后三进院落，有中厅、东西侧厅、东西厢房及大门西倒厅等共16个厅室，恢复了提督署的历史风貌。各厅室内陈设着和官兵职衔、职责对应的军服、军帽、望远镜、扣挂式牛皮腰带等物品。北洋海军提督署大门上方悬挂李鸿章题写的“海军公所”匾额，为复制品。两侧边门分别绘有秦琼、尉迟敬德像，描金点漆。大门外东西两侧各有乐亭一座，用于庆典、迎宾时鸣金奏乐。乐亭前面有东西辕门，样式和牌楼类似。门前广场对称立有旗杆两根。西辕门以西20米处，有了望楼一座，两层，可了望港内舰船活动。在议事厅内，有丁汝昌等北洋海军高级军官的蜡像，围坐