飞担任行政院院长。然而唐飞主张续建核四电厂的主张与民进党政府废核四的主张完全不同，最终唐飞于2000年10月6日被迫辞职，也结束中华民国政治史上短暂的「共治」时期。以陈水扁演说中提到过「搬开路上的大石头」暗喻唐飞的去职。
张俊雄内阁（第一次）.唐飞辞职后，由副阁揆张俊雄于2000年10月接任行政院长，民进党在国会席次佔少数，在联合内阁解组后开启随后长达七年半少数政府执政的局面。其后，在停止兴建核四问题中，陈水扁总统坚持停建核四。当时的国民党主席连战正与总统陈水扁会谈（媒体称「扁