徒时期的教会生活，效法圣经中初期教会的榜样，提出一地只能存在一个教会的地方教会原则，亦公开谴责宗派的罪恶，自然造成各宗派团体对他的反感，批评这是属灵上的骄傲。倪柝声亦主张恢复圣经中信徒皆祭司的理念，谴责包括牧师在内的圣品制度，认为是天主教遗毒，领薪的牧师不符合圣经，提倡全体信徒全体事奉，传福音、祷告，重视信徒的造就，提倡分区家庭聚会。到1948年，倪柝声以“耶路撒冷教会模式”取替过去的“安提阿教会模式”，并且对他的若干重要教会观念作了修定。倪柝声这个时期的思想主要见于《教会的事务》、《教会的正统》、