。从政期间多次担任立法委员及监察委员。2014年1月，在检察总长黄世铭的弹劾案投反对票。2018年3月，行政院提名为促转会首任主委，五月就任。台大历史系教授陈翠莲透过媒体表示，因不能接受行政院提名促转会主委人选，向政院高层婉拒出任委员，时代力量立委黄国昌也反对这项人事案，但总统蔡英文认为社会普遍认为是适合人选。黄煌雄表示秉持「探索真相，伸张公义，追求和解」面对促转会。针对台大历史系教授陈翠莲提出黄煌雄消费蒋渭水的说法，蒋渭水后代家属共同发表声明，共同肯定黄煌雄在戒严时期为蒋渭水立传的努力与成果不容抹煞