智鸿再获委任为医管局成员，2002年10月出任医管局主席，2004年7月，因任内爆发沙士责任问题而辞职。在任期间，他曾积极推动医疗融资改革，及扩大医管局董事局职能。2005年10月，他重返政坛，获新任行政长官曾荫权委任为香港行政会议成员。同时他接替谭耀宗出任安老事务委员会主席。梁智鸿现为私人执业泌尿科医生，标准工时委员会主席。梁智鸿分别于2001年及2010年获颁授金紫荆星章及大紫荆勋章。2019年8月1日，香港城市大学公布，梁智鸿将获颁授荣誉社会科学博士学位。