主要于1996年至1997年间落成的过渡期／第二代和谐式大厦则在外墙设冷气机石矢台，窗户则约缩小大约3份之1；家庭单位方面，客厅窗的面积较大、而睡房窗的面积则较小，但葵芳邨葵明楼及葵正楼、平田邨平信楼、平仁楼、平旺楼及平诚楼、秀茂坪邨秀康楼及秀乐楼、金坪邨以及坪丽苑，则开始採用与第三代设计相近的较大面积的客厅及睡房窗，至于位于厨房外的露台则依然保留，供水、排污及座厕通风喉位置亦与第一代大厦相同。而第二代和谐一型大厦的1P型单位与第一代相似；三睡房单位方面，第二代的仍保留第一代的浴厕分离的设计，部份屋邨