1927年12月，由于国共关系破裂，中共发起武装暴动，攻击国民党深圳区署。1931年，国民政府颁布《县参议会组织条例》，“宝安县参议会”成立。1937年7月，国民党在宝安县实行保甲制。抗日战争期间，县治曾迁至东莞县石马镇。1941年，日军试图从深圳跨过罗湖桥占领香港，驻港英军遂将桥拆毁，以阻止日军入港。1942年2月，中共成立“广东人民抗日游击总队”（后称“东江纵队”），设宝安大队，与国民党军队共同抗击日军。1945年日本投降后，宝安县府由东莞迁回南头。1947年3月，中共在宝安地区成立“惠东宝人民护乡团”