隆起的海岸平原、海拔高度约为24公尺左右，有红壤的分布，地质肥沃，又有八堡圳流经此地，故农业发达，但部份区域却有土壤液化的现象，其中以崙雅里最为严重，已危及现有的建筑物。以东与南投县交界处有座百果山，为八卦台地（丘陵）一分支，地势陡峭，北部、西部地区因侵蚀作用而多侵蚀沟。员林市有员林断层通过，九二一大地震车笼埔断层的活动，穿过了八卦山脉，使得员林地区出现明显的水平位移现象。
气候.员林市属于副热带季风气候区，日照充足，年均温约为23度，年平均雨量约1500mm，年平均相对溼度为