例如一个确定的βαββαβ二级结构模式，就是铁氧化还原蛋白的记号。
核酸.核酸亦有二级结构，<nowiki>（RNA）分子。RNA二级结构可以分为螺旋（紧接的</nowiki>硷基对）及不同种类的环（被螺旋围绕的不成对核苷酸）。茎环结构是一个硷基对螺旋结构，末端为短少的不成对环。这种茎环结构非常普遍，并且是建构大型结构模体，如三叶草结构（即如在转运RNA中的四个螺旋结点）的基本单位。内环结构（在长硷基对螺旋中的短而不成对硷基）及膨出（在螺旋股中额外插入，但却在相对股中没有配对的硷基