门三郎自幼即进步神速，被德川家康召入滨松城，受到赏赐后剃发成僧，赐姓林，改名为林门入。之后拜入本因坊算砂门下，棋力累进到上手，为坊门里除大一岁的中村道硕以外第一高徒。但是根据林元美所着「烂柯堂棋话」里面，是将林门入列为林利玄的门徒，是以后来尊林利玄为林家的元祖。同时「当代记」里面，1611年算砂与利玄的对局，也有被认作是道硕对门入。安井算知当上名人碁所隔年，过继了一位门徒给门入以顶替两年前门入刚死的一位门徒，门入死后承袭其俸禄，于是林家便诞生了，而门入也被尊为第一世。后来的本因坊元丈所着的「古碁枢机