戒备后北条氏残党，率领铁砲队驻扎在甲州街道（国府道）与鎌仓街道的交会处（现在的新宿二丁目附近）。因其功劳获得认可，清成拜领附近一带的土地，建立（现在的新宿御苑，上屋敷在神田小川町，下屋敷在下涩谷）。此外，清成率领的铁砲队在1602年（庆长7年）作为伊贺组铁砲百人组配置到大久保，是当地地名百人町的由来。
「新宿」的诞生.江户时代，甲州街道是江户与甲府之间的主要街道，但第一个宿场高井户距离遥远，造成旅人不便。1625年（寛永2年），在民众的请愿之下，幕府在门前建设町屋，称为内藤宿。