明永乐十一年（1413年），明成祖封萨迦派高僧贡噶扎西（汉籍中称昆泽思巴）为大乘法王（俗称萨迦姑玛、萨迦法王）。明朝中期，细脱、仁钦岗、拉康3个拉章传承断绝，都却拉章则再分为彭措（圆满宫）和卓玛（度母宫）2位颇章，两房的长子轮流担任萨迦法王。西元2017年起更改制度，由两宫诸位法王子轮流担任法王，一任三年；现今萨迦法王为第42任的大宝金刚仁波切。
着名寺院.三大寺：还有西藏贡噶县的贡嘎曲德寺、林周县的那烂陀寺，四川德格县的更庆寺/贡钦寺、若尔盖县的求吉寺，青海玉树县的结古寺