过金井及军部的压力，德王出任蒙疆联合委员会总务委员长。1939年9月1日蒙疆联合自治政府成立，金井任最高顾问。此后因与德王和日本军部发生矛盾，1941年11月27日金井辞职，由大桥忠一接任最高顾问。此后金井先返回满洲国新京。太平洋战争爆发，日军占领新加坡后，金井曾到新加坡研究英国的东亚政策。1942年4月，金井回到东京。1943年4月，金井出版《满蒙行政琐谈》一书。日本投降后，金井一度为“公职追放”对象，1947年后解除。东京审判时，金井曾经就蒙疆的鸦片种植问题出庭作证。1948年，金井在日本杂志《文艺