3年间，圣克莱亦曾负责沙利文远征的补给准备，以及为宾夕法尼亚州编组民兵。
战后.独立战争结束后，圣克莱开始从政生涯。他在1785年获选为宾夕法尼亚州的大陆议会议员，再于1787年当选大陆议会议长。任期结束后，圣克莱获议会任命为西北领地的首任总督。圣克莱上任后随即要处理开拓者与原住民之间的土地冲突。易洛魁联盟与及多个俄亥俄地区的部族，要求开拓者归还部分的康乃狄克西储地，但圣克莱却予以否决，而他促成的（1789年1月）更加剧原住民对开拓者的敌意，触发西北印第安战争。11月4日，圣克