018年7月17日，欧盟执委会主席容克偕同欧洲理事会主席图斯克与日本首相安倍晋三在日本东京签署该协定。2019年2月1日，该协定正式生效。
历史.欧盟是日本的第三大贸易合作伙伴。欧盟在亚洲的第二大贸易伙伴是日本（第一大贸易伙伴为中国），欧盟企业每年出口到日本贸易量为580亿欧元，约2兆新台币，其中78%是中小企业；日本每年出口到欧盟贸易量为280亿欧元，约新台币1兆元；协议全面实施后日本将取消97%、价值约10亿欧元的欧盟进口货物关税，