吴毓江从北京大学经济系毕业，毕业论文为《墨子之经济思想》。1928年至1931年间，吴任《四川日报》主笔，并任四川大学教授。1935年至1937年，他在日本东京帝国大学文哲研究室任研究员。1937年回国，任北平中法大学教授。1940年至1941年，任中央研究院专题研究员。1948年至1950年，任四川省立教育学院教授。1950年8月起，担任西南师范学院政治课教授，主讲政治经济学。1956年7月调任西南师范学院历史系教授，开有历史要籍介绍、历史文选等课程，并负责培养青年教师。