1952年的“三反”运动，顾准受到了撤销党内外一切职务的处分。1953年后，曾先后担任中央建筑工程部财物司司长，洛阳工程局副局长。1956年入经济研究所（现属中国社会科学院）任研究员后，写成《试论社会主义制度下商品生产和价值规律》，第一次提出了社会主义市场经济理论。1957年担任中国科学院资源综合考察委员会副主任，在随后的反右运动中被划为右派分子。1962年重返经济研究所。1965年再被划为“极右派”，文化大革命中受迫害，1968年4月，他的妻子汪璧因不堪迫害而自杀。他在遭受迫害期间，仍坚持独立思考