5世纪开始，巴统就受到鄂图曼帝国和乔治亚人的反复争夺，直至1723年巴统成为了鄂图曼帝国的一部分为止。土耳其人的征服开始了迄今巴统地区的伊斯兰化，但此行动在19世纪中期俄罗斯帝国佔领格鲁吉亚后就终止了，并得到很大程度的逆转。1878年3月23日圣斯特凡诺条约签订，巴统改由俄罗斯帝国统治。由于巴库发现石油，西方资本包括罗斯柴尔德家族投资了巴统使得它成为一个面向西方的中转港。来自巴库的石油在这里被精炼并装船运往法国等地。1878年8月28日，巴统被宣佈为自由港，这到1886年才终止。巴统城的拓展自1883年