64年1月，韦悫被选为第三届全国人民代表大会代表。经廖承志提议，4月调入华侨大学任副校长，代理校长。1966年5月，文化大革命开始，韦悫在华侨大学与其他校领导被抓出来批斗，并被认定为“资产阶级当权派”与“资产阶级反动学术权威”。1970年1月，华侨大学停办。在周恩来安排下，韦悫从福建泉州回到北京。1976年11月25日，韦悫病逝于湖北省宜昌市，终年80岁。