日，中华民国成立，孙中山成为临时大总统，荷马李被任命为首席军事顾问。荷马李不久中风，被迫回到美国，在1912年11月1日病逝，下葬时仍身穿中华民国的将军服。他留下了希望葬在中国土地上的遗愿。1969年4月，其骨灰自美国洛杉矶迁到台北阳明山第一公墓长眠、墓碑书有「国父军事顾问荷马李将军夫妇之墓」。
着作.荷马李心中所设想的战略三书（Strategic Trilogy），其中《无知之勇》（The Valor of Ignorance）与《撒克逊时代》（The Day of the S