于附近的北区医院在1998年落成。自2000年代开始，上水南一带才有更大规模发展。主要发展为清晓路一带，名为「粉岭/上水第36区」的新发展区及相关邻近地区开始发展。成为新市镇现今主要新发展地带。该发展区首期的发展为2003年开课之学校村，包括曾梅千禧学校、佛教正慧小学及风采中学三所学校。而住宅发展方面，发展区首个公共屋邨清河邨第三期于2006年开始陆续落成入伙，而第一、二期（包括屋邨商场）则因承建商资不抵债而一度烂尾，最后延至2008年7月落成。同时，上水南一带的私人屋苑御皇庭、显峰及御景峰相继