改办上海机器制造学校（今上海理工大学），文理学院和商学院分别主要并入复旦大学和上海财经学院（今上海财经大学）。圣约翰大学和震旦大学的医学院合并成立上海第二医学院（后改名为上海第二医科大学，设在重庆南路的震旦大学原址，2005年改为上海交通大学医学院）。东吴大学在上海的法学院也于院系调整中撤销，法律系师生转入华东政法学院，会计系并往上海财经学院，虹口区昆山路校址改作他用。由于上海集中了众多高等教育资源，许多高校被迁往内地。如同济大学的医学院被内迁武汉，交通大学原拟全部内迁西安，后来改为大部分内迁西安，小部