944年，二战期间，一名美军飞行员汉克·马洛与一名日军飞行员碇军平经过一场空战后，共同跳机伞降至南太平洋上的一座岛屿。军平追逐汉克至悬崖边时试图杀他，但一只被称为「金刚」的巨型猩猩突然现身，使两人吓得目瞪口呆。随着二战结束，一转眼到1973年，美国发射人造卫星后，意外在南太平洋区域发现该岛屿，将这座秘境称作「骷髅岛」。调查远古巨型生物的「君主计划」（）高层比尔·朗达获得政府授权去探索这座从未有人涉足的岛屿后，来到越南岘港雇用前英国特种空勤团上尉詹姆斯·康瑞作为追踪者、以及由美军中校普雷斯顿·帕卡德领导的军队