迁址后，于2006年搬入新馆办公。日本驻泰使馆以特命全权大使作为，下辖政治、经济和领事等数个部门，并与泰北的并列日本在泰两大使领馆。
沿革.日本与泰国（旧称暹罗）在1887年9月26日签署友好通商宣言，借此建立了外交关系，而日本外务省于移民增加、保护在泰日人等考量之下，也开始决定在当地设置日本领事机构。1896年2月29日，日本众议院以多数决赞成设馆建议案后，开馆的预算也开始进行安排。1897年3月31日，日本正式通过了首任驻办公使稻垣满次郎的任免令，并于同年在曼谷的东方酒店内开设