据文献记载，战国末，楚相春申君黄歇改封江东后，于吴墟西南立菰城县，因城面溪泽，菰草弥望，故名。因此可知下菰城遗址当年曾作菰城县之治所，且菰城之名始于此。秦始皇二十五年（公元前222年），秦灭楚，改菰城为乌程，县治仍设于斯，直至秦亡汉兴之际才北移至楚霸王项羽建的子城（项王城，今湖州城址）。下菰城是湖州建城2200余年历史的开始，是湖州「祖城」。但据考古调查发现，下菰城的始筑年代当在春秋甚至更早，战国末曾修筑与扩建。因此有专家认为，菰城当建于春秋时，原是吴国屯兵之城，后废弃。
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