法国西部重要的铁路枢纽。南特站位于市区东部，建成初期曾被命名为“南特-奥尔良火车站”，自2017年起进行大规模的改造和扩建，于2019年基本竣工，现已成为一个综合性的交通枢纽车站。截至2020年7月，南特站开行前往巴黎、里昂、里尔、布鲁塞尔、斯特拉斯堡、马赛、蒙彼利埃等城市的高速列车，前往里昂和波尔多的城际列车，前往奥尔良的卢瓦尔河号列车和前往雷恩、布雷斯特、昂热、绍莱、勒克鲁瓦西克、莱萨布勒多洛讷、波尔尼克和圣吉勒等方向的区域列车，同时也是和两条的起点站。2018年，南特站累计发送旅客数量1181.1万人