前时代末期的动乱引起佛教的变革。长久以来以「镇护国家」为主流的佛教，逐渐成为救济民众的宗教。主因是在叡山学习的僧侣力图佛教的民众化，并创立新宗派。其中有唱唸「南无妙法莲华经」的日莲宗、唱唸「南无阿弥陀佛」和念佛的净土宗、还有源自净土宗，提倡恶人正机说的净土真宗（一向宗）、提倡踊念佛的融通念佛和时宗。鎌仓时代也是武士从贵族夺取权力的时代。称为禅宗的临济宗和曹洞宗在此时代传入，受到武士的信仰，鎌仓等地出现许多禅寺，大为繁荣，代表的是「鎌仓五山」。旧佛教之间也有批判现状者，特别是从律宗派生的真言律宗等也有