占领马六甲的130年间虽然遭遇多次外来攻击，但都无法被攻破，直到1641年才被荷兰王国和柔佛联军打败。堡垒内的驻军一般是300人，最多不到500人。
商业政策.葡萄牙人在占领马六甲后，为了使马六甲成为商业繁荣的港口，使积极遣使到中国、暹罗、缅甸等地，建立密切的商业关系。葡萄牙也派遣舰队前往爪哇、苏门答腊、婆罗洲与东印度群岛等地，并建立根据地，迫使该区域的香料贸易及所有商船，都集中到马六港口以便控制与垄断。此外也鋳造新币，以稳定币制，促进商业发展。但是，葡萄牙实行专制的垄断贸易政策，