到1925年。伴随着苏联领导人的更替，新经济政策逐渐被放弃。1928年，康德拉季耶夫被免去研究所领导职务，1930年7月被逮捕，罪名是参加了一个可能不存在的非法的农民劳动党。他被判处8年徒刑，服刑期间，他继续研究并试图完成5本新书。1938年，随着大清洗高潮来临，他最终被处死，终年46岁。50年后，1987年7月16日，他得到了平反。