来在重大选举中受到民进党的挑战，民进党提名陈水扁参选，加上原任台湾省省长的宋楚瑜脱党参选，和与陈水扁不合的前民进党主席许信良、及以批判国民党着称的作家李敖也加入此次选举。国民党败选后李登辉辞去党主席，隔年即遭国民党开除党籍。不久后部分李登辉支持者成立台湾团结联盟奉李为精神领袖，政治立场趋向台湾独立，并与民进党结盟；拿下第二高票的宋楚瑜则在支持者的期盼下创立亲民党，后与国民党合作，组成国亲联盟并掌握立法院的控制权。国民党在选后进行一连串的党务改造并和过去李登辉独台和本土化路线切割，逐渐走向蓝绿两大政治势力的竞