属面积最大、人口最多的行政区，也是连江县政府所在地，自从马祖南竿机场兴建完成后，南竿已成为马祖地区交通、政治、经济、教育及文化中心，因此当地人皆称南竿为「本岛」。南竿乡辖区包括人口聚居的主要岛屿南竿岛，及黄官屿、鞋礁、北泉礁、刘泉礁等无人岛礁，均属于马祖列岛的一部分。
历史.南竿岛最早历史可上推至新石器时代，考古学者在本岛福澳村发现史前文化遗址，考查出土文物证实与福建省闽侯县甘蔗镇昙石村的「昙石山文化遗址」同属新石器时代文化层。南竿岛昔称「下竿塘」，与北竿岛合称「上下竿塘」、