房屋是用木材和瓦建造的。1533年这里建造了一座修道院。
主教驻地.1551年在科马亚瓜建造了一座石教堂。1552年科马亚瓜的牧师被任命为洪都拉斯的第三任主教。当时洪都拉斯的主教驻地位于特鲁希略。而特鲁希略正受到英国和法国海盗的劫掠。科马亚瓜并不是主教驻地，也没有主教座堂。因此新主教向地主会议申请把主教驻地迁移到科马亚瓜。估计1559年到1562年之间教宗批准了这个迁移。1560年科马亚瓜主教在墨西哥正式获得他的任命书。1564年科马亚瓜唯有的教堂被扩建为洪都拉斯的主教座堂，科