x序列可以使特定基因活化、沉默或者和其他基因交换位置——在DNA的层面上，许多操作都可以进行。Cre酶的活性可控，可以使之只在一种特定细胞类型中表达，也可以使之由特定的外部刺激（如化学信号、热刺激）触发表达。这些特异性DNA修饰对细胞系追踪以及有致命性的突变研究十分有效。Cre-Lox重组系统在操作和用途上都与FLP-FRT重组系统十分相似。
历史.Cre-Lox重组是一种由Brian Sauer博士发明的特殊的位点特异性重组技术，最初用于在哺乳动物细胞系中激活基因表达。 之后