注释.虽然识别DNA序列内的开放阅读框简单明了，但识别编码序列却并非如此，因为细胞只会把所有开放阅读框的一部分翻译为蛋白质。目前CDS预测通过对细胞mRNA取样测序完成，但要判断给定mRNA究竟哪一部分实际翻译为了蛋白质，目前仍是问题。CDS预测属于基因预测的一部分，后者不仅包括对编码蛋白质的DNA序列预测，也包括对其它功能元件，如RNA基因和调节序列的预测。