细川直元（生年不详－1581年）是日本战国时代武将。出羽国小国城城主。受领名是摄津守。被认为是奥州细川氏的分族，但是详细情况不明。
生平.与天童氏等最上八楯合力治理出羽国最上郡小国（现今山形县最上郡最上町）。因此在早期与最上义光对立。在天正最上之乱中属于最上义守・中野义时方，不过之后战败并降伏。天正9年（1581年），义光在天童原（现今尾花泽市）进行骑兵阅兵仪式（），但是把女儿嫁给与义光敌对的天童赖澄的直元并没有参加，这等同于向义光宣战。于是义光命令家臣藏增光忠进攻直元，光忠率