丰见亲归顺琉球国，宫古岛进入琉球国控制范围之内。1500年，琉球国派军队攻灭石垣岛统治者远弥计赤蜂。1522年，仲宗根丰见亲攻占了与那国岛，至此琉球国完全控制了八重山群岛。琉球群岛北部的奄美群岛也在1466年时完全进入琉球国的统治范围。1609年，萨摩藩主岛津氏侵略琉球，国王尚宁被迫投降。此后琉球国成为萨摩藩的属国，并将奄美群岛割让给萨摩藩。此后琉球国虽然部分被纳入幕藩体制之中，但在名义上仍是独立国家，并继续对中国朝贡。17世纪中期，羽地朝秀对琉球国的政治和风俗进行大规模改革，实施亲日路线。18世纪中期