最初丰特夫罗修道院受安茹伯爵保护，后来金雀花王朝把此处变为他们的墓地。在13世纪后，修道院开始衰落，在此后长达两个世纪内受到波旁王朝管辖。法国大革命后，修道院的宗教功能被取消，建筑主体被改建为监狱，直到1963年。1840年，丰特夫罗修道院被列为法国历史遗迹， 2000年被列入联合国世界遗产。