011年升任国防科技大学校长。同年当选为中国科学院院士。2013年晋升中将军衔。2017年任军事科学院院长。2019年12月明确为正战区级，并晋升上将军衔。
奖项和荣誉.杨学军曾获得过何梁何利科学与技术成就奖（2011年）、陈嘉庚科学奖（2012年）等奖项。