入日本法政大学法政速成科、専门部。翌年秋，同胡汉民、汪兆铭加入中国同盟会。1907年（光绪33年），古应芬学成归国，任教于广东法政学堂。后来他任广东咨议局秘书，秘密开展革命派的活动。1911年（宣统3年），古应芬赴香港，同黄兴、胡汉民策划广州起义。辛亥革命后，广东都督府成立，胡汉民任都督，古应芬任都督府秘书长。以后，他历任核计院院长、琼崖绥靖署总办等职务。1913年（民国2年）他参加二次革命。二次革命失败后，到1917年（民国6年）之间，他在南洋募集革命资金。
支持孙文.191