辖市之后，台北县政府交通局始为机关，但因公路法明定公路主管机关在县（市）为县（市）政府，因此台北县政府依照该府组织自治条例，将公车业务委任所属下级机关台北县政府交通局办理，成为台北县辖市区公车的主管机关。2010年12年25日，台北县改制为新北市，新北市政府交通局为新的主管机关。而交通部公路总局也将路线比例于新北市辖域内占较多数的公路汽车客运路线移交新北市政府交通局主管，编号也随之由公路客运的4码变更为市区公车的3码。而少部分路线因跨越3个直辖市，如1209、9102，仍维持公路客运身分。此外，在2000年