(即后来的《辽海丛书》)，不断进行渤海史、东北史研究。1931年“九一八事变”后，金毓黻被日军软禁，后被释放并被狱外监视。在此期间，金毓黻拒绝就任伪职，并专心于《渤海国志长编》的编辑与出版工作。1936年，金毓黻赴上海，并先后在南京中央大学、四川三台的东北大学任教，曾任国立中央大学历史系教授兼主任。1945年国民党六大召开前夕，列入朱家骅与陈立夫联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一。1949年后任中国科学院历史研究所研究院。1962年8月3日病逝。
治史