理层在经营方向上也有分歧：一些人主张开展对印度和非洲海岸的贸易，以和英格兰的东印度公司竞争；另一方则支持威廉·佩特森的达连计划。最终达连计划占了上风。1698年7月，公司组织了第一次开发行动，该行动由威廉·佩特森领导，旨在寻求在巴拿马地峡的达连建立殖民地，并以此作为连接欧洲与远东地区的贸易点。虽然1200名苏格兰殖民者分乘五艘船成功在达连登陆，但是他们建立的定居点因为缺少补给而最终被废弃。随后，更大的第二次开发行动（在得知第一次开发行动的最终命运前已经开始了）在戈壁地区建立了定居点，但很快就被西班牙