他在高玉树的竞选总部后头发现一个焚化炉一直在烧，走近一看发现烧的都是王民宁的传单。想不到国民党员再多，特务再多，还是敌不过民心向背。1961年，王民宁等人邀请戴德发出任中国化学制药总经理，然而之后王民宁与戴德发发生冲突，最后戴德发去职。王民宁晚年中风，1986年，王民宁退出开南商工董事长一职，由廖钦福接任。1988年12月23日，病逝。王民宁逝世后，中国化学制药为纪念其创办贡献，成立「财团法人王民宁先生纪念基金会」，该基金会并于1991年设置「王民宁奖」鼓励医药及学术研究。