系聘为讲师。五十年代，中国大陆政治运动频繁。田余庆回忆，那时大多数中青年教师都被政治运动裹挟，难有时间钻研学问、独立思考，业务进步有限，他也不例外。他参加了对胡适的批判，在《历史研究》上发表了批“实用主义考据学”的文章。当时中国大陆史学界盛行研究“五朵金花”，田余庆选定“阶级斗争在社会形态转变中的作用”（此处的“阶级斗争”实际指中国古代农民战争）的题目，征引马克思、恩格斯的语录，准备写一篇长文，已写了几万字的草稿。然而，这时反右倾机会主义运动展开了，北京大学某领导提出要批判“党内专家”，田余庆被列入其中