之下狱，十月初九（11月26日），黑齿常之在狱中自缢而死，享年六十。黑齿常之爱惜士兵，将前后所得赏赐的金帛，都分给手下将士；被诬陷自杀后，当时人们都为他而叹惜。圣历元年（698年），黑齿常之沉冤得雪，被追赠为左玉钤卫大将军，勋封如故。黑齿常之有一子黑齿俊，后任右豹韬卫翊府左郎将。一女嫁给同族的天兵中军副使、右金吾卫将军、遵化郡开国公勿部珣（景龙元年（707年）有造像记）。