由于组织穿透性不佳以及抗药性菌株较多，除蜂窝性组织炎及经确认菌株无抗药性的泌尿道感染仍使用头孢氨苄作首选治疗药物，上述其他病症（中耳炎、咽炎、肺炎、骨与关节感染、以及感染心内膜炎）已经建议使用其他抗生素治疗。头孢氨苄的可能副作用包括过敏、肠胃不适、伪膜性结肠炎等等。对于孕妇而言，本药品在许多孕妇使用后仍没有证据显示它会对孕妇或胎儿造成伤害（等同于美国的怀孕用药等级B；与澳洲的等级A），在哺乳期间使用本药品也是安全的。儿童与65岁以上的老人都可以安全的使用本药。肾功能不佳的病人在使用本药品时应依指示减少剂量