到了12月底，镇压部队由第9团改为第2团接替，但是第2团团长咸炳善继续执行强势镇压作战，在没有经过审判程序的情况下许多居民即遭屠杀，并造成受害人数最多的「北村事件」。1949年3月，设置了济州岛地区战斗司令部，展开了镇压与安抚并行的作战。新任司令官刘载兴发表赦免政策，躲避到汉拏山的人投诚的话，全都可以得到宽恕。这时，有许多居民下山了。1949年5月10日的重新选举，也就成功地举行了。六月，武装队领袖李德九遭射杀之后，武装队已经形同溃灭，武装队的残余份子尽管还有攻势，但力量已经衰微。但「辅导联盟」加入者、