真绪并发掘后者产生异变的实情，珠洲决定踏上旅程，还陆续邂逅几名拥有特殊力量，被称为「守护者」的少年，进而和「守护者」谱出恋情。本作关于玉依姬和守护者的世界观和历史设定有别于《绯色的碎片》和《白华之槛》，其攸关于丰玉姬和玉依姬的叙述，系取材于日本神话丰玉姬分娩并托子于玉依姬的典故。在《绯色的碎片》登场的珠纪和守护者们，将以协助者的身份客串登场。《真·翡翠之雫》则是《翡翠之雫》经过剧情重制的游戏版本，在DS版附有「桃花祭」的后日谈结局。
《苍黑之楔 绯色的碎片3》系列.《苍黑之