赵萌诛杀。王宪被杀后，肃清三辅官民的风闻兴起。三辅各地起兵对抗更始帝军。申屠建不能全部镇压，更始二年（24年）二月，更始帝迁都长安，布告大赦，混乱也没有完全结束。申屠建的业师、新朝大司空崔发归降申屠建，崔发为王莽即位正统化多有贡献，申屠建把崔发交给了丞相刘赐，崔发被处死。申屠建、李松向更始帝送皇帝舆服，催促迁都长安，更始入长安，封申屠建为平氏王。更始三年（25年）六月，更始政权重臣王匡被刘秀部将邓禹打败，赤眉军同时西进，申屠建和王匡、张卬、廖湛、胡殷一起建议更始帝逃回南阳，更始帝不同意。申屠建、