行性研究工作。2019年5月14日，深圳市口岸办召开了深圳口岸通关改革创新研讨会新闻通气会，计划对沙头角口岸联检楼拆除重建，已编制完成《沙头角口岸重建项目可行性研究报告》。
未来发展.因应2019年深圳市口岸办公室根据《粤港澳大湾区发展规划纲要》对深圳各口岸功能进行优化和调整，沙头角口岸将重建，改为纯旅检通道，取消货车通关。
交通.深圳地铁2号线（正式属深圳地铁8号线）将在口岸附近设沙头角站，于2020年10月28日正式开通，届时沙头角口岸客流量也将进