的科学方法，属于系统分类学的一部分。系统发生学的推理方法，通常在性状演变的特定模型下，评估可观察到的遗传性状（例如DNA序列或生物形态）来“假定”这些生物间的关系。这种分析推理方法的结果，就是 系统发生（英语：phylogeny，也称为系统发生树phylogenetic tree）——可显示一群生物演化史的关系图解假说。系统发生树的尖端可以是生物体或化石，且代表演化谱系中的现今生物或“末端”生物。利用系统发生学来分析种系的基本原则是：两个演化支具有“相同的性状状态”是它们对于“共