944年10月20日起，罗森海姆成为盟军13次空袭的目标。在1945年4月18、19和20日的空袭中，车站的整个轨道设施都被摧毁，铁路运营因此中断。只有个别行政建筑和大致没有受到破坏。
战后时期.自1945年5月18日起，开始有美军的个别列车在一些经修复的轨道上驶往弗赖拉辛。直至1950年，整个轨道设施才得到重建。罗森海姆南站仅用于存放列车。为了替换被摧毁的车站大楼，当局在站前广场临时建造了两个寮屋，用于行李托运和售票。仍旧保存完好的车站大楼东翼则被用作的“铁路运输办公室”（），并