998年初，从庞巴迪宇航公司购入两架CRJ-200飞机；1998年末及2000年又增购两架。2002年，庞巴迪宇航公司指定亚德里亚航空为其在欧洲首个授权大型维护中心，为其它航空公司的CRJ飞机提供维护和维修服务。2004年8月，亚德里亚航空获得国际航空运输协会的IOSA认证，是全球首批12家获得此项认证的航空公司之一。同年12月，亚德里亚航空以区域成员的身份加入星空联盟。近年来，亚德里亚航空的旅客运输量逐年提高，2006年首次突破100万人次，2007年达113.6万人次，2008年1-8月份已达9