兵马留后，不久加检校太傅，知节度事。光化二年（899年）五月，在王建要求下，王建刚击败顾彦晖得到的东川被划出五个州府成立新设的武信军，六月王宗佶被任为武信军节度使。天复元年（901年），宰相崔胤召宣武军节度使朱全忠诛杀宦官，当权宦官韩全诲挟持昭宗逃离长安投奔盟友凤翔节度使李茂贞，朱全忠攻打凤翔想夺回皇帝。十二月，李茂贞和朱全忠都向王建求援。王建想戏耍双方，表面上答应朱全忠、拒绝李茂贞，却派密使去凤翔鼓励李茂贞扛住，又派王宗佶和其他养子王宗涤、王宗播等为扈驾指挥使，率兵五万，声言迎驾，率步骑北上，实则攻打