郑氏军队派至各地驻扎，一面开垦，一面守卫。康熙二十三年(1684)，台湾纳入清政府版图，设一府三县，台湾府，台湾县、诸罗县、凤山县。其中诸罗县共辖四里、三十四社。而所谓「外九庄」，成为施琅家族的私有领地，不在编制内。
外九庄.郑芝龙入垦台湾事蹟，记载于黄宗羲所着《赐姓始末》一文，说崇祯元年至五年期间(1628-1632)，福建发生饥荒，巡抚请郑想办法，于是想出「三金一牛」理论，巡抚同意这个论调，以船舶搭载饥民数万人东渡台湾，分地耕种，并结有九个村落。一代大儒黄宗羲的论着说法较可疑的