国学生运动发动之后，大学被拆分成13座独立的大学，巴黎大学从此不复存在。
合并.21世纪法国教育改革以来，13所巴黎大学的分支学校中最着名的几所学校开始通过合并建立跨学科世界级大学， 以争取卓越大学（IDEX，类似中国大陆的985工程、双一流、德国精英大学计划与台湾的迈向顶尖大学计画）称号和拨款。2018年1月1日，巴黎第四大学——旧巴黎大学文学院的部分继承者，与巴黎第六大学——旧巴黎大学理学院的部分继承者，合併为「索邦大学」。2019年，巴黎第五大学与巴黎第七大学合并为巴