。根据教宗诏书，圣雅纳略皇家小堂并不属于教区管辖，而是属于那不勒斯市，由一个古老的机构代表，这个机构今天仍然存在，代表从那不勒斯的各区选出。在17和18世纪，教堂也被用于音乐活动，多米尼科·奇马罗萨、乔万尼·帕伊谢洛、弗朗西斯科·杜兰特、亚历山德罗·斯卡拉蒂和查尔斯·布罗斯基等大师都曾来此献技。
绘画.选择和安排绘画是一个传奇故事，其中涉及17世纪初罗马和那不勒斯的许多顶级画家。负责建造和装饰小堂的代表最初将小堂的绘画委托给朱塞佩·切萨里，克勉八世和保禄五世两位教宗在位期间