海岸。基尔和吕贝克对于去往斯堪的纳维亚的货运非常重要，去往东欧的货运量也不断增高，此外基尔还是一个重要的渡船和游船港口。普特加登是去往丹麦的飞鸟航线上的德国港口。布鲁恩斯比特是一个重要的集装箱港口，此外越来越多的海上风力能源工业也适用这个港口作为基地。基尔运河每年有4.1万以上的船只通行，是世界上使用最频繁的运河。
航空.石勒苏益格-荷尔斯泰因最大的两座机场是基尔机场和吕贝克机场。目前基尔机场暂无商业航班，并在2018年初由绿党发起公投试图关闭并失败，现在基尔机场主要业务为：包机、