1562年，疯堂、花王堂和风顺堂的小教堂建成，成为天主教在澳门最早教堂，隶属于马六甲教区。1576年1月23日，教宗额我略十三世下令成立澳门教区，为东亚第一个成立的教区。澳门教区成立之时，因东亚尚属新宣教的区域，已成立的教区不多，故管辖范围曾广至包括中国、日本、越南以及南洋诸岛（菲律宾除外）。其后天主教会由澳门向外派遣传教人员，各地逐渐升格为宗座代牧区或教区，1981年后迄今之涵盖范围仅澳门全境。澳门教区原属（即果阿总主教）管辖之下，当时果阿与澳门同为葡萄牙殖民地。1961年果阿併入印度后，澳门教区