作战中提供掩护。1942年2月6日午夜，美国海军杜父鱼号潜艇发现了进攻舰队。杜父鱼号将长良号误认为一艘天龙级巡洋舰并向其发射两枚Mk 14型鱼雷，其中一枚鱼雷脱靶，另一枚爆炸过早。1942年2月17日，长良号护送运载着日本陆军第48师团的船队，前往巴厘岛和爪哇登陆。在此次作战中，皇家海军渎职者号潜艇发现长良号并向其发射6枚鱼雷，全部没有命中。1942年3月10日，第3舰队被第2南遣舰队取代。长良号依然隶属于第16巡洋舰队，该舰队另两艘成员为鬼怒号和名取号。1942年3月29日，长良号参加了圣诞岛