如愿寡不敌众，只好与部下杨忠弃城南下投奔梁朝。三年后返回长安，因自己兵败东魏，又弃城奔梁，上书给西魏文帝请求治罪。文帝免其罪，官复原职。大统三年（537年），独孤如愿跟从宇文泰出征东魏，在沙苑大败高欢亲率的10万大军，被封为河内郡公。不久他与冯翊王元季海一起统兵两万直逼洛阳，并占领了金墉城。大统十二年，拜大司马。独孤如愿兼通文武之道，不仅是一名英勇善战的武将，也是一位长于治理地方的官员。在坐镇陇右，任秦州刺史的近十年中，“事无拥滞。示以礼教，劝以耕桑，数年之中，公私富实，流人愿附者数万家(远近跑来归