着维基百科的人气直线上升，用于资助这个计划的收入却停滞了。 由于维基百科消耗Bomis的资源，威尔士和桑格想到了以慈善模式资助该计划。 维基媒体基金会就是在那时（2003年6月20日）为了维基百科和Nupedia而成立了。 2004年9月17日它向美国专利及商标局申请了"Wikipedia"商标。该商标在2006年1月10日被授予注册资格。2004年12月16日在日本得到商标保护，2005年1月20日在欧盟得到保护。也曾经计划许可图书、DVD等一些产品中使用维基百科商标。2005年4月，美国国家税务局统