三年（1887年）在海南岛中部五指山冯还书写“手壁南荒”巨形山壁古刻；后任过云南、贵州提督，累官至太子少保，86岁卒于军旅，朝廷谥曰勇毅。冯子才逝后葬于钦州，朝廷诏予于钦州城东南隅（今市粮食局周围）建“冯勇毅公专祠”纪念，称“宫保祠”。其故居目前为爱国主义教育基地。着有《军牍集要》。