高速公路北陆自动车道和舞鹤若狭自动车道也分别自南侧和西侧进入辖内，舞鹤若狭自动车道自市区南侧山麓通过后，与北陆自动车道在市区东侧的山麓会合，与铁路同样的可以继续往北越过木之芽峠进入福井县的北部；利用高速公路约可在一个半小时抵达名古屋市，两个小时抵达大坂市。在辖区内还有国道8号、和可以自主要市区通往辖内各地。位于主要市区北侧的敦贺港在2011年被日本国土交通省列为「日本海侧据点港」，有定期的货运航班往返北海道的苫小牧港、九州的博多港、韩国的釜山港和俄罗斯的海参崴港，JR货物也在此设有线外货运站将货柜送