学研究兼教育单位，也是唯一同时培训人类学学士、硕士和博士的教育单位。其源于1929年所设立的「台北帝国大学土俗人种学讲座」，在日本学者移川子之藏等人主持下，该讲座收藏大量民族学与考古学标本与照片。1949年国民政府迁台以后，中央研究院历史语言研究所研究员李济根据这些收藏结合史语所于中国大陆的考古学研究与民族学研究，创立「考古人类学系」。在此之后，该系所长期和史语所以及中央研究院民族学研究所紧密结合，主导台湾人类学与台湾考古学发展，并培育出许多相关领域学者与专业人员。1956年该系设立研究所，1982年在当时