民国经历.1912年10月，北京政府授予熊秉坤陆军少将。1913年1月，补授勋五位。同年，熊秉坤参加了“二次革命”，组织改进团，后出任鄂中司令。二次革命失败后，遭黎元洪悬赏通缉、缺席审判，熊秉坤流亡日本。1914年，熊秉坤参加中华革命党。同年秋，熊秉坤回到湖北，被孙中山任命为讨袁鄂军司令。护法运动爆发后，熊秉坤出任广州大元帅府参军、高级副官、代参军长等职。后来，熊秉坤在回到武汉进行策反活动时，正逢二七大罢工，《张国焘回忆录》称，当时武汉的中国共产党的最后一次会议因会议地点被吴佩孚