那就只好放了他。但又怕下令把他关起来的寺内寿一失了面子，就把寺内外放为华北派遣军司令，等到寺内到了中国以后的9月25日，真崎被东京陆军军法会议判处无罪。此后，林铣十郎曾经拜访真崎求得谅解，友人也撮合让其与宿敌宇垣一成握手言和，但是都被他拒绝了。在太平洋战争期间，他的两个儿子和6个外甥死于战场，再加上本身真崎被赶出现役坐冷板凳所受的打击，使得他晚年身体更加衰弱。1945年11月19日，日本战败投降后，真崎作为第二批甲级战犯被逮捕，关押于巢鸭监狱，1947年9月东京军事法庭给予其不起诉处分，将他释放。195