任的殷景仁与当政的大将军、彭城王刘义康之心腹刘湛之间矛盾已经很明显，觊之不想和景仁继续共事，遂以脚疾为由辞官。觊之在家之时常常夜间在牀上不断移动双脚，家人都不明白。元嘉十七年（440年），宋文帝翦除刘义康的党众，不少依附刘湛的官员都受祸。顾觊之后出任东迁令，后转山阴令。山阴县其时有三万户人之多，属于多事务的县邑，以前出任山阴令的人即使不休息也做不完公务，但觊之以简约方式处理繁务，令得县内无事，日间也没甚么人前来问事，终宋一代的山阴令中就只有他和江秉之能够这样。后又回到扬州州府中任治中从事史，又先后当广陵