2016年夏季奥林匹克运动会巴布亚新几内亚代表团是巴布亚新几内亚所派出的2016年夏季奥林匹克运动会代表团，这是该国第10次参加奥运。
田径.巴布亚新几内亚在田径项目上获得以下资格（每个小项最多三名来自同一代表团的运动员参赛）：
拳击.巴布亚新几内亚有一名拳击手获三方委员会邀请，取得奥运参赛资格。
柔道.巴布亚新几内亚有一名柔道运动员获得国际柔道联盟授予的一个额外大洋洲席位，取得奥运参赛资格。
游泳.巴布