起地方抗议，以及建地地基不足、桃园高中交换土地、地上现有房屋拆迁等问题。内政部在1986年5月12日来函同意兴建，工程分两期兴建，庙址属于三元里。在尚未完工前，1988年12月5日上午，孔庙管理委员会以明年没有良日吉时为由，先决搬至新殿，并雇用卅四个阵头游行桃园市区，上午11点举行安座大典。1989年9月28日落成启用，为台湾十三座官设孔庙中最晚建立的。建筑包括大成殿、大成门、东西庑、崇圣祠。落成后地方人士成立桃园县崇圣会，简麒标为创办人。桃园县政府提供两房间以感谢崇圣会出资出力，让崇圣会缴交租金使