图书馆此后的来馆人数转为增加。2000年，神冈町4位女性自愿组成“”，在图书馆内外为他人读书。为整理藏书和引入电脑，图书馆在2003年9月暂时闭馆，将约4万2千册的藏书减少至2万9千册并贴上条形码，随后于12月2日开始使用电脑处理借书。考虑到即将在町村合併中诞生的飞驒市，该馆与古川町图书馆（飞驒市图书馆前身）连入了同一网络，除可互相搜索藏书外，在图书馆的服务台处借阅另一图书馆的藏书也成为可能。2004年2月1日，古川町与、、合併为飞驒市，神冈町立图书馆改名为飞驒市神冈图书馆。古川町图书馆成为飞驒市古