教通也拂衣而起，大唿：“藤原氏的诸位官僚都罢官了吧，春日大神的威严今日是尽头了！”于是诸位藤原氏的官僚都起身，随教通走了。天皇不得已，下诏召还教通并允许了他的请求。大和国国司与兴福寺有争执，天皇亲自裁决，其意支持国司，然而教通不悦，天皇屈从教通之意。延久2年，教通官拜太政大臣，不久即辞。
余生.延久5年（1073年），在位仅5年的后三条天皇因病让位儿子白河天皇，不久驾崩。承保元年（1074年），教通之兄赖通、姐彰子亦以八十几岁高龄辞世。翌年（1075年），教通亦薨，享年八十岁。