任团中央第一书记。由于中共中央总书记习近平批评共青团组织脱离群众，“高位截瘫”，中央巡视组批评共青团存在“机关化、行政化、贵族化、娱乐化”等问题。2016年8月，中共中央办公厅发布《共青团中央改革方案》，开始对共青团进行全面改革，改革试点首先在上海和重庆展开。秦宜智表示：共青团改革最核心的一点就是要解决共青团脱离青年的问题，“比如团代会、委员会、常委会等共青团的领导机构，要有更多基层代表，使我们的领导机构能够更接地气。比如在部门设置上，我们新设立了社会联络部，这个部门的主要职能就是联系一些新兴领域的青年