1938年3月担任经济学部部长。1937年担任部长期间批判左派矢内原忠雄的言论，致使后者以流放形式辞去东京大学教授之职。又逢以河合荣治郎为代表的自由主义派和以大内兵卫为代表的左派矛盾冲突激化，河合荣治郎的着作被禁止出版，1938年底平贺让被任命为新一届东京大学校长。1939年2月13日以大学纲纪紊乱和东京大学再建障碍为由发出休职命令，变相辞退一批教授。。离开东京大学后先后担任日本中央大学、近畿大学、国学院大学、独协大学。