评内容有宣扬迷信与牵涉怪力乱神等因素而未获奖。后续在《电影档案：第35届金马影展得奖影片》一书上，有透露出当时评审动画师黄木村认为此片没有使用电脑特效而有手法过于古老粗糙的问题；另几名评审刘立行、贡敏、王清华等人批评内容有鼓吹迷信情况，并将此与宗教人士宋七力过去引发过的争议事件相提并论，之后游说其他评审跟进而让作品在金马奖落选。
后续.对于《魔法阿妈》是否有续集一事，导演王小棣表示她曾想出以豆豆回去阿妈的乡下度假时，发现乡下的环境遭到破坏，内容偏向探讨环境问题的剧情，但因为有众多需