出当前香港并不适合推行德育及国民教育科，并且不应独立成科。
当代中国研究所.香港浸会大学于2008年成立当代中国研究所，被免职前，薛凤旋自奠基起一直担任所长。初时资金来源为恒基兆业主席李兆基的启动捐款一千万元。除出版《中国模式国情专题教学手册》外，亦接受王新兴有限公司资助500万，撰写《香港通史》一书。 2012年，由薛凤旋主编的《香港蓝皮书：香港发展报告2012》，书中提出香港政制体系中的常任秘书长需由中央政府任命等建议，备受争议，被立法会议员批评违反《基本法》中一国两制的宗