军收兵后，中国派修约代表，与英国签订《中英续订藏印条约》，英国承诺不占并藏境及不干涉西藏一切政治，中国也保证不准他国干涉西藏内治。英国在西藏的扩张刺激了清朝迅速采取开发西藏的一系列措施。1905年，清驻藏帮办大臣凤全在藏区干涉当地事物，被杀害，引发巴塘事变，赵尔丰武力解决四川藏区问题，并开始在西康进行改土归流的政策。这触犯了西藏高层的利益，原本反英的西藏高层统治者转而成爲亲英，而得到英国支持的西藏军队也经常在西康和川边与清军发生军事冲突。
过程.1908年赵尔丰任驻藏大臣兼任川