车站构造.车站是一座地面车站，设有1面2线的岛式月台。道路与车站大楼位于相同高度，而月台位于路堤上。车站大楼与月台之间设有行人隧道。车站大楼是一座钢筋混凝土，为神社设计的建筑物。站前停车场一角设有足汤。此站是由管理的业务委託车站，车站没有但设有。
使用状况.在2016年度，1日平均乘车人次为203人。
车站周边.虽然车站名称为雾岛神宫，但是距离雾岛神宫和雾岛温泉一段距离。雾岛的入口车站位于肥萨线的。