圻发生抗税民变，邓元谨因支持民变而被殖民政府流放至崑崙岛。启定六年（1921年），阮廷在殖民政府授意下，特赦一批崑崙囚犯，邓元谨与黄叔沆、吴德继等人因此被释放。启定八年（1923年），邓元谨去世，寿五十七岁。
子女.子邓台梅是教育家、作家。