甯本瑜（），安徽省徽州府休宁县人，清朝政治人物、进士出身。
生平.光绪九年（1883年），甯本瑜参加癸未科殿试，登进士二甲19名。同年五月，改翰林院庶吉士。光绪十二年四月，散馆，着以知县即用。