国立交通大学生物科技学系隶属于生物科技学院，提供基础与应用并重之生物科技教学研究。生物科技系成立于民国八十三年，由硕士班开始，成为交通大学第一个生物科技相关的系所。1998年博士班成立后，于1999年正式招收第一届大学部学生。成立宗旨为培育具有跨领域生物科技学能和技术的学术与产业人才。
研究领域.主要的专业学科与研究领域包括基因体和蛋白质体学、蛋白质与酵素工程学、生物有机及无机药物化学、医学与工业微生物学、生物资讯与系统生物学、生物电子与生物感测及生物工程等等。根据教授专长不同