。而幕府也很大程度上左右朝廷的政局、摄关的更替及皇位的废立等等。镰仓时代的朝廷仍然维持了院政时期以来的政务治理，并在镰仓幕府的影响之下积极实施诉讼审判制度改革。朝廷与幕府之间建立了以关东申次为核心的公武交涉制度。镰仓时代后期，天皇家分裂为大觉寺统和持明院统，二者交替执政，史称“两统迭立”。“两统迭立”造成的混乱最终给南北朝动乱的爆发埋下了伏笔。在幕府执权北条时宗执政的时候，元世祖忽必烈曾两次侵日未果。但“蒙古袭来”却给日本社会带来了深重的影响。尤其十一、十二世纪以来的“神国”“佛国”思想在“蒙古袭来