有在高岛平站始发终到的列车（出入库列车）。2017年3月25日时刻表改正前在御成门站折返。设有ATO，基本上使用ATO自动运行。2004年12月23日起至2009年为止，临时列车「港未来号」以6300型列车来往高岛平站－横滨高速铁道港未来线元町·中华街站间。除末期外的假日季节设定1至2个月开1次。此列车採用特制方向幕。在三田线内各站停车。除夕日的自开业起至1972年与1986年以后实行。2000年以后此时只限运行以目黑站到发的列车。2014年起为应付距离东京巨蛋举办演唱会，最近的水道桥站于一部分