馆不仅市区遭到美军空袭，青函连络船的大部分船舶也遭到美军空袭，使得函馆和本州之间的交通一度近乎断绝。战后北洋渔业因政治情势的变化而一度终止，函馆经济也因此受到负面影响。1952年后北洋渔业虽然有所恢复，但规模不及战前，更在1977年苏联设立200海里专属经济区之后遭到严重打击。函馆在1962年提出函馆地方综合开发计划，试图由水产贸易都市转型为工业生产都市，并提出了大规模填海以兴建工业园区的计划。然而在1970年代第一次石油危机爆发之后，填海和函馆市的工业化计划终止。1977年，函馆提出了函馆圈综合计划。