废除了禁止转世的命令。都杜饶登被俘后，被彭措南杰拘禁在桑珠孜城堡中，后来越狱被杀。贡噶兰泽、贡噶宁布母子则被命令居住在桑珠孜，但由于害怕受到报复，贡噶兰泽携子逃回了母族的居城浪卡子城堡。1622年彭措南杰病死以后，贡噶宁布被拉萨三大寺僧众迎接到哲蚌寺。同年2月25日，正式被认定为新的达赖喇嘛。3月18日跟随四世班禅喇嘛出家，受沙弥戒，法号阿旺罗桑嘉措。
统一西藏.五世达赖继位的时候仅仅17岁。新继任的藏巴汗丹迥旺波为了挽回颓势，于1635年联合七旗喀尔喀蒙古，共同对抗格鲁派。