1985年，乔森潘在名义上取代波尔布特，出任党总书记，成为红色高棉最高领导人。1991年，柬埔寨内战各方签订《巴黎和平协议》。此后，乔森潘主张红色高棉放下武器，参加1993年大选，成为合法政党，但是在波尔布特一派的坚决反对下未果。其后，乔森潘与农谢、塔莫克等人共同组成了九人委员会，夺取了波尔布特的军权，并在1997年7月25日对其进行了公审。1998年12月，乔森潘和农谢宣布向柬埔寨政府投降，正式结束了红色高棉的武装斗争。2001年，乔森潘被列为红色高棉受审名单的第三位。2004年3月5日，乔森潘的自