物体的代谢物组可以作为其表型的优良探针（即其基因型及其环境的产物）。可以使用许多不同的技术包括核磁共振波谱法（NMR）和质谱法（MS）来测量（识别，定量，或分类）代谢产物。大多数质谱（MS）方法必须连接到各种形式的液相色谱（LC），气相色谱（GC）或毛细管电泳（CE）以促进化合物分离。每种方法通常能够一次识别或表征50-5000种不同的代谢物或代谢物“特征”，这取决于所使用的仪器或方案。参见图2，了解不同分析方法与其灵敏度之间的关系。目前，不可能通过单一的分析方法分析代谢物组的整个范围。与基因组甚至蛋白