森在1999年10月再获贝理雅招揽入阁，接替毛美琳出任北爱尔兰大臣。在上任后第一篇下院演说中，他误将自己的职位称为「爱尔兰大臣」，受到反对党派议员的激烈责难。 在任内，文德森推动权力下放方面的改革，见证北爱尔兰议会和北爱尔兰行政院成立，并着手重新改组当地警队成为北爱尔兰警务处。在2000年10月16日，有传媒披露杰佛里·罗宾逊指责文德森在贷款丑闻一事上向下议院隐瞒真相，致令两人双双从政府辞职。然而文德森没有承认罗宾逊的指控。
再度辞职.在2001年1月，文德森被揭发曾经致电内政