，李汝祺为了解国际上将种群遗传学和数理统计结合起来进行研究的最新成就和方法，以客籍教授身份赴英国伦敦大学约翰·伯顿·桑德森·霍尔丹的实验室工作。1949年夏回到北京。此后一直在北京大学的动物系和以后的生物系任教授。1950年代前期，因李汝祺不认同李森科学派的学说，他曾一度被停止遗传学教学和科研。1956年青岛遗传学座谈会召开后，李汝祺及其学生在北京大学生物系下创建细胞学及遗传学专业，李本人任细胞学及遗传学教研室主任，研究领域包括小鼠发生遗传学、摇蚊胚胎发育与基因表达、原核生物遗传学、细胞超微结构、细胞离