于凝胶过滤机理，分子按大小分开，由于凝胶电泳机理，分子按电泳迁移率分开。 此外，还有二级色谱溶质保留机制。 
毛细管电色谱.毛细管电色谱（CEC）是一种电色谱技术，其中液相流动相通过电渗作用通过包含色谱固定相的毛细管。 它是高效液相色谱和毛细管电泳的结合。毛细管用高效液相色谱固定相填充，通过分析物的电泳迁移和在固定相中的差别分配，施加高压实现分离。