。抗日战争爆发后，郑效峰先后担任军委一局指导员、三局通讯大队教导员，直接负责包括毛泽东等中共中央的警卫工作。1939年，任总政治部总务科长。1941年，任延安抗日军政大学二大队队长。1942年，调中央党校学习。抗日战争结束后，1945年郑效峰随军奔赴东北，出任东北民主联军七纵二十旅五十八团政委。1946年11月，担任辽宁一军分区（通化）政治部主任。1947年7月至12月，担任辽宁军区第一军分区政治部主任。1948年2月，担任辽宁军区独立一师政治部主任（师长赵杰、副师长夏德胜、副政委马毅之、参谋长罗春生）