，武汉医学院更名为同济医科大学，医院则更名为同济医科大学附属同济医院，并继续使用武汉同济医院名称。1993年，医院被中国卫生部评定为湖北省首批三级甲等医院之一。2000年，同济医科大学与华中理工大学、武汉城市建设学院、科技部干部管理学院合并为华中科技大学。医院则更名为华中科技大学同济医学院附属同济医院，继续沿用武汉同济医院名称。2012年，武汉同济医院新外科大楼启用，是当时中南地区最大外科楼，由德国着名设计师图克尔·科萨设计。
现状.目前，武汉同济医院现有主院区、光谷院