束后，金忠善奉命守卫李氏朝鲜的北方边境达十年之久。1624年，李适谋反，拥立朝鲜仁祖的叔父兴安君李瑅为王，史称「李适之乱」。金忠善支持仁祖反正，捕斩李适的部将徐牙之。1636年，清朝军队入侵朝鲜（史称「丙子胡乱」），金忠善奉命防御，杀清兵500人，击退了清朝的进攻。此后金忠善退隐，迁居大邱，娶张春点的女儿为妻，潜心研究儒学。着有《慕夏堂文集》。今大韩民国大邱广域市的鹿洞书院，据说是后世为了纪念他而兴建，为日本游客到大邱必访景点。