国公朱元璋改改枢密院为大都督府。明太祖洪武十三年（1380年），大都督府改为五军都督府：中军都督府﹑左军都督府﹑右军都督府﹑前军都督府﹑后军都督府。
民国初年.辛亥革命后，各省设立都督府主管本省军政，如鄂军都督府、沪军都督府、云南军都督府等，后来改称督军府或省政府。
日本.日本在1906年到1919年于旅顺设立关东都督府。日本在1872年到1891年设立的近卫都督府即近卫师团的前身。