朝的皇太后褚蒜子亦重用何充，让他可带甲杖百人入殿。又应何充认为自己不宜兼任中书监和录尚书事之要求，解任中书监并加授侍中，又赐其羽林骑十人。
辅助幼主.穆帝即位后当年庾冰就逝世，次年庾翼亦患病，何充独自辅政。何充认为太后父亲左将军褚裒身为外戚，应总掌朝政，于是曾推荐褚裒参录尚书，但褚裒为避嫌而坚持不受。终以会稽王司马昱录尚书六条事辅政。患病的庾翼当年就逝世，临终前上表由其子庾爰之接掌自己荆州刺史一职。当时很多人都因庾氏自庾亮起长时间出镇荆州等地，人心归附，都认为应该依从庾翼要求。但何