萨号为对船舵进行彻底检修而退役，并一直持续至1905年1月。当维修完成后，它并没有重返现役，而是开始了一项大规模的重建。在现代化重建的过程中，德皇巴巴罗萨号有四门150毫米炮被移除，但增加了两门88毫米炮。全部十二门37毫米机炮均被移除，安装在舰艉的鱼雷管亦是如此。其舰艛也遭部分削减，以减轻舰只过度横摇的倾向；而则被更轻便的单杆桅所取代。此外，舰只的烟囱也得到加长。德皇巴巴罗萨号的现代化工程于1907年10月1日完成并重新投入使用。与此同时，最新式的德国级战列舰正在逐步投入使用；连同不伦瑞克级舰只一起，它