华民国总统选举中，民主进步党推选的候选人、代理党主席谢长廷惨败，选举后谢长廷宣布辞去党主席职务，但经中央党部挽留后决定留任至新任党主席产生为止。该次选举共有三位参选人，依抽签顺序分别为：前任总统府资政辜宽敏、前任行政院副院长蔡英文、以及时任立法委员蔡同荣。民主进步党于5月18日晚间宣布开票结果，蔡英文以历届最高的73,865票胜出，当选民主进步党第12届党主席，得票率57.14%；辜宽敏以48,882票次之，得票率37.81%；而蔡同荣由于在选举末期宣布退选，转而支持辜宽敏，故仅获得6,530票，得票率