叶飞任新四军挺进纵队副司令员，率领部队北渡长江发展苏北根据地，指挥郭村保卫战。1940年7月起任新四军苏北指挥部第一纵队司令员兼政治委员，9月起任苏北区党委委员，10月率一纵作为主力部队参加黄桥战役。1941年，皖南事变后，新四军重新整编，叶飞任新四军第一师第一旅旅长兼政治委员，11月起任新四军第一师副师长兼第一师第一旅旅长、政治委员。1942年12月起任中共苏中区第三地委书记、苏中军区副司令员，指挥反扫荡战争。1944年3月，新四军发动车桥战役，叶飞负责前线指挥，击毙日军465人，俘虏24人。1944