对稳定，甚至胜过类似的化合物，如酯类。肽键在化学反应下可以保持不变，通常会透过阴电性原子攻击羰基碳，打断羰基双键形成四面体。这是蛋白水解的过程，而且更常发生在<chem>N-O</chem>、酰基的交换反应中，好比内含蛋白。在环醇假说中，要是如巯基、羟基、氨等官能基攻击肽键，与其结合，那么生成的分子可称其为Cyclo分子。