大森担任所长，胡瑛为总干事，曹亚伯负责宣传和湖南湖北之间的联络，时功璧负责财政，宋教仁担任文书。此外欧阳瑞骅、宋教仁和刘复担任文普通学堂干事，刘度成担任武高等学堂干事，陈应甲担任武普通学堂干事，朱子淘和易本义在所本部工作。另外先后加入科学补习所的成员包括孙武、冯特民等人，以及日后担任国会议员的欧阳振声、张汉、刘彦等。成立之后的科学补习所不断招收新军士兵加入，此外胡瑛还曾介绍一批会党成员加入。
解散.8月，黄兴自上海抵达武昌，科学补习所专门为黄兴召开了欢迎会。黄兴在会上知会科学补习所