旨意消灭了剩余的准噶尔人，除病死或逃往国外的以外，数十万准噶尔人遭到屠杀。据魏源记载：「计数十万户中，先痘死者十之四，继窜入俄罗斯哈萨克者十之二，卒歼于大兵者十之三。除妇孺充赏外，至今惟来降受屯之厄鲁特若干户，编设佐领昂吉，此外数千里间，无瓦剌一氊帐。」昭槤的描写更加夸张：「凡病死者十之三；逃入俄罗斯、哈萨克者十之三，为我兵杀者十之五，数千里内遂无一人」。留下的空地由大量移民填充。