校训为指导，在条件极其艰苦的情况下开展教学、科研工作。由于清华拥有庚款，战前抢运了不少图书、仪器设备，因此对联大贡献较多。由于北大并无工学院，南开仅有化学工程系，因此联大工学院基本上为清华工学院的延续。联大规章制度也基本沿袭清华制度，时任联大经济系主任陈岱孙曾总结：“西南联合大学校内领导体制和清华大学有相似之处。清华大学的领导体制，在西南联大期间，仍然发挥作用，制度的延续性并没有中断。”西南联大期间，清华还单独设立清华大学昆明办事处、清华大学研究院、清华特种研究所。研究院自1939年起逐渐恢复，设有文科