内后，耿飚率部在江界渡口强渡乌江，攻占娄山关，为红军主力开辟前进通道。遵义会议后，升任红一军团一师参谋长。继又率部通过彝族地区，抢渡大渡河，夺占泸定桥，随军抵达陕北。1935年11月，率部参加直罗镇战役，在攻打甘泉时颈部负重伤。1936年2月，率部参加东征战役，此后进入抗日军政大学学习。12月，任新到达的红四方面军红四军参谋长。
抗日战争与第二次国共内战时期.抗日战争开始后，耿飚任八路军一二九师三八五旅参谋长、副旅长兼副政治委员，驻守甘肃东部，负责保卫陕甘宁边区的西部边境。1941