共有建造事业、电气推进船「」的研究开发、国铁用地处分等国铁清算业务以及支援运输分野之基础研究。设立时为东日本旅客铁道以外其他JR各社的股东，2004年3月将西日本旅客铁道的股份全部出售，2006年4月出售东海旅客铁道全部持股，2016年10月出售九州旅客铁道全部持股，因此现在为北海道旅客铁道、四国旅客铁道及日本货物铁道的全资股东。
沿革.2002年12月18日，《独立行政法人铁道建设、运输设施整备支援机构法》（平成14年法律第180号，以下简称「法律」）公布，决定设立机构。