隶属于苗栗一堡。该庄西北临台湾海崃，东北与外埔庄为邻，东南与大山脚庄为邻，西南边隔后龙溪与公司藔庄为界。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于苗栗厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄改隶属于新竹厅。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制并雅化为「水尾子」大字，隶属于新竹州竹南郡后龙庄。战后后龙庄改制为后龙乡，隶属于新竹县，大字亦改制为村。1950年桃、竹、苗分治，后龙乡改隶属于苗栗县。1951年，后龙乡升格为后龙镇，村改制为里