崎一揆及九户政实之乱。天正20年（1592年），获赐丰臣姓。文禄2年（1593年），因朝鲜出兵的功绩，获封甲斐国府中21万5千石，成为甲府城主。秀吉死后，庆长4年（1599年），由于被德川家康暗杀事件的影响，成为了嫌疑者，将家督让给幸长而在武藏国隐居。在关原之战协助家康三男德川秀忠，由中山道进军。幸长担任东军先锋并攻陷岐阜城，于关原之战活跃。战后，幸长因功绩获加封纪伊国和歌山37万石。长政自身于江户幕府成立后，担任家康近侍，庆长10年（1605年）移居江户。后来自幸长领地的常陆国真璧领有五万石隐