与关中豪强韦子粲等人商量起兵讨伐他，计划败露，孝昌三年十月廿日（527年11月28日），元仲冏在长安的公馆中被萧宝夤派人杀死，时年虚岁三十八。朝廷得知后，赠予元仲冏使持节、卫大将军、尚书右仆射、都督雍岐南豳三州诸军事、雍州刺史，增加封邑三百户，谥号武贞。武泰元年岁次戊申三月戊午朔十六日癸酉（528年4月20日），元仲冏归葬于景陵东山南面，其墓志首题《魏故使持节散骑常侍卫大将军尚书右仆射都督雍岐南豳三州诸军事雍州刺史南平王墓志铭》，1928年农历6月于洛阳城北四公里盘龙冢村东南地出土，盖已失没，志石现存开封市