里奥斯‧蒙特在内战期间，犯下血腥的种族屠杀和反人类的战争罪行。尤其，里奥斯‧蒙特在总统任内（1982年~1983年），为了剷除叛军，被指控派兵屠杀基切省内可能协助叛军的伊西尔（Ixil）马雅原住民，蒙特被指控放任军方犯下强姦、凌虐、酷刑、纵火等恶行，且对屠村视而不见。蒙特在法庭上为自己辩护，认为自己是无辜的，因为「并不知道军队犯下大屠杀的情形」、「从未下令群体灭绝」、「对战场上发生的事没有控制权」；但法官巴里奥斯（Yassmin Barrios）在法庭上表示「蒙特知悉每件发生的事情…但他没有制止，尽管蒙