1998–99年亚洲盃赛冠军盃是第 9 届亚洲盃赛冠军盃赛事。本届赛事一共有 28 队参赛。最终冠军由来自沙特阿拉伯的伊蒂哈德赢得。
第一圈.
西亚区. 内泽默放弃参赛。
东亚区. 斯里兰卡警察放弃参赛。 <br>
第二圈.
东亚区. 仰光市发展局因球员伤病问题，无法派出足够队员出赛，判输 0–3。
半准决赛.
西亚区. 卡斯马 放弃参赛。