一定程度的看起来是自动修复的修复，这是因为里面住有能够分解这些化合物的微生物部落的缘故要在环境中消灭各种类型的污染物和废弃物就需要继续深入理解碳通量不同线路和监管网络的相对重要性，尤其是某些特定环境和某些化合物的，因为它们肯定能促进生物修复技术和生物转化作用过程的发展速度。
真菌修复.真菌修复是生物修复的形式之一，其中真菌被用于净化污染区域。术语"真菌修复"具体是指在生物修复中使用真菌的菌丝体。在生态系统中真菌的主要角色之一是分解作用，这是由菌丝体执行。菌丝体分泌和酸分解木