那烂陀寺中，属瑜珈唯识派之护法、戒贤等人，依《解深密经》与《瑜伽师地论》等经典，建立法相宗；而属中观派之清辩、智光等人，建立法性宗。性、相二宗，形成那烂陀寺中的两大宗派，这个分类随后传入中国。
历史.瑜伽行派的历史起源不明，说一切有部《大毗婆沙论》记载了一个小流派，这个学派的成员，被称为瑜伽师。瑜伽师的见解属于上座部传统，与譬喻师相近，其流传地区在西北印度一带，学者一般将他们视为在说一切有部之下独立发展的流派，但他们有部份学说与分别说部相近。现代学者，如印顺等人，比较了《大毗婆沙论