Mehl也发现，波波龙与兽脚类恐龙有数个相似处，例如后肢骨头中空、臀部关节深，但也发现波波龙的每节荐椎连接一对肋骨，而兽脚类恐龙的每节荐椎连接多对肋骨，因此也不认为波波龙是属于恐龙。之后数十年，波波龙曾后被分类于爬行动物的不同演化支。在1921年，匈牙利古生物学家法兰兹·诺普乔将波波龙归类于鸟臀目恐龙，他认为波波龙、禽龙类、弯龙类有相似处。七年后，诺普乔建立波波龙超科（Poposauroidea）、波波龙科（Poposauridae），以包含波波龙属。在诺普乔的分类法里，鸟脚类包含三个次分类单元，其中一