台湾日治初期，溪洲地区为一街庄，称为「溪洲庄」，隶属于港东中里。该庄北隔溪洲溪与过溪仔庄、崁顶庄为邻，东与巷仔内庄为邻，南边为牛埔庄、车路墘庄，西边为七块厝庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台设置二十厅，该庄隶属于阿猴厅（1903年改称阿缑厅）。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄仍隶属于阿缑厅。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「溪洲」大字，隶属于高雄州东港郡林边庄。战后林边庄改制为林边乡，隶属于高雄县，大字亦改制为村。1950年高、屏分治，