2月14日，新竹地检署检察官吴昭莹对朱有玄提起当选无效之民事诉讼。2006年3月27日，台湾新竹地方法院合议庭推翻检方举证的朱有玄坦承犯案及彭兆瀛指证的证词，认为朱有玄与涉嫌买票的彭兆瀛并无犯意联络，一审刑事判决朱有玄无罪。2006年8月20日，台湾高等法院合议庭基于朱某曾在侦查坦承，有拿30万元给桩脚彭兆瀛，要求提供可贿选名单，选后也愿给予服务处秘书一职，认定贿选非彭某一人所为，撤销朱某无罪判决，改判徒刑1年，并褫夺公权2年。民事当选无效部分，一审判决「原告（检察官）之诉驳回」，2006年10月11