琴科攻入在切尔西的首粒英格兰足总杯进球。舍甫琴科在2006-07赛季欧冠对阵波尔图和瓦伦西亚的比赛中均扳平进球，以及足总杯对阵伦敦劲旅托特纳姆热刺的进球，帮助球队晋级半决赛。舍甫琴科的2006-07赛季因为伤病和疝气手术而被缩短。但在2007年联赛杯中，舍甫琴科仍然在4场比赛中打进3球，帮助切尔西最终击败阿森纳赢得2007年联赛杯冠军，在切尔西的首个赛季舍甫琴科共为切尔西出场51次攻入14球10助攻，杯赛11场7球，欧冠10场3球，联赛30场1807分钟4球7助，并帮助球队获得英格兰联赛杯冠军，英超