新四军军部成立后，李志高跟随项英与赖传珠、李子芳、胡立教等一起抵汉口，筹建新四军军部。以后担任军部侦察科长和作战科长。1941年“皖南事变”中，突围成功后，他与第二支队参谋长谢忠良等新四军干部七八十人分别在皖南坚持数月，4月中旬北渡过江到无为县，与曾希圣的第七师会合，并担任七师参谋长。
冤死.据《回顾新四军军部》一书记载，李志高、谢忠良二人自皖北突围后，曾给刘少奇写过一份关于副军长项英与参谋长周子昆遇害的真实报告，详细汇报了二人被叛徒刘厚总杀害的经过。但是盐城军部根据突围干部中