古事记》和《日本书纪》的典故。故事背景也参考了神道教视角对原始宇宙的描述，而神道神话中神祇伊邪那岐与伊邪那美的长矛被用作EVA同使徒作战时使用的武器。犹太基督教传统的元素也充斥于整部动画中，其中包括亚当、莉莉斯、夏娃、朗基努斯之枪、死海古卷以及卡巴拉的生命之树等。在故事的最后，通过“人类补完计划”以达到使“所有人类的灵魂合并成一个”这一做法也类似于卡巴拉的“”概念。EVA的形象也被比作中魔像的身影，它们的形象设计使人能联想到鬼（日本妖魔或食人魔）的传统形象。佛教术语和一些源自祆教的引用也被嵌入在整个故事中。