结束后，让-皮埃尔·本巴加入刚果过渡政府担任副总统。本巴在2006年总统选举中败于约瑟夫·卡比拉。2007年3月，刚果政府军在首都金沙萨对人数超出规定上限的本巴卫队採取行动，强行解除武装，本巴卫队不敌政府军后，本巴外逃到欧洲。2008年，本巴因在中非共和国犯有战争罪指控，在比利时被捕。