首府被迁往托尔高，但是它依然是宗教改革的中心。在这里路德圣经出版。在这段时间里市内也建造了许多新建筑，来满足数量不断增长的居民的要求。1526年城墙又一次被加固。一座新市政大厦被建成，16世纪末市内还建造了供水设施。宗教改革导致的冲突最终导致了施马尔卡尔登战争（Schmalkaldischen Krieg）的爆发。维滕贝格继续保持了正宗路德宗的中心。
17和18世纪.17世纪初着名学者如丹尼尔·森纳特（Daniel Sennert）等还吸引了许多学生，但是三十年战争开始后局势转