BS被学校网络中心强行物理屏蔽校外访问，进站画面声明改为校内型。3月17日凌晨，站务委员会发布公告，声明水木BBS进入特殊时期，迫于校方压力，“改变现状的可能性基本为零”。学生纷纷创作文章、诗词、进站画面表达伤感之情。3月18日中午，数百名学生自发地在大礼堂前日晷处集会，共同祭奠水木清华。4月14日，网络中心陈茂科等人强行进入水木BBS服务器机房并替换核心程序。下午，站务委员会发布公告，宣布已失去最高管理权限，“水木清华站务委员会成员一直团结在一起，但是我们无法与暴力和强权抗衡”，并于19日下午宣布集体辞职