就在家中开设私塾。他曾担任沤汪文衡殿的董事，并在庙中设立「育英书院」，出任山长。
抗日经过.关于林崑冈抗日的经过，有数种说法。根据连横《台湾通史》（1920年）的记载，乙未战争嘉义城陷落后，林崑冈听闻义勇军履遭败仗，乃召集曾文溪以北各庄人士筹组义勇军，宣告说：「台湾亡矣，若等将何往？吾欲率子弟，卫桑梓。若等能从吾乎？」响应者百余人，公推新营庄生员沈芳徽为统率，而自己作为辅佐。派人赴台南请求拨付武器装备，但仅得旧铳数十桿。林崑冈率所部与日军对战于铁线桥。崑冈手持盾牌与利刃，勇士数