而孔祥珂成年后，在书法、鑑赏以及文学方面都有所造诣。同治二年（1863年）袭爵，诰授光禄大夫。同年奏请皇帝恩准，赐孔氏七十六世至八十五世字派为：「令德维垂佑，钦绍念显扬。」此时捻军自北突过泗水，直扑曲阜。与知县率领官兵拚死抵抗，直到援兵到来。为保护林庙及孔府安全，孔祥珂中断了一年一度的林庙会及每年春、秋两次的孔庙丁祭活动。孔祥珂在光绪二年（1876年）九月二十九日申时卒，得年仅二十九岁；赐谥庄悫。