猪笼草进行了对比。此外，法萨猪笼草的笼盖比暗色猪笼草的更接近圆形。
其他.可依照其较宽的唇及笼盖的下表面无附属物，将宽唇猪笼草与暗色猪笼草相区别。暗色猪笼草同时也与产于苏拉威西的艾玛猪笼草及广布于苏拉威西、新几内亚和马鲁古群岛的大猪笼草间存在着密切的近缘关系。
自然杂交种.由于暗色猪笼草广布于婆罗洲，因此其与许多猪笼草物种形成了自然杂交种。但这些自然杂交种大多继承了暗色猪笼草附生的特点，因此常较难以发现它们。
豹斑猪笼草与暗色猪笼草的