1995年开始选择地址，最后决定将民康街游乐场剷平以兴建大楼。2003年6月13日，立法会财务委员会通过拨款兴建廉政公署总部大楼。2004年8月，判授建造工程合约，由瑞安建业投得。此前，廉政公署执行处办公室位于香港岛金钟美利道停车场大厦（原址移交中西区区议会），其他部门则位于邻近的东昌大厦。廉政公署总部大楼于2007年12月8日由行政长官曾荫权、廉政专员汤显明、最高人民检察院检察长贾春旺及廉政公署执行处首长兼任副廉政专员李铭泽主持开幕仪式。2009年2月15日及22日，廉政公署总部大楼首度举行开