了中国在南海、藏南地区等区域的主权范围，引起菲律宾、越南和印度等国的抗议和不满。中国新版电子护照第8、24、32（海南省版图）、37（西藏版图）、43（台湾版图）及46页出现中国地图及局部区域版图，将主权争议地区纳入中华人民共和国领土版图，包括印度“阿鲁纳恰尔邦”（藏南地区）、阿克赛钦地区以及南海九段线等，引起部分当事国不满而拒绝在中国新版护照上贴签证或盖章，但是相关国家均承认新版中国护照为有效的出入境证件。由于中华人民共和国公民前往台湾地区时其旅行证件不会被盖印，因此中华民国方面虽有抗议，并无实际的反制措