甲烷丝菌属（学名：），也称甲烷发菌属，为甲烷八叠球菌目甲烷鬃菌科的一属革兰氏阴性菌。分离于厌氧消化器。此属的模式种为宋氏甲烷丝菌("Methanothrix soehngenii")。