羲及中大本土学社召集人何钧，但他们因不满现届及下届代表均有权投票的规定而退选，令秘书长一职暂时出缺。其后会上通过了取消现届代表投票权的会章修定。2016年4月10日，学联常委会认为学联作为学生会联会平台，不应加入其他组织，因此一致决定退出支联会和民间人权阵线。2016年6月7日，学联于代表会常务会议补选秘书长，由唯一候选人陈旻羲以信任票10票、不信任0票、及弃权票4票当选。而何钧则报称，因手提电话问题，以致未能于限期前提交报名表，所以无法参选。
历届秘书处名单.2018 年