书、门下侍郎、监修国史、判度支。三年（896年）五月，昭宗杀崔昭纬，与崔昭纬同宗的中书侍郎同平章事崔胤因而作为崔昭纬党羽被罢相。同月，钱镠败杀后来取消帝号的董昌，从而控制威胜军。七月，昭宗因李茂贞再攻京城避难镇国军军部华州。王抟等宰相畏惧镇国军节度使韩建，不敢专断政事。八月，王抟以扶危匡国致理功臣、判度支、诸道盐铁转运等使、金紫光禄大夫、兼户部尚书、门下侍郎、平章事、监修国史、上柱国、琅琊郡开国公、食邑二千户的身份被任为检校户部尚书、检校尚书左仆射、同平章事、兼越州刺史、充威胜军节度、浙江东道管内观察处