会站按双倍计。整个网络中的行车最高限速为80公里/小时。不同于其它网络，慕尼黑地铁除了跨年和狂欢节外，在其余时间均不设通宵运营；大约凌晨1时至4时为常规停运时段，在周五至周六、以及周六至周日夜间则推迟为约2时至4时。除U5和U6线外，所有路线都完全在隧道内运行。U5线在路线南端终点的新佩拉赫南站之前不远伸出地面，U6线的地面段则包括学生城至加兴高桥区间以及加兴至加兴科教中心间的较短路段。所有路线上的列车通常以10分钟一班的间隔运行，在高峰时段会缩短为5分钟间隔，但部分是以短线形式开行。在清晨初段和午夜过