海中会看到夜光藻发出的光芒，因随着海浪浮动，因此又被称为「海上幽灵」或「海上鬼火」。甲藻类所形成的不只是赤潮，形成的颜色取决于的藻类液胞，例如一旦绿藻类大量聚集，即会形成「绿潮」。甲藻类本身并无毒性，但其吞食浮游生物之后，体内会留下大量的氨，这些氨会被藻类排泄出来至附近水域，有些特殊甲藻类则能将之转化为神经毒素（例如亚历山大藻），造成该水域中的生物死亡。夜光藻的生物发光现象又被称为「蓝眼泪」，在世界各地皆有类似现象，在台湾的垦丁、花东海岸和外岛即时有所见，2012年4月在台湾马祖地区即出现大量「