代理文学院院长职务。1946年末，国立台湾大学校长陆志鸿想请魏建功做教授兼文学院院长，魏没有应允。1947年4月，魏建功应陆校长聘，兼任文学系中国文学特约教授。到这时台大文学系还是没有主任，第1任台湾省主席魏道明5月16日裁撤编译馆，原馆长许寿裳同时转任台大中国文学教授兼文学系主任（实际的第1位文学系主任）。1948年2月18日晚上，沉睡中的许寿裳在白色恐怖大环境下的台北市被神秘兇手用刀斧砍死在卧室里；魏建功在同年6月学期结束后请辞特约教授兼职，不久永远离开台湾，9月1日新学期开学后已经转任