设有9座国家公园，总面积为7,489.49平方公里。另外政府还设有自然保留区、野生动物保护区等自然生态保护区，佔实际统治地区近20%。
行政区划.
实际统治区域.1955年大陈岛撤退后，中华民国仅实际管辖台湾本岛及其附属岛屿（时全境属台湾省）、澎湖群岛（时全境属台湾省）、金门群岛（全境属福建省金门县）、马祖列岛（原分属福建省长乐县、罗源县、连江县，1956年后全境划归连江县管辖）、乌坵屿（原属福建省莆田县，1954年后交由金门县代管），以及东沙群岛和南沙群岛之