义昭在成为将军前，就曾在六角氏的庇护下短暂住于此地。「守山」的名称据说是过去位于琵琶湖对岸的比叡山在此设立的东门院的别号。17世纪江户时代后，此区域被分割为众多领地，包括幕府、、淀藩、狭山藩、、大沟藩、、、、膳所藩、旗本都有领地位于此；同时由于中山道通过此地，在守山也因此设有。19世纪末明治维新后，原先的幕府直属领及旗本领先后改隶属大津裁判所及大津县，其他原本属于各藩的区域则在1871年实施废藩置县后，改隶属淀县、川越县、宫津县、伯太县、山上县、前桥县、膳所县；不过在仅四个月之后的府县整併中，郡