伪造海关文件和走私天然气而遭到逮捕，数周后被释放。 其政治支持者在季莫申科被拘提的附近举行数次抗议行动。根据季莫申科的说法，这些指控是库奇马政府所杜撰的，是由于寡头对于她努力扫除腐败及建立以市场为基础的改革深感威胁，而向政府施压所致。尽管指控已被撤销，莫斯科当局在四年后才撤销逮捕令。此外，季莫申科的丈夫，亚历山大，为了躲避监禁费用而躲藏两年。但两人表示这说法毫无根据，并认为背后有前库奇马政府的政治动机存在。
反对库奇马运动和2002年选举.指控撤销后，她马上回到库奇马总统反对运