被废嫡一事始终耿耿于怀，并且埋下暗杀政元和澄元的伏线。
永正之错乱.虽然澄元姑且算是政元的继承人，但是其后政元又领养更为接近细川氏一族的野州家之子，导致同时出现三名继承人并立的形势。永正4年6月23日（1507年），支持澄之的和暗杀政元，爆发。翌日，澄元亦受到澄之家臣的袭击，他与拜托甲贺郡的山中为俊，成功逃亡至近江青地城。同年8月1日，澄元借助近江国人的力量反攻京都，成功击败澄之的势力，并且在翌日获将军义澄承认其细川家家督的地位。尽管如此，年轻的澄元却受制于家宰三好之长，最终导