反叛罪逮捕了东帝汶民族解放军司令官沙纳纳·古斯芒，在军队内部得到很高的评价。1996年，普拉博沃在印尼的巴布亚山区领导了Mapenduma行动，这次任务包括英国军事专员和空降特勤队（SAS）的秘密支持。这次行动的目标是释放11名科学研究人员，他们被自由巴布亚运动（Organisasi Papua Merdeka，简作OPM）劫持为人质，研究人员包括5名印尼人、4名英国人、1名荷兰人和1名怀孕的德国女人。两名印尼男性人质在救援行动前不久被杀害。在人质转移之后，普拉博沃领导的Kopassus开始了一场针对支持O