此后晋升为右都御史，检举揭发代府宗室朱充灼谋反，晋升爲左都御史。翁万达因为在边疆做事很久，深得世宗倚重，其进言均得到听从，唯独俺答汗称臣之事与世宗想法不一致。嘉靖二十一年，俺答汗阿不孩派遣使者石天爵等求贡，但明朝廷并不採纳。石天爵等人再次抵达，巡抚龙大有等逮捕。石天爵后被磔杀。蒙古大怒，于是大举进犯、屠杀村堡，绝信使五年。恰逢玉林卫百户杨威被掠夺，杨威诡称可以能够互市而得以释放。俺答汗于是再派使者同款大同左卫，边帅家丁董宝等逮捕使者并斩杀，以报首功。翁万达再次上疏请和议，而没有得到使者赞同。不久，俺答阿