此在糖质新生的过程中，需要一个替代途径，才能将丙酮酸还原成磷酸烯醇丙酮酸。首先丙酮酸必需要先在丙酮酸羧化酶（Pyruvate carboxylase）的催化之下，消耗ATP分子并转变成草酰乙酸（Oxaloacetate）。之后草醋酸又会经由磷酸烯醇丙酮酸羧化激酶（Phosphoenolpyruvate carboxykinase）的催化，生成磷酸烯醇丙酮酸，在这个反应中，会消耗掉GTP，并生成GDP与二氧化碳。与前后反应不同的是，以上的两个反应是在粒线体中进行。而且除了直接转变之外，草醋酸还可以利用