鲁斯专制国夺回。1246年尼西亚帝国在收复塞萨洛尼基城及马其顿大部分地区之后，重新恢复了军区。1392年，奥斯曼土耳其人侵占此地，当时军区实际上只余塞萨洛尼基城本身。1402年拜占庭重新收复此地后，塞萨洛尼基成为一名专制君主的治所，直到1423年该城向威尼斯投降。1430年，在经历了奥斯曼帝国的之后，塞萨洛尼基最终沦陷。