藩厅设在萩城（现山口县萩市），所以又叫毛利藩或萩藩。幕末，藩厅移转至周防山口的山口城（山口政事堂），所以称周防山口藩（すおうやまぐちはん）。一般将萩藩・（周防）山口藩时代总称「长州藩」。幕末时期，长州藩与萨摩藩组成萨长同盟，为讨幕运动的中心。后来的明治维新时期，长州藩政治家形成了藩阀政治中占主导地位的「长州阀」。时至现代，长州山口县出身的政治家仍长期把持日本政府。例如岸信介、佐藤荣作、安倍晋三等，山口县出身的内阁总理大臣达9位，居各都道府县之冠。
历史.长州藩距离江户较远，毛利