011年开始增设C班，中五设有五班和中六和中七分别设有三班，分别为B、S、SS班（代表其选修科目组别：Biology、Science、Social Science，即生物、科学和社会科学）。各级修读科目如下： 
旧学制.另外天主教徒每週有一节圣经课，而中五生及中七生亦可自行选择增修或退修选修科目。直至1990年代初期，中一至中五仅设四班，分别为A1、A2、B1、B2。
文化.九龙华仁书院学习气氛自由，着重自学精神，即「华仁精神」（，同时亦包含自主、