核糖体DNA（Ribosomal DNA，rDNA）是一种DNA序列，该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合，翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。如该图所示，真核生物的rDNA包括一个单元段，一个操纵子，以及由、、、、、和束组成的串联重复序列。rDNA的还有另一个基因，由5S rRNA基因编码，位于大多数真核生物的基因组中。5S rDNA序列也存在于果蝇的串联重复序列。
重复单元的序列同质性.在大型的rDNA序列，rDNA的之间的多态性非常低，这表明rDNA的串