编组体系.EMU1200型从原本在EMU200型的3辆一组，改为9辆一组，一共有4个列车编组，其中三组为固定9辆车的一般编组，而另外一组为3辆为一编组的备用车辆，备用编组已停用，列车的动拖比为6M3T。EMU1200型列车从高雄到台北方向开始连结，分别是驾驶附车长室马达车EMC1200型、电源动力车EP1200型以及马达车EM1200型。
形式说明与编组方式.EMU1200型一共有4个列车编组，其中三组为固定9辆车的一般编组，而另外一组为3辆为一编组的备用车