德河贸易开始营运后，实际每年平均参观人数只有5万人，比起当初预估的还少，更者营运三年以来亏损1千多万元，平均一年损失2到300万元，使得业者不堪负荷，决定向水产试验所提前提出解除合约要求，后经由中华民国仲裁协会仲裁，认定德河贸易已尽力履行合约，然而因不敌经济环境改变，因此判定履约保证金500万元可交还给德河贸易，双方解除合约后，德河贸易营运直到同年10月31日才正式结束营运。在台东海生馆结束委外经营后，由东部海洋生物研究中心所託养之大型鱼类继续由该中心之研究人员饲养，其他部分非中心所有之爬虫类生物则由德