莱茵河对岸的威斯特伐利亚公国、伯格和马克这两个地区。传统上，科隆总主教被列为德国的选帝侯之一，以及意大利和勃艮第的大书记官（Archchancellor），技术上从1238年和1263年（不再改变）直到1803年。在16世纪，至少有两位科隆总主教改宗新教。第一位Hermann von Wied 在改宗后辞去总主教职务。但是格布哈特·特鲁赫泽斯·冯·瓦尔德堡在1582年改宗加尔文派后，试图进行世俗化，这导致科隆战争，巴伐利亚军队安排一位巴伐利亚王子Ernst担任总主教，这是德国的反宗教改革第一个重大胜利。