然别属于JR北海道本社（札幌总部）的直辖范围，站内设置有小型站房，并由余市车站代管。然别的车站名称源自于当地的地名，也就是爱奴语中的「si-kari-pet」，意指「圆形的河川/回旋的河川」。
车站构造.对向式月台2面2线的地面车站。此站是余市站管理的无人站，备有小型的。