大量设置在各式舰艇，以及新式战斗机服役抵销日军战机。之后，九九舰爆在空中的优势也宣告结束；而九九舰爆因缺乏防御设备，在火网充沛的舰队近迫防御下伴随着极高的折损率，飞行员因此把他以谐音的含意讽刺为「九九式棺材」或「穷穷式舰爆」。而九九舰爆的后继机种：空技厂D4Y彗星的研发落后，生产与设计也出现许多问题，以致于战争末期，许多仅受过粗浅训练、毫无实战经验的飞行员还是驾着九九舰爆上战场，成为美军战斗机的标靶，最后只能以神风特攻队的自杀机作为结尾收场；而九九舰爆因缺乏防御设备，因此在自杀任务时折损机率更大。在日本