肇庆达成的协议，显示独立反袁的意志，将4月6日广东宣布独立后即逮捕的蔡乃煌交由谭学衡公开枪决。1916年5月1日，两广都司令部在肇庆成立，岑春煊任都司令，梁启超任都参谋，李根源任副都参谋，章士钊任秘书长。5 月5日，梁启超、李根源、张鸣岐等人赴广州越秀山会见龙济光进行商谈。龙济光派部下以武力威胁梁启超。事后，梁启超在致蔡锷的电文中称，此次广州之行“饮泪言和，奋身入虎穴，鸿门恶会，仅乃生还。”5月8日，云南、贵州、广西、广东等独立省份为统一军事及对外交涉，在肇庆成立中华民国军务院，唐继尧任抚军长，岑春煊任