表陈情，没有赴任，为有司所劾，被免官。侯景之乱，张种带着母亲东逃，逃归乡里，不久母亲去世。50岁的张种服丧哀痛过甚，荒乱中遗体没有埋葬，于是丧期满后依然如服丧之时。侯景之乱平定，张种受王僧辩推举，被起用为贞威将军、治中从事史。母亲葬礼完毕才就职。承圣四年（555年），贞阳侯萧渊明称帝，张种任廷尉卿、太子中庶子。梁敬帝即位，张种任散骑常侍，转任御史中丞，兼前军将军。永定元年（557年），陈朝建国，陈武帝任命他为太府卿。天嘉元年（560年），任左民尚书。天嘉二年（561年），权监吴郡，不久召还任左民尚书