在同年8月于喀拉蚩成立，由总理利雅卡特·阿里·汗兼任一职，伊斯坎德尔·米尔扎则担任。英军的将官直到1956年为止，一直担任巴基斯坦陆海空三军的总司令。1959年12月，因为阿尤布·汗军政府的伊斯兰马巴德-拉瓦尔品第都会圈计画，巴基斯坦联邦首都暂时迁至拉瓦尔品第。拉瓦尔品第的陆军总部邻近地区，在决定迁都的过程中，有着重要作用。1972年5月，总统佐勒菲卡尔·阿里·布托因为先前的战争中，各军种难以互相协调而受到批评，因此下令将各军种的总部迁到伊斯兰马巴德。1974年，海军总部首先完工，它从卡拉奇迁移到了伊斯兰马