袭击后，特别行动组活跃于巴基斯坦的领土中，并以基地组织成员为目标让美军实施轰炸。据称他们也曾为巴基斯坦特种部队提供训练 。2011年5月1日，在中情局和美国海军特种作战开发组的合作下发起了海神之矛行动，最后成功击毙基地组织领导人和911袭击主谋奥萨马·本·拉登。
索马里.1992年，特别行动组被派到索马里以为之后的入侵行动作准备。其中一名叫的特工在侦察任务中阵亡，成为美方于是次冲突中的最初牺性者。踏入21世纪后，特别行动组也在索马里与其他美军特种部队合作猎杀恐怖份子和训练当