非干隆年间原物，故中国藏语系高级佛学院就地对原有地基基础和土衬石进行了遗址保护。修缮论证期间，专业人员多次提出恢复慧香阁的历史原貌，但因慧香阁为全木结构，修缮资金落实困难，慧香阁复建计划暂遭搁置。2006年11月，全国政协副主席、中共中央统战部部长刘延东到西黄寺施工现场视察时表示：“既然叫慧香阁，阁就应该是两层。况且历史上就是两层，我们应该恢复慧香阁的历史原貌。”由此，慧香阁复建并恢复了历史原貌。此次修缮由国家拨款，此外香港新鸿基地产郭氏基金会还为此进行了捐款。
建筑.西黄