队」、「陆军1001、1002连」以及「反共救国海上突击队」三个单位合併，正名为「陆军101两栖侦察营」，代号「海龙蛙兵」。1998年纳编国防部军事情报局驻澎湖海上情报大队。2000年因海岸巡防署成立，故两栖营已无驱离大陆渔船、监管大陆渔工、查缉走私等任务。2006年已正式纳编至陆军航空特战指挥部，成为直属之营级单位「陆军航空特战指挥部两栖侦察营」，也和其高空特勤队之军士官干部做交流、轮调等，以互相了解其单位属性。两岸对立时期，海龙蛙兵主要利用夜间渗透敌军据点，执行沿岸摸哨、袭杀、破坏等任务