双方的军队都曾多次侵入对方控制下的领土。红色高棉的高层认为下高棉人正准备推翻越南人统治，便企图将下柬埔寨纳入民主柬埔寨势力范围。柬埔寨革命军多次侵入湄公河三角洲，并派特工人员煽动下高棉人起义。然而，下高棉人根本就没有足够的装备、动机和组织能力发动起义。波尔布特认为是特工人员受到越南当局的收买叛变了，于是对下高棉人展开报复行动。红色高棉越境对越南平民进行无差别屠杀的同时，亦对下高棉人大开杀戒，因为红色高棉认为这些人是“有越南心的高棉人”。红色高棉在巴祝、土珠岛等地的屠杀行为引起越南人的愤怒，最后成为越南全面发