其中约80种是新几内亚岛的特有鸟类。公园所在地区的鱼类多样性也很丰富，总共发现的111种鱼类大部分来自瓦苏尔国家公园。这里的常见物种包括小袋鼠、南方鹤鸵、蓝凤冠鸠、大极乐鸟、王风鸟、红极乐鸟、新畿内亚鳄和湾鳄。 瓦苏尔国家公园还是许多稀有物种和特有物种的栖息地。其濒危物种包括紫胸凤冠鸠和小杓鹬等。这里有3种弗莱河特有鸟类，包括和灰冠文鸟。1928年，荷兰人将一些鬣鹿带入巴布亚的马老奇。随后，该物种在巴布亚南部沿海大片区域泛滥。这次生物入侵导致公园内沼泽草地大量减少，间接影响了澳洲鹈鹕和鹊鹅等动物