河流为黑龙江、乌苏里江、霍尔河、乌第河、阿姆贡河。此外还有多个小湖泊：胡姆米湖、奥列利湖、乌德利湖、博隆湖、奇利亚湖、丘克恰吉尔斯科耶湖、大苏卢克湖、埃沃龙湖、基济湖、阿穆特湖、布拉戈达特诺埃湖、卡季湖。
历史.中世纪时期（中国宋朝时期），在今哈巴罗夫斯克边疆区境域生活的主要的是通古斯民族，也就是后来建立金朝的女真族。中国明朝宣德七年，亦失哈在奴儿干都指挥使司（外东北）时，重建毁坏的永宁寺，并在黑龙江入海口立下一块石碑，在之前的永乐十一年，在修建永宁寺时也在入海口立下一块碑，这