死后，他于1182年推翻了摄政太后安条克的玛丽的统治，次年又杀死了年幼的皇帝阿莱克修斯二世（1180年－1183年在位）。他试图进行改革，但遭到了贵族们的反对，1185年诺曼人入侵，他被推翻且被杀害，拜占庭帝国的科穆宁王朝也就此结束。但安德洛尼卡的长子曼努埃尔的两个儿子日后创建了特拉比松帝国，该支科穆宁家族成员自称大科穆宁（Μεγαλοκομνηνοί，Megalokomnenoi）家族。
文学与建筑.不同于忙于战争的约翰二世，伊萨克是个学术与艺术的赞助者，自己也是个学者。除了建立