儁被逮捕，并被流放到黄海道铁岛。一个月后在闵泳焕的周旋下被释放。1905年5月，他又组建了宪政研究会，在政治改革的名义下从事抗日救亡运动。1905年11月17日，日本强迫韩国政府签订了《日韩保护协约》，剥夺了大韩帝国的外交权，将韩国变为日本事实上的殖民地。李儁等爱国志士奔走唿号，企图挽回国家主权。他开始投身教育事业，参加了爱国文化启蒙运动，1906年，他组织了国民教育会，建立了普光学校，采取教育救国的方针。1907年又积极响应国债报偿运动，在汉城建立了国债报偿联合会议所。李儁还在当年4月加入了安昌浩等人