现为「由南而北，先西后东」的顺序。今日台湾尚有大量带有「股」、「份」、「结」的地名，如五股、头份、五结等，显示当时已有垦户股份或结首制的形式来开发土地。为了提高农作物收成，开始兴修大量水利设施，着名的如位于今彰化县的八堡圳、今台北市的瑠公圳、今高雄市的曹公圳等。农业生产的主要作物则以稻米和甘蔗为主。同时，经济的发展伴随了港口与商贸的兴起，随着贸易量的发展，在台湾府城之后，又有鹿港、艋舺等口岸发展兴起，有「一府二鹿三艋舺」的说法。由于台湾官府社会掌控力较低，仰赖土豪协调地方，在大清统治台湾的两百多年间，台湾