终点鹿儿岛站间为单线区间。
车站结构.车站北侧（大分市街中心部侧）为北口、南侧（大道侧）为南口。结合日丰本线、久大本线、丰肥本线，混合月台4面7线的大型地上车站。车站周边于2010年实施高架化，工程现已完成。改建工程的设计由水户冈锐治负责。
月台配置.月台与车站大楼间以地下道连接。
外部连结.JR九州 – 大分站