轮增压的FDL16型中速柴油机，但额定功率从2500马力提高至2800马力，除此之外早期的U28B型柴油机车实际上与后期的U25B型柴油机车完全一样，传动系统同样使用直—直流电传动，柴油机直接驱动一台GT-598型直流牵引发电机，并将发出的直流电供给四台并联的GE-752型串励直流牵引电动机。随着采用交—直流电传动的U30B型柴油机车于1966年5月面世，部分后期生产的U28B型柴油机车亦改装GTA-9型三相交流同步发电机和硅二极管整流器。