选后的抗议大幅打击泛蓝及其支持者的形象，泛绿支持者及少数泛蓝支持者则谴责连宋「输不起，所以制造《枪击案自导自演》及《做票》等谣言来污蔑陈水扁」，掩饰其拒绝接受选举结果的事实。选后泛蓝的抗议行为则让泛绿支持者对泛蓝不尊重选举结果「感到仇恨」；泛绿（如林浊水）批评泛蓝支持者及亲蓝媒体制造谣言、仇恨、族群阶级歧视。选后台湾的政治冲突也令人忧心，这是因为蓝绿双方抗议行为过于激烈、言论过于恶毒；这种作法至少会引起对方内心的仇恨与蔑视、也可能引起对方学习此恶劣手段。此外，时任总统陈水扁在4年内增长150万张选票