垂直海拔差约低于；和多数佛州的水路一样，流速缓，约，被当地人称为「懒惰河」。它是美国少数流向自南向北的河川。圣约翰河水道范围形成许多湖泊，或汇流至河中，但河道最宽处只有，横跨帕拉特卡和杰克逊维尔，后者更是圣约翰河畔最大的都市区。它的最窄处位于源头，为印第安河县内一个无法航行的沼泽湿地。圣约翰河流域内总计约有3500万人栖居。