地8.2公顷，总面积预计达49.2公顷；2009年校区内第一栋建筑「奇美楼」落成启用，并开始招收第一届学生。目前台南校区设有光电学院与智慧科学暨绿能学院（AI学院）各硕士班、博士班。
历史沿革.台南校区位处台南市归仁区高速铁路台南车站特定区东侧。自交通大学有了与新竹科学园区成功的经验后，2002年起便积极与全球光电产业佈局最完整的台南科学园区接洽，以前瞻性的应用科技和产学合作所带来的附加价值，维持交大在高科技领域的地位。当时台南县县长苏焕智表示，交通大学台南分校的筹设，将有助于台南