离出来的化合物被简单的标记为05865，但是最后它有了一个通用的名称：Vancomycin（从单词 "vanquished" (征服)衍生而来）。很快，万古霉素的优点就表现了出来：尽管在含万古霉素的培养基上经过多代的传代培养，葡萄球菌仍然未显示出明显的抗药性。当时，越来越多的葡萄球菌对青霉素类抗生素产生了抗药性，这使万古霉素很快在1958年获得了FDA的许可。Eli Lily公司首先生产并销售万古霉素，商标是 Vancocin。由于以下几个原因，万古霉素从来没有成为治疗金黄色葡萄球菌感染的一线药物：