科」改称为「决策局」、「资源科」改称为「资源局」。其时共有13个决策局及2个资源局，决策局分别为政制事务局、教育统筹局、规划环境地政局、运输局、工务局、衞生福利局、民政事务局、房屋局、 保安局、工商局、文康广播局、经济局及财经事务局；两个资源局分别为公务员事务局及库务局。其后部份部门曾被整合，当中较重要的是1998年成立新的决策局资讯科技及广播局及解散文康广播局；和2000年成立的环境食物局，规划环境地政局改名为规划地政局及将市政总署及区域市政总署解散，并以新成立的康乐及文化事务署和食物环境衞生署取代。