于1987年2月建筑城门隧道公路时收回，其时绝大部份博雅山庄的建筑物均被拆卸，使博雅山庄一分为二。而余下未被清拆的私人园林（池塘、龙津阁）部分，后来被新鸿基地产收购（原拟发展为晓翠山庄后续期数），于2004年完成补地价，并于2005-06年清拆，重建为壹号云顶第一及第三期。
场景.邓丽君曾以古装打扮于博雅山庄内取景拍摄虞美人（又名：几多愁）MV，片中可见现今残余城楼部份。
现况.现时，博雅山庄只残余其城楼部分。沙田民政事务处在2004年8月竣工建成地台及加