界大战.在纳粹德国的统治下，1938年4月30日纳粹分子在萨尔茨堡焚书和逮捕犹太人和不同政见者，同年11月9日“水晶之夜”萨尔茨堡的犹太教堂被毁。1942年纳粹德国在萨尔茨堡市内建立了战俘集中营，1943年市内山丘上建起了防空洞。1944年至1945年美国空军在总共15次空袭中摧毁或损坏了萨尔茨堡46%的建筑，7600间民房被毁，14563人流离失所，有超过550人在空袭中丧生。受损最严重的是火车站附近地区和中心城区，包括萨尔茨堡主教座堂的穹窿和莫扎特故居，不过除了主教座堂与桥梁以外，大部分巴洛克建筑都保