机场包括原有的北京、上海浦东、广州、厦门、南京外，还有杭州等新进航点，台湾方面则开放桃园、高雄、台中、台北、澎湖、花莲、金门、台东8个航点，同时，上海浦东、广州、高雄和桃园开放货运包机。 在随后的几个星期内，随后加入的大陆航点包括武汉、成都、大连、重庆、青岛、天津、西安、昆明、海口、福州和长沙。2009年4月18日，又开通了沈阳－台北航线，这是东北省会城市唯一直飞台湾的直航包机，也是大陆现有航点中最北端的城市直飞台湾及航线最长的两岸包机。关于两岸平日包机的后续效应，多方反应不一。由于两岸航线定位不明，延