组都只有一小部分可编译成蛋白质。以人类为例，在人类的基因组中只有1.5%属于含有蛋白质编码的外显子，另有超过50%属于无编码的重复序列。真核生物基因组中如此大量的非编码DNA，以及物种之间不寻常的基因组大小或C值差异，长久以来一直是个难题，人们称之为「C值谜」。不过这些不含蛋白质编码的脱氧核醣核酸序列，仍可能合成出具有功能的非编码RNA分子，用以调控基因表现。染色体中的某些非编码脱氧核醣核酸序列，本身具有结构上的功能。例如一般只带有少量基因的端粒与zh-hans:着; zh-hant:着;丝粒，