国共内战时期.抗日战争胜利后，1946年，出任国民政府参军处警卫室副主任。1947年4月，陆军大学将官第二期乙级班毕业后，派任国民政府总统侍从室副侍卫长，少将军衔。1948年9月，正式授予中华民国陆军少将军衔。1949年春，出任第八军副军长，参与国共内战。
缅甸时期.1949年底，柳元麟所带领军队败退缅甸北部。1954年至1955年，缅甸军方对果敢特区国军93师发动进攻。柳元麟率云南人民反共志愿军（原名“东南亚人民反共志愿军”）抵抗，军队人数初期3000余人，为从中国大陆