目前尚不清楚怀孕期间使用该药对婴儿是否安全， 但该药可随母乳分泌，因此只有在症状严重时才能在怀孕或哺乳期间使用。 亚胺培南西司他丁钠主要经肾排泄，故肾功能不全患者应谨慎使用。 对β-内酰胺类药物过敏的患者对亚胺培南也可能产生过敏反应。 有脑部疾病（如癫痫、头部损伤和脑肿瘤等）、肝功能不全和严重胃肠道疾病的患者应慎用该药。 
肝毒性.在大型临床试验中，约6％的患者服用该药物5至14天后发生了与亚胺培南相关的血清转氨酶水平短暂无症状升高。 亚胺培南西司他丁钠一般很少会造成更严重的肝