后法办追诉」三策略，全面防制黑帮假借各项名义制造暴力冲突。2007年，署长任内将基层员警之年功俸由原来的450元级提高两级到500元级，每人每月增加3875元。
转任警大校长.2008年，马英九政府执政，原台北市警察局局长王卓钧升任为警政署长，侯友宜转任中央警察大学校长。
从政生涯.
新北市副市长（2010－2018）.2010年，受新北市市长朱立伦之邀担任副市长。后担任新北市副市长七年多，故传媒通称为「侯副」，2015年10月1