是由伊斯兰教创始人、先知穆罕默德（尊称穆圣）奠基，并亲自主持建造而成的。根据伊斯兰教传统，在库巴清真寺中跪拜两次（即在寺内做一次主麻拜）等于做了一次副朝。
历史.据伊斯兰史学家记载，穆圣在麦加创立伊斯兰教后，不断受到当地非穆斯林的迫害，乃与麦加的穆斯林（后称“迁士”）迁往叶斯里卜（今麦地那），史称“徙志”，为伊斯兰纪元的开始。西元622年9月20日，穆圣一行来到叶斯里卜城外西南约3公里处的库巴镇，因为附近有一水井名“库巴”，故名。穆圣受到叶斯里卜穆斯林（后称“辅士”）的热烈欢迎