西向快速公路与五条东西向高速公路互相连结，但这些东西向的高速与快速公路拥有各自的编号，并不属于国道三号的一部份。此外，2006年完工的北宜高速公路（国道五号）与国道三号在南港系统交流道相交，2009年完工的水沙连高速公路（国道六号）与国道三号在雾峰系统交流道相交。目前已计画将往南延伸至屏东枫港，以衔接南回公路及连络垦丁国家公园，可纾解恆春半岛地区假日严重的车潮，也可解决南横高计划搁置的问题，碍于由原本的终点林边开始修筑延伸线将会有通过人口稠密地区、用地取得较为困难的问题，因此延伸起点初步决定由竹田、