继续担任东北边防军司令长官公署参议。1937年七七事变爆发后，于珍隐居北平。在北平市社会局局长任内，曾为八路军做秘密工作。他和儿子于国勋都是王岳石情报站人员。抗日战争结束后的1946年，于珍在国民政府军事委员会委员长东北行营任职。1949年中华人民共和国成立后，于珍出任辽宁省政协委员、常委。1956年，作为特邀委员参加了中国人民政治协商会议第二届全国委员会会议。1950年起，被北京市人民政府聘为参事室参事，一直任至1959年逝世。1959年秋，于珍在北京市因脑溢血病逝，享年72岁。1960年安葬在北