受新型冠状病毒疫情致乘客量下跌影响，由2020年2月29日起，星期六早上繁忙时间所有列车均往来红磡站至上水站。
沙田马场赛马日或双边投注赛事特别班次.在沙田马场举行赛马日、进行双边投注赛事或有特别活动时，东铁线会有特别班次途经马场，主要路线如下︰
城际客运服务.港铁公司、中国铁路广州局集团、中国铁路上海局集团联合营运来往香港红磡站至广州、上海及北京的城际客运列车服务。通常直通车会全程使用本线的正线（罗湖-火炭-红磡），并在整段九广铁路（广深铁路及东铁线）