继承顺序中排除出去，而由他那接受天主教教育的异母弟汉斯来继承王位。终于在1533年弗雷德里克一世去世之后，丹麦爆发了内战。
获取王位.1534年克里斯蒂安三世在维堡的一个地方议会上被部分丹麦贵族和高级教士选立为国王。德国贵族、奥尔登堡伯爵克里斯托弗（他是丹麦王室的一位远亲）得到一些德意志商业城市的支持，发动兵变企图让1523年被废黜的克里斯蒂安二世（此时被幽禁）复位。克里斯蒂安二世信仰天主教，而且需要指出的是，由于其在位时执行过一些有利于人民的政策，有相当一部分丹麦人对他抱有好感。