而成，且硷基与骨架之间是以亚甲羰键相连。与多肽链相似的是PNA也有N端（氮端）与C端（碳端）的差别。由于PNA没有如DNA或RNA上的磷酸基团，因此PNA与DNA之间缺乏电性相斥的现象，使两者之间的结合强度大于DNA与DNA。肽核酸基团构象不同于普通核酸, 不易被蛋白酶或者核酸酶水解，且碱基配对特异性极强，热稳定性高。有一些理论认为早期地球上的生命型态是以PNA为遗传物质，但目前没有证据。