辞去主教职务，林家骏宣布同日荣休；正权主教由助理主教黎鸿昇于同日傍晚真除接任。2009年3月，林家骏被确诊胃癌；同年5月11日入院治疗。林家骏于同年7月27日下午于镜湖医院病逝；7月31日下午，天主教澳门教区假圣母圣诞主教座堂由黎鸿昇主教主祭，并由陈日君枢机、天主教香港教区汤汉主教等约60位司铎共祭为林家骏举行逾越圣祭（即大礼安息弥撒）；同日下葬于圣味基坟场。
牧徽.林家骏的教区主教牧徽的中间是一个盾牌，内饰以十诫约版的形状；盾牌上由左至右分为两列写着中文格言「诚信桓祥，天道永