育厅厅长，徐庆钟为委员兼农林厅厅长；同时也任命吴国桢兼台湾省保安司令。吴国桢担任台湾省主席期间，致力于推动台湾地方自治、农业改革，允许某些地方官员职位由普选产生，并试图减少滥用警权。1950年1月，吴国桢在一场由蒋介石召集三军将领的会议中，提出应严禁军队走私，并将茅头直指海军总司令桂永清，桂要求吴拿出证据，吴随即将海军走私材料递呈蒋介石，并称已逮捕海军司令部情报处长钟山以及舰长周齐荣。1950年6月25日，韩战爆发后，美国改为全力支持国民政府，在外交上承认台湾的国府当局，并给予美援，吴国桢地位不再重要，