选安福国会衆议院议员。国民政府成立后的1929年（民国18年），他任蒙藏委员会驻北平办事处副处长。1932年（民国21年）10月，他任蒙古地方自治政务委员会察哈尔部保安长官。翌年8月，他任察哈尔省政府委员。1934年（民国23年）3月，他任蒙古地方自治政务委员会委员。1936年1月22日，德穆楚克栋鲁普以蒙古地方自治政务委员会的名义，将察哈尔左翼四旗及四牧群改设察哈尔盟，卓特巴扎普任盟长。1月23日，卓特巴扎普的好友尼冠洲（蒙古名尼玛鄂特索尔）遭日本人策划遇刺身亡。这导致卓特巴扎普被迫更紧密地同日本