各种不同大小的分子。不同大小的分子在胶体电泳之后，会分离而散佈在胶体上不同的位置。接着，这些DNA分子可以利用虹吸作用，转染到一个薄膜上，经由DNA变性使它们的双股分开。因为双股DNA已经固定在薄膜上，所以变性后无法再形成双股螺旋；然后将上述薄膜暴露在杂交探针（probe）里，让探针和DNA杂交（hybridize）。探针是会产生放射线、或可以放出颜色或萤光的物质标记的单股DNA或核糖核酸（RNA）片段；最后是观察结果。薄膜上可以侦测到放射性或者萤光讯号的位置，就是含有可以与探针核酸序列进行偶合的去氧核糖核