立。
发展.1931年6月末，研究所职员全部开始工作。研究所分为医学部和理学部，医学部下设病理科、卫生科、细菌科、药物科，理学部下设生物科、物理科、化学科、地理科。自1934年起，研究所每年派遣一名职员赴欧美留学。1936年，新城新藏出任研究所第二任所长。1939年后，研究所为配合侵华战争，进行了9次相关的调查工作。此后研究所废除了“医学部”、“理学部”的称号，更加重视应用方面的研究。
接收.1945年，日本投降。是年9月，中华民国中央研究院接收自然科学研究