参加了《中华人民共和国香港特别行政区基本法》、《中华人民共和国澳门特别行政区基本法》的起草工作。吴建璠是香港特别行政区基本法起草委员会委员、澳门特别行政区基本法起草委员会委员，香港特别行政区筹备委员会委员、香港特别行政区筹备委员会预备工作委员会委员，中国法学会理事、中国法学会香港法律研究会副会长，第八届全国政协委员、全国人大常委会香港特别行政区基本法委员会委员。2002年，获聘为中国社会科学院法学研究所终身研究员、终身教授，任中国社会科学院台港澳法律研究中心主任。吴建璠精通古汉语、英语、俄语，长期研究法