贝克岛没有天然淡水来源。这里没有树木，只有四种草本植物和低矮的灌木，植被稀疏。该岛是海鸟、海洋生物筑巢、栖息和觅食的栖息地。贝克岛是一些生存受到威胁的濒危物种的家园。翻石鹬、斑尾塍鹬、三趾鹬、"Numenius tahitiensis"和金斑鸻，这些涉禽栖息于此，牠们都是美国国家优先保护计划重的高度关注物种。绿蠵龟和玳瑁都是生存受到威胁的物种，也出没于沿礁。海鸟诸如白斑军舰鸟、白顶玄鸥和乌燕鸥也在该岛筑巢和栖息。该岛也被认为是北极繁殖的涉禽的中途休息站。
美国国家野生动物保护