日，西康省政府委员兼主席刘文辉违抗命令，应予撤职；所有违抗命令情节，着由西南军政长官顾祝同查明呈候核办。
晚年.1950年3月，赴台兼任代国防部长。1954年，晋任陆军一级上将。1959年6月，蒋介石以顾祝同为国防会议秘书长，彭孟缉为参谋总长，罗列为陆军总司令。1967年，调战略顾问委员会副主任。1972年，任总统府战略顾问。1987年，病逝台北，享耆寿94岁。
亲属.顾祝同共有子女十人：其侄儿顾安生，为台湾知名新闻及电视工作者，曾长期担任台视晚间新闻