转乘通道拆除共2条扶手电梯，改为升降机，并将C2出口的升降机改入已付费区，独立为E出口，方便残疾人士转乘两线；而在该站转线通道将有八成划为收费区，方便乘客转乘，而有关工程亦已于2008年9月28日完成。
将军澳南支线（康城站）及九龙南线（2009年－2014年）.随着位于将军澳南，邻近将军澳车厂的全新大型物业发展区日出康城入伙，港铁于2009年7月26日正式开放康城站，而之前单纯用来让空车往返将军澳车厂和将军澳站、长达3.5公里的路轨亦开始负责康城站至沿线各站的客运服务。康城站启用