借民房办公。民国34年（1945年）第二次世界大战结束后，中华民国收复金门，设二镇四乡；民国35年（1946年）变更为二镇二乡。
中华民国军管时期.民国37年（1948年）12月10日，中华民国政府发佈全国戒严令，从此金门县进入戒严。民国38年（1949年）年初，改为金城、沙美、烈屿、大嶝四区区公所，同年10月，解放军进佔福建沿海，中华民国国军自嶝岛群岛（大嶝、小嶝）撤退，古宁头战役爆发，金门全境进入「军管时期」，同年11月古宁头战役结束后，金门县政府建制被撤销，中华民国国军将金门