国民军，直到1930年才被南京任为金树仁的部下新疆边防督办公署参谋处上校参谋。因南京无力解决冲突，战事继续。盛世才感到沮丧，于1934年投靠苏联。在苏联支持下，马虎山于1937年被击败。盛世才将新疆变为苏联的保护国和中国共产党的安全天堂。1941年纳粹德国入侵苏联，盛世才决定重新加入国民党，驱逐苏联顾问，处决共产党员。蒋介石不信任意图重新和约瑟夫·斯大林谈判的盛世才，1944年将其罢黜，建立直接统治。新的国民党政府随即面临一场东突厥斯坦共和国的叛乱。