真菌病毒（）泛指可以感染真菌的病毒。多数真菌病毒都属于，但也有约三成属于正义单链RNA病毒。真菌病毒必须具备感染健康真菌的能力，许多真菌细胞内类似病毒的物质并无感染能力，故只能称为，并非真正的真菌病毒。大多数真菌病毒的感染都没有任何症状，它们可能在长期共演化之下，演化出对宿主无害、甚至对宿主有益的共生机制，例如细胞内的双股RNA病毒可编码毒素，帮助其宿主毒杀周围的其他酵母菌，不过仍有少数真菌病毒的感染会严重影响真菌的生长，并降低部分植物病原真菌感染植物的能力。真菌病毒学（）是病毒学中一个相对较新的分支领域，