旗津贝壳博物馆位于中华民国高雄市旗津区旗津三路、旗津海岸公园游客中心二楼，以贝壳和螃蟹的收藏而闻名。
沿革.旗津贝壳博物馆于2000年9月11日在旗津海岸公园行政中心2楼成立。之后因为原址空间过小，高雄市政府于2009年对该馆进行改建，并迁移至现址。2011年10月，改建完成的新馆开始试营运。
特色.旗津贝壳博物馆馆藏贝壳种类超过2600种，展示约有2000多种贝类和约200种蟹类的标本（预定增加至3000种以上），5大天王贝壳全到齐，是台湾收藏贝壳种类最