维持亲上杉氏政策的父亲长职和重臣小岛职镇等对立，翌年10月，上杉谦信以长职方援军身份渡过神通川，长住等反上杉派被镇压。天正5年（1577年）11月16日，上杉谦信把能登珠洲郡细谷村89贯457文赐予饭田与三左卫门。因此发起反抗但是失败，之后逃到能登畠山氏处。但是后来因为能登亦被谦信征服，长住就前往京都并仕于织田信长。天正6年（1578年），以谦信突然死亡为契机，在信长令佐佐长穐等率兵经由飞驒向越中侵攻时担任织田军的先锋，国人众斋藤信利、小谷六右卫门、二宫长恆等加入并攻略增山城，制压越中西南部。在9月