雨林区于2018年完工，以仿自然环境之绿篱及水道贯穿全区。展示大食蚁兽（全台唯一）、水豚、三种蜘蛛猴及多种中南美洲灵长类等。热带雨林馆即穿山甲馆座落于两个半区的中间。曾展示于热带雨林区的动物包括：赤颈鹤、紫秧鸡、白琵鹭、河口鳄、猪尾猕猴、马来猕猴、缅甸蟒、黑豹、河马、侏儒河马、、绿蓑鸽、懒猴、印度灰獴。现阶段展示于热带雨林区的动物包括：马来长吻鳄、、白面卷尾猴、、黑掌蜘蛛猴、水豚、小爪水獭、大食蚁兽、、马来貘、小食蚁兽、棉头绢猴、二趾树懒、青鸾、大宝冠鸟、栗喉蜂虎、大巨嘴鸟、琉璃金刚鹦鹉、射纹陆龟、