在当天晚上，波尔布特等待被转移到另外一个地方的时候在床上死了。塔莫克宣称波尔布特死于心脏衰竭；但由于尸体指甲出现变色的情况，有人怀疑他死于服毒自杀或谋杀。曾经采访过波尔布特的记者纳特·塞耶也认为，波尔布特意识到塔莫克要把自己交给美国后，服用了致死剂量的地西泮和氯喹，最终导致了死亡。有亚洲外交官认为，波尔布特若被红色高棉移交政府，将被送上国际法庭，那时他与金边、中国，甚至泰国时任领导人的关系就会彻底曝光，将令事情复杂化；若是杀死波尔布特灭口，这些问题将得到彻底解决。4月17日，波尔布特的死讯被泰国军方证实