开除所有耶稣会教师，并对课程进行现代化改革。1831年，该校由于爆发学生抗议活动而被帕尔马女公爵玛丽·路易丝暂时关闭，直到1854年才被帕尔马公爵夫人重新开放。并在1859年进行组织调整，调整后的大学由神学院、法学院、医学院、物理与数学院、哲学与文学院及妇科、药学与兽医学院组成。义大利统一运动后，由于境内大专院校过多，帕尔马大学遂于1862年宣布降为B级大学，导致经费减少，教学质量也随之下降。该校最终在1887年恢复为A级大学，并且稳定发展至今。
组织.帕尔马大学目前由9个系所