23、25、H4、H5道）及4条正线（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ道，其中Ⅳ道兼办理客运作业）。车站设有5个客运站台，在开通初期仅启用3、4、5站台，1、2站台并未在2015年12月开通时启用，车站在预留的2站台旁设立了防护栅栏。2016年11月，为2017年3月起金华站普速场停办客运业务、部分列车分流至金华南站做准备，金华南站1、2站台股道开始施工。1、2号站台于2017年3月投入使用。车站上行金端咽喉接入金温公司金华南机务库，货场H3道接入金温公司水泥厂。车站站场及周边线路同时受上海局杭长高铁台、沪昆三台、金温台