西日本的山阳本线；由坂急神户高速线、坂神神户高速线和神户电铁神户高速线三条路线共同组成的神户高速线；连接神户市和姬路市的山阳电气铁道本线；连接神户市中心和六甲山北麓神户市郊，由神户电铁运营的有马线、三田线、粟生线；由JR西日本营运、连接海边重工业地带的和田岬线；由北神急行电铁公司运营的北神线。神户新交通运行有两条旅客捷运系统路线——港湾人工岛线和六甲人工岛线，其中港湾人工岛线更是世界上首条无人驾驶的捷运路线。神户市内有两条地铁线路，分别是神户市营地下铁西神-山手线和神户市营地铁海岸线，均由神户市交通局运营。