为是脱文而实际无字29个，共解决了180字，从而使好太王碑的研究有了巨大突破。近年来各国史学界围绕着该碑文产生了一些争议，重点在「而倭以辛卯年来渡海（或作「每」)破百残，□□新罗以为臣民。」一句（缺字可能是「任那」或「又破」等字）。因为这段话似乎指出倭国曾击破百济，并使新罗服属；而辛卯年征韩之事，恰好符合《日本书纪》神功皇后「远征三韩」的纪录。不过《日本书纪》是一部可信性有限的典籍。朝鲜半岛的朴时亨、李进熙认为日本在391年不具备征服百济和新罗的能力。也认为，在颂扬高句丽国王的石碑上记录倭的功绩是不合常