人从水路取道上海转赴南北各地，十六铺码头成为“温州人的桥头堡……几乎每个闯江湖的温州人都有在这里排队买轮船票的经历。”此后，上海港的水路客运受到公路、铁路和航空强有力的竞争，迅速衰落。十六铺客运码头沿用到2003年9月，此后剩余的少数客运线路迁移到吴淞口的上海港客运中心。2004年12月，十六铺客运码头被拆除，预计将改建成水上旅游集散中心。十六铺街区也被夷平新建。