期间，他从团长逐步升为师长，参加了莱芜、孟良崮、开封、济南、淮海、渡江、福州等战役。1949年以后历任处长、副军长兼参谋长、福建省军区司令员。朱耀华是中共九大代表、第六届全国人大代表。曾任中国人民解放军第28军副军长兼参谋长。1955年，授予中国人民解放军少将。曾荣获三级八一勋章、二级独立自由勋章、二级解放勋章和一级红星功勋荣誉章。2009年6月18日在福州病故。