明朝洪武元年(1368年)，改福州路设福州府。洪武二年，福宁州及福清州降为县，福州府管辖闽县、侯官、怀安、长乐、连江、古田、永福、闽清、罗源、福安、宁德、福宁及福清13县。成化九年(1473年)，设福宁州。福州府减辖福宁、宁德、福安3县，所辖地改为闽县、侯官、怀安、长乐、连江、古田、永福、闽清、罗源、福清10县。万历八年，怀安县并入侯官县。清朝顺治二年（1645年）闰六月，明唐王朱聿键在福州称帝，建元隆武，福州府改为天兴府。顺治三年(1646年)九月，清兵攻克福州，天兴府复称福州府。雍正十二年(1