逮捕入狱，后于1950年被遣返义大利。返回义大利后，他仍矢志服务更多被病痛折磨的患者，于是在罗马马尔大医学专科学校潜心研习，并在毕业后成为正式的医师。1953年，何义士前往甫由多位灵医会会士成立于台湾宜兰县的罗东圣母医院服务；当时，他经常骑自行车前往三星、大同等地提供原住民免费医疗服务，也曾在冬山乡丸山村圣母分院（疗养院）协助患者面对因罹患肺结核所带来的问题。同年，何义士首次来到澎湖；5月，他协助马仁光修士（）在马公市成立「玛利诊所」。1957年，他又前往澎湖，并协助罗德信神父将「玛利诊所」扩建成「天主