盖菇属的物种进一步区分为数个组，有些缺乏棘红细胞的节已被提升为独立的属，如2008年提升的"Leratiomyces"属是来自球盖菇属的"Stropholoma"节，前述的"Protostropharia"属是来自"Stercophila"节。属于迷幻蘑菇的曾被分类在球盖菇属，之后被辛格改分至，此变动与后续DNA序列分析一致。古巴裸盖菇的中大型大小、发育完整的蕈环与深色的孢子和球盖菇外表相像，但应属于裸盖菇属，而和球盖菇属没有密切关系。
描述.球盖菇属的特征为蕈柄上明显的蕈环，