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生平.康米纽斯出生于摩拉维亚，但没有历史记录记载他的确切出生地。目前有三个地点可能是他的出生地：科姆那、尼奈斯与乌赫尔布罗德（三地位置皆位于捷克南摩拉维亚的乌赫尔堡区）。他早逝的父亲生前是波西米亚兄弟会成员，一个在三十年战争前夕仍处于鲁道夫二世保护之下，相当宽容的福音新教团体。在夸美纽斯的母亲及姊妹去世之后，夸美纽斯由亲戚抚养长大。从1608年到1611年夸美纽斯就读于普热罗夫的兄弟会高级文科中学，在那里他接受了赐名阿摩司。从1611年起夸美纽斯在喀尔文教派的Herb