左宗棠、张之洞、端方等皆在此任两江总督。1853年，太平天国在南京定都后，洪秀全将总督署改建为宏大奢华的天王宫，史称天王府。清军攻破南京后，曾国藩下令将天王府彻底焚毁，1870年重建符合封建礼制的两江总督署。1911年辛亥革命爆发，次年1月1日中华民国成立，孙中山在这里就任中华民国临时大总统，改原两江总督署为临时大总统府。4月孙中山卸任后，改为南京留守府。1927年，国民政府定都南京，此地为办公厅舍。1937年抗日战争爆发，11月国民政府迁往重庆。12月13日日军攻占南京。1938年3月28日梁鸿志