客运申请联营屏东经南二高往台南之路线，扩大服务范围。同年7月因台湾汽车客运公司民营化接驶屏东往高雄省道路线，并设立高雄站。2002年，屏东客运接驶恆春半岛地区路线，并与高雄客运申请联营高雄至垦丁路线，同时设立恆春营业所。2004年，屏东客运向屏东县政府申请恆春地区八条营运路线，同年行驶由交通部观光局辅导之观光巴士。除此之外，屏东客运并以垦丁街车行驶半岛各景点，建构恆春半岛观光交通网。2013年，通过经济部先导运行专案，与高雄客运、南台湾客运股份有限公司以及华德电能股份有限公司共同执行「绿色高屏电