科应放在分类学中的哪个地位一直有所争议，一些人主张其为蕨类，另一些人则认为它们是最初的维管植物（泥盆纪时的松叶蕨门）的后代。最近从基因中得出的证据显示松叶蕨科和蕨类的关系比较相近，且和瓶尔小草目特别相近。所有的松叶蕨属植物有着一些相同的特征。它们是维管植物，且缺乏叶子而是另有一小突起物。此一小突起物不被认为是真正的叶子，因为维管束只是在其下面，而非如叶子般在其里面。松叶蕨属也没有真正的根，它们是以假根来抓住地面，吸收则是借由称之为菌根的共生真菌的帮忙。松叶蕨每三个孢子囊组成一个「聚合囊」，看起来像是