发现桡脚类与在未经处理供水中的霍乱有关，而霍乱菌是附在浮游生物的表面。此外，在麦地那龙线虫的幼虫可以传播给人类之前，牠要在桡脚类动物的消化道内才可以发育。感染这些疾病的风险，可以透过利用布过泸器之类的物品把桡足类及其他物质泸走，来减低问题的影响。在越南已经成功以桡脚类来控制带病的蚊，如传播登革热的埃及斑蚊。将桡脚类（如中剑水蚤及大剑溞属）加入容器中，牠们可以在容器中生活多个月，攻击、杀死及掠食孑孓。这类生物控制方法须与清理及回收垃圾等配合，以消除蚊子滋生的地方。