高雄县市合併，高雄市捷运局纳入旧县区而重新规划捷运路线，于2011年12月委託顾问公司进行《高雄都会区大众捷运系统整体路网规划作业》专案，并于2015年12月完成审定。该专案中，将一些旧有规划路线重新命名，也有一些路线修改。核心路网增加了民族高铁线、莲潭本馆线、旗津线，以及当时已完成公车捷运综合规划的中华双铁线，延伸线则增加了燕巢高铁线、奇美延伸线。2011年11月30日环状轻轨与水岸轻轨两者路线合併送审行政院，隔年11月26日获核定，并取消BOT改为政府自办。2012年7月捷运局进行《高雄都会区大众捷运系