百分之2.2，但仍较合併前收费稍低。2012年6月17日，港铁第三度按「可加可减机制」调整票价，平均加幅百分之5.4，部份车程的车费较合併前为高。2013年6月29日，港铁第四度按「可加可减机制」调整票价，平均加幅百分之2.7。同年7月8日起，港铁将免费热点服务扩展到全线车站。2012年12月21日起，负责牵引城际直通车于东铁线及广深铁路行走的东风11型柴油机车正式由韶山8型电力机车全面取代，自此所有在港铁系统内的载客列车（包括直通车）均以电力推动，实施完全电气化；在完全电气化前一天晚上10时许开出往广