细胞抗原HLA I、HLA II，以及HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1的基因频率后，发现生活在日本北部和俄罗斯东南部的阿伊努人与部份的美洲原住民有关，特别是美国、加拿大西岸的特林吉特人。科学家推测，阿伊努人和这些美洲原住民的主要祖先可以追溯到旧石器时代的南西伯利亚族群上。最新的基因研究发现波利尼西亚人早在前哥伦布时期就已经和南美原住民有所接触，并且发生了基因交流。
农业.美洲原住民所培育出的玉米、马铃薯、番薯、木薯、凤梨、辣椒、番茄、菸草、古柯、可可、藜麦、酪梨、火龙果