地区，一些战斗在贵州发生。清朝派出八旗、绿营并调动当地民兵和自卫队。叛乱苗人的土地被没收，以为对他们的惩罚，也为了增强政权势力；但因新的汉族地主无情剥削苗族佃户，这一举措却激发了进一步的矛盾。在已平定的地区建立了堡垒和军事殖民地，苗族和中原人的领地被带有烽堠的墙所分离。但朝廷也用了11年的时间最终平定此乱。朝廷于1795年将绿营兵从湖北重新部署到湖南处理苗人，因而对北方省份的控制削弱，助长了川楚教乱。军事行动后是强迫同化的政策：传统的衣服被禁止，种族隔离被强制执行。也有引入儒家教育的尝试。然而，骚乱的深