下三十名骑兵捉拿崔器，崔器于是向北逃到灵武。崔器一向和吕諲相互友善，吕諲引荐崔器出任御史中丞、兼任户部侍郎。崔器又跟随唐肃宗李亨前往凤翔，加礼仪使。唐军收复二京后，崔器出任三司使。崔器起草仪注，唐肃宗车驾回到西京长安，崔器命令陷落叛军的官员都站立于含元殿之前，脱帽去鞋，捶胸叩头请罪，以持刀卫兵环绕他们，又让扈从唐肃宗的百官都来观看。等到东京洛阳收复，崔器又命令陈希烈以下数百人依照长安的样式请罪。崔器性格阴险刻薄幸灾乐祸，又残忍少恩，迎合唐肃宗的旨意奏请将陷落叛军的官员全部依照法律处死。唐肃宗将要听从崔器