空允许，便能在车上堆叠两层货柜。假如两层货柜规格一致，上方货柜便可经由平车内建的隔板固定到下部货柜，否则便使用货柜间连接器固定。 双层货柜平车的优点包括车辆负载的重心较低，皮重较轻而提高了稳定性。 双层货柜平车最常见于北美，因海陆联运常见、铁路电气化程度不高，上方净空通常问题较少。 
瓶颈点.如路线上有较低的桥樑与较窄的隧道，则需进行昂贵的升级以供双层货柜平车通过。美国一些一级铁路公司已经启动了改善计划，以消除双层火车的障碍物。 参见 心脏地带走廊 （ 诺福克南方铁路 ）和