年），闯王李自成陷北京，崇祯帝自缢。镇守山海关的辽东总兵吴三桂引清兵入关，福王朱由崧即于南京称帝，黄端伯面北働哭，盼为国效力。经礼部尚书姜曰广推荐，授为正六品礼部仪制司主事、礼部仪制司郎中。弘光元年（1645年）五月，南京失守，朱由崧逃逸，礼部尚书钱谦益及忻城伯赵之龙等百官皆迎降，城内自杀殉国的，除了南京守备太监韩赞周以外，只有十二个人，其中高级官员仅刑部尚书高倬，其余皆是中下级官吏以及一般读书人，故时人叹曰：“国家无事，公卿大臣享其尊荣；不幸有变，儒生小臣奋其义烈！”黄端伯在其寓所能仁寺傍门书写“