第一部由第一集到第十二集，主要讲述了北宋仁宗景祐年间，于阗被黑汗王朝灭国，于阗小公主梅朵在于阗僧人的护卫下逃往敦煌投奔姊姊珍娘，途中与一心独霸西域的西夏景宗李元昊相遇。
第二部.第二部由第十三集到第三十集，主要讲述了清末，工部主事秦文明奉旨前往敦煌征玉，离奇失踪，死不见尸。恋人春霞也因此变疯。秦文明的孪生兄弟秦文玉奔赴敦煌寻兄，却陷入了一场云谲波诡的阴谋之中。
第三部.第三部由第三十一集到四十六集，主要讲述西元1936年(民国25年)，抗战全面爆发前的