方略中亦存在严重缺陷，直接或间接导致其后来的军事失利：
燕军防御阶段.
朱棣起兵，夺取幽燕.洪武三十一年十二月，为了提防燕王谋反，朱允炆派工部侍郎张昺为北平布政使，都指挥使谢贵、张信为北平都指挥使。随后又命都督宋忠屯兵驻开平，并调走北平原属燕王管辖的军队。燕王朱棣见到几位亲王先后被削藩，或贬或死，明白如此下去必定无法逃过此劫，遂一边争取时间一边做战争准备。爲了争取时间，建文元年，朱棣先装病，使惠帝放三子回北平；之后由于属下被朝廷处死，遂借机装作精神失常。但