29届省港盃次回合赛事，28分钟，陈肇麒把握广东队守门员一次失误门前剷射入网，为香港队反超前2–1，机警的陈肇麒成为一时佳话。结果香港队以4–2力挫广东队，以总比数4–3夺得第第29届省港盃。2009年8月25日，在高雄举行的东亚足球锦标赛外围赛，对北韩一战中，陈肇麒在上半场主射12码中楣不入，令香港队失去嬴波机会，结果只能与有日联前锋郑大世领军的北韩一打成0–0。2009年8月27日，在高雄上演的2010东亚盃外围赛最后一战，香港凭陈肇麒个人完成「大四喜」射入4球，协助香港以12–0狂数关岛，凭得失球