了趋同演化，两者独立的进化出了神经系统。栉水母有8条不发达的神经索。栉水母的神经发育及运作的基础机制不同于水母。例如，水母及其他高等动物中神经系统发育关键基因在栉水母中都不存在。同样，栉水母也不使用水母及其他动物常用的神经递质，如多巴胺，乙酰胆碱，血清素等。于此同时，栉水母依赖使用谷氨酸作为最主要的神经递质，尽管其他动物同样使用谷氨酸作为神经递质，但栉水母中谷氨酸受体基因远比其他动物的多。由于其他动物的神经系统都是由原始水母的神经系统进化出来的，拥有与水母相同的基础机制，因此可以认为栉水母的神经系统是独