澳门总督拒绝为其举行军人葬礼，而澳门市议会亦拒绝为其举行天主教葬礼。30年后，由于民间认为美士基打在澳门历史中有重要地位，认为其「保护澳门有功」，因此为其平反，并于1910年8月28日以军礼将其迁葬旧西洋坟场，
纪念.现在位于澳门半岛中部的美副将大马路（Avenida do Coronel Mesquita）、美上校里、美上校围、美副将街和美副将巷、及位于凼仔的美副将马路（Estrada Coronel Nicolau de Mesquita），全是纪念他而命名的。