选制宪国民大会代表。1947年（民国36年）12月，冯钦哉就任国民政府主席北平行辕副主任。翌年8月，任华北剿匪总司令部副总司令（总司令：傅作义）。1949年（民国38年）1月，傅作义北平和平解放，冯钦哉下野成为北京民间人士。1956年夏，加入中国国民党革命委员会（民革），任北京市民革第13支部委员，同年冬任北京市第1届政治协商会议委员。1958年反右派斗争中，冯钦哉被打成右派分子，被民革除名。翌年，他因被指控对杨虎城失势及死亡负有责任而遭到收监，1961年才因病获释。1963年1月22日，冯钦哉