“大跃进”开始后，浦口站新建简易驼峰调车场和上行到达场，增加股道，规模为二级三场，车辆编解作业能力提高。简易编组站的建成满足了铁路轮渡增加渡轮后和津浦铁路建成双线后增长的运输需求，也使车站成为了设施完整的、兼营客货运的编组站。1961年4月，车站上行至东葛站区间实现复线化。
衰落.1968年10月，南京长江大桥和南京新客站相继建成后，浦口站停办客运业务，通行的货车也渐渐变少。1973年，南京东编组站改造完成，铁路轮渡正式停运，浦口站的编组业务也转移到了南京东站，车站便冷清了下来。