前来招降的妹妹（马红‧莫那）诀别之后，和残余的6名战士一起全部上吊自杀。参与雾社事件的六个部落，共1236人，总计有644人死亡，其中267人被杀、290人自杀，剩余35人投降。
身后.莫那鲁道死后，尸体没有完全腐化，一半变成木乃伊，1933年才被寻获，1934年先是在埔里能高郡役所落成之际被展示，接着送到台北帝国大学（今台湾大学）作为人类学研究的标本，但随即被「借展」。1934年7月1日，在新高新报社举办、警察协会、消防协会协办的「警察展览会」上，莫那的遗骸，第二度被公开展示