他被任命为钦差大臣，同伊里布一起赴浙江向英军求和。8月，英军闯入南京下关长江江面，耆英同伊里布赶奔南京，跟英国代表砵甸乍谈判，签订了中英《南京条约》。1843年，耆英再任钦差大臣，与英国签订《中英五口通商章程》和《虎门条约》。1844年，耆英任两广总督兼办通商事务，与美国签订了《望厦条约》，与法国签订了《黄埔条约》，与瑞典签署了《中瑞广州条约》。1858年第二次鸦片战争期间，耆英被派赴天津协助桂良与英法联军交涉，由于英军在占领广州期间查获两广总督衙门大量档案文件，发现耆英在上报朝廷时对英国言辞不