所发现的绳纹时代宫之平遗迹中就有发现可能是祭坛的环状石头结构。6世纪末推古天皇开始大力推广佛教，于是各地开始兴建佛教寺院，此时期之后吉野也开始出现多个寺院，吉野建于此时期的寺院包括：金峯山寺、、、、；其中知名咒术师役小角在吉野的金峰山修行时，创立了藏王权现，并结合了佛教和日本传统的山岳信仰，开创修验道的信仰。
平安时代.平安时代后，或许是平安京的距离较远，天皇较少来到吉野，但在9世纪期间仍有清和天皇、宇多天皇来到吉野拜访各寺院的纪录。役小角开创的修验道在平安时代初期一度断绝