制失败，北洋女医学堂因失去来自袁世凯的支持而停办，虽然之后重开，金韵梅没有回到这里工作，而是选择留在美国。1917年起，金韵梅为美国农业部聘用，调研中国的大豆与豆制品，在美国介绍推广。
晚年生活.1918年，金韵梅的儿子在第一次世界大战中战死。1920年，她的养母去世。之后，金韵梅回到北京定居，她热心参与社会活动，捐助社会事业。1934年3月4日，金韵梅因肺炎在北京协和医学院去世。她将遗产的大部分捐赠给燕京大学及其他学校，价值逾两万元。教育部特授与她捐资兴学一等奖状，刻于她墓碑的背