本斯总统流亡海外，卡斯蒂略·阿马斯成为新的独裁者。阿马斯新政府立刻废除前阿本斯政府所作的改革。1957年阿马斯被刺，讽刺的是他的继承人是一个在40年代独裁政府中就已经以其血腥出名的军人。
内战（1960年—1996年）.不满阿本斯政权被推翻的农民组织了一支游击队，开始与政府军展开长达36年的内战，直到1996年交战双方才签署一份和平条约，正式结束内战。这场内战中约数十万人丧生，上百万人流离失所。瓜地马拉军队对原住民玛雅人的迫害近似种族灭绝，仅1982年9月里奥斯·蒙特当政时期就有9