联合成立中国西北植物调查所。1941年他又随北平研究院迁往昆明。抗战结束后回到北平，继续从事植物学研究。中华人民共和国成立后，刘慎谔于1950年出任东北农学院植物调查所所长。1954年调任中国科学院林业土壤研究所副所长、植物研究室主任。此后他还曾前往苏联、朝鲜等地进行考察。1963年他编写了《动态地植物学》、《历史植物地理学》，并提出了地带性顶极与非地带性顶级的观点。此外，他还主编了《中国北部植物图志》、《东北木本植物图志》、《东北植物检索表》、《东北资源植物手册》、《东北药用植物志》等着作。刘慎谔