码头南端沿北131度，向海续建一段长60米的新码头，建成后命名为「九龙城码头」，给香港的蒸汽小轮使用。日佔时期，日军在1942年起大规模扩建机场，龙津石桥及九龙城码头随启德滨楼房一併拆卸，码头石墩及基座等被埋。
考古发现.启德机场在1998年停用后，政府曾委託考古专家在2003年进行考古调查，发现1924年启德滨海堤及上岸梯级，但没有发现龙津桥遗迹。2008年3月，考古学家发现一段龙津桥及9座石桥墩，政府在同年11月委託考古专家发掘，终找到1875年龙津桥、上下船平台、码头石墩