1981年，姨妈蒋宋美龄移居美国纽约，先后居住的长岛庄园和曼哈顿上东城公寓的2处寓所，均为孔家产业，并由孔令仪悉心照料，直到22年后的2003年去世。在2008年8月22日，孔令仪在美国纽约曼哈顿第五大道寓所内去世，享年93岁。8月26日，孔令仪葬礼告别式于纽约曼哈顿举行，之后她葬于纽约上州芬克里夫墓园。