泉州府晋江县人。万历四十三年（1615年）乙卯科举人，初知灵州。崇祯十五年（1642年），知亳州。亳州自崇祯八年后，寇贼交横，遍地饥馑，人民死徙过半，十仅一存。何燮想尽办法收容饥民，又能统兵，杀流贼李忠、常显吾等人，刳其肠以示敌。敌稍退怯。是时李自成陷河南州县十余处。四月十五日，力战李自成军，兵不满五百，至中午被俘，贼人断其足、割去耳鼻，最后被凌迟死。十余日后由何春、王隆斗殓埋于东关。崇祯十七年（1644年）三月，赐太仆寺少卿，谥忠壮，赠其一子入国子监读书。