于民国八十八年十月十六日经台南县政府评定为县定古蹟。新庙重建委请高雄市谢自南建筑师设计庙貌蓝图。重建蓝图分为前后两殿、两层，两厢为香客大楼，并遵从神示，坐向为：坐辰向乙兼酉卯；宽139，.2尺，深118.9尺，高116尺。民国六十九年九月二十五日岁次庚申年农历八月十七日巳时正刻，三合会吉日良辰举行动土典礼；并于民国七十年三月二十四日岁次辛酉年农历二月十九日卯时开工兴建，至民国七十三年底完成一楼内殿硬体建设，而于十二月十六日岁次甲子年农历闰十月二十四日，进行入火安座仪式，当时参观人数达数万余人，车水马龙，