。1929年回中国，到苏州东吴大学生物系任教授。1933年，到开封河南大学生物系任教授。1935年到北京师范大学生物系任教授。1936年1月27日，参加马叙伦、白鹏飞、张申府、黄松龄等发起，在北平大学法商学院举行的北平文化界救国会成立大会。1937年到辅仁大学生物系任教授。1940年至1949年，先后在北京大学、中国大学任教授，在中国大学任生物系主任兼理学院院长。武兆发长期从事动物细胞学、生物制片学的研究工作，曾经创办前进生物标本馆。撰有《对“水螅活质的演变”一问题的重新研究》、《用新的染色方法揭示鸡卵黄球