当时的武汉大学、华中理工大学、武汉水利电力大学、中国地质大学和武汉测绘科技大学签署了联合办学协议。协议规定这5所学校的校本科二、三年级学生可在5所高校之间相互选课、辅修专业和修读双学位。这一时期被称为第一阶段联合办学。2000年高校体制调整后，武汉水利电力大学、武汉测绘科技大学与武汉大学合并成立新的武汉大学，华中理工大学与同济医科大学等学校合并成立华中科技大学。在这种情况下，五校联合办学变为三校联合办学。2001年经华中科技大学提议，开展由武汉大学、华中科技大学、武汉理工大学、中国地质大学、华中师范大学