会上海中远，两个赛季后退役，开始担任二队教练、体能教练、助理教练、领队等职务，并随队搬迁到陕西，长期协助转任主教练的成耀东。2009年赛季开始前，吴兵以个人原因辞职返回了上海。2010年，吴兵曾重新回到职业足坛，出任上海东亚的领队兼助理教练，协助主教练范志毅。