再任左金吾将军，为了写谢表，遍访当时才子，请托吏部侍郎裴行俭管书记苏味道，苏味道援笔而成，谢表辞理精密，盛传于当时。
唐睿宗年间.垂拱元年（685年），在高宗之子、李弘胞弟唐睿宗年间，裴居道任秋官（刑部）尚书，睿宗母后武太后（武则天）摄政，二月，因裴居道为太子妃父，任裴居道为同凤阁鸾台三品，实际上相当于宰相。五月，他又被任为内史。三年（687年）四月，他又任纳言。载初元年（689年）十二月，在洛阳定居的武太后命裴居道留守长安，次年一月，裴居道被任为太子少傅，依旧同凤阁鸾台三品。在任