总督锡良当面责令康宝忠的父亲交出康宝忠，后来幸亏锡良调离四川，康宝忠才免入狱。他回到日本后，随章太炎学习国学，入早稻田大学经济科。光绪三十二年十月十七日（1906年12月2日） ，黄兴主持在东京神田锦辉馆举办《民报》创刊一周年庆祝大会，孙中山在康宝忠、景梅九的陪同下进入会场并且发表了演讲。宣统元年（1909年）康宝忠从日本回国，参加了清廷举行的留学生考试，中举人，授七品京官，分到邮传部，历任大清银行学堂教习、监学、代理教务长。宣统二年三月初七（1910年4月16日），汪精卫谋刺摄政王载沣而被捕，康宝忠被