837年，当时辉格党以压倒优胜获胜，让他丢掉了席位。博伊德很快通过努力再次夺回联邦众议院席位，任期从1839年至1855年。任内，他是美国总统安德鲁·杰克逊的坚定支持者。1845年约翰·泰勒总统期间，在操纵并购德州案中，博伊德在国会扮演了核心角色。1850年妥协案中，尽管主要功劳是亨利·克莱，博伊德也发挥重要作用，促使国会通过妥协案，联邦政府也能以和平方式得以稳定存续。因为他在“1850年妥协案”中的领导地位，次年博伊德当选为美国众议院议长，并任至1855年。1848年，博伊德在党内提名竞选肯塔基州州长