之子，郑郏之兄。七岁读《毛诗》、《史记》，常被视为狂士，崇祯八年（1635年），为诸生。黄道周说他：“郑牧仲一日千里，未易才也。”入清后，遯迹于壶公山之南泉，号南泉居士，以遗民自守，专心写作。与叶后诏、黄骧陛、林兰友、徐孚远等结为方外七友。康熙四年（1665年）五月，孚远哭逝，由郑郊和张密经纪其丧。卒年不详。着有《注易》十七卷、《史统》百四十五卷等。