在争议声中出发，却打出近年来港队的最佳成绩，首场大胜中华台北4比0，次场与朝鲜打成0比0平手，尾场更狂胜关岛12比0，打入2010年东亚足球锦标赛决赛圈。2009-10年球季开始前，南华于8月2日在香港大球场与英超着名球会热刺进行一场友赛，南华凭借陈肇麒和李海强的入球，以2比0击败对手。连接上赛季的2009年亚洲足协盃八强，首回合于9月15日举行，南华作客乌兹别克尼夫治，在曾领先3比2的情况下，最后因补时阶段被罚具争议性的十二码，以4比5仅负，惟取得四个作客入球。次回合开赛前，T史高斯及陈肇麒被罚临