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新兴疾病.在大多数情况，微生物透过互利共生或偏利共生与宿主和谐相处。当现有的寄生物成为病原体，或新的致病性寄生物进入新的宿主时，就会产生疾病。人类有些活动，导致人畜共通传染病的病原体产生，包括病毒、细菌、原生动物，和立克次体，以及传播依靠病媒传播的疾病 。请参考全球化与疾病和
细菌病学理论.在上古时期，古希腊历史学家修昔底德（生卒约为公元前460年到400年）是首度描述雅典大瘟疫的人，他认为疾病可能会从受感染者传播到其他人。希腊罗马（请参考古典时