车站是JR东海所属的两条干线铁路、东海道本线与御殿场线的交会车站，除了是所在地沼津市的主车站外，也是静冈县东部主要的交通枢纽。包括日出濑户（）、日出出云（）2列卧舖列车与行驶在御殿场线上的特急列车朝雾（）皆有在本站停靠，站内也设有绿窗口（）。本站亦是上野东京线列车最西的终点站。在JR东海的分类上，沼津车站是设有站长与站员的直营车站，除此之外沼津也负责东海道本线上两个相邻的小车站、片滨与原的运务代管。由于负责御殿场线上行驶列车维护工作的沼津运输区就位在站区东侧，因此站内设有大量调度用途的停车线。在过去的日