冰锦标赛短曲中取得第二名，长曲取得第三名，总分获得银牌，被选为四大洲锦标赛和世界花式滑冰锦标赛的代表。在2016年四大洲锦标赛短曲中，以92.99分宇野创造新的个人最佳成绩，取得第二名。在长曲终四周跳失误取得了第五名。他总合结果取得第四名，落后陈伟群、金博洋和闫涵。在首次参加的世界锦标赛中，宇野在短曲取得第四名，在长曲后半的四周跳时摔倒，总合顺位是第七名。综合羽生结弦第二名的成绩，两人获得了日本队参加2017年世界锦标赛三名额的资格。日本也是该年唯一获得三名额的国家。接下来在，宇野昌磨成为第一位在国际比