建立桓楚，但三个月后刘裕就举义兵反抗桓玄，桓玄不敌而逃奔江陵重整军力，但后再遭西讨的义军击败。试图入蜀途中遇上护送毛璠灵柩的费恬等人，遭益州督护冯迁杀害。因曾袭父亲「南郡公」之爵，故世称「桓南郡」。
生平.桓玄自幼为桓温所喜爱。宁康元年（373年），桓温去世，遗命其弟桓沖统率其军队，并接替他任扬州刺史，并以时年五岁的桓玄承袭其封爵南郡公。两年后，桓玄的服丧期满，桓沖亦离任扬州刺史，扬州文武官员与桓沖告别，桓沖摸着桓玄的头说：「这是你家的旧官属呀。」桓玄听后就掩面哭泣，众人都对这反应