久被元军镇压，林桂芳等人被杀，起义失败。至正年间，主簿徐闻可以土石为料修筑新会土城，奠定了后世新会城的雏形。至正二十一年（1361年），黄斌聚众反元，攻占并烧燬新会城。
明清时期.明洪武元年（1368年）六月，朱元璋派征南将军廖永忠捕杀久据不降的农民军领袖黄斌，正式将新会纳入明朝的版图。洪武三十年（1397年），千户宋斌以砖石围筑城墙，县城西起犀山东至马山，周长六百六十丈，县衙建于城内，是为内城。成化十年（1474年），知县陶鲁以蚝壳修筑了新会子城，并开凿会城河。至万历元年（157