斗争使解放军正规化训练和院校教育遭到严重破坏。军事学院战役系随后调往北京西郊红山口与原中央军委训练总监部院校部机关合编为中国人民解放军高等军事学院。后来历经历次党内政治斗争磨难，曾一度被撤销，后来复建为解放军军政大学、军事学院、延续至今成为中国人民解放军国防大学，为中国人民解放军最高军政学府。留在南京的军事学院的部分人员和系科与中国人民解放军总高级步兵学校合并，继续沿用军事学院番号，担负中级指挥干部培训，廖汉生中将调走后，由张震中将接任院长。军事学院于1969年奉命停办，文化大革命后期又组建南京