麦迪逊还推动议会审议杰斐逊的《弗吉尼亚宗教自由法》，该法主张政教分离，于1786年通过。
再任州长（1784至1786年）.亨利再任州长的任期共计两年，州议会在1785年推举他连任。与首次担任州长相比，这两年更加平静；他在切斯特菲尔德县乡间租下索尔兹伯里（）种植园和家人居住，这里距首府约21公里，离弗吉尼亚州议会大厦不远的州长官邸此时还在建筑。州议会通过法案为民兵配备新武器，由亨利与拉法耶特侯爵合作从法国进口。各县民兵受当地严密控制，虽然这纯属州内事务，但的确在战争期间引发问题