年由松仓氏入主，对领内的基督教徒镇压，加上实行暴政，导致了岛原之乱的原因。松仓氏因而被处罚。并由高力氏入主。后来经户田、松平氏管治。废藩置县后，成为岛原县，然后被编入为长崎县。
历代藩主.
有马家.4万石外样（1600年～1614年）
天领.1614-1616年
松仓家.4万石 外样 （1616年～1638年）
高力家.4万石 谱代 （1638年～1668年）Section: