牠们的迁徙模式所知甚少，因仍未能追踪个别南极磷虾的运动。
南极洲生态位.南极磷虾是南极洲生态系统的重点物种，并且为鲸鱼、海豹、豹形海豹、海狗、食蟹海豹、鱿鱼、冰鱼、企鹅、信天翁及其他的鸟类提供了重要的食物来源。食蟹海豹有着特别的牙齿，就像一个完美的隔筛，可以从水中筛出南极磷虾。食蟹海豹是世界上最多的海豹，牠的98%食物就是南极磷虾，每年消耗超过6千3百万吨。豹形海豹亦有着相似的牙齿，南极磷虾是牠饮食的45%。所有海豹每年一共消耗6千3百万至1亿3千万吨的南极磷虾，所有鲸鱼就消耗3千