最大债券投资公司太平洋投资管理公司（Pimco）任职。2005年，升任该公司董事总经理，后来39岁时正在PIMCO负责230亿美元“绝对回报策略”的对冲基金系列。2009年底，出任中华人民共和国国家外汇管理局储备管理部门首席投资官。任内，朱长虹减持美国国债，扩大投资美国企业债券、股票、不动产。此后，随着美国经济复苏，中国获得的外汇投资收益较高。2012年下半年，他又大举买入日本股票。随着2013年安倍经济学推行，日本股市暴涨，中国再度获高额回报。