为新的主教练，率队征战2011年中超和亚冠联赛。2011年赛季初期，上海申花虽然在亚冠赛场表现不佳，但是在联赛中仍然发挥出主场强大优势，一度占据积分榜三甲。不过进入7月后，球队再次遭遇夏季战役不利的问题，连续六轮不胜下，俱乐部最终决定调整教练组，由克罗地亚籍教练拜塞克出任主教练，而奚志康重新成为助理教练。2012年12月底，奚志康离开申花，加盟上海东亚，担任助理教练。2013年12月，奚志康正式担任上海东亚主教练。2014年11月18日，受聘为新成立的上港集团足球俱乐部领队兼助理教练。