双方调解不成功后展开仲裁。路政署最终要支付2.73亿元予承建商解决纷争，但亦成功向顾问公司追讨1.33亿元，即政府实际帐面损失约1.4亿元。路政署署长钟锦华在会上否认部门「先斩后奏」。立法会议员林卓廷认为事件中有人失职，批评政府监管不足。运输及房屋局局长陈帆表示，同意审计报告内容，已责成相关部门作出检讨。