1月26日，杜润臣从北京来到上海新乐路55号的圣母大堂，正式接管上海教区。 1956年3月30日，中苏两国签订《关于交接在中华人民共和国的俄罗斯东正教会和莫斯科大主教区所属东亚教区财产的议定书》后，成立了脱离莫斯科宗主教区管辖的自治的中国东正教会，上海教区受北京总会管辖。不过这时上海教区已经仅剩一座圣母大堂，数十名教徒，另有3名中国神父协助杜润臣主教，“已到了山穷水尽的地步，困难万分”。1965年3月3日，杜润臣在上海去世。圣母大堂举行了最后一次宗教仪式后，神父被政府安排转业，上海的东正教活动就此结束。