获大总统冯国璋特赦，任参议院副议长、总统府高等顾问。10月，与熊希龄等24人通电发起“和平期成会”，主张南北言和。12月任北京总统府财政委员会委员长。1920年8月任北京政府财政总长，兼盐务署督办、币制局督办。次年11月，以中国代表团高级顾问身份出席华盛顿会议。1922年任徐世昌大总统下的国务院总理兼教育总长，6月2日徐世昌辞职，将印信交由国务院摄行大总统职权，周自齐等通电表示，将大总统职权交还国会，以国民资格维持一切，听候接收。是日，周自齐等内阁成员发布国务院令，宣告国务院依法摄行大总统职权，并于6月