使用Helson的“结构图生成算法”（Structure Diagram Generation algorithms）。
典范SMILES.典范SMILES保证每个化学分子只有一个SMILES表达式。典范SMILES常用于分子数据库的索引。
异构SMILES.异构SMILES是指扩展的，可以表示同位素、手性和双键结构的SMILES版本。它的一个显着特征是可以精确地说明局部手性。
立体化学.双键两侧的结构分别用符号/和\表示，例