12月，贝京正式脱离波兰军队加入伊尔贡。在犹太人大屠杀期间，贝京的父母和哥哥均不幸遇难。贝京的妻子阿莉扎则幸运的躲过了屠杀，并和他在巴勒斯坦团聚。
犹太人地下组织.贝京在巴勒斯坦期间以激进的态度投身犹太复国运动，他反对以色列地工人党与英国政府的合作关系。贝京强烈抨击英国政府在欧洲犹太人面临灭顶之灾之时还在限制犹太人移民巴勒斯坦，他认为驱逐英国托管当局并在巴勒斯坦建立犹太国才是拯救欧洲犹太同胞的唯一方法。1943年，贝京成为了伊尔贡的领导人，他决定率领伊尔贡以武力打击英国托管当