初全国废府州厅改县，于民国元年（1912年）废州为县。在抗日战争和第二次国共内战期间，高邮县澄子河以南地区曾属江高行政区、江都县，高邮县湖西地区曾先后属天高县(天长县)、甘泉县、东南县、仪扬县、仪征县。中华人民共和国成立后设高邮县。1991年2月，经中国国务院批准撤县设市，4月1日正式建高邮市（县级）。