1年（民国20年）的二刘之战，邓钖侯经过曲折，最后支持刘湘，击败了刘文辉。抗日战争爆发后，邓钖侯率军赴山西省。此后，历任第4集团军总司令、第22集团军总司令。其间，他同朱德领导的八路军有过交流，这对日后邓钖侯的政治行动产生了影响。其后，邓钖侯部调属第五战区司令长官李宗仁，负责津浦铁路的守备。1938年（民国27年）1月，刘湘病死，张群继任四川省政府主席，但川军指挥官纷纷反对，张群未能就任。同年10月邓钖侯就任川康绥靖主任，缓和川军对立情绪。蒋介石兼任四川省政府主席时期之后，1940年（民国29年）1