00万年前，海南孔雀雉在与大陆上的类群发生地理隔离后，渐形成新种。
保育状况.海南孔雀雉在野外的数量已非常稀少，严重濒临绝种，过去本种曾广泛分佈于海南岛的热带森林中，如今尚存的野外的个体多被分割成破碎的18个族群，包括霸王岭国家级自然保护区、猴猕岭省级自然保护区、佳西省级自然保护区、尖峰岭国家级自然保护区、鹦哥岭国家自然保护区与黎母山省级自然保护区等12个国家级与省级自然保护区。1990年的统计显示海南孔雀雉的数目为2700只，2000年统计结果仅存300只，此数量一般认为有所低估