同时美因茨也与其西部的县、镇（不属于都市地区）组成了一个统一的运输联盟。美因茨的港口面积约30公顷，2003年由约2200条船在这里停泊，共装卸130万吨货物。德国快速列车ICE列车通过美因茨，向北快车开往科隆，向东通过法兰克福国际机场一直开往慕尼黑，向南通过曼海姆、卡尔斯鲁厄与瑞士城市相接。地方性的列车开向法兰克福或西部的内地。沿莱茵河通过美因茨的铁路也是德国的一条重要的货物运输线。美因茨市内有五座横跨莱茵河的桥梁：两座高速公路桥，两座铁路桥和一座公路桥，这座公路桥就位于恺撒建造的第一座莱茵河