二十六日（1899年1月7日）才抵达马尼拉上任。光绪二十五年正月初二（1899年2月11日），美国国务院向时任清朝驻美国公使伍廷芳出示指控陈纲之父陈谦善的信件，再次要求清朝撤换驻菲律宾的领事。英国、德国商人在信件中指控陈谦善已经加入西班牙籍，曾替菲律宾都督府滥收税项，并中饱私囊。如果陈纲担任当地领事，一切事务必由其父把持。闽籍商人当时以牙还牙，分别向清廷及美属菲律宾当局指控粤人串通英国商人诬告陈谦善，并请求让陈纲留任领事，但美国的态度仍然强硬。陈纲知道已经不可能留任，于是在同年二月十三（1899年3月5