后，以对马国地设立对马府中藩，宗氏成为外样大名。后来，宗氏尽力恢复与朝鲜外交关系的举措得到幕府的认可，接受了十万石的国主格俸禄，特许每三年至江户一次进行参勤交代。德川幕府颁布锁国令之后，经幕府许可，宗氏依然与朝鲜贸易。对马藩与萨摩藩（与琉球贸易）、松前藩（与虾夷贸易），成为当时日本仅有的三个能够通过对外贸易获得利益的藩。明治维新后，对马府中藩被废除。宗氏当主被明治天皇册封为伯爵，列居华族。
系谱图. ※宗义智以前的系谱众说纷纭