在化学中，质子化是原子、分子或离子获得质子（H）的过程。简单的可以理解为和质子化合， 即结合一个质子，一般都是该物质有孤对电子，所以可以通过配位键结合一个质子。如HO变成HO，NH变成NH等等。质子化的逆过程是去质子化。质子化可能是最基本的化学反应，是很多化学计量和催化过程中的一步。一些多元离子和原子可以进行多次质子化，例如很多生物高分子。基底经过质子化后，其中每一种粒子的质量和电荷都增加了一个单位。分子质子化或去质子化后，很多化学性质都发生了改变，不仅限于电荷和质量，如亲水性、还原势、光学特性