「国立」二字遂引发「易名风潮」，师生要求改名「国立南京大学」，提议改名「国立首都大学」的声音也颇具份量。1928年5月，定名国立中央大学。1928年时国立中央大学的院系设置：1932年6月，国民政府国立中央大学整理委员会将中央大学商学院独立为上海商学院，将中央大学医学院独立为上海医学院。1935年5月，中央大学在南京重建医学院。1937年对日抗战爆发，学校随国民政府西迁重庆，1946年还址南京。1937年，中国抗日战争爆发，11月，中央大学西迁重庆沙坪坝，在重庆大学借出的松林坡建造校舍开学，