贡献以及行政长官认为发生特别重大伤亡的不幸事件或严重自然灾害而造成重大伤亡适宜下半旗，也可以下半旗志哀。2008年5月19至21日中华人民共和国全国哀悼日期间，澳门特区政府按中国国务院公告于哀悼期把有关旗帜下半旗以悼念汶川大地震死难者；这次下半旗是澳门回归后的第一次下半旗。2017年8月24日，澳门行政长官崔世安宣佈政府各机关、边境口岸、对外海空港口及驻外办事处的区旗于翌日下半旗，哀悼在台风天鸽吹袭澳门时引致十名澳门居民死亡的惨剧。