定《垂拱格》后至神龙元年已来制敕，为《散颁格》七卷。又奉诏与韦巨源、唐休璟、李怀远、苏瑰等定《垂拱格》及《格后敕》，前后计二十卷，颁下施行。二年（706年），与魏元忠、武三思、徐彦伯、柳冲、韦承庆、崔融、岑羲、徐坚等撰《则天皇后实录》二十卷。七月，中丞萧至忠弹劾祝钦明为逃避服丧而隐瞒亲人死讯，有违孝道，八月，祝钦明因此一度下台，被贬为申州刺史。百官为此惊悚。因担心不能重获权力，祝钦明谄事韦后，不久被召回重任国子祭酒。景龙三年（709年）八月，中宗想亲自在长安城南郊祭祀天地，祝钦明和时任国子司业的郭山恽为