项2015年的分析甚至发现难觅龙、糙节龙也属于叉龙科。而2016年对阿马格巨龙的重新检视也将牠纳入叉龙科中。2018年，新属皮尔马图埃龙和灵武龙被叙述。叉龙科不同于其姊妹群梁龙科、以及其他大部分蜥脚类的特征在于相对较小的体型和短颈部。叉龙科是单系群新蜥脚类中的一个先进演化支，后者以普遍的巨大化趋势闻名，但前者缩小的体型成为后者中的例外。
系统发生学.已经提出了几个不同的系统发生学分析，但科内关系仍未得到解决。春雷龙的位置有不同变动（基础叉龙科或基础梁龙科）。以下演化树取自Tsc