2016年5月，川上纱惠奈出战越南羽毛球国际挑战赛，在女单决赛中恶战三局以1比2（21-19、19-21、13-21）败于越南的武氏妆，赢得亚军。同年7月，她出战美国羽毛球公开赛，在女单决赛激战三局以1比2（21-16、11-21、15-21）不敌队友峰步美，屈居亚军。年尾10月，她出战中华台北羽毛球大师赛，成功地与队友会师决赛，提前为日本锁定女单冠亚军。面对赛会3号种子、同胞峰步美，最终以1比3 10-12、11-7、9-11、10-12）错失冠军。2017年4月，川上纱惠奈出战中国羽毛球大师赛，携手