亚纲，还有许多石炭纪与二叠纪的原始爬行类（原先被分类在无孔亚纲里的杯龙目）。原始真爬行动物非常小，外表类似蜥蜴，可能在古生代在地表上猎食昆虫为生。双孔亚纲是惟一生存过二叠纪的真爬行动物。真爬行动物的定义是头骨有缩小的上枕骨、横骨、横枕骨，以上不再与眶后骨连结。
种系演化.以下演化树是由Muller与Reisz在1995年以亲缘分支分类法建立: