着《猪笼草属（猪笼草科）的框架性修订》和2001年的专着《猪笼草科》中确认了3个杂交种。这三个类群通常被视为自然杂交种，而不是物种。其中，因基纳巴卢山猪笼草自我维持的种群独立于其假定的亲本，所以将其提升为物种的观点最为强烈。朱马特·哈吉·亚当和克里斯托弗·C·威尔科克在1998年的文章中即主张将基纳巴卢山猪笼草视为独立物种。
已灭绝物种.最初被归入茅膏菜石属的部分花粉化石被数位学者初步放置于猪笼草属内。以下三个物种于1985年由维尔弗雷德归入猪笼草属。大茅膏菜石和小茅膏菜石被部