3年春，班禅堪布会议厅拜嘉雅活佛为贡布慈丹的副经师。1944年在拉卜楞寺拉科活佛拉科·晋美赤烈嘉措（同年成为贡布慈丹的正经师）主持下，于宗喀巴诞生处圣迹前举行仪式，从10名灵童中确认贡布慈丹为第九世班禅额尔德尼的转世灵童，授法名“确吉坚赞”，迎请至塔尔寺供养，接受严格的经学教育，潜心研习《释量论》、《现观庄严论》、《入中论》、《戒律本论》、《俱舍论》（合称五部大论）等佛教经典。经过诸多过程，最后在1949年6月3日，由处于广州的国民政府代总统李宗仁颁布文书:“青海灵童宫保慈丹，慧性澄圆，灵异夙着，查