较晚的埔里盆地于清嘉庆十九年（1814年）因遭到汉人的入侵而爆发郭百年事件，对泰雅、布农两族的冲击甚大，导致清政府一度禁止汉人入垦。依《公议同立合约字》记载，平埔人是在清道光三年（1823年）受邀入垦，较汉人晚于九年进驻，来自的族群有洪安雅、拍瀑拉、道卡斯、巴布萨与巴宰等五族十四社，是埔里有史以来最大规模移民潮 。平埔族族群进入埔里后，一开始以埔社与眉社的佃田为生，后来依恃其农耕技术较当地族群进步，逐渐获得当地大多土地，当地原居民因此逐渐撤往山区居住。汉人也随着逐渐松弛废除的内山开垦禁令陆续前来开垦居住。