逻辑（相当于一个较弱版本的类型论），可用于编码诸多对象逻辑，如一阶逻辑、高阶逻辑、或ZF集合论。最常被用到的对象逻辑是 Isabelle/HOL；而其对集合论的形式化工作则使用了 Isabelle/ZF。Isabelle 的主要证明手段利用了高阶版本的归结原理（resolution），基于高阶的合一（unification）。尽管 Isabelle 主要采取交互式的证明方式，它同时亦提供了若干高效的自动化推理工具，例如项重写引擎、tableaux 证明器、以及各种判定过程。借由 "sledgehamme