馆的雏形在荷兰殖民时期刚刚统治东印度群岛的时候就已经出现，不过档案馆直至1860年才得到有序的管理，并于1945年荷兰把东印度群岛的主权移交给印尼的时候转交给印尼政府。这座档案馆所收藏的荷兰东印度公司档案在数量上位居世界之冠，还在2003年与荷兰、印度、南非和斯里兰卡所收藏的同类档案一同列入联合国教科文组织的世界记忆名录。
历史.在荷兰刚刚开始统治东印度群岛的时候，档案维护是殖民政府总秘书处的职责。当时殖民政府很少会关注档案维护的事宜，所以已经储存下来的档案通常得不到适当的维护，遭