投身各种救国运动。1907年4月，他与安昌浩、梁起铎、李东宁等人成立。1909年10月安重根在哈尔滨火车站击毙伊藤博文后，金九被日本人当做“安重根同党”逮捕入狱，一个多月后因缺乏证据而被释放。1910年12月27日，朝鲜独立志士在西北部试图暗杀朝鲜总督寺内正毅但未遂。日本人开始大规模逮捕朝鲜独立志士。1911年1月，金九、梁起铎、李东辉等600多名新民会成员被捕，新民会被解散。日本警察以违反保安法和与安明根谋杀寺内正毅未遂罪判处他17年徒刑。1912年日本明治天皇和皇后相继去世，日本人对囚犯相继实行两次大赦