元气化生为阴、阳二气，再由阴阳二气衍化为天、地、人三才，由此产生天下的万事万物，一化为三，三本于一，因此，三清尊神就是“道”的人格化。
朱熹的看法.朱熹认为三清之说是效法佛教中释迦牟尼佛的法身、报身、化身之说，且三清不应该居于昊天上帝（道教称玉皇上帝）之上。