民在此居住，之后又有洪、王、蔡、李、白、潘等姓移住，逐渐增加到20余户。到了1691年（康熙30年），各姓头人协议创建妈祖宫，尔后人烟渐趋稠密、商业活动也愈加发达。1865年，原本在台湾府城（今台南）的马雅各，迁往打狗行医。受其推荐，另一名英国医师万巴德（Patrick Manson）也到打狗协助马雅各在旗后的医务。1869年后，马雅各回到台南，旗后的医馆便由万巴德继续维持至1871年。经过万大卫（David Mason）与连多马（Thomas Rennie）的接替之后，W. W. Myers于1879