Pteranodon orientalis"）。在1989年，Nessov与Yarkov建立为新属，以发现化石的科学家N. Nikolaevich Bogolubov为名。波氏翼龙曾被归类于神龙翼龙科。在1991年，Wellnofer将波氏翼龙归类于无齿翼龙科。目前大部分古动物学家认为波氏翼龙可能属于神龙翼龙科。但波氏翼龙的翼展只有3到4公尺，在神龙翼龙科中属于中等的体型。