公司在日本还设有漫画出版部门Gangan Comics，其继承自艾尼克斯，并仅在日本市场发行作品。然而2010年，史克威尔艾尼克斯通过会员服务，为北美用户开启数码漫画商店，其在Gangan选集中收录数个知名连载。Gangan Comics出版的作品有：《黑神》、《无头骑士异闻录 DuRaRaRa!!》、《南国少年奇小邪》、《热带雨林的爆笑生活》、《不可思议的教室》、《推理之绊》、《我的主人爱作怪》、《梦喰见闻》、《Doubt》、《Bamboo Blade》、《Heroman》、《潘朵拉之心》、《黑执事》、《