于制取农药、农业杀虫剂和用于火车车厢消毒。用作有机合成试剂，氰根离子是很好的离去基团，用氰基甲酸甲酯可以向分子中引入甲氧基羰基基团。它与手性配体和金属催化剂共用时可从醛制取有手性的"O"-甲氧基羰基羟腈。
制取.由氯甲酸甲酯与氰化钠在甲醇反应中反应制得。