藏野线往西船桥站的联络线和京叶线二俣支线的分岔站，通过该线的武藏野线的列车有一部分停靠此站。视乎不同时间可能直通至海滨幕张站。此站为方便起见多在二俣支线显示为「武藏野线」。
车站构造.南船桥是一个设有两座座岛式月台四条乘车线的高架车站，车站站房设至于高架路轨的正下方。南船桥车站是由京叶线本线与高谷支线、二俣支线三条路线所组合成的三角线之东侧顶点。虽然路线上南船桥车站仅有京叶线一条路线通过，但实际的运务上根据时间带的不同部分行驶于武藏野线上的列车会自西船桥方向经过二俣支线抵达南船