与隋朝的战争中失败后分裂为东突厥、西突厥；东突厥与隋朝的屡次战争中失败而走向衰落。最终在唐代，唐太宗贞观四年（630年）灭东突厥；唐高宗显庆五年（657年）时，在唐将苏定方持续打击下西突厥也灭亡。（参见唐与突厥的战争）。唐朝在西突厥故地设崑陵都护府和蒙池都护府管辖，后不久由于阿拉伯帝国势力东扩而丧失。大约在八世纪初，阿拉伯帝国攻佔中亚各地，西突厥也被纳入其统治。840年，回纥汗国灭亡之后，大部分回鹘人也西迁进入中亚，就这样回纥人与突厥人在中亚合流。经过迁徙和混合，已经和原中亚突厥人关系较远。Sectio