左宗棠管领，于是林文察先北上扺浦城，再由江山攻打金华。期间林文察表现优异，屡立战功，顺利解除衢州之围，但准备追击撤退的敌军时，却传来祖母过世的消息。这时林文察理应回乡守孝，但因表现杰出，且局势危急，被庆瑞上奏留营。12月10日，李秀成攻佔杭州，浙江巡抚王有龄与杭州将军瑞昌相继自杀，庆瑞因而被革职。但林文察仍领军至建宁，准备攻打杭州。但年底时李元度率军抵达，加上林文察军新兵尚未到营，于是改命攻打庆州。1862年，林文察与弟弟林文明率兵4700人驻守龙泉，准备攻打遂昌，而此时敌军约三万多人。4月7日，林文察