1988年，井上使用本名（成合雄彦）以短篇「紫色的枫（）」获得手冢奖出道。1990年，他开始改用现在的笔名在《週刊少年Jump》（集英社）连载篮球题材漫画《灌篮高手》。连载的期间，日本国内和海外邻近国家掀起了打篮球的热潮。1998年，井上转移《MORNING》（讲谈社）开始连载《浪人剑客》。并从次年1999年开始，在《週刊YOUNG JUMP》（集英社）连载以轮椅篮球为题材的漫画《REAL》。之后，《浪人剑客》获颁媒体艺术祭大奖和手冢治虫文化奖大奖。2012年，井上获颁文化奖。