河上游盆地的马拉卡勒增至783毫米﹐南部的卡盖卢高达2260毫米。雨量分布对各地农牧业生产有显着的影响。雨季来临的迟早和长短﹐南北明显不同。南部雨季始于3月﹐长达8～10个月﹔向北逐渐推迟到7月﹐雨季也逐渐缩短到3个月。
河流.白尼罗河上游属山地型河流﹐朱巴以下进入尼罗河上游盆地﹐形成大片沼泽地带﹐蒸发强烈﹐河水大量耗失﹔至马拉卡勒附近先后有加扎勒河和索巴特河汇入﹐水量大增﹐河床展宽﹐河水流量全年比较稳定。在喀土穆﹐白尼罗河与最大支流青尼罗河汇合﹐水量骤增。青尼罗河全年流量极不稳定﹐