um和他的同事在国防分析研究所的一系列文章中首次描述。HMMs最初主要应用于语音处理领域。20世纪80年代，HMMs开始成为分析生物系统和信息，特别是遗传信息的有用工具。此后，它们成为基因组序列概率建模的重要工具。
介绍.隐马尔可夫模型描述了一组“隐含”变量和可观测到的离散随机变量的联合概率。它依赖于假设：第formula_1个隐藏变量只与第formula_2个隐含变量相关，而与其他先前的隐藏变量无关，而当前观测到的状态仅依赖于当前的隐藏状态。Baum-Welch算法利用EM算