建华任为民政局长后，同年9月决定透过内部拨款招聘研究总监，陈云根最后透过公开招聘程序，获聘为民政局研究总监。陈云根的研究小组随着何志平的离任于2007年6月底解散。陈云根曾任职岭南大学中文系助理教授，主要作品包括《香港城邦论》系列。《香港城邦论》在香港电台第五届香港书奖中得奖。2008年获香港艺术发展奖年度最佳艺术家奖（艺术评论）。其余着作及报章专栏内容多数以香港风俗、香港文化、中国语文及时事评论为主。2016年8月15日，岭南大学决定不与其续约而结束他的七年教学生涯。2016年7月27日，陈云根代