后墙左右各有一圆拱小门，通向后殿。后殿为伏波将军和夫人“葛氏娘娘”的寝宫，其内有葛氏娘娘的造像。庙内还保留有大量的名人题词和楹联。
保护.1983年，横县人民政府将伏波庙列为横县文物保护单位。1994年，伏波庙被列为广西壮族自治区文物保护单位。2008年3月，横县政府出资70万元重修伏波庙，该工程于当年12月完工，基本恢复了伏波庙的原状。2013年3月5日，伏波庙被列为全国重点文物保护单位，同时成为横县首个全国重点文物保护单位。