酮酸在线粒体中可以分解为6 mol CO，8 mol NADH+H,2 mol FADH和2 mol GTP。在无氧唿吸中丙酮酸可以转化为乳酸或者乙醇。（参见发酵）。丙酮酸的代谢产物会随尿液被排除。
分析.定性分析可使用苯肼，α-或β-萘酚或者2,4-二硝基苯肼，定量分析可使用乳酸脱氢酶。其代谢产物主要为苯基丙酮酸，随尿液排出。