设有2座站台（编号1-3）、4条股道。站台与候车室间设有地道连接。车站设有通往广州车辆段汕头客整所的专用线。
始发车次.汕头站是广梅汕铁路的车站。每日办理旅客列车36列，其中始发列车17列。当中一对特快终到广州东站，一对快速经过梅州站终到武昌站；2014年7月1日调整运行图，新增往来重庆北站之快速列车一对；2019年1月5日调整运行图，新增往来广州东站之动车组列车7.5对，往来深圳北站之动车组列车6.5对；2019年7月10日，新增往来香港西九龙站之高速动车组列车1对。春运、暑运