圆室，无可避免的，部份的彫刻就此被移除与失散，原本刻划的神像，有些可能以再诠释的方式，融入基督教的情境，保存下来，其他的不是移除就是拆毁。
鄂图曼统治时期.1456年，雅典陷落于鄂图曼土耳其帝国手中，帕德嫩神庙又再度被改为一座清真寺。不同于后世的误解，土耳其人很尊重领土内的古蹟，未曾故意损坏雅典的遗迹，但也没有特别地努力进行保护。例如在数次战争中，常破坏庙体以取得构筑城墙与防御工事的材料。此外土耳其人加盖了一座宣礼塔，盖的跟柱顶齐高，遮住由神庙里向外看的视野，好在神庙本体与石阶仍然