月台（其中一座岸式月台为因应在新竹市举行的台湾灯会而临时建造，并设有直通后站的出入口通道。）与两座岛式月台。月台遮雨篷的骨架为钢制，骨架与铸铁柱接头处有浮雕图案，铸铁柱下方也有乳丁装饰。昔日在第二月台北端14车以后的位置，曾有一段缩减式的月台，用以停靠内湾线的列车，但在内湾线整修完工复驶后，该月台内的路轨被拆除，发车也改至第三月台。2016年1月1日起，于上午6点半至晚间9点50分开放地下道可连接到各个月台。新竹车站逆行列车出站(2A月台)需拐16号道岔，即使是通过列车最高也仅能以时速60公里通过。