90年代，澳门奥委会亦随着社团体育活动的法例不断完善和发展，并在1991年至1999年期间兴建了20个具规模的体育设施。至2000年，澳门因应政权移交而改以「中国澳门」之名义参与国际体育运动。此后，澳门奥委会先后协办在澳门举行的大型运动会——2005年东亚运动会、2006年葡语系运动会及2007年亚洲室内运动会；2005年，澳门奥委会第一副主席萧威利获推选为亚奥理事会（亚洲室内运动会）副会长。2008年4月10日，根据《澳门日报》报道，澳门奥林匹克委员会希望申请加入国际奥林匹克委员会，惟国际奥委会曾