站有一个岛式月台以橙黄色为主色调，月台墙身铺设的焗漆板印有地铁公司退休建筑师区杰棠书写的站名书法大字，是首批非属于原地铁系统而印有书法字的车站。而月台漆版会有与启德机场或飞机驾驶室有关的设计。
商店.车站合共有10间商店，其中香港置业有两个舖位。其中已经开业的商店包括OK便利店、HKTVmall、原味家作、唐包点、争鲜、山崎面包、恒生银行自动柜员机和食家优惠店等。
出入口.启德站设有3个出入口，并预留1个出入口（C出入口）通往车站上盖及地下街。其中A出口通