刘休仁司徒参军，广德令如故。叔父王彧不高兴，对他说：“阿答，汝灭我门户。”王蕴回答：“答与童乌（王绚小字）贵贱异。”。宋明帝最终取胜，遂以功封吉阳县男，食邑三百户。历任中书郎、黄门郎、晋陵太守及义兴太守，但王蕴为官却处处贪贿放纵，将被收捕治罪，因为太后王贞风的缘故，只是免官。宋后废帝元徽初年，王蕴再当上给事黄门侍郎，后转东阳太守。但他未到郡就任就遇上桂阳王刘休范进犯京城。当时叛军进攻朱雀门，右衞将军王道隆兵败被杀，王蕴亦力战受重伤跌在河渠里，幸得人救起。同年叛军被平定，王蕴转任侍中。然而在乱时开东府门迎叛军