「义和团之乱已经是十几年前清国的事情，为何今日台湾还有此类的暴动？盲从暴动者至少也该知道，迷信是不能依赖的。」认为迷信不可取，承认台湾教育失败，台湾总督府也因此事件，展开更深入的宗教「惯习」调查。 西来庵事件结束，亦使台湾人认识到由于军事实力的悬殊，抗日起义举动断然不可行，民众开始以和平方式争取民主与自治，从此由武装暴力转型为以社会运动与政治诉求的社会及政治抗争运动，所以西来庵事件也成为台湾汉人有纪录以来的最后一次武装抗日。不过在国际社会上，这事件虽然规模较大，知名度仍旧不及原住民抗日的雾社事件。有学者