域有许多欧美船只出没，相当重视此地国防地位的江户幕府便提出改封宗氏至河内国10万石领地（也有20万石的说法）的计画。不过因为宗氏自中世以来便担任本地的领主，家臣们也适应了此处特别的生活方式，因此予以婉拒。因为作为幕府与朝鲜重要的外交窗口，本藩亦合併肥前国内的1万石成为2万石，并自初代藩主宗义智以来，对马府中藩一直以10万石国主的地位受到礼遇。第11代藩主宗义功与第12代藩主宗义功同名，这是因为第11代义功在觐见幕府将军前忽然去世，其弟富寿便以替身身分继承本藩。1869年9月12日版籍奉还后改称严