府将给一委员，结果遭到叶氏以服务地方拒绝。日后叶廷珪一度名列《自由中国》「选举改进座谈会」召集人，并名列新党筹备委员会召集人。直到7月原定台南举行座谈会前夕，叶廷珪在报上发表启事声明与座谈会无关。此举被视为对吴三连在市长选举支持辛文炳不满，而召集人之一郭国基也因李万居对他的批评不满，鼓励叶氏不要参加座谈会。1964年第五届台南市长选举，叶廷珪以无党籍身分再度角逐市长宝座，最后以65,099票击败中国国民党提名的省议员黄业61,055票当选，三度当选台南市市长。叶廷珪任内重修延平郡王祠及赤嵌楼，使其焕然一