寺坐落在拉萨市驻地以东，拉萨河南岸的蔡公堂乡，距离拉萨市区10公里。当地群众称之为“扬庚寺”。它是蔡巴噶举派的创始人向·尊珠扎巴于1175年（藏历第三绕迥木羊年）发起修建。“蔡巴噶举”即由蔡巴寺而得名。1193年（藏历第三绕迥木虎年、宋绍熙五年）向·尊珠扎巴圆寂后，蔡巴噶举派的宗教活动由蔡巴寺和贡塘寺的堪布主持。两寺的实权被向·尊珠扎巴侍者达玛宣奴掌握，再被他的后辈叔侄相承。达玛宣奴的侄孙意希迥乃时期，蔡巴噶举派兼并了很多的古麦村寨，权势日渐扩大，辖区有“四部八支”之称。意希迥乃的继承者是噶尔·杰哇迥乃