柔佛的华人教会，槟城、怡保和吉隆坡的外国人教会成长起来。 圣公会和天主教于1882年在英属北婆罗洲成立后来到北婆罗洲。例如天主教的米尔山宣教机构(Mill Hill Missionaries)，主要是集中在华人和土着社区，如卡达山-杜顺人。1882年，崇真会开始向沙巴派遣传教士。移民也是基督教传播的一个重要因素。中国的义和团起义后，从中国来的移民人数有所增加，特别是实力雄厚的中国卫理公会。1936年，信徒较少的玛多玛叙利亚东方正统教会(Mar Thoma Syrian Church)从印度喀拉拉邦海岸迁移到