6年），颍川太守寇恂因事罢免，颍川人严终、赵敦集兵一万余人，和河南尹密县出身贾期连兵作乱。破姦将军侯进和复为颍川太守的寇恂讨伐贾期，数月斩贾期，郡内平定。同年十二月，侯进奉光武帝之命驻屯弘农郡新安，和驻屯弘农郡宜阳的建威大将军耿弇，等待从长安东归的赤眉军。建武三年（27年），赤眉军击败大司徒邓禹，改变路途从南路走宜阳。侯进引新安驻军在宜阳河光武帝、耿弇大军合军。最后，赤眉军在宜阳投降汉军。建武四年（28年），侯进在辅威将军耿植、建义大将军朱祜指挥下，包围攻打黎丘秦丰，建武五年（29年）夏，秦丰降。