丰臣政权时代由池田恒兴为城主。1596年由伊藤祐盛扩建，增设天守。1600年关原之战前后石田三成在此作为西军的据点，负责指挥的工作，其后受到东军攻击而落城。关于落城的记载，现时存有一书为《》。在江户幕府，自从1635年由户田氏铁成为了城主，自此城为大垣藩及户田氏的本据地。在明治时代免于拆除。但是在1945年受到空袭失火而烧毁。其后得到重建，1959年完全建成。现今由财团法人大垣市文化事业团所管理。
外部连结.财团法人大垣市文化事业团