称大许皇帝，封宇文士及为蜀王，宇文化及再遭李神通攻击退至聊城，宇文士及和封德彝前去济北征督军粮，619年春，窦建德攻克聊城，擒斩宇文化及、宇文智及和宇文禅师。宇文士及的属下建议主帅趁虚夺取窦建德在河北的领地，但宇文士及未同意并和封德彝一起降唐。唐高祖李渊责备其不来早降，惟在涿郡、汾阴宫时宇文士及和李渊就是一起谈论天下事的密友，且宇文士及的妹妹是唐高祖的宠妃宇文昭仪，故仍授宇文士及仪同。后宇文士及跟随秦王李世民讨伐刘武周，因战功复封隋末爵位新城县公，娶寿光县主为妻。620年到621年，跟随秦王李世民讨伐王