别市政府奉令将所辖浦东南区等区政务署改称区公署。民国30年（1941年）8月1日，《上海特别市政府各区公署暂行规则》发布，规定区公署分为二等，浦东南区为二等区。民国32年（1943年）8月6日，浦东南区改称第六区。民国33年（1944年）8月1日，上海特别市政府布告，全市行政区域划定为市区、郊区和县区，第六区复名浦东南区，浦东南区属郊区。民国34年（1945年）抗战胜利后，浦东南区撤销。