系统支持.Xilinx 官方版本支持 Microsoft Windows、Red Hat Enterprise 4, 5和6工作站版（包括32位和64位）以及 SUSE Linux Enterprise 11（包括32位和64位）。其他某些基于GNU/Linux的发行版在进行一些修改或配置后可以运行 Xilinx ISE WebPack。这些发行版包括 Gentoo Linux，Arch Linux，FreeBSD 和 Fedora。
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