南市区有三座火车站：渭南站（陇海线）、渭南北站（郑西线、大西线）和渭南西站（宁西线）。渭南站位于陇海线上始建于1933年，目前主要停靠K字头列车，同时有少量T字头和Z字头列车停靠。渭南北站为高铁车站，有高铁列车通往西安北、郑州东、太原南、武汉、长沙南、南昌西、广州南、深圳北、石家庄、北京西等主要车站。渭南南站是宁西线的一座车站，位于市南郊沋河水库东侧，目前已停用。市域内其他主要车站还有华山北站（徐兰高速线）、大荔站（大西线）、蒲城东站（包西线）、华山站（陇海线）、张桥站(包西线、侯西线)和韩城站（侯西线