教授的联合下，维雷最终力图建立一个宗教法庭，并制定将颂扬共融者开除教籍的教会法律。但是加尔文教会并未统治伯尔尼，所以贝扎于1558年到了日内瓦。在日内瓦他在新成立的学院内获得了希腊语的教职，在加尔文去世后又获得了神学教职。他也义务布道。他完成了对新约皮埃尔·奥利韦唐（Pierre Olivetan）译本的修订，这件事已经拖了很久。1559年他出于对雨格诺派的兴趣又进行了一次旅行，这次他到了海德堡。在几乎同一时间，他不得不为维护加尔文而同汉堡的约阿希姆·维斯特法尔（Joachim Westphal）以