皆须申请签证方可入境对方国家。持有中华民国护照的中华民国公民可以预审制落地签证的方式入境吉尔吉斯，事先透过吉尔吉斯旅行社出具落地签证邀请函向申请，核准后持函于首都的玛纳斯国际机场办理落地签证，停留最多30天。经吉尔吉斯转机，若未离开机场转机区，无须申办过境签证。持有的抵台参加国际会议、运动赛事、商展活动，则可以电子签证入境中华民国，停留最多30天并不得延期。
相关警示.有鑑于2019冠状病毒病疫情，中华民国外交部的国外旅游警示分级表将吉尔吉斯归类为红色警示：不宜前往，宜尽速离境