三个月后，他就上调中央，出任审计署副审计长；从副厅局级官员，直接升任副部级官员；李金华时年42岁。在担任副审计长十三年后的1998年3月，终于在朱镕基内阁中，李金华得以出掌审计署，任审计长、并兼党组书记。2003年3月17日，中华人民共和国国家主席胡锦涛发布第二号中华人民共和国主席令，根据中华人民共和国第十届全国人民代表大会第一次会议的决定，李金华继续担任审计长。在任期间一再推出爆炸性的审计报告，被媒体称为“铁面审计长”。因此，他在2004年被评为《南方周末》年度人物。第62届联合国大会于2007年