各种学说、各种教派纷纷形成，对西藏未来的历史产生了巨大的影响。在这段和平时期里，藏传佛教再度兴盛，史称后弘期。阿底峡就是在这段时期里来到吐蕃的。因为吐蕃大乱，故不对位于东邻的宋朝造成任何威胁，使宋朝得以专注应付辽朝、西夏和金朝。1240年，蒙古帝国派阔端侵略吐蕃，试图借此牵制南宋。蒙古人希望找到一个单一的君主来投降，但发现吐蕃各地事实上是各自为政，便将最具实力的萨迦派首领萨迦·班智达请到凉州，商讨归顺之事。萨迦·班智达向阔端宣讲佛法，阔端皈依了藏传佛教，吐蕃与蒙古开始建立供施关系。1264年，忽必烈