进了14辆车的情况下，运力最高只能达到4500人单向每小时。如果要达到广州地铁所宣称的运力，则需要继续增购列车，而增购了列车后，APM的总体投资将会远超21亿元人民币。
海心沙站.海心沙站在开通初期若乘客需要出站就必须购票进入海心沙公园，这种极不合理的蛮横设计和规划引发社会强烈不满。最后地铁方面让步，辟出一条非付费出站通道。直至2012年9月30日起海心沙公园免费开放之后才取消。
报站缺失粤语.2011年8月，有网民在微博上指海心沙站是唯一一个没有粤语报站