法令在1938年至1945年间忠于捷克斯洛伐克的德国人不被驱逐和没收财产，不过受到这个例外的人很少。1948年2月25日已经重病的贝奈斯在重重压力下接受了非共产党部长的辞职，由此使得共产党上台。5月他拒绝在新的宪法上签字，6月2日他被迫辞职。克莱门特·哥特瓦尔德继任捷克斯洛伐克总统职。9月3日贝奈斯逝世于塔布尔附近。
任职.因他在争取独立中所起的作用，同托马斯·马萨里克和一起，被称作捷克斯洛伐克开国三元勋。2005年6月捷克票选「最伟大的捷克人」（"Největší