费用由政府出资，另外30%则源于国际捐赠或其他私人来源。政府在每个公社都至少开设一家基本卫生中心。私营医疗机构基本集中在城市地区，特别是中部高地的城市区域。虽然存在这些障碍，但马达加斯加的医疗服务在过去20年中已呈现改善趋势。儿童接种乙型肝炎、白喉和麻疹疫苗的平均比例在此期间上升60%，基本医疗服务和治疗普及率虽低，但也在不断上升。2009年，平均每位马达加斯加妇女生育4.6个孩子，与1990年的6.3个相比已有明显下降。不过2011年时少女怀孕率达到14.8%，远高于非洲平均水平，并且也是人口迅速增长