下出口共有30组之多，无法按原有字母编号排序，因此福田地铁站是深圳地铁站少数以数字为出口编号的，配合福田高铁站出入口排序规格。福田综合交通枢纽（包括地铁福田站以及国铁福田站等）总共有36个出入口，其中1-14号出口在深南大道南侧。目前配合地铁及广深港高速铁路运营，开通使用的出入口已有超过12个。17－27号出口位于深南大道以北的益田路下方，为远期规划出口，并将设有地下商业设施。
车站模型.车站放置了福田综合交通枢纽及深圳地铁3号线一期的模型，分别在近29a出口及近31号出口