在钖德拉湾上空进行飞行训练时，两架F-14雄猫式战斗机遭遇利比亚战机的攻击，在还击时击落了两架利比亚战机。尼米兹号于1987年更换母港至华盛顿州的布雷默顿。
1990年代.1991年2月25日尼米兹号前往波斯湾参加海湾战争以接替游骑兵号航空母舰，并于1991年8月24日返回。并于1993年再次部署至波斯湾数个月以接替小鹰号航空母舰。在1996年的3月的台湾海崃飞弹危机中，尼米兹号奉派至台湾海崃巡逻，以表示反对中国大陆动武的立场。在1997年9月1日，尼米兹号于环绕世