19年（宽仁3年），九州北部发生名为刀伊入寇的女真族入侵事件并被大宰府击退。11世纪之后，随着朝鲜半岛和中国大陆的局势趋于稳定，日宋贸易繁盛，福冈地区也成为日宋贸易的主要据点。
鎌仓时代至江户时代.12世纪中期，九州北部地区是平氏政权的支配地区，但也引发当地武士势力的反抗。坛之浦之战后，九州北部也进入鎌仓幕府的势力范围。1274年（文永11年）和1281年（弘安4年），蒙古两次入侵日本，福冈地区是两国交战的前线。幕府为加强对九州北部的控制而设立镇西探题，结果反而引发九州在地御家人的