治十三年（1500年），嘉靖十四年（1535年）成进士，授浙江慈谿县知县，改江西九江府儒学教授，累迁南京考功郎中，主管京察。大学士严嵩曾为给事中王晔所劾，怀恨在心，托尚宝司丞诸杰写信给应旂，令其将王晔落职。薛应旂反而罢黜诸杰，严嵩大怒。此后，应旂又罢黜常州府知府符验，严嵩令御史桂荣劾其挟私报复家乡郡守，谪建昌府通判。严嵩失势后复起，官至浙江提学副使。以大计罢归。无钖顾宪成兄弟年少，从其求学。万历二年（1574年）卒。长子薛近鲁之子薛敷政、薛敷教；四子薛近兖均成进士。
着作.应旂雅工