需要照顾出现严重妊娠併发症的妻子Kelli与他们刚出生的的第一个孩子，他也同样因此缺席了一个明星赛前的比赛。佩德罗亚在2009年9月9日的比赛对巴尔的摩金莺击出了第一次的单场两支全垒打。继2008年跑回联盟最高分118分后，2009年佩德罗亚又跑回美国联盟最多的115分（全大联盟纪录则是亚伯特·普荷斯跑回的124分），并且击出了大联盟第三多的二垒安打。2010年6月24日比赛中对科罗拉多洛矶队，佩德罗亚完成了5打席5安打5打点，并有三支全垒打，在第十局打出第三支全垒打带领红袜队以13-11赢得比赛。