2016年夏季奥林匹克运动会帆船男子双人小艇49人型比赛于2016年8月12日至18日在巴西里约热内卢格洛里亚码头举行。该项目共有12场资格赛以及1场奖牌赛，12场资格赛过后总分最低的10名选手将晋级最终的奖牌赛。曾获2012年伦敦奥运该项目亚军的新西兰组合Peter Burling和Blair Tuke在预赛轮期间积累巨大优势，并在奖牌赛开始之前锁定胜局，最终力压其他选手夺冠。澳大利亚组合Nathan Outteridge和Iain Jensen以78分的总分收获亚军，未能成功卫冕。铜牌归属于德国组合