遭遇沉泥段，发生与扫叭隧道相似困境，工程一度受阻。最初试图以「迂回导坑法」克服，然而成效不佳，后来在西德顾问建议下，自国外引进「新奥工法」才成功解决难题。又因工程艰鉅而进度拖延，导致1982年6月台东线拓宽工程通车时，自强一号隧道尚未完工，只能先在扫叭隧道铺设1067毫米轨距的铁轨，并降挖增加隧道净空，暂时供1067毫米轨距列车通行。1984年10月17日上午11时，自强一号隧道全线贯通，随后于1984年12月28日与扫叭隧道完成轨道切换，1985年1月1日启用通车，1985年7月正式完工。自启用通