多数患者的严重症状持续数周至六个月。其中 15 至 50％ 患者的关节炎会反覆发作。慢性关节炎或荐肠关节炎患者占其中的 15-30%。延续多年的反覆发作很常见，最终病情有时会转变为慢性且破坏关节的关节炎、心血管疾病、类淀粉沈积症、僵直性嵴椎炎、IgA肾病变、心脏传导异常或合併。然而，大多数反应性关节炎患者的预期寿命与一般人相近，且适度调整生活以保护受影响的器官，尚能维持接近正常的生活方式。
流行病学.由于女性的诊断可能被低估，反应性关节炎正确发生率难以估计。以下数个已完成的研究可