一样，在乙醛酸循环体中脂肪酸由过氧化物酶体中的β-氧化酶类水解为乙酰-CoA。当脂肪酸被氧化时，产生过氧化氢(HO)，因为氧气(O) 被消耗。但除了具有一般过氧化物酶体所具有的过氧化功能，乙醛酸循环体还额外包含乙醛酸循环中重要的酶（如异柠檬酸裂合酶及苹果酸合酶等），这些酶是完成乙醛酸循环旁路的关键。乙醛酸循环体是一种含有参与乙醛酸循环的酶的细胞器，是植物细胞内一种特异化的过氧化物酶体。因此，乙醛酸循环体与其他一般过氧化物酶体一样，包含可以起始脂肪酸分解的酶并另外拥有催化在糖异生过程中合成糖类物质需要