政上归英属印度洋领地管辖。该群岛最早由瓦斯科·达·伽马发现，18世纪初作为毛里求斯的一部分被法国占领。1814年，根据维也纳和约，法国将该群岛割让给英国，作为塞舌尔的一部分。1903年8月31日，英国将其从塞舌尔划出，重归毛里求斯管理。在1965年，英国将查戈斯群岛从毛里裘斯分割出来，成立英属印度洋领地来管理该群岛。国际法院及一些国际法律专家指出这个分割是非法的，因爲国际法并不允许在未独立前便将国家分割。但是，毛里裘斯殖民地自治政府则接受此次分割，换取三百万英镑赔偿金，及英国承诺在防卫用途结束后，会将查