真菌在美洲，印度和东南亚最为普遍，流行于美国的某些地区。感染通常是由于吸入受污染的空气。
肺孢子菌.（旧名卡氏肺孢子菌 "Pneumocystis carinii"）可以在早产儿，老年人和艾滋病患者等免疫系统较弱的人群中引起一种肺炎。
宿主防御机制.
内温性.哺乳动物的和恆温性（homeothermy）可能是对大多数真菌有效的非特异性防御，许多真菌不能适应哺乳动物体内的温度，只能在体温较低的两生类或昆虫等动物或植物中造成感染。Se