南投县境内有155科489属831种维管束植物，其中特有种植物167种就佔了五分之一，另计稀有植物31种；动物方面则调查出8目16科32种哺乳类，27科91种鸟类，两栖类与爬虫类各有6种，其中为数不少属于保育类，如台湾黑熊、帝雉、台湾蓝鹊、菊池氏龟壳花、石虎…等数种。为实行「中央山脉生态廊道」，以保存珍贵动植物资源与多样性的生态环境，行政院农业委员会于2000年2月25日依《野生动物保护法》公告设立「丹大野生动物重要栖息环境」。丹大野生动物重要栖息环境深处高山，范围广阔，境内交通多为林道。南投县则有一条