于慈安邨1-3座在1996年起重建，学校需要搬迁。得何志豪捐助，于1995年迁往新蒲岗康强街30号原属启德官立小学的校舍，同时为纪念何志豪的父亲何寿南而易名为保良局何寿南小学。保良局何寿南小学本来为半日制小学，2002年落实转为全日制，上午校则迁往慈云山蒲岗村道学校村，并易名为保良局锦泰小学。校舍在2001年扩建，提供更多元化活动予学生。还有全日驻校社工为学生辅导。现时校舍用地曾于2002年分配予彩云圣约瑟小学作转全日制之用，当时预计于2007年开课，但最后邻近的前皇家香港辅助空军基地公屋项目（