巩固新朝的统治，曾五次颁布禁海令，并三次颁布「迁海令」，禁止人民出海贸易。1683年清军攻佔台湾后，康熙接受东南沿海的官员请求，停止清初的海禁政策，并在“粤东之澳门（一说广州）、福建之漳州府、浙江之宁波府、江南之云台山”分别设立粤海关、闽海关、浙海关、江海关作为管理对外贸易和征收关税的机构。江浙闽粤四大海关总领各自所在省的所有海关口岸，通常下辖十几至几十个海关口岸。但当时西方殖民者的殖民地已遍佈中国周围，其殖民步伐引起了清廷警惕，康熙甚至曾口谕大臣们：「海外如西洋等国，千百年后中国恐受其累，此朕逆料之言」。