郡除北部部分地区属于幕府直属领外，大部分区域皆为宫津藩领地；明治维新后，幕府直辖领先后改隶属府中裁判所、久美滨县，宫津藩领地在1871年废藩置县后改隶属宫津县，同年年底的第一次府县整併中，与谢郡全境被划入丰冈县，直到1876年的第二次府县整併中被改划入京都府。1879年实施，正式的设置了近代的行政区划「与谢郡」，郡役所设于宫津（位于现在的宫津市）。