名主力离队他投，以及赵俊杰、陈衍光、冯振霆等球员长期受伤，至最终只能以 24 战得 41 分，获得联赛第六名。不过，大埔却连续两年成功杀入足总盃决赛，并以 4–2 击败另一支地区球队天水围飞马，夺得球队升上甲组以来的首项锦标，取得下一年度代表香港出战亚洲足协盃资格。
进军亚协（2010 年）.大埔季前组军策略亦针对亚洲足协盃而作出准备，除了季末已经宣佈离队的外援祖利亚，从四海借用的中锋卡立亦离队而去。华人球员方面，有冯振霆转投愉园，李树烊转投「升班马」大中。从结盟球队番禺明珠俱乐部