檬酸循环产生能量，但是当细胞没有能量的需求时，会在细胞质中将柠檬酸再次裂解为乙醯辅酶A以及草醯乙酸，并以乙醯辅酶A为原料合成脂肪酸。而脂肪酸合成的另一部分需要NADPH，这样的还原能力由草醯乙酸返回粒线体穿越内膜时提供：首先草醯乙酸被NADH还原成为苹果酸。接着将苹果酸脱羧形成丙酮酸后进入粒线体，在此借由丙酮酸羧化酶将丙酮酸转化形成草醯乙酸。如此一来，乙醯辅酶A由粒线体移往细胞质的过程会形成一分子的NADH。整体看来，此反应为自发性反应，简化如下：合成胺基酸有六种必需胺基酸和三种非必需胺基酸的合成