年连战出任外交部长，一上任即促成「苏联贸易访问团」成行。访苏是台湾经贸外交的一大突破，但这项大胆的外交行动由于事先未按过去的常例征询沈昌焕的意见，在决策定案之后，又不理会沈的劝阻，引起沈昌焕的恐慌和不满。于是，沈昌焕便在国民党中常会中大举反攻，手拿《苏俄在中国》一书痛斥「访苏团」的成行，结果被李登辉顺水推舟地解除其总统府秘书长的职务，转任总统府资政，结束了外交上近30年的「沈昌焕时代」。转任资政后，多所赋闲，偶尔出席一些活动，1998年7月2日过世。