设有十二个纪念花园。该署亦负责管理十个公众坟场包括香港坟场、扫桿埔咖啡园坟场、新九龙8号坟场（钻石山金塔坟场）、赤柱监狱坟场、和合石坟场、长洲坟场、大澳坟场、礼智园坟场及两个位于沙岭的坟场。
跨部门合作.食物环境衞生署联同康乐及文化事务署、房屋署、渔农自然护理署、路政署、环境保护署、海事处及香港警务处7个部门，由2003年6月27日起，向违反公众地方洁净罪行之人士判处定额罚款HK$1,500（2002年5月27日至2003年6月26日期间为HK$600）。食物环境衞生署与屋宇署