1日起，由原有的37部会分阶段整併为29个部会。分成14部、8会、3独立机关、1行、1院、2总处，中央政府总员额上限则从现行的19万200人减至17万3000人。2012年1月1日起，陆续启动新的行政院及中央部会组织架构。原组织架构的11部会，原行政院新闻局、行政院消费者保护委员会、行政院青年辅导委员会、行政院体育委员会、行政院经济建设委员会及行政院研究发展考核委员会等已遭裁撤或降编；尚有行政院海岸巡防署、蒙藏委员会、行政院公共工程委员会及行政院原子能委员会等待新法源实施后也将裁撤或降编。2012年