1930年代，程子卿也曾为中国国民党左派以及中国共产党做工作。他参加了宋庆龄领导的中国民权保障同盟的活动，并加保护。他接受宋庆龄等人的疏通，使一些被捕的中国共产党党员获释。他还参与侦破了国民党特务暗杀杨杏佛案。国民党特务在上海法租界绑架邓演达，被上海法租界巡捕房破获，此后程子卿托宋庆龄转告邓演达称，“切戒一人随便外出，最好通知捕房派人保护，以防不测。”程子卿还曾说，“我现在也是教徒，愿追随真理做人和做事。”国民党右派对他甚为不满，1931年至1936年间，程子卿先后七次收到匿名警告信，而且最后两次附子弹。