后，广陵县为侨置青州治所。东晋太宁三年（325），兖州也侨置于广陵。晋成帝时，兖州改称南兖州，治所还于京口。义熙八年(412)，东晋收复青州旧地，在东阳城(今山东省益都县北)复置青州，而称侨置于广陵者为南青州。南朝宋永初元年(420)，撤南青州并入南兖州，侨置在广陵郡的原青州各侨郡侨县改属南兖州。次年，徐州改称南徐州，广陵县随广陵郡属之。北齐天保三年(552)，南兖州归属北齐，并改名为东广州，广陵县随广陵郡属之。南陈太建六年(574)，东广州入南朝，复称南兖州。十一年，南兖州又入北朝，并改名吴州，置总管