实录时，又值西人党掌权。由于东、西两党对事件的记载大相径庭，目前对己丑狱事的真相尚存争议。在李肯翊编订的野史燃藜室记述中，从东、西两党角度出发的记载都得以保留，在书中以不同颜色标记。
背景：士林派.宣祖时，长期受到勋旧派打压的士林派终于夺取权力。然而，士林派内部很快出现分裂。分裂后的西人党成员多在先王明宗时即参政、相对老派；而东人党则相对年轻化。西人党以外戚沈义谦为首，支持李栗谷（即李珥）的主气说；东人党以金孝元为首，支持李退溪的主理说。   两派的冲突最初体现在沈义谦和金孝元