央栋、白洲和土间等的北栋。本来，从正面玄关进入后前方建有高约16.5米的，但是在箱馆战争期间遭到军舰甲铁砲击时，旧幕府军认为太鼓橹可能成为其攻击目标，因此急忙地将它拆毁。函馆市最初希望复原整个奉行所，但是由于规定每1,000平方米的地方必须设置防火墙，最终在与文化厅商讨后，认为景观上也可能造成影响而放弃，将复原部份维持在约1,000平方米内。奉行所採用相同的材料和建筑方法，成功复原南栋和中央栋部分，其后在2011年获颁。
兵粮库.兵粮库是唯一残留下来的建筑物。1897至19