上为业务委託车站，但亦设有绿色窗口（营业时间：7:00 - 19:00）、自动售票机、候车室、自动贩卖机等设施。而北越急行站区与JR站区共通，并委託JR东日本管理，故剪票口是北越急行与JR东日本共用。除车站设施外，东口地下设有南鱼沼市观光协会的询问处及美术馆「栋方志功 Art Station」。月台採侧式月台1面1线及岛式月台2面4线的构造。
车站周边.
东侧.由东侧徒步5分可到达国道17号，为商店的聚集处。
西侧.多为住宅区，