川都指挥使司属于右军都督府。
下辖卫所.成都左护卫、成都右护卫（后为龙虎左卫，隶南京左府）、成都中护卫（后为豹韬左卫，隶南京前府）、成都左卫（革）、成都右卫、成都前卫、成都后卫、成都中卫、宁川卫、茂州卫、建昌卫（后属行都司）、重庆卫、叙南衞、苏州卫（后为宁番卫，属行都司，革）、泸州卫、松潘军民指挥使司、岩州卫（革）、青川千户所、威州千户所、大渡河千户所后来改制：成都左护卫、成都右卫、成都中卫、成都前卫、成都后卫、宁川卫、茂州卫、重庆卫、叙南卫、泸州卫、利州卫旧无，后设、松潘