，由于幕府和长州藩达成停战后返回。又在庆应元年(1866年)末参加了第二次长州征讨，以山阴为目标进军（途中阿部正方身体不适，交由家老内藤角右卫门指挥）。顺带一说，此次出兵的准备过程中，福山城内保管的火药大爆炸，毁坏橹3栋。并且在翌年6月17日，福山藩在石见国益田与大村益次郎带领的长州军展开战斗后败走。这对福山藩来说是岛原之乱以来相隔了230年的战斗。此后，幕府方面诸藩因为多次败走而开始撤退，福山藩也在7月23日回归福山了。和战斗一样，严峻的藩内财政形势也越发紧迫，不过作为财政重建的王牌，庆应元年(1865年