日后于凹头、牛潭尾及新田增设中途站，并向东延伸至粉岭北、恐龙坑／坪輋／打鼓岭。2019年6月，皇岗口岸临时旅检场地建设项目开工，皇岗口岸重建正式启动。预留后期升级为「合作查验、一次放行」查验模式的空间。计划引入深广中轴城际轨道、穗莞深城际轨道和深圳地铁20号线，并且预留港铁北环线支线接入条件。2020年12月16日，行政长官会同行政会议已批准政府邀请港铁开展北环线项目的详细规划及设计，该线全长10.7公里，第一期先兴建在东铁线落马洲支线上增设的古洞站，第二期则为西铁线锦上路站及古洞站之间的北环线主线