多数的伤亡者为平民，其中有87个不同国家的公民。另外根据验尸官确认，至少有1人因暴露于世贸中心倒塌时的烟尘中引发唿吸系统疾病死亡。作为对这次袭击的回应，美国发动反恐战争入侵阿富汗以消灭藏匿基地组织恐怖分子的塔利班，并通过《美国爱国者法案》；其他国家也加强反恐立法，并扩大执法权。美国一些证券交易所在袭击发生后的当週内都处于关闭状态，股市在重新开始股票交易后曾经急挫，尤其是航空和保险相关类别的股票。价值数十亿美元的办公场所在这次袭击中被摧毁，连同损失的技术人才的生命与家庭社会负担，为曼哈顿下城经济乃至于美国经济