3月1日担任了空军作战部参谋长，还在同年11月晋升为上校。1939年2月1日，耶匈尼克取代了汉斯-尤根·史托普将军，成为空军参谋长直到他死去。1939年8月14日，他晋升为少将。在二战初期的波兰战役第一天，耶匈尼克唿叫德国驻莫斯科大使，要求苏联保持明斯克无线电台的运作，因此德军飞行员可以以其帮助航行、攻击波军目标。耶匈尼克后来于1939年10月27日、波兰被打败后受获骑士铁十字勋章。由于德国空军在波兰和法国战役的成功，耶匈尼克于1940年8月19日被晋升为航空兵上将。虽然德国空军已于波兰和法国获得巨