求荷兰退出澎湖，如果退出澎湖，去占领对面的「化外之岛」台湾，明政府则无异议。经此议和，荷兰人遂在1624年进入南台湾，建「奥伦治城」，后又改建为热兰遮城。后因郭怀一事件，于1653年建普罗民遮城。荷兰人统治台湾的第3年（1626年），西班牙也自菲律宾马尼拉派兵占领台湾北部。他们先后佔据鸡笼、沪尾一带，并建造圣多明哥城，与南部的荷兰人展开殖民与商业竞争，但情况不佳。此外，西班牙统治者在金山、三貂角（San Diego）等地都建有天主教教堂，试图向原住民传教。西班牙神父也研究原住民语言，着有《台湾岛淡水语词汇