石以及宇都宫藩15万5000石，此事更加引起周遭的怨言。
失势.元和8年（1622年）8月，出羽山形的最上氏改易之际，正纯作为使者前往接收山形城，忽然接到来自秀忠处，指控其秘密制造铁砲以及修筑宇都宫城的本丸石垣，甚至预谋宇都宫城钓天井事件中暗杀秀忠等11条罪状，并将领地全部没收。但由于自先代以来的功劳，另外赐与出羽国内由利郡的5万5000石。但正纯却婉拒了这5万5000石，此举更加激怒了秀忠，使本多家最终遭到改易，正纯被佐竹义宣囚禁后流放出羽国横手，仅以幕府施舍的1000石维生。