1589年）中进士，除江西新建县知县，擢吏科给事中。蓟州总兵官王保滥杀南方士卒，士衡极论其罪；又弹劾石星误国大罪。因仁圣太后梓宫事，弹劾郑一麟、陈增等人。万历二十五年，因日本事弹劾沈惟敬、杨方亨、南京工部尚书叶梦熊、刑部侍郎吕坤、蓟辽总督孙幰及通政参议李宜春等人，随后因此被贬，乃授陕西盐课副提举。未抵，恰逢《忧危竑议》起，竟连坐遣戍。万历四十五年（1617年），死于戍所。天启年间，赠太仆少卿。