有找到的2人亦被船长吃掉（船长否认）。6月，警察依杀人、尸体遗弃及尸体损坏嫌疑拘捕船长。船长对警察承认曾吃掉1名船员的遗体，但就否认有杀人。检察最后依尸体损坏嫌疑落案起诉船长。由于刑法无食人相关规定，审讯中未就食人提出控罪。8月，法庭判定本案中紧急避难不成立，同时认定船长犯案时精神衰弱，判监1年。1954年，武田泰淳发表事件改编小说《光苔》。
民间传言.船长食人一事当时未有报章报道，而是经口耳相传逐渐传开。由于法庭记录已被销毁，案件调查记录亦在战后发生的火灾中付之一炬，