神户新交通运行有两条旅客捷运系统路线——港湾人工岛线和六甲人工岛线，其中港湾人工岛线更是世界上首条无人驾驶的捷运路线。神户市内有两条地铁线路，分别是神户市营地下铁西神-山手线和神户市营地铁海岸线，均由神户市交通局运营。六甲山的山地地形使得神户市内有多处缆索铁路和索道，包括了、、、、、。
海运.神户的历史和神户港的发展有着密不可分的关系。神户港的历史可追溯至奈良时代的大轮田泊。自鎌仓时代之后，大轮田泊改称兵库津。在室町时代，兵库津作为日明贸易的据点曾是一座国际港口。然而由于日本在江户