1880年就由宫营幌内铁道开始启用的手稻车站，在刚设置时原名轻川，之间经过几次经营单位的更改与整併后，1952年正式改为现名，并一直沿用至今。1987年日本国铁分割民营化时，手稻车站的客运业务除了由JR北海道接收外，当时还有名义上存在的货运站业务是由日本货物铁道（JR货物）所承接，但实际上并没有任何货运列车的班次设定。2006年JR货物所属的货运站部分正式废站，无论是名义上还是实质上都成为客运专用的车站。
车站结构.2面4线岛式月台（2面的月台长：135m）的地面车站，设有跨站式站房