袭南联盟任务中兼任美国联合特遣部队参谋长。2000年，阿莫斯调到五角大楼，担任海军陆战队分管航空助理副司令，2001年12月，改任计划政策和作战助理副司令。2002年8月阿莫斯再次回到部队任职，担任第3陆战航空联队联队长，率部出征科威特和伊拉克，参加伊拉克战争。2004年7月到2006年7月，担任司令。2006年8月到2008年7月，阿莫斯担任海军陆战队战斗发展整合副司令，兼任海军陆战队战斗发展司令部司令。2008年7月4日，阿莫斯晋升上将，担任海军陆战队副司令。2010年6月，时任国防部长罗伯特·盖茨