由于「孔子和平奖」被视为抗衡诺贝尔和平奖，因此该概念诞生时就出现了不少争议，有中国大陆网民用「让中国人汗颜的笑话」、「对孔子的亵渎」和「山寨和平奖」来形容此奖项。获得提名的谯达摩认为诺贝尔和平奖评选委员会规模过小（5个人），代表性不足。东西方对于“和平”和“人权”理解不同。他声称“孔子和平奖”评审委员会成员多数是中国哲学界大师。香港中国事务问题专家刘锐绍表示，中共由「批林批孔」到「孔子和平奖」，乃「觉今是而昨非」的表现，政治私利压倒一切、任意扭曲历史和真理的霸气。孔子第76代传人，香港天主教正