年5月20日，台北市政府勒令远雄全面停工。 同月22日，因台北市政府贸然停工可能会导致板南线崩塌，而核准远雄针对大巨蛋靠近捷运南港线一侧的大底工程先行提出报备施工。同月25日，台北市政府继续核准远雄进行大巨蛋全区大底工程并于7月31日前完工。远雄后续提出仲裁，但原订于6月22日的第一次会议却临时因远雄方仲裁人辞职而延期。2016年3月24日 - 大巨蛋工期展延仲裁结果出炉，远雄以土方运弃条件变更为由，提出工期展延459天，最后获得展延110天，其他尚有工期延伸申请中。2016年5月23日，柯文哲亲自拍讲