基础研究；为科学家、学生及访问学者提供相应层次的训练；为成员国的科学家提供必需的科研服务；在生命科学领域内开发新型的科研仪器及研究手段；积极参与生物技术的转化及应用。有许多重大的科学进展是在欧洲分子生物学实验室完成的，其中最为着名的例子是克里斯汀·纽斯林-沃尔哈德和艾瑞克·威斯乔斯首次对果蝇的胚胎发育进行系统的遗传学分析，基于这一工作，他们两人及美国遗传学家爱德华·路易斯于1995年获颁诺贝尔生理学或医学奖。
培训.高级培训是EMBL的四个核心任务之一。多年来，实验室已经建立了