派驻清华大学的工作组进驻清华大学，校长兼党委书记蒋南翔停职反省，工作组代行学校党委职权。(该工作组由刘少奇亲自过问，其夫人王光美于6月21日以工作组的“一个普通工作人员”的名义加入该工作组并成为中坚力量) 该工作组将从校长兼党委书记蒋南翔到各班主任、政治辅导员、教师打为“走资派”、“反动学术权威”、“牛鬼蛇神”、黑帮分子、黑帮爪牙，进行残酷批斗。12日至16日，103名清华干部被迫带上高帽上街游行。另一方面，工作组同时对清华造反学生进行严厉的批判打击。工程化学系902班蒯大富等激进造反学生受到工作组冲击