举令百官震惊战慄，但王彪之知道桓温不臣之心早已揭露，不可能以理说服他以阻止此事，于是反而协助桓温筹备废立的礼仪。又因当时朝臣都不知废立君主之详细事项，一手准备好事宜的王彪之就因而获得众官佩服。桓温废掉晋废帝后便立了司马昱为帝，即晋简文帝。随后便要废去时任太宰的武陵王司马晞，王彪之当时试图劝阻桓温但桓温心意已决，并不接纳。次年，晋简文帝逝世，当时群臣都很疑惑，不敢让皇太子司马曜继位，更有人认为要等待桓温作出决定。王彪之严正地维护太子继位的正当性，终令众官议决迎皇太子继位，即晋孝武帝。太皇太后褚蒜子当时下令