别行政区法律管辖该口岸所设港方口岸区，在深圳实行香港法律，属于香港范围。2018年9月成立的西九龙站内地口岸区，在香港境内实行中国内地法律。另外，2017年1月3日，香港及深圳两地官员签署《关于港深推进落马洲河套地区共同发展的合作备忘录》，正式确认河套区为香港属地，在该地发展港深创新及科技园，佔地87公顷，是整个香港科学园的四倍。尽管河套区已经纳入香港范围内，但中国及世界各国的电子地图服务普遍未对此修正，仍视河套区为深圳的属地；而且其归属于的行政区划则未有决定。18个分区分别为：Section