巴丁说服伊利诺大学厄巴纳-香槟分校，提供巴丁一份年薪一万元的工作。巴丁由于和肖克利不合，接受了聘用后，离开贝尔实验室，进入伊利诺大学香槟分校电机学院和物理学院担任教授。巴丁建立了2个主要研究计画，一个计画在电机系，另一个在物理系。电机系的研究计画是关于半导体实验和理论，物理系的研究计画是关于宏观量子理论，特别是量子超导性和量子液体。他的第1个博士学生正是后来在1962年发明了LED的尼克·何伦亚克。1950年代早期，巴丁就已经开始考虑超导电性的问题。他意识到电子与声子的相互作用是解决问题的关键。1953