研究发现大部份选择HRT的妇女多为上流社会阶层，一般而言有着较好的膳食及运动习惯。病例对照研究误将潜在变数看为成因。现时仍有类似的争论在维他命与癌症、抗生素及哮喘、大麻及精神病等关联上。所有关联都只是倚赖少型的病例对照研究，而不能代表整个人口。吸烟及肺癌关联的研究可以作为借镜。病例对照研究指向吸烟与肺癌之间的关联，而进一步扩大人口及动物实验证实了肺癌的发生率与吸烟程度的关系。现时的研究反驳了大部份的病例对照研究结果，及证实多是过于大规模。所以有学者建议在了解病例对照研究时须留意以下各点：Sect