论立场及其推行的变革引起民间的反对者组织武装反抗。塔拉基在1979年9月被其副手部长会议主席哈菲佐拉·阿明在政变中取代，哈菲佐拉强调国家自主性、外交独立等，显然并不是勃列日涅夫政府所中意的人选。在苏方警告不从后，同年12月27日阿明与家眷等遭苏军特种部队杀害，苏联人支持的另一名左翼分子巴布拉克·卡尔迈勒上台。政府的内部斗争导致权威大减，反政府武装日益壮大。卡尔迈勒要求并接受苏联增加援助镇压反政府武装，苏联军队大举进入阿富汗，但始终无法消灭得到美国、巴基斯坦等国支援的圣战者。
塔利班酋