后，累迁王亮为太子中庶子，尚书吏部郎，行事有条理有次序，迁侍中。建武末年，为吏部尚书。永泰元年（498年），明帝杀宗室高帝子河东王萧铉等，指使侄扬州刺史始安王萧遥光、高帝孙临川王萧子晋、武帝孙竟陵王萧昭胄、太尉陈显达、尚书令徐孝嗣、右仆射沈文季、尚书沈渊、沈约、王亮奏萧铉等罪行请求诛杀，又不认同，众人再奏，才认同。当时尚书右仆射江祏管朝政，多所进拔，为士子所归。王亮因选官职责所在，常持异议。鲍几家贫，因母亲年老，拜访王亮求官，王亮一见就嗟叹赞赏，举为舂陵令。起初王亮还未担任吏部郎时，因江祏是明帝表弟