底物是糖酵解与糖异生途径中的磷酸烯醇式丙酮酸和卡尔文循环与磷酸戊糖途径中的赤鲜糖-4-磷酸，它们由催化合成为3-脱氧-D-阿糖基庚糖酮酸-7-磷酸（DAHP），并释放一个磷酸。DAHP再由环化为3-脱氢奎尼酸（DHQ）。3-脱氢奎尼酸再由脱水形成3-脱氢莽草酸，之后在脱氢莽草酸还原酶作用下，3-脱氢莽草酸消耗一个NADPH还原为莽草酸。
从莽草酸到芳香族氨基酸.莽草酸合成后的第一个酶是，消耗ATP催化莽草酸磷酸化为。莽草酸-3-磷酸再由催化与磷酸烯醇式丙酮酸结合形成5-烯醇式丙酮酸