新疆入青海，统一了蒙古族分编为5部29旗。其中，海北地区有11旗，置于青海钦差大臣（驻西宁）管辖之下。同时，筑大通（今门源县城）、白塔（今大通县城关镇）、永安（门源县城西北55千米处）3城，在今门源县城设“大通卫”，辖永安营和白塔营，属西宁府管辖。清雍正二年（1724年），设大通卫于北大通城，今门源、祁连县东部地区为大通卫地，隶西宁府。干隆二十六年（1761年）改卫为县，辖33堡，今门源县为大通县属北大通营红山堡辖地。清干隆二十六年（1761年），改卫为县治。民国十八年（1929年）青海建省后，先后