姻。南宋干道三年（1167年），生于鄞县。父陈居仁，母王氏，家中排行第五。南宋绍熙元年（1190年），考中余复榜进士。庆元二年（1196年），任宣教郎、余姚县知县。庆元三年（1197年）六月，丁父忧回四明守孝。后任江州知府，转任宁国府知府。早年曾与史弥远相熟，但从政后理念多有不和。嘉定十一年（1218年）春，李全率部下归顺朝廷，朝廷诏为京东路总管。宝庆三年（1227年）五月，李全叛变，用青州投降蒙古。陈卓被任命为签书枢密院事，负责起草褫夺李全爵位的诏书，诏书写得很感人，诏书到了淮地，百姓们都自相勉励。