属于第二类MHC的HLA（HLA-DP, HLA-DM, HLA-DO, HLA-DQ, HLA-DR）将来自细胞外的抗原呈现给T淋巴细胞。这些抗原刺激辅助T细胞（T-helper cells，也称CD 4+ T细胞）增殖，进而刺激B细胞产生抗原特异性抗体。自身抗原会被调节T细胞抑制（regulatory T cell）。
遗传学.HLA复合体位于6号染色体短臂上的21.31区（6p21.31），由360万个碱基对组成，是目前已知的人类染色体中基因密度最高，也是多态性最为丰富的区