瑜在国发会有决议以后，宣布辞职抗议。结果在李登辉挽留下，宣布请辞待命。本来宋楚瑜与李登辉情同父子，如今反目成仇。无论李登辉以甚么理由冻省，但在宋心中都是针对其本人的削权打压之举。就以1997年8月的国民党中常委选举来说，宋得到第一高票当选中常委。但党报中央日报中，完全没有宋楚瑜以第一高票当选的消息，头版只有“萧万长以数票之差得到第二名”。自此宋与李渐行渐远。萧万长于1997年国民党全代会后接任行政院长。虽然连战已经下台，但接下来的县市长选举，国民党因冻省风波以及党内内闹而大败。民进党得到一些从未执政的县