伊尔斯·科赫一直留在布痕瓦尔德集中营，直到1943年8月24日收到她和她丈夫被德国当局逮捕的命令。对二人的指控包括私人集资，贪污，谋杀囚犯以防止他们作证。伊尔斯·科赫被监禁到1944年，后因证据不足无罪释放。但她的丈夫被慕尼黑的法院裁定罪名成立，判处死刑，于1945年4月5日（6天后布痕瓦尔德被美军解放）在布痕瓦尔德执行。她和家人搬到路德维希堡的一个镇上生活，在1945年6月30日在那里被美军当局逮捕。
第一次审判.1947年科赫和其他30名被告在设在达豪的美国军事法院接受审判