还在修改《大学·诚意章》的注，如他自己所说“毕力鉆研，死而后已”。1313年，元仁宗发布诏令定“四书集注”为科举考试的定本，指望中举的读书人必须熟读，不得另外解释。明清两朝沿用。，可见其对日后学术发展的重要性。
负面评价.毛奇龄反对朱熹理学，曾撰《四书改错》批评《四书集注》，书中首句便谓「四书无一不错」，罗列朱熹《四书》注释的错误达451条。