后宫建筑平面格局採二进三间闽南式庙宇，座东偏北朝西北，早年临海滨，因此庙埕外围尚留有防波堤，后因开辟西滨快速道路，海岸往外推出许多。三川殿入口以一字型展开，中港间约小港间宽两倍，除展现主从关系，在美学上也有较佳之效果。正门两侧为抱鼓石鼓石，不若其他庙以石狮子为座，系因主神为妈祖，以显现妈祖宫庙貌之特色。前后共用三柱，为一般小型传统建筑常见之构造形式。其占地约400坪。龙、虎边门两侧置门枕石。正门门神为秦琼与尉迟恭；龙边门门神为宦官，手持牡丹与香炉；虎边门门神为宫女，手持仙桃与茶壶。三川殿内部作二通二瓜，