于一些难治的临床表现如纤维肌痛、大肠激躁症等，一些病人可能会从主流医学之外寻求治疗方法。
反响.整合医学有时会和所谓“万能”的却备受诟病的替代医学混为一谈。主要问题在于替代医疗实践是否已经通过了客观的测试。1998年，前《新英格兰医学杂志》编辑Arnold S.Relman 在《新共和》杂志发表文章称：世上不存在传统医学和非传统医学两种医学，也不存在所谓的结合两种医学的整合医学。也不是Andrew Weil和他的朋友试图让我们相信的那样，世上同样也不存在两种思路来判断治疗是否有效。