马尾藻对航运不构成威胁，历史上帆船被困的事件是由于当地经常出现的微风天气。马尾藻海也在欧洲鳗和美洲鳗的迁移中发挥了重大作用。这两个物种的幼虫在那里孵化后前往欧洲或北美东海岸。成年后，它们还会试图回到马尾藻海产卵。据信，年幼的蠵海龟在孵化后会借例如墨西哥湾暖流的洋流前往马尾藻海，利用马尾藻为掩护躲避捕食者，直到它们成熟马尾藻海是最近全球海洋抽样调查（Global Ocean Sampling）基因组研究的主题。该研究由克莱格·凡特等人进行，目的是评估当地微生物生命的多样性。该调查结果显示，与以前的理论