aperture）大，额骨未融合且颅骨后部无纹饰（ornamentation），显示巨颌鳄确实是鳄形超目的非鳄形类（non-crocodyliform）成员。此外，巨颌鳄头部内的构造，如较为扩展且高度气室化（heavily pneumatized）的基蝶骨（basisphenoid），则可能表示巨颌鳄在鳄形总目家族中是较为进化的一员。而针对巨颌鳄和跳足鳄的关系，莱迪等人认为跳足鳄确是巨颌鳄的近亲，并且和跳足鳄形成姐妹群的演化关系。与格里等人的观点不同的是，莱迪等人的研究指出巨颌鳄和跳足鳄的姊妹群又和它