在大灾之后的集体主义自救，引起了毛主席的嘉奖。而与此同毛泽东与刘少奇就四清问题展开了激烈对峙。申纪兰和李顺达决定跟随“农业学大寨”思潮，她负责办理猪场以解决肥料问题。1965年，西沟完成了砖窑厂的建设和通电。
“文革”期间.文化大革命期间，由于申纪兰出身不好，一度被人攻击。由于李顺达的力挺，文革初期的冲击并未波及至她。1968年，红卫兵开始冲击李顺达，他一度被关押于长治城。申纪兰除了进入北京开会，其他时间均主要在西沟村里从事建设，并未受到严重冲击。1971年，大寨贾承让等人抵达西沟