其后曾搬迁合共12次），与钱穆、张丕介等人创办亚洲文商学院，1950年更名新亚书院。1957年，应美国国务院所邀，赴洋讲学。1958年，与徐复观、张君劢、牟宗三发表《为中国文化敬告世界人士宣言》。1963年，新亚书院与崇基学院、联合书院合组成香港中文大学，出任新亚书院哲学系讲座教授，兼任教务长及哲学系系主任等职，至1974年9月5日后退休。唐氏在1968年至1978年担任新亚研究所所长期间，广邀学界名宿来校主讲文化讲座，令香港一时成为研究中华文化的重镇；但在其任内，由于研究所与大学间冲突变得白热化，