资讯系统（TIMS）的改良版──先进列车运行资讯系统（AIMS）。除此以外，两个控制室的讯号装置（ATS-P）是互通的，一旦正在使用的一台故障，另一台能立即替补故障的一台，使列车能继续运作。而控制室上方的方向幕也使用了不同的技术。E993-1安装了全色LED方向幕，而E993-1和其他车身上的方向幕则採用E231系只能显示橙绿两色的LED方向幕，但尺寸较E231系的大。
车厢.因为车体进一步扩阔并採用外悬式车门设计（E993-1除外），使E993系车厢比E231系扩阔80mm。另外