第三次会议通过《中华人民共和国香港特别行政区基本法》，由国家主席杨尚昆签署中华人民共和国主席令正式颁佈。1997年后，香港特别行政区政府和建制派配合中国共产党的各种政策和措施，引起了部分香港本土派的不满。一些香港人宣称，中国共产党和香港政府涉嫌轻视“两制、港人治港”，认为香港政府涉嫌将大陆人利益放在港人利益之上，削弱港人地位和公民权利。2012年梁振英上任香港行政长官后，推行港深两地融合的政策，使香港成为深圳最大贸易伙伴，并在经济、教育等多个领域加深合作。但此举遭到部分「本土派」香港人指责，认为其不