有一个，因此必须将该单个细胞培育成生物体。细菌由单个细胞组成并且不需要克隆再生。在植物中，这通过使用组织培养来实现。每种植物对通过组织培养成功再生具有不同的要求。如果成功，则产生在每个细胞中含有转基因的成年植物。在动物中，有必要确保插入的DNA存在于胚胎干细胞中。
目的基因的检测与鉴定.选择标记用于区分转化的和未转化的细胞。这些标记通常存在于转基因生物体中，尽管已经开发了可以从成熟转基因植物中除去选择性标记的多种策略。 当产生后代时，可以筛选基因的存在。来自第一代的所有后代对于插入