60年10月，总爷代用国校新校舍落成。1968年8月1日，台糖将各厂附设小学移交地方政府接办，总爷代用国校改名为「台南县麻豆镇总爷国民小学」。2008年3月至4月，总爷国小六十週年校庆，同时也是最后的校庆。2008年5月，台南县第15届县长苏焕智提出将总爷国小与文正国小合併。同月，「总爷国小反併校行动联盟」成立。总爷校友发起了「反併校连署」与「给县长的陈情书」的救总爷运动。2008年7月15日，总爷学生代表郑雅心胜诉。各界开始发起「小学生告赢大县长」的话题。2008年8月1日，总爷国小与