会去问他意见。太和十一年（487年），高允去世，享年九十八岁。朝廷追赠他为侍中、司空公、冀州刺史、镇军大将军、咸阳公，并赐谥号文。着作有《左氏释》、《公羊释》、《毛诗拾遣》、《论杂解》等，辑有《高允集》二十一卷。至明人张溥辑有《高令公集》载于《汉魏六朝百三家集》中。