53年，当女王玛丽亚二世难产逝世后继承王位。在父亲斐迪南二世帮助下，佩德罗五世在位期间积极公共事业如道路、铁路、电报等及改善公共卫生，所以民望极高，深得人民爱戴。不幸的是他及其弟斐迪南皆在1861年爆发的一场霍乱中染病逝世。其二弟路易斯继承王位，是为路易斯一世。