食禁令并亲自食用牛肉，才终结了一般日本人不吃兽肉的历史。现在的日本料理大多含有肉类，如牛肉、猪肉和鸡肉等都是日常料理中经常出现的食材。由于日本是海岛型国家，日本人相当喜好海产品，因此生食成为了日本料理当中的一项特色，例如鲔鱼、鲑鱼、河豚、章鱼、贝类、虾蟹类和海草等海产物均可以作刺身食用，甚至牛肉、马肉、鸡肉和鸡蛋都可以生食入菜。关东和关西的日本料理存在不少差异，例如关西人较喜欢清淡的菜式，如乌龙面和白味噌煮圆年糕等，而关东人则偏好较浓口味的荞麦面和高汤煮长方形年糕。源自中国的面条是日本料理很重要的