重叠积分（），又称S积分，是原子轨道线性组合为分子轨道时，通过变分法求得的久期方程组包含的三类积分之一，通常用S表示。对于双原子分子，由于久期方程组矩阵形式为：所以：它与核间距离有关，其中R=0是S为1，而R→+∞时，S→0。