5至30班的运煤列车通过德国与瑞士之间的边境。这种运输是必不可少的，因为在德国与意大利结盟后，英国已经停止向后者输送煤炭。而由于意大利本身并没有煤炭储量，它与瑞士一样都依赖煤炭进口。由于货物运输必须以当地货币结算，因此巴登车站也成为了德意志国铁路重要的外汇收入来源之一。在战争年代，巴登车站与其它德国车站一样使用欧洲中部夏时制，但瑞士则除了1941年和1942年外都使用欧洲中部标准时间。在德意志国铁路的运行时表中也对此有专门的标示。
特殊地位.虽然巴登车站位于瑞士境内，但根据巴登