织制造业牵涉的制作过程，往往需用上高温和有害溶剂，更会产生污染物。就上述步骤进行细胞工程将可以引伸出一系列程序，其中一些更可以在室温的环境下进行，最后不会产生有害的副产品。
农业.现时，合成生物学获应用于植物工程学，将有助科学家设计一系列能带来更丰硕收成、具抗病能力，及能抵抗极端或恶劣环境的农作植物品种。
制药业.可重新改造细菌及酵母，达致低成本制药的目的，例如採用经基因重组的细菌生产抗疟疾。上述过程将有效大幅降低生产成本，从而将药物推广于发展中国家的庞大