人民共和国成立之后，任燃料工业部副部长。1950年之后调任东北。1952年升任天津市市长，1955年又升任吉林省第一书记。1952年至1957年，吴德曾兼任天津大学校长。
文化大革命时期.1966年，文化大革命开始，毛泽东认为北京市市委不配合其发动文革，是“针插不进、水泼不进的独立王国”，将北京市和北京军区的主要领导打成“彭、罗、陆、杨反党集团”。6月4日，吴德被任命为北京市委第二书记。7月23日，毛泽东批评北京市委压制学生运动，要求北京市立即撤回派驻各高校的工作组。7月29日