党中央请假，以无党籍身份参选，大家仍视其为亲民党主席。尽管他宣称这是「封刀之作」、「只做一任」。有人认为，他的参选，可能成为泛蓝罪人，而使民进党候选人当选。亦有人认为，他的参选象征着亲民党的主体性，并对国民党的打压表示不满。2006年12月9日，台北市长选举结果，宋楚瑜获得53281票(得票率约4.14%)。随后宋楚瑜召开记者会，一度宣佈从此退出中华民国政坛。几天之后，立法院长王金平表示:「宋楚瑜愿考虑暂不退出政坛」。宋楚瑜在宣示退出政坛后，主要的公开露面，是中国国民党主席吴伯雄进行国亲联盟协商