在1903年的报告中批评该火炮装弹机速度不足，而且能使用的弹药库存也不足够；在没有配备夜战专属的射控系统下，其能力比其它大口径和中口径的火炮还差，但在夜间战斗时又仅能仰仗口径火砲，因此在报告后面又向上司唿吁需正视这个缺陷并尽快改进之。本舰另装设4组口径鱼雷管，其中2组在船体水面下，另外2组则位于水线以上；在水线以下的鱼雷管与船轴线夹60度角，而水线以上的鱼雷管可左右旋转80度。舰上共有12枚1889年型鱼雷可使用，其中4枚为训练弹。
装甲.耶拿号舰体拥有完整的水面装甲带，材料以为主