问」。另一个受到探讨的层面在于「性」、「性别认同」和「自我认同」。日本现代文学及流行文化研究教授莎拉琳·奥尔博（）表示：「整个故事围绕着性/性别认同的本质，以及在一个机械复制体已经取代有性生殖的未来世界中，找寻自我认同的课题。」。开头草薙提到，她因为月经来了导致大脑出现异常电波；但有着生化躯体的她其实不会有月经。奥尔博指出，草薙的女性性别认同和外表相唿应，但她的身体是一个由他人制造出来、没有生殖器官进而没有月经的生化躯体，除了「人格」（Ghost）外根本无从证明她真正的性别；她认为本片的主题在于「后世人