在辞任公务员工作后，于1927年7月加入神职，在1928年进入Paromeos修道院。1959年5月10日成为亚历山大科普特正教牧首，1965年西里尔六世主持在埃塞俄比亚首都阿迪斯阿贝巴推动教会现代化。1968年6月，获得圣马可的圣遗物，并为其在开罗建立圣马可主教座堂，当时埃及总统纳赛尔及埃塞俄比亚皇帝海尔·塞拉西一世均出席了仪式。同年，西里尔六世等确认见证圣母玛利亚灵体出现在埃及圣母教堂。1971年3月9日，西里尔六世逝世。 欣诺达三世曾经谈到他：「在教会历史中没有人能像西里尔六世般能为如此多