猷也是创始教授之一。1938年夏起任西南联大物理系教授。1939年综合其研究成果，撰写专着《多原子的结构及其振动光谱》。在西南联大任教的8年期间，吴大猷主要负责的科目为电磁学、近代物理、古典力学、量子力学等，在这方面也培育出许多杰出的人才，李政道和杨振宁便是其中最着名的两位。1941年，吴大猷在西南联大开高等物理课程，听课学生有杨振宁等人。1945年，吴大猷被选为西南联合大学第八届校务会议代表。李政道由浙大转来，接受他的指导。抗战胜利后，1946年夏，吴大猷被军政部借聘筹建国防科研工作，赴美考察