发现历史.巨针鼹最初是由理查·欧文（Richard Owen）于1884年根据一根断裂的左肱骨描述的，是为"M. ramsayi"。后来也发现了完整的头颅骨及颅后化石。于1896年，澳洲古生物学家William Sutherland Dun描述了第二个物种，即"M. robusta"。"M. ramsayi"的化石在澳洲大陆及塔斯曼尼亚多个地方都有发现；而"M. robusta"的则只在新南威尔士被发现。"M. robusta"是已知最古老的针鼹及生存于中新世的物种。
特征.