1990年代酒厂因市场和体制等问题陷入困境，2005年改制后方扭转颓势。垣曲菖蒲酒乃为以高粱为主料，大麦和豌豆制成的大曲为糖化发酵剂酿成的清香型白酒为基酒，配以菖蒲、天麻、阿胶、檀香、木香、黄芪、党参、砂仁和冰糖等二十余味中药，以冷冻浸泡、清蒸清杂、地缸发酵、地窖贮藏等列入山西省级非物质文化遗产名录的传统工艺酿制而成。