人员在进行携带氧气瓶潜水训练时，教练会经常拔掉人员的氧气管、关掉供氧按钮或者扯掉其氧气罩，让人员学习解决及适应在无氧气条件下的水下生存情况。2010年9月，全体海上特勤队人员被保送到位于青岛市的中国人民解放军海军潜艇学院，学习潜水战斗、水下排除障碍、爆破、射击、医学及特种装备的使用等项目。此外，海上特勤队每年都会联同香港警务处水警总区及特别任务连进行联合表演练习。