进士出身。
生平.冯元飇于天启元年（1621年）中举人。天启二年（1622年）登壬戌科进士。担任澄海知县。天启六年（1626年）任广东揭阳县知县，政绩卓然。崇祯四年（1631年）升任户科给事中，有直声。先后仕礼科右给事中、太常寺少卿、南京太仆寺卿、通政使，崇祯十五年（1642年）擢兵部右侍郎，崇祯帝对他倚重，崇祯十六年（1643年）五月，晋升为兵部尚书。冯元飙并为东林党健将。多智谋，喜弄权术，与兄冯元飏好结纳，并称“二冯”。出任兵部尚书前，冯已是重病在身；任上李自成起义，明朝已风雨