U/Linux命名争论。还可能因为商业模块和商标使用的争论，就像对Debian还是Mozilla命名的争论。
公司进入团体.由于一些像Linux、Apache HTTP Server、Mozilla Firefox和OpenOffice.org自由软体的成功，很多公司开始与自由软体社群互动。困难包括对自由软体协议的选择，和对哪些软体将被选择作为自由软体释出。一个比较成功地进入自由软体社群的例子是昇阳电脑2000年7月19日在GNU较宽松公共许可证下对StarOffice的释出，