疫系统未有遭遇的经验，一旦传入人群中，极易发生大流行，此时若有疫苗的使用，将可有效阻止疫情的爆发，这种情况便称为族群免疫力（），尤其当一种传染病仅在特定或极少数物种间流传时，甚至可如同天花灭绝一般执行消灭计画，将流行病控制为地方病，进一步予以消除，例如小儿麻痺仅在人类中传染，目前已受侷限为极少数国家之地方病，但因部分感染区不易完全实施该项计画，直至2006年底消灭小儿麻痺的预定日已两度延期。
副作用和风险.疫苗接种也有风险，有时可导致接种者不适甚至死亡，但多数副作用仅会造成的微小的