年来港驻防的英军的说法，分流炮台己于当时处于废弃状态，不过这又与1842年刊的《广东通志》与1879年刊的《广州府志》两本地方志所指分流炮台共有三十人驻守之说法有所冲突。炮台被废弃的年份，依古物古蹟办事处的说法为1900年，估计与新界的租借（《展拓香港界址专条》）有关。至1981年为止，分流炮台一直被野生植物覆盖。
修缮工作.香港政府于1981年宣佈分流炮台为法定古蹟，炮台的第一期修缮工作于1985年完成，期间费用得到香港赛马会的资助。建筑署于1990年开展第二期的工程，在炮台