八岁时，他的父亲在法国政府获得了一个新职位，带着家人，包括勒邦的弟弟乔治，离开了诺让勒罗特鲁，再也没有回到这个小镇。尽管如此，小镇对于古斯塔夫·勒邦的出生仍然很自豪，后来以他的名字命名了一条街道。 人们对勒邦的童年知之甚少，除了他曾是安德尔-卢瓦尔省省会图尔的一名普通中学生。勒邦自1860年起在巴黎大学学习医学，于1866年在医院完成实习并取得博士学位。在那之后，他开始称唿自己为医生，尽管他从来没有从事过此职业。在大学期间，勒邦撰写了一系列关于医学主题的论文，其中第一篇是关于那些生活在沼泽地的人的疾病。