（Capillary electrophoresis）利用毛细管中被分析的带电分子在电场作用下，因移动速率不同而达到分离不同分子的目的。
原理.毛细管电泳开始于20世纪60年代。在进行分析时将毛细管内充满了电解液，毛细管两端通高压电，使电解液内带电分子移到毛细管相反电荷的一端。因为不同分子的大小对电荷比不同，就以不同的速率在管中移动，达到毛细管终点也有快有慢。毛细管电泳既依此探测、分离不同分子。
仪器.毛细管电泳系统的主要部件包括一长毛细管，毛细管两端的液