《明史》，有眼疾，曾以钱名世为助手，“时万老矣，两目尽废，而胸罗全史，信口衍说，贯串成章。”
逝世.康熙四十一年（1702年）四月八日，季野在京师王鸿绪家中去世，享年六十四岁，葬于浙江奉化莼湖镇乌阳观山南麓半山腰，身边的藏书被钱名世佔有。刘坊写有《万季野先生行状》。季野的去世，象征《明史》编纂第一个阶段结束，其后经过数次易稿，干隆始四年（1739年）正式刊行，距季野过世，已有三十余年。文革时，万斯同墓惨遭破坏。后又重修。
评价.经学家杨椿认为：“《明史》成