台湾的发展起步较迟，图敦梭巴仁波切来台弘法，成立「经续法林」，为国际「护持大乘法脉联合会」组织的一员。十四世达赖喇嘛于1997年、2001年两度来台弘法，也为藏传佛教在台弘传掀起高潮，并成立「达赖喇嘛西藏宗教基金会」，安排格西长期教授藏语文基础、《菩提道次第广论》、佛教经典等课程。而南印度三大寺（甘丹寺、哲蚌寺、色拉寺）及札什伦布寺也陆续派僧侣驻台弘法并设立佛学会。另一方面，佛法要生根发展，需要结合当地文化与民情，藏传佛教传入台湾亦是如此，此即为本土化（或称中土化、汉化）的藏传佛教。例如，日常法师创立的