对，他极为推崇Hetch Hetchy，甚至都超过了约塞米蒂山谷。塞拉俱乐部的缪尔和Robert Underwood Johnson一起反对山谷被淹，缪尔甚至写信给罗斯福总统，请他阻止该工程。经过多年争论，大众对该工程的观点两极分化，罗斯福的继任者伍德罗·威尔逊总统于1913年12月19日签署了大坝修建法案。这场论战的结果是山谷被毁，缪尔对此感到极为失落。1914年12月24日，约翰·缪尔因肺炎，在洛杉矶的一家医院去世， 之前他去看望了他女儿Helen。加利福尼亚的攀岩爱好者认为，缪尔去世是因为他的心碎