警遭府院高层撤换，由陈士魁接任侨委会委员长一职，详细原因没有表明，吴在事前也对自己遭到撤换一事毫无所悉。吴英毅卸任后的生活平实低调，较引发关注的公开行程仅有2017年五月底世界卫生大会期间，中共当局阻扰台湾方面出席之际，率领多名现任侨务人员前往中华人民共和国交流，接受中共国务院侨务办公室招待。遭各界批评后仅简单表示：「反正我是中华民国的老百姓，我是去玩的，不必要别人说三道四。」