州刺史。泰始元年十二月丙寅（466年1月9日），刘彧正式即皇帝位，是为宋明帝。不久休仁因中护军刘道隆曾经在废帝指示下姦污了休仁生母杨修仪，上表辞让官职，表示不肯与刘道隆同朝，最后明帝为他赐死了刘道隆。明帝虽然即位，但另一方面，本已起兵反前废帝的江州刺史刘子勋在邓琬等人主导下拒绝明帝任命，抗拒其建康政权，而国内多个地方都支持刘子勋,形势对明帝相当不利。泰始二年正月甲午（466年2月6日），刘休仁被任命为都督征讨诸军事，率军南讨刘子勋。不久加领太子太傅，进攻刘子勋的诸军都由休仁总统，因战况对各军进行支援。正月七