门只进行国家重点学科的评估，依国家重点学科的评估结果，官方高校排名由北京大学，清华大学和复旦大学位前三甲，目前在该评估中学科优势较为明显的学校有北京大学，清华大学，中国人民大学，北京理工大学，复旦大学，上海交大，浙江大学，南京大学，中国科学技术大学，武汉大学，厦门大学, 中山大学, 南开大学, 西安交通大学等。 而中国论坛网络曾经传言教育部九十年代中期有过部属院校的排名，而经证是《黄金时代》、《跨世纪人才》两本杂志没有根据的文章，其列出名单有：清华大学、北京大学、浙江大学、北京理工大学、南京大学、复旦大学