天主教并无恶乱之处，相应将天主教仍令伊等照旧供奉。」康熙初年，成为传教士在中国的蜜月期。1689年，清朝与俄罗斯帝国准备划订疆界，商议尼布楚条约，精于拉丁文的传教士负责代表中方与俄国人沟通，这条条约最终以拉丁文签订。南怀仁等亦协助清廷铸造火炮，平定三藩之乱。他们准确预测日食，使皇帝可以为相关祭奠做好准备；一些耶稣会传教士则成为宫廷画家。1692年（康熙三十一年），康熙下达一道容教令，标志着传教士的势力攀上高峰：康熙年间，新来中国的道明会及方济会教士反对明末以来耶稣会教士容许中国教徒祭天、敬孔、祀