维护被诬陷的选曹尚书缪祎被再次流放广州。但还未到达广州，便又被召回朝中，再次授予左国史的职务。薛莹曾多次上疏请求革除严苛的刑罚，减轻百姓的徭役，有时建议会被孙皓所採纳。后又升为光禄勋。天纪四年（280年，晋泰始六年），吴国灭亡的态势已定，薛莹和中书令胡沖建议孙皓分别遣送使节向王濬、司马伷、王浑请降，试图分化晋军，未能奏效，降书即出自薛莹之手。
晋武帝时期.后薛莹随孙皓降晋，到达洛阳后受到晋武帝的召见，被任命为散骑常侍。晋武帝曾问他孙皓灭亡的原因，薛莹将其归纳为“昵近小人，刑罚妄