于自家土地内的松下村塾，并开始在塾内上课；此时期曾在松下村塾接受吉田松阴指导的学生包括：久坂玄瑞、高杉晋作、伊藤博文、山县有朋、吉田稔麿、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、宍户玑等多位日后活耀于明治维新前后的人物。但在1858年江户幕府与美国缔结美日修好通商条约后，吉田松阴不但大肆指责幕府的外交政策，还主张暗杀老中，被长州藩再次关入野山狱，也结束了吉田松阴在松下村塾的教学。此后也由于进入幕府时代末期的动乱时代，许多松下村塾学生陆续离开萩，也造成松下村塾一度暂停。直到1866年才由河合惣太