矶郡立自然历史博物馆与中国地质博物馆组成的挖掘团队发现了第二个部分颅骨。杨钟健当时将贫齿鳄归类于原鳄亚目的贫齿鳄科（Edentosuchidae）。在2004年，迪亚戈·玻尔（Diego Pol）等科学家根据新发现的第二个颅骨，将贫齿鳄归类于原鳄亚目的原鳄科。贫齿鳄是种异齿型动物。贫齿鳄的前上颌骨牙齿呈圆椎状。上颌骨的前两颗牙齿有三个齿尖；接下来两颗具有更多的小型齿尖；而其余的上颌骨牙齿体积较大、呈球根状、有小型齿尖。贫齿鳄的下颌每边有九颗牙齿，第二颗牙齿相当长。贫齿鳄的颅骨只有数公分长，口鼻部短、颅骨