后龙溪主流上游，流域跨越泰安乡、狮潭乡、大湖乡及三个乡。该溪发源于泰安乡梅园村标高2,618公尺的鹿场大山西南山谷，先向西南西流，汇集源自东洗水山的支流东洗水溪后转向西，流经上岛、虎山、八卦力后，于八卦口地区转向西南，以开口朝北的半圆弧形流经清安（泰安乡公所所在地）、砲石，于汶水与来自南方的大湖溪汇合后，改称后龙溪。汶水溪由八卦口至清安段为泰安乡、狮潭乡的界河，清安至汶水段为狮潭乡、大湖乡的界河。
水系主要河川.以下由下游至源头列出水系主要河川，其中粗体字为主流河道。