返回地面后，认为自己「亲见泉国，此既不祥」，于是在筑紫日向进行一次「禊祓」（袪除污秽的净化仪式）。在洗濯过程中，从他抛弃的衣物及身上的秽物，生成三位污秽之神，他们是八十枉津日神、神直毘神、大直毘神，另外又生海神、船神，以及三位「贵子」天照大神、月读尊、素戋呜尊等神灵。之后，伊奘诺尊安排天照大神管治「高天原」、月夜见尊「配日而知天事」，又命素戋呜尊管治「海原国」，素戋呜尊不从，遭到放逐。到此伊奘诺尊功德圆满，《日本书纪》说他最后「神功既笔，灵运当迁。是以，构幽宫于淡路之洲，寂然长隐者矣。亦曰，伊奘诺尊，功既至