逃离鎌仓的二阶堂盛秀之子秀高（清仙上人）于此地创建永安寺（源自同样名为大藏的鎌仓大藏谷永安寺）。16世纪，此地为吉良赖康领地，1557年（弘治3年）转予大平氏。1633年（寛永10年）成为彦根藩领地。1889年（明治22年），为砧村大字。1936年（昭和11年）世田谷区成立，为大藏町。1971年（昭和46年）实施住居表示。本地着名农作物是大藏大根。1953年（昭和28年），石井泰次郎改良江户时代丰多摩郡的「源内つまり大根」后，旋即种植在区内各地。1974年（昭和49年）左右被青首大根所取代，一度消失