本岛有贸易往来，1510年，琉球王国尚真王在位期间被纳入琉球国版图之内，1879年改属沖绳县。二次战后的1945年至1972年期间的美国统治琉球时期为美国所统治，直到沖绳政权移交才再度由日本治理。日本防卫省在2009年即开始规划在岛上派驻日本陆上自卫队，设立，用以24小时全天候蒐集东海一带的情报，监察区内的飞机及船只2014年正式开始兴建，基地于2016年启用，现约有150自卫队员进驻与那国岛。
人头税.与那国岛在琉球王国时代必须缴交年贡（人头税）。为了减轻年贡，与那国岛上