环境的交互，一部分软件能够被自由下载。即使如此，我们如今依然对这个简单有机体中这些神经元的连接如何产生惊人地复杂的行为缺乏理解。开放蠕虫计划（The OpenWorm Project）——这是一个致力于通过生物逆向工程在电脑中构建出虚拟秀丽隐杆线虫的开源计划，他们目前已经作出了能够重现蠕虫肌肉运动的软件。
模拟果蝇的中枢神经系统.果蝇（Drosophila fruit fly）的神经系统也已经被仔细地研究，并在一定程度上得到了模拟。果蝇的全部神经元的连接的完整测绘有望在近几年内