级联系统也存在一些差异。E4 泛素链延长酶, 能够在 E3 泛素连接酶产生的单泛素化蛋白上延长泛素。
E3.E3泛素连接酶具有两个结构域中的一个:泛素最终通过两种方式转移至蛋白质底物:2004年，阿龙·切哈诺沃、阿夫拉姆·赫什科、欧文·罗斯因发现了泛素调节的蛋白质降解过程而获得了诺贝尔化学奖。
去泛素化.蛋白质的泛素化是一个可逆的过程，这一过程叫做去泛素化（Deubiquitination），由一类蛋白水解酶——去泛素化酶(Deubiquitina