循因而南逃广州。刘裕早于卢循撤出蔡洲后就已派了孙处及沈田子经海路攻佔了卢循根据地番禺，卢循败逃广州后于义熙七年（411年）又于广州败于沈田子等人，终在交州被刺史杜慧度所杀。
诛除异己.刘裕于义熙七年（411年）班师回到建康，并受太尉、中书监职位。次年（412年）四月，刘裕以刘毅为荆州刺史。刘毅自以能力不亚于刘裕，甚不服在刘裕以下，他亦得朝中有名望人士归心交结，故此迁镇荆州时就将大部分豫州府属及江州万多人的军队都带去荆州，到任后又重新调度荆州郡县首长，更以患病为由请堂弟刘藩去做他副手