格的机会。但联赛第27轮上海申花2-4惨败贵州人和，亚冠梦想提前破灭。最终申花队以联赛第9名收场。
2013年.2013赛季开始之前，申花斥巨资引进的两名外援阿内尔卡与德罗巴相继转会离开。2月18日，中国足协收回球队2003年中国足球甲A联赛冠军头衔并让上海申花队从负6分开始比赛。虽然申花再陷“欠薪门”，三名南美外援曾因欠薪拒绝比赛，主帅巴蒂斯塔也被欠薪，但申花在联赛中保持着良好的上升势头，联赛前八轮五次在落后的情况下完成逆转，上海申花也被媒体冠以“落后的申花惹不起”之名。赛季中期