瑞军进入爱沙尼亚。齐格蒙特在1600年宣称将爱沙尼亚并入联邦，这相当于对瑞宣战，这时联邦对摩尔达维亚地区的干预正处关键阶段。于尔根·冯·法伦斯巴赫被授予联邦军队的指挥权，此时他遭到被卡尔率领的大得多的瑞军压制，后者的快攻使得瑞典在1600年夺取了直到道加瓦河一带的利沃尼亚大部，除了里加。当地人那时对波兰-立陶宛的统治越发不满，因此他们很多都欢迎瑞军。但在扬·扎莫伊斯基带来更加坚实的军队后，瑞军便不断退缩至（不包括）雷瓦尔，其中，1601年，克雷什托夫·拉齐维乌在科肯豪森战役中取得决定性胜利。这支军队的大部