1889年成立的弗里堡大学是瑞士第一所天主教大学，卢塞恩因此丧失将耶稣会学院扩建为天主教大学的机会。1920年，合并弗里堡和卢塞恩的神学院建立瑞士国家天主教大学的计划也失败了。后经全州公投，卢塞恩大学于2000年成立，现有近3,000名学生就读。圣加仑大学的前身是19世纪末成立的贸易与交通学院，1963年该校更名为圣加仑经济与社会科学学院。圣加仑大学现有约6,500名学生，是瑞士最小的大学之一。该校主要培养经济、公共行政和司法领域的专业精英。在2018年泰晤士高等教育-QS世界大学排名中，圣加仑大学排在