1年8月10日，首府定在杰佛逊市。是美国第24个加入联邦的联邦州。由于密苏里州南部地理气候和阿肯色州类似，适合种植棉花，加上为了在参议院占倨优势地位，蓄奴主义者强烈要求将密苏里作为蓄奴州加入联邦，导致了密苏里妥协案，密苏里州成为蓄奴州。但该州北部是玉米带，且靠近像伊利诺伊和艾奥瓦这样的自由州，协助黑奴逃离蓄奴州的地下铁道行动十分频繁，加上沿密苏里河的奉行自由主义的城市工商业繁盛，人口占比高，密苏里州在南北战争时选择了北方阵营，从而免受了战争破坏和战后军事管制的损失。19世纪末期，美国工业爆发式增长，