治维新后，这些区域曾先后隶属奈良县、五条县、堺县、大坂府，直到1887年重新恢复设置奈良县后，才再次隶属奈良县。在1880年实施时，正式的设置了近代的行政区划「宇智郡」，并在五条村（位于现在的五条市）设置「五条役所」，由于郡役所同时也负责管辖周边的吉野郡，因此后来又改称为「宇智吉野郡役所」。