在一系列的权力斗争下取得胜利，取得革命政府的控制权。同年，革命党人与西班牙政府签定破石洞条约（the Pact of Biak-na-Bato），双方暂时停止敌对状态，阿奎纳多随即逃亡至香港。然而，敌对状态从未中止。1898年12月，美国和西班牙在美西战争后签订巴黎条约，西班牙以两千万美元将菲律宾卖给美国。由于菲律宾第一共和国政府反对巴黎条约，1899年美菲战争爆发，美国获胜，佔领菲律宾。美国在二战后的1946年承认菲律宾独立。