面游说当时主政的西藏活佛承认民国政府，消弭化解了一场可能发生的战争。
领导佛协.1949年，应邀赴北京参加佛教协会筹备会议，在广济寺与圆瑛法师、赵朴初等成立中国佛教协会筹备处。10月，他代表中国佛教徒接受锡兰佛教代表团赠送的“佛舍利”、“贝叶经”、“菩提树”三宝。1951年春，虚云老和尚拟在云门山大觉寺传戒。适值中国展开「镇反运动」（镇压反革命），广东省乳源县民兵包围寺院，以该寺隐匿反革命分子，窝藏军械及金银为由，将虚云老和尚等二十六名僧人囚禁起来拷打。虚云和尚被拘禁于方丈室内