受禁止开发海埔新生地的保育禁令限制，以利此案能填海造陆兴建国光石化园区。不过后来即将政权轮替，陈水扁政府临时喊卡：行政院以「内阁即将改组，列为重大计画兹事体大」为由，在2008年5月14日函覆指示经济部，依未来国家整体规画审视后再报院，把此一提案留待马英九政府决定。2008年5月20日政权轮替后，国光石化董事会于2008年6月24日决议将努力多年的云林离岛工业区建厂计画转向彰化县大城乡，但要求政府保证2015年能如期投产，否则股东将会撤资。据2008年12月1日报载，为了发展经济，行政院以专案将国光石化