亚出售给新加坡的淡水定价、新加坡的土地开垦对马来西亚水域造成的负面环境影响、海上边界、马来亚铁路在新加坡的保留地、白礁以及一座计划用来取代新柔长堤的新桥建设经费等问题，马新两国之间仍有许多争端。2008年5月24日，国际法院宣布白礁属于新加坡，而附近的中岩礁属于马来西亚。至于新加坡的旧铁路地段，也在1990年《马来亚铁道公司在新加坡土地发展协议要点》（Malaysia-Singapore Points of Agreement of 1990，简称POA）获得解决。
菲律宾.北婆罗