转到深圳和广州。结果，香港的日本人口从1999年的高峰下降。香港政府统计处在二零零一年只录得14,100名日本人，减幅达33%。然而之后却回升；2004年，日本总领事馆估计有25,600名在香港居住的日本人。日本人在香港大多数居住于跑马地、红磡、沙田、太古城、大埔一带。
对整合的态度.日本人社群在国外被描述为「外国的日本村庄...其居民最重要的关注维持与东京的文化，经济和政治关系」，虽然大部分来港的日本人继续是商人及其家人，但在1990年代期间，日本单身女子的“繁荣”，逃离了以男性