国后移至南京（今吉林图们市磨盘村山城）。蒲鲜万奴在国内依照金朝官制设立诸官，军队则按勐安谋克组织。1233年，窝阔台派皇子贵由率领左翼蒙古军征讨蒲鲜万奴，在南京擒之，东夏从此灭亡，不再是独立国家，但其后蒙古仍任命万奴子孙镇守原地，为其藩属。忽必烈建立元朝后，在东夏故地建立辽阳行省。
政权仍存.自康熙二十五年（1686年）发现刻有“大同”年款的官印以来，对东夏国的存亡又有新说。据王国维的考证：“《高丽史》多记东真即大真与高丽交涉事，自太宗癸巳（1233）以后，至世祖至元之末（12