之间还会发育出第三个胚层——中胚层。随后这些胚层分化为不同的组织、器官。反覆近亲繁殖会导致隐性的缺陷基因盛行率增加，进而导致近交衰退现象。为了避免此种情形，动物演化出了多种。例如辉蓝细尾鹩莺的雌鸟会与多只公鸟交配，提升后代的基因多样性。当然动物也有远交衰退现象。有些动物能进行无性生殖，此类的动物基因会与亲本完全相同。无性生殖的方式包含断裂生殖、出芽生殖（如水螅等刺胞动物）和单性生殖（如可在未交配的情形下自行产生受精卵的蚜虫）。
生态学.依据摄入与消耗有机质的形式，动物可分作