二元论放在基督教的信仰中，是当时甚受欢迎的一种思想。他认为《希伯来圣经》（又称《旧约》）内所记载的上帝与耶稣基督的父的论述，有所不同，且《希伯来圣经》内本身充斥着矛盾。马吉安指《希伯来圣经》中的上帝是「创造的上帝」，讲求天谴，是充满愤怒且暴力的神；基督之圣父则是温柔敦厚的神。他摒弃了《希伯来圣经》，且只集合了数卷使徒保罗及路加的着作成为正典。由于马吉安主义没有任何着作留下来，包括相信是记载马吉安思想的《对比论》（"Antitheses"），他的主张及思想只有从反对他的人的着作中重新构筑出来。这些作者包括