胡宗南的第十八兵团、马继援的陇东兵团反攻咸阳、西安，遭到中国人民解放军打击。同年7月，中国人民解放军第一野战军在华北野战军的配合下，发起扶眉战役，陇南兵团遭重创，王治岐只身逃脱，陇南兵团机构解体，各军残部各自退回甘肃。1949年11月，王治岐被广州中华民国政府任命为已溃败的甘肃省政府的主席。1949年12月9日，第一一九军军长王治岐、副军长蒋云台在武都县率部通电宣布起义，配合中国人民解放军第七军和平解放了武都。中华人民共和国成立后，任甘肃省人民政府委员，民革甘肃省第五届委员会副主任委员，民革第六届中