于作为首号代表的张献忠的研究，只能作正面的评价。因此部分学者在摘用《圣教入川记》时只引用有利于对张献忠的的评价，对教士对献忠的疯狂性格，滥杀无辜的负面报道则尽量回避或淡化，反映政治正确性对历史的研究的严重影响。
西方学者的研究.美国汉学家和历史学家费正清教授说：「从1644年夏天起，西南三省四川、贵州和云南发生了一系列次要的戏剧性事件，影响到永历朝廷最后10年的进程。主要起义领袖之一的张献忠，在崇祯时期没有被李自成消灭或吞并，1643年在湖广中部第一个称王。1644年，他率部入川，