市区面积3774.35平方公里；2016年底吉林市城区面积498.75平方公里，建成区面积189.04平方公里。
地势.城区为河谷盆地地形，平均海拔约200米，四面被龙潭山、小白山、朱雀山、玄天岭环抱，如神话中青龙、白虎、朱雀、玄武四神拱卫，又有松花江穿城而过。近年来吉林市向西北北穿过玄天岭发展，而东南面则由于山岭阻隔，发展缓慢。
水文.吉林市全市属于松花江流域，分为第二松花江、拉林河、牡丹江3个水系，全市有10公里长以上河流277条，20公里以上的73条