庭皇帝查士丁尼一世在君士坦丁堡地区会议上更发表了十点反对教父俄利根的非正统见解，引发了与「基督一性论」的争论。查士丁尼一世试图调和矛盾，但却因具体措施上犹豫不决而不成功。「基督一性论」派指出教会没有指责观点与涅斯多留相同的着名教会文章「三章案」。埃及和叙利亚的地方教会因支持「基督一性论」，从大公教会中分离了出去。为了解决分歧和试图挽回分裂，查士丁尼一世决号召举此大公会议。是次会议审查「三章案」。结果提出谴责「三章案」，并制定了十四项绝罚条文。「基督一性论」的讨论被禁止；「否定复活论」被定为异端。而此会议