来到了台湾担任台糖第一任总经理，台糖公司随后在1946年成立。沈镇南来台首要的任务是以他留洋习得的制糖专业，恢复台湾糖业在战争中受到的破坏。沈镇南将任务达成，直至1949年，台湾糖产量达到战时的两倍—63万公吨，也就是已经恢复战前水准，使得糖业在1974年以前仍是台湾最重要的工业，为台湾赚取了大量的外汇，由此可知，沈镇南先生对于其份内任务可说非常重视。在台糖公司的员工们对沈镇南的印象都赞誉有加，像是前溪州糖厂厂长说到：「沈经理为人和善，敦厚仁慈，具有恢弘坦荡的的胸襟和刚正坚毅的风骨。」可见沈镇南在为