为触怒了时任首相滨口雄幸的愤怒，海军内不得已由加藤宽治出面训诫末次。同年6月7日，末次趁着向昭和天皇讲课的机会，试图宣传自己的反条约思想，但这与海军省和军令部遵从条约的既定方针不符，遭致天皇对其的不满。1930年（昭和5年）12月1日，到地方出任舞鹤要港部司令。1931年（昭和6年）12月1日，任第二舰队司令长官。1932年一·二八事变爆发，末次下令海军用舰炮开火支援，完全不顾战斗区域位于居民区的状况。但是末次也害怕事态扩大，反对向大陆增派陆军。1933年（昭和8年）11月15日，升任联合舰队司