中最高的分类单元，该系统中，包含细菌、古菌与真核生物等三个域，其中前两者为原核生物，不具有细胞核，后者则具有细胞核。
三域生物特色.
古菌.古菌属于单细胞原核生物，外形类似细菌，但部分分子序列与代谢途径与真核生物较相近，其细胞膜为所组成，不同于另两域生物细胞膜主要成分为酯类。早期发现的古菌多为嗜极生物，后来渐发现古菌普遍存在各种环境中。
细菌.细菌也属于单细胞原核生物，其细胞膜为酯类组成，广泛分布于不同环境中，外形、营养方式与生长环境