7世纪，布旦康萨被五世达赖定为多杰雄登神的参康（btsan khang，即保护神殿）。”五世达赖的摄政第司桑结嘉错将该寺庙托付给格鲁派寺院日乌曲林寺，从而拓展了该寺庙的功能。除了作为神庙之外，布旦康萨还接纳来自日乌曲林寺的僧众，并且还有一位召唤多杰雄登的神巫（吹仲）。文化大革命之后，布旦康萨获得日乌曲林寺恢复重建。在达扎活佛担任西藏摄政时期（1941年－1950年），展开过一项对寺院收藏的藏文木刻印版的调查。结果发现布旦康萨收藏的木刻印版中，有许多是有关多杰雄登献祭仪轨（chos skyong