对Linux、BSD等操作系统设计编写的，用户可以通过选择窗口管理器更改电脑的图形用户界面外观和使用方式。对于微软Windows操作系统而言，用户可以选择利用替代壳程式的软件来修改图形用户界面。例如，LiteStep可用以修改Windows 95、98或NT的用户界面，让其拥有Afterstep类的风格。OS/2的默认壳层是Presentation Manager，但是第三方可以提供替代品。macOS使用苹果自行研发的窗口管理器。
分类.窗口管理器根据管理窗口的方式不同，