聚居地的卫生问题一直为人诟病。1890年代，华南发生鼠疫。1894年春，在广州传出逾10万人死亡的消息。同年5月，上环太平山街一带的中国人集中聚居的地区亦爆发鼠疫，每天的死亡人数最多达100人。结果当年之内共有2,552人死于瘟疫，为数约十万名的华人离开香港，贸易额亦一度大幅下降。之后30年内，鼠疫仍然偶尔出现，1898年至1900年期间，再有1,290人死于鼠疫。
社会民生.教育方面，香港政府于1847年推行公立学校教育制度，补助中文学校的经费，于1873年将教会学校纳入在内。首