设期间，深圳北理莫斯科大学使用了深圳市体育学校的楼宇作为过渡校区进行教学。
永久校区.永久校区于2019年7月启用，位于深圳市龙岗区国际大学园路1号，占地面积达33.37万平方米，建设校舍21栋，总建筑面积约30万平方米，由深圳市人民政府投资20.43亿元兴建。校园整体分为行政教学区域、生活运动区和山水景观区等三个区域，配有3栋教学楼、2栋实验楼、6栋学生宿舍，并建有标准400米跑道及田径赛场、标准室内游泳池、室内外篮球场及学生活动中心，可容纳5000名学生学习生活。