是唯一得以照原名称唿的中华民国中央政府部会，但亦有把陆委会称为「台湾当局大陆事务部门」之情形。而其他部会皆遭其单方面修改，如称内政部为「内政部门」等等。2014年2月间，时任陆委会主委王郁琦访问中国大陆，中国大陆官方的新华社、中央电视台、中新社、《人民日报》、《环球时报》、中国台湾网等媒体，都依循大陆官方标准，称王郁琦为“台湾方面大陆委员会负责人”，在南京会谈现场，中国大陆国台办发给媒体的手册中，也依此称谓。