华民国国军与中国人民解放军之间的军事平衡。中华民国政府遂对张宪义发佈通缉令。1988年7月2日，参谋总长郝柏村上将在中正理工学院毕业典礼演讲上，指责张宪义出卖国家。在1998年出版的《教战记》中，称张宪义是外国间谍、是个汉奸。张宪义在1998年曾传真给《联合报》，称：张宪义于1988年1月9日滞美不归逃亡，所涉为「军中逃亡」罪，经国防部发布通缉，追诉权时效为12年6月。2000年7月11日，追诉权时效完成，由国防部最高军事法院检察署撤销通缉。2000年，张宪义已经转向研究民用核能，曾两度致信总统