院迁入沙田马料水大学校园后，校舍便成为今日新亚中学的校址。
校舍设计与组成.该校的校舍是由中国近代着名建筑师、南京国立中央博物院的设计者与香港建筑师学会的创会会长徐敬直所设计。该校没有採用混合「中国式」特征的建筑风格，而是带有现代主义风格，以功能主导，线条简约流畅，重视空间安排，极具特色。校舍自1956年落成至今，保存完好。最初落成之际，只有一幢校舍、图书馆以及圆亭。学校校舍由A座、B座、C座、圆亭以及图书馆大楼组成。在校园的A座旁边有一个全港中学独有的圆亭，原为理学院实验教室