去春节及假日前后不过数日。总统亲自数度直接召集并参与讨论一个科学园区开发小案，实属罕见，未以任何手段来影响竹科管理局，则纯为推托之词。特侦组认为，陈水扁夫妇收受贿款，影响新竹科学园区管理局收购土地，起诉陈水扁及其夫人吴淑珍。陈水扁夫妇主张该笔款项是政治献金，强调他们并未以任何手段来影响竹科管理局；相关官员也表示并未受到关说、也不知道他们收到政治献金，他们收购该土地是专业考量。最高法院在2010年以实质影响力说，将前总统陈水扁及夫人吴淑珍各判11年徒刑，併科1.5亿元罚金。
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