担任今治城主的养子藤堂高吉继续管理。直到1635年换封至伊势国名张的领地，藤堂家对此地的统治才结束。1635年松平定行自伊势国桑名藩转封至伊予松山藩的15万石领地，其弟松平定房也从伊势长岛城的七千石领地转封至三万石的今治。1665年松平定房担任江户城大御留守居役，作为薪资而加封武藏国、下总国、常陆国的一万石。根据第二代松平定时死前对嫡长子松平定陈的遗言，将关东五千石的领地分给定陈之弟松平定直。从此本藩石高成为3万5千石。1698年关东领地5千石收公，改以伊予国宇摩郡的5千石领地代替。本藩的财政建