团之经费与志工遴选方式备受在野党质疑，加上2004年7月总统府2名工友自杀原因被指与总统府留用青年工作团5位团员影响员工升迁有关，2004年9月10日总统府祕书长苏贞昌证实不再进行青年工作团志工遴选。2008年5月20日，马英九就任总统后正式增设总统府发言人一职；在此之前，总统府的新闻发布向来都是由公共事务室主任负责。为了使总统顺利行使职权，2010年9月1日《总统府组织法》修正，增设法规委员会。
历史.1912年1月1日，中华民国临时政府于南京成立，设置总统府于清代原两江总督