近五百万个湖泊以及为数更多的池塘，池塘中的生物可分为三大类:生活于水面的浮游生物（包括轮虫在内小型无嵴椎动物等。）、游动于整个水域的自由生物（如:常见的淡水鱼、大型无嵴椎动物。），以及在整个湖泊或池塘生态中数量最多的底栖生物（如:无嵴椎动物、水生昆虫及软体动物等。），而湖泊的沿岸的树林也时常会有动物生活
河川以及溪流.河川与溪流的溶氧量、混浊度及营养量，关系着其生物数量的多少以及种类，这些三样条件只要愈趋于稳定，生物的数量就愈多；而某些河川或溪流，在特定季节或时间会有河水水位变化等