这令格瓦拉完全地被隔离。格瓦拉一厢情愿的所谓革命最终不但没有得到人民甚至玻利维亚共产党的支持反而使民心倒向政府一方，玻利维亚政府的军事行动在美国的援助之下节节胜利，令格瓦拉的形势显得十分不妙。
结局.1967年10月在玻利维亚拉伊格拉，格瓦拉游击队中的一个逃兵向玻利维亚特种部队透露了格瓦拉游击队的营地。10月8日，当格瓦拉在拉伊格拉附近带领巡逻，特种部队包围了营地并且捉住了他。他在他的腿受伤后投降。他被捕获时身份仍然不为人所知。当巴里恩托斯知道他被擒马上命令处死他。格瓦拉被囚在一个