“钟秀书院”等匾额及大批精美雕刻被毁。1973年，县政府在此创办第二中学，文庙重新得到保护。1989年5月，江川县政府将文庙列入第一批县级文物保护单位；1996年，市、县两级政府投资60多万元对庙内的两庑、四祠进行了大规模重修；2001年4月，文庙成为玉溪市市级文物保护单位，2003年12月，被云南省人民政府公布为第六批省级文物保护单位。2019年，列入第八批全国重点文物保护单位。