仅三万，而金人不敢犯。南宋绍定元年（1228年）改楚州为淮安军。金兵南征，淮安频遭战祸，人烟凋敝，遂改淮安军为淮安州，元代再改为淮安路，治所仍然是山阳。
明清.明清时期，淮安是河、漕、盐东南三大政的枢纽重地，朝廷在此设立南河、漕运两位总督，城市繁荣达于极盛，府城、河下镇、板闸镇和清江浦组成绵延数十里的巨大带形城市；与扬州、苏州、杭州并称为京杭大运河沿线的「四大都市」。明代淮安府是今江苏长江以北仅有的2个府之一，辖区范围基本上相当于今日淮安、盐城、宿迁、连云港4市以及徐州