圣保罗再度夺下解放者杯，他们击败来自智利的大学队。在比赛结束之后Raí离开圣保罗。同一年的圣保罗又夺继去年下洲际杯。它们在东京以3-2击败卡佩罗索率领的AC米兰；Müller在第86分钟攻入致胜球。 1994年圣保罗三度叩关解放者杯，不过这一次来自阿根廷的Vélez Sarsfield却在圣保罗的主场的点球大战中击败圣保罗。
1996–2004年：后Telê年代.由于健康因素，Telê Santana在1996年离队。他为圣保罗带来的黄金年代也宣告结束。在1995年到2004年