代表中方与俄国人沟通，这条条约最终以拉丁文签订。南怀仁等亦协助清廷铸造火炮，平定三藩之乱。他们准确预测日食，使皇帝可以为相关祭奠做好准备；一些耶稣会传教士则成为宫廷画家。1692年（康熙三十一年），康熙下达一道容教令，标志着传教士的势力攀上高峰：康熙年间，新来中国的道明会及方济会教士反对明末以来耶稣会教士容许中国教徒祭天、敬孔、祀祖等礼俗，爆发礼仪之争，因此1720年（康熙五十九年）清廷决定禁教（未严格执行），1723年（雍正元年）清世宗开始严格执行禁教，再加上日后传教士介入世宗未登极时，与兄弟争夺