不久，又上书朝廷，说明孔庙雅乐及乐舞官服的损坏情况，明宣宗命有司修治。景泰元年（1450年）明代宗到国子监视察。孔彦缙率孔、颜、孟三氏学子入京观礼，赐座彝伦堂听讲。皇帝每次视察国子监时，都诏衍圣公前去观礼，自此形成定例。景泰三年（1452年）朝廷赐正一品朝服、公服、常服。孔彦缙自幼失怙，能够独立自主，然而却与族人相处不睦。景泰六年（1455年）与族祖克昫等人相讦，代宗将相讦之事搁置一旁，不予过问。同年十月二十一日（1455年11月30日）去世，享年五十五岁。太子太师、吏部尚书王直为其撰写墓表。孔彦缙有四