34年，因机关被特务破坏而被捕。抗日战争初期出狱，1937年遵照周恩来指示，黄玠然到山西参加抗日工作，任山西牺牲救国同盟会宣传部部长。1939年，因阎锡山公开反共而离开山西，到重庆向周恩来汇报，后在国统区从事工商界上层人士的统战工作。曾在民族资本家章乃器开办的上川实业公司任襄理、协理等职，直接影响了章乃器的政治态度。1948年，按中共中央指示加入民族工商界的政党中国民主建国会，参与筹建民建港九分会。解放军攻占上海前，他协助上海市委负责人刘少文、吴克坚进行秘密情报工作，负责将大额党的经费和重要文件安全存放