为ATP合成的动力学要求，它们也需要一个小的膜电位。至少在梭杆菌"P. modestum"的情况中，它驱动ATP合酶F转子的a、c亚基逆向旋转。与通过厌氧发酵产生的能量相比较，通过氧化磷酸化释放的能量很多。糖酵解只产生2个ATP分子，而通过将一分子葡萄糖转变为二氧化碳和水而生成的10个NADH和两分子琥珀酸氧化磷酸化，可以产生30到36个ATP。以上的ATP产量均为理论最大值；在实际中，一些质子会发生跨膜泄漏，从而降低了ATP的产量。
电子和质子的转移分子.电子传递链能承载质子