日本面临败亡之际，1945年4月板垣接替土肥原贤二大将任第7方面军司令官，司令部设于新加坡，指挥日军在荷属东印度和马来亚等地日军作战。8月15日，日本宣布无条件投降。9月间，板垣率第7方面军在新加坡向英军投降。1945年日本战败后，板垣征四郎被远东国际军事法庭定为甲级战犯，并被判处死刑。1948年12月23日，板垣征四郎在东京都丰岛区池袋巢鸭监狱内被处以绞刑。
遗迹.1941年抗战期间，住在青岛的日本人为板垣征四郎1938年登陆青岛而立碑。碑的正面是板垣的手迹“东亚建设之础”。