陈其遒在1993年入选广东省羽毛球队，至1997年入选中国国家羽毛球队。陈其遒是国家队团体赛的主力成员，曾出战1999、2001、2003和2005年苏迪曼盃，以及2002和2004年汤姆斯盃。在个人单项方面，1999年，陈其遒伙拍余锦豪出战在丹麦哥本哈根举行的世界羽毛球锦标赛男子双打比赛，于半准决赛负于英格兰的对手出局。2003年，他则伙拍赵婷婷在伯明翰举行的2003年世界羽毛球锦标赛混合双打比赛，战至准决赛败给韩国的金东文/罗景民，仅得季军。陈其遒于2005年从国家队退役，其后曾在中国国家羽毛球