入濒危保护动物名单，属于A类（濒危）保护级别；并且只在若干自然保护区内仍有分布。在危地马拉，墨西哥毒蜥也受国家法律保护，其部分栖息地被划为了自然保护区；这些保护区在CITES（濒危野生动植物物种国际贸易公约）的附录Ⅱ中列出。目前，有不到200只危地马拉珠毒蜥栖息在莫塔瓜河谷的（热带和亚热带落叶阔叶林）中，由于当地人的捕杀以及开垦农田导致它们的栖息地被破坏，这种蜥蜴濒临灭绝。 目前，美国大自然保护协会及其合作伙伴 ZOOTROPIC、CONAP、国际爬行动物保护基金会、、以及圣迭戈动物园已经联合启动了一项