后投奔张绣。董卓死后，汉献帝从李傕处东归至华阴，宁辑将军段煨出营迎接，供给献帝饮食衣服。后将军杨定与段煨不和，串通董承、杨奉等人，诬陷段煨勾结郭汜。杨定攻打段煨，双方激战十余天，不分胜负。后为献帝劝解。建安三年（198年），在裴茂的指挥下，煨入长安，指挥梁兴、张横击杀逃到黄白城的李傕，将李傕全家老少200余口押解许都，曹操下令夷三族，献帝封段煨为“安南将军”。官至大鸿胪、光禄大夫，建安十四年（209年），以寿终。
修缮华岳庙.据《艺文类聚》，《初学记》，《古文苑》、《文选·沈约游沈