故，由郭正域代理尚书。同年楚太子案，主张判别实情，得罪沈一贯，郭正域只好辞官。而后的“第二次妖书案”狱起，差点被沈一贯害死，在太子与东厂提督陈万化的运作下，郭才得以倖免。郭正域博通载籍，勇于任事，有经济大略，自守介然，故人望归之。惜扼于权相，遂不复起，于万历四十年（1612年）病卒，后四年，赠礼部尚书。光宗遗诏，加恩旧学，赠太子少保，谥文毅，官其子中书舍人，谥文毅。
着作.着有《批点考工记》、《明典礼志》、《韩文杜律》等。
家族.曾祖父郭佑；祖父郭镗；父亲