明亡时自杀。入清后与彭孙贻创立瞻社，为名流所重，时人称“武原二仲”。吴蕃昌曾将父亲吴麟征生前书信中的告诫加以摘录，编撰成《家诫要言》一书。蕃昌事嗣母至孝，顺治十二年（1655）正月，查氏逝世，蕃昌循古礼守丧，“水浆不入口四日”。不久，因持丧过礼而致疾，张履祥曾多次劝告吴蕃昌要照顾身体。顺治十三年，于守丧期间去世。