月13日，民进党「立委辅选策略小组」第一次会议，邱义仁说，2004年立法委员选举，民进党要延续2004年总统大选「割喉」策略，「割到断为止」；此言引发国亲联盟反弹，选举结果民进党惨败，邱义仁自此以「割喉邱」着称。2008年间，邱义仁被指控涉入巴纽外交公款侵吞案，于5月5日辞去行政院副院长一职，声明退出民主进步党与政坛。5月6日请辞获zh-cn:准; zh-tw:准;，外交部部长黄志芳、国防部副部长柯承亨也同步跟进请辞获zh-cn:准; zh-tw:准;。在回到民间后，又因安亚专案、鐽震案