共有三位女儿进宫为后妃，时人有「<nowiki>一家立三后</nowiki>」的叹语。然而在道长之后，继承的藤原赖通、教通，其入宫之女儿皆未顺利产下皇子，使得皇位继承权轮到与当时北家较远的后三条天皇身上。后三条天皇颁佈限制设置庄园的命令，且自动退位，以太上天皇的身份，绕过传统上由摄关把持的朝廷，以影响朝政；后三条之子白河天皇进一步确立院政的政治型态，拉拢武士来对抗藤原北家。加上后三条、白河以后，天皇后宫逐渐由北家旁支闲院流所瓜分，自此日本的政治开始非由藤原北家独佔。后来进入武家政权的时代，经历保元之乱、