fMet而不是加到tRNA.Met上时，甲酰转移酶才会催化将甲酰基加到甲硫氨酸上。这一甲硫氨酸会从大多数的蛋白质上被甲硫氨酸胺基肽酶（MAP）移除（发生在宿主和重组体中）。
与免疫的相关性.因为"N"-甲酰甲硫氨酸只存在于原核生物所合成的蛋白质中，而不存在于真核生物生产出的蛋白质中，故免疫系统可以用以帮助识别异己。多形核细胞可以与以"N"-甲酰甲硫氨酸开头的蛋白相结合，并用其启动吞噬作用功能。