名为「教理学校」（Colegio de la Doctrina）寄宿，跟他一起生活都是孤儿或贫苦的孩童，并一起学习读书和写字。这是他第一次亲尝正规学习的滋味。根据若望的兄长所说，若望在这所学校度过了数天之后，他已学会了读和写。与此同时，若望决定在附近的奥斯定会作为一名辅祭为那里的修女们服务。 长大后，若望在一家医院工作，并于1559年至1563年间在一所耶稣会学校学习人文学科。那时耶稣会还是新兴修会，几年前刚由圣依纳爵·罗耀拉创立。于1563年 ，若望加入了加尔默罗会，取会名圣玛蒂亚·若望。圣玛蒂亚·若