驻日总召集人冈村宁次有意招募旧日本军，来防御中华人民共和国的进攻。后以「台湾募兵问题」此一名称被国际媒体广泛报导后，引起驻日盟军总司令部关注而宣告流产。根本博秘密渡航至台湾的事件也遭日本国会查问，当时的日本首相吉田茂，在国会答询时模稜两可。因此事件而导致白团对根本博不满，所以根本博未能加入白团。
晚年.1952年6月25日，搭乘民航空运公司（CAT）机回到日本。3年前秘密渡航的事件获得不起诉处分。之后在鹤川的自宅过日，1966年5月5日，在孙子出生的第一个节日后，因健康状况恶化而入