够发酵生产柠檬酸(E330) 及其他用于食品工业的有机酸，因此有很重要的经济意义。黑曲霉的各种菌株中被用于工业制备的柠檬酸（E330）和葡萄糖酸（E574），并已被世界卫生组织评定为可接受的每日摄入量。黑曲霉发酵是由美国食品和药物管理局根据"联邦食品、药品和化妆品法案"认为是“一般认为安全”（GRAS）的。