瞻基础建设计画缺乏「战略思考」，现实与期待出现太大落差，还不如取名为「振兴经济方案」。2017年11月14日，苏焕智表示，蔡英文政府修法将农田水利会改制为公部门，赤裸裸涉及侵害人民结社自由及财产权，有违宪之虞，「牺牲了人民团体农民自治的精神，而交由执政党人事独揽；结果是消灭了国民党的某些地方派系，但也相对的产生新的执政党的派系」。2017年12月15日，立法院会议在民进党席次优势下，表决将《农田水利会组织通则》修正草案迳付二读；苏焕智表示，行政院美其名为农田水利会「改制」为公务机关，实则赤裸裸消灭农