政府任职。1992年担任南戈壁省第一副省长，代理省长。1996年至2000年，当选蒙古民族民主党总理事会成员，并任蒙古民族民主党南戈壁省委员会主席，还作为蒙古民族民主党代表在南戈壁省第29选区当选国家大唿拉尔委员。在2000年国家大唿拉尔选举中，他作为民主联盟候选人，在该选区失利。2001年至2004年，巴亚尔赛汗在财经高等学校（Higher School of Finance and Economics）任教。2000年12月民主党（DP）成立后，巴亚尔赛汗当选南戈壁省第29选区民主党国家顾问委员会成