查士丁尼大瘟疫（英语：Plague of Justinian）是公元541至542年发生在拜占庭帝国的一场大瘟疫，是第一次鼠疫大流行的开端，也是人类历史上致死人数最多的流行病之一。当时包括首都君士坦丁堡在内多地受到影响。关于是次瘟疫的具体疾病，最广为接受的说法是鼠疫。大瘟疫分为五次爆发：公元541-544、557-558、572-574、590及599。其中第一次爆发导致了帝国1/3总人口病死，人口数由约4000万下降到2600万，单是首都君士坦丁堡就已病死了40%居民。547-548年轮到牲畜爆发瘟疫