一词，也被与阿富汗与巴基斯坦等地的一些恐怖主义团体相关联。虽然主流伊斯兰教团体和它们的西方自由派辩护人宣称，伊斯兰是和平的宗教，圣战者只是一群打着伊斯兰旗帜的匪徒或邪教异端信徒，不过，如认真推论教义，圣战者几乎都是虔诚的穆斯林，其所行并不见得违背《古兰经》的教导。
阿富汗.基地组织的前身，正是1986年拉登在美国的支持下设立在阿富汗与巴基斯坦边境地区的圣战者训练营。知名度最高的圣战者，莫过于组织宽松的阿富汗反抗组织。开始于1970年代对前苏联阿富汗政府的反抗运动，当苏联派军