在姚刘沙上堆土建州城，置州署。至正十三年（1352年），州城南面为潮汐冲啮而坍塌于水，达鲁花赤八里颜、知州程世昌、同知王也先不花在原州城以北15里以土筑城，城墙方圆九里三十步，城壕宽十步。
明代.明洪武元年（1368年），太祖朱元璋因元崇明知州何允孚率众归附，御书“东海瀛州”赠之。洪武二年（1369年），因地坍户减，降崇明州为崇明县，仍隶扬州路。并置县署，以胡兴福为首任知县。洪武八年（1375年），改隶苏州府。永乐十八年（1420年），县城南为海潮所迫，坍于水，知县高居正、王瑛及指