淡色藻门（学名：）是不等鞭毛类的一大部分光合生物。它被分为两个亚门——Phaeista（包括Hypogyristea及Chrysista）和Khakista（包括及zh-cn:硅;zh-tw:硅藻纲）。Chrysoparadoxophyceae纲在两个亚门以外；还有另外一堆被综合为Subphylum Ochrophyta "incertae sedis"这个临时名称的亚门级分类单元。Class Placidiophyceae 这个名称已不再使用，因为其成员在现时的分类已不再属于淡色藻门，但仍然