子再度因怀孕退居竹三条府邸，据《枕草子·皇后住在三条宫殿的时代》记载，脩子、敦康此次随行。同年末的长保2年12月15日（1001年1月12日）定子生下第二女媄子内亲王后崩逝。
手足分离.母亲死后，脩子最初和一弟一妹为四姨母、宫人御匣殿抚养，但御匣殿于长保四年（1002年）去世。其后脩子被养育于宫中，敦康亲王为中宫彰子之养子，居飞香舍，妹媄子则先被太后诠子收为养女，很快诠子死去，之后出居宫外舅家，姐弟三人就此被分开抚养。后脩子于宽弘2年3月27日（1005年5月8日）虚岁9岁时举行