剌子模在迦腻色伽死后率先独立，萨珊王朝及笈多王朝的兴起，使帝国领土不断缩小，最终亡于嚈哒人的手下。
中古时期.
嚈哒人时期.嚈哒人征服了贵霜帝国后，建立了新的政权，此时被赶出巴克特里亚地区的大月氏人仍保有印度河以东的小部份土地，后来被旃陀罗笈多一世所统一。嚈哒人对阿富汗文化带来很大的冲击，他们是信奉祆教，并积极推广，破坏了佛教的发展。压制佛教的政策，引起佛教徒强烈反抗。游牧文化再次来到阿富汗，城市文明衰落，贵族兴建城堡，回到农业经济形式。嚈哒人统治期间并不注重