祁酉源（生卒年不详），清朝末年政治人物。甘肃河州人。光绪二十七年（1901年）辛丑，广东、广西、甘肃、云南、贵州五省补行庚子恩科乡试。祁酉源中式甘肃乡试第一名举人（解元）。主讲临夏凤林书院。光绪二十九年（1903年）秋，任西宁县儒学训导，卸任后病卒于家。