马龙山乡民奉祀之「朱府王爷」降乩曰：「本庄西北方草港，有天神驾临，应即前往迎接銮驾，回来供奉。」乡民前去果然发现王船，上有神像三尊、香炉一个、药签簿一册，并有红绫，上书五年千岁十二王爷之姓氏与诞日。而后，马龙山、昌南、新厝、芋头、吕厝、同安、林朱寮等七庄檀越鸠资建庙奉祀，祈求平安。马龙山因堪舆学上有「马龙相会」格，风水甚佳，故称「马龙山」，台湾日治时期官吏因汉字「龙」与「鸣」的闽南语音相近，误记为「马鸣山」。日本投降后，乡民原本有意投书国民政府，正名为「马龙山」，后因有学者查出大乘佛教有祖师「马鸣菩萨」