被军法庭判死刑。同日接获上级命令，依《赦免法》改无期徒刑。其妻与二子1956年初搬进特勤室主任毛惕园在圆山的家中居住。郭在单独关押近十年后被转移到桃园的情报局看守所。1975年4月5日，蒋介石过世，郭廷亮被减刑为15年刑满出狱。7月8日，警备总部总司令郑为元下令以郭廷亮有英文专长，准备聘用他为英文教师为由，将他移送到绿岛。之后被指派担任绿指部的后勤组工作，再改为图书馆管理员，将他长期软禁在绿岛。在这期间，国防部长期照顾其家属。1981年，台湾警备总司令部出资30万元新台币，买下永和一处房产，将产权交给郭