他们是使用一种叫做「爪夷文」的改良式阿拉伯字母书写系统来进行书写的。在西方殖民者到来后，另外一种叫做「Rumi」的罗马字母书写系统，则逐渐在日常生活中取代了「爪夷文」原本的地位。马来西亚和印尼在书写系统上的差别，其实正反映了当时统治两地的不同殖民政府──英国殖民政府和荷属东印度公司——在书写系统上的差别。在印尼语中，英文字「moon」中的母音，是遵循荷兰语的习惯而写成「oe」。在日本佔领印尼的时候，这个母音又被日本殖民政府改为「u」（因此，印尼第一任总统苏卡诺的名字，也从Soekarno被改为Sukar