结构蛋白、酶或不涉及调控的非编码RNA。这些基因对细胞的形态和功能特征非常重要。在真核生物中，这些基因是以片段化的形式存在，即分为外显子和内含子。但在原核生物中，这些基因是连续的，甚至几个功能相关的基因与调控基因组成一个操纵子来共同转录。如在乳糖操纵子中，结构基因编码的就是与乳糖代谢有关的酶，这三个基因是：