防锈及防蚀。工业上会使用不同氧化态的锰离子当作不同颜色的染料。含有硷金属或硷土族离子的过锰酸盐类是强氧化剂。在碳锌电池及硷性电池中，二氧化锰会被当作阴极使用。 在生物学中，锰离子可在多种的酵素中担任辅因子的角色。锰酵素对组织中超氧自由基的解毒，清除元素态氧原子非常重要。锰也会在光合植物的氧释放复合体中作用。虽然目前已知所有的有机生命体皆需要微量的锰，但其过量却会变成神经毒素。尤其过度吸入可以导致锰中毒，有时会造成不可逆的神经危害。
对人体的影响.和其他较普遍的金属相比，锰的毒性较低