上及地震是由水面搅动引起的（而不是海神引起的）。他的学生毕达哥拉斯创立了毕达哥拉斯主义，他对数学的原理进行了研究，并且是第一个提出大地是球体。留基伯率先提出了原子论，认为每一种事物都是由原子所组成的，其后由他的学生德谟克利特发扬光大。其后以柏拉图和亚里士多德等为首的后起者，相继出版了首批的自然哲学着作。他们发展的演绎推理对后来的科学研究起重要作用。柏拉图于前387年建立了柏拉图学院，许多古希腊哲学名士曾受教于此。他的学生亚里士多德提出的经验主义认为，一起宇宙真理都可以通过观察和归纳得到，这就是科学方法的基