前四百大，董事长蔡长海医师于2012年表示，未来目标为三年内进入世界前四百大。中国医药大学在2012年列在世界大学学术排名前500大，更挺进世界临床医学与药学（简称医科）领域前200强。临床医学与药学的排名中，台湾有三所进入世界前200强，分别为国立台湾大学、中国医药大学与长庚大学。中国医药大学研发长蔡辅仁表示，论文数相较于六年前，成长4.1倍，而高品质的期刊论文则成长6.5倍，达215篇。近三年的论文平均被引用次数达3.44次，居台湾7所医学大学之首。但2018出现危机，台北医学大学论文数量于Q1超越