拒绝比赛，主帅巴蒂斯塔也被欠薪，但申花在联赛中保持着良好的上升势头，联赛前八轮五次在落后的情况下完成逆转，上海申花也被媒体冠以“落后的申花惹不起”之名。赛季中期，申花宣布巴蒂斯塔因为个人原因辞职。随后也爆出申花俱乐部对巴蒂斯塔欠薪的消息，中方教练组组长沈祥福即时出任申花主教练。最终，从负六分起步得上海申花以38分的积分排名第八。（如加上6分扣分，申花队排名中超第4位）
绿地时期（2014年起）.
2014年.2013赛季结束后，球队球队一度传闻朱骏将带队西迁云