ection::::台南分灵说.一是日治时期之初，日军驻在台南白龙庵附近，但每次扶乩或迎神赛会，让士兵们觉得吵闹异常，经过交涉后，庙方在亭仔脚街建立新庙，在此举办宗教活动，自比为达摩祖师开宗立派，故以「祖师西来」之意，改称西来庵，而信众改到新庙宇扶乩、求签。也有说法表示清代时，台南白龙庵多为福州籍官兵祭祀，闽南士绅为了祭祀方便，分香建造了西来庵。
福州白龙庵分灵说.另一说法则是有一名旅行者携带福州白龙庵香火，经过亭仔脚街，打算如厕，又恐怕污秽香火，于是将香火绑在树上，如厕后，却发