肢在形态及功能上有很大分野，唯一相同的就是其位置：螯肢出于第竹二节，位于口器前；而须肢来自第三节，位于口器之后。螯肢一般分三节，第三节上有螯爪。不过，蜘蛛的螯肢只有两节，于第二节有螯爪，不使用时螯爪可以收起。螯肢的大小也各有不同：板足鲎的螯爪很大，而蝎子的则很细小。大部份螯肢亚门的须肢相对较为细小及用作感官。不过雄性蜘蛛的须肢端呈球状，可以作为针筒将精子注入雌性的生殖口，而蝎子的则有大钳用来捕捉猎物。
体腔及循环系统.螯肢亚门的体腔非常细小，在生殖系统及排泄系统之外只余少许