。偶而地牠会引致蜂窝组织炎、及关节感染。自从1990年开始，美国使用HiB结合型疫苗后，HiB病症的患病率减少至每十万名儿童有1.3名儿童感染。但是，HiB仍然是发展中国家引致婴儿及儿童下唿吸道疾病的主因。没有荚膜的流感嗜血桿菌会引致儿童的耳朵感染（如中耳炎）、眼睛感染（结膜炎）及鼻窦炎，并且联带肺炎。
与肺炎链球菌的相互关系.流感嗜血桿菌与肺炎链球菌都能在人类的上唿吸系统中发现。一项有关牠们之间的竞争研究指出，在培养基内，肺炎链球菌能以过氧化氢攻击流感嗜血桿菌及能排除在表面流感嗜