湾西半部AQI大于100日数，以北部、桃竹苗较佳，介于23~64日；中部地区次之，介于69~84日；南投、云嘉南则有97~120日，高屏地区则有100~160日，其中最差3区分别为左营、潮州及大寮，都在142日以上。高雄市左营区、云林县崙背、屏东县屏东市为2016年全台最频繁触及PM2.5红色警戒的地方。
北部.北部地区的空气污染源，主要来自都会区庞大的汽机车废气的细悬浮微粒 (PM2.5)。
离岛、东部.金门、马祖等离岛地区的空气污染主要来自中国大陆