直通电车外，本站还有数班东横线、港未来线电车在本站发车或终停。2006年9月，武藏小杉站 - 本站间高架化并变更配线，新的元住吉站无法直通。由于本站在切换高架线时，同时铺设一条元住吉检车区通往本站的「下行出库线」，因此原先在元住吉发车的各列车改至武藏小杉站，而下行线（元町・中华街方向）则大半改至本站。
目黑线转线工程.除了前述的大规模改良工程时期，内侧2线（2、3号线）曾长期作为待避线使用。而东横线内的末班车时段有终停本站的班次，会停放在拖上线与2、3号线月台至隔天早晨作为首班