格里芬龙只有一个物种，模式种巨型哈格里芬龙（"H. giganteus"），是在2005年由林赛·札诺（Lindsay Zanno）、史考特·山普森（Scott Sampson）所叙述、命名。牠的学名是来自于埃及神话的西方沙漠神祇哈以及希腊神话的狮鹫；种名在拉丁文意为「巨大的」。哈格里芬龙正模标本（编号UMNH VP 12765）是在2002年发现于犹他州南部的大阶梯艾斯可兰特国家纪念区，属于Kaiparowits组。放射性年代测定显示该标本所属的地层可追溯至7600万至7500万年前，约坎潘阶