和皇后区，以及曼哈顿南部的斯塔滕岛。介于东区和南区间的水域由两区法院共同行使管辖权。该院有两处原址，分别位于布鲁克林和 Central Islip。该院受理位于其管辖区内的民事及刑事诉讼。本法院判决的案件如需上诉，需去联邦第二巡回上诉法院上诉，专利及《塔克法案》相关的案件需上诉至联邦巡回区法院。