每天能做的事情只有待机。1943年（昭和18年）6月8日，姊妹舰「陆奥」在「长门」的面前爆炸沈没。8月，进入楚克锚地待机。1944年2月从楚克岛撤退后，转到林加锚地作为基地。于1944年6月参加安号作战（），于19日的马里亚纳海战作为第二航空战队的航空母舰「飞鹰」与「隼鹰」的护卫，虽然期间受到空袭但损伤轻微。同时间亦曾经考虑以「长门」为「飞鹰」进行曳航，但在进行之前「飞鹰」已经沉没。
捷一号作战.1944年10月参加捷一号作战，于10月24日钖布延海海战中，于14:16被航空母