为参与商业活动而使得往后评论受到影响。而担任过行政院卫生署疾病管制局副局长的施文仪则表示不少医师成名后会被政府或者厂商收买，但是「没有人买得动林杰樑」。不过由于其不受到财团、政府乃至于黑道威胁利诱影响、而仅凭借着其专业提供民众许多意见，这使得他作为公共卫生和食品安全倡导者而在台湾社会享有很高声望与推崇。其中前行政院卫生署食品药物管理局局长康照洲在接受採访时表示，无论是进行关门会议或者接受新闻媒体访问时，林杰樑说话的内容始终保持言行一致。而其主张「有几分证据讲几分话」、「该说的绝不退缩」的率真且耿直态度也