李严到永安宫，拜尚书令，辅助丞相诸葛亮处理国政。章武三年（223年），夷陵兵败的刘备临终时，托孤丞相诸葛亮，以尚书令李严为副，共同辅佐少主，又委任李严为中都护，统内外军事，留镇永安。建兴元年（223年5月），李严受封为都乡侯，假节，加光禄勋。南中雍闿在益州作乱，李严写了六张纸的书信给雍闿，向他解释利害，但雍闿不听，依旧煽动南中叛乱，后诸葛亮只得率军平定南中。建兴四年（226年），李严转前将军。由于诸葛亮率军进驻从汉中，李严被委以管理后方事务，于是移屯江州（今重庆市一带），留护军、征西将军陈到驻永