由北海道大学的远藤哲也、原口浩一与坂田正胜等人针对在日本贩售的鲸鱼部位检测显示其具有高剂量的水银以及其他毒素存在，尤其是鲸鱼肝。在每公克的鲸鱼肉上含有 370 微克的水银，远超过政府限制量的900倍。在肺与肾脏中则约超标100倍。这个结果肇因于动物的营养级，这也代表着位于较高营养级的齿鲸比起须鲸会含有更高剂量的水银残留，而与体型较无关系。
环境影响.以挪威为首的北高联盟，提到食用鲸鱼肉所产生的碳足迹远低于食用牛肉。绿色和平则回应说：「比起透过吃鲸鱼来减少温室气体的排放，我们更应该