而两个盆地中，北方的盆地约深400公尺，南方的盆地约深800公尺。因为被沃斯托克湖分为两个盆地构造，所以科学家们认为，这两个独立生态系的化学、生物因子应该都不太相同。沃斯托克湖面积15,690平方公里。估计的湖水体积约为5400立方公里 ，且皆为未冻结的淡水。2005年5月，科学家在湖的中央发现了一座岛屿。沃斯托克湖的平均水温为−3℃，在水的凝固点以下。湖水仍以液态存在，目前认为是三种因素共同作用造成：
生态环境.沃斯托克湖是一个贫养的（缺少养分的）极端环境。湖水为氮气和氧气的