害怕袁祖铭夺去湖南省的统治权。此外，袁祖铭的部下王天培、彭汉章也参加了国民革命军，但是袁、彭与中国国民党的关系尤其薄弱，受到蒋介石的猜疑。另一方面，虽然袁祖铭参加了国民革命军，但他的立场也不坚定。袁祖铭的部下赵毓松（赵是中国青年党党员）建议袁祖铭同孙传芳、吴佩孚缔结反共同盟，并颠覆容共的武汉国民政府。袁祖铭自己也准备了颠覆计划。1927年（民国16年）1月31日，袁祖铭获唐生智手下的师长周斓在常德假意设宴款待，席间被突然杀害。这是唐生智获得蒋介石认可后下令杀害的。袁祖铭享年39岁。