长）算法生成化合物类（药物，天然产物，多样性合成产品）的虚拟文库 。这是通过使用化学信息工具来训练马可夫链在真实化合物类别上的转变概率，然后使用马尔可夫链产生类似于训练数据库的全新化合物。
定量构效关系（QSAR）.这是定量结构-活性关系和定量结构性质关系值的计算，用于预测其结构中化合物的活性。在这种情况下，化学计量学也和它有很强的关系。化学专家系统也是相关的，因为它们代表化学知识的一部分，作为计算机(In silico)表示。有一个相对较新的或预测驱动的MMPA的概念，它与QSA