形态学研究和系统发育分析则支持菊虎总科为的一个支序，为稳定叩头虫总科的单系性，便将其划入叩头虫总科，而分子系统发育学也证实这样的处理。目前本科已知有、、、尖须菊虎亚科、荧菊虎亚科等五个亚科。
古生物学.目前该科最早的纪录则来自黎巴嫩琥珀（1.25~1.35亿年前，白垩纪早期），然而身体后方完全损毁，以致无法确认物种分类。澳大利亚则于（Koonwarra）化石层有白垩纪早期（1.15亿年前）有菊虎化石的纪录，然而保存状况亦不佳。目前除了三例白垩纪缅甸琥珀的种类（均来自缅甸），大多数琥