师范大学化学系毕业，获学士学位。此后历任哈尔滨师范大学化学系讲师、教授，1987年6月任化学系副系主任。1992年5月任哈尔滨师范大学校长助理。1993年2月任哈尔滨师范大学副校长。1997年4月任哈尔滨师范大学校长。1989年5月，王佐书加入中国民主促进会。1995年4月任中国民主促进会黑龙江省委副主委。1997年5月任中国民主促进会黑龙江省委主委。1998年春，王佐书高票当选黑龙江省人民政府副省长，分管卫生工作。他在1998年夏的嫩江、松花江流域特大洪灾中，亲自走遍了黑龙江省确定的22个重灾县（