c和Boc这两种基团加入多肽之未保护胺基酸单体保护的。自动化合成器也可用于两种技术，但许多研究小组继续手动进行固相多肽合成。固相多肽合成的收率有限，而且产出的多肽或蛋白质也只侷限在70个胺基酸单体以内。合成的难度是属于序列依赖性，要合成典型的类淀粉蛋白多肽和蛋白质也是有困难的。如果要合成更长的多肽就必须透过的方式连接两段多肽在定量的收率下。固相多肽合成推出以达40年以上，技术上也有显着的优化：第一，使用树脂上的优化。 第二，C端的氨基酸和聚苯乙烯树脂之间的连接体附着和裂解上在大致上定量产率下的改