技园南区设立“深圳虚拟大学园”，有清华大学、北京大学、南开大学、哈尔滨工业大学等多所中国知名高校进驻。2002年，深圳市政府在南山区西丽建立深圳大学城，先后进驻清华大学深圳国际研究生院、、哈尔滨工业大学（深圳）、中国科学院深圳先进技术研究院、天津大学佐治亚理工深圳学院等高校及科研机构，主要功能为培养研究生和科学研究。2012年，南方科技大学获批成立，定位为研究型大学。2018年，深圳技术大学获批成立，定位为应用型大学。此外，深圳通过合作办学先后建立了香港中文大学（深圳）、深圳北理莫斯科大学等高校，创办暨南大