国国民党党史史料编纂委员会和原国史馆的所有档案史料。这批档案经政务院文化教育委员会决定，交中国科学院近代史研究所设立南京史料整理处。1951年2月1日，南京史料整理处正式成立，设在原中国国民党党史史料编纂委员会旧址。该处先后从广州、重庆等地收集、接收了国民政府的大量档案，并接管了保存在北京的北洋政府档案。1964年4月，南京史料整理处改隶于国家档案局，更名为中国第二历史档案馆。至2003年，馆藏档案932余个全宗，共计180多万卷。
馆藏档案.至2003年，中国第二历史档案馆馆藏档