曾荫权改任贸易署署长，主理贸易谈判及有关贸易的行政事宜。到1993年5月，曾荫权获擢升为库务司，负责政府的资源调配、税务系统的运作和控制政府的成本效益。
财政司.1995年9月，曾荫权获时任香港总督彭定康委任为财政司，接替麦高乐爵士，成为香港历史上首任华人财政司。在任期间，香港的公共开支一直稳步增长，公共收入雄厚稳健，政府亦出现充裕的盈余。当时香港的公共开支上升至佔本地生产总值的23%。在香港主权移交前夕，曾荫权在港督府获查理斯王子颁授英国爵级司令勋章（），以志他对香港多年的贡献。