能和这些系统在一个单独的NTFS或FAT文件系统里和平共处，但是FreeDOS内核还是可以被添加到Windows NT Boot Loader配置文件，boot.ini，或React OS中的freeldr.ini来引导它启动。FreeDOS也可以在虚拟化软件Virtual PC和VirtualBox或Bochs和QEMU一类模拟器软件中运行。
FreeDOS-32.FreeDOS-32是一个有不同目标且单独的项目。FreeDOS要再造一个MS-DOS，因此不仅仅有它的特点也有它