飞行中心担任博士后研究员。1989年返台任教于国立中央大学物理系。1992年8月国立中央大学天文研究所成立后曾任所长，并曾出任中华民国天文学会理事长、国立中央大学科学教育中心主任。2007年转任国立台湾大学物理系暨天文物理研究所教授，以及梁次震宇宙学与粒子天文物理学研究中心研究员。2011年1月17日借调至国立自然科学博物馆担任馆长。
研究.孙维新的主要研究是活跃星系核与类星体、交互作用星系、星系演化与恆星形成。并且有鹿林山星际物质发射线巡天计画、垦丁天文台教育训练计画、BATC多