弛内脏平滑肌的作用，特别是当其处于痉挛状态下，效果更为显着。但肠道除了蕈毒硷受器，也受其他种类的受器在支配，故阿托品阻断蕈毒硷受器不能完全使肠道停止活动。可显着的解除胃肠道平滑肌痉挛，降低蠕动幅度和频率。可解除膀胱逼尿肌痉挛。可轻微的解除输尿管、胆管、支气管和子宫平滑肌痉挛。阿托品也对括约肌有一定效果，但不稳定。
中枢神经系统.治疗量的阿托品对中枢神经系统的作用不明显，随着剂量的不断增加，其作用为先兴奋后抑制。大剂量（1~2 mg）可兴奋延髓唿吸中枢；更大剂量（2~5 mg）可兴奋