置清廷法令于不顾，一改“三百千”(三字经、百家姓、千字文)和四书五经的传统套路，首创按语言规律循循善诱，然后由实而虚的方法，使教育生活化。抛弃了经学教育，使新式教育踏上了正道。1903年，返绍兴与人创立越郡公学。普通学书室后亦陷入困境。1904年秋，应夏瑞芳、张元济的邀请，进入商务印书馆编译所任理化部主任，历时共28年。编写或主持编写了数百种理科中小学教科书及科学着作。
思想转变.其早年研究西方自然科学遂醉心于西方文化，但第一次世界大战后，他被现实所震惊，思想发生重大变化。他意识到