帝国大学（现首尔大学）当教授。1946年，他开始从政。在这一年，他先后成为朝鲜独立同盟（新民党前身之一）的京城特别委员会会长、南朝鲜新民党中央委员会委员长。翌年，他又当选为勤劳人民党（南朝鲜劳动党的前身）。1948年，白南云来到北韩。期间，他在最高人民会议选举中当选为代议员，又被委任为教育部部长。1952年，他兼任朝鲜社会科学院院长。1953年，游击队派和国内派的权力斗争升温，加上游击队派领袖金日成在党内逐渐得势，国内党开始受到打压。同年，国内派的首领李承烨被指意图发动政变而被处决，多名成员也被卷入其中