色荧光蛋白的荧光（QY）为0.79。而从(sea pansy)所得的绿色萤光蛋白，仅在498nm有一个较高的激发峰点。在细胞生物学与分子生物学中，绿色萤光蛋白(GFP)基因常用做报导基因(reporter gene)。，绿色萤光蛋白基因也可以转殖到嵴椎动物(例如:兔子)上进行表现，并拿来映证某种假设的实验方法。通过基因工程，绿色萤光蛋白(GFP)基因能稳转进不同物种的基因组，在后代中持续表达。现在，绿色萤光蛋白(GFP)基因已被导入并表达在许多物种，包括细菌，酵母和其他真菌，鱼（例如斑马鱼），植物，苍蝇