市政设计院开始组织工作人员开始规划，并向北京市市委提出一个方案。这个方案为此运河以密云水库调节池为起点，经时密云区韩各庄船闸流向西南，过怀柔水库后，行至西崔村，并流经温榆河各支流，之后，从昆明湖汇出，流向玉渊潭上游的罗道庄，最后与永定河引水渠会合，流入西便门护城河；流入护城河后，运河将会分为两部分，其一流向前三门护城河，另一支流入南护城河，经龙潭湖至通县马驹桥，并与同在规划中的京津运河汇流。除此之外，设计人员还规划了一条支流，这条支流始于昌平县（今昌平区）小辛峰，流经沙河水库、清河镇、东直门，流入东护城河。