体与溶酶体融合之前逃逸到细胞质基质中。包括结核分支杆菌（"Mycobacterium tuberculosis"）及鸟副结核分支杆菌（"Mycobacteria avium paratuberculosis"）的许多分支杆菌属细菌还可以操纵寄主巨噬细胞，使含有亚硝酸的溶酶体不能与吞噬体融合成吞噬溶酶体。这种在成熟过程中被阻断的吞噬体反而会成为其中的病原体繁殖的适宜环境。