其后转至今日的「老果阿」地区。彼时由印度至欧洲的传统陆上香料贸易路线被奥斯曼帝国所中断，而葡萄牙的目标，是在印度成立一个殖民地，以垄断印度至欧洲的海上香料贸易。1510年，葡萄牙的舰队司令阿尔布克尔克击败对当地土官首领提玛亚拥有主权的旁遮普土王，佔领了果阿旧城。有别于葡萄牙于印度沿岸其他的佔领飞地，葡萄牙不仅在果阿屯兵，还期许将果阿建设成一处殖民地及海军基地。根据果阿宗教裁判所（1560年–1812年）的命令，许多果阿的本地人都被传教士强迫改信天主教。成千上万的居民为了逃避质问和侵扰，纷纷移居邻近的卡纳