晚年.2000年代，吴敦厚进行了心导管手术，膝关节也出了一些问题，因此开始减少接受委託制作灯笼；同时，他最小的儿子吴怡德开始准备接掌灯笼舖的事业。2017年1月30日，吴敦厚于鹿港自宅安详辞世。2017年2月19日，文化部部长郑丽君、彰化县长魏明谷等相关官员前往公祭现场致意并颁赠褒扬令；同时，文化资产局局长施国隆、台湾工艺研究发展中心主任许耿修、彰化县文化局局长陈文彬、鹿港镇长黄振彦为其棺椁覆上中华民国国旗。
作品.
流派.福州式灯笼、泉州式灯笼、日