而本国籍神父也逐渐接手教务。今日台湾的天主教会，共分成七个教区、一个宗座署理区、主教十七位，其中包括单国玺枢机的这些主教，均由教宗所敕封。另外，台湾天主教会辖下还有神父修女共两千位，分别在八百个教堂及社会事业，包括大学（辅大、静宜、文藻）、医院、地方诊所、安老院、启智中心等处所服务。台湾天主教信徒虽仅佔台湾人口约百分之一余(根据2010年天主教官方报告有会堂718间，会友239,565人，无崇拜人数)，但其社会服务事业却极为有名。
基督新教.
台湾基督长老教