于1891年通车，配置机车4辆，客车14辆，无货车，这也是纵贯线的开始。后续延伸至新竹的纵贯线路段于1893年通车，当时路线经过今日台北大桥及三重、新庄。唯1891年巡抚刘铭传去职，继任巡抚邵友濂以台湾财政困难，奏请清廷中止台湾铁路的兴建，故路线在台湾被日本接收前，仅完成基隆─新竹段。1895年进入日治时代后，台湾铁路由日军接管，先成立「陆军台湾区临时铁道队」作为过渡；而后台湾总督府成立，铁道建设政策暂定由民间主导。这时台湾铁路共配置有机车8辆，客车20辆，货车26辆。在台湾铁道株式会社、台北铁道会社等