7年，在组建重庆直辖市时，涪陵并入重庆；王鸿举出任市委副书记、副市长。2002年10月，接替包叙定出任代市长、市政府党组书记。2003年1月，在重庆市第二届人民代表大会第一次会议上，正式当选重庆市市长。王鸿举自重庆升直辖市后，共历经张德邻、贺国强、黄镇东、汪洋、薄熙来五任市委书记。2009年11月底，中共中央宣布免去王鸿举的职务；数天后，在12月3日举行的重庆市第三届人大常委会第十四次会议上，64岁的王鸿举辞去重庆市市长的职务；26日，他被增选为第十一届全国人大常委会委员、环境与资源保护委员会副主任委员