票阶段时遭遇父亲沈友仁（前台大医院副院长、小儿科主任、首届资讯主任）过世；而党员投票败给时任立委陈朝龙，未待进入民意调查阶段即于2007年5月7日宣佈退出党内初选、支持陈朝龙，并未竞选连任；不过陈朝龙最后仍然败给了连任多届资深立委、从双和空降此区参选的李庆华。2007年底，沈发惠出任民进党中央党部政策委员会首席副执行长。2008年5月，民进党在野后中央党部改组，沈发惠转任社会发展部主任。2010年11月，沈发惠高票当选第一届新北市议员；2012年中华民国立法委员选举，沈发惠接受民进党征召于新北市第十二选