特征，使南极甲龙很难以分类。南极甲龙目前为甲龙下目的未定属，目前还没有亲缘分支分类法的研究。
发现与命名.南极甲龙的正模标本，是该属目前所发现的唯一化石，同时也是南极洲所发现的第一个恐龙化石。这个正模标本是在1986年1月，由阿根廷地质学家爱德华多·奥立维罗（Eduardo Olivero）与罗贝托·斯加索（Roberto Scasso），发现于南极半岛附近的詹姆斯罗斯岛。挖掘区域约6平方公尺大小，但因为冰冻的地层与恶劣的气候，在经历数次挖掘活动后，直到10几年后才被完全的挖出，但