于1571年由Jérôme de Rouen（亦称Jerónimo de Ruão）完成，他最后在建筑中加入了一些古典的元素。该修道院的工程于1580年正式结束，因为西班牙的埃斯科里亚尔修道院建设工程已耗尽所有经费。1755年，哲罗姆派修道院在经历大地震的洗礼后，仍然屹立不倒，且更甚的是，它并没有什么损毁。1833年，葡萄牙的教会宣佈停止使用哲罗姆派修道院。这以后，它开始年久失修，而其墙壁亦已开始严重断裂。西南方的塔后来被加上一个圆顶（cupola）。
圣玛利亚教堂.Secti