合金弹头6使用Sammy 基板开发，并发行在PS2、Microsoft Windows上。为该系列的第7作，2006年2月发售。本作亮点为各位主角能力有了差别，并增加2名新角色。
剧情简介.把枪一丢，那震撼的一战就代表了一切结束的期望关于摩丁元帅的第3次反叛计画，因为无法确认他的生死，也没有任何叛乱军残党的活动情报，而这次有队员提出离职的请求但和平才维持没多久，情报部有一些另人无法相信的资讯传来未确认的飞行物体、宇宙人、甚至一些奇奇怪怪的大型不明生物的出现所幸目前没