源自《论语·颜渊》书中曾子的格言：「君子以文会友，以友辅仁」。其意指「借学问集合同志朋友，共同发挥仁道精神」。英译校名经常省略「天主教」（Catholic）字眼，使用FJCU、FJU两种缩写。中文全衔有：
哲学传统.士林哲学、三知论为辅大哲学传统，基于会通儒学的悠久传统，着重「反对相对主义的霸权」。2005年，辅仁学派依此创建。2012年，社会公义与科技发展列为研发重点 。基于基督宗教信仰，辅大校长明确支持废除死刑、反对堕胎、反对高等教育功利化。自从政府实施弹性学杂费方案后，辅