李烈钧通电全国倒袁，发动湖口起义，二次革命爆发。徐元诰和江西护军使欧阳武参加，在讨袁檄文上签名。二次革命失败后，参加起义人员均遭通缉。9月初，李烈钧逃往日本；欧阳武潜居吉安，在青原山出家为僧，号“止戈和尚”；徐元诰寓居上海法租界。当时，徐元诰被中华书局陆费逵聘为古文编辑，主编《中华大字典》，于民国4年（1915年）出版。民国4年（1915年）12月，袁世凯称帝，随后蔡锷等人在云南起义，宣布云南独立，组织护国军讨伐袁世凯。徐元诰赴云南，在李烈钧手下的护国军中任要职，随李烈钧部进军广西、广东。民国5年（