授为户部尚书，列议政大臣。十二年，尚可喜、吴三桂、耿精忠疏请撤籓。康熙集诸大臣廷议，廷上众人认为三藩决不可撤，仅兵部尚书明珠和米思翰主张撤藩。米思翰死时仅四十三岁，时三藩之乱猖獗，廷议追究主张撤藩诸臣，帝不允；及三藩平定，屡次称道米思翰，其四子（马斯喀、马齐、马武、李荣保）皆获重用。