敦自任丞相并掌握朝政，见司马绍勇而有谋，而且朝野中亦有很高名望，于是打算诬陷他不孝而将他废掉，但因温峤等大臣支持司马绍，王敦终也不能废掉司马绍。晋元帝因王敦之乱而忧愤成疾，于当年闰十一月己丑日（323年1月3日）病逝，司马绍在次日继位，为晋明帝，并由司空王导辅政。王敦虽于永昌元年（322年）就回到武昌遥控朝廷，但因为图谋篡位，于太宁元年（323年）暗示要朝廷征召自己入朝，晋明帝于是以手诏征召王敦。同年，王允之乘酒宴而知道王敦的图谋，于是回京告诉其父王舒，王舒于是与王导一同报告晋明帝，得以早作防备。