MZ DOS可执行文件可在DOS和基于Windows 9x的操作系统中运行。基于Windows NT的32位系统也可以使用内置的DOS虚拟机运行（尽管一些图形模式是不支持的）。64位版本的Windows无法原生运行。替代方法是运行这些模拟器程序，例如DOSBox、DOSEMU和Wine。MZ DOS可执行文件可由链接器生成，如Digital Mars Optlink、微软链接器、VALX或Open Watcom的WLINK。另外FASM可以直接创建它们。