，后巴图尔珲台吉以伊犁为根据地兼并厄鲁特蒙古各部，压迫西方的哈萨克族。1670年巴图尔珲台吉的儿子僧格被杀后，他的异母弟噶尔丹夺得了准噶尔的统治权。1678年，西藏的五世达赖赐噶尔丹可汗号，准噶尔汗国正式成立。此年噶尔丹出兵回部，占领叶尔羌汗国，把广大维吾尔族地区置于其统治之下。1688年噶尔丹突然率兵越过杭爱山，大举进攻土谢图汗，迫使喀尔喀蒙古诸部南迁。1690年6月，噶尔丹又向漠南喀尔喀蒙古进攻，俘掠人口，抢劫牲畜。
衰弱.1690年同年，康熙帝决计亲征，组织左右两路大军分别出