蔡存远，字思毅，福建承宣布政使司泉州府晋江县（今福建省泉州市）人。明朝官员。蔡存远为蔡清第四子。嘉靖五年（1526年），蔡存远中式丙戌科三甲进士。历任吉安、松江二府推官，擢太仆寺丞。平生笔录有《宋鑑摘要》、《胡传摘文批》、《续程文批点论则》及《进呈易经蒙引表》。自着有《周易正说》。清道光《晋江县志》有传。