将庄野兼时等人破坏城郭后弃城，三好康长岩仓城跟夷山城两地爲根据持续招降三好家旧臣，如一宫城主一宫成助跟牛岐城主新开实纲就相继跟三好康长内通，表示改投织田家。在天正10年（1582年）时据《阿州将裔记》所载，三好康长率数千骑进入阿波，被任命协助织田信孝进攻四国，织田信长也属意将阿波一国交给三好康长，但织田信长突然死于本能寺之变，使三好康长被迫回归河内国。往后，三好康长依附羽柴秀吉，曾加入纪州攻伐，因为嫡男三好康俊和长宗我部元亲作战身亡，收了后来的丰臣秀次为养子，疑似在天正十三年（1585年）辞世。