28日，林荣三因肝肿瘤併发心肺衰竭于台大医院离世，享寿77岁。一位不具名的《自由时报》资深员工回忆，过去林荣三对于该报编务可说是「亲力亲为」，每天都要等到晚上，隔天的大样排出来后，才会回家。2005年，林荣三把《自由时报》交给次子林鸿邦，虽然淡出编务，但社论等内容仍要亲自过目。同日，另一位不愿具名的《自由时报》资深员工回忆，本年9、10月林荣三亲自出席该报内部会议，是该报员工最后一次看到他。
荣誉.2000年4月12日下午，林荣三获李登辉颁赠二等景星勋章。天主教辅仁大学名誉法学