詹姆斯（即后来的詹姆斯二世及七世）与其第一任妻子安妮·海德所生的第四个孩子及第二个女儿。。她的父亲是英格兰、苏格兰及爱尔兰三国国王查尔斯二世之弟，她的母亲是大法官（1660-1667年在任）第一代克拉伦登伯爵爱德华·海德之女。安妮在圣詹姆斯宫王家礼拜堂获新教施洗，她和姐姐玛丽的教父和教母包括坎特伯雷大主教与。约克公爵与夫人虽育有八个孩子，但唯有玛丽和安妮活至成年。。安妮幼时患有一种症状为流泪过多，称之为「流下」的眼疾。为治疗此症，她被送往法兰西和祖母亨利埃塔·玛丽亚王太后一起居住在巴黎附近的白鸽城堡。安