泰始二年（266年）郡治所移往池阳县。晋惠帝即位，改扶风国为「秦国」（《晋书·地理志上》），作为秦王司马柬的封地。据《晋书·地理志》记载，太康年间（280-289）扶风郡有户二万三千。
十六国北朝时期.后赵明帝时，分扶风等郡置咸阳郡，池阳县改属咸阳郡。北魏太武帝太延二年（436年），分扶风郡置平秦郡，雍县改属平秦郡。太平真君七年（446年），省併始平郡，所领始平、槐里、武功三县改属扶风郡，武功县併入盩厔县。北魏孝文帝太和十一年（487年），分扶风郡置武功郡，美阳县改属武功郡。至