转押至迪化（今乌鲁木齐市）第二监狱。1943年，哈斯木江获得释放，但仍受盛世才当局监视。1944年从迪化回到伊宁以后，他参加了地下革命组织领导的游击队，成为“解放组织”领导成员之一。1944年三区革命爆发以后，他参与创建革命政权，获授上校军衔，出任三区革命南征军司令。1945年率南征军赴南疆参加领导武装斗争以及建设政权。南征军自阿克苏撤回以后，他在伊宁负责三区革命临时政府的文化、教育、卫生工作。1946年新疆省联合政府成立后，1946年6月，他任喀什专署副专员。1947年7月，中国国民党新疆当局镇压迪化