崇祯帝父亲明光宗诸弟中选择。福王朱常洵为光宗诸弟中居长，虽于崇祯十四年被李自成杀害，但朱由崧为朱常洵长子，因此在崇祯太子及定、永二王无法至南京继位的情况下，福王本为第一顺位。然而东林党人却持相反意见，他们恐朱由崧即位后追究昔日“三案”及国本之争攻讦郑贵妃（朱由崧祖母）之事，主张立明神宗之侄潞王朱常淓。史可法并称福王“在藩不忠不孝，恐难主天下”。四月二十六日，张慎言、高弘图、姜曰广、李沾、郭维经、诚意伯刘孔昭、司礼太监韩赞周等在朝中会议，李沾、刘孔昭、韩赞周议立福王，议遂定以福王继统，