长宗我部国亲的三男亲泰为新的养子，并令秀通隐居。此时以自身生有实子等为理由，反对亲泰入嗣，于是与亲秀对立。因此亲秀指示家臣暗杀秀通，弘治2年（1556年）10月21日，被杀害。享年47岁。秀通死后，家督由亲泰继承。嫡男泰吉在亲秀庇护下，改姓中山田，以家老身份活动。墓所在邻接高知县香南市野市町香美神社的地方。为秀通殉死的家臣亦被葬在该地。明治26年（1893年），子孙武田秀山建立题有「香宗我部秀通公碑」字的石碑。秀山死后，亦被葬在该地。