630年到1635年期间，琼斯还为查理一世信仰罗马天主教的王后亨利耶塔·玛丽亚专门建造了一座小礼拜堂。这得到方济嘉布遣会的支持。礼拜堂建在大庭的西南方向，同时附设有一座小型的墓园。今天，人们经过四合院下方的甬道时，可以看到墙上镶嵌着当年的一些墓碑。英国内战结束了王室对萨默塞特府的占有。1649年，议会决定出售萨府，实物作价11万8千英镑，这个金额相当优惠，然而还是没有买主。不久萨府被派上新用场。议会把部分建筑改为军部，不仅为议会军总司令（Parliamentary Commander-in-Chief）