于是和平的努力完结了。1597年开始了第二次入侵朝鲜，但是随着1598年因秀吉的病逝，日本全军撤退而结束。
后期.1598年8月18日，丰臣秀吉病逝于伏见城，享年62岁。死前他亦已託付前田利家监视德川家康及辅佐丰臣秀赖。而入侵朝鲜半岛的日军在接获德川家康为首的五大老命令及以石田三成为首的五奉行安排下，向明朝隐瞒了秀吉的死讯，随后与明朝议和并逐渐从朝鲜撤军。可是这两场战争日军损失巨大；元气大伤，此役也埋下了德川家康日后成为征夷大将军的一个重要伏因。而日本与朝鲜的关系，到1607年才恢