朝廷的实力，在大顺元年（890年）已招募到十万军队，但他贸然宣布西川节度使陈敬瑄、河东节度使李克用为叛逆予以讨伐，反被李克用击败，不得不恢复李克用官爵。而对西川的讨伐战则陷入僵局，昭宗因河东之败决定终止西川战事并恢复陈敬瑄官爵，但讨伐陈敬瑄的永平军节度使王建却抗命继续攻打，最终取代陈敬瑄成为西川节度使。大顺二年（891年），唐昭宗下令逮捕杨复恭，杨复恭抵抗失败，出奔投靠养侄山南西道节度使杨守亮。昭宗的举动也引起了藩镇的疑心。景福二年（893年），凤翔节度使李茂贞击败杨守亮后上表昭宗，求任山南西道节度使，