世纪立陶宛大公国成立后，萨莫吉希亚为其附属领土，虽然有时立陶宛大公的影响非常有限。在第一位立陶宛国王明道加斯统治时期，萨莫吉希亚奉行独立自主的外交政策，甚至在明道加斯国王与宝剑骑士团签署合约时，萨莫吉希亚依然继续跟宝剑骑士团作战。萨莫吉希亚在停止条顿骑士团的扩张，在苏勒战役（1236年）击败宝剑骑士团，在斯库奥达斯战役（1259年）和杜尔贝战役（1260年）击败利沃尼亚骑士团中起到很大作用。 在和条顿骑士团凶狠的战争的环境中，立陶宛统治者瓦迪斯瓦夫二世和维陶塔斯大帝在1382年，1398年和1404