1946年，国立艺术专科学校迁校杭州，李仲生于当年8月1日被续聘为该校教授，但不久即因病离职。1948年8月，李仲生出任广州市立艺术专业学校教授至1949年5月8日止。 1949年后期，李仲生随国民政府迁居台湾，并进入台湾省立台北第二女子中学担任美术教师，同时与何铁华、黄荣灿等结识。1950年代初期，李仲生开始透过大量文字论述传播其西方现代主义绘画观念及理解。1950年起，李仲生与黄荣灿、刘狮、朱德群、林圣扬等在台北市汉口街成立「美术研究班」，并亲自于班上教授「美术概论」；当时，其学员有吴昊