2012年7月，民进党中央党职改选，余政宪参选中央执行委员（中执委），却首度以零票在中执委改选中落选。2014年7月20日，民进党第16届全国党代表大会选出中执委30人，余天、蔡宪浩、陈明文、余政宪、高志鹏、游钖堃、林俊宪、张基长、许西彬、钟佳滨、张廖万坚、王定宇、施义芳、陈启昱、陈茂松、王孝维、邱议莹与管碧玲均以18票当选中执委。​