截至2019年7月，卢安达航空服务于以下目的地（不包括代码共享目的地）：
代码共享.卢旺达航空与以下航空公司拥有代码共享:2009年4月，有关方面宣佈卢旺达航空会与布鲁塞尔航空实行代码共享协议，所有来往布鲁塞尔机场及基加利国际机场的航班均会以SN 及 WB的班号营运，作为售票航空公司的卢旺达航空亦会出售10个经济客位予市场2009年9月，卢旺达航空与埃塞俄比亚航空签署代码共享协议。2010年5月，卢旺达航空与乌干达航空实施代码共享协议 唯此协议于2012年3月终止，及后于20