白处以逐出教会，这使伊丽莎白无法继续宗教宽容的政策。同时敌人的阴谋也使伊丽莎白非常震怒，廿载以来，苏格兰女王玛丽·斯图亚特从不愿意向伊丽莎白挑战，但此刻玛丽陷入了天主教拥护者的阴谋中。这些阴谋的主谋是安东尼·巴宾顿，其目的是营救玛丽，并使其取得伊丽莎白的宝座，对伊丽莎白来说，这却是个歼敌良机。1587年伊丽莎白不得已之下，处死了玛丽（据说伊丽莎白并不情愿下这条命令）。
与西班牙的战争.伊丽莎白向法国的新教徒亨利四世提供了军队和钱财来让他获得法国王位。在八年战争中，他向荷兰的新教徒奥