贸会员后，CNLA及CNAB于2003年合併成财团法人全国认证基金会TAF。中华民国于2008年以HACCP原则建立「食品安全管制系统」，并推行餐饮业HACCP认证标章。2015年受欧盟洁净饮食风潮、过多食品添加物的滥用及标示不实的食品诈欺影响，A.A.无添加协会在台湾成立并开始推行无添加星等认证制度。台湾政府以世界卫生组织的促进食品安全的指导原则将GMP制度（良好作业规范）、HACCP（危害分析重要管制点）纳入政府规范，并在原有公共卫生系统的基础上，于2010年成立「行政院卫生署食品药物管理局」（即后