先从抽真空学起。尔后，重组加速器之计画在1946年10月开始进行，并于1948年5月13日下午8时35分完成了中华民国暨战后全亚洲首次人工撞击原子核实验。为了保持进度，太田赖常在那段期间时常与许云基睡在实验室内过夜，醒过来后便继续工作。该加速器目前被国立台湾大学校方展示于台大物理文物厅，即原物理学讲座原子核实验室。然而据记载，戴运轨在日后的回忆录虽多次谈及该次实验，却从未提及该实验乃建立在荒胜文策遗留的基础上进行的，并淡化了太田赖常的贡献。此外，在这段时期，太田赖常专研于光谱研究以及继续其在新竹期间进行的油