有：未经污水处理导致的水污染，工业废水污染和农业水土流失；有限的自然水资源；多数人口没有用上经处理的水；森林砍伐、土壤侵蚀和土地荒漠化。
气候变化与温室效应.地处巴北部属于印度河上游地区的喜马拉雅山区，研究人员收集到了树木年轮的标本，树龄可以追溯到前828年 。通过对树龄千年的树木分析表明，巴基斯坦北部山区最近一百年和过去的一千年相比，湿度明显升高，很可能是由于人类诱发的全球变暖所致。
国际多边合作.巴基斯坦参与环境保护、气候与大气相关的国际公约主要如下：