然而据庵野导演所言：“当这些符号混合在一起时，第一次出现了某种相互关系或意义之类的东西”。剧情结合了密宗元素和的犹太卡巴拉神秘主义，例如使徒就与宗教传统的天使，如萨基尔、圣德芬和有许多共同的特征。据解释，《EVA》中还包含了大量来自神道教的经文如《古事记》和《日本书纪》的典故。故事背景也参考了神道教视角对原始宇宙的描述，而神道神话中神祇伊邪那岐与伊邪那美的长矛被用作EVA同使徒作战时使用的武器。犹太基督教传统的元素也充斥于整部动画中，其中包括亚当、莉莉斯、夏娃、朗基努斯之枪、死海古卷以及卡巴拉的生命之树