历任滇军营长等职。辛亥革命期间，杨蓁参加了1911年10月蔡锷、唐继尧等人发动昆明重九起义。1912年（民国元年）5月，任滇军第2师第7团团长。1915年（民国4年）12月，护国战争爆发，任护国军第1军第1梯团第2支队长，出征四川。当时，他与第1支队长邓泰中合作击败敌军，立下军功。1917年（民国6年），任靖国联军参谋长，后赴日本考察军事。1920年（民国9年）12月初，杨蓁、邓泰中、金汉鼎等滇军指挥官因对滇系领导人唐继尧不满而秘密集会。会上决定迅速发动兵变，杨蓁劝靖国军第1军军长顾品珍回师昆明。次年2