被指控与中国共产党有所联系。洪子瑜因生性爽朗、个性耿直且经常评论时局，被情治单位视为思想亲近中国共产党而不忠于政府。也因为得罪公营事业情报单位主管龙次云，最后遭沈镇南资匪案牵连。洪子瑜和数名同事在台中县关押1天后，隔天凌晨3时由龙次云亲自监督，从台中县大甲车站送往台北市保安警察第二总队看守所，之后在台湾省保安司令部军法处接受时间侦讯、威胁与利诱，当中指控、逮捕、侦讯、移送、审判等流程都由保安警察第二总队执行。由于遭到长时间的招供与刑罚，再想到过去有月眉糖厂员工被保安警察灌水致死、及家中仍有年幼子女，使得