大类：无论胺酰基开始被连接到腺苷上的哪一个羟基上，最终都会连接到3'羟基上，因为2'-O-胺酰-tRNA会通过酯交换反应（transesterification）转移到3'羟基上。
结构.两类胺酰tRNA合成酶都是多结构域蛋白质。典型的情况下，一个胺酰tRNA合成酶是由一个催化结构域（以上反应发生的区域）和一个反密码子结合结构域（与tRNA上的反密码子作用的区域，来保证胺基酸结合到正确的tRNA分子上）。一些胺酰tRNA合成酶还具有RNA结合结构域和“编辑”结构域，负责将不正确