中除强调母语教学的优势外，亦同时把马来语和英语列为必修且必考科目，提倡“三文三语”的教育方针。在教育观点上，推崇 “德、智、体、群、美”五育并重。各独中皆设有教务处、训育处、课外活动处和辅导处。华文独中的学制与美国、英国（苏格兰）、台湾、日本、中华人民共和国、香港等地区的教育体系相似。独中实行六年中学教育，以三年初中、三年高中（三三学制）分为两个阶段完成。此此外，大部分独中实施留级制度，学生成绩若未达校方所设之标准，便不得升班。在教材方面，独中采用的是董总所编纂的高、初中统一课本。课本是根据董教总全