南美土着马曾被认为是约于250万年前迁徙到南美洲的上新马的后裔DNA分析却发现牠们应属于马属，与马有亲密的关系。南美土着马肩高约1.4米，外观像驴。脆弱的鼻骨结构显示牠们是独立于其他北美洲马种自行演化的。南美土着马及其他南美洲马于8000年前消失。在智利的米罗登洞穴内就发现了其下的"H. saldiasi"生存到1-1.2万年前。