德堡大学的研究团队都带到了约翰·霍普金斯医院，继续自己的实验研究，同时依然关心医学生和住院医师的教育。在此期间，布莱洛克与托马斯二人合作开发出通过手术治疗的方法，但实验并没有完全成功。之后，布莱洛克遇到了小儿心脏病学专家海伦·陶西格，陶西格向他介绍了“青紫婴儿”的问题。这是由一种先天性的心脏畸形，即法洛四联症导致的现象，会导致婴儿血液中含氧量偏低。1944年，布莱洛克、陶西格二人与托马斯共同发明了一种手术，通过将锁骨下动脉与肺动脉相吻合，能有效改善患者的供氧状况，缓解法洛四联症的症状。在经过多次动物实验之后