9月，刘良模应邀回国参加第一届中国人民政治协商会议。徐悲鸿、张奚若、郭沫若、刘良模、梁思成几位委员提出以《义勇军进行曲》为代国歌的建议，获得通过。中华人民共和国成立后，任中华基督教青年会全国协会事工部主任，全国青联副主席。1950年7月28日，刘良模与吴耀宗等40人联名发表《中国基督教在新中国建设中努力的途径》公开信，开始了基督教三自革新运动（“自治、自尊、自传”）。随后又陆续在《天风》上发表文章，批判帝国主义。1951年5月19日，刘良模为配合控诉运动，在“天风”周刊上发表《怎样开好控诉会》，批判“超政治