，为一座受道教与台湾民间信仰影响极多的佛教祖师庙，是淡水地方上的信仰中心。每年农历五月初五、初六举办「清水祖师得道纪念日绕境庆典」，俗称「淡水大拜拜」，是淡水的盛事。淡水清水巖与艋舺祖师庙、三崃祖师庙、瑞芳祖师庙，称为「大台北四大祖师庙」。清水巖、鄞山寺、福祐宫与淡水龙山寺合称为「淡水四大庙」。
祀神.清水祖师、地藏菩萨、保生大帝、西秦尊王、萧府千岁、文昌帝君、斗姥元君、太岁星君。
源由.相传安溪清水巖在宋代得到一块巨大的沈香木，雕制六尊清水祖师神像，