与井上拓斗出战波兰羽毛球公开赛，在男双准决赛以0比2（19-21、15-21）不敌赛会头号种子、波兰的亚当·克瓦林纳/普热梅斯瓦夫·瓦查。同年4月，他与井上拓斗出战大坂羽毛球国际挑战赛，在男双决赛以0比2（9-21、19-21）不敌赛会2号种子、队友的数野健太/山田和司，赢得亚军。2016年7月，金子祐树与井上拓斗出战美国羽毛球黄金大奖赛，在男双决赛以0比2（11-21、20-22）不敌赛会头号种子、丹麦的玛蒂亚斯·鲍伊/卡斯腾·摩根森，赢得亚军。同年10月，他与井上拓斗出战泰国羽毛球黄金大奖赛，在男双