站的各路线都设有车站编号。
车站构造.西大井站是一个高架车站，月台位于新干线高架轨道的正下方，採用2面2线的对向式月台设计。旧山手货物线的连接线分岐点（蛇洼信号场）位于南侧位置。现在是横滨站方向至横须贺线品川站方向与湘南新宿线大崎站的分岐站。
月台配置.（来源：JR东日本:车站构内图）
使用情况.2019年（令和元年）度的1日平均上车人次为16,028人。东京都区内的JR车站当中次于绫濑站，使用人数排行倒数第8。近年的推移如