兵家屯兵踞守之处，而清朝初年的刘体纯、李来亨军队、干隆、嘉庆年间的白莲教军队、同治年间的太平天国军队、光绪年间的红带会抗清组织都曾在神农架驻扎。第一次国共内战时，中国共产党开辟了巴兴归和鄂西北革命根据地，并建立了红花、古水两区及23个乡的苏维埃政府。中国抗日战争时，神农架人民为同盟国阵营修马路、背军粮、运弹药。1949年2月，神农架正式由中国共产党控制。中华人民共和国建立初期，神农架在南山地区自皇界以北属郧阳地区房县辖地。在皇界以南，包括新华、老君山至木鱼坪、红花一带属宜昌地区兴山县辖地，其中新华属于兴