深圳地铁14号线的惠阳段，以及拟建的惠州地铁1号线，将会途经本站。2020年，深圳地铁14号线惠州段列入交通运输部关于深圳市开展高品质创新型国际航空枢纽建设等交通强国建设试点工作的意见。
未来发展.2020年9月17日，深圳市地铁集团发布了深汕高速铁路首次环评报告，惠州南站将成为该线的一个中途地下车站。