大肠内最常见的细菌类型是类杆菌属细菌，这类细菌也是导致大肠炎和结肠癌的原因之一。此外双歧杆菌属细菌也很常见，通常他们也被认为是“友善的细菌”。大肠内的粘液可以保护大肠免受偏利共生型细菌的攻击。
其他动物的大肠.动物中只有四足类（两栖动物、爬行动物、鸟类及哺乳动物）的大肠彼此之间有显着的不同，两者之间是由隔开。对于大部份的嵴椎动物而言，大肠只是一段连接到肛门，长度较短的组织，不过其宽度明显比小肠要宽。虽然大部份的羊膜动物都有盲肠，但只有哺乳类的大肠中有发展出真正的结肠。一些