负责再次与明使沈惟敬进行讲和及斡旋的事务，提出了日明贸易再开、跟割让朝鲜四道等条件，但随着明神宗一纸"册封丰臣秀吉为日本王"的圣旨，谈判宣告破裂。秀吉再遣十二万兵马进攻朝鲜，小西行长率二番队一万四千人出阵，连夺梁山、三浪、庆州，和宇喜多秀家、加藤清正、岛津义弘等日军参与攻略南原城，后驻军朝鲜西南部的顺天倭城。但期后遭受明军刘綎的包围苦守城池，小西行长的左路军只好也随同撤退，于是两军在东南部沿海布阵固守。丰臣秀吉病殁后，接掌政权的德川家康和前田利家等五大老下命征朝军回国，在顺天的小西行长连忙领兵脱出明、朝