尔、索伦（鄂温克）、鄂伦春、锡伯等族，编入八旗，由布特哈总管、唿伦贝尔总管管辖。黑龙江、乌苏里江下游及库页岛的赫哲、费雅喀、库页、奇楞等渔猎部落则分设姓长、乡长，由三姓副都统管辖。1858年，清俄签订不平等条约《瑷珲条约》，清国被迫割让黑龙江以北国土予沙皇俄国。1860年，黑龙江将军特普钦上疏朝廷，唿吁开禁放垦，鼓励移民，获得采纳，闯关东移民潮开始。1894年甲午战争战败后，清国被迫割让辽东半岛给日本，后经俄法德三国干涉，日本交还辽东予清。1898年，俄国租借关东州（今辽宁大连）。1900年（光绪26年），