959年11月28日落成举行献堂典礼，1967年3月增建二、三楼，课室10间，两大理化实验室，9月开办英文中学，初时只有中一三班，中二一班；后逐年增办至中七。再逐步停办小学和初中。学校现时的校舍为1975年加建后的外貌。政府于2000年起逐步停止向私立学校买位，该校于2001年起由当时少数剩余的买位中学之一改办成高中学校。学校未转型前是没有与政府签约的买位中学。但随后三三四高中教育改革推行，该校因无法适应变化，于2014年暂时停办中学，而向教育局申办幼稚园及其他专科课程。九龙闽南中华基督教会于2018年