请孙中山、唐绍仪、伍廷芳回广东参政。11月孙中山从上海回到广州，改编陈的军队由其直辖。后陈与孙政见逐渐产生矛盾。陈炯明主张实行“联省自治”，孙打算以武力制压北方军阀。1922年6月16日发生六一六事变，孙中山与陈炯明决裂。1923年孙控制的部队联合滇、桂军阀，击败陈炯明取得广州的控制权。孙中山控制广州后，因为二次护法运动失败，于是重组军政府。他一方面征召平民入伍，另一方面征收了一些团体如寺庙的土地进行拍卖，并大量发行纸币以筹集资金。各地军队驻扎广州以及对陈炯明部队的对峙，导致军费上升，政府因此大幅度扩大税收