7年（1538年）与后北条氏和睦并背弃了扇谷家。扇谷朝兴的儿子上杉朝定与山内家和解并再次与后北条氏战斗，但是在天文15年（1546年）的河越夜战中战死（有异説），扇谷家灭亡。扇谷家的名迹由一族的上杉宪胜继承，永禄4年（1561年），依赖继承山内家家督和关东管领职的越后长尾景虎（上杉谦信）而成为武藏松山城城主，但是在永禄6年（1563年）降伏于后北条氏。之后下落不明。还有继承山内家名迹的米泽藩藩主上杉纲宪的实父吉良义央有扇谷家的血统，因此以后的上杉家都是扇谷家的血统（吉良义央的父亲义冬和祖父义弥的