S一架要花费1亿日圆（93万美元，依照1USD = 107JPY计算），对于YS-11这种年代久远的飞机来说并不划算，因此航空公司是引进新机种取代它。停飞后的YS-11除了报废解体及公开展览外，尚于适航状态的飞机则卖给国外的航空公司。在日本官方，海上自卫队拥有10架、航空自卫队拥有13架、zh-hans:海上保安庁; zh-hant:海上保安厅;拥有5架、国土交通省（运输省）航空局有6架。通常用来训练、运输、巡逻用。海上自卫队曾经以此机载运库页岛的一名全身烧伤少年紧急就医。有部份飞机换装性能更好