三国至南朝初，今秀山地属酉阳县，隋唐属务川县，宋起为羁縻思州辖地，明朝时为四川布政使司辖区内，设有平茶洞长官司、邑梅洞长官司、石耶洞长官司、地坝洞副长官司。清干隆元年（1736年），为进行改土归流，割酉阳县东南境石堤、宋农、晚森等土司据地置秀山县，初隶四川省黔彭直隶厅，后改隶川东道酉阳直隶州。曾为湘鄂川黔革命根据地的一部分。民国24年（1935年）隶四川省第八行政督察区。民国28年（1939年）曾确立为待成立的“青江省”省会，后计划撤销。民国35年（1946年），秀山县之九江乡划归贵州省松桃县管辖（19