越前国的政治中心便往北移至现今福井市的位置。16世纪织田信长消灭朝仓氏后，将此地的龙门寺城交朝仓氏旧臣富田长繁，不过因为富田长繁与掌管一乘谷城的朝仓氏旧臣前波吉继之间的纷争，引起了越前一向一揆，在织田信长重新出兵平定越前国后，一度将此地交给被称为府中三人众的不破光治、佐佐成政和前田利家共同治理。江户时代后，本地大部分区域都是福井藩的领地，并交由家老本多氏经营位于此地的府中领，另有少部分区域属于、、、大野藩、小滨藩、旗本领及幕府直属领地，幕府也在本地设有本保阵屋负责管理整个越前国的幕府直属领和旗本领；