蓝分别在正保、明历和万治年间建成，剩余的回廊等其他部分，最晚的也在宽文3年（1663年）全数完工。延享3年（1764年），山门北面的浴室失火，结果导致浴室、山门、七间净头和禅堂都付之一炬。伽蓝虽然大部分在早期已经重建，但是碍于加贺藩的财政问题，山门则延至文化10年（1813年）才获准重建，最终在文政元年（1818）11月完工。瑞龙寺原本佔地达33,643步，设有塔头东渐院、龟占庵、法性庵和林洞庵，但是瑞龙寺在废藩置县后失去了来自加贺藩的援助，而且受到废佛毁释的影响，改建成火首金刚堂，、浴室和回廊等部分建筑物