筑面积为12930平方米，设有5个出入口，分别通向红山南路、南京站及龙蟠路，于2005年8月12日启用。2014年6月28日，1号线北站厅重新开放，与南京火车站北广场、小红山客运站对接，北站厅设有换乘通道连接3号线部分。站台位于地下二层，设有一个分离式月台，供南京地铁1号线列车停靠。站台间设有2条连接通道。站厅设有南北两组楼梯通往南北两个站厅，换乘需从北侧的楼梯进入北站厅和换乘通道。
3号线部分.3号线站台位于南京火车站北广场地下，总建筑面积为47280平方米，深29.8米，是