警察（SiPo）、武装党卫队与特殊别动队在前线后方执行独立于军队的任务，系统地枪决数万男女老幼。波兰东部地区（原苏占区）中有超过30个地点发生了屠杀事件，，包括布列斯特、塔尔诺波尔与比亚韦斯托克隔都等地，以及战前的省会城市、利沃夫、斯坦尼斯瓦乌夫及维尔纽斯（参见）大规模杀戮行动的幸存者被关押在新的用于剥削的隔都，并且在德国当局的心血来潮下因而慢慢饿死。出于卫生考虑，成千上万因饥饿和虐待而死的人的尸体被埋葬在乱葬坑中。1941年11月起，毒气车投入使用。截至12月，波兰东半部和苏联最西部的共和国共有439