新加坡的铁路及车站坐落之土地由马来联邦政府向海峡殖民地政府租借。新加坡于1965年独立之后，铁路租借地继续由马来西亚管理。两国之间设立边境管制时，丹戎巴葛火车总站被设立为两国的铁路边境管制站，实施一地两检（类似香港西九龙站，相关区域亦以永久租赁方式划入深圳市管辖，但不包括指定六项民法及名义深港边界）。两国分家的政治现况导致马来亚铁路在新加坡无法持续发展。马来西亚长期着重于公路发展而忽略了铁路发展，铁路运输无法与时并进与道路运输竞争，道路超越铁路成为两国之间最主要的运输模式。此外，马来西亚在国内建设巴生港