教会君士坦丁宗主教的治理下。这导致了天主教徒们与亚美尼亚信产生冲突，甚至受到其压迫。直到1829年，在法国的施压下，当局才同意将亚美尼亚礼天主教会设立独立的米利特，并由亚美尼亚礼君士坦丁堡总主教来治理。
教座迁移.于1867年，教宗庇护九世将君士坦丁堡总教区与基里基雅宗主教区结合在一起，并将宗主教教座移到君士坦丁堡。自此，亚美尼亚礼宗主教在君士坦丁堡拥有宗教与米利特制度所容许的政治权利，而在黎巴嫩则单纯拥有宗教上的权威。一次大战期间，在土耳其的军事威胁以及对亚美尼亚人的