部命令该校搬迁到重庆近郊九龙坡原上海交大战时之校址，校方师生不从和教育部对峙，拖至1946年8月才搬迁完毕。1950年10月，和四川省立教育学院（前身为1906年的川东师范学堂）合併组成西南师范学院（1985年更名为西南师范大学，2005年7月和西南农业大学合併组成西南大学）。