主要由东日本旅客铁道（JR东日本）、北海道旅客铁道（JR北海道）、弘南铁道、津轻铁道、青森铁道运营。青森县内的JR东日本的在来线有连接青森市和秋田市的奥羽本线、津轻半岛东海岸的津轻线、东南部的八户线、西南部的五能线、下北半岛西海岸的大凑线。JR北海道的海崃线是连接北海道和本州的陆路交通大动脉，途径全长53.9公里的青函隧道。青森县内有东北新干线和北海道新干线两条高速铁路。乘坐东北新干线隼号列车从东京站到新青森车站只需约3小时。2016年北海道新干线开通之后，青森县新设奥津轻今别车站，使得青森县现在拥有八户车