因台北公会堂（今台北市中山堂）兴建需要，原址既有之钦差行台厅舍一部份移筑至台北植物园，另一部份移至圆山动物园。1949年（民国38年），台湾省立林业试验所改为台湾省农林厅林业试验所。1999年（民国88年），台湾省农林厅林业试验所改为行政院农业委员会林业试验所。
园区设施.园内有二级古蹟钦差行台、市定古蹟台北植物园腊叶馆、仿日式木造平房南门町三二三，在部分大王椰子树干上甚至还留有二次世界大战遗留的砲弹痕迹。十二生肖植物园区、裸子植物园区、多肉植物园区、圆形温室（仿自纽约