民主选举中，出狱仅42天的哈维尔被选为捷克斯洛伐克联邦共和国总统。1992年捷克斯洛伐克和平解体，捷克共和国成立；1993年瓦茨拉夫·哈维尔当选捷克共和国总统，并且于1998年连任，2003年卸任，卸任后隔年访问台湾。2008年与后担任德国总统的约阿希姆·高克在布拉格签署《关于欧洲良知和谴责共产主义罪行布拉格宣言》。2010年1月6日，发表《捷克前总统哈维尔等人就刘晓波案致胡锦涛的公开信》。
逝世.2011年12月18日，他在家乡Hrádeček去世。时任总统瓦茨拉夫·克劳斯宣佈