洋热带海域的佛得角附近由一股东风波形成。系统朝西北方向前进，进入一片水温较高，风切变很弱的环境后稳步加强，于9月11日达到风速每小时270公里的最高强度。经过四天的强度波动后，飓风逐渐减弱，于9月18日在北卡罗莱纳州的外滩群岛以风速每小时165公里的强度登陆。风暴登陆后迅速减弱，于次日在宾夕法尼亚州西部转变为温带气旋。伊莎贝尔产生的风暴潮在北卡罗莱纳州冲走了哈特拉斯岛（）的一部分，这里形成了新的水湾，并非正式地命名为伊莎贝尔水湾。外滩群岛受到了最为沉重的打击，成千上万的民宅受损甚至被完全摧毁。因这场飓风