个体发生学（英语：Ontogeny），或称做形态发生学，是描述一个生命体从受精卵到成体的起源和发育。个体发生学在发育生物学、发展心理学和发展生理学中被研究。更一般的用语，个体发生学被定义为，在不失去个体借之存在的组织的情况下，个体（可能是细胞、生命体或生命体社群）发生结构改变的历史（Maturana and Varela, 1987, p. 74）。