禄二世强烈批评美伊战争。他认为应该由联合国来解决国际事务，单边行动是对和平的犯罪，也违反国际法。在2003年和2004年欧盟商讨新宪法时，圣座的代表没有成功地将“基督教遗产”提上会议议程，而这是教宗最希望达到的目标之一。教宗若望保禄二世明确反对同性婚姻。他形容同性婚姻为“一种新的邪恶理念”，严重威胁社会。他也批评变性与心理性移位的人群，禁止他们在教会供职，称他们“精神病态”。
评价.尽管广受欢迎，若望保禄二世也遭到了许多批评。其中有一条批评认为教宗对共产主义的反对态度使得他