出版物和书籍开始在图书馆具主导地位。直到1991年苏联解体，爱沙尼亚第二次独立后才慢慢恢复各项交流事务。1989年，爱沙尼亚政府恢复了图书馆原国家图书馆的法律地位。
建筑.目前爱沙尼亚国家图书馆所在的建筑是由爱沙尼亚建筑师及室内设计师苏列夫·瓦赫特拉(Sulev Vahtra)设计建造。为两栋位于塔琳的八层楼建筑，目前是波罗的海国家中规模最大的图书馆。2012年，图书馆对馆内进行部分整修，并更新设备系统。