缺乏本国籍神父，必须从东南亚等地派遣神父来台；而各教区研议允许教友担任神职人员（如终身执事），也显示出台湾天主教会的牧民工作必须更加本土化的迫切性。此外，虽然台湾与中国大陆自1949年起便处于政治分治的状态，但圣座仍因为承认中华民国为中国代表将台湾的教省、教区等教会管区划归于中国（相关政治问题请参见海崃两岸关系）。而台湾与中国大陆的教务在教会法上尚未分开，如台湾主教团的英文名称「Chinese Regional Bishops' Conference」，直译即是「中华区主教团」之意；圣座在台湾的大使馆为