据《日本书纪》记载，他以遣隋使的身分于607年与609年两度被派遣至隋朝，担任外交工作。在隋朝的汉名为「苏因高(そいもこ)」，为其名的汉语谐音。
经歴.大业三年（推古天皇15年，607年），小野妹子代表倭王多利思比孤向隋炀帝递交国书以表明日本的独立国地位，其中有着名语句：「日出处天子致书日没处天子无恙」。然而该国书将日本与中国最高统治者置于同等地位，并称“天子”，与中国传统的“天无二日，民无二主”思想相违背，引得炀帝勃然大怒。其后在由裴世清带去日本的隋炀帝国书中第一句就是“