现在（2009年4月），253系仍是JR集团内唯一採用欧洲铁路车辆座椅排列方式的特急型列车。1990年落成时，所有列车（共21列）均是3辆编组。1992年起，部分3辆编组列车扩编为6辆编组。而2002年落成的第5批列车则在出厂时已是6辆编组。E259系投入营运前，253系以3辆+3辆、3辆+3辆+3辆或3辆+3辆+6辆的编组营运。E259系投入营运后，则只以6辆编组营运，最长以6辆+6辆编组营运。
列车运用.
日光、鬼怒川.2011年投入日光、鬼怒川等