方有蹄目般只生存于新生代的南美洲。不过，牠们并非广佈整个大洲，反而只是散佈在玻利维亚及智利的中海拔地区。牠们的化石在高海拔的地区很罕见，而更是绝迹于热带的南美洲北部。中黑格兽科最早的是"Trachytherus mendocensis"，可以追溯至始新世晚期或渐新世早期，但却有质疑所属的地层应属于中新世早期。已确定最早的化石纪录属于渐新世晚期的"Anatrachytherus"及粗型兽属。中黑格兽科于中新世达至多样化的顶峰，并一直生存至更新世中期。中黑格兽科是南方有蹄目中三个生存至第四纪的科之一。S