，温氏返回香港，担任崇基学院神学院「中国文化与基督教」课程的老师，其后他负责「当代基督教教学资源中心」，以暑期密集课程方式为内地学者提供全面的基督教教学训练，并提供基督宗教研究相关的教材。1999年起任教于香港中文大学文化及宗教研究系，并兼任汉语基督教文化研究所莫庆尧医生杰出神学教授、加拿大多伦多大学亚洲神学中心研究员。温氏并致力参与中国学术界对基督教的研究及教学，曾被邀担任中国人民大学、浙江大学、武汉大学、山东大学、四川大学等七所大学的客座教授。由1984年至2016年，温氏先后任教于香港中国神学