基岩性为石英砂岩。该台是中国近代地震科学发展史上历史较长的观测台之一。该台由竺可桢倡导创建，1930年4月动土启造，1931年3月落成，命名为中国南京北极阁地震台，隶属当时的国立中央研究院气象研究所。这是中国自建的第二个地震台。建台的目的是探求地震、海啸与气象的关系。以后因为日本侵华战争，两个观测台站几经搬迁。中华人民共和国成立后，1951年择址重建南京鸡鸣寺地震台（代号NJ1）。1976年又在南京中山陵扩建具有多种观测项目的南京基准地震台（代号NJ2）。南京基准地震台目前拥有地震观测、地磁观测