岩菖蒲科只有3属27种，主要分布在北半球寒冷区域，中国有1属分布在西北。本科植物以前一直没有被大多数分类学家承认为一个科。只是1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法将其单独分为一个科，放在泽泻目下，此后到2016年的APG IV依然维持此分类。
系统发生学.本科属于泽泻目，