由于推进器故障而提前被结束。斯科特和阿姆斯特朗执行了航天史上首次两艘航天器的对接，也显示了出色的在困难情况下克服问题安全返回的能力。
阿波罗9号.斯科特第二次太空任务是1969年3月担任阿波罗9号的指令舱驾驶员。阿波罗9号是阿波罗计划中的第三次载人飞行任务，也是土星5号的第二次载人发射。阿波罗9号还是登月舱的第一次载人测试。这次十天的任务对登月舱的推进系统和生命支持系统的功能、稳定性以及可靠性进行了详细的测试。在任务中，三位宇航员斯科特、詹姆斯·麦克迪维特（）和拉塞尔·施威卡特（）