魏征的案例劝他投降。卓敬不屈，但求一死，成祖亦不杀。国师姚道衍与卓敬有仇隙，便在成祖面前进谗：“敬言诚见用，上宁有今日。”成祖深以为意，因而斩卓敬并灭族。根据史学家柴德赓的考証，姚道衍根本当时不在金陵，根本不可能劝成祖杀卓敬，这是《明史》的编撰者乱抄野史的结果。抄家时“一室萧然，唯有书画数轴”，朱棣叹道：“国家养士三十年，不负其君，惟卓敬尔！”，隆庆中，私谥“忠贞”。在御史屠叔方的建议下，万历九年“褒表遗忠”，获得平反，旌表其坟墓，建祠奉祀。弘光中，谥忠毅。
关于其甲次.当