情况大幅改善，但此播放时间令到原本收视率偏低的情况进一步恶化，因此东映动画制作组考虑到严峻的播放时间亦相对作出剧情配合，由第31话起进入新的两个篇章，并加上副主题「～邪恶的死亡指挥官与七个王国～」和「～穿越时空的少年猎人们～」，希望保持固有收视率。中国大陆方面，东映动画于2010年向国家知识产权局注册商标为《数码宝贝大会战》，而持版权的视频网站将译名更改为《数码宝贝06合体战争》。搜狐视频2015年版权到期后，转由爱奇艺联手东映动画成为深度合作伙伴关系，爱奇艺享有本作TV