闻媒体报导下，柯文哲成为知名人物。2010年，自美国引进整合医疗照护观念，在台大医院成立整合医疗照护，希望达到降低医疗支出、改善医疗品质与医护生活品质的目标。11月26日，连胜文枪击案发生，柯文哲指挥外科急救团队，在台大医院医疗团队配合下，积极抢救连胜文，由于连胜文康复迅速，一度引发枪击造假的传闻，对此柯文哲出面来驳斥此传闻。2011年8月24日，台湾发生首例的爱滋病患者器官移植案。由柯文哲负责的台大医院器官移植团队将爱滋病患者器官移植给了五名病人。卫生署认定柯文哲有督导之责，对他进行惩处。2012