马师抓捕夏侯玄等人，并将他们皆夷三族。下狱时，廷尉钟毓之弟钟会意欲与他交友，被他拒绝。夏侯玄后在东市被处刑，死前神情自若，面色不变，享年四十六岁。据传相貌英俊，与嵇康、潘岳等人同为魏晋时期的美男子。在文学上颇有造诣，着有《乐毅论》，因后来为“书圣”王羲之所书写而传于天下。他与一些当时俊士合称「四聪」，和诸葛诞等八达及刘熙等三豫共十五人并称，皆遭明帝以其鼓吹浮华之风而贬黜。又与何晏、王弼二人同属当时社会所称的“士派”，玄、晏、弼三人据说是中国服食药散的祖师。