790年），吐蕃攻占庭州，北庭大都护府遂废。目前，北庭都护府遗址仍存，为全国重点文物保护单位。
行政区划.全盛时期，北庭都护府下辖金满、轮台、蒲类三县；瀚海、天山、伊吾三军；以及盐治州、盐禄州、阴山州、大漠州、轮台州、金满州、玄池州、哥系州、咽面州、金附州、西盐州、东盐州、叱勒州、迦瑟州、冯洛州和孤舒州等十六个羁縻州：