1年，担任美军随军牧师的朱友渔仍兼任云贵分教区主教。1944年，朱友渔赴重庆会见蒋介石，随后乘陈纳德的轰炸机返回昆明。1945年冬，港粤教区主教何明华宣布，英国圣公会无力顾及云贵，如果云贵能够自立则继续举办，无法自立则停办。后来，经朱友渔策划，晋升黄奎元为主教，同北美圣公会挂钩，筹建云贵教区。1946年春，黄奎元以讲学为名，离开贵筑赴美国，先后获得美国费城神学院哲学和神学博士学位，又于1946年在美国举行按立主教仪式，并获北美圣公会认可，建立云贵教区。回国后，黄奎元到上海。1947年8月，中华圣公会总议