仅限于该市的公立学校，后透过自学成为美国印地安人专家，并在旅居各部落的期间进行实地考察。1885年，他任职于华盛顿特区的美国民族学局。在局长约翰·威斯利·鲍威尔的领导下，他编制了一份多达3000个条目的部落名单，该名单于1890年美国陆军对南达科他州苏族的伤膝河大屠杀后完成，以此奠定他国家级印地安学者的地位。1897年9月28日，穆尼在华盛顿特区与Ione Lee Gaut结婚，育有六个孩子。1921年12月22日，穆尼在华盛顿特区因心脏病去世。