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站厅.新港东站分为南北两个站厅，均位于地下一层。两个站厅及两个月台无论在收费区范围以及非收费区范围均可由两条路轨下方的联络通道前往。车站商店及自助服务方面，新港东站设置了便利店、洗衣店以及面包糕饼店；另外，本站亦提供中国建设银行自动柜员机以及自动售卖机等自助服务。“M-Touch”机，可查询地铁线路、首末班车等资讯以及地铁安全指引的查询，更亦供乘客登记为广州地铁荟会员、查阅奖分、换领奖赏。
月台.本站设有两个侧式月台，位于新港东路地底。Sect