为大厅层，地下2楼为月台。车站改建工程在站内增设电扶梯与电梯。付费区内有无障碍厕所。付费区的列车资讯显示器原先与其他车站一样採用LED式，之后随着成田机场线（成田Sky Acces）通车，2010年改为LCD式。车站往地面的出入口分别有靠近东日本旅客铁道（JR东日本）上野站与上野公园（西乡铜像附近）入口的正面口与两个池之端口。透过检票口外的地下通道可往中央通对向的友都八喜多媒体上野店与阿美横丁方向（开放时间为首班车至22时），也可通往东京地下铁、JR东日本上野站进行转乘。乘客可购入JR东日本、京