有本土的神道和来自中国的思想，例如，佛教、儒教的融合。如同过去受中国哲学和印度哲学影响的水户学、禅宗，近代至今的日本哲学也受西洋哲学影响。
古代・中世的思想.佛教在封建制定着以前的日本是日本思想的主流。圣德太子导入的佛教文化在奈良时代确立为「国家镇护」的思想。平安时代以降，着重个人现世利益的密教取代「国家镇护的思想」。但是，在「末法思想」的悲观主义普及的时代到来之后，强调来世的净土思想普遍化。武士掌握政权的鎌仓时代开始后，出现以新兴的社会阶级（武士）为对象的「新」佛教。Sect