热带山地及高地森林消失，减少率高于任何一种热带森林。云雾森林面积最大的国家之一的哥伦比亚，仅保留了原云雾森林的10%至20%。大部分地区已转变成人工林，用以农业和畜牧业。山地森林地区的主要农作物是茶叶和咖啡，但也记录到一些特殊物种导致的森林结构改变，如罗汉松属植物。 2004年的调查数据显示，约三分之一的云雾森林得到保护。
气候变化对云雾森林的影响.由于云雾森林对气候的依赖，其必将受到气候变化的巨大影响。气候模型显示，低空云量将不断减少，这意味着适宜云雾森林的海拔高度将上升。再