改路为府，辖保昌、始兴两县，属广东道。洪武二年改行中书省，九年改行省为承宣布政使司，南雄府属相随。清嘉庆十二年（1807年）改府为南雄直隶州，直隶广东布政使司，裁去保昌县，领始兴一县。嘉庆十六年复升为府，次年又降为直隶州，直至清末。民国开始，改南雄州为南雄县，隶属广东省。