、南京信息工程大学、南京工业大学、江苏大学、江南大学、电子科技大学、上海海洋大学、集美大学、南京航空航天大学、南京体育学院、南京艺术学院、中央美术学院、中国传媒大学等校和南京大学也有不同程度的密切渊源关系。国立政治大学、香港中文大学（新亚书院）、中国文化大学、国立台湾体育学院、国立联合大学、中华科技大学、南华大学等和南京大学同样存在密切渊源联系。南京大学附属丁家桥小学、南京大学附属中学、南京师范大学附属中学、金陵中学、南京师范大学附属小学、鼓楼幼儿园等。
合作交流与伙伴友校.