方药师佛与西方阿弥陀佛被视为解决众生生死问题之两大并行佛陀，中央释迦牟尼佛。药师佛法门除同样鼓励命终往生净土外，还着重强调可蒙药师佛愿力加被，以求现生即得安乐利益，增福延寿，消灾免难，清除修行路上重重障碍。佛教界有说法认为横三世佛为一体，只是为了渡众生而化身为不同的形貌。
八大菩萨.依《药师经》记载，若有修弥陀净土法门者，或生退转心、生疑心者。如果听闻到药师佛的名号能够受持，在临命终时会有八大菩萨前来接引示其道路，随愿往生极乐世界或净琉璃世界。这八大菩萨是：文殊师利菩萨、观世音菩萨