磡货场位置（现有C出入口车站大堂下方）的新车站部分（新「红磡站」）将供本地客运服务使用，较原有用地向东移。另外，来往中国大陆的城际客运服务（直通车）于1979年重新投入服务，城际客运服务列车在香港的总站即设于红磡站。城际客运服务一直延续至今，并遍及中国内地多个城市，目前包括广州、上海、北京等地。2020年1月28日，受2019冠状病毒病疫情影响，行政长官林郑月娥宣布将大幅缩减两地交通，由30日凌晨起暂停红磡站口岸服务，故自当日起本站的城际直通车服务全部暂停。
车站结构.Se