一段时间里，约翰·查尔斯都在与癌症抗争。但是人们经常可以看到他出现在埃兰路球场的看台上与老少球迷在一起。作为一个时代的伟大球员，约翰·查尔斯常常兴奋地向球迷们挥手致意。基于约翰·查尔斯对足球运动做出的杰出贡献，2001年夏天，约翰·查尔斯被正式授予CBE勋章。在生命的最后几年时间里，约翰·查尔斯顽强地与癌症进行抗争。尽管如此，约翰·查尔斯还是常常出现在艾兰路为小伙子们打气。2004年1月，约翰·查尔斯在意大利参加一个特别的电视节目时因心脏病突发而住院。几次手术之后，约翰·查尔斯乘搭祖云达斯方面提供的飞机