研究班学习。1942年，阎红彦在中共中央党校学习，参加延安整风。此间高岗指控阎红彦“有野心”，中共中央中央对阎红彦的历史进行了全面审查，对他充分肯定。1945年4月，阎红彦参加了中共七大。1945年9月，阎红彦任晋冀鲁豫野战军第三纵队副司令员，参加邯郸战役。11月，改任第三纵队副政委兼政治部主任，参加出击陇海路、定陶、鲁西南诸战役。1947年4月，参与豫北战役，歼灭国军第二快速纵队。随后协同友军攻取汤阴，生擒孙殿英。同年7月，参加进军大别山，率部队率先抢渡淮河，到达大别山北麓，半个月攻占宛西地区9个县城