站内起火爆炸。另外，2008年受台风黑格比影响，关闸总站更发生严重水浸，要封闭多日。
争议（天鸽风灾前）.
关闸总站通风差及酷热.澳门坊间一直批评关闸总站内通风差非常酷热，通风欠佳，澳门立法会议员吴国昌及陈明金亦因此提出书面质询，澳门日报更作头条报导。而交通事务局局长汪云于2010年8月7日指，将在关闸总站开四个天窗加强通风，并兴建冷气候车室。
站内指示不足.2007年6月28日，澳门日报以“指示欠奉地点隐．机场快线站难寻”为