部卫生部直属医院。1954年3月18日命名为中国人民解放军第八一医院。1983年到1986年，是南京军区军医学校教学医院。1978年被定为全军肿瘤专科中心。2016年，在深化国防和军队改革中，中国人民解放军第八一医院由中国人民解放军南京军区转隶无锡联勤保障中心。
东部战区总医院.2018年，以原南京军区南京总医院、原第八十一医院（含八十六临床部）、原第八十二医院（含一四九临床部）、原第三五九医院为基础，纳入驻宁及周边地区机关院校15家门诊部，重组为中国人民解放军东部战区总医院。