于中洲车站新设第一月台A侧及高架第三月台，出站后下行线以半径200公尺之曲线转东、上行线亦转东但以17‰坡度爬升并越过纵贯线，稍后两线会合掠过高速公路仁德服务区南缘。复续往东转东北进入大潭，于长荣大学前方设站。出大潭后跨越南160线，进入高铁特定区后与台39线、高铁路线平行。最后进入站区并止于高铁车站南方，台铁与高铁站两间有空廊相衔。
车站一览.（註：车站等级：分为特等、一等、二等、三等、甲简、乙简、丙简、简易、招唿、号志）