攻击吉伦特派成功后，1793年的秋天，他继续攻击他认为太温和的其他人，包括丹敦、和罗伯斯庇尔。1794年3月13日夜晚，得到雅各宾派支持的国民公会政府，被激怒，不愿、和反对，最后决定占压，命令逮捕埃贝尔派的领导人，包括在战争部和其他地点的人。革命法庭对待埃贝尔非常不同于丹敦，更像审讯一个小偷不是一个阴谋家；他的早期诈骗被揭露并鉴定。他与他的共同被告在审讯的第三天被判处死刑。1794年3月24日，他们在断头台被处决。前往断头台的路上埃贝尔昏晕了几次，当他被安置在断头刀刃下时，歇斯底里地尖叫着。埃