规模6台18线，分为普速场和高速场。普速场位于站场北侧，有沪昆铁路、衢九铁路和衢宁铁路经过，设有3台11线，包括9条到发线、1个侧式月台和2个岛式月台。高速场位于站场南侧，有沪昆客运专线经过，设有3台7线，包括2条通过线、5条到发线、2个岛式月台和1个侧式月台。衢州站原设有两个货场。业务货场位于农贸城东侧的农市路122号，现车站的东北侧、老衢州火车站东侧，办理整车、集装箱发到业务，并设有专用线通往中央储备粮衢州直属库、顺昌粮食以及空军衢州机场的专用线。作为衢宁铁路工程的一部分，衢州机场专用线（粮食专用线