弘治元年十一月初九日（1488年12月8日），朱奠垒去世，享年六十二岁，谥号昭定。庶第四子镇国将军朱觐鑉早卒，其嫡长子辅国将军朱宸湔后袭爵。
墓葬.朱奠垒葬于江西南昌府新建县洪崖乡二十九都增寿山（今江西省南昌市新建区望城镇幸福村花坑山）。1987年2月28日晚，朱奠垒夫妇的合葬墓被盗。墓葬坐北朝南，由甬道、前室、后室构成，墓室呈券拱状。随葬品有金器、银器、玉器、陶俑、圹志等。圹志现藏于江西省博物馆，高77釐米，宽75.4釐米，楷书。