棱两可的指定。性别也可以在分娩前透过产前性别鉴别完成。出生时的指定性别通常与孩子的解剖上的性别与性表型相符。据报导婴儿当中的双性人，也就是并非未真正符合女性和男性严格定义的出生人数可能低至0.018％，最高可达约1.7％，这取决于哪些条件可以被当作双性人。生殖器模棱两可的的出生人数在0.02％至0.05％的范围内。这些情况可能会使性别指定复杂化。其他原因包括非典型染色体、性腺或激素。人们通常认为通过性别指定手术或荷尔蒙治疗的干预来强化性别指定会侵犯个人的人权。性别指定行为带有对未来性别认同的隐含期望