藏以《元始无量度人上品妙经》居首。明神宗万历年间又刻印《续道藏》，增收《三官经》、洪应明《长生诠经》《无生诀经》《消摇墟经》等道书。明代编修有《历代神仙通鑑》，又名《三教同原录》，广收仙佛圣贤之传说。明末清初时，道教逐渐形成早晚课诵的风气，而编集《功课经》。清初，龙门派王常月住持第一丛林白云观开坛授戒，传下《龙门心法》。这段时期，也产出不少内丹着作，陆西星《方壶外史》，伍守阳《天仙正理直论》，刘一明《修真九要》，李西月《三车秘旨》，黄元吉《乐育堂语录》等，作者不详的《性命圭旨》、《太乙金华宗旨》也颇为流