因年老而同样无嗣的恩里克一世驾崩，葡萄牙发生，西班牙国王腓力二世趁机宣称他作为葡萄牙国王曼努埃尔一世的外孙拥有葡萄牙的继承权，发动葡萄牙王位继承战争，派遣阿尔瓦公爵率军入侵葡萄牙，腓力二世宣布兼任葡萄牙国王（称腓力一世），葡萄牙及其殖民帝国至此由西班牙哈布斯堡王朝统治。1640年，葡萄牙发生革命，西班牙势力被驱逐，布拉干萨公爵若昂被推举为国王（即若昂四世），葡萄牙王国从西班牙独立，伊比利亚联盟解体。