菲拉赫、耶塞尼采，并沿索查河通往戈里齐亚和的里雅斯特的铁路有两座超过6000米长的隧道。一战后，斯洛文尼亚境内又陆续建成了几条铁路，其中由奥尔莫日经柳托梅尔至穆尔斯卡索博塔的铁路于1924年建成。第二次世界大战结束后，连接普雷塞尼察至科佩尔的单线电气化铁路建于1967年。1999年，穆尔斯卡索博塔至霍多什的单线铁路得到重建，提供与匈牙利铁路系统的直通线路。该线路始建于1907年，并于1968年关闭——与许多其他线路一同均在1960年代遭到废弃。许多遗留在斯洛文尼亚境内的前南斯拉夫铁路蒸汽机车目前存放