泛亚铁路工程最大的问题，是多数利用既有的铁路线，必须统一轨距。 另外通关、边检等问题都需要各国协商。
路线.根据新华社2004年8月31日报导，泛亚铁路由三条线组成：
东线.由昆明市的昆明南站向南至河口口岸与越南铁路相接，有改造既有米轨铁路和新建准轨两个方案，形成昆明至新加坡国际铁路通道运营总里程5500公里，其中境外新建线430公里。目前还有胡志明市~金边市，以及泰柬边境波贝市~泰国曼谷尚未建成铁路。该线的主要优点是，可充分利用既有铁路设备，新建