永元八年（96年），册立为皇后。父阴纲被封为吴房侯，官位特进。阴纲三个儿子阴轶、阴辅、阴敞，皆为黄门侍郎。自邓绥入宫后，汉和帝对阴皇后的爱宠稍为衰退，阴皇后时常有恚恨。阴皇后外祖母邓朱时常出入宫廷，在永元十四年夏（102年），有谣言指阴皇后与邓朱共挟巫蛊之道。事情被揭发后，汉和帝遂使中常侍张慎与尚书陈褒于掖庭狱杂考究此案。邓朱及二子奉、毅与阴皇后弟阴轶、阴辅、阴敞辞语相连及，以为祠祭祝诅，大逆无道。奉、毅、辅在考察此案时死于狱中。汉和帝遣司徒鲁恭持节赐阴皇后书策，缴上玺绶，迁于桐宫，阴皇后遂因此忧伤