忙的车站，过境乘客经常挤进车厢，令部份往罗湖站的车厢过于挤迫。上午繁忙时间南行方向由于没有直通车，加上班次较下午繁忙时间为多，所以车厢挤迫情况尚可接受。下午繁忙时间受到直通车影响（现时北行有2班）及班次较上午繁忙时间为少，而直通车多数不准时开出，令红磡站北行列车迟上加迟开出，部份班次相距达7分钟，再下一班车则可以只相距2分钟，形成「拖卡」。再加上部份乘客冲门，以致列车车门往往要关上3次甚至更多才成功，令随后列车延迟到达，尾随列车不能载上全部乘客，特别是九龙塘站。随着广深港高速铁路香港段投入服务，城际直通