源头。卡通河的源头位于海拔高度为的别卢哈山，这也是西伯利亚最高的山，位于卡通自然保护区的东部边缘。国际上来讲，卡通自然保护区是重要的生物多样性中心，构成了阿尔泰金山世界文化遗址的一部分。
地貌.卡通自然保护区涵盖了多种地貌，包括冰川、高山苔原、草地和森林。大部分地形是通过冰川形成的，同时还有小型湖泊、溪流、瀑布和陡峭的斜坡。
气候.卡通自然保护区属于高山气候。这表明当地的气候，其中至少有一个月的平均温度高到足以融化雪，但没有一个月的平均温度超过10 ℃（5