主进步党籍立法委员的彭百显脱党参选，以数千票差距打败该党提名的林宗男及中国国民党提名的许惠祐，成功当选县长。他上任后，一天工作十六小时，堪称「打拚县长」。2001年县长选举时，除彭百显有意竞选连任外，民进党亦再次提名时任立委的林宗男参选。亲民党则因宋楚瑜在2000年总统大选中于南投获得高票，因而提名时任立委的陈振盛参选。另一方面，国民党则陷入分裂，时任集集镇镇长的林明溱和时任立委的张明雄相持不下。后来当时的党主席连战裁决：「兄弟爬山，各自努力」，说最后关头会集中全力支持民调较高的一人，但一直拖到选前十天