靖二十二年三月癸酉，“初，禁苑北墙下，故有大慈恩寺一区，为西域群僧所居，至是，上以为邪秽，不宜迩禁地，诏所司毁之，驱置番僧于他所。”由此，大慈恩寺被毁。《礼部志稿》载，“嘉靖十年，右春坊右中允廖道南请改大慈恩寺兴辟雍以行养老之礼。”《万历野获编》载，“廖中允上疏，以大慈恩寺与灵济并称，欲废慈恩改辟雍行养老之礼。礼臣以既有国学为至尊临幸之地，似不必更葺别所。唯寺内欢喜佛，为故元丑俗相应毁弃。上是之，谓夷鬼淫像可便毁之，不数年，而此寺铲为鞠场矣。”
建筑.《永乐大典》本《顺天府志》卷七