属于恐龙，而非哺乳动物，而进行命名。属名意为「有三个齿尖的牙齿」；种名在拉丁文意为「楔形」。正模标本目前由柏林自由大学所保存、管理，但没有标本编号。除此之外，葡萄牙当地还发现其他牙齿化石。Richard A. Thulborn最初将三尖齿龙归类于法布尔龙科，在2001年被改归类于畸齿龙科。近年研究则认为三尖齿龙是原始鸟臀目恐龙的分类未定属