轴式电阻控制器和CS28型电动凸轮轴式励磁控制器。除了电阻调压外，亦可以通过改变牵引电动机回路连接方式（串联、串—并联、并联），来改变牵引电动机的端电压。该项转换是通过主电阻控制器的串并联切换来进行的，并采用桥式换接电路以减少串并联换接过程中造成的牵引力冲击。此外，为扩大机车的恒功调速范围，还可以对牵引电动机施行八级磁场削弱，级位数量比EF65型电力机车增加一倍，进一步减少磁场削弱时电流和牵引力的冲击，磁场削弱率最深可达40%。此外，EF66型电力机车还采用了类似电力动车组的MC46型转轮式司机控制