睡病、轮班工作睡眠紊乱以及与阻塞性睡眠唿吸暂停相关的等紊乱症的治疗。因为其可能导致过敏反应以及精神障碍，欧洲药品管理局建议新的莫达非尼处方应该仅在用于治疗嗜睡相关的睡眠障碍时开出。
非适应症用途.莫达非尼也被发现用于治疗多发性硬化症导致的疲劳感。在2000年，Cephalon公司进行了一项研究，以评估莫达非尼作为一种治疗多发性硬化症导致的疲劳的可行性。72名患病程度不同的患者在9周内分别使用了两种不同剂量的莫达非尼和安慰剂，由患者本人在参考标准上自我评估疲劳程度。使用低剂量的患