《日本沉没》(2006)2005年，在《无厘头森林之第一次接触》杀青宴的时候，庵野和一同出演的广告导演轰木一骑聊起了特摄的话题，之后轰木作了庵野的助手。当时已经做好了一部电视特摄作品的企画，但不幸的是企画搁浅了。于是又同时企画了「Rebuild of Evangelion」和另一部动画作品，为了推动他的计划，庵野想要成立一家自己的公司。
khara时代.2006年，创立动画制作公司株式会社khara、设立khara工作室，在此之前退出GAINAX董事会，之后离开GAINAX。新