帕巴拉活佛世系于16世纪初形成。藏历土羊年（1439年），德青多吉出生于工布日窝柱增地方。15岁时，德青多吉在宗喀巴的亲传弟子森巴青波曲帕前受沙弥戒，起法名为“帕巴拉”。帕巴拉活佛的名称便由此而来。德青多吉成为第一世帕巴拉活佛。第二世帕巴拉活佛帕巴拉·帕巴桑吉生于藏历火兔年（1507年），出生后不久便被认定为第二世帕巴拉活佛。第二世帕巴拉活佛是藏传佛教格鲁派中首位被云南丽江木氏土司正式邀请讲经的活佛。1594年（明朝万历二十二年），第三世帕巴拉活佛帕巴拉·通娃顿垫被聘为强巴林寺的第十四任法嗣堪布。自