陈朝于1226年（建中二年），派陈守度击破伞圆山及广威山诸蛮，阮嫰亦于1228年（建中四年）农历十二月消灭段尚势力。次年（1229年，建中五年），阮嫩病死，其割据势力瓦解，从此「天下归于一」。除地方乱事外，王室内部曾发生太宗之兄陈柳的叛变，事缘太宗之后李佛金无子，陈守度改立陈柳之妻顺天公主（李佛金之姊）为太宗皇后，引起陈柳不满，乃于1236年（天应政平六年）在大江起兵，但旋即被陈守度所平。陈太宗提出和解，安抚陈柳，并处死参予事件的大江乱兵，事件遂告平息。太宗时期除解决内部纷争，又着手整顿政务。1228年