升中共福建省委副书记，不再担任福州市委书记、闽江职业大学校长；1999年，出任福建省人民政府副省长、代理省长；2000年任福建省省长，期间协助中央处理朱镕基总理督办的厦门“远华案”。
主政浙沪.2002年10月，习近平转任浙江省人民政府副省长、代省长。在任期间，于清华大学人文社会学院马克思主义理论与思想政治教育专业在职研究生班，以《农村市场化研究》为学位论文题目，获法学博士学位。11月，随着浙江省委原书记张德江升任中央政治局委员并调任广东，习近平升任中共浙江省委书记。2003年1月