班军机大臣但是常年卧病在床，加上满朝文武已经附属和珅，已没有能力阻止和珅两兄弟掌握军权。但是和琳在三月后围攻平陇战役中染病身亡，和珅失去了弟弟和可以信赖的将军，但是和珅此时已经手握50万左右的大军。与康熙时手握63万军队的鳌拜一样，和珅已经有能力影响爱新觉罗氏的统治。嘉庆2年（1797年），领班军机大臣阿桂去世，武官派大多为和珅收编为手下。虽然有零星的反抗，但他们在权力下都化为了泡影。镇压川楚教乱所用之将领更多为和珅手下，《清史稿》记载：「川、楚匪乱，因激变而起，将帅多倚和珅，糜饷奢侈，久无功。」S