宗因无心之过，害死了泾河龙王，龙王阴魂不散，闹得太宗六神无主。魏征建议派秦琼、尉迟恭守住前后宫门保驾，果然奏效，皇帝由于两人太过疲惫，命画家吴道子画了两人之像，贴在宫门口，照样管用。后来此举在民间流传开来，秦琼与尉迟恭成了最常见的门神。黄易小说《大唐双龙传》中，秦琼因打赌输给沈落雁而投效瓦岗寨，武功、兵法皆颇为出色，善用双锏，和寇仲、徐子陵有段交情，曾暗恋吕梁派千金多年。在李密失势后，一度投效王世充，后在寇仲帮助下以保护突利回国为名，转投李世民。相声作品《关公战秦琼》中，利用关公与秦琼出生于不同年代