贵族所统治的斯洛文尼亚东部地区（如普雷克穆列）；从历史上，匈牙利人在改宗归正宗（加尔文主义）之前，就接受了路德宗，所以没有消灭新教的政策。斯洛文尼亚人的新教信仰在反宗教改革中倖存下来。新教信徒是斯洛文尼亚的少数信仰群体；大多数新教信徒居住在东部的普雷克穆列（Prekmurje）地区，其中大多数属于路德宗。
正教会.斯洛文尼亚的正教会信徒大多是塞尔维亚人，斯洛文尼亚的正教会基督徒属于萨格勒布和卢布尔雅那塞尔维亚正教会大主教的管辖范围。
伊斯兰教.斯洛文尼