伐战后依旧领有北松浦郡与壹岐国。接着庆长五年（1600年）的関原之战时表示中立的态度，因此战后换取了6万3千石领地的安泰，确定了平戸藩的地位，在他任内国际贸易是藩经济的重要来源。4代镇信（天祥）分了今福领1,500石的领地给其弟信贞。在他治理的期间，宽永十八年（1641年）荷兰商馆被强制（幕府之意）从平户城搬到长崎，导致藩的财政发生很大的困难。为了强化藩的内政进行了全面的地籍丈量，以及振兴农、渔、商业，稳固了藩财政的基础。贞享四年（1687年）还改革了家臣的俸给制度，从知行制改成俸禄制。5代栋再分了