初将约塞米蒂山谷的主要地貌是由巨大的高山冰川所创建并将其理论化的一个。他竭力反对已确认的科学家们如，但那些科学家们认为缪尔只是个业余爱好者。然而，缪尔写下了有关约塞米蒂区域生物的科学论文。
增强的保护工作.过度放牧的草甸（尤其是羊）、巨型红杉的采伐以及其它损害导致了缪尔成了进一步保护约塞米蒂公园的倡议者。缪尔说服了杰出的客人们将该区域置于联邦保护的重要性；其中之一就是《》的编辑。缪尔和约翰逊对国会议员进行疏通活动而与1890年10月1日创建了约塞米蒂国家公园的条例。然而，加利福尼亚