五七干校劳动改造，1971年因时任中国科学院院长郭沫若计划修改《中国史稿》被调回北京。1974年，李学勤开始参与新出土马王堆帛书的整理，1975年被借调到国家文物局。1976年，参与整理睡虎地秦墓竹简。1977年5月，中国科学院哲学社会科学部独立为中国社会科学院，历史研究所属之。1978年，李学勤返回历史研究所，任先秦研究室主任。1985年至1988年，任中国社会科学院历史研究所副所长。1991年至1998年，任中国科学院历史研究所所长。1995年12月，李学勤任国家“九五”科技攻关重点项目“夏商周断代