于明智光秀战败后随之一同灭亡。1600年关原之战后，京极高知领有整个丹后国，但在1622年京极高知过世后，将丹后国划为三分，竹野郡西部大部分区域成为领地，东部大部分成为幕府直辖领。明治维新后，幕府直辖领先后被划入府中裁判所、久美滨县；1871年实施废藩置县后，宫津藩则被改设为宫津县，但在同年底竹野郡全部区域被改划入新设立的丰冈县，直到1876年的第二次府县整併中，丰冈县被废除，竹野郡被改划入京都府。1879年实施，正式的设置了近代的行政区划「竹野郡」，郡役所设于网野村（位于现在的京丹后市）。