季后赛，可惜连续三年均在第一轮出局。2003年起，出任纽约尼克斯的总管，至2006年兼任该队的总教练。托马斯接任纽约尼克斯队总管时，曾作出许多令人不解的交易，包括先后交易马布里、弗朗西斯、克劳福德等一众功能、个性相近的球员，此外，又先后聘请威尔肯斯和布朗两位名人堂级千胜教练执教球队，却屡屡传出与两人不和的传闻。但总括来说，托马斯是一名颇受球员欢迎的教练，许多明星级球员均曾表态支持他，使他仍能于联盟内立足。