099年，第一次十字军包围了耶路撒冷，一个多月后的7月15日，耶路撒冷被十字军攻佔。十字军进城后，屠杀了城内大多数穆斯林和犹太人，并在这里建立了耶路撒冷王国，穆斯林不准入城。1173年，一个来到耶路撒冷的人写到，耶路撒冷是一座小城市，充满了东正教教徒、亚美尼亚人、希腊人和格鲁吉亚人，只有200名犹太人住在城市的一角。1187年，埃及穆斯林苏丹萨拉丁又重新占领耶路撒冷。1219年，大马士革的苏丹下令将城墙销毁。1228年-1229年，神圣罗马帝国皇帝腓特烈二世组织第六次十字军东征，通过与埃及签定条约，