史料很少，甚至日本近世历史学家曾就他是否曾经即位的问题发生过争议。以至于到了1911年（明治44年）3月明治天皇下诏定南朝一系天皇为正统时没有认定他天皇的名分。直到大正时代，八代国治和武田祐吉根据实证学研究认定他曾经当过天皇，因此大正天皇才在1926年（大正15年）下诏，正式确认其日本第98代天皇的身份。
略历.长庆天皇的早期生平事蹟不明，可能曾被父亲后村上天皇立为东宫，但没有相关的史料证明这一点。1368年（正平23年 / 应安元年）阴历3月，26岁的长庆天皇在摄津国的住吉行宫（