政十三年，由枢密都承旨步步高升。先成为正一品太师，又官昇至比一般宰相地位还高的「平章军国事」。他因为害怕朱熹在士大夫间的影响力，因此把朱熹的理学称作伪学，加以禁绝，即是所谓的庆元党禁，另一说是因为为了北伐作出准备，而理学徒众中有苟且偷安之辈，故加以禁绝。庆元五年（1199年），陆游曾为韩侂冑写《南园记》，据称韩侂胄为此还命四夫人擘阮琴起舞。陆游在文中则勉励韩侂胄勿忘抗金中兴。开禧元年（1205年），韩侂冑任平章军国事，独揽军政大权，志在收复山河，开始作北伐准备，并在宁宗的支持下给岳飞加谥号武穆之后，追封