近亲是塞舌尔隼，曾一度被认为是同一物种。牠们的共同祖先似乎是在很近期才分支，有可能是少于100万年前的更新世初期或中期。
特征.马岛隼长30厘米，雄鸟及雌鸟的翼展分别阔18-19.5厘米及18.8-20.3厘米。阿尔达布拉群岛的亚种"F. n. aldabranus"则较为细小，雄鸟及雌鸟的翼展分别只有17-18.3厘米及17.7-18.6厘米。雄鸟重112-118克，雌鸟则重达128克。雄鸟的头部及颈部呈红灰色，有深色斑纹。在喙下有一道深色的斑纹伸延至喉咙两侧。上身及翼底都是