墨西哥总统米格尔·阿莱曼·巴尔德斯（Miguel Alemán Valdés）出席了奠基典礼，同日大学奥运体育场破土动工。1957年，成立了旨在管理和组织研究生培育的博士学位委员会。1966年在考试规章上又产生了一次规模较大的学生罢课活动，学生们闯入校长办公室迫使校长辞职。但大学董事会不接受校长辞呈，因此，教授们也进行了罢教，瘫痪大学日常教学并迫使董事会接受事实。到夏季，大学附属的一些预科学校中又发生暴力冲突，警察接管了一些产生伤害的高校。1968年，墨西哥国立自治大学以及以及其他墨西哥城大学的学生