参与审理“戊午科场案”，一意秉承肃顺等人意图，致顺天府乡试主考官、文渊阁大学士柏葰于死地。程炳采临刑时大哭：“吾为陈孚恩所绐，代弟到案以至于此。陈孚恩谄媚权奸，吾在冥间当观其结局也”。后肃顺等失势，少詹事许彭寿疏请治党援，陈孚恩遭罢黜，有诏谓：“孚恩当大行皇帝行幸热河，命诸臣议可否，孚恩有‘窃负而逃，遵海滨而处’之语，意在迎合载垣等。大行皇帝上宾，留京诸大臣中独召孚恩一人赴行在，足证为载垣等心腹。革职，永不叙用。”时廷臣议郊坛配位，陈孚恩称：“前议宣宗配位时，大行皇帝有定为三祖六宗之谕，出于大学士杜受田所拟