却很快的辞职去探索中南美洲。1821年，邦普兰建立位于巴拉圭和阿根廷交界的巴拉那河圣塔安娜殖民地，用以生产和贩卖巴拉圭冬青。当时，巴拉圭靠着贩卖巴拉圭冬青赚取了巨大的利润。但是，邦普兰设立这个殖民地未受到巴拉圭政府的允许，因此独裁者何塞·加斯帕尔·罗德里格斯·德·弗朗西亚下令摧毁了它。邦普兰被逮捕并拘禁在圣玛丽亚一间房舍中，他被允许持有他自己的财产和制造药物。在拘禁期间，邦普兰无偿地替穷人看病，但也被迫替看守人员看病。1831年，重获自由的邦普兰定居于阿根廷科连特斯圣博尔哈，他在当地结婚并当起了巴拉