侯转任中央陆军第30师师长，驻重庆。随着杨森的势力逐渐强大，杨森开始了统一四川的军事行动。邓钖侯进行反抗，同刘湘、袁祖铭（黔军）合力击败杨森。随后，为了将袁祖铭逐出四川，邓钖侯再度同杨森联合，击败了袁祖铭。
国民政府的活动.中国国民党势力逐渐强大后，邓钖侯和其他川军指挥官均转向中国国民党方面。1926年（民国15年）冬，邓钖侯被任命为国民革命军第28军军长。此后，在四川混战中，邓钖侯的势力排在刘湘、刘文辉之后占第3位，掌握战局主导权。1931年（民国20年）的二刘之战，邓钖侯经过曲