日可以说是第一期台湾民主国抗日运动的延伸。1896年，苗栗地区部分义军撤往大湖，加入泰雅族原住民抗日行列。由「得磨波耐社」大头目「北都巴博」率领，在马那邦山区与日军展开一场殊死战。但日军拥有zh-cn:山炮; zh-tw:山砲;等重型武器。原住民4位头目北都巴博、接卡久因、杜哈鲁、莫拉邦、和义军将领柯山塘及属下全部阵亡，日军阵亡七十多人。中南部地区简义、柯铁虎、刘德杓为首的民勇。于1896年6月进攻驻守南投街及斗六街的日军，7月进攻鹿港，辜显荣率「别动队」协助日军。虽有部份「别动队」成员倒戈