东正教最高宗务会议直接领导，并将东正教北京传道团所驻的东江米巷南馆改成了俄国驻华公使馆，令东正教北京传道团迁回北馆居住。从1861年到1889年，东正教北京传道团管辖的机构，包括圣索菲亚教堂（北馆），奉献节教堂（南馆），以及安定门外东安定村的圣伊尔库茨基·英诺肯提乙教堂。同时还辅有修道院，以及教会办的男女学校等。1861年原南馆改建为俄国驻华公使馆后，原有建筑除奉献节教堂以外，全部拆除。俄国公使馆与英国公使馆相邻，在《辛丑条约》签订后，两国公使馆面积都有所扩大，平分了由东交民巷、东长安街、西河沿、户部街