主教会和埃塞俄比亚正教会之间的区别包括：一些在圣礼（英语：Sacrament）上的神学说观点不同、使用天主教正典（英语：canon of Scripture）和天主教反对衣索比亚正教会与科普特正教会所奉行的耶稣二性合一论（）。另外，天主教神职人员通常穿着罗马衣领和长袍。相反正教会主要穿当地的民族穿着。