1984年10月26日被列入海曙区文物保护单位。1993年，出于保护目的，水北阁迁建至天一阁博物馆内。1999年，水北阁成为中国地方志珍藏馆。
历史.徐时栋最初的藏书楼位于月湖恋湖楼（又称烟屿楼），但因咸丰十一年（1861年）太平天国军队攻宁波，恋湖楼内藏书大部分被盗窃或焚毁。同治元年（1862年）徐时栋迁居宁波西门外，将藏书楼命名为城西草堂，但于同治二年（1863年）十一月二十九日被大火将书与楼一并焚毁。同治三年（1864年）六月，在城西草堂旧址建立水北阁，有河将水北阁与住宅隔开