瑞正想借孙中山逝世的机会推翻广东政府，乃改广东南路八属为特区，任命邓本殷为八属善后督办，申葆藩、黄志恒为会办，邓本殷还获将军府授“植威将军”、陆军中将。段祺瑞另外派出军舰帮助邓本殷守卫琼崖。
遭国民革命军击败.1925年8月，廖仲恺遇刺身亡。此后，建国粤军参谋长兼黄埔军校校长蒋介石驱逐粤军总司令许崇智，驻四邑的一部分粤军乃转投邓本殷。邓本殷乘机进攻广州国民政府。1925年9月，邓本殷命苏有廷同梁鸿林师自两阳进攻江门，并电请北京政府援助。10月中旬，北京政府封邓本殷陆军上将衔，支