存储器.Wii主机内置512 MB不可移除闪存和一个用于增加外部储存空间的SD卡插槽，SD卡可以用于上传照片、备份游戏存档和存放下载的Virtual Console和WiiWare游戏。要使用SD卡槽传输游戏存档，主机必须进行系统升级。系统可以在Wii选项菜单通过互联网连接进行升级，或插入一张内含系统升级数据的游戏光盘。SD卡中存储的Virtual Console数据只能恢复到原备份的Wii主机中。SD卡也可以通过存储MP3文件来创建自制游戏内音乐（最初出现于游戏《》）和用于使用在照