那知觉协会内部出现虐待行为，令很多协会成员退出该会。国际奎师那知觉协会要求成员的儿女在五岁起住在协会的寄宿学校，从而令他们的父母可以毫无负担地为协会提供服务；有住在这些寄宿学校的儿童表示遭到其他协会成员和学校教师的性骚扰或强姦，亦有儿童被殴打、虐待、体罚和威吓，而且还没有足够的食物和及时的医疗服务。2000年，92名曾就读国际奎师那知觉协会寄宿学校的儿童提出集体诉讼，声称在寄宿学校内受到性侵犯、身体虐待和精神虐待，协会因而被判令赔偿。国际奎师那知觉协会的领袖在1996年卷入诈骗和谋杀诉讼，被指涉嫌参