杭州铁路运输法院整体移交给浙江省高级人民法院实行属地管理，纳入国家司法管理体系。2013年1月，中国共产党浙江省委员会政法委员会关于印发浙政法发9号《杭州铁路运输法院检察院改制移交工作领导小组协调会纪要（第2期）》的通知，将杭州铁路运输法院移交浙江省杭州市中级人民法院管理。杭州铁路运输法院作为专门人民法院，承担浙江省铁路的各类刑事案件、部分民商事案件的审判和执行工作。2016年1月1日起，集中管辖杭州市、区（县、县级市）两级人民政府作为复议机关作共同被告的原由其他基层人民法院管辖的第一审行政诉讼案件。2