二楼（但检票口位于一楼），至于信浓铁道与上田电铁的部分，检票口皆位于二楼的桥上站屋内，但月台与铁路线则分别设置于二楼（上田电铁别所线）与一楼（信浓铁道线）处。
车站结构.
JR东日本.对向式月台2面2线的高架车站。。是北陆新干线轻井泽至长野段唯一的高架车站。由于不设待避线，因此设有月台闸门。起初计划为岛式2面4线，但根据通车后的需求预测轻井泽与长野之间不需要待避设备，成为现时对向式月台2面2线。
信浓铁道.对向式月台（下行本线）与岛式