势贞亲，开始采取抑制守护大名的政策，文正元年（1466年），诸大名联手令贞亲失势，义政的基础开始弱化，翌年畠山政长和畠山义就争夺畠山氏之家督为导火线，细川胜元与山名持丰的对立激化，诸大名的势立分成两方，应仁、文明之乱起，文明五年（1473年）让将军给嫡子义尚，十年后移住东山山庄，称为东山殿，延德元年（1489年）义尚死后再度执政，翌年病故，法名慈照院喜山道庆。足利义政在位四十多年期间，幕府财政日益窘迫，日本境内的土一揆此起彼伏，比较着名的有1454年的享德土一揆、1457年的长禄土一揆等。因此在其统治后