006年2月2日发行第四张配乐专辑《机动战士高达SEED DESTINY原声大碟IV》收录剧中的精选音乐。四张专辑的首发版都包含一个豪华的塑料收纳盒。2005年12月16日发行名为《交响组曲 机动战士高达SEED DESTINY》的精选管弦乐专辑，由伦敦交响乐团演出。除了配乐外，版权方还发行6支角色定制CD单曲，其中包括歌曲和广播剧节目。这几张CD同时也被作为《SEED》时期发行的6张CD的后续系列冠以顺接的序号。《SEED DESTINY》共使用四套片头和片尾主题曲。与最初的在《SEED》中类似，这些