等武家后独立，尽管在关原之战时分出了东西军，西军的真田昌幸和次男真田幸村曾经在第二次上田合战中击退东军德川秀忠率领的军队，但是由于长男真田信幸站在东军而保住了领地，其后从上田藩增封至松代藩，历经十代藩主直至废藩置县为止。
由来.宽永18年（1641年），学者林罗山奉江户幕府之命编撰《》，并且收录了真田氏提供的系谱，显示其始祖是清和天皇之子贞秀亲王，视为初代，其子滋野幸恒在移居信浓国小县郡海野（现长野县东御市内）后改姓，自称海野小太郎，而真田氏则是海野氏的嫡流，在海野栋纲之孙