徒刑一年定谳。马英九无罪却判余文有罪的判决，遭到绿营民众的质疑。但在2007年时任台南市长许添财与副市长许阳明特别费案，之后检查官给予许添财予不起诉处分，而副市长许阳明则遭检查官依贪渎罪起诉而曾担任桃园县长及宜兰县长的吕秀莲和游钖堃以及曾担任外交部长的陈唐山也因特别费遭起诉，之后许阳明案成为台湾绿营第一位受到特别费起诉且第一位判决无罪定谳的政治人物，而后续绿营尚有副总统及多位部长受起诉尚在审理中，但最后以立法院通过特别费除罪化而结束问题；但绿营人士在各方媒体上，已将余文已经成为他们口中「代罪羔羊」及「顶罪」