四月丙寅（249年5月8日）领丞相一职，为孙权祭拜鹊鸟。当时正处于太子孙和和鲁王孙霸的二宫之争，朱据拥护太子，意志十分坚定，更多次上书维护太子。次年（250年），孙和被废而孙霸被赐死，朱据亦因多次进恳切进谏而触怒孙权，被降职为新都郡丞，还未上任就被中书令孙弘进言诬害，当时孙权病重，孙弘就自行下诏赐死朱据。朱据死时五十七岁。