由于自然条件优越，1800年便成为美国最大港口。后来南北战争结束后，美国开始了快速的扩张，经济中心也逐渐转移到北方，再加上移民人口的遽增，纽约港日益繁忙，更加速城市的发展；再加上伊利运河的开放通行，使得纽约港的腹地扩大至美国中西部，亦使得当地产品得以自五大湖透过纽约港外销全球，纽约因此成为美国产品最为重要的集散地。至1871年，纽约成了美国第一大港市。1921年，纽约港务局（今纽约与新泽西港口事务管理局）建立，负责港口规划和建设。纽约港有水域约700多平方公里和陆地1000多平方公里。全港有16个主要港区：