大部份赛事，而外援祖尔则在季中转投中甲球会广东日之泉，陈旭智除了成为必然正选以外，更要担当起防线领军的工作，在调整期间大埔战绩有所下滑，而他在下半季的中坚拍档不停转换，先后有张志勇、王得豪、李树烊及吕志兴。最终，球队经过调整期后，2009年6月6日于香港足总盃决赛以4－2击败天水围飞马，夺得球队首项甲组锦标。陈旭智赛后表示，当初大学毕业选择当职业球员，家人曾质疑他的决定，这个奖盃可让他们心悦诚服。而他亦表示加薪与否并不在意，亦很享受大埔球会内的温暖气氛。他更称，在球会七年内，由丙组到甲组，跟球会一起有很多经