到1990年代，随着香港工业北移，屯门工业区同为货仓多而工厂少，市民大都是坐长途的车程往市区上班，徧离「自给自足」的原意。蝴蝶湾以西至稔湾一带为「特殊工业区」、物流业、回收业、废物处理、堆填区、发电厂等都在这一带。其中最大的乃屯门内河码头，位于屯门龙鼓滩，不但让各物流公司进驻，更设有大型货柜场，方便接驳珠江三角洲的内河货运往来。此外香港最大的英泥制造商、中华电力的青山发电厂、龙鼓滩发电厂，以及香港唯一一个环保园也坐落此区。小冷水堆填区、望后石谷堆填区、新界西堆填区、垃圾处理设施、污泥处理设施、都在这一带