宫旧址驻扎有八旗军队，设江宁将军管辖。清廷在江宁设立规模庞大的江宁织造署，生产供应皇家需求的丝织品，因此在经济方面江宁也具有相当的重要性。干隆时，以江宁织造署官署为江宁行宫。1842年8月，清朝在第一次鸦片战争中战败，被迫与陈兵江宁江面的英国签订《南京条约》。1853年3月，太平军攻陷江宁后定都于此，改名“天京”。1864年7月，曾国藩弟曾国荃率湘军攻破天京后纵火杀掠。中央研究院近代史研究所创所所长郭廷以院士、在其所着《近代中国史纲》记载：「湘军『贪掠夺，颇乱伍。中军各勇留营者皆去搜括』，……『沿街死尸