查德威克让罗特布拉德留在利物浦当负责人，自己则于1943年11月开始视察曼哈顿计划的各处设施，而唯一没去的是生产钚的汉福德区，因为美方不准他看。他成为了除格罗夫斯和他的副手以外唯一一个可以进入美国所有铀原子弹研究及生产设施的人。查德威克在视察过位于田纳西州橡树岭K-25气体扩散设施之后，意识到他之前想要在战时英国兴建这种厂房是多么错的一件事。那种大小的厂房是不可能避过纳粹德国空军的注意。他在1944年初与妻子和现在带加拿大口音的孪生女儿迁往新墨西哥州的洛斯阿拉莫斯。由于保安理由，所以他有个假名，叫詹姆斯