督让给幸长而在武藏国隐居。在关原之战协助家康三男德川秀忠，由中山道进军。幸长担任东军先锋并攻陷岐阜城，于关原之战活跃。战后，幸长因功绩获加封纪伊国和歌山37万石。长政自身于江户幕府成立后，担任家康近侍，庆长10年（1605年）移居江户。后来自幸长领地的常陆国真璧领有五万石隐居料，1611年于此地死去，终年65岁，真璧领地由三男长重继承。法名为传正院殿前霜台功山道忠大居士。墓所在茨城县樱川市樱井天目山传正寺以及和歌山县高野町高野山悉地院。1910年（明治43年）4月2日赠从三位。