取得联赛第5名。敖德萨黑海人足球俱乐部在其后两季取得第3名，并在之后两季取得第2名。同时，它在1994年再一次赢得乌克兰杯。然而，敖德萨黑海人足球俱乐部在1998年面临财政危机，球会被逼售卖主力球员并降下乌克兰二级联赛作赛。它在1999年重新升上乌克兰足球超级联赛作赛，但以倒数第二名完成赛季，再一次降下乌克兰二级联赛作赛。在2002年，敖德萨黑海人足球俱乐部重新升上乌克兰足球超级联赛。在随后数个赛季，敖德萨黑海人足球俱乐部都成功保持在乌克兰足球超级联赛作赛。它更在2006年取得联赛第3名，参与2006/07