东省仍是由旧桂系掌权。此后，孙中山到广东发动护法运动，陈炯明成为孙中山的支持者，其部队也改名为援闽粤军，叶举在民国6年（1917年）秋，任援闽粤军总司令部参谋处长。民国9年（1920年）夏，叶举在陈炯明麾下投入第一次粤桂战争，率部回广东成功驱逐旧桂系的统治，任中路指挥、援闽粤军第二军代理军长。同年秋，任肇庆善后处处长。民国10年（1921年），第二次粤桂战争爆发。叶举率部进入广西，任粤军前敌总指挥兼粤桂边防督办。民国11年（1922年）任粤军总指挥，在5月20日将其率领部队回师广东迎奉陈炯明复职