独立媒体网最初由于2005年註册为社团「独立媒体（香港）」筹办，该社团以会员制度为基础。2005年年底，香港独立媒体以有限公司形式註册，有二名股东成员。2012年，香港独立媒体受到东方报业集团提告诽谤，被定罪名成立后，inmediahk.net改由一家在美国内华达州登记、名为inmediahk.net LLC的私人公司负责管理。2020年12月10日，「香港独立媒体网」更改为「独立媒体 inmediahk.net」。
参与社会运动.2005年12月，香港独立媒体编辑与数名民间