新冠肺炎，导致一起参加会议的慕尤丁等其他官员都必须居家隔离14天。9月18日沙巴州选举期间，慕尤丁在亚庇向选民强调，国盟政府已成功抗击新冠病毒疫情、证明治国能力；卫生部在沙巴州选举后曾建议从当地返回的民众须隔离，国防部则宣布曾前往沙巴投票的人士，在返回西马半岛时不必接受强制隔离14天的措施。9月26日选举结束后，马来西亚新冠肺炎确诊病例增加，大多数新增病例来自沙巴或吉打，慕尤丁内阁也有数名部长证实确诊，他们曾至沙巴助选；当中首相署宗教事务部长在10月3日的国家安全理事特别内阁会议后于同月5日宣布感染新冠肺炎