计画结束，航发改制，中科院内有关航空工程的第一研究所实际上处于研发能量闲置状态，当时也缺乏后续研发计画，中科院开始了研发无人飞行载具的工程，外界得知中科院开发无人机的讯息则是在1999年9月3日由军闻社发佈中科院「中翔无人机」坠机之新闻，命名者为当时的副总统连战。但除了航空所外，同时间负责飞行控制的第三研究所(资通所)也在经济部的军民通用科技研发计画中制造了「天隼系列无人机」，且在1998年底试飞。由此可见在当时没有详细的工作分配让两个不同单位作同类装备的开发，中科院内对于开发UAV一案横向连结相当混乱，也