892年）三月，郑延昌在户部尚书任上被任为中书侍郎，授宰相衔同中书门下平章事。六月，又兼刑部尚书，加食邑至千户。拜相期间无功。次年（893年）七月，军阀凤翔节度使李茂贞派数百人混在长安市人中纠集数百千人抗议昭宗计划讨伐自己，这些人等候郑延昌及其同僚宰相崔昭纬回家时包围其肩舆抗议，乱投瓦石，迫使他们逃到民家躲避，堂印及朝服都丢了。唐昭宗大怒，捕杀带头之人，坚定了讨伐李茂贞的决心，但反被李茂贞所败。干宁元年（894年）五月，因病辞职，罢为右仆射。又拜尚书左仆射，不久卒，但日期不详。