。五世达赖喇嘛与和硕特蒙古联合统治西藏的时期被称为“甘丹颇章”时期。
清代.
驻藏大臣和噶厦的设立.1701年，和硕特汗国最后一任可汗拉藏汗继承汗位，清朝康熙皇帝册封为翊法恭顺汗。1705年，厄鲁特蒙古准噶尔汗国与清朝发生战争，拉藏汗进攻拉萨，罢免并诱杀第悉桑结嘉措。1706年6月28日，拉藏汗杀桑结嘉措后，更与康熙皇帝决定同时废黜第六世达赖喇嘛仓央嘉措，重新选定阿旺伊西嘉措为六世达赖，得到康熙皇帝的册封。清康熙四十八年（1709年），清朝派遣侍郎赫寿前往拉萨