行的既存路线，特别称为「并行在来线」，例如路线多与东海道新干线并行的东海道本线。数家JR公司因为同时拥有在来线与新干线，为减轻营运上的压力，已把部份并行在来线交由第三部门业者经营。例如与东北新干线并行的东北本线盛冈～青森路段交由IGR岩手银河铁道与青森铁道经营，与九州新干线并行的鹿儿岛本线八代～川内路段交由肥萨橙铁道经营等。