2006年，吉文明赴南京军区任职，任中国人民解放军第一集团军代理副军长。2009年9月任南京陆军指挥学院院长，2011年9月任总参办公厅主任，2014年7月任济南军区副司令员，2016年1月任济南军区善后办主任、党委副书记。2005年晋升中国人民解放军少将，2015年7月，晋升中国人民解放军中将军衔。