侯爵进驻大皇宫，全城被洗劫三日。在接下来的半个世纪里，君士坦丁堡成为了拉丁帝国的首都。拜占庭的贵族流离在各地，许多去了尼西亚和伊庇鲁斯，还有一些去了特拉比松。尼西亚和伊庇鲁斯两国都有意夺取拜占庭皇室头衔，重夺君士坦丁堡。1261年，尼西亚帝国皇帝米海尔八世从拉丁帝国末代皇帝鲍德温二世手中夺取了君士坦丁堡。
1261年至1453年君士坦丁堡陷落.虽然米海尔八世夺回了君士坦丁堡，但拜占庭帝国却早已丧失了许多重要的经济资源，处境艰难。布拉海尔奈宫成为了主要的皇室居所，而大皇宫则逐渐被