任安东省政府主席。同年5月成为东北行辕政务委员会委员。随着第二次国共内战中国国民党作战失利，董彦平逃到台湾，并保留国民大会代表身份。后任中华学术院东北研究所所长。他还担任过国民党中央政策委员会副秘书长以及中央党务顾问。1976年11月5日，董彦平在台北市去世。享年80岁。