入了莫桑比克解放阵线（莫解阵）。在国外接受了军事训练后，他于1964年返回国内，在莫桑比克北部地区展开游击战反对葡萄牙军队。1970年，马谢尔成为莫解阵的主要军事领导人。在莫解阵的军事打击下，葡萄牙深陷战争泥潭。1974年4月25日，葡萄牙国内发生军事政变，新政府宣布从莫桑比克撤军。莫解阵终于带领莫桑比克人民获得了独立。1975年6月25日，马谢尔当选莫桑比克总统。
实行一党专政.当政期间，马谢尔在国内建立了一党专政，将原葡萄牙殖民者的财产国有化，并在不发达地区普及基础教育和医