常被用来煮龟汤。 现在其主要威胁则来自栖息地的破坏，同时宠物贸易和车辆的碾压也对其造成了一定的威胁。 美国密西西比州交通部在通过穴龟属龟栖息地的高速公路两边安置了有角度的护栏，以防止这些龟爬到公路上而被车辆碾压造成伤亡。 2009年11月9日，美国鱼类及野生动物管理局将美国东部的地鼠穴龟列到了其濒危物种名单上。