埃及伊斯兰圣战组织最初主要目标是推翻埃及政府，建立一个以伊斯兰教法为基础的伊斯兰国。后来埃及伊斯兰圣战组织开始攻击美国和以色列。埃及伊斯兰圣战组织成立于1980年，它是由两个伊斯兰组织合并而成。1981年，埃及伊斯兰圣战组织成员刺杀埃及总统穆罕默德·安瓦尔·萨达特。2001年6月，基地组织和埃及伊斯兰圣战组织宣佈合併。