阿涅莱维奇来到波兰南区，试图在该处策划军事反抗活动，当时该处已被德国併吞。当他返回华沙前，一次大规模的Treblinka灭绝营遣送行动开始了，该营的35万犹太人中只有6万人倖存。于是他加入了犹太战斗组织，并在11月时成为总司令。1943年初，由于该组织与伦敦的波兰流亡政府的关系，他们从波兰亲亚利安的地下组织获得若干军火。1943年1月18日，为了避免第二次的遣送浪潮发生，他促成了第一波的华沙犹太人区起义活动。这次的武装事件造成4月19日的起义活动，直到5月16日德军镇压为止。5月18日，眼见自己已逃不过