说有飞机低空向，方向是西南方向。此后，该客机沿着马来西亚与泰国边境线，飞越了马来半岛。据称由于“马来亚半岛有许多海拔1000至2000公尺的山地，低空飞行较为危险”，该航班一度恢复至正常巡航高度。当航行至马六甲海峡东岸的槟城后转向西偏北飞行，越过了霹雳岛，并逐渐降低了飞行高度。此后从马来西亚军方雷达中消失。凌晨2时40分，航班再次短暂出现在军方雷达中。此时航班位于航点VAMPI，往安达曼群岛方向继续飞行，随后再度从军方雷达中消失。凌晨2时53分，胡志明航管要求另一架马航客机MH386尝试联系MH