权、大顺、大西政权被消灭，南明的残余势力诸如郑成功等退居东南沿海一带继续抗清。1662年，郑成功从荷兰人手中夺取台湾，奉南明永历帝为正朔，对抗清朝。在清朝完全占领中原之后，明朝的支持者们并没有被彻底消灭。他们或是流亡海外，或转入地下活动，形成天地会、洪门等反清复明的秘密结社组织。
康熙时期.
削平三藩.1662年，年仅八岁的康熙帝即位，康熙初年，西南的三藩云南吴三桂、广东尚可喜、福建耿精忠为朝廷的最大割据势力，威胁中央集权在华南地区的权威。康熙十二年（16