出记者驻所讲座。2007年起担任台大新闻所实务教师兼荣誉讲座。2012年8月，在旺中案引发走路工事件中，因对《中国时报》对于涉己议题公器私用的报导方式感到不满而辞去副总编辑离职。2012年11月，加入《天下杂志》并担任总主笔。2015年9月1日，与张铁志共同创办网路媒体《报导者》并任执行长及总编辑。2018年3月，担任台大社会系兼任副教授，教授「公民社会学写作」。2018年9月，将《报导者》总编辑交棒给李雪莉，专任报导者文化基金会执行长。2019年4月，与房慧真等人合着《烟囱之岛：我们与石化