新的馒头蟹科两个分类的物种之间是否有紧密的关系。以下详列本科的六个属：
化石纪录."Szaboa"是现时已知唯一来自匈牙利中新世中期化石沉积层的物种，"Eomatuta"同样来自中新世中期的地层，于2009年在意大利发现。月神蟹属的化石亦有在日本的中新世地层发现，但月神蟹属仍然有现存物种。