教为伊斯兰教，四颗星和四条横条都表达出国家的四个岛屿，黄色代表了莫爱利岛、白色代表出马约特岛、红色为安朱安岛的象征，而蓝色就是大葛摩岛。另外，弦月抱与四颗星同时表达出国家的图腾。
历史沿革.科摩罗在1887年直至独立之前是法国殖民地。由于科摩罗一直没有属于自己的殖民地旗帜，法国国旗因此成为科摩罗的官方旗帜。随着1961年科摩罗取得内部自治，1963年Suzanne Gauthier设计了科摩罗旗帜。当时的旗帜长宽比例为5:7，绿底，左上角绘有新月，从左下到右上有四颗白色五角星以对角