。1963年创建中国科学院世界历史研究所，亲自设计印度史的研究方向和计划。
文革受难.文革中被怀疑是国民党间谍受冲击。1969年下放外交部湖南茶陵干校，先被分配在菜园劳动, 后来在收发室发报纸信件。1971年下半年，因患严重的青光眼、白内障从湖南茶陵干校返回北京，妹妹陈素雅及其女儿、女婿、及其孩子搬来北京与陈翰笙同住。
晚年.文革后任中国社会科学院顾问, 国际关系研究所名誉所长，北京大学兼职教授、名誉教授，商务印书馆《世界历史小丛书》主编等职。2004