。2000年发行的《最终幻想IX》没有延续《VII》和《VIII》的现代世界设定，而是回归系列本源，改用传统最终幻想舞台。PlayStation 2同样有三部最终幻想本传，其中一部为网络游戏。2001年作品《最终幻想X》首度在系列中使用全3D地图和配音员，也是首部有电子游戏后传（《最终幻想X-2》）的作品。首部大型多人在线角色扮演游戏（MMORPG）《最终幻想XI》于2002年在PlayStation 2和PC上发行，后来又于Xbox 360平台发行。游戏以实时战斗取代随机遇敌。第十二作于2006年发行