662年手抄而成的《澳门仁慈堂章程》正本、绘于18世纪的身兼首任天主教澳门教区主教的仁慈堂创始人贾耐劳主教全身油画、头颅遗骨和其陪葬的十字架、圣辣非医院内的铜钟外，也有展出大部分由土生葡人飞安达及马若龙捐赠从欧洲、日本及中国大陆等地搜购天主教传教士过去在中国江西景德镇制造到的天主教东方礼的祭献仪式所用的器具以及刻有耶稣会徽号的陶瓷器皿等藏品。于2011年年底开设新展厅佔地800平方呎；其展品大多突显天主教在东西文化影响而制成的瓷器、象牙、木雕、银器物品，也展有104.5厘米高于同治年间烧制瓷器粉彩的耶稣