3年2月，威廉·巴加加入英国海军，在俄里翁号战舰上服务，身份是船长约翰·托马斯·达克沃斯（John Thomas Duckworth）的仆从。俄里翁号当时属于豪勋爵（Lord Howe）指挥下的海峡舰队，参加过“光荣的六月一日”海战。后来达克沃斯被调到利维坦号，进驻西印度，巴加也跟随前往，并被达克沃斯任命为护卫舰马格西尼（Magicienne）号上的代理中尉。 1798年5月，他被派往海德·巴加（Hyde Parker）的旗舰女王号，后于次年5月1日担任窝拉疑号的代理船长， 在墨西哥湾和古巴沿岸进行了几个月