，甚至经常譁变，最后为明亡埋下伏笔。
衰弱.卫所制代有世兵制及屯兵性质，指挥使以下世袭，日久则军官、将官众多，底层军户无论生活压力，或战事兵役皆遭遇压迫，终难避免历代兵制的轮回。明初举国卫军270万，不费百姓一粒米，但最终仍如王船山评断府兵制之言：「府兵者犹之无兵也。」
清初卫所.因卫所并非单纯的军事组织，也同时是地方行政组织，清初继承了卫所制度，到雍正年间改革行政区划，才完全被淘汰。卫所或被废除，或改设为府、厅、州、县。