2012年1月1日起，陆续启动新的行政院及中央部会组织架构。原组织架构的11部会，原行政院新闻局、行政院消费者保护委员会、行政院青年辅导委员会、行政院体育委员会、行政院经济建设委员会及行政院研究发展考核委员会等已遭裁撤或降编；尚有行政院海岸巡防署、蒙藏委员会、行政院公共工程委员会及行政院原子能委员会等待新法源实施后也将裁撤或降编。2012年10月1日，行政院人事行政总处「总处培字第10100518151号函」载明：「因应行政院组织改造，有关行政院所属机关（构）考试职缺之实际用人机关、工作地点及内容，以