蒙古衙门”为理藩院。定土谢图汗、车臣汗、札萨克图汗贡物为八匹白马与一匹白驼。次年，苏尼特部首领腾机思、阿巴噶部首领多尔济归附。顺治九年（1652年），青海顾实汗导达赖喇嘛入觐。顺治十二年（1655年），居俄罗斯额济勒河（伏尔加河）之土尔扈特部首领书库尔岱青遣使入贡。康熙二十七年（1688年），准噶尔部噶尔丹入侵漠北，喀尔喀三部大败，土谢图汗、车臣汗、札萨克图汗部举族南迁，归附清朝，被安置于漠南边内。二十九年（1690年），噶尔丹领进兵至赤峰。清军在乌兰布通将其击退。噶尔丹退回漠北后，被其侄策妄阿拉布坦拒