年早春3月集群离开越冬地云贵高原北上迁至青藏高原东北部，在高寒草甸沼泽地或湖泊河流沼泽地中选择适应的地区，于4月下旬开始繁殖育幼。到了10月下旬则飞到青藏高原东南部、云贵高原及中印、中巴边境过冬。黑颈鹤一般选择海拔在1900m以上湖泊、河流等湿地内，距离耕地较近且人、畜干扰较少的栖息地停歇。黑颈鹤越冬时集群较大，一般都有十几只至几百只在一起，长途飞行时多排成“一”字纵队或“V”字队形前。刚飞到越冬地时黑颈鹤胆很小，特别警惕，一直要在空中盘旋，直到它们认为安全了才会慢慢降落下来。