元十三年（1276年），升阆州为保宁府，以阆中为首县（府治所在地），下辖阆中、南部、苍溪、西水、奉国、新井、新政七县。至元二十年（1283年），奉国并入苍溪，西水、新井、新政并入南部。属广元路。
明.明太祖洪武四年（1371年）直隶四川行省。洪武六年（1373年），剑州划入保宁府，剑州下辖梓潼。洪武九年（1376年），剑州并入阆中，广元州、巴县、通江、梓潼划入保宁府。广元州下辖昭化、巴州下辖通江。洪武十年（1377年），苍溪、南部并入阆中，昭化并入广元州。洪武十三年（1380年），