郭宗清被台湾总督府警方拘捕两个多月后，以涉案轻微为由被释放。1946年赴南京参加海军军官学校招生考试，放弃国立台湾大学政治学系的录取，在上海就读海军官校39年班，为该校第一位台湾本省籍学生，后随学校迁往青岛，厦门等地，最后迁往台湾。1947年二二八事件时目睹许多亲朋好友被捕杀受害。郭于海军官校毕业后继续进修，毕业于海军指挥参谋大学正规班15期、美国海军情报学校高级外国军官情报班、海军航海学校驱逐舰舰长训练班1期、三军大学战争学院将官召训班。郭担任贵阳舰长期间，只要出航外海，经常会出现大风，因