也故意设计成水车的印象，并在车站旁（西口外）设有水车造型的钟台。能登川车站是琵琶湖线沿线所有的停车站中，唯一一个没有特急列车停靠的车站。
车站zh-tw:构造;zh-hk:结构;zh-cn:构造;.侧式月台1面1线与岛式月台1面2线，合计2面3线的地面车站，设有跨站式站房。
使用情况.根据「滋贺县统计书」，1日平均上车人次如下表。