东乡试第八名举人，万历三十八年庚戌科第三甲第一百八名进士。礼部观政，授山西太谷县知县，丁忧去官。守丧期满，补河南安阳县知县。天启元年（1621年），以政绩卓异，升监察御史，次年巡按广西。天启五年（1625年）任满回京，遭阉党罢官。崇祯即位，魏忠贤事败自杀，贾毓祥超擢左副都御史。后因被劾，再度罢职。明亡不仕，隐居大泽山，卒年92。现存暮年之作《九日登高》诗一首。
家族.曾祖贾祯，祖贾文胜，父贾汉臣，母周氏（赠太孺人）。