不能负荷扫墓人士所带来的交通流量。化宝炉烟囱与校园接近，排出的废气会影响学童的健康。在城市规划委员会批准慈云阁设骨灰龛前，地政总署曾于2008年公佈慈云阁擅自将庙宇改建成骨灰龛场，违反土地契约。
灵牛事件.1983年7月中，长沙湾屠场一头重900斤、约17至18岁的大水牛在多次被拉往屠宰时竟流下眼泪并跪地，屠房工人遂认为此牛有灵性，不愿屠宰，并希望送往香港海洋公园饲养，让牠安渡余生，惟该园表示无兴趣。工人其后查询兄长信奉的慈云山慈云阁，7月16日慈云阁主持亲到屠房了解并向牠「发问」