识形态的转变与同苏联的合作，黑龙会与国民党人开始决裂，因爲黑龙会认为俄罗斯作为半欧洲势力直接压迫亚洲人，因此将国民党后期的联俄容共政策视为对泛亚主义理想的背叛，这是他们带头让日本入侵中国的真正原因。日俄战争后，黑龙会与日本军部紧密合作，先后参与镇压米骚动和关东大地震后屠杀朝鲜侨民。1931年九一八事变之后，改组为，支持军部，鼓吹反共主义。1934年，内田良平因卷入事件而被迫淡出黑龙会，改由头山满主持黑龙会。二战结束后，被定义为极端右翼组织。1945年9月13日，遭驻日盟军总司令部（GHQ