短肢攀蜥、黄口攀蜥、哈特氏蛇蜥与台湾蜓蜥等属于台湾特有种。
鱼类.在大安溪系、大甲溪系、兰阳溪系、德基水库等地共调查发现了17种鱼类。大甲溪是台湾鱼类分布的海拔最高点，一般溪鱼分布的上限约为1,800公尺，分布于大甲溪上游的樱花钩吻鲑则可达1,800公尺以上。台湾石宾、台湾间爬岩鳅、樱花钩吻鲑、台湾缨口鳅、明潭吻虾虎鱼、短吻红斑虾虎鱼为已纪录到的台湾特有种。在雪见地区，北坑溪在台湾属高山溪流，许多鱼都无法适应这低温的溪流环境，故鱼类种类较少。经调查北坑溪鱼类计有短吻红斑吻虾虎、