化支，而管齿目实际上与长鼻目、象鼩目、海牛目等有更亲近的关系，所以被归类于非洲兽总目。管齿目是正在衰亡的一个类群。化石不多，但是非洲的土豚尚没有受到威胁。
内部分类.根据2009年莱曼等人的分类，本科包含下列物种（“†”为已灭绝）：