应用上用途较少，顺式聚异戊二烯才是天然橡胶目前应用上的主流，口语上说天然橡胶也通常都指顺式聚异戊二烯。以反式聚异戊二烯为主结构的天然橡胶有很多别名，大多与其植物来源有关。从巴拉塔树的树汁取得称为巴拉塔胶（balata），马来语percha树的树汁称为，从杜仲树取得的则称为杜仲胶。不同植物来源的反式聚异戊二烯天然橡胶成分差别不大，用途也稍有不同。巴拉塔胶最早期的被用于水下电缆的绝缘材料现今则做特种黏合剂等功能，而古搭帕恰胶现今运用在牙科与骨科等方面。由于聚异戊二烯可以被合成制造，所以用这种方式生产的聚异戊