头轨道末端的像胶缓冲器的声音－并读取、运行第0轨中的代码。磁盘目录存储在第17轨，正好是在一般的35轨磁盘的中间，以减少平均寻轨时间－对于常用的目录轨。目录大小固定，可容纳最多105个文件。不支持子目录。许多游戏出版商并没有在他们的磁盘中包含Apple DOS，因为他们需要那些被占用的空间。他们通常自己编写开机程序与其只读文件系统。这也是为了防止游戏破解者窥探其防拷源码，因为磁盘上的数据并不是可以轻易存取的文件。一些第三方厂商生产了可以在大部份5¼磁盘上写入40轨、存储160KB数据的软驱，然而这种