目的亲缘关系密切，两者互为姐妹群，而双翅目和长翅目则是与毛翅目亲缘关系第二接近的类群。毛翅目内部类群的亲缘关系演化树，此图基于2002年一项分析rDNA序列，核延伸因子基因的序列，以及线粒体细胞色素氧化酶的序列的分子系统发生学研究绘制。和均为图中的演化支，但内类群的演化关系仍不清楚，有可能不是单系群。
分布.石蛾遍布全球，在更温暖的地区更加多样化。它们与淡水水体有关，幼虫存在于湖泊，池塘，河流，溪流和其他水体中。陆地石蛾，Enoicyla pusilla，生活在森林地面的潮湿的底