但也被陈瑞钿驾驶的格斗士战斗机击落两架，此外，九六式也曾轰炸武汉和重庆等中国城市，由于为九六式陆上攻击机护航的九六式舰载战斗机航程不足，要深入中国内陆的九六式因此被中国空军击落，战损超过百分之十，这令日本海军不得不让三菱研制零式战斗机。1941年太平洋战争爆发，九六式仍从台湾等当时日本领土以及日军佔领区起飞去轰炸菲律宾和马来西亚等地，之后渐被一式陆上攻击机取代。
消灭英国远东舰队.1941年12月太平洋战争开始不久，日本帝国海军收到由菲利普海军少将率领的一队由威尔斯亲王号战舰和