日在吴港空袭中舰体又受损，因此将其拖往其它泊地的计画遭到推延，是次空袭带来的损害在15天内就维修完毕。在8月时，吴港靠泊的航舰中，还可以航行的只剩“葛城”与本舰。在日本战败时，盟军到9月接收日本各地设施时发现停泊在吴港的此舰是唯一一艘没有受损的日军航空母舰。本舰随即与“鹿岛”号一同作为复员运输舰自海外接运被遣返回国的士兵与侨民。当时凤翔号编制操作人数为41位军官、369位士兵。1945年10月至11月间凤翔号自沃特杰环礁载回700人，贾卢伊特环礁载回311人，埃内韦塔克环礁运回数人（数据不详），并将遣返