备改产无烟火药及硝化棉提供内迁的兵工单位炸药与火药，停止化学兵器的研制。1947年，第23兵工厂与第2兵工厂合併；1948年，中华民国国民政府将其应用化学所迁往台湾，由此奠定了中华民国现行化学武器的发展基础。23兵工厂设备则在1949年11月底中国人民解放军攻入泸州市时完整移交，后改名泸州化工厂（现泸州北方化学工业）。
迁台后.1949年，中华民国政府撤入台湾后，美国海军在1955年借用国立台湾大学医学院附设医院部分院区设立了（U. S. Naval Medical Resea