政区行政长官为政府首长。大部分华裔香港永久性居民不论意愿，自动获得中华人民共和国国籍，可申领香港特别行政区护照。有本土派认为，香港于1840年代起由大清帝国以三张不同条约割让或租借予英国，而这些条约在1912年后由中华民国继承，中华民国政府至今仍存在台湾，且条约正本现藏于台北国立故宫博物院，所以新界归还对象应为条约的持有者中华民国。但由于英国与中华人民共和国建交后，不承认中华民国。因此，即使时任中华民国总统李登辉曾经公开表示「《南京条约》的正本在台湾，香港主权属于中华民国」，英国仍然无视中华民国之要求。