至永华市政中心及永华市政中心至平实转运站为起讫点，预算达658亿，于2016年10月正式提报中华民国交通部审查。2017年11月正式成立「台南市政府捷运工程处筹备处」，2018年10月22日「台南市捷运工程处」正式成立。不过658亿的方案在纳入前瞻基础建设计画后受到了变更，除原先绿线的长度不变，预算为220.93亿元外；蓝线则改为推动大桥站－大同路站间的路段为第一期，预算改为186.04亿。两者的总长度自39.2公里缩短至20.5公里，总预算也从658亿降低至406.97亿元。