1940年晋升为空军少将。1941年起任国民党中央海外部部长，中国航空建设协会常委兼总干事。此外，陈庆云还是国民党第四届候补中央执行委员，第五、六届中央执行委员，制宪国民大会代表，并先后获颁五等文虎章（1919年）、三等宝鼎勋章（1930年）、四等云麾勋章（1936年）、二等空军复兴荣誉勋章（1943年）、胜利勋章（1945年）、河图勋章（1947年）。1949年国民政府迁台时陈庆云辞去了海外部部长之职，侨居美国纽约。1981年12月14日，他在纽约逝世。