回部分失地。祖逖本有希望恢复旧土，但他被晋元帝及世家大族挟制，郁郁而终。桓温的北伐则被慕容垂击败。376年，前秦苻坚灭掉代国，统一北方，南北分立之势从此而成。其后苻坚开始率兵南侵。383年，苻坚率约八十七万兵马大幅南侵，东晋宰相谢安力主抗击，派谢石、谢玄率军，在淝水之战大获全胜，苻坚逃回北方。之后苻坚力量衰弱，因此原本统一的北方再次分裂为多国。后有桓玄叛乱，废安帝，自立为天子，后为大将刘裕所平，拥恭帝，然大权落于刘裕。420年，刘裕篡位建立刘宋，开启南北朝时代，东晋亡。
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