918年（中华民国七年）40岁，在上海开业。同时任上海商务印书馆编辑。1925年（中华民国十四年）47岁，8月，被任中日文化事业委员会上海分会委员。10月，赴日本，出席远东热带病学会。在大会上演讲《中国结核病历史的研究》，指出瘰疬与肺痨同原之说，中国唐朝时《崔氏别录》已有明确记载，早于欧洲林匿克氏者1200余年。11月，组织上海市医师公会，被推为第一任会长。1926年（中华民国十五年）48岁，11月任南京中央卫生委员会委员。1928年（中华民国十七年）50岁，2月，余云岫创办《社会医报》，并自任