1920年实行五州制，成立六甲庄，隶台南州曾文郡管辖，与六甲区范围相当。战后再改为台南县六甲乡，2010年12月25日改称六甲区。六甲区境内有多处聚落，其中以林凤营最着名，名气甚至远高于六甲区本身。此系林凤营以鲜乳产地着称，且纵贯铁路设有林凤营车站之缘故。
历任首长.
乡长.林致捷
行政区划.2018年1月29日因里邻调整，将龙湖里併入七甲里。经此调整后，六甲区下设11里：七甲里、二甲里、大丘里、中社里、