处起义军据点相继失守。1896年8月2日，据报清军诸将大范围屠戮乱军，有的地区被杀8,000人，女子被卖为奴。董福祥命令马福禄处理“河湟善后”，马福禄率所部“安宁军”大肆屠杀起义群众近3万人，韩文秀、马大头三三、马成林、冶主麻等重要首领均遭诛杀。哆吧的大约400穆斯林没有参加叛乱，宣称效忠中国。一个汉族人和他的穆斯林妻子争吵，后者恫吓称多巴的穆斯林将攻打丹噶尔，焚烧山顶的寺庙作为示意同教信徒起事和开门的信号。丈夫报官，次日这些穆斯林除一小部分嫁给汉人的穆斯林女孩外都被屠戮。苏茜·卡森·林哈特记录