综合征治疗的主要目的是：处理胃肠道息肉发生的并发症以及并发的恶性肿瘤；摘除小息肉；防止息肉增大或恶变。单纯的息肉可以通过内镜治疗进行摘除，常规的内镜治疗有纤维结肠镜，胃镜等，近几年双气囊电子小肠镜的使用率逐渐增加。对不能在内镜下处理的息肉或已经发生肠梗阻，肠套叠，肠出血，癌变等并发症者应进行手术治疗。
随访.对珀茨－杰格斯综合征的患者，其本人和家族成员，都应该进行积极的随访，以发现家族中新出现的患者，达到早诊断，早治疗，并及早发现以及处理胃肠道或其他部位恶性肿瘤的目的。随访需制