磺酸会造成皮肤烧伤和长期的组织损伤。如少量CFSOH·HO被吸入肺部，它将造成痉挛，炎症和水肿
用途.在实验室中, 三氟甲磺酸是有用的质子化试剂，部分原因是因为其共轭碱不是亲核试剂。它常被采用为在非水溶液滴定所使用的酸（因为它在乙腈，乙酸等多种溶质中都能表现出可观的酸性且往往强于无机酸HCl或HSO)