斯屈普（"Üsküp"）。斯科普里在此之后被奥斯曼统治超过500年，是于斯屈普帕夏桑扎克的首府。之后又是科索沃州（Vilayet of Kosovo）的首府。在这一期间，市内建造了许多着名的东方样式的建筑物。在1912年巴尔干战争期间，斯科普里被塞尔维亚王国征服，第一次世界大战之后，斯科普里成为新建国家塞尔维亚人、克罗埃西亚人和斯洛维尼亚人王国（后成为南斯拉夫王国）的一部份。第二次世界大战时期，斯科普里被轴心国国家保加利亚王国军队佔领。1944年，成为南斯拉夫社会主义联邦共和国的加盟国马其顿社会主义共和