2007年，吴树根代表国家队出战在巴黎举行的法国柔道超A级奥运会积分赛，表现一鸣惊人，连胜了意大利、俄罗斯、韩国等好手闯进决赛。吴树根在决赛对战雅典奥运会银牌得主、法国的弗雷德里克·若西内，不但没有手软，更以一本的优势一举夺冠。2008年，吴树根代表中国出战北京举行的奥林匹克运动会柔道比赛女子48公斤级赛事，轻松进入八强，最后负于曾连续四届在奥运会上夺得2金2银的日本名将谷亮子出局。2012年，吴树根代表中国出战英国伦敦举行的奥林匹克运动会柔道比赛女子48公斤级赛事。