争端.齐格蒙特二世·奥古斯特的“波罗的海自治领”计划旨在维护波兰对其在波罗的海沿岸有切实利益要保护的地区与港湾的通行权和控制权，而这一计划让联邦参与到利沃尼亚的冲突之中，而利沃尼亚也因此成为波兰立陶宛与沙俄之间的一系列争端的另一个发生地。1563年，伊凡四世攻占波洛茨克。1570年的斯德丁和约（包括瑞典、丹麦等几个势力）后，联邦仍然保留对利沃尼亚主要地区的控制权，包括里加和派尔努。1577年，伊凡发起远征，为自己或其封臣霍尔斯泰因公爵马格努斯夺取利沃尼亚大部，除了里加和雷瓦尔的沿海地区。不过，随着巴托利从