玛丽．奥立佛（Marie Elizabeth Watkins Oliver）所设计，于1913年起採用并延续至今。此旗的背景由三个横条所构成，由上而下为红色（代表勇气）、白色（代表纯洁）、蓝色（代表警惕与公正），这三个颜色同时也象征着曾经统治此州的新法兰西。在白色横条的中央为密苏里州州徽，为蓝色圆框以及24个星形所围绕，代表了密苏里州是美国的第24州。