总管府在至元十三年（1276年）分为澂江路和曲靖路，落蒙部改为路南州，置土知州，土司为秦氏，领有邑市（今宜良县古城）、弥沙（今宜良县马街）二县，隶澂江路。至元二十四年（1287年）弥沙县并入邑市县，仍隶路南州。明洪武十五年（1382年），路南州随澂江路达鲁花赤降明，延续元建制，隶澂江府，同年设立云南前卫，路南为驻地之一；四年后设前卫屯军，路南州设三屯（路南屯、古城屯和邑市屯），自此大量内地汉人迁入石林。成化十三年（1477年），原土官病故，云南巡抚都御史委派流官知州，完成改土归流过渡。弘治三年（1490年）