APEC各经济体台风资讯及研究成果，有助于加强因应天然灾害之能力。2015年，举办台菲高速电脑、资料同化技术、数值模式后处理技术等教育训练，提升菲律宾在台风等剧烈降水天气系统处理技术能力。中华民国政府每年提供固定名额的奖学金给予菲律宾学生赴台就读中文及攻读硕、博士学位；台湾学生在菲律宾进修者尚属少数。
援助.1990年7月16日，菲律宾吕宋岛后，中华民国政府自「国际灾难人道基金」中拨款20万美元协助赈灾救难工作。1991年6月，菲律宾皮纳土波火山爆发造成吕宋岛惨重灾情，