德皇威廉二世号曾锚泊于特隆赫姆。在8月26日至9月6日的秋季演习中，舰队与第九军在石勒苏益格北部进行了登陆演习。冬季训练巡航则于11月22－30日进入卡特加特海峡。1908年5月，舰队以进入大西洋的大型巡航取代了常规的北海之旅，期间德皇威廉二世号在亚速尔群岛的奥尔塔作停留。8月13日，舰队返回基尔，为8月27日至9月7日的秋季演习做准备。在波罗的海的支队训练紧随其后于9月7－13日进行。在这些演习结束后，德皇威廉二世号被停止使用。它于1910－1911年间在威廉港进行了重大重建。内容包括削减舯部的部分舰艛