历史.寺院建于1433年。曾经多次因为大火而被烧毁的记录。此本能寺与原址不同，近年在一所旧学校附近（堀川高等学校）发现可能是本能寺原址的遗留建筑。1582年，日本史上的重要事件本能寺之变发生，明智光秀兵变杀害了其主君织田信长、织田信忠父子，并火烧本能寺。经此一役后，本能寺并没有在原址重建，目前的本能寺建在京都京都市役所前站附近。