006年7月，任中共中央台办、国务院台办副主任。2006年7月，任海峡两岸关系协会副会长。同时兼任中国和平统一促进会常务理事、全国台湾研究会副会长（2014年1月13日任）、中国国际战略学会高级研究员，中国人民解放军国防大学、浙江大学、厦门大学、中华文化学院兼职教授，浙江大学台湾研究所所长等职。王在希主张武力胁迫台湾统一。