首三名一共24队连同欧联小组赛第三名的8队球队可进入第一圈淘汰赛。如在小组中两队得同分则顺次序根据以下准则定出胜方：
淘汰赛.
三十二强.8 支欧洲联赛冠军盃分组赛第三名的队伍加入第三圈淘汰赛，共计由欧洲足协盃分组赛阶段晋身的 24 支球队总共有 32 队，于12月16日进行抽签，对赛球队採取主客两回合赛制，赛事首回合于2006年2月15日及16日进行，而次回合则在2月23日进行。
十六强.抽签仪式于12月16日进行，对赛球队採取主