7月25日，日本对清不宣而战，炮轰停泊在朝鲜牙山湾的清朝军舰，史称“丰岛海战”，从而挑起中日甲午战争。日军将清朝军队逐出朝鲜半岛后，日军和金弘集亲日政府开始将矛头转向农民起义军。全琫准决定北上讨伐日寇。10月15日，全琫准率各地汇集而来的起义军攻克忠清道论山。此后，他两次试图攻克忠清道首府公州。但由于武器装备落后，缺乏正规军事训练，起义军败退至论山。血战11天后，论山也失守。在退却途中，全琫准因叛徒出卖被逮捕，后被押往汉城。1895年4月23日（农历3月29日），全琫准被日本当局和朝鲜亲日政府处死。