1907年11月发生北埔事件，武装抗日才进入第3期。这段5年的停歇时间，一方面是源自儿玉源太郎总督的高压统治，一方面也因为总督府以民生等政策拉拢台人。在双重因素影响下，台湾汉族对于抗日行动採取了观望的态度。自1907年的北埔事件起，到1915年的西来庵事件为止，总共有13起零星武装抗日事件。但是，除了最后一次的西来庵事件外，规模都很小，还有的事先就被发觉捕获，因此和过去大规模的反抗不同。西来庵事件是汉人第一次利用宗教力量来推动抗日，规模的浩大，事件的结束，亦使台湾人认识，因为军事实力的悬殊，起义举动难有