专有的miniDVD光盘格式作为主机的存储介质，其能够存储高达1.5 GB的数据。 该光盘由松下电器产业（现松下电器产业株式会社）采用专有复制保护方案设计，该标准与标准DVD中为防止未经授权的复制而设计的内容扰乱系统不同（CSS）。任天堂在它发布的、FC磁碟机、和64DD中试验了各种互补存储技术，GameCube是任天堂的首款完全基于媒体的主机。GameCube的1.5英寸miniDVD光盘有足够的空间供大多数游戏使用，不过仍有少数游戏需要额外的光盘来存储更多的数据，或使用更高的视频压缩率或删除其他游戏机版