去大分机场也曾开办过飞往北海道、中国、四国、沖绳、乃至于九州其他机场的定期航班，但因为日本国内航线与城际铁路逐渐高速化的趋势，这些运量较小的定期航班都已缩减停航或降为包机航线。大分机场在1992年时启用国际航站大楼，但固定营运的国际航线仅有飞往韩国首尔（仁川）一条，其他多为不定期包机业务。由于与东京及大坂两主要城市之间都是採多家航空公司复式经营的模式，航班密度高，因此旅运数量逐年递增，在1995年时年起降旅客数突破200万人，并在2006年2月累计旅客数量突破5000万人次。而根据2014年度的统计，大分机