诸塞湾交通局的债务攀升速度十分可观。2006年，将部分城镇从马萨诸塞湾交通局的服务中剥离出来，马萨诸塞湾交通局获得的预算并没有什么改变。第二年，马萨诸塞湾交通局将通勤铁路服务延伸至的区域，这是的第三条分支。罗德岛州于2010年出资将延伸至西奥多·弗朗西斯·格林机场，于2012年延伸至。2012年11月，上新增了。2009年6月26日，州长德瓦尔·帕特里克签署法令将马萨诸塞湾交通局和其他运输机构归为马萨诸塞州交通部(MassDOT)管辖，马萨诸塞湾交通局成为交通部的大众运输部门(MassTrans)。