法院通过《台湾地区与大陆地区人民关系条例》修法、两岸春节包机直航、完成台湾和香港航权谈判等。蔡英文致力处理、主持海崃两岸政策的发展，也因为这是一份备受瞩目的困难任务，让她在台湾很快受到注意。她在连续4年的内阁阁员满意度舆论调查都是第一名。相对地，中华人民共和国政府则是把其视为「斗争与谈判的对手」，并运用「文攻武吓」的策略。
不分区立委.蔡英文原本是一位无党籍人士，直到2004年9月7日才正式加入民主进步党，使得她的政治生涯很晚才开始。在2004年至2005年间，她转而担任中华民国总