仲琳随孙中山南下护法，出任大元帅府参议。民国七年（1918年），卢仲琳的父母“七秩双寿”，孙中山亲自出席在广州举行的寿筵，并现场书写了一幅寿幅。后来，历任中国国民党本部广州特设办事处财务科主任、通讯处代处长，中国国民党中央党部交际科干事。1925年，任河南省偃师县知事。此后还历任中国国民党四川中江县等级主任、川北各县党务指导员等。卢仲琳曾当选训政时期第一至四届立法院立法委员，行宪后第1届立法委员候补人，制宪国民大会代表。1947年，兼任中国国民党中央党部党史史料编纂委员会名誉委员。