3年，康巴塞雷斯一直担任常规国防委员会的成员，但他始终不是由国防委员会演变成为后继着名的公共安全委员会的成员，历经恐怖统治及热月政变，到1794年年底。在革命期间，他多半致力于立法的工作。在1795年，他做为外交官，并致力于谈判实现与西班牙，托斯卡尼，普鲁士和巴达维亚共和国的和平。1795年政变取得权力后，康巴塞雷斯被认为是督政府五名督导(Director)中过于保守的一个，他被排挤退出政坛。然而，1799年，革命进入一个较为温和的阶段，他成为司法部长。他支持1799年11月的雾月政变，设计建立稳定的宪