化合物包括环氧乙烷和过氧乙酸等。几乎所有生物分子都含有氧原子。只有少数复杂生物分子不含氧，如鲨烯和胡萝卜素。在生物学中起到重要作用的有机化合物中，碳水化合物的含氧质量比例最高。所有脂肪、脂肪酸、氨基酸及蛋白质都含氧原子（因为均含有羰基）。氧还出现在磷酸盐（<chem>PO4^{3-}</chem>）中，是承载能量的ATP和ADP分子的组成部分；在嘌呤（腺嘌呤除外）和嘧啶中，形成RNA和DNA；以及在磷酸钙和羟磷灰石中，形成骨骼。
安全.美国NFPA 704标准将压缩氧气评为一种