16S rRNA的A位点结合而阻碍原核翻译。但由质粒介导的16S rRNA甲基化酶能将16S rRNA甲基化，从而导致细菌产生对该类抗生素较高的抗药性。
5S rRNA.基本上所有70S核糖体与80S核糖体（除了少数真菌、少数原生动物和少数较高级动物的线粒体核糖体）的大亚基中都含有5S rRNA。5S rRNA相对分子质量约为40 kDa，长度约为120 nt，分子中有5个螺旋。它在70S核糖体的50S核糖体亚基中与核糖体蛋白质L5、L18及L25结合。5S rRNA约60%的