岛式月台车站，总建筑面积为7,700平方米。
出入口.后瑞站共设有四个出入口，均位于宝安大道两侧。
机场接驳车站.由于深圳宝安国际机场于2013年11月28日转场至新航站楼并正式投入使用，原有位于地铁机场东站附近的A、B航站楼亦停用，此站由于距机场T3航站楼相对较近，在深圳地铁11号线开通前曾承担原机场东站前往机场旅客的客流，前往T3航站楼的乘客，需乘坐地铁至后瑞站，出站换乘机场接驳公交M416路（票价2元）到达T3新航站楼。。2016年6月28日，深