。一开始，苹果公司与许多第一方程序开发员开发存储于录音带上的软件，但在Disk II上市后，基于录音带的软件基本上就从市场上消失了。Disk II软驱使用5¼英寸磁盘，第一款在Apple II上应用的磁盘操作系统是Apple DOS 3.1与Apple DOS3.2，它们可在每张磁盘上存储113.75kB，组织成35轨x13个256byte磁区。约在2年后，Apple DOS 3.3发表，每张磁盘可存储140kB，因为一个磁盘控制器上的微小硬件改动，使其可存16个磁区。（用户可以自行在旧的控制器上应用