苏联内务部下发命令，撤销马员生的刑事处分，解除流放，完全恢复公民权。1955年，马员生获苏联最高苏维埃指令：“取消案件，彻底平反，恢复名誉”。经马员生努力及中共中央关怀，1955年10月马员生回到中国，并恢复了中国共产党党籍。回中国后，马员生一直在黑龙江省富拉尔基中国第一重型机械厂工作，起初任工艺处处长，1960年代初调任技术处处长，并被选举为该厂党委委员。文化大革命爆发后，马员生被打成走资派、反动技术权威、“老托洛茨基分子”，很快就被送进“牛棚”隔离审查。1971年九一三事件后，马员生也被从“牛棚”放