。由于有报道说外科手术会损害性功能和性感觉，并造成终身健康问题，因此性别指定手术的历史已经引起争议。在婴儿期、青春期和成人年龄进行手术的时间、证据、必要性和适应症一直存在争议，也连带涉及同意问题。对双性人婴儿和儿童的性别干预越来越被认为是人权问题。双性人组织和人权机构越来越质疑这种干预措施的基础和必要性。2011年，ChristianeVölling赢得了首例针对外科医生进行非自愿手术干预的成功判例。2015年，欧洲委员会第一次承认双性人拥有不接受性别指定治疗的权利，马耳他成为第一个禁止非自愿或强迫改变