明中隔腔、后血管联合、黑质中的苍白核以及蓝斑核、嗅核、丘脑、乳头状体、脑干与小脑的萎缩。进阶的慢性创伤性脑病变，甚至有可能导致海马回、内嗅皮质及杏仁核的萎缩。在显微镜下可以看到神经纤维的空洞化、tau蛋白沉积、TDP-43包含体(TDP 43)沉积、白质的变化以及其他异常。tau蛋白沉积形成神经原纤维缠结（英文：neurofibrillary tangle，NFT）、轴突以及富含星状细胞与神经胶细胞的缠绕。 前类淀粉蛋白质的沉积在慢性创伤性脑病变较少发现。有一小部分慢性创伤性脑病变的患者，将会发展成慢性