后的侏罗纪和早白垩世达到了鼎盛时期，广泛分布于世界各大洲，但在赤道地区和南极洲没有发现报道。当被子植物于早白垩世晚期迅速崛起时，银杏类像其它裸子植物一样也急剧衰落。晚白垩世后除个别发现外，银杏科以外的银杏类植物已基本绝迹。晚白垩世和古近纪，银杏（主要为银杏属"Ginkgo" 和似银杏属"Ginkgoites"）在欧亚大陆和北美高纬度地区呈环北极分布，渐新世时由于寒冷气候不断向南迁徙，并在此之后不断衰落。中新世末在北美消失，上新世晚期在欧洲消失。而东亚是银杏类植物的最后栖息地。中国的银杏大化石纪录始于始新世；