全自旧庙拆得，并由董旺主持一切工程事务。终战后，管理人叶万福、林松、赖渊爵及信士董旺、王天恩、潘丽水、林焕彩等发起整修，信众热情响应捐助，后于1946年（民国三十五年）修建完工。1948年农历九月，八吉境五帝庙举办落成典礼，八吉境各庙宇及交谊境东岳殿赠送匾额表示庆贺。1978年，信徒董水治及周金建发起整修募捐，并于1980年农历九月宣告完工；期间，潘岳雄义务协助彩绘门神及其结构构件，陈高福捐赠牌楼内五帝庙石碑，多位信众提供物资与人力。1984年1月，台南市都市计画变更，忠义路进行道路拓宽工程