程里，随之而来的便是阿维森纳主义的冒起。政治权力的重心由穆斯林转移到西欧（西班牙及葡萄牙）的基督徒，西欧的穆斯林也顺理成章地没有再钻研哲学，这导致东方的穆斯林世界与西方的交流疏离。在东方的穆斯林则继续研习哲学，特别是位于现今伊朗及印度的一些王国及奥斯曼帝国的学者，他们流传下来的着作可以证明这一点，较着名的有沙阿·瓦里乌拉（Shah Waliullah）及艾哈迈德·希尔信迪（Ahmad Sirhindi），这时期却被前现代时期的伊斯兰哲学史家所忽略。当时神学院依然教授逻辑学，直到近代。伊本·鲁世德以后