认同上一直认为自己是中国人，并曾在戒严时代时主张两岸和平统一，遭当时的国民党以「通匪」名义逮捕过。余登发曾在民进党的场合上喊出中国统一的口号，1988年也曾与胡秋原共同担任中国统一联盟首任名誉主席。他跟现在的民进党在两岸政策主张和国族认同上南辕北辙，但在民主的追求上一致。余登发开创了高雄县的政治家族「余家班」，他与女婿黄友仁、儿媳妇余陈月瑛、长孙余政宪合计担任过6次高雄县县长；余陈月瑛、余政宪及女儿黄余秀鸾、孙余政道、孙女余玲雅、孙媳郑贵莲合计担任过11次立法委员；余陈月瑛、余政道、余玲雅合计担任过8次