（后黎朝永祚四年、日本元和八年）再到广南国，她亦没有随行。日本锁国后，她与丈夫、女儿居住在长崎，其夫于1636年（日本宽永十三年，后黎朝阳和二年）农历十一月初七于家中逝世，而阮氏玉华仍继续于长崎生活，直至1645年（越南后黎朝福泰三年、莫朝顺德八年；日本正保二年）逝世，在日本生活了26年。她和丈夫合葬于长崎后山墓地。
相关文化及纪念.阮氏玉华在越南及日本皆被视为越日友好的象征，两地皆有以她为题材的文化及纪念。在越南会安市有一条街道名为公女玉华街（），是以阮氏玉华命名。2014年