熔岩体积大约达900公里，足以在环形山底部形成厚达200米的地层。撞击时产生的陨石坑深度比现在更深，口径更小。但其底部立即“反弹”，抛出数座中央峰及向内塌陷的环壁，在斜壁坡上留下“锯齿”边缘的台地。哥白尼环形山形成前，该地区覆盖着深达数几百米的月海玄武岩，玄武岩层下是雨海盆地形成时产生的撞击溅射物，主要为厚达0.4-3公里的苏长岩，更深层是岩石蠕变层，再下面基本上是铁镁质角砾岩。有资料表明，雨海盆地堆积层下是一座更古老的撞击坑，其中心位于哥白尼环形山附近，直径可能达600公里，被称作“岛海盆地”，但