，仅有少数汉族冒险家或渔民与原住民从事贸易，这样的情况维持到16世纪。1281年（元世祖至元18年）元军东征日本因台风失败，迂回琉求国，道经澎湖设澎湖巡检司，企图进取琉求国，作为征日本之准备，然使者仅至澎湖而返。随后占领澎湖，并划该地方区划隶属于福建泉州路，主官为澎湖寨巡检。澎湖巡检司不但是澎湖群岛的首次行政区划，。明朝仍依循前例于澎湖设置该官署，直至1384年因为实施封海政策，予以废除。明太祖于《皇明祖训》载明正南偏东的「不征之国」包括大琉球（琉球国）与「不通往来，未尝入贡」的小琉球，后者是否指台湾或仍