与基因组不同的是：不考虑突变，在固定给定细胞株的基因组数量基本上是不变的；然而，转录物组可以随外部环境条件而有所转变。由于转录物组包括了所有在细胞里的mRNA的转录 ，除却异常的mRNA降解现象（例如转录衰减）以外，转录组反映了在任何给定时间内活跃表达的基因。转录物组学的研究，也被称为“基因表达谱”，检测了在一个特定的细胞群内的mRNA表达水平，通常採用基于DNA微阵列技术的高通量技术。透过使用新一代测序技术来研究在核苷酸水平的转录物组，被称为“RNA测序（RNA-Seq）”。
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