产9架两款原型机。Ju 89与竞争者的未来充了希望，但是瓦尔特·韦佛将军于1936年死于飞机失事改变了德国空军的建军方向。继任者-恩斯特·乌德特与汉斯·耶匈尼克-为了能减少生产时人力与物力的消耗，故青睐轻型轰炸机。例如能为前线部队执行密接支援轰炸的俯冲轰炸机（Ju 87 斯图卡），而不是能轰炸敌人军武工业的重轰炸机。他们说服赫尔曼·戈林军队需要的是能在前线战场上提供支援的战术轰炸机。戈林被德军闪电战的前期胜利所说服，但缺乏战略轰炸机严重影响在不列颠战役时的德国空军。
第一架原型