事后，这些人携带五星旗却未拿中华民国国旗的举动，引起台湾舆论譁然，持续在台湾各大讨论区、论坛发酵。有网友批评「其实保钓只是幌子，宣示台湾是中国的一部份才是真的」中华民国总统府副发言人表示，马英九对保钓人士的作法感到不可思议，也强调绝对不能认同，已请行政院要求相关机关检讨，防类似事情再次发生。国会议长王金平则对此事表示「简直匪夷所思」，太不可思议了。民进党主席苏贞昌则表示痛心。在大陆方面，2012年7月5日，中国官媒和网络论坛一致高调报导台湾保钓人士黄钖麟「抛出五星旗，活动成功」、「只有大陆才能拿回钓