素结合，透过氢键、疏水交互作用或两者都有。活性位点上的残基作为质子或其他受质化学基团的接受者或提供者，进而降低反应活化能，加快反应速率。当酵素和受质间的作用完后，产物在活性位点会相当的不稳定，进而离开酵素。
辅因子.酵素会运用辅因子来帮忙与受质的结合；辅酶也是辅因子的一种，在受质和酵素发生化学反应时，就会离开。例如：金属物质。
抑制剂.抑制剂会阻扰受质和酵素的交互作用，进而降低反应速率。抑制剂有几种不同的种类，分别有可逆和不可逆、竞争和非竞争；竞争型，一种