主教徒在古时曾和平共处，因此当地社群也应为路德宗信徒保留一席之地。此外，1535年传入波兰的再洗礼派及1526年出现在波兰的门诺派，同样也享有宗教宽容。唯一在波兰激起的宗教斗争为「焚书焰」事件。1557年 – 1559年间，普鲁士城市陆续获得齐格蒙特・奥古斯特的保证，享有信奉奥古斯堡派的自由；利沃尼亚也在1561年的维尔纽斯协定中获得同样的特权，享有国王赋予贵族及中产阶级信奉路德宗的自由，同时确保对天主教的宽容。1563年及1568年齐格蒙特・奥古斯特国王陆续废除了立陶宛大公国内东正教信徒不得担任最高公