性疟患者常见的併发症，多达25%的成人和40%的幼童会有此症状，成因可能是造成的唿吸代偿、非心源性肺水肿、併发性肺炎和贫血；急性唿吸窘迫症候群在患有恶性疟的儿童中很少见，但却出现于5–25%的成人和多达29%的孕妇。肾衰竭是的重要特征，疟原虫造成溶血后血红素进入尿液，而使尿液呈暗红色至黑色。同时感染爱滋病的疟疾患者死亡风险会提高。恶性疟可能会影响脑部而导致脑疟疾，视网膜白化为此病临床上重要的判断依据，其他症状包括脾脏肿大、、严重头痛、低血糖，以及肾衰竭造成的血红蛋白尿。其併发症包括自发性出血、凝血功能障