.HCCC通过组织检查（例如活体组织切片）来诊断。
病理.HCCC由具有丰富透明细胞质的细胞组成，呈索状、小梁状或簇状排列于透明基质中。核多形性通常很小，少见有丝分裂。由于肿瘤细胞的糖原含量，其在显微镜下外观清晰，可被PAS染色。S100和平滑肌肌动蛋白（SMA）的免疫染色通常为阴性，而细胞角蛋白和上皮膜抗原（EMA）则为阳性。HCCC通常具有复发性染色体易位t(12;22)，涉及基因EWSR1和ATF1。在透明细胞肉瘤中可见相同的易位。组织学鉴别诊断包括粘液表皮样癌