林争夺苏联领导权的时候，克列斯京斯基支持托洛茨基和其支持的左翼反对派主张，但在1927年晚些时候，他开始远离托洛茨基。1928年4月，托洛茨基在苏联政坛上被彻底打倒。 
公审.之后，克列斯京斯基一直担任外交官。1937年，在苏联大清洗中，克列斯京斯基被逮捕。1938年3月12日，作为二十一人审判中的一员，克列斯京斯基被审判，指控其与托洛茨基、德国情报部门联系，试图对党领导实施恐怖活动。在莫斯科审判中，在当时几乎所有被告承认自己有罪的情况下，克列斯京斯基起初否认一切“罪行”，但在第二