即已开始建造。飞鸟时代为日本律令制度逐渐发展完备的时代，飞鸟净御原令、大宝律令等国家基本法陆续颁布，效仿中国以壮丽的宫殿及都城来彰显天皇的权威是必要的，藤原京因此成为日本最初的大型中国风都城。藤原京自启用开始，经历持统、文武、元明三代，708年（和铜元年）元明天皇下令迁都，710年（和铜3年）迁都平城京，藤原京作为都城的地位因此结束。按《扶桑略记》的记载，藤原宫于迁都翌年烧毁。
名称.「藤原京」乃近代所使用的学术用语，《日本书纪》将藤原京称为「新益京」；而皇宫宫则称为「藤原