东香山，1849年生于香港，父亲韦光（1825年－1879年）为当地殷富，任职有利银行华人买办。韦宝珊在家中排行最大，其中两名弟弟名韦安及韦培，两人后来分别成为律师及大律师。韦宝珊幼年在家中学习汉学，历时十年，后来入读香港首间官立学校中央书院（现称皇仁书院），当时校长是史钊域博士。在1867年，时年18岁的韦宝珊在家人安排下，前往英国留学，入读英格兰莱斯特的斯东尼盖尔学校（Stoneygate School），一年后在1869年升读苏格兰大来学院（Dollar Academy）。韦宝珊在大来学院学习四年