11年辛亥革命，唐继尧受蔡锷之命率滇军援贵州立宪派，被推为贵州都督。1913年，他支持袁世凯，参与镇压孙中山二次革命，攻打四川熊克武率领军队。同年10月，他继蔡锷任云南都督。1915年12月25日，不满袁世凯称帝，于是与蔡锷联合宣佈云南独立，并发起护国战争，自任中华民国护国军总司令，任蔡锷为第一军司令官、李烈钧为第二军司令官。该行动，被视为中华帝国失败主因。护国战争结束后，任云南督军兼省长。1917年他与孙中山修好，并支持孙中山发动的护法运动，1918年被推为护法军总裁之一，并任滇川黔鄂豫陕湘闽八省