其他障碍或与之重叠，最明显的有注意力不足过动症。例如一个患者是怠慢他人的、没有完成家庭作业及不能维持坐下等都会很易被诊断成为注意力不足过动症，尤其是当病人未有进行胎儿酒精综合症的诊断。一般的做法是转介往小儿科医生，小儿科医生可能会建议尝试使用利他能。药物在治疗胎儿酒精综合症是很重要，但必须与其他治疗方式一拼使用，以应付多种的障碍。
行为疗法.传统的行为治疗是根据学习理论的，学习理论是很多教养及专业策略及治疗的基础。连同一般教养模式，这些策略很多时预设对象是患有胎儿酒精综合症。由