辞官获准，与傅汝舟、福州太守汪文盛有来往。嘉靖元年（1522年），都御史周季风荐任南京刑部郎中，未几，改任吏部验封司。嘉靖二年（1523年）游武夷山，感染风寒返家，两天后病逝，葬于福州西郊梅亭山。善夫精于天文、算学，能推算日蚀、月食，上疏请改历元。《明史·文苑传》有传，称其“闽中诗文，自林鸿、高棅后，阅百余年，善夫继之。”
着作.着有《少谷集》。清代阮元收录其《改历元疏》、《日宿例》、《时宿例》、《序数传》、《田制论》、《九章乘除法》、《九归法》等文章于《畴人传》。