后，蓄谋以朝鲜为踏板攻打明朝，于1592年4月率15万陆军和数万水军入侵朝鲜。倭寇攻占釜山和东莱城后，兵分东、中、西三路北上，20天后攻下汉城，后又占领平壤。朝鲜宣祖逃往鸭绿江边的义州。全罗左道水军节度使李舜臣率领朝鲜水军抵抗外敌，并研制出了极具战斗力的龟船，在玉浦、赤珍浦、泗川、唐浦，特别是闲山岛等海战中击败敌军，有效遏制住倭寇“水陆并进”的计划，使其难以向平壤以北地区进犯。在陆上，虽然朝鲜官兵节节败退，但朝鲜各地民众却自发组织义兵，抵抗倭寇入侵，出现了郭再祐、等义兵部队，取得了延安大捷、晋州大捷等胜利。