驻有站员的直营车站，并设有绿窗口（）。1913年时，藤相铁道（后来的静冈铁道）曾在藤枝车站的北侧设置「藤枝新站」（），并在1956年时改名为新藤枝车站。但该站已在1970年时，随着静冈铁道骏远线废线，而一同废站。
车站结构.侧式月台1面1线与岛式月台1面2线、合计2面3线的地面车站。
使用情况.根据「静冈县统计年鑑」，近年1日平均上车人次如下表。静冈县车站当中次于静冈站、滨松站、三岛站、沼津站、挂川站排行第6位。
相邻车站.※「静