hem>2 H^+</chem>和<chem>\frac{1}{2} O2</chem>则留作之后使用。 然后，光系统反应核心中心周围的光合色素吸收一个光子。 光激发这些色素中的电子，引起连锁反应，最终将能量转移到光系统II的核心，并激发主要电子受体脱镁叶绿素的两个电子。 电子的不足由另一个水分子中的电子来补充。 电子从脱镁叶绿素传输到质体醌 ，它从脱镁叶绿素接受<chem>2 e^-</chem>，从基质接受两个<chem>H^+</chem>离子并合成<chem>PQH2</chem>。它后来被分解成<