后再度进入硬地赛，加拿大大师赛(罗杰斯盃)，费德勒打进了决赛，受伤病困扰，以3:6、4:6败给了亚历山大·兹维列夫。随后费德勒选择退出辛辛那堤大师赛以准备美网赛事。在美网，于半决赛以1:3负于下半年状况爆发的胡安·马丁·德尔波特罗。随后，费德勒于上海大师赛决赛再度与纳达尔交手，并以6:4和6:3直落二盘击败纳达尔，达成首度生涯费纳决五连胜，并于瑞士巴塞尔公开赛决赛以6:7、6:4、6:3击败了胡安·马丁·德尔波特罗，第八度举起冠军杯，同时也是其生涯第95座ATP冠军奖杯，超越前辈伊凡·蓝道独居公开赛时代