人民解放军总医院的八个医学中心之一，正师级，是一所综合性三级甲等医院。
沿革.1958年，重庆的中国人民解放军第四十一医院、武汉的中国人民解放军第三一五医院、南京军事学院附属医院合并成立中国人民解放军第三〇九医院，隶属中国人民解放军总后勤部。2004年5月，根据中央军委下达的部队精简命令，解放军第三〇九医院被并入中国人民解放军总医院，对内称中国人民解放军总医院第三〇九临床部，对外称中国人民解放军总医院第二附属医院。2009年8月，解放军总医院第二附属医院转隶中国人民解放军总参谋部，