作用能力。其中乙醯辅酶A抑制的对象是E2，NADH则是抑制E3。除此之外，这两种抑制物氧化之后生成的辅酶A与NAD，则能够促进复合物的作用。第二种调控方式是由核苷酸来执行，例如GTP有抑制作用，AMP则有促进作用。第三种称为共价修饰作用，当E1中的丝氨酸残基被ATP磷酸酯化之后，复合物会失去活性；反之如果磷酸酯化产生的磷酸酯基被水解掉，则复合物会再度活化。另外磷酸酯化作用本身又受到丙酮酸的抑制；并且当ATP/ADP、乙醯辅酶A／辅酶A，以及NADH/NAD的比值高时，将有促进磷酸酯化的效果。