胁到统治台中一带的大肚王国，双方的冲突已无法避免。永历二十四年（1670年）大肚社、沙辘社、斗尾龙岸社举兵反抗，这次事件规模不小，就连郑经自己也亲征。刘国轩先后击败沙辘社、大肚社，将沙辘社的平埔族从数百人屠杀只剩6人，逼迫大肚社迁往埔里，水里社（原位今龙井区）逃往水里。再和郑经一起进攻斗尾龙岸社，双方互有胜负，残余居民退守山区，郑军只烧毁其聚落就撤退。
粤东战役.永历二十八年（1674年）郑经响应三藩事变，却因为领土纠纷和耿精忠决裂，耿精忠派20000人进攻泉州，郑经派刘国