导团炮兵科。后来进入日本陆军士官学校，属于熊本步兵联队。1882年，毕业于日本陆军士官学校（旧第5期）。加入歩兵第13连队。1885年，他加入日本陆军参谋本部支那部，隔年受参谋本部之命，为了收集情报而到清国赴任。1890年9月，他在上海所设立的日清贸易研究所里主导以民间人士角度来进行大陆研究，而暗中支援日本陆军的大陆工作的人物有不少都出自此研究所。而日清贸易研究所是在他死后设立的东亚同文书院的前身。1893年7月，荒尾精编入了预备役，之后在1896年9月在台湾因鼠疫而去世。玄洋社的头山满曾说荒尾是「