琛生于成化十三年（1477年）十月十六日。弘治十一年（1498年）陈琛参加福建乡试落榜。正德元年（1506年）蔡清督学江西，邀请陈琛同行并教其二子读书。正德三年（1508年）陈琛返乡。并于正德五年（1510年）考中举人。正德十二年（1517年）中式丁丑科进士，授刑部山西司主事。不久，陈琛以母亲年老为由，改任南京户部主事。不久升任吏部考功司郎中。嘉靖元年（1522年）陈琛请求回乡归养。嘉靖七年（1528年）因大臣推荐下诏征用，但陈琛辞而不任。嘉靖八年（1529年）下诏命其任贵州按察使司佥事，后改江西提学佥事，