般而言，科学家借由基因工程将此标签放置于重组蛋白质的N端、C端或两端。
应用.
蛋白质纯化.以大肠桿菌或其他原核生物表现的重组蛋白会累积在细胞质中，为了取得重组蛋白，以物理性的方式如高压，或生物性的方式如溶菌酶，或两种方式合併使用去破坏细胞膜，使得重组蛋白悬浮于缓冲溶液中。此时要将重组蛋白从许许多多细菌的蛋白质中分离出来并不容易，但若重组蛋白带有组氨酸标签，则利用亲和性层析即可有效的进行纯化。 市面上常见的组氨酸标签亲和性层析法，是利用琼脂糖(Agaros