倪元璐、徐石麟等人“以文章相引重”。天启四年（1624年）福建乡试中举人。崇祯四年（1631年），登进士二甲三十九名。崇祯五年担任南户部主事、广东司员外。崇祯八年任嘉兴知府，崇祯十二年任浙江副使。在浙江期间，“政务简静，听讼必折以理”。崇祯十五年，授右佥都御史、任应天巡抚，后改江南巡抚。崇祯十六年十一月，郑瑄移镇芜湖，后徙池阳。崇祯十七年，任南京大理寺卿。，是年十一月罢大理寺卿。隔年（1645年），闰六月，迎立唐王朱聿键于福州，擢刑部左侍郎，升工部尚书。郑瑄曾为郑成功请发鸟铳，遭到隆武责备。隆武二年（164