内应将织田军引进城内，于是接受羽柴秀吉的策反，与儿子贞大一起改投织田家。由于山本山城乃是监视北近江和北国街道连接的重要要塞，阿闭贞征的反叛令浅井家完全断绝了来自朝仓家的援助，但阿闭贞征作为人质送入小谷城的十岁幼子也因此被浅井家杀害。同年八月织田军大举攻入越前时，担任先锋立下战功。浅井家灭亡后，阿闭贞征得到山本山城和伊香郡所领的安堵，担任羽柴秀吉之与力，更招募了渡边勘兵卫、藤堂高虎等浅井家旧臣，天正3年（1575年）与秀吉一起镇压越前一向一揆。后来却与秀吉为了竹生岛一带的寺领界限划分产生强烈争执，