生活环境而死亡(参见六月流放)。这是起义发生的重要原因之一。这些惨剧也让德军对苏联的进攻取得某些正当性。立陶宛人开始组织起他们的武装团体，并躲进森林中，等待时机发动起义。立陶宛武装团体，(LAF)，于1940年秋天成立，其目标为重建立陶宛的独立，由驻柏林的立陶宛大使，，所领导。因此他们准备组织、整合立陶宛的起义行动并储备起义行动所需的物资。其以的方式运作而且有许多团体以LAF自居，即使他们跟LAF一点联系也没有。LAF在维尔纽斯和考纳斯建立了军事-政治总部。然而他们和柏林的联系却十分薄弱。然而苏联在19