941年，升任国民革命军第十一集团军总司令兼昆明防守司令。指挥滇西缅北战役，在滇西惠通桥击退日军第五十六师团，接回从缅甸撤退之中国远征军残部。1944年5月，宋希濂第十一集团军为左集团军，渡过怒江，进攻日军盘踞之龙陵、松山地区，包围、歼灭两处日军，打通滇缅公路，因而获得青天白日勋章和美国自由勋章。
国共内战时期.
新疆时期.1946年10月，宋希濂被委任为新疆省警备总司令。在新疆期间，宋希濂与西北行辕主任张治中、陶峙岳将军等配合。先是1947年6月5日激战北塔