一直病至去世。
与三国志不同之记载.裴松之在《三国志注》引《献帝春秋》记载，豫章太守周术病亡后，刘表荐封诸葛玄接替(另说是袁术上表荐封)，治南昌（今江西南昌）。东汉朝廷听闻周术过世，任命朱皓代替诸葛玄为豫章太守，朱皓请求扬州刺史刘繇出兵，共击诸葛玄。诸葛玄退守西城。建安二年（197年）正月，西城居民叛乱，杀诸葛玄，斩其首级送与刘繇。此说法与《三国志·诸葛亮传》的记载不同。裴松之认为《献帝春秋》作者袁晔、乐资所编撰的记述内文是悖离正统史书的妄说，应不可尽信(袁晔、乐资等诸所记载，