顾琮上疏说道，“运河堤未设堡房。请视黄河例，每二里建堡房，都计四百馀座。”十九年（1754年），因江南总河任内在施工银两方面有浪费，再度被夺官，不久，顾琮病卒。顾琮个人操守严肃正直，曾入宫接受皇帝询问，当时恰逢气候干旱多风，雍正帝为此担忧。顾琮引述《尚书·洪范》中的“蒙恒风若，虑臣或蔽君”，使雍正帝为之动容。此后，雍正帝驾崩，顾琮也刚刚丧偶，三年之后才续娶。方苞认为此举合乎礼法。