轩一家迁往北京，改隶汉军八旗。刘国轩于康熙三十二年（1693年）逝世，享年六十五岁，清廷同年追赠太子少保。
反对进攻吕宋.西元1683年，刘国轩于澎湖海战中败于施琅，逃回承天府（今台南市）。战后，宰辅冯钖范召开文武会议，与黄良骥、洪邦柱以及中书舍人郑得潇共同奏请幼王郑克塽攻佔吕宋岛，以延续东宁国的国祚。施琅此时派遣曾蜚前来招抚，并以总兵之职欲诱降刘国轩，刘国轩因而主张举国投降满清，并且拉拢冯钖范以及众多将领，东宁王国遂亡。