障问题因为根本性解决，原本1942年3月瑞穗号还有入坞维修计画，但因为遭到击沉而不再需要。日美开战后，瑞穗号被编入比岛部队（攻占菲律宾编成的混合部队，水面舰部队以第三舰队为核心），搭载零式水上观测机12架、九四式水上侦察机3架。1942年1月4日在达沃市南方海湾的菲律宾南部攻佔舰队（妙高、那智、羽黒、长良、那珂、神通、千歳、瑞穂、平安丸、南海丸、雪风等）停泊集结之际，遭8架B-17轰炸机空袭，妙高号重巡洋舰因此中度毁损，瑞穗号则没有损失。1月9日瑞穗号与千岁号自集结泊地出发，一同开往印尼支援美娜多攻