境胡同因其地原有明朝道观灵济宫而得名。明朝时，今灵境胡同分为东、西两段，东段因有灵济宫，因此称作“灵济宫”，西段南侧有宣城伯府，因此称作“宣城伯后墙街”。清朝时，以今西黄城根南街为界，东段因为原“灵济宫”逐渐变读为灵清宫、林清宫（传说与嘉庆年间进攻皇宫的林清有关），因此称作“林清胡同”，西段则称作“细米胡同”。 中华民国时期，灵济宫谐音而成“灵境胡同”，以今西黄城根南街为界，今灵境胡同分为东、西两段，东段称“黄城根”，西段称“灵境胡同”。东段实际上是一段东西走向的北京皇城城墙旧址。明清北京皇城有两个西南角。