政大权，与黎元洪分庭抗礼。因一方为大总统府、一方为国务院，所以它们间的争斗被称为“府院之争”。按照《中华民国临时约法》，国务院重大决定要经过大总统盖印方可发布。国务院秘书长徐树铮常对大总统黎元洪态度蛮横无礼，久之黎怀恨在心。徐树铮在国务院与内务总长孙洪伊有矛盾，段祺瑞下令将孙撤职，让徐到总统府盖章。黎元洪拒绝盖章。府院陷入僵局，元老徐世昌出面调解，最后徐树铮孙洪伊共同被撤职，才算了结。一波未平一波又起，在要不要参加第一次世界大战对德国宣战这个问题上，双方冲突更趋激烈。1917年3月4日，段祺瑞偕同全