最大股东中华航空事业发展基金会（航发会）于6月决定了董事会改组名单，只有董事长蒋洪彝获得留任，其余由各界领域人士担任；在此同时，确立了政府对航发会的主导权及华航未来的释股计画，以进行华航的整体改造。1998年5月25日，航空器飞航安全委员会（今国家运输安全调查委员会）成立。在本次的事故之后，该时段由峇里机场飞往中正国际机场（今台湾桃园国际机场）的航班班号改为「688」。失事现场于2002年，由前大园乡长的次子（亦为空难地面罹难者家属之一）陈义丰将其重建后予以改建为一家露天景观咖啡店「奇迹咖飞场」。