花园、三号干线西九龙公路、青衣岛（连带马湾、大屿山与赤鱲角）、鸭脷洲和大部分新发展的新市镇区域（例如四顺地区除顺利邨道与新清水湾道外所有道路、上葵涌东部公共屋邨（石篱邨、石荫邨与安荫邨）之内街、天水围全域、将军澳全域（后来开放翠琳、宝琳北路及宝宁路）及马鞍山全域）均禁止红色小巴驶入。红色小巴的服务路线、服务时间、班次和收费不固定和不受政府监管；虽然如此，随着行业发展，不少红色小巴路线已由有社团背景的商会或小型公司管理，有固定的路线、服务时间、班次和收费，但会因应各种情况而作出更改，例如堵车时可以转用较畅通的