2005年拆除曹雪芹故居，2006年拆除唐绍仪故居。 与此同时，一些四合院被列入北京市和各区县级的保护院落，但即使保存下来的四合院，也在高楼大厦四面的围合之中，成为现代化城市中的孤岛。随着老城区保护的开展，一些原有四合院进行了改造，例如1990年由清华大学吴良镛教授主持的对北京菊儿胡同四合院的危改项目，在保留院落结构的基础上，将原有四合院的平房改为楼房，增加了厨房、卫生间等设施。该改造工程获得了联合国的世界人居奖。 北京南池子危改中，也将部分四合院房屋改成两层，并修建了地下车库。2006年，北京市公布了