纳杰克生于1854年，其故乡为Hukvaldy（位于摩拉维亚且当时为奥地利帝国一部份），是一乡村教师之子。由于家中兄弟姊妹众多，经济十分拮据，杨纳杰克的父亲希望他能承袭家中传统担任教师，但由于幼年于合唱团中便展现了过人的音乐天赋，于是于1865年他进了布尔诺的奥古斯丁慈善学校（现今为孟德尔博物馆），在Pavel Křížkovský地指导下杨纳杰克主要学习合唱与管风琴。而一位杨纳杰克的同学曾形容他为一位"出色的钢琴家"。1866年到1869年他则上了德语并在1869到1872年上斯拉夫语师范学校。1872年