赛事有82支球队参加，其中47队是各地都道府县的代表，另外有1队是大学队的代表。以上球队将会参与第一及第二圈之赛事，胜方将可以于第三圈挑战J2球队，18支J1球队亦会于第四圈加入角逐。
比赛.
第一圈.各地都道府县共47队球队及大学代表（坂南大学）开始角逐2008年天皇盃。
第二圈.第一圈胜出之球队将会于本圈互相对碰，胜出者将会晋级第三圈。
第三圈.本圈有15支J2球队及一支日本足球联赛代表（栃木SC）加入。