所辖翁牛特、喀喇沁、敖汉等六旗县及甘肃所辖巴彦浩特蒙古族自治州、额济纳蒙古族自治旗划归内蒙古。1969年3月，中苏爆发中苏珍宝岛事件，由于内蒙古自治区较为狭长，战时不利于管理。为应对苏联威胁，中共中央决定﹕将内蒙古自治区唿伦贝尔盟（相当于地区）划归黑龙江省；哲里木盟划吉林省；巴彦淖尔盟划归宁夏回族自治区；阿拉善盟划归甘肃省。结果，使原内蒙古自治区三分之二的区域被划出。中苏关系缓和后，1979年7月1日，内蒙古自治区恢复原行政区划。