行之偏袒、独尊天主教的政策引起了国内佛教徒的不满。1963年南越佛教徒和政府之间的矛盾引起一连串事件，爆发佛教徒危机。1963年5月8日发生顺化佛诞枪击案；6月3日发生顺化化学攻击；6月11日释广德于西贡街头公开自焚；8月21日吴廷瑈又指挥特种部队查抄西贡舍利寺。吴廷琰政府在剿共作战的失败以及宗教政策的错误，导致南越军政界及美国肯尼迪政府失去了对吴廷琰的信心。1963年8月24日，美国国务院向美国驻南越大使馆发送的243号电报表明了美国对吴廷琰的失望，称将“另立新的南越领袖”。11月2日早晨，杨文明将军