访问阿富汗，邀请伊敏前往重庆。1942年，英属印度政府以间谍罪将伊敏逮捕，经国民政府交涉，伊敏回到中国。此后伊敏加入中国国民党。1945年5月，中国国民党第六届全国代表大会召开，伊敏任候补中央监察委员、中央组织部专员。1945年10月，国民政府派伊敏、麦斯武德、阿布甫泰肯前往新疆省会迪化工作。1946年，伊敏出任新疆省政府委员兼建设厅长，1947年成为国民党中央监察委员。1948年12月，伊敏被任命为新疆省政府副主席。
流亡土耳其.1949年9月，穆罕默德·伊敏、阿布甫泰肯等人从南