邦交国向世界卫生组织（WHO）提案「邀请中华民国以参与世界卫生大会」，并在大会（WHA）中发言支持；2001年5月，萨尔瓦多于大会中发言支持；2008年1月，萨尔瓦多与其他3个中华民国的邦交国向世界卫生组织执行委员会提案「要求世界卫生组织与尚未获纳入国际卫生条例2005之国家、地区及领土就国际卫生条例之执行建立直接沟通与联系」，并在会议中发言支持；2018年1月、5月，萨尔瓦多在世界卫生组织执行委员会与世界卫生大会中，发言支持台湾参与。2009年11月、2010年11月，萨尔瓦多与其他中华民国的邦交国向