粤汉铁路、广三铁路、广九铁路全面管理，修筑了一条由广北联络线云麓至广九铁路永村的联络线，两端设云麓、永村线路所，称为“云永联络线”。至此，大沙头站扩张为广九及粤汉两路的旅客列车的始发、终到站，并改名为广州东站，仅负责客运业务。同时，粤汉铁路的原终点站黄沙火车站更名为广州南站，主营货运及列车编组。粤汉、广九两线虽相连，但管理上自成体系，而广三铁路又位于珠江南岸，彼时广州枢纽尚未形成。
新中国成立后.1949年10月14日，解放军接管广州市，广九直通列车中断运行。三天后，解放军先后