9线起点位于台17线，鲲鯓桥南侧往东叉路，在起点路口附近的聚落就是保吉里小蚵寮。本线以大致东南走向，穿越渔塭中的路段到达玉港里西埔内、灰磘港两聚落，并在交会市道171号时短暂共线。共线终点后，本线南转经由灰磘港村落东侧、玉湖国小前路段南行，并在此连接通往北门市区的南12线。离开村落的南9线南行不远后，跨入学甲区境内，在学甲区境内路段所经之处为无聚落的渔塭区土地，继续南行后跨回北门区境内。回到北门区则为仁里里二重港范围，亦为本区道的终点，最后止于市道174号叉路口处。南9线沿线在村落外的路段，沿线两侧以台南市