就有四门四额之称，所谓四门四额分别是指：东门为定额山—善光寺，南门为南命山—无量寿寺，北门为北空山—云上寺，西门为不舍山—净土寺。善光寺并无明显的属于哪个佛教教派，因为善光寺成立之前日本尚无教派的分别。但是也因为历史上多次辗转易主，所以同时也是属于天台宗与净土宗的别格本山，目前寺内住持是由天台宗与净土宗各别掌管。寺中供奉的善光寺阿弥陀三尊是日本文化史上重要的绝对密佛之一，所谓密佛是在其他的佛教国家当中相当罕见的祭拜形式，由于信仰上的理由，密佛是属于非公开的佛像，因各派教义与规定不同，会有一定时间的公开参