国胆泽郡塩釜村（今岩手县奥州市水泽区）一武士之家，父亲十右卫门，在仙台藩水泽馆主伊达将监门下当侍卫长，明治维新后归家务农。后藤新平年幼时给胆泽大参事安场保和当书僮，工作之余，勤学不倦。1871年，后藤到东京去求学，不得志而归。1874年，安场保和任福岛县县长时，进入福岛县须贺川医学校学习后取得医师资格，毕业后历任爱知县病院医师、院长兼爱知医学校校长。1883年任内务省卫生局技师，1890年赴德国留学，得到医学博士学位。
青年时期.1876年，适逢安场保和任爱知县县长，邀请他去名