2001年，当选为中国工程院院士。
学术研究.主要学术成就在病毒性肝炎研究上。庄辉首先证明了中国存在两大类型的肝炎：流行性和散发性戊型肝炎。庄辉经长期考察研究，基于中国肝炎流行情况，提出在中国戊型肝炎流行和散发与肝炎病毒基因型无明显关联，而主要与流行因素相关。庄辉发现戊型肝炎开放读框（open reading frame）的3抗原主要与肝炎急性期抗体相关，而开放读框的2抗原则与处于恢复期的抗体有着密切关系。庄辉在中国率先建成了戊型肝炎的实验室诊断技术和肝炎的猕猴动物