性别女性的雄激素受体基因比顺性别男性长，这种结合睾酮的效果较差，可能会阻止大脑完全男性化（产前雄激素的暴露和敏感性或缺乏，是一种经常被引用来解释观察到的脑结构差异的理论）。Bentz的一项研究发现，跨性别男性的CYP17等位基因分佈与顺性别男性一样，与顺性别女性不同。 发表在国际跨性别主义杂志上的一项双胞胎研究发现，33％的同卵双胞胎都是跨性别双胞胎，而同一家族同时抚养的非同卵双胞胎只有2.6％，而每对中不全然是跨性别，基因不完全相同。环境因素也已经被提出。在大卫·利马的生殖器被意外摧毁之后，试图将其从