面抗战爆发后，广东省建立人民抗日自卫团队统率委员会，邓世增应余汉谋、香翰屏之聘，任该会委员。1938年春任钦廉地区抗日游击司令。1939年3月任广东省第八区行政督察专员兼保安司令，5月兼任第四战区南地区特别守备区司令（后改第八区游击指挥部指挥官），参加桂南会战和历次南路抗击日寇之战役。在北海“焦土抗战”中，关键时刻下令不能轻率举火，使北海得免“焦土”浩劫。1942年5月辞职。1943年任军事委员会桂林办公厅参谋长（后改高等顾问，主任李济深），统筹整合西南抗战。1946年夏任广州行营军调顾问。1948年5