2008年2月当选安徽省人民政府副省长。2013年1月，倪发科不再担任安徽副省长。2013年6月4日倪发科涉嫌严重违纪正接受调查。2013年9月30日，倪发科被开除党籍和公职，其涉嫌犯罪问题移送司法机关依法处理。倪发科被调查后即被网民以与其名字谐音的粗口调侃，以讽刺其践踏公共利益的行为。2014年12月15日，倪发科受贿、巨额财产来源不明一案在山东省东营市中级人民法院公开审理。公诉机关指控倪发科先后49次非法收受他人给予的字画、玉石、现金等财物，共计折合人民币1300余万元。同时指控倪发科对折合人民