次全国羽球排名赛获得乙组双打亚军，得以晋级甲组。2016年3月，杨博轩与苏敬恒合作出战怀卡托羽毛球国际赛男子双打项目，在决赛中以0比2的成绩（20-22、10-21）不敌队友兼头号种子刘韦辰/杨博涵组合，屈居亚军。11月，杨博轩与温晧昀晋级马来西亚羽毛球国际挑战赛混合双打决赛，最终以直落二（13-21、17-21）败于马来西亚组合吴顺发/赖洁敏。2017年1月，杨博轩/温皓昀在第一次全国羽球排名赛夺得第三名，获得2017年台北世大运选手培训资格。同年6月，杨博轩代表中华台北出战夏季世界大学运动会羽球