干佑闻风而逃，新任刺史李彦圣也被变民军击杀。在福建，变民军还被土豪的反抗，福州人陈岩聚众数千保乡里，号称九龙军。黄巢不和他为敌，绕过其地，从蒲城兵分两路，一路取崇安、建阳、南平，另一路途经政和、福安、霞浦，扩大打击范围，两路变民军席席卷福建，十二月十三日，会师攻占福州。福建观察使韦岫弃城逃走。整个福建迅速为变民军占领。黄巢南下攻取福州之战，为扩大变民军政治影响，夺取全国胜利创造了有利条件。