琉球的先王，实际上是祈求清朝战胜日本。沖绳县盛传清朝的黄色舰队将攻打那霸，一时十分紧张。亲清派人士计画在清朝进攻沖绳之际举行暴动，以支援清军。然而清朝战败，与日本签订《马关条约》，台湾割让给日本。日本佔领琉球遂成定局。此后，琉球人于1896年发动公同会运动，试图恢复尚氏在琉球的统治权，成为世袭的沖绳县知事，但被日本拒绝。不满日本统治的部分琉球人流亡清朝。而日本对琉球群岛的统治一直持续到1945年沖绳岛战役结束为止。