副校长，李方训（原金陵大学校长）为第二副校长，保留原南大、金大必要职员组织行政机关。原南京大学及前金陵大学的档案、文物（如校印等），除需立即应用者以外均归南京大学。全校专任教师253人，本科生1296人，专科生482人。1956年，心理系迁往北京组建中国科学院心理研究所。
工学院：南京工学院、华东水利学院、华东航空学院.以原南京大学工学院建筑系、机械系、电机系、土木系、化工系和农学院食品工业系为基础，合并金陵大学理学院电机系、化工系，私立江南大学机械系、电机系、食品工业系，武汉大学