洪堡圈的主要目标，是扩大和提高生物多样性研究领域以及地球系统研究的基础设施条件。所谓地球系统研究，涵盖了生物分类学、分子生物学、生态学、进化生物学研究；特别是古生物学、人类学、地球生物学、地理学、矿物学研究，以及和样本收集相关的研究；另外还涉及相关的科学史、博物馆学以及科研方法方面的研究，比如、统计方法、地理信息学、模型学等。其他目标包括协商制定一套共同的博物馆研究工作标准和战略、博物馆的总方针、管理机构布局、藏品和实验室的使用，以及研究项目和样品收集项目。