UNIX目录层次保持一致。现在的Linux发行版包含一个codice_4目录作为虚拟文件系统(sysfs，类似于 codice_5，一个procfs)，它存储且允许修改连接到系统的设备，然而许多传统UNIX和类Unix操作系统使用codice_4作为内核代码树的符号链接。一些Linux系统如GoboLinux和Syllable Server使用了和FHS完全不同的文件系统层次组织方法。
历史.开发一套文件系统层次结构标准的进程始于1993年8月，标准努力重整Linux的文件