捞、航运、兴修水利工程和海洋污染等人类活动的影响，86%的齿鲸生存受到威胁。中国长江特有的白A|鱀豚可能已在21世纪初灭绝，而加利福尼亚湾北部的小头鼠海豚仅剩约30头，可能是当前最接近灭绝的水生哺乳动物。
系统发生.根据美国于2018年出版的《海洋哺乳动物百科全书（第三版）》，齿鲸内部的系统发育关系如下（符号 † 表示已灭绝）：
下级分类.本列表自 齿鲸小目 Odontoceti 往下逐级显示，具体到科级，科级位置未定者，具体到属级。符号 † 表示已