与咖啡叶接触后，孢子萌发并产生附着器，并从气孔进入叶片，在24-48小时内侵染完成。一个病灶能在3-5个月内产生4–6个孢子堆，并通过气孔产生孢子，能释放300–400,000孢子，新产生的孢子将继续感染其他的咖啡叶片。咖啡驼孢锈菌主要侵害叶子，很少在幼茎和果实上发现。虽然目前主要认为咖啡驼孢锈菌是异主寄生，理论上需要另一种寄主来完成生命週期，但目前尚未发现这样的寄主植物；另一种假说认为咖啡驼孢锈菌是一种早期变异的同寄主锈病，所以冬孢子是无功能的残留构造，有性生活週期也是由夏孢子完成。目前已经普遍在夏孢