巴塞尔重建成为瑞士足球的领军力量，并取得了比担任草蜢主教练时更大的成就。在格罗斯的指导下，巴塞尔赢得了四次瑞士足球冠军和四次瑞士杯冠军，并在2002-03赛季的欧洲冠军联赛中取得了童话般的成绩，击败过最终的决赛球队尤文图斯，淘汰了凯尔特人，并曾逼平利物浦（两次）和曼联。格罗斯在这些对阵英国球队的比赛中取得的成功，让他在英国媒体和球迷中重拾声誉。三个赛季后，他率领巴塞尔踏上了另一场欧洲之旅，当他们闯入2005-06赛季欧洲联盟杯的四分之一决赛时，尽管首回合在圣雅克布公园球场以2比0占先，但仍以总比分3比4