个公司俱乐部会籍等奢侈而非必要的福利，为外界所非议。政府有感该等问题日渐严重，如同「独立王国」。为此，政府于2001年修订《九广铁路公司条例》，将管理局主席及行政总裁交由两人出任，以加强政府对九铁的管治，并于同年12月委任田北辰为九铁管理局主席，而杨启彦则为九铁行政总裁。
事件经过及结果.2006年3月10日，九铁署理行政总裁黎文熹连同全部5名总监及19名总经理，写了一封机密信给公司管理局信去管理局，指主席田北辰在九铁内部干预过多、要求透明度过高及过份要求问责、公司主席和行政总