变种是发现于沙捞越的总状苹果猪笼草，其具有总状花序。B·H·丹瑟将其余视为非重要的变种。已发表的品种包括：
自然杂交种.苹果猪笼草每年开花一至两次，花期数周。它的花期与其他许多猪笼草属植物吻合，因此它很容易和其他种形成自然杂交种。以下为已发现的自然杂交种。