95年5月1日台湾省警务处改制为「台湾省政府警务处」，1997年1月16日台湾省政府警务处改制升格为「台湾省政府警政厅」，1999年7月1日实施「台湾省政府功能业务与组织调整」，台湾省政府警政厅之人员与业务全数由内政部警政署接收1995年3月1日内政部消防署正式成立，至此警察机关、消防机关分立。2000年1月28日行政院海岸巡防署正式成立，将海洋巡防及海岸安全检查业务移拨分出警察机关。2007年1月2日内政部入出国及移民署正式成立，将移民业务移拨分出警察机关。2013年8月21日，制定《内政部警政署组织