开播的动画有线电视频道开始播映汉纳巴伯拉动画的作品，到了20世纪90年代中期，汉纳巴伯拉动画已为该频道创作出多个原创动画系列，其中包括《德克斯特的实验室》和《飞天小女警》。1996年，透纳广播公司与华纳兄弟母公司时代华纳合并，汉纳巴伯拉动画最终并入华纳兄弟动画公司。巴伯拉和汉纳继续在新公司担任顾问，并一起定期制作新节目，其中包括多部《动画秀》短片，还有1994年上映的《摩登原始人》电影版《摩登原始人之摔跤赛攻击波》（）和2002年发行的《史酷比》。此外，巴伯拉还曾在2000年制作的《猫和老鼠：宅猫》（）