风差非常酷热，通风欠佳，澳门立法会议员吴国昌及陈明金亦因此提出书面质询，澳门日报更作头条报导。而交通事务局局长汪云于2010年8月7日指，将在关闸总站开四个天窗加强通风，并兴建冷气候车室。
站内指示不足.2007年6月28日，澳门日报以“指示欠奉地点隐．机场快线站难寻”为题，批评站内没有机场线（AP1路线的指示，不便旅客）。
鼠患.2010年10月27日，澳门日报头版刊登关闸总站闹鼠患，指站内冷气通风管道与地下污水渠已成老鼠藏身之所，鼠辈横行，排泄物处处，