以防敌人进攻，然后才令人通知曹操及向他解释。曹操听了，认为于禁的做法很对，当众说：“当时敌人来攻，相当混乱，于禁能在混乱中整顿军队，追讨抢掠的恶行，安营筑寨地坚守，真是好将领的榜样啊！”并封于禁为益寿亭侯。建安三年（198年），破张绣于穰。后擒吕布于下邳。次年（199年）夏四月，与史涣、徐晃、曹仁、乐进攻破张杨旧部眭固于射犬。
夺朱灵兵权.官渡之战时，朱灵不愿出兵攻打旧主袁绍，引起了曹操的憎恶，想解除他的兵权。于是派威名显赫的于禁率数十骑兵，带着敕令，前往朱灵的营中夺其兵权。朱