击败。联邦党在1789年正式成为执政党，而民主共和党成为在野党。
约翰·亚当斯任期.1796年美国总统选举，联邦党候选人、美国副总统约翰·亚当斯当选，接替华盛顿出任第二任美国总统，民主共和党候选人杰弗逊则当选副总统（当时没发展政党政治，选举人票第二多的候选人出任副总统，此后改由总统、副总统分开选出）。1800年美国总统选举，亚当斯被杰弗逊击败而连任失败，失去政权。
没落.在美国和英国之间发生1812年战争后，主张反战的联邦党失势。