：这是一种刻画有机体神经系统（尤其是脑和眼）的连接方式的完整线路图。由于这些结构极其复杂，高效筛选的神经成像和组织学方法被用于提高绘制神经连接线路图的速度、效率和精度。尽管连接组学的主要研究对象是大脑，但其他任何神经连接也可由连接组学的方法测绘，例如神经肌肉接点（neuromuscular junctions）。
工具.在宏观层面上用于连通组学研究的主要工具之一是扩散MRI。 微观级别的连通组学研究的主要工具是化学脑保存，然后是3D电子显微镜，用于神经回路重建。 将荧光与3D电子显