1787年（干隆52年）平定林爽文起义后，将诸罗县改名为嘉义县。1811年（嘉庆16年）增设噶玛兰厅。1875年（光绪元年），台湾增设为二府八县四厅。新设立的台北府下辖三县一厅，即宜兰县、淡水县、新竹县及基隆厅。台湾府下辖五县三厅，即彰化县、嘉义县、台湾县、凤山县、恆春县、卑南厅、澎湖厅及埔里社厅。
台湾省时期.1885年（光绪11年）朝廷敕命台湾建省，设二府八县四厅。1887年（光绪13年）台湾才独立设省，因为与福建省仍有部分行政业务，因此官方正式名称称为福建台湾省