府而言，日本涉及美国诸多的利益因素。在日本国土上设有驻日美军的横须贺与冲绳等基地，对美国有重要的战略价值。奥巴马当选美国总统后，同样非常重视与日本的关系。对于时任日本首相鸠山由纪夫提出的“对等的日美关系”，他非常欢迎。2009年11月，他访问日本，与鸠山由纪夫就深化日美同盟达成意见共识，他认为“日美同盟关系是亚太地区稳定的基轴”。奥巴马还与鸠山由纪夫探讨碳捕捉与封存技术、核设施防震技术等问题，双方还携手致力于发展“绿色科技”，并达成意见统一。他访日期间在东京发表演讲，认为日本是亚洲稳定的关键。另有媒体分析认