9月20日晚以风速每小时137公里强度从弗朗西斯角（）登陆。飓风穿过古巴进入墨西哥湾，行进速度有所放缓。由于水温较高，气旋得以快速增强，于9月21日达到风力时速201公里的最高强度。虽然卫星通过德沃夏克分析法判断飓风风速一度达到每小时233公里，但飓风猎人侦察机测得的数据表明伊西多尔此时的风速为每小时201公里，仍属三级飓风标准，最低气压则是934毫巴（百帕，27.6英寸汞柱），通常要达到四级飓风强度的热带气旋才会有这么低的气压值。伊西多尔此时已创下有史以来气压最低的三级大西洋飓风纪录并保持至今。由于附