1648年，郑成功攻同安，甘辉出战斩清守备，清军弃城逃走，得同安。1650年，授甘辉为右冲镇，旋管亲丁镇。1653年，清军水路合攻海澄，为郑军击溃。1656年，郑成功退回思明，甘辉断后，遇清军来犯，是时马信与师来会，合斩清将，郑军大捷。1657年，永历帝封郑成功为「延平王」，左、右、前、后、中提督封伯爵，甘辉封「崇明伯」。1659年，郑成功第三次北伐南京，甘辉亦在军阵中。郑成功领舟师逆长江而上，势如破竹，破镇江、瓜洲，江南地区府县多望风披靡。攻南京前，甘辉向郑成功进言之记载，从征实录:"兵贵神速，乘