时，植物从土壤中取出硷，为每个硷基阳离子交换质子。当除去植物材料时，例如当森林被砍伐或作物收获时，它们所佔据的基质永久地从土壤中丧失。
植物留在土壤上.许多植物产生有机酸。当植物垃圾在土壤上积聚或结合到土壤中时，释放这些酸（包括乙酸、腐殖酸、草酸和鞣酸）。这在针叶树如松树、云杉和冷杉的土壤中尤其严重。
岩石在土壤中.某些岩石也有助于土壤酸化。花岗岩和火成岩他们有大量的石英对抗风化。此外，它们具有相对低量的钙和镁。一些沉积岩石如页岩和煤富含硫化物，当水合和氧