滞留线不足等缘故，于1989年5月在大野工场解体，没有被保存下来。剩余的4种编组，后来主要用于「朝雾号」线，由于1987年所投入使用的大量增加，1989年7月15日起SE车仅用于「朝雾号」线的定期运行班次。稍早一点的1988年7月，小田急要求东海旅客铁道（JR东海）更换车龄超过30年的SE列车。以此为开端，在两公司之间进行有关相互直通运行的协议。这其中，两公司在分别引进新型车辆的基础上逐渐变为相互直通运行，自此逐渐可以看出SE车被替代的趋势。1990年年末，RSE车入线运行，进入1991年以后开