帝国对于葡萄牙所代表的天主教势力有所软化，再加上葡萄牙籍的耶稣会传教士的积极运作，最后使得衣索比亚皇帝苏西尼约司（英语：Susenyos I）改宗为天主教，并在1622年宣布天主教为国教。次年，教宗国瑞十五世任命了一位耶稣会会士阿方索·门德斯为衣索比亚宗主教。然而，门德斯宗主教对衣索比亚的教会施行的过于急进的拉丁化政策，招惹了原先奉行衣索比亚正教会礼仪的群众的反感，这导致了在苏西尼约司过世后其继任者法西里迪斯（英语：Fasilides）对天主教的禁止。直到1839年，天主教在衣索比亚的活动再度由遣使会与嘉布