日本—菲律宾关系（日语：日本とフィリピンの関系、他加禄语：Ugnayang Hapon-Pilipinas、英语：Japan–Philippines relations），又称日菲关系，是指日本国与菲律宾共和国之间的外交关系。目前，两国互设大使馆，日本还在菲律宾第二大城市达沃、第三大城市宿雾拥有总领事馆，而菲律宾也在日本名古屋和大坂设有总领事馆。
背景.日本与菲律宾关系主要因为日本海上经济贸易与交通线会通过南海海域相关，日本为了确保在南海海域的海上航道安全与在南海的自由航行权，加强