口器位于头部底，接近第一对脚之间，有点像已灭绝的板足鲎目及现存的鲎。4亿200万年前泥盆纪早期的陆生蝎子化石拥有书肺。
与其他的关系.传统上螯肢亚门与其他主要的节肢动物门较为疏远。但近期的分子种系发生学及对节肢动物的神经系统在胚胎时期的发育研究，显示螯肢亚门与多足纲较为接近。不过，研究结果只是针对现存的节肢动物，若结合已灭绝的动物（如三叶虫），结果可能会重返传统的观点上。
主要亚类.一般认同螯肢亚门包含了蛛形纲、剑尾目及板足鲎目。已灭绝的是板足鲎目下的亚