进检校太傅、枢密使。吴充虽与王安石连姻，而心里不喜欢王安石的变法，数次向皇帝说政事新法不便于民。帝察其中立无与，欲更换宰相，熙宁九年（1071年），王安石罢相，吴充遂继任为同中书门下平章事、监修国史。吴充欲有所变革，乞召还司马光、吕公着、韩维、苏颂，并荐孙觉、李常、程颢等数十人。光亦以充可告语，与之书曰：「自新法之行，中外汹汹。民困于烦苛，迫于诛敛，愁怨流离，转死沟壑。日夜引领，冀朝廷觉悟，一变敝法，几年于兹矣。今日救天下之急，苟不罢青苗、免役、保甲、市易，息征伐之谋，而欲求成效，犹恶汤之沸，而益薪鼓橐也。