什噶尔办事大臣管辖，称阿斯图阿尔图什，在阿图什庄设阿奇木伯克，管理地方事务。清光绪十年（1884年），阿图什辖于新疆省。
地理.“阿图什”为维吾尔语，意为“两山之间”。地处天山南脉南麓，塔里木盆地的西北边缘，东邻柯坪县，南接巴楚县、伽师县、疏附县，西邻乌恰县，北与吉尔吉斯斯坦为界。市境东西长约241km，南北宽约136km，边境线长128km，总面积约为14800km。市境内海拔高度1200—4562m，地势北高南低，由西南向东降缓，地形复杂。北部玛依丹山与喀拉铁热克山相连，