历初年（1573年）经御史刘台推荐，起为大理寺少卿。历官顺天府尹，以右副都御史巡抚贵州。后来刘台得罪张居正，同亨是刘台的姊夫，给事中陈三谟将他弹劾。张居正死后，起用为南京太常寺卿，入为大理寺卿，迁工部右侍郎。督治寿宫，节省浮夸的经费三十余万。由左侍郎进工部尚书。万历三十三年（1605年）告老还乡，两年后病逝，赠少保，谥恭端。
家族.曾祖曾克绍、祖父曾伯崇，封礼部郎中、父曾存仁，曾任左布政使。母罗氏（封孺人）。