社长岩田聪召开发布会宣布公司将与日本移动游戏运营商DeNA合作，两家公司将会在智能手机平台制作5款手机游戏。《超级马里奥酷跑》作为两者合作的第二款作品，由系列资深制作人手冢卓志担任游戏设计，“马里奥之父”宫本茂担任制作人，这是宫本茂继2007年的《超级马里奥银河》后再次亲临游戏开发的整个过程。此外任天堂还把制作过“新超级马里奥兄弟”系列作品的开发团队作为本作的主要开发主力，开发团队内部根据游戏的三个主要的游戏模式又分为三个开发小组。游戏采用Unity游戏引擎开发。《超级马里奥酷跑》首次公布于2016年9