不于9月下旬率主力转移至鲁西。1939年11月，萧华出任鲁西军区司令员兼政治委员，次年年初被选为鲁西行政公署主任，在鲁西开辟根据地。1940年7月，萧华率部击败国军石友三部。1941年12月起，肖华任第一一五师政治部主任，兼山东军区政治部主任，协助罗荣桓领导山东根据地的斗争，粉碎日军扫荡，并争取了四支伪军部队参加八路军。萧华还领导了山东地区的整风运动、精兵简政、开展“铁的模范党军活动”等项工作。
第二次国共内战时期.抗战胜利后，萧华率部渡海抢占东北，开辟南满根据地，任东满人民自