牛顿一直将已完成的着作《光学》延迟到胡克过世后才出版。光学出版后，奠定了光微粒说的统治地位，直到一百多年以后的菲涅耳才重新发现胡克的光波动说。1674年－1679年间两人曾通信讨论物体的圆周运动问题，胡克给牛顿写信，说明了他从1660年以后就有的平方反比定律（见万有引力定律）的思想，但是他无法从中推导出开普勒的行星运动定律。通信中出现了常被引用的名言：“如果我看得远一些，那是因为我站在了巨人的肩膀上”。在考虑上文下理的语境后，这句话被认为是在讽刺胡克矮小。1684年1月胡克在和爱德蒙·哈雷及雷恩的谈话中