同知、通判及经历、知事、照磨等官。后添设治中、推官。洪武三年、陞格为正三品衙门。赐银印。同时，将知府改为府尹。同知更为府丞。洪武二十七年、添设检校。后应天府尹是南京的治安与政务的最高行政长官,相当于现在的南京市市长，为正三品。应天府的官僚机构略同于顺天府。
顺天府尹.永乐迁都燕京，称顺天府。顺天府尹是北京的治安与政务的最高行政长官,相当于现在的北京市市长，为正三品.它是有着跟御史台、步军统领衙门、九门提督府等衙门有几乎相等的权限。而且，顺天府还有承接全国各地诉状的资格，相当