1789年安南发生西山朝统一后黎朝、郑主与广南国。清军击败西山朝，护送黎帝黎愍帝复位，途中遭西山军的伏击而败，史称清越战争。西山朝阮惠遣使向清朝谢罪，清廷封为安南王。干隆末年，尼泊尔的廓尔喀王国两次入侵西藏。1793年清朝派福康安与海兰察领兵入藏，击退廓尔喀入侵，不丹与哲孟雄（今锡金）亦为藩属国，加强驻藏大臣的权力。1792年清朝打退了廓尔喀的进犯。1793年，清朝中央制定和颁行了《钦定藏内善后章程二十九条》，以法律形式予以确定西藏的各项事务，《钦定藏内善后章程二十九条》是清朝对西藏行使主权的重要文献证明。