化运动。一次，警务课长井野边招集台东市绅此妈祖庙开会，主张废除台东所有寺庙，改成神社。首先被问的原住民南医师赞同。第二位身为基督徒的陈姓市绅亦赞同。第三位「台东三赖」之一的赖金木说庙宇是众人所有，应问众人，被井野边责骂。第四位吴金玉则答至少保留天后宫与海山寺，因为是民众的信仰中心，而且战争方殷，为安定人心，废庙不宜。于是，两寺庙皆得以保存。
战后时期.1945年，赖金木等士绅发起募捐将庙宇重予整修，于1948年3月完工。国民党政府来台后，庙方一千多坪土地被登录为县有地。直到19