，动拖比为4M4T。为了避免干扰列车自动保护系统的运作，台铁首次将动力车编组的配置更动，改为驾驶拖车TED1000型、马达车TEM1000型、电源动力车TEP1000型以及马达车TEM1000型的编组方式，而后续引进的TEMU2000型电联车以及EMU800型电联车皆採用相同编组方式。TEMU1000型电联车一共有376个座位，由于此车种所开行的太鲁阁自强号不开放无座搭乘，而是採取全车定员划位制，故载运上限即376名乘客。参考资料：
编组方式.第一批车辆于2006年12月17日运抵