生病，请求归养获准。还朝，授吏科给事中。随后其赶赴大同调查战事，并弹劾巡抚洪汉、中官刘云、总兵官王玺等人，均获罪。内使刘雄因仪真知县徐淮不整治食宿供应而迁怒，向南京守备中官举报，徐淮被逮捕下诏狱。许天钖与御史冯允中论救，改为调往边疆县令。此后，御史文森、张津、曾大有因言下吏部监狱，崔志端由道士擢尚书等，许天钖均力争。明武宗即位，许天钖因灾异上疏，请求皇帝痛加修省，广求直言，迁工科左给事中。正德元年（1506年），出使安南，途中升都给事中。正德三年（1508年），完成任务回朝，见朝纲大变，敢言者皆遭贬斥，