，果敢成为自治的特区。特区具备有限的军力，中央政府派驻少量的公共服务人员至果敢，包含医务人员，小学教师。1992年发生内战，杨茂良兄弟执政。1995年彭家声重返果敢，重掌果敢政局。在国际反毒的压力下以及多次禁毒挫败之后，2003年终于全面推行停止种植罂粟的政策，引入农业生产技术并发展博弈业。产业转型对果敢带来相当大的冲击，替代种植在果敢高冷干的环境推行困难重重，农民陷入贫困。由于缺乏粮食等原因而在山村地区爆发大规模的疟疾，死亡279人。国际展开人道救援，联合国粮食及农业组织提供救济粮。而日本外务省的国际