元整，悉数由台湾省政府公路局补贴。1995年6月20日，跨海大桥中段、架设吼门水域上120根樑柱安装完成，西屿端和白沙端的桥樑正式连结；同年10月，则进行旧桥的拆除工程。1996年元月，第二代跨海大桥大抵落成。1996年3月14日，时任中华民国总统李登辉（1923年－2020年）亲赴澎湖，主持通车典礼，第二代跨海大桥正式通车。
影响.
航运没落.民国50年代之前（约1960年代），西屿、马公之间长期倚赖船运（含军船），跨海大桥完工后渐渐不敌陆运竞争，例如竹