个总目，基于分子基因序列分析和逆转位子存在/消失的资料，以啮形大目（啮齿目和兔形目）和真灵长大目（树鼩目、灵长目和皮翼目）所组成。
演化.灵长总目可能是在八千五百万年至九千五百万年前的白垩纪时由旁系群劳亚兽总目分出的。这个假设有化石和分子证据的支持。
种系发生学.根据分子学的研究成果，灵长总目和其它真兽类旁系群的亲缘关系可能如下:灵长总目内各目的假定关系如下：