因突变而得以耐受化学农药，或感染具抗性的水稻品系。防治稻热病需要许多措施多管齐下，包括移除作物的稻秆、残株以避免稻热病菌的孢子残留于其中越冬，以及多栽种对稻热病菌抗性较高的水稻品系、施用药剂消毒、避免过度施肥与定期灌溉等。等农药已被证实可抑制稻热病菌的附着器穿透植物组织，而避免感染。
重要性.稻热病菌造成严重的稻作感染，因水稻为重要的食物来源，稻热病的影响层面甚广。目前已有85个国家存在稻热病菌感染，每年损害的稻作足以供6000万人食用。稻热病菌从未在任一地区被完全清除。