宗病重，群臣请建东宫，不予批准。商辂继奏称：「陛下宣宗章皇帝之子，当立章皇帝子孙。」闻者感动。因为日暮，奏未入，而同夜石亨等人已迎复上皇复位。此日，王文、于谦等被收拿，召商辂与高谷入殿，让他们起草复位诏书。石亨私下请其增加条款，遭到商辂拒绝。石亨不悦，命言官弹劾商辂，商辂于是下狱。商辂自诉《复储疏》在礼部，可以覆验，没有得到回覆。当时中官兴安稍微解释，英宗更加震怒，兴安则称：「向者此辈创议南迁，不审置陛下何地。」英宗稍解，于是改释商辂为民。后来，英宗常自言自语道：「辂，朕所取士，尝与姚夔侍东宫」，不忍弃之。