同皮定均、徐子荣率领的抗日武装会合，组建河南军区并任司令员，并攻占登封等地。
第二次国共内战时期.第二次国共内战时期，王树声奉命南下桐柏山，与新四军第5师会合，组建中原军区，并任军区副司令员兼第1纵队司令员。1946年6月协助李先念指挥中原突围，率左路军由广水越过平汉铁路，西进武当山区，创建鄂西北游击根据地，任中共鄂西北区委书记、鄂西北军区司令员兼政治委员。1947年2月，王树声离开鄂西北，辗转荆门、武汉、南京、上海，到达山东解放区。1947年7月，他率部协同晋冀鲁豫野战军进入大别