重显、密双修，而显宗学院是格鲁派僧人学习的根本，所以显宗学院在格鲁派寺院中，占极重要的地位。该学院习究三藏（论、律、经）、三学（戒律、禅定、胜慧）、四大教义（毗婆沙、经部师、唯识师、中观师）为主。通过师授、背诵和辩论的形式，达到通晓五大论（因明、般若、中观、俱舍、律学），这五大部经典，分十三级学习，一般最少须15年才能完成。
因明部.因明部，全部学程为五年，分为五年五级。因明部学僧，在升至第五年级时，必须学会一定的逻辑学和认识论的知识，能够解释“正确认识”与“不正确认识”之间的区别