高中时期，艾萨克先是主打后卫，但在长到6英尺10英寸（2.08米）之后，艾萨克的场上位置调到了内线，但仍然保留了外线技术。2015年，艾萨克进入，读了一年预科，期间在参加的所有比赛中，艾萨克场均能得到17.6分和10个篮板，在美国资讯上被评选为五星级，ESPN则将他排名在第12位。2016年，艾萨克参加了和。
大学生涯.
佛罗里达州立大学（2016−2017）.2016年，艾萨克进入佛罗里达州立大学。 2016–17赛季，乔纳森·艾萨克场均出场26.2