络、细胞信号通路、调节网络、以及在系统生物学研究范畴中的其它系统。
历史.2000年，在日本科学技术振兴机构(JST) 的资助下，Hiroaki Kitano和John C. Doyle发起组建了一个研究小组试图为系统生物学的计算模型发展更佳的基础性软件。Hamid Bolouri是这个小组的组长，其成员有Andrew Finney、Herbert Sauro以及Michael Hucka。他们最初的工作集中于设计一个使现有的生物学模拟软件包中的一部分可以互相交换数据的系统。这些软