地问题，东莞段进度较慢，仍有三站未能动工。
南延伸段.2012年4月10日下午，在龙华新区（现龙华区）召开的轨道交通建设座谈会上，深圳市规划和国土资源委员会发布的《深圳市轨道交通规划（修编）》显示，6号线将会南延至市中心区，共设民乐、银湖、八卦岭、体育馆、通新岭、科学馆6个站，全长12千米。国家发改委批复的深圳地铁三期工程并不包含地铁6号线南延段。但为了增加南北方向轨道线路，缓解4号线压力，深圳市已将6号线南延段拟纳入地铁三期工程，提前建设。6号线南延将加强光明次中心与中心城区