定入住养和医院，并于当晚接受割肠手术，惟手术后一直陷入昏迷状态，最后在6月19日上午九时因为动脉出血流入腹腔逝世，终年85岁。据了解，邓肇坚腹痛前的身体状况仍显得非常正常，他除了在去世三星期前出席公开场合，捐赠25万港元予消防处福利基金外，亦曾与朋友到澳门旅游，并在6月17日上午才返抵香港。不过，邓肇坚在出事前数天曾在会所门外绊倒，可能是病发前的先兆。邓肇坚身后，当日的圣约翰救伤会週年大会在港督带领下全场默哀，而东华三院、九巴及恆生银行都参与了治丧工作。邓肇坚在6月24日于香港殡仪馆出殡，当日各界出席