一定的问题，例如缺乏音频支持或硬件加速（导致图形性能不佳）。尽管已经在计划中，但是目前还没有实现对OpenCL和CUDA的支持。也就是说，微软明确指出WSL面向应用程序的开发者，而不是面向桌面环境或生产服务器，建议使用虚拟机（Hyper-V或Kubernetes）和Azure来实现这些目的。
性能.在性能测试中，Windows Subsystem for Linux通常接近原生Linux（如Ubuntu、Debian、Intel Clear Linux或其他Linux发行版）。