侯仁之在北京友谊医院病逝，享年102岁。
逸事.1988年，由侯仁之撰文、刘炳森书丹的《明北京城城墙遗迹维修记》竖立在北京市西二环西便门桥中央的明北京城城墙遗迹处。1990年，侯仁之撰写《白浮泉遗址整修记》，刻成石碑立在北京市海淀区白浮泉遗址。1995年，为纪念北京建城3040年，宣武区人民政府决定在滨河公园建一座蓟城纪念柱。该柱后来拆除，于2002年重建，仍由中央美术学院设计，2003年1月竣工。蓟城纪念柱前立有石碑，正面刻有侯仁之撰写的《北京建城记》，背面刻有《宣武区