后，邓本殷以“特别军务督办”的名义颁布了琼崖全岛水陆戒严令，并电请北京政府派兵救援。1926年1月，国民革命军进攻琼崖，陈济棠第十一师、张发奎第十二师强渡琼州海峡，于琼崖文昌、琼山、临高登陆，进攻八属联军，八属联军各部纷纷投降。邓本殷化装乘坐日本船只逃往越南。北京政府段祺瑞派出的练习舰司令曾以鼎率3艘军舰驶到海口附近时，正逢邓本殷逃离琼崖，故未能起到支援作用。
抗日战争将领.邓本殷战败后，称病住到上海宝隆医院，不久对外宣称病逝，并找了替身交亲信运回老家防城茅岭下葬。一些史料乃记录邓