2年至2005年分别担任行政院研究发展考核委员会副主任委员、行政院环境保护署副署长。之后进入台湾教授协会、公投护台湾联盟，投身社会运动，致力于公投、集会游行法、台湾独立运动等议题。
从政经历.1993年，受当时担任台北县县长尤清之邀担任机要祕书兼国宅局局长，但不到2个月时间，被《中国时报》记者揭露具双重国籍，因不愿放弃美国籍，而重返台大任教。2002年至2004年，担任行政院研究发展考核委员会副主任委员。2003年8月16日，随内政部长余政宪前往南沙群岛的太平岛。2