厦门市郊区划出禾山乡，更名为集美区。直至2000年初，集美区辖3个镇，为集美镇、灌口镇和后溪镇。2000年，撤销集美镇，设立集美街道办事处；从后溪镇划出浒井、孙厝、叶厝、凤林美4个居委会和东安、兑山2个村，设立侨英街道办事处。2003年4月26日，国务院批准将杏林区更名海沧区，同时将杏林区的杏林街道办事处和杏林镇划归集美区管辖。其时，集美区辖3个街道，3个镇，为集美街道、侨英街道、杏林街道、灌口镇、后溪镇和杏林镇。2004年9月23日，福建省人民政府（闽政文[2004]291号）批复同意厦门市集美区