1944年，在二战的硝烟中柏林爱乐大厅被炮火摧毁，乐团在教堂的场合继续演出。1945年4月15日，柏林被攻陷前的最后一场音乐会。1945年5月26日，指挥里奥·波查德就在废墟中指挥乐队举行了战争结束后的首场音乐会。1945年，罗马尼亚指挥切利比达奇成为乐团首席指挥。1947年，福特万格勒重返柏林爱乐。1952年，福特万格勒再次就任音乐总监。1954年，福特万格勒逝世。但临终时的福特万格勒并不愿意让卡拉扬接任。1955年，卡拉扬成为柏林爱乐首席指挥。乐团人数达120人，成为一个可演