院长、历史系主任等职。11月任北京市副市长。1953年，任中华全国青年联合会副主席。以后还历任中国科学院历史研究所学术委员，中国科学院哲学社会科学部学部委员，北京市政协副主席等职。1954年起主持改绘杨守敬的《历代舆地图》，标点《资治通鉴》和《二十四史》，明十三陵中定陵的发掘等工作，后主编《中国历史小丛书》、《外国历史小丛书》等系列。1955年10月，时任北京市副市长的吴晗发起挖掘明长陵，实地勘测后改为定陵。因当时文物保存条件不足，规章制度不规范，造成大量文物损坏，成为中国考古一大悲剧。19