也划归海崃殖民地总督管辖。在第二次世界大战期间，除科科斯群岛外，海崃殖民地所有领土全为日军佔领。至战后，海崃殖民地一度成立军政府，而海崃殖民地总督一职名义上继续存在，惟未几到1946年，海崃殖民地为英政府解散，总督之职遂随之废置。海崃殖民地总督废置后，新加坡置星洲总督一职，并成为独立的皇室殖民地，同时管辖科科斯群岛和圣诞岛。而槟城与马六甲则与马来亚联盟的九个州合组为马来联邦，纳闽则划归英属北婆罗洲。