治十三年（1656），靖南王耿继茂兵至南宁，马雄擒阳春伯李先芳，斩参将杜纪，俘获无数，因功加右都督。顺治十五年（1658），攻克横州。顺治十六年（1659），授云骑尉世袭。顺治十七年（1660），广州巡按御史张问政弹劾马雄庇商抗课，降二级。顺治十八年授广西提督，筑清真寺，经营伊斯兰教坟山，又延聘经师李秉旭、马明龙、马承益、皇甫经、舍起灵等至柳州讲学，时称“马大老爷”。康熙十二年（1673年），爆发三藩之乱，当时马雄驻柳州，投靠吴三桂，广东十府失其四，康熙帝大为惋惜。十四年（1675年），马雄及王弘勋攻高州，