二林设立医院时，玛喜乐也决定离开埔里，前往二林。1964年5月，玛喜乐来到二林，除了在医院工作，有时也随谢纬到乡下义诊。她在乡下看到有许多穷困的小儿麻痺只能爬地，父母根本没有能力扶养。同年11月3日，首间由台湾人所设立的教会医院－二林基督教医院（今彰化基督教医院二林分院）创院，首日门诊小儿麻痺患者时，就来二百多位患者。见此状况的玛喜乐，决定要为照料小儿麻痺病患。1965年8月，二林基督教医院正式成立附设小儿麻痺的保育院，首批收留十六名院童，全由玛喜乐负责照护。1967年9月，该院附设的小儿麻痺儿童保育院