被迫转入地下，直到19世纪中叶鸦片战争之后。1922年外蒙古建立了第一个教区，但不久蒙古建立了共产党政权，所有传教活动全部终止。1991年蒙古民主化以后，天主教传教士回到蒙古，重建教堂。到2006年，已经有1个监牧区（天主教乌兰巴托宗座监牧区），一名主教（主教座堂为乌兰巴托圣伯多禄圣保禄主教座堂），3座教堂，1992年圣座和蒙古建立了外交关系。若望保禄二世曾计划访问蒙古国，本笃十六世有望成为第一位访问蒙古的教宗。
历史.天主教在蒙古地区有悠久的历史根源。传教士如鲁不鲁乞和柏郎嘉