蒂被法西斯分子刺杀后，佩尔蒂尼更加致力于对抗极权主义政权。1926年，他被判处拘留，但设法躲藏起来。其后组织和陪同统一社会党重要人物菲利波·图拉蒂逃到法国，在那里当泥水匠为生。1926年回到意大利，在比萨被捕，并被判处十年监禁。1935年，他被囚禁在圣斯特凡诺岛，伊特鲁里亚海上的一个岛屿。在那里，他保护了着名记者安东尼奥·葛兰西的日记。贝尼托·墨索里尼被捕后一个月他被释放，加入了意大利抵抗运动，反对纳粹德国占领者和墨索里尼的新政权——意大利社会共和国。不久被德国人捕获，被判处死刑，后由党内派人突袭而获救