大专院校都有学生会及其他相关自治组织，其中各校仅有一个学生会定位为一级学生自治组织，以全校学生为学生会之当然会员，并代表全校行使学生自治权力，而中华民国教育部高等教育司的大专院校改制评鑑亦将学生组织的自治程度列入考量。《大学法》所定义的学生自治组织并非学生社团，《大学法》也规定大学应辅导学生成立由全校学生选举产生之学生会及其他相关自治组织，学生会亦可向学生收取会费，但缴纳会费并不是学生的义务，学生会或校方也不得因学生未缴交会费而作出惩处。学生会如同一个小型的国家组织，学生有权直接或间接的参与学生相关事务的决