年–1932年之间除了任团长之外他的职责还包括训练军官。1933年7月31日他再次被晋升为上校。随后在1936年之前先后又被晋升为准将和空军省级指挥官。在那时，航空学上的一大难题是坏天气，因此，雅努塞克又开始在布拉格查理大学学习气象学和地球物理学。苏台德事件期间，捷克斯洛伐克于5月21日开始局部动员，并于9月23日完成这次动员。雅努塞克在这次事件期间指挥将军的第一军的空中武装，负责西南起捷克布杰约维采，北至克拉利基的前线。但在9月29日，法国和英国与德国签署了慕尼黑协定，迫使捷克斯洛伐克割让了苏台德地区。