面车站，设有1面1线的单式月台。前往王寺方向的列车会开启左边车门。前往生驹方向和王寺方向的列车停靠在同一月台。月台可容纳4卡车厢。车站大楼邻接月台。站前回旋路设有巴士站。此站设有厕所。此站是由王寺站管理的有人车站。此站设有可支援PiTaPa、ICOCA的和（支援卡和IC卡增值服务）。
在此站上下车人次.以下列出近年来1日中上下车人次：
巴士路线.（元山上口站巴士站）　※ 截至2017年5月12日