普撤奇的研究中，似鲸龙与特维尔切龙互成姊妹群，属于一个包括马门溪龙、峨嵋龙、盘足龙的类群，而马门溪龙＋峨嵋龙的分类位置也可在採用威尔森的数据中找到。根据这两种结果，希斯克特和阿普撤奇得出结论，认为似鲸龙并不是梁龙科，甚至被排除于梁龙超科以外，而是种位于新蜥脚类之外、更基础的蜥脚类。劳赫特等人（2005）的系统发生学分析将似鲸龙与峨嵋龙构成一个演化支，并与露丝娜龙、马门溪龙属于同一类群，位于新蜥脚类之外。乔普等人（2015）也检验了似鲸龙的系统发育关系，将其作为一个潜在的梁龙科。虽然有一个研究方法可让似鲸龙属