未结构化的元件直接储存为档案，同时将结构化的中继资料储存在结构化的存放区中。WinFS在内部使用关联式资料库来管理资料。但是，它不会将资料限制为属于任何特定资料模型，例如关联式或阶层式，而且它可以是任何已完整定义的结构描述。WinFS执行阶段会将结构描述对应到关联式特征（modality），方式是定义将储存类型的资料表，以及重新呈现关系时所需的主索引键与外部索引键。WinFS预设包含物件与XML结构描述的对应；至于其他结构描述的对应，则必须另行指定。物件结构描述是使用XML来指定；WinFS会产生指令码以将