后蒋仲苓如期退役，转任战略顾问。后来再出任国防部长。而李登辉后来在推动修宪时，取消行政院长的副署权，亦源于此事。
军事会议.郝柏村就任行政院长后，多次不顾总统才是三军统帅而擅自召开军事会议引发重大争议。1990年7月，立法委员叶菊兰率先质询郝柏村召开「体制外军事会议」，对此郝柏村起先透过郭天佑对外发言：「这是无中生有、颠倒不实的消息」，国防部军事发言人也否认郝召开军事会议。7月23日，郝柏村第七度召开军事会议，终于引起总统府的反击。叶菊兰于其夫婿郑南榕为争取言论自由而自焚当年，