1369年（明洪武二年），降崇明州为崇明县。
清朝.崇明县在清朝时输入苏州府太仓州，管辖范围包括今天上海市崇明区和浙江省嵊泗县。在不被重庆国民政府承认的情况下：“中华民国维新政府”于1939年（民国二十八年）6月7日，撤江苏省崇明县，设上海特别市崇明区；后续的汪伪南京国民政府于1942年至1943年（民国三十一年至三十二年）清乡期间将崇明区公署改称崇明特别区公署，又于1944年（民国三十三年）8月将崇明特别区公署复称崇明县政府。经中华人民共和国国务院批准，1958年1月，