清华在台复校后首次招生，因校舍还未完工，以国立台湾大学为上课地点，至此清华校务在台正式运行。1957年，清华在新竹的教学大楼、办公大楼、教职员工宿舍、学生宿舍等相继完工，学生于是返回新竹上课。1961年原子炉兴建工程完工，此原子炉土木工程部分由校友华泰建筑师张昌华负责设计，机械装置则由中油、台电、台湾铝业公司分别派员操作，并得到经济部联合工业研究所的协助，是台湾第一次由产官学界共同完成的成果。1962年5月19日，梅校长病逝于台大医院后，校务暂由教务长陈可忠代理，1965年陈可忠正式担任校长，在其任内增