塔西洛三世（Tassilo III）788年退位，结束了阿吉洛尔芬王朝的统治。雷根斯堡是德国最古老的天主教教区之一，739年起隶属于罗马主教，即使在1542年作为帝国自由城市而信仰新教后，雷根斯堡依旧保持天主教主教驻地的身份。9世纪，雷根斯堡成为东法兰克王国加洛林王朝的重要城市，日耳曼人路易（Ludwig der Deutsche）的皇后、东法兰克王国的最后两位加洛林王朝国王克恩滕的阿努尔夫和孩童路易都葬在了雷根斯堡。中世纪时，通过与巴黎、威尼斯和基辅进行远程贸易，雷根斯堡迎来了经济的繁荣时期，在当