老保险，深圳的卫生部门成立“丛飞特别医疗小组”，政府有关部门亦迅速为丛飞办好调令和落户深圳的手续。2006年4月12日，在深圳市领导的安排下，丛飞一家迁入新居。2006年4月20日20时40分（UTC+8时间），丛飞去世，他的遗愿是将眼角膜捐出，并将钢琴赠给莲花北残疾人康复站。他的眼角膜使五人重获光明。2006年4月26日，丛飞经火化后下葬深圳吉田墓园。
身后.丛飞的妻子是邢丹，两人生有一女。邢丹于2011年4月13日遭袭并于次日伤重身亡。