时期（1683－1895年）的1684年（康熙23年），当时首任诸罗知县季麒光在其着作《台湾杂记》中有提到日月潭，但由文辞上看来，显然仅止于记述传闻，并未身临其境。该地区正式纳入管辖，首见于1694年（康熙32年）出版的高拱干补纂《台湾府志》：「（诸罗县下辖）木武郡赤嘴社、水沙连思麻丹社、麻咄目靠社、挽鳞倒咯社、狎里禅恋蛮社、干那雾社。」其中的思麻丹社，即指位于今日月潭畔水社的原住民邵族聚落。到了1697年（康熙36年）郁永河游历台湾时，更已记载水沙连地区缴纳贡赋，并提到了日月潭中的珠屿（今拉鲁岛）。