国、张长庚由阆州逃窜至营山，遂回军迎击，斩杀萧占国、张长庚，其后再大败射杀冷天禄。旬日之间连殄三头目，叠诏嘉赉，先封二等男爵，再晋升为一等男爵。额勒登保又追剿张子聪，擒斩白莲教徒甚众。其后，勒保因罪被逮捕下狱，额勒登保代为经略。当时白莲教众王登廷与冉天元、苟文明合阮正漋的叛军流窜至广元，主力集结在川北。额勒登保率领杨遇春歼灭阮正漋于云雾山。同年十一月，部下穆克登布轻进，被冉天元大败，额勒登保当时因病留在太平。嘉庆五年（1800年）春天，冉天元势力日众，乘魁伦刚受命接掌四川剿匪之事，而额勒登保抱恙开赴陕西