2006年全日本综合羽毛球锦标赛（），为第60届全日本综合羽毛球锦标赛，是日本国内最高级别的羽毛球比赛。本届赛事于2006年11月15日至11月19日在日本东京都驹沢体育馆举行。
项目奖牌榜.以下为各项目的优胜者及其所属团体名单：