护的宗教，天皇家本身也建立寺院。
奈良时代.佛教在「镇护国家」的发想下，导入「僧尼令」、僧纲・度牒制度，僧尼成为官僚组织的一员。此时称作「南都六宗」的三论宗、成实宗、法相宗、俱舍宗、律宗、华严宗大为发展。圣武天皇下诏在诸国建造国分寺、国分尼寺，在大和东大寺建造大佛。佛教确立之际，出现日本的八百万之神也是佛化身显现的「权现」的本地垂迹说，制定神的本地（佛），制作僧侣形态的神像。
平安时代.寺院群开始对政治发挥影响力。桓武天皇为了弱化寺院的影响力，迁都平安京；