官齐州儒学教授、国子直讲。为湘潭县令时，“县出金矿，财货饶溢”。哲宗元祐年间，历官集贤校理，着作郎，国子司业。后拜为中书舍人。以宝文阁待制知洪州。绍圣三年（1096年），被免职，定居池州（今安徽贵池县），专心着作。约卒于哲宗绍圣末年，与兄孔文仲、弟孔平仲并称“三孔”。着有《书说》13卷、《诗说》20卷、《论语说》10卷、《金华讲义》13卷、《孔氏奏议》3卷、《芍药园序》及《孔氏杂说》等。