斑蝶属的学名是来自希腊传说的埃及国王及宙斯的曾孙达那俄斯，或是来自达那俄斯的玄孙女达那埃的雄性化版本。种小名是来自达那俄斯的双生兄弟埃古普托斯的50个儿子之一的Plexippus。君主斑蝶与两个相似的近亲物种于2005年前同属于斑蝶亚属。这两个物种是牙买加及伊斯帕尼奥拉岛的"Danaus cleophile"，及南美洲阿玛逊河的南大桦斑蝶。"Danaus erippus"差不多与君主斑蝶完全一样，但是蛹却有所不同，故曾一度被认为是君主斑蝶的亚种。不过根据形态学、线粒体DNA 12S 核糖体RNA、胞色素氧