产生大小不同的，对应雌雄配子体。泥盆纪的几个植物群独立地进化出，及随后的内生孢子（endospory），因而配子体开始小型化生长于孢子壁内。外生孢子（exosporous）植物，如蕨类，孢子出芽生长并突破孢子壁释放到外界。内生孢子植物的大配子体，如种子蕨门（一种已灭绝的古裸子植物）在母本孢子体的孢子囊中产生微型化的多细胞雌性配子体的性器官颈卵器。卵母细胞产生的卵细胞在颈卵器中受精。雄性配子体即花粉粒产生具有双鞭毛可游泳的精子。合子（受精卵）仍然在子房内发育下一代的孢子体。