宗教与科学的比较，民国12年公开演讲中说到「就宗教和科学比较起来，科学自然较优」，因为「科学的知识，不服从迷信，对于一件事，须用观察和实验的方法，过细去研究，研究屡次不错，始认定为知识。」孙中山在政治上偏向政教分离，反对宗教影响政治，主张政教分立、宗教自由，推崇宗教在道德建设上的力量，譬如「佛教为救世之仁」。
宗教与科学.孙中山在1923年10月20日的中华基督教青年会第九次全国大会的《人格救国与地方自治》演讲中表示：「人类的知识，多是科学的知识，古时人类的知识，多是宗教的感觉