组赛阶段分别击败了中国香港的胡赟以及德国的马克·茨维布勒，唯有输给了中国的田厚威，但仍然以小组次名出线；在准决赛鏖战三局以1比2（17-21、21-19、13-21）不敌中国的田厚威。2017年2月，简·奥·约根森代表丹麦参加波兰卢宾举办的欧洲羽毛球混合团体锦标赛，助球队赢得混合团体冠军。2018年2月，简·奥·约根森出战瑞士羽毛球公开赛，在男单决赛以0比2（15-21、13-21）不敌赛会2号种子、印度的萨米尔·维尔马，赢得亚军。同年4月，他代表丹麦参加西班牙韦尔瓦举办的欧洲羽毛球锦标赛，在男单准