台东县并设置有台东红叶村台东苏铁自然保留区，该区是台湾野生的台东苏铁分佈面积最广、数量最多，且生长情况良好的区域。除此之外，海岸山脉台东苏铁自然保护区为另一位于县境的台东苏铁保护区。
威胁.台东苏铁目前正受东陞苏铁小灰蝶及苏铁白轮盾介壳虫所威胁，令大量植株枯黄以至死亡。台湾正以物理，化学以及生物方法防治。物理方法是把受东陞苏铁小灰蝶苏铁白轮盾介壳虫所寄生的台东苏铁叶整片切去，然后密封于塑胶袋并放在阳光下暴晒使害虫死亡。化学方法是把可溶性化学物质放在树上，化学物质溶解后便会被台东苏铁