派前任主教练墨里西以及三名高水平巴西外援到申花效力。至此，申花队开始真正向技术型足球风格过渡。同年球队获得了1998年足协杯冠军，成为中国职业足坛第一支获得过联赛和杯赛冠军的球队。
世界名帅.1999年,申花队聘请了着名的前巴西国家队主教练塞巴斯蒂奥·拉扎罗尼出任主教练，球队主场也迁回中国第一个专业足球场虹口足球场（原虹口体育场）。但由于拉扎罗尼与俱乐部和球员没有良好的沟通，他与其它方面矛盾越来越大，造成球队成绩大幅下降，这个赛季也成为了申花建队后的第一个低谷，之前从未跌出联赛三甲