，一些上层分子勾结权势，并借故敛财。宋宁宗庆元、嘉泰年间，再一次遭到禁止。元朝灭南宋后，白云宗势力进一步发展，徒众多达数十万人，皆以出家为名不纳赋税。于是元成宗大德七年（1303年），中央政府令白云宗田产依例输租，徒众与民一体负担赋役。经过整顿后，元武宗至大元年（1308年），白云宗再次获得合法地位。元仁宗延祐二年（1315年），白云宗宗主沈明仁一度被授予荣禄大夫、司空等荣职。但不久，元朝政府再度出手打击白云宗。延祐六年（1319年），沈明仁坐罪入狱。延祐七年（1320年），朝廷诏籍白云宗僧者还俗。元英