作成长篇动画电影。1986年1月工作室转移至东京吉祥寺 (武藏野市)，开始制作长篇动画电影《王立宇宙军～欧尼亚米斯之翼～》(山贺博之导演)，于1987年3月公映。《王立宇宙军》票房大失败，原先予定制作完便解散的GAINAX为弥补赤字而企画了OVA动画《飞越巅峰》(庵野秀明导演)。《飞越巅峰》虽然叫好叫座，但由于过大投入而赤字未减。接着制作了NHK电视动画《冒险少女娜汀亚》，依然叫好叫座。GAINAX亦制作电脑游戏。1989年发售猜谜游戏《电脑学园》，1991年发售养成游戏《美少女梦工场》。1992年