任命潘振球为新任救国团主任。1985年调任中国广播公司董事长，两年后任国民党中央组工会主任，1987年11月，获蒋经国总统礼聘为总统府国策顾问。1995年3月，潘振球由总统李登辉任命为国史馆馆长。任内聘学者进行「中华民国建国文献」的汇编工作，并与中央研究院合作研发完成「档案史料管理作业系统」和「史籍全文检索系统」，奠定了国史修纂与史料管理的现代化基础。2000年4月1日，潘振球卸任国史馆馆长。2001年，潘振球因摄护腺癌与疝气多次进出医院。2010年4月，复因肺炎积水，进入加护病房诊治，至11月6日