往佛山站的服务也就此停止，以增强东铁线于香港境内之客运服务。随后广深公司利用闲置车底一组编组方式：SS8+RZ25T+SS8）开行广州东~河源~深圳~河源~广州东的直达特快旅客列车。2020年1月28日，香港政府鑑于COVID-19扩散，宣佈包括香港红磡站在内的若干个跨境口岸，将于同月30日凌晨零时起暂停服务，故自1月30日起开行的广九直通车班次将会取消，直至另行通知为止。2020年4月，广深公司利用因受新冠肺炎影响而闲置的广九直通车车底一组及原广州东/深圳~河源管内直车底（编组方式：SS8+RZ2