一可知的是内大臣巴图鲁公鳌拜审理最早被点名的广东雷州道王秉干，因雷州道偏僻，想撤回另选故贿赂吴良辅，委其在皇帝前美言，后判斩立决，改着免死，籍没、鞭一百、发宁古塔与披甲人为奴。顺治十八年正月二日，顺治帝出家未遂，把吴良辅送到悯忠寺（今北京市广安门内法源寺）剃发为僧，顺治帝并于过世前五日亲自到悯忠寺为吴良辅剃度。此事件与孝庄太后下嫁、胤禛夺嫡并为清初三大疑案。同年，顺治帝驾崩，康熙帝即位。孝庄太皇太后干政，即于康熙元年依「变易祖宗旧制，倡立十三衙门名色」之罪，将之处死，并重申「皇室包衣