和扫雷艇人员，组织了小型的「德国扫雷部门」，其中有前战争海军27,000名人员和300艘船只。1956年西德加入北约组织，一个新的海军组织诞生：。有些如和奥托·克瑞奇米尔等前战争海军指挥官继续为联邦海军服务；战后不久东德的人民海军也跟着成立，1990年两德统一后，海军改名为德国海军。
指挥结构与人员编制.战争海军的指挥体系基本上与国家海军相同，希特勒是德国全军统帅，德意志国防军设有德国海军总司令部，由战争海军总司令（Oberbefehlshaber der Kriegsmarine