较困难，这些燃料需要进行再处理 。对于军用反应堆和研究反应堆中使用的高浓缩铀来说，同位素的生产过程与反应堆堆芯燃料的管理过程和反应堆的工作条件密切相关。
乏核燃料衰变热.当核反应堆关闭的时候，链式核反应也随之停止，然而由于衰变产物的β衰变，乏燃料仍然会放出的大量的热量。因此，在核反应堆关闭的时刻，衰变放出的热功率大约是核反应堆稳定工作时功率的7%。在反应堆关闭1小时以后，衰变热功率约为稳定工作时的功率的1.5%；一天以后变为0.4%；一周后变为0.2%。衰变热功率随着时间会继续