待上大约3年，在这3年中，它们会消耗自身包含的铀的3%，在这之后，它们会被送到乏燃料水池，在这里，核裂变中产生的一些半衰期短的同位素会衰变掉。在这里待上大约5年后，这些反应棒的放射性会降低到安全范围之内，之后就会被装进干式贮存桶永久储藏，等待未来进行深地质处置或被送到再处理工厂进行再处理。使用铀作为燃料的反应堆中，裂变产物中包括钚，一种可以制造核武器的裂变材料，因此反应棒的再处理有时会引起国际争议。