后，林文察架砲台连日砲轰，于2月6日斩杀林日成，大致平定戴潮春事件。此战林文明表现杰出，晋升为副将，并赏戴花翎。1864年，林文察将平定内山的军务交付林文明，并于9月15日令林文明执行军务。
成为林家家主.1864年十月，林文察赴福建作战，旋于12月1日战死于漳州万松关。林文明身为家中辈分最高（活着人中仅有顶厝系的林奠国辈分上比他大，但此时林奠国因案滞留福州）与官位最大者，自然成为雾峰林家的家主。由于受到台湾兵备道丁曰健的压迫，林文明于戴潮春事件时立下的功勋被刻意忽视，而其在台