就认定，穆兄会是“首要敌人”。2011年，在阿拉伯之春期间，卡塔尔支持抗议者革命，包括穆斯林兄弟会。相比之下，沙特阿拉伯则支持穆巴拉克，目前支持塞西。2013年，埃及军方政变，终止穆兄会的民选政府。卡塔尔被指支持恐怖主义。一些国家指责卡塔尔资助包括基地组织在叙利亚的分支机构努斯拉阵线,尽管其他阿拉伯国家也做出类似举动。卡塔尔和沙特阿拉伯也都参与了中情局牵头的代号Timber Sycamore的秘密行动，以训练和武装叙利亚反叛份子。阿富汗塔利班和哈马斯的官员藏身于卡塔尔。卡塔尔辩称此举只是为了在地区冲