栅线通车前不断发生试车事故，内湖民众对于中运量系统的排斥感高涨，因此坚持要求变更设计，改採用高运量系统，以及兴建地下化路线，并透过市议员提出这方面的诉求，于1997年7月31日台北市议会第七届第廿七次临时大议第四次会议议决：内湖线应採高运量办理。台北市政府捷运工程局则基于路线佈设考量，以及兴建成本可能激增、内湖地区道路狭窄施工困难等理由，认为变更设计一事窒碍难行，双方并无共识。之后台北市议会通过决议，冻结相关预算，要求重新评估替代方案。经过多次重新评估，以及与地方长期沟通后，尽管捷运局曾提出一些替代方案