─落马洲站是一个楼高4层，佔地约9公顷的车站大楼。大堂里设有购物区、免税店等方便乘客。由于车站大楼同时为香港入境事务处的出入境检查之用，所以大楼内设有海关、出入境及其他重要的过境设施。乘客办妥出境手续后，会经由一条横跨深圳河，单臂斜拉式天桥步行至深圳的福田口岸联检大楼。乘客亦可于同时设于该联检大楼内的深圳地铁福田口岸站，换乘深圳地铁4号线前往深圳市其他地方。
文天祥纪念公园.文氏原居民认为落马洲支线途经洲头村及新田，造成「铁蛇拦路」的风水格局。村民要求该处建造一座6米高文天祥巨型雕