地区有很多受威胁的物种，比如属于羚羊类的就有大耳小羚羊、沙羚、银犬羚和斯氏瞪羚等好几种。其他较着名的动物还有索马里野驴、沙漠疣猪、阿拉伯狒狒、索马里沙鼠、鳞掌沙鼠和斯氏软毛梳趾鼠等。细纹斑马是该地区唯一的野生马科动物。非洲之角的重要鸟类有解放伯劳、金翅雀、栗腰朱顶雀和吉布提鹧鸪等。非洲之角拥有比非洲其他地区更多的特有种爬行类，非洲约285种特有种爬行类在这里就有90种，而且这90种只生活在该地区。根据属来区分，它们分别属于"Haackgreerius"属、"Haemodracon"属、索科特拉蛇属、