、来鹤轩等；在大门外东西两侧各有一座牌坊，大门对面有照壁，大门前还有元代从波斯国运来的白矾石狮子一对。大堂坐北朝南，东西长28.8米、南北宽22.8米，五开间五进，青砖地坪，有大柱34根。1860年，清朝裁撤南河总督，而将漕运总督署迁往15千米外的清江浦原南河总督署，这里的建筑逐渐废弃。1945年10月，新四军攻占淮安城，将大堂拆除，木材运到盐城用作武器原料，总督部院旧址则改为扩建的叶挺体育场。只有房基、础石仍存。2002年8月，淮安市楚州区在旧城改造中挖掘发现了明清时期的总督漕运部院遗址，在明