国代表大会上当选为中国共产党第十六届中央委员会候补委员。2007年，当选为中国共产党第十七届中央委员会委员。他是中共十六大、十七大代表，第十届、十一届全国人大代表。2013年3月，当选第十二届全国人大常委会委员。自卸任浙江省长后，吕祖善一直坚持在浙江省博物馆做义务讲解员；截止2014年12月4日，已进行47场义务讲解。吕祖善选择到博物馆做志愿者基于两点考虑：“一是宣传浙江，虽然不在省长位置，但作为地地道道的浙江人，热爱浙江，想继续为浙江做点事，而宣传浙江最好是从文化入手；二是身体力行，从事社会公益事业，