鬼会战斗时，陆军中将、帝国华击团总司令米田一基（池田胜配音）遭枪击暗杀未遂，失去意识；与此同时，金融界迫于政治压力，停止对华击团的经济援助。米田康复期间，藤枝枫（折笠爱配音）接替前作中牺牲的姐姐藤枝菖蒲，赴任帝国华击团新副司令。数月后，黑鬼会幕后黑手、陆军大臣京极庆吾发动军事政变，占领东京主要机关，并派政变军及黑鬼会袭击大帝国剧场。花组队员被迫逃出，重整力量展开反击，最终夺回了剧场；而京极的政变亦以失败告终。数月后，京极庆吾再度现身。他以政变爲幌子，等待时机发动“净化”——毁灭人类文明，建立充满怨灵的世