私立华南女子高级中学和陶淑女中合并为福州第二中学，后改为福建师大附中；文山女中并入福州八中；格致中学并入福州五中。1951年，华南女子文理学院、私立福建协和大学等校合并为福州大学，1953年复名福建师范学院，1972年复办后改名福建师范大学。1958年福州大学在福州创办。福建农学院于1983年迁回福州，2000年和福建林学院合并为福建农林大学。「福、师、农」并称福州三大校。根据21世纪初的统计，福州市有高等院校一共31所，学生共计13.5239万。目前福州着名的中学有福州第一中学、福州第二中学、福州第三