改革柳州铁路局管理体制的决定，自1997年11月1日起撤销柳州、南宁铁路分局，实行由铁路局直接领导基层站段的新体制，原铁路分局行政和党群工作职能改由铁路局统一管理。同时将中国铁路机车车辆工业总公司下属的柳州机车车辆厂划归柳州铁路局领导。11月11日，将南昆铁路接管运营筹备组改名为柳州铁路局南昆铁路临管运营处。 1994年，柳州铁路局进行了工商登记。截至2007年，全局图定开行旅客列车49对，货物列车450对，比2002年分别增长16.7%及42%。仅2006年，全局开行直达列车以及“五定”班列124