线脱离国民党成立新党后，1994年庞建国接受新党征召，参选台北市议员，以中正、万华选区第一高票当选。1998年庞建国参与新党立法委员初选失利，改以无党籍身份参选市议员，再度当选，并为该届台北市议会唯一无党籍之市议员。2000年总统大选时，庞建国担任宋楚瑜和张昭雄台北市竞选总部主任委员，选后参与亲民党之创立，并于2001年以亲民党籍当选台北市南区之立法委员。庞建国于担任立法委员期间，曾结合关心科技发展与数位化趋势之立法委员成立「数位汇流立法推动联盟」，担任联盟召集人，主导「电信法」、「广播电视法」、「通讯