任车臣共和国总统的焦哈尔·杜达耶夫发表了独立宣言，但俄罗斯联邦拒绝承认其地位。1992年5月25日，杜达耶夫政权与俄罗斯签署了《关于撤军和车臣共和国与俄罗斯联邦分配财产条约》。根据这个条约，俄罗斯联邦一切行政机构全部撤出车臣。 1992年12月10日印古什共和国与车臣共和国分开。1994年，俄罗斯总统叶利钦指派俄军大举进攻车臣，即为第一次车臣战争。这是一场造成超过十万人死亡的战争惨剧。之后，双方的冲突不但一直没有平息，还让车臣的伊斯兰原教旨主义分子得势。结果针对莫斯科的恐怖袭击不断发生。1999年，