末期，孙氏仍不是日本公民。他的日本妻子随他姓孙。结婚后，法律承认了她的新姓氏，孙正义随之而成为日本公民而不用改姓传统的日本姓氏。1991年，孙正义归化为日本人。
家族.其本贯为一直孙氏，据孙正义本人描述，出自春秋时代的着名兵法家孙武的一族。他的后代移居到朝鲜半岛，传到22世孙钟庆，从韩国大邱市渡海定居在日本，孙家在日本定居已有三代。他的家人说：「我们的孙氏和韩国固有的孙氏不一样，我祖籍和汉民族的孙氏属于同一根源。」。