在各门中，北大红门、南大红门作为进出南苑的南北主要通道，规制最高，开三个门洞，顶覆黄琉璃瓦，门色大红。西红门开有两个门洞，东红门开有一个门洞。双桥门、镇国寺门都开三个门洞，但比南、北大红门略窄。双桥门是清帝自南苑去清东陵的通道，镇国寺门是清帝自南苑去颐和园、圆明园等地的通道。自干隆晚期后，清廷再未对南苑进行过大规模修缮。《大兴县志》记载，1890年水灾淹没南苑，海子墙多处被冲垮，各海子门的门扇也被冲走。1900年八国联军焚掠南苑后，清廷敞开南苑大门招佃垦荒。此后，当地农民不断拆除南苑围墙、盗取城砖。到