同盟国无条件投降，第二次世界大战结束。中华民国政府改台南州为台南县，州辖台南市改制为省辖市，从而与台南县分离；1946年，台南县安顺乡併入台南市，改为安南区，形成了省辖市时期的行政区范围。在此时期，原城区週围辟建了许多眷村，安置大量中国大陆各省市民。二二八事件发生后，台南市亦有士绅无辜受牵连。日治时期结束后，台南市先后于仁和、安平工业区发展轻工业。然而此时南邻高雄市快速崛起，并于1979年改为直辖市，台南市经济发展相对受限。1968年起台南市政府开始市地重划，其中第四期的竹篙厝与第五期的安平等区面积较广