便自立门户，广收信徒，着名的弟子有阿皮利（Apelles）。初期，马吉安加入罗马教会，对教会慈善事工极为热衷，把大量的产业捐献给教会，并且以传纯正的福音为己任。不久，他为罪与苦难困扰之下，发展出一种尖锐极端的二元论，也就是「世界之神与耶稣所启示的慈爱上帝是相对立的」。他的思想明显地受到古希腊善恶二元论、部份克尔多（Cardo）的诺斯底派理论，以及柏拉图对话录创造论的影响，最终提出「善恶二元论的神论与基督论」，并且于罗马大肆宣传，引发罗马教会许多的跟从者。之后，马吉安另行组织由主教、长老、信徒与慕道友构成