级保护植物——天山雪莲，由于非法滥采，濒临灭绝。海拔2,500~2,300米分布有广袤的针叶林，林地生长多种名贵食用菌，是夏季当地群众重要的副业来源之一。海拔2,300米以下，除农垦区外，罕见高大乔木，多低矮灌丛和草地。巴里坤盆地动物品种繁多，有盘羊、岩羊、黄羊、马鹿、野驴、狼、猞猁、棕熊（1992年以来，未得到进一步确认）、雪豹、金雕、隼、雪鸡等。2005年以来，狼灾对牧业生产构成了一定威胁。
全新世古环境.近年来，通过对巴里坤湖湖相沉积的分析可知：
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