樊钟秀进攻山西，一时山西危急，商震出兵迎撃并取胜，樊钟秀败退回河南。1926年（民国15年）南口大战中，他协同北京政府军包围并攻击国民军。同年8月，国民军撤离南口，商震任绥远都统。
脱离晋系.1927年（民国十六年），阎钖山响应北伐，晋军改编为国民革命军第三集团军。商震任阎锡山的第3集团军代理总司令，展开对奉系的攻撃。同年7月，任第1军团军团长，9月兼任第三集团军左路总指挥。1928年（民国十七年）4月，商震先后攻取保定、北京、天津等地。6月，被任命为河北省政府主席。10月，任国民