立蒙古帝国。从13世纪中叶开始，蒙古大军开始与西藏有接触。藏传佛教的萨迦派八思巴在与蒙古王子忽必烈（即后来的元世祖）会晤后，使忽必烈对佛法产生虔诚的信仰。忽必烈即位后建立了元朝，并设立宣政院（初为总制院）掌管西藏事务，由八思巴负责，由此建立了统一西藏的政教合一政权，开始了各教派统治时期。由于元世祖及其后的元朝皇帝的大力支持，宣政院的职权一直由萨迦派所掌握，负责统治整个西藏地区，直至元末。元朝还在西藏驻扎军队，设立各级官府和驿站，以保证当时萨迦派在西藏的地位和政令的推行。自13世纪后的约500年，不同的藏传佛