879年琉球藩被废除，沖绳县设立，原琉球藩境内的岛屿群均纳入沖绳县管辖。清政府虽对此于1877年至1880年提出交涉，但随着清朝国势的衰弱而无疾而终。这个琉球被日本合併的事件被称为「琉球处分」。
美国託管时期.第二次世界大战太平洋战争期间，琉球群岛为交战双方重要的军事据点。1945年发生沖绳岛战役，美军登陆沖绳本岛，4月成立美国海军政府，管辖的范围包括奄美群岛（1945年至1953年），沖绳群岛、宫古群岛和八重山群岛（1945年至1972年）。1946年7月转为美国陆军政府管辖，1