家罗伯特·布鲁姆（Robert Broom）所命名。在1920年，德国古生物学家弗雷德里克·冯·休尼（ Friedrich von Huene）建立派克鳄科，被分类于伪鳄亚目；当时伪鳄亚目包含许多三叠纪的鳄鱼远亲。近年种系发生学研究，多将派克鳄科分类于主龙形类的基础位置。派克鳄科与鳄鱼、鸟鳄科、恐龙的共同祖先类似，但并非直系祖先。派克鳄科目前的有效属只有派克鳄，其他的可能属包含："Halazaisuchus"、欧斯莫斯卡鳄（"Osmolskina"）。