爪哇海海战中，埃克塞特号的锅炉室被中一发8英寸炮弹后接到命令迅速撤退至泗水港修理。2天后的3月1日早晨，她在遭遇号（HMS Encounter）与蒲柏号（USS Pope, DD-225）护航下再次出发试图穿过巽他海峡时，遭遇日本海军第五战队的那智号、羽黑号，第三战队足柄号、妙高号，以及附属的驱逐舰曙号、雷号、山风号、江风号。盟军将本次战斗称为“第二次爪哇海海战”。正午前埃克塞特遭遇正在搜寻荷兰医疗船“Op ten Noort”号的日本驱逐舰曙号，进入炮击战。随后由侦察机引导，带来了第五战队的重巡洋舰那