判，新国王睿宗对他不满，把他降职为兼司仆将，与南怡同时被登用的柳子光告发他谋叛，南怡被逮捕审问后承认有谋叛计划。与谋叛计划有牵连的官员包括领议政康纯，后来发展为大规模整肃，南怡、康纯、曹敬治、文孝良（女真族出身将军）等30位武官被处刑，他们家人被贬为奴婢。
影响.韩明浍和申叔舟等勋旧派人独佔权力至成宗前半期，直到士林派兴起为止。万历朝鲜之役后，一部野史指摘柳子光捏造谋叛事件，南怡在民间被神格化成为信仰的对象，350年后朝鲜纯祖时代，应他后代上疏恢复南怡名誉。