制，堪布师徒相承。到第十三任堪布喇尊白巴（生卒年不详）主持该寺期间，正值蒙古准噶尔部侵入西藏，曲果伦堡寺遭严重破坏，师徒传承堪布的制度中断。后来直至民主改革前，又有第十四任至第二十五任堪布主持该寺，最后一任堪布是坚赞桑布。过去，曲果伦堡寺的组织机构由堪布、翁则、卡孜、格贵、吉巴等组成，拥有土地300余亩。民主改革前，该寺有喇嘛80人。文化大革命中，该寺被毁灭。1982年，民众集资恢复该寺，新建莲花生殿，殿内供奉莲花生及二妃泥塑像。
建筑.曲果伦堡寺原有的主要建筑有：曲果伦堡