四个大门仍维持开放，其他出入口改为实施门禁管制。
沈葆桢厅牌匾争议.马英九市府时期，台北市市政大楼一楼中庭命名为「沈葆桢厅」和挂上「沈葆桢厅」牌匾，2006年12月揭牌。2015年台北市议员李芳儒要求柯文哲市府推动台湾原住民族转型正义，2016年6月台北市市政大楼公共事务管理中心取消命名和移除牌匾。