日本新干线车辆的标准。2003年至2004年，JR东日本对所有E1系车辆进行更新工程。内部除了更新车厢装潢外，也换上E2系1000番台（绿色车厢）和E4系（普通车厢）使用的座椅。此外，还将灰色系为主的涂装换成E4系白色和蓝色为主的涂装，中间彩带则採用朱鹭色，并在车身的Max标志中加入朱鹭的图案。首列完成更新工程的列车于2003年11月28日重新投入服务。更新后的E1系在经过几年的使用之后，于2012年7月的改点公告中宣布将于9月29日自定期车班用车的行列中退出，结束其长达18年的定期车班服务。原本以