局势外，亦会因应公共卫生风险或传染病而发出外游警示。2020年3月13日，因应新型冠状病毒欧洲疫情，港府当晚一次过发出对神根公约其余25个国家的红色外游警示，是设立制度以来对最多国家和地区同时发出外游警示的一次。3月17日晚上，港府基于公共卫生考虑向全球发出红色外游警示（不包括中国大陆、台湾、澳门）。惟同时维持早前对部份国家或地区因安全风险而发出之红色或黄色警示。
机制.保安局因应受到警示制度监控的国家可能出现影响香港居民人身安全或者风险变化，并且对该国家或者地区所出现的风险性