差异对于开凿运河的影响。尽管巴拿马运河的长度最终仅为苏伊士运河的40%，建造前者工程上的挑战却比后者更大。巴拿马地区属于热带丛林气候，天气潮湿闷热，暴雨、洪水多发，不利工程进行；另外地形亦更复杂，开凿运河所挖出的土石体积高达2亿5千9百万立方米，远超苏伊士运河工程的总量。雷赛布原本计划按苏伊士运河的经验，建造与海平面等高的运河，但他仅在每年四个月的旱季内造访过巴拿马地区几次。整个工程团队对雨季没有做任何准备，就遇上运河起点处的查格雷斯河水位暴涨；同时，工地密林中遍佈毒蛇、昆虫和蜘蛛。当地肆虐的黄热病、疟