皇驾崩之后，朝廷才承认足利义澄的将军之位。政变发生后，细川政元派人出兵河内国，击败了足利义材。畠山政长自杀，足利义材持足利将军家的两件传家宝：甲胄「御小袖」和「御剑」，前往细川政元家臣上原元秀的军中投降。随后义材被押往京都，幽禁在龙安寺。在此期间，日野富子指示毒死义材，但失败了。
流离诸国和回到京都.足利义材在幽禁期间，得知自己将被流放到小豆岛，同年6月29日在侧近人的帮助下逃离京都，到达畠山政长的领国越中国的放生津，并受到了政长家臣神保长诚的保护，在该地区竖立幕府，称为「越中