十一月以准二等官聘任李仙得为顾问。李仙得并为日本规划详细的出兵、殖民计画。同治十三年（1874年，日本明治七年），日本政府成立台湾蕃地事务局，任命西乡从道为事务局都督，率兵三千六百攻打台湾琅地区以牡丹社为主的原住民部落，称为「台湾出兵」（中方称「牡丹社事件」）。李仙得在牡丹社事件中为日本拟定外交策略，并帮日本雇用外籍军人、承租船舰、购买军火；中国方面得知李仙得在此事件中扮演关键角色。李鸿章上总理衙门〈论日本图攻台湾〉一函中便指出，日本依赖美国人；促美撤回人员、船只，即能迫使日本罢兵。于是清廷向美