循环中将异柠檬酸切割为乙醛酸和琥珀酸的酶。其产物再通过苹果酸合酶合成苹果酸，跳过了三羧酸循环（TCA循环）中脱去CO的两步。这一途径广泛存在于细菌、真菌与植物中。
机制.异柠檬酸裂合酶属于，该家族的其它成员有（），以及磷酸烯醇式丙酮酸变位酶（，参与草丁膦类三肽抗生素的合成）。在乙醛酸循环中，苹果酸合酶可催化乙酰辅酶A与乙醛酸缩合形成苹果酸从而使循环得以继续。
酶结构.截止2007年底，已有5个这类酶的结构被解析，PDB接入代码为、、、和。