发射管外，其余三枚全部命中目标。第一枚击中左舷的船头，第二枚钻进位于船身中间的游泳池，第三枚击中尾部的发动机房，爆炸点附近的乘客即时丧命，包括挤在游泳池的女性医护人员，而船上其他乘客都听到响亮的爆炸声。随之而来的，是船上乘客的惊惶失措。有些难民纷纷涌向救生艇及争夺救生衣，在混乱中有些救生设备掉下海去。有些人被涌入的海水溺死，有些是因为发生恐慌时在楼梯里或甲板上遭踩死或压死，也有些乘客跳进冰冷的海水里冻毙。一月份的波罗的海水温平均是摄氏4度，但当天是特别严寒的一天，气温只有摄氏-10至-18度，海面上有浮冰。