筲箕湾、青山、大埔、西贡及长洲设有联络办事处。渔护署共管理4个渔业贷款基金，分别为「鱼类统营处贷款基金」、「渔业发展贷款基金」、「世界难民年贷款基金」及「美国经援协会贷款基金」，为渔民转型至可持续发展渔业及一般生产用途提供低息贷款。 渔护署管理的鱼类统营处提供海鱼统销服务，现时合共经营7个鱼类批发市场，分别位于香港仔、筲箕湾、油塘、长沙湾、青山、大埔及西贡。位于香港仔石排湾道香港仔渔业办事处的「渔业教育中心」于2003年9月30日启用，增加香港市民对渔业的认识，提高保育渔业资源及存护海洋环境的意识。