"sauro"意为「蜥蜴」，意指特殊的踝部结构。而种小名"bonapartei"是以阿根廷古生物学家约瑟·波拿巴（Jose Bonaparte）为名。
分类.在1980年，地质学家Juan Carlos Sciutto在阿根廷丘布特省发现一些兽脚类化石。数年后，古生物学家约瑟·波拿巴（Jose Bonaparte）发现这些化石，可能来自于同一个体。怪踝龙的化石发现于阿根廷丘布特省的Bajo Barreal组地层。这个地层最初被认为是坎潘阶，目前被认为是较早的森诺曼阶/土崙阶交界