高估的股价，在另一个市场上做多被低估的股价，期待两者价差回归正常范围。但股票价差回归的时间难以预测，套利者的头寸可能需保有较长时间才能获得盈利，有时价差会进一步扩大，甚至迫使套利者追加保证金或放弃持仓。两地上市企业股票套利的着名风险案例可以参见长期资本管理公司在皇家荷兰壳牌股票套利上的失败。
风险.套利交易虽然理论上比单边交易风险低，但其风险亦不可低估。以股票价差套利为例，虽然股票价差套利交易风险一般很低，但仍存在出现极端价格变动导致风险大幅提高的可能，特别是在金融危机导致价格