分被分流到南站，而且上海西站日益残破，所以上海西站同时停止办理客运业务，原来所有客运列车分别转至上海南站和上海站到发。但仍保留为铁路职工而的通勤车乘降、货运及行包业务。2009年1月8日，投资40亿元人民币的铁路上海西站交通枢纽工程开始动工，接入沪宁城际铁路。车站在沪宁铁路修建期间施工单位对上海西站进行改造，以配合线路接入上海枢纽。改造工程包括既有京沪、沪昆铁路及站内到发线拨线、修建沪昆铁路南翔动走线特大桥等事项，期间对既有京沪和沪昆铁路修建了外绕线以方便站场施工。改造完成后上海西-上海区间4条股道北向