，不久与尼子经久达成和解。1508年，京极政经托孤于尼子经久，并将出云守护一职让与嫡孙吉童子丸后去世，吉童子丸此后事迹不明，尼子经久实际成为出云守护。
反叛大内.1507年，室町幕府管领细川政元遭到暗杀，政元的三名养子细川澄之、细川澄元、细川高国展开混战。次年，西国霸主大内义兴向中国地方和北九州的大名、国人发出动员令，拥立前将军足利义材和细川高国上洛。尼子经久应大内义兴之邀，参与上洛，参加了1511年的船冈山之战。尼子经久的次子和三子也分别拜受细川高国和大内义兴的偏讳，改名为尼子国久