黄河堤防失修，有的地段常年决口，漕运影响甚重，康熙元年（1662年）6月，黄河泛滥，中牟城西、南、北三关均被水淹，康熙二十二年（1683年）修筑高4丈，宽10丈的黄河堤。光绪十三年（1887年）9月30日，郑州下汛十堡（今惠济区花园口镇石桥村）发生黄河决口，致使200多万（一说93万；一说最保守估计150万；一说700万）人罹难，清史研究学者夏明方称其为“近代中国人口损失最严重的一次洪水灾害”，英国密德萨斯大学国际关系学教授彼得·霍夫（Peter Hough）称其为“人类历史上最致命的自然灾害之一”。