5年（1551年），菊池义武趁大友家二阶崩之变时，举起反旗，大友义镇出兵肥后镇定地区试图镇压。阿苏氏派宗运率军配合大将。惟教进攻菊池义武部将合志隆重守备的，但未能攻落，双方以交出人质讲和后撤退。永禄5年（1562年），岛津氏势力扩展至肥后国，与冲突。天正6年（1578年），大友氏于耳川之战被岛津氏击败后，在肥后地区的影响力降低，肥后的国人众大多跟从岛津氏或龙造寺氏，只有宗运坚定维持与大友氏的同盟关系。天正8年（1580年）3月，从属于龙造寺氏的、、河尻氏、鹿子木氏，及从属于岛津氏的名和显孝、等肥后国