之初，水师提督施琅发布的渡台禁令，规定「男子不准携眷，业经渡台者，亦不得招致」，故相当多数闽南籍（祖籍泉州、漳州）男子，与台湾的平埔原住民女子结婚或者入赘。而平埔族大致上为母系社会，女子是主要的财产继承者，故此闽南人往往取得了平埔族的土地，为了对平埔族的先人表示敬意而加以祭祀，称为地基主。或谓地基主原为平埔族人的祭祀神之一，平埔族古时祭祀地基主，往后汉化的平埔族人弔慰亡魂，并且混入中国的道教习俗，与灶神信仰、土地神信仰开始混杂变形，认为地基主是土地神的部下。但中国大陆福建一带及现属中华民国政府的澎湖