藏大臣的权力逐渐消失。驻藏大臣联豫与达赖之间的矛盾颇深，并受到西藏高层的普遍敌视。在达赖尚未抵达拉萨之时，联豫以改革西藏政制、巩固边防为由，奏请派遣四川驻军入藏。清廷令四川总督赵尔巽出兵西藏。达赖得知后，命令戴琫改桑坚参等率藏军严阵以防，川军和边军分别由钟颖和赵尔丰率领，进入康区的察木多（今昌都）。川军和边军都是持新式武器的新式陆军，藏军无法抵抗，大败溃散，赵尔丰便率边军攻佔霍尔三十九族、波密、八宿等地，将当地土司强制废除，改土归流。达赖行至那曲，得知藏军溃败的消息。他派人前往江孜，在那里向清廷及各国驻清公