研究院天文及天文物理研究所筹备处担任博士后研究员，2000年前往中央大学天文研究所任教并曾任所长。
研究.黄崇源的研究主要是观测天文学。主要是以下电磁波段；
个人兴趣.黄崇源的个人兴趣有国际标准舞、太极拳和塔罗牌。