帕韦和索非布费的治疗对于第1型有高达93-99%的成功率，但非常昂贵。 在第6型中，长效型干扰素和瑞比达于60-90%的案例是有效的。第6型也有使用司美匹韦的试验数据在2011年之前，会用和瑞比达（利巴韦林）的组合作为治疗药物，给药期间视根据HCV基因型的种类，为24週至48週，这分别对第2型和第3型有70%和80%的治癒率，对第1型和第4型有45-70%的治癒率。但这些药物常见有副作用，有一半的人会有，有三分之一的人会经历情绪上的问题。在C型肝炎的前六个月治疗药物会比较有效，但C型肝炎转变成慢性后，效