深客运专线厦门至深圳段）已经建成，是深圳市对外连接的重要铁路，并有深茂铁路，赣深客运专线，穗莞深城际铁路等在建。位于深圳龙华镇的深圳北站是深圳的高铁枢纽站，也是华南地区的铁路客运枢纽。截至2015年底，深圳的主要铁路站点有：深圳站、深圳北站、深圳西站、福田站、深圳东站、笋岗站和平湖列车编组站。未来会于西丽与机场北设高铁站，并拆除平南铁路以及既有深圳西站。
城际铁路.2021年，深汕铁路开工，该铁路同时承担国家中长途高速铁路功能和深圳与深汕合作区间高频高速城际功能，深惠、深大、穗莞深