市境内的车站，与过去设籍京都市西京区境内的旧保津崃车站有些不同。除此之外，虽然位于龟冈市境内，但在JR的特定都区市内制度中，保津崃车站仍然被归属是「京都市内」诸站之一。
车站结构.对向式月台2面2线在桥樑上的高架车站。由于没有转辙器与绝对信号机，被分类为停留所。
使用情况.2017年（平成29年）度1日平均上车人次为425人。
各年度1日平均上车人次（1930年代—1940年代）.各年度1日平均上车人次如下表。