大利（1998年）、以色列（1998）都有小规模爆发。特别是1998年在以色列发生过对鹅和鹳致命的爆发，是唯一的黄病毒对禽类有致死作用的感染。1999年夏天，纽约市十分炎热。城市周围开始有大量乌鸦死亡，长岛的东端已经开始有不寻常的马脑炎的爆发，布朗克斯动物园的智利火烈鸟和雪鸮的生病和死亡。皇后区人群中出现脑炎爆发。公共卫生应对疫情不能等待病毒分离验证的结果，纽约市市长指示积极的多方位的在皇后区干预公共卫生。美国网球公开赛上分配驱蚊药和卡车空中喷洒杀蚊药。但之后新的病例陆续于布鲁克林、布朗克斯和曼哈顿出现