之乱也造成了四川人被杀害，因此当时四川布政使司的治所曾迁往保宁府阆中。顺治十五年（1658年）之后，清廷实施“湖广填四川”，成都逐渐恢复生机，省会也又迁回成都。清沿明制，设四川布政使司于成都。皇帝另简派四川总督、成都将军驻成都。同治二年（1863年），太平天国将领翼王石达开率兵攻入四川，在攻打成都时遭到失败，后来清军诱俘之，在成都城内科甲巷将其凌迟处死。光绪三年（1877年），四川总督丁宝祯创办四川机械局，是成都城市经济近代化因素出现的标志。1895年五月初五，成都爆发“成都教案”，成都民众因受谣言影响对洋