864年林肯再次当选总统后，因与美利坚联盟国领导人私人关系良好，布莱尔被林肯派往里士满与联盟国总统杰斐逊·戴维斯接触，劝说其派出代表与美利坚合众国代表进行谈判。1865年2月3日举行的“汉普顿锚地会议”即是此行的结果。美国南北战争结束后，布莱尔成为安德鲁·约翰逊总统重建政策的反对者，并因此最终加入了民主党。1876年10月18日，布莱尔在马里兰州银泉逝世。
家庭.1812年7月21日，弗朗西斯与伊丽莎·维奥莱·吉斯特结婚，婚后两人共育有三子一女：曾任美国参议院议员、密苏里州州长