613年，荷兰势力入侵帝汶。1618年，荷兰在西帝汶建立基地，并排挤葡萄牙至东部地区。18世纪，英国殖民者曾短暂控制西帝汶。1816年，荷兰恢复对帝汶岛的殖民地位。1859年，葡萄牙、荷兰签订条约，重新瓜分帝汶岛。帝汶岛东部及欧库西归葡，西部併入荷属东印度。1941年12月17日，盟军为了避免日军攻佔葡属帝汶而将其佔领，之后英国和葡萄牙协议将葡属帝汶归还葡萄牙，但在葡军到来之前日军旋即于1942年2月发动帝汶战役佔领了帝汶岛，在持续的反抗战事中，帝汶总人口之13%，即6万人死亡。1945年，第二次世