阿玛尔与鲁布桑沙拉布被关押在一处，而正是鲁布桑沙拉布逮捕了阿玛尔。阿玛尔遭到审判后不久，鲁布桑沙拉布便被逮捕，史达林在大清洗的尾声时，要求蒙古再度拉紧弓弦，要清除每一个反革命分子。
莫斯科审判.1941年7月10日，阿玛尔被一个苏联“特罗伊卡”审判并被判处死刑。在审判过程中，阿玛尔强调，如果蒙古人民共和国是一个真正的独立国家，那么他的政府总理应当被蒙古法庭审判。他的最后陈述是“当一个强权殖民一个小国时，典型便是逮捕和迫害其领导人。我个人的经验表明了苏联对蒙古就是这样的态度。”阿