兵负责管理军队。此外，又派遣朝廷大员前往重要的省份担任总督之职，其地位居于巡抚之上，负责考察官吏、维护疆界。对于少数民族聚居地，明命帝施行改土归流的政策，任命当地酋长为知州，并派遣流官监督内政。1834年，明命帝参照宋朝的枢密院和清朝的军机处，设置机密院。机密院之职由四名四品以上的大臣担任，奉特旨佩戴金牌。其属下官僚有员外郎、主事、司务、编修，由各部、各院选出充补。1836年，鉴于北城各地贫富差距悬殊、官僚仗势欺人、百姓好赌博和铺张浪费，明命帝接受裴茂先的建议，训导百姓，并严厉打击违法乱纪的官员豪强