某些微生物需要在活体动物中培养。虽然血清学和显微镜技术让运用活体动物培养成为不必要，但细菌（例如痲疯桿菌和）必须在活体动物中培养。在培养物或动物体内生长之外，也有替代的方法来鑑定病毒。有些病毒可在卵中培养。另一种有用的鑑定方法是，使用载体来培养传染原。恰加斯病异种接种诊断法是个重要的例子，因为不容易直接证明病原体在患者体内存在，碰到这种情况，可用异种接种诊断法-从疑似受感染者取得的餵食给未受感染的（克鲁氏锥虫的载体），然后检查接吻虫的肠道，看是否有克鲁氏锥虫存在。
显微镜学诊断.诊断