一。传说，孜珠寺始建于公元前10世纪，是第二代藏王穆赤赞布倡议兴建的三十七处苯教道场之一，为苯教“译师传承”八大成就者之一穆邦萨东创建。该寺的住持喇嘛被尊称为“孜珠活佛”，自第一世穆邦萨东传承至今，已传至第四十三世丁真祖普俄色。8世纪，第三十代藏王赤松德赞“灭苯”，孜珠寺随之衰败。14世纪中期，苯教高僧罗丹宁布·仁增康珠再度兴修并恢复了该寺。由于佛教的兴盛，苯教被迫到边远地区发展，琼波丁青的三十九族地区成为苯教寺院及信徒最多、影响最大的地区。17世纪，圣僧桑吉林巴主持孜珠寺，孜珠寺因而获得空前发展。