12月，任中共四平市委书记。2003年1月，任吉林省人民政府秘书长。2004年12月，48岁的马俊清任中共吉林省委常委、宣传部部长，晋升副部级。2007年5月，任吉林省委常委、省委秘书长、省直机关工委书记。2008年8月，马俊清任吉林省委常委、吉林省人民政府副省长。2012年5月，任中共吉林省委常委，省政府党组副书记、常务副省长。2015年11月20日，马俊清任中共吉林省委副书记。2017年1月19日，吉林省第十二届人民代表大会第六次会议选举马俊清为吉林省人民代表大会常务委员会副主任。2017年2月