勒开始在巴塞尔的嘉基公司任研究化学家。一开始他的研究内容是植物和人造染料，后来他转向人造鞣剂。1935年嘉基才开始研究纺织品保护剂和农药。穆勒研制出了一中不含汞的种子放霉剂。1939年秋天他认识到的杀虫功效。1948年穆勒因“发现了作为接触毒剂针对节肢动物的强烈作用”而获得了诺贝尔生理学或医学奖。到他1961年退休为止穆勒始终在嘉基公司工作，从1946年开始他是该公司的副总裁。穆勒于1927年结婚，他有两个儿子和一个女儿。