（1898年）6月，废新竹县，苗栗改隶台北县「新竹办务署」；同年11月，苗栗复隶台中县，并设「苗栗办务署」。明治34年（1901年），又设立独立的苗栗厅。明治42年（1909年），苗栗地方废苗栗厅，改隶「新竹厅」。大正九年（1920年），复设苗栗街，为苗栗郡治，隶属于「新竹州」。二次大战后，国民政府于民国35年（1946年）改「州、郡、街庄」为「县、区、乡镇」。原苗栗街改称「苗栗镇」，为苗栗区区署所在地。政府迁台后，于民国39年（1950年）10月调整行政区域，将新竹县分为桃园、新竹、苗栗三县，