而，少数细菌，大约有100余种已知的物种，能导致疾病。细菌性疾病在世界的亚热带和热带地区更为普遍的多。大多数植物病原细菌是革兰氏阴性杆状菌（杆菌）。为了能够定殖的植物，它们具有特定的致病因素。众所周知的五种主要类型的细菌致病因素是：使用细胞壁降解酶，毒素，效应蛋白，植物激素，和。
植物菌质体.植物菌质体（phytoplasma）是一种无细胞壁的原核生物。
病毒，类病毒和病毒类生物.有许多类型的，有的甚至是无症状的。大多数植物病毒具有小的，单链RNA