连克丽奥佩脱拉的哥哥亚历山大也离开马其顿宫廷，流亡到伊利里亚，但克丽奥佩脱拉仍留在王都培拉。其后不久，腓力二世认为必须与伊庇鲁斯结盟，便把克丽奥佩脱拉许配给伊庇鲁斯的亚历山大一世。前336年，一场盛大婚礼在马其顿旧都埃格举行，腓力二世被他的近身护卫官保萨尼亚斯刺杀，婚礼顿成悲剧。
伊庇鲁斯王后.仅管发生了腓力二世遇刺的大事件，但这场婚姻没有因为国王剧逝而失效，克丽奥佩脱拉于是与亚历山大一世返回伊庇鲁斯，成为他的王后。这段期间，这对新人俩共诞生了两个孩子，儿子涅俄普托勒摩斯二世和女儿