负责迎击B-29轰炸机。日本陆军亦在小月机场布置防空战斗机队，与此同时在大坂市周边地区布置高射炮 。但由于日军的雷达并不完善，要阻止美军投放水雷已是遥不可及的事。5月3日至12日，开始实施第2期作战计划。攻击目标不仅只为关门海峡，乃至延伸至东京港、大坂港、神户港、名古屋港等太平洋沿岸主要港口。第2期作战使用了1422枚水雷，并且在关门海峡发挥水雷的强大威力，大型轮船的无法航行，大坂港及神户港等关键运输港口因此不能使用。即使是小船也不能安全航行，约有三分一船只在通过关门海峡时沉没。5月13日到6月6日