军总司令瓦德西占领北京后，居住于中南海仪鸾殿。溥仪即位后，曾在中海西岸集灵囿修建摄政王府。
中华民国.1911年清朝宣统帝退位后，根据《清室优待条件》，皇室虽得以保留紫禁城和颐和园，但北、中、南三海即刻归民国所有。中南海随即被中华民国大总统袁世凯佔用，成为北洋政府的大总统府。袁世凯称帝时期，中南海曾改名新华宫，同时宝月楼拆外墙、更名为新华门。从此，新华门取代西苑门成为中南海的正门。此后中南海又先后被用做北洋政府的大总统和总理办公地、以及张作霖的大元帅府。中华民国国民政府接管北平