45年，在第二次世界大战末期，苏蒙联军使用坦克撞击并推掀汇宗寺主殿未果，遂将主殿浇上汽油放火烧毁。1960年代，汇宗寺闲置无人管理后，成为国家粮食储备库专用仓库，俗称“大仓粮站”。由此，除了被苏蒙联军烧毁的主殿外，汇宗寺的大部分古建筑得以幸存，躲过了文化大革命的破坏。1996年，多伦县消防大队将大仓粮站列为消防重大隐患单位，向中共多伦县委、多伦县人民政府进行了专题汇报，大仓粮站遂被命令迁出汇宗寺。随后，汇宗寺逐步进行了全面修复。
建筑.该寺总占地面积276亩。主体建筑大殿面阔七间，