参与世界卫生组织（WHO），但每次都受到中华人民共和国的反对，使其邦交国的提案都不能提交世界卫生大会（WHA）讨论或表决。2009年世界卫生组织同意中华民国政府以世界卫生大会观察员身分参加世界卫生大会；2009年5月，中华民国行政院卫生署署长叶金川以「中华台北」的名义参加世界卫生大会，在感谢邦交国家的自办餐会后被一名留学生质疑其参加世界卫生大会的名义，并指责其为“亲中卖台”，蔡英文也称：“台湾不能为了参加世界卫生会议牺牲主权”。到了2016年蔡英文政府上任后，除了在该年得以参与世界卫生大会（但该年邀请函延后