引信不可靠(这点是二战日军所有其他鱼雷的命门)。九三式鱼雷採用触发式引信，由于引信过于敏感，导致容易被海浪或军舰尾流诱爆，在实战中经常发生鱼雷尚未抵达目标便提早爆炸的状况。虽然后来日军着力于改进引信，但直到战争结束问题都没有解决。在瓜岛夜战中，日本高雄号、爱宕号重巡洋舰向美国战列舰南达科他号发射鱼雷。然而九三式鱼雷由于引信的不稳定，大部分鱼雷都在靠近南达科他号之前就过早的爆炸。日军不仅未能击沉南达科他号战列舰，还让华盛顿号战列舰抓住了反击的机会，借助新式雷达定位，重创日舰，扭转了战局。第三个缺点是维