98年第一次描述时，它被归为肉鳍鱼类，因为它的头骨和下颚与原始肺鱼相似。1999年朱等人由于不知道这是最原始的肉鳍鱼还是最原始的硬骨鱼类，所以无法在演化分支图中找到斑鳞鱼属。斑鳞鱼属有一些硬骨鱼类所不具备的特征，例如位于头部后面的正中棘，这在鲨鱼和棘鱼纲中很常见，胸椎从肩带向后延伸，这在一些石首鱼身上也有发现。后来，在2001年，朱和舒尔茨提出了一个依据更多的假设，认为斑鳞鱼属很可能是一种基干硬骨鱼。同一年，他重新检查了这种鱼的系统发育位置，指出了斑鳞鱼属和爪齿鱼目之间的一些相似之处。他还指出，旋转