为陈霸先和陈蒨佐理政务，得到两朝君主的厚待，赏赐比平常人丰厚；历任兰陵、阳羡、临津、临安等县令，在地皆有好名声。太建初年，萧济入朝为五兵尚书，与左仆射徐陵、特进周弘正、度支尚书王玚、散骑常侍袁宪共同服侍东宫陈叔宝。他复任司徒长史，很快授官度支尚书，领羽林监；转为国子祭酒，仍然领羽林监。后朝廷加萧济为金紫光禄大夫，兼安德宫卫尉；再转仁威将军、扬州长史。陈宣帝曾下令扬州曹事检讨自己，见他文章条理通顺，就对左右的臣子说：「我本来以为期萧长史只懂得经传，不会说话扼要繁重，才会这样。」迁任祠部尚书，加给事中，再次