由于氢氟酸溶解氧化物的能力，它在铝和铀的提纯中起着重要作用。氢氟酸也用来蚀刻玻璃，半导体工业使用它来除去硅表面的氧化物，在炼油厂中它可以用作异丁烷和丁烷的烷基化反应的催化剂，除去不锈钢表面的含氧杂质的“浸酸”过程中也会用到氢氟酸。氢氟酸也用于多种含氟有机物的合成，比如特氟隆（聚四氟乙烯），还有氟利昂一类的致冷剂。
安全性.氢氟酸有剧毒，在坊间有蚀骨水、化骨水、白骨酸之称，其所释出的氟离子腐蚀力很强，会直接穿透组织，与钙（除了骨头，其他器官也会影响）结合，形成不溶于水的氟化钙。