三天后，由于主要的海上战斗皆集中于珊瑚海区域，日军莫士比港登陆运输舰队立即掉头北转，以避开战火。接续而来的珊瑚海海战对日本海军第四舰队造成严重打击，祥凤号航空母舰被击沉，翔鹤号航空母舰则严重受损。隶属于该二艘航空母舰的航空兵团以及损伤相对轻微的瑞鹤号航空母舰在遭受如此严重的打击后，被调回日本本土进行整补、维修等工作。日军随后放弃了以南洋分遣队直接登陆并佔领莫士比港的计画。7月11日时，由于日军主力航母舰队于中途岛战役中被歼灭，大本营因此下令停止一切针对新喀里多尼亚、斐济以及萨摩亚等地的夺岛作战。