交互作用。这可能会导致细胞膜脂质双层的瓦解，影响细胞质渗透性的控制并导致细胞质的洩漏。其他存在于细菌细胞中的生物分子也同样会被分解。用于精细调控多种唿吸与代谢作用的酵素很容易受到影响。这种高度特异的生化系统中的关键分子间相互作用和三级结构可借由阳离子表面活性剂很轻易地破坏。苯扎氯铵溶液是有效时间适当的速效杀菌剂。它可有效地对抗细菌和一些病毒以及原生动物。而细菌的孢子被认为是具有抗性的。水溶液根据它们的浓度可以是抑菌或是杀菌。革兰氏阳性细菌通常比革兰氏阴性细菌更容易受到影响。pH值对于苯扎氯铵活性没有很大