1943年9月，和中共党员陈潭秋、毛泽民等被军阀盛世才秘密杀害。父亲阿不都拉·扎克洛夫，早年赴苏联留学；1949年12月，成为中共在新疆地区发展的首批15名维吾尔族党员之一，是新疆省人民政府首任秘书长；文化大革命前，官至中共新疆维吾尔自治区党委常委、自治区政府副主席。和大多数维吾尔族不同的是，雪克来提·扎克尔拥有家族姓氏，即扎克尔。对他的称唿可以是“扎克尔先生”。
早年经历.文化大革命期间，1970年12月至1972年2月，雪克来提·扎克尔先后在新疆玛纳斯县、乌鲁木齐县接受再教