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三级医院.截至2015年2月，共有48所三级医疗机构在上海市卫生健康委员会（上海市中医药管理局）注册登记。下文中，标注为“市管”的医院，其由上海市卫生健康委员会直接进行行政监管；标注为“委管”，则指该医院由中华人民共和国国家卫生健康委员会和上海市共管，并由市卫健委直接监管，此类医院共六所，均是复旦大学附属医院；“部队”指由第二军医大学（海军军医大学）等机构管辖的解放军医院，其中第二军医大学附属的三所医院为部队、地方共建医院。
二级医院.截至2015年