新教等宗教。1949年，该市有天主教信徒7000多人，基督新教信徒2.3万人，文化大革命结束以后人数增加迅速，到2005年增加到天主教徒8万多人，基督新教信徒18万多人（居福建省第一位）。福清的基督教新教有6个教派，以卫理公会、圣公会、基督徒聚会处、真耶稣教会的规模较大，卫理公会曾经办有融美中学、惠乐生医院、龙田和新田医院，福华堂为福建省最大教堂之一。福清市重点寺院万福寺 (福清)，又称般若堂、万福禅寺，位于福建省福清市渔溪镇黄檗山上。汉传佛教禅宗寺庙，为汉族地区佛教全国重点寺院之一，亦为日本黄檗宗祖庭