吉尔吉斯人原本世代居于西伯利亚南部、叶尼塞河上游的盆地。曾受匈奴统治，2世纪中叶后受鲜卑和柔然统治。北齐、隋唐时期先后受突厥汗国、回纥汗国统治，后在840年打败回鹘汗国后独立过一段时间，一直到924年才被耶律阿保机建立的辽朝统治。元代在叶尼塞河上游设立益兰州、谦州。到17世纪，受到准噶尔汗国蒙古人和俄罗斯帝国人排挤，渐渐迁移到天山北麓的伊塞克湖一带，即今日吉尔吉斯斯坦之地。清代，吉尔吉斯部落分为东布鲁特、西布鲁特。西布鲁特游牧于回部境内，受喀什噶尔参赞大臣等各路驻扎大臣管制，东布鲁特为清朝境外的藩属部落。