中心改为庆元，割据一方，并采用保境安民的政策，使得庆元在当时全国动乱的背景下较为安定。1367年(至正二十七年)12月，方国珍起义军归降朱元璋，庆元路重新更名明州府。
学术发展.宋末元初，浙东历史考据之学兴起，其代表是鄞县学者王应麟。王应麟一生着成700余卷书，其代表作为《通鉴地理通释》。王应麟的研究方法和研究成果为明清时期众多学者树立了榜样，在中国史学研究中获得了较高的地位。
明代.为避国号讳，1381年(明洪武14年)3月20日，明州因辖有定海县，取“