病毒基因组与SARS-CoV的主要差别是前者在ORF6与ORF7间多出了一个开放阅读框ORFX，体外细胞实验结果显示缺少ORFX不会导致WIV病毒感染细胞的能力下降，但ORFX编码的蛋白可能可以抑制宿主细胞的干扰素β，并刺激NF-κB表现，进而调解宿主的免疫反应。另一与SARS-CoV相关的蝙蝠病毒株WIV16亦具有ORFX。