便将蒋中正、孙传芳、汪兆铭、唐生智、张发奎及共产党等各路力量一一逐出中国政治中心，问鼎南京国民政府。新桂系主导国民政府期间，在军事上以自身系统为重心，并联合何应钦、程潜；在政治上平反西山会议派，恢复其党籍及党内领导地位。然忽略了党工、财政金融两项，未将陈果夫、陈立夫兄弟，宋子文、孔祥熙等人予以更换，使得中央党部、中央银行、财政部等要害部门仍控制在蒋中正手中，成为蒋日后复出的重要基础。
挫折与二次北伐.1928年初，蒋中正趁广州事变及“桂系排汪”造成的影响，得以复出。1月9日，蒋中正