此后马文辉、联合国香港协会、香港民主自治党等透过不同途径推动香港的自决与自治。根据2007年港大民意研究，受访者中有独立倾向者约佔25%，不认同独立者约佔64.7%，另外33%香港人认为若中国共产党在中国持续执政则会增加香港独立的倾向。香港自治运动是香港本土派的意识运动，理念建基于香港学者陈云所编着的《香港城邦论》为基础，认为香港是一个城邦格局。主张香港在《基本法》和一国两制的大前提下，应享有真正的自治权利，并非主张香港独立。陈云本为运动的提倡者，但于2013年6月13日，「香港自治运动」的脸书专页宣布