据宪法增修条文规定，副总统缺位时，总统应于三个月内提名候选人，由立法院补选，继任至原任期届满为止。若副总统与总统同时缺位，由行政院院长代行其职权，并依前述规定补选总统、副总统，继任至原任期届满为止。
代理或继任总统.在第二次国共内战时，总统蒋中正曾一度下野（惟仍掌握中央党政军权力），由副总统李宗仁在1949年1月21日至1950年3月1日代理总统一职。行宪后有二位副总统在总统逝世之后继任总统，分别为严家淦在1975年总统蒋中正逝世后继任总统和李登辉在1988年总统蒋经国逝世后，