1998–99年欧洲盃赛冠军盃是欧洲足协举办的第 39 届欧洲盃赛冠军盃赛事，同时亦是最后一届赛事，下季开始欧洲盃赛冠军盃会併入欧洲足协盃当中。本届赛事由拉素赢得冠军，他们于决赛以 2–1 击败马略卡，赢得最后一届赛事冠军。