站因处于半密封设计的环境，也没有安装空调，通风不足长期受到诟病。
接驳交通.旺角东站平台建有旺角东站公共运输交汇处，方便乘客转乘专线小巴或巴士。邻近太子道西、旺角道及亚皆老街亦设有巴士及小巴站。此外，车站旁的新世纪广场连接旺角行人天桥系统，经行人天桥系统连接旺角一带。
与太子站及旺角站接驳.旺角东站与荃湾线及观塘线的太子站及旺角站并非正式的转车站。两铁合併前，曾在邻近的新世纪广场设港铁特惠站，鼓励乘客在本站出站，再前往旺角站或太子站转乘港铁，以减轻九龙塘站