最主要的贸易港口为府城（今台南安平）、鹿港（今彰化鹿港）与艋舺（今台北万华）三地，俗称的“一府二鹿三艋舺”，就是形容此时期最兴盛的贸易港口。
目前的经贸交流.今日海崃两岸关系的互动主要体现在经济上，可说经济实力决定一切。两岸的双边贸易方面，2011年台湾对中国大陆出口1240.5亿美元，进口452.8亿美元，顺差达787.7亿美元，是长期以来台湾的最大贸易出口和顺差地区，占了台湾全年贸易出口的40%。自中华民国政府于1987年开放中国大陆探亲以来，两岸民间交流一直在不断发展，日