行政制度方面，明治42年（1909年），花莲地区脱离台东，成为花莲港厅，独立设治至今。台湾战后时期，于1946年1月9日设立花莲县。1950年10月15日成为第一个依据《中华民国宪法》实行地方自治的县市。由中国民主社会党的杨仲鲸当选首任民选县长，有华人社会第一位民选县长之说。1992年第二届立法委员选举时贿选与集体作票的中国国民党候选人魏木村及其弟魏东河则成为因作票而当选无效且遭判刑入狱的台湾历史首例，这也是民主进步党候选人（黄信介）第一次在花莲当选公职人员。2008年，因应交通建设需要，县政府公佈