二世将选侯转赐其表亲巴伐利亚公爵马克西米利安一世，但未允许其子孙继承选侯；在1648年战后的《威斯特伐利亚和约》中，莱茵-普法尔茨伯爵被重新授予为选侯，巴伐利亚公爵依然保留选侯席位，但普法尔茨选侯的地位和权利低于其余七位，在八位选侯中居于末位。至此维特尔斯巴赫家族的长幼两系都跻身选侯行列，双方不再构成潜在威胁。在哈布斯堡家族掌权时，选帝侯常能左右未来继承人的去留，甚至干涉王权。如宗教改革时，马丁·路德遭到教廷迫害出逃，所有的诸侯国皆因震慑于教宗的命令，不敢收留马丁路德。最后是哈布斯堡家族的几名选帝侯公然