映其开化派思想的《谦谷文稿》和教育思想体系的《学规新论》两部着作。1904年，日本在日俄战争期间强迫朝鲜签订《日韩议定书》。朴殷植在《皇城新闻》上发表大量文章抨击日本的侵略行径。他因此被捕入狱。《皇城新闻》也于1905年被停刊。朴殷植重获自由后转任《大韩每日申报》的主编，继续发表文章抨击日本的侵略和朝鲜封建政府的软弱、卖国。1906年2月，《皇城新闻》复刊后，他转任《皇城新闻》总编。1906年3月，朴殷植与张志渊等人创建大韩自强会，在《大韩自强会月报》发表思想启蒙文章。同年10月，他创建西友学会，任其机