内的难民无须遵从遣返令，库珀还因此获得第3集团军的军政府表彰。为了取缔所有纳粹官员的职务，德国巴伐利亚的239个法院都在库珀的监督下重组，为此他获得了一枚铜星勋章。在此期间上任的法官包括之后成为巴伐利亚总理的威廉·霍格纳（），以及之后当上德国总理的路德维希·艾哈德。1943或1944年，库珀在军中迎娶护士伊夫林·普法夫（）。1945年，人在德国，完全没有竞选的库珀又在没有竞争对手的情况下获选为肯塔基州第28巡回法院法官。1946年2月，他以上尉军衔退役，返回肯塔基州担任法官。
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