六届五中全会上当选中央政治局候补委员。2月任中华苏维埃共和国中央政府执行委员会委员，中央政府主席团成员，国家政治保卫局局长，负责秘密警察事务，有“中国的捷尔任斯基”之称。长征开始前，邓发因邱会作了解当时红军的机密情况，便决定将其就地处决。但邱会作找到了周恩来和叶季壮，并向他们求情。最终，邱会作参加了长征。1934年10月，邓发随中央红军参加长征，任军委第二纵队副司令员兼副政治委员。1935年1月，邓发参加遵义会议，在会上支持毛泽东的主张。此后，邓发又担任陕甘支队第三纵队政治委员，并随军到达陕北。1936