7年，参加全国科学大会文件起草工作。1978年，鲍彤被任命为国家科学技术委员会办公室负责人，后又调任政策研究室副主任。 1979年，鲍彤参加中共中央召开的理论工作务虚会。
改革开放.1980年改革开放时期开始，鲍担任国务院总理赵紫阳的政治秘书，后又兼任国家经济体制改革委员会委员、副主任、党组副书记等职。1987年，在中共十三大上当选为中央委员，任中共中央政治体制改革研究室主任。1989年六四天安门事件中，鲍彤被撤职，并于5月28日在北京被捕。1992年3月，被撤销中央委员职务，开除