历经多次军事政变，加上马可仕下台后濒临崩溃的经济，但最终仍完成任期，1992年6月30日卸任，由菲德尔·瓦尔德斯·拉莫斯将军接任。菲律宾首次和平转移政权，实现政党轮替。1998年5月，约瑟夫·艾斯特拉达当选总统。2001年1月20日，约瑟夫·艾斯特拉达因受贿丑闻，而于第二次人民力量革命中被迫下台，副总统阿罗约夫人继任。2004年，阿罗约夫人当选总统，成功连任。2006年菲律宾政变，五千多人示威要求总统阿罗约夫人下台，总统阿罗约夫人其后宣佈全国进入紧急状态。2010年5月10日，柯拉蓉之子诺诺·艾奎诺击败约瑟