学位以后前往美国芝加哥大学担任气象学教授，1968年成为美国公民。1991年成为芝加哥大学荣誉退休教授，1998年病逝。
研究.藤田哲也被认为是下击暴流和微下击暴流的发现者，并且提出了依照龙卷风强度以及和风速相关破坏程度评估的藤田级数。藤田最为人所知的贡献就是龙卷风的研究，他因此被同事和媒体称为「龙卷风先生」（Mr. Tornado）。除了藤田级数以外，藤田还是飞越龙卷风和损害调查技术开发的先驱者。他使用这些技术研究发生在1970年5月11日在德克萨斯州拉伯克发生的两个龙卷风，