G II 分类法，将其放入木兰藤目，属于比较原始的被子植物，和八角茴香科可以选择性地放到一起。2009年的APG III 分类法中八角茴香科并入五味子科。
内部分类.五味子科有三属：八角属、五味子属和南五味子属，一共几十种，分布在东亚、东南亚和美洲的加勒比海地区，一般为藤本、灌木和少数乔木品种，有的品种可以提炼芳香油。