左光禄大夫、开府仪同三司。永和二年（346年）领司徒，录尚书六条事，与会稽王司马昱共同辅政。次年扬州刺史殷浩因父丧离职，蔡谟加任扬州刺史。
拒受司徒.永和四年（348年），蔡谟获迁任侍中、司徒。但蔡谟坚持辞让，即使临朝的皇太后褚蒜子下诏不许，蔡谟仍辞让，更向人说：「我若为司徒，将为后代所晒，义不敢拜也。」诏命连续下达整整一年，蔡谟仍不受。永和六年（350年），蔡谟更上表求退，要送呈左光禄大夫及领司徒的印绶。后穆帝临轩征召蔡谟，蔡谟竟派主簿谢攸回报，不肯奉诏。穆帝即使由朝到晚派了使者