奇的两年执教合约在2004年6月到期后未获续约。前克罗埃西亚国脚在2004年7月被任命为新任国家队总教练。在克兰尼察的执教之下，克罗埃西亚在2006年世界盃外围赛一败未尝，在瑞典和保加利亚之上，以分组第一出线。然而，克罗埃西亚国内部分媒体不满他疑似利用裙带关系，将他的儿子尼科·克兰尼察选入国家队。2006年世界盃，克罗埃西亚在开幕战败给巴西，并在对上日本的比赛中，因为达里奥·斯尔纳在上半场踢失一球十二码，终场以0–0和局作收。最后一场分组赛对上澳洲，比赛中犯规不断，共有三名球员被红牌罚下，终场以2–2踢和，