校在此期间始终没有停课，坚持教学，没有师生参与炼钢。在1961年，学校曾经出现过粮食危机，还发生了学生集体进入食堂偷馒头的事件。但是，学校努力协调各方面、各部门，努力为学生提供了相对充足的粮食。相对其他单位而言，十一学校粮食危机较轻。1966年，文化大革命开始。此后，全国各所学校纷纷停课闹革命。1966年，十一学校曾被批判为“贵族学校”、培养“修正主义苗子”，因而遭停办，期间出现了较大规模的动乱。学校在1968年恢复办学。在停办期间，曾一度发生学生侮辱甚至攻击教师的事件，但是，老师们依然为学生提供生活上