京大学法学部毕业，1967年入外务省。曾任外务省在日本驻华大使馆参赞、情报调査局企画课长、亚洲局中国课长、大臣官房会计课长、亚特兰大总领事、亚洲局局长。
驻华大使.2001年阿南惟茂出任驻中华人民共和国大使。2002年发生沈阳总领事馆事件，在事件中阿南的应对被视为失职，遭到批评，最后遭到日方处分。2006年卸任。
家庭.阿南惟茂的父亲为前陆军大臣阿南惟几，在日本二战战败时切腹自尽。儿子是知名政治学家阿南友亮。