仲舒居家写《灾异之记》，当时辽东高庙发生了火灾，主父偃把书上奏给了汉武帝。汉武帝让学者讨论，以为该书讥讽朝政。吕步舒不知是董仲舒的作品，批评此书是“大愚！”。结果，董仲舒被判死罪。后来被汉武帝赦免。董仲舒写文痛诋吕步舒。曾持斧钺治淮南狱。1952年陈寅恪因程曦“不辞而别”之事，写有《吕步舒》一诗云：“证羊见怪借粗奇，生父犹然况本身。不识董文因痛诋，时贤应笑步舒痴。”陈的学生蔡鸿生在《释“陈门恩怨”》文中认为此诗“字里行间，颇见几份厉色”。