理工学院当了4年博士后的袁驷回到了清华大学任教。此后，他历任清华大学土木系教授，清华大学土木系结构力学教研组主任，清华大学土木系博士生导师、系主任。后来出任清华大学土木水利学院院长，教育部长江学者特聘教授，北京市海淀区第12届人民代表大会代表，中国土木工程学会第八届理事会副理事长。此后，他担任清华大学副校长、教务长。1989年，袁驷首次提出了“有限元线法”。1993年，他出版了世界上第一部关于有限元线法的英文专着。袁驷还于1992年研制出了FEMOL92通用程序软件。2003年，当选为第十届全国