物和森林植物保护司、林业公安局（后来改为公安局）、森林防火办公室（武装森林警察办公室）、综合计划司、财务司、科学技术司、国际合作司、人事教育司13个职能司局和机关党委。另设离退休干部局、驻部监察局、驻部审计局。部机关行政编制446人。1998年国务院机构改革中，1998年3月10日，九届全国人大一次会议通过国务院机构改革方案，撤销林业部，组建国务院直属机构国家林业局。
职责.1994年1月30日，国务院办公厅发出《林业部职能配置、内设机构和人员编制方案》（国办发（1994）21