中毒有约5％的情况于8-9小时后死亡，但及时诊断和使用阿托品可以完全避免。阿托品是毒蕈碱的特效解毒剂，其它解毒剂还有东莨菪碱和。
代谢.毒蕈碱代谢相关研究缺乏，目前认为其可能在体内不被代谢。毒蕈碱与突触后膜的受体结合而不能被乙酰胆碱酯酶降解，从而持续刺激神经细胞，这或许是造成其毒性的原因之一。毒蕈碱易溶于水，最有可能的方式离开血液的方式是通过肾脏从尿液排出。
应用.作为蕈毒硷型乙醯胆硷受体的激动剂，毒蕈碱用于治疗青光眼，术后肠梗阻，先天性巨结肠，尿潴留和口干