女王学院于公元1839年在京士顿成立。公元1841年10月16日，维多利亚女王发佈皇家特许状并由苏格兰长老会委托汤玛斯‧里德尔抵至京士顿正式成立女王学院。女王学院的建立乃是由上加拿大之苏格兰长老会为了加拿大本地的教育以及培育科学和文化所极力推动的。初期以英国苏格兰风格的爱丁堡大学和格拉斯哥大学体系为雏形，在公元1842年3月7日于当时的京士顿郊区有两位教授和十三位学生开始了第一堂课。
草创时期.最初的11年里，大学没有固定的校舍，直到教学楼Summerhill的修建（至今仍矗立在校