改建为高架车站前还曾有专供大社线使用的0号月台。目前1号月台位于最北侧，4号月台位于最南侧；位于内侧的2号、3号月台为本线所使用，外侧的1号、4号月台则为待避线使用，以本站为终点站的快速列车或普通会停靠于1号或4号月台。但以本站为终点站的特急列车八云号列车是停靠于2号月台再等候折返，此期间如果有自滨田方向驶来的列车则会停靠于1号月台。
一畑电车（电铁出云市站）.一畑电车的电铁出云市车站也是有人车站，位于西日本旅客铁道北口以东约100公尺处，与西日本旅客铁道的车站之间无法直接换乘