派有四系。宝通法系（《宝通贤首传灯录》），始于不夜照灯，从初祖杜顺载录至「贤首第四十二世慧果密禅」为止。云栖法系（《灌顶伯亭大师塔铭》）从初祖杜顺至明末云栖袾宏等诸位宗师，凡三十传，而至伯亭续法。另外，尚有高原明昱、雪浪洪恩法系。与雪浪洪恩同师门的憨山德清禅师，着有《华严纲要》，该书为提挈澄观《华严大疏钞》要义的作品。
日本华严宗.大唐道璇律师于开元二十四年（736年，日本天平八年），赍《华严宗章疏》入日本，新罗之往大唐，从贤首法藏学《华严经》，后至日本，住于大安寺。其日本徒