1913年，北京政府授其勋位。1913年底，他任河北定县知事，旋升道尹。1916年7月，他任山东省省长。1916年10月，他改任山西省省长。1917年6月5日他被阎锡山驱逐而离任，由阎锡山继任山西省省长。1923年孙发绪起草了《统一方案》，并联合曹锟、吴佩孚、冯玉祥、张绍曾等人签字后，向南方提出。此举惹恼了黎元洪。后来他去保定任曹锟的高等顾问。