列入海洋资源组分工计画，行政院永续会生物多样性分组亦列为工作事项中。直到2006年年尾，行政院核定内政部所报「东沙海洋国家公园计画」草案，并请内政部将计画书名称修正为「东沙环礁国家公园计画」，以凸显所保育之东沙环礁生态系及地景特性。2007年1月，内政部正式公告「东沙环礁国家公园计画书、东沙环礁国家公园计画图」，东沙环礁国家公园为中华民国第七座国家公园，并于2007年1月17日正式挂牌成立。同年10月4日，成立海洋国家公园管理处，作为管理此国家公园成立所设之管理单位，其后经行政院修订计划内容，拟将岛屿或