一类为南京大屠杀期间留在南京的西方目击者的日记、书信和回忆。第二类为德国、英国和美国等国使领馆的文书和西方媒体的有关报道。第四部分为战后远东国际军事法庭和南京国防部军事法庭等方面的史料。远东国际军事法庭的资料包括法庭法律文件、起诉方和辩护方的证据、检察官的开庭词、国际检察局南京取证报告、判决书等。南京国防部军事法庭的资料主要有法庭法律文件，法庭成立概况，战犯谷寿夫罪行总表，审判战犯谷寿夫、向井敏明、野田岩、田中军吉起诉和辩护材料及法庭判决书等。另外，有关南京大屠杀的历史图像则编为第28册《历史图像》