大围站共设7个出入口，于2004年新设的出入口有5个，其中3个位于扩建的大堂，2个位于美田路以南连接东铁线北行大堂。原有位于美田路以南连接东铁线南行大堂，以及位于村南道的出入口均被保留。
利用状况.在屯马线一期通车前，大围站是东铁线及马鞍山线唯一的转车站，加上附近也有多个大型屋苑及大量出租单车的店舖，因此不论平日还是假日，均有大量人流，人流密集导致大围站在繁忙时段十分挤拥，早上繁忙时间东铁线往红磡方向可能要轮候多于2至3班车才能登车。直到屯马线一期启用后，乘客可前往钻石山站转乘观塘