书院接受香港政府提出的「二二一」学制建议，获香港政府批准註册为专上学院，并由港府提供资助，岭南书院改名为「岭南学院」。1991年，岭南学院通过香港学术评审局评审，获大学及理工教育资助委员会资助，开办资助学士学位课程。1995年，岭南学院迁入在屯门虎地的前船民禁闭营地皮兴建的新校舍，并于1999年升格为岭南大学。岭南大学虽然在1999年成为法定大学，政府在大学的行政具有主导权，但岭南教育机构仍按《岭南大学条例》，在岭大校董会中佔一定席位，并在谘议会中佔多数席位。在岭南大学现有架构中，岭南教育机构在