病毒核蛋白（Influenza virus nucleoprotein (NP)）是包被流感病毒反义RNA的蛋白质。流感病毒核蛋白是决定流感病毒种间差异的主要因素之一。目前关于流感病毒核蛋白的研究有两个主要问题：流感病毒核蛋白基因通过能在多大程度上跨越种间屏障、通过突变（能作出多大程度上的改变）以适应新的宿主。