到第二阶段，在这个阶段当中，波士尼亚的克罗埃西亚裔与穆斯林联合对抗波士尼亚的塞尔维亚裔。这些塞裔在1月宣布成立「波斯尼亚和黑塞哥维那塞族共和国(Republika srpskog naroda Bosne i Hercegovine)」，8月又更名为塞族共和国。塞裔借其优势，将原先佔有55%的土地扩张到约70%左右。之后，塞裔的战斗的目标转向波士尼亚东北部，他们计画在这区建立一条连接塞尔维亚本土与塞尔维亚克拉伊纳共和国地区的走廊，并在1992年10月达成这项计画后。 1993年春天，战争转换到第三个阶段