（多为政府单位）于1988年捐出股权，成立财团法人中华航空事业发展基金会（简称航发会），为中华民国交通部监管之财团法人机构，迄今仍是华航的最大股东。1993年2月26日，华航股票在台湾证券交易所上市。
两岸竞争.由于华航为代表中华民国的航空公司，因此于机身涂装也漆上中华民国国旗和与其相符的「红、蓝、白」三色条纹。1970年代起中华民国外交处境日益艰难，在中国大陆与国际各界打压之下，部分国家如加拿大和澳洲被中华人民共和国政府要求拒绝漆有中华民国国旗的华航班机飞航，使得华航航线扩张困难