来传递细胞因子的信号。该酶参与干扰素α和β产生的信号通路，因此也可能在抗病毒免疫中扮演一个角色。细胞因子通过调节免疫细胞以及其它系统的细胞的存活、增殖、分化以及功能在免疫与炎症中起关键作用。因此，以细胞因子及其受体为靶标是治疗这类疾病的有效手段。白细胞介素、干扰素和促红细胞生成素等细胞因子正是通过I型和II型细胞因子受体与JAK家族的激酶结合来传递胞内信号。哺乳动物的JAK激酶家族拥有四个成员：JAK1、JAK2、JAK3和酪氨酸激酶2（TYK2）。Jak激酶和细胞因子信号之间关系的第一次阐明是在筛