囚犯遭受惨无人道的待遇，而且盟军轰炸使得日本人将战俘营搬迁到内陆的兰瑙，有260公里之遥。当时所有的战俘犯人数量已减少到2504人，被迫展开恶名昭彰的山打根死亡行军（Sandakan Death March）。几乎所有的战俘都在这场行军中死亡，只有六名澳大利亚人逃跑幸存。1945年9月10日战争结束。日本投降后，北婆罗洲由英国军事管制区（British Military Administration）所管理，1946年成为北婆罗洲直辖殖民地。北婆罗洲直辖殖民地的首都由山打根迁至爵士顿。总督由英国国王乔治