取得美国迈阿密大学生化学及分子生物学哲学博士学位，并在1969~1971年间拿到Helen Hay Whitrey研究奖学金。李明亮的夫人廖雅慧毕业于台大外文系，并在美国迈阿密大学拿到英国文学硕士学位，担任证严法师的外宾即席翻译并任教于慈济大学。陈水扁于2000年就任中华民国总统之后，李明亮被邀入阁，担任卫生署长。其任内推动全民健康保险重大措施，包括健保总额支付制度、健保IC卡、健保法修法、健保费率和部份负担调整。2009年出书《走过SARS》，大公开抗煞内幕，中央与地方之对立状态。现回任慈济大学