继承引退的父亲而返回鎌仓，六波罗探题的职位则由其弟担任，长时自己则成为评定众，并且在同年7月获任命为武藏守。按《吾妻镜》记载，建长8年（1256年）11月22日，时赖虽然患病，却没有让出执权一职予其嫡子时宗，而是意外地让给长时，并且同时领授武藏国务、侍所别当和鎌仓小町的别屋敷，然而时赖康复后却重掌实权。正元2年和文应元年（1260年），长时虽然代表身患痢疾的宗尊亲王参与在鹤冈举行的放生会，但是长时自己在年末时亦受到病魔缠绕。文永元年（1264年）7月3日，长时因病辞去执权职务并且出家，由叔父北条政村继任