骨之间有一些像气囊的东西。过去一些学者曾假设，兽脚亚目恐龙的身体都有气囊，而小坐骨龙的发现可能就是一个证明。另一个特征是骨头的骨壁很薄。
种系发生学.小坐骨龙被命名时被归类于美颌龙科，与生存于侏罗纪晚期欧洲的美颌龙、白垩纪早期英格兰的极鳄龙是近亲。小坐骨龙是当时已知的唯一美洲美颌龙科。在2010年，德恩·奈许提出小坐骨龙可能是暴龙超科的基础物种。