师进军东北。1946年2月，任辽西军区副司令员，1946年7月，任黑龙江军区司令员，领导剿匪工作。1947年任东北民主联军（后改为人民解放军东北野战军）第六纵队司令员，参与三下江南作战、东北夏秋冬攻势作战。1948年11月任第四野战军四十三军军长，参加平津战役，指挥部队围困北平，促使傅作义率部易帜。1949年4月，洪学智参加渡江战役，从黄冈、黄石、蕲春三地渡过长江。1949年6月任第十五兵团第一副司令员兼参谋长，率部参加湘赣战役、广东战役。10月14日攻占广州，洪学智兼任广东军区副司令员和参谋长，兼海防司令