东汉时，南阳郡仍属荆州部，南阳郡辖县和西汉大体相同，治所在宛县（今河南南阳宛城）。领县：
三国两晋南北朝.东汉末年，南阳太守张咨被长沙太守孙坚所杀。袁术继为南阳太守，后在匡亭之战兵败后出逃。荆州牧刘表置张绣于宛城。后来张绣投降曹操。三国时，南阳为曹魏所有，隶属荆州。晋，南阳曾为南阳国，辖十四县，都宛。东晋，南北朝仍为南阳郡。南梁，天监十年（511年）析武陵郡侨置南阳郡，以安置南阳郡南下的流民。治建昌县（今湖南省辰溪县西北），属卢州。隋开皇九年（589年），废南阳郡置寿州。