喀什噶尔河流域由克孜河、盖孜河、库山河、依格孜牙河、恰克马克河、吐曼河、布谷孜河等7条组成。年均径流量45.9亿m，总人口250万，灌溉总面积511万亩，其中耕地371.5万亩。流经乌恰、疏勒、伽师、巴楚、阿瓦提等县，最终流入塔里木河。上个世纪因截流至巴楚县的阿纳库勒水库，其下游已经干涸，从农一师3团起原河道成为自然排碱渠，水量不大，但常年有水。全长1200公里，平均宽度40米。新疆维吾尔自治区人民政府新政函[1990]78号文件批准，1991年1月设新疆水利厅喀什噶尔河流域管理处，为流域水行政管理部门