哈斯·皮尼利亚返回哥伦比亚后，成为哥伦比亚军火厂技术部长，1942年始任职军事学院董事。隔年被派往美国，订购军队所需要的武器装备，1944年任职高等军事学院副校长，1945年任民航局长，获上校军衔，1946年任驻守通哈军队的第一旅指挥官。1948年为驻守卡利第三旅的指挥官，该年4月9日，哥伦比亚自由党领袖豪尔赫·埃利塞尔·盖坦于波哥大遇刺，引发全国大规模的抗议浪潮，波哥大和全国各地发生暴动，罗哈斯·皮尼利亚使用军事手段镇压卡利地区的暴乱，使卡利的局势整体稳定，因平定叛乱有功，罗哈斯·皮尼利亚荣升中将军衔，并