为日俄战争日方战胜的关键。卒于任内的明石元二郎还在生前留嘱，将墓地设置于台湾。文官总督时代则大约与大正民主时代重叠，且都是日本党派派系所推选赴任。1919年－1937年间，共有田健治郎、内田嘉吉、伊泽多喜男、上山满之进、川村竹治、石冢英藏、太田政弘、南弘及中川健藏担任其职务。该阶段总督，身分为文官，且均为内阁所属党派推派。1937年中国抗日战争爆发，日本军国主义抬头，台湾总督重新由军方担任，此间共有小林跻造、长谷川清与安藤利吉。最后一位安藤利吉总督为台湾总督府的末任总督，在战后作为战犯受审，1946