为各重要基础设施提供风险评估，测验其保安漏洞，并且度身订造保护计划，以及协调相关机构改善，以不断地加强防范恐怖袭击。此外，亦为各机构提供顾问建议及培训服务。有关重要基础设施涵盖反恐特勤队日常负责反恐巡逻的逾400个目标单位，包括各香港地标建筑物、领事馆、医院、大型公共运输系统、水塘、电厂、煤气库、银行及电讯体系等等。
组织.重要基础设施保安协调中心由一名高级警司出任主管，由两名警司出任副主管，编制为60名人员，包括3名总督察、18名高级督察、18名督察、18名警长和18名警员。