在2004年3月九州新干线正式开始营运前，总共制造了五编组的新车，编号分别为U001～U005，并于3月13日正式开始营运，行驶于九州新干线新八代车站与鹿儿岛中央车站间已经建设完成的路线上，取代原本行驶于鹿儿岛本线上的JR九州787系列车，成为第五代的「燕号」，而787系则改作为接驳用的L特急（）列车「接力燕号」（），行驶于博多车站与新八代车站间、九州新干线尚未全线完工前暂时接驳用的在来线路线上。在2010年九州新干线全线完成后，旅客可以直接搭乘新干线800系，由福冈的博多车站一路通行至九州岛南的鹿儿岛。但