垄断经济的贸易局以防贪污腐化及垄断操控，颇引当局侧目。1947年二月底二二八事件爆发，3月1日由反对当局组织的台中市联席会议提出「改组长官公署」、「实施省县市长民选」，林连宗被推为代表，北上交涉联络；3月6日被选为台中地区时局处委会常务委员；3月8日国军登陆台湾；3月10日林连宗已因当局实施戒严致交通中断而无法返回台中，便前往好友李瑞汉家。因林连宗前几日与台湾高等法院院长杨鹏，商量司法人事改革，引起陈仪猜忌，被诬以「强力接收台湾高等法院第一分院，并自任院长」之罪名逮捕。傍晚，警总与宪兵第四团人员至李家捉