包头龙的整个头部及身体都覆盖者鳞甲，这些鳞甲以带状排列，仍保持一定的动作灵活性。在甲龙科中，牠是首个化石与其鳞甲一同被发现，这些鳞甲更可以覆盖其眼睑，骨质眼睑可以上下开阖。头颅顶部有不规则鳞甲，覆盖住其他恐龙所拥有的头部窝孔。每一个鳞甲带是由嵌入于厚皮肤内的厚椭圆形甲板组成，皮肤佈满只有10-15厘米的短角刺（像鳄鱼），沿者背部排成数列，横向之间则有区隔带。除了身体的角刺外，包头龙的颅后也有短、宽的尖刺。牠的尾巴末端是一个骨质的尾槌。尾巴有发达的肌肉，可以随意的向两边挥动尾槌来防卫。在重装甲之下