，石正丽也是作者之一。2017年8月，石正丽发表论文，认为SARS病毒源头来自云南蝙蝠洞里的中华菊头蝠。2018年4月，石正丽团队在国际权威学术期刊《自然》上发表论文，称发现了引发广东大范围猪急性腹泻死亡的一种新型冠状病毒，并将其命名为猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS冠状病毒）。该病毒与一些从广东菊头蝠样本所分离病毒的基因组序列一致性高达98％。
争议.2019新型冠状病毒疫情期间，自称医学博士的武小华提出阴谋论指，石正丽所在的武汉P4实验室管理不善，是泄露病毒的来源。