常熟，疑与孙旸一家，派遣学士王熙至承恩寓面询。王熙与孙承恩原有交情，承恩坦承不讳，王熙说：“升天沈渊，决于一语，今当以何奏？”承恩良久慨然曰：“祸福命也，不可以欺君卖弟！”王熙既上马，又回头问：「得毋悔乎？」承恩曰：「虽死无悔。」于是学士回宫禀告。顺治帝对孙承恩非常嘉赏。授职翰林院修撰，掌修国史。顺治十六年（1659年）初夏，随顺治帝至南海子，赐骑御名马，结果马怕生疾驰，承恩受惊受寒，又误投医药，不数日而卒。葬于河阳山麓。