连丹后守护职的名分都被宿敌若狭武田氏夺去，长时间以守护家的权威支配丹后。永禄元年（1558年），因为父亲义幸隐居而继承家督，进入加佐郡的八田守护所和建部山城，令弟弟义清进入吉原城并治理丹后国奥三郡。把名字中的「辰」字赐予弟弟昭辰，而昭辰亦同样受将军足利义昭下赐偏讳（「昭」字），并以奉公众的身份成为将军家的近侍。因为昭辰的介绍，与毛利辉元加深关系，由此确立战国武将的地位。而且参加越前一向一揆讨伐战等，与织田信长亦加深关系，被信长拥立的足利义昭将军正式承认拥有丹后一国，不过在比叡山被火攻后，因为匿藏被追