郑兼才于干隆五十四年（1789年）成为拔贡生，后考充正蓝旗官学教习，而后在嘉庆三年（1798年）铨授为闽清教谕。嘉庆三年（1798年）戊午科福建乡试第一（解元），后来改任安溪教谕。嘉庆九年（1804年）调为台湾县教谕。在担任台湾县教谕期间，他先是在嘉庆十年（1805年）十一月蔡牵进犯鹿耳门时，受命协助防守城池，次年议请续修台湾县志。《续修台湾县志》于嘉庆十二年（1807年）三月开始编纂后不久，郑兼才因先前的军功而在该年四月调为江西长宁知县，但他认为编纂志书之事不能中断，遂辞退不就，等到初稿完成，方内渡