期负担保管费，自由中国号遭码头管理处拍卖，从此不知去向。2009年，被发现弃置在美国旧金山一家私人船场，面临拆解、销毁命运。台湾海洋文史工作者曾树铭在《联合报》投书，希望政府协助保存，曾参与横渡的船员也致信马英九总统，引起中华民国政府重视。当时行政院长刘兆玄指示环保署副署长邱文彦与文建会协助抢救。在文建会联络后，船主杰西（Zuniga Jesse）同意捐出船体，2012年4月19日中午，船主杰西与受文建会委託前去接船的主持人国立台湾海洋大学人文社会科学院院长罗纶新会面完成交付，两人并挥手举旗正式开始启程