教育部次长陈良基接任、农委会主委由宜兰县长林聪贤接任、劳动部长则由政务委员林美珠接任，而原先的四位首长仍会留在执政团队。2017年9月4日，有消息透露内阁改组，随后行政院在中午证实行政院长林全已于3日向蔡英文总统提出辞呈，总统府秘书长吴钊燮表示总统蔡英文将在5日上午举行记者会，后于记者会正式公布新任阁揆为赖清德。
任内争议.
国道夜间收费之争议.2016年4月30日，当时准交通部长贺陈旦于接受媒体专访时表示，未来连假期间免收费措施恐将不复见；横向国道甚