穷追严剿，“分兵穷搜，务获得魁，尽屠丑类”，镇压之时，将所有的土司头目，戮杀殆尽。最后招民垦种，“给予田地、耕牛、谷种，俾得各安其业”。至干隆初年（1736年），会泽“民夷商贾，四方辐辏，食货浩穰”。涉及的地区和民族有滇、黔、桂、蜀、湘、鄂省的苗族、彝族、布依族、侗族、白族、傣族等，实行“改土归流”之前，云南土司有47家。实行“改土归流”之后，不但以汉族为主导的中央集权的中国统治得到了加强，各少数民族的文化和政治地位被毁灭性地打击，汉化也进一步加快。民国时期，少数地区虽然还残存土司制度，其作用和影响也已