种类。大多数细菌营兼性或者专性厌氧及异养或者自养化能生物生活，但有很多例外。很多并非紧密相关的属可以利用光合作用储存能量。因其多数具有紫红色的色素，被称爲紫细菌。
分类.变形菌门根据rRNA序列被分爲五类（通常作爲五个纲），用希腊字母α、β、γ、δ和ε命名。其中有的类别可能是併系的。α-变形菌除包括光合的种类外，还有代谢C1化合物的种类、和植物共生的细菌（如根瘤菌属）、与动物共生的细菌和一类危险的致病菌立克次体目。此外真核生物的线粒体的前身也很可能属于这一类（参见内共生学说）。