本隧道为「花东线电气化暨瓶颈路段双轨化工程」改善项目之一，万荣＝光复间原有之第一代光复隧道为单线隧道且净空不足（后述），施作电气化时将难以维持营运，故须新建符合标准之双轨隧道。第二代光复隧道于2013年10月24日清晨切换路线通车。隧道内的轨道採用无道碴版式轨道，可容许电气化列车以时速130km/h高速通过。第二代光复隧道同样为河底隧道，路线约在第一代隧道东侧30公尺处平行布设，并改善北口路段曲线线型。隧道施工方法以明挖覆盖法为主，局部穿越堤防等部分採用钻掘工法施工。通过台9线下方路段的施工期间，公路一