以自杀作为结论，但没有正式发表。而搜查二课却坚持是他杀继续调查，1950年，二课的搜查员调职，调查力度和范围大幅缩小。1949年12月15日，「下山事件特别搜查本部」编成内部资料《下山国铁总裁事件搜查报告》（俗称「下山白皮书」），1950年1月在《文艺春秋》和《改造》杂志上发表。矢田喜美雄与松本清张等人都批评报告的自杀结论与事实有许多矛盾之处。1964年7月6日，杀人事件的公诉时效到期。
死亡原因.下山事件自杀论一般认为，下山同情国铁工人遭遇，但不得不执行GHQ命令，结论是