学门径略能领悟后，即按日轮班，随医官往医院诊视。学习年限4年，学成后发给执照，准以医学谋生。学堂的一切费用从政府海防经费中拨付，目的在于专门培养海军军医人才。同时正式改名为北洋医学堂。1900年因义和团运动而关闭。1901年李鸿章病逝。1902年，袁世凯恢复办学并更名为“北洋海军医学堂”，又称“北洋海军医院学校”。1913年，北洋海军医学堂改名为“直隶医学专门学校”，经亨咸任校长。1914年，该校新建楼房及解剖室。医院门诊每日约400至500人次。挂号每次5分钱，药费低廉，无正式护士，一切注射、换药都由