年12月1日他接替金谷范三大将任参谋总长。闲院宫载仁亲王出任参谋总长期间，日本帝国陆军犯下了南京大屠杀和使用化学武器等战争暴行。1937年日军仅小范围的使用毒气，但到了1938年春，日军开始大规模使用催泪弹和红色呕吐性气体；1939年夏，日军在作战中对中国军队使用了芥子气。 1937年7月28日，载仁亲王传达天皇特别命令，允许对中国人使用化学武器。同年9月11日他传达了第2号特别命令，将731部队和516部队调往上海，投入作战。 1938年11月11日，载仁亲王以参谋总长的身份授权华北方面军在内蒙古对国民革