有一对慢车停靠；不办理货运业务。车站站场沿大渡河布置，设有3条股道，有效长度分别为849、867、892米，部分站场位于尼日车站三线大桥上，下行方向为毛头马3号隧道。1987年铁路部门在车站昆端咽喉修建120.95的棚洞一座，于1989年完工。在瀑布沟水电站工程中，施工单位在车站站场新建一座钢架棚洞、一座墙式棚洞和一座防雾墙，以减缓日后电站泄洪时对线路的影响。其中钢架棚洞系在既有棚洞的基础上向上行方向延长401米。
事故灾害.尼日站曾发生过因调度办错进路，使列车误入安全线的事故