。2000年，以色列追赠「国际义人奖」给予中华民国前驻维也纳总领事何凤山，肯定其在第二次世界大战期间从宽核发犹太人赴华签证，得以脱离纳粹德国的迫害。2002年3月，第二届台湾、美国、以色列三边国防安全研讨会在以色列举行，邀集三方学者就外交、国防及战略等共同关切之议题进行研讨，并建立第二轨道对话。2004年5月，以色列在世界卫生大会全会中，对于「邀请台湾以参与世界卫生大会」的提案表决，投下弃权票。2012年6月13日，台湾云门舞集在以色列特拉维夫歌剧院演出《屋漏痕》，荣誉团长、中华民国第一夫人