大厦于2001年决定全面清拆，改建公屋，大厦于2003年2月28日全部收回单位，在2005年施政报告中，政府曾提出计划翻新长沙湾工厂大厦作为创意艺术村，然而已因种种原因搁置。大厦于2005年6月开始招标拆卸，2007年3月拆卸，第1、1A及第2座被纳入元州邨第五期，以继续接收苏屋邨的拆建户。第3、4及第5座则兴建学校，作为圣公会圣多马小学及中华基督教会协和小学（长沙湾）之新校舍，2011年开始迁入。