年，刘曜在多次战败之下只好撤出长安，贾疋收复长安，并请司马业入城。并于数月后称皇太子，建立行台，由护送司马业入关的阎鼎总管各事。当时麴允妒忌阎鼎之功，亦意图参与政事，于是借京兆太守梁综与阎鼎争权被对方所杀的机会与索綝等人联手攻伐阎鼎，逼其出走。同时，雍州刺史贾疋在讨伐叛胡时被杀，麴允于是继位雍州刺史。建兴元年（313年），晋怀帝于平阳被杀，司马业即位，是为晋愍帝，并以麴允为尚书左仆射、领军、持节、西戎校尉、录尚书事，继续任雍州刺史。愍帝即位不久，汉国将领刘曜、乔智明和赵染等人即进攻长安，麴允奉命到黄白城