庶华出任国民政府农矿部技监兼农民司、农林司司长。1929年6月，经国民政府教育部部长蒋梦麟推荐，任国立同济大学校长。1931年，兼任立法院第二届立法委员。1932年初，一·二八事变后，上海成立救国联合会，胡庶华加入了教育界救国联合会，成为大学教授及中国工程师学会的代表，并任救国会领导，领衔发出系列通电及宣言。1932年，胡庶华辞去同济大学校长职务，回湖南任湖南大学校长。抗日战争时期，胡庶华历任第三、四届国民参政会参政员，中国国民党中央训练团教授委员、中国国民党第六届中央监察委员。1943年，出任三民主义青年