后，她实际上是摄政王，支持诺切拉公爵，反对首相加斯帕尔·德古斯曼公爵，成功在1643年推倒加斯帕尔。另外面对当时严重的财政问题与军队无饷，她曾用自己的珠宝为军队提供资金。总体上说，伊丽莎白以其美丽、智慧和高贵的个性而闻名，深得西班牙人民的欢迎。她酷爱戏剧，甚至亲自参与宫廷戏剧的演出。1644年10月6日在马德里逝世，遗体埋葬在埃斯科里亚尔修道院。她的女儿玛丽-泰蕾兹后来成为了路易十四的第一任妻；曾孙安茹公爵成为了国王费利佩五世。在她逝世后，丈夫腓力四世迎娶了奥地利的玛丽亚纳，即下一任西班牙王后。