再也无法小便，就算是一点点的量也带来难以忍受的疼痛。在他去世前一天晚上，他患了精神错乱，期间他常常听到惊唿，他希望他此生没有白活。临死前他要求克卜勒完成Rudolphine表，并表示希望他採用第谷的行星系统，而不是哥白尼的。现代的医生将他的死归咎于肾结石，但在1901年进行尸检的过程中并没有发现肾结石从他的身体被挖掘出来，而现代医学的评估是，第谷更可能罹患尿毒症，最近的调查表明，第谷没有死于泌尿系统的问题，而是从他的头发、胡子发现汞剧毒的中毒现象结果，然而没有定论。2010年2月，布拉格市政府批准丹麦科