眉蓁2008年的国立中山大学硕士论文《台湾对中国大陆之贸易分析》，遭揭露整本论文有96%内容抄袭自国立台北大学公共行政暨政策系雷政儒于2000年发表的硕士学位论文《两岸经贸互动与台商投资之演变分析》，另外有4页一字不漏抄袭自童振源2005年5月发表于国立政治大学的文章〈两岸政经互动〉。李眉蓁于2020年7月23日自行宣布放弃该硕士学位，但中山大学表示，依《学位授予法》，学位不存在自行放弃之规范，仍需经中山大学审查后撤销该学位。8月19日，中山大学表示，经送3位校外专业公正人士审查，3位审查人均认为抄袭事证明