到不安者亦所在多有，于是双方结合谋图对付菅原道真；昌泰2年（899年），道真升任为右大臣并兼任右近卫大将。次年，文章博士三善清行建议道真应该知足退隐享受人生之乐，但不被道真接受。901年，他升任从二位，但却被诬告意图帮助齐世亲王簒夺皇位因而获罪，被眨为大宰权帅，流放至九州太宰府。宇多上皇闻讯意图阻止但未能成功。以长子菅原高视为首的四名子女皆被处以流刑（是为昌泰之变）。菅原道真于903年在太宰府病逝、并葬在当地（现在之太宰府天满宫）。
历任官职.※日期为阴历Section:::