桿菌属与芽孢桿菌属的特色，因此分类地位曾倍受争议，1957年，第七版依据生化特性将其归入芽孢桿菌属，但「芽孢乳酸菌」的名称仍被广泛使用。虽然凝结芽孢桿菌可以产生乳酸，商品行销时也常被称为一种乳酸菌，但严格说起来它并不属于乳酸菌，因为乳酸菌通常只包含乳桿菌属、链球菌属与的细菌，这些细菌都不会形成内孢子，不过凝结芽孢桿菌属于芽孢桿菌属，会形成内孢子。
益生菌.多数益生菌在室温下不稳定，经过冷冻、干燥等加工过程后，制成药品或食品添加物时多数细菌都已经失去活性，加上被食用后还会被消化道