能呈现醒目的颜色但又不影响内容的阅读，因此不少人都喜欢使用萤光笔标示文件或课本上的重点。荧光笔的墨水为半透明颜色，。
特色.许多萤光笔带有明亮且萤光的颜色，在紫外光之下会发出萤光的颜色。最常见的颜色为黄色，其他还有粉红色、蓝色、绿色、橘色和紫色等颜色。另外有一种干式的萤光笔，它没有毡布的笔尖，而有一个特殊的开口将笔内的萤光条黏在文件上，就像卡带一样。这种的萤光笔不像传统的那样不易清除