廓尔喀有功的济咙唿图克图管理，僧人改宗格鲁派，寺庙方才得以保留。文化大革命时期，羊八井寺被毁灭。中共十一届三中全会以后，党的民族宗教政策逐步落实，1985年由人民政府拨款对该寺进行了修复。如今，该寺仍为噶玛噶举派红帽系的主寺。2013年，电影《一家人》进入羊八井寺拍摄取景。该剧反映西藏军区副司令员兼西藏军区总医院院长李素芝率医疗队赴边远藏区巡诊的故事。