龙亚科）互成姊妹群，支序图如下所示：始糙齿龙同时具有祖先型（鸭嘴龙形态类）和进阶型（栉龙亚科）的特征。其发现表明，栉龙亚科在与赖氏龙亚科分化后，经过不久的辐射演化就发展出前者的典型吻部结构；同时又与其他阿帕拉契亚鸭嘴龙科：鸭嘴龙、冠长鼻龙、破碎龙、阔步龙的两个种一起，可能代表着阿帕拉契亚是鸭嘴龙科的起源地，牠们在那里发展一阵子后才迁徙到西方的拉腊米迪亚。