瓦伊勒·谢里亦在此办完手续。瓦伊勒·谢里和苏卡米各登记了一件行李，瓦立德·谢里则没有登记。CAPPS指示三人的行李都需要详细检查。由于CAPPS的扫描仅针对行李，这三名劫机者在安检处未被附加检查。到7时40分，五名劫机者全部登机。穆罕默德·阿塔坐在商务舱的8D座位，阿卜杜勒阿齐兹·奥马里和萨塔姆·苏卡米的位置分别是8G和10B，瓦立德·谢里和瓦伊勒·谢里则在头等舱的2B和2A座位。
起飞.根据航空公司的班次表，客机原定于上午7时45分起飞，但因为登机程序落后进度（在原定起飞的时