代时间先后顺序排列。至于第三册则是接续第二册，收录1859年至1867年的所有公文书，其编排方式也同第二册，为年代时间先后顺序的编年史。
手抄本.经过增修，该书主要原稿涵盖琉球史实年代起自1424年（琉球国王尚巴志3年、中国明朝永乐22年），迄于1867年（琉球国王尚泰20年、中国清朝同治6年），前后计444年。1868年日本明治政府成立，该政府正式将琉球视为己国领土，琉球王府形同崩溃。也因此，琉球国王府主导的《历代宝案》撰写工作不但停止，也将其该宝案正本移至位于日本东京的