政府宣佈取消黑名单，释放因主张台湾独立而被捕的「叛乱犯」，并承认主张台湾独立人士的结社权。陈婉真成为当时街头运动的代表人物。1992年，陈婉真以「中华民国终结者」为口号，代表民进党于台北县当选第二届立法委员，在立法院以强烈的肢体语言屡次挑战行政院长郝柏村。1993年2月1日，陈婉真宣誓就任立法委员；但几天后，她宣布要做一名称职、全职的立法委员，因此辞去台湾建国运动组织所有职务，并与台湾建国运动组织划清界线。1993年，中国国民党立法院党团强行通过「国安三法」，民进党立法院党团佔据立法院议场主席台阻挡