，将朝廷的官员数予以削减，对国司及的监督也越发严格，试图以此规范地方政治。然而在780年（宝龟11年），陆奥国爆发了以为首的叛乱，东北地区虾夷的抵抗也逐渐加强。
从长冈京迁往平安京.为了摆脱逐渐膨胀的寺社势力的控制，桓武天皇于784年（延历3年）在山背国长冈之地另建新都（即长冈京）。不过此次迁都并非一帆风顺——负责迁都的藤原种继遭到保守势力暗杀横死，而桓武天皇之弟早良亲王也被怀疑“阻碍迁都”而因此连坐被废。早良亲王于流放途中郁郁而终，然而此后饥荒和瘟疫屡次发生，桓武天皇近亲相继离奇