1980年代，Sibley和Monroe根据DNA分析的结果对当时的传统鸟类分类作出重大调整。在鸟类DNA分类系统中，鸵鸟目变成鸵鸟下目，和美洲鸵鸟下目(美洲鸵鸟目)合组鸵鸟亚目，鸵鸟亚目再和鹤鸵亚目合组鸵形目，但后来又发现这并非一个单系群，之前包括的鹤鸵、鸸鹋等动物又被独立出去，到了2014年，只剩鸵鸟科。