地线客运服务于1959年结束运营，但是通往阿什蒙特的地铁一直未间断。1965年8月26日，剑桥-多切斯特线更名，成为波士顿地铁红线。1971年，红线开通布伦特里支线，当时的布伦特里支线不在哥伦比亚站停靠。1982年12月1日车站更名，以附近的麻州大学波士顿分校和肯尼迪总统图书馆暨博物馆作为标志，命名为肯尼迪博物馆/马萨诸塞大学站（），车站站牌副标题为哥伦比亚站。1988年12月4日，车站重建，为布伦特里支线增加一座站台。工程花费1350万美元。1997年9月，马萨诸塞湾交通局恢复了开往米德尔伯勒/莱克