载4枚500kg（2,200 lb）SC500炸弹。A-6结构与A-5与颇为类似，但A-6在机鼻区域加装防空气球钢缆切断装置，为了平衡重心故在机尾增重60kg（132 lb），A-6/U3人座型海上侦察机，由于安装FuG 200 荷恩特非对海平面搜索雷达（Hohentwiel (Radar)），故将机腹吊舱移除。
C系列机型.Ju 88C的目地即为战轰机与驱逐机，由Ju 88 V7原型机修改过来的C-2则是首批进入大量生产机型，採用容克Jomo211B-1发动机，最大推力达