在850公里外的台北市大屯山和林口长庚医院旁的台湾「火腿族」临时电台完成通联，而且还创下一瓦以下超低功率完成通联的纪录。1999年5月，高雄市长谢长廷至岛上渔民服务站挂上「旗津区中兴里18邻东沙31号」门牌，以宣示主权。2005年7月28日，中华民国总统陈水扁第二次赴东沙岛视察。2007年，东沙环礁国家公园成立，东沙岛纳入新成立的海洋国家公园管理处的管辖。2013年1月8日，东沙岛成立中华邮政代办所。2019年1月，中华民国内政部一度宣布将于该年4、5月开放试办观光，但因专家建议生态措施