种子植物分为裸子植物和被子植物两种，两者都是利用种子来繁衍的。其中，裸子植物包含了包含了苏铁门、银杏门、松柏门和买麻藤门，被子植物则细分出更多的门。被子植物是是有胚植物中为数最多且最为人所知的一种，是植物界最多样化的种类，约有304000种。不过，被子植物现在被认为是演化自裸子植物，这使得裸子植物若包含进已灭绝的物种时，会变成一个併系群。然而，即使已知不是一个 单系群的分类单位了，但「裸子植物」还是依旧被广泛地使用在指被子植物门以外的四种非开花种子植物上。分子系统发生学反驳了基于形态学所提出来的「现