亦受通行证系统束缚，以该系统侷限原住民于印地安人保留区中。印第安寄宿学校系统从1876年开始实行至1996年最后一所寄宿学校关闭，时间长达120年。印地安人寄宿学校对于原住民学童造成的创伤包括强制分离原生家庭，扼杀族语及先人文化，以及各种肢体攻击和性虐待，并强制剥夺其原住民身分（以提供公民权的美名）。学童被迫断绝自己与家庭和文化的连结，并被强制说英语或法语。从寄宿学校毕业的原住民学生往往陷入既无法成功融入加拿大社会也无法回归部落文化的处境。最终，此寄宿学校系统不可逆的破坏了原住民族文化和信仰的传承。此后