甯恩承作为东北大学的负责人沉着应变，及时转移全校师生、并疏散职工和家属。甯恩承又冒着生命危险从边业银行调出300万元，辗转多地亲自交与住在北平顺承郡王府、正身处窘境中的张学良，使张深为感动。来到关内后，甯恩承继续为安置东北大学的学生做努力。他得到了北大、清华和南开的支持，使得一部分学生得以转到这三所学校借读。另一部分学生则被安置到南京、杭州和河南开封等地就读。其后，甯恩承还担任了财政部特派员、华北四省直接税务局局长、中国农民银行总稽核、沈阳世合公银行总经理等职。1946年，国民政府召开制宪国民大会，甯恩