解放军基建工程兵财务制度，第502大队在国家基建投资中开支；其他支队、大队执行冶金工业部地勘财务管理制度，在国家地质事业费中开支。3个支队和所属15个大队的地区性党政工作和军事行政工作，分别由沈阳军区、北京军区、济南军区、兰州军区、成都军区、昆明军区、广州军区代管。
冶金工业部为主双重领导时期.中央军委、国务院［1984］73号、120号文件精神，基建工程兵黄金指挥部从1985年1月1日起列入武警部队序列，称中国人民武装警察部队黄金指挥部，受冶金工业部和公安部双重领导，以冶金工业部