井塘赴台湾。1950年3月，余井塘在台湾任行政院政务委员兼中华民国内政部部长。同年，出任蒙藏委员会委员长。1952年起，专任行政院政务委员。1954年递补为第一届国民大会代表，并任国民大会宪政研讨会常务委员及历次国民大会主席团主席。1963年，任行政院副院长，兼行政院经济动员计划委员会主任委员。1966年，改聘为总统府资政。1983年4月，任中国国民党中央评议委员会主席团主席。1985年9月2日，余井塘因指责十信案，气急攻心而脑溢血，在台北逝世，享年89岁。