本海军的多次积极地推动之下，英日会谈的机会受到破坏，海军拒绝了陆军和外交部的对英协调论，坚持实现了对海南岛的占领，并做好了和英国开战的准备，海南岛进入为时6年的日占时期。占领期间，致力于缅甸从英属印度独立的志士昂山等人在海南岛上进行了军事训练。。中国抗日战争结束后的1947年8月，行政院院务会议通过以琼崖改爲海南特别行政区，隶属行政院，民国37年（1948年）行政院命令公佈，民国38年（1949年）4月正式成立行政长官公署，派陈济棠爲行政长官。5月20日，《海南特区行政长官公署组织条例》制定10条；5月