邓本元（），福建福州人。汉族。1987年1月参加工作，中共党员。上海交通大学工业管理工程专业毕业。1987年1月从上海交通大学毕业后，先后在福建省经济研究中心、省台办、省政府办公厅、省委办公厅、省委政策研究室工作，1995年7月任正处级职务。1998年4月，任中共福建省委办公厅副主任、厅务会议成员（其间：1998年11月至12月在福建省委党校地厅级干部进修班学习；2002年3月至7月在中央党校进修二班学习；1995年7月至2000年12月为陈明义秘书）。2003年12月，任中共福建省委副秘书长、厅务会议