专业人士，例如蔡英文为大陆委员会主任委员、鈡琴为行政院新闻局长。同时又任命了几位民主进步党立法委员，例如陈定南为法务部长、叶菊兰为交通部长。在大选中选择挺扁的嘉义市长张博雅，亦在陈水扁总统的力邀下出任内政部长兼台湾省主席。已故民主进步党立委卢修一的妻子陈郁秀则出任文建会主委。
任内大事纪.
八掌溪事件.八掌溪事件发生在2000年7月22日，有四名工人因溪水暴涨而受困于八掌溪中沙洲，由于政府救灾系统反应过迟以致四名工人皆遭溪水沖走不幸罹难。此事件使政府受到舆论