二、三舰队，其中第一舰队（主要兵力为战列舰构成的第一战队、新式防护巡洋舰构成的第三战队）、第二舰队（主要为装甲巡洋舰构成的第二战队、旧式防护巡洋舰构成的第四战队）编组为联合舰队，预定担负主要的对俄作战任务；而第三舰队（旗下大多为老式铁甲舰、老式巡洋舰、三景舰等慢速舰艇）留守在吴港和。除了军舰之外，日本方面在战前也对沿海地区的预警系统作了相应的部署。日本在千岛群岛、朝鲜、台湾、澎湖群岛等各地设立了超过300个了望哨，大的哨站有6名了望员，小的哨站也有4人。日本本土沿岸则发动当地居民，建立了近千个海岸观察点