有一个逻辑分区、支持最大64MB的硬盘。在MS-DOS 3.3（1987年8月）这个限制更改到24个分区；它可能来自于强制性的C:-Z：的磁盘命名规则。逻辑分区表使用盘上的数据结构来描述，可能是为了简化编码它与主引导记录非常相似，并且它们组织成类似于俄罗斯套娃那样的结构。一颗硬碟中只能有一个扩展分区。在扩展分区观念导入之前，一些硬盘控制器（当时採用独立的硬碟控制卡，IDE标准尚未出现）能够将大硬盘显示为两个独立的硬盘。
最终的FAT16.1987年11月，我们今天称之为"FAT