王昆仑在南京首次见到周恩来，并应周恩来的要求，继续做孙科的工作。
抗战时期.1937年7月抗日战争全面爆发后，王昆仑一方面做冯玉祥等人工作，一方面陪出狱不久的沈钧儒等人赴太湖，以散心的名义讨论抗日事宜。1938年，日军在台儿庄战役等战役失败后，调整了军事部署，调华北方面军、华中派遣军共达30万兵力，自南北两个方向夹击徐州。李宗仁率60万军队在徐州与日军会战。王昆仑等人在结束了临沂、台儿庄等地战争中的难童救护工作后，和曹孟君赴徐州战场抢救难童，多次险些死亡。回武汉后，王昆仑写下多