嗣美等交相上章相救蔡时鼎和同时因言获罪被贬的南京御史王学曾，被夺俸一级。礼科给事中王士性上疏请求召还蔡时鼎等，忤旨，无果。万历十五年（1587年），起用为太平府推官，代行知府事。八月，被吏部推为南京刑部广西司主事，神宗不许。御史王世扬请求如石星、海瑞、邹元标例起用蔡时鼎，无果。万历十七年（1589年），进南京刑部主事，不久转南京吏部验封司主事。万历十八年（1590年）九月，又上疏弹劾时任大学士的申时行，历数其十大过失，劝其反省改过。上疏被留中。万历十九年（1591年）进为南京礼部祠祭司郎中。十二月，吏部