个明礁、14个暗礁。陆地总面积11.13平方千米，海域总面积201.6平方千米，处台湾暖流与江浙沿岸海流交汇海区，海域底质以粉砂质粘土为主，含沙量低，水质清澈，成为海洋生物栖息生长的良好场所，海域内的海洋生物约1850种，其中以海洋贝藻类为主，海洋贝类占世界贝类总数的20%，海藻类占中国藻类总数的20%，有“贝藻王国”之美誉。1990年被国务院列为国家级海洋类型自然保护区。南麂岛在海洋生态方面有着重要的研究价值，是海洋生物“南种北移，北种南移”的资源库，于1999年被联合国教科文组织列为世界生物圈保护区