洪旭于澎湖立营垒、烟墩、砲台，戍兵守之。1666年旭复请郑经令各镇营于农隙教习武艺弓矢，春秋操演阵法；檄南北路屯兵入深山穷谷採办桅舵含檀，修造船只；又遣商船，往各地购买船料，兴造洋艘鸟船，以白糖、鹿皮等物，上通日本，制造铜炮、倭刀、盔甲，并铸永历钱，下贩暹罗、交趾各处以富国，致田畴市肆不让内地。8月，旭以忧劳染寒疾卒。关于洪旭的卒年，《海上见闻录》及《闽海纪要》皆载卒于永历二十三年。然而《台湾外记》则记卒于永历二十年八月，因寒疾病逝，引起郑经悲伤，并亲自治丧。
参考资料.