帕巴寺是松赞干布按照尼泊尔赤尊公主的提议，在边镇建立的镇边寺庙之一，带有尼泊尔寺庙的建筑风格。从建筑及壁画看，历代曾对帕巴寺进行修葺，但帕巴寺主体建筑仍保持历史旧貌，带有浓厚的南亚风格。帕巴寺是廓藏战争时的重要地点。1789年，中国清朝和廓尔喀（今尼泊尔）两国在如今吉隆镇帕巴寺附近举行和谈，中方代表在廓尔喀侵略军的武力胁迫下，在不平等条约上签字。1791年，廓尔喀人在聂拉木“雪康”大楼（如今该楼尚存墙基）以和谈为名，杀害西藏噶厦官员代表及随从，并且绑押了西藏方面两名官员送往廓尔喀首都加德满都关押。当年，