攻陷首都南京，中华民国政府在此前已南迁至广州；同月23日，中共解放军进入镇江，5月27日佔领上海，6月2日攻陷崇明，江苏省政府撤往嵊泗列岛。中共于江苏省境分设苏南、苏北两个行政公署。9月3日，中华民国政府将位于嵊泗列岛的嵊泗设治局升为嵊泗县（今属浙江省舟山市），使之成为中华民国江苏省最后管辖的县。民国39年（1950年）国军撤离海南岛、舟山群岛撤退后，江苏省主席丁治磐率领政府官员以及当地居民随同国军于5月18日起陆续撤离嵊泗，26日全数抵台（一说是7月7日至8日撤离），中华民国的江苏省至此完全沦陷。