化县、嘉义县、台湾县、凤山县、恆春县五县及埔里社厅、澎湖厅、卑南厅三厅。
加强军防.为加强台湾的防御能力，沈葆桢乃命人在台湾各地修筑相关建筑。如台南二鲲鯓砲台、恆春县城墙等。
开山抚番.沈葆桢奏请增设台北府，也认为须同时进行开山抚番，计划一面开发后山（东台湾）地区，先行佔领，以免为外人所佔领，因此建设三路，北路由噶玛兰苏澳镇至花莲县奇莱，共计205里、中路由彰化林圮埔至花莲璞石阁，共计265里，以及南路由屏东射寮（车城）至台东卑南，共计214里。另外则是“