此再次成为中国经济的重要节点。清世祖顺治二年（1645年）4月，多铎铁骑南下，史可法据守扬州，5月20日城池被攻陷。扬州城被清军屠城，史称「扬州十日」。根据王秀楚所着《扬州十日记》中记载，扬州城被清军屠杀八十万人，然而根据明末清初史学家计六奇所着《明季南略》中记载：“扬州（府）初被高杰（明军）屠害二次，杀人无算。及豫王（清军）至，复尽屠之。总计前后杀人凡八十万，诚生民一大劫也”。待清朝政局稳定后，扬州经济又迅速恢复。徽商逐步代替了明中后期活跃于扬州的山陕商人，垄断了利润可观的两淮盐业。扬州盐业与漕运发达