肠炎的病因并不明确。与其病因相关的理论有自体免疫性疾病、遗传学、肠道菌群的改变，以及环境因素。对于已开发国家之罹病率较高，部分提出的论点为：缺少接触感染原的卫生假说、的引进及生活方式的差异等。早期将阑尾去除，可能有一定的预防作用。典型的诊断方式为搭配活体组织切片。溃疡性结肠炎是一种伴随着克隆氏症和的炎症性肠病。饮食习性的改变有助于改善症状，例如高热量饮食或是无乳糖饮食。几种药物常用于治疗症状，或是缓解症状，包含如：柳氮磺胺吡啶、皮质类固醇；免疫抑制剂如：硫唑嘌呤和。若病情严重、治疗后不见改善、或是出现像大