林朝栋请假返乡，然后于10月7日率援军返回。9月30日，刘铭传离开台北城，并于10月10日抵达前线视察，却于10月14日遭到伏击，于是清军与原住民双方爆发激战。之后几日，清军入山勐攻，途中被多次伏击，死伤颇多，直到10月28日进攻武荣社，林朝栋与前来台湾镇总兵章高元等人围攻，击杀100多人终迫使武荣、苏鲁等七社投降。12月6日，林朝栋因抚番有功得赏二品顶戴，并于十二月就抚石加禄北路二十四社（石加禄现译为霞喀罗）。该年，刘铭传开办抚垦总局等部门管理开垦事宜，林朝栋被命负责大湖与东势两地抚垦局的事务，从此负责台