989年9月，台湾经济研究所扩大组织编制，更名为「台湾经济研究院」，首任董事长辜振甫，首任院长刘泰英。1992年，台湾经济研究院迁至台北市光复北路11号。1996年，台湾经济研究院迁至台北市中山区德惠街16之8号（现址）。台湾经济研究院现任董事长为王志刚，现任院长为张建一。