战死者约12,000人，美军战死者约1,020人、受伤5,565人。平民老百姓死伤约100,000人至150,000人之间，约为当时马尼拉人口数的10%。战后成为菲律宾总统的埃尔皮迪奥·基里诺，妻子与5个儿女中的3个都在屠杀中遇害。日后在韩战期间菲律宾政府对日本提出80亿美元的战争赔偿遭到日本拒绝后，基里诺立刻在1天之内下令将14名日本战犯处决。屠杀倖存者成立“铭记马尼拉1945基金会”，举办纪念活动，要求日本政府承认日军暴行并正式道歉，不要篡改历史。