有重要影响力的人物被捕：石田三成在伊吹山被田中吉政队所捕、小西行长在较早前向农民自首后被竹中重门队所捕获，还有逃到京都的安国寺惠琼同样被奥平信昌拘捕。三人在10月1日（儒略历11月6日）六条河原被斩首示众。随即，三人的头颅在三条河原地区巡游示众。9月27日家康进入大坂城后，指派井伊直政、本多忠胜、榊原康政、本多正信、大久保忠邻和德永寿昌六人调查各将领的战功。调查完成后，家康对大部份大名作出的领土调整，共九十家大名被除封、四家被减封，受影响领地的石高合计有660万。增封的大名一共有一百零五家（包括新分封）