F-15E都参与了1991年在波斯湾发动的沙漠风暴行动，并获得空军39场空战胜利中的36场。地面打击专用的F-15E主要于夜间使用LANTIRN进行飞云飞弹载具与砲阵地的猎杀任务。接下来F-15仍持续支援南方守望行动，在伊拉克南部禁航区巡逻，以及土耳其的Provide Comfort行动，北约在波士尼亚的行动等。驻防于阿拉斯加第3联队-第12中队的18架F-15C已经全面换装更为先进APG-63（V）2 AESA雷达，暱称「金鹰」（Golden Eagle），不过由于（V）2雷达使用较旧的AESA