一个新的肾，其实是一种浪费。」圣严法师早年即体弱，晚年又有肾疾等病痛，但却不减其对于社会的关怀以及汉传佛教思想的推动。2009年农历正月初九（2月3日）下午四点（台湾时间），于台大医院出院返回台北县金山乡（今新北市金山区）法鼓山世界佛教教育园区的途中圆寂（辞世），享寿80岁。法鼓山则由方丈-果东法师代为宣读圣严法师的十点遗言：他生前曾留遗偈给弟子：主持法鼓人文社会学院动土典礼。出席在曼谷召开的「世界宗教领袖理事会」与「亚太青年和平高峰会」。出席在约旦召开的「世界宗教领袖理事会」。担任总召集人，举办「