明郑的财务已经严重透支，军队又缺乏补给，郑经只得放弃东南沿海的所有据点，于永历三十四年三月十二（1680年4月10日）退回台湾，并将国事都交给儿子郑克处理。永历三十四年（1680年），郑经于台南建造园亭「北园别馆」，为其在台湾的行馆，以及安养母亲董王太妃之所，1960年改建为「海会寺」，亦名台南开元寺，至今已有将近三百年的历史，历经几次修建，在建筑风格上保有「伽蓝格局」，为典型佛寺的形制，为中华民国国家二级古蹟。南明永历三十五年正月廿八（1681年3月17日），郑经去世，享年40岁。郑经之死于夏琳