徽被红卫兵认为是“四旧”，被迫錾掉，祭堂和墓室屋顶用彩色马赛克镶嵌的中华民国国旗图案也被凿除，改用水泥粉刷。祭堂北墙上的蒋介石手书《总理遗训》、胡汉民手书《总理遗嘱》、谭延闿手书《总理告诫党员演说词》被磨平。文化大革命结束后，1979年奉安50周年时国家文物局拨款整修中山陵，陵园管理处维修了下水道，全面整修了台阶，并处理了渗水的建筑缝隙。1981年6月至9月，为准备辛亥革命70周年纪念活动，中山陵管委会开始着手修复在文革中受到破坏的部份。恢复了“博爱”匾额石刻，修复了祭堂和墓室的国民党党徽与中华民国国旗图案