任命为保定巡警局总办，同时，还获袁世凯奏保为知府加盐运使衔。当时，奉袁世凯之命，赵秉钧与驻中国的日本警官合力创制了中国近代警察制度。赵秉钧在保定创设了警务学堂，后调任天津南段巡警局总办，在天津设立巡警学堂。1903年（光绪29年），两所学堂合并，成立北洋巡警学堂。1905年（光绪31年），清朝的巡警部成立，经袁世凯推荐，赵秉钧被任命为巡警部右侍郎。由此，赵秉钧掌握了巡警部的实权。而且袁世凯将巡警部当作一种特务机关开展活动。1909年（宣统元年）1月，袁世凯一时失势，赵秉钧遂被罢免。1911年（宣统3年）