民国与日本关系的一部分。
史前至清代.琉球与台湾在地理上相当接近，但情感上始终无法做出连结。在约3万年前的旧石器时代，就有人从中国渡海到琉球居住。分析人骨化石和DNA后认为，当时住在琉球的很可能是台湾过去的人。1874年（清同治十三年，日本明治七年），琉球国船难者因误闯台湾原住民领地而遭到出草遇害，史称八瑶湾事件；日本因而出兵攻打台湾南部原住民各部落的军事行动，引发中日两国的外交折冲，史称牡丹社事件。
日治时期.1895年清朝割让台湾后，台湾与琉球均成