2016年夏季奥林匹克运动会奖牌榜列出参与本届奥运会并获得奖牌的队伍与其所得奖牌枚数。依照国际奥林匹克委员会的官方排名榜排列，即首先衡量金牌枚数的多少，银牌次之，最后对比铜牌枚数。而北美洲则以奖牌总数来决定排名。若两支或以上的队伍在同一时间拥有相同的金、银、铜牌枚数，则排同一名次，并采用国际奥委会发佈的国家或地区编码，依首字母顺序进行排列。本届奥运的科索沃、斐济、越南、新加坡、波多黎各、巴林、约旦、塔吉克和科特迪瓦获得首面金牌，其中科索沃、斐济和约旦更首次获得奖牌。另外亦首次有独立奥林匹克运动员获得金牌。