绿色专线小巴行走人口较少的住宅区。除沙田马场、大围、大埔公路、沙田路、狮子山隧道公路及狮子山隧道外，沙田新市镇均禁止红色小巴行驶。另外，新界的士亦不能在香港中文大学以外沙田新市镇区域载客。
九广铁路（港铁）.九广铁路（营运已与香港地铁合併为港铁）对于新市镇的发展至为重要。新市镇共有五个东铁线车站，即大围、沙田、火炭、马场和大学站。屯马线一期（前称马鞍山线）显径至乌溪沙均位于沙田区内，连接启德及马鞍山乌溪沙（利安邨东北面），全长约17公里，全程共有十二个车站及一个维修中心，这条铁路于