治疗不足、没有正确按医嘱服药或药物品质低劣而得到多发性肺结核。抗药性肺结核在很多发展中国家是一个严重的公共卫生议题，因为这延长疗程及需要较昂贵药物。多重抗药性结核病（MDR-TB）的定义是结核菌同时对两种最有效的第一线药物利福平和异烟肼具抗药性。广泛耐药结核则是指同时对三种以上或六类第二线药物具抗药性。是指对所有用作治疗的药物具抗药性。此类结核病于2003年在义大利首次发现，在伊朗和印度也有案例，不过到2012年才有广泛报告。（Bedaquiline）暂时受到认受作为治疗多重抗药性结核病的药物。高剂量莫