日本足球俱乐部列表会列出位于现时有参加日本足球联赛系统所属职业联赛（J1、J2、J3及JFL）的足球俱乐部，以下列表分别按俱乐部所地地区及所属联赛级别排列。
按联赛等级.
日本足球联赛（第四级）.日本足球联赛（Japan Football League，简称JFL）为日本最高级别的业余足球联赛，大部份球队都是日本公司所属的业余球队。职业联赛球队的B队也可参加，只有持有日职联准成员资格的A队，才可升级至职业联赛。
日本地区联赛（第五级至第六