市建立之际的名称为「Kjøbmandehavn」，意为「商人的港口」。英语「Copenhagen」的名称来自于低地德语「Kopenhagen」，中文译名也由此而来。
历史.12世纪时在厄松区域建立了一个城堡，其目的是保护一个通向瑞典的小港口。这个城堡及在其附近建立的居民区被称为"Købmandens Havn"（商人的港口）。后来这个名字改成哥本哈根。1254年哥本哈根获得城市权。1369年汉萨同盟视这个新兴城市为竞争对手，将它连城带堡摧毁。1416年丹麦国王将其住地迁到重新建