第五名（其中八强击败孔令辉促成孔退役），同年11月重上国家一队，起初做王皓等主力阵容陪练。2008年3月首度突破队内预选得以征战国际赛单打，在卡塔尔公开赛八强4-3击败马龙，是下放省队以来首胜马龙，初露茅头。2008年11月全国乒乓球锦标赛，连挫马琳、王励勤、王皓（分别是当年北京奥运男单金、铜、银牌）夺男单冠军，2009年2月确立为「八大主力」，名列第七。然而张继科错失第一次上位机会，2009年世乒赛3月中国队内选拔循环赛，争夺7个单打名额，张继科名列第四，惟总教练刘国梁不满张继科在比赛中不服从战术暂停指令