对国家的认同也出现了危机。
清前期民变.
吴球事件.康熙三十五年（1696年），在台湾由吴球率七人反清复明，后来被清兵带回北京处死刑。
朱一贵事件.康熙五十九年（1720年），在朱一贵的领导下台湾第一次大规模民变。
清中后期民变.
苗民起义.从雍正时期一直到嘉庆元年，黔、湘地区的苗族人民发动的一系列反清起义。其中大起义三次，小暴动约二三十次。
大甲西社抗清事件.