大营被偷袭，匆忙撤军，张须陀领军回身追击，大破之。卢明月惨败，带领数百骑兵逃遁，其余人皆被俘虏。此战后，叔宝声名大噪，以勇气闻名于世。随后在海曲征讨孙宣雅，先登破之。以前后功，授建节尉。
瓦岗寨时期.616年跟随张须陀在荥阳讨伐李密瓦岗军，兵败，张须陀战死，秦琼领部下归附隋将裴仁基。裴仁基以武牢关投降李密，秦琼也随之归降，受到重用，被任用为帐内骠骑。李密与王世充决战失败后，秦琼和程知节、裴仁基等人投降王世充。
李唐时期.武德二年（619年），因不满王世充，