爆发后，他积极投身革命，创办《人民之友》报，批评《人权宣言》只是富人安慰穷人的诱惑物。1790年参加科尔得利俱乐部并成为领袖之一。1792年9月，马拉当选国民公会代表。1793年5月参与起义推翻吉伦特派统治，建立雅各宾专政。马拉经常攻击在巴黎国民制宪议会中最具影响力的当权派，为躲避追捕，长期躲在，加剧了他的慢性皮肤疾病（可能是）。为了减轻病痛而不影响工作，他每天泡在带有药液的浴缸中工作。1793年7月13日马拉被吉伦特派的女刺客夏绿蒂·科黛刺杀身亡，终年50岁。马拉死后被国民公会授以烈士葬礼，遗体被