都主要通过肾小球泸过清除。因为磺胺嘧啶水溶性低，可能会在尿中形成结晶，对肾脏产生损害。可服用与磺胺嘧啶等量的碳酸氢钠使尿液碱化、增加磺胺嘧啶溶解度、减少结晶尿对肾脏的损伤。
医疗用途.借由抑制细菌内的叶酸生产，达到杀死引起感染的细菌，常用于治疗泌尿道感染和烧烫伤。亦可用于治疗全身性的感染，适用症包括风湿热、软性下疳、披衣菌感染，以及流感嗜血桿菌引发的感染。因为磺胺嘧啶的血脑屏障透过率高，也用于治疗流行性脑炎。临床上，会併用磺胺嘧啶与乙胺嘧啶（pyrimethamine），以