家取得了独立，但是仍然面临很多的难题，尤其是面临国内的冲突或者分离问题。她唿吁亚洲和非洲的国家加强合作，面对国际种种制裁和限制的挑战，处理好各自国内的问题，重新崛起。梅加瓦蒂在其任内实现了总统全民直选，总统不再由印尼人民协商会议选出。2004年印度尼西亚总统选举秩序受欧美和国际组织的大批观察员表示充分肯定。但梅加瓦蒂在是次大选中未能当选，并在第二轮投票败于苏西洛领导的印尼民主党。而苏西洛则感谢梅加瓦蒂为奠定印尼民主选举制度的良好基础所作的贡献。2009年的总统大选梅加瓦蒂再次竞选总统但失败。