，如果耗尽那么信仰点就会开始随着时间逐渐减少。击破敌机与收集道具可以使计时条恢复。此外，本作还有一些细节上的变化，例如自机火力未满也可到屏幕上方收集画面所有道具、续关从关卡开头重新开始、取消擦弹计数与擦弹分数奖励等。
故事.神社本应是会有人类前来参拜的地方。可是对博丽神社来说，则完全不见一个人前来参拜，因为博丽神社被妖怪所佔据。因此，神社的巫女博丽灵梦就面对着参拜客不足的问题。正当灵梦在烦恼的时候，一个自称是妖怪之山上神社巫女的人到来博丽神社，还提出了要博丽神社关闭的要求。灵梦