政府迅採有效办法；傅斯年称：现在国家资本被官僚资本吃尽，官僚资本又被豪门资本吃尽，此现象如不取缔，国家将陷于极端危险的境地。1948年12月15日，南京行政院批准台湾大学庄长恭校长辞职，同时发表傅斯年校长的人事案。1949年1月5日，陈诚接掌台湾省政府，当日即致电傅斯年「弟已于今日先行接事，介公深意及先生等善意，恐仍须有识者之共同努力，方能有济。弟一时不能离台，希先生速驾来台，共负巨艰」。1月19日，他搭机飞到台北，1月20日从代理校长杜聪明（1948年12月7日开始代理）手中接任国立台湾大学校长。