伟历任云南军区副司令员、昆明军区副司令员，同年被授予中将军衔，获二级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章。1957年毕业于南京军事学院，9月升任昆明军区司令员。1967年1月文化大革命时期，昆明军区瘫痪，第一政委、副司令员先后被批斗，秦基伟亦被扣“保皇派”、“走资派”等帽。春节将军区事务交由第二政委李成芳后，乘飞机到北京接受保护，旋被下放到湖南常德西湖农场劳改。1973年，秦基伟恢复工作，担任成都军区司令员。1975年10月调入北京军区，先后任第二政委、第一政委。1980年1月，秦基伟接任北京军区司