到拉萨，结束了他多年的流亡生涯。2月14日（藏历水牛年正月初八日），他发表「水牛年文告」，正式宣佈解除与中国皇帝之间的「供施关系」，并宣佈实行体制改革等新政。这份文告被部份学者认为是「西藏独立宣言」。在掌握西藏大权之后，他着手推行西藏的现代化进程，改进了货币、邮政、电讯设施等，强化了西藏地方军事力量，创办了藏医院。1912年底，西藏成立自己的中央银行（欧康），推出了第一套纸币，又推出了第一套邮票。1918年，他下令把藏军军旗雪山狮子旗确立为西藏国旗。1913年，在大昭寺旁建立了西藏历史上第一个现代化的藏