亚人中最受欢迎的宗教教派（11％是路德教派），正教会主要由的斯拉夫族裔（约佔45％）所信奉。根据塔尔图大学指出，不信教的爱沙尼亚人不一定是无神论者，新异教主义、佛教徒和印度教徒宣称自己是“不信教”的人。
历史.公元十三世纪，条顿骑士团把基督宗教传进了爱沙尼亚，在宗教改革前，爱沙尼亚地区主要教会为天主教。在宗教改革期间，变成主要教会。 在第二次世界大战之前，爱沙尼亚约有80％是新教基督徒，绝大多数属于路德教派，也有归正宗及其他新教教派。Robert T. Francoeur和Raym