末期至日治初期，大屯子地区为一街庄，称为「大墩仔庄」，隶属于大坵田堡。该庄北与罗厝庄、三块厝庄为邻，东与北溪厝庄、竹围仔庄为邻，南边为三合庄、石庙仔庄，西边为牛埔仔庄、新庄仔庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于斗六厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「大墩仔区」，隶属于斗六厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，大墩仔区改隶属于嘉义厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制并雅化为「大屯子」大字，隶属于台