亮正式征召苏峻，苏峻于是联合祖约以讨庾亮为名起兵。卞壸便复任尚书令、右将军、领右卫将军。次年，苏峻进军到东陵口，卞壸再被任命为都督大桁(京师朱雀桥)东诸军事、假节，加领军将军、给事中。卞壸后率领郭默和赵胤等在西陵与苏峻军大战，但战败。卞壸于是撤退，并归还符节谢罪。及后苏峻攻青溪，卞壸又与诸军抵抗，但仍战败，更被苏峻火烧宫寺。卞壸当时背部受的伤仍未癒合，仍与散卒和左右吏士数百人进攻，最终战死，享年四十八岁。咸和四年（329年），苏峻之乱平定，卞壸获追赠侍中、骠骑将军、开府仪同三司，谥忠贞，并以太牢之礼祭祀