起参与护法战争反抗北洋政府，并宣布湖南独立，控制了湘南的24个县。其后北洋军内閧，直系军阀吴佩孚收下的湖南地盘被皖系军阀张敬尧佔去，吴佩孚不愿皖系把势力扩张到湖南，吴佩孚不顾皖系首领段祺瑞反对和林修梅在耒阳于1918年6月签字停战。1921年，林修梅任孙中山中华民国非常大总统府代理参军长。1921年10月，林修梅因牙病被庸医治疗，病逝于广州中法韬美医院，享年42岁。孙中山发布大总统令，为其举行国葬。