震奉派前往，全旅覆灭。回到山西后，商震任兵工厂主管，表现优秀，为晋军的强化作出了贡献。后来重任军队指挥官，立下军功，1918年7月任山西陆军第1混成旅旅长。1924年（民国十三年）1月，商震升任山西省暂编第一混成旅旅长。同年冬，国民军方面的河南省的樊钟秀进攻山西，一时山西危急，商震出兵迎撃并取胜，樊钟秀败退回河南。1926年（民国15年）南口大战中，他协同北京政府军包围并攻击国民军。同年8月，国民军撤离南口，商震任绥远都统。
脱离晋系.1927年（民国十六年），阎钖山响应北伐，