台北设立太平洋盆地贸易推广暨谘询办事处。但在1989年关闭。1994年3月3日，复于台北设立同等性质的秘鲁驻台北商务办事处（西班牙文：）。
事件.2020年3月，对于2019冠状病毒病疫情在全球扩散，秘鲁政府于16日宣布进入国家紧急状态，限制人民行动与民用航空起降，导致约150名台湾旅客滞留秘鲁无法出境。驻秘鲁台北经济文化办事处协调、秘鲁军方、秘鲁南美航空与台湾雄狮旅行社，在取得飞行许可后，首架包机将72名台湾旅客送离秘鲁。至于第2架包机则考量滞留的台湾旅客人数有限，单独包机成本过