南哈马黑拉县（印尼语：Kabupaten Halmahera Selatan）是印度尼西亚北马鲁古省的一个县，位于哈马黑拉岛南部，另辖哈马黑拉岛西部和南部的部分小岛。2010年人口普查，全县共有198,911人。县治是位于巴占岛上的拉布哈。2003年2月25日，印尼议会通过2003年第1号法令批准北马鲁古县的9个区组建新的南哈马黑拉县。
岛屿.南哈马黑拉县的主要岛屿：
行政区划.现在南哈马黑拉县下分30个区（"kecamatan"）：