干达全国解放阵线成立了临时政府，以优素福·卢莱为总统和Jeremiah Lucas Opira为安全部长。政府通过了一项部长级的管理制度，并创建了一个准议会的组织—全国协商委员会（NCC）。1979年6月，随着一系列对于是否扩大总统权力的争议之后，戈弗雷·比奈萨取代了卢莱。在对于临时总统的持续争议中，比奈萨于1980年5月下台。此后，乌干达由保罗·穆万加主持的军事委员会统治。1996年，在第一次刚果战争中，乌干达为一大重要支持者，来推翻萨伊总统蒙博托·塞塞·塞科。在1998年至2003年间，乌干