《孔北海集》残缺不全。但是孔融的言论仍然对当时和后世产生了影响。杀孔融被视为曹操杀名士的污点之一，而孔融反对肉刑等的作品甚至到隋唐时期仍然被用作朝廷政策讨论的论据。魏文帝曹丕〈典论论文〉为示范「君子审己以度人」的客观文学批评态度，把孔融与王粲、陈琳、徐干、阮瑀、应玚、刘桢六位文学家相提并论，列为“建安七子”。然而因与孔融政治立场相对，曹丕的私人书信〈与吴质书〉评论建安七子独不提及孔融。六朝文人，论文也多不涉及孔融。文化大革命期间批林批孔运动中，孔融作为孔子的二十世孙，以及反对受毛泽东欣赏的曹操之典型