年陈水扁当选后，罗文嘉担任行政院文化建设委员会副主委。2001年，辞去文建会副主委一职，在台北市北区参选立法委员并当选。在担任立法委员期间，分别获得澄社调查及国会记者调查的「最优秀立委」的评鑑。2004年，罗文嘉出任行政院客家委员会主委，全力推动客家电视台公共化与提升客家话使用比例。2005年3月，辞去客家委员会主委一职，并代表民主进步党宣佈参选台北县县长，选举期间和段宜康一起提出「新民进党运动」；但因民进党台北县汐止市党部主委蔡茂雄性侵少年案、高雄捷运外劳弊案、全国工人总工会理事长郑素华走路工事件等疑