当美国于1776年宣布从英国独立时，肖尼族产生了分裂。他们并不支持美国的反叛事业。康史达克带领了属少数的中立派。在俄亥俄河以北的肖尼族都不喜欢移入肯塔基州的美国人。有历史学家记录称大多数肖尼族与英国一起对抗美国。和等战争领袖加入了在田纳西河下游和的切罗基人去对抗当地的殖民者。有部分殖民者称他们为“奇克莫加（Chickamauga）”因为他们在期间住在当地。在美国独立战争后的西北印第安战争中，肖尼族和在俄亥俄谷地结合成了一支强大的力量。在1794年中战败后，多数肖尼族支派于次年签署了《》。他们被迫割让