移植产生的血型变化.如果接受ABO式血型不同的捐献者的骨髓移植，由移植来的造血干细胞制造血液，最终会变成与捐献者相同的血型。此外，血液细胞的染色体，DNA也将变成捐献者的。这是因为对于骨髓移植而言重要的白血球血型「HLA型」与红血球的血型「ABO式」无关，移植并无必要令ABO式血型一致。
后遗症及其课题.由于移植的前处置，施用了超过致死量的大量抗癌药物并进行放射线照射，做为其后遗症，儿童可能发生发育障碍，此外男女都会有很高可能永久性不育。在曾经是「不治之症