太空军的最高指挥机构为太空军作战部长办公室(OCSO)，其下的作战组织可分为三类：司令部(Field Commands)、三角翼部队(Deltas)以及中队(Squadrons)。司令部由一位上将或中将指挥，负责某一特定职能和任务的指挥工作；三角翼部队由上校领导，负责某一特定功能，例如作战、技术支援或训练；中队由中校指挥，负责特定的战术任务。根据太空军于2020年6月底公佈的组织计划，太空军将会建立三个司令部：太空作战司令部(SpOC)、太空系统司令部(SSC)和太空训练暨战备司令部(STARCOM)。