46线的营办商于屯门市中心加开额外特别班次以疏导乘客，有关班次于富泰邨落客后会直接返回屯门市中心总站。该等班次在屯门市中心开出后，会直接经屯汇街、屯喜路、屯门公路、新德街、新和里、屯门乡事会路返回青山公路前往富泰。若按该行车路线，屯门乡事会路近圣公会圣西门吕明才中学分站候车的乘客，将会久候多时仍无法乘搭登车。因此，营办商会安排部分班次小巴在屯门市中心清客后立即不载客前往圣公会圣西门吕明才中学分站起载。为方便乘客识别及减少对乘客不便，由2019年10月28日起，营办商由46线分拆出一条支线46X（即本路线