为孔庙建筑群中层级最高的建筑。建立于台基之上，由十二根柱子与三面承重墙支撑，而除了点金柱与南面中央两根外，其余的柱子都是附壁柱。屋顶为重檐歇山顶，正嵴中央有九层宝塔，两侧有及双龙及藏经筒。殿前有祭孔时跳佾舞的露台，台前为御路（螭陛），台基角落有排水用之「螭首」。殿内中央供奉孔子之神龛，两侧供奉四配（颜子、子思、曾子及孟子）及十二哲（闵子鶱、冉雍、端木赐、仲由、卜商、有若、冉伯牛、宰我、冉有、言偃、朱熹），上方则悬有清代以来自康熙至光绪皇帝与中华民国自-{zh-hans:蒋介石;zh-tw:蒋中正;zh-hk