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运用及改造.两台东风9型机车分别完成鉴定试验和运行考核后，于1993年配属广州铁路集团广深铁路总公司（今广深铁路股份有限公司），投入广深铁路运用，担当广深城际列车的牵引任务。2003年初，东风9型机车曾经一度同时担当牵引广九直通车进入香港。2005年，两台东风9型机车的走行公里数已到大修期，为了提高零部件的通用性、方便日常维护检修，东风9型机车通过返回戚墅堰机车车辆厂大修的机会，进行了较大范围的更新改造。除了柴油机、 转向架、主发电机及车体等重大部件仍利用原车部件，其余部分