官三司使，舆情大哗。吴奎与知谏院谏官包拯、陈旭等联合上书：尧佐“乃凡庸之人，只因宠私，骤居要职。”至和元年（1054年）加知制诰。嘉祐四年（1059年）为翰林学士。神宗即位，拜参知政事，因反对王安石变法出知青州。熙宁元年（1068年）卒。吴奎曾为仁宗嘉祐七年（1062年）去世的包拯写墓志铭-《》。