学教科书的研究报告，认为台湾是个海岛国家，但过去的教育始终错以中华大陆文明为主体，严重忽略台湾原有的海洋特质，学生无法建立对于海洋文化的整体认识。2012年6月，台湾历史学会与其他学术界人士对教育部违反程序、企图以非专业意见影响历史教科书编写、引发去台湾化争议的作法提出抗议，并于台湾连署资源运筹平台发起「『我是民众，我反对窜改历史』 抢救历史教科书连署活动」，短时间内即有超过五千多人连署。此外，2009年，台湾历史学会召开年会，许多知名的台湾历史研究学者对台南县市以「文化首都」作为合併升格的主轴诉求