日战争爆发，北平沦陷；辅仁大学奉国民政府命令维持现状，以利用其国际关系培养爱国青年。1938年春季，英千里与其他有心人士共组「炎社」（后改名「华北文教协会」），以结合华北各所大学师生祕密抗日，并负责运送大学及中学毕业生到后方就业或升学；获罗马教廷封为爵士。1942年，夏季，英千里出任中国国民党北平市党部书记长兼代主任委员职务；年底，与辅仁大学多位同仁遭日本当局逮捕入狱，并于次年获释。1944年，英千里再遭日本宪兵逮捕并以军法判刑；次年再获释；不久，辗转前赴重庆。1945年，英千里受当局请託出