。至2000年起，圣路易斯市亦开设了数家特许学校（charter schools）。这些学校由州政府许可成立，多由当地或企业赞助，提供从幼稚园到高中的系统性教育。天主教圣路易斯总教区开设数家教区学校，部分能提供高中阶段的教育。其他私立高中有天主教学校，信义宗学校和几所非宗教私立高中。圣路易斯市内亦有两所大型研究性大学：圣路易斯华盛顿大学和圣路易斯大学。两所学校均为多学科综合性私立大学。圣路易斯华盛顿大学医学院久负盛名，为美国新闻与世界报道评出前十名的医学院。圣路易斯大学为天主教背景的私立大学，是圣路易斯