大量番商外逃，外侨社区解体，泉州的海外贸易和商业遭受近乎毁灭性的打击，经济一落千丈，泉州港开始走向没落。
评价.对于亦思巴奚战乱造成的后果，历代各方的学者大多都持否定的态度，认为它造成了生灵涂炭、民族仇杀、人口减少、经济衰退、泉州港盛极而衰的严重负面影响。但对其起因和性质，学界则有不同的看法。代表明朝官方学者观点的《元史》把亦思巴奚兵乱认为是一场反对元朝政府的叛乱事件。而现代一些研究者认为亦思巴奚战乱乃是元末福建政府和地方豪强之间争权角力引发的，是由福建行省平章事（称为“省”）和廉