。接着数年，诺克斯逐步成为缅因州的大地主。他又创办了，与各个独立战争军官保持联络。1785年，联邦议会终于决定任命诺克斯为美国战争部长。诺克斯在任初期，负责组建一支常备民兵，然而这支军队却难以应付谢司叛乱。诺克斯主张建立一支正规陆军，他的建议更成为美国陆军创立的滥觞。谢司叛乱后，美国制宪会议召开。诺克斯主张扩大联邦政府权力，并鼓励华盛顿参与会议，自己则大力游说麻萨诸塞自治政府支持。当美国宪法通过后，诺克斯一度成为副总统的热门人选，但他选择继续留任战争部。副总统最终由约翰·亚当斯获选。华盛顿就任总统后