马奖尝试颁奖给外文片，例如当届由美国籍的威廉·赫特以《意外的旅客》获金马奖外片最佳男主角、加拿大籍导演大卫·柯能堡以《》获外片最佳导演等，但金马奖外片奖被批评不伦不类，仅办一届就停止，并且未在官方特刊历届得奖名单上获得记录。1998年，台湾动画长片魔法阿妈以14票中取得12票的压倒性支持入围，却在评审得奖会议受到部分抱有主观偏见的评审纠葛，导致该届最佳动画长片从缺。例如评审黄木村认为该片没有使用电脑特效、手法过于古老粗糙；评审刘立行、贡敏、王清华批评该片宣扬迷信、牵涉怪力乱神，将之与「宋七力」相提并论，