分子轨域（）是化学中用以描述分子中电子的波动特性的函数。这个函数可以计算出化学和物理性质，例如在任意一个特定区域找到电子的机率。「轨域」一词由罗伯特·桑德森·马利肯于1932年提出，为「单电子轨域波函数」（）的简称。从基本层面上来说，它用于描述该函数具有显着振幅的空间区域。分子轨域通常由分子中的个别原子提供的原子轨域、混成轨域，或者其他原子团的分子轨域结合而成。这些可以由哈特里－福克方程或自洽场方法（）量化计算。分子轨域可以用来表示分子中佔有该轨域的电子可能出现的区域。分子轨域由原子轨域结合而成，其中原