水上侦察机因技术不成熟而失败，使得侦查机能并不健全；加上对美战略改变，潜水舰队旗舰的功能已变得无意义。完工后的大淀号先是在吴港至横须贺间海域训练，同时间和她一同训练的包括新月号驱逐舰，以及在濑户内海培训舰载机组员的龙凤号、凤翔号。在1943年5月上旬阿图岛战役爆发趋势明显后，大淀号与航舰部队一同集结在横须贺待机；但是盟军很快地就夷平阿图岛防御部队，因此在5月31日集结的军舰一同往西日本集中训练，包括航舰（翔鹤、瑞鹤、瑞凤），巡洋舰（最上、大淀），驱逐舰队（新月、初月、凉月、时雨、有明）。自1943年12