现有1个国家实验室（筹），7个国家重点实验室，15个部、省重点实验室，21个国家和部、省工程中心，人文社会科学方面有27个各类重点研究基地，此外全校还设有200多个研究机构。医学院有附属鼓楼医院、金陵医院（南京总医院）、南京市口腔医院。除大学外，还有南大附属中学、丁家桥小学等。另有科技产业园区和多个产学研结合机构。南京大学有超过二十位诺贝尔奖得者作为荣誉教授。依据评估全球大学的自然科学研究成果的主要指标“自然指数排行榜”(Nature Index 2017 Tables)，南京大学的排名为全国第二（仅次于