益王朝埃米尔软禁于雷伊，控制了巴格达的哈里发政权。在随后不久，哈里发穆克塔菲于公元1157年在驱逐塞尔柱人，并而获得实权。11—13世纪来自西方的十字军东征对伊斯兰世界造成的不稳余波未退之际，一个新的威胁在十三世纪从东方而来，是为蒙古人西征。1206年，中亚的成吉思汗建立了强大的蒙古帝国。据说一名会见阿拔斯王朝哈里发的蒙古使节被杀，使之可能成为旭烈兀在1258年洗劫巴格达的原因之一。中亚的蒙古人及突厥人征服了大半个欧亚大陆，包括东面的中国、花剌子模、西面的俄国及东欧，以及累范特地区。后来突厥人领袖如帖木