他俄国情报单位合作，像是在车臣共和国内，联邦安全局就曾与俄罗斯内政部底下的GRU、内部小组、俄罗斯特种部队合作。联邦安全局必须为俄罗斯内部事务负责，例如反情报、与黑社会、恐怖份子或毒枭对抗。联邦安全局是一个相当庞大的组织，论功能或影响力与美国联邦调查局、联邦保护局、密勤局、国土安全局、海岸防卫队相似。联邦安全局可以指挥国内军队、俄罗斯特种部队的分遣队或是大规模的市民情报网。联邦安全局的人事预算则是国家机密，有报导指出2006年时预算就佔了全部的40%左右。
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