经成为众多攻击的目标。2000年，一场大火在游客集市爆发，有两个维吾尔人被枪杀。2005年，维吾尔族为主的马迪纳集市在一场选举与有关的骚乱中被纵火，维吾尔族商人那里遭受殴打和枪击。维吾尔族也在当地经营餐厅。
教育.不像在哈萨克斯坦的同族，吉尔吉斯斯坦的维吾尔人多欠缺正式教育。一些年长的维吾尔人从事教授维吾尔语，结果维吾尔语在年青一代衰落，他们多数只能说但无法看懂老维文。
族际关系.吉尔吉斯大众媒体经常描述维吾尔人为恐怖份子和极端主义者，另一种常见的刻板