沈田子更图穷追姚泓至长安，但因沈林之劝阻而作罢，但其时关中各郡县都望风向晋军归降了。不久长安（今陕西西安市）城陷，姚泓出降，后秦灭亡，沈田子获授咸阳、始平二郡太守。
擅杀国将.同年十二月，刘裕班师，留次子刘义真为镇守长安，并命王镇恶、沈田子、傅弘之等留戍长安，协助刘义真，沈田子亦受命为刘义真的中兵参军。沈田子在峣柳战胜后，刘裕曾上书称颂沈田子的功勋，又在灭秦后的宴会中向沈田子说：「咸阳得以平定，是你的功劳呀。」故此沈田子心中觉得自己在灭秦战争中的功劳比起攻陷长安的王镇恶更大。且由于