小牧·长久手之战，5月参加竹鼻城水攻，战后，秀吉令养女大友宗麟之女桂姬（又名孝子、引地君）与元总订下婚约，并从自己的名字中选出"藤"和"秀"字下赐给元总，因此改名为藤四郎秀包。并于翌年1月受领河内国1万石俸禄。
四国、九州时期.天正十三年（1585年）3月参加纪州杂贺征伐，6月参与四国征伐，并作为小早川隆景的先锋横渡濑户内海，于冰见原之战击退了金子元宅及长宗我部的增援后进攻高尾城，秀包此时讨取了长宗我部家臣花房亲兵卫。随后于7月进攻金子元春(金子元宅之弟)所处的伊予国金子城，在包围