古生物学界具有一定的影响力。20世纪80年代，新的支序分类学技术表明，这两个目的恐龙在三叠纪中有共同的祖先。2017年，《自然》期刊上的一篇文章对西利的分类提出了质疑和挑战。科研人员在研究了从三叠纪到白垩纪的74种恐龙的475个结构特征后认为，蜥臀目的兽脚亚目和蜥脚形亚目似乎没有之前认为的那么相关，而兽脚亚目与鸟臀目恐龙的关系则更近。西利也是翼龙的权威。他于1901年出版了《飞龙》（""）一书，概述了鸟类、爬行动物、翼龙和对翼龙骨骼结构的新发现。在他之前的科学家理查·欧文认为翼龙是冷血动物，不擅长飞行。