福安被逮捕的教徒多被治罪，而周学健特别按首犯责任追究白多禄。周学健于1746年9月12日专折上奏要求判处白多禄斩首，干隆帝初批“未免言之过当，然照律定拟，自所应当”，而交由三法司复议后最终还是下诏处斩。白多禄经受狱中长期的折磨之后于1747年5月26日（干隆十二年）在福州西门外被斩首，时年66岁。他殉道后一年的1748年，另外四名先后被捕的西班牙神父施方济、华雅敬、德方济及费若望也被处决。
影响和评价.清代中期时，政府认为白多禄所代表的天主教会居心叵测、扰乱中国的礼教、威胁政府统治