全港专营巴士路线独有的「二段票」模式收费，即同一车程分两段，分别在上车及下车时收费，乘客登车时须先付8.5元，过洪水桥站后落车则再付3.5元。2014年8月24日，往元朗方向增设上客服务，但往深圳湾方向沿途仍然不可落车2017年9月18日：往深圳湾口岸方向增设青山公路－洪水桥段「尚城」分站。2020年2月6日，因应2019新型冠状病毒疫情，B2线调减班次至每60或75分钟一班。2020年4月3日，因应深圳湾口岸缩短通关时间，B2线缩短服务时间。
收费.全程：$12