藏、伊能忠敬等人探险北海道、库页岛和千岛群岛地区，和人对北海道的地理状况亦有了更多了解。1799年，幕府将东虾夷地改为幕府直辖地。1807年又将西虾夷地改为幕府直辖地。不过在沙俄的威胁减轻之后，1821年，全虾夷地又重新成为松前藩领地。幕府末年经由培里来航而签下日美神奈川条约（即「」），依此条约，日本开放了下田及箱馆两港口。随着尊王攘夷思想强盛，幕府大老遇刺身亡与萨英战争都令幕府的权威一落千丈，最终德川庆喜先后把政权与领地交还朝廷。
近现代.
明治维新到大日