崃谷周围大城市所产生的空气污染直接影响着大崃谷的景观：因为视野开阔，崃谷两岸又有一定距离，所以空气污染问题常常像是被放大了似的在此特别明显。空气品质好的时候，崃谷对岸清晰可见；空气污染严重的时候，崃谷对岸像是被笼罩在一层雾中。这个问题不好解决，因为国家公园管理局无权过问各大城市的空气污染排放量，各大城市也不对甚么「世界遗产」的空气品质负责。大崃谷只好一厢情愿地期盼着各大城市严格限制并大副降低其空气污染排放量，听命于当时的风向、风速等自然条件了。
生态系统问题.自从西方人发现大崃谷以