的河田末吉接手。
京都帝国大学时期.荒胜文策于1936年（昭和11年）11月转任京都帝国大学教授，接任石野又吉的物理学第四讲座，并继续进行其核子物理研究。他也在京大建造了考克饶夫－瓦耳顿型加速器，该加速器可将粒子加速至约50万电子伏特的能量。除了利用加速器进行实验，荒胜文策也曾与木村和植村一同利用宇宙射线进行高能物理研究，并将其实验结果发表至1937年8月的《自然》杂志上。另外，他也开设了实验原子核物理学与量子力学等课程，甚至连尔后于1949年成为日本首位诺贝尔物理学奖得主的汤川秀