疾病主要的研究领域，因此诊所不会筛检这些疾病，其中有些疾病已确定会透过性行为传播。以下是一些病原体，㑹借由性行为而传染疾病：
病理生理学.许多性传染疾病很容易由阴茎、阴户、直肠、泌尿道的黏膜进入体内，有些性传染疾病也可能经由口腔、喉咙、唿吸道及眼睛的黏膜入侵人体。像龟头上的组织也是黏膜组织，只是不会分泌黏液而已（类似嘴唇的构造）。黏膜和皮肤不同，黏膜会让一些致病源进入人体。会造成感染的接触次数视病原体而不同，不过即使是患病者的载液（精液或阴部分泌物）和黏膜的轻微接触都有可能造成