迎回妈祖等众神的时间，则有大正七年（1918年）与大正十年（1921年）两种说法。
鹿耳门圣母庙时期.二次大战后，显宫在民国36年（1947年）建了鹿耳门天后宫，主张开基鹿耳门妈供奉在该庙。民国45年（1956年）8月9日台大杨云萍教授率学生考察，之后为认为郑成功登陆于显宫，且支持显宫鹿耳门天后宫的主张。以此事为开端，引发土城与显宫两地的正统之争。之后庙方在民国49年（1960年）改名为「鹿耳门圣母庙」，以昭显香火传承。民国64年（1975年）圣母庙在今址重建，于次年（1976