部秘书罗杰斯·莫顿创建贝克岛国家野生动物保护区，并于2009年扩大保护区范围以包括的岛屿的下沉陆地。现在保护区域包括陆地和水域。 贝克岛和其他六个岛屿属于太平洋偏远岛屿国家野生动物综合保护区，由美国鱼类及野生动物管理局管理。2009年1月，乔治·W·布什总统将其升级为太平洋偏远国家海洋保护区。贝克岛面临的环境挑战包括二战中废弃的军事残骸和非法海上捕鱼。 人类活动导致的外来物种入侵，包括蟑螂和椰子树，取代了本地的野生动物。1937年引入的野猫，于1965年被根除。公众只能持从美国鱼类及野生动物管理局的