内地出发，但并未抵达目的地，因为北洋政府仍不想违反《中俄蒙协约》。1919年初期，贝加尔湖地区白军将领格里戈里·谢苗诺夫建立了一支部队，意图在蒙古建立政权。8月，外蒙古外事人员请求陈毅支援一支应对谢苗诺夫的部队。1919年11月7日，中华民国大总统徐世昌和国务总理段祺瑞决定出兵外蒙，派皖系将领徐树铮率兵进入外蒙古库伦，挟持“内阁理”巴德玛多尔济，软禁哲布尊丹巴活佛，并召陈毅回京，全面否定《中俄声明》。11月17日，外蒙古正式上书中华民国大总统徐世昌，呈请废除俄蒙一切条约。南方孙中山护法军政府亦致电庆贺。