24日为院庆，虽然为军医学校的延伸，但实际上大部份的官职与教职来自协和医学院体系的卫生勤务训练所。国防医学院随着国共内战情势告急，国防医学院决定展开第八次迁校，1949年该校师生、仪器分成三批（2月16日、3月16日、5月4日分别抵台）乘坐安达轮转进台湾，于上海江湾遗留下来的校舍演变为今日的中国人民解放军第二军医大学。国防医学院转进台湾后，部分教职员生曾入驻台北县新店镇清风园（来台初期曾作为入伍生营舍与卫勤训练班训练场所）、陆军802总医院等地，最后选择于台北水道水源地原日本陆军砲兵联队营舍进行在台复校