参选总统选举落败，结束肯尼亚非洲民族联盟长达四十年执政。2005年起，任肯尼亚非洲民族联盟主席。肯雅塔被指在2007年总统选举期间，策划了2007-2008年肯尼亚危机，这场危机造成约1300人死亡，激化了肯尼亚的部族矛盾。2014年12月，国际刑事法院撤销对肯雅塔的反人类罪指控。国际刑事法院检察官法图·本索达在一份书面声明中说，肯尼亚政府不予合作给案件带来“严重影响”。她还表示，如果有更多的证据出现，她保留再次提出指控的权利。2013年3月，他以50.07%的得票率击败对手拉伊拉·奥廷加，成为