触到新认识的波拿巴而恢复了影响力。 1799年11月9-10日发动的所谓雾月政变，西哀士和他的盟友解散了督政府，使拿破崙掌握政权。 此后，西哀士提出他早就规划的宪法，只是它被波拿巴经由「政变中的政变」，完全改造为波拿巴的""就成为1799-1804年法兰西执政府的基础。
拿破崙时代和最后的岁月.西哀士很快就从临时的执政官职位退休，这是他雾月政变后担任的职务，由1799年11月11日到12月12日，并成为首批成员之一，并成为其1799-1801年的主席;这种让步是由于他从拿破崙取得在