看守所拟定书面声明〈我的决心─杨儒门狱中绝食抗议声明〉，表态将绝食抗议WTO第六次部长级会议。2005年12月13日10时整至同月19日10时整，杨儒门在台北看守所展开连续绝食144小时，以抗议WTO第六次部长级会议；声援杨儒门联盟则于同月13日于立法院中兴大楼召开记者会声援杨儒门，国立清华大学中国文学系教授方圣平代杨儒门宣读书面声明。杨儒门表示，台湾农民追求的是公平交易、不是自由贸易的迷思。2006年2月17日，杨儒门入狱服刑。2007年6月19日，中华民国总统陈水扁在基隆市参加中华民国海军一三一