助郑氏与莫朝长期交战，以取得郑氏信任。莫朝在1592年被郑主击溃后，虽然阮潢表示效忠于后黎朝朝廷，但控制后黎朝及越南北部的郑主对阮潢渐有戒心，更一度强留阮潢在北方，但1600年，阮潢成功离开北方返回广南，与郑氏逐渐交恶。1620年，阮氏宗亲阮福洽和阮福泽与郑氏政权内通，可是阴谋被揭发，阮福洽、阮福泽被擒，郑主只好退兵，于是阮福源正式拒绝将赋税交予河内朝廷。一份要求阮氏臣服于朝廷权威的正式谕令，也被阮福源拒绝。
名称由来.阮主自称「大越国阮主」，仍名义上以后黎朝皇帝为君主，故而阮