改为七年制中学。同时亦更改校名为「圣公会圣本德工业中学」。1997年起採用现时名称「圣公会圣本德中学」。在2006年，该校曾发生校园暴力事件。一名中二女生因为身体碰撞与其余四名女同学有积怨。及后被对方多番殴打和勒索汤药费。而现时，圣公会圣本德中学与北京市回民学校、韶关市仁化县丹霞中学以及广州市从化区第二中学结为姊妹学校。在校园设施方面，该校校内设有二十四个课室及十六个特别室、多媒体学习中心、英语自学中心、中文及通识教育资源中心、图书馆、学生活动中心、礼堂、小礼堂（兼食物部）以及露天操场。