管辖东港街、新园庄、万丹庄、林边庄、佳冬庄、琉球庄。东港郡辖域即今屏东县东港镇、新园乡、崁顶乡、万丹乡、林边乡、南州乡、佳冬乡、琉球乡等地。
后续发展.1945年3月重庆国民政府通过之台湾接管计划纲要地方政制中，计画将东港郡及屏东郡合併为东港县，为该地方政制的18个二级县之一。1945年10月，实际接收台湾后台湾省行政长官公署认为该政制不符实际，并未实施「台湾接管计划地方政制」，仅将州厅－郡－街、庄改称县－区－镇、乡，东港郡改制为东港区，其中万丹庄改隶屏东市管辖，为万丹区。19