天主教乌干达军中教长区（、）是乌干达一个罗马天主教军中教长区，直属圣座，负责牧养信奉天主教的乌干达军人及其家眷。1964年1月20日成立军中代牧区，1986年7月21日被升为教长区。现任教长为雅各伯·奥当戈。