最终陈唐山获得民进党提名连任。陈唐山赢得民进党内初选后，当时国民党大老吴修齐曾告诉他，吴修齐曾对总统李登辉说：「陈唐山这么好，国民党不用再提名，让他一个人参选就可以。」使陈氏更加有信心。唯最终李登辉并未接受吴修齐的建议，最后国民党派出下营出身的政坛老将洪玉钦出马，与陈唐山角逐第十三届县长。最终陈唐山以囊括台南县65.73%的选票高票获得连任，创下民进党候选人在台南县得票率最高记录。直到2010年县市合併。新新闻週刊曾经报导，脱离中国国民党参选第十任总统选举的宋楚瑜，曾多度力邀陈唐山作其副总统竞选搭档。陈