共八届十一中全会上再次受到批判。全会根据毛泽东的提议，改组中央领导机构，中央政治局常务委员的排名降到了第九位，林彪升到了第二位。1967年1月，出席中央政治局扩大会议。在发言中指出，现在文化大革命搞到破坏生产的程度，要注意解决。之后，在江青授意下，造反派称朱德是“大野心家、大军阀、黑司令”，朱德受到政治迫害，勒令交代反毛罪行。1968年10月，中共八届十二中全会召开，朱德、陈云、叶剑英、徐向前、陈毅、聂荣臻等人被分为不同小组，进行批判。1969年4月中国共产党第九次全国代表大会上，朱德、陈毅、徐向前、聂