旧历五月初五傍晚开始举行「暗访」，五月初六中午开始展开日间遶境，巡游全区，希望能够驱逐瘴疠、瘟神，庇佑平安。官方名为「淡水清水巖清水祖师遶境」，俗称「淡水大拜拜」。2013年新北市政府已将「淡水大拜拜」，列为「无形文化资产」。相较之下，淡水另一个公庙淡水福佑宫的「妈祖遶境」范围，与清水祖师遶境相近，但妈祖的绕境并不是境内所有角头庙都会参与，更突显出清水祖师作为淡水全境境主神祇的代表性，以及清水祖师遶境活动凝聚地方的重要意义。清水祖师的各尊神像中，以「蓬莱老祖」最受檀越崇敬，淡水清水巖与艋舺清水巖两庙在日