部队本队分道扬镳，独自参与珊瑚海战役。1942年5月珊瑚海海战中，“翔鹤”号和“瑞鹤”号舰载机击沉美军“列克星敦”号、重创“约克镇”号航空母舰，然而“翔鹤”号也受损，且与“瑞鹤”号的舰载机均损失过半，必须回国修理。因此两舰没有参加1942年6月的中途岛海战，而由于中途岛海战日本海军一举损失四艘大型航空母舰（即赤城，加贺，苍龙，飞龙），故翔鹤级两舰随之成为日本海军西南太平洋鏖战中的主力。而在中途岛后由于航母的损失，第五航空战队遭到撤裁，两艘翔鹤级转调至第一航空战队。之后接连参加第二次索罗门海战、南太平洋海