把全国地方组织分为“后方组织”和“沦陷区组织”两类，各自根据实际情况开展活动。1947年2月，在上海召开第四次全国干部会议，改党名为中国农工民主党，选举章伯钧为中央执行委员会主席。1949年9月，农工党代表彭泽民、郭冠杰、李士豪等出席中国人民政治协商会议第一届全体会议，参与制定《中国人民政治协商会议共同纲领》，该党领袖章伯钧入政府任交通部长。农工党分别于1949年、1951年召开第五、六次全国干部会议。1957年反右运动中，大批农工党党员被划为右派，其中最着名的十大右派是：韩兆鹗、张申府、章伯钧、黄琪翔