湾乡土动物区的动物包括：山羌、梅花鹿、水鹿、台湾野猪、蓝腹鹇、白鼻心、竹鸡、八哥、云豹、石虎、黑熊、水獭、台湾长鬃山羊、台湾猕猴、鼬獾、穿山甲。
热带雨林区.该区由两个半区结合而成；亚洲热带雨林区于1998年落成，模拟东南亚热带雨林的生态景观，依展示动线规划成河口生态、密林生态及林缘生态三大展示区，是台湾首座兼具雨林景观与活体动物的生态展示场。有亚洲象、犀鸟、马来貘、马来长吻鳄、红毛猩猩、白掌长臂猿、孟加拉虎等。中南美洲热带雨林区于2018年完工，以仿自然环境之绿篱及水道贯穿全区