1年（宣统3年），任陆军第四镇第7协协统。中华民国成立后，随着军制改革，陆军第四镇改为陆军第4师，杨善德升任该师师长。1913年（民国2年）9月，任江苏松江镇守使。上海镇守使郑汝成1915年被革命党暗杀后，1915年（民国4年）11月，杨善德暂行兼署上海镇守使。不久，改任松沪护军使兼江苏军务会办。翌月，袁世凯称帝，杨善德获封一等伯。袁世凯死后，杨善德归属段祺瑞领导的皖系。1917年（民国6年）1月，被任命为浙江督军。段祺瑞被大总统黎元洪罢免国务总理职务后，拥护段祺瑞的杨善德与浙江省长齐耀珊发表浙江省