种种的措施使得立法院朝野两党开始不断发生冲突，
朝野协商.在2013年6月25日时，中国国民党与民主进步党在经过朝野协商后同意强制逐条审查并且表决通过，并且未经实质审查通过前协议不得启动生效。其中朝野协商的签署者除了立法院院长王金平和立法院副院长洪秀柱，还包括中国国民党籍立法委员林鸿池、赖士葆和林德福、民主进步党籍立法委员柯建铭、邱议莹和潘孟安、台湾团结联盟立法委员许忠信和黄文玲以及亲民党籍立法委员李桐豪。之后中华民国经济部在7月时提出《两岸洽签服务贸易协议对我总体经济及产业之影响