因为他发明了一系列分离抗生素的方法和技术， 使他的实验室分离了多种抗生素。1951年瓦克斯曼用他个人一半的专利费建立了瓦克斯曼微生物学基金会。用此基金在罗格斯大学建立了瓦克斯曼微生物学研究所。
法律纠纷.瓦克斯曼的研究生艾伯特·沙茨认为链霉素是他亲自分离成功的，他也应该得诺贝尔奖，以至告到法院。瓦克斯曼曾经写信给A. Schatz:此案最终认定沙茨为链霉素的“共同发现人”。