innaeus）于1758年所描述，其最初的学名一直缘用至今。其属名是直接取自秃鹰的拉丁文。种小名则是来自古希腊文的「γρυπός」，意思是「钩鼻」。安地斯神鹰及其他六种新大陆秃鹫的准确分类仍然不明。虽然新大陆秃鹫与旧大陆秃鹫有着相似的外表及接近的生态位，但牠们却是源自于不同地方及互不相关的祖先。两者之间的分野仍在争论中，早期有指新大陆秃鹫较接近鹳，较近期的说法则指牠们应与旧大陆秃鹫一同分类在隼形目或自成一目的美洲鹫目中。美国鸟类学者协会（American Ornithologists' Union）就