。宋真宗北征，周起领随军粮草事。以右正言知制诰，权判吏部流内铨。不久后担任东京留守判官，判登闻鼓院。东封泰山，摄御史中丞、考制度副使，所过之处留心采访官吏是否能干和民间疾苦上报。东封之后，近臣都称颂功德，周起上疏请求以居安为戒。进升为金部员外郎、判集贤院。开始设置纠察刑狱司，周起首任。周起于是请求已经判决而事实有所冤枉的以及官吏屈打成招的，一起听他们的申诉，宋真宗听从。擢升为枢密直学士、权知开封府。周起听断明审，没有遗留的事。真宗曾亲自到官衙问劳，周起奏请：“陛下从前没有登基的时候在这里，我请求避开