配位域相比，第二配位域对金属络合物的反应活性和化学性质的影响较小。 然而，第二配位领域仍然与理解金属络合物的反应有关，比如配体交换和催化的机理。 
在催化中的作用.金属蛋白的机制通常会调用该蛋白对第二配位域进行调节。例如，某些氢化酶的第二配位域中的胺辅因子有助于活化二氢底物。 
在机械无机化学中的作用.第一配体和第二配体之间配体交换的速率是配体取代反应的第一步。 在缔合配体取代中 ，亲核试剂进入的是第二配位域。 这些影响与MRI中使用的造影剂这类实际应用有关