石井提交毕业论文《革兰氏阳性双球菌的研究》（グラム阳性双球菌について），获得博士学位。
考察与提倡细菌战.由于第一次世界大战中化学武器造成了惨重的伤亡，因此导致1925年6月世界各国推动签署禁止在战争中使用毒气和细菌武器的《日内瓦议定书》。日本代表原田丰二等军医正回国后，将会议内容发表于《军医团杂志》（）上，石井阅读过原田的报告后，即认为日本有必要推动细菌战部队的设置。石井日后还在说服中央时指出，使用细菌武器的成本很低，对于缺乏煤铁等资源的日本而言是最适合发展的项目，且与枪砲武器造