围环流给日本地区带来了10年一遇的暴风雨天气，其中以濑户内海区域为甚，四国中部部分地区降水量超过800毫米，甚至在高知县的某些地区甚至出现了1000毫米以上的降水量。即便在娜基莉登陆大韩民国以后，其残余依旧对日本一些地区造成不小的影响，在鹿儿岛县和熊本县一度出现暴雨天气。当娜基莉的低压中心出海后在8月4日及5日依旧为北海道带来暴风、巨浪和强降水。
四国、淡路岛、纪伊半岛.当娜基莉开始对沖绳县造成影响时，其外围环流亦开始对濑户内海地区造成影响。自8月1日至8月4日，娜基莉的螺旋雨