台湾最南端设立恆春县，将率芒溪（今春日乡）以南规划恆春县，这个时期等于将屏东分割成二部分，率芒溪以北属于凤山县，以南属于恆春县，其上为台湾府（台湾设省后改称台南府）。而在屏东县南边的恆春半岛地区，则是在光绪元年（1875年）才从凤山县划出恆春县，建恆春县城。
日治时期.今日屏东县内最大城市屏东市，旧名阿猴，日治初期改阿缑，原本为平埔原住民聚落，因「阿猴」地理位置位于今高雄市半屏山之东，所以后来在日治时期，「阿缑」这个地名，被日本人改名为屏东。日本领有台湾以后，台南府改为台南