中国突厥斯坦”一词曾是“东突厥斯坦”的同义词，但已不再使用，它因带有“中国”而被维吾尔分离主义者抵制 ，因带有“突厥斯坦”而被中国人抵制。在中国，“东突厥斯坦”仅仅意味着旧时的西方帝国主义，曾经的东突厥斯坦伊斯兰共和国和东突厥斯坦共和国，以及现代的恐怖主义组织“东突厥斯坦伊斯兰运动”。中国政府常将东突厥斯坦伊斯兰运动、东突厥斯坦解放组织等多个分离主义组织的暴力活动混为一谈，仅简单的称其来自“东突恐怖组织”。历史上“东突厥斯坦”的定义多种多样且含煳不清，但无论是自然地理上，还是人文地理上与现在新疆的范围均