那霉素、阿拉明、多黏菌素B、氯化钾、氯化钠、盬酸普鲁卡因、链霉素、四环素、维生素类等等，都不可与两性霉素B合用。不可用生理盐水稀释，因为会产生沉淀。静滴时，药剂需避光，否则可逐渐引起降效。为减少不良反应如发热、静脉炎等，可以同时静滴氢化可的松或地塞米松，也可在滴注前半小时给予消炎痛或抗组织胺药。注意必需在用本药前半小时给予抗组织胺药。