亲王被藤原基经拥立为光孝天皇。此后的日本皇室都是光孝天皇的后裔，而文德天皇的男系子孙最后丧失皇族资格，演变为文德源氏、清和源氏以及阳成源氏。源经基938年任武藏介，赴任时预先察觉平将门谋反之图谋。其后参与藤原纯友谋反后的余党平定工作。969年，源满仲告发源高明连同橘繁延、藤原千晴等密谋废立，引发安和之变，导致源高明、藤原千晴等从朝廷失势流放。事后清和源氏在京都的势力大增，其与藤原北家的关连也更加紧密。1030年，源赖信接替平直方，开始平定平忠常的叛乱。至1031年乱平，杀平忠常。经此事件，原属平