近平即场指示国家有关部门跟进事件。外交部新闻发言人华春莹翌日在例行记者会，透露中方已通过外交渠道向菲方表达立场，「敦促菲律宾政府高度重视受害者家属要求和关切，採取切实有效措施，尽早拿出妥善解决问题的办法」。国务院总理李克强10月9日在汶莱出席东亚领导人系列会议时，与阿基诺三世简短交谈，期间阐述中国在南海问题上的原则立场，并提及马尼拉人质事件拖延已久，牵动中国人民、特别是香港同胞感情，希望菲方高度重视并严肃处理事件，尽快合情合理解决。但菲律宾传媒报道有关会面时，则指两人仅谈及南海主权争议问题，只字不提人质