与天祚帝同被金兵俘获，与辽主被金军所俘，金太宗以其忠于主，特加礼待。金太宗天会四年（1126年），奉命出使宋朝。北宋朝廷请他致蜡丸书于辽旧臣耶律余睹，使为内应。萧仲恭明面上应许，北还见完颜宗望，即献蜡丸书。金人遂以此为借口大举侵宋，攻陷开封，俘宋徽宗、宋钦宗二帝。萧仲恭历任右宣徽使、殿前都点检。金熙宗天眷三年（1140年）指斥完颜宗磐，因功进升为尚书右丞。皇统初年，封兰陵郡王，授世袭勐安。皇统七年（1147年），升平章政事，监修国史，封济王。皇统八年（1148年）六月，改任行台左丞相，八月，入为尚书右丞相，