有不少汉人新教徒及新港社原住民新教徒。代表人物为郑成功在台通事何斌。随着荷兰东印度公司败退离台后，基督新教也与荷兰人一起退出台湾，在台湾传播首度中断。
外交.
东亚.
清帝国.郑经曾派柯平、叶亨与清廷议和，并要求礼遇同等于李氏朝鲜的国与国地位，但不被慕天颜接受。
日本.由于清帝国对明郑势力的封锁，郑经便开启对外贸易，其中包含与日本的往来。当时对日本主要输出品为稻米、鹿皮、蔗糖及来自中国的丝织品，输入银、铜、铅、盔