过去因为松山新店线中的松山线仍在兴建，因此先独立营运小南门线「西门—中正纪念堂」，由两个月台的其中一个进行单线双向营运，另一个则不开放，每四个月交替（换轨行驶）一次，因此两面月台墙上皆装有停站列车运行方向显示器。信义线通车后，开放两个月台供绿线区间车「西门－台电大楼」使用，其中尖峰时段会同时使用两个月台单线双向营运。2014年10月18日起，除松山线履勘及通车当日或通车前系统发生异常外，小南门线改为固定月台候车。台北捷运松山线通车后经由小南门线与新店线直通营运，本站的月台与轨道也恢复原本的规划来运