国际协力机构派遣到埃及首都开罗为开罗地铁提供科技支援，而近畿车辆株式会社和东芝则提供零件和设计。还有一个日本考古学家团队在埃及工作40多年。他们的一个主要项目是在大金字塔内部和外部进行雷达扫描，他们并在代赫舒尔和阿布西尔也进行了重要的工作。在2011年埃及革命后多数日本人离开埃及，约470位日本国民乘搭日本外务省的紧急任务组安排的班机逃离日益骚乱的开罗。