7月31日，戈林书面授权海德里希，以保证各政府部门协调推动犹太人问题最终解决方案的施行。1941年10月10日，海德里希作为高级军官参加了在布拉格举行的国家安全部“最终解决方案”会议。会议讨论了将50,000名波希米亚和摩拉维亚境内的犹太人迁移至明斯克犹太区和的方案。海德里希的地位使其在执行这一计划上扮演重要的角色：盖世太保已准备好在西部开展人口迁移，而别动队已经在东部开展大规模屠杀行动。与会人士亦计划在“之后几周”将布拉格的5,000名犹太人送交别动队指挥官及，而在保护国境内亦会建立犹太区：特雷津集中