人民共和国成立后，1951年柳亚子在所作的《费韦斋集》序文中还写有“香曾复以在重庆签名民主运动，为蒋逆党羽所劫持，存亡未卜”。直到后来经过调查，才发现费巩遭秘密绑架后，不久便已在渣滓洞遭到秘密杀害。
纪念.1978年9月，上海市革命委员会追认费巩为革命烈士。1980年3月16日，上海龙华烈士陵园举行了怀念会暨费巩衣冠盒安放仪式。1997年浙江大学建校100周年时，该校在校园内建了“费巩亭”。 2001年11月1日，费巩的子女将其全部遗物捐给上海龙华烈士陵园纪念馆，其中费巩全套日记共