委员会，负责管理清真寺的教务、资产、宗教活动、聘请阿訇等事宜。
碑刻.福州清真寺内现有明朝到民国时期一共7方碑刻，分别是：明永乐皇帝敕谕碑，高115厘米，宽65厘米，主旨为敕谕保护伊斯兰教；明嘉靖二十八年《重建清真寺记》碑刻；清康熙二十九年（1690年）秋七月修寺碑记；嘉庆十七年（1812年）《公置产业碑记》；道光二十三年（1843年）十月初十《奉宪给示勒石》；民国十一年（1922年）《修清真寺碑记》。