马洲支线通车后，乘客如果于其他车站误乘往落马洲站的列车，可直接乘坐反方向的列车，列车也有广播指可以坐回头车返回上水或罗湖。
车站艺术.落马洲站设一组车站艺术品，位于大堂。
利用状况.前九广铁路公司主席田北辰估计，落马洲支线首年客量平均可达每日6万人次。前九广东铁客运总经理黎守谦表示，通车首日（2007年8月15日，只服务了6.5小时左右）约有1万人次使用落马洲站。而据香港入境处的数据显示，连同东铁线、巴士、小巴及的士在内，通车翌日（2007年8月16日