。中东冠状病毒具单链核糖核酸，为冠状病毒属的新成员，按基因组区别被分为了甲、乙两大系统发生分支；最早期的感染病例是由甲类病毒造成，与后来的不同。中东冠状病毒主要袭击支气管上的无纤毛上皮细胞。它能避开宿主体内的起始免疫反应，并阻止免疫细胞分泌干扰素。此向性在众多唿吸系统病毒里实属独特，因为其他病毒大多都袭击纤毛上皮细胞。
传播途径.2010年至2013年间进行的一项研究，在310头单峰骆驼的身上评估MERS的发病率，揭示出MERS冠状病毒中和抗体在这些动物的血清中的滴度高。进一步