”最直观的理解是指《新世纪福音战士》中出现的各种各样的使徒（Angel）。作为《新世纪福音战士》实际制作人的大月俊伦对这首歌很重视，刻意让作词者与作曲者在完全未碰面的情况下制作乐曲。《残酷天使的行动纲领》的歌词，尤其是其中的一些宗教和哲学用语，侧重对圣经和母亲形象描述，目的是与TV动画的剧情配合。《残酷天使的行动纲领》间奏的歌词语意不详，可能是某个地区的古文；一般认定间奏所表达的语音如下：新世纪福音战士音乐专辑中收录有多个版本的《残酷天使的行动纲领》。其中，由高桥洋子演唱的共有6个版本，分别是：