楼、汇智楼等建筑。1998年，金陵中学与南京大学共同设立高中教改实验班，并在金陵中学挂牌南京大学实验中学。
21世纪.2000年，金陵中学被评为全国群众体育先进集体。2000年1月，金陵中学率先于全国在高一、高二年级开设研究性学习课程。2006年，学校取消初中部。2011年，金陵中学被南京市教育局确定为南京市首批高中多样化特色化建设工程“综合改革高中学校”。2011年8月，金陵中学被江苏省教育厅确定为首批“江苏省普通高中创新拔尖人才培养试点学校”和“以传感器为载体的物化课程基地