井政尚等人的围攻，力战不敌后退往阿波。而三好义继与松永久秀则向织田信长投降。隔年正月，三好三人众再度举兵进入畿内，与织田信长拥立的十五代将军足利义昭及织田军作战，失败后再次退回阿波（本圀寺之变）。1569年三好三人众与足利义昭和解，开始支持足利义昭对抗织田信长。1570年三好三人众联合三好家安宅信康（三好长庆之侄）的淡路众与篠原长房的阿波众，总计两万余兵力与织田家各路兵马在畿内展开拉锯战，一度收复了大片三好家旧领。1571年松永久秀与三好三人众和解，共同进攻织田家的附属势力。1573年，武田晴信上洛