东正教在菲律宾已经有200多年的历史了。菲律宾正教会属于正教会普世宗主教圣统香港及东南亚都主教教区，1999年，菲律宾大约有560名东正教基督徒。
伊斯兰教.伊斯兰教于公元14世纪传入菲律宾，主要由西亚（波斯湾国家）、南印度及马来群岛的穆斯林贸易商人传入。伊斯兰教曾经是菲律宾的主要宗教，在西班牙殖民期间，由于西班牙传教士引入了罗马天主教，伊斯兰教迅速沦为菲律宾的次要一神论信仰。绝大多数的菲律宾穆斯林属于逊尼派中的沙斐仪派，也有小部分的什叶派和阿赫迈底亚穆斯林。根据菲律宾全国宗教调查