楼内共设5条安检通道，13间贵宾室。贵宾室整体风格融入海南黎族特色，黎族图腾大力神地毯及黎族风情的油画，配上精致典雅的蝴蝶兰，凸显海南优美的人文风情。机场内多处设置室内园林景观，候机楼内选用具有热带特色的植物，以向日葵相衬。2016年3月3日，一架海南航空的波音737-800型客机在博鳌机场成功试飞，并于3月8日起投入试运行。2017年12月22日，博鳌机场旅客吞吐量突破30万人次。