该寺的创建，拉开了格鲁派在康区传教的序幕。《土观宗派源流》称，由于昌都强巴林寺的创建，方才“使格鲁派遍布于号称六岗、六绒、六雪、三茹的整个康区。”据藏文史书记载，康熙五十八年（1719年），强巴林寺对清廷派往冈底斯山勘界的人员给予大力配合，为此清朝康熙帝特颁圣旨，敕封第六世帕巴拉活佛帕巴拉·济美丹贝甲措为“阐讲黄法额尔德尼那门汗”名号，赐铜印，并为寺庙御赐“俱善弥勒寺”（译成藏文为“甘丹强巴林”）之名，所以一些藏文史料称昌都强巴林寺为“昌都甘丹强巴林”。第七世帕巴拉活佛帕巴拉·邓巴贡布为表示对干隆帝