机构是设在台北市的澳洲办事处，前身为澳大利亚商工办事处。
代表.1975年4月在墨尔本设立「远东贸易公司」综理澳洲业务。1991年更名为「台北经济文化办事处」，驻澳大利亚代表主要办公地点为澳大利亚首都坎培拉。依中华民国国会立法院于2012年1月20日通过、经总统公布的《》，自2012年9月1日开始驻外机构（大使馆与代表处）之馆长对内自称大使。现任大使为常以立（曾任驻纽西兰代表、外交部亚太司司长）。