等人倒台之后，旧国会被解散，杨永泰与政学系的一帮人都陷入了历史的低谷。杨永泰寄居上海，过上了“寓公”的生活。1925年任善后会议财政委员会副委员长。
南京国民政府.1927年任南京国民政府军委会参议，为政学系首领之一。1928的黄郛因办理济案身心交瘁，萌生退意，在即将隐退时对蒋介石说：“海内有奇才杨畅卿先生，胸罗经纶，足以佐治，凡吾所能者，畅卿无不能，畅卿所能者，有时吾还不及，国家大计，望公商之。”针对1929年初中国的四大强藩的不同特点，杨永泰又提出了新的整体解决方案：以军事手段