进入两栖类的皮肤，并迅速长出孢子囊，再产生新的游离孢子。随着新的游离孢子再次在主体生长，主体因而感染壶菌病。感染了壶菌病的蛙类会有形态上的改变，包括腹部皮肤会变为红色、后肢抽搐、身上积聚脱下的皮、脚部及其他部份的浅表皮脱落、皮肤出现轻微粗化及细小的溃疡或出血。患者行为上表现无力、不能找到遮蔽处、不能逃跑、失去正常的反射作用及出现不正常的姿势。
研究.研究显示蛙壶菌在28℃以上机能下降，将感染壶菌病的蛙类放在高温下可以杀死壶菌。这可以解释为何由壶菌病引致的两栖类数量下降主要是发生在寒