华民国空军的飞机前往当时仍在国军控制下的浙江定海，计划从那里乘船前往被解放军控制的上海。由于在大陆的失败已成定局，国民党为了巩固它在台湾的政权，其侦察机关在岛内加大了对共产党谍报和特工人员的侦察搜捕。1949年10月，保密局在一连串的案件中发现了中国共产党台湾工委委员陈泽民，随即将其逮捕。在审讯中，陈泽民最终招供。保密局依据其供词，于1950年1月逮捕了中国共产党台湾工委书记蔡孝干。蔡孝干是直接受命于共产党高层而负责台湾工作的台湾省籍中共老党员。一周之内蔡便向中华民国政府投诚，供出他所掌握的所有在台湾的