兴南客运玉井站是台南市政府规划的大台南公车转运站，位于台南市玉井区中正路54号，经台南市政府补助兴南客运进行改善工程，于2014年2月22日重新启用，在旁亦有统一超商进驻服务。本站为行驶台南山区地带的绿支线与干线的转运中枢，同时亦为橘、绿两大干线转运中心。