于是命令军士胁迫种劭。种劭发怒，声称有诏令，大声斥责，军士四散，种劭责备董卓，董卓理亏，于是退军夕阳亭。何进失败后，汉献帝即位，拜劭为侍中。董卓既擅权，厌恶种劭彊力，把他降为议郎，出任益凉二州刺史。由于父亲战死，种劭不到职，守丧期满后，征召为少府、大鸿胪，但种劭都不接受。种劭说：「昔日先父以身徇国，作为臣子，不能除残复怨，有何面目朝觐明主！」兴平元年（公元194年），种劭外联马腾、韩遂，和议大夫马宇、左中郎将刘范作内应，共攻李傕、郭汜，以报其仇。与郭汜战于长平观下，军败种劭等皆死。