每次都领兵抵抗，被称为精锐部队。约建安二十年，迁任都护、<nowiki>征</nowiki>虏将军，接替程普统领夏口。后来黄盖和兄长孙瑜先后逝世，他们的军队都交由孙皎统率。又赐沙羡、云杜、南新市及竟陵为奉邑，并且有权自置官吏。建安二十四年(219年)吕蒙攻取南郡，孙权以吕蒙为督，孙皎为后勤。孙皎在其后擒获关羽，平定荆州之中都有功劳，同年逝世。孙权追念他的功绩，封他的儿子孙胤为丹阳侯。