阿伊努人的土地，同时还将这些土地拨给新迁入的日本移民，以便鼓励这些新移民对北海道的开拓工作。1869年(明治2年)，北海道总人口为58,467人；1901年(明治34年)，北海道的人口就超过了100万人，该地的原住民阿伊努人在自己的土地上成了不折不扣的少数民族（Thomason 1999）。明治时期的日本政府，对阿伊努人进行种种的同化，阿伊努民族长期以来的生活习惯都受到官方的禁止，成为和人眼中的「旧土人」，被迫强行接受「日本人」的生活习惯。1899年，日本政府制定北海道旧土人保护法，在这个时候，阿伊努人