国家一级企业。1998年，中国全国总工会授予同仁堂“全国五一奖状”。1997年，同仁堂在上海证券交易所上市。1999年，同仁堂成立“同仁堂发展委员会”。2000年10月，同仁堂分拆同仁堂科技在香港创业板上市。2011年，台湾上柜公司众星国际代销同仁堂中药酒。2016年1月26日，同仁堂党委书记、董事长梅群表示在十三五期间，同仁堂所有制药工厂将迁往河北和安徽亳州，而北京只保留同仁堂总部和少数项目。2018年12月，北京同仁堂旗下蜂业公司代工厂商盐城金蜂食品科技有限公司被曝回收过期蜂