教会内部产生了分裂。虽然在861年在君士坦丁堡召开的教会会议上佛提乌的地位被确定，但是863年教宗尼各老一世宣布他非法。佛提乌主动进行的传教活动的成功更加加大了对牧首地位的争执和教宗与牧首之间地位关系的争执。在佛提乌的指导下米海尔三世资助了西里尔对可萨人可汉的传教，目的是为了阻止犹太教在可萨人当中的传播。不过这次传教失败。863年米海尔三世又支持了对大摩拉维亚公国的传教。这次传教很成功。在这次传教的过程中用来书写斯拉夫语的格拉哥里字母被发明。由于米海尔三世怕鲍里斯一世会在法兰克人的影响下信奉罗马的基督教