大问题与科技发展布局。拟定与实施上海科技发展的中长期规划和年度计划，推荐上海市创新体系建设。上海市科委还负责实施与编制，基础性与应用性和或开发性科研项目计划、上海市重点实验室、科学研究中心和工程技术研究中心、研发公共服务平台建设规划，负责与推荐中华人民共和国科学技术部在上海的各项工作。 上海市科委的主要工作还包括有，指导张江高新技术产业开发区的业务工作、组织实施与制定科普工作规划、科技经费管理、负责相关科技基金项目与科技人才培训、还负责向中国科学院和中国工程院推荐上海市的院士候选人工作。