位后，郑经曾参与三藩之乱，率军反攻大陆失利。1681年，郑经逝世，权臣冯钖范与宗室郑聪发动东宁之变，杀监国郑克，改立郑克塽嗣位，明郑国势大衰。1683年，清朝康熙帝命施琅为水师提督进攻台湾。郑克塽投降，明郑灭亡。
影响.明末，鼠疫与旱灾在中国盛行，直隶「一望极目，田地荒凉」，河南「满目榛荒，人丁稀少」。四川经战争兵火更是「榛榛莽莽，如天地初辟」。顺治二年，御史刘明瑛称：“比年以来，烽烟不靖赤地千里，由畿南以及山东，比比皆然。”顺治八年和硕端重亲王形容山西：“田地榛芜，生齿雕耗，…