6年8月，文化大革命爆发，上海各礼拜堂的神职人员无一幸免，均遭到残酷野蛮的批斗，这时李储文才被迫向批斗他的红卫兵公开表明了自己共产党员的身份，随后被有关部门保护起来。李储文的共产党员身分的公开，使得许多不知内情的基督教人士感到十分震惊（与之类似的还有中华圣公会华北教区总干事、燕京协和神学院教务长、北京基督教三自爱国运动委员会副主席赵复三，在1964年夏作为革命干部奉命调入世界宗教研究所，负责批判神学的任务，并在1980年代出任中国社会科学院副院长和党委副书记）。据新华社香港分社前社长许家屯表示，李储文确实是