章钺等八人，责打四十大板，家产籍没。吴兆骞虽“审无情弊”，但因不能完卷，也被革去功名，流徙奉天宁古塔（今黑龙江宁安县）的严厉处分。据孟心史考证：“丁酉狱蔓延几及全国，以顺天、江南两省为鉅，次则河南，又次则山东、山西，共五闱”。有学者认为，科场案是清初打击汉族士绅的手段之一。受丁酉科场一案的牵连，吴兆骞、方拱干等文人被流放到东北宁古塔，处境凄苦。吴汉槎给顾贞观的信中写道：“塞外苦寒，四时冰雪。鸣镝唿风，哀笳带血。一身飘寄，双鬓渐星。妇复多病，一男两女，藜藿不充。回念老母，茕然在堂，迢递关河，归省无日……”