来，济南、乐安的黄巾军徐和、司马俱等攻城，杀死城中长吏，夏侯渊便与臧霸和吕虔率领泰山、齐、平原三郡的士兵讨伐他们，大破敌军，斩杀徐和，平定各县，没收食谷分与军士。
五出平叛.建安十四年（209年），夏侯渊被任为行领军。后曹操征伐孙权回师，夏侯渊被派去督领诸将攻击庐江叛军雷绪，将其击溃。建安十六年（211年）正月，太原商曜等据大陵叛，曹操以夏侯渊行征西护军职，督徐晃击之，攻落其二十余座据点，斩其帅商曜，屠大陵城。三月，曹操命司隶校尉钟繇讨伐汉中张鲁，使夏侯渊等率兵出河东，与钟繇会