武昌起义爆发时，其统制是吴禄贞。11协协统李纯，12协协统吴鸿昌，参谋官张联棻。1911年11月7日，吴禄贞被马步周暗杀。之后，李纯接任六镇统制，参加南下镇压辛亥革命军事行动。民国之后改名为陆军第六师，李纯任师长，1913年率部进入江西参加镇压二次革命，后任江西都督，再后江苏都督。李纯为冯国璋的嫡系。李纯都江西后，马继曾继任六师师长。护国战争时期六师进军湘西，因遭贵州护国军强烈，马继曾兵败，于湖南省麻阳县自杀，第11旅旅长周文炳升任。不久周亦兵败，患上精神病，乃由第12旅旅长齐燮元升任。