参与发起西山会议，后在国民党二大会议上被开除。1927年，蒋介石进行清党，邹鲁退出政坛、出游欧美，撰写《中国国民党党史》。1929年，中国军阀割据，邹鲁自日本归国。1930年，邹鲁回到广州，张学良支持蒋介石，出兵入京调解军阀间的矛论。日本土肥原贤二借机拉拢邹鲁，反受到驳斥。1932年2月至1940年4月，任国立中山大学校长。1935年，代表西南参加国民党第六次全体中委会。1946年，任监察委员。1949年，参加广州召开之非常会议，离开中国大陆经香港，到达台北。任中央评议委员，着《