39年，杨如轩调任云南省军参处主任，但未就任，而是赴安宁温泉置办田宅、种果树及蔬菜。1941年，杨如轩决定在平川县创建初级中学，邀西南联大化学系的李伯昂任校长，并自西南联大等高校聘请18位教师，设平川中学（今宾川二中的前身）。抗日战争结束后，杨如轩曾任国民大会代表。中华人民共和国成立后，杨如轩被关押判刑。1964年，朱德到云南，杨如轩致信朱德，此后杨如轩被释放出狱，监外执行。文化大革命期间，杨如轩自愿回到监狱，以求得保护，直到1973年才再次释放出狱。此后，杨如轩出任云南省文史研究馆馆员、云南省第四届政