局的公立医院，医疗分级上属于「区域医院」，分设七大院区，院本部位于大同区中兴院区。现任院长是黄胜坚医师。为了有效整合台北市各市立医院资源，台北市政府于2005年元旦将各市立医院资源合併成立台北市立联合医院。但台北市立万芳医院与台北市立关渡医院，现分属台北医学大学与台北荣民总医院代管，是唯二未整合进入北市联医体系的医院。
院区.
台北市立联合医院中兴院区（含院本部）.本名台北市立中兴医院，地址为台北市大同区郑州路145号（市民大道一段），目前市立联院总院行