约540公里时，对巴士海崃、台湾东南部（含绿岛、兰屿海面）及台湾东北部海面发布海上台风警报。气象局表示沿海地区会有长浪，另外受尼莎的外围环流影响，恆春半岛、台湾东半部及西南部沿海地区有长浪发生。下午2时半，当尼莎移至花莲的东南方约510公里时，气象局对花东地区（包含兰屿及绿岛）发布陆上台风警报。晚间气象局将陆上警报范围扩大至中部及南部地区，更在隔天（29日）上午把陆警范围扩大至台湾本岛与澎湖群岛，东半部地区在下午停班停课，下午6时后台湾本岛各地区停班停课在台风登陆前，屏东沿海降下时雨量破百的暴雨，造成了淹水