坑附近与大林溪合流后，始称南港溪，由外加道坑开始沿溪地形形成崃谷，经过牛洞，来到水头便渐渐失去崃谷景观，由鱼池盆地进入埔里盆地后向西北流，于盆地西部之向善附近与眉溪汇流，至柑子林此段仍为南港溪。主流上游眉溪河谷为通往台湾东部地区的重要孔道之一，省道台14线即通过此一地段。