而由于西来庵抗日事件，余清芳等人借王爷信仰名义发动起事，台湾总督府开始在1915年10月进行全台性的宗教调查，并逐渐改变原先的宽容政策。后来推动皇民化运动后，传统信仰又开始受到打压。而在城隍信仰部分，则有像彰化县城隍庙的神像便被市役所接管禁止参拜、凤山县旧城城隍庙除主神外之神像全被焚毁等情形。二次大战结束后，日本人离去，台湾民间信仰发展迅速，而据前台湾省文献委员黄有兴的调查，在战后成立的城隍庙数量佔今天台湾城隍庙总数的一半以上。这些新成立的城隍庙有的是从旧有的城隍庙分灵，也有的是从大众爷庙升格而成。