分类单元很早就被提出，但直到2007年才被正式定义。在某些研究人员的定义里，波波龙超科跟波波龙科的范围相同，仅包含波波龙与其最近亲。
分类历史.在1923年，古生物学家法兰兹·诺普乔（Franz Nopcsa）建立波波龙超科、波波龙科分类单元，当时仅包含波波龙属，当时被认为是种三叠纪的兽脚亚目恐龙。之后，波波龙曾被多次归类于不同分类位置，包含：蜥臀目、兽脚亚目、肉食龙下目。直到1970年代，发现更完整的波波龙化石，才显示波波龙属于伪鳄类，而非恐龙。近年被命名的岩鳄、苏牟龙也被认为是