原去世，享寿七十一岁。《元史》载至顺四年（1333年），朝廷追赠邓文原为江浙行省参知政事，谥文肃。《新元史》则是至正九年（1349年），邓文原的弟子集贤院大学士冯思温上奏说邓文原经筵旧臣，应该要加以恩礼。于是赠中奉大夫、江浙行省参知政事、护军，追封南阳郡公，谥文肃。原本太常议论应该谥壮康，因冯思温之请，改谥文肃。
轶事.邓文原斋居之室名为素履人，所以人们称他为素履先生。邓文原年轻时就与赵孟頫为好友，被赵孟頫称为自己的“畏友”。邓文原对自己人严厉对外则宽恕，家贫而廉洁。早年