2007年8月4日，中央研究院近代史研究所副研究员陈仪深声言：「两国论至少是『两中』，将海崃两岸切开，在北京政府眼中也是一种台独。而今李登辉自我摘除台独标签却念念不忘正名制宪，实是如假包换的台独。李登辉台独论述的调整或许得不偿失，但是许庆雄、江永芳、傅云钦可以给他批评；民进党以及拥护民进党的本土社团，最不适宜批评李登辉的『变质』。」2008年2月21日，国立中山大学电机学系教授陈茂雄讽刺：「陈总统（陈水扁）与李前总统（李登辉）本来合作得相当好；可是自从陈总统在电视媒体上指名道姓的大骂李前总统之后，两人