，台湾总督府专卖局于1901年6月设立后，台南盐务局改制为「台南支局」，继续负责食盐专卖，并已迁至台南市盐埕；同年12月，台湾总督府在台南厅及台南邮便局厅舍内设立了「专卖局台南出张所」，负责鸦片烟膏保管和药品试验事务。烟草专卖于1905年4月实施后，在台南车站北侧另设了台南出张所，负责台湾南部的香菸制造与经销，且兴建新厅舍（即现今的建筑），其于1906年11月启用。然而，台湾总督府于1912年5月将台南出张所废除，将菸叶专卖改由专卖局菸草科自行管理；但由于业务范围广泛，专卖局无法负荷，先于1914年4月设立