泌的物质组成，直到菌丝团开始分解之后，表面介质才开始出现纤维素与果胶，这可能表示菌丝感染的初期会释放溶解酶以分解纤维素与果胶，甚至将其吸收，直到菌丝团开始崩解后才停止。有些的真菌原本就有形成的能力，形成兰菌根时，也可在菌丝团中形成菌核，其菌丝膨大并累积蛋白质与肝糖等营养物质，目前尚不知兰花是否有机制刺激菌核的形成，以提升真菌对其的营养价值。兰菌根中，真菌进入兰花的机制又可细分为tolypophagy与ptyophagy两种，大多数兰菌根都属于前者，即菌丝形成卷曲状的菌丝团后再被分解，天麻属等少数绝对菌异