一日只食一餐。申佳胤自幼便以节操刚正自励，面对他人不显露饥寒的神色，他人无法看出其境况。万历四十八年（1620年）补生员。天启元年（1621年）辛酉乡试举人。崇祯四年（1631年）辛未科第三甲第九十五名同进士出身。崇祯六年（1633年），授河南开封府仪封县知县。仪封民风勤谨简朴易于治理，申佳胤减省繁苛的教条，打算与民休息；仪封县原本多盗贼，申佳允严格实行保甲法，使盗贼无处容身，治安渐佳；遇到大雨不止，黄河决口，申佳胤亲自冒着怒涛乘船组织民工堵塞决口；县内有大土豪，奸诈狡猾而扰乱治安，申佳胤将之捕捉处