，组建新四军江北指挥部。期间，他下令处决了新四军第四支队司令员高敬亭。其后，他又前往重庆解决新四军编制经费问题。由于先前项英仍未能处理好同叶挺的关系，加之蒋介石拒绝了叶挺的要求，致使叶挺再次提出辞职，随后回到澳门。1940年5月，在周恩来劝说下，叶挺由袁国平陪同返回部队。1940年10月，叶挺亲率部粉碎了日军对皖南的“扫荡”，得到了蒋介石的致电嘉奖。
皖南事变与囚禁.1940年10月19日，何应钦、白崇禧以国民政府军事委员会名义，强令新四军、八路军必须在一个月内全部撤到旧黄河河道以