36年（1903年）8月因洪水导致曾文溪及盐水溪氾滥，旧运河溃堤且淤积，于是后来有了开辟新运河的计画。今日古运河旧址位于安北路86巷至安平路500巷之间，已成一绿带步道。
今运河.大正11年（1922年）4月16日安平港至永乐町间的新运河工程开工，位于古运河的南侧（即今日所见的台南运河），随后在大正15年（1926年）3月竣工，并于4月25日举行开通式。新完工的运河为台湾总督府技师松本虎太所设计，长3.782公里，河面宽37公尺、河底宽27.3公尺，退潮水深1.8公尺，主要用途