传授五部大论。后他又入拉萨下密院学习《密咒金刚乘》。1697年，根登彭措赴更培山，获一世嘉木样活佛传授《金刚鬘密乘灌顶》。1699年春，任拉萨下密院翁则（领经师），期间再度到更培山，获一世嘉木样活佛传授《集密》、《胜乐》、《怖畏》灌顶，并传授《菩提道次第广论》。1706年，任下密院堪布。一世嘉木样活佛传授其《四家合注》十四章以后的部分，以及《集密》等佛教经典。1709年5月，一世嘉木样活佛奉西藏噶厦旨意，赴布达拉宫扎西郭巴寝宫讲经，根登彭措和藏王拉藏汗以及拉藏汗所立的达赖喇嘛益西嘉措共同听嘉木样活佛传授