员会组织民众聚集菲律宾驻华代表处前抗议，宣读《对菲律宾政府的公开抗议信》和《对马总统具体作为的唿吁》，要求政府考虑与中国大陆联手与菲律宾交涉。另外，由于菲律宾在此次事件发生后，始终坚持不道歉，并称此为「意外」事件，仅对事件表达遗憾。台湾网友发起「键盘开战行动」的网路战，以瘫痪菲律宾政府网站的方式表达抗议。5月13日，匿名者组织入侵菲律宾政府网站，要求菲律宾道歉；该组织并于该日凌晨侵入菲律宾DNS资料库，并公开资料库的帐号密码，一度造成菲律宾三分之二的政府网站瘫痪，甚至还有骇客高手打开后台管理许可权，上传