1月17日以总预算案覆议未获支持为由，向中华民国总统陈水扁请辞获准。2006年1月19日，陈水扁宣布任命前民主进步党主席苏贞昌接任行政院长。
概述.苏贞昌与谢长廷被视为在2008年中华民国总统选举中的潜在竞争对手。苏贞昌内阁与谢长廷内阁不同的地方：谢内阁延用游钖堃内阁的主要官员；反之，苏贞昌则对内阁大幅度改组，内政、外交等部长均作出改组，并延揽曾任行政院大陆委员会主任委员四年的民进党不分区立委蔡英文为行政院副院长。苏贞昌内阁在任期间，建立法源冻结及罢免有案在身、后来被起诉的金融监