冒险的游玩方式，玩家所扮演的是本作男主角七瀬祐一。基本上玩家在游玩的时候都需阅览萤幕上所显示的文本，用以了解故事情节和人物之间的对话。该些文字会与人物拼合图和背景一同出现，并叠在后两者之上，用以表示祐一在跟谁对话。玩家会在故事中遇见代替背景和人物拼合图的CG。《妹天堂！3》拥有多条剧情分支路线，每条路线的结局皆有所不同。玩家的选择最终会影响进入哪条路线，从而影响结局。玩家在某些预设的段落中须选择行为选项，对话框的下一段文本在做出选择前并不能够显示。一些选项可能会令游戏提早结束，另一些则会改变结局。玩家必