一个街区，使水族馆站出入口落到新的大西洋大道东侧。</ref>老旧的电梯导致多起乘客受伤事件，包括1995年，一个三岁的孩子腿部严重割伤。
车站重建.1996年，马萨诸塞湾交通局开始对水族馆站进行翻新，并对车站站台加长，项目在大开掘工程同时进行。大开掘工程将波士顿中央动脉高速深埋至隧道，并在原有的高架桥处兴建。2000年10月14日至2001年10月29日，车站完全关闭进行改造施工。州街站临时重命名为“州街-水族馆”站，临时摆渡车650路公交往返于两座车站。重建后的水族馆站在大西洋