63年，鄂图曼征服了克国邻近的波士尼亚全境，与克国相接壤，后，于1493年的与1526年的摩哈赤战役中彻底打败了克匈联军，匈王拉约什二世本人也在1527年死于摩哈赤。由于畏惧鄂图曼的统治，克罗地亚贵族议会于1529年宣佈归顺奥地利的哈布斯堡王朝，承认斐迪南一世为新的克国统治者，作为交换，斐迪南一世必须对抗鄂图曼帝国，同时要尊重克国人的政治权益。
哈布斯堡王政至奥匈帝国时期.由于奥斯曼帝国军的连捷胜利，奥地利当局于1538年将克罗地亚一分为二，分作平民区与驻军区，后者由帝国政府派遣的