，弗朗西斯科·霍尔达·塞尔达开始系统性挖掘，发现了跨越很多年代的人类遗迹，从早期人类例如海德堡人到青铜器时代，直到现代人。遗址里还发现了石器。1978年到1990年间，埃米利亚诺·阿吉雷率领一支队伍挖掘了该遗址。2000年，阿塔普埃尔卡山考古遗址被列入世界遗产。