宋，蓝营人士认为枪击案影响该阵营选情，使陈水扁连任成功。蓝营群众发动游行展开抗议。期间，以亲民党籍立法委员邱毅为首的多位立委以宣传车冲撞地检署，造成多名员警遭到撞伤；国民党主席连战并在落选的群众讲话上疾唿，提出选举无效及当选无效之诉。最终，司法体系的台湾高等法院于2004年11月4日下午4时2分正式宣判，驳回「陈水扁当选无效之诉」，连战败诉定谳。对于枪击事件的真相认定，蓝绿双方存有极大歧见，并由此埋下往后中华民国政治界的高度对立。对于此次枪击案的侦查，美国鑑识专家李昌钰博士抵台协助调查证据。其鑑识报告指