种群瓶颈效应或人口瓶颈（population bottleneck；genetic bottleneck）是指某个种群的数量由于突然的灾难所造成的死亡或不能生育造成减少50%以上或者数量级减少的事件。种群瓶颈可能促成遗传漂变加剧。种群瓶颈发生后，可能造成种群的灭绝，或种群恢复但仅存有限的遗传多样性。
动物.一个例子是猎豹（"Acinonyx jubatus"），由于猎豹彼此之间的关系过于相近，猎豹之间的直接皮肤移植已经不会引发任何免疫反应。猎豹也遭受低精子浓度、低精子活动力及畸形精