到底部1185年间，伊势平氏控制了局面。平清盛殁后，平氏最终在坛之浦之战败于源氏，政权瓦解。源頼朝消灭奥州藤原氏后，从京都贵族和中央政府中取得政权受册封为征夷大将军。在镰仓建立了日本史上第一个以幕府将军为首的封建武家政权鎌仓幕府，令自己取得实权之余，亦令天皇在按照法律的情况下继续保持一国之君的地位。在1192年源頼朝被天皇封为征夷大将军，他发展出的军人政权被人称之为幕府。源頼朝的妻子北条政子所属的北条氏家族在源赖朝殁后取得政权。源赖朝的子嗣源赖家及源实朝相继被杀后，源氏家族被灭。幕府将军已成为傀儡，任由世袭