秘书，封冯翊王，以兄长原太子拓跋晃辅臣尚书令古弼为司徒，兼太尉张黎为太尉，羽林中郎、幢将乌程子建威将军吕罗汉典宿卫。但他也彻夜畅饮，夜夜笙歌，很快即令国库空虚，又多次出猎，即使边境有事，亦不加体恤，百姓皆愤怒，而他不作改变。南朝宋文帝刘义隆遣将檀和之侵犯济州，拓跋余令侍中、尚书左仆射、征南将军韩茂讨之，檀和之遁走。另外，宗爱自拓跋余登位后掌权日久，朝野内外皆忌惮他，而拓跋余则怀疑宗爱另有所图，密谋削夺宗爱权力，宗爱于是于十月一日（10月29日）使小黄门贾周等乘夜趁拓跋余祭祀东庙而