把部落里一百多座坟墓全部开挖；每个坟墓大都有一刀一枪，总共得到两百多把刀鎗，使得残存居民更无武器用以抵抗。又因已获埔里社的土地，围筑十三座土造城堡和一座木栅碉堡，招来更多的汉人开垦，打算永久居住。埔里社的壮丁打猎归来后眼见无力挽回，携带残余老弱妇孺依附泰雅族的眉社，迁至眉溪旁赤崁台地居住。
台湾总兵和道台派人调查.在郭百年等众人刚入埔里社与部落居民对峙时，台南府城的的总兵和台湾道员就已听闻消息，并派人前去查证。但查证之人亦已被郭百年等人收买，因此都回报表示只是当地居民和深山里的原住