实际上，民族恐怖主义则更通常与政治的血腥暴力联系起来，由一个执政党及其领导的独裁政府对其境内的少数民族开展实施的种族屠杀，例如：纳粹德国在欧洲领导的犹太人大屠杀、沙皇俄国对犹太人的屠杀、鄂图曼土耳其帝国的亚美尼亚大屠杀、印度尼西亚苏哈托军政府（对印度尼西亚华人及共产党）、缅甸军政府、泰国军政府、中国国民党及中华民国政府（针对本省人及台湾原住民），印度（1980年代针等钖克教徒及信奉该教的族裔）以及1994年的卢旺达胡图族政权。