长5年（1600年），参与岐阜城之战，在关原之战中，与大谷吉继队战斗等，立下战功。战后，被赐予丹后国12万3千石，以的身份，自称京极丹后守。在进入后，把据点移至。在元和8年8月12日（1622年9月17日）死去。享年50岁。墓所在京都府舞鹤市的和京都府京都市北区的大德寺芳春院。
子孙.此后，领地被分封予嫡男高广、三男高三、以及外甥兼婿养子高通，变成、、峰山藩。嫡流成为宫津7万8千2百石的领主，不过在第3代被改易，子孙以高家身份存续至幕末。田边藩京极家在第3代转封至但马国丰冈。峰山藩