建立了奋起湖、瑞里等聚落，邹族被迫退往更高的山区居住，「吴凤神话」也是在此时期发生。日治时期，日本政府为了开採此地的桧木林，自嘉义市兴建了阿里山森林铁路，进入山区大量採伐林木，再经由铁路运往山下，同时也将阿里山开发成为重要的观光景点。1909年嘉义厅长津田义一编纂《吴凤传》，1913年日本当局兴建吴凤庙，由当时的台湾总督佐久间左马太亲自主祭，同时吴凤事蹟也编入小学教科书。吴凤遂成为日本统治者「理蕃」的论述基础，成功的宣达原住民的行为是「野蛮落后」的，是应该被「教化」与「开化」的，而吴凤则是「宽大」、