院院会通过后颁布实施的，这与立法院上会期审查总统府预算时通过决议，要求总统府内非编制组织包括人权委员会、科技谘询委员会停止运作的情形不同，因为这些组织都是没有法源依据的。陈水扁的言论引发泛蓝人士的勐烈抨击，被认为是违反了“四不一没有”的承诺。时任中国国民党主席的马英九认为陈水扁在2000年和2004年总统大选就职时，对人民都有承诺，他已表达这项作为可能产生的后果，目前暂时还在静观其变。而另一方面台联党主席苏进强则对陈水扁的观点表示肯定，认为是“做对的事，走对的路”，并要求陈“说到做到”。当初开催成立国统