5个系、85个本科专业。根据2015年的官方信息，学校有28个直属院系，设本科专业86个。
社团与生活.南京大学历史上有过许多社团，有些是跨师生的、跨校的或者跨在校和毕业同学的，不少具有相当的历史影响，如史地研究会、文学研究会、潜社、梅社、白雪国乐社、紫霞曲社、学生自治会、同学会。但是由于种种原因，基本没有得到长期延续。南京大学现在活跃着近百个学生社团，大致可以分为文化、艺术、学术、科技、体育、社会活动、社会实践、实用技能、其他兴趣等类别，如国学社、凝眸文学社、朝日文学社、重唱