Cândido的牙齿」，是以巴西科学家Cândido Simões Ferreira为名。坎迪多齿鳄的最明显特征，是颚骨的内鼻孔非常长。在2004年，坎迪多齿鳄被归类于新建立的坎迪多齿鳄科（Candidodontidae）。坎迪多齿鳄最初被认为是马里利亚鳄的近亲。2006年的种系发生学研究，提出马里利亚鳄其实是科玛绘鳄的近亲，属于科玛绘鳄科；而马里利亚鳄、坎迪多齿鳄其实是远亲。如果这个研究属实，坎迪多齿鳄科将只有坎迪多齿鳄属。