什米尔人血统。霍梅尼在霍梅恩出生，他在6岁时即开始学习伊斯兰教的圣书古兰经及基本的波斯语。翌年，他在当地的学校上课，学习宗教等传统学科。他的幼年时代都在远亲贾法尔和兄长莫尔塔礼·帕桑迪德的帮助下接受宗教教育。第一次世界大战结束后，霍梅尼原本被安排到伊斯法罕一所伊斯兰神学院就读，但是他反而到阿拉克的另一所神学院就读，接受阿亚图拉阿卜杜勒-卡里姆·哈埃里·亚兹迪（Abdul-Karim Ha'eri Yazdi）的指导。为了方便学习，霍梅尼在1920年迁到阿拉克。翌年，哈埃里·亚兹迪转到圣城库姆的伊斯兰神学