天下祖庭”匾额。宋徽宗于崇宁元年（1102年）御题“天下禅林”。期间，师戒、法演、表自、宗拔等法师任五祖寺方丈，特别是法演住持时期，大振宗风。此后，佛果克勤、佛鉴慧勤、佛眼清远三人，时称“三杰”，广扬佛法，禅风大盛。宋末后东山毁于战火，一时冷落萧条。元朝至元十九年（1282年）了行禅师入东山五祖寺，重建祖庭。至治二年（1322年），法式禅师恢复佛事，使一时趋于衰微的五祖寺中兴。至顺二年（1331年）元文宗改东山五祖寺，一直沿用至今。
着名典故.五祖寺中曾经发生过着名的禅宗作偈之