几乎所有主要的游戏主机上都曾推出过《生化危机》系列的作品，而卡普空也曾两度宣佈将单一作品或整个系列定为某款主机的独佔作品。《生化危机 圣女密码》原本预计在世嘉土星主机上推出，制作人三上真司在1998年宣佈将改为在Dreamcast平台上继续开发，并和世嘉（Sega）合作，于2000年2月发售。由于卡普空仅负责《圣女密码》的美术设定和系统监督，实质的开发工作是由世嘉的子公司「Nextech Corporation」负责，因此《圣女密码》仅会在Dreamcast上发行。开发过程中，三上也决定将二代和三代移植