全体僧众站在策墨林一边。当时策墨林寺遭到一定程度破坏。直至今日，策墨林仍归属色拉寺。策墨林寺主体建筑原来分为红宫和白宫，白宫为第一世策墨林活佛兴建，红宫由第二世策墨林活佛兴建。此外还设有拉章和策墨林活佛的夏宫，夏宫和寺庙中间为一片规模较大的林卡。文化大革命之后，策默林寺获得重建，但重建的只占原来寺院建筑的一部分，其他殿堂仍被民居、小工厂等占据。由于策墨林寺在教规上隶属色拉寺麦扎仓，所以除供奉释迦牟尼、宗喀巴、历代策墨林活佛像之外，也供奉有色拉寺麦扎仓的主供护法“塔乌”。殿内左侧的长条形配殿供奉不动佛等等