（当时英国政府不负责法院的费用，因此法官普遍收礼来支付法院的开支），当时国会正在攻击国王在专利权发放的问题上图利私人，培根因身为大法官而出审此案，但由于他与国王的同一阵线，也遭到国会的指控与攻击，培根为了保护国王，只好全部认罪，培根被裁罚四万英镑的鉅款，罢免一切官位，从此一生不得担任公职，并禁锢于伦敦塔，等候发落。罚款后来由国王支付。得到了国王的赦免后，他唯有闭门着书，生活颇为凄凉，却在学术上卓有成就，于一个寒冷的风雪中做用「白雪保存食物」（当时购买了一只鸡）实验，而感染风寒，肺炎一病不起，终于丧命，卒