升为球队主力右前卫。11月2日，他打进职业生涯的首个进球，帮助广州香雪在客场6比1狂扫哈尔滨兰格。在此后几个赛季，冯俊彦一直都是广州队右前卫的绝对主力。2007年由于受到伤病影响，冯俊彦的状态一般，时任广州医药主教练的沈祥福更喜欢在右路使用杨朋锋和徐德恩，冯俊彦成为替补球员，赛季只出场13次。但在广州医药升上中超后，他被沈祥福成功地改造成一名后腰，并在该位置有出色的表现。2008年6月28日，他替补出场并在补时阶段打进自己的首个中超进球，使得广州在主场3比2绝杀青岛中能。此后冯俊彦重新占据球队的主力位置