皮通常为红色、黄色、绿色、粉红色或者变褐，也有许多双色甚至三色的品种。果皮被表皮蜡质的保护层覆盖。 外果皮（即果肉）通常为浅黄白色，但也有粉红色或黄色的。
野生祖先.苹果的野生祖先是新疆野苹果，在南哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和中国新疆的都有发现野生。苹果的选育很可能开始于被森林覆盖的天山两侧，选育过程经过了很长一段时间，选育使其他物种的基因渗入开放授粉的种子中。由于与欧洲野苹果、海棠的大量基因交换，现在的苹果与海棠的联系更为紧密，而不是与形态学相似的新疆野苹果。在没有现代