6世纪，整个阿塞拜疆境内被波斯帝国居鲁士大帝所占领。在帝国持续了将近250年之后，亚历山大大帝征服了这里，这个使得希腊文化在此兴起。在亚历山大大帝于公元前323年死后，塞琉古帝国继承了高加索地区。
中世纪.公元642年被阿拉伯哈里发国(阿拉伯帝国)征服，9世纪-16世纪遭受土耳其人、蒙古人和波斯人的入侵。
伊朗萨法维王朝.由伊斯梅尔一世领导的萨法维人，从他们的基地阿尔达比勒开始扩张。他们征服高加索地区以及安纳托利亚东部、美索不达米亚、中亚的部分区域和南亚西