日根野高吉（1539年－1600年8月5日）是日本战国时代武将。父亲是日根野弘就。信浓诹访藩（高岛藩）初代藩主。别名高弘。
经历.最初仕于美浓斋藤氏。在斋藤氏灭亡后仕于织田信长，在信长死后先后仕于织田信孝和羽柴秀吉。在天正18年（1590年）的小田原征伐中因为攻略山中城的功绩而被赞赏，被赐予信浓高岛3万8千石（异説是2万7千石或2万8千石），筑起被称为「诹访的浮城」的高岛城。在文禄之役中驻屯在肥前名护屋。在建筑伏见城时亦立下功劳。在庆长5年（1600年）的关原之战中属于东军，但