甲基球菌属（学名：）为甲基球菌目甲基球菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。细胞球状，通常成对出现。此属的模式种为荚膜甲基球菌("Methylococcus capsulatus")。