脑包含了若干直接投射到嵴髓的运动区域。其中最底层的是延髓和桥脑的运动区域，控制一些刻板运动，例如行走、唿吸和吞咽。在中脑里的运动区域要高级一些，例如负责手脚协调运动的。更高级的层级是，位于额叶后部的一条神经组织。初级运动皮层投射到皮层下运动区域，也通过锥体束大量投射到嵴髓。皮层嵴髓投射使得精确地自主控制运动的细节变得可能。其他运动相关的脑区通过投射到初级运动区域产生次要的作用，其中最重要的区域是前运动皮质、基底核和小脑。除了上述的区域以外，脑和嵴髓还包括控制自主神经系统的控制回路，通过分泌荷尔蒙和调节内脏