何氏家族，民国政要何思源为其堂兄，何兹全称他为“仙槎大哥”。何思源之女、原民革中央主席何鲁丽则称其为“八叔”。他于1937年抗日战争爆发后于汉口与郭良玉结婚。婚后他们育有独子何芳川，何芳川后来也成为知名历史学家，并曾任北京大学副校长，于2006年患白血病去世。