民党元老谭延闿亦于一个月前被段祺瑞免职），两人宣告湖南独立，引起湖南战祸，至1918年6月停战。同年11月，他在同陆荣廷领导的旧桂系作战中败北，被迫退出湖南。后来他转任边防督办公署参谋长。1920年（民国9年）7月直皖战争时，傅良佐作为段祺瑞的密使到天津同直系进行交涉。后来，他被直系逮捕收监。结果皖系在直皖战争中败北，他也于1922年（民国11年）5月被释放。此后，他从政界引退，在天津闲居。1924年（民国13年），他在天津逝世。
家庭.傅良佐之父傅锡畴为清朝官员，与段祺瑞