斯阿拉莫斯实验室英国代表团的负责人，领导了一个多国杰出科学家组成的团队，成员包括杰弗里·泰勒、、尼尔斯·玻尔、、弗里施、富赫斯等人，这一团队后由派尔斯继续领导。团队中的四个成员在洛斯阿拉莫斯实验室成为了其他小组的领导。彭尼于1945年8月9日观测了长崎市原子弹爆炸的情形，1946年参加了十字路口行动核试验。1944年，魁北克协定遭遇了重大挑战。美国发现英国和签署了一份秘密协定（“哈尔班协定”），约定英国将在战后向法国提供核能相关信息，交换法国物理学家弗雷德里克·约里奥-居里及其法兰西公学院团队在核反应堆