在本站大堂内、C和D出入口旁均设有不同类型的商店。此外，也有自助服务设施供乘客使用，包括自动柜员机、自动售卖机以及香港邮政邮箱。另外，大堂非付费区并设有「会员服务站」，供乘客享用港铁友礼会的会员优惠。
月台.上水站设有2个侧式月台，并不设月台幕门。月台中央设有扶手电梯连接大堂，而在月台两旁均设有紧急出口。
出入口.上水站设有10个出入口，而当中A1、A4、B、E出入口则连接区内行人天桥网络通往邻近商场、住宅等设施。而在各个车站出入口，均设有指示牌显示出