7年美南长老会向中国杭州派出了第一批传教士，以后沿京杭大运河向北扩展，尤其在江苏省均有重要影响。1952年退出中国大陆后，继续在台湾协助传教。
日本.1885年，美南长老会向日本高知县派出了2名传教士。1888年，美南长老会在名古屋设立了金城女学校。1901年，植村正久在美北长老会的明治学院讲授自由主义神学、进化论。1907年，神戸神学院成立。校长塞缪尔·富尔顿。教师多为普林斯顿神学院毕业的美南长老会传教士。1927年，神戸神学院与大坂神学院合併成立中央神学院，校长塞缪尔·