于1992年解体后分裂出来的球队之一，参加每两年举办一次的欧洲U-21足球锦标赛。
竞赛历史.2006年欧洲U-21足球锦标赛斯洛文尼亚U21在分组赛10战4胜3和3负，最后一场主场3-0击败苏格兰，锁定次名席位，紧随卫冕冠军义大利出线附加赛。附加赛对手为荷兰，首回合主场凭门将汉丹洛域（Samir Handanovič）出色的表现守和0-0；次回合作客被亨特拿连下两城锻羽而回。晋级决赛週的荷兰其后更赢得冠军锦标。