凡熙宁以来政事弗便者，次第罢之”。司马光上台后，不顾一切尽罢新法（熙宁变法），“举而仰听于太皇太后”。宋哲宗对此感到不满。元祐八年（1093年）九月，高太皇太后去世。十月，哲宗亲政。哲宗亲政后表明绍述，追贬司马光，并贬谪苏轼、苏辙等旧党党人于岭南(今广西、广东、海南)，接着重用革新派如章惇、曾布等，恢复王安石变法中的保甲法、免役法、青苗法等，减轻农民负担，使国势有所起色。次年改元“绍圣”，并停止与西夏谈判，多次出兵讨伐西夏，迫使西夏向宋朝乞和。元符三年正月十二（1100年2月23日），崩于福宁殿。