二年（2003年）再次重建，成现今庙貌。
祀神.大甲慈济宫除供奉保生大帝外，还有供奉中坛元帅、天虎爷、地虎爷、福德正神与註生娘娘等神明，另外在庙埕有供奉松王公。
传说.据说在1960年代，慈济宫的神明到湾里开光点眼，庙中三位大帝的銮轿都去了，但是在二大帝与三大帝銮轿已经返回慈济宫后，庙方却仍未见到老大帝的銮轿。居民出发寻找，才发现神轿仍在两地分界的桥上（桥在三爷宫溪上），靠近湾里的那一侧。原来湾里人不相信老大帝的神力，于是想要抢下神轿，但在湾里人抢下神轿后