汉魂为总参议，于次年将汕头及粤东一带军政交予其指挥。1936年因一宗日本人在汕头走私事件，引发日军派军舰往汕头海域，李汉魂下令备战。与此同时发生两广事变，陈济棠与桂系以抗日为名再次反蒋。李汉魂决定辞职，同时通电劝告陈济棠息兵，及请求各军人团结抗日。陈济棠下野后李汉魂复职。抗战开始后，李汉魂任六十四军军长，于1938年初在陇海线一带与日军作战，于罗王砦战役中歼灭土肥原贤二第十四师团，缴获土肥原的军刀及勋章。李汉魂获「华胄勋章」。年中于武汉保卫战中在德安又取得胜利。同年10月，日军在广东大亚湾登陆后攻陷广州