此馆开幕，当时它仅仅是柏林博物馆中的一个分部。到了1999年，犹太博物馆正式独立成为单一的机构，并寻找馆址成立独立的建筑物。2001年，柏林犹太博物馆落成，建筑师是知名的丹尼尔·里伯斯金。目前博物馆馆长是出生于柏林的麦可·布鲁蒙赛尔教授。他曾在美国卡特总统时期，担任过美国的财务部长。
建筑.柏林犹太博物馆的新建筑是相当不同于其他博物馆的，因为它并不反应任何功能需求，空间设计的诉求不是为了展出文献、绘画或是播放纪录等，而是将空间本身视做德国犹太人的历史故事来铨释。因此整个博物馆建