1942年随着关门隧道的完成启用，下关车站与原本的下关港车站合併，往西迁移至现在的位置，此后下关车站也失去客运转乘的功能，改以下关港的货物转运功能为主。1987年国铁分割民营化后，隶属西日本旅客铁道。
车站构造.高架车站，岛式月台3面6线。月台与闸口全部有上行扶手电梯连接。
月台配置.东端的1号线是下行通过线，西端的10号线是上行通过线，与作为机回线的2、5号线皆不设月台。除了下行列车不使用9号线、上行列车不使用3、4号线以外，发车月台没有固定。