天保六年（567年），河东郡陷于南陈，属南荆州。至此，荆州领三郡：南郡、新兴郡、监利郡。南朝陈光大二年（568年），分南荆州南平、河东二郡，武州天门、义阳二郡复置荆州，治南平郡公安县（今湖北省公安县西北）。
十六国北朝.后赵太和元年（328年），佔领东晋荆州之南阳郡，仍置荆州，治南阳郡宛县（今河南省南阳市宛城区）。太和二年（329年），佔领前赵豫州之顺阳郡，属荆州。建平元年（330年），佔领东晋新野郡。建平三年（332年），新野郡陷于东晋。建武元年（335年），割司州上洛郡属荆