也因之改名为大佛寺。唐朝开元年间，大佛寺改名开元寺。大历四年（公元769年），禅宗高僧马祖道一造访寺院，同时讲经说法。因此四方信徒云集洪洲，马祖道一收入室弟子139人，这一时期的开元寺成为江南的佛学中心。据《中朝佛教文化交流史》记载，开元年间初期，有新罗僧人金大悲居住于寺内。大历年间，洪州一度改名钟陵。大历八年（公元773年），禅宗八祖之尊的释道一住入寺内，在寺内弘法长达15年。唐朝以后，寺院建筑多次毁而又修，同时曾多番更名，如承天寺、能仁寺、永宁寺。清朝顺治年间，寺院更名为佑清寺。嘉庆年间，寺