正6年（1578年）3月，直正病死。天正7年9月，其根据地黒井城被织田军夷为平地。波多野秀治（丹波） - 天正7年（1579年）6月投降，后被处死。荒木村重（摄津） - 天正7年（1579年）9月，抛弃了有冈城逃亡。后成为羽柴秀吉的家臣。宇喜多直家（备前） - 天正7年（1579年）10月，投降。别所长治（播磨） - 天正8年（1580年）1月，自杀。本愿寺（摄津） - 天正8年（1580年）闰3月，与织田家讲和。同年8月，一向宗彻底退出石山本愿寺。山名氏（但马、因幡）- 天正8年（