九部联军之后，清太祖命令噶盖与额亦都、安费扬古率兵千人攻打讷殷佛多和山寨，斩其路长搜稳塞克什。明万历二十六年（1598年）正月，噶盖与台吉褚英、巴雅喇及费英东率兵千人攻打安褚拉库路，降服屯寨二十余座。次年（1599年），噶盖奉清太祖之命与额尔德尼共同创制满文。同年九月，噶盖与费英东率领二千人驻守哈达。哈达贝勒孟格布禄暗中联络明朝，并计划生擒噶盖和费英东。二人将这一计划告知清太祖，于是建州发兵攻克哈达，孟格布禄投降。不久，孟格布禄密谋刺杀清太祖事发，噶盖以未能觉察孟格布禄谋逆而论罪，与孟格布禄一同被处死。