元叔仁与父亲元熙一起前往镇守邺城，当时刘腾、元叉隔绝灵太后和魏孝明帝元诩不见面，假传诏令杀死清河王元怿，元熙因此起兵反对刘腾和元叉，被击败后与四个儿子元景献、元仲献、元叔献、元叔仁都被俘获。正光元年八月廿四日（520年9月21日），元叔仁的父亲元熙、叔叔元纂以及三个哥哥同时被杀。元叔仁因为年幼得以保全，与母亲于氏一起被流放到朔州。孝昌元年，灵太后诏令元叔仁回到京城，归还他家的财产住宅。孝昌二年三月庚子（526年3月29日），朝廷恢复元熙的中山王爵位，以元叔仁继承爵位，授任征虏将军、通直散骑常侍。建义元年四月