为名家手校本、手抄本、批校本和稿本，其中包括『永嘉学派』及浙江各地方的大量文献。孙衣言曾订《藏书规约》十六条贴在书楼堂壁之上，禁止任何人携书出楼，但民国初年时书楼的珍藏书籍大量流失，现藏书约32000册左右。1996年，玉海楼被中国国务院列为全国重点文物保护单位。