进了弗兰克·里贝里。新的引援成功奏效，他们再次获得了2008年的双冠王，并从联赛开始起就一直占据榜首位置直至赛季结束。这一赛季结束后，为拜仁镇守多年的守门员奥利弗·卡恩正式退役，这使得俱乐部在未来几年内都缺乏一名顶级门将。希斯费尔德也宣告退役，尤尔根·克林斯曼成为他的继任者，与拜仁签订了一份为期两年的合约。然而，克林斯曼甚至未能熬过首个赛季，这是源于拜仁在2008-09赛季首先迎来了一个糟糕的开局，先是在德国超级杯以1:2不敌多特蒙德，又在前6轮联赛中只胜2场，继而在德国杯八强被勒沃库森淘汰。欧洲冠军联