5月任务型国代选举，代表建国党宣称外独会提名的林志昇当选；6月，林志昇发表辞职声明。在国代选举中唿吁支持林志昇的台湾建州运动发起人周威霖，选后与林志昇因出书问题认知差距发生金钱纠纷。原本为周威霖网路宣传建州理念的邓芬慧与周威霖反目成仇，自此加入林志昇与何瑞元的团队；随后周威霖台湾建州论述的支持者陈祖贤也投入林志昇阵营，加上苏南成与萧惟仁的加入宣传，美属台湾群岛方案在此时走入全盛时期。林志昇在一片形势大好的氛围下，决定参选高雄市长，并将主要竞选目标锁定在民主进步党的候选人陈菊。2006年12月林志昇参选高