事件看似解决之际，本应要迳行提审重村教授的菊冈却将教授带往称为「RATH」的工作室，准备执行使另一项计画（Alicization计划）……
故事背景.2022年，以量子物理学者兼天才游戏设计师闻名于世的程式设计师茅场晶彦成功开发世界第一款完全潜行专用的装置「NERvGear」。「NERvGear」装置机器具有虚拟实境（VR）功能，外型类似包覆头部的拳击用护具，创新的设计替世界带来无限可能，无论是医疗、通讯、交易等。因「SAO事件」而产生以「强化安全性」的后续机种