惟此定线忽略了香港仔居民的需要，故地铁于2004年提出修订方案，将南港岛线一分为二，并将拆出来的西段与当时建议的「西港岛线」（现称港岛线西延）合併，西段的终点站为西营盘，服务数码港至黄竹坑。东段仍称为南港岛线，终点站则延长到金钟，服务香港海洋公园至鸭脷洲。当时东段亦考虑加停跑马地及湾仔。
分段兴建方案.在2005年2月，地铁公司在详细考虑立法会议员及公众对南港岛线建议的意见后，完成分段兴建的可行性研究及将有关的分段兴建方案递交政府审议。「西港岛线」（现称港岛线西延）将会成为港岛