同时也于1998年至2000年之间担任该系第九任系主任的工作。
社会运动及政治参与.
决定加入民进党.在专业生涯之外，刘俊秀也一直对社会和政治运动十分关心。1990年12月9日，主张「政治民主」、「学术自由」、「社会正义」、「文化提昇」、以及「环境保护」的「台湾教授协会」在台北宣布成立，刘俊秀不但是创会会员，同时也当选为该会的执行委员会委员（台湾教授协会 2009）。1991年，法务部调查局侦办之「独台会案」发生，调查局干员在未通知校方的情况下，于5月