四角蔺、紫苏草、菲律宾谷精草、台湾水韭、香蒲、水毛花、水社柳，并且，值得一提的是，东源湿地中的水社柳，是全球水社柳林面积最大的区域之一。
动物.大肚鱼、高体、台湾沼虾、日本沼虾、东台湾赤腹鹰、灰面鵟鹰、鱼鹰、大冠鹫、黄嘴角鸮、盘古蟾蜍、莫氏树蛙、䴙鹈、水蛙、带纹赤蛇、乳指沼虾、黑眶蟾蜍、盘古蟾蜍、小雨蛙、黑蒙西氏小雨蛙、小䴙鹈、鱼狗、红尾伯劳、白鼻心、龟壳花、眼镜蛇、百步蛇以及近50种以上的蝴蝶。