专员必须向欧洲议会问责。 欧洲议会有权动用不信任动议，逼使全届欧盟委员会请辞。 提出不信任动议，需要提明议员总数起过三分之二通过、然后获全体欧洲议会的大比数通过，才可成效。 虽然此权力仍没行使，欧洲议会在1999年，关于欧盟委员会多项贪污指称，曾威胁雅克·桑特动用不信任动议。 回应贪污指称，自动全体请辞。
薪酬.每一位欧盟委员会专员的基本月薪，被欧洲议会规限固定为甲级官员的112.5%，现时为19,909.89€。 欧盟委员会主席的基本月薪为甲级官员的138%（即是24,422.8