三区革命政权的人犯成批屠杀，第一次杀十六人，其中包括阿巴索夫的弟弟斯依提·阿巴索夫（Siyiti Abbas），第二次杀十二人，其中包括着名的维吾尔族诗人鲁特甫拉·穆塔里甫。9月中旬，阿巴索夫重新包围阿克苏，这次有苏联顾问纳斯洛夫（Nasyrov）及艾力汗·吐烈之子的增援。但经过数周无望的战斗后，民族军在10月6日被迫撤走。6天之后，临时政府与国民政府中央在迪化开始和谈。1946年2月，双方签订了《和平条款》。
联合政府时期.1946年，具有共产主义思想的领导人取得了“三区革命”的