自民党长期的执政地位；2009年9月16日，他出任第93任日本首相，成为第一位民主党籍首相，同时亦是自1996年以来首位非自民党首相。2010年6月2日，他因沖绳美军普天间基地搬迁问题、与美国处理不当的关系以及内政的失误而被迫请辞，6月8日其继任人菅直人正式组成新内阁，鸠山由纪夫合计仅在任265日，合8个月，成为近期日本任期最短的首相之一。2012年，不再参与众议院选举，结束26年众议员生涯。2013年9月，获香港城市大学颁赠荣誉法学博士学位，以表扬其在该领域的贡献。另外，他于2013年宣布