前提下；即）。在这个概念下，我们可以预期蝙蝠与猴的亲缘关系较近而蝙蝠与鱼则较远，因为蝙蝠与猴共享有体毛的相同特征。然而，我们并不能说蝙蝠与猴的亲缘关系较近而蝙蝠与鲸鱼则较远，因为我们以三者的共同祖先具有体毛特征为前提。然而，演化过程有诸多现象，包括趋同演化、平行演化与祖征重现（），也就是多个非同源物种发生相同特征（）的现象，使得以上述概念估计亲缘关系树时发生偏差。由于诸多原因，二个物种可能发生相同特征但并非源自于他们的共同祖先。假如我们视这项相同特征为二物种关系相近的证据，则会重建一个错误的亲缘关系树。