陆军军官速成学校创设，王陵基自拉萨回到成都，担任该校翻译官。当时，四川省的保路运动发生，革命派活动积极，但王陵基拒绝了革命派的劝诱。中华民国成立后，王陵基继续留在川军并升任团长。1913年（民国2年），二次革命爆发，王陵基奉四川都督胡景伊之命击败了在重庆起义的革命派的熊克武。1915年（民国4年）12月，护国战争爆发，王陵基被任命为四川督军陈宧手下的川军第1师第4团团长，同护国军作战，很快升任第3师第5旅旅长。1916年（民国5年）5月，陈宧倒向护国军方面并发表四川独立宣言，王陵基转而投靠支持袁世凯的川