从无线电得悉第一波机队正在攻击美军航母，却不知道战果。山本五十六在12时20分终于打破无线电缄默，下令暂缓佔领中途岛和阿留申基斯卡岛，并调派近藤信竹的战舰、栗田健男的巡洋舰和瑞凤号航母支援南云忠一水面作战。山本五十六也下令角田觉治尽快率领第4航空战队（龙骧号和隼鹰号）由阿留申海域南下增援。下午1时，山口多闻从下属审问约克镇号一名俘虏，才终于得悉美军有三艘航母参战。不久，苍龙号的彗星试作机返回飞龙号并投下信息，确认美军共有两个航母编队。这促使南云忠一再下令派出侦察机索敌，而友永丈市则在1时30分率领飞龙号第二