傅作恭从绥远到北京探望傅作义时，恰好遇见时任甘肃省政府主席的邓宝珊。受邓宝珊邀请到甘肃工作，后任甘肃省林业厅造林科科长，曾主持开展了多项甘肃省的植树造林工作和兰州市的绿化工作。
命丧夹边沟.1957年的反右运动和1959年的反右倾运动相继爆发，傅作恭被甘肃省林业部门划为右派分子，随后被送到酒泉市的夹边沟农场进行劳动教养。由于恰逢三年大饥荒，夹边沟农场关押劳教人员远超农场可自给自足的数量，当时农场管教和上级部门又按照“右派就是反动派”的逻辑未给农场提供充足的粮食，致使在夹边沟农场的部