过富营养作用间接影响鱼类的生存。氮素已经导致了一些水体的富营养化问题。从2006年起，在英国和美国使用氮肥将受到更严厉的限制，磷肥的使用也将受到了同样的限制。这些措施被普遍认为是为了治理恢复被富营养化的水体而采取的。在无氧或低氧条件下，厌氧细菌的“反硝化作用”将会发生。最终将硝酸中氮的成分还原成氮气归还到大气中去。
氮气(N)的转化.有三种将游离态的N（大气中的氮气）转化为化合态氮的方法：另外，闪电亦可使N和O化合形成NO，是大气化学的一个重要过程，但对陆地和水域的氮含量影响不