堂正堂（即蒋中正铜像所在大厅）的大型铜门，在改名前后就以「整修」的名义对外关闭，参观民众只能由一楼楼梯前往。经过五个多月的「整修」后，二楼正堂于2008年1月1日重新对外开放，并由陈水扁总统亲自主持开馆典礼。并以「空间解严」的概念，使用大量的装置艺术（如风筝、新闻照片等）佈满整个大厅，白色恐怖时期的受难者名单也陈列于大厅两侧，以和蒋中正铜像代表的「威权统治」相对。2009年2月，台湾民主纪念馆经撤销后，正堂的「中正纪念堂」牌匾亦于2009年7月20日挂回复旧。2007年12月8日，前总统李登辉在圆山大饭