05年12月搭机返国时超带香烟并咆哮机场海关人员，李镇楠连同卢博基、郭荣宗、张花冠、陈朝龙等六位民进党立委借由此事连番上场砲轰关税总局声援杜文卿因而引发争议。。2007年4月18日、维吉尼亚理工大学枪击事件发生后的两天，李镇楠和同为民进党的立法委员林国庆在无预警的状况下带着大批人员到台大校园模拟挟持学生的演练。因为当时正值大学段考时间，除了造成警方虚惊一场以外、学生作息也受到打扰。事后外界一阵挞伐、批评李镇楠的行为是作秀。民进党团在事件第二天召开记者会道歉，但李镇楠却坚持自己出于一片好意、并拒绝承认错误