北部蜿蜒行进期间一共夺走12条人命，其中9人是因石油钻井平台或船只倾覆致死。飓风直接造成的损失就有15亿美元，如不考虑通货膨胀因素，这一数值当时可以在所有吹袭美国的飓风中排第4，仅次于1979年的飓风弗雷德里克、1972年的飓风艾格尼丝和1983年的飓风艾丽西亚。胡安造成的经济损失大部分来自石油业、受损农作物，以及洪水引起的破坏，其中又以路易斯安那州灾情最重。据联邦紧急事务管理署统计，气旋还导致1357人受伤，不过伤势较轻。不到两个月前，墨西哥湾北岸还曾受到飓风艾琳娜重创，胡安的来袭更令本已满目疮痍的地区雪