碰上大航海时代，天主教便积极在西班牙和葡萄牙的殖民地传教；反之，刚出现的新教却没有再进行任何佈道宣教工作，甚至不少新教徒回到天主教的信仰里。直到二百年之后，美国的清教徒才醒觉，认为有宣教的需要，自此基督新教便揭开了宣教工作的历史。至今，几乎每一个新教的大宗派也有自己的差会协助自己的教会培训宣教士，例如浸信差会、宣道差会等。但也有不少差会是属于无宗派的独立基督教非牟利机构，甚至不属于任何组织的独立差会，例如专注向穆斯林佈道的前线差会，专向犹太人宣教的以色列福音差会，以及向华人佈道的中国信徒佈道会和中国内地会。