4号线车站都贴有列车时刻表。而到2006年，4号线二期（新造至沖尾）的工程可行性研究报告亦获得批覆。2006年8月16日，4号线新造—黄阁段区间8标高架桥合龙，成为4号线高架段首段合龙的高架桥，以及首段采用拼接法建造的高架桥。2006年11月18日，新造至黄阁段长轨，于低涌站完成焊接，标志着四号线长轨正式铺通。2006年12月4日，黄阁变电所成功受电，标志着四号线二期全线电通。12月20日，四号线大学城专线段暂停服务9天，进行熟悉路线及开通前的营运演练。2006年12月30日，4号线恢复服务，同时从新造