部尚书何鳌，将继盛与闽浙总督张经、浙江巡抚李天宠、苏松副总兵汤克宽等九人处决，弃尸于市。杨继盛临刑有诗曰：“浩气还太虚，丹心照千古。生平未报国，留作忠魂补。」，继盛妻殉夫自缢。
后世.燕京士民敬而悯之，以继盛故宅，改庙以奉，尊为城隍，并以其妻配祀。死后十二年，穆宗立，追谥忠愍。「杨椒山祠」位于北京市西城区达智桥胡同12号，为杨继盛故居。祠内有谏草堂，堂内石碑上刻杨两次批评朝政的谏言草稿。
评述.高阳评道：“明朝杀谏臣，自此而始（按——宣宗曾杀谏官戴纶，此言