日战争时期，弥勒殿、大雄宝殿、禅堂和斋堂等大部分建筑被被日军飞机炸毁，仅存山门、观音阁、虎岑堂等建筑。 
中华人民共和国.文化大革命以前曾有7名僧人住寺，文化大革命期间佛教活动中止。1983年，麓山寺被国务院确定为汉族地区佛教全国重点寺院，寺庙被移交给长沙市佛教协会管理，之后由政府拨款重修了大雄宝殿、弥勒殿、讲堂、禅堂。1994年8月，释圣辉任驻寺方丈。1999年经国家宗教局批准该寺创办湖南第一所佛教院校。2013年5月10日起，经中国佛教协会副会长、湖南省佛教协会会长