，失去了测验的本意。同时，香港中学校长会也认为在校内试中获得最佳成绩的学生，未必是学能测验中取得最高成绩的学生；而男生通常会取得较佳的成绩，而女生在校内试的表现却普遍比男生好，因此不大公平。因此，教育统筹局于2000年7月4日公佈取消学能测验。教育统筹委员会于2000年9月发表的《终身学习　全人发展：香港教育制度改革建议》亦指出了废除学能测验的即时性。虽然学能测验被取消，但因教育统筹局未能即时作出新的调整方案，因此以1999年至2000年的各校学能测验成绩作调整便成为一时的过渡方案，直至2004/200