武元甲与原美国国防部长罗伯特·S·麦克纳马拉会面时便予以否认，只承认8月2日发生过冲突。詹森总统本人事后（1965年）也对8月4日的事件有怀疑，称两舰是“向鲸发炮”。1971年6月丹尼尔·艾尔斯伯格向《纽约时报》发布了他拿到的长达7000页的绝密文件五角大楼文件，首次指出该事件系美方的夸大和虚构。除了北部湾事件之外，该文件还涉及美国对老挝和柬埔寨的举措等，大量真相震动了公众。
揭露的进展.2005年美国国家安全局发表报告，进一步承认8月2日的事件亦是由于马多克斯号率先开火警告而引起