中国国民党独裁统治下的台湾出现民主化和人权这两股潮流权，而民主进步党为此提供相当的贡献并且受到社会支持，但是在转而成为执政党后并没有因而让民众感到实现理想。不过有鉴于对中国国民党掌握立法院多数的忧虑，使得林义雄对于2006年12月举办的2006年中华民国直辖市市长暨市议员选举上仍表态支持民主进步党提名的台北市市长候选人谢长廷、高雄市市长候选人陈菊等友人，并且认为民主进步党相对来说仍然是具有进步价值的政党。2008年时林义雄则决定出面劝进蔡英文参选民主进步党主席，并且亦唿吁民众支持2008年台湾入联公民投票和