经很生气的蒋介石随即于当晚命唐纵召叶秀峰、马元放来自己的官邸晋见。叶秀峰先到，被蒋介石痛骂，结果吓得随后到达的马元放未敢晋见蒋介石。蒋介石在6月25日的日记中称自己痛斥“党部人员之无知，作事徒增政府困难”，并称自己“痛心极矣”。6月26日，延安的《解放日报》发表社论，强烈抗议下关惨案；毛泽东、朱德也自延安向马叙伦等人发出慰问电称，“中共一贯坚持和平方针，誓与全国人民一致为阻止内战、争取和平奋斗”。6月26日，蒋介石询问了下关事件的善后及社会各界的反响。由于下关惨案的影响极为恶劣，政府方面随即对有关人