始组建潜艇部队，1904年（明治37年），日本海军从通用动力电船公司购买的五艘潜水艇运抵横须贺海军工厂，次年年底组装完毕并投入使用。1904年（明治37年）2月8日，酝酿已久的日俄战争正式爆发。1905年（明治38年）5月，在日本海海战中海军大将东乡平八郎的旗舰三笠号率领着日本海军几乎全灭俄罗斯海军第二太平洋舰队。俄国海军38艘派往远东的军舰中有21艘被击沉，7艘被捕获，6艘被解除武装，4545名官兵战死，6106人被俘。日本海军则只损失三艘鱼雷艇和116人。日本海军之后在“复制·改进·创新”的政策