堆积方式的比较，确认鲤鱼山遗址在其文化类缘上属于卑南文化，而根据鲤鱼山遗址挖掘中所发现的，陶片与板岩参合，出土数量不少的陶把、罐口缘带弦纹以及陶容器多带圈足等等的迹象显示，鲤鱼山遗址与卑南遗址中、晚期文化相近并且与邻近卑南遗址有密切的来往关系。根据卑南遗址、渔场南遗址所测出的绝对年代，推测鲤鱼山遗址史前文化的相对年代约距今2500到2300年前，显示鲤鱼山早期就有人类活动之迹象。目前鲤鱼山遗址已停止挖掘，并且已出土的文物保存在龙凤佛堂一楼的古文物展示室中。