有特别的情意。他为台湾建立自由、民主、人权的普世价值，同时奠定日台关系的基础，许多日本国民对他怀有特别的亲切感。对于李登辉辞世真的感到很遗憾，由衷祈祝他在天之灵安息。」驻日代表处于8月3日设置追思处供日本各界追悼，包括日本副首相麻生太郎、前首相森喜朗、福田康夫、环境大臣小泉进次郎、文部科学大臣萩生田光一、沖绳及北方对策担当大臣、国土交通大臣政务官、外务副大臣、内阁官房长官菅义伟、内阁官房副长官、、东京都知事小池百合子，以及多位参众议员等日本政要前往致哀。8月9日，前首相森喜朗和等15人搭乘包机赴台弔唁李登辉