冯玉祥组织国民军，自任国民军总司令兼第1军军长，鹿任第1军暂编第1师师长兼北京警备司令。段祺瑞政府成立后，年末同孙文交涉，邀请其访问北京，冯命鹿负责孙文的接待及警备工作。1925年（民国14年）3月孙文在北京去世，鹿曾帮助孙中山灵柩移奉北京西山碧云寺。
同北方各派的战斗.民国15年（1926年）1月冯玉祥因爲被指“赤化”而下野（3月访问苏联），张之江任国民军全军总司令，鹿钟麟任国民军前敌总司令（后任东路总司令）。4月段祺瑞与奉系的密约曝光，9日鹿驱逐段祺瑞，释放曹锟。同