权协会的宗旨是促进教育、法律、生活、政治等四个方面的性别人权，冀望打破教育、家庭、政治、经济、婚姻爱情、法律等主要社会建制内的性别人权，解除传统社会制度对性别弱势的压迫。台湾性别人权协会多次参与性别事件，例如反对《出版品及录影节目带分级办法》、声援晶晶书库遭控妨害风化罪案，以及于2005年8月主办亚洲拉子影展等。在这些事件中，性别人权协会常与日日春关怀互助协会、台湾TG蝶园、台湾同志谘询热线等团体合作，就共同领域的新闻事件发表声明或採取行动。2006年2月27日，台湾性别人权协会加入废刑235行动联