999年转投乙级球队河南建业，再次以主力前锋的身份帮助球队升级成功。2000年底，钟俊被河南建业挂牌。由于无人摘牌，钟俊选择了退役。
裁判生涯.钟俊在2000年退役后，回到武汉体育学院教书，之后成为一名足球裁判。2012年中国足球超级联赛大连阿尔滨主场与北京国安的比赛中，钟俊曾将主队主教练斯塔诺耶维奇驱逐出场，主队球迷认为钟俊漏判给主队一个点球；客队则认为主队球员皮特·乌塔卡严重犯规本应吃一张红牌，钟俊却只给了一张黄牌。北京国安队医张阳在比赛中谩骂钟俊，事后被停赛、处以罚款。