噶举派道场。16世纪中叶，噶举派学者巴卧·祖拉陈瓦对拉隆寺加以修缮，形成了如今的格局。根据拉隆寺志记载，巴卧·祖拉陈瓦按照坛城的形状布置该寺格局，他圆寂之后，寺院开始活佛转世制度。拉隆寺从建寺开始，便经常派僧人赴中国内地朝廷进贡，该寺的大门上也曾悬有明朝皇帝所赐的横匾，寺院壁画中也有明显的中国内地青绿山水画风格的影响。到第三世活佛崔称多吉时，五世达赖将拉隆寺改宗格鲁派，并且为该寺册封了庄园、土地、属民。该寺寺志引用封文称：“凡是太阳可以照到的地方，凡是有流水的地方，凡是有牧草生长的地方，都是拉隆寺权