结构.3公司站体分别在不同建物，因此只能站外转乘。JR东日本站房在筑波快线建设时的2005年改建，增加无障碍设施。另外，东京地下铁站房也在同年进行整修增加无障碍设施。筑波快线站房在建设时就已加入无障碍设施。
JR东日本.岛式月台1面2线的高架车站，月台在二楼。唯一的南侧出口位于日比谷线车站的北口附近。地方居民提出增设北口的请求，但JR东日本以「未达增设出口的使用人数」为理由拒绝，并表示「若是地方（荒川区）愿意负担开设费用，或是使用人数达到标准，将研拟设置」。本站是的业