2016年夏季奥林匹克运动会斯洛文尼亚代表团是斯洛文尼亚所派出的2016年夏季奥林匹克运动会代表团，这是该国第7次参加夏季奥运。本届奥运斯洛文尼亚代表团开幕式旗手是曾获得两枚奥运奖牌的瓦西里·日博加尔。
田径.斯洛文尼亚在田径项目上获得以下资格（每个小项最多3名来自同一代表团的运动员参赛）：
皮划艇.
激流.斯洛文尼亚在2015年世界皮划艇激流锦标赛上获得以下奥运席位。
静水.斯洛文尼亚在2015年世界皮划艇