从哲前往问安。方从哲称皇帝「讳疾」，杨涟用宋仁宗旧事辩驳。二天后，从哲终于率廷臣入宫探望。到神宗病危时，太子仍踌躇于宫门外。杨涟、左光斗派人建议太子「当力请入侍」，深得太子赞赏。不久，神宗驾崩。
顾命.八月丙午朔，太子嗣位，即明光宗。四天后病倒。京城传言为郑贵妃进献美女八人，又指使太监崔文昇下泻药所致。当时，贵妃据干清宫，与光宗宠爱之李选侍结交，贵妃为选侍请封皇后，选侍也请封贵妃为皇太后。光宗果然催促礼部，封贵妃为皇太后。杨涟、左光斗在朝中倡言，令贵妃移慈宁宫，杨涟又弹劾崔文昇用药