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历史.巴基斯坦国防部源自于1776年英国东印度公司在加尔各答所建立的「军事部」（）。该部主要的工作是协调，和记录东印度公司各政府部门与陆军有关的命令。军事部最初作为公共部的下辖机构，并持有陆军人员的名册。随着1947年巴基斯坦独立，巴基斯坦国防部在同年8月于喀拉蚩成立，由总理利雅卡特·阿里·汗兼任一职，伊斯坎德尔·米尔扎则担任。英军的将官直到1956年为止，一直担任巴基斯坦陆海空三军的总司令。1959年12月，因为阿尤布·汗军政府的伊斯兰马巴德-拉瓦尔品第都会圈计画，巴基斯坦