客运大楼原址兴建沙田至中环线铁路车厂、多用途体育场馆、都会公园、在原机场跑道末端兴建启德邮轮码头客运大楼及旅游枢纽连上盖直昇机坪，以及兴建全长3.9公里，连接西九龙公路的中九龙干线。另外，在九龙湾连接与观塘绕道平行的东南九龙T2主干道，直达茶果岭与将军澳－蓝田隧道连接。
填海司法覆核.2003年2月27日，保护海港协会向法院提出司法覆核，认为城市规划委员会通过的湾仔填海计划第2期工程违反《保护海港条例》。法院于7月8日裁决城市规划委员会败诉，使湾仔填海计划第2期的工程批准被迫取消，