琬琛与公民党中央关系紧张，一度传出退党。公民党原拟游说陈琬琛参选超级区议会议席，惟陈琬琛因工作问题放弃。最终陈琬琛留在公民党，惟新界西支部有大批成员退党。2015年香港区议会选举，陈琬琛获得3,169票，大胜1,773票的民建联对手、时任北区区议员刘国勋妻子吕迪明，创下个人区议会选举得票新高，并且将得票差距拉开至1,300多票。2016年香港立法会选举，陈琬琛获公民党推荐出选区议会（第二）功能界别，他任职医管局护士的太太更取出二百多万港元的公积金给他应付选举开支。但由于在民意调查中一直些微落后，为了