，1780年他又提出了军队重新整编的提案，做成后由华盛顿提交给大陆议会。在这以后，施托伊本又与新上任的南方军指挥官纳撒尼尔·格林在佛吉尼亚州设立了南方军总部，负责军需供给。1781年春，为了支援南方作战，他向费城派去了450名佛吉尼亚军团的士兵。在约克镇围城战役期间，施托伊本作为一个军团的指挥官，参加了独立战争的这个最后战役。独立战争结束后的1783年，他又协助华盛顿解散大陆军以及制定新的国防大纲。1784年3月，根据佛吉尼亚法律，他成为了美国公民。1784年3月24日满载荣誉的施托伊本结束了戎马生涯，