路系统，也是全世界第一个投入商业营运的高速铁路系统，採用标准轨（1435mm）之轨距，均为纯客运服务。第一条路线是连结东京与大坂之间的东海道新干线，于东京奥运开幕前的1964年10月1日通车营运；经过多年扩展，目前有9条路线，其中包含2条路线较短的「迷你新干线」，将日本大多数的重要都市连结起来。最初由日本国有铁道研发与营运，国铁分割民营化后由JR集团接续，目前有JR北海道、JR东日本、JR东海、JR西日本、JR四国、JR九州等6家JR公司提供服务。新干线是以同时适合快速及大量运输而设计，因而其建造与营运