晋升为陆军准将。安德森带着萨姆特堡的三十三星国旗回到纽约，并参与了在联合广场举行的当时北美最大的群众集会。随后，安德森在北方进行了一次非常成功的募兵活动。1861年5月28日，安德森被指派到一个敏感的政治位置---肯塔基军团（后更名为坎伯兰陆军）司令，肯塔基州是当时正式宣布中立的边境州之一。10月6日，威廉·特库姆塞·舍曼准将接替了健康状况不佳的安德森。1863年8月，安德森被指派担任其最后的一个军事职务---位于罗得岛州纽波特的亚当斯堡的指挥官。巧合的是，博雷加德自西点军校毕业后的第一个任命即是亚当斯