卫三之间2:3的轨道共振而存在。共振可能造成轨道离心率变化和潮汐加速造成的潮汐加热，使土卫三内部温度够高足以形成海洋。在卫星的轨道共振消失后，卫星海洋的冻结造成额外应力，因此形成伊萨卡崃谷。另一个假设则是伊萨卡崃谷和位于崃谷一端附近的巨大撞击坑奥德修斯撞击坑同时形成。当形成撞击坑的撞击事件发生时，会产生震波并形成有多个环撞地堑的多环撞击盆地。但根据卡西尼号拍摄高解析度影像进行撞击坑数量计算的方式定年结果，伊萨卡崃谷年代比奥德修斯撞击坑年代久，因此这一假说较不可能。