东京至名古屋中间、山梨实验线以西的路段需要通过日本阿尔卑斯山脉地区。然而JR东海无法就选线问题与该路段所属的地方政府——长野县获得共识。在JR东海于2009年12月送交国土交通省的调查报告书中，总共列出了3条线路，分别为JR东海方面自己倡议的、直接贯穿赤石山脉（南阿尔卑斯）的「C路线」（），另外两条则是长野县府以促进县内经济为由而提出的北弯方案，其中的「A路线」行经和木曾福岛，「B路线」行经及饭田。伊那谷的B路线拉的最长，使东京至名古屋的轨道距离增为346公里、车程47分钟、要价5.74兆日圆；A路线的数据