宇被毁，419座被移作他用，为全台各州厅中最惨烈的地区。而在同一时期，掌管大天后宫的三郊组合因为内部的派系冲突等问题，终于在昭和十五年（1940年）12月25日的协议后召开临时总会，而三郊组合临时总会决议将三郊产业，移交给台南州厅。时任台南州知事一番濑佳雄将三郊产业移交给「台南商工会议所」（今台南市商业会前身）。商工会取得三郊产业后，决定标售包括大天后宫在内的多笔产业，当时身任台湾总督府文教局调查官的宫本延人恰好到台南调查，于参访大天后宫时遇到石旸睢告知大天后宫面临标售拆除的危机。宫本延人得知后介入此一