格道尔吉在2008年9月2日辞去民主党党主席职位。
任职总统.在2009年4月3日的民主党大会上，额勒贝格道尔吉被选为民主党总统候选人。在大选中他获得了51.21%的选票，击败了获得47.41%选票的蒙古人民革命党候选人那木巴尔·恩赫巴亚尔。蒙古国会在6月5日决议通过选举结果，承认额勒贝格道尔吉为新的蒙古国总统。国际货币基金组织的数据显示，他在总统任职期间推行的反腐败和促增长政策，经济于2011年增长了17%，2012年增长了12%，使蒙古跻身于世界上经济增长最快的五个经济体之列。