湖北省文物局对学堂梁子遗址进行深度发掘，以保护这一重要遗址。
新发现.2012年2月，郧县弥陀寺村青曲中学的一位教师杨正林在学堂梁子遗址上发现一把长约15厘米，宽约10厘米，厚约3厘米的石斧，之后杨正林又在附近发现其他石器。经武汉大学考古专家初步鉴定，杨正林发现的这些石器，应该就是新石器时代中晚期人类使用的石器。