全国抵抗军的最高统帅。莫伊领导的肯尼亚政府，起初怀疑全国抵抗运动政府支持该国的异见组织。1987年下半年，两军更在边城布西亚对峙，这时肯、乌两国的紧张关系达到顶点。如果肯尼亚关闭边境，乌干达的经济将会受到严重损害，因为作为内陆国家的乌干达需要使用肯尼亚蒙巴萨的港口进出印度洋。在对抗奥博特期间，全国抵抗军不论国籍招募任何愿意战斗的人。许多居于乌干达的卢旺达流亡者曾受到奥博特政权的迫害，这促使他们加入全国抵抗军的编制。穆塞韦尼掌权后数年，乌干达武装部队的发薪名单中仍有几千名卢旺达人。1990年9月30日夜晚