有早上一班列车使用，周末和假日也只有「假日快速奥多摩」号（6辆编组列车）、少部分普通列车班次和临时列车班次使用。站房为两层式建筑，剪票口设于地面，旁边是由奥多摩观光协会营运的商店，二楼则是车站画廊和餐厅。由于奥多摩站是JR东日本的直营站，站内设有自动售票机和简易Suica闸机，但没有绿色窗口。车站两个月台的出发提示乐曲是一首名为「」的童谣。由于两个月台的乐曲採用不同段落，因此两者有不少差异。
使用情况.2019年（令和元年）度1日平均上车人次为866人。近年的推移如下表。