吸虫病、疟疾和性传播疾病在马达加斯加很常见，但艾滋病感染率与非洲大陆的许多国家相比还是比较低，只占成年人口的千分之二。疟疾死亡率为每10万人中有8.5人死亡，在非洲各国中属比例最低之列，这部分是因为岛上使用经杀虫剂处理过蚊帐的比例也是非洲最高的。另据世界卫生组织2011年4月公佈的数据显示，该国男性的预期寿命为64.9岁，女性68.1岁，男女平均寿命66.5岁，在全球排名第131。2017年，马达加斯加城市地区爆发腺鼠疫，造成74人死亡。
教育.19世纪前，马达加斯加没有正式的