，该地名命名方式与山顶上的芝山巖庙宇也有很大关系。（巖与岩同音。）数百万年前，芝山岩连同台北盆地仍为海底世界。直至数千年前的史前时代，台北盆地仍为一咸淡水交接的大湖泊时，芝山岩成为一小岛屿。自1896年至2000年的多次考古挖掘后，发现芝山岩遗址为台湾地区罕见的多文化层遗址。该遗址至少包含了汉人文化（清文化）植物园文化、圆山文化，芝山岩文化、讯塘埔文化与大坌坑文化等一个历史文化与五个史前文化文化层。1896年该遗迹初发现时，依照国际通行的办法，以最接近遗址的现代村落为该遗址命名的原则，因此将其遗址命