陆军领导权和对苏联对中国战争准备上两派都对自己的主张互不让步，此为陆军皇道派与统治派之争的开端。同年8月与永田一起离开参谋本部，小畑转为近卫步兵第1旅团长，永田转任步兵第1旅团长。1934年1月，荒木辞任陆军大臣，而有望接任真崎甚三郎在参谋总长闲院宫载仁亲王的反对下，改任教育总监，支持统制派的林铣十郎接任陆军大臣，皇道派势力受到大幅压制。小畑在同年3月任陆大干事，1935年3月任陆大校长。陆军内部的争权斗争激化，同年7月，真崎的教育总监职务被免去，8月相泽事件中，时任陆军省军务局长永田铁山被中佐持刀砍杀