为1896年成立的总督府制药所之检查课，1901年，专卖局成立后废止制药所，原检查课继承专卖局检定课。1909年，为研究所的卫生学部，从事微生物、动植物病理、血清、疫苗及药品的研究，辖有以下支所：中央研究所撤废后，成立热带医学研究所，独自改隶于台北帝国大学，并增设「热带医学研究所士林支所」（战后为蒋介石住所之一、梅庄营区），从事人体血清研究。热带医学研究所为今台大职业医学与工业卫生研究所及公共卫生学院。
庶务课.位于本部。