运设备移转工程延误，货物列车仍持续行驶地面线路。高架货物设备第1期工程（西侧货物装卸场）于1928年（昭和3年）4月1日、第2期工程（东侧货物装卸场）于1932年（昭和7年）7月1日完成，同时废止地面货物线，货物列车移至高架。同日，总武本线御茶之水 -两国区间开通，本站成为三层立体高架站。此时，车站西半部为客运站，东半部为货运站。因此现在车站北侧（藏前桥通附近）线路在进站前稍微东偏。高架货物月台共有2面，全长180公尺，宽9 - 12公尺，设有电梯24台、斜坡等。货车在替换后，会经由常磐线日暮里站