的车站大多设于地底，建于距离地面12至37米之下。而位于新界的车站，很多都以地面或高架形式建造，但坑口站、将军澳站、调景岭站、大窝口站、荃湾西站及东涌站等新界车站的月台则因为路段及车站设计问题而须建于地底。除了以上铁路及巴士路线外，港铁公司亦经营来往东涌至昂坪的旅游缆车系统──昂坪360。所有列车服务由港铁公司车务部负责，而列车维修则由港铁公司车辆维修部负责。
重型及中型铁路系统.港铁市区线为连接香港各区的主要铁路网，在大部份日子提供每日约19小时的服务，其中东铁线及屯马线