偏角来获取经度。然而，法莱罗在将各个方案解释清楚前便离开了船队，继承了他的工作，并选择了在当时可得出较满意结果的第二种方案作为测量经度的方法。由于法莱罗的离去，他对船队的指挥权转移到了麦哲伦上将手中。然而，船队中最大吨位的船圣安东尼奥号的舰长——布尔戈斯城主教的堂兄弟——得到了另一份令其拥有与麦哲伦平等权力的补充文件，文件委任他“协助”（adjunto）葡萄牙人（指麦哲伦）以确保此次派遣顺利，并防止疏忽。尽管麦哲伦对舰队拥有绝对指挥权，但卡塔赫纳的加入多少带有些限制其职权的意味；此决定带有一些政治考虑，