、「元史专题研究」、「汉学述评」等课程，并致力于发展辽金元史为清华历史所之特色。1999年，获得中央研究院颁发「八十八年度国家研究菁英演讲会主讲人」的殊荣，由总统李登辉先生于6月4日亲自颁发奖座。由于数十年来在蒙元史研究的贡献，他在2000年获选为中央研究院院士。2001年，获清华大学聘为梅贻琦讲座。2002年，萧启庆自清华退休，并持续执教、着述不辍。自获聘梅贻琦讲座以来，讲座酬金分文未取，全数捐出转作「萧启庆教授梅贻琦讲座奖助学金」，奖励课业及研究表现优异之清华历史一般史组同学，鼓励继续从事中国一般史，尤