913年竣工，第五期则因太平洋战争爆发而未全部完工。这五期的筑港工程，清除了原本密佈内港区内的礁石（原本港内的鲎公屿、鲎母屿即在第二期工程被剷除），并在外港陆续整建了大型造船厂及军港、渔港区等设施，从码头货栈到港区铁路系统皆相当完备。基隆港现存的西二、西三码头仓库即在此时期兴建，分别于1932年、1934年完工。日治时代的筑港工程，不但奠定了日后基隆港的发展基础，也使基隆港在1970年代前稳坐台湾第一大港宝座。较特别的是，基隆港的筑港工程并不由政府行政系统负责，而是由日本军方主导，并被列为日本海军列管军