1、共同筹组跨校、跨领域的研究中心。初期挂牌成立「公共政策研究中心」、「微奈米研究中心」及「海洋政策研究中心」三个跨校整合的研究单位，并以生命科学、海洋科学、能源与前瞻科技（Advanced Research）为主要合作项目。2、成立学生跨校选课、教师巡回上课的「领袖通识课程」。3、打通跨校转系管道，教育部初步同意保留10%到20%的名额，供学生转换校系。4、2013年，台综大4校试办运动绩优学生联合招生；2016年，台综大转学生考试将进行跨校联招。5、学生可到盟校担任交换学生，各校每学年