巴里切罗宣布将在2006年转投本田车队，谣言臆测与法拉利时期巴里切罗受到的差别待遇有关。2006年赛季初期，巴里切罗的表现明显差于队友詹森·巴顿，他表示本田赛车的特性与他的驾驶方式不符合是主要原因，尤其是煞车系统。在对车辆做出调教之后，情况开始好转，摩纳哥大奖赛有机会成为巴里切罗在加入本田车队后首次站上颁奖台，但是在维修区的超速让他被判罚再次通过维修区，最后以第四名结束比赛。中国大奖赛巴里切罗在第三位起跑，优于麦可·舒马可和奇米·雷克南。赛季最终他一共获得30分排名第七，低于队友詹森·巴顿的56分。Se