日本出场6次，是队中左后卫位置的第一选择。2010年南非世界杯，长友佑都此时已经牢牢占据了日本国家队主力左边后卫位置。在世界杯赛场上，长友佑都在攻防两方面都表现出色，帮助日本国家队从小组出线。2011年亚洲杯，他以助攻王的身份帮助日本在决赛中击败澳洲夺冠。2018年5月31日，长友佑都入选日本足球协会公布2018年俄罗斯世界杯23人大名单。2018年12月，长友佑都入选日本国家足球队公布2019年亚洲盃23人大名单。是届亚洲杯决赛由日本对赛首次晋身亚洲杯决赛的卡塔尔，结果卡塔尔在决赛以3-1