商馆在1623年由于财务问题关闭。1615年，亚当斯访问琉球那霸的时候，带回番薯回到平户，并由平户英国商馆长理查·考克斯（Richard Cocks）最早在日本本土成功栽培了番薯。
家康死后.1616年4月家康病殁，继任的德川秀忠和德川家光对于外国人与基督徒更加不信任、对外政策逐渐转趋保守。1620年5月26日亚当斯在平户死去，享年55，埋葬于平户商馆附近的公共墓园，现在是平户市的崎方公园。另外根据亚当斯的遗言，在可以望见江户城的逸见山顶修筑了按针冢。之后亚当斯的领地被儿子