辑佚也成为了一门显学。这段时期的民间辑佚代表作有由马国翰辑出的《玉函山房辑佚书》、由黄奭辑出的《汉学堂丛书》、由严可均辑出的《全上古三代秦汉三国六朝文》等等。另一个对清代的辑佚活动产生巨大影响的事件是干隆年间《四库全书》的修撰。干隆三十八年，安徽学政朱筠奏请从内库所藏的《永乐大典》中辑出佚书。在干隆皇帝的首肯下，《四库全书》的编撰们，从《永乐大典》中辑出经部书籍66种、史部书籍41种、子部书籍130种、集部书籍175种，合共375种，4926卷。今天《四库全书》中所有标有“永乐大典本”的书籍，都是通过辑