个胺基酸的蛋白质，其序列与一些同属病毒的辅助蛋白相似，可能作为一种结构蛋白组装到病毒中，并可能与病毒出芽离开宿主细胞有关。冠状病毒均是以刺突蛋白结合宿主细胞表面的受体造成感染，NL63病毒使用的受体与SARS-CoV和SARS-CoV-2同为血管紧张素转化酶2（ACE2），但除刺突蛋白和ACE2的结合外，有实验结果显示NL63病毒的膜蛋白可和宿主细胞表面的醣蛋白（HSPG）结合，但仍须有刺突蛋白才能成功感染。
演化.早期有研究指人类冠状病毒NL63与229E病毒序列的相似度为6