年6月中国人民解放军首次攻克开封时，应中国人民解放军邀请，马步云出面维持地方治安。此后他脱离中国国民党阵营，携家迁居南京。中华人民共和国成立后，他历任南京中山陵园管理委员会委员、江苏省文史研究馆馆员、政协江苏省委员会委员、 江苏省人大代表、中国国民党革命委员会江苏省委员会委员。文化大革命中，他受到冲击，1970年3月7日他逝世于南京。