“伽蓝十余所僧徒二千余人,习学小乘教说一切有部。经教律仪皆尊印度诸习学者,即其文而远之”。至公元15世纪时伊斯兰的到来，佛寺才被废弃。在19世纪末20世纪初，欧美和日本各国探险家纷纷进入新疆，寻找古迹、挖掘遗址，拿走文物。先后来到七个星佛寺遗址的有斯文·赫定、格伦威德尔、斯坦因、奥登堡等人，他们拿走大量可移动文物，并切割壁画，使该佛寺遭受严重破坏。
结构病害.七个星佛寺遗址主要结构病害类型有：掏蚀部位多出现在墙体根部 ，最大掏蚀深度达0.6米，掏蚀方向与地表水流走向一致。建筑