任台湾海基会副董事长兼秘书长。妻罗惠珠，育有二子；现任中原大学兼任讲座教授。2015年2月11日高孔廉出任国民党主席特别顾问兼大陆事务部主任2016年10月，高孔廉直言除了历史定位，马英九并没有在马习会中得到什么，甚至被问到马英九是否有望争取诺贝尔和平奖，高坦言目前两岸继续僵持，要得奖「很难」。