达中国前折返。及至1289年，教廷再派方济各会宣教士孟德高维诺前往东方各汗廷。1293年，孟德高维诺到达元大都拜见忽必烈，并获准在大都宣教，由是开始了元代基督教在华传教之历史，当时与唐代以来传入中国的景教被合称为也里可温教。1328年，孟德高维诺死于中国，当时全中国内有信徒三万人，可见其盛况。
在华宣教之终结.终元一代，方济各会之宣教士不断来华进行宣教活动，且得元朝政府之信任，然而其信徒仍主要以色目人为主，未能传于汉人。及至1368年，朱元璋建立明朝，由于缺乏汉人信徒，元代也里