12月随政府迁台北。1955年，调查局接收国防部军事情报局的保防侦查等业务。1956年6月1日调查局改隶司法行政部（今法务部）而更名为司法行政部调查局，1980年8月1日再随司法行政部更名为法务部而更名为法务部调查局。1997年4月23日，依据行政院核定之《法务部调查局洗钱防制中心设置要点》，调查局成立「洗钱防制中心」，执行金融情报中心及防制洗钱所涉相关业务。1998年6月，艾格蒙联盟第六届年会，调查局洗钱防制中心加入艾格蒙联盟。2007年12月19日，总统令公布《法务部调查局组织法》，第2条第7款