大使馆馆址从曼谷的沙吞县转移到碧武里新路上，2006年11月27日后，又为了将主馆与分散在市内其他地点的领事部、宣传文化部等使馆下属机构进行统合，而迁移至曼谷地铁是乐园车站週边、无线电路177号的新馆内运作。原本与大使馆共用碧武里新路旧址的日本外务省国际协力机构（）驻泰事务所也跟着搬到曼谷别处的高级大楼内办公。
组织与职掌.日本驻泰国大使馆的职责为保护日本人、促进日泰关系和国际社会合作，编员包括日籍馆员约60人、本地雇员约100人。馆内分为总务部（协调、预算、人事、警备、设备相关事