白山落叶松、樟子松、哈密落叶松和油松。松科植物以下，杨柳科的苦杨、山杨、山柳、旱柳、密穗柳以及崖柳和榆科的欧洲白榆等次生林则在中山带常见。低山带则常见蔷薇科的金丝桃叶绣线菊、宽刺蔷薇、刺梗蔷薇、疏花蔷薇、腺果蔷薇、天山花楸、异花栒子和山里红以及忍冬科的刚毛忍冬、新疆忍冬和蓝果忍冬。另外还有关东巧玲花、刺果茶藨子、镰叶锦鸡儿、红花锦鸡儿和准噶尔铁线莲等植物也生长在大峡谷内。大峡谷景区内常见的草类有白花老鹳草、地榆、早熟禾、唐松草、草莓、石生悬钩子等。除此之外，车前、雪莲花、甘草、大黄橐吾、草麻黄等野生中草药也