以及几家大型私营公司的资助，在1958年创立了法国高等科学研究所（，简称IHÉS）。1962年研究所迁往现址，在伊维特河畔比尔（Bures-sur-Yvette）的玛丽林（Bois Marie）。他出席了1966年8月莫斯科的国际数学家大会，代替亚历山大·格罗滕迪克领取菲尔兹奖，因为格罗滕迪克抗议异见作家受到的对待而杯葛大会。莫查纳从1958年起，担任法国高等科学研究所所长，直至1971年退休，由荷兰数学家接任。