孙毓汶（），字莱山，号迟盦，山东济宁人，清朝末年政治人物。
生平.户部尚书孙瑞珍次子。咸丰六年（1856年）榜眼，授编修，侍读学士。咸丰十年，以在籍办团抗捐被劾，革职遣戍，为恭亲王深恶痛绝。同治元年（1862年），以输饷复原官。光绪十年（1884年），法越事起（北圻远征），策划醇亲王复出，排挤恭亲王，促使慈禧尽撤全班军机大臣，孙毓汶以工部左侍郎在军机大臣上学习行走，兼总理各国事务衙门大臣。当时清议纷嚣，孙出张佩纶、陈宝琛等会办南北洋、闽海军务，令清流气燄顿敛。十四年，授吏部右侍郎。