统会成立后共举行十四次会议，最后一次集会是在1999年4月8日（美国总统柯林顿访问中华人民共和国提出「新三不」后），已经没有追求「国家统一」的结论，而是强调朝「缩小双方发展差距，促成两岸融合」说法，尤其强调「促进双方关系正常化」。台湾政党轮替之后上任的陈水扁总统则从未再召开过国统会议，而国统会每年的预算则少到象征性的新台币1000元，最终于2006年2月28日正式「终止运作」（cease to function）。
历史.1991年2月23日，国家统一委员会第三次会议通《国家统一纲