十五年（1566）十二月即帝位，隆庆六年（1572）去世。安葬明穆宗朱载坖及三位皇后的昭陵，早年施工不周，完工后一年，建筑便出现了地基沉陷的问题。1574年，昭陵神宫监官陶金等上奏说：「六月以来，阴雨二日，本陵棱恩门里外砖石沉陷。」1575年正月，明神宗不得不委派等提督再修昭陵。第一次兴建地面建筑，共动用库银390,932两，仍未计算当中木植、白城砖、大石窝等费用。后来又有户、兵二部动用110,119银两，总计501,050银两。其中；营缮司又用204,422银两，虞衡司 13,145两，都水司118,