1949年后任中国科学院历史研究所研究院。1962年8月3日病逝。
治史观.金毓黻年轻时时代积弊，清廷衰亡，土地沦丧，使得金毓黻更加重视边疆问题的研究——“溯自逊清之季，国人憷于外患日亟，多喜谈边疆地理”。金毓黻专治宋、辽、金朝历史，他的《中国史学史》受到梁启超的启发：“谨依刘、章之义例，纬以梁氏之条目，粗加诠次，以为诵说之资”。其主张“靺鞨，当亦为沃沮、勿吉之音转”，认为朝鲜半岛北部的沃沮即勿吉，又分北沃沮(黑水等部)、东沃沮（白山等部），东女真当即古代东沃沮的后