会的所有财产被转移至俄罗斯正教会，全国所有教堂关闭。由1945年开始，大量神职人员和信徒被限制活动、被驱逐出境和被送到西伯利亚的劳改营，有800名神父被监禁。但也一些神职人员转入地下教会继续传教。另外，在19世纪70年代开始，因为大量乌克兰人移民至西欧和美洲等地区，使该教会在这些地区快速发展，并成立多个教区。而且，在苏联时期为乌克兰的地下教会提供大量支持。直到80年代末期，苏联对宗教的态度改变，直至1991年12月，戈尔巴乔夫在苏联实行宗教自由，该教会也可以恢复。但是，该教会的财产在苏联统治初期被没收，使