处将附属肄业馆改为学堂，依据所在地而定名“清华学堂”（Tsing Hua Imperial College），后沿袭更名“清华学校”（Tsing Hua College）。1928年6月，南京国民政府掌控北京后准备改办大学，由于清华接收美国退还庚款，对罗家伦校长的委任状中定名为“清华大学”，未加“国立”二字，后经罗家伦多次争取，最终定名为国立清华大学。1949年新中国成立后，奉中央人民政府教育部令，去掉「国立」二字，并延续至今。
英文校名.“清华”二字按照晚清流行的威妥玛拼音写为“