吾尔族分离主义者在喀什建立了短命的东突厥斯坦伊斯兰共和国，使用了“东突厥斯坦”一名来宣告其脱离中国独立，为这个旧时的地理概念赋予了政治内涵。仅几个月后的1934年2月，东突厥斯坦伊斯兰共和国就在西北青海马家军军阀马仲英的进攻下宣布解散。1933年，盛世才发动政变驱逐金树仁，并成为新疆的军政领导人，并依靠苏联的支持，最终平息全省境内的叛乱势力。1942年，盛世才转而与南京国民政府合作，苏联开始积极扶植遭盛世才压迫的新疆各少数民族人士，组织各种武装及政治组织。1944年9月，盛世才因试图再度投靠苏联斯大林而