为太子詹事，总摄百揆（实际上的丞相）；加贾疋征西大将军，秦州刺史南阳王司马保为大司马；命荀藩督摄远近，荀组领司隶校尉、行豫州刺史，与荀藩共守开封。十二月，贾疋兵败被杀，众人推始平太守麴允领雍州刺史。同月，阎鼎与京兆太守梁综争权，杀梁综；麴允与抚夷护军索綝、冯翊太守梁肃合兵攻阎鼎，阎鼎出奔被杀。
统治.永嘉七年（313年）晋怀帝于平阳遇害，四月消息传到长安，司马邺为怀帝举哀，于长安即帝位，改元建兴，是为晋愍帝，以卫将军梁芬为司徒，麴允为尚书左仆射、录尚书事，京兆太守索綝为尚书左仆