五年（1882年），李威利率法国军队来到北圻，宣称要协助越南镇压山贼。河内总督黄耀怀疑，派黄有秤前去接待。但李威利发兵攻破河内，黄耀自杀。黄有秤被降职为按察使，被嗣德帝疏远，直到同庆帝继位之后才重获朝廷重用。同庆二年（1887年），黄有秤进呈《大南国疆界汇编》，被同庆帝任命为吏部侍郎，署理左参知，兼国史馆纂修。成泰三年（1891年），充任经筵日讲官。成泰四年（1892年）五月，加尚书衔，仍任吏部参知。后升任工部尚书。成泰八年（1896年）九月，充任国史馆副总裁。成泰九年（1897年），升授协办大学士。成