定区少数地区与厦门市海沧区南半部、金门县金城镇东碇岛、广东南澳县东半部。雍正十年（1732年），以广东潮州府饶平、福建漳州府诏安两县分别持有之南澳岛诸澳合置南澳厅，由潮州府、漳州府共管。雍正十二年（1734年），升龙巖县为龙巖直隶州，划漳平县并宁洋县归龙巖直隶州管辖，漳州府辖境缩小，只相当今福建省九龙江中、下游流域及其西南地区。同年，划漳浦县六都之东山岛东北角铜山保属诏安县。雍正十三年（1735年），划南靖县车田总十五保属漳浦县。嘉庆三年（1798年），析平和、漳浦、诏安三县地置云霄厅。