在接着的两个球季(2013-14及2014-15)，1860慕尼黑II亦以季军完成赛事。而最令人感到可惜的事情于2016-17球季降临，由于1860慕尼黑(一队)于当季护级(德乙)失败需降班至德丙，但却未能于期限前缴交牌照费用而被直接降至德国地区足球联赛(巴伐利亚)。导致1860慕尼黑II即使以63分夺得亚军，亦需降班至巴伐利亚足球联赛。
现役球员 (2019/20).备註： : : <small>一队球员