2年，比萨获乌尔班二世赋予主权，治理科西嘉和萨丁尼亚，并升格为大主教管区。1088年，比萨攻陷突尼西亚城市Mahdia。四年后，比萨和热那亚的船舰协助阿方索六世，把席德从瓦伦西亚（Valencia）迫退。
衰落.1284年，梅洛里亚海战爆发。在与热那亚的交战中，比萨军舰尽毁，不少水兵被囚。1290年，敌方船舰攻击比萨港（意大利文：Porto Pisano），比萨受重创。1399年，比萨成为维斯孔蒂家族的自治领，1402年售予佛罗伦斯。垂死反抗过后，比萨最终于1406年接受管治。