目前长江主航道平均桥距不足50公里。由于桥梁选址、桥墩设计等原因，桥区航道变窄，泥沙淤积严重，船舶航行困难。有数据表明2003年到达南京以上港口的船舶仅占长江上船舶总数的3.6％，吨位仅占总数的1.3％，万吨级的安庆、武汉港、五千吨级的芜湖、铜陵、九江等港口的到港船舶严重不足，港口大量资源闲置。而船舶撞击桥墩的事故却频频发生，例如黄石长江大桥1993年4月至9月间就发生撞桥事故16起，沉船9艘。