离子输入和输出细胞。通过了解药物结合位点的相互作用，超分子化学对于新药物疗法的开发也很重要。 由于超分子化学提供了封装和靶向释放机制，药物输送(Drug delivery)领域也取得了重大进展。 此外，超分子系统被设计用于破坏对细胞功能很重要的蛋白质交互作用(protein-protein interactions)。