元继出征，还未出兵时，泾阳又遭到攻击，元仲冏因此出任使持节、都督泾州诸军事、右将军、泾州刺史，后改任平西将军、银青光禄大夫、署理安西将军、使持节为征讨都督，莫折天生被击败后北逃。朝廷认为秦川地区民心未定，因此任命元仲冏担任使持节、都督秦州诸军事、本将军、秦州刺史、署理镇西将军都督。孝昌三年（527年）正月，北魏由于兵将疲惫，萧宝夤和元恒芝在泾州大败，大陇都督元仲冏和小陇都督高聿接连退散。萧宝夤阴谋反叛北魏，元仲冏和封伟伯察觉之后，暗中与关中豪强韦子粲等人商量起兵讨伐他，计划败露，孝昌三年十月廿日（527年1