胚虫目与直泳动物门一同分类在中生动物门中。不过，分子种系发生学显示二胚动物门应该较为接近线虫动物门。二胚虫目可以细分为Conocyemidae及二胚虫科。
结构.菱形虫门长约0.1—9.0毫米，在显微镜下可以清晰看见。它们的细胞数目恆定，约有由20-30个细胞组成，故很轻易分辨。外层是单层的具有纤毛的体细胞，包围着中央的轴细胞。前端有一个极帽，可以将它们连接在寄主的肾附属物表层上。
生命周期.菱形动物门同时有无性繁殖及有性繁殖的形态。前者多在幼生及未成