量的伊朗逊尼派穆斯林改信什叶派十二伊玛目派。直至现在，十二伊玛目派仍然是伊朗的国教。奥斯曼帝国则通过海陆路的武力扩张威胁欧洲，他们在1529年的维也纳之围兵锋直指中欧。通过征服阿尔巴尼亚、保加利亚及塞尔维亚，伊斯兰教亦乘势传入东欧。在16世纪之前，克里米亚、俄国南部、哈萨克及西伯利亚西部亦受到伊斯兰教法的管治。高加索地区在17世纪中叶之前亦落入伊斯兰势力的手里。在1800年代开始，穆斯林世界的政治局势开始全面衰退。这种衰退在文化上十分明显，18世纪尚有塔基丁在伊斯坦堡设立天文台，杰辛格天文台也是在这