歇特和洛克罗伊的腹足类分类 (2005年)的新生腹足类支序被放置于"Zygopleuroid group"之下。更早期时，深水螺总科被划归Loxonematoidea。之后，深水螺科及其姊妹群组科在Kain et al. (2008)的文献被移入深水螺总科（Abyssochrysoidea Tomlin, 1927）。