山（青龙山）之间而得名。但实际上三山庵并不位于三山之间，三山庵和证果寺间的同济桥周围才是三山之间。许多文人曾在三山庵留下诗画。知名画作有明朝的《观流图》、《观泉图》、《观月图》，清朝的《灵光指径》、《香界重游》、《干隆松石流泉闲坐图》。清朝曾获干隆帝赐紫袈娑、封“阐教禅师”尊号的贤首宗僧人达天通理，曾在三山庵隐居，注疏《法华经》，写作《楞严指掌疏》。清朝嘉庆十九年（1814年）夏，觉生寺住持海峰源亮曾在三山庵居住休养，并和崇理杲鉴禅师共倡重修八大处证果禅林。
建筑.三山庵坐