过了二十世纪中叶，航空及高速公路的发展，威胁了铁路运输的运输地位。大纽约地区的铁路系统运输功能，开始转为以都会区的通勤为主。
通勤铁路.纽约大都会运输署（，简写MTA）营运及维护纽约地区之通勤铁路，其中主要的有大都会北方铁路与长岛铁路，并拥有位于曼哈顿的大中央车站与部分的宾夕法尼亚车站。大都会北方铁路（）是一条提供纽约上州与康乃狄克州的居民往返纽约市的通勤铁路。所有大都会北方铁路列车的纽约市终点站是大中央车站，往北可到达纽约州的瓦塞克（）、波基普希（Poughkeepsie）、杰维