吴自新（），字伯恒，直隶祁门县人，应天府江宁县民籍，明朝政治人物。
生平.应天府乡试第八名举人。隆庆二年（1568年）中式戊辰科二甲第六十九名进士。初授工部都水司主事，擢杭州府知府。迁浙江兵备副使，歴浙江左右布政。入爲太常寺少卿。万历十八年（1590年）擢都察院右副都御史，巡抚河南，陞南京刑部侍郎。
藏书.吴自新一生嗜读书，晚年尤好易学。嗜书，曾辟“玩易窝”、“万卷楼”以藏书。
家族.曾祖吴佳；祖父吴节，寿官；父吴明德，母李氏；继