本海默亲自向曼哈顿计划的安全部门举报佐治·埃尔滕顿（George Eltenton），指他受苏联指使从洛斯阿拉莫斯实验室里的三人索取核机密。他自己并不认识埃尔滕顿。欧本海默之后承认，是他的好友舍瓦利耶在他家作客时把这件事告诉他的。曼哈顿计划主任莱斯利·理查德·格罗夫斯认为欧本海默对计划太重要了，不值得因这一可疑行为把他剔除。他在1943年7月20日对曼哈顿工程特区写道：
曼哈顿计划.
洛斯阿拉莫斯.1941年10月9日，美国参与二战不久，美国总统富兰克林·德拉