与徂莱山起义部队合编为山东抗日游击第四支队，刘居英任第四支队第一团政治委员。1938年9月调山东省委搞统战工作。1939年2月任中共中央山东分局社会部部长，1941年2月任山东省战时工作推行委员会公安处首任处长。1945年8月13日，中国共产党领导的山东省政府在莒南大店成立，刘居英任山东省政府秘书长兼山东省公安总局局长。第二次国共内战时期，1945年11月任长春特别市市长（这是中共的首任长春市长）兼长春卫戍区司令部政治委员，1945年12月兼任吉黑纵队政委。1946年2月任吉林省政府秘书长。1946年1