入境的乘客只能利用过境穿梭巴士出入境。经港珠澳大桥出入境的乘客只能利用过境穿梭巴士出入境。经深圳湾出入境的乘客可乘城巴B3、B3A或B3X以及屿巴B2或B2P来往屯门、天水围及元朗。经港铁东铁线落马洲站出入境的乘客可乘九巴B1往来元朗。经港铁东涌线欣澳站转港珠澳大桥管制站出入境的乘客可乘城巴B5往来欣澳。港珠澳大桥转车站设有以下巴士路线：
专线小巴.落马洲转车站设有以下新界小巴路线：港珠澳大桥设有新界小巴路线901往来迎东邨，深圳湾设有新界小巴路线618往来