89年以后，欧洲大陆在科学、政治、经济等领域都经历了重大的变化。欧洲科学院也应之不断发展，从创建时一个由西欧学者主导的组织，成为目前完全独立、真正覆盖整个欧洲大陆的科学院。欧洲科学院的运营资金包括创建时设立的基金、成员国的捐赠、特别的项目资金、德国国家科学院等各国科学院的资金支持等。
使命.欧洲科学院的使命包括：欧洲科学院将致力于： 
学术管理.欧洲科学院的学术管理基于学部的架构。所有的院士当选后均被安排至一个学部。目前，欧洲科学院一共有二