代表大会，起草发言《建军新阶段政治工作的若干问题》，制定解放军在新阶段的发展方向并总结问题，随后被中央军委印发全军。此后，谭政当选为中共中央书记处书记。12月，任中国人民解放军总政治部主任。1959年，庐山会议上，谭政反对继续整彭德怀、黄克诚、张闻天和周小舟等人。1959年9月，任中央军委常委，兼任中共中央监委副书记、第二届国防委员会委员。谭政在突出政治的问题上屡次和林彪的提议发生抵触，这也导致林彪的嫉恨。1960年10月，谭政被林彪诬陷“反对毛泽东思想”、“在总政结成反党宗派集团”等罪名，并受到撤职、