钙等矿物缓慢地渗入木干内心，同时木干外层的有机木质被分解，这些从土层中新渗入木干的无机矿物质由而替换了原树干中的有机木质。以一种物质（有机木纤维）的分解作用与另一种物质（无机二氧化硅）的沉积作用同时地发生，从而一种矿物被另一种矿物取代，这种作用被称为「交代作用」，其中以二氧化硅成分为多，所以也被称作“硅化过程”。这种分解替换过程以分子单位进行，整个过程既精细又漫长，承袭了树木的原貌，甚至连木干细胞的形状都如实体现。经过千百年不停地分解替换，整个木干的有机木质会被替换为无机的硅钙晶体。木干的硅化过程完后，整个