将军澳名称来源并不可考，故老相传南宋末年，宋帝昺等人曾经逃难至今九龙半岛，此为一说；如果这种说法可信，所指的将军大概是一位勤皇的将军。以前将军澳是人烟稀少的海湾，只有坑口村才有较多人口，另外在海湾北面尽头有将军澳村。很多人认为是因为清朝时此海湾常有走私船出没，朝廷便派一名将军镇守此地打击走私活动，故名「将军澳」。另一说法是，在明朝时候某位将军败走到今将军澳现址，最后伤重死去。后人为纪念这位将军，除在原地安葬该将军外，还把安葬地称作「将军澳」以作纪念。1866年，「将军澳 Tseung-kwan-o