后方实际防御力相对空虚；当时日本陆军在台湾仅驻扎飞行第54战队的一个中队，在1943年9月因为前线战力孔急将战斗机中队调到印尼巨港，亦即当时日本在台防卫主力主要是海军航空队负责，且大多数是训练单位，战斗单位极少。十四航空队选定的海军据点目标有三个：高雄港、台南飞行基地和新竹飞行基地。高雄港虽然为转运重要据点，但除了有寿山要塞掩护、同时也是高雄警备府所在地，对空防御较为周延；台南飞行基地附近有糖厂等军需相关单位，但该机场为日本海军航空队在台湾的主要据点，空中战力较为充足，不易得手；最终十四航空队选择以防御