1月，华东野战军成立东线兵团。华东野战军第三后方医院第一分院在山东省莱阳县整编为华东野战军东线兵团卫生部前方办事处野战医院。这时正值胶东保卫战打响两个月，医院临时奉命执行伤员转运总站的任务。在整个内战时期，医院先后参加涟水保卫战、莱芜战役、孟良崮战役、兖州战役、济南战役、淮海战役、渡江战役等战役战斗，辗转5个省数十个县市，行程数千公里，救治伤病员两万余名。1950年6月朝鲜战争爆发。1950年11月，医院奉华东军区命令，除直属所划归卫生部仍留浙江省杭州市外，其余组成华东军区第十一野战医院，北上抵达辽宁省