殿上香者增多。据慈玄寺的工作人员表示皆是泛蓝支持者，有时就在现场高谈阔论。除是老荣民为主的聚会场所，洪门等团体常到此举办纪念国父与蒋公的活动。一名吴姓洪门人士还送心玄法师《清洪祕录》，内载洪门配合进行的革命与建国的历史。2000年，新店市青帮、洪门、理教等团体筹办纪念国父活动时，认为到国立国父纪念馆前举行，不如借新店极具草根味的慈玄寺办。选在该地聚办国父诞辰纪念会，理由是此地供奉孙中山及蒋中正的神像及神位，两帮并强调该庙和帮会并没有任何关联。青帮与关怀服务协会合作于2004年4月初在弥勒殿开办图书馆