旗和甘肃省长期存在领土划界纠纷，曾发生过2015年额济纳旗检查站砸毁事件。达（达来库布镇）银（银川）线。
交通.
公路.还可以从蒙古国通过西伯库伦口岸进入。
铁路.临策铁路、清绿铁路、嘉策铁路贯穿全境。有客运列车在唿和浩特与达来唿布间往返。
航空.额济纳旗桃来机场于2013年12月17日通航。目前有幸福航空和东方航空来往阿拉善左旗和西安的定期航班。