完善了木村资生的中性演化理论。他1987年出版的《分子演化遗传学》（“Molecular Evolutionary Genetics”）被认为是经典群体遗传学的集大成之作。
评价.根井正利早年受教于木村资生， 是木村资生中性演化理论的坚实拥护者和发展者。他在1997年选美国科学院院士，2002年获国际生物学奖，2006年获美国遗传学会摩尔根奖。他从1958年开始发表学术论文到现在五十多年间，发表了300多篇学术和5本书，其中，超过5o篇的单篇引用率超过100次，超过10篇超