台南神学院是一所在台湾的神学院，简称南神，隶属台湾基督长老教会。创校可追溯至1869年李庥牧师及马雅各医生在旗后、府城所设立的「传道者养成班」(Student’s Class) ，1876年巴克礼牧师再将两者合併为「府城学院」(Capital College) ，曾因战争而数度停办。1903年建立现址校舍，1948年更改校名为台南神学院迄今。位于台南市东安坊文化园区里面位于高雄市燕巢区
市定古蹟.该校在台湾日治时期所建的校舍，也就是今天的巴克礼纪念馆与礼拜堂为台南市的市