至宣统元年(1909年)停办，前后毕业生共100名。抗日战争中，长门炮台参加对日作战，屡遭日军轰炸。1941年4月，日军占领炮台后，运走火炮，炸塌炮台，烧毁营房。
现状.1991年4月17日，福建省人民政府公布第三批福建省文物保护单位，长门炮台作为近现代重要史迹及代表性建筑位列其中。福州市人民政府也将长门炮台作为爱国主义教育基地、青少年德育基地。尽管位列福建省文物保护单位，但是长门炮台由于缺乏维护修缮，有大量的人为破坏，严重影响其原有风貌。