马永琳叛军，连破高家集、三甲集，打通了道路。曾在左宗棠手下镇压过1860年代和1870年代的同治陕甘回变的董福祥在当年十一月成为甘肃提督，总统甘军，前敌诸将均归其节制。他统领左宗棠曾在当地招募的民兵。又自请援西宁。次年（1896年），克上下五庄，乘胜收复大通、多巴，奉朝命驻西宁专务剿抚，并统领魏光焘二十七营。叛首刘四复奔关外，董福祥派骑兵追杀，攻克卡尔冈，先后攻克海城、冶诸麻、甘州南山的叛军堡垒，新任固原提督邓增会合甘军搜治海城叛乱回民。当年春，关内外甘肃、青海再度平定。董福祥在平乱过程中，收编了马福禄自己