斯科特堡坐落在北纬37度50分7秒、西经94度42分7秒（亦可表示为37.835180, -94.702015）处，海拔高度846英尺（258公尺）。位处内之马马顿河南畔。54号美国国道与69号美国国道交叉口位于此城市内。斯科特堡离密苏里州北方约有；离堪萨斯城南方约有；离威奇托东方则约有。根据美国人口调查局的资料，此城市总面积为，其中为陆地，为水域。
气候.斯科特堡因夏季溼热、冬季不甚干冷，在柯本气候分类法中属于副热带湿润气候。斯科特堡在一年当中平均气温为57°F（13°C），