后，他向加拿大海外宣道会申请成为海外宣教士。1892年8月17日，他与Margaret Mellis（汉名吴玛利）结婚。
传道台湾.1892年10月23日，吴威廉牧师偕同妻子乘「福建号」轮船抵淡水港；马偕亲自率领家人和学生到码头相迎。 1893年，吴牧师在马偕再次返乡后暂时接掌其宣教事业，其中包括教会、神学院及医院。在乙未战争发生时，他负责守护淡水地区宣教产业。1899年，他在获准休假归乡后被紧急召唤回台；不久，马偕在将宣教事业託付与他后逝世。此后，他将北部台湾基督