也选择了这些洞穴作为他们的居所，而在洞穴里留下一层新石器时代晚期的文化层。
新石器文化.林朝棨教授发现八仙洞的史前文化时，便注意到新石器文化层。然而对于遗址内的新石器一直缺乏进展。2008年臧振华进行调查发掘时，判断主要文物为麒麟文化，部分细蛇纹陶器可能属于富山文化。
金属器文化.2008年臧振华进行发掘时，找到硬陶与琉璃珠等金属器时期文化，判断主要文物属于静浦文化。
洞中寺庙.八仙洞因地灵人杰，曾有修道者于洞中建立寺庙奉祀神佛，