至2007年，中华人民共和国新疆维吾尔族自治区共有大型水库20座，按库容量依次为克孜尔水库、小海子水库、乌鲁瓦提水利枢纽、“635”水库、福海水库、塘巴湖水库、上游水库、蘑菇湖水库、大西海子二库、恰拉水库、多浪水库、可可托海水库、永安坝南库、苏库恰克水库、胜利水库、跃进水库 (玛纳斯)、柳沟水库、夹河子水库、西克尔水库、风城水库。根据中华人民共和国水利部发布的《中国水库名称代码》（中华人民共和国行业标准SL259-2000）将新疆维吾尔族自治区所有大型水库及中型水库列表如下。