，勃艮第国王大胆查理被勒内二世刺杀，大公国宣告破灭，重新回入了法兰西王室的控制之中。而当时第戎已是是欧洲的政治、经济、文化、学术和科学中心。
16至18世纪.收归法兰西的勃艮第降级为伯国，而第戎则保持其区域性的行政中心的地位，路易十一在此设立勃艮第议会，并组织修建了一处城堡。哈布斯堡王朝则始终觊觎勃艮第，1513年，神圣罗马帝国马克西米利安一世与法兰西在第戎发生，最终在当地士兵及民众的抵抗下，哈布斯堡军队未能得逞。在十六世纪的反宗教改革运动中，第戎市区兴建了大批天主教建筑，被称