对和亲缘分析显示，H9N2禽流感病毒来源于上海、浙江、江苏等地的鸡群；而北京林业大学候鸟专家郭玉民则表示，在中国野生动物监测网中未发现候鸟或其他野生动物携带H7N9病毒，但台湾农委会防检局副局长黄国青4月1日表示在2009─2011年间曾于台南市四草与宜兰县礁溪乡，在候鸟排遗里检出H7N9低病原性病毒，但在採样点半径三公里范围内养禽场採集样本，并未检出禽流感病毒。中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室研究人员表示：基因重配的发生地很有可能在中国的长江三角洲地区。过程可能经由韩国野鸟在自然迁徙