陈进兴三个死刑确定，依法已可立即枪毙，但因检警考量白晓燕命案尚有共犯等细节待釐清，或是陈进兴可能仍涉及其他重大刑案及惩治盗匪条例存废争议等因素。1998年11月5日，陈进兴在狱中归信基督教，由黄明镇牧师带领受洗。1999年10月6日，法务部部长叶金凤方批准陈进兴的死刑执行令，同日晚间于土城看守所执行枪决，时年41岁。