ws 95的抢占式多任务处理有着完全不同的改善。它可以由使用者决定是平均分配系统资源进行多任务操作，或是将某一个较不急于达成、或完成时间较长的程式设为背景（后台）执行，高度增加了多任务的实用性。在Windows 98中，微软新增一个名为「Windows Update」的附件，此附件可以自动从微软官网下载系统的重大更新（2006年7月1日后停止）。
第二版.Windows 98 SE（第二版）发行于1999年5月5日（也有1999年6月10日这样的说法，可能是中文版的发布时间）。