658年返国后获封骑士。复辟时期，他前往爱丁堡重投蒙克将军，发挥了重要作用。12月卸任后在1661年2月1日获封从男爵。摩根在1662年召集了英格兰对葡萄牙远征军，帮助葡萄牙的新教徒对抗信仰天主教的西班牙人。1665年，他获封泽西总督。次年主持修复泽西岛的堡垒和重组民兵。1699年据说是他自己写的一本小册子面世，叙述了他1657年和1658年在法国和佛兰德斯的经历。他的家安在蒙茅斯郡Llangattock Lingoed的Old Court。