学者（Alex Kerr）的协助下，将原站务室经翻新后成为了「祖谷生活展示馆」，也将附近原来暱称为「Hot案内所」（）的休息站迁搬至生活展示馆，而原来细小候车室则加装了无线上网设施，成为旅游观光角，亦先后增设了「观光旅游站长」—用榉树所雕刻而成的妖怪「子泣爷爷」及助理站长「虎太郎」—活性化协议会其中一位成员所饲养的柴犬。大步危站由1个岛式月台及1个侧式月台所组成，与其他车站稍为不同的是，它的侧式月台位于最外围，而非依靠在站舍旁边。而往来月台及站舍之间是靠往小步危站方向的月台末端平交道连接。由于会经过列车