亚的身体状况恶化，1919年2月3日，她在子女陪伴下于威尔登瓦尔特城堡去世。9日，她的遗体被安放在当地教堂，1921年11月5日和丈夫的遗骨一同被转移到慕尼黑大教堂。
詹姆斯党继承.玛丽亚是无子嗣的英格兰、苏格兰和爱尔兰王位的詹姆斯党继承人摩德纳公爵弗朗切斯科五世的侄女和继承人。因此在弗朗切斯科于1875年死后，她成为了继承人。她死后，她的儿子巴伐利亚王储鲁普雷希特继承了她的权利。和1807年之后的其他詹姆斯党继承人一样，她从未认真寻求这项权利。玛丽亚是詹姆斯·弗朗西斯·爱德华