26年北伐战争爆发，同年12月川军刘湘部改编为国民革命军第二十一军，车耀先任四师十团团长兼国民党党代表，同时一批中共地下党员到其中做兵运工作，车耀先深受影响，开始接触中国共产党。1927年2月，刘湘与蒋介石合作，制造三·三一惨案，杀害了中共重庆地委书记杨闇公等，车耀先厌恶清党，愤而离开川军。1928年2月，车耀先以四川基督教代表身份到达上海参加“基督教东亚协会”，在会上他发言道：“基督教本是好的，可是他的光辉已为外国的大炮军舰所遮蔽了”。中国、朝鲜、日本代表提出的主张收回教权、教产意见，受到白人传教士反对而