747年（黎景兴八年）考中乡贡，任官至谨事郎太常寺寺丞。父亲李致位（1765年─1824年），以行医、教学为业。李文馥本人以科举入仕。1819年（嘉隆十八年）在乡试考中乡贡。明命（1820年─1840年）初年，任翰林编修、充史馆，后历任礼部佥事、协理广义兼管六坚奇、直隶广南营参协。李文馥担任这些官职期间，办事甚有表现，获明命帝赏识，升至户部右侍郎、署右参知之职。1829年（明命十年），李文馥因受贿罪被一度撤职。事缘在该年农历二月，有奸商廖宁泰、杜辉松等谋领北城（河内）关税，以百余两银贿赂李文馥，文馥