工作会议原先主要讨论农业问题、1978年至1980年国民经济计划议题，但后期突破了原先讨论重点。11月12日，全国人大常委会副委员长陈云在会议上发言，指部分批判四人帮揭发出来的问题要由中央作考虑或决定；他先指出六十一人叛徒集团案牵涉者并非反共，是经中共中央组织部批准，应予以平反；第二谈到彭德怀冤案，应予以平反；第三是四五天安门事件，指出四五事件并非反革命，中央应平反并肯定；最后是对康生在文化大革命所犯的种种罪行，应予以批评调查。陈云的发言得到很大响应，大量出席者就陈云的意见提出反应，会议展开突破性进展。