为T 07，半藏门线车站编号为Z 06，新宿线车站编号为S 05。其所在地东京地下铁为九段南一丁目，东京都交通局则为九段北一丁目。东京都交通局车站副站名为「二松学舍大学前」。
车站构造.九段下站为地下车站。东西线是2面2线侧式月台，半藏门线、新宿线各为2面2线，合计3面4线的一岛两侧月台。东京地下铁与都营地下铁为连续的月台编号。半藏门线与新宿线共用验票闸口。2020年更将东西线车站也纳入东京地下铁－都营地铁站内转乘的范围内。2013年3月15日以前，东京地下铁半藏门线4号线