日本－巴基斯坦关系（乌尔都语: 、）指的是日本与巴基斯坦之间的外交关系。根据2017年BBC的调查结果，有38％的巴基斯坦人对日本的印象较好，20％的巴基斯坦人不认为日本很亲切。目前两国均于对方首都互设大使馆，日本在卡拉奇亦设有领事馆。
历史.日本和巴基斯坦于1952年4月28日建交。多年来，日本和巴基斯坦之间的互惠关系继续增长，但政治和经济方面发生了变化。巴基斯坦是日本的主要贸易伙伴之一。在20世纪60年代，日本经济快速增长，1968年跃升为世界第二大经济体（至到2010年被中国