1958年与总爷糖厂合併为麻佳总厂，萧壠厂仅保留生产部门。1974年改制，两厂分别更名为麻豆糖厂与佳里糖厂，并改隶新营总厂。1985年改由总公司直接管辖。1998年7月1日因国际糖价长期低迷及台湾加入世界贸易组织的双重影响下，本厂正式裁撤，制糖业务併入善化糖厂。
使用车辆.德马牌 DIEMA B型基本资料:车号(佳里糖厂):129142147149
现况.大部份厂区由台南县政府于2003年承租，名为萧壠文化园区，经常举办各种艺文活动，其中以举办