了刘劭，何偃继续获得任用，先任大司马长史、后转侍中、领太子中庶子，再改领骁骑将军，又更得孝武帝亲信，甚至比其旧臣更为亲近。何偃及后转任负责选任官员的重要职位吏部尚书，而上任之时离其父何尚之解领吏部相距不足五年，当时的人以此为荣。不过，这就令昔日同为侍中的颜竣相当不满，以往颜竣和何偃谈论文辞义理，十分欢愉，然而随着颜竣愈得孝武帝宠任，他就愈想获得重用，但至此时何偃却取代了颜竣吏部尚书之位，二人之间遂生嫌隙。时颜竣权势甚大，何偃很不安心，患上了心悸病，遂告病辞职。孝武帝却按其病况需要提供名医和上好药物去治他的病