5年10月，任共青团贵州省委书记，开始了从政之路。值得注意的是，时任中共贵州省委书记的正是胡锦涛。1990年，任共青团中央统战部副部长（正局级）、全国青联副秘书长。1991年，离开共青团系统，出任中共中央统战部民族宗教局局长。1995年5月，任国务院宗教事务局局长。1998年3月，国务院决定，将“国务院宗教事务局”更名为“国家宗教事务局”，叶小文继续担任局长职务。此外，他还当选第九、十、十一届全国政协常务委员；曾兼任全国哲学社会科学规划领导小组社会学学科组成员，中国宗教学会顾问，中国社会学会、中国人权研