然保持可运作的状态八云指定为复员船（日方称为“特别输送舰”），运送滞留在中国的北部地区以及台湾的日本军人、平民回日本。1946年6月，八云完成了最后一次撤离航行，共计撤走9010人。同年6月26日，解除对八云的复员船的指定。7月20日，八云进入位于舞鹤市的的船坞进行拆解，拆解工作一直持续到1947年4月1日才结束。
历任舰长.下表系根据《日本海军史》第9、10卷《将官履歴》，以及《官报》进行整理。