在2007年3月，爱沙尼亚航空宣布，他们将租赁另一架波音737-500和服务一个新的目的地——维也纳。爱沙尼亚航空租用两架萨博集团340客机和在2008年6月爱沙尼亚航空建立了一个新的公司——爱沙尼亚航空区域。据称，爱沙尼亚航空还会开办由塔林至库雷萨雷、塔林至斯德哥尔摩、塔林至赫尔辛基和塔林至维尔纽斯的航线，稍后还会开办由塔林至圣彼得堡以及塔林至明斯克的航线爱沙尼亚航空公司与北欧航空具有很强的联系，经常飞行北欧航空位于哥本哈根、奥斯陆和斯德哥尔摩的枢纽。爱沙尼亚航空拥有良好的联系网络，参加北欧航空的Eu