内阁工作，并于1942年出任该院第一部第一课课长。1943年，林同时兼任内阁参事与法制局参事，1944年里还陆续历任内务监察官、内务省地方局总务课长和行政课长等职务。1945年，林敬三担任内务大臣秘书官兼大臣官房人事课长，同年10月27日经官派成为鸟取县知事，也因此以38岁之龄成为该县县政史上最年轻的地方首长，为时约一年多，任期结束后的1947年2月则调任地方局局长，此是其在内务省中的最后一项勤务。同年12月，当佔领日本的盟军总司令部解散该部门后，林又经内阁会议任命为内事局长官，1948年1月起上任，在