03年，北京解放军301医院的退休医生蒋彦永认为SARS疫情与张文康所宣布相差甚远，其拒绝透露实情，从而给中国媒体和凤凰卫视写电子邮件反映情况但都没有结果。
马立诚离职事件.2004年，凤凰卫视评论员，曾供职于中国共产党党报《人民日报》评论部的记者马立诚突然离职。被指因为马立诚是因为高调批评中国的对日政策和北韩政策，引起了北京方面的不满而离开凤凰卫视的。法新社报道说，马立诚离去原因，凤凰卫视未加说明。
涉嫌窃取机密.2005年，凤凰卫视美洲台工程部主管麦大