中文大学内部设立多个筹划工作小组，就学术、校园发展、人力资源及财务的事宜积极探讨并给予意见。此外，香港中文大学曾多次举办谘询简报会，让教职员、学生、校友及关心中大发展的各界人士了解港港中大（深圳）的发展，并给予意见和建议；10月11日，国家教育部于深圳龙岗区港中大（深圳）选址举行的仪式上宣佈正式批准筹建港中大（深圳），是港中大（深圳）发展的里程碑。2013年3月，香港中文大学与深圳市人民政府签订详细办学协议，并组成香港中文大学（深圳）理事会；8月1日，香港中文大学原副校长徐扬生正式出任香港中文大学（深圳）