。最上层的法院则是以色列最高法院，位于耶路撒冷，目前的最高法院首席大法官是Dorit Beinisch。最高法院是最高的上诉法院，也身兼高等法院（HCQJ）的功能，高等法院主要是负责解决个别公民对于法院提出的请愿，这些请愿通常由政府部门回覆（包括以色列国防军）。这样的请愿可能使得高等法院作出决定，指导政府部门改正行政的方式。一般的法官是由国会组成的委员会、最高法院的法官、以及以色列律师行会的会员联合选出的。法律规定要求法官在70岁时退休。最高法院的首席大法官由司法部长所批准，负责指派所有法庭的常务官