之问题，就是撷取水流的主流水质会变成季节性轮替清澈与污浊的状态。在雨季时，为防止都市内因大雨淹水，这段期间，截流站上的各道污水闸门都必须开启，以疏导洪水排入主河道中，而原先想要拦截的污水也随之流入河川主流，造成河川水质急剧恶化并经常造成大量鱼类的死亡。而旱季时，因节流站的污水闸门紧闭，完整拦截污水，使得这时的河川水质较为清澈。
构造.截流站的构造主要分为防洪与拦截闸门、 污水抽水机（扬水泵）、 机械式拦污栅、 除臭设备（耙污机）、 紧急备用发电机等。