朝同治二年七月二十五日（1863年9月7日），朱志尧出生于上海南市董家渡。受天主教洗礼后取教名“尼格老”（Nicolas）。早年朱志尧就读耶稣会在上海徐家汇创办、二舅马相伯担任校长的徐汇公学，学习法语和自然科学。1880年代曾数次作为随员随舅父马相伯、马建忠出访欧美。1882年，朱家遭遇风灾和火灾，沙船业和钱庄均遭受重大损失，父亲朱朴斋一病不起。于是朱志尧开始从商，担任沙船上的“耆民”（经理）。1886年，三舅马建忠任轮船招商局总办，1888年介绍朱志尧担任江天轮（行驶上海、宁波航线）、江裕轮（行驶上海、汉