南馆位于长巷头条路北，南馆的后门隔长巷二条与北馆相对。北馆建于明朝万历十五年（1587年），也有说法称建于明朝弘治年间。南馆兴建时间较晚，大约建于清朝干隆年间。北馆有六个院落，房屋50多间。中院为主院，正厅面阔五间，是供奉天后娘娘的祠堂。正厅全部采用江南出产的杉木建成。房顶覆盖台瓦，平缓起坡，前出廊，后出厦。正厅的装饰非常考究，房椽头全部雕出象鼻状，粱头雕有神牛、天马等动物纹图案，门窗全部用雕花格子组成，这些雕工十分精细，动物形象生动逼真，花卉图案也玲珑剔透。其他院落的房屋也做工细致，和正院浑然一体。