儸纪到晚白垩纪期间，蜥脚类的化石纪录很稀少。这段期间的北美洲很少发现标本，所发现的标本也通常是破碎骨头，或是幼年个体。而白垩纪存活的蜥脚类恐龙在体型上缩减（身长减到15公尺左右，而体重为10到15公吨），因此波塞东龙的发现相当不寻常。波塞东龙生存于墨西哥湾的海岸，墨西哥湾的海岸在当时侵入到奥克拉荷马州一带，形成巨大的三角洲，类似今日的密西西比河三角洲。这个地区在当时可能没有掠食动物可以攻击完全成长的波塞东龙个体，但肉食龙下目的高棘龙（体型较小于暴龙）与以群体行动的恐爪龙可能以幼年波塞东龙个体为猎物。