地底，属于港铁观塘线与荃湾线的铁路转乘站。
车站设计.太子站是一个地底车站，共有3层，最高一层是大堂；中间的一层是1号月台（荃湾线往荃湾）及2号月台（观塘线往黄埔）；而最低的一层则为3号月台（观塘线往调景岭）及4号月台（荃湾线往中环）。
大堂.车站设有两个收费区大堂，其中一个近E出入口的大堂只设有入闸机，并设有两条分别通往不同层的月台的扶手电梯，并只会被启用作下行用途。在油麻地站和黄大仙站亦有相似的设计，但后者并非全日开放的。
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