皇帝肯定诸罗县军民在这场乱事中同心戮力、抗敌有功的表现，干隆52年（1787年）「诸罗县」更名为「嘉义县」，乃取「嘉勉其义」之意，但台湾行政设置仍保持「一府四县二厅」，并未变动。直到嘉庆初年，漳籍的吴沙率领漳州、泉州、粤籍人士向今宜兰地区开垦，侵占噶玛兰族土地，造成当地原汉纠纷甚多，实有新设行政官厅的必要，朝廷遂在嘉庆16年（1811年）增设「噶玛兰厅」，正式将宜兰地区纳入清朝行政版图；尔后又延续牡丹社事件爆发之后的同治13年（1874年），长达六十多年时间行政机关未再有变动。道光年间，曾任台湾道、