兼省委第一书记。在此期间，他发现并宣扬了毛远新。1969年，在中共九大上，陈锡联进入中共中央政治局。1973年12月，陈锡联与李德生对调，任北京军区司令员。在任上，他秉承毛泽东的意思，整顿北京军区、北京卫戍区，大力清洗原来的部众，其中消除了郑维山、聂荣臻的双重势力，也因此与聂荣臻有隙，才有了后来的陈锡联的 “西山事件”。1974年1月，陈锡联成为负责处理中共中央军委日常工作的军委六人小组成员。1975年1月，第四届全国人民代表大会第一次会议任命陈锡联为国务院副总理，后又任中共中央军委常务委员。1976年