对科学研究上的补助，许多共和党人积极的反对联邦政府补助胎儿干细胞研究，因为认为那会採集到并摧毁人类的胚胎（一些人认为那在伦理上是和堕胎一致的）。其他一些人则支持补助仅限成人的干细胞研究。
外交政策.在九一一袭击事件后，共和党在反恐战争上推行新保守主义，包括了2001年入侵阿富汗和2003年入侵伊拉克。布希政府认为在伊拉克的「非法战斗人员」（Unlawful combatant）不属于日内瓦公约的保护范围，主张日内瓦公约仅只保护主权国家的军队人员，并不适用于盖达等恐怖组织的恐怖份子。