在仍是谜。有人认为跟美洲印第安人过度捕猎有关。从此，在近一万九千五百多年的时间里作为马的发源地的北美洲第一次没有了马的存在，一直到公元十六世纪西班牙人再一次把马带回了美洲。现代家马虽然已有超过500个品种，但是由于遗传湮没效应，已有超过88个地方品种灭绝。而在培育品种过程中所采用得纯系育种策略和血统系谱登记制度, 导致家马品种的遗传多样性衰退。
驯化.现代饲养的马是由欧洲野马驯化而来的。野生的马已经灭绝。现存的普氏野马不是家马的祖先。马的进化历程充满了艰难险阻。马科动物曾经是如