近期有一项主要基于化石物种的文献对本下目的分类大幅修改：除了包括多个旧属其他下目的分类单元，还重新分类为多个总科。不过这项修订并未获广泛接受。
分类.本下目可分成若干总科，所有现存的三个科都属于大蚊总科，其它总科都是已灭绝的化石类群。现时大蚊下目最广为接纳的分类如下：