疹和疱疹病毒科）的抗原可能导致这个疾病。这些病原可能促使自体免疫的爆发，但是在发病时这些病原已经找不到了。也有人怀疑这种病是由至今还没有被发现的病毒导致的。自体免疫肝炎的肝脏丧失了自身相容的能力。诊断自体免疫肝炎的标志是血浆中转氨酶值升高，此外球蛋白，尤其是免疫球蛋白（）的升高。尤其典型的是针对细胞核、平滑肌、肝和肾的微粒体以及一种肝的可溶蛋白质的抗体的出现。这些抗体并不是导致病态的原因，但是它们是最重要的诊断标志。按照不同抗体的出现或者缺乏医学上分三类自体免疫肝炎。这三类类自体免疫肝炎之间的过渡是