中央组织部的职权被刘少奇任书记的中央组织委员会代替。陈云在主管中组部的七年中，中共党员从3万上升至121万，培养并向全国输送了大批干部。然而他执意反对康生在湖西事件、“拯救运动”中夸大右派、肃托及打压迫害干部行为；反对江青转入鲁迅艺术学校；以及在毛泽东与江青结婚的问题上，他也表达了反对意见；这些事情却给他在文化大革命期间被打击迫害，埋下了伏笔。1944年3月5日,彭真任中共中央组织部代理部长。1944年3月6日，病愈复出的陈云任中共中央西北局委员、西北财经办事处副主任兼政治部主任，主持陕甘宁边区的财经工