.多囊卵巢综合症为一种成因不明的异质性失调。 有一些证据如: 家族病例、同卵双胞胎相比异卵双胞胎在多囊卵巢综合症的内分泌和代谢之遗传性特征上有较高的一致性等，点出多囊性卵巢综合症可能为遗传性疾病。亦有证据表明若胎儿于子宫中暴露于高浓度的雄性激素与抗穆氏管荷尔蒙中，随着年纪增长会提升其患多囊卵巢综合症的风险。
基因.致病性的基因为体染色体显性遗传，在女性身上具有高度的基因外显性且多变的表现度；这代表小孩有50%的机率从双亲其中一方获得可能致病的基因片段，如果获得此基因片段的为女儿，则