料郭汜将杨彪和司空张喜、大司农朱儁、卫尉士孙瑞、太仆韩融等人扣留为人质。郭汜又大会公卿，议论责备李傕。杨彪说道：“群臣共斗，其中一人劫持天子，一人以公卿为人质，这可以吗！”郭汜恼怒，想要动手杀之。杨彪说：“你尚且不侍奉陛下，我怎么能独自求生呢！”经中郎将杨密力劝，郭汜才没有加害他。同年，汉献帝东迁，杨彪尽节护主，在最危急的关头，几乎遇害。汉献帝回到洛阳后，杨彪代理尚书令。
晚年沉浮.建安元年（196年），杨彪随汉献帝定都许县。当时大宴百官，兖州刺史曹操上殿，见杨彪神情不悦，惧怕会被