，可附属水雷艇队・水雷敷设队・运送船等，幕僚中增加主计长。1903年3月10日，第4回海军大演习时，临时第1舰队、第2舰队编成。演习终了后之4月10日，于神户沖举行观舰式。同年12月28日、常备舰队解队，分割成第一舰队和第二舰队。最后的司令长官为东乡平八郎。
编制.1889年7月29日、新编时的编制1894年7月19日、连合舰队时的编制1896年3月31日、日清战争后的编制1902年4月22日、特别检閲后的编制