管理危机，聘任宁恩承担任东北大学秘书长并代理校长职务，宁几经请辞留任并得到张伯苓的支持。张伯苓派出南开“四大金刚”之一的孟琴襄到东北大学支援校务管理，并亲自义务担任东北大学委员会委员。南开大学实行校董事会下的校长负责制。1932年，校董事会的董事为严智怡、颜惠庆、陶孟和、胡适、李组绅、李琴湘、卞俶成、王秉喆、丁文江等九人。同年，张伯苓当选斐陶斐励学会全国总会会长。1933年12月24日，张伯苓列席南开学校召开董事会，商议南开大学接办海军医学院的相关事宜，最终未能成功。在张伯苓的主持下，南开大学的资产