殿面积130平方米，是砖木结构建筑，整体格局为传统四合院。21世纪初，日常参加宗教活动的信众约70人，附近高等院校的外国穆斯林留学生也常来该寺礼拜。长辛店清真寺因为年久失修，礼拜殿的卷棚顶漏雨严重。为此丰台区文委在2011年完成了对长辛店清真寺、长辛店火神庙这两处丰台区文物保护单位的修缮工程。
建筑.长辛店清真寺位于长辛店大街北端路东，大门开在长辛店大街上，另有旁门开在北侧的大寺口胡同内。现存礼拜堂三间，以及勾连搭带、重檐攒尖、周有回廊的六角邦克亭一座。邦克亭顶的第一层是大式硬