贡多活佛三位中，推荐一位住持该寺政教事务。西藏和平解放前，昌都宗是帕巴拉活佛掌权的封地，实行政教合一的统治。帕巴拉既是强巴林寺最高宗教领袖，又是昌都宗最高行政首领。帕巴拉政教合一的机构分为“孜勒空”、“雪勒空”。强巴林寺有五大活佛世系，依次为帕巴拉活佛、谢瓦拉活佛、甲热活佛、贡多活佛、嘉热活佛。这五大活佛世系的关系，在《土观宗派源流》中有记载：“后来帕巴拉（圣天）投生为宗喀巴大师亲教弟子古交朵丹巴或名瑜伽师畏巴多吉（无量光金刚）之子，由他和其他以后的各代转世继承了法位。帕巴拉弟子中又有希瓦桑布、甲热