水平上揭示药物及具有生理活性物质的作用机理，研究药物及生理活性物质在体内的代谢过程。药物化学的任务包括：研究药物的化学结构和活性间的关系（构效关系）；药物化学结构与物理化学性质的关系；阐明药物与受体的相互作用；鉴定药物在体内吸收、转运、分布的情况及代谢产物；通过药物分子设计或对先导化合物的化学修饰获得新化学实体创制新药。
药物化学的历史.19世纪以前的药学作为商品学的一个分支学科，研究的对象是一些天然来源的药物，直到19世纪开始人们从一些天然药物中陆续分离出一些具有生理活性的化