对兔经口的半数致死量为7mg/kg，对大鼠经口的半数致死量为46mg/kg。丙烯醛是国际癌症研究机构（IARC）分类中的第三类物质，目前尚未证实丙烯醛对人类有致癌作用，对动物则为不肯定性反应。丙烯醛是有神经毒性的化学治疗药剂环磷酰胺的代谢产物之一，对膀胱上皮有损害，会导致出血性膀胱炎。最近的一项研究也发现了存在于吸烟烟雾中的丙烯醛与肺癌之间的联系。