入法属印度支那，成为这个殖民地与保护国联邦的一部分。君主和法国代表对柬埔寨进行联合统治，其中法国代表拥有数位助理协助，这些助理常驻于各省的行政中心，例如马德望、乌栋、暹粒和菩萨市，法国代表则直接统治金边。法国在柬埔寨建立统治后的第一个十年内，推行多项改革，例如减少君主的权力、废除奴隶制等。诺罗敦一世的同父兄弟西沃达，于1885年领导叛乱，企图推翻获法国支持的诺罗敦并夺得王位，诺罗敦被迫流亡到暹罗。法国军队很快平息了这场叛乱，借此继续扩大其政治特权。1896年，法国与英国签订协议，划分了双方在印度支那