拓跋珪于邺置行台后回到中山，并打算回盛乐，于是修治由望都至代的直道，设中山行台以防变乱，又下令强迁新佔之山东六州官民和外族人士到代郡充实人口。皇始三年（398年）七月，拓跋珪迁都平城，营建宫殿、宗庙、社稷。同年十二月二日（399年1月24日），改年号天兴，即皇帝位。天兴二年（399年）正月，拓跋珪即位后不久便北巡，并分三道进攻高车各部，至二月会师时大破高车三十余部，另拓跋仪又以三万骑兵攻破高车残余的七部，皆大有所获。同年三月二十日，拓跋珪派遣建义将军庾真及越骑校尉奚斤进攻北方的库狄部及宥连部，将他们