见六世班禅在九月十八日、十九日、二十日这三天居住在昭庙。清朝咸丰十年九月初五、初六日（1860年10月18日、19日），昭庙遭英法联军劫掠并焚毁。1900年，八国联军再度破坏昭庙。经过两次破坏，仅留下残破的清净法智殿、琉璃塔，以及白台、红台的裙房等。中华民国初年，静宜女子中学、香山慈幼院先后在香山创办，在昭庙兴建了部分建筑。1920年，女界红十字会在昭庙开办香山医院。1949年，中共中央自西柏坡迁驻香山，昭庙为中共中央秘书处的办公地。1956年，香山公园开放，昭庙为公园的服务场所。21世纪初，昭庙作为香山