政府征收，从此成为西班牙的每位菲律宾总督的临时夏季居所。1863年马尼拉地震摧毁总督在王城区的官邸后，即为自Rafael de Echague y Berminghan后菲律宾政府首长的宅邸。美西战争后，西班牙政府将菲律宾以二千万美元的代价，售予美国。马拉坎南宫在美属时期亦成为文人总督的官邸，这期间扩建的行政大楼Kalayaan Hall已转型为博物馆。总计有18位西班牙的总督（军事总督）、14位美国的菲律宾总督（文官总督）、和除了菲律宾革命期间获选为首位菲律宾总统的艾米里俄·阿圭那多（Emil