司马；刘裕更因毛修之的建设而赏赐了他时值二千万钱的物品。同年刘裕灭后秦，以本官受河南、河内二郡太守，行司州事，戍守洛阳（今河南洛阳市），并修治洛阳城垒。
被俘.刘裕灭后秦后班师，留了次子刘义真为安西将军，镇守关中。次年安西司马王镇恶被沈田子杀害，毛修之于是代任其职。不过，其时关中已遭夏国军队攻击，待朱龄石到后，刘义真就已出发东归。夏国将领赫连璝率军追击，刘义真因不愿弃车轻逃而被赶上，晋军最终战败，殿后的傅弘之及蒯恩等都被俘，毛修之则与刘义真失散，逃到了一个山势高峻山坡。当时晋军有逃