奈桑伯爵领地，成为教宗的领土。1305年，因法兰西王国和神圣罗马帝国之间的政教冲突，教宗克勉五世由梵蒂冈迁至阿维尼翁境内，成为亚维农教廷，此后共有七任教宗在阿维尼翁就位，直到1378年教宗额我略十一世才将圣座重新迁回罗马，但阿维尼翁教廷的出现也使得法国对立教宗的形成，成为了中世纪末期天主教会大分裂的重要导火索。阿维尼翁在圣座迁走以后一直为帝国领地，直到1790年法国大革命结束。自1791年起，阿维尼翁成为沃克吕兹省的省会。工业革命后，阿维尼翁成为一个铁路枢纽，城市开始向四周扩张，并发展至加尔省和罗讷河口省境