32年初哈尔滨被日军占领。东三省防疫事务总处的中外专家陈永汉、林家瑞、伯力士（Pollitzer，R.）、叶默（Jettmar，H.）等人追随总办兼总医官伍连德博士赴上海，加入南京国民政府卫生署海港检疫管理处，继续开展卫生防疫工作。1933年7月，满洲国民生部接管了东三省防疫事务总处，改为卫生实验所。1934年11月3日，改称卫生技术工厂哈尔滨分厂，从事疫苗制造、卫生试验检查、病原检索研究等等工作。
建筑.防疫处筹建时最初的办公地址是哈尔滨海关大楼，1990年代被拆除，原址兴建