庆帝正式亲政，立刻赐死和珅，并逮捕戴如煌、常丹葵等官逼民反的祸端以收买人心。和珅伏诛之日，王三槐押解到京。嘉庆帝命军机大臣等审问三槐，供称“官逼民反”四字。清廷改以勒保为经略大臣，明亮、额勒登保为参赞大臣，节制川、陕、楚、豫、甘五省官军进击，并晓谕州县办团练，并依山隘寨堡，扼守要路，坚壁清野。嘉庆四年（1799年）正月，白莲教青号徐天德部为额勒登保所败，逃至开江仁市铺，与黄号王光祖会合。三月，清军追打冷天禄于大竹，萧占国、张长庚由阆州逃窜至营山，并斩杀萧占国、张长庚，再杀冷天禄。嘉庆四年，清军庆成，陕西巡抚