3年，维尔纳到苏黎世大学工作并且在1895年晋升为教授，在这一年，他也成为了瑞士公民。
研究.
配位化学.1893年，维尔纳是第一位提出复合离子配位化合物的正确结构的化学家，其过渡中心的金属原子被中性或阴性配体所包围。例如钴可以形成一个复杂的复合体三氯化六氨合钴（化学式：CoCl•6NH），但这个表示方法并不能确定这个复合体是怎么构成的。因此维尔纳提出了[Co(NH)<nowiki>]</nowiki>Cl，这个结构式表示Co离子在八面体的顶点被6个NH所包围