979年8月3日，恩圭马被侄儿特奥多罗·奥比昂·恩圭马·姆巴索戈发动政变推翻，遭到逮捕。9月24日，军事法庭以种族灭绝、屠杀、侵吞公款、违反人权、叛国等十项罪名，判处其死刑并立即枪决。其妻1979年11月带领三名子女流亡朝鲜民主主义人民共和国，获得金日成的庇护。他的三名子女此后都在北朝鲜生活成长，均会讲流利的朝鲜语。其女1995年至2017年间曾定居大韩民国，着有自传《我是平壤的莫妮卡》。