，借调出任环保署副署长，于2003年10月底真除署长一职。2003年10月到2005年4月第七任行政院环境保护署署长。2005年离任后，返成大任环工系教授。张祖恩出身于大家庭，兄弟姊妹连他共十人。妻子是中医师，在台南开业，育有一子一女，分别曾在美国和英国求学。