谱系地理学是对个体地理分布历史过程的研究。通过遗传学，特别是群体遗传学来研究个体的地理分布 。在生物学上，谱系地理学是指对物种内部和物种之间地理位置遗传信号的研究。不同于经典的群体遗传学和系统发生学，谱系地理学更注重于物种生物地理历史的研究 。