自闭症等疾病产生了争论。2010年2月英国《柳叶刀》医学週刊正式废除在1998年对于这种疫苗对于自闭症的报导。此学说首次提出，是在1998年2月出刊的《柳叶刀》刊出由为首的研究，表示自闭症可能和麻腮风三联疫苗有关。但此研究有人批评可信性成疑，因为有利益冲突。2005年10月，考科蓝协作网总结了31项有关自闭症和麻腮风三联疫苗的研究，未有证据证明麻腮风三联疫苗与自闭症有关。1998年由吉尔伯格领导的研究，分析瑞典由1975至1984年的数据，发现加入麻腮风三联疫苗于防疫计划之前和之后，自闭症的发病率没