赠南京吏部尚书；祖父林元美，曾任知府，累赠南京吏部尚书；父林瀚，曾任南京兵部尚书 赠太子大保 谥文安。嫡母黄氏（封孺人加赠一品夫人）；生母朱氏。福州林浦林氏在明朝一季，共有八位进士，其中有五位官至尚书。史称「三代五尚书，七科八进士」。林庭机之子林燫、林烃亦出身进士，官至尚书。