工业区以南到大鹏湾需兴建跨高屏溪、东港溪的桥樑，造成成本大增，且这段的评估运量仅佔全线两成；因此该专案将之列为第二阶段，并又评估第一阶段的12.2公里路段。而第一阶段的自偿率为负，但加上林园机厂联开商场，自偿率可提到为正；然而将土地开发成本考量进去，BOT模式仍不可行；且过低，纵使採用OT模式，仍然不可行。但由于第一阶段路线评估仍有经济效益，以社会公益角度来看，专案仍建议政府可以兴建并自行营运第一阶段路线。由于轻轨推行进度缓慢，2012年高雄市交通局另外规划了高雄公车捷运沿海线，从小港站沿着沿海路到凤鼻