治九年（1652年）十一月，授职靖南将军，南下广东。旋以广东立即平定而作罢。顺治十二年（1655年）八月，命令与固山额真阿尔津统领大军屯兵荆州，当时张献忠将领孙可望、李定国、白文选等投降于南明，屯兵辰州。顺治十三年（1656年）八月，卓罗与阿尔津取道澧州、常德，南下辰州，孙可望焚舟夜遁，卓罗与梅勒额真泰什哈、巴牙喇纛章京费雅思哈等率兵渡江攻打孙可望，遂攻克辰州。顺治十四年（1657年），孙可望到长沙投降，李定国、白文选等跟从南明桂王走入云南。顺治十五年（1658年），谋划攻取云南，吴三桂自四川，征南