种子植物，部分学者主张其为被子植物，也有学者质疑其为松柏类裸子植物。若干项关于被子植物起源时间的研究认为，依据分子钟的结论，被子植物可能起源于侏罗纪甚至三叠纪，但尚无可靠的化石证据支持，分析指出，这可能是由于早期被子植物在生态上并不重要，或者其生活在化石化作用难以发生的环境中。
系统发生.
外类群.依据目前的研究，植物界是双鞭毛生物>多貌生物的一支，其与相关类群间的系统发生关系如下。
内类群.植物界各类群的系统发生关系尚不明晰，目前主要