失调查委员会委员。1945年4月，被派为中国国民党第六次全国代表大会代表。1945年9月，任兴安省政府主席委员兼主席。1947年7月19日，国民政府派吴焕章为兴安选举事务所主任委员；国民政府同时派定其为国民大会代表，立法院立法委员。1947年，任国民政府主席东北行辕政务委员会委员。1948年2月，兼任东北政务委员会委员，并出任行宪国民大会代表。同年4月，当选为国民大会主席团主席。
逝世.中华人民共和国成立前夕，吴焕章赴台湾，继续担任国民大会代表。1988年1月11日，吴焕章逝世。