派官员（己卯士祸）。多次士祸后，士林派退到农村，通过书院与乡约传播他们的理念。
朋党政治展开.宣祖即位后积极起用士林，勋旧派不再有影响力。由于官职数目与学派理念不同外加个人恩怨，士林遂分为不同的朋党。1575年士林派分裂为东人党（主理说）与西人党（主气説），事情缘起金孝元与沈义谦之间私怨，明宗时期，时任议政府舍人沈义谦拜会领议政尹元衡，在尹元衡女婿李肇敏指引下入书室，室内多有寝具，沈问及何人所寝。肇敏随问以对。其一则金孝元卧具，当时金孝元未登第，已有文名，沈心鄙之。后来金孝元状