达沃省东南部的汉密吉伊坦山的高地山坡上。周围的大部分地区都未仅考察过是否存在猪笼草，所以其很可能也出现于棉兰老岛南部的其他地区。其分布范围从海拔1100米的地区至山顶海拔1635米的地区。
原生地.其陆生于非常广泛的区域内，包括高地山地苔藓森林、次生植被、山嵴顶部、悬崖边缘和塌方处。其也存在于称之为矮小森林的地区。小瓮猪笼草生长于超基性岩上。虽然其可以在非常阴暗的环境下生存，但在有直射光的环境下生长得更好。在汉密吉伊坦山上，小瓮猪笼草与翼状猪笼草、棉兰老岛猪笼草和盾叶猪笼草同域分布