也有一部分呈灌木状或树蕨状，只有少部份是高可达10米的乔木。它们绝大部分有真蕨植物一样的大型羽状复叶和具有二歧分叉的主叶柄，但叶的表面角质层较真蕨类厚。根据种子蕨类的解剖结构，它们既有蕨类植物性状，又有裸子植物性状；茎和根有像真蕨一样的维管束，又有像苏铁一样的形成层、次生木质部和次生韧皮部等。在种子蕨的生殖叶上长有花粉囊和种子，以种子进行繁殖。种子有的长在叶的羽片顶端，有的则生在叶的裂片上。在种子蕨类植物中，至今仅发现两例种子中有胚，大多数种子实际上是胚珠。胚珠有离生珠被。研究发现它们还没有花，但已