孙应奎，字文卿，号蒙泉，浙江承宣布政使司绍兴府余姚县（今浙江省余姚市）人，明朝政治人物。
生平.嘉靖八年（1529年）己丑科进士第三甲第四名。授行人司行人，升礼科给事中。弹劾汪鋐而忤旨下诏狱，施廷杖，谪华亭县县丞。汪鋐亦被罢免。累升山东布政使，以右副都御史，总理河道，一年多后归乡。
家族.曾祖孙伦；祖父孙鼎；父孙钥。母童氏。