海工统委员会委员、金陵关监督等职。1924年，追随孙中山北上与段祺瑞共相国事，在孙中山病重之时，侍奉在侧。之后参加办理孙中山之丧事，是料理孙中山后事的国民党党员之一。1928年春，担任国民革命军总司令部战地政务委员兼外交处主任。同年4、5月间，蒋中正率北伐军进入山东时，日军以保护侨民为由横加阻挠，蔡公时奉命赴济南与日方交涉。然而，日本军队于5月3日强行进入交涉公署。蔡公时为维护民族正义慷慨陈辞，用日语斥责日本军人之暴行，被日军割去耳鼻挖去双眼舌头，最终将蔡公时及随从17位外交人员杀害。史称“济南惨案