每次交战常在士卒前面，前后征讨，不曾失败，所以每当有重大困难时，都命令长孙肥去面对。向南平定中原，向西摧破羌族贼寇，长孙肥的功劳为多，赏赐给他奴婢几百人，牲畜财物以千计数。后来降爵为蓝田侯。天赐五年（408年），长孙肥去世，谥号「武」，在金陵陪葬。其子长孙翰继承爵位。