作战任务临时编组多种类型舰船的兵力集团成为特混舰队。现代海军舰队的有的设有下属的舰队，如美国海军太平洋舰队下属第三舰队与第七舰队；有的下设海军基地，如中国人民解放军海军、苏联海军；有的设有区舰队、分舰队或按任务编组的特混舰队。更低层级的舰艇编制单位有总队、支队、大队、中队、分队、小队等。海军舰队受海军总部领导。有的国家海军舰队在作战上归战区司令部指挥。例如，美国陆海空军军事行动受各个战区的联合作战司令部指挥，部署在印度洋波斯湾的美国海军舰艇的作战行动受美国中央司令部（USCENTCOM）指挥，在印度