朝第一次修建是在康熙五十七年（1718年）左右，不过目前保留者为光绪十三年（1887）建的金龟头新式砲台，于民国九十年（2001年）11月21日公告为国定古蹟。
沿革.金龟头砲台是在清康熙五十七年（1718年）兵部特准福建总督觉罗满保所奏而修建之明朝遗留之十二座砲台之一，后于清同治三年（1864年）再修。光绪九年（1883年）中法战争中，《法军侵台始末》记载说金龟头旧砲台与新城砲台是澎湖厅诸砲台中火力最强者，但后来因为弹药库被法国军舰击中而失去作战能力。台湾建省之后，首任巡抚刘