作为奸细入城的200名织田军铁炮队在三之丸叛变，织田军迅速攻破城池。松永久秀随后在信贵山城的天守阁放火，久秀、久通父子二人切腹或投火自尽。另一个流传甚广的说法是松永久秀将炸药放入古天明平蜘蛛，点燃炸药爆炸身亡。松永久秀死后遭筒井顺庆收埋，首冢位于今奈良县王寺町达磨寺，其墓所位于今京都市下京区妙惠会墓地。此外，奈良县生驹郡三乡町还有松永久秀的供养塔。