州加入后，联盟国将首都从阿拉巴马州蒙哥马利迁至弗吉尼亚州的里士满。密苏里州与肯塔基州政府继续留在合众国内，但两州内的敌对派系被联盟国招揽，所以联盟国成员州数有时被视为13个。印第安领地（后来的俄克拉荷马州）上的五个部落政府主要也是支持联盟国。新墨西哥领地南部（包含盖兹登购地）加入联盟国，成为亚历桑那属地。其首批移居者请愿，要求联盟国政府归併其土地，并促使探险考查北纬34度以南属联盟国管辖的区域。亚历桑那军队经官方承认为联盟国的武装力量。将军在其之前，对新墨西哥居民发佈宣言，企图将他对该属主的管辖