吴桂芳（），字子实，号自湖、石潭，江西新建县人。中国明朝官员。
生平.江西乡试第二名举人。嘉靖二十三年（1544年）中式甲辰科会试第二百十三名，登第二甲第二十名进士。授刑部主事。累迁两广提督、福建巡抚、漕运总督、工部尚书。卒于万历六年（1578年）春，享年58岁，赠太子少保。嘉靖三十四年（1555年），吴桂芳在任扬州府知府期间，主持修筑了扬州新城。
家族.曾祖吴世雄；祖父吴珂，省祭官；父吴山。前母叶氏；舒氏；继母潘氏。