象资料的空军都强调能见度有达标准，拒绝更换跑道。《台湾壹週刊》随即报导，GE222航班机长当时向塔台航管人员表示能见度不佳，要求改降落在20跑道，航管人员立刻向军方连络，但军方竟已能见度达到1600公尺的理由拒绝要求，塔台也因此拒绝机长要求。对此，国防部空军司令部政战主任刘守仁澄清表示，马公机场的02跑道与20跑道其实是同一条跑道，但是降落的方向不同，只是民航局在02跑道的方向有装设「仪器降落系统」（ILS），20跑道的方向没有ILS；他说，飞机降落跑道的方向完全是由塔台所决定，并非空军所能决定，就连军机起