离岛，依法统一指挥作战区内的陆、海、空军、民、政、警等单位。由于本防区范围人口众多，且包含了中华民国首都同时亦是台湾政经中枢所在地－台北都会区，因此有别于陆军第八军团、陆军第十军团的副指挥官领少将军衔，第六军团的副指挥官是领中将军衔。第六军团因为须防守台湾海崃最窄处及卫戍首都圈，所以是陆军拥有最多兵力及最多主力战车的军团。
指挥管辖.<onlyinclude>