2名船员项彦豪、杨坤风则是在6月12日自沖绳那霸机场搭乘中华航空班机返台，6月13日晚间，船长被释放并撘乘班机返华。
各界反应.这次事件，引发台湾朝野各界震惊，6月12日，渔民劳动人权协会等民间组织包围日本交流协会示威，而时任台北县县长周钖玮亦亲自前往日本交流协会为县籍鱼船遭撞表达抗议，要求日方释放被扣留人士。中华民国外交部表示关切，时任外交部长欧鸿鍊在事发后旋即召见日本交流协会台北事务所所长池田维（驻台代表），当面表达「严正抗议」，另外也声明中华民国拥有钓鱼台列屿的主权，要求放人