月山富田城沦陷，战国大名尼子氏灭亡。元通获许领有原领地，并担任伯耆国末石城主。永禄12年（1569年），目贺田幸宣等尼子旧臣决议叛变，山中幸盛等人拥立新宫党遗儿尼子胜久为主，组成尼子再兴军意欲复兴尼子家，元通此时加入再兴军。元龟元年（1570年），毛利辉元率毛利军与山中幸盛大战（布部山之战），再兴军败北，元通逃往京都。天正5年（1577年），尼子再兴军加入织田氏家臣羽柴秀吉的配下，于攻下播磨国上月城之后，以该城为据点。但后来毛利氏率6万大军将上月城团团包围。在此种军势劣势之下，秀吉未派出援军，而进攻