院合并为福建农林大学。「福、师、农」并称福州三大校。根据21世纪初的统计，福州市有高等院校一共31所，学生共计13.5239万。目前福州着名的中学有福州第一中学、福州第二中学、福州第三中学、福州第四中学、福州格致中学、福州第八中学、福建师大附中、福州高级中学。福州市现时拥有一所筹备中的教育部直属重点大学——天津大学福州国际校区。当地的重要大学有福州大学、福建师范大学、福建医科大学、福建农林大学、福建中医药大学、福建工程学院、闽江学院等。乌龙江南岸的福州大学城建于21世纪初，福州多所大学的主校区位于其中。