主进步党在台中市提名洪奇昌、刘文庆、陈阳德与纪万生参选，林俊义唿吁台中市的选民支持洪奇昌与刘文庆，结果洪奇昌与刘文庆均当选；纪万生认为林俊义「公然残杀自己同志」，扬言控告林俊义。2003年10月22日，因肾结石住院的民主进步党秘书长张俊雄由副秘书长李应元代发声明恳请党内同志「回首来时路，要能够沉得住气」，其中提到，当年他以辩护律师身分去探视美丽岛事件被告，他见到纪万生满身伤痕、面容枯藁、被折磨得不成人形，因此他决定不把自白书拿给当事人看，因为那样的自白书是人性的摧残、是历史的伪造。2004年10月2