慧珊本人亲口证实，已于2006年在美国秘密结婚，丈夫是多年好友兼任经理人钟家鸿（Mike）。同年，陈慧珊承认怀孕，并准备做最少一年的全职母亲，因此将无线电视的工作暂时延后。同年9月16日，在香港一间医院产下一女钟律然。2009年7月，陈慧珊出演时装电视剧《搜下留情》，与马德钟共同演出，并于2010年间播出。2012年2月，其夫钟家鸿的公司经营不善破产，陈慧珊宣佈复出；下半年将返回无线电视拍剧，并落实参演《冲上云霄II》，可惜最后亦无缘参与当中。其后于2012年7月宣佈，9月会在香港大学就读硕士学位，