南苏丹护照是南苏丹政府发行给该国公民的国际旅行证件。南苏丹共和国于2012年1月开始发行被国际承认的电子护照。这些护照于2012年1月3日由总统萨尔瓦·基尔·马亚尔迪特于首都朱巴的一场仪式上发出。新护照的有效期限为五年。