分爲孢子体自交不亲和性和配子体自交不亲和性两大类，此外，还有一些特殊的机制，但这些特殊机制迄今鲜有科学家对其进行研究。自交不亲和性在植物界中分佈广泛，超过60%的被子植物都具有这种特性。
原理.达尔文等早期的生物学家就已发现，报春花有两种柱头与花葯相对位置不同的花，只有不同形态的花之间的授粉才可能成功。此爲自交不亲和性的发现。20世纪80年代之后，科学家开始研究自交不亲和性的分子机制。大多数植物的自交不亲和性由一个称为S位点的复等位基因位点控制。S位点基因的类型众多，在自然群体