旗下继续营运。1944年，经营台湾西部电力业务的台湾电力株式会社正式合併东台湾电力株式会社。然而，同年台湾接连遭受多次台风以及暴雨侵袭，导致各地的水力发电所皆受到大小不一的损坏。其中，砂婆礑第二发电所发电用水的头水引水道遭到洪水破坏，但因当时太平洋战争已经爆发，大日本帝国面对盟军之攻势，逐陷入颓势，日本人无力修复，最终原本台湾东部地区原总共有装置容量55,000KW的发电量在当时仅剩下清水第一发电所的7,000KW能够正常发电。
战后时期.1945年8月，第二次世界大战结束