斯科普里机场有前往阿姆斯特丹、贝尔格莱德、布尔萨、布鲁塞尔、汉堡、伦敦等欧洲主要城市的航班。
公路.欧洲E75公路自挪威瓦尔德出发至希腊克里特岛，通过斯科普里东侧。E75号线还连接了斯科普里和马其顿国内其他都市，包括库马诺沃和韦莱斯、内戈蒂诺、盖夫盖利亚。欧洲E65公路则通过斯科普里北侧和西侧，并连接斯科普里和泰托沃、戈斯蒂瓦尔、基切沃、奥赫里德、比托拉等马其顿国内其他城市。
铁路.斯科普里中央车站位于距市中心以东2公里处，建设于1970年代，作为新的交通