.为更换学研都市线及JR京都线、神户线的103系，于2002年制造出2000番台。特征如下：共有4辆×11编组的T编组，3辆×12编组S编组服务。这是最后一批207系。
福知山线事故影响.在2005年4月25日JR福知山线出轨事故后，JR西日本决定将全部207系的车辆涂装线色，和当时处于研发阶段的321系一起改为橙蓝相间线涂装。工程由2005年11月25日开始，到2006年3月完成涂装更换作业。当时日本媒体引述一些传言，谓「铁路公司方面，考虑到遗族及被害者的感情，不想