种固定巨噬细胞都会因所在部位的不同而得到不同的特定名称。库佛氏细胞的研究受到限制，因为只有来自活检或尸检的人类库佛氏细胞可以用于免疫组织化学分析。而要在老鼠中把之分离是非常困难的，而且在提纯以后，亦只能从一只鼠身上获得大约五百万个细胞。巨噬细胞在器官中亦有旁泌性功能，这也是为该器官的功能而独有的。以睪丸为例，巨噬细胞能够分泌氧类固醇以及25-羟基胆固醇（可以在睪丸间质细胞附近转换为睾丸酮）来与睪丸间质细胞相互作用。而且，在睪丸中睪丸巨噬细胞能够参与形成一个免疫特化的环境，以及在睪丸发炎期间介导不育。