1985年8月退居二线后，萧全夫继续深入各地调查研究，写出了许多调查报告和文章。1988年7月，获得一级红星荣誉功勋章。萧全夫最后一次病重住院后不久，写下遗嘱，要求在逝世后，从其积蓄中拿出5万元人民币，其中2万元交给中共党组织作为党费，3万元捐给家乡的希望工程。2005年2月4日，萧全夫在北京病逝，享年89岁。
着作.萧全夫写过许多回忆文章，主要有：