警队协助重整警队工作，并于1945年至1948年间担任警察学堂教官，短短3年间亲手培训约2,000名学警，更于1947年获得时任香港总督杨慕琦爵士嘉许。1948年，他获指派筹设铁路警察，同时担任铁路警察指挥官，对铁路警察的早期运作奠下基础。方奕辉其后调往新界，于大埔警署服务，复于1950年6月获英廷颁授殖民地警察劳绩奖章（C.P.M.），其后又于1953年6月获得英女皇伊利沙伯二世加冕奖章。1950年9月，方奕辉与另一华人警官获警队挑选，保送往英国伦敦市郊的亨顿警察学院接受为期六个月的警务培训，1951