数斛矣，安得不病乎？”贞观十二年（638年）去世，谥号：壮，追赠徐州都督，陪葬昭陵，唐太宗在他墓地内立石人石马，以旌战阵之功。
后事.贞观十三年（639年），秦琼被改封为胡国公。贞观十七年（643年），秦琼与长孙无忌等人被图形凌烟阁，封为凌烟阁二十四功臣之一。
家族.《旧唐书》、《新唐书》中秦琼传记均没有记载秦琼家族情况。1990年代后，陆续有秦氏家族成员的墓志出土，秦琼家族方才渐渐明朗。1995年，山东省济南市发现秦爱墓葬，墓志记载有秦琼父、祖、曾祖