奴隶宣言》，以及在战争中动用黑奴参军的做法。第37届联邦国会闭幕后，克里滕登返回肯塔基州，他的身体健康开始衰退，经常感到气短和胸痛。他本已决定从国会退休，但朋友们再次说服他竞选连任。获提名后不久，克里滕登在路易维尔病倒，然后与夫人前去印第安纳州的一处矾泉，以期改善自己每况愈下的身体状况。他在当地一位医生的家里卧病在床，过了些时日才再度返回法兰克福。1863年7月26日，约翰·乔丹·克里滕登在法兰克福逝世，终年75岁，身后遗骨下葬在当地州立公墓。他的其他亲属中的军政人物还包括北军准将托马斯·图尔平·克里滕