族解放军在战争初期取得了一些胜利。1989年，马共来到谈判桌旁，承诺只要马来西亚政府允许马共和民族解放军的干部回国，就解除所有武装投降。马共和民族解放军摧毁了他们的武器后，部分民族解放军和马共成员在泰国南部定居下来，其他成员可以返回马来西亚生活。而马共总书记陈平则被剥夺返回马来西亚的权利。