相领导。首相由最高元首从国会下议员中任命，通常由下议院多数党领袖担任。现任首相为丹斯里慕尤丁，2020年3月1日从敦马哈迪·莫哈末接任首相。内阁各部长由首相从下议员或上议员中推举、最高元首任命。马来西亚的司法机构独立于行政与立法机构。最高司法机构为联邦法院。最高法院于1985年1月1日正式成立，在这之前马来西亚案件可上诉到英国的枢密院。1994年6月最高法院改名为联邦法院。同时，联邦法院之下，也设立了上诉庭，紧接着为高庭（高等法庭），高庭可分为马来亚高级法院（负责马来西亚半岛）和婆罗洲高级法院（负责东马