地下中央委员会被破坏后不久，他和另外两名中央委员一起，建立了第二个地下中央委员会。1942年4月24日因叛徒出卖，他被德军逮捕，并被刑讯逼供，几度濒死，被收押于布拉格庞克拉茨监狱中。1943年8月25日，他在柏林被纳粹德国法庭判处死刑，9月8日，伏契克在柏林勃洛琛斯监狱被德国纳粹绞死。狱中有最后遗着《绞刑架下的报告》写道：“我们为欢乐而生，为欢乐而战斗，我们也为欢乐而死。因此，永远不能让悲哀同我们的名字联系在一起。”。他是捷克文学史上最早发现鲍日娜·聂姆曹娃和扬·聂鲁达的重要地位的文学评论家之一。