茅斯战役中予以重任，负责追踪北美英军总司令亨利·克林顿指挥的英军的动向，同时直接向乔治·华盛顿和威廉·亚历山大报告。这是门罗在大陆军参加的最后一场战役。之后，由于大陆军的冗员问题严重，门罗作为额外人员退役。尽管乔治·华盛顿亲自写信推荐门罗在弗吉尼亚州民兵中担任职务，但是因为弗吉尼亚无力再支撑一支新的部队，门罗只能改任弗吉尼亚州州长托马斯·杰斐逊的助手，并在托马斯·杰斐逊的指导下学习法律和古典学。此后，门罗长期作为托马斯·杰斐逊的追随者。1780年，门罗被托马斯·杰斐逊任命为弗吉尼亚州民兵的陆军中校，