1980年1月，各左翼政治组织共同组建了“”组织。数月后，各左翼武装团体联合组建了“统一革命指导委员会”（后更名为“法拉本多·马蒂民族解放阵线”），开始和军政府全面交战。在历时12年的内战中，萨尔瓦多政府军、安全机关和警察机关犯下了屠杀、暗杀、绑架、酷刑一系列反人类罪行。内战共造成萨尔瓦多全国7.5万人死亡，8000多人失踪，社会经济遭到严重破坏。在吉米·卡特担任美国总统期间，美国为萨尔瓦多军政府提供了大量军事援助。罗纳德·里根继任总统后，继续执行这一政策。