体反应性的T细胞族群数量增加，并延长后续的发炎反应。虽然会用检测抗甲状腺抗体来追踪与诊断自体免疫甲状腺炎，但是一般却认为它们不会直接破坏甲状腺。
对人类生殖的影响.孕妇身上若有抗甲状腺抗体存在，她们发生（ 1.5，95%信赖区间1.1–2.0）、流产（OR 3.73, 95% CI 1.8–7.6）、反覆流产（OR 2.3, 95% CI 1.5–3.5）、早产（OR 1.9, 95% CI 1.1-3.5）和孕妇（OR 11.5, 95% CI 5.6–24）的风险比没有