强烈的反对情绪受到安抚，但计画案之决策层次后来已经升高到政治领域，例如当时的台湾省议会在国民党与民进党的派系角力下决定拜耳案是否需进行环境影响评估与通过租地给拜耳公司，以及立法院决定是否给予地方自治团体透过公民投票决定地方公共事务之法定地位。而1997年台中县县长选举的结果，也变成了拜耳案是否透过公民投票作为决策的依据。以结果来看，1997年当选第13届台中县长的廖永来以履行竞选诺言而要进行公投，在计画案后期主导了反拜耳设厂一案。也有研究认为，当时的台湾省长宋楚瑜与行政院连战内阁的心结也导致了拜耳案迟迟未能