突起物为卷曲状的螺旋状杆，通过与微管的反复结合与分离，使动力蛋白在微管上“行走”。另外一个突出物为延长尾，结合至中间链和轻链上，负责运输货物与动力蛋白的连接。重链在整个动力蛋白中的轮流活动使单个动力蛋白在不脱离微管的情况下长距离运输货物。在真核生物有丝分裂中的动力蛋白需要由动力蛋白激活蛋白激活。动力蛋白激活蛋白可促使动力蛋白与运输货物结合，也可以调节动力蛋白的活动。
轴丝动力蛋白.轴丝动力蛋白依据生物的不同具有一到三个不等同的重链，每一个重链有一个环状马达结构域，一个起跟踪作用