国立台湾科技大学、国立台湾师范大学。。另外5所大学包括5个研究中心获得特别补助：国立台湾海洋大学、国立中正大学、中国医药大学、台北医学大学、元智大学。除本计画外，教育部对技职体系之大专院校，设有「发展典范科技大学计画」；与奖助提升教学品质的「奖励大学教学卓越计画」。
各校每年补助金额与重点发展领域.
第一期第一梯次.本计画分为「一流大学」及「顶尖研究中心(重点领域)」执行，获选一流大学者实补助2亿元以上，并通常有数个研究领域；获选重点领域者，补助约1亿元，