科学共同体内部存在偏见。同时，，边缘科学，伪科学与科学之间的界限也成了人们常常争论的问题。在这些未达成共识的问题上，研究机构以外的一些持怀疑态度的组织投入了大量的时间和金钱与主流科学机构争夺话语权。科学哲学认为科学立足的知识论限制了科学共识，包括托马斯·库恩在内的一些科学哲学家，认为科学史中科学革命的存在，意味着科学共识曾错误了许多次。尽管如此，科学在精准预测和在设计和工程上的新技术方面所具有的完美解释力，让科学共同体的科学共识成为了学术界和流行文化中备受尊重的一种知识形式。