1960年毕业于北京大学物理系。在中国科学技术大学任教，1985年升任教授，1991至1995年间担任该校天体物理中心主任。1997年开始担任中国科学院宇宙线和高能天体物理开放实验室学术委员会副主任。周又元还曾担任过中国科学院国家天文台研究员，中国天文学会常务理事、星系和宇宙专业委员会主任、教育工作委员会主任。