老大议决将妈祖金身藏匿于林昭顶保正住宅。尔后深感日本政府之压力沉重，再商议移驾土库顺天宫避难，直至日治时代结束为止。从此六房天上圣母与土库顺天宫天上圣母即成为当时斗六郡、虎尾郡内仅存最珍贵、最有历史价值之神尊。但妈祖被当时的台湾总督府视为佛教神祇而非道教神祇，虽同样受到打击，但比其余道教神祇要教授到包容。仅需改建为日本神社佛寺、迎请日本神佛与变换为日本宗教习俗即可，故而不需遭到销毁。也于是乎，土库顺天宫配合日本「古义真言宗台湾开教计画案」，成为该案第三十四所关系寺庙，并自日本迎请一尊观音塑像供奉于正