地特殊的玄武岩地形景观。 澎湖群岛是台湾三大火山群之一，除了花屿之外，各岛大多由玄武岩组成。火山熔岩在冷却时体积收缩，形成玄武岩的柱状节理，呈现六角柱或多角柱结构。随后由于海蚀及其他地形作用的影响，形成许多高低起伏、变化多端的柱状玄武岩。保留区位于黑潮支流、南海季风流、及潮汐流交会处，邻近海域蕴藏丰富的渔类资源。鸟类大多为冬季候鸟和过境鸟，常见鸟种包括黄足鹬、大苇莺和家燕等。夏季候鸟以苍燕鸥和白眉燕鸥较多，其次为小燕鸥和红燕鸥。澎湖县野鸟学会2014年6月在保留区内的鸡善屿发现有黑嘴端凤头燕鸥在此繁殖