泗淇回国到上海，在中共中央秘书处任职。1931年5月，甘泗淇调任中共湘赣省委宣传部部长，后被派到中国工农红军湘东南独立第1师工作。1932年1月，他担任中共湘赣省委宣传部部长、湘赣军区政治委员，参加湘赣苏区反围剿战争。1933年，因拒绝揭发王首道、张启龙所谓“右倾错误”，被指责为肃清AB团不积极，调任湘赣省委苏维埃政府财政部部长兼国民经济部部长。1933年年底，甘泗淇任红六军团第18师政治委员、红6军团政治部主任、代理政治委员。1934年8月，随红六军团西征。1934年11月，他改任红二军团政治部主任，