熙六年（1667年），皇帝亲政之后，特封一等公加太师。适逢鳌拜独断专行，屡次矫诏诛杀大臣。遏必隆身为顾命大臣却选择明哲保身，不加阻止也未曾弹劾。康熙八年（1669年）五月，康熙帝命严加惩处鳌拜及其党羽与遏必隆，议他们的罪。康亲王杰书等人遵旨勘问，以大清律例十二项罪责议处遏必隆。拘拏审问过后，康熙帝谕曰：「遏必隆因无结党之事，所以免其重罪，但是削去太师之职及后加公爵，其原有一等公爵，仍准留与伊子」。康熙九年（1670年）正月十九日，康熙帝又念遏必隆受清世祖顾命为四大辅政大臣，而且又是清初开国五大功臣额