有两个细胞膜。它们还包含一个肽聚醣的细胞壁，这是比在其他革兰氏阴性菌较厚的细胞壁，且位于它们的两个之间。就像叶绿体一样，它们有它们的内部类囊体。
结构.叶绿体中的液体被称为（Stroma）——和细菌的细胞质相对应，尽管叶绿体的蛋白质大多由细胞核的遗传信息编码而成，基质中仍含有小的环状脱氧核糖核酸（DNA）和核糖体。叶绿体内含有堆叠的扁平状的颗粒类囊体（Thylakoids）和其延伸部分-基质类囊体，内囊体有内腔。光合作用在类囊体的表面和基质中进行。叶绿体和叶绿体内膜的光合作用蛋