束正家返回水口城时，便立即派池田辉政、稻叶贞通进攻水口城。9月30日，长束正家开城。10月3日正家自尽。另外，细川幽斋在小野木重胜解除对田边城包围时，反攻小野木的福知山城，但是后者仍然抵抗到底，直到11月18日小野木自尽。至于五奉行中另外两名弹劾家康的前田玄以和增田长盛为家康内应，前者保留原有领地，后者则被没收领地。立花宗茂要求毛利辉元在大坂反击，但辉元最终离大坂城而去。德川家康在辉元离开后进入大坂城。其中三名有重要影响力的人物被捕：石田三成在伊吹山被田中吉政队所捕、小西行长在较早前向农民自首后被竹中重