华池县的水泛（台）、吴旗二个区、定边县罗涧区与乱石头区、靖边县凤凰（寺）区、志丹县金汤区划入，辖六个区33个乡113个行政村472个自然村3970户30453人，驻吴旗镇，隶属于三边分区。1949年9月30日为支援大西北解放，抽调干部接管新解放区，陕甘宁边区政府撤销了吴旗县，其所辖一（吴旗）、六（水泛）区划归华池县，二区划归志丹县、三区划归靖边县、四、五区划归定边县。1950年12月陕西省人民政府决定恢复吴旗县，隶属于延安地区。2005年10月19日当红军胜利会师七十周年之际，更名为吴起县。现有「毛