因方便乘客乘搭地铁前往广州塔，同时避免广州塔与赤岗塔混淆，要求变更此站站名，最终地铁公司在2013年12月28日正式由「赤岗塔站（Chigang Pagoda Station）」更名为「广州塔站（Canton Tower Station）」，APM线的大剧院站也在同一时间更名。因此，广州塔站是继大学城南站和大学城北站之后又一个在营运后更改名字的地铁车站。在车站更名前夕，3号线月台的搪瓷板书法站名及站名均更换为新的搪瓷板书法站名及站名，以配合现有名称。
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