4月晋升为入境事务处助理处长，并且先后出任助理处长（执法及诉讼）和助理处长（签证及政策）岗位，至2009年9月晋升为入境事务处副处长。2011年，中华人民共和国国务院根据行政长官曾荫权的提名和建议，任命入境事务处副处长陈国基于3月28日接替退休前休假的白韫六出任入境事务处处长。2016年4月5日，陈国基开始退休前休假，由副处长曾国卫接任。2017年5月4日，陈国基出任候任行政长官办公室主任； 同年7月1日成为香港特别行政区行政长官办公室主任。2020年7月2日国务院根据林郑月娥提名，任命陈国基为首任香港特别