岛屿如弹丸礁主张拥有主权，但海域疆界依然有待继续协商。马来西亚是唯一在亚洲大陆与马来群岛都拥有领土的国家，位于柔佛州南部笨珍县的丹绒比艾是亚洲大陆的最南端。马六甲海崃位于苏门答腊与马来西亚半岛中间，是来往东西方的海运渠道。马来西亚大部分的沿海地区都是平原，中部则是布满茂密热带雨林的高原。西马约佔全国陆地面积40%，从北到南延伸740公里，最宽的部份是322公里东西海岸地区是由蒂迪旺沙山脉所区隔，。这是属于半岛中心地带的一系列山脉的一部份。这座山脉也是马来西亚半岛某些河流的源头，其中计有彭亨河和吉兰丹河。