，如、或等，也会增加罹患脑膜炎的几率。在这些案例中，葡萄球菌、和其他革兰氏阴性菌的感染较常见，有免疫缺陷的脑膜炎患者亦较常感染这些病原菌。头部与颈部的感染，如中耳炎或，也可能会在小部分人群中引起脑膜炎。人工耳蜗植入者则较容易罹患肺炎球菌脑膜炎。即为结核桿菌所引起的脑膜炎，在结核病盛行的国家较常见，但也见于免疫缺陷的患者中，如爱滋病患。反覆发作的细菌性脑膜炎可能是因为解剖结构缺陷（包括先天性或后天性缺陷）或免疫系统失调所导致。解剖结构缺陷使得外部环境与神经系统之间得以接触，其中最常见的因素就是，尤其是