局改组为「招商局轮船股份有限公司」（China Merchants Steam Navigation Co.）。
迁台后至阳明海运时期.1949年，招商局轮船迁至台湾；中国大陆的原轮船招商局，在中华人民共和国成立后并入了中华人民共和国交通部下属的上海海运局、广州海运局与中国长江航运（集团）总公司；而香港招商局于1950年1月15日宣布倒戈中华人民共和国，此后作为中华人民共和国交通部直属的中资在港企业沿革至今。这导致台湾与香港各有「轮船招商局」的情形发生。1972年12月28日，