反对苏联路线的左派人士因此另起炉灶，发起所谓的新左派运动。1968年1月29日　东京大学医学部学生为反对登记医师制度代替实习制度进入无限期罢课，最终发展为政治斗争，1969年1月18日-19日，机动队强行强行进入东大安田讲堂，逮捕450名学生（东大安田讲堂事件），被称为东京大学事件。为组织斗争而设立的学生团体被称为“全学共斗会议”（全共斗）。1968年至1970年间的第二次反安保运动带来了新左派的另一高峰。在70年代，日本的新左派进行了反越战、反美军基地与成田机场等等抗争，与政府的“机动队”爆发多次