军区的野战军，直接参加剿匪工作，任合江军区野战军政治部民运科长。1947年任中共佳木斯市委宣传部长，1948年任佳木斯市副市长。1948年辽沈战役胜利后，参与接收沈阳，任中共沈阳市委妇委副书记。1950年，李万新调到中央人民政府林垦部（后改为中央人民政府林业部，1954年改为中华人民共和国林业部），任森林利用司副司长。其间，由中共中央组织部决定参加了九三学社。1952年秋，由农业部、林垦部、中共中央农工部组成代表团到苏联考察，李万新是代表团成员，所在组的重点任务是考察乌克兰集体农庄建设经验，参观顿巴斯煤