鲜色衣服，以区别他人，他生气地说：「你们这些县吏，怎可以自比为贵人？」命令他们着粗布衣服，终日站着服侍，失足跌倒就拷打。他年幼时曾经低下，被富人羞辱，因此报复，让是人民埋怨，但他清廉奉公，因此能这样做。之后朝廷北伐，征任他为建威将军，管理运漕，不久兼官都水使者，很快就改任少府卿，外任安南长史、寻阳太守。江州刺史曹景宗病重，让他代理府州事，到曹景宗逝世，沈瑀改任萧颖达的长史，依然任职太守。他个性倔强，经常不不顺从萧颖达，萧颖达怀恨在心。天监八年（509年），沈瑀入府谘事，言辞激厉，萧颖达发怒：「朝廷用你做事啊