复能登国后，就一直属于能登国。15世纪时为能登畠山氏所控制，但畠山氏在16世纪中因家族内的纷争而灭亡；16世纪战国时代末期，织田信长在1581年平地此地后，随着能登国成为前田氏的领地，战后也一度随着能登国成为前田利家次子前田利政的领地。17世纪江户时代后大部分区域都成为前田氏加贺藩的领地，在17世纪初期，前田氏的亲戚也曾在能登半岛包括羽咋郡内领有领地，不过由于土方氏的领地散佈在日本各地，随着土方氏多次增加领地并迁移阵屋位置，藩名也多次变更，因此羽咋郡内属于土方氏的这些领地先后属于、石崎藩、、，直到1