与符腾堡的伊莉莎白结婚。伊莉莎白的父亲是符腾堡公爵腓特烈二世·欧根，母亲是布兰登堡-施韦特的弗蕾德里克。两人的独女卢多维卡（Ludovika）于1790年出生，1791年夭折。伊莉莎白在生产卢多维卡时去世。1790年，法兰兹与那不勒斯和西西里的玛丽亚·特蕾莎结婚。玛丽亚·特蕾莎的父亲是那不勒斯和西西里国王费迪南多四世和三世，母亲是奥地利的玛丽亚·卡罗琳娜。两人共有4子5女：玛丽亚·特蕾莎于1807年去世。隔年，法兰兹与奥地利-埃斯特的玛丽亚·卢多维卡结婚。玛丽亚·卢多维卡的父亲是法兰兹的叔叔、奥地利