通过膜输送到类囊体腔中，以提供类囊体腔腔与叶绿体基质之间的潜在能量差异，相当于可用于产生ATP的质子动力。 质子由质体醌运输。 如果电子仅通过一次，则该过程称为非循环光合磷酸化。 当电子到达光系统I时，它填充光系统I的反应中心叶绿素的电子缺陷。当ATP合酶将存在于管腔中的质子通过膜转运到基质时产生ATP。电子可以继续通过PS I周围的循环电子传递或通过铁氧还蛋白传递给酶NADP 还原酶。将电子和氢离子加入NADP 中以形成NADPH。 这种还原剂被输送到卡尔文循环，与3-磷酸甘油盐一起与ATP反应生成甘