新的高速列车时代。4月28日起，杭州站开行经由沪昆铁路（即原沪杭铁路和浙赣铁路）运行的既有线动车组列车。2009年7月5日开始至2010年春运前，杭州站新建第七、第八候车室以及长450米的8、9站台。新建的两个候车室位于站房高架候车室最东面，以作为杭州东站改造前的配套工程。2010年10月21日沪杭高铁开通，由于杭州东站仍在建设中，杭州站承担了沪杭高铁绝大部分的始发列车作业。2014年11月下旬开始，城站迎来史上规模最大的一次综合性更新改造，包括周边道路、建筑立面、广告牌、广场的一、二层等改造项目，