宾常驻，在菲律宾遭日本占领后主要驻扎在两个地点，阿拉斯加的荷兰港、澳大利亚；因S级潜艇体积较小续航力不足，因此母港的距离离前线较近，主要任务是邻近海域的巡逻、侦查、防御任务；至1943年，猫鲨级潜艇产量已能汰换旧型潜艇，S型潜艇开始撤离前线，在后方进行反潜作战训练用假想敌，大部分美国海军所属的S级潜艇在二战胜利后便退役，1946年拆解。二战期间有7艘S级潜艇遭击沉，除了1艘可能是轴心国战果，其它皆为操作或友军误击折损。除了美国海军，英国皇家海军在二战中获得6艘军援的S级潜艇，主要任务也是作为反潜训练使用