空军供应部时期.二次大战后，中华民国空军供应司令部（后更名为空军后勤司令部）由上海迁至台南，第三办公处于民国38年（1949年）进驻稍加整修后的州厅，当时仅修复为桁架斜屋顶，大厅柱子亦只作简单收头。民国57年（1968年）经台南市议会决议后，台南市政府函请空军供应司令部迁让该机构所使用的台南州厅建筑，补偿新台币900万元作为空军供应司令部迁建费用，于是空供部司令陈御风将军于民国58年（1969年）4月7日将州厅移交台南市长林钖山，在此之前台南市政府于原南门寻常小学校舍（今建兴国中）