升任从三位权中纳言，兼任春宫权大夫；其长女衍子成为宇多天皇的女侍。次年8月，他兼任民部卿；寛平9年（897年），他的女儿和宇多天皇之子齐世亲王结婚，同年6月，道真升任权大纳言，兼任右近卫大将；7月，宇多天皇让位与醍醐天皇，醍醐天皇继续重用他，将他升任为正三位，并兼任中宫大夫；在当时只有藤原时平与他拥有“官奏执奏”（又称为「内览」）的特权。醍醐天皇即位后，道真一直晋昇，但对于道真掌权感到威胁的藤原氏开始有所行动，以及中下层贵族中对道真的政治改革感到不安者亦所在多有，于是双方结合谋图对付菅原道真；昌泰2年（