大家（本因坊家、安井家、井上家、林家）之首，以仕于织田信长、丰臣秀吉和德川家康的日海（本因坊算砂）为开祖的家系。「本因坊」之名是来自算砂担任住持的京都寂光寺的塔头。共世袭了二十一世，日本江户时代围棋名人共十位，本因坊家就有七位，足见其影响力，后来本因坊秀哉将此名捐出，做为头衔战名，是为本因坊战。