。雍正元年（1723年），配合台厦道增设彰化县，虎尾溪以北皆纳为其管辖。雍正九年(1731年)台湾道成立，并增设淡水厅。至光绪十三年(1887年)，福建台湾省成立，台湾府迁移至台中，并新设台湾县，范围包含今日南投地区。开垦初期南投地区仍有部分地区为平埔族聚落。也因为位处于番界边缘，官府有驻军于此，并令平埔族人在番界一带土地耕种，后平埔族群转入埔里盆地。汉人亦渐渐入垦埔里、水里等地。开发较晚的埔里盆地于清嘉庆十九年（1814年）因遭到汉人的入侵而爆发郭百年事件，对泰雅、布农两族的冲击甚大，导致清政府一