航协总部设在加拿大蒙特利尔，并在瑞士日内瓦设有行政办公室。
历史.国际航空运输协会于1945年4月成立于古巴哈瓦那。在成立之初，国际航协由31个国家的57家成员航空公司组成。其早期工作主要涉及技术方面，为新成立的国际民航组织（ICAO）提供行业洞见，详情可参见《芝加哥公约》附件，该国际公约至今仍规范着国际航空运输业务。由于《芝加哥公约》无法解决航空公司航线分配问题，于是成千上万份的双边航空运输协定被签署，且至今仍有效。早期双边协定的基准是1946年美国和英国之间的《百慕大协定》