厅没收在东京反对台湾总督府实施「台湾米谷移出管理法令」的反对书刊；该书刊的发行者为吴三连、刘明电以及他的堂叔杨肇嘉。1939年10月，杨基铨通过日本高等文官行政科考试优等及格。
官僚生涯.1940年，杨基铨于大学毕业后出任拓务省属官，随后旋转任于台湾总督府。1941年，杨基铨出任宜兰郡守；在任期间，他曾与日本籍宜兰市长抗争，也曾撤换一位日本籍巡查部长。1942年8月起，杨基铨转任台湾总督府事务官，历任农务课系长。昭和十八年（1943年）12月奉命转任回台北州，出任台北州