由电子传递链和三羧酸循环（柠檬酸循环）分解。无氧唿吸与有氧唿吸不同，一些（比如硫酸盐、硝酸盐、铁、锰、汞、一氧化碳等）在它的电子传输鍊中取代了氧的位置。发酵与无氧唿吸不同，电子传递链没有参与糖酵解生成的丙酮酸的分解（即没有氧化磷酸化）。乳酸发酵、混合酸发酵、均爲发酵的实例。在消耗等量有机物的情况下，无氧唿吸和发酵产生的能量（即ATP（三磷酸腺苷）的产量）比有氧唿吸要低。这也是兼性厌氧菌在氧气充足的条件下优先进行有氧唿吸的原因。兼性厌氧菌的此行爲可在它们被培养于巯基乙酸肉汤培养基时观察到。Sect