停歇，但最惨烈的莫过于是将军足利义辉被弒一事。明应之变中被管领细川氏罢黜将军一职的足利义材，日后得到中国大名大内义兴的支持，在成功推翻第十一代将军足利义澄后，改名足利义稙再次任职将军。但是，由于足利义稙膝下无子，因此他又认养前将军义澄次子足利义维为养子。永正十五年（1518年），大内义兴返回所属领国，失去庇祐的足利义稙不敌管领细川氏，再次辞去将军一职，由前将军义澄长子足利义晴接任。然而，义晴因与管领细川晴元长期失和，在天文十五年（1546年）辞退将军一职，由长子足利义辉接任第十三代将军。足利义辉立志重振幕府