三师调往新编第三军，新编第三军第一八二师则改隶该军。此时，该军下辖第一八二师和第一八四师两个师，参加了第二次长沙会战。民囯32年（1943年）秋，日军由印支半岛进攻滇缅边境，第六十军由中南战场回防云南。民囯34年（1945年）8月15日，日本无条件投降，卢汉率第六十军同第九十三军开进越南北部南定接受日军投降。11月，蒋中正又重新整编滇军，将8个步兵师缩编为2个军，即第九十三军、第六十军。同月，曾泽生被任命为第六十军军长。
第二次国共内战时期.民国35年（1946年）4月，第六十军奉