的权力真空期，在一次大屠杀中，焚毁了雷根斯堡的犹太人区，驱逐了当时德国最大的一座犹太人居住区。1542年，在教区与城市议会的斗争中，雷根斯堡改为一座新教城市，人民希望借此摆脱天主教主教和皇帝，但是同主教之间的冲突并没有因此而减少。1633年雷根斯堡在三十年战争中被瑞典军队占领，1634年被神圣罗马帝国皇帝和巴伐利亚的军队夺回。自从东法兰克王国时起，雷根斯堡就已经是重要的政治中心，多次举行帝国议会。18世纪末，雷根斯堡经历了严重的内政危机，在面临经济崩溃的背景下，市民和政府官员代表成功地在维也纳帝国宫廷议