分析结果显示"Isthminia"为亚河豚属的姊妹群，且两者与等吻河豚（"Ischyrorhynchus vanbenedeni"）和梅赫林亚河豚共同组成亚河豚超科下的其中一个演化支。2016年的一篇研究进行支序分析的结果则认为梅赫林亚河豚为亚河豚超科的基群。