地砖、增强照明及音响系统和在用作奉献中华殉道圣人的苦难小堂（现称中华殉道圣人小堂）安装新的彩绘玻璃窗。整个耗资110万美元的保育计划于2002年12月8日完成。由于这个计划成功将主教座堂内的文化遗产保存，联合国教科文组织宣佈该座堂获得2003年度亚太区文物古蹟保护奖荣誉奖。相关奖项于同年的主教座堂落成日颁发。圣母无原罪主教座堂每两年会在开启典礼（现称法律年度开启典礼）开始前为香港司法机构举行。如果主教座堂在某一年举行该礼仪后，香港圣公会的圣约翰座堂会于下一年成为举行地。然而天主教香港教区在花园道圣若瑟堂