0年至1941年亲自驾机飞往中国常德市上空执行散播传染病任务。前陆军军医汤浅谦在战后曾表示：「对我们来说，石井就像神一样。那时候，我们认为他所作的一切，对我们国家赢得战争来说，都是必要的。」1942年8月，石井被撤销「731部队」部队长职务，转任「中国派遣军」第1军军医部长，其原因常为人引用的说法是石井因挥霍公帑与贿赂贪渎而被惩处，经中国湖南文理学院「侵华日军细菌战罪行研究所」教授陈致远与朱清如两人的考证，此说最早出现于日本作家森村诚一在其纪实着作《》，源于作者对若干名不愿具名的前「731部队」成员之访谈