919年之前，称为民政长官（或称民政局长官），1919年之后称为总务长官。另外，总督府编制尚有总督官房与五局二部及所辖的官署机关。
总督.不管1896年发布的六三法及后来1906年三一法或1921年法三号，日本帝国所属台湾皆採委任立法制度，总督府为当然中央机关。而一般政策形成过程，通常是由总督府内的技术官僚制定法律政策后即授权台湾总督以总督府令命其中央机关、所辖官署或地方政府执行政策。但有部分情况，总督仍须与日本内地的国会协商并取得其同意，如专卖制度的推行等事务。在1895年到1