015年，石正丽曾参与可感染人的冠状病毒研究。2015年11月，北卡罗莱纳大学教堂山分校的研究人员在《自然-医学》上发表关于合成类似SARS冠状病毒的论文，石正丽也是作者之一。2017年8月，石正丽发表论文，认为SARS病毒源头来自云南蝙蝠洞里的中华菊头蝠。2018年4月，石正丽团队在国际权威学术期刊《自然》上发表论文，称发现了引发广东大范围猪急性腹泻死亡的一种新型冠状病毒，并将其命名为猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS冠状病毒）。该病毒与一些从广东菊头蝠样本所分离病毒的基因组序列一致性高达98％。