分辨的分析物; 在质谱法(MS)分析中，离子抑制减少; 分析物的保留时间用作关于其身份的信息。这种分离步骤不是强制性的，通常在核磁共振和基于“霰弹枪”的方法如(Shotgun lipidomics)中被省略。
检测方法.核磁共振波谱法和质谱法两大分析技术是用于检测代谢物最主要的手段，它们也通常和色谱法联合使用以提高灵敏度和准确度。
核磁共振波谱技术.迄今为止，核磁共振波谱技术(Nuclear magnetic resonance spectroscopy