该市东侧边界通过，在公馆乡与省道台6线交会处设有「苗栗交流道」，可供利用以前往南北各地。福尔摩沙高速公路虽未经过辖区，但在后龙镇与省道台6线交会处所设之「后龙交流道」距离颇近，为苗栗市西北部地区常用要道。东西向快速公路台72线（后龙 - 汶水）则沿后龙溪东岸绕行该市北侧及东侧，在后龙镇与省道台13甲线交会处设有「造桥交流道」，在头屋乡与省道台13线、乡道苗27-1线交会处分别设有「头屋一交流道」及「头屋二交流道」，在该市水流娘地区（该地深入公馆乡）与省道台6线交会处设有「公馆交流道」，可供利用以前往苗栗