无上瑜伽续后来传入西藏成为西藏密宗的主流，大瑜伽怛特罗被译为父续，瑜伽母怛特罗被称为母续，而时轮续则自称为无二续，地位高于父续与母续之上。由于信奉伊斯兰教的突厥人入侵直接导致了印度佛教灭亡。现代研究中有人声称，由于信徒要向密教阿阇梨奉献瑜伽母以供双修（一种性行为修行方式），加上其他一些因素而失去了民众的支持。使东印度波罗王朝的仍与佛教有关的密教最后灭亡。此后印度仅在孟加拉一些地区还有密教活动。20世纪80年代缅甸僧王到孟加拉佛教密宗地区弘法，使全部密宗信徒改信上座部佛教。
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