该陨坑西侧和西北分别靠近卡本托陨石坑和卡利尼陨石坑、东侧和东南毗邻桑普森陨石坑及梯摩恰里斯陨石坑，更大朗伯陨石坑则横亘在它的南面。麦克唐纳陨石坑四周还分布着一系列的皱岭，西南是齐克尔山嵴和拉西尔山、东面为葛利普山嵴、东南和南面分别延伸着赫加齐山嵴和施蒂勒山嵴。该陨坑中心月面坐标为，直径6.97公里，深约1.17公里。麦克唐纳陨石坑外观呈圆杯状，几乎未受到撞击侵蚀，坑壁最大高出周边地形260米，内部容积约13.54公里，陨坑形态特征隶属于"ALC 型"(以该类陨石坑的典型代表—卫星坑"阿尔巴塔尼环形山