孔继尹（），云南通海（今云南省通海县）人，清朝政治人物、同进士出身。嘉庆十九年（1814年），登进士。道光四年，任山东武定府海丰县知县。道光七年，任山东兖州府滋阳县知县。道光十二年，任德州知州。道光十三年，任四川夔州府知府，后升任广东粮道。道光二十三年，任广东按察使。道光二十五年，任广西布政使。