县为青衣羌人的聚居地。秦汉时设青衣县，属蜀郡。唐宋之际，为羁縻州地，隶属雅州都督府。元末始称董卜，这时开始有藏传佛教传入，青衣羌人转化为蕃民，隶属吐蕃宣慰司。清朝干隆年间设穆坪土司。1928年国民政府行改土归流之政策。1930年建县，因矿产丰富，取《礼记·中庸》“今夫山，一卷石之多基广大，草木生之，禽兽居之，宝藏兴焉”之意而命名为宝兴。1935年，中国工农红军长征经过宝兴县，曾建立苏维埃政权。1939年，西康省成立，宝兴划归西康省管辖。1949年10月，中华人民共和国成立后，复归四川省，属雅安专区管辖。20