四十年代末是港航的全盛时期。当时大批内地富裕难民为逃避战乱（国共内战）而来港，令港航经营的多条往返中国大陆的航线皆十分繁忙——当时单是来往广州的航线，一天便有4班以上。但中华人民共和国成立后跟香港断航，令港航失去多条主要航线。继后，由于韩战的理由，朝鲜半岛航线也因安全理由而断航（至韩战结束后恢复至南韩的航线），经营变得更见困难。后来，港航的航线更只剩下日本和台湾航线。随着经营恶化，英国海外航空将大部份股权让给怡和洋行。怡和入主港航后为减低营运成本，放弃了原本的DC-3机队，改为向其他航空公司租用飞机