地形非常复杂，西部波希米亚是易北河（）和伏尔塔瓦河流域，周围是山地，包括捷克最高峰，海拔1,602米的斯涅日卡峰，东部摩拉维亚地区是摩拉瓦河流域，也包括奥得河（）的源头，捷克境内的河流分别流往北海、波罗的海和黑海。捷克是内陆国家。根据1929年的凡尔赛条约，德国易北河下游汉堡3万平方米的摩尔达乌港租借给捷克斯洛伐克，直到2028年，目前捷克继承了租借权。