类SARS病毒29nt缺失的附近），将ORF8分为3个较小的开放阅读框。HKU3与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）有两段分别长5和12个胺基酸的序列缺失（但不见于WIV1病毒与SHC014病毒）