和中日甲午战争，战后代表日本与清朝代表直隶总督兼北洋通商大臣李鸿章等人签订《马关条约》，将台湾和澎湖纳入日本版图。1898年，清廷戊戌变法时前往北京访问，面见光绪皇帝和康有为，提供改革方针。慈禧太后发动戊戌政变，大肆逮捕维新党，博文遂参与救援被捕的黄遵宪，并协助康有为和梁启超逃往日本。1900年，领导日本加入八国联军之役。创立立宪政友会，自任总裁，开日本两党政治的先河。
韩国统监与遇刺.1905年，日本在日俄战争中的日本海海战（对马海峡海战）获胜后，伊藤博文被任命为第一任韩