牛.1999年，味全龙完成3连霸后，被顶新集团解散。其后包含张泰山、叶君璋等龙队球员加盟牛队。
总冠军之路.2000年，实力和人气再度大跃进的兴农牛队再度叩关台湾大赛，和统一狮鏖战7场，最终落败。2003年，牛队第三度参与台湾大赛，激战6场，2:4些微差距，不敌卫冕军兄弟象。2004年，兴农牛队于台湾大赛闯关成功，以四胜三败击落统一狮，终于夺得队史第一座台湾大赛冠军。2005年，牛队以直落4横扫诚泰COBRAS拿下台湾大赛冠军，完成二连霸，堪称牛队全盛时期。2006