是利用首长特支费来支付马小九的健康检查及医疗费用，金额达79,700元。马英九回应说：主计处认为该项费用是用在推动认养流浪狗的公务活动上，故予以认可。马英九并同时表示，他已经将认养后的马小九该项费用以缴回市库的方式而改成自付了。至于台北市政府也召开记者会表示民主进步党立法委员谢欣霓说法皆不符事实。 除此，台湾高等法院检察署查缉黑金行动中心表示，马英九用特支费来支付认养马小九费用一事，是否有违法，会进一步调查。由于有民进党立法委员质疑马小九的存在，周美青特于2006年11月亲自带马小九至景美动物医院