11年5月，他于报章撰写评论文章，指特区政府将内地推行了六十多年的国民教育定为香港中小学生必修科，是教育制造说谎下一代。吴志森作为香港电台节目主持，其被认为亲泛民主派的政治立场及言论，引起部分建制派人士不满，因此他多次受到亲中共传媒如《文汇报》、《大公报》、《香港商报》的点名抨击，评论称他身为官方香港电台节目主持，在某些事中，例如早前的「刘晓波获诺贝尔和平奖」、「毒奶受害者代表赵连海」等，他在节目中批评内地政府及制度，立场反共。吴亦常在报章撰文批评特区政府。不过与其他泛民主派传媒人相比，吴的立场尚算温和