郡为后凉所攻佔，改属秦州。太初十年（397年），收复兴晋郡，河州移治兴晋郡枹罕县。至此，河州领六郡：武始郡、安故郡、武城郡、武阳郡、兴晋郡、大夏郡。后秦弘始二年（400年），灭西秦，苑川、金城二郡改属河州。弘始九年（407年），河州为彭奚念所据。西秦更始元年（409年），复国，河州仍领六郡。永康元年（412年），攻佔南凉凉州三河郡，改属河州。后析置西安郡。建弘七年（426年），在兴晋郡境内侨置南安郡，属河州。永弘三年（430年），河州为吐谷浑所攻佔。
北朝.北魏孝文帝太和十