异蕊草科共有15属约180种，主要分布在东南亚、澳洲、美洲和太平洋岛屿等区域。1981年的克朗奎斯特分类法将其分入百合科；1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法将这些植物单独分出一个科，放在天门冬目中；2003年经过修订的APG II 分类法认为可以选择性地和天门冬科合并。