妻子于1963年结婚，共有三名子女，在1988年10月13日在洛杉矶举行的第二次总统辩论中，杜卡基斯透露，他和他的妻子还有另一个孩子，但在出生后大约20分钟就去世了。麦可·杜卡基斯同时也是女演员奥林匹亚·杜卡基斯的堂弟。如同多数希腊裔居民，他是一名正教会基督徒。