川康绥靖公署高等顾问。1941年，但懋辛作为社会贤达出任国民参政会参政员兼川东办事处主任。1943年，当选第三届国民参政会参政员。1945年，以陆军上将退役。1947年，但懋辛当选四川第二行政区国大代表，1948年当选立法委员。他参加了金绍先等人在立法院组织的以反独裁为目的的“二·五座谈会”。在北平和谈期间，座谈会由但懋辛领衔发表了《拥护和谈的宣言》。中国人民解放军占领成都前夕，但懋辛协助中国共产党地 下组织在国民党方面的军政界策反，促使刘文辉、邓锡侯、潘文华、鲁崇义等起义。
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