992年8月24日结束与中华民国政府的双边外交关系，中华民国政府与之断交。而政府随后与布吉纳法索复交，连战出访宏都拉斯与巴哈马时，并以总统特使身分出使萨尔瓦多与瓜地马拉。1998年，南非结束与中华民国政府的双边外交关系。作为总统的李登辉也前往菲律宾、泰国、印尼进行度假外交，同时也进行17年来元首首次拜访邦交国的出访，先后前往尼加拉瓜、哥斯大黎加、南非与史瓦济兰，并在1995年前往美国访问。
国防军事领域.在军事上，1997年7月1日，中华民国国军在李登辉政府所主导的精实案开始实施