花植物分4个目：藻类，苔藓，蕨类和真菌。之后，植物学家对地衣有所研究，使得隐花植物包含五类植物：藻类、真菌类、地衣、苔藓和蕨类。但随着生物学研究的发展，隐花植物下属的真菌已经从植物界中独立出来，单独列为真菌界，而藻类中很多也已划分出植物界，比如蓝藻被划入细菌。地衣也被发现属于共生生物体系，这使得“隐花植物”一词已经不再用于系统命名法中，但仍在描述一类植物系群时使用。