法律和行政方面的争议，纪念馆于2016年7月11日正式闭馆，物色新馆址工作亦展开。
重置纪念馆.2018年12月9日举行的支联会第三十届周年大会上，一致通过购入新馆址。由于香港基督徒学会打算物色新会址，遂考虑将该会原拥有位于旺角道11至13号艺旺商业大厦10楼的自置物业出售予支联会。支联会会将物业重新装修为办公室及纪念馆作展览用途。新馆原定2019年4月26日重开，惟在4月7日工作人员发现新馆被人潜入毁坏，铁闸被打开，多个电掣和电箱被人用盐水弄湿，亦引致冷气机电路板烧毁，其他