1908年，他与霍夫汉内斯·图马尼扬等其他158名亚美尼亚知识分子一道被捕，他在第比利斯的Metekha监狱中待了半年后被保释出狱。1911年，他由于参加革命活动而被俄罗斯帝国驱逐，待在高加索地区已经是不可能了，所有他又去了国外。伊萨克扬不相信青年土耳其党人政府关于给予西亚美尼亚自治的承诺。他认为泛突厥主义是要消灭所有的亚美尼亚人的，而且他还认为土耳其的支持者德国是有能力阻止这些的，所以去了柏林。他在那里和一些德国知识分子一起参加了德国亚美尼亚运动，创建了杂志《梅斯罗布》。1914年，他与约翰内斯·莱普