祀日本靖国神社内之台湾籍阵亡将士。后来因为先总统蒋中正认为原建筑简陋，有失庄严，不足以祭祀国民革命英烈，因此指示由陆军一级上将何应钦将军主持重建，于民国五十八年（1969年）3月25日落成启用，并依《国民革命忠烈祠入祀办法》设置与管理，1969年由行政院制颁、1999年修订的行政命令《》第八条明订「中央政府所在地之首都，建立首都忠烈祠，并得特准建立专祠专坊或专碑」，同办法第二十四条并规定「各地忠烈祠应于每年三月二十九日及九月三日，依公祭礼节举行公祭；首都忠烈祠，由总统主祭」，典礼相当隆重且庄严。