开始随同京都不死鸟一线队训练。2011年，久保裕也以高中球员的身份注册至京都不死鸟一线队。4月17日，在京都不死鸟对阵磐田喜悦的训练赛中，久保裕也完成帽子戏法，帮助京都不死鸟以6：2的比分战胜磐田喜悦。4月21日，在日乙联赛第8轮京都不死鸟主场对阵冈山绿雉的比赛中，久保裕也首发出场并打入一球，在完成职业生涯首秀的同时也打入了个人职业生涯的第一粒进球，帮助京都不死鸟以2：1的比分战胜冈山绿雉。6月21日，在日乙联赛第16轮京都不死鸟主场对阵大分三神的比赛中，久保裕也打入2粒进球，帮助京都不死鸟以2：0的比