部消失的悲剧，初号机则是通过直接捕食使徒成功获得S机关。 量产机成功搭载S机关。
操纵系统.EVA需要选出适格者来操纵。操纵者（亦称驾驶员）乘坐于「插入栓」（エントリープラグ、Entry Plug）内部的操纵席，之后插入栓内注满羊水般的LCL液体以提供氧气等生命所需。再将细长的胶囊状驾驶舱「插入栓」插入EVA嵴髓部并与核心连接，操纵者通过头部介面装置从A神经开始做神经连接从而完成启动并操纵EVA，之后可利用操纵杆进入高机动模式。神经连接的同步率影响到EVA的操纵，EVA在受创时会令