随后郑芝龙也大规招募移民渡海拓殖台湾。1661年，由郑成功所领导的郑军围攻热兰遮城，佔领台湾，1662年2月荷兰人接受条件开城投降，结束对台湾38年的统治（1624～1662）。
明郑时期.郑氏治理时期从1662年南明延平郡王郑成功领兵渡海打败荷兰东印度公司军队起，经郑氏三代统治南台湾至1683年降清为止，统治时间前后共22年。以反清复明为志的郑成功经过九个月的苦战，攻下「热兰遮城」，怀念故乡闽南的郑成功将它改称安平城，赓续的战役迫使荷兰东印度公司台湾长官揆一于1662年2月1