方签有多项教育合作备忘录，中华民国政府及台湾多所大专院校每年也提供多项奖学金，如台湾奖学金、华语文奖学金、国际合作发展基金会奖学金等，提供蒙古国学生前往台湾攻读学位或学习中文。2017年，约有850名蒙古国学生在台就读。台湾多所大专院校在蒙古国首都乌兰巴托举行台湾教育展，至2017年，已举办第九届。
援助.2004年2月，中华民国援赠蒙古国两千公吨食米赈济粮荒。台湾儿童暨家庭扶助基金会（家扶基金会）蒙古分事务所协助贫困家庭儿童，提供生活物资、奖助学金补助及职业训练，2004