高雄市以中央山脉为界，北面则以布拉桑克山、崙天山、海岸山脉等为界山与花莲县相邻。全县海岸线长达176公里，是全台湾海岸线最长的县份。台东县大致可分为中央山脉、花东纵谷平原、卑南溪三角洲、海岸山脉及泰源盆地等地理区。主要河川有卑南溪、知本溪、利嘉溪、金崙溪、太麻里溪、马武窟溪等，其中卑南溪是台东县境内的最大河川，发源于中央山脉的卑南主山东侧，主流全长约有84.35公里，流经台东县的七个乡镇市，流域面积达1,603平方公里，是台东灌溉用水的最主要来源。
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