俾斯麦的文化斗争（Kulturkampf），反抗达尔维希克男爵和克特勒主教。在1866年的普奥战争中，黑森站在奥地利帝国一方。战争的结果是奥地利同盟的失败，黑森大公国被迫将刚刚获得的黑森-霍姆堡割让给普鲁士。次年，黑森大公国北部的上黑森省加入新成立的北德意志邦联，1871年普法战争之后，整个黑森大公国加入北德意志邦联，德意志帝国成立。路德维希三世于同年罢免了达尔维希克男爵的首相职务。
晚年.路德维希三世的第一任妻子于1862年去世，他于1868年续娶了平民安娜·玛格达勒娜·阿培尔（