南区新设立的台南科技工业园区、近郊台南县新市乡新设立的南部科学园区等重大开发，经济情况好转，为台湾屈指可数之人口增加及实住人口多于户籍人口之县市。同时与台北市并列为失业率最低之县市。
直辖市时期.2009年6月29日，中华民国行政院审议通过「台南县市合併改制直辖市」案，并于2010年12月25日改制为直辖市。2015年夏，台南爆发登革热流行，超过两万名确诊病例，其中以北区、中西区、南区、永康等地最为严重。