侍奉的增田长盛又因在关原之战中从属于西军，辗转下井赖投往赞岐国丸龟城主，在庆长19年（1614年）爆发的大坂冬之阵和大坂夏之阵中均作为丰臣家一方作战，丰臣家被德川家消灭后他投靠若狭小滨城主，并且领取500石知行，其后京极氏先后转封至出云国松江藩、播磨国龙野藩和赞岐丸龟藩，他亦有跟随。
秀吉时代.浅井家灭亡后按《信长公记》记载，久政和长政的头盖骨被信长制成酒杯，而长政的妻子阿市和三名女儿最初停留在岐阜城，后来转移到清洲城，最终投靠兄长伊势国主织田信包。本能寺之变后，羽柴秀吉和柴田胜家