地貌.本地区群岛地形以崎岖的山地为骨架，上覆着火山带，许多火山锥高出三千公尺（一万呎）。在稳定的巽他陆棚各地，山坡长期遭受风化，轮廓平缓；而不稳定地区山脉地形很不规则。有些岛屿有广阔的河口湾，而许多浅海沿岸，如苏门答腊东岸、婆罗洲西岸和南岸、新几内亚西南岸，拥有大片沼泽带，终年积水，不适人居；而爪哇中部和东部、苏门答腊北部以及小巽他群岛部分地方则因地处冲积平原且排水良好，故人口众多。
水文.群岛的多山地形，加上充沛的年降雨量，使短小、坡降陡的河流侵蚀力强