深密经认为，一切种子识为所有生命最初的根本识，阿陀那识、阿赖耶识与心为其异名。后世瑜伽行唯识学派，认为一切种子识就是阿赖耶识。
概论.种子识（bījaka-vijñāna），其字根源自植物种子（）。经量部认为，业与果报的媒介，是意的种子，由意的活动熏成，剎那相续，成为习气。在种子成熟时，成为果报。《解深密经》提出，所有意的种子都储存在种子识中，因此称为一切种子识。一切种子识为生命的根本识。