物列车到发场和编发场（驼峰）两场并排排列，位于客场上行方向，其中货物列车到发场设有7条股道；编发场位于货物列车到发场东北侧，其简易驼峰高2.02米，采用单推单熘作业方式。峰下设有11条股道，1-8道为编发线，9-11道为调车线。南京北站货场设有通往南京港第二、第三港务公司，南京东机务段浦口折返段、上海铁路局合肥车辆段和南京棉麻储运公司的专用线。
使用情况.南京北站已于2004年10月停止客运业务。封存许久的先锋号电力动车组停放于南京北站。由于仍有货运列车停靠，该站目前已禁止市民参