，恢复延边地委，孔原为地委书记兼宣传部长。1948年5月17日，孔原调任吉林市委书记、吉林市警备司令部政委。1949年1月任抚顺市军管会主任、抚顺市委书记、抚顺市卫戍司令部政委。1949年7月调北京，负责海关总署筹备处。1949年10月5日任中央人民政府政务院财经委员会委员、中央人民政府海关总署署长。1953年1月9日，海关总署并入中央人民政府对外贸易部，1954年11月1日孔原调任对外贸易部副部长主管海关工作。并先后分管过与苏联、朝鲜、越南、蒙古和东欧诸国的贸易。1958年3月7日任国务院外办副主任（