北地区。明朝取得了内蒙古西部和东南部，设立多个卫所和羁縻卫所。盘踞辽东的纳哈出部归降明朝后，听命北元的地方势力几乎全数不存。由于窝阔台系、阿里不哥系诸王日趋反叛北元大汗，北元汗廷后来常驻唿伦贝尔一带。洪武二十一年（1388年），明军在捕鱼儿海大败北元，北元末主败逃，军队、财物大多被明军虏获。此战过后，明朝又几次出兵清理北元残部，蒙古势力基本退出漠南，明朝控制了自亦集乃到唿伦贝尔的内蒙古大部分地区。靖难之役中，朱棣凭借兀良哈三卫控制了宁王朱权。后来朱棣南下用兵、取得天下过程中，兀良哈三卫多次立功。永乐初年，