民国总统陈水扁任命杨仁寿为最高法院院长。2012年1月13日，中华民国总统马英九发布命令，核准最高法院院长杨仁寿退职。2012年2月16日，杨仁寿正式退休。
批判与评论.针对2013年九月政争之际，杨仁寿表示：此外，针对中国国民党关说检方不要上诉台北市长马英九特别费案，杨仁寿说，因为检察官上诉不合法，并没有就原判决如何不适用法则或适用法则不当之情形，进一步具体叙明，未针对重大关键所在的大水库理论上诉，内容只是「那些有的没有的」枝枝节节，最高法院才以违背法令，驳回检方上诉，影射已