努埃尔·德·罗萨斯与库约地区的其他的军事统帅们联手发动了攻击，企图消灭进行抵抗的部落们，但是只有罗萨斯取得了一点成功。与此同时，智利于1845年在麦哲伦海峡建立了蓬塔阿雷纳斯，这便威胁到了阿根廷对巴塔哥尼亚宣示主权。之后在1861年，智利开始了占领阿劳卡尼亚活动。智利在该地带的影响力逐渐增强，这便警告了阿根廷当权者们。当时在智利被打败了的马普切人与安第斯山脉东侧的那些游牧部落们有着很牢固的关系，并且他们说着同样的语言。第二次征服沙漠的计划的决定与执行之所以被触发，可能是因为胡安·加利弗古扎和他的60