那木札勒性情乖张，驻藏大臣纪山约束不力，致使干隆皇帝认为“藏地关系甚要，彼处应办事件有二人相商，较爲有益，且换班先后更替，有一旧人，尤觉妥当。”遂于干隆十四年（1749年）恢复了驻藏大臣二员的旧制。果然，次年珠尔默特那木札勒发难，驻藏大臣傅清、拉布敦二人被杀，干隆帝对其忘恩负义极为震怒，曾有意在西藏设州县，建城池，任命流官统治，后经三世章嘉的劝阻乃止。珠尔默特那木札勒叛乱平定以后，驻藏大臣制度始通过《西藏善后章程》得以确固。干隆四十五年后，驻藏办事大臣与驻藏帮办大臣始有严格区分。驻藏大臣多由满洲