又说这个特使“不可理喻”，愤怒的康熙帝，敕将铎罗押往澳门交葡萄牙人禁锢，直至其病死狱中。此即中国礼仪之争事件。之后康熙再下谕令：「朕已将话传至宗主国（教宗国），如教化王（克勉十一世）不遵从，尔等可自任去留；尔等既是出家人，即留于本国着住修道。」从此，清朝和罗马教廷关系急剧恶化，禁止了西班牙传教士在中国的活动，并进一步严格的实行了闭关锁国政策。数百年后，教宗庇护十二世于1939年12月8日废除祭祖敬孔的禁令，这也侧面显示出了利玛窦对中国文化的了解。