为余登发之孙、余陈月瑛之子、余政宪之弟。1989年，余政道与台北医学院同学张良穗结婚，婚后育有三个子女。2004年12月22日，无党团结联盟立委朱星羽担任立法院财政委员会主席时宣布《海关进口税则》修正草案不经朝野协商迳付二读，余政道、亲民党立委刘忆如与中国国民党立委罗世雄发言反对，但朱星羽抛下一句「若你们有意见，到二读时再去反对」之后宣布散会；随后多位立委围住朱星羽，朱星羽出拳攻击余政道，两人随后被其他立委拉开。2004年12月27日，余政道不满遭朱星羽指控向中国农民银行关说，由律师陪同召开记者