::地理.科莫多国家公园包括弗洛勒斯岛的西海岸、科莫多岛、林卡岛、帕达尔岛和26个其他较小的岛屿。这一地区有活火山，地形比较崎岖，以圆山为主要特点，最高海拔为735 m。这一地区的气候属于印度尼西亚较为干旱的地区之一，年降水量约800-1000mm。在旱季（5月至10月），每日平均气温约40℃。
保护.帕达尔岛和林卡岛的一部分在1938年建立为自然保护区。科莫多岛在1965年对外宣布成为保护区，并在1977年时成为联合国教科文组织生物圈保护区。1980年三个岛屿合建国家公园，