自北非的摩尔人征服了这里。716年，科尔多瓦成行省首府，766年成为穆斯林政权安达卢斯的首都。786年，着名的科尔多瓦大清真建成。到了10世纪的后倭马亚王朝时期，科尔多瓦以其文化、教育和宗教闻名于世。城内建有300余座清真寺，还包括众多的宫殿以及一座大图书馆。1236年，在收复失地运动期间，卡斯蒂利亚国王费尔南多三世的军队占领了这座城市。基督徒在这里建造了新的防御系统，包括基督风格的宫殿、教堂和堡垒，并将大清真寺改造成了科尔多瓦主教座堂。虽然在基督教统治下的科尔多瓦失去了往日作为政治中心的重要地位，但由