自然哲学是现代自然科学的奠基，主要是思考人对于的自然界的哲学问题--包括自然界和人的相互关系、人造自然和原生自然的关系、自然界的最基本规律等。这当中不少理论，都奠下了今时今日物理学的基石。法兰西斯·培根称自然哲学为「科学的伟大母亲」。不少近代的名人，如英国科学家艾萨克·牛顿、德国哲学家格奥尔格·黑格尔都曾为自然哲学编写过着作。从发展脉络上来看，现代科学是通过经历自然历史、自然哲学、自然科学三个阶段发展而来。牛顿的着作有《自然哲学的数学原理》（，1687）