群通常被视为门，但有时也会被视为纲，且偶尔会被缩至只剩两个门。一些分类学则将有胚植物放在总门上，并将其和部份轮藻一起归为一个亚界，称之为链形植物亚界。从分子生物学角度看，有胚植物和绿藻形似，它们都具有真核，有由两层原生质分泌形成的，有叶绿体可以进行光合作用生成淀粉，主要叶绿体都是由叶绿体a和叶绿体b组成的，两者都有大液泡，没有中心质，除了配子以外也都没有鞭毛。传统上高等植物包括四个门：苔藓植物门、蕨类植物门、裸子植物门和被子植物门。苔藓和蕨类又合称颈卵器植物；蕨类植物、裸子植物和被子植物又合称维管植