捕下吏部。恰逢当时尹旻被驱逐，佀钟与其为同乡，于是被贬为曲靖府知府，后改知徽州府，再入为大理寺左少卿。弘治三年（1490年）以右副都御史巡抚苏州、松江等地。召为户部侍郎，总督仓场。不久，改吏部侍郎。弘治十一年（1498年）升右都御史，两年后进户部尚书。因东厂特务举发其子佀瑞受贿之事，辞职回乡。正德年间，权阉刘瑾指摘其在部期间旧事，罚米三次。正德六年（1511年）卒。
轶事.有一回，佀钟与通政使强珍共同赴宴。强珍手拿酒壶劝酒，并对其说：“要你饮四盅。”佀钟则回说：“你莫要强斟。”