往蒙特勒，被意大利年轻的无政府主义者路易吉·卢切尼用一把磨尖的锉刀刺伤心脏。她遭到袭击后，不知道她的受伤严重程度，还继续登船。直到除去紧身衣，周围人才意识到问题的严重。终因流血过多身亡，时年60岁。她的最后一句话是：“出了什么事？”据报道，卢切尼本来想暗杀奥尔良公爵作为行动宣传，但奥尔良公爵临时将他的行程改变了。卢切尼事后说：“我只想要杀死一名皇室成员，不在意是什么人”。而伊丽莎白当时虽然匿名在日内瓦逗留，但报纸上还是报道了她的行踪，因此卢切尼决定刺杀伊丽莎白。她被葬在维也纳的皇家墓室里，几个世纪以来