仍然采用EF81型电力机车牵引。1994年12月，“白鹤号”列车由583系电力动车组改为使用24系25型客车，并使用EF81型电力机车担当上野至青森间的牵引任务，直到“白鹤号”列车于2002年12月停运为止。1999年7月，JR东日本开行上野至札幌的“仙后座号”卧铺特急列车，同样使用EF81型电力机车担当上野至青森间的牵引任务。国铁分割民营化后，JR东日本陆续更换了EF81型电力机车的车体涂装，以国铁交流电力机车标准色“赤2号”取代了原本的“赤13号”。此外，部分EF81型电力机车还采用了特别涂装，例如