府依《文化资产保存法》，将新竹州厅指定为省定古蹟，同年精省后改为国定古蹟。1999年九二一大地震后建筑部分受损，2000年开始进行古蹟修护工程，至2005年4月完工后恢复其旧貌。
建筑.新竹州厅採西洋建筑风格，为二层楼加强砖造建筑物，地板与横樑主要使用铁筋混凝土，两个坡式斜屋顶由木屋架组立而成，屋面材料使用日本黑瓦。整体而言保存良好。