分子马达将存在三磷酸腺苷内的化学能转换至机械能。例如三磷酸腺苷酶马达，其作用即是水解ATP来产生指向性的能量。此一指向性的能量会使粒子(或离子或多肽)偏向；其结果最终会使得粒子扩散的静移动会强烈地偏向一个方向。布朗马达的力学与活动是现今理论及实验生物物理学研究的客题。布朗马达有时会用佛克耳-普朗克方程或以蒙特·卡罗方法来模拟。许多的研究者现在都忙着想要了解分子尺寸的马达如何在不可忽略的热杂讯中运作。这一马达的热力学被归在扰动定理的分支中。