究所毕业后，进入台湾出版界，先后在麦田出版及联经出版工作。在麦田时期，主要负责人文与文学范畴。2004年底，胡金伦与香港作家董启章相谈合作出版，董启章依序在麦田出版了《天工开物‧栩栩如真》、《时间繁史‧哑瓷之光》、《物种源始‧贝贝重生之学习年代》，因而从台湾红回香港。
联经时期.2009年起，应联经发行人林载爵延揽转任，并于2013年起担任联经出版总编辑，2020年2月底离职转任时报出版第一编辑部总编辑。