长郑瑞城直接裁示，国文与历史课纲搁置，其余通过。与会的历史科召集人周樑楷教授，以及林富士教授曾发言抗议，但不受採纳。会议结束后，在王晓波提议下，教育部组成研商高中课程纲要专案小组，对国文与历史课纲进行调整。专案小组召集人吴文星，委员王晓波、廖隆盛、吕芳上、黄秀政、周婉窈、王文霞、孙若怡、翁嘉声、周愚文，以及五位高中老师，李彦龙、蓝朝金、林桂玲、伍少侠、林秀蓉。专案小组运作期间，黄秀政中途退出，由吕春盛取代。11月25日，郑瑞城发函公告，98课纲暂缓一年实施，改称99课纲。国文、历史两科，沿用95暂纲