萨达姆就任总统时，任命易卜拉欣为复兴党地区领导机构副书记、革命指挥委员会副主席。革命指挥委员会副主席在非常场合可代行主席和伊拉克总统职务，事实上是萨达姆政权的第二号人物。作为副主席的他，曾参与对1980年两伊战争初期的入侵伊朗军事行动、1990年的侵略科威特的决定。1980年代末，担任复兴党北部局副书记的易卜拉欣指挥了镇压库尔德人的军事行动，曾有屠杀大量库尔德人的报导。1991年海湾战争期间，攻打沙特阿拉伯的的提议也是由易卜拉欣提出来的。海湾战争后，易卜拉欣被任命为伊拉克军队的副总司令，指挥镇压什叶派和库尔