用于计算化学的方法由计算系统的MO开始。分子轨域描述一个电子在原子核产生的电场中的表现，以及与其他电子的平均分佈。根据包立不相容原理，两个电子佔据相同轨域时，必须具有相反的自旋。这注定只是一个近似值，能够高度精准描述的分子电子波函数并没有轨域（参：组态相互作用方法）。