教会教士李斐理（Philiber Le Blanc，又名卜于善）到兴化传教，黄母将儿子託付给他。三年后，李斐理又将黄嘉略託付另一位外方传教会教士梁弘仁（Artus de Lionne），期间曾拜一位信奉基督的举人江为标为师，学习汉语、拉丁文、中国典籍及基督教义，并曾游历中国多个地方。据黄嘉略所述，他16岁时，「出于一些没有必要详述、但两位先生认为正当的原因」，他被安排回乡，不久母亲病逝，守孝百日之后，他再次离家。
远赴罗马.当时正值康熙年间，各会传教士在中国礼仪之争上势同水火，李斐