护区为候鸟迁徙的重要栖地，为高跷鸻在台湾的最大繁殖地点。该保护区在台江国家公园成立后，也被划入国家公园的范围之内。
保护区范围.保护区包括台南市安南区台17线以西的三个区域，包括在东北方的高跷鸻繁殖区54.653公顷、东南方的盐水溪河口东岸的北汕尾水鸟保护区337.3052公顷、西面的鹿耳门溪河口西岸的竹筏港水鸟保护区131.8898公顷，总面积达523.848公顷。