，李鹏飞与一众行政局议员立即总辞。1993年创立自由党，成为创党主席。自此与香港政府管治阶层渐行渐远。彭定康的普选成份较高的「三违反」政改方案不为中方接受，他与自由党于是提出与香港政府对抗而中共领导人接受的修正案「九四方案」，但被否决。李在1995年香港立法局选举中，赢得新界东北选区的席次。后来被任为临时立法会的议员，在1998年立法会选举中，李的名单在新界东选区得3万多票，在余额计票下被当时寂寂无名的前线何秀兰击败，未能取得席次，于是他辞去了自由党主席一职，自由党亦在这次选举的地方选区中全军尽墨，自由