991年，在参加立法院国防委员会期间，主持编撰《国防组织法》草案，期间结识李天羽等国军高阶将领，并揭露多起军购弊案，其中包括备受关注的拉法叶军购案。期间更与行政院长郝柏村口角，场面十分经典。1991年，担任立委期间并以国防委员会委员身份，有意与中国人民解放军举办座谈会。于7月21日到7月26日参访北京，并在北京的中国人民革命军事博物馆及天安门广场留影。1992年3月，成为立法院中第一位在野党籍的国防委员会召集委员。1992年中华民国立法委员选举，陈水扁连任立委成功。1993年7月，获美国《新