院中拥有极其特殊与崇高的地位，堪与奈良东大寺齐名，是众多日本佛教徒的朝圣之地。法隆寺的正式名称是法隆学门寺，正如这一正式名称所述，是一处佛教教学的道场。法隆寺宗派在中世称为「三经宗」或「太子宗」。在此以前主要研究的是法相、律、三论等学派。特别是到了鎌仓时代，圣德太子撰述的胜鬘经、维摩经、法华经得注释书「三经义疏」备受推崇、合「三论宗」、「法相宗」、「真言宗」、「律宗」成为四宗兼学之寺。明治五年，太政官布告建议「真言宗」、「净土宗」等大宗派统合，结果法隆寺一度被「真言宗」所辖，法隆寺与兴福寺传统上成为共通