门内原为儒学署，学署建筑仍保留了明代建筑风格。穿过礼门和礼门后的仪门后为儒学的主要建筑明伦堂和当湖书院。其中明伦堂为单檐歇山灰瓦顶，堂前有抱厦结构，作勾连搭顶，堂内采用减柱造法。明伦堂西墙建有碑廊，共有碑刻、石刻、墓志铭等87方，以唐代石刻为最早，其中有朱熹等人的书法。当湖书院面积500平方米，整体为三进院落，院内设有仿贡院考场，此外还种有古玉兰等树木。
保护.1961年，嘉定博物馆迁入嘉定孔庙。1962年，嘉定孔庙被列为上海市级文物保护单位。1980年，嘉定孔庙被重新公布为市级文物