站的过关模式不同。由于珠澳两座边检大楼之间，经由莲花大桥连接，且莲花大桥禁止行人通行。因此所有出入境人士，必须在禁区，乘搭专线巴士，前往对岸之边检大楼。2020年8月18日14:30前，往返两地的莲花口岸专线巴士，由岐关及澳巴联营。车费为港币、澳门币或人民币6元。接受澳门通付款，但不提供车资优惠。岐关车辆不支援澳门钱包乘车码乘车。2020年8月18日14:30，末班莲花口岸专线巴士抵达珠海横琴口岸的入境区域。莲花大桥往返两地旧口岸之路段随即封闭。并停用原位于路凼边检大楼禁区内的站点，由新设「莲花大桥」站