1979年4月4日，来往九龙至广州的广九直通车重新运作。1981年4月26日，双轨设计的新笔架山隧道正式启用。1982年5月6日，英段首阶段的电气化工程完成，九龙至沙田近郊线电气化列车正式启用。1983年5月2日，沙田至大埔墟段完成工程。大埔墟至罗湖段电气化工程于同年7月15日投入服务，并由当时的香港总督尤德爵士主持通车仪式。
车站增减.因九广铁路电气化，九铁需增建车站，取消部份车站，及将其余车站现代化。1980年8月16日，位于染布房街/太平道的临时旺角站率先启用（即