筑面积7997平方米的北站房、改建普速场站台，并延伸南站房进站天桥并和普速场连接，工程概算总额3.3亿元。北站房于2016年12月13日停办客运业务，之后北广场所有列车将暂时调整到南广场售票、进站以建设新北站房。在拆除过程中，北站房萧娴的站名题字交给镇江博物馆保存，而候车室内长16.3米、宽3米的壁画则于2015年12月分为1820块拆除，日后将转交给建设中的火车主题博物馆保存；站房的钟楼则于2017年2月16日拆除。整个改造工程于2018年1月28日结束。连镇铁路规划接入镇江枢纽，为此车站于2019年