本番台区分带有以下特征。另外，开始运用后，又实施了以下的设备追加搭载和变更。撒砂装置手拉环受电弓ATS停车站通过防止装置磐越西线运用车(H-10 - H-15编组)在2016年，为了替代本系列，投入了E721系1000番台。截至2018年10月1日，仙台车辆中心2辆编组15列、秋田车辆中心2辆编组2列共计配属34辆。新造车辆部署后的调动如下：
5000番台.在奥羽本线标准轨区间(福岛-新庄，通称: 山形线)的普通列车， 作为JR集