而诸葛亮则分南中四郡益州、永昌、牂柯、越巂为六郡益州、永昌、牂柯、越巂、云南、兴古，以当地人或将领统领，有人曾劝谏诸葛亮留兵镇守，但诸葛亮认为这有三不易：最后，诸葛亮平衡各条件，决定达至「不留兵，不运粮」的政策，任李恢为建宁太守、吕凯为云南太守，又收降爨习、孟琰等，与孟获一起授予官职，笼络南人。只有马忠是外地人而被任为牂柯太守，但仍能做到受夷人所敬重。蜀汉亦移南中万多家劲卒、青羌到蜀地，分成为五部，号为「飞军」，非常勇勐。又分开瘦弱，配给大族焦、雍、娄、爨、孟、量、毛、李为部曲，设置五部都尉，号为五子