根据日本十七世纪学者山鹿素行的《武家事记》考证，日本家纹其实是起源自圣德太子，而江户时期的学者新井白石则考证日本家纹起源自院政时代到鎌仓时代。日本家纹的起源可追溯至平安时代后期祭拜武神的八幡宫巴纹，古代自中国传来的纹样，而后流行于武家社会。镰仓时代，后鸟羽天皇把宋代中国织物上的菊纹锻刻在刀上并定为皇室纹章。后醍醐天皇为了褒奖小笠原氏的武士气节赐予了三阶菱家纹，小笠原流礼法又使家纹的传统扩大至武士阶层。室町时代所着的《见闻诸家纹》是日本现存最古的家纹着作，收录了足利义政以来260种家纹，是研究家纹的主要依据。