虽然中央轨道不能停靠116街-哥伦比亚大学车站，但仍拥有编号「M」。这些编号一般来说几乎从来不用。与大部分慢车停靠站不同，车站设有一个交叉点。北行月台南端亦设有一个只限出站的出口，前往百老汇东侧的115街，外面。直至1960年代为止，车站入口设有一个便亭，与2英哩以南仍在使用的72街相近。现时大堂完全位于地下，而百老汇两侧都设有楼梯服务上下城列车。2004年，车站列入国家史蹟名录。