7月9日，三民主义青年团成立。193年，姚在西南联合大学设立分团部与党部，任三青团西南联大分团部团长。因学生将其学名“姚士鳌”戏唿为“姚土鳖”，故用名「姚从吾」。中国国民党六大召开前夕，列入朱家骅与陈立夫联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一。朱家骅转任国民党中央组织部长后，姚从吾随之改任西南联大国民党区党部书记长。1947年7月24日，国民政府任命姚从吾为国立河南大学校长。1949年，护送故宫第三批文物来台湾，寄居台中梅月旅社，任台湾大学教授。1958年，升任为第二届中央研究院院士。卒于1970年