上书上海市人民委员会，表示愿意将徐光启墓交由国家保管，徐光启墓遂由上海市文化局接管。1957年时，该墓被重新休整，在墓园上种菜的居民被安置到其他地方，除去被上海市气象局家属区占去的部分土地之外，其余部分按照原样重修墓园，补种了墓园内的树木，附近被开辟为南丹公园。“文化大革命”期间，墓园内的地标建筑大多被毁坏，重建的华表、石牌坊和石像生等全部遭到砸毁，墓地被改作露天仓库。1975年，该墓园被上海市园林部门联合上海市文物管理委员会收回，并加以整修。1980年，数学家苏步青为徐光启墓题了一块墓碑，树立于徐光启墓前