新宿站南口、高岛屋时代广场。丸之内线与副都心线、丸之内线与新宿线剪票口层有电梯与斜坡连通，各自剪票口层与月台之间也设有电梯。电梯的地面出入口共有5处。新宿线车站与其他两线距离较远。丸之内线与新宿线的定期乘车券须在本站转乘。新宿线新宿站由于是京王电铁管辖站，两线无法进行转乘。
东京地下铁.丸之内线月台东端与副都心线月台北端有连络通道连结，可站内转乘。但由于尖峰时刻通道拥挤，2012年3月17日起开放普通乘车券、回数券、PASMO、Suica付费区外转乘。与其他付费区外转乘