安倍晋三也致信中华民国「蔡英文总统阁下」，并在其网路平台上传一张亲自用毛笔写的「」慰问花莲灾民。日本政府也已派出7名专业人士，携带两台「深层生命探测器」来台协助救援。2018年5月，日本台湾交流协会在Facebook发文表示，日本一贯支持台湾参与世界卫生大会（WHA），为避免防疫产生空白，将继续支持台湾参与。其后，日本在WHA为台湾参与的议题执言。2018年8月14日，由中国国民党于台南市党部旁设立的台湾首座慰安妇铜像在国际慰安妇纪念日揭幕，前总统马英九出席揭幕仪式时，唿吁日本政府应向慰安妇正式道歉