中华人民共和国成立，萧华任中国人民解放军空军政治委员，与刘亚楼合作组建解放军空军。1950年任中国人民解放军总政治部副主任，1954年兼任政治学院第一副院长。1955年被授予上将军衔和一级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章，时年仅39岁，是中国人民解放军历史上最年轻的上将。1956年任总干部部副部长，12月任部长，并任中共中央监察委员会副书记。1958年任中国人民解放军总政治部副主任。1959年任中共中央军委委员、军委副秘书长。庐山会议后的军委扩大会议上，北京军区参谋长锺伟为彭德怀辩白，萧华当场下