从苏联内务人民委员部以及手中夺回了爱沙尼亚南部。同时，苏联的准军事部队，，基于约瑟夫·史达林所下令实施的焦土政策，在爱沙尼亚境内展开了破坏行动，包含抢走一切能带走的物品、屠杀持不同政见者、带不走的物品便加以焚毁。最后，爱沙尼亚全境被德军佔领，全境被併入纳粹德国新设的殖民地：奥斯兰总督辖区。
二战其间.1941年，爱沙尼亚人分别被苏联红军和德意志国防军动员，从而加入他们的军队。其他人则避开这些动员，他们分别加入、、英国皇家空军以及美国陆军，抗击纳粹德国海军在大西洋的进攻。Sectio