馆最初位于设于东京都港区六本木5丁目6−20，不过原先的规划仍只是短期经营的博物馆，从2016年4月23日营运至2018年9月24日。在六本木的近两年半期间，史努比博物馆共吸引了超过130万人次前来参观，因此在2018年闭馆前，营运方决定在东京都的町田市的开设长期营运的新馆，而在重新开馆前，博物馆的展示内容则先后至大坂市和名古屋市举办「SNOOPY博物馆展」。位于町田的新博物馆在2019年12月14日开幕启用。
历年展出主题.最初在六本木时期，博物馆的展出内容以约半年为一个