光谱吸收曲线上，α螺旋结构会在208nm及222nm两处同时出现极小值，而204nm和207nm处出现单个极小值则分别表示存在无规卷曲和β折叠结构。另一个较常用的方法是红外光谱，它可以侦测因氢键所造成胺基的震盪。而光谱中，测定二级结构最准确的方法是利用核磁共振光谱所纪录的化学位移，由于仪器和样品制备上的原因，这一方法较为少用。
类型.
蛋白质.蛋白质的二级结构包含局部残基之间由氢键所调节的相互作用。最普遍的二级结构就是α螺旋及β折叠。经计算后发现其他螺旋，例如