教宗亚历山大六世与他的情妇瓦诺莎·卡塔内所生的第4个，同时也是最小的孩子，他另外3个兄弟姊妹分别是兄长切萨雷·波吉亚、乔凡尼·波吉亚以及姊姊卢克雷齐亚·波吉亚。
婚姻.乔弗雷于1494年他12岁时娶了那不勒斯的阿方索二世之女阿拉贡的珊莎为妻，珊莎比乔弗雷大4岁，他们年轻的爱情也成为了许多艺术作品的题材。因着与珊莎的婚姻，1494年珊莎获得了斯奎拉切公国作为嫁妆，也让她与丈夫获得了斯奎拉切亲王与亲王妃的称号，在那不勒斯经过了一段动盪的政治情势后，他们也于1497年获得了阿尔维托(