其后到北京大学法律学院担任经济法博士研究生。毕业后，何超明进入广东高等法院工作，他从书记员开始，由审判助理一直做到经济审判庭庭长，年仅36岁就成为当时全国最年轻的庭长。1983年起担任澳门高等法院助理法官、法官、庭长等职务。 1991至1993年到葡萄牙科英布拉大学修读葡萄牙文及法律课程；修毕该课程后返回澳门担任反贪污暨反行政违法性高级专员公署协调员；其后于1995年被升为副高级专员。何超明于1999年8月获中华人民共和国国务院任命为澳门特别行政区检察院检察长；2004年12月4日再度被任命为检察院