6年调中共中央办公厅工作。一年后，回到上海，出任“上海申能电力开发公司”总经理。1991年，华建敏正式进入政府部门工作，出任上海市计委副主任，并继续兼任申能公司总经理；1993年晋升为上海市计委主任，上海市综合经济工作委员会副书记；1994年进入中共上海市委市委常委，并出任上海市副市长。1996年，华建敏被调往中央，出任中央财经领导小组办公室副主任；1998年晋升主任。2003年3月17日，中华人民共和国国家主席胡锦涛发布第二号中华人民共和国主席令，根据中华人民共和国第十届全国人民代表大会第一次会议