居龟兹建龟兹回鹘。11世纪末，被高昌回鹘吞并。其中前两支定居天山山脉南北的回纥，据称成为今天的维吾尔族祖先的一部分。回鹘亡国后，仍有大量回鹘人停留在漠北，辽国置回鹘国单于府管辖，这些回鹘人融入其他突厥语族部落。
语言文字.鄂尔浑河流域的古突厥文石碑，有一部分由回纥人刻成。石碑使用突厥文，属突厥语族。回纥人原使用突厥文 ，西迁之后改为採用粟特文字母拼写自己的回纥语，学界称之为回鹘文，也有学者认为回鹘文字母是源自景教徒的叙利亚文。回鹘文是回鹘式蒙古文和满文的始祖。