会议中，提出应严禁军队走私，并将茅头直指海军总司令桂永清，桂要求吴拿出证据，吴随即将海军走私材料递呈蒋介石，并称已逮捕海军司令部情报处长钟山以及舰长周齐荣。1950年6月25日，韩战爆发后，美国改为全力支持国民政府，在外交上承认台湾的国府当局，并给予美援，吴国桢地位不再重要，与蒋经国与彭孟缉的特务系统也不断发生冲突。1952年，台湾第二次市县长和市县议会的选举在即，吴国桢在台北建立培训学校，轮番培训从各区选出的民众代表，此举引发蒋氏父子高度不满。台湾火柴公司总经理王哲甫无辜被捕，吴下令放人。台湾保安副司