际货币基金组织、澳洲政府等纷纷向巴布亚新畿内亚政府施压，要求把新畿内亚航空私营化。但巴布亚新畿内亚政府却指出，私营化反而会对国内航线构成不利影响，同时盈利也会减少。2004年9月，开始引入福克F100服务国内、凯恩斯及霍尼亚拉航线，取代机龄渐高的福克F28。2006年3月，航空及交通大臣当·普里（Don Polye）宣布将于2007年起实行「开放天空」政策，容许其他国家的航空公司开办往返巴布亚新畿内亚的航班。2008年4月18日，开办悉尼航线。2018年9月28日，由密克罗尼西亚联邦波纳佩国