枯草桿菌（学名：Bacillus subtilis），是芽孢桿菌属的一种细菌，为革兰氏阳性的好氧性菌，普遍存在于土壤及植物体表，在人体亦可发现在肠道内共生的枯草桿菌。型态上的主要特征是菌体表面生有鞭毛，体内形成的内生孢子可抵抗恶劣的外在环境而存活。最近的研究显示，枯草桿菌其实并不全然是好气性的。枯草桿菌在食品和饲料添加剂上广泛使用，如日本人使用该菌的纳豆亚种（"var. natto"）将黄豆发酵成为纳豆和韩国料理中的清麴酱，近年来使用在种子保护及生物防治上，也经常被拿来应用。临床医学上是属于安全性的有益微生