发射接近引信飞弹，飞弹接近目标爆炸，以摧毁或使目标失效。由于飞弹瞄准了目标的质量中心，在对付飞机的时候毫无问题，但在对付高速飞行的飞毛腿飞弹时，爱国者通常只能击中其尾部，而不是其弹头。此外，伊拉克对飞毛腿飞弹的重新设计也影响了爱国者的准确度。伊拉克把苏联设计的飞毛腿飞弹重新设计使之飞得更快，结果这些改动弱化飞弹弹体，令飞弹更有可能在重返大气层时碎裂。这令爱国者面对大量新增目标，却无法知道碎片和弹头是哪一个。根据Zimmerman的分析，要实际计算「击杀率」变得很困难。一次成功击杀是等于命中弹头还是命