重修，于日据大正六年（1917年）重修一次。昭和三年（1928年）六月复由再度重修，奉祀天上圣母。昭和十二年（1937年），日本人推行皇民化运动，将原建于斗六街头奉祀天上圣母之妈祖庙焚毁，新兴宫因设有夜间学堂，在地方士绅陈情下未被拆除。信徒将神像移至草岭，于风波过后迎回奉祀。自此新兴宫成为斗六地区妈祖信仰中心。