各师团和旅团则有直属飞行队（以空中机动力见长的第12旅团则拥有独有的直升机队）。关于航空交通管制的部队包括直属于防卫大臣的中央管制气象队合各方面航空队直辖的方面管制气象队，而方面管制气象队会在方面队内的各航空科部队的驻屯地派遣分队。职种学校为三重县伊势市的陆上自卫队航空学校，其实习与研究支援部队为教育支援飞行队，由于飞行机整备需要专门的特殊技术，随着后方支援体制的变革而附属于方面航空队之指挥。