新民府陆军第二十镇当兵，后被第二十镇统领张绍曾保送至奉天武备学堂。毕业后返回第20镇，任上尉参谋，与第二十镇四十协八十标三营管带冯玉祥为友，过从甚密。1911年，为响应武昌起义，石敬亭与第二十镇的冯玉祥、王金铭、施从云等军官，以及冯玉祥部下韩复榘、张之江、张树声、郑金声等人于滦州发动起义，推翻清朝，成立军政府。但事机不密，起义被清军王怀庆、曹锟等人镇压。石敬亭被革职遣散回京，隐居于京郊。
北洋时期.1913年，经第二十镇旧友介绍，石敬亭入绥远第12混成旅任参谋官，后历任营长、团