国总统黎元洪下令免去时任国务总理段祺瑞之职，段祺瑞立即以下属督军宣告进行抗衡。为调停府院之争，双方邀请长江巡阅使张勋进京调停。张勋随即解散国会进行复辟。在混乱中，1917年7月6日，应瑞号奉程璧光命令护送孙中山南下广东，10日抵达汕头。然而应瑞号在接获冯国璋电报后即留下孙中山一行径自北返，因此没有参加后来组建的护法舰队，而是一直留在中央海军序列内。1922年4月29日，第一次直奉战争爆发。此时第二舰队司令杜钖珪倒向直系。同年北伐粤军许崇智所部因对陈炯明作战失利而退到闽赣交界处。时福建督办李厚基叛皖投直，