傅斯年领导的历史语言研究所较完整迁台外，其他研究所仅少数人员离开大陆，大部分都留在了大陆。除胡适、梅贻琦等数十位教授外，中央研究院81位院士中有60位留在大陆，占院士总数的74％。去台湾的中央研究院院士有：凌鸿勋、林可胜、傅斯年、董作宾、李济、王世杰、吴稚晖、朱家骅、李先闻9人（占院士总数的11.9％）；去美国的有：陈省身、李书华、吴宪、林可胜、赵元任、汪敬熙、陈克恢、李方桂、胡适、吴大猷、萧公权、萨本栋等12人（占院士总数的15％）。1949年6月9日，部分留守的中央研究院人员在上海举办21周年纪念会