，当选为内蒙古人民革命党中央执行委员。1926年秋，恩克巴雅尔参与创建内蒙古人民革命军，并亲自领导内蒙古人民革命军。1927年，蒋介石发动四一二政变后，蒙旗上层人士投靠蒋介石，并多次围攻内蒙古人民革命军。恩克巴雅尔为保存力量，于1928年7月率部向外蒙古转移，途中遭到阻击，抵达中旗恩格尔庙休息时，遭到中旗保安团包围，恩克巴雅尔中弹阵亡，享年27岁。中华人民共和国成立后，恩克巴雅尔被追认为革命烈士。