560年教会会议（Kirk Session）开始举行，但区会（Presbytery）直到1580年才有。改革之后的苏格兰议会像英格兰一样，无条件支持教会统一法令。他们以苏格兰长老会为唯一的正统。从英格兰宗教迫害中逃出的一些新教徒将爱德华六世的第二版公祷书（1552年）带到苏格兰，诺克斯本来也支持此这个宗教宪法，然而后来因受加尔文的影响而自创了《苏格兰教会公共秩序书》（Book of Common Order），后者在1562年被苏格兰长老会批准成为正式的教会祈祷书，它到1643年才被《威斯敏斯特公共敬拜