嘉义遭到逮捕，1950年11月28日被枪决于马场町刑场。
生平.父亲郭坤木善于理财，担任过彰化银行板桥分行行长、常务董事。郭琇琮生长在富裕家庭，因此进入贵族学校桦山国小就读，考入台北一中（现为建国中学），1938年考取台湾总督府台北高等学校理科甲组，毕业后原本考取东京工业大学，却因为父亲拒绝提供学费仅就读一个月，复于1941年4月考取台北帝国大学医学部，与来台湾的北京大学教授徐征学习北京话，亦阅读鲁迅、巴金、老舍等人作品，成为具有强烈中国意识民族主义者，暑假曾至中国的厦门、上海、广