曾经聘请律师团寄送存证信函，不过林杰樑则会明确指出其所说的内容源自于医学杂志何处以证实并非虚构。不过在其提出有关污染的统计数据时，有时候也会遭到跟预期结果不一的环保团体给予压力。而虽然他时常受邀成为政府单位谘询的专家学者，但由于多次在新闻媒体上批评行政院农业委员会和行政院卫生署等等政府机构的医疗政策、食品安全机制和潜在公共健康威胁等，这使得使得一些新闻媒体形容他是不受官方欢迎的黑名单学者，甚至认为他因而被排除在美国牛肉跨部会技术谘询小组专家之外。而对此他也提到：「常常被当做绊脚石，觉得好累，但不把问题及真相