大剂量（大于500毫克）服用会导致胃痛、反应迟缓或轻度抑郁。而在一些特例中，缬草亦会导致头痛甚至夜惊。在大多数标准药物筛选中，都要检验个体是否对缬草提取物产品中所含苯二氮䓬类药物呈阳性。缬草的成分需由肝脏分解，因此肝机能不全患者禁用。而缬草所含成分与烟酸或烟酰胺共用对肝脏有很大的毒性，因此要避免混用。在妊娠过程中使用缬草产品有流产的可能，因此尽量不要服用相关产品，而关于缬草对妊娠和哺乳的安全性，仍未获得充分的相关资料。缬草的成分对中枢神经系统有抑制作用，因此不应与酒精、苯二氮䓬类药物、巴比妥酸盐、等