曾文溪、高屏溪等及其水系都属于中央管辖河川，且灾害发生极快，中央政府仅做到灾害发生后的支援协助与动员救灾，是不足的。此外，依《》规定：「总统为避免国家或人民遭遇紧急危难或应付财政经济上重大变故，得经行政院会议之决议发布紧急命令，为必要之处置。」虽然立法院院长王金平、国民党立法院党团、部分县市首长、及在野之民进党等公开建议总统发佈更具行政弹性的紧急命令，但各界对此有不同意见。依《中华民国宪法》，总统身为中华民国三军统帅，是唯一有权就国内灾害指挥调动军队的人。行政院长、主管风灾的内政部、主管水灾的经济部