国公，改吴国为吴郡。元兴三年（404年），晋室匡复，改吴郡为吴国。义熙十四年（418年），琅邪王司马德文即皇帝位，国除，改吴国为吴郡。宋孝武帝大明七年（463年），改隶南徐州。次年复归扬州。南梁太清三年（549年），侯景叛乱，攻占吴县，改吴郡为吴州。大宝元年（550年）二月，复改吴州为吴郡。陈后主祯明元年（587年），析扬州地置吴州，治吴县，吴郡隶属吴州。
隋唐.隋文帝开皇九年（589年），灭陈，废吴郡，改吴州为苏州。隋炀帝大业三年（607年），改苏州为吴郡。吴郡领五县：吴、崑