油机.东方红6型柴油机车装用一台16气缸、V型结构、预燃室式、涡轮增压、中间冷却的16V200Z型四冲程高速柴油机，气缸夹角为45°，气缸内径200毫米、活塞行程220毫米，采用灰铸铁机体、合金铸铁气缸套、半隧道式曲轴箱、悬挂式合金钢全纤维锻压曲轴、铝合金低压铸造活塞。标定功率为2250马力，装车功率为2000马力，额定转速为每分钟1500转。
传动系统.东方红6型柴油机车是单机组设计的六轴柴油机车，由一套液力传动装置驱动全部六根车轴，传动系统包括液力变速箱、万向轴、车轴齿轮箱等