工等步骤被释放。这步反应发生在剪接体上，U1-snRNA会被所谓的反式剪接引导序列“Spliced-Leader” (SL) snRNA替换。和U1 snRNA不同，SL RNA会在剪接过程中被消耗，其5'端有一迷你外显子，它会和一段多顺反子的抄本中的外显子组成成熟mRNA，(见旁边的插图)。SL RNA的迷你外显子含有ATG-启动子，它是完整mRNA拥有正确的开放阅读框（open reading frame）的前提。锥虫中，除了反式剪接外，还有一经典的顺式剪接，它发生于为多聚A多聚酶编码的基因上。锥虫也