加实习，正式开始了海军军人生涯。宣统年间，他升任「宿」号鱼雷艇管带、海军副参领。辛亥革命爆发后，林建章到武汉镇压革命派。此后，目睹清朝陆军在汉阳残酷镇压军民后，林建章被激怒，遂唿应上海的革命派，举行起义。林建章乘「南深」号舰艇，同清朝军队作战。中华民国成立后的1913年（民国2年）1月，他被授予海军中校衔。8月升任海军上校。1917年（民国6年）8月，他被任命为巡洋舰「海容」号的舰长。
西伯利亚干涉.在俄国爆发十月革命以后，协约国对新生的苏维埃俄国宣战，同为协约国一员的北洋