1928年3月16日辞行政职，林语堂接教务长。蔡元培主国民政府大学院，他做秘书长；蔡元培主中央研究院，他做秘书处主任。
事绩.1913年，与鲁迅、钱稻孙代表教育部，做读音统一会会员，参与审定国语字音，会上与马裕藻、朱希祖、钱稻孙、周树人共同提议（鲁迅起草议案）「统一读音，不过改良反切，故以合于双声叠韵的简笔汉字最为适用」，将会中审定字音暂用的『记音字母』正式通过为『注音字母』；此套字母大致从章炳麟创始，为『取古文篆籀径省之形』的简笔汉字。（国立台湾师范大学，国音教材编辑委员