11号、15号与2号染色体上，书写时只有首字母大写，例如Hoxa-11与Hoxd-11。第3平行同源家族，也就是Hoxa-3、Hoxb-3与Hoxd-3基因，主要作用是产生颈部的嵴椎骨。另外Hoxa-11或是Hoxd-11其中一的基因发生突变时，会使桡骨（radius）或尺骨（ulna）产生轻微缺陷。若是两个基因同时突变，则会使两块骨头皆退化。