座囊菌纲（学名：Dothideomycetes）是子囊菌门盘菌亚门下的一纲，共包含11个目、90个科、1300个属及超过19000个种。传统上本纲的大多数真菌都被算作腔菌（loculoascomycetes），不过现在这一分类已不被接受。本纲原先认为的一些传统的形态学特征现在发现并非是特殊的，目前的划分是基于DNA序列的比较进行的。