3月18日，徐谦和李大钊、赵世炎等人发起在天安门前举行“反对八国最后通牒国民大会”，徐谦任大会主席团主席。随后三·一八惨案发生。惨案之后，徐谦随即和李大钊、顾孟余等5人遭到临时执政段祺瑞通缉。徐谦逃入北京的苏联驻华使馆，随后和顾孟余等人秘密离开北京，经外蒙古库伦赴苏联。当时，冯玉祥因遭奉直共同反对而被迫下野，启程赴苏联考察。在库伦，徐谦与冯玉祥相遇，并介绍冯玉祥加入中国国民党。同年7月，徐谦离开莫斯科，取道欧洲回广州，8月回到广州，就任广州国民政府委员兼司法部长。同年10月，中国国民党中央在广州举行中央执监