院徐桐不合，后来辞职。此后事编撰校勘十余年。1888年任南菁书院山长。1891年掌泺源书院。1894年任南京钟山书院山长，兼掌常州龙城书院。1901年任江楚编译局总纂。1902年，钟山书院改为江南高等学堂，任学堂监督。癸卯学制实施后，废古江宁府学，两江总督府拟在江宁“先办一大师范学堂，以为学务全局之纲领”，1902年5月出任学堂总稽查，负责筹建三江师范学堂，并与徐乃昌、柳诒征等七教席赴东洋考察学务，学堂遂仿日本东京大学，在南京国子监旧址筑校，以后更名两江师范。1906年得悉藏书家丁丙去世，他