赴任陵州。建德三年（574年），任太子少傅。建德六年（577年），任丰州刺史，进位上开府仪同大将军。宣政元年（578年），入朝为司宗中大夫、转洛州刺史。大象二年（580年），进位大将军。开皇元年（581年），隋朝建国，任贝州刺史。因要奉养老母辞职，隋文帝准许。开皇四年（584年），萧圆肃去世。享年46岁。文集10卷，又作时人诗文章《文海》40卷、《广堪》10卷、《淮海乱离志》4卷。