酶A羧化而形成的。一分子乙酰辅酶A与一分子碳酸氢盐相结合，其中需要三磷酸腺苷以提供能量。丙二酰辅酶A被一种称作丙二酰辅酶A：酰基载体蛋白转酰基酶（MCAT）用于合成脂肪酸。MCAT负责将丙二酰辅酶A上的丙二酸基团转移到完全酰基载体蛋白（ACP）末尾的硫醇上。
聚酮生物合成.MCAT同时涉及到细菌中聚酮生物合成，这一事实是很少有争议的。脂肪酸MCAT与酰基载体蛋白（ACP）、聚酮合酶和链长因子异质二聚体一起，组成了II型聚酮的多聚乙酰合酶。
调节.在脂肪