波昂兼任首任外交部长。2000年，外交部总部迁至柏林德意志帝国银行暨德国统一社会党（前东德执政党）旧址，而原来的波昂办公室则成为第二办公室。
部长及领导架构.德国外交部在联邦外交部长之下尚设有和国务秘书（）两种职位，国务部长为政务官，负责辅佐外交部长执行公务，主要承担政治机能。国务秘书则是外交部层级最高的事务官，代表外长管理部务，除了专门领域之业务外，德国驻海外使领馆亦由国务秘书管理，每日例行主持的各司司长会议也由国务秘书主持，探讨全球局势。德国外交部高层设有如下部门：