鸟种类不同，孔子鸟的存在历史超过1500万年，就是热河组地层的形成时。这些表明，孔子鸟相比与之竞争的鸟类虽然在飞行方面略逊一筹，但在身体构造方面却更先进一些。从中还可看到进化的轨迹，直到九佛堂组的形成之前，反鸟亚纲一直在其在白垩纪灭绝之前主宰着多个生态系统。有趣的是，比起孔子鸟，与始祖鸟更相似的原始热河鸟（"Jeholornis prima"）直到热河组形成末期才出现。