2号月台。
使用状况.以下为1日平均乘车人次和上下车人次列表：
车站周边.车站周边设有住宅区和商店区。车站南边为日奈久温泉街，当中温泉设施、旅馆、商店、住宅等密集建筑物。另外，在国道上设有日奈久站前巴士站，设有巴士路线前往八代站方向和日奈久温泉、二见方向。曾经在站前设有连接温泉街的直行马车列车。此马车是日奈久温泉的着名特色，一直以来受到当地人与观光客的欢迎，但是该服务于1984年废止。在营业末期，只在星期六、假日、观光季节时，并配合特急列车停站时间