第6届国际量子通信奖，2005年的尼尔斯玻尔金奖，德国物理学会的马克斯·普朗克奖，2000年的洪堡基金会的洪堡研究奖，1998年奥地利科学院的薛定谔奖，美国光学学会的马克斯波恩奖，以及奥地利科学界的最高奖—维根斯坦奖。彼得·佐勒于2001年当选为奥地利科学院院士，2008年当选为美国国家科学院外籍院士，荷兰皇家艺术科学院外籍院士，并于2009年当选为西班牙皇家科学院外籍院士。