开行动车组列车，但由于嘉兴站设备受限，动车组列车无法停靠停靠嘉兴站。经嘉兴市政府和上海铁路局共同研究，决定实施嘉兴火车站整体改扩建工程：工程包括一号站台高站台改造、延长了地道并新建了5号高站台、及新建和谐号候车室和扩建售票处，同时将车站货运业务全部迁往嘉兴东站办理。2008年1月1日，嘉兴站扩建改造的第一阶段完成，和谐号动车组开始停靠嘉兴站。2008年5月嘉兴当地政府开始商讨后续改造，包括车站广场和站房扩建，但相关直至2019年才开始落实。根据相关规划，嘉兴站改造将重建既有北站房，同时新建南站房；并对站