在970年占领了喀喇汗国德喀什，获得的战利品除开常见东西外还得到了大象，并向宋朝进贡了一头会跳舞的大象。但在1006年，喀喇汗国在付出沉重代价后攻陷了和阗城，吞并了于阗，结束了于阗李氏的统治。但于阗的佛教徒持续抵抗了半个多世纪。喀喇汗国的皇室作家麻赫穆德·喀什噶里用了一首简短的诗来描述这次入侵：明永乐六年派遣使者进贡。于阗在喀喇汗国的统治下，语言和人种逐渐突厥化，并皈依了伊斯兰教。在1271至1275年间，马可波罗曾来过于阗。并记载于阗人已全尊崇默罕默德了。后经西辽、蒙古帝国、察合台汗国、叶