。经验值和升级系统取自《最终幻想III》。田中称游戏战斗系统机制最初是为《最终幻想IV》设计的。而如同《最终幻想IV》的制作，《圣剑传说2》中未使用的功能被《时空之轮》团队取用。最初的计划将《圣剑传说》作为超级任天堂CD扩展的首发作品发行。在任天堂和索尼的制作计划告吹，索尼决定转而将超级任天堂CD开发为PlayStation后，史克威尔选择继续为超级任天堂开发游戏。游戏转而面向容量较小的标准游戏卡带开发。因CD扩展的取消势必导致大量游戏内容被砍，开发者反对在此情况下继续开发，但他们被公司管理层驳回。最终