北京政府的活动.中华民国成立后，李鼎新留在北京政府的海军部，从参事一直升至海军参谋长。1912年（民国元年）10月，获授海军少将。12月，升任海军总司令，获授海军中将，驻扎上海。翌年，二次革命爆发，李鼎新奉袁世凯之命，击败了在上海起义的陈其美军。因立下军功，8月获加海军上将衔。1915年（民国4年）12月上旬，李鼎新下属的肇和舰策划反袁世凯的起义，获得有关情报察知此事的李鼎新成功镇压了起义，但事件引起了袁世凯的不满，12月21日袁世凯令海军总司令李鼎新褫职留任，并且褫夺其上将