出兵陕城讨伐赫连昌，敕令薛谨率领侧翼部队作为前锋带路，薛谨活捉了胡夏东平公乙兜。北魏攻克蒲坂后，魏太武帝把新旧之民合并在一郡之中，薛谨仍为太守、平西将军。神䴥三年（430年），薛谨出任使持节、秦州刺史，平西将军如故。山胡白龙据险叛逆，魏太武帝诏令镇南将军奚眷与薛谨一起担任都将，从太平向北进军，讨伐平定了白龙。薛谨加号安西将军，封涪陵郡公，仍然为秦州刺史。太延元年（435年），薛谨讨伐吐没骨将其平定。薛谨从太守升任刺史后，恩威兼施，地方的风气大为改观。当时处于兵荒马乱之后，儒学沉寂。薛谨命令建立学校，教授儒家