百年的台湾独立出来，改设为行省，并任刘铭传为首任台湾巡抚。伴随台湾建省，行政区划再次调整，全台从南到北分为三府（台南府、台湾府、台北府）、一州（台东直隶州）、十一县（淡水、新竹、苗栗、台湾、彰化、云林、嘉义、安平、凤山、恆春、宜兰）、三厅（基隆、澎湖、埔里社）。刘铭传在台湾积极实施建设，在1891年有了大清帝国第一条官办客运铁路（基隆—新竹），南北普设可通福州的电报线，同时也设立邮政与新式学堂，台北城的街头亮起了路灯。在刘铭传的积极治理下，台湾成为当时大清帝国近代化程度最高的行省。其后的台湾巡抚邵友濂、唐景