红海沿岸等热门旅游地区的包机航班，主要航点为西班牙的帕尔马和土耳其的安塔利亚。在旅游旺季还有包机飞往布尔加斯和瓦尔纳。在定期航班中，由汉莎航空的合作伙伴卷云航空每日提供若干个航班往返于慕尼黑，以31座的多尼尔328-100飞机执行。机场曾为开办往返于汉堡的定期航班做过各种努力，但都一一失败。机场的货运航班目前只有TNT航空提供前往列日的航班，通常会在夜间22点抵达埃尔福特，由BAe 146飞机执飞。此外，除了民用航空，联邦国防军的军用飞机偶尔也会使用埃尔福特机场。