为降低列车重心，车载空调乃装于地板下，故其车顶高度与E5系一样为3650毫米，比E3系的4300毫米为矮。
主要设备.
电源控制装置.本车采用VVVF控制方式驱动。从架线引来的25kV单相交流电在由主变压器降压的基础上，还需经过主变频器装置将单相交流电整流为直流电，而后转化为三相交流电驱动主电动机。全编组由11号到14号车厢4辆（M1sc+Tk+M1+M1）和15号到17号车3辆（M1+T+M1c）2个单元构成，电动车安装了与E5系共通化设计的主变频器