局承诺每年向市政府缴纳400万美元以替代税金，市政府则要求该金额的四倍。这一争论持续了两年，在这期间，世贸中心的计划造价节节攀升。港务局最初乐观预计，世贸中心造价约为3.5亿美元。1966年12月，港务局宣布提高计划造价至5.75亿美元。这一声明受到《纽约时报》批评。文章表示，港务局的数字低得不切实际，预计项目最终造价会是7.5亿美元。实际上，世贸中心双子塔完工之时，港务局已为项目拨款9亿美元。1966年7月，市政府与纽新港务局仍然未能达成共识。但谈判依旧在继续，二者最终在1966年8月3日谈妥。港务局