员会针对此案作出应进行第二阶段环境影响评估后，最后决定同意拜耳公司台中港区投资案，并于1997年12月通过将台中港区土地租给拜耳公司。
反对行动.1996年开始，立法院、台湾省议会及民间兴起反对拜耳设厂的声浪。依照1995年《土地法》第25条规定，省政府对于其所管公有土地，非经该管区内民意机关同意并经行政院核准，不得处分或设定负担或为超过十年期间之租赁。由于拜耳公司所需台中港区土地属于台湾省政府之台中港务局所有，因此拜耳设厂案仍需经台湾省议会通过。拜耳案虽然经过中央与省府同意，但当