自此，历世帕巴拉正式成为强巴林寺住持，并成为该寺第一大活佛世系。第四世帕巴拉活佛帕巴拉·帕巴曲吉加布任强巴林寺第十六任法台，并获固始汗颁发了写有“中部康区所有地方均听从帕巴拉的指令”的执照。自此，帕巴拉活佛的政教势力获大幅提高。第五世帕巴拉活佛帕巴拉·甲娃甲措出任强巴林寺第十九任法台，任内曾调解三藩之乱时期昌都地方的武装冲突。1676年（康熙十五年），以五世帕巴拉创建拉让为标志，形成了帕巴拉在昌都政教合一的统治制度。帕巴拉政教合一的机关称“孜拉让”，下设“孜勒空”、“雪勒空”两个机构。孜勒空主管帕巴拉管