理后，改鹤庆为鹤州，以其首领高氏为土司。明军平云南之后，置鹤庆府，以土官高隆为鹤庆世袭知府。1437年（正统二年），鹤庆土司高伦被控告与弟弟高纯在境内行凶作恶，与母杨氏、叔父高宣互相贼害。黔国公沐昂遣使讯问，但高伦拒不前往。高伦获罪被诛，其属地也被改土归流，以林遒节为第一任流官知府，原高氏土司则改为世袭千户土官。1683年，再降为世袭土通判。鹤庆土司与姚安土司、永胜土司是同一祖宗。