，中国人民解放军试射飞弹，叶国兴与林山田、傅云钦、叶博文、卓荣德等人创立建国广场，倡导台湾意识；几个月后，叶国兴与卓荣德相继淡出建国广场。2002年2月1日，叶国兴接任行政院新闻局局长。2003年6月27日，行政院院长游钖堃宣布，叶国兴与行政院政务委员黄辉珍对调职务，于同年7月1日生效。2003年7月1日，叶国兴转任行政院政务委员。2004年5月20日，叶国兴接任行政院秘书长。2009年4月1日，叶国兴发表声明指称，因民主进步党中央执行委员会通过征召李俊毅参选台南县县长一事与他对民主进步党选战策略小组成