国家主席李先念签署中华人民共和国主席令第二十号公布施行。1999年7月1日，根据中央机构编制委员会办公室、最高人民法院、交通部、财政部《关于理顺大连等6个海事法院管理体制若干问题的意见》，广州海事法院由交通部移交中共广东省委、广东省人民政府、广东省高级人民法院管理，行政级别由副厅局级提升为正厅局级，受广州市人民代表大会常务委员会监督并向其报告工作。
管辖.广州海事法院的辖区是广东省海域及通海的内河可航水域，包括其岸带及各港口。辖区海岸线长3368公里，海域面积37万多平方公里，