疟原虫的表膜-线粒体功能，通过影响疟原虫红内期的超微结构，使其膜系结构发生变化。由于对食物泡膜的作用，阻断了疟原虫的营养摄取，当疟原虫损失大量胞浆和营养物质，而又得不到补充，因而很快死亡。其作用方式是通过其内过氧化物(双氧)桥，经血红蛋白分解后产生的游离铁所介导，产生不稳定的有机自由基及/或其他亲电子的中介物，然后与疟原虫的蛋白质形成共价加合物，而使疟原虫死亡。 此外，青蒿琥酯能有效抑制恶性疟原虫输出蛋白1（EXP1），一种膜谷胱甘肽S-转移酶，使得寄生虫体内谷胱甘肽的量减少。2015年，Wang等人利