院学习期间，叶仲裕深受马相伯器中。叶仲裕和马相伯等人经历斗争，另起炉灶办学，于清朝光绪三十一年(1905年)创办复旦公学，即今复旦大学前身。叶仲裕担任复旦公学学长（相当于美国大学中的Provost）。光绪三十二年（1906年），叶仲裕加入光复会，鼓吹革命，期间兼任浙江杭州私立安定中学监督（相当于今之学校校长）。宣统元年（1909年），叶仲裕投长江自尽，年仅29岁。