在儿子申征在北京市的家中长达三个月。李克伟后来自首，供出了申公元。2010年4月下旬，太原市检察院正式批捕申公元和儿子申征。2011年1月，山西省纪委通报，已开除申公元党籍和公职，并且移交司法机关处理。2006年底至2008年春节前，申公元和长子向刘志军的心腹、原中铁集装箱运输有限公司董事长罗金宝行贿人民币600万元人民币。申公元接受调查之后，罗金宝将钱退给了申公元的次子。