计划的保密形势是很严峻的。对于曼哈顿计划的民间猜测甚至开始于计划之前，因此在1939年二战爆发之后，美国政府便停止了所有公共媒体对于核研究计划的刊载和讨论，并要求国家科学院以及其他媒体驳回前先所刊登的关于原子理论及核研究的讨论，并避免了一切含有类似「铀」、「中子」、「原子武器」等字眼的文章。曼哈顿计划的规模巨大，参与人员众多，光是前后参与计划的美国人总数都高达六十万，而且计划分散在田纳西州，俄亥俄州，新墨西哥州和华盛顿等地秘密进行。如此庞大而且分散的计划，光靠限制媒体的措施肯定是远远不够的。参与人员