有河马、水獭和海牛。而雨林中还生活着当地特有的非洲森林象。刚果河流域水生生物的物种多样性非常高，有已知最高密度的特有种。在刚果河已发现了将近700种鱼，其中大部份都还没有相关研究。由于此处的生物多样性及流域中的生态差异，一般会将刚果河流域划分为四个生态区。在这些生态区中，李文斯顿瀑布有超过五十种鱼，其中有八十种是特有种。流域的西南边（开赛河）有超过二百种鱼，其中约有四分之一是特有种。此区域主要的鱼包括鲤科（辛普森野鲮）、象鼻鱼科（象鼻鱼）、鲑脂鲤科（单带矮非脂鲤）、倒立鲶科（squeaker catfi