中只能有一个扩展分区。在扩展分区观念导入之前，一些硬盘控制器（当时採用独立的硬碟控制卡，IDE标准尚未出现）能够将大硬盘显示为两个独立的硬盘。
最终的FAT16.1987年11月，我们今天称之为"FAT"的格式最终到来，它在康柏DOS 3.31中去掉了磁盘扇区的16位计数器。这个结果曾经一度被称为"DOS 3.31大文件系统"。尽管看起来磁盘上的变动很小，这个DOS的磁盘代码都必须检查并转换到32位的扇区数，由于它完全是16位的汇编语言这样一个现实，这项工作就变得非常复杂。