、中华大学、玄奘大学、元培医事科技大学等五校。其中「国立清华大学」与「国立交通大学」已纳入中华民国教育部迈向顶尖大学计画为政府重点发展大学。公私立高级中等学校12所，分别有国立新竹高级中学、国立新竹女子高级中学、国立新竹科学园区实验高级中等学校、新竹市立建功高级中学、新竹市立成德高级中学、新竹市立香山高级中学、新竹市私立光复高级中学、新竹市私立曙光女子高级中学、新竹市私立世界高级中学、新竹市私立天主教磐石高级中学等普通型高级中等学校十校，以及国立新竹高级工业职业学校、国立新竹高级商业职业学校等技术型高级中等