他，常与同学议论时政，并走上了反清革命之道路。是年8月，黄兴到武昌，两人相识并从此成为挚友。不久，黄兴因激烈的反清言论，被驱逐出武昌，回到长沙。随后，宋教仁也回到湖南，为成立革命团体到长沙、常德一带做联络工作。1903年11月4日，偕黄兴、刘揆一、陈天华、章士钊共同成立华兴会。1904年2月25日，以「驱除鞑虏、恢复中华」的政治口号，正式在长沙西园成立华兴会，众人选出黄兴担任会长，宋教仁为副会长。宋教仁旋回武昌，倡组科学补习所，即此种活动之一环。6月，科学补习社举行成立大会，宋教仁任文书。10月，宋教仁