日本派遣士兵和劳工登陆。12月7日，有更多日本人登陆。1939年4月，日军佔领太平岛，将其取名为「长岛」，纳入日治台湾高雄州高雄市辖下的新南群岛所管理。期间日本曾在岛上驻扎过陆战队、气象情报队、通信派遣队和侦察机部队。1944年，日本在岛上建立了潜艇基地。
20世纪后期.1945年二次大战后，先由台湾省行政长官公署接收管辖南海诸岛。12月12日，中华民国政府设立「南沙管理处」，隶属广东省政府管辖，并修建电台、气象台。1946年10月5日，法国军舰Chevreud号登陆南