就任总统。
总统.执政期间颁布了土地改革法，没收了美资联合果品公司闲置地分配给农民，引起美国的相关利益者强烈不满。联合果品公司开始在美国国内游说政界推翻阿本斯政府。随着强烈反共的艾森豪威尔上台，1954年6月，美国雇佣军自洪都拉斯入侵，配合危地马拉军队叛变人士。在美国中情局策动下发动政变，最终推翻了阿本斯政府，建立了右翼军事独裁政权。阿本斯流亡国外，1971年1月27日于墨西哥城去世。