国际局势的变化，清政府于是积极拟定经营台湾的方针。 1884年10月，中法战争时，法国海军将领孤拔也曾佔领基隆，进攻淡水，并下令封锁台湾。 1875年，沈葆桢以大清帝国钦差大臣身份再度抵台，尽管他在台湾仅停留不足一年，却对台湾近代化有所建树。他推行开山抚番的政策，下令开北、中、南三路通往后山，鼓励汉人入山开垦，至此台湾东部才逐渐纳入大清帝国的领土，但在以武力开拓东部的过程中，也杀害了不少原住民族。此外废除渡台禁令，积极推动近代化建设，如机器採煤；在安平建新式炮台亿载金城等。沈葆桢数度奏请调整台湾行政区划