一个站厅。站厅联通1号和2号口，设有无障碍电梯通往站台和地面，和两对通向站台的楼梯，站厅内均设有自动售票处、服务中心、安检和进出站闸机和一个卫生间。
站台.长江南路站设有两个侧式站台，为3号线使用。其中西侧站台为3号线列车往上海南站站方向列车使用；东侧站台为3号线列车往江杨北路站方向列车使用。每个站台均设有半高屏蔽门和候车座椅，并有2个楼梯通往站厅层，其中站台中部设有无障碍电梯通往站厅。长江南路站是上海轨道交通3号线小交路列车终点站，车站北侧设有折返线供3号线小交路列车折返。