骏在1990年代制作了两部在票房和影评上极为成功的作品，分别是1992年的《红猪》和1997年的《魔法公主》。这两部动画电影在上映时都打破了日本最高票房纪录。在1990年代，许多新锐的动画导演也开始受到注目，让动画从单纯的娱乐进入到当代艺术的层次。押井守在1996年推出了获得国际赞誉的哲学科幻作品《攻殻机动队》。今敏执导了获得多项奖座的心理惊悚动画《蓝色恐惧》（）。庵野秀明也在1997年制作了《新世纪福音战士剧场版：THE END OF EVANGELION》。
2000年代.