部教会』与『北部教会』之区别，分别由英国长老教会与加拿大教会派遣宣教师，但均属于英国苏格兰长老教会系统，1951年合併，但至今仍有北部大会(虚级化)。
社会公益事业.台湾基督长老教会共辖有26个公益事业机构，其中淡江中学、真理大学、马偕医护管理专科学校、马偕医学院、台湾神学院由北部大会掌理，其余事业机构由总会管理。
教育.长老教会注重教育，有神学院、中学、女学、妇学、主日学。在南部创办长荣大学、长荣中学、长荣女中，在北部办淡江中学、真理大学、马偕医护管