华民国建立之初，全国废厅。民国二年（1912年）改“南州直隶厅”为“南州县”，1913年9月更名为“南县”至今。民国十八年的《南县乡土笔记》载：民国肇造……经省议会议决，改南洲厅为南县。南县之名相称至今。1943年5月9日至5月12日，侵华日军在华中方面军司令官畑俊六的率领下，在南县厂窖镇屠杀了三万余中国平民百姓，强奸当地妇女两千多人，犯下滔天罪行，震惊中外，史称厂窖惨案。后来当地建有厂窖惨案遇难同胞纪念碑。2013年，厂窖惨案遗址被中国国务院列入第七批全国重点文物保护单位（近现代重要史迹及代表性建筑）