残部在商震带领下进入山西，阎锡山顶住北洋陆军部压力，以“省防务紧要，商旅尚属可用”为由，用山西省财政报销商震所部的军饷。1917年8月扩编为四个混成旅加两个混成团。1918年山西第四混成旅一分为二，至此晋军已经有三万之众。1912年以日本留学归国的赵戴文担任山西将校研究所所长，集中历次整编中编余的军官约100多人。1915年建立军事教育团，招收知识青年和军队基层挑选的出色士兵，前后共两期，共有1000余人接受了基本的军事教育，返回晋军中担任班长。1919年6月，商震担任山西学兵团团长，至1930年学兵团