邱晋昕，广东省潮州府大埔县，清朝政治人物。进士出身。光绪六年，登进士；同年五月，着交吏部掣签，分发各省以知县即用。光绪十九年(1893年)，接替董毓琦任邵武府知府一职，同年由王琛接任。