年代，波波卡特佩特火山逐渐冰川范围缩小，一部分原因是气温上升，而主要原因则是火山活动加剧。2001年初，波波卡特佩特火山冰川消失，虽然火山高处仍有冰雪存在，但是已经没有冰川典型特征出现，例如冰隙。波波卡特佩特火山喷发物主要是安山岩，但同时也有大量的英安岩。当前的火山岩浆喷发经常产生安山岩与英安岩混合物。
构造.波波卡特佩特火山口宽度是400公尺×600公尺（1300英尺×2,000英尺），是一座复式火山。至少曾有三个波波卡特佩特火山锥在更新世因重力因素毁坏，产生大量岩屑覆盖火山