以用奥司他韦，或治疗。若在出现症状后的48小时内治疗，效果最好。甲型流感病毒中H5N1亚型（也称为禽流感）的许多病毒株已对金刚乙胺和金刚烷胺有抗药性。一些专家仍建议在病毒性肺炎中使用抗生素，因为无法排除併发的细菌感染。建议若症状轻微，不要使用抗生素。皮质类固醇在病毒性肺炎的使用仍有争议。
吸入性.一般而言，吸入性肺炎会使用原来只用来治疗吸入性肺炎的抗生素进行治疗。抗生素的选用和许多因素有关，包括疑似的致病微生物，以及肺炎是社区获得性或在医院罹患的有关。常见的用药包括克林霉素、Β-内