共和国帮助其总统昂热-菲利克斯·帕塔塞平定叛乱。次年帕塔塞被推翻后，本巴同其一道被新政府以屠杀反对者的罪名告上国际法庭。甚至有人指责他屠杀俾格米人并吃人肉，本巴本人声称这是刚果政府为赢得选举而造的谣。2003年，本巴率领刚果解放运动参与旨在解决第二次刚果战争的和平对话，并参加过渡政府，成为其副总统。本巴在2006年刚果大选的口号是“百分之百的刚果人”，这被认为是对约瑟夫·卡比拉的攻击，因为据称卡比拉的母亲是卢旺达人。但是不久本巴也被指出其母是安哥拉人。选举失利后本巴担任议员，后与政府发生冲突流亡欧洲