，设有3台7线，包括2条通过线、5条到发线、2个岛式月台和1个侧式月台。衢州站原设有两个货场。业务货场位于农贸城东侧的农市路122号，现车站的东北侧、老衢州火车站东侧，办理整车、集装箱发到业务，并设有专用线通往中央储备粮衢州直属库、顺昌粮食以及空军衢州机场的专用线。作为衢宁铁路工程的一部分，衢州机场专用线（粮食专用线）改由衢州东站接轨，于2020年5月19日启用。巨化货场位于目前车站的西南侧，通过专用线连接，由巨化集团运输分公司营运并为该集团服务。巨化货场主要到发煤、化工、粮食、化肥、非矿等类型的货