殖民统治就此开始。1502年，西班牙岛正式成为西班牙殖民地，首府被命名为“圣多明哥城”，岛上土着的军事反抗被镇压。至16世纪，西班牙人已经在岛上建立了15座城市。此外，西班牙官兵们都分得了岛上的土地，并且把居住在这些土地上的土着变成了奴隶，从事掘金、种植甘蔗和养牛。由于西班牙人带来的天花传播，泰诺人于1544年在岛上绝迹。土着绝迹以后，西班牙岛西部的种植农地和牧场纷纷被西班牙人的地主抛弃，该岛西部遂成为荒凉的无人区，并逐渐变成来自英国、法国、荷兰等国的海盗的据点。到16世纪末，这些海盗已经严重地威胁西班