齐淮阳王开府参军事。后任司州主簿，进中书舍人。北周灭北齐，仕北周任帅都督。隋文帝即位后，开三府官，冯慈明任司空司仓参军事，累进行台礼部侍郎。晋王杨广为并州（今山西太原）总管，以冯慈明为司士。后任吏部员外郎，兼内史舍人。隋炀帝即位，冯慈明因母丧去职。左迁伊吾镇副，转任交阯郡丞。大业九年（613年）召还入朝，拜尚书兵曹郎，加位朝请大夫。大业十三年（617年），摄江都郡丞事。李密逼近东都洛阳，隋炀帝派冯慈明到东都，冯慈明集瀍洛之兵追击李密。在鄢陵被李密部下崔枢抓获。李密之前听说冯慈明之名，让冯慈明坐下，深表敬意。