底物的C-O键；而Asp52作为亲核试剂参与生成糖基酶中间体。随后，糖基酶中间体与水分子发生反应，水解生成产物，而酶保持不变。
相关疾病.在一些遗传性淀粉变性症中发现，病人编码的溶菌酶基因中含有一个突变，从而导致溶菌酶在体内多个组织中聚集。
应用.溶菌酶被广泛用于实验室中对细菌所进行的细胞破碎。由于溶菌酶易于结晶，常被用于各种晶体学相关的研究。