有许多实质的疗效，因此又被称为「药祖祖师」，有着许多治病的神蹟流传。最后，值得注意的是，台湾北部有许多宫庙神坛模仿其落鼻造型，而雕塑许多清水祖师分灵神像，诸如：台北市北投区稻香里集应庙、台北市北投山脚广福宫、新北市瑞芳龙巖宫、新北市瑞芳区忠仁庙、新北市汐止区忠顺庙、新北市汐止济德宫、新北市新庄区如意堂等（可参见辜神彻，2009）。
民间咒语.依据各巖仔、伽蓝、神坛不同，词句大同小异。
清水真人咒.敕封清水真人，黑帝化身，风火乘脚，沙界踪横，七星宝剑，斩断妖精