短时间中迅速崛起，奠定一个现代大学的基础，确是难以想象和不可能的。据陈雪屏回忆，傅赴台时健康情形已很是令人担忧，“但他一方面心忧大局，同时锐志要把台大建设成一个够世界水准的学府，殚精竭虑，竟无一刻的轻松”。当时的教育界评论为傅斯年仿效其恩师、曾任北京大学校长的蔡元培先生改革北大，其同窗、后来成为台湾国立清华大学校长的罗家伦亦是如此改革清大。其中比较有争议的地方是将留学日本的医学博士杜聪明等在聘期满之后，便不再续聘，使之离开台大医学院。杜聪明之后往台湾南部发展，并在台湾五大家族之一的高雄陈家后代陈启川的赞助下