在麻豆设「教会大学」。于1637年4月兴建学校及建筑教员住宅。到1638年2月，除35呎教会场和181呎校舍外，还有教员舍数间。当时信基督教者已达二千人。
郑氏到清治时期.1661年4月，郑成功登陆台湾后，登陆后数日，曾亲率部将杨英等人亲赴包括麻豆在内四社等地勘察。随后谕告官兵、家眷：「准就此处择地起盖房屋，开辟田地，尽其力量，永为世业」，唯其先决条件「不许混圈土民及百姓现耕田地」。而从《梅氏日记》中，可看出郑氏的拓垦活动刻意避开麻豆等社的态势。当时自茅尾港（今下营区）到诸罗山（今