通银行将总行迁到重庆，直至战争结束以后为止。同时，在香港设立了总管理处办事机构。1946年至1947年，上海总行重建为装饰主义风格的6层大楼。1949年，国共内战战局底定，交通银行随同中华民国政府播迁台湾，留置中国大陆之交通银行各部则被新成立的中华人民共和国收归国有，续称「交通银行」。
中华人民共和国时期.1950年，交通银行开始承担国家基础建设拨款工作，成为经营工矿交通事业之长期信用银行。1951年，交通银行总行迁回北京，中央人民政府政务院通过《企业中公股公产清理办法》，指定