代表东帝汶社会民主协会参与制宪会议的讨论，制宪会议在2002年正式独立后则改名为第一届国民议会，并持续担任议员而直到逝世为止。阿马拉尔曾参与2002年4月举办的，但仅获得17.3%票数，而遭到获得82.7%票数的沙纳纳·古斯芒击败。在东帝汶总理马里·阿尔卡蒂里推荐下，阿马拉尔成为东帝汶副总理。2007年时，他再度代表东帝汶社会民主协会当选成为国民议会议员。而随着东帝汶社会民主协会也加入沙纳纳·古斯芒政府，阿马拉尔因而加入内阁。不过在同年4月举行的中，作为总统候选人的阿马拉尔仅获得14.39%选票而排行第