院院长（游钖堃2000年升任行政院副院长，同年转任总统府秘书长；刘兆玄1997年升任行政院副院长；1998年1月起以行政院副院长兼行政院教育改革推动小组召集人）；林清江（1998年）、黄荣村（2002年）升任教育部部长并为政务委员（林清江1996年升任考试院考试委员；黄荣村2000年升任行政院不管部会政务委员）；黄镇台升任行政院国家科学委员会主任委员（1998年），陈其南升任行政院政务委员（2002年）、行政院文化建设委员会主任委员（2004年）；韦端升任行政院主计长（1996年）；杨国赐升任教育部政务次长