港铁接手后，同时负责4号线二期的兴建，因此4号线二期的建筑风格和4号线一期以至深圳地铁其他路线的风格不同。二期每个车站都採用颜色接近的马赛克砖粉饰墙身，而每个车站的色调都会和其他车站不同，相关风格可在港铁早期车站（由前地下铁路公司设计研究组设计）如观塘线和荃湾线中找到，如莲花北站使用蓝色色调，与九龙塘站和金钟站接近。二期车站墙身也会贴上剪纸形状的图案，这些图案风格上和两铁合併后在东铁线和马鞍山线各车站找到的接近。此外，4号线二期车站的洗手间都设在车站站厅的付费区内（按前九铁标准设计），这和4号线一期甚至