主教座到普世牧首宗座，甚至多瑙河一带摩尔达维亚和瓦拉几亚公国的教职他都有插手。 1565年，他撤换了受欢迎的约阿撒弗二世牧首，并拥立米特罗凡三世为牧首，此前，米海尔已经帮助此人攫取了拉里萨和希俄斯的主教座。 作为利益交换，米特罗凡每年要向米海尔支付两千弗罗林，持续八年。而这笔钱中的一大部分都进了索库鲁帕夏的腰包。 尽管一开始支持米海尔的许多谋划，米特罗凡最终还是与他决裂，并于1572年以“与西方互通款曲”的指控遭废黜。 米海尔还将瓦拉几亚公爵彼得拉下了台，他似乎由此控制了瓦拉几亚和摩尔达维亚的收入并在哪里实