专门研究病原体的特点，例如其传播方式、感染和生长机制。医学微生物学家经常作为顾问医生，提供识别病原体，并提出治疗方案。医学微生物学主要集中于人体里感染的存在和生长的微生物。
历史.在1676年，雷文霍克用他自己设计的单镜头显微镜，观察到的细菌和其他微生物。