。日本虽然躲过了第二次世界性流行，但第三次流行时却未能幸免，从缔结安政条约的1858年起，经历了历时3年的全国性大流行。这也就是所谓的“安政霍乱”，根据非正式的统计数字，据说仅在江户就有10万人死亡。当时，霍乱的爆发始于长崎，在江户大肆流行，并扩散到箱馆。当时认为芳香酸和芥菜是较为有效的治疗方法。文久2年(1862年)，残留下来的霍乱弧菌再次引发大流行，造成了56万名患者，江户则有73000人死亡。此后，进入明治年间，每隔两年三就会爆发感染者达万人以上的疫情，1879年、1886年的死亡人数都在10万左