横田氏出任。社领称为「住吉庄」，先后为后白河院领、宣阳门院领、伏见院领和天皇家领。建武元年（1334年），初次有文献记载神社为筑前国一宫，文献同时指出位于福冈市东区的筥崎宫也是筑前国的一宫，然而按照中世以前的史料记载，筑前国一宫是单指住吉神社，当时竹崎季长的《蒙古袭来绘词》就描绘了住吉神社的朱红色鸟居。文明12年（1480年），师宗祇前往神社参拜，并且在《筑紫道记》中记载神社受战事波及而荒废的状态。进入战国时代后，按神社的古文书记载，神社在大内义隆的势力下，地位有所提升，但是由于卷入在天文20年（155