艾玛莉亚的父母是那不勒斯和西西里国王费迪南多一世和奥地利的玛丽亚·卡罗琳娜。她的姐姐玛丽亚·特蕾莎是神圣罗马帝国皇后。年幼的她曾经和法国王太子和表哥路易-约瑟夫订婚，但七岁的路易-约瑟夫在1789年病逝。1793年，她的姨姨玛丽·安托瓦内特一家在法国大革命期间被害。1809年，玛丽亚·艾玛莉亚和法国奥尔良王朝的路易-菲利普结婚。这段婚姻引起不少的争论，因为路易-菲利普的父亲路易-菲利普二世在革命期间支持处决表亲路易十六和其妻玛丽·安托瓦内特。玛丽亚·卡洛琳娜，玛丽亚·艾玛莉亚的母亲兼玛丽·安托瓦内特