斯·韦恩的祖先很早就发现了这个洞穴，在南北战争时期，这个洞穴被用作仓库及运送逃亡奴隶等目的。18世纪的拓荒英雄在这个洞穴的后部发现了一只巨大的蝙蝠，这只蝙蝠属于亚瑟王传说里的人物摩根勒菲；或许是因为这只蝙蝠，这个洞穴才得名“蝙蝠洞”。布鲁斯在小时候跌入韦恩庄园的枯井时发现了这个洞穴，但他一直将个洞穴封存到他再度返回哥谭市并成为蝙蝠侠的时候，由此可知他最初并没有打算将这个洞穴视为自己的秘密行动基地。除了蝙蝠侠总部的作用外，蝙蝠洞还给布鲁斯提供了一个隐私与安宁的地方，就好像超人的孤独堡垒。在蝙蝠侠故事的早期