经常受到原住民的骚扰。哥萨克领袖叶尔马克·齐莫菲叶维奇在1578年（明万历六年）10月开始东侵。几年内，叶尔马克等征服了库臣汗国，平定了西伯利亚西部。其后叶尔马克在进攻西伯利亚汗国时阵亡，西伯利亚汗国则于1598年灭亡。之后俄国人继续东进，1636年（明崇祯九年）到达鄂霍次克海，征服了西伯利亚全境。这个地区成为了俄国人的领土，俄罗斯亦至此成为世界上领土最大的国家。当俄国的势力接近清朝领土时，便发生了军事冲突。1652年（清顺治九年），俄人东入黑龙江，「驻防宁古塔章京海色率所部击之，战于乌扎拉村」。这是中