何应钦就对陈明仁说：「你就当华中剿匪总司令部副总司令兼武汉警备司令好了。」1948年10月，陈明仁到武汉就职，旋兼任第二十九军军长。后改任第一兵团司令长官、湖南省政府代理主席。
中华人民共和国成立后.1949年8月4日，陈明仁与程潜率部在长沙宣布起义，加入中国人民解放军，受毛泽东和朱德嘉勉。其后他任中国国民党人民解放军第一兵团司令员、湖南军区副司令员。9月1日，陈明仁兼任湖南省临时政府主席。11月，任中国人民解放军第四野战军第二十一兵团司令、中南军政委员会委员等职。1951年，