县为诸罗县，县署设于佳里兴（今之台南市佳里区）。康熙四十三年（1704年），县治自佳里兴迁移诸罗山（即今嘉义市），诸罗知县宋永清以木栅为城，而自嘉义以北至今日的台北（台北市、新北市、基隆市）为止，皆属于当时诸罗县的管辖范围内。雍正元年（1723年），知县孙鲁改建土城堡，并重设护城河。雍正五年（1727年），知县刘良璧重建门楼，砌水洞，各置砲座，并命四门为：东曰「襟山」，西曰「带海」，南曰「崇阳」，北曰「拱辰」。雍正十二年（1734年），知县陆鸿于土城外植刺竹护城益固。干隆五十一年（1786年），林爽文反清之