二年（绍兴二十年，1150年），巨野因河水淹没而废县，州治迁至任城。袭庆府于金朝时复降为兖州，辖滋阳、曲阜、泗水、宁阳，而邹县割与滕州。
元.元太宗七年（宋理宗端平二年，1235年）济州割属东平府。至元六年（1269年），复立巨野县，并迁州治到此。至元八年（1271年），升济州为济宁府，治任城，不久迁回巨野。十二年（1275年）以任城当江淮水陆要冲，废县复立济州，属济宁府。二十三年（1286年）复立任城县隶属济州。至元十六年（1279年）升济宁府为济宁路，辖巨野、金乡等7县