示各香港政府部门将会全力向他们提供一切所需要的协助。行政长官梁振英在10月2日联同香港政府高级官员召开跨部门会议，就南丫岛事故商量及讨论善后事务，包括搜索及救援、为家属提供支援及协助，以及调查事故等事宜。同日，香港政府公佈社会福利署、民政事务署及医院管理局将会为到每一位需要帮助的家庭和个人，提供一位专门负责的支援联络主任，直接和相关家属或者伤者联络，并且协调各香港政府部门跟进他们的个案，为他们提供善后服务。其后，南丫四号被拖往牙较湾，以便警务处、政府化验所法证事务部及消防处人员先后蒐证，又在船上的四