统治下的法兰西王国也对勃艮第公国拥有主张，导致两国之间爆发继承战争。最后法兰西王国取胜，索恩河以西的勃艮第公国仍归法兰西王国所有。勃艮第伯国随宗主国阿尔勒王国于1033年并入神圣罗马帝国后，勃艮第伯国仍保持较大自主权。1153年，神圣罗马帝国皇帝腓特烈一世与联姻，获得勃艮第伯国继承权，勃艮第伯国进入霍亨斯陶芬王朝统治阶段。但勃艮第伯国在文化上一直与法兰西王国的联系更强，与德意志的联系则相对较弱。1335年，勃艮第公国的通过一桩与的政治联姻获得了勃艮第伯国的继承权，使勃艮第伯国成为勃艮第公爵名下的领地