年6月30日出任当时新成立的环境食物局局长，任内工作包括推行全港性的废物回收计划，及处理当时香港禽流感。2002年7月1日前香港特首董建华开始实行高官问责制当日提早退休，离开公务员队伍。其后环境食物局亦被分拆到另外两个决策局—卫生福利及食物局和环境运输及工务局。
动态.2006年9月23日陈方安生召开记者会，宣布她筹组的政制核心小组成员名单，任关佩英是其中之一。2019年6月23日，任关佩英等前高官发起联署致函行政长官林郑月娥，促请立即撤回《逃犯条例》修订建议及成立独立调查