，燕王朱棣举兵叛乱，指称齐泰和黄子澄为奸臣。事情传到应天，齐泰奏请将燕王从宗室谱籍中削除，声明其罪状并派兵征讨。有人责难齐泰，齐泰则说：“将他们明示为贼，就可以将敌人击败。”于是朝廷决定讨伐燕王，布告天下。当时明太祖的功臣留下来的很少，建文帝便授长兴侯耿炳文为大将军，率军分道北伐，到真定为燕军所败。黄子澄推荐曹国公李景隆代替耿炳文统率军队，齐泰极言不可。黄子澄不听，最终还是命李景隆率军。当时，建文帝将五十万军队全部交给李景隆，并称短时间内便可灭燕。朱棣因此大喜道：“昔日汉高祖只能统兵十万。李景隆有什么才能，