日知会成为中国同盟会的分支。1906年夏，法国人欧几罗奉孙文之命到湖北视察中国同盟会会务，刘静庵等人在日知会为欧几罗召开欢迎会，并宣讲革命，遭到密探侦知。同年12月，他和革命党人朱子龙等秘密策划响应萍浏醴起义，被郭尧阶向清政府告密，并称刘静庵即湖南通缉的会党领袖刘家运。1907年1月，刘静庵在黄陂农村被捕，押到武昌入狱，受到刑讯逼供，后被判处死刑。经各界援救，1909年与胡瑛一同被判为永远监禁。在狱中，刘静庵组织囚犯以“铁血军”的名义开展活动，并和监狱外的其他各革命团体取得联系。刘静庵还在狱中读书并记日记，