威廉姆斯成为分离主义者。威廉姆斯在语言方面有特殊的天赋，年纪轻轻就掌握了拉丁语、希腊语、希伯来语、荷兰语和法语。多年后威廉姆斯教约翰·弥尔顿荷兰语，弥尔顿投桃报李地教授威廉姆斯进阶的希伯来语。虽然由于他的学业优良，威廉姆斯可以在英国国教会任要职，但是清教徒的身份，使他失去了在教会晋升的机会。毕业于剑桥后，威廉姆斯成为了清教徒威廉·马翰（William Masham）爵士的随行牧师。
离开英格兰.在查理一世威廉·劳德统治下，英国开始了长达一个世纪的宗教斗争。威廉姆斯知道清教徒领袖们