葺而新之。始于三月十日，至七月讫工。”从明朝末年至清朝干隆初年，大慈延福宫已全无香火。据民间传说，明朝末年，李自成率军逼近北京，明朝崇祯帝朱由检赴大慈延福宫抽签卜吉凶。但他连求三签，签上内容皆不利。崇祯帝十分气愤，遂发口谕：此庙永远不得香火！不久，李自成军便攻入了北京。此后，大家认为该庙不吉利，所以香火断绝。清朝定都北京后，曾经“聚满汉子弟，教学于斯”。干隆三十六年（1771年），由皇室出资对大慈延福宫进行了一年的修复。“以干隆庚寅嘉平即工，阅辛卯月辰载浃用底厥成，若值若竕，支内帑之羡所司请为记。”