之后，罢免新井白石，任命室鸠巢为文学侍讲。室鸠巢执政后，施行享保改革。其颁佈的足高之制对才能欠佳的官员进行罢免，改进了日本的官制。同时，他奉德川吉宗之命，将《六谕衍义》翻译成日本语，称为《六谕衍义大意》，并在日本刊行。后来这本书成为寺子屋的教科书，直到明治维新为止。室鸠巢晚年迁住骏河台的屋敷。死后，葬于其师父木下顺庵的墓侧，其遗址为今东京都文京区的大冢先儒墓所。着作有《六谕衍义大意》、《五常名义》、《五伦名义》、《骏台杂话》、《赤穗义人录》、《献可录》、《兼山秘策》等。