在1859年发表了《物种起源》。达尔文的天择演化论后和突变论发生对立，有一段时间未受重视。至到1930年－1940年，现代综合演化论出现后，演化生物学正式成为一个独立的学科。然而直到1970年－1980年才有大量的的大学把演化生物学正式作为一个系。在美国，由于分子生物学与细胞生物学的快速发展，很多大学把原有的生物系拆分或合并为"分子与细胞"-类型的生物系与"生态与演化"-类型的生物系。早期的演化生物学主要依赖形态，包括比较解剖学、胚胎学、分类学等方式。生态学透过观察比较不用性状的适应度，也是重要的研