上洛后，道三亦替其诊症，并且获赏赐名香。道三的作品除了《启迪集》外，还有《药性能毒》、《百腹图说》、《正心集》、《指南针灸集》和《辨証配剂医灯》等，门下学生数百人，闻名全国。天正12年（1584年），道三替丰后府内的耶稣会传教士诊症，因缘际会下信奉基督教，并且受洗，洗礼名是Bellshawl。天正20年（1592年），道三获后阳成天皇赐姓橘氏和今大路的家号，及后在文禄3年（1594年）1月4日死去，追赠正二位。道三死前收其侄为养子，以后代代均担任官医。