1849年，日本第一所制铁工场落成，1855年建成后，派遣藩士学习。而佐贺藩对于幕府不稳的形势处于旁观的态度，直到表明支持反乱军才正式出兵。当明治政府成立时，不少藩士被新政府录用，包括了副岛种臣、江藤新平、大隈重信、、佐野常民等，因此与萨摩藩、土佐藩及长州藩合称「萨长土肥」。1871年因废藩置县的关系，成为了佐贺县。1884年藩主成为了华族中的侯爵。
藩政.佐贺藩虽然表面上是35万石大名，但是当中有部份领地石高为支藩（下文详述）和庶流家所有，而（多久、武雄、谏早、须古）也拥有其