三藏教言：龙树菩萨于南印度南天铁塔面见金刚萨埵。金刚萨埵为龙树灌顶，并传授龙树源自大日如来的密教教法，尔后龙树菩萨再将密法传予之后的传法阿阇梨。此段经历亦出现在《大日经》。空海对于金刚萨埵的本源未有更进一步的描述。
藏传佛教.藏传佛教密法中，金刚萨埵承继了为金刚持尊者的五方佛，为第六金刚持尊者。金刚萨埵乃是心灵纯净的表征，为净化业障的本尊。在藏传佛教的四大传承（宁玛、噶举、格鲁、萨迦）皆修习金刚萨埵法门，为修习本尊法之前的四加行之一。此法门可净除业障，修补毁坏的三昧耶戒等戒律与誓言