湖发起成立反清组织“岳王会”并任总会会长。1907年春，陈独秀第三次留学日本，入东京正则英语学校学习，后入早稻田大学学习法国等西欧文化。
教学生涯.1908年陈独秀从日本回国，在杭州浙江陆军小学任国文史地教习。1911年，辛亥革命爆发，陈独秀应安徽军政府都督孙毓筠邀请，回乡任安徽都督府秘书长和安徽高等学堂教务主任。1913年，陈独秀追随柏文蔚参加反袁世凯“二次革命”，在芜湖一度遭龚振鹏逮捕，后获释。1914年春，反袁运动失败后，陈独秀再度赴日本，协助章士钊办《甲寅》杂志