1939年3月，第一军区扩容，克莱佩达区被纳入其中。1939年10月，军区再次扩容，切哈努夫和苏瓦乌基地区纳入。1942年，军区第三次扩容，比亚韦斯托克地区纳入。到达柯尼斯堡的部队包括第一步兵团和第61步兵团，后者的军人主要来自东普鲁士。军区参与了入侵比利时和苏联的行动。英国首相温斯顿·丘吉尔在其着作《第二次世界大战回忆录》中称柯尼斯堡为“现代化重型防御堡垒”。根据1939年5月17日人口普查，柯尼斯堡拥有人口372,164人。第一次世界大战后，东普鲁士的13,000名犹太人有三分之一居住在柯尼斯堡