政务院总理周恩来亲自指示，欢迎夏格巴尽快去北京谈判。但是最终由于英国拒绝给与夏格巴赴香港的签证，夏格巴最终未能成行，后滞留印度，此后长期驻噶伦堡。1950年代中期，他和达赖喇嘛的两个哥哥嘉乐顿珠、土登晋美诺布共同致力于整合独立运动的各派力量。1959年藏区骚乱，达赖喇嘛率大批藏民流亡印度，夏格巴被任命为达赖驻新德里的代表，并负责组织西藏福利会，以安顿西藏难民。1959年底，奉命前往美国纽约市，希望促使联合国关注西藏形势。1963年，夏格巴辞去在流亡政府的职务，寓居美国耶鲁大学，致力于《西藏政治史》一书的