1959年在古巴建立共产政权；此时美国中央情报局欲利用部份流亡美国的古巴人，以将之推翻。17日流亡军开始攻击古巴。美军一直避免直接介入战事，故陆战队未有离舰登陆；而艾塞克斯号亦仅在19日开始有限的空中支援，派A-1到滩头招引防空炮火，并保护流亡军的B-26轰炸机，但仍有数架轰炸机被古巴击落，四名美国志愿飞行员死亡。入侵最终失败告终。由于入侵猪湾为机密行动，艾塞克斯号上下官兵均被严令保密。行动结束后艾塞克斯号于4月返港。艾塞克斯号分别在1961年7月及9月在西大西洋巡航，又于10月至1962年2月到北大西