因为中国共产党为吓阻台湾举办首次总统直选，在中国大陆沿海发动军演，演变成震惊台海内外的「1996年台海危机」，台湾民众对共产党作法十分愤怒，将反弹力道全灌注在对共产党强硬的李登辉身上，彭谢配声势根本拉不起来，即使国民党分裂出前司法院长林洋港和前监察院长陈履安脱党独立参选，亦无损李登辉的选情。选举结果，李登辉和副手连战大胜，彭谢配的得票率创民进党的新低，只获得21%的选票，远低于当时民进党平均30%的得票率。1998年时任立委的谢长廷南下高雄选举，9月2日在三民区千北里里长的陪同下，前往该区户政事务所