课时间及人力资源，设立此科引致原有科目教授时数不足，增加学生暑假回校补课的时间，严重加重工作量。国民教育科亦管制学生的思想空间，倘答案不符官方的立场，就是不合标准。以及当局从来未有谘询学生的意见，担心会成为洗脑科目，令学生失去审辩式思维。学民思潮曾与高登讨论区网友联手在三家报刊以「官员子女赴洋升学　市民子女留港洗脑」为口号，要求永久撤回国民教育。顺德联谊总会梁銶琚中学五优生梁倬睿批评国民教育是多余，于2011年参加七一游行反对国民教育。
家长.香港教育学院文理学院与其他机构2011