逊，无法忍受，打算发兵进攻李茂贞，让能反对说“茂贞地大兵强，而唐力未可以致讨；凤翔又近京师，易以自危而难于后悔，佗日虽欲诛晁错以谢诸侯，恐不能也。”昭宗不听，下令让能率禁军三万人，直逼凤翔。茂贞以六万兵马截击。后禁军大败，茂贞要求诏杀宰相，二十日，处死西门君遂、李周潼、段诩等三人。李茂贞不退兵，扬言进兵京师，乘胜至三桥。让能自知必死，曰“臣请归死以纾难。”昭宗流泪曰：「与卿决矣！」又将杜让能贬为雷州司户。十月乙未，赐死杜让能及户部侍郎杜弘徽兄弟。《新唐书》作另一弟杜彦林亦遇害，误。