细菌内的叶酸生产，达到杀死引起感染的细菌，常用于治疗泌尿道感染和烧烫伤。亦可用于治疗全身性的感染，适用症包括风湿热、软性下疳、披衣菌感染，以及流感嗜血桿菌引发的感染。因为磺胺嘧啶的血脑屏障透过率高，也用于治疗流行性脑炎。临床上，会併用磺胺嘧啶与乙胺嘧啶（pyrimethamine），以治疗弓形虫的感染症。
作用机转.磺胺嘧啶会抑制酵素。
副作用.磺胺嘧啶的副作用包括恶心、食欲不振和头晕。