胡安·卡布里洛探索门多西诺县一带），以及洛伦佐·门多萨，新西班牙于1580年至1583年的总督。「门多西诺」是「门多萨」的形容词形式。于19世纪，尽管门多西诺县于1856年设置了门多西诺印第安保留地和圆谷印第安保留地，门多西诺县仍然发生许多白人灭绝原住民的暴行，其中受迫害的原住民包括如纪人、波莫人、卡察人和温图人。这些白人侵佔了原住民的土地，并将原住民变为他们的奴隶。因此，这些原住民对白人作出反击，并最终于1859年爆发门多西诺战争，导致几百个原住民死亡。原住民与白人的斗争一直持续至20世纪中期才停止。