金门气象站隶属于交通部中央气象局，位于金门岛西南角，邻近水头社区，与茅山塔比肩而立。
气象观测历史沿革.民国43年(1954年)，未改善金门岛上的农业劳动情况，金门地区成立农业试验所，而当时农试所内每8小时观测一次的气象资料，为金门地区最早有系统的气象观测资料。由于当时金门岛为军管时期，气象为重要军事情资，相关的资讯都受到严格的管控。一直到民国81年（1992年），国防部宣布金门县解除戒严，气象局才开始着手规划金门地区一连串的气象观测改善作业。民国84年(1995年)，中央气象