部分乘客在清华园站乘坐这一并上车补票。10月31日22时53分，清华园车站停靠的最后一班列车S232次列车进站。22时55分列车开出后，清华园站站长关闭了站灯并锁上了通往站台的门，清华园站正式停运。清华园站关闭后，车站内的股道将会拆除以腾出场地安装盾构机，但是车站站房将会保留；而车站的大部分职工将会被调配至黄土店临时车站负责客运业务。
站房建筑.
老站.该站初代站房建于1910年，在原京张铁路第五道口东南方向约150米。京包铁路迁移后，这里结束了客运历史，