8年间的，在教区担任司铎。教宗若望·保禄二世于1988年5月5日将他任命为海得拉巴教区主教，他于9月16日晋牧。他于1998年6月27日获调任为费萨拉巴德教区主教。若瑟·考茨曾长期担任巴基斯坦明爱主席，他于2005年指挥震灾救援工作。由于卡拉奇总教区总主教荣休，因此若瑟·考茨于2012年1月25日获委任为卡拉奇总教区正权总主教。教宗方济各于2018年5月20日宣佈于同年6月28日将若瑟·考茨擢升为枢机。他于该日获擢升为司铎级枢机，领衔。