又成为第一个提出在减数分裂时染色体有交换现象发生的假设，由此她更观察出染色体透过重组会形成新的特征。1931年她发表了玉米的遗传谱。
在德国短期留学.1933年（大约31岁左右），国家研究委员会的研究奖学金到期时，麦克林托克在摩尔根，爱默生，和斯塔德勒的推荐下获得了德国古根汉基金会（Guggenheim Foundation）的资助。 最初的计划是使她能够与柏林的（Curt Stern）合作。但是自从纳粹上台，像斯特恩这样的犹太科学家面临第一次压制。斯特恩搬到加利福尼亚的加州理工学