四库全书总目》将四部分类发展到了一个新的高峰，成为了四部分类中的代表作品。清干隆时曾由政府编纂四库全书，亦按照经史子集分类编辑。据文津阁藏本，四库全书收录古籍三千五百零三(3503)种、七万九千三百三十七(79337)卷、装订成三万六千余册。其中：清朝在编纂四库全书时曾将许多对清朝不利的书籍销毁，据统计为一万三千六百卷。焚书总数为15万册，并销毁版片170余种共计8万余块。除了焚毁书籍，清朝还命史官系统性的对明朝档案进行销毁。目前明代档案仅存三千余件，主要是天启、崇祯朝兵部档案，也有少量洪武至泰昌期间