998年，调任中共山东省委常务副秘书长。1998年8月，调升中共甘肃省委常委、省委宣传部部长；半年后，转任中共甘肃省委常委、中共兰州市委书记。1999年10月，调任中共新疆维吾尔自治区党委常委、新疆生产建设兵团司令员；2005年1月起，兼任新疆维吾尔自治区人民政府副主席。其间，1999年至2001年，在石河子大学农业经济管理专业研究生课程进修班学习；2002年至2005年，在中央党校函授学院省部级干部在职研究生班政治学专业学习，获研究生学历。2005年3月，被免去新疆生产建设兵团司令员职务。2005