3年正式成为国防医学院之教学医院。目前是中华民国唯一「医学中心」级的国军医院。除对中华民国国军官兵及眷属提供医疗服务和因应国防和军事需求的医学研究外，也以「三军总医院附设民众诊疗服务处」的名义对一般大众提供医疗服务。
历史.台湾战后时期，于1946年将「日本台湾陆军病院南门病室」（今台北市立联合医院和平院区与附近地区）改编为台湾陆军医院，以吴国兴上校为院长，并接管日军北投病室。台湾战后时期多次改制，1949年改制为联合勤务总司令部第五总医院。此后医院名称编制更动，1950年改组为陆