有恆前往东京，祝贺日本「王政一新」；同时要求归还奄美之地，遭日本拒绝。在东京，日本宣佈废除琉球国，改称琉球藩，并赐予东京府下饭田町的一栋住宅为尚泰王的「琉球藩府」。琉球所欠的债务20万日元，理论上被划归日本明治政府偿还；不过为了维持琉球的主体性，琉球以大藏省为担保人，从日本东京国立银行以低息贷款了20万日元偿还了债务。与此同时，萨摩藩的琉球馆、首里城的在番奉行所也被废除，被那霸士族垄断的大和横目、别当、侧用闻等职务也一併废除，大量那霸士族陷入失业状态。1872年，琉球年贡船被漂到台湾，遭到台湾原住民杀害