，家庭是茶农出身，陈秋菊生于清咸丰年间的淡水厅拳山堡深坑仔庄（日治时期为台北厅深坑支厅文山堡乌月庄）。自幼颇知诗书，长大后，曾担任深坑庄总理。清法战争(西仔反)时，曾奉命招募团练义勇五百人防守基隆，并于基隆附近邀击法军有功，翌年获清廷以军功任命为四品武官，顶戴双花蓝翎，加赐都司。1894年，奉巡抚唐景崧之令率义勇以备边警。乙未战争之时，因守备黄宗河内渡，台民愤激，陈秋菊兼领其军，率领栋字隘勇左营及前营并兼有十数营乡勇，共约六千多人兵力（参见栋军），纷起义以武力抗御日本殖民者。日本佔领台南后仍在深