钓天井事件），幕府把正纯禁闭在佐竹氏的领地，正纯被流放到出羽横手，亦因为与佐竹氏有仇的关系而没有收到特别照顾，于是正纯就这样在横手城度过余生。
江户时代以降.在江户时代中支配久保田藩并以外様大名的身份存续。转封时没有明示的石高在宽文4年（1664年）4月2日被决定是20万5千8百石（实际是40万石）。其中5千8百石是庆长10年（1605年）10月17日追加的下野国河内郡、都贺郡的外飞地11条村（『梅津政景日记』）。元禄14年（1701年），佐竹氏第21代当主‧久保田藩第3代藩主