总教区总主教皮漱石主礼祝圣。上海教区主教座堂也迁到徐家汇圣依纳爵主教座堂。张家树总结这一时期说：“我60年圣主教后，政府只叫我做两件事：写材料，交代自己，揭发他人。”1966年“文化大革命”开始，蒯大富率领北京清华大学红卫兵“井冈山兵团”南下，以“破四旧”为名毁坏徐家汇圣依纳爵主教座堂，批斗神父和修女，并强迫他们污辱圣像和十字架。张家树对着圣像祈祷长跪不起。此后张家树被下放劳动，修伞、洗玻璃瓶子。1979年，张家树得到平反。1980年5月，中国天主教第三届代表会议召开，张家树当选为新成立的中国天主教