1955年吸收武汉大学水利学院水道海港系。1985年建校70周年时恢复传统校名“河海大学”，中共中央顾问委员会主任邓小平亲笔题写了校名。1995年建校80周年校庆时，中共中央总书记江泽民为学校题词：“面向未来，开拓进取，进一步发展水利教育事业”，李鹏、李岚清、钱正英等党和国家领导人也分别为学校题词，对学校的事业发展予以肯定、寄予厚望。2005年10月23日，学校90周年校庆，国务院总理温家宝视察河海大学发表讲话并提出“献身，求实，负责”六字要求。2009年11月24日，成为江苏省第四所教育部