大大增加了医疗成本。在住院病人不良药物反应中，抗菌剂的不利影响占了近25%。在意大利医生记录的不良反应报告中，氟喹诺酮类药物在处方药对神经和精神的不利影响排名中位居前三。这些神经和精神的影响包括手震、混乱、焦虑、失眠、情绪激动及严重时会出现的思觉失调。莫西沙星（Moxifloxacin）是造成中枢神经系统毒性的喹诺酮类中危害最大的。中枢神经系统是氟喹诺酮介导的神经毒性的重要目标。
抗生素抗药性.虽然抗生素在治疗严重的传染病和危及生命的细菌感染中非常重要和必要，但是其相关的抗生素滥用