-CoV-2的相似度约为88%，与SARS-CoV的相似度则约为81%。
发现.2015年至2017年间，研究人员在浙江舟山採集334只小菊头蝠样本，发现其中含有多种冠状病毒序列，其中有两个新病毒株（即ZC45与ZXC21）的基因组被完整定序，分别长29802与29732nt，彼此基因组序列相似度为97%。这两个病毒株的基因组序列与SARS-CoV相似度约为81%，刺突蛋白（S）胺基酸序列和SARS-CoV的相似度则为77%，皆低于Rs3367等数种较早发现的蝙蝠SARSr-CoV