系统.展区用一些实例展示了自地球形成以来，地球上水圈和岩石圈的变迁，以及有机自然和无机自然之间的复杂关系和相互影响。
矿物标本.矿物标本展厅保持了19世纪建馆时的原貌，参观者在这里可以欣赏到超过一千种矿石标本，其中包括亚历山大·冯·洪堡从俄罗斯搜集的珍贵矿石。
进化进行时.这个展区于2007年建成，着重介绍生物进化理论中，决定动植物性状、行为以及生物多样性的一些重要机制。具体的例子譬如为什么孔雀五彩斑斓的尾羽并不是为了飞行，以及为什么斑马有黑白相间的条纹。