月台1线，合计3面7线的高架车站。站舍位于构内西侧。1、2号月台为小滨线列车到发，3－7号月台为北陆本线列车到发。原有称为「敦贺港线」的货运支线通往敦贺港车站，但2009年起不再有列车行驶，2019年4月正式废止。
新干线.北陆新干线的金泽－敦贺段预计2023年通车。月台的位置为跨过国道8号的绕道上，高约24米（相当于8层楼高），计划设于现时站舍的月台距离约200米的位置，被批评对旅客不方便。计划构造为2面4线。
交直流分界.JR西日本在2006年9月24