叔孙通为太常，并赏赐黄金五百斤。随叔孙通入京的儒生获汉高祖封为郎，另外叔孙通把赏赐所得全数分赠随行的儒生。
辅佐汉惠帝.前198年，叔孙通出任太子太傅，辅佐太子刘盈。三年后 (前195年)，汉高祖有意改立刘如意为太子。叔孙通以晋献公和秦始皇立嗣不定终致国家内乱的事向汉高祖进谏。据《楚汉春秋》记载，叔孙通曾在汉高祖面前企图自杀，迫使汉高祖收回易储的建议。汉高祖死后，刘盈继位，是为汉惠帝。叔孙通再次出任太常，负责制订汉朝各种礼仪。汉惠帝曾因前往长乐宫朝见吕后时需封闭道路而造成不便，