于仅有小部分同源区域不能完全联会。核小体从细胞核中心移至其边缘。
粗线期.前期I的第三阶段是粗线期，在联会完成后开始。染色质此时足够缩聚，在显微镜下可见染色体。联会复合体上形成了重组节。重组节促使二价体上的非姊妹染色单体交换遗传信息，该过程为染色体互换或遗传重组。每个二价体可发生多次重组，人类每个染色体平均发生二到三次重组。
双线期.前期I的第四阶段是双线期，此时染色体互换完成。同源染色体此时有参杂父母来源的整套遗传信息。染色体互换发生位置形成了交叉，