诺和未来查理五世皇帝从法兰德斯来到西班牙为止。除斐迪南以外，她所有的五个手足均出生在低地国，并由姑姑玛格丽特（Margaret of Austria）抚养，胡安娜只有年轻的凯瑟琳在身边。凯瑟琳是在阿拉贡（Aragon）的祖父斐迪南二世摄政期间，在托德西利亚斯（Tordesillas）与母亲待在一起。