更改高中历史课纲（98课纲），更换课纲修订委员，并施压委员通过王晓波提出的修正方案。周婉窈因此宣布退出专案小组。2月26日，民进党立法委员针对此事提出质询，行政院长吴敦义承诺台湾史和中国史的比重不会改变，台湾史维持独立成册，不会改变。9月18日，中国统一联盟等民间社团，在教育部外发起游行，主张将历史教科书中分离主义（台湾独立运动）的内容删除，以中华民族观点重新编写。
教育部长蒋伟宁时期.
2012年.2012年2月，蒋伟宁接任教育部长。专案小组公布审订过后