来确定名次，最终山东鲁能成绩最好，与其它三支俱乐部一起获得了亚冠资格。这其中河南是首次参与这项亚洲最高荣誉的赛事。杭州绿城和重庆力帆排名最后两位，原定降级至2010年中甲联赛。但是，由于在中国足坛反赌风暴中被查明曾实施贿赂行为，成都谢菲联和广州医药受到中国足协的处罚，取代原定降级的杭州绿城和重庆力帆，降级至中甲联赛。
升级与降级球队.
升级球队.上赛季从中甲联赛升级：
降级球队.上赛季从中超联赛降入中甲联赛：Section:::