易名为「慈云山天主教小学」。该校后来于2006年增设「圣母山」及「学生活动中心」。其校友会于翌年成立；另外，校园内的「祈祷室」及校园电视台在2014年才出现。同年3月亦正式组成法团校董会，实施校本管理政策。
毗邻建筑.毗邻黄大仙官立小学，黄大仙铁路站C2/D2 出口，黄大仙中心，黄大仙下邨龙光楼、龙辉楼、现祟山、黄大仙警署。
班别架构.黄大仙天主教小学在校学生约600人共24个班别。
圣云先小堂.圣云先小堂（英语：St. Vin