列为极危的原因。在缅甸，电渔法及淘金对短吻海豚造成严重的危害。虽然大部份渔民并非有意猎杀牠们，但因生活而误杀的不计其数。在越南及泰国曾一度盛行的炸渔亦造成不少的间接伤害。在某些亚洲国家，短吻海豚会被捕捉来观赏或表演。牠们对淡水的适应可以减少建造海水水族箱的成本。于2002年，在亚洲就有最少80个水族馆。不过，以往猎杀短吻海豚的目标是获取其鲸脂。短吻海豚现时被列为《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录一的保护物种，其贸易受到禁止。另外，在孟加拉等地，亦纷纷设立保育区，以免牠们再次受到渔业的伤害及失去栖息