山亦经常在日本引发灾害。近年日本较为活跃的火山有有珠山、浅间山、三宅岛、阿苏山和樱岛等。日本其他的主要自然灾害还有山体滑坡、泥石流、洪灾、风灾和雪灾等。
主要城市.日本没有法定首都，国家的行政中心位于东京都。截至2012年，东京都区部（又称为「东京23区」，即口语所称的东京市区）人口中有900万，全东京都的人口有1,323万。以东京都为中心，包括神奈川县、埼玉县、千叶县的首都圏人口为3,670万，是世界上最大的都市圈。日本的皇居、国会议事堂、内阁、最高裁判所、各省厅、各国驻日大使馆