之后宰相宗楚客、纪处讷陷害魏元忠参与重俊之变，因为魏元忠的儿子魏升参加了李重俊的起事。杨再思附和宗楚客、纪处讷，最后魏元忠被贬为务川县尉，死在途中的涪陵。九月，杨再思重任中书令。708年春二月十五，杨再思升职为尚书右仆射（尚书省长官），同中书门下三品，景龙三年夏六月二十三日（709年8月3日），杨再思去世，年七十六，赠特进、并州大都督，陪葬干陵，谥号恭。前夫人河东裴氏，新都县主，后夫人清河张氏，合葬陪于干陵。弟杨季昭为考功郎中，杨温玉为户部侍郎。子杨祯，司勋员外郎；孙杨献，汝南太守；曾孙杨和。