蜥蜴一系演化而成的，例如巨蜥或其它邻近种类。一条早期被发现并被命名为「"Najash rionegrina"」的蛇类化石，相信是以双足活动的洞栖性生物，牠的身体已经拥有荐骨，而且其生活习性完全是陆行性的。一种被认为与上述化石相似的现存生物，是位于东南亚婆罗洲的拟毒蜥，不过这种巨蜥是半水行性的，与前面所说的古蛇化石的习性仍有不同之处。由于这些远古生物是生活于地洞中的，牠们的四肢逐渐退化消失，其身体亦变得更强调流线型，方便进出于地穴之间。根据这个假设，蛇类的一些特征如其拥有透明的眼膜（功能类似眼睑）、欠缺外耳等