1940年，满洲国外交部委派王荆山出任萨尔瓦多驻满洲国名誉领事。虽然在1941年12月珍珠港事变后，萨尔瓦多就追随美国对日本宣战，但直到1943年1月，萨尔瓦多才宣布取消对满洲国的承认。1941年4月9日，中华民国与萨尔瓦多建立公使级外交关系，由驻巴拿马公使兼任驻萨尔瓦多公使。1949年10月1日中华人民共和国成立后，萨尔瓦多继续维持与中华民国政府的外交关系，且于1961年6月1日升格大使级外交关系。2018年8月21日，萨尔瓦多与中华民国断交。中华民国外交部长吴钊燮宣布，停止双边合作并撤离大使馆、