首尔东部看守所成立于1977年，由于地处首尔城东区，看守所命名为城东看守所（）。2017年，看守所迁入松坡区新址，紧邻与。同年6月，城东看守所更名为首尔东部看守所。2016年崔顺实干政丑闻中被捕的崔顺实关押在此。2018年3月23日凌晨，韩国前总统李明博也被移送至首尔东部看守所。
爆发新型冠状病毒.2020年11月27日，首尔东部看守所内发现首例确诊病例，随后病毒于看守所内极速扩散，当中于23日的全体检测中有2名工作人员及286名囚犯确诊。截至目前累计确诊病例达到1118例。