淡水豚类的骨骼后，否定了米勒的结论，并建立了白鱀豚科，并得到了其他一些学者的认可。但是Barnes对弗西豚科的化石与白鱀豚进行对比后认为白鱀豚应该属于弗西豚科的亚科Lipotinae。而Heyning在进行比较解剖学研究后，把白鱀豚作为了亚河豚科下的一个属。而DNA序列的测定结果则表明，亚河豚、弗西豚和白鱀豚各属于不同的科。
演化.根据古生物学家们通过化石考证，白鱀豚在第三纪中新世及上新世就已经出现在长江流域。1981年9月，中国地质学家在广西桂平发现了一块下颌骨化石片段。这件下颌