时钟的观念。但是近年的研究发现，分子时钟也并非等速进行，而是在不同物种或是不同年代具有不同的演化速度。且不同的研究中，对分子演化速率的推算差异相当大。另外曾有一种源自托马斯·亨特·摩尔根果蝇研究的突变论，认为物种只需要一个世代就能经由突变形成。在现代演化综论后，演化生物学已经放弃此理论，只有少数特例符合此情况，例如蜗牛的左右旋、蝉的羽化时间、以及植物的多倍体可以在一两个世代内因突变而造成生殖隔离，成为新物种。另一个造成快速演化的是灾变，例如火山爆发、陨石撞击造成的大灭绝。
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