间仅有微弱的分化，这显示倭岩羊不应是一个独立物种，可能更适合划为岩羊的亚种。然而更进一步的遗传学研究认为，即使是亚种级别也不适用于倭岩羊。最新的研究显示，倭岩羊为多系起源，与四川岩羊在系统发育树上相互交错，形成错综复杂的母系进化关系，并不能直接聚为一个单系群，因此不宜将倭岩羊划为一个独立的种或亚种，而应视为四川岩羊中一个形态变异的特殊种群。倭岩羊与四川岩羊处于基因交流半隔离状态，它们同域栖息，但岩羊在海拔较高处，倭岩羊在海拔较低处，二者被海拔仅1000米处的森林带隔开，种群之间未有互动。有学者提出倭岩羊