借予香港教区一途外，亦可选择转往其他教区，不过不同于一般的例子，华南总修院的毕业生若要转往其他教区，除了要有本人、旧教区及新教区的同意外，亦要有教廷传信部的同意。
停办.虽然华南总修院于1945年后复办，但由于自1949年中华人民共和国成立后华南地区再也没有选派修士前来，所以罗马教廷传信部于1964年将华南总修院的院址交由香港教区管理，当时原位于薄扶林太古楼一块由巴黎外方传教会所捐献的土地的圣神修院就此迁入华南总修院原址发展。虽然由耶稣会管理的华南总修院就此停办，但耶稣会士们依然有