附葬于母亲墓旁。熙宁六年六月初七（1073年7月24日）病逝，死后神宗赐谥「元」，人称「元公」。弟子程颢、程颐继承和完善了他的思想。后来经过南宋着名学者朱熹进一步的探讨，归纳为程朱理学。是孔子、孟子之后儒学最重要的发展，在中国思想史上的影响深远。《宋元学案》中对于周敦颐的地位有这样的论述："孔孟而后，汉儒止有传经之学。性道微言之绝久矣。元公崛起，二程嗣之，又复横渠诸大儒辈出，圣学大昌。" 《宋史·道学传》:“两汉而下，儒学几至大坏。千有余载，至宋中叶，周敦颐出于舂陵，乃得圣贤不传之学，作《太极图说》、《