总结：“西南联合大学校内领导体制和清华大学有相似之处。清华大学的领导体制，在西南联大期间，仍然发挥作用，制度的延续性并没有中断。”西南联大期间，清华还单独设立清华大学昆明办事处、清华大学研究院、清华特种研究所。研究院自1939年起逐渐恢复，设有文科、理科、法科3个研究所共12个学部，招收研究生。特种研究所为利用庚款基金利息单独举办，包括农业、航空、无线电、金属、国情普查五个研究所。1934年成立农业研究所，1936年于南昌成立航空研究所，1937年于长沙成立无线电、金属研究所。之后均前往云南昆明并成立国