两党候选人皆实力相当，以致选战极为激烈，选情一直到投票前一天仍混沌不明；最后，两市现任市长均以不大的差距落选，其中国民党高雄市长吴敦义以四千票之差未能连任更令众人跌破眼镜。此次选举与1997年中华民国县市长选举，同为民进党在2000年总统大选的中央政府政党轮替奠定基础。
概论.各直辖市之市长选举当选者及次高票者之名单（竞选连任者以粗体字标示）：各直辖市之市议员选举席次：
台北市.
选举结果.台北市长选举中，执政四年、市民满意度高达八