科校士改至道署举行，校士院因而闲置，后来干隆二十七年（1762年）时巡道觉罗四明整修校士院，将海东书院再迁到此地，并从中国大陆聘请师资，制定「端士习、重师友、立课程、敦实行、看书理、正文体、崇诗学、习举业」的学规八则。干隆三十年（1765年）在知府蒋允焄捐俸与清廷拨款下，又于宁南坊学宫西边重建海东书院，但与初址有别。此次重建于春仲动工，历时四个月，而新建的书院宽三十丈（约75公尺），长八十丈（约200公尺），方位坐北朝南，建有一百多间书斋，设有五子祠、禄位祠等。之后书院于嘉庆十九年（1814年）、道光七