入侵马来亚时成立，被认为是联合马来亚共产党、英国殖民政府及马来亚地区在日本占领下各种抗日组织尝试。虽然马来亚人民抗日军与马来亚共产党在官方上是不同的组织，但许多抗日军的领导层几乎都是华裔共产主义者担任，因而被视为马来亚共产党实际上的一个武装派别。在马来亚紧急状态期间，马来亚共产党与英属马来亚殖民政府公开对立，许多脱离抗日军的游击队员后来加入马来亚共产党。