还是有一些明显的不同，这可能是因为与犹太人长期地理隔离，且后来阿拉伯人移入通婚所致。在遗传谱系的研究方面，有一项关于人类Y染色体DNA单倍群的短串联重复序列的研究。而研究样本则是巴勒斯坦地区的人民，其中基督徒44位，穆斯林119位。研究结果指出，巴勒斯坦基督徒与穆斯林在遗传上有所差异。巴勒斯坦基督徒有31.82%属于E1b1b（），11.36%属于G2a（），9.09%属于J1（。而巴勒斯坦穆斯林则有37.82%属于J1（，19.33%属于E1b1b（），5.88%属于T（）。在2003年，根据谢米诺（