兼任总参谋长，叶剑英为副参谋长。整个第二次国共内战期间，只设有军委总参谋长（先后由彭德怀、周恩来担任）和军委作战部，并无总参谋部的名义。1947年6月，出现了中国人民解放军总部或总司令部的名义，但一直没有以总参谋部的名义出现。第二次国共内战爆发后，胡宗南率部进攻陕北，彭德怀任西北野战军司令员兼政委，1947年8月30日中央决定总参谋长一职由中央军委副主席周恩来代理。
建国初期.1949年10月1日，中华人民共和国成立，同时成立中央人民政府人民革命军事委员会，华北军区第一副司令员