场生产的豆芽菜疑似为疫情爆发的源头。但6日官员表示这个说法没有经实验证实，在疑似感染农场的40个样本中，有23检验结果呈现阴性。6月10日，罗伯特·科赫研究所的负责人证实豆芽菜为这次疫情的源头，食用过豆芽菜的人发生出血性腹泻（）的比率是其他人的九倍。世界卫生组织于同日发表的「第13版更新」（）证实了这项叙述。根据德国联邦风险评估研究所的国家大肠桿菌实验室负责人表示，这次爆发的大肠桿菌菌株已在德国境内流传了十年，对象是人类而非牲畜，食物则疑似遭到人类排泄物的污染。6月29日，与ECDC公布两方共同进行