2001年5月，因应政府组织改造，「东部发电处」改组成「东部发电厂」，旗下多座发电厂亦改称为发电机组，铜门发电厂也自此改称为东部发电厂铜门机组。并且完成自动化遥控机组工程，在铜门机组设立铜门副控，控制清水机组、清流机组、铜门机组、榕树机组、初英机组、溪口机组与其发电水坝进水口闸门的开关。2014年5月，因应东部发电厂组织及人员精简，铜门区域控制中心正式裁撤，原副控功能转移至花莲市区的厂本部继续远端遥控各机组。
设施.铜门发电厂是一座地下化水力发电厂，主要是因为木瓜溪上游山区地