六日赴南京向国民政府教育部请愿，请求政府即派军队赴沪保护国民﹔并请求政府要求英国和日本撤换两国领事。七七事变之后，方宗鳌入中华民国临时政府，任议政委员会秘书长、教育部次长兼秘书长。1940年出任华北政务委员会教育总署署长，并兼任教育总署编审会会长。汤尔和任教育总署督办时，因患肺病而一直请假，故由教育总署署长方宗鳌代行职权。在二战日本统治下，北平许多大学都迁到西南内地。为了使身在中国北方的青年能有受到高等教育的机会，在方宗鳌的主持筹备下，恢复设立了国立大学，并主持筹备成立了北京大学法学院（1941年8