赵南明还曾任国务院学位委员会生物学科评议组成员、中国生物物理学会理事长、国际纯粹与应用生物物理学会执行理事、国际科联中国委员会委员等职。
奖项和荣誉.他获得过国家教委科技进步一等奖、二等奖，清华大学突出贡献奖（2006年），贝时璋奖（2013年）等奖励，2008年当选国际欧亚科学院院士。