击败红教统一全藏，之后分裂成青海与西藏和硕特。达赖六世时，藏区政事交由第巴（理事大臣）桑结嘉错管理，他联合准噶尔对抗西藏和硕特的拉藏汗，拉藏汗先下手杀桑结嘉错并废除达赖六世。1717年噶尔丹的侄子策妄阿拉布坦入侵西藏，攻杀拉藏汗，并且佔领拉萨。清军于1718年试图进藏但被准军击败，最后于1720年由胤禵率军驱除成功，协助七世达赖入藏，以拉藏汗旧臣管理藏区。这是清朝正式经营青藏地区之始。清政府从此在西藏驻军。雍正初年青海亲王罗卜藏丹津意图复兴和硕特汗国而乱，隔年年羹尧与岳钟琪等人平定。为此雍正帝佔领部分西