结合的强度因辅酶和酶的种类而异，或强或弱。辅酶能够将化学基团从一个酶转移到另一个酶上。NADH、NADPH爲两种常见的辅酶。核黄素、硫胺、叶酸等维生素类辅酶人体不能合成，需要通过膳食补充。辅酶能携带化学基团，如NAD或NADP能携带负氢离子、ATP能携带磷酸基团、辅酶A能携带乙酰基团、叶酸基团能携带甲酰基、次甲基，或甲基、S-腺苷甲硫氨酸能携带甲基。辅酶在酶促反应发生后化学结构会发生改变。因此，可以将看作一类普遍存在的特殊底物。许多酶都有与之匹配的辅酶，2015年已知大约1000种酶使用NADH作爲辅酶