梅哈芬港分别是欧洲第二和第四大集装箱港。威廉港是德国唯一的集装箱深水港，同时也是德国最大的原油、煤炭等能源物资的转运枢纽。不来梅内港、布拉克港、罗斯托克港、诺登海姆港、布伦斯比特尔港和维斯马港主要装卸大宗散货和件杂货，埃姆登港、罗斯托克港、库克斯港、基尔港、普特加登港、吕贝克港和萨斯尼茨港主要接挂滚装船和轮渡。
集装箱货物.德国港口的集装箱化始于1966年。2000年，汉堡港和不来梅哈芬港的集装箱吞吐量分别为428万和270万标准箱，2015年，这两座港口的吞吐量分别攀升至88