时代设立兵部省，负责管辖国家的防卫和治安维持的机関。因王政复古，征夷大将军被废除，日本朝廷其他的省决定恢复原有的权威。1871年（明治4年）7月，兵部省设立了陆军参谋局。应萨摩阀以及长州阀的要求，次年2月，根据太政官公告，兵部省废除，拆分为海军省和陆军省，陆军参谋局改为陆军省参谋局。1873年4月1日，陆军省参谋局改称第六局，1874年2月22日又改回原状。1875年6月18日改为陆军省直属机构。1878年12月，陆军省独立出分管军令权的参谋本部。1886年3月，参谋本部内分设海军部和陆军部，分别掌