「大目降办务署」，改为「湾里办务支署」。1901年（明治34年）全台分为二十厅，在台南厅湾里支厅下分善化东里区及湾里区，设区长统辖，并设置了铁路车站湾里驿；1920年（大正九年）实施地方制度，两区合併为「善化庄」，置「庄役场」，由台南州新化郡管辖。1940年（昭和15年）6月17日改制为「善化街」，设「街役场」。1945年8月14日，日本昭和天皇发表《终战诏书》接受波茨坦公告，大日本帝国无条件投降，日本由同盟国军事佔领，而盟军最高统帅麦克阿瑟元帅发布《一般命令第一号》，命令在台日军向蒋介