建设.6号线是深圳市政府确定的轨道交通融资改革试点线路。政府授权深圳市地铁三号线投资有限公司为项目发起人，通过一定的程序选择拥有丰富经验和雄厚实力的社会投资人，共同组建项目公司，负责6号线项目的建设、运营和相关资源的开发。2010年6月，三号线公司与港铁公司达成合作备忘录，就轨道交通6号线项目的推进正式展开深入合作。2011年4月，三号线公司被深圳市地铁集团有限公司兼并，相关事宜亦由深圳市地铁集团接手。招标公告已于2013年3月发布，预计总投资约168亿元。2014年，本线确定由深铁与港铁（深圳）合营公司