察院院长，惟2005年完成六年任期，婉拒陈水扁总统续任，而陈水扁提名的人选不获国民党控制的立法院同意提名任命，监察院空转直至2008年结束。2009年到2011年期间参与博鳌论坛会面温家宝，又作钱温会。共计三次。
争议.美军驻防台湾期间，发生多起当地女子遭到性侵猥亵的案件，但是最后都以庭外和解作收，不予起诉。根据钱复在1969年9月8日写给外交部的签呈里，他主张涉案美军交由美军当局自行处理，也显示出当时国民党政府息事宁人的态度：「惟查以往我政府对于美军强姦案件，均舍弃管辖权