南教堂所属的联合基督教会渊源于公理会，是美国最古老的宗教团体之一。1669年，波士顿第一教会的一批持不同意见者自行聚会，称为波士顿第三教会。他们先在Cedar 聚会所聚会（1670年），1729年在华盛顿街和牛奶街路口建造了老南聚会所。会众成员包括塞缪尔·亚当斯、本杰明·富兰克林等人。1773年，塞缪尔·亚当斯从老南聚会所发出 "war whoops" 信号，开始了波士顿茶叶事件. 在19世纪初的一神论运动期间，老南教堂是波士顿唯一坚持三位一体教义的公理会教堂。1816年，老南教堂与公园街教堂联合组成城