1999年10月19日，曹锦辉以220万美元签约金加入科罗拉多洛矶队，在其所属的美国职棒小联盟出赛起步。2001年右肘受伤，并接受汤米约翰韧带重建手术，伤癒后待在小联盟奋战。2003年7月25日，首度于美国职棒大联盟出赛，担任先发投手，成为继野手陈金锋后，第二位登上大联盟的台湾球员，也是以投手身份，第一位登上大联盟的台湾球员。在科罗拉多落矶队的主场丹佛库尔斯球场面对密尔瓦基酿酒人队时，曹锦辉主投六又三分之一局，取得大联盟生涯首胜。除了许多投手记录的第一次之外，也在该年挥出台湾选手在美国职棒大联盟的首支