前往科孚岛，预备对鄂图曼帝国在巴尔干的领土展开海上行动。但是，传达这道命令的信使被贝都因截住并被加以杀害，所以布鲁伊并不知道拿破崙这想法。阿布基尔湾是个向内陆凹进去的海湾，长16海里（30公里），从西边阿布基尔的村落伸延到东边罗塞塔的城镇；此海湾正是尼罗河其中一个流向地中海的出口。1798年，此海湾受它在西边延伸出去的石头浅滩所保护；这浅滩由一个在3里（4.8公里）远、受阿布基尔城堡所守卫的岬延伸出来。在上，有个位处石堆中的小炮台保卫该浅滩。该炮台由法军士兵驻守，有着最少四门加农炮和两门重型迫击炮。布鲁伊