在令制国时代属于山城国。16世纪末丰臣秀吉晚年在此建立了伏见城，此后开始以城下町的形势发展，因此出现大量的武士住宅，虽然一度遭遇损毁，但很快地有完成重建，而丰臣秀吉最终过世于伏见城内。此后伏见城成为德川家康监视位于大坂的丰臣秀赖的据点，1600年关原之战前发生的伏见城之战，西军先进攻了德川家康所拥有的伏见城，造成伏见城再次烧毁，但德川家康为了继续监视丰臣家，再次迅速的完成重建；最终德川将柯在此就任征夷大将军，此后建立了江户幕府。江户时代后，纪伊郡南部大部分区域成为幕府直属的领地，其余地区则分属皇室