宗朝.天顺初年，撤除各地巡抚官，李秉改任江南粮储总督，因举荐知府违例，连坐被逮，幸得英宗宽恕，恢复原职。恰逢御史李周等被贬，李秉上疏请救，英宗大怒，将定其罪。廷议恢复巡抚职位，而大臣举荐李秉有才能，命其担任大同巡抚，在任期间弹劾多人，英宗责其专擅，逮下诏狱，斥为民。三年后，因内阁大臣举荐，恢复原职，并莅南京都察院。
宪宗朝.明宪宗继位，李秉陞任都察院右副都御史，巡抚宣府。数月后，召拜左都御史。成化二年（1466年），命其整饬辽东抵大同边备，抵任即弹劾镇守中官李良、总兵武安侯郑