照, 单倍体人的的基因是3180 Mb 单倍体小麦是16 000 Mb）。多倍性或者多线性可能是这种大规模的细胞DNA内容，但DNA再聚集动力学不支持这一理论。除了不成比例的庞大的基因组，甲藻细胞核在形态、调节、组成上也是独特的。甲藻与其近亲，顶复门，具有不寻常的非常精简的线粒体基因组。顶复门细胞的线粒体基因组只有大约6Kb。甲藻基因组经历了很多重组，包括基因组放大、重组合，导致了每个基因或基因片段的多个拷贝或多个组合。失去了标准的停止密码子与cox3的mRNA的转结合部分，大多数基因的大量RNA编