以被流洗掉，接着用含有150-300mM的咪唑(Imidazole)溶液将重组蛋白洗出，达到纯化的效果。
侦测.组氨酸标签可以作为抗原，故可利用抗体侦测带有组氨酸标签的重组蛋白。广泛用于酵素结合免疫吸附分析法（ELISA）及西方墨点法（western blotting）等免疫分析方法。亦可利用含有金属离子的萤光染剂，将聚丙烯醯胺凝胶胶体染色。
固着.带有组氨酸标签的蛋白质，可固着(immobilization)于有镍离子或钴离子涂层之微量滴定板(micro