南行一段路程后再于田地中间东转，并往南岔出一条通往「竹仔港 」的支线南36-1线。东行的南36线短暂的切回七股区竹港里境内，在经过麻豆寮后往东行并进入西港区境内，最后止于南41线叉路口处的终点。南36线在1976年以前的路线只由"乡道169号"／"台17线"路口通至顶看坪为止，里程仅约1.77公里。在后续路线整编时，将"南40线"蚶寮至竹港路段整併于路线之中。南36主线终点路段在竹港里部份改为东行，终点移至南41线路口，跨入西港区境内；原来"南40线"岔往竹仔港的南向路段则编为南36-1线，成为今日所见