将军对于地方守护的命令，皆须透过管领来传达，管领并掌有许多中央机构〔见下文〕，因此可说是幕府中央最高行政官。依照惯例，管领这个职位由足利氏下的有力守护细川氏、斯波氏、畠山氏三个家族来担任，直到幕府后期力量衰微，方有私相授受的情形发生。管领之下设置侍所〔统领御家人、负责警备任务〕、政所〔掌管财政〕、问注所〔保管纪录文书〕、引付众〔管民事诉讼〕等等机构，处理不同政务。侍所的长官〔所司〕则由赤松氏、一色氏、山名氏、京极氏四个家族的人出任，其实权仅次于管领。前述的三个管领家和四个所司家合称为「三管四