总司令黄镇球为国防部参谋本部参谋次长；原任参谋次长郭忏为联合勤务总部总司令。1949年8月30日，联勤总部奉命裁撤。1949年，在台湾担任东南军政长官公署副长官兼舟山指挥所主任。舟山登步岛之役发生时，郭忏为舟山国军最高长官，督导实际负责指挥的舟山防卫司令石觉进行反攻，成功击退来攻解放军。1950年3月调任战略顾问闲职。郭将军生前最高军阶为中将，死后追加为上将。曾获颁青天白日勋章。
逝世.四个月后（1950年7月31日），因脑溢血骤逝于台北，葬于台北县淡水。1950年8月