本完整的教堂正面前壁、石阶、学院入口的回廊以及未被完全毁坏的钟塔、主祭室入口的大砖拱及巴洛克风格的主祭坛。由于耶稣会士已于1762年失势离澳，故一时之间没有人代谋重建教堂的计划。
圣保禄坟场时期.圣保禄学院和教堂毁于火灾后，澳门议事会于1835年4月委派佛郎高神父（Cândido Gonçalves Franco）把大三巴废墟开辟为一座坟场，利用废墟的坭墙按传统天主教葬式安葬一些教徒。1836年5月，议事会调整计划，将圣保禄坟场交予仁慈堂管理。在建设及经营上，圣保禄坟场内葬有教士、