恩施泰因的牲畜列车以及1对慕尼黑至萨尔茨堡的普快货运列车。在第二次世界大战爆发前，德意志国铁路于1939年8月22日停办了大量的快速列车及国际服务。而在战事开始后，该线路的电气化运营于1939年9月1日结束。所有列车均依靠蒸汽机车牵引，因为当局担心发电厂设施会遭到敌人破坏。但由于发电厂实际上并没有遭到袭击，电气化运营随后在1939年9月22日得到恢复。在第二次世界大战期间，有大量的军事部队及装备均经由这条铁路被发送往东线战场。1943年6月1日，一座新的利弗灵车站在萨尔茨堡至弗赖拉辛区间建成，以方便参加