1999年日本羽球公开赛，为第18届日本羽球公开赛，于1999年4月6日至11在日本东京都代代木第二体育馆举行，总奖金18万美元。本届赛事五个项目中，有两个项目卫冕成功，分别是男子单打的丹麦选手彼得·盖德、女子双打的中国组合葛菲/顾俊，其中后者是三连霸。