的尼罗河是历史上第五条从埃塞俄比亚高原向北流的河流。使用卫星图像可以在沙漠里看到今天尼罗河以西的干枯了的河道。一条在中新世晚期古尼罗河的河道今天已经被泥砂填没。古尼罗河将碎屑岩沉淀带入地中海，今天在这些岩层中发现了数个天然气矿。中新世晚期的地中海与大西洋隔绝，蒸发导致整个地中海几乎干枯时，尼罗河一直流到地中海的海底，到海拔数百米以下。今天这条河谷已经被后来的沉淀堆满。在维龙加山脉的火山将河道截断之前坦噶尼喀湖的水注入尼罗河，当时尼罗河最远的河源位于今天赞比亚的境内。