件构体系统，使用摩擦搅拌銲接（Friction stir welding）方式将铝合金制造成双皮层构造。在车体外观参考了885系，而车头结构则採用玻璃纤维制造的连结器罩，并且首次使用连结器罩将车头的连结器隐藏，进行列车调度时才会开启使用，而车头外型与推拉式自强号相比较为圆滑。车灯的设计与885系不相同，在驾驶车窗上方加上了头灯。车窗与885系相同採用小型车窗，而车门不同于885系所使用的嵌入式滑轨自动门，而採用了滑塞式自动门。由于每个车站月台高度不同以及间隙较大，在TEMU1000型设置了与新干线400系电