菌红素在pH6.8（如乳癌细胞）下表现出最有效的DNA破坏作用，而普通细胞的pH则为7.4左右，这种性质更助长了其抗癌针对性。另外灵菌红素可能可以通过抑制细胞中型拓扑异构酶I和Ⅱ的活性而进一步达到破化DNA复制的目的。另外，灵菌红素可以破化细胞内的线粒体，高尔基体和溶酶体对细胞质的pH梯度，降低细胞内ATP水平。这是由于灵菌红素可以在这些细胞器的膜上起到离子孔（Ionophore）的作用，而抵消氢氯离子的同向转运。第三，灵菌红素可以激活细胞内细胞凋亡途径。一方面，灵菌红素激活前半胱天冬酶8（Pro-