至1998年10月间，辜振甫率团访问中国大陆，才再次达成加强对话、恢复协商的共识。
第三次（未举行）.此后不久，1999年李登辉发表「特殊两国论」，致使两岸关系一度趋于紧张，第三次辜汪会谈未能如期在1999年举行。2000年民主进步党在台湾执政后依然坚持台独党纲、反中路线，两岸关系持续紧张，第三次辜汪会谈遂始终未能实现。此后辜汪会谈的主角辜振甫与汪道涵，于2005年先后以87岁和90岁的高龄去世。