东区现有大专院校二所，分别为国立清华大学、国立阳明交通大学等二校。公私立高级中等学校九所，分别有国立新竹高级中学、国立新竹女子高级中学、国立新竹科学园区实验高级中等学校、新竹市立建功高级中学、新竹市私立光复高级中学、新竹市私立曙光女子高级中学、新竹市私立世界高级中学等普通型高级中等学校七校，以及国立新竹高级商业职业学校、国立新竹高级工业职业学校技术型高级中等学校二校。其他公立教育机构计有新竹市立光武国民中学、新竹市立育贤国民中学、新竹市立建华国民中学、新竹市立新科国民中学、新竹市立三民国民中学、新竹市立培英