相似，且未受伤害的另一条染色体，来进行DNA修复作用。细菌的同源重组，则发生于细菌进行接合（conjugation）、转导（transduction）或是转化（transformation）的过程中。许多技术利用同源重组将基因导入生物个体中，形成重组DNA，方法又称基因标的（gene targeting）。