DNA定序可以准确得知DNA或RNA的硷基。将整个基因体定序的成本正快速下降中，因此完全定序的物种数量正呈指数上升。
和形态演化的不同步.特别是在在单系胞生物中，分子演化和形态演化有时并不同步，会出现「单一形态多重支系」（例如趋同演化和隐存种）和「单一支系多重形态」（例如性状可塑性和不同生命週期）。有些案例可以用中性理论解释 。
学术界.
社群和期刊.分子生物学与演化社群（Society for Molecular Biology a