次直奉战争奉系败北，于珍任奉天全省警备队统领。并且还担任奉天保甲局总办、奉天省警务处会办。1923年10月，兼任奉天警务处处长。1925年（民国14年）冬，于珍任镇威军第8军副军长、第3方面军后方留守总司令、东北陆军第10师师长。1926年3月，任张学良、韩麟春所率的第3、第4方面军团第10军军长兼第8师师长。同年8月，获授将军府珍威将军。同年9月，任京畿警卫司令。1927年（民国16年）2月，任安国军第10军军长，出兵河南省，击败河南保卫军总司令靳云鹗。但是，随后他同武汉国民政府的北伐军战斗，全军