中的细胞器。在生物化学领域，利用加入对细胞中特殊物质（如对DNA，蛋白质，脂类，糖类等）具有选择性的生物染色剂，以定性或定量分析特定化合物的含量。在这一点上染色和萤光标示具有类似的用途。生物染色还被用于标记流式细胞计中的细胞，以及凝胶电泳中的蛋白质或核酸。除生物组织之外，染色还被用于研究一些其它材料的形态，如半晶态聚合物的薄层结构及共聚合物的区域结构。
活体内染色和活体外染色.活体内染色是指对于活的生物组织进行染色。通过将特定细胞或结构染成某种颜色， 其位于组织或细胞内的形