果一发不可收拾。週日，整个伦敦已有1300间房屋和87个教区的教堂被烧毁。週一晚上，历史悠久的彻夜燃烧。週二白天，火势从普丁巷附近开始东移。附近的房屋被大规模破坏，阻止了大火蔓延。
大火与鼠疫.在大火的前一年，伦敦爆发了大规模的瘟疫，死亡人数超过10万人。1665年的6月以来的3个月内，伦敦的人口减少了十分之一。鼠疫由伦敦向外蔓延，英国王室逃出伦敦暂住牛津，市内的有钱人纷纷携家带口急忙出逃，有病人的住房都用红粉笔打上十字标记。伦敦不再有扰人的官司问题，因为法律界人士已全都移居乡下。