巴蒂亚修道院的画作被后人认为是利皮一生中最重要的作品之一：全篇由一系列非真实的元素组成，包括拉长的人形、怪异的岩石背景和拟人形态的树干。作品完成于1480年至1496年间。1487年4月21日，佛罗伦萨银行家和商人菲利普·斯特罗齐委托利皮为其在新圣母玛利亚教堂的家庭礼拜堂创作《布道者圣胡安和圣菲利普的故事》。利皮断断续续地绘制这件作品，并最终完成于1503年，但此时他的雇主却已经过世了。此外，利皮还为礼拜堂设计了音乐主题的窗户，它们完成于同年的六、七月份。所有的这些作品反映了当时佛罗伦萨经历的政治和宗教