8年（1603年），叙任安房守。同年，养父隐居。翌年（1604年），继任家督并成为藩主。此后，改筑土浦城、整备水户街道至城下等，并与嫡男忠国一同在两次大坂之阵中出阵。元和3年8月（1617年），转封至高崎城5万石。元和5年（1619年）10月，移至篠山城，并转任伊豆守。在数度转封后，加上原来已经体弱，在移封至篠山的翌年，于京都的藩邸中病死。享年41岁。
子孙.长男忠国的家系世袭山城守，而次男忠晴的家系则世袭伊贺守。因此，藤井松平家分为两家。伊贺守家多数出任老中。