日就任中华民国临时大总统，广东都督一职从缺，广东地方人士力举孙眉出任。同年2月21日，孙中山发电报劝孙眉不要从政，孙眉接纳孙中山意见，同年底在家乡开办中山合胜公司。1913年秋天移居澳门。1915年2月11日病逝于澳门，享年61岁。1933年，国民党中央执行委员会决议，拨款将孙眉遗骨迁回故乡翠亨村厚葬。2000年11月，中山市政府宣布，将孙眉墓列为文物保护单位。