老建筑出现沉降及墙体开裂，整体结构濒临失稳，德寿堂药店被迫停业。2003年，德寿堂药店整体修缮。2004年11月18日，德寿堂药店修复重张，此次修复恢复了楼顶侧外立面的仿真小火车景观。这是北京市唯一完整保留店堂历史原貌的老字号中药店，随后此处成为北京市文物保护单位、北京市旅游定点单位。德寿堂药店还是北京市医保定点药店。但楼顶的小火车不久便“停运”，到2010年已经“停运”多年。德寿堂药店遵循“重医德，顾客至上，守信誉，诚信无欺”的经营宗旨，经营中国各地中西药品、中药饮片、参茸、营养保健品、医疗器械等等。