到阮福映的拒绝，随后被任命为镇边（今边和省）留守。阮文仁虽然没有文化，但他在此任内开始拜师读书，涉猎经史。1797年，阮福映亲征归仁，任命阮文仁为掌奇，辅佐皇二子阮福曦留守嘉定。在任期间劝课农桑，将嘉定治理地很好。1802年，阮福映统一越南，建立阮朝，改元嘉隆。阮文仁被任命为掌振武军郡公。阮文仁向嘉隆帝上表，提出广求贤才、制定法度、设立学校、劝课农桑等等十四条建议，被嘉隆帝一一採纳。1808年，阮文仁取代阮文张，成为嘉定总镇，遥领平顺、河僊二镇。同年暹罗入侵真腊，阮文仁率军来到暹罗边境，迫使其撤