康德罗加堡不战而退极为愤怒，部分新英格兰民兵更拒绝听命两人。华盛顿随即派林肯到纽约，指挥及安抚新英格兰地区的民兵，而议会最终改为任命霍雷肖·盖茨接掌北军。
萨拉托加战役.林肯在8月初赶抵上纽约州。起初，林肯按照斯凯勒的命令，到哈德逊河以东、一带重编民兵，打算吸引并分散伯戈因的南进部队。由于伯戈因的推进受到阻碍，斯凯勒一度下令林肯回防哈德逊河西岸，但林肯却另有考虑。事缘约翰·史塔克刚好率领新罕布什尔州的民兵抵达新罕布什尔赠地。虽然史塔克于年前不获大陆军晋陞，愤而退出军队，并且拒绝听命