变法失败后，两次东渡日本求学。中华民国成立后，出任南京临时政府教育次长、总长，国民政府教育总长。1921年曾以教育总长的名义发表言论，反对教会学校学生强制做礼拜和读《圣经》。1925年任中华教育文化基金董事会（中基会）首任干事长，1926年任北京师范大学校长。1927年12月23日在天津病逝。
纪念.范源濂去世后，由中国动物学家秉志和植物学家胡先骕所创办的静生生物调查所，以他命名，纪念范源濂对中国生物学研究的赞助和提倡。后来的中国科学院动物研究所和植物研究所是自静生生物调查