装修完工，位于台北市忠孝东路一段85号9楼（凯撒世贸中心大楼）。2006年，二二八事件纪念基金会出版《二二八事件责任归属研究报告》。2008年2月1日，二二八事件纪念基金会举行记者会宣布系列活动，未受邀的台湾二二八和平促进会秘书长张秋梧（民主进步党政治人物王世坚的阿姨、音乐人林暐哲的母亲）到场质疑二二八事件纪念基金会贪污、安插陈水扁政府的「落难官员」。张秋梧说，她与其夫林明德催生二二八事件纪念基金会，也曾任该会董事；该会却在陈水扁政府上台后排除异己，补助款发放不公，拒用民间推荐董事。张秋梧要求该会董事长