轻巡洋舰前往北海布置水雷。这项任务耗时一个月，结束后本舰返回波罗的海接受额外训练。1939年11月17日至19日间，莱比钖号重返北海布雷；21日至22日间再与科隆号、德国号以及三艘鱼雷艇前往斯卡格拉克海崃对盟军的补给船团进行骚扰。接着莱比钖号奉命护卫格奈森瑙号与沙恩霍斯特号战舰穿越斯卡格拉克海崃，并于27日护送两舰返航。12月13日，莱比钖号奉命护卫一支驱逐舰队穿越斯卡格拉克海崃。航程途中，英国皇家海军所属的突然对德军军舰展开攻击；11时25分，英军以鱼雷击中莱比钖号水线下一处用以分隔两间锅炉室的水密隔