代谢网络（）是完整的一决定细胞生理学和生物化学属性的整套代谢与物质过程。这些网络包含了代谢的化学反应以及指导这些反应的调整性相互作用。随着基因组测序完成，重建从细菌到人类的有机体中的生化反应网络现已成为可能。一些代谢网络已经上线：京都基因与基因组百科全书（KEGG），EcoCyc ，BioCyc 与metaTIGER 。对于学习及代谢建模来说，代谢网络是十分强大的工具。
用途.代谢网络可用于检测患病患者的合并症模式(comorbidity patterns)。 某些疾病，如肥