爆发太平洋战争，在珍珠港攻击事件中，九九舰爆的战绩显赫，当时日本海军的飞行员皆接受了严酷的训练，所以在飞行员技术纯熟、士气高昂状况下，停泊在珍珠港内的许多战舰都成了它俯冲投弹的牺牲品。直到瓜达康纳尔战役之后，日本海军所拥有的优秀飞行员几乎所剩无几，再加上美军的近接信管问世、波佛斯40高炮大量设置在各式舰艇，以及新式战斗机服役抵销日军战机。之后，九九舰爆在空中的优势也宣告结束；而九九舰爆因缺乏防御设备，在火网充沛的舰队近迫防御下伴随着极高的折损率，飞行员因此把他以谐音的含意讽刺为「九九式棺材」或「穷穷式舰爆」