分子云湍流的运动远超过音速，但是可与磁场扰动的速度相比。这种状态被认为会迅速失去能量，不是会整体塌缩就是具有稳定的能量回输。同时，在分子云大部分的质量形成恆星之前，牠们也会被一些过程瓦解──最可能是大质量恆星的作用。分子云，特别是巨分子云通常也是天文物理迈射（astronomical masers）的来源。