三书记改为海军党委第一书记，全揽海军大权。与海军司令员萧劲光不和。1969年8月7日，中央军委批复海军第四届党委常委组成，李作鹏任第一书记，萧劲光任第二书记，王宏坤任第三书记。李作鹏成为政治局中林彪派系的重要一员，成为「林彪五虎将——黄、吴、叶、李、邱」之一，登上个人事业的顶峰。据中共官方称李作鹏在海军期间，对苏振华、刘道生、杜义德等海军将领进行了诬陷和迫害，并间接导致了东海舰队司令员陶勇的死亡。不过随着1970年的庐山会议上毛泽东和林彪的决裂，李作鹏很快被冷落，被毛泽东点名批评并将自己和林彪的矛盾