，其编制为内司镇（藩主直辖）前镇、后镇、一镇、二镇、三镇、四镇、五镇、楼船镇、左、右武卫营、左、右虎卫营、骁骑镇骑兵营、神器营（砲兵营）、亲丁镇等。
据台后.攻下台湾的明郑军队，随郑成功去世及丧失金厦据点后军力大幅受损，除郑经于闽南西征所建立的军队外，以屯兵方式为主的明郑军队于台湾并简化成约数万名，如五军戎政（五军戎务）、总督军务、管军提督、将军、亲军卫镇、陆师镇、水师镇及监军数部份。1683年郑氏王朝覆灭后，郑军将领与军队悉数被强迫内渡唐山，而据《钦命太保建平侯郑造报官员兵民