内殿由一个圣坛屏与其他部分分开，圣坛屏由8个红色大理石圆柱组成，表面覆盖哥特式雕塑的杰作（14世纪末）。圣堂中间最后方是黄金祭坛（Pala d'Oro），上面共有2,000多颗的宝石，包括珍珠、祖母绿和紫水晶。内殿的后方是祭衣间和一座建于15世纪的小圣堂，奉献给圣西奥多（威尼斯的主保圣人），义大利着名画家乔凡尼·巴蒂斯塔·提埃坡罗则有一幅画作放置在此。圣坛屏的右侧是平台，新当选的公爵会从这里现身众人面前。左侧通道是圣克勉堂和圣主机坛。圣马尔谷的遗物在1094年于此地被重新发现，镶嵌画被描绘于右侧通道