19个学系(97学年成立光电工程学系)，35个硕士班、25个博士班，现有学生人数近万人，专任师资470余位。2000年代成为全台7所「研究型大学」之一，稳居国际主要大学排名全台8强地位，属全台250余所大学中的佼佼者。2014年，国立中山大学在世界大学学术排名位列第426名，为全台第6，也是4所「中字辈大学」之首。同一年，首位陆生台湾博士从本校亚太所毕业。