党主席补选中赢得78,829票（得票率56.16%），得票数过半而成为第一位民选的中国国民党主席，同时也是首位女性中国国民党主席，任期将持续到2017年7月底。在洪秀柱当选后，中国共产党中央委员会总书记习近平也立即发布贺电，向其重申坚持九二共识和反对台湾独立运动的立场。同年3月30日，洪秀柱正式就任中国国民党主席一职，另外她还接任国家政策研究基金会董事长。之后洪秀柱开始公布新的人事安排，包括任命莫天虎担任秘书长职务，并由前立法委员蔡正元担任与立法院党团沟通的政策会执行长。在当选成为中国国民党主席后，洪秀