河流经过该市：瓜达洛塞河和瓜达尔麦迪娜河，这两条河流最终注入地中海，并在此地形成了一个沿海冲积平原。然而降雨的不规则性导致这两条河流的水道在夏季通常是干燥状态。
生态.马拉加附近地区拥有地中海原生植被：如冬青栎、西班牙栓皮栎以及栗、胡桃、杨树、梣树、草莓树和长角豆等。其他植被还有帚石楠、唇形花、丛榈、百里香、迷迭香和芦笋等。在灌木丛和松树林中，还有金雀儿、刺柏和白欧石楠。马拉加的河流入海口三角洲有一片河流湿地，这里有芦苇、香附、碱蓬等草本植物，也有杨树、桉树、柳树、红荆和棕榈等