辖州治、赣榆、沭阳三地。嘉庆八年（1803年），改属淮扬道。清咸丰五年（1855年），黄河大改道，转向东北，由大清河入海，结束了700年由淮入海。今云台地区逐渐淤平，与陆地联成一体。
中华民国至今.民国元年（1912年），废海州直隶州，除沭阳县、赣榆县外的原有辖区新设东海县，属徐海道。同年4月，析东海县之东南境为灌云县，同年东海县又析出灌南县。民国34年（1945年），抗战结束，连云市正式设立，张振汉任市长，35年4月正式到任。1949年初，第二次国共内战后重建政权，析东海