期至日治初期，小东地区为一街庄，称为「小东庄」，隶属于他里雾堡。该庄西北及北隔虎尾溪与过溪仔庄、惠来厝庄为界，东与田头庄、新庄为邻，南边为他里雾庄，西南边为大东庄，西边为蕃薯庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台废县厅改设二十厅，该庄隶属于斗六厅。1903年（明治三十六年）6月，该庄编入「他里雾区」，隶属于斗六厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，他里雾区改隶属于嘉义厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「小东」大字，隶属于台南州斗六