日本和中国以及韩国对历史和领土等认知的分歧，故至今跟两国的关系仍较其他国家相对紧张。首尔的日本驻韩大使馆经常有示威者要求日本政府对韩国慰安妇问题作出赔偿和道歉，中国民间也经常发生反日示威和抵制日货运动。日本目前与中俄韩三国存在领土纠纷的问题，包括与中华人民共和国有争议的东海油气田；与台海两岸政府之间所存在的尖阁诸岛/钓鱼台列屿主权问题；与韩国的竹岛（独岛）主权争端和与俄罗斯之间的北方四岛（南千岛群岛）主权问题，但是日本和俄罗斯的关系在近年已大幅改善，两国在天然气以及其他自然资源方面的合作亦越趋紧密。日本