安妮·珍·马卡纳马拉17岁时进入墨尔本大学就读，并于1922年获得理学学士。 1923年，马卡纳马拉成为墨尔本的住院医生。她在儿童医院工作期间，发生了小儿麻痹症疫情，她与弗兰克·麦克法兰·伯内特合作发现了多种嵴髓灰质炎病毒株，这一发现对于后来嵴髓灰质炎疫苗的研发非常重要。1925年至1931年期间，她成为维多利亚州嵴髓灰质炎委员会的顾问和医务人员，1930年至1931年期间，她被新南威尔士州、南澳大利亚州和塔斯马尼亚州的官方机构聘请为小儿麻痹症名誉顾问。1931年，她获得了洛克菲勒奖学金，前往英国