东部马脑炎病毒（英文：Eastern Equine Encephalitis，简称：EEE）为一种马因病毒而感染的疾病。常见于美洲及加勒比海一带。最早在1831年于美国马萨诸塞州发现。因为病毒较常感染美国东部省份的马类，因此被称为东部马脑炎病毒。（有一种比较温和的病毒较常见于美国西部，请参考西部马脑炎病毒）感染此病毒而引致死亡的机率甚高，在马类的死亡机率为70-80%，而人也有50%的死亡机率。病毒会经由蚊子感染人、鸟和两栖动物。