路线在古川这里以垂直方向交会，其中陆羽东线的在来线月台位于地面上，新干线月台则是高架设计。在2002年之前，JR货物原本在古川车站内也设有货运专用车站，但在货运站废站之后改以古川货柜中心（）取而代之，并在2006年时根据新的政策，将货柜中心改名为古川线外货运站（，或简写为「古川ORS」）。
车站构造.东北新干线与陆羽东线的轨道在本站是以接近垂直的角度立体交差。其中，在来线的陆羽东线为岛式月台1面2线的地面车站，由于月台的容量是根据1980年客运设施迁至目前位置时的需求决定，因此