一年又两个月的有期徒刑定谳，但未被褫夺公权，且入狱时仍为立法委员之身分。
国民党时期.2007年3月22日，邱毅因涉嫌于2004年总统大选后率众包围及指挥货车冲撞高雄地方法院一案，最高法院维持二审原判，依「首谋聚众滋扰罪」判处有期徒刑一年两个月定谳，随后邱毅的照片即遭张贴各港口以防潜逃出境。后因立法院实行特赦政策，连带减刑为七个月，邱毅在入狱前与妻子离婚。2007年4月20日，邱毅爆料指出319枪击案之时，总统府有数千万的不明资金流入并举出交易明细。总统府则回应邱毅所提明细之「