表的保皇派宣布讨伐国会，英国内战爆发。1645年，邓迪被保皇派的蒙特罗斯侯爵围困。1651年，奥利弗·克伦威尔的手下乔治·蒙克率领议会派军队袭击了邓迪，并将该城洗劫一空，甚至杀害了许多居民。
大英帝国时代.1688年，英国发生光荣革命，信奉旧教的斯图亚特王朝君主詹姆斯二世被罢黜。苏格兰的一些贵族为了维护传统的氏族制度，迫切希望詹姆斯二世重归王位。1689年，第一代邓迪子爵约翰·格雷厄姆在邓迪附近树立了斯图亚特王朝旗帜，该镇成为了詹姆斯党的重要据点。从1715年开始，詹姆斯党在邓迪连