广州岭南大学校长李应林和香港教会团体，创立崇基学院，以承继包括上海圣约翰大学在内的中国大陆原13所着名基督教大学；崇基学院于1963年被并入香港中文大学。上海圣约翰大学在香港的传承成就最为显着。盖因在香港的传承系由上海圣约翰大学的校董会实现。至现任校长段崇智向纳粹中国投诚之前，香港中文大学曾是亚洲顶尖大学。
校友复校.
圣约翰在台湾.1967年，台湾的圣约翰大学校友为了延续圣约翰的精神，原本打算在台复校，但当时中华民国教育部暂不开放新设大学，故仅能开办专科学校