第二次冲击是指2000年9月13日（漫画版是2000年8月15日），在南极进行的针对亚当的接触实验（活捉亚当）所引起的一系列灾难。被唤醒并且受伤的亚当释放出强大的反AT力场，进而引发大爆炸。爆炸导致整个南极冰帽的融化之际也改变了地球的"倾角"。严重的洪水和海啸紧随而来，南半球的20亿居民当场遇难。爆炸发生后两天，为了争夺紧缺的食物和资源，印度和巴基斯坦之间展开了战争。争端很快弥漫到了全球而引发世界大战。直到2001年2月14日，情人节条约（The Valentine Treaty）签订后，战争才逐渐