肄业越级考取台北高等学校。1937年，杨基铨前往日本，参与东京帝国大学入学考试，并以德文最高分录取该校经济学部商业学科。1938年，杨基铨亲眼目睹东京警视厅没收在东京反对台湾总督府实施「台湾米谷移出管理法令」的反对书刊；该书刊的发行者为吴三连、刘明电以及他的堂叔杨肇嘉。1939年10月，杨基铨通过日本高等文官行政科考试优等及格。
官僚生涯.1940年，杨基铨于大学毕业后出任拓务省属官，随后旋转任于台湾总督府。1941年，杨基铨出任宜兰郡守；在任期间，他曾与日本籍宜兰