达曼地区直到1945年第二次世界大战日本战败为止。在日本殖民统治的期间，实行恐怖统治。起初日本人和安达曼人之间相处融洽，但在发现安达曼人试图联合原先的英国政府推翻日本的统治后，日本殖民政府的政策转趋严厉，两者的关系也因此急速恶化。在二战时同盟国实行海上经济封锁，迫使安达曼人开始了自给自足的生活。在1945年10月8日时，同盟国联军接受日本投降，并帮助修复当地。1946年2月7日，安达曼群岛的行政部门重建。日本人在殖民统治期间在当地建设公路，并致力于经济建设，巩固安达曼群岛的防卫机制。自1947年8月15日