加盟浦和红钻，双方签约三年。2006年12月，天皇盃准决赛浦和红钻对磐田喜悦，小野伸二在球队落后的逆境中带伤出场，马上扭转了场上局势，使得浦和红钻最后反败为胜。半决赛中他先发出场并得分，浦和红钻击败鹿岛鹿角进入决赛，其后在决赛中浦和红钻以1:0击败大坂飞脚获得天皇盃，小野伸二作出了巨大贡献。冬季转会期间，高原直泰离开法兰克福加盟日职联赛球队浦和红钻，一度使得日本球员在德甲联赛中断档。但是继沃尔夫斯堡成功引进了日本国脚长谷部诚之后，中场球星小野伸二也来到德国接受波鸿足球俱乐部的转会例行体检，表现出色的