随季节变化颇为规律。夏季常吹南南西风及西南风，秋冬后几全为北北东风或东北风。入冬后季风常伴随冷气团南下，风势强劲而寒冷。
交通.在空中交通方面，目前仅有国内航班，立荣航空每日从台北松山机场往返马祖南竿机场八个班次，多于往返马祖北竿机场的三个班次，航行时间均约50分钟。另外，立荣班机每天往返台中国际机场与马祖南竿机场一个班次，航行时间约70分钟。如果因为天候不佳，则实施「南机北降」，旅客由北竿机场下机后搭车前往白沙港，转乘每小时一班的南、北竿交通船前往南竿福澳港，航程约12分钟。