实权被重臣长续连掌握。『长尾家谱』中记载在天正5年（1577年）受到越后的上杉谦信攻撃，在七尾城被围困时，患上城内发生的疫病而死去（七尾城之战）。不久后七尾城被攻陷，战国大名能登畠山氏在歴史舞台上消失。畠山氏的血统由成为上杉家家臣的义春（春王丸的祖父义纲的弟弟。有说指和上条政繁是同一人物。）流传。后来义春成为江户幕府的高家，由一时间称上条和上杉的姓改回畠山姓。还有在这段时期，畠山家的状况多数被记载成与上杉谦信或织田信长的行动有关连，世代交替十分激烈，但是因为缺乏史料，从当时的文书至现代的历史小説中的