育制度实施三三四学制，虽然该校也曾经开办新高中课程，但因无法适应变化，于2014年起暂时停办中学，而向教育局申办幼稚园及其他专科课程。该校为第三组别中学，最后一任校长为戴汉生先生。
历史.闽光书院的历史可追溯至1950年代的中国大陆，由于中华人民共和国成立后，福建与台湾只有一海之隔，社会动荡不安。当时，大量福建人逃往香港。部分福建人在九龙城设立教会，以便居港的福建人前往聚会。于1950年代，「九龙闽南中华基督教会」有见区内中学学位不足，便兴起了办学念头，于是向香港政府申请办