杀及其引入的外来流行性疾病是造成绝大多数美洲原住民死亡的主要原因。在那之前，欧洲人已对很多流行疾病有着免疫力，而美洲原住民却没有接触过这些病毒（如天花），对北美原住民造成毁灭性影响；同时，只存在于美洲而旧大陆人从未接触过的病毒，旧大陆人对此没有抵抗力（如梅毒），同样传染到整个旧大陆。
遗传现况.尽管今天的美洲原住民大多都是混血，但仍然能够在一些人口稀少、濒临消失的未接触部落中寻找原始美洲人的遗传证据，以进行相关的研究。在 Patrick Tierney 所着的 Darkness