洲亦担任改编后首任校长，至2002年1月31日为止。2003年9月退役。曾任总统府战略顾问。
退役生涯.2010年4月，许历农组织新同盟会退役将领参访问团访大陆，其中包括八位退役中将和七位退役少将，夏瀛洲参与其中，获得国台办主任王毅接见。同年5月，参与发起首届中山黄埔两岸情论坛。
争议.2011年6月8日，依照中国大陆媒体中评社报导，夏瀛洲以前国防大学校长身份前往北京与中共将领交流，于6月5日晚参与第二届「中山‧黄埔‧两岸情」论坛时发言「今后不要再分什么国