室町幕府的统治得到巩固。足利义满不仅担任征夷大将军，还兼任了公家顶级官职太政大臣。足利义满时期，室町幕府的行政机构也大体形成，大体上沿袭了鎌仓幕府的形式。管领主要辅佐将军职务。其中，政所主要管理财政，侍所则负责京都内外警卫和刑事裁决。管领由细川氏、斯波氏和畠山氏轮流担任，是为“三管领”，而侍所长官则由赤松氏、一色氏、山名氏和京极氏担任，是为“四职”，幕府核心由“三管四职”构成。在地方行政上，室町幕府在镰仓设立镰仓府，最初足利尊氏三子足利基氏任镰仓公方（关东公方）。镰仓府在行政、司法、军事方面具有相对的