。由当时据守台东的清代官兵出资兴建，因此石碑上赞助官兵有姓元、洋、以、捐等满人音译的姓氏。当时庙址为现在的东禅寺。台湾的妈祖庙有五间官庙，此庙是清朝认证的最后一间，也是东台湾唯一的官庙。原在埤南宝桑庄之东海滨、光绪七年（1881年）同知袁闻柝所建的昭忠祠，在光绪九年（1893年）遭台风吹倒，暂移祠中神主于此庙之旁，后来重建天后宫时置昭忠祠于右护室。
日治时期.1930年强烈地震引起龟裂，遂有迁建之议。由吴金（吴锦麟）捐出原为菜园的一千六百余坪土地，并由林舍、陈冬路、