里）宽的区域，主要原因是其河床有着大量壕沟。然而，美国陆军工兵部队认为圣胡安 - 卡皮斯特拉诺区内的许多堤坝不足以应对百年一遇洪水，并预计该种洪水将会造成1.49亿美元的财产损失。
生态.圣胡安溪流域的上下部份本来皆有着丰富的河岸湿地及其他种类的栖息地，而在1950年都市化未实行之前，下游流域的湿地总面积更超过1.2平方公里（300英亩）。可惜的是，现时仍存在于流域内的湿地只剩下当初的0.3%。后来，当地政府提出溪流保育计划，当中包括动植物栖息地的保育计划。圣胡安溪流域有16个