助于斌枢机主教办《益世报》，并任浙江大学、复旦大学教授。1949年到台湾，任教于台湾大学、天主教辅仁大学、政治大学，曾任清史编纂委员会委员、政大哲学系首任系主任、政大历史系代主任、政大文学院院长。1974年当选为中央研究院院士。1975年7月9日，获教廷授予蒙席称号。1980年去世，生平藏书捐赠政大社会科学资料中心。方豪在台大教授宋史，李敖早期的作品常提到方豪，1981年写有〈方神父的惊人秘密〉（《千秋评论》第六集）。