被划入港口要塞之范围，英国因此放弃打狗领事建物的使用权。1925年，由日人接收使用，领事馆改作为高雄水产试验所，领事官邸改作高雄海洋观测所。日治时期结束后又逢多次风灾，处处断垣残壁。直至1985年后「打狗英国领事馆官邸」方才开始进行修复。1987年中华民国内政部公告打狗英国领事馆（实为打狗英国领事馆官邸）为直辖市定古蹟。由于政权及产权的多次转移以及资料的误用，数十年来，山丘下码头边的领事馆建筑物一直未被重视，而山丘上的领事官邸建筑物，却长期被误认为英国领事馆。经考据后，发现至少在19世纪末期，领事馆位置