仁大学（Fu Jen）、交通大学（Chiao Tung）、中正大学（Chung Cheng）、暨南国际大学（Chi Nan），而政治大学（Chengchi）的「治」在威妥玛拼音应为chih，而非chi。少数几个在中华民国政府迁台前便已存在的大学则使用邮政式拼音，像是清华大学（Tsing Hua）、东吴大学（Soochow，苏州）。有些大学的名称使用地方方言，像是採用台湾闽南语拼音的淡江大学（Tamkang）、粤语（广州话）拼音的国立中山大学（Sun Yat-sen，孙逸仙）、德明财经科技大学（Takming