了旧的开山王庙，在原址重建福州式建筑式样之「延平郡王祠」一座。沈葆桢并亲写对联一副：「开万古得未曾有之奇，洪荒留此山川，作遗民世界；极一生无可如何之遇，缺憾还诸天地，是刱格完人。」自彼时起，郑成功即成为清廷所承认之模范人物。台湾重要官员包括刘铭传、唐景崧等人，亦皆曾为延平郡王祠作赞颂楹联。
日本.台湾日本统治时期，日本殖民当局以拥有大和民族血统之郑成功统治过台湾，以此解释日本统治台湾是继承遗储，合理化日本对台湾的统治。当时在台湾的公学校曾教学童唱「郑成功之歌」。台南的延平郡王祠