年日本战局不利，为防止苏联放弃中立，日本主动要求与苏联谈判放弃「北库页岛利权」，1944年3月30日双方签署议定书，北库页的日方企业资产作价500万卢布，并于随后五年每年提供五万吨石油。1942年11月1日，日本拓务省与其他省厅因为一元化计划而合併成为大东亚省。桦太厅改为隶属于内务省之下。1943年4月1日，库页岛编入日本本土，属于北海地方。
战后时期.1945年2月11日，英美于《雅尔塔协定》中承诺将库页岛南部归还苏联，1945年8月8日日苏战争爆发，苏军进攻库页岛，于8月28日