第二类主要组织相容性复合体.第二类主要组织相容性复合体由一个α链和一个β链组成，两个链都穿过整个细胞膜。在细胞外这个分子有四个区（α1、α2、β1和β2），其中α1和β1组成一个凹坑。第二型主要组织相容性复合体比第一型主要组织相容性复合体稍大些。只有吞噬性的细胞（比如吞噬细胞）的表面有第二型主要组织相容性复合体（第二型人类白细胞抗原）。在巨噬过程中被溶酶体分解的蛋白质的肽被粘在第二型主要组织相容性复合体的结合位中。这个型的分子又可以下分为HLA-DP、HLA-DQ、HLA-DR、HLA-DN和HLA-DO