都没能挽回局面。在全罗道顺昌郡，全琫准将部队分散成几个小分队躲避，以期日后东山再起。此后，全罗道、忠清道、庆尚道等都被日军和亲日政府控制。参加起义的农民遭到当局血腥报复，连家属也不放过，约三、四十万人被屠杀。当局悬赏一千两白银捉拿全琫准。全琫准原本想在淳昌郡金敬天家中躲避。不料金敬天当时已经变节，将全琫准交给了朝廷，后被押往汉城。1895年4月23日（农历3月29日），全琫准被日本当局和朝鲜亲日政府处死。