10月，国务院宣布，由王光亚接替即将退休的廖晖，出任国务院港澳事务办公室主任。时任香港特别行政区行政长官曾荫权，在10月8日晚即发表声明，祝贺王光亚接任港澳办主任一职，期望与王光亚紧密合作。2017年9月，王光亚届龄退休。2018年3月，在第十三届全国人民代表大会第一次会议上，当选全国人大常委会委员、华侨委员会主任委员。
言论.2011年6月，王光亚访问香港时表示特区政府应避免让香港的房屋问题演变成政治问题，要求特区政府加倍关注，解决市民住屋问题。2018年3月中，香港刚