村上水军是日本南北朝时代到室町・战国时代在濑户内海活动的水军（海贼众）。势力据点是以艺予诸岛为中心的海域，之后大致分成能岛村上家、来岛村上家、因岛村上家。代表的家纹是「丸内上文字」。
起源.村上三家也总称「三岛村上氏」，起源不明，但是可以确知原为一家。最有力的说法是《尊卑分脉》的记载，源自河内源氏之庶流信浓村上氏。平安时代活跃的村上为国之弟定国在保元之乱后，经由淡路岛在塩饱诸岛定居；平治之乱后的永历元年（1160年）移居越智大岛，成为伊予村上氏之祖。能岛村上氏的系图内，村上源氏的