籍贯福建省泉州府同安县（今属福建省厦门市），生于香港，孙中山的侧室。
经历.陈大约十九岁时与孙中山相恋，曾随其流亡日本，并曾参与历次起义的组织准备工作。后因患肺病，返回香港疗养。中华民国成立后，入住澳门孙家，后来往于广州、河南、香港等地。其与孙中山分手的具体时间不详。陈粹芬为孙中山革命时的伴侣，与孙未有过正式婚礼，但孙中山之兄长孙眉和孙之元配卢慕贞皆视陈为孙之侧室，并将陈载于族谱之内；陈身故后亦下葬于孙家之家族墓园之内，被孙家家族承认为孙中山的妾。陈曾收养一名苏姓女婴为女儿