是南京最知名的地区性河流。它的南北两源分别在溧水的东庐山和句容的宝华山南麓，在江宁方山汇合后在南京城通济门外又分为内外两支。内秦淮流经南京城南，为着名的“十里秦淮”，出西水关与外秦淮复合后汇入长江。南京其他重要的水域还包括市区的金川河水系、从六合区流过的滁河、高淳的固城湖、溧水的石臼湖等。“石头虎踞，钟山龙蟠”概括了南京城周边的地势。紫金山盘桓于东，余脉向西延伸入城区，自东向西分别为太平门内的富贵山、玄武湖南岸的九华山（覆舟山）、北极阁（鸡笼山），向西由鼓楼岗延伸至五台山、清凉山，最后连接古长江冲积物堆