子内亲王为继妃，生下二女与一子尊仁亲王。待到后朱雀天皇继位，教通之兄赖通依然没有成年可入内的女儿，只得将养女即妻子隆姬女王之妹与敦康亲王所生的嫄子女王（藤原嫄子）送入后宫，嫄子在连生两女后也因产褥热薨。这时，赖通已无女可送，教通终于得将长女藤原生子于长历三年（1039）年送入后宫为女御。同时，教通次女藤原真子也以尚侍的名义入内。然而直到宽德2年（1045年）后朱雀天皇崩御，教通两女都未生下皇嗣。
后冷泉、后三条天皇时代.宽德3年（1045年），尊仁亲王被立为皇太弟，教通再任东宫