湾交通局超出车票净收益的所有额外开支都由马萨诸塞州联邦政府报销。自那天之后，马萨诸塞湾交通局资金来源为所服务城镇评估的金额，外加5%州营业税的20%，靠这种“远期资金”预算维持。联邦政府将一项重要任务交给了马萨诸塞湾交通局：拓展公共交通以减少波士顿大开掘(Big Dig)工程实施中日益增加的汽车尾气污染。然而大开掘工程资金中并不给马萨诸塞湾交通局拨款，马萨诸塞湾交通局所能运用的资源极其有限。即便大波士顿地区是美国增长最慢的几个大都会之一，马萨诸塞湾交通局还是成为了1988年后美国扩张最快的公共交通系统。