早已加入中共组织」等罪名判处死刑。而蒋经国与蒋介石间也出现沟通不良，蒋经国不敢向蒋介石提出保证李友邦与共谍案无关。以至于在严秀峰入狱两年后，蒋介石仍在阳明山实践研究院国民党省党部新旧任要员交接典礼上，亲自下令将李友邦下狱处死。在处理此案的国民党特务谷正文的回忆录中，对李友邦被蒋介石亲口下令逮捕的过程有生动描述：1952年4月22日，李友邦已在狱中重病，但仍由三军总医院以担架将之抬押至台北马场町刑场枪毙，其后被葬于八里（今新北市八里区龙米路一段旁）。李友邦将军终其一生，都在反抗日本帝国主义的压迫，