监督者的立场，只有发现弊害时，才逐渐改善，这样的行政就事半功倍。当时大多数日本人认为日本文明而台湾野蛮，后藤新平这样肯尊重台湾旧习惯的想法实在难能可贵。后藤新平为了彻底尊重台湾旧习惯，首先他展开大规模调查。1900年，后藤新平聘请京都帝国大学教授冈松参太郎，于1901年成立临时台湾旧习惯调查会，后藤新平自己担任会长。1903年，京都帝国大学教授织田万加入调查会。途中，织田万对调查的对象太庞大、复杂，而有些气馁，后藤新平勉励他说：「这是为了世界文化，而且只有日本人能做。」
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