01年7月31日重新投入使用，并担任新组建的活动舰队预备役总队旗舰，受海军少将胡戈·冯·舒克曼指挥。在8月6日的部队演练期间，舰只的一台左舷锅炉发生爆燃，造成5名司炉兵严重受伤。为了筹备秋季演习，威廉港的预备役总队又加入了海军中将麾下的第二分舰队，并由铁甲舰担任旗舰。由于发动机故障，埃吉尔号只得推迟参加秋季演习。之后，这艘岸防舰于9月中旬被发配回波罗的海预备役总队。它于10月又在东普鲁士沿岸展开了一次训练巡航。1902年4月，埃吉尔号与哈根号一同在基尔湾进行了鱼雷射击演练。5月，该舰在波罗的海展开了几次