高速列车（包括TGV、Ouigo和少量AVE），其中近半数前往巴黎，另有长途班次可直达里尔、布鲁塞尔、南特、雷恩、勒阿弗尔、梅斯、卢森堡、斯特拉斯堡、法兰克福以及马德里，节假日还开行直达伦敦的欧洲之星列车；马赛每天开行4班前往波尔多的城际列车，沿途停靠蒙彼利埃、图卢兹等车站。在区域列车方面，马赛有五个方向的区域列车线路，分别前往纳博讷、里昂、米拉马斯、加普和尼斯方向。2018年，马赛圣夏尔站累计发送旅客数量达14,638,309人次，是法国铁路系统的a级车站。除圣夏尔站外，马赛境内还有11个铁路乘降所：