着F-4战斗机战斗机的退役，阿莫斯改飞F/A-18大黄蜂战斗攻击机，并担任第312陆战队攻击战斗机中队长，配属到第8舰载机联队，在西奥多·罗斯福号航空母舰（CVN-71）上执行任务。1996年5月，已经晋升上校的阿莫斯担任第31陆战航空大队长，驻扎在南卡罗来纳州的博福特。1998年晋升为准将，阿莫斯派赴北约，担任南欧海上攻击部队副司令，兼任海军陆战队欧洲舰队副司令，驻扎在意大利那不勒斯。此期间，还曾兼任北约科索沃核查协调中心主任，空袭南联盟任务中兼任美国联合特遣部队参谋长。2000年，阿莫斯调到五角