是有记录以来最早的鼠疫大规模流行。查士丁尼大瘟疫中，据估计有2500万-1亿人病死，约25%-60%的欧洲人口死亡。 此后，鼠疫在欧洲不再出现，直至14世纪的黑死病爆发。对于第二次鼠疫大流行的源头，存在争议，一说起源于中亚或克里米亚， 一说起源于喜马拉雅山区，一说起源于黑海城市卡法，等等。1347-1351年间，黑死病导致欧洲7500万-2亿人死亡，占当时欧洲人口总数的30%-60%。此后，鼠疫时常出现地方性爆发，直至19世纪初，在各地造成的人员死亡情况也各不相同。19世纪中叶，清朝云南地区爆发鼠疫