41年回到中国，在驻满洲的第6军任副参谋长，旋升任参谋长。1943年至1944年任宪兵司令部副司令官，而后又转任第19军参谋长。1945年3月升任陆军中将，就任近卫第1师团师团长，负责宫城警备。
宫城事件.1945年8月14日日本投降前夕，少壮派军官畑中健二等为阻止《终战诏书》的广播和日本无条件接受《波茨坦宣言》，试图发起政变。畑中等人为了获取近卫师团的支持，深夜求见森赳。当时森赳正在与内弟白石通教谈话，几人数度强行求见，8月15日凌晨方得进见。见面后井田正孝等向森提出了自己的请求