因爲他被允许説服苏格兰政府执行达连计划，并对计划在1695年成立苏格兰银行的构想产生影响，这银行将成为苏格兰王国的中央银行。佩特森等待多年的理想终于在1698年实现，他跟随远征巴拿马的苏格兰殖民者出发，然而这次远征的结果却是灾难性的，殖民者抵受不了当地的气候和热病，不少人死于当地。那些死亡者包括佩特森的妻儿，极少人连同身染重病的佩特森在内侥幸地存活，他于1699年12月逃回苏格兰。他积极参与有关英格兰和苏格兰合併的活动，推动了《1707年联合法案》的通过。佩特森选择在西敏度过生命最后的日子，1719年1月于