关键的共生真菌均只有的种类。能与许多种真菌形成兰菌根的兰花种类，其共生真菌通常也是能与多种兰花形成兰菌根者，这些兰花也可能同时与多种真菌形成兰菌根。不同种兰花间也可能因争夺形成兰菌根的共生真菌而产生竞争。有研究发现两种同域的珊瑚兰属真菌借由寄生不同基因型的真菌来避免竞争。了解兰菌根中兰科植物与真菌间的特异性，对濒危兰花的保育与复育相当重要，印度已有科学家成功从濒临绝种的成株兰菌根中分离共生的真菌，再加入种子的培养基上以助于其萌发，长成全株后成功移植回野外以达成复育的目标。