1926至59年，比奥科岛及木尼河区合併为西属几内亚。在20世纪上半叶，西班牙缺乏财富和兴趣来发展其非洲殖民地的经济基础。但是，西班牙引进奈及利亚人作为佣工。而且，西班牙更令赤道几内亚拥有全洲最高识字率，并发展良好的医疗设施网络。1956年，法属摩洛哥独立，西班牙交出西属摩洛哥予摩洛哥，但保留西属撒哈拉。摩洛哥苏丹在1957年入侵西属撒哈拉。1958年，西班牙把塔尔法亚割予摩洛哥。1968年3月，联合国及赤道几内亚的民族主义者施加压力，使西班牙宣布让赤道几内亚独立。赤道几内亚在该年取得独立时，是