纪万生在《2100全民开讲》说，远东集团董事长徐旭东曾带电脑到玉山官邸拜访陈水扁之妻吴淑珍，拿着财务报表谈判后谢事宜。2008年8月26日，远东集团发表声明稿批评，纪万生仅凭匿名消息来源就放言高论、编造故事，肆意伤害他人名誉，已构成诽谤罪嫌；远东集团已请律师函请纪万生更正言论，若未获纪万生善意回应，将对纪万生提起刑事告诉并请求民事损害赔偿。 2011年7月17日，针对民主进步党2012年全国不分区立法委员候选人提名争议，纪万生表示，民主进步党主席蔡英文陷入「权力的迷失」，民主进步党的危机处理「只结痂、没