寺内有佛像近万座，此外壁画、典籍、唐卡（佛教卷轴画）、经幡、挂幢等也都遍布各殿。寺内还藏有明朝皇帝赠送的典籍、佛像和法器。其中最重要的是一套用朱砂汁书写的藏汉文对照《甘珠尔》（大藏经），乃明成祖馈赠绛钦却杰之物。这是世界上第一部用藏文书写的佛经版本，在藏传佛教界和版本学领域内都具有非凡的价值。此外如金泥书写的《大般若经》、白檀木雕刻的十六尊者像、金汁绘就的释迦牟尼转法轮唐卡和大慈法王缂丝像等也都是弥足珍贵之物。绛钦却杰曾被明成祖和明宣宗封为“大国师”和“大慈法王”，因此由他创建的色拉寺也享有了崇高的声望