%，其中又以台湾历史部分具有最大的争议处。国立台湾大学历史学系教授周婉窈便统计相较于101课纲，台湾历史的内容异动部分超过60%，其中台湾战后时期更改比率更高达近140%。另外包含地理科、公民科与国文科也有不同程度的争议，例如公民科部分仅概括性陈述台湾白色恐怖时期历史。对此周婉窈在Facebook个人页面上指出这次历史科课纲微调将会带来中华文化霸权主义，并且造成历史学严重退步等伤害。随后教育部国民及学前教育署署长吴清山表示中华民国教育部的政策是採取新旧教科书并行，针对新旧版本的差异将会委託教育部国民及学前教