防共协定》，也造成之后两军种间的不和。1938年上任的德国外交部长约阿希姆·冯·里宾特洛甫希望透过防共协定的强化，推动德日与义大利之间的三国军事联盟。这再度造成陆军亲德派与关注美日关系、英日关系的海军和内阁之间的冲突。但德军在1939年与1940年发动闪电战袭卷欧洲大陆后，偏向日本陆军与德意日轴心联盟的舆论使得海军高层停止反对。空中与海上的发展也同样成为日本帝国陆军与海军之间的冲突点。在单位编制及作战角色上，陆军拥有属于自己的潜艇、水上舰艇（包括驱潜舰）以及造船厂，甚至还有专门负责海运的部门；而海军亦拥