南王、西王与北王，设置大将军等官位，安抚百姓，俨然自成一国，且控有几乎全部的台湾中部与北台湾部分区域。入清以来，福建省本部向来靠台湾供应粮食，事件爆发后台湾白米价格大涨，演变为恶性通货膨胀，福建顿时陷入经济危机。于是，闽浙总督庆瑞紧急派遣福甯镇总兵曾玉明渡海来台，召集台勇平定战事，另外命台湾镇总兵林向荣自西螺出兵作战。另一方面，台湾府知府洪毓琛紧急成立筹防局应对事变，并向外国洋行筹借十五万两银作为军费，并承诺以关税抵还。
阿罩雾庄攻防战.4月28日，戴军南王林日成为了替