和伊拉克.炭疽攻击发生后白宫官员立即重复对联邦调查局局长罗伯特·穆勒施加压力，要他证实这是基地组织的第二波攻击。据一前助手说在总统每日造成的情报报告中穆勒一再被“谴责”没有能够证明杀人孢子是恐怖主义后台乌萨玛·本·拉登的产物。“他们的确像要把罪过归罪于中东的人，”这名退休高级联邦调查局官员说。联邦调查局从早期就已经知道被使用的炭疽是武器化的，它们的制造需要复杂的仪器，不太可能会是在“山洞”里生产的。同时布什总统和切尼副总统公开猜想基地组织与炭疽攻击之间有联系。《卫报》于10月初报道美国科学家怀疑伊拉克是炭