意愿保卫清廷，最后清朝建立的海军包括器物及教育人才大部分都顺利转移给了中华民国，不少由清廷开办的海军学校训练出的海军军官均继续向易帜后的政府效命。
北洋政府时期.1912年北洋政府设中华民国海军部，统辖的舰队有：1926年北洋政府中华民国海军部统辖的舰队有：中华民国建立后，海军舰艇由海军部指挥；虽然海军部多度提出扩军计划，然而受限于经费不足，加上后续国家爆发延绵日久的军阀内战，中华民国海军发展进入停滞期；同时孙中山领导的国民党政府以护法运动为号召多度策反北京政府的海军改帜，