除了重启因战争而遭破坏或改装的监狱外，亦陆续在香港各地开设不同的惩教设施，以应付日后需求，例如1953年的首间教导所「赤柱教导所」（马坑监狱的前身）、1968年的首间中途宿舍「新生之家」（今被併入紫荆楼）、1969年的首间戒毒所「大榄戒毒所」（今改为大榄惩教所）、1972年的首间劳役中心「沙咀劳役中心」（即沙咀惩教所）、2002年首间更生中心励志更生中心等。另外，因应香港越南船民问题，惩教署曾经在一些地方开设羁留中心，亦一度成立难民组及增聘相关临时职员。时至今日，赤柱监狱仍然运作，荔枝角监狱被改为荔枝角收押