西藏314事件之后，他的蒙藏学校受到政府的怀疑，政府最后收回了拨给他的土地，造成他无法继续办学，迫于压力他只有远走他乡。
申请政治庇护.巴图张嘎一家三口2009年5月26日持有效护照和签证前往蒙古国，抵达蒙古后到联合国难民署驻乌兰巴托办事机构递交了政治庇护申请。难民机构当时接受了他们的申请，并于5月29日给巴图张嘎一家人签发了为期3个月的联合国难民申请人被准许逗留在蒙古的寻求庇护者证，等待政治难民审理的结果。乌兰巴托联合国难民机构三个月后向巴图张嘎签发了第二份寻求避难者证，有效