十七年（1609年），起复升任右副都御史、巡抚宣府。四十年升兵部右侍郎，总督蓟辽保定边防军务。加兵部尚书，协理京营戎政。四十七年四月卒，谥恭敏，赠太子太保。
家族.曾祖薛儒；祖父薛一灿；本生祖一相（贡生）；父薛鬯。母郑氏。其弟薛三省，官至礼部尚书，身后亦赠太子太保。兄弟二人同致仕，为一时佳话。