成东、西两所。西药房由院使、院判、御医、吏目分班轮值；东药房由御医、医士等轮值。御药房的轮值医官主要为皇帝熬药。御药房设有生药库，各地进贡的生药基本均存放在生药库。御药房通常还设有管理大臣（七品衔），委署主事，兼管司员、内管领、库掌等员办理具体之事。顺治十年（1653年）设立“御药房”。《钦定总管内务府现行则例·御药房》载：“顺治十年立药房，系总管首领太监管理。清字笔帖式（八员），内务府汉字书办（四名），领催（四名），听事碾药苏拉（三十名），太医院合药医生（二十名）。”伊桑阿等人于康熙二十九年（1690