代历经多次扩建，但始终应付不了日益增长的使用量，政府便于1989年宣佈香港机场核心计划，在赤鱲角兴建新机场。新机场于1998年7月6日启用，运作了73年的启德机场正式完成使命。为应付长远发展，二号客运大楼亦于2007年2月初开始投入服务。1997年香港回归后，数间新的航空公司在香港提供民航服务，计有2001年成立的中富航空（现称香港航空）、2004年成立的港联航空（现称HK Express），以及2005年成立（2006年启航）的甘泉香港航空。其中甘泉香港航空更是香港首家长途廉价航空公司，惜于启航后不足