寛政改革时被松平定信认定为对幕府有危险的人物，因此其着书《海国兵谈》被禁止发卖和没收原版的处分，《三国通览图说》也同时被禁止发售。幕府还认定『三国通览图説』是「地理相违之图」，以此为由处罚着者林子平。但是，《三国通览图说》在之后由医师桂川甫周从长崎传到荷兰、德国，在俄罗斯翻译成欧洲各国语版。
写本.京都大学付属图书馆谷村文库所藏『三国通览图说』写本，其中有二种江户时代的「琉球三省并三十六岛之图」彩色写本，其中甲图琉球是褐色、中国和钓鱼诸岛是淡褐色、日本是青绿色、台湾、澎湖是黄色；