大学为主体构成的塔林大学在2005年3月18日成立。在此之前，欧洲各国首都中仅有塔林没有直接以其城市名来命名的大学。
机构设置.塔林大学的教学组织由18个研究所和8个学院展开，分别是：爱沙尼亚未来学研究所、爱沙尼亚人文研究所、生态学研究所、教育学研究所、爱沙尼亚人口统计学研究所、爱沙尼亚语言文化研究所、美术研究所、日尔曼-罗曼语言文化研究所、健康科学与体育研究所、历史研究所、信息学研究所、情报学研究所、国际与社会学研究所、数学与自然科学研究所、政治学与政府管理研究所、心理学研究所、