1997年6月，舟嵊要塞区与舟山军分区合并，改编为舟山警备区。1998年8月，浙江陆军预备役步兵第一师作为全军第一个省建师，更名为浙江陆军预备役步兵师，并扩大组建范围。2016年，在深化国防和军队改革中，浙江省军区由中国人民解放军南京军区转隶中央军委国防动员部，成为国防动员单位。2017年，在深化国防和军队改革中，省军区机关由原来的司令部、政治部、后勤部、装备部，调整为办公室、政治工作局、战备建设局、国防动员局、保障局。（中共浙江省委书记兼）