同，一般会破坏细胞的特定部份，或是抑制代谢机能的进行。已知有毒物质中，有些最毒的就是外毒素，例如只要1 mg的肉毒桿菌毒素就可以杀死百万只天竺鼠，这类的疾病常是因为外毒素造成，而不是因为病原细菌本身所造成。
治疗.细菌感染会用抗细菌药来治疗，若药物可以伤死细菌，则会分类为杀菌剂，若只是抑制细菌的成长，则算是。抗细菌药有许多不同的种类，每一类会抑制一种会细菌和宿主不同的生物作用。例如氯霉素和四环霉素会抑制细菌的核糖体，但不会抑制结构不同的真核细胞核糖体，因此只对细菌有毒性。抗细菌药除