职请调四川。到达四川成都后，他任四川陆军小学堂总办。当时赵尔丰督川边军事，罗长裿参与其幕府。1908年，他被赵尔丰任命统领川边巡防新军五营，同时赵尔丰任命钟颖统领川边混成协。在任上，他主张对藏人以抚绥为主。1909年，清政府电令川军2000人调防西藏，英属印度政府唆使西藏三大领主叛乱。他因主张抚绥而遭到下属和赵尔丰的不满。1909年10月，新军后营管带程凤翔率兵入藏东，罗长裿令其撤回，却被程抗命，罗遂赶紧报告赵尔丰。不久，程凤翔所部遭到藏东民众抗击而败归。赵尔丰未处分程凤翔，并严斥罗长裿怯懦，罗长裿遂称病告