道南昌街的名称是来自香港开埠初期的富商陈南昌先生，但有香港史爱好者反驳指出南昌街命名时陈南昌才7岁，故「南昌」不可能是指陈南昌。
建造.南昌站原址是深水埗码头，因香港机场核心计划而填海造地。车站于2000年10月5日动工，由九广铁路公司兴建，车站的土木工程（建筑工程）由九广铁路公司负责，而机电工程则由地铁负责。
启用.南昌站于2003年12月16日配合九广西铁试搭日而率先试用，并于2003年12月20日九广西铁全线通车时正式启用。