地震的机率低，且建筑物的设计可承受芮氏规模10.0的地震，周围也长年覆盖永久冻土，即使岛内的冰帽融化，种子库仍然能保持设备和建筑物的干燥，建筑物内的种子则被密封在三层铝箔包装中，并将其放入箱子内保存。为保护种子，人员须穿越400英尺长的隧道，并通过5道密码锁门，才可进入地下的种子储存库。种子库拥有3个种子储存库，每个储存库可储藏150万份种子，总共可储存约450万份。由于斯瓦巴群岛产煤矿，为种子库制冷机的动力提供原料来源，使其能进一步将种子冷却至摄氏−18℃的最佳温度，且即使制冷机发生故障，种子库也需