长度370kb－1.51Mb。拟菌病毒科的病毒常与噬病毒体和等元件共同出现，且本科病毒基因组中，早期转录的基因之启动子中常有AAAATTGA的序列，基因的转录常以茎环结构终止，且许多病毒具有编码氨酰-tRNA合成酶的基因，为此类病毒的重要特色，其中图邦病毒的基因组中甚至有多达20种不同氨酰-tRNA合成酶的基因；多数本科病毒亦具有一种麸醯胺酸依赖型（glutamine-dependent asparagine synthetase, AsnS）的基因；此外已知的所有本科病毒都具有MutS7基因，该基因存