四十五年（1706年）四月完成初稿，“先誉目录、凡例为一册上呈”。康熙御览后认为尚需修订增益，改赐书名《古今图书集成》。康熙六十一年（1722年）康熙逝世，诚亲王胤祉失势，陈因曾奉其侍读而受到株连。雍正元年（1723年）一月，陈梦雷被流放黑龙江。同年雍正皇帝下令抹去陈梦雷编书之名，改命经筵讲官、户部尚书蒋廷钖（1669年—1732年）重新排校《古今图书集成》。此书于雍正四年（1726年）校成。