第一任驻台美军司令由时任第七舰队司令中将担任，第七舰队在台湾的分遣队（）也利用左营海军基地作为驻点，并透过高雄港运补物提供物资，直至1970年代后期断交为止。1996年，中华民国举行首次总统民选，中国大陆方面对台湾本岛基隆、高雄的外海发射短程弹道飞弹，台湾地区均陷入战争爆发的恐慌中，导致美国总统比尔·柯林顿下令第七舰队尼米兹级核动力航空母舰及从波斯湾调来的独立号航空母舰两艘航舰打击群开进台湾周边海域，为越战结束后美国海军在东亚地区最大的一次兵力集结。往后，台湾每届总统大选，美国为了防止中国大陆以武力干涉台湾