，叙利亚和也发生叛乱。609或610年，安条克牧首被乱民杀害，许多记载称犹太人参与了这一动乱，一些人参加了政治派系或开始反对基督教。随后福卡斯派遣博努斯出任东方管区长官，他严厉地惩罚了动乱的主要参与者，安条克的赛车绿党。610年，老希拉克略派侄子攻打埃及，博努斯前往埃及组织防御，但在亚历山大城外被击败，尼刻塔斯遂占领了整个行省。他帮助当选亚历山大牧首，约翰则帮助他建立了稳固的统治。叛军主力则由老希拉克略的同名儿子希拉克略率领，渡海前往君士坦丁堡，他没有受到多少有组织的抵抗，福卡斯被贵族普罗波斯抓住送