军司令部有主权侵害的象征。而且韩国政府把朝鲜38度军事分界线附近广大土地都借给美军全权使用、美军基地週边住民为补偿金问题也常发生纠纷，而基地佔去的用地往往也对蔓延中的城市构成发展上的障碍。这些都是反美情绪的温床。1999年9月29日，AP通信报报导朝鲜战争中，美军于1950年7月虐杀韩国平民的老斤里事件。2000年7月13日，韩国环保组织“绿色韩国”指责驻韩美军于2月9日将大量甲醛倾倒入汉江，并要求美军惩罚相关负责人。14日，驻韩美军司令部就向汉江倾倒甲醛一事，向南韩民众公开承认并道歉。2002