基认为迷惑齿龙是脆弱异特龙的次异名；然而，由于正模标本中的骨骼碎片已经丢失，这个问题现在已经无法解决。属名来源于古希腊语单词απατη（意为“诡计”或“欺骗”）和οδους（属格是οδοντος，意为“牙齿”），指的是它最初不正确的识别）。 种名在拉丁语中意为“奇异的”。