第八届全国政协委员、全国人大常委会香港特别行政区基本法委员会委员。2002年，获聘为中国社会科学院法学研究所终身研究员、终身教授，任中国社会科学院台港澳法律研究中心主任。吴建璠精通古汉语、英语、俄语，长期研究法学理论、中国古代法制史、港澳台法律、刑事诉讼法。1997年5月6日，在江泽民主持、中共中央举办的第五次法制讲座会上，吴建璠向包括5位中共中央政治局常委在内的中央领导作《“一国两制”与香港基本法》专题讲座。1999年1月，香港终审法院作出判决，撤销对《入境条例》的修订，并宣布香港终审法院有权审查