。除了已经提到的气体，彗核还包含各种各样的有机化合物，它们可能包括甲醇、氰化氢、甲醛、乙醇、和乙烷，或许还有更复杂的分子，如长链的烃类和氨基酸。在 2009年，从NASA星尘任务带回的彗星尘埃中发现了氨基酸中的甘氨酸。在2011年8月，NASA一份根据在地球上发现的陨石所做的报告指出，已经发现DNA和RNA的元件（腺嘌呤、鸟嘌呤、及相关的有机分子），可能已经在小行星和彗星上形成。彗核表面的反照率非常的低，使它们成为太阳系内反照率最低的物体。乔托号太空探测器发现哈雷彗星的彗核只反射了大约4%照射在它上面的