存在于管腔中的质子通过膜转运到基质时产生ATP。电子可以继续通过PS I周围的循环电子传递或通过铁氧还蛋白传递给酶NADP 还原酶。将电子和氢离子加入NADP 中以形成NADPH。 这种还原剂被输送到卡尔文循环，与3-磷酸甘油盐一起与ATP反应生成甘油醛3-磷酸，这是植物可以制造各种物质的基本构件。