染色体成为Xa，第二次去活化则是随机选择。这种机制使胎盘的X染色体全为母系，可能可以避免其受母体细胞排斥（但由于控制排斥的基因多不在X染色体上，关闭胎盘的父系X染色体可能无法避免移植排斥，目前这种说法未有定论）。
演化意义.正常男性只有一条X染色体，女性却有两条，使两者X染色体的剂量不一致，早在1930年代，生物学家就已发现这种染色体含量不均等的问题，并疑惑为何女性不会因为X染色体剂量过多而发生问题，里昂的理论则可解释这个问题，为了避免基因过量，女性胚胎会随机让每个细胞的一条X染色