成立“中华民国知识界反台独大联合”，邵为主要发起人之一。1991年12月，当选第二届台北市第三选区国民大会代表。后出任国民党国大党团副书记长，1993年8月，当选国民党第十四届中央委员。，2000年曾出任亲民党助理主席兼首席政策总顾问，专门为党主席宋楚瑜在两岸政策上献策，而亲民党的党章也是出自邵教授之手，并意图角逐2001年台北市南区立法委员席次，但在党内提名机制被刷掉，故此愤而离开亲民党，并重返中国国民党。致力于两岸文化交流，任台湾两岸关系发展协会理事长。2000年9月，受聘北京大学国际关系学院客