府拓建街道，北移本堂，转换方向以玉门街为出入口，大殿因而座东向西。此举破坏了山门进入正殿的轴线。蒙东海宜诚之故，日本的临济宗妙心寺派依然与台湾寺院延续交流。1990年代，因工务局将寺地纳入圆山公园工程范围内，地上与地下建物都须拆迁，寺方遂找议员陈玉梅陈情。1996年9月6日，时任台北市市长的陈水扁在议员陈玉梅与陈正德、及民政局、工务局和都市发展局等相关官员陪同下，来该寺视察，在绕寺一周后，即表示列为古蹟的长安西路台北市政府旧址可与建成国中兼容并蓄，临济护国禅寺部分建筑有必要予以保存，随即责成民政局，