2日，成都双流国际机场在地震发生后随即关闭，当日所有前往成都的航班被取消，受到影响的航班全部被转往重庆江北国际机场。21时45分，双流机场恢复单向开放。5月13日0时23分，双流机场恢复双向开放。铁路方面，宝成铁路、成昆铁路及相关支线线路多处塌方。铁道部表示，受地震影响，有三十一列客车、一百四十九列货车在途滞留。其中宝成线徽县至虞关段109号隧道山体塌方最为严重，导致21043次货物列车在隧道内脱轨，包括12节油罐车在内的货车起火燃烧。宝成线因此从2008年5月12日起中断行车，经过抢修，直至5月24日