010年1月，与社会学者吕大乐就香港高铁争议拨款引发严重警民冲突以及不同世代论争，爆发笔战。
马尼拉香港旅行团事件中次主权概念争议.2010年8月马尼拉前警员劫持香港旅行团事件发生后，沈旭晖撰文反驳凤凰卫视时事评论员及节目主持阮次山指曾荫权无权致电菲律宾总统阿奎诺三世的观点，并以学术概念「次主权」解释。亲共前政协委员刘迺强的恶毒批评指次主权为「假学术」，乃至有分裂中共中央主权推动香港独立之嫌。时事评论员刘锐绍认为争议脱离民情，明显有中方人动员制造事端，庸人自扰。中央政策组首席顾问刘