龙填海区（该处于2003年设立了南昌站）以紧急月台形式预留建站位置，以应付未来北大屿山及西九龙发展的交通需求。机场铁路工程由政府邀请地铁公司（现称港铁公司）负责兴建，1995年4月正式动工。东涌线于1998年6月21日由香港特别行政区第一任行政长官董建华主持开幕仪式，并于翌日正式运作，而机场快线则于同年7月6日连同新香港国际机场一併启用。通车初期，东涌线使用7卡载客车卡，机场快线则使用6卡载客车卡和1卡行李车卡，列车车厢由西班牙CAF及德国ADtranz共同制造。现时东涌线及机场快线的车厢分别于2003