1519年被选为新大陆第三批考察队的队长，他也资助了这次考察队部份的资金。。和古巴总督迪亚哥·委拉斯开兹·德-库埃里亚尔之间的敌意，让他在要出发前的最后一刻被召回，而科尔特斯没有理会这次的召回。科尔特斯到达新大陆后，採用了一个成功的策略，他和一些美洲原住民结盟，和其他的美洲原住民作战，他也用一个原住民女子马林切（唐娜·玛丽娜）为翻译，后来也生下他的第一个儿子。当古巴总督发佈派遣使节要逮捕科尔特斯时，科尔特斯和他们战斗，利用额外部队作为增援的情形下战胜了他们，科尔特斯直接写信给西班牙国王，希望国王直接