中华民国政府则希望获得政治实质关系的提升，由于双方并未谈妥细节，对双边实质关系并没有显着的改变。同年，中华民国副总统连战、行政院长萧万长访问马来西亚。1998年11月，APEC非正式领袖会议在马来西亚吉隆坡举办，马来西亚在会前派遣特使向中华民国总统李登辉呈递首相马哈迪的邀请函，但由于政治因素无法实际参与，后指派经济建设委员会主任委员江丙坤为代表。2016年11月，中华民国前总统马英九接受马来西亚《星洲日报》专访，后「星洲网」却将纸本中的「台湾前总统」迳自更改为「台湾前领导人」。17日，马英九出席「世