和菲律宾南部，印度尼西亚更是全球人口最多的穆斯林国家。之后爲佛教，全东南亚拥有2.05亿佛教徒，位居东南亚第二（38%的当地人口），主要分佈在越南、泰国、老挝、柬埔寨、缅甸和新加坡。新加坡及越南亦相当流行儒教。基督教爲菲律宾、印度尼西亚东部、马来西亚东部及和东帝汶的强势宗教。当中菲律宾拥有全亚洲最大的罗马天主教人口，而东帝汶则由于是长年受葡萄牙殖民而成爲基督教国家。印度教是印尼巴厘岛的主要宗教，但由于融合了当地原生的泛灵信仰而与其他地区的印度教有所不同。由于庞大的印度裔人口，新加坡和马来西亚亦有