德川家康此后臣服秀吉。同年，受天皇赐姓丰臣并就任关白（平民出身者第一人），确立了天下人的地位。1586年，九州大名大友宗麟向秀吉请求支援，1587年派遣秀长率领大军攻击岛津氏的支城，使义久投降，战后岛津氏被分配到萨摩、大隅、日向三国。平定九州后迁入聚乐第，同年十月于北野天满宫举办北野大茶会，邀请农民与公卿贵族，据说儿时玩伴石川五右卫门也有参加。1588年秀吉开始实行刀狩令，加强了兵农分离的政策。1587年，禁止基督教。1589年北条氏的家臣猪俣邦宪夺取了真田昌幸管辖下名胡桃城，导致秀吉下令全日本大名