研究者将其独立归入名为"Melananas"的亚属中（该亚属只有非洲黑鸭一种）。非洲黑鸭有两种亚种：另外也有人将加彭与喀麦隆的族群独立成一个新亚种"A. s. maclatchyi"，但并未被学界所接受。
生态.这种鸭的领域性很强，且生性相当害羞，常成对或成小群出现，一年四季均可繁殖。非洲黑鸭一窝可有4至8颗蛋，蛋约30天后孵出小鸭，再经过86天后小鸭飞羽长成，孵蛋与育幼都只有雌鸭参与。非洲黑鸭在日间偏好栖息在溪流等流动水域，夜间则偏好湖泊等广大的开放水域，通常在溪流沿岸