0年2月被指定为祭祀天照大神的官币大社，同年11月1日，伊藤博精公爵将御灵代带到南洋神社，执行了为期三天的镇座祭。南洋神社的落成被日本政府视为建立东亚新秩序的重要进展。
疏散与废止.第二次世界大战末期，为了躲避连续数日的空袭，1944年11月22日在帛琉本岛（巴贝图阿普岛）的丛林中设立临时本殿，将御神体迁移过去。1945年9月11日，日本方面在美国的同意下进行了奉烧式，将位于柯罗的社殿进行奉烧。御神体则以船运送至位于东京的宫内省，1月19日完成御奉迁的手续。Section::