海豹、南美毛皮海狮和各种类型的鲸，近海岛屿上还生活有罕见的条纹卡拉鹰。群岛周边的特有鱼类主要是南乳鱼属。福克兰群岛上没有乔木，其植物群主要由各种亚灌木抗风植物组成。整个群岛几乎都是绵羊的牧场，引进物种包括驯鹿、野兔、家兔、巴塔哥尼亚狐、猪、马、褐鼠和猫。这些外来物种已经对原生动植物构成不利影响，为此政府试图对狐、兔和鼠之类入侵物种的繁殖设限，甚至将其全部剿杀。特有陆地动物受这些引进物种的影响最大。由于缺乏生境变化的长期数据，人类对福克兰群岛环境的影响程度暂不明了。
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