匿于桃园，化名为「杨仔」，白色恐怖倖存者徐文赞及吴敦仁回忆提及「桃园无线电台支部」案：「简吉叫我写自传给他，我即加入组织，先后接受新竹州干部张志忠、陈福星和周慎源 等人的领导。」，显示周慎源此时已加入共产党，其领导时期积极发展组织，但与当时重组省工委的陈福星发生路线之争，周慎源一度出走，后与师院同学林希鹏联系上而回归省工委。但最后仍逃不过情治单位的追捕。
寻找周慎源.由于周慎源在四六事件发生之后即四处躲藏不知去向，死因成谜，根据官方资料显示于台湾省保安司令部（41）安洁字第466