犹太裔僱员在1933年到1934年被迫害开除。大量的学位被撤销。持有不同政见的教职工和学生被拒收、开除和勒令退学，这期间共有三分之一的学校人员被开除。
两个「柏林大学」.1810年柏林大学创校，校区原址位于菩提树下大街。到第二次世界大战结束为止，柏林原本只有一个「柏林大学」，而大学师生也很骄傲地以拉丁文校名「柏林大学」（）自称。冷战期间，柏林大学被划入东柏林境内，部分师生从原校出走，并在美英等西方阵营的支持下，1948年于西柏林成立了「自由的柏林大学」（即今柏林自由大学），成为西德