1972年成立了叙利亚全国进步阵线。巴格达什决定加入该政治联盟。20世纪80年代初，叙利亚政府宣佈了对叙利亚共产党的禁令。该党许多活动受到限制并被安全部门严密监视，叙利亚共产党出版的《人民斗争》和《光明》刊物受到严重影响。1986年，由于叙利亚政府与苏联的良好关系，对叙利亚共产党的禁令解除。同年，巴格达什和副书记优素福·费萨尔就戈尔巴乔夫的改革与开放政策产生了严重分歧。并导致党的分裂。分裂的两党仍以叙利亚共产党名称加入叙利亚全国进步阵线。