军队退兵的原因，据《颇罗鼐传》所载，由于诸护法神的庇佑，导致敌军突然大哭而逃，颇具传奇色彰。也有史料表明，菲戴汗是接受了甘丹才旺的巨额贿赂并达成所谓某种协议，才离开了拉达克。拉达克战争大约于1684年春结束。据史料载，在莫卧儿军队撤退后，噶丹泽旺借助准噶尔汗国首领噶尔丹的增援部队再次来到拉达克列城。失去援助的抵抗毫无意义，拉达克王最终投降。
战争结局.蒙藏联军最终取得胜利。此后，主巴噶举派的第六世竹钦活佛米旁旺布 (又译作密庞旺波）前来斡旋，蒙藏联军后勤供应困难，也不想久留，于是交