5年8月，日本投降，三校开始准备复员。10月27日，陈岱孙前往接收清华园校舍并开始组织修缮。1946年5月4日，联大结束，三校复员。10月10日，清华恢复上课。清华在战争伤痕下努力恢复发展，到1948年，校园面积扩大到1600多亩。相比战前扩充了农学、人类学、气象学、法学、航空工程、化工、建筑等院系。但由于战争动荡、经济崩溃，学校教学和学术研究只能勉强维持，众多研究所未能招生。1948年3月28日，华北学联举行平津同学万人营火晚会，成立华北院校自治会保卫自治权利联合会，后被当局查禁。之后各校开始罢课、罢