戒大师受到摩诃衍派的信徒袭击，受伤而死。另一个传说则指出，莲华戒大师后来又返回印度，继续修行。
思想、着作及影响.莲华戒大师受到寂护大师的影响，属于随瑜伽行中观派，揉合了中观自续派与瑜伽行唯识学派的观点，认为在心外无境，与其师祖清辨大师的立场有所不同。他曾经为寂护大师《摄真性颂》作《摄真性难处释》，註解《中观庄严论》作《中观光明》、《中观庄严论精释》。其中，《中观光明》一书，与智藏大师的《二谛分别论》，寂护论师的《中观庄严论》合称为中观自续派三大杰作之一。他也曾经为法称论师的《正理