清朝时，府治仍为永嘉县。雍正六年（1728年）后，温州府范围大约等同今日的温州市（不包含泰顺县西南少数地区、乐清市少数地区、文成县大部分、洞头区大部分）以及丽水市青田县东部少数地区、福建福鼎市沙埕镇台山列岛。雍正六年（1728年），析温州府乐清县、台州府太平县地置玉环厅，为温处道直辖之直隶厅，不属温州府。至此，温州府辖五县如下：
中华民国.民国初年，全国废府州厅改县，于民国二年（1913年）废，共开府545年。
职官.
冲繁疲难