年幼的清世祖以及朝廷由东北的盛京迁都至北京，封吴三桂为「平西王」。
从西北到西南.顺治二年（1645年）八月，在李自成主力基本被消灭之后，清政府将其从前线调回，出镇锦州。顺治四年（1647年），清政府又调吴三桂入关，与八旗将领李国翰同镇汉中，受到李国翰的监视。其间剿灭李自成、张献忠及明朝余部。顺治六年（1649年）挥军北上，平定随山西姜镶叛乱的，在陕西之叛军。顺治八年（1651年），吴三桂和李国翰一起率军入川，攻打大西军余部，于川北保宁府击败大西军统帅刘文秀部，平定成都、重