层地下水的污染。卡拉奇的水污染如此严重以至于居民只有煮沸才可以使用。在这个城市，由于大多数地区排污设施和供水系统互相交错，水网的泄漏成为污染的主要原因。诸如此类的污染问题在伊斯兰堡和拉瓦尔品第也开始出现。在绝大多数城市，空气污染渐渐成为重要问题。汽车污染没有得到有效控制，总计90％的空气污染来自汽车。国家可持续发展报告指出，有25％的一氧化碳来自汽车排放，是其他碳氧化物的20倍；和美国相比，汽车每公里氮氧化物的排放量高出3.5倍。另一个问题即噪声污染在国家可持续发展报告没有提及。自1960年代开