守丧期满后，补福建汀州府，调漳州府。当地民风彪悍，常有械斗。赓芸治理有方。不久，升汀漳龙道。嘉庆二十年（1815年），擢福建按察使，署布政使，年余之后实授。
横遭诬告.赓芸任漳州知府期间，龙溪县有械斗，县令懦弱，无法管理。有代理和平知县朱履中，看似忠厚，实则狡诈，赓芸命其移任龙溪。然而履中到任日久，于事毫无裨益。赓芸方才知其狡诈。待赓芸署任布政使，便将履中改任教职。履中亏欠盐课，唯恐获罪，于是向总督汪志伊、巡抚王绍兰诬告，称亏欠帑币是因道府贪婪勒索。赓芸为人耿直，曾因言得罪汪志伊，