理智慧财产案件，其案件包含第一、二审之民事、刑事智慧财产案件与第一审之行政智慧财产案件。行政诉讼由行政法院管辖，採二级二审制：依军事审判法之规定，军事法院分为最高军事法院、高等军事法院以及地方军事法院，除最高军事法院应设于中央政府所在地外，均由行政院国防部视部队任务需要设置。
检察体系.检察体系制度上于各法院设置检察署，分为最高法院检察署、高等法院检察署以及地方法院检察署，各置检察长和检察官，负责对刑事案件的侦察与起诉。虽然检察署均附属法院设置，但检察体系乃独立于法院体系运