弗朗切斯科三世在位期间历经多场战争，几乎将公国的财政透支，被迫变卖许多珍贵的艺术品收藏。1796年，拿破崙率领法军佔领摩德纳公国，埃尔科莱三世·埃斯特逃亡，公国被废立并创立了奇斯帕达纳共和国，1801年吕内维尔条约签订，作为补偿，埃尔科莱三世获得了前奥地利地区，位于德国南方的布赖斯高。
奥地利-埃斯特家族.埃尔科莱三世·埃斯特于1803年去世，由于没有留下合法继承人，头衔由他的女婿斐迪南·卡尔继承，奥地利-埃斯特家族成立。斐迪南·卡尔是奥地利女大公玛丽亚·特蕾西亚与神圣罗马皇帝