区旁的福田口岸。该口岸在2007年8月15日启用，地铁乘客可通过口岸检查，在香港境内的落马洲站转乘港铁东铁线或其它交通工具前往香港各区。皇岗站启用的同时，4号线亦增至以两组列车行驶，行车间隔由原来的17分钟一班，缩短至约每10分钟一班。为免与皇岗口岸混淆，2008年8月15日，皇岗站改名为福田口岸站， 变更期间皇岗站与福田口岸站称谓共存，最后完全过渡为新站名。
转交港铁营运.深圳地铁4号线已经于2010年7月1日交由香港铁路有限公司（简称港铁公司，其前身为香港地下铁路公司