后毁于元末战火中。明洪武四年（1371年），迁建于舜源峰下。当时的人们以九嶷山首峰舜源峰为陵山，将陵庙合为一处。正德元年（1506年），乡人重建。但在嘉靖三十四年（1555年）的地震中又遭毁坏。万历三十一年（1603年），安邑县令吴愈再次重建。清嘉庆二十年（1815年）的大地震中又为瓦砾，仅存正殿。嘉庆二十一年（1816年），在乡人王步洲等倡导下，重建舜庙。陵庙历经明清两个朝代四次修葺，有仪门、午门、拜殿、正殿、寝殿及东西朝房，祭碑房等建筑群，规模宏大。民国24年，一场大火烧了正殿；1962