直言台湾海崃两岸关系一定要走和平发展的道路，他认为民进党即使在2016年中华民国总统选举重返执政也不致于走到法理台独，「台湾共和国可以是我们的理想，但它不是一个可以落实的目标」。
遭到台湾新社会智库除名.2016年3月21日，风传媒独家报导，新潮流系不满洪奇昌近年在两岸议题上与苏起互动紧密，为避免让外界将洪奇昌的主张视为新潮流系意见，新潮流所属台湾新社会智库近期将正式决定将洪奇昌除名。同日，新潮流系大老利锦祥证实，近年来洪奇昌与新潮流系台湾新社会智库运作较为疏离、也甚少参与相关活动