亚队最终取得了第六名。2009年，东亚的主场搬到了上海观众容量最大的八万人体育场。由于要为年中的全运会做准备，该年东亚队仍未引进内外援，继续以全华班出战中甲。2009年8月1日，以上海东亚为班底组成的上海队在决赛中以3比0战胜广东队，夺得了第十一届全运会足球比赛男子甲组的金牌。然而中甲联赛中，东亚队却在一度占据冲超领先地位的情况下未能成功升级，最终排名第四。在2010年中甲联赛开始之前，俱乐部提出了“冲超”的目标，首次引进三名外援，并由范志毅接任主教练，但最终只取得第四名未能成功“冲超”，赛季结束后