解放军总后方勤务部改称中国人民解放军总后勤部，即日起启用新印章。1965年3月至5月，总后勤部增设工厂管理部、军马部、军需部。后来总后勤部油料部、物资计划部、工厂管理部、军马部等机构陆续撤销。文化大革命爆发后，总后勤部在中共九大之前几乎被紧跟林彪的邱会作等人控制，总后勤部副部长傅连暲、饶正锡等都遭残酷迫害。1969年9月，王希克、陈庞、封永顺、伊文、张明远、严俊任总后勤部副部长，戴金川任副政委。1970年7月丁先国任总后勤部副部长，不久邱创成任总后勤部副部长。1971年九一三事件发生，中央责令邱会作离职