4年最严重的一次爆发期间，仅发生了30次的跨物种传染，即使有大量的蝙蝠被屠宰并食用。而狐蝠在食用水果时，果浆及部分未食用完的水果会掉落至地面，陆生动物如大猩猩与小羚羊则会去取食这些水果，也因此于牠们体内都能发现有病毒的存在。2007年5月，于刚果中南部鲁耶波爆发的伊波拉疫情被发现来自于当地的锤头果蝠与族群，这些蝙蝠迁徙到鲁耶波地区并以当地果树上的水果为食，并被当地人宰杀来食用。2014年西非伊波拉病毒疫情的指示病例来自于居住在（Meliandou）的两岁男童，在有栖居的树洞内玩耍后遭到感染。于赖比瑞亚伊