持续地在波斯湾地区活跃，参与美军在此地区的大小任务，例如2003年3月开始的伊拉克战争（美军方面代号「伊拉克自由行动」，Operation Iraqi Freedom）。2009年3月21日，罗斯福号将任务转移给姊妹舰艾森豪号，于4月18日返抵母港诺福克。同年8月26日国防承包商诺斯洛普·格拉曼（Northrop Grumman）获得一纸24亿美元的合约，进行罗斯福号的（Refueling and Complex OverHaul, RCOH），进行核燃料棒的更换与大规模的舰身结构与舰上设备检修。201