为队史第二差名次。不过这一年中球队四次在主场最后时刻绝杀对手，其中包括山东鲁能、杭州绿城与北京国安三个“宿敌”，成为赛季的亮点。
2012年.2012赛季开赛前，上海申花俱乐部大手笔地引进了法国球星尼古拉·阿内尔卡与法国名帅让·蒂加纳，使得球队的联赛夺冠唿声甚至超过了卫冕冠军广州恒大。但由于球队战绩不佳以及与俱乐部高层矛盾激化，蒂加纳宣告辞职。球队助理教练让·弗洛伦特·伊本吉成为代理主教练，阿内尔卡成为球队队长兼助理教练。05月30日，上海申花队宣布前阿根廷国家队主教练塞尔吉奥·巴