任命为世子东中郎参军事，没有就任。晋愍帝司马邺征拜王峤担任着作郎，右丞相南阳王司马保也征召王峤做官，王峤都以道路艰险没有前往。司马睿担任丞相，任命王峤为水曹属，王峤出任长山县县令，升任太子中舍人，因病没有就任。王敦请王峤担任参军，封九原县公。王敦在石头城时，想要禁止私人砍伐蔡洲的荻，向属下官员询问。当时朝廷的军队刚战败，士人和百姓惧怕，没人敢反对。只有王峤说：“中原有菽，老百姓去采摘。百姓不富足，您怎么能富足！如果禁止人们砍柴和采集，不知有什么好处。”王敦不高兴。王敦将要杀周顗和戴渊时，王峤在座位上劝谏