3个独立的实验室通过X射线晶体学，核磁共振（NMR）光谱学或两者的组合来解决。这些结构研究中的两个用于确定人VDAC1（hVDAC1）结构，而X射线晶体学用于解决鼠VDAC1（mVDAC1）结构，其仅与hVDAC1相差仅两个残基。这些确定的结构与先前的圆二色研究一致，该研究预测了α螺旋和β链结构域的存在。mVDAC1的结构分析显示由19个两亲性β-链组成的桶状通道，其N-末端和C-末端均朝向线粒体的膜间隙。β-链通过环转连接并以反平行模式排列，除了平行的β-链1和19。通道的高度为40Ẳ，在开口处跨越2