核盘菌科（学名：Sclerotiniaceae）是子囊菌门锤舌菌纲柔膜菌目的一个科，于1945年由美国真菌学家赫伯特·海斯·怀素定义。本科许多物种为植物病原菌，例如灰葡萄孢菌、等。传统上蜡盘菌科的类群也被归在本科中。分子种系发生学的研究结果显示柔膜菌目中，蜡盘菌科与核盘菌科、贫盘菌科的亲缘关系最接近，前两者组成一个单系群，三者亦共同组成一个单系群。