用作肥料。气态副产物如甲烷，可以被用作发电机的沼气燃料。细菌消化的一个优点是它减少了和污水的气味和批量，从而减少了所需的倾倒空间。细菌消化在污水处理的主要缺点是，它是一个非常缓慢的过程。
发展简史.20世纪20年代的酒精、甘油和丙酮等发酵工业，属于厌氧发酵。20世纪40年代初，随着青霉素的发现，抗生素发酵工业逐渐兴起。由于青霉素产生菌是需氧型的，微生物学家就在厌氧发酵技术的基础上，成功地引进了通气搅拌和一整套无菌技术，建立了深层通气发酵技术。这使有机酸、维生素、激素等都可以用发酵