喀什噶尔、叶尔羌建立了白山派的短暂统治。伊达雅图勒拉之子雅雅和卓有子玛罕木特，被准噶尔汗噶尔丹策零囚禁于伊犁。玛罕木特有二子：波罗尼都、霍集占，被清军释放后发动了大小和卓之乱，兵败被杀。波罗尼都之子阿不都哈里克等人被清军送往北京，编入八旗蒙古；另有一子萨木萨克死在浩罕汗国。萨木萨克之子迈玛特·玉素普、张格尔、巴布顶分别于道光年间潜入新疆作乱。三人的后代迈买的明（卡塔条勒）、克齐克罕（阿布都拉）、呵里雅、布素鲁克、倭里罕也曾随浩罕军队来到新疆，最后在阿古柏之乱中败亡。
黑山派.圣人伊