面党政军各单位在第二次国共内战即将失败时撤往台湾，中华民国海军海道测量局随之迁往台湾。1949年5月26日，华东军区海军接管了原中华民国海军海道测量局，在上海创建了中华人民共和国海道测量机构——华东军区海军海道测量局，并于1951年2月转隶中国人民解放军海军司令部，改称中国人民解放军海军海道测量局。1953年7月扩建为中国人民解放军海军司令部海道测量部。1956年8月底，海道测量部机关迁至天津。1959年11月，改称中国人民解放军海军司令部航海保证部。2012年增加新名称中国人民解放军海军海道测量局。按