立后，南谦被录为开国功臣第一等，赐名南在授予中枢院学士兼大司宪的官职，封义城君。1394年3月担任参赞门下府事。1396年，南在被任命为都兵马使，与辛克恭、李茂一起，跟随金士衡参加对马岛征伐。南在反对郑道传激进的改革，与南誾保持一定距离。南誾在第一次王子之乱中被杀害，并被认定为郑道传逆党的一员，南在没有受到牵连。1401年，与赵浚一起推戴世子李芳远即位，是为朝鲜太宗。南在于太宗朝先后担任右议政、左议政、领议政的官职。死后谥忠景，配享太祖庙庭。