其他中生代恐龙而非现代鸟类，如尖利牙齿、三指爪、长而有骨骼的尾巴、伸长的第二指、羽毛、以及许多骨骼特征，显示它和驰龙科或伤齿龙科非常接近。这让始祖鸟成了恐龙和鸟类的过渡化石，对恐龙和鸟类演化的研究都非常重要。
南方古猿.人科的南方古猿是二足行走的人类和四足行走的猿猴的过渡。南方古猿的许多型态都显示二足行走，以致于许多研究人员认为二足行走可能在南方古猿那之前已经演化了一段时间。在解剖学形态上，骨盆较像人而不像猿猴：髂骨短而宽，骶骨宽，位在股关节后，并且有明显的股直肌。除此之外，股骨自