球予队友马里奥·格策令他替拜仁首开纪录。曼祖基奇在法定时间完结前1分钟打进一球从而协助拜仁在主场大胜对手5:0。2014年2月12日，曼祖基奇在德国盃半准决赛作客汉堡的比赛中做出他在这个赛季的第一个帽子戏法，协助拜仁以5:0大胜对手。随后曼祖基奇在对阵汉诺威的比赛中接应队友zh-hans:拉菲尼亚;zh-hk:拉芬拿;zh-tw:拉菲尼亚;的传球打进自己在德甲联赛的第100个进球。虽然曼祖基奇在这个赛季以26球进球成为拜仁阵中最佳射手，但他仍然在2014年德国盃决赛被主教练瓜迪奥拉剔出18人大名单。