购置类似神像作为替代品。而神像虽倖免于难，但 护庇宫被改成谷仓。二次大战后，信众于民国四十七年（1958年）11月组织重建 护庇宫委员会，次年（1959年）3月动工，11月上樑，到民国六十一年（1972年）才完工。此次重修请来潘丽水负责庙中的彩绘，叶进益制作壁堵与水车堵。民国九十四年（2005年），护庇宫的凌霄宝殿完成。
宗教活动.护庇宫除了是盐水的公庙之外，由于当地过去曾是倒风内海的总吞吐口岸，使得其信仰范围涵盖咸水港保、太子宫保、龙蛟潭保、白须公潭保等地（今台南市盐水区、新