拔4700米左右。主要山脉申扎杰岗山，属冈底斯山脉的支脉，与南部将县境一分为二；主峰甲岗海拔6444米，常年积雪。境内河流纵横，且多以内流湖泊为中心。有大小湖泊30多个。通过4条较大河流和9个湖泊相连。主要河流有申扎藏布、巴汝藏布和永珠藏布。主要湖泊有色林错、格仁错、错鄂、吴如错、木纠错、越恰错等。
行政区划.下辖2个镇、6个乡：
人口.2010年第六次人口普查，申扎县常住总人口20,285人，其中，申扎镇4,296人，雄梅镇3,437人，马跃乡1,829