二层式2面4线的车站，并同时增设月台与拆除干线道路的平交道。有关工程已于2012年10月21日完成。路线在糀谷站的东侧回降到地上，经过产业道路和环八次的平交道，再进入地下的大鸟居站。之后路线返回地上，在 首都高速公路速羽田线羽田出入口下穿过，到达穴守稻荷站。路线随后再进入地下，横过海老取川与东海道货物线，抵达天空桥站（此站与同在地下的东京单轨连接）与羽田机场第3航站楼站，再通过建筑在羽田机场停机坪与跑道的地底，到达羽田机场第1、第2航站楼站。