异构、位置异构和官能团异构三类。
链异构.链异构通常指碳链异构，是指化合物分子中的原子骨架连接方式不同，一般用于形容碳氢化合物。它可以看作是分子式相同的直链化合物与支链化合物之间的异构。以戊烷为例，它有三种异构体：俗名分别为“正戊烷”、“异戊烷”和“新戊烷”。后两种是将第一种的一些碳原子当作支链而得到的。烷烃存在的碳链异构体数目可以参见 。
位置异构.位置异构可以模煳地划分为“官能团位置异构”和“取代基位置异构”。前者的例子如1-戊烯和2-戊烯，后者的例子