N-末端残基的N端法则来确定蛋白质的半衰期。
切除信号肽.蛋白质是通过N-末端的信号肽来到达最终目的地或特定细胞器的。在蛋白质的完成跨膜后，信号肽就会被切除。
多聚蛋白的切割.一些蛋白和真核生物的大部分肽类激素在转译时是以多个肽段聚合成一个大的肽链被合成的，这被称为多聚蛋白质（polyprotein），多聚蛋白需要切割才能形成有功能的肽段。如多聚蛋白质前阿片黑素细胞皮质激素（POMC）就包含了多条多肽类激素。而POMC的切割模式在不同组织间有很大不同，同一个