46年）获衞将军褚裒举荐为建武将军、扬州刺史，殷浩仍上疏辞让，并写信给当时任抚军大将军、录尚书六条事，总理万机的会稽王司马昱，说明自己的理由。但司马昱仍劝殷浩出仕，四个月后，殷浩多番辞让后最终接受官职。
抗衡桓温.次年，安西将军桓温平灭成汉，因为这项功勋，他的威望和势力都强盛起来，但同时令朝廷忌惮他。司马昱因为殷浩有极高的名声，又受朝野推崇，于是引为心腹，以抗衡桓温。桓温和殷浩因而生了嫌隙。司马昱对殷浩因而十分重视，虽然在当时殷浩就因其父殷羡逝世而守丧，但司马昱竟派蔡谟加摄扬州等待