5日，在打狗登陆，暂居旗后，向打狗（今高雄）的李庥（Hugh Ritchie）学习传教，成为英国长老教会第5位赴台的宣教师（第3位牧师）。巴克礼以非常贫乏的语言能力肩挑了教区内12间教会之重任。那个时候，英国长老教会在台湾的宣教事工已经进行十年之久，而马雅各医生在台南受迫害的情形已成为历史，宣教工作已经传入讲台湾话的山脚下平埔族区域了，有些整个村落全部村民集体信教。同年12月21日，台湾北部传道人在台南府城开会，巴克礼受邀以台湾话讲道。巴克礼牧师初到台湾即受到疟疾的侵袭，幸好得到旗后医馆的万医生医治得以