紧张，朱启明只好重返城工部。1948年3月底，中共中央华北局城工部学委负责人孙国良通知朱启明，已经批准其重新加入中国共产党，介绍人为刘仁。孙国良还称，之所以不是恢复党籍而是重新入党，是因为重新入党比较快，便于及早投入工作，过去的党龄则不再计算。中华人民共和国成立后，朱启明任中共北京市委政策研究室组长。1964年，任北京市商业局副局长。文化大革命爆发后，随着彭真领导的原中共北京市委倒台，朱启明也遭到批斗，被打成受“彭真反革命修正主义集团”重用的“日伪特务”，又有的说是受到刘仁网罗的“美蒋特务”，受到迫害。