，甘利不顾山崎派支持福田的方针，声明在自民党总裁选举支持处于劣势的麻生，还因此申请退出山崎派，但没有被受理。福田顺利当选后，甘利留任经产相。2008年福田辞职后的自民党总裁选举，甘利是麻生的推荐人之一。麻生内阁成立后，甘利担任内阁府特命担当大臣（规制改革担当），兼任行政改革、公务员制度改革担当。2009年大选，自民党大败下台。2011年6月成立跨派阀的政策团体「最高日本」，有批评指这是事实上的「甘利派」。同年11月，被起用为 自民党经济·财政·金融政策调查会长。2012年9月举行的自民党总裁选举