冯·曼斯费尔德占领直至1621年。1633年，阿尔布雷希特·冯·瓦伦斯坦将其作为冬季驻扎地。1637年和1648年，瑞典人对比尔森进行围攻但均以失败而告终。17世纪末，比尔森的建筑开始受到巴洛克风格的影响。自1989年以来，比尔森的老城区已经处于历史遗迹保护之中。1945年5月6日，在第二次世界大战行将结束之际，比尔森被乔治·S·巴顿将军的部队从纳粹德国手中解放，而德国控制的捷克斯洛伐克其余地区则由苏联红军解放。根据同盟国之间的协议，巴顿及美军在几天后撤离，苏联接管了比尔森。自1990年起，比尔森每