于外国，水鼠耳蝠主要在秋天时候交配，至春天生产。牠们通常一胎一只，蝙蝠出生后大约三个星期就懂得飞行，至6至8个星期后就可以完全独立。
保育状况.由1981年起，所有英国境内的蝙蝠都系受到《野生动物及郊野公园条例》第5条保护，而香港也有相似法例：《野生动物保护条例》，但香港自1990年后再没有水鼠耳蝠的记录。此外，水鼠耳蝠于德国及奥地利属于濒危物种。