江南区住家被人发现在浴室浴缸内断气身亡，享年88岁。警方初步判定为心脏麻痺原因之自然死亡。巧合的是，黄长烨逝世当日正是朝鲜劳动党成立65週年阅兵大游行的日子。2010年10月12日，受韩国政府追赠国民勋章无穷花章；2010年10月14日，埋葬于国立大田显忠院。
脱北原因.现时对于他出走的原因有数种说法：
朝鲜反应.金正日在黄长烨投奔后对其发表了侮辱性言论，他说：“黄长烨是猪狗不如的叛徒。”2010年4月5日，朝鲜媒体对黄长烨发出威胁，声称：“谁也不能保