今日仍然存在。只要计算光秀的话，女儿玉子（明智玉）嫁给细川忠兴并令血脉流传至今。关于其他，有指担任江户町年寄的喜多村弥平兵卫是光秀的末子。此外，明智姓的庶子系统（还有明田姓）的一族亦都存在。在山崎之战后被消灭的明智氏多数为了避难而逃往长宗我部元亲的土佐国。土佐藩乡士中有在幕末时期中活跃的坂本龙马的坂本家使用桔梗纹，是明智氏一族的明智秀满末裔，之后成为坂本家（才谷家）（有说法指这是坂崎紫澜的小説（『汗血千里驹』）的创作。龙马称自己是纪姓以及是纪贯之的子孙。而以坂本为姓氏前的大滨姓的家纹是「丸田字」纹）。