间开行德意志国防军列车。在1944年和1945年，线路上仍有7对长途列车继续服务，其中包括3对前线休假快速列车和4对快速列车。前线休假快速列车的运行区间分别为慕尼黑至、慕尼黑至维也纳以及慕尼黑至林茨。4对快速列车的运行区间则分别为梅斯至维也纳、慕尼黑至克拉根福和斯特拉斯堡至维也纳。梅斯至维也纳的快速列车在慕尼黑－萨尔茨堡区间以2小时40分的行车时间成为了该路段运行最快的列车。1944年11月，有更多的快速列车及通勤列车在慕尼黑－萨尔茨堡区间被停运。自1945年1月起，由于快速列车不可以在超过75公里的路程中