察局长被捕，马里兰州议会多名议员被捕。在整个美国内战期间马里兰州被置于美国联邦政府的直接管理。德拉瓦州则被置为北方军事占领状态。阿肯色州和田纳西州在了解到林肯政府对亲南方的地区的镇压后宣布脱离美国北方加入南方邦联。1862年9月，罗伯特·李发动了马里兰战役。40,000人的北维吉尼亚军渡过波托马克河。乔治·B·麦克莱伦则指挥87,000人的波托马克军迎战。9月17日，双方在安蒂特姆展开激战。当天北方战死12,410人，南方战死10,700人，是美国内战中死亡人数最多的一天。由于乔治·B·麦克莱伦指挥不力