续纠劾。崇祯七年，出任湖广巡按，后为巡抚，镇压农民军，熊文灿上疏弹劾应桂“破坏抚局”，受杨嗣昌诋诬，被逮下狱。崇祯十六年，潼关失守，起为兵部右侍郎，出代孙传庭总督陕西军务，发帑金五万，行至山西，徘徊不前，被革职，由陕西巡抚李化熙升任，后家居都昌。永历二年十二月（合1649年），起兵都昌反清，招致石光龙旧部练为水军，败于落星湖，清兵破都昌，不屈而死。《明史》有传。