郡治不位在北门庄，而是位在佳里街。北门庄在二战后成为台南县北门乡，在2010年随着台南县市升格改为台南市北门区至今。
行政区划.北门地区在清治时期隶属学甲堡，于日治时期1896年4月隶属于台南县嘉义支厅。1897年5月，改隶于嘉义县盐水港辨务署。1898年6月，改隶于台南县盐水港辨务署。1901年11月，改隶于盐水港厅北门屿支厅。1904年4月，盐水港厅实施街庄整併，北门地区整併为4庄，成为日后大字的雏形。1909年10月，改隶于台南厅北门屿支厅。1920年9月1日，原堡里之行