越南佛教由此日趋衰落。公元16～17世纪，天主教开始传入越南。由于越南封建中央政权的衰落，形成了南北割据分裂的局面，但这也从某种程度上帮助了越南佛教的振兴。佛教在越南虽不似以前兴盛，但仍绵延不绝。
近、现代.公元19世纪初，阮朝建立。虽然阮朝支持佛教，但在初期却制定了保护临济正宗、歧视莲宗的政策。但莲宗仍在北方民间活动。进入近代后，越南兴起了佛、道、儒三教合一运动，这一时期更是出现了把佛、道、儒和天主教、伊斯兰教，甚至民间信仰和对李白、牛顿、孙中山、丘吉尔等古今着名人士的崇