如今窦建德快要到了，宇文化及还没有平定，两方敌人夹击，我军必定失败。不攻而夺取城池，功劳非常大。如今贪图财物，我军一定会失败的。”李神通大怒，把崔民干囚禁在军中。唐太宗即位后，下令申国公高士廉、黄门侍郎韦挺、礼部侍郎令狐德棻、中书侍郎岑文本等人修《氏族志》，贞观十二年（638年）《氏族志》编修完成，黄门侍郎崔民干被定为第一等，唐太宗看后非常不满意，下令重新编纂，以唐朝的官品为评定标准，以皇族为首，外戚次之，崔民干被降为第三等。崔民干后在贞观六年（632年）至七年（633年）之间任宋州刺史，之后转任豳