值得注意的是，天皇居所虽然迁往江户城，但京都御所原有的皇宫地位并没有被废除，象征天皇驻地所在的天皇宝座「高御座」也仍然留置于此，直至今日。现今的京都御所是日本皇室关联设施之一，由宫内厅京都事务所管理。邻近的皇室设施还有与仙洞御所，与京都御所共同被京都御苑环绕。目前京都御所部分区域在平日开放公众参观。
御所建筑.京都御所建立后经历过多次整修，现今的内里为幕末的安政2年（1855年）仿造平安様式重建，被称为「安政内里」。现今御所各门、殿，其名称多沿袭原先大内里中内里的门名及殿名。