八达通车费一律为港币3.9元（仅适用于乌溪沙站至显径站）。而在钻石山站至启德站即採用市区重铁系统的收费，而启德站的收费参考邻近的彩虹站。另外，港铁提供屯马线通车八达通车资优惠，由一期通车日（2020年2月14日）至屯马线全线通车日止，在启德站及／或显径站入闸／出闸，均享有成人$1及小童$0.5优惠。
上水／乌溪沙－尖东全月通加强版.上水／乌溪沙－尖东全月通加强版使用者可以无限次乘搭东铁线上水至红磡各站普通等（罗湖、落马洲及马场站除外）、西铁线红磡站至尖东站及屯马线一期所有车站；