。室町时代京都建筑的代表是金阁寺和银阁寺，这两座建筑也分别代表了北山文化和东山文化两种不同的文化艺术流派。室町时代也是京都庭园艺术最为发达的一个时期，禅宗思想融入庭园艺术当中，枯山水即为这一潮流的体现。室町时代庭园艺术的代表作有天龙寺、龙安寺、西芳寺、等持院等寺院的庭园。在安土桃山时代和江户时代，随着技术的进步，重现平安时代建筑修建当时的外观变为可能，京都寺院建筑的样式也趋于复古。例如教王护国寺（东寺）和清水寺都是始建于平安时代，在江户时代重建的寺院建筑。江户时代京都的庭园建筑的代表则是採用数寄屋造风格建设