其中更包括数种受威胁物种。但是，流域同时亦遭受入侵物种侵袭，而它们更会对原生物种乃至生态系统造成严重威胁。河流发生多次洪灾，其中1921年的洪灾更促使圣安东尼奥市进行河道截断工程及修建水坝下水道等防洪设施，而及后成为市内景点的亦应运而生。数十年后，美国陆军工兵部队与圣安东尼奥河管理局合作，先后进行河流渠道化、改善水坝及修建地下泄洪隧道等工程，强化河流的防洪能力。流域内设有多个休闲设施，除了河滨步道外，多个经修复的传教站亦是着名景点，而其中五个传教站及相关建筑更于2015年被联合国教科文组织列入世界遗产。