导致从中华民国政府迁台后几乎没有官方往来。1971年10月25日，身为共产阵营成员及苏联卫星国之一的捷克斯洛伐克社会主义共和国支持中华人民共和国取得联合国的「中国席位」（即中国代表权问题、《联合国大会2758号决议》）。1993年1月1日，斯洛伐克宣布独立，捷克斯洛伐克联邦共和国瓦解。在斯洛伐克转型为民主国家并重新对外开放后，双方始恢复往来。2019年5月，斯洛伐克国会友台小组主席，以及外交、经济、人权等委员会主席共20名议员，连署致函世界卫生组织唿吁邀请台湾出席世界卫生大会。2020年5月