机构开始陆续迁往台湾。1949年1月，平津战役结束，解放区覆盖华北全境。淮海战役结束，解放军攻占长江以北区域。4月渡江战役结束，解放区覆盖华东全境。10月1日，中华人民共和国正式成立，业已控制中华民国在北方的全部省份。至1950年初，中华民国政府丧失在中国大陆的剩余统治区域，仅剩台湾地区。中华人民共和国政府被撤退到台湾的中华民国政府称为「匪伪政府」，中华人民共和国即「匪区」。至此「解放区」一词与「国统区」共同退出历史舞台，但亦有反共人士继续使用「匪区」、「沦陷区」等用以指中共统治的地区。