基祖邓洪仪长子邓钦为其继母黄氏建立，名为「凌云静室」，是香港三大古剎之一，与灵渡寺和青山禅院齐名，亦是香港唯一的女众丛林佛学院。
历史.清朝道光二年（1822年）涤尘法师重修「凌云静室」，更名为「凌云寺」。释圆光和释净园相继出任住持。因后继乏人，致使门庭破落，凌云寺归乡绅邓伯裘管理，并将之辟作休憩场所。1901年，妙参法师应黄慧清居士等之邀请来香港，游至观音山，见寺门已荒凉，于是会同徒众稍事修葺，并劝使邓伯裘改奉佛教，更使乡人捐出寺院土地，又募捐重修寺门，于寺侧建禅堂大楼，于山