袭魏揭飞，派镇远将军王超等人攻击斩杀魏揭飞。393年，东晋的氐族首领杨佛嵩叛变，九月，晋军在潼关附近将杨佛嵩打败。姚崇出兵搭救杨佛嵩，击败晋军，杀死晋将赵睦。姚苌去世。姚兴不对外宣布，任命叔叔姚绪镇守安定，姚硕德镇守阴密，姚崇留守长安。395年，后秦皇帝姚兴封他的弟弟姚崇为齐公，姚显为常山公。397年，姚崇进犯洛阳，东晋河南郡太守夏侯宗之坚守在金墉城，姚崇没有攻克，便裹胁二万多户流民撤回。399年，后秦齐公姚崇、镇东将军杨佛嵩进犯东晋的洛阳，河南太守陇西郡人辛恭靖加固防守。