雷德里克·冯·休尼（Friedrich von Huene）首次提出糙节龙是种侏罗纪恐龙，并认为糙节龙是种草食性兽脚亚目恐龙，同时建立糙节龙科（Dystrophaeidae）以包含糙节龙属。在1908年，冯·休尼修正他的错误，将糙节龙改归类于蜥脚下目的鲸龙科；之后在1927年改归类于鲸龙科的央齿龙亚科（Cardiodontinae）。在1966年，阿尔弗雷德·罗默（Alfred Romer）提出不同的分类法，将糙节龙归类于腕龙科的鲸龙亚科（Cetiosaurinae）。根据David Gillette在