认为是东察合台汗国的延续。至1680年成为准噶尔汗国的附属国，在17世纪末策妄阿拉布坦时期消亡。早期的首都在喀什噶尔（今喀什市），后迁往叶尔坎叶尔羌城（今莎车县）。疆域最大时包括吐鲁番、哈密以及塔里木盆地。汗国版图的东达敦煌，南达吐蕃乌思藏，西南达博罗尔、巴尔蒂斯坦，与乌兹别克以费尔干纳谷地为界，北方以天山为界，与准噶尔相邻。
国名.17、18世纪当地作家着作中，有多个国名，其意均为“蒙古国”。近代多称“叶尔羌汗国”，中国学术界普遍接受并使用这一名称。欧洲史学家根据其早期统治中