辆进入平成时代后日渐老化，而制造E655的目的就是为了替换这些老旧的皇家专运车辆。E655专运动车组可担当只有天皇、其他皇族成员及随从人员乘坐的“1号编成”列车，以及天皇和要员乘坐的“特别车辆”。在解编皇室专运车卡后，E655也担当供一般乘客乘坐的（JR称其为“”）。
编组.E655在东北本线上运行时，方向的车厢为1号车，或方向的车厢则为5号车，而用于专运的特别车辆没有车厢编号。特别车辆所属车辆段为（简称），其余车厢则配属（简称）。除特别车辆外，全列车均为绿色车厢，一般旅客