袁崇焕等将领的抗击下，收复锦州以西地区。。
西北地区.明成祖永乐年间，西北疆界达到今新疆东部哈密地区，并设置沙州、安定、阿端、曲先、赤斤蒙古、罕东左一系列卫所。15世纪30年代之后，西北吐鲁番与青海蒙古部日益强大。1472年，哈密卫城一度被吐鲁番攻破，卫内迁，后复，1514年再度被并。16世纪后半期后，西北诸卫全部丧失，明军退守嘉峪关。
西南地区.明朝在1381年才将云贵地区完全划入疆域，并设置一系列土司、宣慰司管辖之，除正式府州外另设有三宣六慰，永乐年间