T还用于需影像资料引导进行的及治疗颅内肿瘤，动静脉畸形或其他可治疗相关疾病的放射手术。
眼部观察窗.诊断者可以使用专用的眼部观察窗来检查诊断眼部相关疾病。CT扫描可由专业的眼科医生操作以检查异物（尤指金属物体）、骨折、脓肿，蜂窝组织炎、鼻窦炎、颅内出血）、，眼睛的弥漫性毒性甲状腺肿， 并评估眶尖和海绵窦的情况。
与MRI相比较.当确定头痛的原因是否为肿瘤，，病变，延颈髓质病变或颅内压力异常时，头颅核磁共振（MRI）扫描能比头颅CT更好地提供辅助资讯，同时也