人造的刺激物和环境中的研究，不利于探索动物们在自然环境中的本能认知反应。但是也有很多现代认识性动物学家提出了自然生态与设计实验相结合的研究方法。
与数学的联系.研究认知动物行为学的数学家们，通常将动物们在自然环境中的认识反应与数学哲学相联系。数学家们联系“动作与感知”，从而解释其与欧拉恒等式中的常数关系。（例如，动物们有意识地用手臂扫出的空间。）
与道德学的联系.Bekoff, M and Allen, C (1997)描述三种主要人群（支持者，怀疑论者以