相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且可能出现在一个还未有蛋白质的核糖核酸世界。虽然以下两种剪接可以在没有蛋白质的情况下进行，但依然会额外的使用5个RNA分子(snoRNAs)及超过50多个蛋白质，并水解多个三磷酸腺苷（ATP）分子。使用 ATP 是要提高剪接mRNA的准确性，避免出现错误。以下两次转酯化是自剪接的特征：以下是自剪接的特征（与第Ｉ型相同是两次交酯化）：的自剪接过程则类似第二型内含子。以下为其他特征：
转运RNA剪接