了东方教会放弃与西方的联盟，而这是1439年费拉拉-佛罗伦萨会议隆重宣布过的。阿塔纳修斯二世在圣索菲亚大教堂给都主教米特罗凡·基泽斯基，马卡里·尼科米季斯基和来自已经处在穆斯林监督下的尼西亚的新信徒行了按手礼。不过在那个时候，帝国已经宣布自己是奥斯曼苏丹的属国。有关牧首退位或死亡的资料没有保存下来，看来大概他和皇帝本人以及被征服城市中的大多数居民一样，在袭击发生时或之后立即遇难了。不过，如果阿塔纳修斯在那场变故中确实是牧首的话，那他就是拜占庭帝国最后的相对独立自主的东正教会牧首了，因为接下来所有的牧首