通辩论的逻辑观念》为题（"The Logical Concept of Ordinary Discourse"）用英文发表毕业论文。适逢蒋中正在台执政，不顾舆论反对，连任第三任总统，许亲身目睹当时威权统治，包括雷震事件以及台湾大学哲学系教授殷海光被《中国季刊》围勦。后来役毕后回台大任哲学系殷海光教授之助教，替殷教授上大一理则学的课。同时以独立思考的能力参与中西文化论战，在《文星杂志》上发表文章，帮助李敖笔战胡秋原、徐复观等人抗诘政府对言论自由的钳制。1963年许登源留学美国同时得到哈佛大学、史丹福大学