进党执政以后担任原民会主委，却不敢对民进党立委邱议莹以「番仔」污辱台湾原住民这样的事情表示意见。2020年6月9日，钓鱼台教育协会、台湾钓鱼台光复会、中华保钓协会共同发起，十多个团体聚集于日本台湾交流协会台北事务所前，抗议日本沖绳县石垣市意图更改钓鱼台列屿之名称；日本台湾交流协会未派员出面回应，也未收下抗议书。莫那能出席时说，至今台湾还有三点没有光复，即钓鱼台主权问题仍未解决、慰安妇问题仍未解决、高砂义勇队仍被供奉于靖国神社；他怒批，日本殖民时把台湾原住民当作砲灰，现在台湾渔民也受到日本的欺负。