木屋一度被侵占当作青年旅舍使用。1945年台湾光复后，国民政府将该建筑改制为朴子镇卫生所，黄吴彩云的丈夫黄清木医师担任卫生所第一任主任。后来政府于他处新建卫生所，将原址变卖，黄清木便独资将建筑买下，开设「清木外科诊所」，作为诊所间住宅，黄吴彩云于此担任药剂师之职务。黄清木医师逝世后，诊所遭到闲置。2015年，长孙黄崇哲与孙媳萧秀霜，受到朴子日新医院保存协会古蹟守护活动启发，重新整修诊所建筑。2016年7月起，原址以「清木屋」为名，作为餐饮空间使用，并展出黄氏夫妇的相关文物及医疗用品。