宪大会和1898年的最后一次制宪大会也都是在墨尔本召开，两次会议上都有代表对联邦宪法第一百一十六条提出异议。新南威尔士州的新教教会要求在宪法中明确“法律的最终根源”是天神意旨，与会代表约翰·奎克（）和帕特里克·格林（）还要求宪法中明确承认上帝存在。基督复临安息日会提倡严格的政教分离原则，担心新成立的联邦政府会禁止其教众在周日工作。争议各方在一定程度上都实现了目标：第一百一十六条在最后一次制宪大会上通过，格林一方也成功将英国法令序言中常见的象征用词“万能的上帝”加入宪法文本。接下来宪法在六个殖民地各自举行的公