。信长在压制中国地方的毛利氏时，长治与其唿应并担任先锋，但是对成为中国方面总司令官的羽柴秀吉不满，于是响应丹波国的波多野秀治（妻子的娘家）而反抗信长（虽然长治本人亦抱持不满，但是更重要的是受到叔父吉亲影响）。与多数周边势力合作，进攻不顺从的势力，于是东播磨国一带成为反织田势力。因此长治被受到信长命令的秀吉进攻。长治在笼城并彻底抗战，令秀吉感到相当麻烦，后来更有荒木村重的谋反和毛利氏的援军等良好条件，一度撃退织田军，不久后遭到秀吉使用切断兵粮运输线（）的战法所影响（三木合战），和等支城陷落，亦失去毛利氏的