983年任武汉地质学院院长。王鸿祯是中国地层古生物事业的开创者之一、历史大地构造学的奠基人之一。20世纪70年代建立了四射珊瑚的分类演化体系。还提出以年代地层和岩石地层两者为主的地层分类方案。组织参与了《中国古地理图集》的编纂。1980年被选为中国科学院院士。王鸿祯从事地质教育和地质科研工作六十多年，在北京大学或北京地质学院期间，由其亲自授课和指导毕业论文的，有18位后来成为了中科院院士。