汶岛加入抗葡联盟，并取得了从Hitu购买香料的唯一权利。葡萄牙殖民者在1609年遭荷兰人驱逐。1623年时，10名英国人、9名日本人和1名葡萄牙人在安汶被荷兰殖民者指控叛国罪并将之处决，另有4名英国人和2名日本人被赦免。1623年3月9日遭斩首，称为安汶大屠杀。事件导致英国人定居点被摧毁。英国人于1796到1803年短暂统治安汶岛，1810年再次统治，1814年复归荷兰人控制。此后直到1942年日军攻入安汶岛，安汶一直在荷兰的统治之下。在荷兰统治时期，安汶既是荷兰人的居民点，也是马鲁古军事司令官的所在地