仁曾经表示“民进党的所谓‘台独’，骨子里头就是要对台湾人民实施“去中国化”的思想大清洗，企图将台湾人民塑造成日本皇民的炮灰”。彰化县长魏明谷则对此回应「有种就去中国升中华民国国旗」，并唿吁警方注意该组织在台湾的运作情况以维护国家安全。碧云禅寺邻居的定觉寺则定期升起青天白日满地红旗，形成一种对比。
违建拆除.由于该寺部分建物属于违章建筑，彰化县政府于2018年9月21日宣布于该日下午开始对该寺断水、断电。当县府公务人员前往执行断水断电时，魏明仁朝公务员脸上挥拳，导致其下巴受伤、牙