飞燕诺以主场身份出战，决赛阶段汤马臣于五十分钟建功为球队将比数三比一，飞燕诺最终以三比二击败对手多蒙特，汤马臣则成为比赛的最佳球员。2002年暑假，汤马臣与飞燕诺的合约到期，随着欧洲足协盃的成功得到意大利劲旅AC米兰以自由转会邀请加盟。同时汤马臣获丹麦国家足球队入选出席2002年世界盃足球赛，赛事中他更取得四个入球。
AC米兰.在效力首个球季，由于AC米兰拥有舍甫琴科及里瓦尔多在阵，托马森大多数沦为球队后备，出场机会少之又少，但他在欧洲联赛冠军盃取得三个入球，更压倒尤文图斯而赢得赛