门去检阅时，必让善继跟随。出关领兵时，又命其为赞画。善继穿着布衣，骑瘦马，出入于亭障当中，召集将士来加以慰问，并开拓四百里边疆，收复城池堡垒数十座。承宗以大学士督师边关期间，鹿善继累进员外郎、郎中，都在承宗幕府。承宗解除兵权后，善继亦罢归。赋闲在家四年。崇祯元年（1628年）起任为尚宝卿、又迁太常寺少卿兼管光禄寺丞事。任官未满三年，再次告归田里。
殉国.崇祯九年（1636年）七月，清兵入关袭扰，攻定兴。鹿善继才刚称病寓居家乡。考虑到定兴在涿州之南、保定之北，是京师屏障，遂辞别祖坟，