特，他的母亲伊丽莎白以其弟弟伊什特万五世的名字命名其幼子，将此名引入维特尔斯巴赫家族。为了减少维特尔斯巴赫家族的影响力，于1290年教皇尼古拉四世拒绝确认已经被假定出任萨尔茨堡大主教的斯特凡，斯特凡于1290年-1292年在帕绍圣斯德望主教座堂担任法政牧师，斯特凡只好回巴伐利亚于1294年夏天与他兄弟奥托三世及路易三世共同统治下巴伐利亚。当长兄奥托三世在匈牙利担任国王而不在巴伐利亚期间（1305年-1308年），斯特凡独自统治下巴伐利亚。斯特凡一世是哈布斯堡王朝的反对者，最后他于1310年在与奥地利公爵