三年（1564年），由格勒巴桑为亲教师，格敦丹巴达吉为羯摩师，他受比丘戒。之后云游各地，收徒传法。万历五年（1577年），应蒙古土默特部领袖俺答汗之邀赴青海。次年（1578年），在青海湖东部的仰华寺会见俺答汗，向其宣传格鲁派教义，于是蒙古族放弃了对萨满教的信仰，改信佛教，俺答汗尊之以“圣识一切瓦齐尔达喇达赖喇嘛”的名号。这样达赖喇嘛成为西藏佛教领袖的尊号。转世制度建立后，他追认根敦嘉措为达赖二世，根敦朱巴为达赖一世，而自己则为达赖三世。他又规劝蒙古人废除夫死妻殉和为死者宰杀驼马祭祀的风俗，为俺答汗赠尊号