2006年世界大学棒球锦标赛是于2006年8月6日至8月15日所举行的大学国际棒球赛事，限定由23岁以下的球员参加，也是第三届的世界大学棒球锦标赛。赛事在古巴哈瓦那举办，共有11个国家参与。美国八场比赛全胜，顺利达成连霸。