n::::演化史.兽孔目的演化途径起源于早二叠纪，当时一群盘龙目中的楔齿龙类（包含异齿龙与其近亲），演化出兽孔目。证据是牠们解剖学上的特征，例如头骨与嵴椎。在二叠纪中期，兽孔目取代盘龙目成为陆地上的优势动物。兽孔目的颞颥孔远比盘龙目的大。兽孔目可能在二叠纪中或晚期演化出热量调节能力（温血动物）。兽孔目可能拥有皮腺，较类似哺乳类，而非爬行动物的鳞片。早期兽孔目没有皮毛；晚二叠纪演化出的兽齿类可能是目前所知唯一拥有皮毛的兽孔目。兽孔目由三个主要的演化支组成，恐头兽亚目、草食性的异齿亚目、还有大多是肉食性的兽齿