1年，孙立人兵变案的关键证人郭廷亮，在获得假释以后，在桃园县中坜的火车上坠落而死亡，死因极为离奇，学者怀疑长期监控郭廷亮的警备总部可能涉入。
后续调查.在孙立人兵变案发生后，监察院也由中国国民党籍监委陶百川、无党籍监委曹启华、萧一山、王枕华、余俊贤等「五人小组」自行发动调查。但监察院五人小组的报告，认为孙立人无罪，与陈诚九人委员会的结果不同。2001年1月8日，监察院通过决议，称孙案乃「被阴谋设局的假案」。中央研究院近代史研究所朱浤源教授获政府新台币六十万元经费补助，就孙立人兵