全隧道方式兴建（即「专用通道方案」），北环线的研究亦暂时搁置。
港口铁路线.港口铁路线是一条货运铁路线，连接罗湖和葵涌货柜码头。路线有两个方案：第一是由葵涌的港口铁路货运站开始，经一条连接葵涌和大围的新建隧道，然后取道东铁（现东铁线）大围至罗湖一段前往罗湖。第二是由港口铁路货运站连接附近的西铁（现西铁线），经西铁至锦上路，然后经北环线前往罗湖。铁路发展策略2000中指出，港口铁路线可吸纳来自内陆偏远腹地的货运，有助促进港口货运量的增长。该路线由策略2000发表以后并没有重大更动