事部部长汤化龙（未就任），副部长张知本，政事部下设七局（外交局（黄中恺为局长）、财政局（胡瑞霖为局长）、内务局、交通局、司法局、实业局、教育局）。各部中以军务部最为重要。随着革命形势的发展，为了加强革命党人对军政府的领导，10月25日由孙武、刘公、张振武等提议修改了《军政府暂行条例》，颁布了《中华民国鄂军政府改订暂行条例》。同时调整了都督府的机构设置和组成成员，取消了包揽行政大权的政事部，改设内务、外交、理财、交通、司法、编辑等6个部，后又增设教育、实业2个部，连同原有4个部，共12个部。军令部长杜锡钧