就开始卧床不起。《纽约太阳报》把阿尔杰的辞职归功于霍巴特“水晶般的洞察力”和“天鹅绒般的圆滑”，之后霍巴特在给麦金莱的信中写道：“我那‘水晶般的洞察力’仍然清清楚楚，但那‘天鹅绒般的圆滑’已经被（我的）小睡消磨掉了那么一点点。”霍巴特与麦金莱一同到尚普兰湖度了一次假，于9月返回帕特森。1899年11月1日，联邦政府宣布霍巴特不会再返回公众视野。他的病情迅速恶化，1899年11月21日，美国副总统加勒特·奥古斯都·霍巴特与世长辞，享年55岁。总统麦金莱向他的家人们表示：“在这个家以外的任何人都无法比我更深