治挂帅的国家，因为科学界的一轮政治震荡，伊万诺夫及其他几位同样涉及灵长类动物的研究与实验的科学家失去了他们的职位。1930年春天，伊万诺夫在他工作的兽医学院遭受政治指控。结果，在同年12月13日，因试验未完成预期使命而遭到批斗与逮捕。他被判处五年流放至哈萨克首府阿拉木图。在阿拉木图，伊万诺夫在哈萨克兽医动物学学院工作，最终于1932年2月提前获释并于同年3月20日死于动脉粥样硬化引发的缺血性中风。而为伊万诺夫撰写讣闻的，就是后来知名的生理学暨心理学权威伊凡·巴甫洛夫。