民政府对东北和新疆的主权，不支持中国共产党与新疆内部事务交换承认外蒙古独立。斯大林表面上同意此条件，将东突厥斯坦的领导人，从苏联潜回的艾力汗·吐列秘密解回苏联，但是对东突厥斯坦独立运动和中国共产党的援助依然源源不断。8、9月，在苏联协助下攻佔哈巴河县、布尔津县、承化县、拜城、阿克苏旧城、库尔干均纳入东突厥斯坦共和国版图。共击溃国军12个团2个营，俘虏前线最高指挥官郭岐、师长宛凌云在内的国军6,000多名政府官兵，确立伊犁、塔城、阿山全境为统治区。9月，国军新编第46师徐汝诚到达迪化前线，第八战区副司令郭寄峤