多厚壁菌可以产生内生孢子，它可以抵抗脱水和极端环境。很多环境中都可找到内生孢子，很多着名的病原菌都能产生孢子。有一类厚壁菌，太阳桿菌科可以通过光合作用产生能量。
分类.厚壁菌门原来分为三个纲：厌氧的梭菌纲、兼性或者专性好氧的芽孢桿菌纲，和没有细胞壁的柔膜菌纲。在系统发育树上前两类显示出并系群或者复系群的特征。因此它们的分类有待进一步研究，例如柔膜菌纲，有研究认为应该放在另外一个门，但也有其他研究认为应该留在这个门。以下为本门当中比较着名的属及其所属的纲目：