在台首任校长。民国71年（西元1982年），zh-hans:余传韬; zh-hant:余传韬;出任校长；79年（西元1990年），刘兆汉出任校长，87年（西元1998年）核准成立地球科学学院、资讯电机学院；91年（西元2002年），入选中华民国教育部最初7所重点研究型大学之一。；92年（西元2003年），刘全生出任校长，同年成立客家学院；95年（西元2006年），李罗权出任校长，民国97年（西元2008年）五月，李罗权入阁出掌国科会，遂由副校长蒋伟宁任代理校长并于次年一月真除，民国101年2月，