国立清华大学理学院（），隶属于国立清华大学，为目前该校十一个学院之一。1956年国立清华大学于台湾新竹市复校，成立原子科学研究所，下设数学组、物理组、放射化学组，其中数学及物理分别于1964、1965年独立成系。1973年理学院成立，沈君山为首任院长。2020年，该学院共有数学系、物理学系及化学系3科系，统计学研究所、天文研究所及计算与建模科学研究所3研究所，并设有理学院学士班、先进光源科技学位学程。