艾尔米斯（Randall Benjamin Irmis）叙述、命名了模式种强森氏钉头龙。属名由希腊语的ἄκαινα／"akaina"（意为「钉刺」，象征头部的刺甲）与κεφαλή／"kephalè"（意为「头」）所组成。种名纪念清复化石的强森先生。正模标本UMNH VP 20202发现于凯帕罗维兹组地层，年代属于坎潘阶晚期，根据锆石定年算出的结果为7597万年前。标本是一具带有头骨的部分骨骼，包含：完整的头骨与下颌（包括前齿骨）、四节背椎、八节荐椎、八节可动的尾椎、十一节尾椎构成尾槌的支撑把柄、尾槌本身