轻铁系统于通车时被划分为5个收费区（2003年路线扩张后增加至6个，位于天水围北的5A收费区），成为全香港首个引入分区收费概念的铁路系统。单程车费以起点及终点经过多少个收费区来计算，而1997年前，轻铁的4款月票也是以收费区来分类。（註：港铁提供的接驳巴士则没有分区收费，但为转乘轻铁的乘客提供转乘优惠。）
优先过路权.轻铁的另一特色是优先过路权，顾名思义，即轻铁拥有较其他道路车辆和行人高的优先权。当一列轻铁列车驶至距离平交道或由交通灯号控制的路口约100米处时，列车会发出讯号予