法加以赦免。以得炀帝欢心。以后刑罚无论大小都由他经手，刑部、大理不敢违逆。薛道衡批判炀帝诛杀高颎，而被陷害而死。苏威进言中止高句丽远征，而被剥夺官位，都有裴蕴谗言的作用。杨玄感之乱后，炀帝受意裴蕴，将参加反乱者数万人处死。618年，在扬州宇文化及、司马德戡策划对炀帝的宫廷政变，江阳县长张惠绍报告裴蕴。裴蕴便假造诏勅命来护儿率兵，在城外捕宇文化及同党。同时，计划派遣范富娄闭宫门，以救炀帝。裴蕴将这个计划报告虞世基，虞世基不信宇文化及会反乱，裴蕴计划不得实行。宇文化及作乱，裴蕴与炀帝、虞世基同时被杀害。