于政局变迁，于1950年被逼关闭神学院，由于香港浸信会教会缺乏传道人服侍和发展教会，所以决定在香港筹办神学院，由林子丰担任筹委会主席，并于1951年正式成立香港浸信会神学院，刘粤声牧师担任首任院长。1958年9月，院舍迁往何文田山道1号。1999年迁往西贡北西澳现址。现址由新鸿基地产负责兴建，作为购入何文田山道地皮以发展住宅项目的代价之一。
现况.浸信会神学院现任院长为曹伟彤博士。神学院提供的课程，包括神学学士、道学硕士、宗教教育硕士、教牧辅导硕士、神学硕士，神学博士及宗教教育高级