暴露于细菌或细菌抗原时，潘氏细胞会分泌防御素等抗菌分子到小肠管腔的绒毛，帮助维持胃肠道屏障。
功能.潘氏细胞能够分泌肠抗菌肽、防御素、溶菌霉素、磷脂酶和C-型凝集素等多种物质，有助潘氏细胞在维持肠道先天性免疫、肠道抗菌抗炎及肠上皮组织完整性等方面中发挥作用。潘氏细胞和阳性肠干细胞会共同构成干细胞巢，潘氏细胞可提供一些维护干性特征的关键受体或配体，如表皮生长因子、、等，从而激活相应的细胞信号通路，继而维持Lgr-5阳性肠干细胞的正常细胞功能。潘氏细胞结构和功能的异常已被证实和肠道疾病