年，胡佛研究所中文馆和日文馆合并为东亚馆，吴文津出任第一任馆长。胡佛研究所经芮玛丽和吴文津多年的努力，建立了中国共产党自1921年建党到抗战时期相当完整的原始资料文库， 独缺江西瑞金“中华苏维埃共和国”（1931-1934）那一段，吴文津经过多方努力，在胡适的帮助下，从陈诚处获得了这些资料，他为胡佛研究所收集的这些中国共产党早期资料均为在西方前所未见的。在斯坦福大学任职期间，吴文津还同时修读历史系、政治系和亚洲语文系联合项目的博士学位，1964年吴文津已修完所有博士课程，并通过了口试，开始撰写论文，同年