十三期航海班和第二十四期轮机班学生，由校长李庆文率领，迁校至郁南县连滩。1938年10月迁往广西柳州三都村。1939年8月奉令停办，第二十一期、二十二期学生毕业分配工作。第二十三期航海班学生9人以及第二十四期轮机班学生13人（共22人）转到四川万县“青岛海军学校”第五期航海班及轮机班续学。其余66名学生转到贵州都匀中央军校第十六期炮科学习，毕业后再送往四川万县要塞干部训练班，结业后分配在沿江要塞及陆军部队工作。抗战胜利后，召集该部份第二十三期、二十四期学生在青岛补习海军课程半年，经毕业考试后派回海军工作。