华南总修院，随后往意大利都灵慈幼大学学习并于1961年2月11日于都灵晋铎。1976年至1978年间于澳门慈幼中学担任校长；1977至1983担任慈幼会中华省会长；1986年至1989年间在香港仔工业学校任职院长；1996年10月20日获任命为天主教香港教区助理主教，同年12月8日正式由时任香港教区主教胡振中枢机祝圣为主教。2002年9月23日，胡振中枢机离世后接任香港教区主教的职务。2006年2月22日，教宗本笃十六世宣布将陈日君擢升为枢机；3月24日举行了擢升册封仪式，陈日君领衔按梵蒂冈规定，陈日