全、确定了马德里法院的席位、并通过对城镇居民进行演练建立起了一支常备军。在摄政期间，他处理了西班牙对纳瓦拉的征服。他下令拆除纳瓦拉的大部分要塞（例如方济·沙勿略家族的住所沙勿略城堡），目的是消灭任何抵抗精神，并预防未来对西班牙佔领的叛乱。1517年9月，查理在拉雷多（今坎塔布里亚）登陆，希梅内斯赶去见他。然而在途中希梅内斯却生病了。1517年11月8日，在他如此衰弱的同时，收到了查理的来信，后者冷冷地感谢他的服务，并给予他退居教区的休假。国王解僱信到达的几个小时后，希梅内斯枢机于在罗阿去世，终年81岁。