据其门下洪亮吉记载，毕沅生平礼贤下士，“爱才尤笃，人有一技之长，必驰币聘请，唯恐其不来，来则厚资给之。”，着名学者章学诚、孙星衍、汪中、段玉裁等皆入幕门下。如孙星衍、武亿等人均受邀参与。清代显宦待士之优厚，以毕沅为最。干隆五十三年，毕沅任河南巡抚时，由周震荣推荐章学诚开始编写《史籍考》。毕沅也致力于古迹调查和保护。任陕西巡抚期间，对州府内重要名胜古迹进行了绘图与记录，编撰成《关中胜迹图志》三十卷。对明代后期以来疏于管理与保护的西安碑林进行了大规模整修，建立保管机构和保护制度，并整理编目和进行研究。