返台，于新营街开业。二二八事件发生不久前的2月21日到2月28日期间，他与台湾大学的金关丈夫、国分直一、余锦泉教授、蔡滋里讲师、蔡钖圭助教等人在当时的台南县大内乡的头社村、呜头村（今台南市大内区头社里、环湖里）进行平埔族体质研究。二二八事件期间，任二二八事件处理委员会台南县分会负责人。3月21日遭到当局以监狱犯人生病要求前往看病为由诱捕，被绑上军用卡车游街示众后再往台南监狱。关了一个多月。后来仍受到情治单位监视，其所开设的沈内科诊所亦受到影响，病患踏出诊所大门就遭询问。他在民国三十九