经历一段时间后会积聚一些具有遗传能力突变，因此其中所包含的历史讯息，可经由脱氧核醣核酸序列的比较，使遗传学家了解生物体的演化历史，也就是种系。这些研究是种系发生学的一部分，也是演化生物学上的有利工具。假如对物种以内范围的脱氧核醣核酸序列进行比较，那么群体遗传学家就可得知特定族群的历史。此方法的应用范围可从生态遗传学到人类学，举例而言，脱氧核醣核酸证据已被试图用来寻找失踪的以色列十支派。DNA也可以用来调查现代家族的亲戚关系，例如建构莎丽·海明斯与-{zh-hans:托马斯·杰斐逊;zh-hant:托马斯·杰