后，此版本护照理论上可使用至有效期届满（即2012年9月15日）为止。但是，由于ICAO后来规定成员国护照必须为可机读格式，因此部分国家自2010年4月起已经不再承认1995年版护照。
2006年版护照.2006年，外交部与菲律宾中央银行合作推出新一代可机读护照，但由于发行计划遭受司法覆核，最后延至2007年9月17日才正式发行 （而公务及外交护照，则早三个月开始改为新版相比上一代护照，2006年版封面改用酒红色，但图文设计不变；而内页则由旧版的32页增至44页，并将资料页改为可