帮助日本舰队在日俄战争形成战舰群核心。其后两次在1904年2月9日的旅顺（亚瑟港）砲击期间被击中，其后在3月22日再次砲击旅顺。1904年8月10日，参与了黄海海战。在1905年5月27日的对马海崃海战中，富士被11发砲弹命中，而在返航时致命地击中俄罗斯的博罗季诺号战舰(Borodino)，导致该舰爆炸并沉没，当中的830名乘员仅有1人生还。日俄战争结束，富士被安排整修，其中包括换上新锅炉。1910年，舰上由英国制造的舰砲均由日本制造的所替化，并且舰种被更加为一等海防舰并负起训练砲手及水兵的责任。其