清朝时，康熙十九年（1680年），郧阳抚治都察院被撤，南阳府同知移驻淅川。嘉庆七年（1802年），荆紫关镇已成为商业重镇，为加强管理，设副将、都司等军事长官；1827年，荆紫关镇增设副将一名，守营千总一名，同时在荆紫关镇南夯建土城，在李官桥镇设千总一员；道光十二年（1832年）淅川县升为淅川厅，设同知，属南汝光淅道；咸丰七年（1857年），捻军首领姜太林率部进攻李官桥镇，杀富济贫；清穆宗同治元年（1862年3月5日）太平天国军由内乡攻入淅川，包围县城，数日未克，转而西进，攻占荆紫关镇；1864年3月19日，