各方曾多次展开和平对话，并于1999年达成《》。尽管卡加梅、卡比拉和涉入的外国政府皆为签署协议，由于签署者并未包括诸反抗组织，因此武装斗争并未协议签署而结束。卢旺达爱国阵线于2000年时仍高度介入战事并和多方交战，除了于基桑加尼和乌干达军方交战，亦于与加丹加省和卡比拉的部队交战。2001年1月，卡比拉于总统府遭射杀身亡。刚果民主共和国政府声称兇手为卡比拉的其中一名护卫，并称其已于现场遭击毙。法国报纸《世界报》所刊登的一则报导则指出，卡比拉是遭自己于第一次刚果战争时组建的童兵团卡多戈（Kadogo）所击毙