旗本领先后被划入大津裁判所和大津县，其余区域在1871年实施废藩置县后改隶属彦根县、郡山县、宫川县、水口县、山上县，直到1872年的第一次府县整併后，全数区域改划入长滨县，虽然长滨县在仅三个月后更名为犬上县，但1872年年底犬上县又与滋贺县合併为现在的滋贺县。1889年日本实施町村制，现在的米原市辖区在当时分属、、、、、、、、、、共11个行政区划，其中的入江村也就是位于现在米原市主要市区的部分在1923年升格并更名为；在1950年代的昭和大合併期间，这11个行政区划被整併为位于最南部的、位于西部邻琵琶湖