根本不适合12米车辆行走，该线很快就改用短身巴士。1999年8月22日，来往坚尼地城及跑马地的5A线改为全日服务，而且只收取港币3.4元（现时为3.7元），对当时收费$5.1的1号线是一大打击。
21世纪.2003年6月10日，新巴母公司周大福集团收购城巴后，重组旗下巴士路线。当时，计划1号线与5A线合併，并使用编号5A。两线于2004年5月31日起合併，总站改为跑马地（上）至坚尼地城（卑路乍湾），并降低全程车费。当时由于香港岛区议员及民间团体认为1号有保留的价值，因此城巴提供了一