空航天局优异服务勋章之外，他于1978年10月1日获得时任总统吉米·卡特颁发的国会太空荣誉勋章。谢泼德还于1962年获得科莱尔奖杯；1963年获得国际试飞员协会；1963年12月5日获得全国航空航天职业协会（）和共同颁发的；1964年5月5日获得史密森尼学会最高奖；1971年获得纽约市颁发的金牌和美国航天学会飞行成就奖；1981年获得颁发的金盘奖科学和探索奖（）。1962年，谢泼德获得达特茅斯学院文学硕士名誉学位，之后于1971年又获得迈阿密大学名誉自然科学博士学位，1972年获人文学博士名誉学位。