天主教斯科普里教区 （、）是马其顿共和国一个罗马天主教教区，属萨拉热窝总教区。范围包括马其顿共和国全境，教座位于首都斯科普里。2011年有教友3,649人（估辖区人口0.2%）、两个堂区、4名司铎。现任教区主教为基罗·斯托扬诺夫 。教区设于4世纪，称为达尔达尼亚总教区，1656年易名为斯科普里总教区。1924年10月29日降格为教区。1969年10月2日普里兹伦教区併入，易名为斯科普里-普里兹伦教区。2000年5月24日普里兹伦署理区分出。