和第十八旅向江北转移，进入江都、宝应、高邮地区。所部十六旅遭偷袭后，谭震林返回苏南兼任十六旅旅长，整顿部队。1942年3月，谭震林任新四军第一师兼苏中军区政治委员，10月调任新四军政治部主任。1943年2月，谭震林担任新四军第二师兼淮南军区政治委员，与罗炳辉领导淮南新四军反击日军扫荡，并扩大根据地。1945年，谭震林当选中共第七届中央委员。
第二次国共内战时期.中日战争结束后，中共部队战略调整，新四军主力进入山东。11月宣布正式成立成立华中分局，谭震林为副书记，华中留下的新四军合并