海军各自拥有运兵舰，这些舰艇分别由横须贺（陆）和吴市（海）出发，先在塞班岛集结，然后由田中赖三的一艘轻巡洋舰（神通号）和11艘驱逐舰（黑潮号、亲潮号、雪风号、天津风号、时津风号、不知火号、、阳炎号、）护送往中途岛。紧随登陆舰艇的是栗田健男四艘重巡洋舰（熊野号、铃谷号、三隈号、最上号）及两艘驱逐舰（、），负责登陆炮火支援。最后则是近藤信竹的主力部队，包括两艘高速战舰（金刚号、比叡号）、四艘重巡洋舰（爱宕号、鸟海号、妙高号、羽黑号），七艘驱逐舰（村雨号、五月雨号、春雨号、夕立号、、、，外加驱逐领舰由良号）及一艘