国长老会在宁波开设一所男塾。其后又有多所学校在香港和五个通商口岸开设。到1875年，新教传教士开办的学校有三百五十所，以小学为主。其中狄考文在1864年于山东登州创办的蒙养学堂非常有名，1876年改为登州文会馆。圣公会创办了上海圣约翰大学，循道宗创办了东吴大学、金陵大学、华南女子大学，浸信会创办了沪江大学，长老会创建了之江大学和岭南大学，伦敦会创建了协和医学堂；还有新教几个宗派合作创建了金陵女子大学、燕京大学、齐鲁大学、华中大学、福建协和大学。到1914年为止，美国传教士开设的初等学校有近两千所，中高等学校