移民者及其后裔，都会被认定为大清国的子民。中华民国成立后，中华民国政府继承以属人主义为主的国籍认定法律，并以此制定《中华民国国籍法》。直至今天，许多印尼华人仍然被界定为中华民国籍的侨民。但与此同时，统治印尼的荷兰王国，採用出生地主义国籍法，任何在印度尼西亚出生的人，都会被认定为荷兰臣民（），而清政府与荷兰政府之间，曾就这问题所引发的领事保护权问题发生纠纷。印尼独立前出生的华人，有权同时申领中华民国护照，以及荷兰发出的护照。
印尼独立后.
中华人民共和国与印尼