参议员通过了第466号法令，并改组了现有的警察制度。因此，拉塞尔奥所说的情况渐渐得到改善。在1856年7月，“合并法”开始生效。该法案设立了警察局长一职。三藩市首个警察局长为詹姆斯·F·柯蒂斯，他是于1856年由大众选举出来的。在1997年，旧金山国际机场警察合并至三藩市警察局，并更名为三藩市警察局机场分署。
组织.三藩市警察局的领导人为警察局长。现今的警察局长为格雷格·苏尔。他是由市长李孟贤(Edward Lee)任命，以顶替离任的乔治·加斯科。警察局长手下有六个副局长