学院、理学院、及人文社会与艺术学院。同时为了因应台湾教师需求的萎缩，除了教育学院的教育与学习科技学系、幼儿教育学系、特殊教育学系仍然保留师资培育架构外，其余各系所已经转型成一般大学架构，借此增强和其他大学竞争的能力。自2006年开始，竹教大连续2年获得教育部奖励大学教学卓越计画补助，在2007年也被教育部列为25所繁星计画优质大学之一。2016年10月14日，教育部核定竹教大与清大的合併案。11月1日，两校正式合併为「国立清华大学」，106学年度起开始招生。
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