而高屏溪河床遭长期採砂影响，也使得二代桥出现安全疑虑，因此台湾省公路局设置蛇笼保护二代桥桥墩，屏东县政府也在1995年5月驱离高屏溪上的採砂船，以免危害第二代高屏大桥。
断桥意外.2000年8月27日下午3时8分许，由于受到台风碧利斯以及其后之降雨影响，第二代高屏大桥的P22/P23桥墩被溪水沖毁，100多公尺长的大桥桥面塌陷，造成行驶其上的17辆汽机车坠落，22人轻重伤，高屏两地交通旋即中断，高雄与屏东之间仅能够绕道最近的万大大桥或往北借道里岭大桥通行，造成当时高雄县与屏东市都会