高聪望风败退，他和刘藻在悬瓠被囚禁。孝文帝赦免高聪一命，剥夺官爵为民，流配平州。途中到瀛州，刺史王质获白兔上献皇帝，王质命高聪上表。孝文帝见到高聪上表的文章，问王肃谁人写的文章，王肃回答为高聪所作。魏宣武帝初年，高聪回到洛阳。当时，北海王元详、广阳王元嘉、任城王元澄、咸阳王元禧、王肃、宋弁六人辅政。高聪进言废六辅。501年（景明二年），宣武帝开始亲政，高聪任给事黄门侍郎，加号辅国将军。后黄门如故，转任散骑常侍。502年（景明三年），宣武帝行幸邺城，回来时进入河内郡怀县境内，亲自射箭，箭射一里五十步。侍中