993年马自达加拿大分公司为了纪念25周年庆，推出一款名为「马自达MX-3 GS」的特别限量车；同时马自达美国分公司也推出一款类似的限量车，故两地合计制造了2,000辆而已。限量车款包含V6引擎、皮革内装（座椅、方向盘、排档桿桿头）、可加热式座椅（仅限加拿大）以及由日本Enkei（エンケイ株式会社）制15吋铝合金轮框。1996年欧洲的马自达制造发售了100辆名为「马自达MX-3 V6 SE」的限量版，拥有皮革内装与纯白色车身涂装。