富汗和伊拉克等的沙漠地区顺利运作。2014年12月，贝瑞塔公开了最新改进型M9A3以希望向美军提供一个节省成本的方案以取代他们的旧版M9手枪。其改进之处包括：改用了较薄的手枪握把，并新增了一个可拆卸的环绕式模组化握把、皮卡汀尼导轨、可拆卸式氚光前后照准器、一根延长并刻有螺纹的枪管以方便装上抑制器，弹匣容量增至17发，以及全枪改为泥色涂装等。然而，美军已决定不採用该改型，他们认为M9已无法再满足军队的要求，继续採用的话只会增加替换新枪和维修成本。为此贝瑞塔强调M9A3已修正了旧型号的缺陷，而且售价亦比它们