褐狐猴在IUCN红色名录内被列入「近危」级别，保护现状比较低，但可能在不久的将来有濒危或灭绝等危险。IUCN需常对此范围内的物种级别进行重新评估，以确保其危险状况。而在濒危野生动植物种国际贸易公约中亦被列入《附录I》中，禁止在国际间的交易。于台北市立动物园中，为繁殖状况最好的狐猴。