都道府县的事务移让给政令市。政令市之下划设「」（非地方公共团体），地址表记可省略县名。截至2012年，日本全国总共有20个政令市。另外，也设置标准较低、不设「区」、但仍有较多自治权的中核市。在2000年至2015年，还设有自治权介于中核市与普通市之间的特例市；2015年后特例市法规废除，原有的特例市可申请升格中核市，尚未申请的则仍保有过去特例市的权限并被称为「施行时特例市」。在更低层级，则有不属于地方公共团体的两个行政区划等级。三级为和大字，此町跟二级区划市町村的町在法律上地位不同，并与大字合称，为日本