务部所公布之调查报告中，并无任何违法部分。2008年爆发陈前总统国务机要费案后，前调查局长叶盛茂声称曾在2008年2月初携带艾格蒙联盟相关公文面呈陈聪明。陈聪明严词否认，后叶盛茂在2008年10月14日庭讯时，当庭承认并未将相关公文交给陈聪明。立法委员吴敦义在2008年9月24日立法院质询时，爆料陈聪明曾于检方搜索陈前总统住宅当天凌晨前往黄芳彦住处，但于两日后承认自己爆错料。特侦组侦办陈前总统案件时，反不断遭到绿营人士质疑司法不公。2010年1月5日，监察院弹劾检察总长陈聪明一案，在一名监察委员请假，六