廷任用壮健者作入辽使臣，可以侦察国情，又可以和辽国人互市，令更多人愿意担任而；朝廷也听从他的意见。献宗初年邵台辅拜门下侍郞平章事（相当于副宰相）、上柱国，当时叛乱，他命令领兵守卫；又唿唤壮士高义和斩杀李资义和其党羽。邵台辅以功勋权兼吏部事，转特进、守司徒。肃宗受禅即位，他升任守太尉、门下侍中，并赏赐大量宝物给他，又在他家中设宴。宴中，邵台辅上奏中国的国学不适合高丽模仿，而且劳民伤财，请求废除，但未被允许。到肃宗八年（1103年），他想退休，肃宗不允许，命尙书兵部郞中许庆赐他坐几、手杖留任。