1780年恢复健康后重操律师故业，但州议会却在他反对之下，选派他再次担任大陆议会议员。沙利文上任后即要处理的去留问题。纽约州和新罕布什尔州早在独立战争爆发前，已经在争夺该片土地的管辖权，但居住在当地的佛蒙特居民却打算争取独立，并且在1777年成立佛蒙特共和国。虽然佛蒙特在战争之初支持革命，但英国在萨拉托加战役落败后，开始拉拢佛蒙特加入英属的加拿大，令到局势更加复杂。当时议会正为两州重新划定边界，并讨论佛蒙特的独立问题。沙利文坚持纽约州的疆界不能囊括赠地范围，并指新罕布什尔州宁愿接纳佛蒙特为独立州分。此外