用于局部施用药物以使皮肤干燥，例如治疗疣。许多水族养殖爱好者使用甲醛处理寄生虫淡水性白点虫病。海水白点虫则对甲醛有抗性。甲醛于产制类毒素疫苗时用于灭活该细菌。它也于疫苗生产过程中用来杀死不需要的病毒和细菌以免污染疫苗。尿路感染也常使用甲醛的衍生物（乌洛托品）来治疗，它可以防止滥用抗生素和产生耐药性细菌。在酸性环境中乌洛托品在肾脏转化为甲醛，然后在尿道中行成抗菌作用。一些外用药膏化妆品和个人卫生产品中含有甲醛的衍生物作为防止潜在有害细菌的生长。
组织标本固定液及防腐剂.甲醛保存或