新干线与在来线各线（后述）、东京地下铁丸之内线。JR东日本车站的为「」，而丸之内线车站编号为「M 17」。另外，本站JR线与东京地下铁大手町站之间仅有东西线可进行。JR的正式路线名称分别为新干线的东海道新干线与东北新干线2路线，在来线的东海道本线、东北本线、总武本线、京叶线4路线（详细参见路线条目以及「」）。东海道本线是本站在来线的所属线。管辖公司方面，东海道新干线由JR东海管理，东北新干线等其他路线由JR东日本管理。所有路线皆以本站为起点，站内亦设有0公里距离标。旅客资讯使用的是后述的运行系统名称