和国主席杨尙昆、国务院总理李鹏、国防部长秦基伟等人均曾出访阿联酋。后来，阿联酋和伊朗之间发生，阿联酋方面希望得到中华人民共和国的支持；同时，中华民国总统李登辉访问阿联酋，中华人民共和国与阿联酋间的外交关系掉进谷底，但中国没有召回大使。1997年，国务院副总理吴邦国到访阿联酋，阿联酋向中方保证同类事件不会再发生，两国关系好转。2005年9月30日，中华民国总统陈水扁在中美洲行程结束后到阿布扎比进行过境访问，在当地受到元首级接待；中华人民共和国方面对陈水扁此举表示强烈不满，又指阿联酋允许陈水扁过境的做法