战争的尾声.1944年11月5日至13日的马尼拉空袭后，于11月18日与战舰「金刚」、「大和」与数只驱逐舰共同返回日本，这次为日本海军最后一次外洋航海。于11月22日，于台湾海崃近淤海，因受到美军潜艇「海狮」号（SS-315）攻击，同行的「金刚」与阳炎型驱逐舰「浦风」被撃沈，随后收容了「金刚」的生还者。于11月25日，「长门」在第十七驱逐队（滨风、雪风、矶风）的护卫下回到神奈川县横须贺港，但因燃料、物资均不足无法再次作远程航行，后于1945年2月受命执行沿岸防御任务，并于6月1日舰种变更为特别警备舰，