被分封到矢作4万石。1600年，元忠在伏见城阵亡，长男忠成加封到陆奥国磐城平藩，矢作藩第一次被废藩。1618年，三浦正次被幕府封为780石旗本，后来增加到5000石。1630年再增加到5000石，成为了大名，再次成立矢作藩。1639年，正次被移封到下野国壬生藩，再次被废藩。