一週后，行政院院会通过开放大陆探亲政策，两岸人民恢复往来。虽获蒋经国赏识，洪立委依旧抨击政府以「汉贼不两立」为由拒绝出席1987亚银年会等国际会议。1992年更在院会质询郝柏村时要求改变「一中政策」并主张「双重承认」，承认「中华人民共和国」为独立于中华民国之外另一国家之事实（媒体称之「两个中国」），惟不为当时李登辉政府所接受。1998年姚立明、郝龙斌、高惠宇为首的新党「十人小组」亦提出「一中两国」，同遭反对而夭折。直到1999年李登辉总统提出「两国论」为止，洪昭男可视为是国民党内推动「双重承认」的主将之