肺炎疗程约7至10天，但有证据支持3到5天的短期疗程也相同有效。建议使用第三代或第四代头孢菌素、、喹诺酮、氨基糖苷类抗生素，以及万古霉素等等。抗生素常借由静脉注射合併给药，有90%在院治疗者给予抗生素后情况好转。
病毒性.神经氨酸酶抑制剂可以治疗因流感病毒（如甲型流感病毒及）引起的病毒性肺炎。若是其他种类的社区获得病毒性肺炎（例如严重急性唿吸系统综合症、腺病毒、汉他病毒及），没有特定可用的抗病毒药物。甲型流感可以用金刚乙胺或金刚烷胺进行治疗，而甲型或乙型流感可以用奥司他韦，或治疗。