一个嵴椎其实是发现于其他地点，属于一个未命名的小型兽脚类恐龙。在1995年，怀俄明州发现的一个部份骨骸，一度被认为是个较大型的虚骨龙。数年后，这个新发现骨骸被建立为新属长臂猎龙，是虚骨龙的近亲。
种.虚骨龙目前只有一个有效种，模式种脆弱虚骨龙（"C. fragilis"），过去还有六个种被建立过。敏捷虚骨龙（"C. agilis"）由马什在1884年建立，后来改归类于脆弱虚骨龙。在1887年，科普根据在新墨西哥州发现的晚三叠纪化石，建立了鲍氏虚骨龙（"C. bauri"）与洛氏虚骨