灭绝的六千五百万年前之后不久之时，即古新世时。不过，有些分子钟的资料猜测现今的啮齿目早在白垩纪晚期就已出现，但也有其他分子差异的研究和化石纪录相符。到了始新世结束时，河狸的近亲、睡鼠、松鼠和其他类群开始出现于化石纪录之中。一开始是在劳亚大陆（以前北美洲、欧洲和亚洲还连接时的大陆），然后一些物种移居到非洲，形成了最早期的豪猪下目的物种。然而，在科学界里有一小部份的人认为由粒线体DNA可推测豪猪下目可能是属于不同的演化分支，因此应和啮齿目属于不同的目。从非洲，豪猪下目渡海至南美洲（在渐新世和中新世时独立的一块大