虽然已经开工，但是设计仍然经历了很多变动。2009年8月，应沿线居民要求，在首经贸站与草桥站之间增设了纪家庙站。而位于莲花桥站和六里桥站之间的马官营站则受到沿线个别居民反对而取消。2010年，铁道部又提出对丰台火车站进行改扩建，接入京广高铁，以缓解北京西站的压力，新站站址位于既有丰台站东侧，10号线孟家村站以北，前泥洼站以南。由于需要更改规划，两座车站于2010年5月停止施工。规划部门提出将孟家村站、前泥洼站取消，合并至新丰台火车站地下，称作“三站合一”，这一方案会使附近居民出行受到极大影响，因此受到沿