1942年6月16日随黔桂铁路泗亭至都匀段通车而开通，车站名称来源于布依语“芒尾”谐音。1944年11月独山战役后车站设施被日军轰炸而无法继续使用，停运数十年。1955年铁路部门开始黔桂铁路修复工程，于1956年3月15日修至麻尾，同年9月15日修复至独山站，1957年1月7日恢复临时客货运业务。车站由于位于贵州、广西两地交界，因此设有麻尾机务段。2004年黔桂铁路扩能工程开工，计划在麻尾镇新建车站。都匀至麻尾段于2008年10月24日开通，新火车站则于2009年1月11日随麻尾至段启用而投用。根据规划