分组赛阶段，它们与去季欧冠亚军、英格兰的托特纳姆热刺，以及希腊的奥林匹亚科斯和塞尔维亚的贝尔格莱德红星一同被分入B组。球队于赛季初期的主教练是克罗地亚人尼科·科瓦奇。分组赛的首场比赛，拜仁坐镇安联竞技场迎战贝尔格莱德红星，并通过金斯利·科芒、罗伯特·莱万多夫斯基和托马斯·穆勒的入球以3比0获胜。在托定咸热刺球场挑战热刺的第二场比赛中，拜仁凭借约书亚·基米希的远射中的、莱万多夫斯基的梅开二度和塞尔吉·格纳布里上演而取得7比2的大胜，主队仅由孙兴慜和哈里·凯恩射入挽回颜面的两球。这场比赛也造就了英格兰球队在