997年香港回归前，河流南岸即属原英属香港之管辖范围，香港回归后中心线以北划归深圳市管辖。罗湖桥和福田口岸边境大楼等等均横跨于深圳河之上。此外，港深边界还有与之相连的沙头角河以及中英街。深圳河史称明溪，自1898年《展拓香港界址专条》起改为现称，作为英国租借香港新界地区99年时期界限之界河，同时也是香港最长的河流。冷战时期，曾有大批内地居民经由深圳河逃港，因此也被喻为「中国柏林墙」，是共产主义地区人民逃往资本主义地区「投奔自由」的世界史中之一部份。
地理.深圳河通常是指沙湾河与