宣下。异母兄后嵯峨天皇即位，十二月十六日（1245年1月15日），21歳卜定斋宫。宽元3年八月十三日（1245年9月5日），左近卫府初斋院，同年九月十七日（10月9日）入野宫。同4年正月廿九日（1246年2月16日），后嵯峨天皇让位，群行退下。宝治2年八月初八日（1248年8月27日），后嵯峨天皇册立曦子内亲王为准母、皇后。建长3年三月廿七日（1251年4月19日）院号宣下，称仙华门院。弘长2年八月廿一日（1262年10月5日），39歳驾崩。