直至1638年，方改以石头重新兴建。其后在1810年和1874年进行过两次重修，1930年才形成今日的外观和规模。另外，教堂亦供奉了曾于澳门学习神学的韩国第一位圣人圣金大建(St. Andrew Kim)。教堂虽屡遭多次火劫。在1874年9月22日甲戌风灾，圣堂被雷电击中起火，但其火光却引导了海上的居民上岸，故教堂每年都会庆祝「天灾节」，以纪念这事迹。
建筑特色.教堂两层的顶部都有古典式的三角楣，而正中有一个壁龛，内里放了里斯本圣安多尼像。而教堂的正面则为对称的主题，左方接有三