、第六次大提速的双重影响使得沪昆铁路嘉善站的客运功能日益萎缩。而原先沪杭客运专线在建设之初并未在嘉善设立站点，当消息被媒体披露后，引起嘉善市民的哗然。嘉善县政府随即成立特别小组向上级部门争取，而嘉兴市政府以该线在本地区里程最长、占用土地面积最多为由，向铁道部、上级政府积极奔走，最终争取到在嘉善设立站点。2010年10月26日嘉善南站随沪杭客运专线开通而启用，首班停靠的列车为开往的G7412次列车
车站结构.
站房.嘉善南站站房面积4998平方米，高22米。