黄麴霉菌是造成麴菌症第二常见的病媒，仅次于薰烟麴菌（""）。黄麴霉菌会入侵肺或是脑的动脉，因而造成梗塞（Infarction）。嗜中性白血球减少症（Neutropenia）目前也被认定为是麴菌属的传染病。黄麴霉菌也产生毒素（黄麴毒素），而该毒素则是肝细胞癌（hepatocellular carcinoma）的其中一种病源媒介。
霉害.黄麴霉菌特别普遍存在于各种存放得不够干燥通风/真空的五谷杂粮(过期面粉、面包、稻米...)、坚果(榛子、核桃、杏仁...)、玉米、花生或黄豆之中，