选的何智辉及民主进步党候选人陈唐山胜出。
民主进步党.民主进步党在此次选举中，总得票率拿下41.20%，却只当选6席。虽然民进党最后成功力保台北县、宜兰县、新竹县、高雄县及澎湖县等五席，并首次入主台南县，但包括彰化县的周清玉及屏东县的苏贞昌都连任失败，总席次比前届的7席还减少1席。在这场选战中，原先夸口将拿下半数的县市长席次的民进党党主席许信良，为信守政治承诺及败选负责，宣布辞去党主席一职，其余任期由中常委施明德递补。早期的党外势力虽然在民主进步党建党初期大多与其结合，但仍然以