生改当公费生，曼殊遂经横滨侨胞推举，转学振武学校（由东京成城学校改制而来）。曾有人说其就读于东京上野美术专科学校，实不可考。此时他开始醉心于佛理。在日本期间，还结识了陈独秀、章士钊、廖仲恺和何香凝等留学生，并先后参加了在日本成立的中国革命团体如青年会、兴中会等。1903年，俄国侵占东三省，苏曼殊所在青年会组织拒俄义勇队，后迁至香港。当时苏杰生在家乡已经为苏曼殊订下亲事，赶到香港想劝其完婚，苏曼殊避而不见。在革命同志陈少白的劝说下勉强返乡，但是数月后即返港，并已剃度出家，法号曼殊。苏曼殊很快来到江浙一带，