马吉安另行组织由主教、长老、信徒与慕道友构成的教会，他坚定组织，基于平等的精神，因此教义传播的相当的快速。马吉安努力的想要使罗马教会回到他所认识的基督与保罗所传授的福音，因此他努力的宣讲他所主张的教义，并且着手编了一套他心目中的正典。144年，在皇帝安敦宁·毕尤时期被罗马教会控为异端，禁领圣餐、革除会籍，并逐出教会。马吉安是第一位在历史上尝试编列《新约》正典的人。他所编辑的典籍，其中包含保罗的10封书信（除教牧书信外）和他自行删节的路加福音，这是人们第一次尝试想要将新约各书卷集结编辑成为一部世人所公认的