三维构造中有五个同源性免疫球蛋白结合域，每个结合域都能与多种哺乳类的免疫球蛋白结合，最主要为IgG。蛋白质A能与大多数免疫球蛋白重链的结合，甚至可与人类VH3蛋白质家族的结合。当蛋白质A与免疫球蛋白结合后，这些免疫球蛋白便失去了作用，进而摧毁免疫系统的吞噬作用及。