新竹的铁路曾铺设轻便铁道应急，铁道桥修好之后，铁路营运路段在该年8月从新竹延伸到中港溪附近，于8月10日新设香山、中港（今竹南车站）二站。而后纵贯线继续向南延伸，明治卅六年（1903年）5月25日完成中港苗栗段，隔年（1904年）推进至三叉河（今苗栗县三义乡）。至于纵贯线南段则从明治卅二年（1899年）11月自打狗（今高雄鼓山区南部）往北铺设，隔年（1900年）11月29日打狗台南段开始营运，再隔年（1901年）5月15日营业路段沿伸至今善化车站。而到了明治卅七年（1904年）时南段路线已经延伸到了彰化