美国陆军寻求帮助。1804年杰斐逊批准炮兵团二等中尉威廉·克拉克和他的私人秘书、曾任第一步兵团上尉的梅里韦瑟·刘易斯带领探险队共45人，其中包括懂西班牙语和印第安语的翻译，并准许刘易斯和克拉克在必要的情况下可以使用军事手段。行动前，杰斐逊感到了来自英国、法国和西班牙的威胁，他告诫刘易斯和克拉克：“必须利用各种方法与我们保持联系。”就这样，这支自称为“探索军团”的队伍，乘着一只龙骨艇和两只双桅平底船，沿着密苏里河逆流而上，开始了史诗般的探险之旅。
路易斯安那购地和西部考察.1803年