肌肉疼痛、头痛和背痛。其他如红舌、红脸、红眼，亦容或有之。在约15%的病例中，甚至牵连到内脏——肝、肾和心。也有的出现消化管道出血（吐血）现象。随后病情可能因伴随肝功能衰竭的黄疸和/或伴随蛋白尿症的肾功能不足而变得复杂。如果继续恶化，会跟着发生精神错乱、痉挛（seizures）和昏迷、低血压和脱水也是常有的，此阶段会导致死亡，约为20%。因此整体的死亡率约为3％，但个别地区的整体死亡率可高达50％。病死者在发病后的六至七天内常常这样。由于黄热病的死亡率高及传染性强，已纳入世界卫生组织规定之检疫传染病之一