嗣同接受湖南巡抚陈宝箴邀请，和唐才常等人设立时务学堂，筹办内河轮船、开矿、修筑铁路等新政。1898年，创建南学会、事务学堂、武备学堂、4月和唐才常、熊希龄等主办《湘报》，积极宣传变法，成为维新运动的激进派。维新运动时期，《湘报》和上海《时务报》、天津《国闻报》三足鼎立，是全国最有影响力的三大维新报刊。同年4月，得翰林院侍读学士徐致靖推荐，被征入京，擢四品卿衔军机章京，与林旭、杨锐等人参与新政，时号「军机四卿」。当宫中zh-cn:后; zh-hk:后; zh-sg:后; zh-tw:后;党密谋政变