湿地，都因人为的干扰而缩小或消失之际，知本湿地却因无人干扰而复活，并逐渐扩张还原，实在是个相当珍贵的案例。因此，目前有将知本湿地列入国家重要湿地保育计画的行动中。
沿革.知本湿地原本是知本溪出海口的旧河道，因海岸泥沙堵塞而形成的河口潟湖，并且承接了射马干溪（知本大排）的溪水作为湖区水源，属于海岸自然湿地。后因知本当地农民为争地，将知本湿地湖区辟为农田，并将当时的知本湿地海岸泥沙堆积处疏濬排水路，让湖水洩流至海洋，使得当时知本湿地的范围缩至最小。距今14年前，当时台东县政府将该地