后退守泾阳。曹世英派人密约樊钟秀里应外合夺取泾阳，但因联络失败而未能成功。不久，胡景翼部张义安等人率部进攻西安，樊钟秀部被陈树藩调往西安援救。樊钟秀率部进驻西安后，受张义安鼓动而脱离陈树藩，加入靖国军。此后，樊钟秀部赴商州地区休整。1918年8月，于右任应邀回到陕西任陕西靖国军总司令，将靖国军编为六路，樊钟秀任第二路司令。陈树藩向北京政府求援，并以陕西省长一职作为诱饵，请刘镇华率镇嵩军进入陕西进行援救。同年四五月间，樊钟秀得知陈树藩在保定训练的一个旅将入驻潼关，遂接受了惠又光的建议，突袭潼关击溃了陈