李秀成等人支撑下，太平军在数年间挡住了清军的多次攻势。1859年族弟洪仁玕抵达天京，洪秀全大喜，封仁玕为军师、干王，名义上总理天国朝政，却不肯把军事权力交给他。由于洪仁玕未有立功而封王，洪秀全怕其他人不服，再次封异姓为王。1862年英王陈玉成被杀后，形势急转直下，天京附近据点逐一陷落。李秀成知道天京难以久守，向洪秀全建议放弃天京，转战中原，被洪秀全斥责。1864年3月，天京遭到包围后，城内粮食不足，洪秀全带头吃“甜露”（杂草与观音土混成的黏团）充饥，因而致病。1864年6月1日（同治三年