资助中学，于2001年9月正式开课，校长为杨耀忠。他之前担任香岛中学校长，具有丰富行政经验。创校校监叶慧珍。2001年9月5日，天水围香岛中学校董会以担保有限公司形式註册成立。。2003年1月10日，天水围香岛中学举行新校舍开幕典礼，立法会主席范徐丽泰、民政事务局局长何志平及中联办教科部部长初志农任主礼嘉宾。学校成立「仁、勤、信、健」四社，并将课外活动提升为联课活动。2003年12月14日，天水围香岛中学第一届家长教师会成立。2004年6月，天水围香岛中学假香岛中学正校举行首屈联校毕业典礼。