元年（1645年）闰六月，隆武帝在福州即位，以黄道周为吏部尚书武英殿大学士、苏观生为吏部右侍郎兼东阁大学士、福建巡抚张肯堂为兵部尚书兼左都御史、何楷为户部尚书、四川按察使曹学佺为礼部尚书，吴春枝为兵部右侍郎兼右副都御史、周应期为刑部尚书、郑瑄为工部尚书、黄锦为礼部右侍郎，并赐号「奉天翊运中兴宣猷守正文臣」。十一月，隆武帝敕上游抚臣吴春枝速移驻邵武，以探虔州消息。监察御史吴春枝纠劾邵武通判陈主谟、古田知县吴士燿、汀州府知府王国冕贪污虐民。隆武二年（1646年）正月，隆武帝命令上游巡抚吴春枝选募健丁，精勤训练。