尼环形山的坑壁已严重磨损，部分地区带有撞击形成的凹槽，其东侧坑壁上覆盖了多座相联的撞击坑，而东南侧壁被也已磨损的卫星坑-"马吉尼 C"击破。构成马吉尼环形山的原始坑壁已残存极少，而它的外侧壁几乎已不复存在。北侧内壁上横贯了3-4道平行的断层痕迹，可能是东海盆地创建时所形成。坑壁平均较周边地形高出1930米。坑底表面接近平坦，分布有二座低矮的中央峰，地表上穿插了一些来自第谷坑的射纹束。构成该陨坑坑底的岩石成分到底是撞击抛射物，还是火山喷出岩，目前仍不清楚。
卫星陨石坑.按惯例，最