重点学科，是全军实验诊断重点实验室，国家药品临床研究基地，军队药品临床研究基地。医院具有骨科、肾内科、神经外科、泌尿外科、整形外科、急救科等传统优势学科。1960年，长征医院医学教育家屠开元成功进行了中国首例断肢再植动物实验。1978年6月，医院在中国内地率先进行肾脏移植。1985年，何清廉教授完成了中国内地第一例公开报道的变性手术。1996年，傅志仁教授手术创下中国内地存活时间最长的单次原位全肝移植。在2018年度国家科学技术奖励大会上，医院神经外科主任侯立军教授牵头完成的“海上作业重要伤病防护与救治