要由两家公司经营：一号线至九号线（彦州站至中央报勋医院站）及金浦都市铁道由首尔交通公社（一号线至四号线由2005年10月27日前称为首尔地下铁公社及后改称首尔地铁，而五号线至八号线由首尔特别市都市铁道公社营运，两者营运至2017年5月30日）。而九号线开花站至新论岘站由首尔市地铁9号线株式会社营运。此外，KORAIL亦参与营运一号线、三号线、四号线、京义中央线、京春线、京江线、西海线、盆唐线及水仁线的首尔市至市外区间。至于仁川国际机场铁路由空港铁道株式会社营运、仁川1号线、仁川2号线及议政府轻电铁由仁川交通