酶PH和多核苷酸磷酸化酶（PNPase）中。细菌中的核糖核酸酶PH，参与tRNA的处理，同样可以形成一个由六个相同的核糖核酸酶PH蛋白组成的六元环复合物。以多核苷酸磷酸化酶为例，它是一种能够降解磷酸化的RNA的蛋白质，存在于细菌和一些真核生物的叶绿体和线粒体中，它的结构中既含有两个PH结构域又含有一个S1结构域和一个KH结构域；多核苷酸磷酸化酶可以形成同源三聚体复合物，其构象与外切体的环状结构非常相似。因为在结构域组成和结构上的相似性，外切体和这两个复合物被认为在进化上有联系，可能具有共同祖先。外切体的核糖