原属该公司所有的百选车站已废站。十和田观光电铁线已于2012年停驶废线，唯一入选的十和田市车站已废站。JR东日本的岩泉线已于2014年4月1日起正式废线，该线唯一入选的岩泉车站随之废站。实存车站总数只剩96个。
暂时停业车站.大船渡线的大船渡车站因东日本大地震导致站房及路线严重受损而暂停营运铁路，改为BRT暂时恢复交通。2020年4月起，BRT路段的铁路事业正式废止，BRT回归道路运送法的规范，大船渡车站不再是铁路车站而纯为BRT站。除了大船渡车站，多个入选车站亦因东日本大地震