持批判态度。但当时，北京大学研究杂交玉米的李竞雄教授和研究植物多倍体鲍文奎教授却反对米丘林的遗传学说，支持摩尔根的遗传学说。鲍文奎的观点给卢永根留下了深刻印象，卢永根一番查验，发现苏联相关论文确实经不起推敲，也对米丘林的遗传学观点产生怀疑。1958年，反右运动中卢永根这些观点成为他的重大政治问题，被处以留党察看一年的处分，但卢永根还是坚持自己的观点，不认同米丘林的遗传学说。1961年8月，在北京担任中国农业科学院院长的丁颖需要助手，选择了卢永根担任此职。1962年8月，卢永根赴北京，成为了丁颖的科研助手