主党在直选议席中得票率43%，20席中取得了9个直选议席，连同功能界别共13席。虽维持立法会第一大党地位，但选举制度由以往单议席单票制变成名单比例代表制，受制于选举制度，仅佔总议席22%。随着时间发展，党内渐渐陷入派系及路线之争；先有1998年党内少壮派借换届选举，拉倒「汇点派」的张炳良，推举了刘千石取代成为副主席；继于1999年就应否将「支持设立最低工资」纳入党纲少壮派再与主流派激烈辩论，少壮派指主流派路线偏离基层，有关提案最后在会员大会上被否决；2000年立法会选举又因资源分配、选举名单排名而内讧，