务归武警总部司令部领导。1985年，恢复公安部边防局，负责全国边防检查、边境管理、机场安全检查等业务。1987年，边防武警从武警总队中分离，划归各级公安机关领导。1994年1月，重要城市边防检查站升格为副师级建制，改称边防检查总站。1991年，国家边防委员会成立（2005年更名国家边海防委员会），负责指导、协调有关部门和地区的边防工作。1992年，机场安全检查及飞机监护工作移交民航部门。1997年，成立出入境边防检查总站，将边防检查现役警察改成职业警察。2003年，将公安边防部队担负的中朝边境、中缅边境