探花，此后在袁炜提携下成为翰林院编修，因作风清廉而获得声誉。万历二年（1574年），余有丁任国子监祭酒。万历十年（1582年）六月，张居正病危，在其举荐下，余有丁担任礼部尚书兼文渊阁大学士。万历十二年（1584年）十一月，余有丁去世，朝廷为其罢朝一日，明神宗命令宁波府、绍兴府、台州府三府为其修建墓地。
墓葬形制.余有丁墓道坐北朝南，总长200米，宽25米，修筑于地势依次升高的七个台地上。完整的墓道建筑从南向北依次为石牌楼、石望柱、石笋、跪羊、蹲虎、站马、文臣，最后一台地中部为方形墓