会战中失利，长三角地区被日本占领。战争期间，浦东地区多次遭受日军轰炸和袭击，许多设施被摧毁，一些居民被迫流往他处。在接下来的几年里，浦东被汪精卫政权和日本所控制，然而，中国共产党领导的抗日游击队也在此地区活动，并控制了一些乡镇。1949年5月，中国人民解放军占领上海及周边地区。在那时，所谓“浦东”并非地图上的名词，而是泛指以川沙县为主、同时包含南汇县、以及奉贤县东部和其他区县在黄浦江东岸的地区。1950年，南汇县北部地区有29个乡被划入川沙县，此时的浦东地界为上海的三个区杨思、洋泾、高桥和江苏省上海县、