1912年9月7日，任北京政府海军部视察。1913年1月17日授海军中校，5月16日调任海军部军需司司长。10月27日复任海军部视察。1913年12月15日，王崇文被海军部派任政治会议议员。1914年5月25日晋升海军上校。1915年12月17日派驻英国任中国驻英国公使馆海军武官，兼驻英海军留学生监督处监督、驻美海军留学生监督处监督，他一直任至1916年9月14日才被免职。1916年1月14日获三等文虎章，6月任海军部参事，12月4日兼任海军部视察，12月9日获三等嘉禾章。1917年3月8日授海军少将。