设有仲裁所来处理商业纠纷，而当无法解决时，则在仲裁所与上鲲鯓沙崙之间的决斗场解决。而在1604年荷兰东印度公司派遣韦麻郎到澎湖时，他除了派人到厦门与明朝交涉通商事宜外，也派人到安平海域寻找其他的良港。
日治时期.1895年乙未战争末期，台南一带驻军主帅刘永福潜逃至厦门后，安平驻军士气低落，10月20日，在安平海关税务司主管麦嘉林（C. J. McCollum）劝告下交出武器装备，收藏于海关鸦片仓库准备投降。次日（10月21日），日军少将率军进入台南府城，而海军常备舰队有地中将于