任可汗秃忽鲁帖木儿统治下，蒙兀儿人集体皈依伊斯兰教，而第五任可汗马哈麻加速了蒙兀儿人伊斯兰化进程。这个地区原是由东察合台汗国管辖，但到了15世纪，大批游牧民脱离乌兹别克的阿布海儿汗，跟随朮赤系的苏丹，克烈汗与贾尼别克前往此地。东察合台汗国也先不花二世及羽奴思汗拨一块蒙兀儿斯坦的土地（库齐巴什），收留了他们，从此这就是哈萨克汗国的一部分。察合台汗国也愈来愈局限在南疆。这地方后来成为哈萨克汗国的大玉兹，居民是康里、乌孙、杜格拉特、札剌亦儿等部落。有研究者认为，至羽奴思汗时，蒙兀儿人的穆斯林身份已被伊斯兰世界所接