（如天花），对北美原住民造成毁灭性影响；同时，只存在于美洲而旧大陆人从未接触过的病毒，旧大陆人对此没有抵抗力（如梅毒），同样传染到整个旧大陆。
遗传现况.尽管今天的美洲原住民大多都是混血，但仍然能够在一些人口稀少、濒临消失的未接触部落中寻找原始美洲人的遗传证据，以进行相关的研究。在 Patrick Tierney 所着的 Darkness in El Dorado 书中指出，原始部落居民不断被现代外来文明侵扰，成为了矿工或被传教士欺骗引诱等。亚马逊河流域的原始部落不仅人口数稀少