制.2011年，在未获董事会通过的情况下，马云决定终止支付宝与阿里巴巴集团之间的协议控制关系，以获取央行发放的支付牌照。由于此事件影响阿里巴巴集团这一上市公司的估值，故对投资者造成冲击。
六四言论.2013年7月13日起，《南华早报》相继刊发对马云的系列访谈录。录音中马云在回顾阿里巴巴公司遭遇的“欺诈门”、“支付宝拆分”等危机时说：“一家公司的CEO，无论是阿里巴巴事件也好，无论是支付宝的拆分也好，你在这个当口上，好像邓小平在‘六四’当中，他作为国家最高的决策者，他要稳定，他必须