崇文区教育局使用。1986年2月落实宗教政策，将被占用的教堂归由天主教北京教区管理，9月1日经视圣正式开堂，并将教堂内院的修女学校恢复为若瑟修女会的初学院，定名为“小德肋撒修女初学院”，为天主教北京教区培养修女。1988年，南岗子天主教堂被列为北京市崇文区文物保护单位。
主任司铎.1991年，贾西成神父首任本堂司铎。后由罗春海神父接任本堂。2004年11月，杨科神父自深圳圣安多尼堂返回北京，担任南岗子天主堂本堂司铎。