无力修复，于1828年以7,400银元将一半权利卖给板桥林家「林本源」号。隔年又再连续豪雨破坏水圳，只好再以4200银元卖出剩下权利。瑠公费半生心血的水圳，在通水五、六十年后即全被他人掌控。此后部份水圳权益交易频仍，但一直由板桥林家掌握绝大多数。台湾总督府于 1901 年颁布〈台湾公共埤圳规则〉。瑠公圳也就因此与雾里薛圳、大坪林圳一起被公告为与公共利益有关的「公共埤圳」，受官方监督。到了1907年，更与上埤一起併入受「瑠公水利组合」 (今「瑠公农田水利会」) 管理。到 1910 年，又加入柴头埤、双连埤