梁朝宗室被残杀，不能埋葬，司马暠作为宫臣上奏北周要求回到江陵改葬，文辞悲切。北周朝廷嘉奖他，回覆说：「过去主父被杀，孔车有长者之风；彭越遇害，栾布有家臣礼仪。你的故国已经改朝换代，但你还有送往的情节，才知道你的忠贞和为臣之道，现在敕令荆州以礼改葬。」南陈太建八年（576年）他回来，陈宣帝特别礼遇，赏赐有加，授命为宜都王陈叔明的谘议参军事，徙官安德宫长秋卿、通直散骑常侍、太中大夫、司州大中正，在任内去世。有文集十卷。