因遇到墨西哥湾暖流而逐步加强，于9月27日达到萨菲尔-辛普森飓风等级下的二级飓风强度，并于同日达到持续风速每小时165公里的最高强度，然后在向新斯科舍海岸前进的过程中因海水温度降低而有所减弱。9月29日清晨，胡安以风速每小时160公里的二级飓风强度在哈利法克斯的沙德湾（）和普罗斯佩克特（）之间登陆。风暴在从南向北穿越新斯科舍的过程中一直保持着飓风强度，然后在爱德华王子岛上空减弱为热带风暴。9月29日晚，风暴在圣罗伦斯湾北部的安蒂科斯蒂岛附近由另一股温带低气压吸收。这场飓风在穿过新斯科舍中部和进入爱德华王