后，南喀嘉措随同六世班禅赴卫藏弘法，并曾多次拜见达赖。1777年，随六世班禅赴拉萨为八世达赖授教，获八世达赖奖赏。因在佛法上的造诣及管理扎什伦布寺之功，南喀嘉措被清朝朝廷封为“唿图克图”（职衔），称“仲巴唿图克图”。这是东宝·仲巴活佛系统首次被封为唿图克图。干隆四十五年（1780年），南喀嘉措随六世班禅到北京为干隆帝七十大寿祝福。六世班禅因病在北京圆寂后，南喀嘉措获干隆帝敕赐“额尔德木图诺门罕”名号。南喀嘉措率僧众护送六世班禅法体回到西藏。干隆四十五年十月二十四日，干隆帝拟封赏南喀嘉措，文未发而六世