3月12日开始，国军开始大规模镇压市民。3月18日，和国军谈判的嘉义士绅代表陈复志、吴溪水、苏宪章、施珠文、黄水树、陈澄波、卢炳钦、潘木枝、柯麟等人也被枪决，使得嘉义沦为二二八事件的重灾区。1950年10月25日，实施调整县市行政区划，原台南县所属嘉义区、东石区与嘉义市合併为嘉义县，并撤销区级行政区。1951年11月撤销新东、新西、新南、新北四镇建制合併为嘉义市，成为县内唯一的县辖市，并置县治于此。1982年，嘉义市再度升格为省辖市。1991年11月，设置嘉义县政府特区于太保乡与朴子镇之间的祥和新村（原