时，圣士提反书院内亦有加拿大陆军的随行神职人员。
日军发动屠杀.1941年12月25日凌晨4时，日军攻进圣士提反书院，也有指日军是在清晨6时左右攻入书院，亦有倖存者忆述日军是在5时30分左右闯入。日军攻入书院大楼后，日军士兵便用刺刀杀害15名卧牀的伤兵，并把职员和能够行走的伤者赶入储物室，没有任何武器的伤兵及职员先后被杀。一名倖存者在翌日发现有2名伤兵遭到肢解，眼珠被人挖掉，耳朵和舌头则被割去。有些日本士兵把伤兵的尸体当作垫子，在上面轮姦女护士，并在强姦后伤害或杀死她们。一些教职员