谊守尚书左丞、同中书门下平章事（宰相），任命王叔文为翰林学士，开始进行永贞改革。王叔文主张废除宦官军权，受到宦官俱文珍等人的抵制。韦执谊企图施恩于岳父杜黄裳，封杜黄裳为太常卿，但杜黄裳并不领情。同年八月，唐顺宗被俱文珍发动的政变逼退，号称太上皇；唐宪宗李纯即位，史称“永贞内禅”。十一月，宪宗下诏贬韦执谊为崖州（今海南省琼山）司马，再贬司户。元和三年（808年）以前病死于崖州，杜夫人归其丧。