书长一人，并决定筹备第十八届全国代表大会。党主席简吉元因案收押交保后，由副主席林汉仓召开中常会及第十八届全国党代表筹备会，由嘉义市选务委员方中和担任党代表筹备会主任委员。2009年（民国98年）3月15日，经过一年多筹备，「第十八届全国代表大会」于南投县竹山镇山海园餐厅召开，大会由筹备会主任委员方中和与青年党代理主席林汉仓共同主持，首先推选五席主席团，并且通过大会组织规程，同时改选15位中常委、20席中执委、5席中评委，再召开第一次中央常务委员会议选出吴文舟为党主席。同年11月中央党部自台北南迁云林县斗