人工合成的RNA温度计通常都设计成只含有一个简单茎环结构。然而，这样的短RNA温度计的对突变很敏感，即使是一个硷基对的变化（点突变）也可能造成其茎环结构在体内（"in vivo"）失活。
机理.RNA温度计一般位于mRNA5'端非转译区，即编码基因的上游。位于此处使得RNA温度计能遮蔽核糖体结合位点（RBS），阻止mRNA转译爲蛋白质。随温度增加，茎环结构会解旋，使核糖体结合位点或SD序列暴露，使得mRNA能与核糖体30S亚基（小亚基）结合。紧接着，转译机器会完成组装。一般位于