划在随后三年内，利用新开发的、更快、更便宜的技术，测定来自不同族群的数量至少一千名的匿名参与者的基因组序列。在2010年，该项目完成了试点阶段，数据结果发表在《自然 (期刊)》杂志（Nature）上。在2012年10月，1092个基因组的测序结果公布在《自然》杂志上。2015年，两篇关于项目结果和未来展望的论文发表在了《自然》杂志上。项目识别出许多限于密切相关群体的罕见变异和八种结构类变异。该项目联合来自世界各地机构的多学科研究团队，包括中国、意大利、日本、肯尼亚、尼日利亚、秘鲁、英国和美国。每一个团队