11月30日，欲自日本返国，被滞留东京，无法登机；乃迂回经菲律宾，于12月2日企图闯关，遭原机遣返。前往接机的群众与军警爆发激烈的冲突，是为桃园机场事件。1989年许信良终于经由中国大陆偷渡回台湾，但抵台后，旋即为当局以叛乱罪起诉并判刑10年，林正杰等人率10万民众包围土城看守所，要求国民党政府释放许信良，国民党政府出动镇暴部队镇压民众，爆发土城事件。
民进党主席.1990年获得李登辉总统特赦而出狱。1991年，许当选民进党主席。1992年春，参与推动总统直接民选。