许世友的职位撤销。1961年和1962年，副总参谋长陈赓、李克农相继去世。随后中央军委于1962年和1963年分别调任李天佑、王新亭担任副总参谋长。1965年，杨成武担任中国人民解放军第一副总参谋长。同年底，因罗瑞卿事件，罗瑞卿被免去总参谋长职位，改由杨成武代理。1955年八总部时期，总参谋部下辖作战部、情报部、技术部、通信部、装备计划部、组织编制部、队列部、动员部、军事交通部、政治部、机要局、测绘局、气象局等13个部局。1958年杨成武任中国人民解放军常务副总参谋长。1959年恢复三总部体制之