秘雕鱼是当鱼畸形导致鱼背隆起或体侧弯曲，以X光检视骨骼型态，嵴椎形状呈现波浪状、单弯、双弯，甚至3弯，弯曲程度视个体畸形的严重情况而异。因为看起来像是黄俊雄布袋戏里面的角色「秘雕」，故被称为「秘雕鱼」。于1993年，台湾环保团体曾于核二厂附近发现畸形花身鸡鱼，于是台湾电力公司特别委託专家调查，并解释为水温所引起，但在调整出水口及水温之后，畸形鱼并没有减少，邵广昭（中央研究院动物所所长）表示，这是因为核二厂改善工程当初并非是为了解决82年发现秘雕鱼事件而作，而是早在76年时台电为符合环保署制订之两项「放流水