任南京国民政府最高法院一庭庭长。1937年抗日战争爆发，日军攻占上海，翁敬棠奉命在上海租界设立上海特区分庭，担任庭长。当时，汪精卫政权内政部部长陈群企图以同乡的关系要其出任伪职，被翁敬棠拒绝。1941年太平洋战争爆发，日军进占上海公共租界。翁敬棠奉调至福建省战时省会永安县，在该县吉山乡设最高法院闽浙赣分庭，并任庭长。抗日战争胜利后，翁敬棠回到南京，任中央公务员惩戒委员会委员长。第二次国共内战期间，翁敬棠见国民党政府腐败，乃于1948年初辞职返回福州，任福建学院教授。南京政府发表翁敬棠为司法院大法官，他未