三台用于惯性除尘通风机。此外，辅助电机还包括两台为空气制动系统提供压缩空气的FC2000型电动空气压缩机，和一台为受电弓升弓提供压缩空气的MH99-AK18型辅助电动压缩机（由蓄电池供电）。
制动系统.EF200型电力机车设有电阻制动和空气制动系统。当使用电阻制动时，牵引电动机变为三相交流发电机运转，而牵引逆变器则变为整流器工作，将发出的电能整流为直流电并连接到制动电阻，最大制动功率为2280千瓦。机车具有电空联合制动的协调功能，当电阻制动无法产生足够制动力时以空气制动补足，电阻制