上却是以间谍的身分加入。之后他回到新选组时，还顺便偷走御陵卫士的活动资金。这是为了营造出他疑似为钱所困而侵占公款逃亡的假象。根据的回忆，斋藤回到新选组后，向大家公开说「副长助勤斋藤一氏，因公出差，本日归队，并回复以前职务」。新选组暗杀伊东等御陵卫士的油小路事件，就是依据斋藤归队时带来的情报而进行。同年12月7日，受纪州藩委託，负责保护藩士，并因此遭到海援队及陆援队队员等16人袭击（）。与三浦一起召开酒宴时，由于新选组迟到，造成与舟津釜太郎因此死亡，则为了保护斋藤而身受重伤，但斋藤则因为穿着锁帷子而无事。