，真菌感染在T细胞缺陷患者身上往往也很常见且严重。
癌症.T细胞癌变诱发的肿瘤称为T细胞淋巴瘤，在非霍奇金淋巴瘤中约占10%。
耗竭.T细胞耗竭是一种T细胞功能失常的状态，其表现为进展性的功能丧失、基因表达谱的变化、和抑制性细胞因子的持续分泌。T细胞耗竭可能发生于慢性感染、败血症、癌症的进程中。耗竭的T细胞即使再次暴露于抗原刺激之中也无法恢复正常功能。
慢性感染和败血症.T细胞耗竭的直接原因包括持续的抗原刺激、以及CD4细胞的缺失