个案可部分归因于罕见的，包括22q11、1q21以及16p11。该些罕见的拷贝数变异会使个体发展精神分裂症的机会增加最多20倍，当事人亦常伴发自闭症和智能障碍。2018年6月，《科学》期刊发表一篇统合分析初步发现，思觉失调症和躁郁症、忧郁症、和注意力不足过动症有许多共同的可能致病基因。
环境因子.与精神分裂症的病发相关的环境因子包括生活环境、使用药物，以及产前压力。母体应激跟患上精神分裂症的风险增加有关，而这可能是络丝蛋白所致的。孕妇营养缺乏和肥胖皆可能是精神分裂症的风险因