946年3月19日美国撤销“驻华美军司令部”，在南京市黄埔路4号另设“美国军事顾问团”，总部设在南京，上海设有办事处，在北平、成都、杭州和台北各派有小型联络处。按照中华民国国防部组织架构为对象配备，国防部各司、厅、局、处及陆军总司令部、海军总司令部、空军总司令部、联合勤务总司令部及宪兵司令部，美军顾问团都派顾问或联络官进驻，总计约有2000余人。例如，时任中华民国国民政府主席蒋中正下手谕要求宪兵司令部直属参谋总长，但美军顾问团坚持宪兵司令部与军法处、副官处必须隶属于联勤，反复交涉多轮直至1946年底蒋中正的