有尿苷、苹果酸、苯甲酰基衍生物、硫代葡萄糖苷、金莲葡糖硫苷，和m-甲氧基苄基芥子油苷。马卡块茎的甲醇提取物也含有(1R,3S)-1-甲基四氢-3-羧酸-咔啉，据称是一种对人中枢神经系统有作用的物质。在玛卡中还发现有许多炔烃类物质。另外，玛卡还含有硒和镁，与多糖。
对健康的影响.玛卡是人畜都可食用的一种食物，，但是玛卡确实含有硫代葡萄糖苷，这种物质在大量摄入后，会与食物中的碘发生反应，造成人患上甲状腺肿大的问题。但同时颜色较深的玛卡根部，比如红色、紫色、黑色的，本身也含有许多的碘