花山院家是藤原氏北家师实流的嫡流（花山院流）的名门家系。家格为清华家。花山院家的始祖是平安时代后期，藤原师实次子藤原家忠。家忠将从父亲处得到的住所花山院（东一条院）的名字作为了本家的家名。家忠之孙藤原忠雅官至太政大臣，忠雅之子藤原兼雅作为后白河上皇的近臣，官至左大臣。由此，花山院家的家格确定为公家次席的清华家。南北朝时期，花山院家嫡流效力于北朝朝廷，而作为支流的花山院师信与其子师贤作为后醍醐天皇的亲信，子子孙孙都效力于南朝朝廷。此一支流的女性后裔在南北朝统一后，于后小松天皇时期嫁入宫中，据说受到天皇