光到达海草的叶片上，减少光合作用与初级生产。腐坏的海草叶与海藻激起藻华增殖，导致正向反馈。这种情形可能引发彻底的从海草过渡到海藻的相互消长。累积的证据也支持过度捕捞顶端的掠食者（广泛的掠食鱼类）可能间接增加海藻生长，借由实行减低放牧控制中级草食者，诸如甲壳类与腹足类通过「营养瀑布」。以最多使用的方式进行保护与回复海草地，包括减低营养层级与污染，用海洋保护区达成保育，以及运用移植来复原族群。