赴美前即认识，两人于2003年亚锦赛后留台期间，于同年12月7日于台南成婚，婚后两人仍赴美共同生活。2009年6月16日约早上九时（UTC-5），太太吴嘉姈于美国纽约产下长子王鹏砚（Justin Jesse Wang，贾斯汀·杰西·王）于出生，孩子拥有美国公民与中华民国国民的双重国籍，而王建民也成为首位子女于大联盟生涯期间诞生的台湾籍美国职棒大联盟球员。2013年1月17日次子王照升（Wellington Wang）诞生。不过在2012年，一向给人爱家好男人形象的王建民，却在开季后不久爆发外遇绯闻。4月