龙无首的守军见法舰后纷纷弃守，不战而逃。8月26日，孤拔率领8艘军舰停泊馆头，砲轰金牌砲台和长门砲台，前者遭法舰击毁，后者曾以反击，但却遭到法军陆战队袭击，随后遭法舰迪盖-特鲁安号摧毁。这时清军福州一带的海防设施已全被催毁，剩余的福建水师船舰则逃往舟山群岛躲避法舰。而法军远东舰队则停留至8月29日，与东京湾舰队正式合併为远东舰队后才离开闽江江口，驶往台湾，转攻澎湖。
影响.该战役中福建水师损失惨重，不但主要船舰在该战役中被击毁，剩下的战舰也在日后法军追击下陆续被击沉或被迫自沉，