使东京被迫戒严；事后更逮捕了两千多人，其中被起诉者多达三百八十余人。第一次桂内阁声势因而更加低落，终被迫于次年1月总辞；桂太郎推荐明治维新功臣之一，出身公家、时任立宪政友会总裁的好友西园寺公望继任。在经明治天皇同意任命后，西园寺于1906年1月就任为内阁总理大臣。1908年6月，日本社会主义人士由于在集会中公开展示大面红色旗帜，被警方认为「对天皇不敬」，双方发生激烈冲突，并演变为大规模械斗。其中荒畑寒村、及堺利彦等14人更因而遭到警方逮捕，并分别被判处1年6个月至2年6个月的有期徒刑，史称赤旗事件。赤旗