立委名单引发许多蓝军支持者不满，原表态不提名不分区立委的新党主席郁慕明表示，新党决定在26日上午公佈不分区立委名单，于隔日确认排名、登记参选。2016年1月16日，新党在不分区立委的选举中获得510,074票，占总票数的4.18%，虽创下了自1998年立委选举十七年以来的新高，但仍不足5%，无法获得不分区立委席次，不过这一票数已经大幅超越第八届立委选举所获得之19.5万票，且超过3.5%门槛，往后四年将获得政党补助款一亿多元。新党为除了获得不分区席次之四党之外，所有参选政党中唯一冲破3.5%门槛之政党，