年，大陆会议加衔霍根为准将，但当时有多位议员和北卡罗来纳殖民地议会都期望先提升北卡罗莱纳的托马斯·克拉克。1780年春，霍根在查尔斯顿围城战期间指挥北卡罗莱纳旅，这场战争以大陆军惨败告终，北卡罗莱纳所有正规部队中只有一个团没有投降，同样投降的还有本杰明·林肯少将下属的约5000名爱国者军人。霍根是该战结束后被俘的北卡罗莱纳军官中军衔最高的一位，他本有机会与其他被俘军官一起获得假释，但却放弃了机会，选择留在查尔斯顿附近的英军战俘营。霍根留在战俘营很可能是为了防止英国陆军招募投降的大陆军士兵参加西印度群岛战