002年至2016年间，日本共向东帝汶提供约290亿日圆的无偿资金援助以及约124亿日圆的技术援助。
教育与文化.日本从2001年就开始对东帝汶唯一的大学——的教育体制、运营以及环境设备等方面实施支援；2006年至2010年，埼玉大学、长冈技术科学大学和岐阜大学实施了支援项目以协助提高学校教职员的基础能力。另外九州大学也从2005年开始对东帝汶大学农学部的研修实施支援。根据日本外务省的数据，截至2017年5月有124名日本人居住在东帝汶。