998年9月，郑斯林再次被调入中央，出任国家经济贸易委员会正部级的副主任，后又兼任中共中央企业工作委员会副书记，成为中国“国有企业管理者”的管理者。郑斯林也曾毫不隐晦地批评一些企业领导干部一些错误和不当之处。2003年3月17日，中华人民共和国国家主席胡锦涛发布第二号中华人民共和国主席令，根据中华人民共和国第十届全国人民代表大会第一次会议的决定，郑斯林被任命为劳动和社会保障部部长。2004年初，劳动和社会保障部成立了工伤保险司。这是郑斯林上任后，对他所掌管的部门进行的最重要的改革。郑斯林将再就业问题作为工作