用音波振动所产生机械性压缩与膨胀的波穿过生物组织时，所产生热效应及非热效应，达到治疗的效果。而在物理治疗中，治疗用超音波可以用热效应增加深层富含胶原蛋白的组织(如肌腱与靭带)温度，因而增加组织的伸展性或者减轻疼痛；其非热效应可以改变细胞的通透性，因而消除水肿、促进组织癒合、或帮助药物传递进入皮下组织。