参选台南市长而曾脱党的许添财，国民党方面则提名陈荣盛。最后由许添财以四成三票数获胜。在2004年中华民国总统大选中，陈水扁在台南市取得了五成八的票数大幅领先连战。而在2005年中华民国县市长暨县市议员选举中，许添财第三次对上陈荣盛，而同时台联也提名钱林慧君参选，导致泛绿再次出现了分裂的情形。此次选情格外激烈，许添财仅领先陈荣盛一万四千票，不过最后仍然连任成功。在2008年中华民国立法委员选举中，民进党提名的候选人在台南市境内的两个选区均成功当选。但在同年的2008年中华民国总统大选中，谢长廷的票数却小幅