带领一百壮士据南门楼，坚决不降。西秦三天也没有攻下，最后隗仁精疲力尽，寡不敌众，被乞伏炽磐抓获。乞伏炽磐打算杀了隗仁，被段晖阻止。于是，把他囚禁起来。隗仁被囚五年不变节。段晖又为他求情，乞伏炽磐赦免了他，让他回姑臧。当时誉为凉之苏武。沮渠蒙逊任命他为高昌太守，为政有威惠。但是颇以爱财为失。