守朝廷法令而不为任何人徇私的原则和决心，坚持要将犯罪者受应得的刑罚。明帝知道后都对他表示支持。司马芝任官十一年，多次指出律令的不足之处；而在各臣之间亦遵从正道行事。太和五年（231年）冬，诸王到洛阳朝觐，司马芝与洛阳的人相交，后因而免职。及后任大司农。当时典农各部的吏民都自谋生计亦求增加收入，司马芝于是上书要求魏明帝曹叡重视农业，增加国家谷物的储备，有利于增强国家实力和国家日后统一；同时压抑官吏们自谋生计的风气，让他们可以专心于农务。司马芝后来在任内逝世，死时家无余财。自曹魏建立后，多任河南尹中