nation of EVANGELION:1.01」的反射式字幕解说、屋岛作战BGM《Angel of Doom》的PV等特别收录。比较特别的是，特装版附赠有从院线放映用胶卷剪下来的随机五帧影像，重要片段的胶卷在网路拍卖中高价售出，获得媒体报导。根据Oricon统计，本作的特装版DVD在发行首週售出了21.9万张，排名当週第一，同时也是《EVA》系列中家用媒体最畅销的一部。到了2008年年底统计时，本作以297,927张的特装版DVD销量名列年度DVD销量排行第3名，仅次于欧美片《变形金刚》和《神鬼奇航3：