株式会社被国民政府接收，并入西北实业建设公司，河本仍然担任该公司的最高顾问。战前该公司任职的日本人民间人士有半数在战争结束时回国了，不过，也半数的人们由于保留了与战争结束前同样的待遇而留任，河本自己也保留了“总顾问”的头衔。此后，在太原的日本人配合阎锡山的部队同中国人民解放军作战。1949年解放军攻克太原，河本成为了俘虏，后被中华人民共和国政府作为战犯被监禁在太原战犯管理所。1955年8月25日，河本大作病逝于太原战犯管理所。终年72岁。河本的遗骨于同年12月18日被送回日本。