并且与脚本家田中澄江合作。1963年，吉村公三郎脑出血。1972年，吉村整个胃需要摘除，体力大不如前。1974年，三国连太郎主演之《褴褛之旗》为吉村公三郎最后执导之电影。1976年，吉村获得紫绶褒章。1982年，吉村获得勲四等旭日小绶章。1985年，电影导演牛原虚彦去世，吉村担任葬仪委员长。1994年，新藤兼人的妻子乙羽信子去世后，吉村再度担任葬仪委员长。2000年11月27日，吉村公三郎因急性心衰竭去世，终年89岁。
家族.吉村公三郎长兄为文学家吉村正一郎。吉村公三郎育有