州共和党大会代表，虽然他不是全国大会代表，但还是与爱荷华州的代表们一起出席了1860年共和党全国大会，亚伯拉罕·林肯就是在这次会议上获得总统候选人提名。林肯最终在普选中获胜，并且也拿下了爱荷华州，但南方各州对共和党的胜利作出激烈反应，相继宣布脱离联邦，南北战争由此打响。
南北战争.1861年4月，邦联陆军炮轰萨姆特堡，南北战争正式爆发，林肯号召7.5万人加入北军应战。韦弗所加入的部队之后会成为爱荷华州第2志愿步兵团的连，他还获选为连队中尉。统领第2团的是前联邦众议员塞缪尔·瑞恩·柯