期，在传召法会中，臧巴拉佛殿曾作为乃琼寺僧人的法会堂，鼎盛时期该寺曾聚集114名僧人。该寺现存许多精美的壁画，大多绘于十三世达赖扩建该寺时期。这些壁画绘于黑底上，多以黄色单线勾勒。这些宗教题材壁画带有浓郁的密宗特点，以念青唐古拉及众眷属神众、五方乃琼护法神及众眷属、十二丹玛女神、尸陀林主等宁玛派神灵为主。其中，五方乃琼护法及众眷属这一题材的壁画非常少见。这些壁画带有汉式、尼泊尔画派、印度画派风格。其中一幅位于寺庙二层楼梯口的壁画，很像张果老的鹤寿延年图，但张果老的坐骑驴在该壁画中改为梅花鹿，由善财童子牵