列客车进入厦门站，标志着正式开办客货运业务，为三等客货运综合站。当时的厦门火车站占地800平方米，站房为木质结构，站场设有到发线4股、码头线2股、调车线1股。1960年代车站到发线由450米延长至550米并新建货物线1股，但由于车站所在地区经常受到金门的国军炮弹袭击而难以扩建。随着鹰厦铁路运量的增加，原先的厦门站已不敷应用。1979年9月，厦门火车站扩建计划得到铁道部批准，并于次年5月动工。当初批准的站房面积为4000平方米，厦门政府以“厦门是经济特区”为由经过6次与铁道部相关领导交涉后，1983年5月