致数以百计的教会倒闭，成千上万的牧师被驱逐出境。在法国大革命之后，有名的自由主义和共产主义哲学家，如约翰·斯图尔特·密尔和马克思，批评基督教教义，认为它是保守的和反民主的。 <br>对圣经的理性分析和批评催生了基督徒自然神论， 该理论是源自基督教的宗教哲学观点, 相信耶稣的道德教义,但不相信耶稣的超自然的神性。18世纪美国最着名的基督自然神论者可能是第3任美国总统托马斯·杰斐逊。他把《新约圣经》福音书中引用的神灵干预和奇迹干预的部分删除，生成了《杰斐逊圣经》。 受作为主要起草人托马斯·杰斐逊的影响，自然