元朗区和九龙美孚站只需约20分钟。而落马洲支线亦已于2007年8月15日启用，其新建的过境车站落马洲站及落马洲支线管制站亦是位于元朗区，但与之连接的东铁线并不能到达本区市中心。
道路.元朗区过去主要依靠青山公路、屯门公路、大榄隧道及环回公路（即现在的9号干线，元朗区内有元朗公路及新田公路）连接香港其他地区。因此，一般其他地区发生交通事故，元朗区的对外交通亦同时受到影响。不过，自从香港3号干线于1998年上半年启用后，元朗区对外交通已大为改善。元朗区也是三条主要公路（青朗公路、元