见。 常见的透石膏（selenite）并不是硒的矿物质，不含亚硒酸根离子，而是早在发现硒之前，就像硒一样被称为月亮的一种石膏（硫酸钙水合物）。硒是许多金属硫化物矿物中最常见的杂质，它取代了一小部分的硫。在生命系统中，硒存在于氨基酸：硒代甲硫胺酸、硒代半胱胺酸和中。在这些化合物中，硒扮演类似于硫的作用。 另一种天然存在的有机硒化合物是二甲基硒。某些土壤富含硒，而硒可以被某些植物进行生物累积。在土壤中，硒最常以可溶形式存在，例如硒酸盐（类似于硫酸盐），它们很容易透过淋溶进入河流，海水含有相当量的硒。