建次奔走二年，终获台糖总公司以租赁方式，让此庙租下四百五十坪土地。2001年信徒们决定改建新庙，在同年10月8日早上9点举行入火安座，把大妈、二妈、三妈、镇殿妈和虎爷、太子爷神像移到临时行宫。
祭祀.台湾日治时代，厂方仅可接受台湾人上香，没有庆典、进香活动等大开销，也无收丁口钱或乐捐。此外也无庙公管理，日常上香清扫是由每一户台湾人家庭轮流，用一块红牌子作轮替的依据。此庙祭祀提前于农历三月初十，而不是妈祖诞辰，而八月初一还有拜埤沟的传统。同样为台糖员工所祭祀的妈祖庙还有彰化糖