本地铁路服务亏损严重，不过由于罗湖站的票价甚高，足可弥补前者的亏损。新界东的快速公路网络并不完善，于繁忙时间，狮子山隧道、上水至沙田之间的九号干线；以及窝打老道及公主道一带，时有挤塞，以致东铁线比巴士有明显的时间优势；只有途经城门隧道、大老山隧道、青沙公路等较铁路直接的巴士路线可与东铁线竞争，故此本线一向是沿线新市镇的主要交通工具。本线在停止货运业务前所提供的主要货运业务有货柜运输、一般货运（平板拖卡）及牲口运输，来往香港与中国大陆，最远至乌鲁木齐。在上水屠房运作以前，载着牲畜的列车（俗称「猪车」，