占汴京，在耶律楚材建议下，窝阔台命孔元措回到曲阜，依然袭封衍圣公。孔元措回到曲阜，整理失散的礼乐，打下了元朝礼乐制度的基础。元太宗九年（1237年），窝阔台令孔元措重修孔庙，给复守庙一百户。元宪宗元年（1251年）孔元措去世，没有儿子，他弟弟孔元綋的孙子孔浈袭封。