营而得名，日治时期当局认为「查亩营」地名不雅，便以此地居民姓氏大宗的刘姓，取日语音译为「柳」，易名为「柳营」。1920年台湾地方改制，在此地设置「柳营庄」，划归台南州新营郡管辖，战后改设台南县柳营乡。2010年12月25日，因台南县市合併为直辖市而改称柳营区。1968年6月3日，一架C-46运输机坠落于今太康里农田，多年后当地民众立七十二圣人庙以祭祀。
行政区划.2018年1月29日因里邻调整，调整了光福里与中埕里之间的里界。经此调整后，柳营区底下仍设13里：人