于山下的闽中协会（美部会）总部，担任闽中协会总干事及美国母会公理会的联络秘书。不久后中共占领福建，开始驱逐当地的传教士。但是麻安德坚持留在新中国，试图与新政权合作，继续推进教会工作。但这一切由于他的美国人身份而举步维艰，直到1950年他在福建圣公会会督张光旭的劝告下方决定离开。在离开中国前，麻安德妥善交接了教会管理事宜，将一笔母会的资金留给了中国教会（黄金183两，及美钞、银蕃、港币等折合人民币6万多元，按闽中协会当时的全盘预算可用两年），并将一些无法带走的档案、函件、字据等文件悉数焚毁。在整理美部会档案时