源自该区靠海岸的一部分「苓仔寮」（）。「苓仔」是指渔网，本区因为滨海而渔产丰盛，早期渔民捕鱼后，便在岸边兴建一个存放网具的场所，故得名，后因取谐音及雅字，改为「苓雅寮」。明郑时期便有张、王、吴、方及陈姓随军来本区五块厝地区开垦。清代，随着凤山县城迁往凤山，因着地利之便而逐渐发展起来。清朝统治时，苓雅寮一带隶属于凤山县大竹里。1897年日本殖民初期，苓雅寮属于凤山县，并在1898年改隶台南县。1901年时，再成为凤山厅下的苓雅寮庄；1909年，苓雅寮成为台南厅下的打狗支厅大竹里所管。192