份路段之行车速度，上水站至红磡站之行车时间被延长6分钟，非官方港铁故障消息「MTR Service Update」曾为此事制作短片，列车在其中三路段实施「临时速度限制」导致车程延长，包括：到2016年10月1日起，因应环保署的《噪音管制条例》要求，旺角东站至九龙塘段被收紧至30公里，使每班列车驶过该处时需要多约30秒至2分钟不等，变相较平日接载少约6000名乘客。惟报章测试后发现，由红磡至九龙塘站车程时间大增1至6分钟不等。「MTR Service Update」认为可能会增加乘客候车时间，使一早已十分