台湾，由于以年轻族群为主的人士担忧该协议签订前对民间沟通不足，因而导致两岸服务贸易协议存查争议与太阳花学运的发生，也使该协议在台湾社会造成广泛的争议和讨论。
法律关系.目前两岸双方的法律都不承认对方为一个拥有完全主权的国家。中华民国宪法第4条规定：「中华民国领土，依其固有之疆域，非经国民大会之决议，不得变更之。」宪法增修条文前言有：「为因应国家统一前之需要……」中华人民共和国宪法序言中亦有：「台湾是中华人民共和国的神圣领土的一部分。完成统一祖国的大业是包括台湾同胞在内的全中国人民的