颅骨后段较长，牙齿间隔宽、外形呈钉状。玲珑塔达尔文翼龙的头颅骨较短、较高，牙齿较短、呈圆椎状。粗齿达尔文翼龙的牙齿非常粗壮。吕君昌等人同时提出一个理论，达尔文翼龙的三种不同型态牙齿，可能分别特化成以不同食物来源为食，显示达尔文翼龙的不同种分别佔据不同的生态位。举例而言，粗齿达尔文翼龙的牙齿较粗壮，可能会以外壳坚硬的甲虫为食。
古生物学.目前已发现30到40个达尔文翼龙的化石，其中许多化石保存状态良好，甚至包含蛋化石。古生物学家得以研究达尔文翼龙的多个古生物学层面，包含：生长模式、个