时大总统后，李燮和辞任。4月，南京留守黄兴任命他为长江水师总司令，不久即辞任。以后，李燮和离开政界。1913年3月，宋教仁被刺后，他由湖南经沪、宁至北京，以调和南北自任。后寓居北京。1915年（民国4年），应杨度的邀请，李燮和参加了拥护袁世凯称帝的筹安会。另一方面，他秘密帮助蔡锷逃离北京，使其可以参加护国战争（第三革命），李燮和此时行动的本意并不清楚。在护国军的进攻及反袁舆论的压迫下，袁世凯取消帝制，翌年6月死去。由于帮助蔡锷以及革命时代的功绩，李燮和没有被问罪。但是李燮和自己却深感惭愧，完全隐居起