着染色体的差异。在其他情况下，性别是由环境因素（如温度）或社会因素。决定系统的一些细节目前还没有完全理解。
非遗传性性别决定系统.但是，有些物种是没有性别决定系统的。雌雄同体包括蚯蚓和部分的蜗牛。部分鱼种、爬行动物和昆虫是单性生殖，完全是雌性。在一些节肢动物，性别是透过细菌感染来决定：当节肢动物感染了沃尔巴克氏体属细菌，会改变动物的性别。一些物种天生的性别原来只有ZZ，令沃尔巴克氏体的存在决定了物种的性别。其他不寻常的系统（这部分还在研究中）：