队驶入凤山（今高雄市凤山区），包围台湾府城。嘉庆十二年冬十二月（1807年）李长庚与福建水师提督张见陞在广东黑水外洋合击蔡牵，蔡牵在只剩大船三艘的情况下于船尾发炮、开枪，狙杀了李长庚。
败亡.嘉庆十四年（1809年）李长庚部将王得禄、邱良功分接任福建、浙江提督，合兵围攻蔡牵于浙江台州渔山外洋，血战一昼夜，蔡牵之妻也是海盗，能督造炮弹。蔡牵弹丸射尽竟以银元为弹。次日寡不敌众，开炮自炸座船，与妻小及部众250余人沉海而死（一说蔡牵自搂金锚投海自尽），余众四千人降服。