林起元，是中国清朝官员，于1684年上任台湾府经历，隶属于台湾道台湾府，为台湾清治时期的地方官员，官职品等则为正七品以下，该官职主要从事台湾府府内典簿奏章的收发与校注，也分掌章奏文书。