教堂的基址即是《新约圣经》中描述的基督耶稣被钉死的地方，即各各他的所在之处，而且据说耶稣的圣墓也在其中，他们因而对此地顶礼膜拜。从西元4世纪开始，教堂即已成为一处朝圣的重要目的地。时至今日，教堂是耶路撒冷牧首的教座所在，而建筑本身则由罗马天主教会、亚美尼亚使徒教会、正教会三个教会负责主要的行政及管理，另外叙利亚正教会、衣索比亚正教会、科普特正教会则享有部分祭坛等设施的使用及管理权。
历史.2世纪时，今日教堂的所在地曾是一座阿佛洛狄忒神庙，也有一些古代作家将其描述为维纳斯神庙，即罗马