后，眼见到台湾的族群分类械斗严重，在中港（今苗栗县竹南镇）慈裕宫立〈中壠泉漳和睦碑〉。希望漳、泉、粤人等族群能和睦相处。因而提出不论出身籍贯为何，只要是居住台湾的人，就是台湾人，希望大家能不分彼此，和睦相处。后因道光二十四（1844年）平息械斗与缉捕海盗之功赏戴花翎，并补以海疆知府。于道光廿五年（1845年）十月告病返乡，后于道光廿九年闰四月十八日（1849年6月8日）在家中去世，在咸丰二年六月二十四日（1852年8月9日）由次子曹榕将他与同年逝世的长子曹檍安葬于故乡城南祖坟旁（今河南沁阳市南门街东侧）