梨山溪谷的温带气候，在短短数公里内因地势拔高而演变至寒带，因此林相多变，连带的也有多种野生动物栖息在此地，包括台湾黑熊、山羌、金翼白眉、帝雉、樱花钩吻鲑等台湾特有种生物。在植物方面，雪山主峰基部以杉树与阔叶树混生林为主要林相，海拔高度提升后，转为以铁杉、冷杉、玉山圆柏等多种针叶树为主；在峰顶附近，则只有玉山圆柏、玉山杜鹃、玉山小檗等植物能够生长。雪山主峰东侧有一全台海拔最高的冷杉纯林，俗称黑森林；在主峰西坡之下、翠池附近则有一处玉山圆柏纯林，此区的因处于背风处，玉山圆柏生长得特别高大，型态有别于台湾其他