乘站。车站以临近哈尔滨医科大学附属第二医院命名。医大二院站位于学府路下，学府路与保健路交叉口处。附近有哈尔滨医科大学、哈药集团制药总厂、哈尔滨医科大学附属第二医院等，最近的公交车站为医大二院站。
结构.医大二院站为三层地下车站，地下2层岛式站台由哈尔滨地铁1号线列车使用，地下3层两个侧式站台由哈尔滨地铁3号线列车使用。