5月5日，砵甸乍邀请上述官员筹组登记署小组（Registry Committee），又发出多封公函，着他们详细并具体讨论成立登记署的细则。 6月26日，砵甸乍正式获委任成为首任港督， 并于8月21日委任庄士敦、威廉·坚，以及时任商务总监中文祕书兼传译员马儒翰为首批香港议政局兼定例局官守议员。1843年10月，庄士敦因病返回英国休假， 后以其曾于复仇女神号上为第一次鸦片战争服役，获英国政府颁发勋章表扬。 1845年6月5日，庄士敦因其于中国任职殖民地官员期间研治中国自然史的学术贡献，获选英国皇家学会院士。