广东都督职位由陈炯明代替。6月30日，安徽都督柏文蔚（国民党籍）相继被免，同时黎元洪在武汉亦大捕地下党。在九江要塞司令陈廷训的请求下，7月3日袁世凯派北洋军第六师李纯部进入江西。
南方各省独立.7月12日，被免职的李烈钧在孙中山指示下，从上海回到江西，在湖口召集旧部成立讨袁军总司令部，正式宣佈江西独立，并发表电告讨袁。7月15日，黄兴抵达南京，组织讨袁，宣布江苏独立。推举江苏都督程德全为南军司令，但程弃职，逃遁上海。7月17日，安徽柏文蔚宣布安徽独立。7月18日，陈