含头颅骨、股骨、以及牙齿。模式种是南方闪电兽龙（"F. australe"），由Huene在1932年正式描述、命名。属名的"fulgur"在拉丁文意为「闪电」，"therion"在古希腊文意为「野兽」。Huene最初将闪电兽龙归类于兽脚亚目的似鸟龙科。之后，闪电兽龙被归类于稜齿龙类。但由于牠的化石有可能是来自几个鸟脚下目的物种，所以闪电兽龙被认为是一个嵌合体。闪电兽龙目前常被认为是疑名。