亚松森奥林匹克.圣克鲁斯在他九岁时就加入了亚松森奥林匹克俱乐部。他在起初几个赛季成为了青训营的射手王。他在15岁时被教练路易斯·库比拉看重，进入一线队。圣克鲁斯在1998年7月27日对阵伽罗博腾诺(Cerro Porteño)的德比首次为一线队登场，那时他年满16岁。圣克鲁斯依靠自己优异的表现，带领球队拿到了巴拉圭联赛冠军，自己也因此获得了1998-1999年。
拜仁慕尼黑.圣克鲁斯在亚松森奥林匹克以及巴拉圭国家队的优异表现引起了德甲豪门拜仁慕尼黑的注意。