军在战争中节节败退。9月初，日军将清军逐出朝鲜，战场由朝鲜半岛转移到中国。
公州决战.清军被逐出朝鲜半岛后，金弘集亲日政府和日军开始将矛头转向农民起义军。1894年9月，全琫准在全罗道与各地东学教接主商讨第二次起义。但以忠清道崔时亨为代表的北接派仍然反对全罗道南接派北上。但随着金弘集亲日政府和日军对东学教徒迫害的加剧，北接派最终也加入南接派北上讨伐日寇的队伍。10月15日，全琫准率各地汇集而来的起义军攻克忠清道南部的谷物集散地论山。次日，起义军发布檄文，怒斥日本侵略和亲日派卖国行为