个侧式月台，位于旧白云机场中轴线地底，两个月台在乘客眼中看似两个位于不同层数的单向式月台，但事实上它们是对向式月台设计，只是两个月台之间被墙壁完全阻隔，令乘客无从得知两月台位于同一层，与2号线飞翔公园站至黄边站的车站设计类似。另外，本站同时预留一个岛式月台（仅预留部分结构），位于齐心路地底。预留月台原计划由12号线使用，但由于12号线规划更改，不再于本站换乘，现时预留前往该月台结构的扶梯和楼梯位置用地板覆盖。
出入口.白云公园站共设有4个出入口，其中A、D出入口位于西站厅，B、C