，孙金龙在中国共产党第十九次全国代表大会上当选中国共产党中央委员。2018年2月24日，当选为第十三届全国人大代表。
生态环境部.在新疆工作四年后，2020年4月8日，孙金龙结束在地方十七年的工作回到北京，补缺调任山东省省长的李干杰，出任生态环境部党组书记。当日生态环境部官网一度登上孙金龙个人信息，但随即撤下；直到4月13日，始正式发布孙金龙履新信息。4月20日，明确为生态环境部副部长，排位在来自党外的部长黄润秋之上。4月27日，不再担任新疆兵团政委职务。2020年7月31日，