聪等被杀于杭州，祁班孙、李谦汝等百余人遣戍宁古塔，其兄祁理孙抑郁而死。杨宾之父杨越亦受牵连流放宁古塔，最后死于戌所。陈三岛在事发前忧愤死。于元凯被孝庄皇太后赦免后，不知去向。清廷兴通海大狱滥杀无辜，株连甚广，“其时被祸者衣冠之族八十三家”。计六奇《明季南略》载：“金坛因海寇一案，屠戮灭门，流徙遣戍，不止千余人。”