塔，按严格的几何图案对称地布置：顶层的五座宝塔，一在正中，四角各一，如五点梅花；庙山的每一层正方形台基的四角，安置角塔，共20座角塔；四道五层阶梯的每一道每一层，各有一对宝塔伺立左右，共有阶梯宝塔40座；另有44座宝塔环立庙山四周。14世纪初元代航海家汪大渊访问真腊时称巴肯寺为“百塔洲”，当时的百余座塔还是金塔。今日不少宝塔已经残缺不全。