始新世的地层未露出地表，必须以钻探方式得知。云林层是白垩纪的地层，只能从钻孔得知其存在。该层地质是粉砂岩、玄武岩、页岩和石灰岩。古新世的王功层则包含火山砾岩、砂岩、页岩和石灰岩，深度超过 1000 公尺。始新世的双吉层则主要是火山物质组成的凝灰岩和凝灰质砂岩。厚度从 100 到 3000 公尺不等。渐新世的五指山层则主要是由厚层、白色而较粗粒的砂岩所构成。该地层厚度可从 0.9 到 1.2 公里 中新世的野柳群主要是细颗粒砂岩，包含部分页岩、玄武岩质凝灰岩和三层煤层。该群包含大寮层、木山