太出名了，最后只能转会到日乙弱旅熊本深红。在熊本深红的第一个赛季，南雄太一度帮助熊本深红跻身升级附加赛区域，但奈何熊本深红自身上限摆在那，南雄太独木难支。南雄太在熊本深红效力了3个赛季，在发觉熊本深红就是个扶不起来的阿斗之后，南雄太在2013年转会横滨FC。此时南雄太已经34岁了，以他的资历和薪水（2013年2000万日元，队内第三高），他似乎不用竞争就能上岗，但他还是一度面临高丘阳平等年轻球员的竞争。不过最终凭借着经验和个人能力，南雄太成为了横滨FC的主力门将。2019年赛季的日乙联赛，身为队长的南雄