2016年夏季帕拉林匹克运动会的独木舟比赛在9月14日至15日于罗德里戈·弗雷塔斯潟湖举行。本届是独木舟比赛首次成为残疾人奥林匹克运动会比赛项目。本届独木舟比赛只设爱斯基摩艇及竞速（或称静水）项目，共产生6面金牌。
比赛分级.残疾人奥林匹克运动会独木舟比赛是让有肢体残障的运动员参加的项目，所有运动员都会使用双叶浆进行比赛。按照运动员的残障程度，将他们分为3个级别：
参赛资格.每个国家最多只能在每个项目派出1名运动员，共6位运动员。运动员必须参加201