底隧道影响行车，贯彻「晨早特别线」的使命；全程跨越9个地区，亦成为全港路程最长的专利巴士路线。但缺点是容易受到大老山隧道和东区走廊经常塞车之麻烦而引起延误。1998年5月底，贯通新界西元朗和香港岛西营盘的3号干线随大榄隧道启用而正式全面通车，途经西区海底隧道往返元朗、天水围及铜锣湾的968和969线也随即改经大榄隧道。由于两线在行车时间和收费上佔优，在天水围、元朗和香港岛的覆盖亦较广，来往新界西元朗、天水围和香港岛两地的乘客很快便舍本线和903R线而去。经过近4个月时间，九巴决定放弃经营本线，于同年9月