系统发生学（；，现代希腊语：——种系、宗族；，现代希腊语：——起源，血统。英语：phylogenetics，又称 种系发生学、谱系发生学，简称 谱系学，是研究及推理生物个体或群体（例如物种或种群）间演化史及关系的科学方法，属于系统分类学的一部分。系统发生学的推理方法，通常在性状演变的特定模型下，评估可观察到的遗传性状（例如DNA序列或生物形态）来“假定”这些生物间的关系。这种分析推理方法的结果，就是 系统发生（英语：phylogeny，也称为 系统发生树 phylogenetic