出寻求建院用地的构想，总统允诺，指示当时的花莲县县长吴水云设法协助建院用地问题。后历经三次换地，两次动土，终于在1984年4月正式兴建。1986年8月17日正式启业。而慈济医院秉持救人为先的观念，成为全台湾医院立下免缴住院保证金之先例，尔后时称之行政院卫生署要求全国医院也比照办理。
各院院址.
其他国家（地区）.
印尼慈济医院.印度尼西亚共和国
相关争议.2010年，台北慈济医院急诊室医师在对某轻症病人看诊