1924年段祺瑞被北洋军阀推举为中华民国临时执政后以此地为执政府。1926年3月18日， 反对列强干涉中国革命的游行群众抵达段祺瑞执政府门前时遭到卫队开枪镇压，共造成47人死亡，200余人受伤，史称“三一八惨案”。1926年4月10日，冯玉祥率国民军推翻段祺瑞执政府，执政府驻地改为北平卫戍区司令部驻地，后改为宋哲元的二十九军军部和冀察政务委员会驻地。卢沟桥事变后，西院成为日本驻华驻屯军总司令部驻地，东院为日本特务机关兴亚院驻地，其内至今仍有水牢。抗日战争胜利后，此处由孙连仲接管，改为十一战区长官司令