菌的感染有关，抽烟则容易造成肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌和嗜肺军团菌的感染，接触鸟类和有关，农场动物和有关，将胃中内容物误吸到肺部容易造成厌氧生物感染，囊肿性纤维化和绿脓桿菌及金黄色葡萄球菌有关。冬天较容易有肺炎链球菌，而且也需要考虑误吸入大量厌氧生物到肺部的可能性。
病毒.在成人身上，病毒性肺炎佔肺炎病例的三分之一，儿童则为15%。通常，较容易造成肺炎的病毒包含鼻病毒、冠状病毒、正黏液病毒、人类唿吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒，以及副黏液病毒。而简单疱疹病毒则鲜少造成肺炎