萄牙人声称对整个几内亚比索拥有主权，但他们实际控制范围很有限。19世纪，奴隶贸易的衰微令葡萄牙人向内陆找寻新利益。葡萄牙人对内陆的征服十分缓慢，且遭遇激烈反抗。另外，葡萄牙割了很多土地给法属西非，包括繁荣的卡萨芒斯河流域。葡萄牙亦曾为Bolama而和英国争论，经美国总统尤里西斯·格兰特于1870年的介入，最后Bolama归入葡属zh:几内亚;zh-hans:几内亚;zh-hant:几内亚;。1879年，葡属zh:几内亚;zh-hans:几内亚;zh-hant:几内亚;从葡属佛得角分开，在