对东北地区的掌握，但丰臣秀吉强行改易当地大名、豪族的决定和检地时爆发的领民不满，也使东北一带间接连爆发一揆暴动，像是在木村吉清领地内的葛西大崎一揆、小野寺义道领内的仙北一揆及和贺稗贯一揆、出羽庄内的藤岛一揆，在南部信直领内更有豪族九户政实发起的叛乱（九户政实之乱），迫使丰臣政权在天正十九年（1591年）大规模的调动兵力北上平乱。