（有时候每日）向国王报告，使得其权力超越了西印度当地政府，也超越了1503年于塞维亚创立，负责西印度海关的通商院。具有一定重要程度的民事诉讼会从新世界的皇家审问院上诉上来，印度议会扮演着最高法院的角色。秘鲁互相残杀的征战和不稳定的政治，加上巴托洛梅·德拉斯·卡萨斯为原住民人权不屈不挠的努力，促使查理五世1542年颁布《新法》，彻底改革议会。塞维亚与遥远殖民地之间的贸易，以及这些贸易必经的港口都由塞维亚的通商院掌控。通商院有权管理殖民地商业、移民出境和海上私人企业。印度议会和王室对西印度事务的大量