43年任三青团中央团部评议员。1945年当选国民党中央执行委员。抗战结束后，任武汉大学复校委员会主任委员、武汉大学教务长。1948年被聘为国立北平研究院学术会议社会科学组会员。1949年返回武汉任教。中华人民共和国成立后，杨端六于1950年出任中南军政委员会财政委员会委员。1956年加入中国国民党革命委员会。1957年被划为“右派”。文化大革命初期于1966年9月在武汉因病逝世，享年81岁。
家庭.杨端六之妻为号称“珞珈三女杰”之一的女作家袁昌英。他们二人育有一子一女。女儿杨静