属于司法院；1944年后改隶属行政院。民国69年（1980年）7月1日改为「法务部」。1992年，法务部设立政风司，各政府机关的「人事室第二办公室」（人二室）走入历史。为改革狱政和罪犯矫治专业化，于2010年9月1日修法设立矫正署，并在2011年元旦成立。为反贪和肃贪，另于2011年7月20日成立廉政署。2013年7月1日司法官训练所改制为司法官学院。