治下，他以高压手段镇压其反对者，尤其是苏共支持者，屠杀了大量犹太人和一些中国商人。恩琴自称成吉思汗转世，并被十三世达赖喇嘛土登嘉措认定为大黑天的转世。他还提出泛蒙古主义，主张使博克多汗重建蒙古帝国。1921年7月，他着手袭击俄国和外蒙古的边疆，尤其是蒙古人民党控制的恰克图，但不久又失陷被红军佔领外蒙古，并使他在7月6日被逐出库伦。8月21日，他被其蒙古盟友出卖、逮捕，随之被送交红军。1921年9月15日，叶梅利扬·米哈伊洛维奇·雅罗斯拉夫斯基担任检察官，经过6小时的摆样子公审后，恩琴被判以反革命罪，在新