云南总督富纲议改时民运民销，得到初彭龄支持，又参劾兵部侍郎江兰失职。嘉庆九年（1804年），误信湖北巡抚高杞之言，上疏参劾吴熊光。由于查无实证，初彭龄被撤职。次年起复为内阁学士兼礼部侍郎。查办西宁盐务。历任山西巡抚、陕西巡抚。嘉庆十五年（1810年）被刘大观劾奏“任性乖张，不学无术。”道光元年（1821年），担任兵部尚书。道光四年（1824年），退休。翌年卒。葬于京西山吕村。《清史稿》有传。
亲属.弟初乔龄，子初铭峻。