）.1895年11月19日抵达淡水港，面对的是统治者已改变成日本的台湾日治时期。由于甲午战争后，马关条约将台湾与澎湖割给日本。1895年5月29日，日军登陆澳底，台湾各地纷纷起义抗日。在此情势下，各地基督徒再度遭受迫害和损失。 马偕见此情景，谒见乃木总督，告诉他台湾教会受害情形。1899年3月9日，马偕的两位女儿同日出嫁，大女儿偕玛连嫁给陈清义牧师，二女儿偕以利嫁给柯维思（原名柯玖）长老，都成为「台湾媳妇」。
逝世.噶玛兰地区从事最后一次巡视宜兰的教会，回到淡水，在长期