生后没有组织立即宣佈对此事件负责，但是基地组织公开赞扬这次事件。美国政府立即做出反应，公开表示会以军事手段打击事件的策划者。9月底，英国首相托尼·布莱尔援引西方情报机构手上证据指称沙特阿拉伯富豪本·拉登为事件的幕后主使。本·拉登是基地组织的首领，与阿富汗塔利班政权有密切关系。塔利班政权拒绝在无确凿证据的情况下引渡奥萨马·本·拉登或其他基地组织头目。由美国领导的联军在未提供塔利班政权承认的证据的情况下，于10月7日对阿富汗发动军事攻击。在美国军事打击成功剷除塔利班政权后，联军在阿富汗首都喀布尔发现一卷