.Ⅱ是完全自动的（由Otacon遥控），玩家也可以自己控制。在东欧任务后，Mk.Ⅱ在追踪敌人时被Vamp破坏。后面的任务中被Mk.Ⅲ取代，除颜色是红色外，两者的机能基本上是一样的。游戏中的任务简介时使用Mk.Ⅱ击打人物可以获得一些面具道具。小岛秀夫的另一游戏上也有Metal Gear Mk.Ⅱ出现，其设定是“20世纪曾出现的Metal Gear的复制品”，主要作用是协助主角进行侦查活动。其外貌有点像TX-55，上面有视像电话供主角与其他角色联系。另一游戏SD Snatcher有手掌大小的名叫Pe