全部溃散，南明海军趁机追杀，焚毁了大量清军舰只。清先锋泉州总兵韩尚亮被击毙，清军遭到惨败，狼狈逃回大陆，南明军取得了泉州战役的胜利。
影响.泉州战役之后，清军畏惧郑成功麾下军队的海上战力，相当长时间内不敢再进攻海岛。清廷改而采用海禁，封锁沿海地区，妄想困死郑成功部队，不过这反而使郑成功利用武装海商、走私等策略垄断了海上贸易。