可能会发生碰撞事故，因此决定留在旅顺口外锚泊，打算次日早上再进港。当晚台风袭击旅顺，天刚亮福靖号即起锚，却因此受到风浪冲击，失去控制。福靖号本身过于修长，而且动力不足，被风浪裹挟着冲向海滩，撞击3次，断成三截。全舰270人余人全部遇难。不过根据当时日本驻芝罘公使的报告，遇难人数约150人，有3名水兵抓着木板游上旅顺灯塔而得以幸免；当晚另有两名军官上岸，因而也逃过一劫。