矿山上有多个採矿工程的通风井遗址，由于杂草丛生，井口难以察见。现时莲麻坑矿山通风井一带已经封锁，以免有人误堕井内。据新闻报道，昔日矿场有塌陷及从高处堕下的风险。
自然生态环境.嘉道理农场的一份生态调查报告指出，莲麻坑的风水林及次生林为「生态热点」，森林中曾发现橙头地鸫、赤麂、果子狸、野猪、七间狸、针毛鼠等。一些罕见物种如香港后稜蛇和3种香港的飞蛾特有品种，都在莲麻坑发现。次生林中亦首次于香港境内发现麦氏桫椤（"Gymnosphaera metteniana"），林中亦可以看到受保护