在西部青藏高原开展有蹄类保护，在东北地区开展跨国界东北虎保护，在长江中下游地区参与扬子鳄和斑鳖的保护，在华南地区开展减少野生生物消费和贸易以及野生动物保护宣传教育项目。WCS首席科学家乔治·夏勒博士于20世纪80年代开始长期在四川和羌塘开展大熊猫与高原有蹄类的保护工作，也曾在中国进行过雪豹调查。WCS在中国保护的主要物种包括：