六军分区政治委员兼中共冀南六地委书记，指挥反扫荡作战。1945年1月，文建武调任新四军第五师参谋长兼鄂豫皖湘赣军区参谋长。
第二次国共内战时期.抗日战争胜利后，任新四军第五师野战军司令员，11月改任中原军区第二纵队司令员，参加中原突围作战。1946年8月，任鄂豫陕军区司令员。1947年初，由于外线作战和疾病折磨，身体已很虚弱，经领导劝说，才离职住院。1947年2月20日随鄂豫陕军区野战纵队北渡黄河，转入晋冀鲁豫边区。7月任晋冀鲁豫野战军第十二纵队政治委员。1948年6月任豫西军区第