试十九名。万历十四年（1586年），登进士第三甲第十八名。任改翰林院庶吉士，三年后授简讨，升左赞善，历国子监司业、右庶子，升祭酒、詹事，升礼部右侍郎，教习庶吉士。又一年，改吏部右侍郎，充经筵日讲官三品。满六年，以继母羊太夫人里居，乞省觐。天启初召用，升礼部尚书，未及一年，致仕归。萧云举是万历三十八年（1610年）庚戌科的主考官，是礼部尚书钱谦益的座主。天启七年（1627年）二月，因病卒于家，享年七十三岁。着有《青萝集》五十余卷。
家族.曾祖萧蕃，生员；祖父萧满，曾任经历；父萧栋，曾