开始受到打压，结束了原先的合作关系。他们在布尔什维克政权稳固后遭到清算。俄国中部的无政府主义者要不受到监禁或加入布尔什维克派，就要转至地下活动。圣彼得堡及莫斯科的无政府主义者为此逃至乌克兰。他们于该处建立了自由地区，其共有400平方里，约700万人。在俄国内战中曾对抗白军的无政府主义者，现在则被红军、乌克兰人民军、签订了《布列斯特-立陶夫斯克条约》的奥地利和德国联合一起打压。 此一冲突于喀琅施塔得起义中变得白热化，当地水手、士兵、平民因渴望改革而参与之。不过新任政府却选择了对此进行镇压。在喀琅施塔得叛乱过后