，教宗册封一百二十位中华殉道圣人庆典，政府组织各地教会大事负面宣扬和反对封圣活动，李笃安主教依然坚强的拒绝参加反封圣运动和会议。此后他被政府官员盘问，批评和教育，并禁止他邀请外籍和港澳台教授来陕西神哲学院授课。教宗本笃十六世特邀李笃安主教，上海金鲁贤主教，凤翔李镜峰主教和齐齐哈尔魏景仪主教参加2005年十月在罗马的世界主教会议，但因政府阻挠四人都未能前往。2005年十一月已重病住院的李笃安主教得知曾因政府侵占的教产即西安南堂隔壁的五星街小学，本应在另迁至新址时归还教会地产，而政府官员伙同小学领导