有抄袭他人论文的情形，像是日本学者小保方晴子在2014年春天于《自然》期刊上发表了世界首例有效制作STAP细胞的论文，2014年1月29日论文发表后就在PubPeer有许多的议论，几天后就指出有数据异常的情形。若要申请PubPeer的帐号，需要有PubMed期刊资料库的帐号才能註册，表示是PubMed资料库收录期刊的第一作者或是通讯作者才能申请帐号，但是平台上的发言是採匿名方式进行。PubPeer有些用户曾被指控诽谤，有些已和解，PubPeer的评论只能使用可公开验证的事实。