1999年起开始配备武器。这些核原料运输船在航行期间，英国的核监管部门会派出武装警卫登船进行护卫，船上还会搭载有两到3门30毫米机关炮，也一并由武装警卫进行操作。另外两个例外是冷战时期的苏联商船船队（）的各种船只。1979年，中华人民共和国商船在进行台湾海峡复航时，为了抵抗中华民国政府对台湾海峡的军事封锁（关闭政策），对商船和船员进行了武装。2010年4月，有报道指称有俄罗斯公司可以提供3M-54反舰导弹的一种改进型，其发射装置可以隐藏在船上。这种导弹理论上使得任何货船都可以装备反舰火力。按某些描述该型