为中国远征军副司令长官（司令最初为陈诚，后为卫立煌），兼为中印公路东段警备司令。 1944年5月远征军发动了震惊全球的“滇西缅北战役”。在盟军的配合下，经过六个多月的艰苦战斗，全歼日寇精锐部队五万余人，收复失地两万四千平方公里。1938年黄琪翔夫人郭秀仪与宋美龄、邓颖超等各界知名人士创建并领导了中国战时儿童保育会，拯救、收容和培育了战争难童三万余名。郭秀仪是保育会的常务理事，并担任经济委员会副主任兼征募部副部长。黄琪翔和夫人郭秀仪因在抗战中的功绩，双双荣获抗日战争胜利勋章。黄琪翔并获授青天白日勋章和