协合大学的人类学家葛维汉对广汉三星堆进行了首次发掘。抗日战争爆发后，该校与迁来成都的齐鲁大学、金陵大学、金陵女子文理学院、中央大学、燕京大学等校联合办学。爲躲避日军对成都轰炸，该校一度迁往峨嵋山脚下。
结局.1949年中国人民解放军佔领成都。随后，中共建立的中华人民共和国政府接管华西协合大学，任教于该校的外教纷纷归国。1951年，该校被改名爲「华西大学」。随后，中华人民共和国在全国进行院系调整，华西大学除医药学以外的专业均被调离，但也有其他高校的医学学科併入该校。1953年，仅