而，等位基因的随机分布是在选择不参与和其他前提下成立的。当这些前提成立时，一个种群的状态被称为哈蒂－温伯格平衡。一个基因中所有等位基因的频率可以被绘制为等位基因分布柱状图。群体遗传学研究的内容包括影响等位基因频率的因素－换句话说，演化。除了自然和人工选择外，这些因素还包括遗传漂变、突变和迁移。
例子.如果在一个种群中有10个个体，一个特定基因座有两个可能的等位基因A和a，个体的基因型分别为：那么等位基因A和a的等位基因频率分别为：当然，也可以分开单独计算AA、Aa、aa个体