校学生人数日渐增多，菩提国中与菩提独中虽各有其教室及办公室，但运作上总是诸多不便，加上原有的校地已不能再扩建，董事会深谋远虑，决定将国中迁至槟岛西南县。
迁校至西南县.2007年，菩提国中获得教育部所发出的迁校准证，以迁至槟岛东北县南部，临近西南县的双溪赖。同年8月22日，在诸位法师长老、董事会主席陈火炎先生与董事会成员，以及捍卫华教人士的见证下，由时任槟州首席部长许子根先生按下电钮，打下了第一桩地基支柱。2008年，莫钧发校长荣休，同年年底由赖文祥先生接任校长一职，而当中的空