在广州授徒讲学，力图以教育兴国，鼓吹变法，培养出了梁启超、陈千秋、麦孟华、徐勤等一批政治家和学者。他们后来都成为戊戌变法的骨干人物。丘逢甲于1896年6月首次到万木草堂，其时草堂已被清廷取缔，屋宇也早也归还丘家。丘逢甲在此先后拜见了广东巡抚许仙屏、翰林院编修刘葆贞、菊坡精舍山长梁诗五等。这也是丘逢甲第一次到广州，在邱氏书室写下了《镇海楼》、《珠江书感》等20多首诗。他第二次到书室是在1903年冬辞去岭东学堂监督一职前来，谋求在省城发展新式教育，未果返回家乡。第三次到书室是1906年，他被两广总督岑春煊聘