至顺治九年（西元1652年），清世祖册封格鲁派领袖五世达赖为「西天大善自在佛统领天下释教普通瓦赤喇达剌达赖喇嘛」。
宗派.
宁玛派（旧译派）.宁玛派一直以来遵循莲花生大士与寂护上师最初所传的旧密咒，即便是朗达玛灭佛后，宁玛派的教法传承也与藏传佛教前弘时期的法统一脉相承。在禁佛时期是采取更为隐蔽的方式进行传授。宁玛派的教法传承，主要有三种：一远者经典传承，二近者埋藏传承，三甚深净境传承。宁玛派的教法全部包括在九乘三部里，九乘包括显三乘〈一声闻，二独觉，三菩萨〉、