延德二年正月初七日（1490年1月27日）足利义政病逝于银阁寺内，享年五十四岁，死后追赠正一位太政大臣。结束了长达四十年的统治。安葬于京都相国寺，以足利义材嗣位为将军。
评价.虽然足利义政在政治上是个失败的统治者，但他却对日本室町时代的文化发展做出了一定贡献。义政好艺术风流，常庇护艺术者与文化人。曾召庭师善阿弥、狩野派画师狩野正信、能乐者音阿弥等入东山殿（今慈照寺），兴起东山文化。足利义教被暗杀后，日本与明朝的勘合贸易一度中断。足利义政嗣位后，于1451年（宝德3年）恢复了明日