尽管当局原先希望能同时进行修复作业、同时维持限度营运，但考量到施工期间的扬尘会干扰列车，因此放弃了这种方案，改而决定封闭车站和隧道，才完成车站的恢复。1995年10月起，腓特烈大街车站的地面建筑和高架站体实施了全面翻新，至1999年9月时宣告完成，德国铁路总共为车站改造工程挹注了2亿2千万马克的经费，车站建筑的正面也铺上了陶瓦色的，以往仅有石灰粉刷的南侧外墙也在1999年透过这次彻底的改头换面，顺势砌上了同样的砖块，并在入口处采用玻璃檐棚。与此同时，腓特烈大街车站还增设了内附电梯的地铁站联络通道，佔地约