次刊登涉及前中共中央总书记赵紫阳的文章，江泽民担心自己的影响会因此被削弱，甚至被否定，所以引起江泽民不满，要求分管意识形态的时任中共中央政治局常委李长春严肃处置。故而文化部以杂志相关人员年龄过大劝其退休。但在时任中共中央总书记胡锦涛的干预下，当时的社长杜导正得以继续任职。该事件引起海内外的广泛的关注，杂志的命运被华人社会担忧。本杂志在2008年刊登的敏感文章有《文革后期我与四川省委书记的交往》、《我看党与国家和人民的关系》、《中国政治体制改革论稿》等。中国知名作家邵燕祥随后写诗表示支持《炎黄春秋》。