丁堡成为苏格兰重镇及宫廷所在地，因此皇室成员更加频繁地造访荷里路德修道院。实际上詹姆斯二世和他的孪生兄弟亚历山大·斯图亚特都是在1430年10月于此修道院诞生的，詹姆斯二世在1437年于此地加冕，并在1449年在此地结婚。 1498年至1501年间，詹姆斯四世在修道院的旁边兴建宫殿。1538年詹姆斯五世幼子罗伯特·斯图亚特，第1代奥克尼伯爵被任命为荷里路德修道院的commendator。在争夺玛丽皇后的粗暴求婚一役中，由爱德华·西摩带领的英格兰军队在1544年和1547年两度对荷里路德修道院进行了破坏，