调系内教授的纠纷，并改革物理系的各项制度、充实了该系的软硬体设施。此外，她也同时和沈君山致力于执行并推广「通识教育」课程，但受到当时中华民国教育部的反对。同年9月，当林清凉动员物理系师生做系馆大扫除时，在楼梯转弯处发现石蜡，当时技工林松云指出里面可能存有镭-铍中子源，但是经检查后发现中子源并不在里面，表示中子源的下落不明。在报告校方后，行政院原子能委员会于9月24日派员彻查该系系馆，最后找到该遗失的中子源。隔年2月，台湾各大报大篇幅报导该次中子源事件，教育部也因此事受立法委员质询，最后导致台大辐射防护委员会