国力的衰微以及土鲁番势力的强大，哈密卫的“弃”与“守”成为当朝大臣讨论争锋的焦点。世宗和穆宗统治时期边患增多，北虏南倭使明朝疲于应付，特别是面对套寇屡屡犯边，边疆祸事不断，曾铣等有识之士就收复河套问题多次上疏。穆宗在位期间实现了明蒙之间具有里程碑意义的隆庆和议，结束了蒙古各部与中原王朝近二百年兵戈交战的局面。神宗在位时爆发了万历三大征，虽然取得胜利，但是耗费了明朝人力物力财力，使国家日趋衰败。内阁首辅张居正启用大将李成梁和戚继光，在辽东和蓟镇取得大捷。熹宗明思宗时期明朝衰落到不可收拾的地步，东北女真建立