该馆东侧建了一座550平方米的书库，藏书最多可达20万册。包兆龙图书馆建成后不再作为图书馆使用，但作为校史遗迹，建筑上方仍保留“图书馆”字样。该建筑现作为上海交通大学档案馆和上海交通大学校史博物馆使用。农学院图书馆，为原上海农学院图书馆，位于上海交通大学七宝校区，创建于1978年10月上海农学院复校时。到1996年底，该馆藏书共计22.86万册，其中中外文图书7.6万种，并有中外文现刊1,129种，音像资料333种，阅览座位220个，建筑面积约3,000平方米，馆舍面积为2,045平方米。1999年上海