006年的联赛中，巴塞罗那作客对西甲另一支强队皇家马德里时，梅西在球场上的走动间接削减了敌方球队的进攻，结果皇家马德里在主场以0:3不敌巴塞罗那。
2006－07赛季.2007年3月12日，梅西于2006-07赛季中次回合的「世纪德比」中展示出精湛的球技，皇家马德里作客三度领先巴塞罗那，但主队凭梅西大演帽子戏法三度追平，最终以三比三逼和，他不但成为继前巴西国脚罗马里奥后十三年来首位在国家德比中连中三元的巴塞罗那球员，更是历史上第6位在比赛中独中三元的球员。同赛季梅西在2007年4月