朱棣去世后二十多年的短暂安宁被彻底打破。1449年的土木堡之变是明朝和蒙古的军事力量对比的转折点，也使得兀良哈三卫与明朝的关系从根本上发生了改变。15世纪中期之后，兀良哈三卫的势力范围延伸到了明朝长城边外。自此，兀良哈三卫驻牧地分布是：“自大宁前抵喜峰口，近宣府，曰朵颜；自锦（州）、义（州）厉广宁（卫）至辽河，曰泰宁；自黄泥漥逾沈阳、铁岭至开原，曰福余”。
后代.进入16世纪中期，达赉逊大汗率领蒙古左翼察哈尔和喀尔喀两个万户东迁到兀良哈地区驻牧。进入兀良哈地区后，与当地部落彼此