选派朱兆莘赴美国留学。在美国，他先在纽约大学商务财政科获得商务财政大学学士学位，后在哥伦比亚大学法政科获得法政硕士学位。民国2年（1913年）归国，当选为民元国会参议院议员，并兼任北京大学商科主任、大总统府秘书、咨议等职务。1914年1月10日，大总统袁世凯宣布解散国会，朱兆莘遂赴厦门，任鼓浪屿会审公堂堂长。民国6年（1917年），朱兆莘被任命为驻沪外交部特派江苏交涉员，驻上海。其后，伍廷芳自北京携带外交印信至上海，以上海的朱兆莘的交涉公署作为行辕，进行外交活动。朱兆莘支持伍廷芳讨逆护法的立场，配合孙中