冷遹任广西民军混成协帮统，率部援鄂。1912年初，广西民军被南京临时政府编入中华民国陆军第一军，冷遹获中华民国临时大总统孙中山授予中将军衔及文虎勋章，任第一军第三师师长。同年5月，冷遹转任第一军第九师师长，驻徐州。1913年二次革命爆发，北洋军冯国璋部和张勋辫子军进犯徐州，冷遹寡不敌众，放弃徐州，流亡日本。1915年冬袁世凯复辟帝制，冷遹立即从日本回国，投入讨袁护国运动。1916年5月任岑春煊、梁启超广东肇庆都司令部参谋处长。1916年6月，冷遹、黄炎培等人在上海创办了中华职业教育社，冷遹历任中华职业教育社