这之后任职于右大臣，而石川麻吕的女儿远智娘和她的妹妹(姪娘)都是中大兄皇子（天智天皇）的妃子。石川麻吕649年由于冤罪自杀，谗言的弟弟苏我日向也让大宰府降职(也有封口一说)。但是，他的弟弟和，在天智天皇的时代任职于大臣（苏我赤兄是左大臣，苏我连子被推为右大臣），苏我氏始终在朝廷保有着一定的地位。苏我连子在天智天皇尚未正式即位之前就去世，苏我赤兄和另一位弟弟－苏我果安在壬申之乱中战败，分别处以流放、自杀。赤兄的外甥（苏我连子的儿子）——苏我安麻吕取得天武天皇的信任，苏我氏的后继者被赐姓石川。在乙巳之乱之后