队成功攻下了圣埃尔莫堡，守方的防御依然坚固。马耳他守军日以继夜地修补了防御缺口，攻下马耳他更是变得难上加难。进入夏季后，许多驻扎在拥挤地区的奥斯曼士兵纷纷染病。粮弹开始紧缺，久攻不下的马耳他也让土耳其士兵的士气不断下降。6月23日，奥斯曼舰队的海军上将德拉古特战死对奥斯曼军队而言更是个沉重的打击。土耳其的另外两个指挥官和穆斯塔法·帕夏更是犯下多次失误：只使用了一次庞大的土耳其舰队、不与非洲海岸联系、没有拦截西西里的增援部队。9月1日，土耳其军队发动最后一次进攻。士气低落、进攻乏力的土耳其军队使得被围困的