开发当初称为松庵新田，正德、享保期成立松庵村。1889年（明治22年）为高井户村大字。1932年（昭和7年）分为杉并区松庵北町、松庵南町。1969年（昭和44年）两町与西高井户一、二丁目合併成立松庵一～三丁目。
地名由来.来自江户时代指导开拓此地的医师荻野松庵。也有说是来自圆光寺的住持。
备註.※吉祥寺东町仅一点连接。