余子俊亦称王越赏不酬功，于是王越进兵部尚书，仍掌都察院事，加太子太保，封威宁伯。明年，寇犯延绥，王越调兵援助，颇有斩获，后因调兵与汪直结怨。次年，下诏夺爵除名，谪居安陆，三子以功荫得官者，皆削籍。弘治七年，尚书讼冤，诏复左都御史，致仕。给事中季源、御史王一言交章论。弘治十年，达延汗寇犯甘肃，廷议复设总制官，先后会举七人。吏部尚书屠滽举荐王越，于是王越恢复原职，加封太子太保，总制甘、凉边务兼巡抚。王越言甘镇兵弱，非用延、宁两镇兵难以克敌，后请兼制两镇。次年分兵进攻获胜。后加少保，兼太子太傅。之后朝廷制置哈密事