于香港，但也有一说指他的先祖由河南落户广东。莫干生是莫仕扬家族成员，父祖与英资太古洋行具密切关系，他的祖父莫仕扬（1820年－1879年）早年于广州十三行之一的同顺行工作，后来转到香港经商。及至1870年，太古洋行来港扩展业务，莫仕扬旋获聘任为洋行的首任买办，由此透过买办的身份致富；莫干生的父亲莫藻泉（1857年－1917年）同样曾任太古洋行买办，协助洋行拓展业务，深获倚重，且获得清廷授予户部主事、内部郎中候选道加四级、以及诰授资政大夫正二品等衔。莫干生是莫藻泉各房妻妾之中的长子，他的三弟莫应溎（190