发生后，喀什警备司令兼参谋长刘斌率领700名士兵迅速前往镇压起义，9架苏军战机同时对英吉沙和莎车发动空袭。马木提·穆依提到达斯利那加后，于翌年前往麦加朝圣。新疆南部发生的叛乱直接影响了大约400名维吾尔族留学生的命运，这批由中华民国新疆省政府派赴苏联塔什干大学的留学生。在1937年5月被内务人民委员部逮捕，未经审判就因约瑟夫·斯大林下达的命令而被处决。位于乌鲁木齐、焉耆、伊宁、塔城和阿尔泰的苏联领事馆外交人员也受大清洗波及而被处决。苏联乌鲁木齐总领事Garegin Apresoff被召回莫斯科后被处决，原