但是争议并没有停息，在日本宝龟年间（公元770－782年），日本派遣德清法师至中国鑑定此书真伪，德清之师法详居士认为此书是房融伪造。在唐朝之后，对《楞严经》的怀疑仍然持续。南宋时至中国留学的日本学问僧道元认为，《楞严经》内容与其他大乘经典不一致，向天童如净请问，天童如净认为《楞严经》及《圆觉经》的来源自古可疑。朱熹认为除了第七品建立道场及楞严咒之外，其余部份是房融假造。明朝道衍禅师（姚广孝）则反驳朱熹的见解没有根据。至明朝末年时，有人询问莲池祩宏大师有关楞严经是否是房融伪造，而莲池大师则肯定楞严经是真，