平洋战争爆发没有成行。之后她因缘际会地在香港加入了地下工作组织，1941年日军佔领香港，杨惠敏那时负责联系梅兰芳、胡蝶等知名艺术家，从香港撤退到重庆。但过程因拒绝帮影星胡蝶携带三十多口行李箱子发生误会；又当时国民政府军统局长戴笠对有夫之妇的胡蝶情有独钟，胡蝶在成为戴笠情妇之际，向戴笠抱怨因运送行李与杨惠敏发生的私人过节。所以权倾一时的戴笠便下令将杨惠敏关进监狱，并安上了「共产党」和「日本间谍」的罪名。一直到1946年3月，戴笠因座机撞山死亡之后，杨惠敏才悄悄获释，从27岁到31岁，杨惠敏坐了大约4年的黑