1987年4月加入人民入境事务处任职助理入境事务主任。后来于1991年晋升为入境事务主任，再于2000年晋升为高级入境事务主任。在2004年，曾国衞晋升为总入境事务主任，至2007年升任助理首席入境事务主任。而在2003年至2006年期间，他曾被借调到保安局担任助理秘书长。2009年，他成为首席入境事务主任。到了2012年接任入境事务处助理处长（管制），并于2014年晋升入境事务处副处长。曾国衞于2016年4月5日获中国国务院根据时任行政长官梁振英提名和建议任命，接替退休的陈国基出任入境事务处处长，同日