车修筑了新的车站大楼。除此之外，配合樱桃东根车站的设置，原本位于本站北方约900公尺、奥羽本线上的蟹泽车站由于站距过近而予以撤除。樱桃东根车站位于东根市的市中心，相对的，隔邻的东根车站反而不在市中心地带。1901年奥羽本线山形车站～楯冈车站（今日的村山车站）间路段初通车时，当时离尚未设市的东根地区最为接近的车站，是因为军事考量（邻近大日本帝国陆军神町基地）而设置的神町车站。1910年发现东根温泉，又为了观光考量，而把东根车站设在比较靠近温泉而非市中心的位置。直到1999年山形新干线新庄延伸线通车