XY性别决定系统是一种普遍存在的性别决定系统。人类、多数哺乳类、部分昆虫（果蝇属）、部分的蛇、部分植物（银杏）都是使用此系统。在此系统中，一个个体的性别是由一对性染色体决定的。 雌性生物拥有两个相同的性染色体（XX），被称为「同染色体性别」。雄性生物拥有两个不同的性染色体（XY），被称为「异染色体性别」。它们当中的例外有与。