基处拥有一片富含A、T碱基的区域，有助于加快转录速度。真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化，转录起始时，RNA聚合酶不直接结合模板，其起始过程比原核生物复杂。转录的启动还受到另外的蛋白质影响，如转录激活蛋白和。前两个NTP缩合成3′-5′磷酸二酯键后，RNA聚合酶脱离启动子，启动阶段结束，进入延伸阶段。
延伸.转录启动后，DNA双螺旋链解开，其中一条链作为模板链。随着转录的进行，RNA聚合酶在DNA模板链上移动，根据碱基互补配对原则合成RNA单链。转录的方向为3′