反对该决议，江苏、浙江军界反对黄兴任大元帅。12月17日，联合会改推举黎元洪为大元帅，黄兴为副元帅，由黄兴组织临时政府。但是黄兴因为得知孙中山将回国，故没有赴南京任职。12月25日，孙中山抵达上海。12月26日，代表会议决通电各省继续战斗，并推谭人凤、马君武、王正廷与徐绍桢会面，商议作战计划。
选举临时大总统.12月28日，在南京召开临时大总统选举预备会。12月29日，各省代表在南京召开选举临时大总统会。临时大总统根据临时政府组织大纲第一条：「临时大总统，由各省都督代表选举之；以得