隆多雨环境与岩石风化影响，植被丰富，多生榕树，并且生长大量的野百合、金花石蒜、石板菜、女贞、防葵、万年松、木槿等植物。目前基隆市政府逐步复育百合、金花石蒜。五、六月份为百合花季；八至九月为金花石蒜花季。岛上除了珍贵的火山地形之外，也有独有的火山螃蟹(乌龟怪方蟹)，有时可观察到戴胜、白头翁及雨燕等鸟类，但是岛上并无野生的大型哺乳动物。 基隆岛海域乃着名的矶钓场，鱼类种类多达30余种。