他为卫将军，开府仪同三司，给鼓吹一部。武帝大行在殡，竟陵王萧子良在殿内，太孙萧昭业未立，众论纷纷。萧曅说：“若立长则应在我，立嫡则应在太孙。”萧昭业为皇帝，很信赖萧曅。隆昌元年四月辛巳日（494年4月27日），年二十八，萧曅去世。赐东园秘器，朝服。赠司空，侍中如故。谥昭。给节，班剑二十人。