宗教中立原则上要求在学校同时教授演化论和智能设计论，声称仅仅教演化论是对创造论信仰的歧视。教授两种理论，容忍宗教信仰的可能性，不会让政府真的提倡这种信仰。许多智能设计假说支持者认为，科学主义本身就是一种宗教信仰—在公衆生活中提倡世俗主义和唯物主义而侵蚀有神论(主要是侵蚀到反科学的一神论，多神论没有一神论那样极端的教义也没有那样严重的教条主义所以比较能接受科学观点)，他们提倡智能设计的行动可以看成是在教育和公共生活中让宗教的中心单位回归。某些人认为这个大辩论的言外之意已经超出智能设计假说本身，也有人把智能设计