。三磷酸化物能抑制病毒DNA聚合酶，从而影响病毒在细胞内的复制。喷昔洛韦的选择性可能来自于两个原因。首先是在正常细胞中，喷昔洛韦磷酸化速度显着低于病毒感染细胞，所以在病毒感染细胞内，三磷酸化产物含量显着高于未感染细胞。三磷酸化产物与病毒DNA聚合酶的亲和性显着高于人DNA聚合酶。喷昔洛韦的结构和作用机理与其他核苷酸类似物相似。喷昔洛韦与阿昔洛韦的不同在于，喷昔洛韦的三磷酸活化产物在细胞内存在时间更长，所以喷昔洛韦细胞内浓度更高。
不良反应.未见全身不良反应，偶见用药局部灼热感，