007年，获得连任后的阿兰·贝尔塞成功当选瑞士联邦院副主席，并于2008年至2009年间顺利成为该院主席。此外，贝尔塞亦是其中一位欧洲安全与合作组织议会成员。2011年12月14日，阿兰·贝尔塞在瑞士联邦院内的245票中以126张支持票成功当选瑞士联邦委员会委员，接替决定辞职的时任瑞士联邦委员会委员、瑞士联邦外交事务部部长兼瑞士社会民主党党员米舍利娜·卡尔米-雷伊，后来贝尔塞也接替改任瑞士联邦外交事务部部长的迪迪埃·布尔克哈尔特（Didier Burkhalter）从而担任瑞士联邦内务部部长。