不久进封为相国，董卓母为池阳君。后来命令荀爽和蔡邕等人赴任朝廷官职；而后袁绍与董卓发生争执，只身离开雒阳，董卓本想杀害袁绍，经过手下伍琼和周毖等劝说，乃改以怀柔手段安抚之，命袁绍为渤海太守，同时也提拔另一批名士为官，如陈留太守张邈、冀州刺史韩馥和豫州刺史孔伷等人，后来这些人却全部成为日后讨伐董卓的主力。与此同时，董卓自己的亲信仅为列校，并未被董卓提拔。
联军讨伐.献帝初平元年（190年），关东联军以讨董为名起兵，但大多并未对董卓发兵；190年1月17日，董卓迁都长安，董卓知道自己的