也不表示病人一定没有罹患天花。实验室人员也可以利用电子显微镜观察从患者身上取得的脓疱或皮痂样本，这可以协助他们确定患者不是受到形态相异的疱疹病毒的侵袭。不过，由于所有痘病毒的形态相若，此方法仍无法完全锁定天花病毒。病毒培植法为针对性诊断方式。此乃鸡只胚胎的一部分。专家需在特定温度下培植病毒，透过观察最后的痘疤病变，专家可以确定样本中的病毒是否天花病毒。聚合酶链式反应及限制性片段长度多态性测试则能进一步鑑定天花的病毒株。除此，针对天花病毒的免疫球蛋白和抗原的血清测试及酵素结合免疫吸附分析法也起到一定的辅助