4月第12届连任朝鲜民主主义人民共和国最高人民会议常任委员会委员长。2009年4月9日，朝鲜第12届最高人民会议修订宪法，宣布国务委员会委员长为国家元首。金正日成为名义和实际意义上的朝鲜国家元首。在外交方面，金永南以朝鲜国家元首身份出席了2008年北京奥运会开幕式、2014年索契冬奥会会开幕式和2018年韩国平昌冬奥会开幕式。2010年9月，在朝鲜劳动党代表会议上当选中央政治局常务委员会委员。2011年12月17日金正日去世。在金正日的中央追悼大会上，金永南致悼词。金正恩继位，金永南为朝鲜第二号