民国教育部公布《学校系统令》，确定了包括大学、中学、小学及专科学校等在内的学校制度。随后，教育部陆续公布了《专门学校令》、《公立私立专门学校规程》、《医学专门学校规程令》、《药学专门学校规程令》，1913年1月公布了《大学规程》等。以上制度后来统称“壬子癸丑学制”。在医科上，大学及专门学校未设与中医有关的课目，中医未能被纳入教育体系中。中医药界对此提出抗议。教育部在回复各中医团体的电文中称：“部颁医药专门学校规程，系由临时教育会议，参照中西，择善详订，决非有所歧视。至中医中药专校，既为部令所无，所请立案之处