多蛋白质的复杂性不仅仅是碳水化合物的载体，糖蛋白，而是特异性参与与碳水化合物反应的蛋白质：
使用的工具.以下是聚糖分析中常用技术的例子
高分辨质谱法（MS）和高效液相色谱法（HPLC）.最常用的方法是质谱法（MS）和高效液相色谱法（HPLC），其中聚糖部分从目标物酶的或化学的裂解并进行分析。在糖脂的情况下，它们可以直接分析而不分离脂质成分。
软件和数据库.有几种在线软件和数据库可供糖组研究使用。 这包括：