又强调尽管如此，他仍旧希望留在拜仁。
2012-13赛季.2012年8月27日，穆勒在对阵上赛季德乙冠军菲尔特的新赛季德甲首轮比赛中即射入1球，帮助拜仁以3比0获胜。同年9月2日，他又在新扩建的安联球场的71,000名观众面前梅开二度，致使拜仁在南部德比中以6比1轻取斯图加特。穆勒还帮助拜仁创造了联赛最佳开局纪录，他在10月20日以5比0战胜升班马杜塞尔多夫的比赛中射入1球，使球队实现了史无前例的开局8连胜。3天后，他又射入了自己再该赛季欧洲冠军联赛的首球，通过一记点球帮助拜仁在新