原先用于中的大肠杆菌DNA聚合酶。Taq酶的最适活性温度为75–80°C，在92.5°C时半衰期高于2小时，95°C时为40分钟，97.5°C时为9分钟；Taq酶可在72°C时于10秒内复制一含有1000个碱基对的DNA。Taq酶的缺点之一是缺乏从3'端到5'端的外切酶校正活性，从而导致Taq在复制时保真度不高。原先测得的错误率为每9000个核苷酸中出现1次错误。为了降低出错的机率，科学家陆陆续续发现了其他可以取代Taq聚合酶的聚合酶。举例来说，Pfu是具有3'至5'端外切酵素特性的聚合酶，出错机率