1966年，文化大革命爆发，二中学生卷入了“大破四旧、大斗老师”的浪潮中，众多教师被打倒批斗，学校亦被学生要求将校名改为“东方红战校”。1967年1月，群众组织夺权，学校工作全面瘫痪。1969年冬，为“战备疏散”以及配合学生学农的相关政策，二中在广州花县狮岭振兴白水寨建立农村分校，并开设校办工厂；1974年再迁至竹料公社陈洞大队陈洞水库旁。高考制度于1977年恢复后，学校重新回到以教学为重点的发展道路，并陆续开展一系列教学改革活动。1978年3月，校革命委员会撤消；同年8月，陈洞分校撤销。Section