亚帝国的首都。然而，当希腊人恢复统治君士坦丁堡后，尼西亚的重要性逐步下降。尽管1290年，拜占庭皇帝安德洛尼卡二世曾到访尼西亚，并指导修复当地的防御工程，晚期拜占庭帝国已无法阻止鄂图曼土耳其在小亚细亚的扩张。1331年3月2日，经历了3年围城战后，奥尔汗一世从拜占庭帝国夺得此城。伊兹尼克得以在鄂图曼帝国扩张期短暂地成为帝国的首都。由于市内的许多建筑、公共设施都已因战乱而破败，鄂图曼人重新利用废墟中的建筑物料建筑清真寺和其他设施。当今君士坦丁堡普世牧首区保留了尼西亚都主教区的建制，目前的尼西亚都主教老君士坦