依法指定部分行政案件和减刑假释案件由铁路运输法院受理。2014年12月25日，上海市第十四届人大常委会第十七次会议审议并表决通过多条人事任免案，决定任命吴偕林为上海市第三中级人民法院院长、上海知识产权法院院长、上海铁路运输中级法院院长，免去其上海市高级人民法院副院长、审判委员会委员、审判员职务。2014年12月28日，上海市第三中级人民法院、上海知识产权法院在上海市浦东新区张衡路988号挂牌成立。上海市第三中级人民法院依托上海铁路运输中级法院设立，同时组建上海知识产权法院，与上海市第三中级人民法院合