孢锈菌起源于东非，现在已经广泛分佈于非洲、热带亚洲、中美洲和南美洲。咖啡起源于埃塞俄比亚、苏丹和肯尼亚的高海拔地区，并据信锈病也是起源于相同地区。咖啡锈病最早在1860年发现被发现，是由英国探险家于1861年在肯亚的维多利亚湖周围发现，并且在1867年斯里兰卡（当时称为钖兰）的咖啡种植区发现了咖啡锈病，当时，英国真菌学家迈克尔·约瑟夫·伯克利（Michael Joseph Berkeley）和他的合作者克里斯托弗·埃德蒙·布鲁姆（Christopher Edmund Broome）分析了由乔治·科威特在钖兰