战指挥部、防空暨飞弹指挥部、教育训练暨准则发展指挥部、保修指挥部等4个指挥部；以及7个直属空军司令部的作战联队。松山基地指挥部的名称中虽然同为「指挥部」，但实际编制与其他作战联队同级。另外，空军军官学校、空军航空科技发展中心以及中区人才招募中心则直属空军司令部。中华民国空军的指挥单位组成与英、美空军编制相似。大致而言，在空军司令部下，可以分为指挥部与作战联队；其下设置作战队、大队；并按照任务需求，再分为中队、小队、分队、小组等。比较特殊的是，在防空暨飞弹指挥部辖下的指挥单位，并非以空军编制组成，而是比较