以詹事府少詹事掌南京翰林院事，优游两载，寻召纂修，未赴。甲申之变，崇祯帝自尽后，南明福王在南都金陵监国，管绍宁拜礼部右侍郎行尚书事。与时相马士英多忤，遂引疾归里。清军破南都后，顺治二年（1645）闰六月二十九日，管绍宁因与清常州知府宗灏有仇，遂以拒绝剃发令而全家被杀。只遗一孙滋琪，年甫三岁，为家仆带出逃亡而免一难。其夫人董氏、三子管铉、管键、管鐩一门四十余口俱死之。从兄管绍恂，崇祯甲戌武进士，亦遇害。从弟管绍恒，被下狱刑讯孤子滋琪所在，终不言，三閲月始得释，寻悒悒致疾卒。同时遇害的还有太常少卿杨兆升一家