太平岛处于较干燥且低海平面的时期因风化所形成，时代可能纵跨过去200万年。岩芯下段的碳酸盐岩已经白云岩化，被白云岩化的碳酸盐岩前系生成于浅海的珊瑚礁或潟湖，年龄难以考究，推测可能老于300、400万年。
气候.太平岛属热带海洋性气候，地处低纬度，四季皆夏，年均温，5月最热，可达35℃，1月最冷，但也有26℃。降雨颇丰，6 ~ 12月为雨季，年雨量1,500 ~ 3000毫米。季风盛行，夏季西南风，冬季东北风，风向在5月和10月转换，年均风速每秒3.7公尺。台风常发源于南沙群岛北