易·波拿巴合作，被驱逐出法国，他流亡到了意大利，仍然继续坚持从事历史学研究。拿破仑战败下台之后，他返回到了法国。1874年2月9日，米什莱在法国伊埃雷因心脏病逝世，并葬于当地。在他的遗孀的请求下，他的遗体在1876年5月13日重新掘出，16日在拉雪兹神父公墓重新下葬。他的纪念碑则是1893年由让-路易·帕斯卡设计的。