将军，并改名足利义尊。室町幕府派兵讨伐，于同年九月攻下书写山坂本城，迫使赤松满祐逃亡城山城，不过九月十一日就将此城给攻破，赤松满祐放火自尽。嘉吉之乱后，赤松氏的领地转给了山名氏，使得后者势力逐渐扩大。山名氏与细川氏的矛盾最终造成了发生在1467年的应仁之乱。