成了起义头功。后民国建立，参加了二次革命，曾被补，为光复会同人救出。袁世凯死后，沈祖緜回国，先后去山东、山西、江西勘察煤矿工作。其后执教沪上，1923年定居苏州，着述讲学。1939年，抗战期间，因避日伪胁迫，寄寓上海友人家坚持到抗战胜利。此后，在上海与马叙伦、王绍鏊诸友，积极参与民主活动。沈氏亦曾在原新四军有关组织开办的长江商行任董事。1949年，中华人民共和国成立后，毛泽东和周恩来亦有谘询沈祖緜有关民主党派的数量。沈氏先后担任江苏省和苏州市政协委员。由于沈氏精研易学，亦被聘任中国科学院历史研究所特约研