执行者是台湾警备总司令部）对可疑人士及批评、反对国民党政府者滥捕滥杀、没收财产，不时传出冤狱，史称「白色恐怖」。1950年3月，代总统李宗仁滞留美国，蒋中正宣布在台湾复行视事。此时政府财政匮乏，使用先前抢运到台湾的黄金解危。期间中国大陆东南沿海依旧动盪不安，受到解放军勐烈攻击。1950年韩战爆发后，美国派第七舰队协防并给予经济援助，使中华民国转危为安并且稳定军事与经济。但因国军优先守卫台湾，海南岛、万山群岛与舟山群岛先后落入中华人民共和国政府之控制；另外，据守滇南的国军撤至缅甸北部，最后部份军队撤往台湾