子接着变长成为具活动力的卵动子，卵动子再穿出肠壁，在肠壁下形成卵囊。疟原虫在卵囊中行无性生殖，形成具单套染色体的子孢子，卵囊在成熟后破裂，子孢子进入蚊子的血体腔，穿透各种组织后进入蚊子的唾腺，准备感染新的嵴椎动物宿主。除了蚊虫感染外，疟原虫也可能经由输血感染，但此情况相当罕见。1995年，台北荣民总医院发生了一起严重的院内感染案例，因输血方式不当造成4名病患感染恶性疟死亡。
疟疾复发.疟疾的患者可能会在一段无症状期后复发，此种复发现象可依成因不同而分为（recrudescenc