2月调任第39师团长（隶属于第34军），在湖北作战。1945年7月第39师团调往中国东北地区转隶属关东军编入第30军，1945年8月23日在四平被苏联军队俘获。1950年7月被移交中华人民共和国，关押在抚顺战犯管理所。1956年成立中华人民共和国最高人民法院特别军事法庭，在沈阳公开审判时，佐佐真之助承认“犯下了滔天的罪行”，被判处16年徒刑。1959年因患胃癌病死在中国，是被判刑的45名日本侵华战犯中唯一服刑期间死在中国而没有被特赦释放回日本的。