顿·奥博特出生于乌干达北部阿帕克区的阿科科罗村（），他的父亲是一个兰戈族地区酋长。1940年，奥博特在利拉开始接受教育，并曾入读马凯雷雷大学。大学时期，奥博特展现了他的演说天份，但后来因为参与罢课而被开除学籍（奥博特声称他自愿离开马凯雷雷大学）。他前往肯尼亚一家工程公司任职建筑工人前，曾在乌干达南部布干达工作。奥博特在肯尼亚参与了当地的独立运动。1956年他回到乌干达后，随即加入国家大会党，并在1957年获选为立法议会议员。1959年，国家大会党分裂成两派，其中一派由奥博特领导，与乌干达人民联盟合并成乌干达