轰塌城墙，8月17日，清军从缺口攻入城内，经过数天激战，占领了古牧地。随后清军乘胜追剿，收复了乌鲁木齐。叛军二号首领白彦虎逃到托克逊。金顺继续率军西进，昌吉、唿图壁和玛纳斯北城的守敌闻风而逃，9月初，金顺部队攻打玛纳斯南城，久攻不克。后来刘锦棠、伊犁将军荣全先后率兵增援，于11月6日攻克该城。至此，清军收复了天山以北的全部阿古柏军占领之地。
清军收复南疆.1877年4月14日，清军休整了几个月后，向南疆进军。刘锦棠命董福祥率主力“董字三营”为先锋，从乌鲁木齐南下，急行军1200多里