路在东西两淀汇聚，淤泥增多、河水漫出有隐患，请求设置垡船捞泥，以三角淀通判、清河同知管理相关事宜，后朱藻被罢官，顾琮再度担任河道总督。五年（1740年），顾琮疏通了青县兴济、沧州捷地两处减河，向朝廷奏报善后处理方法，提出疏通海口，在远出修筑堤坝，同时多设涵洞。六年（1741年），顾琮请求改定子牙河管河官制，不久因朝廷裁缺而回京。同年，授漕运总督。七年（1742年），顾琮奏言，“清江以上，运河两岸，向来只知束水济运，未知借水灌田，坐听万顷源泉，未收涓滴之利。同此田亩，淮南、淮北，腴瘠相悬。或疑运河泄水，于济运