圣日尔曼的背景与身份成谜，引发许多对其出身的猜测。根据Prince Charles of Hesse的说法，圣日耳曼在晚年自称是特兰西瓦尼亚王子Francis II Rakoczi与第一任妻子所生的儿子。这似乎是主流说法。另一个理论是说他是西班牙国王卡洛斯二世的寡妇Maria Anna of Pfalz-Neuburg的私生子，还有一个猜测说他是葡萄牙王之子。圣日耳曼可能曾在义大利的钖耶纳大学（Università di Siena）读书，为美第奇家族最后一位大公吉安·加斯东的学生。他第一次以圣日耳