指相对分子质量，但是字面上常与分子质量这一概念混淆。分子质量指分子的实际质量，而非比值。国际单位制中的单位为kg，但由于分子质量很小，所以常用道尔顿（Dalton，Da）或原子质量单位（u）或亚佛加厥常数（6.02）作为原子或分子质量的单位，大分子（如蛋白质）的分子质量通常使用kDa。例如二氧化硫（SO）的相对分子质量（分子量）为64.06，但分子质量为0.06406（kg/mol）÷亚佛加厥常数=1.06374×10kg=64.06 Da。为了便于区分这两者，分子量在中国大陆又称为“相对分子质量”