府以完善西藏行政为借口，制定《二十九条章程》，要求以“金瓶掣签”认定达赖喇嘛、班禅喇嘛和其他唿图克图的转世。。后来认证方式即众人使用至今的金瓶掣签。蒙古活佛哲布尊丹巴，章嘉活佛须经在北京的金瓶掣签决定，达赖和班禅的金瓶掣签使用在拉萨的金瓶举行。因为夏玛巴参与反对清朝政府，噶玛噶举派传承被废除，因此在《钦定藏内善后章程》未规定噶玛噶举派的祖古噶玛巴要参与金瓶掣签。清朝政府随后对于转世传承多所限制，出现多位被禁止转世的活佛，如准噶尔的喇嘛与噶举派活佛夏玛巴，因为曾经反对清朝统治，都被禁止转世；所有转世都必须