死后，他唯一合法的儿子小托马斯·怀亚特爵士发动了反对亨利八世之女玛丽一世的叛乱并推举安妮·博林的女儿，信奉新教的伊丽莎白为女王，结果失败并被处死。 怀亚特的妹妹玛格丽特·怀亚特嫁予安东尼·李爵士，其后代之一是美国南北战争时期的罗伯特·李将军。爱德华八世国王，即后来的温莎公爵，之妻，沃利斯·辛普森的家系可以追溯到怀亚特的孙子，乔治·怀亚特爵士。 弗吉尼亚殖民地总督弗朗西斯·怀亚特爵士是托马斯·怀亚特的曾孙。