澳华历史博物馆也会主办一些特别展览或临时展览，如《华裔军人展览（Chinese Anzacs）》讲述包括沈比利在内的华裔澳洲军人的故事。此展已在维州多个展出。但澳大利亚战争纪念馆和墨尔本战争纪念馆都因排展已满曾拒绝过该展览。2018年，博物馆开始与中华人民共和国的城市合作推出城市特别展，《印象上海（Impressions of Shanghai）》便是与上海市档案馆、上海历史博物馆合作推出的介绍上海的文化展览。2019年开展的《百万则故事：华人来澳200周年展（One Million Stories: Ch