十九年，回任两广总督。三十二年，袭二等昭信伯。三十八年，拜武英殿大学士。四十二年，迁云贵总督；翌年，暂在军机处行走，不久还总督本任。四十五年，云南粮储道海宁揭李贪纵，干隆帝派钱沣、和珅赴滇彻查，拟斩监候；翌年，甘肃爆发撒拉族苏四十三动乱，帝遣阿桂督师，特旨「予侍尧三品顶戴、孔雀翎，赴甘肃治军事」；旋甘肃冒赈案事发，陕甘总督勒尔谨获罪，命李摄总督。四十九年，撒拉族田五动乱，乱久未定，上责「玩延怯懦」，遭革职，命「随军效力督饷」；福康安至军，发侍尧「玩愒贻误诸罪」诸罪，状拟斩立决，帝仍从宽改斩监