筹划复建事宜，2007年，大报恩寺遗址公园正式启动建设。2008年8月7日，在南京大报恩寺遗址出土的铁函中发现了七宝阿育王塔，内藏“佛顶真骨”。被评为2010年度全国十大考古新发现。大报恩寺重建工程是南京市2010年城市建设“十六个重大项目”之一，万达集团董事长王健林向该工程捐赠10亿元人民币。2015年12月16日，大报恩寺遗址公园开园并于次日正式开放。