穆尔祜又设置埋伏于山隘，大顺军自山上来袭，穆尔祜击退敌军因而在其后恢复宗室资格，封为三等镇国将军，顺治三年（1646年），进封为一等镇国将军。跟从多铎战胜苏尼特部腾机思等。顺治四年（1647年），进封为辅国公。顺治六年（1649年），跟从叔父尼堪击败叛将姜瓖，进封为贝子。再跟从尼堪征讨湖南，被赐蟒衣、鞍马、弓矢。大军进至衡州，敬谨亲王尼堪战殁。顺治九年（1652年）七月，议论前罪，革去固山贝子。顺治十一年（1654）十二月二十二日申时，年38岁逝世。其子长源，被授镇国将军品级。子孙递降至云骑尉品级，爵位