前拥有9个连的爱国者飞弹，分别部署于南港、新店、万里与中南部等位置，用于拦截短程弹道飞弹，另外中华民国国防部于新竹县乐山设置铺路爪长程预警雷达，提供预警。
撤除导弹谈判.2008年12月中国共产党中央委员会总书记胡锦涛表示，在一个中国原则的基础上，为有利于稳定台海局势，减轻军事安全顾虑，两岸可以适时就军事问题进行接触交流，探讨建立军事安全互信机制问题。2010年7月，中华人民共和国国防部新闻发言人耿雁生大校表示，撤除福建沿海导弹，实现两岸关系和平发展，符合两岸同胞根本利益。撤导弹困