官托勒密战死，波利伯孔因过往优异的表现而接替这个职位，率领泰菲亚旅作战。在高加米拉战役前夕的作战会议中，波利伯孔赞同大将帕曼纽发动夜袭的方案，然而这方案虽未受到亚历山大青睐，但也说明波利伯孔在军事上的性格倾向。在波斯门战役中，菲罗塔斯率领波利伯孔、科那斯、阿敏塔斯的方阵部队越过阿拉斯河，与亚历山大迂回的军队合击敌军。后来在前328年亚历山大征战索格底亚那时，波利伯孔、墨勒阿革洛斯、阿塔罗斯、高尔吉亚的部队被留在巴克特里亚，在克拉特鲁斯的统领下扫荡并防卫叛军的侵扰。前327年，亚历山大大帝率军返回巴克特里