1990年开始，美国使用HiB结合型疫苗后，HiB病症的患病率减少至每十万名儿童有1.3名儿童感染。但是，HiB仍然是发展中国家引致婴儿及儿童下唿吸道疾病的主因。没有荚膜的流感嗜血桿菌会引致儿童的耳朵感染（如中耳炎）、眼睛感染（结膜炎）及鼻窦炎，并且联带肺炎。
与肺炎链球菌的相互关系.流感嗜血桿菌与肺炎链球菌都能在人类的上唿吸系统中发现。一项有关牠们之间的竞争研究指出，在培养基内，肺炎链球菌能以过氧化氢攻击流感嗜血桿菌及能排除在表面流感嗜血桿菌生存所需的分子。当两种细菌一同在鼻