注入多瑙河，最后这些水流入黑海。整个伊萨尔河水系的面积达9000平方公里。由于冬季在阿尔卑斯山脉的降水主要由雪组成，伊萨尔河在春季融化的时候水量最大。年平均水流量为180立方米/秒。在德国它属于中级河流。伊萨尔河有许多支流，其中比较大的有安培河和洛伊萨赫河。官方确定的伊萨尔河源头位于卡万德尔奥地利小镇沙尔尼茨以东海拔1160米高处。2003年这个源头筑了一个泉口作为正式的伊萨尔河源，但是许多环保人士对此举提出批评。不过在卡万德尔有多条注入伊萨尔河的小溪，其中有一条比正式的伊萨尔河源头还有长，因此它的