的官设铁道真冈开通，此站启用。翌年1913年（大正2年）7月11日，真冈轻便线真冈站至七井站之间开通。在1987年（昭和62年）4月1日，国铁在分割民营化下，成为了东日本旅客铁道（JR东日本）车站。翌年1988年（昭和63年）4月11日，JR东日本真冈线由第三部门真冈铁道接管。同时，真冈站的日文读法由「もうか」变为「もおか」。在1996年（平成8年）3月22日，车站内设置了转车盘。翌年1997年（平成9年）3月30日，以蒸气机车为外型的车站大楼落成，并开始使用。同年被选为关东车站百选。在2013