化支。玛君颅龙（"Majungatholus"）一度被认为是厚头龙类，现在被认为属于兽脚亚目阿贝力龙科，是玛君龙的一个标本。雅尔龙（"Yaverlandia"）起初也被认为是厚头龙科，最近在苏利文的2006年研究中，也被重新归类于兽脚亚目虚骨龙类。而个体发生学与性状使得厚头龙亚目的分类更加困难。常被认为是最原始厚头龙类的狭盘龙，被苏利文认为无法鑑定，而归类于鸟臀目的未定位属。在2007年，有研究人员提出龙王龙与冥河龙可能是厚头龙的未成年体。在2009年，另一个研究则也提出龙王龙、冥河龙、厚头龙是同一物种