日举行的第12届国会大选中，却以九千多票之差败给了行动党新人拉马沙米，民政党也遭到创党以来最大的败绩，和马华公会一起在槟城全军覆没。这是槟城政权继1969年之后第二次易手。选举后，许子根大方的召开记者招待会承认败选。3日之后的3月11日大方的出席民主行动党籍的林冠英宣誓出任第4届槟城首席部长，并向对方祝贺。然而选举后，许子根曾经宣告天下不会接受成为受委国会上议院议员身份当上内阁部长。虽然如此，许子根仍然在2009年4月获国阵领袖推荐出任国会上议院议员，受委入阁出任首相署部长，主管团结及表现指标等事务