新潟地区的除雪任务，至1980年代初开始停运及封存，至1986年正式除籍报废。机车报废后曾经被存放在新津车辆所，至1991年在新津车辆制作所解体。
技术特点.DD21型柴油机车是在DD20型柴油机车基础上开发的犁式除雪机车。与DD14、DD15型柴油机车等国铁现代化除雪车辆一样，DD21型柴油机车也是以多功能的兼用原则进行设计，平时无需执行除雪任务时可以作为普通的调车机车使用，但是DD15型柴油机车必须借助起重机来装拆除雪装置，在冬季期间改作为调车机车较为不便。因此，DD21型柴油