化学遗传学(Chemical genetics)是通过筛选小分子来研究细胞中蛋白质和讯息传递途径的功能。近年来应用高通量技术进行化学遗传学的筛选正越来越受到关注。化学遗传学类似于经典遗传筛选，在经典遗传学筛选中，随机突变被引入生物中，这些突变体的表型被观察到，并且最后产生该表型的特定基因突变（基因型）被鉴定出。
实例.目前中国国内可提供化学遗传学筛选的机构有：中国科学院上海生命科学院植物生理生态所化学遗传学筛选平台。