月，除授（拜官授职）尚书右仆射。同年刑部侍郎、权判太常卿马缟奏请明宗别立亲庙，追尊生身父祖为“皇”，得李琪等认可，但明宗想追尊生身父祖为皇帝，李琪等又请追尊明宗生身父祖为皇帝，曾祖、高祖为皇。在郑珏合群议所奏下，最后明宗追尊四代生身先祖为皇帝。李琪上书中书省称按《开元礼》“上事日合有恩赐百官酒食”“仆射上事日，中书、门下率百官送上”，中书省下发太常寺，太常寺说查《开元礼》无“送上”之文，亦无恩赐酒食之事。前次拜相之争后，李琪为宰相们所疑，他们仔细检查他的上表，寻找错漏，导致李琪所奏事多被阻拦。三年（92