头壳召开股东会，决定停止营运。胡元辉表示，新头壳资本额还算足够，新头壳关门并非外界传言「钱烧光了」，而是找不到永续经营的商业模式：以台湾的网路环境，独立媒体无法靠网路广告支持营运，新头壳这几年想找多元营收的方式维持营运却无法达成目标。同年12月1日，《镜週刊》报导，新头壳创办人兼董事长苏正平表示，考量未来几年媒体环境可能不会改善，新头壳董事会及股东会决议2016年年底停止营运。2016年12月15日，新头壳发出公告，新头壳原经营团队在2016年11月时认为以现有经营条件，未来发展有若干关键瓶颈难以突破，