BCKA(branched-chain α-keto acid decarboxylase)对这些引子前驱物进行去羧化，则可以经由与大肠桿菌合成饱和直链脂肪酸类似的路径去合成支链脂肪酸。这条反应路径的产物是一群碳数为12到17的脂肪酸。其脂肪酸种类惠依照细菌种类而定(不同的细菌会依此路径合成不同脂肪酸)，故也可以依此分类细菌。BCKA脱羧酶与相对应的α-酮酸BCKA是一个由两个次单元(AB)所组成的四聚体酵素，为合成支链脂肪酸所必需的酵素之一。BCKA的功能主要是将α-酮酸去羧化，这项功能在支链脂肪酸