被生态位相近的偶蹄目逐渐取代，现仅存约 17 个物种（马科 7 或 8 种，犀科、貘科各 5 种），但因为很多奇蹄目是在接触人类后才灭绝的，所以是不一定是因为构造不如偶蹄目才灭绝的。，且多数处于濒危状态。
进化.奇蹄目动物是由古新世的踝节目动物进化而来。基本上从始新世开始分化，马科的祖先是下始新世的曙马。犀牛与貘的祖先则为始新世的貘犀。奇蹄目共有马科7－8种（普氏野马是否与家马同种存有争议）、犀科 5 种、貘科 5 种，共 17－18 个现存种，化石种达200个。