治二十三年十月七日勅令第二百十五号），在1890年（明治二十三年）10月7日被颁佈。因此，第一次小学校令被废止。而第二次小学校令，于明治三十三年，被全部修订（见下文#第三次小学校令）。在1889年（明治二十二年）4月开始实施，并在同年颁佈了、，通过地方自治系统的确立，而导致了诸多敕令中条款的确立。第二次小学校令比起第一次，更为详细地制定了对学校的制度的规定，全文共计96条。
变化.敕令被变更内容总体如下：
相关敕令.第二次小学校令规定了很多具体的规定。