族馆和动物园曾经试图来饲养港湾鼠海豚。但是由于港湾鼠海豚对环境的要求高，而且比较容易生病因此它们不适合于饲养。大多数饲养的港湾鼠海豚在数周内就死了。因此今天港湾鼠海豚几乎只有在科研机构里才有饲养，此外只有因为受伤或者偶尔被捕的动物被饲养。1862年在伦敦和1864年在汉堡市是最早试图饲养港湾鼠海豚的。1914年布赖顿和1935年柏林也尝试过。在所有这些尝试中被饲养的动物均在数日内就死了。在伦敦港湾鼠海豚在运到时就已经很虚弱了。当时人们试图用烧酒来加强它，但是它在此后数小时内就死了。在1970年代里随海豚