国共产党对三区革命持支持态度，并加以正面宣传。但在21世纪，面对三区革命遗留的影响和新疆社会因分离主义问题动荡不安的现实，有研究者认为应打破沉默，重新评价苏联、新疆关系和三区革命，还原历史真实。伊犁哈萨克自治州至今依然是特殊的“副省级自治州”，管辖塔城地区、阿勒泰地区。