本笃会修道院内，该修道院毁于15世纪。《魔鬼圣经》随后被存放在一所熙笃会修道院内，后又被布拉格的本笃会修道院买下。1477年到1593年间，此书存放在布劳莫夫的修道院中。1594年，《魔鬼圣经》作为礼物献给了神圣罗马帝国的皇帝鲁道夫二世，成为了这位爱好神秘主义艺术的君主的众多收藏品之一。1648年，三十年战争结束时，神圣罗马帝国皇帝的收藏被瑞典军队洗劫一空。《魔鬼圣经》也作为战利品之一被带回斯德哥尔摩。在这之后的三百多年中，此书一直被保存在瑞典皇家图书馆。直到2007年，经过了359年之后，《魔鬼圣经》