名称与在新加坡的城市丰收教会相似，有不少人都误会两者有关连：香港丰收教会是一间聚会人数不多，资源有限，本是一安分守己，毫不起眼之堂会；新加坡的城市丰收教会是当地最大的教会。2005年12月15日，教会的其中一位董事谭珮筠组织了一个祈祷团前往东马来西亚沙巴的鲁姆神山静修，并在山上失踪。之后一直音讯杳然，而且参与者对于她失踪的详情及原因众说纷纭。到了2006年2月初，她的家人发现有人不断透过从她的八达通卡提取现金，总额接近一万元，于是报警求助。教会负责人拒绝就事件回应。但亦有人指出涉及此次事件为另一同名教会