催化除5S外的所有rRNA基因的转录。 编码这些rRNA的为同一个基因，该基因表达时会形成连续的RNA转录物，然后该前体RNA会被剪接成3种rRNA：18S、5.8S、和28S。rRNA基因的转录发生在细胞核的特化结构——核仁中。 转录产生的rRNA与蛋白质结合形成核糖体。RNA聚合酶II（Pol II）负责所有mRNA、siRNA、多数snRNA和所有miRNA的转录。 Pol II的转录产物多为单链的（hnRNA），这些hnRNA会被进一步加工为成熟的mRNA。 绝大部分的前体mRNA在通过核孔离开