由于中国香港队与中国队单独参加比赛，假设中国香港运动员获得金牌，而来自中国内地的运动员在同一比赛中获得银牌或铜牌，则香港特别行政区区旗在奖牌颁奖典礼中将在中央升起，并且高于中华人民共和国国旗。2018年11月，列根号航空母舰访港，并排展示同样大小之美国国旗与香港特区区旗，香港特区区旗在美国国旗右边，而同时没有展示五星红旗。
降半旗.当下列人员逝世时，香港区旗需要降半旗致哀：当发生不幸事件导致重大伤亡的或者严重自然灾害造成重大伤亡，中央人民政府向行政长官建议下半旗或者行政长官