有3个主要的校区，分别为校本部（北校区）、南校区和东校区，其中东校区全部为学生宿舍区、生活区。校本部由主楼、理工楼、蒙古学学院楼、经济管理学院楼、生命科学学院楼、化学化工学院楼、计算机学院楼、研究生楼、国际教育学院楼、民族博物馆、行政楼、幼儿园、家属区、食堂、奥都饭店、桃李湖宾馆、桃李湖、游泳池、学生宿舍楼、留学生宿舍、校医院、花园、文体馆、成吉思汗青铜像及附属广场、操场等建筑与景观组成。南校区位于昭君路街道小黑河村南八里庄，面积大，但比较空旷，主要由主楼、交通学院楼、艺术学院楼、转基因国家实验室、学生活动