光绪三十三年（1907年），徐世昌出任东三省总督，銭能训随其前往奉天赴任，任奉天行省右参赞。1909年袁世凯被罢回籍，徐世昌离开东北，钱能训亦被裁缺，1910年署顺天府府尹。宣统二年（1910年），经军机大臣徐世昌推荐，銭能训任陕西布政使，任内护理陕西巡抚。銭能训大肆搜捕革命党。后见大势已去，自戕未遂，由革命军医治后送出潼关。中华民国成立后，銭能训因为和徐世昌的关系而得到袁世凯重用。民国二年（1913年）10月，出任熊希龄内阁内务部次长。民国三年（1914年）4月，当选蒙古、西藏、青海三省区选出的约