可以用于脂肪酸合成。另外，输入线粒体的脂肪酸（脂肪的消化产物）也能通过转化爲乙酰辅酶A进入循环。
卟啉合成.另外，琥珀酰辅酶A亦是卟啉环合成的重要中间体，卟啉中大部分的碳原子都来自琥珀酰辅酶A。卟啉是（包括血红蛋白、肌红蛋白和细胞色素等）的重要组成成分。