自此笑祖塔院基本形成了如今的规模。光绪十三年（1887年），笑祖塔院又获重修。《重立月心禅师碑记》称，“自有明至今三百年来，寰海宗工凡临济正宗皆其后裔，每值春季，定规扫塔。”这俗称为“三月三转塔”，即每年农历三月初三举行的扫塔仪式。该仪式一直到中华人民共和国初期仍在举行。文化大革命期间，笑祖塔院被北京皮鞋厂占为职工宿舍。灵塔被造反派毁灭，院墙被拆毁。1980年代，笑祖塔院的产权收归北京市佛教协会，但殿宇一直未能腾退，周围被民房遮挡。21世纪初，海淀区人民政府对笑祖塔院建筑进行过翻修。Sectio