络车务控制室设于本车厂办公区内。1997年，车务控制室搬迁至青衣站。1981年12月，首批九铁3094型列车（今港铁中期翻新列车）到港，在两铁协议下，该等列车在本厂进行组装。2001年，地铁公司在九龙湾车厂举行「第一代载客列车退役仪式」，而港铁机场铁路列车亦有同场展出。这次亦是机铁列车唯一一次进入市区线区段。2003年至2004年，九龙湾车厂曾经为部份第三代港铁市区线现代化列车（H-Stock）进行迪士尼线改装工程。2003-04年，本厂曾为深圳市地铁集团（辖下深圳地铁于2004年开通）首批