凯撒与克拉苏秘密结成「三头政治同盟」跟元老院对抗。后和凯撒发生权力之争，爆发内战。他于法萨卢斯战役进行决战中被凯撒击败后，逃往埃及。前48年秋季，庞培在凯撒军的追击下来到了亚历山卓外海，寻求庇护。年仅15岁的托勒密十三世还很年轻，此事主要由财政大臣波提纽斯处理。前48年9月28日，庞培虽然觉得事情有异，托勒密迎接的场面既不隆重，还有点肃杀，岸上满是士兵，加上托勒密还派出舰队像是监视庞培般。庞培自知无法逃脱，只得乘着对方安排的一艘小船，准备要登上埃及的海岸。然而迎接他的托勒密军官在庞培一上岸，就杀了庞