一同放在三尖杉科当中；但也有将三尖杉科独立，穗花杉属至于红豆杉科，如《世界松柏类名录及文献》。但多数学者仍认为红豆杉科分5个属，有许多共同之处，是比较自然的分类群。
分佈.台湾穗花杉于地质史上为新生代第三纪变动后的孑遗物种，根据化石纪录穗花杉科自白垩纪晚期以来，曾广泛分佈于北美西部及欧洲等地区，现仅有穗花杉1属3种，且大多以小族群散佈于台湾及中国南部、中部、西部及越南北部 。台湾穗花杉主要分佈于台湾南部中央山脉海拔800至1400公尺间的原始阔叶林中，生育地有大武山、大里立山、