孔崇基曾孙，孔璲之之孙，孔萱之子。唐德宗建中三年（782年），孔齐卿在曲阜为袭封文宣公，为第三代文宣公。同时兼任兖州功曹（今山东省济宁市兖州区）。后来转任青州（今山东省青州市）司兵参军。淄青节度使李纳在山东叛乱，孔齐卿滞留在淄青的首府郓州（今山东省东平县）。有三个儿子孔惟晊、孔惟昉、孔惟时（郏县派始祖）。