1月起，兼任清华大学台湾研究院院长。郑立中是中共十六大、中共十七大代表。2002年11月，当选中共第十六届中央候补委员。2007年10月，当选为中共第十七届中央候补委员。2013年3月，郑立中当选为第十二届全国政协委员、常委，并出任第十二届全国政协港澳台侨委员会副主任。
免职及处分.2017年2月28日，政协第十二届全国委员会常务委员会第十九次会议通过《关于免去郑立中中国人民政治协商会议第十二届全国委员会常务委员、港澳台侨委员会副主任职务，撤销其委员资格的决定》，有鉴于郑立中严