围政元于岩仓的金龙寺（妙善院）。为了重任管领一职，细川政元与伊势贞宗达成协议，派人杀害了留在京都的义材的弟弟实相院义忠。义忠是政元所主意的将军继承人，杀害义忠使细川政元废黜义澄一事成为了泡影，此后细川政元与足利义澄一直试图维持着关系。1507年（永正4年）细川政元被暗杀，细川氏（京兆家）陷入了争夺家督之位的内讧中（永正错乱）。翌年四月，周防守护大内义兴得知此事后，拥戴前将军足利义材（即足利义材）进军京都。足利义澄在近江守护六角高赖的拥护下逃奔朽木谷，后逃往蒲生郡水茎冈山城。七月，足利义澄被废黜，足利