天主教厄瓜多尔军中教长教区（；）是厄瓜多尔一个罗马天主教军中教长区，直属圣座，负责牧养信奉天主教的厄瓜多尔军人及其家眷。军中教长区于2004年时有二十名司铎和廿六名修士。军中教长现时出缺，荣休军中教长为。军中代牧区于1983年3月30日成立，1986年7月21日升为军中教长区。