发外界质疑是靠其夫顾立雄裙带关系之靠夫争议。王美花表示，「过去专业在智慧财产权领域，未来新增督导国贸局国贸业务，一定会有压力，希望能够赶快上手」。2016年9月再担任行政院经贸谈判办公室副总谈判代表。2016年10月，发生透过经济部行文所属单位替凯达格兰学校国策班招生，被国民党立院党团批评违反行政中立，党国不分，公器私用。对此，王美花本人澄清不知情。但据传她同时也是凯校的招生组组长。2018年5月，爆发日本大创违法进口日本核灾地区食品案，立委黄国昌爆料王美花一直找他关说此事，甚至要求「只要让大创罚钱