欲重组第一文明基因组从而实行一项目的不明的「凤凰计画」（Phoenix Project），因此侵占了玩家神经细胞搜索基因记忆资料，寻找古今拥有大量第一文明成员基因的圣者。为阻止Abstergo ，现代刺客希望玩家能加入组织并抢先进入活跃于18世纪末法国大革命时期、曾接触一名圣者之刺客亚诺·维克特·多里安（Arno Victor Dorian）的记忆。1776年12月27日八岁之亚诺跟随刺客父亲查尔斯·多里安（Charles Dorian）前往凡尔赛宫，在等待父亲回来时初遇法国圣殿骑士团大团长弗朗索瓦