人大量移民最终可能会导致蒙古人自身被同化或全面汉化，加上汉商的诈欺手法以及清朝统治者的政策转变，一些蒙古人因此怀恨在心并发起叛变。然而那些叛变基本上是地区性的叛变，而非组织严密的「全区性暴动」。
西南地区.自雍正朝大规模地实行改土归流政策以后，内地与西南广西和云南边疆地区之间的交流被加强，地域壁垒被打破，内地人迅速移往西南边疆地区，自清初至道光中叶，约有200-350多万人迁入了西南滇桂地区。
台湾地区.康熙二十三年（1685）以后，清朝向前往台湾的大陆人