件GNU Octave和商业软件MATLAB。
套件.R的功能能够透过由用户撰写的套件增强。增加的功能有特殊的统计技术、绘图功能，以及编程介面和数据输出／输入功能。这些软件包是由R语言、LaTeX、Java及最常用C语言和Fortran撰写。下载的执行档版本会连同一批核心功能的软件包，而根据CRAN纪录有一万多种不同的软件包。其中有几款较为常用，例如用于经济计量、财经分析、人文科学与社会科学研究以及人工智能。
发展.生物信息学社群时常使用R进行分子生物学数