13年（1544年）、出生于美浓国大野郡大御堂城（岐阜県揖斐郡大野町）。永禄元年（1558年），与当时担任不破郡岩手城主的父亲，一同击败岩手弹正守忠诚，并于永禄2年（1559年）着手修建菩提山城并移居该城。竹中重治元服后，与美浓三人众之一的岩村城城主安藤守就之女（法名得月院）成亲，1562年父亲去世，重治继承竹中家的家督之位及菩提山城，拥有约三万石高土地，侍奉美浓国大名斋藤龙兴。早前美浓国发生斋藤道三及斋藤义龙父子相争，竹中重元因支持道三而失势，作为重元之子的重治虽然凭借岳父安藤守就的关系重归斋藤家的行列