乌恰县析置阿克陶县。1955年2月5日，改称克孜勒苏柯尔克孜自治州，同年新疆省改为新疆维吾尔自治区。1976年，将阿克陶县划归喀什专区，将喀什专区的伽师县划归克孜勒苏州。1980年，恢复阿克陶县和伽师县原来的行政归属。1986年6月，撤销阿图什县，设立阿图什市。
地理.克孜勒苏柯尔克孜自治州地处帕米尔高原，山地占全州总面积的90%以上。地势由东南向西北呈梯状上升，东南部为塔里木盆地边缘绿洲和喀什噶尔平原，最低处海拔1197米，北部、西北部为天山南脉和帕米尔高原。山地以克孜勒苏河为界