主要是在欧洲为白色生物技术）是用于工业用途的生物技术的应用，包括工业发酵。它包括使用微生物例如细胞，或 细胞成分酶，以产生在行业工业上有用的产品，例如化学品，食品和饲料，洗涤剂，纸和纸浆，纺织品和生物燃料。在工业上，利用工业菌种的特殊代谢路径，来替代一些化学反应。除了专一性提高，也在常温常压下，节约能源。也由于专一性高，产生的废弃物量低，也因此被称为绿色工业。
环境保护.当环境受到破坏，可以利用生物技术的处理方式，让环境免于第二次受害。生物具有高度专一性，能针对特殊的污染源进行排除