河道处在现代河道以东的位置上，当时的江水从清凉山西麓拍岸而过，秦淮河则在此汇入长江，山上的石头城要塞“控江守淮”，地势十分险要。在城北的狮子山（卢龙山）则是幕府山的余脉。秦淮河与金川河是南京城内的两大水系。紫金山及其横贯南京城的余脉形成了它们的天然分水岭。分水岭南侧的青溪、珍珠河、进香河等汇入内秦淮河。北侧的金川河水系与玄武湖水系相通。玄武湖水质为4类，而金川河则污染严重，为劣5类水质。市区内除玄武湖外、还有莫愁湖、南湖、紫霞湖、月牙湖（原城东护城河一部）等大小湖泊。
气候.南