年6月17日，首任台湾总督桦山资纪在台北举行始政式，宣告日本殖民统治的开始。日治初期，台湾总督府对台湾本地宗教採不干涉的放任态度。1896年7月，时任台南县知事矶贝静藏向台湾总督桂太郎提议将延平郡王祠改为神社，此举借着结合本地信仰来推展神道，并透过强调郑成功的日本血统和其作为民族英雄开山圣王的地位，以争取台人对日本统治的认同，将有利于政务推动。台湾总督府在向日本拓务省核示后，1897年2月13日，延平郡王祠改号为「开山神社」，建筑则沿用原延平郡王寺的闽南宫庙式建筑，并未依循日本的神社规划传统。此为台湾第一座