《星际旅行：无限太空》（1979年）中，柯克将麦科伊召回了星际舰队；满腹忿恨的麦科伊说自己是被人“拖回来”（）的。在《星际旅行II：可汗怒吼》中，斯波克在赴死前将带有其知识与经验的“灵魂”（）传给了麦科伊。这为麦科伊带来了极大的精神痛苦，他在《星际旅行III：石破天惊》（1984年）中与众人协力让斯波克的“灵魂”返回到了其复活的身体中。在《星际旅行IV：抢救未来》（1986年）的尾幕中，麦科伊成为了柯克指挥的联邦星舰进取号A的船员。在《星际旅行VI：未来之城》（1991年）里，麦科伊与柯克从克林贡的一处监狱