助建省.光绪11年（1885年），台湾建省。台湾巡抚刘铭传数度访查蓝兴堡下桥仔头后，确定于现今台中市一带建立省城。财力雄厚的吴鸾旂授命为董工总理，负责督造城廓。为筹措建省的财源，吴鸾旂协助刘铭传进行台湾中部的清赋工作，并随林朝栋平定因清赋不公引发的施九缎事件。
日治时期.1895年，乙未割台。日本人为了巩固在台湾的统治力量，积极拉拢地方仕绅。当时拥有土地800甲的吴鸾旂，自然也成为日人积极拢络的对象之一。明治29年（1896年）吴氏担任台中县联甲总局办事员，隔年担任地方招安委员，