基督教抗美援朝爱国行动大会上，根据吴高梓的提议，成立了“上海基督教团体抗美援朝委员会” 。从1950年起，吴高梓开始担任中华全国基督教协进会会长和中华基督教卫理公会中央议会总干事，这2个职务分别到1955年和1958年结束。1951年，吴高梓也积极参与控诉运动。1980年中国基督教协会成立后，吴高梓曾当选过第一届（1980年）及第二届（1986年）副会长，1992年起担任中国基督教两会顾问，1993年逝世。