阿历克塞三世废黜，刺瞎后囚禁起来。腓特烈一世本来准备为伊萨克二世而出兵拜占庭帝国，但是被贝拉三世所阻止。原本贝拉三世打算带领十字军解放圣地，但是最终因病不能遂其所愿。1196年4月23日，贝拉三世因病逝世，长子伊姆雷继承王位。贝拉三世原本葬于塞克什白堡巴西利卡中。19世纪考古学家发掘及以他的身高识别其遗体。其后，将他的遗体重新下葬于布达佩斯的马加什教堂。
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