约翰继续执行其父的分离主义政策，企图使勃艮第变成一个完全独立的公国，并致力于加强对尼德兰的控制。1408年，无畏的约翰率勃艮第军队镇压列日市民起义。他与奥尔良公爵路易一世进行残酷的夺权斗争（所谓阿马尼亚克派与勃艮第派内战的斗争），以争夺患精神病的法王查理六世的摄政权。1407年，无畏的约翰派人刺杀了路易，此后他成为法国的摄政（至1413年）。无畏的约翰曾支持1413年西蒙·卡博希领导的巴黎市民起义，企图利用这一运动打击奥尔良派；但在宫廷作出镇压的决定后，他就出卖了他的盟友。为达个人目的，无畏的约翰