仲图曾在3月6日与议长彭清靠、凃光明与苓雅区长林界台湾电力公司高雄办事处主任李佛续等人前往寿山的要塞司令部，会见要塞司令彭孟缉，希望禁止巡逻队再射击民众。然而却全数遭到逮捕，只有李佛续、黄仲图、彭清靠三人获释下山。其他人先后遇害。同年6月，受聘为国立台湾大学外文系副教授，教授日文，并出任系主任。8月，黄强接任高雄市长。1950年，黄仲图卸下系主任职务，任台湾大学总务长，直到1953年卸任。1958年，升任教授。1976年，自台湾大学退休。1988年去世。