西方科学书籍作出较高的评价：「欧罗巴人天文推算之密，工匠制作之巧，实逾前古。其议论夸诈迁怪，亦为异端之尤。国朝节取其技能而禁传其学术，具存深意」，也将西方宗教与西方科学作了区分，强调“「节取其技能」”，《四库全书》的作者们明白传教士的来华目的是为了传播天主教，介绍西学不过是传教的手段。因此他们在赞扬西学的同时指出「盖欲借推测之有验，以证天主堂之不诬，用意极为诡谲」。另外，《四库全书》收录了27种西方传教士的着述，当中包括西洋的数学、天文、仪器及机械等方面的着作，被收录的书籍包括有《泰西水法》、《西儒耳目资》