马奖》中再得八项大奖；1991年的《阮玲玉》除了在香港获奖外，亦令女主角张曼玉在1992年第42届柏林国际电影节中当上最佳女演员。此外，《阮》一作品在该年度的台湾金马奖中获得十一项奖项提名。1996年，关锦鹏借纪录片《男生女相：华语电影之性别》在威尼斯电影节上公开自己的同性恋身份。2002年，他执导了以同性恋为题材的电影《蓝宇》，而其本人亦走出来表示片中的角色是他的影子，并承认自己为同性恋者。2005年，他执导由郑秀文主演的《长恨歌》，获提名参加《第62届威尼斯电影节》竞赛部份；2010年担任第67届威