护灵穴，庙方也装上了强化玻璃。目前庙殿供奉着福建马祖籍登山怪杰李小石攀登珠穆朗玛峰(圣母峰)时，所揹带的妈祖金身圣像。马港天后宫是南竿乡的信仰中心，据说，每次有大灾难之前，都会见到由灵穴飞出一团火球，当地居民说看到火球飞出，就知道妈祖娘娘又出去救海难了。2009年，高达28.8公尺的妈祖巨石像正式于马港天后宫旁揭幕，不仅全部以花岗岩打造，而且也成功挑战世界第一高的金氏世界纪录，28.8公尺的高度对照马祖的总面积28.8公顷，象征着妈祖将守护马祖每吋土地上的子民，更强化「妈祖在马祖」的意涵。连