制造公司无预警倒闭，导致后续补料不易，使得EMU308编组当作器官车，一直到后续零件补料后，才逐渐获得改善，列车开始进行验收以及试运转之后，并于1989年9月2日的改点中开始营运，而EMU300型成为第3款自强号电联车。EMU300型最初营运时曾创下台北到高雄不到4小时的行车记录（1019次3小时47分，经海线仅停靠台南），后来E1000型推拉式自强号行驶北高的最快一班车也须要花上3小时49分(1021次，经山线沿途停靠板桥、台中，为前述1019次之演进)的时间，营运速度在当年没有列车自动保护系统（AT