治二年（1664年）夏，阮有进生病，召回旧营调养。景治四年（1666年）秋，阮有进病逝。阮福濒追赠其为协谋佐理功臣、特进、左军都督府掌府事、节制、顺郡公（），谥正勤。嘉隆四年（1805年），阮福映将他配享太庙。嘉隆九年（1810年），列祀开国功臣庙。明命十二年（1831年），追封其为开国功臣、特进、壮武将军、左军都统府掌府事、太保，谥襄武，改封英国公（）。明命十六年（1835年），又配享武庙。
子女.阮有进子阮有威，官至掌奇平康营镇守，孙阮有奉，官至内队长。