子、贵族和使节等达数万人。元末至正十七年(1357年)，波斯义兵万户赛甫丁和阿迷里丁占据泉州，酿起亦思巴奚兵乱，持续五年未息。至正二十二年（1362年），色目人那兀纳夺取亦思巴奚军领导权，又据泉州叛乱，到至正二十六年（1366年）才被效忠元朝的军阀陈友定平息。这次兵乱前后达十年之久，泉州社会因此受到极大破坏，经济开始衰败。
明、清.明初，明朝政府改泉州路为泉州府。明时设立兴泉道，驻泉州，设兴泉兵备一员，分巡兴泉道兼分理军务。清代因之，管辖泉州府、兴化府。康熙九年（永历二十四年，