计全台县市级以上列管河川共118水系。其中淡水河虽列为「跨省市河川」，但因较为重要，随后于同年9月公告为「比照省管河川」。冻省之后，河川主管单位改制为经济部水利署。民国89年（2000年）1月4日，经济部公告将台湾河川改区分为「中央管河川」及「县（市）管河川」。中央管河川即为原有之省管河川改制而成，数量仍为24水系，县（市）管河川亦仍为91水系。在该次公告中，并未提及原本归类为「比照省管河川」的淡水河如何归属，造成诸多不便。民国98年（2009年）4月8日，经济部公告台湾河川区分为「中央管河川」、「