包含克洛尔在内的全体预科师生被动员，编入第13861部队，并于当月起在淡水至新庄间从事阵地构筑，战后方解散复学。然而，克洛尔在战争期间仍不忘研究，他在1944年发表一篇数学物理论文，并登于《台北帝国大学理学部记要》。
战后时期.战后，国民政府接收台湾，负责接收台北帝国大学的罗宗洛亦因此成为战后台大的首任代理校长，并邀请克洛尔留任台大，并由讲师升任为副教授，调往物理学系教授物理学与德语。然而，在罗宗洛离任之后，由于克洛尔身为败战国国民，因此有了将被降职的传闻。直到傅斯年就任台湾大学校