因应新和谐式单位设计于2000年面世，于2001年尾至2003年落成的部份末代和谐式屋邨採用了经改良的单位设计，家庭式单位的厨厕改为与新和谐式相近的设计，单位面积依旧不变，而和谐一型大厦电梯大堂外的平衡阵则改为每层都加设。此款设计仅可见于富昌邨富悦楼、石篱邨九期、长宏邨一期、鲤鱼门邨一期、牛头角上邨一期及爱东邨爱宝楼。第三代和谐式大厦的公共屋邨及居屋屋苑包括有：天慈邨、兴华（一）邨、天恆邨（唯一一个不提供一人单位的第三代后期版本和谐一型大厦的屋邨）、田湾邨、尚德邨、天丽苑、晓丽苑、锦丰苑（集齐前后期和谐