棘鱼科等部分深海鱼的繁殖活动具有明显的季节性，这些鱼类在浅海生物的繁衍旺盛期与它们同时产卵。一般游泳深海鱼产下大量小型卵；底栖鱼的卵往往较大，但数量很少。
雌雄同体・性转换.雌雄同体的鱼只要两者相遇就可以繁殖。虽然必须维持两性的性腺导致能量负担很大，但是对于人口密度低的深海鱼来说十分值得。仙女鱼目所属崖蜥鱼科、 帆蜥鱼科、炉眼鱼科、深海蜥鱼科的深海鱼均为雌雄同体。仙女鱼目青眼鱼科的深海种类雌雄同体，而浅海种类分为两性。浅海中有性转换鱼，深海鱼也有类似的繁殖策略。浅海鱼多见雌性先