离开日活，创立了北山电影制作所。同年与同样从日活离开并创立了的合作制作教育电影。1923年（大正12年）9月1日，北山的制作所在关东大地震发生后遭受损毁，北山于是迁往大坂。1945年（昭和20年）2月13日上午4时30分，北山清太郎因脑肿瘤在大坂府泉北郡高石町北55番地去世，时年56岁。墓地位于和歌山市打越町的真光寺。北山先驱性的电影作品当中，留存至今的仅有松本夏树于2008年（平成20年）发现并进行数码复原的《》，以及北山电影制作所制作、北山的弟子户田早苗担任演出和作画的《教育童话漫画 兔与龟》（