袁崇焕只升一级。当时兵部尚书霍维华认为不公，上疏请求让荫，魏忠贤亦拒绝其请求。相反，魏忠贤派使其党羽以袁不救锦州为由，弹劾袁崇焕。袁崇焕不得已请求辞职告老还乡，同年七月获准，而王之臣代为督师兼辽东巡抚，满桂镇守宁远。
再次复出.熹宗去世，思宗即位，建立东林党内阁，魏忠贤被诛，朝臣纷请召袁崇焕还朝。崇祯元年（1628年）任命袁崇焕为兵部尚书兼右副都御史，督师蓟、辽，兼督登、莱、天津军务。七月，思宗召见袁崇焕。期间，袁崇焕慷慨陈词，计划以五年复辽，并疏陈方略。袁崇焕表示其在边关立功，唯