乱渡过长江。当时琅邪王司马睿镇守建邺，下令说：“王佑的三个儿子才到，名德之人的后代，都有操守品行，应得到录用。而且可以给钱三十万，帛三百匹，米五十斛，亲兵二十人。”王峤很快被任命为世子东中郎参军事，没有就任。晋愍帝司马邺征拜王峤担任着作郎，右丞相南阳王司马保也征召王峤做官，王峤都以道路艰险没有前往。司马睿担任丞相，任命王峤为水曹属，王峤出任长山县县令，升任太子中舍人，因病没有就任。王敦请王峤担任参军，封九原县公。王敦在石头城时，想要禁止私人砍伐蔡洲的荻，向属下官员询问。当时朝廷的军队刚战败，士人和百姓惧