支援两名玩家一同游玩，在双玩家模式时，玩家的战斗将对变成双打对战，捕捉时也会各投掷一的精灵球，捕捉宝可梦的机率会翻倍。依据版本不同，玩家的初始宝可梦可能是皮卡丘或伊布，在画面处于第三人称鸟瞰视角时，它将会位在玩家的肩膀或头上，这个机制类似于《精灵宝可梦 皮卡丘》中首次引进的步行宝可梦机制。当玩家靠近隐藏道具时，玩家的搭档宝可梦会摆动它的尾巴，也可以透过换装功能来装饰宝可梦的外观。玩家还可以像《精灵宝可梦 心金·魂银》一样选择一个宝可梦当作自己的伙伴，让它们跟随自己，如果选择的宝可梦的体型比较大，那么玩家