马拉市经常受热带气旋所带来的灾害袭击，其中1998年11月的飓风米奇以及2005年的飓风斯坦，是瓜地马拉市有纪录以来，最严重的飓风灾害。2010年，瓜地马拉市亦受热带风暴阿加莎吹袭，其短时间内庞大的降雨量，加上排水系统崩溃，于瓜地马拉市北部曾造成一巨大坑洞。
火山活动.瓜地马拉市周边可见四座火山，其中有两座是活火山。最接近瓜地马拉市，且最活跃的火山为帕卡亚火山，其有时会排出大量的火山灰。2010年五月27日晚间七时十分，该火山曾经再次喷发，火山灰喷至1,500公尺高，影响地