人类微生物组计划（，缩写：HMP）是美国国立卫生研究院于2008年发起的一项旨在鉴定与阐明和人类健康与疾病相关的微生物（人类微生物组）功能的计划，计划耗时五年，总投资达1.150亿美元。这和类似的美国国立卫生研究院赞助微生物（Microbiome）项目的最终目的都是测试人类微生物变化如何与人类健康或疾病有关。这个主题目前还不十分清楚。