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生态行.博物馆除了设有馆内的导赏团外，亦设有连同博物馆导赏团的生态行。每节生态行约两至三小时，开放予公众团体、学校及各个机构参加。生态行会在博物馆以外参观香港中文大学的生态景点及环保设施，包括未圆湖一带的树木研习径、邻近百万大道的太阳能花园及再生园。透过介绍自然生态和设置环保设施的目的，宣传可持续发展的重要性。由博物馆开幕起，已经有不少学校、香港童军总会等青少年组织及香港天文台和渔农自然护理署等政府机构参与博物馆生态行。
社区教育.博物馆每年举办多个