祐树参加日本举行的世界青年羽毛球锦标赛，与井上拓斗合作打进男双决赛，最终以0比2（16-21、17-21）不敌香港组合，屈居亚军。2013年3月，金子祐树与井上拓斗出战罗马尼亚羽毛球国际赛，在男双决赛以2比0（21-10、21-10）击败了法国的昆廷·文森特/塞巴斯蒂安·文森特，夺得其首个国际赛冠军。同年3月，他与井上拓斗出战波兰羽毛球公开赛，在男双准决赛以0比2（18-21、15-21）不敌赛会3号种子、波兰的亚当·克瓦林纳/普热梅斯瓦夫·瓦查。2014年4月，金子祐树与井上拓斗出战纽西兰羽毛球大