逆的，即氨基酸也可以通过脱氨基作用转化爲柠檬酸循环的中间体而进入柠檬酸循环分解代谢。不过，氨基酸通过上述途径分解代谢产生的能量很少，一般情况下，只佔生物体总产能的1%不到。
脂肪酸合成.在非反刍动物体内，细胞质基质中发生的长链脂肪酸合成以乙酰辅酶A爲主要原料。但丙酮酸氧化生成的乙酰辅酶A却位于线粒体基质内，且乙酰辅酶A是无法穿过线粒体膜的。不过，在乌头酸酶与底物的结合处于饱和状态的条件下，线粒体基质中的柠檬酸可转运到细胞质基质中。细胞质基质中的ATP-柠檬酸裂解酶可将柠檬酸裂解爲乙