支持国民革命军，依附直系的渤海舰队的海圻号等舰与北伐军的长江舰队交战。1927年，处境艰难的渤海舰队同意了奉系的条件，海圻号成为了东北海军的主力舰只。1928年12月29日东北易帜，海圻号等随之名义上加入民国第三舰队。1933年发生薛家岛事件，海圻号、海琛号、肇和号等三舰官兵因不满沈鸿烈的政策，脱离东北海军南下，投奔粤系陈济棠，加入粤海舰队。1935年海圻号、海琛号官兵与粤系矛盾激化，两舰再次出走，重返中央海军。1937年淞沪会战爆发，海军选择将已经老旧的海圻号自沉于江阴阻塞线。
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