下旬，会以芒草等干叶筑巢于丛薮的底部，巢呈杯状。每窝共产两枚卵，呈白色，表面散布红紫色斑点，其钝端斑点较浓，形成帽状，卵的大小平均约为19×14 mm。雌雄鸟皆参与孵卵。 
保育.在保育等级上属一般类。在国际自然保护联盟濒危物种(IUCN)红色名录内保护等级为无危LC。 台湾短翅莺在适当的栖地内，种群数量尚称普遍，高山地区的开阔草生地环境还算稳定，近年高山农业受到政策与经济因素的限制，开发压力减缓，对台湾短翅莺的族群繁衍应有正面的助益。