府占用该寺，逐渐改建寺内建筑。1966年文化大革命中砸毁普同塔（苏州市文物保护单位）。1979年拆除大殿。1980年代末县政府迁到城南长桥镇，此处由供销总社开办茶叶批发市场，至1990年代末又改建为居民小区。无梁殿是开元寺目前仅存的一座古建筑，建于明万历四十六年（1618年），即藏经阁，高两层，面阔七间，歇山顶，覆以绿、黄二色琉璃瓦。建筑雕刻均颇精细。