，1900年5月开始申请台南城壁贯通认可 ，并配合铁道的开发申请今北门路的道路开通许可。1900年6月总督府同意铁道贯通台南城壁之铺设 ，成为台南因城市发展而拆除城墙的首例。
第一代车站.第一代台南驿（台南停车场）为木造建筑，于明治33年（1900年）5月15日落成，明治38年（1905年）小幅增建。启用当时，仅开通台南＝打狗（高雄港车站前身）。时任总督儿玉源太郎特地到打狗乘车至台南。翌年铁路向北推向至湾里（善化），此后分段通车，直至明治41年（1908年）纵贯线全线通车。由于木造