华民国是法治国家，林毅夫若返台到案，将由军法机关依法办理。中华民国前总统陈水扁在《壹週刊》专栏中表示，如果台湾与大陆真是马英九总统所说「一国两区」，现任世界银行副行长林毅夫当年「何叛逃之有」？陈水扁表示，若依一国两区之说，林毅夫不过是从中华民国的「台湾地区」跑到「大陆地区」，都在「一国」之内，这样如何「叛逃」。陈水扁表示，中华民国领土所称「固有疆域」范围的界定，属重大政治问题，不应由释宪机关解释。因此，他说「台湾中国、一边一国」，马总统说「一国两区」，应该都是「政治语言」。中华民国前总统李登辉表示，