基因组，基因表达数据， UniProt蛋白质数据库，InterPro（蛋白质家族/域/蛋白指纹等）和PDBe（大分子结构）。ENA由原EMBL-Bank核酸序列数据库基础上发展起来，是欧洲最重要的核酸序列资源，与美国NCBI的GenBank和日本的日本DNA数据库（DDBJ）组成国际核酸序列数据库合作联盟（INSDC）。这三大数据库各自收录了世界上所报道的所有序列数据的一部分，并且每天实时更新交换各自的序列信息。欧洲生物信息研究新的数据资源包括蛋白质相互作用（IntAct），反应途径（Reactome）