用「圣约翰大学」或工商学院名义申请在台复校，然而当时中华民国教育部已终止开放设立新的私立大学。再者，为配合当时国家经济发展之需要及政府教育政策之要求，当时只好奉中华民国教育部之核准而改办五年制工业专科学校，并于1967年开始招生。校名採用学校所在地、今淡水区新埔仔，故命名为「新埔工业专科学校」（英文校名仍承併校宗旨，称 St. John's and St. Mary's Institute of Technology）。最初只有五专部的工业设计科、工业管理科及机械工程科等三科。 1968年，增设电子工程