2000年1月开工，5月底开通运营。1998年8月，邯济铁路山东段建设指挥部和聊城地方铁路局撤销。1999年7月1日，邯济铁路开办临管分流运输，运输组织作业委托济南局济南分局管理。2000年4月19日，开始临管运输。2002年11月，国家计委委托的铁道部、山东省与河北省有关部门同意对铁路正式验收。
改造.邯济铁路自通车以来一直是单线内燃动力铁路。2010年10月，邯济铁路开始增建二线和电气化的扩能改造工程。初设批复总投资69.77亿元。项目资本金占总投资的50%，其余靠银行贷款