一年（1786年）时日茂行已有雄厚经济实力可以承担鹿港龙山寺的迁移工程。干隆五十三年（1788年）林振嵩因母丧而返乡，日茂行则交由三子林文濬负责，其业务日益发展，在嘉庆二十一年（1816年）翻新改建。而林文濬于道光六年（1826年）逝世后，由其五子林廷璋继承日茂行，然而此时鹿港已经因为港口淤塞逐渐没落，日茂行也由于鹿港失去航运功能而衰微。二次大战之后，日茂行曾在民国五十六年（1967年）进行整修。民国六十三年（1974年）时汉宝德等学者专家曾受委託对鹿港古老建筑评鑑，此时日茂行并未被列为古蹟，后来在