行政长官公署组织条例》也于1972年公告停止适用，2003年废止；但直到2005年10月行政院主计处（今行政院主计总处）主管之「中华民国各省（市）县（市）行政区域代码」公告停止适用后，其建制才正式撤销。另外，原由海南特别行政区管辖之东沙群岛、西沙群岛、中沙群岛及南沙群岛等南海诸岛屿（目前中华民国仅有效控制东沙群岛全境与南沙之太平岛及中洲礁）则于1990年后划归高雄市旗津区代管至今。
地方.中华民国政府在1949年12月迁台前，共设置了西藏地方及蒙古地方两个地方。虽然名义上领有西藏及