生物染色剂是利用加入对细胞中特殊物质(如DNA，蛋白质，脂质，糖类等)具有选择性的染剂，借以区别特殊物质。与萤光标示类似。染剂和色素常用于生物学与医学以标示身体上的特殊构造如(肌纤维)，细胞的分佈(例如区分不同的血球)，或细胞内部的胞器。生物染色剂也用于电泳时标示蛋白质、核酸等物质。
例子.孔雀石绿：可用作生物染色剂，把细胞或细胞组织染成蓝绿色，方便在显微镜下研究。
用途.作为生物染色剂