韩的兵权，命石敬亭接任韩部第20师师长职务，令韩复榘十分气愤，且石敬亭任20师师长后指责该师军纪败坏，形同土匪部队，亦使韩、石结下了不解之怨。1929年2月17日，石敬亭被蒋中正任命为国民革命军编遣委员会第二编遣区驻开封办事处副主任委员。1930年中原大战时，石敬亭任讨蒋国民军第一路总指挥，率部于陇海铁路沿线及河南、山东边界同蒋军何成浚部作战。后因张学良宣布东北易帜、率军进入关内，冯军失败，石敬亭被蒋任命为陇海铁路暂办。
中原大战后.由于中原大战的失败，冯玉祥辖下的西北军军权大