6月9日，部分留守的中央研究院人员在上海举办21周年纪念会。6月17日，中央研究院正式被军管会接管。9月16日，竺可桢、陶孟和、吴有训等联名致信在海外的赵元任等人，介绍上海战役结束4个月来的情况，动员他们回国参加“新中国建设”。1949年11月1日，中国科学院成立，郭沫若任院长，李四光、陶孟和、竺可桢任副院长。
计划提出与实施.1948年11月29日，平津战役打响。蒋介石急召朱家骅、傅斯年等人，拟定了平津学术教育界知名人士抢救计划。朱家骅、傅斯年、蒋经国等人拟定了抢救细节办法。接到