马加丹位于切尔斯基山脉-科雷马山的冻原生态区。这个生态区包括西伯利亚东北部的山区，是一个极度寒冷和极端干旱的生态区。
植物群和动物群.超过半数的保护区是针叶林，大部分是落叶松。第二种最常见的树种是。在哺乳动物中，常见的种类有田鼠、花栗鼠、鼠兔、棕熊、狐狸、水貂、紫貂、雪貂。
生态旅游.作为一个严格自然保护区，马加丹自然保护区只对得到公园管理部门许可的科学家和以“环境教育”为目的者开放。但是，保护区现在向公众提供了去现场进行生态旅游的机会，但公众游客必须