在运用生涯的后期，腓特烈·卡尔号安装了六挺，用以防御鱼雷艇，同期还安装有五具直径为350毫米的鱼雷发射管：其中两具置于舰艏、两具置于每边舷侧、一具置于舰艉左舷。它们均被安装在水线之上，合共配备12枚鱼雷。舰只配备有锻铁装甲，并背衬以厚柚木。其水线装甲带由114毫米厚的铁板和254毫米厚的柚木组成。装甲带上方是一层厚度与装甲带相同的铁质，但柚木厚度为260毫米，用于保护中央炮台。炮台顶部为9毫米厚的铁板，目的是挡开从舰只一侧掠过的炮弹或爆炸碎片。司令塔也受到114毫米厚的装甲保护，这是安装在400毫米