中华民国流亡政府论是中华民国政府统治台湾的一种地位论述，是基于台湾地位未定论对于中华民国政府在台湾的定位。该观点认为，中华民国政府在1949年被中国共产党击败后，从中国流亡台湾，并以殖民体制进行统治。在2000年至2008年陈水扁政府时期，该观点较少被媒体关注。但在2008年马英九政府时期，该观点再度兴起。时任民主进步党主席蔡英文于2010年5月25日在一场座谈会上表示，“中华民国是一个流亡政府”，引发蓝营不满。随后，台湾Yahoo!奇摩以「你认为中华民国是流亡政府吗？」为题进行了网路投票，结果认为「是」的