12日，美国民主党当选总统约翰·F·肯尼迪任命腊斯克为国务卿，1961年1月宣誓就职。作为国务卿，腊斯克赞成使用军事行动来与共产主义斗争。在古巴导弹危机期间，腊斯克支持进行外交努力。在任期早期，腊斯克对美国干涉越南事务表示强烈怀疑，但其在公开场合对越南战争中美军行动的辩护又使之成为反战人士的目标。除了反对共产主义外，腊斯克继续实行洛克菲勒基金会的理念援助发展中国家，并支持低关税政策以促进全球贸易发展。在自传中，腊斯克回忆与肯尼迪总统关系并不好，几次提交辞职申请，但都被退回。约翰·F·肯尼迪遇袭后，腊