次流标后，最终于第5次招标由台湾中油公司得标，续建工程得以继续。2003年9月26日，中油公司进驻厂区，续建工程正式展开。直到2007年3月29日，永康垃圾焚化厂完工启用。2010年县市合併后，原隶属在台南县政府环保局之下的永康垃圾焚化厂改隶属在台南市政府环保局之下。