土地统治权的本所（寺社、公家）与武家等也以公方的名义自居。1283年，镰仓幕府的将军为了与执权北条氏的得宗家、御内人、御内御领势力对抗，皇族将军被称为「公方」，御家人被称为「公方人人」，关东御领被称作「公方御领」。到了南北朝时代，创立室町幕府的足利尊氏接受了朝廷授予的「公方」称号。这件事在伊势贞丈的《贞丈杂记》中有记载。伊势贞丈是江户时代的旗本，为室町幕府政所执事伊势氏的末裔。此后的足利将军也延续使用了「公方」的称号。到了第三代足利义满时，「公方」成为对将军的敬称。而幕府亦在全国各地设有若干个管领，