，而兴建于洲头则有比较低的成本的优势，而且对荃湾和新界的乘客有比较大的吸引力。当局认为，西九龙的选择地址在运输效益方面比较洲头为佳。2007年，与西铁线共轨的方案被否决，改为独立兴建全新的路轨。
共用或者专用通道方案.由香港边境禁区前往西九龙的路线，亦曾经有两个方案：亦即「共用通道方案」及「专用通道方案」，两者均计划在现落马洲站附近接驳广深段（落马洲站连接福田口岸）。2008年4月，当局决定以西九龙总站（现称：香港西九龙站）作为终点站，路线採用全隧道的「专用通道方案」中线方