在离开江南西站之后，不再前往晓港站，改行一段新建的铁路路段前往新的昌岗站。然后再大致往南，最终以广州南站作爲终点。自此，新2号线全线正式通车。至于连接江南西站及晓港站的两条路轨，往三元里方向的路轨已经改为联络路轨，目前仅供工程车或车务调动使用。而往万胜围方向的路轨因为与新建路线平交，故已被拆走，隧道也同时被废弃，并用砖墙封起，与营运中的路线分隔。
新二号线时期.2012年1月2日晚上约6时半，2号线广州火车站一架扶梯运行中突然损坏，梳齿板断裂变形，所幸未造成人员伤亡。后经调查，