21、20-22）不敌赛会头号种子、印尼强档的吉德翁·马库斯·费尔纳尔迪/凯文·桑加亚·苏卡穆约。2016年2月，小林优吾与保木卓朗出战奥地利羽毛球公开赛，在男双准决赛以0比2（12-21、12-21）不敌赛会头号种子、英格兰的马库斯·埃利斯/克里斯·兰格瑞奇。同年6月， 小林优吾与保木卓朗出战西班牙羽毛球公开赛，在男双决赛以2比0（21-10、21-6）击败丹麦的马蒂亚斯·克里斯蒂安森/大卫·道嘉德，赢得冠军。同年7月，小林优吾伙拍永原和可那和保木卓朗参加美国洛杉矶举行的美国羽毛球公开赛混合双打和男子