当时还扩建了起初兴建的大经堂，增加了三十二根柱子。各殿内有大量反映蒙古族历史及生活的壁画。扩建之后，清廷赐寺名“崇善寺”。贝子庙此次扩建后的建筑规模，基本保持至文化大革命前。在贝子庙建成后的百余年时间内，贝子庙香火极盛。鼎盛时期，贝子庙与五当召、锡拉木伦庙、百灵庙是内蒙古中西部四大藏传佛教寺庙。贝子庙原有清朝度牒（编额）喇嘛不超过50多人，但至清朝嘉庆年间，该庙实际已有喇嘛1500多人，达到鼎盛时期。1944年时，该庙仍有喇嘛800余人。第二次国共内战时期，贝子庙是中共锡察巴乌工委所在地。中国共