828年，耶稣会在岛上以2,000澳门元购入私人土地兴建圣若瑟修院。澳葡政府先在1865年(清朝同治四年)筑青洲山炮台，后于1890年（清光绪十六年）筑海堤连接莲峰庙（即今青洲大马路）使之与半岛连成一体。青洲因为靠近边境，故在澳葡时代长期属军事禁区，山上植被受人类干预较少。昔日青洲产蟹，后因建水泥厂而绝迹。青洲水泥厂创办于1887年（清光绪十二年），是为中国最早的水泥厂。因应社会需要，政府亦在青洲山周围填海造地。青洲木屋区曾于1950、1955及1989年发生大火，以1955年的一次最严重，三母子被烧死