个差异曾经在市场引起巨大争议。此外，南航在航线审批、航班时刻申请、飞机引进、资本金注入等直接关系其盈利水平的行政审批事项上，也获得了明显的优势。截至2009年9月30日，南航总资产925亿元，总负债793亿元，资产负债率达85.73%。信用评级公司惠誉国际曾对南航的财务状况表示担忧，称南航存在高财务杠杆、大量资本性支出承诺、应对高油价和控制成本的能力脆弱等问题。
价格争议.2009年，南航曾在其网站上推出由广州出发的199元系列特价境外机票，价格甚至低于廉价航空公司亚洲航空当天