在11月返回印度与总督寇松商议进军西藏的计划。1903年12月，英国发动英藏战争，出兵侵略西藏。1903年底或1904年初，已回到拉萨的擦绒·旺秋杰布被任命为西藏噶厦噶伦。他是第二次英藏战争中参与《拉萨条约》谈判的藏方代表之一。1906年，清政府派张荫棠查办藏事，于“是年十月十二日到达拉萨”。张荫棠到拉萨后，采取了一系列治藏新政策，根据新政策的纲领，设立了交涉、督练、盐茶、财政、交通、工商、学务、农务、巡警共九大机构，任命新的噶伦次丹旺秋为交涉、工商局的负责人，噶伦擦绒·旺秋杰布为督练、交通和盐茶等三个