千年时期，柬埔寨由信奉印度教的国王统治，中间也有信仰佛教国王的出现，如Jayavarman一世和Suryvarman一世。
印度教.柬埔寨在扶南王国开始时受到印度教的影响。印度教是高棉帝国的官方宗教之一。柬埔寨是世界上唯一有两座梵天寺庙的国家。柬埔寨吴哥窟是世界上最大的印度教寺庙。
伊斯兰教.柬埔寨穆斯林大多数是占族和马来族，在红色高棉统治期间，穆斯林曾遭受迫害。
基督宗教.基督宗教第一次在柬埔寨传教是在1555-1556年由葡萄