留于生态系统中，供给一切生命的需要；另一方面是生态系统中的有机物被各级消费者（动物）摄取，并在转化、唿吸和排泄等生理过程中不断地消耗掉。有机物还可以通过人类的收获、地表水和地下水的流出等方式从系统中输出。生态系统中的分解者（微生物）又把生态系统中的植物和动物残体分解和转化为无机物，归还给环境，供植物再利用。生态系统中的能量和物质每时每刻都在生产者、消费者和分解者之间不停地流动和转化。在生态系统能量和物质的输入量大于输出量的情况下，生态系统的总生物量增加，反之则减少。在自然条件下，生态系统的演替总是自动地