亲是左卫门督村上显国（赖平・赖冲）。母亲是室町幕府三管领斯波义寛的女儿。乳娘是家臣出浦国则之妻。正室是信浓守护小笠原长栋的女儿。幼名武王丸，信浓埴科郡葛尾城城主时期两度击退武田晴信（后来的信玄）的侵攻等，武勇为人所知，继任家督后，把佐久郡、埴科郡、小县郡、水内郡、高井郡等信浓东部及北部纳入领地支配，成为村上氏最盛期的当主。实质上是身为战国大名的村上氏的最后当主。
生平.文龟元年（1501年）3月11日于葛尾城出生，为村上显国之子。在永正12年（1515年）3月15日元服并称右京