2011年12月12日，突尼斯制宪议会以155票赞成、3票反对、2票弃权以及44张空白的废票的结果，选举马佐基为总统。马佐基在当选后表示：“能承担这最宝贵的责任，担任人民、国家和这场革命的保证人，我深感骄傲”。
卸任.他在2014年总统选举第一轮中获得1,092,418票，得票率33.43%，与得票第一的前总理贝吉·凯德·埃塞卜西在12月举行的第二轮中对决。第二轮中他获得1,378,513张选票，以44.32%的得票率败于对手。