《台湾人四百年史》中率先剖析二二八事件。不过《台湾人四百年史》出版之后，也被列为禁书长达30年。直到1987年《台湾省戒严令》解除后，台湾的历史学家才开始参与二二八事件的调查，逐渐釐清事件的经过。相对地，针对其所提出的「台湾民族主义」理念，也曾遭遇台湾独立建国联盟等听众、学者的质疑或反对。而针对此类质问，他亦有更进一步的论述回答。过去在欧美各地曾经参与史明宣讲的海外青年学者，在1987年《台湾省戒严令》解除后陆续回国，在海内外的学术界、艺文界和台湾社会运动界，扮演着极重要的关键角色。2013年，台湾重金