大陆政权后，大量在香港、台湾以及五口通商的城市流动闽南人口向台湾、香港以及南洋移民。明清两朝，闽南人开始大量向海外移民、殖民并且经商。除了向更南方的广东移动之外，也大量地往台湾、菲律宾、印尼与马来西亚迁移。由于台湾地理位置最为靠近，又加上施琅颁布的渡台禁令禁止粤人入台，使得闽南人成为台湾的主体族群。来到台湾的闽南人及后裔重于经商，开创了郊商文化。整体来说，闽南民系于汉朝开始初步形成，晋朝到唐朝为大量人口迁入福建而成为现今闽南民系的主要成份，明朝到清朝则是闽南民系向广东、台湾扩散的时期，清末以及民国则