加拉人民共和国以后，1971年12月20日叶海亚·汗又把政权移交给布托。布托出任总统后，他把关键性的工业收归国有，并且向土地占有者征税。1973年改任总理兼外交、国防和内政部长。1976年5月27日，阿里·布托出访中华人民共和国，是中共中央主席毛泽东最后一次接见的外宾。1977年，他被军人穆罕默德·齐亚·哈克推翻并囚禁。布托以1974年下令杀害政敌的罪名受审，1979年4月4日因涉嫌谋杀Ahmad Raza Khan Kasuri被穆罕默德·齐亚·哈克处以绞刑。他的女儿贝娜齐尔·布托于1988