将校舍由般含道迁往旺角的一处山头。1927年，新校舍竣工在即，英军征用新校舍一年，然亦协助完成了最后工段。1930年，费瑟士东牧师因故辞职。1937年，卢沟桥事变爆发，拔萃男书院显示出对南京国民政府的高度支持。1938年1月，「拔萃擦鞋团」在当时校长舒展牧师的俞允下成立。团员奔走港九，为国民政府募款。1939年，新任校长葛宾委任一日籍台湾学生为首席学生长，甚至导致集体罢课。1941年，日军佔领香港。葛宾及大部分教职员皆遭遣往集中营，校舍改为日军医院之用。
战后.1945年8