终于来到了五台山。随后用三个月的时间，朝拜了五台山上的五个台顶。最后驻锡于五台山广济茅篷（今碧山寺）。在碧山寺修行期间，用自己的血书写了《普贤行愿品》等19部佛经，共计20余万字。1939年，出任碧山寺第三代方丈。1947年，游历天下禅院，朝拜了北京弥勒院、天津居士林、上海普济寺。1949年2月5日（正月初八），继承汉传佛教高僧释虚云法脉，为临济宗第四十四代传人。随后出任南华寺方丈。1958年，中华人民共和国开始“反右运动”运动，释本焕蒙冤入狱，在狱中被关押达22年，佛教居士赵朴初曾多次奔走