被俘，180面军旗和9支军团鹰徽被缴获。
战后.这场战役是罗马内战中的决定性战役，庞培几乎全军覆没，仅以身免。罗马境内再无可以和凯撒抗衡的势力，凯撒成为罗马共和国的实际最高统治者。战后庞培逃亡埃及，并为托勒密十三世所杀，前三头同盟就此结束。而罗马内战并未结束，以庞培的两个儿子为首的贵族共和派继续在埃及及亚非利加行省等地继续与凯撒及其后继者马克·安东尼、屋大维相斗了数年。追赶庞培来到埃及的凯撒则在此处遇到了人称“埃及艳后”的克利奥帕特拉七世并介入了埃及的内战，使凯萨放慢了追击贵族