除了拥有原版中的绫波丽路线，还可以解开一个新的明日香路线。任天堂DS版《新世纪福音战士：绫波育成计划DS与明日香补完计划》（）于2008年8月28日发布。
游戏概述.在《绫波育成计划》，玩家会扮演一名刚刚被分配到第三新东京市的NERV成员（名字由玩家决定），阶级为三尉。在会见指挥官碇源堂后，他被指派去照顾第一适任者——神秘的EVA驾驶员绫波丽，任期为2015年4月1日至2016年3月31日（「人类补完计画」发动日），包含了整个《EVA》系列动画以及剧场版《THE END OF EV