机构在1921年8月，随着中央研究所的成立而合併成中央研究所「嘉义农事试验支所」，其土地南侧为林业试验所中埔支所嘉义试验地（今 嘉义植物园）。1939年4月，改隶为台湾总督府农业试验所「嘉义农业试验支所」。二战后，嘉义农业试验支所改组为直隶于台湾省行政长官公署的台湾省农业试验所嘉义农业试验支所，民国三十六年（1947年）5月时改隶于台湾省政府，于民国三十八年（1949年）8月改隶于农林厅，名称里的支所也改称为分所。在民国八十八年（1999年）7月1日之后，该机构名称改为行政院农业委员会农业试验所「嘉义农