5月27日，威廉·海尔赛海军上将从雷蒙德·斯普鲁恩斯海军上将手中接过第五舰队指挥权，第58特遣舰队更名第38特遣舰队（），5月下旬至6月继续在冲绳岛近海作战。6月2至3日，特遣舰队空袭九州机场，6月8日再度袭击。两天后，第38特遣舰队离开日本前往菲律宾莱特岛休整。7月1日，第38特遣舰队离开莱特岛攻打日本列岛。此时特遣舰队共有九艘舰队航母，六艘轻型航母及附属护航舰队。战争结束前的几个月里，哈尔西力图将舰队攻势与陆军航空军的陆基战机协调，但两支部队的行动经常相互独立。7月10日，第38特遣舰队的飞机袭击东