主教于斌枢机主教创立康宁医院。1971年，登记财团法人康宁医院。1992年，行政院卫生署核准设立476床。1995年6月，成立财团法人康宁医院建院筹备处。1997年，兴建动工康宁医疗大楼。1999年9月，正式开幕，首位院长尹在信为国防医学院及三军总医院院长，在尹院长的带领下，各项医疗服务渐上轨道。同年医疗大楼落成启用。2001年5月，吴子嘉任执行长。2001年9月纳莉风灾，台北市内湖区水患严重，在吴执行长指挥调度下，应变完善。2002年3月，由吴濬哲任执行长。6月，引进北台湾第一