1日卸任校长，获颁干城甲种二等奖章，肯定他推动校务发展及完成校务规划的重大贡献，随即接任六军团副指挥官，再于2013年1月1日接任花东防卫指挥部指挥官。
治校与校际发展.全子瑞认为，陆军官校是培养中华民国陆军军事干部的摇篮，更为国家的安定与发展的基础，因此官校教学要着重品德教育，形塑允文允武现代化优质干部。除治理校务，他也致力于校际发展，于2010年8月18日参访台湾专案管理学会洽谈未来相关合作事宜。另于2011年12月27日拜访与敦聘成功大学校长黄煌煇为校务委员，交换治校理念。