义上说燕京大学与其他中国教会学校的历史在1949年正式终止。另外，香港地区的香港校友会则成立中华基督教会燕京书院，以继承及发扬燕京大学之办学精神和传统。学校沿用「因真理，得自由，以服务」为校训。
校园.燕京大学原址即今天的北京大学校园。校园最初的基址是清朝三山五园的附属园林，包括漱春园、弘雅园（墨尔根园）（漱春园和弘雅园为明朝勺园的一部分），1921年自军阀陈树藩手中买入。后又陆续从载沣等人手中购入朗润园、蔚秀园、承泽园等园林（1949年后，原由徐世昌家族租用的镜春园、鸣鹤园并