为了替代高架化之后完全客运专用的岐阜车站，作为邻近地区铁路货运枢纽而设置的岐阜货物总站，拥有非常高的运输量。每日皆有21班以货柜板车编成的高速货物列车停靠本站（其中下行列车11班，上行10班），并进行货柜的装卸。除此之外，本站也与名古屋货物总站及札幌货物总站之间有列车往返。