投降，忽必烈把他禁锢，赦免他的死罪，只是斩杀了他幕府的许多部属。1266年逝世，可能是遭忽必烈毒杀。忽必烈在1271年（至元八年）建立元朝。
家庭与后代.阿里不哥有一妻及共有三子。玄孙阿儿巴曾短暂地被拥立为伊儿汗。有说法指杀害北元天元帝的也速迭尔（卓里克图汗）为阿里不哥的后裔，之后恩克汗、坤帖木儿、答里巴、斡亦剌歹也被考证为阿里不哥的后裔。