莲宗、净土宗等佛教宗派也颇有发展。例如，曹洞宗就曾自费于台北观音山的山路上（今凌云路）设置沿路有三十三座石观音像的礼佛古道（台北西国三十三所灵场）。战后，日本佛教各宗派因政治因素影响撤出台湾，此后的长期间因戒严，宗教活动受到严格的控制，直到1987年解严后，宗教信仰有了充分的自由，日本佛教才又重回台湾弘法。日本佛教有真言宗系的高野山真言宗在台湾布教，也有僧侣亲自前往真言宗两大道场之一的高野山修行。净土真宗系则有台湾人自建道场者，也有净土真宗亲鸾会在台弘法。目前在台湾，还有创价学会、灵友会、立正佼成会、真