5年，总税务司迁往北京台基厂。1929年，总税务司署迁回上海。中国抗日战争前期，总税务司不顾日军的威胁，设法保持海关完整。太平洋战争爆发后，日军立即佔领各地海关及在上海的总税务司署。国民政府在后方重新设置总税务司署，以美国人为首，统辖各地海关，管理国统区与外国，以及国统区与沦陷区之间的贸易。1945年日本投降后，两个海关总署在上海合併。1949年4月，渡江战役前，随中华民国政府迁往台湾。同年5月，在中国大陆的遗留机构被中国共产党下令中止职权，同年10月撤销。1950年，末任外籍总税务司李度退休，海关