事会主席潘天赐兼任香港职工会联盟会长。其最高权力机构是会员代表大会。会员代表大会休会期间，由理事会执行日常事务，监事会从旁监察。理事会与监事会都是由全体会员一人一票不记名投票选出。
历史.香港教育专业人员协会由前市政局议员钱世年于1973年倡议创立，及后葛量洪校友会观塘学校校长司徒华获选为首任主席。教协会的创立阶段，适逢文凭教师争取合理薪级制度运动。1972年，政府降低了文凭教师入职薪点，并企图将教师薪级脱离公务员总薪级表。当时，香港教育专业人员协会正是在申请註册等待批准的