中全会后，姚依林任中共中央副秘书长、中共中央办公厅主任。1979年3月，中央决定设国务院财政经济委员会，姚依林任秘书长，任内协助副总理陈云、李先念纠正前两年经济工作中的失误，清理“左”倾错误影响，为调整国民经济做了许多工作。1979年7月，在全国人大五届二次会议上，姚依林被任命为国务院副总理，分管经济工作。此后，还兼任国家计划委员会主任、党组书记，中央财经领导小组副组长，中央引进智力领导小组组长。他主持编制并实施了国民经济和社会发展第六个、第七个五年计划，主持编制了第八个五年计划。在制定“六五”计划时，