林光祖（），字以谦，广东潮州府揭阳县人，民籍，明朝政治人物。
生平.广东乡试第三名举人。嘉靖二十三年（1544年）中式甲辰科会试第六名，登第二甲第五十八名进士。任广西按察使司副使。
家族.曾祖林鸾；祖父林恺；父林文，国子监学正。母陈氏；继母郑氏；杨氏。