以免日后阻碍自己专政，但遭到温峤的大力反对，其他人亦同意温峤，王敦无法得逞。但王敦却因周顗和戴渊二人有很高的名声和才能而十分忌惮，将二人杀害。王敦亦更置百官及军镇，影响数百人，但决策朝令夕改，只是随心而作。不久王敦即回到武昌，并遥控朝政。后又自行加领宁、益二州都督。甘卓知道王敦得胜并杀害周顗等人后，又得到王敦命台城所发的驺虞幡，声言害怕他攻击武昌会逼王敦劫持皇帝，于是决心撤回襄阳。都尉秦康和乐道融劝甘卓分兵截断彭泽湖口，断绝王敦在武昌和建康两批的军队的接触支援，让王敦士众自动离散。但甘卓十分坚决，断然拒