政府在经济上也有许多纠葛。政治领袖也很自然地也介入宗教的事物，他们建立教堂、修道院，出兵支持十字军。这种密切联系的后果是信仰的问题马上演化成为政治，并进而军事的问题。宗教改革过程中，各级的世俗政权纷纷表明立场，并且使用政治、军事的力量支持自己的立场，神圣罗马帝国的皇帝查理五世支持罗马，发诏书通缉马丁路德；德意志的选帝侯腓特烈三世则是马丁路德最坚定的支持者，将马丁路德保护起来；慈运理在苏黎世成立政教合一的新教政府，亲自上阵打仗捍卫自己的信仰；英国亨利八世为了离婚，宣布脱离罗马教会而成立盎格鲁宗，成为英国的国教