是非特异性的。这意味着反应中间体不与甲状腺过氧化物酶结合，但是碘化过程中所需的活性碘物质是介由甲状腺过氧化物酶催化产生并释放的。甲状腺过氧化物酶催化的化学反应发生于细胞顶膜外表面，并以过氧化氢作为另一底物。
促进与抑制作用.促甲状腺激素（TSH）可以上调"TPO"基因的表达，进而提升甲状腺过氧化物酶的量。硫代酰胺类药物可以抑制甲状腺过氧化物酶，例如丙硫氧嘧啶（propylthiouracil）及甲巯咪唑（methimazole）。实验室研究未能摄取足够量碘的小鼠，发现染料木黄酮