神户开往基隆。1943年（昭和18年）3月19日，由门司航向基隆的途中，在基隆外海彭佳屿东北方遭到美国潜舰攻击后沉没，包括船客和船员在内，罹难者共844名。3月24日，递信省公布高千穗丸遇难。
高千穗丸题材的作品.电影《南方纪事之浮世光影》以高千穗丸遇难的事件作背景，主角黄清埕为罹难者之一。黄玉珊导演、2005年。