月之后的府县整併中，现在彦根是的辖区都被併入长滨县。最初长滨县厅虽然设于彦根城内，但由于规划未来将会把县厅迁移至至坂田郡长滨，因而新县名命名为「长滨县」；在县厅迁移至长滨后仅十天，又决定要再将县厅迁回彦根，因而县名即改以彦根所在地的犬上郡之名称，更名为犬上县。不过半年后，犬上县又与滋贺县合併，虽然与滋贺县的县厅所在地大津相比，彦根位于整个新县的中央位置，但在中央政府认为本地的民风过于保守，因而决定将新县的县厅设于西部的大津，合併后新县也就因此继续使用滋贺县做为县名，自此彦根也失去成为县厅所在地的机会。1