于2000年合并至诸暨车务段，后者又于2005并入新成立的金华车务段，萧山的大部分车站改由金华车务段管理。金华车务段管理的萧山铁路车站又于2009年10月1日起移交杭州直属站管辖。
航空.杭州萧山国际机场位于区内瓜沥镇，是杭州市的主要民航机场，同时也是浙江省以及长三角地区的重要机场，处于华东第三，全国前十的水平。机场于2001年开航，以取代杭州城区军民合用的矛盾日益突出的笕桥机场。但随着萧山机场航班量日益增加，尤其是第二跑道启用后，萧山机场造成机场周边以及萧山城区受到噪声影响日