候选人或无法凝聚全国选民的候选人资格的情况并不罕见。此导致了候选人的人数受到限制。总统选举的选举活动历时3个月，自2016年2月初开始至选举日前夕为止，濯足节和耶稣受难日时暂停选举活动。点票工作先在个别选区进行，然后再进依次序行市内及省内点票，而菲律宾国会是最后的点票机关。而选后对结果的异议则由菲律宾最高法院的总统选举法庭负责处理。
背景.时任菲律宾自由党参议员贝尼格诺·阿基诺三世在2010年总统选举中赢得42.08%的选票，击败曾在2001年因贪污罪名而下台的前总统约瑟夫·埃