干线增加列车连结行驶的班次。由于当时东北新干线的列车最长为16辆车厢（2012年起增加至17辆车厢），12辆编组的E1系未能与其他列车连结行驶，因而被转往上越新干线继续服务。现时所有E1系列车均已被转配到新潟新干线车辆中心，主要服务「Max朱鹭」和「Max谷川」号（）班次。而东北新干线的高运量列车空缺则由8辆编组的E4系取代。在2012年9月29日，JR东日本重编所管辖的新干线运行时间表及採用列车，E1系也在同一时间退役。