到了「恶左府」的绰号。赖长有一女名多子，嫁给近卫天皇为皇后。1155年，近卫天皇逝世。鸟羽法皇本希望让崇德上皇的儿子重仁亲王继位，但遭关白藤原忠通（赖长的兄长）反对，认为雅仁亲王的长子守仁亲王有作为国君的才能，因此改立雅仁亲王即位，是为后白河天皇。崇德天皇十分怨恨，暗中拉拢藤原赖长同后白河天皇一派对抗。次年，鸟羽法皇驾崩，两派的冲突白热化。京都风传赖长勾结崇德上皇谋反，因此，后白河天皇下令没收藤原赖长拥有的庄园。当时，没收庄园意味着被定为谋反之罪，赖长以此为理由举兵，拥立崇德上皇讨伐后白河天皇。7月