。在义大利南部的内战和政治上的不稳定，使汤姆森很难和他在英国的同事保持联系。替他传讯的人被谋杀，这使他遗失了重要的通讯。结果是，在1804年，他的发现只在法国的"Bibliothèque Britannique"上发表。在1806年初，法国的拿破崙入侵那不勒斯，汤姆森被迫逃到西西里 ，在当年的11月，他在巴勒莫过逝，享年46岁。在1808年，汤姆森的工作再度在义大利被发表（从原始的英文稿翻译）于"Atti dell'Accademia Delle Scienze di Siena"。横扫欧洲的拿破崙战争妨碍