经费从海关税收中拨付。华特森及其密友、在北京的中国海关总税务司安格联（Francis Aglen）均对此持合作态度。伍连德和华特森在海关大楼内的华特森办公室工作三天，制订出预算方案。随后会同李家鏊完成了创建北满防疫机构规划的呈文。此后，伍连德赴北京向清朝外务部呈报，再由外务部向清政府呈递。伍连德走访了颜福庆博士及驻北京外交使团与海关的人士，向他们介绍了此前“万国鼠疫研究会”会议情况及与会中外专家建议，还有呈文内容，获得了支持。初拟在北满创建防疫机构及多处医院，东三省地方政府筹措开办费用，常年开支由海关税