2009年，南航货运订购的首架波音777F型货机交付使用，随即在12月4日开通上海至法兰克福的往返货运航线。2010年7月23日，为了推进南航广州货运转运中心的建设，南航货运开设了首条从广州始发的货运航线：广州－阿姆斯特丹。2010年11月3日，在荷兰阿姆斯特丹举行的国际航空货运协会航空货运论坛暨博览会上，南航货运与天合联盟正式签署了入盟对标协议。南航货运按计划加入天合联盟货运，成为中国首家加入国际航空货运联盟的航空公司。2018年11月15日，中国南方航空发布公告，决定自2019年1月1日起不再