实际处理铁路运输等业务，但铁路事务的主导权仍在军方系统的台湾铁道线区司令部手上。
沿革.台湾铁道线区司令部于1895年6月10日成立，司令官为当时台湾总督府陆军局工兵部长儿玉德太郎（陆军工兵大佐）。该部门主要的任务是在维持清代台湾铁路最低限度的畅通，以支援日军的军事行动与物资运输。司令部底下则先是在台北、基隆两车站设置「停车场司令部」，日后于其他各站增置「停车场司令部」。而在1895年8月成立的临时台湾铁道队来台后，台湾铁道线区司令部于9月24解散，底下各「停车场司令部」改隶于