企业家古贺辰四郎过去曾于黄尾屿西南地区兴建柴鱼片工厂以及鸟羽加工厂，然而随着太平洋战争爆发以及工厂结束营运后岛屿也成为一座荒岛。而在1972年5月15日到1978年6月为止，黄尾屿和赤尾屿则一直被美军作为轰炸练习基地使用之。今日黄尾屿岛上栖息着大量的短尾信天翁，并且有报告指出亦有信天翁开始于此结巢繁殖。此外在岛屿周遭还有包括黄尾屿龙虾在内的丰富海产，另外岛屿上还有栖息着作为特有种之的黄尾屿蜈蚣。