东大学附属中学占用；1938年日本侵华，傀儡政权曾一度占用光孝寺作为伪政府的“和平救国军总司令部”。日本投降后，又被广东省义理学院占用，后义理学院撤出，又被广东省立艺术专科学校占用，并在寺里开设了美术部、音乐部、戏剧部，把绝大部分的禅房、佛殿占去。当时国民政府提出“教育建国”方略，因此只要与教育有关，一切均要大开绿灯让道。所以寺庙里传出的钟声、经声，经常夹杂着乐声、歌声、读书声。
中华人民共和国.1949年中华人民共和国建政；僧侣们对中国共产党提倡的信仰自由感到高兴，期望能把霸占寺