李茂贞的跋扈不能容忍，于是命嗣覃王李嗣周率新组建的禁军讨伐，但禁军反为李茂贞及静难节度使王行瑜所败。李茂贞、王行瑜指宰相杜让能为自己与昭宗失和的祸首，迫使昭宗诏贬杜让能，李茂贞、王行瑜仍不满，昭宗只得赐死杜让能。
中期发展受挫.干宁二年（895年），护国节度使（河中节度使）王重盈去世，王重盈侄王珂与王重盈子王珙争位，王珂为李克用之婿，故李克用为其请求唐政府任命为河中节度使；而李茂贞与王行瑜、匡国节度使韩建支持王珙，但为昭宗所拒，三帅遂联军进京挟持昭宗，迫使昭宗贬斥宰相韦昭度、李磎，