弥撒。1993年2月，圣中管乐团成立。1993学年把第二校初中部迁入校本部上课；天神巷43号新校舍命名为第二、三校，设小学。1996年成立圣中史地学会、圣中救伤队。1999年校本部新教学大楼落成启用；11月4日举行第25届校运会，由候任澳门行政长官何厚铧主礼；12月20日，澳门回归中国，圣若瑟教区中学全体中学师生参加在澳门运动场举行的「澳门同胞庆祝澳门回归祖国大型文艺表演」；2005年10月29日，圣若瑟教区中学初三至高三师生参与第四届澳门东亚运动会开幕典礼的表演。2006年3月19日，即圣若瑟教区中学