一块发现于阿玛纳陵墓的所谓“核心石碑”娜芙蒂蒂可能成为了阿肯那顿共同执政者，但这并不完全确定，因为上面的名字被去掉并被刻成安赫塞那蒙和娜芙娜芙鲁阿顿的名字。
后世纪念.阿肯那顿死后，被后继者斥为「异端」，很多关于他的纪录都遭到之后的统治者抹煞。美国作曲家菲利普·格拉斯作有歌剧《阿肯那顿》。