90年，庚午年），由于袁绍、袁术率领关东诸侯发动董卓讨伐战，于阴历三月戊午日（阳历5月10日）遭董卓以通敌嫌疑罪名和叔父袁隗等仍居洛阳的汝南袁氏二十余族人（一说五十余人）受牵连，夷其族。袁绍、袁术知悉袁基身亡后便争夺汝南袁氏宗主之位。一说袁绍曾让长子袁谭以宗法将之过继给亡兄袁基为嗣子。