开始动工，第一期管道长50公里，由东莞太源至深圳雁田水库，工程已于2003年6月正式启用。
污染.相比较先前港府自珠江口引水，东深供水工程避免了海水倒灌造成的水质威胁。但早期染问题亦；2004年，当密封管道落成一年后，环保组织绿色和平于3月18日至19日，分别在密封水管的入口地带抽取32个样本，在源头水样本中，大肠桿菌超标3,200倍、部分样本发现重金属如水银等，「污染程度犹如粪水」，化验由香港标准及检定中心受委托进行。其中，位于东江水起点的太园抽水站，每100毫升水中含有12