多蒙娜丽莎在运用透视法方面和罗浮宫版蒙娜丽莎存在着细微的差异。据推测两幅蒙娜丽莎画像的组合有可能构成了世界上最早的三维图像，如果用左眼观看普拉多版蒙娜丽莎的同时用右眼观看罗浮宫版蒙娜丽莎可能会令人产生立体的感观。这种猜想是合理的，因为达文西曾经在他的《绘画论》中谈及立体感的基本原理。然而近期有报告指出这两幅画并未展现出可信赖的立体深度。
作者.在作品被复原以前，因为它的黑色背景的缘故，普拉多版蒙娜丽莎有时会被当作是一名佛拉芒画家的作品。另外还有一个原因就是长期以来作品的木制框架被假