慈航禅林寺座北朝南，占地444平方米。建筑面积263平方米。庙之四周，圈有围墙，山门在东南角，门前置石狮一对。山门内有影壁，上嵌“法轮长转”四字。寺内建筑全为砖木结构，三层大殿座落于中轴线上，头层大殿面阔三间，进深七檩，前后出廊。殿中供着弥勒佛，两侧为十八罗汉，四面墙上都绘有壁画。二层为正殿，位居全寺中央，同为三间，殿顶全为黄色琉璃瓦，昭示着御赐皇封的尊贵，是为全寺的主要建筑。此殿前廊之上，左设铜钟一口，身高两米、口阔一米；右置响鼓一面，直径一米有余。殿门两侧各自设有树一扇“清规”、“戒律”牌。步入殿内