地理学家徐霞客着《徐霞客游记》，明末清初思想家顾炎武着《肇域志》、《天下郡国利病书》。造园家计成写成园林学着作《园冶》。明初学者叶子奇指出:“草木一核之微,而色香臭味,花实枝叶,无不具于一仁之中。及其再生，一一相肖”，指出草木种子的重要性。后来学者王廷相更进一步指出，生物种的不变是由于“气种之有定”。他说:“万物巨细柔刚,各异其材；声色臭味,各殊其性,阅千古不变者，气种之有定也。」。
科技与发明.
晚明实用主义.晚明实学思潮造成这个时期学术文化的生机蓬勃，