关卡与原版不尽相同，早期关卡只有细微差别，例如删除了1UP蘑菇和其他隐藏道具，平台更窄，敌人更危险等，而后期的关卡则完全不同了。这些差异使得《VS. 超级马力欧兄弟》与原版《超级马力欧兄弟》相比难度大增。游戏中更换了的关卡很多后来重新出现在了日版《超级马力欧兄弟2》中。本作是任天堂在日本发行最后一款街机游戏。
通宵日本超级马力欧兄弟.是为纪念1987年日本知名广播节目《通宵日本》（）播送20周年，于1986年12月限定生产的《超级马力欧兄弟》纪念版，由日本放送在日本发售。游戏采用了