九月十五风暴潮所造成之强风以及巨浪而折返台湾，下午五时许，行经澎湖龙门外四海里处时，遭逢九级风势，船只疑似触礁，右舷倾斜船舱进水发出遇险讯号，船体故障失去动力，不但如此，连三台备用发电机都失效，由于海象恶劣，立即发出求救讯号。当晚9时30分，其于澎湖县湖西乡龙门外海触礁沉没。海军4舰、海巡署5舰2运输机、国搜中心2架直升机全力搜救，船上45人全部获救。送医后有2人宣告不治，另有25人受伤。死者为中央研究院研究员许世杰博士，以及海洋中心海洋调查人员林怡君。此事件除了学术上的损失以外，对台湾的军事来说也是重大损