艺术类和理工类的17个系。2009年，嘉庚学院增设机械电子工程专业，招生专业数达41个，专业方向近70个。本科毕业生达到学校毕业要求后可获得厦门大学学士学位，从2012届本科毕业生开始将由厦门大学嘉庚学院独立授予学位。厦门大学嘉庚学院首任及现任院长为从新加坡归国的王瑞芳。