清，擒献准噶尔汗噶尔丹之子色布腾巴勒珠尔，清朝授额贝都拉为札萨克，视同蒙古。额贝都拉子孙世袭爵位，管理哈密回民，史称哈密回王。哈密厅初置时为散厅。干隆二十四年（1759年），裁撤甘肃省靖逆厅，置哈密厅，设办事大臣、协办大臣、抚民通判、巡检，隶属于乌鲁木齐都统。干隆三十七年（1772年），改属甘肃省镇西府，安西道道员移驻巴里坤。光绪七年（1881年），辟为商埠。光绪十年（1884年），升为哈密直隶厅。光绪十二年（1886年），改属新疆省，隶镇迪道，副将驻防，且考语为「冲、繁」。民国二年（1913年）改为哈