熙三年（1664年）分湖广省为湖广左、右布政史司，其中右司即为现在的湖南省，长沙为湖广右布政使驻地、长沙府府治、长沙县和善化县县治。雍正元年（1723年）改湖广右布政使司为湖南布政使司。湘潭在明朝后期形成的商贸繁荣逐渐转移到长沙。清朝中期时长沙成为四大米市之一，贸易繁荣。湘军的建立是湖南历史与长沙历史的重大事件。出生于长沙府湘乡县的曾国藩成立了湘军并带领一批着名将领，如左宗棠、曾国荃、李鸿章等人，帮助清政府镇压太平天国运动。经过十多年的战斗，太平天国运动被镇压，湘军主要人物都成为了清朝重臣。湘军人物