些阿拉伯马的毛色看似白色，但这种毛色是源自于其灰色基因，所以实际上是灰色来的。但亦有极少的阿拉伯马是白色的，有粉红色的皮肤及深色的眼睛，这可能源于DNA的无义突变（）。就一种在肩膀上有红色斑点的阿拉伯马，在贝都因人中流传着多个不同的传说。其中一个是指先知穆罕默德在一次战争中受了伤，所骑乘的灰色马救他回到阵营中。而穆罕默德所流的血则溅在这匹马的毛皮上，成为了牠永久的印记。自此真神阿拉就认为这是最优秀的马种。 纯种的阿拉伯马亦有斑点的毛色，称为Sabino。Sabino基因会令阿拉伯马在脚上、腹部或面部