霉菌在25−37℃培养时生长迅速, 产生大量黄绿色分生孢。“黄麴霉菌”的中文名称也是来自于外观的颜色。通常会产生深棕色至黑色菌核, 能产生黄曲霉毒素B和圆弧偶氮酸, 少数还产生黄曲霉毒素G。黄麴霉菌的许多菌种在紫外光照射下会呈现出一种绿色的萤光，这个与黄麴毒素生产的程度有所相关。黄麴霉适应能力很强，10−48℃下都可生长。一般在热带和高温干旱地区高产毒类群更多, 而在温带和较湿润的地区无毒类群占优势。
分类.1989年研究者将在美国发现的一些产毒能力强的黄曲霉小核菌株称为S型菌