上色方式以传统的画笔上色为大宗，当电脑等数位工具渐渐普及之后，动画制作公司便陆续引进了许多美术编辑软体来进行数位上色。
上色检查.日文称为「」。对于上好颜色的所有原画、动画分格，必须仔细检查所有颜色是否有误，以免在播出时因为前后分格的颜色不同而产生快速闪烁的现象。
特殊效果.此处的特殊效果和拍摄的后制特效有明显不同，专指早期在赛璐珞原画纸上所进行的加工处理。通常是使用喷枪或是毛笔等工具，在已经上好颜色的原画稿上面进行加工，以呈现出独特的透明感、立体感等。因