众干部训练团和军政训练班，担任指导员。1937年8月1日，担任山西新军（即山西青年抗敌决死队）第一总队大队指导员，第一纵队第三总队政治主任。1939年十二月事变后，山西新军改编为八路军。王鹤峰被任命为八路军129师决死一纵队政治部主任，随后组织参加百团大战。1940年冬，推选为中共第七次全国代表大会代表，1941年抵达延安，进入中央党校参加整风运动。1944年初，他从延安返回前线，代理太岳军区政委兼区党委副书记。
第二次国共内战.1945年后，他任晋冀鲁豫军区野战军第四纵队政委