1925年12月至1926年9月，任青年团武汉地方执行委员会委员、组织部负责人。1926年10月，共青团湖北省执行委员会成立，李子芬任组织部部长兼汉口市团委书记。1927年春，李子芬组织青年参加收回汉口英租界的人民斗争。1927年4月，他参加中国共产党第五次全国代表大会，但代表资格尚未完全确定。5月，出席中国共青团第四次代表大会，代表团中央作组织工作报告，当选为共青团中央执委会委员。国共合作失败后，李子芬以共青团中央代表身份出席八七会议。1927年8月至1928年7月，他任中国共青团中央委员、组织部部长