富有韬略，然而也恃才而骄，在郑军内部先是与陈斌不睦，与黄廷产生冲突。郑成功手下曾德一度得罪施琅，施琅借故杀了曾德，因而得罪了郑成功，郑成功立即诛杀施琅全家，施琅逃走，父亲与兄弟被杀。由于亲人被郑成功族灭的大恨，施琅再次降清。施琅先后担任清朝副将、总兵、水师提督，参与清军对郑军的进攻和招抚。施琅甫投清营二次领军征台遇风不顺，后调北京任内大臣期间，甚为贫苦，依靠妻子在北京当女红裁缝贴补家用所需。期间郑成功在台湾病逝、郑经继为延平郡王；郑经主政期间，明郑内部派系斗争日趋激烈，群臣分以支持郑经二子克臧、克塽为名