在签订停战协议时，将该舰作为德国海军的现代化舰只而列入需要扣押至斯卡帕湾的舰船名单中，并以此取代了协约国所要求的公海舰队旗舰巴登号。然而，错误很快便被发现并得到纠正。无论如何，交付仅完工了一半并且不具备适航条件的马肯森号几乎是不可能的。由于根据《凡尔赛条约》的规定，德意志国不允许建造排水量超过的舰只，于是马肯森号完工的可能性被彻底排除了。因此，舰只于1919年11月17日正式从中除籍。它于1921年出售，并在1923年至1924年间由汉堡拆船商库巴茨（）在基尔北堤拆解报废。