回吐鲁番、管理旧部。班第认为，莽苏尔为察合台后王，应送回吐鲁番管理回衆；而额敏和卓所属部众，应遣回原籍鲁克察克（今鄯善县鲁克沁镇）。未几，阿睦尔撒纳及大小和卓相继反叛。莽苏尔不得回归吐鲁番，与哈什木一同逃往叶尔羌。干隆二十四年（1759年），清军平定大小和卓之乱，获莽苏尔、哈什木。次年（1760年），莽苏尔、哈什木赴京师朝觐，干隆皇帝加恩授其为一等台吉。此后，莽苏尔及其子孙长居京师，隶属于正白旗蒙古。