后参加援外医疗、抗击“非典”、汶川大地震抗震救灾、收治结石患儿等重大任务。其中，2008年9月初，该院泌尿外科主任张伟致信《南方周末》，揭露三鹿奶粉导致婴儿患结石，后来他又和科室医生商量后，让患儿家属找《兰州晨报》曝光，最终促使三鹿奶粉事件曝光，中华人民共和国卫生部部长陈竺来该医院视察时说：“张伟是一名具有战略眼光，敢于承担责任的医生。”该医院也成为全国发现最早、救治最及时、抢救危重结石患儿最多的医院。截至2008年，医院设有高压氧治疗、肝胆外科、传染病防治等3个兰州军区专科中心。2016年，在深化国防