幅差距败给人称「花莲王」的傅崑萁，长达十年的经营仍不敌傅崑萁强大的基层实力与五星级县长民间声望，得票退至十年前的四成余，仅在丰滨乡以非常些微差距胜出、得票在民进党曾执政的花莲市和吉安乡亦落后，最终无缘连任。卸下立委职务后，2月初陪同中华民国副总统当选人赖清德访问美国，是断交41年以来台湾方面派出的最高层级访团；同月底，服务处正式熄灯关闭。6月21日，选后5个月余正式全面结束整整10年在花莲的经营，准备赴美履新。
关注西藏人权.2012年6月，萧美琴表示世界各国的国会都有成立图博之友