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车站构造.新干线车站的管辖是属JR东海，在来线与车站出入口管辖则是属JR西日本。唯一位于滋贺县的东海道新干线车站。
JR西日本、JR东海.现在的站舍是于2009年3月21日开始使用的跨站式站房。
在来线.岛式月台3面6线。
新干线.东海道新干线为岛式月台1面2线与单式月台1面1线、合计2面3线。11号线为下行（新大坂・博多方向）、12号线为上行（名古屋・东京方向）、13号线通常不使用。