党则推出王建煊参选。结果，马英九以七万余票之差击败陈水扁。对于陈水扁的落选，除了是因为新党票源回流至超人气的马英九下以外，还是因陈水扁当市长时改革过于强势，包括国民党政治人物的违章建筑处理、处理国学大师钱穆事件话题延续等，引发不满。在本次选举中，中国国民党已经从中央执政党变成在野党。而民进党在陈水扁落选市长后再次出发，在两年后成功得到中央执政权，于2000年中华民国总统选举中，陈水扁在台北市得到五十九万票，脱党参选的前台湾省省长宋楚瑜得到六十三万票，而国民党则得到三十四万票，显然宋楚瑜变成台北市市长选举