主基金会是「境外敌对势力的头目」。有大陆媒体认为，日本右翼团体、美国之音与自由亚洲电台、部分在中国大陆境内的非政府组织也属于境外敌对组织。法轮功、藏独（西藏流亡政府，即“达赖集团”）、疆独（世界维吾尔大会、东突厥斯坦）、台独（泛绿阵营，以民主进步党、台湾团结联盟为代表）、港独、「海外民运」等则是“境外敌对势力的工具”。境外敌对势力，根据2019年通过的《反渗透法》规定，是指“与中华民国交战、武力对峙或主张採取非和平手段之国家、政治实体或团体”。2019年5月7日，中华民国立法院三读通过「中华民国刑法」