16年2月，大批经第三方维修商更换过零件（尤其是用于Touch ID的指纹辨识器）的装置，在升级至iOS 9后竟当机砖化。此问题被称为「错误53」。根据第三方维修团队iFixit表示，「错误53」仅会出现于iPhone 6及iPhone 6 Plus上。苹果随后发布官方声明表示：「当装置未通过安全测试时，就会出现错误53。此测试的目的，是在装置出厂前检查Touch ID是否运作正常，其用意不是要影响客户。」，并在iOS 9.2.1更新中修正了此问题，不过仍引发部分用户不满。
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