特遂单独进军台湾。1664年1月19日，荷军从打狗登陆，郑经遂提出割让南澳岛、交还战俘向博特谈和。博特坚持要取回台湾才肯缔和，双方谈判破裂；不过荷军也无力拿下台湾，博特只得于2月26日返回巴达维亚，等待清廷的消息。6月，巴达维亚当局决定佔领鸡笼，任命上尉比特（Herman de Bitter）为鸡笼长官，并由博特率12艘战舰负责进攻。8月27日，荷军抵达鸡笼，重新修复1661年废弃的北荷兰城，作为进攻台湾的滩头堡。事后博特前往福建，商讨进攻郑氏事宜。不过清军将领如耿继茂、黄梧等正热衷与日本贸易，不太愿意