赵祖元（），字宗仁，浙江金华府东阳县人，民籍，明朝政治人物。
生平.浙江乡试第九十名举人。嘉靖二十三年（1544年）中式甲辰科会试第三十名，登第三甲第一百九十名进士。
家族.曾祖赵太锦，监生；祖父赵为濂；父赵继宋，母吴氏。