1929年，经学院最有天赋的学生之一哈伊姆（Chaim Leib Shmuelevitz）与埃利泽·耶胡达·芬克尔拉比的女儿结婚。哈伊姆拉比于1935年担任学院的教师。
逃到东方.1939年，纳粹德国和苏联从西面和东面同时入侵波兰，密尔地处共产党苏联统治区，意味着经学院不能留在密尔。许多在外国出生的学生离开，但经学院的大部分搬迁到立陶宛，那里虽然已被苏联占领，但尚未苏维埃化。经学院首先重建于维尔纽斯，然后在凯代尼艾。几个月后，立陶宛被苏联吞并，经学院的未来再次堪忧。经学院临时