椎有明显、柱状的中后椎骨关节突骨板，中段颈部的神经棘明显的向前倾斜，而棘尖超过椎体的前端，第1至6前背椎的神经棘有垂直的基部及往前倾斜的前端。根据27个蜥脚下目及154个解剖学特征的亲缘分支分类法研究，奥利佛·劳赫将短颈潘龙分类在叉龙科之中，而且与晚侏罗纪非洲的叉龙是姊妹分类单元，而非白垩纪早期南美洲的阿马加龙。这明显是一种迅速的演化扩散，显示叉龙科在侏罗纪中期因南半球及北半球大洲的分裂而散佈。