总统图书馆暨博物馆、和均有私营摆渡车可以方便前往目的地。在遇到线路故障及轨道施工等情况时，红线客运服务被打断，这时候肯尼迪博物馆/马萨诸塞大学站通常被用作临时终点站。
车站结构.肯尼迪博物馆/马萨诸塞大学站共有两座岛式站台，地铁红线的两条支线使用不同的岛式站台。阿什蒙特支线于布伦特里支线轨道在车站北部汇合。由于早先布伦特里支线列车跳过此站，不在此停车，因此其轨道与阿什蒙特支线分开。后来，马萨诸塞湾交通局决定让布伦特里线也在此站停靠后，为它加了一座岛式站台。车站夹层检票大厅标有显示