持有马来西亚护照的马来西亚公民亦可免签证入境中华民国，停留最多30天。
相关警示.有鑑于2019冠状病毒病疫情，中华民国外交部的国外旅游警示分级表将马来西亚归类为红色警示：不宜前往，宜尽速离境（2020年3月19日发布）；卫生福利部的国际旅游疫情建议等级表将马来西亚按疾病归类为第一级注意：提醒遵守当地的一般预防措施，与第二级警示：对当地採取加强防护（2020年11月6日发布）。另有鑑于严重特殊传染性肺炎疫情，已将各国家与地区归类为第三级警告：避免至当地所有非必要旅游（2020年3