员组成的部队被内务部重新命名“维加特种部队”。1995年，俄罗斯联邦安全局接管了维加特种部队并将其改名回“信号旗特种部队”，信号旗特种部队随后隶属于联邦安全局特别用途中心V科。信号旗特种部队参与了2000年3月的逮捕萨尔曼·拉杜耶夫的行动和2004年别斯兰人质事件。2019年6月，7名联邦安全局人员涉及一宗劫案被警方拘捕，当中3人为阿尔法小组的干员、1人为信号旗小组干员、2人为K部门干员，其余1人则来自联邦安全局学院。据指，7人涉嫌在6月10日打劫一名进入银行的企业家，并从其身上盗取1,360万卢布