为国民革命军第二集团军的国民军开入河南，河南部队被改编为第二集团军第2方面军，秦德纯任第2方面军副总指挥。后因斩云鸮与冯玉祥决裂，第2方面军被整併为国民革命军第二十三军，秦德纯续任军长。由于二十三军的直系血统过于明显，后来秦德纯与国民革命军第十四军军长冯治安互换职务避免冯玉祥的猜忌。后冯玉祥调秦德纯担任第二集团军总司令部副参谋长，进入国民军系服务。1928年（民国17年）6月，秦得纯开始兼任山东省政府委员。北伐结束后，因军队彻裁问题冯玉祥发动多度联合地方实力派军人试图推翻蒋中正执政，最终引爆了中原大