世达赖在英国支持下领导西藏僧俗驱逐清朝驻藏军队，并返回拉萨恢复执掌西藏政教大权，之后西藏与北洋政府和地方军阀发生一系列冲突，直到北洋政府的官员入藏交涉才逐渐平息。
拉萨兵变.清末新政时期，清廷治藏政策多有失误，驻藏大臣（即钦差）联豫处理失当，加上英国的幕后活动，西藏噶厦与清廷的关系严重恶化，导致第十三世达赖喇嘛于1910年2月出走英属印度。而以钟颖为统领的约二千名川军（属于新建陆军，简称“新军”）从四川省抵达西藏拉萨驻扎，从而使清朝在拉萨的驻军形成“营兵”（旧驻藏军）与“新军”共驻