，β-异构体始终具有至少一对遮蔽的（共面1,3- 相互作用）孤对，这种n－n排斥是高能量的情况。
合成应用.端基异构效应被考虑合成。 由于其在糖中的发现，糖和碳水化合物化学是端基异构效应的更常见的合成用途之一。 例如，柯尼希斯－克诺尔糖苷化（Koenigs–Knorr反应）以异源效应实现高非对映选择性的α-OR或β-OR基团的安装。 ，（+）-Lepicidin A和（-）-Lisperpermoside是通过Koenigs-Knorr糖苷化克服端基异构效应而合成的一些产物。