配房被用作临时停灵的灵房。中华人民共和国成立后，该寺大部分房屋成为居民住宅。1976年唐山大地震波及北京，法华寺的居民在寺内搭建了许多新房子。1984年1月法华寺被崇文区人民政府公布为北京市崇文区文物暂保单位，并立保护牌。1989年法华寺被列为北京市崇文区文物保护单位。2000年，法华寺所在区域划为崇外6号地项目区域。北京市住房和城乡建设委网站称，崇外6号地由北京崇文新世界房地产发展有限公司开发，项目实施区域包含法华寺。崇外6号地项目确定之初，文物部门介入，会同规划部门对法华寺所在地区开展了文物保护范围