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历史.西汉时属蒲类后国，由西域都护管理。唐朝时属蒲类县，开元时设独山守捉于今县境内。清朝雍正时，将军岳钟琪修木垒城。雍正十三年（1735年），清政府定名为“穆垒”。穆垒由蒲类转音，即巴里坤湖的古称“蒲类海”。干隆时间，政府从甘州募民开垦。1917年，设木垒河县佐，属奇台县。次年，开始修筑木垒城。1930年从奇台县析置木垒河县。新疆和平解放后，设立木垒河县人民政府，隶属迪化专区。1954年3月，木垒河县改为木垒县。同年7月17日建立木垒哈萨克自治区，1955年改自治县，属乌鲁