配以长刀、自制竹刀与弓箭在南靖庄埋伏，7月12日清晨4点多，发现日军水路运送队40名士兵，客家义勇军躲在暗处先以弓箭射击，部分日军见状持枪反击，但天色昏暗无法得知埋伏义勇军，加上部分日本士兵中箭而纷纷弃船逃离，而逃亡的日本士兵登岸后往一片树丛（位在今国立台北大学校园）移走，将近百余人的义勇军纷纷持大刀等武器开始杀红了眼追击日本士兵，并发生近身短兵厮杀，日方兵力单薄不敌百余人义勇军，一一被乱刀砍死并弃之于此，惟义勇军商议后将日本士兵埋葬与此，借以湮灭证物以防日军报复，然而因为树丛掩蔽仍有数名日本兵倖免脱逃。日