以及物资，并经常访问八路军太原办事处、八路军西安办事处，先后会见周恩来、彭德怀、徐向前、林伯渠等中共中央领导人。后来，杜重远赴新疆考察，并于1938年在武汉征得周恩来同意后，应盛世才之邀举家迁居新疆，于1939年1月任新疆学院院长。1939年底杜重远被盛世才停职、软禁。1941年5月8日，他被盛世才逮捕，并被以所谓“汉奸”、“阴谋暴动”的罪名长期关押。关押期间，他受到酷刑折磨。1943年9月某晚，杜重远被秘密杀害。其尸骨至今未能寻获。