会神父克里斯多夫·费雷拉开始，他目睹了他试图将天主教信仰带到日本的皈依者所受的致命酷刑。在日本当局进行酷刑的情况下，神父似乎无能为力地以任何方式帮助他的信徒。几年后，在澳门的圣保禄学院，一名意大利耶稣会神父范礼安收到有关费雷拉被折磨后在日本放弃信仰（叛教）的消息。难以置信之下，费雷拉的葡萄牙学生、耶稣会神父赛巴斯提奥·罗德里奎兹和法兰西斯柯·卡罗培出发去找他。一名逃离日本自救的酒鬼渔民，吉治郎，同意引导他们。到了日本的友义村，神父们不安地发现当地的天主教居民被驱赶到地下活动。当一个武士寻找村民们称为