功入台到1683年9月郑克塽降清为止，郑氏计在南台湾经营共23年 。不过，此后台湾仍存有经常性的反清复明活动，俗谚称台湾「三年一小反，五年一大乱」。在清朝统治台湾的212年，大大小小民变事件发生116次，比如康熙时期的朱一贵、吴福生和干隆时期的林爽文，同治时期的戴潮春等所发动的起事，但最终均以失败告终。