中心方向终点站为政府中心站。E支线也被称作“希思街线”（）或“亨廷顿大道线”（），在科普利站与其他支线分开，向西南方向进入亨廷顿大道地铁隧道。列车从东北大学和波士顿交响大厅之间的隧道出入口来到地面，沿着亨廷顿大道行驶，终点站为退伍军人医疗中心附近的希思街站。1985年之前，E支线终点为的。，E支线北方终点站为莱希米尔站。
已关停支线.于1969年停运，曾经在派卡角站分叉口与B支线分开驶向奥尔斯顿，其终点站为。尽管该支线在停运前2年就被分配了字母A，但该支线的列车从未使用过A标志