魂的创造者的理念相抵而被弃置数个世纪。期间偶有恢复原子论的尝试，但都在教会的高压下失败。15世纪初，古希腊原子论着作残片被发现，被意大利学者带回意大利传抄，于15世纪下半叶出版，并于17世纪被译成法语、英语广为流传。“原子”作为一个自然哲学概念，在皮埃尔·伽桑狄、弗朗西斯·培根、罗伯特·波义耳、伽利略·伽利莱等人的努力下得以重拾。艾萨克·牛顿是一个原子论者，并将原子这一概念引入他的科学研究。他对于质量给出定义，提出了物质组成粒子说、光的微粒说以及质点和质点系等理论模型，这都与他对于原子论的信仰有关。牛顿