将以轨道运输取代公路建设，以解决环境问题。2007年起，由于大量轨道运输路线的兴筑，以及公路建设已近完备的原因，轨道与公路的建设预算比例已达到6:4。2011年，台铁先后开辟沙崙线、六家线，为台铁1991年以来新线。
空中交通.机场多为军民合用机场，民用部份由交通部民用航空局管理，军用则分由中华民国空军与中华民国海军管理。包括东引、东莒、西莒（连江县政府）、小琉球（屏东县政府）、玉里（花莲县玉里镇公所）、嘉义竹崎（中兴航空公司）、溪头米堤、天龙、童综合医院及台北荣民总医院。