深2公尺处有一批古钱币，且唐代至明初期间均有，推测为由古代的船只触礁后所遗落，期间应是在明代年间。1998年11月12日，中华民国业余无线电促进会进行东沙岛八天七夜通讯活动，首度试通短距离VHF144MHz频道，顺利完成和架设在850公里外的台北市大屯山和林口长庚医院旁的台湾「火腿族」临时电台完成通联，而且还创下一瓦以下超低功率完成通联的纪录。1999年5月，高雄市长谢长廷至岛上渔民服务站挂上「旗津区中兴里18邻东沙31号」门牌，以宣示主权。2005年7月28日，中华民国总统陈水扁第二次赴东沙岛