思宗为总指挥。将福建的武平、上杭、龙巖、永定、平和列为「匪区」。因应勘乱时期剿共需要，于2月实施战时体制，恢复福建省保安司令部。8月至9月，集中3个保安团，在各县地方保安队等配合下，对中共据点实行大规模的扫荡。民国38年（1949年）4月，解放军在渡江战役胜利后，乘胜南下，国军兵败如山倒。第三野战军佔领上海后，向东南沿海进军，中共闽浙赣省委和闽粤赣边区委随即领导福建各地游击队，全力配合和支援南下野战军。8月，福建省政府随中华民国国军由福州市迁驻金门县。8月17日解放军第三野战军第十兵团司令叶飞攻佔福建省