。种群瓶颈发生后，可能造成种群的灭绝，或种群恢复但仅存有限的遗传多样性。
动物.一个例子是猎豹（"Acinonyx jubatus"），由于猎豹彼此之间的关系过于相近，猎豹之间的直接皮肤移植已经不会引发任何免疫反应。猎豹也遭受低精子浓度、低精子活动力及畸形精子鞭毛等问题。科学家推测，猎豹约在一万年前的上一个冰河期中经历了种群瓶颈，加上长年近亲交配，因而造成其基因库寡少情形，使得族群对于疾病没有应变能力；如致命的猫传染性腹膜炎（Feline infectious peritoniti