科学院地球物理研究所在北京中关村成立，气象所被并入其中，赵九章为首任所长。新成立的地球物理研究所设四个研究组：天气组、物探组、地震组、地磁组，对外称地球物理和气象研究所（Institute of Geophysics and Meteorology），叶笃正任天气组组长。1966年，中国科学院决定气象研究室从地球物理所分出，成立大气物理研究所，下设五个研究室：雷电物理研究室，云物理研究室，中小尺度动力学研究室，大尺度大气动力学研究室和低纬度气象研究室。