.日本投降后，高玉树担任「东京台湾同乡会」副会长，后来组织「日本华侨总会」，当上会长。后来因替在「涩谷事件」中的在日台湾人争取权益曾被国民政府以「战俘疑犯」罪名从东京押到在上海看守所92天，成为「我日夜企盼、回到『祖国』怀抱的见面礼」。但也因此避过二二八事件。从日本返台后，高玉树曾出任台北市商会总干事。
省辖台北市长.
参选台北市市长.1951年，台湾省主席吴国桢为了向美国表示民主作风举办县市长选举。据高玉树回忆，当时参选台北市长并非其本意，而是陈重光因