宋朝扬州的科技文化也有长足发展。《梦溪笔谈》着者沈括的多篇科技文章在扬州地区完成。欧阳修、苏轼等人在扬州寓居，并兴建平山堂等人文名胜。“二十四孝”中，扬州天长人朱寿昌的事迹也成为儒家孝道的典范之一。1126年—1129年，金国的军队从北方攻占了包括江南东路、江南西路、荆湖南路北部和两浙路的大半个中国，最南推进到赣州。扬州在1129年也被金军攻占和屠城。绍兴和议之后，淮水成为金国和赵宋的边界线，而今日扬州市的北部郊县也成为了宋朝防御金国军队的前线。姜夔因此作名篇《扬州慢》。13世纪，大蒙古国攻占了中国