此后，清廷允许波密地方仅向噶厦交付酥油差。自嘉庆年起，波密土王共历七代：历代土王并非都是父子相传，如白马策旺为索南央坚之入赘女婿，旺钦顿堆亦为白马策旺之赘婿。
灭亡.清末，波密部众经常剽掠过往商旅，并与川军发生冲突。“同治年间及光绪五、六年皆屡次投诚，屡次背叛。自恃地险民悍，不时出剿抢劫，焚杀重案，无岁无之。”宣统二年（1910年），驻藏大臣联豫派协统钟颖率驻藏新军征讨波密。然而钟颖是皇亲，素无指挥之才，驻藏新军又无实战经验，故兵败于东久（在今林芝县）。联豫遂起用左参