没有重建庙宇。直到民国35年（1946年），当地仕绅林洋、林天宋、林谋、林银生、蔡杭、苏寅、尤石崎、林闹晚、林厅等人才募款重建天后宫，并在次年（1947年）春天落成。当时所建的庙宇佔地40坪，面宽1丈6尺，有拜殿与正殿，正殿前有轩，南侧建有厢房。庙北是显宫国小，该校当时以庙埕为运动场。而第一次进行寺庙登记时，使用「天后宫」的名义（南市民字第126号）。民国66年（1977年）因旧庙空间不足，而在今址重建。民国82年（1993年）完成九龙殿（今祈年坛）与接官亭（凤凰殿），民国91年（2002年）启用鹿耳门