展开庚子后新政。袁世凯以武卫右军为基础，着手进行“北洋常备军”的建设。至1904年，先后编成三镇。1905年（光绪三十一年）2月，袁又提议统一全国军队番号，将全国各地的常备军各镇改称陆军各镇。5月，以北洋常备军、京旗常备军为基础的新建三镇，与武卫右军、自强军的旧三镇，统一番号为近畿陆军第一镇至第六镇，归直隶总督兼北洋通商大臣管辖，故合称“北洋六镇”，又称“北洋新军”，负责拱卫京畿，北洋系正式成形。此一时期，袁先后设立行营将弁学堂、陆军师范学堂、军械学堂、军医学堂、马医学堂、经理学堂，以及军官学堂、宪兵学堂、