从北园街上的山门进入后，便是宽广的庙埕，庙埕北边立有碑亭。而过了庙埕之后，便是三川门，其中央宽五开间，有三对由台南名师蔡草如所绘的门神，分别是中央的韦驮与伽蓝护法与两侧的四大天王。而在三川门之上，外挂有「开元寺」匾，内则挂「小西天」匾，门旁还有清代名士林朝英所书的楹联。而在三川门之内，则于两侧供奉哼哈二将。进了三川门后，其后便是弥勒殿（天王殿），左边则为开山堂，右边为净业堂。弥勒殿供奉弥勒佛与四大天王，而在弥勒佛背后则供有韦驮神像。开山堂里因该寺与郑经与其母董夫人有渊源，而供有延平郡王郑成功神位，此外堂