企业对企业（B2B）是中国电子药房商务的主要发展趋势。虽然B2B电子药房商务的交易量仅佔药房总销售额的一部分，但有很大的发展潜力。目前B2B电子药房商务每年以300％的速度增长。在2003年，电子药房商务的交易量估计佔总数的10％。此外，越来越多的信息技术和其他行业领先公司已将其投资转移到制药行业。其中一个例子是方正科技，这是一家信息技术公司，它在制药和医疗卫生领域的投资总额为3.63亿美元。广州市白云山医药拨出专款1,200万美元，用于启动一项外用药的项目，用来补充原有4,800万美元的抗生素项目的投