进行过两次改扩建工程。原飞行区等级为4D级，1条2800×45×0.24米的水泥跑道，候机楼4,856平方米。1997年至1999年进行了飞行区改扩建工程，投资2亿元新建一条长3,200米的标准跑道，飞行区等级升级为4E级。1993年4月23日，经国务院批准开放喀什机场口岸。国际联检楼建筑面积3,100平方米，于2001年8月完工，并于2002年6月5日正式启用。2004年，喀什-巴基斯坦伊斯兰堡的国际航线正式开通。2018年，喀什机场旅客吞吐量为206万人，居全国第62位。