任吴三桂在外专权。后来，鳌拜被擒，满洲保守势力一时抬头，撤藩之声逐渐壮大。为专注于应对撤藩可能带来的军事后果，康熙帝晋封察哈尔部首领布尔尼为亲王，位列内蒙古四十八旗王公之上，抵御可能来自于西蒙古准噶尔部的入侵；同时，在东北地区仅以驱逐等保守策略应对罗刹彼得一世在远东的扩张。在整体军事实力上，自清廷定鼎北京后，八旗兵力总数约为20万人；绿营兵曾一度达60余万，后经裁减，只剩下20余万。因此，在康熙初年，清廷总兵力约在40万左右。
三藩形势.之前，清廷为方便与南明作战，将云南军政全权交