在最急迫的项目就是扮演长距离海上的角色，这让Ju 290A-2就此诞生了。3架的A-1机型在生产线上就地改装为A-2。生产作业的缓慢原因在于武装系统的增加与改装。A-2安装上FuG 200荷恩特非低-特高频带搜索雷达并在机背区域安装一门20 mmMG 151机炮砲塔。荷恩特非雷达是成功的用于搜索盟军护卫船队，它的搜索能力在高度下可搜索的船舰；在高度下，搜索范围增加到。可以在防空高射炮的火力范围之外搜索盟军的车队行踪。A-3机型在加装导航设备与武装系统后成为二次大战期间拥有最重的武装系统；在机背区域安装