己所鄙视为人偶的绫波零，明日香因而大受打击，自尊心至此完全粉碎。明日香于是将自己的内心封闭起来，但这也导致她无法启动贰号机。丧失驾驶员资格，以及倾慕的加持良治的死去，明日香自认已经没有存在理由，就这样陷入失神状态，被NERV情报部门找到后送入医院。 在剧场版中，失去意识的明日香被安置于贰号机内。明日香意识到母亲的存在后重新振作起来，驾驶贰号机再次战斗。短短的三分钟，就重创9台EVA量产机。然而，贰号机被朗基努斯之枪贯穿后停止运作，之后又被恢复的量产机分尸。在电影最后的场景，明日香与真嗣两人出现在沙滩上，真嗣