将加州神鹫描述为"Vultur californianus"。最初将其与安地斯秃鹰（"V. gryphus"）分为同一种类，但是由于安地斯秃鹰的印记有细微的不同，翅膀也稍长，并且喜好捕食动物，因此加州神鹫被描述为独立的种。属名"Gymnogyps"来自古希腊语，"gymnos"/γυμνος指“秃的”或“光的”，"gyps"/γυψ指“兀鹰”，种名 "californianus" 来自牠的居住地加利福尼亚。"Ccondor"一词来自厄瓜多尔的克丘亚语"cuntur"。加州神鹫确切的分类学位置以及新大陆秃