获得连任。在民主进步党首度取得执政权后1月后表示自认任务已经完成，因此决定提前请辞民主进步党主席，只愿意继续担任民主进步党首席顾问一职，并且引用美国诗人罗伯特·佛洛斯特的诗作《》表明志向。而在之后举办的2000年民主进步党主席选举中，仅由当时高雄市市长谢长廷一人同额参选，最后由其当选下一任民主进步党主席并且于7月22日就任。
胜选后.
停建争议.而过去执政前始终主张非核家园理念的民主进步党在组成政府后，随即面对过去长期支持民主进步党的反核团体与前民主进步党主席