下设副都御史、佥都御史。清朝时都御史为从一品。清崇德元年（1636年），皇太极即位后，清廷将监察文武百官的职责归于都察院。大清顺治元年（1644年），清兵入关，都察院设左都御史、右都御史、左副都御史、右副都御史，负责纠察中国十五道、在京百官。雍正元年（1723年）始，凡总督授加兵部尚书衔者，惯例兼都察院右都御史衔。不加尚书衔则一律加兵部右侍郎兼都察院右副都御史衔。