抵抗到最后的几个据点，分别是：克拉科夫瓦维尔城堡的卫兵，在1772年4月28日宣布投降；蒂涅茨要塞在7月13日宣布投降；琴斯托霍瓦要塞在在8月18日宣布投降；联盟最后的要塞，应该是11月28日宣布投降的扎古日的修道院）。巴尔联盟失败后，他们的家人被俄罗斯当做囚犯，成为了第一批被流放至西伯利亚的波兰人。俄罗斯人在波兰立陶宛联邦建立了3所集中营以关押波兰战俘，在那里战俘要等候发落。
影响.一些历史学家将巴尔联盟看做是第一次波兰起义。一开始，巴尔联盟的参与者被看做是反叛中央与不爱国的