于5岁夭折后，腓特烈六世于翌年被继承为士瓦本公爵，当时只有3岁，他改名“腓特烈”以纪念兄长，被称为“腓特烈六世”。腓特烈六世曾与匈牙利国王贝拉三世的女儿订婚，但是最终二人并没有结婚。1184年，腓特烈六世在美茵茨（Mainz）与其兄长罗马人民的国王亨利六世一同在隆重的仪式后被封为骑士。其后于跟随父亲参加第三次十字军东征期间，不单父亲于1189年在渡过格克苏河时被淹死，腓特烈六世带领退兵后的剩余5000人前往安条克。可惜他亦于1191年在中因感染疫病逝世。死后由其五弟康拉德二世继承士瓦本公国。