后，立法院于2010年1月12日正式通过「政府组织再造四法」（2010年2月3日施行），做为中央政府各行政部门进行组织调整的基准法源，并将该改革措施的法定名称定为「行政院功能业务与组织调整」，由政府治理之主管机关负责执行（行政院研究发展考核委员会→国家发展委员会）。经过22年的讨论与规划，整个组织调整计画自2012年1月1日起分段实施。截至2018年7月止，共有34个机关（分为12部、8会、3委员会、1署、6独立机关、1行、1院、2总处），最终将调整为33个机关（分为14部、8会、7独立机关、1行、1院、2