线以本站为终点，但与以本站为起点的东叶高速线、以及JR总武线各站停车（仅平日早晨尖峰时刻）相互直通运转。东西线与总武线直通电车在本站的东京地下铁月台发车。JR总武本线快速线（总武快速线）不停靠本站，也未设月台（但站内保有月台设置空间。）。1991年（平成3年）10月，县府在千叶县议会表示「总武快速停靠「西船」有困难」。2007年（平成19年）第2回船桥市议会定例会中，该市企划部长表示「千叶县与沿线市町村希望JR让西船桥站停靠总武快速线」，但现在JR东日本并无进一步动作。
车站构