员。6月6日，裴恩才因联赛成绩欠佳而下课。6月21日，赵发庆成为重庆俱乐部新任主教练。重庆队后来居上以南区预赛第二名晋级决赛阶段。11月，球队在半决赛客场击败东莞南城升入中甲联赛，但其后在主场进行的决赛不敌哈尔滨毅腾获得乙级联赛亚军。2012年随着重庆市政府领导的异常变动，重庆足球俱乐部的经济状况开始恶化，多名主力球员遭遇欠薪。赛季结束后，重庆足球俱乐部一度险些被转让给乙级联赛球队青海森科，但后来由于欠薪等问题，最终未能达成协议。2013年重庆队在中甲联赛未能保级成功，在积分榜上排名倒数第二降入乙级