整的身体骨骼，但化石呈现接近扁平状态。这个标本大约是正模标本的2/3大小，翼展约17公分。Dalla Vecchia认为这代表物种内的个体变化。根据亚历山大·克尔纳（Alexander Kellner）的早期研究，卡尼亚翼龙是蓓天翼龙的近亲，属于双型齿翼龙科。大卫·安文（David Unwin）提出不同看法，将卡尼亚翼龙归类于曲颌形翼龙科。Dalla Vecchia沿用这个分类法，并提出卡尼亚翼龙是空枝翼龙（"Caviramus"）的姊妹分类单元。