国科大的教育体制成功培养出了大批优秀的科技人才。从建校至2011年，科大已有53名毕业生（包括50名本科毕业生）当选中国科学院或中国工程院院士，有11名毕业生获选第三世界科学院院士；此外，更有不少科大毕业生被评选为美国艺术与科学院（AAAS）院士、美国国家科学院（NAS）院士、美国物理学会（APS）会士、计算机协会（ACM）会士、电气电子工程师学会（IEEE）会士、美国机械工程师学会（ASME）会士等；而高科技企业带头人中也不乏科大校友，如联想集团董事长杨元庆等。1999年到2008年间，校友中共有7人入选