1月19日投入舰队服役。于四天后进行；在试验的首日，威廉二世携勃兰登堡省政府代表团登舰视察。12月27日，该舰获颁了一面带有的旗帜，可在特殊场合悬挂。当月底，勃兰登堡号被正式分配至第一分舰队的第二支队。试航一直持续至1894年，然而当2月16日在施特兰德湾进行强制通风实验时，该舰遭遇了德意志帝国海军有史以来最严重的机械事故。右舷锅炉的一个主蒸汽阀发生爆炸，导致锅炉舱内44人死亡及7人受伤。爆炸的原因是阀门结构上的缺陷。正搭乘运输船鹈鹕号在附近的海因里希亲王立即指示舰只驶向勃兰登堡号提供救援，并将死伤者接