表英华书院夺得中银全港学界羽毛球团体锦标赛冠军及至13、14岁左右就入选香港羽毛球代表队。2013年8月，李卓耀代表香港参加在中国南京举行的第二届亚洲青年运动会羽毛球比赛，并打进男子单打项目决赛。最终，他以0比2（22-24、14-21）不敌东道主林贵埔，屈居亚军。赛后，李卓耀表示因为之前比赛激烈，以致自己在最后体力不够而落败，但对这个成绩还是很满意的。2017年8月，李卓耀出战纽西兰羽毛球黄金大奖赛，在男单决赛中以2比1（11-21、21-15、22-20）反胜大会头号种子、中华台北选手王子维，赢