站式站房），设有1面2线的岛式月台。此站是由新潟站管理的业务委託车站，委托了负责车站业务。闸口处设有3座自动闸机，所有闸机可支援Suica等IC卡。而闸口附近设有有人检票口暨绿色窗口（营业时间为 7:00 - 19:30，中间设有休息时间）、2台自动售票机和长椅（闸内）。在月台上设有厕所、自动贩卖机（在2014年12月的雷暴后至今暂停使用）。此站设有无障碍设施，包括在闸内大堂和月台之间设有1座升降机。闸外行人通道（寺尾站南北行人通道）是由新潟市西区建设课管理。车站大楼与行人通道位于2楼。该处也有无障