234名台商的南航CZ3097班机由广州白云国际机场起飞，并于9时20分首先降落台北中正国际机场，成为1949年中国内战结束后首架合法降落台湾的中国大陆飞机。3年后的2008年7月4日，搭载230名乘客的一架南航A330飞机再次首先降落台北，与先前的直航包机不同的是，两岸所有合法旅客皆可乘机往返。2009年8月13日，中国南方航空台湾分公司在台北成立，南航成为首批在台湾取得营业执照并正式成立分公司的大陆企业。2012年9月24日，南方航空与国企河南民航发展投资公司订立合资合同协议成立合资公司中国南方航空