大化，可随意废立皇帝，成为高于皇权的象征。霍亨斯陶芬王朝绝嗣后，神圣罗马皇帝不再随意插手圣座事务，教宗国与神圣罗马帝国进入相安无事的状态。到14世纪初，教宗国像其他意大利邦国一样，已经成为完全独立的国家。
文艺复兴时期.在文艺复兴时期，特别是教宗亚历山大三世和教宗儒略二世这二位教宗统治时期，教宗国的领土再度获得大幅扩充，并成为意大利最重要的政治力量之一。但是，教宗对其大多数领地的统治仍是有名无实的，教宗国各个城邦的真正主子仍是当地的王子、贵族。直至16世纪，教宗才得以直接统治教