乙酰辅酶A先在硫解酶的作用下缩合成为乙酰乙酰辅酶A，后者在β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶A合酶的作用下与另一分子的乙酰辅酶A合成出β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶A。该物质可以走向两种途径：在β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶A裂解酶的作用下裂解为乙酰乙酸，继而生成丙酮和"β"--羟丁酸，这三者被称为酮体；在β-羟-β-甲戊二酸单酰辅酶A还原酶的作用下还原为甲羟戊酸，继而参与动植物中萜类、固醇类化合物的合成。故植物中不少次生代谢产物或激素是由这种化合物衍生而来的，如赤霉素、脱落酸等，动物体内则以此合成胆固醇及各种类固醇