建军初期，由于许多萨摩藩出身者组成了帝国海军的骨干，而陆军的中枢将校群则有许多长州藩的人士，因此有「陆军长州，海军萨摩」（）的并称。1894年甲午战争后，日本将《马关条约》赔款投放于扩充军队。1945年8月15日，第二次世界大战轴心国日本向同盟国投降，日本军解散。
组织结构.日本的两大军种——陆军和海军是各自为政的，彼此拥有自己的军事组织与空中武力。两者之间亦长期存在军种对立的情形。大体来说，日本的军事组织可分为军队（如陆军的军、师团，海军的镇守府、舰队等）、官衙（如陆军省