取措施减少蚊子繁殖的水域，喷施杀虫剂。目前尚无防治昆津病毒的疫苗。
医用.2005年，昆士兰医学研究院和昆士兰大学的科学家将修饰的昆津病毒颗粒注入小鼠可以向免疫系统释放一种基因，以癌细胞为靶向。这一研究可能会用于研制病毒和人类免疫缺陷病毒的疫苗。