铁道仙台空港线通车启用之前，馆腰曾一度是距离仙台机场（）最近的铁路车站，因此又有仙台空港口的副站名，但此副站名早已在专属铁路线通车后停用。馆腰车站隶属于JR东日本仙台分社的管辖范围，但在实际车站经营方面是一个委由JR东日本子公司东北综合服务（）的业务委託车站，站内设有简单的订票、售票与补票设备，在管理上是由名取车站代管。
车站结构.对向式月台2面2线的地面车站。