于6月13日解散国会。数日后张勋复辟满清帝制并失败，但段祺瑞主张“再造共和”，拒绝恢复国会，重设临时参议院，另行选举第二届国会。1917年7月，吴景濂、王正廷等响应孙中山护法号召，率领130多名议员南下广州。8月25日，在广州召开国会非常会议。选举吴景濂、褚辅成为正副议长。9月1日，选举孙中山为大元帅，唐继尧、陆荣廷为元帅，开始护法战争。1918年4月10日通过《中华民国军政府组织大纲修正案》，大元帅被七总裁代替，迫使孙中山辞去大元帅，离开广州赴上海。1920年11月，孙中山回到陈炯明控制下的广州。