中枢神经系统.中枢神经系统的副作用包括昏睡、眩晕、头痛、颤抖、昏厥、睡眠障碍、恶梦、烦躁、运动不能、搅动、癫痫发作、痉挛、静坐不能、神志不清、疲劳、失眠、运动机能亢进、虚弱、共济失调、説话含煳不清、抑郁症、肌阵挛和焦虑。罕见的副作用有妄想、幻觉、谵妄、失忆、性慾增加或减少、偏执和烦躁、脑电图异常、精神病恶化、感觉异常、癫痫持续状态和强迫性症状。与其他抗精神病药类似，氯氮平很少会引起抗精神病药物恶性症候群。
小便失禁.氯氮平与尿失禁有关， 虽然这并未有共识。Section:::