来人们对于眼镜蛇瓶子草的授粉方式都不甚了解。其花朵形状特殊而复杂，是虫媒花的特化标志，但尚未被确定。眼镜蛇瓶子草的花朵为黄紫色。花外侧有5枚绿色的花萼，内侧有5枚带有红色纹路的花瓣，花萼比花瓣长。目前尚未实际观察到授粉的过程，只能推测授粉者为苍蝇或一些夜行性昆虫，被花朵怪异的味道吸引而来。
种下类群.斯图尔特·麦克弗森和唐纳德·施奈尔在他们2010年的专着《北美的瓶子草科植物》中对瓶子草进行了全面的修订。他们确定了以下眼镜蛇瓶子草的类群：巴里·赖斯博士发现并命名了一种名为奥赛罗