14日才被免职。1916年1月14日获三等文虎章，6月任海军部参事，12月4日兼任海军部视察，12月9日获三等嘉禾章。1917年3月8日授海军少将。1917年10月7日，王崇文获晋给二等嘉禾章。
组建江防舰队.1917年，俄国十月革命爆发，时任海军部少将参事的王崇文向海军部提议，趁机从俄国手中收回黑龙江航权。他的提议获得海军总长萨镇冰的赞同，北京政府乃决定收回黑龙江及松花江的航权。上海海军总司令公署第二舰队抽调了江亨舰、利捷舰、利绥舰、利川舰于1917年7月离开上海北上，1918年