斑马鱼不是一个完全理想的实验模型，其在别的科研领域也有不适用之处，例如其不存在标准的饮食，又比如在一些有关人类疾病的基因方面，斑马鱼和哺乳类存在细小但很重大的差异。
再生能力.斑马鱼在幼鱼阶段能够再生其鳍、皮肤、心脏、体侧线的毛细胞以及大脑。在2011年，广告宣传以公布其将这项能力应用于人体的企划，以期筹措5,000万英镑。斑马鱼也被发现可在创伤后再生感光细胞与视网膜神经。目前研究显示，这是由(Muller glia)的去分化与增殖介导的。研究人员不断截断背上以及腹面上的尾鳍，