物局公布元谋人博物馆为国家三级博物馆。元谋人化石产地目前保护状况不佳，科考发掘处于停滞状态，经费投入几乎没有。遗址属于旷野遗址，面积很大，保护难度不小。多年的雨水冲刷和水土流失可能会将地下的文物冲走，垃圾随处可见，当地村民希望将土地开发成为农地，种植葡萄。当地文物部门意图对遗址进行再次发掘，或进行旅游开发，但经费无所着落，也没有企业愿意投资。事实上，县城内的元谋人博物馆也没有元谋人的化石标本。