伯人再次入侵。13世纪，威尼斯共和国占领了克里特岛。他们最初住在山上的拜占庭城墙内，但随着人口的增加，许多居民住到了城墙外。1336年开始扩建并加高城墙，历时20年得以完成。到16世纪初，奥斯曼帝国成为威尼斯人的主要威胁，于是威尼斯人扩建了哈尼亚、伊拉克利翁和雷西姆农三地的城墙。新城墙修建于1536年，由Michele Sanmicheli设计，完成于1568年。1645年6月23日，克里特战争爆发，奥斯曼军队围困哈尼亚56天后，在8月22日突破西南城墙，占领哈尼亚。 奥斯曼帝国统治哈尼亚直到1898