方同意中方购买飞机673架以及发动机、军械等武器装备。1960年3月8日，王秉璋出任国防部第五研究院党委书记、第一副院长，钱学森任副院长。他们顶住了苏联撤走技术专家的压力，1960年11月成功发射中国第一枚导弹——“东风一号”短程弹道导弹。此后，“东风二号”至“东风五号”陆续发射，并陆续成功研制多种型号的地空导弹和海航导弹。1962年6月，王秉璋由第一副院长升任院长。1964年12月到1967年7月，任中华人民共和国第七机械工业部部长。1968年10月，王秉璋任国防科委党委书记、第一副主任。上任后在