这一年中，徐有贞被石亨中伤，被戍金齿。又过了几年，曹石之变事发，石亨也被关入监狱得死，曹吉祥因谋反被处罚族诛，于谦的冤屈最终得以昭雪。成化年间，其子于冕获赦，上疏为父鸣冤，宪宗亲自审理，并下诏予以平反：弘治二年，经给事中孙需进言，孝宗追赠于谦为「特进光禄大夫、柱国、太傅」，谥号「肃愍」，钦赐「在墓建祠」，题为「旌功」，设春秋两祭。葬于谦于杭州西湖三台山麓。万历年间，明神宗改授谥号为“忠肃”。在此后的数百年中，杭州、河南、山西等地祭祀他的事情仍不绝。
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