外车埕＝内车埕的工事用铁道也一併完工后，日月潭工事铁道正式营运。1927年，二水＝外车埕路段由台湾总督府收购改善，即后来的台铁集集线，外车埕＝内车埕约1.7哩（2.832公里）的铁道则在日月潭发电所工程完工后（1934年7月）拆除，原有路廊成为旧县道131号的路基。1934年，随着日月潭第一发电所的竣工，此工程线路拆除。仅保留原有四座隧道。1959年，八七水灾重创台湾中南部地区，导致门牌潭线与小埔线的不少路段毁损并最终停运。1985年，由于明湖水库、明潭水库的兴建，水位上涨导致一号、二号隧道