卓仓曼巴仓活佛系统源自第一世（不计追认）智合仓活佛班觉丹增之弟阿旺诺尔布。阿旺诺尔布也曾住持瞿昙寺，圆寂之后以贡唐仓活佛的弟子罗桑贡却尼玛为其转世。罗桑贡却尼玛曾任塔尔寺曼巴扎仓第十五任堪布，故该活佛转世系统被称为“卓仓曼巴仓”。1949年前夕，瞿昙寺的卓仓曼巴仓活佛系统已告消亡。
历世卓仓曼巴仓活佛.历世卓仓曼巴仓活佛如下（第二世之后不详姓名，故暂未列出）：