第一代核武库、第一批导弹阵地，还参与建设了人民大会堂、毛主席纪念堂、北京首都机场等工程。1990年代末，第二炮兵工程技术总队奉命承接大批阵地工程建设任务。当时，该总队已经数年未承接大的施工任务，但该总队克服困难完成了任务。2000年，该总队被中华人民共和国建设部评为“国家一级安装企业”。2000年代至2010年代，该部队是全军地下工程建设的主体力量，分散在中国20多个省（自治区、直辖市）、数十个施工点位上，担负中国人民解放军第二炮兵部队（2015年12月改为中国人民解放军火箭军）所有导弹阵地和部分军