教要求教宗玛尔定五世与教宗恩仁四世谴责伯尔纳定，但两者都认定他是无罪的。在弗罗伦斯公会议上，他也被宣布为无罪。1433年，伯尔纳定陪同西吉斯蒙德前往罗马进行加冕礼。
方济各精修会士总会长.1438年起，伯尔纳定放弃传道工作，任方济各会精修会士总会长。他入会时，意大利全境的会士人数仅三百名；他去世时，会士人数上升至四千。伯尔纳定对会士的学术研究非常注意，加强会士对神学和教会法的研究工作。他自己学问也很渊博，精通拉丁语与希腊语，在弗罗伦斯公会议期间，用希腊语对希腊教会代表们致词。