届国会成立时，刘冠三任众议院议员，和徐镜心、丁惟汾等反对袁世凯的活动，并拒绝袁世凯的贿赂。刘冠三还多次搭救被袁世凯方面逮捕的革命党人如商震等。1914年，吴大洲、薄子明等人在山东起兵倒袁，刘冠三乃自北京回到山东参加。袁世凯下令逮捕刘冠三，刘冠三经商震、侯延爽等相助而脱险，赴陕西。1916年，第一次恢复国会时，刘冠三继续任众议院议员。1917年，国会再度遭到解散后，他刘冠三赴广州，帮孙中山成立护法政府，并担任护法国会众议院议员、山东招讨使，负责山东省军务，协助南方的革命军北伐。其间，刘冠三在徐州率军击败山东督