理都转移到泽尼特体育会名下。在1939年赛季结束后，泽尼特足球俱乐部被命令代替钢铁工人队参加比赛。
苏联联赛时期.1944年泽尼特赢得了他们第一项荣誉。在双方完整出场的决赛中，他们战胜了莫斯科中央陆军，夺得了战争时期的1944年苏联杯。在列宁格勒，有大量的球迷支持泽尼特，但是球队并没有在苏联足球超级联赛中取得特别好的成绩。1967年，泽尼特排名倒数第一，却被从降级的深渊中挽救了回来，因为苏联领导人认为在1917年俄国革命五十周年的时候让一只来自革命起源地－列宁格勒的球队降级是没有道