种佛教与医学的大辩论，印度佛教体系最终获得採纳。11和12世纪许多印度医学文献随着印度文化广传至西藏，例如阿育吠陀的医学之心（Astāngahrdayasamhitā）由仁钦桑布翻译成藏文。西藏还吸收了印度早期阿毘达摩的文献，例如世亲于5世纪所着《阿毗达磨俱舍论》，阐述了诸如胎儿发育等医学话题。随后，大量印度金刚乘密宗包含基于医学解剖的医疗行为被引进西藏。
理论.藏医学在理论文献中提出了健康的具体定义。为了身体健康，必须保持身体三个系统的平衡：风（ rLung）、胆（mKhris-