在日韩合併后的朝鲜南部小镇、庆尚南道的山清郡出生，本贯咸安尹氏。1935年，他前往日本本土的大坂学习大提琴和乐理及东京修读作曲及对位法。回到朝鲜后，曾因为参与反日运动而被逮捕。其后，他成为音乐老师。二战后，韩国独立。1956年，尹伊桑前往法国留学，再移居西德。1959年，他所写的《7种乐器的音乐》得到世界的注目，其作品开始为世界所认识。1967年他50岁时，前往东柏林演奏，发生东柏林事件，他被递解出境，并被韩国中央情报部（现国家情报院）特工移送往韩国，遭到逮捕、拷问。当法庭宣判尹伊桑终身监禁的消息公布后