一次比较严重的天花流行，疫情从韦拉克鲁斯州开始一直蔓延到墨西哥城、特拉斯卡拉州、伊达尔戈州等地。一些军队官员进行了预防性措辞，包括疫苗接种等。 此后天花在墨西哥地区有零星的爆发。
疫苗接种及根除.1803年，来自西班牙的医生在新西班牙地区开展了天花疫苗接种，史称“”，此次接种活动成功降低了此后天花的发病率、重症率和病死率。 虽然此前也有医生于1801年进行过疫苗接种活动，但并未获得成功。巴尔米斯的疫苗此后在当地被持续沿用，直到1951年墨西哥官方宣布天花在当地绝迹。