奥利艾西南、西德维纳河、索利齐和诺夫哥罗德等地的防御作战中显示出顽强的战斗力。由于坦克耗尽，1941年12月之后，他改为步兵第241师师长。1942年5月，切尔尼亚霍夫斯基被授予少将军衔，不久升任第18坦克军军长。1942年7月切尔尼亚霍夫斯基担任沃罗涅日方面军所属第60集团军司令，指挥该集团军参与沃罗涅日—卡斯托尔诺耶战役。1943年1月在奥斯特罗戈日斯克—罗索什战役中收复沃罗涅日，获得红旗勋章。1943年，切尔尼亚霍夫斯基指挥部队参与库尔斯克战役，之后强渡杰斯纳河和第聂伯河。因在强渡第聂伯河作战英勇，被