天主教海门教区（）是天主教在中国江苏省东南部设立的一个教区。也是中国第一批由本国国籍主教负责的教区之一。
历史.天主教海门教区是位于华东长江入海口北岸的正式教区。明朝崇祯十年（1637年），天主教传入南通地区。意大利籍传教士潘国光司铎（徐光启墓志铭的作者）先到崇明传教。时年新河镇医生徐启元接受福音，由潘国光神父傅洗入教，成为日后天主教海门教区辖区内第一位基督徒。这是天主教海门教区正式开教日。开教时期，这里隶属澳门主教，后转属北京主教。崇祯十二年（1639年），徐启元邀请潘国光神父在