允许使用上杉姓，成为江户幕府的高家（高家上杉家）。父亲的实家畠山氏是清和源氏足利氏的支流（原本是桓武平氏），不过因为上杉家的本姓是藤原氏，所以使用藤原朝臣之名和「上条之五三桐」（）为家纹。庆长6年（1601年）11月，谒见德川家康，受家康赐予下总国印旛郡、、常陆国、合计1千4百9十石所领，并列为幕府旗本。庆长9年（1604年），因为家康的命令而附属于德川秀忠。在元和9年（1623年）8月24日死去。享年42岁。墓所在东京都文京区小石川。法名是宗林。家督由长男长政继承。