，源赖朝则积极收服、铲除关东地区同为源氏的志田义广、新田义重、佐竹氏与藤姓藤原氏的足利忠纲等反抗势力，并巩固己方武士集团的权益。
其它武士团兴兵与战乱的扩大.除了关东之外，各地接获令旨的源氏势力也一一兴兵响应。例如土佐的源希义、河内石川的源义基与源义兼父子、美浓的土岐氏、近江的佐佐木氏、山本义经、熊野的湛増、伊予的河野氏、肥后的菊池氏等，此外，在若狭、越前、加贺也有官吏阶级起事。1180年9月，信浓的源义仲（又称木曾义仲，源赖朝的堂弟）誓师，迅速席卷信浓、越后。之后曾一度进兵至