年同济大学恢复了文法学院。1995年实现由教育部和上海市“共建”。1996年并入了原上海城市建设学院和上海建筑材料工业学院，被国务院领导赞为高校体制改革中的“同济模式”。2000年与上海铁道大学合并，组建成新的同济大学，同济大学得以恢复建立医学院。2001年教育部正式批准将同济大学列入创建世界一流大学（即“985工程”）名单。2004年嘉定校区启用，同济大学软件学院以及汽车学院首批入驻。2006年同济大学在原文法学院基础上重组人文学院和法学院。2012年同济大学测绘与地理信息学院