是说，史迹中被认为特别重要者、被评价为日本文化之象征者为特别史迹。截至2014年3月18日，已有61件文物被指定为特别史迹。
指定基准的改正.为了适当保护近代的文化遗产，1995年（平成7年）3月6日时改正了指定基准，直到第二次世界大战终结时的政治、经济、文化、社会等各方面的重要的遗迹可成为史迹指定的对象。改正后之同年6月，原子弹爆炸圆顶屋被指定为史迹，以国内法之保护为前提，该史迹又登录于联合国教科文组织的世界遗产。
地方公共团体指定史迹.《》第182条第