才都不应让赵胤当上此该职。王导不听，亦因其守正而令王导有所记恨。后来合左右仆射为尚书仆射，由孔愉担当。后愉转护军将军，加散骑常侍。再转领军将军，加金紫光禄大夫，领国子祭酒。不久再以镇军将军外任会稽内史，加散骑常侍。重返会稽后，孔愉将当时荒废数百年的句章县汉修旧陂加以修复，灌溉了二百多顷田地。当内史三年后，孔愉于山阴湖南侯山下数亩地建草屋为宅，有了这数间草屋后就弃官住下去。咸康八年（342年），孔愉去世，享年七十五岁。朝廷追赠车骑将军、开府仪同三司，赐谥号贞。
逸事.孔愉曾经经