史书及《元史》、《新元史》，考定：「蒙元世祖远征日本因风失败，迂回台湾，道经澎湖设治澎湖，企图进取台湾，作为征日本之准备。」该地原于南宋隶属于晋江县，曾遣兵戍守澎湖。到元朝时该地方区划隶属于元朝福建行省泉州路，主官为澎湖寨巡检。而澎湖寨巡检是元朝于澎湖群岛设置的官职，也是澎湖群岛首度设立正式的地方统治官署（前澎湖列岛归属于晋江县）。驻于澎湖马公的巡检官职，是元朝最基层的官员，隶属于福建泉州路。而1366年尚在任的澎湖寨巡检陈信惠是元朝首位驻澎官员。
明朝澎湖巡检司.1370