1912年（民国元年）8月结成了民主党。1913年，孙洪伊出任第一届国会众议院议员、宪法起草委员，并成为韬园派领袖。但是，抱持国会中心主义立场的孙洪伊，对袁世凯逐渐加强独裁感到失望。由此，他和与袁世凯接近的梁启超也逐渐疏远。1913年（民国2年）5月，共和党、民主党、统一党合併成立进步党，孙洪伊未参与，同年10月孙洪伊退居上海。1915年（民国4年）袁世凯称帝之际，孙洪伊公开表示反对。1916年5月25日，孙洪伊接受孙中山亲自交给的活动经费3000元（“交孙伯兰银叁千元正”），以开展针对北方军阀的斗争。