n Peaks"）中扮演一名男扮女装的美国缉毒局（Drug Enforcement Administration）探员。杜考夫尼于1993年开始在科幻影集《X档案》中演出，于片中扮演男主角FBI探员福克斯·穆德（Fox Mulder）。这个角色是个阴谋论者，相信自己妹妹遭到外星人的绑架。《X档案》不久之后成为福斯电视网的卖座影集。杜考夫尼参与了第一季到第六季的拍摄，并且演出了《X档案》的电影版。直到第七季才因合约争议而退出。他偶尔会在第八季中现身，到了第九季才完全离开，而《X档案》也在第九季（2002年