得以亲政。不过随即阮有整攫取了大权，并与统治南河的西山朝就乂安之地发生领土冲突。翌年，阮惠再度北伐，杀阮有整。黎昭统帝向清朝求救，清朝于1788年发兵攻打西山朝，初期取得胜利，但其后被西山军大败。最终阮惠主动向清朝请和。昭统帝便流亡清朝，后黎朝灭亡。阮朝建立后，嘉隆帝册封后黎朝宗室黎维为延嗣公，主后黎朝祭祀；郑氏宗亲郑楈主郑主祭祀，以安抚北城之人。