明远楼即于此时建成。万历年间，考试号舍增至八千余间。明太祖还在秦淮河畔建立官营妓院，称为旧院或富乐院，与贡院隔河相望，原为才子佳人而设。秦淮河畔也因贡院、富乐院、夫子庙的存在而一度繁荣起来。清朝沿袭明代制度，乡试仍为三年一次。清代初期，南直隶改江南省，由此得名“江南贡院”。康熙年间，考试号舍已增至一万三千余间。同时，江南分省，江南贡院逐成为江苏、安徽两省共用乡试贡院。咸丰三年（1853年），太平军攻领南京城后，江南乡试停止。同治二年（1864年），湘军攻下南京城，江南贡院已破败，在曾国藩主持下，