处理器的运算能力。用户需要根据模拟系统运行的程序需要决定给予必要的计算能力。使用DOS/4GW等开放源代码的保护模式扩展程序DOS32a有时能减小问题。但是，因为该模拟器使用虚拟化方式，保护模式下的DOS程序，包括大多1995年之后的游戏，可能不如在VMware或者Virtual PC运行上有效。DOSBox与中文系统的配合存在一些问题，早期的5.8版本支持倚天，国桥等DOS中文系统，但之后的版本却出现花屏乱码的情况。DOSBox似乎不支持在程式运行期间对软碟映像档进行替换，这在某些以多个软碟映像档形式