美国恢复在使馆被炸后所中断的军事等方面联系的障碍。中美关系到1999年底开始逐渐恢复，北约对死伤的受难者进行了经济赔偿。时任美国总统比尔·克林顿亲自为此事件道歉。1999年北约炸毁中国驻南斯拉夫大使馆时，曾在克林顿政府担任国家情报官，负责东亚事务的傅高义，以“前中情局官员”身分直指中情局对外宣称因地图定位错误而“误炸”中国使馆的说法并非事实，引起美方高度紧张。傅高义不认为此事有人故意，更不可能是政策性决定。此事应该是一连串失误造成的惨剧。中国驻南联盟大使馆后于1999年11月临时迁至拉斯科维切瓦街6号院