蛋白质一般都会与适切的DNA段结合。但是，某些分子可以与活跃基因结合，以阻止它与DNA的结合，从而阻止转录的发生。
乳糖操纵子.模式生物大肠桿菌的乳糖操纵子是首先被发现的操纵子，亦提供了操纵子功能的典型例子。它包含了三个相连的结构基因、启动子、终结子及操纵基因。乳糖操纵子是由多种因素，包括葡萄糖及乳糖的存在来调控的。
操纵子数量及组织的预测.操纵子的数量及组织可以从大肠桿菌的研究中得知。预测可以基于基因组序列。其中一个方法是使用不同读架中基因间的距离作