首阿道夫·希特勒下令指示亲卫队的军事编成单位于战争时期将划归国防军管辖。根据希姆莱的请求，希特勒同时表示在特别机动部队中服役的成员即视为已履行兵役义务，无须再受国防军或其他单位征召。此外，骷髅总队在战争期间将作为特别机动部队的后备队使用。这项命令使第二次世界大战期间的武装亲卫队成员与纳粹集中营管理人员间维持着相当紧密的互通关系。截至1939年9月1日为止，在希姆莱领导下的亲卫队军事单位共辖有下列子单位：
早期行动.特别机动部队的部分成员与德意志国防军一同参与了佔领苏台德地区、奥