1866年12月，会议在伦敦正式召开，麦克唐纳在会议中的表现，获得公众赞赏。在伦敦开会时，他娶了秘书的姊妹阿格尼丝·伯纳德为妻。1867年1月，麦克唐纳在酒店坐在椅上睡觉时，蜡烛点着了他坐着的椅子，烧伤了他，但他仍然坚持开会。2月，他与阿格尼丝在汉诺威广场圣乔治教堂举行婚礼。3月8日，英国下议院通过了英属北美法令，维多利亚女皇在同月29日御准法令。麦克唐纳希望联邦在7月15日正式成立，但英国人希望联邦早些成立。5月22日，有关人士宣布加拿大联邦将会在7月1日正式成立。蒙克勋爵任命麦克唐纳为联邦第一任总理