翠玉因此遭地方法院判决需免职软禁的处罚。后续陈翠玉虽得到最高法院宣判无罪证明清白，但感于受到打击而决定离开台湾前往海外。而台大护校也在陈翠玉远离后面临终止校务运作情况。
海外运动.再次离开台湾的陈翠玉之后前往中南美洲一带，在世界卫生组织帮忙下担任该地方一带国家的卫生顾问，并长年居住于美属波多黎各。而在世界卫生组织里服务的十八年期间，为了符合职责规范陈翠玉虽未参与海外相关社团运动，但当时波多黎各人民争取独立的情况让她理念走向支持台湾独立建国。1980年从世界卫生组织退休后，陈翠玉