科大学与中山大学合并，该院改为现名。目前该院现有职工近2000人，其中医疗技术人员1385人，高级职称人员221人。
分院区.
岭南医院.中山大学附属第三医院岭南医院于2011年9月8日正式启用，由原萝岗区政府和中山大学合作共建的综合性三级医院。
粤东医院.中山大学附属第三医院粤东医院创建于1937年，前身为梅县人民医院。2014年2月，梅县区人民政府和中山大学签署合作托管框架协议，将建成后的梅县人民医院新院区全权委托中山三院经营