公安分局亦于两日后结束，所有人员改隶首都国际机场公安队伍；但是，为解决转场工作仓促而引致的混乱，中联航在南苑机场的服务柜台延至同年10月16日停运；至此，南苑机场所有设施均已关闭，但一直未拆卸。此前，军用航空也已搬迁到大兴国际机场西侧的南郊机场，但少量轰-6轰炸机在机场关闭后一年，仍旧驻扎在南苑机场。
停止客运服务.2019年9月25日，随着中国联合航空KN5830（广州—十堰—北京南苑）抵达南苑机场，南苑机场正式停止客运服务。