联社担任副职领导，但没有成功。2006年，上官永清被任命为中共山西省农村信用社联社党委书记。在联社任职期间，上官永清身为党委书记却积极干预联社银行业务，因此造成很多冲突，她本人也被人举报。
晋商银行董事长.2008年8月6日，晋商银行筹备组挂牌成立，上官永清被任命为筹备组组长。晋商银行前身为太原市商业银行。太原市商行不良贷款过多、资本充足率不足，中国银监会曾予以警告。为了避免摘牌退市，山西省政府、太原市政府出手，将太原市商业银行重组为省级金融机构晋商银行。山西省、太原市两级财政均给