元旦正式运营，2005年底完成复线改造。在河唇站与河茂铁路相连，在塘口站与粤海铁路相连。2016年底，黎湛铁路黎塘至玉林段完成电气化改造，并开行动车组。2017年12月20日，黎湛铁路玉林至湛江段电气化开通。黎湛铁路全线，包括广东境内的茂名支线（现河茂铁路），都归南宁铁路局（原柳州铁路局）管辖。
重大事故.2008年6月30日，黎湛铁路广西境内米场—玉林间（K164+900），因山体滑坡，造成广州开往重庆1322次列车的机车及机后1至6位车厢脱轨，7人受伤。