0-90％的病例在手术过后会有病毒复发的情形。肝脏移植造成10-30％的病人在五年内罹患肝硬化。但在术后若接受长效型干扰素和瑞比达（ribavirin）等药物治疗能将病毒复发的可能性减低到70%。
替代医学.奶蓟草、人蔘和这些替代医学或中医被各自的拥护者认为有助于丙型肝炎的治疗，然而，没有任一另类疗法显示能改善丙级肝炎的症状，亦无任何证据证明替代医学能对丙级肝炎病毒有任何作用。
预后.治疗成效以持续性病毒学反应（SVR）测量，定义为疗程停止至少24週后，血