日战争爆发后，大夏大学与复旦大学组成第一、第二联合大学西迁庐山、贵阳后，任第二联合大学副校长。1940至1945年，任贵州省政府委员兼教育厅厅长。1945年，欧元怀辞去官职，返回大夏大学担任校长，兼光华大学、国立政治大学教授。1947年欧元怀在李宗仁的支持下，当选为立法委员。全国解放前夕，即与留在沪、宁、杭一带的五十三名立法委员发表声明，宣告脱离中国国民党。1949年，中华人民共和国成立后任大夏大学校长。1951年，华东教育部决定将大夏大学与光华大学合并，改名“华东师范大学”，欧元怀首先表示