国务、侍所别当和鎌仓小町的别屋敷，然而时赖康复后却重掌实权。正元2年和文应元年（1260年），长时虽然代表身患痢疾的宗尊亲王参与在鹤冈举行的放生会，但是长时自己在年末时亦受到病魔缠绕。文永元年（1264年）7月3日，长时因病辞去执权职务并且出家，由叔父北条政村继任执权。同年8月21日，35岁的长时在妙光寺死去，同寺现在仍然保存长时的木像和牌位。长时家系赤桥流的、和北条守时等人扶摇直上，无需经由引付众便能够擢升为评定众，在北条氏中的家格仅次于得宗，长时的曾孙分别有最后一任执权赤桥守时和足利尊氏正室赤桥登子