投降翌日，由华里士准将率领的赤柱守军亦确认投降消息而停火，至于杨慕琦本人于签署降书后即沦为日军战俘。日本佔领香港后，大部份原殖民地政府要员都被羁押于赤柱拘留营，而杨慕琦最初仍获日方礼待，被软禁于半岛酒店内。 日方后来将杨慕琦转到台湾拘留，除他以外，在台湾战俘营的英国俘虏还包括海崃殖民地总督珊顿·托马斯爵士等盟军阵营的殖民地官员。 不幸的是，杨慕琦在当地受尽折腾，甚至被关进竹笼，受尽日军凌虐。 到二战后期，杨慕琦再被日方转送到满州国的奉天俘虏收容所（沈阳二战盟军战俘营）羁押。当1945年8月日本投降，人们还以