中国特色社会主义的意识形态，意图影响各国对中国的评价。美国《华盛顿邮报》指，和其它文化学院（如英国文化协会和法国文化协会）不同的是，孔子学院一般是在大学内运作，并在这些机构的课程上行使一定的影响力。并指这样可能威胁它们的诚信。美国华盛顿智库「2049计画研究所」2013年10月公布一份报告中指，孔子学院在传授汉语的同时，也在灌输有利中国的意识形态，借此影响对中国的评价。2009年芝加哥大学设立孔子学院时，该校174名教授联名反对，理由是担心大学的学术自由会受到有中国政府背景的孔子学院影响。组织这项连