渡轮返回珠三角，部分船公司及航空公司更提供预办登机及行李托运等服务。海天客运码头现时由珠江船务企业（集团）有限公司及信德中旅国际物流投资有限公司组成的香港国际机场码头服务有限公司营运，由珠江客运提供前往中山、深圳蛇口、东莞虎门（太平）、珠海九洲及由喷射飞航提供前往澳门及深圳福永的境外客轮服务。而于蛇口港亦设有预办登机的服务柜台。
跨境旅游车服务.跨境巴士服务在2003年开始运作，连接各珠三角城市。机场认可的营运商包括香港中旅汽车服务、永东直通巴士、环岛大陆通、中港通及华通中港