刘邦建立汉朝后，两浙仍置会稽郡，并一度为封国吴国的范围。浙江东南部的东瓯国在吴王刘濞叛乱以后被闽越国灭亡，后来也属会稽郡管辖。这一时期两浙属于秦帝国和汉帝国的边陲地区，尤其在秦始皇和汉武帝时期，太湖流域和宁绍地区与岭南等地一样，是罪犯流放之地。到东汉时期（25年－220年），会稽郡治所迁往山阴（今绍兴），苏州成为新设的吴郡治所。秦国占领浙江后，将原越国本部设立会稽郡，行政中心位于今天的苏州，此前相继为吴国、越国的故都。浙江省当时主要属会稽郡，西北一部属丹杨郡，南部温台丽地区属于东瓯国，大片地区仍