个载玻片上能够放下大量的非常小的（100微米直径）的斑点。每个斑点具有一个DNA片段分子互补的单个DNA序列（类似于南方墨点法）。该技术的变化允许生物在发育的特定阶段的基因表现是合格的（表达谱）。在该技术中，组织中的RNA被分离并转化为标记的互补脱氧核醣核酸(cDNA)。 然后将该cDNA与阵列上的片段杂交，并且可以进行杂交的可视化。由于可以用完全相同的片段位置制备多个阵列，因此它们特别可用于比较两种不同组织（例如健康和癌性组织）的基因表达。此外，人们可以测量什么基因被表达和如何表达随时间或与其他因素的变化