段祺瑞下野，马良也遭免职，闲居济南，着《中华新武术》。民国16年（1927年），发生「五三惨案」，日军进入济南，马良任济南治安维持会会长。民国16年(1927年)，受张之江邀请，任南京中央国术馆教务处处长，并负责教授摔跤。民国19年（1930年），韩复榘任山东省主席，任命马良为山东肃清毒品委员会会长。抗战开始，民国26年（1937年），日军攻陷南京，在北京成立中华民国临时政府，马良加入成为委员，民国27年（1938年），受任命为山东省省长兼保安总司令。民国29年（1940年），汪精卫在南京建立中央政