，台湾亦爆发戴潮春之乱，此乃继朱一贵、林爽文之后的大乱事。同治二年六月，林文察升至陆路提督，带兵返台平乱, 至同治四年方渐平息。由于抗清领袖均系林家族敌，因此乱事渐平后，其他大族没落，戴潮春事件时林文察收购或佔有大量房屋土地，使林家田产倍增，并因平定戴潮春事件有功，得清廷赏赐全福建省（当时包含台湾）的樟脑专卖权, 林家蜕变为中部第一大家。林文察在中国与太平军作战而阵亡后，林文明继任族长，林文明利用处理戴潮春事件叛军财产的机会，再次大力扩充家业。得罪公家与民家，屡遭诉讼，最后被官府当庭斩首，林家一度想要造反，