总署.督办、署长各1名、参事若干名。下级机关4局（总务・民政・礼俗・卫生）。1943年3月，治安总署所属警政局改属内务总署，形成5局体制。
财务总署.督办、署长各1名、参事若干名。下级机关4局（总务・税务・会计・库藏）、中国联合准备银行、华北统税总局、华北禁烟总局。
治安总署.督办、署长各1名、参事若干名。下级机关7局（总务・军咨・军务・军学・军需・宣导・警政）2处（军医・军法）。1943年3月，警政局改归内务总署。
教育总署.督