为女性早期受教育的重要启蒙所在，1887年在新楼（今台南神学院慕林馆址）正式开设 。
长老教会学校设立之目的.十九世纪末叶是基督教宣史上的重要时期，在欧美各地的教会掀起了向殖民地和异教徒传教的热潮，随着天津条约（1858年）与北京条约（1860年）的签订，中国与台湾亦即成为宣教的地区。来台的长老教会宣教会以大甲溪为界，大甲溪以南（南部）为英国长老教会，大甲溪以北（北部）为加拿大长老教会。宣教师为了传杨上帝的福音，在差会母国的经济资助下，并对台湾的医疗、教育与社会服务工作做出极大的贡