欧本海默受任为其中的总顾问委员会主席。他在项目经费、实验室的兴建、国际政策等方面都提出过建议，但他的建议并未全被採纳。他以总顾问委员会主席的身份大力游说国际社会对军备实施管制，拨款鼓励基础科学，还利用他的影响力试图避免军备竞赛。当政府在探讨是否要研发以核聚变为原理的核武器（即氢弹）时，欧本海默首先表示反对，尽管他在曼哈顿计划时是持支持态度的。反对原因之一是道德上的考量：这样的强力武器从战略上必定会用于攻击平民目标，殃及上百万人。另一原因，是当时还没有一个可行的氢弹设计。欧本海默觉得把资源投入到裂变武器的强化