3°09′~23°40′、东经98°57′~99°26′之间，西起沧源县小母空山顶，经班洪村到耿马县三家村，东起沧源县登革洛河岔口到耿马县石楼梯，南起沧源县勐角林场，北到耿马县三叉河。保护区位于横断山系怒山山脉的南延部分，属滇西纵谷区，是云贵高原向缅甸掸邦山地的过渡地带，地跨澜沧江、怒江两大水系。南滚河是云南境内怒江下游仅次于勐波罗河、南定河的第三大支流，水网丰富。地质上属古滇西地槽的中三江褶皱系的一部分，在中生代印支运动和燕山运动时褶皱成陆，后受喜马拉雅山运动影响，第三纪开始形成高原雏形，自第四纪起高