尔·菲利普斯办学的还有他的商业伙伴，他成了学院的首位校长。菲利普斯学院宪章于1778年4月21日签署，学院于同年4月30日开张。创校第一年，乔治·华盛顿造访了菲利普斯学院。小塞缪尔的伯父资助了菲利普斯学院的创办，见其创办成功，便后来在1781年于新罕布什尔州的埃克塞特建立了菲利普斯埃克塞特学院。1782年，美国革命者保罗·里维尔为菲利普斯学院制作了校徽。校徽上，太阳中的拉丁文“Non Sibi”意为“勿为利己”，而横幅上的拉丁文“Finis Origine Pendet”意为“有始方有终”。17