特兵一千开赴乌兰固木等处屯田。康熙五十六年（1717年），傅尔丹授职为振武将军，与靖逆将军富宁安出兵讨伐噶尔丹，驻军阿尔泰。康熙五十七年（1718年），傅尔丹上疏请与富宁安分路进兵，谕定师期。其后，傅尔丹请与征西将军祁里德统领一万二千人，以七月为期出兵布鲁尔，直抵额尔齐斯河。刚好，策妄阿喇布坦遣使前来乞和，朝廷下令暂停进取，缮兵防守。其后傅尔丹更击溃准噶尔，建立殊功。
雍正年间.雍正三年（1725年），傅尔丹被召还任内大臣。雍正四年（1726年），任黑龙江将军。雍正六年（1728年