有东海、仁川、金山、木浦、蔚山、浦项以及济州等基地。舰队司令部设在镇海基地，管辖三大舰队，在和平时期同时为韩美联合军司令部下的「海军构成军司令部」（；，），战争时期则是「韩美联合海军构成军副司令部」（，）。
第1舰队.驻江原道东海市，负担东部海域－东海（即日本海）作战警备区的巡逻警戒和防御作战任务，在镇海、济州、新村设有前进基地，集中部署有韩国海军大部分P-3C反潜机飞机。第1舰队的责任海区地处前沿，作战任务较重。
第2舰队.驻京畿道平泽市，负责西部海域－西