O、水和NaCO溶液洗涤，便可得到纯净的碘甲烷。
保存与纯化.和其他许多有机碘化物一样，碘甲烷试剂通常存放在棕色瓶中以防止其见光分解生成单质碘而使得试剂略带紫色。商品化的碘甲烷试剂中通常会加入铜或银丝使其稳定。也可以通过先用硫代硫酸钠洗涤后蒸馏的方法来除去碘单质。
甲基化反应.碘甲烷是很好的甲基化试剂，但仍有一些缺点：因此在选择甲基化试剂时，通常要均衡考虑价格、来源、毒性、化学选择性及反应容易程度等诸多因素。
用途.除了用作甲基