利克天文台移交给加利福尼亚大学董事会管辖，成为世界上首个建于山顶的永久天文台。首任台长是爱德华·霍顿。1898年，詹姆斯·基勒担任天文台的第二任台长。随着圣荷西的日益繁华，光污染逐渐开始对天文台的观测工作造成影响。1980年代，圣荷西的路灯全部改用低压钠灯，这种灯的灯光容易用望远镜上的滤光片去除。为了感谢圣荷西在降低光害方面所做的努力，利克天文台发现的第6216号小行星命名为“圣荷西”。利克天文台的主要观测设备有：