4年），日本帝国借口琉球漂民为土着所杀，发动侵台的「牡丹社事件」。清廷命时任福州船政大臣、平定太平天国的名臣沈葆祯为钦差大臣并借饷银200万两为军费以主持台海防务。日本退兵之后，沈葆祯奏请抚垦后山及山区，板桥林家大力帮助。光绪10年（1884年），中法战争波及台湾，清廷派钦差大臣刘铭传以巡抚的身份主持台湾防务，林维源捐助饷20万两银圆，并协助刘铭传帮办台湾防务及出任垦务大臣，一跃为「红顶商人」，再经刘铭传而得与在燕京权倾一时的李鸿章、盛宣怀等人相识。光绪16年（1890年），出任太仆寺正卿。1894