系统取代《圣剑传说》的蓄力槽速度升级系统。游戏还升级了《圣剑传说》的临时同伴系统，前作中的同伴不可升级，但本作队员变成了永久主角，且可由其他玩家操作。《圣剑传说2》即时战斗系统创作者称，该系统最终幻想前三作战斗系统的延伸。经验值和升级系统取自《最终幻想III》。田中称游戏战斗系统机制最初是为《最终幻想IV》设计的。而如同《最终幻想IV》的制作，《圣剑传说2》中未使用的功能被《时空之轮》团队取用。最初的计划将《圣剑传说》作为超级任天堂CD扩展的首发作品发行。在任天堂和索尼的制作计划告吹，索尼决定转而将