0平方千米大于1平方千米的有18个。其中面积在30平方公里以上的滇池、洱海、抚仙湖、泸沽湖、星云湖、杞麓湖、程海、异龙湖和阳宗海等9个湖泊，被称为云南九大高原湖泊。
概况.云南省的湖泊多为断陷湖泊，形成时代较早，大多在上新世末到第四纪初期。在距今4万到2万年前，云南地区曾经历大湖时代，滇池水面至少是现在的3倍，抚仙湖、星云湖连成一片，玉溪盆地也被古湖泊淹没。后随着气候变干，水位逐渐下降。云南省较大的湖泊大多分布在断裂带或各大水系的分水岭地带，湖泊水深岸陡，中国第二深水湖抚仙湖即位