1930年间，沪宁铁路局陆续增加了一些车站，并在原先无交会股道的车站加铺交会车到发线。1912年1月1日上午10时，孙中山乘沪宁铁路专用花车起行离沪，到南京就任中华民国临时大总统。启程时，上海各界万余人在车站送行。经过7个小时的旅行，下午5时，车抵南京下关站。1927年，北伐军攻占南京，军阀孙传芳从下关车站过江，沿津浦铁路继续逃亡。沪宁铁路通车的同时也设立了“沪宁铁路管理局”，即今中国铁路上海局集团有限公司的前身。该局名义上由华人主持局务，但管理实权仍在英国人手中，直到1929年后才由国民政府铁道部逐步