被任命为德国北方部队和民防司令。1945年4月30日，希特勒自杀。根据他最后的遗言，希特勒将赫尔曼·戈林和海因里希·希姆莱从纳粹党里开除、撤去他们所有权力，并任命邓尼茨为他的继承者，作为帝国联邦大总统（并非元首）和德意志武装力量最高统帅，而宣传部长约瑟夫·戈培尔成为政府首脑和德国总理。希特勒认为，德国陆军（因为没有执行希特勒「战到最后一人」的命令）、空军（空军总司令戈林和盟军私下谈和）和党卫军（党卫军全国领袖希姆莱也和盟军私下接触，党卫军上将的菲利克斯·施坦因纳又不执行希特勒的攻击命令）都背叛了他，只有海军