合，促使伊势平氏与清和源氏等武家势力急剧上升。庄园制度让开垦耕地的人永久拥有耕地，他们结合成利益集团，更武力兼併庄园，渐成各地武家实力的来源。
中世.
院政时代（1086年－1185年）.平安时代晚期后三条天皇开启日本的院政期。现在的研究认为，作为历史分期的标志的主要因素，如庄园制、权门体制等等，都在院政期确立。因此，中世从院政时代开始而不是镰仓时代开始已经成为共识。院政是中世王权的基本形式，退位的天皇即“治天”作为天皇家的家长执掌国政。尽管院政时代一般仅指