口服或者静脉注射的系统性疗法（即摧毁全身的尿道癌细胞）。不同药物常合併使用，以破坏已转移的尿道癌细胞。常用的药物包括顺铂（cisplatin )、长春新硷（vincristine）、以及氨甲蝶呤（methotrexate）。副作用包括贫血（引起疲劳，虚弱）、恶心与呕吐、食慾不振、落发、口疮、感染风险增加、唿吸急促、或过量出血和淤青。