令载客量获得进一步提升（12辆列车的载客量达1,235人）。同时，E1系採用加阔车门，缩短乘客上下车的时间。至于无障碍乘车环境，列车的第8号和第9号车厢设有轮椅升降台。此外，E1系还设有座位电动转向系统，缩短列车的整备时间。E1系的控制系统採用VVVF逆变器搭配可关断晶闸管（GTO），制动系统採用电传操纵空气制动和再生制动并用的设计。两者均是JR东日本在新干线车辆上首次採用的技术。由于E1系编组中动力车比例比其他新干线车辆低，故E1系安装功率较高（每台输出功率达410kW）的电动机（笼形三相诱导电动机）