兰教的迫害而迁徙至此。葡萄牙人到来以前，印度的圣多马基督徒在神学和教会方面维持了近一千年的统一。1498年4月，圣多马基督徒曾为达伽马的小型舰队领航。后来圣多马基督徒也曾帮助耶稣会方济·沙勿略传教，并加入罗马天主教。1561年后，圣多马基督徒被果阿宗教裁判所定为异端，教徒受到破坏，许多人被处决。1653年，发生反天主教反叛，在葡萄牙人影响下，圣多马基督徒因而分裂并建立了马兰卡拉教派。从那时起发生了进一步的分裂，圣托马斯基督徒现在被分为东仪天主教会、东方正统教会、东方亚述教会等不同教派，每个都有自己的礼仪