家有所不同，依靠的理论基础也有差异。双方除了为共同的目标合作，同时也一直在争夺东突的话语权。世界各国在美国9·11事件后加强了对恐怖主义的谴责与打击，世俗派东突势力一直在回避东突伊斯兰恐怖主义的存在。2007年，代表维吾尔族世俗东突独立势力的世界维吾尔代表大会主席热比娅否认新疆存在着东突厥斯坦伊斯兰运动之组织，声称所有的维吾尔组织都是以“和平方式”抗争。2013年10月28日天安门金水桥恐怖袭击案发生后，10月31日中央政法委书记孟建柱在乌兹别克斯坦明确表示，是“东伊运”指使了这起恐怖袭击事件。随后