博都巴哈和父亲一起踏上了去巴格达的路。在去巴格达的路上，阿博都巴哈被冻伤所折磨。在巴格达，巴哈欧拉和米尔扎·叶海亚争斗了一年后，选择了隐居，并在1854年4月去往苏莱曼尼亚秘密隐居起来，而当时正好是阿博都巴哈生日前的一个月。 阿博都巴哈和他母亲和妹妹对巴哈欧拉的离开感到十分伤心，但这促使他们的感情变得更加深厚， 他的母亲也因此在阿博都巴哈的抚养和教育中扮演更重要的角色。 在巴哈欧拉离开的两年里，阿博都巴哈担起了处理更多家庭事务的担子， 而在当时的中东，一般认为14岁才有能力担此责任。 同时，阿博都巴哈也积极