高层次的结构。最基本的形状为一个10纳米的纤维或一连串的珠子。这涉及将在每一个核小体之间约50对的DNA硷基对围在这些核小体上，这些DNA又称为连接DNA。较高层次的结构包括有30及100纳米的纤维，是在一般细胞内的结构。在减数分裂中，透过核小体与其他蛋白质的相互作用，合成染色体。合成的组织蛋白与DNA称为染色质。核心组织蛋白是高度保守的蛋白质，意即组织蛋白在氨基酸序列中有着非常小的改变。连接组织蛋白通常有着多于一种的形状，对比核心组织蛋白是保守程度较低的。在主要的组织蛋白类别中，亦存在一些异构体。