1939年7月9日，鲁布桑沙拉布被内务部以反革命罪名逮捕。1941年7月5日，苏联最高法院军事审判庭在莫斯科判处其死刑，并于同年7月30日将其处决。1962年，鲁布桑沙拉布获得平反。鲁布桑沙拉布是32名被送往苏联接受审判的1930年代至1940年代大清洗的蒙古受害者之一，俄罗斯联邦政府于1993年公布了有关材料。