3年发起的伊拉克战争。不过加图研究所支持了2001年对阿富汗的入侵以作为对911恐怖攻击事件的回应。加图的政策分析者也经常批评近年来政府政策对于公民自由所构成的侵犯，他们尖锐批评司法部长珍妮特·雷诺（Janet Reno）在1993年攻击德州瓦科市大卫教派本营的决定。而最近加图研究所也反对了美国爱国法（USA Patriot Act），以及对涉嫌恐怖行动的外籍人士的未审拘禁，并且也批评布希总统第二届任内对于执政权力的强硬扩张。
其他国内政策.加图研究所在1998年对许多州分与菸