发窝阔台系的海都出兵争夺汗位，造成漠北地区动荡不安，史称海都之乱。1279年3月，张弘范在崖山海战攻灭南宋，陆秀夫挟持8岁的小皇帝宋幼主赵昺投海而死，南宋亡。元朝统一中国，结束自燕云十六州割让以来三百多年的分裂局面。元朝周边一些国家或地区（包括高丽、安南、占城、缅甸）臣服，加入元朝的朝贡关系。
中期的统治.1294年元世祖驾崩，元成宗继位。元成宗主要恪守元世祖时期的成宪，任用其侄海山（答剌麻八剌之子）镇守和林以平定西北海都之乱，并且下令停止征讨日本与安南。在内政方面专力整顿国内