法庭的独立权力问题上发生严重争论。亨利二世在1164年《克拉林敦宪章》里，禁止教会向罗马上诉，冲突的结果，贝克特被放逐到法国。1170年圣诞，贝克特回到坎特伯里，在他自己的祭坛前被杀害。基督徒震怒，立刻奉贝克特为殉道者。亚历山大三世在1173年封贝克特为圣徒，并订立法规，规定以后一切敕封圣徒是教宗特定的权力。1179年，亚历山大召开第三次拉特朗公会议，为改革通过法案。亚历山大三世死在罗马近郊奇维塔卡斯泰拉纳，他的尸体安葬在拉特郎堂内。
亚历山大的政治.亚历山大三世是第一位直接关注波