原址同时转为一所全日制小学。牛头角天主教小学最后一届小六学生于2002年毕业，校舍交回香港政府并随后于2003年开始清拆工程；而未完成课程的学生，则转入乐华天主教小学继续学业。
乐华天主教小学校舍.牛头角天主教小学的后继校乐华天主教小学校舍现址曾盖另一所玛利诺会所创办之小学庇护十二学校。该校于1979年与复华村一併被清拆，后者后来建成乐华邨，而原庇护十二学校的位置则建成乐华天主教小学，两者同是原为玛利诺会所创办，可谓巧合。