天降玺书褒美之。 武周长安年间（701—704年），七迁秋官侍郎，因忤逆张昌宗被外放为定州刺史，转晋州刺史。不久复入朝为司府少卿。当时司府卿侯知一与尹思贞同样严厉，吏员们为之语曰：“不畏侯卿杖，惟畏尹卿笔。”寻加银青光禄大夫。他在自己宅中挖到十二架古戟，不久府门就因升官而加棨戟，当时人们对这件事很奇异。神龙初年（705年），尹思贞为大理卿，时武三思擅权，御史大夫李承嘉附会之。雍州人韦月将上告武三思谋逆，唐中宗大怒，命将其斩首。尹思贞以当月不宜杀人，坚持认为不可行刑，最终韦月将被判杖配流放岭南。武三思