共设2640个座椅，最多同时可容纳13300名旅客候车，此外还设有10个自助售票机。高架候车室南北各设12个检票口，每个检票口设有4台自动检票机和1人工检票口。候车室上方为商业夹层，据上海铁路局官网显示共有25家商户入驻，包括黄生记面铺、永和豆浆、康师傅私房牛肉面等。
站场.杭州南站规划有4个车场，从西向东分别为越江场、普速场、杭甬场和杭长场，共7台21线。越江场为杭金衢城际铁路预留所用，目前暂时归为普速场，有沪昆铁路和萧甬铁路经过，共计3台10线，其中8、9站台原为低站台，后改为