至2001年新的阿富汗过渡政府成立为止。2001年，美国推翻阿富汗伊斯兰酋长国以后，将政权移交给阿富汗过渡政府。拉巴尼在2001年短暂担任过渡政府总统。2010年10月，被阿富汗政府任命为「高级和平委员会」主席。2011年9月20日，在首都喀布尔的住家与两名塔利班成员会面时，遭遇对方引爆藏在头巾里的炸弹袭击而身亡，巧合的是当天是他71岁生日。9月23日，阿富汗政府为他举行了国葬，总统卡尔扎伊在葬礼上发表演讲说：“拉巴尼的鲜血和其他为自由付出生命的烈士要求我们继续为实现和平与稳定作出努力”，“我们