是到那里办理一下事务而已。”孝文帝说：“要是这样的话，只要任命一位令史去办就行了，何必让你去呢？”不久便改任元澄为尚书右仆射，随从皇帝南征。孝文帝逝世时，受命佐政。
辅助宣武.宣武帝元恪即位初年，有前来投降的严叔懋报告说，尚书令王肃派孔思达私通南齐，准备叛变。元澄相信了他的话，便上表说，王肃将要叛变，立即将他监禁起来。而咸阳王、北海王上表说元澄擅自拘禁朝廷宰辅大臣，于是被免官回来。不久又被任命为开府、扬州刺史。他一到扬州，便加封增修孙叔敖的陵墓，捣毁蒋子文的神庙，同时上表请求修建和