到加强，其中包括安装了炮和两门博福斯炮。1944年底，舰只参加了在斯卡格拉克海峡的两次布雷行动，第一次是在9月19－21日，第二次是在10月5－6日。由于盟军对布雷行动的空袭频率越来越高，相关行动至10月下旬被全部取消。在这年剩余的时间里，它在波罗的海的护航船队中占据了一席之地。1944年11月1日，埃姆登号曾协助搁浅的巡洋舰科隆号松脱。埃姆登号自己则于12月9日在奥斯陆峡湾搁浅，但得以在次日重新浮起。它于12月23日离开奥斯陆，前往柯尼斯堡进行维修，并于两天后抵达。进入的旱坞后，埃姆登号的武器遭到移除