而质问为何丰臣氏集结浪人。元和2年（1616年），家康死去后，崇传主张以明神作为家康的神号，但是最终决定採用天海主张的权现。元和4年（1618年），崇传在江户建立金地院。翌年，他成为僧录后，金地院僧录全由崇传法系的僧人佔据。其后，他往返南禅寺（金地院）和江户的金地院，并且执行政务。另外，崇传亦修复南禅寺和建长寺，并且在收集和发行古籍等艺术层面作出贡献。宽永4年（1627年），崇传原本打算将在紫衣事件上反对幕府的泽庵宗彭、玉室宗珀和江月宗玩流放至远岛，但是在天海和柳生宗矩等人介入下，改为将泽庵流放