（光绪33年）归国，出任云南省学务公所普通课课长兼省城两级师范教务长。同年，就云南省内的矿山权利，清朝政府同英国、法国缔结不平等条约，激起云南各界反对，云南各界派出代表周钟岳等人赴北京。1910年（宣统2年）秋，片马事件（英国侵犯中国领土事件）发生，云南咨议局派出周钟岳等人作为代表，赴北京要求清朝外务部向英国提出抗议。
蔡锷的心腹.1911年（宣统3年）10月30日，昆明重九起义发生，周钟岳当时正在北京交涉上述事宜。11月12日，周钟岳回到昆明，被云南军都督蔡锷任命为都督府秘书长。