鹦鹉嘴龙是半水生动物的理论，牠们的尾巴的功能类似现代鳄鱼的尾巴，并使用前肢拍打、后肢踢水的方式在水中前进。他们提出的根据包含：许多化石发现于湖泊沉积层、鼻孔与眼眶的位置、前肢与后肢的可移动范围、尾巴下方具有长人字骨、尾巴上方的鬃毛状物可能具有鳍的功能、而胃石被认为是在水中的承载物。他们也指出，鹦鹉嘴龙的某些种是陆栖动物，而其他种是半水生动物。
活动时间.在2011年，科学家比较恐龙、现代鸟类与爬行动物的巩膜环大小，提出鹦鹉嘴龙可能属于无定时活跃性的动物，觅食、移动行为跟白天黑夜没有