白晓燕命案等政治风雨，行政院政务委员马英九5月8日提出“辞官退隐”声明，辞去政务委员，不参选1998年台北市市长选举。辞官后，向政大提出申请教职，政大法学院为此召开临时院务会议通过受理申请，并将申请截止日期延长到五月底，为此，当时政大法学院陈惠馨和许玉秀两位教授撰文「特权很难反省」，批评马先生的特权问题。同年8月任政大政治系副教授。
台北市市长.马英九辞政务委员后，虽屡次公开表示不会参选台北市长，但1998年复出参加国民党内初选并胜出，成为该届台北市市长国民党籍候选人，12月2