改受第九战区司令长官部节制。同时第九十一师调归国民革命军第八十五军序列。9月，本军参加武汉会战，于阳新地区抗击日军近一个月，因损失过重撤往湖南沅陵整补。
二战后与全国总动员勘平叛乱.1945年8月日本政府宣布无条件投降后，本军入越南，于河内接受日本驻军投降。1946年3月，法军为重佔越南，于越南海防强行登陆，遭第五十三军第一三〇师反击，狼狈而逃。6月，第五十三军奉调回国，海运华北参与剿匪，改受第三十四集团军总司令部节制。第五十三军抵达秦皇岛后，先后解除徐水、保定之围。8月改受东北保