。由于玉名市是九州新干线沿线人口较少的城市，因此在本站停靠的列车并不多。除了极少数班次的樱号（）列车会停靠外，只有负责九州新干线每站皆停的燕号（）会在本站停靠。
车站构造.新玉名是一个站内设置有相对式月台一对、两条乘车线的高架车站。为了配合不停站的列车班次高速穿过站内时之安全考量，因此设置有月台幕门。