砂有防腐作用，为复方硼砂溶液的主要成分。硼砂是制造光学玻璃、珐琅和瓷釉的原料；也用于钢铁冶金。实验室中常用硼砂来配置硼砂缓冲溶液，用于DNA的凝胶电泳以及分析化学等。硼砂珠实验可用来鉴定特定金属，例如铜、铁、铬、锰、钴和镍等。早年在台湾，贡丸会加入硼砂以增加弹性及口感，后来禁用。硼砂溶液（硼砂水）亦是流行儿童玩具鬼口水的主要制作原料。
药用.中医称硼砂可用作清热解毒药，性凉、味甘咸，外治咽喉肿痛、牙疳、口疮、目生翳障、中耳炎、香港脚等，内服治噎嗝、咳嗽痰稠等。