建立两个独立国家的话在印度次大陆上会爆发内战。1943年7月26日有人试图刺杀真纳，真纳负伤。一开始这个分裂的建议只遭到了国民大会党的嘲笑，英国也不认为它有任何政治意义。但是1940年代的印度内部本身已经分裂了。钱德拉·鲍斯带领着一支武装力量试图在纳粹德国和日本的帮助下解放印度。在所有印度党派中，除穆斯林联盟外，印度共产党和印度教大斋会均反对甘地和国民大会党组织的退出印度运动。这个运动虽然被看作是最强大的印度反抗运动，但是被英国无情镇压。穆斯林联盟参加几乎印度所有省的政府，着名的真纳支持者如阿迦罕座在英