2014年“罗塞塔号”探测器计划（the Rosetta mission）将使用手性GC-MS分析丘留莫夫－格拉西缅科彗星(67P／Churyumov-Gerasimenko)中的物质。
医药.十几种先天性代谢疾病，也叫遗传性代谢缺陷（ ，缩写"IEM"）现在都可以通过新生儿筛检试验测到，特别是使用气相色谱－质谱法进行监测。GC-MS可以测定尿中的化合物，甚至该化合物在非常小的浓度下都可被测出。这些化合物在正常人体内不存在，但出现在患代谢疾病的人群中。因而，该方法日益成为早期诊断