对进入新西班牙的进口商品进行管制和征税，成为政府最大的收入来源。 海关最初设于2月5日街, 1676年迁入位于圣多明我广场的 Villamayor 府。后来, 政府买下了这所房子，并在1730年重建了目前的建筑。20世纪初，墨西哥城海关大楼关闭，由墨西哥公共教育部接管。