数量在战争爆发时是当时世界海军列强中最少者，但因为潜艇总司令卡尔·邓尼茨以狼群战术、先进的通信制度和战略规划而取得所有交战国潜艇部队里最大的战绩。到了1943年德国潜艇在大西洋越来越力不从心，盟军不但破解了密码机和开发了多种先进反潜武器，如更先进的声呐、雷达、深水炸弹，还投入了大量护卫航空母舰和反潜战斗群进行护航；同年5月德国潜艇因为损失过高而放弃了狼群战术，改以单舰巡弋的方式继续作战。战争末期德国海军虽研制了先进的通气管式潜艇，如XXI级潜艇和XXIII级，并投入使用直到战争结束，但仍无法扭转战败的结果。