连串社会事件及新型冠状病毒疫情影响，广深港高速铁路停驶、严格出入境管制措施使访港旅客近大减及迪士尼乐园数度暂停对外开放，使本线失去往返迪士尼乐园、机场及市区的客源，乘客量明显下跌。因此由2020年2月29日起直至另行通知，星期六早上所有列车往来东涌站至香港站。此外，乘客又能够借本线转乘机场快线、西铁线、荃湾线和港岛线，所以本线亦分流了原来使用荃湾线往返新界西和香港岛的人流。某程度上舒缓了荃湾线九龙段（美孚站至尖沙咀站）及金钟站的挤逼情况。惟2002年8月起观塘线不再过海前往香港岛，部份观塘线石硖尾站至彩