望·保禄二世任命为日本西北部新潟教区主教。同年9月20日由晋牧。2009年至2013年间，曾兼担任札幌教区宗座署理。后来，他出任日本明爱和亚洲明爱会长，亦是国际明爱代表议会成员。于2011年3月16日，菊地功以日本明爱主席身份，探访在2011年日本东北地方太平洋近海地震受灾最严重的仙台教区。2014年起成为圣座万民福音部的成员。直到2017年10月25日，接替荣休的冈田武夫成为东京总教区正权总主教。
评论.
促进和平.2015年8月6日，菊地功主教就日