国政府于1949年迁往台湾后，革命实践研究院军官训练团于1950年成立，彭孟缉任主任，此后并成立高级班及石牌班等训练机构。1952年，彭孟缉担任阳明山革命实践研究院主任。
参谋总长.1954年，擢升为副参谋总长。8月，参谋总长桂永清病故，蒋中正以副参谋总长彭孟缉接代理参谋总长。1957年，彭孟缉调任陆军总司令并兼台湾防卫总司令。1959年晋升陆军一级上将，再任参谋总长。1963年5月，蒋中正明令发表参谋总长彭孟缉连任一次。1965年6月，蒋明令以彭孟缉为总统府参军长。Sec