育委员会颁授第4段（最高荣誉）的高等学府，同时也是菲律宾少数获得教育委员会允准完全学术自主的大学。在中、小学体系部份，马尼拉亚典耀亦获得第3段（最高荣誉）的肯定。
耶稣会东亚5大学「全球领导力」课程.2008年开始，东亚4所耶稣会顶尖大学－日本上智大学、韩国西江大学、菲律宾马尼拉雅典耀大学、台湾辅仁大学联合开办「全球领导力课程」，课程目标透过小组讨论，培养现代社会的未来全球领导人。2012年，印尼圣那塔达玛大学加入，课程改称「东亚5大学」。2013年，美国马凯特大学