年由姬十三创立，与其之前创办的非盈利组织科学松鼠会在运营上完全独立。果壳网现有科学人、小组、问答、MOOC学院等板块，由专业科技团队负责编辑，网站主编为拇姬。果壳传媒另有“果壳阅读”这一阅读品牌，负责科普类图书的编辑。
词源.哈姆雷特曾言“即使我身处果壳之中，仍自以为是无限宇宙之王”，霍金以此为题着书《果壳中的宇宙》，暗示自己身处轮椅之上的那些时光。姬十三是在一次洗澡中想到了这个典故，并决定用果壳来命名这个网站：网络是我们的果壳，然而这里所谈论的，大至宇宙小至原子，没有什么能束缚我