本土有很大不同，在有文献记录之前可以分为旧石器时代和贝冢时代两个时代。沖绳县内最早的人类活动遗迹是距今3万2000年前的山下洞人和1万8000年前的港川人。2012年，在沖绳县南城市发现了世界最古老的钓钩。贝冢时代在时间上相当于日本本土的绳文时代至平安时代，和旧石器时代之间有约一万年的空白时期。贝冢时代初期，琉球群岛南部的土器和日本本土的绳文土器极为相似。但在贝冢时代中期，沖绳的土器开始带有较强的独自特征。至贝冢时代后期时，沖绳的土器再次受到九州的强烈影响。在贝冢时代后期，海岸地区开始出现大型遗迹，并且