发起中国科学社并创办《科学》杂志。同年回国，之后先后在湖南长沙高等工业学校、南京高等师范学校（后国立东南大学）、浙江高等工业学校等校任教，其中在浙江高等工业学校时创建了中国第一个化学工程系。1928年，创建中央研究院化学研究所并任所长。1931年一·二八事变发生，王琎和中央研究院化学研究所的同事，在实验室秘密研制出爆炸性极强的硝酸纤维渣压，并且雇佣一位船工，用小船拖着炸药包炸日本军舰，但船工因紧张而提前引爆，行动失败。当时，王琎还号召科学界人士捐钱支援抗日。1934年，受化学家艾萨克·科尔索夫（Iz