同地球一样，大气层的最高处，外逸层的顶端，也没有明确的界限。密度梯度逐渐降低，直到平稳的转入星际物质之中，这大约是在"表面"上5000公里的高度。木星大气层的垂直温度变化与地球大气层相似，对流层的温度随着高度降低，直到抵达对流层顶温度也到达最低值，对流层顶是对流层和平流层的交界处。在木星，对流层顶大约在可见的云层（或1大气压之处）之上50公里，该处的气压是0.1巴，温度110K。在平流层，当转折至增温层时温度已上升至约200K，高度大约是320公里，压力为1微巴。在增温层，温度继续上升，大约在1,000