为了在东郊中央体育场举行的第五届全国运动大会的交通方便，南京市工务局将旧中山门及瓮城拆除，门基挖低降坡，在原址偏北处另建三孔券门，即现中山门。中山门是连接南京城与东郊的重要通道。1996年，在城门下方两侧开辟全长1600米的双线行车隧道，城门则作为沪宁高速公路进入南京城的入口。由于历经战火和隧道施工的影响，中山门墙体的塌陷、渗水现象越来越严重。2003年，作为南京明城墙申报世界文化遗产的准备工作，南京市政府对中山门进行了整修。整修工程清除了墙体内的约3000立方米填土，减轻自重约5000吨，并浇筑钢筋混凝