他曾在社会上募捐，得到10950元。1929年夏学校发生学潮。当时学校在暑假加收住宿、水电、练琴费等共计八元。而此时南京政府的《专科学校组织法》使得国立音乐院降格为音乐专科学校，师生之中有不满情绪，因此前往南京请愿。参加者包括洪潘、蒋风之、陈振铎、冼星海等，其中洪潘甚至要求开除萧友梅。这导致学校锁琴房、断水电，闹事的学生（包括冼星海和陈振铎）和老师停发录取、录用通知书。这最终使得中华民国教育部于1929年7月25日下令国立音乐院临时停办并成立改组委员会。萧友梅也因此在当月辞职，不过又在8月19日得到复聘