已癒合。头骨的长度约38公分，由此可知卡索亚鳄是种中型动物。卡索亚鳄的头骨长而低矮，前后弯曲，使头骨的前后两端高于中段。前上颌骨加大，形成宽广的前端；左上颌骨比右上颌骨完整。右前上颌骨的牙齿有至少4颗，左前上颌骨有至少5颗；左上颌骨有至少29颗牙齿。鼻骨与额骨的中间有条深沟。两块额骨癒合成一块，如同其他成年的中真鳄类。卡索亚鳄有外侧眶前孔（antorbital fenestra），这与更衍化的新鳄类不同。Ronald Tykowski等人利用电脑断层扫描，研究这个头骨的内部空间与通道，发现次生颚由两层壁