862年5月19日，他获得了巴斯爵级司令勋章。1864年11月，他离开英格兰，在3月3日抵达上海，在1858年12月21日被任命为领事。
日本.1865年5月，正在前往扬子江港口的巴夏礼收到通知，他被任命为驻日特命全权公使与领事，而上一任特命全权公使与领事是阿礼国。这个职位他担任了18年，在任内，他不断使用自己的影响力去支持日本的自由派。他向幕府的对手示好，所以对明治政府有影响力。因为他支持改革派，所以他成为了守旧派的目标，守旧派三次试图刺杀他。他鼓励低级成员深入研究日本：