波多黎各总督 （；〔男性〕或〔女性〕），为波多黎各政府的行政首脑，也是波多黎各国民警卫队的总司令。1948年至今，波多黎各总督皆由公民选举产生。
大航海时代之前.泰诺族是加勒比海多个海岛上的原住民。领导人被称为酋长“Cacique”。期间最有名的酋长是（1510年逝世）以及他的兄弟（1511年逝世）。阿圭巴纳一世是西班牙探险家在1493年11月19日哥伦布第一次登上波多黎各时的酋长，被当地人称为“伟大的太阳” ("The Great Sun")。阿圭巴纳一世逝世后，阿圭巴纳二世继任