史的研究，收集、整理成《辛亥人物碑传集》、《民国人物碑传集》两书。后以唐代文史为主攻方向，先后撰写了《刘禹锡年谱》、《元稹年谱》、《唐代文史论丛》、《刘禹锡丛考》等，主编了《中华大典·文学典·隋唐五代文学分典》、《唐代文学百科辞典》等。卞孝萱精于对唐传奇的研究。其《唐传奇新探》、《唐人小说与政治》等书备受学界称道。晚年又集中于对谱牒学的研究，通过收藏家谱文献来对历史人物进行研究，补充常见传记文献的不足；又对家谱文献做了去伪存真的工作，出版有《郑板桥丛考》、《现代国学大师学记》、《家谱中的名人身影——家谱