“各照其位，继续安定学习”，后派开封市教育局副局长郭海长到苏州迎接河大返回开封。7月，国立河南大学六院十六个系的1200多名师生员工和2000多名家眷北归中原。8月，时任河南省人民政府主席吴芝圃认定国立河南大学在国共内战期间跟随中国国民党南逃苏州。并从阶级斗争角度清算学校部分师生，国立河南大学停办。
共和国时期.1950年3月，河南人民革命大学改名为河南大学，吴芝圃担任校长。1952年，原国立河南大学的农学院、医学院、行政学院分别独立设置为河南农学院（今河南农业大学）、河南医科