会后李健华入选深圳平安二队，2002年入选深圳平安一队，2002年中国足协出台了硬性规定，每场比赛必须有两个21岁以下的年轻队员上场，这才给了他一个机会。2003年李健华在深圳的右路站稳了脚跟，2004年协助深圳健力宝夺得首届中国足球超级联赛的冠军。2007赛季后半程他开始担任球队队长。2008赛季结束后，深圳队连年的不稳定让李健华萌生离开球队的想法，而另一支中超球队广州医药也有意引进李健华，但深圳足球俱乐部为李健华标出的260万身价却使转会陷入僵局。2009年转会即将截止的最后时刻，深圳队与广州医药队