道寄生虫阿米巴分泌血清素，在一些患病者中，引起持续的分泌性腹泻。感染溶组织阿米巴的病人，发现血清中血清素的浓度昇高，而在感染治疗好后恢复正常。溶组织阿米巴也通过血清素的存在变得更有毒性。
植物.血清素存在于蘑菇，水果和蔬菜中。在核桃和山核桃属的坚果中发现为25-400毫克/公斤(最多)。在大蕉，菠萝，香蕉，奇异果，李子和番茄中发现5-30毫克/公斤的血清素。在广泛的测试的蔬菜中发现了0.1-3毫克/公斤的血清素(中等水平)。血清素是荨麻中含有的一种有毒化合物，其在注射时会引起疼