用以关联原始化合物的元素成分和化合物结构。在当今时代分析实验室里，质谱技术的使用非常普遍，用于研究各种各样化合物的物理、化学以及生物的性能。质谱技术早在上个世纪七八十年代就用于测量生物体的目标代谢物。质谱技术的最大优势在于高灵敏度，测量范围宽广，可以与色谱法(chromatography)技术（包括气相色谱法和液相色谱）有机联用，近年来成为代谢物组学领域一个主要的研究工具。
关键应用.通过代谢分析（特别是尿液或血浆样本）的毒性评估/毒理学检测由化学物质（或化学物质混合物）的毒性损伤