多数的病患在患病后在卵巢、输卵管和子宫周围的组织会有感染与影响，而且，甚至有极少数的患者在身体的其他部位也会产生感染。每个月因子宫内膜异位症造成出血的部位会有发炎与留疤，促进此疾病生长的细胞不是癌症。诊断常是依据症状并结合血液检测及医学影像技术。然而活体组织切片是所有检验当中最精确的方法。会引起相同症状的疾病包括有：骨盆腔发炎、大肠激躁症、间质性膀胱炎，和纤维肌痛。子宫内膜异位症很容易被误诊，许多病患被告知这些症状是微小或是正常的。一些实验证据显示，服用复合口服避孕药能降低罹患子宫内膜异位症的机率，大量的