种极为罕见。因珊瑚覆盖率较好，因而常可见到大型无嵴椎动物。礁台表面地形十分平坦，偶而有些大型礁块突起，大多数是以珊瑚碎屑和活珊瑚群体所构成；表面有大小不一的潮地，潮池中的生物种很多，包括许多种大型藻类和海草。甲壳类动物的种类与数量较少，与1998年圣婴现象珊瑚大量白化死亡而造成大型虾蟹无法栖住在珊瑚分枝间，及受到过渔的影响有关。2004年有前往东沙岛附近海域捕鱼的渔民，因误食软体动物有毒贝类橡子织纹螺（具有河鲀毒），6人中毒送医，其中2人死亡。东沙岛上相对于海上的动植物种类则稍微稀少，植物皆为热