通车后的路线重组计划，称为2003年轻铁重组计划，务求把乘搭轻铁来往屯门至元朗的乘客改乘西铁，并加强区内与西铁站的接驳。原本计划的重组方案，原意是使屯门码头总站、美乐站至青云站、三圣总站、兆禧站至市中心站及杯渡站至凤地站一带的乘客，均可乘轻铁路线到屯门站再转乘西铁，及方便来往屯门、元朗及天水围的乘客到屯门站或兆康站转乘西铁。但屯门区议会则认为，重组后会令屯门东一带的乘客，连唯一直接前往市中心站、安定站、友爱站（该站更曾因邻近安定站而考虑取消）、屯门泳池站一带的614线因被永久停驶，而变成没有直接的途径该