「东南人民反共救国军」，自任总指挥，以台湾和舟山群岛为据点策划反攻大陆。同年，军统与中统被取消，特务领导权被蒋经国所据。翌年毛森被改任台湾省警务处处长，但他志在反攻大陆，准备前往泰缅边境组织国军残部从事反共游击活动，拒绝了这个任命。他在泰国的活动引起李弥亲信的不安，又批评台湾驻泰人员与李弥亲信，俞济时邀他1951年底前返台详述。他后来遭到国民政府的通缉，经香港流亡到琉球。1968年移居美国。由于毛森军统特务的身份，在文化大革命期间，留在江山的父亲与两位兄长都被红卫兵迫害致死。晚年的毛森罹患帕金森氏症