顿于1687年发表 《自然哲学的数学原理》。查理也拔擢深具才干的建筑师克里斯多佛·雷恩，命其为伦敦重建的总策画人；1682年为了让退役士兵有家可归，他也命雷恩建造知名的切尔西皇家医院。为了增加国家的收入，并促进英国的海外殖民与商贸，查理二世继续推行重商主义，鼓励贸易特许公司的设立与扩大。1660年查理设立皇家非洲公司并授与特许状，让它垄断西非与美州之间的奴隶贸易；查理也在1670年不断更新英国东印度公司的特许状并扩大其自治权，授予东印度公司自主佔领地盘、铸造钱币、指令要塞和军队、结盟和宣战、签订和平条约