28年创办省立广西大学，曾三任广西大学校长。1931年九一八事变后马君武作诗《哀沈阳》两首，讽喻张学良，然而有关指控乃属诬蔑（见下章）。1940年8月1日，在桂林病逝。马君武墓位于今桂林市雁山区。
马君武《哀沈阳》.九一八事变后，马君武诗作指控张学良软弱，令张学良被称为「不抵抗将军」，然而马君武这指控却是出于两人私怨而凭空诬告。诗云：首先，诗中的胡蝶（蝴蝶）不但当时不在北平，终其一生根本未见过张学良。朱五小姐朱湄筠于九一八事变前一年早已成婚，主婚人正是张学良。香港