初的形成开始于白垩纪和古新世时期，也就是在5400万年以前，台湾中部地区开始被水淹，中间成为浅海，开始成为海峡。在始新世早期的地壳运动中，台湾开始“太平运动”，大陆开始“茅山运动”，两岸陆地连成一片。直到第四纪更新世时期，华南地区的花岗岩被沙化，岩石中的石英和云母被冲积到台湾海峡中的低部地区，今天台湾北部和中部地区大量开采，成为新竹玻璃工业的重要原料。自第四纪冰河时期（1800万年—6000年之间）以来，大海进入海进期，海水面上升有100—130米，形成了今天的海平面，台湾海峡开始形成。自此开始，两岸间