晚年生活低调，他在1958年12月26日下午一时于香港的寓所内病逝，终年76岁。在家人安排下，他的遗体翌日于香港殡仪馆内大殓，其讣告同日以莫大义堂名义刊登各大报章。莫干生在12月28日出殡，各界官绅执绋者逾千人，当中包括周埈年爵士夫妇、罗文锦爵士夫妇、邓肇坚和关祖尧等，其遗体随后移奉往香港仔华人永远坟场安葬。虽然莫干生后期与太古洋行关系不美，其三弟莫应溎又涉及1952年的「粤穗慰问团事件」，使港府感到尴尬，但为肯定莫干生多年来在社会公益方面的贡献，港府仍打算向他颁授勋衔。在1958年，港府向英廷奏请向莫