水平上可分为沿海栖息地和远海栖息地两种。 沿海栖息地从海岸线一直延伸到大陆架。虽然大陆架地区只占整个海洋的7%左右，大多数海洋生物还是被发现于沿海栖息地。远海栖息地位于大陆架边缘向外的深海区域。另外，海洋栖息地从竖直面上也可被分为浮游生物界（远海），底层区（海床上沿），和 海底生物界（海底）这几类。第三种分类方式是通过纬度：从热带到温带一直到两极的海面。珊瑚礁，被称作“海中的热带雨林”，仅仅只占地球海洋表面的0.1%，但它的生态系统却拥有25%的海洋物种。 其中最为出名的是热带珊瑚礁，比如澳大利亚的大