中，他当选为同一党派的联邦众议员。他连续7届任职。多年来，他曾数次转换政党。2014年，他是在里约热内卢获得最多选票的联邦众议员，获得464,000票。他担任联邦众议员28年以来，对左翼和劳工党政府（2003－2016）的主张持强烈反对态度。他反对同性婚姻、堕胎、肯定性行动、毒品合法化、土地改革和世俗主义。他支持经济自由主义政策。
2018年巴西总统选举.博索纳罗在2018年1月退出基督社会党，改投社会自由党。2018年7月，社会自由党正式提名他参选在10月举行的总统选举。