机制会在糖醛酸的四号碳与五号碳之间产生一个不稳定的双键。由于这个具有不稳定双键的糖醛酸（称为 ΔUA 或 UA）会吸收232奈米紫外光，因此在实验室常用232奈米吸收的变化来监控肝素酶的反应。
化学解聚.在pH1.5或4之下，亚硝酸可用于肝素与硫酸肝素的化学解聚。 在这两种条件下，亚硝酸会使肝素糖链发生脱氨裂解。脱氨裂解发生在GlcNS-GlcA以及GlcNS-IdoA之间，氧原子是否硫化并不受影响，不过在较高的pH值下进行反应时，速率会较慢。 在较低的pH条件下，脱氨裂解会释放出