本的第三支柱被完全拆散，不复存在；而欧盟的一切内政与司法合作决策，皆复归由两个立法机关（欧盟部长理事会与欧洲议会）共同参与的通常立法程序。依据《里斯本条约》的架构，「自由、安全与正义的领域」的体系位置如下：
会员国参与程度.英国、爱尔兰、丹麦三国，行使了附加议定书里的权利，对于内政与司法合作只做有限的参与。