结构得到改善。协调世界时9月13日中午12点，美国国家飓风中心将系统归类为第十三号热带低气压并开始发布公告，表明该天气系统中已经有足够多层次分明的环流。风切变这时已基本消失，气旋所处海域水温也比较高，这些因素都有利于强化，只是其位置距陆地较近，还受到热带辐合带的影响，这两项因素对热带气旋发展不利。经过短短数小时的发展，低气压快速增强成热带风暴并获名“曼努埃尔”（）。到了9月14日清晨，气旋内已随雨带增长而发展出眼状特征。曼努埃尔位于东太平洋延伸到墨西哥的大规模天气系统内，坎佩切湾内的飓风英格丽德也在其中