澎湖厅长是台湾日治时期明治三十年（1897年）～大正九年（1920年）以及大正十五年（1926年）～昭和二十年（1945年）间澎湖厅（今澎湖地区）的地方首长。本项包括辖域与澎湖厅相同的澎湖列岛行政厅、澎湖岛厅和高雄州澎湖郡之地方首长。