2年在澳门大学任教，担任澳门大学社会科学及人文学院政府与公共行政学系助理教授，曾于亚洲开发银行研究所、新加坡国立大学、及香港城市大学从事访问研究工作，其研究领域涉及中港澳公共行政改革。2014年8月，位至政治学副教授的仇国平不获该校续约。后来他在香港中文大学担任社会科学系客座副教授。
疑遭打压事件.2014年8月13日，仇国平获校方通知不予续约。校方起初指控他「不尊重与大学有关连的人士」、「不服从上司」，后来又指他「违反专业操守指引」，包括「歧视学生」和「把政治理念强加学生身上