由于小肠较短，功能较弱所引起的。主要症状是腹泻，其可导致脱水，营养不良和体重减轻。其他症状可能包括腹胀，胃灼热，感觉疲倦，乳糖不耐症和恶臭味的粪便。併发症可能包括贫血和肾结石。大多数案例是由于手术切除了大部分的小肠所造成。这类手术主要是因为成年人的克隆氏症和幼儿的坏死性小肠结肠炎。其他原因包括小肠的损伤，以及出生时有异常的短肠。短肠症候群它通常不易发现，小肠长度通常为6.1米，一般要到长度不到2米（6.6英尺）时才会发现到。治疗可能包括特定饮食，药物治疗或手术。饮食可能会包括、维生素和矿物质补充剂，