与横溪各自注入大嵙崁溪分流河道，三崃溪于刘厝埔汇入分流，为横溪汇注点之上游约八百公尺处。其后因河沙堆积，河床日渐昇高，导致分流消退，原本两溪汇注处之大嵙崁溪分流河道成为三崃溪河道之延伸，因而形成今日三崃溪纳横榽之势。
地质.在台北盆地形成前，古大汉溪和古新店溪是独立入海的两条河，大汉溪自源地以降，河道多有曲折，在石门以上呈东西走向。早在台北地区还是一片山地时，大汉溪在石门流出山区后，就直接由石门直接向西迳流入海。台北下陷成盆地后，古新店溪转往北流，同时加速了上游的向源侵蚀作用，源头