代时，松本积极申办官立旧制高等学校。设立于1919年，是信州大学的前身之一。长野县唯一的国立大学信州大学的总部位于松本市，使得长野县成为只有一所国立大学的县中少数大学不位于县厅所在地的县（其他类似情况还有位于弘前市的弘前大学、位于彦根市的滋贺大学、位于东广岛市的广岛大学、位于西原町的琉球大学。现在信州大学的人文学院、经法学院、理学院、医学院设在松本市。拥有超过一个世纪历史的则是松本唯一的私立大学。松本市还是铃木教学法的发祥地。
交通.松本市内的铁路路线由东日本旅客铁道（JR东日本）