反对下，最后港铁决定更改选址，改于红磡站附近的原红磡货运站设置列车停放处。红磡货运站本身有13条轨道可停泊列车，其中2条可用于清洁及检查列车，日后转作停放处毋须扩建，亦不须增设任何维修设施及额外建筑物，仅需重新装修、拆卸机车行车室、拆卸重建厂内轨道及与东铁线连接轨道。不过港铁同时要在未来启德站加建一条侧线路轨，以作紧急列车停放处；而八乡车厂亦要预留数条轨道，作为日后屯马线早上出车之用。