未在一些低等动物，例如多孔动物门中，发现间隙连接。
结构.在嵴椎动物中，连接子是由连接蛋白（Connexin）组成的同构或异构六聚体。无嵴椎动物的间隙连接由无嵴椎连接蛋白（Innexin）构成，与嵴椎动物的连接蛋白之间没有明显的同源序列。尽管序列上存在差异，但无嵴椎动物连接蛋白在结构和功能上与嵴椎动物的连接蛋白极为相似，以至于可以宣称它几乎以相同的方式构成了间隙连接。（Pannexin）家族原本被认为也是形成细胞间通道的一种蛋白，但其实际上作为一个单层膜通道让细胞与胞外环境进行交流，