其附属小岛共计36个岛屿、礁屿组成，面积29.6平方公里，居民人口13,000多人。1999年以马祖列岛为范围的马祖国家风景区成立，隶属于交通部观光局管理。除了地形地貌和人文特色外，因地理位置关系而成为多种候鸟过境或渡冬的区域，2000年成立马祖列岛燕鸥保护区，主要针对白眉燕鸥、红燕鸥、苍燕鸥、凤头燕鸥、黑尾鸥、岩鹭、插尾雨燕等7种鸟类。2000年6月曾在此发现在世界鸟类红皮书中被列为临绝种的黑嘴端凤头燕鸥共4对，每年的最佳赏燕鸥季为5月到8月。马祖除通用中华民国国语之外，还通用操长乐口音的闽东语，