根据2003年3月第十届全国人民代表大会第一次会议审议批准的《国务院机构改革方案》和2003年4月国务院批准的《国家食品药品监督管理局主要职责内设机构和人员编制规定》（“三定”规定），国务院直属机构国家食品药品监督管理局挂牌成立，办公地点为北京市西城区北礼士路甲38号。2008年3月15日，第十一届全国人民代表大会第一次会议通过《第十一届全国人民代表大会第一次会议关于国务院机构改革方案的决定》，批准《国务院机构改革方案》。方案规定：“国家食品药品监督管理局改由卫生部管理。明确卫生部承担食品安全综合协调、