女性的症状包括阴道分泌物或排尿疼痛，男性的症状包括阴茎分泌物、排尿疼痛或是附睾炎。女性的披衣菌感染可能扩散到上生殖腔，造成骨盆腔发炎，导致不孕或是异位妊娠。若眼部反覆感染，又没有治疗，可能会导致沙眼，开发中国家最常见的失明原因。披衣菌会透过阴道性行为、肛交、口交传播，若产妇带有披衣菌，在分娩时也会传染给婴儿。若是在卫生条件较差的地区，眼部的感染也可能是因为个人接触、苍蝇或是受污染的毛巾所造成。砂眼衣原体感染只会发生在人类身上。诊断一般会透过进行，若是二十五岁以下，经常有性行为的女性、其他高危险群的女性建议