"vanN"。其中"vanA"和"vanB"在临床上最为常见。"vanA"和"vanB"编码的特殊连接酶使C端肽序列转从acyl-d-Ala-d-Ala变为acyl-d-Ala-d-Lac（其中，“acyl”代表酰基，d-Ala代表D-丙氨酸，Lac代表乳酸残基），使糖肽类抗生素难以与之结合。乳杆菌等革兰氏阳性菌拥有天然的万古霉素抗药性，因为它们脂质IIC端的肽序列本身就是d-Ala-d-Lac。具有中等万古霉素耐药性的金黄色葡萄球菌通过使细胞壁增厚获得对糖肽类抗生素的耐药性。
临床