生素K2、提高蛋白质的消化吸收率，更重要的是发酵过程产生了多种生理活性物质，具有溶解体内纤维蛋白及其他调节生理机能的保健作用。根据藤原明衡所着的新猿乐纪推算，日本人食用纳豆至今已有超过一千年的历史。
起源.虽然日本近代古书《和汉三才图会》中曾记载：『纳豆自中国秦汉以来开始制作。』，然《和汉三才图会》是1712年才出版，同时内容也被认为含有空想荒诞不经的成分。在可信的学术文献中，「纳豆」一词最早出现于平安时代11世纪中期，由藤原明衡所着的『新猿乐纪』当中所记载的；『腐水葱香疾大根舂塩