宋哲元在民国二十一年（1932年）秋开始兼任察哈尔省政府主席，秦因此也兼任省政府民政厅厅长兼委员。东北军因九一八事件后根据地遭夺取，二十九军成为华北最主要的军事势力。民国二十四年（1935年）6月5日爆发张北事件，秦德纯作为中方代表与日本军方代表土肥原贤二交涉事件处理。同月27日秦土协定缔结。秦德纯因为怕由于「秦土协定」而被国内舆论挞伐，称该协定由何应钦直接指挥签订，应该称为「何土协定」。协定中宋哲元的察哈尔省主席一职被日本方面逼迫离任，其察哈尔政府主席一职由秦德纯暂代，由于宋的强烈不满，秦不敢就任代理