和持有交情，及后陈蒨担任吴兴太守，任用他为郡丞，兼掌管文书，自此他跟随陈蒨。陈蒨攻克张彪，镇守会稽，又下令庾持监督临海郡，他贪婪放纵失去民心，被山贼洗劫囚禁十个月，陈蒨派刘澄讨平才获释。陈霸先受禅建立南陈，庾持获授安东将军、临川王陈蒨的王府谘议参军，天嘉初年转迁为尚书左丞，因为防御预长城的功勋封为崇德县子，食邑三百户。受封当日，他宴请令史收受馈赠，陈文帝因而生气免爵。不久庾持为宣惠将军、始兴王陈伯茂的王府谘议参军，担任临安县令，因打死县民免任。其后再给他出任给事黄门侍郎、稜威将军、盐官县令。光大元年（5