则天任他为麟台监，修国史，不再任相。武则天令侍御医张文仲集当时名医共撰治疗风气的药方，令王方庆监其修撰。李哲被立为太子时，已改名李显，武则天任王方庆为行太子左庶子。二年（699年），武则天想在季冬讲武，有司办理不及，遂决定明年孟春再讲武。王方庆说：“按《月令》：‘冬季，天子命将帅习武，练习射箭、驾战车，角力较量’。这是三个季度务农，一个季度练武，平安之日不忘战乱之时。春天不可以举兵。兵，当五行之金；金胜木。春天，正是木旺之时，举金会伤德，扼杀生气。孟春季节而干冬季干的事，将会发生水涝，雪霜也会使人不安，种子