马耳他岛有“地中海心脏”之称。地中海的海岸线曲折，各个半岛将整个地中海分割成不同的海域，国际海道测量组织将地中海分为以下几个较小的水体，自西向东分别是：
入海河流.有众多河流自不同方向注入地中海，主要河流包括：尼罗河、罗讷河、台伯河、阿迪杰河、阿诺河