多数波罗的海的德国人成为爱沙尼亚国或拉脱维亚国的公民。波罗的海德国人的历史在1939年骤然告终，莫洛托夫—里宾特洛甫条约的秘密附加协议书划分出德苏势力范围－－爱沙尼亚与拉脱维亚被纳入苏联势力范围，希特勒将大批波罗的海德国人迁移到纳粹德国在二战中占领的波兰西部。1944年苏联占领爱沙尼亚和拉脱维亚国，波罗的海德国人再也没有返回爱沙尼亚和拉脱维亚的家园。时至今日，波罗的海德国人的后裔，分布世界各地方，以德国和加拿大人数最多。