晨0时1分30秒，执行官开动了绞刑架下的踏台，松井受绞11分30秒后断气。松井死后，遗体被送往横滨久保山的火葬场火化，美军将其骨灰装箱扔入东京湾内，以防有人以此立碑纪念。然而，现场还留有少量骨灰，美军将其收集至一水泥制件坑内，火葬场场长飞田美善将此告诉小矶国昭辩护律师三文字正平，后者于1948年12月16日穿越美军的封锁，将剩余骨灰收集取走，送入松井建造的观音堂内存放。1978年，靖国神社松平永芳将由「远东国际军事法庭」所处决、包括松井在内的七名甲级战犯秘密合祀，而此事在1979年4月19日被《朝日新闻》