先天二年（713年），加金紫光禄大夫，复任兵部尚书，同中书门下三品（拜相），秋七月，太子李隆基率羽林军诛杀太平公主一党，睿宗登承天门察看，诸宰相中只郭元振一人陪同睿宗左右，玄宗即位后，元振宿卫中书省十四日，独知政事，被进封为代国公，食实封四百户。又兼御史大夫、天下行军大元帅。玄宗于骊山讲武，大阅军操，征兵至一百万，号三百万，由郭元振指挥。当天三令（三令五申）之后，玄宗要亲自击鼓，郭元振怕有大变，省略对玄宗行礼。玄宗大怒，引坐纛下，几乎宣敕处斩，经刘幽求、张说等人说情，乃斩给事中、知礼仪事唐绍，流放元振