部较粗且具有分枝，可能具有类似根部的构造，但仍然未有化石纪录。可能为原杉藻根部构造的铸型印痕化石在泥盆纪地层年代十分常见。主枝干具有环状生长轮，这些生长轮中偶尔会嵌入一些植物残骸，显示原杉藻可能透过不断包覆外层来进行成长。它们的主枝干可能为子实体，透过菌丝体供给营养。微观上，原杉藻的枝干由两种管束（可能为菌丝）交织而成：骨架管束直径约，内壁厚度约；另一种增生管束则较细，直径约，且具有许多交叉的分枝，增生管束内具有，且隔膜上具有小孔隙，这项特征只有在现存的真菌与红藻上发现。志留纪晚期疑似为植物的化石同样有