埃位于塔拉斯孔－塞特铁路线上，该铁路为复线电气化铁路，是法国南部重要的铁路干线；已于1970年停止运营，后部分路段被南段利用。除此之外，法国高速铁路尼姆－蒙彼利埃绕道已于2017年建成通车，并远期计划。蒙彼利埃市区内共有两个铁路客运车站：蒙彼利埃圣罗克火车站，2005年以前名为“蒙彼利埃火车站”，位于市中心，是一个复合式铁路车站，候车厅位于铁道线上方，西侧为主站房，南侧和东侧亦可出入，该站每天开行直达巴黎、里昂、卢森堡、斯特拉斯堡、里尔、里昂、布鲁塞尔、巴塞罗那、马德里等地的高铁列车，前往波尔多、图