过深圳湾（香港称后海湾）；进入香港后，在新界西北部分支，一支线通往香港国际机场，另一支线则连接香港商业中心区（即香港岛中环一带），深圳地铁11号线将会在前海湾站附近预留向南延伸至香港的条件。香港方面已因成本为由而搁置计划，目前海天客运码头与福永码头设有定期航班服务接驳香港国际机场与深圳机场。
历史.本线前称西部深港城际线。由深圳西部至香港机场的城际铁路，本来计划由穗莞深城际线的一条支线负责。而在2007年7月公佈的深圳市轨道交通规划中，该支线已经被本线取代。