十年（1884年）清法战争西仔反，辉煌组织团练守备苏澳，转进基隆，由正四品都司衔陞为从三品游击衔。十一年（1885年）五月，法军全退，台北府解严，福建台湾巡抚刘铭传请旨奖叙，免候补都司、以游击尽先补用。十六年（1890年），刘铭传经略南澳诸社原住民，辉煌招募土勇三百名作为向导，晋升从二品副将衔，钦赐涅红顶戴，。二十年（1894年），台湾海防五年期满，福建台湾巡抚邵友濂奏保奖出力人员，陈辉煌以蓝翎留闽尽先补用游击，俟补缺后以参将仍归原省补用。辉煌雅好戏曲，由福建延师来台授徒，自己为北管福禄派