岀于担心古巴袭击基地，在周围佈满地雷，地雷带长达几十公里，是世界上最恐怖的雷区之一。20世纪后期，基地的主要作用是收留在公海上拦截的古巴和海地难民，不过从2002年起，基地的一小部分设为关塔那摩湾拘留营，被用来关押在阿富汗和其他地区捕获的基地组织和塔利班嫌犯。2006年3月3日，美国五角大楼公布了被关押在关塔那摩监狱的数百名恐怖活动嫌疑犯的姓名和国籍等身份信息，是美军方首次公布该监狱囚犯身份。2009年1月21日，美国总统巴拉克·奥巴马刚上任后曾计划于一年内关闭关塔那摩湾拘留营，但被国会反对，加上现