基于以上两个原因，湄公河航运并不发达，上下游航运不能直通：通过湄公河委员会成员国的协调，湄公河干流及其若干支流的通航条件也已得到改善，可望成为全线通航河流。
湄公河的支流.湄公河的主要支流都比较短小，长度均只有数百公里，主要支流有南塔河、南乌河、南康河、南俄河、南屯河、邦非河、色邦亨河、蒙河、桑河及洞里萨河。自出海口起至缅甸、中国边界的主要支流如下：自缅甸、中国边界至源头（澜沧江河段）的主要支流如下：湄公河最大支流是起源于泰国境内的蒙河，该河发源于泰国呵叻府