有三木城，但是在主家衰退时扩大势力，之后成为战国大名并独立。在同样从赤松氏之下独立的浦上村宗与细川高国连结并逼向东播磨时，就治与柳本贤治结盟并与浦上氏对抗，与浦上氏方的依藤氏战斗，但是因为贤治在阵中死去（可能是暗杀）而被浦上氏击败并失去三木城，不过后来大物崩时高国和村宗被消灭而复归。后来亦击退尼子晴久的侵攻，但是被与有马重则结盟的三好长庆压倒，于是与其停战。在晩年压倒依藤氏而确保东播磨的霸权，建立起别所氏的最盛时期。弘治2年（1556年）把家督让给长男安治。永禄6年（1563年）死去。享年62岁。