冥号（HMS Erebus）和惊恐号（HMS Terror）远赴南极大陆开始为期4年的探险。克罗兹负责指挥惊恐号，并在1841年被任命为上校（Captain）。幽冥号和惊恐号于1843年返回英国，此次考察船队最大程度地深入南极浮冰内，发现了包括罗斯海、罗斯岛、埃里伯斯火山及罗斯冰架等大部分内陆区。1843年，为表彰克罗兹对磁学的出色研究，他被选入为皇家学会会员。
西北航道探险.1845年，他担任惊恐号船长参加了约翰·富兰克林爵士组织的西北航道探险。1847年6月在富兰克林去世后，