00番台出厂前退役，因此从中央、总武缓行线抽调共5列209系500番台，以暂代这批试作车。而原有批次的空缺则由新制的E231系来补充。2009年9月，京滨东北线所使用的209系500番台列车，除第516编组返回中央、总武缓行线外，其他4个编组最初被调往京叶线。后来由于京叶线启用了E233系，除1列返回中央、总武缓行线外，其他3列拆解其中两zh-tw:节;zh-hk:卡;zh-cn:节;zh-tw:无动力车;zh-cn:无动力车;zh-hk:拖卡（ SaHa209，原2号车及4-6号车其中一辆