就全港性系统评估的争议，叶建源及其独立研究员完成近五万字的《全港性系统评估(TSA)政策实施研究》，为小三TSA的争议提供学术研究基础。
学术自主议题.学术自主是叶建源其中一个关心的议题。例如于2020年4月，民建联立法会议员葛珮帆基于试卷内容提及一些亲建制派人物言论，指控一份香港中文大学通识课程试卷偏颇。试卷本身并无要求学生评价言论孰是孰非，其后叶建源看过试卷，反指考题只是以有关人士的言论作为切入点，并非要求考生分析时事，而是评核考生对中国传统思想的了解，认为属哲学层面的思考，批