，首回合于9月15日举行，南华作客乌兹别克尼夫治，在曾领先3比2的情况下，最后因补时阶段被罚具争议性的十二码，以4比5仅负，惟取得四个作客入球。次回合开赛前，T史高斯及陈肇麒被罚临时停赛，令南华失去两名进攻重心。次回合于9月30日于香港大球场举行，南华凭巴西前锋卡里祖于开波2分钟头槌建功，在超过20,000名情绪高涨的主场球迷见证下以1比0胜出。两回合双方打成5比5，南华凭作客入球优惠，晋身四强，将会对科威特联赛冠军阿尔科威特。2009年亚洲足协盃四强首回合于2009年10月15日举行，南华作客阿尔科威特