刑满以后，当局将他继续关押，，最后在1972年6月1日凌晨，倪柝声在安徽省广德县白茅岭监狱（属于上海市管理）逝世。现在倪柝声与妻子张品蕙、二弟倪怀祖、弟媳徐奉先一同安葬在江苏省苏州市郊外的香山公墓。1958年10月，倪柝声反革命集团案其他案犯判刑。李渊如、汪佩真被指控在倪被捕后，变本加厉地组织反政府行动（退出三自），以反革命罪被判处15年徒刑。两人都一直没有出狱，文革期间病故。张愚之判刑12年，在青海劳改。释放后由于帮助基督徒逃离上海、传福音等罪名再次被捕，于1970年4月25日在上海人民广场公审后被枪