海军全部缴械并关押在南普陀；随后又包围海军厦门要港司令部，活捉了正在办公的林国赓。当天，海军马尾要港司令李世甲致电福建省主席陈仪表示强烈抗议。经陈仪干预，翌日林国赓获释。已被缴械的海军随即获发还武器。1937年9月1日，黄涛经南京国民政府军政部军医署署长张建，向蒋介石发出秘电，诬告林国赓卖国私通日本。1939年9月1日，林国赓在厦门《江声报》头版发表《林国赓启事》，斥责此等诬告为谎言。南京国民政府军事委员会、第四战区司令长官部对厦门陆海军冲突十分不满。1937年9月初，驻厦门海军陆战队第二旅第三团被调到福州