结束了拜占庭帝国。十六世纪时鄂图曼帝国统治地中海周围的许多地区，在现在的法国南部、阿尔及利亚及突尼尼亚建立海军基地。巴巴罗萨·海雷丁帕夏是着名的鄂图曼船长，在中获胜。是鄂图曼帝国在地中海势力的顶峰。后来欧洲各国的海军势力兴起，对抗鄂图曼帝国的扩张，在勒班陀战役时欧洲各国的海军和鄂图曼海军对抗，这也是最后一次以桨帆船为主的战争。北非的巴巴利海盗掠夺西地中海的基督教国家船只。根据罗伯特戴维斯的记载，在16到19世纪时，海盗抓了100万到125万的欧洲人当奴隶。海洋运输业的发展也影响整个地中海地区，东方和