兵入关，杨廷麟起兵，彭士望为他募兵。杨廷麟战死，彭士望竭囊营救其子。南明隆武元年（1645年），史可法督师扬州，他和欧阳斌元应召前往，建议用高杰、左良玉，以清君侧。史可法未采纳，彭士望辞归。后清兵二十万人围攻南昌，彭士望避难宁都，居翠微峰。与魏禧、魏际瑞、魏礼、林时益、李腾蛟、邱维屏、彭任、曾灿等九人躬耕相食，论道讲学，提倡古文实学，世称“易堂九子”。士望精于《春秋》、《左传》诸史。着有《手评通鉴》、《春秋五传》、《耻躬堂诗文集》等。