立总监督办处，以汤尔和为总监督，并任命周作人为图书馆馆长。1940年3月，汪精卫政权成立，中华民国临时政府改组为华北政务委员会，学校亦改受华北政务委员会教育总署督办之指导监督，并废除总监督，设校长一人总理学校校务，由钱稻孙担任。1945年8月，日本投降，伪北京大学解散。 南迁参与组建西南联合大学的北京大学于1946年返回原址复校。
校友.校友中，后来成为中国科学院院士的有金建中、周同惠、张树政、郭承基，成为中国工程院院士的有张蔚榛。其他校友有宿白、爱新觉罗·瀛生等。