1942年，连接门司和下关的关门隧道开通，是世界首条海底隧道，显示北九州地区在二战爆发之后仍取得发展。然而北九州地区重要的军事和工业地位亦使其成为美军空袭的目标。北九州市在二战期间经历了三次大规模空袭。1944年6月16日的空袭是美军首次使用B-29超级堡垒轰炸机轰炸日本本土，范围覆盖整个北九州地区，322人在空袭中遇难。1945年6月29日的空袭则以门司市为主要目标，55人遇难，3616户住宅被烧毁。1945年8月8日的空袭以八幡、若松、户畑三地为目标。1945年8月9日，美军原本计划在小仓投下原子弹，