台风玛姬（，国际编号：9903，台湾编号：9906，联合台风警报中心：06W，菲律宾大气地球物理和天文服务管理局：Etang）于当年6月曾对台湾和香港造成较严重的影响，其与同年九月出现的台风约克正面袭港，导致香港需于一年内悬挂2次九号或以上热带气旋警告信号（上一次出现此情况于1964年，该年曾悬挂达3次九号或以上台风信号，纪录至今仍未被打破）。
发展过程.1999年是强拉尼娜年。当年6月1日，在菲律宾以东的低压区增强为热带低气压，初时向西北移动。翌日清晨增强为热带风暴，命名为玛姬。