事件调查，但两天过后，调查得出两起事件的相似点，调查人员确定事件有关联，因此视作同一人或同一方犯下的复合恐怖主义行为进行整体调查。事发数小时后，警方断定爆炸有预谋，排除了的可能性。侦查人员没有立马找到与恐怖主义有关的证据，当时最初的调查还出现了纵火或破坏的可能性，直到几天后才发现恐怖主义的联系。曼哈顿的两个炸弹采用了相同的设计，装满轴承和BB金属弹的高压锅配备手机和爆炸时释放小剂量六亚甲基三过氧化二胺的，用作引发类似于的更大剂量的次级炸药的雷管。联邦调查局第27大街东已爆炸的高压锅炸弹及其附带的