日，慈航法师安排十几名学僧到灵隐寺，但新竹市警察局就将他们逮捕送到台北刑警队。星云法师也被从圆光寺抓来囚禁。当初逮捕原因官方档案阙如，民间众说参差。陆军中将退役后出家的律航法师得知后，发动营救，而且在第一天陪同入狱。台湾佛教界也展开救援，包括律航、斌宗、东初、无上等法师，以及国代李子宽、立委董正之、监委丁俊生、孙立人妻张清扬、法学家吴经熊、军统居士廖化平等人都去救人。经三周后，台湾警备总司令陈诚才放人。僧人出狱后仍受严密监控。1955年5月，此寺发生第二次白色恐怖。涉案者为当时41岁的广东潮安人陈师潜，