中心是中国首个国家超级计算中心，部署天河一号超级计算机，天河一号在投用时是世界最快的超级计算机。2009年11月，中国科学院和深圳市政府宣布在深圳大学城建设“国家超级计算深圳中心”。2010年11月，位于湖南大学内的国家超级计算长沙中心奠基，部署天河一号超级计算机。2011年10月，国家超级计算济南中心在济南正式揭牌，部署有国产芯片的超级计算机。2013年下半年，位于中山大学内的国家超级计算广州中心正式投入使用，部署的天河二号超级计算机在2013年6月成为世界最快的超级计算机，该记录一直保持至