卤代醚麻醉药甲氧氟醚在代谢过程中也会释放氟离子。由于甲氧氟醚可导致肾衰竭，恩氟醚被认为同样具有损伤肾脏的风险。但从临床经验来讲，恩氟醚麻醉时的血浆氟离子浓度较低，通常不会导致肾衰竭。正如其他卤代醚麻醉药般，恩氟醚可引发恶性高热。此外恩氟醚会诱使病患癫痫发作，故绝对不能用于有癫痫病史的病患身上。