励台湾人改日本姓名；禁止歌仔戏、布袋戏；废止台湾阴历年习俗，但台湾人照过，日本人乃订阴历初一起五日内为劳动服务週，积极去台湾文化；强制参拜神社；实施管制米谷输出；关闭中央研究所；设热带医学研究所；建农业试验场；新高港筑港开工；建基隆港船坞；设立国家公园（大屯、次高太鲁阁、新高阿里山）。1940年11月辞台湾总督职，后任大政翼赞会中央协力会议议长、翼赞政治会总裁、国务大臣等，1944年被敕选为贵族院议员。战后被指为战犯，入巢鸭监狱，旋获释。坊间有《小林跻造传》及《海军大将小林跻造觉书》等。