第十一管区因而会联同与协力打击走私活动。另一方面，为确保船只安全、日本与东南亚的海上通道航路之畅通和方便远海捜索救难等用途，第十一管区配备可用作空中巡逻的与YS-11A，以提高海难救助能力。此外，由于石垣市设有医疗航空事务所，因此石垣航空基地负上了沖绳县的直昇机救护之责，进行对八重山群岛地区紧急伤患运送之任务。
主要的船艇・飞机.
巡视船・巡视艇.十一管计有26艘巡视船、巡视艇及各式船艇、吨位由5吨至3100吨不等。所有巡视船装置系统，可以准确在海上定