例子即为世界上的人不都是双性人，以及杂交完全不同颜色的花产生的后代可能跟其中一个亲代同色，甚至可能与亲代双方颜色都不相同，而是与其一个世代前的祖代同色。达尔文自己曾意识到这两个矛盾，因此开始强烈怀疑融合遗传说的准确性。他在1857年11月12日给托马斯·亨利·赫胥黎的信中写道：在另一封于1866年2月6日写给阿尔弗雷德·华莱士的信中，达尔文提到用豆做的杂交实验（与孟德尔的实验类似），种出了性状相互分离（即性状不混合）的豆，证明他建立在融合遗传上的泛生论是错误的。泛生论也与达尔文的自然选择理论互相矛盾