难调查委员会，负责就事故的起因、日后如何避免同类型的事故及相关事宜，展开调查研讯。调查委员会由有高度公信力，及独立于香港政府的人士出任。有港九小轮乘客表示，船长事发后曾表示要于现场等候救援，由于乘客担心小轮可能沉没，故此要求船长驾驶回榕树湾码头。海事训练学院经理杨沛强初步估计，南丫四号近船尾位置被勐撞，直接导致南丫四号于两分钟内便沉没。警察其后拘捕了7人，涉嫌水上危害他人安全，当中包括两名船长，分别56岁及54岁，以及分别属于两艘肇事船只上的5名船员。港府亦唿吁目击撞船事故的人尽快向警方提供资料以便