川幕府第三代将军德川家光力主闭关锁国政策，1616年下令禁止除长崎和平户两港口外的对外贸易。大名们失去贸易收入，转向对领地民众增加税收来维持收入。岛原藩主松仓重政于1621年开始建筑岛原城，并镇压当地的天主教徒，其子松仓胜家更是以残暴闻名。1634年起，岛原和天草地区连续发生天灾，更加重了民众的负担。
过程.1637年10月，岛原的一名农民交不起农租，妻子被领主松仓胜家的家臣田中宗夫带人抓走，数百名愤怒的村民放火烧毁了田中的家宅，16岁的天草四郎时贞（教名Jerome）被推举为领袖