大教堂于1919年被关闭，于1924年改为博物馆。它目前仍然是正式的博物馆，但是自2000年起已经恢复了宗教仪式。 大教堂内保存了从彼得大帝到尼古拉二世的几乎所有的俄罗斯沙皇和皇后的遗骸，尼古拉二世一家于1998年7月安葬于此。（只有彼得二世和伊凡六世没有埋葬在这里，彼得二世安葬在克林姆林宫的天使长米迦勒大教堂）。 2006年9月28日，亚历山大三世的皇后，末代沙皇尼古拉二世的母亲玛丽亚·费奥多萝芙娜，在去世78年以后，从丹麦罗斯基勒大教堂迁葬彼得保罗大教堂。该堂在1859年以前是该市的主教