消毒用途.二氧化氯可以用作熏蒸剂处理，以消毒诸如发霉和发酵的蓝莓，树莓和草莓等水果。 二氧化氯可用于在屠宰家禽后通过喷雾或浸泡将其消毒。 二氧化氯可以用于内视镜的消毒，例如商品名为Tristel的产品。 它也可以三者组合使用，其中包括预先用表面活性剂进行预清洗，然后用去离子水和低浓度的抗氧化剂冲洗。 二氧化氯可用于控制进水口中的斑马贻贝和。 已证明二氧化氯对消除臭虫有效。 
假药.该化合物已被欺诈性地用于治疗多种疾病，包括儿童自闭症。一些人也声称可饮用二氧化氯溶液