学时与邱威杰等人开始办地下刊物《火种》，支持党外运动，批判万年国会，反对国民党的威权统治与国民党扶植的组织「薪传社」。丁允恭考取国立台湾大学经济系之后，成为学校风云人物，曾担任第十七届台大学生会副会长，投身工运、社运，毕业后，丁允恭曾在长庚大学、高雄医学大学、国立中山大学等校修读硕士，最后为国立台湾大学科际整合法律研究所硕士毕业，对参与政治很有热忱，就读台大研究所期间，与台大、政大大学部学弟妹组成10多人的「派阀」，被成员称作「派阀长」，颇有领导架势，在校园主导政治议题。念研究所时还因抗议高学费政策被警