两岸政策不明确。新台湾国策智库董事长吴荣义说，从民调结果看来，国民党表现不佳未必会使民进党得到社会支持，民进党并非没有重大具体政策，但民调显示仍有高比例的民众认为民进党没有具体政策，民进党应检讨。2013年10月11－12日，二十一世纪基金会与全国台湾研究会主办首届「两岸和平论坛」，新台湾国策智库列名协办单位，新台湾国策智库董事长吴荣义与中国社会科学院台湾研究所所长余克礼担任「议题一：两岸政治关系」主持人。2016年8月1日，新台湾国策智库宣布，在「本土政权」蔡英文政府执政后，新台湾国策智库已完成阶