部分施工开始后，才因为占用高铁正线而被完全拆除。芜湖站由芜湖车务段管辖，1996年至1999年8月曾短暂划归芜湖东直属站管辖。作为芜湖长江大桥附属工程的一部分，1998年车站附近新建芜湖客车整备所；1999年车站至区间开始复线化工程，其中芜湖至火龙岗站区间新建外绕线，于2001年9月27日竣工通车。
改扩建.2013年8月20日起，作为新建宁安城际铁路、商杭客运专线工程的一部分，芜湖站开始了改造工程。首先在现有铁路场站东侧，原计划在1995年建设四号站台的地块，以及2条存车