建设协会的统计，每日平均有441万辆车使用高速公路，平均行驶距离为43.7公里。日本的国家高速公路收费较高，经东名高速公路从东京到名古屋的路程需要7650日圆。
空运.日本的航空运输业相当发达，东京国际机场（羽田机场）和成田国际机场的客货吞吐量均居世界前列，其中东京国际机场（羽田机场）2012年的旅客吞吐量为亚洲第二，达到6782.5万人次，是世界上最繁忙的机场之一。在2013年机场服务质量排名中，羽田机场也位列世界第二，航班晚点率全球最低，而且是全球卫生情况最佳的机场。日本的