祖仁波切于联合国世界文化遗产─摩诃菩提寺（正觉寺）附近，兴建「菩提迦耶白玉南卓林寺」，提供僧众佛学教育，祈愿世界和平与安乐。寺名中之菩提迦耶，乃佛陀成道之圣地。白玉南卓林寺至今于台湾、香港、新加玻、澳门、马来西亚、菲律宾、尼泊尔、美国、加拿大、英国、德国、法国、瑞士建立佛法中心，弘扬佛法，利乐一切有缘的众生。