在组织学中磷钨酸常用在细胞样本的染色，常和苏木精一称使用，称为。磷钨酸会和结缔组织中的纤维蛋白、胶原蛋白及纤维结合，形成不同的颜色。磷钨酸是电子致密的物质，在电子下是不透明的。在透射电子显微镜中，可以用磷钨酸来针对病毒、神经、多糖及其他生物组织进行负染色。
结构.Gouzerh整理了历史上有关磷钨酸结构的不同观点，结果得到以下Keggin认为的结构：磷钨酸的正确结构最早是由J.F Keggin在1933年及1934年提出，一般称为。此离子有完整的全四面体对称性，十二个和氧原子