2次总计7分钟的国家队出场。2018年，在对阵哥斯达黎加的比赛中，南野拓实时隔三年后第一次入选国家队，但他登场后很快就取得了进球，日本队也轻松的战胜了对手。对北美另外一支球队巴拿马，南野拓实上半场为球队打破僵局，这也是他在国家队的第二个进球。在对阵乌拉圭的比赛中，南野拓实对迭戈·戈丁领衔的防线完成了梅开二度，帮助日本队4-3战胜对手。2019年的亚洲杯，是南野拓实第一次以国家队领军人物的身份出战洲际大赛，虽然日本最终负于卡塔尔，但南野拓实在中岛翔哉缺阵的情况下发挥依然可圈可点，除了在决赛打入一粒进球