亚纲更为原始；因为当时对反鸟亚纲所知甚少，而伊比利亚鸟亦未被纳入分类之内。随着发现更多的反鸟亚纲化石，昆卡鸟亦被正式分类到反鸟亚纲之内。事实上，昆卡鸟所属的年代及其结构都显示它们是较为原始的反鸟亚纲。昆卡鸟有时被分类到反鸟目之中，但未被完全接纳。支序分类学的研究则认为它们应属于华夏鸟目，与中国鸟及内乌肯鸟有关。昆卡鸟与中国鸟或华夏鸟相似的地方是它们拥有独特呈Y状的胸骨。无论哪一个说法正确，昆卡鸟都是可以飞越海洋的能手。
生态.昆卡鸟的脚及飞行结构显示它们是广生性的，能够在植物间