鸟园亦种了大量树木。园内尽可能引入源自马来群岛的植物或相似品种，以适应香港冬天。树木品种主要为无花果树（例如不同品种榕树）、木棉、石栗、棕榈树、竹及羊齿植物等，丰富林内植物品种。
水禽湖.水禽湖位于观鸟园旁边，原本是饲养塘鹅及其他水禽的地方。自从禽流感爆发后，为免受到感染，塘鹅已迁至园内饲养，水禽湖亦已荒废。2005年9月，从澳洲运至的3只塘鹅，若水禽湖未弃用，应该会在该地继续养。
雀鸟展览区.由于体型大的犀鸟会捕捉其他雀鸟吃，所以观鸟园编了牠们