年，担任全国政协副主席，中国基督教三自爱国运动委员会主席、中国基督教协会会长，南京大学副校长、金陵协和神学院院长。1993年以后，丁光训不断批评基督教内占主导地位的“保守落后”的神学思想，主张建设一种“积极、开放、包容、能动”的神学思想，提出淡化“因信称义”的教义和“信者与不信者”的对立（他自称在家中醒目位置陈设观音像以测试访客神学态度），倡导“伦理型、服务型和理性”的新自由神学思想，以“与社会主义社会相适应”。1997年初，改任全国政协副主席、金陵协和神学院院长、基督教全国“两会”名誉主席、会长。