强势，以十一胜三和一负优秀成绩成为冠军，可是球队下半季稍为进入颓势，次阶段联赛以第六名完成，与次阶段的冠军浦和红钻决战；在总决赛首回合主场的赛事中，倒戈的河合龙二射入一球击败对手。然而，在次回合中，红钻由三都主追回一球，结果要以互射十二码决胜，但红钻的长谷部诚及田中斗莉王射失十二码，横滨水手顺利卫冕日职联总冠军，达成两连霸。
中游分子（2005年－2010年）.2005年开始日职联取代双阶段制，水手亦在两夺联赛冠军高峰期后的进入低沉的调整期，2005年及2006年联赛在中游中只能浮