孩子都是女儿（倪闺臣和倪闺贞），常受重视男嗣的婆婆讽刺。再次怀孕时，就模仿《圣经》中撒母耳的母亲哈拿的祷告，应许如果所生为男孩，就将他一生献给神。此后共生有五子，分别为：倪述祖（倪柝声）、倪怀祖、倪承祖、倪洪祖、倪兴祖。倪文修和倪林和平夫妇都是福州美以美会福州天安堂的教友，并在天安堂务德部、召益会等教徒团体中任职。倪柝声在婴儿时期，就由美以美会的监督受洗。1910年，7岁时，倪柝声随家人回到原籍福州，住在闽江南岸南台岛新发展的商埠区（今仓山区）。倪文修在这一带购置了三处房产，分别位于海关巷17、14号（