冷战局面。世界各地的一些国家开发出了高科技防空系统，使空袭失去效果。因此，多数国家之间通过秘密特工进行敌后战争。科学和技术已经从根本上改变了地球的面貌和人类的未来。社会暴力抗议逐渐增加，人们试图阻止被科学家鼓吹为“进步”的科技发展。军事技术高度发展，机械化士兵将在战斗中发挥重要作用，而超级战士则已具备前线作战能力。人类的人性正在逐渐泯灭。玩家将扮演一名来自“黑色行动”团队的超级士兵，进入一个“黑暗、扭曲的未来”。
故事.在劳尔·梅南德斯（Raul Menendez）的阴谋破产后，时