56年6月中华人民共和国最高人民法院沈阳特别军事法庭公开审判第一批战犯，藤田茂被判处18年徒刑，宣判后在庭上说：“"若论我的罪，判几个死刑，也不能赎罪于万一"”。藤田茂有亲属死于广岛市原子弹爆炸对其触动很大。1957年被提前释放回国，回到日本成为“中国归还者联络会”（简称“中归联”）首任会长。在日本进行反战巡回演讲。他曾数次率团访问中国，1965年、1972年两次受中华人民共和国国务院总理周恩来接见。1980年去世，享年90岁。
轶闻.藤田茂在一篇文章中记述：“我是1965年9月