歧日益严重，加上有传闻因为当时的马来精英惧怕新加坡的华族人口会削弱以马来人占多数的原有人口比例，致使新加坡被迫选择独立，从而离开马来西亚。虽然马来西亚政府后来克服这两个危机，但因其产生的内部矛盾仍旧导致1969年间五一三事件的事件发生。马来西亚为此进入紧急状态，政治生活和国民自由受到限制，这个措施维持至今。从1970年开始，巫统（）在华人和印度人领袖的协助下组成国民阵线，在马来西亚几乎达到一党制的地步。在巫统管治下，马来西亚经济得到快速发展，但人均GDP却只有新加坡的六分之一，常被质疑是否与本国贪腐问题