中新世早期。已确定最早的化石纪录属于渐新世晚期的"Anatrachytherus"及粗型兽属。中黑格兽科于中新世达至多样化的顶峰，并一直生存至更新世中期。中黑格兽科是南方有蹄目中三个生存至第四纪的科之一。
分类.中黑格兽科在南方有蹄目内被分类在型兽亚目之下。事实上，型兽亚目是为印齿兽（即中黑格兽属的异名）来命名的。除了中黑格兽科外，型兽亚目传统上包含了其他细小的南方有蹄目。近期的意见认为要将古蹄兔科及黑格兽科加入到型兽亚目中。这两科以往分类在黑格兽亚目中，但系统发生学研究指若将牠们