当校长，帮助沪江大学实现了从教会大学向私立大学的过渡，进而实现了“中国化”。卸任校长之后，魏馥兰担任沪江大学名誉校长，直到1936年退休返回美国。1937年5月，位于沪江大学礼堂北侧的“思魏堂”建成，以纪念魏馥兰。
逸事.徐志摩1915年底至1916年底在沪江大学学习时，魏馥兰正在任校长。其间，逢魏馥兰例行返回美国休假。徐志摩乃写《魏校长归国序》，发表在《天籁》1916年11月的第4卷第3号。当时，徐志摩是《天籁》的“汉文主笔”。这篇《魏校长归国序》是迄今发现的徐志摩大学时期最