8年，冯玉祥追随蒋介石进行清党。萧振瀛时任军法处处长，释放了被捕的三千多名青年，包括于振瀛、李子健、陈健民等人。冯玉祥认为萧振瀛违犯军令，并且怀疑萧振瀛在苏联时同苏联共产党勾结，欲杀萧振瀛。但萧振瀛受到宋哲元、马鸿宾、门致中、冯治安等将领的支持，并且有闻承烈、张树声进行调解，冯玉祥乃未杀害萧振瀛，但二人自此结下深怨。1930年夏，冯玉祥在中原大战中败北，西北军解体。蒋介石委托张学良主持华北军政，处理冯玉祥、阎锡山的善后问题。西北军将领推举萧振瀛出面召集西北军余部，重新编组成军队。在山西运城，萧振瀛召开了