行任职。同时他还在重庆众多学校兼职任教，1945年起担任重庆大学商学院专任教授。期间，他还参与组织了三民主义同志联合会（民联），并加入了中国民主革命同盟、中国民主建国会。中华人民共和国成立后，他作民联代表出席中国国民党民主派代表会议，会后当选中国国民党革命委员会中央候补委员。1949年12月，出任政务院人民监察委员会（后改为中华人民共和国监察部）第二厅厅长，此后又任司长、部长助理，直至1959年监察部撤销为止。甘祠森还是第三届民革中央委员、第四届民革中央常委兼副秘书长、第五届民革中央副主席兼秘书长，