了解了美国年轻男同志HIV/AIDS患者的有关症状后回国，发现近期到美国的年轻澳大利亚男子亦出现同个症状。1985年，库珀在《柳叶刀》期刊发表了一名患有HIV血清转化症的病例报告，确诊澳大利亚首个HIV病例的功劳从此归于他。库珀于1983年荣获UNSW医学士学位，1986年获任命为该大学的高级讲师，同年也成为新成立的全国HIV流行病学与临床研究所所长（现为柯比研究所）。1991年，他获任世界卫生组织AIDS临床研究与药物开发全球计划委员会主席，1994年被委任为全职教授，并获颁UNSW自然科学博士学位。