从皇室博物馆到国立博物馆.1889年（明治22年），博物馆改称“帝国博物馆”，馆长为九鬼隆一。当时，在京都和奈良都设有帝国博物馆（京都馆设于1897年，奈良馆设于1895年）。当时馆内的美术部长是明治时期日本美术界的核心人物冈仓天心，此外从美国来的哲学家・美术史学家Ernest Francisco Fenollosa也被聘为美术部理事。因此博物馆在美术方面的力量得到了加强。1900年，位于东京・京都・奈良三地的“帝国博物馆”同时改称“帝室博物馆”。这个名称一直使用至1947年