莫子纯参加会试前已有功名，担任过官职，遂状元被退充，（一说：得第二名，即榜眼）。签书平江军节度判官厅公事，终仕中书舍人。为官清正廉洁，受朝中朝外交赞。时权臣韩侂胄把持朝政，莫子纯得罪权贵，被调离临安（首都），充任温州知州。不久，又降职作江州太平兴国宫提举。卒于任上，享年五十七岁。
遗址.莫子纯状元墓，今浙江慈溪市横河镇。