于1929年参加兴国县的红军赤卫队，不久编入红军正规部队。1932年加入中国共产党。邱会作在红军内职务一直不高，担任连级指挥员。1934年跟随中央红军长征。到达陕北后在军委总部担任后勤部门负责职务。抗日战争爆发后，在军委继续负责后勤部门工作。1940年皖南事变后，调至新四军第四师。国共内战爆发后，至东北，跟随东北民主联军，在东北民主联军第八纵队、中国人民解放军第四野战军第四十五军作战，参加辽沈战役、平津战役、衡宝战役。战后在中南军区任职，后任总后方勤务部副部长，后方勤务学院院长。1955年被授予中将军衔