第五次提速后首列火车正式开始运行。为迎接中国铁路第六次大提速，杭州站将既有1号及4-7号站台改为高站台。2007年1月28日上午7点15分，杭州站始发的N522次列车从杭州城站开出驶往上海南站，该列车由CRH2A担当，是当时中国最先进的列车。该车是和谐号电力动车组在中国的首次运营，同时标志着中国铁路以此为起点，进入了全新的高速列车时代。4月28日起，杭州站开行经由沪昆铁路（即原沪杭铁路和浙赣铁路）运行的既有线动车组列车。2009年7月5日开始至2010年春运前，杭州站新建第七、第八候车室以及长450米的