对此委员会的掌管，如何实践行政一体，就是争议所在。
司法解释.按大法官会议释字第 613 号的解释文有以下重点（以现代中文书写）：
独立机关的界限.大法官许宗力在意见书中指出，独立机关的组织形态不可能由宪法定明（否则变成司法院，监察院等是指定独立于行政院与立法院的机关），而是由立法者因政治需要而订明。换句话说，独立机关的「独立程度」始终由宪法框架所限，若碰到这个底线，即构成行政一体与责任政治的当然违反。另外，独立机关不可以成为由立法者制造，有行政能力机关，