13年（1585年），隆景积极地参加秀吉的四国征伐，而吉川军则以元长为总大将出阵，元春本人没有出阵。天正14年（1586年），受到已经成为天下人的丰臣秀吉强烈邀请，加上因为弟弟隆景和侄儿辉元等人游説，于是以隐居的身份参加九州征伐。不过此时元春因为化脓性炎症（一说为癌）而令身体状况转差，因此在出征前就在丰前小仓城二之丸中死去。享年57岁。
关于妻子的逸话.元春把熊谷信直的女儿新庄局娶为正室，一生中都没有娶过侧室并诞下4男2女。通说指新庄局是丑女，在宣阿的『阴德太平记』卷十六「