酸、脚气水肿等症，外治口舌生疮。中医以吴茱萸为主药的成方很多，如《丹溪心法》用它治肝火，《千金翼方》中用它治头风，《圣惠方》中用它治胃虚冷等。吴茱萸辛热燥烈，易损气动火，故不宜过量久服，阴虚有热者忌用。
历史.吴茱萸始载于《神农本草经》，被列为中品。《名医别录》中记载：「吴茱萸生上谷川谷及冤句……九月九日采，阴干。陈久者良。」唐代陈藏器说：「茱萸南北总有，入药以吴地者为好，所以有吴之名也。」宋代苏颂说：「今处处有之，江浙、蜀汉尤多，木高丈余，皮青绿色，叶似椿而阔厚，紫色