与陈并肩作战，单独南走，驻扎池州，打算渡江投靠李秀成。陈玉成派军拦阻，双方在和州附近发生冲突。韦俊被迫降清。1860年，援救天京，配合各军消灭江南大营，进军浙江。因太平天国军事重镇安庆再次被清军围城，为了解围，天京总部打算由李秀成和陈玉成兵分两路，从长江南北向西进攻武汉，逼使安庆一带的清军撤退。陈在1861年初率军从安徽出发，十余日后便攻下武汉附近的黄州。当时武汉清军严重不足，但在武汉的英国官员要求陈玉成不要进攻武汉，陈玉成因此犹疑，又考虑到李秀成部按期未到，遂放弃进攻武汉，改回师救安庆，与湘军数月激战