英国派遣使节团与阿古柏·伯克签订条约，英国取得天山南部自由通商权与治外法权。1876年，清朝发动收复新疆之战。1881年，清朝收复了包含伊犁河谷在内的新疆全境。
东突厥斯坦伊斯兰共和国.1931年，新疆发生哈密暴动，新疆省主席金树仁为扩张权力发动改土归流，而政府军又因压榨当地平民百姓，引起维吾尔社会从王府到一般民众的普遍不满，在和加尼牙孜领导下对当地汉族移民进行屠杀；甘肃军阀马仲英亦派兵入疆，与省政府展开激战。1933年11月12日，沙比提大毛拉等在喀什疏附县建立了东突厥斯坦共和