法庭，主审法官判处两人枭首，11人斩首，136人入狱，240人贬为平民，7人禁锢，10,713人无罪释放。参与叛乱的士族11,820名，有罪人数是410人，阵亡人数是173人。政府军在通信、装备和运输等多方面都胜于佐贺一方，佐贺一方失算于原本以为鹿儿岛、高知的士族也会一同举兵。参与政府军士族队的人数是4,300多名，总数达5,300名，阵亡人数为350人。大久保对于政府过去的核心人物参与士族叛乱一事，选择通过採用极刑来彰显政府的威信以及迅速对应来遏止其他士族。