最近一次的变化发生在威斯康辛冰期（70,000至10,000年前），当时该地区属于温带雨林，年降雨量超过2,000毫米（80英寸）。圣胡安溪的水流量增加，有助溪流保持其原有的河道，而不是转往流向东方或西方。
水文与地下水.美国地质调查局分别在1928年至1969年及1969年至1985年这两段时期内，测量了流经圣胡安 - 卡皮斯特拉诺的一段圣胡安溪的流量。由于城市径流的增加，两段时期的数据有着明显差异。在1928年至1969年期间，该河段的平均流量为0.40立方米每秒（14.3立方