少垃圾体积，节省掩埋空间，有效控制二次污染，并回收能源。复因应「焚化为主，掩埋为辅」的政策及有效纾解本市日益严重垃圾处理问题，于1989年7月1日及1991年7月1日相继增设木栅垃圾焚化厂、士林垃圾焚化厂(1995年8月7日配合行政区域调整，改名为北投垃圾焚化厂)，1993年12月辟建山猪窟垃圾卫生掩埋场。2005年4月为配合本府组织条例之制定，总务室改设为秘书室，始成本局今日建制。