属内物种的羽毛差异，它们一直要到1953年才被确认是一个物种。爪哇鹰鵰是最稀有的勐禽之一。估计它们是一夫一妻制的。鸟巢会筑在树顶。雌鸟每次会生一颗鸟蛋。它们主要吃鸟类、蜥蜴、狐蝠科及哺乳动物。爪哇鹰鵰是印尼的国鸟，在国内有时被称为印度教及佛教的迦楼罗神秘生物。由于持续失去栖息地、群落细小、有限的分佈地及在某些地区被猎杀，爪哇鹰鵰被世界自然保护联盟评为濒危。它们也被列为《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录二所保护的物种。