德川家康的东军，和池田辉政等人负责攻略岐阜城。9月15日关原本战当日，在垂井一里冢附近佈阵，防备在南宫山的毛利秀元、长束正家等西军部队。战后，受封纪伊国和歌山藩37万6000石。同年，叙任从四位下‧纪伊守。庆长16年（1611年）、和加藤清正协力促成在二条城家康和丰臣秀赖的会谈，并与清正共同担任警备工作。庆长18年（1613年）8月25日，在和歌山城逝世，享年38岁。墓所位在和歌山市吹上曹源山大泉寺与和歌山县伊都郡高野町高野山悉地院。幸长因为没有儿子，所以死后由弟弟‧长晟（长政次子）继承家督之位。元和5