了此后驻藏大臣的权力，《清史稿》等说使清朝丧失了对西藏的财权和兵权。
上司.驻藏大臣的奏折通常送交军机处处理，但在有危机时由四川总督代递奏折，因为对西藏的任何行动都会交由四川总督办理。西藏进贡和西藏与青海、甘肃、蒙古的贸易则由理藩院办理。
僚属.驻藏大臣的下属有理藩院司官夷情章京，辅助管理霍尔三十九族（即藏北三十九族）的土纳马赋事务。另有随印笔贴式一人，以及粮台、把总等低级官吏。达木蒙古八旗佐领直属于驻藏大臣。驻藏办事大臣与帮办大臣名义上为一正一副，实