司与华纳兄弟母公司时代华纳合并，汉纳巴伯拉动画最终并入华纳兄弟动画公司。巴伯拉和汉纳继续在新公司担任顾问，并一起定期制作新节目，其中包括多部《动画秀》短片，还有1994年上映的《摩登原始人》电影版《摩登原始人之摔跤赛攻击波》（）和2002年发行的《史酷比》。此外，巴伯拉还曾在2000年制作的《猫和老鼠：宅猫》（）中为房主配音。2001年3月汉纳因咽喉癌去世后，汉纳巴伯拉动画终于并入华纳兄弟动画公司，原本为卡通频道制作原创动画系列剧的部门分拆成卡通网络工作室。巴伯拉成为华纳兄弟的执行制片人，继续活跃在