明延平郡王郑成功1661年取得了荷兰殖民者的据点台湾，并以台湾作为抗清根据地。永历帝死后，新即位的郑经继续使用南明的永历年号，但未再拥立朱氏皇帝或监国。
巩固与盛世.1662年康熙帝幼年即位，在位初期，康熙帝成功铲除了威胁皇权的鳌拜及其党羽，并开始亲政。针对镇守南方的吴三桂、尚可喜、耿精忠三个藩王问题，康熙帝进行了削藩，但很快三个藩王便进行了叛乱，史称“三藩之乱”。从许多记载来看在平三藩时还有清军对平民的大量屠杀，不仅仅只在四川、云南，其他相关地区也遭受类似的厄运，比如江西百姓遭受