992年1月6日正式将素书楼辟为纪念馆。后由于素书楼年久失修，台北市政府于2001年进行修缮工程，随后将素书楼转交台北市政府文化局管理，台北市政府文化局于2001年12月31日将素书楼改名为钱穆故居。而素书楼事件在日后无论在陈水扁竞逐台北市市长，还是中华民国总统时，都被选举对手指斥他「残酷不仁」的事证之一。民国九十九年（2010年），时任中华民国总统马英九在钱穆逝世20周年纪念会上，以总统身份向胡美琦为素书楼事件中台北市政府的做法致歉，并肯定钱穆的清白。1990年8月30日，钱穆逝世，生前曾对胡美琦说：