「横滨市内」车站。车站编号是JI 52。
车站构造.1边1线的单式月台，终点侧端设有入闸口，亦装有简化版的Suica验票机。月台是面对着海（京滨运河），是少有的车站。月台设有上盖。
车站周边.车站位于东芝京滨事业所，车站出口同时亦是工场的进出口，东芝公司派有警卫驻守，只限东芝员工及与东芝有商业上来往和洽公的人进入。因此，海芝浦站有「不能下车的站」之称。但由于车站设有车票回收箱及Suica读卡机，因此在形式上是可以下车。于2016年9月30日之前曾有装