会议，在该次会议上便有许多成员热烈提案讨论。在这期间，她还与台湾着名研究机构中央研究院、及国家生技医疗产业策进会合作，协助起草《生技新药产业发展条例》。而作为行政院消费者保护委员会主任委员，其施政满意度则是维持在第一名。根据一份遭洩密的2006年美国外交电报中指出，蔡英文以技术官僚身分奠定「坚定的谈判者」、「聪明的内行人」以及「经济历练令人惊艳」的名声，并且被认定其能力极强、很有说服力。不过在5月17日，随着新行政院院长张俊雄及其内阁获得任命，蔡英文在这波内阁改组中遭到撤换，并由中华民国总统府秘书长邱义