副作用，逐渐引起医学界注意但尚未有确定结论，但现阶段医师只能建议如果能用饮食改变与作息解决胃酸问题的人就尽量少用PPI。
药物相互作用.奥美拉唑为CYP2C19和CYP2C9的竞争性抑制剂，而影响到经由这两个酶代谢的物质，像是地西泮、西酞普兰、华法令等；这些药物如果跟奥美拉唑一起并用的话，可能会使它们的血中浓度升高。 氯吡格雷（商品名：Plavix），是一种前药，需要CYP2C19才能转成活性态；所以如果抑制了CYP2C19的活性，会使的氯吡格雷的活性态减少，增加需要依靠氯吡格雷来