和左大臣藤原赖长之间亲近，与鸟羽法皇和藤原通宪支持的后白河天皇对抗。
保元之乱.保元元年（1156年），鸟羽法皇死后，立即发生保元之乱。后白河天皇以武家平清盛、源义朝等击败崇德上皇突袭的军队，崇德上皇被流放到赞岐，支持他的武家源为义等被斩首。乱后后白河天皇尽力强化政权，推行保元新制和庄园整理等。保元三年（1158年）八月十一日后白河天皇让位给守仁亲王（二条天皇）开始院政。以后的二条天皇、六条天皇、高仓天皇、安德天皇与后鸟羽天皇5代都由后白河上皇院政所操控。Section::