仁之兄实仁亲王因患天花，年仅15岁便薨去，未及登基。然而白河天皇并未奉父亲遗诏立辅仁亲王为新皇太弟，而是在翌应德3年（1059年）立自己的嫡子善仁亲王为皇太子，并于立太子同日禅位于皇太子，善仁亲王践祚为堀河天皇。宽治元年（1087年）辅仁亲王于祖母阳明门院的御所室町第行元服礼，藤原实季为其加冠，源道良为其理髪。
第二次储位相争.本该身居储位的辅仁亲王在堀河天皇登基后闷闷不乐，退居仁和寺花园，以琴歌消遣。白河上皇赐给他食邑来安慰他，并敕他有时间时来和自己见面。辅仁奉诗答复曰：“有琴