终身统治者”的布劳略·卡里略，试图以此为基地重建中美洲联邦，但是不久即被推翻；9月15日，即中美洲联邦共和国成立纪念日的当天被处决。莫拉桑死后被洪都拉斯和萨尔瓦多奉为民族英雄，两国各有一个省以其名字命名，即洪都拉斯的弗朗西斯科·莫拉桑省和萨尔瓦多的莫拉桑省。