虽执业西医，亦极重视传统中医的现代化，曾于1926年在上海创办「中华医学专科学校」，又于1930年在厦门创设「厦门中华医学校」，自任校长，培育诸多人才。1937年7月7日芦沟桥事变，翁俊明立即声明脱离日本国籍。1938年5月，日军攻陷厦门，他到英属香港。1940年9月，奉命在港成立中国国民党「台湾党部筹备处」，就是后来的「中国国民党台湾省党部」。1943年，中国国民党台湾党部筹备处秘密迁到日本人佔领下的福建漳州，并开设「中正医院」以为掩护。1943年11月18日晚间，翁俊明饮酒后中毒，在