分析以"rbcL(或 RuBisCO)"为基础，而且形态学上的资料均证实了这些假定和想法，即“皇帝毛毡苔”和所有其他已调查的"茅膏菜属"物种是支序分类学上的姊妹关系，与"捕蝇草"则和所有"茅膏菜属"物种成姊妹群关系。2002年所做的进一步分析是以 ,色素体DNA ("rbcL", "matK", "atpB"),和形态学数据证实了这些关系，支持"皇帝毛毡苔"是"茅膏菜属"中的基础物种和它与"茅膏菜属"、"貉藻属"间的密切关系。在2003年新的分析显示"皇帝毛毡苔"与"亚瑟毛毡苔"间的密切关系，它们都是所