神护寺（）是位在日本京都府京都市右京区的寺院，高野山真言宗遗迹本山。山号「高雄山」（）。本尊药师如来、开基（创立者）为和气清麻吕。别称「高雄神护寺」。空海曾在此举行镇护国家之修法、最澄也曾在此讲解法华经，是日本佛教史上重要的寺院。