主教期间还成立了澳门公教婚姻辅导会（即今澳门美满家庭协进会），并被选为该会主席至2003年荣休。
真除主教.教宗若望保禄二世于1987年6月27日任命林家骏为天主教澳门教区助理主教；同年9月8日晋牧。1988年10月6日，高秉常主教获准卸除主教职务，林家骏同日真除为天主教澳门教区第22任正权主教，成为天主教澳门教区成立以来首位华人主教；同年被委任为澳门基本法起草委员会委员。1989年起担任罗马宗座乌尔庞大学附属学院的香港圣神修院神哲学院校董。林家骏出任主教期间除在澳门六个堂区外