些「街外」舖面，中央街一带的所谓「七街一市」，处理台闽来往商务的「台厦郊」商会也在此成立，并于清光绪元年设会馆于水仙宫，更强化了中央街地区宗教、商业及社会组织的中心地位。1885年中法战争（清法战争）时，澎湖一度被法军攻占，同年6月中法在天津签订《中法新约》后法军撤离，澎湖重新纳入清朝。1886年筹建清政府妈宫城，为清朝在台湾最后建造的一座城墙式防御型古城。
日治时期.1894年日清战争和谈期间，日军发动澎湖之役，于1895年3月23日派军登陆澎湖本岛，3月25日攻下澎湖。并设