到了高雄市第六届议员（2002年－2006年）才转为以无党籍参选，但立场仍被认为倾向泛蓝阵营。在前高雄市议长朱安雄爆发贿选案后，蔡见兴由蓝转绿，并得到高雄市泛绿议员的支持。2004年1月5日，蔡见兴在高雄市议会议长补选中当选第六届高雄市议会议长。成为民主进步党在南台湾首任的民进党籍议长，可惜2006年第七届高雄市议员选举却只在第三选区拿到8375票，惨糟滑铁卢。之后蔡见兴数度返回澎湖家乡为民进党籍候选人助选，使得不少澎湖乡亲对他留下印象。而蔡见兴也频频与澎湖人士接触，展现投入选举的企图心。在2009年1月2