伊邪那岐板块在中生代之前已经存在。在侏罗纪时，它与古太平洋板块、法拉龙板块和菲尼克斯板块彼此远离，共同做放射性运动。伊邪那岐板块向西北方向运移，与欧亚板块发生俯冲，从而使中国大陆地区发生了燕山运动。这一俯冲作用还使日本中央构造线以西的地区（大致相当于“日本海侧”地区）向北移动，在其东部边缘形成三波川变质带，在其西部边缘则形成阿武隈变质带，二者构成双变质带。进入白垩纪，伊邪那岐板块与欧亚板块的俯冲作用减弱，转为以彼此走滑为主，但与北美洲板块的俯冲作用则加强，并在约95Ma的时候完全消减于北美洲板块的西北部