时，正赶上台湾的民主浪潮，郑丽文开始投入学运，曾参与野百合学运、担任国立台湾大学大学论坛社社长、新生代国家安全论坛召集人等，积极参与民主进步党领导的街头游行活动。大学毕业后，加入民主进步党，郑丽文出任台湾人权促进会秘书长。1996年代表民进党当选第三届国民大会代表，参与了当时的修宪活动，1999年任民进党国民大会党团副总召集人。2000年国民大会虚级化后，郑丽文担任民进党青年部副主任，后期与陈水扁领导的民进党理念发生落差，郑开始在媒体上批评民进党，并辞去青年部副主任一职，与民进党主流渐行渐远。200