本教育电视台在开台时的总部候选地点有御茶之水的、东京大仓饭店邻接地、河田町（后成为富士电视台总部）等地。在考量交通便利和扩张余地后，日本教育电视台从东映购得六本木的一块面积9,147平方公尺的土地作为总部所在地。日本教育电视台本馆由久米建筑事务所设计，清水建设施工。地上有4层，地下有2层，设有4个摄影棚，耗资约4亿日元。这座建筑在1958年2月19日举办开工式，同年11月24日举办竣工式。由于本馆面积远小于其他各核心局总部面积，日本教育电视台在本馆之外还修建了众多建筑物。1959年4月18日，日本教育电