一年，迁散骑常侍、中书监，尚未上任，武帝就因皇弟雍州刺史萧嶷去世而认为需要有威望的人代为镇守边地，于二月癸卯（493年3月25日）改任萧子懋为持节、都督雍、梁、南秦、北秦四州、郢州之竟陵、司州之随郡军事、征北将军、雍州刺史，给鼓吹一部，解除第八子随郡王萧子隆的雍州都督之职。武帝下敕教萧子懋守边之略，并将萧子懋先前请求的杜预亲手所定《左传》及《古今善言》赐给他。萧子懋曾将茶米分给属官。永明十一年（493年），皇孙萧昭业登基，萧子懋即本号为征北大将军。萧子懋见新帝年幼，时事艰难，图谋自全，打造兵器，并想