重排的一种特殊类型。1940年代，美国微生物学家莫里斯·希勒曼发现了抗原移型现象。抗原移型与抗原漂移不同，后者是指已知病毒毒株随时间的自然突变，可能造成人对其的免疫丧失或疫苗失效。抗原漂移出现在所有人类流感病毒中，包括甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒。而抗原移型只发生在甲型流感病毒上，因为该病毒可以感染人以外的物种； 受影响的物种包括其他哺乳动物和鸟类，这给了甲型病毒进行较大表面抗原重组的机会。乙型和丙型病毒则基本只感染人类，因此能导致重大表型变化的基因重排很难发生。