放后，吴光新参与奉系军阀。1924年（民国13年）9月第2次直奉战争中，他任奉军第6方面军副司令率军参战。段祺瑞的中华民国临时政府成立后，他任陆军总长、陆军训练总监。1925年（民国14年）12月辞职，随段祺瑞移住上海。1939年（民国28年），他在香港病逝。享年59嵗。