参政院闲职，同时任命陈宦为“成武将军”，督理四川军务，取代胡景伊掌控全川的军政大权。1915年12月，袁世凯称帝，蔡锷为反对复辟帝制，带领护国军起义讨袁，各地讨袁义军纷起，四川成为主战场。1916年4月，双方商定停战。6月6日，袁世凯病发而死，次日黎元洪宣布就任中华民国大总统。7月6日，黎元洪召回陈宦，任命蔡锷四川督军兼省长，北洋军退出川境，护国战争结束。8月，因患结核病，蔡锷赴日本福冈市接受治疗，辞去四川督军兼省长职务。1916年8月13日，北洋政府任命罗佩金代理四川督军兼省长。1917年1月15