行的世界游泳锦标赛，在4×100米自由泳接力与队友郑莉梅、何诗蓓及谭凯琳游出3分40秒40排第10，获得2020东京奥运的资格。其后在4×200米自由泳接力与郑莉梅、何诗蓓、欧铠淳游出8分04秒98排第11，再夺多一张奥运入场券。8月何南慧代表香港参加匈牙利布达佩斯举行的，表现平平，未有项目游进前十六名。十月何南慧在学界最后探戈中以三金作结，既两破A Grade100米自由泳记录，也把自己保持的200米自由泳纪录推前1秒，画上圆满句号。自2019年3月东京奥运达标期开始何南慧一直在个人项目未能达B标，因