马在畿内展开拉锯战，一度收复了大片三好家旧领。1571年松永久秀与三好三人众和解，共同进攻织田家的附属势力。1573年，武田晴信上洛的威胁解除，织田信长进攻足利义昭及支持将军的三好氏。岩成友通在山城国淀城与织田家臣细川藤孝的战斗中战死（淀城之战）。三好政康开高屋城向织田信长投降。三好长逸则去向不明。之后三好三人众不再见于记载。
民间传说.在日本的一些民间故事和文艺作品中，三好政康后来出家为僧，法号清海，人称三好清海入道。三好政康之弟三好政胜出家后人称三好伊三入道。两人加入丰臣氏