台南县长.1973年高育仁当选台南县县长，在台南县长任内，由于高育仁协调能力，因此县府与议会关系良好。任内县府预算都获县议会支持，也受到中央高层注目。
中央仕途.1976年7月9日，高育仁获内政部长张丰绪延揽为内政部常务次长。1978年转任中国国民党中央委员会秘书处主任。1978年省政府改组时，由主席林洋港调任为省府委员兼民政厅厅长。1981年，高育仁回台南县参选第七届台湾省议员，在国民党辅选下于12月当选省议员。并且当选台湾省议会第七届议长。在议长