仁（六条天皇）为亲王，立为太子，并于当日禅让，七月二十七日（9月4日）举行六条天皇践祚仪式，翌日二条天皇驾崩。六条天皇受禅时出生仅7个月零11日，是日本最年幼的天皇。践祚仪式一度因天皇哭泣而中断，由乳母（藤原公长女、藤原邦纲母，名不详）为其哺乳并由藤原育子怀抱天皇登御座才使仪式进行下去。
政治.二条天皇在位期间，曾因亲政问题与后白河上皇产生矛盾，贵族中亦产生支持后白河上皇的院政派与支持二条天皇的亲政派。虽二条天皇终得以逼退后白河上皇院政影响，但却形成与后白河上皇对立的局面。二条