龋菌的新陈代谢与生长，降低致龋菌的产酸能力。含氟化合物被用于预防龋齿、饮水加氟及牙膏等口腔卫生产品中。 起初是用氟化钠来为饮用水加氟，但后来逐渐被氟硅酸（HSiF）及其盐氟硅酸钠（NaSiF）代替，尤其是在美国。饮水加氟可以预防龋齿， 并被美国疾病控制与预防中心（CDC）认为是“20世纪10大公共健康成就之一”。 然而在一些集中供水系统并不发达的国家，政府则采用对食盐加氟的方法来补充氟。饮水加氟也受到过质疑，参见。
生物医药应用.正电子发射计算机断层扫描技术利用了用氟-18