理确保列车的稳定运行，以及控制列车的发车间隔。此外，2号线控制中心采用了了西门子交通集团的Vicos OC 501系统和Sicas ECC计算机联锁系统。
安全设施.南京地铁1号线在建设初期并没有安装安全门。2006年12月，中胜站上行侧加装了站台安全门系统，截至2010年8月，奥体中心站、中胜站、元通站、小行站和安德门站已经安装了安全门，1号线其他站台的安全门已于2011年全部安装完毕。南京地铁1号线南延线安全门在地铁建设时已经全部建好，主要由深圳市方大自动化系统有限公司提供。1