行政院副院长蔡英文说，请内政部会同中华民国外交部、大陆委员会等相关机关，务必向各党派立法委员详实说明《难民法草案》精神与制度内涵，早日完成立法程序。2009年，立法院三读通过《公民与政治权利国际公约及经济社会文化权利国际公约施行法》。内政部随即请内政部移民署重新评估，从而有了「国民党行政院版」草案，便撤回「民进党行政院版」草案。行政院重新将《难民法草案》送入立法院，并排除陆籍寻求庇护者适用，陆籍寻求庇护者需回到《两岸人民关系条例》第十七条做修法。2013年2月，第一次的国家人权报告国际审查，国际审查