。依鄂图曼帝国的规定，所有成年皇子皆会被派任到各地担任总督，以培养他们管理帝国事务的能力，因此巴耶济德也被派往安纳托利亚担任总督的职务。1553年间，苏莱曼一世率军离开伊斯坦堡远征波斯萨法维帝国，在此期间巴耶济德负责治理埃迪尔内（即隶属鄂图曼帝国鲁米利亚的首府），但于战争途中，王储穆斯塔法皇子被苏莱曼下令处决，而穆斯塔法遭到处决的消息引起了帝国各地的动乱，一名伪称是自己是穆斯塔法皇子的叛徒在鲁梅利亚起兵反抗苏莱曼，尽管叛乱很快便被镇压下来，但苏莱曼仍怀疑他的儿子巴耶济德故意拖延对叛军的剿灭时间。S