藻从南郑出兵，征讨南齐。太和十九年正月乙未（495年3月7日），元衍进攻钟离，南齐徐州刺史萧惠休据守城池，趁机袭击北魏军队，将他们击败。太和二十二年（498年），魏孝文帝亲征南齐，三月，南齐将军裴叔业率领军队围困涡阳，想要围魏救赵解义阳之围，魏孝文帝诏令高聪等四路军队前往支援，之后又派遣元衍前往，魏军都战败了。景明元年（500年）八月，南齐将军陈伯之进犯北魏的寿春，沿着淮河进攻，当时元衍和司徒彭城王元勰共同镇守寿春，因为九江郡刚归附北魏，民心尚未完全顺服，而且北魏行台的援兵没到，元衍和元勰对此非常担心。魏宣