学校长阎振兴挂名，唐君铂任副院长，却实际操作。1972年唐君铂自军中退役，继续任文人副院长。1975年2月接任院长。
发展核子武器.据说唐君铂反对发展核子武器，他认为在有限的资源能力下发展核子武器不切实际。台湾核子武器发展原向以色列核弹先驱柏格曼教授求教，以后以色列政治转变，双方讨论中断。1976年初夏，吴大猷回台湾担任科导会主委，并受国防部邀请参与中山科学院所拟议的『新竹计画』。在经过多方的考虑之后，吴大猷最终指出，此项核能计画所需消耗的人力及金钱过于庞大，以当时政府的经济财政力