区境内。着名观光地美原和上高地也位于松本市辖区内。松本市地形复杂，市内有众多沖积扇，纟鱼川静冈构造线亦穿过松本盆地东侧。因松本市内有较多断层，因此也是地震较多的地区，最近一次较强的地震发生在2011年6月30日，松本市内最大震度达5强。松本市主要的河川有梓川、、等河流。松本市的森林面积达74,000公顷，森林覆盖率达81%。
气候.按柯本气候分类法，松本市属于副热带湿润气候（Cfa）和（Df）。按日本国内的气候分类，松本市则经常被视为的典型代表。松本市降水较少，日照时间较长。但山地