宣扬新政府会大幅削减田税（称“年贡半减”），为新政府所忌而设计捕杀，罪名是假冒官军，至1928年获平反。1860年代初，相乐总三为实现尊王攘夷的主张，开始交结各地志士，密谋武力反抗幕府政权，屡遭失败。1860年代中期，他结识了讨幕派重要人物西乡隆盛和大久保利通。1867年，西乡隆盛等人派遣相乐总三与其他人潜入江户进行反幕府的行动。1868年戊辰战争开始后，相乐总三组织了赤报队，作为政府军的先头部队。相乐总三向政府建议减轻幕府领地的租税，获接纳，发出“年贡半减令”，他又请求政府发给官军印章，却被拒