结构.头孢曲松是一种橙黄色的结晶粉，可溶于水，仅溶于甲醇及甚少溶于乙醇。1%的头孢曲松溶液的pH值约为6.7。甲氧基亚胺的结构能提高在于对革兰氏阴性菌所分泌的β内醯胺酶的稳定性。这种特别的稳定性能增加头孢曲松对抗革兰氏阴性菌的阻力。取代头孢噻肟易于水解的乙醯，头孢曲松的一端有着代谢稳定的偶氮离子酮。