12年5月，任总统办公厅副主任。2016年8月12日，普京免去总统办公厅主任谢尔盖·伊万诺夫的职务，任命总统办公厅副主任安东·瓦伊诺为新主任。随后任俄罗斯联邦安全会议委员、常委。2020年7月，他在俄罗斯百大政治人物排行榜位列第三，仅次于普京和米舒斯京。