响应的元件的数量差异，比如在一个细胞中，两个基因在相同的条件下，仍有着表达量的差异。而外部噪声描述的是不同的单个细胞在相同条件下，特定基因的表达所具有差异。这两种噪音可以通过双荧光报告系统（dual reporter studies）进行研究，比如将绿色荧光蛋白和在同样的条件下，用成像的手段去进行研究。
可用技术.可供研究的技术有：一个是用荧光原位杂交技术来看单细胞mRNA转录数量随时间的变化，也可以使用单细胞的RNA测序技术，但是后者失去了时间的信息。
机制