壁的设计以防止外面的水源渗入以及核废料外洩。第一层壁障是将核废料以混凝土浇灌固化成一固体硬块，第二层壁障为将混凝土固块以铁桶封装。第三层壁障是铁桶运抵兰屿贮存场后，铁桶所存放的混凝土壕沟内。其中，壕沟内加装有入渗水收集系统做为第四层壁障。入渗水收集后再以蒸发器处理至其放射性活度小于仪器最小可测量后回送至于场内使用，则是最终的第五层壁障。而贮存场东侧靠海段更建有长约1,300公尺的海岸防坡堤，防波堤形式採用「混凝土及浆砌卵石混合重力式复合断面」，堤顶宽度1公尺，高度为海拔12.5公尺，可防止大浪及海啸入侵