2016年夏季奥林匹克运动会轻艇男子1000公尺单人爱斯基摩艇比赛于2016年8月15日至16日在巴西里约热内卢罗德里戈·弗雷塔斯潟湖举行。西班牙选手Marcus Walz在此次比赛中以3分31秒447的成绩获得冠军，这是西班牙第一次在男子单人皮艇1000米项目上摘金。捷克选手Josef Dostál和俄罗斯选手Roman Anoshkin分别获得亚军和季军。
比赛形式.此次比赛分为预赛、半决赛和决赛。预赛中每组前五名的选手以及所有三名小组排名第六的选手当中最快的选手晋级半决赛