“目前是认真思考废除国统会及国统纲领的适当时机”这一观点。就此民进党籍的立法委员柯建铭表示，1月立法院在审查总预算时，就已通过由在野党提出的“政府非法制化任务小组应停止运作”，因此包括人权小组及国统会都该废除。针对柯建铭的言论，国民党籍的立法院院长王金平则强调说，当初国统会与国统纲领是行政院院会通过后颁布实施的，这与立法院上会期审查总统府预算时通过决议，要求总统府内非编制组织包括人权委员会、科技谘询委员会停止运作的情形不同，因为这些组织都是没有法源依据的。陈水扁的言论引发泛蓝人士的勐烈抨击，被认为是