U900型固定每列车10辆编组。不过台铁为了纾解连续假期的旅客需求，会使用通勤电联车行驶区间快车，中途小站不停，以达到主要车站间大量快速运输的效益。有时对号列车发生事故或故障也会以通勤电联车代为跑完全程。通勤电联车的票价为复兴／区间（快）等级，每公里为新台币1.46元。坐椅配置为长条椅（未优化EMU500型、EMU600型、EMU800增购编组）或非字形椅（EMU800型前74组及优化EMU500型），也有两种座椅混搭的车型（EMU700型、EMU900型）。现役车型各车厢两侧皆设有3个车门(唯一2个车门的