吉州任上得罪员外司户郭若讷、司马周季重，两人合谋诬陷杜审言，定了死罪。杜审言十六岁的儿子杜并为父报仇，潜入刺杀了周季重，杜并也被侍卫当场杀死。此事震惊朝野，皆称杜并为孝子。武则天闻知此事，召杜审言入京师，又因欣赏其诗文，授着作佐郎，再迁膳部员外郎。神龙革命后，因结交张易之兄弟，与大批文人一起被贬，杜审言被流放到峰州。在途中，与一起被贬的沈佺期、宋之问等人互有唱酬的诗，但杜审言的诗今已不存。不久，召回任国子监主簿。景龙二年（708年）五月，任修文馆直学士，当年冬天病逝。宋之问作祭文，武平一作表。葬于河