一级、二级保护珍稀植物在武功山已发现十多种，另外还有江西省重点保护植物约70种。主要为红豆杉、银杏、樟树、鹅掌楸、金毛狗、黄皮树、厚朴、香枫、云锦杜鹃、猴头杜鹃、粗榧、香果树、观光木、夜光树、水桠木、黄山木兰、独花兰、藤檀、鸡爪槭、橄榄树、麻栎、桧柏、黄山松（台湾松）等。尤其台湾松，从明月山玉皇殿、中引塘、雪竹坳，直到羊角尖分布达10余华里，面积约有11000亩，其面积之大，生长之好，林相之齐可谓全国仅有。
动物.武功山由于地域辽阔，植被覆盖度高，自然环境优越，给多种野生动物生长繁