日本学士院奖（）是日本学士院颁发的奖章。毎年限颁发9名以内的日本学者。根据日本学士院法8条1款，日本学士院奖授予发表贡献巨大的论文、着作或者其他研究业绩巨大的日本学者。学士院奖和同为日本学术院颁发的日本学士院恩赐奖是日本最权威最重要的奖章之一。1911年设立。