事务所设计监造、胜记营造公司负责施工后，于1989年（民国78年）3月2日正式竣工，总修复费用约新台币一千四百九十多万元。自从西雝社成立以来，经由文昌祠的改建一直到民国政府修复为止，磺溪书院经历了各种不同的天灾与人祸摧残，但是因为书院的成立，带给了台中市、彰化县一带的文化教育有很深的影响。
结构.磺溪书院内祭拜有五尊神明文昌帝君、孚佑帝君、文衡帝君、朱衣星君与魁斗星君，合称为「五文昌」，是古时科举时代掌管所有考试的神明。内设有大殿与拜殿，所以俗称文昌祠或文昌庙，建筑的样式属于传