位置在华盛顿特区和波士顿之间，纽约市紧邻哈德逊河，海上运输极其便利，这使其得以快速发展成为一个贸易重镇。纽约的大部分城区位于狭小的曼哈顿、史泰登岛和长岛，因此人口密度很高。哈德逊河经过哈德逊河谷流入纽约湾，是纽约市和纽泽西州的分界线。一样位在纽约市的东河流经长岛海湾，将布朗克斯和曼哈顿与长岛隔开。哈莱姆河位于东河与哈德逊河之间，分隔曼哈顿和布朗克斯两行政区。布朗克斯河流经布朗克斯和威斯特彻斯特郡，是纽约市唯一皆为淡水的河流。纽约市的大部分地区都被人为的修整过，自荷兰统治时期开始就有大量的填海造地工程