后则将此名称让给新设的东根室车站。不过，本车站仍然是日本最东端的设置职员车站。
车站构造.根室站为1面1线侧式月台车站。月台北面为车站大楼，而南面为侧线。为配置职员车站。车站大楼开放时间为05时30分～00时10分。并设有绿窗口（营业时间05时30分～17时00分）及自动售票机（不能使用橘卡（））。由于车站租车于2015年（平成27年）3月30日停止在车站的服务，因此不会再有车辆停摆在车站旁供出租之用，而必须向在根室市营运的丰田租车出租汽车。
车站週