山连绵，峰峦高耸，最高峰位于闽赣交界处的黄岗山，海拔达2158米。黄岗山是福建省的最高峰，也是中国东南部的最高峰。市区平均海拔200米，最低处兴田镇，海拔165米。武夷山地貌广布变质岩，属于中生代的火山岩、花岗岩和碎屑岩。全境分布着高岭土、煤、钨、铜、银等地质矿产。地质史上的风化剥蚀、流水侵蚀等作用是造就武夷山地貌现状的主要因素。武夷山与广东丹霞山、江西龙虎山的地质类似，属于丹霞地貌，岩层呈暗红色。奇特的地貌特征，被誉为“碧水丹山”，是中国着名的旅游目的地之一。武夷山市的土壤分布因海拔不同