立修章工作小组，启动对大学章程的修订工作，实现大学步向现代化和国际化，并于2006年通过新大学章程。修章带来的学术自由和行政弹性加速了大学日后发展步伐。2006年也是澳门大学建校25週年校庆，澳门邮政特于9月28日发行了纪念邮票，小型张的图案为行政楼和澳门总督韦奇立赠予澳大的毕业生铜像。2007年2月，葡萄牙总理若瑟·苏格拉底到访澳门大学。
澳门大学新校区时期.2009年，中国国务院将珠海市横琴岛东部，横琴口岸南面，与路凼城一河之隔的一幅约一平方公里土地租借给澳门特别行政区作为兴建