同年10月，代理委员长职务。民国二十五年（1936年）5月至民国二十七年（1938年）6月，正式出任黄河水利委员会委员长。民国二十八年（1939年）5月再度出任委员长，民国三十年（1941年）在任上病逝。
故居.孔祥榕故居位于开封市双龙巷45号（现为35号）。有一种说法认为，民国二十七年（1938年）韩复榘便是在孔家被逮捕后押解到武汉的。