华获释。1927年8月中旬，陈祖康当选为中共闽南特委宣传委员兼军事委员。9月，回闽西传达八七会议精神。10月，任中共闽西特派员。12月4日，当选中共福建临时省委执行委员。1928年初，陈祖康以教书为职业掩护，在龙溪程溪的南坑一带活动，组织农民进城请愿减交鸦片捐。1928年2月10日，当选为中共福建临时省委常委，分管组织和漳州党务工作。3月，驻漳州的国民革命军独立第四师师长张贞派黄澄渊、郑墨西劝说陈祖康与其合作。1928年4月，中共福建临时省委书记罗明因赴莫斯科参加中共六大，指定陈祖康代理中共福建临时省委书记