蜜蜂（Apis mellifera）相比，最显着的是，东非蜂（Apis mellifera scutellata）围绕蜂巢、成群叮咬敌人的防守行为。东非蜂体型也稍微小一些，其差异只能使用显微镜确定。欧洲的蜜蜂比东非蜂更能承受寒冷的温度。欧洲蜜蜂一般每年能繁殖两次至三次，但东非蜂每年繁殖次数则高达17次。东非蜂需面对恶劣干燥多变的环境与大自然许多的掠食者而演化出非常强烈的性情，环境不利容易弃巢迁徙。东非蜂相对于其他蜜蜂亚种投注更多的资源在蜂群的增殖上，即使天灾使大多数的蜂群灭亡，少数存活的蜂群仍能逐渐恢复