民署所签发予设籍金马地区及澎湖县居民，经由金门、马祖及澎湖县往来中国大陆的旅行证件，外表为一本天蓝色簿子，有效期限三年，申请金马证免费。台湾籍居民要户籍迁到金门或马祖满六个月以上始可办理金马证。2008年6月19日，行政院院长刘兆玄正式公告实施扩大小三通方案，即日起只要持有中华民国政府签发的中华民国护照及中国大陆政府签发的台湾居民来往大陆通行证（台湾居民通行证），即可经由金马地区进出台海两岸。2015年6月1日，金马证改为芯片卡型式，新实施的芯片卡与身分证大小相同，便于随身携带且具胶膜护贝防伪功能，