警区指挥官期间，被质疑多次包庇和纵容新界乡黑势力，任内因元朗警区几宗警察丑闻，包括将海洛英当作食盐来处理，需让警察公共关系科为邓炳强解画，甚至亲自致电游说各大媒体的採访主任，要求传媒「笔下留情」，为丑闻降温，被斥干预新闻自由。2020年5月，区议员陈树晖在元朗区议会的会议中指出，邓炳强出任元朗警区指挥官期间出现的第一次官商乡黑勾结，是2013年时香港特首梁振英的一次落区活动中，警察任由一批乡黑殴打示威市民；而于2019年11月14日，撑警人士及乡黑组成的「东江纵队」于元朗大马路游行，却未有人被控以非法集