设在北京的武警水电指挥部，正军级建制。武警水电部队共建成大中型水电站20多座(总装机容量260多万kW)、架设高压线路150多km、修建公路750多km。着名工程有：天生桥二级、天生桥一级、西藏羊卓雍湖抽水蓄能电站、长江三峡永久船闸和潘家口水利枢纽、万安水电站。
武警水电一总队.辖第1、2、3、12支队。前身为中国人民解放军基本建设工程兵第六十一支队。总队部驻广西南宁市。主建天生桥一级，二级电站等大型水利工程设施。
武警水电二总队.辖第7、8、9、10支队