校办学绩效、学术能量、学生人数等方面进行经费审查核定。该计画之第一部分全面性提升大学品质及促进高教多元发展，维护学生平等受教权。第二部分全球链结核定学校，协助具国际竞争能量之学校及研究中心在既有之基础上持续发展，追求国际一流地位，共有24校入选，其中国立台湾大学、国立清华大学、国立阳明交通大学、国立成功大学4校参与全校型计画。为鼓励大学走出象牙塔，在区域创新发展的过程中，扮演更关键及重要的地方智库角色，投入学界能量深耕在地，发挥大学价值，教育部于「高等教育深耕计画」中以「善尽社会责任」为四大目标之一，鼓励各