村井启太郎毕业于熊本五高1部法科。1898年，村井启太郎自东京帝国大学法科毕业，入东京《朝日新闻》社任记者。明治33年（1900年）庚子事变之际，日本率先派军队到北京镇压，他参加义勇兵，受东京朝日新闻社派为特派员，驻北京采访。其间，他还充当随军记者考察辽东半岛。他以“筑紫二郎”为笔名，在《朝日新闻》上发表了许多随军见闻。自1900年（明治33年）8月29日起，《朝日新闻》开始连载其《北京笼上日记》。他因《北京笼上日记》而声名鹊起。他还因功受奖。 1907年3月起，他任满铁嘱托、调查员、地方课课长等职。