号的蛋白质（一种泛素标签）并将它们进料到蛋白水解腔体中。另一大类蛋白质区室是(Bacterial microcompartment)，它由包裹各种酶的蛋白质外壳制成。 这些隔室通常约100-200纳米，由互锁蛋白制成。 一个众所周知的例子是，它包含碳固定中涉及的酶，如RuBisCO。
生物分子缩合物.非膜结合的细胞器可以形成为生物分子缩合物，其通过高分子的聚集，寡聚化或聚合而产生，以驱动细胞质或细胞核的胶体相分离。
细胞骨架筛分.虽然细胞骨架不是细胞质