路易斯建立贸易总部。1813年密苏里成为美国一个州时，克拉克被任命为州长。在1812年战争期间他带领了几次竞选，并且在现在的威斯康辛州建立了第一个邮局。战争结束后，克拉克回到了印第安事务的管理，他使用各种各样的外交和军事措施镇压所在区域的起义，譬如黑鹰战争（Black Hawk War）。他还担任过地图测量员。1838年9月1日，克拉克死于圣路易斯，享年68岁，被葬在贝尔方丹公墓（Bellefontaine Cemetery），他的坟墓上立有35英尺（11米）的灰色花岗岩方尖碑。虽然他的家族