九巴亦与其余四大运输机构九广铁路、地铁公司、城巴及香港小轮联合推出智慧卡八达通缴付系统，系统于9月1日正式启用，而香港小轮之大部分股权亦因应渡轮服务交接而移交予新世界第一巴士和渡轮。同年，九巴集团进行重组，九巴、龙运巴士等成员公司成为一家新成立之九龙巴士控股有限公司旗下的子公司，主要股东维持不变。而九巴控股已于2005年改名为载通国际控股有限公司。1998年，九巴成立全资附属公司阳光巴士有限公司，专门提供屋村巴士（首位客户为上水蔚翠花园）、员工及学童接送专车、购物商场穿梭巴士等各种非专利巴士服务。该公司