。传统双生子研究的方法的部分批评没有考虑到上面提到的方法创新和改进。
多代谱系设计.对多代人进行研究可以提高结果的功效，可以使用类似于ASReml的软件分解遗传和环境的多种混合，估计遗传度。此类研究有助于对类似于逆向因果、母体效应和显性、共享环境、母方基因效应的混杂进行控制，但一般得到的遗传度估计的功效低于双生子研究。
方差分析估计法.另一种估计遗传度的方法是方差分析。
基础模型.以下是Kempthorne (1957 [19