菩萨的慈云寺，南投武德殿现址有主祀城隍尊神的指南宫，中山街永生诊所处有主祀土地神的福德宫。至于慈云寺是干隆二十四年（1759年），官府倡建于南投县丞署前，迨干隆四十二年（1777年）六月，松茂和尚倡议重修，并得地方人士各族代表捐出若干田园，由南投县丞周丰勒石。嘉庆七年（1802年），信徒捐置吊钟一座，铭文：「阿弥陀佛，法轮常转，皇图永固，帝道遐昌，佛日增辉」。 1896年6月29日，南投发生抗日事件，至7月6日，日军放火焚街，慈云寺遂罹兵燹，佛像寄祀于配天宫。慈云寺的土地与香灯碑后为日僧建立的尊猷寺