1902年），他因“教操有方”、“剿匪奋勇”而以哨长记名。光绪二十九年（1903年），他因“剿办南境等处逆匪……尤为出力”获得袁世凯举奏，以外委把总尽先拔补。宣统二年（1910年）农历十二月十八日，王翰章以千总尽先拔补。宣统三年（1911年），他署理陆军第五镇步兵十七标第二营管带。中华民国成立后，他所在的陆军第五镇改为陆军第五师，他也成为陆军第五师第十七团第二营营长。1913年二次革命发生后，陆军第五师参与进攻南京，因兵源不足，乃于同年7月添招了步兵第一旅，王翰章因此于1913年8月7日被陆军第五师师长