为拿破崙诞下皇子——弗朗索瓦·夏尔·约瑟夫·波拿巴（罗马王、莱希斯塔德公爵）。当拿破崙离开法国作战时，玛丽·路易莎曾二度担任法国摄政王，分别是1812年4月－12月的俄国战役和1813年4月－1814年1月的德国战役。1814年，拿破崙被迫退位，流放到厄尔巴岛。玛丽·路易莎回到奥地利，两人从此没再见面。拿破崙曾指出一点，比起第一任妻子约瑟芬，拿破崙更喜欢玛丽·路易莎。拿破崙声称虽然他曾爱过约瑟芬，但他不尊重约瑟芬，与玛丽·路易莎不同——大概是指约瑟芬的婚外情传闻和名声败坏。况且玛丽·路易莎在政治上的能力