国入侵苏联后太平洋舰队还是向欧洲战场派遣许多官兵和武备。1943年苏联国防部下令从太平洋舰队把一艘重驱逐舰、两艘驱逐舰和一支潜艇分队派给北方舰队。在第二次世界大战中共有14.3万名太平洋舰队的官兵参加陆上战斗，他们参加列宁格勒、敖德萨、塞瓦斯托波尔和斯大林格勒的战役。1945年首先冲入柏林国会大厦的营是由一名太平洋舰队的军官指挥的。1945年8月太平洋舰队有两艘巡洋舰、一艘驱逐领舰、十艘驱逐舰、两艘雷击舰、19艘护卫舰、78艘潜艇、十艘布雷舰、52艘扫雷舰、49艘猎潜艇、204艘鱼雷艇和1549架飞机。