返回了美国，于1867年经新奥尔良到达路易斯维尔。疫情爆发期间实行援助后，他和家人移居夫人在阿肯色州拥有的种植园。布莱克本一直没有受到逮捕，他于1873年初与家人回到肯塔基州，住进路易斯维尔的盖尔特堡酒店（），然后开始重新在该市行医。1873年的一次霍乱疫情期间，布莱克本准确地认为这一疾病是通过受到污染的水进行传播，但大部分市民并没有接受他的看法，而是相信城里一位更有名气医师托马斯··贝尔（）的理论，认为霍乱属于瘴气疾病，这导致有成千上万的市民由于没有听从布莱克本在饮水前先煮沸的忠告而死。之后，布莱克本