奇尼被其儿子路易十三及其亲信吕伊内公爵杀死后，与路易国王及首相黎塞留发生激烈冲突。玛丽摄政一开始就打击权贵，但后来不得不停止这种斗争，在1614年的圣美诺乌条约和1615的鲁顿条约中，对权贵做了很多让步。她抛弃了亨利四世的外交政策，与西班牙接近，并将奥地利的安妮公主定为路易十三的王后。1617年孔奇尼死后，她实际上已失去所有权力，被路易十三和首席大臣吕伊内放逐到布卢瓦。玛丽并不就此甘心，组织多起叛乱以图东山再起，她的第三子奥尔良公爵加斯东于1619年发动叛乱以支持母亲，吉斯公爵夏尔·德·洛林也对她进行武