刘崇佑等人组织了与之对抗的「宪法案研究会」。随后该会和以王家襄、陈国祥为首的宪法研究同志会于1916年9月12日合并为宪法研究会。特别是，在各省是否可以制定省宪法的问题上，宪法研究会和宪政商榷会对立，汤化龙明确反对制定省宪法。民国六年（1917年），在西原借款和对德国宣战问题上，汤化龙支持段祺瑞。同年5月，段被黎元洪罢免，汤遂辞任议长。同年7月张勋复辟失败，段祺瑞重新上台，汤化龙任内务总长。同年11月，直系抬头，段祺瑞再度辞任国务总理。在短期任职于汪大燮临时内阁后，汤化龙也辞任。可是之后，段信任心腹徐树