。1961年，调任技术局主任工程师兼科技处副处长。1962年1月，任技术局主任工程师兼科技处处长。1963年任技术司副总工程师。陈其谔的造船技术及英语、德语水平都很高，在造船方面对国家作出了较大贡献。文化大革命前，他作为先进知识分子代表受到国家主席刘少奇的接见，并有与刘少奇主席握手的照片。1964年在大连港四清工作团工作。1965年在上海船研所四清工作队工作。1966年至1969年任技术司科技处处长。文化大革命期间，陈被打成走资本主义道路的反动学术权威，受到了不公正的批判，于1969年5月到吉林敦化