藩主松平乘寿以6万石入主。1661年第二代藩主松平乘久移封至佐仓藩。然后是德川家纲之弟德川纲吉以25万石。1680年家纲逝世，由于没有子孙改由纲吉继承将军位，藩主之位由纲吉之子德松继承。1683年4月28日在4岁夭折，因而成为幕府的天领。1707年德川纲重次男松平清武成为了藩主，后来获两次增封。第三代藩主松平武元在1728年移封到陆奥国棚仓藩。由若年寄太田资晴以5万石入藩，资晴后来成为了大坂城代而被藩废。1740年资晴之子资俊再度立藩。6年后被移封至远州国挂川藩。之后松平武元再次成为馆林藩主，1836年