年4月17日通过「边境传染病计画」分别在加州南部边境圣迭戈县（San Diego）和帝王县（Imperial County）的儿童身上发现首两宗A/09(H1N1)猪流感病例。由4月21日起，加强监察以要搜索美国加州和德克萨斯州的其它病例，而且美国疾病控制与预防中心确认了该病毒变种的基因与1999年以来在猪只间流传的H1N1甲型猪流感病毒相类似的。该病毒是人类流感病毒、北美猪流感病毒和欧亚猪流感病毒所组合而成；当初这种变种流感病毒对金刚烷胺（amantadine）和金刚乙胺（rimantadine）呈现抗药