于北魏宣武帝景明、正始年间（500年—508年），唐朝贞观年间（627年-649年）重建。唐朝开元二十三年（735年）扩建。北宋淳化元年（990年）契丹入侵，庙宇遭纵火焚毁，次年，宋太宗下诏重修。元朝初年，辟为道教活动场所，明朝嘉靖年间规模达到顶峰。清朝顺治十七年（1660年）改祀北岳于山西浑源，曲阳北岳庙逐渐衰落。1982年2月23日，北岳庙被中华人民共和国国务院公布为第二批全国重点文物保护单位。2015年3月，第十二届全国政协委员、中国道教协会副会长、北京市道教协会会长黄信阳在中国人民政治协商会