起，兰屿乡公所补助台东富冈渔港航班于淡季亦固定行驶，自此全年均有固定船班行驶于台东兰屿间，唯因天候或台风等因素，每日开航状况仍以船公司讯息为主。连假期间如元旦、春节等，视情况加开班次。目前共有两家船公司营运兰屿航线。不定期的渡轮海运航线分别往来垦丁、台东、绿岛，多为旅行团包船并开放余票供一般民众搭乘，预订乘客满80人即开船。巨龙航运股份有限公司所有之「巨龙」货轮、「龙春」货轮，每週定期行驶两次（同船经营每週台东-绿岛、台东-兰屿各往返两次）及新发航运所有之「大发壹号」货轮，每週不定期行驶，主要承揽货