879年，琉球被日本灭掉，改为沖绳县。久米村人被划归外交官类，因此大多未能受到沖绳县厅的照顾。久米村人多为支持清朝的人士，因此，久米村成为了中城御殿之外亲清派士族的另一大反对日本统治的中心。但是清朝于1895年甲午战争中战败，许多支持清朝的久米人选择流亡清朝。而其余之人则逐渐融入了琉球人之中，从事渔业、农耕等行业。从此以后，久米村开始走向衰落。1992年，为了纪念福建与沖绳的特殊历史因缘，福州市协助那霸市政府在久米村原址上建立了一座庭园，命名为福州园。