菌物总界（Holomycota，）是单鞭毛生物的一个演化支，包含所有与真菌近缘而与动物远缘的生物，或可定义为，包含真菌界与核形虫目的最小包容支（即，二者的最后共同祖先及其全部后代）。
种系发生.透过支序图可以看出真菌和其他物种之间的关系，是根据Philippe Silar的研究及《The Mycota: A Comprehensive Treatise on Fungi as Experimental Systems for Basic and Applied Research》的