成生长迟缓。其他肌肉骨骼问题包括关节、肌肉无力或萎缩和骨质疏松症。延误治疗、未接受物理治疗的儿童或病情严重的儿童，会造成手和手指的关节畸形。随着时间流逝，手部功能尚失后且几乎无法恢复。
病因.JIA 的病因尚不清楚。但它与自体免疫有关 — 代表在没有明显的原因下，自己体内免疫系统攻击并破坏细胞和组织（特别是关节内）。环境的变化刺激免疫系统，加上许多相关基因的突变和/或基因表现上的差异。实验显示某些突变的病毒可能诱发 JIA。幼年特发性关节炎好发于女孩，且最常出现于白种人中。