原癌基因的突变导致10-30%的肺腺癌。大概4%的非小细胞肺癌与一个酪氨酸激酶融合基因有关。表观遗传学的变化——如DNA甲基化，组织蛋白尾部修饰或小核糖核酸（微RNA）调控的改变可能会导致抑癌基因的灭活。表皮细胞生长因子受体（EGFR）调控细胞增殖、凋亡、血管生成和肿瘤侵袭。EGFR基因的突变和增幅是非小细胞癌常见的致病机转，因此EGFR抑制剂可以用于某些肺癌的治疗。其它经常发生突变或扩增的基因有、、、和。其细胞株系起源机制尚不完全清楚。机理可能涉及干细胞的异常活化。在气道近端，表达的干细胞最易发生