其胞弟忽必烈争夺汗位未获普遍承认，于1271年在中国地区建立了元朝，蒙古语称为“大元大蒙古国”，并最终灭亡南宋，使元朝成为了中国历史上继唐以后的又一个大一统王朝。在忽必烈与阿里不哥争夺汗位期间，蒙古帝国分裂成若干互不隶属的四大汗国、以及后来忽必烈在蒙古灭金基础上建立的元朝；直到元成宗时期，经过与四大汗国协商，才再一次取得了“大蒙古国”名义上的统一，确立了元朝为名义上宗主、元朝皇帝称“蒙古大汗”。蒙古高原地区自元朝建立后，隶属于元朝治下岭北行省。
北元、蒙古混战时期.明朝建立后，元朝