机构有：侦查监督厅、公诉厅、反贪污贿赂总局、渎职侵权检察厅、监所检察厅、民事行政检察厅、控告检察厅（对外挂牌称最高人民检察院举报中心）、刑事申诉检察厅、铁路运输检察厅、职务犯罪预防厅。最高人民检察院反贪污贿赂总局成立后，先后参加查办了原北京市副市长王宝森案、原中共贵州省委书记刘方仁案、原浙江省副省长王钟麓案、原黑龙江省政协主席韩桂芝案、原中共上海市委书记陈良宇案等大案要案。但最高人民检察院反贪污贿赂总局的级别仅为局级，不能适应反腐败工作的需要。为加强反腐败工作，2007年，中华人民共和国又成立了国家预防