卿与台湾共产党的矛盾中，工会路线是最为突出的问题。台共建党之前，连温卿曾主张在台湾组织台湾总工会以对抗蒋渭水台湾民众党系统的台湾工友总联盟。但台共建党之初的《一九二八年纲领》并没有特别突出台湾总工会路线。因为台共企图将「台湾总工会」路线同台共的亲密战友王敏川所主导的另一条路线相调和，这条路线就是全岛劳动运动统一同盟路线。台湾总工会路线与全岛劳动运动统一同盟路线的差别在于，前者主张由上而下首先实现左派工会之间的内部统一，后者则主张由下而上逐渐实现左右派工会之间的统一。在当时，由于台共《一九二八年纲领》採取了调