年9月1日起发行。陈水扁政府决定在封面国徽和「护照」二字之间加入「TAIWAN」字样，目的在于显示中华民国与中华人民共和国的不同，使台湾旅客在国外时不致被误认为中华人民共和国籍，以免被错认为不适用免签证待遇致登机受阻，使持护照的中华民国国民能清楚地向各国海关说明自己是来自台湾而非中国大陆，以避免遭到禁止入境或于国外时因遭误认为中华人民共和国人民而惹来麻烦困扰。政府称措施目的在于便民，但引来泛蓝阵营强力批判，同时也导致抵制预算审查。立法委员周钖玮质疑，加註「台湾」字眼将引发意识形态对立，同时势必会让对岸视为是