作业区成立，对外称为内一码头，后由广州港集团有限公司经营。1965年11月20日，经国务院批准，广州港成为对外开放港口，码头成为国家一类对外开放口岸。1968年，在上山下乡浪潮中，太古仓码头成为运送广州知识青年赴湛江、海南参加南疆建设的重要码头。文化大革命期间，太古仓曾经遭受重创。1967年9月1－3日，太古仓发生了“武斗”，致使部分仓库着火，死7人，伤10余人，其中三层高的8号仓库被烧毁，财产损失巨大，3日，中央调查组还曾亲自到太古仓现场进行调查。在“十年浩劫”中，太古仓曾经遭到炮击，其中一座以储存包