位于东北地方的陆海空自卫队基地或驻屯地，设施或设备大多数受损。松岛基地飞机场的停机坪和机库共有飞机28架（F-2战斗机18架、T-4教练机4架、2架、UH-60J黑鹰救援直升机4架）被水淹没而损坏。因此，驻扎其中遭到巨大破坏。此外，陆上自卫队第1直升机团下属的一架EC225直升机遭遇海啸袭击而被破坏。日本防卫省于3月11日14时50分设置「灾害対策本部」；14时52分的司令下令调动一切可能的船只；14时57分海上自卫队的UH-60黑鹰直升机升空；海陆空自卫队用于救援以及侦察的直升机和战斗机和海上