对于系统的伤害就意味着已存在于身体原本受到压制的病毒将会活化。在太空中，T细胞（一种淋巴细胞）更不容易正确的重新产生，并且重新产生的T细胞也较难抵抗感染。长期的免疫不全将会造成组员之间的快速感染，特别是在太空载具的封闭空间内。辐射也对于太空人增加的白内障罹患率有所关连。前苏联太空人于1982年在轨道上待了221天，因而导致白内障造成的视力损失。他表示：「我承受了太空中大量的辐射。这些都在前苏联时代被隐瞒下来，但是我现在可以说我因为那趟旅程而遭受健康损失。」在2013年5月31日，美国太空总署的科学家