1940年许世贤夫妇回到台湾后，于嘉义市开设顺天堂医院。第二次世界大战结束之后，许世贤出任嘉义女中校长，是台湾最早的女校长之一，她创办高中部，积极推动校务。1946年许世贤当选嘉义市参议员以及候补制宪国大代表。1947年二二八事件爆发，许世贤与女儿张博雅前往阳明山避难，之后回到嘉义。1954年许世贤当选临时省议员、之后当选台湾省议员长达十五年。许世贤起初以中国国民党籍身份当选，惟当选后不久就因不愿受党团控制而主动退党。许世贤也因犀利、强烈批判的问政风格，与李万居、郭国基、郭雨新、吴三连、李源栈省议员有省