吴兆毅（）籍贯不详，清朝及中华民国官员。
生平.光绪二十七年七月十三日（1901年），陈夔龙等奏请以候补知县吴兆毅署通州知州，后获准。任内，美国牧师都春圃同知州吴兆毅议定了赔款事项，还威逼知州吴兆毅在通州新城南门西侧开小南门，将此前霸占的通州城内外的两块地区连为一体，形成了美国人的“独立王国”复兴庄。后吴兆毅署雄县知县。光绪二十八年十二月（1902年），署雄县知县吴兆毅遭王振声奏参“嗜好甚深，公务废弛，任用匪人，声名贪劣，请一并饬查。”上着袁世凯查明具奏，袁世凯奏称吴兆毅无劣迹