1935年，为庆祝「始政四十周年记念台湾博览会」，台南市役所配合成立「台南历史馆」共计三处会场，第一会场台南州商品陈列馆（今台南高分院址），第二会场今热兰遮城博物，第三会场今大南门址。1937年后，为将馆藏长久保存及展示，于大正公园（原民生绿园，今汤德章纪念公园）武德殿旧址（今中西区公所址）兴建兴亚式钢筋混凝土造之「台南市历史馆」，但于太平洋战争期间遭美军炸毁。民国三十四年（1945年）于赤崁楼重新设立「台南市立历史馆」，民国五十三年（1964年）延平郡王祠改建为北方宫殿式建筑，于南侧兴建西式平顶馆舍乃自赤