，方舟子写了《错误百出的圣经》，列举了《圣经》中近百处自相矛盾的错误，此文随后引起基督徒专门成立网站予以驳斥。此后，方舟子从历史的角度否认耶稣的真实性，从教义的角度批判基督教的野蛮、邪恶。”方舟子认为《圣经》是一本“血淋淋、赤裸裸地诲淫诲盗的书”，耶和华是“杀人魔王”。同时，他认为基督教是西方社会的一个“毒瘤”，曾经给西方社会带来了无数的灾难。“现在这个毒瘤有向中国扩散之势，而且还是最毒的部分。”因此“基督教将会是中华文化的一大威胁”。关于耶稣，方舟子认为“没有任何可信的史料证明曾经存在拿撒勒的耶稣