满洲国兴安西分省成立，扎噶尔道尔吉任省长。1937年（满洲国康德4年）7月，满洲国设兴安局，扎噶尔道尔吉被调往新京任兴安局总裁，并列席国务会议。1939年（康德6年），诺门汗战役爆发，日军在沈阳组织中央军事代表团，关东军司令部拟派扎噶尔道尔吉参加同外蒙古的边界谈判，但扎噶尔道尔吉抵达沈阳后，又被命令返回新京，由其秘书萨嘎拉扎布为代表兼翻译参加谈判。1940年（康德7年），扎噶尔道尔吉调任满洲国参议府参议，1941年（康德8年）任参议府副议长。1944年（康德11年）夏，扎噶尔道尔吉参加了关东军在新京