odesmidae）、沙鰕虎科（Kraemeriidae）及辛氏微体鱼科（Schindleriidae）目前都被并入本科。相反的，本科除了原有的虾虎鱼亚科（Gobiinae）保持不变外，以下四个过去曾归类于本科的亚科均已被独立出来成为另外一科，即背眼虾虎鱼科（Oxudercidae）：虾虎鱼类由于非主流经济鱼类，因此受人们关注不及其它的大型鱼类。也由于其多样性极为丰富、某些种属间形态相近，鉴别难度大，因此对于其分类，尤其是属内及属间分类尚存在一些争议。本科鱼类估计尚有不少未被描述和定名的物种有待人们