恭额、提督祝廷彪命守孝中的葛云飞墨绖从军。闽浙总督邓廷桢也荐其可用。于是葛云飞再署定海镇总兵，主持收复定海。葛云飞筹画先守后战，扼招宝、金鸡两山要害，列砲于江岸，建造土城，召集旧兵训练，士气逐渐振奋。次年，钦差大臣琦善擅自与英国代表义律在广东签订《穿鼻草约》，以香港岛换取定海。钦差大臣伊里布命葛云飞率所部渡海收复失地，然后释放俘虏，并与寿春镇王钖朋、处州镇郑国鸿同往。此后，裕谦接替伊里布，改议战守。葛云飞认为定海三面环山，临海一面缺乏屏障，建议在海边建筑土城，并在竹山、晓峯岭增设砲台，又在五奎山、吉祥门