湾糖业的主要出口对象仍然是日本，借此换取制造火器需要的铜铅等金属，1682年时输出到长崎的糖有9,923担，此外在1677年5月有一笔英船福尔摩沙号载运台湾糖到印度的记录。
清治时期.台湾为清朝所统治之后，制糖业依然持续发展，而糖廍主要集中于今天的台南一带，清末时有八成糖廍都集中于此。而相较于荷兰与明郑对糖业採取政府掌控专卖的态度，清朝对于糖业的发展较为自由放任，不过基本上不太鼓励制糖，而是鼓励种稻，如高拱干的《台湾府志》中便有收录〈禁饬插蔗并力种田〉一文。清朝初期台湾糖进入中国大