在化学中，Z-矩阵（）是表示由原子构成的系统的一种方式。 Z矩阵有时也被称为内坐标（）。它提供了分子中每个原子的原子序数，键长，键角和二面角（即所谓的内部坐标）的描述。然而Z -矩阵并非总能提供化学键相关的信息，因为矩阵本身是基于描述空间中原子取向的一系列向量的。但是Z-矩阵仍是一种对键长，键角和二面角等性质的方便表示，毕竟它能保留实际的键连关系。Z -矩阵这个名字来源于生成Z -矩阵时将第一个原子与第二个原子的连线设为Z轴这一规则。Z-矩阵可以与笛卡尔坐标系相互转换，但是空间中的位置和方向却不同。尽管