查会，于1931年至1932年进行各地史蹟之调查工作，红毛城则被列为「台北州指定史蹟」之一。1937年 ，日本建筑史家参访红毛城，对其外观与内部设施做了详细的记载，并同时做测量。1938年，英方改建领事官邸的计划因英日关系恶化而暂缓。1941年，太平洋战争爆发，日本向英美宣战，红毛城的英国领事馆也在12月8日关闭。英方聘任二位日本工作人员负责在战争期间负责管理并维护领事馆，当地派出所警官在查封领事馆门户后，向英国领事表示档案皆已留存在安全的地方，领事馆财产将被保管至战争结束。英国领事被软禁在其住宅与花园