他改任交通司路政科长。1912年中华民国成立，不久国民党成立，龙毓峻以同盟会员资格加入国民党。龙毓峻力主将铁路学堂更名湖南铁路专门学校，并任校长，同时辞去了交通司路政科长和实业学堂的职务，专任该校校长。
二次革命后.1913年二次革命爆发，11月袁世凯任汤芗铭为湖南都督，以取代谭延闿。汤芗铭到任后，先后杀害了财政司司长杨德麟、警察局局长文经纬、会计检察院院长易宗羲、筹饷局次长伍任钧等。龙璋则被龙毓峻等人保护起来，护送出长沙。1914年，贝允昕主办的进步党机关报《长沙大公报》指责龙毓