所属一级机关，负责新竹市环境保护之相关业务，局址位于新竹渔港附近之新竹市垃圾焚化厂（原垃圾掩埋场址）。
组织架构.设置局长、副局长、秘书以及技正各一名 。
垃圾焚化厂.新竹市垃圾焚化厂，位于新竹市北区南寮海滨里，兴建工程系依据「台湾地区垃圾资源回收(焚化)厂兴建工程计画」办理，由行政院环境保护署办理兴建工程相关事务；2000年8月31日完工，佔地约5.5公顷。2001年正式启炉运转，以处理桃竹苗地区及新竹市之家户垃圾及一般事业废弃物。平均每日处理量为