有普通列车都使用一人控制模式。宫崎至志布志之间的列车大约1至2小时一班、此外还有区间列车运行宫崎/南宫崎至青岛/油津/南郷。除了普通列车，还有快速列车「日南海洋号」运行下行的宫崎至志布志、上行的南郷至宫崎，每日来回一班，「日南海洋号」的下行使用一节KiHa40型车厢、上行使用两节KiHa47型车厢运行。在2009年10月10日，高千穗铁路线结业，而其下的TR400形就改造成为KiHa125型400番台，并用作观光特急「海幸山幸」号之用，行走宫崎至南乡之间。此列车为田吉站之南的唯一特急列车。在非电气化