对付巡洋舰等级的装甲。主砲弹药库则直接改放航舰存放的高射砲弹、机砲砲弹、机枪子弹、炸弹和鱼雷。在主结构区域前后的重油罐部分还另外增设了飞机用燃油储存库，由于这地方本来就没有装设装甲板保护，因此油罐除了原有的25公釐厚度外，还在上面装了被解体的姊妹舰「111号舰」弹药库底部的80公釐装甲板来补强。原先计划在油罐附近设置一块中空区域来存放2,000吨的水，但因为吸取了「大凤号」的教训，改为填充混凝土。舰底方面，为对应磁性水雷和舰底引爆的鱼雷威胁，从自「大和号」和「武藏号」两舰原设计的二重底部强化为三重底部。