带电荷，能自由进入阿米巴的溶酶体，进入溶酶体后，其酸性pH环境使氯喹发生质子化，不能再穿透出胞膜，因而能浓集于阿米巴内；同时氯喹在给药后主要分布在内脏，故在肝脏中浓度较高。而氯喹在高浓度下能抑制蛋白、RNA和DNA的合成，因而能杀灭阿米巴滋养体，常用于甲硝唑治疗失败的阿米巴肝脓肿患者。
2019冠状病毒病疫情的应用.在2019冠状病毒病疫情中，临床发现长期服用羟氯喹的系统性红斑狼疮患者中没发现新型冠状病毒病案例，而且也有相关研究认为氯喹有阻断病毒感染和调节免疫的作用，推估具有相似功