1592年），郑松才再次攻佔昇龙，处决了莫茂洽。次年阮潢亲自来到了朝廷，带来了钱粮兵马协助剿灭残余的莫朝军队。莫朝被击败，郑氏对于阮潢以一个南方主公的身分施行其独立的统治感到越来越不满，并一度将阮潢留在北方，不准他回南方根据地。1600年，年过六十的阮潢避过郑氏的耳目成功返回广南。之后阮潢死于1613年，临终前嘱咐族人：「顺（化）广（南）北有横山灵江之险，南有海云碑山之固，山产金铁，海出渔盐，实英雄用武之地。若能驯民厉兵与郑氏抗衡，足建万世之业。」阮家的新领导者，阮潢的儿子阮福源（1563-1635