。搬回台湾之前，林清凉每年暑假必返台，尔后林清凉在1976年先行返回国立台湾大学物理学系任教，开授近代物理与普通物理等课程。冯缵华则在不久后提早退休前往台大环境工程研究所任教，同时关注并参与处理当时台湾的污染问题。在这段期间，林清凉致力于原子核理论、电子散射与核型态因数等相关领域之研究。1981年8月，由于师资匮乏与系内矛盾，林清凉从黄振麟手中接下了台大物理系系主任的位置。在任期间，林清凉不仅介入协调系内教授的纠纷，并改革物理系的各项制度、充实了该系的软硬体设施。此外，她也同时和沈君山致力于执行并推广「