，被召回朝廷，以三品京堂在总理衙门行走，同年授二品衔，后又授光禄寺卿、太常寺卿。当时朝廷财政匮乏，朝廷讨论增加厘税弥补不足，袁昶表示反对，认为“增厘税，名病商，实病民，不可增议”。
庚子事变.光绪二十三年（1897年），因曹州教案，德国趁机出兵强占胶州湾，光绪帝下诏求言。袁昶向朝廷条陈了时政二万言书，提出：光绪帝亲自将其纲要书写在册子中，下发大臣们议行。光绪二十六年（1900年）山东兴起义和团，杀戮外国教士。慈禧太后和端王载漪想利用义和团的力量对付列强，准备攻打各国公使