自己是匪谍。总统府汇集情报局资料以及警备总部彭孟缉收集的证据，连同郭廷亮自白书，派遣局长黄伯度，送至当时被软禁的孙立人住处，希望他自行辞职。孙立人原本态度强硬，认为郭廷亮必是遭到诬陷，但黄伯度透过原副总司令贾幼慧、及侄子孙克刚等人转达孙立人，此事为层峰（两蒋）的意思，孙立人如不肯屈服，将会株连更多旧属。孙立人于8月3日写亲笔信给蒋介石，请辞总统府参军长一职。8月20日，蒋介石批准孙立人辞呈。同日下令，正式拘捕孙立人，并由副总统陈诚为主任委员，与王宠惠、许世英、张群、何应钦、吴忠信、王云五、黄少谷、俞大维