桑托斯俱乐部支付120万欧元获得乔纳森30%的所有权，桑托斯的投资合伙人Teisa公司用80万买下另外20%所有权。乔纳森和桑托斯的合同签到2014年，最低解约金为1500万欧元。2011年上半年，他和桑托斯俱乐部一起获得圣保罗州足球甲级联赛和2011年南美解放者杯冠军。2011年7月15日，意大利足球甲级联赛球队国际米兰宣布以500万欧元买下乔纳森。乔纳森和国际米兰签订了4年的合同。乔纳森在国际米兰的表现一般，很难得到出场机会，在2011/12赛季的冬季转会窗中，他被租借到帕尔马。他在下半赛季代表帕尔