命萧撝兼中书侍郎，受币于宾馆。转任黄门侍郎。出为宁远将军、宋宁宋兴二郡太守，转任轻车将军、巴西郡梓潼郡太守。侯景之乱，萧撝为武陵王萧纪属下使持节、忠武将军。转任平北将军、散骑常侍兼益州刺史军防事。552年（承圣元年），萧纪在成都称皇帝，萧撝为侍中、中书令，封秦郡王。萧纪率军东下，萧撝以尚书令、征西大将军・都督益梁秦潼安泸青戎宁华信渠万江新邑楚义十八州诸军事、益州刺史，留守成都。梁州刺史杨干运守潼州。553年（承圣2年），西魏大将军尉迟迥入剑阁，杨干运投降。萧撝率兵1万人阻止尉迟迥入蜀