年，上书《乞假将归留别成亲王极言时政启》：“人才至今日消磨殆尽矣。数十年来，以模棱为晓事，以软弱为良，以钻营为进取之阶，以苟且为服官之计，由所遭者，无不各得其所欲而去，以定衣钵相承牢结而不可解……士大夫渐不顾廉耻……”，触怒嘉庆帝，下狱论斩。翰林王引之、贵庆等冒险入狱看望洪亮吉。后改流放伊犁，途中至保定，始知有“不许作诗，不许饮酒”之谕，“交将军保宁严加管束”。百日之后，以“罪亮吉后，言事者日少”，被释放回籍。从此家居撰述以终。洪亮吉的伊犁百日行留下《天山客话》以及《伊犁日记》详细记载了伊犁的山川、物产、风