美菲战争，也称为菲律宾独立或菲律宾起义（1899-1902）战争，由最初反抗西班牙殖民统治并成立菲律宾第一共和国，转变成对抗美国兼併菲律宾的新殖民战争。这场战争发生在菲律宾革命和美国西班牙开战之后，是菲律宾独立斗争的一系列冲突之一。1898年8月14日，美军佔领马尼拉成立军事政府，美国总统授权军事总督掌握行政、立法、司法大权。1899年2月4日，美国和菲律宾共和军之间爆发战斗，并迅速升级到1899年的马尼拉战役。1899年6月2日，菲律宾第一共和国正式对美宣战。这场战争在1902年7月4日正式结束。