王司马羕辟命，但不就职。后东海王司马沖任长水校尉，选了庾怿为其功曹，后又先后任暨阳县令、中军将军司马沖的司马、散骑常侍、左衞将军等职。咸和三年（328年），苏峻叛军攻破建康，庾亮带着庾怿等人一同逃到寻阳投靠温峤，共组讨伐苏峻的义军。咸和四年（329年）苏峻之乱被平定后，庾怿因讨伐苏峻的功勋封广饶男，出任临川太守。咸康四年（338年），时任征西将军的庾亮锐意北伐，于是表庾怿为辅国将军，假节监梁、雍二州诸军事、梁州刺史，镇守魏兴。因着庾怿宽厚有人缘，故此获授此职，与庾亮所置于邾城的重兵及在荆州及江州的各兵镇