（291年），贾后密谋诛除杨骏，当时有宫中发生事变的传闻，洛阳宫南门云龙门封闭，杨骏召集众官到府第商议，但杨骏最终未能决定有作何行动。傅祗于是自请与尚书武茂入宫察看情形，作揖而走，其余一众官员亦离开。当晚杨骏就被诛杀。杨骏死后，尚书左仆射荀恺因与太子少师裴楷不和，因而以裴楷儿子是杨骏女婿而将裴楷收付廷尉，而杨骏属官很多也被送到廷尉审判。傅祗不单证明裴楷无罪，又以高平陵之变后司马懿不诛杀曹爽司马鲁芝，日后更任用他为青州刺史的事例，上书表示不应一併诛除杨骏属官。最终他们都获下诏赦免。傅祗及后改任司隶校尉，因