上邽（今甘肃省天水市），乞伏干归派大将乞伏益州率军讨伐，边芮以为乞伏益州脾气暴躁，骄兵必败，难当此任，乞伏干归不听，后乞伏益州果然至大败。乞伏干归降附后秦。401年后秦归义侯乞伏干归自长安回到苑川，任命边芮为长史，王松寿为司马。