须鲸小目的其他科分离。但是对于须鲸科的成员何时彼此分离演化还未知。虽然蓝鲸通常被归类在须鲸属，但也有学者将牠归类在单型属－蓝鲸属（"Sibbaldus"）中，不过这种分类方法并没有被其他学者接受。DNA序列分析显示，蓝鲸比其属中的其他物种在种系上更接近座头鲸和灰鲸。如果进一步的测试可以证实这种关系的话，将有把须鲸重分类的必要。 关于蓝鲸与长须鲸在野外杂交而诞生的成鲸至少有11项文献记载。阿伦逊（Arnason）和格尔伯格（Gullberg）认为蓝鲸和鳍鲸的差别类似于人类和大猩猩之间的差异。目前也已知有蓝