1957年4月21日起，安提顿号被派往彭萨科拉，以训练海军飞行员。其时彭萨科拉的水位尚浅，安提顿号无法进入，故此母港暂时设于梅港（Mayport），直到1958年海军挖深海床后，安提顿号才在1959年1月将母港设在彭萨科拉。每年夏季，安提顿号均会搭载美国海军学院的学员，到近岸考核训练。1961年5月4日，马尔康·罗斯（Malcolm Ross）与维克托·普罗泽 （Victor Prather）乘坐氦气球平流层实验室五号（Strato-Lab V），在安提顿号甲板上升空，测试水星计画的太空衣。气球上升至3