（1601年），福建的文武官员便针对澎湖游兵兵力过度裁减的问题起过争执，赞同裁减者多主张彭湖（澎湖）路遥，地方寸草不生，粮食补给和救援不易，财务开销庞大更是沉重的负担、反对裁军者则认为彭湖（澎湖）若被海盗佔据，则对沿岸海防的防务更形不利。包括时任福建的总兵官朱文达在内，当时大多数的官员都赞同裁减澎湖游兵的兵力；巡海道员王在晋虽持反对裁兵的意见，但也发表过「彭胡（游兵）必不可不增也，不增则不如撤耳」的言论。
编制.澎湖游兵组成主要人员略述如下：
勤务.澎湖游