一个天主教国王使得瑞典最高层非常不安。因此齐格蒙特签署了《卡尔马声明》来阐明今后将怎样安排波兰和瑞典之间的关系。在这个声明里齐格蒙特规定瑞典和波兰是两个独立的王国。他还保障瑞典新教宗教自由。1594年他父亲死后齐格蒙特加冕为瑞典国王。瑞典和波兰成为共主邦联。但是齐格蒙特继续住在波兰首都克拉科夫并试图从那里统治瑞典。4年后瑞典反叛，反叛者的领导人是南曼兰公爵和齐格蒙特的叔叔新教徒卡尔。反叛者指责齐格蒙特违背他过去的允诺，偷偷在瑞典促进反宗教改革，限制瑞典的独立。齐格蒙特带领数千雇佣兵在卡尔马登陆瑞典捍卫他