班也是混龄编班，由学生每学期自选想进的导师班，再由校方依志愿编班。
生活秩序.种籽实小的校规称为生活公约，是由师生一起在每週一次的「生活会议」中讨论制定的，师生都必须遵守。违规的教导与惩戒，由师生信任投票选出的「法官团」负责。无体罚，老师亦不会任意惩罚学生。
历史.民国83年，种籽由一群关心教育的家长兴学，当时的家长在创办人李雅卿的号召下，展开了一场官民合作的教育实验。第一阶段：台北市自主学习实验计画时期民国83年，「毛毛虫学苑」在新店燕子湖畔创校