帝溥仪退位后，理藩部仍然暂时负责蒙藏事务，大政方针则由具临时政府性质的“临时筹备处”决定。该时期，理藩部正首领先是达寿，后来达寿“因病不克进署”，中华民国临时大总统袁世凯乃于1912年农历三月初七任命荣勋为理藩部正首领。1912年4月10日，袁世凯任命张元奇为内务次长，专管蒙藏事务。同年4月22日，袁世凯下令内务部接管理藩部，理藩部原来负责的事务划归各部。1912年7月24日，北京政府成立蒙藏事务局，7月25日公布了《蒙藏事务局官制》。8月5日，内务部发出通告称，概不接受关于蒙藏的文件，蒙藏事务由此正式