遭严重打击，期间有近二千人感染，共299人死亡（包括6名医护人员）。政府于4月1日封锁淘大花园E座，4月起，全港所有学校停课，至5月中旬止。香港市面变得一片萧条，外地访港旅客数字大跌，经济损失无法估计，失业率升上至8.3%的历史新高。及至6月23日，世界卫生组织始将香港从「发生本地传染地区」的名单中剔除。由于政府处理抗疫时多处失当及反应缓慢，引致市民强烈不满。2004年7月，立法会沙士调查委员会公布调查报告，时任衞生福利及食物局局长杨永强被批评「向公众传达的讯息混乱不清，使公众以为他在试图淡化疫情的严重性」