国军攻佔当时中共中央所在的中央苏区，中国工农红军主力被迫展开逃亡，于1935年抵达陕北。1936年12月发生西安事变后，国共双方同意停止内战，达成合作抗日协议，中国工农红军编入国民革命军，中国共产党统治的陕甘宁边区则在名义上由国民政府直辖。1937年中国抗日战争爆发后，国民政府将大量地方军阀武装推上抗战前线，而胡宗南等中央军精锐则包围陕甘宁边区；中国共产党则以游击战为主，建立大量敌后根据地。国共双方皆指责对方抗战不力，并多次军事冲突。1945年抗日战争结束后，国共之间的矛盾因裁军、行宪与联合政府等议题再