。还乡后，闭户读书着述。康熙十三年（1674年），被抚州知府王永茂诬陷与耿精忠部属勾结叛乱，被下狱，后经多方营救免罪。康熙十八年（1679年），获举荐参加博学鸿词科考试，列第二等第一名，授翰林院侍讲，参与修撰《明史》。康熙二十年（1681年），主湖广乡试。康熙二十三年（1684年）卒于官邸。《清史稿》有传。
着作.李来泰文章广博深奥，为清初八股文大家。着有《莲龛集》40余卷，但毁于兵火，仅余16卷流传至今。