二次国共内战期间由于军事上不断的失利导致中央政府屡次被迫迁移，经广州、重庆和成都，最后迁播至台北市，并于1949年12月10日开始办公，一直持续到今日。由于《中华民国宪法》中并无首都的条文，仅曾经在行政命令内提到「中央政府所在地之首都」，及迁台后的地理教科书中仍长期采用政府迁台前的历史地理，教育人民「中华民国首都在南京」。但中华民国中央政府迁台后，已在不少法律、命令、公报、报告、外交文件内有「首都」之表述（参见中华民国首都#中华民国政府对于台北之首都地位的宣示），而其指涉与台北市之联结或等同也越来越明确