1945年任该校教员兼校长。1945年抗日战争胜利，朱洗回到上海，任上海生物研究所研究员、主任，北平研究院生理研究所研究员、所长。不久，应国立台湾大学校长罗宗洛的邀请，又兼任国立台湾大学动物系教授、系主任。1949年春，朱洗从台北返回上海。中华人民共和国成立后，1950年至1952年，任中国科学院实验生物研究所研究员兼发生生理室主任。1953年至1957年，任中国科学院实验生物研究所研究员兼副所长。其间，1955年，朱洗被选聘为中国科学院学部委员。1958年至1962年，任中国科学院实验生物研究所研