审团制度自第一届起就出现有疏离市场的批评。对于评审团的评判观点和标准常常成为业界和媒体的争论焦点。除第14届金曲奖发生「最佳台语男演唱人奖」从缺的争议之外，《自由时报》的记者特稿表示金曲奖与市场脱节，偶像派或主流歌手的作品多半不能入围。另有媒体指出舞曲和嘻哈等特定音乐类型的作品在金曲奖也受到忽视。主办方认为金曲奖应具有前瞻性，并应肯定具有艺术价值的作品，因此评判结果不全反映市场商业导向。行政院新闻局曾考虑将金曲奖的评审工作委託民间单位主办，但业者及相关团体则认为由民间单位主办易遭怀疑立场。新闻局也曾参考美国