后来，时任左将军的王敦任用他为长史。建兴三年（315年），杜弢的叛乱被平定，领导平乱的王敦因功获升任镇东大将军，谢鲲亦被封为咸亭侯。谢鲲为官不求功名，不作磨炼，一举一动都不要危及到自己。及见王敦不臣之心显露，谢鲲心知王敦不能够辅助，于是不理政事，更常与毕卓、阮放等人纵酒。永昌元年（322年），王敦以诛刘隗、刁协之名起兵，谢鲲向王敦称刘隗只是「城狐社鼠」，反对王敦起兵。王敦听后大怒，命谢鲲出任豫章太守，但却不派他到豫章上任，反倒要他随自己进攻建康，要借助他有才的声望协助自己。同年王敦攻陷建康，及后谢