加封江忠源二品顶戴。9月，以太平军从南昌撤围西上，急赴湖北田家镇（今武穴西北）增防，被太平军击败，退至武汉，江忠源上疏自劾，被降四级留任。10月，太平军攻陷安徽省会安庆，清廷任命江忠源为安徽巡抚兼军门提督，并授都察院副右都察御使兼兵部侍郎。12月率部入守庐州，陷入太平军的重围。咸丰三年十二月（1854年）因兵单粮乏，援兵不至，兼之庐州知府胡元炜暗中作内应，咸丰三年十二月十六日（1854年1月14日）太平军由水西门突入，攻破庐州。江忠源见大势已去，提刀自刎不成，都司马良勋背着江忠源疾走，江忠源咬马良勋的耳