051年，当时乌克兰处于基辅大公国时代。自中世纪至近代，修道院都对乌克兰的宗教、教育和学术有巨大的影响。在1990年，洞窟修道院和圣索菲亚大教堂一併列入世界文化遗产。目前，该修道院的管辖权属于乌克兰国家博物馆、国家基辅洞窟历史文化保护协会以及俄统乌克兰正教会。基辅及全乌克兰都主教欧诺菲力的住所也在修道院中。