有《大乘掌珍论》，以因明论法驳斥他宗学说，确立大乘空宗之实义（掌珍比量）。世亲《大乘百法明门论》、安慧《大乘广五蕴论》为唯识学的入门书。《究竟一乘宝性论》为宣扬众生本有佛性，以七「金刚句」摄一切佛法，确立如来藏学说的重要论书。《大乘起信论》相传是马鸣论师依《楞伽经》所造（亦有观点认为本论是五世纪的印度大乘论师所造，又或者是中国的地论师、摄论师造出），归结大乘佛教之中心要义令起信心修行，对中国传统佛学有深刻影响。除了印度佛教论书着述的译出，有些佛教僧人东来中国传法，留下了个人的论着，例如：禅宗初祖