毕的避孕套最终都会送至垃圾填埋场，甚至被随意遗弃在街上，这便引起了部分环保份子的担忧——如果没有以像焚化般的方式永久处置，那么它们便有可能流入野生动物的栖息地，并对动物构成损害。与其他类型的避孕套相比，聚氨酯避孕套对环境及动物的损害更甚，因为聚氨酯是一种塑料，并不能被生物降解；乳胶避孕套也需很长时间才能完全分解。此外避孕套的塑料和铝箔包装也不能被生物降解。但不少观点认为避孕套所带来的好处已经足以弥补其在垃圾填埋场所佔的少许空间。像般的权威组织及专家皆建议把用毕的避孕套弃于垃圾桶内，因为把其弃于马桶然后沖走此