因的表达。在这个级联的末端是控制细胞迁移等细胞行为的分子类，或者更广泛地说，它们的特性，如细胞粘附或细胞收缩。例如，在调节过程中，干细胞簇脱离细胞与细胞的粘附，成为迁移，在胚胎中重新激活特定细胞粘附蛋白并形成新的组织和器官。发育信号通路涉及形态发生包括Wnt、Hedgehog和ephrins。
细胞基础.在组织层面上，无视控制手段，形态发生是由于细胞生长和运动。形态发生也涉及细胞结构的变化或细胞在组织中的相互作用。这些变化可能导致组织的伸长、变薄、折叠、入侵或分离成不同的层。后一种