特别篇.
怪医黑杰克2小时特别篇 ～4个生命奇蹟～.《怪医黑杰克2小时特别篇 ～4个生命奇蹟～》（）是因《怪医黑杰克》30週年以及读卖电视台开播45週年的纪念作品。分为四个故事。手冢真监督。主题歌为B'z「ROOTS」。主题曲是松本孝弘「THE THEME OF B.J.」。
动画电影.
怪医黑杰克 两位神秘医师.《怪医黑杰克 两位神秘医师》（）是于2005年12月17日上映的93分钟的剧场动画，本作是由TV版的动画团队制作。在台湾此片