5公分，估计生前的完整长度约33公分。鼻眶前孔（Nasoantorbital fenestra）非常大，大约佔了头颅骨长度的58%。下颌长度为29.1公分。牠们的头颅骨非常类似帆翼龙的头颅骨，尤其是侧向扁平的牙齿、长的鼻眶前孔；帆翼龙生存于约同一时代的英格兰。努尔哈赤翼龙与帆翼龙的差异在于数个细部特征，包含：较低矮的头颅骨、不同形状的颧骨、牙齿紧密地排列、下颌的上缘稍为弯曲。努尔哈赤翼龙的每颗牙齿大幅向后弯曲、有三个齿根、牙齿粗壮。牙齿仅限于嘴部前段，上颌有28颗牙齿、下颌有26颗牙齿，总共有54颗牙齿。努