9年，戴顿被选为美国众议院议员，但是在1791年再次当选后没有上任。1795年，担任美国众议院议长。像大多数联邦党人一样，他支持汉密尔顿的财政政策，并协助镇压威士忌暴乱。此外，他还支持路易斯安那购地案，并反对的废除。因为他在俄亥俄州进行的大量投资，戴顿市以他命名。戴顿还向阿龙·伯尔借钱，因而牵扯至副总统伯尔叛国案，此案最终宣布无罪，戴顿也被释放，但此事仍然直接影响了他的政治生涯。他仍然在新泽西州很受欢迎，并继续在当地的议会任职。
晚年和家庭.1779年，戴顿娶了苏珊·威廉姆森（