有重要的海洋和气候生态研究价值。该列岛处于副热带季风气候区，位于中华民国实际控制领土的最北端，冬季温和湿润，有时较为寒冷，而春秋季少雨且干燥，夏季多雨，与大陆地区的福建省沿海气候类似。岛上海鸟众多，有银鸥、信天翁、棕头鸥等海鸟栖息和繁衍。岛上由于主要为花岗岩质地，所以植被不丰富，以草地为主。福建省乌坵列岛面积较小，但鱼类和水生生物丰富，偶尔有中华白海豚出没。福建省金门群岛位于厦门岛南面，北回归线附近，为典型的热带季风性气候，目前与厦门市联合申请珍稀动物文昌鱼栖息地自然保护区计划。中国南海中的太平