造成查莫洛人数量由50,000减少到5,000。多恩·马里亚诺·陶比斯（Don Mariano Tobias）于1771年9月15日就任关岛总督后，开始进行农业改革，向原住民提供土地，鼓励发展，自马尼拉引进鹿及水牛，自阿卡普尔科引进驴和骡子，建设棉花厂及盐田。拿破崙战争后，许多西班牙西半球殖民地独立，关岛经济重心由墨西哥转向菲律宾。1856年爆发天花疫情，造成3,644名关岛人死亡，因而允许加罗林人及日本人于马里亚纳群岛定居。
美西战争至第二次世界大战.美国1898年的美西战争期间