盐水港溪挟带泥沙堆积而成。香山湿地出现过的涉禽，纪录中有277种，其中26种为保育类动物，聚集于客雅溪口的水笔仔纯林内，每当退潮时大批水鸟集中至浅滩觅食，涨潮后再退至客雅溪北岸的新竹海埔新生地。由于淡水河口近年的开发压力，冬季来自西伯利亚、中国东北、朝鲜半岛与日本的候鸟，多由竹围湿地与关渡湿地转至香山湿地栖息。香山湿地是台湾本岛招潮蟹种类最多、数量最大的地区，纪录上超过40种，数量达400,000,000只，其中和尚蟹有250,000,000只，台湾招潮蟹有10,000只。香山湿地也是北台湾重要的鱼场