下一度与皇长子朱常洛争为皇太子，而慈圣太后、王皇后也支持立常洛，是为国本之争。万历廿九年（1601年）朱常洵封为福王，崇祯十四年（1641年）被入侵的大顺军烹杀，清兵入关后，朱常洵长子朱由崧成为南明弘光帝。
生平.朱常洵生于万历十四年正月初五日，子以母贵，神宗极为疼爱。但是按《皇明祖训》立储的原则，应该册立王恭妃所生长子朱常洛为太子。神宗则想册立朱常洵，被众大臣极力反对。神宗因此不再上朝，以示抗议，是为万历怠政，最后在慈圣太后的干预与大臣们的坚持之下，神宗终于在万历廿九年（16