树纪念馆、新北市客家文化园区以及正在兴建的新北市立美术馆，若再加上国家级的原住民族博物馆，可望打造出新北市「博物馆特区」吸引庞大观光人潮，因此桃园高铁站特定区最后仍然不敌三莺新生地而落选。
重新选址.最后张善政为了调解桃园市和新北市的博物馆之争，宣布博物馆地点重新评估。
尘埃落定.2017年9月21日原民会宣布，博物馆兴建地点落脚在高雄市鸟松区澄清湖。花莲县原住民行政处长陈建村表示，花莲县有将近十万原住民，涵盖六大原住民族群，人数位居全国第一，也是许多外县