COMICS）作品从《C'mon数码宝贝》至《数码宝贝大冒险V驯兽师01～新的勇气～》共计11部（长篇6部，短篇5部）。《C'mon数码宝贝》作为数码宝贝系列最早的雏形漫画，由于那时数码宝贝具体设定还没完成，该作兽设风格有别于正常兽设风格。《数码宝贝大冒险V驯兽师01》系列、《数码宝贝合体战争》以及《数码宝贝宇宙 应用怪兽》系列漫画作品主人公虽与动画版相同，但他们通常被看作是处于平行世界的同一人物。《数码宝贝次世代》虽然与动画《数码宝贝拯救者》主人公不同，但有着千丝万缕的关系，如使用相同的数码器、数码之魂等