有这些基因的细菌能够在其它细菌存在的情况下或者在其它环境中生存和繁殖。它们往往具有抵抗噬菌体、抗菌素和一些重金属的特性。通过限制酶它们可以比较容易地被消除或者分立出来。在受到限制酶处理后质粒往往会断开，这时可以把特意挑选的段添加进去。这些段比如可以生产胰岛素、生长激素和催生素之类的肽类激素药物。在把这些有用的基因加入质粒之后这些细菌被用作病毒载体，它们不断复制并且把被更改的基因感染到其它细胞中去，增加携带重组的细胞数量。在基因治疗中质粒的使用也是一个关键因素。在这里使用的病毒是-{zh-cn:克隆;zh