由于陆海长期的内斗而完全隔离、未进行合作。陆海两军的龃龉不合到了战争时期更显得严重。一个显着的例子是日本海军在1942年中途岛海战中严重挫败后，隔了数週才通知陆军这场灾难性的结果。两军对资源的争夺也使得战况对日不利，日本海军的舰艇消耗大量燃料，但荷属东印度的石油却掌握在对燃料需求较少的日本陆军手中。油料的分配不均，间接导致了1944年菲律宾海海战和雷伊泰湾海战中，均发生了战场附近的日本海军舰队无法支援的情形。日本昭和天皇在《》里提到，日本输在陆海两军之间的恶劣关系和作战上的不一致。Section