源较丰富的化学系借取之外，也向中国广播电台与台湾电力公司等单位要到了报废的真空管与大弹壳等物品作为其实验材料。之后，他们的重组加速器计画在1946年10月开始进行，并于1948年5月13日下午8时35分以高速质子撞击锂，使其分裂成两个α粒子，完成了中华民国暨战后全亚洲首次人工撞击原子核实验。同年6月20日，他们重复进行实验，证明其结果具有再现性。为了保持进度，许云基在那段期间将新婚妻子寄托在大甲老家，并时常与太田赖常和许玉钏、林松云一同睡在实验室内过夜，醒过来后便继续工作。该加速器目前被国立台湾大学校方