明成祖赐建真觉寺，并下诏为金佛建塔，成化九年（1473年）十一月建成。金刚宝座塔是依据西域来的印度僧人室利沙的图纸修建的。至于此塔是为室利沙修建还是仅仅为了压过前朝的王气一直存有争议。清朝时，干隆十六年（1751年），干隆第一次重修真觉寺，重修后为避雍正帝胤禛之讳，改名为“正觉寺”。干隆二十六年（1761年）重修改名大正觉寺。清末，真觉寺的建筑毁于一场大火，只有金刚宝座塔保留下来。关于真觉寺寺院被毁有很多种说法，一种说法是于1860年被英法联军烧毁，只剩下明成化九年建造的金刚宝座塔，还有认为在此期间