不久转任右卫大将军。隋文帝闲谈的时候说：“保护朕躬，成此基业，是元胄的功劳。”几年后，出任为豫州刺史，历任亳州、淅州二州刺史。当时突厥多次为边患，朝廷以元胄平素就有威名，拜他为灵州总管，突厥非常畏惧他。后再征入朝中为右卫大将军，与皇帝关系更加密切。一年正月十五日，隋文帝与近臣登高游玩，元胄已经下班，隋文帝派人驰马召他来。见到元胄，文帝对他说：“元公与外面的人登高游览，不如跟着朕更好。”赐宴非常高兴。晋王杨广经常为他致礼。太子杨勇被废为房陵王，元胄参与计划。文帝追查东宫之事，左卫大将军元旻苦苦劝谏，杨素于是说