孝武帝初年，申徽投奔宇文泰，宇文泰镇夏州，任为记室参军，兼府主簿，深得信任。宇文泰的文告，多出自他的手笔。封大行台郎中。以奉迎孝武帝西迁有功，封博平县子、本州大中正。西魏大统年间，进爵为侯，因功转任都官尚书。拜中书舍人，修起居注，转任给事黄门侍郎。东阳王元荣死后，其婿邓彦杀元荣之子元康据瓜州。宇文泰以申徽为河西大使，密令他除掉邓彦。申徽与瓜州豪右令狐整密谋，率五十骑在馆驿中擒邓彦。大统十二年（546年）申徽为瓜州刺史，镇守瓜州，有安边功。大统十六年（550年），召回朝廷，官至尚书右仆射，加侍中、骠骑大将军、