然死亡，布隆迪政府宣布其死于心脏病。然而，《卫报》报导称他疑似因感染2019冠状病毒病而死亡。就在其死亡的一週前，肯亚的《旗帜报》报导称其妻子丢下他飞往奈洛比接受2019新型冠状毒病的治疗。恩库伦齐扎死于2020年总统大选之后，新当选的总统埃瓦里斯特·恩达伊希米耶将于8月20日就任。根据该国宪法，由国会议长代行总统职务。后来恩达伊希米耶于6月18日提早就任。