到京都谒见天皇并取得日本全国传教之权，但两者均未成功。他在1551年离开日本前往中国传教。这时日本有教友一千。织田信长对从西洋传来的基督教非常欢迎。织田信长在安土城设有基督教的教堂，并且容许基督教的传教士到日本传教。信长统治市民的政策相对丰臣秀吉和德川家康比较宽松，对基督教也不例外。所以在安土桃山时代的基督教发展十分蓬勃，直到江户时代初期才逐渐减退。丰臣秀吉时代开始后、基督教势力扩大。十六世纪末叶相继发生各地信奉佛教或神道的大名迫害吉利支丹的事件；相对的，信奉天主教的吉利支丹大名与吉利支丹烧燬本地寺