辛亥革命爆发，韩玉书、徐三泰率回族义军配合杨缵绪进攻伊犁将军署。革命成功后，成立中华民国新伊大都督府，韩玉书任参议院参事。1912年3月，韩玉书兼办《伊犁新报》，宣传五族共和。1912年9月，韩玉书作为中华民国新伊大都督府的代表赴迪化，同新疆省都督杨增新议和。新、伊和谈达成协议后，杨增新将杨缵绪、冯特民等人分别调往南疆、北疆各地，任命韩玉书为新平县（今尉犁县）知事。新平县位于塔里木沙漠边缘，交通困难，风沙多，缺水，民众生活困苦。韩玉书到任后，亲到农村，率当地农民治沙造林，开渠引水，开荒种地。韩玉书既