所经过的都道府县承担。过去，由于法定的建设主体和运营主体都是日本铁道建设公团和日本国有铁道，并不需要进行各阶段的协商，而只需要根据国家的决策推进。后来在国铁改革时变成了现在这样。2011年（平成23年）5月20日指定建设、营业主体的中央新干线，东海旅客铁道（JR东海）不仅是营业主体，还是建设主体。这是本法制定以来第一次将建设主体指定为JR本体。JR东海当时表示，建设经费将来源于希望设置站点的地方自治体和JR东海本身的自主资金。