。北伐战争期间，担任北伐军第十七军一师二团党代表、军政治部代理主任、第二军政治部组织科长。1927年2月，由胡秉铎、周邦采、胡轶寰介绍，经周恩来批准，周肃清在杭州与李木菴、蒋仕祥一同入党。四一二事变期间，周肃清被列入蒋中正的密电处决名单。同年8月，参加南昌起义，任第二十军三师教导团三营党代表兼营长、招募处处长。1927年，参加广州暴动，任广州军委士兵运动委员会主席。1928年，担任中央福建巡视员，赴任福建省委军事运动委员会主席，组建福建省中共地下党组织。1929年12月，中共中央派他与陈明进入苏联莫斯科