彦成为替补球员，赛季只出场13次。但在广州医药升上中超后，他被沈祥福成功地改造成一名后腰，并在该位置有出色的表现。2008年6月28日，他替补出场并在补时阶段打进自己的首个中超进球，使得广州在主场3比2绝杀青岛中能。此后冯俊彦重新占据球队的主力位置。2009赛季结束后，他代表广州队在联赛中出场160次，超越吕建军成为代表广州队职业联赛出场最多的球员。2010年，广州队在中国足坛反赌风暴中被揭发打假球，被罚降级到中甲联赛。冯俊彦留在球队，2010赛季出场21次射进3球，帮助球队以联赛冠军的成绩重返中超。2