墨器所含的颜色，笔桿和笔帽的一小块区域会有相应的墨水颜色。筒上有一个小孔，让笔内及笔外保持相同的气压。笔的墨水颜色种类繁多，除了有典型原子笔墨水颜色（蓝、黑、红、绿）之外，也有粉色及紫色。浓稠的墨水由于毛细现象从笔筒内部的管子流下来，送入球轴承，球轴承在黄铜笔尖内自由旋转。1961年，不锈钢球被更硬的碳化钨取代。原子笔首先经过，然后在涂有工业金刚石磨料的旋转板之间进行研磨，精度达到。原本的笔帽因为一端是堵住的，误吞的话可能会堵塞气道导致窒息，所以1991年起，该笔的流线型笔帽末端加上一个小孔。即使误吞也不会