教练会的「游向北京」计划的部分奖金及游泳教练和家长捐款成立「蔡晓慧游泳基金」以减轻香港年轻游泳运动员的经济压力；该基金于翌年6月首次颁发。2009年6月，蔡晓慧的十字韧带撕裂，但她在完成香港东亚运赛事后才动手术医治。同年8月29日，蔡晓慧在得到香港业余游泳总会提名而成为「香港2009东亚运动会火炬接力传递」火炬手。蔡晓慧于2009年12月10日在香港主办的东亚运女子4x100米混合泳接力以破香港纪录成绩夺得铜牌，结束14年运动员生涯。退役后的蔡晓慧在中国香港体育协会暨奥林匹克委员会工作，以自由身份担