铁路也在中南部各地的大小路口均有设置各种不同的平交道，从只有在路口设置单一警告标志到保安设施完整的种类都有。也有如过去屏东县屏东市民和路上列车在马路中间行驶的情形，在糖厂停产和放弃铁路运输后除了观光用途外大多数已经废除。阿里山森林铁路除了路面宽广的嘉义市东区忠孝路平交道和途中北门至竹崎区间的县道159号设有专员定时看守的卷线栅栏外，其余的路口原本只有设置简单的警铃与警告标志，但在台铁接手经营阿里山森林铁路后，也为原本没有栅栏的平交道增设栅栏，并更换为台铁样式的警铃及灯号。台湾高铁正线自始即以专用路权