确立了本山末寺制度。各本山必须负责管制其末寺，幕府只需通过对各宗派本山的统制，即可以达到统制佛教界全体的效果。
大本山寺院一览.日本的传统佛教宗派（指近世以前成立），在第二次大战以前公认13宗56派。13宗指奈良佛教系的3宗（法相宗、华严宗、律宗）、平安时代初期成立的天台宗和真言宗、平安时代后期到鎌仓时代成立的净土教系4宗（融通念佛宗、净土宗、净土真宗、时宗）、禅宗系2宗（临济宗、曹洞宗）和日莲宗、近世初期成立的禅宗系的黄檗宗。战时体制下，宗教团体法（1939年公布、1940年施行