995-96赛季起，它改称为现名，而州级联赛此后仅担任协会联赛的下级赛事。自成立以来，联赛的规模主要维持在16支参赛球队，偶尔也会受到升级或降级名额的影响而转向17支球队。梅克伦堡-前波美拉尼亚协会联赛是东北高级联赛北区的输送联赛，它与柏林联赛、勃兰登堡联赛一样，冠军可获直接升级。因此，它最初位居德国足球联赛系统的第四级。随着东北地区联赛在1994年作为联赛系统的第三级面世，协会联赛下滑至第五级。2008年，当德丙联赛成立时，协会联赛再降一个级别。然而，联赛作为东北高级联赛的输送联赛状态却并没有发生变化