行署置军务、军需、军医、军法四课，各设课长1人、课员2-4人，课长受参谋长指导。1916年7月，改将军为督军，其机构则称督军公署。
国民政府设立行政督察专员公署.民国十六年（1927年）国民政府北伐期间，国民政府下令废除原先由北洋政府在全国设立的道，采用省县两级体制。但由于交通不便，一省管辖愈百或者几十个县鞭长莫及，特别是不适应当时剿共军事政治形势需要。1932年，时任鄂豫皖三省剿匪总司令的蒋介石决定在江西、河南、湖北、安徽等省试行行政督察专员制度，“行政督察专员公署”（简称“专署