在此期间，他担任了《力学学报》、《物理学报》、《新建设》和《新观察》杂志的编委，并成为国家科学规划委员会委员。根据周恩来委托，他还承担了筹建中国科学院力学研究所的任务。1953年还为青少年读者写作了科普着作《中国历史上的科学发明》一书。1957年中国力学学会成立，任副理事长。当年1月发表《高等教育的培养目标》，反对苏联教育体制中的一些工作思路，提倡理工合校，重视基础学科，在清华大学内引发三个月的大讨论，并最终在反右中被划为右派分子，批判为反动学术权威、万能科学家，停止一切工作。连钱学森都被迫和他划清界限