任中共中央华东局书记处书记。1958年起兼任上海市政协主席。1965年11月至1967年1月任中共上海市委第一书记兼上海警备区第一政委。1966年4月至12月31日因罹患鼻癌治疗休养，由曹荻秋代理第一书记。文化大革命爆发后，1967年1月在上海市“一月风暴”中被夺权，此后被长期关押，隔离审查。1974年9月9日，陈丕显致信毛泽东，希望获得从宽处理，分配工作，或者先解除隔离并参加集体学习，听候党的继续审查和处理。同年9月17日，毛泽东对该信作批示：“洪文同志：此人如何处理，请在政治局一议为盼！毛泽东七