国家太空中心需求，于探空一号火箭飞行测试完成后，原备份火箭提供大学作科学或工程研究载具。国立中央大学于1998年10月获国科会补助，与美国克莱门森大学（Clemson University）物理系合作发展TMA（Tri-Methyl Aluminum，三甲基铝）科学酬载，进行电离层E层，高度80至150公里范围内大气中性风场及乱流参数之量测。 探空二号火箭比探空一号火箭多装TMA酬载，并预定在飞行途中释放TMA。于2001年10月24日凌晨发射，发射后12秒，因第二节未能依照预设指令点火而失去上升推力，