南语、客家语、原住民语适用的版本之后，于2002年编订《》，全面採用通用拼音做为中文音译标准（仍是根据国语发音音译），因为部份地方政府反弹，而且此原则只是「行政指导」位阶，不禁止地方政府自行决定其它方案，所以并未达到统一拼音方式的目的。例如当时的台北市市长马英九，考量到更换拼音系统的成本和国际化的需求后，决定採用汉语拼音标示台北市的街道名称，并将之推向整个台北捷运（含台北县路段）的车站英文标示。至于在台北县境内的车站及地名，若两者拼法相异时，则以汉语拼音为主，同时以括弧标示通用拼音。此作法也用于台北县市