至元二年（1265年），废彭城、萧、永固三县入州。至元八年（1271年），徐州隶归德府。至元十二年（1275年），分徐州复置萧县（故萧、永固二县辖境），为州之属县。至正八年（1348年），升徐州为徐州路。至正十三年（1353年），降徐州路为武安州，复属归德府。
明清.龙凤十二年（丙午岁，1366年），朱元璋佔领武安州，复名徐州。吴元年（1367年），割济宁路沛县、丰县、砀山县属徐州。明朝洪武元年（1368年），降归德府为开封府归德州，徐州改属开封府，割济宁府鱼台县属徐州。洪武二