军事机关，负责办理中华民国海军军事事务的规划、督导及执行。现址位于台湾台北市中山区大直营区，下辖政治作战室、督察室、人事军务处、军事情报处、战备训练处、后勤处、计划处、战斗系统处、主计处等幕僚部门。
组织.国防部海军司令部（驻台湾台北市中山区大直营区）<onlyinclude>**海军陆战队陆战第六六旅（驻台湾桃园市龟山区） ——「先锋部队」（旅长 一位 少将）</onlyinclude>***通电中队