午12时57分发出代表飞机发生紧急状况的「7700」识别电码，且依照国际惯例与标准作业程序向中华民国交通部民用航空局（民航局）申请紧急降落在最近的高雄国际机场，但民航局顾及小港机场民航机起降班次频繁，而建议美机转赴位处不远，曾为前美军驻台基地的台南机场降落。而为维持任务编制的完整性，另外一架编号「410」且未挂弹的F/A-18大黄蜂式战斗攻击机也随后申请降落。由于这时2架美军战斗攻击机已经因为宣告紧急状况而飞抵台湾南部上空，因此民航局飞航服务总台高雄进场台立即协助引导飞机降落至位于台南市的台南机场。