弟、之前同样当过皇帝的相王李旦继位为唐睿宗。景云元年（710年）十二月，侍御史倪若水弹劾祝钦明、郭山恽奉承韦后、希旨误导中宗，指二人为小人，不宜在朝。睿宗贬祝钦明为饶州刺史。儒生都以他为羞。后来，祝钦明又被迁为洪州都督，最后被召回任崇文馆学士，并在唐玄宗先天初年以金紫光禄大夫、崇文馆学士、上柱国、鲁国公身份参与了《妙门由起》的编撰，不久卒于任上。