也是中华民国的三军统帅，有统帅三军之权。总统及副总统由自由地区的全体公民直接选举。行政院院长为国家最高行政首长，由总统直接任命，无须经立法院同意，负责总统职权以外的行政权。然而实质上，总统掌握所有行政权，总统向全国国民负责，行政院院长近似总统之幕僚长，行政院院长及其部会首长代替总统向立法院负责。
与总统制及内阁制的比较和运作.半总统制之下，总统与国会权力完全分离，因此执政者必须在行政、立法两者相互兼顾，得着重总统与国会多数党的互动关系，并大致有三种可能：半总统制与总统制有以