东部最早的汉人移民据点。1886年台湾建省，将卑南厅升格为台东直隶州，州治设于今花莲瑞穗乡，并于原卑南厅治设州同，花莲港设州判，预计于州下设三个行政区。但由于发生大庄事件，州治毁败，实际上的州治仍在卑南。
日治时期.1895年马关条约后，台湾割让给日本。7月3日公布《地方官假官制制定件》，拟定将清政府时期的三府改制为三县，府下县、厅改制为县下支厅，而台东直隶州遭降级成与西部县等同的支厅，预计设立台南县台东支厅。但总督府实际上未统治中南东部，8月改为派出性质的台南民政支部台东出张所。