开始拍摄写实性较高的电影，例如《风柜来的人》和《冬冬的假期》。《风柜来的人》也获得法国南特三大洲影展最佳影片奖。在戒严风气渐退之下，侯孝贤首先拍摄了自传性的电影《童年往事》，由于内容涉及批判当时的国民政府，他在寻找合作的过程十分艰辛。后来他又拍摄《恋恋风尘》，打破了过去国片过度矫情、虚伪的内容，是一部着重写实的文艺爱情片，并受到许多国际影评及大导演的喜爱（例如罗杰·艾伯特及马丁·史柯西斯就曾在影评节目上提到这部片子）。1992年，侯孝贤创立「侯孝贤电影社有限公司」，经营电影制作和发行，是「三三电影制