任院长。张之洞移任湖广后，梁鼎芬追随充当幕僚。张之洞在武汉办《楚学报》，聘请王仁俊为坐办，由章太炎主笔。梁鼎芬见章太炎写《排满论》六万言，两人发生冲突。王仁俊向张辩解，谓章本是个疯子，“即日逐之出境可也”。梁鼎芬让轿夫用抬轿子的木杠子痛打章的屁股。梁嗜食鱼翅，张之洞举办宴会时，必准备鱼翅一大盘给他大快朵颐。戊戌变法时，梁鼎芬支持张之洞查封上海强学会。称康有为、梁启超“提倡维新”是“邪教、邪说，心同叛逆”。张之洞死后，梁鼎芬亲往送葬至南皮。一路上痛哭失声，响彻云霄。送殡完毕后，梁在张宅门前徘徊多时，不忍离去。