汉（后改名为汉口）、广州（后降为省辖市，抗战胜利后再升格）、西京（后降为省辖市，抗战胜利后改称西安并再升格）、重庆（抗战时期设置）等9个特别市（即直辖市）。1945年后，国民政府将东三省划分成九省，增设辽北、安东、合江、松江、嫩江、兴安等6省及沈阳、大连、哈尔滨等3个直辖市。抗战胜利后，中华民国政府接收台湾和澎湖，台湾成为行省之一。并将海南岛及南海诸岛设立海南特别行政区，作为建省之准备。截至中华民国政府于1949年底撤退至台湾前，中华民国全国设35个省、12个直辖市、2个地方、和1个特别行政区。