木柱和其他木质部件没有使用钉子，清真寺的墙壁是用木板做的，屋顶是用锡做的。内部饰有阿拉伯文，也有民族饰品。寺院的东北方有一个小院子，而南方则是伊斯兰学校。清真寺整体被2.3米的石墙围绕，有南北两侧门。
历史.1887年，在一次穆斯林社区聚会中，维吾尔族商人提议集资修建清真寺，并得到支持。Hong Pique作为总设计、建筑师同工匠们一起修建了扎尔肯特清真寺，而装饰工作则是由Hong Pique与哈桑·伊玛诺夫、塔希尔·伊斯梅洛夫、纳斯列丁·卡拉、阿布都卡迪尔等当地艺术家共同完成的。