阿姆斯特丹有两所大学：阿姆斯特丹大学与阿姆斯特丹自由大学。其他的高等学府还包括：以及其他一些高等专业学校。阿姆斯特丹社会历史国际学院是世界上最大的关于社会史的记录和研究机构，尤其是历史上的劳工运动。始建于1638年的阿姆斯特丹植物园则是世界上最古老的植物园之一，其中陈列了许多稀有的植物，包括整个拉丁美洲的咖啡标本。阿姆斯特丹拥有完善的初等教育系统。其中一些学校的教育方式比较独特，比如蒙台梭利学校。也有一些是教会学校，原先主要是天主教和新教建立的，后来随着穆斯林的迁入，伊斯兰教学校也开始出现。在城市南郊