扫描”主要报道当日和近期与台湾有关的热点新闻；“热点透视”则为当日或近期涉台热点深度报道，以及两岸专家和时事评论员对此事的评论，有时也会涉及其他周边地区的事件。2003年5月，改为每天播出。《海峡两岸》时常引用台湾电视节目的视频，但会进行处理，如对中华民国字样、中华民国国旗、手语同步翻译等打马赛克或删去。