他多年阅读研究《史记》后，自己评点《史记》，自谓：“特采录而详阅之，务使开卷释然，皆可成诵，间加论断，必出心裁。”康熙六十年辛丑（1721年）开始撰写《史记菁华录》并成书。嘉庆末，姚祖恩又辑录朱彝尊之《明诗综》全部诗人小传，成《静志居诗话》二十四卷，好友曾燠为之序。