联盟之中。但是，交大西迁仍旧带来的许多问题，一些遗留至今。两校都把西迁这段历史作为校史的重要部分，西安交大更是针对这段历史修建了纪念馆。
冤假错案.在迁校期间，本来被归为人民内部矛盾的内迁之争，随着反右的斗争的开展及其后文化大革命席卷全国，一些过去反对迁校的声音被收集为反革命言论，一些发表过反对迁校看法的人被划为右派遭到迫害。直到十一届三中全会之后，这些人才被陆续平反。西安交通大学第一任校长彭康，因为说过学习毛主席语录不能形式化，加上其在交大迁校时听取不迁意见的作为，在文革