事中，宣德二年（1437年），升户部右侍郎，巡视太仓、临清、德州等地仓库。当时平江伯陈瑄称漕运劳苦，乞求更番转运，明宣宗下诏王佐与黄福商议，之后会奏商议从陈瑄意。之后受命治理通州至直沽河道。明英宗继位后，镇守河南，又督理甘肃军饷。正统三年，户部尚书刘中敷得罪，王佐进尚书。正统十三年（1448年），因张安兄弟争禄事连坐，下吏部狱，不久获释。其治理财务有方，人称君子。正统十四年（1449年）随英宗北伐，土木之变时死难。赠少保，成化初年，谥忠简。