退出民进党，退党声明抨击「民进党至今仍然竟日追逐眼前短小的党内派系政治利益，而漠视台湾人民如此的焦虑及疏离感日益扩大」。2019年6月10日，「民进党初选观察团」公布2020年民主进步党总统提名选举观察报告，蔡明宪批评，最应该维持中立的五人协调小组成员苏贞昌、陈菊、郑文灿却公开支持中华民国总统蔡英文。2019年10月18日，蔡明宪发表致蔡英文公开信，扬言如果蔡英文没有清楚回应，2020年中华民国总统选举「台湾本土派及海外台湾人……我们不再接受含泪投票」。