教署求助下紧急增援，又派遣机动部队及施放催泪弹平息场面。骚乱最后在翌日凌晨才结束，造成13名越籍犯人及20名本地犯人受伤，另有24名惩教署职员及8名警察受伤，54名犯人事后也被控暴动等不同罪名，戒毒所内越籍人囚仓及多处营房亦遭破坏，署方需花费1,200万港元修复。惩教署其后成立调查委员会，并在同年11月提出27项建议，包括对部分职员作纪律处分及予以警告，并将涉事犯人隔离囚禁及加强戒毒所保安。自2001年起，惩教署在喜灵洲推行「绿岛计划」，安排学生、青少年、社工及老师等探访岛上犯人，并参观由犯人和职员合作