转到隶属中直机关的“外联系统”，出任中共中央对外联络部副部长；同一些“红色国家”、或曾经是“共产主义阵营”国家的原执政党保持联系和沟通。1997年8月，在中共十五大召开前夕，戴秉国升任中联部部长。
处理朝核危机.2002年底，朝鲜半岛核危机再度爆发。2003年1月10日，朝鲜公开宣布退出《不扩散核武器条约》。为了应对危机，当年5月，戴秉国返回外交部，继续出任副部长，并担任部党委书记（至2008年4月），挂帅斡旋“朝鲜核危机”；2005年3月，接替刘华秋，兼任中央外事办主任。在任