在上新世时期，莱茵河已经靠着河流袭夺达到孚日山脉，包括摩泽尔河、美因河与内卡河都成为它的支流。阿尔卑斯山北部则是隆河的流域。莱茵河在更新世早期时，已经将现在大部分阿尔卑斯山原本流入隆河的河川纳入流域之中，包括阿勒河在内。从这个时候开始，莱茵河流域扩展到博登湖上游，而美因河的上游（施韦因富特之后）与孚日山脉（马士河）也已经成为莱茵河流域的一部份。
冰河时期.更新世是冰河期交错的时代，大约6个主要的冰河期在600,000年前开始。当时海平面下降120公尺，大陆大部分的边缘地区于是暴露出