在2004年，Michael Maisch、Andreas Matzke将这些化石进行叙述、命名，模式种是尖喙枪颌翼龙（"L. acutirostris"）。属名在古希腊文意为「长枪颌部的蜥蜴」，意指其嘴部形状；种名在拉丁文意为「针状的口鼻部」。正模标本（编号SGP 2001/19）发现于乌鲁木齐市市郊，是一个头颅骨前段与下颌，是一个大型个体，头颅骨的完整长度估计约40公分长。前上颌骨修长，有针状牙齿；每个上颌骨有8颗牙齿。大部分翼龙类的上颌的下缘有大幅弯曲，而枪颌翼龙的上颌的下缘笔直。上颌的牙齿排列