后又逐渐加上了一些伊斯兰建筑，如米哈拉布、敏拜尔及外面的四座叫拜楼。随着土耳其共和国的建立，1934年该教堂失去了其宗教意义，1935年2月1日，这座见证了数个帝国兴盛衰亡的建筑以博物馆的身份重新对世人开放。直到2020年7月2日，时任总统雷杰普·塔伊普·埃尔多安撤销国父凯末尔在1934年签署改为博物馆的政令，恢复其宗教场所的角色。大教堂藏有大量圣物，当中以一个15公尺（49英尺）高的银圣幛最具特色，圣索菲亚大教堂是君士坦丁堡牧首的圣座，在将近千年的时间里都是正教会的焦点。1054年，枢机宏伯特到圣