未能继续卫冕男双冠军。同期12月，他与卡斯腾·摩根森出战哥本哈根羽毛球大师赛，在男双决赛以2比0（21-8、21-14）击败了队友的马德斯·康拉德-彼德森/马德斯·皮勒尔·科尔丁，赢得男双冠军。2014年1月，玛蒂亚斯·鲍伊与卡斯腾·摩根森出战韩国羽毛球超级赛，在男双决赛以2比0（21-12、21-17）击败了中国的傅海峰/洪炜，赢得超级赛男双冠军。同年2月，他代表丹麦参加瑞士巴塞尔举办的欧洲男子羽毛球团体锦标赛，助球队赢得男子团体冠军。同年3月，他与卡斯腾·摩根森出战瑞士羽毛球黄金大奖赛，在男双准决赛