941年合併并改制为出云市，因此车站在1957年改名为出云市站，1964年一畑电气铁道将出云市端的车站自原本与国铁共用的车站分出，设立电铁出云市站，并在1965年将立久惠线废除停止营运。而1987年国铁分割民营化后，原属于国铁的出云市站则改隶属西日本旅客铁道，但西日本旅客铁道所经营的大社线也随之在1990年停驶。1998年及2000年，出云市站和电铁出云市站先后完成高架化成为高架车站。
车站构造.
西日本旅客铁道.出云市车站的月台为位于高架二楼的2面4