华书院等教会中学相继成立，影响日增，为大批福州女性提供了受教育机会，教会学校的生源也由早期的社会中下层为主发展到民国时期的中上阶层为主。1866年官方在福州创办福建船政学堂，此外，各种官办的新式中小学堂和专业学堂也陆续建立，而民办的外文私塾也应运而生，幼稚园也于清末在福州出现。很多近现代的着名学者、官员和社会人士都毕业于福州的教会学校或官办新学。新式教育对旧学堂造成巨大冲击，但旧学到清末仍有一定的影响。福州高等教育始于1902年创建的全闽大学堂，到了清朝结束前夕的1911年，包括教会大学在内，福州有全闽高等