日原住民的祖先，例如十三行文化人可能是凯达格兰族的祖先，不过目前的考古证据还不能完全确定台湾原住民与新石器时代文化间的对应关系。台湾原住民族的呈现多元而复杂，中华民国接续日治时期研究分类当作官方认定的族群有：泰雅族、赛夏族、卑南族、阿美族、排湾族、布农族、邹族、鲁凯族和达悟族等9族。21世纪后，新增认定族群有：邵族、噶玛兰族、太鲁阁族、撒奇莱雅族、赛德克族、拉阿鲁哇族、卡那卡那富族等7族，此等7族今日多居住在山地与东海岸纵谷，其文化特色至今大抵尚清晰可辨。除了官方认定的族群之外尚有：凯达格兰族、道卡