药学以希腊医药学为基础，但帝国地理上的扩展，使得穆斯林们获得了更多新的疾病和新的药物的相关知识。药剂师和医生要经过考试，才能营业。他们在古代的医药典籍中增加了水银、丁香、肉桂、龙涎香、樟脑等药物药剂。当时阿拉伯商船曾将药物大批运往意大利。15世纪初，中国明朝郑和的船队也在阿拉伯采购了大量的药材，并交流医学知识。直到17世纪以前，被欧洲人尊称为“穆罕穆德·拉齐斯”的艾卜·伯克尔·穆罕默德·伊本·宰克里雅·拉齐（865年—925年）和“阿维森纳”的艾布·阿里·侯赛因·伊本·西拿（980年—1037年）的医学着作