替罗纳尔多的位置。在2002/03赛季，国际米兰在联赛中表现不佳，以较大分差落后于尤文图斯屈居亚军。而在欧冠赛场上，国际米兰一路闯入了四强，但在半决赛负于AC米兰。2003/04赛季，卡纳瓦罗遭遇伤病困扰，联赛仅仅出场22次，国际米兰也只得了联赛第四名，欧冠小组赛就宣告出局。2004年夏天，卡纳瓦罗的国米生涯宣告结束，他被球队以1000万欧元的低价卖到了尤文图斯。卡纳瓦罗在国际米兰的两个赛季联赛总共出场50次打进两球，而这两年是卡纳瓦罗职业生涯的低谷期，国米也成为了他最不喜欢的球队。