吴钊燮转任总统府秘书长。
外交部部长.2018年2月23日，行政院发布人事异动，吴钊燮转任外交部部长。2月26日到任。2018年5月1日，中华民国与多明尼加断交。5月24日，中华民国与布吉纳法索断交。8月21日，中华民国与萨尔瓦多断交。2019年9月16日，中华民国与索罗门群岛断交。9月20日，中华民国与吉里巴斯断交，邦交国剩15个。
媒体评论.《中国时报》长年驻美的特派员傅建中对吴钊燮评论颇佳。2019年1月14日，吴钊燮接受郑弘仪等专访，对赵怡