运营仍然受到图-104糟糕的安全记录的影响。1980年1月21日，苏联民航将其机队中最后12架图124退役，结束了图-124作为民航客机运营的历史。之后，图-124仍继续在一些军队中服役至20世纪90年代初期。其中，伊拉克空军的图-124在1990年的海湾战争中被摧毁。
意外事故.在服役期内，共有15架图-124失事并全机损毁。此外，两架伊拉克航空的图-124在海湾战争中在地面上被摧毁。