宗干道五年（1169年），雷孝友中进士，担任南剑教授、国子监祭酒。庆元党禁，辞官求去，被朱熹推重。起用为国子监祭酒、御史中丞，弹劾韩侂胄。宋宁宗开禧三年（1207年）韩侂胄被杀，十二月，雷孝友和卫泾自御史中丞转任参知政事，以钱象祖为右丞相，兼枢密院事。吏部尚书林大中签书枢密院事。嘉定元年（1208年），兼知枢密院事。二月，知枢密院事雷孝友罢职。以观文殿学士知福州。死后封唐国公，赠太师，谥文简。