事变，闵妃被杀，赵重应负责处理事后事务，包括废闵妃为庶人的事务。1898年金弘集内阁倒台之后被剥夺一切职务，流亡日本。期间在日本学习近代农业技术以及政治学、法学，1906年获特赦归国。1907年任李完用内阁的法部大臣兼刑法改定总裁。同年参与签订第三次日韩协约，获得勋二等太极章、升正二品资宪大夫。他也因此被韩国人斥为丁未七贼之一。1908年任农商工部大臣。1910年，参与日韩合并条约的签订，被日本列为朝鲜贵族，封子爵，任朝鲜总督府中枢院顾问。赵重应被今日的韩国政府列为亲日反民族行为者之一。