科学技术学院、人文与社会科学学院进行本科和研究生教学，2002年新建立的软件学院则只进行硕士培养；具有科大独特风格的少年班学院，专门进行英才教育；设立有创新试点班，与少年班学院统一管理，且没有年龄限制；部分院系设有科技英才班。此外还有继续教育学院可进行成人教育，网络教育学院可进行远程教育。中国科大在苏州和上海还设有专门的研究院。
少年班学院.少年班学院包括少年班、教改实验班和创新试点班。科大少年班创建于1978年3月，得益于华裔物理学家李政道的建议和邓小平、方毅等国家领导人的支持和