贸易发展协会（外贸协会）于马来西亚首都吉隆坡设立台湾贸易中心。经济部国际贸易局也在吉隆坡设立驻马来西亚代表处经济组。1997年5月，首届台马经贸部长级会议在台北举行。2012年，中华民国是马来西亚第8大贸易伙伴（次于中国大陆、新加坡、日本、美国、泰国、印尼与韩国）、第7大供应来源与第11大出口市场。2019年，马来西亚是中华民国第7大贸易伙伴、第5大进口伙伴、第8大出口伙伴。出口至马来西亚的金额为94亿0,064万3,156美元，年减11.335%。自马来西亚进口的金额为103亿7,972万1,