之后，由于皇帝党和教宗党之间的争斗，建筑部分恢复和部分重建。立面完成于1307年和1312年之间，内部柱廊重建。罗曼式建筑保持了原状，增加了宗教题材的壁画。在14和15世纪，建起了许多祭台和小堂。立面东北塔楼上的小凉廊建于1455年；对面的凉廊属于风格主义，建于1522年。 1550年，佩鲁贾建筑师Galeazzo Alessi受市政长官委派，计划重建整座建筑；但是他只完成了大厅和过道的屋顶、路面、穹顶和后殿。主教座堂的建造结束于17世纪。穹顶和中世纪部分在1894年至1900年恢复。