大战期间，马赛被傀儡通敌政权统治，菲利普·贝当曾于1940年12月3日访问马赛，此后马赛被纳粹德军实际控制。1943年1月，在希特勒的指挥下，纳粹德军在马赛对当地的犹太人进行了大规模的搜查，，当地的犹太区被冠以“罪恶街区”的名号而摧毁。1944年8月龙骑兵行动后，联军和法兰西内政军登陆普罗旺斯，于8月21日至28日间在马赛与当地的纳粹德军并取得胜利。二战后，随着殖民地独立运动的推进，越来越多原居于北非及中东地区殖民地的法裔居民返回法国本土。1962年阿尔及利亚战争结束后，大批黑脚和离开阿尔及利亚，他们其