并称会津三奉行。此时信能的知行高（含其家臣）约为8400石，依然列家臣团的第十五位。庆长5年（1600年）会津征伐时与本庄繁长一同负责守备陆奥福岛城。随后在松川之战中与繁长、须田长义一道击退了进犯福岛城的伊达政宗大军。然而与信能等人的活跃相对的是，关原之战中石田三成率领的西军最终战败。庆长6年（1601年）、上杉氏被减封到出羽国米泽30万石，信能也随之离开了宫代城。庆长7年（1602年）在直江兼续的住持下，与大国实赖、安田能元、前田利益等一同参加了在龟冈文殊堂举办的歌会。会上的和歌和汉诗被编辑为「直