年特别股已经到期，但因为特别股东大多是公营或泛公股公司，所以各股东都睁一只眼闭一只眼，未向高铁公司要求赎回。然而，2012年因为立法院交通委员会的要求，以及监查院的调查，航发会首先开始对对高铁公司提起诉讼，要求赎回股本和支付股息。事情上了台面后，因为《公司法》规定公司经理人必须对公司利益负责，其他四十多间持有特别股的公司也不得不跟着提告。
交通部立场.交通部认为运量本来就仅供参考，各方预估都没预见台湾经济成长趋缓，这不是政府的责任，原始股东应自行承担投资风险。然而因为合约的规定，若