淤积成陆地后，使新庄失去了航运之便，交通辐辏地位让予艋舺，新庄的发展也就此停滞。沉寂一时的新庄到光绪中叶，因台湾铁路兴建完成有了重振迹象。但日治初期铁路改线经由枋桥（今板桥），新庄再次丧失交通地位。日治时期大正9年（1920年）隶属台北州新庄郡，辖新庄街、鹭洲庄、五股庄和林口庄，是当时农业重镇。又因临近台北市，新庄的商业活动也跟着兴盛起来。二次大战末期，总督府为避免盟军轰炸，疏散台北市的重要工厂都移往邻近乡镇，该政策使新庄的工业开始发展。1945年日本投降，国民政府接管台湾后