9年版护照.1999年版卡塔尔护照的封面设计与1979及1990年版相同。从此版本开始，护照尺寸开始统一为ICAO所规定的标准。在内页方面，1999年版护照设有64页，并採用红、蓝双色水纸，同时具有紫外萤光及水印两种防伪特征；而所有护照资料均为可机读格式。此版本护照共发行了七年，一直发行至2006年6月30日为止。
2006年版护照.2006年7月1日，卡塔尔内政部发行新版护照。与上一个版本比较，封面及水纸设计分别不大，但萤光防伪图案则有所不同，而个人资料页则加入了持证