使用659转乘其他巴士线的乘客稀少，主要客源是转乘轻铁的乘客，2002年8月18日起配合轻铁辅助巴士A71永久停驶，659绕经天水围公园及天瑞邨。 本线于2003年11月24日起投入服务，原本为一条临时路线，最初往来兆康及天恆，以方便天水围北居民往返蓝地，只在平日繁忙时间提供服务，最初计划九广西铁通车后永久停驶，但遭到强烈反对而获得保留。由12月1日起，本线的服务班次由9分钟一班增强至6至7分钟一班，服务时间及车费维持不变，以增加路线的载客量。后来为配合天水围北轻铁支线通车，轻铁新线751及761（