三十六师主要装备包括大刀、李-恩菲尔德步枪、缴获的苏联步枪、机关枪和轻型大炮。在苏联入侵新疆期间，回族士兵从俄罗斯人手中缴获了标有1930年的苏联步枪作为战利品。
制服和徽章.马占仓的部队穿着绿色制服。许多军人都穿着带有中国国民党的中华民国国徽臂章的军服，并使用中国国民党的中华民国国徽旗帜。
训练.马仲英让他的士兵们在低于零下的温度下训练。马虎山让他的士兵每天进行围城演习和模拟骑兵突袭。曾表扬第三十六师：“我从未见过中国军队能像他们那样训练得如此刻苦。