一名原职纽约警局的警员（威尔·史密斯饰）加入MIB，成为MIB探员「J」（杰），而MIB老探员「K」（凯）（汤米·李·琼斯饰）则从旁指导「J」执行任务。MIB的探员戴着能防止被洗脑的墨镜，穿着黑色套装，并常于UFO出现的地点现身，跟现实世界中的黑衣人大同小异。因为MIB是个秘密组织，所以并没有可以证明他们存在的证据留下。比起恐吓及威胁，MIB会把目睹过超常现象的人消除记忆，再以一些较「现实」的「记忆」取代，例如是告诉被洗脑的人看到的是生化气体，而并非外星人。除此之外，以防秘密组织外洩，洗脑器亦适