酝酿建立高新区，并在1990年3月经浙江省人民政府批准建立杭州高新技术产业开发区。唯当时高新区仅包含城西与下沙两个区块。1991年3月6日，经国务院批准，杭州高新技术产业开发区为国家级高新区之一。1996年5月9日，萧山市的浦沿、长河、西兴三镇划归西湖区管辖；5月24日，西兴镇的东湖、杜湖、湖头陈3个村划归萧山市城厢镇管辖。1996年7月3日，高新区管委会对三镇内由钱塘江、浙赣铁路及长江路围合而成的面积约10.5平方千米的之江区块进行管辖。该区块于1997年12月26日由国家科委批准，正式并入高新区。