北部吕贝克的一家餐厅可能是这波疫情的源头，因为有十七个人在这家餐厅用餐后遭到感染。此时，德国各大医院已经快被感染大肠桿菌的患者占满。6月5日，下萨克森农业部的一名发言人警告人们不要食用本土产的豆芽菜，因为豆芽菜也成了被污染的作物之一。下萨克森境内比嫩比特尔一处农场生产的豆芽菜疑似为疫情爆发的源头。但6日官员表示这个说法没有经实验证实，在疑似感染农场的40个样本中，有23检验结果呈现阴性。6月10日，罗伯特·科赫研究所的负责人证实豆芽菜为这次疫情的源头，食用过豆芽菜的人发生出血性腹泻（）的比率是其他人的九