但其间却饱受腔室症候群伤痛困扰，每每只要肌肉一僵硬就会疼痛不已，动弹不得，以致她一度陷入低潮。在2017年4月进行的世界青少年羽球锦标赛国手选拔中，她在女单决赛以2比0击败北市大同的黄映瑄，首获青少年选拔赛国手冠军。2017年8月，林芝昀参加怀卡托羽毛球国际赛，与洪恩慈打进女子双打比赛四强。