弥先进入札幌农学校（今北海道大学）预科就学，后来正式进入札幌农学校就读。札幌农学校和台湾的关系非常密切，不少毕业生都曾在台湾服务。在学时，川上经常在北海道各地进行採集制作标本。作为明治维新后接受西式教育的新一代知识分子，他受到札幌农学校老师宫部金吾、新渡户稻造等的照顾。1897年（明治30年），川上泷弥在阿寒湖的尻驹别湾发现绿藻，并命名为「毬藻」。川上参加雌阿寒岳的气象调查并发现毬藻的缘由，是因为在那个交通不便的年代，旅行成本极高，他不去当打工仔根本无法爬山。之后发表关于利尻岛植物分布的论文，在1899