国民政府调整台湾省地方政治制度，废除台湾省行政长官公署，改设台湾省政府，由文人出身的魏道明任首届省主席。1948年接获第一笔美援后，随即拨付款项重建台糖、台铁、台电。1949年（民国卅八年），陈诚就任台湾省主席，改革币制（旧台币以四万比一的比率兑换新台币），并实施长达38年之久的《台湾省戒严令》。同年，国共内战局势大变，中国共产党在中国大陆建立中华人民共和国，使得于同年12月7日将中央政府迁至台湾。此时中华民国仅统治台湾地区（台澎金马），失去中国大陆的统治权。
两蒋及台湾戒严时期