政治运动不断。燕京大学由于是教会大学，以“控诉美帝文化侵略，肃清亲美、崇美、恐美思想”为主。随后又开展“知识分子思想改造”。侯仁之在燕京大学属于“可以信赖”的知识分子，率先在全校大会上作示范性检查，并顺利过关。后来，侯仁之递交了入党申请。1956年，中国共产党虽对高级知识分子采取温和政策，但其中的刚性本质仍然很强。如北京大学党委的报告称冯友兰、侯仁之为“投机取巧分子”，认为他们企图混入中共党内。1959年，中共北京市委布置北京市各高校吸收一批老专家入党，由中共北京市委大学部提名，报经中共北京市委同意。北京大