全国第三届体育大会公开水域游泳项目为期两天，于5月27日至5月28日的苏州太湖明珠度假村浴场进行，设男子2000米、女子2000米、男子5000米和女子5000米，4个小项，是三体会中唯一一项的奥运项目（该项目于2008年的北京奥运首度举行）。