的「义」字改名为三好义重，并因义辉的奏请叙任左京大夫。不过三好三人众控制了大权，永禄8年5月18日，在三人众与松永久通（久秀之子）伴随下上洛，5月19日突然在二条御所爆发袭击义辉事件，显然暗杀足利义辉均由他们负责。事件过后，义重改名为义继，三人众与松永久秀的关系开始不和，与松永氏进入敌对状态，但三好义继也对三好三人众尽揽大权不满，于永禄10年投奔松永久秀方。1568年织田信长拥护足利义昭上洛时，三好义继跟松永久秀降服织田家，三好义继获得河内国北半部及若江城的安堵，并曾于永禄12年参与救援足利义昭（本圀寺