现在的布鲁塞尔-首都大区旗启用于2015年。旗帜颜色为蓝底，中央的图案象征黄菖蒲，也是布鲁塞尔的市花。布鲁塞尔的首个市旗制定于1991年。黄菖蒲在1924年之前就是布鲁塞尔的象征。1989年6月18日，布鲁塞尔首都大区正式设立。1991年，启用了首面大区旗帜。2014年，布鲁塞尔决定变更大区旗帜，理由是城市公众形象的改变。但这一变更引发不少批评。
历史.黄菖蒲作为布鲁塞尔市花的历史可以追溯到1924年。布鲁塞尔市建立之前，当地曾经是一片沼泽地。而黄菖蒲也是一种能在沼泽中找到的花