院位于香港黄竹坑惠福道6号，原址属创办于1931年的华南总修院（）。华南总修院于香港日治时期曾一度停办，复办后又因大陆政权更迭，华南地区没有修士前来而停办。罗马教廷传信部于1964年将华南总修院移交予香港教区管理。同年，原址位于薄扶林太古楼、一块由巴黎外方传教会所捐献的土地的圣神修院（于1957年成立）迁入华南总修院原址发展。圣神修院现时除了是香港训练天主教神职人员的重要地方外，也为教友提供神哲学培训、图书馆、朝圣及参观导赏等服务，以及开放教区文物室予已预约人士。圣神修院平日不对外开放，但有每月一次