王载沣而被捕，康宝忠被清政府怀疑并受到跟踪，康宝忠遂借年假以省亲的名义回到四川成都。宣统三年正月（1911年），因父亲逝世，康宝忠居丧于家。四川保路运动时，革命党人以康宝忠家为聚会地点，密谋反清。1911年武昌起义爆发后，康宝忠赴重庆，到达重庆时，张培爵等已宣布独立，请康宝忠任内务部部长，康宝忠推辞未就任。随后他到南京，任临时大总统府秘书处文牍科负责人。后他任南京临时参议院议员，不顾孙中山建都南京的主张，力主迁都北京。后经临时大总统府交通部次长于右任劝说，康宝忠放弃迁都北京之见，但未出席参议院会议。此后