号，均以"S3"字开头，如S3BL。较早前出牌的MCW 12米，也由"M"改为"3M"，标志着九巴开始细分同车厂各种不同长度的巴士。90年代初期，九巴开始购入空调巴士，所有空调巴士，车队编号均以"A"开头，如"AM"、"AL"等。较早前投入服务的丹尼士猎鹰巴士，车队编号由"FD"改为"AF"，与其他空调巴士看齐。2000年中期，九巴开始为不同车身和不同欧盟标准的引擎的巴士，配上不同的编号。例如同样是Volvo B9TL型，配上Enviro500车身的称为""，配上欧盟三型引擎连Wright车身的称为