侦查组在调查中国国民党籍的立法院院长王金平与民主进步党立法院党团总召集人柯建铭的案件时，居然包含了国会总机号码，因而可以监听每一位使用该电话，或通过该电话通讯的国会议员，引发监听国会的疑虑特侦组多次表示，是因为不知该号码为国会电话，才会「误听」，但法务部事后却发觉，特侦组5月时便曾拨打此号码，是刻意监听国会专线，居然在9月还坚称不知情，匪夷所思，饱受各界抨击。这个事件被视为「废除特侦组」的最后一根稻草，2016年立法院修法，2017年元旦当日正式废除特侦组 。
事件披露.201