厌氧鞭菌属是新美鞭菌门新美鞭菌科真菌的一属。其学名来自古希腊语词根"anaero-"（厌氧）和"mykēs"（真菌），指该属和新美鞭菌门其他各属真菌一样，为生活在食草动物消化道内的厌氧性真菌。