1946年，詹逊获委任为星加坡总督兼三军总司令，并在同年4月1日履新，取消蒙巴顿勋爵设置的临时军政府，复设文官政府。他上任总督初期，由于经济在战后迟未恢复，以致1947年的时候曾发生过大规模的骚乱。在1947年7月，星加坡脱离海崃殖民地，成为独立的皇家殖民地。詹逊于是成立了立法局和行政局，至1948年3月，他又容许立法局内25个议席中的6个由选举产生。到1948年6月，马来亚共产党发动游击战，马来亚殖民地政府随即宣佈进入紧急状态。詹逊立即对星加坡的左翼团体加以打压，并通过极具争议性的《内部安全法案》，容