蛋白可能具有对抗宿主免疫反应的功能，辅助蛋白NS2（由2a基因编码）有2′,5′磷酸二酯酶的功能，可将细胞中的2′,5′-寡腺苷酸（2′,5′-oligoadenylate）降解，避免其活化细胞中的而启动分解病毒RNA的防卫机制；辅助蛋白5a有抑制宿主干扰素作用的功能；不同病毒株的辅助蛋白种类可能稍有不同，例如MHV-S不具有辅助蛋白5a，因此对干扰素的抗性较差。四种辅助蛋白皆非鼠肝炎病毒感染细胞所必须。
感染.冠状病毒感染宿主细胞时，其刺突蛋白（S）会与宿主细胞表面的受体结合，