曾为学界长期争议的议题，近代分子种系发生学研究表明本属应有超过70种物种，包含黑羊肚菌类（以为代表）、黄羊肚菌类（以美味羊肚菌为代表）与变红羊肚菌类（以为代表）等三大类群，其中许多物种为地区的特有种，也有些为跨洲分布的物种。有些羊肚菌与落叶树、针叶树共生，有些则为腐生，部分物种常在甫发生大火的森林中大量生长。羊肚菌煮熟后可食用，为法国料理的重要食材，过去较难以，多需从野外採集，北半球温带的许多地区都有採集野生羊肚菌的产业。近年来已渐有大规模养殖羊肚菌的技术出现。部分盘菌目其他科属的真菌外形与羊肚菌相似，