共和国航空航天工业部撤销，成立中国航天工业总公司，本院随即改称中国航天工业总公司第一研究院。1999年7月，根据第九届全国人民代表大会第一次会议的决定，经国务院批准，中国航天工业总公司分拆为中国航天科技集团公司和中国航天机电集团公司（后来改为中国航天科工集团公司），本院随即改称中国航天科技集团公司第一研究院。1998年，依托中国运载火箭技术研究院建立了中国亚太移动通信卫星有限责任公司。2016年10月19日，该公司改组为中国长征火箭有限公司（简称中国火箭；CHINAROCKET），并在北京钱学森青少