开始任第戎大学物理学教授，后在1849年转至斯特拉斯堡大学理学院任化学教授。在那里，巴斯德遇到了他的妻子并于1849年5月29日结婚。巴斯德共有过5个子女中，只有两个活到成年，而其余三个死于伤寒，此事激发了他去研究治癒各种传染病的方法。他在1868年首次中风，1887年再次中风。1895年9月28日卒于巴黎，享寿72岁。
研究经历.巴斯德于1854年-1857年任里尔科技大学理学院院长和化学教授，1857年-1867年任巴黎高师的主管行政管理和科学研究的主任，于1862年被选为法国