古国首都乌兰巴托设立代表处、在外交部网站的各国介绍中加入蒙古国，而蒙方亦于2003年在台北市设立代表处。2005年10月3日又弃用法理上各省（市）县（市）行政区域代码。不再发行「中华民国全图」，承认蒙古国的独立现状。目前台湾市面上所发售的中国地图和世界地图，均已将外蒙古排除在中国之外作为独立国家标示，教科书亦然。包含外蒙古在内的「中华民国全图」（俗称「秋海棠」）则已相当罕见或不再发行。民间也普遍视蒙古为主权国家。