》卷八十八泉州知府〈汪大猷行状〉：干道七年（1171年）四月，起知泉州，到郡……郡实临海，中有沙洲数万亩，号平湖……」文中并描述汪大猷为保护在平湖的汉人不被毗舍邪国人（传说是今菲律宾米沙鄢群岛上的原住民）所劫掠，乃在平湖造屋二百间遣将驻守。平湖与澎湖在闽南语中发音相近，台湾学界便普遍同意平湖即澎湖。由此可知中国最晚在南宋时已派兵驻守，将澎湖收为版图。
元代.1278年，大元政府入主泉州后，将泉州升格为泉州路。到了1281年，始置澎湖寨巡检司。根据相关史书记载，驻于澎湖马公的巡检