6-C9蛋白都含有相同的（Membrane Attack Complex/Perforin superfamily，MACPF结构域）。这一结构域与革兰氏阳性菌分泌的溶细胞素（Cholesterol-dependent Cytolysin，CDC）具有同源性。上述由C9生成的环可以认为是膜上的一个可以允许分子自由出入的孔洞。如果有足够多的这种孔洞生成的话，那么靶细胞就难以再存活。
起始：C5-C7.膜攻击复合物形成的第一步是将（C5）裂解为C5a和C5b的过程。随后，另一种补体