次列车脱线事故影响，沪九直通车发生继2008年雪灾之后的另一次严重晚点，当日途经该路段的T100次沪九直通车停靠江西新余站，后改道经京九线、铜九线、宁铜线、皖赣线及宣杭线运行，并临时调整了机车交路，韶山9G型电力机车在南昌站摘挂，换挂南昌机务段的东风4D型柴油机车及东风11G型内燃机车双机牵引。列车最终在5月24日凌晨1时50分抵达上海站，晚点15小时42分钟。而沪昆线脱轨事故亦导致23日从上海开往香港的T99次，以及24日从香港开往上海的T100次直通车延误。其中原定于23日晚上6点24分由上海发车的T9