鹰司殿。同年9月，母亲中宫威子崩驾，十月与馨子内亲王一起迁居上东门院处。父母接连过世，使其幼年时即与父母死别。1037年（长历元年十二月）进行着裳仪式，入12歳皇太子亲仁亲王（日后的后冷泉天皇）东宫，居飞香舍。1045年（宽德二年）亲仁亲王受后朱雀天皇的禅让而成为第70代天皇，章子内亲王被封为女御。1046年（永承元年）迁京极殿，立为中宫。1068年（治历四年）改称皇太后，两天后后冷泉天皇驾崩。1069年（延久元年）落发为尼，同年七月，尊为太皇太后。1074年（延久六年）赠与女院院号，称之为二条院。