秀柱接替职务。之后洪秀柱便以中国国民党副主席身分，先后参与在2012年和2014年于中华人民共和国福建省厦门市举办的海崃论坛，她也曾传出将有机会接任监察院院长。2014年11月29日，中国国民党因内部政策、海崃两岸论述与社会现况未获选民接受，在地方公职人员选举失去大部分席次。在民主进步党取得胜利、中国国民党基层民心涣散下，中国国民党主席马英九和秘书长曾永权辞职负责，分别由第一顺位副主席吴敦义担任代理主席，及第三顺位副主席洪秀柱接任代理秘书长。期间洪秀柱负责协调中国国民党中央委员会事务，并协助明年举办主席