总统府经手管理，不过所有权仍归台湾银行。而台湾银行于接手后，本有意立即加以拆除改建，但遭到部分学者团体与台北市文化局的反对。为避免台湾银行仓促拆除该建物，台北市政府于2000年将其洋楼指定为市定古蹟。并在2002年1月23日，再由中华民国内政部依《文化资产保存法》公告其为国定古蹟。即使指定为国定古蹟，但因为管理不善与年久失修及历经多次地震等因素，该建物呈现危楼状态。2005年12月，为了抢救该古蹟，行政院特地以紧急防护钢棚架保护该古蹟，并积极寻觅可供合作的民间团体代为经营管理。