办，经过谈判，于1926年8月1日代表江苏省政府与外国驻上海领团签订《收回上海会审公廨暂行章程》。但是投奔孙传芳幕下的选择，也引发不少争议。当时还在欧洲求学的傅斯年曾经因此向友人疾唿：「丁文江该杀！」后来孙传芳失败，丁文江因此沉潜了一阵子。1931年任北京大学地质系教授。1932年，任私立南开大学校董会董事。1933年与翁文灏、曾世英合编《中华民国新地图》以及《中国分省新图》并出版，此举对中国的近代边疆研究作出了不可磨灭的贡献。1934年6月任中央研究院总干事。1936年，他在湖南勘探煤矿。时值冬季，但是煤