直隶州管辖，泉州府辖境缩小。干隆四十年（1775年），从同安析置马巷厅，驻马家巷（今厦门市翔安区马巷）。至此，泉州府辖五县一散厅如下：一、晋江县二、南安县三、惠安县四、安溪县五、同安县六、马巷厅
中华民国.民国元年（1912年），取消府、州、厅，实行省、道、县三级地方政制，废除泉州府，下辖各县归属南路道，共开府544年。
兵制.
清朝.顺治三年（1646年），设提督军门统辖全省水陆军务。康熙十七年（1678年