1957年，庆应义塾创立100周年时设立。商学部的主攻方向又分为经营，会计，商业，经济产业4个领域。1935年经济学部内设立了经济学科与商业学科。商业学科独立成商学部。
医学部.医学部的前身为1873年为培养西洋医学人才而在东京都港区所设置的医学所。1917年由初代学部长北里柴三郎设立。1920年于东京信浓町设立附属医院。医学部6年级学生暑假通常会去美国进行实习，此外亦有和拉丁美洲各国医学院校的合作项目。前身为1939年藤原银次郎设立的藤原工业大学。1944年藤原工业大学并入