录过程中作爲RNA生物合成的底物。它的结构与含氮硷基鸟嘌呤相似，唯一的不同是GTP连有一个核糖基团以及三个磷酸基团，其中，鸟嘌呤与核糖基团的1位碳相连，磷酸基团与核糖基团的5位碳相连。另外，GTP还能在生物体代谢过程中作能量源或底物活化剂，这一点和ATP（三磷酸腺苷）相似，不过，它的专一性较强。GTP在蛋白质生物合成以及糖质新生过程中作能量源。GTP在信号转导过程中起不可或缺的作用，特别是和G蛋白作用时以及在第二信使机制中，在的催化作用下，GTP会转化爲GDP（二磷酸鸟苷）。Section:::