朝鲜政府赔偿损失、同意日军驻扎朝鲜。清朝官员拜访日本军人后又探望云岘君，8月25日马建忠拜访云岘君时表示清朝不会逮捕他，并邀请他回访；等到第二天云岘君回访时，吴长庆先和云岘君喝茶，云岘君立刻察觉事情不对，在笔谈中对吴长庆说：「将军将作云梦之游耶？」（西汉时汉高祖刘邦为了擒拿楚王韩信，便声称去云梦泽巡游，其实是诱捕韩信。）在一旁的朝鲜帮办大臣袁世凯见此情形，立刻逮捕了云岘君，将其塞进轿内并转运至中国军舰中。与此同时，云岘君的儿子李载冕也在其他地方被捕。之后清军又进攻汉城郊区起义士兵营地，抓获了170多人，