2016年1月26日，在巴勒斯坦袭击以色列后，潘基文说：“与人类历史上被压迫民族一样，这是人性对侵略的自然反映，这也经常会成为仇恨与极端主义的孵化器”。同年12月16日，他在接受采访时说联合国批评以色列的决议、报告和会议数目过多。潘基文批评沙特领导的干预也门行动说：“由于冲突的升级，对儿童的严重侵害大幅增加”2016年6月，潘基文将沙特领导的联合军从侵犯儿童人权名单中去除，之后声称沙特威胁如果不把沙特从在也门杀害儿童的黑名单上删除，沙特将停止对巴勒斯坦和其它联合国项目的援助。有消息称，有威胁说利雅德的伊