但在环评未通过前，美丽湾渡假村已在该土地兴建旅馆，判决违法；且因环评不合规定，溯及既往，台东县政府已核发的建照失效。行政法院要求台东县政府应命令美丽湾渡假村公司停止开发行为。美丽湾渡假村开发案之行政诉讼，目前大致上可分为两种途径，第一种是由原告台湾环境保护联盟所提起的公民诉讼，要求被告台东县政府命美丽湾公司停止一切开发工程行为，第二种则是由当地居民要求台东县政府撤销已经作成的环评审查结论。2012年9月20日最高行政法院判决后，全案定谳。
各界立场.
台东县