过后，沈镇南的家产被没收，于是全家寄住在亲戚家的小房间，其妻子于1964年过世。而当时的台糖副管理师洪子瑜，则被送往绿岛进行感化教育两年六个月的时间，出狱后也因为此事件影响找不到工作。
事件平反.沈镇南死后，他的家属一直积极寻求平反。在安全局的事后检讨中，对于本案在侦查过程时，认为事前无充分资料，且办案时「以行动代替侦查」，所以显示办案当局承认本案件在侦查时未能尽善其职责，过程中有许多的疏失。研究沈镇南事件的学者程玉凤认为，1949年8月时无人知晓孙越崎已暗中投共，沈镇南与老长