共和国的反应，1958年2月，伊拉克和约旦达成协议也要合并，组成阿拉伯联邦。但是，由于同年伊拉克的王朝被推翻，这个计划未能实现。美国派空军入驻约旦，以防止约旦发生类似的政变。政变后的伊拉克却拒绝加入阿拉伯联合共和国。在黎巴嫩亲西方的基督教徒和泛阿拉伯的穆斯林之间爆发冲突。美国介入后使得这场冲突没有扩大。
解散.联盟中的两个国家有许多分歧。埃及把所有在叙利亚从事的企业和银行国有化，并确定开罗为整个共和国的首都，几乎所有的政府成员都是埃及人，叙利亚因此觉得自己被欺骗和出卖。1961年9