法警察厅升格为司级部门（司法警察司）。1999年12月20日澳门回归后，司法警察司更名为司法警察局。2015年，据维基解密揭发的文件及电邮显示，司警局于2012年从意大利跨国黑客软件公司Hacking Team洽购手机监控系统。该公司亦曾向利比亚、摩洛哥、苏丹、沙地阿拉伯、埃及和埃塞俄比亚的安全机构提供入侵式黑客软件。相关文件亦显示，专门负责刑事调查的澳门司法警察曾在2012年10月安排Hacking Team到警署示范黑客软件。2020年10月12日起，澳门特区政府司法警察局增设保安厅及下辖的国家