僧侣自8世纪便访问日本，古代印度佛教中心那烂陀寺也早有关于日本留学生的记载，在众多日本旅行者中，最着名的便是江户时代的天竺德兵卫（1612–1692），其名天竺即为印度古称。两国之间的文化交流造成了两民族民间传说中的相似之处，印度的辩才天女在日本以辩才天之名为人所知，印度的阎罗，也成了日本佛教众神的一位。在当代流行文化如动漫作品中，亦时常出现一些佛教中的神魔、阿修罗和一些哲学概念。此外，日本的神道教的万物有灵信念也与印度教相似，而有别与世界其他地区的一神教崇拜。古印度的梵语曾被移民至印度的中国祭祀所使用