战的氏真家臣朝比奈泰朝而一度陷入苦战，但是最终成功攻下挂川城。在元龟元年（1570年）6月爆发的姊川之战中，清长亦有参战，并且立下军功，从而获赐予远州100贯文的领地。元龟3年（1572年）12月爆发的三方原之战中，清长亦有参战，然而德川军却大败于武田信玄，清长本人亦受伤，同族和郎党共数十人战死。天正8年（1580年），清长获家康赐予远州马伏冢城和鎌田乡。天正10年（1582年）6月，织田信长在本能寺之变中死去，在家康期间，清长以小荷駄奉行身份担任殿军之职，却不幸被盗贼以铁砲击伤。同年，清长获赐予骏