那些边界模煳、或是被云层填满，或是完全被中心密集云区遮挡的风眼则必须通过其他的监测手段。船只和飓风猎人侦察机可以直接通过肉眼来观察风眼的存在，也可以通过寻找风暴中心风速较低，并且雨量很少的区域来确定风眼的位置。美国、韩国，以及为数不多的其他几个国家拥有气象雷达站组成的网络，可能探测到接近海岸线的风眼。气象卫星上还可以携带设备测量大气中的水蒸气和云层温度，这些数据能够用来确认逐渐形成风眼的存在。此外，科学家还在近年发现风眼中的臭氧含量远高于风眼墙，这主要是因为富含臭氧的平流层空气下沉导致。因此可以利用对臭氧敏