1911年辛亥革命爆发，同年12月1日，土谢图汗部亲王杭达多尔济、赛音诺颜部亲王那木囊苏伦等人宣佈外蒙古独立，随后拥立第八世哲布尊丹巴唿图克图为博克多汗。1912年，巴德玛多尔济被任命为第一任宗教与国务大臣。1915年，中、俄、蒙三方最终签订了《恰克图协定》，承认外蒙古的完全自治，中国拥有外蒙古的宗主权。随后，1915年6月9日，外蒙古取消了独立，在中国的宗主权之下实行自治。实行自治之后，外蒙古的内阁总理大臣一职改由五部衙门长之一兼充，原内阁总理大臣那木囊苏伦的职务改为陆军衙门长兼充内阁总理大臣。同年，