体仁阁大学士，成为“三殿三阁”。此后，大学士员限为满汉各二。大学士的迁转也大多按从体仁阁至文华殿这样的顺序迁转。有清一代，正式诏书等均以内阁名义拟出，臣下正式奏章也递交内阁，所以内阁仍是清代名义上正式的最高行政机构。
崇德年间.天聪二年（1628年），皇太极设立文馆，命令儒臣入值。崇德元年（1636年），改设内国史院、内弘文院及内秘书院，统称内三院，各置大学士一人。内国史院掌记注诏会、编纂史书、撰拟表章。内秘书院掌撰外国往来文书及中央诏会、祭文。内弘文院掌历代善恶记注，侍读皇子、教