一班运送犹太人囚犯的列车，后者在被送往一处森林后全数遭到枪决。在随后的几天，特劳恩施泰因周边再有大量的桥梁被炸。爆炸迫使特劳恩施泰因的守军投降，并交出城市的守备权。萨尔茨堡也在5月4日和平移交政权。在战事于1945年5月完全结束后，线路的大部分路段仅具备单线运行的能力。其中包括在罗森海姆车站、在于伯塞－特劳恩施泰因－劳特区间、在泰森多夫车站、在弗赖拉辛车站以及在弗赖拉辛－萨尔茨堡区间均只能以单线通行。1945年5月18日，美国军队的首班列车再度上线运行，该铁路成为了一条重要的军事补给线。至1949年，线路的