明智光秀受到柴田胜全的帮助逃离山崎后，秀政把援助光秀的从兄弟明智秀满迫入坂本城。对败北有所觉悟的秀满把先祖代代相传的家宝让给秀政的家老直政后，在城中放火自杀。
北之庄攻略战.清洲会议后，秀政取代丹羽长秀拜领近江佐和山城并成为三法师藏入领的代官和守役。在天正10年（1582年）10月20日送出的书状中使用羽柴姓，被认为是在秀吉一族以外最初被赐予羽柴氏（名字）的人（『』49号「」 村川浩平 1996年）。天正11年（1583年）4月，秀吉进攻越前北之庄的柴田胜家。家康向秀吉送出的