9年香港甲组足球联赛，深圳队由此创造了一项记录就是成为首支同时征战内地和香港联赛的球队（后来有成都谢菲联效仿）。但由于俱乐部整体财力不足，导致球队被迫在香港常驻，无法使用在深圳的训练场地，训练质量难以保证，参赛成绩亦不甚理想，最终位列榜末而需降级到香港乙组足球联赛。随着降级二队也于09年夏退出香港联赛。2009年1月，前深圳队94年建队元老球员范育红的南山少年足球倶乐部以提供训练基地及队员的方式入股深圳队，故此南山足校9192年龄段的队员（南山区一队）补充进入深足一线队和预备队，9394年龄段（南山区二