先请21位基督教牧师联合祈祷，而后请出指南宫举办佛道法会，有36位道教、佛教法师联合举办超度与祈福典礼，还请出了本宫纯阳祖师（吕洞宾真人）神像亲临鑑醮，以超度罹难者的灵魂。而后又请了台北地藏禅寺地皎法师举办洒净仪式及法会诵经为亡者超渡，地藏禅寺出家法师及居士共108人，与台北捷运公司副总经理及员工等，一起持诵《八十八佛洪名宝忏》为亡者超渡，禅寺请出专门度化死者的地藏菩萨，也准备水果与端午节应景的素粽等祭品，希望亡者能早日「离苦得乐、得生善处。」也保佑以后的捷运旅客可以平安。
案发列车