约翰福音》的两个章节，是在西元2世纪才出现的，目的可能是为了把抹大拉的马利亚，与耶稣所爱的门徒分开。
公义者雅各.学者詹姆斯·泰伯（James D. Tabor）认为，耶稣所爱的门徒，可能是指马利亚的儿子，耶稣的最大的弟弟，公义者雅各。