立独立于国教的自治教会，不赞成设立统管各教会的上级领导机构（教区制度），仅允许设立各教会自由参加的联谊性机构。全体信徒对教会事务行使平等权力，民主选举执事，聘任牧师。发展不久，便形成称为公理会的新宗派。
美国.当时的英国女王伊丽莎白一世迫害非国教派别，罗伯特·布朗被囚禁，不少公理会成员逃亡荷兰。1620年，102名流亡者乘五月花号帆船抵达北美新英格兰地区。其后，新英格兰地区建立了6个以公理会为官方宗教的殖民地，分别是在麻省、康涅狄格、新罕布夏、佛蒙特、缅因、罗得岛。进入20世纪