南部地区地势逐渐升高，过渡至危地马拉高地。北部地区则覆盖着密集的雨林。被雨林所覆盖的区域还包括今伯利兹，及墨西哥金塔纳罗奥州大部、坎佩切州南部、尤卡坦州南部；雨林以北地域的植被类型逐渐过渡为矮灌木丛。玛雅文明分布区域的最南端是索科努斯科沿岸地带，被恰帕斯马德雷山脉隔开，分布有狭长的沿海平原，北望则是马德雷山的山脚。玛雅文明的高地区域向东自墨西哥恰帕斯州延伸至今危地马拉境内，在库丘马塔内斯山脉达到其海拔最高峰。高地南部沿海岸分布有一系列的火山锥；高地的边界向北则延伸至今危地马拉的贝拉帕斯地区，地势朝东逐渐降低