，现在通常认为跨性别并不是一种疾病（但在除伊朗以外的大多数伊斯兰国家不承认跨性别者的身份，仍然以过时的“性别认同障碍”来诊断跨性别者），也不是一种个人选择（无论顺性别者还是跨性别者通常都无法选择自己的性别认同），更不是可以凭借当事人意志坚持或放弃的癖好及兴趣。
精神医疗.大多数精神卫生专业人员建议治疗性别认同与其出生时指定的性别角色不同时所引起的痛苦，特别是当事人想从一种性别过渡到另一种性别的情况。因性别认同与他人期望不同，或是因性别认同与生理性征冲突而产生痛苦的人，皆可以通过深入