新研究都认定两者应该归爲一个语系，沙加尔视之爲东亚超级语系的南支，谢尔盖·阿纳托利耶维奇·斯塔罗斯金视之爲南方大语系的一支，帅德乐（Stanley Starosta）称之爲扬子语系。
语言与分类.最初，语言学家在苗瑶语中只列出了苗语和瑶语（勉语）两种语言，之后逐渐识别出了更多语言，包括畲语、巴哼语、布努语、炯奈语、优诺语、巴那语等。在一些独立语言和方言的划分上，也存在一些争议，如海南苗族说的话，有学者认为是“勉语金门方言”，有学者则认为是“门语”；自称“唔奈”的瑶族说的话，有学者认