由于内奥地利需要负责对抗土耳其大军的侵略，他们于1579年在克罗地亚建立卡尔洛瓦茨城堡，以查理二世的名字命名。查理二世亦因对艺术及科学的帮助而受人纪念，其中作曲家奥兰多·德·拉絮斯及音乐理论家洛多维科·扎科尼都是他的门客。1580年，查理二世将安达卢西亚的马带到斯洛文尼亚的利皮查以培养出新种的利比扎马。1585年，查理二世创立了以他命名的卡尔·弗朗岑斯大学。1590年，查理二世于格拉茨逝世。由其长子斐迪南继承爵位，斐迪南就是日后的神圣罗马帝国皇帝斐迪南二世（即奥地利大公斐迪南三世）。1619年奥地