丹麦羽毛球首要超级赛，在男单准决赛以0比2（20-22、15-21）不敌赛会头号种子、马来西亚一哥的李宗伟。同期10月，他出战法国羽毛球超级赛，在男单准决赛以1比2（21-18、17-21、10-21）不敌马来西亚名将的刘国伦。同年12月，他出战哥本哈根羽毛球大师赛，在男单决赛以2比0（21-12、21-11）击败了中国香港名将的胡赟，赢得冠军。
2013年 法国超级赛夺冠.2013年1月，简·奥·约根森出战马来西亚羽毛球超级赛，在男单准决赛以1比2（13-21、21-17、12-