肽酶（EC 编号：3.4.16-3.4.18）属于一种蛋白酶，可水解（裂解）蛋白质或肽的羧基端（C端）末的肽键。 过程与相反，该氨基肽酶在蛋白质的N末端能够切割肽键。 人、动物、细菌，以及植物包含有几种类型的羧肽酶，且具有从分解代谢至蛋白质成熟等之多种功能。
运作机制.产生羧肽酶的机制涉及酶底物配位水被羰基(C=O)基团底物所取代之现象。