51年至1956年，苏秉琦和石兴邦带领中国科学院考古研究所的工作人员再次在陕西调查古迹位置，这次调查的配图中标出了阿房宫遗址的位置，该位置位于阿房村的东南，与1923年苏秉琦的调查结果基本一致。1956年8月6日，陕西省人民委员会公布阿房宫遗址为陕西省文物保护单位时，给出了两个不同编号的阿房宫遗址，这个编号在1961年公布阿房宫遗址为全国重点文物保护单位时消失，两处遗址此后均被认为共同组成了阿房宫遗址。20世纪50年代至80年代，考古工作者对阿房宫遗址进行了多次调查和试掘，探明和认定了多处遗址。20世纪