情形以三连败四连胜逆转棋士赵治勋，重获本因坊头衔。1988年林海峰得到首届世界选手权之富士通盃的参赛权，打进决赛，虽败给木谷实门下的武宫正树，但仍有亚军佳绩。1989年面对武宫正树二度败北，仍为亚军。最受关注的是在1990年，林海峰遇上的是中国棋圣聂卫平，获得胜利成为世界冠军。同年在中日天元对抗赛，林海峰接连击败刘小光和聂卫平，此后却后继无力，1992年至1994年，反倒接连败给聂卫平、刘小光及马晓春，1994年林海峰败给柳时熏六段，失去日本天元头衔。1996年林海峰参加了第三届应氏盃，是由台湾企业