显目猪笼草与裸瓶猪笼草一起被归入了一个小分支中。然而，由于该研究在地理范围上的局限，其分析的地域可能无法准确反应显目猪笼草与其密切相关的物种之间的关系。
自然杂交种.显目猪笼草与其他许多猪笼草属物种同域分布，并已记录到了大量自然杂交种。
卵形猪笼草与显目猪笼草的自然杂交种.现已知卵形猪笼草与显目猪笼草的自然杂交种存在于潘丘卢保山的顶峰山径。该自然杂交种的捕虫笼呈现出亲本的中间型。其唇平展，宽大，但不如卵形猪笼草的唇发达。其继承了显目猪笼草捕虫笼的斑点，但颜