口与建康十分接近，而荆州道远，兵势不相及，于是并没有派兵前赴建康，仅仅答应王恭而已。直至王国宝被司马道子诛杀后，殷仲堪才作出军事行动，但司马道子及后就写信制止殷仲堪，殷仲堪于是撤回江陵。隆安二年（398年），王恭在豫州刺史庾楷的劝说下再度举兵，讨伐司马尚之兄弟及王愉。当时王恭亦联结殷仲堪，而殷仲堪亦因为司马道子上一年因王恭起兵而诛杀王国宝，认为这次王恭肯定会成功；殷仲堪这次更决定立刻出兵，意图分享王恭举兵成功的功业。殷仲堪于是派杨佺期领五千水军作前锋，又将五千士兵借给留在江陵的广州刺史桓玄，任命桓玄率五