从长安城内调来的三万精兵防御停驻于灞上的桓温大军。后桓温因败于苻雄，亦缺乏军粮，于是退兵，苻苌等于是率大军追击，杀伤晋兵以万计。苻健不久追论抵抗桓温的功劳，以苻菁为司空。皇始五年（355年），苻菁改任太尉。同年，因应苻苌于上一年十月去世，苻健立了三子苻生为太子。苻健在六月患病，至庚辰日（7月5日），苻菁以为苻健已死，于是带兵攻入太子所住的东宫，意图杀死苻生，自己登位。不过当时苻生在苻健所住的西宫侍疾，苻菁于是转攻东掖门。苻健知道外有变乱，于是登上端门陈兵自衞。苻菁部众见苻健未死，恐惧之下都自溃，苻健于是