选后被写上不利的讯息，杨阵营发现后欲修改，但因条目实施半保护而无法编辑，愤而指控对手的网军搞「小动作」。11月27日，在高雄市市长的选举中，杨秋兴获得414,950票，惨败给民进党候选人陈菊的821,089票，最终未能当选高雄市市长。选举后，杨秋兴大肠癌复发，住院开刀，县长卸任前夕出院。
县长卸任后.杨秋兴卸任后曾有传言指出他将获邀进入行政院担任政务委员或参选立法委员的传闻，不过杨秋兴于2011年1月13日在高雄市博爱路成立办公室时，否认将入内阁或参与高雄市立法委员补选。杨