屯马线分别可以在沿线各座车站转乘轻铁（屯门站、兆康站、天水围站及元朗站），港铁巴士（屯门站、兆康站、天水围站、朗屏站及元朗站），东铁线（红磡站、大围站），荃湾线（美孚站、尖东站 ➡ 尖沙咀站），观塘线（何文田站、钻石山站），东涌线（南昌站），高速铁路（柯士甸站➡ 香港西九龙站），城际直通车（红磡站 ➡ 香港红磡站）。
票务.
屯马线一期.
屯马线一期车费.现时屯马线一期主要以分区作为收费模式，收费区如下：由启德站乘坐屯马线一期至乌溪