市长的陈水扁原允诺出席证婚，当晚却以养病为由缺席，委由北市新闻处处长罗文嘉出席代读讲稿，此举引发同志社群的反感与不谅解。1996年公开结婚后，三年间，许佑生接受无数媒体邀访，致力于建立国内民众对同性恋的正确认知与同志人权运动。2000年，许佑生隐藏多年的遗传性忧郁症爆发，诊断为「中重忧郁症」，病情虽有起伏，但在该年底，仍毅然决定赴美攻读性学博士。于2003年取得美国旧金山「高级人类性学研究院」（The Institute for Advanced Study of Human Sexuality）性学博士学