护」的前线工作。1986年进入中华民国陆军服兵役，在第二六九师任少尉军医预官，于1988年退伍，回到台大医院任职。
医师生涯.于台大医院担任「急诊」与「重症加护」工作11年后，为研究器官移植，决定赴美进修。1993年，至美国明尼苏达大学医学院外科进修1年，研究「人工肝脏」。1994年返国，回到急诊室工作，同时进入台湾大学医学研究所博士班。经台大医院外科主任朱树勋指派，柯文哲建立起台大器官移植小组，并以心脏移植为目标。为增加移植成功率，柯文哲率先从美国引进叶克膜技术。其所负责的创伤急