群则失去清水溪流域与浊水溪流域的丘陵地，向后往大水窟迁徙。县域中部的埔里盆地、集集河谷仍属原住民之传统领域，泰雅族与布农族两大族群眉溪为界，北为泰雅族人，南为布农族人。
清治时期.1683年（清康熙二十二年）隶属于福建省台湾府诸罗县。1723年（雍正元年）增设彰化县，该县隶属之。至1759年（干隆二十四年）正式设县丞。1887年（光绪十三年）福建、台湾分治，台湾改制为台湾省，这时的南投行政区属台湾府台湾县（县治在今台中市南区），县丞驻南投堡。清初台湾中部地区尚未大规模开发，尚有