专利权问题，Red Hat Linux不包含很多的功能。例如Rhythmbox和XMMS中的MP3支持被Red Hat方面移除了，并推荐用户使用没有版权问题的Ogg Vorbis取而代之，但用户可以自行安装MP3的支持。Red Hat Linux亦缺少NTFS的支持，不过有需要的用户亦可自行安装。
台湾抵制.2002年在台湾出现自由软体用户抵制Red Hat Linux的活动。自于Red Hat Linux 8.0版开始，Red Hat Linux的国家列表中，将原本的「台湾」改称