宋仙逝后，乡人于白礁立庙祭祀时，雕刻有「大大帝」、「二大帝」、「三大帝」三尊保生大帝神像，大大帝奉祀于龙海白礁慈济宫，二大帝则由同安县百姓李胜迎祀随明郑郑成功军队前来台湾，原由台南学甲下社角李姓后代私人奉祀，后成为学甲地区信仰核心。大观音亭兴济宫建于明郑永历三十二年（1678年），军民在台湾府城的尖山南坡建「观音宫」，供奉观音菩萨。康熙时重修扩建之后，因拜亭採用了抱厦的形式而改名「观音亭」，后来又因要与小东门的观音亭区分，而习称「大观音亭」。隔年（1679年），来自泉州同安郑军将士又在「大观音亭」旁建今