对亚太事务特别热心，尤其是此时还禁止几乎一切对外交往的日本。美国商人和船东希望日本开门做生意，这不但包括贸易，还包括准许美国船只补给食品和水，而且在紧急情况下可以便宜从事不受惩罚，希望在日本海岸逗留的美国水手不会被当成罪犯关起来。菲尔莫尔和韦伯斯特派马休·佩里准将带队远征，力求推动日本打开国门同外界交流。佩里的船队于1853年7月抵达日本，此时菲尔莫尔已卸任总统四个月。菲尔莫尔坚决反对欧洲染指夏威夷。拿破仑三世统治的法国意图吞并夏威夷，菲尔莫尔为此发出措辞强硬的警告信，称“美国不会坐视此类行径”，法国最