马拉.危地马拉境内的火山帕卡亚火山于风暴来袭2天前爆发，导致火山灰迅速飘至瓜地马拉市及拉奥罗拉国际机场，并堵塞当地排水系统，加剧了风暴所带来的破坏，拉奥罗拉国际机场一度需要关闭。当地政府提醒，阿加莎所带来的暴雨可能引发火山泥流，并加剧灾情；不过，在咖啡田工作的人认为，降雨能沖走咖啡树上的火山灰，对他们有帮助。表示，当地在5月29日的总雨量达360毫米。南部地区出现小规模的山泥倾泻，阻塞了道路交通。位于别哈城的水火山附近出现了泥石流，导致9人死亡，13人失踪，超过100户受灾；克萨尔特南戈省阿尔莫隆加