6年6月到2016年10月，任中国环境科学研究院院长、党委副书记。2009年12月当选中国工程院院士。是第十一届、第十二届全国人大代表，2013年3月当选第十二届全国人大环境与资源保护委员会副主任委员。孟伟曾任中国环境科学研究院院长、研究员、博士生导师，中国环境科学学会副理事长、常务理事，环境标准与基准专业委员会主任委员；中国毒理学会名誉理事长、常务理事，环境毒理与生态毒理专业委员会主任委员；全国高等学校环境工程教学指导委员会副主任；第二届国家气候变化专家委员会委员，享受国务院政府特殊津贴专家。