不久外任都督郢武巴定四州诸军事、军师将军、郢州刺史；天嘉六年（565年）再征召为中护军，改任护军将军。光大二年（568年），沈恪转迁使持节、都督荆武祐三州诸军事、平西将军、荆州刺史，唯未就镇就改为护军将军。陈宣帝即位，他获加散骑常侍、都督广衡东衡交越成定新合罗爱德宜黄利安石双等十八州诸军事、镇南将军、平越中郎将、广州刺史；他未到岭南，前广州刺史欧阳纥就举兵抵抗，令他不能前进，朝廷派遣司空章昭达督军讨伐欧阳纥，之后欧阳纥平定，沈恪入州。广州经历兵荒，房屋遭摧残破坏，他关心安抚，施行恩惠，当地人民很依靠他。