肯尼亚国内有和被英国带来建造乌干达铁路和工人后代的海外印度人。在印度独立前，印度人在东非的福利得到印度自由斗士的注意。尽管两国种族之间关系恶化，两国的经济合作蓬勃发展，更成为南南合作的典范。1963年，肯尼亚独立，内罗毕随即设立了一所印度高级专员公署，蒙巴萨也设立了印度助理高级专员署，而肯尼亚维持在新德里、孟加拉国、斯里兰卡和新加坡设高级专员公署。肯尼亚和印度为联合国、不结盟运动、七十七国集团、和环印度洋地区合作联盟的共同成员，两国经常在这些论坛上相互合作。
经贸关系.印度和肯尼亚