因为这些基因学的特征并非在所有抗氨苄青霉素（ampicillin）的"E. faecium"皆有一致的表现。也就是说，若没有检测出这些基因变异，并不能证明"E. faecium"菌株不会有扩散或导致疾病的风险。世界卫生组织（WHO）在2017年初将抗万古霉素肠球菌列为「高度威胁」的致病菌。肠球菌性脑膜炎是神经外科上罕见的併发症。它一般需要透过静脉或鞘内万古霉素来进行治疗，但是治疗效果仍有争议。新的流行病学证据显示，肠球菌亦是慢性细菌性摄护腺炎的主要感染因子，肠球菌会在摄护腺中形成生物膜，使其难以治疗。