此举违反中国国民党中央委员会「不可炒作琉球问题」的要求，导致上司丁文治被开除。1970年代阮大方赴美国，住在纽约，后移居加州。1984年10月15日发生江南案，主持《加州论坛报》首刊刘宜良（江南）《蒋经国传》的阮大方向美国政府揭发江南案内幕后，被蒋经国政府以「母病速归」为由诱骗回台湾软禁，一直到1987年蒋经国政府解除戒严后始获准出境。1992年，阮大方回到杭州居住十年之久。2002年，阮大方退休，回到台北。2006至2007年，阮大方担任《台湾公论报》社长。阮大方常在中国大陆和台湾讲学，听者甚众。