绩作废，阮尚贤逃往清化避难。成泰四年（1892年），他获得赦免，重新回到顺化，参加了廷试，并考中第二甲进士出身。此后，历任国史馆纂修、宁平督学、南定督学等官职。阮尚贤在顺化时，阅读了阮露泽《天下大势论》和中国传来的维新书籍，并结交了曾拔虎、潘佩珠、潘周桢和黄叔沆等爱国志士，接触了革命思想。成泰十九年（1907年），成泰帝因反抗法国殖民统治而被逼禅位，他愤而辞官。他同潘佩珠、强㭽一起去了日本，在那里发起反对法国殖民统治的运动。此后，又随潘佩珠去中国广东接触新成立的越南光复会成员。维新八年（1914年）