巴图巴根（，），男，蒙古族，吉林镇赉人，中华人民共和国政治人物。中共第十二届、十三届中央候补委员。
生平.早年毕业于内蒙古乌兰浩特育成学院，后任唿伦贝尔盟独立九团政委。1954年，任中共内蒙古自治区东部区委宣传部副部长。1956年，改任中共内蒙古自治区巴彦淖尔盟委第一书记、书记，中共唿和浩特市委第一书记、市长。1973年，任中共伊克昭盟委第一书记。1982年，任自治区政府副主席。1983年，任自治区副书记。1983年，任自治区人大常委会主任。