8月10日，南区大恩里出现第一位死亡病例，12日中西区安海里出现第二例死亡。25日，市政府再公开死亡已超过一週的两名病例，皆来自北区。8月下旬，台南市已累积超过两千名确诊病例，感染人数快速增加，其中以北区最为严重，次严重疫区则包括中西区、南区、永康区、安南区。台南市部分零售市场从8月起强迫休市。8月底，登革热确诊病例突破3000例。国军于8月11日至9月14日间，派遣兵力2,751人次，进入台南、高雄疫区进行防疫工作，但疫情丝毫没有减缓的迹象。9月初，台南市确诊病例数已达五千例，前疾管局长苏益仁、涂醒哲等多