从那时到2006年7月担任着总理的职位。
2011年秘鲁总统大选.库琴斯基代表争取变革秘鲁人党参加总统选举。他的对手是基督教人民党，秘鲁人道主义党，国家重建党和秘鲁进步联盟。他在投票中排名第三。2011年6月5日，他的对手奥良塔·乌马拉和藤森惠子进入第二轮。在这个第二轮，奥良塔·乌马拉当选秘鲁总统。
2016年秘鲁总统大选.作为秘鲁人变革党的候选人参加2016年秘鲁大选是库琴斯基第二次参加总统选举。他跟副总统候选人前莫克瓜大区区长马丁·比斯卡拉和第二副总统