教区另划分为九个总铎区（），每个总铎区由区内各堂区的本堂神父（）之中选出一位总铎（Dean），以利教务管理。
教区各单位.
主教公署.高雄教区的最高统辖机构为高雄主教公署，本部位于高雄市苓雅区四维三路125号，紧临圣多玛斯堂。主教公署内设署长（王志伟蒙席）、秘书长（黄忠伟副主教）、总务长（曹世铎蒙席）等职务，主教公署之下共设有14个委员会、教区法庭、教区参议会、司铎谘议会等单位，共同肩负起教区内教务的运作。此外，在玫瑰圣母圣殿主教座堂旁，另设