不久蒋经国去世，李登辉接任总统，从此，台湾进入一个崭新的时代。1991年4月30日，中华民国政府宣佈废止动员戡乱时期临时条款，使得台澎金马单方面解除对大陆的积极军事对峙（即正式以成文方式宣告放弃反攻大陆政策）。之后，宪法多次增修后，1996年举行第一次总统公民直选，由中国国民党籍的原总统李登辉当选连任；2000年，中华民国第二次总统民选，由在野党民主进步党所推举的陈水扁当选，此次总统选举亦实现史上第一次的和平政党轮替。2005年，末代国民大会召开，宪法第七次增修。2008年，提出「不统、不独、不武」的中国国