到庞培落入手中后便把他的头砍下，有意把庞培的头作为送给凯撒的礼物，来取悦凯撒。当凯撒随后跟着庞培的逃亡路线来到埃及，发现庞培已死，对此凯撒相当哀伤，且气愤波提纽斯的作为，并为庞培办理一场庄隆的罗马式葬礼。波提纽斯可能没有设想到凯撒曾经饶恕政敌的事蹟，如西塞罗等等，而失策。因此克丽奥佩脱拉借此机会获得凯撒支持，最后成为他的情人。另外，在评论波提纽斯杀了庞培一事时，有关史料上仅有罗马一方，因此对波提纽斯而言相当负面的评论，并认为他是有意取悦凯撒才做了此事，但很可能他的这项决议是为了防止埃及卷入罗马内战才施行的。