目的地.目前上海站所有列车均为始发列车，并以南京方向为主。在春运，节假日期间还会加开前往阜阳、徐州、河南方向的临时旅客列车。
动车组列车.上海站始发终到的动车组列车多以在沪宁高铁运行的高速动车组列车（G字头列车）为主，也有在京沪既有线运行的，往、、、的卧铺动车组列车。在经京沪高速线列车方面，上海站有开行往、方向的高速动车组列车。2018年4月10日起，两对原先在上海虹桥站到发的京沪高速动车组列车改由上海站始发终到。2020年7月1日起，上海站开始开行经由沪苏通铁路的城际动车组列