礁生态系野生动物保护区的设立，在南边7公里较为健康的藻礁区域，目前仅有观新藻礁（桃园观新藻礁生态系野生动物保护区）有较多的定量生态研究资料，保护区内含丰富海洋生物及鸟类生态：根据调查发现，藻礁具有高度的物种生物多样性，动物密度为新竹香山溼地的八倍、台中高美溼地的五倍。2017年，相较于白玉藻礁，除了发现大潭藻礁具有许多疑为新种的壳状珊瑚藻，也发现一级保育类动物柴山多杯孔珊瑚，显示大潭藻礁生态系统非常丰富，与观新藻礁(桃园观新藻礁生态系野生动物保护区)的生态相比可说是并驾齐驱。因此，在桃园藻礁南边7公里较为健