都君士坦丁堡与整个东罗马帝国。目前并未有明确的数字统计多少人因此死亡，然此次流行导致帝国至少1/3人口死亡。严重影响该帝国经济税基与军制兵源，削弱了拜占庭帝国实力。查士丁尼鼠疫爆发后，从541年－717年，鼠疫沿着海陆贸易网扩散到西欧与不列颠。首先是高卢(法国)，543年法国西南部亚耳爆发鼠疫病情，接着547年鼠疫传染至爱尔兰与不列颠西部，588年－590年的一次鼠疫横扫马赛、亚威农，以及法国北部里昂地区的隆河流域，造成2500万人死亡，鼠疫不止波及英法等国，它使当时整个地中海贸易衰退。更造成许多昔日王