袁世凯死后，孙文（孙中山）发动护法运动，获得王正廷支持。民国6年（1917年）8月，王正廷担任广州非常国会副议长。9月，护法军政府成立，王正廷担任外交次长（暂行署理外交总长）。1919年（民国8年）巴黎和会召开，王正廷作为护法军政府代表，同北京政府代表陆征祥、顾维钧等人一起组成中国代表团参加和会。《凡尔赛条约》使日本继承了德国在中国山东半岛的旧有权益，在中国代表团中，王正廷极力反对此条约。结果，随着五四运动爆发等国内情势变化，中国代表团拒绝签署《凡尔赛条约》。归国后，护法军政府内部发生矛盾，王正廷被迫下