宪法中保障宗教自由，神道教不再视为国教，但神道习俗也在日本人的生活中融入。神道教是在日本本土所发展出来的宗教，祭神的场所是神社，神道教认为自然界万物皆有神。也有奉祀先烈先贤、名人武士、诸侯大名、公家卿相甚至是幕府将军与天皇者，如明治神宫、日光东照宫、靖国神社等。
佛教.在《日本书纪》中，佛教于552年（公元6世纪）由朝鲜半岛百济国传入日本，7世纪初，圣德太子兴建法隆寺，致力推广并普及佛教。根据2010年东本愿寺僧侣的调查，净土宗系（含净土真宗）宗派占大多数，约佔47%；日莲宗系（