军在兆惠等的带领下，按照干隆帝的旨意消灭了准噶尔部，屠杀了数十万准噶尔人。据魏源记载：「计数十万户中，先痘死者十之四，继窜入俄罗斯哈萨克者十之二，卒歼于大兵者十之三。除妇孺充赏外，至今惟来降受屯之厄鲁特若干户，编设佐领昂吉，此外数千里间，无瓦剌一氊帐。」昭槤的描写更加夸张：「凡病死者十之三；逃入俄罗斯、哈萨克者十之三，为我兵杀者十之五，数千里内遂无一人」。留下的空地由大量移民填充。主要是哈萨克人。
藏传佛教.准噶尔信奉藏传佛教，喇嘛有行政权，号称宰桑（相当于喇嘛旗）。可汗大事未与集