92年至1993年间，赴柬埔寨参与联合国的维和工作。自柬埔寨回国后，傅莹继续在亚洲司工作，先后担任综合处处长、亚洲司参赞，主管综合调研、东盟事务以及亚太安全等方面的工作。1997年，调任中国驻印度尼西亚使馆，任首席馆员。1998年11月，江泽民颁布主席令，任命傅莹为中国驻菲律宾第八任大使。这使她成为中国第一位少数民族女大使，也是当时中国最年轻的女大使。一年后，傅莹升任外交部亚洲司司长，是该司成立以来的第二位女司长。2004年，她再次出使，任中国驻澳大利亚第十任大使；三年任期结束后，又改任中国驻英国大使。