府，并深受曾国藩器重。咸丰九年（1859年），代理安庆知府，因病回乡调养。同治元年（1862年），经河南巡抚严树森上疏推荐，重新任职。同治三年（1864年），曾国藩派其筹办江北厘金总局（即税务总局），期间制定《沿江收税条例》，整顿税务。清军克复南京后，以道员归两江补用。同治四年（1865年）春，代理两淮盐运使，兼扬州道，任内组织在瓜州口东开凿运河。同年3月，升安徽按察使，8月调任江宁布政使。同治八年（1869年），李宗羲升任山西巡抚，加强黄河防务。同年冬，黄河冻结，宗羲指挥三次击退欲过黄河的陕西回民反清