府南靖县迁台定居于云林县古坑乡崁头厝（今永光村），其祖父是清朝武官，曾任「千总」一职，吴克明父亲吴朝宗曾被选为「云林大总理」，后来由古坑迁居至斗六大潭庄。他于清光绪二十年（1894年）参加县学考试，考中秀才，为台湾清领时期最后一年考上秀才者。在日治时期时，吴克明先后担任台南县公议局参事、斗六办务署参事、斗六区长与斗六厅参事等职务。明治四十二年（1909年），他与台湾糖界四大名人的王雪农合作创办斗六制糖合资会社（今台糖斗六糖厂），后来于大正三年（1914年）合併至东洋制糖株式会社为「东洋制糖株式会社斗