同治六年（1867年），移师兰州。当时省城缺乏战备，数千回众突然来犯，长顺率百人隐于小沟，出其不意勐击来敌，回军惊愕而逃，又败回军于平番、皋兰、狄道，规取河州，连破太子寺、高家集，获清廷赏赉。同治八年（1869年），擢镶黄旗汉军副都统，回京供职兼充神机营专操官。同治十年（1871年）冬，陕西、甘肃回民侵扰北路军台，迁科布多参赞大臣。同治十一年（1872年），署乌里雅苏台将军。因与前署乌里雅苏台参赞大臣互参，于同治十三年（1872年）被革职。光绪三年（1877年）复官，左宗棠进规新疆，并举荐长顺，历署