因为秀忠的失态而被激怒，全靠康政的调解，在伏见城的会面后秀忠才得到原谅。而且康政曾对秀忠进言应停止对上田城攻撃。在关原合战后成为老中，所领没有増加，而且被家康疏远。被家康冷待的其中一个可能性是，作为武功派家臣失态的康政被远离。另有一说是因为康政讨厌本多正信的权势，考虑到老臣争权是亡国的先兆，所以自己离开。一説是家康想康政加增转封到水户，但是康政以在关原之战中没有获得战功及在馆林较容易到江户城参勤等理由拒绝。家康被康政的态度所感动，于是把在神明前发誓的証文送予康政。在庆长11年（1606年）5月14日