导致1682年叶尔羌发生暴乱，阿卜都里什特投奔清朝，准噶尔改立他的幼弟马哈麻特·额敏继位。准噶尔自1680年作为塔里木盆地的宗主后，用叶尔羌汗与和卓作为他们的傀儡统治者，另一方面又以他们的儿子作人质囚禁于伊犁确保他们的忠诚。与此同时准噶尔又不断搜刮维吾尔族的财富，包括水利税，牲口税，水果税，人头税，土地税，树木和草税，金银税，营业税，还勒索了额外的棉花，白银，黄金。每年准噶尔从喀什噶尔人提取67000腾格银税，如果他们拥有果园，人们不得不付出水果税，准噶尔使者每次到南疆，也要强姦妇女，抢劫和偷窃财物和牲