.1976年10月，侯建国进入福建省福清县轻工机械厂工作。1978年，在中国科学技术大学物理系晶体专业学习。1982年在中国科学技术大学就读固体物理专业硕士研究生、基础物理中心固体物理专业博士研究生，获得凝聚态物理专业博士学位。1985年12月加入中国共产党。1989年至1995年，先后在前苏联科学院结晶学研究所电镜实验室、中国科学院福建物质结构研究所、美国柏克莱加州大学、美国俄勒冈州立大学化学系从事科学研究工作。1995年，任中国科学技术大学教授，先后任中国科学院结构分析重点实验室主任、中国科学技术