1803年日本四名飘流者登陆巴西。日本和巴西其后在1895年建立外交关系。而自1908年日本首批移民乘坐「笠户丸」移民巴西以来，日本开始出现移民巴西的浪潮，使巴西至21世纪后仍为日本海外日侨数量最多的国家，为数约150万人。两国曾在1940年代因在第二次世界大战中身处不同阵营而断交，但其后已恢复。日巴两国因为移民的原因，而在经贸和文化上维持密切的联系。日本是巴西的第二大援助国，仅次于德国。两国并互为彼此在拉丁美洲和亚洲前几名的贸易伙伴。日本于巴西首都巴西利亚设有大使馆，在圣保罗、里约热内卢、库里奇巴