退隐回澎湖行医.之后高植澎退隐，并且在澎湖开设诊所行医。
重出政坛.直到2002年重新于马公市参与澎湖县议员并当选，成为澎湖县唯一的民进党籍议员。2004年高植澎接受民进党征召，参选澎湖县立法委员，但是败于无党团结联盟的林炳坤。