，为纪念出生于该镇的佛教洪州宗创始人，唐朝着名禅师马道一而改为现名。马祖镇北接灵杰镇，南接元石镇；西与南泉镇、师古镇接壤，东和双盛镇相邻，总面积23.89平方公里，下辖14个行政村、1个居委会，人口26375人（2000年）。2019年12月，撤销双盛镇，将其所属行政区域划归马祖镇管辖。
行政区划.现辖：