孟君也被逮捕，合称救国会“九君子”。王昆仑多方营救这“九君子”。时逢1936年12月西安事变爆发，在西安事变期间，王昆仑根据中共指示，在中国国民党高层进行工作，促进事变的和平解决。自西安事变起，国共两党开始公开和谈。为此，周恩来等中国共产党领导人到杭州、庐山、南京，和蒋介石多次谈判，王昆仑在南京首次见到周恩来，并应周恩来的要求，继续做孙科的工作。
抗战时期.1937年7月抗日战争全面爆发后，王昆仑一方面做冯玉祥等人工作，一方面陪出狱不久的沈钧儒等人赴太湖，以散心的名义讨论抗日事宜。