校长为萧云淡，于1970年3月1日上任。1971年起，学生开始享有公费待遇。1997年8月1日改制为完全中学，改为现名，并开设建筑餐饮管理学程。1999年增设高中进修部。2018年起推动转型为「TAO民族实验教育高级中学」。2019年，兰屿高中与农委会林试所合作，在校园中设立「雅美TAO民族植物园」以保存当地濒临绝种与具文化价值的植物。
特色.本校现在的校园为2007年所改建，由建筑师贾孝远设计。校舍为达悟族传统地下屋斜屋顶及卵石砌墙，兼具现代与民族风格。专科教室于2014年兴