后，瓦西里于1946年升为空军少将，翌年升为空军中将，提拔为莫斯科军区空军司令官。瓦西里非常热衷于体育运动，他为苏联的体育发展做出了一定贡献。1952年7月27日，在苏联空军纪念日上，莫斯科军区举办了飞行演习。由于在恶劣的天气里强行起飞，导致了一架图-4战斗机发生坠毁事故。瓦西里被斯大林解除了空军司令的职务。不久以后，1953年3月5日，父亲斯大林死去，瓦西里失去了后盾，于1953年4月28日以叛国罪的嫌疑遭到逮捕。瓦西里被控以“诋毁党中央、散布反苏维埃言论、怠慢军务、渎职”等等罪名，遭到严刑拷问，最终