ction::::分类.岩豚鼠属曾被认为是水豚科（Hydrochoeridae）的生物，和豚鼠分在一起。后来的种系发生研究显示其关系与水豚更为接近，因此又被划分到了豚鼠科中。Woods 和 Kilpatrick（2005）将其分在水豚亚科下，认为其在中新世中期从水豚中分化出来独自进化。