屈服，他集结来自阿波的细川氏部队，在重臣三好之长辅佐下誓要夺回京都而积极展开反攻。经历一系列战斗，例如如意岳之战、芦屋河源合战、深井城合战，细川高国和大内义兴在近畿地区战败而暂时撤退到京都西部的丹波。1510年8月14日，细川澄元手中的皇牌----将军足利义澄突然死去，为大内义兴和细川高国一方创造了机会。8月23日，双方在船冈山展开决战，是为船冈山之战，大内义兴、细川高国联军击破细川澄元军，重夺京都。此刻大内氏和义兴本人可说达致事业上的巅峰。1512年获得从三位晋身公卿行列。大内义兴亦把自己的女儿嫁给足