司令员（1946年5月由韦国清接任），赵启民任政治委员。1946年朝阳集战役中，第二纵队全歼国军第九十二旅。后参加泗县战役、淮阴、涟水保卫战，全歼国军第六十九师。1947年参加鲁南战役。1947年9月，与华中野战军第九纵队一部合编为华东野战军第二纵队，韦国清任司令员兼政治委员，张震任副司令员。原第四旅、第九旅分别改为第四师、第六师，原第九纵队部队编为第五师。1948年2月，第二纵队奉命南下华中，参与宿北战役。随后参加莱芜战役、孟良崮战役、淮海战役，围歼黄百韬兵团并活捉杜聿明。1949年2月，第二纵队改编