伊斯兰国曾策划于奥运期间攻击法国代表队。2016年7月21日，距比赛开幕还有两个星期，巴西联邦警察挫败一群密谋利用有如1972年慕尼黑惨案的方式造成严重破坏的伊斯兰圣战恐怖分子。10名伊斯兰国份子被逮捕，另有两人在逃。另外，该恐怖组织一直积极鼓励针对英、美、法、以运动员发动单人袭击，建议使用无人驾驶飞机投毒或引爆炸药。同时，受害者也衍生到选手身上，例如选手在选手村的东西会被失窃、帆船选手在外的维修工具会被偷走等，甚至代表团路上就被抢劫袭击、被行事不良的警察绑架等过去奥运史上罕见的情形。Secti