德国植物学家Otto Kuntze将之更名为"Lactifluus indigo"，但却没有得到接纳。Lexemuel Ray Hesler及Alexander Hanchett Smith在研究北美洲的乳菇属后认为蓝绿乳菇是"Caerulei"亚组的模式种，"Caerulei"是一类含有蓝色乳汁的真菌。于1979年，他们修订了乳菇属内的分类，并将蓝绿乳菇分类到"Lactarius"亚组中，建基于蓝绿乳菇的乳汁颜色及其转变。蓝绿乳菇的种小名是拉丁文的「靛蓝色」，故又名靛蓝乳菇。