状长筒形，外部被毛；花管直或微弯，雄蕊6枚、花柱6裂。长筒圆形蒴果，具6条背嵴，胞间开裂，种子多数，周边具膜质翅，春至秋季开花。 
与昆虫的关系.分布于台湾的数种马兜铃中，以港口马兜铃作为宿主植物的蝴蝶种类最多，如麝凤蝶属以及裳凤蝶属皆可以港口马兜铃作为食草。以往由于生育地的破坏，使得港口马兜铃的族群数量急遽减少，一度被评估为濒临灭绝，连带影响以此为食的黄裳凤蝶和珠光凤蝶族群数量，后由于爱蝶人士及保育人士大量栽培港口马兜铃，栽培地点遍及台湾全岛及兰屿地区，如今其植株数量已大大恢