山君统治仅维持12年。1506年中宗反正后，燕山君遭成希颜、朴元宗等朝臣废黜，被流放至江华岛，两个月后病死，得年30岁。因以暴君身分被废，因而无庙号、尊号、谥号、陵名等。中宗是个平庸之人，只是因所处的历史时期而被推上王位。不过在中宗时期，中宗的大臣士林派首领赵光祖开展许多大规模的改革。赵光祖建立乡约以加强地方的管理，并通过土地改革降低贫富差距。赵光祖还通过发行简易本的儒学在大众中传播儒家思想，并致力于精简国家机构。据《朝鲜王朝实录》记载，由于赵光祖的严厉监督，在这一时期朝鲜的官员无人敢收受贿赂或滥用职权