对于Y染色体及粒线体DNA的单倍群研究已大大支持一个晚近的非洲起源。来自常染色体DNA的证据也支持晚近非洲起源的可能性。然而，某些研究显示，古智人（Archaic Homo sapiens）的遗传成分也有可能掺杂在当代人类当中。最近关于尼安德塔人与丹尼索瓦人的基因体排序也显示确实发生某些混杂。在非洲以外的现代人类在其基因体中，有2-4％的尼安德塔人的等位基因，美拉尼西亚人额外具有4-6％的丹尼索瓦人等位基因。这些新的结果并不与《源出非洲》模型相抵触，但显示发生了一些额外的混杂事件。可能源自于距今73,00