有原生动物，它们靠细菌来协助他们分解纤维素。白蚁肠道内的原生动物共有两门，分别为 Parabasalia 和 Preaxostyla ，其中 Preaxostyla 门的原生动物皆属于 Oxymonadida 目。
体外共生.白蚁科中的大白蚁亚科会盖菌圃，并种植真菌，取食孢子。台湾土白蚁 （"Coptotermes" "formosanus" ） 与鸡肉丝菇 （"Termitomyces" "eurhizus" ） 共生，鸡肉丝菇的孢子中含有色胺酸（tryptophan），色胺酸为