，当真嗣看到这个同龄少女身受重伤却仍欲出击的状况之后，真嗣终于下了决定、乘上EVA。作为EVA适格者、EVA驾驶员，真嗣被称为第三适格者、驾驶含有他母亲灵魂的EVA初号机。战斗结束后，真嗣在第3新东京市展开了新生活，不过父亲还是和他分开住；这时他的上司葛城美里见真嗣很孤独，于是提议一起生活并成为他的监护人，因此真嗣就住进了她家。自从成为NERV一员、和葛城美里一起住之后，他渐渐产生了变化，也交到了朋友，如他的同学铃原冬二和相田剑介，以及同是驾驶员的绫波零和惣流·明日香·兰格雷。经过多次战斗后，身边的人