事防备。丘民仰善于处理繁重的事物，所以调任的都是重要的地方。崇祯十三年（1640年）三月提升为右佥都御史，代替方一藻巡抚辽东，考察巡视关外的八座城，驻守在宁远。崇祯十四年（1641年）春，锦州被围困，填塞壕沟毁坏工事，声援断绝。有人传达锦州部队统帅祖大寿的话：“以车辆组成阵营逼近敌人，不要轻率交战。”总督洪承畴集结部队，丘民仰转运粮饷，军队驻扎宁远观望态势，不敢冒进。朝廷官员日日催促洪承畴进兵，崇祯亦诏令洪承畴“刻期进兵”，洪承畴不得已于崇祯十四年（1641年）七月二十六日誓师，率八总兵、十三万人出战。