，安平驻军士气低落，10月20日，在安平海关税务司主管麦嘉林（C. J. McCollum）劝告下交出武器装备，收藏于海关鸦片仓库准备投降。次日（10月21日），日军少将率军进入台南府城，而海军常备舰队有地中将于清晨则派部队于四鲲鯓附近登陆，之后佔领二鲲鯓砲台（亿载金城），进入安平市街。10月23日，因运输船「旅顺号」在前往香港修理的路上刚好途经安平，日军利用该船搭载安平一带5千多人的俘虏遣返到金门。而后该年10月27日创立台南民政支部安平出张所，所长是西乡菊次郎，而开始运作则是在11月1日。安平出张所的职