马祖村有天主教宝血幼稚园，现已废弃。天主教石仁爱修女1975年至马祖村宝血幼稚园服务，其为比利时人，居民多称「姆姆」，2001年返回比利时，2010年6月1日病逝鲁汶圣母圣心院退休修女之家，享寿92岁。马祖地区许多青、壮年辈曾是她的园生。天主教会将金门县、连江县（马祖）划分为天主教金门、马祖宗座署理区。
一贯道.一贯道于南竿乡仁爱村建有佛堂。 
其他.如末世收圆信仰、灵山母娘信仰、其他新兴宗教等。
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