993年至1994年及2009年至2012年成为在野党。其中1994年至1996年自民党是作为联合政权其中一党，拥立日本社会党委员长村山富市担任首相，1996年初开始才重新掌握组阁权。2009年，时任首相麻生太郎宣布提前举行众议院选举，结果自民党大败，民主党大胜。然而，由于民主党在执政后迟迟未能兑现竞选承诺，因此在执政仅仅三年多后的大选即惨败下台，自民党再次成为执政党，党总裁安倍晋三取代落败的民主党代表野田佳彦成为首相，执政至2020年9月16日，由自民党第26任总裁菅义伟接任。虽然所有内阁总理大臣均需由天