。该寺是临济宗妙心寺派在台北布教据点之一。1918年11月19日在北投去世的温泉、制陶业者松本龟太郎就是由临济宗赠法号「破庵无住禅师」。1949年格鲁派第17世甘珠活佛驻钖时更名，全称是「灵泉山普济寺」。后来由性如法师接任主持。1987年前，台北市政府拟将普济寺作为中华汉藏文化协会会址，担任理事长的星云法师不忍让原住持迁出，便与悟一法师前往，当面将政府公文撕掉以表示让寺方续住。第8、9任住持分别是慧明、如目法师。
修复.一位在寺内帮忙的张姓女子曾说，该寺性如法师、莲航法