一些专业的基础上先后建立了半导体系（现为电子科学与工程学院）、计算机科学系（现为计算机科学与技术学院）、原子与分子物理研究所、超硬材料国家重点实验室、材料科学系（现为材料科学与工程学院）和测试科学实验中心。2001年7月，原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学和长春邮电学院等五所院校的物理系（室）合并为吉林大学物理学院。
科研机构.
凝聚态物理系.物理学院凝聚态物理系由原吉林大学物理系的固体物理、磁学教研室和金属物理教研室的部分老师组成，属吉林