斯特分类法将本科放到锦葵目中，1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法和2003年经过修订的APG II 分类法将本科合并到锦葵科中，列为木棉亚科。
主要属.原榴梿属植物自Heywood et al. 2007后分类于锦葵科下自Heywood et al. 2007后分类于Malvaceae s. s.之下的属自Kubitzki 2003之后认为是异名的属Kubitzki未包含之属