科学院秘书长、次长访台。2000年，中华民国外交部长田弘茂访问梵蒂冈；教廷主席高德士总主教访台。2003年，中华民国总统夫人吴淑珍访问梵蒂冈，参加教宗若望保禄二世的就职25周年纪念典礼。2005年4月2日，教宗若望保禄二世逝世，中华民国总统陈水扁前往梵蒂冈出席葬礼，为首次中华民国国家元首出访梵蒂冈。中华民国总统府与行政院自3日起降半旗2日以示哀悼。2009年，教廷宗座一心委员会决定「亚洲人道援助国际会议」在台湾召开，由辅仁大学主办。会议吸引29国约450位人道援助领袖代表出席，包括5位枢机、