在于所有高等真核生物和很多病毒中。该途径的产物可以看作是活化的异戊二烯单位，是类固醇、类萜等生物分子的合成前体。某些植物、原生生物顶复门的生物及大多数细菌（如结核杆菌）可以通过另一种途径合成IPP和DMAPP，即非甲羟戊酸途径。它发生在质体内，是以丙酮酸和3-磷酸甘油醛作原料，以2-甲基赤藓醇磷酸（MEP）和1-脱氧木酮糖-5-磷酸（DOXP）为中间体，因此也称MEP/DOXP途径。
反应.总反应：
药理.许多药物通过甲羟戊酸途径发挥作用：Sec