有不同序列的16S rRNA。
功能.已知16S rRNA具有如下几项功能：
通用引物.由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因（16S rDNA）是高度保守的，16S rDNA常被用于对各种生物进行的系统发生学方面的研究这种运用16S rRNA对生物进行系统发生学研究的方法由卡尔·沃斯（Carl Woese）开创。另外，线粒体和叶绿体中的rRNA也都被扩增了。在获得能提供系统发育学信息的16S rRNA分子时需要利用通用PCR引物对16S rR