开校园扩建计划，而分流科大学生及教职员前往九龙或西贡等地方。现时「正门」为前往新界（「南闸」除外）的路线停靠，「南闸」则停靠前往九龙的路线（因需要顾及大埔仔村一带的乘客，原先计划使用两巴士站的目的地跟现时对调）。为区别两站，九巴作出相应识别。「南闸」巴士站命名为「香港科技大学（南）（H.K.U.S.T.（South））」（简称科大南）；「正门」巴士站命名为「香港科技大学（北）（H.K.U.S.T.（North））」 （简称科大北，新巴称此站为「香港科技大学」巴士站）。
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