帝力发动政变，一场小规模的内战随即爆发。拉莫斯·奥尔塔在后来描述到，这是一场“血淋淋的”战争，并细数了革阵和民盟犯下的暴行。他引用红十字国际委员会的统计结果称，2000-3000名东帝汶人因战死于非命。东帝汶内战使葡萄牙方面感到不安，曾派官员到东帝汶的阿陶罗岛对局势进行观察。出乎印尼和葡萄牙预料：在两周后，革阵击败民盟，民盟领导人溃逃至印尼的西帝汶。9月7日，民盟在西帝汶请愿，希望印尼吞并东帝汶；许多报道称民盟的立场是印度尼西亚迫使其持有的。革阵夺得对东帝汶控制权后，印尼军队（时称印尼共和国军，ABRI）