莎拉撮合了肖卡特和巴沙尔的关系。在巴沙尔·阿萨德成为总统后，他也成为一名重要的高级军官。而另一方面，肖卡特与布莎拉和巴沙尔的弟弟马希尔·阿萨德关系糟糕，据说1999年马希尔开枪射中了肖卡特的肚子。
政治生涯.2000年6月巴沙尔·阿萨德继任总统后，肖卡特被广泛认为是叙利亚最有权势的人之一。2001年，他担任叙军事情报部门的副主管，军事情报部门是叙情报机构的主要组成部分。他的主要任务是与巴勒斯坦的激进组织如哈马斯和杰哈德联络，他也是叙利亚驻军黎巴嫩期间的关键人物。九一一恐怖袭击后，肖