、染色体异常、删除突变、姐妹分体交换以及DNA与蛋白质交联。有研究证明虽然砷不直接作用于DNA，是一种弱突变原，但它会增强其他致癌物质导致突变的能力。比如，人类和其他哺乳动物细胞在接触紫外线后再接触砷，二者的协同致突变性就会增加。一系列实验观察显示砷的基因毒性主要和其在生物转化中产生的活性氧（ROS）有关。生成的活性氧会产生，DNA链断裂、交联以及染色体异常。DNA碱基的改变，特别是使G:C对突变为T:A对的，会造成氧化损伤。无机砷即使在低浓度时也会导致DNA链断裂。
抑制DNA修复