原本打算直接逃往竹堑城（今新竹）。据英国商人约翰·陶德记载大稻埕传来消息：刘铭传率领一千多名士兵，携带大量财宝离开台北，行经艋舺（今台北市万华区）时，民众认为刘铭传想「落跑」而将刘包围，甚至被从轿子中拉出来殴斗，并大骂刘铭传为汉奸、为懦夫，然后监禁在艋舺龙山寺内，直到刘决定坐镇台北督战后才被放出来。 刘发现沪尾形势并没有明显恶化，即以章高元部四个营增援沪尾，曹志忠部仍折回基隆，在水返脚（今汐止）一带扼守。攻下基隆后，法军战舰于10月4日全面砲轰沪尾，共发射了一两千枚砲弹，但仅造成清军10多人伤亡。