部分盘菌目其他科属的真菌外形与羊肚菌相似，合称假羊肚菌，这些真菌通常具有毒素，食用后可能导致中毒。
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早期研究历史.羊肚菌属的学名"Morchella"是由德国植物学家命名，来自德文的，后者可能来自低地德语一种方言的mörk，意指黑暗，也可能是来自德语的moor，意指沼泽。1794年，克里斯蒂安·亨德里克·珀森描述发表了羊肚菌属，并指定为模式种。1805年，奥古斯丁·彼拉姆斯·德堪多发表了本属新种半开羊肚菌（"M. semilibera"）。1818年，