凌正被诛杀，军城遂安。建中二年（781年）三月，振武军乱，其帅彭令芳、监军刘惠光被杀，王翃继任振武军使、东中二受降城镇北绥银麟胜等州留后。三年七月，任京兆尹。建中四年（783年）十月，王翃受命犒劳泾原镇军士，军士以伙食不嘉，愤而生叛，泾原兵变发生，唐德宗慌忙出逃奉天，王翃与宰相崔宁、御史大夫于颀一起从延平门西逃奉天。加御史大夫，改将作监，从幸山南。之后与卢杞一同陷害崔宁，导致崔宁被杀。唐军收复京城，德宗回京，王翃改任大理卿。贞元九年（793年），出为福州刺史、福建观察使，入为太子宾客。贞元十二年（7