切断、扭曲且重新连接 DNA，形成电泳速率较慢的可观察结果。拓扑学也被用于演化生物学里，以表示表现型与基因型间的关系。基因型的改变对表现型的改变之影响方式，可决定是否只需少数的突变，即可呈现出极为不同的表现型来。
电脑科学.拓扑数据分析使用代数拓扑学里的技术，以确认一个集合的大尺度结构（如确认许多点组成的云是球形或环形）。拓扑数据分析使用的主要方法为：
物理学.在物理学里，拓扑学被用于量子场论及宇宙论等领域。拓扑量子场论（或称拓扑场论）是一个用来计算拓