站位于成田机场第2大楼的地下1楼，为地下车站，JR东日本月台为单式月台1面1线，京成电铁为岛式月台1面2线。由于此路段建于成田新干线的预留空间，所以开站时只能把原有的两线设计分割，成为单线配置（京成线自此站起往市区方向的路轨从单线转为双线，因此设有安全侧线）。作为中途站的机场第2大楼站也一样，原设计的2面2线对向式月台分别交由JR东日本和京成电铁使用，而来往的列车班次不论行驶方向均使用同一月台。大堂设有通往zh-hans:东成田站;zh-hk:东成田站;zh-tw:东成田车站;的通道。不