电信总局依据电信三法，将其营运部门分割成立中华电信，至此电信总局仅专责电信事业的管理监督，但同时增加无线电波（含电视与电台广播）之监理工作；同日，电信总局迁往台北市济南路二段16号。1999年12月29日，电信总局与中华民国电脑学会共同捐助成立台湾网路资讯中心。2004年6月20日，电信总局为配合行政院新闻局辅导地下电台合法化计画，提出三项频率释出方案，不开放申设全国性大功率电台，仅开放小功率电台、或小功率及中功率电台搭配开放，预计最多可成立181家新电台。2006年2月22日，国家通讯传播委员