温尼伯戈西斯湖流域覆盖马尼托巴和沙士吉万内的49,825平方公里，支流有雷德迪尔河（Red Deer River）、伍迪河（Woody River）和天鹅河（Swan River）。湖水经Water Hen River进入马尼托巴湖，因此属于温尼伯湖、纳尔逊河（Nelson River）和哈德逊湾（Hudson Bay）的流域。湖名温尼伯戈西斯是取自温尼伯湖，温尼伯意为「大型泥水区」（big muddy waters），而湖名温尼伯戈西斯意为「小型泥水区」（little muddy waters）。