运总站车站后第二复杂的转车站。截至2015年，大西洋大道-巴克莱中心车站是布鲁克林最繁忙的地铁站，每年有13,617,153人次进出，排行纽约地铁第21位。自1980年起其控制室就被列入国家史蹟名录，而车站复合整体则于2004年列入国家史蹟名录，并可无障碍通行。
车站结构.车站设有三层。离地最近的一层为IRT东公园道线月台，与长岛铁路月台同层，位于地面以下20英呎。第二层为BMT第四大道线月台，深40英呎并设有夹层和一条通往IRT东公园道线和BMT布莱顿线的通道，均位于其月台上方。