龙下目。在2004年，诺瓦斯及Agnolin修正耻骨的方向错误后，提出乌奎洛龙属于手盗龙类、或至少在手盗龙形类的范围，并是鸟翼类或阿瓦拉慈龙科的近亲；甚至有可能是鸟类演化支「Metornithes」的原始物种。在2006年，诺瓦斯提出乌奎洛龙可能是属于驰龙科。