非蛋白胺基酸是生物化学上指在蛋白质内找不到（例如：肉碱、GABA和L-DOPA），或没有被标准遗传密码编码的其他胺基酸。尽管在合成蛋白质时只会用到23种胺基酸（真核细胞只会用21种），事实上目前已经知道还有另外超过140种的天然胺基酸，而相信穷尽所有组合，这数目可以数以千计。在所有的非蛋白胺基酸当中，有部份较为值得注意，因为下列各种原因：
通过否定来定义.在技术上，任何具有胺（-NH）和羧酸（-COOH）官能团的有机化合物都是氨基酸。 蛋白胺基酸是该组的一小部分，具有带有一个