察院右佥都御史、巡抚贵州。都匀答千岩苗族叛乱，土官蒙诏不能制服，萧彦命令副使杨寅秋平定叛乱。宣慰安国亨诡称要献上大木，受到赏赐。等到征求大木时却称没有，被萧彦弹劾。安国亨非常害怕，诬赖商人掠夺了他的大木，在朝廷上攻击萧彦。神宗大怒，准备治罪萧彦。大学士申时行等称是安国亨反咬一口，轻视朝廷，神宗才作罢。万历十六年（1588年），萧彦改任云南巡抚，当时明朝用兵陇川，副将邓子龙不善统御部队，士兵群起喧哗，守备姜忻安抚他们，但是，士兵平素就骄纵，兵饷给得稍慢，就犯上作乱。部队很快走到永昌，直趋大理，抵澜沧，过会