成都前夕，但懋辛协助中国共产党地 下组织在国民党方面的军政界策反，促使刘文辉、邓锡侯、潘文华、鲁崇义等起义。
中华人民共和国.1949年10月18日政务院第六次会议提议，12月2日中央人民政府第四次会议批准，但懋辛被任命为西南军政委员会委员兼司法部部长。1950年7月，但懋辛赴北京开会，经李济深、朱蕴山介绍，加入中国国民党革命委员会，任中央委员。民革川康临时工委成立时，但懋辛出任副主任委员。1954年，中央人民政府撤销了西南大区，但懋辛赴成都任职。他是第一、二、三届全国人大代表