大选期间，他是尼克松阵营的秘密线人，曾给尼克松竞选团提供了詹森政府在巴黎和谈中的机密内容。1968年尼克松凭借尽快结束越南战争的口号当选总统，并在就任伊始就开始执行所谓的越南化计划——逐渐撤走驻越美军的同时，扶持南越的越南共和国军以继续独立抵抗北越的越南人民军和南方越共游击队。与此同时，基辛格在尼克松支持下，主持了轰炸柬埔寨（当时是主权独立国家）境内的越南人民军和越共游击队目标的行动。虽然行动计划一开始是秘密进行的，然而在美国国内，消息一经流出还是激起了一片片的反战浪潮。不仅如此，轰炸行动还间接引发了柬埔寨