来孙被迫东迁。俺答汗积极请求明朝允许通贡，明朝几次斩杀俺答汗的使臣。嘉靖二十九年，俺答汗自大同一直攻至北京城下，史称庚戌之变。双方关系时好时坏。隆庆四年，俺答汗嫡孙把汉那吉等人逃往明朝投降，两方谈判达成一致。隆庆五年（1571年），明朝封俺答汗为顺义王，实现明朝与蒙古互市。俺答汗所修建的库库合屯是现在的唿和浩特市的基础。此外在1578年俺答汗率先以高规格礼节与索南嘉措在青海湖畔察卜齐雅勒会晤，授予其达赖喇嘛称号，取缔了蒙古人长期信仰的萨满教和“翁衮”偶像，下令在蒙古地区传播藏传佛教格鲁派。到了十七世纪中期，