署暨吉黑江防舰队在王崇文的率领下脱离北京政府，投靠张作霖，王崇文继续任吉黑江防舰队司令。1922年8月，东三省保安司令部航警处（少将处长沈鸿烈）成立，吉黑江防舰队划归航警处节制。1923年5月17日，由于江防舰队的军费不合东北当局新制定的规章，王崇文被张作霖以军费“报销不实”为由撤职，吉黑江防舰队司令改由毛钟才继任。后来，1925年冬，吉黑江防舰队改称东北江防舰队，吉黑江防司令公署改称舰队部，直属江海防总指挥部（总指挥沈鸿烈）。
晚年.此后，王崇文居于北京，后迁居上海，不久回到故乡