·比波牧师、迈克尔·阿考迪牧师三人共同创建，位于旧金山市场街，后来成为旧金山市场中心的建筑物。1859年4月30日，加利福尼亚州州长约翰·B·韦勒签署政府文件，正是命名为“圣依纳爵书院”（St. Ignatius College）。原有课程包括希腊语，西班牙语，拉丁语，英语，法语，意大利语，代数，算术，历史，地理，演讲，和会计。马卡斯神父（Father Maraschi）是学校的第一任校长，同时也是一名教授、财务主管和牧师。新校址建于1862年，1863年6月，旧金山大学第一个学位艺术硕士学位颁发给学生