因如此，阿列克谢的出生实给予拉斯普廷一个掌权的机会。1918年，俄罗斯帝国灭亡，尼古拉二世全家遭布尔什维克军队（即后来的苏联共产党）处决，但快14岁生日的阿列克谢和其姐姐安娜斯塔西亚的遗体当时仍下落不明。
死亡后的后世研究.《纽约时报》2007年11月25日报导，苏维埃时期的档案中，有行刑者回忆处决过程的祕密报告。一群业余人士分析报告后发现，线索就在行刑队带头者尤洛夫斯基的证词中。尤洛夫斯基表示，其他王室成员或支持者未来寻找沙皇一家遗骸时，会将目标设定为十一具遗体；他们为了混淆视听