36年回国，在上海国立音乐专科学校任教。抗战期间，历任广西省艺术师资训练班主任、励志社管弦乐团指挥，中训团音干班副主任、国立女子师范学院音乐系主任、国立音乐院院长等职。在国立女子师范学院(原校址在重庆白沙镇新桥)任教期间，1942年3月29日，黄花岗七十二烈士殉难纪念日，由白沙音乐教育促进会与教育部音乐教育委员会合作，借驴溪半岛江津师范学校场地，举办了「中国音乐月万人大合唱」。由卢前撰写《白沙镇歌》歌词，吴伯超指挥，这是中国音乐史上第一次万人大合唱。1949年1月27日，乘太平轮前往台湾为国立音乐院