DSi，同时不再支持多人模式。主角玛丽医生在2001年格斗游戏《任天堂明星大乱斗DX》作为隐藏角色登场，并通过投掷胶囊来攻击对方。而续作《任天堂明星大乱斗X》中选入并改编了《马里奥医生》初版的背景音乐“发烧”和另一版的音乐“发冷”，改编者是原Data East音乐工作组“魔法气泡”的作曲岩崎政明。在用瓦里奥替换马里奥系列人物的Game Boy Advance游戏《瓦里奥制造》中，收录了一个未上锁小游戏《瓦里奥医生》。任天堂DS游戏《更多大人的DS脑力锻鍊》以“杀毒者”为名收录了一个精简版的《马里奥医