有华佗庙，或配祀华佗像，道教尊为「青囊济世华真人」、「神功妙手华真人」，信众尊称华佗仙师、华佗仙翁、「华佗神医」等。台湾有许多庙宇奉祀华佗，如台北市艋舺龙山寺、高雄市新庄仔天公庙等。安徽亳州永安街中段路北建有华祖庵，1962年增设「华佗纪念馆」，由郭沫若题写馆名。1980年经维修，次年（1981）正式列为省级重点文物保护单位。该纪念馆介绍华佗一生事迹，并特别展示了华佗施行外科手术之工具及过程资料。