阴道内主要的细菌是乳桿菌属<ref name="doi10.1128/JCM.40.8.2746-2749.2002"></ref>（例如），普遍认为这种细菌分泌的乳酸可以避免致病原的感染。
乳桿菌.健康女性阴道内主要的细菌是乳桿菌属的细菌，自从窦特兰首次提到阴道中的乳桿菌起，一般都认为乳桿菌有助于维持阴道内的生态系统。已证实乳桿菌可以抑制致病微生物的生长，例如、大肠桿菌、、动弯杆菌（"Mobiluncus"）属、淋球菌、厌氧消化链球菌（"Peptostreptococcus an