盛产于华南，但由于牙香树在中国大陆遭到任意砍伐，因此属于易危品种，被列入中国国家二级保护野生树种，分佈地区包括海南、广东、广西、云南。台湾亦出产可衍生沉香木质的牙香树。台湾原生种被IUCN物种保育等级评估为接近威胁，分布于西南沿海湿地地区，为耐盐的红树林伴生植物，多数生长于沿海和沼泽地区，这些地方易受开发破坏，许多栖地已划入垦丁国家公园和台江国家公园等及中华民国的国家重要湿地保护中。此外，亚洲热带、澳洲、玻里尼西亚等地区也有牙香树分布。牙香树与南洋出产的品种（Aquilaria agallocha）