色高棉的席位问题上投上赞成票，与印度背道而驰。1950年，《印度-尼泊尔友好条约》签订，因印度移民问题，该条约广受争议，并激起了尼泊尔民众的不满情绪。不丹与尼泊尔不同，印不关系并未因《友好条约》的规定所引发的关切而受到影响。2003年至2004年，不丹王军对阿萨姆联合解放阵线开展军事行动。后者曾利用其在不丹的部分基地对印度进行攻击。