府并未实际统治到清朝所谓的番地，即原住民的势力范围，因此原住民部落，甚至是某些周围的汉族部落仍属原住民的统治者管理，因此各原住民族的大头目亦可属岛内最高地方统治者。
日治时期.
台湾总督.台湾总督是指台湾日治时期，由日本所指派的总督。大清帝国因为甲午战争战败，在1895年将台湾割让给日本，1945年日本于第二次世界大战中战败，日本放弃对台统治，台湾日治时期结束。在1895年到1945年半个世纪当中，日本共派任了19个总督，可以划分为以下三个时代：「前期武官总