大学布鲁明顿分校是印第安纳大学系统的旗舰，西雅图华盛顿大学是华盛顿州的旗舰等等。然而在其它的一些州里，例如俄勒冈州、罗德岛州和佐治亚州，所有的州立大学系统的成员学校都被同等对待，并无旗舰学校的说法。在有些州份里，州立大学系统下面还会分出子系统，如加利福尼亚州的州立大学系统下分加州大学系统和加州州立大学系统（该州第三大高等教育系统加州社区学院系统并不属于州立大学系统）、而德克萨斯州下面则有多达六个子系统，为各州之最。最特殊的为宾夕法尼亚州。该州除了州立大学系统以外，还有四个州关联（State Relate