维生素B、维生素B、维生素B以及辅酶Q等；对某些酶复合物缺乏者给药物以建立代谢旁路（如唿吸链复合物Ⅱ和唿吸链复合物Ⅲ缺乏者给以维生素K和维生素C建立代谢旁路有一定疗效）。ATF、脂肪乳、素高捷疗等药物能明显改善肌无力、疲劳及胸闷等症状。也有科学家开发出以胚胎线粒体移植来治疗这一类遗传疾病的疗法。