坡海军基地扩张，遏制日本朝当地扩张。“乔治六世国王”干船坞和“海军部九号”（）浮动干船坞均是这段时间建成，即便在整个大英帝国都是非常重要的设施。然而，太平洋战争爆发后，英联邦部队调至马来亚，新加坡守军仅数月后就被日军击败，于1942年2月15日投降。马来亚战役及之后的新加坡战役期间，新加坡多次遭日本飞机轰炸，导致大批平民丧生。新加坡海军基地在1941至1942年的战斗期间基本未受损伤，成为大日本帝国海军除本土外最重要的基地。当地许多平民也像英国统治时期一样应聘进入基地工作，只是日本海军的管理纪律非常严厉