究员，兼任所长。1958年，北京实验生物学研究所改建为中国科学院生物物理研究所，贝时璋担任研究员，并兼任所长。1983年，贝时璋改任中国科学院生物物理研究所名誉所长。1958年，兼任中国科学技术大学生物物理学系系主任。1972年，率领中国科学家代表团访问美国。1973年，撰写《科学技术基本建设的建议》。1978年—1982年，兼任中国科学技术大学研究生院生物学教学部主任。1977年，参加制定中国《国家八年科学规划》。1978年—1984年，担任中国动物学会理事长。1980年—1983年，担任中国生物物理学会