9年返台，他开始着手计划建盲人学校事宜。1891年10月，租用台南府城洪公祠，期限5年，开设盲人学校青盲学，这是台湾第一间盲人学校。1897年3月洪公祠租约到期，青盲学关闭。
日治时期.甘为霖数度劝请日本政府成立官办的盲校，儿玉源太郎总督下令在台南慈惠院接办盲人学校，并聘用秋山珩三为该校第一任校长。1897年，甘为霖出版《中国的盲人》。1898年2月19日，甘为霖担任长荣中学代理校长。
退休.1917年2月，甘为霖返回英国，1921年9月9日逝世于