庆长7年（1602年）5月，因为义宣没有出兵的暧昧态度，令佐竹氏被减封至出羽国久保田20万石（实际是40万石）。因为向以前有交情的家康、秀忠父子请求，于是不用被改易。在转移到久保田后，为了对付相继爆发的反佐竹一揆，前往与义宣不同的六乡城（现今仙北郡美乡町）的居城，在六乡町进行，并建设所领南部（仙北郡、、雄胜郡）。庆长17年（1612年）4月19日，于狩猎中坠马死去。享年66岁。菩提寺是阗信寺（现今秋田市手形字蛇野）。