在8月28日上报给日本中央监督总督府业务的拓殖务大臣高岛鞆之助，指出松村雄之进支厅长原本即有不能让军队不分好坏残害人民的责任，报请拓殖务大臣上奏免松村支厅长官职及缴还勋章、位阶证明书。拓殖务省也很快在8月29日发文送交主管人事奖惩的赏勋局。9月2日，松村雄之进正式被撤职，并且被要求缴还勋章、叙位证明书，离开台湾。1896年10月14日，乃木希典就任第3任台湾总督。11月14日，总督乃木希典训令「各混成旅团长、宪兵队司令官」，严禁烧夷良民家屋，但是「若战术上有其必要，述明理由报告」即可。1897年3月27