办客运，为地方交通主力；由窄轨轻便铁道接驳至纵贯线车站，再转乘大火车至其他主要都市。日本政府的兴建铁路政策被国民政府批评为掠夺殖民地资源。历任部长有：后藤新平、长谷川谨介等。
海港.为了改进台湾海运运输，日本政府整建了基隆港，并花费鉅资建造高雄港，使其成为可停靠大量船只与吞吐货物的现代化港口。此外，为了改善东部与离岛交通，也兴建花莲港与马公港。
运河.日治时期亦兴建数条运河供船只通行，代表作为台南运河。
水电基础建设整治.