，METLIN数据库已经含有超过450,000种代谢物和其他化学实体，每个化合物都具有从分子标准物以多种碰撞能以及正电离和负电离模式生成的实验串联质谱法数据。METLIN数据库是同类型的串联质谱法数据的最大存储库。在2007年1月23日，由加拿大阿尔伯塔大学的David Wishart博士领导的人体代谢物项目完成了(Human Metabolome Database)的初稿，其中包含大约2500种代谢物，1200种药物，和3500种食物成分的数据库。另外，有几个植物物种，尤其是蒺藜苜蓿(Medicago