亚洲杯之前因伤退出。之后三年时间内，王鹏都没有再次入围，直至2007年，才再次入选奔赴马来西亚参加了2007年亚洲杯，不过中国队小组赛即遭淘汰，王鹏并未获得上场机会。2006年王鹏被大连实德租借到西安国际，2007年返回大连效力，2008年1月又由大连实德正式转会已经改名为陕西中新的原国际队。
争议.2020年7月31日，被大连广播电视台邀请为中超联赛河南建业与大连人职业足球俱乐部的比赛解说嘉宾的王鹏在19时40分直播开始前与解说员郭毅飞预测比赛结果，得知河南建业队外援巴索戈因