离开了巴达霍斯。之后的几百年，这里一直平安无事。直到1640年的葡萄牙王政复古战争，将战火蔓延至巴达霍斯。
1660-1811.从1660年开始，葡萄牙人对巴达霍斯及其堡垒的攻击没有消停过。1700年，西班牙哈布斯堡王朝国王卡洛斯二世去世，西班牙王位继承战争随即爆发。1705年，它被法兰西王国路易十四的孙子费利佩五世接管。西班牙独立战争期间，巴达霍斯曾在1808年和1809年被法国军队攻击。西班牙内战期间，巴达霍斯也发生过交战，最终弗朗哥军队战胜。
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