国以义和团破坏东清铁路为借口，对海兰泡和清朝管辖下的江东六十四屯两地中国居民进行惨绝人寰的大屠杀，共造成两地约7000名中国无辜居民死亡。此城在俄罗斯内战期间曾被日军占领，用以支持俄国白军。1920年至1922年为远东共和国的一部分。1932年被确立为阿穆尔州首府。文化大革命期间（1966年—1976年），中国共产党通过喇叭24小时不间断地隔着黑龙江对海兰泡放送毛泽东思想的宣传广播。