这三架客机再无指定需要飞行来往纽约的直飞航班，机舱亦改为日航国际线机型的标准配置。约在2000年左右，JA8161、JA8169被改为货机，直至2007年退役，而继续担任客运的JA8162亦于2007年退役。截至2018年1月，JL6/5这对航班号用于东京羽田往返纽约的不经停航班，成田往返纽约的航班号则为JL4/3，这两对航班均由波音777-300ER担当。