蛋白酶加工并分解为胜肽。这些加工过后的胜肽可以被送进内质网，是回到一些胞内体然后被MHC-1装载。现在科学家大多相信MHC-1的装载胜肽程序可以在内质网或是吞噬囊泡，像是细胞质路径的胞内体中进行。对在内质网进行MHC-1装载路径来说，外来抗原借由Beta2微球蛋白、、、等「胜肽安装酶」和「伴护蛋白」的帮助才能顺利装到MHC-1上。在胜肽安装完以后，MHC分子被运输出内质网，透过高基氏体，然后进入细胞表面进行交叉呈递。两种路径都可以在抗原呈现细胞中发生，而且可能会被蛋白酶体抑制剂和吞噬作用抑制剂等等环境因