陈顼即位为陈宣帝，太建六年（574年）十二月十二日，陈朝任命度支尚书孔奂为吏部尚书。孔奂为官清正，性格梗直，敢于直谏，居官正直，选举不受请托。太建八年（576年）加侍中。当时始兴王陈叔陵在湘州，求宰相之职。孔奂说：“三公之职，本以德举，未必皇枝。”陈后主时，终官弘范宫卫尉。其子孔绍新、孔绍安、孔绍忠。有集十五卷，弹文四卷，已佚。今存诗作一首。