。由于具有团结权，职员可依国公法规定自由成立或加入劳动组合「」（国公法第108条之2第3项）。2018年3月31日现在人事院登录的职员团体有七个联合体、6个单一体、52个支部。人数2万6,598人，组织率67.5%。组织率在13府省厅2院中仅次于农林水产省（72.6%）。现在的主要组合有全厚生职员劳动组合（全厚生）、（全医劳）、全劳动省劳动组合（全劳动）、东京职业安定行政职员劳动组合（东京职安劳组）、大坂劳动局职业安定行政职员劳动组合、沖縄非现业国家公务员劳动组合劳动支部、以及中央劳动委员会事务局劳动组