代后，越后青苎座负责管理进出越后的苎麻船，并且征收税项，逐渐取得对苎麻的主导权。战国时代末期，上杉谦信加强在直江津和柏崎等地征收税项，促使了天王寺苎座的瓦解。另外，近江国和枝村（现滋贺县丰乡町一带）的商人则通过伊势国、美浓等地将苎麻带进京都。然而，随着织田政权在领内推行了乐市乐座，继承的丰臣政权更是将乐市乐座推行至日本全国各地，导致了座的解体，加上上杉景胜至会津后木棉的普及，以及堀秀治入主后加重对苎麻的税额，其后的高田藩主松平光长也维持这个方针，使到苎麻的成品愈见停滞不前，反之在先后移至会津藩和米泽藩的上杉