一家大名，肥前的龙造寺政家、大村喜前、松浦镇信等人及对马国的宗义智，也在臣服秀吉后获得本领的安堵。而丰臣秀吉的家臣中，黑田孝高得到了丰前六郡12万5千石(后增封至17万石)的领地、毛利胜信则获得丰前小仓6万石。肥后国的大部分则交给了原本支配越中国的佐佐成政，当地豪族天草五人众也获得安堵，另外在相良氏家臣深水长智的奔走下，相良赖房也重新获得肥后人吉2万石的安堵。但因为佐佐成政检地失力，引发严重的肥后国人一揆，佐佐成政被问罪赐死，在平定当地一揆后，原属佐佐成政的领地一分为二，切割成加藤清正拥有肥后北半国19