安排簗田广正、河尻秀隆、佐佐成政、冢本小大膳、明智光秀、苗木久兵卫、村井贞胜、佐久间信盛、进藤贤盛、后藤高治、多贺常则、梶原平次、永井雅乐助、种田助之丞、佐藤秀方、中条家忠等16名将领入驻。田中一带由柴田胜家、氏家卜全、安藤守就、稻叶一铁布阵、唐崎砦由佐治信方、津田太郎左卫门入驻，织田信长本阵则设在志贺的宇佐山城。比叡山西麓的将军地藏山古城迹则由织田信广、三好康长、香西元成率领2千兵力布阵｡八濑、大原口则由山本对马守、高野莲养坊构筑阵地，对当地地形详细了解的两人还数度趁夜派遣忍者上山放火，使寺方大为苦恼。