6年11月3日，筹备处从王家堡迁到新址办公，归中国农业科学院筹备组领导。1957年10月28日，正式成立中国农业科学院西北畜牧兽医研究所。所址位于兰州市城关区盐场堡徐家坪。时任省畜牧厅厅长陈玉山兼任所长。1965年9月，农业部决定将中国农业科学院哈尔滨兽医研究所领导中心和一部分研究工作（家畜寄生虫病、家畜真菌病、兽医卫生、药学、抗菌素等）由哈尔滨市迁至兰州市，同时与中国农业科学院西北畜牧兽医研究所的兽医部分、中国农业科学院中兽医研究所合并，组成中国农业科学院兽医研究所。1970年，研究所下放给甘肃省