清朝雍正七年（1728年）。当时，蒙古准噶尔部侵入西藏，藏区秩序混乱。为了加强西藏高层人士同中国内地的联系，清朝政府特在干宁（原称“泰宁”）修建寺庙。清朝政府为建该寺拨库银40万两，并动用了大批工匠，建成了这座仅僧舍便有千余间的大型寺庙。寺庙建成之后，雍正帝钦定寺名为“惠远寺”，并题写了“惠远寺”的匾额，又派1800名官兵驻守该寺。寺院建成后，雍正帝派人迎请七世达赖到该寺居住以避难，七世达赖在该寺驻锡七年（1728年至1735年）。雍正帝特派担任理藩院主事的果亲王允礼、国师章嘉唿图克图到惠远寺经办七世达