站目前作为2号线和5号线两线的换乘站兼终点站。5号线未来将规划继续向南伸延至蛇口邮轮中心一带。
车站结构.赤湾站是一个地下两层11米双岛式月台车站，其中2号线月台总建筑面积为14900平方米。赤湾站的结构共分两层，其中两个岛式月台设于下层，而上层则为车站大堂。车站设有四条轨道。2号线月台西端设有两条交叉渡线连接蛇口西车辆段，供2号线列车站后折返或返回车辆段，同样在东端设有交叉渡线进行站前折返。5号线月台西南设有交叉渡线，供5号线列车进行站前折返，正线南端尽头亦有预留继续未来5号