许多百济王族和贵族成员与日本皇族通婚也是被广泛承认的，即使是明仁天皇也承认这个事实。据《续日本纪》记载，桓武天皇的母亲高野新笠是武宁王的嫡系子孙，而明仁天皇是桓武天皇的后代。学者中最着名的是阿直岐（achiki）与王仁（他受阿直岐推荐到大和国）。从应神天皇之邀而舶来，是为归化日本之学者。《古事记》记载：王仁献《论语》、《千字文》与日本，中国的儒教与汉字亦被认为是借此传至日本。有趣的是，有很多日本贵族是来自百济。百济阿莘王的太子于397－405年曾与应神天皇一起住在大和宫廷。他后来成为百济腆支王。应神