.本科曾长期被视为猪科的近亲而归类于猪形亚目之中，直到2009年的研究显示本科与河马科及鲸类的关系更亲近，因而归类于鲸凹齿形类。
特征.巨猪科是较为像猪之类的动物，身体庞大，脚短幼，鼻口长。牠们有完整的牙齿，包括大的犬齿、重的门齿、尖锐的前臼齿及相对简单而有力的臼齿。由此可见牠们像现今的猪一样是杂食性的。就像其他的偶蹄目，牠们有分趾蹄，其中二趾接触地面，余下二趾则退化了。由 M. Mendoza、C. M. Janis 及 P. Palmqvist 针对巨猪科样本所测量的质量