为齿状核（Dentate nucleus），拴状核（Emboliform nucleus），球状核（Globose nucleus）以及顶核（Fastigial nucleus）。其中，拴状核和球状核常合称为间位核。深部核团在小脑半球的中心，被小脑的白质包维。深部核团是小脑除了其前庭部分以外的唯一输出途径。
输入.小脑深部核团的抑制性输入主要来自小脑皮层的普金耶细胞。这些抑制性输入的神经传导物质为GABA。小脑深部核团的兴奋性输入主要来自苔藓纤维(Mossy fibers)