水溪与浊水溪的氾滥中断往西的交通，所以最后县治便从林圯埔云林坪迁到斗六门。今该城城垣已无痕迹，但斗六市太平路的街道规划仍可看出当时古城大街的格局，而斗六市也以古城门做为市徽。
沿革.在清廷准奏将县治移到斗六门后，云林县第五任知县李烇于光绪十九年（1893年）八月便将办公处移到斗六门并积极筹备筑城事宜，而该年十月第六任知县程森在上任后便捐建了县署和成立「云林城工局」，但因经费不足，最初只种刺竹为城，后来勉强建了土城墙，其周长1160丈，高5尺宽8尺，建有四方城门，外面有刺竹与深7尺宽