2006年亚洲运动会即第十六届亚运会，又称多哈亚运会，是于2006年12月1日至15日在卡塔尔首都多哈举办的综合运动会。本奖牌榜以各参与成员国之运动员所获得的奖牌数排行。本表格的排行计算方式与国际奥林匹克委员会所公告的奖牌榜相符。依照惯例，表格以参赛国运动员所获得的总金牌数做为排行的首要依据，其次依序为为银牌数及铜牌数。如果比序至此各参赛国仍然持平，则判定为同名次，并依据国际奥委会国家编码的字母顺序排列。
奖牌榜.<onlyinclude></onlyinclude>Sect