胶东特委改为胶东区委，王文任区委书记兼军政委员会主席。1939年9月，在胶东成立了山东省第三军区，统一领导除第五支队以外的各地方武装，王文兼任政治委员。1940年6月，王文率胶东区党政军机关进驻大泽山区，扩大了大泽山抗日根据地。1940年9月，山东分局派林浩任胶东区委书记兼军政委员会主席，王文改任区委副书记。1940年底，八路军山东纵队整编，原山东纵队第五支队改编为山东纵队第五旅，以原第三军区机关及所属地方武装为基础，重新组建山东纵队第五支队，王文兼任政委。1942年9月，王文任胶东区行政主任公署主任兼兼胶