日的战争中受了伤，在医院修养到了8月，并被晋升到了准尉。十月革命之后，捷克斯洛伐克军团也受到了亲布尔什维克与反布尔什维克派系内斗的影响。雅努塞克忠于军团中的反布尔什维克派，而反布派最终获得了捷克斯洛伐克军团的控制权。因此，捷克斯洛伐克军团拒绝了爱德华·贝奈斯向布尔什维克“叛乱”投降的命令。1918年10月，雅努塞克晋升至暂代捷克斯洛伐克军团第1团II营7连的连长。捷克斯洛伐克军团在俄国内战中加入了俄国白军。雅努塞克随军先后在布古利马、梅列克斯、布劳地那（Braudina）、沁比尔斯克和喀山与红军作战