磷脂抗体也是抗线粒体抗体中的一种，因为心磷脂存在于线粒体内膜当中。
与非线粒体抗原的关系.急性肝功能衰竭的患者中，有57%会出现抗反转谷氨酰胺酶抗体（anti-tTG）升高的情况，这种情况与乳糜泻有关。细胞间免疫反应所引起的麸质过敏炎症，可能会导致氧化应急反应。而这种反应则会修饰线粒体抗原，并导致急性肝功能衰竭。抗糖蛋白210抗体也被发现存在于百分之四十七的原发性胆汁性肝硬化患者中。