日治时期.1896年，日本曹洞宗若生国荣、芳川雄悟抵达台南，致力于县内各处斋堂的布教，很多寺院斋堂同曹洞宗缔结本末关系。1900年，分别由冈田原龙、大场道贤、岛津博巖、井上秀夫诸师到此寺、与德化堂、万福院等共修并说教。据许丙丁回忆，从清治到日治时，名为「寿山班」、「福海班」这两班乱弹戏班的戏馆皆设于此。1910年2月3日的《台湾日日新报》报导广慈庵新募集了一个戏班，成员皆是14、15岁，名叫「玉记班」，开演三天用低廉的票价来吸引观众。1915年调查，庙址为广慈庵街丁10番