生物学上一个重要研究生物对象超过50多年，它被研究的学术主题领域相当地广，这些主题包括了遗传重组、去氧核糖核酸修复、突变、细胞週期控制、致病原理（pathogenesis）与代谢等等。小巢状麴菌在它所属的曲霉属（'）之中是少数可以经由在实验室中菌株交互减数分裂来形成有性孢子的其中一种物种。小巢状麴菌是一种雌雄同体（homothallic）真菌，这是指小巢状麴菌可以自花授粉（self-fertilize），并且在没有其他交配个体的情形下形成子实体（sporocarp，或称孢子果，fruiting body）。