战双打，但第二轮落败而未能卫冕，单打方面则打进决赛，以2-6、1-6、 4-6败于安迪·梅利而取得银牌。之后美网系列赛开打，但奥运会后费德勒需要休息退出了罗杰斯盃，但之后立即于辛辛那提大师赛复出并在决赛中两盘击败德约科维奇（第一盘一局未失）捧得冠军。来到美网，费德勒进入八强遭遇伯蒂奇，虽然与第三盘扳回一城仍4盘不敌对手，9年来首次无缘美网4强。年终赛则晋身决赛，以6-7、5-7不敌乔科维奇。戴维斯盃瑞士队凭借他的两场单打胜利客场战胜荷兰队顺利保组。费德勒本年度共夺得6座ATP单打冠军，一座大满贯（温布顿），