菌丝（）是丝状真菌()或称霉菌()中的一种长、支链丝状结构，它是大多数真菌的结构单位，而部分原核生物如放线菌同样存在菌丝。在大多数真菌中，菌丝是营养生长的主要模式。酵母是单细胞真菌不成长为菌丝。
结构.孢子生出嫩芽形成芽管，芽管逐渐延长呈丝状，称为菌丝。菌丝的平均直径为4-6微米。一个菌丝包含一个或多个由管状细胞壁包围的细胞。菌丝细胞壁的主要成分主要是多糖，可占细胞干重的80%-90%，其次是蛋白质和脂质。其多糖成分含有：β-(1,3)-葡聚糖、甘露醇、几丁质等。某些真菌菌丝在一定