西国的控制及军力，在永仁4年（1296年）新增开设镇西探题的职位，而西国的守护多为北条氏一族，贞时因而支配西国。
退位及死亡.正安3年（1301年），鎌仓有彗星飞来、民众认为是凶兆，因为忧虑而扰乱，贞时因此将执权之位让给从兄弟北条师时后出家，但是据说贞时保存其政治力，幕府内的事务隐然由其操纵。应长元年10月26日（1311年12月6日）北条贞时去世，享年40岁。临死前，贞时召集他的亲信长崎圆喜及安达时显二人到床前，希望他们二人辅佐其年幼的儿子北条高时。