分别受台湾道、福建台湾布政使及福建台湾巡抚等官职制约。1895年，台湾被清朝政府割让予日本后，台湾府予以裁撤废除。
台湾巡抚.台湾巡抚设置于1885年，为台湾建省后的岛内最高地方统治者。同年，福建巡抚裁撤，设闽浙总督，而建省后的台湾省正式名称亦称为福建台湾省。1887年，台湾巡抚更名为福建台湾巡抚。台湾巡抚或福建台湾巡抚总管台湾军政。在官职上，台湾属巡抚官衔，品等为正二品或从二品。在官饷方面，以首任巡抚刘铭传为例：年薪约为白银155两，养廉银则为一万两，与升格前的按察使衔台湾道道