时台北城的清军已成了人人畏惧的乱民强盗。留守士人绅商乃先后派辜显荣与外籍人士代表等赴基隆见日本人并一路引领日军进台北城。日军于6月7日未发一弹即顺利进城。日军入城后即布告安民。6月下旬，台湾民主国余部在台南拥立大将军刘永福为第二任大总统，设总统府于大天后宫，由士绅重新成立台湾民主国议会，台南成为民主国首都。为筹措经费，刘永福曾发行纸币、邮票等。有些学者将刘永福在台南所建的政权称之为相对于「北台湾民主国」之「南台湾民主国」或「台南共和」（Tainan Republic）或「第二共和」（Second Rep