日，北海道新干线正式通车，站名亦从更名为新函馆北斗站。
新干线站名争议.当北海道新干线正式动工时，本站的命名一直都争论不休。当中所在地的北斗市，时任市长的海老泽顺三曾要求将车站名定命为「」，认为车站名称应跟随地名，结果遭到具有中核市地位的邻市函馆市方面大力反对，坚持要求以较为人认识的「」命名。后来JR北海道及北海道道厅，均以「」作为暂定名称。2012年9月及2013年7月，时任北斗市市长高谷寿峰两度约见JR北海道管理层，在命名作让步，建议採用「」命名。北斗市议会亦早于2012年