压力让吾妻在80到90年间曾因酒瘾多次入院治疗，两度失踪成为街友，企图自杀但失败。他将这段期间的经历以诙谐手法画成漫画作品《失踪日记》（），于2005年出版。《失踪日记》获得第34届日本漫画家协会奖的大奖、第9届文化厅媒体艺术祭漫画组大奖、第10届手冢治虫文化奖漫画大奖（是史上第一部同时得到前三个奖项的作品）、第37届日本科幻大会非科幻组星云奖，以及义大利格兰·圭尼吉奖（）的再发现作品奖。2017年罹患食道癌，2019年10月13日于病院过世，享寿69岁。