设有金门校区外，国立高雄大学亦于同年6月1日成立金门校区，目前只提供EMBA班。连江县则希望设立一所新大学，目前有铭传大学设立的硕士在职专班，及国立金门大学设立的马祖分班。
交通.
空运.福建省建有金门机场（金门县金湖镇）、南竿机场（连江县南竿乡）、北竿机场（连江县北竿乡），负责与台湾、澎湖间之空中航运。目前金门机场可飞台北、台中、嘉义、台南、高雄及澎湖；南竿机场可飞台北、台中；北竿机场可飞台北；然金门县与连江县（马祖）二地之间并无直飞航班。Se