的切萨皮克蓝蟹等。一部分的旗舰种在自然界中是关键种，例如生活在非洲大草原上的非洲狮，该物种在草原上是顶级掠食者，并且在食物链中可控制大型食草动物的数量，维护整个生态系统平衡。然而随着非洲狮的数量及活动范围下降，其作为关键种的效应也正在降低当中。世界自然基金会利用旗舰种、关键种、来为生物群体分门别类，当某个区域面临生态威胁时，利用此分类可对多个物种排列保育优先程序。被选为旗舰种的生物群体，通常代表环境特征（例如单一物种或生态系统）、受威胁原因（例如气候变化或海洋酸化）、保护组织（例如非政府组织或政府部