派则又分裂成骨北、肉北和中北三派。小北派在光海君即位后被大北派剷除，大北派在光海君时期把持朝政，倡导“废母论”，怂恿光海君囚禁仁穆大妃，并且在朝中买卖官职，引起朝野公愤，仁祖反正后定为奸佞，其党魁被赐死，大北派至此消亡。南人党分裂为清南和浊南。西人党在仁祖反正、废黜光海君的政变中得势，同时分裂为功西派（参加仁祖反正）和清西派（未参加反正），南人党李元翼被任命为领议政，形成了西人党和南人党近百年的党争。随后，功西派的势力超过清西派，功西派又分裂为原党（反清）和洛党（亲清），洛党得势，孝宗即位后剷除了洛党势力，