布拉格领导的入侵肯塔基军事行动，这场行动以失败告终，之后他成为埃德蒙·柯比·史密斯在跨密西西比部的参谋长。战争结束后，巴克纳开始在政坛上活跃起来，于1887年第二度参选肯塔基州州长并成功当选。他的任期长期受到该州东部暴力争斗的困扰，其中包括哈特菲尔德-麦考伊夙怨和罗恩县战争。并且绰号“诚实迪克”的州财务官詹姆斯·威廉·塔特从州国库中盗取25万美元潜逃这一丑闻也令他所领导的行政部门声誉大受打击。身为州长的巴克纳以经常行使否决权闻名，单1888年立法会议期间行使的次数就超过之前十任州长总和。1895年，他参