。1829年玉素普和卓，1846年卡塔条勒和卓，最后一次是1857年倭里罕入侵，入侵喀什因杀人太多失民心。他后来被阿古柏杀死。
云南回变.1855年－1873年云南发生冋汉冲突，杜文秀建立政权。失败后云南回族逃亡缅甸与泰国成为潘泰人。
同治回变.同治年间，甘肃、陕西、宁夏、新疆回族动乱。加上阿古柏入侵，最后由左宗棠平定，白彦虎逃走。
种族清洗.同治回乱后清政府实行洗回，左宗棠把陕甘回民送到宁夏管理。不准再信新教，而一早投降的马占鳌