唐景崧在同年5月25日宣布建国，并由唐景崧担任首任大总统。然而在随后因日方接收台湾而起的乙未战争中，其中部分民兵首先叛变，台北遭到佔领，唐景崧不久后便逃亡厦门，第一共和迅速瓦解。同年6月26日，刘永福被选出任第二任大总统，以台南为基地建立第二共和，并以大天后宫为总统府。但刘永福亦于该年10月19日西渡中国大陆，两日后台南遭日军攻陷，台湾民主国灭亡，历时150天。台日军队有数场激战，日军伤亡以病死者多。台湾民主国是台湾住民为了引起国际社会牵制日本统治而建立的，由年号定为「永清」便可看出其本质上奉清朝为宗主