。入祀典礼开始时，军警应行最高礼，典礼进行地点之车辆行人均停止进行。而典礼包含奏哀乐、上香、献花、读祭文、默哀及烈士忠烈殉难事蹟报告。除了入祀典礼之外，忠烈祠都会定时举行公祭祭典，于春、秋二季举行公祭。该公祭设定为中华民国国家祭典，于每年3月29日青年节举行春祭国殇、9月3日军人节举行秋祭国殇。主祭者在首都忠烈祠为中华民国总统，在地方则为当地地方首长，两者皆会率领军人或公务员以及烈士遗眷与各界代表参与。每年清明节于国民革命忠烈祠举行中枢遥祭黄帝陵典礼(自蔡英文就任总统后删除)，县市政府则多结合春、秋二祭