勗以大义。乙酉（1645年）六月，隆武帝在福州监国，元汴投袂而起，辞母趋赴，九月至福州，授兵科给事中，上《朋党策》，十一月奉旨宣慰两广，充册封二藩副使，便道奉母回潮。丙戌（1646年）二月至肇庆、梧州，遂抵桂林，有降绅希郑芝龙意弹劾他，遂革职还潮听勘。永历帝时期，复任兵科给事中。己丑（1649年）五月奉命以监军募兵平远，联络宗人谢志良、谢良友等。庚寅（1650年），广州破，永历帝出逃南宁，继入缅甸，元汴仍往来潮循之间，日谋抗清。癸巳（1653年），郝尚久反正，元汴与李士淳、罗万杰等响应，尚久兵败，元汴乃奉母