以及Cu离子连接并处于同一平面上，Mo离子被还原为+IV价，Mo与O之间距离缩短，可能形成了三键连接；在HO分子的攻击下，CO和H被释放出来，Mo与O之间回到双键连接，而O变为OH基团与Mo离子之间形成单键连接，整个活性中心处于还原态；将两个电子传递给铁硫簇II后，活性中心又重新回到氧化态，从而完成一轮催化过程。
抑制作用.Mo-CODH很容易被氰化物所抑制，这种抑制主要是通过氰化物与[CuSMoO2]簇的硫桥和Cu离子反应生成游离的硫氰离子（SCN-）和氰化铜（CuCN）来使活性