把黎族聚居的海南及广西门户雷州、钦州、廉州划归广东承宣布政使司，雷州府下辖徐闻、海康、遂溪三县，府治海康县。吴川县、石城县（今廉江）则隶属高州府。清朝沿袭明制。
19世纪末以来.1899年11月，法国与清政府签订《中法互订广州湾租界条约》，将雷州府遂溪县、高州府吴川县两县所属部分陆地、岛屿以及两县间的麻斜海湾（今湛江港）划为法国租界，统称“广州湾”，划入法属印度支那联邦范围，设广州湾行政总公使署，受法国印度支那总督管辖。1943年2月太平洋战争时期，被大日本帝国军队佔领。