服抗生素，例如青霉素、环丙沙星、四环霉素、红霉素、和万古霉素，以肺炭疽为例，却唯有在暴露于病原体后一天之内施用抗生素，才能有显着效果，而以抗生素预防法防止病人死亡对肺炭疽而言则是极为关键的程序，否则以其快速的病理进展，将难以避免病人死亡，而目前已发现具抗药性的菌株。目前已经开发了许多炭疽疫苗，用于家畜和人类的预防。炭疽吸附疫苗（AVA）可以保护以免经皮肤或吸入炭疽菌而得病。然而，该疫苗仅用于对暴露于炭疽菌前有风险的成年人，而在暴露后并未被批准使用。炭疽桿菌感染可以用β-内醯胺抗生素例如青霉素，以及对革兰