斯特分类法之中被归类于五桠果亚纲山茶目，包含27个属，下分两个亚科：藤黄亚科（）与金丝桃亚科（）。随后分子学的研究发现旧有的黄藤科是个并系群，于是，1998年的被子植物APG分类法将金丝桃科与藤黄科分开并列于金虎尾目，到2009年APG III，红厚壳属（'）及黄果木属（'）等也被进一步独立出来成立新的胡桐科。
内部分类.本科目前约有14到24属，大致上可归类为3族，如下：