成立于日治时期的1899年（明治32年）11月4日，时称台中县土库公学校，有校舍三间、205名学生。1917年设埔姜崙分教场（今褒忠国小）、1918年设五间厝分教场（今虎尾国小）、1928年设埤脚分教场（今埤脚国小）——后来三个分教场各自独立成校。台湾光复后，中华民国政府在台湾省实施地方自治，民国39年校名改为云林县土库镇土库国民学校；民国57年实施九年国教，改为现名至今。今有普通班三十五班（本校二十九班、越港分校六班）、资源班二班、幼稚园一班、附设补校三班。
行政组织.土库国