两岸渔业冲突，是指中华民国（台湾）与中华人民共和国（中国大陆）双方海域的渔业冲突，也是海崃两岸关系的一部份。
历史事件.
南澳31049号事件.2017年5月6日，中国大陆籍渔船「南澳31049号」，在花屿西北方海域20.4浬处（座标：）越界进行捕捞作业，且为休渔期期间内；上午5点20分，由澎湖海巡队PP-10038巡防艇取缔，并广播数十次告知渔船受检，但渔船仍蛇行逃逸拒检，渔工甚至攀爬到船舷边当人肉盾牌，最后海巡队射击5发橡胶子弹吓阻；5点41分，海巡队