大悲赴南京，同何海鸣重振讨袁军，和张勋、冯国璋战斗十多日，终告失败。1913年，方觉慧曾游历内蒙古及外蒙古。
从日本到湖北.讨袁军失败后，方觉慧和第一师师长王献章逃往日本。1914年方觉慧入早稻田大学学习经济学。1914年，中华革命党成立，方觉慧加入该党。田桐偕方觉慧在东京见孙中山，商谈在长江发动革命。孙中山派田桐回湖北负责党务、军队，并派方觉慧为中华革命党驻汉特派员，提前回湖北组织中华革命党分部。方觉慧乃放弃学业，于1915年回到中国，潜回蕲春，将家中的田产作抵押，借银400两。