日君向记者解释：「就像同性恋，未必是罪恶，但无论在医学还是心理学的角度来看都是不正常的，没有理由去鼓励、甚至合法化；堕胎等同杀人，即使是避孕也要用自然的方法。」2003年8月17日，同志组织「彩虹行动」的八位请愿人士闯进主教座堂，扰乱正在进行中的主日弥撒，以抗议天主教会反对同性婚姻的立场。上述事件后，陈日君主教与一些同性恋组织的人士会晤，澄清教会立场，并重申教会并不歧视同性恋人士。
反对校本条例.2004年教统局在香港教育改革中，引入俗称为校本条例（正式名称《2004年教育（修