005年间，任国立台湾大学社会科学院副院长。2006年至2008年间，任国立台湾大学副教务长。随后进入政界。于2008年至2009年9月间，刘兆玄内阁时期，任行政院研究发展考核委员会主任委员，负责推动马英九总统的爱台十二项建设。2009年9月，于吴敦义内阁时期，出任内政部部长。2012年2月6日，陈沖内阁时，出任行政院副院长。2013年2月18日，任行政院院长，7月18日发生大埔强拆事件。2014年3月发生太阳花学运，被怀疑是下令镇压的决策者，故被部分反对者称为「血腥阁揆」，12月因国民党在县市长选