北周、隋朝的人口增减，太宗再次表示赞赏，不久让他兼任检校兵部侍郎，知五品选。卢承庆不接受，认为选官是尚书的职责，自己不能越权，但太宗没有答应，说：“朕相信你，你为什么不相信你自己呢？”后来卢承庆又历任雍州别驾、尚书左丞。二十二年（648年），太宗封禅泰山，以时任户部侍郎卢承庆为检校封禅副大使。
唐高宗年间.贞观二十三年（649年）唐太宗驾崩，唐高宗继位。由于权相褚遂良诬告，卢承庆被贬为益州大都督府长史；褚遂良又指控卢承庆在雍州时失职，卢承庆又被贬为简州司马。在这段时间，卢承庆结