976年3月7日，南日在地方视察时遭遇交通事故，一辆卡车撞击了南日的轿车，致其死亡。有西方学者认为此次车祸不像是真的，可能是金日成将南日当作是潜在的竞争对手而将其暗杀。3月9日，朝鲜对其进行国葬。2011年8月10日，一名曾参加南日车祸现场检查的朝鲜脱北高官在《朝鲜日报》上刊登证词，声称车祸现场有众多疑点，南日很可能是遭到暗杀。由于南日支持金平一上位，被金正日视为危险分子，于是策划车祸将其杀害。