为部份宣教士可能是某些殖民地国家的秘密间谍，因此在20世纪50-60年代，中共政府将所有在华传教士驱逐出国，并在本地教徒中间开展控诉运动和反帝国主义教育，又在宣传中一直给传教士贴上帝国主义分子的标签；在前苏联国家，很多人因为坚持有神论的宗教信仰被流放到西伯利亚，而政府所持观点就是认为他们跟境外的某些人或者机构联系，有出卖国家背叛国家的嫌疑，最后的罪名一般就是间谍罪；不过，大部份宣教士主要是服务当地人民的，有的更是反对殖民主义和反对帝国主义的提倡者。当然在众多的基督教教派里面也有一些并不是以上述工作为重点