民国科技部在前西德首都波昂设立驻德国代表处科技组，教育部则在首都与第1大城柏林设立驻德国代表处教育组。2013年3－5月，德国研究船前往台湾海域探勘，由台湾能源国家型科技计画办公室与德国基尔亥姆霍兹海洋研究中心及合作，进行天然气水合物（可燃冰）、遥控潜水器的科学应用，结合二氧化碳海底地层储存地质探勘及黑潮发电海洋地质钻勘。双方于2009年在台北首次举行关于可燃冰议题的双边会议，第四届「可燃冰双边会议（TaiGer IV）」于2014年2月13－14日在德国不莱梅大学海洋环境科学研究中心举行，会中并签署合