平定江东，197年，朱治被举为孝廉。200年孙策被许贡门客所伤，不治。朱治与张昭、周瑜等继续帮助孙权。202年，孙权表朱治为吴郡太守，行扶义将军，以割娄、由拳、无钖、毗陵为食邑，设置长吏。后参与征讨夷越，平定东南，擒获黄巾余军陈败、万秉等。孙权之堂兄孙贲的女儿是曹操儿子曹彰的妻子，208年，曹操佔领荆州，威震南土，孙贲畏惧，欲送儿子到曹军处为人质。朱治听到后，向孙贲，孙贲便不送子质。孙权视他为上将，后孙权为吴王，朱治每次进见，孙权都会亲自迎接，以厚礼待他，设宴、赠予，恩泽、敬意特别多，而朱治的随从甚