（台湾海崃飞弹危机），对福建和台湾之间的关系产生负面影响。台湾一直希望大陆可以撤除沿海的飞弹。2016年7月1日台湾发生雄风三型反舰飞弹误射事件，导弹在朝福建方向飞行一段距离后，击中一艘在澎湖东吉东南方海域的台湾渔船，造成台湾渔民一死三伤的惨剧。此事被阴谋论者认为是挑衅中共党庆。据英国《简氏防务周刊》网站报道，中国大陆在福建部署巨型雷达，可能会影响台湾铺路爪长程预警雷达的正常工作。另外据媒体报道，在福建有一个叫做「福建村」的地方，可以模拟台湾各种重要的军事设施及各军事据点，供解放军演练对台作战，特别是机