日为止，农林水产省主管之独立行政法人有、、、、、、、及九法人。另外，独立行政法人与厚生劳动省、经济产业省及国土交通省共管，与国土交通省共管，与内阁府共管。农林水产消费安全技术中心为，职员具有国家公务员身分。2018年4月1日为止主管之特殊法人为日本中央竞马会。2018年4月1日为止主管之有与全国渔业共济组合联合会。主管之为。主管之有。主管之有全国土地改良事业团体联合会及全国食肉业务用卸协同组合联合会，并与经济产业省共管。
财政.2018年度（平成30年度）一般会