台湾总督府派任，于台湾台北地区担任设市后首届台北市尹（该官职约等于今台北市市长），1924年（大正13年）12月23日卸任。后转于台湾总督府土木局担任末任局长，任期为1924年（大正13年）12月23日 至该年12月25日。矿物学家、北投石发现者冈本要八郎为其弟，因过继给三河国士族冈本多丸翁作为养子故改姓冈本。据要八郎之子、贝类学家冈本正豊所言，冈本氏会来台湾教学、研究是受到武藤氏的影响。