需要留力应付亚协盃赛事，在国际赛不符合本地球员的林柱机首度为杰志登场，而他更在完半场前在禁区内第一时间施射，可惜皮球被对方门将李瀚灏双手扑出，直至半场后由佐迪入替。到5月18日，他在对南区的季后附加赛中，在82分钟直射罚球入网，取得职业生涯首个入球，协助杰志锁定2–0的胜局。直到季尾，他取得其职业生涯首项锦标，助杰志以不败姿态夺得联赛冠军。其后，林柱机在杰志多番转换教练下，不论在朱志光，加西亚或摩连拿麾下都能稳住正选位置，更于2016年10月28日对香港飞马的高级组银牌8强中，职业生涯首度梅开二度，协助