当中微子探测器的精度足以探测从太阳来的中微子流时，所探测到的中微子数量很明显低于太阳内部模型所预测的数量。中微子探测数在各种实验中为预测数的三分之一至二分之一。这个差异后来被称为“太阳中微子问题”。
测量.雷蒙德·戴维斯和约翰·巴考尔于1960年代晚期在美国南达科他州矿井中的最早测量了太阳产生的中微子的流量，并探测到与理论值存在缺失。之后不少的放射性化学探测器和水契忍可夫探测器都确认了这个缺失，当中包括神冈探测器和萨德伯里中微子观测站。太阳中微子的理论值是用标准太阳模型计算的