文而命名为孙中山纪念医院。1949年后曾称上海第一医学院附属第二医院、上海第一医学院附属中山医院、上海医科大学附属中山医院，2001年随着上海医科大学并入复旦大学而改用现名。2020年12月5日，国家放射与治疗临床医学研究中心落户复旦大学附属中山医院，葛均波担任中心主任。
特色.特色为治疗心血管病、肝癌、肺病等的科室。