1936年10月1日，西班牙共和国议会通过巴斯克自治法案，第一届巴斯克政府宣告成立。它由巴斯克民族主义党何塞·安东尼奥·阿吉雷领导，获得了内战中与国民军作战的所有政党联盟支持，其中包括人民阵线、工人社会党和共产党等共和派团体。毕尔巴鄂陷落后，政府迁到巴塞罗那，最终流亡至法国。佛朗哥去世及西班牙民主转型后，1979年国会通过了巴斯克《自治权法令》，同年流亡政府正式解散。1980年，新的巴斯克自治区政府宣告成立，取代了过渡期设立的巴斯克总委员会。卡洛斯·加赖科切亚是新政府的首任主席。