基地安全人员主要由底特律海军战备支援中心（，密西根州）所下辖的一个海军后备司令部提供。而在驻基地的40个美军单位中，较大的单位包括了一个P-3C巡逻机中队、一个海军电脑与通信区主控站（），以及海军医院。该医院建于1992年，在此之前，西哥奈拉基地仅有一间诊所，而最近的海军医院远在那不勒斯。西哥奈拉海军航空基地大致分为2区：I区（）及II区（）。I区是原本的美军基地，但现在仅作为一个支援设施，并附设了海军贩卖部、学校和一部份的军眷住宅区（主要供准将、海军航空基地司令官、副司令官居住），及大部份的休闲、娱乐