等大名亦对秀吉表示臣服(奥州仕置)，至此丰臣政权在名义上统一了日本。虽然在名义上统一日本，但在其后仍然发生了葛西大崎一揆暴动、南部氏内乱、九户政实之乱等小规模战争。为了镇压暴乱，秀吉命蒲生氏乡・石田三成等家臣率领了6万大军前往奥州进行讨伐。至此，自应仁之乱起持续100多年的混乱局面告一段落，丰臣政权名副其实地统一日本。在统一后，秀吉开始对部分功臣进行了肃清。从在信长家臣时代起并一直支持着秀吉，后来被称为羽柴四天王的四人中，有两人（神子田正治，尾藤知宣）分别在被流放后赐死及被处刑（另外两人中，宫田光次