所指使有争议。失去程璧光海军对抗的非常国会从此受桂系操控。1918年2月靖国军控制四川，陕西、湖南、福建部分军事首领，亦以"靖国"相号召，唐继尧自命川、滇、黔、鄂、豫、陕、湘、闽八省联军总司令，滇系军阀的声威达到空前绝后的顶点。1918年3月，徐绍桢被孙中山任命代军政府卫戍总司令、广州卫戍总司令兼陆军部练兵处督办。滇系、桂系勾结直系，破坏护法军的北伐计划，4月10日非常国会秉承西南军阀的意旨，通过《中华民国军政府组织大纲修正案》，决定改组军政府，将大元帅制改为总裁合议制。孙中山坚决反对这一决定。