5年，圣加仑从教会的统治下独立出来。15世纪中期，圣加仑城市及教会同时加入了瑞士联盟。圣加仑州则于1803年才加入了瑞士联盟。
宗教改革.1526年，当地的市长、学者瓦迪安（Joachim Vadian）开启了宗教改革。城市转信新教，但教会仍归罗马天主教管辖。破坏圣像运动期间，许多僧侣被迫逃离城市，一些教堂的图绘也被移除，但修道院整体未受影响。
纺织工业中心.15世纪起，圣加仑逐渐以生产高质量的纺织品闻名。1714年，年产衣物达3.8万件。18世纪中叶，由