个独立委员会拟定新州旗方案，2001年4月17日面向全州公民进行更换州旗公投。新方案将左上角的联盟国战旗更换为蓝底上的20颗星，外圈13颗星代表十三州殖民地，内圈6颗星表示曾拥有密西西比地区主权的六个国家（不同的印第安人视为一个国家、法国、西班牙、英国、美国和美利坚联盟国），中间的大星表示密西西比州。20颗星还表示密西西比州是第二十个加入美国的州份。但是这面新旗在公投中以35：65的比例落选，原旗得以继续使用。
2020年换旗.2020年，一名非裔美国人乔治弗洛伊德在警方执法中丧生