开始逮捕台糖相关人员。5月30日，人事室主任林良桐被捕。6月16日，沈镇南被捕。其实调查单位一开始就锁定沈镇南，之所以从基层员工抓起，是要造成外界本案是由下而上发展的印象。
罪名.判决书指控，宋以信为已经投共的资源委员会前主委孙越崎传口信给沈镇南，招致沈于1949年8月去香港与孙越崎会面通匪。而根据《安全局机密文件－历年办理匪案汇编》记载，沈镇南返台后秉承孙越崎意旨「资匪」的行为，可归纳为以下数点：上述各项罪状是「利用业务上之便利，从事有利于匪之各种活动，以达成借合法掩护非法