虫囊为卵球形，膜质，侧扁，长2至4毫米。囊口侧生，边缘具多分枝的感觉毛，上唇具2条细长多分枝的刚毛状附属物。异枝狸藻的花序为总状花序，直立，长8至20厘米，花位于中上部，共2至5朵。花两性，两侧对称。花序轴圆柱形，直径0.4至1毫米，具1至2枚鳞片。苞片与鳞片同形，为宽卵状三角形，基部着生，长2至4毫米，顶端急尖，基部耳状。花梗丝状，长8至10毫米，花期直立，果期下弯。花萼2裂至基部，裂片为卵圆形或卵状椭圆形，长3.5至5毫米，宽3至4毫米，顶端急尖、锐尖或钝形。花冠黄色或淡黄色，长9至13毫米；上唇宽