第二年(1861年)，美国爆发南北战争，林乐知故乡乔治亚州加入到南方阵营。由于战争，监理会差会无力顾及海外宣教士的生活，这使得林乐知经费断绝，不得不在宣教事工之外，兼谋一些差事来贴补家用。他曾先后担任过商品推销员，以及保险经纪人等职，以维持生计。后来在冯桂芬的介绍下，林乐知在清政府办的广方言馆内谋得英文教习一职；不久又应徐寿之请，到上海江南制造总局翻译馆译书，同时还兼任字林洋行中文报纸《上海新报》的主编。林乐知对这段艰苦日子曾如此记述说：「长达四年之久，我们收不到母会分文，也接不到亲友片纸只字。全家生计