行V(D)J重组以产生具多样性的抗体时，由RAG蛋白作用所造成的DNA断裂，也是需要NHEJ来进行善后工作的。
细胞週期检查点与DNA修复的相关性.除了既有的DNA修复机制，细胞还有一项用来对抗DNA损害生成的武器，那就是细胞週期检查点（cell cycle checkpoint）。对于一个持续进行週期的细胞，若DNA遭受损害，除了既有的DNA修复机制可以侦测损害的地点，检查点机制相关的蛋白也被认为具有类似的能力，只是检查点侦测到损害形成时所做的反应是停滞细胞週期的进行。不过有越来