到鸡笼湾内的鸡笼岛上建立圣萨尔瓦多城作为统治中心。虽然西班牙人不被允许和明朝展开正式贸易，但却以免关税、免货物税，甚至免入关查验的方式，吸引走私商到鸡笼作生意。1633年（崇祯六年）荷兰东印度公司以台湾为基地对大陆福建沿海进行封锁、掠劫，明朝水师在郑芝龙率领下击败荷兰东印度公司与海盗联军，史称崇祯明荷海战。在台湾的汉人也曾反抗荷兰统治，较知名的是1652年郭怀一事件。当时有四五千汉人参与，约为台湾汉人总数的四分之一，历时12天后被镇压，三四千名汉人死亡。清张廷玉所修《明史》中描述的台湾疆域是，“其地