方式保护其它变形虫细胞不受细菌侵害，这和嵴椎动物免疫系统中吞噬细胞的自我牺牲行为相似，有理论因此推测变形虫的吞噬作用可能与动物界的吞噬细胞的作用同源。然而，哺乳动物吞噬细胞和变形虫的同源关系还未经证实。吞噬细胞存在于几乎所有动物界成员，不论是海绵动物、节肢动物、高等或低等的嵴椎动物体内都有吞噬细胞。变形虫区别自我和非我的能力非常重要，是许多变形虫免疫系统的根基。