军明亮、提督鄂辉赶往会同他们剿灭苗军。同年十月，攻克平陇，石柳邓遁走盘踞养牛塘山梁，额勒登保分兵攻克。十二月，斩杀石柳邓，苗人缚吴八月之子吴廷义献给清军。军事告竣，朝廷下诏嘉赏额勒登保其军功最高，钖封为威勇侯，赐双眼花翎。
围剿川楚教乱.嘉庆二年（1797年），额勒登保移师围剿湖北白莲教徒。当时起事教徒林之华、覃加耀盘踞长阳黄柏山，地险粮足，总督福宁久攻不下。额勒登保大败敌军于大茅田，击毙林之华。十二月，额勒登保攻陷长乐朱里寨，惟被覃加耀遁走，盘踞于归州终报寨。朝廷下诏斥责额勒登保