百姓多次迁移，虽一定程度上阻碍了清帝国沿海人民和主要位处台湾的明郑政权的物资人员沟通，但也造成清朝控制下的东南沿海地区田园荒芜、人民流离、生计困顿。
迁界令的提出.
反清势力.1644年，李自成所率领的农民起义军攻陷北京，吴三桂所率领的山海关明军陷入一面抗清、一面又要抵挡李自成攻势的两线作战，吴三桂决定引清兵入关在一片石战役击溃李自成的大顺军，然而大清王朝的摄政王多尔衮也顺便迎顺治皇帝进入北京，而大清也迅速占领中国大部分地区。这一系列军事活动并没有完全消灭敌对