兼任陕甘宁晋绥联防军卫生部部长。1943年与张琴秋结婚，二人无子女。第二次国共内战时期，1945年9月至1949年8月任中共中央军委总卫生部部长。1946年5月总卫生部与联防军卫生部抽调陕甘宁各部队的卫生队长、团、营军医三十多人，在延安柳树店中国医科大学旧址，开办了全军第一个公共卫生人员训练班。在四个月时间里学习了生理学，病理学、细菌学、寄生虫学、传染病学，环境卫生学，医学统计学等课程，实习了临床化验、水质检验、消毒，杀灭传染媒介等技术。1946年秋，为准备抗击胡宗南军队进攻延安，军委总卫生部把