现今的塞舌尔国旗启用于1996年6月18日，为该国独立后的第三版国旗。国旗是一面由蓝 （象征海洋）、黄 （太阳）、红 （人民及其在爱与团结中奋斗的决心）、白 （社会正义与和谐）、绿 （土地与自然）五种颜色所组成的旗帜，五色呈放射状排列，象征塞舌尔在独立二十年之后，换以全新的面貌走向未来。国旗颜色以前两版国旗的红、白、蓝、绿加上代表太阳的黄色组合而成。在同日启用的新国歌中亦有提及。
历代国旗.塞舌尔第一版国旗于1976年6月29日自英国独立后启用，当时国旗图案是交叉的两个蓝三