。果齿龙的亲缘关系较接近畸齿龙，而与年代相近的棘齿龙关系较远。
古生态学与古生物学.果齿龙的四副化石，发现于莫里逊组的Brushy Basin段的底层，该地层是个砂岩层，过去是个氾滥平原。在弗鲁塔市的相同年代地层，还发现了蜗牛、蛤蜊、龙虾、不同的昆虫（根据足迹化石鑑定）、肺鱼类的角齿鱼（"Ceratodus"）、辐鳍鱼类、乌龟（"Glyptops"）、喙头蜥目的"Eilenodon"与"Opisthias"、数种蜥蜴、一种鳄形类，以及哺乳类的"Fruitafossor"、"Glir