丹麦钖尔克堡举办的世界青年锦标赛获得女子单打亚军，为印度选手在世青赛的第一面奖牌。1997年，阿帕娜获得生涯第一座印度全国羽毛球锦标赛冠军，并且在此后八年卫冕成功。1998年，她在法国公开赛女单决赛以11-8、11-4击败德国选手，并在同一年于马来西亚吉隆坡举办的大英国协运动会赢得女子单打银牌。为了加强自己的能力，阿帕娜在2001年前往印度体育局训练中心接受训练。隔年的大英国协运动会，阿帕娜在女单项目再次为印度夺下一枚铜牌。2006年，阿帕娜·波帕特因为腕部伤痛的问题，在该年赢得印度全国冠军后宣布退役，