地盘内享有相当大的自主权，可说处于半割据状态。其宁海军由初建时的1300余人，到第一次国共内战时扩增至15万人，除多次镇压藏、哈萨克等少数民族叛乱，还曾派兵在青南和河西围剿堵截红军。第二次国共内战末期，马步芳的宁海军在陇东战役、固关战役、兰州战役中，被彭德怀率领的中国人民解放军消灭。民国三十八年（1949年）9月5日，解放军进入西宁市，结束了马氏家族在青海省40多年的统治。青海省成为中华人民共和国的一省，中华民国青海省政府也随之消亡。
行政区划.
县、市、设治局