微吸盘科（学名：Microcotylidae）是扁形动物门之下的一个科。根据Catalogue of Life，本科原属吸虫纲单殖目，Dyntaxa把本科归入新皮纲（Neodermata）单殖亚纲的多后吸盘目。 
特征.虫体后端扩张成为斧状，该处两侧有多数相称或不相称排列之吸瓣，生殖器有钩，膣开口于中央背面或腹面，虫卵有附属物。寄生于海水鱼之鳃。
分类.过往本科之下只有"Microcotyle"一个属，但现时根据Catalogue of Life及Dyn