蛋白胺基酸（proteinogenic amino acids）是指在翻译期间被生物合成併入蛋白质的α-氨基酸，除了属于仲胺（环状氨基酸，旧称为亚胺酸）的脯胺酸以外都是伯胺。“蛋白”一词是指“蛋白质形成”。在已知的生命中，有22种遗传编码（蛋白质）胺基酸，20种在标准遗传密码中，另外2种可以通过特殊的翻译机制来引入。相反的，非蛋白胺基酸则是指在蛋白质内找不到（如carnitine、GABA和L-DOPA），或没有被标准遗传密码编码（如羟脯胺酸和硒甲硫氨酸）的其他胺基酸。后者通常源自于蛋白质的转译后修饰