准备位入侵苏联的巴巴罗萨作战准备。隔年春天德国空军帮助轴心国盟友义大利在巴尔干地区取得胜利，并持续支援义军在中东、北非和地中海的战斗直到1945年5月。1941年6月德国入侵苏联。德国空军在初期取得了巨大的胜利，摧毁了数千架苏联飞机，但并未完全摧毁苏联空军。德国因为缺乏战略轰炸机，无法摧毁苏联的战争工业。而随着战争不断延长，德国空军的力量持续被削弱，苏联空军不断在增强。在史达林格勒会战和库斯克会战后更确定了德意志国防军在东线的战败。与此同时德国空军还要肩负德佔欧洲对抗逐渐增强力量的英国皇家空军和美国