埔公路—沙田段时，均会引起马鞍山区居民（大多为学生）反对，情况与马鞍山居民要求89D线全日不入形成强烈对比。然而，由于本线往葵涌方向于源禾路不设分段收费，乘搭本线由马鞍山前往源禾路时需付全程车费$9.1，对当区学生而言相对昂贵。因此，亦有声音要求把86S线改为全日服务，以分担该批乘客。根据2014年巴士路线发展计划中的资料显示，本线在最繁忙的一小时载客率为82%；而非繁忙时段的平均载客率则为41%。二十世纪新界（东）区巴士路线发展史