化石是在法国南部早二叠世发现的毛状叶（"Trichopitys"）化石（也有认为晚石炭世的两歧叶属 "Dichophyllum" 是最早的银杏类化石）。楔拜拉（"Sphenobaiera"）于晚二叠世时出现。二叠纪-三叠纪灭绝事件使银杏类植物濒临灭绝。晚三叠世时，银杏类植物快速发展，之后的侏罗纪和早白垩世达到了鼎盛时期，广泛分布于世界各大洲，但在赤道地区和南极洲没有发现报道。当被子植物于早白垩世晚期迅速崛起时，银杏类像其它裸子植物一样也急剧衰落。晚白垩世后除个别发现外，银杏科以外的银杏类植物已基本绝迹。晚白