日甲午战后台湾割日，废县改置民政支厅，专司民政。翌年颁定台湾总督府地方官制，为三县一厅，斗六街置台湾县云林出张所。1897年（明治三十年）又改为六县三厅，改置嘉义县斗六办务所，并设置街庄长，翌年改隶台中县。1901年（明治三十四年）改正官制，置斗六厅，至1911年（明治四十四年）废斗六厅，併入嘉义厅。至大正九年（1920年）改行政区域为五州三厅，斗六郡役所将原斗六区、林内区及树子脚、菜公区之部分裁併为斗六街之区域。
民国时期.至光复后于民国三十五年（1946年）成立台南