在该年4月更颁布「推动中国动漫产业发展意见和通知」，为配合国内业界发展，动漫节新增「中港数码娱乐阵营」，邀请国内多家漫画机构及政府部门来港，将中国大陆动漫作品引进本港。本年度的代言人为Twins,参展商开始以性感打扮的少女模特儿作招徕，动漫Maggie李曼筠成为全场焦点。是年展览主要分为四部份：香港动漫节2006、X-Zone创意地摊、香港电玩展2006和FUN FUN SHOW 2006：
香港国际动漫影展.于2006年的香港动漫节首次引入的活动，目的为配合大会主题，