引发中国大陆媒体不悦。2018年3月30日，赖清德于立法院重申自己是「台独工作者」。2019年3月21日，参加民进党2020年中华民国总统选举党内初选的赖清德在脸书指出，台湾已经是个主权独立的国家，名字叫中华民国，不必另外宣布台湾独立。在传统独派眼中，赖清德的说法不是台独，而是「华独」。
陈水扁案.赖清德于2013年11月表示，与其同党之前的总统陈水扁涉入的陈水扁家庭密帐案审判不公，又陈水扁身体不佳，应使之保外就医。2014年8月6日特侦组宣佈该案的确查无不法实据并签结