李涤非、王嘉谟等人受到牵连，王嘉猷也未免，被撤职。1962年，文化部仍将他从南京电影设备厂调入北京电影研究所总工程师。1966年，文化大革命爆发，文化部首当其冲，王嘉猷再次被冲击。文化大革命结束后，再次担任中国电影科学技术研究所副所长。1978年，策划上海浦东开发，担任上海开发研究会副会长。1991年，退休。2004年，被诊断出身患胃癌。同年9月16日，辞去中央军委主席的江泽民到协和医院看望王嘉猷。9月20日手术成功。9月27日，江泽民再次探望王嘉猷。
家庭.王嘉猷父亲王锦洲早