面的研究成果大量发表在《科学》、《自然》、《细胞》、《柳叶刀》、《新英格兰医学杂志》等顶级学术期刊上。其主要研究兴趣在于新发/再发病原体跨物种传播的分子机制和结构免疫学，主要领域包括：新发病毒的起源与进化；囊膜病毒的受体识别与机制；中和抗体的筛选及病毒和抗体的相互作用机制；新型抗病毒药物的设计；T细胞免疫和分子识别。其代表性知名贡献有：
争议.2019年3月4日，全国政协十三届二次会议期间，高福在接受专访时表示，“经常有人问我，SARS过去十几年了，还会来吗？SARS这一类病