府迁台后，牛稠子遗址经历了地表调查和各项试掘计画。由不同的单位负责，但都缺少整合性的调查研究，以近期2013年的牛稠子范围、内涵调查研究及文化资产价值评估计画，最为全面且详细釐清牛稠子遗址的相关文化内涵及文化类缘。1960年林朝棨先生针对西南平原地区进行贝冢调查、1975年宋文薰先生等地表调查、1976、1991年国立台湾大学人类学系试掘、1980年全省重要史蹟勘查与整修建议─考古遗址与旧社部分调查、1992年台湾地区重要考古遗址初步评估第一阶段研究计划、2012年仁德文华二段与2号计画道路叉口牛稠子遗址抢