个领域开始应用在结构生物学与生物物理学中解决基础科学问题。最初，DNA纳米技术设想应用于晶体学研究上：难以在隔离状态下结晶的分子可被置于立体核酸晶格中从而测定其的结构。另一种应用是在蛋白质核磁共振波谱学中的残基偶极耦合（RDC）实验中用DNA折纸棒来代替液晶。用DNA折纸术是非常有好处的，因为不像液晶，DNA折纸棒可以承受使膜蛋白悬浮的洗涤剂。DNA 行走者（DNA walkers）被用作纳米组合线来移动纳米粒子，指导化学合成。不仅如此，DNA折纸结构也促进了酶功能和蛋白质折叠方面的研究。DNA纳米技术