架冲8-Q400外加4架多尼尔328JET替代了之前的运-7机队，并从海南航空本部调入波音737投入干线航空运营。2002年10月27日起，长安航空和“海南航空集团”旗下的其他三家航空公司（即，海南航空、中国新华航空、山西航空）实施了合并运行，统一使用海南航空的IATA代码“HU”、涂装以及企业形象系统。在这之后变为海航在西安的运营分公司。其自有客机涂装除公司名称仍是“长安航空”外，其余与海南航空本部的标准涂装无异。随着大新华航空于2007年11月29日正式成立，长安航空的资产也并入了新成立的企业。