吴三郡为国，吴兴太守改称内史。晋惠帝永兴元年（304年），立义兴郡，阳羡县改属义兴郡。晋安帝隆安四年（400年），绍封司马彦璋为东海王，改食吴兴郡，太守改称内史。元兴元年（402年），东海王伏诛，国除，内史改称太守。宋后废帝元徽四年（476年），改东迁县为东安县，宋顺帝昇明元年（477年）复旧。梁末，分扬州立震州，以太湖古名震泽而得名，仅领吴兴一郡。梁敬帝太平元年（556年），罢震州，吴兴郡还属扬州。
隋唐.隋文帝开皇九年（589年），灭陈，废吴兴郡，其地分属苏州、杭州。唐