CpG岛（CpG islands）是指DNA上一个区域，此区域含有大量相联的胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G），以及使两者相连的磷酸酯键（p）。哺乳类基因中的启动子上，含有约40%的CpG岛（人类约70%）。一般CpG岛的长度约300到3000个硷基对（bp）。常用的正式定义是指一个至少含有200bp的区域，其中GC所佔比例超过50%，且CpG的观察值／预测值比例必须高于0.6。此部份的CpG岛与基因相连，可用来作为限制酶的辨识位置。几乎管家基因都含有CpG岛；一般位于基因的5’端区域；大多数CpG岛是未甲