毛凤来与另一名三司官马兼才（与那原亲方良杰）前赴东京，反对日本在琉球设藩，要求日本同意琉球继续向中国朝贡，并要求美国、法国公使斡旋。其二人在国内的事务，则由退隐的三司官毛增光（池城亲方安邑）代理。1879年，日本派松田道之前往琉球，将琉球吞併，设置沖绳县。尚泰王被迫同尚典、尚寅前往东京。马兼才跟随前往，毛凤来与向居谦（浦添亲方朝昭）则以中城御殿为中心，组织士族反抗日本的吞併。日本被迫任命他们为县厅顾问，以缓和日本与琉球士族的矛盾。与此同时，清朝向日本就琉球问题提出交涉。清国与日本方面达成「分岛改约案