业余天文学家发现的彗星数量锐减。到了2000年，板垣公一改为搜索超新星。2001年5月17日，板垣公一发现第一颗超新星，位于「NGC 5534」星系的「2001bq」。2008年起，在金田宏的协助下，又再一次搜索彗星，并于同年9月10日，在天鹰座与宝瓶座的边界附近发现一颗13等的彗星。后来有专家指出，这颗彗星其实是失落了110年的「D/1896 R2」，就是说板垣公一重新发现一颗彗星，找回天文学史失落的一环。2009年3月14日，在鲸鱼座发现新彗星「C/2009 E1」。这颗彗星被名命为「板垣彗星」，是