带来一统的罗马帝国，反而宗教的争端渐多。在君士坦丁堡及帝国的东部，希腊语仍然是流通的语言，新约圣经亦是以希腊语流传。在罗马及帝国的西部，则以拉丁文传教。在罗马、君士坦丁堡、安提亚、亚历山大城、耶路撒冷的牧区互不统属。在几次的大公会议中，基督教被国教化，三位一体被确立为正统，但其他学说则被视为异端，聂斯脱利被逐出教会在中东形成东方亚述教会，阿里乌教派亦被逐出教会。