以「不合体制」为由，所请事项一律不准。
晚年经历.1795年，马戛尔尼作为密使出访撒丁王国，商谈反法同盟事宜，之后他再次被封为“马戛尔尼男爵”，不过这次是作为大不列颠贵族受封。1796年底，他被任命为好望角总督，统治新获得的开普殖民地。1798年11月，他因健康原因辞职。1806年逝世。
其他.其后裔简·马戛尔尼（Jane Macartney，中文名马珍）于2008年5月开始为《泰晤士报》驻北京特派记者，汶川大地震之际做了许多相关报道。