鳄的化石带有波波龙、苏牟龙的骨头，因此被错误鑑定为波波龙超科。之后波斯特鳄被重新归类到劳氏鳄科，波波龙超科则被认为不是三叠纪的兽脚类恐龙。在2007年，Jonathan C. Weinbaum、Axel Hungerbühler首次提出波波龙超科的演化支定义。他们研究波波龙的两个新发现标本，建立波波龙的数个新鑑定特征，并提出种系发生学分析，将波波龙超科定义为单系群演化支；而劳氏鳄科、迅勐鳄科的演化位置较为原始，三者共同属于副鳄形类演化支。在2005年，保罗·塞里诺（Paul Sereno）提出波波龙