然而拉科·晋美赤烈嘉措年事已高，便请嘉雅活佛协助，实际上全靠嘉雅活佛亲自授教，为贡布慈丹教藏文文法教材《三十颂》，并讲解佛经。1945年，拉科·晋美赤烈嘉措因病辞去正经师职务，嘉雅活佛成为此后贡布慈丹居住在塔尔寺期间的唯一一位经师。1946年底，扎什伦布寺派出的迎请第九世班禅额尔德尼转世灵童的僧俗官员到达塔尔寺，此后经同班禅堪布会议厅官员会商，双方进一步确认贡布慈丹为转世灵童，并呈报国民政府核准。1949年初，中华民国政府迁往广州，班禅堪布会议厅再次派其负责人计晋美赴广州，请中华民国政府代总统李宗仁请求