中大工学院下设建筑工程、土木工程、电机工程、机械工程、航空工程、水利工程、化学工程7系，医学院下设临床医学、生理、药理、病理等学科。
院系调整时期（1949‒1952）.1949年1月，南京国民政府的失败已经成为定局，中大校长周鸿经奉命迁校。但中大教职工普遍对国民党丧失去信心，多数教授决定留在南京。周鸿经弃职离校后，中大在共产党地下组织的主持下先后组成应变委员会、临时校务委员会维持校务、保护校产，准备迎接中国人民解放军入城。4月1日，南京爆发反对国民党政府的学生游行，遭到军警镇压，