90年代，波波夫等(1993)用分支系统学 (cladistics)的方法，提出对腕足动物门物种作新的高级别分类。他们建议提出加入“钙质壳纲”去优化这个二分分类。根据这个建议，加入按外壳的主要成分为分类的原则。无铰纲生物壳主要成分是几丁质或几丁磷灰质与磷酸钙组成，有肛门；有铰纲生物的壳主要成分是碳酸钙，无肛门，排泄器官为原肾。按这原则，髑髅贝类从无铰纲被归入有铰纲，而平圆贝目则被归入无铰纲。但亦有批评指髑髅贝类跟原来的有铰纲的差别太大，令这个建议变得不合理。
三纲分类.对于波波夫