岛分为十一个联邦州及二个联邦直辖区吉隆坡和布城，常称为「西马」，北接泰国，南部隔着柔佛海崃，以新柔长堤和第二通道与新加坡连接；而东半部位于世界第三大岛婆罗洲的北部，分属沙巴和砂拉越两个联邦州及纳闽联邦直辖区，常被称为「东马」，南邻印度尼西亚的加里曼丹，而汶莱则与东马三面接壤。首都位于吉隆坡，是马来西亚人口中最密集和最繁荣的地区，联邦政府所在地则位于布城。马来西亚的地理位置接近赤道，其气候于亚洲热带型雨林气候，导致人口密度较低，而马来西亚半岛地区的人口密集度比婆罗洲地区高许多，也是首都和联邦政府所在地。截至2