管理的最高机构。明朝太祖元年（1364年），曾经依元制设立尚药局，其奉御是正六品，负责管理御用药物。洪武六年（1373年）置御药局（即自尚药局演变而来）于内府，御药局的奉御等官员均由内官、内侍充任。明朝嘉靖十五年（1536年）之前，称“御药局”或“御药房”，此后将御药房改称“圣济殿”，并且附设御药库（亦即生药库）。明朝以御药局（圣济殿）直接管理宫廷中的药物，和太医院相互配合。到清朝，以御药房管理宫廷药物，和太医院相互配合。