1995年，出任公司国际贸易一部副总经理；1996年，晋升公司副总裁；1998年起，兼任北方工业公司党委书记，中国万宝工程公司副董事长、董事长。1999年，根据中共中央、国务院、中央军委有关国防科技工业体制改革的决策，北方工业公司划归新成立的中国兵器工业集团公司管理；张国清以兵器工业集团党组成员、副总经理的职衔，继续兼任北方工业公司党委书记、副总裁。在此期间，他还在清华大学经济管理学院攻读数量经济学博士研究生；并于2001年9月至11月，参加了美国哈佛大学商学院高级管理培训班的学习。在2007年11月召