08年（清光绪三十四年），清廷拟于漠河设治，划归瑷珲道管辖。同年，讨论由嫩江之源开辟山道，卒以工费浩繁中止。1914年（民国三年）为设治局公署驻地，1917年由设治局改升为二等县城所在地。1947年解放后并入唿玛县。1981年漠河重新建县后，选西林吉镇为县城，老县城漠河村为漠河乡政府所在地。2018年2月经国务院批准，撤销漠河县设立县级漠河市。
行政区划.下辖6个镇：境内有西林吉、图强、阿木尔三个林业局及所属古莲河露天煤矿、漠河发电厂。西林吉镇设4个社区，1个村委会