同不一的状态被称作性别认同障碍（性别焦虑/性别不安）。一般人可以很轻松的维持自己对出生性别的认同，但性别不安者则不同。例如，在实验中让被试者尽可能快的写出尽可能多的、描述自己的语句，通常被试都会做出很多跟自己性别相关的描述。一般人做出的描述都会和其性别指定或社会普遍认同的相应性别特征一致。而性别认同障碍者却会做出很多跟自己性别指定相矛盾的描述。这种矛盾的性别认同往往会给人以严重的痛苦体验。在过去，一般认为性别是由生殖器和染色体所决定的，并一直认为这和性别认同是一回事，但是解剖学上也有发现染色体与性腺