负气，见理未明”，遣他回家，令阮朝文多加教导。永祚八年（1626年），阮有镒在家勤学三年后，再次担任文职，深得阮福源器重。永祚九年（1627年），郑梉派遣使者携后黎朝皇帝黎神宗的诏书前往顺化，要求阮福源入朝觐见皇帝，但被阮福源拒绝。于是郑梉挟持黎神宗征讨阮主，拉开了郑阮纷争的序幕。在这次战斗中，阮福源命令侄儿阮福卫为节制，阮有镒监战，两人一起扼守险要之地，在江附近一带抗击郑军。虽然郑军伤亡惨重，但郑梉依旧没有退兵的意图。于是阮有镒遣使进入郑军营寨，诈称是昇龙的使者，谎称郑嘉、郑岳在北河发动了叛乱。