指挥官（，缩写为CO），在军队编制中，拥有指挥权的军官。现代军队中，指挥官受到军法的拘束，他必需肩负对这个组织的责任，负责其部属的安危。但在这个编制中，他拥有最高的决定权，能够对其部属下达命令，要求他们执行。他对于拒绝执行命令或是执行不力的部下，通常也拥有处罚的权力。领导大型军事组织的指挥官称为司令。在美国通常一个连的队长、连长就可称为指挥官，在英国、加拿大和澳大利亚就是团营级别，大约是中校（Lieutenant colonel）或称为the Colonel。在中华民国通常是指有统帅部队权及命令指挥权的部队