监狱中订装书籍的工作坊工作时，与另外3名在囚人士发生口角，违反《监狱规则》，后来被裁定罪名成立，被判决惩罚多加监禁3日、扣除7日薪金及需要单独囚禁7日等，有关刑罚使他本来可以于预计于2019年10月出狱的日期需要延后。叶继欢因为不满在纪律聆讯时未能够聘请律师代为抗辩，于2012年年初申请司法覆核。8月23日，法官发出命令，同意撤销叶继欢的两项违规定罪及相关刑罚，案件将会交由另外一个审裁委员会处理，惩教署需要支付讼费。其后惩教署与叶继欢达成和解，双方同意重新展开纪律聆讯。2012年8月26日，叶继欢身体不