1998年至1999年德国足球甲级联赛是第36届德国足球甲级联赛。赛季于1998年8月14日开始，至1999年5月29日结束。凯泽斯劳滕为该赛季的卫冕冠军。最终，拜仁慕尼黑夺得了本届德国足球冠军，最佳射手则由射入23球的柏林赫塔球员获得。
参赛球队.共有18支球队参加该届赛事的角逐，其中包括15支参加了1997年至1998年德国足球甲级联赛的球队。卡尔斯鲁厄、科隆及比勒费尔德作为上赛季德甲积分榜的最后3位而降入乙级联赛，其名额则被乙级联赛冠军法兰克福、亚军弗赖堡和季军纽伦堡所取代。