阐明人类微生物组的问题基本上是鉴定包括细菌，真核生物和病毒的微生物群落的成员。2012年6月13日，美国国立卫生研究院(NIH)主任法兰西斯·柯林斯(Francis Collins)宣布了人类微生物组计划(HMP)的一个重要里程碑。该公告伴随着在《自然》期刊发表的一系列相应的文章，和在《公共科学图书馆》（PLoS）在同一天的几个期刊。通过使用基因组测序技术绘制健康人的正常微生物组成，人类微生物组计划(HMP)的研究人员创建了参考数据库和人类正常微生物变化的边界。
宿生部位.