特·达蒙的坚持下，这段内容才得以保留。李曼和达蒙认为，虽然这场戏有些低调，但对于观众理解伯恩的个性以及电影的核心主题来说是不可或缺的。之后这场农场的戏段在最终确定保留前，还经过了多次改写。电影拍摄过程中存在的其它问题包括：制片商希望把巴黎的镜头改在蒙特利尔或布拉格拍摄，以求节约成本。李曼坚持在电影中使用法语，试映时观众对电影在巴黎结局的反映很差。其中最后一个问题让剧组和演员又回到拍摄地点来拍摄一个新的，拥有更多动作镜头的结局。除了巴黎外，剧组还分别在布拉格、因佩里亚、罗马、米科诺斯岛和苏黎世进行了拍摄，