方应恆，中国湖南巴陵人，中国清朝官员。方应恆于1797年接替遇昌，于台湾担任台湾府海防兼南路理番同知。品等为正五品的该官职隶属于台湾府，主管全台湾船政治安业务及台湾南路之台湾原住民事务，相当于副知府。嘉庆六年(1801年)，接替景文任漳州府知府一职，嘉庆九年(1804年)由景敏接任。