S. spixi"则是准噶尔翼龙科的成员。沃尔赫费尔也在1991年将"S. spixi"从桑塔纳翼龙属中移除了，而Kellner与Campos在1992年时认为"S. spixi"是属于古神翼龙科。这些问题一部分是因为在桑塔纳岩层发现的翼龙类与牠们生存于英国的同类之间复杂的分类上，总共包括几个属，如残喙翼龙、古魔翼龙、鸟掌翼龙、阿拉利坡龙、梳颌翼龙、嵴颌翼龙。
古生物学.桑塔纳翼龙被认为是一种大型的翼龙，翼展为2.9至5.7公尺。牠的翅膀可能会比较适合滑翔，而不是振翅飞翔。