80年代末，新规格的9801改为采用更先进的Intel 80286／386处理器。
垄断日本.1980年代和1990年代初，PC-9801基本上垄断着日本个人电脑市场，占有60%以上的市场份额；而当时风靡世界的IBM PC及其兼容机却没有打进日本市场，这是因为1980年代的IBM PC及其搭配的MS-DOS操作系统无法显示日文字符。1990年，日本IBM开发了能显示日文的DOS/V系统；自此，PC-98在日本的垄断地位开始动摇。
没落至停产.1990年，日