紧密包围，这种起支撑作用的结构比嵴椎简单得多，又被称为嵴索（notochord）。文昌鱼的嵴索和嵴椎动物的嵴椎不同，它一直延伸进入头部，故文昌鱼所属的亚门被称作头索动物亚门（），其中“cephalo-”在拉丁文的意思就是“与头部相连”。文昌鱼于头部被称为脑室的神经索部份比较粗大，但并不是脑部。并文昌鱼嘴的前端长有口笠触手（oral cirri），起到感觉器官和过滤进入口中的海水的作用。文昌鱼拥有血管系统，但没有心脏，血液由一部份血管的脉动带动。
习性.文昌鱼成熟个体平均体长大约5厘