保加利亚民主化后，天主教才重新获得宗教自由，并再度与梵蒂冈建立关系。
亚美尼亚使徒教会、犹太教和无神论者.保加利亚境内约有10,000名亚美尼亚人，他们大多数是亚美尼亚使徒教会的成员，该教会在首都索非亚设有一个国家主教区。犹太人自罗马时期便定居在保加利亚这块土地上，经常在保加利亚历史上扮演着重要角色。犹太人在西元379年遭罗马皇帝迪奥多西一世迫害，随后在保加利亚帝国成立后，迫害情况略为减缓，但后来又因为宗教因素遭到保加利亚教会驱逐。鄂图曼帝国在1396年征服保加利亚帝国，逐渐出