港沦陷，开展为期三年零八个月的日治时期。沦陷初期，谭雅士被中止大律师业务和原有的公职，并因其政界背景被日治政府强迫出任香港善后处理委员会其中一名委员。及至1942年初，日治政府组织华民各界协议会，谭雅士再被迫出任协议会其中一名委员，后来又获准与简悦强和施玉麒合组律师楼，恢复业务，一直到1945年日本无条件投降为止。
战后生涯.1945年8月香港重光和香港重归英国管治后，港府旋即强调大部份华人代表出于捍卫香港华人利益，并在得到英方秘密许可下，才接受出任日治政府的公职，当中并不涉及通敌