领骑兵部队与日军多次周旋。马占山通过马贼时代的经验掌握巧妙的游击战术，在日军官兵中获得「东洋的拿破仑」的别名。1940年，马占山被任命为黑龙江省政府主席；1945年抗日战争胜利后，被任命为东北行营政治委员会委员。第八战区部队战后与中国共产党军进行平绥路战役，两军僵持不下，也阻碍国军北上接收日佔地区的进度，在战役后，马占山便称病寓居北平。
晚年.虽然在1946年10月马占山被任命为东北副司令长官，但并未授予任何军权，因此在1948年10月再度称病辞职，再次返回北平寓居。1948年