崔孝芬通直散骑常侍，以将军出任荆州刺史，兼尚书南道行台，领军司，率领将军们救援李神俊，因此代替李神俊出任刺史。当时，荆州州郡内的防守据点都已失陷，通过的道路经三鵶，已经被梁军占据。崔孝芬统帅的部队人数少，不能径直前进，于是从弘农堰渠山山道南下，派遣弟弟崔孝直率领轻装士兵在前，出乎梁军的意料之外，梁军奔逃溃散，人民回家安居。魏孝明帝嘉奖慰劳崔孝芬，并赐给马匹和绵绢等物品。后来，崔孝芬因为是元乂的党羽，和卢同、李奖等人一起被除名，召回朝廷。当年崔孝芬担任廷尉少卿的时候，章武王元融因为贪污被弹劾，崔孝芬依重罪