当局以减刑为诱因吸收成为间谍，被委派从事蒐集厦门地区情报的任务，并在就读上海大学期间，由日本位在上海的情报机构秘密送回台湾汇报三次。
双面谍.由于侯朝宗的共党背景，到厦门后获得当地台湾留学生詹以昌、王天强等的支持，加入共产党外共青团组织从事学生运动，并曾经与反日的台湾共产党员翁泽生、谢雪红、蔡孝干、林日高等一起推动反日本帝国主义殖民的台湾独立运动，延续一贯反日反日本帝国主义侵略的左翼社会运动路线。这个时期侯朝宗与翁泽生、林日高经常从事地下活动，并曾经与蔡孝干前往上海大学学习过社会主