保留着将军之头衔，以后的幕府将军皆袭用「征夷大将军」之官位。由1192年开始，大部分幕府将军或武家取代日本皇室与天皇，掌握日本实际政权，直到1868年明治维新为止，相关政治地位日后由太政大臣及日本内阁总理大臣取而代之。由于将军为首的幕府掌握实际政权，明朝朝廷也封一部分室町幕府将军为“日本国王”（例如足利义满）。而鎌仓幕府和江户幕府将军时不受封日本国王，江户幕府将军大多自号“日本国大君”。在欧美，由于将军的长期世袭统治，到后来欧洲人执访日本，一直误以为将军就是天皇；直到江户幕府末年，美国派到日本的特使也还