着截然不同的性质。和上面两个例子不同的是，氧原子并不是连接着一个碳原子和一个氢原子，而是和两个碳原子相连。因为它没有羟基，上面这个化合物并不是一个醇而是一个醚，因此它的化学性质和其他的醚更加相近。另外一个有着不同化学性质的同分异构体的例子是黄嘌呤。巧克力中的可可碱中如果两个甲基中的一个移动到双环上的另外一个位置，这个同分异构体就是茶碱了。
分类.同分异构体可以分为结构异构和几何异构（又称立体异构）。
结构异构.在结构异构中，原子或官能团以不同的形式互相