对基督教神秘主义，反对柏拉图和圣奥古斯丁的二元并存理念以及世界本身就是有罪的观念。最有名的经院派创始者是托马斯·阿奎那，他引领众人离开柏拉图主义及圣奥古斯丁转向亚里斯多德学派。透过经院哲学，阿奎那发展出精神哲学，在其着作中提倡人的心灵从一出生就是一块白板，拥有经由神学思考及辨证的能力的观念。其他有名的经院哲学家还括有洛色林、彼得·阿伯拉。这时期主要的落在宇宙相关的讨论，同时期受到经院哲学影响的还有安瑟伦、圣彼得达米安、圣伯尔纳铎及维克多修道派。