以由等位基因的重组率计算出基因的相对位置。此外有性生殖中的孟德尔遗传规则，能够使有害的突变被清除，有益的突变被保留。且因为具有这种清除有害突变效果，因此当一个等位基因无法进行基因重组的时候（例如孤立的Y染色体），便因为有害突变逐渐累积，而使族群的有效种群大小缩减，这种现象称为）。若是染色体逐渐退化，则称为，这种现象比较容易出现在无性生殖的生物中。
差异的维持.如果一个族群中的每个个体都一模一样，演化就无法发生。如何维持差异是一个重要的课题。如果突变率够高，差异自然可以维持，但是