特穆斯林统治者的关系也变得紧张。葡萄牙人在1575年被驱逐，1606年西班牙军队从特尔纳特人手中攻下原先的葡萄牙堡垒，将特尔纳特苏丹及随从驱逐到马尼拉。1607年，荷兰人来到特尔纳特，在特尔纳特人的帮助下建起堡垒。特尔纳特岛这时分为两股势力：西班牙人与蒂多雷人结盟，荷兰人与特尔纳特人结盟。1663年西班牙人放弃了在马鲁古地区的殖民活动。1683年特尔纳特苏丹国被迫与荷兰签订不平等条约失去了许多土地。通过这个条约，特尔纳特也失去了与荷兰的平等地位并成为其附庸。但是，特尔纳特的苏丹以及人民从未完全被荷兰控制。特