983年至1986年任武汉市委书记（时设第一书记）、市长。
地方工作.1986年至1995年，吴官正任江西省委副书记、副省长、代省长、省长。1995年至1997年任江西省委书记。1997年至2002年任中共中央政治局委员、山东省委书记、省委党校校长。
进入中央纪委.2002年11月15日，吴官正在中共十六届一中全会上当选中共中央政治局常委（排名第七）、中央纪律检查委员会书记，进入最高领导层。吴官正在其中纪委工作后期，在胡温的支持下，着力推动了反腐败体制