位后，尊马氏为慈宁皇太后，不久改称昭圣恭懿皇太后。封马太后兄子马九爵为镇远伯，马九爵兄马承祖管中军都督府，马九爵弟马九功管右军都督府。永历帝巡幸新宁，加马太后尊号为昭圣仁寿皇太后。永历九年（1655年）六月再加尊号慈惠，全称昭圣慈惠仁寿皇太后。咒水之难后，缅甸王莽白将永历帝及马太后等人献给吴三桂。永历帝在昆明遭绞死，马太后得知，大哭曰：「吴三桂你这个逆贼！你立志谋反，而以我家作计。我死不瞑目，看见你一定碎尸万段！」不久她被送往北京，在黄茆驿见孝刚匡皇后王氏，二人自相扼喉，马太后却死不了。到北京后