陆军小学停课，顾祝同参加推翻满清的革命。1912年加入国民党，后毕业于武昌预备军官学校，再升读保定陆军军官学校第六期步科毕业。1922年赴粤，加入粤军二军任参谋。陈炯明反叛时担任东路讨贼军副官长，与蒋介石结识。
四处征战.黄埔军校成立后，调任军校战术教官，管理部主任。1925年东征陈炯明时任教导团营长。国民革命军北伐时升任师长、军长。之后参加中原大战，任十六路军总指挥。1931年，任国民政府南京警卫军军长。12月15日，蒋中正召开第四十九次国务会议，任命顾祝同为江苏省政府主