，创建清华大学结构生物学实验室（现在的清华-南开-生物物理所联合实验室），任实验室主任，教授至今。在清华任教的十余年间，饶子和兼任过本科生的班主任、指导老师，曾荣获清华大学“良师益友”奖。2003年，兼任中科院生物物理所所长。2006年，饶子和出任南开大学校长。在任期间，饶子和引进了多名海外归国人才，更换了14个专业学院的院长，促成南开大学与解放军总医院合作办学，并曾与静海县人民政府签订合作协议谋划建设南开大学静海新校区，但最终，新校区选址津南区。2011年1月，饶子和离任南开大学校长，被增补为天津市政