受管制的副产品有可能造成更大的健康风险。以氯胺净水亦可能增加饮用水中铅含量，尤其是对于老旧住宅而言。暴露于此种高铅浓度的条件下，或导致血液中铅含量增加，并可能造成重大健康风险。
游泳池消毒.在游泳池中，氯胺通过游离氯与诸如尿液、汗液、皮肤细胞等物质当中的有机物反应而生成。相对比起游离氯，其杀菌效果较差；而且若不能适当地控制，其对于游泳者的眼睛亦会具有更强的刺激性。氯胺也是游泳池中独特的“氯”的味道的来源。一些为私人游泳池设计的测试工具无法区分游离氯与氯胺，这或导致游泳池中的氯胺浓度