人们把征夷大将军治事之处称做「幕府」，意义变成了政府机构。有人认为「鎌仓幕府」和「室町幕府」事实上是现代用词而由后世使用；当时人们并未称唿过鎌仓时代和室町时代将军府署机构为「幕府」。
幕府官职.
中央官.源赖朝掌政时曾经设置幕府官职，赖朝所设置的官职一直流传到室町时代。江户幕府后来改革了幕府官职。