新整理了鲸目 的分类，并将长须鲸改置于须鲸科（"Balaenoptiidae"）须鲸属（"Balaenoptera"）以下，而其原有的属名（"Balaena"）则由弓头鲸保留，并成为单型属。长须鲸属须鲸科，同科异种的还有座头鲸、蓝鲸、布氏鲸、塞鲸和小须鲸。须鲸科早在中新世中期时就从其他须鲸亚目的科中分裂出来。可是直到现时为止，仍未有科学家能研究出此科的成员是在何时分裂成不同的物种的。在北大西洋和北太平洋的海域，偶尔会有蓝鲸跟长须鲸杂交的情况出现。直到2006年，人类发现的长须鲸亚种有二：一为北长须鲸