恩还经常插手干预。麦凯恩这时身高只有1米7，体重58公斤，虽然技能不佳，但凭借无畏且勇往直前“没有倒车档”的品性，他还是在学院轻量拳击队中打了3年。在该校就读的最后一年里，麦凯恩率领营级拳击队拿下全旅冠军。麦凯恩天资聪颖，1984年的测试结果表明他的智商达到133，所以在感兴趣的几个科目，如英语文学、历史和政府上表现优异。海军学院的所有学生都必须学习固定的理学士课程，许多同学对他在数学、科学和工程类课程上临时抱佛脚的能力留下深刻印象。不过由于偏科严重，麦凯恩的总体成绩不佳，他之后也表示学习这些课程让他非