止了杀戮。权善才感激崔知温的建议，想送他500降人，崔知温拒绝了，说自己的建议是为了让国家得益，而非为己谋私利。后，党项余部因此投降崔知温。
任职中央.后，崔知温被召回长安任尚书左丞。永隆元年（680年）四月，因官秩不够高，拜黄门侍郎，特诏同中书门下三品，为实质宰相，与侍中郝处俊、左庶子高智周、给事中刘景先兼修国史。开耀元年（681年）七月，迁中书令。永淳元年（682年）四月，高宗想任用黄门侍郎郭待举、兵部侍郎岑长倩、秘书员外少监、检校中书侍郎郭正一、吏部侍郎魏玄同，对崔知温说：“