印尼统治东帝汶期间，葡萄牙语被遭到禁止，取而代之地，印尼语成为了政府、教育和公共贸易的官方语言，并在学校被列为必修课程。印尼官方的国家意识形态潘查希拉（即印尼建国五项原则）也被强加于东帝汶，且东帝汶政府的工作局限于确保潘查希拉在当地得以实行。东帝汶人泛灵论之信仰不符合印尼宪法中一神论的精神，因而导致许多东帝汶人皈依天主教。印尼神父替换了葡萄牙的神父，印尼语弥撒取代了拉丁语和葡萄牙语弥撒。在印尼入侵之前的东帝汶，少于三成的民众是天主教徒，而到二十世纪八十年代时，已有八成民众信仰天主教。如今，此数字增长至九成