粹上台后作为犹太人门德尔松不得不逃往英国。他的财富后来全部被纳粹没收了。至1936年他在英国与人合作。从1934年开始他开始在巴勒斯坦进行一系列的项目。此时孟德尔松认识后来的以色列总统哈伊姆·魏茨曼已经很长时间了。他开始为魏茨曼夫妇工作。1935年他在耶路撒冷开办了一个办公室。1938年他加入英国国籍。从1941年至1953年门德尔松定居美国。至第二次世界大战末他在那里只允许做报告和出版书，因为他没有美国国籍和劳动许可，不过在这段时间里他为美国联邦政府顾问。在他的指导下在犹他州的一个武器试验区里建成了一