李国翰与固山额真叶臣谋曰：「自成新败，贼无固志，当以大兵直捣太原。太原既下，分道略定诸郡县，余贼非降即就馘耳。」乃合兵进拔太原，分道略定诸郡县。师还，赉白金五百両。寻又从大将军英亲王阿济格征陕西，李自成出走湖广，大军追从，大战于应山，进攻武昌，与固山额真金砺等夺舟数百。顺治二年（1645年），命偕固山额真巴颜率兵下四川，次西安，叛将贺珍自汉中来犯，李国翰与驻防西安内大臣和洛辉分兵夹击，大破叛军，进位世职二等。顺治三年（1646年），大将军肃亲王豪格师至，命令李国翰与巴颜逐捕延安余寇，寇保张果老崖，掘壕围