安装备用器械的设计。而特急型车厢座位加入屏幕的设计，则于E655系高级列车中首次应用。至于关节式转向架的实用化，则由2006年3月落成的E331系来实现。E331系只有一列14辆的量产先行车辆落成。经过一年的试车后，于翌年（2007年）3月18日于京叶线投入服务。但使用时间并不长，中间曾数次停驶后复驶，于2011年1月起停驶后没有再恢复行驶。最终在2014年4月2日于长野综合车辆中心除役解体。
退役.2006年7月12日至13日间，E993系被牵引至郡山综合车辆中心，并于抵达后