多条连接佩皮尼昂和的常规或学生巴士线路。2018年，60.7%的佩皮尼昂居民拥有至少1辆私人汽车
铁路.佩皮尼昂位于和的交汇处，佩皮尼昂－菲格雷斯高速铁路则于2010年建成通车。佩皮尼昂火车站位于市中心西部，该站每天开行前往巴黎的高速列车，同时开行前往里昂、马赛、巴塞罗那、马德里等地的高速列车以及前往图卢兹、阿维尼翁、塞尔贝尔等地的区域列车，是法国铁路系统A级车站。2017年12月以前，佩皮尼昂还开行直达自由城-韦尔内莱班站的区域列车，后因而停运。2018年，佩皮尼昂站累计发送