十七年（1558年）出生于江西安福县学，少时从父习文，稍长，读书过目成诵。万历四年（1576年）与兄何乔迁同举丙子科乡试，万历十年（1582年）父殁于家。万历十四年（1586年）中丙戌科进士，因母林氏去世，乃归家守孝。万历十六年四月，孝满后选授刑部云南司主事，每折大狱，人服明允。历官礼部仪制郎中。国本之争，神宗欲封皇长子常洛为亲王，而非太子，乔远力争其不可。万历二十二年（1596年），因属吏校对奏章失误，以“奏牍不恭罪”，谪贬添注广西省布政司经历。万历二十三年（1597年），其妻病亡，遂隐居镜山（清源山