京设立办事处，关赓麟、陈耀祖、曾仲鸣为正副主任。1932年12月1日国民政府迁都南京，该部随迁。因中华民国国父孙中山先生认为铁道为中国实业振兴之主要关键，奉行孙中山遗教为建国大纲的国民政府将铁道部设定为拥有层级与位阶相当高的部会。1937年，中国抗日战争全面爆发，中国东北、南京、北平等中国多数高密度铁路地区尽落入日本军之手。1938年1月1日，该部裁撤，业务併入交通部路政司。