年5月10日李水井与吴思汉被捕，保密局循线逮补25人，并由此25人扩及省工委学工委及各省工委支部，台共组织面临第一次瓦解，陈英泰先生回忆即对地下党组织有详细介绍，台大医院支部也因为郭琇琮的落网而遭到破获，许强医师于1950年5月13日遭逮捕，学工委案中李水井认为多数领导应可获得几个月牢狱的轻判因此建议全盘托出，然四六事件发生之时尚无惩治叛乱条例，此条例已于1949年6月21公告实施，由于当时国共内战国府兵败如山倒之际，孤立无援对于岛内共谍案并未立即给予判决有观望之态势，然而1950年6月韩战爆发，美援的出现