很高的依赖性。在G1期，染色体套数为2n的情况下，同源染色体是HR唯一可使用的模板。等到在S期／G2期有了姊妹染色分体（sister chromatid）的加入，染色体套数倍增为4n，这时候HR机制就有更多的修复模板可供选择，因此一般认为HR修复的运作在S期／G2期比较活跃。值得一提的是，NHEJ除了负责DNA损害的修复，高等生物所特有的免疫系统在进行V(D)J重组以产生具多样性的抗体时，由RAG蛋白作用所造成的DNA断裂，也是需要NHEJ来进行善后工作的。
细胞週期检查点与DNA