前往新加坡定居，并于翌年入读新加坡南洋大学中文系（后来转修历史系）。在南大就读期间，他一方面在《星洲日报》、《南洋商报》等报刊写作，另一方面也撰书介绍马来亚文学和印尼文学。他在1962年毕业，获颁文学士学位。然后，他在1962年转到印度尼西亚大学，主修印尼历史，至1965年毕业，获颁硕士学位，期间廖建裕开始对印尼华人社群产生兴趣，并在毕业论文讲述印尼土生华人开办的报刊和20世纪初印尼民族主义运动的关系。从印度尼西亚大学毕业之后，廖建裕先到澳洲蒙纳士大学研究东南亚史，于1970年获颁硕士学位，再到美国俄亥