与辛亥革命元老、同盟会嘉应州主盟人何子渊等秘密筹划潮州黄冈起义，并参与营救遇险的革命党人。三十四年（1908年），被推为广东教育总会会长。宣统元年（1909年），广东谘议局成立，丘逢甲当选议员，既而被推举为副议长。丘逢甲积极支持姚雨平、邹鲁等人的反清革命活动。宣统三年（1911年），武昌起义爆发，各省响应，广东宣佈独立，推胡汉民为都督。丘逢甲被选为代表，选举孙文为中华民国临时大总统。民国元年（1912年），丘逢甲因积劳成疾，请假南返。2月25日，卒于广东镇平县（今梅州市蕉岭县）员山里门第，遗言「葬须