阔端侵略吐蕃，试图借此牵制南宋。蒙古人希望找到一个单一的君主来投降，但发现吐蕃各地事实上是各自为政，便将最具实力的萨迦派首领萨迦·班智达请到凉州，商讨归顺之事。萨迦·班智达向阔端宣讲佛法，阔端皈依了藏传佛教，吐蕃与蒙古开始建立供施关系。1264年，忽必烈在吐蕃设置总制院（后改为宣政院），委派萨迦派首领管理吐蕃政教事务，建立萨迦巴政权。吐蕃分裂时期结束，随后展开了约500年的教派统治。
与汉地关系.建隆元年（960年），宋朝建立。由于所处地区的缘故，与远离汉族地区的卫藏等地藏族各