宣统元年（1909年）康宝忠从日本回国，参加了清廷举行的留学生考试，中举人，授七品京官，分到邮传部，历任大清银行学堂教习、监学、代理教务长。宣统二年三月初七（1910年4月16日），汪精卫谋刺摄政王载沣而被捕，康宝忠被清政府怀疑并受到跟踪，康宝忠遂借年假以省亲的名义回到四川成都。宣统三年正月（1911年），因父亲逝世，康宝忠居丧于家。四川保路运动时，革命党人以康宝忠家为聚会地点，密谋反清。1911年武昌起义爆发后，康宝忠赴重庆，到达重庆时，张培爵等已宣布独立，请康宝忠任内务部部长，康宝忠推辞未就任。