含一些以氢为主的化合物，例如氯化氢和氟化氢。其他还有一氧化碳、水蒸气和氧分子等等。氢原子在金星大气层中的数量相对较少，因此理论上大量的氢被认为消失在太空中，而剩余的氢绝大多数形成硫酸（HSO）和硫化氢（HS）。金星大气层中的氢大量流失可由大气层中极高的D/H 含量比值得知。该比值在金星大气层中大约是0.025，远高于地球大气层的1.6。此外，在金星高层大气层这个值更高达1.5。2020年9月14日，英国科学家团队在英国《自然·天文学》杂志发表文章，表示首次在金星大气中探测到了磷化氢气体。Sectio