让国安俱乐部为球队的不成熟付出了代价。第六名的排名是除甲A元年之外，国安队的最差战绩。当然在整个99赛季，国安也并非全然没有亮点。12月5日，联赛的最后一轮，国安主场迎战当时排名积分榜首的升班马辽宁队。在辽宁队取胜就可以稳获冠军的情况下，国安队通过高雷雷的进球逼平了对手，最终使对手与冠军失之交臂，成全了山东鲁能队。这在当年假球与默契球横行的时代显得弥足珍贵，时至今日这场比赛仍然被不时提起。
2000年.2000赛季，北京国安足球俱乐部终于有所动作，从大连万达队引进了高中锋小王涛