会试同考官。康熙初年（1662年）华亦祥陪康熙帝到北京西郊香山，康熙帝向僧人礼拜，华亦祥忍耐不语，康熙一走，华亦祥便拿棍子殴打僧人，还骂道：“你是甚么人，竟敢受天子礼拜？”僧答道：“天子不是拜我，是拜佛！”华亦祥则回答：“我不是打你，是打佛。”僧称：“阿弥陀佛，善知识”。侍母至孝，爱及族人，“曲沃天伦，尤恤乡旧”。累迁弘文院侍读学士。为官清廉，卒时，无以成殓。徐元文与叶方蔼为他处理丧葬事宜。
佚事.《清稗类钞》记其殴打傲慢僧人之事。