年研究噶玛兰族唾液，收集29名噶玛兰族原住民的唾液检体，事前已获得头目及长老们同意，也提供唾液的研究对象签立「同意书」。半年后，噶玛兰发展协会提出异议，认为林未完整告知研究目的及接受採检唾液者应有的权利，也未依《原住民基本法》取得部落会议同意，违反了医学研究伦理，而向国科会和原住民委员会举发。国科会学术伦理审议委员会讨论后，要求林妈利须永久封存噶玛兰族人之唾液检验数据，不得作为任何研究及论文发表，并决议对林妈利及马偕医院以违反医学伦理提出纠正。