本地人心目中对日本人的印象却不算很好。第二次世界大战印尼被日本佔领期间，很多日本军官都迫当地妇女嫁给他们为妾。他们生下的孩子都在战后时期成长，通常他们都会发现自己因为血统的关系而成为欺凌对象，也会因为政府招聘公务员时会优先取录土着而受到官方歧视。在雅加达的大威查雅中心（Grand Wijaya Center）和M栋商场，专为日本侨民服务的商店星罗棋布，比如餐厅、售卖进口食物产品的超市；另外M栋也以居酒屋林立而闻名。
通婚.在印尼居住并享有当地永久居留权的日本人共有759名，当中