由中国国民党的派系轮流掌政。然而随着反对势力抬头，自1993年县长选举民进党籍的陈唐山当选县长以来，台南县便由蓝翻绿，直至2010年五都改制皆由民主进步党执政。原台南市在1990年代以前，则长年由党外人士及国民党轮流主政，反映了府城鲜明的反对意识。自1997年，民进党籍的张灿鍙当选市长起，台南市亦一直由民进党执政至2010年县市合併。历年来，民进党在台南地区得票率最高的一次是在2004年总统大选，由陈吕配拿下六成二的票数。国民党近年来在台南地区的最高得票率则在2008年总统大选，由马萧配拿下四成六的票数