方面对「一个中国」的定义不断紧缩，两岸关系陷入低潮，且引发台湾海崃飞弹危机。1996年3月中华民国首次举行首次总统直选，李登辉当选连任。1997年7月1日，香港主权移交给中华人民共和国，澳门也将于1999年12月20日主权移交给中华人民共和国。中华人民共和国的一国两制宣传主张对台湾的压力益增，美国又不断有人主张两岸应签订中程协议，故李登辉指示成立「强化中华民国主权国家地位专案小组」研究对策。1999年5月，该小组研议以「特殊的国与国关系」为两岸关系定位。1998年8月，成立『强化中华民国主权国家地位