伯社会主义复兴党发动军事政变夺权后回到伊拉克巴格达，萨达姆开始掌管党内势力；但同年11月，当时总统阿里夫大举缉捕复兴党人；他在1964年被捕。但在狱中他被选为复兴党副总书记，并在1967年越狱；此时的萨达姆已经是复兴党的第二号领导人物，权力仅次于阿卜杜拉赫曼·阿里夫。1968年7月，回到伊拉克协助发动政变，推翻阿里夫总统，使复兴党再次掌权；1969年，成为革命指挥部的副书记以及宣传部长和安全部长。
重建伊拉克.1972年6月1日起，他开始将在伊拉克投资的外资石油公司收归国有，并