3年，陈得才攻占汉中，年底时收到天京命令回师救天京。大军在1864年春夏之交时抵达湖北安徽交界一带，因天京缺乏粮食而停留不进，等待秋收后才进兵。1864年7月天京失陷，清廷派僧格林沁督师清军攻陈得才部。陈得才部下自从知道天京失守、天王洪秀全去世及幼天王洪天贵福被俘后，军心开始动摇。11月，陈得才在安徽霍山兵败，大批部将陆续向清军投降，陈得才势孤力弱，又听闻身边有将士正在策划把他擒送清军，遂服毒自杀。当时陈得才部队中，赖文光部仍大致完整，赖文光后来与捻军合作继续抗清。