借由水解便可让肽键断裂，分解并释放8–16千焦耳/莫尔（2–4卡/莫尔）的自由能，但这过程相当缓慢。而在活体中，此过程可被酵素催化使反应加速，肽酶与蛋白酶即具有此功能。
光谱.肽键的吸收光谱介于190–230奈米间，以至于易受紫外光影响。
化学反应.由于共振稳定，以生理条件而言是相对稳定，甚至胜过类似的化合物，如酯类。肽键在化学反应下可以保持不变，通常会透过阴电性原子攻击羰基碳，打断羰基双键形成四面体。这是蛋白水解的过程，而且更常发生在<chem>N-O<