然它们仍有一定的资金储备，但仍然需要面对巨大的财政困难，因为它们无法收集租金，而且亦有很高赔偿的开支。这促使他们进行更多慈善活动以筹集捐款，例如音乐和戏曲表演等。
慈善及社会服务.日佔时期，慈善组织受到很大限制，以免被用作支援游击队。虽然日方设立一个以「东亚建设基金」为名的所谓慈善组织，但事实上捐款是用以支援日本政府所需，并非用作慈善用途。当时，香港圣公会会督及华人代表联会希望透过举办慈善活动来救济穷人，所以向当时日佔政府要求援助。1942年9月，总督矶谷廉介答应他们的要求，于是着