族入侵洮、岷，萧如薰与临洮总兵孙仁御敌，擒斩番族二百五十余人，青海寇八十二人，抚纳招降作乱番族五千人，得到驼马、甲仗不可胜数。再镇宁夏。银定、歹成数次有人进犯，都被其打败。如三十一年（1603年），海部鞑靼数次进入陕西塞，就被萧如薰与兵备副使李自实和同僚达云等击退。改镇蓟州。久后，罢官。后又起复，仍镇延绥。天启初年，廷议京师军队不足用，召边将分营训练，以萧如薰典神机营。面圣时，天启帝赐食嘉奖慰劳。次年，出镇徐州。不久召还北京，又以总兵官之职镇守保定。五年（1625年）夏，宦官魏忠贤之党弹劾萧如薰与已故南