setta@home的优势则在于蛋白质运算设计以及蛋白质结构和对接的预测。这两个项目在计算资源和主机分布上也存在显着差异。Rosetta@home的主机群体基于PC，平均执行速度为78万亿FLOPS；而Folding@home的主机群体包括了PlayStation 3和图形处理器，平均执行速度达4769万亿FLOPS，大约是Rosetta@home的61倍。
世界公共网格.世界公共网格的子项目(HPF)1期和2期均使用Rosetta程序来为不同的基因组添加结构和功能注解。人类蛋白质