11月初，铁道部产品质量监督检验中心在沈山铁路和辽溪铁路上，对东风4D型3001号机车进行了动力学性能试验，测试机车的运行安全性、平稳性及主要部件的动载荷特性。1999年11月5日起，东风4D型3001号机车配属沈阳铁路局沈阳机务段投入运用考核，用于牵引沈阳至大连间的“辽东半岛号”快速列车，每天往返一次走行近800公里。2000年2月18日，东风4D型3002号机车同样配属沈阳机务段投入运用考核。2000年6月，铁科院机车车辆研究所对准高速全悬挂转向架构架进行静强度试验和疲劳强度试验，试验结果均符合设计要求