概论.此次选举为台湾省实施地方自治以来之第16届县市长及乡镇市长选举及第17届县市议员选举（新竹市及嘉义市因较晚改制，故为第8届）；同时亦为福建省之金门县及连江县实施地方自治以来之第5届县市长、县市议员及乡镇长选举。同时，这场选举亦是2008年民主进步党卸下执政权、中国国民党的马英九政府执政后面对的首次全国性选举，被视为对马英九政府的信任投票，不过得票率有蓝消绿长的趋势。其结果如下：
选举日程.以下依中央选举委员会于2009年5月22日公佈的日程：
县