犯罪嫌疑人的人身安全是否有保障也是一个有争议的问题。一个典型的例子是李庄案，作为一名“黑老大”龚刚模的辩护律师，他因“涉嫌诱导、唆使龚刚模编造证言、引诱证人作伪证”等被提起公诉，被判18个月有期徒刑。他宣称自己的当事人遭到警方的虐待，香港立法会议员何俊仁认为他是被当局迫害的。另一位律师朱明勇也证明龚本人遭到了酷刑逼供。最后他还公布了录像带详细描述他的当事人樊奇杭（2009年6月被逮捕）如何被折磨了半年。
后续及影响.打黑行动高潮后，2010年2月，重庆宣布将原本的交、巡警合一，