毕业归国后，历任两广法政大学堂教务长，广东高等巡警学堂教务长，两广官报局总编辑，广西抚署交涉科参事，福建巡抚署文案。1912年后，历任北京大总统府秘书，广西银行监理官，广西国税厅筹备处处长等职。1914年5月到1915年10月，任广西省财政厅厅长。后任国务院咨议。1926年6月到1927年6月，任北京政府司法部次长。1931年，任国民政府最高法院东北分院院长。后来任北平市禁烟委员会委员，北平市自治讨论会常务委员。1943年，孔昭焱逝世。2016年清华大学艺术博物馆开馆首展之一的《“尺素情怀”—— 清