018年改为现名。俱乐部的前身丽江嘉云昊创建于2012年，为昆明敏建机电设备有限公司、丽江翥春拆迁公司筹资所建，2013年3月完成组队，牛洪利是俱乐部的首任主教练。2013年中国足球乙级联赛中，球队首次参赛中乙就打入南区前四，晋级季后淘汰赛。2016赛季，丽江再次打入淘汰赛。在准决赛中点球大战淘汰四川安纳普尔那并在决赛2比0击败保定容大夺冠，冲甲成功。2017年1月23日更名为云南丽江足球俱乐部。2017年10月21日，云南丽江在主场0-1输给了大连一方而提早一轮降级至中乙联赛。2018