脑皮质。蓝斑产生的去甲肾上腺素对脑的大多部位具有兴奋性作用，从而加强觉醒状态，并预备脑的神经元对未来刺激的响应。据某些估计，蓝斑内的单个神经元可以通过其巨大的轴突分支激活几乎整个大脑皮质。蓝斑接受下丘脑的传入。下丘脑是机体内稳态的控制中心。扣带回和杏仁核也向蓝斑投射，从而使得某些情感刺激能够激活蓝斑的神经元。此外，小脑和中缝核也对蓝斑投射。蓝斑还接受来自以下这些脑区的输入有：（1）前额叶内侧，该输入为兴奋性，长期性的，并随着脑和机体活动程度的增加而增强；（2）旁巨细胞核（Nucleus paragiga