度尼西亚之时，绝大多数的荷兰政府机构都已经被日本根除。1949年，在美国的强力敦促下，荷兰给予印度尼西亚独立自治地位。现居荷兰的日本人约为6600余人。
外交机构.日本在荷兰的海牙设有日本驻荷兰大使馆（）。荷兰在日本的东京都港区芝公园设有荷兰驻日本大使馆，并于下列城市设有领事馆：