塘、察雅、昌都归四川，中甸（今香格里拉县）归云南。内地管理的藏族地区，由朝廷选出头目担任世袭的土司。松潘镇总兵周瑛奉命勘定疆界，以南墩、宁静山为界，竖立分界碑。岭东的巴塘属四川，岭西属西藏，宗吽察卡、中甸归云南管理。1904年（光绪三十年），建昌道赵尔丰向四川总督钖良上「平康三策」，提出要对四川、云南境内的藏族土司进行改土归流，然后对当地进行开发并逐渐控制整个康区，再发兵控制达赖喇嘛的地域，以制衡英国。1905年，赵尔丰借巴塘事变，废除了不少土司，但不久辛亥革命爆发，赵尔丰被革命党擒获处死，改土归流才告