洋政府想要收藏、国外有人且重金求让等，罗氏均不许。不久商部忽勒令移出，只好将少部分带回天津河北京旗生计维持会博爱工厂，大部分觅赁善果寺余屋，并连夜迁入。这一阶段整理编印了《史料丛刊初集》十册等。终因人力财力的限制，以不得转售异国为约，转让李盛铎。后归中央研究院历史语言研究所，档案才最终被保护起来。其后，市面上仍有不少流散的大库档案，罗氏继续在北京收集，移居旅顺时，与所藏文物一起运旅。1934年成立大库旧档整理处，印行《大库史料目录》六编。除此以外，自1924年至1936年罗氏编辑、影印出版的有：《史料丛