根据条约，邦联平常由一个宪法权力的组织管理，但邦联各邦国都拥有独立的主权。 邦联亦是一个军事同盟：各邦国有义务向拿破崙提供一定数量的军队助战。作为回报，统治这些邦国的王公将被给予较高地位：巴登、黑森、克莱韦和伯尔升为大公国，而符腾堡和巴伐利亚则升为王国。其他邦国亦可以与其他前神圣罗马帝国的邦国合併而得到扩展。1806年10月14日的耶拿会战普鲁士王国败于法国后，很多中小德意志邦国都加入邦联。1808年邦联达到最大的版图，包括3个王国、13个公国、17个侯国、及汉堡、吕贝克和不莱梅三个汉萨同盟城市。