重新编制了湖北新军。袁世凯接替孙文（孙中山）任临时大总统后，属于革命派的蒋作宾对袁世凯十分排斥。1915年（民国4年）袁世凯称帝，蒋托病辞职。袁世凯恐怕蒋作宾会反对自己，遂将他幽禁于西山。翌年，护国战争激化阶段，蒋被释放。 1916年5月4日，他获将军府授予“翊威将军”。1916年（民国5年）6月袁世凯死去，黎元洪任大总统，蒋作宾升任参谋本部次长。翌年7月张勋复辟，黎元洪失势。取代其掌握实权的段祺瑞想请蒋作宾任职，被蒋拒绝。此后蒋作宾投向南方的孙文。9月，蒋作宾经孙文同意，到欧美各国考察国际情势。