支升级球队留下的空缺名额由科隆和凯泽斯劳滕填补，他们是在2011-12赛季德甲结束后降级。其中科隆是连续4年停留于德甲后重返德乙，而凯泽斯劳滕则是时隔2年便回到德乙。在积分榜的另一端，亚琛和汉莎罗斯托克直接降至2012-13赛季德丙。亚琛是自1998-99赛季以来首次跌落第三级别联赛，而罗斯托克则结束了他们在德乙的客串赛季。两支降级球队留下的名额空缺由2011-12赛季德丙的冠军桑德豪森和亚军阿伦填补，这是两支球队在这一级别联赛的首次亮相。另外2个参赛名额则通过两回合制的附加赛决出。在上季德甲第16