体学的研究，固态次氟酸分子为角形，键角为101°， O-F和O-H距离分别为1.442和0.78A，分子间有O-H…O键连成的链。右图是气态次氟酸分子的结构。
有机合成.次氟酸是一个较新颖的氧化剂。分子中，O-F键不稳定；氧与电负性比氧强的氟连接，以致当中的氧偏向带正电，因此次氟酸是具有高度亲电性的供氧试剂(次氟酸中的氧有亲电性)，应用性极强。有机合成中最常用的是它的乙腈溶液（HOF·CHCN）。该溶液具有较高的稳定性，可由氮气稀释的氟气通过含水分的乙腈得到，室温下可稳定存在数