评论赞扬，《GamePro》和《电子游戏月刊》分别为游戏打了4.5/5和9.5/10。《任天堂力量》2006年再度将游戏列为最佳任天堂游戏之一，将其置于“任天堂平台最佳200游戏”的第13位，称其可能是史上“最棒的”最终幻想。2005年，多媒体新闻网站IGN将《最终幻想VI》列为最佳100游戏的第56位，在最终幻想作品中位次《最终幻想IV》名列第二。IGN称PlayStation移植版的图形“美丽而令人震惊”，并称在发布当时“《最终幻想III》代表RPG应有的一切”，状态值成长系统的灵感后来影响了《荒野兵器