定数量的植物(视各品种), 当种植量超过水中养份含量, 会产生生长不良的情况, 当种植量不足时, 则养份会有累积的问题
鱼（或其他水生生物）.目前鱼菜共生中主要是使用淡水鱼，例如：宝石鱼、大头鱼、锦鲤等等，但也有使用淡水小龙虾和虾。
细菌.硝化菌，在有氧的环境下将氨转化成硝酸盐，是在鱼菜共生系统中最重要的功能之一，从而有效地降低了对水生生物的毒性，并为植物提供可吸收的硝酸盐化合物。氨为鱼类等水生生物新陈代谢的产物通过排泄作用和鱼腮持续的排放，虽然植物在水中