10月12日，升任汉斯·法郎克治理下的德占波兰总督辖区的副总督。1940年5月18日，赛斯-英夸特取代亚历山大·冯·法肯豪森将军成为荷兰总督辖区总督，主管平民事务与增进德国所获利益。到任后，赛斯-英夸特开展了称之为“消灭敌手”的行动，大力扶植荷兰国家社会主义运动并授权该政党创建一个辅警组织，用以取缔其他政党，逮捕荷兰前政府官员。在担任德占荷兰总督期间，赛斯-英夸特积极与地方党卫军的高级首脑和盖世太保头目合作，迫害反纳粹人士和犹太人，其中荷兰的十四万犹太人中有近十二万人被送往东方的集中营。经济上他实行