进剿吉安、赣州吴军，多有斩获。1679年，尚之孝招降吴军总兵林兴隆、参将王国赞等战将二十余员、士兵六千余人。吴将杨一豹、江机进犯福建，尚之孝领兵赴闽，至汀州，杨一豹等人已向康亲王杰书投降，尚之孝返回江西。1680年，江西平定，尚之孝被召回京师，所部编为绿旗营留镇江西。同年九月，尚之信获罪被赐死于广州，部议尚之孝应该连坐，被康熙帝赦免，入朝仍随内大臣之列。1681年五月，尚之孝奏请朝廷以迎其父灵柩于广州，归葬海城。获朝廷允许后，尚之孝亦久留海城，并奏请守陵。1683年，议政大臣等追论尚之孝先前不能御敌、滞