湾清治末期至日治初期，大河底地区为一街庄，称为「大河底庄」，隶属于竹南一堡。该庄北与永和山庄、下林坪庄、员林庄为邻，东与四湾庄、南庄为邻，南边为狮潭庄、大桃坪庄，西边为大坪林庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于新竹厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄隶属不变。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「大河底」大字，隶属于新竹州竹南郡三湾庄。战后三湾庄改制为三湾乡，隶属于新竹县，大字亦改制为村。1950年桃、竹、苗分治，三