小谷城开设京极丸，给他们父子居住并供应其所需，有了一段短暂的和平。然而，在天文10年(1541年)，京极高延又再次发起了对亮政的反旗。这个时候已50岁的亮政还来不及解决与京极家长期的斗争问题便在隔年天文11年(1542年)1月6日病逝。死后，亮政嫡子久政与其女婿兼养子田屋明政为了新任家督的继承权起了争执，明政与京极高延结盟一同攻打久政，而久政则对六角家表示臣服。