最大的支流为沃佩斯河。 内格罗河可通航的河段长度有720千米，在旱季时水深可达1米，但河道中也有沙洲。雨季时（4月-10月）下游640千米段河道可宽达32千米，河流湍急，摩托艇可直接航行到安第斯山脚下。内格罗河之所以被称为黑河，主要是因为上游植物落叶腐烂造成其河水颜色深如同浓茶水，而河水中含大量腐殖酸，有大量鱼繁殖，岸旁的沙洲也成为了多种海龟的繁殖地。