山东省自然科学教育研究所及山东省人民政府古代文物保管委员会的一部分。其自然类藏品大多可追溯至济南广智院。1952年，山东自然科学教育研究所与广智院合并改组成立山东自然博物馆筹备处。1954年山东博物馆正式成立。其馆址分为东西两院，位于广智院街原博物馆广智院旧址的东院为自然陈列室，位于上新街原宗教团体驻地世界红万字会济南母院旧址的西院为历史陈列室。早期的藏品来源分为以下几个方面：原山东金石保存所收藏的一部分青铜器、书画、善本书等文物；原广智院所收集的动植物标本、古生物化石等各类藏品；以及原解放区山东人民政