996年.1996年12月4日，空军防砲警卫司令部警卫指挥部警卫连二兵蔡照政因军中管教问题，不适应军中生活，在值卫哨勤务时持步枪杀人后自裁，造成三死三伤的惨剧。
1999年.1999年10月，空军桃园基地弹药库两次遭窃，T65突击步枪子弹、手榴弹等大量弹药不翼而飞，引发社会譁然。空军迫于追缉压力，将基地士兵苏黄平、罗樟坪及王至伟三人羁押四个多月并刑求逼供，造成三名士兵身心严重创伤，成为台湾军中人权事件之一。
陈水扁时期.
2002年.