平定太平军筹划，张亮基三顾茅庐，但左宗棠不愿为其幕客，胡林翼劝了左宗棠一番，左才勉强答应。后来张亮基调往山东，左宗棠就隐居了。骆秉章为湖南巡抚，用尽手法才让左宗棠投效。骆重用左宗棠，对他百依百顺。左宗棠因而在骆幕府中出了名，连咸丰帝都知晓，皇帝于是透过郭嵩焘联系左宗棠，要左氏出来任官，攻击太平军。1856年，升任兵部郎中。1862年由曾国藩举荐由太常卿升任浙江巡抚，并组成中法混合军和扩充中英混合军与太平军作战，克金华、绍兴等地，升任闽浙总督。1864年，克杭州，并受封一等恪靖伯。之后致力于剿灭东