过渡区、和日冕的温度都比太阳表面高，原因还没有获得证实，但证据指向阿尔文波可能携带了足够的能量将日冕加热。
温度极小区.太阳上温度最低的地区称为温度极小区，大约在光球上方，温度大约是。这一部分的温度低到可以维持简单的分子，像是一氧化碳和水，并且可以从检出它们的吸收谱线。
色球.在温度极小区之上是一层大约厚，主导着谱线的吸收和发射。因为在日全食的开始和结束时可以看见彩色的闪光，因此称为"色球"，名字来自希腊的字根"chroma"，意思就是颜色。色球层的温度随