从1871年开始梵蒂冈与新成立的意大利王国的关系恶化，梵蒂冈的主权被剥夺，教宗庇护九世和教宗良十三世觉得自己越来越像囚犯，他们下令改建和美化花园。良十三世于1888年设立了梵蒂冈动物园。一开始面只有鸣禽。非洲的神父在庆祝良十三世晋铎周年纪念时送给他瞪羚、鸵鸟和鹈鹕，因此又建造了其它笼子。他于1890年在花园中心的高地上建造了一座夏宫，他称之为“我的小冈道尔夫堡”，来将它与阿尔巴诺湖畔的教宗夏宫相比。圣座于1929年签署《拉特朗条约》后，教宗庇护十一世为显示梵蒂冈重获的自主权而下令建造多座墨索里尼时