悲愤导致他晚年身体衰弱，科希丘什科在1817年10月15日死于伤寒症。死前两年，他解放了他的黑奴。科希丘什科的遗体得到了妥善保存，并安葬在索洛图恩耶稣会教堂地下室中。他的内脏在进行尸体保存的过程中被移出遗体，除心脏外的内脏都分别埋葬在索洛图恩附近的楚赫维尔的坟场中，而他的心脏被铸在一个瓮中。在1818年，科希丘什科的遗体被转移到波兰克拉科夫瓦维尔主教座堂的地下室中，一个安葬波兰国王与民族英雄的先贤祠中。科希丘什科被安置在瑞士拉波斯维尔波兰博物馆的心脏在1927年和博物馆的其他馆藏送回华沙，心脏现在被安置