、嘉义、台南、高雄及澎湖等航线。在每年的三月到四月间，暖湿空气平流移动到寒冷的地表，地表空气冷却而达饱和，使水气凝结成雾，金门机场常因此关闭。此外，金门机场亦是政府开放小三通的重要转运据点，旅客购买小三通的票，各家航空公司都会帮乘客以游览车接送到金门水头码头，大约历时15-20分钟后，再由水头码头搭船前往厦门或泉州。
航空公司与航点.由立荣航空及华信航空营运台北松山、台中、台南、嘉义、高雄及澎湖共6条航线，主要以ATR72-600、A321-200及ERJ190机型执飞。20