拉萨后，他们宣布5岁的十二世达赖喇嘛亲政，并于藏历3月12日在布达拉宫举行了仪式。然而，哲蚌寺及甘丹寺僧众强烈要求旺曲杰布返回拉萨并恢复旧职。骚乱期间，旺曲杰布已被满庆召回拉萨从事调解工作。藏历5月13日，十二世达赖喇嘛在拉萨正式宣布亲政，并接见了新任哲蚌寺首领以及旺曲杰布。藏历5月19日，色拉寺首领也前来表示效忠。藏历5月27日，噶厦官员们称，“尽管逹赖喇嘛已经挑起了宗教和世俗统治两付重担，但他还太幼小，难以胜任，因此，急需任命一位行政首脑。”哲蚌寺及甘丹寺提名旺曲杰布担任行政首脑，最后该提名被上报驻藏大