。而最近日本的DNA研究发现了新的亚种，立山毬藻（），但尚未正式发表，故学名尚未确定。
日语.在日语中，毬藻被称作マリモ（汉字：毬藻，拼音：marimo）。命名者是札幌农学校（现今的北海道大学）的川上泷弥。他根据在阿寒湖的尻驹别湾发现的球状集合体，于1898年（明治31年）定其名为。（是球，通常为橡皮制。も泛指所有水生植物及藻类。
爱奴语.北海道的原住民爱奴人将毬藻称为"to-raw-sampe"（沼泽中的肝脏、心脏）和"to-karip"（沼