细川澄元、细川高国展开混战。次年，西国霸主大内义兴向中国地方和北九州的大名、国人发出动员令，拥立前将军足利义材和细川高国上洛。尼子经久应大内义兴之邀，参与上洛，参加了1511年的船冈山之战。尼子经久的次子和三子也分别拜受细川高国和大内义兴的偏讳，改名为尼子国久和盐冶兴久。但由于尼子经久不满大内义兴微薄的赏赐，提前离开京都返回领国，支援反大内势力。1512年，尼子经久支持备后国大场山城城主古志为信反叛大内家。1515年，应邀上洛的武田元繁返回领地后与大内义兴养女离婚，转而与尼子经久弟弟尼子久幸的女儿结为姻亲，