学者细井平州在领内的藩校兴让馆执教，废除了藩内的官位世袭制。虽然新政受到守旧派的反对，甚至是对鹰山的弹劾，这群守旧派后来大多被迫隐居或切腹。鹰山实行新政相当成功，成功还清幕府的债务，即使鹰山隐居让位给后代，仍然积极管理藩政。幕末时期，米泽藩加入奥羽越列藩同盟对抗新政府军，米泽藩在出羽及越后国境边界大里峠投降，出兵攻击庄内藩。领地则因为对抗新政府的关系减封到只有14万7千石。1869年与米泽新田藩合併。1871年，因废藩置县的关系成为了米泽县，经过了县的合併后成为了山形县的一部份。1884年，藩主家成为了