东大工科师资逐步增强，聘请了杨杏佛、涂羽卿、沈祖玮、李世琼等学者任教授，各项设备也逐渐添置齐全。然而，1924年4月东南大学校董事会以学校经费不足为由单方面决定停办工科，郭秉文和茅以升力争保留未果。8月，经与水利局协商，东大工科与河海工程学校合并组建河海工科大学，由茅以升出任首任校长，设机械工程、电机工程、土木工程、水利工程系。
中央大学时期（1927‒1949）.1927年，国民政府定都南京，6月将东南大学、河海工科大学、上海商科大学、江苏法政大学、江苏医科大学、南京工业专门学校