力学系、宇航技术研究中心等基础上建立航天航空学院；2006年，与中国协和医科大学紧密合作办学，成立北京协和医学院-清华大学医学部联合培养八年制临床医学专业的学生；2008年恢复心理学系，同年成立马克思主义学院，邢贲思任院长；2009年成立教育研究院和生命科学学院，同年复建清华国学研究院，由着名哲学家陈来任院长科研方面，清华在各领域的研究有所突破。2000年6月28日18时37分，清华与中国航天科工集团公司、萨里大学联合研制的50公斤“航天清华一号”微小卫星在俄罗斯发射场顺利发射升空，并准确进入700公里