以细胞数目计，拟桿菌属("Bacteroides")是主要微生物种类。黄桿菌纲主要存在于水生环境中，也会在食物中存在。多数黄桿菌纲细菌对人无害，但脑膜脓毒性金黄桿菌("Chryseobacterium meningosepticum")可引起新生儿脑膜炎。黄桿菌纲还有一些嗜冷类群。鞘脂桿菌纲重要类群爲噬胞菌属("Cytophaga")，在海洋细菌中佔有较大比例，可以降解纤维素。