。1939年7月至1947年10月任国立东北大学校长。1946年11月当选为制宪国民大会代表。1948年任国民政府财政部顾问、教育部教育委员会委员，同时兼任中央大学教授。1949年赴台湾，任国立编译馆编译委员，兼《反攻》杂志主编。1957年9月，任东海大学经济系教授及系主任。1961年2月28日病逝。终年67岁。臧启芳当选为立法委员。
史实探索.唐德刚《张学良口述历史》的“市长风波”一节中，张学良说“天津（市长）原应是臧启芳出任，臧启芳原来教我念过几天书，可因为东北大学