责。军令部次长的职掌为辅佐部长／总长，两者皆为御前会议的成员。军令部平时主管作战与用兵计划的作为，战时为联合舰队总司令的直属长官，并决定作战目标。军令部虽属于海军最高单位，但设置之初，政府为尊重陆军，是将军令部与参谋本部一併列于陆军之下，这现象到太平洋战争爆发后才有改变。
1893年海军军令部条例.第一条 海军军令部设置于东京，掌管制定出师作战、沿岸防御的计划，监督镇守府及舰队的参谋将校，并监视教育训练。第二条 海军军令部长由天皇从海军大将或海军中将中亲补，直属天皇，参