始大力批判时政甚至支持民进党候选人后，国亲合作的关系就备受挑战。此外，本次选举中，国亲联盟立委较上次大选减少了六席，除了傅崐萁因被开除党籍而丧失国亲联盟身分外，不分区立委张显耀和郑金玲初选落败而放弃竞选连任，吴清池、黄义交和钟绍和则因落选而离开立法院。罗淑蕾则是唯一一个于国民党党内初选中胜出的国亲联盟成员，并最终在首次参选区域立委的情况下，以北市最高票连任成功；李鸿钧终得以代表国民党出线并顺利连任；徐耀昌则长期经营苗栗，在无初选竞争对手下代表国民党再次胜选。虽然亲民党仍被大众归类于泛蓝，但国亲双方已同床异梦