，开都河源区降水量是开都河径流量的主要补给水源；博斯腾湖水位变化受气候和人类活动影响，气候通过调节温度和降水量来改变径流量间接影响水位变化，人类活动主要通过土地开垦、跨流域引水和下游水量分配来影响水位。博斯腾湖的主要补给水源是开都河，同时，博斯腾湖又是孔雀河的源头。湖区周围生长着广茂的芦苇，是中国重要的芦苇生产基地。此外博斯腾湖盛产各种淡水鱼，是新疆最大的渔业生产基地。博斯腾湖水域面积曾一度超过1200平方公里。21世纪初，因为各种原因，不少水域已消失或正在消失。到2010年代初已缩小至800多平方公里。