靖姑成为闽东一带最重要的道教女神之一，而福州则成为闾山派的中心，闾山派的另外一支则尊奉法主真君为祖师。明清以来，新建道观渐少，清干隆四年(1739年)朝廷下令禁止道教之后，道教急剧衰落。但福州的道教通过渗透到民间宗教中去，仍在民间流行。福州市道教协会位于于山九仙观。妈祖、临水夫人是福州最重要的道教神祇，其余如包括懿德夫人、开闽圣王、威武尊王、白马尊王（射鳝尊王）、五福王爷、水部尚书、武夷真君、齐天大圣、丹霞大圣、董真人、裴真人、马天君、照天君等等，等都是福州知名的神祇。
基督新教.