地方官员也纷纷倒向后黎朝，越南进入了南北朝时代。广和元年八月二十一日（1541年9月11日），莫登庸逝世，皇帝莫福海（莫宪宗）开始亲政。死后庙号太祖，谥号仁明高皇帝，葬安陵（An Lăng）。
后世评价.由于莫登庸篡夺了后黎朝的皇位，后来又向明朝投降，传统越南史官不承认莫氏皇位的正统性，并且给予莫登庸非常差的评价。近代越南历史学家陈仲金对其评价也不好，称他为乱臣贼子和卖国贼。越共学者们对莫登庸的评价依然非常差，认为莫登庸投靠外国，「非常无耻」。|-style="text