约于400年前分裂为两个种群，即土耳其及摩洛哥群族，自此在形态、生态及基因上都有所分化，不过却没有列为亚种。这两个群族的分别在于其线粒体DNA的细胞色素b的单一突变。在法国南部发现隐䴉的化石，可以追溯至全新世；另外在西西里岛发现的属于更新世中期；在西班牙地中海海岸发现的则属于上新世及更新世之间。在保加利亚发现了似乎是其祖先的"Geronticus balcanicus"。这些都显示牠们很早已广泛分佈在欧洲各地，并且可能源自欧洲东南部或中东。隐䴉的种加词"eremita"源自希腊文的，意思是「沙漠」，