田径男子马拉松比赛于2016年8月21日在巴西里约热内卢萨普卡伊侯爵森巴场举行。比赛在雨中进行，结果2016年年度排名第一的肯尼亚选手埃利乌德·基普乔盖在30至35公里处开始发力，并将优势保持到最后，以2小时8分44秒的成绩夺冠，埃塞俄比亚选手费伊萨·利勒沙以70秒之差屈居亚军，盖伦·鲁普则以2小时10分5秒的个人最好成绩为美国队夺得一枚铜牌，2015年世锦赛该项目冠军得主格尔麦·格赫布雷斯拉塞虽然在后程发力并逐渐提升排名，但仍以59秒之差与奖牌失之交臂。按照以往惯例，该项目的颁奖典礼会在奥运闭幕式