正、检查时基本以4号车厢和5号车厢之间分割新宿方面6辆和小田原方面4辆的“反分割”10辆编组。
车体.车头长19,700mm・全长20,150mm，中间车19,500mm・全长20,000mm，车身宽度为了能驶进隧道断面较小的千代田线，选用2,770mm宽的窄身车体。车身基础与E233系一样，车桥·结构采用不锈钢的车体制造，提高车身强度以及侧面和车顶材料相应加厚。车头前面是由设计过50000型VSE车的冈部宪明设计，为了在紧急情况下能在隧道内疏散乘客，列车在车头设有紧急逃生门。