。2000年代，占用单位全部腾退，此处挂上北京市西城区伊斯兰教协会什刹海清真寺筹备处的牌子，筹备重建什刹海清真寺。但此后重建工作长期停滞。
历任教长.从干隆十年（1745年）马良创寺到1958年，什刹海清真寺一直由忠恕堂马氏任伊玛目，例如：马良（首任）、马仪模、马福隆、马九思（马九为）、马春瑞、马守信、马有桂（字凤池）（末任）等等。曾任阿訇等教职的自光绪年间起有：回履祥、于长明、于勉斋、王静斋、刘殿卿、李怀真、杨三阿訇、李秉真等等，曾任其他教职的有刘文亭、王秉钧、王炳堃、王宝龄、王