穆斯林们将他收殓，并带到了巴勒莫。最终安放他遗体的石棺被放置在巴勒莫主教座堂的礼拜堂内，与他的父亲亨利六世和西西里国王罗杰二世放在一起。19世纪时，当时的历史学家们对腓特烈二世的遗体进行了学术调查。石棺中他的尸体穿着伊斯兰风格的服装，外衣的衣袖上用阿拉伯语绣着“朋友，宽宏大量的人，诚实的人，富有知识的人，胜利者”。
才艺.腓特烈二世给人留下深刻的印象，仿佛他不是个君主而是位学者。他本人掌握了七种语言：德语，意大利语，法语，拉丁语，希腊语，希伯来语和阿拉伯语。这在教育比较落后的中