999年1月16日收回归政府所有。第二阶段收回用地，包括荃湾保华工业大厦、华基工业中心，于1999年7月刊宪，2000年1月起收回。位于柴湾角海傍、属于房委会的顺基工业大厦被迁拆用作兴建大榄隧道的通风楼；荔枝角公园大部份土地亦被征用（其后已重置）；屯门新发邨的原址成为公共交通交汇处。然而，收地过程及方式就引起了争议，当中华基工业中心的户主赔偿问题更困扰政府多年。当时多名厂户要求政府就赔偿问题作调解及仲裁被拒，至今未获赔偿，有厂户被迫领取综援甚至最终因破产而自杀身亡。
西门子事件.