讲座于1928年12月设立，首任讲座教授为自京都帝国大学毕业的荒胜文策。1934年7月25日，荒胜文策领导建造直线粒子加速器，成功在台湾做出亚洲第一次，世界第二次人工撞击原子核实验。该加速器目前被国立台湾大学校方展示于台大物理文物厅。第二任讲座教授则是河田末吉，主要在台湾的玉山与阿里山等高山地区的高山营林所利用探空气球收集中子数据，进行宇宙射线研究。河田末吉团队也曾利用X光以单晶绕射法分析北投石结晶。
国立台湾大学物理学系时期.1946年戴运轨教授接收物理学讲座，与工业物理、气象、