院长聘任兼课，教授「论理学」等，但因二二八事变遭陈仪政府下令「封闭」，1948年2月受开南商工陈有谅校长任教务主任，规划课程，同年虽延平学院复校曾邀黄金穗回任，但在白色恐怖下延平师生遭逢囹圄之灾，黄金穗不得不避走琉球。1958年受时任台湾大学哲学系主任洪耀勋邀兼课，1964年为专任副教授，开授「理则学」、「数理解析」、「数学逻辑」等课，并专研数理哲学、逻辑系统建构理论等，曾于1959出版笛卡儿《方法导论》中译、并曾于1964至66年间发表一系列以英文撰写的逻辑系统建构理论研究〈前设逻辑运作论〉〉（Proto