亚马都可以追溯到18和19世纪由宗教团体育种的一小批马匹。从16世纪开始涌入的的血统，导致很多血统被稀释；只有那些受到选育保护的品种才能完好地保存下来，成为现代安达卢西亚马。在19世纪，安达卢西亚马这一品种受到威胁，因为很多马被盗或在战时被征用，包括、半岛战争和三次卡洛斯战争。拿破仑的侵略军也偷走了很多马。但是有一群安达卢西亚马被藏起来了，没有被入侵者偷走，并且后来被用于更新品种。1822年，育种者开始向西班牙马血统中注入的血液，并进一步注入阿拉伯马的血液。部分原因是，由于机械化程度的提高和军队内需求的变化