在打狗(今高雄一带)设有分行，并在盐水跟林杞埔（今南投竹山）设有货栈以收购商品。日治时期，因为樟脑专卖制度的实施，东兴洋行业绩受到打击，而在1898年离开安平。此后1901年设置台南厅安平支厅时，东兴洋行建筑被用为安平支厅的厅舍，1920年后改为台南警察署安平派出所。二次大战后曾作为宿舍使用，而后闲置荒废，1980年代才由台南市政府收回整修。