将台湾割让给日本的决定，在台湾住民中引起了轩然大波。1895年5月25日，台湾官民宣佈于台北成立台湾民主国，推举巡抚唐景崧为总统并向各国通告建国宗旨。未料，日军在5月29日于基隆背后的澳底登陆，6月3日攻陷基隆。于是台湾民主国政府的领袖们，包括唐景崧和丘逢甲，都内渡逃亡至中国大陆。6月11日，泉州籍辜显荣代表艋舺士绅迎接日本军进入台北城。6月下旬，余众又在台南拥立大将军刘永福为民主国第二任总统，民主国虽和日军发生不少规模不小的血战。但到10月下旬，刘永福也弃守内渡中国大陆，日军佔领台南，这个武装远远不敌日军