主教与东正教分立出来的，源自431年东方教会的分裂（东方与西方教会直到1054年的「教会大分裂」之前是未分离的），然而亚述教会的神学体系并不能清楚的当作聂斯脱里的教义。聂斯脱里，摩普绥的狄奥多的学生和君士坦丁堡普世牧首，他是遭到责难的，因为他拒绝称唿童贞女玛利亚是「生神之母」（希腊文：「Theotokos」）。他仅称唿她为「基督之母」（希腊文：「Christotokos」）。他的反对者亚历山大的区利罗控告他的区分使基督成为两个位格，他明确地否定。由于区利罗不清楚的论点，事件是复杂难解的。在不久后便导致基督一