时认为，本初早年用笔气力深沈，晚期则内敛悠远。黄宾虹将其措于倪瓒、黄公望之间。龚柴丈认为，恽本初的笔法得到了董源的真传。徐沁的《明画录》评价他的画时称：“（本初）画山水全师子久，苍老雄浑。运笔处，悉以草圣书法相通，生趣勃勃。真士家最胜一流也。”其堂侄为恽寿平。