马上就被印尼入侵并佔领，1976年7月成为印尼的东帝汶省（Timor Timur）。接下来的20年zh-hans:里;zh-hant:里;，不断发生抗争运动，并爆发了持续二十多年的独立战争，造成了10－25万人的死亡。1999年8月30日，在联合国的监督下举行了全民公投，绝大多数的东帝汶人投票同意从印尼独立。印尼军方和反东帝汶独立者组建的东帝汶民兵随即展开了大规模的焦土运动进行报复。大约有1,400名东帝汶人被杀害，并强行驱离了30万人到西帝汶成为难民。国家大部分的基础设施（包括住宅、灌溉系统、供