，发兵沿江而下，要「清君侧」、「除马阮」。马士英提出：「宁可君臣皆死于大清，不可死于左良玉之手」。命史可法从泗州移兵抵燕子矶，以防左良玉。左良玉兵败后，史可法移师扬州，在清军攻击下失守，史可法壮烈殉国，南京政权被灭。弘光帝被虏，马士英逃至浙江，投靠总兵方国安，后被清军所俘，拒降身死。（一说逃慝台州四明山之金钟寺剃发，被清兵俘虏，最后殛死）。
家族.曾祖父马福、祖父马云龙、父马明卿。有两子，一名马钖，一名马銮。马钖由于看不惯其父为人，哭着劝其父改过。明亡后在南京靠算命为生，终其天