长期从事植物生理和生物化学领域的研究。1950年，施教耐在中国科学院实验生物研究所植物生理研究室担任助理研究员一职。1953年，植物生理研究室改为研究所。1960年，施教耐升为副研究员。20世纪60年代初，施教耐开始了植物代谢和植物酶的研究工作。受到文化大革命影响，因基础理论的研究工作被迫暂停，施教耐开始进行纤维素酶应用的研究。文化大革命结束之后，于1982年升为研究员。1991年当选为中国科学院院士（学部委员）。
荣誉.施教耐曾因磷磷烯醇式丙酮酸羧化酶的研究获1987年中国科学院