也引来了国际间的一阵挞伐。荒胜文策在日记中表示，该次拆除工作完全是非必要的，因为该设施是用作纯学术用途的，与原子弹制造毫无关系。拆除工作由两位来自美国海军部的军官监视。荒胜文策的大量报告与制作之仪器因此大量流失，但其中有部分被保留在广岛县西南部的吴市海事历史科学馆。在拆除作业中担任翻译员的柏克莱加州大学名誉教授汤玛斯·史密斯表示，他因为亲身参与了侵犯荒胜教授学术成就的工作，而感到黯淡无光。拆除后，荒胜文策在日记中描述其研究室成为一片「惨澹的光景」。除了京都大学之外，该次行动也拆除了东京大学与大坂大学的加速器