北提督段祺瑞聘掌书记。辛亥革命爆发后，他曾参与段祺瑞等要求共和第一电。中华民国成立后，他历任北京政府交通部各职，1914年（民国3年）他任陆军部军需处处长、张家口盐务稽核所经理。1916年（民国5年），他任国务院秘书、京汉铁路局长。翌年7月，他随从段祺瑞讨伐张勋，任讨逆军总司令部军需处长。曽毓隽当时被视爲皖系军阀、交通系政治家。1918年（民国7年），他任参议院议员。同年10月，他任交通部次长兼鉄路总办。翌年，他任川粤汉鉄路督办。同年6月，钱能训内阁因五四运动而辞任，他继曹汝霖后任代理交通总长。同年