二轮三盘输给当时的世界第四萨芬。以外卡身份参赛的穆雷，在美网首轮首度五盘获胜，第二轮五盘负于克莱门特。对阵瑞士队的戴维斯杯中，他再次被选中，首场单打负于瓦林卡。其后在美国公开赛晋身次轮。在泰国网球公开赛击败索德林后，世界排名首次进入前100，不过决赛被费德勒所击败。巴塞尔站中首轮三盘淘汰时任英国第一亨曼，然后以同样的方式战胜伯蒂奇。之后在输给冈萨雷斯。年终当选BBC2005年度苏格兰体育人物。穆雷在2005年终的排名是第64。
2006年.2006是穆雷的首个完整赛季，他解雇了