石井的卫生部队（659部队）除了平房本部（731部队）外，还有4个支队：
设施.731部队的建筑群占地6平方公里，由150余座建筑组成。设施设计用以抵御空袭，防止设施摧毁。建筑群包括各式不同的工厂，还有大约4500个用于饲养跳蚤的容器，6个用于制造化学制剂的大锅炉以及约1800个用于制造生物制剂的容器，几天内可制出约30千克的腺鼠疫细菌。如今731部队周边设施除已被深埋地下，无法搬迁的部分外，绝大部分作为731部队罪证遗址供游客参观和考古研究使用，另建有侵华日军第七三一部队