可达到85％以上，因与肠道中物质的交互作用，吸收率较有变化。一旦吸收后，保留程度高于硒酸盐。硒酸盐（selenate）的吸收又比亚硒酸盐好，几乎被完全吸收；但併入组织前，大部分会由尿中排除。维生素A、维生素C、维生素E都会增加硒的吸收，当在小肠腔的谷胱甘肽（glutathione，GSH）浓度低时也会增加吸收。重金属(例：水银)和植酸被认为会抑制硒的吸收。高剂量的维生素C、锌及重金属（例如：汞）会减少硒的吸收；但若在饮食中合併食用硒及维生素C，硒可以和饮食中的胺基酸形成保护结构进而不影响其吸收。