这种分裂要到7世纪末法主米尔（Mihr）统治时期才结束。7世纪中叶，阿拉伯人征服波斯之后，伍麦叶王朝给予了摩尼教一定的活动自由，有些摩尼教徒甚至从唿罗珊回到了美索不达米亚。阿拔斯王朝时期，大量的摩尼教文献从中古波斯语被翻译成阿拉伯语。然而，摩尼的学说对穆斯林似乎有一种独特的魅力，引起了阿拔斯王朝统治者的警觉。大量具有波斯血统的作家和翻译家被指责为同情摩尼教者“”而被迫害，伍麦叶王朝最后的哈里发的老师就以二神教之罪名而被处死。783年，在哈里发麦海迪的命令下，巴格达成立了针对二神教的宗教裁判所，利用极为残酷的