过受到这次佔领运动的影响，除了使中华民国政府放缓与中华人民共和国政府的谈判外，后者促进中国统一的路线也被迫重新调整。直到6月25日，为了重建太阳花学运后的海崃两岸关系，国务院台湾事务办公室主任张志军抵达台湾，除了进行为期4天的访问外，亦与陆委会主任委员王郁琦举行会谈。
社会运动.在太阳花学运期间及之后，许多学生运动者、青年运动者动组成各种社团组织，这次运动也促成台湾公民社会的复兴。例如学生社团在3月31日串连成立民主黑潮学生联盟、及号召罢免国民党立法委员后，后续的割阑尾计画在201