根据美国法律规定，伊利诺伊铁道博物馆为免税的非营利组织，博物馆的董事会从160名表现积极会员中选出，负责博物馆的日常运作。董事长由董事会选举，负责协调各部门之间运作。博物馆的主要部门有蒸汽机车，柴油机车，电力机车，客车，货车，号志，基础设施，无轨电车，公共汽车和动态展览等。其他部门有图书馆，电力设施和展示教育等。各部门首长由志愿者担任，职员也多由铁路迷自愿承担，博物馆亦提供相关岗位训练。
大众文化.由于伊利诺伊铁道博物馆地理位置和芝加哥较近，并且藏品众多，因此常用于铁路题材的电影拍