中国科学院水生生物研究所（），中国科学院早期成立的研究所之一，是“从事内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用研究的综合性学术研究机构”。现有在职员工367人，科研人员292人。该所前身为1930年成立于南京的的国立中央研究院自然历史博物馆，1934年7月自然历史博物馆改名动植物研究所。日本侵华战争爆发后，动植物研究所多次迁移，先后移至湖南衡山、广西阳朔、重庆北碚。1944年5月，动植物研究所分建为动物研究所和植物研究所，侵华战争结束后又迁入上海。1950年中国科学院成立后，动植物研究所和北平研究院