其规模更大，手段更为残忍。蒙古人民共和国内务部揪出了所谓“喇嘛反革命集团”，其揪出喇嘛的逻辑为，如你为学生，则你的老师定是同谋，如你为老师，则你的学生定是同谋。由于藏传佛教重视师徒传承，每个上师的弟子众多，每个弟子也往往向不同的上师、仁波切求法，结果所有喇嘛均可被打成反革命。指导大镇压的苏联总顾问格鲁伯奇克于1938年8月报告斯大林称：“到7月20日，771座寺院已有615个变成废墟，仍在运转的仅有26座，8.5万名喇嘛仅留下17,338人，这些人还未逮捕，对中高层喇嘛我们将在下一阶段战役中全部解决。”