拥有两条轨道。两个站台之间有一座无障碍的行人天桥衔接两处。车站大厅和主入口皆位于南边的站台上。
综合换乘.于2010年开始建设的巴生谷捷运工程当中，双溪毛糯捷运站是双加捷运与马来亚铁道之间的4个转换站之一。另三个转换站为与吉隆坡中央车站、与吉隆坡旧火车站和。当时双溪毛糯捷运站将建在现有的双溪毛糯火车站旁边，并建在露天地面停车场的旧址。虽然捷运轨道的部分建设工程越过旧有的火车轨道，但火车站在施工期间仍然继续运营。随着新综合车站的建成和开通，旧有的火车站结构被拆除。火车站票务处