领军抵抗又有功。次年（253年），孙峻杀死诸葛恪专政，吕据获迁任骠骑将军，平西宫事。五凤二年（255年），假节，与孙峻等攻击寿春，失败撤军，中途遇到魏将曹珍，在高亭破之。
自杀.太平元年（256年），吕据领军攻打曹魏，还未到淮河就听到孙峻逝世的消息，堂弟孙綝取代他的位置专政。吕据听后立刻领兵归国，意图推翻孙綝。孙綝知道后，派文钦、刘纂、唐咨等人捉拿吕据；又派堂兄孙宪守江都。吕据身边士兵见失败在即，都劝吕据投降曹魏，但吕据不愿，说：「耻为叛臣」。于是自杀，后来被诛灭三族。