945年至1949年的印度尼西亚独立战争期间，印尼的内阁由总统制转为议会制，尽管这并不是制宪者的初衷。不过在一些关键时期，内阁曾恢复为总统制。在独立战争期间，内阁通常由12至15个部门的16到37位部长组成。1949年12月27日，荷兰承认了印度尼西亚联邦共和国的主权。根据《1949年联邦宪法》，联邦共和国内阁为议会制，内阁成员负责制定政府的各项政策。1950年8月印尼共和国（原印尼联邦共和国的组成部分）政府与印尼联邦共和国政府达成协议，印尼恢复为统一的单一制共和国，保留议会制内阁。《1950年临时宪法