兼收并用的，他们对各种思想几乎一视同仁，都加以承认与提倡，「三教九流，莫不崇奉」。然而元廷在一定程度上尊重儒学，特别是于宋朝形成的理学，更是尊为官学，使得理学得以北传。元仁宗初年恢复科举，史称延祐复科，在「明经」、「经疑」和「经义」的考试都规定用南宋儒者朱熹等人的注释，影响后来明朝的科举考试皆採用朱熹注释。理学在元朝还有一些变化，南宋时期即有调和程朱理学的朱熹与心学的陆九龄等两家学派的思想，元代理学家大多舍弃两派其短而综汇所长，最后「合会朱陆」成为元代理学的重要特点。当时有名的理学家有黄震、许衡与刘因与调和