弗拉卡斯托罗主张传染病是通过接触传染，他也是梅毒（"Syphilis"）及斑疹伤寒（"typhus"）的命名者。人类第一次看到病原体(病原微生物)，形式上来说普遍认为是1684年荷兰科学家安东尼·凡·列文虎克通过光学显微镜进行的细菌观察。列文虎克对显微镜的改良，使细菌变得易于被肉眼所观察。1838年，表示细菌意义的拉丁语 ""bacterium"" 出现；像如今这样判明病原体则是在19世纪以后，法国科学家路易·巴斯德及德国科学家罗伯特·科赫对此居功至伟。尤其是科赫，他在1875年首次使用光学显微镜观察