方的卫吉岛採集到，该地也是这种鸭种小名的来源，但该岛并非现在花纹鸭的分布范围，有学者认为原始的标签不精确，而怀疑真实採集地点应是新几内亚岛上的多贝拉伊半岛山区。原本花纹鸭与南美洲的和纽西兰的一起被归入湍鸭族（Merganettini），它们被认为与秋沙鸭和较为接近，1940年代恩斯特·瓦尔特·迈尔根据解剖特征将花纹鸭归入属于钻水鸭的鸭属中，不过后续又有研究将花纹鸭移回独立的花纹鸭属中。花纹鸭在演化上自成一个孤立的支序，尚不知哪些物种与其关系较近。
生态.现时花纹鸭只分布在新几内