，香港公开大学一向在学生毕业时收取毕业费，但未有详细交代收费的用途，缴交的费用一律不予退还，且颁授大学学位或高级文凭的收费由最初的500港元涨到现在的750港元。
公立与私立的混淆及误解.2002年，作为非法定谘询组织的大学教育资助委员会曾发表「香港高等教育」检讨报告宣称公开大学为私立大学，惟2002年的香港实际上并不存在私立大学。公开大学就此回应，指出有关宣称与大学的成立历史及法定地位不符，并表明此报告存在偏差，忽视各院校的作用，同时指出香港各高校都有自己的角色，需公平地一致对待