监攻打高丽国兴化军，没有获胜。回国后，求任用的人在门前排队，萧合卓生活与之前没有不同。圣宗知道他清廉，把皇族之女嫁给萧合卓之子为妻。太平五年（1025年），萧合卓卧病在床。圣宗想要探望他，萧合卓以皇帝见而伤心固辞。十二月，北府宰相萧朴探病，萧合卓抓住他的手说：「吾死，君必为枢密使。慎重不要推举超过自己的人」。萧朴出来后很鄙视他。当日萧合卓去世。其子萧乌古为突吕不部节度使。