航班的后续飞行正常，MU5106次航班亦安全滑行至既定机位停靠。A320飞机在36L跑道获准起飞，A330飞机获准横穿36L-18R跑道，都是由36L塔台的值班空管员通过同一无线电频率下达的指令。
事后调查.事发后，由中国民用航空局、民航华东地区管理局共同组成的调查组，分别对事发相关人员进行了调查问询，调取通话录音、雷达录像，并对两架涉事飞机的飞行数据记录器、驾驶舱语音记录器进行了译码。经调查组连夜调查，初步判断，该事件是一起因塔台管制员指挥失误造成跑道侵入的不安全事件。1