郛成为北京政府参加华盛顿会议代表团的顾问，重归政界。翌年2月，就任张绍曾内阁的署理外交总长。其后，在高凌霨摄政内阁、高凌霨临时内阁、颜惠庆内阁任教育总长。1924年（民国13年）10月，策划冯玉祥、胡景翼等人发动甲子兵变（又称北京政变、首都革命），使直系失势。黄郛支持冯，任代理内阁总理，成立黄郛摄政内阁。冯玉祥部下鹿钟麟「奉摄行大总统黄郛命令」带领军队佔领紫禁城，要求溥仪取消大清皇帝尊号，并命令溥仪在两天内收拾行囊，离开紫禁城；否则就用大炮把紫禁城夷为平地。溥仪被迫离城，并在日本人协助之下，逃至天津。