组织架构.在全台湾已经设立了七个地方性分院，更有多个专业性的学院。也在筹设全球的分校与分院，如美国、泰国、马来西亚、澳洲等地，也会在中国大陆、香港、澳门陆续成立分院或校友会。
争议.2017年时，有台大领袖学程学生，来到原先学程办公室却发现变成孙文学校，他指称里面的人员在为国民党洪秀柱竞选国民党党主席拉票。台大校方查明认定孙文学校因有政治活动违规使用，收回该地方。而孙文学校校长张亚中认为是政治迫害，他们有缴交房租。