四起，海澄、同安、厦门、安溪、仙游相继失陷。王懿德令参将李煌、都司顾飞熊破贼，收复尤溪县城。水师提督施得高、金门镇总兵孙鼎鳌又于金门破贼。厦门、仙游皆复。四年，实授闽浙总督。七年，太平军自江西入境，陷光泽、汀州，但不久又被清军先后收复。王懿德遣福建总兵饶廷选进援浙江、江西。八年，太平军再从江西入境，陷浦城、松溪、政和等县，邵武、光泽、连城亦被扰。周天培军赴援福建，迫太平军退回江西，清军收复福建各地。十年，以病乞致仕。十一年，卒，谥靖毅。