线坚持不与阿米尼政府合作的理由之一，令政治局势越趋恶劣。1962年，由于阿米尼计划裁减军事开支，与沙阿有所争执，阿米尼辞任总理。在翌年的1963年6月，德黑兰、库姆、马什哈德、设拉子及瓦拉明发生大规模的宗教叛乱，被伊朗军队武力镇压。叛乱的原因是鲁霍拉·穆萨维·霍梅尼被捕，他是沙阿的强烈反对者，并反对沙阿的土地改革及赋予投票权给妇女的计划。民族阵线大约在这个时候得以重新成立，包括在内的组织有伊朗自由运动、民族党、社会主义协会（哈利勒·马利基领导的组织，曾经因为参加伊朗人民党而不被民族阵线接纳）及激进的学生。