婴儿造成严重的影响。性传染病的会造成死产、周产期死亡、低出生体重儿及早产、败血症、肺炎、及先天性障碍。怀孕时的梅毒已造成每年超过三万名婴儿及新生儿死亡，也增加21万名婴儿因为早产、体重过轻或是先天性障碍而死亡的风险。像披衣菌感染及淋病等疾病是造成骨盆腔发炎（PID）的重要原因，也可能会导致女性的不孕。像生殖器疱疹及梅毒等疾病也会让受到人类免疫缺陷病毒感染的风险增加三倍，也会影响其传播过程。。性传染病常常和不安全性行为有关，也常常是女性未同意下进行的性行为。
残割女性生殖器.残割