悠玛列车每班车开放120张无座票，但持定期票、电子票证及非当日当次车票旅客仍不得搭乘，其无座票管制措施较其他自强号严格。近年来为提供在外地工作的东部地区民众返乡返工乘车保障，花莲县政府与台东县政府逢传统节日连续假期均自办专车，专门提供户籍于花莲县及台东县的民众购票。花莲县返乡返工专车原则由推拉式自强号行驶，台东县返乡返工专车则由太鲁阁号或普悠玛号行驶。台铁亦以太鲁阁号或普悠玛号行驶「花东实名制」列车，提供特定身分证字号民众优先订票。自2021年春节起，台东县返乡返工专车车票由台铁代售，花莲县返乡返工专车