主要分布在内脏，故在肝脏中浓度较高。而氯喹在高浓度下能抑制蛋白、RNA和DNA的合成，因而能杀灭阿米巴滋养体，常用于甲硝唑治疗失败的阿米巴肝脓肿患者。
2019冠状病毒病疫情的应用.在2019冠状病毒病疫情中，临床发现长期服用羟氯喹的系统性红斑狼疮患者中没发现新型冠状病毒病案例，而且也有相关研究认为氯喹有阻断病毒感染和调节免疫的作用，推估具有相似功效和毒性更大的氯喹也能起到抑制新型冠状病毒的作用，于是投入到临床治疗应用中。美国食品药品监督管理局经过一段时间的评估后，认定氯喹对于治疗