52年，南京市军事管制委员会的各机构工作都移交给了南京市人民政府治理。1955年，改称南京市人民委员会。1966年，南京市人民委员会被造反派夺权，1967年年初全面瘫痪。1967年3月成立南京市军事管制委员会，实行军事管制。1968年3月，成立南京市革命委员会，地位等同于南京市人民政府。1981年1月3日，南京市第八届人民代表大会选举市长，恢复建立南京市人民政府，停止使用革委会名称。
机构设置.根据《》，南京市人民政府设置下列机构：（办公厅挂市人民政府参事室牌子；发展和改革