在汤山溶洞发掘出土的南京直立人化石是在南京地区发现的最早的人类遗迹，被评为1994年度全国十大考古发现、“九五”期间全国十大考古发现。象山六朝家族墓地的考古发掘获得了六朝世家墓葬规制与习俗的珍贵资料，被评为1998年度全国十大考古发现。在高淳薛城遗址发掘出土了大批新石器时代文物，是北阴阳营遗址考古发现后，在南京地区又一处新石器时代聚落遗址，被提名为1997年度全国十大考古发现。在金陵长干寺地宫发掘出土佛祖顶骨舍利和七宝阿育王塔，引起世界佛教界轰动。