文献对此的描述高度相似，病毒大小都在400nm到800nm之间。在电子显微镜下，病毒的衣壳呈六边形，因此衣壳的立体结构为正二十面体。拟菌病毒并没有包膜，这意味着这类病毒并非通过胞吐被放出细胞的。发现拟菌病毒的小组后来发现了一种略微更大的病毒，命名为妈妈病毒（mamavirus） ，以及能感染它的亚病毒Sputnik virophage.拟菌病毒有着所有NCLDV上共同的形态学特征。M. Suzan-Monti等人提出，如同其他NCLDV病毒，拟菌病毒可能也有这内含的包裹DNA核的脂质层。在电子显微镜