清华开始组织学生参加北京国际马拉松赛，2004年参加人数增加到6447人，占总参赛人数2万5千人的四分之一，其中770人向全程冲刺，627人跑完全程。1999年开始，清华与国家射击射箭运动管理中心开展合作，将清华大学射击队列入国家射击训练队管理体系，由王义夫担任教练。到2009年底，在十年中，射击队在国内外比赛中夺得149块金牌、111块银牌、58块铜牌。2005年8月，经管学院体育特长生胡凯在伊兹密尔第23届夏季世界大学生运动会夺得男子100米赛跑冠军，被称为“眼镜飞人”，王颖夺得女子三级跳金牌。2008