智力、道德等精神因素——都可在其他动物中找到雏形，也必定有其自然的起源。演化论推翻了人类自以为与众不同的地位。人类和猿猴分享同一个祖先，这在当时的时空背景是很多人难以接受的。对于信奉基督教的人士而言，这一点更与圣经的创世故事有冲突。演化论与字面解读的《圣经．创世记》相冲突。演化论也导致一些以宗教观点解读演化论的理论出现。例如天主教，将其信仰与演化论调和为神导演化论。而除了传统的创造论之外，也有一种称为智慧设计的理论出现，是认为生物的出现必定受到某种智慧体的安排。19世记的社会学和人类学者由演化论进一步