萧新煌、瞿海源共十六位学者参与，正式创社，推选杨国枢为第一任社长。澄社成立后，杨国枢于1989年6月22日《中国时报》发表创社声明〈我们为什么要组织澄社〉，声明中对当时国民党主政下的政治、社会局势提出批判，要求废止《动员戡乱时期临时条款》、实践《中华民国宪法》、回归宪政；而对特权垄断、资源独占、族群冲突问题也有所诉求。创社成员讨论声明内容时，已经隐约浮现台湾统独议题。
发展过程.国民党主政期间，澄社与民进党等在野势力合作，批判国民党，共同推展不少政治改革，发起相关议题，许多成员