（1516年），家贫好学，常借雪映月光苦读，十七岁考取生员，十九岁身染重病。嘉靖二十二年（1543年）中举，在楞严寺苦读。嘉靖二十六年（1547年）成进士，授武进知县。历官兵科给事中。嘉靖四十五年，以右佥都御史巡抚陕西。万历十年（1685年），出任南京户部尚书。次年授资政大夫衔，不久改任工部尚书。官至户部、吏部尚书。万历三十三年（1608年）卒。赠少保。杨巍最初历任中外官职，甚有名声，但到官至吏部尚书秉铨时，已是年耄骫骳，故行事多听首辅申时行的指挥，故被御使江东之、李植等弹劾抨击，以致他名望大损，但是他为人