方早有预谋将双溪口河旁的五四名琉球民墓改建葬在车城统埔。而墓碑上刻有「大日本琉球藩民五十四名墓」之大字则表示琉球属于日本。西乡从道又将其中44名被排湾族人「出草」、预定交付中国官员的死者头颅带回，阻止原本循福州琉球馆处置相关事务的旧例，交由鹿儿岛县负责琉球藩官员交给琉球王府，用意在于向琉球王府证明已达成惩罚及报复之任务和宣告琉球地位形同日本之藩国。而《北京专约》中抚恤银之支付对象被称为「日本国属民」，而日本政府又将出兵报复宫古岛遇害事件称为「保民义举」，让「琉球人」等同「日本国属民」，将条文诠释为中国已承诺