以南京内守备府为行宫。此时的南京明宫城内大多殿宇已因年久失修而坍毁无存，前三殿更是早在正统十四年便被烧毁。五月初三庚寅，朱由崧自大明门入内朝，行告天礼，随后在武英殿就监国之位。五月十五日壬寅，朱由崧在南京武英殿即位，宣布翌年改元弘光，建立南明政权。朱由崧在位时期，以内宫监作为朝殿，并对南京宫殿进行了一些修复工作，比如为迎接嫡母邹氏（仁寿皇太后）而下令修建“西宫之园”（即慈禧殿），并整修或新建了午门、奉天门、奉先殿、兴宁宫等建筑：
清初至民国荒废.明弘光元