岛式月台。此站是整日无人车站，设有车站大楼。列车通常使用1号月台（西边）。车站正式名称中设有「远州」，但是在各种标示和车内广播中会省略「远州」两字，只会标示「西崎站」。车站东西两边设有单车停泊场（可容纳346架）。车站东北方设有侧线，停泊了电力机车和3辆。该处也存放了工程物资，包括压载物，由于土地空间有限，因此侧线较短，通常货车需要分开停泊。此站侧线会进行废车拆毁作业，当中机车和货车会把拆毁的部件运送往西鹿岛站。曾经此站设有车厂，在1977年（昭和52年）工场迁移至西鹿岛站，使现时只有留置线和维