菌酶（subtilase）类，通过活性位点丝氨酸残基对肽键的亲核进攻而造成蛋白质的水解。典型的分子量为2万至4.5万道尔顿，除可从枯草杆菌中获得外，还可从解淀粉芽孢杆菌（"Bacillus amyloliquefaciens"）等土壤细菌中获得。许多芽孢桿菌属细菌均可大量分泌枯草杆菌蛋白酶。