年（崇祯十五年），犹太会堂被李自成所攻取，开封因人为的黄河决口所冲毁。「汴没而寺因以废，寺废而经亦荡于洪波巨流之中。教众获北渡者仅二百余家，流离河朔。」 其后虽然幸存的犹太人陆续返回，并重建了会堂，重修了经书，但是社区显然已经元气大伤。而到了1841年（道光二十一年），当黄河再次决口时，会堂被拆毁护城，尔后也未能修复。1850年，随着开封犹太社团的最后一个拉比（Rabbi，犹太教神职人员）的去世，教众中不再有人认识希伯来语了，结果犹太宗教生活和犹太人的自身身份识别终结了。
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