本岛东部有一片热带海岸林，其树高可达20公尺，主要以檄树、榄仁树、莲叶桐、葛塔德木、草海桐、白水木、海柠檬、藤蟛蜞菊、长柄菊、长鞍藤、葛蕾草等乔木为主，本岛较高大的植物有椰子、琼亚海棠、太平皮孙木、莲叶恫及榄仁树。。太平岛的陆域植物，其世界分布属于马来西亚植物区系。岛上曾纪录到11种未见于台湾本岛的植物，包括海柠檬、橙花破布子、苎麻叶铁苋、白避霜花、匍地垂桉草、穗花落尾麻、三叶乌敛莓、露兜树及窄沟草、莲实藤及毛短颖马唐。因中央道路的拓宽，太平岛上原有的森林面积大幅减少，人为干扰区域变多，约占全岛面积