学校长蔡元培兼任国史编纂处主任。1919年6月，大总统徐世昌以“国史有关制作仅由学校附设机关，不足以昭郑重”为由，于1919年8月30日由国务院公布《国史编纂处简章》，使国史编纂处改为直隶国务院，“掌编纂国史并征集保存关于国史之一切材料”，以国务院参事涂凤书兼任国史编纂处处长，以王树枬任总编纂。1927年9月21日，张作霖组织的安国军政府颁布《国史馆制》，恢复国史馆。1928年，随着张作霖在北伐战争中倒台，安国军政府覆灭，国史馆也随之消亡。1931年8月，国民政府内政部、教育部呈准行政院设立国史馆筹备处