为幕府的中枢，组成了奉公众和奉行众，并授予近臣和大名室町幕府中的官职。除了近畿周边的信长势力圈以外（北陆地方、中国地方、九州地方），足利义昭依然保持着被流放以前的权力，甚至对京都五山的住持还有任命权。在信长与三好义继的关系恶化后，义昭于11月5日移驾到和泉国的堺。足利义昭曾提出要返回京都，但信长提出送交人质的条件，最终交涉破裂。1574年移驾纪伊国兴国寺，又移驾泊城。当时纪伊国是管领畠山氏的领地，值得一提的是畠山高政的重臣汤川直春的势力在当时很强大，直春的父亲汤川直光担任河内守护代一职。1576年（