毕业于上海中西书院（后为东吴大学）。毕业后，赴美国留学。入读胡思托大学，获得理学学士学位。后又入读哥伦比亚大学，获得文学硕士学位。回国后，历任南京金陵大学教授，天津南开大学教授。民国八年（1919年）5月7日，曾参与南京请愿，南京中等以上学校在鸡鸣寺召开国民大会，金陵大学的应尚德被推举为副会长，会议致电北洋政府，声援北京学生，要求尊重大学，释放五四运动中被捕学生。是沈宗瀚的教授。曾参与,筹建南京学界联合会，时任金陵大学教授应尚德出任会长。1922年，南开大学成立生物学系（今南开大学生命科学院的前身）