护送德皇威廉二世的前往出访荷兰的弗利辛恩和英国的朴茨茅斯。1908年1月4日，沙恩霍斯特号在附近并遭受了严重的水下部分损伤。维修在布洛姆－福斯船厂进行，至2月22日完工。然后它恢复了试航，一直持续至4月底。5月1日，在海军少将的指挥下，沙恩霍斯特号取代约克号成为公海舰队侦察部队的旗舰。在该年余下的时间里，它参加了和平时期常规的例行训练操演和舰队演习。
东亚役期.1909年3月11日，沙恩霍斯特号被分派至东亚分舰队；并由约克号取代其成为侦察部队的旗舰。在完成航行准备工作后，沙恩霍斯特