16号线在最初设计上，安排了普通车（站站停）、大站车、直达车三种运行模式。运行初期采取普通车和大站车结合的模式开行。当前实际运营时间为，普通车全程57分钟，大站车全程46分钟。自2013年12月29日起开行的大站车停靠罗山路站、新场站、惠南站以及滴水湖站。于工作日早晚高峰期间开行，每天16对。后于2014年1月30日暂时取消大站车，站站停普通列车运行间隔从原来的20分钟缩短到10分钟左右。2016年3月21日起，16号线恢复大站车运营模式，并将运行范围扩大到龙阳路站，运营时间覆盖到工作日和节假日。20