裸囊菌科（学名：Arthrodermataceae）是子囊菌门散囊菌纲爪甲团囊菌目的一个科，共包含七个属，本科物种多为感染哺乳动物皮肤、毛发或指甲的。
形态.本科真菌不具有子座（stromata），子囊果为小型无柄的闭囊壳（cleistothecia），子囊呈球状或囊状，子囊孢子不具隔膜，表面平滑且无黏液包覆。其分生孢子则可能具有隔膜与表面饰物。
属.裸囊菌科共包含七个属，皆为单系群。