入伙，城巴应区议员要求，将90A线于1998年11月16日转为全日服务，编号改为90C。由于附近小巴当道，该线于2002年1月28日，改为只在平日早上单向由鸭脷洲大街开往中环。N90线是通宵巴士路线之一，于1994年8月25日开办，初期总站设于中环交易广场，后来在1997年4月21日迁往上环港澳码头。该线提供八达通转乘优惠，乘客可免费转乘城巴N72线，或补付数元乘搭N11、N962及N969线。除此之外，与90系其他路线不同的是，N90线还途经利东邨，以方便居民。
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