也可以用于从目标生物体去除遗传物质，创建一个基因敲除生物体在欧洲，遗传修饰是遗传工程的同义词，而在美国，“基因修饰”一词也可以指常规的育种方法。加拿大的监管制度是基于产品是否具有新颖的特征，而不管来源的方法。换句话说，如果产品携带一些先前在物种中未发现的性状，则其被调节为遗传修饰，无论其是使用传统育种方法（例如选择育种，细胞融合，突变育种）还是遗传工程产生的。在科学界，“基因工程”这个术语并不常用。取而代之的是更为具体的术语，例如“转基因”。
历史.数千年来，人类通过选择性育种或人