the Moon）和藏骨集团的故事。艾伦于是下令摩根航向新世界，寻找月之湖。然而，摩根却在路上遇到海盗莉丝·兰西（Lizzie Ramesy）的袭击而被逼流落加勒比海的岛屿。经过复原及战斗后，莉丝被击败了，摩根的人马亦找到了一些航海图，引导他们安全航至墨西哥。在中美洲，摩根再次遇上寻找着月之湖的夏伊和鄂图曼人，并成功摧毁了鄂图曼人的基地。不过，却是西班牙征服者第尔卡多（Delgado）俘虏夏伊等人，摩根逼于无奈下与西班牙人开战。西班牙人攻击了摩根的新盟友阿兹特克人，在防卫阿兹特克人的战斗中，摩根击败了对