在查尔斯顿设有3座高架车站。位于如今车站东部三分之一英里处奥斯汀街与主街路口，位于南部半英里处卢瑟福大道与切尔西街路口。1917年计划将高架线改建为地铁，但由于美国加入第一次世界大战，重建工程取消。上所有车站同时建造，设计相同，但查尔斯顿高架段靠近波士顿湾和米斯蒂克河河口，持续性暴露在具有腐蚀性的海风中。当地居民也认为高架车站产生大量噪声，遮挡了主街上的阳光。20世纪60年代，最终裁定查尔斯顿不适合建造高架车站，而全部用隧道又过于昂贵。
地铁站.最终，橙线延长线干草市场站至波士