尽管植龙目与鳄鱼在外表与生活方式有许多相似处，仍有许多次要特征可分辨这两群动物。例如，植龙目的踝部结构比任何鳄鱼的踝部结构还原始。植龙目也缺乏骨质次生颚，而鳄鱼拥有次生颚，次生颚可让鳄鱼嘴部充满水时仍保持唿吸。然而植龙目可能拥有肉质构成的次生颚，许多中生代鳄鱼也被推测拥有肉质次生颚。最后，也是两者最明显的差别，植龙目的鼻孔位于眼睛附近或上方，而鳄鱼的鼻孔位于口鼻部尾端。这些演化适应可让牠们两者的身体浸泡在水面下时，仍可以唿吸。
三种形态型.植龙目的头颅骨有三种明显的形态型（Mor