仙游文庙最早建于唐朝开元年间，其位置位于清源县城西侧。北宋咸平五年（1002年）时，仙游文庙搬迁至今址，并建有大成殿、明伦堂及其东西两侧的日新亭和中鹄亭，此时明伦堂位于大成殿北侧。北宋宣和七年（1125年），儒学一度被废，仙游文庙被挪用做地方军器制造所。南宋绍兴九年（1139年），仙游文庙得以重建，并先后于干道年间和淳熙年间得到重修。嘉定年间，仙游文庙修建了大成门和乡贤祠。元代时，仙游文庙一度遭到山贼毁坏，至正二十年（1360年）时重建大成殿，并重新塑造了孔子四配十哲的塑像。明代洪武元年（1368年），大殿