重庆地区和四川地区经济的蓬勃发展对抗击蒙古入侵打下了坚实的物质基础。宋端平二年(公元1235年)，蒙古军队首次入川，于次年再攻四川，陷成都，全川震动。时任四川制置副使兼重庆知府彭大雅遂加固重庆城，并派部将于合州钓鱼城筑寨。淳祐三年(1243年)宋廷命余玠权兵部侍郎、四川安抚制置使兼知重庆府。淳佑四年正月，以余玠华、文阁待制，依旧四川安抚制置使兼四川总领财赋、夔路转运使、知重庆府，四川军事、政治、财政等主要机构都集中到了重庆。此后直到南宋灭亡共36年(1243年-1279年)，宋廷在成都府均未设制置使。