圳的海运港口，截至2014年底，深圳共有港口泊位159个，万吨级及集装箱泊位分别达67个和46个。蛇口邮轮中心、福永码头是深圳的客运港口。蛇口邮轮中心于2016年10月31日启用，承担原蛇口客运码头的所有客货运业务。蛇口邮轮中心隶属于招商局集团旗下招商蛇口，是招商蛇口太子湾国际邮轮母港的核心组成部分，目前开通有往返珠海九洲、澳门外港/凼仔、香港机场、香港港澳等客运渡轮航线以及日本（冲绳、八重山群岛）、菲律宾（马尼拉）、越南（岘港）等邮轮航线。而福永码头现已开通深圳宝安国际机场至香港机场、屯门、澳门外港/