来亚战役于1941年12月8日爆发，日军沿着马来西亚半岛西海岸南下，英军和其他盟军撤退到新山；然而，随着日军在1942年1月29日进一步的对其轰炸，第二天英国人于撤退前，炸毁了到新加坡的堤道，以此作为阻止日军在英属马来亚的更一步进逼。日本时任司令官山下奉文于1942年1月31日攻入新山，并且中断了该镇的发展。日本人随后使用位于新山的武吉仕林王宫作为他们的主要临时基地，策划新加坡战役的备战，同时等待堤道修复。
马来西亚时期.1963年马来西亚成立后，新山继续作为柔佛州首府，随