两方多次发生冲突。为此1919年皖系军阀控制的北洋政府派徐树铮出兵西北解决问题，其手下的军队改称“西北边防军”。徐树铮在1918年杀死陆建章。几年之后，徐树铮被冯玉祥杀死。
成军.在冯玉祥的连襟陕西省长阎相文给直系军阀的曹锟、吴佩孚的推荐下冯玉祥所部扩编为师。1921年阎相文因为工作压力过大自杀。冯玉祥趁机接掌西北兵权，任陕西督军、河南督军。1922年，冯玉祥任陆军检阅使。1923年5月11日，裁撤蒙疆善后委员会，同时成立西北边防督办公署，由大总统曹锟特任陆军检阅使冯玉祥为西北边防