建设台湾成为「绿色硅岛」，因此亚太营运中心计画在2000年后就不再是中华民国经济政策的主轴，但绿色硅岛关键的两兆双星政策最终并未获得成功。2016年蔡英文政府执政后，改推动台湾做亚洲·硅谷计画。
批评意见.前民主进步党立法委员林浊水表示，亚太营运中心的可行性本来就不高，不过是时任中华民国总统李登辉执政时期所宣传的经济神话。1990年代，李登辉想让台湾成为亚太营运中心，但在中国大陆发展经济的阻扰之下，造成政策空转十年；而且中华人民共和国政府很早就不愿意配合亚太营运中心计画，2000年