新疆维吾尔自治区高级人民法院生产建设兵团分院是中华人民共和国新疆维吾尔自治区高级人民法院在新疆生产建设兵团的派出机构。
沿革.该院的前身是1954年10月组建成立的新疆生产建设兵团军法处，当时该处在下属10个师级单位设立了军法处，行使刑事审判权。1956年8月，新疆生产建设兵团各级军法处改建为军事法院，隶属中国人民解放军新疆军区军事法院，依法审理刑事案件以及部分民事案件，并担负着改造、教育在押罪犯任务；原新疆生产建设兵团军法处即改为中国人民解放军新疆军区生产建设兵团军事法院。197