后，历任军政部长、国民政府军事委员会北平军分会委员长、大本营参谋总长、陆军总司令、联合国军事参谋团中国代表团团长、国防部部长及行政院院长。于1949年前往台湾担任中华民国总统府战略顾问委员会主任委员、中国国民党中央评议委员会和国民大会主席团主席。为中华民国统帅旗、黄埔军校校旗及中华民国国徽设计者（因青天白日圆形体第一次出现在黄埔军校校旗中）。在高层决策谋划中有「干才」之誉。日本称其为日本通巨头。曾获美国总统罗斯福、英皇乔治六世、法国政府与墨西哥政府等授予各式勋章。着有《八年抗战》、《中国与世界前途》，曾任上