。磷酸核糖焦磷酸负责在下列反应中作为磷酸核糖基团的供体：在嘌呤核苷酸的从头合成中，磷酸核糖焦磷酸受到谷氨酰胺：磷酸核糖焦磷酸氨基转移酶的催化，转变为磷酸核糖胺。
PRPP的增加.体内PRPP的增加会导致尿酸累积，导致高尿酸血症和高尿酸尿症。严重者可能导致痛风。体内次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核苷转移酶（HGPRT）的降低会导致PRPP在身体中累积，称为莱希-尼亨症候群，因为HGPRT会将PRPP回收以制造嘌呤。