由蔡永业医生为首任院长。但在筹办过程中，当时的大学及理工教育资助委员会提出，如中大医学院的学历欲得到英联邦国家承认，就须跟从香港大学医学院的作法，招收参加香港高级程度会考的考生 (这为当时香港大学的入学考试)(修读五年), 但它们同时也不反对中大循香港高等程度会考招收学生(这为当时香港中文大学的入学考试)（修读六年, 但这些学生首年需于理学院就读, 再于第二年投考医学院），这代表中大医学院可以採用双轨制收生。但这个建议引起中大部分师生强烈不满, 因为这令人联想于两年前政府建议中大採纳本科三年制的意图再起。经