括清理周围的空地，保证日常维护，并且通过修复地板和排水孔改进排水系统。第三阶段包括清理所有松动的石块，清扫塔身第一层围栏以下的部分，清理错乱的石块，修复主圆塔。工程总预算大约48,800荷兰盾。Theodor van Erp随后领导修复工程，遵照“原物归位”的原则于1907-1911年修复婆罗浮屠。前面的7个月，Van Erp的工程队挖掘佛塔周围的地面，以寻找丢失的佛像头颅和石板，随后分解和重建了塔顶的三层圆台和舍利塔。同时，Van Erp发现了其它一些修复佛塔的方法，并且提交了另一份预算34,600荷