1958年研制成功并投入批量生产。1958年至1967年，汽车制造、日本车辆制造、新三菱重工业、川崎重工业、日立制作所共生产了416台各种番台的DD13型柴油机车。1960年代至1980年代初，这款机车不仅活跃于日本国铁的中小型调车作业，还广泛运用于和等私铁业者。
开发背景.1950年代初，受到美国和联邦德国（西德）大力推动牵引动力内燃化改革的影响，日本国有铁道也开始计划非电气化干线的牵引动力现代化。1952年，日本正式结束了石油制品统制制度，日本国铁随即恢复新型柴油机车的研制工作