秦军受降共三万六千多人，姚兴则进军枹罕（今甘肃临夏市）。乞伏干归初降秃发利鹿孤，但因怕不为对方所容，最终决定归降后秦。弘始三年（401年），姚兴命姚硕德进攻后凉，并兵围后凉首都姑臧（今甘肃武威）。后凉王吕隆被逼请降。而在后秦攻凉时，西凉李暠、南凉秃发利鹿孤及北凉沮渠蒙逊都遣使向后秦请降。直至弘始五年（403年），后凉被南凉和北凉所逼，最终请后秦派军迎来归附，姚兴因而派了齐难等人到姑臧，驻兵当地并送吕氏宗族内徙长安，吞併后凉。另外在攻打后凉姑臧时，连带的将名僧鸠摩罗什请回长安。尔后为鸠摩罗什讲解《法华经》