63年9月30日设立，旨在“支持和振兴科学技术研究，促进国内外科学技术和文化的发展”，同时设有“武田医学奖”。其图书资料馆名为“杏雨书屋”，意为滋润杏林（医学界的代称）之雨。武田科学振兴财团杏雨书屋藏有日本国宝说文解字木部残卷、宋版毛诗正义、宋刊本史记集解等。