帕彭也协助希特勒损害奥地利的主权，让纳粹党实现梦寐以求的德奥合并。讽刺的是，纳粹党其中一个计划就是由奥地利纳粹党的支持者刺杀帕彭，让德国借故入侵奥地利作为报复。1938年2月4日，帕彭被免职，但希特勒仍下令他安排自己与奥地利总理库尔特·许士尼格在贝希特斯加登会面。2月12日，希特勒向许士尼格提出最后通牒，令奥地利政府屈从于德国的威胁与压力，造就了3月13日的德奥合并。后来，帕彭在1939至44年担任驻土耳其公使。约瑟夫·斯大林曾派人在该国刺杀他，但不成功。二战期间，德国曾考虑任命帕彭为教宗特使，