师与厂长室秘书，协助厂长处理业务，母亲鲁曼珍和家人也住入台湾糖业公司宿舍。不过1950年2月26日，负责厂区安全的内政部警政署保安警察第二总队进入月眉糖厂招待所，指称员工参与非法赌博，洪子瑜因而当场逮捕。与此同时，台湾糖业公司总经理沈镇南被指控与中国共产党有所联系。洪子瑜因生性爽朗、个性耿直且经常评论时局，被情治单位视为思想亲近中国共产党而不忠于政府。也因为得罪公营事业情报单位主管龙次云，最后遭沈镇南资匪案牵连。洪子瑜和数名同事在台中县关押1天后，隔天凌晨3时由龙次云亲自监督，从台中县大甲车站送往台北市