成为库尔德斯坦民主党的领导人。1995年，伊拉克政府请求他协助从现任伊拉克总统，同为库尔德人的贾拉勒·塔拉巴尼领导的库尔德斯坦爱国联盟手中夺回城市阿尔贝拉。在这次行动中，塔拉巴尼得到了伊朗方面的支援。之后，巴尔扎尼和塔拉巴尼都利用土耳其外交护照进入土耳其境内。巴尔扎尼率领库尔德民主党在伊拉克库尔德地区与库尔德斯坦爱国联盟建立了一个联合政府。之后，在美国入侵伊拉克以后，他成为伊拉克临时管理委员会的成员，并于2004年4月担任临管会主席。2005年6月，他由伊拉克库尔德议会选举担任伊拉克库尔德斯坦的总统