遂由此结识了中共领导人周恩来、叶剑英等。　　抗日战争期间，程潜聘任何遂为第一战区高级幕僚室主任。任内，他曾陪周恩来乘汽车自河南前线前往位于山西五台山的八路军总部，结识了八路军领导人朱德、彭德怀等。何遂因与阎锡山结交于辛亥革命之时，因而调解过八路军同阎锡山的矛盾，劝阎锡山与八路军合作抗日；并通过军令部次长林蔚的疏通，给八路军增加了军饷。1939年9月，何遂赴桂林参加第一次长沙会战谋划，11月，又赴桂南前线参与桂南会战谋划。1940 年春赴柳州任军事委员会桂林办公厅(主任李济深，副主任林蔚)总顾问。1941