珰刘瑾之兄去世，百官都前往弔唁，唯独欧阳重不去。张锐、钱宁掌厂衞，接连逮捕官员士绅入狱，欧阳重皆力争反对。此后张锐借其他事情逮捕其入狱，赎杖还职，仍停俸。此后欧阳沖历任刑部郎中、四川、云南提学副使。迁浙江按察使，但未赴任。嘉靖六年，拜为右佥都御史，巡抚应天；恰逢云南土酋安铨、凤朝文谋反，朝廷商议欧阳重了解云南，遂改为云南巡抚。其在任期间，很快就平抚叛乱。之后他振贫乏，轻傜役、税金，规画盐铁商税、屯田诸务，百姓为之称赞。此后他还反对中官採办大理石，节省朝廷费用。后因云南镇守太监杜唐、黔国公沐绍勋勾结张璁，