018年5月14日，叶柏祥表示，台湾民政府绝对不是台独团体，「没有建国的意识，也没有独立的信念，反而是一个『打着台湾反台湾』的团体」，实质是政治诈骗集团；台湾民政府起始成员确实有许多人来自李登辉之友会，「而且是大金主」。2018年5月19日，新北市议员刘美芳说，AIT早已证实台湾民政府发行的身分证与护照等文件不获美国认可，台湾民政府却仍继续经营，检调必须仔细清查；蔡英文政府也该好好思考，为何有民众宁可自称是日本人、美国人，也不愿认同台湾这块土地。2019年2月20日，台湾智库谘询委员张国城批评，台湾民政