各馆.
总馆.为台南市政府文化局辖下的二级机关，按《台南市立图书馆组织规程》，负有督导及评鑑台南市各区图书馆业务之责。新总馆位于台南市永康区康桥大道255号，2020年12月25日试营运，2021年1月2日正式开幕。原旧总馆位于台南市北区公园北路3号，现更名为台南市北区图书馆。
各区图书馆.台南县市合併升格后，台南县各乡镇市公所辖下原有的图书馆，改称区图书馆，并由区公所管辖。民国103年，台南市立图书馆原有7所分馆，改为区图书馆，移拨各区区公所管理。依照《台