授江夏兵予他，命他督诸军前进。当时桓玄密报桓伟作为内应，但桓伟遑恐，更向殷仲堪自首，于是被对方掳为人质，并命其写信给桓玄，在信中苦劝桓玄罢兵，不过桓玄不为所动，自度桓伟必因殷仲堪优柔寡断的性格而无危险。殷仲堪亦派了殷遹率七千水军至西江口，桓玄派郭铨和苻宏击败他；及后殷仲堪又派杨广及殷道护进攻，桓玄再在杨口击败他们，直逼至离江陵二十里的零口，震动江陵。后杨佺期自襄阳来攻，桓玄一度退后避其锋锐，但终大败杨佺期，及后由部将冯该追获并杀掉他。殷仲堪出奔，又被冯该追获，及后被桓玄逼令自杀。桓玄年末消灭了杨佺期