建造实验场破坏地球。在虚拟世界中，有一些人发现自己是生活在虚拟世界中，称为“引导者”。“引导者”的目标就是为了把所有数据化的人类重新还原到现实世界，成为引导者后，会被传送到“海神号”，成为“枪手”或“术士”并和世界蛇对抗。主角是快活的游泳少年，他在千叶县近郊的高中上学，是个忙碌于恋爱和友情的普通高中生。但是，有一天在神秘的转学生紫雫乃的引导下，被卷入了异世界的巨大机器人的战斗中。于反复的战斗中怀抱着各种疑问并且苦恼着的京，为了保护自己与同伴而挺身投入战斗之中……