不被批准。弘治九年（1496年），引病归乡，久之举荐起为广东右布政使，不拜。此后再起为南京右佥都御史，总督操江。弘治十四年（1501年），再次上疏请求减免建造并远离奸臣等，此外还举荐侍郎谢铎，少卿储巏、杨廉，致仕副使曹时中等人。在江西时期，多次抑制宁王朱宸濠贪暴。因母丧丁忧回乡。
正德年间.明武宗即位后，言官交相举荐，朝廷内的江西人合疏乞求召还林俊。起为右副都御史，再抚江西，因父丧丁忧去官。正德四年（1509年）服阙，任四川巡抚，平定眉州人刘烈叛乱。因功晋升爲右都御史。因得罪朝廷权