异，有关细菌型态上的学门即被称为型态学。细菌细胞的大小大约是真核生物细胞的十分之一，大约 0.5–5.0 微米长。然而，有一些种类（如纳米比亚嗜硫珠菌）可以达半毫米长，甚至用肉眼就可以辨识。。最小的细菌则是霉浆菌，长度大概只有 0.3 微米，与最大的病毒差不多大。有些细菌甚至更小，但这些还没有完全被研究，超微细菌并不是一个演化上的分类，而是对于这些细微细菌的通称。细菌通常以外观分为球状的球菌、棒状的桿菌，游泳时个体会有所延展。另外还有逗点状的弧菌，和螺旋体，还有一小部分的细菌是二十面体或是立方体最近