丹马末沙逝世后，其三子阿拉乌丁二世继承王位，在1530年返回柔佛建立苏丹政权，继续展开复国战争。葡萄牙佔领时期，葡萄牙人在文打烟的同一战略要地建造了一座名为Fortaleza de Muar的堡垒，以保护麻坡免受荷兰人和亚齐人的袭击。此古堡后来在亚齐苏丹国佔领麻坡时被摧毁。到了荷兰时代，柔佛王朝因为与荷兰政府的关系良好，让柔佛政权可以在一连串与葡萄牙的战争伤害中得到喘息。柔佛王朝开始大肆发展。但是好景不长，1782年荷兰因为越界收取税务激怒了当时的柔佛苏丹拉惹哈芝（Raja Haji）。以致拉惹哈芝