海洋生态系统是地球中最大的一个部份，海面佔据着地球上三分之二的面积，包括海洋、盐沼、潮间带、河口、潟湖、红树林等等，这些地点支持着众多生物的生存。海洋生态系统不仅对海洋生物重要，对陆地环境也有着很大程度的影响。沿海栖息地佔据了海洋中三分之一的生物生产力，河口生态系统和珊瑚礁也是极重要的一部份。 因为生物多样性丰富，所以海洋生态系统对入侵物种的抵抗能力较强，虽然也有极个别反例，但是其机制还不清楚。