府就两条来往屯门区及元朗区至深圳湾口岸的巴士路线和一条由天水围北开往深圳湾口岸的专线小巴路线进行招标，而城巴成功投得来往屯门区的路线。在招标时，原本计划屯门区总站为屯门码头，并绕经山景、大兴、建生及兆康，但被该区区议员指路线过份迂回，结果分拆出一条由屯门市中心不停站（2008年8月16日起加停中途站）直达深圳湾口岸的特快路线。B3及B3X线于2007年7月1日18:00配合口岸开通正式投入服务，成为城巴首两条来往出入境口岸的独营专利巴士路线，以及城巴首两条并不服务机场或大屿山的新界区独营专利非过海巴士路线。