及利亚战争爆发不久，阿巴斯逃到开罗，加入了民族解放阵线（FLN）。阿巴斯的温和民族主义立场为西方国家所接受。在西方国家支持下，1958年9月18日，阿巴斯成为流亡政府“阿尔及利亚共和国临时政府”（GPRA）的总统。1961年，他辞职把总统位子让给本·优素福·本·赫达。由于巴基斯坦对阿尔及利亚的支持，他这时持有巴基斯坦护照。
阿尔及利亚独立后.1962年3月19日，阿尔及利亚战争结束，法国殖民统治结束。7月5日阿尔及利亚独立，9月25日阿巴斯当选阿尔及利亚制宪会议主席。虽然他与由社会