同时明军也有不少蒙古人，是元顺帝逃回漠北时留下的部众。
清代.在清代，满人为防蒙汉联手反清，实行分而治之政策，对汉人进入蒙古地区设置很多限制。1721年之前，所谓的外蒙古它大部分领土不适合农业，只有少数地方可以种植，为对准噶尔汗国开战，在1725年一些汉人被迁到鄂尔浑河，土拉河流域屯田，而在1762年在科布多地区也成立屯田点，但在战争结束后多数人返回内地，只有少数汉族作为商人留下。尽管有这些限制，汉族的商号仍不断渗透到蒙古各地，主要集中在库伦，乌里雅苏台，科布多和恰克图。他