和二十三年（499年）正月，南齐萧宝卷命陈显达等攻打荆州，元英连战失利。车驾至南阳，免去元英官爵。同年四月，孝文帝因病退兵北还洛阳，于途中驾崩，其太子宣武帝元恪即帝位。宣武帝重新起用元英，重新出任尚书、广武伯。萧宝卷又派遣将军陈伯之攻打淮南，司徒、彭城王元勰镇守寿春，以元英为镇南将军，率大军征讨。元英未至，敌军早已引退。元勰回京，朝廷下诏元英行扬州事。其后元英回京，在南齐雍州刺史萧衍拥戴萧宝融，攻打萧宝卷时，上表请求南伐：「臣闻取乱悔亡，有国之常道；陈师鞠旅，因机而致发。窃以区区宝卷，罔顾天常，凭恃山河