国人民代表大会常务委员会香港特别行政区筹备委员会预备工作委员会主任。1995年12月，兼任全国人民代表大会香港特别行政区筹备委员会主任委员。1998年3月，卸任外长职务，70岁的钱其琛依然在朱镕基政府中，留任国务院副总理（排名第二位），并依然主导中华人民共和国外交及其他相关事务，亦主理港澳与涉台事务。1998年4月，兼任全国人民代表大会澳门特别行政区筹备委员会主任委员。2000年至2005年，还曾出任北京大学国际关系学院院长。2003年3月，75岁的钱其琛从领导岗位上退下来；后担任北京大学国际关系学院名