作于1946年在原址的废墟上开始，1954年5月完工并正式启用，无论是设备、人员还是研究领域都比以前规模大大拓宽，还成立了射电天文、仪器制造等一些新的部门。原有的仪器设备得以修复，又在此基础上安装了65厘米口径折射望远镜、干涉仪、太阳望远镜、日冕仪、射电望远镜等新的设备。1945年西美斯观测站并入苏联科学院的西美斯天体物理台，现归属乌克兰。为纪念普尔科沃天文台，第762号小行星被命名为“普尔科沃”。