后遭到了严重破坏，阿莱克修斯确立了普罗尼亚制以取代农兵制，以极低的代价重建了内战中破坏殆尽的基层管理系统，重新构建起国家的基础。阿莱克修斯也十分热衷于宗教事务，他的统治以严酷迫害异端波格米勒派与保罗派而着称。阿莱克修斯统治了37年。阿莱克修斯的长子约翰二世于1118年继位，在挫败了后来成为历史学家的他的姐姐安娜·科穆宁娜的篡位阴谋后巩固了皇位。约翰继位后拒绝承认其父与威尼斯签订的授予贸易特权的条约，在帝国海军力量薄弱的情况下，这导致威尼斯舰队洗劫了爱琴海的诸多岛屿，约翰只得被迫妥协。此后约翰在在巴尔干方