医疗机构依实际性器官特征开立之诊断证明书。2014年下半年，马英九执政时期，台湾宣布了计划，允许跨性别者不做手术就可以合法地改变其法律性别。但是，由于「政府内部的分歧」，这一措施尚未得到实施。
身份证件.中华民国国民身分证与户籍登记是主要身分证明。其他驾照、牌照、学历证件等都要求这两项。身分证字号有性别之分。旧版第三代至第五代身分证颜色也有性别之分。身分证上的照片则要求要符合指定性别有关的性别角色。平时各种身分验证要求的则是外观与身分证照片，身分证标示的性别一致。另外户籍登记中