石化是指有机物通过置换或有机物孔隙充填矿物而转化为石头的过程。石化通过两种相似方式的结合——矿质充填作用和置换而发生。硅化木是最常见的石化现象，但是所有有机质，从细菌到植物都可以石化。相关的学科有地质学和埋藏学。
分类.生物体形成化石都有一个掩埋过程。否则就会被分解者分解，然后在风化作用下消失。化石可分为实体化石、模铸化石、分子化石和遗迹化石四类，不同的化石有不同的形成方式。实体化石是因为生物体被琥珀包埋，或被冰雪覆盖，或陷入沥青湖中，经碳化作用而形成。