成丹先赶来，结果被诛杀。王匡害怕，投奔张卬。李松与赵萌等进攻位于长安王匡、张卬等人。最终王匡等人逃走，并向赤眉投降。更始回到长安的长信宫居住。更始三年（25年）九月，赤眉军攻入长安，更始帝单骑逃走。同年十月，投降于赤眉军，将玺绶送给赤眉军拥立的皇帝刘盆子，自己被封为畏威侯，不久改封为长沙王，刘秀则遥降封之为淮阳王。由于当时三辅人民不满赤眉暴虐，都同情更始帝，赤眉将领张卬为绝后患，于是派谢禄将更始帝缢死。
东汉官方对刘玄的地位认定.25年刘秀建立东汉后，为确立自己为光复汉室的正统