荷治及明郑时期.「斗六」在荷兰人佔据时期即有「斗六门柴里」之称，简称为「斗六门」或「柴里」等。原先洪雅族有一社位于柴里（现斗六市三光里）。「斗六门」系其族人在狩猎捕获山鹿时发出「ㄉㄨ － ㄌㄨ－ ㄇㄣ」的咆哮以为庆贺，后来以闽南语之发音译成汉字，名称由此而来。
清治时期.1683年8月（南明永历三十七年七月，清康熙二十二年七月），郑克塽投降清朝，台湾进入长达212年的清治时期（1683-1895年）。斗六地方本系平埔族洪雅族于康熙末年移至此地开垦聚成