佩希奇的球队能够以3比0的总比分横扫首都球队。至半决赛，拜仁慕尼黑与卫冕冠军进行激烈对决，最终以总比分2比3惜败。对于2013-14赛季，俱乐部再次获得ULEB发放的外卡，有权利参加欧洲俱乐部的最高级别赛事——欧洲篮球联赛。经过在淘汰赛相继击败、、马拉加和之后，拜仁篮球队历史上首次入围这项赛事的十六强。凭借总共5场胜利——其中包括体面的在主场以85:83击败上届亚军及当届后来的冠军得主皇家马德里，球队尽管仅列分组第六遭到淘汰，却创造了德国篮球俱乐部在这项赛事中新的胜场纪录。与上季一样，拜仁慕尼黑进入了联