细胞谱系指的是一个组织或器官从受精胚胎开始的发育历史。一个生物体内的细胞会发生细胞分裂，过程持续至一个不会再分裂的成熟细胞后分裂终止。细胞谱系正是基于对细胞祖先的追踪而得出。研究人员也可以通过标记一个细胞（用荧光分子或其他可追踪的标记）并跟踪其细胞分裂后的后代来研究细胞谱系。