沦为法国保护国，受法属印度支那政府控制，该政府亦控制了越南（阮朝）与老挝。1940年，法国在第二次世界大战中被德国击败，原法国政府被zh-hans:维希法国;zh-hant:维琪法国;所取代，法属印度支那陷入混乱。暹罗（泰国）趁乱入侵，爆发第二次泰法战争，在日本的干涉下，以泰国割得印度支那的争议领土而告终。其中，柬埔寨失去了1/3的领土，包括50万名国民。
日本占领.1941年8月，日军进占柬埔寨保护国，并在此驻扎约8,000名士兵。尽管如此，法印政府依然没有被日本当局取缔