生态区，和区内的生物已被人类活动和外来物种所威胁。联邦《1999年环境保护和生物多样性保育法案》是保护濒危物种的根本法律。基于“生物多样性行动计划”，设立了许多受保护地区以保育独特的生态系统；64个湿地根据《湿地公约》而登记；另有16个世界遗产。“环境可持续指数”公佈于2005年，澳洲在2006年排名全球第13。澳洲多数木本植物是常绿的，且很能适应火灾和干旱，例如桉树和金合欢。但近十年来，由于干旱恶化，东岸地区屡次发生森林大火；2009年，东岸地区的森林和部分民宅受到有史以来最严重的火灾侵袭，史称2009