配合现时港铁的格式，但亦有部分非转线站至2010年5月仍使用旧格式。另外，所有西铁线站的幕门指示亦已经被转换成港铁的格式。2007年11月，部分地铁站的垃圾桶上已经换上「请保持港铁清洁」的字样，且在上方「严禁吐痰 免生细菌」的告示已换上「违反港铁附例罚款港币5,000元」字样，上面贴有小小的港铁贴纸，遮掩着地铁的标志；出入口旁标有出入口英文字母的胶牌亦已更换成港铁的模样，全部路线都严禁饮食。为加快两铁标志换置，很多需要改动的九广铁路焗漆指示版在合併前先给换成港铁样式（例如两铁交汇的转车站），再在新告示版