市发展，上千座工厂在深圳侧建起，百万人口涌入原本只有30万人口的区域，污水和垃圾污染问题日益严重。自1995年起，深港两地开始着手治理深圳河，2000年后，深圳河历经3期河道治理，泄洪能力提高，深圳再未发生过大的洪涝灾害。「深圳河治理工程」由香港渠务署和深圳市水务局共同承担。基本分为三期，主要目标是改善香港北区每逢雨季的水浸情况，其次是改善水质。第一、二及三期工程分别于1997年、2000年及2006年完成，前三期将原有长约18公里的深圳河拉直、扩阔和挖深为13.5公里的新河道，大幅度地提高了从平原河