殿堂楼宇600多间。其中，圆通宝殿为单层重檐，为观音菩萨正殿。可同时容纳数千人，殿中供奉毗卢观音，四周塑有观音道场特有的观音三十二应化身。普济寺前的莲花池，面积约15亩，以盛产五色并蒂莲花而闻名。湖上永寿桥建于明万历三十四年（1606年）。寺东南的多宝塔，建于元元统二年（1334年），为普陀山现存最早建筑。塔四面五层，以太湖石砌筑而成。