相当远，它们相似的外型与生活史只是趋同演化的结果。另外有一种黏菌称为，与真菌、动物同属后鞭毛生物，且与核形虫共同组成现生真菌的姊妹群，与现生真菌关系非常密切。不过关于这些生物的研究有时仍被视为真菌学的范畴，出现在真菌学的课本与论文中。、、与原本归属接合菌门，后来发现它们属于动物总界，与现生动物的关系更为密切，与真菌相似的外型也是趋同演化的结果。与曾被认为是一种酵母菌 ，"Ellobiopsis"曾被认为是一种壶菌，两者现在都归属于SAR超类群。历史上放线菌也曾因可以形成菌丝状的构造而被归为真菌，但很