市轨道交通系统则处于萌芽阶段。1945年终战后，日本的铁路事业进入新的发展期，1960年代面世的新干线，使日本铁路的发展水准达到世界前列。现今日本是全世界铁路事业最发达的国家之一（含运输服务及相关上游产业），除了原属国营的JR之外，民营铁路也非常兴盛，在东京、大坂等重要都市亦有发达的城市轨道交通（地铁）与通勤铁路系统。此外，日本各地尚有多家以服务偏乡为主的第三部门铁道。
概要.日本的铁道，是基于而建设，并由国土交通省管辖，而轨道是基于而建设。在法例上铁道与轨道是不同的，但一般都只称