变后，李巨川被发配到汉中，兴元节度使杨守亮大喜，录用于幕府，称：「上天赐给我李书记啊！」杨守亮与枢密使杨复恭举事，为华州节度使韩建所擒后，巨川亦是战俘，题诗于叶子上送给韩建，文词甚哀，韩建欣然释放了他，命为掌书记，后为韩建从事。。凤翔节度使李茂贞与唐昭宗不和，发兵攻击唐昭宗，韩建乘机劫持了昭宗到华州，随行宰相们王抟、孙偓、陆扆害怕韩建，不敢专断政事。八月，昭宗下诏韩建参与议论朝政，韩建上表坚辞，于是作罢。韩建遣李巨川传檄天下诸藩镇，让他们把资粮运到华州行在，协助修缮京城，唐昭宗很重视他的文笔，「即时巨川