十月，朱元璋命徐达、常遇春率军北伐，明洪武元年（1368年）八月，徐达、常遇春率领明军攻入元大都，改大都为北平，随即移师西向，陆续攻取山西、陕西、甘肃等地。洪武二年（1369年）六月，因元朝残余势力不断在背部边疆骚扰，朱元璋又命常遇春率军北伐，攻克元上都开平，常遇春因病卒于军中。第二年，朱元璋命徐达、李文忠再分道出征沙漠，攻克应昌。暂时稳定了北方形势。
征伐福建和湖广.早在明朝建立之前，朱元璋就命汤和和廖永忠消灭在浙江盘踞的方国珍势力，后率军攻入福建境内，在洪武元年（1368年