将这个化石进行叙述、命名，模式种是小赫伯斯翼龙（"H. pigmaeus"）。属名意为「赫伯斯的蜥蜴」，以发现化石的拉菲尔·赫伯斯为名；种名在拉丁文意为「侏儒」。Rodolfo Magín Casamiquela命名这个新物种时，认为牠们是种小型虚骨龙类恐龙，类似美颌龙，并将新物种归类于虚骨龙科，当时被认为是最小型的恐龙之一。
特征.正模标本（编号CTES-PZ-1711）是目前的唯一化石，包含：荐骨、骨盆、左右股骨，曾遭到上方岩层严重挤压成扁平状。被发现的化石的大腿骨长9.15厘