学在1947年4月被东北民主联军接管，改名为“东北军政大学吉林分校医学院”。兴山中国医大的李震勋任院长，卢基舜任副院长。学校的教职员工和学生都编入东北民主联军，成为军人，身穿军装。由于办学宗旨上的变化，一部分教员和学生离开了学校。1948年1月，由于中国医科大学和东北军医大学合并后的改编，“东北军政大学吉林分校医学院”改名为“中国医科大学第一分校”。学校领导也改为由中国医科大学总校调来的人员担任。1948年4月，中国人民解放军全面进入反攻阶段。10月1日，延边在吉林省教育工作会议精神指导下在延吉成立四年