，据传当时的萨拉米斯总主教安提蒙斯（Anthemios）因为神视而找到了巴尔纳伯的圣髑，因此获得了拜占庭皇帝芝诺的支持，因此巩固了赛普勒斯教会的自主权。七世纪末，拜占庭皇帝查士丁尼二世为了因应阿拉伯军队对塞普勒斯岛的侵扰，因此将岛上人口迁移到今日的埃尔代克所在地，并将新建立的都市命名为新查士丁尼亚（）。萨拉米斯总主教也将教座迁至当地，自此「新查士丁尼亚及全赛普勒斯总主教」就成为赛普勒斯教会领导者的头衔至今。
十字军时代及鄂图曼帝国.1091年，十字军佔领了赛普勒斯岛，建立了赛普