执行的bash脚本，可以透过执行它们来安装档案。在Autopackage包里的档案并不易透过除了Autopackage以外的软体进行解压缩，因为其必须透过Autopackage解析以避免档案放置错误或其他问题。Autopackage包的程式会被安装在写死的系统路径，可能会导致与已有的软体包冲突， 从而导致部份错误。这通常可以利用反安装使用Autopackage安装的旧版软体解决。Autopackage档案也可以使用Listaller工具安装或移除。Listaller在其档案格式中包含了Autopac