够自组装的分子通过多氢键制备的。最着名的笼形复合物是甲烷水合物，其中氢键骨架由水构成，客体分子为甲烷。大量 甲烷 以这种形式存在于永久冻土和海床。其他氢键网络由对苯二酚、尿素和硫脲衍生。也常被研究。 霍夫曼化合物（Ni(CN)·Ni(NH)）是配位聚合物。这些材料可以吸附小的芳香化合物客体(苯或特定取代位的二甲苯)，这种选择性，已经在商业上得到运用。 金属有机框架材料（MOF）也能形成笼合物。光敏的笼形复合物已经作为定向的容器。
研究历史.笼形水合物在1810年由汉弗里·