JR线及其他私铁路线直通运行，使得整体服务范围扩及整个首都圈，以东京都为中心涵盖至神奈川县、埼玉县、千叶县与茨城县。东京的每一条地下铁路线，皆与环状运行的山手线铁路上之车站交会，其中包括几个JR、私铁与地下铁路线共同汇集的大型转运车站（像是池袋站、新宿站与涩谷站），增加了转乘上的可选择性。不过有时转乘所需步行的距离略长，而且部分车站构造如迷宫般复杂。值得一提的是，东京地下铁的英文名称是Tokyo Metro，都営地鉄的是Toei Subway，由以上两者构成的东京的地铁系统英文名则是Tokyo Su