郡还属荆州。永和五年（349年），平范贲，收复蜀郡，益州还治成都。永和八年（352年），因安置三蜀流民，分蜀郡置宁蜀郡。后侨置江阳郡。至此，益州领八郡：蜀郡、汶山郡、犍为郡、晋原郡、沈黎郡、越巂郡、宁蜀郡、江阳郡。宁康元年（373年），益州陷于前秦。太元十年（385年），收复益州。义熙元年（405年），益州陷于谯蜀。义熙九年（413年），收复益州。后以关陇流民置始康郡，以秦州流民置晋熙郡，以江阳郡旧土置东江阳郡。
南北朝.南朝宋初，梁州广汉郡、遂宁郡、巴郡、巴西郡、南阴平郡改属