00年国家大唿拉尔选举中，他作为民主联盟候选人，在该选区失利。2001年至2004年，巴亚尔赛汗在财经高等学校（Higher School of Finance and Economics）任教。2000年12月民主党（DP）成立后，巴亚尔赛汗当选南戈壁省第29选区民主党国家顾问委员会成员。在2004年国家大唿拉尔选举中，巴亚尔赛汗作为“祖国－民主联盟”候选人在南戈壁省第29选区当选国家大唿拉尔委员。2004年9月至2006年1月，担任蒙古国社会福利和劳动部部长。他是“戈壁”（Gobi）国际集团的总裁。