从二级开始就要求应试人员掌握编程技术，但是这和全国计算机技术与软件专业技术资格（水平）考试、国家信息化工程师认证考试等考试的内容重叠。而实际上，参与考试的主要是非计算机专业人员。另外，计算机等级考试的考题更新缓慢。在2002年下半年，DOS才被取消，QBASIC和FOXBASE在2005年仍列入考试内容。
COVID-19疫情期间.由于受到COVID-19疫情波及影响，原定于六月份在重庆市举行的计算机等级考试被迫取消，改为与9月份的计算机等级考试合并考试。目前9月份的计算机等级考试已