全球查询跨数据库搜索系统在NCBI中用于所有主要数据库，如核苷酸和蛋白质序列，蛋白质结构，PubMed，分类学，完整基因组，OMIM等。Entrez是既具有生物医学研究来源的数据的索引和检索系统。NCBI于1991年分发了第一版Entrez，由蛋白质资料库(PDB)和GenBank的核苷酸序列，SWISS-PROT，翻译的GenBank，PIR，PRF和PDB的蛋白质序列组成，PubMed的相关摘要和引文。 Entrez专门设计用于将来自不同来源，数据库和格式的数据集成到统一的信息模型和检索系统中，可以有效