治地位的蒙古盟、旗或西藏基巧、宗，与新设治之府（道）、县相参杂，为使两套不同的行政体系相容而设置特别行政区，以因应当地蒙（藏）族与汉人之关系。国民党北伐后，认为孙中山遗教里并未提到特别区之设置，于是将上述各地皆改制为省，即察哈尔省、绥远省、热河省、西康省（川边特别区）。此后特别行政区被视为「准省」，定位变成建省前置作业之建制。依此准则设立的第一个特别行政区为海南特别行政区，辖区为海南岛与南海诸岛。海南岛于1950年因内战失守后，海南特别行政区不复存在，但中华民国政府仍将海南特别行政区列入行政区序列之中，