国民党当局包围了集中在云南大学、南菁中学两校的学生，并以断水、断电、断粮相逼迫。1948年7月8日，特务又在南菁中学门口开枪打伤3名学生，抓捕1名教师。1948年7月9日，蒋介石电令云南当局“即饬宪警进入云大等校逮捕奸党”。1948年7月13日，国民党教育部派参事刘英士到昆明，以“疏导学潮”为名，与云南国民党当局密谋策划，加紧镇压学生运动。1948年7月15日凌晨4时左右， 2000多名军、警、宪、特在警备总司令何绍周亲自指挥下，进攻集中于云南大学会泽院和南菁中学的学生。经过数小时的抵抗，南菁中学当