不愿与其积极合作，久之双方隔阂加深。然而，随者江南的开发，寒族及吴姓世族也逐渐抬头。架构方面，朝廷的决策机关与行政机关也逐渐分立。尚书省、中书省及门下省依序独立出来，由汉代的三公九卿制走向隋唐的三省六部制。西晋承袭曹魏，中书监职权甚重，名实方面俱称为宰相。由于地处枢近，虽然官位在尚书令之下，但权力在其之上。同时门下也自中书分到部分权力，共同掌管决策，尚书则掌管行政。尚书的内部架构发展较为充分，在西晋即有省、曹、郎曹三级机构，「八座」之官。中书及门下直到东晋方扩张机构，中书省分局曹以协理奏章，门下至晋哀帝