长断层泥岩与砾石的堆积带，使得该工程段的涌水量大并且岩压异常。台电以安全为考量，决定将此段放弃，并从6号横坑另绕道重新衔接7号横坑的施工路段。第二段改线的隧道路段为11.4公里处至11.5公里处，其原因在于，最初在进行隧道定线时，因设计的台电仅以小比例尺的地形图绘制，导致原隧道行经路线在经过磐东溪时会凸出地面，因此经会勘后将路线绕至磐东溪下方通过。并且，台电在进行绕线规划时，顺势调查了隧道上方的磐东溪的流量测计工作，后于1980年9月时获得的流量数据为0.08秒立方公尺。经评估，如将磐东溪溪水引入奇莱引