圣公会堂，秘密告诉他：华兴会举义不幸先期洩漏，致被官厅破获，黄兴等幸而免脱，劝宋速避难他方。宋教仁闻讯后颇镇静，初拟即回常德速行破坏，以牵制省中之劫，只以款项缺乏，终不得不依曹之劝告附舟东下，以追踪黄兴。宋遂潜赴日本。12月13日，宋教仁抵达日本，在日本东京成立中国同盟会，成为中国同盟会的主要领导人。1905年5月，宋到东京之初，与友人合办刊物《二十世纪之支那》。6月，入读日本法政大学。7月，在宫崎滔天的介绍下结识孙中山。8月，支持孙中山在日本东京成立中国同盟会，并当任其司法部检事长。11月，于东京创立