上重新进行编制时，松原担任第四队队长与柔术师傅。但松原却在同年9月1日去世，新选组记载他是因病而死，但松原之死的原因却众说纷纭，当时最主要的论调是松原斩杀了某位浪士，并爱上这位浪士的遗孀。后来副长土方岁三严厉谴责他，让身为干部的松原感到自责，因此举刀切腹，后来被篠原泰之进发现而及时救回。但因为松原自暴自弃，导致伤口恶化而逝世，也有一说是被枪杀。但为爱而自杀的说法是八木为三郎从篠原泰之进以及斋藤一那边听到关于松原的事情，并由子母泽宽重新编制而成、另外子母泽的作品以及八木的谈话很多都是创作、因此这个故事也被