随军医生加入倒幕军，战后师从英国医生在学习现代医学，1872年加入日本海军任军医。1875年至1880年公派留学英国，回国后任东京海军医院院长，致力于解决脚气病问题。1884年，高木通过航海试验证明脚气病的病因在于营养失调，进而推行伙食改良，引进以及各种副食，成功从日本海军中消灭了脚气病。1885年升任日本海军。1905年因营养学方面的成就被明治天皇授予男爵爵位，人称“麦饭男爵”。晚年在日本国内外举行巡回演讲，继续普及卫生保健思想。1920年在东京病逝，享年70岁。追封从二位、授旭日大绶章。南极大陆有一处海