都重新画过一次，将风格统一。EVA零号机和初号机的设计基本上沿用TV版，山下表示，庵野有一本《EVA》初期设定稿集锦《》，那本书是他和另一位设计师的作品。庵野就问山下可不可以照着上面的初始彩图去做，山下就说OK。初号机和零号机大部份是由机械作画监督本田雄亲手绘制。在TV版担任角色和机械作画监督的本田雄受邀参与《序》时正在制作另一部作品，要到2007年秋天才能上工，可是到那时会来不及。本田很想参与但时间不足，所以让铃木俊二和松原秀典负责角色，増尾昭一负责特效，自己只有画EVA相关的东西，自称EVA作画监督