石佛山下合击，大败朱瑾军，朱瑾逃回兖州，朱友裕放弃不追。干宁四年（897年）朱瑾从兄天平节度使朱瑄被朱温所杀，朱瑾出城求粮时，其子朱用贞和大将康怀贞以兖州降朱温，朱瑾奔海州，刺史尹处宾不纳，又奔沂州，为朱温追兵所逼，遂与沂州刺史朱用芝等与河东节度使李克用派出支援朱瑄及朱瑾的将领史俨、李承嗣逃奔杨行密，杨行密任命朱瑾为行营副都统、平卢军节度使、同中书门下平章事。朱温军抓到朱瑾妻孥，送往郓城。瑾妻饶有姿色，朱温想佔为己有，为朱妻张氏所阻，入寺为尼。朱瑾后续娶陶雅女。杨行密死后，杨隆演继位，以瑾为同平章事