仑战争而统治短暂中断，1815年莱茵-普法尔茨的一部分回到了维特尔斯巴赫家族手中，并入已于1806年被拿破仑升格为王国的巴伐利亚。1253年，路易一世的独子鄂图二世去世，他的儿子们将其领地一分为二：长子路德维希得到上巴伐利亚和莱茵-普法尔茨，史称路德维希二世；次子海因里希得到下巴伐利亚，史称海因里希十三世。由于这一分家安排不符合当时的律法，巴伐利亚的主教们与波西米亚国王奥托卡二世于1257年结盟反对。同年8月，奥托卡二世率军入侵巴伐利亚，但兄弟两人合作成功退敌。海因里希十三世的长子下巴伐利亚公爵奥托三世