齿翼龙的牙齿有多齿尖，是种衍化的特征，而侏罗纪翼龙类的牙齿只有一个齿尖，显示真双型齿翼龙与侏罗纪翼龙类的直系祖先是远亲。科学家推论，真双型齿翼龙是翼龙类演化过程中的一个旁支，曲颌形翼龙科。
发现与种.真双型齿翼龙目前有两个种。模式种"E. ranzii"是在1973年被叙述、命名，种名是以Silvio Ranzi教授为名。正模标本（编号MCSNB 2888）发现于义大利。第二个种是"E. cromptonellus"，是在2001年被叙述、命名，种名是以Alfred W. Crom