声，在知事到当地勘察后，于1955年决定设站，并在1959年4月16日完工启用。余部车站虽然只是一个偏远地区的小车站，但因为车站东侧紧邻的就是知名的余部桥，因此经常有观光客来到此地造访。在车站后方的山坡上设有了望台，可以欣赏余部桥与日本海的景色。但由于桥梁年纪老旧再加上缺乏防侧风结构在风速过高时得停驶列车，影响营运。因此2007年起开始在原桥梁南侧7公尺处开始修筑一座与原路线平行、设有防风壁的钢筋混凝土新桥，新桥已于2010年7月完工通车，而旧的铁桥仅保留部份路轨与三座桥墩，改建为了望设