了上述的三所大学之外，东京都还有东京外国语大学、东京医科齿科大学、东京艺术大学等在专业领域享有盛名的国立大学。东京都立大学的前身是成立于2005年，由四家大学合併而成的首都大学东京，在2020年改为现名，是由东京都政府成立的公立大学。由大隈重信创建的早稻田大学和由福泽谕吉创建的庆应义塾大学合称「早庆」，被认为是东京都私立大学的双璧。有基督宗教色彩的上智大学、国际基督教大学；以理工科为主的东京理科大学；常被合称为MARCH的明治大学、青山学院大学、立教大学、中央大学、法政大学；和日本皇室有密切联系的学习院大学