2004年5月搬迁到沙田污水处理厂化验室大楼，由1名化验师、5名一级技术员、14名二级技术员及1名服务员协同运作，每月负责测试约3,000个污水及20,000个污泥样本，主要测试包括生化需氧量、化学需氧量、总悬浮固体、总固体（Total Solids）、氨氮、硝酸盐氮、亚硝酸盐氮（Nitrite Nitrogen）、总克氏氮量（Total Kjeldahl Nitrogen）、正磷酸盐（ortho-Phosphate）、总磷量（Total Phosphorus）、氯化物、硫化物、重金属、微生物显微镜观察、毒