憾的是，1991年之后，波普不仅被排除出GAUSSIAN软件的开发团队，甚至被公司禁止使用这一软件。1986年以前波普一直任职于宾夕法尼亚州匹兹堡的卡内基梅隆大学，在这里他完成了早年的主要理论贡献。1986年波普离开卡内基梅隆大学，来到芝加哥供职于西北大学。1998年年他由于在量子化学计算方法方面卓越的贡献获得了当年度诺贝尔化学奖；2003年获得封爵。