哀鸽的学名"Zenaida macroura"是1838年由法国动物学家夏尔·吕西安·波拿巴为纪念他的妻子公主而命名的。“哀鸽”就是因其哀伤的鸣叫而得名。
近缘物种.哀鸽与斑颊哀鸽（"Zenaida auriculata"）和索哥罗鸠（"Zenaida graysoni"）有近缘关系。部分专家将它们归类为一个超种，而这三种鸟有时被分在独立的"Zenaidura"属内，但目前的分类法是将它们与其他物种分在哀鸽属（"Zenaida"）内。而在鸟类DNA分类系统中，哀鸽被归入雀总目，科属