流域特大洪水，第四十一集团军奔赴第一线，在湖北、湖南等地参加抗洪抢险。2016年，中国人民解放军七大军区撤销，成立五大战区，陆军第四十一集团军划归中国人民解放军南部战区陆军。军部驻地从广西柳州迁往云南昆明。2017年4月18日，中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平在北京八一大楼接见新调整组建的84个军级单位主官，并对各单位发布训令；中共中央政治局委员、中央军委副主席许其亮宣读习近平主席签发的中央军委关于调整组建军兵种部队和省军区系统军级单位的命令、决定。在这次军级单位调整组建中，以陆军第四十