保税仓库为经海关核准登记供存储保税货物之仓库。包括普通、专用、发货中心等三种。依据「保税仓库设立及管理办法」第5条第2项规定：「保税仓库须建筑坚固，经主管机关核定得作为仓库使用，并视其存仓货物之性质，具有防盗、防火、防水、通风、照明或其他确保存仓货物安全与便利海关管理之设备及适当之工作场所。」近年来,因应跨境电商交易模式兴起，境内关外保税仓等概念也逐渐普及，台湾平潭海外仓即为一例。
普通保税仓库.仅供存储一般保税货物。
专用保税仓库.专供存储经营国