等教育出版社印刷厂在天津市河东区万新村奠基。1988年10月，中央教育电影洗印厂与高等教育出版社合併，高等教育出版社于中央教育电影洗印厂原址成立分部。2003年4月，高等教育出版社搬迁至北京市西城区德外大街4号。2006年4月，高等教育出版社启用北京市朝阳区惠新东街4号富盛大厦办公区。2010年1月，高等教育出版社启用位于北京市大兴区的物流中心。2010年12月18日，中国教育出版传媒集团有限公司成立，高等教育出版社成为其核心成员单位之一。2011年11月，高等教育出版社重组改制为高等教育出版社有限公司。