始筹备起义。2月初，但懋辛、熊克武、喻培伦赴广州察看地形。2月中旬，但懋辛携10万元赴日本交给吴玉章购买武器弹药。革命党人将军火分为六批运回中国，但懋辛负责押送第五批，于3月28日抵达广州。当天，黄兴和众人商定，于3月29日下午5点30分举行起义。在黄花岗起义中，但懋辛冲进两广总督府时负伤，喻培伦为其包扎，后来熊克武扶其撤退，但清军搜查甚严，但懋辛让熊克武到东一区找巡官李天均（革命党人）回香港。李天均送走了熊克武，却因胆小而未搭救但懋辛。此后，但懋辛赴东一区找李天均，途中被捕。巡警道王秉恩见其自供状文辞巧妙