经常在繁忙时间出现挤塞，而青沙公路的交通配套并不完善，使用大榄隧道又会显得迂回，因此现时东铁线仍为往返新界东及九龙最快捷、方便、直接的路线。目前新界东人口仍然处于增长期（香港政府已启动古洞北及粉岭北新市镇发展计划，而北区、大埔区和沙田区亦有大量新建公营房屋即将落成），再加上2003年自由行政策开放后大量使用罗湖口岸及落马洲口岸入境的内地旅客使用东铁线进入香港市区，故本线的挤迫情况依旧十分严重。到2020年1月春节过后受2019冠状病毒病疫情影响，政府停止边境禁区的车站出入境服务，加上政府及部分企业先