至于独立的南港岛线之定线雏形，可追溯至香港政府运输科于1993年发表的铁路发展谘询文件，南港岛线是一个中型铁路系统，定线分为两部份：纵线来往金钟南部的太古广场站、田湾、鸭脷洲邨及利东邨；横线来往钢线湾（今数码港所在地）、华富邨、华贵邨、田湾、香港仔、黄竹坑及香港海洋公园。当时政府表示该线并无逼切需要兴建，而造价则估计约58亿港元。 而在1999年香港政府的铁路发展研究中，南港岛线改为以上环站林士街月台作为港岛北岸的总站，与1989年的建议类似，惟研究结论依然是未有逼切需要兴建，故一直被有关当局暂时搁置