评鑑与党员初选中，曾离开台湾一阵子的林义雄仅排行第三位。之后由获得高票的彭明敏和许信良而进入第二轮投票，最后透过开放各县市民众投票的方式推举彭明敏代表民主进步党参选中华民国总统。之后林义雄则积极参与民主进步党党内决策工作，并在同年12月举办的中华民国立法委员选举中担任了民主进步党选战指挥中心的总指挥，除了到处站台外还首创联合竞选策略。隔年林义雄则受聘成为民主进步党首席顾问，并且在1997年5月4日、5月18日和5月24日时结合社会运动团体共同发起「总统认错，撤换内阁」之万人大游行。其中尽管民主进步党主席