通常是包括「连接酶」这个字，就如DNA连接酶是将脱氧核糖核酸（DNA）片段连接。其他普遍的名称包括「合成酶」，因为这些酶是用作合成新的分子，或当它们是将二氧化碳加入一个分子时则称为「羧化酶」。需要留意的是「合成酶」是与合酶有所分别，合成酶是会使用三磷酸腺苷（ATP），但合酶不会使用ATP且是属于裂合酶。
分类.连接酶在EC编号中分类为EC6，并再细分为6个子类：