呈北北西-南南东走向；在西域板块内部是北南走向至北北东-南南西走向；在扬子板块南部是北南走向；在华夏板块内部是东西走向。后二者主应力方向的不同，明确地说明了扬子板块和华夏板块在早古生代还不可能拼合在一起。经复原，祁连期构成后世中国大陆的各地块均位于南半球，而且大致呈东西向排列。
对现代地貌的影响.祁连期形成的阿尔泰-准噶尔-额尔古纳碰撞带和祁连-阿尔金碰撞带，为后来的构造运动中阿尔泰山脉、阿尔金山脉和祁连山脉的隆起奠定了地质基础。