同法国达成和约，和约恢复了西法二国的战前边界，西班牙将伊斯帕尼奥拉岛的西属领地割让予法国。尽管戈多伊的媾和之举引得不满，但他仍然因此被国王卡洛斯四世封为“和平亲王”，为居于贵族顶阶的格伦代（Grande）。1796年，戈多伊同法兰西共和国达成《第二次圣伊尔德丰索协约》，令西班牙加入反英战争。1797年卸任首相一职，升为军队元帅（Capitán-General）。1801年，戈多伊再度出任首相一职，就任不久向葡萄牙宣战。戈多伊率军入侵葡国，击败葡军，同年和葡国代表达成巴达霍斯条约。葡国割让奥利文萨予西国，