隧道巴士空调化计划展开，在2000年9月开始实行，首条改为全空调服务的全非空调城隧巴士线为线，整项计划随线在2001年6月10日改为全空调服务告一段落。九巴在过渡期间推出票价优惠，所有转车客只须缴付非空调巴士的票价，无须补付空调巴士较高昂的车资（往沙田或荃葵青免费、往马鞍山付$0.7、往大埔付$1.4）。九巴同时加密城隧巴士班次，并将有关车队数目将由原有130辆增至超过160辆。
重大事故.1991年6月23日，一批匪徒在大埔打劫金行后劫持两架的士逃走，至城门隧道沙田入口被警员截停