永泰县森林生态系统具有中亚热带向南亚热带过渡性的典型特征，境内生物多样性丰富。国家Ⅰ级保护植物有四川苏铁、银杏、水松、南方红豆杉4种；国家Ⅱ级保护植物有金狗毛蕨、刺桫椤、福建柏、香樟、香榧、花榈木、红豆树、鹅掌揪、半枫荷、粗齿桫椤、针毛桫椤、闽楠、短萼黄连、金荞麦、绞股蓝、中华猕猴桃、榉树、伞花木、喜树等21种；国家重点保护野生动物（1988）的Ⅰ级保护动物有云豹、黄腹角雉、鼋和蟒蛇4种，国家Ⅱ级保护动物有穿山甲、黑熊、水獭、大灵猫、小灵猫、鬣羚、白鹇、林雕、虎纹蛙、花鳗鲡等39种。永泰县国土总面积