在15和16世纪，这一地区通常在强大的特尔纳特苏丹国控制之下，摩罗泰岛和北哈马黑拉县的沿海在一个叫做Moro的大范围地区中。在16世纪中期，一个葡萄牙耶稣会使团来到哈马黑拉和摩罗泰，并在1571年与此时控制特尔纳特和哈马黑拉的穆斯林发生冲突，穆斯林将基督徒迁离摩罗泰岛。在1627年和1628年时，特尔纳特的哈姆扎苏丹（Sultan Hamzah）将许多岛上的基督徒迁至特尔纳特岛上的Malayu。之后，此地受到荷兰东印度公司的管辖。原属此县的摩罗泰岛于1942年初被日军攻陷，1944年9月的中美军收复岛