愿寺投降，之后尾山御坊被柴田胜家、佐久间盛政等人攻下，加贺一向一揆正式宣告灭亡。
与织田家之战.织田信长在天正3年（1575年）平定越前一向一揆的同时，让稻叶一铁父子跟明智光秀、羽柴秀吉、细川藤孝、簗田广正趁机追杀一揆众败兵攻入加贺国，拿下能美、江沼两郡，并将加贺的桧屋城跟大圣寺城则交给簗田广正、佐佐长穐跟堀江景忠父子镇守。在织田家大举平定越前一向一揆，而上杉谦信也击破越中一向一揆后，本愿寺显如开始跟上杉谦信接触进行和谈，并由将军足利义昭跟毛利家出面，在天正4年（1576年）6月