603年德川家康建立幕府后，出于基督教渗透的威胁，日本减少了与南蛮商人的接触。至1650年，除对荷兰和中国的贸易外，与其他外国人进行贸易会被处死，而基督徒受迫害。枪枝被禁止，恢复使用更「文明」的武士刀。航海与大型船只的制造亦被禁止。从此进入封闭、和平的江户时代。「南蛮人」于二百五十年后再次到来（1854年美国黑船来航事件），但此次经历了工业化的洗礼，凭恃武力结束了日本的闭关自守。