高海拔地区，若要排除高原症脑水肿，就必须要维持脑中氧的恆定。主要造成高原脑水肿的原因是缺氧。这发生在人类尚未适应低氧状态前就前往高海拔区域，而新环境的氧含量和正常环境的氧含量的比率可以用来预测是否会得到高原脑水肿。长时间在氧含量低的环境下，也会造成低二氧化碳血症，这也是造成高原脑水肿的原因之一。这些原因导致脑中充满液体，并造成严重的损害，例如脑肿胀如果不立即治疗，则会因脑疝而死亡。脑肿胀可能是出自于血管性水肿，也就是液体渗透过了血脑屏障，这个过程已经由MRI研究得到证实。缺氧导致细胞外液增加，通过了大脑