松果腺主要由松果腺细胞与其他已确认的四种细胞所组成。松果体受到来自颈上神经节的交感神经支配。然而，也受到来自翼颚神经节与耳神经节的副交感神经的支配。甚至有一些神经纤维经由松果体柄穿入了松果体内(主要的神经支配)。最后，在三叉神经节的神经元则以含有神经肽类物质「脑垂腺苷酸环化酶活化肽」(PACAP)的神经纤维来支配松果体。人类的松果体小囊包含了一种大量变异的沙砾状物质，名为脑沙(corpora arenacea，或名为「acervuli」、「brain sand」)。化学分析显示脑沙是由磷酸钙、碳酸