尾天皇为后继者，为此后水尾天皇与后阳成天皇父子长期不和。据説德川家康因爲顾忌后阳成天皇和丰臣秀吉的关系，所以逼退天皇，让亲近德川家的政仁亲王继位。后阳成天皇于庆长十六年（1611年）借幕府干涉朝廷处分女官（官女）与公卿私通的处分为由。让位给第三皇子政仁亲王，1617年（元和三年九月二十五日）病逝，享年四十七岁，安葬于深草北陵。后阳成这谥号是取自平安时代阳成天皇的谥号，当时阳成天皇被迫退位，是藤原氏强迫所致，而且还要被强迫让位给自己父亲的叔叔光孝天皇（时年五十五）。以此讽刺德川氏为藤原氏。有说认为当时