于颜的生平活动和另一位活跃于日本和台湾的大海商甲必丹李旦太过相似，曾有学者认为颜思齐并不存在，或为李旦的化名。后有学者找到崇祯八年（1635年）卢化鳌所着《太史李公居乡颂德碑记》，其中提到：「自天启壬戌以后，红夷与海寇颜思齐交讧……」以及明代官书《崇祯长编》载：「初，海寇郑芝龙先从海贼颜枢泉；枢泉死，遂有其众。」根据这些记录，认为颜思齐真有其人。另有学者根据荷兰东印度公司史料判断，颜思齐是李旦的二把手，负责李旦在台湾的活动和实际运作李旦的武装集团。目前关于颜的资料多来自具有小说性质的清江日昇《台湾外