车站停靠，除此之外该站也是地方铁道业者北近畿丹后铁道的几个据点车站之一。
车站构造.西舞鹤车站全部的月台皆筑于地面上，月台区大体可以分为JR西日本所使用的主月台区域，与北近畿丹后铁道所使用的区域。其中JR西日本的部分配置有两座岛式月台共4条贯通车站的乘车线，而北近畿丹后铁道则是配置一座侧式月台（实际上是岛式月台的半边）与一条乘车线，且为单向通行的终端式路线。有部分站体是建在横跨铁路线的天桥之上。另外，两家铁路公司为了方便双方的直达列车能够互相在对方的路线中行驶，特别让JR西日本