956年6月17日，美国空军正式赋予F-102B新编号：F-106。一方面是以为空军认为F-102B已经是脱胎换骨的新设计，另一方面也是希望在行政上不要被F-102项目所干扰。1956年12月26日，第1架YF-106A（之前的F-102B）在爱德华兹空军基地进行了首飞。试飞员是康维尔公司的试飞员理查德·约翰逊。这次试飞受到了很多故障的影响，没有达到预期目标。第2架YF-106在1957年2月26日交机，2号机的电子设备较1号机完整，但2架原型机在测评时仍旧出现极速不达标和加速性差的问题。尤其是后者，严