玄立，赤眉军闻汉复兴，遂西降更始帝。刘恭随樊崇等西入洛阳，被封为式侯。以明经数言事，拜侍中，从更始在长安。后赤眉军复叛，立刘恭弟弟刘盆子为帝，攻更始帝，刘恭自首入狱。赤眉于更始三年（25年）九月入长安，刘恭得知，枷锁没解除就出狱投奔更始帝。中途遇到京兆尹解恽和定陶王刘祉。刘祉解开刘恭枷锁并和解恽以及刘恭一同和更始帝会合。赤眉号称20天内更始帝投降，可以封为长沙王，更始帝刘玄于是于同年十一月让刘恭向赤眉请降。赤眉本欲杀死更始帝，刘恭大怒要自刎，赤眉首领急忙制止，并封更始帝为畏威侯。刘恭不满，持续向赤眉施压