座部佛教教义，尤其是斯大林主义和毛泽东思想的影响，形成了自身独特的一套意识形态。该组织认为高棉人是高贵的种族，声称自己是“吴哥儿女”，宣扬柬埔寨自身固有的伟大，不断重申吴哥的辉煌历史。红色高棉对一些异族人进行有计划地屠杀，尤其是针对越南人和泰国人，越南与泰国在历史上长期被柬埔寨视为敌人。宗教方面，红色高棉奉行国家无神论政策，对天主教徒、基督徒、佛教徒、穆斯林进行广泛的镇压。与同时期其他共产党不同的是，柬共反对个人崇拜，他们认为英雄的生命短暂，但“革命组织”可以永葆生机。红色高棉在组织内部强调自我纯化，不