其总理藏内事务，由噶伦阿尔布巴等协理。然而各噶伦之间明争暗闘，各自为政。雍正五年（1727年），康济鼐为阿尔布巴、隆布鼐一党所杀。另一噶伦颇罗鼐平定了阿尔布巴之乱，被干隆皇帝封为札萨克郡王，主持藏政。但颇罗鼐死后，其子珠尔默特那木札勒心怀异志，被驻藏大臣傅清、拉布敦斩杀，其党羽遂后发动叛乱。干隆十六年（1751年），清军入藏平定珠尔默特那木札勒之乱，并颁布《西藏善后章程》十三条，正式设立噶厦衙门，定噶伦员额为四人，三俗一僧，正三品。噶厦始置时的四噶伦为辅国公班第达、札萨克台吉策棱旺札勒、色裕特塞布腾、喇嘛尼