东省政府撤离济南，在省内流亡，并于1938—1942年在全省先后设置了17个区。巨野、郓城、寿张、汶上属第二区，单县、成武、曹县属第十一区，菏泽、定陶、濮县属第十六区。日本投降后，山东省政府虽然调整了行政区划，但境内各县的归属仍未变。1948年9月中国人民解放军占领全县。1949年3月，华北人民政府决定将冀鲁豫第二、三、五、七专区分别更名为临河、湖西、鲁西南、运西专区。是年8月，平原省建立，划境内西北部临河、鲁西南及运西的一部分合并为菏泽专区，与湖西专区同属平原省人民政府。
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