也有不少穆斯林。之后，清朝施琅攻打经营台湾时，也带进了不少闽南裔的穆斯林。这些为数不少的汉化穆斯林大部分是来自泉州府的晋江县陈埭丁氏与郭氏族人。陈埭郭氏相传唐朝名将「郭子仪」后代。这些大部分来自福建泉州惠安白奇乡郭姓族人也有「北奇郭」的另外称唿（闽南语泉州话北奇与白奇音近）。丁氏、郭氏族人的后代大多世居于台湾西部海岸乡镇，现代的彰化县鹿港镇丁氏与云林县台西乡丁氏，为闽南化伊斯兰人之后代。本土伊斯兰族群在其祖居地唐山时，便已开始融入当地闽南社会；唐山过台湾后，更长期融入台湾社会，与台湾各族群通婚通俗，在外