抑制了ATP合酶，质子就不能回流到线粒体内​​。结果，质子泵就无法工作，因为梯度差太大以至于无法克服。然后，NADH不再被氧化，而因为NAD浓度低于酶可用的浓度，三羧酸循环也随之停止运转。并非所有的氧化磷酸化抑制剂都是毒物。在棕色脂肪组织里，称为解偶联蛋白的调节性质子通道可将唿吸作用与ATP合成解耦。它能使唿吸作用快速产生热量，对冬眠动物和幼年哺乳动物来说，这对维持体温尤为重要，虽然这些蛋白质可能在细胞的应激反应中有更一般化的功能。
历史.对氧化磷酸化的研究起源于阿瑟·哈登19