妈盛拖至林定邦墓前报仇雪恨，之后前往自首而进行判决，直到1853年小刀会来台起事后才被召入军中担任勇首，随后赴福建支援太平天国战事，并于1863年回台平定戴潮春事件，最后在1864年年底返回福建支援，而战死于漳州万松关，当时林朝栋14岁。虽然与父亲林文察相处时间有限，但林朝栋和父亲一样，自幼熟读兵书，喜欢练武，有次练武时不小心伤到一只眼睛，只剩一眼能见事物，因而得到「目仔少爷」的称号。1868年林朝栋与杨水萍结婚，婚后杨水萍鼓励他考取功名，但林朝栋对考试没兴趣，故无未听从妻子的建议。1870年，林朝