与三邑人的顶郊为了争取艋舺码头的泊船权利，加上同安人自己奉祀有乡土神霞海城隍，并未加入龙山寺的信仰圈，时常发生冲突。在公家官衙刻意忽视下，1853年，三邑人终于与同安人发生了俗称「顶下郊拚」的分类械斗。另外也有种说法，械斗发生原因，是因为同安县地处泉州府、漳州府两府（意即比起偏北的三邑，同安地理上较接近漳州；今日同安隶属厦门市）交接，台湾的同安人于18世纪末开始的台湾泉漳械斗中，立场过于中立，并不援救同属泉州府的三邑人。据此说法，部分学者将顶下郊拚视为漳泉械斗的余波。
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