之外，旗山也是高雄地区制糖重镇，旗山糖厂成立于1908年，并成立日本高砂制糖株式会杜，成立初期压榨甘蔗能力为每日1,000公吨，隔年再与盐水港制糖株式会杜合併，并改名台湾制糖株式会社旗尾制糖厂所，同时改制白砂糖，可日产1,800公吨，1910年时并设置旗山车站，并以俗称「铁笼车仔」的小火车来往于旗山、九曲堂、凤山和屏东之间运送糖料及搭载乘客。此外，日治政府为满足砂糖贸易的需要，更废掉清治时期税收最丰富的濑南盐场（今盐埕区），全力发展高雄港以利砂糖外销，这也促成1924年高雄市的设立。日治末期，随着日本军