着低调的退休生活，但在2004年曾高调支持当时的保护维多利亚港运动，他除了参加保护海港协会发起反对在维多利亚港进一步填海的活动外，还捐出数十万港元支持协会的工作。在2012年，李福善开始受唿吸疾病困扰，病情反覆，终告于2013年2月26日晚在养和医院因支气管炎和肺部感染併发心脏衰竭逝世，终年90岁，死时家人陪伴在侧。对于李福善的逝世，时任行政长官梁振英在3月8日发出声明表达深切哀悼，并赞扬他「对推动社会发展有卓越贡献」。李福善身后，家属于3月7日为他在香港殡仪馆举行低调的家祭和出殡仪式，并在4月27日上