父亲有抗日倾向，要反对日本统治台湾的政治理念；二哥吴澍培在白色恐怖时代因参加中国共产党外围组织的读书会而入狱，但不减对共产主义和社会主义的热情，诉求中国共产党统治台湾。吴澧培身为台独大老，强力主张台湾独立的正名与建国运动。他的侄子吴钊燮是现任中华民国的外交部部长。吴澧培妻舅赖文雄是全美台湾独立联盟（UFAI）组织部首任部长、民进党美东党部第一届主委，2012年12月22日逝世。