意将古巴的通缉犯遣返，古巴也同意将在关塔那摩湾犯罪的嫌犯押送至美国。1964年古巴政府切断了通向基地的水源供给，迫使美国首先从牙买加运水，后来又建立了海水淡化设备。时至今日，此基地能够在水电方面自给自足。美国在冷战期间岀于担心古巴袭击基地，在周围佈满地雷，地雷带长达几十公里，是世界上最恐怖的雷区之一。20世纪后期，基地的主要作用是收留在公海上拦截的古巴和海地难民，不过从2002年起，基地的一小部分设为关塔那摩湾拘留营，被用来关押在阿富汗和其他地区捕获的基地组织和塔利班嫌犯。2006年3月3日，美国五