1938年3月，刘戡升任国民革命军第九十三军中将军长，下辖国民革命军第83师（师长刘戡兼任）、国民革命军第94师（师长朱怀冰）；1940年九十三军移驻陕西阳城监视中国共产党根据地活动，刘戡因私下和中国共产党接触，且军参谋长魏巍同时是中共地下党员，因此被军统监控，军统要求刘戡将魏巍调职以便诱杀，但刘戡抗命并协助其逃往延安，1942年9月蒋介石将其撤职，九十三军军长由副军长兼刘的黄埔一期同学陈牧农接任。刘戡遭撤职后，转调陆军大学进修兼就近监视。1944年豫中会战洛阳遭日军佔领后，在同学兼前上司胡宗南的保荐