2000年代JR时间表修正（）是指2000年代在JR集团内路线中实施的。
2000年（平成12年）.
1月22日.九州中，随着筑肥线下山门站至筑前前原站之间成为双线铁路实施时间表修正。当中包括由于增加班次而引入由JR九州开发的首架直流型电动列车。
3月11日.各地实施时间表修正。
4月21日.由于山阳新干线「光号铁路之星」规定使用指定编成，「West光」终止运行。同时，0系不再连接绿色车厢。S