中央目的事业主管机关以既定的经济政策先行核准污染源的设置后，才进行环境影响评估，使得环境影响评估承受各界极大压力，加上环境影响评估法制中民众参与机制不足，使得环评程序无法有效发挥功能。
中央与地方权限之争.拜耳案除了经济发展与环境保护之争议外，也突显了中央与地方权限争议问题。在地方分权化潮流下，惟有建立起中央与地方之间充分协调机制，才可以避免冲突，减少社会成本，达成地方自治行政。若中央立法并执行之重大政策决定事项与地方有利害关系，但地方无有效参与的机会，则中央执行时将遭遇地方强力反