有车辆基地——小牛田运输区。小牛田车站的站名源自于过去此处的行政区划、小牛田町，也是该町的主车站。但小牛田町已在2006年时的平成大合併中，与隔邻的南乡町合併为美里町，小牛田车站也因而成继续为美里町的主车站。
车站构造.岛式月台2面4线的地面车站。站房于月台西侧、有跨线天桥连结。设有绿窗口（营业时间 6：20～21：00）与自动售票机、自动补票机（）。小牛田车站全日皆有站员驻站（直营站），并负责以下各车站的代管事务（管理站）：