教宗集权体制，达成了1417年天主教会大分裂结束后，历任教宗80多年来朝思暮想的盼望（此前教宗对罗马涅和教宗国只有名义上的封建领主权，教宗国实际上四分五裂、贵族割据），同时也使他的权力迅速增长、威震八方。至1501年，切萨雷已征服弗利、佩萨罗、里米尼、法恩扎并且被封为罗马涅公爵；1502年，切萨雷·波吉亚强迫李奥纳多·达文西为军队工程师；在同年的乌尔比诺叛乱中他被叛军击败，但立刻与法王路易十二结盟并获得法军援助、迅速收复了失地，年底以残忍的方式处死一大批雇佣军队长（亦是义大利中部各城的小执政官）。这一惨案传