.兴南客运玉井站是台南市政府规划的公车转运站，位于台南市玉井区中正路54号（邻近糖厂、市集等），经台南市政府补助兴南客运进行改善工程，于2014年2月22日重新启用，其维修厂位于三和里（南185乡道上）。
兴南客运佳里站.兴南客运佳里站是台南市政府规划的公车转运站，位于台南市佳里区文化路198号，经台南市政府补助兴南客运进行改善工程，于2014年11月13日重新启用。
新营客运新营总站.新营客运新营总站是台南市政府规划的公车转运站，与新营车站隔着站前圆环相对