地的奉行，此地有部分地区也成为药王寺的寺领。1889年德岛县实施町村制时，现在美波町的辖区在当时分别属于海部郡日和佐村、赤河内村、三岐田村、阿部村。其中日和佐村和三岐田村分别于1907年和1922年改制为日和佐町和三岐田町。1955年三岐田町和阿部村合併为由岐町，1956年赤河内村与日和佐町合併。在平成大合併期间，日和佐町、由岐町在2006年3月31日合併为现在的美波町。
教育.过去辖区内原有德岛县立水产高等学校和德岛县立日和佐高等学校，但在2004年和2009分别被整