因此在战争期间为增强运输能力而设置别线，让特急列车及货物列车使用。在此路段的新垂井站，因下行线的列车不会停站而有名，1986年车站被停止使用。垂井站停车是普通电车由旧下行线前进，特急及货物列车从山麓之下行驶。再向前一点就是关原站。从此至醒井间可看到伊吹山。越过关原后，是东海道本线之中路况最坏的路段，这里是暴雪地区之一。此外，大垣至米原之间是县境边界，是连接东海与关西两大日本经济领域的地区，当地交通流动量较少，因此列车的车卡较少。通过伊吹山背后即进入近江盆地的田园地带，到达JR西日本营运地区的边境车站