2月，调任黑龙江办理全省教育。民国5年（1916年），林传甲因病辞职，离开黑龙江。民国六年(1917年)，林传甲发起编纂《大中华地理志》。其后又编纂了浙江、江苏、安徽、福建、直隶、京师、京兆、湖北、山东、湖南、吉林等行省、地方之地理志及《大中华直隶省易县志》、《察哈尔乡土志》等。民国10年（1921年）林到吉林任职。民国11年（1922年）1月，病逝于吉林教育官署。