毓民与郑经翰曾向警方透露他们受到黑社会头子不断滋扰和施压，对方扬言受到国安部中某领导所委託，只要他们收声，愿意补偿给他们。及后，黄毓民妻子亦表示有人曾扬言不希望于9月12日香港立法会选举前在香港看见黄毓民。2010年尾，社民连爆发内讧之际，萧若元在香港人网节目爆料指黄毓民这段时间，共产党曾派人与他进行秘密谈判，共产党说只要他肯收口不再批评共产党，共产党愿意用3千万港币作报酬，萧若元建议以黄毓民当年的经济考虑，最好收下这笔报酬，但是黄毓民却表示如果他收下的话，他就这一辈子都抬不起头做人，所以拒绝收取3千万