同时，戴季英在红二十五军内部展开肃反。1934年11月，戴季英改任红二十五军政治部主任，参加长征。在红二十五军政委吴焕先阵亡后，改任二十五军参谋长，进入陕北后历任中共陕甘晋省委常委、西北革命军事委员会政治保卫局局长。戴季英在保卫局长任上，于10月初将高岗、习仲勋、马文瑞、刘志丹等逮捕。，刘志丹遭严刑拷打，红26军营级以上、陕甘边地方县级以上干部全部遭到关押，习仲勋差点被活埋。中央红军到达陕北后，张闻天主持为刘志丹等平反举行的党的活动分子会议，宣读了《中共西北中央局党务委员会关于戴季英、聂洪钧二同志在