购或者共享方式购买不同的是，《毁灭战士II》的完全版作为商业品在软件店内销售。
故事主线.《毁灭战士II》的故事紧接着前作展开，玩家扮演的战士于前作中在火卫一进行了殊死搏斗，并且摧毁了火卫二和整个地狱后回到地球，发现自己沦为了外星人侵略的受害者。本作中玩家被再次带到了一个无名的火星空间内（该处在《毁灭战士》小说内被称为「Flynn Taggart」），并再次需要杀出血路逃离这个地狱。玩家将会在全三维的关卡中穿行（不包括两个秘密关卡），在途中玩家会知道所有地球劫后余生的人们都被收