时由加莱搬至都柏林。母亲名安妮·道达尔（Anne Dowdall）。家中生有五个小孩，威廉·莫利纽兹排行第二，他们全家信仰圣公宗。1671年，就读都柏林圣三一大学，期间对科学革命产生浓厚兴趣。在取得艺术硕士学位后，在1675年至1678年间，他至英国伦敦学习法律。1678年与露西·东维尔（Lucy Domville）结婚。两人生有三个小孩，但只有撒母耳·莫利纽兹（Samuel Molyneux）长大成人。