称巴东郡，并分置2县为巴东属国（后来的涪陵郡）。建安末，又从巴西郡分置宕渠郡，原来的巴郡一分为五，范围大大缩小。到西晋时，郡辖只剩下4县，基本都在今天重庆市范围，仍然以江州为郡治。
隋代巴郡.隋朝巴郡辖3县，治所江州改名为巴县。唐朝以后废除郡置，改为渝州，巴郡的名称不再使用。
名称.巴郡常与巴东郡、巴西郡等合称“巴”、“三巴”等。巴郡也与蜀郡合称“巴蜀”，至今仍是对四川、重庆地区的别称。