会成为新苏丹。在1578年3月，西班牙舰队由桑德率领，开始了他们对文莱的远征。探险队由400个西班牙人，1500个菲律宾当地人和300个汶莱人。战争还包括对还包括在棉兰老岛和苏禄的行动。西班牙军队在1578年4月16日成功入侵首都哥打峇都，他们烧毁清真寺但因霍乱和痢疾疫情，在1578年6月26日他们决定放弃文莱返回马尼拉，前后停留72天。尽管自文莱撤退，西班牙还是设法保持在吕宋岛的据点。几年后，他们再次准备与苏丹国交易，在1599年他们要求与汶莱帝国关系正常化。战后，文莱帝国国将不再是在海上帝国