昆曲被联合国教科文组织列为首批“人类口头和非物质遗产代表作”名录。借此时机相关部门在苏州戏曲博物馆的基础上筹建中国昆曲博物馆。昆曲博物馆以抢救、保护、传承、弘扬昆曲文化为宗旨，2003年建成。同年，苏州戏曲博物馆增设两块馆牌，分别为中国昆曲博物馆和苏州评弹博物馆。2014年，中国大运河被列入世界遗产名录，全晋会馆作为大运河苏州段的重要古迹之一，入选为遗产点。由此，昆博成为了“双遗产”博物馆。同年昆博开始整治提升工程，扩大展出面积、增加游览活动，历时一年余完工。
馆舍馆藏.苏州戏