有表态支持哪一组候选人，因为精神领袖的语带保留，中执会虽然做出支持民进党的谢长廷及苏贞昌的决议，但台联并未像2004年总统选举时全党皆支持陈吕配；台联南部要角包括前秘书长钱橙山、前立委钱林慧君、前立委罗志明、台南市党部主委褚显明更在选前公开支持国民党的马英九。总统选举前两天，李登辉才表态支持民进党总统候选人谢长廷。李登辉说他推动民主化就是希望台湾人民当家作主，他关心并非蓝绿的问题，而是台湾要如何走出去，以及深化台湾民主。他的一票将投给谢长廷，至于选举结果如何，他尊重台湾人民的选择。开票结果国民党马萧