012-2013学年，苏格兰的大学共拿到了英国科研委员会拨款中的13.1%。伦敦大学学院的阿兰·特伦彻认为，苏格兰独立后，那里的大学将会获得的科研资金将明显下跌。威莉·伦妮认为苏格兰的大学将失去2.1亿英镑的资金。苏格兰物理研究所警告称，要用到欧洲核子研究组织大型强子对撞机、欧洲航天局和欧洲南方天文台等国际设施，需要苏政府重新协商，也引发英国慈善机构的研究经费及国际公司对苏格兰设施的担忧。苏格兰教育部长迈克尔·拉塞尔曾表示，苏格兰大学“享誉全球”，独立后能继续吸引投资。2013年9月，阿伯丁大学校长