钱学榘的堂兄为即为中国“导弹之父”钱学森，中国科学院和中国工程院两院院士，钱永健是钱学森的堂侄。钱永健在一次学术采访中曾被问起提及堂伯父钱学森。钱永健表示知道钱学森曾为着名工程师，却与美国政府有过节而离境，回到中国后领衔中国导弹研究。。钱永健之兄钱永佑是神经生物学家，美国科学院、医学院双院士，曾任斯坦福大学生理系主任。钱永健妻温迪·格劳伯·钱（）女士，无子女，有一继子。2004年，刚获得沃尔夫奖后，钱永健携夫人、母亲李懿颖回浙江游览。
荣誉.钱永健是当今生命科学集大成