属于热带季风性气候，全年高温，分旱雨两季，东北部山区较为凉爽。12月和1月日平均气温在20℃左右，而在4月和5月，日平均气温高达30℃以上。6月至11月为雨季，年均降水量为1000到1500毫米。
河流和湖泊.柬埔寨最长的河流为湄公河，在其境内长501.7公里，流域面积15.5万平方公里，多年平均流量每秒2860立方米。境内的洞里萨湖是东南亚地区最大的淡水湖，富水产资源，同时也是柬埔寨重要的灌溉水源。长约100公里洞里萨河将湄公河与洞里萨湖相连。