印尼海军水文海洋学办公室统计，印度尼西亚则拥有17508个岛屿。群岛海中的岛屿在最后一个冰川期过后不久出现。由于冰期后地壳反弹仍在发挥作用，导致新的岩礁和岛屿逐渐产生、旧的岛屿逐渐增大或合并。当时的回弹率为每年4～10毫米。 由于岛屿主要是由坚硬的花岗岩和片麻岩两种岩石构成，侵蚀作用明显慢于回弹。群岛海的水域浅，平均只有23米深，大多数的水道都不能容纳大型船舶航行。群岛海中有三个火山口状的地形。其中之一，位于奥兰的仑帕勒兰，是一个撞击坑。（）另外两个则是岩浆侵入作用形成的。其中比较知名的是位于布伦德