西帝汶人中大多数的安东尼人（Atoni）传统上便与东帝汶人有敌对关系。而东帝汶独立运动从未宣称将西帝汶包括在内，东帝汶政府也完全承认印尼从荷属东印度继承而来的边界。位于帝汶岛上的东帝汶和西帝汶的关系与新几内亚岛上的关系类似，处于新几内亚岛东部的巴布亚新几内亚原先从澳大利亚独立而来，而西部则是属于印尼的巴布亚省与西巴布亚省。