西省委常委，次年1月兼任中共南昌市委常务副书记主持市委工作，2003年4月正式兼任中共南昌市委书记。2011年4月，任中共安徽省委常委、安徽省人民政府副省长、党组副书记。2012年3月，任农业部常务副部长、党组副书记。2018年1月，当选第十三届全国政协委员。同年3月出任改组后的农业农村部副部长、党组副书记。2020年2月10日，国务院任免国家工作人员，免去余欣荣的农业农村部副部长职务。