地下二层为广佛地铁站台层。
站厅.菊树站站厅中南侧被划分为收费区，周围被行人通道以及车站商店包围，站厅收费区内设有一台专用电梯、三条扶手电梯和一组楼梯供乘客前往车站月台。商店及自助服务方面，本站现时没有设置车站商店；但设有中国银行自动柜员机以及“好易”自助服务等自助服务设施。
月台.本站设有一个岛式月台，位于增南路左侧的地底。
出入口.菊树站目前共设有2个出入口供乘客进出。
利用情况.本站周围目前被仓