星加藤纮一出任，并在隔年内阁改组留任。1990年代以后，历经波湾战争等的日本，在包含军事层面在内的国际贡献，以及整备、驻日美军再编与美日同盟再定义等国防相关议题逐渐成为重要国政课题。1997年内阁改组，尚待解决普天间基地移设问题的桥本龙太郎留下亲信久间章生继续掌管防卫厅。随着防卫政策的重要性提升，防卫厅在第1次安倍内阁的2007年（平成19年）升格为防卫省，防卫大臣（防卫厅长官）也开始要求参与对外交涉与国会辩论，21世纪以后多由曾在政党与政府担任相关职务的国防系议员，如中谷元（2001年）、石破茂（