在位45年，因为与巡按御史徐南金互相攻讦参奏，被嘉靖帝夺禄米，问罪于属下官校。王妃滕氏为妾刘氏所害，朱邦薴因为刘氏的儿子朱任昌为世子，未敢追究，但没有给刘氏封号，而是封侍女郑氏为夫人（宪定王朱任晟的母亲）。隆庆六年（1572年）朱邦薴薨逝，谥恭惠，儿子朱任昌嗣位。