车站设计.宝琳站为半开放设计，月台、大堂同位于地面，设有空调。此站是少数可直接由月台层走出车站的地面车站之一，在将军澳线车站中，此乃独一无二。铁路路轨由地面在隔音墙内慢慢下降至地底，在宝琳站南端一路沿着景林邨旁建有一个绿化公园，一方面覆盖路轨，另一方面可以为区内提供绿化空间。
大堂.大堂非收费区内，及A、B出入口上层连接新都城商场通道旁，均设有各类型的商店，如便利店、时装店、面包糕饼店、诊所等，以及不少自助服务设施供乘客使用，包括自动柜员机、自动售卖