和魏内克陨石坑则分别坐落在南面和东南偏南方。该环形山的东北绵延着巍峨的比利牛斯山脉，西南则横亘着阿尔泰峭壁。该陨坑中心月面坐标为，直径120.58公里，深度约2.911公里。弗拉卡斯托罗环形山外观呈多边形状，整体已严重损毁，其北侧坑壁已完全消失，现在月海表面仅剩一些显示轮廓痕迹的丘堆，并构成了酒海中的一处月湾结构；其余部分坑壁也已受侵蚀，西侧和南侧壁覆盖了一系列的小撞击坑，其中最醒目的是位于西侧壁上的卫星坑"弗拉卡斯托罗 D"。陨坑内侧壁显示有平缓的阶地状结构残迹，坑壁最大高度有2.4公里，平均高出周边