德意志国防军一同参与了佔领苏台德地区、奥地利与捷克斯洛伐克的行动。在这些行动中，特别机动部队均由国防军指挥领导。此外，特别机动部队还为了这些行动特别组成了数个炮兵团，借以充实部份陆军单位的战斗力。特别机动部队所属的「德意志」、「日耳曼尼亚」两个团与希特勒警卫旗队均参与了波兰战役；而「元首」团（德奥合併后在奥地利征募而成立）则被划为后备单位，驻扎于布拉格。1939年9月，特别机动部队与纳粹德国陆军部份单位共同组成了肯夫装甲师，并于入侵波兰期间实施了多次联合行动。该单位于1939年10月7日在波兰城镇尼济察被解