本作中试着给予能同时满足双方的圆满解释，因此本作中设定为「轩辕剑是天神女魃为了自己的爱人黄帝而偷来的天界之剑，在黄帝对蚩尤之战中折断，之后两人将其以精铁上万斤，黄铜五千斤重铸，并命名为轩辕剑」。外传《云之遥》的〈兰茵篇〉并提及，剑内因此带着黄帝的剑气，和天女的剑气。
剧情.
故事概要.游戏讲述一个人间（游戏中称「轩辕界」）少年陆承轩（上古神器「昊天塔」转世）因精神失控，杀死自己父母而被同族人驱赶，最后绝望想跳崖自尽，此时「皇甫暮云」（轩辕剑转世）用盘古斧打开轩