cer 2于2002年发佈，可以透过FTP伺服器免费取得，当时已有数千次的下载量。2007年，3D Slicer于版本3进行了全面的改造。而3D Slicer于2009年开始下一个主要重构，它将3D Slicer採用的GUI套件从KWWidgets转换为Qt。採用Qt的3D Slicer 4于2011年发布。
用户.3D Slicer已被用于多种临床研究中。在影像导引放射治疗（Image Guided Radiotherapy,IGRT）的研究中，3D Slicer常被用于建立和视