苷于1980年被批准用于医疗用途。它也是口服抗癌药物的一个组成部分。
医疗用途.三氟胸苷滴眼液可用于治疗单纯疱疹病毒1型和2型所引起的角膜炎和，以及预防和治疗被牛痘病毒感染的眼睛。一项考科蓝的系统综述显示，三氟胸苷和阿昔洛韦比起碘苷或阿糖腺苷更有效。相比之下，在採用三氟胸苷的病人中，在14天内治愈的数目轻微增加。三氟胸苷亦是抗癌药物的组成部分。
副作用.三氟胸苷滴眼液常见的副作用包括瞬间的烧灼感，刺痛，局部刺激和眼睑的水肿。对于抗癌制剂三氟胸苷∕替吡嘧啶