泰源感训监狱」，1962年成立。1973年改名为「国防部泰源监狱」。1970年2月8日，狱中爆发泰源事件，事后多人被判死刑及无期徒刑。1974年迁至台南市北区实践街，更名为「国防部台南监狱」 （简称"台南军监"，别名"日新山庄"），1980年再迁至台南县六甲乡曾文街（今址，故又称"六甲军监"）。2005年11月1日中华民国国军「精进案」，国防部新店监狱（今法务部矫正署新店戒治所）裁撤后，其业务转移至台南军监执行，至此国防部台南监狱成为中华民国唯一的军事监狱。2013年8月15日《军事审判法》修正后