受到的损伤最大，三层的结构也受到严重破坏。主承重柱并不在影响范围内，但是一些次要的钢结构部件一定程度上遭到损害。被炸坏的楼板需要修复，恢复它们对柱子的结构支撑作用。地下连续墙受损严重，失去了楼板的侧向支撑，墙体无法阻挡哈德逊河的河水。世贸中心建筑群的空调制冷设备位于地下五层，也受到了非常严重的破坏。1993年夏季，大楼换用临时制冷设备。的关键电缆和信号设备在爆炸中损坏，需要全面更换。新系统耗时数年才安装完成，一些设备直到2001年9月仍在安装。