、鄂霍次克号、北斗号、十胜号、超级大空号列车等JR北海道运行的行驶于北海道各主要都市间的特急列车全部以札幌作为运行端点。2013年，札幌站日均乘客数达93,152人。除了JR北海道之外，北海道还有三家铁路事业者。在钏路市经营有一条运煤的货运铁路。函馆市企业局交通部经营函馆市路面电车业务。札幌市交通局是札幌市营地下铁的经营者，现在札幌市营地下铁包括了南北线、东西线、东丰线三条线路。贯通日本本土的新干线亦有开进北海道，北海道新干线在2016年3月开通新青森至新函馆北斗区间，预计2030年末从新函馆北斗延伸至札幌