营市区公车，须经直辖市、县（市）政府所设置的审议会的审议，由直辖市、县（市）政府或其设立的下属业务主管机关核定后，方可营运。亦有由各级地方政府设立所属机关来专责经营该管辖区内的市区公车业务者。收费方式也因分属各直辖市、县（市）管理而各有不同，如桃园市、台中市、嘉义县、澎湖县採用「里程计费」模式；台北市、台南市、高雄市、彰化县、南投县、屏东县、宜兰县、花莲县、台东县等则兼採段次及里程计费；其他直辖市、县（市）则採「段次计费」（如：新北市、基隆市、新竹市、新竹县、云林县、嘉义市、金门县、连江县）。凡由直辖市