皇储宝座的皇子拉拢的重要对象。雍正朝起设“军机处”，立军机大臣等专职，南书房虽仍为翰林入值之所，但已不参预政务。清代士人则以入值南书房为荣。清初不少着名文人学者入值过南书房，如：熊赐履、叶方霭、张玉书、孙在丰、徐干学、陈廷敬、王士祯、查慎行、朱彝尊、方苞、沈荃、何焯、戴梓、黄钺等。1923年，王国维（1877年—1927年）曾应召为“末代皇帝”溥仪的南书房行走。