术住进台北荣民总医院，经过两週住院疗养后，在4月29日出院。2000年10月6日，因国民党支持续建核四，与当时政策主张废除核四的民进党相违背；总统陈水扁通知唐飞准辞（曾于9月退回其提出的辞呈），在任仅139天，是政府迁台以来任期第二短的阁揆（仅长于张善政，任期仅109天）。
卸职后情况.
2000年卸任阁揆时.唐飞卸任后曾言：「不在其位，不谋其政」，婉拒接受总统陈水扁安排有给职的总统府资政，也没有要“总统府”派的公用车，他只搭计程车、捷运到处跑，亲自探索社