吉王朝占领了阿勒颇，并将其作为首都。阿尤布王朝在1183年占领这里，1250年迁都于此。1138年，阿勒颇爆发大地震，阿勒颇和邻近的安条克等城市几乎被完全摧毁。据记载，地震中约有23万人丧生。1260年一月，蒙古帝国西征统帅旭烈兀，以及其傀儡安条克公国、奇里乞亚亚美尼亚王国组成的联军围城四周后攻占了阿勒颇，屠杀了当地的穆斯林和犹太人，但放过了基督教徒。蒙古人继续前进，两个月后攻占了大马士革。同年九月，马穆鲁克王朝于阿音札鲁特战役击败蒙古人，占领了阿勒颇和大马士革。此后，旭烈兀在波斯地区建立伊儿汗国，