维吾尔自治区南部与中部，甚至整个新疆维吾尔自治区。“东突厥斯坦”一词最早于18世纪中叶由“突厥斯坦”衍生而来，是西方旅行家、地理学家用于描述塔里木盆地一带的地理概念之一，19世纪初因俄国汉学家的使用而传播开来。1930年代，“东突厥斯坦”成为新疆操突厥语族语言、信仰伊斯兰教的反叛者反对中国政府当局的战斗口号，并先后建立了东突厥斯坦伊斯兰共和国和东突厥斯坦共和国两个政权。20世纪末，受泛伊斯兰主义和泛突厥主义影响，新疆再度出现分离主义情绪，分离主义者用“东突厥斯坦”指代整个新疆或他们希望在新疆建立的独立国