国初，由于公路、铁路以及大型轮船货运的发展，上新河逐渐没落。1927年，南京国民政府成立，因建设需要，上新河的木业一度盛极一时，但1931年的自然灾害又使其遭受了重挫。20世纪30年代，上新河镇、北圩镇等乡镇划归上新河区，区公所驻上新河镇。1937年，中日战争爆发。是年12月，日军攻占南京后展开南京大屠杀，上新河地区为屠杀执行的主要地点之一。中华人民共和国成立后，上新河镇和上新河区均被撤销并入建邺区。21世纪，因建设河西新城，上新河地区的建筑被大批拆除改建为现代建筑。
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