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成因.1998年，经济部中央地质调查所所长陈肇夏对嘉明湖採集样品分析后，在2000年11月，于中国地质学会会刊发表论文，以在当地发现微角砾岩中的石英沙粒极度碎裂、石英熔融留下的玻璃丝、不属于当地原生岩盘的镍、铜等金属碎片，提出嘉明湖是陨石撞击地球所造成的陨石坑的理论，并认为撞击年代约在数万年到一万年前。不过，同为中央地质调查所的学者朱傚祖却以无法在嘉明湖找到陨石坑应有的柯石英与斯石英；2004年，中央地质调查所出版的《地质》期刊中，冯奎智等人发表〈嘉明湖畔石