间和东京台湾青年会成员商讨后，将同盟会本部从台北改为东京，由林呈禄向东京的早稻田警察署申请建立成功。此举造成台湾总督府的不满，多名运动参与者在1923年12月16日遭大规模搜察、扣押和起诉，史称「治警事件」。最后蒋渭水、蔡培火、蔡惠如、林呈禄、石焕长、林幼春和陈逢源等6人遭判刑3到4个月不等。治警事件造成台湾民众的恐惧，事件发生后的第4回请愿和审判开始前的第5回请愿均导致签署人数大减。连同遭到初步压制的第3回，是运动的挫折期。不过，治警事件在日本被媒体报导后，台湾议会设置请愿运动反而受到媒体、官员、学者