玉总督暨后藤民政长官纪念馆」（即今国立台湾博物馆前身），以纪念前任台湾总督儿玉源太郎与民政长官后藤新平。据传，拆除前后，庙内所有神像都被收置于台北州厅厅舍一储藏室内。庙体部分石造建筑结构在拆解后被散置于当地至今。
后续.三芝福成宫之主祀妈祖神像据传原属台北大天后宫，该庙也因而成为北台湾妈祖文化节的重要成员之一。