005年8月主办亚洲拉子影展等。在这些事件中，性别人权协会常与日日春关怀互助协会、台湾TG蝶园、台湾同志谘询热线等团体合作，就共同领域的新闻事件发表声明或採取行动。2006年2月27日，台湾性别人权协会加入废刑235行动联盟，要求释宪修改或废除《中华民国刑法》第235条。2016年11月27日，台湾性别人权协会秘书长王苹在秋斗说，同志应该反对用简单的认同政治来自我认识，不要将同性恋、工人、台湾原住民、性工作者等身分区分开来，要看见当中复杂的社会关系，站在左翼连结的同一阵线，挑战并翻转资本逻辑压榨底层