遂以清方所说的“生番系化外之民”为话柄，于1874年向「无主番界」台湾出兵，史称牡丹社事件。
清琉断交.由于清朝方面在《北京专约》中承认了日本的出兵系“保民义举”，这给予了日本吞併琉球的口实。在北京签订完《北京专约》的内务卿大久保利通，回日本后，便通过太政大臣三条实美，向明治天皇提出“今通过与清国之谈判，彼承认我征藩地为义举，并出银两抚恤受害难民，虽似足以表明琉球属于我国版图之实迹，但仍难说两国分界业已判然”，为将来计，期望明治政府借机断绝琉球“与中国之关系，在那霸设置镇台分营”。