复了众多佛教经典书籍、佛教法器及文物。1986年，有80多名僧人过访昭觉寺，僧人们推选了清定上师担任昭觉寺方丈。1991年5月21日，昭觉寺重建后的大雄宝殿进行了开光仪式，大雄宝殿内供奉着三座佛像，毗卢遮那佛、卢舍那佛及释迦牟尼佛。佛像2侧塑有佛侍者阿难和迦叶像，大雄宝殿四周塑有十八罗汉像。同时昭觉寺成立了昭觉寺管理委员会，制定了宗教活动、文物保护、财务收支、安全卫生等各种规章制度，使寺院生活更加得到保障。原中国佛教协会副会长隆莲法师曾经写诗赞叹：常涕流血处，千古众香城。难化苌弘碧，如闻杜宇声。