与附属岛屿后，设置行政长官公署，两年后方改组为台湾省政府。行政公署将台湾省分设8县（台北县、新竹县、台中县、台南县、高雄县、花莲县、台东县、澎湖县）、9个市（基隆市、台北市、新竹市、台中市、彰化市、嘉义市、台南市、高雄市、屏东市）与2个县辖市（宜兰市、花莲市）。当时的金门群岛隶属于福建省金门县，马祖列岛则分属于福建省长乐县、连江县、罗源县，乌坵隶属于福建省莆田县，东沙岛与南沙太平岛等南海诸岛隶属于广东省。1949年南海诸岛由广东省改隶新成立的海南特别行政区，同年中华民国政府迁台后，台湾省改置为16个县、