她成为被运送到该处最年轻的人之一。安妮很快就意识到很多人于抵达后被毒气杀害，但她不知道后宅里的人有否在侥倖生还，而且她推断年过５０岁而且身体不是很强健的父亲会在跟她们分开后立即被杀。跟其他没被送进毒气室的女性和女孩一样，安妮和玛戈都要脱光全身衣物进行消毒、剃光头，并于手臂纹上纳粹集中营识别码。白天，这些妇女被逼当作奴隶式的苦工，法兰克姊妹俩被迫拖运岩石和挖草皮；晚上她们都被挤进十分寒冷且人满为患的营房中。后来有人作证指每当安妮看见有小孩被送到毒气室都会变得沮丧和流泪；有些人说她很多时候也展现出坚强和勇气