萤光素和以可见光的形式放出能量。现在还不知道有多少种萤光素存在，但下方会列出一些有较好研究的化合物。萤光素有许多类型，然而所有类型都利用活性氧而发光。
萤火虫.萤火虫萤光素是一种在多个萤科物种的身体内发现的萤光素，是萤光素酶(EC编号1.13.12.7)的底物。荧光素酶使荧光素发出特征性黄色亮光。和其它的荧光素一样，萤火虫荧光素需要氧气来发光，ATP和镁也被发现是荧光素发光必需的。｀
淡水螺.一种纽西兰北岛特有种的淡水螺"Latia"属物种在受到外界干扰