萩博物馆（）是位于日本山口县萩市的一座综合博物馆。萩市保留有众多历史资料和建筑，市政府慾将萩市整体打造为一座大博物馆，而萩博物馆就是这一构想的核心设施。现在的萩博物馆开业于2004年。