绪二十九年（1903年）改监察御史，历任河南、江西各道监察御史。次年成为巡警部尚书（后改民政部尚书）徐世昌的僚属，历任巡警部左参议、左丞，民政部左丞。光绪三十三年（1907年），徐世昌出任东三省总督，銭能训随其前往奉天赴任，任奉天行省右参赞。1909年袁世凯被罢回籍，徐世昌离开东北，钱能训亦被裁缺，1910年署顺天府府尹。宣统二年（1910年），经军机大臣徐世昌推荐，銭能训任陕西布政使，任内护理陕西巡抚。銭能训大肆搜捕革命党。后见大势已去，自戕未遂，由革命军医治后送出潼关。中华民国成立后，銭能训因为