明治新政府与西方列强进行交涉，江户时代的不平等条约开始“条约改正”，日荷通商航海条约于1912年（明治45年）签订，正是修订不平等条例。
第二次世界大战.第二次世界大战期间（1942年3月至1945年9月），日本侵略并占领了荷属东印度。
战后日荷关系.日本在印度尼西亚的统治尽管短暂，却极大地削弱了荷兰在当地的势力和影响范围。第二次世界大战结束后，当荷兰再次回到印度尼西亚之时，绝大多数的荷兰政府机构都已经被日本根除。1949年，在美国的强力敦促下，荷兰给予印