9年（民国28年）2月，升任察哈尔省政府委员兼民政厅长（当时的察哈尔省主席为石友三）。4月赴重庆，在国民党中央训练班第3期受训。1940年（民国29年）12月，任国民革命军第69军军长。翌年8月代理察哈尔省政府主席。1943年（民国32年）5月，任河北省政府委员。抗日战争胜利后，毕泽宇任吉林省临时参议会议长。1948年（民国37年）3月当选行宪国民大会代表。8月，任哈尔滨市市长。第二次国共内战，他随国民党败退台湾，继续任国民大会代表。1968年（民国57年）1月8日，毕泽宇在台北市逝世。享年76