完工以来，每年春季的融雪期间种子库的入口会有少量的雪水流入，但在2016年10月因异常高温和暴雨，导致大量的水入侵种子库入口，最终在进入隧道约15公尺处结冻，并未影响储存库中的种子。
荣誉.斯瓦尔巴全球种子库于2008年获《时代杂志》最佳发明奖第六名，2019年被国际专案管理学会评为50个最具影响力的项目之一，装置艺术《永恆的反射》于2009年获颁挪威照明奖。