中华民国成立后，他任教育部临时教育会议议长。民国三年（1914年），中华民国教育部认为京津两地相距不远，北京大学与北洋大学学科又相同，拟令北洋大学办成专门性工科大学。王劭廉反对这一改组，辞去北洋大学教务提调职务，并推荐赵天麟教授继任。此后，王劭廉应周学熙之请，到开滦矿务局任协理。1936年11月19日，王劭廉病逝于天津寓所，终年七十岁。