二年（1622年）考中壬戌科三甲进士，选翰林院庶吉士。馆试后授检讨。不久，告假回乡，为父养老送终。
谄附阉党.守丧期满后，孙之獬重回京师。当时权阉魏忠贤势力正盛，孙之獬谄附阉党，破格陞任侍讲。天启七年（1627年），与徐时泰主顺天府乡试。阉党重要成员崔呈秀之子崔铎，才不能文，却通过孙之獬的关系，得以中举。不久，熹宗驾崩，思宗（即崇祯帝）即位。魏忠贤很快遭到参劾，畏罪自杀。次年（崇祯元年，1628年），翰林倪元璐请毁《三朝要典》，并清算阉党。《三朝要典》初名《从信鸿编》，又称《三大