初在北京东城侯位胡同内办公，后迁入史家胡同。9月，将西直门外“清华园”移交游美学务处建设肄业馆。外务部中堂那桐选定清华园作为肄业馆场地，经批准后，开始修理建筑，原计划1910年秋即可使用，不料工人罢工数月。期间建校门（现二校门）、修缮工字厅、建造一院（清华学堂西半部）、二院、三院、同方部、北院，以及校医院，先后于1911年前后竣工，建校时校园面积450亩（27公顷）。1911年2月，肄业馆改称“清华学堂”（全称为“帝国清华学堂”），由军机大臣那桐题写校名。3月，在宣武门内学部举行入学复试，录用全部468