三层和别馆四层之间有天桥连接。1996年10月，长崎电视台开设了官方网站。1998年度，受到设备投资费用增加的影响，长崎电视台出现0.49亿日元的亏损。但翌年恢复盈利。2001年，长崎电视台启用了吉祥物「K-tan」（（））。2004年，长崎电视台以全日10.3%、黄金时段14.9%、晚间时段15.1%的收视率首次获得收视率三冠王，并在2005年蝉联。2006年12月1日，长崎电视台开始播出数位电视讯号。2008年，为庆祝开播40週年，长崎电视台和上海广播电视台共同制作电视剧《月之光》，并在富士电视台系