部科技顾问及顾问室主任；在教育部任内，规划大学校园、校际网路，后来发展为「台湾学术网路」，为台湾第一个网际网路，并推动中小学资讯化、大学前瞻科技教育改进计画。1994年创办清大电脑与通讯科技研发中心 ，1998年创立清大电机资讯学院，2003年受聘台湾联合大学系统首任研发副校长。2006年，通过清大及教育部校长遴选委员会征选，陈文村出任清大第三任遴选校长；为清大在台建校以来，所培育出的第一位清大校长。校长任内执行「迈向顶尖大学计画」，创设相当多新制度，大幅提升清大学术声誉及国际知名度；任内特别重视大学部