3月14日，台湾行政长官公署秘书长葛敬恩乘专机飞南京，代表陈仪向蒋报告事变经过；葛谈话称，2月28日暴动原因系日据时代遗留之鹰犬与近由海外遣回之台籍浪人受奸徒煽惑。美国驻华大使司徒雷登也向蒋中正提出备忘录，批评陈仪的镇压行为，且要求陈仪撤职，由于担心美援落空，蒋中正勉强接受撤换的意见。当各界挞伐陈仪的声音风起云涌，陈仪一手导演国大代表、参政员、省县市参议会、各保甲长联名电呈中央挽留自身职位的戏码。3月17日，陈仪电请蒋中正表示辞职。3月18日，蒋中正批准请辞，并慰勉陈仪「收复台湾，劳苦功高，不幸变故突起