1979年美丽岛事件发生之后，吴淑珍对于陈水扁是否成为该案辩护律师即曾表示赞成。1985年11月18日，外出为落选台南县长选举的陈水扁谢票时，吴淑珍遭张荣财驾驶拼装货车从巷弄中撞击，自此下半身瘫痪，终身须依靠轮椅。1986年6月，其夫陈水扁因蓬莱岛杂志案入狱；12月，吴淑珍代夫出征，代表甫成立的民进党参选第五次增额立委，并以第七名（应选八名）当选。陈水扁出狱后担任其特别助理。1987年于立院大会质询，吁请政府调查金门三七事件。
争议.
贪腐丑闻.