tion::::分类.在2009年的APG III分类法，睡莲目直接置于被子植物分支之下，是继无油樟目之后较早和其它被子植物分开演化的支系之一。其下包括了三科：
沿革.在1981年的克朗奎斯特分类法里，睡莲目属于木兰纲（即双子叶植物），置于木兰亚纲之下，该分类法的睡莲目下有5个科：在1989年Dahlgren分类法里，睡莲目属于木兰纲木兰亚纲之下的睡莲总目（Nymphaeanae），莲科已被独立划为木兰总目之下的莲目（Nelumbonales）（后来1998年APG分类法中，