语相似性最高的是古代日本语，其次是中世朝鲜语，而地理上较接近的通古斯语族差异相对较大。高句丽语中已判定的四个数词与日语存在音韵上的相似，为日语起源的研究也提供了参考。美国印地安那大学的白桂思（Christopher I. Beckwith）认为现时的日语仍然可以看到昔日的扶余语的痕迹，而这一段日语及扶余语系的连结最早于1907年为两位日本学者所留意。他尝试透过约140个含有高句丽词语的地方面来重新构建高句丽语的发音。他发现：高句丽语在文法构词方面与日语相似，例如：属格 "-no"及修饰语 "-si"。他