1号机车采用车身两侧白色带，302、303号机车的机车编号牌采用白色字体和边框，304号机车的车体正面增添了两道蓝色带。2003年至2004年间，JR货物从JR东日本购置了8台EF81型电力机车，并配属到富士机关区和东新潟机关区。随着新一代的EF510型电力机车于2002年开始投入日本海纵贯线，以及EH500型电力机车于2007年开始投入关门隧道区间运用，JR货物开始分批报废部分车龄最长且状况较差的EF81型电力机车。至2009年，JR货物在本州范围内的EF81型电力机车均集中配属富山机关区，担当日本海