现了喜冷、湿的蕨类植物，说明气温进一步下降。在发现的植物遗存中，包含大量稻谷及稻杆、稻叶形成的堆积，位于木构建筑遗迹附近，厚度达到20至50厘米，种类为栽培稻中的籼稻。大量稻谷保存完好，稻叶在出土时仍呈绿色，且能辨别稻谷上的稃毛。除此之外，也发现了小葫芦、橡子、菱角、酸枣、芡实等果实，说明采集仍是当时重要的食物来源。出土植物遗存中包含大量樟科植物叶片，应为人工采集，并可能作为药用。
骨、石、木器.河姆渡遗址发掘出的生产工具由骨、石、木等材料制成。在第二次正式发掘出土的4670件