2005年1月宣佈斥资12亿港元为香港的16段明渠进行覆盖工程，佐敦谷明渠亦被包括在内。由于该区的工程和土地问题比较复杂，所以工程于约2011年才完成。现今原明渠上方的地带已经铺上混凝土，部分地段被建设为绿化带，接近淘大花园一段的渠道的上盖被更改兴建为游乐场。