列主义研究院成立后，起初租用北京市海淀区西颐宾馆北馆作为办公场所，后迁至中央党校。研究院成立后，遵照陈伯达的意思，工作人员全都下基层，起初在北京市通县农村开展“四清”，后又在北京、天津的工厂开展“四清”。1966年6月，陈伯达命工作人员全体回院参加“文化大革命”。在这期间，陈伯达先后主笔起草了指导四清运动的文件《二十三条》及标志“文化大革命”开始的《五一六通知》。1966年5月，中共中央政治局扩大会议在北京举行，批判彭真、罗瑞卿、陆定一、杨尚昆的“反党错误”，也涉及田家英。会议期间，陈伯达三次到马列主义