为盐水溪、曾文溪淤积平原，近三百年来增加大量土地，平坦适合农作。地势平缓且有大小河川横亘；东侧有丘陵，属于阿里山山脉的尾段，有部分丘陵、山地分布。最高峰为大冻山（标高1,241公尺）。西侧临台湾海崃，有40余公里的海岸线。在历史上沿海地带曾有倒风内海、台江内海等潟湖，但多已陆化，2009年于当地设立以湿地保护为主的台江国家公园。绿覆率六都之中仅次于高雄，若相较两市地形及平原面积，山区不易到达之处，台南每人可分配绿地面积已超越世卫组织建议标准。
地貌.南瀛大地貌最彻底改变的当属清道光