出越南，改为加入越南共和国空军。1954年越南南北分裂，阮高祺投奔南越军队，曾参与1963年南越政变。1965年出任总理，再于1967年登上副总统宝座。
流亡生活.南越于1975年被北越打败，西贡陷落当日，阮高祺登上美国海军蓝岭号指挥舰逃往美国，于加州威斯敏斯特定居，在当地经营一家小酒庄。阮高祺撰写了两本自传，分别为《How We Lost the Vietnam War》和《Buddha's Child: My Fight to Save Vietnam》2004年，阮高