会港会的联赛中，取得加盟后的首个入球，更在季尾夺得其职业生涯首个菁英盃冠军，球季完结后，中村祐人于5月17日举行的香港足球明星选举最佳金球公众投票中，凭着对九巴元朗的一记30码罚球笠射当选，到2017/18球季，由于大埔队中核心球员伊达离队，使球会教练李志坚将中村祐人的位置堕后，担起伊达的角色，控制球队进攻节奏。2018年7月，中村转会港超联球会杰志。2019年9月，因缺乏上阵机会，中村被杰志外借至和富大埔直至球季完结。2020年6月，中村转会港超联球会理文。
国际赛生涯