毕业生大多选择继续深造。例如，本科毕业生每年的出国学习的比例约30％，在中国大陆大学中名列首位；而保送和考取国内研究生则为50%左右，保送比例位居全国高校前列。截至到2017年，科大共培养了72名院士；本科生中约每千人就产生1名中国科学院或中国工程院院士以及700多名硕士、博士，比例高居全国高校第一。
学术研究.中国科大是一个研究型大学，科研力量在国内名列前茅。科大是一所拥有国家实验室的大学，包括：国家同步辐射实验室，量子信息科学国家实验室；此外，科大还拥有合肥微尺度物质科学国