化时，宝积寺车站仍设有货运站，因此也是日本货物铁道（JR货物）的车站之一，但货物列车班次已在2006年时被取消。
车站构造.本站是一地面车站，月台是由一座侧式月台及一座岛式月台组成。而目前的站房是在2008年3月才落成启用的跨站式站房。
月台配置.（来源：JR东日本:车站构内图）
使用情况.根据JR东日本，2019年（令和元年）度1日平均上车人次为2,251人<ref group="利用客数" name="passenger/20