所有人类感染甲型流感，这类甲型流感有别于当前流传于人类社会的H1亚型和H3亚型病毒。这些亚型病毒包括了非人类源头和未分类的病毒。新变种病毒就是促使这次猪流感大爆发。美国疾病控制与预防中心于2009年4月17日通过「边境传染病计画」分别在加州南部边境圣迭戈县（San Diego）和帝王县（Imperial County）的儿童身上发现首两宗A/09(H1N1)猪流感病例。由4月21日起，加强监察以要搜索美国加州和德克萨斯州的其它病例，而且美国疾病控制与预防中心确认了该病毒变种的基因与1999年以来在猪只间