大学获得强大的后盾，包文寻求更多教会组织的支持。除创办金大的基督会、北长老会、美以美会外，1911年，争取到了浸礼会的加入，1917年，南长老会亦加入，金大的经济基础由此得以厚植。1915年，母校西北大学授与包文荣誉法学博士学位。1927年，在南京事件中，金陵大学副校长文怀恩死亡，包文率外籍人员撤离。待事件平息后，包文回到了金陵大学，因中国政府要求各学校不得以外籍人士为校长，他辞去校长一职，由陈裕光接任。他在金陵大学工作至1930年，而后，退休到美国加利福利亚州生活。1936年，陈裕光力邀他再次到金