补秘书省正字。大和初年，任侍御史。改中书舍人。郑注被任命为翰林侍进学士，由高元裕撰写诏书，叙述郑注因医药精湛，得以侍奉君王，认为郑注不应为翰林学士。为郑注所忌。大和九年，李宗闵获罪南迁，元裕出城饯别，被郑注检举，开成二年五月，贬阆州刺史。开成三年复召为谏议大夫、翰林侍讲学士，兼太子宾客。开成四年，任御史中丞。唐武宗时，担任京兆尹，历左散骑常侍，迁兵部侍郎，转尚书左丞。会昌五年，为宣州刺史、宣歙观察使。大中初年，改任刑部尚书。大中二年，为山南东道节度使。官至吏部尚书。高元裕为官清廉，生活俭约，通儒术，性格耿直