侯自新（），男，上海人，中国数学家，曾任南开大学校长、数学系教授。
生平.1967年于南开大学数学系研究所毕业，1995年起任南开大学校长。并任中国数学学会副理事长，他在数学研究上，集中于李群、李代数及齐性空间微分几何等方面。曾担任第九届、十届全国人民代表大会代表。2006年，侯自新卸任南开大学校长一职，官方给出的卸任原因为年龄过大，不再适任。据传言，侯自新离任南开大学校长与南开大学允公集团经济案件有关。当时兼任允公集团董事长的侯自新，在对于允公集团化工厂拆迁并建设学生公寓一事