年2月10日至16日，因占压清河站西侧主入口进站大厅库等空间，北京地铁13号线临时停运改线，上地站至西二旗站区间约1.3公里线路东移至清河站内，线路拨接完毕后，清河站进入第二阶段施工。2019年12月30日，新清河站投入使用。2020年10月，北京市重点站区管理委员会在清河站设立站区管理办公室，负责站区的日常管理和服务工作。
车站结构.
车站设计.改造后的清河站以“海纳百川”作为设计灵感，建筑面积13.75万平方米。车站结构西高东低，形成U型过渡的弧面屋顶结构