21年5月，孙在广州任非常大总统后，彭任赣军总司令，奉命率领两梯团在广东连县一举击破桂军一个旅，俘获该旅旅长。到达桂林后，与李烈钧所率滇军会合。12月孙抵桂林，成立北伐大本营，部署北伐。1922年6月，北伐军经南雄，进大庾，抵江西吉安。彭率两个旅和滇军朱培德部配合攻打赣州，与北洋军岳兆麟和周荫人部苦战十余日。12月18日晨，攻入赣州。1922年6月16日，陈炯明叛变，孙在广州蒙难。赣军固守赣南。北洋军蔡成勋师入赣，旧桂系沈鸿英部从赣西入。胡汉民电令北伐各军于集中于瑞金。彭部下赖世璜率部往广东投向陈炯明。