在地为代代木一丁目）是属于旧千駄谷村区域，开业当时旧代代木村町域尚未有路线、车站，因而定名「代代木站」。
历史.
地名变迁.「代代木村」曾记载于战国时代的书状，江户时代为大名、旗本的屋敷地。1878年（明治11年），郡区町村编制法施行，代代木村属南丰岛郡。1889年（明治22年）市制町村制施行。代代木村与幡谷村合併为代代幡村。1896年（明治29年），南丰岛郡与东多摩郡合併成立丰多摩郡。1915年（大正4年），代代幡村施行町制。1932年（昭和7年