宗即位后，补东西班都知，迁本班副点检。从征淮南，迁都虞候，转都指挥使，改前殿都指挥使。宋朝初期，出为淄州刺史，有善政，州民向朝廷请求刻石碑颂扬他的德政，宋太祖于是命殿中侍御史李穆撰文赐之。征讨湖南时，尹崇珂为行营前军马军都指挥使。平定荆湘后，授朗州团练使。干德二年(964年)九月，与潘美、丁德裕克郴州。干德中期，大宋出兵南征岭表，以尹崇珂为行营马步军副部署。克广州，擒刘鋹，即日诏与潘美同为广州知州兼市舶转运等使，录功迁保信军节度。未几，南汉开府乐范、容州都指挥使邓存忠、韶州贼帅周思琼、春恩道都指挥使