起，阿拉伯帝国征服西亚、北非，当地逐渐伊斯兰化，基督徒人口成为少数。同时受阿拉伯人统治影响，非阿拉伯族逐渐阿拉伯化。他们与早期阿拉伯基督徒是阿拉伯基督徒的两个主要组成部分，而近代，由阿拉伯穆斯林改宗基督教的人群则是阿拉伯基督徒中的极少数。奥斯曼帝国在13世纪末崛起，攻占了阿拉伯世界的大部分地区。根据伊斯兰教齐米制度，奥斯曼帝国内的基督徒享有有限的宗教自由，被视为二等公民。进入20世纪，在奥斯曼帝国灭亡之前，安那托利亚东部的亚美尼亚和叙利亚基督徒被屠杀和驱逐，针对亚美尼亚人的屠杀和驱逐即是亚美尼亚大屠杀。