子任命为官员。隆安二年（398年），王恭叛乱，孙泰以为东晋快要覆亡，故此煽动百姓，招集信众，并获很多三吴地区人民响应。事件遭到会稽内史谢輶揭发，孙泰因而遭司马道子处死。孙恩及后逃到海上，召集到百多人，于是等待机会复仇。隆安三年（399年），会稽世子司马元显下令三吴各郡，公卿以下被转为荫客的官奴都移置建康，称作「乐属」以补充朝廷兵员。然而此举却令各郡士庶都十分不满。孙恩看准当时人心不稳，于是起兵叛晋。
经过.
初袭会稽.孙恩先与部众登陆进攻上虞（今浙江上虞）