何金龙的剪黏作品亦是慈济宫建筑的一绝，在庙壁上可见「古城会」、「打黄盖」、「鸿门宴」、「甘露寺看新郎」、「金山寺」等208件作品，十分精美。正殿中有着名书法家杨草仙先生于九十高龄时手书狂草「龙飞」、「凤舞」四字，字长四尺。山川殿门神原由台南彩绘名匠潘丽水所绘，惜乎于2004年改建时，重新绘制，而两旁龙、虎门的门神彩绘，则是由已故新传奖得主李汉卿所构绘。庙中楹联多由名人手书，如正殿中可见叶公超、钱大钧所写的对联，后殿则有吴三连、黄雪村、宗孝忱的作品。庙中的匾额甚多，其中有六方清代古匾，分别是1861年