张感而采纳。不久调京任工部都水司主事，督理易州厂务，抗疏请革惜薪司中官常例以甦商困。坐谴，补德州同知。后升兵部职方司员外郎，上《筹边策》，为台臣所攻，降茶陵州同知。吏部察其诬，转顺天府制，移户部主事。万历十年（1582年），张居正死。神宗迷信炼丹，道师张国祥，威势显赫，位在六卿之右。许乃上疏请求崇正学，斥邪道，以“忤旨”罪被免职回乡。
着作.万历十三年（1585年，许协助知县沈尧中编成《南陵县志》16卷付印。一生着述，大都散失，其中《襟日楼草》、《寓理千言》，《省志》有着录。《南陵小