神经节都在头胸部融合成单一团，而腹部则完全没有神经节。古疣亚目腹部及头胸后部的神经节并没有融合，而蝎子头胸部的神经节融合在一起，但腹部的则保持分离。
感觉.螯肢亚门的表皮阻隔了外界的资讯，只透过传感器或神经系统的连接来获得感觉。蜘蛛及其他节肢动物都改进了其表皮成一系列的传感器。绒毛是触觉及振动的传感器，由强烈的接触至非常弱的气流也可以感知。化学传感器提供了与味觉及嗅觉一样的功用。现存螯肢亚门拥有复眼及单眼，复眼位于头部两侧，单眼位于中央。鲎的眼睛可以在没有形成影像的情况下侦测运