黑町、三条绳手寺屋敷、都市町、东桥诘町、五条河原田、五轩町、三条大桥东十五轩町、二町目、三町目、知恩院门前、五条下寺町、福田寺町、平居町、上生洲町、四条河原、五条河原、下京畑和葛野郡的三条新畑、来迎堂廻。1889年日本实施市制，上京区和下京区合设为京都市，但上京区和下京区的行政区划仍被保留。1889年起至1931年期间，爱宕郡今熊野村、清闲寺村、葛野郡大内村、七条村、朱雀野村、纪伊郡柳原町、东九条村、上鸟羽村、吉祥院村陆续被併入京都市，并划入下京区；1929年，下京区四条通以北地区与上京区丸太町通以