围湖造田，增加农地，并在千代川左岸建设专用灌溉的大井，着手桑、楮等树林育成，政绩颇丰，当地居民留有龟井堤、龟井笠、龟井踊等名称纪念他。而在内政之外，龟井兹矩于1607年（庆长十二年）、1609年（庆长十四年）、1610年（庆长十五年）三度加入江户幕府的朱印船贸易派遣通商船只与暹罗往来交易，採用通过贸易得来的明橹、朝鲜橹兴建城馆，还在城下设建供奉山中鹿之介的幸盛寺已示不忘旧恩义。龟井兹矩最后于1610年（庆长十五年）在鹿野城病逝，法名中山道月大居士。1912年（明治45年）2月26日赠从三位。