海洋委员会海巡署组织法》。2016年1月8日，行政院公告，《海洋委员会组织法》及《海洋委员会海巡署组织法》于同年7月4日开始施行；惟同年3月21日立法院通过临时提案暂缓施行《海洋委员会组织法》，6月30日行政院公告暂缓施行。2018年4月28日，海洋委员会成立后，海巡署调整为该会所属机关并更名为海洋委员会海巡署，依《海洋委员会海巡署组织法》规定署长由海洋委员会副主任委员兼任。
历任首长.
副署长.2018年4月28日组织调整前，海巡署编制人员的最高阶职务分