紧邻高铁嘉义车站，已于民国96年（2007年）1月通车，搭乘嘉义公车捷运，从位于市中心的台铁嘉义车站至与高铁嘉义车站车程为20分钟。嘉义市主要铁路车站为台湾铁路管理局纵贯线的一等站嘉义车站、简易站嘉北车站及阿里山森林铁路管理处阿里山森林铁路的简易站北门车站，嘉义车站亦为阿里山森林铁路的起始站。水上机场线（已废止路线）：从中油炼油所直通嘉义机场，距离2公里约需8分钟，目前已废止改为自行车道嘉油铁马道。嘉义市区铁路高架化，简称「嘉义铁路高架化」，计画范围从牛稠溪北端至北回归线站南端，全长为10.9公