年（1888年至1894年）间，由黎巨林设计。作为书院，始建时用作广东各县陈氏子弟来省城应科举时学习及住宿场所，也是祭祀祖宗的宗祠，为私人物业。中华民国年间，陈家祠内供奉的牌位，据统计有上万块之多。日军佔领广州期间，陈家祠并未遭遇严重损毁。中华人民共和国成立后，1957年，进行了全面维修。1959年，陈氏书院被政府辟为广东民间工艺博物馆，从此停止祭祖功能。1964年对头门和聚贤堂进行维修。1966年文化大革命期间，万块牌位尽被烧毁，尽余两块倖存。两栋坚厚的木大门上的两个门神公，被人用凿子挖成大坑