宝藏去世，守丧去职。后为内直监。隋炀帝即位，担任尚书度支郎。612年（大业八年），隋第二次远征高句丽，兼左骁卫长史，监军盖牟道。受位朝请大夫，兼治书侍御史。宇文述大败，游元审查他的战败责任。宇文述依靠权势，想要请託游元，游元率直纠弹宇文述之罪。613年（大业九年），游元在黎阳监督运输，杨玄感作乱，想让他参加，游元不从，杨玄感将他抓起来。多次威胁，游元不肯屈服，于是被杀害。隋朝追赠他为银青光禄大夫。其子游仁宗，官至正议大夫、弋阳郡通守。