少数派伊斯兰教徒之间的对立日益激化，特别是以穆罕默德·阿里·真纳为领导者的全印穆斯林联盟在1940年的拉合尔决议上鼓吹「二民族论」，强烈主张印度教徒和伊斯兰教徒的分离。一些历史学家则认为，真纳是以独立作为要挟，换取西部穆斯林较多的省份获得更多的自治权。圣雄甘地强烈反对这些分离思想，提倡实现统一印度。印度国民大会党也出于政教分离和世俗主义的立场而对因宗教的分离表示谨慎，印度共产党和印度民族主义者虽然也有各自的反应，但都未能阻止分裂的大势。
分割的确定.英国在当时规划了由印度教徒较多的