，成为反对党。1796年的美国总统选举，民主共和党领袖杰佛逊输给联邦党候选人、时任美国副总统的约翰·亚当斯，但杰佛逊是该次选举得票数第二多的候选人而成为副总统，随后宪法修正使总统和副总统分开改选，使总统的对手不会因位居第二而成为副总统。1800年的美国总统选举，杰佛逊在国会选举人票中，击败寻求连任的亚当斯，终于当选总统，并于西元1804年通过美国宪法第十二修正案，获得连任。之后，民主共和党人麦迪逊和詹姆斯·门罗赢得之后的四次美国总统选举，使得民主共和党连续执政长达24年，也使得主要竞争对手联邦党瓦解