8年10月，日军占领武汉，他赴重庆，1940年9月任国民政府军事委员会政治部文化工作委员会委员。1942年，他在重庆创办作家书屋，又与老舍、赵铭彝等创刊《文坛小报》。1945年抗战胜利后，他迁作家书屋至上海继续营业，并出版《北方文丛》等。1954年公私合营，作家书屋并入上海教育出版社，姚蓬子、周修文夫妇同入上海教育出版社任职员。1955年姚蓬子因卷入潘汉年、杨帆反党小集团案而被捕，同年被释放后成为自由职业者，以译着和写作为生。1963年后，任教于上海师范学院中文系。1969年，姚蓬子在上海病逝。