。《颇罗鼐传》记载说，噶丹泽旺在战争胜利后留下数百名蒙古兵丁驻守阿里，带领其他的军队返回。
统治阿里.噶丹泽旺是甘丹颇章政权委任的第一任堆噶本（阿里总管）。他于1682年到1688年在阿里地区任总管，按照甘丹颇章政权的制度，在阿里地区建立行政制度，设立驻军和委任宗本的制度，改变了阿里地区一直由土王统治的局面，对于加强阿里地区和前藏、后藏的联系作出了开创性贡献。从他以后，西藏地方政府向阿里地区派驻堆噶本 ，并委任各宗的宗本，形成了定制，直至1959年民主改革时为止。