为源所实施之三段警备制，于台湾实施之初，曾有效消灭抗日活动，并将反日人员阻绝于台湾山区，惟三等区划分不易，陆军、宪兵、警员治理区域无法明确区分，因此自1898年2月乃木希典辞去台湾总督后，新任总督儿玉源太郎与民政长官后藤新平，随即将三段警备制取消，改用保甲制度。