安徽巡抚衙门，于清代康熙元年（1662年）以操江军务（所部十二营）归并两江总督，专设安徽巡抚，裁撤操江巡抚。安徽巡抚驻地在安庆府（今安徽省安庆市）。康熙六年（1667年），江南分省后，安徽巡抚与安徽布政使司辖区一致，安徽省亦在此后成型。干隆时，亦或以安徽巡抚驻地称安庆省。
衙门驻地.衙门驻地最初在安庆府。咸丰三年（1853年），因太平军攻佔安庆，省会迁到庐州（今安徽省合肥市），巡抚衙门随迁。同治元年（1862年），巡抚衙门迁回安庆，直到清末。
机构设置.无