牙国王桑丘四世（）在埃纳雷斯堡建立了一所综合学校。1499年，教宗亚历山大六世同意西斯内罗斯枢机的请求，在综合学校的基础上建立一所完全大学，并发布教宗诏书以学校所在地埃纳雷斯堡的拉丁语名称（）为该大学命名为马德里孔普鲁腾西斯大学（）。1836年学校搬到马德里。1850年，合并一些院校后更名为马德里大学（），也叫中央大学（）。1970年恢复原名。
校区.马德里康普顿斯大学大学目前是西班牙规模最大的综合性大学，有两个校区：一处位于马德里大学城；一处位于波苏埃洛·德·阿拉尔孔近郊。Se