之后，Dimitri van Heesch重写了Doxygen的源代码。Doxygen是一个编写软件参考文档的工具。该文档是直接写在源代码中的，因此比较容易保持更新。Doxygen可以交叉引用和源代码，使文件的读者可以很容易地引用实际的源代码。KDE将Doxygen作为它的一部分且KDevelop具有内置的支持。Doxygen的发布遵守GNU通用公共许可证，是自由软件。
用法.如同Javadoc，Doxygen从源文件提取註解。除了Javadoc的语法，Doxygen支持