，由于中原发生五胡乱华，晋皇室南迁至前吴国故都南京。与此同时，大量中原贵族和士大夫南迁，也就是所谓的衣冠南渡。此时的南下中原人口主要居住在南京周围和太湖以西地区，会稽八郡并不是这次中原士族南迁的最主要居住地，不过东晋时的望族谢氏则主要居住于八郡，王氏（王羲之家族）也定居山阴。东晋隆安年间，由于对上层士族的门阀统治不满，会稽八郡发生以五斗米道教主孙恩为首的起义。
隋唐.公元589年，在陈为隋所并后，浙江再次进入中原王朝统治时期。隋朝修建了大运河，将太湖流域和洛阳连接起来。武德