邦转让给联城，更名上海联城队，代表联城征战1个赛季后，申花联城大合并，更名上海申花队，常琳也是联城队中唯一几个能在申花踢上主力的队员，是当时的“四队长”之一。2007年代表申花出场15次，发挥稳定，2007年赛季结束，被俱乐部挂牌。2008年初，在与杜威、李玮锋组合竞争中难以确保主力中后卫位置的常琳成为47名被一起挂牌的申花球员之一。2008年1月31日，小年夜上海申花与浙江绿城达成协议，在挂牌上榜截止时间的前一个小时，申花方面最终松口，让一直与绿城惺惺相惜的常琳挂牌上榜。应该说，常琳上榜之后，到目前一