港务局管理高雄港业务，同时打捞沉船以清理航道。民国48年（1959年）后，高雄港展开12年扩建计画等多项措施，至民国69年（1980年）完成中岛商港区，并增加深水码头27座，浅水码头2座。附设高雄加工出口区、前镇渔港、临海工业区、中国钢铁公司、台湾国际造船公司，以及第一、二、三、四货柜中心等。民国64年（1975年）第二港口开通，并在民国73年（1984年）完成高雄港过港隧道。第五货柜中心，于民国78年（1989年）完成。高雄港于民国88年（1999年）位居世界货柜吞吐量第3大港，当年货柜进出口量约