取政权，被任命为大提学。1462年，出任朝鲜王朝的最高官职领议政。朝鲜世祖十分重用申叔舟，将他比作唐朝着名大臣魏征。朝鲜睿宗即位之后，申叔舟进入承政院，执掌大权。通过南怡谋叛事件，申叔舟剷除了自己的政敌南怡等人。此后申叔舟一直担任朝鲜王朝朝中的要职。成宗即位后，命令申叔舟将自己出使日本室町幕府时所获得的经验写成书籍，是为《海东诸国纪》，并于1471年刊行。1475年，申叔舟病逝，谥号文忠。