人民政府命名的“江苏省古籍重点保护单位”。同时亦是国家中医药管理局的中国中医药文献检索中心南京分中心。拥有古籍资源以明初刻本、明孤本、明稀见刻本、未刊稿本、珍贵抄本、日本、高丽早期刻本等为主。
现况.南京中医药大学现有中医学、中药学、中西医结合学3个博士后科研流动站、16个博士点和19个硕士点，研究生学位点覆盖中医、中药、中西医结合所有二级学科；有3个七年制学、硕士连读专业，17个本科专业，30多个专业方向；现有各类在校生逾万人，其中研究生一千余人，各类留学生近千人。目前全校（不