联当局为保持R-16机密掩盖了这个事件，对外宣称涅杰林死于空难，直到戈尔巴乔夫时代才公布了真相。在事故发生后，R-16的开发工作继续进行。1961年1月27日进行了第2次试射。导弹成功点火升空，但由于导航系统故障而偏离预定弹道，最后坠落于西伯利亚的托木斯克附近，仅仅飞行了520千米。又经过数次不成功的试射后，R-16终于在1961年10月完成了飞行试验。随之而来的是地下井发射型号R-16U的发射试验，在这些试射中游动发动机总出问题，但最后获得了解决。第一支装备R-16U的火箭部队于1963年进入战斗值班