见长，颇有干嘉考证余风。着有《经余杂录》、《芸阁山人集》、《小草拾遗》、《三长赘笔》与《一肚皮集》等书，然皆稿本行世。其手稿后藏神冈吕家，后为陈炎正所得，陈氏后赠「台湾史蹟中心」。该中心曾影印併陈氏所撰《年谱》编为《吴子光全书》三册。而早年编印《台湾文献丛刊》时，也曾从其《一肚皮集》中辑录有关台湾资料，编为《台湾纪事》。