.腔肠素（Coelenterazine）存在于放射虫、栉水母、刺胞动物、鱿鱼、蛇尾（棘皮动物）、桡足类、毛颚动物、鱼类和虾之中。腔肠素含有水母发光蛋白，是令动物产生蓝光的辅基（）。
甲藻.甲藻荧光素是一种叶绿素衍生物（即一种四吡咯），并在一些腰鞭毛虫内发现。这些甲藻类生物就是这些生物光的来源。文学上往往说在海上看到的「点点磷光」，就是来自这些甲藻。此外，在某些磷虾亦有发现类似的化合物，但化学结构略有不同（见右图）。
介形虫.介形虫萤光素（）可在特定的介