二世之侄。他的母亲是克利奥帕特拉·特亚。在安条克七世死于和帕提亚帝国的战争后，安条克九世的母亲把他送往库齐库斯，这使他得到了“库齐库斯的”这个外号。安条克九世最终于前116年返回叙利亚，与异母兄安条克八世瓜分了帝国。前96年，他在与安条克八世之子塞琉古六世的战斗中被杀。