家来说是非常重要的副业。1871年（明治4年），有马家上屋敷搬迁至赤坂，当时神社也一同迁座至赤坂，但次年旋即又迁座至中屋敷，即现址。为了纪念镇座江户200年，神社管理方决定重新改建社殿。2013年3月1日至2016年4月7日期间，作为代替，在日本桥滨町的附近设置了临时神社（假宫）。2016年4月8日起，新社殿启用。由于历史渊源，江户水天宫的宫司一直是有马家担任。现任宫司为有马家当代家主有马赖央兼任。
年间行事.每月1日、5日、15日为月次祭，此外还有按照日期地支确定的“