赖朝，江户氏成为源氏的下属势力。至12世纪，江户一族已广泛佔据武藏国的江户湾沿岸地区。13世纪后，北条氏成为武藏国新的统治者。进入14世纪后，包括武藏国在内的关东地方先后经历南北朝和战国时代的长期混战。1476年（文明8年），武藏国割据势力之一的扇谷上杉家家宰太田道灌修筑了江户城。太田在江户筑城的同时还在江户城下的河口地区开辟港口，令江户城下成为贸易据点。但太田在1486年（文明18年）被暗杀，江户再次陷入战乱。1520年代，后北条氏控制了武藏、相模等国，成为关东地方最大势力。1582年（天正18年），