出任参知政事（副相），掌政期间，整顿行政效率，整理当年吕夷简制定的行政则例。后来富弼与韩琦、欧阳修二人，因作风不同而不和。嘉祐八年（1063年），宋仁宗驾崩，遗命欧阳修与韩琦辅佐其过继的姪儿宋英宗。欧阳修支持英宗追尊生父濮王赵允让，称之为「皇考」，引起「濮议」之争。大多数大臣如司马光、吕公着等，认为英宗已过继给仁宗，应称生父为「皇伯」，批评欧阳修是罪魁祸首，欧阳修亦竭力辩护，主张应考虑亲情。欧阳修自知在朝中已孤立，请求外任，但不获准。当时从舅薛宗孺与欧阳修有私怨，治平四年（1067年），扬言欧阳修与媳妇吴氏