线、筑波快线是东京都的两条第三部门重铁路线。除了上述的重铁路线之外，东京都还拥有连接东京都心的和羽田机场的东京单轨电车；多摩地区西部的南北向交通动脉多摩都市单轨电车；前往临海副都心的重要交通方式百合鸥号；东京都北部的日暮里-舍人线；东京唯一公营路面电车荒川线；唯一私营路面电车世田谷线等中运量铁路交通系统。
巴士.都营巴士是东京都区部主要的巴士业者，由东京都交通局运营。2019年时，都营巴士共有130条路线，营业里程740.6公里。2018年度，都营巴士的日均乘客数约有63.9万人。