头骨也很独特，因为牠们的下颞孔消失了，使牠们看起来像是阔孔类爬行动物的头骨，所以三稜龙类最初跟楯齿龙目、鳍龙超目一起被归类于阔孔亚纲。在1988年，Robert L. Carroll提出下颞孔消失是为了使头骨强化。到目前为止，三稜龙的化石发现于北美与欧洲的晚三叠纪地层。