水调节运用，有效蓄水量为3,218万吨。宝山第二水库与宝山水库联合运用，可增加新竹地区水资源之调蓄及供给能力。
沿革.有鉴于新竹地区工商业快速发展，公共及工业用水量与日俱增，经济部水利署为增进新竹地区水源调度与供应能力，与台湾自来水公司及新竹县政府共同兴建宝山第二水库。宝山第二水库于1987年开始规画，并于1997年4月开始实施，至2006年6月正式完工。