肯尼亚东非大裂谷的湖泊系统是肯尼亚的一处世界遗产，由三个浅水湖泊组成，分别为博戈尼亚湖、纳库鲁湖、Elementaita湖。肯尼亚东非大裂谷的湖泊系统于2011年列入世界遗产名录，面积32 034 ha，缓冲区面积3 581 ha 。