年2月8日，陈时中接任卫生福利部部长。陈时中在上任时，引用医师誓词表示，医疗是服务业。陈时中上任时也表示会重新检讨健保「具名核删制」，引起医界及在野党时代力量之批评。同年五月，陈时中部长提出健保核删试办「团体组织制」。2017年9月8日，行政院院长由林全换为赖清德，卫福部长陈时中由总统蔡英文续任命。2018年9月，陈时中超越蒋丙煌，成为卫福部成立以来任期最长的部长。2019年1月14日，行政院院长由赖清德换为苏贞昌，卫福部长陈时中由总统蔡英文续任命。2020年初，因应2019冠状病毒病疫情，于二