概念已深入人心，因此现行生物分类法为二法并用——在以支序分类理论为主导的同时，保留传统的分类阶元，甚至根据系统分类的需要而增设新的阶元。然而，林奈分类法的局限性使其无法与系统分类很好地兼容，从而造成了许多难以解决的分类问题。系统分类法会收集遗传学、古生物学和形态学等方面的资料，最终拟制出一幅树状关系图（即分支图，Cladogram）来表现各物种之间假定的演化关系。在分支图中，所有的生物体都如同一片树叶，且每个内节点理想上都是二元（有两条分歧）的，在此一分歧点两端的分类群互为旁系群，或称姊妹群。每一分支不