被受驳斥，不过一些物种仍能以形态及粒线体DNA来分辨。侏儒变色龙的种系发生学及生物地理学较为一致。西开普侏儒变色龙及"B. damaranum"是分支的基底，但彼此关系不明。牠们之间似乎比其他物种更为接近，但整体上却很疏远。牠们散佈在西开普省海岸及东开普省西部，栖息在多种环境。牠们的祖征包括体型很大，呈突出的绿色，及有长的尾巴。其余的物种组成了一个分支，且可以分为小群。一群是源自德拉肯斯堡山脉，包括北部的"B. dracomontanum"、南部的"B. transvaalense"及在东南部未描述