人口亦有所增长，更成为海防要地；当时，明代在这里设防，主要是为了防御南中国海一带的海盗、日本江户幕府来的「倭寇」、葡萄牙王国、西班牙帝国及荷兰的侵略者。明朝中叶，广东沿海有三路巡海备倭官军。其中的中路「自东莞县南头城，出佛堂门、十字门、冷水角诸海澳」。佛堂门在香港地区，该地区显然属于中路的防御范围。万历年间的《广东沿海图》中已标有香港以及赤柱、黄泥涌、尖沙咀等地名。此外，香港在明朝时盛产及出口香木。这种香木属于莞香，又名女儿香，当年在广东、南直隶、浙江等地备受欢迎。据说，「香港」的名称的由来就是因为香木