堡大主教被迫放弃雷根斯堡给巴伐利亚王国。并入巴伐利亚，意味着雷根斯堡失去了昔日的特殊政治地位，而雷根斯堡的经济在帝国时期早已荒废，城市的自治已无可能，但仍是雷根斯堡县的首府，1838年起是雷根斯堡和上普法尔茨县的首府，1953年起是上普法尔茨行政区和雷根斯堡县的首府和巴伐利亚州的直辖市，雷根斯堡也逐渐恢复它的重要地位。
二战及现代.随着1933年德国纳粹的上台，雷根斯堡的纳粹市长也随之上台，雷根斯堡随即发生了“焚书事件”，同年，纳粹市长下令在城北建造了纳粹一座示范居民区。1938年