恢复章武王的爵位，元融袭封章武王，出任骁骑将军。梁武帝萧衍派遣将领侵犯进逼淮阳，梁城陷落，皇帝诏令元融出任假节、征虏将军，跟随伯父中山王元英担任别将，另外率领军队向南讨伐，杀伤大量的南梁士兵，收复梁城。当时扬州刺史元嵩被奴仆杀害，元英上表推荐元融代理扬州事务。回到京城后，元融很快升任假节、征虏将军、都督并州诸军事、并州刺史。魏宣武帝元恪去世后，元融兼任司空，营造景陵。元融出任宗正卿，又出任使持节、散骑常侍、平东将军、都督青州诸军事、青州刺史，回朝担任秘书监，升任中护军，军号升为抚军将军，兼领河南尹，