瓶猪笼草在形态特征和生活习性都非常的相似。它们同域分布于潘丘卢保山。此外，菱茎猪笼草还表现出与婆罗洲特有的刚毛猪笼草较为近似。2001年，查尔斯·克拉克对产自苏门答腊及西马来西亚的猪笼草进行了分支系统学分析，利共用了70个形态特征。但菱茎猪笼草与本斯通猪笼草一起还未确定到底是归入山地分支还是高贵分支。
自然杂交种.至少已发现了4种关于菱茎猪笼草的自然杂交种，其中至少有三种自然杂交种的亲本（除菱茎猪笼草外）存在于潘丘卢保山。