咬下果实如种子蕨。根据杨氏马门溪龙的头骨，下颌长51公分、宽19.8公分、高40.1公分；脑容量只有60毫升；上颌两侧各有14至18颗牙齿、前上颌缘有4颗牙齿、下颌两侧各有18至24颗牙齿。大部分已知的马门溪龙科都具有相对身体比例极度加长的颈部，平均颈椎数目在17至19节左右，很少恐龙能超过这个数值，除了一些盘足龙科。前段颈椎横扁，不像大部分蜥脚类剖面为圆形。颈椎特别横向加长，长度是宽度的四倍左右，这样加长的情况也可见于后期不相关的长生天龙。颈肋很长，其中中加马门溪龙的颈肋长达4.1公尺，创下蜥脚类最长