接受顾命。温峤指阮孚德高望重，国家非常需要他效力。阮孚没有回应，只是不断要求下车，但被温峤拒绝。在车子到达宫门前，阮孚声称内急，要求下车解手，但他下车后就自己步行回家。
自求外放.晋成帝即位后，阮孚被委任为丹阳尹。阮孚对庾太后和庾亮辅政持不同意见，认为庾亮经验不足，不能服众，相信将会有祸乱发生。他对亲信发表自己意见后不久，广州刺史刘顗去世。阮孚主动请求朝廷委任自己继任。在朝中主政的王导等人以阮孚性格放荡不羁，不适合在中央任职，决定批准他的请求，任命他为「都督交、广、宁三州军事」