素亦存在同位素。约瑟夫.汤姆森透过质量分离氖离子流而发现氖同位素是质谱法的第一个实例，随后这个方法经由阿斯顿和一同改善并且发展成普遍的方法。
其他.1905年，汤姆孙发现了钾的天然放射性。在1906年，汤姆孙证明了每一个氢原子只有一个电子。以前的理论中允许氢原子有不同数量的电子。
阴极射线实验.
磁偏转.汤姆森首先研究有关阴极射线的磁偏转。阴极射线是产生于装置左边的侧管，并且借由磁铁的偏转使阴极射线由阳极传递装置的主钟罩。汤姆