建政以来规模最大、组织最严密的分裂集团武装叛变，涉案人数达五千人；1975年8月，因文革动乱中共中央从宽认定，除暴乱中已遭击毙之外，其他1165名东突党成员以「政治错误」改判非该党党员，给予减刑或释放。中国政府也被指控利用维吾尔难民非法在挪威、德国和美国进行间谍活动，视图监视散居海外的维吾尔流亡人士从中挑拨离间，或威逼利诱从事间谍活动。2009年瑞典因此驱逐了一名中国外交官，2010年间谍梅苏特（Babur Maihesuti）遭瑞典判刑。2016年中国在新疆地区开辟新式集中营，拘禁12万名以上的穆