北环线与广深港高速铁路香港段合併为一个项目进行研究，在广深港高速铁路香港段的「共用通道方案」下，高速铁路列车将会行经北环线锦上路至洲头附近一段的路轨；然而共用通道方案在2007年8月香港政府决定採用「专用通道方案」的同时被否决。东铁线落马洲支线及西铁线锦上路站已经预留了设施以作伸延之用至今。虽然九广铁路公司的铁路网已经交予香港铁路有限公司营运50年，而香港铁路有限公司于2008年年报中亦有绘出北环线之路线，但是由于香港政府没有表态，北环线的处理也没有包括在两铁合併的内容中，所以就兴建计划没有确实的结果。