博物院与德国联邦艺术及展览馆、人类学博物馆合作，于波昂、慕尼黑举办《蒙古帝国－成吉思汗及其世代》特展，展期至2006年1月。2015年5月，世界自由民主联盟（世盟）中华民国总会与德国分会于柏林共同举办年会，与会代表来自35国近百人，并会见，德国联邦经济合作及发展部次长兼国会议员则宴请与会代表。
学术.中华民国科技部在前西德首都波昂设立驻德国代表处科技组，教育部则在首都与第1大城柏林设立驻德国代表处教育组。2013年3－5月，德国研究船前往台湾海域探勘，由台湾能源国家型科技计