便成为南华青年军，1999年获提升为甲组后备。在2000-01年度球季，马嘉祺开始获得较多上阵机会，由于他可以胜任后防任何一个位置，故此每当有主力球员停赛或因伤缺阵，他便会获派正选上阵，球季结束后在球队颁奖礼上获得「进步神速奖」。2004年夏天，离开母会南华，专注发展他的足球学校事业。2006年，在好友何国泉邀请下，以玩票性质，复出加盟重返甲组的业余球队港会，虽然只上阵两场，但已吸引到正在物色中坚的公民球会高层注意。2007年夏天，获公民罗致，并效力至今。2007年10月13日，公民对南华之战，是他