自创校以来一直增设多项创新课程，以配合香港社会的发展，较着名的包括传理学、中医药学、社会工作学、人力资源管理学及政治及国际关系学等。浸大开办的中国研究、体康管理、欧洲研究、翻译学及人文学等课程，也是香港首创的。2005年，香港浸会大学和北京师范大学在中国的珠海市合作建立北京师范大学-香港浸会大学联合国际学院，是中国第一所由中国内地和香港高等教育界以中外合作办学模式联合创办的大学，并获得教育部特批及广东省教育厅支持，该校学生毕业后会获颁浸大毕业证书。浸会大学2013年1月成立「饶宗颐国学院」，邀得国学