眼睛色彩是一种多基因遗传特征，是指眼睛虹膜的色彩。由虹膜中黑色素数量、黑色素种类（真黑色素与假黑色素），黑色素的分布所决定。。人类与其他动物的眼睛色彩，拥有许多表型变异。许多鸟类拥有鲜明的眼睛色彩，这些颜色是决定于其他的色素，如蝶酸、嘌呤与类胡萝卜素。虹膜的颜色受三种主要原因影响，分别是黑色素在虹膜色素上皮细胞中的含量、黑色素在虹膜基质的含量，以及虹膜基质的细胞密度。不论是任何颜色的眼睛，在虹膜色素上皮细胞中都含有真黑色素；而色彩的变异一般是决定于虹膜基质中的黑色素含量。虹膜基质中的细胞密度影响色素上皮