1997年7月1日，香港主权移交，布政司署宪制事务科改称政制事务局；首长则由宪制事务司改称为政制事务局局长（两者英文皆没变）。近年政制及内地事务局亦负责台港事务，但因2005年中国国民党主席连战经香港转机期间拒绝台湾驻港机构中华旅行社代表鲍正钢进入机场禁区接机遭市民批评。香港立法会于2005年12月批准在政制事务局设立内地事务联络办公室，加强统筹香港与内地之间的交流和合作，负责管理香港驻内地的各个办事处（包括驻京办），以及现时粤港合作统筹小组的工作，该办公室已于2006年4月1日成立。2007