系统不力，公路运力仍然不足。水路长约11,000公里，发挥了重要的货运作用。主要的通航河流为拉普拉塔河、巴拉那河、巴拉圭河和乌拉圭河。主要的海港有拉普拉塔–、布兰卡港、马德普拉塔、–内科切阿、里瓦达维亚海军准将城、德塞阿多港、马德林港、乌斯怀亚和西圣安东尼奥。1990年代，位于圣菲省的新河港区取代布宜诺斯艾利斯港，成为阿根廷最重要的航运枢纽，它沿巴拉那河延展67公里，包括17个港口，担负总出口量的五成。2013年，阿根廷有超过一千座机场，其中159座有铺面化跑道。距离布宜诺斯艾利斯市中心35公里的埃