射入1球。其中在对阵勒沃库森和奥格斯堡的比赛中各射入一记点球。随后的三场比赛中，穆勒未能取得入球，甚至在第七轮对阵美因茨05时将点球射失。他随后的德甲入球发生于第八轮，在面对多特蒙德的比赛中梅开二度，其中之一为点球。穆勒的入球势头也延续到其它赛事：他在德国杯第二轮对阵沃尔夫斯堡的比赛中独中两元，以及在欧冠联赛分组赛中先后射入奥林匹亚科斯2球、阿森纳2球以及次回合的奥林匹亚科斯1球。在主场击败奥林匹亚科斯的比赛中取得入球后，穆勒成为赢得50场欧冠胜利的最年轻球员，比此前的纪录保持者-{zh-hans:利昂内尔