建炎年间，则增设江湾巡检司。建炎三年（1129年），为抵御金人南侵，浙西制置使韩世忠中军驻扎江湾。嘉定十年（1218年），置嘉定县，吴淞江北岸归属嘉定。元至元二十八年（1291年），析华亭县东部为上海县，吴淞江南岸为上海县。大德八年（1304年），任仁发疏浚境内吴淞江。明永乐三年（1405年），夏元吉主持区境南段范家浜的河道治理，并引导黄浦由此入海。嘉靖二十三年（1544年），倭寇入侵江湾等地，导致全镇被焚。隆庆三年（1569年），海瑞主持吴淞江疏浚，吴淞江下游沿今河道进入黄浦江。此后全区均位于吴淞