献灭贼五策促请清廷斩杀郑芝龙全家并毁坏郑氏祖坟。康熙二年（1663年），郑军攻厦门，靖南王耿继茂出浔尾，黄梧偕李率泰出蒿屿，督军水陆夹击，斩获无算，克厦门、金门、浯屿三岛。郑经遁铜山。耿继茂令黄梧统兵驻云霄防剿。康熙三年（1664年），黄梧招降周全斌、陈昇、黄廷、何政、许贞、李思忠等人。遂偕耿继茂、李率泰及提督王进功乘夜渡海，拔铜山。郑经退回台湾。康熙六年（1667年），封一等海澄公，世袭十二次。康熙十三年（1674年），耿精忠谋反，传檄至漳州。黄梧方病疽，闻变惊恚，卒，终年57岁，谥忠恪。