构酶被发现存在于几乎所有的生物体，包括哺乳动物、昆虫、真菌、植物和大多数细菌中。但也有一些不进行糖酵解的细菌，如解脲支原体（），则缺乏该酶。
结构.磷酸丙糖异构酶是由两个相同的亚基所形成的二聚体；每一个亚基都含有250个左右的氨基酸残基。每个亚基的三维结构中都包含位于外部的8个α螺旋和位于内部的8个平行β链。这样的一种结构花样被称为αβ桶或TIM桶，是目前观察到的最为普遍的一种蛋白质折叠方式。该酶的活性位点位于“桶”的中心，其中一个谷氨酸和一个组氨酸参与了催化反应进程。活性位点附近