新西兰首次报道该病，1959年提出手足口病命名。
疫情爆发.2008年春季，中国大陆曾爆发EV71型病毒疫情，造成超过40名儿童死亡，染病者逾万。中国卫生部在5月3日凌晨紧急发布《手足口病预防控制指南》，并即时把手足口病纳入丙类传染病管理。最先爆发的安徽阜阳涉嫌隐瞒疫情，引起民众广泛不满。2009年1月1日至3月26日，中国大陆除西藏外，30个省区共报告手足口病例41846例，其中重症94例，死亡病例18例。截止4月7日，卫生部公布的手足口病病例勐增至115618人，其中773