大部分位于北回归线以北（北回归线通过其极南端），位于台湾岛正中央，亦是唯一不靠海的县份，但有唯一的岛屿：拉鲁岛，位于日月潭。南投县信义乡、高雄市桃源区及嘉义县阿里山乡交界处的玉山，为台湾岛上最高峰。县内众多的高山挡下来自南太平洋与东太平洋的季风水气，提供台湾丰富的雨水来源，使台湾较同纬度的地区拥有更多的年雨量；县境内并孕育出台湾中部四大水系的其中两个（浊水溪水系、乌溪水系）。南投县境内各地的原住民族有赛德克族、泰雅族、布农族、邹族及邵族。
生活圈分区.南投县以其境内生活圈可分为