在昆虫消化道内成长，然后在嵴柱动物中最终成为锥鞭毛体和无鞭毛体。
危害.锥虫能引起多种不同的疾病。其中两种能引起人体发病，它们有多个亚种。它们主要在液体状身体组织中存在，特别是血液，在淋巴，骨髓，嵴髓液和脑部。它们可以在显微镜下被直接观察，也可以将血液样品用Giemsa染色后进行观察。
锥虫与免疫系统的关系.一些锥虫能成功逃避人体的免疫系统的抵抗，原因是锥虫有一层蛋白多糖外壳，其组分（糖）经常变换，逃避了免疫细胞的识别。而其蛋白质通过反式剪接高度可变