日本首相和菲律宾总统向陈水扁发出慰问电话。中国大陆国台办则表示「将继续注意事态的发展」，新华社称「陈水扁、吕秀莲在台南市街头进行选举活动时遭枪击，陈、吕受轻伤。」。在次日举行的大选投票中，陈水扁和吕秀莲都出现在投票所，两人分别发表了一段讲话，称不会被子弹打倒。大选的开票结果是陈吕获胜，双方得票率胜差为0.228%。当时泛蓝阵营认为，由于数万军警等公务人员因受管制无法顺利投票，被认为直接逆转了泛蓝阵营原可胜选的结果（军公教大多为泛蓝选民），但经选举无效之诉合议庭调查后认为虽启动国安机制，军宪警人员并未