前任高雄县长、高雄白派大老陈新安，母亲陈魏莲芷经营幼儿园。陈建仁总共有八个兄弟姊妹，么弟陈建德是同步辐射学者，国家同步辐射研究中心主任，和陈建仁一样以47岁之龄即当选中央研究院院士，两人也都获得总统科学奖。陈建仁的妻子罗凤苹是外省第二代，父母皆来自中华民国南京市，两人结识于台大慈幼会（又称慈幼社），婚后勤学台语与夫家沟通；两人育有二女，中华电信退休后在教会服务。受妻子影响，陈建仁及女儿都是虔诚天主教教徒。
生平.1951年6月6日，出生于旗山延平一路故居，他于台北市立建国高级中