列车将暂时不停靠金华站。2019年4月1日起，中国铁路总公司把「九龙站」更名为「香港红磡站」，城际直通车车票上的列印名称由「红磡（九龙）」改为「香港红磡」。2019年9月17日，受港铁东铁线红磡站列车出轨事故影响，导致Z99/100次临时要改为广州东站终到/始发。受香港反对逃犯条例修订草案示威影响，2019年10月6日、11月11日、11月13日香港红磡终到始发的Z99/100次列车临时更改为广州东站终到/始发。2020年1月28日，香港政府鑑于2019冠状病毒病疫情在中国大陆扩散，宣佈关闭