卸任海军司令员，并于次年起连续当选第六、七届全国人民代表大会常务委员会副委员长，并担任全国人民代表大会华侨委员会主任委员。1984年4月，叶飞当选全国侨联名誉主席。另据《美国之音》间接引述胡绩伟的说法，1989年六四事件中，叶飞及张爱萍、杨得志、萧克、陈再道、宋时轮、李聚奎等七位将军强调人民解放军的枪口不能对着人民群众。叶飞晚年着有《叶飞回忆录》。1999年4月18日中午12时，叶飞于北京去世，享年85岁。
家庭.叶飞的夫人是王于畊，他们于1941年由陈毅介绍结婚；王于畊曾任福建省