党不同的是，日本社会党内部的派系往往存在意识形态上的差异，使得不同派系之间的矛盾难以调和，内部派系斗争往往具有破坏性。日本社会党的基层组织薄弱，十分依赖工会组织（总评），甚至被称为“总评政治部”。1989年总评宣布解散，与其他派系的工会组织合并为全国劳动组合总联合。全国劳动组合总联合与社会党的关系不如总评密切，对社会党造成冲击。前社会党委员长成田知巳认为日本社会党有三大问题：依赖工会、日常活动不足，以及脱离基层的“议员党”特性。
组织构架.日本社会党的党首是日本社会党中央执行委员长