党史会主任委员期间，编有《国父全集》（1989年）、《总统蒋公思想言论总集》（1984年）等书籍。秦孝仪自幼继承家学，精通儒学、经史，博览群书，曾独创“秦体字”，亦曾任国立台湾大学教授。1983年起，秦孝仪任国立故宫博物院院长。2000年以80岁高龄退休，主持故宫长达18年。中华电视公司八点档连续剧《怀玉公主》片头题字者即是秦孝仪。秦孝仪由于与蒋家关系源远深厚，被认爲是“宫廷派”。如故总统蒋经国80冥诞当天，秦孝仪发动党史会举行学术讨论会，推崇蒋经国行谊事功，并特别引介日本学者小谷豪冶郎所着的《蒋经