在野联盟，成为国会的绝对多数。但在2001年的立委选举中，由于亲民党提名了许多原新党市议员参选立委，带走了原本新党的支持者，导致了新党面临立委选举得票面临5%门槛保卫战而继续提出不分区名单，但时任主席谢启大高额提名策略失败使新党票源分散而大败，同时在台北县长选举由泛蓝共推的新党王建煊因缺乏基层组织仅以论述固票，导致多个传统蓝营票仓失守，以数万票之差败于苏贞昌的高票连任，也让民进党首度在北县拿下过半选票，这些选举结果使新党遭受重大挫败，仅在金门县获选一席立委及县长，退居为台湾第五大党。新党决议进行改革，将主力