人之间的主动弃保引发民进党内部反思，党内四大派系于选后进行电视实况转播的中国政策辩论会。会后，民进党为了迈向执政而採取较温和的两岸政策。1999年，国民党总统提名初选，连战副总统获得提名，而宋楚瑜决定脱党参选。连任台北市长失利的陈水扁获民进党提名，许信良脱党参选。新党提名作家李敖参选。
中国国民党.自时任总统李登辉连任以后，国民党中生代的接班竞争日渐激烈。由于连战已当选副总统，理应卸下行政院长一职。但时任总统李登辉考量立法院的席次以及中生代抢位置的问题，决定由连战续任行政院长，