吉斯斯坦，当中也有前东突厥斯坦第二共和国人士，第三波在吉尔吉斯斯坦独立后，维吾尔人作为贸易商前往当地，非官方估计有100000-200000人。一些维吾尔人被政府登记为乌兹别克族。
贸易与劳工.从事跨境贸易的维吾尔移民倾向于在比什凯克东郊区生活，他们的双语能力使他们成为中国汉族和当地人民之间的业务中介机构。然而他们的集贸市场已经成为众多攻击的目标。2000年，一场大火在游客集市爆发，有两个维吾尔人被枪杀。2005年，维吾尔族为主的马迪纳集市在一场选举与有关的骚乱中被纵火，维吾尔族商