卫生署署长任内，他主管公共卫生和社区医学等事务，积极向外推广器官捐赠计划、健康城市计划和参与一系列的医疗改革，并在1993年创立香港社会医学院和出任首任院长一职。1992年及1993年，他又署任卫生福利司一职，管辖医院管理局、卫生署、医院事务署和社会福利署各事宜，任内促成《1992年医生註册（修订）条例》获立法局通过。此外，李绍鸿在1988年至1996年担任香港防痨心脏及胸病协会会长，其后改任副会长；以及在1988年至1994年任医疗辅助队总监，任内与香港总督卫奕信爵士在1991年12月一同主持位于何文