。有些三叶虫是瞎的，可能牠们居住在非常深的海底，那里没有光，因此用不着眼睛。有些（比如蛙形镜眼虫"）有很大的眼睛。三叶虫的眼睛是由方解石（碳酸钙，）组成的。纯的方解石是透明的，有些三叶虫使用单晶的、透明的方解石来组成其每只眼睛的透镜。这与大多数其他节肢动物不同，大多数节肢动物使用软透镜的、由甲壳素组成的眼睛。三叶虫坚固的方解石透镜无法像人的软晶状体的眼睛那样来调节焦距。但是有些三叶虫的方解石组成一个内部的、复合结构，这个结构可以降低球差，同时提供极好的景深。在今天生存的动物中蛇尾海星"使用类似的透镜。