域、结构模体与折叠类型.蛋白质经常描述为由几个结构单元所构成。这些结构单位包括结构域，模体，和折叠。尽管真核生物体可以表达数万种不同的蛋白质，但对应的结构域、模体与折叠类型的数量却少得多。一种合理的解释是，这是进化的结果；因为基因或基因的一部分可以在基因组内被加倍或移动。也就是说，通过基因重组，一个结构域可以从相应蛋白质A移动到本不具有此结构域的蛋白质B上，而其发生的进化驱动力可能是由于该结构域对应的生物学功能趋向于被蛋白质B所利用。
蛋白质结构域.许多蛋白质都可以被分为多个结构