站停靠。每日平均上下车旅客数超过五位数，是JR北海道下辖的诸多车站之中旅运量第四大的车站。除了JR所属的琴似车站外，札幌市营地下铁东西线沿线也存在一相同站名的地下铁车站。两站之间相聚约在800公尺左右，因此勉强可以利用步行方式互相转车。名称源自阿伊努语的「kot-ne-i」，意思是「凹陷的地方」。
车站结构.岛式月台1面2线与无月台折返线的高架车站。月台与相邻的桑园站、札幌站同样以屋顶和墙壁覆盖。