08赛季受到伤病的困扰，梅西在40场比赛打入16球，巴塞罗那也在此赛季也显现出过多的弊病，决意在下赛季的阵容方面大量进行改造重建。
2008－09赛季.2008-09赛季时，穿上了离去的zh-hans:罗纳尔迪尼奥;zh-hk:朗拿甸奴;zh-tw:罗纳尔迪尼奥;所留下的10号球衣，成为了红蓝军新一代的领军人物，2008年的欧洲足球先生和世界足球先生中，美斯都名列第二，紧随克里斯蒂亚诺·罗纳尔多其后。在2009年2月1日联赛做客对上桑坦德竞技时，为巴塞隆纳射进了俱乐部历史上