更严重的併发症。通常即是新型隐球菌所引发，因此其被列为危险的真菌之一。新型隐球菌很少在免疫完好的人体中造成感染，因此通常被归为伺机感染性真菌。
治疗.没有影响神经系统的新型隐球菌感染可服用氟康唑（）治疗。若併发真菌性脑膜炎则需静脉注射两性霉素B（每天每公斤体重0.7-1.0毫克，连续两週），并同时口服每天每公斤体重100毫克（若病人无法吞嚥可採静脉注射，每天每公斤体重75毫克），接下来需连续十个星期每天口服200毫克的氟康唑。之后继续服用，直到体内的CD4指数连续三个月高过100，