萨洛尼基大学（塞萨洛尼基）和英国肯特大学（堪特伯雷）的荣誉博士，德国波恩大学的荣誉校务委员。他是1984年Pour le Mérite勋章的第二副总务，1985年和1992年的第一副总务。他还获得了捷克布拉格科学学会的金质奖章、澳大利亚新南威尔士大学的狄拉克奖章和德国联邦十字勋章，德国物理学会授予他“罗伯特-维夏德-波尔奖”（Robert-Wichard-Pohl-Preis）。以沃尔夫冈·保罗的名字命名的有德国质谱学会的“沃尔夫冈·保罗学习奖”（Wolfgang Paul-Studienpreis），