1年末，太平洋战争爆发。1942年2月，日军攻陷新加坡。陈嘉庚在日军进占前夕将塑像深埋在橡胶厂地下，以避过日军搜索。1945年日本投降后，第二次世界大战结束，铜像才重见天日。1950年左右，陈嘉庚的侄子陈共存意欲将蔡公时铜像赠送给中国，但他致函给中国共产党有关单位后，对方回复“没有单位可以接收”。1965年，孙中山南洋纪念馆：晚晴园重新修复，此后蔡公时铜像便摆放在馆内。2001年11月，晚晴园再次重修扩建，蔡公时铜像被摆放在园门正前方，受到很大关注。2002年9月，陈共存接受新加坡《联合早报》记者区如柏