上充满了火山熔岩凝固的玄武岩，有柱状节理、板状节理与放射状节理。绵延数千公尺的熔岩台地、大湾玄武岩海蚀地形、望夫石玄武岩质岩脉、龙埕海蚀平台的折皱构造、分叉子海蚀柱、海蚀沟、下巷海崖、砾滩、壶穴、澎湖石沪…等多种海蚀地形。号称为七美的「自然宝藏」。银合欢为日治时期引进的植物，由于生命力强且适合本地环境，已成为七美屿分佈最广的植被。马樱丹是经由候鸟粪便带进七美屿，经快速蔓延后，目前为七美屿第二多之野生植物。七美屿长年流水侵蚀作用，在西湖村北侧与平和村西侧形成了河谷地形。然由于土壤、雨量及东北季风的影响