（光绪27年）11月，军机大臣荣禄下命令，称其与太监殴斗致数人负伤，乃转至袁世凯手下营官。又因为牵涉其他伤害事件，许兰洲乃转入张勋手下。1908年（光绪34年），被任命为黑龙江巡防营第2路统领。因讨伐土匪的功绩，升任黑龙江省巡防统领，但是1909年（宣统元年）因军纪不良而被罢免。1911年（宣统3年）10月，黑龙江巡抚宋小濂再度起用其为巡防队统领官。1913年（民国2年），升任黑龙江省陆军第2混成旅旅长，授陆军少将。翌年，因讨伐马贼立下军功，被任命为黑龙江省陆军暂编第1师师长，获授陆军中将。袁世凯称