阮朝建立之后，郑怀德被任命为户部尚书。同年，阮福映遣郑怀德为正使，由兵部参知吴仁静、刑部参知黄玉蕴担任副使，将缴获的西山朝印绶献给清廷，同时将华南海盗首领东海王莫观扶以及统兵梁文庚、樊文才三人移交清廷。郑怀德一行自顺安海口出发，抵达广东的珠江三角洲，由两广总督吉庆护送到京师（今北京）。不久阮福映灭西山朝，遣兵部尚书黎光定到京师请封。翌年，两使团皆到达京师。1804年，郑怀德随清朝的册封使齐布森回到顺化，充当通译使。1805年，郑怀德被任命为嘉定留镇事，前往嘉定协助阮文张。1808年，嘉定镇被改为嘉定城，