职守贪赃枉法的知县等多达十人，因此被捕下狱，遇到赦免，并官复原职，调补广东作地方官员。从此王来执政温和，注重修举。正统十三年（1448年），迁河南左布政使。第二年，改都察院左副都御史，巡抚河南、湖广、襄阳诸府。也先率军逼近京师，王来督兵勤王，率军渡过黄河，听到也先军撤退，才退兵。景泰元年，贵州苗族叛乱。王来以右都御史总督湖广、贵州军务，平定了叛乱。景泰三年十月，升迁并兼任大理寺卿。景泰四年，召为南京工部尚书。明英宗复辟，朝中尚书都被罢官，王来遂回到乡里。成化六年（1470年），在家中逝世。