故遭拆除，原址随后建立「故儿玉总督暨后藤民政长官纪念馆」（后改称「台湾总督府博物馆」，即今国立台湾博物馆前身），同时成为台北新公园（现称二二八和平纪念公园）的一部分。现在，其部分石造结构遗物仍散置于当地。此外，该庙被弃置于台北州厅厅舍的「二妈」妈祖软身神像，在1910年代初被曾石岳等三芝地方仕绅迎请至当地，并由庄民集资建庙供奉至今。
简介.光绪十四年（1888年），台湾巡抚刘铭传依《钦定大清会典事例》开基起建台北大天后宫于台北府城中心地区，祭祀妈祖，祈求守护。该庙主建物