留下了基因的族谱，Y-DNA分析现在已应用于民族迁徙、家族历史的研究。
概观.大多数哺乳动物每个体细胞中含有一对性染色体，其中雌性拥有两条X染色体；而雄性则拥有一条X染色体与一条Y染色体。哺乳动物的Y染色体的DNA上含有能够促使胚胎发育成雄性的基因，这个基因称为SRY基因。Y染色体上的其他基因还包含制造正常精子所必需的基因。动物中也有少数具有多对性染色体的物种。例如，鸭嘴兽依靠包含5对染色体的XY性别决定系统来决定性别。鸭嘴兽的性染色体其实与禽类的Z染色体具有更高的同源性，在其