台湾第一座孔子庙建成，这也是台湾第一座官立的儒学学堂，被称作全台首学。当时庙学的国子监助教由着有《五经讲义》叶亨担任。另外，地方上也设立学校，只要年满八岁就要入学。陈永华还制定科举办法，在天兴州、万年州，每三年有二次州试，合格后再通过府试、院试，就可进入太学就读。此外为推动汉化，陈永华特别免除入学的原住民的徭役。郑氏政权灭亡后，于康熙25年（1686）上任的第一任台厦道周昌言：「本道自履任后，窃见伪进生员犹勤藜火，后秀子弟亦乐絃诵。」可见郑氏政权于台湾实施儒学教化卓有成效。到了清领时期，台湾各府设府儒学