隶台北市政府文化局。1999年8月18日，台北市政府订定发布《台北市文献委员会组织规程》。1999年11月6日，台北市文献委员会正式改隶台北市政府文化局，主任委员由台北市政府文化局局长兼任。2003年5月19日，台北市文献委员会会址迁至台北市大同区承德路二段33号6至7楼（建成大楼）。2009年2月25日，依台北市政府文化局业务协调分工，原由台北市政府民政局主政之《文化资产保存法》「民俗及有关文物」登录等相关业务移交台北市文献委员会办理。2012年4月18日，台北市政府核定，建成大楼为高氯离子混凝土建筑