时被对手林郁方指控支持毒品合法化，林郁方称其依据为林昶佐的募款茶会出席来宾包括浊水溪公社主唱柯仁坚，而柯仁坚曾支持大麻、安非他命合法化；以及林昶佐曾在2008年与谢长廷的青年座谈会上，代表网友与观众向谢提问「你支不支持大麻合法化？」。林昶佐于后在Hit FM联播网《蔻蔻早餐》、民视《头家来开讲》、三立《新台湾加油》、JET频道《新闻挖挖哇》等电视、电台节目上，并在其龙山寺造势活动的演讲，否认自己支持毒品合法化，表示这是扣帽子、不讲道理的妄加揣测。竞选期间，林昶佐曾于脸书表示，台湾的祖国曾是日本，却不像真