4月8日对上夏洛特山猫的比赛再次达成。2008-09 NBA赛季，杰佛森在此球季打出生涯年，前50场比赛平均23.1分、11.0篮板、1.6助攻及1.7个阻攻，直到在对上纽奥良黄蜂的比赛中单脚不规则落地，最终导致右膝伤势并宣告本季报销。而诊断结果为前十字韧带撕裂并需要动手术。当时灰狼队的战绩为17胜33败，但在杰佛森缺席后只打出7胜25败，再度缺席季后赛。2009-10 NBA赛季，2010年1月13日，在对上休士顿火箭的三度延长赛中，杰弗逊缔造队史单场26个篮板的最高纪录，而该队史纪录现已由凯文·乐