怪事件或现象，这些都被称为「异变」（）。东方Project系列作品都是以这些异变作主题的。原因多数都是因为妖怪们的各种理由而作的，异变开始之后，基本都是由博丽神社的巫女博丽灵梦出发调查，找出犯人加以惩罚。有时会有像雾雨魔理沙的人物一起解决异变。异变之中，精灵或是妖精的力量都会大幅增强，就算是一介妖精都能把灵梦打倒。解决大异变后，经常都会再发生小规模的骚动。
作中有登场的异变.另外，在《东方风神录 ～ Mountain of Faith.》（简称《风神录》）一作中，