共有310,746人感染，死亡31人。1988整年发病352,048例，其中市区310,746例。
影响.这场疫情使上海市政府开始重视突发传染病疫情的防控，并逐步建立了传染病的防控应急预警机制，另一方面，这次严重的甲肝流行也使上海人意识到生吃毛蚶的巨大风险，逐步改善了饮食和卫生习惯，在2003年非典期间，上海并未发生严重疫情。上海自禁售毛蚶起，至今未再次允许售卖，部分老字号的醉蚶也受到波及。