法院正式裁定马偕医学院、马偕医护管理专科学校法人合併，成立「马偕学校财团法人」。2014年5月1日台东分院新建医疗大楼启用感恩礼拜，提升后山急重症医疗品质。2014年7月，发行第一本企业永续报告书《2014马偕纪念医院企业永续报告书》，是第一间获得台湾企业永续奖金奖的医疗院所。2014年12月29日马偕儿童医院揭牌仪式。2016年4月28日卫生福利部核准「财团法人台湾基督长老教会马偕纪念社会事业基金会」更名为「台湾基督长老教会马偕医疗财团法人」。
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