下令将中小学课本中的“共和”字样统统删除。同年6月，袁世凯逝世，吴庆桐亲自到北京吊唁，并在南阳的玄妙观举行追悼大会。民国6年（1917年）9月，护法军政府成立，中国西南六省纷纷宣告独立。驻湖北襄阳的陆军第9师师长黎天才也宣布“襄阳自主”，但黎天才部旅长张联升、团长赵荣华率部脱离黎天才，赴南阳投奔吴庆桐，吴庆桐乃率部开入湖北进攻黎天才部，扼杀了襄阳的独立运动。民国8年（1919年），五四运动影响到南阳，吴庆桐亲自到南阳中学勒令同学会解散，并严禁抵制日货。1921年，吴庆桐在天津寓所被侍从曹森刺杀身亡。