《萨尔达传说 时之笛》里的过场动画全都以实时运算的形式制作，而不用预先录制或全动态动画。预购《萨尔达传说 时之笛》的顾客将会得到游戏的限定版本，包装盒上贴上金色塑胶卡牌，上面註明「收藏者版本」。里面的游戏卡带也是金色的，这是自第一代《萨尔达传说》（红白机）就开始的传统。预购反应非常热烈，有游戏零售商甚至于游戏正式推出前的20天（即1998年11月3日）就截止接受预购。后期发售的版本有少量的修改，例如将火之神殿背景音乐中的穆斯林吟唱部分去掉，又把盖侬道夫的血由红色改为绿色等。