北的部队统称为北洋军，形同中央军的角色。而南方各省的非北洋系部队则冠以省名，如鄂军、滇军、粤军、桂军、川军（或蜀军）等。中央政府改北洋军编制的镇、协、标、营为师、旅、团、营，并大肆扩军，增编12个师与16个混成旅。1913年（民国二年）为镇压孙中山的“二次革命”，袁世凯遣冯国璋率北洋军4个师、3个旅及武卫军（张勋部）对南方省分的国民党籍都督发动进攻。1912至1914年间，北洋军持续在豫（河南）、鄂（湖北）、皖（安徽）、陕（陕西）、甘（甘肃）等省镇压白朗起义。1915年（民国四年）3月，袁世凯命陈宦为会办四