D.COM、执行AUTOEXEC.BAT，最后执行WIN.COM。WIN.COM程序利用MS-DOS来加载虚拟机管理器、读取SYSTEM.INI、加载虚拟设备驱动程序、关闭任何运行的EMM386副本并切换到保护模式。一旦在保护模式下，虚拟设备驱动程序（VxD）将传送所有MS-DOS的状态信息到32位文件系统管理器，并关闭MS-DOS。这些VxD允许Windows 9x直接与硬件资源交互，就像提供了底层功能，譬如32位硬盘访问及内存管理。接下来的文件系统操作将会转送到32位文件系统管理器。在Windows