8月23日），高雄教区刘振忠总主教率员将单国玺移灵到高雄，并在当日下午举办追思弥撒，由台北总教区洪山川总主教主祭、教廷驻台代表陆思道蒙席、台北总教区荣休总主教狄刚等神职人员共祭。同时，辅仁大学网站将首页、各主要网页改为黑白（至新学期开学），以资悼念。台湾天主教会于9月1日在高雄市道明中学举行单国玺的殡葬弥撒，随即于当日安葬于高雄市小港区天主教高松墓园（原计划安葬于真福山社福园区，但因法令不允许而作罢），丧礼举行前亦在台北总主教公署及高雄主教座堂放置灵位以供信徒和民众凭弔。逝世后，教宗本笃十六世电唁表示悲