担任总统直到1939年9月，当时他被囚禁在罗马尼亚，法国迫使他辞职。他在他的第一个选择被法国政府拒绝后，将总统一职移交给瓦迪斯瓦夫·拉奇凯维奇。 1939年12月，莫希奇茨基被释放，并被允许迁居瑞士，他在那里渡过二战岁月。1946年10月2日，他在日内瓦附近的家中去世。