随后根据铁道部机务局的安排，将GKD4型机车正式定型为东风12型柴油机车，并要求资阳机车厂在1997年内另外生产三台东风12型机车以供试验。1997年12月，三台机车（DF12-0001～0003）分别配属广州铁路集团公司、北京铁路局和郑州铁路局，在株洲北站、丰台西站、郑州北站三大编组站担当调车作业任务，进行运用考核试验；其中配属广铁集团的0001号机车于1998年6月由株洲北调往广州北站（今江村站）继续运用。完成运用考核以后，0002号机车于1999年4月在铁道部科学研究院环行铁道和北京铁路局管内京秦铁