电脑作为组装单元，运行Linux或BSD系统。各个单元之间通过小型TCP/IP局域网和有关的程序库来分配计算任务和通信。常用的并行程序库包括MPI和PVM。
操作系统.最初的贝奥武夫使用Linux，后来扩展到包括Microsoft Windows的很多操作系统。目前有一些Linux发行版及BSD发行版是专为计算机集群设计的，包括：