中国国民党成立以后.1924年（民国13年）1月，李烈钧参加中国国民党第一次全国代表大会，并当选中央执行委员。1925年（民国14年），孙文逝世。1925年，应冯玉祥之邀，李烈钧任国民军总参议，指导国民军同奉军作战。后来，李烈钧对谢持、邹鲁等西山会议派的反共路线表示支持。1927年（民国16年）4月，蒋中正在南京成立国民政府，李烈钧支持并参加，任国民政府常务委员兼军事委员会常务委员。同年8月，蒋中正一度下野，北京政府方面的孙传芳趁机偷袭南京，李烈钧坐镇南京，联络指挥国民政府方面的