季开始和电影版是相连的，在电影版吸引了一批新影迷的同时，也让一些没有看过电影的人跟不上剧情发展从而放弃了此剧。该剧的第二部续集《X档案：我要相信》（X-Files I want to Believe）于2008年7月25日上映。当初离开的男主角大卫·杜考夫尼再次继续扮演男主角穆德，女主角姬莲·安德森也参与了该续集的演出。剧情依照真实时间讲述第九季下档六年后的故事。然而电影上映时正值蝙蝠侠《黑暗骑士》热映，加上剧情设计上有缺失，整体来说更像是一部迷你影集，被视为失败之作。该片预算约三千五百万美金，在美国只