真菌过滤（）是利用蘑菇菌丝体垫的生物过滤器的处理过程。该术语是由真菌学家保罗·史塔曼兹（Paul Stamets）创造的新词。史塔曼兹原本想出的技术来控制从他的房地产物业流出的水中的大肠杆菌（E. coli）。在种植了蘑菇床在水要离开峡谷后，在一年之内水中大肠杆菌的数量就已降至接近检测不到的水平。他发现蘑菇在日益增长的菌丝体的前面产生结晶实体，瓦解了它们遇到了大肠杆菌。另一种蘑菇，猪苓，已被证明能抑制恶性疟原虫，一种寄生虫引起的最危险的类型的疟疾感染。一个真菌过滤的工业应用是防止水土流失。它的主