在分子云核的尘埃会阻挡背景的星光，造成星际消光的效果形成暗星云。我们“本地”的巨分子云通常在其所在天区的星座范围内佔有明显的位置，因此经常会用星座命名，例如猎户座分子云（OMC）或是金牛座分子云（TMC）。这些分子云围绕着太阳成为一个环形的阵列，称为古尔德带。在银河系内质量最大的分子云是人马座B2，在距离银河中心120秒差距处形成一道环。人马座的区域含有丰富的化学元素，是天文学家在星际空间中寻找新分子的良好标本。
小分子云.孤立的、引力束缚的，质量在数百个太阳质量以下的小分子云称