1949年9月2日，重庆发生火灾，延烧十八小时，死亡近万人，全市精华损失大半，中国国民党指出为中国共产党纵火。同月九日，南岸大火，焚毁八十余家。1949年10月11日，总统令公布政府将于10月15日第二次移渝办公。1949年10月13日，李宗仁代总统由广州飞桂林，行政院各首长由广州迁重庆。1949年10月15日，宣布国民政府正式在重庆办公。1949年10月18日，各界欢迎政府迁渝大会。1949年11月1日，中国人民解放军攻占重庆的南泉战役打响。1949年11月27日，中国国民党中央直接授权中统对关押于渣滓