海交通大学获得博士学位，然后在该校任教至今。1994年至1996年间，毛军发曾在香港中文大学和美国加州大学伯克利分校从事博士后研究。
奖项和荣誉.2012年入选电气电子工程师学会会士，2017年入选中国科学院院士。他曾获得国家自然科学奖二等奖、国家技术发明奖二等奖、国家科技进步奖二等奖各1项。