废去时任太宰的武陵王司马晞，王彪之当时试图劝阻桓温但桓温心意已决，并不接纳。次年，晋简文帝逝世，当时群臣都很疑惑，不敢让皇太子司马曜继位，更有人认为要等待桓温作出决定。王彪之严正地维护太子继位的正当性，终令众官议决迎皇太子继位，即晋孝武帝。太皇太后褚蒜子当时下令由桓温依周公居摄的先例代幼主执政，然而王彪之以桓温必当辞让而影响朝廷运作为理由不奉绍令，封还给太皇太后，此令最终亦没有实行。宁康元年（373年），桓温患病，并表示想获授九钖。王彪之却与谢安联手拖延袁宏撰写赐九钖的诏文，终令文章在桓温于当年死时