就读于荣成十三中（现荣成四中）。1980年，孙政才高中毕业，作为其所在班级考取大学的三四人之一进入山东莱阳农学院农学系学习；1984年本科毕业后参加研究生考试，进入北京市农林科学院，由北京市农林科学院和原北京农业大学共同培养，攻读作物栽培与耕作学专业硕士学位，师从玉米种植专家陈国平；1987年硕士毕业后，留在北京市农林科学院工作；历任作物所研究室副主任（1987－1993）、土肥研究所所长（1993－1994）、副院长（1994－1995）；1990年至1997年间以农学专业在职研究生身份就读于中国农业