总队长王应尊及第5兵团参谋长吴永烈等商议，决定劝兵团司令李文率部投降中国人民解放军。12月27日，陈鞠旅命第1军残部放下武器，接受中国人民解放军第12军的整编。据说，当陈鞠旅在军部召集营以上干部宣布该决定时，与会人员全落下了眼泪。陈鞠旅率部投降中国人民解放军之后，被定为起义人员，送入西南军政大学高级班学习。1950年3月，陈鞠旅被任命为西南军区高级参议。后来，因为和陈鞠旅一起投降的李文、冯龙、周士瀛等人先后逃走，陈鞠旅因此而受牵连，遭逮捕审查。1952年3月2日，陈鞠旅在重庆狱中病逝。