·墨菲与其妻子劳拉·欧文共育有四个孩子，依次为朱莉亚、霍普森、玛丽、沃尔特。霍普森和沃尔特后来分别成为了马里昂军事学院的第二任和第三任校长。其中霍普森在任期间扩大学校规模、邀请威廉·塔夫脱担任校董、设立联邦军校预科、引入、邀请时任普林斯顿大学校长的伍德罗·威尔逊在马里昂军事学院的毕业典礼上发表演讲等一系列举措将该军校带入了一个更高的层次。J·T·墨菲有一个弟弟名叫约翰·墨菲，他也在塔斯卡卢萨之战负伤。