续政权的生存，有将领提出进攻菲律宾，得到冯钖范同意。却传出远征军只想抢劫，还打算逃往海外，因此刘国轩阻止此计画。七月十三日(9月3日)，施琅率军在台湾登陆。后来在刘国轩大力主张下，郑克塽于七月十五日（9月5日）向施琅投降，并于八月十八日（10月8日）剃发易服，东宁王国正式灭亡。郑克塽投降后，清廷为了是否把台湾併入版图产生争论，不少大臣认为台湾孤悬海上，治理以及防守花费不小，主张弃守。最后施琅上奏〈恭陈台湾弃留疏〉以台湾战略地位重要，说服清廷将台湾併入版图。
传说.依据《天妃显