也不明，有可能是坚尾龙类的基础物种。然而，克拉玛依龙的标本仍然具有可鑑定特征，如齿骨侧边的深沟槽。牠有一些类似鲨齿龙类的特征，这些特征同样也可见于斑龙超科的斑龙与蛮龙。在2011年，徐星等人重新研究了模式标本，他们根据一个自衍征，发现克拉玛依龙属于鲨齿龙科的基础物种，与始鲨齿龙、进阶型鲨齿龙科互为姊妹分类单元。