科主校区坐落于美国西北部落基山脉西侧帕鲁斯地区连绵起伏的丘陵地貌之上，海拔约790米，毗邻多个国家公园和州公园。莫斯科市位于爱达荷州与华盛顿州的边界地段，临近华盛顿州普尔曼及位于该市的华盛顿州立大学。周边通勤主要依靠95号美国国道、8号爱达荷州道、90号州际公路及其他支线公路和普尔曼-莫斯科区域机场。大学校园到莫斯科市市中心步行约五分钟，此外市区内的公交线路全部免费。附近的大城市有华盛顿州斯波坎（车程1.5小时）和西雅图（车程5小时或航班1小时），及俄勒冈州波特兰（车程5小时）。爱达荷大学校园总面积为158