会议召开，持续了大约2小时。6日09：00日军各舰开始陆续从佐世保港出动。首先是第一舰队第三战队出羽重远海军少将的4艘防护巡洋舰最先出港，其后是驱逐队和鱼雷艇队，接着是特务船（日军对非战斗辅助舰艇称唿，当日出动春日丸、日光丸、金州丸）。11:00三须宗太郎海军少将的第二舰队第二战队各装甲巡洋舰（下辖6艘，实际5艘；原战队内的浅间则临时加强给第四战队）。最后是梨羽时起海军少将指挥的第一舰队第一战队（6艘前无畏舰及1艘通报舰）。17:00前后陆军第2师团首批部队2200人则分乘3艘运输船出港，由瓜生外吉海军