轮学院和密宗学院，共有经堂及佛殿13座，内藏装有一颗红枣大小的古迦叶佛佛骨的释迦牟尼佛像，装有舍利佛指骨的菩提宝塔等法物，以数万函佛经。寺内有许多塑像、壁画、雕刻、佛经、法器，以及木版印刷或者手抄的藏文经典及史料。清末常有云游僧人在此学经，清末还曾有两位西德人在此学习佛学。天堂寺曾出过众多高僧，如清朝干隆时期国师章嘉·若必多吉，以及土观·却吉尼玛，均曾在该寺接受启蒙教育。甘肃、青海地区藏传佛教的大部分寺院历史上多次遭战乱破坏，天堂寺则因位置险要，且有章嘉国师及东科活佛直接保护，建寺三百多年未遭战火和地震