心雄通知「非主流派」李焕与郝柏村结盟的消息，李元簇以出身情治系统的敏感度紧急向李登辉通报，加上后来来自警政与心腹苏志诚的情资，李登辉才一夕间心生警觉并反守为攻，使李登辉阵营成功反制「非主流派」。1990年3月21日，经国民大会选举成为中华民国第8任副总统，于同年5月20日与总统当选人就职。是迄今最后一位出生于中国大陆、以及经由国民大会选举产生的副总统。任内行事低调，并被外界形容为「没有声音的副总统」。
退休生活.1996年5月20日，卸任后宣告退休。退休后，长年隐居于苗栗