原的东部边缘，和昆仑山余脉接触。山顶常年积雪形成冰川，由几座山峰组成，其中公格尔峰为海拔7649米，慕士塔格峰高7509米（一说7546米），公格尔九别峰高7530米。慕士塔格山阻挡住从中国西进的道路，只有从南北两方绕过慕士塔格山才能分别进入塔吉克斯坦和巴基斯坦。这也分别是当年玄奘西行时去和回来的两条路。