双溪水库之开发计画，受到部分环保团体质疑，双溪水库大坝预定地的丁子兰溪正常状况下水量少，到了下游容易发生干涸的状况，也因此当地常称这条溪为「干溪」，因此极不利于兴建水库，加上坝址与双溪流域内规模最大、最重要之断层，屈尺断层之间最近距离不及一公里，若发生地震恐有安全疑虑。因此台湾绿色公民行动联盟理事陈建志在看过双溪水库之第一阶段环评审查结论后，于2012年12月12日的双溪水库开发公开说明会中表示，水利署应先提出水资源规划及利用替代方案，包含节流、与其他开源，以及东北海岸地区、基隆等地区的未来用水情势，