代基的化学构成，包括其成分的不同以及糖原的不同排列方式，决定了其表面体抗原或是O-抗原的性质，而这正是血清学中对许多革兰氏阴性菌分类的基本手段。军团菌的名字源于1976年7月在费城爆发的一种“神秘疾病”，该病共造成221人患病，34人死亡，患者大都为美国退伍军人，因而被冠名为退伍军人症。退伍军人症被广泛宣传而造成一定程度的恐慌。1977年1月18日，该病的病原体被确定为一种不为人知的细菌，随后被命名为军团菌。