得到法国提供的最好的教育，当她的学习生涯结束时，已经通晓了法语、拉丁语、希腊语、西班牙语和意大利语，还有她原先的母语——苏格兰语。此外她学会两种乐器的演奏方法，并学习了散文，马术，训鹰术和缝纫。1558年4月24日，她在巴黎圣母院嫁给了她的表弟法国王太子法兰索瓦二世。1559年7月10日，亨利二世病故后，她成为法国王后；丈夫成为了法兰西弗朗索瓦二世。按照常规继承法的规定，玛丽在其无嗣的表姑伊丽莎白一世之后，是英格兰王位的下一个继承人。但是，根据天主教规定，伊丽莎白为私生女，这使玛丽成为真正的王位继承人。