进入上海后，傅筱庵因为支援北京政府方面的孙传芳而遭到通缉，被迫逃到大连。1931年（民国20年），对傅筱庵的通缉被解除，傅筱庵回到上海，担任中国通商银行总经理、董事长。1938年（民国27年）10月，被任命为中华民国维新政府之下的上海特别市市长（南京国民政府（汪精卫政权）成立后留任）。同年，蒋介石的重庆国民政府的军统派出特务，企图暗杀正在上海逗留的汪兆铭（汪精卫）。傅筱庵起初与军统协作，但在暗杀实行前向汪兆铭告密，导致参与暗杀计划的军统特务们遭到逮捕。蒋介石十分愤怒，军统领导人戴笠严令暗杀傅筱庵。1