目前尚无科学证据证明芥花籽油对人体有害，欧洲也未有禁用芥花油之情事，食药署提醒大家对于没有根据的谣言，应抱持怀疑的态度，切莫随意听信。」针对相关疑问，加拿大驻台北办事处在其网站上有提出释疑。
荤食或素食争议.由于佛教与道教对荤菜的定义不同，菜籽油是否属于荤菜向来有所争议。在佛教文化里有所谓的「五辛」，《梵网经》记载其为大蒜、茖葱、慈葱、兰葱、兴渠，制作菜籽油所用的芸薹不在其列。在道教文化里有所谓的「五荤」，宋罗愿《尔雅翼》有记载其为韭、蒜、芸薹、胡荽、薤，芸薹名列其中。