向·尊珠扎巴生于拉萨蔡巴竹地方。父亲名俄强多杰山华，母亲名芒吉。7岁时，由其母及兄长教其学习藏文。此后直至24岁期间，拜达布拉吉、贡巴楚臣宁波、奥喀巴、帕竹·多吉杰波等多位上师，学习《般若经》、《毗奈耶》、《量释论》等。26岁时，在康区扎噶哇上师尊前受具足戒（有二百五十三条）出家为僧，改名“尊珠扎巴”；此外还师从噶洛译师等人学习密法。33岁时，从塔布拉杰之侄贡巴·次臣宁波学习佛法。此后，他多年居深山修行。1175年（藏历第三绕迥木羊年），他来到拉萨，获得蔡溪卡噶尔家族首领杰哇琼乃的支持，兴建了蔡巴寺，向·尊