教会接受三位一体教义，同样将亚流派、聂斯托留派等视为异端。教会建立的基础是根植在埃及与埃塞俄比亚，但它也拥有世界各地的大批信众。埃及的科普特人主要属于此教派。科普特正教的教会语言为科普特语（由古埃及语演变而来）。由该教会还分出了两个自治教会，分别为埃塞俄比亚正教会与之后的厄立特里亚正教会。现任亚历山大教宗为塞奥佐罗斯二世。2019年1月7日儒略历圣诞夜，科普特教会的主降生大教堂（）于开罗东部揭幕，该教堂为埃及乃至全中东最大的教堂，埃及总统塞西和亚历山大教宗塞奥佐罗斯二世一同参加了揭幕仪式。