三十三岁再往拜费隐通容，费隐通容介绍性瑫给上座隐元隆琦，性瑫拜隐元隆琦为师。三十六岁回泉州开元寺，闭关修道。三十八岁时到福清县黄檗山万福寺谒见隐元，隐元留他于万福寺，并命其为万福寺上座。随后，追随隐元隆琦到日本弘法。四十一岁时，隐元隆琦授予其袈裟，称嫡传弟子。日本宽文四年（1664年），隐元禅师禅让方丈之位予性瑫，成为黄檗宗万福寺方丈。