1948年4月，中国人民解放军全面进入反攻阶段。10月1日，延边在吉林省教育工作会议精神指导下在延吉成立四年制的“延边医科专门学校”。卢基舜任校长。1949年3月，中国医科大学从原“龙井医科大学”撤离后，“延边医科专门学校”被正式并入同月刚刚成立的延边大学（当时名为“延吉大学”），校舍从延吉迁到原“龙井医科大学”。1950年12月末，延边大学医学部从龙井迁至延边大学校部。