延平王的称号随之消灭。在台湾清治时期之初，民间不敢以「延平郡王」之名义奉祀郑成功，直到清钦差大臣沈葆桢在牡丹社事件时以「钦差办理台湾等处海防兼理各国事务大臣」身分前来台湾，上书请建延平郡王祠，郑成功才名正言顺得以此称号纪念。及至台湾日治时期，因郑成功有日本人血统，亦颇重视郑成功，并未将祠废除，仅将其改为「开山神社」，或许因民众仍习称其为「开山王」所致。直至二战结束，国民政府接管台湾之后，再将开山神社改回「延平郡王祠」，并将原有福州式封火山墙庙宇，改建为北方宫殿式。台南市中西区郡王里因位于「延平郡王祠」所在地