100年校庆期间，李嘉诚基金会向北京大学图书馆捐赠1,000万美元，支持新图书馆的建设。1998年8月，同教育部一同启动实施了“长江学者奖励计划”。1999年，李嘉诚基金会捐款4,000万港元予香港公开大学在上环开设教学中心，香港公开大学将设于信德中心的持续及社区教育中心命名为李嘉诚专业进修学院。2004年南亚海啸，李嘉诚透过旗下的和记黄埔及李嘉诚基金会，共捐出300万美元予受灾人士。2005年5月7日，李嘉诚透过李嘉诚基金会向香港大学医学院捐款10亿港元，不限用途，香港大学宣佈于2006年