由于受到文化大革命爆发后因“家庭出身”波及，陈良宇被指为“出身于可能有敌特嫌疑的家庭”而未能入党，为此，陈良宇后期的大学生涯一直较为低落。1968年8月，陈良宇从军校毕业并获得本科学历，同样受到“家庭出身”影响并未能按政策任职部队军官，而是被分配在中国人民解放军福州军区6716部队（今32266部队，也就是中国人民解放军工程建筑第224团）当兵锻炼直至1970年9月。
回沪任职.1970年9月，陈良宇从部队退伍，回沪后有长达约八年的时间在上海彭浦机器厂当一普通工人，期间于1971年