4年被聘为教授、博士生导师，1999年退休。期间，他在北京大学物理学系普通物理教研室、低温教研室工作。他是中国科学院院士、原北京大学校长王恩哥的博士导师。章立源主要研究超导电性、固体电子结构等，共计发表论文192篇，着作12种。与郝柏林、冯端、陆埮、于渌等人合着的科普丛书《物理改变世界》获2007年度国家科技进步奖二等奖。他在1989年被评为北京市优秀教师，1985年、1997年两次获得北京大学优秀教学奖，1994年获君安-北大科学家奖，1997年被评为北京市高教师德先进个人。合着的《超导物理》、《热学