金会与西藏问题.基金会曾在中国大陆有分支机构，但在1996年撤出。根据西藏流亡政府的说法，这是因为基金会在当年举办了相关问题的国际会议， 同时联邦议会通过一笔款项支持会议的召开。2008年西藏骚乱后，中国官方新华社引述德国外交政策网站刊登文章披露，美国国务院、基金会及西藏流亡组织早在2007年5月就认为可利用北京奥运向中国政府施压并以此部署多项抗议活动。
基金会与香港问题.受到2020年6月30日中国大陆通过备受争议的《港区国安法》的影响，以及一名长期合作的伙伴成为逮捕对象后，基