仍然由亲直继承。1584年（天正12年）秋，亲直被任命为伊予军代。同年9月11日，进攻伊予深田城。1587年（天正14年），爆发户次川之战，元亲的长男长宗我部信亲战死，引发家督继承问题。亲直支持元亲四男长宗我部盛亲，并向元亲进谗言应该即时肃清反对派吉良亲实及比江山亲兴等人。关原之战西军败北，亲直向盛亲进言应该向德川家康持恭顺姿态。但是，由于同时向盛亲进谗言杀害兄长津野亲忠，造成长宗我部家被家康改易之命运。因此，亲直被视为导致长宗我部家灭亡的元凶，被塑造成稀代的奸臣形象。之后，亲直仕于后肥后熊本藩加藤