利后，李聚奎任冀热辽军区参谋长，指挥古北口保卫战。1946年1月，任北平军事调处执行部执行处副处长，12月调东北。1947年初，任西满军区参谋长，参与三下江南战役和东北夏秋冬攻势作战。1948年4月任东北军区后勤部参谋长兼西线后勤司令员、政治委员，参与辽沈战役和平津战役的后勤保障工作。1949年，任第四野战军后勤部第二部长，参与组织四野南下的后勤保障工作。
中华人民共和国成立后.中华人民共和国成立后，任中南军区副参谋长。1950年任东北军区后勤部部长，负责中国人民志愿军的后勤工作。