角色可以导入到游戏中。导入旧角色后，玩家在前作中做出的若干决定将影响《质量效应3》的故事。与前作类似，游戏有六种角色职业供玩家选择，每种职业都有独特的技能。例如，异能者（Adept）精通念力，而战士（Soldier）则擅长使用武器。玩家通过完成任务获取经验值。一旦获得足够的经验，薛帕德就会升级，从而可在技能树解锁或升级技能。《质量效应3》有三种预先设定的游戏模式：动作、故事和角色扮演。在动作模式中，对话由系统自动选择且战斗难度适中；故事模式中，对话由玩家选择且战斗难度最低；角色扮演模式下，对话由玩家选择