学、病毒的检测技术、病毒的分子流行病学研究等方面颇具经验。SARS事件zh-hans:暴发;zh-hant:爆发后，石正丽亲自带领研究团队，在全国各地调查蝙蝠栖息洞穴，采集各类蝙蝠样品做病毒检测，寻找SARS病毒踪迹。2013年将成果发表于《自然》杂志，为SARS蝙蝠起源提供了最为有力的证据。此外她还发现了中国蝙蝠感染尼帕病毒、埃博拉病毒相关病毒的血清学证据，在蝙蝠中发现并鉴定了腺病毒、等新病毒，进一步证实蝙蝠是多种病毒的自然宿主。2015年，石正丽曾参与可感染人的冠状病毒研究。2015年1