3人不服判决而提出上诉。2017年6月3日，台湾新北地方法院承审法官认为，3人损坏国旗的目的为表达政治意见，主观上无侮辱国旗之意图，又《中华民国宪法》保障人民言论自由，3人的政治性言论应受保障，因此改判3人无罪。因新北地检署提起上诉，此案进入台湾高等法院。2017年11月6日，台湾高等法院认为，侮辱国旗罪确有牴触《中华民国宪法》言论自由、思想自由及比例原则之虞，裁定本案停止审判，并声请释宪。11月8日，台湾苹果日报发表社论，认为此案之行为是《中华民国宪法》所保障之表意自由。同日《苹果日报》亦刊出吴馨