高校的学生在译学馆后院礼堂举行大会，商量对策并组建学生联合团体。此次大会及其后的学生联合组织均由段锡朋任主席。时任北京大学学生会主席的段锡朋和傅斯年等被推为天安门大会主席与游行总指挥。1919年5月4日，在段锡朋和傅斯年等人的组织下，五四运动爆发。五四运动之后，段锡朋历任北大学生干事会总务股主任、北京中等以上学校学生联合会会长。6月3日，北京学生遭北洋政府逮捕，引起上海等地的支援爱国学生运动，故6月起五四运动的中心转到了上海。6月16日，中国各省学生代表在上海大东旅社开会，成立中华民国学生联合会，段锡朋