阿尔巴尼亚成为有吸引力的宗教。阿尔巴尼亚穆斯林可分为两大类:逊尼派穆斯林和拜克塔什教团，逊尼派穆斯林多生活在北部和中部，拜克塔什教团信徒多生存在南部。在奥斯曼时代，多数阿尔巴尼亚穆斯林也是因拜克塔什教团的缘故而信教，他们因德夫希尔梅制度多被征入耶尼切里军团，有42位奥斯曼大维齐尔是出身阿尔巴尼亚穆斯林。
独立后初期.阿尔巴尼亚于1912年独立后，在20世纪民主制，君主制以及后来的共产主义政权系统性的去宗教化，在全国所有其他宗教，包括伊斯兰教经历了剧烈的变化。1923年，