2007年3月18日修订时间表开始实施以来，所有车厢都禁止吸烟。零食自动售货机于2008年3月31日起停用。从2012年3月17日开始实施修订列车时刻表起，651系列车中的6列已经停止服务并进入储存状态，取而代之的是超级常陆号的新型10节车厢E657系电力动车组。整个651系车队在2013年3月16日修订时刻表开始实施时退出运用，但为了季节性和额外的服务需求，仍保留了整个车队。同时于2012年起，部分运用离脱的651系，先后被送往青森、大宫等的地方留置。2013年9月，K203编成率先报废，成为本系