初，陈宝仓任中央军校武汉分校教育科长，兼任武汉城防指挥所主任，负责武汉的防务。1937年8月，日军进攻上海，陈宝仓奉命担任昆山。1938年春，陈宝仓参加安徽宣城战役，遭日军飞机轰炸受重伤，右眼失明。1938年6月，日军进攻武汉，陈宝仓眼伤未愈即参加武汉会战，经第九战区司令长官陈诚推荐，出任第二兵团总司令张发奎手下的参谋长，参加了德安战役，在德安战役中歼灭日军2万多人，击毙日军联队长田中大佐。早在抗日战争初期，张发奎在上海访问郭沫若，请郭沫若为其组建政治部，郭沫若与上海的中国共产党组织商议，按照周恩来