随京芜铁路建成通车，营运初期站内只有1间面积48平方米的站房和1条股道，为四等站。至1949年，车站设有面积648平方米的站房和2条股道。1951年，马鞍山站更名为金家庄站，并于1953年升格为三等站，1958年10月改回原名马鞍山站。1957年马鞍山钢铁厂投用后，车站开始大规模扩建。1959年8月车站升级为二等站。1960年5月，车站建成北运转场，同时由本站通往马钢的马向支线开始运营。该支线于1964年移交给马钢。1970年5月，车站新站房投入使用。之后车站一直没有举行过任何大规模扩建工程。2016年