间或同一物种的群体之间的遗传分化的指标。对某一基因来说，两个群体有类似的等位基因，且频率相似，彼此的遗传距离较小，说明他们的共同起源比较近。
常用遗传距离.
根井标准距离.1972年，日裔美国群体遗传学家根井正利（）提出了一种遗传距离的计算方法，后来被称为“根井标准距离”（）。这种方法假设遗传差异是突变和漂变两个因素造成的，适用于每年或每个世代的遗传变化速率稳定的情况。在这种情况下，群体间的根井标准距离（"D"）与彼此分化的时间成正比，公式如下：Secti