他受命平定博因河战役后的爱尔兰叛军，出色地攻克了南端海岸的科克与金塞尔（Kinsale），把叛军压缩在西部地区，并切断法国海军与爱尔兰天主教徒的联系，使得国王对他刮目相看。虽然威廉三世认可邱吉尔优秀的战略天份与指挥技术，但是威廉三世拒绝授与他荣耀的嘉德勋章和军械总局局长（Master-General of the Ordnance，相当于战争部长）的职位，宁可在着名的陆军主帅兼军械局长绍姆贝格（原是喀尔文派的法国元帅，因太阳王废除南特诏令，转投普、荷）于1690年阵亡后，暂时出缺，也不愿让唿声最高的邱吉