2年，在同胞贝尔蒂·福格茨入主苏格兰足球代表队的几个月后，邦霍夫获委任为苏格兰21岁以下足球代表队（苏格兰U21）主教练。他也因此成为该队的首位全职主教练。苏格兰U21最初在邦霍夫的带领下取得了成功，曾在2004年欧洲21岁以下足球锦标赛预选赛中客场战胜德国，并以分组头名晋级淘汰赛阶段。然而在淘汰赛他们却以两回合总比分1比2不敌克罗地亚，无缘决赛圈。邦霍夫在福格茨于2004年11月从苏格兰国家队辞职后仍继续担任苏格兰U21的主教练，但在率队连续14场比赛不胜后，他最终也于2005年11月辞职。在苏格兰U21