上的生物的不到1%。因此，我们看到的化石只是连续的演化过程中的一个个瞬间，过渡化石可以帮助我们了解生物分化的过程有哪些阶段，但无法补满每一步过程。化石纪录也带有偏误。通常坚硬的构造较容易成为化石，因此缺乏骨骼的生物则鲜有化石。化石纪录较完整的类群有嵴椎动物、棘皮动物、腕足动物和一些节肢动物。
重要例子.
始祖鸟.始祖鸟是兽脚亚目底下的一属恐龙，和鸟类非常近缘。第一个完整的化石在1861年发现，之后陆续发现了另10组化石。这11组化石大多都有羽毛存在的痕迹，