南科车站位于台南市新市区与善化区交界，为位于台南科学园区西拉雅大道跨越台铁高架桥下南侧之跨站式车站，为台湾铁路管理局纵贯线的铁路车站。车站出入口设于新市区，副站名为台南科学园区。本站设计之初，即配合南科太阳能产业，以太阳能作为电力来源，是台铁首例。
营运状况.
临时站时期.因月台工程发包不及，因此县府要求厂商在施作永久月台前，需在台湾灯会期间以钢骨与钢板建造临时月台（无站房）。办理客运时，本站由善化站指派站员售票。北上旅客需购买至善化站；南下旅客需购买