0核酸及以内，转录子仍会被正常翻译；但如果终止密码子在任意外显子-外显子连接复合体上游50核酸开外，转录子就会被NMD机制下调。磷酸化的UPF1随后接触SMG-5、SMG-6、SMG-7等蛋白，这些蛋白可以促进UPF1的去磷酸化。 SMG-7常常累积于处理小体中，处理小体是mRNA讲解的细胞质位点，故而SMG-7也被认为是终止效应器（）。在酵母和人类细胞中，主要的mRNA降解通路都是通过核糖核酸外切酶XRN1降解后5′端帽的切除触发的，但亦有透过3’-5'的多腺苷酸化降解的。NMD机制不仅针对异常转录子