请国民党政府「使台湾成为一个新而独立的国家」，引起震撼。国民党执政当局对此除了监控教会外，并持续进行渗透、收买，在教会制造分裂。
美丽岛事件后协助施明德逃亡被捕.1979年美丽岛事件发生后，国民党当局展开大逮捕，高俊明因为帮助施明德逃亡，而在1980年4月24日晚上，被以「涉嫌藏匿逃犯」罪名逮捕，并且取走了高俊明共三十本笔记本（多为讲道稿）、杂志二十九本、文件六袋及录音带一卷。高俊明被捕之后，根据台湾教会公报的报导，台南市区长老教会在得知总会总干事高俊明被捕之后，在太平境教会为高