波罗尼都自当归降。于是兆惠不等纳穆札尔、石三泰的主力抵达，先率四千人向叶尔羌进发，爱隆阿、户部侍郎明瑞、霍集斯、端济布、噶岱默特等从行。干隆皇帝也认为“回部各城迎降相继，大功可计日而成”，开始考虑各城伯克人选，以及驻兵屯田等事宜。又令章嘉唿图克图写信给拉达克（今克什米尔东南）头人，若大小和卓逃至彼处，“即擒解前来”，“断不可容留疏纵”。九月，干隆皇帝令在哈萨克追剿叛军的参赞大臣富德前往阿克苏策应兆惠。又起用舒赫德为头等侍卫，并增派察哈尔兵七百人、绿营兵三百人赴阿克苏，归舒赫德统领。霍集占退回喀什