熙元年（306年）因参与迎惠帝回洛阳而封武陵县侯，后任尚书郎和濮阳太守。次年，当时是瑯琊王的晋元帝司马睿移镇建康后，王廙便弃官南迁至建康，并获司马睿任命为司马，及后多次守备鄱阳和庐江二郡以及参与平定周馥和杜弢的判乱。建兴三年（315年），王敦因忌荆州刺史陶侃的功勋，调陶侃任广州刺史，而以王廙为宁远将军，接任荆州刺史。当是荆州将吏郑攀和马隽等向王敦请求让陶侃留任荆州，但王敦怒而不许。二人见陶侃虽然有平灭杜弢之功但却遭南贬广州，且荆州群众怨愤，于是与杜曾联手进攻前来上任的王廙，王廙因而被逼移守江安，而杜曾等