台南地方法院高雄支部升格成高雄地方法院，管辖区域包括澎湖厅。1945年，中华民国国民政府代表同盟国接管台湾后，由台湾高雄地方法院管辖澎湖所有民、刑诉讼案件，诉讼当事人往返渡海深感不便，乃由澎湖地方士绅陈伯寮等建请在澎湖筹设独立法院。1949年，澎湖七一三事件发生。司法行政部于12月26日设立台湾澎湖地方法院暨检察处，筹备之初，先租民房为法院及检察处之办公处所。1950年2月15日开始受理各种案件，至1953年2月间始筹建院舍，择定马公市中华路48号，地坪七百多坪为院、检址。再因案件渐增，员额随之增加，乃