，续修其《南雷黄氏·宋元儒学案》并增修32个学案，同时七次校订《水经注》，着有《汉书地理志稽疑》等大量史学书籍，编辑有《天一阁碑目》等金石着作，同时着有《鲒琦亭集》38卷及《外编》50卷。晚年生活困难，干隆二十年（1755年）因丧子之痛去世，藏书大部售予卢址抱经楼，丧葬费用方才解决。同时期的文人阮元称全祖望为经学、史才、词科俱佳的学者，现代学者胡适则称全祖望为“绝顶聪明之人”。
墓葬形制.全祖望墓位于宁波市海曙区南郊王家桥，北为南都宾馆，西靠祖关山河，东为苗圃。墓葬坐东朝西，略偏东