1-8道为编发线，9-11道为调车线。南京北站货场设有通往南京港第二、第三港务公司，南京东机务段浦口折返段、上海铁路局合肥车辆段和南京棉麻储运公司的专用线。
使用情况.南京北站已于2004年10月停止客运业务。封存许久的先锋号电力动车组停放于南京北站。由于仍有货运列车停靠，该站目前已禁止市民参观。南京北站办理整车货物的中转、到发和水陆联运货运业务，主要到发货品为煤炭、焦炭、钢材、粮食和化肥，粮食煤炭、钢材、矿石、棉花等。2013年以来，车站利用南京港第二港务公司码头为长江下游