拔位于3.5米以上，吴淞地区的海拔则在2.8米至4米之间。陆地底部的基岩呈现南浅北深的情况。大场地区的基岩位于地下270米左右，顾村、吴淞地区则深约300米，罗店、月浦则深达340-350米左右。大部分地区的基岩为侏罗纪底层，罗店、大场在此基础上还留存寒武纪底层。位于基岩之上的，隔水层和含水层。由于濒临长江，因河流作用，构成了五个承压含水层。含水层和隔水层之上则为硬土层。
水文.长江流至崇明岛时分为南北两支，其中南支又于吴淞口外经长兴岛、横沙岛等分割为南港与北港。宝山即位处于长江口