杀朗达玛的弓箭埋在此地，后来建成了万佛塔。根据现存实物及文献，洛多杰智合寺石窟早在格鲁派盛行前，便已经是藏传佛教其他各派高僧的密修之处，因此其年代早于西宁土楼石窟、平安县白马寺石窟。如今，该寺有古代建成的自然及人工殿堂二十八间（处），收藏的文物有北魏至中华民国时期的佛像、雕塑、卷轴画、壁画、金银手抄佛经等1136件。2004年5月10日，“洛多杰智合寺及其石窟”被公布为第七批青海省文物保护单位，类型为石窟寺及石刻，历史年代为宋。
石窟.智合寺石窟呈“一”字形，由西向北排