四舰队则专管内南洋，负责警备以及保护海上交通。1943年11月，美军发动吉尔伯特及马绍尔群岛战事，将反攻的前锋推进到了内南洋地区。11月底美军发起塔拉瓦战役，攻占了塔拉瓦环礁；1944年1月底，夺取了瓜加林环礁。2月17日，美军发起冰雹行动，楚克群岛（特鲁克岛）的指挥机能瘫痪。联合舰队主力被迫转移到帕劳，但2月底的又对帕劳的设施造成重创。至此日军已经丧失了内南洋的制海权，第四舰队的舰队根据地守备队已经失去了意义。3月4日，日本海军组建中部太平洋方面舰队，司令部设在塞班岛。第四舰队也转隶属于中部太平洋方面