2005年出任中国医药大学校长逾八年，任校长期间致力于全方位调整该大学成为一所「强调大学部教育品质之研究型大学」，全校师生除追求学术卓越外，更强调与人才培育息息相关之教学与教育，因此得以获得多项国际大学评比之肯定（上海交大世界大学排名及英国泰晤士高等教育世界大学排名等）与连续荣获教育部『奖励大学教学卓越计画』全国第一，让校务发展迈向一个新的境界，并将办学目标再度调整为「迈向国际一流大学」。除此之外，则以四年时间（2010～2013），不间断推动「重返史怀哲之路」的学习与实践之旅，为亚洲首见远赴西非史怀哲医