仍然可以在分子生物学、比较胚胎学和比较解剖学上找到相似性。演化也可以解释为什么地球上会有这么多种生物：适应不同栖位。在生物地理学上，相近区域的生物往往在分类学上非常相近，显示出单一物种的辐射演化，而不同地点的生物也可能在类似的环境带有类似的构造，显示出趋同演化。源于最近的共同祖先的共同性状在物种之间更相似，包括共同的DNA序列，可以作为进化关系的依据，建立生命之树（系统发生学）。
演化历史的证据.虽然演化有很大部份发生在久远的过去，但是经由痕迹器官、过渡化石、反祖现象和种系发生学重