946至1949年第二次国共内战期间，中华民国空军在中国以及台湾海崃周边参与作战支援与空袭中国共产党的任务。并且与中国人民解放军空军发生至少11次空战。1949年4月，中华民国空军与中华民国的其他政府部门一起退往台湾。同年10月，中华民国空军在金门的古宁头战役中协助阻止中国人民解放军推进。
1949年-1990年.在1949年后与冷战时期，中华民国空军的飞机在海崃两岸巡弋，并多次与解放军空军交战。此时中华民国空军从美国方面获得大量装备，例如F-86、F-100、F-101、F-10