集体宣誓加入中国共产党（无候补期），马尔果夫·伊斯哈科夫成为中华人民共和国时期中国共产党在新疆发展的首批少数民族党员之一。1954年10月至1960年8月，出任伊犁军区司令员。1960年8月至1961年1月，任新疆军区副参谋长。1955年获授中国人民解放军少将军衔，并且获得一级解放勋章1961年，经中央军委同意后，与祖农·太也夫少将离开中国去苏联。1992年，马尔果夫·伊斯哈科夫在阿拉木图逝世。