东北军事，请示机宜。12月24日，飞返沈阳。1948年1月，他任新成立的东北剿匪总司令部副总司令。3月，他兼任第一兵团司令和吉林省政府主席，率军坚守长春。1948年5月，长春被中国人民解放军东北野战军第一兵团包围，长春围困战开始。24日，解放军攻占长春大房身机场，切断了长春与沈阳的空中联系。5月30日，林彪召集东北局、东北军区负责人会议，会议决定对长春采取围困方针，并决定了围困及严密封锁长春之部署。6月底，郑洞国组织了战时粮食管制委员会，并颁布《战时长春粮食管制暂行办法》，规定市民自留口粮数量只许维持3个月