实施废藩置县后也分别被划为由藩改设立的膳所县、神户县，不过仅半年后的第一次府县整併中，锦部郡全境就全数被整併至堺县。1880年实施，正式的设置了近代的行政区划「锦部郡」，但并未设置自己的郡役所，而是由古市郡役所负责管理周边的石川郡、锦部郡、八上郡、古市郡、安宿部郡、丹南郡、志纪郡，因此古市郡役所也被更名为「石川锦部八上古市安宿部丹南志纪郡役所」。1881年，由于堺县被併入大坂府，锦部郡随之成为大坂府的辖区。