克孜尔屠杀发生于1933年6月，东突厥斯坦伊斯兰共和国指称回族不重视宗教，并打破了他们的不攻击汉族和回族平民的协议；维吾尔族和柯尔克孜族组成的东突厥斯坦军队对叶尔羌新城至喀什一线撤退中的回族军民展开屠杀， 据估计共有800名回族军民及汉族平民在屠杀中丧生。隔年，为了报复克孜尔屠杀，回汉混合的马家军在喀什战役 (1934年)杀害数千名维吾尔平民。