杀天子税使”，皇帝下诏“星夜扭解来京究问”，襄阳人赴阙为何栋如诉冤，出狱后削籍回乡。万历四十八年（1620年），后金兵连克开原、铁岭（今辽宁铁岭），何栋如上《越缨疏》请筹兵，自称“系常州府无钖县军籍”人。天启元年（1621年）四月十一，起用为南京兵部主事，到杭州一带招募新兵，获得六千七百余人。此时广宁失陷，何栋如继续请求出关考查形势。乃进太仆少卿，充军前赞画。天启二年（1622年）至山海关，稳定军民情绪，重新布置防线，后金兵未敢妄动，但所召新兵惧怕出关，多逃亡。天启五年（1625年）三月六日，因上《清诛