保基金一案而被中纪委公开宣布进行调查。8月29日，中共上海市委宣布免去秦裕宝山区党委内的所有职务，接着区长职位亦被免去。2007年1月23日，中华全国青年联合会宣布撤销其青联常委职务。2007年3月2日，秦裕被开除党籍和公职。2007年9月25日，吉林省长春市中级人民法院认定秦裕受贿682万元，主要由其位于上海市区的三套商品房折现而来，判处秦裕无期徒刑，剥夺政治权利终身，没收个人全部财产。2010年4月2日，吉林省最高人民法院裁定将秦裕刑期减为有期徒刑18年，剥夺政治权利6年。2012年5月9日，秦