孙岳任直隷督办兼省长。1926年（民国15年）1月，遭到「赤化」批判的冯玉祥下野。作为冯玉祥的代理，起初孙岳在对阵奉军的前线任前敌总指挥。后来国民军处于劣势，他因操劳过度而在3月病倒。此后，孙岳因病而未能如愿参加五原誓师以及国民政府北伐。后来，他被国民政府任命为河南省政府委员、军事委员会委员，保持了作为国民政府中的一员的地位。1928年（民国17年）5月27日，孙岳在上海病逝。享年51岁。