然陈诚却表示爱莫能助。1950年9月18日，根据《惩治叛乱条例》，判处沈镇南及人事室主任林良桐死刑，沈的罪名是「为叛徒供给资产未遂」，林良桐是「意图以非法之方法颠覆政府，而着手实行」，由于审判採一审制，沈镇南两人毫无上诉机会，隔年1月11日，两人于台北市马场町枪决。
后续影响.
受事件影响的相关人物.在沈镇南资匪案事件过后，沈镇南的家产被没收，于是全家寄住在亲戚家的小房间，其妻子于1964年过世。而当时的台糖副管理师洪子瑜，则被送往绿岛进行感化教育两年六个