生态环境，生物栖地相当多样化。植被可见海湾时期及沼泽溼地时期的植物，包括热带、亚热带、暖温带及凉温带之植物。厂区内有水塘等水生及溼生环境，近年来常见动物有夜鹭、红冠水鸡、翠鸟、小白鹭、鲫鱼、鲤鱼、鲶鱼等。松山菸厂是台北市东区较大且自然度较高的绿岛，也是南港山系自然环境导入台北市区的绿色廊道中第一个生物中继站。
市定古蹟.2001年，台北市政府将“松山菸厂”指定为第99处市定古蹟，其中办公厅、制菸工厂、锅炉房、一至五号仓库为古蹟本体，并将莲花池、运输轨道及第二次世界大战后的新建仓库一