长席次中，民主进步党取得台湾省之台北县、宜兰县、新竹县、台南县、高雄县、澎湖县共6席，无党籍人士何智辉及张文英则分别在苗栗县县长选举与嘉义市市长选举中胜出，而台湾省其余13个县市与福建省之金门县及连江县则皆由中国国民党取得。本届选举中，国民党党主席李登辉首创以中华民国总统之姿下乡为党籍候选人站台助选，虽仍未「光复」「主席的故乡」台北县，然而最终为国民党守住了大多数席次。其后「总统下乡辅选」也成为地方选举的常态。
选举结果.各县市之县市长选举当选者及次高票者之名单（粗体者为寻求连任