保护区被列为国家级森林和野生动物类型自然保护区。2005年，中共吉林省委第7次全委会议决定成立副厅级长白山保护开发区管理委员会。2006年，长白山保护开发区管委会升格为正厅级。
辖区.面积6718km。下辖三个经济管理区：池北区、池西区、池南区。池北区在延边州安图县境，另外两区在白山市抚松县境。