型固氮细菌则可以在植物根的外部（包括许多草类）进行独立生长，并将氮气固定成植物可以吸收利用的形式。虽然这类微生物被认作与植物之间的联系并不是很紧密，但它们也可能会对植物的状态产生很强烈的反应。例如在稻类植物根际的固氮微生物，会模拟植物的生活状态而表现出昼夜交替的特性，并且会在植物最需要含氮物质的生长阶段供应更多的固定下来的含氮物质。有的植物会分泌出异种化感物来抑制其他生物的生长。例如在北美洲的温带森林中，药用蒜芥（"Alliaria petiolata"）会分泌出一种化学物质用来抑制树木与菌根之间的互利