恐龙是恆温动物，而其他则不是。恐龙恆温/变温动物说的争论与新证据仍在持续进行中。在2000年，一个对于奇异龙标本的电脑断层扫描，发现了可能是四腔室心脏的结构，类似现代鸟类与哺乳类。这个研究在科学界中引起争议，有其他生理结构、或其他物体等反对意见。现代鳄鱼与鸟类都拥有四腔室心脏（鳄鱼的心脏较不一样），所以恐龙可能也有类似的心脏结构；但心脏结构与代谢率没有必然的关系。
软组织与DNA.在1998年，义大利的一处石灰岩地层出土了一个虚骨龙类恐龙化石，名为棒爪龙，这个幼年体化石保存了极