又相继为宋、齐、梁、陈四朝所统治，此之谓六朝。六朝期间大量中原汉人贵族和士大夫南迁，其中吴兴郡和会稽郡人口都增加一倍。会稽、吴兴（今湖州）与吴郡并列“三吴”，是六朝膏腴之地，以三吴为中心经济、文化繁荣。
隋唐五代.公元589年，陈朝为隋朝所灭，浙江地区再次为大一统王朝统治。南朝虽然已经灭亡，但南北分治已久，南方士族对北朝统治多有抵触，隋文帝严酷镇压了南方叛乱，甚至有记载称江南60万户人口中有30万人死亡。此后隋朝治江南多以怀柔。为控制江南，隋代修筑大运河直达浙江，创建杭州、嘉兴等州