改名为元资。永禄8年（1565年），在月山富田城之战中，与从兄弟毛利辉元一同初阵。此后亦跟随父亲元春，在山阴各地，持续与尼子氏残军战斗。天正元年（1573年），改名元长，与父亲一同向山阴出兵。天正元年（1574年），在所领内建立万德院。同年，征伐在因幡国扩张势力的尼子残军，不过尼子军不断再起。天正6年（1578年），在上月城之战中令尼子胜久和山中幸盛等人自杀，或处刑，成功断绝祸根。天正9年（1581年），前往救援被织田氏的羽柴秀吉围困的吉川经家坚守的鸟取城，不过因为兵力差距而没有出战，在未等到元春率领的