年度公投案共4案，分别于2008年1月12日与立法委员选举（第3案、第4案），以及2008年3月22日与总统选举（第5案、第6案）同日同时举行。其中第3案、第5案由前民主进步党主席游钖堃领衔提出，第4案由前财政部部长王建煊领衔提出，第6案由副总统参选人萧万长领衔提出。
2018年.因《公民投票法》于2017年底在立法院通过修法，从提案人人数、连署人人数、公投通过票数、公投年龄等多方面降低了公投的门槛，而使本年度公民投票成为中华民国历史上，全国性公民投票案数最多的一次，也是首次有公投