988年，担任以色列内政部部长。1990年，兼任以色列财政部部长。1990年3月15日因工党与利库德集团出现政治分歧，工党退出大联合政府，沙米尔组成的联合政府在不信任投票中落败，虽然在不信任投票中落败，但在佩雷斯领导的工党组阁失败后，沙米尔迅即与其他右派政党组成联合政府，当时被认为是以色列历来最为右翼的联合政府之一。
去世.2012年6月30日晚，伊扎克·沙米尔在特拉维夫去世，终年96岁。遗体葬于耶路撒冷的赫茨尔山。