SIMRAD EK60)、温盐深仪(CTD)、轮盘採水器、表层海水水文及生化特性巡航仪、採泥器、及各式气象资料收集仪器等。
2012年8月任务.海研二号于2012年8月5日下午1时5分在日本沖绳县波照间岛南南西方海域，遭日本海上保安厅11管波照间型巡视船PL62石垣号等巡视船及飞机干扰。调查计画主持人龚国庆说海调目的为：「主要是研究苏拉台风对台湾东部西北太平洋海域海洋生物和生态系统的影响。主要在9个测站做调查，到达第9个测站即离琉球波照间岛60海里处时遭到干扰，此海调点预计待10小