史前至郑氏王朝.台南市辖区过去在荷兰人于17世纪到来时，主要为平埔族中的西拉雅族居住范围，而西拉雅族之中，以新港社、目加熘湾社、萧壠社、蔴荳社势力最大，而除了西拉雅族之外，在今东山区曾有洪雅族的哆啰嘓社。荷兰东印度公司来到台江内海后，先是在今安平区的大员社（Tayouan /Tayowan，亦称台窝湾社）建设热兰遮城（今安平古堡），后来又在赤崁社地兴建普罗民遮城（今赤崁楼）。而对于各地的原住民，自1641年4月10日第六任台湾长官特罗登纽斯（Paulus Traudenius）