马军团可能在征服赫尔维蒂人之后在此建立了居民点。1915年，夏特莱纳小学（école de Châtelaine）建设工地曾出土儒略·凯撒时期军团的铁质遗物。在漫长的中世纪，韦尔涅作为热克斯地区（pays de Gex）的一部分，曾先后被勃艮第人、法兰克人、萨拉森人和日耳曼人占据。后来，萨伏依公国控制了韦尔涅，平静地生活直到1506年被打破。觊觎日内瓦共和国的公爵夏尔三世禁止韦尔涅人为日内瓦工作，使许多当地居民陷入贫困。1536年，伯尔尼占据了热克斯地区，并开展宗教改革。伯尔尼人引领当地人焚烧城堡、