于南京大学英语系，进入外交部工作。1985年，沙祖康任外交部国际司三秘，参加日内瓦裁军谈判会议。1993年7月，时任外交部国际司副司长的沙祖康临危受命，以中国政府代表、中方检查组负责人的身份处理“银河号事件”。1995年至1997年任中国常驻联合国日内瓦办事处和瑞士其他国际组织代表团副代表、裁军事务大使。1997年至2001年任中华人民共和国外交部军控司司长。2001年至2006年任中国常驻联合国日内瓦办事处和瑞士其他国际组织代表团大使、代表。2007年2月至2012年5月，沙祖康任主管联合国经济和