假说，指童年时因缺少接触传染源、共生微生物（如胃肠道菌群、益生菌）与寄生虫，从而抑制了免疫系统的正常发展，进而增加了罹患过敏性疾病的可能性。发达国家青少年自体免疫性疾病与急性淋巴性白血病发病率的增加被认为与卫生假说有关。一些证据指出自闭症与某些免疫疾病细胞因子有关，有一篇文献推测卫生假说可能是导致自闭症的原因之一。近40年来生活在北美洲，欧洲等工业化国家的儿童确诊过敏和自体免疫性疾病的概率有惊人的提升。相对而言，生活在发展中国家的青少年儿童相关疾病的确诊概率处于一个稳定的状态。 例如美国在1980年至1