1年。545年教座迁移至莫诺波利。当时，当地受外族多次入侵，埃格纳齐被毁，教会传承在702年后亦中断了，直到10世纪末才恢复，当时与布林迪西教区处于联合状态。1091年前属罗马教省，此后直属于圣座。1668年教区修院成立。1818年6月27日波利尼亚诺教区被併入，同时确认莫诺波利教区直属于圣座。
合併.1970年1月21日起两个教区由同一主教牧养，1980年10月20莫诺波利教区归属巴里-比通托教省。1986年9月30日两个教区合併并易名至今。