考纳斯开始变得突出，因为它位于贸易路线的交叉路口，又是一个河港。考纳斯在1441年加入了汉萨同盟，汉萨商人开设了办事处。到16世纪，考纳斯设立了公立学校和医院，是立陶宛大公国最好的城镇之一。在1665年，该城曾数次遭受俄国军队袭击，在1701年又被瑞典军队占领。在1657年和1708年，黑死病 袭击了该地区，1731年和1732年，火灾摧毁了城市的一些部分。
俄罗斯帝国.1795年，波兰立陶宛联邦遭到最后一次瓜分，该市由俄罗斯帝国接管，属于维尔纽斯省。在1812年法国入侵俄罗斯