外观变化进行推理诊断。由于受伤及日粮中缺乏色氨酸和抗坏血酸也可以导致类似的情况，最终诊断应当以在鱼软骨内发现粘孢子虫为准。在严重感染的情况下，应当对软骨进行显微检查并发现粘孢子虫。在轻微感染的情况下，更常见的检测是在查找粘孢子虫前调查头软骨中胃蛋白酶和胰蛋白酶的消化情况(the pepsin-trypsin digest, PTD)。头部和其它组织可以用组织病理学做进一步检查并确认粘孢子虫的位置和形态是否符合脑粘体虫的特征。组织部分的胞子血清学鉴定也可以使用抗孢子的抗生素。寄生虫的鉴定可以用聚合酶链锁反应（