书长 (属署长级D6职级)，期间负责监督新立法会大楼的落成和立法会搬迁。2012年退休，由前教育局副局长陈维安接任。其后受立法会聘任为主笔，负责撰写《香港特别行政区立法会历史、规则及行事手册》，2016年完成。吴文华共服务过3届立法局和4届立法会，历经地区直选出现、秘书处脱离香港政府成立为立法会的独立部门、1997年香港主权移交等阶段。2012年起，吴文华受聘于联合国发展计划 (UNDP)在缅甸、越南等国家任国际议会顾问，并协助国会举办培训工作坊。吴文华亦在香港科技大学任客席教授，协助设计和教授公共政策