尼亚对俄罗斯的批评也使两国外交关系进一步僵化。值得注意的是，普京的父亲曾在二战一次爆破任务中险些于爱沙尼亚被杀害，有学者认为这是普京对爱沙尼亚态度冷淡的一个原因。2001年，美国九一一事件发生后，普京同意在中亚成立合作军事基地。这一决定不仅使俄罗斯民族主义人士感到吃惊，亦使俄国国防部长感到惊讶。2003年，俄罗斯联同中国和法国反对美国在未取得联合国安理会同意和授权的情况下入侵伊拉克。开战后，美国总统布什要求取消对伊拉克的制裁，普京支持取消制裁，并认为联合国应该先完成对伊拉克大规模杀伤性武器的调查。慕