共和国进行强制劳动改造。由于环境极其恶劣，以及缺乏基本的粮食和休息，许多战俘死在了劳改地。值得一提的是，这些战俘并非都被送往西伯利亚劳改，也有在中亚、北韩、高加索和波罗的海加盟国家劳改的，这些当时都是苏联的控制范围。也有一些日本人接受了斯大林政权的共产主义教育，成为了「赤化日本人」。1947年至1956年，由于日本与苏联恢复外交关系，西伯利亚滞留者才陆陆续续回到了日本。也有一些没能归国的，成为日本裔俄罗斯人。1993年10月，俄罗斯总统叶利钦在访问日本之际，声称前苏联政府的对待日本战俘是不人道的