德·麦克法兰没有对其进行正式命名，但他指出“所有现有的形态细节表明其为长毛猪笼草与马来王猪笼草的杂交种”。1976年，仓田重夫将其正式描述为基纳巴卢山猪笼草。该名称首次发表于《基纳巴卢山的猪笼草》一书中，但当时因其缺乏模式标本的信息及足够的描述，而被视为裸名。1984年，仓田重夫对其进行了有效描述。
形态特征.基纳巴卢山猪笼草的捕虫笼很巨大，但不如马来王猪笼草和阿里猪笼草。基纳巴卢山猪笼草仅存在于基纳巴卢山及附近的坦布幼昆山，并与亲本同域分布。更具体来说，其存在于帕卡洞附近的步道及