SR扩展共使用了6个引物，共产生了236个片段。高山狸藻被确定与长叶狸藻之间存在着最为密切的种间关系。在形态学特征上，也符合这一结论。这两者都具有椭圆形或倒卵形的叶片，花丝弯曲，子房卵形，萼片为卵形至卵状三角形。但彼得·泰勒在其1989年的专着《狸藻属——分类学专着》将这两个物种分别置于兰花狸藻组和叶状狸藻组内。