对实验室进行管理和运营。1979年，美国国会将桑迪亚实验室指定为国家实验室。1993年10月，桑迪亚公司成为了洛克希德·马丁的子公司，继续实验室的管理。2017年5月，桑迪亚国家实验室开始由霍尼韦尔国际下属的桑迪亚国家技术和工程解决方案管理。实验室在新墨西哥州的阿尔伯克基（SNL/NM）、加利福尼亚州的利弗莫尔（SNL/CA）、内华达州的托诺帕和考艾岛均设有政府所有的设施，其中SNL/NM作为实验室的总部，雇员多达6,600余人；SNL/CA较小，雇员有大约850人。
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