发多项争议，就任第41天（5月29日）后辞职下台，成为任期最短的教育部长。7月3日，再因东华大学专利案遭监察院监察委员记名表决13票全数通过弹劾案，移送公务员惩戒委员会审理后被判记过一次。
生平.吴茂昆生于台湾花莲县玉里镇，为淡江大学物理学士、硕士，攻读硕士学位的主题即为超导物理，服兵役后赴美攻读休士顿大学物理博士。当时任教于阿拉巴马大学亨茨维尔分校的吴茂昆于1987年1月发现世界第一个高于液态氮温度的超导体——钇钡铜氧超导体（YBaCuO Tc~92K），行政院、中研院物理所