们头骨结构、嵴椎骨与脂质构造的不同，在1970年代早期宣布这两个族群是不同的物种。现代基因测序技术对这一分类提出了质疑，在1998年时又恢复为1970年以前的分类方式，即认为恆河与印度河的恆河豚族群并非两个不同的物种，而是同一物种下的两个亚种。线粒体 DNA分析表明，这两个亚种约在55万年前从一个共同祖先分化而来，该祖先被认为是一种海生的恒河豚类，生活在中新世中期海平面上升期间的南亚近岸海域。
形态特征.恆河豚体呈棕灰色，背鳍小而呈三角形，鳍肢和尾鳍较大。具有狭长的嘴喙，即使