证期间，陆钦侃多次与其他人联合，或个人单独上书中央，力主三峡工程不可上马。三峡工程上马后，陆钦侃仍先后六次上书并发表文章，恳切陈说将三峡工程的危害降低到最小程度的挽救措施。比如2000年，陆钦侃和中国科学院院士吴传钧、三峡工程论证水文组专家叶永毅、黄河水利委员会技术委员会委员温善章等50位专家联名唿吁保留三峡大坝导流底孔。在李锐代为上转的多次上书之中，陆钦侃都是上书的执笔人，名字排第一位。