HK帐户，或直接使用AlipayHK内的「易乘码」，可于港铁扫描二维码出入闸。目前已经有1000部出入闸机安装了二维码扫描器。机场快线穿梭巴士则在乘客持有承认乘搭机场快线的有效凭证下免费乘车。另港铁亦设有多款推广及旅游车票，包括屯门－南昌全日通、游客全日通等。
车费结构.有别于一些单一票价的铁路系统，港铁收费并非划一，票价收费亦不是根据路程长短而定，票价的高低亦同时取决于乘车等级以及是否涉及合併前的不同网络。一般而言，乘客不能以所乘搭的距离越长，收费就会越高的常理推断车资，在一