决定兴建一个坚固的要塞都市。1566年3月28日，当时的骑士团总团长瓦莱特为瓦莱塔城奠基，并予以命名。瓦莱塔因而发展成为繁华的市区，当地大部分古色古香的建筑都源自骑士团统治时期。为了保卫瓦莱塔城，骑士团在城内建设了一座向海的碉堡，现列为联合国教科文组织世界遗产之一。经过骑士团统治时期以及短暂的法国统治期间后，瓦莱塔的建筑在19世纪初受到了英国统治的影响。建筑闸门改得更为宽广，或被拆卸重建。第二次世界大战期间，瓦莱塔遭受德国及意大利军队空袭，多处受到严重损坏。最为知名的损坏是建于19世纪初、离瓦莱塔围城门