东南马鲁古县（印尼语：Kabupaten Maluku Tenggara）是印度尼西亚马鲁古省的一个县，位于马鲁古群岛的卡伊群岛，主要辖除了图阿尔市之外的小卡伊岛、大卡伊岛和小卡伊岛西南的几个小岛。虽然在地理上图阿尔市辖境属于卡伊群岛，但是在行政区划上图阿尔市是独立于东南马鲁古县、与其平级的行政区。县治位于朗古尔。
行政区划.印尼议会1999年第46号法令将西东南马鲁古县从本县分出。东南马鲁古县下设11个区（Kecamatan）：