臣真田昌幸的调略，自北条氏离反，臣从武田氏，并进入沼田城。之后由于上州攻略的军功成为沼须城主，武田胜赖并授予5700贯。此时回复藤田氏，并从胜赖拜领武田氏的通字「信」字，改名藤田能登守信吉，及迎娶海野信亲的女儿。在武田氏被织田信长消灭以后，一度仕于泷川一益，本能寺之变后，与上杉家长尾伊贺守内通，率5000兵攻击泷川益重及4000兵防守的沼田城，于进攻水曲轮时获得军功。但后来一益结合小幡、安中、和田、仓贺野、由良、长尾（馆林）、内藤等地约2万兵北上支援，信吉放弃进攻沼田城，于6月13日夜晚前往投靠上杉景胜