印尼国内政治长期动盪不安，在内斗之际，有心人士刻意操弄族群对立，无辜牵连华裔。印尼在1997年和1998年出现多起暴动行为，且明显是专门针对印尼华人。有些暴动看似是自发性，而有些则被认为是幕后策划。其中有说法指出：「支持苏哈托的将军们」试图通过分裂穆斯林中的传统派和非传统派别，穆斯林与基督徒，乃至华人和土着，来达到『削弱反对势力』的目的。」也有些说法认为是某些将军想推翻苏哈托的统治而计画。中国主流媒体都认为，这次暴动是有组织且有预谋的暴乱活动，印尼军方也参与其中。当时苏哈托为转移金融危机压力，缓和国