平安时代末期成为公卿近卫家的庄园。室町时代成为倭寇和遣明船的港口，此时日本对中国大陆、琉球以及南洋的贸易开始频繁。此时期原先的一乘院大大地繁荣，并成为岛津氏对中国和琉球贸易的根据地。中国明代的《武备志》中，把坊津、安浓津和博多津并称为「日本三津」。文禄3年（1594年），触怒后阳成天皇的公卿近卫信辅被流放此地并度过了三年时间。江户时代以后主要贸易港口移到了长崎，坊津港的地位衰退。萨摩藩历代藩主和家老调所广乡等人重视走私贸易，将坊津港划为鹿儿岛城下的直辖地，因此保持了对外贸易的地位。但享保年间突如其