，外地官员争相贿赂，邵基一概严拒不受。雍正九年，升迁户科给事中，雍正帝并命他在上书房行走。雍正四年，升迁任国子监祭酒，在国子监立教术五条，勉励学生端正学习态度。后历任右通政使、左佥都御史，并仍兼任国子监祭酒。雍正九年至十年，任鸿胪寺少卿。雍正十年，转任光禄寺少卿，并任通政司右参议、江西乡试正考官、通政司左参议、右通政史。雍正十一年，任经筵讲官。雍正十二年，升迁任左、右副都御史。并擢升任吏部侍郎。不久后，兼任翰林院掌院学士。雍正十三年，任皇清文颖馆副总裁、江南乡试正考官、吏部左侍郎、翰林院掌院学士、兵部右侍郎