穆斯林（和超过99％的逊尼派、 什叶派 0.5％、阿赫迈底亚 0.2％），6.96％基督新教，2.91％天主教，1.69％印度教，0.72％佛教，0.05％孔教，其它宗教0.13％和0.38％未表态。
历史.历史上，来自印度，阿拉伯，中国，葡萄牙和荷兰的移民对印尼的宗教文化多样性的贡献了不少。在的亚伯拉罕诸教（伊斯兰教、基督宗教和犹太教）传入之前，该地区流行的信仰体系深受印度教和佛教的影响。当印度商人到达苏门答腊岛，爪哇岛和苏拉威西岛时，印度教和佛教分别在第二和第四世纪传入印尼。印