但不久后因为父亲逝世居丧三年，复出后任咸吉道都镇抚，并兼知刑曹事、兵曹参议、刑曹参判等官职。1455年，首阳大君（朝鲜世祖）篡夺端宗的王位。金文起与都中的成三问等人密谋推翻世祖。同谋的金礩向世祖告发此事，导致被捕。他在狱中拒绝承认参与密谋之事，最后被凌迟处死，夷灭家族，没收家产，妻女赐给大臣为奴婢。1791年（正祖十五年），朝鲜正祖为他恢复名誉，追赠谥号忠毅。