时行驶于99线的巴士多为亚历山大丹尼士Enviro 500（81XX-84XX、91XX）及富豪B9TL 11.3米(95XX)。海怡半岛开经：怡南路、海怡路、鸭脷洲桥道、鸭脷洲径、利东邨道、鸭脷洲径、鸭脷洲桥道、黄竹坑道、香港仔隧道、坚拿道天桥、告士打道、维园道、永兴街、英皇道，筲箕湾道、太康街、鲤景道、太安街、成安街、耀兴道、耀东邨巴士总站、耀兴道、南康街、筲箕湾道、爱秩序街及南安街。
行车路线.筲箕湾开经：未命名道路、南安里、筲箕湾道、新成街、耀兴道、惠亨街、太乐街、太康街