抵达澳门，西班牙公使玛斯也从菲律宾调来「麦哲伦号」（Magallanes）兵船。尽管有军队保护，澳门居民惧怕清军反击，数百人逃到香港。
兇手伏法.清廷抓捕了参与刺杀亚马留的六人。9月12日，署顺德县知县郭汝诚等缉获沈志亮，找出用石灰拌过的亚马留的头和手（石灰可以用来保存尸体）。不久，广州知府易棠据线报又抓获郭金堂及李保二人。李保拒捕，被当场击毙。郭金堂则发配边塞，后死于狱中。周有、陈发则在归善县官军缉捕中被击毙，张先被抓获。9月15日，两广总督徐广缙下令将沈志亮处死，并“枭首犯事地