13年2月28日因健康问题辞职后，合资格的115位枢机于翌月12日进行教宗选举秘密会议；经过5轮投票后，枢机团于翌日获出伯格里奥为新任教宗，名号为「方济各」，之后于同月19日在梵蒂冈圣伯多禄大殿举行的后正式成为第266任教宗。其创下多项纪录，包括首位来自美洲、拉丁美洲国家、南半球与耶稣会的教宗，也是继额我略三世后1200年来首位非欧洲出身的教宗。2013年3月28日，方济各首次履行天主教圣週四的洗脚礼，他到罗马一间少年监狱，为12名少年犯洗脚，其中有二名穆斯林，二位少女。这是教宗首次至到监狱履行洗脚礼、