中华民国与南苏丹关系是指中华民国与南苏丹共和国之间的关系。两国无正式外交关系，目前也没有在对方首都互设具大使馆性质的代表机构。对南苏丹的相关事务由。
政治.
外交.1993年7月，中华民国政府拨款30万美元予红十字国际委员会，採购医疗药品援助苏丹南部灾民（时为苏丹共和国的领土）。2011年7月9日，中华民国外交承认南苏丹共和国。
签证.两国公民皆须申请签证方可入境对方国家。持中华民国护照与邀请函或声明书的中华民国公民可附回邮信封将