广州及香港两地校舍次第回收。澳门方面，继续以分校形式留设小学，由赵璧兰（黄启明校长遗孀）出掌主任。1947年，澳校重设初中。1949年，为庆祝成立十周年纪念，特新建教室四间。
现代.1950年，原迁澳之「私立广州培正中学澳门分校」正式正名为「澳门培正中学」，李炎玲出任校长。1953年，李炎玲校长调职，傅渔冰接任校长，并于同年开办高中。1962年，傅渔冰校长离职，林湛继任校长。林湛校长在任期间，因澳门受经济衰退及社会动盪不安的时局影响，师生合力在困难中谋求发展，以