越挟幼主号令天下。司马越遂叱左右斩二人。以二人世家，不再诛杀其亲族，因此上表废除夷三族法令。后晋怀帝开始亲理万机，留心庶事，司马越不悦，求引退回封地，怀帝不许。司马越遂出镇许昌。
掌控西晋.永嘉元年（307年），司马越由许昌率领苟晞及冀州刺史丁劭讨破作乱的汲桑。战后回到许昌，而苟晞因功而加抚军将军、都督青、兖诸军事。司马越长史潘滔说：「兖州天下枢要，公宜自牧。」因此下诏转苟晞爲征东大将军、开府仪同三司，加侍中、假节、都督青州诸军事，领青州刺史，自此与苟晞有仇隙。同时怀帝下诏司马越爲