间，最恶名昭彰的事件莫过于发生在1655年、被称为的大屠杀：近六千名瓦勒度派教徒在屠杀中丧生。英国护国公奥立佛·克伦威尔甚至一度考虑出动海军以援助瓦勒度教徒。即使如此，卡洛·埃马努埃莱仍然对萨伏依公国有所贡献：发展尼斯的港口，建设通往法国的道路，并在首都杜林建造许多建筑，包含着名的杜林王宫。
家庭.1665年，卡洛·埃马努埃莱与结婚，两人的独子维托里奥·阿梅迪奥在隔年出生。