分别掌管行政、监察、司法及刊物出版之权力。首任会长是冼定国，现任会长为方仲贤，对外代表浸大学生会。除中央架构外，浸大学生会辖下共有47个註册组织，包括15个学科学会、4个宿生会以及29个附属组织，为同学提供不同类型的服务。 香港浸会大学学生会曾为香港专上学生联会（学联）的正式成员。2015年4月23日，学生会举行全民投票表决退联而获得通过，成为第三个退出学联的院校学生会。退出学联后，浸大学生会仍与其他院校学生会保持定期对话，一同关注社会事务，争取民主的政治制度和建设公义社会。
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