玮与总领事杨光泩等7人被日军拘留，受拷问酷刑，始终不屈。1942年4月17日，王恭玮被秘密押至马尼拉华侨义山，遭杀害。王恭玮的遗骸被1945年登陆菲律宾的美军辨认找到，因王氏身高1.86米，遗骸后移葬南京菊花台。王恭玮殉职时年仅22岁，是“抗日外交九烈士”中最年轻的。遗有妻室邵秀兰，1941年结婚，后居上海。二人无子嗣。