设经济研究所、应用化学研究所及边疆人文研究室，吴大任、卞之琳、萧采瑜、傅筑夫、高振衡、李广田、罗大冈、汪德熙、谢国桢、张清常等学者加盟南开。
1949年至今.1949年1月，解放军接管天津市。3月，中法大学经济系、生物系及河北省立法商学院的大部分学生转入南开大学相关科系入读。6月27日，华北高等教育委员会决定取消南开大学哲教系。中华人民共和国成立后，南开大学延续了公立大学的建制。1949年底，南开大学教育系并入北京师范大学。1951年，南开大学在木斋图书馆原址上重建了图书馆，卢木斋