道光十八年（1838年）进士。选庶吉士，散馆授编修。道光二十六年（1846年）出任浙江杭州府知府，改湖州府，升杭嘉湖道道尹，历任福建汀漳龙道、浙江宁绍台道等职。咸丰四年（1854年）升任浙江按察使，六年升江西布政使，改山东布政使，同年升任浙江巡抚，兼署学政。咸丰九年（1859年）任大理寺卿，次年任督办江北团练大臣，升左副都御史。同治元年（1862年）署两广总督，兼署广东巡抚。清代野记下卷记载，晏端书担任团练大臣守扬州时，在城楼上看见反贼逼近，就借口内急，而且一定要用习惯的厕所才行，于是便匆匆下城，不知所