生物的叶绿体和线粒体中，它的结构中既含有两个PH结构域又含有一个S1结构域和一个KH结构域；多核苷酸磷酸化酶可以形成同源三聚体复合物，其构象与外切体的环状结构非常相似。因为在结构域组成和结构上的相似性，外切体和这两个复合物被认为在进化上有联系，可能具有共同祖先。外切体的核糖核酸酶PH类似蛋白、核糖核酸酶PH以及多核苷酸磷酸化酶都属于核糖核酸酶PH蛋白家族，为磷酸解核酸外切酶（使用磷酸盐作为亲核攻击分子来从RNA分子的3'端去除核苷酸）。
外围蛋白.除了九个核心蛋白之外，真核生物的外