民营公司股东则是日本货物铁道。这10个股东分别为：
命名、企业识别标志和吉祥物.肥萨橙铁道的公司名称全都取材于沿线当地的风土民情，其中「肥」与「萨」分别代表附近地区的古代国名——肥后国与萨摩国——的首字，再加上沿线与风光明媚的海岸线连在一起的蜜柑等柑橘类水果产地，组合成非常具有地方味道的公司命名。至于由建筑家川西康之所设计的企业识别标志，则是以两个zh-hans:橙;zh-hk:橙;zh-tw:柳橙;排成像是火车车轮般的形状作为基础，中间的叶子则是依照沿线各车站的位置排