38年9月起至燕京大学（美国基督教背景）国文系每周授课6小时，担任客座教授。但遭行刺后日军宪兵进驻周作人家，却加速民众对其亲日印象的怀疑。
出任汪精卫政权职务.经过枪击案的身心冲击，周作人在1939年1月接下汪精卫南京政府国立北京大学图书馆馆长的聘书，3月应聘兼任北京大学「文学院筹办员」，开学后兼任文学院院长。1940年11月8日，汪精卫政权华北政务委员会教育总署督办汤尔和因肺癌病逝，1940年12月19日，汪精卫政权中央政治委员会31次会议通过「特派周作人为华北政务委员会委员