都于阿力麻里附近的虎牙思（固尔札），即今日中华人民共和国新疆霍城县水定镇西北。察合台汗国君主都哇与窝阔台汗国君主海都联合，屡与元朝军队争战，终忽必烈一朝未断，并一度攻占漠北哈拉和林。至公元1304年始与海都子察八儿与元成宗讲和。
清朝时期.清高宗干隆二十二年（1757年）平定准噶尔蒙古后，吉尔吉斯人被清朝统治。向清朝纳贡的吉尔吉斯人被称为「布鲁特」分为东西两部，西布鲁特游牧于喀什噶尔北部河西部、叶尔羌西南部；共有四大部落；东布鲁特游牧于乌什、阿克苏西北，伊犁西南，共有五部落。后来清