。第二阶段的数据集的分析在刊登在2007年10月。第三阶段数据集在2009年春季发布。
背景.与罕见的孟德尔疾病不同，不同基因和环境的组合在常见疾病（如糖尿病，癌症，心脏病，中风，抑郁症和哮喘）的发展和进展中起作用，或在个体对药理学药剂的反应中起作用。为了找到这些疾病中涉及的遗传因素，人们原则上可以进行全基因组关联分析：获得几个个体的完整基因序列，一些人患有疾病，和一些人没有疾病，然后寻找两组基因组之间的差异。 当时，由于的成本，这种方法是不可行的。 HapMap项目提出了一个快捷