段巴士路线调整于2008年12月7日实施，主要是调整行走内港区的巴士路线。此外，同时进行整理但不在本计划以内的路线：
第二阶段.第二阶段巴士路线调整于2009年4月26日实施，主要是新增1条尖峰时间路线，增设位于东北区的东方明珠总站，并新增3条由该站开出的新巴士路线、调整5条现有巴士路线，以及取消两条短线。原计划还会新增M1及M2路线，后取消计划。
第三阶段.第三阶段巴士路线调整于2009年10月18日实施，主要是新增2条巴士路线—36和50路线，以及