直与母校维持紧密的联系，除了多次捐助母校以外，又为母校特设「邱善佑奖学金」，并担任大英义学校友会主席，1918年起终身出任母校校董，其后进一步兼任校董会主席一职。
公职生涯.邱善佑毕业后随即从商，主要在槟城协助父亲邱朝仲打理在马来亚的业务，而他的长兄则负责在荷属东印度打理家族业务。当邱朝仲在1916年逝世后，他承继得大笔财产和槟城的大批产业，未几便成为槟城华民代表之一，开始活跃参与当地的公共事务。早于第二次世界大战前，他已身兼多职，当中包括在1922年起担任平章会馆（槟州华人大会堂