二卷（新罗．太贤撰）、《药师经灯燄》一卷（清．净挺着）、《药师经直解》一卷（清．灵耀撰）、《药师经讲记》（民国．太虚大师讲，竺摩记）、《药师经讲记》（民国．印顺导师讲，妙峰、常觉记）等。并传有众多念诵、观行仪轨等行法。
影响.戴季陶（1891－1949）曾启建药师法会，作为消灾解厄、护国佑民之用，并撰写「现代版药师佛十二大愿」：