留离职回沪。孙中山于1920年11月28日重返广州，重建军政府，返回广州后孙中山宣布重组护法军政府，继续护法运动。「第二次护法」开始。1921年1月12日，非常国会在广州复会。4月2日，非常国会开会，取消军政府，声称组织正式中华民国政府，为广州中华民国政府，4月7日通过选举孙中山为「大总统」，于5月5日在广州就职。孙中山当选后向国内外分别发表声明，并写公开信给北洋政府大总统徐世昌劝他自动离职。同时发表他的新政府的人事名单：孙中山就职「大总统」后主张以武力统一中国。但孙中山的北伐主张，遭到借