做莫亚。大雄不忍心将牠回到古代后要面临绝灭，于是把牠带到专门收容绝灭动物的「贝雷加蒙岛」（原文：ベレーガモンド岛），也就是这次的冒险舞台。 这个陌生的岛屿，拥有「黄金独角仙（黄金海格力斯）」所守护的不可思议力量，可以令古代生物得以继续生存至今，因而被哆啦美称为「奇蹟之岛」。它同时是一个受未来人监管和研究的生态公园，要到那里就必须要由当地的专业向导安排。然而，在该处研究的绝种动物学家凯莉博士（ケリー博士）的冒失助手刚之助（ゴンスケ）在前往大雄家的途中，却弄错时空，误把三十年前，儿时的大雄爸爸带到生态公园去了