2000年5月31日，分属教育部的重庆大学、建设部的重庆建筑大学、中国建筑工程总公司的重庆建筑高等专科学校合并组成新的重庆大学。2001年，成为教育部和重庆市共建的国家“985工程”重点建设高校。2004年，被确定为中央直管高校，为教育部直属副部级大学。2008年，教育部与重庆市人民政府签订了《中华人民共和国教育部、重庆市人民政府关于继续重点共建重庆大学的协议》。协议明确提出，重点推动重庆大学若干学科达到或接近国际一流学科水平，尽快把重庆大学建设成为一所国际知名的高水平研究型大学。2011年