。若望二十三世任命贝亚为此一单位的首位主席，且将他擢升为执事级枢机，领圣撒巴执事区执事衔，但并未同时升他为主教。贝亚枢机在筹备期间提议邀请其他基督宗教团体代表担任大会的观察员。他在大会中也以基督徒合一秘书处主席的身分参与起草不少文案，其中包括以改善犹太人与天主教关系为目标的《教会对非基督宗教态度》宣言。
辞世.贝亚于1968年12月16日辞世。依照他的遗愿，他死后并没有跟其他在罗马的枢机供职一样在当地安葬，而是送回他的故乡里德布林根安葬。