及螺旋藻保健食品进行测试，发现其中竟然有85种保健食品均含有微囊藻毒素。不同种类的蓝菌含有不同类型的毒素，当中包括神经毒素（Neurotoxin）、肝毒素（Hepatotoxicity）、细胞毒素（Cytotoxicity）及内毒素等，使他们对人体及动物构成生命危险。已有纪录証明饮用或于被蓝菌污染的水源接触会引致中毒现象，但实际多少的摄取量会致命则未有定论。
污染水质.蓝菌和藻类皆会产生有腥臭味的“藻华”（又称水华）现象，最大危害是令饮用水源受到威胁，毒素影响人类健康。亦会盖住