821年，伊利阿斯·马格努斯·弗里斯在其书《真菌分类系统》（Systema mycologicum）中提出了「腹菌纲」（Gasteromycetes）一名，与孢子产生于子实体外部的相对。由于他只依巨观形态进行分类，没有使用显微镜，他将一些块菌等许多现属子囊菌门的真菌也归入了腹菌纲中。这种分类方式被沿用了约150年之久，到二十世纪中叶时，研究者已渐渐发现腹菌纲下的类群异质性很大，可能包含许多亲缘关系很远的物种，不是一个自然的分类单元。随后DNA序列分析也证实了腹菌纲不是个单系群。