上发现了约1500年前铃谷文化的遗迹。在此之后，利尻岛则属于鄂霍次克文化区，在岛上的旧旧利尻富士町役场处发现了鄂霍次克文化的遗迹。利尻岛最早出现在文献记录则是在江户时代的《津轻一统志》一书当中，通过这本书可以确认当时已有爱努人在这里生活。1848年（嘉永元年）7月1日，日本首位英语外教拉纳德·麦克唐纳就是在利尻岛登陆并到达日本。虽然他只在利尻岛停留了一个月，但从留下的文献记录来看可以得知他和当地的岛民之间有过交流。现在在岛上的野冢展望台建有纪念麦克唐纳的登陆记念碑。自19世纪中期之后，随着日本本土渔