出征，忠元领命留守萨摩。1600年关原之战爆发时未参战。义弘战败逃归之际，加藤清正攻入苇北城，得知此事的忠元急忙从鹿儿岛城赶回大口城，加强边境的防卫。1610年在大口城逝世，年85岁。新纳忠元身材矮小当胆大，被称为「鬼武藏」。他不仅作战武勇，还擅长于和歌、连歌、汉诗和茶道。