庭卫城所遗留下来的，这设计作为日后修缮及扩建的雏型。据当代的史学家所述，苏丹关于皇宫内部的动工及竣工时间的说法有所差异，克利托布洛认为皇宫的建造在1459至1465年间，但另一些资料显示皇宫在1460年代后期才完工。与其他具有严格规划的皇宫，如美泉宫、凡尔赛宫等有所不同，托卡比皇宫经过多个世纪的发展，其间的苏丹加入及变动了各种建筑，虽然穆罕默德二世的主要设计仍得以保存，但这些无规律的扩建和变动造成建筑不均匀。这些变动主要发生在1520年至1560年间的苏莱曼统治时期，由于奥斯曼帝国的急速扩张，苏莱曼