车、摩托车、汽车等各种交通工具均被大规模应用。日本的车辆靠左行驶。
铁路.日本在2010年的铁路运量达226.7亿人次，为全球第一。东京地铁亦是世界上流量最大的地铁系统。日本的铁路密度高，且基本实现电气化，1964年开通的新干线就成为了世界首个高速铁路。日本的铁路以准时和安全闻名，2006年的东海道新干线全年的班次平均仅有0.3分钟延迟 。如果铁路班次延迟超过五分钟，车站站长会在站内透过广播向乘客道歉，并在每个站的出站处大量发放，让受影响人士可以向公司或学校解释迟到原因。如