疾病可以发展得很快。在免疫系统受损的病人身上，会罕有的出现扩散性的感染及菌血症。
诊断.一般现时就海洋分枝桿菌的感染都会被延误，原因是感染的罕有性及未能即时想起与海水接触的经验。一般的误诊包括有真菌及寄生虫的感染、皮结核、类风湿性关节炎、异物反应及皮肤肿瘤。对于海洋分枝桿菌感染的诊断需要高度的怀疑及完整的历史协助。长时间延误诊断可以导致严重及破坏性的感染。在主要的隔离下，海洋分枝桿菌会在30-33℃的培养基中生长7-21日。不像肺结核菌，大部份海洋分枝桿菌的菌株并不会在37℃中生长