李畿嗣（），字明卿，号九嶷，湖广蕲水（今湖北浠水）人，明朝政治人物，同进士出身。
生平.湖广乡试第六名，后参加会试第一百九十九名。嘉靖四十一年，登进士第三甲第一百五十名。历官江西广信府推官、工部营膳司主事、浙江衢州府推官、福建漳州府同知等职。万历二年（1574年）担任广东惠州府知府。主筑城之事。官至广东按察使司监军副使。
家族.曾祖父李宗本、祖父李大睦、父亲李美。母何氏。