当时的人害怕，没有敢说话的。谢鲲说：“您行大事，不杀一人。王峤因为劝谏触犯意旨，就要杀他，不也太过了吗？”王敦才罢手。王敦还是讨厌王峤，外调王峤担任领军长史。王敦被平定后，王峤担任中书侍郎，兼任大着作，王峤坚决推辞。王峤又转任越骑校尉，多次改任吏部郎、御史中丞、秘书监，兼任本州大中正。咸和初年，朝廷议论想要以王峤担任丹杨尹。王峤认为京尹名望大，不宜带病任职，请求补任庐陵郡，于是任命王峤担任庐陵郡太守。因为王峤家贫困，没钱上路，赐给王峤布百匹，钱十万。王峤不久在庐陵郡太守任内去世，谥号穆。儿子王淡继承爵位