拜仁却目送其德甲劲敌多特蒙德在决赛中战胜尤文图斯，捧起了令人垂涎的大耳朵杯——这仅是多特蒙德在欧冠决赛中的首次亮相，其阵中拥有前拜仁双星科勒尔和罗伊特（他们和另外三名队友也曾效力于尤文图斯）。拜仁只能在吉奥瓦尼·特拉帕托尼的带领下赢得德甲聊以自慰，却在来季欧冠遭到卫冕冠军多特蒙德所淘汰，联赛桂冠也被由雷哈格尔执教的升班马凯泽斯劳滕夺走了。如果这些结果已令人失望，那么更糟糕的还在后面。在1998–99年欧洲冠军联赛，拜仁从由弗格森领衔的曼联和范加尔执教巴塞罗那组成的死亡之组中以头名出线，然后轻松击败凯泽斯劳