舍上进行连载并发行出版；单行本全8卷。尚未完结，后移至集英社连载。此版本为截取电视动画分镜以漫画的形式出版的。全3集。
集英社.
YOUNG JUMP COMICS.曾传出因PEACH-PIT不满幻冬舍遗失原稿与长期对作品的订正错误，因此双方展开长期冷战，使得《蔷薇少女》的连载进度严重拖延。在经过数次的协调后双方关系依然冷淡，因此PEACH-PIT决定结束《蔷薇少女》连载，于2007年5月30日在幻冬舍《Comic Birz》做最后一次连载（43期），