南荣获年度男子最佳新人奖。翌年，他在多哈亚运中与搭档刘天佑和李杰赢得了男子团体气步枪金牌，也是多哈亚运会的首枚金牌。同年4月，在世界盃美国站，他在10米气步枪项目上折桂。2007年4月，在世界盃美国站10米气步枪比赛中再次夺冠。随后在同年10月的武汉六城会中以703.7环的成绩打破男子10米气步枪的总成绩世界纪录，为温州夺得一枚金牌。在2008年北京奥运会10米气步枪比赛中，朱启南以总分699.7环获得银牌。他以597环资格赛第二的成绩晋级决赛。在决赛中，朱启南9发后落后于芬兰射手亨利·海基宁和印度