噶举派红帽系寺院。因该寺反对颇罗鼐（1689年－1747年）政权的统治，从而受到颇罗鼐的镇压，被改为格鲁派寺院“甘丹曲果林”。现存的甘丹曲果林寺是由甲央顿珠等人于1900年修建，工程历时12年。甘丹曲果林寺初定僧人员额130人，后来增至145人。文化大革命期间，该寺被毁。改革开放后，该寺逐步获得修复。2012年，甘丹曲果林寺僧人普布次仁被评为西藏自治区爱国守法先进僧尼。
建筑.甘丹曲果林寺的建筑是传统的藏式建筑。甘丹曲果林寺平面呈方形，东西长 89.2米，南北宽90米，占地