座木结构建筑，单檐歇山顶，面阔与进深各3间。礼亭原建于明代，1990年仿明代风格重建。庭园西侧有康熙御碑亭，碑上“万里波澄”四字，为康熙四十二年（1703年）由康熙帝亲笔书写。东侧是明洪武御碑，该碑立于明朝洪武三年（1370年），由明太祖朱元璋授意，礼部侍郎王玮撰文。
大殿.礼亭的背后是南海神庙最重要的建筑物——大殿，它是仿明代木结构琉璃瓦歇山顶建筑。屋顶用绿色的琉璃瓦覆盖；中间有双凤飞翔、鳌鱼倒悬等纹饰的琉璃瓦嵴；上部有两条躯体弯曲作腾飞疾走状的苍龙造型，正在争夺当中的宝珠。大殿