7万名选民支持瑞士签订申根协议。这次公投的投票率有55.9%，比一般瑞士公投的投票率高约10%。在海外定居的瑞士人极力支持瑞士加入申根区，而在瑞士国内，东部讲德语的选民大都反对这样做，西部讲法语的选民则大都支持这样做。
反应.瑞士政府接受公投结果，并承诺政府不会漠视反对签署有关协议的人。欧盟委员会也对公投结果表示接受，还形容这次公投对瑞士－欧盟关系的增进是「重要的一步」。反对签署协议的人则唿吁政府撤回瑞士加入欧盟的申请案。紧接而来的是一场在9月举行的公投，表决议题是令人员自由流动协