此校舍部分区域，以开办夜间兼读制课程（原称联合书院第二校，后併入同样由联合高层开设的联大书院）。1950年，新亚书院得商人王岳峰先生资助迁入九龙深水埗桂林街校舍。书院初创时期经费不足，院长决定亲赴台湾寻求协助。1950年冬，钱穆赴台会见中华民国总统蒋中正，请求资助。蒋总统于1950年命国民党中央改造委员雷震赴港调研，中改会于同年12月11日举行会议，决议「支持钱穆在港创办之新亚学院，请由教育部予以协助」。结果，蒋总统允诺从总统府办公费项下每月拨款港币三千元支持新亚书院办学，至1954年新亚书院获美国雅礼