半阴茎，平时反进体内收藏在其尾巴之中。雄蛇的半阴茎通常长着凹槽、倒勾或尖刺，目的是要在交配的时候能以性器官抓紧雌蛇的泄殖腔壁。多数蛇类都是卵生的，而且雌蛇都会在诞下蛇卵不久后便遗弃掉它们。可是，亦有部分蛇类会认真地筑起巢穴并守在蛇卵附近孵育它们，如眼镜王蛇。蟒蛇则会在诞下蛇卵后以身体卷着它们，直至幼蛇孵化出来。除了偶尔为要增加体温以助孵蛋因而需要晒太阳及喝水之外，雌性的蟒蛇都不会离开蛇卵。蛇为变温动物，体温不足以孵卵，所以雌蛇会以反覆肌肉收缩的方式摩擦生热来孵蛋。有些蛇类是卵胎生的，蛇卵会保存在母体