其中包括日本国宝89件、重要文化财产644件（2019年3月止）。博物馆由独立行政法人国立文化财机构运作。同时，社团法人“日本工艺会”的总部也设于馆内。
历史.
草创之初.1872年（明治5年）3月，日本文部省博物局在当时的汤岛圣堂大成殿（现在东京都文京区汤岛）举办了国内首次博览会。当时的宣传广告及入场券等均保存于文部省博物馆内，这也是日本“博物馆”的发端。东京国立博物馆也以这一年作为其创设年份。当时博览会主要以将在次年的1873年维也纳万国博览会出展的展品为