:投票日前夕.3月19日下午1点45分，正在台南市市区扫街拜票的时任正副总统陈水扁、吕秀莲遭到枪击，时任副总统吕秀莲膝盖受伤，时任总统陈水扁腹部轻微擦伤。两人后被送往奇美医院治疗，两人都意识清醒，没有大碍，医院外聚集大批民进党支持者。总统府秘书长邱义仁在3点30分证实，陈吕两人遭到枪击，并表示已经找到子弹，但是没有说明一共开了几枪、找到几个子弹，以及是否已经逮捕凶嫌。总统府也表示已经启动国安机制，并表示不会推迟第二天的选举投票。连战也在得知消息后表示“希望他们尽早康复”。针对这次事件泛蓝支持者怀疑