能是因为渗泸水把水溶度较高的基岩（如石灰石）慢慢的溶解侵蚀，又或是因为洞穴屋顶的塌陷，又或是因为水面降低。有时，透过渗穴可以看见底下的洞穴。对于特别大型的渗穴，如：美国马默斯洞穴国家公园的雪松库，可能会在渗穴的底部看到地下水从洞的一边流动到另一边，形成了伏流现象。渗穴一般发生于一些位于地下，而且能被大自然的水慢慢溶解的岩石种类，例如：石灰石、碳酸盐岩或盐床。当岩石被溶解，就会在地下形成空间或溶洞。若地面环境不变，这些地下空间就能保持完整；但若空间的岩面不足以承托其上的重量，就会突然塌陷，形成渗穴。举例说