辉于各乡镇推动设立卫生所，又于各县市推动设置卫生院，使得公共卫生政策及服务得以普及，并使天花、鼠疫、狂犬病等传染病逐渐绝迹。1963年，颜春辉应世界卫生组织邀请，于印度、中东及非洲地区任职防疫顾问，复派驻巴基斯坦任代表，其后又于该组织日内瓦总部掌管流行病部门。 1971年，颜春辉应总统蒋介石征召，返台筹组卫生署；同年3月17日，他出任行政院卫生署首任署长，直至1974年6月25日方卸任。
教学研究.卸下卫生署长职务后，颜春辉在国立台湾大学医学院、国防医学院、高雄医学院、中国