再加上当晚11时52分，台东外海发生zh-tw:芮氏规模6.0; zh-cn:里氏规模6级; zh-hk:黎克特制6级的地震，引发多处坍方、落石、土石流、溪水暴涨及淹水等灾情，其中包括花莲车站、台东车站、鲤鱼山等；翌晨（7日）8时45分，台铁鹿野－山里间受雨势影响，路树倒塌压到电车线，造成电车线断电，二小时后才抢修完成，共影响8列次、旅客约1179人；此外海端乡雾鹿村长余元龙更在巡视当地灾况时遭土石掩埋不幸殉职。诸多灾情导致花莲县政府及台东县政府紧急宣布7日下午停班停课，并成立一级防灾应变中