三营大将石亨、孙镗、曹钦均是夺门之变功臣，庇护部下，认为程信为人苛急，请改隶兵部。程信晓之以理，明英宗仍命其负责太仆寺。次年，改为左佥都御史，巡抚辽东，当时佥事胡鼎弹劾都指挥夏霖不法事，程信听闻后，逮捕胡鼎下诏狱。锦衣卫都指挥门达称程信不当代奏。当时恰逢寇深掌管都察院，于是弹劾程信，下诏狱，降南京太仆少卿。天顺五年，召为刑部右侍郎，母忧归。成化元年（1465年），启为兵部左侍郎。四川发生民变，朝廷以襄城伯李瑾充总兵官，太监刘恒为监督，进程信为兵部尚书，随后调度有功获胜。随即兼任大理寺卿，与白圭共同掌管兵