放弃大别山区东进的命令，先后与中共中央派来的郑位三、萧望东、戴季英等人产生矛盾，同时又因为其部发展过快，引起国民政府猜忌，加上高本人当年曾协助张国焘等人进行肃反，导致高同时受到中共中央、新四军、国民政府和军队内部人员忌恨。1938年11月，新四军参谋长张云逸抵达江北，直接指挥第四支队第八团（原鄂豫边红军游击队）东进。高敬亭依然留驻皖中舒城县西港冲。1939年5月，叶挺率领邓子恢、罗炳辉、赖传珠等人抵达庐江东汤池，宣布组建新四军江北指挥部。之后，叶挺、张云逸、邓子恢到西港冲召开第四支队干部大会，动员东进。