逐步主控南方重建，激进派共和党人积极保障不论肤色所有男子的选举权和公民权利，格里利整体认可国会政策。1866年格里利竞选联邦众议员遭遇惨败，1867年初竞选联邦参议员又输给罗斯科·康克林（）。总统与国会开战，格里利坚定支持国会。1868年3月国会弹劾约翰逊，格里利与《纽约论坛报》强烈要求解除总统职务，谴责约翰逊是“国家大嘴里酸痛的牙齿，拥挤教室中尖叫的巨婴”，宣称“他不滚蛋就永无宁日”。参议院最后裁定罪名不成立，令格里利深感失望。同年格里利一度争取共和党州长候选人提名，但在康克林势力阻挡下无法如愿。格里