与其妻避走。不意，其妻发现物品未带齐全，王乃为其妻返家，却被派来埋伏的便衣人士带走，之后下落不明。有人向王家透露王育霖被监禁于西本愿寺，当时西本愿寺由保安司令部第二处所使用。王家託人询问政府，政府表示王被流氓掳走。《二二八消失的台湾菁英》一书的作者李筱峰声称，王育霖于三月底被军方处死，弃尸淡水河，尸体下落不明。二二八事件时任《民报》记者的吴浊流，在其1970年代的着作《台湾连翘》中描述：「新竹市的检察官王育霖，在新竹市侦察奶粉的吞没案时，偶然发现到「粉虫」竟然是经办救援物资的新竹市长郭绍宗，便携一纸