包含夜翼龙属夜翼龙科的最明显特征，是牠们的手指比较少。大部分翼龙类的手掌有四根手指，第四根手指支撑翼面，其他三指较小、具有指爪，可以在地面行走时支撑前肢、或者是协助攀爬。夜翼龙科的手指较少，显示牠们的一生有大部分时间多在飞行，很少在地面上行走。另外，肱骨拥有明显的三角嵴（Deltopectoral crest），是前肢肌肉的附着处，显示牠们具有非常健壮的前肢肌肉。在过去，夜翼龙科的物种常被归类于无齿翼龙科。某些研究人员，例如克里斯多福·班尼特（Christopher Bennett）、亚历山大·克尔