口岸区的B2、B3层，即在《》中称作“内地监管查验区”的区域。口岸出、入境大厅各设有30条自助和18条人工查验通道，日设计通关流量20万人次。出入境大厅实行口岸限定区域管理，共派驻约700名内地清关部门人员，包括西九龙出入境边防检查站（隶属深圳出入境边防检查总站）、西九龙站海关（隶属深圳海关）和广深港高铁西九龙站口岸管理处（隶属深圳市口岸管理服务中心有限公司，该公司由深圳市人民政府国有资产监督管理委员会实际控制）。上述机构及其人员不在口岸限定区域以外区域执法。中国边检在该口岸开通初期签发的出入境记录