成归国，投冯玉祥，历任第十六混成旅二团一营少尉书记官、河南督军署军法科长、陆军检阅使署军法处处长、西北边防督办署军法处长等职务。1926年11月，邓哲熙赴苏联莫斯科，任冯玉祥部驻苏联的代表。1927年6月，邓哲熙归国，任河南省司法厅厅长，后来调任河南高等法院院长。1927年冬，邓哲熙任河南省民政厅厅长，代理河南省政府主席。中原大战期间，邓哲熙作为冯玉祥的代表，参加了汪精卫主持召开的扩大会议。1930年9月中原大战结束，冯玉祥部瓦解，邓哲熙赴北平隐居。1933年，冯玉祥在张家口组织察哈尔民众抗日同盟军