另外洪秀柱在遇到争议法案时，也多次与民主进步党籍立法委员爆发冲突；她曾指称行政院新闻局局长姚文智为「痞子」，也曾批评罗淑蕾、黄世铭等人作为。2008年，管碧玲、林淑芬、陈亭妃在教育及文化委员会抵制行政院国家科学委员会预算，因管碧玲以抗议看板隔开洪秀柱与李罗权，洪秀柱挪开纸板时不小心砸中管碧玲助理眼睛。两人立即爆发肢体冲突，之后皆向法院提出告诉。在法官调解下，管碧玲为向洪秀柱掴掌表示歉意。之后管碧玲仍高度尊重洪秀柱讲求公益而不谈私利的问政态度，但也曾批评洪秀柱对于黄文雄的言论。2010年，洪秀柱声援台北市