的河流都是内流河，这些河流的水量多来源于高山融雪，故而在春夏时节，河流泛滥，秋冬时节，几近干涸。较大的河流有有叶尔羌河、塔里木河、和田河和车尔臣河等，其中塔里木河是最大的河流，也是中国最大的内流河。在上述内流河的终点，往往形成湖泊，如塔里木河下游的罗布泊。
绿洲.在沙漠的边缘地带，由于河流的经过，往往形成大小不等的绿洲。在各条流入、纵切塔克拉玛干沙漠的季节河河床上，即使深入沙漠腹地五六百公里，都分布许多小绿洲，有维吾尔族乡、村常年定居于此 。较大的绿洲有和田绿洲、吐鲁番绿洲等。