，在1949年1月20日于东京中央区银座4丁目设立驻日本韩国代表部。1951年10月在日韩国人徐甲号在东京都港区南麻布购入用地兴建大使馆，并无偿贷款给韩国政府，1962年11月11日转赠给韩国政府。1965年6月22日韩国与日本签订《大韩民国与日本国间基本关系相关条约》，建立正式外交关系，同年12月18日驻日本韩国代表部昇格为大使馆，（）是第一位大韩民国驻日本大使。2013年6月、南麻布的大使馆馆舍及大使公邸完工，同年7月18日启用。现任大使是姜昌一。