早已不满，1940年还曾考虑设置管理石井的「指导官」；二、石井自视部队为特殊单位，对陆军中央的命令时有对抗、要求过多预算，在浙江和常德的细菌战取得部份成功后，石井于1942年5月「浙赣战役」前还向上级机关要求更多权力；三、1942年6月美国总统富兰克林·德拉诺·罗斯福曾警告日本若继续使用生化武器将遭其报复，使主张大规模实施细菌战、作风激进的石井被日军中央所否定；四、石井策划的细菌战虽造成中国平民的伤害，但对中国军队的成效不高，颇令中央感到不满；五、「浙赣战役」细菌战也造成波及友军的重大意外，使日军有1万人染