对宋明所传心性之学，深感不满，主张「着书不如抄书」。晚年侧重经学的考证，考订古音，分古韵为10部，认为“读九经自考文始，考文自知音始。”着有《日知录》、《音学五书》等。。他是清代古韵学开山祖，成果累累；对切韵学也有贡献，但不如他对古韵学贡献多。平定三藩之乱后，康熙帝开博学鸿儒科，招致明朝遗民，顾炎武三度致书叶方蔼，表示“耿耿此心，终始不变”，以死坚拒推荐，又说“七十老翁何所求？正欠一死！若必相逼，则以身殉之矣！”。康熙十八年 (1679年) 清廷开明史馆，顾炎武以「愿以一死谢公，最下则逃之世外」回拒熊赐