书馆是一座巴洛克风格的图书馆，是这所古代大学的另一个着名地标。巴洛克大学塔由德国建筑师约翰·弗里德里希·路德维希的团队建造，建于1728年至1733年之间，是这座城市的图书馆。
巴洛克风格和现代.1772年，国王若泽一世的首相蓬巴尔侯爵对这所大学进行了一次意义深远的改革，在那里，科学研究具有了巨大的重要性。当时获得的科学仪器和材料的收藏现在收藏在科英布拉大学的科学博物馆，构成了欧洲最重要的历史科学收藏之一。19世纪上半叶是科英布拉的困难时期，在半岛战争期间，科英布拉被安多许·朱诺