斯托波尔从1941年10月一直坚持到1942年7月4日，德国在乌克兰建立乌克兰总督辖区，克里米亚划入此辖区。1944年苏军透过克里米亚攻势打败德军重占塞瓦斯托波尔。苏联领导人斯大林以许多克里米亚半岛鞑靼人与德国合作为由，把全部克里米亚鞑靼人居民强制流放到中亚和西伯利亚，大约46%被流放的人死于饥饿或疾病，其余的人直到数十年后才获准返回克里米亚半岛。1945年2月，美国、英国和苏联在位于克里米亚半岛的雅尔塔召开雅尔塔会议。
归属苏联的二战战后时期.1945年6月以来克里米亚被降格为州