皆有秘密行动以打击彼此，使得情况变得更加复杂。政府声称LTTE不只杀害政敌、招募童兵、进口武器，还杀害政府的安全与情报人员。反方则指控政府支援准军事团体以打击他们，尤其是支援卡鲁纳集团。
海啸与余波.2004年12月26日，印度洋海啸袭击斯里兰卡，超过3万5千人死亡，许多人民流离失所。国际纷纷施以援助，但对于是否该分配给泰米尔勐虎解放组织所控制的泰米尔地区有所争执。直到2005年6月24日，斯里兰卡政府与泰米尔勐虎解放组织达成共识──「海啸后行为管理架构」（Post-Tsunami