段经历对沃伦来说并不愉快，因为作为法官他必须坚持公平和正义，但作为政治家他也明白有些事情必须保密、不能公开。最终，沃伦为了委员会的全体成员能达成一致、在最后的报告上签名，他在几个问题上做了妥协。该委员会得出最终结论是：行刺纯属个人所为（即是由枪手李·哈维·奥斯瓦尔德负全责）。虽然《沃伦报告》公布后的初期受到了好评，但它逐渐变为了一份充满争议的文件。当时，美国国内、国外的许多人都怀疑对肯尼迪的刺杀事件是由古巴或者美国右翼团体策划的，1967年的盖洛普民意调查显示大部分美国人不相信奥斯瓦尔德是单独行动的唯一