，因直言批评大跃进和人民公社化运动，被诬陷为“彭、黄、张、周反党集团”成员而被撤销党内、军内领导职务，在家赋闲。1962年，他参加中共八届十中全会，但中途被勒令退出，此后被剥夺出席中央全会的权利。1965年，黄克诚被贬为山西省人民委员会副省长。在文化大革命期间受到迫害。1975年，黄克诚被按人民内部矛盾处理，安置在太原。1977年12月，黄克诚复出，出任中共中央军委顾问。1978年12月，十一届三中全会后，黄克诚任中国共产党中央纪律检查委员会常务书记，组织纠正了中国共产党及中国人民解放军内的冤假错案。