遗传标记（）是已知在染色体上位置的一种基因或DNA序列，可被用于鉴定生物个体或物种。其可被描述为可观测变异（可因位于基因组基因座中的突变或改变而产生）。遗传标记可能是一段短的DNA序列，例如单个碱基对改变的周围序列（单核苷酸多态性，SNP）或一段长序列，例如小卫星序列。