兴建新校舍及运动场。完工后本校校址迁至该处。1941年（昭和16年），改制为恆春第一国民学校。1943年（昭和18年）4月，垦丁寮分教场独立设校。第二次世界大战日本战败后，国民政府接收台湾。1945年12月，陈敏夫奉命接收本校并担任校长。1950年（民国39年）10月1日，改称为屏东县恆春国民学校。1953年（民国42年），恆春初级中学（今屏东县立恆春国民中学）因需增设高中部而校地不足，与本地交换校地，本校因而迁至该处，即原恆春寻常高等小学校校址。1968年（民国57年）8月1日实施九年国民教育