石灰石的缘故，本站也成为此地区石灰石运输的中继点，每日皆有两列货运列车在本站起讫。虽然一般而言早年兴建的东海道本线沿线车站都会与同名的宿场距离相近，但美浓赤坂车站实际上与中山道六十九次第58号的赤坂宿距离有数公里之远。紧邻赤坂宿的反而是地方铁路业者养老铁道所属的东赤坂车站。
车站zh-tw:构造;zh-hk:结构;zh-cn:构造;.美浓赤坂是座地面车站，虽然是个路线终点站，但因只是支线末端的小车站站内仅配置一座侧式月台，7条路线中也仅有最西侧的1号线供上下客使用，而2