九接下中国国民党主席一职，詹春柏出任国民党秘书长。2006年12月，马英九卸下台北市市长一职，为了专任党主席，所以有意改变个人风格，并且有意起用吴敦义为新任党秘书长，因此使詹先荣升副主席后，再命吴敦义接掌党秘书长一职。2007年1月12日，詹春柏与吴敦义交接党秘书长一职，但是其中过程并不十分顺利，詹春柏得知将升任副主席的消息乃经由传媒披露。事后国民党内有政要表示，马英九的行事风格应当再改善，否则党秘书长即将换人，党秘书长本人却不知道，容易影响到民众对国民党主席乃至于全党的观感。针对这一点，詹春柏表示个人