臣们相继离反，还有高桥绍运在战死（岩屋城之战）等，大友氏陷入灭亡危机。与受丰臣秀吉派遣的援军（因为宗麟的请求）长宗我部元亲和仙石秀久等一同与岛津军战斗，但是在户次川之战中大败，并失去家臣利光宗鱼、户次统常。在父亲宗麟和家臣柴田礼能、臼杵镇尚、志贺亲次、佐伯惟定、木付镇直、狭间镇秀、帆足鑑直、朽网鑑康、森镇生、田北统员、清田正成、吉冈妙林尼等人在居城奋战时，从府内退走，令岛津军进攻到丰后。天正15年（1587年），秀吉亲自率军进入九州，令岛津氏降伏（九州征伐）。最终保留丰后一国和丰前国宇佐郡半郡，总计37