1939年10月重新使用作为拘留所。「放射式」监狱的对角两翼因应扩建而分别于1897年及1901年拆卸。第二次世界大战期间，「放射式」监狱的中央监视塔及两翼被炸摧，仅存其中一半（即现时的D仓），而日治期间，域多利监狱用作囚禁同盟国政要及将领。政府在香港重光后修复域多利监狱，并于1946年重新启用。监狱署从1953年起实施「犯人工资计划」，域多利监狱在1956年于F仓增设工场及洗衣房，让犯人有一技之长。因应有精神病的刑事罪犯日增，监狱署在1961年于域多利监狱设立精神科观察组，设立容纳30名病人的囚仓，用