次年改吏部左侍郎。顺治十三年，升任兵部尚书，钦命赈济顺天府属大兴等处。康熙五年，改任礼部尚书，并于次年担任会试正考官。康熙十年，改任刑部尚书；次年再改户部尚书。康熙二十七年，担任保和殿大学士。梁清标工书法，精鑑赏，收藏甲于海内，有阎立本《步辇图》卷、周昉《簪花仕女图》、荆浩《匡庐图》、顾闳中《韩熙载夜宴图》卷、范宽《雪景寒林图》、陆机《平复帖》、赵孟頫《黄庭经》，鑑藏章有“河北棠村”、“苍岩子梁清标玉立氏印章”、“蕉林”、“观其大略”等。梁清标还从所藏法书中精心选出11种﹐上自《平复帖》﹐下至《黄庭经》