教于国立武昌大学历史系，后转任广东大学（不久更名为中山大学）史学系主任。广州国民政府开始北伐后，段锡朋到中国国民党中央组织部秘书陈果夫处任职，后来任中国国民党江西省党务指导委员，并任中国国民党江西省党部执行委员。在江西任职期间，1927年1月，他和程天放、周利生等人成立AB团。大革命结束后，段锡朋任中国国民党清党委员会委员，中国国民党南京特别市党部整理委员及执行委员，并在中央党务学校任教。段锡朋在中国国民党第四次全国代表大会上当选中执会候补委员。后来接替陈布雷任教育部政务次长，在部长朱家骅视事前代理