株的病人噬菌体治疗现时主要用于无法以传统抗生素治疗的细菌感染，尤其于俄罗斯和格鲁吉亚。波兰弗罗茨瓦夫亦设有一个噬菌体治疗单位，于2005年成立，是欧盟国家唯一的此类中心。现时噬菌体在西方国家成为重新引起临床注意的议题，包括美国。2019年，美国食品药品监督管理局批准了境内首个静脉噬菌体治疗的临床试验。噬菌体治疗无论在人类药物、牙科、兽医科学和农业都有许多潜在的用途。若噬菌体治疗的目标宿主并非动物，通常使用生物防治（以噬菌体作细菌的生物控制）一词代替。