004年7月23日，台湾最高法院认为法医的鑑定报告书跟台湾大学医学院附设医院对假设性问题的覆函内容，似非完全一致，原审未送请其他医事专门机构鑑定，即认定叶永鋕系因病自行昏倒尚嫌率断，原判决撤销并发回台湾高等法院高雄分院。2005年10月31日台湾高等法院高雄分院以行政院卫生署医事审议委员会鑑定书中无法排除死者自身疾病所发生的昏厥，且死者倒卧之处无积水，驳回检察官上诉。2006年5月11日，台湾最高法院以第二审法院以行政院卫生署医事审议委员会鑑定书以无法排除迷走神经性昏厥，即可推认本案被害人当然系因迷