站（海拔-30.58m），故与国铁海拔最高的车站——野边山站结成友好车站。本站剪票口前更摆放了以该站所在地（长野县）出产的白桦木所制成的物件。另外，本站开业时曾以「国铁最深车站」（，JR接手后移除了国铁的字眼）作为车站纪念印章。但因其后最深的纪录被京叶线东京站和海峡线吉冈海底站取代，于2000年将印章更换为「批发街和历史名镇」（）。马喰町的地名由来是指江户时代，此为提供马匹休息吃草的马厩，故2014年8月车站纪念印章再换为「江户时代の马喰町」。
车站构造.岛式月台1面2线的地下