遣陈辉煌驻军位在今寿丰乡的吴全城，招抚太巴塱社，并且修筑到太巴塱的栈道。光绪十三年（1887），台湾建省，东台湾设立台东直隶州，太巴塱隶属台东直隶州奉乡新福堡，由秀姑峦府肯分局管辖。
日本时期.日本政府统治台湾时期，太巴塱隶属凤林郡。大正十二年左右（1923），日本政府压迫并禁止太巴塱举行Ilisin，后来由于部落族人寄望日本政府能够许可部落再次举行祭典，日本政府才再次以月见祭的形式举办，并且要求族人敬奉日本神道教。大正十六年（1925），日本政府为扫除太巴塱、马太鞍猎首习俗，并且