，元中丞蛮子海牙再次以水师袭据采石，使朱元璋军回和州的道路中途被阻。朱元璋亲自率军进攻，派常遇春到处布兵迷惑元军，分散元军的兵力。两军会合后，常遇春操纵轻舟，将蛮子海牙的船队一分为二，然后从左右两侧勐攻，将其大败，尽获其船，江路重新畅通无阻。随即受命驻守溧阳。至正十六年二月，跟随朱元璋进攻集庆，功劳最大。
讨陈友谅.攻占集庆后，常遇春随徐达攻取镇江，进取常州。张士诚军将徐达围困在牛塘，常遇春前去援救，擒获敌将，晋升为统军大元帅。次年，攻克常州，升为中翼大元帅。又随徐达进攻宁国，被飞