.杜亚泉因涉足知识领域极为广泛，故着述宏富，不能一一列举。最为有名的是《动物学大辞典》与《植物学大辞典》，为中国科学界空前巨着，至今仍在发挥作用。为中国第一部有影响的专科辞典，十三人合作，杜任主编。1907年始历时12年出版，1934年再版。收载中国植物名称术语8980条，西文学名术语5880条，日本假名标音植物名称4170条，附植物图1002幅，全书300余万字。蔡元培为之作序说：“吾国近出科学辞典，详博无逾于此者。”时任苏州东吴大学生物系主任的美国科学家祁天锡也认为：“自有此书之作，吾人于中西植物之