民国成立后，他于民国二年（1913年）任第一届国会众议院议员，后任京师逹赖庙诺们罕达喇嘛，约法会议议员。1916年，第一届国会第二期常会开幕，他继续担任众议院议员。1917年8月18日，阿旺根敦在北京因病圆寂。阿旺根敦圆寂后，西藏旅京同乡会呈请蒙藏院给与抚恤，经蒙藏院呈请大总统袁世凯获准。西藏旅京同乡会在致蒙藏院呈中称，蒙藏院在致大总统呈中称，大总统收到蒙藏院呈文后，发布了大总统指令，内称，