刑10年、褫夺公权7年，但后来送至总统府改判死刑。霍振江案与大约同时发生的葛仲卿案牵连极广，对当时的国防医学院造成严重冲击。之后，霍振江在水源地行刑场（今国立台湾大学水源校区）被枪决，因亲属皆在中国大陆，只身在台，无亲友能替他收尸，一度被送回母校国防医学院、准备作大体老师之用，后在该校教师巫祁华等人奔走下另行火化安葬。
同案被告.「国防医学院霍振江等案」牵连人数高达百人，同校学生亦有多人遭到逮捕。