起反旗后，加朗改道前往埃塞俄比亚建立反政府基地，并接纳这些反政府军加入。7月时，加朗已经召集了3000余名原苏丹军队中的黑人官兵，正式组建起“苏丹人民解放军”，以反对苏丹北部阿拉伯人的统治。这标志着第二次苏丹内战的开始。苏丹人民解放军受到了利比亚、乌干达和埃塞俄比亚的支持，他们很快就控制了大部分苏丹南部地区，取名“新苏丹”。直到2005年1月9日，加朗方才与苏丹政府签署《内罗毕全面和平协议》，结束了第二次苏丹内战。7月9日，加朗就任苏丹副总统。7月30日，加朗在同乌干达总统约韦里·穆塞韦尼会谈后乘坐