死所造成的精神打击是难以估量的。日本政府也因此被迫承认美军的战争能力正在迅速恢复，甚至开始反击。山本的遗体在布因岛被火化，他的骨灰由他最后的旗舰——武藏号战列舰运回东京。山本于1943年6月5日获得国葬待遇，葬仪委员长由米内光政担任。同时，山本被追授元帅军衔、大勋位菊花章。稍早（5月27日），纳粹德国也宣佈追授山本橡叶双剑骑士铁十字勋章，在获颁这一勋章的159人之中，只有山本不是德国人。他的部分骨灰被葬在东京，剩下的部分则运回家乡长冈市安葬。
评论.山本五十六