回归后称财经事务局局长），攀上其公务员生涯的事业高峰，掌管香港财经事务长达五年，期间致力巩固香港作为国际金融中心的地位。在1998年亚洲金融风暴期间，金融管理局总裁任志刚联同当时的财政司司长曾荫权以及当时的财经事务局局长许仕仁取得共识，动用逾千亿港元的外汇储备大战炒家，入市购入多只港股，结果击退炒家，其后成立盈富基金将港股出售，成为许仕仁政界生涯最大功绩之一。
官场外之重要职位.2000年6月离开政府，到强制性公积金计划管理局（积金局）担任行政总监；同年12月成功推行强积金计划，为