厄尔利再度接过马奎尔的校长职位。维托里奥·埃马努埃莱二世入侵罗马后，该校学生召开会议谴责侵略，声称这是对教皇的污辱，并投票决定向教皇捐款。大学法律系在马奎尔即将卸任校长时成立，1870年10月开课。1872年12月创刊的《乔治城大学学报》（）是该校首份学生办报。厄尔利于1872年开始出现肾病症状，视力也受到影响，大学的管理工作基本由副校长帕特里克·弗朗西斯·希利接手，希利后来继任校长职务。1873年5月22日，厄尔利中风导致半身不遂且无法言语，于次日与世长辞，享年58岁。他的遗体葬在乔治城大学耶稣会社区