任职的日本人民间人士有半数在战争结束时回国了，不过，也半数的人们由于保留了与战争结束前同样的待遇而留任，河本自己也保留了“总顾问”的头衔。此后，在太原的日本人配合阎锡山的部队同中国人民解放军作战。1949年解放军攻克太原，河本成为了俘虏，后被中华人民共和国政府作为战犯被监禁在太原战犯管理所。1955年8月25日，河本大作病逝于太原战犯管理所。终年72岁。河本的遗骨于同年12月18日被送回日本。
着作.其着作由陈鹏仁译为中文，简体字版书名《我杀死了张作霖》，繁体字版书名《张作霖与