后在国联冠军赛以4胜2败淘汰亚特兰大勇士，只可惜在世界大赛遭到纽约洋基直落4横扫。到了2005年，教士再度打进季后赛，不过在国联分区赛第两度遭到圣路易红雀直落3横扫。2006年教士是最近一次打进季后赛，最终还是在国联分区赛以1胜3败，三度遭到圣路易红雀淘汰。2007年球季结束后科罗拉多落矶和圣地牙哥教士在外卡战绩相同将要进行加赛，圣地牙哥教士和科罗拉多落矶前12局双方8：8平手，直到13局下半教士派出终结者崔佛·霍夫曼上场，结果教士以8：9遭到科罗拉多落矶逆转。教士队也宣布，将由现任响尾蛇队