。这称为移生（colonization）。大多数人不容易受到感染。那些免疫系统受损，或减弱的人，就成为慢性或持续感染的易感个体。免疫系统受到抑制的人特别容易受到机会性感染的侵害。病原体通过宿主的进入身体，这些界面通常就是口腔、鼻子、眼睛、生殖器、肛门等身体孔口上的粘膜，或者微生物也可透过开放性伤口进入身体。有少数微生物可在进入人体的初始位置上生长，但许多生物会迁移，并在不同器官中引起器官系统的感染。一些病原体在宿主细胞内（胞内）生长，而其他病原体则在体液中自由生长。伤口移生是指伤口之内尚未有复制的微生物，