监狱的教诲师表达对南京大屠杀与下属的不满，并将这些暴行归咎于日军在日俄战争后道德衰落，松井说道：1948年12月22日晚，远东国际军事法庭开始执行死刑，松井作为最年长者，被死刑犯们要求带头向皇居方向行礼、大喊三声「万岁」，接着众人便前往绞刑架，松井与东条英机、武藤章和土肥原贤二为第一批受刑人。1948年12月23日清晨0时1分30秒，执行官开动了绞刑架下的踏台，松井受绞11分30秒后断气。松井死后，遗体被送往横滨久保山的火葬场火化，美军将其骨灰装箱扔入东京湾内，以防有人以此立碑纪念。然而，现场还留有少量骨