学的创办人是王德馨医生，广东东莞人，王医生为纪念她已故的双亲王肇端及黎单枝，遂从他们的名字中，各取一字，合併而成为「王肇枝中学」。王医生战前于广州开设医务所，退休后移居香港，她平生笃信基督，乃捐港币255,000元，再得教育司署拨地及资助相等的款额，于大埔墟现址兴建校舍。王肇枝中学校舍于1960年1月落成，同年2月8日正式开课，是大埔首间开设中、英文部及初中、高中班级之政府津贴中学。首届校监为曾任教育司署助理教育司黄国芳先生，首任校长为退休教育官冯锐韶太平绅士。1966年，王医生再捐赠港币十余万元，