在1890年设站时，原名黑泽尻，直到1954年时才改为现名，因此原本连结本站与横手之间的铁路线是命名为「横黑线」，也就是今日的北上线。北上车站虽然在名义上也是JR货物所属的车站之一，但实际上只提供了公路货运服务的货件代收发业务而已，实际上并无定期的货物列车停靠，也没有任何装卸货物用的固定设施。在过去车站西口南侧原本有个通往日本石油北上油槽所的专用线分岔点，有定期的石油运输列车从仙台北港车站出发后，经北上驶往油槽所进行卸货。2001年时油槽所关闭，专用线也随之停用，连带也使北上不再负担专用线管理业务。