。由于马耳也岛战略上十分重要性，在这时期，马耳他岛上的男人都接受军事训练。1192年，西西里国王坦克雷迪封姑父马加里托为首任马耳他伯爵，这可能是因为后者意外成功俘虏了王位竞争者康斯坦丝皇后。1194年，管辖马耳他岛的西西里王国王位落入德国贵族霍亨斯陶芬家族（康斯坦丝的夫家），直至1266年。在此期间，霍亨斯陶芬家族的国王腓特烈二世开始重整了西西里王国，西方文化和宗教开始对西西里及马耳他发挥更强烈的影响力。马耳他更有72年时间成为德意志民族神圣罗马帝国的一部分。虽然如此，在这时期马耳他的贸易被完全摧毁