人蔡宗昇指出，以前漳泉移民以信奉玄天上帝为主，因此此地一带的北帝庙宇密集，集福宫则为其一。后清廷为压制反清复明，引入妈祖与之抗衡，距离集福宫正前方约100公尺即有主祀天上圣母的金安宫，从这样密集的庙宇分佈多少可以窥见明清朝代政治斗争的历史脉络。相传甘国宝曾赐匾于此庙，但匾已遗失。道光以降，台江内海淤积日甚，各港道日渐淤浅，黄姓族人与此庙便西移至信义街尾。道光二年（1822年），黄资盛、黄元贡、黄元门等董事发起募捐，募捐番银一千大员，并迁建现址，且改名为「集福宫」。庙宇搬后的地点因邻近台江，清末时发展成商