部属浊水溪流域，主要河川有浊水溪支流水里溪及其支流水社尾溪、五城溪（合坑溪）、火焙溪、电子溪、头社溪、梅堰堤坑溪等，日月潭南侧一小部份地区则属于浊水溪另一支流益则坑溪流域。两大水系之间大致以三角崙、金龙山、猫囒山、番子田山、卜吉山、水社山为分水岭。日月潭位于本乡南部，原为台湾最大的天然湖泊。其流入的溪流既少又短，集水区仅比潭面略大，西北角有水社尾溪流出。日治时期为了兴建水力发电厂，一方面兴建水社坝截断水社尾溪，又兴建头社坝防止潭水溢入头社盆地；另一方面在浊水溪上游兴建武界坝拦截溪水，并开凿地下涵洞引水注