金门人民基本人权与迁徙自由，反对军事政治、战地政务，并且于1992年在民进党征召之下参选立法委员，但仍然落选。1992年11月7日，金马地区解除战地政务。1998年，翁明志参选金门县议员，落选。2000年5月20日陈水扁当选中华民国总统后，翁明志出任福建省政府委员兼秘书长；同年7月1日，民进党金门县党部成立，翁明志出任首届主任委员。2004年底，翁明志再度被民进党征召参选第六届立法委员选举，但也只得到一千余票，落选。2007年，翁明志出任行政院政务顾问。2009年，翁明志出任国立金门大学企管系兼任讲师。