于狩猎中，两人到后来才成为互相恩爱的伴侣。玛丽婚后很快就怀孕，但似乎因病流产导致健康受损。她从此失去健全的生产能力，每次怀孕都以产后夭折作结，两人最终没有获得任何子嗣。威廉三世除了妻子玛丽以外，还拥有一位公开的情妇，以及一少一壮的男性宠臣（谣传是男同性恋的情人）。现在大多数的历史学者，认为他的同性恋传闻，是英国的詹姆斯党为了恶意中伤他，于1690年代所制造的谣言。他们认为，主要是威廉三世对女性（包含妻子玛丽）过于冷酷而粗鲁的态度，让人误以为他对女性毫无兴趣（但事实上他至少有一个情妇），并反向推论他喜欢男