南澳募集了数千兵力；隆武二年（1646年）十二月（西历为隔年1月），郑成功在小金门（今日金门县烈屿乡），以「忠孝伯招讨大将军罪臣国姓」之名誓师反清。隆武三年（1647年，明永历元年，清顺治四年）七月，郑成功会同郑彩部队攻打海澄，失败；八月，成功又与郑鸿逵部合围泉州府城，清漳州副将王进率援军至，郑军不敌败退。隆武四年（1648年，明永历二年，清顺治五年），原浙江巡抚卢若腾等人来归，郑成功蓄积实力后再次出击，攻克同安县。五月，郑军围攻泉州；七月，清靖南将军陈泰、浙闽总督陈锦、福建提督赵国祚等转而攻击同安