962年7月21日，列星顿号前往美国东岸。由于改建后舰体无法通过巴拿马运河，列星顿号绕道合恩角，于9月11日抵达纽约海军造船厂。
训练航舰.1962年10月1日，正在改建的列星顿号被重编为反潜航母，舷号改为CVS-16。同月古巴导弹危机爆发，其时列星顿号已可出海巡航，但海军并未派列星顿号前往封锁古巴。危机降温后，列星顿号前往墨西哥湾，在12月29日抵达彭萨科拉。此后列星顿号开始往返彭萨科拉、梅港、圣体市及新奥尔良等地，搭载T-2C、TA-4J、A-6及A-7等训练机，在海上考核