法院提出仲裁后，美国调整亚洲的美军军事部署，加强菲律宾的关系，以军舰巡逻协防南海，确保菲律宾在南海的主权，中华人民共和国随后则决定在南沙群岛开展太平洋最大规模的人工造陆活动，宣示主权。2016年7月12日，南海仲裁案仲裁庭在中华人民共和国缺席的情况下作缺席审判，认定中华人民共和国主张的九段线「无效」，否定其对南海的历史权利。此外认为南沙群岛无一岛屿能够产生200海里专属经济区，南海岛屿遭到降格。当中最大的、由中华民国控制的太平岛不是岛屿，没有专属经济区。此次仲裁被认为是菲律宾的完全胜利、中华人民共和国的主张