吉水神社（），是位于日本奈良县吉野郡吉野町吉野山的神社，旧社格为村社。已列入世界遗产「纪伊山地的圣地及朝圣路」之一部分。「吉」的正确字型为「」（上土下口）。原本为金峯山寺的僧房——吉水院（きっすいいん），明治维新时期因神佛分离（废佛毁释）影响，改为神社。主祭后醍醐天皇，配祀南朝的忠臣楠木正成与吉水院宗信法印。
概要.吉水神社，相传为白凤年间（8世纪后期）由役行者小角所创建的吉水院。南北朝时代，后醍醐天皇出逃到吉野，受到宗信法印的援护，于吉水院建立行宫为暂时的居所。后醍醐天皇驾崩