能有效地杀死牠们。若牠们扩散至血液中，就可能会引发菌血症，并且被带到身体的其他地方，如脑膜、关节、骨骼及腹膜，亦可能会导致脑膜炎、脑脓肿、骨髓炎或脓毒性关节炎等。肺炎链球菌有着几种致病因子，包括曾提及的多醣荚膜，能帮助入侵寄主的免疫系统。牠有着表面蛋白质能阻止补体的活性化，及分泌能破坏免疫球蛋白A（IgA）的免疫球蛋白A1分解酶。肺炎链球菌的感染风险对一些在免疫球蛋白G（IgG）合成、吞噬作用或清除细菌能力有缺陷的人会相对提高。而且，如因先天性无脾脏或脾切除而缺乏脾脏功能，或是患有镰刀型红血球疾病会