红、蔡孝干、林日高等一起推动反日本帝国主义殖民的台湾独立运动，延续一贯反日反日本帝国主义侵略的左翼社会运动路线。这个时期侯朝宗与翁泽生、林日高经常从事地下活动，并曾经与蔡孝干前往上海大学学习过社会主义。1931年九一八事变后，侯朝宗加入国民政府成立宋哲元所属的稽查政务委员会，1937年抗战爆发后侯朝宗改名刘启光，在重庆军事委员会总政治部从事对日宣传的工作，不久升任第三战区少将兼中央设计委员会专员，根据侯朝宗1940年写给朱家骅的信件中提及「长年任职于统计局」，显示侯朝宗在1931年至1937年这段期间因