为教务状态渐上轨道的教区制。1960年3月28日，教宗若望二十三世任命时任东京总主教土井辰雄为枢机，成为日本第一位担任枢机者。
现况.截至2018年底的统计，日本的天主教会共设有3个教省、16个教区（包括3个总教区）以及777个堂区，并设有一个主教团做为教会最高领导机构。日本信仰天主教的人口为434,111人，佔日本全国人口的0.34%，其中包括神职人员（包括主教、神父与执事）2,695人，修道者4,997人（含修士161人、修女4,836人）。开教历史悠久的长崎县（长崎总教区）则