县西端，及高雄市、屏东县的23个乡镇市区，流域面积为全台第一大河。高屏溪主流荖浓溪，源流位于南投县信义乡南端，发源于玉山东峰，先向东北流，至八通关转东南，汇集分别源自秀姑峦山西南坡及大水窟山西坡的支流后，转向南南西进入高雄市境，流经梅山、桃源、宝来、六龟，转向南流至大津，纳东侧流入之浊口溪后，转向西南流至里港，纳东南方流入之隘寮溪，名为二重溪，续流至岭口与来自北方之旗山溪（楠梓仙溪）合流后，始称高屏溪。本流转向南经大树、九曲堂、上寮、鲤鱼山，于东汕注入台湾海崃，此河段长约38公里。旗山溪为高屏溪水系