公民投票复决了相关法律条文，法理上于结果公告三日后立即失效，其领衔人认为这代表台湾人民否决了废除核能的政策。事后民进党政府却表示，无意延役任何台湾的核电厂或兴建新的发电机组。
组织.中华民国的核电厂皆由台湾电力公司运营，行政院原子能委员会为其督导机关，核电厂也受国际原子能总署监督。
核废料处理.1980年，台电在兰屿兴建低阶核废料储存场，并在1982年启用，因而引发了兰屿的反核废料运动，1996年后虽然不再将核废料运至兰屿，2002年，台电核废料贮存场租约