2月，评定为博士研究生导师。1995年7月至1995年10月，在美国麻省理工学院作访问教授。1995年10月至1997年11月曾兼任电子工业部计算机与信息化推进司副司长、全国电子信息系统推广与应用办公室副主任（挂职）。1997年11月至1999年6月，清华大学计算机系教授、博士生导师。1998年至1999年又兼任北京鼎新信息系统公司总经理。1999年6月起任教育部科技司副司长（主持工作）、2000年6月任司长。2001年5月调任教育部高等教育司司长。2001年11月至2006年5月，兼任中央广播电视大学