后于1983年推出8MHz的改进型9801E。第二代的9801（编号9801U）推出于1985年，采用了2硬盘+3.5吋软盘的格局，并改为使用性能较8086更强大的日本国产CPU：NEC V30。1980年代末，新规格的9801改为采用更先进的Intel 80286／386处理器。
垄断日本.1980年代和1990年代初，PC-9801基本上垄断着日本个人电脑市场，占有60%以上的市场份额；而当时风靡世界的IBM PC及其兼容机却没有打进日本市场，这是因为1980年代的IBM PC