包括结核杆菌),具外套膜病毒,真菌,甚至转化的细胞或癌细胞。不同于许多传统的抗生素，抗微生物肽还可以作为免疫调节剂以提高免疫力。
结构.抗微生物肽是很小的蛋白质，一般在12至50个氨基酸残基。这些抗微生物肽有两个或两个以上的由精氨酸,赖氨酸,和(在酸性环境中的)组氨酸提供的正电残基。一般有多于百分之五十的疏水性氨基酸残基。这些分子的二级结构包括α-螺旋, β-折叠层、β发卡结构及延伸片段。
抗菌.抗菌肽可以同时具有多种活性，包括抗革兰氏阳性细菌、抗革兰氏阴