华永会计师事务所有限公司将对壹基金善款的使用进行审计。同时每一季度公布季报、每一年度公布年报，向公众详细介绍壹基金的善款募集和使用情况，诚邀媒体以及社会公众共同监督。
理事会.壹基金理事会11人构成，为：冯仑、李连杰、柳传志、马化腾、马蔚华、马云、牛根生、王石、杨鹏、周惟彦、周其仁 。理事长为马蔚华。
争议.
与中国红十字会的关联.壹基金英文官网Donation（捐助）页面曾经有壹基金收到的钱都要打入中国红十字会账户的描述，但这些文