—台北101对飞航安全的影响，民航局考虑改变飞机航班进出松山机场的飞行路线。这问题在1999年年底时获得解决，台北101大楼专案向后延伸一段距离，确保在2003年建造完成时依然可以成为世界第一高楼。
国际与两岸航线重启.随着马英九政府的上台，松山机场的定位转为以服务商务旅客为主的次要辅助机场，并开放国际航班：2008年12月15日上午8时，两岸假日包机正式迈向常态化，半世纪以来第一架直接由台北飞航情报区切入上海飞航情报区的航班由松山机场起飞。2010年6月14日，松山机场直航上海虹