德清县）人。祖父沈僧畟，南朝梁时担任左民尚书。父沈巡，梁朝太清年间曾担任东阳太守。沈君理美风仪，博涉经史，有识鉴。早年担任湘东王法曹参军、会稽府西曹掾（祕书），娶会稽穆公主。一度出任吴郡太守。侯景平后，梁元帝征为少府卿。荆州陷，萧詧署金紫光禄大夫。陈文帝即位，历官明威将军、丹阳尹（市长）。天康元年（566年），父死，丁忧去职。陈宣帝时，担任太子詹事，迁吏部尚书。女沈婺华为陈宣帝皇太子陈叔宝的太子妃。赐沈君理爵望蔡县侯。太建五年九月癸未（573年10月31日）沈君理卒，赠太子少傅、翊左将军、开府仪同三司。