年青岛遗传学座谈会召开后，李汝祺及其学生在北京大学生物系下创建细胞学及遗传学专业，李本人任细胞学及遗传学教研室主任，研究领域包括小鼠发生遗传学、摇蚊胚胎发育与基因表达、原核生物遗传学、细胞超微结构、细胞离体培养、嵴椎动物性染色体，以及嵴椎动物系统发育与同工酶演变。在这一期间，李曾出版《细胞遗传学的基本原理》、《发生遗传学》等着作。1950年李汝祺被选为中国动物学会第一任理事长。1978年10月，被选为中国遗传学会第一任理事长，并兼《遗传学报》编委主任。1991年4月李汝祺逝世。
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