1936年5月，焦作工学院调整系科，采矿冶金系分为采矿系、冶金系，土木工程系分为路工系、水利系。 1937年10月，抗日战争爆发，学院西迁陕西。 1938年7月，教育部决定将焦作工学院与北平大学工学院、北洋工学院、东北大学工学院合组成立国立西北工学院。1946年8月，抗日战争胜利后，焦作工学院在河南洛阳关林暂行复校。1949年9月，焦作工学院迁回焦作，更名为国立焦作工学院。
共和国时期.1950年1月，焦作工学院划归中央人民政府燃料工业部领导。 1950年3月，