分裂驱动并不採取杀死配子的手段，而是利用雌性个体减数分裂的不对称性质：造成驱动的等位基因最终进入卵子，而非进入极体的机率会大于二分之一。研究最为透彻者包括玉米的新着丝粒 (neocentromeres; knobs)，以及哺乳类中许多的染色体易位现象。着丝粒的分子演化常透过此机制发生。
转位子.称为转位子 (transposon) 的基因，其编码出的蛋白质能自身复制并转移到其他基因座上，因此即使其对整体基因组或物种的适存度没有明显助益，甚至常常有害，仍能在基因组中逐渐累积、增加。