惩治恶吏，整顿城防，政绩卓着，入祀当地名宦祠。后赴京入觐，不畏太监张彛。崇祯九年（1636年），调署东安县。同年因对策称旨，被提升为翰林院编修，纂修《熹宗实录》。历升春坊中允兼起居注官，因母丧回乡。不久甲申之变爆发，明朝灭亡，清兵入关后，随南明隆武帝、永历帝抗清，担任要职。因不满朝中派系斗争而乞归，闭门不出，自号“绿园居士”。卒年六十八岁。干隆《揭阳县志》有传。
着作.黄奇遇工诗文，着有《绿园诗草》、《平斋文集》，皆已散佚。有《揭阳县志》所录的《涵元塔记》一篇及《过旧园亭诗》一首传