为牠们是鱼食性动物。在2008年，季强提出辽宁翼龙、古魔翼龙、嵴颌翼龙互为最近亲。大卫·安文（David Unwin）则提出辽宁翼龙属于鸟掌翼龙科。汪筱林根据口鼻部冠饰形状，而将辽宁翼龙归类于古魔翼龙科（Anhangueridae）。在2006年，吕君昌公布一份亲缘分支分类法研究，提出辽宁翼龙是种原始古魔翼龙科