1950年间，曾历任淮北行政公署建设处水利科科长，苏皖边区政府水利局工程科科长，华东军区兵站部交通科副科长、前方工程处处长，山东省黄河河务局副局长、党委书记等职务。1950年3月，年仅27岁的钱正英，经中央人民政府内政部部长曾山的推荐，被破格提升为华东军政委员会水利部副部长兼治淮委员会工程部副部长，成为中国最年轻的女部长；1952年，转任中央人民政府水利部副部长，后又兼任水利部党组副书记。1967年至1970年，钱正英在“文化大革命”中受冲击；1970年恢复工作后，继续但任水利电力部副部长、水利电力部革委会