（今关东路与光复路口一带）在新竹是知名的地名，因此车站规划兴建时，暂以关东此作为站名；但是车站所在地居民以地缘考量，希望争取以里名「新庄」作为车站名称，又暂改此名。站前道路则以关东桥、新庄各取一字命名为「关新路」。新竹市政府考量其是所有车站中距离新竹科学园区最近者的缘故，希望将新站命名为竹科，但遭到地方人士反弹，认为古地名消失、伤害地方情感。2011年4月的时候，地方政府邀集车站所在里长与会研商，决定更名为「竹科新庄」，但台铁表示，在现有票务系统技术下无法实现，同年6月决议以竹科（新庄）的主副站名标