文正惧怕，李饮冰又上奏朱文正有异心。朱元璋立即坐船到城下，召朱文正来。朱文正仓卒出迎，朱元璋说了好几次：「你打算干什么？」遂押回金陵，马皇后劝解说：「这个孩子只是个性刚强，没甚么别的。」被免官软禁于桐城，没多久去世。
身后.洪武三年（1370年）朱元璋将时年八岁朱文正的儿子朱守谦封为靖江王，就藩桂林；是唯一非朱元璋后代的明朝藩王。
妻子.妻：谢翠英，大将谢再兴长女。