事务交给九世班禅喇嘛管理，并由他代替达赖喇嘛的名号。九世班禅拒绝清廷的要求，然而达赖和班禅这两位祖古之间的矛盾从此刻起开始产生了，后来一直没有弥补。十三世达赖在外蒙古期间，俄罗斯人出于牵制英国的需要，也对他礼遇有加。达赖派遣自己最信任的阿格旺多杰去莫斯科求救，希望协助返回西藏，但没有得到俄罗斯的帮助。由于达赖在西藏拥有崇高威望，他与俄罗斯人的交往使得清廷担忧，于是恢复了他的封号，派蒙古王公前往宣慰。十三世达赖回到塔尔寺，准备回到西藏，但受到英国的阻挠，因为当时清廷正在与英国谈判，英国不希望达赖在此时返回