去的流言、璩美凤事件等一定会「万箭齐发、万箭穿心」，因而向璩美凤道歉，璩美凤得知后，落落大方表示「接受他的道歉」并公开祝福他的参选。2001年市长连任失利及璩美凤事件饱受争议之后，蔡仁坚便往返海崃两岸从事所喜爱的探讨新竹市文史与史蹟考察的工作，也曾在福建厦门大学兼课任教，过着「闭门读书、出门采风」的生活，但期间仍持续关心新竹市的政治，帮多组民进党候选人公开站台。并尝试参与许多台商投资中国案件，包含康定县的康定新城台商投资开发案、漳州现代农业投资环境说明暨庐江台湾农民创业园重点项目推介会、洛阳市纯凈水投资