拓扑异构酶（；type I：，type II：）是一种异构酶，能使DNA长链断裂与接合。专门参与DNA拓扑构形（DNA topology）改变的过程，最早的发现者是出身台湾的生化学家王倬。
拓扑问题.DNA在结构上主要有三种拓扑构型的变化：超螺旋（supercoiling）、纽结（knotting）与连锁（catenation）。能够使DNA在不进行DNA复制与转录的时候，尽量维持其紧密性。反之在转录或复制过程中，这些拓扑构型将会阻碍反应。
功能.由于DN