2号线C出口和5号线B出口为同一出口。2016年8月，针对持续近9年的出入口重复编号问题，北京地铁将雍和宫站5号线原A口（西北口）改为E口、原B口改为C口、原C口（东南口）改为F口、原D口（西南口）改为G口。
封站.由于每年农历正月初一均有大量人员前往雍和宫上香，雍和宫站在每年正月初一首班车起至当天下午封站，雍和宫大街南端的北新桥站也会封闭其A、B口。