原有的木如寺便被称为“木如宁巴”，意思是“旧木如”，这是相对新的木如寺而称。新建的这座木如寺是藏传佛教格鲁派寺院。木如寺建成后，起初木如宁巴是主寺，木如寺为其分寺；木如寺扩建后，木如寺成为主寺，木如宁巴变为其分寺。到21世纪初，木如宁巴由乃琼寺、贡嘎曲德寺、木如寺三家共同管理。木如宁巴有政府颁发的一个寺庙许可证，上写：“（山南地区）贡嘎（县）曲德寺所属木如宁巴护法神殿，地址：拉萨市大昭寺东9号，负责人朗真。”1959年之后，木如寺由西藏自治区话剧团使用。后来，该话剧团在其他地方兴建了房子，便搬出木如