被认为对将会移入的物种无害的物种才会被保留下来。物种清除活动既昂贵，亦很集中，所用的方法必须具针对性，而且不会对非目标物种构成太大伤害。流浪猫、山羊及三种鼠类被认为是伤害性最大的入侵物种。大型的物种、如山羊或猪等，一般可以捕猎的方式清除，如在毛里裘斯的龙德岛上，所有的山羊便仅由一名的枪手处理。要处理大型岛屿上的山羊，生物学家会利用头羊，并将无线电装上其身上。当它回到其群落后便能将整过群落处理掉。流浪猫一般需用不同的方法，包括需要有经验的猎手，并需进行晚间搜猎活动。基于鼠类的数量之多，施放陷阱的效用很低