兰遮城，遂于麻豆溪事件发生后六年的1635年展开报复，11月23日，普特曼斯亲率500名荷兰士兵分成七队及500名新港社原住民攻打麻豆社，在普特曼斯的命令下，荷兰士兵见人就杀，第一天杀死麻豆社原住民26名。普特曼斯并下命令烧毁所有住家，房子全燬；谓之麻豆社之役。及至12月18日，麻豆社终于向荷兰人投降，并签订《麻豆协约》表示他们愿完全接受荷兰政府统治 。
之后衍生军事行动.之后荷兰人借由此次军事行动，东征西讨，最后迫使萧壠社（今佳里区）、大目降（今新化区）、目加熘湾（今善化区）、哆