兰人向郑成功投降，递交降书后旋即退出台湾，台湾进入明郑时期。
郑氏治台时期.郑成功取得台湾后，荷兰亟思「光复福尔摩沙」，为此一度与清朝政府结为清荷联军。1663年10月间，荷兰舰队司令率领16艘战舰、2000名士兵，与清靖南王耿继茂、福建总督李率泰签定联兵攻郑协定。1663年11月清荷联军于金门与郑军遭遇，引发金厦海战，清荷联军攻下郑军所据的金门、厦门两岛，郑经退守铜山。然而清军不愿依约与荷兰攻下台湾。荷兰舰队司令一度转与郑经交涉，要求将台湾归还荷兰、释放被郑成功扣留的俘虏以及赔偿