部尚书带领，先登仁寿殿北间谒见慈禧，跪献哈达；九月二十五日慈禧宴请之时，他也「跪迎跪送」。其接待规格也远远低于五世达赖和六世班禅，但他在会见慈禧的时候仍像五世达赖一般，获得与清统治者「平起平坐」的资格。数日后，光绪帝与慈禧太后驾崩，达赖为光绪帝举行葬仪。溥仪继位，封达赖为「诚顺赞化西天大善自在佛」。
川军入藏和二度流亡.慈禧太后试图将十三世达赖留在北京，不让他返回西藏，以便清廷对康区的藏族土司顺利地「改土归流」。此时康区正在经历着重大的历史变革，巴塘、理塘、德格等众多颇具名望的藏族