五世达赖和罗桑却吉坚赞因受到噶举派政权藏巴汗、苯教土司顿月多吉、喀尔喀蒙古却图汗等势力的威胁，共同致信固始汗，请求其出兵救援。1636年，固始汗亲自赴拉萨与五世达赖和四世班禅商议出兵事宜，被赠予“丹增却杰”（执教法王）的称号。之后，他又遣使表示归顺后金皇太极政权，以稳固后方。1637年，固始汗进入安多，灭却图汗，控制安多全境，1640年又发兵西康，灭顿月多吉。此后，他佯称接到达赖旨意返回青海，实则在1641年突袭西藏，并于1642年攻占日喀则，灭藏巴汗政权。为了给这个蒙藏统治者联合的甘丹颇章政权制造