在率先进行的团体赛，助马来西亚队赢得混团亚军；此外，还赢得男子单打亚军。2013年4月，伊斯干达·祖卡奈因·再努丁出战马来西亚羽毛球黄金大奖赛，在男单准决赛以1比2（18-21、21-18、16-21）不敌队友的吴顺发。同年7月，他代表马来西亚参加俄罗斯喀山举办的世界大学生运动会羽球比赛，赢得男子单打铜牌。2014年9月，伊斯干达·祖卡奈因·再努丁代表马来西亚参加南韩仁川举行的亚运会羽毛球比赛，与队友合作赢得男子团体赛铜牌。2015年2月，伊斯干达·祖卡奈因·再努丁出战奥地利羽毛球公开赛，在男单