后不久，哲宗亲政，欲极力摆脱这位祖母的阴影，改而支持新党，提拔新党的章惇做宰相，章惇也支持哲宗最宠爱的刘婕妤，有废孟皇后后位之图，遂酿成了这件冤狱，后刘婕妤被封为皇后。在此之前，刘皇后亦生下一个儿子。
复位与第二次被废.元符三年（1100年），哲宗病逝，端王赵佶继位，是为徽宗。旧党在向太后的支持下重新抬头，孟皇后时来运转，遂被复位，因其封后于元祐年间，故被称为元祐皇后。不料，次年（1101年）向太后病逝，其后于崇宁元年（1102年）又发生元祐党人事件，徽宗重新任