一年（1613年）进士。先后任福建邵武、晋江及山东潍县知县。天启二年，由知县升为御史，追论崔文升、李可灼罪。依附赵南星，成为东林党人，天启七年（1627年）二月因反对魏忠贤被削籍革职，罢官归里。崇祯间复出，任河南、陕西等省巡抚，又曾出任山西巡抚。大学士温体仁告诉吴甡：“流贼癣疥疾，勿忧也。”崇祯四年以吴甡为赈济御史，奉命携带十万两的帑银前去赈济陕北，吴甡描述当时鄜州，“一县之内，十室九空”，延长县“流贼数万，屯聚城下”，清涧县，“荒乱尤甚，县中之民，半化为盗，因之饥馑，人心汹汹……城十里外皆是贼巢”。三边总