七年，再次出任南京礼部右侍郎，升任南京礼部尚书。因病辞职归养，成化十五年（1479年）去世。追赠太子太保，谥文僖。
着作.有《玉堂稿》、《上谷稿》、《归田稿》、《南宫稿》、《辽海编》等。
家族.倪谦之子倪岳，官至明朝礼部尚书、吏部尚书。谥文毅。父子皆谥文，为明世首见。