2006年6月，张茅转任国家发展改革委员会副主任，主导医疗卫生体制改革。2009年1月，接替高强出任卫生部党组书记、副部长，晋升正部级。2013年3月，第十二届全国人民代表大会第一次会议通过《国务院机构改革和职能转变方案》，决定将原国家计生委和卫生部合并，张茅离开卫生部，调任国家工商行政管理总局局长、党组书记。2018年1月，当选第十三届全国政协委员。3月，任第十三届全国政协常委、教科卫体委员会副主任。同月21日，国家工商行政管理总局、国家质量监督检验检疫总局、国家食品药品监督管理总局被撤销，新