为一条约200米长，南北走向的笔直水道，与紫禁城西城墙之间距离约50米。祀马神所位于内金水河进入紫禁城后向西南曲折河段的北岸，西侧紧邻紫禁城西北角楼，祀马神所旁边是皮库。祀马神所西南方向为城隍庙，城隍庙北侧紧邻紫禁城西北角楼。祀马神所有一座正殿，与城隍庙正殿形制相同，均为坐北朝南、面阔五间、黄琉璃瓦硬山顶。殿内主供马神。过去正殿前有香炉、焚炉、祭台。