2009年马英九总统请纪政出任2010年无给职总统府国策顾问。2011年获续聘。2013年纪政抨击马英九总统在马王政争中斗争立法院长王金平，要求马英九总统马上下台，纪政批评马英九现在民调仅剩9%「马英九还有脸在做总统」，其表示当年马英九批评前总统陈水扁仅18%的支持度，而要求陈水扁下台，现在马英九民调为9%，而没有下台，根本是双重标准。
私人生活.
瑞尔.1970年12月纪政与比她年长三十岁的美国教练瑞尔结婚。1976年生女精敏，1977年纪政携女返台，