1平方米，设有高22米钟楼一座。站房室内共有三层，设有2个普通候车室和1个贵宾候车室，可容纳旅客2000人。2003年7月，衢州站四喜亭货场因衢江大桥建设而停用，下张货场新建一条货物线。
外迁.2004年，衢州市政府希望借浙赣铁路电气化改造时机，将车站向南面迁出，该要求很快得到了铁道部的批准。外迁后新建的衢州站正面建筑均大面积采用玻璃幕墙，基调为篮绿色。站房为不规则四边形，建筑面积7200平方米，旅客流程为高进低出，候车室为二层，到二楼候车室旅客由大厅乘自动扶梯进入，上车由天桥