授予中华民国护照持有者免签证或落地签证的国家及地区可能会限制部分人士的免签证或落地签证资格，其判定原则在于护照上是否有国民身分证统一编号。由于无户籍国民没有国民身分证，因此他们的护照不能获得部分国家的免签证资格，如澳大利亚、加拿大、纽西兰、日本、申根区、英国以及美国。2010年，时任外交部政务次长沈吕巡表示，在与澳大利亚协商免签证措施期间，曾提出将无户籍国民也纳入免签证范围中，但澳大利亚方认为这类人士缺乏返回原居地的条件而拒绝这项请求。同样地，美国只授予印有身分证统一编号的中华民国护照持有者免签证；没有身分