方击败关东管领，从而获得公方赏赐其下妻作为领地，并且开始兴建下妻城，最初多贺谷氏臣属于结城氏，后来自立后屡次与旧主交战，并且周旋于小田氏和佐竹氏等关东大名之间，其后后北条氏势力在关东取得优势后，多贺谷氏亦一度臣属，可是上杉氏来袭时却又背叛后北条氏，及至丰臣秀吉发动小田原征伐时，多贺谷氏亦协助丰臣氏消灭旧主后北条氏。虽然下妻城在整个战国时代未曾被其他势力攻佔，但是由于多贺谷氏在关原之战时属于战败的西军一员，因而被胜者德川氏没收所有领地，下妻城亦随之拆毁。进入江户时代后，水户松平家和等亲藩大名或谱代大名均先后入