有列车交会设备的车站，因此在运行上造成障碍。后来，JR东日本和新发田市花费约8亿日圆进行工程。把车站大楼迁移，加设列车交会设备，连带站前广场、连接车站道路等工程，工程在2000年（平成12年）秋天完成。
车站构造.车站是一座地面车站，设有2面2线的相对式月台。各月台上设有跨线桥连接。此站是由新潟站管理的无人车站。在部分时段，职员可能在此站当值。在北出口和南出口的车站大楼内设有候车室。两个车站大楼入口设有简易Suica闸机（入闸与出闸各一部）。1号月台的候车室内设有简易自动售票