不但不退兵，反而利用崔益铉的天真和麻痹袭击包围义兵，结果崔益铉的义兵队伍猝不及防，阵脚大乱，义兵将领郑时海阵亡，崔益铉和林炳瓒等人当场被俘，押往汉城。崔益铉的义兵队伍就这样昙花一现，很快就被镇压了。光武十年（1906年）8月，崔益铉等人被流放到日本对马岛。12月30日（阴历十一月五日），崔益铉在对马绝食殉国，遗诗一首以明其志：
着作.崔益铉一生着述颇丰，他的诗歌、散文、书信、奏疏被收录在《勉庵集》中，全部用汉字写成。1931年，《勉庵集》被编辑出版，合48卷24册。