华民国临时大总统孙文，不属内阁辖制。参谋部由辛亥革命期间独立各省派员组成，设有总长、次长等官。参谋部职责为：「协助临时大总统统掌办中央军令」。首任参谋总长为黄兴，参谋次长为钮永建。1912年5月13日，北京临时政府成立后，改为参谋本部，部址设于北京西安门内路北（法文学堂旧址，早年由清政府购买建军谘府大楼）。5月15日成立，8月15日铨叙局编参谋本部职官表；总长黎元洪（兼），次长陈宦；初设第一至第六局，9月增制图局，11月增第七局；1915年9月改为第一至第六局及制图局。1912年10月30日，临时大总统