，李滉67岁时重返朝政。明宗因病猝死后，宣祖任命他为礼曹判书。但李滉却辞职回乡。 在宣祖多次邀请下，李滉68岁时再次重返朝政。在此期间李滉编纂了《圣学十图》。70岁时李滉最终退休。1570年逝世。
纪念.上印有李滉的头像。 韩国首尔市中心的，庆尚北道安东市的，以及跆拳道的退溪套路都是以李滉的字号命名的。许多研究机构和大学的系别也都以“退溪”命名，比如首尔的退溪学研究院，庆北大学的退溪研究院，檀国大学的退溪研究院和图书馆。