ND PIX」大会。本次可使用不同的领航员。此外，本次的对战方式与前作或后来的作品均不同。整场战斗全由电脑自动操纵，并且借由「Program Deck」来控制晶片使用顺序。其中GP大赛(对战晶片大赛)跟Ｎ１大赛实际内容类同，但两者分别在于一款属于GBA版本(GP大赛)、另一款WSC版本(Ｎ１大赛)。
EXE4.WWW的大战5个月后…从WWW基地凯旋归来的热斗和洛克人升上6年级。就在大家充实的过着和平的生活时，NASA却侦测到有小行星正逐渐接近地球，因此组成了危机应变小组。