镇帕巴寺附近举行和谈，中方代表在廓尔喀侵略军的武力胁迫下，在不平等条约上签字。1791年，廓尔喀人在聂拉木“雪康”大楼（如今该楼尚存墙基）以和谈为名，杀害西藏噶厦官员代表及随从，并且绑押了西藏方面两名官员送往廓尔喀首都加德满都关押。当年，廓尔喀侵略军进攻定日协格尔寺遭到顽强抵抗，不得不转而进攻日喀则。1792年，清朝的将军福康安奉命率领1700多人开至前线同藏军共同作战，将廓尔喀侵略军全部驱逐出西藏，全部收复被廓尔喀军队占领的聂拉木等地。文化大革命时期，该寺被毁灭，1985年修复。到1990年代，有殿堂