1949年，中华民国政府迁台后，法国亦在首都台北保留法兰西共和国驻中华民国大使馆，但仅派驻代办而非大使。1950年11月30日，法国在联合国安全理事会上否决中共代表伍修权等提出之「美国侵略台湾案」。战后，台湾人赴法国留学者，较知名者有法律学者彭明敏。彭明敏于1953年前往法国巴黎，以法文完成太空法律地位研究的论文数篇，1954年完成博士课程，取得巴黎大学法学博士。1960年代，法国开始与中华人民共和国进行关系正常化行动，当时中华民国政府极力阻止，其间中华民国总统蒋中正还致亲笔信给时任法国总统戴