只颁给剧情长片；引起影评、台北市纪录片从业人员职业工会强烈反弹，认为台北电影节失去原创精精神与独厚剧情长片的发展；2010年，台北电影奖正式废除百万首奖的竞逐只能为剧情片的限制，从该届开始连续五年的百万首奖得奖者都是纪录片，该纪录直至2015年电影《醉·生梦死》获得百万首奖才终结。
各届影展概况.2002年开始，台北电影节开创「主题城市」单元，借由一系列电影放映、展览、座谈及各式活动，带领观众认识每年主题城市的电影、历史及文化，本单元至2016年后不再放入影展规划中；2004年起，