童期身材矮小的最常见原因是先天性生长迟缓或家族性(遗传性)身材矮小。从医学角度来说，重度矮小可能是正常的变异，是多个家族性基因相互作用的结果。也可能是由许多异常情况中的一种或多种，如长期（长时间）生长激素或甲状腺激素缺乏、营养不良、主要器官系统疾病、虐待、某些药物治疗、染色体缺失等引起。人类生长激素(HGH)缺乏症可能在婴幼儿时期的任何时候发生，其最明显的症状是生长速度明显减慢。此症可能具有遗传性。在未患有生长激素缺乏症的儿童中，身材矮小可能是由Turner综合征或Noonan综合征、慢性肾脏疾病、早产