在类囊体膜上产生质子梯度，以此经光合磷酸化反应合成三磷酸腺苷（ATP）。在生成水分子之后所剩余的<chem>O2</chem>会释放到大气之中。线粒体中产生ATP的氧化磷酸化过程需氧。有氧唿吸作用的整体反应类似于反向的光合作用，其简化公式为：在嵴椎动物中，<chem>O2</chem>经扩散作用，通过肺内的膜进入红血球。<chem>O2</chem>与红血球中的血红蛋白结合，后者从紫蓝色变为亮红色。（<chem>CO2</chem>会通过玻尔效应从血红蛋白的另一个部分释放出来。）软体动物及某些节肢动