因为天之御中主神在神话故事中没有详细情节，也没有与日常生活息息相关，以往很少成为祭祀对象。中古时代以降，寺院与阴阳道开始祭祀此神。发展迄今，可区分为妙见社及水天宫、东京大神宫、等三大流派系统。妙见社奉中国道教的玉皇大帝为最高神祇，且调合（道教的）北斗七星、（佛教的）妙见菩萨等神明，直到平田笃胤确立了祭拜北斗七星之神的规则。明治时代初期日本政府设置尊皇爱国思想教化的机关大教院（），有某些神社趁此机会改主祭天之御中主神。千叶氏的、的九户神社、琦玉县的等神社皆隶属主祭此神祇的妙见社系统。光是在千叶县立案登记