始了“第二次创业”。
迁至合肥（1970年-1977年）.在文化大革命的严重冲击下，以及战备疏散的要求，尽管受到师生的一致反对，科大还是于1969年12月被迫搬出北京。搬迁处曾三易其址（初为河南南阳，后改安徽安庆），最终确定为安徽省省会合肥市，校址为原合肥师范学院。整个搬迁过程一直到1970年10月才基本完成，搬迁过程中图书、器材、教员均流失大半，其中教师数量不足百人。1972年，学校开始了重建工作；由于师资缺乏，1975年，学校在全国范围内挑选了300多名1967-1970届毕业