号月台的车门落客，然后关门，再开启1号/4号月台的车门上客。这种设计被称作西班牙式月台佈局。自从2004年第二次扩展工程完成后，人流组织採用完全单向方式，列车一旦到达罗湖站，所有乘客必须落车并前往离境大堂，车站有职员强制乘客落车，不可以留在车厢并往返上水至红磡沿途各站，必须出闸前往中国内地，故此当时一旦错误地前往罗湖，亦要先出闸过境，然后在深圳走回港通道，再入境香港才能再入闸乘坐回头车。不过在落马洲支线通车后相关安排获放宽，乘客如果于其他车站误乘往罗湖站的列车，可在本站直接乘坐反方向的列车，列车也有广播