入境大堂启用，乘客只需在始发站及终到站办理出入境手续，于9月开始执行的过渡性方案取消。同时取消杭州东、鹰潭、衡阳、郴州、韶关的停站及客运业务，运行时间缩短至25小时。 2004年1月某天，由韶山9型电力机车牵引的沪九直通车（K100次）运行至京广线白石渡站附近时，机车出现故障并机破，随后由韶关机务段由坪石站调度一台韶山6B型电力机车救援，牵引列车继续北上，沿途停靠郴州站、衡阳站，并晚点数小时到达株洲站。2004年11月11日起，至2006年9月期间，受浙赣线电气化提速改造工程影响，沪港直通车全程运行