县出缺的时候，按惯例应当选派孔氏子弟中贤能有文辞的授予此官。孔闻籍被选为第一，他的哥哥孔闻简排第二。孔闻籍认为弟弟不能排在哥哥之前，坚决请求把官职让给哥哥。这年，孔闻籍考中举人，天启五年（1625年）又考中进士，授官为行人。崇祯二年（1629年），琉球国尚丰王遣使请封。按照惯例应派给事中和行人各一人充当琉球册封使，正使已定杜三策，副使则在萧士玮和孔闻籍中挑选，可是两人互相推诿，互骂至司正杨抡门前，杨抡忍受不了愤怒，于是自请担任副使。崇祯帝便下诏升杨抡为京官，萧士玮降三级并调外任，孔闻籍不准参与考选，调任