内第三次进入欧洲冠军联赛决赛，并在温布利球场以2:1战胜同国对手多特蒙德，第5次赢得欧洲冠军奖杯。随后在6月1日举行的2012-13赛季德国杯决赛中，他们又以3:2战胜斯图加特，成为德国首支加冕三冠王的球队。前巴塞罗那主教练何塞普·瓜迪奥拉于2013-14赛季开始接掌拜仁成为主教练，但他率队却在新赛季的首场正式比赛、2013年德国超级杯中以2比4不敌多特蒙德。而在此前，拜仁还激活了马里奥·格策在多特蒙德的3,700万欧元最低解约条款，从而以创德国球员最高纪录的身价将其签入。2013年8月30日，拜仁在布