由皇帝亲统六部。洪武十四年，降翰林学士为正五品，并革除学士承旨、直学士、待制、应奉等官。但由于工作份量实在过于庞大，洪武十五年，朱元璋不得不设殿阁大学士，为皇帝顾问，一开始大学士并无实权，类似今日的秘书之职。洪武十八年（1385年），更定翰林品员，定进士一甲（状元、探花、榜眼）授翰林院修撰，二甲以下授编修、检讨，其品秩自学士五品以下至七品不等。同年廷试后，一甲进士丁显等授翰林院修撰，二甲马京等为编修，吴文为检讨，进士始入翰林。
建文年间.明朝建文年间，不设大学士官职。