移民至中亚城市如别失八里、阿力麻里、撒马尔罕屯田，吉尔吉斯也是屯驻地之一。长春真人也曾通过吉尔吉斯前往阿富汗与成吉思汗会面。由于中国和吉尔吉斯斯坦是邻国，国家之间的人口流动历史悠久。东干人在反清政府起义失败后于1877年逃到吉尔吉斯斯坦，他们定居在七河地区以及费尔干纳谷地。二十世纪初期，维吾尔族，东干人和汉族人士以煤矿，棉花厂和农场的移民工人身份来到费尔干纳谷地，有些在吉尔吉斯斯坦永久定居。20世纪50年代发生的大跃进失败刺激了许多新疆的人逃往包括吉尔吉斯斯坦在内的苏联中亚地区，以摆脱中国的困难。但是，