C此时已经把PC98系列彻底划归为低端产品。2003年，NEC正式宣布，PC-98系列全面停产、退出市场。自此，日本独特的自主研发PC格式彻底消亡；此后日本生产的个人电脑，全部采用IBM兼容机方案。FreeBSD/pc98 可以在配备有Intel 80386或相容型的PC-9801系列上执行。