金门、马祖一直以来均属福建省，而统一发票当初由台湾省政府财政厅设计及推行，加上该地于1956年推行「战地政务实验」后而精省，因此金马两地当时并未直接纳入统一发票的适用范围。而当时金马地区作为第二次国共内战的交战前线，金融管理上亦与台、澎作出区隔，不论是新台币之流通，抑或印花税票或买受发票，与台湾省内之设计各异。在1950年代，金马地区乃使用营利事业发票，并非台湾省发行之统一发票。直到1960年1月，金马方跟进使用统一发票，为金门县及连江县政府分别统筹管理。1980年，立法院全文修正《营业税法》，统一发票