苏门答腊岛和西马来西亚的猪笼草进行了分支系统学分析，共利用了70个形态特征。长叶猪笼草被归入“第5分支”，相关性达69%。其中长叶猪笼草与莱佛士猪笼草和苏门答腊猪笼草的相关性达58%。该研究未包含贝卡利猪笼草。
宽叶猪笼草.宽叶猪笼草和长叶猪笼草在成年植株的区别较大，但其幼苗在外形上则几乎没有区别。查尔斯·克拉克认为长叶猪笼草可能与宽叶猪笼草之间也存在着较密切的近缘关系。
自然杂交种.尽管长叶猪笼草与许多其他的猪笼草同域分布，但其自然杂交种却十分的少见。仅