国人Mary Loretta Dardis结婚。1915年9月，在横滨港许多人迎接他的归来，在日本期间受到许多邀请前往演讲。这是他前往美国后首次回日本，也是最后一次回国。1918年，为了研究黄热病、奥罗亚热、小儿麻痺症以及沙眼，野口英世频繁地到中美洲与南美洲旅行。1928年，野口英世为了研究黄热病而前往西非的黄金海岸（今加纳），试图证明黄热病的致病体是螺旋菌而非病毒。1928年5月21日，由于感染黄热病而在黄金海岸的阿克拉死去，享年51岁。