仍为会稽郡，郡移治山阴县（今绍兴市）。是为“吴会分治”。尽管吴郡的辖区大大缩小，但这是人口增多的必然结果，丝毫不影响其中国东南中心城市的地位。汉末的孙坚、孙策和孙权父子就在吴郡发家，孙策更在吴县定都。孙氏父子依靠吴郡当地的世家大族（主要是吴郡四姓，即顾、陆、朱、张四姓），建立起江东孙氏政权，后发展为三国之一的吴国。后来孙权迁都京口（今江苏镇江），又迁建业（今江苏南京），吴县的中国东南政治文化中心城市的地位逐渐被建业取代，但它作为孙吴集团的发家之地，仍为重要的经济中心。
三国两晋南北朝