专修科迁至北京组建电影学校（今北京电影学院）。另有部分院系调至其他有关大学。在香港，上海圣约翰大学董事会主席以及岭南大学的李应林将包括金陵大学在内的13所大陆地区国民政府迁台前存在的着名基督教大学，以另组崇基学院的形式承继下去，并于1963年成为香港中文大学的三所创校书院之一。
学术与教育.金陵大学先后设有文科、理科、医科、农科、林科、工科等，以英语文学、中国文化研究和农林闻名，被称为文理农“三院嵯峨”。金陵大学还开创中国电影教育，首开中国医科七年制教育和博士教育。从1888年