深得器重。在杭州任职期间，仍注意自学数、理、化等自然科学，并绘制了一份《秦晋豫三竹黄河阁》，现保存于陕西师范大学图书馆。一八九七年（光绪二十三年），李异材由浙江返陕，行李，新书数箱，除诸子百家外，多系新出版的数学、物理、化学等精本。李异材便指导侄儿李仪祉学习这些新书，为以后的深造奠定了基础。一八九八年（光绪二十四年），陶勤肃聘请李异材主讲兰州兰山书院，开甘陇新学风气。在此期间，李与陶的儿子拙存常谈数理，拙存认为立方以上已无法画图，异材不以为然，便作进一步钻研，甚至通夜深思试绘，终于绘出了九乘方廉隅诸图