油的慾望成为后来取消南方自治的重要诱因。1983年，苏丹总统加法尔·尼迈里宣佈废除《阿迪斯阿贝巴协定》，取消南方自治，并在全国实施伊斯兰教法，引起在南部佔大多数的非穆斯林居民不满，引发第二次内战。
过程.原苏丹政府军上校约翰·加朗是南方人，在1983年5月前往南方策反当地的黑人政府军官兵，组成苏丹人民解放军反抗北方。约翰·加朗及后来成为南苏丹总统的萨尔瓦·基尔·马亚尔迪特早期支持在统一的苏丹内实施南方自治。苏丹人民解放军在1986年的兵力约有12500人，1989年有2万至