局和工商及产业局；发展局和运输及房屋局，则改组为房屋及规划地政局及运输及工务局。但在立法会会议中，否决提早审议架构重组，使新班子未能在同年7月1日以新架构就职。事隔一年半后，梁振英于2014年度施政报告内重提架构重组方案，从商务及经济发展局分拆出创新及科技局。创新及科技局于2015年11月20日正式运作。外界改称为「三司十三局」。
1997年主权移交后决策局变迁.註：除主要政策范筹外，尚有其他细微工作调整，请参阅有关决策局条目。