98年5月下台，结束32年执政。
卸任之后.1998年苏哈托下台后，其总统一职由科技部长优素福·哈比比接任。此后苏哈托被揭发曾透过不同手段来为自己的家族及亲信致富，当中包括贪污、垄断等手段。据估计，苏哈托家族的资产总值达150亿美元。之后联合国人权委员会曾表示，该委员会总共调查了六宗最大型的侵犯人权案件，其中包括苏哈托于20世纪60年代任职期间杀了的近50万人。苏哈托执政期间，其家族成员控制国家经济命脉，官商勾结、裙带资本主义盛行。他的家族和亲友控制了印尼的金融业、汽车业、