返回宁夏之后，马鸿逵和马鸿宾因部队军饷问题曾出现过严重矛盾，最终在国民政府的调停下才告一段落。
马仲英与新疆动乱.马仲英于湟源事件后转战甘肃、宁夏等地。1931年，马仲英进入新疆，支援维吾尔族反抗新疆省主席金树仁。1933年，归化军等在新疆发动「四·一二政变」，盛世才取代金树仁掌控新疆政权。马仲英趁新疆政局不稳，二次进兵，与盛世才发生激战。马仲英是马麟侄子，马步芳与马步青的堂兄弟，因此蒋对马仲英是否与青马暗中合作有疑虑。陈果夫曾建议蒋密令马步芳进击马仲英，迫使马仲英改路，再令新疆省