代化的城市所替代，因此该遗址缺乏必要的完整性。在2016年日本文化事务署提名「长崎的教堂和基督教遗址」，但教科文组织谘询国际文化纪念物与历史场所委员会小组后决定撤回，指出日本未能解释总体价值，因而要求日本审查其提名。其后在2018年以长崎与天草地方的潜伏基督徒相关遗产再次申请成功。