职员和警察数十人赴台湾本岛採购粮食，顺利预先储存七个月的存粮。1944年11月，台湾总督安藤利吉（亦为第十方面军司令）召见大田政作，告知美军即将沖绳列为夺取目标，指示澎湖厅赶紧储备一年份的粮食，并尽量协助澎湖妇女、儿童疏散至台湾本岛躲避空袭。太平洋战争末期，澎湖遭逢多场空袭，大田政作在1945年3月17日正式宣佈澎湖已进入战场化的状态；战争期间，大田亲率厅下职员和马公居民赴港口搬运粮食，而将粮食妥善分布于各处寺庙存放，也有曾多次和民众共同于防空壕避难的经历。根据时任澎湖厅技手颜其硕回忆录《陋巷杂草》