毛泽东希望许崇清任校长，故许崇清获得任命。1953年1月，许崇清兼任中南行政委员会委员。同年，任广东省人民委员会委员兼文教委员会副主任。1954年，当选第一届全国人民代表大会代表（此后连任第二、三届全国人民代表大会代表）。1952年8月15日，加入中国民主促进会（民进）。1955年8月，当选中国民主促进会第四届中央委员会常务委员会委员（后来第五届连任常务委员）。1961年12月，出任第二届广东省副省长。许崇清是第一、二、三届全国人大代表，广东省第三、四届人大代表，第三、四届全国政协常委，第一、二、三届省