败退。在撤退过程中，元亲在丰后臼杵（现大分县臼杵市）被野武者盯上，幸有吉成保护元亲逃脱成功，对此元亲给他很高的评价。庆长4年（1599年），元亲在弥留之际，叮瞩后继者长宗我部盛亲：「让吉成当先锋吧。」（）。庆长5年（1600年），丰臣政权的内战关原之战爆发，盛亲所属的西军战败，其领地亦因而被，对此有家臣建议守城以最后一搏。然而，吉成明白在无外援之下，这些只是毫无意义的准备，因此商请与长宗我部家有关系的僧侣担任使者以说服众人，尽心地完成领地的交接。
藤堂家臣时代.吉成的政治手