少卿兼侍讲学士、到吏部左侍郎。与当时的礼部刘健、兵部谢迁交恶，因此深结阉宦以自固。后来明武宗登位，便与刘瑾合作，逐走刘健、谢迁。
正德朝.正德改元，焦芳依附刘瑾，言必称千岁，并且自称曰门下。《明史》之中列为阉党，有恶誉。与其子焦黄中(正德三年戊辰科进士)同把吏部，掌握官员升迁大权。正德元年（1506年）为吏部尚书兼文渊阁大学士、加太子太保武英殿大学士。正德二年（1507年）晋少傅兼太子太傅谨身殿大学士，正德四年（1509年）晋少师兼太子太师华盖殿大学士，虽为次辅，实却高于首辅李东阳