724年），石门寺遭清军焚毁。雍正三年（1725年），仓央嘉措便开始筹备恢复该寺，新选了寺址，即如今的寺址。雍正五年（1727年），正式开工建设，雍正九年（1731年）基本完工，仅大经堂便耗银7000两。干隆八年（1743年），该寺竣工，称为“达布寺”，清朝御赐匾额为“格丹勒措哇”（意为宗喀巴的信徒），朝廷还发给250名僧人的供奉，并赐藏文版大藏经《甘珠尔》及《丹珠尔》。自此，石门寺重兴，僧众曾发展至800人，一度该寺喇嘛获得各种格西学位者达80多名，其中仅拉然巴格西便达20余人。最知名的僧人是在拉卜楞