核蛋白是指与核酸（脱氧核醣核酸，DNA或者核糖核酸，RNA）有关的任何蛋白质。譬如，组织蛋白类型的蛋白－染色质。端粒酶，核糖核蛋白和精蛋白都是核蛋白。典型的核蛋白包括核醣体，核小体和病毒核衣壳蛋白。
结构.核蛋白倾向于带正电，促进与带负电的核酸链的相互作用。蛋白质三级结构和许多核蛋白的生物学功能被理解。确定核蛋白结构的重要技术包括X射线衍射，核磁共振和低温电子显微镜。
病毒.病毒基因组（DNA或RNA）非常紧密地包装在病毒衣壳中。因此，许多病毒只不过是有组