日本人，定居于西巴布亚和德属新几内亚可以追溯到20世纪初，当时日本的移民在这些岛屿建立了椰树种植园和贸易企业，特别是在拉包尔。在20世纪上半叶日侨社团仍然很小，在巴布亚的大多数日本人是商人和种植园经理，有少数人是渔民，但人数从未超过100人。他们中的许多人与巴布亚人女人结婚，在二次世界大战期间，大多数日本人被驱逐到澳大利亚，在那里他们被拘留。他们中的大多数人在战后被遣返回日本，虽然他们的混血儿被允许留在当地，并与当地民众吸收。
早年.日本人在德属新几内亚的存在可以追溯到20世纪初，