城市地貌造就的道路布局先天不合理因素，造成了杭州市区道路拥堵现象很严重，停车矛盾也非常突出。
铁路.现有线路包括沪昆线（浙赣段（旧称浙赣线）、沪杭段（旧称沪杭铁路））、萧甬线、宣杭线。高速铁路现有沪杭高速铁路、杭宁客运专线、杭甬客运专线、杭长客运专线和杭黄客运专线，在建高铁有杭绍台高铁、杭温高铁、杭衢高铁和湖州至杭州西至杭黄高铁连接线（湖杭高铁）。铁路杭州站位于上城区，因站址在1910年由清泰门外迁当时杭州城清泰门内，故本地媒体和民众一般称“城站”并沿用至今，杭州公交在铁路杭州