週遭西门市场尚未改建等问题，而仍持续闲置。2000年7月22日，迟迟未见改建的西门市场发生大火，红楼虽未被严重波及，但市场及週遭广场林立的摊贩与违建严重毁损。2002年3月，台北市政府以公办民营方式委託纸风车文教基金会经营西门红楼。同年7月26日，柯一正导演主持的纸风车文教基金会在投入大笔资金整修后，重新以「红楼剧场」为名启用西门红楼。重新开张的西门红楼八角堂「红楼剧场」，一楼经营咖啡厅及精品店（现以台湾特色商品为主），并免费供市民参观。而最主要营业项目，则是于二楼定期上演相声、戏曲、舞台剧、舞蹈、音乐