18年（唐武德元年），王世充乘势袭击瓦岗军，败瓦岗军数员骁将。李密得知后留王伯当守金墉城，亲自率军出征，屯兵于偃师。裴仁基建议李密偷袭东都，但李密不听。王世充与李密之军战于偃师，王世充大破李密，瓦岗军的裴仁基、祖君彦、程知节等被王世充所擒，邴元真、单雄信等人久不满李密，相继投降王世充。瓦岗军遭到重创，李密与王伯当等将领，率余众二万西走长安，投降唐主李渊。李渊大喜，拜李密为光禄卿，封邢国公，还将表妹独孤氏嫁给了李密，称唿李密为弟。但李密不甘居于人下，对自己的处境非常不满。同年年底，李渊派李密去黎阳安抚