部分（国际港城）展出宋元时期宁波（时称庆元）的发展情况。包括宁波本土教育的发端和四明学派的出现，宋元市舶司的设立和对港口贸易的影响和元代海外贸易的繁荣。第五部分（海定波宁）展出明代海禁给宁波贸易带来的冲击，双屿港走私贸易的一度繁荣，倭寇侵扰和抗倭斗争，天一阁藏书文化的出现和以王阳明、朱舜水等人为代表的浙东学派在思想史上的贡献。第六部分（东南都会）展出清初以张煌言为代表的宁波抗清斗争，清代以黄宗羲为代表的宁波学术的鼎盛时期和开放海禁后宁波对外交流的兴盛。第七部分（开埠通商）展出宁波在第一次鸦片战争及中法战争中