国大陆的《游戏机实用技术》为本作给出了26分（满分30分），进入“热血推荐”。CNN认为“本作对任何年龄的任意玩家都是一款大作”。在游戏网站HOOKED GAMERS评选的“2011年年度最佳便携游戏”中，《塞尔达传说 时之笛 3D》从《超级玛利欧3D乐园》，《神奇宝贝 黑·白》，《异形：Infestation》和《雷顿教授与魔神之笛》中突围，获得年度最佳便携游戏。
销售情况.《塞尔达传说 时之笛 3D》于2011年6月16日率先在日本地区上市。它帮助任天堂3DS时隔12周