《玛娜之子》由伊藤贤治、岩田匡治和相原隆行谱曲。伊藤曾为圣剑传说首作《圣剑传说 ～最终幻想外传～》及其2003年重制版《新约 圣剑传说》作曲。这是岩田和相原首部谱曲的圣剑传说游戏，不过岩田之前有参与多款史克威尔艾尼克斯游戏的配乐。游戏音乐曲风多样，包括摇滚、爵士和古典乐。史克威尔艾尼克斯音乐在线的克里斯·格林宁称，受任天堂DS硬件的限制，并非所有的合成乐器都“非常有美感或逼真”。专辑《圣剑传说DS 玛娜之子原声音乐》收录了33首《玛娜之子》中的曲目，分为两碟合计约1.5小时。专辑由史克威尔艾尼克斯于200