总统吕秀莲「嘿嘿嘿」指称中华民国总统陈水扁与立法委员萧美琴有暧昧关系，而被提起告诉；在审讯过程中，《新新闻》未能提出足够佐证，因而被中华民国最高法院判决败诉定谳。2004年3月26日，《新新闻》第890期报导记者刘伯姬撰文，说百万废票行动联盟召集人郑村棋与该联盟撇清关系，还说郑村棋对媒体表示「当时喊出一百万张废票的目标，只是广告词，原本就不预期达成」。同日，百万废票行动联盟抨击，该文为「非专业、揣测性报导」、「既不客观，亦藐视理性选民投废票的自主性」；同日下午，该联盟以电话向《新新闻》抗议并要求与总编辑