们由某些氨基酸合成，如脂肪族硫代葡萄糖苷，主要来源于蛋氨酸，其余还有丙氨酸，亮氨酸，异亮氨酸或缬氨酸。 （大多数硫代葡萄糖苷实际上衍生自这些氨基酸的链延长同源物，例如，萝卜硫苷衍生自二高蛋氨酸，其是甲硫氨酸链延长两次）。芳香硫代葡萄糖苷包括衍生自色氨酸的吲哚，例如来自色氨酸的芥子油苷，还有的来自苯丙氨酸，其链延长的同系物高苯丙氨酸，和来自酪氨酸的sinalbin。
酶激活.在有水的条件下，植物中的黑芥子酶会从硫代葡萄糖苷中切除葡萄糖基团。 然后剩余的分子迅速转化为异硫氰酸酯，腈或硫氰