45年4月9日，苏军占领该城，却未发现琥珀宫的下落，自此琥珀宫即告失踪。
可能下落.尽管琥珀宫很有可能在二战中毁于轰炸，但许多人仍坚信它仍存在于某地。如果说琥珀宫被纳粹用船运走了，据考古学家估计，最有可能的藏宝之处，应该是奥地利中部的托普利茨湖。二战期间，纳粹德国在托普利茨湖进行秘密武器实验。二战末期，预感到末日将至的德军把许多东西投进了托普利茨湖。目击者说，其中包括一些刻有俄文的板条箱。不过迄今为止，探险家并没有在湖里发现“琥珀宫”的蛛丝马迹。如果琥珀宫没有被运走，那么它可