“薄葬，不藏明器，祭去牲牢”，并遗有大量的医书，人尊其为「孙药王」。在陕西耀县药王山（原称五台山），有祭祀孙思邈的药王庙，并在每年农历二月初二有「二月二药王庙会」。此外在耀县还建有「真人祠」、圣母殿与祖茔碑。宋徽宗崇宁二年（1103）追封妙应真人。今台湾仍有祭祀孙思邈之庙宇，并称之「天医妙应孙真人」，每年农历正月初四为其祭典，称之为「孙天医圣诞」。
保生三真人信仰.在保生大帝信仰中，有所谓的「保生三真人」，认为孙思邈与吴夲、许逊在成神之后成了结拜兄弟。在厦门一带认为三神排行依序是