根据头颅骨、牙齿的不同差异，或者是採用骨盆的特征，来建立、鑑定鹦鹉嘴龙的不同种。部分物种由于化石材料的残缺或不齐全，并没有体型的估计值，但可借由比较不同种的头颅骨、股骨长度，来估算大致的身长。就目前的18个已命名种中，模式种蒙古鹦鹉嘴龙的化石发现于蒙古国与中国内蒙古，是唯一分佈于蒙古国的种，"Protiguanodon"、奥氏鹦鹉嘴龙、"Psittacosaurus tingi"、固阳鹦鹉嘴龙都是蒙古鹦鹉嘴龙的次异名。化石数量次多的中国鹦鹉嘴龙，发现于中国山东省，发现于同地区的杨氏鹦鹉嘴龙则是中国鹦鹉嘴