硕士及哲学博士学位，并放弃行医，改为全职专注于中文教学和研究工作。他曾任教于香港树仁学院（今树仁大学）、澳门东亚大学、亚洲国际公开大学、新加坡国立大学，其后任教于香港大学中文学院、明德学院。他不时参与电视文学节目，2009年于无线电视正字游戏节目《正识第一》任专家评判。他亦曾担任香港学校朗诵节及青年文学奖评判，以及香港艺术发展局审批员。邓昭祺着作有《元遗山论诗绝句笺证》等，他亦担任《文学论衡》及《东方文化》杂志编辑。