第三产业佔东京都内生产总值的九成以上，其中以批发零售业的比例最大，达21.5%；其次是佔比12.5%的不动产业、佔比11.9%的专门·科学技术服务业、佔比11.3%的资讯通信业。据英国智库的排名，东京在2020年是世界第四位的金融中心，仅次于纽约、伦敦、上海。三大巨型银行（三菱UFJ银行、三井住友银行、瑞穗银行）、野村证券等日本大型金融机构的总部均位于东京。东京证券交易所的股票总市值仅次于纽约证券交易所和纳斯达克，是美国以外市值最大的证券交易所。东京都亦将国际金融都市作为重要的发展目标。以东京站为中心的