改编为「陆军航空特战司令部」（航特部）。2006年2月16日因应《国防部组织法》，再改称为「陆军航空特战指挥部」。
编阶.航特部设一席中将和七席少将共八位将官编制，是军团级单位，和陆军司令部三大军团——第六军团、第八军团、第十军团为同一位阶。
装备.陆军航空特战指挥部于1992年购买42架AH-1W超级眼镜蛇攻击直升机，1997年再度购买21架AH-1W，共拥有63架AH-1W，但在1999年7月17日、2008年7月16日失事折损2架AH-1W