森藩最后也在1711年被废除。19世纪末明治维新后，原属幕府及旗本的领地在1871年被划入新设立的本保县，在同年实施的废藩置县后，其余原属各藩的领地则改隶属福井县、西尾县、大野县、郡上县、鲭江县，不过在同年底进行的第一次府县整併中，全数区域被整併至足羽县，1873年又随着被併入敦贺县，但敦贺县在1876年遭到废除，位于以北的丹生郡被併入石川县，直到1881年才将原本敦贺县的辖区重新恢复设县，不过重新设立的县因为县厅设在福井，因而命名为福井县。1878年石川县实施时，正式设置近代的行政区划「丹生郡」，