。aufs是之前的的完全重写，2006年由开发。它旨在提高可靠性和性能，但也引入了一些新概念，例如可写分支平衡和其他改进——其中一些目前已在UnionFS 2.x分支中实现。aufs被拒绝合并到主线Linux。它的代码被批评为是“稠密，不可读，无注释”。相反，OverlayFS已被合并到Linux内核。在数次尝试后，作者已经放弃。
使用.Docker最初使用aufs作为容器文件系统层。它目前仍作为存储后端之一来支持。数个Linux发行版已选择aufs作为UnionFS的