清初功臣二等伯卓罗。7岁时拜舅父胡先生为师，学习经史，擅长书法。16岁时凭借书法能力考入高阳县衙门当缮写员，每月挣银元十元。1912年佟凌阁20岁时投入冯玉祥的部队，在冯玉祥领导的第16混成旅中任职，后来在该部队中顺利升职。曾参加护国运动。1922年任冯玉祥将军陆军检阅使署高级教导团团长。1924年2月16日大总统任命佟凌阁为陆军第二十五混成旅第一团团长。1924年（民国13年）10月北京政变后，佟凌阁任国民军第1军第11师步兵第21旅旅长。1925年（民国14年）7月，升任西北军第11师师长。1926