连州及其所领的阳山和连山县改属广州府。清雍正七年（1729年），连州改为直隶州，直隶广东布政司，辖阳山、连山2县。清嘉庆十八年（1813年），从清远、英德2县划地设立佛冈直隶厅，管辖清远等6县捕务。二十一年，升连山县为绥瑶直隶厅，统管“连阳”瑶务，清宣统三年（1911年）复称连山县。
中华民国.民国元年（1912年）和民国三年，连州和佛冈直隶厅分别改为连县和佛冈县。抗日战争期间，广东省政府曾北迁连县，今清远市各县（市、区）均属广东省第二行政督察区管辖。民国三十五年，置连南县统管