序为单系群。
分类.
1997年分类.根据大卫·R·林德柏格（David R. Lindberg）及温斯顿·旁得（W.F. Ponder）在1996年出版的腹足纲分类表 (1997年)，珍珠蜑螺总目在原来前鳃亚纲演变而成的真腹足亚纲（Orthogastropoda）之下。只有古轮螺科一个科的古轮螺总科（Palaeotrochoidea）是珍珠蜑螺总目的成员，但其目位置未定。详见古轮螺科条目。
2005年分类.根据布歇特和洛克罗伊的