现行法律或证据法则审查，经认定触犯内乱罪、外患罪确有实据者」，不得申请补偿。意即真正的「匪谍」和「共产党员」不能得到补偿。据中共官方媒体环球时报报导，1949年前后中共共派出1500余名特工进入台湾，被中华民国军事法庭公审处决的有1100余人。中国人民解放军总政联络部于2013年12月在北京西山国家森林公园建设无名英雄广场来纪念这些被处决特工。
争议.一种观点认为「白色恐怖」的根本原因为「内战」，而非「台独」。曾参与中国共产党省工委的陈明忠在「被扭曲的历史集体记忆」中指出白色恐