2009年开始对外公告招标。但招标过程十分不顺，多次开标因无任何厂商投标或得标厂商报价过高而宣告流标、废标。经过台铁多次修改招标规范及提高底标价码，之后也因应物料上涨及求能招标顺利，将数量减为296辆。后来在2011年1月第10次招标时，由唯一投标厂商台湾车辆以合约总价值达新台币154亿3千9百万元的价码得标。2012年6月30日台铁派赴前往日本车辆制造监造EMU800型2列原装车组装进度的相关人员回报，轫机系统相关组件未使用合约中载明应使用的德国克诺尔制轫（Knorr-Bremse）制品，而是使用使用