立之初，以争取人民的政治权利与公民权为首要之务，尤其着重政治犯、死刑犯的救援、解除黑名单、要求保障人身、言论、集会游行和结社等自由。1987年台湾解严之后，台权会完成「破除政治压迫」的部份阶段性目标后，则持续在司法人权上继续努力。此阶段重要的工作有救援苏建和案，。由于社会变迁，台权会目前工作除着重在司法人权改善，并监督政府是否不当滥权；如2005年中华民国内政部要求换发身分证者必须按捺指纹，后由司法院大法官判定违宪。台权会关注多面向人权，目标是提升人权标准、建立及加强人权保护机制，及关怀所有人权受到威胁、侵