东单和崇文门两站换乘通道内增设了自动步道，其他车站设置了换乘楼、扶梯，改善了换乘条件。由于北京地铁线路多为十字交叉，许多换乘站不适合修建最为便捷的同站台换乘（即跨月台转车）。然而在新线路设计中，出现了若干同站台换乘形式，例如已开通的9号线和房山线的郭公庄站（同层同站台换乘）、燕房线和房山线的阎村东站（同层同站台换乘）、4号线和9号线的国家图书馆站（同层同站台换乘）、8号线与昌平线的朱辛庄站（同层同站台换乘）、6号线与8号线的南锣鼓巷站（叠落式同向同站台换乘），以及7号线和9号线的北京西站（同层同站台换乘