到一项额外的任务，担任陆军后备总部（后改名「武警部队和战略储备」）的指挥官，指挥陆军新升任的将军。此外，在1961年10月，他也被指派领导陆军防空司令部1962年1月9日，苏哈托晋升少将，指挥曼达拉司令部，陆海空三军共约42,000兵力，并打赢在荷属新几内亚的战斗。原先荷兰企图违反1949年的规定，让新几内亚独立于印尼之外。身为曼达拉司令，他颁布范围扩及苏拉威西岛、摩鹿加群岛，和小巽他群岛的戒严令，影响范围约500万平方公里。苏哈托组织了3,000人的敢死队，从海上及空中进入争议地区。但这些敢死队员大部