于昭和14年（1939年）组织「冈本翁颂德碑建设会」募得682日圆，并选择一块高105公分、宽70公分、产于日本的帽状辉长岩为碑，由工学博士若林野一郎撰文，曾任台北州知事之高田富藏书写碑题，刻成于昭和15年（1940年）。石碑原预定立于发现北投石的北投公园内，后因第二次世界大战影响暂存于北投天狗庵（冈本氏进行调查时暂居之处）。1960年代徐坤泉先生于天狗庵厨房地板上发现，并将石碑搬移至其所经营的文士阁夜花园中。其后又经杜聪明博士协调，转置于洪长庚医师（亦为受冈本氏启发之矿物研究者）之大稻埕达观眼科医院庭