SV法兰克福和帕德博恩07所取代，它们是2015-16赛季德乙积分垫底的两支球队。在积分榜末端，斯图加特踢球者、科特布斯和斯图加特二队被降入。三支降级球队的名额被的三支胜者所取代，其中雅恩雷根斯堡是从巴伐利亚地区联赛立即重返德丙；来自东北地区联赛的茨维考是时隔16年后重返第三级别；而来自西部地区联赛的洛特体育之友则是首次在德丙亮相。另一个德丙名额是通过两回合的德乙升、降级附加赛产生，对阵双方分别是上季德乙积分榜第16名的杜伊斯堡以及上季德丙积分榜第3名的维尔茨堡踢球者。最终德丙季军凭借总比分4比1击