以预赛不败、南区第一名的战绩挺进全国总决赛的半决赛。半决赛中，球队击败杭州三超，升入中甲联赛，夺得中乙联赛亚军。这一年，李军还率领湖北省U20男足参加了中华人民共和国第十一届运动会，获得预赛小组第一名、决赛第九名。2010年，李军带领以梅方、吴䶮、柯钊、李行等年轻球员为班底的湖北绿茵获得中甲联赛第5名。赛季末，俱乐部资金紧张。2011年，湖北武汉中博置业入主湖北绿茵，球队管理层换人，李军不再担任主教练。离开湖北绿茵后，李军在2011年担任了业余球队武汉宏兴的主教练。2012年，湖北华凯尔足球俱乐部组建，