停止生长、叶黄化、叶变小、落叶、凋萎、果实干瘪等，树皮下出现明显的菌丝层，根部则会腐烂并长出白色棉花状的菌丝，在叶症状出现的数週内即可造成植物死亡，但也可能继续存活两至三年。
真菌病毒.已知多种真菌病毒可感染棕垫炭豆菌。巨型双核糖核酸病毒科的RnMBV1病毒（该科唯一一种病毒）、唿肠孤病毒科的真菌唿肠孤病毒三型（Mycoreovirus 3、MyRV3）的感染会抑制本种真菌菌丝体生长，进而降低其对植物的致病性，故此二病毒有用于生物防治的潜力。Quadriviridae科的RnQV1