8年5月4日，孙中山愤向非常国会提出辞职，通电揭露西南军阀破坏护法的真面目，向国民沉痛宣告：「吾国之大患，莫大于武人之争雄，南与北如一丘之貉。」在广州缺乏制衡桂系军事力量的孙中山，调集手下广东省长朱庆澜的粤军警卫军20营，改编为军政府直辖护法军，由陈炯明率领，并从上海招集蒋中正赴广州，任命蒋为粤军总司令部作战科主任，负责规划闽南战役。改靠沪、粤、闽、浙、赣各省的势力重整展开北伐作战。1918年5月20日通过改组，非常国会不顾孙中山的警告，改组军政府，选举唐绍仪、唐继尧、孙中山、伍廷芳、林葆怿、陆荣廷