由舟山港海通客运有限公司运营有舟山到上海吴淞港、福州马尾港、南通等港口的航线。
港内客运.由舟山海峡渡轮集团有限公司运营有宁波白峰码头至舟山鸭蛋山码头航线，舟山小沙镇至舟山长白岛，舟山三江码头经舟山岱山岛双合码头至舟山小洋山（洋山深水港）航线。由岱山县蓬莱客运轮船有限责任公司运营有宁波镇海经舟山岱山岛高亭码头、舟山衢山岛衢山码头至舟山小洋山（洋山深水港）航线。由舟山港海通客运有限公司运营有舟山普陀山至舟山沈家门、朱家尖，舟山定海至舟山六横，舟山沈家门至舟山桃花、六横等航线。Se