部以札幌作为运行端点。2013年，札幌站日均乘客数达93,152人。除了JR北海道之外，北海道还有三家铁路事业者。在钏路市经营有一条运煤的货运铁路。函馆市企业局交通部经营函馆市路面电车业务。札幌市交通局是札幌市营地下铁的经营者，现在札幌市营地下铁包括了南北线、东西线、东丰线三条线路。贯通日本本土的新干线亦有开进北海道，北海道新干线在2016年3月开通新青森至新函馆北斗区间，预计2030年末从新函馆北斗延伸至札幌。
公路.1870年时，北海道已有170公里长的公路。在19世纪末期，北