转基因食品争议（英语：Genetically modified food controversies）是指关于食用转基因作物及其副产品、在食品生产中利用基因工程技术而非植物配种等方面的争议。这场争议与消费者、生物技术公司、政府管理者、非政府组织和科学家都密切相关。关于基因改造食品的争论核心包括：转基因食品的上市标注、政府管理者的责任、相关科学研究的目的、转基因作物对环境和健康的影响、对害虫之抗药性的影响、对农业生产者的影响和转基因作物对满足全球粮食需求的作用。、、及绿色和平等相关利益团体认为转基因相关的风险