在西藏设立驻藏大臣衙门，内阁学士僧格和副都统马喇成为首任驻藏大臣。驻藏大臣不仅直接掌管西藏政务，还直接督察西藏宗教重大事务。对大活佛转世灵童的认定除了“吹冲”降乩以外，还需报驻藏大臣，并由驻藏大臣上奏清朝皇帝恩准。“吹冲”在各种贿赂下，在跳神降乩中，假借神谕，指定的活佛转世灵童大多出自蒙古王公或西藏的大贵族之家，有的甚至还是“吹冲”家族中人。这种大活佛几都出自一家一族的现象，也是促使干隆皇帝下决心整治西藏活佛转世制度流弊的一个重要原因。 1785年清干隆四十九年，噶玛噶举派红帽系第十世夏玛巴活佛却朱嘉措