第一神户中学校就读，并曾加入柔道部（战争结束后，柔道遭到禁止，于是转入橄榄球）。小松左京在第二次世界大战结束时才14岁，无法加入军队。他感觉自己背负存活下来的责任，成为将来创作科幻小说的契机。
战后.小松左京在战争结束后曾接触到诗人但丁的《神曲》，并受到启发，成为之后创作科幻小说的起点。他在1948年从中学毕业，进入第三高等学校就读。小松左京于京都大学学习文学，专攻义大利文学。他在大学中参加同人志『京大作家集团』活动，高桥和巳、三浦浩等人交流文学。当时他热中于安部公房的作品。