1976年5月19日开始营运，使用嘉义空军基地跑道、滑行道及停机坪营运，管辖单位为中华民国交通部民用航空局，国内航线以飞马公及金门航线为主，由立荣航空经营，每天有固定航班往返澎湖马公机场及金门尚义机场。2013年5月25日、29日，中华航空包机直飞日本静冈机场。2014年4月30日，春秋航空包机直飞上海浦东国际机场。军用部分称为「中华民国空军嘉义基地」。空军基地位于水上乡、太保市与嘉义市交界，航空站出口位于水上乡，距离嘉义市区约八公里，距离中山高速公路水上交流道则约有三公里。
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