格林威治荣军院荣任第四上校。不过，库克一心继续航海事业，因此他只有勉强接受荣誉退役的安排，但他同时要求将来如果获召出海，可以随时卸下荣军院的职务。这个时候的库克已不止于为海军部所赏识，他除了在1776年2月29日当选为皇家学会院士外，同年还获学会颁授科普利奖章，以表扬他对科学界的贡献。两次的航海经历令库克逐渐成为英国家传户晓的航海家，着名画家纳撒尼尔·丹西尔-霍兰（Nathaniel Dance-Holland）为他作画、传记作家詹姆士·包斯威尔为他设宴，在上议院的辩论中，他甚至被高门世族誉为「欧洲第一航海