中学以及部分文理教师和海洋、水产和地矿三系留继续在青岛，形成同一所大学包含山东大学济南校区和山东大学青岛校区的办学局面。
海洋大学时期（1958年至今）.1959年－1960年，山东大学（青岛）在已有学科基础上，整合厦门大学、复旦大学等国内其余海洋科研力量，更名为山东海洋学院，仍为中央直属高校，成为中国海洋科研领域中一所综合性的最高学府。1960年10月被中共中央正式确定为全国13所重点综合大学之一。1988年更名为青岛海洋大学，校名为邓小平题写。2002年10月经国家教育部批准更