化剂的情况下该反应非常慢，但是在氢氧根离子的存在下该反应非常快几乎可以立即进行类似的反应。碳酸酐酶中活性位点的结构从许多晶体结构中是众所周知的。它由由三个组氨酸单元的三个咪唑氮原子配位的锌离子组成。 第四配位位点被水分子占据。 锌离子的配位球近似为四面体。带正电的锌离子使配位的水分子极化，并且带负电的氢氧化物部分对二氧化碳（碳酸酐）的亲核攻击迅速进行。催化循环产生碳酸氢根离子和氢离子作为化学平衡有利于在生物pH值下解离碳酸。
维生素B12依赖酶.含钴的维生素B（也称为钴胺素