义经之间有所隔阂也是在所难免。6月9日，源赖朝命令源义经再押解平宗盛父子及一之谷之战时俘虏的平重衡回京都，不得其门而入的源义经悔恨交加，怒言「关东积怨之辈可从义经！」源赖朝闻之勃然，将源义经的关东领地悉数没收。源义经在黯然返回京都途中，将平宗盛父子于近江篠原宿处斩。平重衡则因曾率大军镇压寺院反平势力并焚燬东大寺及兴福寺等罪状，在寺院势力的引渡要求下，源义经将其交付，最后在奈良被枭首示众。
手足成讐.9月，源赖朝为刺探源义经动向及意志，遣梶原景时之子前往京都堀川御所，封源义经为伊