛、康济鼐、阿尔布巴等和衷办事”，并设立驻藏大臣衙门。自此，朝廷派驻藏大臣二员办理西藏事务。1739年（干隆四年），晋封噶伦颇罗鼐为多罗郡王。1747年，颇罗鼐病故，其次子珠尔默特那木札勒袭封郡王。珠尔默特那木札勒“素不信奉达赖喇嘛，心怀仇隟”，表面上顺从驻藏