系由部属高校变更为省属高校；1999年，与江苏省江海贸易学校（源自1979年创办的江苏省镇江粮食学校）合并；2000年，与中国农业科学院蚕业研究所（源自1951年创办的华东蚕业研究所）合并；2004年，更名为江苏科技大学；2012年，由江苏省人民政府与中国船舶工业集团公司、中国船舶重工集团公司三方签署协议共建；2016年，工业与信息化部国防科技工业局与江苏省人民政府共建。