成为淡水线铁路发车站。1908年（日明治41年）迁至第一代台北车站旧址，并且原地新建日式木造车站；1915年（日大正4年）8月17日改为货运站，客运由同日启用的淡水线北门乘降场接办；1937年（日昭和12年）12月1日纵贯线桦山货物驿（战后改称华山车站）落成后，大稻埕车站废止，货运由桦山接办。旧址南方今有台北捷运北门站，副站名为大稻埕南。