两国区间开通，本站成为三层立体高架站。此时，车站西半部为客运站，东半部为货运站。因此现在车站北侧（藏前桥通附近）线路在进站前稍微东偏。高架货物月台共有2面，全长180公尺，宽9 - 12公尺，设有电梯24台、斜坡等。货车在替换后，会经由常磐线日暮里站送至本站。站内共有14条线路，西起为货物1 - 6号线、上行本线、下行本线、货物7 - 12号线。其中货物1号线为单式月台1面，货物2、5号线与货物8、10号线为岛式月台1面。战后，货物输送逐渐改用货柜运输，然而用地狭小、位于高架的秋叶原站无法设置