荐日初领兵，但日初推辞了鲁王的征召。抗清失败后日初逃往建宁，在灵隐寺出家，法号明昙。后与其子恽寿平相认，一起返乡。康熙八年（1669年）赴绍兴，在当地写成了《刘子节要》（刘子指刘宗周），卒后葬于马杭镇上店村胥城西。其三子分别为恽桢、恽桓、恽格。恽桢在参与王祁抗清运动途中阵亡，恽桓被俘虏后失踪，恽格即恽寿平。
着作.着有《见则堂语录》、《不远堂诗文集》。