延续前作，但之后推出许多盖特机器人系列的电视动画与OVA在故事上和本作无关。接续本作故事时间轴的续作为《》。
故事.恐龙帝国在武藏的牺牲下灭亡，地球也回复了和平，但另一新敌人百鬼帝国展开了他们的侵略行动。百鬼帝国成员是人类称为「鬼」的生物，一直等待能征服世界的机会，早知事态的早乙女博士，建立新早乙女研究所同时制造新的三一万能侠好与百鬼帝国对抗，来保护地球和平。