凤山寺有轴向布局、庭院、有围墙的附属建筑和梁架结构，且不用钉子建造，表现出了卓越不凡的木工技艺。主厅的屋顶是一个两层的歇山顶。屋嵴的中央有二龙戏珠的雕塑。下层屋顶的末端为闽南建筑中常见的螺旋形。寺庙的大殿向前面的露天庭院开放。大殿中央为供奉广泽尊王的祭坛，长度为九米，两侧的二级祭坛分别供奉城隍和玄天上帝。庭院两侧有带盖的走廊，走廊另一侧为寺庙的侧厅。此外，大殿的后面的祭坛还供奉观音、感天大帝、清水祖师等众神佛。大殿有六根黑色实心木柱，在中间轴上呈凸形，且有雕刻的花岗岩底座。黑柱上有新加坡书法家潘寿（）的