志伊依然存疑，翁大立就委命郎中王三锡、徐一忠同谳。两人竟无所平反，被置极刑。数年之后，真兇被捕获。京城人竞称荷花儿冤死。明神宗大怒，欲重谴翁大立等。给事中周良寅、萧彦复劾之，乃追夺翁大立职，调王一忠、王三锡于外。潘志伊已升九江府知府，亦贬为陈州知府。万历二年（1574年）起为南京刑部右侍郎，不久改任南京吏部左侍郎。次年担任刑部右侍郎，不久升任南京兵部尚书。万历六年（1578年）致仕归乡。
家族.曾祖翁珉；祖父翁铨；父翁祚。母杨氏。