个异端学说领袖聂斯脱里认为天主只不过是寄居了耶稣的肉身，阿奎那则回覆道天主的完整乃是耶稣的存在所不可或缺的一部分。不过，阿奎那也曾主张耶稣具有一个真正的（理性的）人类灵魂。这个说法使得耶稣有了双重的本质，也使阿奎那与阿利乌的理论产生矛盾。阿奎那也反驳了欧迪奇所提出的双重本质在化身耶稣结束后依然存在的主张。阿奎那认为这两个本质是同时存在的，但在同一个人类躯体里却是可以清楚辨别的，这个说法也与摩尼等人的理论产生差异。简而言之，「基督有一个与我们相同本质的真实躯体、一个真实的理性灵魂，但除此之外还多出了完美的