加入苏联共产党，穆辛的指挥生涯短暂中断，开始转向教学并成立了列宁格勒管弦乐指挥学校。二战期间，穆辛主要在乌兹别克斯坦首都塔什干活动。1942年6月22日，为纪念纳粹德国入侵苏联一周年，穆辛指挥了肖斯塔科维奇的第七交响曲。 1932年起穆辛任教于列宁格勒音乐学院，留下了许多指挥理论的着作，并教授了一大批指挥家，包括巴尔沙伊、毕契科夫、捷米尔卡诺夫、格吉耶夫、库伦奇思等等。