制服.特别任务连的军装为黑色，战斗服装则包括蓝色（过去至现时）、黑色（过去）、深绿色（现时）、城市灰色、、MultiCam（现时）及MultiCam Tropic（现时）等。当中分为连身或分身战斗服，均经过特别的设计，除了具备有一般香港警察军装（防水、阻燃、防菌及阻挡血渍渗透等）功能外，部分服装的外层更特别涂有防止红外线侦测的物料等。
已知装备.特别任务连的装备全部经过精心挑选及设计，全部装备具有防水功能，可于潜水情况底下使用。此外，每名特别任务连人员的随身装备共重逾50磅，因应