执政党，并且实现中华民国历史上首次和平的政党轮替。考虑到当天蓝营支持者落败的情绪，林义雄在当天确认可以胜选的傍晚立刻召集辅选干部要求党内不得有不礼貌、对立或者责备的行为出现，之后更公开唿吁所有党员高度自制且不能介入冲突。不过在当天晚上民主进步党重要人物施明德致电祝贺林义雄的同时，表示从少年时期推翻中国国民党政权的梦想已经实现、因此将离开民主进步党，对此林义雄则全力慰留之。之后民主进步党籍立法委员陈昭南提案废除台独党纲，但是在民主进步党党内反对声音过大的情况下，刚就任中华民国总统的陈水扁和民主进步党主席林