机车的总体布置比较，主要变化是将制动电阻带安装在高压室和辅助发电机之间的间隔顶部，而不是像原来那样位于动力室的柴油机上方。车顶结构经过重新设计后，不仅方便了动力室顶盖的拆卸和柴油机的维护检修，同时为电阻制动装置的冷却风扇提供了更多的冷却空间。为了符合美国联邦政府于1980年1月颁布生效、关于限制铁路沿线噪声的若干标准，SD50型柴油机车设有排气消声器和低噪音冷却风扇。机车走行部标准配置为两台易安迪HT-C转向架，主要特点包括具有较大刚度的橡胶摇枕弹簧二系悬挂装置、牵引电动机顺置布置、大直径心盘及低位牵引装置