1925年，莫希奇茨基被选为利沃夫理工学校校长，但他随后迁到华沙，以便在华沙理工大学完成他的研究。1926年5月，约瑟夫·毕苏斯基发动政变。政变后的1926年，毕苏斯基谢绝担任总统，他推荐他从前在波兰社会党时的同僚莫希奇茨基担当此职，莫希奇茨基在国民大会上赢得选举，成为波兰总统。 身为总统，莫希奇茨基对毕苏斯基毕恭毕敬，不敢公开体现他在任一方面与毕苏斯基之间的分歧。1935年毕苏斯基逝世后，毕苏斯基的追随者分成三个主要派系：一派支持莫希奇茨基作为毕苏斯基的继承者，一派支持爱德华·雷兹-希米格维，另