该语言的交互格式须遵守61499-2的规定且必须通过兼容性测试，例如必须说明支持文件的扩展名才能交互软件库中的元素。不同供应商所持设备的交互操作性被规定为开放系统互联模式OSI models的层次结构。此外，在不同设备之间信息交互所使用的状态输入、IP地址、端口号以及功能块的数据编码（例如：PUBLISH/SUBSCRIBE and CLIENT/SERVER）均需要被考虑。HOLOBLOC股份有限公司提供了IEC 61499兼容文件的定义， IEC61499软件工具FBDK 和4DIAC 都支持此兼容