，3%的肺炎分枝桿菌，其他的还有金黄色葡萄球菌、、嗜肺军团菌及革兰氏阴性桿菌。上述病菌中有许多已出现有耐药性的菌种，例如耐药肺炎链球菌（DRSP）及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。当有一些容易造成肺炎的危险因子时，细菌就有可在生物体传播的途径。酗酒和肺炎链球菌、厌氧生物及肺炎分枝桿菌的感染有关，抽烟则容易造成肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌和嗜肺军团菌的感染，接触鸟类和有关，农场动物和有关，将胃中内容物误吸到肺部容易造成厌氧生物感染，囊肿性纤维化和绿脓桿菌及金黄色葡萄球菌有关。冬天较容易有肺炎