高丽普照国师知讷（1158～1210）将朝鲜禅门九山集大成立曹溪宗，以禅教兼修为宗风。
朝鲜王朝时期.14世纪，李成桂统一朝鲜半岛，国号朝鲜，为李朝。开始排佛崇儒（朱子学），曹溪宗、天台宗、总南宗（总持宗、南山宗）合为禅宗，华严宗、慈恩宗、中神宗（中道宗、神印宗）、始兴宗合为教宗。此后大规模的毁寺开始，出家亦被视为违犯国禁。直至1592年，日本太阁丰臣秀吉倾全国之力入侵朝鲜，禅僧清虚、休静率徒并募僧兵五千人，与中国明朝军队协同作战，佛教稍稍复兴。
近代.