相，进封郇县伯。当时朝廷缺乏要员，韦巨源主事除十人官职，其一为检校中书令杨再思，杨再思问其余官职授何人，得知都是宰相们的近支亲属。杨再思深叹：“我们真是负了天下。”韦巨源却说这是时下之计。当时有贤德的人终不能进身，士大夫莫不离心。九月，因韦安石任宰相职中书令，韦巨源又被罢为礼部尚书。二年（706年）二月，韦巨源改任刑部尚书，再授同中书门下三品，中宗命他和韦皇后叙宗亲。进封舒国公。从此在朝中成为韦后党羽。三月，中宗婿光禄卿驸马都尉王同皎被控与洛阳人张仲之、祖延庆、武当丞周憬等谋反，计划杀韦后情人、武则天侄