11工程”重点建设的大学之一。1996年10月，物理学家侯杰昌接任武汉大学校长。
武汉大学.1998年5月4日，江泽民在北京大学百年校庆讲话中称：“为了实现现代化，我国要有若干所具有世界先进水平的一流大学”，由此打开了“985工程”序幕。1999年，中国国务院及教育部决定与部分省市共同投资优先建设若干所知名大学使其尽快成为世界一流大学。湖北省委省政府早期方案有武大+华中理工大学+同济医科大学+武汉测绘科技大学+武汉水利电力大学组建新武汉大学，稍后1999年8月的方案为武大+