类猎捕及对自然的开发，大量野生动物现已绝迹。如今仅在少数深山林区分布有野生动物，计有嵴椎动物185种，其中兽类42种、鸟类87种、爬行类32种、两栖类12种。其中有国家二级保护动物15种（兽类7种、鸟类8种）。石林也是国际自然保护联盟于1988年公布的白腹锦鸡主要产区之一。
矿产.石林县境内探明的矿产有煤、铜、铁、银、磷、铅、锌、石灰石、大理石、硫磺、镉、钴、油页岩、石英砂、钒等，其中煤、铁、铜、石灰岩、石英砂等资源较有优势。石林的煤矿集中在圭山地区，圭山煤矿属于滇东煤田南部煤田区