张镇芳为河南都督。《自由报》发表《诘问张镇芳》、《痛斥张镇芳之荒谬绝伦》等文，张镇芳多次勒令该报停刊，但都无效果。1913年8月，该报主编贾侠飞在北京遇害。张凤九逃到德国租借地青岛，大约在此居住了半年时间。1917年，张凤九南下广州参加孙中山领导的护法运动，任护法国会众议院议员。1924年，中国国民党第一次全国代表大会召开，张凤九作为唯一的新疆代表参加。1925年1月，孙中山患肝癌入住北京协和医院，张凤九在其左右，3月12日孙中山病逝。1927年，蒋介石在南京成立国民政府，任命张凤九为新疆省政府驻京