万钢带团归国，提出开发清洁能源汽车的建议，并有了回国的打算。2000年的平安夜，经同济老校长李国豪劝说，并受科技部邀请的万钢回到了中国。不久，他被中华人民共和国科技部聘为国家“863计划”电动汽车重大专项首席科学家、总体组组长。2001年，万钢回到同济大学，历任校长助理、汽车学院院长、新能源汽车工程中心主任；2003年6月，出任同济大学副校长（主持工作）；2004年7月起，正式担任同济大学校长（副部长级），任至2007年；2006年起，兼任上海市科协副主席。
步入政界.2006