被一向一揆（宗教性的暴动）推翻（如加贺守护富樫氏被一向一揆完全消灭）。下克上的风气弥漫着整个日本战国时代，同时也成了这个时代的最大特色。原本辅佐守护的守护代、各地土豪、甚至平民崛起成为大名。各地大名进而称霸一方，甚至于成为掌控天下的「」。于此同时，日本与欧洲人之间的贸易交流正式展开，基督教和铁炮（火枪）的引进改变了社会和战争的形态。到了战国中、后期，过往封建制度下的农奴地主关系也逐渐遭到破坏。
明应之变，关东大乱.应仁之乱后，虽然幕府的影响力大幅丧失，可是当时的各任幕府将军仍试图改