大锏银巷新建校舍。抗日战争中迁往上海。1947年秋，返南京原校址。1950年代初，南京基督教界在中共当局胁迫下，开展“三自”“爱国运动”后，断绝了与美国教会的经济联系。1952年8月院系调整，同金陵神学院（原校址位于汉中路140号）、三一神学院、中央神学院、中国神学院、华北神学院等华东地区12所神学院联合组建金陵协和神学院，并在其校址建院。（最后一句话有误，1951年，女子神学院已经同金陵神学院合并。）
建筑.金陵女子神学院位于南京鼓楼区大锏银巷17号。现存有圣道大楼、学生宿舍