0年代阿富汗内战以及随后塔利班政府统治期间，南希·度普雷仍定期访问喀布尔，带回有关书籍、地图、照片以及稀有的阿富汗民间音乐资料。有关资料还包括政府和非政府文件，以及来自阿富汗交战派系和塔利班政权的勘测、报告以及报纸等。2013年，南希·度普雷创建喀布尔大学阿富汗中心（ACKU），这是该国致力研究阿富汗历史、文化和社会的第一个这类设施。直到逝世前不久，南希·度普雷一直担任该中心的主任。2017年9月10日，南希·度普雷在喀布尔的一家医院去世，终年90岁。