但邓坚决主张倒唐，会议决定迅速发动兵变，并派杨蓁劝靖国军第1军军长顾品珍回师昆明。次年2月，顾、邓、杨、金等人发动兵变，这出乎正在迎击叶荃的唐继尧的意料，唐继尧急忙逃往香港。同年，邓泰中被孙中山任命为援桂总司令。1922年(民国11年)，邓率部讨伐陈炯明，后滇军将领联名电请孙中山回粤主政。次年4月至5月，邓泰中任陆海军大元帅府高级参谋。不久，任广州大本营军政部次长。后任四川宣慰使，晋陆军上将。1927年(民国16年)6月19日，邓泰中任国民政府代表，乘船赴九江。但船在南京江面被日本商船“南洋丸”撞沉