水港厅与台南厅，厅之下设支厅，台南厅之下有安平、噍吧哖、湾里、关帝庙、大目降、车路墘六个支厅，盐水港厅之下有新营庄、六甲、北门屿、萧壠、店仔口、前大埔、蔴荳七个支厅。而在明治卅六年（1903年）时，由于台南市（府城一带）区分复杂，所以临时土地调查局将之用天干自甲到辛分成八区。明治四十二年（1909年）10月25日实施十二厅制，原有的盐水港厅被分割，六甲、北门屿、萧壠、蔴荳归台南厅，盐水港、店仔口归嘉义厅。而在明治四十三年（1910年）1月18日公布的第三号告示中，台南市（原府城地区）分成东西两区，底下又分