治九年三月初七（1652年），五世达赖自西藏启程到北京朝觐，满族官员建议顺治帝出京迎接，汉族官员则主张顺治帝在宫中接见。顺治帝最终采取了折中方案，于顺治九年冬天以“畋猎”的名义，在南苑和达赖路遇，顺便向其表示欢迎。顺治十五年（1658年），顺治帝将南苑的明朝旧衙门提督官署改建为行宫，并在当年他和五世达赖会面之地兴建了德寿寺，以作纪念。干隆二十年（1755年），德寿寺发生火灾而烧毁。随后，德寿寺于干隆二十一年（1756年）重修。为避免火灾，自干隆二十一年（1756年）德寿寺重修后，寺内就未居住过喇嘛。