马达加斯加人的基因组成中南岛民族和班图人大约各占一半，不过也有一些社区的人口基因显示南岛或班图人，亦或阿拉伯、印度及欧洲血统占优势。中部高地的梅里纳人中起源于南岛民族的比例最高，这一民族占到马达加斯加人总数的26%，远超其他任何种族；沿海某些社区的居民中祖先为班图人的相对较多。所有沿海民族团体中以贝齐米萨拉卡人最多，占全国人口的14.9%，其后分别是各占6%的齐米赫蒂人和萨卡拉瓦人。马达加斯加的少数族裔有华人、印度人和葛摩人，还有很少的欧洲血统居民，其中以法国最多。20世纪后期，这些少数族裔的人口因移民