父辗转于内地，曾遭日军监禁。后前往印度，就读于（今属巴基斯坦）。1947年插班入读拔萃男书院，两年后考入香港大学物理系。1952年毕业后，返回拔萃男书院执教，任物理科教师及田径队顾问。1961年，接任拔萃男书院校长。1969年2月26日，获委任为非官守太平绅士；1976年，又获得大英帝国员佐勋章（MBE）。郭慎墀担任拔萃男书院校长期间，强调自由学风，大力发展体育及音乐活动。1983年退休；2001年获香港业余田径总会颁发「长期服务奖」及「杰出表现奖」金奖。2002年，拔萃男书院成立郭慎墀社（紫社），以资铭念