。长井提出航海远略策，主张开国。但由于萨摩藩害怕政局的主导权被长州藩掌握的缘故而失败，长州藩政权掌握在了主张攘夷的周布和桂小五郎手中，对外方针完全转变。1862年7月实行攘夷政策，1863年4月藩厅从萩城迁往山口，5月下令炮击驱逐外国船只。8月，美、英、荷、法四国联军袭击下关，长州藩战败。同年发生了八月十八日政变，毛利敬亲失势，长州藩的攘夷派被驱逐出京都。在池田屋事件中，长州藩藩士遭到会津藩麾下新选组的杀害和逮捕，因此长州藩向京都进军。翌年（1864年）发生禁门之变。幕府下令讨伐长州藩，8月剥夺了敬亲的官位