城市与区域经济研究室拆分并独立成立城市与区域经济研究所。2008年起，南开大学经济研究所曾与潇湘晨报合作编制发布“南开·潇湘晨报指数”。2012年9月10日，南开大学经济研究所成立85周年时举办了相关庆祝活动。2017年10月，南开大学经济研究所原所长陈宗胜因“中国经济转型和发展中的收入分配理论”，获得第八届中国经济理论创新奖。
历任所长.1927年，南开大学校长张伯苓的支持下，南开大学经济研究所的前身南开大学经济社会研究委员会由耶鲁大学经济学博士何廉创办并任首任主任导师（负责人）