本军（大日本帝国海军与大日本帝国陆军）、日本自卫队 与日本海上保安厅相关旗帜。
历史旗帜.曾经在日本出现的历史政权或政府旗帜。
少数族群.代表少数族群的相关旗帜。
都道府县.都道府县相关旗帜：