铁路工程局副局长陈正楷表示，由于台北市政府要求营运补贴、台北县政府无意经营，决定将桃园国际机场捷运交由桃园县政府营运，而其后桃园县政府也邀请台北市政府入股其所成立的捷运公司，2010年7月6日，由台北市政府、桃园县政府、台北县政府三方按路线比例出资的桃园捷运公司正式成立。
2014年－至今.桃园县依《地方自治法》升格直辖市后，2015年2月25日，桃园市长郑文灿于「桃园市政府第8次市政会议」通过桃园市政府人事处提案，筹设「桃园市政府捷运工程处」，该处并于同年4月1日正式成立。就