秉钧被任命为民政部大臣。
国务总理.中华民国成立后的1912年（民国元年）3月，唐绍仪内阁成立，赵秉钧任内务总长。其后，赵秉钧奉袁世凯之命开展反唐运动，唐绍仪被迫辞职。在随之成立的陆征祥内阁中，赵秉钧继续任内务总长。同年8月，陆征祥遭参议院弹劾而辞职，赵秉钧代理国务总理。9月，正式继任国务总理（同时兼任内务总长）。在上台之初，赵秉钧作出了同国民党的融和姿态，故组阁比较顺利。但此后他逐渐摆出同国民党对决的姿态。1913年（民国2年），国民党在选举中获胜。同年3月，国民党领袖宋教仁