之间的重要市镇与中继站，诸罗县知县周钟瑄在康熙五十五年（1716年）设有茅港尾公馆。而由于茅港尾街在交通要道上，清朝时的民变多会波及到茅港尾街。林爽文事件时，梁朝桂领兵到湾里街（台南善化），茅港尾居民则组织义军，以天后宫与观音亭作基地，协助清军收复铁线桥与盐水港一带。事后梁朝桂感念妈祖庇佑与当地居民协助，奏请干隆帝嘉勉，于是在干隆五十五年（1790年）敕封「天后宫」，赐「神昭海表」匾与「护国庇民」诏书，且给予茅港尾妈祖到府城时可以「大北门进，大北门出」的特权。道光廿六年（1846年）天后宫进行重修，