时期的吴国首次设立遂昌县县制。公元239年，更名为平昌县。晋武帝太康元年（公元280年），平昌县又更名遂昌县。据清朝光绪年编的《遂昌县志》记载，东汉末年的遂昌县包含了清朝时的遂昌县，以及龙泉县、庆元县、金华县的部分地方。明代着名的文学家、戏剧家汤显祖曾于此担任五年县令。
2016年遂昌苏村山体滑坡.2016年9月28日傍晚，受台风鲇鱼影响，遂昌县北界镇苏村发生山体滑坡灾害。截至10月1日上午8时统计，灾害已造成8人遇难，仍有19人失联。
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