任3个月。此后，历任中国国民党山西省党务指导委员、国民政府军事委员会委员。阎锡山在中原大战中败北下野后，1930年（民国19年）11月，南桂馨调任陕西省政府委员。1931年（民国20年）10月，被任命为立法院立法委员。1935年（民国24年）6月，调任河北省政府委员。他还担任全国水利委员会委员。抗日战争期间，他在天津闲居，拒不出任亲日政权职务。1946年（民国35年）11月，当选制宪国民大会代表。1947年（民国36年）3月，任宪政实施促进委员会常务委员。1948年3月，任第一届国民大会代表。同年任傅作