1949年10月由中华民国海军直辖，由海军上校刘振铠任嵊泗设治局局长。1949年5月民国江苏省政府由省长丁治磐带领流亡至嵊泗列岛。1949年10月首置嵊泗县，海军刘振铠任首任县长。1950年嵊泗县被解放军攻尅。1949年1月27日死亡932人的太平轮撞船沉没发生在嵊泗列岛内白节山岛东南。，当时嵊泗由中华民国海军直辖。
行政沿革.嵊泗之“嵊”和“泗”，取自嵊山、泗礁两岛。1932年，《新崇报》刊登《开发泗礁、嵊山之商榷》一文中最先使用“嵊泗”地名。今嵊泗一带，唐宋时称翁山县、昌国