新修缮澄源堂，翌年澎湖仕绅许棼乃撰〈澎湖妈宫澄源斋堂记〉碑文。光绪21年（即明治28年，1895年），位于妈宫的鸾堂一新社因被乙未战争战火波及，一度借用澄源堂（斋教之先天道）设坛，扶鸾济世。日治时期间澄源堂仍持续运作，素有「澎湖第一才女」之称的蔡旨禅（1900-1958年）在大正13年（1924年）于澄源堂设帐教学，为澎湖地区首位女性塾师，七个月后，又被延揽至彰化福吉堂（今彰化福善寺）平权轩教授汉文。澄源堂在1945年日本投降、国民政府接收台湾后，一度被军人及军眷佔住侵占，建物也遭受破坏，蔡旨禅与