光十六年（1836年），回京为吏部尚书，兼步军统领。道光二十一年（1841年），入阁为协办大学士。同年十月，奕经被任命为扬威将军，到杭州督管抗击英国入侵。奕经无能，拖延战事两个月，临阵只会到关帝庙求签。结果清军在定海、镇海及宁波府一溃千里。次年，《南京条约》签订，奕经被革职。之后，奕经又任叶尔羌参赞大臣、伊犁领队大臣、伊犁、英吉沙尔领队大臣。咸丰三年（1853年），奕经奉旨到山东防御太平军，在徐州病死。