归元后，更名海宁州，领东海、朐山、沭阳、赣榆4县。明太祖洪武元年(1368年)，海宁州复名海州，治朐山，领赣榆1县，隶属淮安府。终明之世，淮安府所领皆隶南京。清世祖顺治二年(1645年)，废明南京，设江南布政使司治江宁(南京)，所统府、州、县仍明之旧。清顺治十八年(1661年)，江南省分置左、右布政使司，淮安府隶属江南左布政使司。清圣祖康熙六年(1667年)江苏建省。清世宗雍正二年(1724年)，升海州为直隶州。隶属淮安府。清高宗干隆三十年(1765年)，海州直隶州隶属淮徐道。
民国