1942年5月1日陈寅恪从日军占领下的香港大学正式辞职。携妻女逃离香港，至桂林，中研院物理所长丁西林前去迎接，任教于广西大学。1943年12月再前往燕京大学。1945年，左眼失明。是年9月，前去英国治眼疾，却因耽搁太久，无法痊癒，仅一眼能见微光。国民党六大召开前夕，列入朱家骅与陈立夫联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一并出席大会。1946年再任清华大学教授。
岭南-中大时期.1948年底，解放军逼进北平，陈寅恪没有前往台湾的打算。傅斯年电话催请寅恪南下，寅恪举家乘飞机