从虹口少体校、市少体校进入上海队，1965年入选中国国家队。王后军技术全面，身高不足170公分，却以快速灵巧见长，有「飞将军」之称，1970年代初期成为国家队队长。1975年，王后军挂靴退役。
教练生涯.退役后的王后军随即成为上海队的助理教练，经历了1980年的降级，又协助方纫秋重新打回甲级并夺得了1983年五运会的全国冠军。夺冠后方纫秋退休，王后军成为上海队主教练，此后多年内由于场上指挥多变，排兵布阵上的智慧，赢得了「小诸葛」的美名，甚至国家队到上海比赛时，时任国家男足主教练的年