分类方式，指能力能打倒一般上忍、具有独特能力并声誉各国的忍者。他们可以是忍村中的忍者，也可以是周游列国、但仍忠于原忍村的忍者。如「木叶三忍」中的自来也及纲手。也可以是受到各国极度重视的S级忍者，而他们通常是因为做出了严重影响忍村的罪行而叛离（如大蛇丸或宇智波鼬）。「晓」组织内的十人众，本都是从各忍村聚集而来的S级叛忍。他们的能力更可能超越影级忍者，故各忍村均对他们加以防范。由于通常S级忍者身怀绝技，故为很多其他忍者所畏惧，不敢跟他们正面交锋。例： 旗木卡卡西、漩涡鸣人、宇智波佐助、阿凯、我爱罗、「晓」成