高祖的宠妃宇文昭仪，故仍授宇文士及仪同。后宇文士及跟随秦王李世民讨伐刘武周，因战功复封隋末爵位新城县公，娶寿光县主为妻。620年到621年，跟随秦王李世民讨伐王世充、窦建德，宇文士及进爵郢国公。625年，宇文士及权检校门下省侍中，成为宰相之一，兼太子詹事（当时的太子是李建成），同时又是秦王李世民的天策府司马。626年，秦王李世民发动玄武门之变杀死李建成和齐王李元吉，李世民即位后任命宇文士及为中书省的主管—中书令。627年，宇文士及免除中书令，改为检校凉州都督，盛陈兵卫、折节下士以防备突厥。后来回京为殿中