家科学基金会助理会长，掌管数学及自然科学部。他负责统筹及管理部门的科研经费，范围涵盖天文、物理、化学、数学、材料科学以及跨学科活动。2009年3月，陈繁昌获科大校董会一致通过，接替朱经武出任科大第三任校长，9月正式上任，任期为5年，带领科大过渡「三三四学制」，他于2013年获续任校长一职，执掌科大至2018年。陈繁昌已于2017年6月以年届65岁为理由向校董会请辞，将出任校长至2018年8月离任退休。陈繁昌是美国国家工程院院士、美国电机电子工程师学会院士、美国工业及应用数学学会院士、美国科学促进会院