众合力鸠资，建成笨港慈济宫（沿用青礁慈济宫之号），此即新港大兴宫的前身。1799年（嘉庆四年），笨港溪洪水横溢，沖毁笨港街面。信众遂于麻园寮（新港旧称）现址重建新庙，至1804年（嘉庆九年）落成，由王得禄命名为「大兴宫」，并敬献一张桌案。1840年（道光二十年）及1858年（咸丰八年）历经两次重修，今日庙旁凉亭保存一块咸丰八年的「大兴宫重修喜捐缘金名碑」。1904年（明治三十七年）及1906年（明治三十九年）云嘉地区发生两次大地震，大兴宫受损甚巨，由当时的新港区街庄长林维朝倡议重修。庙内留有1907