黄河大学并入。1992年河南体育专科学校并入。1993年郑州大学获批博士学位授予权。1996年列入中国国家“211工程”建设行列，成为大陆21世纪教育振兴计划行列中重点建设的大学之一，亦为河南省唯一入选的高等院校。2000年7月10日，在时任河南省省长李克强主导下，原郑州大学，郑州工业大学，河南医科大学合并组建新郑州大学。2001年8月，由时任华南理工大学建筑设计院院长何镜堂院士主持与设计的郑州大学新校区在郑州市高新区开始建设，总投资19.67亿，总规划建筑面积165万平方米。在建设中学校遭遇了征地拆迁