别为外源物质，从而逃避了先天性免疫的。"金黄色葡萄球菌"可以抑制吞噬细胞对趋化因子的反应能力；而有的物种诸如"结核杆菌"、"化脓葡萄球菌"和"Bacillus anthracis"则可以直接杀灭吞噬细胞来逃避先天性免疫。细菌和真菌也可以通过形成复合生物薄膜来保护自己；最近的研究表明这种生物薄膜是多种感染的关键所在，比如以囊肿性纤维化为特征的慢性绿脓杆菌感染。
其他形式的先天免疫系统.
原核生物的宿主防卫系统.细菌（可能还包括其他的原核生物），利用一种叫做限