::::一楼.博物馆建筑主体一楼主要是作为地质厅、特展区、交趾陶工坊三大区。
二楼.博物馆建筑主体二楼主要是分为化石厅（交趾陶特展区、石猴特展区）两大区。
三楼.博物馆建筑主体三楼主要是做为美术厅（陈澄波纪念区、嘉义艺术空间）使用。
闭馆整修后于2021年重新开馆之楼层简介.
一楼.博物馆建筑主体一楼主要是以儿童厅、特展区两大展区为主。
二楼.博物馆建筑主体二楼主要是以常设展厅：