穆斯林从十字军手中重夺耶路撒冷，并不时与阿萨辛派交手。不过萨拉丁并未领导库尔德人自己建立王朝，而是在库尔德斯坦之外的埃及建国，因此这样一个被阿拉伯人乃至西方人推崇的库尔德人反倒在自己的民族里没有受到那么多的礼赞。随着蒙古军的到来，库尔德地区又从属于蒙古帝国，而蒙古的第三次西征亦灭亡了阿尤布王朝，库尔德人再度完全由外族统治。后来波斯萨非王朝兴起，库尔德斯坦绝大多数地区又被其所佔据，但由于萨非王朝信奉的是伊斯兰教什叶派而库尔德人则多信奉逊尼派，因此库尔德人受到空前的宗教压迫，恰逢此时同属逊尼派的奥斯曼土耳其