到重建，是为现存主要建筑结构。明伦堂也在这次改建中被迁至大成殿东侧。中华民国时期，仙游文庙先后被挪用做当地中小学校舍、政干所所址等。1980年，仙游文庙被列为仙游县文物保护单位。1985年，福建省文化厅拨款重修仙游文庙。1996年，仙游文庙被列为福建省文物保护单位。2006年起，仙游文庙开始全面重修，2006年底，文庙基本完成周边建筑拆除、平整土地等前期工作。仙游县当地几位老人为此筹款近400万元人民币。相关维修工作于2009年正式完工。2013年，该文庙被列为全国重点文物保护单位。