于日本沖绳县中头郡北中城村登陆。在随后的一週，百合以逆时针方向在沖绳岛附近打转了三次，强度反覆变化，并两度增强为台风。9月13日凌晨3时半，百合于久米岛登陆。9月14日，百合开始移向西南，次日它第三次增强为台风，直趋台湾。9月16日晚上9时40分，百合于台湾新北市贡寮区三貂角登陆。百合侵袭台湾后，在9月17日逐步减弱为一热带风暴。百合在9月19日进入台湾海崃南部，并转向西移动。百合在9月20日再次增强，成为一热带风暴，下午4时于中国广东省汕尾市陆丰市甲东镇附近登陆。当晚，百合继续减弱，其后消散于广西内陆。