恩来总理知道此事，派专机把邓宝珊将军接到北京，安排住进了医院。1968年11月27日下午，邓宝珊将军在北京逝世，此后经周恩来努力，邓宝珊的名字位列八宝山革命公墓。
个人生活.邓宝珊虽然出身行伍，只是念过私塾，但是他爱知识，有文学素养，坚持自学，又时常与文化人切磋心得，品诗论画，所以有儒将之称。邓宝珊曾经出资支持天水学者出书，也曾捐资修缮纪将军祠、麦积山石窟栈道等。兰州邓家花园是其故居。