与北一女中第一名毕业保送台大化学系的陈映雪认识，在1964年11月10日结婚。妻子陈映雪的父亲是着名人权律师陈逸松，其母为基隆颜家颜云年之女颜缇。1964年，陈逸松于白色恐怖年代，曾经与周百练、高玉树竞选过台北市长，但失利。陈映雪的兄弟姊妹有陈希宽为台湾独立运动支持者，1971年曾任台独联盟副主席。吴成文于1965年(民国54年)初于金门当兵。与妻子陈映雪的第一胎婴儿龙声于吴成文入伍前诞生，不幸夭折！
出国进修23年.1965年9月底前往美国凯斯西储大学进修医学院的生化系，一个