年（民国2年）二次革命爆发，四川熊克武任讨袁军总司令，杨庶堪被熊克武任命为四川民政部长。不久，熊克武败北，杨庶堪流亡日本。在日本，杨庶堪参加了黄兴组织的欧事研究会。翌年，孙文组织中华革命党，杨庶堪被任命为政治部副部长。1915年（民国4年），杨庶堪赴上海，参加陈其美举行的起义，但以失败告终。此后，杨庶堪赴南洋为革命派筹集资金。1918年（民国7年）3月，熊克武任四川督军，四川省议会接受其推荐，选举杨庶堪为四川省省长。杨庶堪于10月回到四川主持政务。不久，政学系支持的熊克武同孙文支持的杨庶堪发生对立。