了包括建构主义在内的多个非传统人文艺术或社会科学研究。不过，学校也曾出现科学不端行为的丑闻。诺贝尔奖得主戴维·巴尔的摩于1986年接受不端行为调查，更在1991年接受国会聆讯。西奥多教授自2000年以来，曾多次批评麻省理工行政部门撇清林肯实验室一次导弹防御测试的潜在不端行为。陆帆·巴瑞斯副教授于2005年因科学行为不端而被停职，美国研究操守调查部亦于2009年判其有罪。
学术联盟.麻省理工学院一直以来都和学界、工业界、政府等机构组成学术研究联盟。1946年，康普顿校长、乔治·多