第1师、第6师及第2混成旅、第8混成旅在上川东同吴佩孚方面的刘湘、杨森、潘文华、唐式遵及黔军袁祖铭等战斗20余天。因军心涣散，但懋辛部占领重庆后又失守，部队一度瓦解。
从北伐到内战.失败之后，但懋辛被熊克武派遣，同湖北讨贼总司令孔庚、石青阳一起赴贵阳同刘显世达成三省合作意向。随后征得云南唐继尧同意，但懋辛拟成《建国联军协议》，三省代表签字。建国联军由此成立，唐继尧任总司令，刘显世任副司令。熊克武任前敌各军总司令兼建国联军川军总司令，驻湖南常德。协议达成后，但懋辛、石青阳、孔庚携