淞沪会战爆发后，洪深辞去大学教授职位，组建救亡演剧队，深入内地城乡进行抗日救亡宣传。1938年赴武汉，在军委政治部任戏剧科长，组织了十几个抗敌演剧队。1940年秋，洪深任文化工作委员会委员。1941年春到广东中山大学任英文系教授兼系主任，假期中为桂林新中国剧社导演《再会吧，香港！》，1942年被中山大学解聘后到四川江安国立戏剧专科学校任教，同年冬去重庆，为中华剧艺社导演《法西斯细菌》等剧。抗战胜利后随复旦大学回到上海，1947年夏到上海戏剧专科学校任教。在复旦大学、上海戏专任教之余，编辑《戏剧与电影》周