长期担任北京大学法律系副主任（文化大革命期间除外），长期从事宪法学的教学及研究。1980年至1982年，肖蔚云参加了宪法修改委员会秘书处的工作，负责宪法总纲的草拟。肖蔚云与其他专家收集且分析了古今中外的各种宪法资料，提出许多意见。1982年《中华人民共和国宪法》第三条、第五条基本採纳了肖蔚云的意见。1985年至1999年，肖蔚云参加了《中华人民共和国香港特别行政区基本法》的起草、香港特别行政区的筹建、《中华人民共和国澳门特别行政区基本法》的起草、澳门特别行政区的筹建。肖蔚云历任香港特别行政区基本法起