在1997年3月17日除籍，拖行到布雷默顿停放。在与民间组织多番商讨后，海军最终将中途岛号捐赠作博物馆舰。2003年9月30日，中途岛号由拖船先后拖往屋崙及圣地牙哥复修。2004年6月7日，中途岛号博物馆在圣地牙哥正式对外开放。2016年6月，美国职棒小联盟属于高阶1A层级的加州联盟与卡罗莱那联盟举行全明星赛，中途岛号博物馆被相中成为全垒打大赛的场地。中途岛号在越战获颁，并获得五枚战斗之星；在其服役生涯一共四次获颁海军部队嘉许勋表及三次海军部队嘉许奖。全部荣誉见下表：