县政府，指示天后宫不准改建，应妥为维护。后续1979年（民国六十八年）重修澎湖天后宫时，才依照「补建复旧」的方式整修澎湖天后宫，主持该年修复工程为大木匠师叶银河（1933年－？，叶得令之子、叶根壮堂弟）。1983年（民国七十二年）12月28日，中华民国内政部公告第一批15座一级古蹟名单，澎湖天后宫名列其中，并留下修建纪录。1997年（民国八十六年）5月，《文化资产保存法》修法后，不再区分为一至三级古蹟，而採用国定、直辖市定、县市定三级。澎湖天后宫改为国定古蹟。2011年（民国一百年）再启修建，2014年