64年成立以来，国际贸易中心共有六名执行董事。分别在七十年代初和九十年代初，该职位曾有两次空缺。国际贸易中心执行董事是联合国系统内助理秘书长级别的资深的国际公务员。国际贸易中心执行董事及副执行董事由中心的两个上级组织的负责人任命，即世贸组织总干事和贸发会议秘书长。