，而无法接收到足够“存活信号”的T细胞将会凋亡。在这个持续几天的阳性选择过程中，大部分的T细胞都会死去。一个T细胞的命运就在阳性选择的过程中被决定。在双阳性(CD4+/CD8+)T细胞中，能够与MHC-II分子结合得较好的将成为CD4+细胞，而和MHC-I分子有更高亲和力的将成为CD8+细胞。将成为CD4+细胞的细胞将会逐渐下调自己的CD8，最终成为单阳性的CD4+细胞。
阴性选择.在阳性选择中存活下来的T细胞将会向胸腺皮质边缘和髓质区迁移，在髓质区，它们又会接触到胸腺髓质上皮