太子开始失宠，文宗考虑废太子。郑肃趁受召见之机，意图为太子辩护，深切陈说邦国大本、君臣父子之义，文宗感谢他。但在次年（838年）太子近乎被废并于十月死去后，四年（839年）闰正月，郑肃被遣出长安，为检校礼部尚书，兼河中尹、河中节度、晋绛观察等使。这年，中书侍郎、集贤大学士李德裕奏称郑肃有好子弟不敢科举。郑肃平时与李德裕交好，曾共同处理黠戛斯、回鹘等问题。
唐武宗年间.五年（840年）文宗崩，弟唐武宗继位，念故太子李永无罪，将当初陷害李永的人尽行杀害。朝议称郑肃忠正有大臣之节，武宗召