人民解放军取得渡江战役胜利，迅速占领安徽。4月30日，占领绩溪县。至此，中共政权占领皖南全部。于5月7日在徽州屯溪市（今黄山市屯溪区）设立，同年7月行署驻地迁往芜湖市。1950年2月改属华东军政委员会。1951年12月9日，皖南人民行政公署驻地迁往合肥市，与皖北人民行政公署合署办公。1952年8月7日，皖南行政区与皖北行政区合併，成立新的安徽省，省会合肥市。
行政区划.1949年皖南行署驻芜湖市，直辖芜湖市，下设芜当、池州、宣城、徽州4专区。1950年撤销芜当专区。19