对策室等设置后，会根据情况，在内阁设置政府的对策本部。
非常时期.东京都内设有内阁府的预备设施。大规模灾害（最有可能是震源在东京湾北部的南关东直下地震）发生时，内阁总理大臣担任本部长，设置国家紧急灾害对策本部及事务局；官邸、、防衞省（）都损坏而不能作爲紧急灾害对策本部使用时，会在都心以西约30公里的灾害对策本部预备设施设置紧急灾害对策本部，作爲临时据点，官邸职能也可能暂时停止。