向、或各特别区之间横向的联络与协调问题，还设置有这类的机关处理相关事务。特别区与政令指定都市的行政权限类似，唯为确保大都市的行政一体性，如上下水道、警察、等事务，仍由都政府负责。特别区的行政首长为区长，民意机关为区议会，区长与区议会议员都是由该区居民直选产生。但其他国家或地区而言，「区」的高级官员未必都是可以直选。
关于道府县设置特别区.在2012年以前，根据《》，特别区是针对「都」此类行政区设置的行政区划，并不是特别为东京而设的，但由于只有东京一个「都」，因此也只有东京有特别