这些批评作出正式回应的基督徒被称为基督教护教士。圣奥古斯丁和托马斯·阿奎那等神学家是基督教信仰最重要的护教士之一。
认识论基础."对基督教的批评"用形而上学的理性分析和科学检验的方法，旨在坚持与其他哲学(包括自然神论，无神论和不可知论)和科学事业相同的理性调查标准，并接受相同的评估和批评方法。这种认识论上的理性的分析方法，也被神学借用，也被哲学家和神学家用来研究信仰的本身的合理性，将宗教经典的描述和历史，考古，和科学发现相比较。其结果是在欧州催生了接近无神论的自然神学。遵循的方法类