大凑线面向西边的陆奥湾，东边在下北半岛较低的山地，由于强风每年有几次停开的状况。停开时马上有巴士代替行驶（野边地～大凑间巴士代开约1小时30分）。代行巴士由下北交通和JR巴士东北2间公司运行。冬天常有停开或是慢速行驶的状况。在东北新干线最后一段——八户至新青森通车后，原有的东北本线八户至青森段根据法例转交第三部门铁道型态移交给青森铁道管理。大凑线与其他JR路线完全切断联系，成为JR集团中的「孤立路线」之一（另一条为七尾线）。沿线居民对此感到非常不安。2007年11月，JR东日本表示新干线延伸后仍继续营