党增订台独党纲，但开始参与台湾政党政治。黑名单解禁后，从岛外回台湾发展的台独联盟在台湾的发展者如张灿鍙，也和新潮流保持合作关系。民进党在2006年决议「解散派系」后，新潮流名义上已经解散，但实际上在2008年转型为台湾新社会智库，以另一种型态存续。新潮流系、苏系、绿色友谊连线等三个派系关系特别密切，合称为「新苏连」。
成员.
十八飞鹰时期.杨碧川（未入党）、邱义仁、吴乃仁、吴乃德、洪奇昌、林浊水、刘守成、贺端蕃、谢史朗、简钖堦、田秋堇、魏廷昱、陈鸿诚、尤宏