，中华民国总统李登辉主导的《总统府组织法》修正案将设于台湾台北市的中华民国总统府裁撤此官职，其两枚国玺则连同其他的中华民国（台湾）总统官印、职务印章等印信一起由总统府监印官负责保管，而国玺保存地点则由位于总统府附近之警备总部附设的地下防空堡垒移至府内之保险箱。