步兵营、机械化步兵旅、工兵群、海军舰队指挥部及中华民国海军陆战队等单位，共计投入322名官兵，并动员包括悍马车、V-150、中型战术轮车、橡皮艇、AAV-7A1等载重及运输机具共86辆次，协助佳冬地区则有陆军装甲第五八六旅装甲步兵营及战车营以及海军陆战队陆战第九九旅,帮助重建灾区工作。经统计，灾害爆发复原的一个月间，国军光空中运送方面，就出动15,815名官兵。除国军之外，中华民国内政部也出动警消投入救灾，以内政部公佈《莫拉克台风灾害应变处置报告》统计显示，几乎全部动员的重灾区警消共抢救灾民人数达41,