主要类群，从演化关系上来看，四足动物演化自肉鳍鱼总纲扇鳍鱼纲中的四足形亚纲，为了表示生物演化关系，非鱼类的四足动物也列入表中作参考：另外，棘鱼纲是并系群已撤销。一些古生物学家认为牙形石是嵴索动物，且将其视为原始的鱼类。有关更完整的分类法，请参见嵴椎动物。鱼类的物种数量在已知的嵴椎动物中佔了一半以上，现知有约三万两千个现存物种，其中有约三万一千个是硬骨鱼，其余的还有九百七十种左右的软骨鱼和大概108种的盲鳗与七鳃鳗。三分之一的鱼类物种包含在九个科内，由大至小，分别为鲤科、虾虎鱼科、慈鲷科、脂鲤科、