参与多个台语文社团，以及担任多个台语文杂志之编务。2004年方耀干进入成功大学台湾文学系博士班深造，于2008年以《Uì边缘kàu多元中心：台语文学ê主体建构》论文拿到博士学位。在这篇论文里，他提出「多元脉络理论」，企图建立台语文学的主体性，扭转台湾文学史的一元书写，成为互为主体的多元中心书写。
经历.方耀干自1988年开始从事教职，曾经任教单位计有崑山工专、台南家专、台南市救国团、台南女子技术学院、台南大学（前身为台南师范学院）、台南市社区大学、台南应用科技大学。方耀干曾