月台设于3楼，设有岛式月台1座，提供1线2面的配置，而位于11号月台外侧，另设有1条通过侧线，供不用靠站的特急列车通过使用，同样当2015年全废除特急列车后，侧线亦随之暂停使用。
车站周边.
东侧.东侧为十日町市的中心所在地。沿着商店街中心往东徒步5分可到达国道117号。
西侧.西侧多为住宅区。战前于信浓川对岸的千手町建造水力发电厂时，铁道省曾于十日町站分歧出支线搬运人员、设备。1954年发电厂二期工程完成后废除。