学名为，其异名有、、及，表示的都是同一物种。在其拉丁名中，其属名“”来自于古希腊语“（）”，意为“金黄色”，其种加词“”意为“如垫子般膨胀的”，以描述其种子在成熟时由青色变为金黄色，同时膨胀起来的特征。
其他语言中的名称.在英语中，苍耳称作'（、、；“”意为“麦仙翁”，而“”意为“带刺的果实”或“刺蒺藜”）、'或。在印度的阿育吠陀医学中，苍耳子被称作“Chota Gokhru”，其中“chota”意为“小”，“go”意为“牛”，“khuru”意为“足趾”，因为苍耳子的形状类