根亲王号在基尔港更换上了新的舰艉。之后欧根亲王曾尝试返回挪威，但遭到了盟军部队的截击而被迫撤回。从此它直到1943年1月前都一直被闲置，仅仅是做一些日常的训练。
波罗的海.自1944年8月之后，欧根亲王号一直在波罗的海沿海为阻击苏联红军的德国部队提供炮火支援。1944年10月15日，在执行任务后回港的途中，因浓雾所造成的能见度低而与莱比钖号轻巡洋舰相撞。经过14小时损管人员的清理和调整，两者终于被分开。欧根亲王号舰艏遭到损坏，而莱比锡号几乎被撞成两半，该舰之后被改作浮动炮台。欧根亲