系排除政敌行动短暂受挫，但仍成功掌控北伐前数倍的区域。1928年，国民政府第二次北伐，蒋、李宗仁新桂系、阎锡山晋系、冯玉祥西北系合共兵力40万北上，成功击败奉系，进占华北。张作霖退回东北，遭到日本人暗杀。国民政府胜利，促成东北军首领张学良主动宣布“东北易帜”，服从国民政府，使国民政府形式上统一全国。这时，新桂系势力扩张到河北，势力极盛。南京国民政府统一全国之后，四大派别各拥兵数十万，驻军数省地盘。国民政府在蒋中正主导下，以休养生息与战后复员等名义召开“善后编遣会议”，意图裁军。当时，新桂系得到广