他担任在第三届众议院议员，期间他唿吁建立保护性关税和成立一支强大的海军，共同起草的1794年法令，授权建立起。1794年，菲茨西蒙斯未能赢得连任。他被击败，后者在费城的十二个选区中赢得了七个选区，并拥有57%的支持票。这部分归因于公众舆论反对联邦党在威士忌暴乱中对叛乱的镇压。菲茨西蒙斯虽然不再担任某一职务，他在1798年，担任一个商人委员会，监督捐款后建立的一艘用于美法短暂冲突的军舰。1802年，他跟随随着塞缪尔·西特格里夫斯奔赴英国。
晚年.尽管退出政治，菲茨西蒙斯仍然活跃在民间