早年.克丽奥佩脱拉的父亲是腓力二世，母亲奥林匹亚丝出身伊庇鲁斯摩罗西亚王室，其兄为亚历山大大帝，除此之外她还有一些同父异母的兄弟姊妹，如腓力·阿里达乌斯、库娜涅、帖撒罗妮加。在母亲奥林匹亚丝照顾下，克丽奥佩脱拉在马其顿首都佩拉长大，生活与一般公主并无分别。前338年，当母亲与父亲腓力二世不合而怒返娘家伊庇鲁斯，投靠奥林匹亚丝的兄弟亚历山大一世，当时就连克丽奥佩脱拉的哥哥亚历山大也离开马其顿宫廷，流亡到伊利里亚，但克丽奥佩脱拉仍留在王都培拉。其后不久，腓力二世认为必须与伊庇鲁斯