因与环境因子互动所产生的结果。控制食慾与代谢的基因决定了人们在食物不虞匮乏时是否会有肥胖症状。至2006年为止，已认定人类基因体上有超过41个基因在特定情形下会造成肥胖。拥有两套（脂肪与肥胖关联基因）的人比常人平均重了3-4公斤，患上肥胖的机率是没有该等位基因者的1.67倍。因遗传造成的BMI差异会随族群而不同，差异可以6%至85%。肥胖是几个症候群的主要特征，比如说普瑞德威利症候群（俗称小胖威利症候群）、巴德-毕德氏症候群、科恩症候群、以及；因此有时会用「非症候群相关的肥胖」这个名词来排除这些疾病造成