他获推荐的学术论文超过200份，为世界上最常获引述的数学家之一。他曾指导过35位博士生及25位博士后研究员。他于2006年至2009年期间，为美国国家科学基金会助理会长，掌管数学及自然科学部。他负责统筹及管理部门的科研经费，范围涵盖天文、物理、化学、数学、材料科学以及跨学科活动。2009年3月，陈繁昌获科大校董会一致通过，接替朱经武出任科大第三任校长，9月正式上任，任期为5年，带领科大过渡「三三四学制」，他于2013年获续任校长一职，执掌科大至2018年。陈繁昌已于2017年6月以年届65岁为理由向