。在移居慕尼黑后，他开始在慕尼黑大学教授动物学。瓦格勒深入研究了徐毕克斯从巴西带回的众多标本，并与他联合出版了许多关于巴西爬行动物的书籍。他还在1832年出版了《鹦鹉专着》（""），其中包括对蓝色金刚鹦鹉的命名和描述。1832年，瓦格勒在慕尼黑莫萨赫收集标本时，不幸因猎枪意外走火受伤而亡。为了纪念他对动物学的贡献，至少有3种爬行动物以瓦格勒命名，其中包括东南亚毒蛇韦氏竹叶青（）。