雄《山鹿素行》一书的整理，山鹿素行的思想大致可分为六个阶段：而台湾学者林俊宏氏则对此进行了解说：「大致而言，第一期为求学过程，第二期则属融合各派学说。第三期则以儒学为宗，第四期则以周公、孔子思想为宗，第五期则以日本神道思想为宗，第六期则提出宇宙象数观思想。山鹿氏以第四及第五阶段影响为之最大，使儒学日本化。」