政府感受到了严重威胁。蒙古外务衙门于1919年8月向北洋政府请求派一小支部队协助防御库伦。11月7日，中华民国总统徐世昌、总理段祺瑞派徐树铮出兵外蒙古。徐树铮率军队到达库伦后，立即派兵将博克多汗软禁起来。17日，徐树铮强迫外蒙古的内务总理大臣贡齐格扎尔赞吉·巴德玛多尔济、外务大臣巴林·车林多尔济以及博克多汗签订《六十四条》，完全放弃外蒙古自治，将一切权力上交中华民国政府。22日，徐世昌宣布外蒙古取消自治，并单方面撕毁1915年的《中俄蒙协约》，册封第八世哲布尊丹巴为“外蒙翊善辅化博克多哲布尊丹巴唿图克图汗”