抨击台北市长候选人柯文哲是台湾「皇民的后裔」，郝柏村认为柯文哲爷爷同李登辉一样都是皇民，是不是做官并不重要，但当时的皇民在台湾是特权阶级。郝此言论引起舆论挞伐。2016年5月5日，总统马英九邀集前行政院长郝柏村、毛治国、前国安会秘书长苏起、胡为真、丁懋时等多位卸任国安首长，登上太平岛宣示主权；但4日立法院外交及国防委员会要求郝柏村等人登太平岛，政府不能动用预算。对此，郝柏村则透过幕僚表示，「自费很合理」。幕僚也指出，郝柏村卸下公职后，不论到中国大陆、香港或海外其他地区都是自费，不花公家的钱，这次登太平岛