和查理五世之女胡安娜的独子。因为他的父亲在他出生前两周早逝，所以他成为葡萄牙王位的继任人，他于三年后继承王位。当他还是婴儿的时候，由属于西班牙哈布斯堡王朝的祖母卡特林娜摄政，1562年以后，由叔祖埃武拉公爵红衣主教恩里克摄政。这段时期，葡萄牙帝国扩展至安哥拉、莫桑比克、马六甲及澳门。他童年时受到耶稣会的深厚影响，是个神秘主义者，且曾经试过长时间的打猎及守斋。他身体上和精神上都患有疾病，很少过问政事，整日沉湎于占领和扩张基督教的梦幻zh-hans:里; zh-hant:里;。他相信自己会成为一个以耶稣