托斯代表执政党参选。同年，桑托斯作为执政中间偏右民族团结社会党的候选人参与哥伦比亚总统选举，在6月20日举行的总统选举第二轮投票中，桑托斯以高票战胜在野中间派抉择绿党候选人，当选为新一任哥伦比亚总统。2012年，在以古巴和挪威作为担保国、以委内瑞拉和智利作为观察国的斡旋框架下，哥伦比亚政府与哥伦比亚革命军双方开始在古巴首都哈瓦那进行和谈。2016年6月23日，哥伦比亚总统胡安·曼努埃尔·桑托斯与哥伦比亚革命武装力量在哈瓦那签订停火协议。8月24日，哥伦比亚政府与哥伦比亚革命军在古巴首都哈瓦那达成最终全面