祖妣正位宸极”之语，其言失当，及其变乱奉祀礼文、荐牙盘食等数事，哲宗诏罢免吕希纯官职，出为宝文阁待制、仍知亳州。当年，林希等众臣请罢合祭。诏从之。绍圣初年，林希请稽考庆历以后未经编次的臣僚，其子孙应录用者以次编定。绍圣元年十月，知枢密院事曾布、韩忠彦弹劾章惇，举“不欲除林希经筵（讲课之职）而终除”等章惇行事违背哲宗意图的例子。二年（1095年）四月，林希等奉诏举荐堪任使者二员。九月，林希在权知礼部尚书任上，监察御史常安民称林希是章惇谋客，章惇肆横强狠都是林希所教。移吏部尚书、翰林学士，三年（1096