后来成为支配出云及隐岐各地的一族，包括以本地为根据地并成为出云国守护的。此后本地先后由京极氏、尼子氏，最后在16世纪被毛利辉元所掌控。17世纪的江户时代后成为松江藩的领地，部分区域后来又成为松江藩的支藩广濑藩的领地，另外野有部分地区属于出云大社和日御碕神社之寺舍领地。19世纪末明治维新后于1871年实施废藩置县，原属松江藩和广濑藩的区域被改设为松江县和广濑县，但仅半年后的府县整併即被整併为岛根县。1889年日本实施町村制，现在的出云市辖区在当时分属：庄原村、出东村、出西村、直江村、伊波野村、久