员公司成为一家新成立之九龙巴士控股有限公司旗下的子公司，主要股东维持不变。而九巴控股已于2005年改名为载通国际控股有限公司。1998年，九巴成立全资附属公司阳光巴士有限公司，专门提供屋村巴士（首位客户为上水蔚翠花园）、员工及学童接送专车、购物商场穿梭巴士等各种非专利巴士服务。该公司现时为香港其中一间最大的巴士租赁服务公司。1998年，九巴开始在旗下空调巴士安装上海凯伦广播报站系统，该系统由车长控制，在车头的电子显示屏显示站名，并以粤语、英语、普通话报出站名，并于2005年开始推广至旗下非空调巴士。