法委员，继续连任。继续推动美丽岛口述历史研究，历时三年，访问朝野相关人士超过200多人，口述文字超过600万字，终于编写成60多万字，4大册的《珍藏美丽岛》，由时报出版社出版。这是迄今研究1970年代至1990年代，最完整的台湾民主发展史，并获得当年度金鼎奖。这是施明德以个人的财力、物力和影响力投注，完全毫无政府与党的补助下完成的历史研究工程。
台湾首次政党轮替后退党.2000年，民进党籍的陈水扁当选总统当夜，施明德致电祝贺林义雄主席，表示从少年时期以来推翻国民党政权的梦想已经实现