他角色设定和剧情发展也有所不同，根据作者的说法是较为轻松的喜剧。
情节.碇真嗣是个个性内向、封闭的中学生，一次受到朋友剑介和冬二请託，找「加持侦探事务所」求助，结果被所长加持和共同经营者葛城半强迫地要求协助调查。与真嗣搭档的助手薰在调查过程中展现了EVA（肆号机）的力量，成功完成委託。后来加持强硬地要真嗣留在侦探所工作，真嗣于是和薰展开同居生活，偶尔调查案子，并且拿到了EVA（初号机）。真嗣和薰之后接获要用EVA来回收五颗稀有宝石的任务，却遭到侦探所的竞争公司「GI代理机构」阻