舰是固定的，非不得已（如战损）不会变动。但20世纪以后，军舰空间增大、防护增强、通信技术改良，主要水面舰都能提供指挥服务，因此舰队指挥官也逐渐以舰队中速度最快、指挥技术条件最好的船只为旗舰，为保证指挥官的安全一般是以巡洋舰作为旗舰，而不是最大船舰（例如航空母舰或战列舰）。
延伸.在零售业，和英语一样，“旗舰”在汉语中也引申出“高级”、“终极”、“标杆”的含义，如“旗舰店”、“旗舰版”商品等。