隶属于斗六厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，菜公区改隶属于嘉义厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制并改名为「高厝林子头」大字，隶属于台南州斗六郡古坑庄。战后古坑庄改制为古坑乡，隶属于台南县，大字亦改制为村。1950年10月，云、嘉、南分治，古坑乡改隶属云林县。
聚落.本地区发展较早的聚落为高厝林仔头、早井仔、田中央、鱼池仔、埔顶仔、竹围仔、荷苞厝等，在日治期初期的官方地图上已有记载。此外，本地区尚有早寮、二坪仔、