开办诊所，在吉隆坡医学研究院研究热带病。1907年，伍连德应邀到英国伦敦参加神学博士文英兰主持的禁鸦片烟会议。同年，应清朝政府聘请出任天津陆军军医学堂副监督（即副校长职）。
抗击鼠疫.1910年12月，中国爆发东北大鼠疫，隆裕太后任命伍连德为东三省防疫全权总医官，赴哈尔滨调查并开展防治工作。1910年12月24日，伍连德率助手即陆军医学堂高年级学生林家瑞到达疫区中心哈尔滨，领导防治工作，在四个月之内控制了疫情。 通过现代医学方法他确定了鼠疫是由唿吸道传播；他为防疫而设计的较为紧