3月和6月，巡视马祖列岛及金门县。蒋经国连任中常委。11月26日，应邀访问日本。11月27日，「以国防部长身分访日，日皇裕仁接见时表示永不忘怀蒋公宽大德意」。12月12日，蒋经国出席第十三届军事会议。1968年，蒋经国到金门过春节；巡视马祖，6月在成功岭主持大专预官学生开训典礼。8月1日，蒋经国则以中华民国陆军二级上将军衔正式退伍，直到1969年后才卸下中华民国国防部长职位，改由黄杰继任之。1969年，蒋经国访韩，与韩国总统朴正熙、韩国总理丁一权会谈，并发表声明。蒋经国再度访问南韩，代表国府