东中国海及南中国海之间，所以在海洋史（特别是东亚贸易）、国际关系、地缘政治研究中，台湾海峡经常和霍尔木兹海峡及麻六甲海崃等比较研究，以探讨海峡区域的自然、人文发展。台湾海崃在东海及南海的海域交通的位置，也成为明清时期的武装海商集团，如李旦、郑芝龙、林道干、林凤等活动的区域之一，其中台湾海峡更成为郑芝龙及其后继的郑氏舰队的内湖（相关位置参见不同视角的两图如右）。郑芝龙以华南、台湾及日本等地为活跃舞台，经营日本平户岛、长崎、马尼拉、和华南及东南亚华人移民据点形成主要的商业航道为其主要经济命脉，台湾海崃亦为武