反而他将公国交给了瑞典王储让·伯纳多特以作支援。腓特烈·法兰兹一世的梅克伦堡-什未林公国成为莱茵邦联内第一个脱离邦联及反对拿破崙的成员，并派遣代表到拿破崙军中宣佈。后来他加入第六次反法同盟并组织军队对抗法国，与其作战的新盟友普鲁士和俄国后来却欲将公国交给丹麦王国。但是后来1814年的基尔条约丹麦只被答允给予瑞属的波美拉尼亚，梅克伦堡仍然维持对公国的统治。1815年维也纳会议中，腓特烈·法兰兹一世加入了新建立的德意志邦联，跟施特雷利茨家系的堂兄弟卡尔二世一样，两国同时升格为大公国，获得「梅克伦堡的大公爵」