格达费之后，博卡萨决定改宗回教，放弃原本天主教的信仰，并且于1976年10月18日将他的名字改成「萨拉赫丁·阿迈德·博卡萨」。一般都认定这是他打算确保利比亚能持续提供财政支援的算计手法。当格达费没有承诺任何赞助时，博卡萨放弃了他新的宗教信仰。这也与他要在班基天主教大教堂加冕成皇帝的计画不一致。
总统任内.博卡萨夺权后实行独裁统治，内外政策变化莫测，政府不断改组(1年6次)，总统权力日益扩大。博卡萨政治态度亲法反共，因此上台后于1966年1月6日与中华人民共和国断交，改于1968年5