帝读完感到悲痛，说：「江南士绅，无人不洒涕思明，枕戈待举。朕必亲提黄钺，张皇六师，以慰臣民之望。大小文武，当时时刻励尔志，毋狃偏安！」八月，清军入福建，取福州。毛协恭正办理考试完毕，由兴化府行至洪塘，获悉事变大哭，投水自杀，获救，避难流转于泉州府、建宁府境之间，打算前往广东。遇到土寇发起，避难前往崇安县。隆武三年（1647年，顺治四年）七月，毛协恭南下途中于建宁府西北吉阳溪万石滩遭遇清军，女婿刘元赵前行被杀；毛协恭命令两个儿子从小路逃走，自己向清军大喊：「速杀我！」被捕，清军主帅以高官厚禄劝降，毛协