县、群马县、埼玉县、东京都、神奈川县（御殿场线除外）、新潟县（大纟线除外）、山梨县（身延线除外）、长野县（饭田线、中央本线盐尻站以西及大纟线南小谷站以北除外）、静冈县（只限东海道本线热海站以东及伊东线）的各都县旧国铁的在来线与东北新干线、上越新干线、北陆新干线，连同山形新干线、秋田新干线的通称为营运基础。JR东日本营运的路线如下：
与其他JR公司的分界站.JR东日本是JR集团六家旅客铁道公司中，唯一一家管辖所有与其他JR公司分界站的在来线站区。