文澜阁馆藏清代《四库全书》和浙江省立图书馆的大量历代珍贵图书危在旦夕，急需抢运迁移免落入日寇之手。陈训慈主持将文澜阁馆藏《四库全书》抢运出杭州城，运抵富阳县，不久富阳危在旦夕，又不辞万水千山，将《四库全书》运到抗战后方的贵州省贵阳市。当时着名的宁波天一阁藏书楼有大量历代图书（9000多册），亦受日寇及战火的极大威胁。陈训慈日夜赶工，主持将天一阁馆藏抢运到浙江省南部的龙泉县。抗日战争胜利以后，陈训慈又主持将这些图书文物悉数转运回杭州和宁波。今日，在浙江图书馆古籍部能看到保存完好的清代文澜阁《四库全书》