胡宗南在进攻延安前，拟任命高桂滋为前线总指挥，被高桂滋谢绝。1947年9月，蒋介石为拉拢起见，指定高为国民党四中全会中央候补委员。1947年10月，杜斌丞被胡宗南、祝绍周密杀，高出钱托白伯英理其丧葬。1949年，中国人民解放军占领重庆前夕，高桂滋逃入重庆长江南岸海棠滨的一所外国人医院，从而免于被迫逃往台湾。中华人民共和国成立后，高桂滋任西北军政委员会委员兼西北农村工作部副部长。朝鲜战争爆发后，高桂滋为中国人民志愿军捐献了一架飞机。1954年，他当选第二届全国政协委员。1959年1月9日，他在北京病逝。