其嫡子足利义尚在征讨六角氏的阵中死去，义政决定重归政坛，但遭到妻子日野富子的反对。此时义政身患中风，无力管理政务。因此在美浓守护土岐成赖的调停下与亡命的弟弟足利义视达成和解，收养义视的嫡子义材为自己的养子，立之为继承人。
逝世.延德二年正月初七日（1490年1月27日）足利义政病逝于银阁寺内，享年五十四岁，死后追赠正一位太政大臣。结束了长达四十年的统治。安葬于京都相国寺，以足利义材嗣位为将军。
评价.虽然足利义政在政治上是个失败的统治者，但他却对日本室町时