27科96属241种以上，估算高原动物特有种野牦牛有2500头，藏野驴20000头，藏羚羊40000只左右。分布的中国国家一级保护动物除野牦牛、藏野驴和藏羚羊外，还有雪豹、北山羊、黑颈鹤、胡兀鹫、玉带海雕及金雕，二级保护动物有马熊、石貂、猞猁、豺、兔狲、盘羊、岩羊、藏原羚、秃鹫、兀鹫、藏雪鸡、猎隼、红隼等二十余种。
人为破坏.湖中生有大量卤虫(高盐度水域中的小型甲壳动物，含有丰富蛋白和脂肪，为多种水鸟所喜)，近年来随着中国水产养殖业的迅速发展，作为虾蟹幼苗饲料的卤虫卵需求量不断攀升