机场在1997年6月28日通航，1997年7月1日大校场机场结束了其民航机场的作用，此后仅为军用机场。自从1934年大校场机场落成后，总共经历超过十次扩建。1999年，机场已经拥有一条长2,200米、宽60米、厚46厘米的跑道，能够承载波音737、757起降。机场总佔地面积。随着南京市城市建设发展，机场逐渐被城市建成区包围。2003年，军地双方启动了空军南京机场迁建前期工作。2006年1月，确定了新机场场址。2009年1月，国务院、中央军委正式批复同意迁建空军南京机场。2012年8月，空军南京新机场