木善幸继任，缓解了五大派阀的斗争。竹下登内阁时代爆发的瑞可利事件牵涉包含派阀领袖在内的多名党内实力者，使得1989年再次由非派阀会长的宇野宗佑就任总裁。宇野内阁垮台后再由河本派的海部俊树继任。自民党下野的1993年宫泽派河野洋平总裁、1995年小渊派桥本龙太郎总裁，让总裁一职从派阀会长之间的竞争转变为重视选举门面。这段期间，重视参议院议员的竹下登获得几乎全部派阀的支持，更打开了之后「经世会支配」时期与「清和会支配」时期。之后，中选区制改为现在的小选举区比例代表并立制，党本部成为候选人能否出线的重要角色。