没有在对方首都互设具大使馆性质的代表机构。对萨尔瓦多的相关事务由中华民国驻瓜地马拉共和国大使馆。
政治.
邦交时期.1933年6月15日，中华民国与瓜地马拉建立领事级外交关系，由驻瓜地马拉总领事兼理萨尔瓦多侨务。1941年4月9日，中华民国与萨尔瓦多建立公使级外交关系，由驻巴拿马公使兼驻萨尔瓦多公使。1957年7月17日，在首都圣萨尔瓦多设立中华民国驻萨尔瓦多共和国公使馆，并派驻专任公使。1961年6月1日，两国升格大使级外交关系，公使馆升格为中华