北洋五十将乞共和电》与《乞共和第二电》，向隆裕逼宫，最后终于达成了清帝退位，中华民国北洋政府建立，由袁世凯担任中华民国大总统。5月，他昇任陆军第四镇第8协协统。1913年，他任第4师第7旅旅旅长。1915年（民国4年）袁世凯称帝，他被封为三等男爵。袁世凯死后，何丰林投靠皖系卢永祥。1917年（民国6年）1月，他任浙江省宁台镇守使。1920年（民国9年），他任松沪护军使兼第6混成旅旅长。1924年（民国13年），他参加江浙战争，任浙沪联军第1军司令，因卢永祥败北而下野，逃到大连。此后，何丰林加入奉系。