会作被抓走接受批斗，遭剃阴阳头，肩胛骨骨膜、肌肉断裂，右肋骨断裂并横出，多次昏厥。后邱派人写密信向林彪求救，林彪亲自下令将邱会作放出。邱会作放出后，刘伯承、聂荣臻、叶剑英三位元帅亲自前往探望。邱会作遭斗对聂荣臻、叶剑英影响甚大，直接导致1967年2月“二月抗争”的爆发。在林彪的提拔下，邱会作1968年又兼任副总参谋长，1969年4月当选为中国共产党第九届中央政治局委员。成为林彪手下“四大金刚”之一。1971年，“九一三事件”后被免职，1973年被开除党籍。1981年，被指控参与林彪反革命集团，特别法