甚至连梅花鹿都比加拿大马鹿更与马鹿有关。尽管加拿大马鹿和马鹿能透过圈养繁殖产下有生育能力的后代，二野生种间的地理的隔绝，以及交配行为的差异，都显示加拿大马鹿和欧洲马鹿在受制环境以外的繁育是不可能发生的。
亚种.加拿大马鹿有众多的亚种：六种来自北美洲，四种来自亚洲，尽管有些分类学者认为他们是同种中不同的生态型或种族（race，物种透过外观与行为的小幅改变以适应当地环境）。族群的多样化包括鹿角形状与大小、体型、色泽及交配行为的不同。欧亚亚种DNA调查显示，鹿角、鬃毛与臀部斑点的表型变化