马尔堡大学还设有性别研究中心、近东与中东研究中心等16个不同学科的研究中心。马克斯-普朗克陆地微生物学研究所也设在马尔堡大学。马尔堡大学有新旧两座植物园，以及宗教收藏馆和民族收藏馆，还拥有四个博物馆：图像艺术博物馆、文化历史博物馆、解剖学博物馆和矿物博物馆。
声誉.上海交通大学2008年世界大学学术排名将马尔堡大学排在德国第15-24位、欧洲第80-124位和世界第201-302位。英国《泰晤士高等教育》与QS公司联合发布的2008年世界大学排名将马尔堡大学排在世界第368