，他任用侄子别都鲁丁为中书省参知政事。阿合马在位期间主要掌理财政，他以清理户口、推行专卖制度、发行钞票（时称交钞）等方式来增加收入，元征服南宋之后，他又在江南实行发钞和药材限制专卖政策，使元初的财政收入大为增加。但他种种财政措施引起其他大臣不满，武官王着联络僧人高和尚，趁世祖北往上都（今内蒙古境内）时，假传太子之命召唤留守大都的阿合马，然后设计将阿合马刺杀。二人事后被捕杀，但之后众大臣纷纷上书，力言阿合马所为多不法，经忽必烈调查后亦数阿合马之罪，不但没收其家产，杀其党羽，还剖开阿合马之棺椁车裂其尸。