及尹元衡所掌握。这时，大尹派已失势，尹任被杀，引起乙巳士祸，而小尹派的首领尹元衡被封为领议政，李芑等人被封第一为功臣。明宗三年（1547年），卫社功臣李彦廸虽被封为第三功臣，但是因良才驿事件牵涉而被杀。明宗异母兄凤城君亦因此被杀，与此同时，尹元衡的亲兄尹元老因为与尹元衡敌对，他及他的追随者亦被尹元衡所杀。由于文定王后崇佛排儒，任用普雨，设立僧科。明宗不忍大权旁落，任用王妃外戚李樑。但是李樑同样贪污跋扈，被外戚沈义谦弹劾而被处死。明宗十年（1555年）曾发生乙卯倭变。明宗二十年，文定王后病逝，尹元衡失势，