该寺是一座苯教寺院。第一任住持是益西当嘎·阿旺群培。吉日寺内主供莲花生、增巴朗卡、才旺仁增三尊塑像。2001年，经卡斯木村群众的强烈要求，林芝镇人民政府投资对吉日寺进行了维修。如今，本日山周围保存完好的寺庙有4座，即吉日寺、大卓萨寺、达则寺、色迦棍钦寺，均属苯教。2012年初，林芝县在吉日寺举办了“60岁以上僧尼享受社会保险待遇领取基础养老金首发仪式”，这标志着林芝县寺庙僧尼参加社会保险工作的正式启动。