::各县市详细投票结果.（注：领先者使用红色字体标出）
选举后.
公正性.对于台湾选举的公正性一直有很多怀疑，在这一次的选举中，蓝绿双方都指责对方非法操控选举。首先是蓝军称，发现由民进党执政的台北县(今新北市)近日销毁56袋印错的选票，而台北县根本就不需要那么多选票，置疑当局故意多印选票，然后发给民进党支持者，以增加时任总统陈水扁的选票。民进党则称只印错600多张选票，其余是裁剪选票后遗留下来的纸张。但是泛蓝仍然表示担心，称会在各投票站部署人员，现场监看投票