007年，由Lucas E. Fiorelli与Jorge O. Calvo叙述、命名。内乌肯鳄是种小型、修长动物，是南美洲第一个发现的原鳄亚目。内乌肯鳄的胫骨长于股骨，与大部分鳄形类不同，显示牠们善于奔跑。
叙述.内乌肯鳄的正模标本是个天然状态的颅后部份骨骼，包含：6节颈椎、4节背椎、2节荐椎、5节尾椎、肋骨、部分右肩带与前臂、左肩带与肱骨、部分骨盆、脚部以上的右大腿大部分。另一个标本包含部份左脚，已建立为新属。内乌肯鳄的颈部修长，四肢也修长。牠们是种小型动物，模式标本的肱骨