站房最高聚集人数为2000人每小时；设有3个站台，站台上方设有35940平方米的无柱雨棚，总投资2.2亿元，是云南省内第二大客运火车站。建筑形式模仿纳西族民居，采用坡屋顶形式，屋面采用铝镁锰板。丽江站于2011年10月29日随仁丽铁路通车运营，代替位于古城区的丽江东站的客运功能，丽江东站改为货运车站。2015年，丽江站在一站台站台端建了一个观景台，可以眺望玉龙雪山。