熙二年（1663年）正月二十日农历旧年，前来李令皙拜年的客人络绎不绝，李家百余人连同拜年的亲友皆遭逮捕。这时廷鑨已死，被掘墓刨棺，枭首碎骨。此事牵连甚广，康熙二年（1663年）五月二十六日（6月31日）李令皙被凌迟处死，其子李礽焘等四人皆斩杀，史称「庄廷鑨明史案」。