模拟城市3000导入了与邻近城市交易的功能，玩家可以透过交易，将城市过剩的资源卖到邻近的四个城市换取更多的收入，或着是购入不足的资源；此外，可以变动的政府政策和法案在本作中也有所增加。部份新增的项目包括：在《模拟城市3000》中删去了一些《模拟城市2000》存在的项目，其中包括：《模拟城市3000》台湾中文版增加了圆山大饭店、中正纪念堂等五个台湾地标，市长顾问群也改为亚洲人面孔，并赋予他们与真实人物谐音的名字，增加了游戏的趣味性。该作品亦允许玩家读取《模拟城市2000》的游戏存档，但新作删去的部