卫生部长汇报工作。作为联邦政府的最高公共卫生官员，首席公共卫生官为加拿大卫生部长和加拿大联邦政府提供有关于加拿大人民健康和卫生方面的咨询意见。其总部位于两个地点，一个在渥太华，另一个在位于曼尼托巴省温尼伯市的国家微生物实验室, 一个加拿大唯一的生物安全等级4级的微生物实验室。在1998年刚刚创立之时，大多数的工作人员都在位于前南渥太华 Nepean 的 Gandalf Technologies 大楼办公，并隶属于加拿大公共卫生局的前身–卫生部人口与公共卫生司。