7年年间，主张农田水利会改制为行政机关、会长由中央政府派任的风声不断。2017年10月5日，全国农田水利会反延任反改制自救会发动近二千人到立法院外反对农田水利会改制为公务机关。2017年11月9日，由具有台湾农村阵线背景的农委会副主任委员陈吉仲操刀在行政院会议通过《农田水利会组织通则》修正草案，再次确立农田水利会改制为公务机关的农政改革。2017年12月15日，立法院会议通过《农田水利会组织通则》修正草案迳付二读。2018年1月17日，立法院三读通过《农田水利会组织通则》修正草案，农田水利会改制为公务机关，