1945年2月受命执行沿岸防御任务，并于6月1日舰种变更为特别警备舰，其副砲及对空装备更被搬上陆地，桅杆与烟囱亦被拆除，另外涂上空袭伪装用的绿系迷彩涂装。米内光政海军大臣与军务局曾计划战舰「长门」、航空母舰「凤翔」、重巡洋舰「利根」、数只驱逐舰直接回航海参崴并转让给苏联，以换取飞机、物资及燃料，不过在最后没有实行。于1945年7月18日，「长门」被航空母舰「艾塞克斯」号（USS Essex, CV-9）、「兰道夫」号（USS Randolph CV-15）、「香格里拉」号（USS Shangri-la