语：phylogeny，也称为 系统发生树 phylogenetic tree）——可显示一群生物演化史的关系图解假说。系统发生树的尖端可以是生物体或化石，且代表演化谱系中的现今生物或“末端”生物。利用系统发生学来分析种系的基本原则是：两个演化支具有“相同的性状状态”是它们对于“共有祖先同一状态”的保留；而现存生物的性状就是演化史的纪录，可作为重建演化史的依据。由系统发生分析的原则，建构了支序分类学的基本逻辑；而系统发生分析已成为理解生物多样性、演化、生态学和基因组的核心。系统发生学