由大臣于各旗人员中委任。每年年终时值年旗大臣开列二十四旗都统、副都统衔名，奏请皇帝从其中简命隔年的值年旗大臣。民国之后仍沿袭八旗制度，继续任命各旗都统管理值年旗事务，如民国二年（1913年）一月任命载功、景沣、贡桑诺尔布、色楞额、魁斌、溥伦、桂祥、博迪苏管理值年旗事务。民国八年（1919年）十二月二十八日《大总统令》派载涛、江朝宗、麟光、色楞额、瑞丰、治格、志锜、张德彝管理值年旗事务。