熙二十一年（1682年）壬戌科进士。改翰林院庶吉士，散馆授检讨。康熙二十七年（1688年）充会试同考官。康熙三十一年（1692年）升侍讲。康熙帝临国子监，超擢祭酒，政绩卓着，大学士王熙赞其为「近今第一祭酒」。康熙三十一年（1692年），在太学启圣祠中掘出元朝题名碑三块，并令选石材重刻。吴苑为人至孝，笃于师友，一日，因读到阳城责诸生归养语有感，随即以母老乞归。康熙三十九年（1700年）卒，年六十三岁。《清史列传》有传。
着作.曾参纂《一统志》、《明史·礼志》，皆能称旨。工诗，「多和平