抚司掾，改派为户部架阁。之后籍田令、太学博士。当时北方李全、时青归附宋朝，许应龙有“养虎遗患”之说，后来如其所言。升迁为国子博士、国子丞、宗学博士。宋理宗即位，许应龙陈说：“正心为治国平天下之纲领。”转任秘书郎兼权尚右郎官，升迁为着作郎。请求外任，知潮州。陈三枪起兵赣州，出没在江西、福建、广东之间，势力很大。钟全相继为乱，枢密陈韡率领江西担任招捕使，三路调军，分道追剿。乱兵逼进潮州境，许应龙调水军、禁卒、士兵、弓守，扼守要害。明间谍，守关隘，断桥开堑，斩木塞路。点集激励民兵，明晓保家乡、守室庐、保全妻儿