广州为基地，继续开展革命活动。在广州期间，朱卓文历任大元帅府航空局局长、广东兵工厂厂长、中央直辖讨贼军司令、香山县县长、广东省审计局局长等职务。1920年11月29日，孙中山再次南下广州整顿军政，建立航空局，任命朱卓文为航空局局长，组织两个飞机队，张惠长任第一飞机队队长，陈应权任第二飞机队队长。起初，两个飞机队拥有水、陆机5架。朱卓文出任航空局局长后，新购水机2架，陆机4架，陈庆云又奉命赴日本大坂购入寇狄斯双翼飞机1架。1921年5且5日，孙中山在广州就任非常大总统时，朱卓文撰文祝贺称：同时，朱卓