深切体认『主权在民』的精义，否则必将被觉醒的人民唾弃」。台湾对4月12日海协会说明十分无法理解。认为当地政府处理此事时首先封锁消息然后固执己见，因而回应相当强烈。陆委会于12日宣佈即日起暂时停止两岸文教交流活动、自5月1日起停止民众赴大陆旅游。中华民国经济部停止审核批示赴大陆的投资案、中华民国教育部停止台湾和大陆之间的文教交流，旅行业也停止出团到大陆去旅游；可以说，海崃两岸之间的交流活动几乎全告中断。台湾有民众认为可能有军人涉案，21日大陆方面宣佈的嫌犯之一是退伍军人，作案时身着无衔军装，另一嫌犯的