毒（HIV）感染时，如T细胞般，巨噬细胞也会受到感染，更在身体之中被变成持续复制的病毒的仓库。再者，巨噬细胞亦被相信它会帮助癌细胞增生。它们会被吸引到缺氧（低氧）的肿瘤细胞附近并促进慢性炎症。巨噬细胞会释出致炎物质如肿瘤坏死因子（TNF）从而活化NF-κB的基因。其后，NF-κB会进入肿瘤细胞核并启动多种可以停止细胞凋亡及促进细胞增生及发炎的蛋白质的产生。
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