平安丸、南海丸、雪风等）停泊集结之际，遭8架B-17轰炸机空袭，妙高号重巡洋舰因此中度毁损，瑞穗号则没有损失。1月9日瑞穗号与千岁号自集结泊地出发，一同开往印尼支援美娜多攻佔计画，提供必要的空优及反潜能量。但是同年1月11日，瑞穗号在与盟军9架大型飞行艇与4架轰炸机拦截时损失了3架零式水观，但打下了2架盟军飞机；比较严重的「战果」则是本舰所属零式水观将日本海军空降部队所属之1架九六式运输机击坠，里头搭乘了12位横须贺镇守府第一特别陆战队官兵及5位机组员，全员罹难；而在瑞穗号执行作战的那几天盟军仍有派遣B