员大卫·杜考夫尼回归，但有部分批评节目的情节漏洞。《起死回生》获黄金时段艾美奖杰出化妆奖，是《档案》拿下的最后一座艾美奖。联邦调查局特工福克斯·穆德被外星人绑架后身亡，搭档丹娜·斯嘉丽和新同事约翰·多格特继续调查人称“档案”的悬案，这些案件大多同超自然现象有关。穆德的遗体下葬后，同被外星人绑架、经判定已经死亡的比利·迈尔斯在验尸前突然“复活”，副局长沃尔特·斯金纳下令掘出穆德的遗体。经过检查，众人得知穆德还有微弱的生命体征。联邦调查局叛变特工亚历克斯·克雷切克利用纳米机器人侵入斯金纳的血液，以此强迫他杀