邓锡侯、樊钟秀、刘湘、刘兴、刘郁芬、刘文辉、蒋中正、赖心辉、鲁涤平、阎锡山、谭延闿等67人为军事委员会委员，后增加刘峙、钱大钧、顾祝同、黄琪翔、李朗如、徐永昌、刘骥、傅作义为委员。修订的《军事委员会组织大纲》把主席制改为主席团制。之后，军委会主席一度由胡汉民担任。9月20日新的国民政府委员和军事委员会委员同时在南京小营举行就职典礼。军事委员会内设工作机构：1928年1月4日蒋中正恢复总司令职后，胡汉民即辞去军委会主席一职。1928年2月4日，在南京召开国民党二届四中全会，通过《国民政府军事委员会组织大纲