台后，马达加斯加政府获得的捐助减少，珍贵木材也就成为国家财政收入的一个主要来源。预计到2025年时，该国除保护区和东部最陡峭山坡外所有的热带雨林都将被砍伐殆尽。栖息地破坏和人类的捕猎已对马达加斯加的许多独有物种构成威胁，其中部分已经灭亡。岛上特有的巨型鸵鸟科鸟类象鸟就很可能是因遭到偷猎者的猎杀并将其产下的大型蛋作为食品而在17世纪或更早时灭绝。许多巨型狐猴物种都在人类拓荒者来到岛上后消失，过去几个世纪里，不断增长的人口给狐猴栖息地造成更大的压力，部分人类还会捕食狐猴，这都造成多个物种的灭亡。2012年7月