0年将学院迁移至位于克拉科夫老城的现址。而现今，约八十万人口的克拉科夫市拥有着近廿万的大学生，以及廿三所高等院校，为名副其实的大学城。雅盖隆大学图书馆建于1364年，现有藏书650万部，是波兰最大的图书馆之一。藏有大量中世纪手稿，其中包括哥白尼《天体运行论》的原稿。1932年后它成为了波兰的法定送存图书馆之一，因此有权获取在波兰出版的任意书籍。2000年，雅盖隆大学在城郊修建了一座新校园，称为“大学复兴六百年纪念校园”。
学术.波兰加入欧盟后，雅盖隆大学获得了大量资金，设立