最终将导致它们在治疗对抗生素有抗药性的感染中变得无效，因此，对广谱抗生素的使用应有所保留。抗生素处方过量和不适当地使用抗生素助长了细菌的抗药性。例如把氟喹诺酮做为首选抗生素的普遍误用导致了细菌的敏感性降低，这对某些严重的细菌感染有重要影响，比如与囊肿性纤维化相关的感染中，喹诺酮类是其中少量存在的抗生素之一。
使用不当.大约只有5-10％的支气管炎病例是由细菌引起的感染。抗生素对如普通感冒的病毒感染是没有效果的。支气管炎的大多数病例是源于病毒感染，并且具有“自我限制”，在几个星期