出生于日本埼玉县。1894年，安藤正次进入预科，并于1898年自该校本科毕业，前往东京修习英语及德语。到了1901年，安藤正次开始于东京帝国大学文学部言语学科就读，并于1904年7月毕业，二个月后被任命为神宫皇学馆教授直至1916年辞职。辞职该年受文部省委託，进行国语相关调査。1917年，安藤正次成为日本女子大学的国文科教授，到了1925年3月则转任早稻田大学教授。
前往台湾.1926年3月，安藤正次前往台湾，受聘为台湾总督府高等学校语言学教授。同时，他也被台湾总督府聘任为在外