战国时期并没有于此处发现或开採黄金的记录，当时开採的地点是一山之隔的。在的小说《》中，佐渡金山是上杉家的秘密财源，之所以无人知晓是因为上杉家对外保密。 但是在战国时代佐渡是的领土，并非上杉氏所有，因此在当时上杉氏不可能拥有佐渡金山的所有权。不过根据《今昔物语集》第26卷第15话所载“在能登国挖掘铁矿的人，去佐渡国掘金”的传闻，在成书的推定年代十一世纪后半，佐渡可能已经以砂金等形式有黄金产出。天正17年（1589年）上杉谦信的后继者上杉景胜消灭了佐渡岛的大名本间氏，将佐渡岛纳入自己的势力范围。庆长6年