在细胞中共存一段时间。子囊菌门子实层中双核的菌丝会形成一个钩状结构（crozier），以确保细胞核分裂时，两个子细胞核可以分别妥善分配到上方与下方的细胞中，维持菌丝异质双核（有来自双亲的两个细胞核）的状态。细胞中的两个核融合之后，会立刻进行减数分裂产生子囊孢子，子囊孢子释放、散播到其他地方后可以萌发长成新的单倍体菌丝。担子菌门真菌的有性生殖过程与子囊菌门的类似，也是始于两株真菌单倍体的菌丝融合而产生双核体的菌丝，不过双核体在担子菌门更为普遍，除了子实体外，有时连营养菌丝也是双核的状态。担子菌门的子实层会形成