站仍不能进行1号线车站和3、4号线车站间的换乘，出站后需另行购票，里程不连续计算。两个站台在付费区内互不连通，但在非付费区有通道连接。该通道同时作为上海火车站南北广场的连接通道。乘客如需站内换乘1号线与3号线可在上海南站转车；换乘1号线与4号线可在上海体育馆站转车。
进出口.1号线和3、4号线分别使用独立的出口编号，此外部分站厅还设有未编号的专用、单向进出口。
1号线.一号线的出口主要通往铁路上海站的南广场附近。铁路上海站东南出口设有通往1号线站厅的快速进