决定留在上海，在日本人侵占上海后住在犹太人隔离区。导演陈逸飞1999年的纪录片《逃亡上海》中提到，卫登堡勤恳教学，不分老幼，既教专业学生，也教普通初学者，培养出小提琴家谭抒真、指挥家李德伦、大提琴家司徒志文、钢琴家李名强等一批中国早期西洋音乐人才，钢琴家傅聪也曾短暂师从于卫登堡。战争结束后，卫登堡应学生谭抒真之聘，在中央音乐学院华东分院（上海音乐学院前身）任教。1952年7月16日，卫登堡在一次小提琴演奏时心脏病发作，数日后逝于上海大华医院。