重症疟疾的效果都优于奎宁；另一份报告指出青蒿素衍生物（包括蒿甲醚和蒿乙醚）对孩童的脑疟疾和奎宁一样有效。。重症疟疾的治疗也包括支持疗法，患者于重症加护病房中能得到最好的照顾，这包括控制高烧、监控、低血糖和低血钾
抗药性.疟疾的抗药性在21世纪是一个日益严重的问题。目前已知所有的抗疟药都已经出现抗药性，抗药性品系的治疗相当依赖联合疗法，但青蒿素的价格使得开发中国家根本无力负担，且目前已知最有效的青蒿素联合疗法也在柬埔寨和泰国的边界地区出现了抗药性品系，使得此种疟疾难以治疗。使用青蒿素