台之后，警备总部长期派人跟监郭廷亮；逝世当天，警备总部同样派了两名人员跟监郭廷亮。这让人怀疑警备总部跟郭廷亮的死有关。。他的死亡被民进党等团体及当下舆论怀疑是遭警备总部或是其他情治单位所谋杀。针对此疑点，郭廷亮的长子郭家瑜在2017年5月30日接受黄光芹电台专访时，亦认为其父死于谋杀。然而，经过他自己初步的调查，他却研判杀害其父者可能不是警备总部或其他情治单位，而是另有其人。台湾解严以后，对戒严时期疑案的翻案风盛行。当时孙立人兵变案部分相关人与其父并无来往，亦在争取政府相关赔偿。郭家瑜认为其父出面澄清真