法国、哈布斯堡王朝和教皇国)之间许多的战事，慈运理选择站在罗马这一边。作为回报，教皇朱利叶斯二世奖励慈运理，通过提供年度退休金给他。慈运理以随军神父的身分，参与了在义大利的几次战争，包括1513年。然而，瑞士邦联在马里尼亚诺战役中遭受决定性的失败，导致格拉鲁斯的立场开始从支持教皇国倒向法国。属于教皇党的慈运理因此处境尴尬，决定撤退到施维茨的艾因西德伦。这时的慈运理已经开始相信唯利是图的服事是不道德的，且对于未来的任何事，瑞士的团结是必须的。现存他最早的一些着作，例如《牛》（1510）和《迷宫》（1516），