遭幕府怀疑对己不利，被逐出日本。
来台.明天启四年(甲子，1624年)，颜思齐领十三艘船只来到台湾魍港为据点，开始海上为盗。传说颜思齐离开日本后，聚集三千余漳泉贫苦人民先后渡台，并在魍港作为据点，除海上寇略外，也从事开发，防备原住民，为华人开拓台湾之始。明郑及清初的「诸罗外九庄」留有颜氏开垦的遗迹。天启五年(乙丑，1625年)，颜思齐于诸罗山（今嘉义）打猎途中染伤寒病逝。颜思齐死后，所部归于郑芝龙统领。其墓位于台南市白河区内角里的将军山(现今陆军南测中心营区内)Sectio