政府仍具有公法人身分，但成为行政院的派出机关，政策制定与人事任命权均由中央掌握，功能与直辖市、市的区公所类似；省议会则改制为「省谘议会」，成为省政的谘询机关，失去原有立法机关的功能。至于原属省管辖的县、市等地方政府，改由中央政府直接管理，主要监理机关为内政部，各县、市仅在地方区划上仍隶属于省。省虚级化实施后，台湾省受到的影响最大：台湾省政府的组织被大量精简，台湾省议会则依法改组为台湾省谘议会，两者的功能均大幅萎缩。而福建省的政府机构自1956年7月为实施战地政务而精简化。
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