全绍清被德国皇帝授予铁十字勋章。1912年，全绍清留学美国霍普金斯大学。1913年，他到哈佛大学进修公共卫生学。1913年，他作为中国政府代表，到伦敦参加了国际红十字会会议。会后，他回到天津北洋医学堂任医学教授。1914年，他任中国军队军医署长和北洋军医学堂校长。1917年张勋复辟期问，他任段棋瑞的秘书和国防部顾问。从留学美国时起，全绍清多次和伍连德共同代表中国政府参加国际红十字会会议及国际医学会议。1918年，绥远、山西等地发现肺鼠疫疫情，北京政府内务部派全绍清前往主持防疫，任第一区检疫委员，此后疫情