此外，基督教把本书卷（巴拿巴福音）与伪经的巴拿巴书信进行了严格区分，两者截然不同。巴拿巴书信成书于公元2世纪的亚历山大城。这两本书卷无论在风格、内容和历史方面都完全不相干。在割礼方面，两位作者的分歧就更明显：巴拿巴书信依从《使徒行传》中信徒不需要守犹太教徒的割礼，但巴拿巴福音却坚持犹太教的信仰，认为应该要守割礼。