1658年），谋划攻取云南，吴三桂自四川，征南将军卓布泰自广西，卓罗跟从信郡王多尼自湖南，三道并进。顺治十六年（1659年）正月，合攻云南，攻克，屡次打败白文选、李定国的兵队，收取永昌、腾越，追击至南甸。朝廷下命卓罗镇守云南，赐予蟒服、鞍马。南明桂王奔入缅甸，李定国屯兵孟艮，以印札招元江土司那嵩。十月，卓罗与噶布什贤噶喇昂邦[白尔赫图]等共同攻击，攻克其城，那嵩自焚而死。顺治十八年（1661年），定西将军爱星阿与吴三桂统领大军攻入缅甸，卓罗仍镇守云南。缅甸执下南明桂王到军中，云南遂平定。康熙元年（1662年