40次列车经由京沪、宿淮、新长、宁启线运行，增加南通去往北京方向的运力，亦成为宿淮铁路沿线的首班进京列车。2018年7月1日起，Z139/140次列车改为使用BSP车体。
列车编组.Z139/140次列车使用庞巴迪制造的25T型客车，配属北京铁路局北京车辆段，列车满编采取18辆编组，其中软座车4辆、软卧车13辆，餐车1辆。