次古贤会议后，阎锡山开始限制、削弱、分化新军，授意部属向中共提出取消动委会。1938年9月，阎锡山在吉县古贤村召开“抗战行政检讨会议”（第二次古贤会议），进一步从政治上限制和打击牺盟会势力的发展。从1938年底开始，决死队进行了“西林整军”，共产党八路军的朱德、彭德怀、左权等将领来给决死队干部训练，决死队完全由共产党掌控。1939年上半年，决死队发展到50个团，约四五万人，占阎锡山麾下150个团的三分之一。1939年3月25日至4月22日，阎锡山在陕西宜川县秋林镇召开“军政民高级干部会议”（秋林会议