可以联系到非感染性的病因，例如外伤、过敏、解剖特征如憩室(Diverticulum)，以及手术后的疤痕与沾黏。
描述.尿道综合征的迹象呈现，包括在缺乏常规细菌生长、及脓尿(每高倍视野(High-power field)超过5个白血球)下的"慢性复发的尿路感染(UTI)"病史。尿道综合征往往伴随着性交而发生。一些医生认为，尿道综合征可能是由于尿道底部及侧面斯基恩氏腺的低阶感染。斯基恩氏腺在胚胎学上与男性的前列腺有关，而尿道综合征可能与慢性前列腺炎共享一个比较性的病因。Sect