（"S. millenii"），是在1999年被叙述。第二个种是郝氏中国鸟龙（"S. haoiana"），是在2004年所叙述，与千禧中国鸟龙的差异在于头颅骨与臀部的特征。种名"haoiana"献给中科院院士、古生物学家郝诒纯。一个暱称为「Dave」的手盗龙类标本（编号NGMC 91），其保存状态极好，可能代表中国鸟龙的第三个种，或是幼年个体。但2007年的种系发生学研究，显示这个标本可能是小盗龙的近亲。在2011年，菲力·森特（Phil Senter）提出这是因为标本的错误鑑定导致的结果，并将编号NGMC