高屏溪、阿公店溪及二仁溪三条中央管河川，较大河川尚有典宝溪及后劲溪。高屏溪旧名下淡水溪，发源于玉山主峰东坡，主流河长171公里，仅次于浊水溪，为全台第二长河；流域面积广达3,256.85平方公里，分佈于南投县南端、嘉义县东端、台东县西端，及高雄市、屏东县的23个乡镇市区，流域面积为全台最大。高屏溪流域的平均年雨量高达3,130公釐，但其中87%的降雨集中于每年5月至10月的雨季，导致1月至5月的枯水期仍有缺水现象。高屏溪两大主要支流为荖浓溪及旗山溪，均流经本县境内。荖浓溪即为高屏溪主流上游，其上、中游