行政机关缺乏自主。另外，地方行政基层以警察为中心，除了维护治安外，举凡政治思想、结婚生子、户口管理，还有鸦片管理、公共卫生、征收税金、物资分配、地政调查等，均是警察的事务。
军事.
军事参谋与军国体制.明治时代设立兵部省，负责管辖国家的防卫和治安维持的机関。因王政复古，征夷大将军被废除，日本朝廷其他的省决定恢复原有的权威。1871年（明治4年）7月，兵部省设立了陆军参谋局。应萨摩阀以及长州阀的要求，次年2月，根据太政官公告，兵部省废除，拆分为海军省和陆