也发生数起涉外纠纷。同治十年（1871年）淡水厅同知陈培桂，提出「增设学额，请陞直隶州」之议，而后同治十二年（1873年）台湾兵备道夏献纶奏请将淡水同知改为直隶州、噶玛兰改为县、竹堑增设一县，原本清廷有意试办，但因牡丹社事件而搁置。而后台湾海防钦差大臣沈葆桢在同治十三年十二月廿三日（1875年1月30日）上奏〈请琅筑城设官折〉，请求在琅（今恆春镇）建城设官。
析分台北府.光绪元年正月十二日（1875年2月17日），清廷决定依照沈葆桢所上之奏折，设置「恆春县」。而后沈葆桢认为台湾北部