中华民国国家主权和民族尊严」，要求中华民国政府于公文书中，统一使用日据时期称唿日本殖民统治台湾时期。绿营政党多数反对之。教育部对于高中课本，採用日治、日据为简称者，皆予通过。
教育局处长会议手册事件.2012年7月26日，台南市承办2012年全国教育局处长会议，其设计的大会手册封面，有揹弓箭的平埔族人与台湾图案。马英九政府教育部要求修改，认为揹着弓箭有暴力倾向，台湾图案有台独意识的疑虑。
台湾原住民争议.在2014年教育部的高中文史课纲微调案中，支持历