，港口实现了飞跃性的发展。因此在1741年，龟田番所由龟田迁至箱馆。另外在1785年，在箱馆还设置了长崎俵物会所，箱馆成为北国的海产品的集荷据点。据《东游记》记载，和松前及江差相比，无论风向如何，箱馆凑都利于船舶停靠。进入19世纪后，幕府于1801年（享和元年）在内涧町开凿了水渠。在1804年（文化元年）修建了人工岛，并且在岛上建造了造船厂，1811年（文化8年）又修建了沖之口番所。被任命为虾夷地御用定雇船头的高田屋嘉兵卫以箱馆为据点，开展箱馆和国后岛、择捉岛、根室之间的贸易，对箱馆的发展做出了贡献。