机关撤销，改编为中国人民解放军空军第八军军部，空军第八军在福建省福州市重新组建，隶属中国人民解放军南京军区空军建制领导。同时中国人民解放军空军漳州指挥所由军级整编为师级。2003年12月，空军第八军整编为中国人民解放军空军福州指挥所。在2016年深化国防和军队改革前，空军福州指挥所隶属于中国人民解放军南京军区空军。2017年4月18日，中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平在北京八一大楼接见新调整组建的84个军级单位主官，并对各单位发布训令；中共中央政治局委员、中央军委副主席许其亮宣读习近平主席签