马驹桥清真寺，位于北京市通州区马驹桥镇北门口村，是一座伊斯兰教清真寺。
简介.1985年9月，通县人民政府将马驹桥清真寺公布为通县文物保护单位（现为通州区文物保护单位）。马驹桥清真寺始建于明朝，清朝重修。《通州文物志》记载，马驹桥清真寺周围的回民是明朝皇家游猎场南海子建成后，因为商业活动兴旺而聚居起来的人。因马驹桥在京津要道，兴建弘仁石拱桥后，又在桥头造碧霞元君庙，也有利于商业发展，回民纷纷到此定居，故修马驹桥清真寺。清朝、中华民国年间重修。文革期间曾作为生产大队库房，山门被拆除。