村里并没有平民子弟的学校。不过，他的父亲最终还是为他请了位先生，并募集本村和邻村平民子弟，设立了一所平民书院。上学期间，金九曾一度由于父亲生病被迫辍学，后又重返书院。之后，金九又跟随离家10里外的一位当地很有名的远亲文人学习。1892年，金九参加了朝鲜王朝最后一次科举考试，“壬辰庆科”。当时的科举已经腐化成钱权交易的场所，金九最终落第。他的父亲后向他推荐学习风水。《麻衣相书》的一句“相好不如身好；身好不如心好”使一蹶不振的金九大受启迪。他此后开始研读《孙子兵法》、《吴子兵法》、《三略》、《六韬》等兵书。