ion::::对细胞的直接破坏.只要病原细菌入侵细胞内，会利用细胞内的养份，并将代谢产物排至细胞内，因此会造成直接的破坏。若病原细菌在细胞内繁殖及分制，细胞会破裂，会释出病原细菌。像大肠桿菌、志贺氏菌属、沙门氏菌属及淋球菌等细菌会引发宿主的上皮细胞以吞噬作用吞噬这些病菌，之后，病原细菌会破坏细胞，并且以逆吞噬作用的方式离开此细胞，进入其他细胞。有些病原细菌会分泌酵素来穿透宿主细胞，本身即为一种破坏。
产生毒素.毒素是一些微生物产生的有毒物质，一般和病原细菌致病的特性有关。内毒素是