S.x86-64版本的MenuetOS系统于2005年6月推出，虽然原有的32位版本Menuet以GPL授权，但x86-64版本则维持专属，并以免费软件方式发佈，以及提供部分元件的原始码。
NetBSD.x86-64版本的NetBSD最早于2001年6月19日被提出，至2004年12月9日推出的NetBSD 2.0已能完全支援x86-64。
OpenBSD.OpenBSD自2004年5月1日推出的3.5版起，已支援x86-64。