反法同盟战争爆发，奥军再度战败，拿破崙取得整个伊斯特拉、萨瓦河右岸到乌纳河之间的克罗地亚地区，设置伊利里亚省控制其领土，用于封锁中欧透过亚得里亚海和英国之间的联系。1813年，法军已江河日下，奥军重新佔领伊利里亚省，维也纳会议后再併回奥地利，并建立达尔马提亚王国，将沿海地区重新划给克罗地亚王国统治，两者皆臣服于哈布斯堡的统治之下。19世纪初，经历过拿破崙的征服，及后哈布斯堡逐渐收复匈牙利的领土，克罗埃西亚和达尔马提亚皆由哈布斯堡所取得。1830与1840年代，浪漫民族主义盛行，令克罗地亚民族主义重新