当中最为重要的；一项研究就发现仓鸮团粒中的嵴椎动物遗骸就有97.5%是属于稻大鼠的。其他的掠食者包括了鸟类（白尾鹞及横斑林鸮）、蛇（食鱼蝮及其他）、美国短吻鳄、食肉目（浣熊、赤狐、鼬属及臭鼬）。稻大鼠也有很多寄生虫，体外的包括多种蜱螨目、几种蝨毛目及两种跳蚤，体内的包括多种线虫动物门及复殖目、一种舌形动物门及几种球虫亚纲。牙周病影响着稻大鼠的颚部；而牠们也被用作研究牙周病的对象。维他命E、氟化物及碘化物可以保护患病稻大鼠的骨头，高蔗糖的食性会增加稻大鼠患上牙周病的严重性。
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