业后入京都帝国大学医学部就读，后在1943年毕业。毕业后，他被派任徐州博爱医院担任妇产科医师。抗日战争结束后，许子秋从徐州前往北平，进入由美国政府在北京协和医学院开办的「公共卫生研究院」接受为期六个月的训练课程。1946年，许子秋返乡任职台湾省行政长官公署民政处卫生局课员，并在不久后升任视察。1950年，他出任台湾省政府卫生处技术室主任。1951年，许子秋获美援资助，录取公共卫生部门。于1952年与江万瑄、工程部门录取的高玉树、水产部门的杨基铨、农业经济部门的李登辉等三十六名台湾籍青年前往美国进