以寄生绿藻为生。另外，红树林中漂流于水面的落叶上有海生疫病菌（Halophytophthora）与破囊壶菌（Thraustochytrids）生长，不过这些类群现在已被移出真菌界，分别归入卵菌与中，因此已非海洋真菌的范畴。许多真菌会与藻类或蓝绿菌形成地衣，" Arthopyrenia halodytes"、"Pharcidia laminariicola"、"Pharcidia rhachiana"与" Turgidosculum ulvae"等地衣可生长于潮间带或海洋中，也有许多地衣可生长在位于高潮线