com称相对于主游戏，它“可以说是另一种消遣”。评论者通常把游戏和《动物之森》作对比。游戏的反响好坏不一。IGN称“作为一个单纯的附加游戏，其也是令人惊讶的”，而GamePro也称赞了游戏对话“很少有其他游戏能真正做的如此巧妙有趣”。然而，Game Revolution则称游戏在玩了不久就会变成“一件苦差事”，同时一些评论对在欧版游戏中取消此功能而感到不满。《雷顿教授与魔神之笛》游戏获得了RPGFan的最佳图形冒险类游戏奖及IGN的最佳3DS/DS剧情奖。游戏还获得了IGN读者票选的最佳解谜游戏奖。