场军事用地被列入秦淮区区属范围内。2001年，红花镇被改为秦淮区下属的一个街道。2008年，大校场机场确定即将搬迁，原近10平方公里的军事用地将在机场搬迁后正式划入秦淮区政府管辖。2013年2月，中华人民共和国国务院正式批复同意撤销南京市原秦淮区、白下区，合并成立新的秦淮区行政区域。3月28日，新的秦淮区正式揭牌成立，成为南京市四个主城区之一。