该船被大日本帝国海军征集，并被改作运兵船；但是，该船常态搭载的武器装备既少且不足以自保，该船也因此常以「之」字型路径航行，以避免遭鱼雷袭击。该货船在1945年1月12日于圣雀岬港（Port Saint Jacques，后称头顿市）附近遭美国海军快速航母特遣舰队攻击沉没；全船约95人获救，船上约共247位台湾籍人士罹难。
最后的航行.
出发.1944年12月1日，受当局征集自台湾各地的59名医师、80名医务助手、200名农业生产工员等搭乘神靖丸自高雄港出发