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空军.印度尼西亚空军编成第一（西部）、第二（东部）空军作战司令部和特种部队司令部、训练司令部、维修司令部。
海军.印尼海军是印尼国民军的海上武装部队，主要任务有保卫印尼漫长的海岸线、领海、岛屿和专属经济区，捍卫印尼海洋战略利益以及防御海上威胁等。1945年9月10日成立，目前由三支舰队、军事海运司令部以及海军陆战队构成。