南港溪，位于台湾苗栗县的一条河川，为中央管河川中港溪的支流，流域包含苗栗县造桥乡、竹南镇、头份市、三湾乡、南庄乡、狮潭乡。南港溪发源于狮潭乡百寿村标高762公尺之神桌山西南坡，向北流至三湾乡大河底，转向西南流至三湾、造桥乡界的南坪角，沿两乡边界续往西北流，其后成为头份市、造桥乡边界，再成为竹南镇、造桥乡边界，最后流至谈文注入中港溪。，长度为28.89公里，流域面积69.50平方公里。这条南港溪。也是清代的苗栗县与新竹县的县界河流。
水系主要河川.以下由下游至源头列出水系主要河川，