府外交部特派山东交涉员蔡公时及署内职员17人虐杀，随后对城中百姓进行大规模屠杀，超过6000中国居民被杀害，史称“五三惨案”。直至次年3月，南京国民政府与日本政府签订《中日济案协定》之后，日军才退出济南。1937年，日本侵华战争爆发。同年12月，汉奸马良出城迎接欲侵略济南的日军进城，济南陷落。1945年8月日军战败，国民政府于同年收复济南。1948年国共内战时期，战乱导致全国物价飞涨、纸币贬值，济南经济全面崩溃，商埠逐渐消失。同年9月24日，中国人民解放军占领济南，并成立济南特别市和济南市人民政府。