日本海翡翠线列车为主，繁忙时间以2辆编成列车行走，一般时间只派1辆编成一人控制列车，全日共对开18个班次（往市振方向则多1单向班次），约40-90分钟1班，上行绝大部份皆以泊为终站；下行则以直江津站或纟鱼川站为止，当中每天有1来回班次会由纟鱼川站直通至金泽站；另1来回则由纟鱼川直通至高冈（上午上行）或富山（晚间下行），但採用的均为爱之风富山铁道的列车，日本海翡翠线的列车均不会驶入泊站以西的路段。驾驶员及车掌也由所属列车的公司负责。
转换经营权后的问题.过往由JR西日本管理时期，本路