班在被边缘化之下，转群集至相对少外来官吏驻扎的佛山镇，在明万历年间（1573－1620）成立琼花会馆，为本土戏班行会发端。
清朝.1650年（清顺治七年，南明永历四年）11月24日，「平南王」尚可喜与靖南王耿继茂指挥清军（汉军镶蓝旗），动用荷兰炮手等攻破广州城，随后清朝军队一直至12月5日在广州持续屠杀平民，据载死亡人数有约八千、八到十万等说法，史称庚寅之劫。后真修和尚雇人收拾民众遗骸，在东郊乌龙冈，‘聚而殓之，埋其余烬’，合葬立碑。后广州再次成为广东省会、广州府及番禺与南海县