同年12月，许世英内阁成立，沈瑞麟辞去外交总长。1927年（民国16年）6月，任潘复内阁内务总长（北洋政府最后一位内务总长）。翌年，兼任督办京都市政事宜。北洋政府倒台后的1929年（民国17年），任中东铁路理事兼东北边防司令长官公署参议。1932年（大同1年）满洲国成立，沈瑞麟任北满铁路首席理事。1933年（大同2年），任满洲国执政府中令。溥仪即皇帝位的1934年（康德1年）3月，任宫内府大臣。1935年（康德2年）1月，任参议府参议、祭祀府副总裁。1940年（康德7年）5月，被免去参议府参议之职。