又对教堂内部进行修饰。1608年开始建造教堂前壁，于1637年至1640期间完工，前壁上的雕刻及塑像则在1644年完全补上。新建成的圣保禄教堂被誉为当时亚洲最宏伟的教堂，其设计为罗马公共会堂式，教堂平面呈十字架的形状，内为三个中殿，建筑结构与澳门板樟堂前地的圣母玫瑰堂相似。教堂前壁的右面还建有一座钟楼，里面装置了一个由法国国王路易十四赠送的巨钟，每时每刻均会自动鸣响，其钟声可响遍全城。曾经在越南传教的法国天主教传教士亚历山德罗如此评价：
发展与没落.圣保禄学院在1594年创立，