体，和，以及植物共生根瘤菌。III型分泌系统(T3SS)是由大约30种不同的蛋白质组成，使之成为最复杂的分泌系统之一。其组成部分主要分为底座与针状结构两部分。底座(basal body)根植于细胞膜之中，由许多同种蛋白质组成的针状结构伸出胞外。与细菌鞭毛相比，其结构显示许多相似之处（长的，刚性，胞外结构用于能动性）。一些参与T3SS的蛋白质和鞭毛蛋白分享氨基酸序列同源性。一些具有T3SS的细菌有鞭毛，而且能运动（例如，沙门氏菌），和一些不能运动（例如，志贺氏菌）。从技术上来讲，III型分泌既可以被用于分