上海迎接章炳麟出狱并到日本接任《民报》的主编。1905年7月19日孙中山到横滨后，时功玖等留学生自东京到横滨和孙中山见面，并和刘成禺、李书城、冯自由等八人在竹枝园宴请孙中山。时功玖还和刘成禺、李书城等加入了兴中会。1905年7月30日，时功玖经冯自由通知，参加了中国同盟会筹备会。8月20日，时功玖作为湖北代表参加了中国同盟会成立会，并担任中国同盟会湖北分会会长（湖北省区主盟人）。辛亥革命爆发后，时功玖成为南京临时参议院议员。1912年1月16日，时功玖和刘成禺、孙武等人在上海创办民社及其机关报