交通运输等方面的功能被世人所忽略。液态生物燃料的应用始于早期的汽车工业。内燃机的发明者，德国的尼古拉斯·奥托(Nikolaus Otto)，计画用乙醇做为这项发明的燃料。柴油引擎的发明者，德国的鲁道夫·狄塞尔（Rudolph Diesel），打算拿花生油做为它的燃料。由亨利·福特发明的福特T型车，完全使用乙醇为燃料。但是，在宾州与德州的油田被发现后，石油变得很便宜也极易取得，于是汽车便开始改用汽油或柴油。
难题.为了种地而烧荒拓垦，可能排放许多的二氧化碳，需要数十年甚至数个世纪