罪被逮捕，4月被正式逮捕，于是成为打假、打黑的焦点。2003年1月29日，北京市宣武区人民法院公开审理足球裁判龚建平受贿案，以受贿罪判处被告人龚建平有期徒刑10年，他也成为中国足球史上因“黑哨”事件被判刑的第一人。2004年7月11日上午因“骨髓增生异常综合症”（一种不常见的血癌）在北京解放军第304医院病逝。
影响.媒体等始终不满的是龚建平成为打黑风波前后唯一最终承担了个人责任的人，而中国足球追查假球黑哨等丑恶现象的努力也随着他的去世无疾而终。2009年，龚建平逝世五周年