于1939年1月和妻子一起搬到位于捷克和波兰边境上的俄斯特拉发。希特勒攻占捷克斯洛伐克期间，他继续从事间谍活动。埃米莉也在帮他处理文书工作，把阿勃维尔的机密文件处理好并藏在他们的公寓里。辛德勒还多次以经商为由前往波兰，他和手下25名间谍负责为即将展开的波兰战役搜集波兰军队动向和铁路的情报。其中一些有关铁路运输线和隧道方面的情报对德军的行动至关重要。1939年9月1日，德国国防军第14集团军攻占了一条关键的交通要道，并且保持路况完好无损，欧洲战场上的第二次世界大战全面展开。辛德勒继续为阿勃维尔工作直至1940