克兰兹此前不动用服务推进系统的决定正确。接下来众人需要确保登月舱在适当时机与指令舱分离，保障再入时两舱的安全间隔。登月舱正常情况应在月球轨道抛弃，用服务舱的反推力系统将服务与指令舱拉走，但阿波罗13号的服务舱此时已经抛弃。制作登月舱的格鲁门公司派出多伦多大学工程师研究组，由资深科学家伯纳德·埃特金（）带队计算分离两舱所需气压。宇航员落实埃特金一行提出的方案后解决问题。登月舱再入地球大气层后烧毁，残余部分掉入大海。美国原子能委员会要求确保航天器上计划用于放射性同位素热电机SNAP-27的二氧化钚不会落入他国