积极地结合在多脂肪的组织导致它具有极大的分佈体积及相当长的排除半衰期。胺碘酮经由肝脏代谢成主要活性代谢物去乙基胺碘酮（N-desethylamiodarone），它具有与原来化合物相当或更长的排除半衰期。它的活性代谢物广泛地蓄积在身体中，并可能在数个器官引起严重的不良反应。
不良影响.
肺部.胺碘酮毒性发生的机率与给药总剂量（每日给药剂量及服用期间）有关。肺毒性出现的型态可能为过敏性肺炎、间质性肺炎及肺泡炎、肺部纤维化，发生率约为10 %至17 %不等。