包围驻日喀则清军，麦克唐纳以同样手法逼走清军。接着达桑占堆在英国支持下率军包围拉萨，与驻拉萨清军激战3个月，使驻藏清朝官兵商民遭杀害。4月22日临时大总统袁世凯发布大总统令，重申西藏是中国领土的组成部分，并将按历史定制处理西藏问题，5月10日发布命令任命钟颖为西藏办事长官。随后英国以护侨为名直接出兵拉萨干涉，又护送达赖自印度返藏，7月30日英国派廓尔喀驻藏官员噶卜典出面调停，迫使钟颖与达桑占堆军队“讲和”，驻拉萨的钟颖军队交出武器，大部分于9月1日自拉萨启程经印度回内地。钟颖及其卫队也于11月经印度返回中国