，阿富汗纳吉布拉政权垮台，游击队接管政权，改国名为阿富汗伊斯兰国。中阿关系实现了正常化。但不久后阿游击队各派发生冲突，内战加剧。出于安全考虑，中国于1993年2月撤离了驻阿富汗使馆的全部工作人员，两国间正常往来由此暂时中断。在2000年坎大哈的会晤中，塔利班的领导人穆罕默德·奥马尔对中国驻巴基斯坦大使陆树林保证说塔利班不会“允许任何组织用其领土从事任何反对中国的活动。
九一一事件后.九一一恐怖袭击事件之后，美国、联合国和北约对阿富汗采取军事行动——阿富汗战争。之后，中国于2001年