年12月，基于校园疫苗接种作业已展开，因而订定「325停课标准」免用状况-「814原则」，即学生接种率达八成以上之学校，于达八成当日起14天后，无须再依「325停课标准」採行停课措施。
社交活动的防治.为因应在高雄市举行的2009年世界运动会订定「2009年高雄世界运动会传染病监视计画」及「世运期间H1N1新型流感防治相关配套措施」，并启动机动防疫队进驻前进指挥所，加强传染病监测及疫情防堵。
疫苗缓打潮.疑似疫苗接种后产生不良反应的事件频传，尤其是「刘小弟案