武汉大学成为中国最美丽的大学之一。1929年3月辞去湖北省教育厅厅长及武汉大学代理校长职。1930年夏任中央大学教授、北京大学理学院院长。刘树杞虽长期从事大学行政工作，他的学术成就也同样另人称道。刘树杞在哥伦比亚大学的博士论文“从铬酸盐废液中电解再生铬酸的连续方法”，在生产应用后颇受欢迎。解决了困挠美国化工业长达二十年的问题。直到四十年代，还有人引用这篇文章。刘树杞毕生致力于化学的教学和研究，尤长于制革学和电化工程，在国内外发表学术论文13篇。曾有着名化学家说过四十年代中国化学界顶尖人物大多受过刘树杞的