每年正月十三、十五等日，有喇嘛四百名唪诵雨露经道场，跳舞布札送祟之典，俗所谓打鬼者是也。民国十五年之后，因困经费停止。”1940年代，该寺仍为喇嘛庙，开展佛事活动。
人民共和国时期.1949年中华人民共和国成立后，西黄寺归北京市人民政府管辖。1952年，北京市人民政府对清净化城塔及清净化城塔院进行了大规模修缮。1954年，十世班禅出席第一届全国人民代表大会期间，亲赴西黄寺朝拜清净化城塔。1958年，东黄寺、西黄寺的逹赖喇嘛庙因破败而被拆除。自此西黄寺建筑仅剩下清净化城塔及清净化城塔