部民流散，未上任。天祚帝西逃云中，入夹山，薛乙薛供给侍从不缺，拜殿前都点检。金军通过后，他再集结诸营败残兵到上京临潢府，又为上京留守，以安抚散卒。保大三年（1123年），卢彦伦在上京反乱降金，薛乙薛被捕数月后释放。保大四年（1124年）正月，知北院枢密使事。时耶律大石从金军俘营中逃回，因曾参与拥立耶律淳之事受天祚帝责备，心怀不安。七月，耶律大石杀死萧乙薛，自立为王，率部下西去。