在纳粹德国时期，几乎所有居住在科隆的犹太人都通过多伊茨车站的低站台被驱逐出境。这里于1941年10月开始了首次遣送工作，最后一次公开的遣送则是在1944年10月1日发往泰雷津集中营。车站附近的各个展会场馆在当时也被用作集运仓库。多伊茨车站于第二次世界大战中被摧毁，由铁和玻璃材质制成的三船式站台大堂在战后被混凝土制成的站台檐篷所取代。隧道设施的一部分及整个站前广场（奥托广场）则被纳入了科隆市的法定古迹名录。自1988年起，作为计划中通往法兰克福的高速铁路概念的一部分，科隆开始制定城际快车运输在科隆