冷却系统设有来控制水流，当柴油机停机时散热器内的冷却水自动流回水箱，避免低温环境下冷却水结冰膨胀导致散热器损坏。冷却室车体两侧设有电阻制动装置，吸入冷却室的气流先冷却制动电阻器，然后经过风扇冷却上面的散热器。冷却室下部设有一台空气压缩机，同样由柴油机经联轴器直接驱动。
动力系统.ND5型机车装用一台通用电气公司设计制造的7FDL-16型柴油机，这是一款、四冲程、V型结构、直接喷射、、废气涡轮增压、增压空气中间冷却的中速柴油机。为9英寸（228.6毫米），活塞行程为10.5英寸（26