温诬陷朱友裕按兵不追，朱温大怒，令裨将庞师古代朱友裕为帅，以朱友裕交付审问，使者误将信给了朱友裕，朱友裕惶恐，不知所为，率数骑逃到山中。在辉州投奔伯父朱全昱，申诉其冤。朱温妻子张氏听说召他回汴州请罪，朱温还想把儿子下狱，在张氏请求下得免，朱全忠令儿子权知许州。许州近蔡州，因为秦宗权之乱，居民残破，朱友裕招抚流散，增加三万多户。干宁二年（895年），加检校司空，后为武宁军节度留后。四年（897年），朱温攻下郓州东平，改朱友裕天平军留后，加检校司徒。光化元年（898年），再领许州。天复初年，为奉国军节度留后