1986年11月，日本国铁实施民营化之前最后一次运行图调整，正式终止了经营欠佳的行包货运业务。信越本线或东海道、山阳本线上的大部分EF62型电力机车，都在1987年4月国铁分割民营化之前停运报废。其中，EF62 25号机车报废后由所拥有，并参与了本四备赞线（濑户大桥线）开通前的濑户大桥1000吨荷重列车试验。
国铁民营化后.国铁分割民营化之际，信越本线尚存的六台EF62型电力机车（41、43、46、49、53、54）均由东日本旅客铁道（JR东日本）继承，并集中配属于。这六台机车