察吩咐出外要申请，并另写读书心得。10月警察问东问西，突袭检查户口。1960年4月，父亲吴萱草逝世。12月，完成《台南县志稿》十卷十三册。1961年9月，编《震瀛随想录》续稿。1966年，开始编印《震瀛随想录》。1967年3月26日，吴新荣北上台北市参加台湾省医师公会年会，连任监事。27日晚上十一时因心脏病发，送台大医院不治，逝世于台北，稍后归葬台南将军。吴新荣逝世后，张良泽将其作品编为《吴新荣全集》(远景出版社出版)，1997年又有吕兴昌编订《吴新荣选集》(台南县立文化中心)三册。21世纪后，