、军、监察三权，尚书省时置时废、门下省不复置，故中书省较前代尤为重要。中书省下亦再设行中书省，以中央政府名义全权管治地方行政，「行中书省」概念其后发展成为省级地方政府。
明.明初不设中书令，仍以中书省统六部，长官称左右丞相。太祖洪武十三年，废中书省与丞相，六部直接对皇帝负责。至此，三省六部制的三省及宰相制度彻底废止。明朝中后期，明朝内阁实际承担了行政中枢的职能。
清.清沿明制，以六部尚书任天下事，虽然仿效明朝设立了内阁，但没有实权。行政中枢先后有议