在隶属轮船招商局（今阳明海运）、载运香蕉至日本的5,000吨货轮「天山轮」的货舱里，从基隆秘密偷渡到日本神户。1952年5月19日，史明搭乘的「天山轮」驶抵神户港。尽管顺利逃离台湾，但史明从神户登陆上岸不久，就遭巡逻的日本警察逮捕，并被日本政府以「非法入境」罪名拘留数月。由于被日本政府拘留，就意味着有可能会被遣返回台湾，招致中国国民党的杀身之祸，这导致他预藏剃刀准备自杀。不过从1952年起，台湾警备总司令部以「叛乱第一司令」的罪名，向海内外全面通缉史明，要求日本引渡其返回台湾，这也是他第一次被中国国民党