分子量和蛋白质分子中的氨基酸数量却相当困难。斯维德伯格还表示，溶液条件下的变化可能导致蛋白质分解成许多子单元，即现在已知的四级机构变化。在那时，蛋白质的化学结构仍未确定。 最被大众接受（并最终被证实正确）的蛋白质结构假设指出蛋白质是线性的多肽，即无支链聚合物的氨基酸以肽键相连。 然而，一个典型的蛋白质是非常长—数百个氨基酸基团—几位着名的科学家不能确定这样的长的线性大分子是否能稳定的存在于溶液中。 进一步怀疑产生蛋白质的多肽性质是因为观察到某些酶分解蛋白质而不是多肽，另一些分解多肽但是没有折叠蛋白质。