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出发.1944年12月1日，受当局征集自台湾各地的59名医师、80名医务助手、200名农业生产工员等搭乘神靖丸自高雄港出发，准备前往南海地区。
沈没.1945年1月11日，美国海军第三舰队开始在南海展开空袭行动，针对日本船舰进行密集轰炸。1月12日早上，美国海军快速航母特遣舰队的战机群（包括F6F地狱猫战斗机等机型，自附近艾塞克斯级航空母舰等舰艇起飞）出现于圣雀岬港周遭天空，对海面上包括神靖丸在内的所有船只（多为运输船）进行密集轰炸；约3小时后，神靖