后，曾有红卫兵到熊秉坤家抄家，熊秉坤从红卫兵手中夺回了1913年1月大总统袁世凯授予自己的“勋五位章”。1969年5月初，熊秉坤因患感冒而住进医院，后来病情恶化，于5月30日病逝。其子熊辉奉其遗命，通过湖北省革命委员会主任张体学将其去世的消息告诉了周恩来。周恩来当即作出四项指示：“一、安葬在武昌九峰烈士陵园；二、湖北省革命委员会操办丧事，赠送花圈；三、开追悼会，报纸电台发布讣告和消息；四、慰问家属，听取意见。”湖北省革命委员会随后为熊秉坤举办了遗体告别仪式，告别仪式由湖北省革命委员会副主任、湖北军区司令