应机理较其他唿吸复合物认识更为详尽，其包含两个步骤，称作Q循环。首先在第一步中，酶与三个QH底物结合，然后将其氧化，并将所产生的一个电子传递到第二个底物细胞色素C。QH所释放的两个质子被传递到膜间隙。第三个底物Q接受来自QH的第二个电子，而还原为泛半醌自由基Q。先前的两个底物被释放，但这个泛半醌中间体仍然被酶所结合。第二步中，第二个QH分子与酶结合，再一次将它的第一个电子传递给细胞色素c受体。结合的泛半醌得到第二个电子，并获得线粒体基质中的两个质子，而还原为QH。这个QH随后被酶释放。当辅酶Q在膜的内侧