善堂（Misericordia）等机构，专事处理民政事物。参事会由6名参事，如执行长、市长、司法首长、同善堂代表及马六甲大主教等组成，以管理马六甲的财政、城市清洁、公共建筑等。同善堂是慈善机构，其任务是扶老济贫，照顾孤儿和犯人。葡萄牙也沿用一些马六甲苏丹王朝的官职，协助管理外籍侨民、当地民族和一些特殊地区的管理。这些职务有宰相，由葡萄牙国王任命，管理马六甲的亚洲籍外侨；港务官，协助管理来往船舶、接待来使，引见马六甲总督；天勐公， 由葡属印度总督委任一名葡萄牙人担任，属终身制，专门管理南宁 和林茂的米南加