理学、眼视光学、医学检验技术三个本科专业。
艺术系.由内蒙古大学鄂尔多斯学院艺术系资源整合设立，下设舞蹈表演、音乐表演两个本科专业。
专业设置.鄂尔多斯应用技术学院目前拥有校本部（康巴什校区）、医学部（东胜校区）、矿业学院三个校区，设有本科专业15个、硕士点1个、专科专业10个。其中，研究生专业由武汉理工大学鄂尔多斯研究院和内蒙古工业大学矿业学院代为培养。此外，鄂尔多斯应用技术学院另设有8个中专专业，以鄂尔多斯市卫生学校的名义招生。本科专业共计15个。