依林顶着压力艰难维持外贸工作。1977年3月，姚依林任国务院财贸领导小组组长。1978年8月，任商业部部长、党组书记。任内组织开展揭批“四人帮”的斗争，清除“四人帮”影响，平反冤假错案，落实干部政策。姚依林积极支持并投入真理标准问题讨论，反对党主席华国锋的“两个凡是”。中共十一届三中全会后，姚依林任中共中央副秘书长、中共中央办公厅主任。1979年3月，中央决定设国务院财政经济委员会，姚依林任秘书长，任内协助副总理陈云、李先念纠正前两年经济工作中的失误，清理“左”倾错误影响，为调整国民经济做了许多工作