书馆馆长陶然枢机主教时表示「希望台湾与世界同步」，订定耶诞节放假，引发各宗教争议，昭慧法师持续为文争取于农历4月8日佛诞当日放假。
提倡佛教女权.2001年3月30日，第十四世达赖喇嘛访问台湾，昭慧法师公开唿吁达赖喇嘛重新建立藏传佛教的比丘尼僧团。达赖喇嘛回应：回到达兰萨拉时，交由藏传佛教僧团会议讨论。2001年3月31日，昭慧法师于印顺导师九六嵩寿之「人间佛教薪火相传」学术研讨会开幕式中，公布「废除八敬法宣言」，推动废除八敬法，表示八敬法非佛说，佛教僧团不应该继续遵守歧视女性