世界青年羽毛球锦标赛，结果她在女单决赛以2比0（21-15、21-16）战胜队友李盈盈，成为大马首位世青赛女单冠军。2016年3月，吴堇溦出战奥尔良羽毛球国际挑战赛，在女单决赛以2比1击败了印尼的菲特里亚尼，赢得国际赛女单冠军。同年9月，她出战印尼羽毛球大师赛，在女单决赛以0比2不敌赛会头号种子、泰国的布桑兰·恩布鲁庞，赢得亚军。同年10月，她出战泰国羽毛球黄金大奖赛，在女单准决赛以0比2不敌赛会3号种子、东道主的布桑兰·恩布鲁庞。同年11月，她代表马来西亚参加西班牙毕尔巴鄂举办的世界青年羽毛球锦标赛，