，付款方式为购买预付卡，并兑换为线上点数支付；多数软体皆採用了三阶段的定价方案。作为促销手段，任天堂为每部任天堂DSi免费提供了1000点任天堂点数，使用期限依各地区而有所不同。另外，由任天堂及Opera软体开发、专为任天堂DSi设计的网路浏览器任天堂DSi浏览器也同时上架。至2011年6月，已有超过350款游戏及其它软体上架任天堂DSi商店。大部分在任天堂DSi商店购买的游戏皆可转移至任天堂3DS，不过游戏资料本身则无法转移。2016年9月30日，任天堂终止了任天堂点数的退款机能；2017年3月31日