仁亲王的第4子，后龟山天皇之孙。长禄之变时，有说有人夺回神玺，到奥吉野十津川奉南天皇即位。长禄2年8月，赤松氏遗臣小寺藤兵卫丰职袭击南天皇，导致他受到重伤，在熊野八庄的野长濑庄司横矢盛高守护下，终于在同年12月20日在纪伊国牟娄郡神无山村光福寺（现三重县熊野市）去世。位牌曰兴福院殿南天皇都心位尊仪。然而，这些传说中在江户时代的史书才开始出现，并与同时代历料不相合，因而有人认为南天皇不是一个史实人物。熊泽天皇称自己为南天皇的子孙。