众不可能在短期内撤出，宣布马尼拉为无防备都市，并将司令部撤往碧瑶，下令部队撤出马尼拉；但以海军少将为首的拒绝服从，此外陆军的3个大队也拒绝撤出马尼拉。结果日军仍有14,300名陆海军官兵仍在马尼拉市内，以及700,000来不及撤出的菲律宾平民。在马尼拉战役期间，美军强攻马尼拉，日军对平民的屠杀达到高峰；直到2月23日美军夺回，据知死亡的菲律宾人总数达100,000人以上，平均每天有3,000人遇害。死亡的100,000人中，哪些是日军直接屠杀的、哪些是双方交火中死亡，已难以判定，因为美军的炮火同样把街道