日战争胜利，该所由国民政府司法行政部接管，改为中国战区日本官兵善后总联络部拘禁所，同年又改名为“首都监狱”，第一任典狱长是徐崇文。当时监房共172间，可容纳犯人3000名，规模达到历史鼎盛。中国人民解放军攻占南京后，1949年5月10日，该监狱由南京市军管会接管，1949年6月7日更名为“南京市人民法院监狱”，首任典狱长是武士魁。1955年，该监狱更名为“江苏省第一监狱”。1992年更名为“江苏省南京监狱”。1999年3月，按照中共江苏省委、江苏省人民政府的统一规划并经中华人民共和国司法部同意，本监狱整