合胡格诺派，公推国王之弟阿朗松公爵─法兰索瓦为名义领袖，实际主导者为蒙莫朗西家族），亨利採取行动镇压、逮捕怨言派，但当发现吉斯公爵亨利的势力崛起后，他发布「大亲王和约」（给予新教徒部分特权）暂时化解（或延后）了新旧教对立。但吉斯公爵组成了天主教激进派的神圣联盟，一时间声势浩大，亨利于是在1577年取消胡格诺派的一些特权，但天主教的神圣联盟也被解散，部分提升了衰落的王权，并使法国得到七年的安定期与势力平衡，说明他有相当高的政治手腕和权术。然而，1584年亨利三世的弟弟和继承人、安茹和阿朗松公爵法兰索瓦去世