塔瓦尔帕的请求下，西班牙人一致通过将其判决改为绞刑，于1533年7月26日在一个带有金属链的上被绞死。死后，他的衣服和部份肌肤被焚烧，遗体被以基督徒的礼仪下葬在当地的教堂墓园，不过很快尸体便不知所终，可能被其支持者盗走并秘密葬于基多。西班牙人立其弟图帕克·瓦尔帕为傀儡皇帝；不久图帕克·瓦尔帕因天花死去，其弟曼科·卡帕克二世继位。基斯基斯、卢米尼亚维等阿塔瓦尔帕的支持者起兵反抗西班牙殖民统治；瓦斯卡尔的部衆则与西班牙人合作，反对阿塔瓦尔帕的支持者。
家族.阿塔瓦尔帕曾将一个妹妹嫁给皮