柴油机主循环系统（47个冷却单节）和中冷器次循环系统冷却（15个冷却单节），每个传动冷却室顶部均设有三台轴流式冷却风扇，每台风扇均由液力偶合器单独驱动，可据循环水温的高低来自动调节转速。此外，传动冷却室还设有电动空气压缩机和直流起动发电机。车体下方两台转向架之间的空间，吊挂着一个可载10吨柴油的燃油箱、两个总风缸和蓄电池组。
柴油机.北京型6001号机车装用两台12V240ZJ型柴油机，为12气缸、四冲程、水冷式、直接喷射、开式燃烧室、废气涡轮增压的大功率中速柴油机。该型柴油机采用