特别贡献奖给郭水潭。这两个奖项都以结集出版的书籍为奖励对象。1997年，第五届南瀛文学奖开始设置文学创作奖，分现代诗、散文、小说等类。2001年增设儿童文学类，2003年设立传统诗奖，并将文学奖与文学新人奖合併为文学杰出奖，2006年又设长篇小说奖、剧本奖、文学部落格奖。2005年停颁文学杰出奖。目前南瀛文学奖共设有文学创作奖、剧本奖、文学部落格奖，创作奖则分现代诗、散文、短篇小说、儿童文学、传统诗等五类。
参赛资格.参与文学创作奖者，须设籍或出生于台南县者，曾于台南县求学