，在这个政府中波尼亚托夫斯基于10月7日成为战争部长和华沙国家军队领导人（"minister wojny i naczelny wódz wojsk Ks. Warszawskiego"），在那个时候拿破仑还没完全信任他，依然将军队最高领导权留在路易·尼古拉·达武手里，直到1808年夏才把大权交回。波尼亚托夫斯基在1809年3月21日正式成为司令。 战争部长的目标完全变为了创建，发展这支新的，到处炫耀的波兰军队。公国的部队存在于大多数恶劣的环境下，并在这些环境中作战的，它的成功很大一部分要归功于司令在军