59年，1860慕尼黑业余队夺得巴伐利亚业余乙组足球联赛(上巴伐利亚)冠军，并在升班附加赛(上巴伐利亚)击败了法芬贺芬，首次晋身巴伐利亚最高级别的足球联赛，当时德国足球联赛系第三级别的巴伐利亚业余甲组足球联赛(南)。巴伐利亚业余甲组足球联赛(南)覆盖了巴伐利亚邦的南半部，与同级别的巴伐利亚业余甲组足球联赛(北)把巴伐利亚邦平分为两大赛区。1860慕尼黑业余队是三支曾参与此级别的预备组球队之一，另外两队为纽伦堡业余队及拜仁慕尼黑业余队。球队首季在此第三级别赛事中取得很好的成绩，仅以五分之差落后联赛冠军施瓦