替魏成名，任澎湖水师协副将。翌年升任浙江定海镇总兵，之后累功晋升至浙江提督、福建水师提督、总统闽浙两省水师。嘉庆十二年（1807年），在与海盗蔡牵之船战中咽喉中弹阵亡。谥忠毅。三等壮烈伯。
着作.李长庚工诗，有《虞渊集》。《晚晴簃诗滙》收其诗作。另有《水战纪略》、《李忠毅公遗诗》、《李忠毅公诗集》。