湾口岸港方口岸区的土地使用权，由香港特别行政区政府同广东省深圳市人民政府签订国有土地租赁合同，以租赁的方式取得，土地使用期限自口岸启用之日起至2047年6月30日止。经双方协商并按程序报经国务院批准，可提前终止土地使用权或者在租赁期满后续期。由于西九龙站内地口岸区港方每年只收取内地港币1000元的「象征式费用」，深圳湾口岸的香港口岸租金惹起争议，2018年8月，深圳市政府同意由2019年7月1日起下调每年租金至1000元。
港方口岸区属禁区.就《公安条例》（香港法例第245章）及任