系.提摩西·洛威最初将模式标本归类于（现在是"Megapnosaurus kayentakatae"或卡岩塔腔骨龙）。卡岩塔猎龙不太可能是"Megapnosaurus kayentakatae"的异名因为前者距有许多后者缺乏的坚尾龙类特征，例如耻骨孔和胫骨中侧的利嵴。后来的系统分支研究都将卡岩塔猎龙排除于腔骨龙科之外，与异特龙较接近。这将使卡岩塔猎龙成为北美洲最古老的坚尾龙类。但破碎的遗骸使此理论有待进一步讨论的空间。以下兽脚类系谱树取自给（2010）：