4月，参与豫北战役，歼灭国军第二快速纵队。随后协同友军攻取汤阴，生擒孙殿英。同年7月，参加进军大别山，率部队率先抢渡淮河，到达大别山北麓，半个月攻占宛西地区9个县城及大片地区。1948年5月，陈任中原野战军第三纵队司令员。在淮海战役中，陈锡联指挥部队攻占宿县，被称为是淮海战役的点睛之笔。后在双堆集歼灭国军黄维兵团。1949年，任第二野战军三兵团司令员，参加渡江战役，后率部进军大西南，攻占重庆。
中华人民共和国时期.1950年，陈锡联任三兵团司令员兼中共重庆市委第一书记、市长和川东军