教育部筹设国家级二二八纪念馆，委由二二八基金会经营管理」。二二八事件纪念基金会历经第3、4、5届董事会，长达6年之积极推动与政府和各界的支持，「228国家纪念馆」之筹设终于定案，并于2007年2月28日正式挂牌。二二八国家纪念馆挂牌后，同年4月立即由教育部进行纪念馆古蹟修复工程，2009年9月完成修复工程后点交予内政部，并随即移交给二二八事件纪念基金会，接续于2010年进行纪念馆古蹟再利用工程，经过三百历日的全力投入，终如期于2011年1月16日竣工，并于2011年2月28日全馆开馆营运。