天皇同母妹，天武天皇同母姊。乙巳之变后（645年6月），皇极天皇让位予轻皇子（即孝德天皇）。间人皇女成为皇后，以葛城皇子（即中大兄皇子，后来的天智天皇）为皇太子，定年号为大化，并迁都难波京（今大坂市）。中大兄皇子进行大化革新期间与孝德天皇不和，结果于白雉四年（653年）带领皇极天皇、间人皇女和多数官僚返回飞鸟板盖宫。白雉五年（654年）孝德天皇于难波长柄丰碕宫崩御。《万叶集》收录了一首孝德天皇写给间人皇女的和歌，内容是催促妻子返回难波京；不过间人皇女的答歌没有流传下来。间人皇女离开丈夫，与中大兄皇子