廉·何奥下令撤离波士顿。在约翰·亚当斯奔走下，诺克斯在1776年初正式获得上尉军衔，专门负责炮兵事宜。随着波士顿围城战结束，诺克斯被派往纽约市佈防，期间与亚历山大·汉密尔顿及班杰明·林肯等人结交。稍后诺克斯参与纽约及新泽西战役多场重要战事，包括在特伦顿战役中负责补给。这些战功使他在1777年初获陞为准将。费城战役后诺克斯开设了美军第一所炮兵训练学校，成为美国军事学院的前身。约克镇战役时诺克斯亦随军南征，并且负责督导炮兵。1782年，诺克斯获议会擢升为少将。当时诺克斯年仅32岁，是大陆军中最年轻的少将