兵许定国用计杀害高杰后逃往黄河北岸降清，高杰部下为了洩愤报仇而在睢州一带大肆屠杀，「杀掠无虚日」，导致「睢旁近二百里殆尽」。
常熟.清代小说《海角遗编》（又名《七峰遗编》，作者真实姓名未知）写道，在顺治二年，清军先后占领苏州和南直隶常熟之后纵兵焚烧杀掠。在常熟大屠杀中被屠杀的百姓无法计算，沿河沿岸都是人头。
四川.从顺治三年（1646年）至康熙初期，清朝军队开始侵入四川，开始了清军与明军对峙以及农民军在四川混战的局面：“蜀人受祸惨甚，死伤殆尽，千百不存一二