后，侯峒曾入城再议守城抗清一事。随后，守军于北门仓桥炮击清兵，并打死李成栋之弟李成林。七月初三日，清兵围攻嘉定县城。次日城陷，李成栋屠城，侯、黄两人殉国。二十四日，趁李成栋率部离开，邑人朱瑛聚众再次占领县城。李成栋命部众镇压义军，县城再遭屠戮，尤以葛隆、外冈等地死亡人数最多。八月二十七日，因原南明总兵绿营把总吴之藩反清投明，攻打县城，城内民众相应。遭镇压后，清兵再度屠城。史称“嘉定三屠”。民国二十四年（1935年），嘉定全县的教职员与学生为纪念黄淳耀与候峒曾两人率众抵抗并殉国的事迹，设立“明忠节侯黄二先生纪