兼监制，三年之后率舰回国。光绪三十三年（1917年），海军处设立，他任副使（未委任正使）。宣统元年（1909年），他任筹建海军事务处参赞。宣统二年（1910年）年底， 筹建海军事务处改设海军部，他任海军副大臣。袁世凯内阁成立后，他署海军大臣。1912年中华民国成立后，谭学衡任南京临时政府海军部正首领，数天后委任了海军总长，谭随即解职。1914年7月，广东发生水灾。11月13日， 谭学衡任广东治河事宜处督办，同年12月，谭学衡到达广州，设广东治河处。 此后他先后聘请了上海浦江浚河局总工程师海德生、工程少校