前秦灭前燕，齐地入秦。淝水之战之后的太元九年（384年），晋军北伐，前秦青州刺史苻朗降，东晋收复了青州、兖州一带，使辟闾浑以幽州刺史镇广固。太元十九年，燕将慕容农破广固，齐郡入后燕。燕主慕容寳北逃后，青、徐一带被东晋收复。隆安四年（400年），后燕宗室慕容德称帝，在青州建立南燕，以广固为燕都尹。义熙六年（410年），刘裕北伐，灭南燕，克复青州，齐地入晋。
南北朝.宋初于齐郡分置广川郡、高阳郡。青州、临淄县徙治东阳城（在今青州市北关），仍以临淄故城为齐郡治所。宋明帝泰始五年（469年