民国成立后，出任总统府财政顾问。1913年（民国2年），当选参议院议员。同年12月，任中国驻日本全权公使，到日本赴任。翌年秋，日本山东出兵，陆宗舆秉袁世凯之意，向日本方面转达了中国的中立立场。1915年（民国4年）1月，大隈重信内阁突然向袁世凯提出二十一条，外交部次长曹汝霖在北京同日本驻华公使日置益交涉。另一方面，陆宗舆奉命在东京同日本外相加藤高明会谈。5月25日，最终袁世凯接受了日方要求。同年，袁世凯称帝，陆宗舆奉命同大隈内阁交涉，秘密争取日本对袁的支持。但随后，袁世凯在护国战争中处境不利，大隈内