04年10月9日至2005年10月1日，一部名为《机动战士GUNDAM SEED DESTINY》的50集续集在日本播出，与《SEED》在同一电视台首播。《SEED DESTINY》故事发生在前作的两年后，围绕着主角真·飞鸟以及他所参与的新的战争。万代娱乐于2004年2月15日获得《SEED》动画的播映授权，并分别于2004年和2005年开始在美国和加拿大播出。英语改编版本是与联合制作的，英语配音是在加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华的海洋工作室录制的。本剧正剧在2004年8月10日至2005年5月10日期间