证据还不能完全确定台湾原住民与新石器时代文化间的对应关系。台湾原住民族的呈现多元而复杂，中华民国接续日治时期研究分类当作官方认定的族群有：泰雅族、赛夏族、卑南族、阿美族、排湾族、布农族、邹族、鲁凯族和达悟族等9族。21世纪后，新增认定族群有：邵族、噶玛兰族、太鲁阁族、撒奇莱雅族、赛德克族、拉阿鲁哇族、卡那卡那富族等7族，此等7族今日多居住在山地与东海岸纵谷，其文化特色至今大抵尚清晰可辨。除了官方认定的族群之外尚有：凯达格兰族、道卡斯族、巴宰族、巴布拉族、猫雾捒族、洪雅族、西拉雅族以及猴猴族8族不等，