大部分仍居原处，后随科尔沁部归附后金。
清廷赎买.清初，东北地区的兵丁多调入关内，关外兵源不足。同时，锡伯人常常劫掠过往军民，且属科尔沁部，黑龙江将军无法直接管辖，必须通过理藩院处理。为了加强东北防务，并取得对锡伯人的直接控制，康熙三十一年（1692年），清廷自科尔沁蒙古“赎买”走了全部锡伯、卦尔察和达斡尔部，并编入上三旗，派驻齐齐哈尔、伯都讷和吉林乌拉。
南迁.为了加强盛京（今沈阳）及其周边的防卫，同时加强对锡伯人的有效管理，康熙三十八年（1699年），