帝任命中书令魏兰根兼任尚书左仆射，为河北行台。定州、相州、殷州三州都受魏兰根管辖。被尔朱荣部将击败，依附高干，再一起依附高欢。高欢以他为车骑大将军。元朗即帝位，以其为尚书右仆射。高欢入洛阳，封他为永兴县侯。高欢后来考虑元朗世系疏远，有意尊奉尔朱氏所立的魏节闵帝，派魏兰根去观察节闵帝为人。魏兰根认为节闵帝神采高明，日后难制，与侍中、司空高干兄弟及黄门侍郎崔㥄强调节闵帝系尔朱氏所立，共劝高欢为了讨伐尔朱氏师出有名而废帝。高欢废黜了节闵帝，迫元朗禅位给平阳王元修即北魏孝武帝。孝武帝即位，高干被赐死。魏兰根离家避难