厅长、党组书记等职务。2001年10月，42岁的马晓伟任卫生部副部长、党组成员，晋升副部级。2013年4月任国家卫生和计划生育委员会副主任、党组成员，2015年5月当选中国红十字会副会长。2018年3月19日，在十三届人大一次会议上，被任命为国家卫生健康委员会主任。
争议.
非典.2003年4月10日，国务院新闻办公室举行中外记者招待会介绍非典型肺炎防治工作进展情况。时任卫生部副部长马晓伟在会上通报“截止到4月9日，中国大陆共报告非典型肺炎病例1290例，