入波兰王国，东普鲁士仍由骑士团统治，要对波兰国王称臣，成为波兰的附庸国。1512年，来自勃兰登堡霍亨索伦家族的阿尔布雷希特被选为条顿骑士团总团长，他是勃兰登堡选帝侯的近亲。在马丁·路德的影响下，1525年他宣布改信路德宗，从而切断了与骑士团名义宗主罗马教廷的联系，随后宣布解散骑士团，骑士团领地改为普鲁士公国，阿尔布雷希特自任普鲁士公爵，成为臣服于波兰最高权力之下的世俗君主。1809年，拿破崙解散了作为军事组织的条顿骑士团。
改制.1929年，教宗庇护十一世训令，条顿骑士团成