:1985年大选后.在1985年大选中，菲律宾共产党透过新爱国联盟参选，政见是要求美军撤出菲律宾与土地改革。1986年，马可仕下台，柯拉蓉当选总统。柯拉蓉总统任内曾和菲律宾共产党进行和谈，但共产党要求的停止美国军事与经济援助以及土地改革，与柯拉蓉政府利益冲突太大。另一方面，菲律宾武装部队部分军官因为强烈反对和谈与其他原因，于1987年8月28日发动兵变。兵变虽未成功，但对新人民军和谈因此停止。在此期间，新人民军也开始攻击美军。
2001年后.2001年九一一袭击事件后，美国加强反