云南地区，后由高昇泰等高氏政权掌控。1252年蒙哥汗命忽必烈与兀良合台自四川迂回南灭大理，原大理国王段氏被任为大理世袭总管。吐蕃自晚唐就走向衰退，但其境内藏传佛教（又被汉人贬称为喇嘛教）日渐兴盛，喇嘛的势力超过赞普（吐蕃王）的地位。1247年窝阔台汗次子阔端召请喇嘛班智达来凉州，史称凉州会盟，此后吐蕃喇嘛与蒙古大汗形成了布施关系（详见元朝治藏历史）。忽必烈南征大理时，分兵伐吐蕃，喇嘛班智达与赞普同时投降，吐蕃亡。元世祖封班智达的继承人八思巴为「帝师」，兼任总制院（后改为宣政院）院使，取得了统治乌思藏地区的权