别于1989年被重新划分为第1防空导弹指挥部和1992年被划分为第1防空导弹联队。1994年，联队迁入现址。鹰式导弹武器系统则至2001年退役。2011年1月1日，该联队正式负责接管、以及来自已解散的的。通过空军防空导弹体系进行使用的这些系统是由驻胡苏姆的防空大队在2011年3月25日投入运作。联队的绰号“石勒苏益格-荷尔斯泰因”是在1989年获得。但自2014年10月1日起，随着联队的进一步整合，该绰号已不再适用于跨地区的部队名称。第1防空导弹联队在2013年6月30日前都是第4的下属部队。自