年创立于圆山地区，旧称「圆山动物园」，与台北市立儿童育乐中心（台北市立儿童新乐园旧址，今圆山遗址）相邻。1986年，因圆山原址无法扩建，而迁至文山区木栅地区，因此成为台湾人现在所熟悉的「木栅动物园」。搬迁至木栅后的台北市立动物园，园区总面积原为182公顷，随后因捷运动物园站及北二高的开辟，移拨出部分土地，目前仍有165公顷之广，其中已开发使用区域近百公顷，是全台佔地面积最大的动物园。园内包含8个户外展示区、6个室内展示馆、5个环境教育教学场所，2013年底有动物377种、2,783只（不含昆虫及动物收容