3日经墨西哥曼萨尼约以南约740公里海域的东风波发展而成，在向东南方向移动期间稳步增强，于11月15日达到持续风速每小时175公里的最高强度。气旋接下来转向北上，因风切变增多而开始减弱，此后又转向西进，始终远离墨西哥海岸，于11月20日在最初形成位置的西北偏西方向约515公里洋面消散。风暴在墨西哥海岸沿线产生小雨，但总体影响很小。塞尔吉奥的形成标志着2006年太平洋飓风季成为12年来最活跃的太平洋飓风季，也是数十年来首次在11月有多场热带风暴形成。与此同时，塞尔吉奥还是11月1日后形成的最强太平洋飓风，