影迷们指控剧集的制作人们（尤其是罗登贝瑞的后继者瑞克·博曼）亵渎了他们心目中的神。之后的系列影集，如：《重返地球》，特别是《星舰前传》，以及大部分的电影，都被戴上违反罗登贝瑞原则的大帽子。不过支持者们还是赞扬这些后罗登贝瑞时代的制作人们，例如博曼、布兰农·布拉加（）、隆纳德·摩尔（）等人，因为他们让《星舰奇航记》扩展至它的原创人原始梦想之外。
流行文化里的星舰奇航记.由于它的大受欢迎，一些属于星舰奇航记的观念与语言慢慢融入了大多数人的文化当中，而可以被视为一种流行文化。一些句子，比