等学校以上之学生提供奖学金。内门公学校搬迁往内埔后，书院于昭和十一年（1936年）再次重修，四年后（1940年）书院旁又设内门国民学校观音亭分校场（今观亭国小），该校创立之初亦曾使用萃文书院上课，而校地则原为书院的学田。二次大战之后，因三七五减租与公地放领政策，导致该书院的学田被放领，无法获取维持经费。民国57年（1968年）大殿因风灾而毁损，四年后（1972年）会员集资重建大殿，但施工中又遭到雷击破坏。由于缺乏经费，民国64年（1975年）书院经会员大会通过併入内门紫竹寺，由紫竹寺接续重建及日后管理、