但是是持明院统原来的嫡流）的伏见宫家选彦仁王（后花园天皇）为继任者，南朝方面认为北朝因皇统断绝而失去了皇位继承权，并因此开始激烈地反抗。北畠满雅再次拥立小仓宫圣承（后龟山的皇子小仓宫恒敦的王子），在伊势举兵，与幕府军作战，战败身亡。从此事件开始直到应仁之乱为止，南朝的子孙们被反幕势力所拥立，断断续续地进行着活动。1443年（嘉吉3年）9月，提倡南朝复兴的日野家嫡流日野有光势力企图暗杀后花园天皇而闯入皇宫（暗杀未遂），并夺走三神器中的剑和神玺，拥立南朝皇族通藏主、金藏主兄弟（后龟山天皇的弟弟的孙子）逃往比