::::分类.被囊动物与有头类（包括盲鳗、七鳃鳗和有下颌的嵴椎动物）的相关，比较与诸如文昌鱼、棘皮动物、半索动物（hemichordates）、异涡虫（Xenoturbella）或其他无嵴椎动物的相关更密切。包括有被囊动物亚门和嵴索动物的支序叫做嗅球类（Olfactores）支序。被囊动物亚门包括约莫三千个已描述的物种，传统上分成下列三个纲：在2011年，一项有关泸食性海鞘及捕食性海鞘的分子支序亲缘学研究将这些海鞘物种的rDNA进行排序，确认这些物种间的关系，原深水海鞘纲（Sorberacea