体，但实际上没有化学键相接）的现象，或称纽结。当特定的DNA环以不同程度的扭转形式存在时，称为拓扑异构物，除非打断DNA链，否则无法经由任何方式相互转变。而拓扑异构酶就是负责催化并引导一些化学反应，以使DNA的纽结状态得以解除。此外当病毒DNA插入染色体时，或是在其他型态的重组现象中，也可能会有拓扑异构酶的参与。
分类与作用方式.拓扑异构酶可依据其作用方式，而分为两种类型：第一型拓扑异构酶（Type I topoisomerase）：该类型与DNA转录及翻译有关。可将一条D