有德造反，孔的旧交耿仲明也跟进。崇祯六年（1633年）孔、耿力量不支，只好投降皇太极。因孔部掌握了当时先进的火砲技术，使得满人的军备大兴。
背景.崇祯三年（1630年）一月，孙元化随孙承宗镇守山海关，三月加山东按察副使，五月升登莱巡抚。后袁崇焕杀毛文龙，于皮岛的毛文龙旧将哗变，孙元化接收了皮岛的叛将孔有德、耿仲明、李九成、李应元诸将。孔有德被任命为骑兵参将，耿仲明则被派往登州要塞。崇祯四年（1631年）八月，皇太极率清兵攻大凌河城（今辽宁锦县），祖大寿受困城内。崇祯四年八月二十