胡明复不幸溺水身亡，终年36岁。当时胡明复既是社董，又是会计和编辑，同时还到处奔走筹款与募捐。1929年9月，中国科学社在上海亚培尔路（今陕西南路）购买土地，建造新的图书馆，其也成为中国第一座采用新式设计的公共图书馆。图书馆落成时，蔡元培提议以胡明复之名命名图书馆。故而将该馆命名为“明复图书馆”（今明复图书馆之明复楼），以示对中国科学社创始人胡明复的纪念；而蔡元培在开幕式上也致辞称：1931年1月1日，该馆举行开馆仪式。马相伯不顾风寒，赶到会场；蔡元培在开幕式上则盛赞该馆是“合乎科学装置的图书馆”