本政府指定为重要文化财，放置本尊的橱柜也与善光寺本堂一同被指定为日本国宝。
历史.创建于皇极天皇3年（644年）的善光寺，草创期的详细资料完全没有任何史籍文献保留，不过根据发掘出来的史书的内容，以及大正13年（1924年）、昭和27年（1952年）曾经在善光寺境内发现白凤文化（7世纪后半到8世纪初期）的瓦片等建材，推估这座寺庙在当时是个颇具规模的寺庙。善光寺内主要供俸的密佛「善光寺阿弥陀三尊」是日本钦明天皇时代由百济国圣王所呈献，经过多次迂回转折，后来由推古天皇命令本田（本多）