郡陷于成，益州仅余巴东郡。成晏平元年（306年），分蜀郡置汉原郡，分汉嘉郡置沈黎郡，益州领蜀、汉原、汶山、汉嘉、沈黎、犍为六郡。后改益州为司隶。玉衡元年（311年），以晋之益州江阳郡置荆州。后以巴郡、涪陵郡属荆州。东晋咸康八年（342年），安州越巂郡改属益州。永和三年（347年），灭汉，以其蜀、汉原、汶山、沈黎、犍为五郡还属益州，改汉原郡晋原郡，不久蜀郡陷于范贲；巴东郡还属荆州。永和五年（349年），平范贲，收复蜀郡，益州还治成都。永和八年（352年），因安置三蜀流民，分蜀郡置宁蜀郡。后侨置江阳郡。