连战与宋楚瑜败选，泛蓝阵营支持群众认为319枪击案影响选举结果，聚集于凯达格兰大道抗议，要求中国国民党、亲民党、新党合併的唿声甚大。2004年中华民国立法委员选举，新党与中国国民党合作，为中国国民党增加不分区得票，不提不分区名单、国新共推不分区立委曹寿民，除吴成典外的七名新党候选人以中国国民党党员身份参选，在国会仍只维持一席，并持续衰退至国会第六大党。国新两党在总量管制的选举策略下，赖士葆、雷倩及费鸿泰当选立委，吴成典顺利连任、名列不分区的曹寿民也因而当选。2006年直辖市长选举，郝龙斌由国新共推并当选