代后半叶，日本指定横须贺港、、吴港、佐世保港等四个港口为专用军港，并在各军港设有镇守府所办之，也是其海军舰队下辖航空队的母港和归属地。此外，大凑军港被指定为镇守府要港部下辖的「要港」（）之一，并在日美开战之前升格为，但没有部署。这五处军港在二战之后由海上自卫队接管，并以「舰船母港」为现今的主要机能。目前，横须贺和佐世保的两个港口均为驻日美军海军基地及其第七舰队在事实上的母港。位于日本本土以外的部份其它日军军港，包括台湾的马公、满州的旅顺以及朝鲜半岛釜山附近的镇海地区等要港，于1941年11月20日被升格