月台乘车前往机场北站；出口则设置在进站区域，供机场北站出发的乘客抵达本站1号月台下车后，前往站厅出站。经免费转乘通道进站后前往市区车站出站，会被视为无票乘车而需缴纳出闸车站的线网最高票价。
月台.本站设有两个侧式月台，位于广州白云国际机场一号航站楼地底。另外，本站站台北端设有一组交叉渡线，当机场北站出现故障时，往机场北站的列车将会通过此渡线折返，以本站为临时总站。本站为3号线北延段终点站时，列车亦使用该组渡线折返。
出入口.由于本站直接设于广州白云国际机