与其他兽脚类恐龙的差别之一，是牠们的较小型绒球，绒球是小脑的一个区域，可协助调节眼睛与头部的动作。这显示玛君龙与其他拥有小型绒球的阿贝力龙科恐龙，例如印度龙，并非依靠快速的头部运动与视力来捕抓猎物。对于内耳的研究，可以推论出玛君龙的行为模式。内耳的半规管可协助保持平衡，而当头部保持警戒姿势时，侧半规管会与地面保持平行。玛君龙的头颅骨几乎与地面平行，当牠们旋转头部时，牠们的侧半规管会与地面保持平行。当其他兽角类恐龙保持警戒姿势时，牠们的头部会大幅朝下。与牠们的更基础近亲角鼻龙相比，玛君龙的侧半规管明显地较