为内阁的首长，内阁总理大臣对于国务大臣拥有任命权和罢免权。宪法规定，国务大臣过半数要由国会议员组成。《日本宪法》有关内阁的规定起源于英国的议会内阁制。国会拥有对内阁总理大臣的指名权与不信任案决议权、内阁解散决定权；根据内阁的意见与承认，由天皇批准解散众议院。
内阁总理大臣.2000年以后的历任内阁总理大臣名单如下所示。
司法部门.日本的司法部门称为「裁判所」，即汉语所称的「法院」，由最高裁判所与组成。最高裁判所是整个裁判所结构中的顶点，拥有违宪审查权