司法部委任为九龙地方法院助理法官，成为香港开埠以来首位获委任为地方法院法官的华人，至1966年又正式实任九龙地方法院法官。在任内，他多次署任最高法院按察司，且提倡港府保留笞刑，在日常工作以外还高调争取本地公务员应该与外籍公务员获得「同工同酬」的待遇。在六七暴动期间，李福善曾引用紧急法例赋予的权力，重判一名收藏14枚土制炸弹的左派份子入狱10年。在1971年9月，李福善获进一步委任为最高法院副按察司，在1975年杨铁樑（后为爵士）获委任为最高法院按察司前，他更是最高法院内唯一一位华籍法官。1975年1月，