通过的公共法107-228《2003年财政年度外交关系授权法》（）第326款之授权，美国国务卿及其他政府部会首长方可选派人员进入美国在台协会任职。根据2012年发布的报告，美国在台协会台北办事处官员最大宗来源除了国务院外交官外，其次分别为美国国防部及美国商务部海外商务服务处等机构之外派官员。
部门职掌及改组沿革.组织结构方面，美国在台协会台北办事处亦按照各业务领域，如政治事务、商业服务、农产品销售、旅游服务及文化交流等，分为数个组别。台北办事处下属单位在1979年美国国务院东亚暨太