4年当选为中国工程院院士。2017年11月，当选为第六届全国道德模范。中共中央总书记习近平在11月17日举行的全国精神文明建设表彰大会上扶着黄旭华坐到自己身边。2019年9月17日被授予共和国勋章。2020年1月10日，获2019年度国家最高科学技术奖。
争议.黄旭华曾被媒体称为“中国核潜艇之父”，研究中国核潜艇研发历史的海军作家李忠效2018年11月发表评论回顾中国核潜艇的研创历史，提出黄旭华不应被称为“中国核潜艇之父”，如果总设计师可称为“中国核潜艇之父”，那也应该