由于校区面积较大，特别是东区学院建筑分散，为方便师生，学校开设免费校内巴士，大致沿环形路线行走，共设十余站。并定时有校车前往徐汇、七宝等校区。目前上海交大除医学院外的本科生和大部分研究生在该校区生活学习。
徐汇校区.上海交通大学徐汇校区位于上海市徐汇区华山路1954号，占地面积为355亩。该校区是上海交大整体搬迁至闵行校区前的主校区，也是承载老交大历史的校区，1896年南洋公学始建于此。初建时的校区四面环河，位于现今校区的东部，徐汇校区的多数历史建筑亦分布于此。现今东侧草坪