几种方法：
温度杀菌.水加热至少到70°C并维持三分钟。
化学杀菌.大多用氯，二氧化氯，氯化钠，次氯酸水, 次氯酸钙溶剂杀菌，在使用化学品之前必须先清洗水管。
紫外线杀菌.照射紫外线短波，波长254纳米可以使病菌无法活跃，但可能存在于变形虫里。为更有力的除菌可以再附加使用超声波。
薄膜技术.现在越来越多的使用薄膜来去除微生物。一般可以利用薄膜的微孔让直径大于的颗粒包括细菌，甚至部分病毒过滤掉。Secti