定了荆州刺史沈攸之后，崇祖获授持节、督兖青冀三州诸军事，冠军将军、兖州刺史。建元元年（479年），道成篡宋建齐，是为齐高帝，而他为了防备魏军，让崇祖为使持节、监豫司二州诸军事、冠军将军、豫州刺史，镇守寿春，又封望蔡县侯，食邑七百户。建元二年（480年），元嘉及刘昶率领号称二十万的大军进攻寿春，崇祖召集文武属官讨论防守对策，他主张于外城修防御工事待敌，并且引淝水作护城河守衞寿春城三面。可是将吏们都认为元嘉二十七年（450年）宋南平王刘铄守寿春时兵力比现在更强仍然只能守内城，加上自古以来都因地形问题没有人修筑淝