为旧德山藩藩士末次操九郎的次子。末次中学在就读，1896年（明治29年）入读海军兵学校，在27期生114人中排名50。1899年（明治32年）毕业，成为海军少尉候补生。1900年（明治33年）8月10日在战列舰富士上服役，同年12月6日调到防护巡洋舰松岛上。1901年（明治34年）1月18日晋升为海军少尉，调到济远服役。1902年（明治35年）10月6日晋升为海军中尉，11月25日调至第3鱼雷艇队。1903年（明治36年）9月14日调至第5鱼雷艇队，26日临时代理旧式铁甲舰的分队长。1904年（明治