知主君织田信长死于本能寺之变的消息，所以改以让渡备中、伯耆、美作三国以及要求清水宗治切腹已放过城兵为条件，和毛利方讲和。毛利方在征求清水宗治同意后，清水宗治与兄长月清入道、弟弟难波伝兵卫、援将末近信贺在6月2日乘小船出城正式切腹，毛利方也交出桂广繁跟小早川秀包）做为人质，秀吉方也送出毛利重政、毛利高政兄弟当人质，使和约成立。和议达成后，羽柴秀吉也命令黑田孝高打开堤防洩去水势，拯救城中军民（黑田如水传 金子坚太郎着）。尽管急于讨伐明智光秀，羽柴秀吉为防备毛利军可能的追击，也留下宇喜多秀家在备前，安排杉原家