台北市政府卫生局（简称卫生局），1946年成立，是台北市政府所属的一级机关。
历史.1945年，台北市政府暂于台北市警察局设「卫生课」，接管台北市役所卫生课。1946年6月，台北市警察局卫生课独立为台北市卫生院，设于今台北市中山区长安西路15号（台北市政府卫生局旧址），直属台北市政府，下设四股（分掌医政、保健、防疫及总务），附设诊疗室、试验室，附属机关为稻江传染病医院、火葬管理场、牲畜屠宰场、市立各科医院及清洁联合社。1967年7月1日，台北市改制为直辖市，台北市卫生院改为