1月30日晋升海军大佐。因井上照顾患病家人要求在陆上任闲职，1930年任海军大学教官。1932年11月出任海军省军务局第一课课长。1933年3月，为扩大军令部权力的军令部条例及省部事务互涉规定改正案提出的时候，作为海军省代表的井上成美与军令部代表的南云忠一大佐（时任军令部第二科长）发生激烈冲突，南云还威胁要杀死他，但作为主管课长的井上坚持使该案不成立。当时自视为「亚洲第一」的日本朝野上下都弥漫着一股对外扩张的意识，但他却选择与米内光政、山本五十六交好，反对扩大侵华及与德国、意大利结为轴心国，被当时媒体称