垩纪早期的巴列姆阶到阿普第阶。在2011年命名的乌鸦翼龙（"Gwawinapterus"），生存于白垩纪晚期（坎潘阶）的加拿大，被归类于夜翼龙科。但在2012年的一个牙齿替换率研究，发现乌鸦翼龙的牙齿替换率不符合翼龙类，显示牠们可能是不属于翼龙类的其他爬行动物。古帆翼龙（"Archaeoistiodactylus"）生存于侏儸纪中期的中国，可能是生存年代最早的夜翼龙科。但古帆翼龙的正模标本，可能是达尔文翼龙的一个保存较差化石。红山翼龙也生存于中国，过去曾被归类于夜翼龙科。在2012年的种系发生学分析，红山翼