继续僱佣阿尔巴尼亚佣兵团，以期他们能制衡马穆鲁克。1803年，英军撤出埃及，以埃及总督为首的土耳其中央军、分裂的马穆鲁克贵族、以及阿尔巴尼亚僱佣兵此时。在总司令塔尔帕夏被人暗杀身亡后，穆罕默德·阿里继任为总司令。为对抗总督，他选择和在地政治领袖以及伊玛目们结盟，并暗中与马穆鲁克贵族们保持联系。1805年，开罗的民众起义废黜胡尔希德帕夏，并推举穆罕默德·阿里为埃及新任总督。时任苏丹的塞利姆三世最终不得不认可事态发展，追认其统治的合法性。穆罕默德·阿里上任后建立了一个由当地的村长、伊斯兰神职人员和开罗的