十三年（1595年）进士。初授南京礼部主事，进郎中，以亲老归养。起为南京吏部职方司郎中，淘汰老弱营军，每年省银二万。万历三十三年（1605年）京察，上疏抨击大学士沈一贯，留中不发。不久，神宗迁怒元珍等，除名。元珍罢归，以讲学为事。光宗即位，元珍起为光禄寺少卿，卒于官。《明史》有传。
着作.有《文诀》、《文衡》、《依庸絮语》、《三畏堂》、《素业湖畔》、《逸农遗稿》等。