现宇和岛市）7万石领地的藤堂高虎，因关原之战的战功加增至20万石，同时移往今治市内的国分山城建立今治藩。但因为国分山城是山城，不适合建造城下町。1602年开始在今张浦建造新城，隔年开始建设新的城下町，即后来今治市的前身。1608年藤堂高虎转封至伊势国津藩22万石的领地，不过越智郡的2万石领地还是由其担任今治城主的养子藤堂高吉继续管理。直到1635年换封至伊势国名张的领地，藤堂家对此地的统治才结束。1635年松平定行自伊势国桑名藩转封至伊予松山藩的15万石领地，其弟松平定房也从伊势长岛城的七千石领