风中心向新泽西州和纽约州边界到苏福克县莫里切斯（）之间的长岛南部海岸发布了热带风暴警告。飓风登岸约一天前，气象预测部门估计风暴有10%的可能性会在距纽约市不到120公里处经过。估计新英格兰南部其他地区也有类似的概率，伊莎贝尔还有3%的可能性会在距缅因州的东港不到120公里处经过。从飓风吹袭陆地约两天前开始直到其登岸数小时后，气象预测部门都估计风暴将在穿越纽约州西部上空的过程中逐渐转变成温带气旋，然后以温带系统形式进入加拿大。纽约州州长乔治·保陶基敦促居民购买紧急救援物资，并给汽车加满汽油。纽约州应急管理