督鴈门等关巡抚山西。历改廵抚延绥。嘉靖二十九年（1550年）任右副都御史、保定巡抚。不久俺答汗入犯，杨守谦率兵勤王，世宗大喜，命其在崇文门外扎营。副总兵朱楫，参将祝福、冯登亦各自率兵抵达，人心稍定。俺答汗率兵游骑散掠枯柳诸村，距京城二十里。杨守谦在东直门扎营，同仇鸾调度京城及各路援兵。因防御有功，升兵部左侍郎。然而，尚书丁汝夔采用坚壁之策而不愿出战，杨守谦亦不战，流言传入皇宫，两人被逮捕并连坐斩杀。隆庆初年（1567年）赠兵部尚书，谥恪愍。