慢慢地向上游移动，借创意与研发来生存。1990年代，新闻局借着辅导金补助了许多动画长片的制作，包括1994年远东公司所制作，游景源导演，蔡志忠原着的《禅说阿宽》。除了动画、着色等在中国大陆制作外，导演、原画与编剧等皆为台湾制作，虽然票房不佳，但有不错的录影带销售成绩，也曾获得第三十一届金马奖评审特别奖。1998年的王小棣导演的《魔法阿妈》，与韩国合作制作，将台湾本土风俗人情与民间信仰作为动画主题，成功地引起社会大众的共鸣，并获得第一届台北电影节商业类年度最佳影片的肯定；但金马奖评审却认为故事怪力乱神，使