不同的预测，可能用实证研究判断哪个模型正确。另一方面，有些完全不同的现象背后的数学原理却类似，可以用一样的模型来描述，例如生物族群大小的振盪、心律不整、化学的B-Z反应、以及水龙头滴水的速率都可以用霍普夫分岔来描述。在其着作《一种新科学》中，史蒂芬·沃尔夫勒姆主张大多数现象背后都有类似的简单数学原理，因此推动科学进展的最有效方法是研究各种基本数学现象，例如细胞自动机。
概念模型.概念模型是用模型来描述一个不容易用语言来描述的概念。概念模型可以用来说明一个科学理论或假说，或是验证