地层中，真菌的繁衍高峰与二叠纪/三叠纪界线并不一致。藻类被误认为真菌胞，可能代表三叠纪时期全球各地湖泊增加，而非生物的大量死亡与腐烂。在2009年的一个研究，则以生物化学方式分析"Reduviasporonites"的组成，例如：碳同位素、氮同位素、碳/氮比例，发现"Reduviasporonites"的组成接近真菌。 关于这次灭绝的过程、经历时间、以及不同生物群的灭绝模式，仍然相当模煳。一些证据显示这次灭绝事件持续约数百万年，而在二叠纪的最后100万年，急遽地达到高峰。在2000年，科学家研究浙江煤山