瓦人曾在千岛群岛居住或探险。他们将千岛群岛叫做Manitouana，意为精神花园。1812年战争时，千岛群岛也是美英双方的战场之一，许多岛屿至今还保留着战争时期的堡垒和遗迹，如惠灵顿堡。19世纪末期至20世纪初期，这里开始成为富人的避暑圣地，许多来自美国大城市的富商在此购买岛屿并建造度假住宅和别墅，其中最有名的是商人乔治·博尔特（George Boldt）在心岛为妻子建造的在博尔特城堡。千岛群岛一直是休闲游艇的中心，许多游客乘坐游艇游览千岛群岛，此地也承办了很多游艇比赛。