华民国大总统袁世凯佔用，成为北洋政府的大总统府。袁世凯称帝时期，中南海曾改名新华宫，同时宝月楼拆外墙、更名为新华门。从此，新华门取代西苑门成为中南海的正门。此后中南海又先后被用做北洋政府的大总统和总理办公地、以及张作霖的大元帅府。中华民国国民政府接管北平后，中南海作为公园对外开放。中国抗日战争结束后，国民政府军事委员会北平行营设在中南海，华北剿匪总司令傅作义搬进中南海办公。1949年，解放军正式进驻北平，中共中央进驻中南海。
中华人民共和国.1949年中华人民共和国成立以后中南