从2000年至今，北朝鲜先后进行了多次导弹试射及核试，引起日本强烈不满。同时，日本也多次因为对第二次世界大战不负责任的言论以及靖国神社参拜问题引起朝鲜强烈不满。日本与北朝鲜至今没有建交。
与大韩民国关系.美国为防止社会主义势力在东亚扩大，希望韩国和日本恢复友好关系，以起到「防波堤」之作用；受美国政策之影响，两国在朝鲜战争过程中，即1951年9月就开始为建交举行会谈；但是，由于在清算过去问题上存在意见差异，会谈没有取得进展。1961年，通过「五一六政变」掌握政权之朴正熙政府匆忙与