楼阁状建筑，一楼是延续了当初藤原时代样貌的「法水院」（属寝殿造风格，也就是平安时代的贵族建筑风），二楼是鎌仓时期的「潮音洞」（一种武家造，意指武士建筑风格），三楼则为中国（唐朝）风格的「究竟顶」（属禅宗佛殿建筑）。寺顶有宝塔状的结构，顶端有只象征吉祥的金凤凰装饰。三种不同时代不同的风格，却能在一栋建筑物上调和完美，是金阁寺之所以受到推崇的原因，除此之外，效仿自衣笠山的池泉回游式庭园里有许多风格别致的日式造景，让它成为室町时代最具代表性的名园。
文学中的金阁寺.除了是一间寺庙外