显示牠们具有非常健壮的前肢肌肉。在过去，夜翼龙科的物种常被归类于无齿翼龙科。某些研究人员，例如克里斯多福·班尼特（Christopher Bennett）、亚历山大·克尔纳（Alexander Kellner），都认为夜翼龙科、无齿翼龙科是两个不同演化支。在2006年，大卫·安文（David Unwin）提出夜翼龙、无齿翼龙有接近亲缘关系，因此建立无齿翼龙类（Pteranodontia）以包含这两个属。在2006年，墨西哥发现夜翼龙科的第二个属，穆氏翼龙。夜翼龙科的大部分化石，发现于美国西部、墨西哥