但因经费及其他原因而未履任。此时，唐继尧继任云南都督，李曰垓兼任司法司司长。1914年5月，北京政府颁布《省官制》，将各省民政长改为巡按使。唐继尧借《省官制》调整任职之机，将李曰垓改任云南垦务总办。
护国战争.1915年，袁世凯逐步抓紧称帝。曾任云南军都督府民政司长兼司法司长的李曰垓对此强烈反对。当时，云南军界及政界的反袁世凯人士秘密组织了多个小组，分别谋划反袁，但相互之间没有联系。李曰垓同原来同为中国同盟会会员的黄毓成、赵复祥在一个小组内讨论。罗佩金、顾品珍、邓泰中、杨蓁、董