皮内罗洛、萨维利亚诺和佩罗萨未还。后来因为法国爆发从1562-1598年的宗教内战，伊曼纽尔终在1574年让法王亨利三世归还那三块土地，同时让制衡法军的西班牙军队从萨伏依的阿斯蒂和桑梯亚撤出，完整光复了萨伏依公国的主权。他又在1563年将首都从香贝里迁到都灵（人口2.3万），并建立大规模的堡垒工事。
军事改革.趁着法国陷入30多年的新、旧教内战，他一心一意扩展领土。他特别注重军事力量以保卫国家，像是以有限的方式建立征兵制（民兵），对每个教堂的教区征召一支军队，由在职军人进行正规训练