纪初因俄国汉学家的使用而传播开来。1930年代，“东突厥斯坦”成为新疆操突厥语族语言、信仰伊斯兰教的反叛者反对中国政府当局的战斗口号，并先后建立了东突厥斯坦伊斯兰共和国和东突厥斯坦共和国两个政权。20世纪末，受泛伊斯兰主义和泛突厥主义影响，新疆再度出现分离主义情绪，分离主义者用“东突厥斯坦”指代整个新疆或他们希望在新疆建立的独立国家。中国官方则反对使用该词指代新疆，认为使用该词是对中国主权的挑衅。
应用情况.“东突厥斯坦”一名的使用与政治议题紧密相关。由于中亚、新疆一带的民族多样性