1959年升格为泸州医学专科学校，1978年升格并更名为泸州医学院，1993年成为硕士学位授权单位，2001年起先后开始联合培养博士和中医师承博士，2003年获学历教育留学生招生资格，先后开展学历教育本科和留学生研究生培养工作。2010年获准设立国家级博士后科研工作站。2015年，更名为四川医科大学。但该命名受到四川大学的反对，认为其侵犯了四川大学华西医学院（老“川医”）的名誉权。2015年12月，教育部官网发公告同意四川医科大学二度更名为西南医科大学。但再次遭到第三军医大西南医院的反对，第三军医大王正