1997年开始，香港凤凰卫视邀请杜宪加盟。2000年1月，她受聘出任凤凰卫视节目主持人、策划，主持《只有一个地球》栏目，并先后任专题片《穿越风沙线》、《寻找远去的家园》、《永远的三峡》的监制和主持人。2002年，杜宪离开凤凰卫视。后来，杜宪到母校中国传媒大学（前身为北京广播学院）播音主持艺术学院担任副教授。2007年11月2日，杜宪与清华大学签订协议，以父亲杜庆华所获“何梁何利奖”为基础，筹款55万人民币设立“杜庆华奖学金”，主要用于奖励清华大学航天航空学院贫寒而优秀的学生。