道子执掌朝政，宠信王国宝及王绪，更将重要权力授予他。王恭对此十分不满，多次严肃的正言其非，令司马道子十分忌惮并忿恨他。不久王恭入赴山陵，王绪就曾劝王国宝伺机伏兵击杀王恭，却遭王国宝拒绝；而亦有人劝王恭率兵诛除王国宝，但王恭在王珣劝说以及手握强兵的豫州刺史庾楷支持王国宝之下没有实行。期间司马道子将心腹放在王恭身边，以图和解，但王恭每论及时政都声色俱厉，及至临行回京口时亦严辞厉色的要司马道子远离奸，亲掌万机，更令王国宝畏惧。
经过.隆安元年（397年），王国宝被司马道子升为尚书左仆射，