迳送院会，引起民间团体不满，认为审查过于草率，要求逐条审查，至立法院门口抗议。抗议民众进入立法院，黑色岛国青年阵线成员在现场组织学生，宣布佔领立法院，开始太阳花学运。林飞帆与陈为廷成为抗议学生代表。3月23日，抗议群众由立法院外围进入行政院，企图佔领行政院，黑色岛国青年阵线总召魏扬在现场指挥群众。立法院内，林飞帆与陈为廷要求群众不要前往参加佔领行政院，留在原地。警方强力驱逐之后，魏扬以现行犯遭逮捕。稍后，陈廷豪也被检方怀疑是主谋而遭传唤，以涉嫌妨害公务罪嫌，谕令5万元交保候传。3月30日，林飞帆等人