命为刑部郎中。4年后（1650年）他被调往福建出任福建汀漳兵巡道按察使司副使。在当地他官声良好，被认为是一名能干的官员和优秀的儒家学者，清除了当地的盗匪，并创办了一些学校。 1651年（顺治八年），赵映乘联合福建、广东、江西三省兵力围剿永定县的苏荣（被郑成功封为招讨大将军）起义军。顺治九年（1652年），赵映乘返回故乡开封。 经过水灾10年以后，赵映乘致力于重建城市，他得到兄弟赵映斗的帮助，促使犹太人渡过黄河南下，回到他们原来的住处。完全由于赵映乘个人的财务支援，会堂得以在1653年重建起来，包括中国式