26日，日军在澎湖设置「澎湖列岛行政厅」取代清治时期的澎湖厅。1897年5月更名为「澎湖岛厅」，1897年5月3日实施六县三厅之际改称「澎湖厅」。澎湖厅于大正9年（1920年）与阿缑厅（今屏东县及旗山地区）及台南厅一部份（今高雄市及冈山凤山地区）合併为高雄州时，澎湖厅改制为澎湖郡，大正15年（1926年）再独立复设置澎湖厅，1945年二战结束前共管辖二支厅。澎湖在日治时代有「帝国的南方锁钥」之称。
行政区划.
1926年后 (厅-街庄).大正九年（1920