纪录对于黑死病的特征纪录中，有一些关于“淋巴腺肿”的描述，与19世纪起源于清朝云南地区的淋巴腺鼠疫相似（第三次鼠疫大流行），这使得科学家与历史学家相信自14世纪开始的黑死病，与鼠疫相同，皆是由一种称为鼠疫桿菌的细菌所造成。这些细菌是寄生于跳蚤身上，并借由黑鼠（"Rattus rattus"）等动物来传播。也有研究认为病源可能来自亚洲的小沙鼠。第二次鼠疫大流行时，9座城市中有7座透过人类身上衣物的跳蚤与头蝨传播。不过由于其他疾病也有可能产生淋巴腺肿，因此也有人提出其他不同的观点。第二次鼠疫大流行期间，黑死