因扎吉摆脱了伤病的困扰，恢复了良好的状态。2005年10月16日，在卡利亚里和AC米兰的比赛中，因扎吉替补登场。这是他因为伤病缺席5个月后的首次出场。2005年10月23日，在因扎吉参加的第二场联赛的比赛里，他就打入了制胜一球，帮助AC米兰以2比1战胜巴勒莫。2006年2月12日，在AC米兰和雷吉纳的意甲比赛里，因扎吉上演帽子戏法，帮助AC米兰以4比1战胜对手。在这个赛季里，因扎吉重整旗鼓，一扫前两个赛季的低迷，为AC米兰打入了17个球，其中在联赛里打入12个。凭借在AC米兰的出色发挥，因扎吉入选了意大利国