师范学堂时期曾设法制经济课程。1927年国民政府定都南京后，东南大学改组中央大学，为因应中央和地方政府对政治与行政管理人才的需求，国立中央大学政治学系得到进一步充实，形成了中国最早的现代屡践型政治行政系；执教的有周鲠生、王世杰、钱端升、乔万选、张奚若、程天放、雷沛鸿等人。1929年，杭立武回国担任系主任，1932年组织在校成立中国政治学会。1949年，中央大学更名南京大学；1952年，南京大学政治学系调出停办，部分教师转到其他系科。1978年中国大陆文化大革命结束后，恢复政治学专业；1986年正式复建政