国家重建并无明显建树，主要原因在于经济每况愈下，加上疾病流行，使它得到的支持度逐渐下降。1996年至2001年间，塔利班在阿富汗建立全国政权，正式名称为阿富汗伊斯兰酋长国。由于它在阿富汗实施独裁专制和政教合一政策，因此仅被巴基斯坦、阿拉伯联合酋长国和沙特阿拉伯三个国家承认是代表阿富汗的合法政府。它曾经多次不顾联合国的要求，为奥萨玛·宾拉登提供庇护。2001年，塔利班政权不理会联合国教科文组织及外国非政府组织的反对，颁令称巴米扬大佛雕像是崇拜偶像的行为，以炸药及坦克炮火摧毁这座古蹟。在破坏行动期间，塔利班