1990年的全日本综合羽毛球锦标赛上夺得自己第一个女子单打全国冠军。在短期大学毕业后，水井妃佐子于1992年4月加入Fujichu会社（MMG Arrows会社的前身）羽毛球部。
职业赛场.1992年，水井妃佐子代表日本参加在西班牙巴塞罗那举办的1992年夏季奥林匹克运动会羽毛球比赛，在单打项目中进入16强、在双打项目中搭档鸿原春美同样获得16强的成绩。1993年，水井妃佐子在全日本综合羽毛球锦标赛上完成女单三连冠的壮举。1994年，水井妃佐子参加在日本本土广岛举办的亚洲运动会