发腹膜炎于12月21日逝世。
身后.1930年12月22日，他的遗体被送至火葬场火化，亲友再将骨灰送回其位于池袋之住处；张秋海、郭柏川、陈承藩、何德来、李梅树等人与其亲族共同为其举行相关仪式。1931年，亲友等人为其于台北东门町曹洞宗别院举行追悼会，随后将其遗骨葬于三桥町墓地；5月9日及10日，亲族及友人为其于台北举行遗作展，现场展出作品共七十九件。1932年10月30日，《志保田鉎吉校长像》立于台湾总督府台北第一师范学校。1937年2月2日，为其举行遗作捐赠奉告祭，并