沿北卡罗莱纳州海岸平行移动期间，艾琳令该州普降暴雨，局部降雨量最高达到280毫米，另有多处记录下超过152毫米降水。暴雨导致北卡罗莱纳州多条河流严重泛滥，其中许多地区在不到一个月前由飓风弗洛伊德引发的洪水尚未退去。由于径流的影响，塔河、开普菲尔河和纽斯河全部决口。洪灾还造成霍克县中南部的一个水坝溢出。艾琳在该州催出生两场龙卷风，其中一场级出现在昂斯洛县，另一场出现在帕斯阔坦克县，为级，这场级龙卷风摧毁了两辆拖车，令多套房屋受损，导致1人受伤。严重的洪水迫使整个北卡罗莱纳州大量道路封闭，还引发了多起交