校园巴士 (校本部内行驶)、校区区间车 (校本部和南大校区间运输)、台联大系统专车 (前往交大、中央、阳明)、中研院区间车 (前往中央研究院)、同步－国卫院区间车 (前往同步辐射中心、科技生活馆)。2019年11月1日起，新竹市公车83路开通，可前往新竹转运站、南大校区。
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繁星计画.「繁星计画」为清华于2006年陈文村校长任内，为缩减城乡差距、培养更多不同面向的优秀人才、使校园的氛围更多元而推动，方式为採用各高中「推荐保送」方式办理单独招生，给予城