本被安排到伊斯法罕一所伊斯兰神学院就读，但是他反而到阿拉克的另一所神学院就读，接受阿亚图拉阿卜杜勒-卡里姆·哈埃里·亚兹迪（Abdul-Karim Ha'eri Yazdi）的指导。为了方便学习，霍梅尼在1920年迁到阿拉克。翌年，哈埃里·亚兹迪转到圣城库姆的伊斯兰神学院执教，霍梅尼应邀跟随，并在库姆的达尔沙法学校居住。霍梅尼研习伊斯兰教法和法理学（费格赫），亦对诗词及哲学感兴趣，来到库姆后即寻求哲学及神秘学学者米儿咱阿里·阿克巴尔·亚兹迪的指导。亚兹迪在1924年去世，霍梅尼即继续在另外两名导师贾瓦德·阿