过环境影响评估，行政院成立美浓水库建设委员会。 美浓居民展开为期将近十年的抗议与四处陈情。2000年，陈水扁亲口承诺，未来不会盖美浓水库。2009年，马英九政府时期计画重新启动。 当地居民八年来持续北上到台北市向中央政府提出诉求，唿吁马政府正视旗山断层。 陈菊市长也多次强烈表达反对意见，并持续推动让黄蝶翠谷成为美浓国家自然公园的一部分。2015年正值马政府任内再次做民调希望重启美浓水库的计画。蔡英文重申，一旦胜选，其总统任内不会建美浓水库。