付费区并不相通。1号线和5号线站厅的收费区各自设有多组扶手电梯、楼梯以及1台专用电梯供乘客前往月台。杨箕站的1号线站厅层和5号线站厅层均设有商店，例如有便利店、时装店、洗衣店等。此外本站也有不少自助服务设施供乘客使用，包括自动售卖机、中国建设银行和招商银行的自动柜员机、自动售卡充值机以及好易自助服务机等。
换乘.杨箕站与东山口站、黄沙站一样，均采用连接各个站厅的通道换乘模式。如1号线换乘5号线为例：先从1号线站台上1号线站厅，经原来A出入口改造后的换乘通道至客流集散厅，然后到达