解灵敏。十四岁开始学《百论》，十九岁时可以在众人面前，覆述法朗讲过的法语。二十一岁，吉藏受具足戒之后，名声逐渐变高，深受南陈桂阳王的信奉。隋朝平定百越之后，吉藏往东游行，在浙江会稽的秦望山嘉祥寺居住下来，于此说法十五年，并为《法华经》作章疏。597年（隋开皇17年），致书于天台智顗大师，邀请他前来宣讲《法华经》，但智顗大师因病无法前往，不久即病逝。开皇末年，隋炀帝为太子时，设置了四个道场。606年（隋大业二年），吉藏奉命住持扬州的慧日道场，并给予丰渥的奖赏，在此时写作了《三论玄义》一书。他在此时与僧粲论