鹿儿岛县县令因拒不向中央政府交税且积极为萨军提供资金援助而被逮捕，9月30日押至长崎处斩，同时处决的还有后藤纯平、坂田诸洁等响应西乡举兵的鹿儿岛士族首领。野村忍介等投降的萨军大队长一律判处10年徒刑，法庭并没有给他们申辩道义的机会。日本红十字会的先驱在鹿儿岛、熊本等地开设战地医院，一视同仁地收治所有受伤的官军、萨军以及平民。这一人道主义行为在当时却被征讨军总部认为是通敌，并将鸠野交付法庭审判。九州临时法院最终作出无罪判决，该判决书现存于鸠野家中。所有被判入狱者在1881年大赦获释，西乡隆盛于1889年大日本