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分类历史.在1923年，古生物学家法兰兹·诺普乔（Franz Nopcsa）建立波波龙超科、波波龙科分类单元，当时仅包含波波龙属，当时被认为是种三叠纪的兽脚亚目恐龙。之后，波波龙曾被多次归类于不同分类位置，包含：蜥臀目、兽脚亚目、肉食龙下目。直到1970年代，发现更完整的波波龙化石，才显示波波龙属于伪鳄类，而非恐龙。近年被命名的岩鳄、苏牟龙也被认为是波波龙的近亲。苏牟龙最初也曾被认为是三叠纪的兽脚类恐龙，如同波波龙。在1995年，萨克·查特吉（Sankar Chatter