像是莱茵河、隆河、因河、提契诺河与波河，源头都来自阿尔卑斯山脉，流经邻近国家，最后注入北海、地中海、亚得里亚海以及黑海。其它河川如多瑙河，主要支流也源自阿尔卑斯山。隆河是地中海第二大水源，仅次于尼罗河；冰川融化为隆河水源，流入日内瓦湖后再流向法国，在法国还用来冷却核能电厂。莱茵河源自瑞士一个30平方公里的区域，约佔瑞士输出水量的60%。阿尔卑斯山的一些河会形成湖泊，日内瓦湖是一个新月形的湖，湖的一侧是瑞士的日内瓦，另一侧则是法国的埃维昂莱班。德国的圣巴尔多禄茂教堂是在国王湖的南侧，需划船过湖或越过山