民党主席洪秀柱也批评蔡英文政府进行文化台独，将会使台湾与中国大陆政府形成对抗关系。林全内阁废除微调课纲，王晓波认为这个作为回到陈水扁政府时代的98课纲，走向日本皇民化思想，去中国化，追求文化台独。2016年，国民党所属的国家发展研究院筹设孙文学院，推动三民主义现代化，以对抗文化台独，弘扬中华文化道统，推展中华民国史观。