2011年，菲律宾对马来西亚的出口总额为10.98亿美元，而从马来西亚的进口总额为26.35亿美元。2011年，菲律宾与马来西亚的双向贸易总额达到37.3亿美元。菲律宾对马来西亚的主要出口是半导体设备，电气和电子机械以及机械设备，而从马来西亚的主要进口是石油和石油产品。2011年8月，以6.1亿美元的价格收购了埃克森美孚公司持有的Esso Malaysia Berhad 65％的股份。Petron的投资预计将达到12亿美元，以更新Esso的炼油厂并翻新约558个加油站。菲律宾在马来西亚经营的其他菲律宾大型主