潜入山中，和同谋者江定商讨对策。
起事.1915年7月6日，在遭公家通缉下，以「大明慈悲国奉旨平台征伐天下大元帅余」名义发表了《》，该文章基本上为抄袭唐朝骆宾王的《》，发动起事。7月9日余清芳、江定突击甲仙埔支厅（位于今高雄市甲仙区），7月14日江定之子江怜阵亡。8月余清芳、江定奇袭多处警察厅，先是叫人假装邮差送信，警员一开门，他们就立刻冲入警察厅，屠杀警员。但在南庄派出所遇到困境，该所警员警觉性高，并未被骗开门，余清芳就劫掠附近的民宅，取得煤油与各种燃料之后，焚烧南庄派出所，