扁总统任内曾派洪奇昌担任海崃交流基金会董事长，洪奇昌比民进党其他人更了解中国大陆情势，但洪奇昌的柔性立场显然不合新潮流系当权派的胃口，因此洪奇昌遭新潮流系除名；2016年大选蔡英文当选总统，新潮流系是支持蔡英文的主干，新潮流系开除洪奇昌「等于蔡英文开除九二共识」；民进党黑箱作业重重，2006年民进党全代会已经决议解散派系，「怎么还有新潮流这个『党中党』」。2016年3月30日，《新新闻》报导，2006年7月民进党全代会通过「解散派系」决议后，新潮流系如同其他派系办公室于当天晚间发布新闻稿宣告解散，但事实