线的岛式月台，站舍位于铁路的北侧，可透过地下道进入月台。虽然车站站舍也与北侧的铁路相邻，但由于铁路地基高度高于站舍，无法直接从站舍方向上下车，因此站舍靠铁路一侧并未设置月台。车站由松江车站负责管理，并委託西日本旅客铁道旗下的负责车站业务，站内设有自动售票机，业务窗口内设有。目前站内没有商店，仅有自动贩卖机。
车站周边.车站周边过去曾是旧的主要市区，玉造温泉则位于车站南方约2公里处。
路线客运.在车站前约200公尺处的路口，设一畑巴士玉造温泉车站入口巴