清治末期至日治初期，水尾地区为一街庄，称为「水尾庄」，隶属于埔里社堡。该庄西北与北港溪庄为邻，北边一小段与蕃地为邻，东北及东边北段与小埔社庄为邻，东边南段为史港坑庄，南边隔眉溪及南港溪与房里庄、牛相触庄为界，西南边为北山坑庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于南投厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「埔西区」，隶属于南投厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，埔西区仍隶属于南投厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改