当主上杉显房（持朝之子）亦被杀死。幕府决定讨伐足利成氏，令骏河守护今川范忠率领幕府军攻进镰仓。战败的成氏转到下总古河城，自称古河公方并继续抵抗，成氏集结对上杉氏反感的关东的诸将，以关东地方附近的利根川为境线，东侧的古河公方阵营与西侧的关东管领阵营对立（享德之乱）。康正元年（1455年），在品川凑附近建造太田家居馆。同年12月，晋升为正五位下备中守。康正2年（1456年），受道真（父亲资清的法名，在文安4年（1447年）之前出家）让予家督之位。以后辅助上杉政真（显房之子）和定正（显房之弟）扇谷家两代，