部分行李业务，上野站在同年12月1日成为客运专用站。1900年（明治33年），日本铁道在站前广场建设有餐厅、喫茶店、杂货店的上野待合店。这栋110坪（约364m²）的2层楼建筑于1922年（大正11年）拆除。1905年（明治38年）4月1日，常磐线三河岛～日暮里通车，原先于田端折返运行的常磐线列车可直接驶进上野站。同年开始建设新桥～上野间的高架旅客线并改建上野站。1906年（明治39年），随着日本铁道国有化，上野站成为国有车站。1909年（明治42年）10月，秋叶原～上野～青森间定为东北本线。同年12月