区域为幕府直属的领地，不过也是委託加贺藩管理的。19世纪末明治维新后，原属幕府的领地改由高山县管理，1871年实施废藩置县后加贺藩的领地改隶属金泽县，不过同年的第一次府县整併后，此地区被划入新设立的七尾县，但也仅半年过后，又被併回由原金泽县更而成的石川县。1889年日本实施町村制，现在的能登町辖区在当时分属凤至郡的、、、、、、、和珠洲郡的、、、、共13个行政区划，在经历1900年代及1950年代两次的整併后，这13个行政区划成为位于南部的、位于西部的及位于东部的三个行政区划。2000年代日本政府