兴化府莆田县湄洲天后宫分灵妈祖金身来台(今开基大妈)，以茅草建屋，奉祀于干豆（关渡）山区，但是黄富三〈北台首座妈祖庙关渡宫之起源与角色〉一文认为此一说法欠缺历史文献支持。目前就史料《诸罗县志》来说，「干豆门天妃庙」是清康熙五十一年（1712年），大鸡笼社通事赖科鸠众所建于山上；康熙五十四年（1715年）时重修，易茅以瓦，建材自厦门运来，诸罗县知县周钟瑄命名曰「灵山庙」。该庙原建于山顶上，康熙五十八年（1719年）迁到山麓；干隆四十七年（1782年）因庙宇方位不正，再次重修；道光三年（1823年）因风雨侵袭毁