文件禁止被一般学者或人员检阅。教宗方济各于2019年10月将档案馆的名字由「梵蒂冈秘密档案馆」改称「梵蒂冈宗座档案馆」（）。
历史.
档案馆创立前.在基督教会创立的最初几个世纪，因文件数量不多，通常会由教宗携带，并无特定存放位置，导致当时绝大多数的文献都已遗失。在往后的几个世纪，随着教会的权势日增，教宗有与各国统治者会面或政治亮相的需要而游走欧洲，故在各地拥有宅邸。当他们外交访问或其它事务时，会随身携带一些文件以便处理行政工作，也导致了部分文献的丢失。