为水上飞机训练。1941年7月5日，航校组建了歼击机第8团与第9团。1941年9-10月，抗击德机进攻战斗了131批次。随后又组建了装备И-15бис的第10团。1941年9月16日苏联人民委员会 ВМФ № 0895 命令，学校疏散到北奥赛梯的莫兹多克。1942年11月15日并入了位于古比雪夫州的的赛兹兰航校。1943年秋，叶伊斯克被解放，航校旧址已经完全被德军摧毁。整个战争期间，共组建9个航空兵团、18个飞行大队，3500名飞行员。1945年，学校开始培养歼击机飞行员。装备了、拉-7、雅克-9