夏、青海等地的军政要员及官绅民众，得悉金树仁被羁，均表示声援金树仁。同年10月10日，国民政府主席林森宣布：“金树仁与苏联政府订立临时通商协定，是为维护地方，因以获罪，应予特赦。”1935年，金树仁返回甘肃兰州。1941年9月12日，金树仁去世，归葬于永靖县。