中国中央后以驻华大使潘友新向国府「揭发盛世才的罪行」，形容其为中苏友好关系的障碍。国民政府军事委员会参谋总长何应钦拟订「收复新疆主权方略」，经蒋中正审核后决定採行；国民政府将一面安抚盛世才，一面遏止苏联分裂中国的举动，设法收复新疆。1942年8月，国民政府下令新疆省政府：10月，国民政府向苏联提出「除外交人员外，其他苏联顾问、矿场人员、苏联部队均需在三个月内撤离新疆省」。盛世才开始组建10万人的游击队并在迪化挖掘地下掩体，表达不惜与苏军一战的决心。苏联则开始协助阿山哈萨克族暴动，组织反盛亲苏的「阿尔泰