1939–40年香港甲组足球联赛，参赛队伍与上届一样，维持 11 支球队参赛。南华A夺得联赛冠军，东方连续两届获得亚军，南华B得到季军，是香港甲组足球联赛历来首次由华人球队包办三甲。本届高级银牌冠军，则由东方夺得，亦是该队历来首个重要锦标
联赛榜.若果有部分球队于联赛榜中取得相同分数，则根据有关球会的对赛成绩决定。而对赛成绩相同之排名方法，则根据下列次序排名：# 有关赛事的分数