陷于南宋，升为寿春府。大定二年（1162年），夺回寿春府，复为寿州。泰和六年（1206年），升寿州为防御州，同年陷于南宋后又夺回。天兴元年（1232年），下蔡陷于大蒙古国，不久被弃。天兴二年（1233年），下蔡陷于南宋，州治迁至蒙城，不久蒙城亦陷于南宋，南宋改寿州为寿春府。
明清.吴元年（1367年），降寿春府复置寿州，属江南行中书省临濠府，治寿春（今安徽省寿县），领五县：寿春、安丰、下蔡、霍丘、蒙城。明朝洪武二年（1369年），寿州直隶于中书省。洪武四年（1371年），寿州还属临