革命爆发，蔡锷就任云南都督，任命熊廷权为丽江府知府，命其策应西征军总司令殷承瓛进入西藏绥靖边区。西征结束后，熊廷权到北京觐见大总统袁世凯，获政事堂存记，仍发四川办差。1915年袁世凯称帝，四川都督陈宧出走，熊廷权应四川省各界的邀请，赴昆明见蔡锷。此后他和蔡锷定计，护国军和平开入成都。他应蔡锷之邀，入总督署为蔡锷办理机要。不久，他被派往川边，1916年11月11日兼任川边道道尹。在川边，他任职一年多，因形势不佳乃引退，1917年回到昆明。1918年，靖国联军统帅唐继尧聘熊廷权为行营参议。熊廷权随唐继尧到四