哈萨克汗国不断扩张，迫使乌兹别克人南下，所以今天的乌兹别克斯坦却是帖木儿帝国的领土。乌孜别克汗国解体后一部分人随穆罕默德·昔班尼南下，前往河中农业区定居下来，征服了当地的撒尔塔人并与他们融合，逐渐形成了今天的乌孜别克人。16世纪至17世纪，他们（被称为布哈拉人、浩罕人或安集延人）来到南疆塔里木盆地，主要从事商业活动。“乌孜别克”的意思是“自己的领袖”（也可解作乌古斯人的主人）。到清宣宗时代，满人承认已与卡内回民（维吾尔人）无异。乌孜别克人有七十二部落，在钖尔河以北的哈萨克南部城市，他们占人口的多数，在塔