直隶中央六部。洪武二十六年，编户八万七千三百六十四，口五十二万二千三百八十三。弘治四年，户六万八千三百四十四，口一十七万一千五百八。万历六年，户六万九千三十九，口一十六万五千五百八十九。清朝初期沿袭明制，仍领三县。顺治初年，设镇海将军，干隆年间裁撤。雍正八年（1730年），江宁府的溧阳县来属。光绪三十年（1904年），置太平厅。终清一朝，领四县、一厅，考评冲，繁，疲，难。民国初年，全国废府州厅改县，于1913年废。