院紫金山天文台发现。最初的代号是"1958 GQ"。2002年适逢南京大学百年校庆，当年5月16日，国际小行星中心和国际小行星命名委员会批准，将3901号小行星命名为“南京大学星”，以表彰南京大学建校百年来的成就。南京大学星是第二颗以中国大陆高校命名的小行星。