峰间隔3.25分钟，周末高峰时段间隔4分30秒，平峰时段间隔7分钟，周末新秀站往赤湾的尾班车将延长至23:08开出。2018年10月30日起，在早高峰时间设有湾厦站至新秀站区间列车服务，以大小交路形式运作，即一班大交路列车后是一班小交路列车，在湾厦站至新秀站间隔为3分钟，而赤湾站至湾厦站间隔则为6分钟。
车站及接驳路线.2号线车站以白色为主调，令车站显得简洁大方。每个车站站厅设有大型玻璃壁画，为二期中特有，并在此后的深圳地铁新开路线里得以推广。此外全线车站的灯饰均采用LED