妹背牛车站（）是一由北海道旅客铁道（JR北海道）所经营的铁路车站，位于日本北海道雨龙郡妹背牛町，是JR北海道函馆本线沿线的一个无人车站，属于旭川支社的管辖范围，由深川车站负责管理。
车站构造.妹背牛车站站内设有一对对向式月台共两条乘车线，中间以跨线天桥连结。在1984年之前本站原本是使用设有办公室的木造站房，驻站人员主要是负责货运服务的收发工作。车站无人化之后进行了改建，成为今日只有候车室的简易构造，并将售票业务简易委託给车站前的商店，但已于1999年时停办。Section