清军入关后，征补原官。顺治二年（1645年）四月，任侍读学士，同年七月擢礼部侍郎。顺治五年（1648年），调任吏部右侍郎。后加右都御史。顺治八年（1651年），任吏部尚书。次年被御史吴达弹劾，上疏请求罢官。顺治十年（1653年），重新起用，晋弘文院大学士，同年因病回故里。顺治十一年（1654年）卒。追赠少保，谥文端。
着作.有《高文端公文集》。