，起始点识别复合物亦参与相关的基因位点HML和HMR的沉默。起始点识别复合物参与HML、HMR位点的染色质组装，让Sirl沉默蛋白装入染色质中，使得这两个位点沉默。Orc1以及Orc5这两个起始点识别复合物的亚基均与ATP结合，不过只有Orc1具有ATP酶活性。Orc1与ATP的结合使起始点识别复合物得以与DNA结合，对细胞的生存至关重要。另外，Orc1的ATP酶活性亦与复制前复合物的生成有关。而Orc5与ATP的结合则使得起始点识别复合物能作爲一个整体稳定存在。只有Orc1到Orc5这5个亚基对复合物