县碧山岩的寺院安身，教授寺院比丘尼的文史课程，生活才稍为安定。1958年，经徐复观相助，韦政通以着作检定取得教师资格，至台中一中担任高中教师。1963年，韦政通与牟宗三等新儒家学者分道扬镳，在《文星杂志》中批判儒学的缺陷，开始其自身独立的思想探险。殷海光透过学生王晓波与韦政通会面，并对韦政通非常赏识；韦政通由此加入了自由主义者的行列。晚年结识学生陈复，师生常相论学，并共同受邀到越南河内人文社会科学大学讲学，从事台湾研究讲座。后韦政通获聘为国立宜兰大学生命教育研究室荣誉顾问，并颁发「政通学者」的荣誉给其学