帝国继续向土耳其苏丹进贡（新任苏丹为苏里曼之子塞利姆二世，绰号「酒鬼」），以换取哈布斯堡王朝控制下的匈牙利王国西部和北部的和平。马克西米利安1568年再次试图说服新教和天主教言和，以失败告终。在奥地利，他给予新教派贵族以宗教信仰自由，不惜拒绝接受天主教大公会议通过的法令。与此同时，腓力二世的儿子的去世，使得马克西米利安或者他的儿子有可能继承西班牙的王位。马克西米利安同腓力二世的关系因此所缓和改善，马克西米利安也越来越谨慎处理宗教事务。1570年马克西米利安将女儿安娜嫁给了腓力二世，成为他的第四个妻子。