核酸酶保护分析（，亦称为核糖核酸酶保护测定）是一项用于生物化学与遗传学的实验室技术，可用以从细胞中提取出来混杂的RNA样本中鉴定出单独的RNA。此技术可以在即使总浓度很低的情况下鉴定一种或多种已知序列的RNA分子。被提取出来的RNA首先与反义RNA或DNA探针相混合，探针是与被研究的序列相互补的，接下来互补链相互杂交以形成双链RNA（或DNA-RNA杂交分子）。此混合物接下来接触核糖核酸酶，这种酶特异性地切割仅为"单"链的RNA，但对双链RNA来说没有作用。当反应进行完全时，易受影响的RNA区域被降解为非常