006年，他被提升到新组建的上海东亚，参加2006年中国足球乙级联赛。顾超是球队的主力守门员，在2007赛季帮助球队获得联赛冠军，升级到中甲联赛。2011年3月15日，顾超转会加盟中国足球超级联赛球队杭州绿城。 7月6日，他在杭州绿城客场1比1战平大连实德的比赛首发出场，首次代表杭州绿城在正式比赛出场。 7月16日，他在对阵阿森纳的友谊赛中下半场替补出场，并力保大门不失，最终帮助杭州绿城1比1逼平对手。 他在杭州绿城担任姜波的后备门将，2011赛季为杭州绿城在联赛出场4次，2012赛季仅有1次出场机会。