972年到1976年间，王甲乙帮助院长钱国成寻找地方新建最高法院大楼，但该新建计划遭到行政院反对，託辞“即将反攻大陆”，无需再新建大楼”，于是仅在如今的司法大厦加盖一层楼，形成如今的四层楼，这新加的一层楼作为最高法院的院址。1976年，行政院改组，汪道渊接任司法行政部部长。1976年12月8日，王甲乙任司法行政部常务次长。1979年8月1日，任司法行政部政务次长（部长为李元簇）。在司法行政部期间，王甲乙参与了《刑法》及《民法》的修正。1980年，实施“审检分隶”，司法行政部改为法务部，王甲乙仍任政务次长