国宪法增修条文》第9条规定：「总统为决定国家安全有关大政方针，得设国家安全会议及所属国家安全局，其组织以法律定之。」1991年6月30日，国家建设研究委员会与科学发展指导委员会裁撤。1993年12月30日，立法院三读通过《国家安全会议组织法》，总统李登辉于同日公布该法，国家安全会议完成法制化。1994年7月28日修正之《中华民国宪法增修条文》，将原设置国家安全会议之条文由第9条改列于第2条第5项。1997年修正之《中华民国宪法增修条文》，将原第2条第5项改列于同条第4项。《国家安全会议组织法》明