军经过整顿后重新建立，停止以高压政策打击反联邦势力，并以融和政策作为管治方针。其后在人类与ELS之战时，地球联邦军投入可以调动的所有军力在宇宙集结并设置【绝对防卫线】阻止ELS入侵，【绝对防卫线】全军总司令则是卡蒂·马涅钦准将。并与天上人共同合作保衞地球与人类存亡的宇宙最终决战，对抗企图霸佔地球与毁灭人类的未知物体－ELS（Extraterrestrial Livingmetal Shapeshifter）。但由于地球联邦军在军队规模与战力上遭到ELS彻底碾压，加上ELS展现其高度学习能力并与之抗衡（