十二年（1499年）己未科进士，授繁昌县知县，后改监察御史。正德元年，上疏请明武宗远离刘瑾、丘聚、马永成等太监，并清理朝政，此书入奏后，内臣极其仇恨赵佑。恰逢武宗大婚，诏取太仓银四十万两。赵佑亦上疏劝阻，但武宗并未接纳。当时，内臣擅政，赵佑与同官朱廷声、徐钰交相上奏，当时奏折入内阁商议，准备对太监中官施加重罪。恰逢事变，刘健、谢迁被勒令辞职。刘瑾大肆驱逐忤逆他的廷臣，并致认赵佑、朱廷声、徐钰、陈琳、潘镗为奸党，勒令罢免。刘瑾被诛后，赵佑起用为山西佥事。