淘汰赛；但是首尔成功打入当年的联赛杯决赛。居内什带队的第二个赛季，球队出现了改变。尽管主力前锋朴主永转会至法甲球队AS摩纳哥，首尔仍依靠李青龙、奇诚庸和黑山前锋德扬·达米亚诺维奇等球员的出色发挥，得以夺得亚军，在冠军赛中被水原击败。球队因此获得2009年亚足联冠军联赛的参赛席位。在2009年亚足联冠军联赛小组赛中，首尔首战4－2战胜了印尼球队斯里维加亚，随后便遭遇三轮不胜，败给日本球队大坂钢巴，在与中国球队山东鲁能的两回合较量中取得一平一负，出线机会渺茫。但首尔于随后两轮取得连胜，再加上出线竞争对手山东