清盛合作，深感不满的义朝与二条天皇亲政派的联手，引发平治之乱，虽然义朝成功逼使信西自杀，并且一度幽禁二条天皇和后白河上皇，可是最终败于清盛。永历元年（1160年），二条天皇和后白河上皇就朝廷的主导权的争拗进一步激化，二条天皇侧近和奉命企图软禁上皇，按《愚管抄》记载，上皇含泪要求清盛捉拿两人，最终两人与亲近天皇的和均先后被流放，事后清盛就任参议，初次位列公卿，又获任命为检非违使别当，负责维持京都的治安。应保元年（1161年），清盛之妻平时子之妹平滋子替上皇诞下皇子，妻舅等平家一门策划让其成为皇太子一事走漏