年团成立，黄季陆任中央团部常务干事兼宣传处处长。其后，历任内政部常务次长、四川省党部主任委员。1943年（民国32年）1月，任四川大学校长，在抗日战争中为该大学的扩充作出了贡献。1945年（民国34年），黄季陆当选中国国民党第六届中央执行委员。第二次国共内战期间，历任制宪国民大会代表、四川党团统一委员会委员。
1949年后.国共内战后期，1949年黄季陆随中华民国政府迁往台湾。此后，历任行政院政务委员、中央改造委员会设计委员、内政部部长、考试院考选部部长、教育部部长（1961年