其地纳入版图。顺治三年（1646年），江西局势渐稳，孙之獬应召还朝。总兵金声桓劾其擅自为副将高进库、刘一鹏加授总兵衔，孙之獬于十月被革职，永不叙用。
回乡身死.顺治四年（1647年），山东人谢迁举兵抗清，声势浩大。淄川知县刘修己因孙之獬知兵，请其协助城防。然而，当时清廷因惧怕民众叛乱，正在酝酿收缴民间弓矢枪械，虽然尚未下旨，淄川当地的武器已经先行收缴。孙之獬只能率众以木棍、竹竿还有扫墓用的镰刀御敌。六月十三日夜，城中内应垂下绳索，引民军入城，打开城门，淄川城破。孙之獬率家人