任陆军总长。1922年（民国11年）4月第一次直奉战争中奉系败北，鲍贵卿称病辞任陆军总长，回到东北。1924年（民国13年）9月，再任督办东省鉄路公司事宜，至1925年9月卸任。此后历任张作霖的大元帅府顾问、审计院长。1928年（民国17年）6月皇姑屯事件后从政界、军界完全引退。1934年（民国23年）3月1日，鲍贵卿在北平病逝，享年68嵗。安葬在八大处鲍贵卿墓。鲍贵卿旧宅在天津市。