由于黄唇鱼的鱼鳔价格高昂，引致过度採捕问题严重，鱼获产量不断下降，体型也不断缩小。滥捕令能生长至成熟阶段的黄唇鱼减少，捕获的黄唇鱼很多也未成年，没有商业价值。而捕鱼科技愈加先进，回声探测器和炸药捕鱼等科技，也大大加剧过度採捕问题。长江三角洲和珠江三角洲的填海及发展，污染等威胁到黄唇鱼的繁殖和生存。非法採捕问题亦十分严重，虽然列为中国国家二级保护物种和广东省受保护水生动物，但黄唇鱼现今价格可以高至每条100万港元，强大的经济诱因令非法捕捉和买卖持续。在香港，黄唇鱼曾是大澳重要鱼获，有「大澳鱼」