的分类地位在硬尾鸭亚科中则较中型，在黑头鸭稍后从主要分支分出。麝鸭最明显的特征之一是两性异形，其分类地位并不十分明确，解剖学上的特征较类似硬尾鸭，但仍有许多独特的特征。细胞色素b的粒线体DNA序列分析显示麝鸭与的关系较接近，若结果属实，则硬尾鸭将是雁形目下已知最剧烈的分歧演化适应的例子之一。
演化.目前较为确定的是麝鸭严格来说可能不属于硬尾鸭亚科的成员，而是另一个距离不是很远的支序，其后肢骨骼与硬尾鸭亚科的相似则来自趋同演化。麝鸭与硬尾鸭两支可能都很古老，是冈瓦那大陆（主要是现