百週年，计画延平郡王祠大规模重修，重建工程系由成功大学建筑系教授贺陈词主持，因贺陈词认为简陋之样貌不足以彰显郑成功之伟大，故于在民国五十二年（1963年）将该庙从原本的福州建筑形式改建为钢筋水泥造的中国北方式建筑、并铺上当时被认为最具代表中国宫殿形式的琉璃瓦，此型式亦为台湾当时之建筑特色。此举造成其在后来无法被列为古蹟，亦于后被批评为不依原样保存，仅凭建筑师的想像或好恶重建，有违建筑与历史追求真实的普世价值。于2007年，为保存挂在延平郡王祠入口的「前无古人」匾，其被重制后的匾额替换，原物则藏于郑成功文物馆