美拉尼亚和西普鲁士地区成为了波兰的省分皇家普鲁士，获得了数个特权，特别是在但泽市。1569年皇家普鲁士成为了波兰立陶宛联邦的一部分，保留了普鲁士人的自治政府。另一方面，在托伦条约中降为波兰附庸的条顿骑士团仍然拥有东普鲁士。条顿骑士团国1525年升格为普鲁士公国，1660年波兰丧失了对此地的宗主权。1772年大部分的王室普鲁士地区在第一次瓜分波兰之中合并到普鲁士之内，次年成为了普鲁士的西普鲁士省，例外的是并入东普鲁士省的威米亚地区。1793年第二次瓜分波兰之中，但泽这个汉萨城市已经不能靠本身的财富而存活，