不久，解放军就攻陷机场。 1949年12月10日衣复恩驾驶着“中美号”，在成都的凤凰山机场起飞，载着一语不发的蒋中正离开了大陆。
驻美武官.中华民国政府退守台湾后，衣复恩在台重新组建空运大队，1952-1955年奉派赴美担任驻美武官3年。在美国担任武官期间，曾与国防部长俞大维公子俞扬和建立不错的交情。
空军情报署长.1955年返国接掌空军情报署长。情报署长任内，先后直接指挥空军第33中队（3831部队），34中队（黑蝙蝠中队），以及35中队（黑猫中队）。3