。档案系统可能由公司根据其需求开发、由业余爱好者开发，或改写自Unix、Microsoft Windows和其他作业系统。Linux完全支援XFS、JFS、FAT（DOS档案系统）和Macintosh的主要档案系统HFS。现在也已经开发了对于Windows NT的NTFS档案系统的支援，可与其他Unix原生档案系统相提并论。也支援光碟和蓝光光碟的ISO 9660和通用光碟格式。与其他作业系统不同，Linux和Unix允许存放于任何介质的档案系统，包括磁碟、光碟、USB硬碟，甚至是另一个档案系统中的档