运会后就看淡了胜负，在场上缺少激情，并认为当时在苏迪曼杯决赛中用陈宏，而不用他是非常正确的决定。世锦赛结束之后，吉新鹏在国内的九运会和俱乐部联赛仍频遭败绩。隔年，吉新鹏由于不受教练信任而未能出战该年的全英、韩国、日本等公开赛，也未能入选汤姆斯盃和亚洲运动会参赛名单。随着国家队年轻队员林丹、鲍春来的崛起，在国家队的地位愈发尴尬的吉新鹏于2002年秋末向国家队申请转任教练，并于11月起正式担任国家三队（青年队）教练。
国家队执教.吉新鹏自2002年11月起担任国家三队教练，负责年轻