柬埔寨全国的广泛愤怒，1885年，西沃达起兵反抗法国统治，法国人怀疑诺罗敦暗中支持西沃达的反叛，指责他煽动起义。在诺罗敦保证法国人已经做出让步之后，这场叛乱才得以终结。1885年中法战争之后，法国控制了越南。1887年10月，安南、东京、交趾支那、柬埔寨共同组成了法属印度支那联邦，后来老挝于1893年加入法属印度支那。在诺罗敦国王统治的晚年，他已经成为了法国人的傀儡。法国人废除了柬埔寨的传统习惯，将之西化，引起诺罗敦的不满。诺罗敦原本希望自己的儿子诺罗敦·尤根托继承王位，然而尤根托具有强烈的民族主义