2-0淘汰格拉斯哥流浪晋级准决赛，是球队近35年来首次在埃布罗克斯击败这支格拉斯哥班霸，亦是圣庄士东首次在盃赛击败格拉斯哥流浪及对方首次在主要盃赛主场被低级别球队淘汰出局；但最终在准决赛加时后以1-3不敌喜百年出局。圣庄士东于苏格兰盃分别作客淘汰苏超的福尔柯克及马瑟韦尔再次晋身盃赛准决赛，但在咸普顿公园球场以1-2负于些路迪而无缘决赛。同季圣庄士东亦在联赛再次冲击冠军锦标争取升班苏超，2007年3月30日再获选「苏甲每月最佳领队」；圣庄士东与基特拿一直缠斗至联赛煞科日，在球季大部分时间领头的基特拿有1分优势