5年，台汽裁撤票证所与机料厂。1997年，台汽裁撤五个运输处。台汽规模逐年萎缩，亏损却连年增加，累积负债高达约新台币四百亿元。台汽民营化的唿声遂由此而起。1998年台湾省政府功能业务与组织调整后，台汽改由中华民国交通部主管。2001年1月3日，行政院核定交通部拟具的《台湾汽车客运公司民营化方案执行计画》，定下在2001年6月30日前必须完成台汽民营化的目标。台汽的民营化方案是台汽员工集资成立新公司以承接台汽原有业务，这在台湾的公