敦巴创建该寺。后由吞巴·克增云丹嘉措扩建。1986年，经尼木县人民政府批准，该寺修复开放。该寺建筑占地面积3000平方米，寺内收藏文物20余件。第司·桑结嘉措所着《黄琉璃》中载，宗喀巴在后藏弘扬格鲁派时，拜了许多名师，并多次赴位于前藏与后藏结合处的尼木县，吞弥的后代云丹嘉措受宗喀巴的影响而创立杰吉寺。该寺主供宗喀巴，主要景观为高6米的宗喀巴坐像。清朝咸丰八年（1858年），西藏高层发生冲突，噶伦夏扎·旺曲杰布被摄政热振·阿旺益西楚臣坚赞囚禁于杰吉寺。同年末，夏扎·旺曲杰布逃离杰吉寺，最终成为“热振事