不全，包括出现肝脏酵素上升等。女性纯合子会因月经而延后铁质积聚的发生。每个病人都因吸收铁质的不同、突变的本质及是否有对肝脏的破坏而有不同的铁质积聚率。同样，哪一个器官会受到影响都有所不同。HFE遗传性血色病的普遍成因是C282Y的突变，即282点的胱氨酸残基变成酪氨酸残基。
病理生理学.铁质的代谢机制仍有很多不明的地方，例如很多有HFE基因突变的病人都没有铁超载表现出来，相反一些患有铁超载的病人却拥有正常的HFE基因型。这有可能是因HFE基因的突变只是影响肝脏制造铁调激素。