文帝将他抄家，下入锦衣卫诏狱。朱棣发动靖难之变而即位，是为成祖，声称王宁“孝于太祖、忠于国家，刚正不阿”，封永春侯，给予世袭罔替铁券。王宁擅长诗歌，笃信佛教，据说时常劝成祖诵念佛经，打斋奉僧，为太祖朱元璋祈求冥福，成祖因此厌烦，逐渐讨厌王宁。后，王宁因事连坐下狱，虽然被赦免，但出狱不久即卒，王宁死后，明宣宗不承认其家的铁券，也不允许其子弟继承侯爵，只许让王家子弟担任羽林前卫佥事。
子.其有两子王贞亮和王贞庆，王贞亮，官至羽林前卫佥事，先于王宁而死；王贞庆为景泰十才子之一。