时中在理事长任内独排众议，说服全台牙医界响应「总额制」，成为第一个响应健保总额制的科别，得益甚多。「总额制」也避免健保预算无限膨胀，后续中医、西医基层也跟进响应，陈时中对该制度的推动贡献很大。
从政经历.2004年，陈时中获陈水扁政府任命为行政院卫生署（现卫生福利部）副署长，亦曾任台北医学大学董事。于是，自2005年起，在陈水扁政府的谢长廷内阁指挥下，担任行政院卫生署副署长一职，随后历任苏贞昌、张俊雄等行政院院长，皆持续担任该职，迄中国国民党籍总统马英九上任后乃止。2008年之后，