入选中华台北U22代表队，并且他曾担任过中华台北U22男子足球代表队的队长，在2012年6月时，亚足联U23亚洲锦标赛小组赛面对菲律宾一战中，林昌伦于比赛第11分钟以及第31分钟时各进一球，终场帮助U22中华台北代表队以2:1击败菲律宾，之后面对缅甸、马来西亚也都各有攻进1球。然而中华台北却仍无法晋级该项赛事的决赛圈，但林昌伦在该项赛事中独进4球，是当时U22中华台北代表队的进球王。在同年年底的2013年菲律宾和平盃赛事中林昌伦代表中华台北首战面对菲律宾又攻进1球，使得当时林昌伦获得菲律宾杀手的称号。