后进入萧山区境内，随后进入柯桥区钱清镇，与钱清江故道相交。此后运河向东南进入越城区境内，与曹娥江相交。自西兴至曹娥江的运河又名“萧绍运河”。过曹娥江后，运河进入上虞区境内，分为两支。北侧运河又名“虞余运河”，从曹娥江东岸上虞百官的上堰头至余姚市曹墅桥连接姚江。南侧运河又名“四十里河”，自曹娥江至通明坝汇入姚江，另有后新河、十八里河并行。此后主河道进入自然河道，在丈亭镇分出支流称“慈江”，在宁波市海曙区高桥镇大西坝分出支流称“西塘河”。此后干流经姚江与奉化江在宁波三江口汇合成甬江，最后在镇海招宝山东面汇入东海