前者是对其性倾向的歧视；后者是对其性别认同或原生生理性别的歧视。像是直同志是对同性恋者或双性恋者友善的异性恋者，但他们未必接纳跨性别者，而同性恋社群中也有对跨性别者歧视与排斥的问题，包含少数的性别气质和性别酷儿等在一般社会、甚至少数群体(例如：同性恋、BDSM社群以及性产业)中都是被贬抑的。
不同状况的排斥.
家庭.许多跨性别者的双亲、手足以及其他家人无法接受自己孩子的跨性别身分，常常会有想要矫正性其性别认同的行为，包含强制更改发型与衣着、限制其经济与交友，以