主炮炮塔装有厚的的装甲板，副炮则受到150毫米厚的装甲保护。
服役历史.
建成至1900年.德皇腓特烈三世号于1895年3月5日在威廉港的开始，工程编号为22。德意志皇帝威廉二世作为舰只得名者之子，将第一枚铆钉敲入龙骨。它是根据合同代号“普鲁士号替舰（）”进行订购，以取代年迈的铁甲舰普鲁士号。德皇腓特烈三世号于1896年7月1日，威廉二世再度出席，这次是发表演讲。舰只于1898年10月7日入役，并在波罗的海进行。试航的主要关注点是三轴配置如何在德皇腓特烈三世号