是其中的一个最大子类。所有的鳞状细胞肿瘤均来自于癌症干细胞的大量失控地复制，鳞状细胞癌由干细胞而生，并且生存在身体的很多区域。这类癌细胞的聚集使得科学家能够聚焦于某一特定的组织，确定其祖细胞的位置。这些被称之为鳞状细胞原位癌，这类诊断确定肿瘤仍然未穿透基底膜或结构，去侵占其他毗连组织。一旦癌细胞恶化增长并渗透、穿过及破坏连组织，其被称为“侵略性的”鳞状细胞癌。一旦肿瘤开始具备侵略性，它即能侵占其他组织，并引起肿瘤转移。
原发位置.（ICD-O）系统陈列地一类形态学子类及恶性鳞状细胞