1966年，文化大革命开始，仓门口堂被砸，牧师被揪斗，教堂房屋被占用，直到16年之后的1982年12月12日才恢复聚会。该堂经过1976年强烈地震，并未毁损。1987年，被列为天津市文物保护单位。
现状.仓门口堂是天津基督教“两会”在南开区唯一的教堂。除该堂外另有政府批准的王顶堤街道、嘉陵道街道、万德庄街道、长虹街道基督教家庭聚会点，以及红楼宾馆、红宝石酒店、欣苑大厦外国人基督教活动临时地点。2011年仓门口教堂开始进行维修，维修期间不中断聚会活动。