乙醇是医疗中最常用的杀菌剂、消毒剂及解毒剂。在医疗中，常会在静脉穿刺前及手术前，用乙醇擦在皮肤，以进行，乙醇会擦在要治疗患者的皮肤上，也会用在医疗人员的手上作为消毒用，乙醇也可以用来清洁其他部份，也用在漱口水中。在治疗甲醇中毒或乙二醇中毒时，若无法取得甲吡唑，也可以口服或是静脉注射乙醇来治疗。乙醇的副作用包括对皮肤的刺激。若在的场合，要谨慎使用，因为乙醇有可燃性。醇类的分类有乙醇、变性乙醇、1-丙醇及2-丙醇。乙醇对许多种类的微生物都有效，不过无法使其孢子不活化，一般浓度在60%至90%之间效果最好。