在原址动工兴建面积400平方米的经堂，至1990年10月7日第一期工程完工，并举行复建落成典礼暨经堂开光仪式。1993年6月3日，葛根庙住持老布僧希日布扎拉森投资6万元建第二经堂“功德任运寺”，建筑面积120平方米。2000年代，由老布僧金巴接替老布僧希日布扎拉森担任葛根庙住持，老布僧希日布扎拉森则退居葛根庙内。到21世纪初，葛根庙共有喇嘛20多名，每年农历4月15日的庙会日，参加庙会的民众达4000人以上。 
建筑.复建后的葛根庙占地面积153万平方米，坐北朝南，位于陶赖图山