台湾北部观音山与大屯山地质的延伸。岛屿上则分别有4条主要溪流，包括位于岛屿东北部的龙头溪、位于岛屿北部的双溪、位于岛屿西部的西溪以及位于岛屿西北部的小西溪。另外在重要的港湾部分则分别有西部的顺风港和南部的汇鱼湾、钓南锚地，重要的海岬则有北钓角、东钓角、西钓角、南钓角，南边还有两个半岛分别是东龙尾和西龙尾，并且整个岛屿有11多公里的珊瑚礁海岸线围绕着。
生态环境.钓鱼台岛上基岩裸露、土层较薄，但是岛屿内仍然有溪流提供淡水，而附近海域也有大量鱼群栖息。其中为了适应钓鱼台位于海上强风的自