与赵又新、倪致中等人发动建水起义。起义成功，成立南军（南防）军政府，朱任都统。随后再度击败清军，光复迤南各地，拥护昆明的云南军政府（都督：蔡锷）。中华民国成立后，朱朝瑛被委任为临元镇总兵，总南防各营。并获授陆军中将衔、三等嘉禾章。但是不久，广东都督龙济光介入迤南，发生兵乱。朱被打败，逃广东，家产被没收。后归家乡。1929年（民国18年），朱朝瑛逝世。享年60岁。