这是受到人口增长、观光及工业发展造成栖息地破坏所影响的。加上牠们怕羞及不愿与人接触，逐步远离人群，并于近年完全与人隔绝。不过这些洞穴却造成幼海豹的高死亡率。
保育状况.地中海僧海豹以往分佈在地中海及黑海沿岸，包括所有地中海的离岸岛屿，与及大西洋及西至亚速尔群岛、马德拉群岛的岛屿。南至冈比亚及佛得角，北至葡萄牙及法国都有一些离群的地中海僧海豹出没。地中海僧海豹的数量大幅下降的原因是商业捕渔。于20世纪，因牠们破坏渔网，渔民认为牠们是害虫而将牠们根除。另外，城市化及污染亦影响牠们的