清华大学独立学生组织的重要决定都由学生代表大会决定，在争取民主的同时，实践民主。在戒严令宣布之后，代表清华大学成为北京高校学生自治联合会（简称北高联、高自联）常委至5月底辞职。北京当局镇压学生民主运动后的6月8日，北京市政府解散高自联。6月13日，北京市公安局将他列为21名高自联骨干之一，受到通缉。当时，他已回到西安的家中躲避，即在6月13日被公安抓捕并送到北京。根据官方的说法为周锋锁的姐姐和姐夫向政府揭发举报，当局并将此作为大义灭亲的典型进行宣传。但据周锋锁本人口述，其姐姐姐夫当时是被自己的工作单位西安