派活动积极，但王陵基拒绝了革命派的劝诱。中华民国成立后，王陵基继续留在川军并升任团长。1913年（民国2年），二次革命爆发，王陵基奉四川都督胡景伊之命击败了在重庆起义的革命派的熊克武。1915年（民国4年）12月，护国战争爆发，王陵基被任命为四川督军陈宧手下的川军第1师第4团团长，同护国军作战，很快升任第3师第5旅旅长。1916年（民国5年）5月，陈宧倒向护国军方面并发表四川独立宣言，王陵基转而投靠支持袁世凯的川军周骏部，进攻陈宧。同年6月，袁世凯逝世，后盾尽失的周骏、王陵基下野。后来，王陵基出任山东省