来自法规规定， 法院的管辖权起源于联邦立法产生的事项，如税收、贸易、知识产权、劳资关系、公司、移民、破产等事务。澳大利亚联邦法院在所有事务上对联邦巡回法院具有上诉权，但不包括家庭法，法律规定家庭法事务的上诉法院为澳大利亚家庭法院。此外，联邦法院还对诺福克岛最高法院的上诉案件行使一般管辖权，包括刑事和民事事务。在某些联邦事务上对州最高法院行使上诉管辖权 。联邦法院行使上诉管辖权的其他对象还有澳大利亚体育反兴奋剂管理局，澳大利亚人权与机会均等委员会。联邦法院有权对宪法进行解释。