的保护机制将阻止自体免疫反应进一步致病。在1904年，这一理论受到挑战，在阵发性冷血红素尿症的患者血清中发现一种物质会对自体的红血球起反应。在随后的数十年中，发现许多疾病可能与自体免疫反应有关。但是，埃尔利希假设的权威地位阻碍这些发现的进一步探索。免疫学成为生物化学领域的一支，而非临床学科之一。到1950年代，对自体抗体和自体免疫性疾病的现代理解开始普及。最近，人们已了解自体免疫反应是嵴椎动物免疫系统不可或缺的一部分（有时被称为自然自体免疫）。自体免疫不应与混为一谈。
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