院满文档案》：『东北痘疫，太宗于十日至避痘所』。顺治帝宠爱的妃子皇贵妃董鄂氏因丧子，于1660年9月病猝。福临为此悲痛欲绝，沮丧数月，直至他于1661年2月2日染上天花。1661年2月4日，福临急召礼部侍郎兼翰林院掌院学士王熙（福临的知己）和原内阁学士麻勒吉到自己身边，口述遗诏。同日，7岁的皇三子玄烨因曾经感染到天花，但因为他从天花疾病中幸存下来而被获选立为皇太子。。顺治帝于1661年2月5日崩于紫禁城内的养心殿，年仅二十二岁。两年后，康熙二年（1663年）2月，玄烨的生母慈和皇太后也不幸病逝，年仅22岁。