中一段的深圳河拉直后，一幅有136个足球场大小的土地落入香港范围，业权就由直属深圳市人民政府的一间公司收购。当时深圳外经贸局表示希望港商在这里设厂，以及会争取中央政府在这里落实试行CEPA。2000年代后期，香港多所大学院校已经准备北上发展。在2009年10月，时任教育局副局长陈维安指出，香港的大学于5年内在深圳独立办理教学的机会比较低，当局正在研究香港的大学在落马洲河套区发展的可行性。2010年11月23日，香港政府及深圳市政府就河套区发展同步展开为期两个月的公众谘询，河套区主要用作举办高等院校及高新