920年8月11日下令以沈鸿英为攻闽总司令，分三路进攻福建。陈炯明和亲孙中山的许崇智部队反攻，陈于1920年11月回到广东就任省长。长期受到桂系力量打压的广东地区欢迎陈炯明主政，省外广东人合资汇款60万支持陈，又有华侨捐献飞机12架。陈炯明邀请孙中山、唐绍仪、伍廷芳回广东，11月孙中山从上海回到广州，并改编陈的军队由其直辖。11月29日，军政府任陈为总司令。1921年2月中旬，孙中山召集广东的国会议员召开非常会议，推选孙中山为非常大总统。陈炯明等人以选总统无异于自树目标，广东目前无力抵抗北方进攻为由反对