ws XP和Windows Server 2003中，regedit.exe已经增加了权限的功能，regedit32.exe由于失去作用而被剔除。同时，这个版本的注册表是64位的，这导致了一些兼容性问题，少数可以运行在旧版本Windows的程序在Windows XP中无法运作。
64位Windows的注册表.64位Windows中的注册表结构大致与32位版本相同，但32位程序的信息被放在HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node而不是HKEY_L