无法反对蒋介石的命令。1953年，黄杰与其军队由越南富国岛至台湾（详见富台部队）。1954年6月，蒋介石命任黄杰为陆军总司令，将孙立人调为无实权的总统府参军长。12月3日中华民国与美国双方签订《中美共同防御条约》，中美关系不再需要透过孙立人来连系。蒋经国属下的政战单位，开始调查孙立人的部属，锁定在步兵学校服务的郭廷亮。1955年5月25日，郭廷亮被捕，遭到严刑审讯，连续十天遭刑求。5月28日蒋介石召见孙立人，说他打仗不行，对他进行监管。6月，以孙立人与其部属少校郭廷亮预谋发动兵变为由，对孙实施看管侦