一些罕见的病例中，缬草会造成过敏反应，如皮疹、荨麻疹甚至是唿吸困难。缬草的镇静剂作用会导致头昏及嗜睡，因此在驾驶和操纵重型危险设备前要慎用此类药物。缬草三酯是一种潜在的诱变剂，因此缬草只应遵医嘱服用。嗜睡、步行障碍、低体温症、肌无力、痉挛、疲劳、头痛、心悸、麻痹、肝功能障碍、成瘾，这些均是医疗报告中曾见到的症状，但这些情况在大部分报告中都很少出现。大剂量（大于500毫克）服用会导致胃痛、反应迟缓或轻度抑郁。而在一些特例中，缬草亦会导致头痛甚至夜惊。在大多数标准药物筛选中，都要检验个体是否对缬草提取物