亚政府认为蒙内铁路每年将为该国贡献1.5%的经济增长，可在4年内偿还贷款。不过，肯尼亚经济学院院长奥维诺表示，东非经济增长正在逐渐停滞，质疑肯尼亚政府的计划将很难实现。2016年肯尼亚民众抗议铁路阻碍动物迁徙，请愿信要求铁路工程改变施工线路。中国外长王毅称，铁路全线设置14处野生动物通道，「长颈鹿穿过可以不低头、不弯腰，那是一幅多么美妙的人与自然和谐相处的景象」。据肯尼亚运输部数据，蒙内铁路营运首年有98.9亿肯尼亚先令亏损，主要原因是货运量偏低，首个财政年度仅有990,488吨。当局预期随着货运量