主要目的是在中国新疆维吾尔自治区建立政教合一的“东突厥斯坦伊斯兰国”。后来又采用“突厥斯坦伊斯兰党”一名，是因为该组织希望在整个突厥斯坦（包括中国新疆和中亚各国在内）建立独立的政教合一的伊斯兰国家。维吾尔族本身也是中亚地区的跨境民族，许多维吾尔族人持有吉尔吉斯、乌兹别克斯坦等中亚国家的护照。
恐怖活动.世界各国媒体称该组织得到基地组织的资助，在中国及中亚地区实施了一系列暴力恐怖活动。一些该组织的被捕人士承认在阿富汗受到过基地组织的培训。该组织发起人之一艾山·买合苏木于2003年10