2006年并非失望的一年，全北现代队夺下俱乐部历史上第一座亚足联冠军联赛冠军，他们在决赛击败叙利亚的霍姆斯高贵，全北现代队是韩国职业足球联赛第5个获得此项殊荣的俱乐部。全北现代队在晋级过程之中击败了许多亚洲强队，包括小组赛日本以及中国的联赛冠军，分别是大坂飞脚与大连实德，他们在小组赛中与大连实德，大坂飞脚，岘港SHB分在一个小组，第一轮主场在两度落后情况下3-2逆转战胜大坂飞脚，尽管第二轮客场0-1不敌大连实德，而后第三轮主场3-0击败岘港SHB，第四轮客场1-0击败岘港SHB，关键的第五轮客场1-1追平大