副总司令的徐树铮请他到设在中州会馆的驻津奉军司令部一谈。6月14日，陆建章如约而往，徐树铮和奉军参谋长杨宇霆请他到花园密室中谈话，当陆走进花园的时候，被徐树铮的卫兵从后开枪击毙。享年57岁。陆建章被杀案成为直皖两派分裂的导火索，最终导致1920年的直皖战争，双方兵刃相见。