005年6月，秦伯益以72岁的年龄退休，。
贡献.秦伯益曾主持研究成功神经性毒剂预防片（85号），获国家科技进步二等奖；主持研制的盐酸二氢埃托啡，是中国研制成功并获批准生产的第一个麻醉性镇痛药，获国家科技进步二等奖；进行了华南马尾杉活性单体新药福定碱的药理研究，发现其选择性真性胆碱酯酶抑制作用，获国家发明二等奖。主持“八五”国家科技攻关专题阿片类戒毒药物的研究，研制成防复吸药国产纳曲酮。1995年获光华科技奖一等奖。1998年荣获总后勤部“一代名师”称号。