1972年7月，许淇安以28岁之龄晋升为警司，驻守于九龙区冲锋队，继而担任深水埗警区指挥官，其后再晋升为高级警司。1982年6月，许淇安晋升为总警司，同年在美国雪城大学修读职业发展课程。回归警务处后，许淇安按照原定计划应该调返政治部，惟最终出任毒品调查科主管，避免政治部因为临近香港回归而于1995年解散，被限制必须离开警务处的命运。毒品调查科在许淇安的领导期间，经历了重大改革，将情报和行动归纳及统筹后，屡次破获大型毒品罪案，包括在筲箕湾避风塘破获当年最大型的毒品罪案，检获逾100公斤海洛英，轰动一时。