代，岭南归蒲与路所辖，岭北为东北路招讨司所辖，北部为乌古敌烈统军司所辖。蒙古帝国建立者成吉思汗于1214年，将岭南分封于大弟弟拙赤·哈萨尔和二弟合赤温·额勒赤，将岭北分封给三弟帖木哥·斡赤斤。1287年元朝在此设置行省，为辽阳行省开元路管辖。明朝初年属奴儿干都司管辖。今漠河县为木河卫管辖，塔河县为塔哈卫管辖，唿玛县和新林区为额克卫管辖，加格达奇区、松岭区和唿中区为坚河卫管辖。 在清朝时为盛京驻防内大臣管辖，1653年（顺治十年），由镇守宁古塔昂邦章京管辖。1871年（同治十年），清廷将大兴安