晋成帝即位后，迁何充为给事黄门侍郎。咸和三年（328年），历阳内史苏峻领兵攻陷建康后，何充东奔三吴地区以王舒、虞潭等人为的讨伐义军。次年，苏峻之乱被平定，何充封都亭侯，拜散骑常侍。后曾出任东阳太守，及后又拜建威将军，任会稽太守。何充在会稽郡有德政，亦推荐虞喜，提拔当地人谢奉、魏顗等作佐吏。后又迁丹杨尹。
与庾秉政.后来，何充在王导和庾亮的推荐下，以丹杨尹加吏部尚书，并进号冠军将军，领会稽王师。咸康五年（339年）王导死后，何充转护军将军，与中书监庾冰都录尚书事。次年升任中书令，加散