文就任中华民国总统后，吴宏谋升任行政院公共工程委员会主委兼政务委员。2017年11月23日，吴转任台湾港务公司董事长。2018年7月16日，吴再转任交通部部长。2018年10月21日，交通部部长吴宏谋因普悠玛列车出轨事故提出口头请辞，但被行政院院长赖清德慰留。2018年12月1日，吴再度提出口头请辞，随后请辞获准。2019年6月28日，接任中华邮政董事长。