谦知其必及祸，劝他杜绝宾客，道衡却不以为然。一次，朝臣在讨论新令，久无结论，道衡说：“向使高颎不死，令决当久行。”御史大夫裴蕴弹劾他：“道衡负才恃旧，有无君之心。见诏书每下，便腹非私议，推恶于国妄造祸端。”隋炀帝称赞裴蕴说：“公论其逆，妙体本心。”后为隋炀帝赐自尽，薛道衡感到非常意外，不肯自尽。司法部门再上奏皇帝，炀帝下令将他用绳子勒死。妻子儿女被发配且末（今新疆且末县）。天下称冤。唐朝诗人张九龄有《陪王司马登薛公逍遥台》诗：“尝闻薛公泪，非直雍门琴。窜逐留遗迹，悲凉见此心”。唐朝时，追赠薛道衡为上开府