更始政权的命令，在洛阳独自行动。统一河北的刘秀派部将冯异对李轶进行笼络。刘秀故意把李轶给冯异的信件公开，朱鲔得知大怒杀害李轶，李轶的部下于是投降刘秀。更始三年（25年）春，朱鲔派讨难将军苏茂攻打温县、自己攻打平阴，刘秀部将冯异、寇恂将他击败，朱鲔部将贾彊阵亡。朱鲔退回洛阳。同年三月，朱鲔和丞相李松在弘农郡被赤眉军打败。
洛阳围城.建武元年（25年）七月、光武帝刘秀部将吴汉等十一位将军率军包围朱鲔占据的洛阳，迟迟不下。光武帝派朱鲔原来的校尉岑彭，劝降朱鲔。朱鲔回答「大司徒刘縯被杀