癸未科三甲武进士。授南福建守备。历官福建水师提标左营守备、水师提标右营游击、澎湖水师右营游击、闽浙督标水师营参将、湖南洞庭协水师副将等职。干隆四十六年（1781年）升福建海坛镇总兵。干隆四十八年（1783年）任台湾镇总兵。干隆五十二年（1787年）于林爽文事件中力守孤城嘉义近半年，以功封一等义勇伯。福康安入城时，柴大纪未执“橐鞬之仪”。被福康安上参疏议纪「听任兵丁开赌寓娼，贩卖私盐」、「令其每月缴钱」，又说林爽文起事完全是柴大纪「平日废弛贪黯，积渐酿成」。遭槛至京处决。其子柴际甲发配至伊犁为奴。《清史稿》有