式种是卫甲包头龙（"E. tutus"）。第二个物种是"E. acutosquameus"，是于1924年被发现。虽然两个物种的尾槌形状不一样，但牠们却有可能是属同一物种。一些被认为是多智龙及甲龙的标本，亦有科学家认为是属于包头龙。在加拿大艾伯塔省及美国蒙大拿州一共发现了超过40头包头龙的化石，使得牠成为最多资料的甲龙类恐龙。这些化石包括15个头颅骨、牙齿、一个接近完整的骨骼以及鳞甲。特别是尾槌最为常见。