公室设在总参谋部作战部，总参谋部作战部部长兼任国家人民防空办公室、国家边海防委员会办公室主任。2016年改革前，中国人民解放军总参谋部作战部下设：政治部、总合局、应急局、战役训练局、战备建设局、企业管理局、空管局、边防局（国家边海防委员会办公室）、人防局（国家人民防空办公室）、空军作战局、海军作战局、特种作战局、联合作战指挥局（中央军委联合作战指挥中心）、测绘导航局、气象水文局等。在深化国防和军队改革中，2016年1月撤销中国人民解放军总参谋部，组建中央军委联合参谋部，下设中央军委联合参谋部作战局。