历代中心的鄂尔浑河畔之回鹘汗国遗址、原蒙古窝阔台汗驻跸之地，又是喀尔喀蒙古历代土谢图汗的主要召庙。额尔德尼召一度是喀尔喀唯一的的召庙。但后来额尔德尼召并未成为喀尔喀蒙古的首府。其主要原因之一，可能便是额尔德尼召崇奉萨迦派经典。1635年，土谢图汗衮布多尔济之子罗布藏旺布札勒仓成为第一世哲布尊丹巴，从而成为喀尔喀蒙古最早的温都尔格根。他在蒙古剃度受戒之后，在1649年到西藏朝拜班禅、达赖，取经并受戒。由此，温都尔格根信奉黄教（即藏传佛教格鲁派）。当时，黄教势力骤然扩大，在清朝皇帝的扶持之下，在西藏及蒙古发