《先王实录》相较，《海上见闻录》在一些纪录上并无「讳而不言」的情况。如郑成功杀其族兄郑联一事，在《海上见闻录》中「直书不讳」。此外因阮旻钖为明朝大学士曾樱之门人，因此对永历五年（1651年）清军攻陷厦门后，曾樱殉节及身后之事，有所详述记录，被视为可补足《明史》本传中不足之处。