澳门地球物理暨气象局亦随着纳莉的逼近，分别于当日下午2时45分及6时正悬挂三号强风信号以及三号风球。不过纳莉的路线比原先预期稍偏西北，于当日下午4时左右在中国汕尾市登陆，之后继续往西北西方向行进。随着纳莉的远离，香港天文台于当晚10时40分除下所有热带气旋警告信号。登陆之后，强度亦随之迅速减弱，近中心最大持续风速在当晚11时左右下降至热带风暴下限，且风圈逐渐缩小。最终，纳莉于9月21日午夜12时被联合台风警报中心降格为热带低气压之后，澳门地球物理暨气象局于凌晨2时30分除下所有热带气旋信号。当日早上8时