65年组建于西班牙。凯撒于前61年作为远西班牙行省总督获得指挥该军团的权限。随后他带领这些军团参加了前58年到前51年进行的高卢战争。公元前49年，该军团被凯撒部署在西班牙，这可能是该军团“西班牙”称号的由来。在内战中，第九军团参与了前48年的和法萨卢斯战役这些与庞培集团的决战和公元前46年进行的非洲诸战役。凯撒取得了最后胜利后，他解散了第九军团并将老兵安置在意大利的。凯撒遇刺后，屋大维重新征召了第九军团的老兵以镇压塞克斯图斯·庞培在西西里掀起的叛乱。在镇压了塞克斯图斯的叛乱后，该军团受命前往马其顿