大垣市荒尾町境内，是东海道本线美浓赤坂支线沿线的车站。当乘客购买在本站下车的车票时，上面的站名标示方式为「(东)荒尾」，主要是为了与位于九州熊本县荒尾市、九州旅客铁道鹿儿岛本线上的同名车站作区隔。
车站结构.侧式月台1面1线的地面车站。由大垣站管理的无人站（东海道线内的无人站，除此站以外只有相邻的美浓赤坂站与根府川站）。