祖欣赏朴彭年的才华，承诺若是朴彭年承认自己的王位合法，便要赦免他。朴彭年拒绝向世祖称臣，在写给世祖的书信中，故意将「臣」字用「巨」字替换。世祖大怒，将其下狱拷打。他在狱中被折磨而死，尸体被世祖下令车裂，枭首示众。夷其族，籍没家产，妻女赐给大臣为奴婢。肃宗在位的时候，追赠谥号忠正。