清末，属巡抚直接管辖的机构有安徽督练公所和安徽宪政调查局。
安徽督练公所.光绪30年（1904年）八月，清廷令各省设立督练公所。光绪31年（1905年），巡抚诚勋在衙署中增设安徽督练公所。光绪33年（1907年）十一月，巡抚冯煦奏请暂裁督练公所，改为督办处。光绪34年（1908年）七月，又奏请规复，嗣由护理巡抚沈曾植奏明，复设督练公所。安徽督练公所负责管理全省新旧各军及筹备粮饷、编练队伍一切事宜，以及与军队有关的学堂局所等其他有直接或间接关系的各项事务。督练公所设督办1人，