区大部分应该属于中华民国疆域，属新疆省的一部分（参见原中华民国法理疆域行政区划）。
历史.1895年以前，今天的戈尔诺-巴达赫尚自治州加上阿富汗东北部巴达赫尚省所属区域由若干个小型半自治政权构成，它们包括达尔瓦斯、舒格楠、鲁雄、瓦罕等。当时这块区域同时被清朝、沙皇俄国、中国和阿富汗酋长国声称为己方领土。清政府声称拥有整个帕米尔地区，但其军队仅仅控制了塔什库尔干城东面的关口。1890年以前，此地居民臣服于清朝，此地划归新疆省管辖。19世纪后期英俄在亚洲争夺势力范围，1890年沙俄