任皇马体育主管至1990年。退休后他回到加那利群岛，2001年他曾参加皇家马德里和拉斯帕尔马斯比赛的庆祝仪式。2002年他获得加那利群岛金质奖章。莫洛尼的执教理念和处事风格也影响了其他皇家马德里出身的教练。曾在莫洛尼麾下作战，后来成为他助手的比森特·德尔·博斯克认为莫洛尼既对足球很精通又是一位道德导师。而拉法埃尔·贝尼特斯也是因莫洛尼提拔才成为皇马19岁以下青年队主教练，从而开始了自己的教练生涯。