在福州城内太平街（今新权路协和医院）建立了一个50个床位的新医院，旧楼则改为戒烟所。柯为良在福州工作了十多年，直到在1880年夏天病倒。在他十年工作期间，他为51,838名患者和大约1,500名吸食鸦片者提供了医疗援助。1880年8月17日，柯为良因中暑在闽江口附近琅岐岛（Sharp Peak Island）的疗养院去世。在去世前一天，他完成了经典的解剖学教科书《格氏解剖学》的五卷中文译本，中文名为《全体阐微》。 。
墓.柯为良安葬在洋墓亭，靠近墓地的角落，靠近墓地门右侧的墙壁