黑宣布，克林斯曼将在2007-08球季结束后接替离任的希斯菲尔德出任教练一职。克林斯曼上任后拜仁表现反覆，从未能上联赛榜首，更先后在德国盃及欧联出局，其中在欧联八强被巴塞隆拿技术性击倒后，克林斯曼的帅位已岌岌可危；2009年4月26日在主场0-1负于沙尔克04后，忍无可忍的拜仁董事会在联赛尚余5轮，于4月27日辞退克林斯曼。2010年最后一季，克林斯曼获委任为加拿大多伦多足球会顾问一职。 2011年7月29日，移民美国的他接受美国足总任命，接替被辞退的巴特利成为美国国家队领队。克林斯曼于2016年11月，因