确有诸多疑点，其是否知情、採取何种立场等随成为该事件中主要的谜团之一。除花冈两人之外，当时各驻在所尚配属有总数数十名的原住民与汉人籍警手（下级警察），不过在袭击过程中均被放过。
日方之动员与救援行动.袭击发生后约一小时，自公学校侥倖逃出的能高郡视学菊川孝行抵达距雾社约四公里处，尚未遭袭击的眉溪屯驻所，报告雾社发生「蕃人大出草，内地人全灭」的事态（「内地人」即指日本人），消息经由电报于当天下午传至台中州厅、以及台北的总督府。由于当时盛传起事原住民下一步将进攻埔里，因此日方当日即动