年1月28日，在一二八事变中，宝山路真耶稣教会总部正处于交战前线，建筑被日本海军陆战队烧毁，谭配得、张撒迦等长老执事亦曾一度被日军捕走，此后总部迁移至法租界。1929年，发生了张巴拿巴事件。以真耶稣教会创始者自居的张巴拿巴对总会决议不满，该年10月在香港另设总部“中华真耶稣教会”，自立为总监督。1930年真耶稣教会第七次大会将其除名。而真耶稣教会也实现“南北合一”。此后张巴拿巴派主要在海外发展，国内仅在武汉有张派（武汉联合会）教堂与聚会点共9处、信徒372人（当地魏派（湖北省支会）有信徒1118人） ，