因为葡萄牙人的普遍恶行和基督教化的尝试，与特尔纳特穆斯林统治者的关系也变得紧张。1535年，Tabariji苏丹被废位并由葡萄牙人送到果阿，他改信基督教并将名字改为Dom Manuel。在宣布对他无辜之后又被送回重承王位，但是他在1545年回程途中死于马六甲。他将安汶岛遗赠给了他的葡萄牙教父Jordão de Freitas。继任的Hairun苏丹被葡萄牙人谋杀，特尔纳特人于1575年在经过5年的包围后驱逐了葡萄牙人。安汶成为了葡萄牙人在马鲁古群岛殖民活动的新中心。欧洲势力在这一地区变弱，而特尔纳特却不断强