3年8月晋升陆军大佐，8月14日调到支那派遣军总司令部第三课（兵站和政要课）课长。11月24日，以支那派遣军司令官畑俊六大将的名义，在浙江奉化溪口镇举行了一次公祭蒋母的仪式。后人认为，这件事大概是战后蒋介石收留辻政信的原因。1944年7月辻政信调到驻缅甸战线的本多政才中将的第33军任作战参谋。在缅甸曾参与拉孟与腾越作战。辻政信以个人名义对水上源藏少将发出死守密支那命令，水上指挥步兵第114联队在密支那与中美联军展开死战直到1944年8月3日被攻陷为止。水上独自将死守命令压下，下令残存的守军突围撤退，水上