现已更名为窒素化学公司）设置水俣工厂以来，水俣市便依靠其开始快速发展，甚至可以说是一个企业城下町。但该工厂长期将含有的甲基汞的废水排入海中，造成海中生物受到污染，居民又因为捕食海中鱼类而造成水银中毒，全市人口中约有四分之一受害。过去曾有九州旅客铁道山野线，但已于1988年停驶