爆发，历阳内史苏峻出兵攻向建康，孔坦和司徒司马陶回当时就对王导表示应当先出兵断阜陵县界，守当利等江西诸口，以求一战决胜。即使苏峻未到，亦可主动进袭其城池，不要让苏峻先佔据那些地方。王导当时亦同意，然而庾亮认为苏峻是想袭虚直袭建康，故没有听从，最后苏峻攻下姑孰，夺取在当地的盐米，庾亮才后悔。面对苏峻即将兵临城下，孔坦对人说：「看苏峻的势头，肯定可以攻破台城了，若不是战士，不用穿戎装。」城陷之日，身穿戎服的大多都被杀，其他人却无恙，当时人都称他有先见之明。及后，苏峻挟成帝至石头城，孔坦出奔讨伐军盟主陶侃，获其任