有《诸病源候论》。这是中国第一部详细论述疾病分类和病因、病理的着作。书中记有用肠吻合手术治疗外伤断肠，是中国外科手术史上的重大成就。但《诸病源候论》也有不少错误，例如在〈九虫候〉中称：「蛲虫在人肠内，变化多端，发动亦能为癣，而癣内实有虫也。」事实上蛲虫跟癣没有关系。隋炀帝于大业时期敕编《四海类聚方》，全书共2600卷，专述理论，与《诸病源候论》相辅相成。