马来西亚日本人，是指移居马来西亚的日裔族群。日本人于19世纪末期起开始移居英属马来亚。
历史.自足利幕府开始，日本商人已与马来亚人接触。其后由于德川幕府实行锁国政策，日本人与马来亚人的接触亦开始减少，只有琉球群岛商人仍然继续与马六甲人接触。1911年人口普查时，有2,029名日本人在马来亚居住，其中五分之四为女性。但另有史料指出居于马来亚的日本人达四千人。北婆罗洲（今沙巴）的山打根是日本移民的热门目的地。山打根的日本人墓地是现时少数保留的日裔遗址。1941年12月，日本佔领马来