M.施奈德对西庭的一次挖掘当中被发现，由于担心损害现时的圣索菲亚大教堂建筑，发掘工作再也没有开展。
第三代建筑物.
拜占庭教堂（6至15世纪）.532年2月23日，在第二代教堂被摧毁后的仅仅数天，皇帝查士丁尼一世决定兴建第三代截然不同的大教堂，第三代教堂较前两所更为宏大雄伟。查士丁尼一世选用物理学家米利都的伊西多尔和数学家特拉勒斯的安提莫斯为建筑师，但安提莫斯在不足一年内逝世。拜占庭史学家普罗科匹厄斯在《建筑》一书里描述了建造圣索菲亚大教堂的状况。皇帝将