18年2月22日致信给所有地方卫生当局，这实际上禁止了性倾向扭转治疗。卫福部在信中指出，不将性取向转变视为合法的医疗保健做法，且根据《刑法》或《儿童及少年福利与权益保障法》，任何进行所谓治疗的个人均可能视情况被起诉。
兵役.中华民国国军自1994年起不再禁止同性恋者从军。不过在2001年时，宪兵司令部曾通过《宪兵兵员甄选实施计画》禁止同性恋者担任宪兵，理由是「便于生活管理及照顾的需要」。这项政策在2002年5月引起同志团体如台湾同志谘询热线协会、性别人权协会、晶晶书库等发起抗议游行