法、荷、意、西班牙、波兰、希腊、拉丁、希伯来、佛兰芒、叙利亚、马来、大宛、藏、满、蒙等语种的“摇篮本”早期印刷图书和和一批稀见文献，被运出教堂移交北京图书馆收藏；西什库教堂所拥有的出厂号为670、有着16.6米长低音管的法国产Cavaillecoll牌管风琴是北京最大和最好的一座管风琴，于1965年以保护名义被中央音乐学院移走，后在文化大革命中散失。直到1985年西什库教堂才交还给天主教三自爱国会，1985年12月24日在修复后重新开堂。1984年西什库教堂被列为北京市文物保护单位；2006年6月被列为