大冈车站是採高架车站设计，配置有两座岛式月台共四条乘车线，车站站体与京急百货店的店面连为一体。至于横滨市营地下铁部分所属的站区则採地下化设计，配置有岛式月台一座，两条乘车线。
京滨急行电铁.可对应12节编组的岛式月台2面4线的高架车站。车站编号为KK44。月台照明使用CDM灯。剪票口过去仅有月台下一楼一处，1996年开店时于三楼新设直通百货店的剪票口（开放时间10:00 - 21:00），1999年再于1楼南侧新设剪票口，现在共有三处。厕所位于1、3楼付费区内，另1楼有附设多功能厕