部地表被较新的堆积物覆盖，较难发现活断层，但同样有活断层存在，并且是都市直下型地震的原因。东京都的岛屿部分主要由伊豆群岛和小笠原群岛构成，以及并无民间人士居住的火山列岛、西之岛、南鸟岛、沖之鸟岛。伊豆群岛位于东京本土以南120至600公里的海域上，包括大岛、利岛、新岛、式根岛、神津岛、三宅岛、御藏岛、八丈岛、青岛九个有人居住的岛屿，以及超过100个无人岛。伊豆群岛都是火山岛，火山活动十分活跃，其中又以大岛的三原山和三宅岛的雄山活动最为频繁。小笠原群岛由聟岛列岛、父岛列岛、母岛列岛三个群岛构成，其中面积最大