始与各族爆发战争。北部在1902年与赛德克族发生人止关战役，1908年对太鲁阁族发动太鲁阁战役，1910年对泰雅族卡奥湾群发动卡奥湾战役，1910年对泰雅族司加耶武群发动司加耶武战役，1913年对泰雅族霞喀罗群发动霞喀罗战役。1914年对太鲁阁族发动太鲁阁战争。南部则发动了长达十九年针对的布农族的武装冲突。许多原本归顺的部族，在之后几年也相继起事：1908年，原本日方特别拉拢扶植的阿美族七脚川社与巴托兰社（Patulan）及木瓜群等部落联合起事，为七脚川事件。1910年，泰雅族大嵙崁群串联周围各部族起