菌科的演化支约于距今1.56亿年前的侏罗纪晚期出现，与被子植物出现并开始辐射演化的时间吻合。另外块菌属约于距今1.42亿年前的白垩纪早期与本科其他类群分支，至白垩纪晚期时该属下的多数演化支均已出现，不过新生代古近纪中期（距今3000万至5400万年前）山毛榉科、桦木科、杨柳科与胡桃科等被子植物树木的辐射演化，可能促进了与之共生的块菌属类群的进一步分化。