憎恶其为人，作《留都防乱公揭》驱之，曰：“其恶愈甚，其焰愈张，歌儿舞女充溢后庭，广厦高轩照耀街衢，日与南北在案诸逆交通不绝，恐吓多端。”崇祯十一年，阮大铖在金陵倡立群社以图拉拢名流。
弘光朝.南明弘光朝立，由于朝中无人知兵，经马士英推荐，官至兵部尚书，编《蝗蝻录》，据《留都防乱公揭》欲捕杀黄宗羲等人。弘光元年四月初八，以结党乱政为由逼雷演祚自尽。清兵攻陷南京，阮大鋮由太平府逃往朱大典在浙江金华的军营。朱大典兵粮充足，更有意要将军务交由阮大鋮处里。军中譁然，即以公檄声讨其罪名，逐