作为超市使用。此时的吉林站拥有1个侧式站台和2个岛式站台，并在当时的站台东侧拥有货场。
2009年改造.2009年9月1日，为配合长吉城际铁路工程建设，吉林站封站改造并拆除于1992年建成的站房，原吉林站客车被分流到吉林西站、江北站两个临时客站。2011年1月11日，新站房主体建筑投入使用，长吉城际铁路开始运营，开行北京、沈阳、哈尔滨、长春等方向30对动车组列车，先期开通西站房和6-9号站台（后期为10-13号站台）使用。与此同时，东站房、高架候车大厅、未开通的站台都在施工中。