中学校学生一律返回学校，进行“复课闹革命”。1968年3月，“杨、余、傅事件”后，中央文革小组鼓动再次开展“反右倾”斗争，提出“对派性要进行阶级分析”，清华两派矛盾开始膨胀，小型武斗不断。1968年4月23日至7月27日，清华红卫兵两派之间爆发了百日大武斗，是北京最为严重的武斗事件，动用各种棍棒、石块、土枪、土炮、化学剧毒弓箭、地雷、手榴弹、半自动步枪、燃烧瓶、土坦克等装备，针对大礼堂、 东区浴室楼、科学馆等建筑进行抢占与争夺。武斗期间，共致使18人死亡，1100多人受伤，30多人终身残疾，直接经济损失