学兴盛之后，火葬逐渐衰落。元朝规定土着汉人一律土葬。明清之际中国仍禁止火葬，但仍无法完全根除火葬的习俗，据明嘉靖《尤溪县志·地理卷·谣俗》记载，“普通民众逝世，尸体积柴而焚之”，吴县通济寺设焚化亭，供民间火葬。清初受到佛教影响，允许火葬，清兵入关前，满洲风俗也是实行火葬，例如努尔哈赤去世后为火化，称为“宝宫”的骨灰坛葬在福陵，入关后的初期，顺治帝、其爱妃董鄂氏以及孝康章皇后也是火葬，但是此后开始限制火葬而鼓励土葬。顺治五年（1648年）四月，清朝颁布丧葬条例。顾炎武在《天下郡国利病书》引《永康县志》说浙