孙应魁（），字元之，直隶松江府上海县人，民籍，明朝政治人物。
生平.应天府乡试第九十八名举人。嘉靖二十九年（1550年）中式庚戌科三甲第二百零四名进士。
家族.曾祖孙寅，七品散官；祖父孙鹗，刑部司务；父孙继科，监生。母刘氏。