南道元山港负责输送业务的李应俊连忙脱离日军，进入汉城。美军政厅在汉城继续任用日占时期的朝鲜官员，李应俊也被任命为，与金钖源等人一起参与大韩民国国军的创建。1948年大韩民国政府成立时，担任首任陆军参谋总长。1949年出任第5师少将师长。朝鲜战争时，任水原地区防卫司令官。1952年任陆军大学校长，在任期内晋升为中将。1955年退役后，李应俊曾担任过邮电部长，1967年任韩国反共联盟理事长。1972年获授反共有功者保国勋章统一奖章，1979年任国政咨询委员，1980年任国防政策谘问委员长、国土统一院顾问