未行之时，而毕节诸蛮复叛，大掠屯堡、杀戮吏士。何福命毕节部队戒严备战，命都督陶文等跟从茅鼎直捣其巢，并擒杀叛酋。随后分兵尽捕诸蛮，建堡设戍，逼近五开。洪武三十年三月，水西蛮居宗必登等作乱，何福会同顾成讨伐平定。该年冬天，拜为征虏左将军，作为副将辅佐西平侯沐春讨伐麓川叛蛮刀干孟。次年，何福与都督瞿能越过高良公山，直捣南甸、擒拿其酋长刀名孟，后回军攻打景罕寨却未曾攻下。随后沐春率领精兵进入，敌军惊溃，而其酋长干孟亦恐惧乞降。
靖难之役.建文元年，刀干孟之乱仍未平息，明惠帝遂拜何福为征虏