龙相比，卢沟龙的吻部较为宽厚。正模标本的鼻孔很小，直径只有0.5公分；同时其三角形的眶前孔相对宽大，右侧眶前孔宽0.2公分。眼眶外缘前半段相当圆润。牙列短，牙齿扁平且向后弯曲，后侧稜嵴带有细小的锯齿，此与一般的兽脚类恐龙相同。发现于黑果棚的头骨（北平辅仁大学编号CUP 2092，今去向不详）显示，芦沟龙的下颌具有小而位高的下颌孔（mandibular fenestra），前关节骨（prearticular）前端貌似指向前方。此外在这具保存状况不佳的头骨中，隅骨较大以至盖过其上方的上隅骨，甚至到达下颌骨的