到此曲是从梁末隐居九嶷山的会稽人丘明手中流传下来的。《琴操》之说虽不可信，但根据吴文光之说，此曲既非丘明自创，势必师承有人，因此至少在魏晋时就已经存在了。现存的《碣石调·幽兰》文字谱共224行，4954字。明治四年（1871年）至二十一世纪初此谱藏于京都神光院，后来转到东京国立博物馆，被当做日本“国宝”，列品号码为TB1393。但究竟是何时流入日本却不为人所知，在进入神光院之前可能藏于日本皇室，后水尾天皇将它赐予一名京都伶人。江户时代的荻生徂徕（1666年-1728年）有《徂徕幽兰琴谱》和《碣石调幽兰指