从在的复合混合物中，测出各种组分并有可能确定其详细结构。 LC-MS在尿液中药物筛选分析中的局限性在于它常常不能区分特定的代谢产物，特别是对于氢可酮及其代谢物尤为明显。LC-MS尿液分析测试仅测定特定类别的药物，对于有些药物及其代谢物的测定需要用气相色谱法-质谱联用（Gas chromatography-mass spectrometry，简称 GC-MS)
液相色谱法.
规模.传统的高效液相色谱方法与用于LC-MS中的液相色谱方法的主要不同是后者的规模要小得