编入警戒舰队中。1942年3月12日，军令部认为有美军航母来袭征兆，命令警戒舰队从丰后水道出发开赴小笠原群岛搜索。不过舰队并没发现美军踪迹，因此在3月15日返国并在伊势湾待命。1942年4月1日，三航战解散，全部舰艇编入第一舰队。1942年4月18日杜立德空袭后曾在1942年4月18日下午3时出航试图追击撤退的美军航母，但这项作战在4月20日19时30时许被中止，4月22日凤翔号返回本土待命。1942年5月29日，日军发动中途岛海战，当时凤翔号仍作为反潜掩护用的航舰跟随于战舰舰队，当时凤翔号编制机型有9