美国海军预算删减，以及要求海军简化舰载机型的声浪下，尽管在A-6于1990年初逐步的展开机体翻新与更新之工作，且在波湾战争前后仍有新机出厂；A-6E与KA-6D机队仍于1990年代很快的退出现役。在匿踪战机的大放光彩的当下，美国海军原本期望以A-12复仇者II式攻击机取代A-6所负担之打击任务，然由于预算超支且发展屡遇困难，A-12攻击机计画最终遭到取消。因此，A-6机队不得不继续延长服役于海军中的年限，直到海军决定以搭载LANTIRN荚舱的F-14取代A-6为止。1997年2月28日，最后一架A-6攻击机