隆之等人合谋，攻占信都，活捉了元嶷。元嶷后被授任车骑大将军、仪同三司、领军将军。太昌初年，元嶷出任使持节、都督兖州诸军事、兖州刺史、将军，仪同如故。太昌二年（532年）七月，兖州城中百姓王奉伯等人和从夏州迁移来的百姓郭迁互相煽动谋反，元嶷放弃州城逃走。魏孝武帝元修诏令齐州刺史尉景、济州刺史蔡隽各率州中士兵前往讨伐，元嶷复归旧任，加骠骑大将军、开府，朝廷又追论元嶷之前的功勋，封他为濮阳县开国伯，食邑五百户。元嶷后升任尚书右仆射，又转任尚书左仆射。天平元年（534年），元嶷担任领军将军，转任尚书令，兼管吏部选举