光显微观察下标示DNA。由于可将DNA标示，此种染色方式也可以用来辨识内含DNA的细胞核及粒线体的位置。常用的两种染剂为Hoechst 33258与Hoechst 33342 ，这两种染剂可在波长350 nm的紫外光下激化。不过赫斯特染剂是潜在的突变原，处置上需要较为小心。