2016–17年香港足总盃初级组是第 4 届香港足总盃初级组的足球赛事，一共 40 队于甲组联赛、乙组联赛及丙组联赛角逐的球队会参与赛事。第一圈赛事于2016年12月11日进行，决赛则于2017年1月22日进行。
赛制.初级组赛事是由甲组、乙组及丙组球队参赛，整个初级组赛事是以单场淘汰赛形式进，假如双方于法定 90 分钟内赛和，不会进行加时赛，而会直接以互射十二码方式来决胜负。本届初级组赛事前三名球队，不再设晋身香港足总盃的资格。
参赛球队.2016–17