地域相近的台湾和朝鲜是有可能同化于日本的，因此主张将新附领土视为「虽与内地有稍许不同，但仍为内地之一部」，直接适用本国法律。从1896年到1918年，担任民政长官的后藤新平所持的特别统治主义主导了台湾的政策。在这段时间内，台湾总督于「〈六三法〉、〈三一法〉」的授权下，享有所谓「特别律令权」，集行政、立法、司法与军事大权于一身。而握有绝对权力的台湾总督，除了有效压制武装抗日运动之外，也严密控制住整个台湾社会（包括治安在内）。根据后藤新平引述官方统计，仅在1898—1902四年间，总督府杀戮的台湾「土匪