A定序判定共生真菌的种类。分离出这些真菌后还可进一步将它们加入兰花种子的培养基，再借由观察它们是否有助于种子的萌发，判定该种真菌能不能与该种兰花形成兰菌根。某些真菌可能可以促进某些兰科植物种子的萌发，但对另一些兰科植物种子有抑制的效果。一般来说兼性菌异营的兰科植物（即不完全依赖真菌提供有机养分者）可以与许多种真菌形成兰菌根，例如长苞头蕊兰可以与红菇科、口蘑科、与等多种真菌形成兰菌根。绝对菌异营的植物如对共生真菌的专一性则较高，如与红菇科真菌有很密切的关系，产于智利的两种兰科植物"Chloraea col