6－2四盘憾负祖高域。印第安维尔斯大师赛八强负于德尔波特罗出局。迈阿密大师赛则晋身决赛，并以三盘击败费拿夺冠。泥地赛事方面，在蒙地卡罗、马德里及罗马，分别于第三圈、八强及次圈出局，之后因伤退出法国网球公开赛。但他在草地赛事表现出色，先在皇后会盃决赛击败契利奇夺冠，后在温布顿网球公开赛决赛击败老对手祖高域夺冠，成为七十七年来和公开赛年代第一位夺得温布顿冠军的英国本土球手。在2013年美网，穆雷止步8强，未能卫冕。在戴维斯杯后，穆雷决定进行手术治疗背伤，提前结束了该赛季。预计他将在2014年布里斯本国际赛复