了儒学，国学等等的思想外，也包括天文学，医学等等的自然科学，成为总合的学科。在水户藩产生的水户学，虽然给予了幕末尊王攘夷运动很大的影响，也是明治维新的原动力之一，但却得不到后来政府的保护；如弘道馆解散，大部分藏书成为国有。现在，水户学主要是由茨城县水户市的水户史学会研究，主要涉及历史、思想。