1岁的司马聃，因而由司马聃继位，是为晋穆帝，褚皇后也升为太后。由于穆帝年幼，因此由朝臣奏请褚太后临朝称制，并由大臣何充、蔡谟、司马昱等相继辅政。褚蒜子也是中国历史上第一位以当朝原配皇后身份生下未来皇帝者。褚太后临朝称制后，有司奏曰，褚太后亲母谢氏既获乡君封号，前母荀氏、卞氏亦应追赠，但为褚太后婉拒。晋穆帝成年行冠礼后，褚太后归政，隐居崇德宫，不再过问政事。晋穆帝亲政不久后驾崩，无子，于是由堂兄司马丕继位，是为晋哀帝。由于穆、哀两帝之间为平辈继位，因此褚蒜子仍为太后。晋哀帝即位不久，迷上道士传授的长生