皇子胤禛晋封为雍亲王，并充任镶白旗旗主。年羹尧之妹年氏被选为雍亲王侧福晋，因此成为胤禛亲信。同年，年被抬入汉军镶黄旗并被任命为四川巡抚。
征战西藏.康熙五十六年（1717年），准噶尔策妄阿喇布坦遣其将策凌敦多卜袭击西藏，并杀死拉藏汗。四川提督康泰率兵出黄胜关，却发生部队哗变。年羹尧遂派参将杨尽信抚谕士兵，并密奏康泰失去兵心，请求亲自赶赴松潘协理军务，并派遣都统法喇率兵赴四川助剿叛军。康熙五十七年（1718年），策妄阿拉布坦占领西藏，年羹尧上疏请求在打箭炉至理塘加设驿站，保证清军后勤