8年到1991年清点核燃料棒数量并全部运回美国，当时有699根燃料棒以干式贮存存放，处理过程中因部分燃料棒护套年久劣化，燃料棒中的金属铀跟水气经过擦撞产生氢气，在抽出燃料棒时前后共发生六次氢爆、一次大火，历经三年左右的时间才顺利取出空运至美国，但氢爆后放射性物质已流到核研所下方国有地。此后美国每年都会到核研所来检查三次，美方声称强制执行是要让中华民国遵守《核不扩散条约》，避免加剧台湾海崃的紧张局势。
现况.目前无直接证据显示中华民国拥有任何核武器，但部分学者认为中华民国在核武研究中