对殿内僧众说：「迩来学佛者惟饱餐优游沈薶岁月，如金刚楞伽心经皆摄心之要与，何不研穷其义？今有不通者当质诸白眉法师。」此后，每回太祖召见法师时，都称慧日法师为「白眉」，不称法师的法号。一日，慧日法师与金碧峰禅师等高僧，奉召赐食应供，席间，他向太祖讲述天台宗法要，并讲到金陵瓦宫寺是当年智者大师释讲《法华经》之所，应当重建，不宜令其荒废。太祖听了就下令在金凌选址重建，以保存瓦官寺的史蹟。洪武五年（1372年），于钟山建水陆大法会，命师说毘尼戒，太祖亲自率文武百官前往听法，法会结束返回上天竺寺后便卸除寺中职