昭和17年）11月，师团从华北转战新几内亚，编入第8方面军隷下的第18军。先遣队步兵第239联队以及师团主力分别于1943年（昭和18年）2月下旬和同年5月进攻新几内亚东部的韦瓦克。然而，此时第51师团已经在莱城、萨拉毛亚战役战败，后来在芬夏范战役中第20师团遭到重创，此时的第18军已经处在已被摧毁的状态。。1944年（昭和19年）7月10日，以第41师团为主力的第18军残部倾全力发起艾塔佩战役，以后残余部队在亚历山大山脉于持续饥饿中继续作战。