提出五界说之前，生物学家已发现卵菌和黏菌等并不属于真菌界的核心成员。因此惠特克在处理真菌界时，已经将这些生物划归此界的核心之外。因此讨论菌类的指称时，开始出现所指涉的名词是指「广义真菌」或「狭义真菌」（仅包含真菌的核心成员）的问题。1981年，汤玛斯·卡弗利尔-史密斯曾建议以「真真菌界」（Eufungi）作为狭义真菌的界名。1992年则建议以「fungi」视为广义真菌的指称，同年唐纳德·J·S·巴尔（Donald J. S. Barr）等人又建议以「总真菌」（Union of Fungi）代指广义真菌，「E