建立浩罕的明格部落是16世纪从原金帐汗国南迁至河中的乌兹别克人的一系（1514年第一位统治者名阿尔丁别什）。这一时期在中亚，由自称为乌兹别克人的金帐汗国末裔建立起的国家共有三个，除了浩罕汗国，其他两个汗国都宣称是昔班尼的后裔。在这三个汗国中，布哈拉汗国居于统治地位。17世纪末，布哈拉汗国国势衰微，其实际控制领地仅剩首都所在的河中地区的一部分。于是在费尔干纳地区，信仰伊斯兰神秘主义的和卓们开始了领地自治化。大约1710年左右，费尔干纳地区的明格部落首领沙鲁克开始反抗宗教政权，并于1740年定都浩罕，