试验和模拟运行后，“蓝箭”列车于2000年12月28日起在广深铁路投入载客试运营，试运行期间采用准高速列车的运行图，最高运行速度为160公里/小时。2001年1月8日，首列“蓝箭”电力动车组正式投入商业运营，最高运行速度为200公里/小时，从广州东站至深圳站间的直达运行时间为60分钟，至同年3月1日新运行图实施后仅需要55分钟，与X2000列车相同。至同年10月，广深铁路公司又陆续接收了另外7组“蓝箭”电力动车组。2001年10月，广深铁路公司以中国铁路第四次大提速为契机，进一步扩大广深城际列车“公交化