海将周镐安排在国民政府军事委员会军事处第六科，担任少将科长。周镐遂秘密组建军统南京站，按南京的区域划分成立了八个组。任内，他与伪军孙良诚、张岚峰、吴化文、郝鹏举等部建立了联系。因工作出色，戴笠提拔周镐为军统少将。 
接管南京.日本投降后的第二天，周镐在南京成立了国民政府军事委员会京沪行动总队南京指挥部，接管汪精卫政权，开始搜捕汪精卫政权要人。由于办事凌厉，指挥部同汪精卫政权的国民政府主席陈公博的卫士团发生了冲突，日军请周镐来到司令部商谈接管事宜，周镐一来便被扣押，其部下被解散。南京