因为金马地区实施战地军政指挥，福建省政府虚级化并迁至台湾省台北县新店镇（今新北市新店区）办公。民国47年（1958年）8月23日－10月5日，中华人民共和国声称「声援中东人民的反侵略斗争」，于金门爆发八二三砲战。民国68年（1979年），美国与中华人民共和国建交，中国大陆发表《停止砲击大、小金门等岛屿的声明》，历时21年的金门砲战正式划上句号。中华民国国军自1949年10月撤出金门县大嶝乡后，中华人民共和国政府曾于1955年在大嶝乡设立金门县人民政府；1970年12月併入同安县（今厦门市翔安区大嶝街