约的正常运转，于是他在1994年撤去了原计划拨给MTA的4亿美元经费，而他也不提出任何改善地铁系统的计划。而纽约州议员也在90年代减少了提供给MTA的经费，直至21世纪后才大致不变。
2001年9月11日.九一一事件发生时，世界贸易中心下方的地铁车站临时封锁，其余列车服务也缩短服务时间为上午10:20至中午12:48。大楼倒塌后，行经曼哈顿下城的多班列车因停电而无法行驶，乘客须经隧道疏散。部分仍可行驶的列车因信号失灵，需启动特别操作程序。位于世界贸易中心地底的IRT百老汇-第七