群岛和马德拉群岛位于亚热带，但岛屿间复杂的气候细节以及粗糙的地形使得天气预报变得困难。两地的年平均气温变化幅度不大，沿海地区不少于。亚速尔群岛的一些岛屿则拥有旱季。根据柯本分类法，亚速尔群岛和马德拉群岛大部分属于地中海式气候，而亚速尔群岛的弗洛雷斯岛和科尔武岛介于副热带湿润气候和海洋性气候之间，马德拉群岛的圣港岛属于半干旱气候、属于沙漠气候，年降水量约为。两地的海面温度冬季介于，夏季介于，最高可达到。
生态环境.虽然葡萄牙有着数千年的人类定居史，但是一些地区仍然保留着原始的植被地貌