个站车程更要在油塘站及鲗鱼涌站转车，而将军澳线班次受制于宝琳站单月台设计而较观塘线少，所以在油塘站转车较之前多花约4分钟，这不便使部份观塘线乘客(石硖尾站至彩虹站)重投旺角站及金钟站转车前往港岛，使荃湾线太子站至金钟站路段及旺角站及金钟站人流上升，亦令东涌线分流荃湾线及金钟站乘客量作用减少。
Y形路线导致的班次问题.港铁在将军澳南小赤沙设置康城站，把将军澳线设计成Y形姿态，以现在2班往宝琳列车+后1班往康城列车制度服务，分薄来往宝琳班次，加上单月台宝琳站设计问题，导致来往西贡各地区