职务期间，审批8家药厂的药品和医疗器械过程中，直接或者透过妻子刘耐雪和儿子郑海榕，受贿649万多元人民币。2001年到2003年，擅自降低审批药品标准，其后被揭发部分药厂虚报药品资料，其中6种是假药。2006年4月暴发齐齐哈尔第二制药有限公司（齐二药）亮菌甲素注射液事件（详见「二甘醇」条目）；2006年8月暴发安徽华源生物药业有限公司「欣弗」注射液事件，导致十人死亡，多名病人出现肾功能衰竭。2007年5月29日上午，北京市第一中级人民法院对郑筱萸案作出一审判决，以受贿罪判处郑筱萸死刑，剥夺政治权利终身，没收