原孢囊藻属（学名：）是绿藻的一个属，归类于绿藻门共球藻纲小球藻目小球藻科。本属物种目前被归类为绿藻，但它们都因丧失了叶绿体而失去光合作用能力，必须寄生于其他生物。某些原孢囊藻可导致动物和人类疾病，称原孢囊藻病。严重感染可导致败血症而致死。 
语源.原孢囊藻的学名'来自于拉丁语 '（意为“原始”）和""（意为“囊”）。