吉晴之后只维持了3代就家系断绝。1634年（宽永11年），被转封为松江藩主，但京极氏统治时期也只维持3年就告断绝。此后的被任命为松江藩主。松平家担任松江的统治者直到明治维新。在松平家的历代藩主中，以第七代藩主，别号「不昧公」的茶道家最为着名。1871年废藩置县之后，松江藩在同年7月改为松江县，并在11月和广瀬县、母里县及隐岐地方合併为岛根县，松江也进入了新的时代。1889年，松江实施市制，松江市正式诞生。也是在明治维新时期，英国作家派屈克·拉夫卡迪奥·赫恩（后入籍日本并改名小泉八云）在1890年来到松江