罗文干的不称职无耻，辞职又去漫游欧洲。1924年11月至1926年2月，蔡元培到德国求学，专攻民族学。1926年2月回国，参加中国国民党主持的国民革命军北伐。1927年3月28日，蔡元培在上海主持召开中国国民党中央监察委员会会议，与吴稚晖、张静江、李石曾提出发动“护党救国”运动。4月1日，汪精卫穿越西伯利亚再转苏联邮轮，从欧洲赶回上海。蒋介石、吴稚晖、蔡元培等向汪投诉中国共产党问题。4月2日，中央监察委员会会议召开紧急全体会议，讨论清除中国共产党的行动。蔡元培亦有参会。4月2日，蔡元培和吴稚晖、