当前设定的工作组列举如下（取自www.c-hpp.org ），按照染色体顺序排序。
计算资源.由Eric Deutsch领导的、美国西雅图系统生物研究所（）的小组正在提供基于MS/MS的蛋白质组学结果的数据简化、分析和验证。与抗体方法相关的数据处理由在瑞典斯德哥尔摩的Kalle von Feilitzen（Human Protein Atlas）进行协调。在瑞士日内瓦SIB的Lydie Lane负责整体整合和报告信息（）。生成的所有数据都存入数据库，作为HPP贡献的一部分。S