于巨噬细胞所在的组织和特定微环境。一方面来说，巨噬细胞极化对人体防御病原体是十分重要的，另一方面而言，它对维持生理恆定也很重要。 延长的巨噬细胞M1型对个体是有害的，而这也是为何组织修复是必要的。M2巨噬细胞的功能就是使组织修复，即便他们也被认为与慢性传染病有关。
M1巨噬细胞.典型活化巨噬细胞是由Mackaness于1960年代命名的。他们会表现转录因子，像是（interferon-regulatory factor）、NF-kB（核因子活化B细胞κ轻链增强子，nuclear f