在张家口成立锡林郭勒盟政府，雄努敦都布任盟长。该政府与中国共产党方面成立的锡林郭勒盟民主政府相对抗，但未能对锡林郭勒盟行使有效的行政管辖权。1948年底，中国人民解放军占领张家口，中国国民党方面的锡林郭勒盟政府随之垮台。1949年，雄努敦都布随德穆楚克栋鲁普逃入蒙古人民共和国，1950年被中华人民共和国引渡回国，关押改造。1959年12月，经中央批准，他获得首批特赦释放。1959年12月4日，在监所召开了特赦大会，雄努敦都布向政府致谢词，其儿子代表家属发言。雄努敦都布获释后，起初被安置在锡林郭勒盟锡林浩