990年代，由副堂主涂让麟接任堂主。1997年，中华民国内政部实行「治平专案」全国大扫黑，雷堂堂主涂让麟为防政府监控，宣佈解散雷堂。2000年中期，堂内掌法何光明退居幕后，鲜少再出来活动，堂主权位传给「石头」。2004年年初，内政部警政署展开「雷霆三十号」扫黑行动，逮捕了因非法替成龙电影《免死金牌》围事、在其电影上映时以砸摊等暴力「扫荡」该部电影盗版光碟的雷堂大老傅强及会长谢家琪。台北地检署查出是谢家琪等人受自称王羽的人士委託所为，并将傅强、谢家琪等五人被依违反《组织犯罪防制条例》起