海月水母有大量的天敌，包括翻车鱼、棱皮龟、钵水母纲的"Phacellophora camtschatica"及非常大型的维多利亚多管发光水母。海月水母也会被海鸟所掠食。海月水母生存及繁殖了几个月后就会自然死亡。在野外很少会活多于6个月，但也有一些在水族箱的可以生存达数年。于夏末时的暖流会令它们的食物量下降，导致其组织再生率也同时下降，此时它们特别容易受到细菌感染。另外，季节性的繁殖亦令它们打开生殖腺而受到感染。一些寄生虫也会攻击海月水母。