指挥，实施金门、马祖地区「战地政务实验办法」，省府移驻台北县新店市北新路办公，负责研究有关收复福建地区之重建计画方案及对大陆福建地区广播、闽侨联系、人才储备与不属战地政务之一般省政工作。 1956年2月，戴仲玉所题的「中兴在望」四个字，被转刻在金门太武山上。1962年4月，戴仲玉被选为台北县三重市私立东海高级中学董事长，1974年8月卸任。1986年5月21日，担任福建省政府主席长达31年的戴仲玉逝世，由时任第一届立法委员的吴金赞接任。