1年6月巴巴罗萨行动发生不久，此前德国士兵在入侵时绕过了该镇。德国士兵制止了进一步的屠杀。 波兰人后来在7月份屠杀了大约100名犹太人。1941年8月德国盖世太保接管什丘琴后，约有600名犹太人被德国人杀害；剩下的犹太人被安置在隔都，随后被送往特雷布林卡灭绝营。 
历史背景.在战前，该镇4,502名居民中约有56％是犹太人。.第二次世界大战爆发时，什丘琴被德国军队短暂占领，他们将350名男子（主要是犹太人）送去强迫劳动，五个月后只有30人返回。该镇后来被移交给苏联人，后者逮捕了