台南神社扩建，庄雅桥街的台南博物馆，移至两广会馆重新开馆，之后也更名台南州立教育博物馆。1927年，新的商品陈列馆落成，一部分展品移转至新馆。
战后.两广会馆在二战时，遭盟军空袭击中全毁，原址已成商业用地。一部分馆藏移至国立台南第二高级中学保存。
其他.奇美集团创办人许文龙，小时候常造访教育博物馆，立志长大后也要开一间博物馆，最后成立奇美博物馆圆梦。而奇美为了彰显与教育博物馆的关系，2014年新馆落成后，首档特展「我的梦．阮的梦．咱的梦–奇美博物馆的故事」