丰臣秀赖，从此更确立了她在丰臣家中第一侧室的地位。1598年，秀吉过世，六岁的秀赖继位，淀夫人以生母身份辅政，直至丰臣家灭亡为止，一直实际上掌握整个丰臣家的实权。
与德川家康的冲突.1600年发生关原之战，这场战事主要是石田三成代表的丰臣家与德川家康两方面的战争。三成最后战败，本人不但被德川家逮捕处死，丰臣家的整体权威也大为下降，领地遭到削减。1603年，原本秀吉在世时还向丰臣家俯首称臣的德川家康，获天皇受封为征夷大将军。虽然两方遵守秀吉生前约定，将秀忠之女千姬嫁给秀