交通大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学。2000年，增加7所，分别是浙江大学、南开大学、天津大学、南京大学、武汉大学、四川大学、中山大学。2003年12月，又增列11所，分别是吉林大学、中南大学、厦门大学、大连理工大学、山东大学、同济大学、西北农林科技大学、华中科技大学、东南大学、重庆大学、兰州大学。
辨析.所有中管高校均为双一流、985工程、211工程院校。中管高校仍按正厅局级单位标准设置机构，党委书记、校长的副部级需加注括号予以明确，党委副书记、副校长本身仍为副厅局级。