只是奥羽本线的一个沿线车站，但因为以奥羽本线部分路段进行路线升级而成、与奥羽本线共用路线的山形新干线也在本站停靠，因此在实际运务上村山是山形新干线与奥羽本线之间的转车站之一。村山车站在1901年初设置时，原名楯冈，是楯冈町（已在1954年时整合周围的数个村级行政区，升格成为村山市）的主车站，但1954年村山市设置后车站并未随之改名，直到1999年时，才配合山形新干线新庄延伸段的通车，在搬迁入新设的车站建筑同时改名为村山车站。
车站结构.侧式月台1面1线与岛式月台1面2线，合