部委託台湾省政府管理，成为台湾省政府交通处主管的事业机构。由于基隆、高雄两港的腹地逐渐饱和，为了弥补既有国际商港之不足，继台中港之后，中华民国政府先在1970年代开辟苏澳港（基隆港务局管辖），后于1990年代建设台北港（又称淡水新港；基隆港务局管辖）与安平新港（高雄港务局管辖），使台湾的联外国际商港增加至7座。1999年精省实施后，此4个港务局改为隶属中华民国交通部主管。因着台湾的经济起飞，并且以商港开始快速发展，尤其是坐落南北两地的高雄港与基隆港，全盛时期曾分别成为世界第三大与第七大货柜港，对台湾经济