于1890年成为美国第5人口大州，法院审理的案件也相应大幅增加。
进一步分裂与扩张.1887年的一项国会法案将东区联邦地区法院细分为北部、东部两个法庭。其中东部法庭继续在圣路易斯的联邦海关和邮局大楼办公，北部法庭则转战汉尼拔的邮政局，并在那里持续办公至1960年。这两个法庭加上西部联邦地区法院细分出来的4个法庭，让密苏里州一共有了6个联邦法庭，成为当时全国拥有联邦法庭最多的一个州。之后法院又进一步从原有的东、北两部细分为东、北和东南三个部分。1888年，奥德雷恩县从东部改为由西