温带，受西风带影响，降水稍多，喀纳斯湖年平均降水量超过1000毫米。南疆为暖温带，降水稀少，吐鲁番市年平均降水量不足20毫米。高山地区为高地气候，地形雨偏多，山顶有冰川。冬季有天山准静止锋活动。
水文.主要河流：塔里木河、伊犁河、额尔齐斯河主要湖泊：博斯腾湖、喀纳斯湖、赛里木湖、艾比湖、艾丁湖
山口.由南向北，与新疆接壤的山口是
交通.喀喇昆仑公路连接巴基斯坦伊斯兰堡和喀什，经过红其拉甫口岸。公路：吐乌大高速公路、乌奎