1804年2月，民主共和党举办代表大会提名小组会议，选举出这年大选的候选人名单。不像上次大选那样，这一次的提名会议是公开举办的。与会众人达成一致意见，推举杰斐逊为总统候选人，不过，对于应该推举谁来担任副总统候选人，以接替与杰斐逊的关系恶化了的副总统阿龙·伯尔，众人出现了一些分歧。最后，会议延续了同时提名一个弗吉尼亚人和一个纽约人的传统，推举纽约州州长乔治·克林顿担任杰斐逊的竞选搭档。
联邦党的提名.联邦党没有举办提名会议，而是由代表大会的主席们非正式地决定提名南卡罗来纳州的和前