于结构域自身可以稳定存在，因此可以将不同来源的结构域通过基因工程人为地结合在一起，形成。
结构模体和序列模体.结构模体（structural motif）和是指在大量不同蛋白质中被发现的蛋白质的三维结构或氨基酸序列的短的片断。结构模体是一种结构组成单元，它是由几个二级结构的特定组合（如螺旋-转角-螺旋）所组成；这些组合又被称为超二级结构。结构模体往往还包含有长度不同的loop区。
蛋白质折叠.折叠类型则指的是整体的结构排列类型，如螺旋束、β桶、和罗斯曼折叠