隧道和约9.4公里长的高架桥组成。高架桥设计成180米的特大跨度，远离北大屿山生态敏感地区的同时，亦与机场南跑道和政府飞行服务队总部保持距离，减少工程和车辆行驶对机场及飞行服务队运作和附近码头的影响。在北大屿山一段设计成离水面和陆地较高之高架桥直接跨过沙螺湾，以避免触及极具保育价值的沙螺湾古迹遗址一带陆地。
珠海连接线.港珠澳大桥珠海连接线于2012年7月开始动工；东起自珠澳口岸人工岛，在拱北口岸和澳门关闸之间地底穿过，经高架桥到达南屏，再在竹仙洞水库旁山中穿过，西行止于黄茅海，与