萄牙商船固定每年来航长崎，长崎作为葡萄牙的贸易港逐渐发展起来。织田信长与丰臣秀吉政权基本上对南蛮贸易取支持态度。西班牙继葡萄牙之后也经由美洲大陆开辟了太平洋的航路，以吕宋岛马尼拉为据点前来日本进行贸易。德川家康对对西贸易持积极态度，曾在1610年派遣京都的商人田中胜介前往西班牙统治下的墨西哥。此外为了独占与葡商交易生丝的利益，幕府于1604年建立了「丝割符制度」，只允许特定的商人集团输入和向国内商人售卖生丝。家康当政时取缔基督教但允许贸易。
荷兰人的加入.荷兰人被日本人称为「红