畿。三世纪时期的九州有铜镜文化，而本州畿内则有铜铎文化。至四世纪古坟文化兴起，畿内铜铎文化消亡。这表示了位于九州的邪马台国在内乱发生之后可能有将首都向东迁移的情况。而在日本的传说中，也有神武天皇东征神话的记载，这样就得以解释承接邪马台国而兴起的倭政权位于奈良的原因。
琉球说.此说《魏志倭人传》记载邪马台的位置、风土等与琉球相似，而沖绳本岛各间切的名称又与邪马台国地名发音相近，且在琉球出土的一些文物亦与《魏志倭人传》相符，并推断北谷海底遗迹为卑弥唿之城堡，与那国岛海底地形则是补给地。