于该目的物种孢子多具二壳，故得名。该目下属有一系列对水产养殖业和渔业会造成巨大经济损失的物种，比较着名的是寄生于鲑科的脑粘体虫和寄生于南海鱼类的五角虫属。下属绝大多数物种的孢子具2个极囊，但部分也可具1或4个。
亚目.本目有三个亚目：
学名与系统分类.双壳目分出3个亚目和13个科