重叠（英语：Stacking，又译堆积）在超分子化学中是指芳香性分子的一类排列堆积形式。例如DNA中连续性硷基的堆积系统，或是某些具有两个非极性环的酵素，会以π轨域重叠的方式而堆积在一起。
生物学上的重叠.DNA分子中的π重叠出现在相连的核苷酸之间，可加强分子结构的稳定性。核苷酸中的含氮硷基皆拥有芳香环。在DNA分子中，这些芳香环是以面对面的平行方式排列，使硷基之间得以发生芳香交互作用（aromatic interactions）。在此交互作用中，双键中的π键会与另一个π键重叠。