4月左右逐渐发育成熟且假种皮渐转暗红色，于5至6月间成熟落果，与红豆杉属最大不同就是其雄毬果两两对生，形成穗状花序，而非单生雄毬果。由于台湾穗花杉树高有限，很少超过中冠层（15公尺）以上，所以属于中下层耐阴树种，喜生于溪谷或较为潮湿山坡及谷地，常与阔叶林混生。註：幼种实为当年生且经授粉后正在发育中的种实；绿果及红果为前一年发育之种实。
复育及研究.目前为台湾穗花杉进行分佈及数量调查的学术单位为屏科大，主要目的是为台湾林务单位拟定更完整的保护及复育计画书。实地调查报告显示