，傅斯年在国民参政会上，向行政院院长孔祥熙发难，揭发其在发行美金公债中贪污舞弊。不久，孔被免去财政部长职位。1945年，孔再辞去行政院副院长及中央银行总裁。1947年，以宋霭龄病重为由赴美国定居。1948年，辞去最后的中国银行董事长职。1962年后，曾赴台湾暂住，据周宏涛回忆录载，他是意欲安排长子孔令侃出任财政部长。1965年10月27日，蒋经国函电宋美龄：
逝世.1967年8月15日，孔祥熙在纽约心脏病发去世，蒋介石发表〈孔庸之先生事略〉悼文，并派宋美龄和蒋纬国率领一支5人仪仗