以东国为势力范围的源氏和以西国为势力范围的平氏两个庞大的武家势力，1159年，发生平治之乱，源氏实力虽遭遇很大削弱，但在东国仍拥有强大实力，国家内部因为割据有源平二氏及奥州藤原氏等势力，加上各界不满架空朝廷的太政大臣平清盛专横擅政而内战频仍。经过长期的源平合战，平氏被赶出京都，将朝廷迁往福原京，之后于1185年在坛之浦之战中彻底覆灭。
幕府时代.1192年，武家首领源赖朝被封为征夷大将军，建立镰仓幕府，并展开幕府统治，开始日本600多年的幕府时代。源赖朝过世后，其妻子的娘家北条氏实