系统发生学的研究数据指出蚬蝶科是灰蝶科的旁系群，所以将其独立成科。蛱蝶科则是灰蝶-蚬蝶演化支的旁系群。
内类群.蚬蝶大约在9600万年前的白垩纪中期时从灰蝶中分离出，并约在8100万年前繁衍出不同物种。蚬蝶是单系演化支，起源如新热带界的原始亚马逊雨林低地。古蚬蝶亚科的白珂蚬蝶族中，两个新热带界单型物种白珂蚬蝶和粉蚬蝶是衍生出分佈于旧大陆的古蚬蝶亚科物种的起源，并相信是在渐新世时横跨白令陆桥扩展到欧亚等地。蚬蝶中亦只有古蚬蝶亚科和白珂蚬蝶族的物种幼虫会以报春花科植物作寄主。