三世离世2天后，各枢机于于佩鲁贾聚集。他们自愿或受到地方当局的压力下把自己关在一个地方里进行选举。出席选举的枢机决定以一个折衷的方法来选出新教宗。枢机团授权其中几个枢机成立一个委员会来委任一位新教宗，而委员会以外的各枢机则无权选出教宗。委员会内只有乌戈利诺·迪塞尼和圭多·巴巴拉斯基2名主教级枢机。2人随即选择琴乔枢机为新教宗，琴乔枢机称唿自己为何诺三世。选举完结后，何诺三世1216年7月24日于圣伯多禄大殿晋牧和加冕。1个月后，何诺三世回到罗马并于数天后到拉特朗圣若望大殿就任为罗马教区主教。