卸职后，吴宗濂在北京居住，后来迁居上海，任上海法租界公董局董事，维持晚年生计。有子吴匡时。
着作.吴宗濂着有《随轺笔记》4卷。译着有《德国陆军考》、《法语锦囊》、《桉谱》等。
逸事.1890年，桉树被引进中国栽种。1910年，驻意大利钦差大臣吴宗濂编译出版了《桉谱》一书。他还向清廷提议引种桉树。他根据法文音译而为该植物起了中文名“桉树”。