三分之一的人会有幻肢。然而，这项研究忽略了单纯截肢及性别重置手术之间的差异。截肢时连接阴茎和大脑的神经会被切断，而性别重置手术中一些阴茎和阴囊可以再次使用以产生阴道腔，阴唇和阴蒂。在这种情况下，生殖器连接到大脑的神经会有一些保持完整的功能。三分之二的跨性别男性报告了从童年开始幻想阴茎的感觉，浮现出勃起和其他现象。
产前雄激素暴露.产前缺乏雄激素的接触或缺乏或对产前雄激素敏感性是通常被引用来解释以下的发现。为了验证这一点，研究检查了跨性别者和顺性别者的指长比（一种普遍接受的产前雄激素