前往札幌市进行佔领工作，接下来的几年都在监督与执行扣押日本军事物资及设施，解除日本武装。第九军的职责还包括处理归国的日本人、产业转换。随着佔领工作完成，越来越多美军部队返国，佔领军规模开始缩小。1950年，第六军团离开日本，佔领军由美国第八军团指挥第一军（下辖第24步兵师和第25步兵师）及第九军（下辖第1骑兵师和第7步兵师），第九军后来因为规模缩小转移到仙台市，直到1950年3月28日解编，其指挥职责与其他单位合併。
韩战时期.韩战爆发后，大批美军部队从日本进驻南韩，首当其冲的