1365年（至正二十五年）十二月，元惠宗册封奇氏为皇后，册文是：1368年（至正二十八年）正月，朱元璋建立了明朝，建元洪武。朱元璋派征虏大将军徐达，副将军常遇春，率师25万北上灭元。元朝仍旧内部纷争不息。元惠宗只好集合后妃、皇太子、皇太子妃，半夜北逃上都开平（今内蒙古多伦西北）。1368年9月14日，明军攻入元大都，元朝至此灭亡，自元世祖忽必烈1260年登基到元惠宗1368年北奔共108年。奇皇后逝世于1369年，这年朱元璋出师进攻开平，元惠宗又逃到应昌。不久51岁的元惠宗因痢疾去世。皇太子爱猷识理达