地形的特征来说，佐贺市辖区内的北部为嵴振山地等地势较高的地方，中央部份是肥沃的沖积平原地形，而南方有着涨潮、退潮差异很大的有明海海域。整个辖区的北半部属于为嵴振山地，是属于地势较高的地区。南半部大部分都是个标高100公尺以下的佐贺平原，属于沖积而成的平原，嘉濑川以南北向通过平原连结。在平成大合併之前佐贺市的辖区大都在南方的这块平原上，也由于位在低海拔地区的关系，所以自古以来这里就是个相当容易发生洪水的地域；不过也因为洪水带来大量含有养分的土壤，让这里成为主要的农业耕种地带。辖区内主要的山地与河流如下