都认为乳桿菌有助于维持阴道内的生态系统。已证实乳桿菌可以抑制致病微生物的生长，例如、大肠桿菌、、动弯杆菌（"Mobiluncus"）属、淋球菌、厌氧消化链球菌（"Peptostreptococcus anaerobius"）、"P. bivia"及金黄色葡萄球菌等。一般认为抑制致病微生物的作用是透过乳酸进行的。而且乳桿菌属会附着在阴道上皮细胞，因此可以避免其他致病菌的感染以及长期生长。乳桿菌可以制造乳酸，并且乳桿菌会附着在阴道上皮组织，影响其他微生物的生长，其他阴道内的拮抗作用包括产生过氧化氢（广谱抗菌