1957年妻子陈英娘被阿姨安排改嫁，三位孩子由陈英娘母亲扶养，她曾告诫子女们不要责怪父亲。
担任「台湾共和国临时政府」的驻东南亚巡回大使.目睹印尼经由人民的奋斗而终获独立的过程，陈智雄不仅萌生了台湾独立的想法，而且决定献身于台湾独立运动，因此，他接受了设于日本之「台湾共和国临时政府」大统领廖文毅的委任，担任其驻东南亚巡回大使一年。透过陈智雄的良好关系及人脉，廖文毅曾于1955年应邀参加了在印尼举行的「万隆会议」，使他的国际声望达到了最高点。当时出席的各国代表当中，除了台湾共和国临时