瓜巴龙科（Guaibasauridae）是原始蜥臀目的一科，化石已在巴西与阿根廷等地发现，年代为三叠纪晚期。瓜巴龙科的实际物种、分类关系仍无定论。瓜巴龙科最初是由约瑟·波拿巴（Jose Bonaparte）与其同事在1999年提出，当时只包含瓜巴龙。瓜巴龙同时具有兽脚亚目与蜥脚形亚目的特征，因此很难去归类。在2007年，瓜巴龙的第二个标本被发现，这个较完整标本有助于与其它早期蜥臀目恐龙相比。波拿巴与其同事根据这个标本，提出农神龙非常类似瓜巴龙，而将其归类于瓜巴龙科，但是他们并没有提出瓜巴龙科的系统发