、动物废料、杀虫剂和化肥等污染，农业非点污染源经过直接渗透、地表水的冲刷造成污染，各种农事活动也造成土壤团粒的破坏；因侵蚀造成的沉积物直接影响鱼类栖息地和湿地。另外，消耗过剩的农业化学物质导致水和其他流体物质的污染。流体物质直接影响水生物的栖息环境，诸如温度升高、水中氧气减少。非点源污染造成地表水中绝大多数剩余营养物质为化肥、动物排泄物，结果直接导致地表水富营养化。农业生产中控制病虫害的杀虫剂同样污染地表水资源，这种污染在农田浇灌后，经过水的冲刷，经过流体物质也造成水的污染和富营养化；另外就是邻近河岸的放牧