1920年开办护士学校，来自约翰霍普金斯大学医学院的沃安娜（Anna D.Wolf）担任护校校长。1928年6月，国民教育部规定高等院校校长必须是中国人，学校董事会必须华人董事为多数。1929年4月，美国董事辞呈，董事会改选，胡适、张伯苓、伍朝枢、施肇基、周诒春、翁文灏、刘瑞恒等组成北京协和医院新一届董事，刘瑞恒出任第一任中国籍协和医学院院长。同年，北京协和医学院被国民政府教育部改名为私立北平协和医学院。1942年1月，因为太平洋战争爆发，学校停办。1947年10月学校第一次复校。1949年9月复称