，机车车体、转向架、柴油机等机械部分均与TE2型机车相同，但由于TE6型机车并不会双机重联使用，因此取消了车体尾部的通过台及重联插座。TE6型机车的最主要特点在于其发电设备，牵引发电机采用交流发电机，而非TE2型机车的直流发电机。此外，为了防范战争时的核打击以及生化武器攻击，机车配备了较全面的防核生化攻击能力，全车所有主要电气线路均以金属屏蔽保护罩包覆，以防范核爆炸产生的强电磁辐射；为隔离核辐射污染，机车车体采用全密封结构，并设有二重空气滤清系统，分别为格网式空气过滤网及油浴式空气滤清器，为柴油机及车体内部