复杂的技术，要费时一週才能使用，使用聚合酶连锁反应技术则时间缩短至一小时所以仅需一小时的聚合酶连锁反应技术能节省大量时间和繁复的操作，聚合酶连锁反应技术被广泛地运用在医学和生物学的实验室。穆利斯因此获得日本国际奖和诺贝尔化学奖因为聚合酶链式反应是1990年代之后分子生物学发展过程中重要的技术。因此其专利之争不断，包括穆利斯的学校史丹佛大学、与穆利斯一同研发的（Cetus公司）、买下鲸鱼座公司使用聚合酶连锁反应检测HIV检测技术的Roche公司也声称拥有专利。至今一直是个复杂的问题。