秘书长（）为政府机关、政党或非营利社团法人（NPO）中经常设置的高阶职位之一，通常为机关团体中的幕僚长，承组织首长（委员长、理事长、干事长、会长、政党领袖等）之命总管行政业务，并指挥监督所属职员，并可依状况设置副秘书长以辅佐秘书长职务。类似古代的长史、功曹等官职。若组织有秘书处、室则另有该处首长或秘书长兼任。秘书长一职的名称，可能随着各地的民情而有不同的称唿。立法院等民意机关内的党团则称为干事长、书记长，各级法院则称为书记官长，传统民营组织（例：农会）亦可能称总干事。在日本和韩国，则将秘书长称为「干事长