政区分别通过填海造地形成，首期总面积约0.4平方公里，其中，珠海园区面积约0.29平方公里，澳门园区面积约0.11平方公里；两个园区之间由一条约15米宽的水道作为隔离，开设专门口岸通道连接。在统一规划的前提下，珠海园区、澳门园区由珠海市人民政府、澳门特别行政区政府分别管理。填海形成的澳门园区的土地所有权属于国家所有，使用权归属澳门特别行政区，由澳门特别行政区进行司法和行政管辖。该工业区由澳门特别行政区政府在2002年提出建设构思，由珠海市人民政府提出申报，2003年12月5日经国务院批准设立。珠澳跨境工