逃往淮安，与南逃的周王、崇王一同寓居于湖嘴舟中。三月十一日周王朱恭枵薨于舟上，三月十八日福王上岸，住在杜光绍园中。三月十九日李自成陷北京，崇祯帝自缢，是为甲申之变。廿九日，消息传至淮安。四月崇祯帝自尽的消息，传至南京，北京沦陷后，南京以及南方各省仍在明朝的控制之下。南京诸臣皆认为国不可一日无君，议立新帝。但对大宝谁属，则有一番论战。从血统上来说，崇祯帝殉国，其子太子朱慈烺及永王朱慈炤、定王朱慈炯陷入清军之手，而崇祯帝已无在世兄弟，而崇祯兄长天启帝无子，其他兄弟皆在未成年之前已死而无后，而故应从崇祯帝