业后返部。民国2年（1913年）11月，被北洋政府任命为第十四混成旅旅长。1917年，任福建陆军第二师师长，属皖系李厚基部。因反对李厚基、陈炯明“联省自治”的主张，被削去师长职务。1918年，任汀漳镇守使。1923年，任漳厦护军使。当年，北京政府命直系孙传芳督闽，臧致平与王永泉联袂电京，力拒孙督闽。及孙闽抵南平，臧致平于3月9日赴福州与刘冠雄等协商阻止，并调兵北上，联合王永泉部抵御孙传芳。因王背臧投孙，臧致乎于4月17日正式发表通电，反孙独立。于4月30日在厦门召集福建各军将领举行联合讨伐孙传芳的军事会议。