为主任委员的荆江分洪委员会，至1953年4月，荆江分洪工程全部竣工。1953年1月，李先念兼任中共中央中南局副书记、中南行政委员会副主席。1954年9月，李先念任国务院副总理。10月，兼任国务院财贸办公室主任，负责综合管理财政部、粮食部、商业部、对外贸易部、中国人民银行和指导全国供销合作总社的工作。在社会主义改造中，李先念提出建议，在工农业产品货源已为国营经济掌握的情况下，城市要允许私营零售商继续经营，农村要发挥小商小贩在流通领域的作用，恢复农村集市贸易，允许农民出售完成统购任务后的多余农产品，以活跃城