巴尼亚族的不平等对待亦是常有所闻。也因为如此，在于马其顿共和国境内的阿尔巴尼亚族开始要求政治权利的改善、要求修改宪法，使阿尔巴尼亚族得以在马其顿之下成立自治国、并要求将阿尔巴尼亚语立为国家的第二官方语言，且对在泰托沃的地下阿尔巴尼亚大学提供政府支持。阿尔巴尼亚族并宣称其在马其顿共和国内佔比30%-40%而不是1994年六月官方所认定的22.9%。国内阿尔巴尼亚人即占25%为国内第二大的构成民族，1999年爆发的科索沃战争让高达50万人的阿尔巴尼亚人难民涌入马其顿共和国内，使阿尔巴尼亚的人口占马其顿内的比