军讲武堂毕业，被任命为连长。1929年1月，马本斋任东北军独立21师第四团团长。1931年九一八事变后，因不满蒋介石的不抵抗政策，毅然弃官回乡。1937年抗日战争全面爆发后，组织“回民义勇队”，抗击日本侵略军。1938年率部参加八路军，同年10月加入中国共产党。1939年，回民教导总队改编为八路军第三纵队回民支队，马本斋任司令员，率部转战于冀中和冀鲁豫平原。1941年8月4日深夜，河间、献县、沙河桥、淮镇、景和等据点的日伪军千余人，包围了献县东辛庄。5日早晨，全村人都被日军赶到清真寺门前，抓捕了马本斋的