以1290日成为在任时间最长的内阁官房长官，超越福田康夫。2017年8月3日，成为第4次安倍内阁成员之一，留任内阁官房长官。 2019年4月1日，发表新年号「令和」，因而知名度上昇，被媒体称为「令和大叔」。2020年8月28日，安倍晋三因溃疡性结肠炎复发，宣布9月将请辞总理总裁（日本内阁总理大臣、自由民主党总裁），作为安倍晋三左右手的官房长官菅义伟决定竞逐。同年9月14日，菅义伟以377票的高票当选第26届自民党总裁，击败了以89票居次的岸田文雄以及得到68票的石破茂，在9月16日成为首位于令和