湾独立理论与运动的先行者廖文奎及廖文毅之姪子廖史豪的介绍下加入战后台湾岛外的第一个台湾独立运动组织台湾再解放联盟。1948年，因参与台独运动，遭中国政府监视并下达逮捕令，邱永汉因此白色恐怖而于12月逃亡至英属香港，1954年再移居日本，并加入「台湾青年独立联盟」。
文学创作.邱永汉在台北高校时即创办诗志《月来香》，参与台湾文艺家协会，在西川满主持的文艺杂志《华丽岛》、《文艺台湾》发表作品。其日文诗作〈凤凰木〉、〈癈港〉，战后由台湾诗人陈千武翻译成中文，之后被收录在陈明台主编的《