2001年间还是有着很多敌对的情况。这种情况在1998年Eric S. Raymond发表《万圣节文件》的时候变得明显起来。这里由一位微软工程师写的关于寻求解决自由软件对微软的威胁的策略的文章。
SCO.2003年3月，SCO Group指责IBM把UNIX的代码移植到Linux侵犯了他们的版权。SCO声称它们拥有代码的版权并对IBM提起了诉讼。Red Hat又提起了反诉讼，因此SCO又提起了其他相关的诉讼。在这些诉讼进行的同时，SCO开始把Linux的许可权卖给那些不愿意冒受SC