时，门罗总统邀请他担任战争部长，但他以自己年势已高为由谢绝了。作为肯塔基圣经公会的创始成员，谢尔比曾于1816年同意担任新美国圣经公会的副主席。他本是丹维尔长老教会的忠实信徒，但却于1816年在自己的土地上建起了一座小型非宗派教堂。1818年，他与安德鲁·杰克逊一起作为特派代表与奇克索印第安人部落展开谈判，完成杰克逊购地。1818年，他还成为肯塔基州农业协会的首任会长，并且在1819年成为美国中央大学首任校董会主席。1820年，谢尔比的右手和右脚瘫痪。1826年7月18日，艾萨克·谢尔比在自己位于林肯县