类囊体膜中最丰富的脂肪酸酰基链，因此在环境低温时，仍可以使囊膜有高度的流动性。大部份天然的（有双键的）脂肪酸是顺式的，不过有些天然的脂肪酸是反式的，而人工氢化的脂肪和油类也是反式的。在生物中重要的脂肪酸包括主要衍生自花生四烯酸的类花生酸，另一种为二十碳五烯酸（EPA），包括前列腺素、白三烯、血栓素等。二十二碳六烯酸（DHA）对生物体也相当的重要，尤其是在生物的视觉上。其他重要的脂肪酸类脂质包括脂肪酸酯及脂肪酸胺，脂肪酸酯包括重要的生物化学中间产物，例如、及脂肪酸硫酯辅酶A衍生物、脂肪酸硫酯醯基载体蛋白衍