后，大部分隐匿基督徒回归了正统的天主教会，这样的信徒又称为「潜伏基督徒」（）。也有一部分隐匿基督徒没有回归正统的天主教会，而是选择坚持过去已与本土宗教发生一定融合的信仰。直到今天仍然有保守这种融合信仰的信徒，他们现在主要居住于九州北部的长崎县五岛群岛、生月岛等地。这类仍然坚持融合信仰的信徒即狭义的“隐匿基督徒”。狭义“隐匿基督徒”坚持的融合信仰已逐渐式微。根据统计，坚持融合信仰的狭义“隐匿基督徒”人数在1930年代有30,000人左右，到2007年已不到500人。2018年，与隐匿基督徒相关的长崎与天草