华大学人文学院下属的一个系，始建于2017年5月16日，首任系主任是吴国盛教授。科学史系主要在西方科学技术史、中国近现代科学技术史、科学哲学与技术哲学、科学传播学与科学博物馆学四个方向做研究，并培养本硕博三层次的科学技术史专业人才，并做好校内的本科通识教育以及主持清华大学科学博物馆的内容建设和日常管理。
历史.1950年代，清华的刘仙洲、梁思成、张子高等教授分别在机械史、建筑史和化学史等方面做出成果。1954年9月2日，新中国第一个科学技术史研究机构——中国科学院自然科学史研