现代的食物处理过程，例如：烹调，都会令这些生化素被破坏或消失。因此，经过工业化加工的食物很可能已丧失了相当的植物生化素，从而使其比未经处理的食物不健康。欠缺植物生化素的经处理食物，很可能是多种可预防的疾病的成因，又或可增加得病的风险。幸运的是，番茄中的番茄红素的浓度再制成果汁或番茄酱后并不会有所改变，甚至会增加。