噶厦同意签署条约，并提出将赔款期限由三年改为75年，每年支付10万卢比。1904年9月7日，噶厦、三大寺代表在布达拉宫与荣赫鹏签署条约，史称《拉萨条约》。荣赫鹏代表英国签字，噶伦、甘丹寺、哲蚌寺、色拉寺住持和民众大会首领代表西藏画押、钤印。甘丹赤巴罗桑嘉措在条约文本上钤盖了逹赖喇嘛之印。由于清廷多次电令不得批准该条约，驻藏大臣有泰没有签字。条约要点为：
善后.《拉萨条约》签订后，英军于1904年9月23日撤离拉萨。11月11日，印度总督批准《拉萨条约》，但对条约内容进行了修改：