，他自己却觉得太过武断。林奈相信上帝造物说，人们常说林奈曾说过“上帝创造，林奈管理”。因为作品颇受欢迎，林奈继续创作并最终将只有11大页的第1版（1735年）扩写到了有2,400页的第12版（1766–1768）。同时其理念也在不断进步，例如第1版中鲸被当做鱼，而在第10版中被移到了哺乳纲下。而在这一版中，仿照1753年出版的《植物种志》，他将使用两部分名字的方法引入了动物命名中，而这便是二名法的前身。
命名法.除了将自然界系统地分为动物界、植物界和矿物界外，《自然系统》还为二