于1907年9月30日再次退役。在此期间，勃兰登堡号唯一值得注意的事件是在斯德哥尔摩外围发生过轻微搁浅，但未造成任何损坏。在第二度退役后，其船员再被转移往新式战列舰，这次是汉诺威号。此后，勃兰登堡号被分配至北海预备役分舰队（）。至1910年，第一批无畏舰开始进入德国舰队服役，使勃兰登堡号这样的老旧舰船显得过时。那一年，它临时重返第三分舰队服役，以参加年度舰队演习。演习结束后，它回到了北海预备役，并在那里进行了进一步的训练。在1911年中期，它被调往训练及实验船部队，随该部队参加了在波罗的海的训练演习。勃