日后风速达每秒66.9米，气压再跌至934百帕。柯娜于日本时间9月5日晚上，以巅峰强度每秒72米、气压917百帕到达宫古岛。当时因北方浅槽关系，一度有伪装转向的姿态，但未几折回西北偏西路径。柯娜之后保持强度，经东海持续向西北偏西移动，到9月7日上午7时在中国福建省宁德市霞浦县牙城镇登陆，登陆时最低气压970百帕、最大持续风速每秒37米。由于地形因素，它很快便减弱为热带风暴，并转向东北移动，翌日在江苏省以热带低气压强度出黄海，最终在韩国首尔东南方转化为温带气旋。
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