与不能飞却适于行走的新鸟亚纲很相似，例如鸵鸟，因而做出尾羽龙是鸟类的结论。在2005年，G.J. Dyke与马克·诺瑞尔（Mark Norell）批评了Jones等人研究在科学方法上有瑕疵，并提出完全相反的结论。其他没有正式加入争论的研究人员，例如周忠和等人，则承认尾羽龙的分类倾向是有争议的。
亲缘位置.在亲缘分支分类法中，尾羽龙一般都是与偷蛋龙科有亲缘关系，位于偷蛋龙科中的原始位置。切齿龙是偷蛋龙科中唯一比尾羽龙原始的物种。大部份的科学家认为尾羽龙是鸟类的恐龙祖先。但在2