2002年时球队再度组成，2002年11月23日曾经与摩纳哥打成0比0平手。梵蒂冈国家足球队于2006年曾经与瑞士一支足球队SV Vollmond进行一场友谊赛，最终梵蒂冈足球队以五比一胜出。 梵蒂冈足球代表队成员皆为梵蒂冈的雇员组成，像是宗座瑞士近卫队、梵蒂冈政府雇员、梵蒂冈邮政成员组成，由于有梵蒂冈国民资格者中占多数是宗座瑞士近卫队的成员他们无法长时间参与球队的运作，因此长久以来梵蒂冈足球队能参与国际比赛的机会不多，也只以友谊赛为主。2006年12月18日，圣座国务卿塔尔奇西奥·贝尔托内枢机