01年（日治明治三十四年）11月，全台设二十厅，该庄隶属于新竹厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄隶属不变。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「上公馆」大字，隶属于新竹州竹东郡竹东街。战后竹东街改制为竹东镇，隶属于新竹县，大字亦改制为里。1950年桃、竹、苗分治，竹东镇隶属不变。
交通.省道台3线俗称「内山公路」，是台北至屏东的内陆纵贯干道，大致以东南—西北走向转东北东—西南西走向再转东北—西南走向蜿蜒经过上公馆地区，向东可经下公