建国以来最大幅度的机构精简，采取了积极的财政政策，通过政府举债促进经济的成长、增加公务员薪金等方法，使得中国经济能够在软着陆后再度步入高速发展的轨道。任内大力打击贪污腐败与走私活动，并亲自督办广东湛江特大走私受贿案和中华人民共和国建国来最大的一起走私案远华案（嫌疑主犯赖昌星）。
国有企业改革.任内，朱镕基继续大刀阔斧地进行经济体制改革和国务院体制改革。在1998年就任总理后，他提出“一个确保、三个到位、五项改革”的施政方针。一个确保，就是确保中国年经济增长达到8%，通货膨胀控制在3