桥头，穿越虚、实量体，终于北侧湖岸。博物馆主体建筑内部共分四层及一阁楼层，地板面积为38,333平方公尺。其中包括展厅面积约8,800平方公尺（常设展厅5,200平方公尺、特别展厅3,600平方公尺）及库房5,085平方公尺，还设有国内博物馆第一间穆斯林祈祷室。。馆内规划设有五个常设展厅、一个多媒体展厅、一个专题展厅、一个借展厅及儿童创意中心。常设展包括「奔流不息—嘉义发展史」、「佛陀形影—院藏亚洲佛教艺术之美」、「芳茗远播—亚洲茶文化展」、「锦绣缤纷—院藏亚洲织品展」、「认识亚洲—新媒体艺术展」五大主