方进行「集体谈判」，并且在无法配合的大学内以路障等强硬手段封锁校园。学园纷争的范围遍及日本全国，最盛期间，东京都内有55所大学遭到封锁，此事发展成极为严重的社会问题。
经过.为了反对东京大学实施登记医师制度代替现行的实习制度，医学院的学生发起了医学生运动，纷争因此展开。在运动发起之后，抗争逐渐激烈，1968年3月12日的医学院综合中央馆、3月27日的安田讲堂一度遭到佔领，原订于隔日举行的毕业典礼也因而中止。6月15日医学院学生再度佔领安田讲堂，校长大河内一男引入警察驱离佔据讲堂