理课纲多为用语调整，内容改变不大。其中加入「外籍新娘」、「菲佣」、「印佣」等名词，一些民间团体认为违反2008年通过的入出国及移民法中的反歧视条款。
语文领域国文科.98课纲与101课纲比较，台湾相关题材作品由二成减少至一成，文言文作品比例提高根据朱宥勋的整理，政府认为在国文课纲只「微调」了两处，但他比较98课纲与104课纲后，认为国文课纲至少调整了五个地方：对此，教育部认为，有关国文科微调后，文言文比率问题，依据101学年度实施的普通高级中学国文科课程纲要规定，文言范文所