，任教国立四川大学。民国三十八年，林尹携全家到台湾，任国立台湾师范大学教授、国文研究所所长。其后任教于国立政治大学、东吴大学、中国文化大学、辅仁大学、淡江大学，并先后担任中国文字学会首任理事长、中华文学协会会长、孔孟学会常务理事、第一届国大代表等。陈新雄1990年称，台湾百分之八十的中文系主任均出自林尹门下。林尹同时受教育部委託，参与研定常用、次用、罕用〈国字标准字体〉等工作。1983年6月8日，林尹因肺癌病逝于台北荣民总医院，以党旗、中华民国国旗覆棺，享年74岁。
作品