教会另组福音信义会教会协会（），而纽豪斯也因而转到此会。在1988年，福音信义会教会协会分别与其他两个较开放的信义会教会－美国路德会（）和路德会在美国（）合併成为美国福音信义会，而当时纽豪斯也是此宗派的神职人员。他于1961至1978年期间在纽约市威廉斯堡的圣约翰传道者教会牧会。此教会的信众多为较为贫困的黑人或墨西哥人。他在讲坛上提及公民权利和社会公义，及公开反对越南战争。他于六十年代后期开始获得全国注意，因为他联同耶稣会神父亚伯拉罕·约书亚·赫舍尔（）和士丹尼尔·贝利根（）创立了神职人员与平信徒越南关