腔棘鱼科（学名：）是腔棘鱼目下的一科，化石分布于全世界，起源于古生代二叠纪，然后在中生代侏儸纪时完全灭绝。现存的矛尾鱼经常被认为是腔棘鱼科的成员，不过事实上，牠们是属于比较进化的矛尾鱼属，一直到更新世才出现。