时尚未与万代合併）和卡普空也为主机研发了一些游戏。史克威尔（后与艾尼克斯合併为史克威尔艾尼克斯）推出了《最终幻想》、《最终幻想II》和《最终幻想IV》的重制版，这些游戏之后也登上了Game Boy Advance平台。太东移植了《太空侵略者》和一些电车GO!系列作品，获得良好评价。万代自己也为主机制作了数款数码宝贝系列和钢弹系列作品独佔游戏。为了与Game Boy系列的杀手级游戏《俄罗斯方块》竞争，横井军平为WonderSwan开发了一款益智游戏，之后为纪念他以《》（即「军平」）之名发行；其续作《》则是Wo