外交始终都与巴拿马运河有密切的关系。长时间里巴拿马政府相当不稳定，贪污严重，经常发生一个政府在其总统任期结束前就倒台了。而巴拿马的实际掌权者，就是于1968年上台的将军。直至他在一次空难中逝世为止，他都是巴拿马政治界的实际掌权者。托里霍斯死后，曼纽尔·诺列加独揽大权。1980年代末，巴拿马和美国当时的外交关系渐趋恶化。
美国入侵巴拿马.1989年12月，美国入侵巴拿马，其行代号为「正义之师行动」（Operation Just Cause）。当时正值巴拿马运河主权移交前十年，老布