中国人民解放军海军厦门水警区，机关驻地福建省厦门市，是中国人民解放军东部战区海军的水警区，隶属中国人民解放军海军福建基地。
沿革.1951年4月23日，以接收福建军区所属的厦门要塞炮兵指挥所的1000余人，与华东军区海军福州办事处合并组成华东军区海军厦门基地筹备处，归华东军区海军建制。下辖2个岸炮营、1个直属营、1个布雷分队。1953年11月9日，根据地方军委1953年10月25日命令，华东军区海军厦门基地筹备处改组为中国人民解放军海军厦门水警区，仍归福建军区指挥。郑友生任政委、代