而东京地下铁丸之内线则由于地形影响，即使在市中心也有一部分在地上运行。大坂市营地下铁中央线在刚开业曾整条线路都是高架，完全没有地下区间。名古屋市营地下铁东山线的上社车站 - 藤丘车站间在建设当时因无必要使用地下方式因而以高架形式修筑。与之相反的是，京王新线与都营地下铁新宿线；西武有乐町线与东京地下铁有乐町线在地下相连。近铁难波线及JR东西线、京坂中之岛线虽不和地下铁直通，但其线路本身几乎都在地下行驶。日本的大手私铁中，完全没有地下线或与地下车站、地下铁进行直通运行的车辆仅有南海电气铁道和西日本铁道两