以减少美国的“足迹”，并将相关人员遣返美国。2000年10月，造成17名美国水兵死亡，这起事件与奥萨马·本·拉登的基地组织有关。2001年9月11日针对美国的恐怖袭击导致布什总统宣布打击国际恐怖主义。中央司令部很快推出了“持久自由行动”，驱逐阿富汗塔利班政府，阿富汗境内藏着基地组织恐怖主义分子，举办恐怖主义训练营，镇压阿富汗人民。中央战区司令部于2002年10月开始在非洲之角进行活动，协助东道国打击恐怖主义，建立安全的环境，促进区域稳定。这些行动主要采取人道主义援助，后果管理和各种公民行动方案的形式