就是以两种现实存在的刺猬去进行命名。而及后发现的「音猬因子」则是以世嘉一套相当有名的电玩主角刺猬索尼克（Sonic the Hedgehog，即「音速小子」或「超音鼠」）而进行命名。
研究.果蝇的刺猬因子在上世纪的90年代早期被克隆。除果蝇外，也有在其他非嵴椎动物中克隆这类基因，如水蛭和海胆。至于嵴椎动物，其直系同源基因于1993年被克隆，包括的动物有小鼠，斑马鱼和鸡。之后不久，分别于1994年及1995年，第一个大鼠和人的刺猬因子也宣告克隆成功。
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