没有敢于营救。王安礼上言神宗说：“自古大度之主，不以言语罪人。” 被宋神宗所纳，苏轼得以从轻处罚。元丰五年（1082年），拜中大夫、尚书右丞。元丰六年（1083年）进尚书左丞。变法之际，先后任两制官，论事上前，守正不阿，敢直言，权贵多畏惧他。他对兄长的熙宁变法持保守态度。亟言执政大臣“用力殚于沟瘠，取利究于园夫”，“计边馈之非实，杜西师之再举”。劝神宗勿用兵，少置狱。元丰七年（1084年），御史张汝贤弹劾他，以端明殿学士知江宁府。宋哲宗元祐年间，历任知扬州、青州、蔡州、舒州。绍圣元年（1094年）知永兴军。