947年招商局共拥有船舶246艘、25.7万吨，约佔全国船舶总吨位的40%。1948年10月1日，股份化改组为招商局轮船股份有限公司，刘鸿生任董事长，徐学禹任总经理。1949年3月20日，中华民国政府对招商局全面军管。1949年4月30日，渡江战役发起10天后，招商局在台湾设立总管理处。1972年12月28日，由于中华民国在联合国的席位被中华人民共和国取代，为了防止招商局轮船旗下所有资产被中华人民共和国以「继承中国」之姿强行接收，招商局轮船转投资成立阳明海运，成立时资本额为新台币1亿元，第一