揆中，酒井忠尚等多数酒井氏其中还包括了本多正信及夏目吉信加入一揆军，而忠次则跟随家康平乱。永禄7年（1564年）攻击吉田城立下战功，守将小原镇实撤退，无血开城，战后成为吉田城城主。自此忠次成为旗本先手役和「东三河旗头」统领三河东部的松平家国人（西三河为石川数正）。永禄12年（1569年）末，甲斐的武田信玄开始侵入今川氏真的领国骏河国，德川氏与武田氏达成协议瓜分今川氏领国，由忠次负责与武田方进行交涉。之后参加元龟元年（1570年）的姉川之战布阵于姉川河川沿岸，与小笠原信兴的部队一同突入朝仓军，元龟3年