北海道旅客铁道根室本线沿着海岸以东西向通过辖内，往西可经由十胜地区接往北海道的道央地区，往东则可接往根室地区；位于市区内的钏路车站则是辖内最主要的车站，行驶纵贯北海道东部的钏网本线的列车也以钏路车站为起点，在此往北穿过钏路溼原，一直通往鄂霍次克海沿岸的网走市。根室线规划以东西向穿过钏路市辖内，目前道东自动车道已自十胜地区通车至市内的阿寒町地区，未来预定将通过钏路市市区北侧再往东通往根室地区。1972年起曾经营自东京港有明码头往返钏路的定期渡轮，单程时间约需31小时，但已在1999年11月停止营运。