木被推为临时市长。3月8日，国军攻入屏东市并进行捕杀活动，叶秋木遭国府军拘捕。之后，以「暴乱首谋」名义游街示众，于屏东市台湾银行前三角公园遭枪决。被控行为不端，遭到枪决。 据口述历史，被逮捕的叶秋木下场十分悲惨，国军以「暴乱首谋」的罪名，割掉鼻耳及生殖器，将叶秋木拖出去游街示众，最后再予以枪杀。