分析发现有别的画作被覆盖在下，图案是一个跪着的女子一手抱着婴儿，另一手展开，部分研究者认为可能作者原来要画的主题是朝拜初生的耶稣。其实现代有许多图稿用X光或红外线检查时被发现出来。
《达文西密码》的相关情节应用.由美国小说作家丹·布朗所写的着名小说《达文西密码》里，它指出两幅《岩间圣母》中较早创作的罗浮宫版本含有否定正统的基督信仰的隐藏象征，因为画中耶稣基督向约翰祈祷，而不是反过来由约翰向耶稣祷告（小说里认为左边的婴儿靠着圣母玛利亚，所以应该是耶稣而不是约翰），书里另外还指出圣母玛