根国际机场起飞的一刻，联邦航空局(FAA)位于波士顿的一直都有监察着其动态。航空管制员重覆与该飞机联络，稍后从机内传出一句「我们还有其他飞机」，便知发生了劫机事件。该名管制员随即向主管提出此警报，指该飞机正向纽约市领空飞去。上午8时32分，FAA位于维珍尼亚州的指挥中心向FAA总部发出通知。 上午8时37分，波士顿控制中心直接与纽约罗马的北美空防司令部（NORAD）联络。东北空防部队随即派出停泊于麻萨诸塞州法尔茅斯的两架F-15前往拦截11号班机，并于上午8时46分从奥的斯基地起飞。但在这时，11号班机