旗额亦都世居长白山，早年其父母被害，十三岁时报仇，此后避居嘉木湖村。数年后，清太祖努尔哈赤路过该地，额亦都与其交谈，认为非同常人，至此跟随努尔哈赤，成为其最早的部属之一。努尔哈赤起兵后，奉命攻取巴尔达城，额亦都勇渡浑河发动夜袭，负伤五十余处将其攻克，赐巴图鲁号。此后屡立战功，于古勒山参与击退叶赫等九部联军。因清太祖努尔哈赤之故，曾娶和硕公主穆库什，为额驸，授左翼总兵官、位列清初和后金开国五大臣之一，清太祖去世后，皇太极追赠额亦都为弘毅公，配享太庙，与费英东位列清太祖神位之左右，皇亲国戚之中地位特别崇高。