培养起来的上杉家势力和威信大幅衰退。御馆之乱亦是令到武田家灭亡的远因。氏政向实弟（或从弟）景虎送出支援而依赖同盟者武田胜赖。当初胜赖为了支援景虎而亲自出阵，但是后来变为支援景胜。的理由是遭到德川家康向远江、骏河方面侵攻(借口)接受景胜的求和条件（割让上野沼田领和黄金）。同时，武田家中支持与景胜和睦的唿声相当高，胜赖于是背叛景虎并与景胜和睦，并让景胜迎娶妹妹菊姬。氏政因为胜赖的背信而破弃第二次甲相同盟，在天正7年（1579年）与德川家结盟，翌年（1580年）再与织田家结盟。所以在上杉家的国力大幅度疲弊