两大涧于王店乡南部樊岗村以东合流进入盱眙与天长交界处的时湾水库，出库后东南流至汊涧镇西与南源合流。两源合流后白塔河向东流至石梁镇北，右岸有1968年开挖的新白塔河，向东经天长市北、万寿镇北分流入高邮湖。白塔河自新白塔河分流口向东北，形成一个S型河道，于杨村镇湖边村注入高邮湖。全长110公里，流域面积1604平方公里。新白塔河自源头算起长91.5千米，流域面积1303平方千米