1969年，郭国基因直肠癌赴台大医院手术。一度赴日本接受钴六十放射治疗。同年3月，〈动员戡乱时期自由地区中央公职人员增补选办法〉公佈，举行增选立法委员选举，为国民党政府迁台来首次立委增选补选。本次立委为终身职。郭国基以「助我进军立法院」为号召，投入台湾省第二选区参选，选区包括彰化、嘉义、云林、台南、高雄、屏东、台东、花莲、澎湖九县及台南、高雄二市，郭国基在十五天竞选过程中耗尽精力，成功当选立法委员。在立法委员就职典礼上，当记者问他到国会后第一件事要争取什么。郭国基不假思索回答「成立反对党：没有反对党，说