佈有着正向关联，脑干病变也与缺牙有所关联。缺牙症与家族遗传关系密切，外胚层发育障碍或是唐氏症候群都是可能的原因。唇颚裂患者也经常同时患有缺牙症。除了家族遗传，激素分祕、环境因子及病原体感染亦是缺牙症的可能肇因。激素因子包含自发性副甲状腺素低下症、及假性副甲状腺素低下症；可能为念珠菌感染〈念珠菌致内分泌病症候群，candida endocrinopathy syndrome〉所导致。环境因子包含接触多氯联苯〈如戴奥辛与类戴奥辛物质〉、辐射、抗癌化学疗法、过敏原、及药物治疗后的毒性表皮溶解症〈tox