发生了分歧，几乎很快就被孤立，富歇使尽浑身解数应付温和派的攻击。 1795年8月9日，他本人被 谴责，导致他被拘捕，但保皇党人的叛乱中止了他的执行，随后因公告实施的大赦，他被释放了。在随后1795年至1799年的督政府，富歇起初保持默默无闻，但他与极左派的关系，曾经是由领导现在是格拉克斯·巴贝夫，帮助他再一次窜起。 据说，1796年的巴贝夫，因他背叛而投靠保罗·巴拉斯督导(the Director)被处决，最近的研究倾向于将怀疑转为断定。他由贫困缓慢的爬升， 1797年，他获得了处理军用物资的任命，