由原任国安会副秘书长邱义仁转任，总统府发表由江春男接任国安会副秘书长，江春男辞去所有媒体职务。江春男历经庄铭耀、丁渝洲、邱义仁、康宁祥4位5任（邱义仁在康宁祥卸职后又回任）国安会秘书长。2003年间，媒体曾报导江春男将由国安会副秘书长转任台湾政府驻以色列代表，最后他续任国安会副秘书长。2004年6月16日，《中国时报》曾报导江春男被内定为台湾驻加拿大代表，但在他在卸任国安会副秘书长后回到报界。2005年10月3日，江春男在〈司马观点〉批评，陈水扁政府最令人难以相信的是把裙带关系和政治酬庸带到高峰