、有马温泉、道后温泉、白滨温泉和秋保温泉。平安时代的「延喜式神名帐」里亦记载了几所供奉温泉神的温泉神社的名字。日本人自古以来一直视温泉为一个与宗教和信仰有关的场所，而功效方面日本部分传统药用方式和发现其疗效可能是从中国唐朝由遣唐使带来日本的，不过在鎌仓时代之后，经一遍上人等僧侣开放浴室让贫苦和患病的人入浴，入浴开始变得一般化，而温泉在医学上的实用性亦开始被重视。在鎌仓中期，大友赖康在别府温泉设置了温泉奉行一职，有文献记载元寇之役的战伤者曾来到别府温泉治伤。此外，有说战国时代的武田信玄和上杉谦信也特别注意