车站，全部车站均设在地底，大剧院站及世界之窗站为与1号线的换乘站，福田站为与3号线和11号线的换乘站，市民中心站为与4号线的换乘站，赤湾站及黄贝岭站为与5号线的换乘站，华强北站及安托山站为与7号线的换乘站，景田站为与9号线的换乘站，后海站为与11号线的换乘站。而莲塘站则是2号线与8号线的“分界”站。值得一提的是，2号线是深圳地铁网络中第一条全线在地底行走暨全线位于原深圳经济特区一线关范围内的地铁线路，其余是7号线和9号线。（註：7号线未启用的文体公园站为地面车站，而连接文体公园站及深云站／安托山站的部分