孝芬出任都督三荆诸军事、车骑将军、署理骠骑将军。崔孝芬已经出兵，于是改任散骑常侍、骠骑将军、西兖州刺史。太昌初年（532年），崔孝芬兼任殿中尚书，很快出任车骑大将军、左光禄大夫，仍为尚书。永熙二年九月壬子（533年10月30日），崔孝芬加仪同三司，兼任吏部尚书。魏孝武帝受高欢逼迫，西逃入关中。永熙三年八月甲寅（534年8月28日），高欢在洛阳永宁寺召集百官，收捕崔孝芬和辛雄、开府仪同三司叱列延庆、兼度支尚书杨机、散骑常侍元士弼，将他们都杀了，崔孝芬时年虚岁五十，他的家属被发配为官奴，东魏天平年间才被赦免