上海市医疗机构列表列出今上海市境内的主要医疗机构。出于篇幅限制，此列表只收录由上海市卫生健康委员会认定为二级及以上的医疗机构；因非部队、地方共建医院不会向上海市卫生健康委员会登记，故此类部队医院不予列出。
三级医院.截至2015年2月，共有48所三级医疗机构在上海市卫生健康委员会（上海市中医药管理局）注册登记。下文中，标注为“市管”的医院，其由上海市卫生健康委员会直接进行行政监管；标注为“委管”，则指该医院由中华人民共和国国家卫生健康委员会和上海市共管，并由市卫健委直接监管，此