王叔和整理过后的版本，被称为《张仲景伤寒》、《张仲景方》或《王叔和张仲景方》，在东晋、南北朝时期，流传于民间。在这段期间，抄本流传的状况并不清楚，在同时期的医书，如《肘后方》、《针灸甲乙经》、《小品方》、《辅行诀》中皆有抄录部份的伤寒论内容。在隋代太医巢元方编着《诸病源候论》时也收录了许多伤寒论的内容。
唐本.《伤寒论》在唐代开始被史书记载，只是尚未被称为《伤寒论》。《隋书》〈经籍志〉中记载有《张仲景方》十二卷，《张仲景疗妇人方》二卷。注引《梁七录》，有《张仲景辨伤寒》十卷。《旧唐