回国后旋任广东省惠阳县县长，今惠州市市长相当。国民革命军北伐初期，任国军第二十六军第一师党代表，兼任政治部主任。后历任两浙缉私统领，中华民国财政部皖南缉私局长，浙江省内河水上警察局长等职。1944年，当选奉化县临时参议会议长。1949年，移居台湾。1985年，病逝于台北，享年91岁。
故居.1949年后，刘祖汉旧居被奉化地方接管征用。2008年，浙江省文物普查时发现。刘祖汉台湾后人曾拜访故居。据刘氏后人，刘生前曾回忆，蒋介石少年时爱好舞龙。