翰林院庶吉士，散馆后授翰林院编修。咸丰四年（1854年），文宗命翰林缮录《贞观政要》，椿寿充任总校，纠正数十事上呈，获嘉奖。后署广东雷州府知府，因平反前任所判冤案得罪上级，调任廉州府知府。咸丰七年（1857年），天地会反清农民军李文彩部攻打廉州属地灵山县，郭椿寿坐镇县城督剿。十一月十三日晚，城破，郭椿寿微服缒城出逃，回到府城后，闭门痛哭三日，人称“哭府”。不久受到追究，被撤职。后来得以开复原官，因积劳病卒。光绪《安邑县续志》有传。