胞和有鞭毛的游动细胞，类似α-变形菌纲的柄桿菌属。浮霉菌门的细胞壁中含有糖蛋白而不含胞壁质，因此它们可以通过青霉素等破坏细胞壁的抗生素来选择性富集。最爲奇特的一点是，浮霉菌门细胞具有复杂的胞内膜结构，甚至有些属（如出芽菌属("Gemmata")）的染色质被膜包围且紧缩，类似真核生物的细胞核，这在原核生物中是仅有的。此外，在浮霉菌门中还有一类和浮霉菌属等关系较远的细菌，如(Candidatus "Brocadia")、(Candidatus "Kuenenia")和(Candidatus "Scali