太子被废，窦婴由是称病数月不出，后来经人劝说才重新上朝。窦婴虽为窦家最为贤能之人，却长期不受窦太后喜爱。孝景三年，梁王刘武入朝，景帝设宴款待，饮酒时表示要把皇位传予梁王。梁王是窦太后宠爱的小儿子，故而太后听到之后也非常高兴。这时窦婴挺身而出，陈说汉室天下父死子继的祖制，打消了景帝的念头。窦太后由此非常讨厌窦婴，并革除了窦婴的门籍。后来窦太后的态度有所缓和，但因为窦婴喜好儒家学说，而太后则钟情于黄老之学，故而关系始终不够融洽。
武帝时期.武帝初即位，大力推崇儒家思想，任窦婴为丞相