护联盟目前仅承认有9个亚种的一个长颈鹿物种。在2001年，有人提出了将长颈鹿分为两种物种的分类建议。2007年一篇关于长颈鹿遗传学的研究建议将其分为6个物种：西非长颈鹿、罗氏长颈鹿、网纹长颈鹿、马赛长颈鹿、安哥拉长颈鹿和南非长颈鹿。该研究从核DNA和线粒体DNA（mtDNA）的遗传差异推论得出，尽管没有自然障碍阻碍不同种类的长颈鹿的相互接近，但一些地理位置很近的长颈鹿群（如罗氏长颈鹿、网纹长颈鹿和马赛长颈鹿）有生殖隔离，很少杂交。研究同时还建议将马赛长颈鹿分为由东非裂谷隔开的两个物种。和源自东非的长颈鹿类似