主经常长期留在京都，委派守护代管治领地。在应仁之乱期间斯波氏守护职在越前出现下克上的事件。应仁之乱前，斯波家嫡流武卫家斯波义健死后，家督继承问题引起纷争斯波氏庶流中斯波大野氏的养子斯波义敏与涩川氏出身斯波义廉纷争（武卫騒动）。这次纷争是足利将军家与畠山氏家督继续相关，是应仁之乱其中一个起因。在应仁之乱期间，斯波氏失去了远江国被骏河守护今川氏夺去、越前国被下属朝仓氏乘机夺去大部份的领地。至于尾张国义敏子孙获得守护代织田氏支持仍然存活。此外，斯波义廉之子义俊，与室町将军家分家继承越前鞍谷公方，形式的是得