，改装完后即于同年10月与地中海分舰队一同前去访问巴利阿里群岛；在回航途中，2名船员因在大浪中进行手动操舵装置训练，不幸落海丧生。1903年11月3日，马奎斯的舰长职务被海军准将取代，随后于1903年11月19日至12月17日期间，巴尔诺带领耶拿号前往普罗旺斯沿岸海域进行训练。1904年4月至5月期间，时任法国总统埃米勒·卢贝前往拿坡里与义大利国王维托里奥·埃马努埃莱三世进行国事访问，而耶拿号也在当地参与一场海上阅兵典礼。耶拿号接下来随地中海舰队前往黎凡特一带执行巡航任务，途经贝鲁特、、士麦那、米蒂利尼