异裂酶（）是指识别相同的核酸序列，但酶切位点不同的限制酶，在一些特殊的实验中有很大的应用价值。 例如：<br>限制酶 MaeII 的酶切位点为 A^CGT <br>限制酶 TaiI 的酶切位点为 ACGT^限制酶 ApaI 的酶切位点为 GGGCC^C<br>限制酶 Bsp120I 的酶切位点为 G^GGCCC以及其它一些例子。识别相同序列，酶切位点也相同的限制酶称为同裂酶。