需要与周围建筑进行一体化同步建设，因此目前16号线所有列车以大约50km/h的速度通过，均不停靠本站。根据施工计划，16号线二里沟站预计在2021~2022年随16号线南段（甘家口至宛平城段）同步开通。
位置.二里沟站位于三里河路（南北向）和车公庄西路－车公庄大街（东西向）交口，6号线车站呈东西向布置，16号线车站呈南北向布置。
结构.两线均为地下车站，其中16号线在本站上穿6号线。站内设有8条换乘通道。