共中央正式发文，任命杨尚昆为中共中央办公厅主任、兼中央直属机关党委书记、中央直属机关警卫司令部司令员（中社部二室主任方志纯为参谋长）。以及军委秘书长、中央副秘书长等职；协助周恩来等处理中共中央和中央军委的日常工作。自1945年10月，杨尚昆一直担任中共中央办公厅主任一职，直到“文革”开始；前后执掌中共中央枢要长达20年。
1949年后.中华人民共和国成立后，杨尚昆继续担任中共中央副秘书长、中央办公厅主任，同时兼任中央军委秘书长、中直机关党委书记等职。1956年9月，当选中共中央委员