学和作文上有着优异的成绩。旧东北帝国大学附属医院保留的病历显示他在幼儿时期因为麻疹种过几次痘。小时候的梦想曾经是成为陆军大将。
陆军学校时代.1902年石原莞尔考入了，这段时期在班级里的51名学生中他的成绩一直名列前茅，特别是在德语，数学，国语和汉文有杰出的表现，但在不擅长体育和剑术等术科。1905年进入了陆军中央幼年学校，同期生还包括了后来的陆军中将横山勇和岛本正一。中央幼年学校的主要科目包括了基础军事训练与武器分解和骑马等，而石原常常喜欢研究世界战争史和哲学，也是在此时开始接触