。虽然真核细胞的80S核糖体也对这部分抗生素敏感，但由于这部分抗生素无法透过真核细胞膜，所以它们不能抑制活体真核细胞的蛋白质合生。
酰胺醇类抗生素.酰胺醇类抗生素能选择性他与原核细胞内70S核糖体的50S核糖体亚基或真核细胞线粒体核糖体39S核糖体亚基结合，抑制其中肽酰转移酶的活性，从而阻断肽键的形成。但这类抗生素不会抑制真核细胞线粒体外的蛋白质合成。这类抗生素包括氯霉素、叠氮氯霉素、甲砜霉素及氟甲砜霉素等。
大环内酯类抗生素.大环内酯类抗生素也能与50S