之后，日本政府有见1964年东海道新干线通车，1966年的多宗飞行事故等背景，需要作出干预，在1966年5月20日的内阁备忘中，以日本航空与日本国内航空合併为前提，对日本国内航空进行提携，日本国内航空需要离开国内干线营运，将其所拥有的康维尔880和波音727租借予日本航空，却导致日本国内航空亏蚀。1967年情况好转，至1969年终于转亏为盈。1970年，内阁备忘决定改为日本国内航空与东亚航空合併。1971年5月15日，日本国内航空与成立于1953年，以大坂伊丹机场为基地，营运国内本地线的东亚航空合併，