1986年落架大修后，二灵塔恢复原貌。
保护.二灵塔于1982年6月被列入鄞县文物保护单位，县政府曾于1986年对二灵塔实施落架大修。1997年8月，二灵塔被列入第四批浙江省文物保护单位。2013年3月，二灵塔被列入第七批全国重点文物保护单位。保护范围为塔身及塔基，建设控制地带确定为塔基向西21米，向北、东、南各20米。2013年10月，二灵塔附近发现一盗洞，为盗贼试图偷窃地宫宝物所挖。2014年，二灵塔附近由东钱湖区安装24小时监控摄像头以避免文物遭到破坏。