香港供职期间，彭定国负责防范中共特务渗透香港，其中最广为舆论关注的事蹟，是在1961年侦破轰动一时的曾昭科案。曾昭科是当时少数晋身警队高层的华人，在警队内备受器重，他在1960年9月获港府补送到英国剑桥大学深造，到1961年更以年仅36岁之龄返港后出任黄竹坑警察训练学校副校长，职级为助理警司。然而，在1961年10月3日，政治部在彭定国主持下突然採取行动，引用《递解外国人出境条例》（Deportation of Aliens Ordinance）把曾昭科拘捕，一时引起舆论议论纷纷。曾昭科被捕后，先后被拘