797年的使英吉利海峡和北海舰队近乎瘫痪，但这一问题很快得到解决。纳尔逊领导的英国地中海舰队未能于1798年阻止拿破仑·波拿巴入侵埃及，但在此后的尼罗河河口海战中击溃法国海军，将其陆军困于埃及。波罗的海诸国决定加入法国一方，于是英国对丹麦发动攻击，在哥本哈根战役（1801年）中丹麦海军损失严重，被迫同英国求和。战争期间皇家海军亦通过两栖行动夺取了多数的法属加勒比岛屿及好望角、锡兰和东印度的荷兰殖民地，但加勒比地区的战事导致了大量由热带疾病造成的损失。1802年的《亚眠和约》暂时中止了战事，多数所得均归还