开主流教会事奉，转而领导社会运动。陈士齐亦是不少香港同性恋组织和基督路小教会的顾问和组织者，该教会的牧师亦指出其多年来深入研究香港的同性恋人群，支持同性恋者捍卫自身权益，也支持同性婚姻合法化，并屡为香港和两岸多个同性恋权益组织提供帮助，也发表多篇同性恋社会学的研究文章。
家庭.陈士齐妻子是资深社工霍玉莲，她1982年本科毕业于香港大学社会工作系，1988年与陈士齐同于英国鸭巴甸大学取得神道学学士学位。霍玉莲曾任《橄榄》杂志总编辑、曾为《突破》、《吶喊》、《中学生月刊》及大专生刊物撰