航空部门本来同意不限制农历新年加班机总量，中华民国交通部民用航空局一改11日表态，宣布不准许中国东方航空及厦门航空合共176班加班机的申请，预计受影响未能回乡过年人次达5万之众。对此，中国民航局表示强烈谴责，并指责此举漠视人民福祉。1月19日，中华民国总统府发言人林鹤明表示，蔡英文唿吁北京政府，应对台给予弥补措施。国际航空运输协会（IATA）在1月19日已就M503航线情事回覆中华民国交通部民航局，指出M503航线已于2015年3月起投入使用，并不是新航线，且是经过国际民航组织（ICAO）批准，航线相