造于1993年。这个分泌系统是被从革兰氏阴性菌中发现的至少五个其他分泌系统区别开来。许多细菌拥有一个T3SS和能够把T3SS水平转移到其他物种。研究的最多的T3SSs来自志贺氏菌（引起细菌性痢疾），沙门氏菌（伤寒），大肠杆菌（，某些菌株引起食物中毒），弧菌属（胃肠炎和腹泻），伯克霍尔德杆菌（马鼻疽）的种，（鼠疫），衣原体（性病），（感染人类，动物和植物），和植物病原体，和，以及植物共生根瘤菌。III型分泌系统(T3SS)是由大约30种不同的蛋白质组成，使之成为最复杂的分泌系统之一。其组成部分主要分为底座