改装为，并为了进行离子溅射实验而将加速器彻底改装为重离子加速器。另外，他们的研究团队也使用以派热克斯玻璃烧杯和中广报废的高功率真空管电极改造而成的水银整流管制造重水。经过约一年的努力，他们成功制作出98%的重水。1954年3月1日，美国在比基尼岛试爆氢弹，并造成该岛周围海域严重辐射污染，而在该处海域污染的鱼类也被运回台湾。为此，当时的台湾省渔会将那些鱼运至台大二号馆大厅，利用许云基团队自制之盖革计数器检测其放射性。另外在1960年代，许云基率领的团队开始自制碳-14侦测器，主要目的是了解二战后大气层核试