学生及职员由伦敦撤至布里斯托和格拉斯哥。部份校舍，包括国王大楼、方庭、教堂的后殿拱顶和彩绘玻璃窗在战时遭受炸弹破坏。国王学院对DNA的双股螺旋结构作出关键贡献。1953年，任职于国王学院的罗莎琳·富兰克林（Rosalind Franklin）和莫里斯·威尔金斯（Maurice Wilkins），联同共事的雷蒙·葛斯林（Raymond Gosling）、艾力克·斯托克斯（Alex Stokes）、贺伯特·威尔森（Herbert Wilson）等人在国王学院细胞及分子生物物理学院发现DNA结构。1966