被誉为「日内瓦的教宗」，积极派出传教士传教，特别是他的母国法兰西，将他优秀文笔的着作与论文充分吸收后，开始兴起浪潮般的改宗运动，大多是城市的中产阶级与印刷工人、小商人及部分农民、下层教士（至16世纪中已有近十分之一的法国人改宗），这些喀尔文宗人士被称为胡格诺派，而庇护喀尔文宗的几个中心地区，很多是贵族妇女的庄园城堡，如王姊玛格丽特·德·那瓦尔。到1547年法王亨利二世即位之后，因亨利为虔诚的天主教徒，他在巴黎高等法院中特设了一个被称为「火焰法庭」的机构来审判新教徒。1555年又因为亲信洛林的枢机怂恿成功