于土城妈祖田山谷间的集水区，循大安圳圳路，经土城工业区，在城林大桥以下河段加盖，在浮洲桥附近的新兴桥前流出涵洞，以露天方式往下流，经湳兴桥，于四汴头抽水站流入大汉溪。昔日湳仔沟的水源主要自大汉溪、大安圳溪流等，惟目前大汉溪水源部份已因浮洲桥旁的台北捷运土城机厂设厂而被填掉，故目前主要水源来自大安圳支线，而且因为污水干管仍未佈建完成，大量民生污水自大安圳支线流到湳仔沟，因此造成湳仔沟的水脏臭不堪。
现况.湳仔沟整治及绿美化工程，2010年底完工。