坂市住之江区，父亲是前职棒选手黑田一博，曾是日本职棒南海鹰队的球员。黑田博树后来就读上宫高中与专修大学，大学时球速已经达到时速150公里。
日本职棒时期.黑田博树于1997年加入广岛东洋鲤鱼队，但是表现不如同队的另一位菜鸟投手泽崎俊和。然而黑田博树后来的表现逐渐超过泽崎俊和，成为广岛东洋鲤鱼队的固定先发投手。他在1999年参加澳大利亚雪梨举行的洲际盃棒球赛，代表日本队出赛，黑田博树在赛事中击败南韩队，并且完封中华台北队。黑田博树从2001年至2003年之间连续三年都获得10场胜