宫式年迁宫时，以「神殿建有、高栏和御桥，屋顶又以萱葺建造，却又没有御垣，相当凌乱」的「体裁上不统一」为由改建。太平洋战争期间，接管了矶部村国民学校（现志摩市立矶部小学校）的校舍，那些受影响的小学生便改在佐美长神社上课。1959年9月26日，神社受到伊势湾台风吹袭，导致境内的大树倒塌。1994年，式年迁宫举行。2013年2月1日播放的三重电视台节目《》中，俳人作为嘉宾参演，并且参拜了佐美长神社。
祭祀和迁宫.作为伊杂宫的管辖社，神社祭祀从平安时代至中世为止，每逢、和式年迁宫时，神社