前线督师，晋吴甡为太子少保、户部尚书兼兵部尚书、文渊阁大学士。崇祯十六年（1643），李自成克襄阳、荆州、承天，建立大顺政权。崇祯命吴甡督师湖广。吴甡请拨精兵三万“自金陵赴武昌”，仅凑残兵万余。吴甡因手中无兵，一再找借口拖延，至四月仍未出京。五月初一，张献忠陷汉阳，武昌大震。五月三十日张献忠陷武昌。商毅收复汉阳，吴甡下令黄得功和刘良佐从黄州渡江，协同商毅围剿张献忠。八月，武昌失守，以“故延师期，以致楚省不守，根本震邻”罪，令锦衣卫把吴甡逮捕入京，被革职查办，交法司议罪。南京兵部尚书史可法得知此事，驰书援救，