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出身尊贵.亚历山大出生于1545年，他的祖父是教宗保禄三世的私生子──皮埃尔·路易吉·法尔内塞，父亲为帕尔马公爵奥塔维奥·法尔内塞、母亲是皇帝查理五世的私生女玛格丽特。他有一个出生一月即夭折的挛生兄弟。亚历山大作为西班牙王国腓力二世和唐胡安的姪子，和西班牙王室关系紧密，在腓力照看下长大；当他母亲于1559年就任尼德兰总督时，他跟着移居布鲁塞尔。1565年，在母亲玛格丽特的主导下，法尔内塞和结婚，在布鲁塞尔举行的婚礼非常华丽盛大；1567年两夫妻回到帕尔马居住，同年生下了长女玛