年，他返回国立台湾大学历史学系担任讲师，并考入该系第一届博士班，师从沈刚伯、李宗侗、姚从吾等学者，以论文《魏晋史学的特色--以杂传为范围所作的分析》获颁博士学位；同时，他又通过中华民国教育部所举办之口试，取得国家文学博士学位。其间，他还前往平冈武夫位在京都大学的研究室做访问研究。此后，他曾任教于国立台湾大学、辅仁大学、香港中文大学、国立政治大学等处。
晚年.2006年2月13日23时，逯耀东因心脏副主动脉瘤破裂过世于高雄荣民总医院，享寿七十三岁。