（2001）、《去恐惧，开创台湾历史新时代!》（2002）、《两个台湾的命运：认同TAIWAN vs. 认同CHINA》（2004）、《从宁静革命到宁静建国》（2004）等书。2002年，阮铭在台取得中华民国国籍，2004年被时任总统陈水扁聘为总统府国策顾问。