分别是台湾长鬃山羊、台湾水鹿、台湾山羌、白鼻心和台湾猕猴，其它4种发现则为非保育类动物，分别是台湾野猪、大赤鼯鼠、白面鼯鼠和赤腹松鼠。鸟类有蓝腹鷴、大冠鹫、小剪尾、深山竹鸡、冠羽画眉、白耳画眉、青背山雀、红头山雀、红山椒鸟、铅色水鸫、帝雉、朱鹂、薮鸟、黄鱼鸮和台湾紫啸鸫等15种保育类，其中因为瓦拉米地区的林相，遮蔽性足够，在甚少人为干扰下，已经有蓝腹鷴、帝雉、 黄鱼鸮在此栖息。王颖曾在1992年至1994年间对瓦拉米地区做过调查，山猪、飞鼠、台湾猕猴和台湾长鬃山羊都是常见的动物，而且有台湾黑熊、棕簑猫在