斗时纵火更导致多人受伤、数千册图书资料被烧毁。在文革早期，全校有约300人被查抄、380余人被批斗审查，14名教工死亡；大量教学设施和校舍遭到破坏，共有价值180余万元的教学设备仪器遗失、损坏。1969年12月，原教育部直属的院校均被下放给所在地方的革命委员会领导。1970年10月，广东省革委会对广东省高等学校做出“调、并、迁、改”的决定，华南工学院被更名为广东工学院；原省属广东工学院改为广东矿冶学院，并迁往韶关，其3个专业调入新的广东工学院；暨南大学被撤销，其化学系、数理化基础教职工及行政系统与原华南工学