，再次转为地方官。同年九月，发生惠美押胜之乱，惠美押胜自宇治逃往近江国，向各地派遣使者调动兵马。淡海三船与正在近江国建造水库的造池使判官佐伯三野一起逮捕了惠美押胜的使者，支持孝谦上皇的活动。叛乱平定后，三船因功，自正五位上昇了三级，叙勋三等，任近江守。天平神护二年（766年），获赐功田20町。称德天皇（孝谦天皇重祚）在位期间，历任兵部大辅、侍从，天平神护二年（766年），任东山道巡察使。翌年解任，转太宰少贰。宝龟二年（771年）任刑部大辅。此后历任大学头、文章博士等，宝龟十一年（780年）叙从四位下