标志.标志由陈秀燕设计，是民政总署在2006年初为博物馆标志举行的设计比赛中从170件作品里所挑选。
考古.第二展室展示首次在凼仔进行考古发掘的“凼仔前海岛市政厅地下室石结构遗址”及文物，有近百年历史，是澳门考古史以来首次完全由澳门人主持的考古发掘，亦为澳门特别行政区成立后首次考古发掘。