pe Alou的带领下巨人队从输掉2002年世界大赛的阴影中重新站了起来，在季赛取得了超过100场胜利，是球队历史第七次和在旧金山的第三次。巨人队在整个2003年球季都是第一名，是仅有第九次有球队达到这个纪录。但是如同1997年球季，巨人队在第一轮的联盟分区赛，以一胜三败输给了将成为那个球季世界大赛冠军的佛罗里达马林鱼队。2004年，巨人队直到球季的最后一天才被淘汰，最后分别以一场的胜差无法取得外卡资格，和两场的胜差输给了分区冠军洛杉矶道奇队。这个球季结束在一场充满戏剧性的比赛上，道奇队在第九局靠着St