能接受自己在纳粹罪行中扮演的角色，期间，维森塔尔常被忽略，甚至被揶揄。多年来，维森塔尔接过多次死亡恐吓。1982年，德国和奥地利的新纳粹份子在他维也纳的家外引爆炸弹。维森塔尔90岁后仍常留在位于维也纳的犹太人档案中心的细小办公室中工作。2003年4月，维森塔尔宣布退休，声称他已找到他要找的屠杀者，又说：「我比他们活得久。如果仍有漏网之鱼，他们已衰老得不能接受审判。我的工作已经完成。」根据维森塔尔，最后一个仍在生的奥地利主要战犯是阿罗伊斯·布鲁纳尔（Alois Brunner），他是阿道夫·艾希曼