4年（元徽二年），建平王刘景素担任征北将军、南徐州刺史，何昌㝢为征北府主簿。因为要养老母求官禄，出任湘东郡太守。后为萧道成属下骠骑功曹。476年（元徽四年），刘景素乱起败死，何昌㝢向萧道成、褚渊上书申诉刘景素的冤屈。483年（永明元年），南齐竟陵王萧子良上表置文学官，何昌㝢担任竟陵王文学，受到厚遇。转为豫章王萧嶷扬州别驾，被萧嶷看重。转任太子中庶子，出任临川郡内史。担任庐陵王中军长史，没有任命，再任太子中庶子，兼屯骑校尉。转任吏部郎、侍中。494年（隆昌元年）、临海王萧昭秀担任荆州刺史，何昌㝢作为属下的