。1999年大选，扎希成功捍卫巴眼拿督国会议席，同时在巫统党选成为最高理事会成员。但因为在烈火莫熄运动期间支持安华而被内安法令逮捕。根据纳吉的说法，马哈迪派政治部警员会见阿末扎希，并要求他辞去巫青团长职得以尽早获释。最后扎希同意辞职而获释。2004年大选再次蝉联国会议员，扎希被首相阿都拉委任旅游部副部长。在他担任副部长期间，他发表论文“大选期间国阵在马来语报章所发表的承诺”而获得博特拉大学荣誉博士学位 。经过2008年的政治海啸，尽管国阵数位重要领袖竞选失利，扎希再次蝉联峇眼拿督国会议席。之后他受