后来增加到十八万锭，官府将所有的茶叶都移交，还不到一半，其他的都向百姓勒索。当时转运司的官吏任用乡里奸狡的人，动不动就诬告百姓犯法，转运司又对当地相当专制，五品以下的官员都能施以杖刑。邓文原奏请废除榷茶都转运司，建议由州县征收。但建言没有呈送到朝廷。徽州百姓谢兰家姓汪的家僮被人杀害，谢兰的侄子谢回收买汪氏一族，诬告家僮是被谢兰所杀，谢兰被迫认罪。邓文原复审后，查明了真相，因此谢兰被释放，改判谢回的罪。
晚年.至治二年（1322年），邓文原入朝任集贤直学士。由于发生地震，朝廷诏令