越翡翠水库集水区，但在雪山隧道开工后发现问题，为了避开水源地问题，路线东移计划：2014年4月22日铁工局决定採用新的方案二，工期预计为十年，完工后移转给台铁经营。预期可缩短北部与东部往来的时间，台北＝宜兰行车时间将缩为47分钟。但台北市市长柯文哲当选后，重新提出最短路线方案，如果翡翠水库的环保问题是可以解决，仍不放弃争取，其方案南港－头城间36.3公里，以3座长隧道连接，台北－宜兰间行车时间可望缩短至39分钟。（目前台铁倾斜式列车行车时间约1小时5分）2019年7月24日交通部铁道局召开「台