穿越龙鼓水道，最后到达面积约16.5公顷、屯门西南第40区望后石内河码头旁的新填海区，利用约0.5公里的高架行车道横跨龙门路连接拟在屯门第46区即望后石附近兴建的巴士转乘站、巴士车厂及停泊处（原订的收费设施拆除），后再连接在蝴蝶湾附近的龙门路及龙富路。技术上可以在隧道并设铁路，但是政府表示先以道路规划优先。值得一提的是，屯门－赤鱲角隧道底部设有共同沟，是继1991年兴建的香港科技大学后，相隔29年后再有香港建筑工程採纳共同沟概念。在2007年的早期设计中，连接路的隧道南面出入口和收费广场