在物理和化学及相关领域，主方程（Master equation）被用来描述特定的系统。这种系统可以被建模成在任何时间下都处于多个态的概率叠加状态，并且态之间的切换由转换概率矩阵（transition rate matrix）决定。该方程由一组含时微分方程组成，描述系统对不同态的占据情况随时间的变化。
简介.主方程是唯象的一阶微分方程，用于描述系统随连续变量"t"（时间）占据各离散态的概率。一般以矩阵的形式出现：其中formula_2是列向量，元素"i" 代表"i 态"，form