1994年首次办理省长选举时高票当选连任，成为台湾省第一位民选省长。1998年台湾省被冻省，从此不再进行省长选举，宋楚瑜成为唯一一任民选省长。
角逐2000年总统大选.1999年，因为争取中国国民党总统候选人提名未果而和李登辉、连战决裂，遭国民党开除党籍。宋楚瑜自行以无党籍身份，成立新台湾人服务团队，与长庚医学大学校长张昭雄搭档参选2000年中华民国总统选举。最后在泛蓝分裂的情况下，以30万票的差距败给民进党的陈水扁。落选后，联同以新台湾人服务团队为班底的支持者，成立亲民党，