益川敏英于2003年4月成为京都大学名誉教授，并于当月开始在理学院担任教授。益川敏英在2008年因小林-益川模型的贡献与小林诚及南部阳一郎共同获得2008年的诺贝尔物理学奖。他在12月参加瑞典斯德哥尔摩的诺贝尔奖颁奖典礼时，因为不擅长以英语演讲，所以改用日语发表得奖感言。这也是益川敏英生平首次离开日本国土。在诺贝尔奖颁奖典礼中，授奖人首次以全程日语朗读颂词，以表达对益川敏英的敬意。他在2008年11月成为文化功劳者同时获得日本文化勋章，这是皇室授与对于科学技术与艺术文化的发展提升有显着贡献者的勋章，授与