巴丹群岛以南为巴布延群岛，再往南则为吕宋岛，南方群岛均隶属菲律宾管辖。巴丹群岛和巴布烟群岛之间为巴林塘海崃，巴布烟群岛和吕宋岛之间为巴布延海崃，此三海崃合称为吕宋海崃。自古以来，台湾的兰屿与菲律宾的巴丹岛，皆是靠着小舟往来。根据民族学的研究，两地的原住民有深厚的血缘关系（皆属南岛民族），语言及传统歌曲亦有高度的相似性，现今双方已逐渐恢复连络。目前本处的经济海域划分尚未协商，因此常发生菲律宾军队扣押台湾渔民的行动，引发双方外交上的冲突，尤其是在2013年广大兴事件发生后，双方关系更为紧张。