认为这次特别的军训的目的在于灌输思想。此后，每年六四大学都比较紧张，部分地区会有警车停在大学校园门口。
军队人事调整.在6月3日-4日的镇压中估计有3500名解放军军官不服从命令。西方媒体报导，在6月4日之后，这些军官面临了军事法庭的审判。虽然没有得到证实，但从1990年开始，军方领导层进行大面积改组，指挥官的职阶被下降到师级。这样的情况持续了数年。第38军的前军长徐勤先将军因拒绝执行戒严，在事后被开除党籍、开除军籍，并判处五年以下有期徒刑。在清场中执行任务最积极的部队和将领