政硕士学位。民国2年（1913年）归国，当选为民元国会参议院议员，并兼任北京大学商科主任、大总统府秘书、咨议等职务。1914年1月10日，大总统袁世凯宣布解散国会，朱兆莘遂赴厦门，任鼓浪屿会审公堂堂长。民国6年（1917年），朱兆莘被任命为驻沪外交部特派江苏交涉员，驻上海。其后，伍廷芳自北京携带外交印信至上海，以上海的朱兆莘的交涉公署作为行辕，进行外交活动。朱兆莘支持伍廷芳讨逆护法的立场，配合孙中山方面争取友好国家支持讨逆护法，从而激怒了北京政府，于1917年7月22日遭段祺瑞政府褫免驻沪外交部特派江苏