卓尼设治局，民国时设置于甘肃省的设治局，位于甘肃西南部，今甘肃省卓尼县。
历史沿革.辖地原为卓尼世袭土司杨氏领地。民国二十八年（1939年）以卓尼土司辖地改置。设治局局所驻卓尼（今甘肃省卓尼县驻地柳林镇），隶属于甘肃省第一行政督察区。1959年5月，改为卓尼自治区。