解放独立后，他回国并成为总理。当时全国多数地区已被希腊共产党佔领，而作为一个亲英且坚定的反共主义者，帕潘德里欧的内阁成了1944年12月共军叛乱的攻击目标。虽然英国的出兵拯救了他的中央政府，但其首相一职仍被将军尼古拉斯·普拉斯提拉斯取代。1949年希腊内战结束并由亲英美政府完全执政之后，1950年他创立乔治·帕潘德里欧党，并在1952年的全国大选中，与帕帕戈斯将军联手合作而获胜，但两人随即拆伙。1950年代后期他成为自由党联合主席一段时间后，成为1961年操纵「中间联盟」改组重建的核心力量。因为他怀疑同