站台原为低站台，后改为高站台。杭甬场接杭深线和宁杭客运专线，规模2台6线；而杭长场则有沪昆客运专线接入，规模2台5线。新的站台序号从原先的由西向东改为由东向西。杭州南站南侧设有萧山疏解区，面积约61.4公顷，是目前中国国内最复杂的高速铁路疏解区。沪昆客运专线和杭深线在疏解区南侧分别设有杭长杭州南线路所和杭甬杭州南线路所、通过4条疏解线形成互通，而和杭黄客运专线则通过杭长杭州南线路所的渡线接入。2016年1月10日启用杭州东至杭州南三四线、杭州东站南侧的宁杭甬场和沪杭长场南端的互通取消后，所以跨线列车需要