7战胜波士顿塞尔提克，马刺三巨头在例行赛的胜场数达到541场，正式超越前塞尔提克三人组（拉里·伯德、凯文·麦克海尔以及罗伯特·派瑞许）所保持的540场。在季后赛期间，马刺于第一轮横扫了曼菲斯灰熊，但却在第二轮不幸败给了奥克拉荷马雷霆。尴尬地成为自2006–07赛季的达拉斯独行侠以来，第二支以67胜结束例行赛却在决赛前被淘汰出局的球队。2016年7月11日，提姆·邓肯宣佈退役，结束其在马刺的十九年职业生涯。
科怀·雷纳德的领袖挑战（2016−2018）.在2016–17赛季，尽管