斯科特经常同立法部门发生冲突，其中一次是州参议院拒绝确认州长提名，任命沃尔特·布拉希尔博士（）出任州民兵第二团中校（副团长）。州长坚称布拉希尔就是最佳人选，拒绝再提名其他人，认为参议院应该不会想要让能力不及的人担当此任。担任州长期间，斯科特共有三次行使否决权，但都被议会推翻。斯科特否决组建哈里森县和允许擅自占地者以更优惠条件购买所占土地的法案主要是因为，他觉得法案的通过太过仓促，没有经过充分辩论。州议会决定停发不久前退休的肯塔基州上诉法院法官乔治·穆特的退休金，斯科特认为此举会导致州内居民对政府的承诺失去信