县1871年第一次府县整併中，将辖下位于丰前国的区域划入新设立的小仓县，位于日高国的区域划入新设立的美美津县，其余在丰后国的区域，则与同属丰后国的杵筑县（原杵筑藩）、日出县（原日出藩）、府内县（原府内藩）、臼杵县（原臼杵藩）、森县（原森藩）、冈县（原冈藩）、佐伯县（原）合併为大分县。