金会麦克阿瑟奖的第一个获得者，每年获得60,000美元，为期5年，获得了拉斯克基础医学研究奖，沃尔夫医学奖 和托马斯·亨特·摩尔根奖章（与马库斯·罗兹（Marcus Rhodes））。 1982年，麦克林托克因研究改变遗传信息和控制其遗传表达而获得哥伦比亚大学奖。终于証明巴巴拉当时的假设是正确的，因此她终于得到世人的认同并获得来自于各界的殊荣，而最大赞扬莫过于1983年诺贝尔的生理医学奖。
晚年.麦克林托克在纽约长岛的冷泉港实验室（Cold Spring Harbor Labo