从英国搭乘「波罗乃西号」（"Polmaise"）出发，经过好望角(喜望峰)，渡过印度洋，终于在12月4日抵达上海英国租界。马雅各在此参观了教会、医院，也会见教会中的宣教前辈。1864年1月2日，抵达厦门，学习语言。1864年10月5日，马雅各与杜嘉德牧师、吴水文、2位信徒在打狗（今高雄港）登陆，探寻在台湾宣教的可能性，考察后认为府城台南的人口远比打狗还多，最适合作为宣教的起点和中心。10月30日一行人返回厦门。
台南看西街佈道所 (1865年6月16日-1865年7月9日).