于1879年6月15日启用，初期是连接哥本哈根至腓特烈松的铁路终点站，位置也大致是现在的位置。1928年Hvalsø⟷腓特烈松段通车后，腓特烈松站迁至南边500米外的位置，第二代站房启用。当时的腓特烈松还有跨罗斯基勒湾的铁路桥。当时还计划将延线至和希勒勒，但该计划最终因1936年Hvalsø⟷腓特烈松的铁路关闭而取消。此后，腓特烈松站又在新地址运营了50余年。腓特烈松站新老车站间通过巴士接驳。老站房一直是铁路资产，在腓特烈松站在新地址运营期间老站房被用作货运。1989年5月28日，哥本哈根市郊铁路引