彼得小学，小学会考后升读英皇书院，与香港天文台前台长李本滢是相差一年师兄弟。林氏初上英文中学，所有学科均以英文授课，极不习惯。他在初中时期校内的成绩排名较差，直至中四时醍醐灌顶，受到对天文学的兴趣影响下，多读英文书籍，成绩逐渐变好。除了学业以外，他就读英皇书院期间曾考取急救证书，又会参与童军活动。林超英自小已有意加入天文台。他中一时已学懂阅读经纬度，在格子簿上自行记录台风风眼位置，并预测移动路径。中二时当童军，为了超越学长，刻意拣选考取天文观星章，与高一年级的小队长结伴到维多利亚公园西北角的小山开始观星