始，以巫统为首的执政联盟在第二任首相阿都拉萨领导下，为组织稳定政府，拉拢在大选中新崛起的反对党如民政党、霹雳进步党、泛马回教党等加入联盟，改组成国民阵线（国阵），并在此后的44年内长期执政，使马来西亚几乎达到一党制的地步。马来西亚成立之初，即经历了马印冲突、1965年8月9日新加坡脱离大马、1969年的五一三事件及1969年居銮水灾。1969年5月13日，首都吉隆坡发生严重的种族冲突，政府颁布紧急状态。事发后，阿都拉萨政府开始推行颇受争议的新经济政策，目标是想通过配额制，提高土着的经济权益比例。此后，马