19种嵴椎动物中，只有蝙蝠受到伊波拉病毒（模式种）的感染，可它们事后并没有发病，此乃天然宿主的一大特点。1976-98年期间，共有30,000只哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类及节肢类动物接受检验，惟研究者只在六只中非共和国的囓齿动物（与非洲柔毛鼠）及一只鼩鼱动物（）的体内找到过病毒的遗传痕迹，其他均一无所获。2001及2003年疾病爆发期间，人们在一些大猩猩及黑猩猩的尸体中，发现伊波拉病毒（模式种）的构成物。可此病对灵长动物的杀伤力高，故他们作为天然宿主的机会微乎其微。一项于2002-03年、涉及1,030只