流放巴蜀。没几日，王世充仇家独孤机的儿子独孤修德，趁着防守不备杀掉了王世充及其兄长，高祖仅罢免了独孤修德的官位，后来其他王氏亲族也以谋反罪被处死。窦建德被杀害后，昔日部下将士愤慨，推刘黑闼为王，半年内收复窦建德的旧地。武德六年（623年），刘黑闼被李建成平定。
影响.虎牢一战，彻底扭转中原的情势，李世民一举平定窦建德、王世充两大集团，统一中国北方，奠定唐朝版图基础，军功显赫，高祖特设天策上将册封李世民，也间接导致日后的玄武门之变。