岛之间的深海海崃形成，并穿过峇里岛和龙目岛之间的龙目海崃。过渡区现称为华莱士区（Wallacea Zone），拥有源于亚洲和澳洲的混合种，以及当地的特有种。
物种.
动物.马来群岛的动物区系也颇丰富，但大型动物不多，象、虎、犀牛、野牛、貘及猿都属于亚洲种。区系动物在巽他陆棚岛屿的分布不均匀，标志着这些岛屿在不同地质时期的联接或分离。澳大利亚的区系动物，袋鼠在新几内亚有被发现，其他有袋类分布越过莎湖陆棚远达帝汶和西里伯斯岛，两岛之间的某些岛屿则有风土种如矮水牛以