国师附中适逢中国人民抗日战争。1944年8月，日军逼近安化。战乱当中，学校跟随国立师范学院辗转从安化蓝田迁移至溆浦。抗战结束后的1946年8月，学校奉令迁往衡山县南岳大庙东廊。1949年11月，衡阳解放。1950年2月，省临时政府要求国立师院前往长沙与湖南大学合办，但湖南大学没有设立附中的规划，不愿接收国师附中；省教育厅遂要求国师附中与省立十二中合办，以省立十二中在衡山两路口的校址为永久校址。省立衡山中学于1952年全国中学名称调整中更名为衡山第二中学。1960年，衡山县析置南岳镇等地为南岳县，位于