1922年5月兼任），京汉京绥铁路管理局局长（1922年7月），交通大学北平铁道管理学院院长（1928年9月—1930年7月）等职。其中交通部铁路管理学校是1919年由他倡办。沈琪还是位建筑设计师。如今北京市张自忠路3号院内的灰砖洋楼，当年是清陆军部和海军部旧址，该楼始建于1906年（光绪三十二年），高两层，局部三层，面积近2200平方米，墙身采用砖柱和拱，屋顶采用木桁架和铁皮，并有大量精美砖雕，是现存规模最大且质量最好的晚清政府建筑。这栋建筑的设计师就是沈琪。2007年，该建筑入选“20世纪中国最不该