五十五年（1716）又因康熙帝赐额而改称敷文书院。该书院为明末清初杭州最着名的书院，与崇文书院、紫阳书院、诂经精舍并称杭州四大书院，又以齐备的祭田祭祀、完备的学规章程和丰厚的藏书而居四大书院之首，对浙江当时和后世的教育影响深远。明代王守仁曾在此讲学，清代袁枚曾在此读书，康熙帝、干隆帝南巡时分别赐"浙水敷文"、"湖山萃秀"两块匾额。后在清光绪时迁至葵巷，原址逐渐荒废，仅存孔子像石碑照壁及万世师表牌坊等民国遗迹。自2001年9月开始杭州市人民政府以清干隆南巡胜迹图中的“敷文书院图”为蓝本复建书院，现主要建筑