科病毒的病毒颗粒不具有包膜，直径约为40奈米。其基因组为单一的线型双股RNA，长4.6–6.7kb，有GAG与POL两个有部分区域重叠的开放阅读框，分别编码衣壳蛋白与RNA复制酶，基因组的5′非转译区有一内部核糖体进入位点（IRES）为转译起始的区域，核糖体将GAG的开放阅读框转译完后，有一定机率发生-1使转译继续，形成一个GAG与POL组成的融合蛋白，不过也有部分本科病毒（例如感染的真菌病毒Hv190SV）可能在此区域有转译先终止再开始的机制，因此产生独立的POL蛋白。