糖体RNA和β-血影蛋白对核序列进行了分析，结论也证实了高角羚属和岛羚属的演化上的关联。下图是按照1999年的研究绘制的演化树：已有六个高角羚亚种被描述，但是根据线粒体DNA数据而被广泛认可的只有两个亚种。尽管在形态上很相似，这两个亚种间存在显着的遗传距离，并且两个亚种间没有杂交种被发现。根据弗尔巴的研究，高角羚自狷羚亚科的祖先演化而来，虽然狷羚亚科的形态历经至少18次，高角羚维持了其基本形态至少五百万年没有重大变化。历史上还曾发现过高角羚的数个化石种，包括在埃塞俄比亚发现的上新世化石种"A. d