战争初期纳粹德国空军拥有237架可供作战的Bf 110s。但在战役中Bf 110总计损失223架飞机。在1941年5月10日，不列颠空战之后发生了一件不可思议之事，纳粹党副领导人鲁道夫·赫斯驾驶Bf 110从慕尼黑北部奥格斯堡飞往苏格兰试图为德国与大英帝国缔结和平协定。
巴尔干战役.梅塞施密特Bf 110C被指派投入巴尔干战役。第26驱逐机联队的第一、二大队开始投入战区布署。Bf 110再一次遭遇国外梅塞施密特Bf 109的抗击，如同1940年的瑞士一样，在巴尔干所遭遇的是的B