两座站台和站房间通过天桥连接。车站西侧引出有专用线，分别通往樟树转运站、樟树盐业公司、樟树粮油公司。其中樟树转运站货场设有2条货物线、3座货物站台；盐专线建于1979年1月，1981年10月竣工。专用线在业主晶昊盐化（原江西盐矿）于2017年厂区搬迁至樟树东站樟树盐化工基地后停用，2020年计划改建为城市道路；码头货场专用线建于1962年，1973年投入使用，长2.5公里，连接四、五码头、粮油公司外还通往特克泰欧、纺织有限公司诚通物流等单位。2013年车站利用该专线进行樟树港河东港区五码头的扩建工程。车站另