水线昂贵，又比不上港岛线和东区走廊特快线快捷，且部分路线车费大小同价，并且普遍只于平日日间行走，结果半直通路线网络在1990年代起不断萎缩，仅存兼顾西区的线，但该线于西港岛线通车后亦难逃被重创的命运，改为只于繁忙时间服务，不再服务西区。由和线取代其服务。南区的半直通路线则因为未受地铁影响，仍然能维持服务，其中线客量仍然高企。城巴由1991年踏足专营巴士业务时，车费等级表已没有类似市区特快或半直通路线的类别。该公司于1993和1995年先后接办、及线时，即时将有关路线改为全空调服务，并改用全空调路线的站牌