东正教主教仍遵从君士坦丁堡牧区的指示，也因为近年来的发展，莫斯科牧区在1589年成立，东正教会当时被认为是会危害到国家安全的威胁。莫斯科牧区当时宣称对波兰立陶宛联邦的东正教徒享有宗教裁判权，此事态使联邦的很多东正教徒人心不安，诱使他们接受另一个选择，即与西方合作。联盟的主意得到国王齐格蒙特三世·瓦萨与东边的波兰贵族的支持；但东正教会与信徒中的世俗领导人却因此产生分歧。1595年至1596年间，天主教徒与东正教徒磋商并正式缔结布列斯特联合法案。此次联合并没有将罗马天主教会和东正教会合二为一，但促成了斯拉夫