民国行政院院长萧万长召开高层首长会报，并宣布九项紧急处理指示；清晨6点，中华民国国防部与国防部参谋本部成立「救灾应变指挥中心」，下午4点30分中华民国行政院邀集各部会局处署召开「九二一地震灾后重建会议」，会中达成15项结论。9月22日，时任中华民国总统李登辉宣布成立「九二一地震救灾督导中心」，由时任中华民国副总统连战负责；9月23日行政院召开第2647次行政院会议，听取内政部等单位报告921地震灾情及处理情形，并自当日起全国降半旗3日致哀。9月21日凌晨1时47分地震发生，国防部下令，中华民国国军官兵不