微斑线虫科（学名：）是色矛纲的一种线虫，旧属圈旋头孔线虫目（Chromadorida）的大瓣线虫亚目（Monhysterina），今属于薄咽目（Araeolaimida）的微斑线虫总科（Axonolaimoidea）。