宽政年间(1789-1801)创立，并在江户建立道场教授剑术之。后由近藤三助继任第二代掌门人，除了江户地方，该流派现已普及广范围流传于多摩、埼玉、神奈川等地。在江户时代后期其近藤周助的养子，亦为第四代掌门人的近藤勇在京都组织新撰组后，其组织之事蹟(如池田屋事件、禁门之变)更使该流派广为世人所知。近藤勇身亡后，天然理心流流派第五代掌门人则由近藤勇的婿养子近藤勇五郎继承，近藤勇五郎应是和多摩地区的剑术师范学习而获得天然理心流的认可。天然理心流除了剑术外，亦是教授其他如拔刀术、柔道、棍棒术、气功等的综合武