F。747-400货机型号的上层甲板重新缩短回波音747-100/200/SP的长度，但与747-200F一样设置开合式机鼻舱门。而-400D因为属于短程型，并没有加装翼尖小翼，但亦可按航空公司要求而补回。首架747-400客机在1989年1月加入西北航空机队（N663US为最先交付西北航空的747-400），负责明尼阿波利斯－凤凰城；首架客货混合型于1989年6月30日首飞，同年9月1日加入KLM机队；747-400D型于1991年首飞并交付日本航空；首架747-400F在1993年加入卢森堡货运机队