转投屯门。2013年，巢鹏飞重返愉园，至2014年1月7日因涉嫌打假波遭廉政公署拘捕。之后，巢鹏飞转投另一甲组球会流浪。2014-15年度，巢鹏飞效力澳门业余球会球会的士之友。
国际赛生涯.2008年11月，巢鹏飞首次入选香港足球代表队。2009年1月1日，举行的省港盃足球赛，巢鹏飞首次代表香港队上阵。2009年1月14日，香港场对印度的热身赛，则是巢鹏飞首场正式国际赛。2009年8月27日，在高雄举行的2010年东亚足球锦标赛预赛，最后一轮对关岛的比赛，首次取得国际赛入球便个人连