擅自决定迁都南京。邓演达坚决反对，于2月9日同徐谦等五人在武汉组成行动委员会，开展反蒋活动。3月7日，国民党二届三中全会在武汉召开，免去了蒋介石的国民党中央常务委员会主席、军事委员会主席和军人部部长等职，邓演达当选中央执行委员、中央政治委员会委员、中央军事委员会主席团成员，军事委员会总政治部主任和中央农民部部长。之后，邓演达多次发表讲话，阐述反对“军事指挥党”，被蒋介石视为心腹之患。1927年蒋介石发动“四一二”政变，邓演达主张东征讨蒋，没有被汪精卫采纳。4月随军北进河南。6月从河南回到武汉，6月30日