在光球顶端的温度只有大约4,400K，而在色球层顶端，通常高约2,000公里，温度已经达到25,000K。因而，我们发现这与光球的温度随高度增加而下降是相反的。我们还不清楚是甚么现象导致色球层的温度会与太阳的内部产生矛盾。然而，它似乎或多或少的可以利用磁重联来解释。
特征.在色球层可以观察到许多有趣的现象，它们有着非常复杂的动态： 
外部连结.