领地献予当地贵族或是寺社，借此变为庄园主，奉宗主为领家；领家再将庄园献给中央的权势贵族，奉之为本家。此类庄园称为寄进地系庄园。由于进献盛行，日本至12世纪末已是庄园遍布，庄园主几乎成为封建主，而内部由于层层进献又形成封建等级制度。武家政权时代，日本商品经济得到发展，庄园自给自足的经济模式受到冲击，趋于瓦解；武家政权先后下达多条政令遏制庄园主权力。1582年，丰臣秀吉为征服日本各地而推行太阁检地，整理以前复杂的土地拥有权，更新土地制度。日本庄园制度被完全消除。