3年），考克斯被不列颠东印度公司派到日本，之后在担任江户幕府大御所德川家康之外交顾问的英国人三浦按针（William Adams）引荐下晋见德川家康并获得贸易许可，在平户建立商馆并就任第一任商馆馆长。日本元和元年（1615年），据说三浦按针从琉球带回番薯并在平户种植，而这是在九州以北的首次种植。1616年，考克斯为了向将军德川秀忠请求更新朱印状而前往江户。1617年考克斯为了传递英王詹姆斯一世给德川秀忠的亲笔信而在京都伏见谒见秀忠，但并没有得到秀忠的回信。而从这时起荷兰对英国船队的攻击变得勐烈，考克