，成为河南的两大留防勇营之一。平捻次年1869年，毅军再奉调随左宗棠镇压陕甘回民起义，到光绪元年（1875年）调回内地，驻兵潼关。其间宋庆先后升补了湖南提督、四川提督，但都未到任，还是统领着他的毅军四处拼杀。
驻防旅顺.光绪六年（1880年），中俄关系紧张。清政府开始经营旅顺军港，毅军奉调填防旅顺，直接受北洋大臣节制。毅军在旅顺一驻就是十多年。至甲午战前毅军有九营一哨兵力，宋庆加太子少保、尚书衔。毅军虽非李鸿章嫡系淮军，但受命专守北洋要港旅顺，足见其名声、战力不容小觑。