870年到1873年，布伦塔诺激烈地反对教皇无误论的教条，最终他放弃了神父身份。在布伦塔诺的宗教挣扎之后，当时正在研究神学的斯图姆夫也离开了教会。1874年，布伦塔诺发表了重要着作《从经验的观点看心理学》。从1874年到1895年，布伦塔诺任教于维也纳大学。他的学生中有埃德蒙德·胡塞尔、亚历克修斯·迈农、克里斯蒂安·冯·厄棱费尔、鲁道夫·斯坦纳、西格蒙德·弗洛伊德等人（详见布伦塔诺学派）。1880年为了结婚被迫放弃了奥地利国籍和教授职位。后来他作为“无薪大学教师”才得以返回大学。他退休后移居到意大利的佛