后担任冀南军区司令员。同年，陈再道、宋任穷率冀南部队十个团部队兵力参加百团大战。1943年，他进入延安中共中央党校学习。
第二次国共内战时期.抗日战争后，他担任晋冀鲁豫野战军第2纵队司令员，兼冀南军区司令员，率部参加上党战役、邯郸战役、陇海路战役等。1946年9月，陈再道率晋冀鲁豫野战军二纵参加巨野战役，并在龙堌集成功阻击国民革命军第五军。1947年7月，陈再道在鲁西南战役中，奉命统一指挥七个旅兵力，击溃国民党军整编第66师，并牵制国军七个整编师的驰援。此役后，他调动大军进入大别山