自1990年以来各个新教教会在立陶宛建立，包括联合循道会，浸信会和门诺会 。
伊斯兰教.立陶宛伊斯兰教存在的历史悠久，不像许多其他东欧和北欧国家。中世纪的立陶宛大公国和波兰立陶宛联邦，有少数穆斯林生活在国内，主要是维陶塔斯时期脱脱迷失带去的鞑靼人。现在被称为立陶宛鞑靼人，随着时间的推移不再讲鞑靼语，现在讲立陶宛语，但他们保持着伊斯兰教作为他们的宗教。
犹太教.立陶宛犹太社群的根源可以追溯到立陶宛大公国之前。立陶宛历史上有大型犹太社群存在过，纳粹德国入侵立陶