国内及驻外使领馆、办事处开始签发第二版电子护照，新版本的护照加强了个人信息安全性，并且在签证页加入日本的风景画以增强防伪能力。日本政府于1998年将2月20日定为「旅券之日」，以纪念日本国海外旅券的发行。
台湾.1897年，台湾割让予日本后，大批日本浪人经台湾前往中国，造成治安问题，因此日本当局宣布需要持有加註有台湾籍的日本旅券，才能出入台湾。1907年，由于申请日本旅券手续过于繁复，台湾总督府宣布，前往中国及香港的旅客，可以自行决定是否申请日本旅券。另一方面，当时日本