861年，水云在龙潭开始传教后便遭到儒生和官府的非难与镇压。次年，他回到庆州传教，在那里建立起东学组织——“接”，并任命了16位接主。东学开始以庆尚和全罗两道为中心向朝鲜全国扩散，信徒众多，势力不断扩大，引起朝鲜封建统治者的担忧。东学也被朝鲜朝廷定为与天主教一样的邪教。水云预感自己有殉教的危险，于是在1863年9月26日（农历8月14日）将教主之位传给自己的大弟子、远亲崔时亨。1864年4月15日（农历3月10日），水云在大邱被庆尚道观察使徐宪淳以左道惑民之罪处于极刑殉教。