65年），山西巡抚万恭筑连城，南关城与太原城连为一体。明末的1644年，李自成军攻太原时，明军“焚南关城以守”。李自成将陈永福拆连城，太原城和南关城皆损毁严重。同年九月，清军攻陷太原城。1646年四月十二日，明晋王府起大火，太原城北部和东部化为焦土。清朝时，商业和居民聚集于太原城南和南关城地区，城市未能恢复明代规模。晚清时，城西地区在光绪十二年（1886年）因汾河洪水严重损毁。终明清两朝，太原城为太原府和阳曲县同城而治的城池所在。
太原城墙.明代太原城墙周长24里，共有8道城门