港口铁路线、长途客运线及近郊客运线（大致为现时西铁线）。整个项目被建议优先兴建，预计耗资231亿港元，于2001启用。其中长途客运线曾分为与近郊客运线同时兴建的独立路轨方案，及与近郊客运线共轨的方案。在《铁路发展策略2000》，区域快线的走线建议由红磡站出发，先经石硖尾站，再经锦上路站或新建的粉岭南站直往边境。2005年，当局启动对广深港高速铁路香港段计划的研究后，曾经考虑採用多个方案的可能，香港段的总站可以选择兴建位于新界北部的洲头或者西九龙，其中西九龙在交通接驳、对环境影响及对香港岛及九龙等香港