结束后，中央信托局因接运海外物资需要，国民政府交通部出资恢复，并于民国36年1月21日修复，同年12月15日起重新营业，办理军、公物资运输。1950年3月，由于运量较低，自虬江码头起拆除约5.7公里的轨道，后用于修建上海石油站专用线。1958年，上海铁路枢纽工程开始，为减少穿越市区的影响，同时为杨浦地区的工厂提供服务。上海铁路局决定修建何杨支线，并部分使用原虬江支线的路基和上海石油站专用线。线路在闸殷路1号桥处离开原路基，修建新线至杨浦站。1960年3月工程竣工。1976年与1989年曾分别对路轨和道床