苏联入侵阿富汗后，无国界医生立即展开实地救援的任务，提供医药援助给伊斯兰游击队战士。1980年二月，无国界医生公开谴责赤棉。1984年衣索比亚爆发大饥荒，无国界医生于该国成立营养计画，但1985年因谴责衣索比亚滥用国际援助及武装移民遭到驱逐。1986年萨尔瓦多发生大地震后，无国界提供水源给该国首都圣萨尔瓦多。1982年，Malhuret和Rony Brauman（在1982年成为该组织的会长），借由邮件介绍资金募集活动增加捐款收入，促使该组织财务独立。1980年代，法国无国界医生（1971）促使多国成立