下表现异常出色，在第一阶段联赛休战时处于积分榜领先位置。不过在夏季引援中球队未能有效增补外援，下半赛季随着停赛及伤病等情况的反复出现，暴露出明显的板凳深度不足问题，被山东鲁能反超，最终获得季军。赛季中外援里亚斯科斯表现突出，打破了申花球员单季入球纪录，冯仁亮、吴曦、宋博轩等新加盟且第一次参加顶级联赛的球员也凭借自己的表现入选了国字号球队。赛季结束后，上海申花登上了国际足联的俱乐部名人堂，并被评价为中国第一家独立于政府的足球俱乐部。此时由于中国国奥队在广州亚运会上连续大比分负于日本和韩国，中国足协决定聘请