份与《生化危机2》重叠，女主角吉儿（Jill Valentine）于《生化危机》的洋馆事件后，一直调查有关保护伞公司的地下业务。当时美国联邦政府决定以核弹彻底毁灭浣熊市，于是吉儿展开她的逃亡之旅。在逃亡期间，她受到保护伞公司欧洲分部派来浣熊市的生物武器追迹者（Nemesis）追杀，并且遇上了隶属于保护伞生物灾害对策部队（Umbrella Biohazard Countermeasure Service，简称UBCS）的男主角卡洛斯·奥利维拉（Carlos Oliveira），以及UBCS成员米海尔·维克多（