把教授从燕京押送到山东省集中营，学生则被遣散，周汝昌只好回家自学。1947年，他通过复试，回到燕京大学西语系完成学业。同年，周汝昌开始涉足《红楼梦》研究。1953年9月，周汝昌在四川大学外文系任教，并且在棠棣出版社发表新书《红楼梦新证》，此书被誉为“红学史上一部划时代的着作”，也奠定了周汝昌在红学上的地位。 1954年，红学界发起批评俞平伯的论战，冯雪峰力邀周汝昌，迫于形势，他不得不发起对胡适的批评，但同时自身也遭到批判。胡适在看过《红楼梦新证》后说：“周汝昌是我在‘红学’方面的一个最后起、最有成就