3年APG II分类法将本科列为系属有待厘清的科，其目级分类地位未定。2004年的分子学研究证实原来分入大花草科的植物是多种起源的多系群，4个族都单独各列为一个“科”（大花草科、离花科、簇花草科、帽蕊草科）；同年的遗传学研究进一步显示本科应当包含在金虎尾目之中，获2009年的APG III分类法所承认。至APG IV，已确定离花科属葫芦目，簇花草科属锦葵目，帽蕊草科则属杜鹃花目。