2年（万历四十年），卒于泰安萧家府第，享年81岁。1616年（万历四十四年），朝廷追赠太傅。
着作.着作有《今古文钞》、《文章正宗》、《岳峰萧公奏议》、《家训》、《夷俗记》、《曲阜县志序》等。
墓地.明神宗敕令在泰安城西南金牛山之阳，为其营建陵墓，1617年（万历四十五年）竣工。今位于山东省泰安市岱岳区满庄镇东萧家林村，是山东省文保单位、全国重点文保单位。墓地保存有较完好的石刻和神道。
家族.曾祖萧叙经；祖父萧胜；父亲萧干（一说