议院通过专门决议，使用五色旗作为国旗，含“五族共和”之义。同时通过的还有十八星旗为中华民国陆军军旗。1913年，青天白日满地红旗被订为中华民国海军军旗。除了上述三种使用上较普遍的旗帜外，其他地区亦使用其他的旗帜。此时五色旗亦被用作海军舰艏旗。最后，其中华民国国旗的地位在1928年12月17日国民革命军北伐成功后，由青天白日满地红旗取代。中国抗日战争时期，五色旗变成了亲日政府的代表旗帜，例如满洲国国旗（见后文）就是由五色旗衍生设计外，其他像「冀东防共自治政府」、北平的「中华民国临时政府」（华北政务委员会前