士学位以后返回台湾，进入东吴大学物理学系任教至今。他曾于1996年至2004年担任东吴大学校长，2006年1月至2008年7月担任台北市立教育大学校长。现担任《科学月刊》董事长。
科学教育.刘源俊对台湾的科学教育相当重视，是《科学月刊》杂志创办者之一。近年刘源俊对台湾教育改革也提出相关批评。
争议.刘源俊在2015年5月4日抢救国文教育联盟记者会上表示，不读古文导致台湾「目前是空心文化，社会也是『四无』无礼、无义、无廉、无耻；年轻一代也是『六没有』没有认同