台独联盟声势一度如日中天，但没多久就陷入分裂危机，内部存在「行动派」与「和平派」两派路线争执，事件后黄文雄与郑自财都离开台独联盟。后来黄文雄与郑自财弃保潜逃美国。郑自财前往瑞典寻求政治庇护，不过在1972年遭引渡回美国并被判刑5年，在服刑8个月后获得假释，先后定居于瑞典与加拿大，1991年偷渡回台湾；黄文雄则从此未曾露面，一直到1996年春季经过26年的流亡才偷渡回台湾公开露面。假如黄文雄当时没有参与刺蒋案，可能会是台湾第一位留美的社会学博士。黄文雄日后受访时表示：
回台湾推