开始后，渐有较高比例的移民前往高雄地区。在1930年代已有万余人。澎湖移民在早期高雄行成了澎湖社、澎湖寮等同乡社群，也建立「澎湖庙」，奉祀自澎湖分灵的神明。在1940年的人口籍贯调查中，有11.23%的高雄市人口籍贯为澎湖厅，在台湾内部移民中仅次于台南州人。战后高雄地区涌入更多澎湖人，但也渐无过去聚居的习惯。按照1953年统计，高雄市有4万多澎湖籍人口，佔当时全市30多万人口的13.1%。由于近年澎湖人口外移可供选择的地点增多，移往高雄的比例已逐渐下降，但仍为主要迁移地点。