国伊朗签订外交协议，伊朗于是停止支持伊拉克境内的库尔德人叛乱。1979年6月，萨达姆借自己女儿的生日会，把总统贝克尔和伊拉克的内阁成员都邀请到家里赴宴，接着萨达姆就在自己家里不动声色的发动了政变，以武力威胁原总统贝克尔下台。7月16日，萨达姆就任伊拉克总统兼任总理，成为伊拉克的最高领导人，贝克尔则改任伊拉克革命指挥委员会主席；复兴党原领导人物阿卜杜拉赫曼·阿里夫亦在该年淡出政治，萨达姆就任地区领导机构书记。刚一上台，萨达姆就导演一场恐怖的政治清洗。他召集复兴党高级干部开会，指出安全机构破获一起由叙利亚支