2年9月2日建交，克罗地亚视印尼为克罗地亚在东盟最大、最有影响力的贸易伙伴以及扩展东南亚市场的门户；印尼亦视克罗地亚为扩展欧盟、巴尔干半岛市场的门户国家。克罗地亚希望借由与印尼的外交关系在2015年加入东盟经济共同体。2011年双边贸易额达6710万美元，2012年下降至3017万美元。除了在经贸上的往来，克罗地亚也积极在技术合作方面加强与印尼的合作关系，发展军事工业；两国间亦有一些大学合作研究项目。