多数基督徒都是属于正教会的俄罗斯裔。除了东正教会外，也有罗马天主教徒的基督徒社群，信徒主要是波兰人。乌兹别克斯坦的天主教会在教廷梵谛冈的管辖下，属于普世天主教会的一部分。新教基督徒不到百分之一的人口。乌兹别克斯坦福音路德教会有七个教区。主教的教区在塔什干。2015年的一项研究估计，来自该国从穆斯林改宗基督徒约1万名，其中大部分属于福音派或其他新教教派。
犹太教.2007年，乌兹别克斯坦的犹太人人数上升到5000人，佔总人口的0.2％。 只有少数的布哈拉犹太人留在乌兹别克斯坦。