不过腓力二世对于宗教的狂热也在各地遭遇反抗，1568年起信仰新教的尼德兰地区开始反抗西班牙的统治（八十年战争）。英国对于尼德兰叛军的支持触怒了腓力二世，于是腓力二世在1588年派出无敌舰队意图征服英格兰，但是失败。1590-1598年腓力二世又在法国宗教战争中出兵法国支持天主教派。哈布斯堡西班牙在腓力二世的统治下国势空前强大，领有西班牙、西西里和那不勒斯、尼德兰、弗朗什-孔泰、米兰、葡萄牙以及美洲、非洲、亚洲等遍及全球的海外殖民地。从美洲搜刮来的财富使得西班牙得以不断发动战争，但是连年战争使得西班牙经济