年6月，袁世凯死去，李宗黄昇任云南督军府（督军：唐继尧）参谋处长，并获北京政府黎元洪授予陆军少将位。1918年（民国7年），赴日本考察地方自治。1919年（民国8年）1月，担任云南省市政公所督办。1921年（民国10年）3月，李宗黄作为唐継尧的代表赴广东，担任护法军政府交通部次长、署理部长事务。1923年（民国12年）8月，被任命为驻粤滇军第2军参谋长，积极讨伐陈炯明，获孙文（孙中山）授予陆军中将位。同年中，担任大本营参议及高级参谋。1924年（民国13年）1月，任广东江防司令，当选中国国民党第1届候补