006年美国外交电报中指出，蔡英文以技术官僚身分奠定「坚定的谈判者」、「聪明的内行人」以及「经济历练令人惊艳」的名声，并且被认定其能力极强、很有说服力。不过在5月17日，随着新行政院院长张俊雄及其内阁获得任命，蔡英文在这波内阁改组中遭到撤换，并由中华民国总统府秘书长邱义仁出任行政院副院长。
宇昌董事长.2007年5月21日，行政院院苏贞昌宣布总辞职当日，蔡英文便和其他几位苏贞昌内阁的部长跟进辞职。在辞去行政院副院长后，蔡英文返回家乡屏东县，暂不从事任何政府或政党职务。随后她则接任家