铁在2000年代初採购ER20型柴油机车，目的之一就是为了日后发展港口货运的可能性。这条铁路原来属于九广铁路旗下货运发展策略的一部份，自从两铁合併之后，这个计划的进展未有更新。加上铁路货运量的萎缩，计划最后也不了了之。2009年10月16日，运输及房屋局局长在立法会经济发展事务委员会上简介来年运输科的施政纲领时表示：政府正式搁置推展港口铁路线计划，并且将会预留作为港口铁路货运站的土地作永久物流用途。当局解释搁置计划有三个原因：