以后将北政所再昇到从一位的地位。宁宁与养子丰臣秀次的关系也很好，视如己出。1591年（天正十九年）12月(旧历)，养子秀次任关白及丰臣政权家督。1595年（文禄四年），养子丰臣秀次卷入谋反的事件，身为养母的宁宁多次在太阁秀吉面前帮秀次说话，但因家臣石田三成离间秀吉与秀次的父子关系，再加上秀次并不是亲生的儿子，让秀吉起了杀意，派石田三成等人将关白及丰臣政权家督之位收回，命丰臣秀次离开丰臣家前往高野山，不久丰臣秀次于高野山被杀害，家族也被诛族。宁宁为此十分痛心，与家臣石田三成的关系也因丰臣秀次事件而疏远。