责军官升迁、战死者的丧葬和家属的抚恤、分配补充兵员乃至战后的复员遣散等事宜。在此期间晋升为海军中佐。1897年（明治30年），在4年的文职工作后重返军舰，担任防护巡洋舰须磨的舰长。1888年（明治31年），调任浪速舰长。年底二度赴英，预定作为装甲巡洋舰出云的舰长接收返国，不过因为出云没有完成，于是改为作为战列舰朝日的舰长。1900年返回日本。1901年（明治34年）7月，晋升为海军少将，同时出任人事局长。此时日本海军为了准备对俄罗斯帝国的战争而急剧扩大规模，这使得三须的工作量比起以前出任人事课长