2岁父母双亡，姐姐当童养媳，薛少卿当小长工。1929年，贺龙在监利县洪湖地区组建了湘鄂西红军队伍，在大哥的鼓励下，薛少卿投身革命，1929年7月加入中国共产主义青年团，1930年5月转党。1931年3月扩红运动中，作为团区委书记带领一部分本区农民参加了段德昌为师长的红三军第九师。长征中，任红二军团政治部没收委员会主任。抗日战争爆发后，任八路军120师政治部地方工作部武装动员科科长、师政治部组织部部长、代理政治部主任。第二次国共内战时期，担任嫩江省委组织部长。1947年夏调东北航校任副政委兼政治部主任