6点44分，首批-29轰炸机抵达新加坡海军基地上空。轰炸十分精准，领队轰炸机投下的炸弹距干船坞的沉箱坞门不到15米。第三架-29轰炸机的炸弹也落在附近，其他飞机很多都直接命中干船坞，令其运作瘫痪三个月。落在干船坞内及附近的炸弹还导致基地正在维修的142米货船受损，部分正在船坞和附近工作的平民无法逃离而被炸死，空袭还令海军基地内的其他设施受损。轰炸新加坡海军基地的共有53架-29轰炸机，七架袭击庞卡兰布兰丹炼油厂。日方高射炮或战斗机基本没有向来袭轰炸机开火，但还是有两架-29轰炸机因事故损毁。此次空袭创下日间