主忠孝在江户被7000石旗本板仓胜该斩死，自此将家纹改变。1755年开设藩校时习馆，重贤进行改革，成功将熊本藩中兴。幕末时代藩内分为勤王党、时习馆党、实学党等。1870年末代藩主护久，支持实学党，控制了藩政。1871年废藩置县后，原有领地成为了熊本县的行政区划。细川护久直系后代，第18代细川家当主细川护熙是第79任日本首相。
藩主.
加藤家.外样 52万石
细川家.外样 54万石
支藩.熊本藩