下半旗及哀悼仪式，国务院其后亦公告8月26日所有特区政府及中央驻港机构的国旗下半旗致哀，因此当天的国旗及区旗均下半旗。升旗及下半旗仪式规格略次于回归纪念日的升旗仪式，由身穿常服的警察仪杖队执行，并由香港警察乐队负责奏乐，香港电台负责直播及安排大会司仪（倪秉郎及彭晴），下半旗后司仪逐一宣读死难者姓名，全场默哀3分钟。2012年10月1日晚上8时23分发生南丫岛撞船事故，时任行政长官梁振英宣佈10月4日为全港哀悼日，由当日起连续3日(10月4至6日)，所有政府总部和公司等都下半旗致哀，当中亦包括金紫荆广场。