若在服用抗生素期间发生了脑膜炎的症状（如在脑膜炎之前发生鼻窦炎而服用抗生素），会导致诊断和治疗上的困难。此类患者的脑嵴液的检查结果可能会类似病毒性脑膜炎。此类病人必需继续服用抗生素，直到找出明确病毒感染的证据为止。
遗体解剖.遗体解剖也可以进行脑膜炎的诊断。脑膜炎死者的软脑膜及常表现大面积的发炎反应；脑嵴液、脑底以及脑神经和嵴髓常有来自血管的中性粒细胞浸润，可能也会伴随脓液。
预防措施.部分脑膜炎病原，可以通过注射疫苗来进行长期的预防，或给予短期抗生素进行