山堡一带添置台北府分防南雅理番捕盗同知（即“南雅同知”）一员，隶属台北府；建议厅治设于南仔，管辖一堡（即海山堡）。南雅厅只管需就地即时处理的事务，而治安工作等重大案件仍由新竹、淡水县掌管。同年，清政府拟析淡水县设南雅厅，厅治置于大嵙崁。此时，台湾省共隶3府、1直隶州、4散厅、11县。另有一説谓由于1895年台湾被割让给日本，南雅厅并未正式设立。
争议.中国人民大学清史研究所副教授胡恒认为南雅厅本身并不存在。其主张所谓“南雅厅”长官台北府分防南雅理番捕盗同知（即“南雅同知”）并非厅长