。1913年（民国2年）10月，蔡锷离任云南都督职位赴北京，殷承瓛随从蔡锷赴北京，任北京总统府顾问官。1915年（民国4年）1月，任全国经界局清丈处处长（全国经界局督办为蔡锷）。殷承瓛赴东三省及朝鲜，了解中国土地的现状。在此基础上，他同经界局秘书长周钟岳共同研究田地调査的法规制定工作。其成果为《经界法规草案》、《中国歴代经界纪要》、《各国经界纪要》这3部着作。
护国战争与晩年.1915年，袁世凯企图称帝，殷承瓛同蔡锷逃离北京，回到云南。12月袁世凯称帝，殷承瓛协助蔡锷、唐継尧在