维新九年（1915年），任上审院总督。启定六年（1921年）五月，申仲回京任职，升授协佐大学士。八月，领学部尚书，充机密院大臣。启定七年（1922年）正月，改领兵部尚书，兼领学部尚书，并兼都察院都御史。九月，申仲上奏，请求将翻译所改为古学院，得启定帝批准。启定八年（1923年）正月，加太子少保衔。启定十年（1925年）七月，申仲去世，寿五十七岁。追赠东阁大学士。
家庭.申仲娶坚太王阮福洪侅幼女阮氏如璠，生2子2女。