中则较少出现。截至2008年，本属共记录有约50种物种。2002年，一项大规模的分子种系发生学研究以核糖体大次单元的基因序列分析伞菌目中各类群的亲缘关系，发现半小菇属与小菇科其他属间的亲缘关系并不接近，不与其形成共同支序，而是与亲缘关系最近，两者组成一单系群。
物种.以下为部分半小菇属的物种。