京大旱，丘处机为百姓设醮祈雨，天马上就下雨，被誉作“神仙雨”。1227年农历五月二十五日，王志明自秦州前来传成吉思汗圣旨，圣旨中将天长观改名长春宫（今北京白云观），北宫仙岛为万安宫，并赐「金虎牌」，以“道家事一切仰『神仙』处置”，即诏命丘处机掌管天下道教。诏书中还提到“朕常念神仙，神仙毋忘朕也。”，显示成吉思汗对丘处机的礼遇极高。元太祖二十二年农历七月初九日（1227年8月22日），丘处机在长春宫宝玄堂羽化逝世，享龄80岁。在逝世一周年，他的弟子将他安葬在长春宫内的处顺堂。至元六年(1269年)，忽