担心格鲁派的地位会因此式微，这两个因素的结合，让多杰雄登信仰重新盛行于西藏，引起许多社会问题。20世纪初，十三世达赖曾正式发布禁令，禁止多杰雄登信仰。但是这并没有影响到多杰雄登信仰的兴盛，着名的格鲁派僧侣帕绷喀仁波切就是多杰雄登的信仰者，他的弟子赤绛仁波切与林仁波切后来成为十四世达赖的老师，因此十四世达赖在青年时也曾信奉多杰雄登。十四世达赖经过询问乃琼护法的神谕，在1996年5月宣布禁令，禁止格鲁派信众继续信奉多杰雄登，多杰雄登的信徒不得参加格鲁派的法会以及接受灌顶。据中国官媒《中国民族报》报导