在数学中, 一个距离矩阵是一个各项元素为点之间距离的矩阵（二维数组）。因此给定"N"个欧几里得空间中的点，其距离矩阵就是一个非负实数作为元素的"N"×"N"的对称矩阵距离矩阵和邻接矩阵概念相似，其区别在于后者仅包含元素（点）之间是否有连边，并没有包含元素（点）之间的连通的距离的讯息。因此，距离矩阵可以看成是邻接矩阵的加权形式。举例来说，我们分析如下二维点a至f。在这里，我们把点所在像素之间的欧几里得度量作为距离度量。其距离矩阵为：距离矩阵的这些数据可以进一步被看成是图形表示的热度图（如下图所示）