分布有普者黑湖泊群。中下游为中低山地貌，坡陡谷深。流域内森林植被主要是云南松、杉木，森林覆盖率为25.8%。流域属中亚热带气候，平均年降水量1065毫米。清水江流域水力资源理论蕴藏量22.89万千瓦，技术可开发量6.35万千瓦。已建有听湖水库和红旗水库两座中型水库。主要支流为北门河、者莫河、石葵河和安歪河。