都或多或少有坏的记忆体单元，为确保设备运行正常，控制器能检测出已坏不能工作的快闪记忆体单元，并分配备用单元将坏的单元取代。控制器会指定某些部分的单元用于存储固件驱动、特定存储设备的操作格式和控制器其它特殊功能等。闪存控制器接着会创建的目录结构，控制器管理逻辑扇区的请求转换为实际的闪存芯片的物理位置上。
读取写入和擦除规范.当系统或设备需要读取数据或将数据写入到闪存，它会与闪存控制器进行沟通。一些结构简单的设备，如SD卡和USB闪存驱动器通常有一个闪速存储器芯片同时连接数的限制操作，