从阜阳败退到三河尖。颍上、正阳受威胁，寿州城也处于危急之中，与此同时，各军队每天都到司令部索要军饷和军械，王庆云被迫在农历十一月下旬离开寿州到南京，准备向南京、上海方面求得枪炮。不久，张汇滔率部回到寿州，各军乃推举张汇滔继任司令。淮上军方安定下来。中华民国成立后，民国元年（1912年）初，淮上军被统编为国民军第一军，王庆云任第一军第四师师长。但王庆云以不熟悉军事为借口，始终没有到任。同年，他任北京临时参议院议员。1936年，王庆云逝世。