到达北角站后，会经由新隧道继续向西行，而且经炮台山站直达天后站，再经原有的港岛线往坚尼地城。基于中西区填海区的就业人口在十年内无明显增加，加上路线需要配合中环第三期填海，该计划一直受到环保人士反对，指填海计划会破坏维多利亚港，有可能需要修订定线。另外沙田至中环线（第四条过海铁路）是否落实亦左右了第三期填海区车站的归属地点，在各种因素下，香港政府于2003年决定将北港岛线的完成时间押后至2016年以后。当建议得到落实后，由于东涌线与港岛线所使用的列车类型和信号系统有所不同，需要作出调整及接合，极可能需要修