兄长神圣罗马帝国皇帝鲁道夫二世并无帮助其弟争取波兰王位，亦因此事大大损害了鲁道夫二世的声望。1593年至1595年，马克西米连担任其年轻的侄儿内奥地利大公斐迪南三世的摄政。1602年，马克西米连为他的兄长鲁道夫五世管理蒂罗尔和外奥地利，他在当地是反宗教改革的坚实倡议者。1612年，马蒂亚斯任命马克西米连为外奥地利大公，被称为总督-大公。另一方面，他用心辅助斐迪南三世，废除并囚禁反对斐迪南三世继位的主教梅尔希奥·克莱斯尔，为斐迪南三世铺路顺利继承为奥地利大公。1618年，马克西米连三世于维也纳逝世，被