查员认为有人把操纵桿向后拉，令机头拉高，而这个动作令飞机作出相应的反应，超出人体可承受的力度。飞机出现逐渐增强、最后无法控制的俯仰震盪，即是所谓的飞行员诱发震盪（）。然后出现一次强烈的起伏令飞机在沼泽坠毁。劫机者操日文口音，令人怀疑劫机和谋杀机师计划由日本赤军策划。所有尸体经过X光处理，尝试找出子弹，但最后并没有找到任何武器和子弹。而这些尸体后来在丹绒古邦纪念公墓安葬，位于柔佛新山的哥文茶路（）。这次事故成为马来西亚航空370号班机空难及马来西亚航空17号班机空难前，马航最严重，也是马来西亚境内历史上最