新建车站中，维园站后来被中止兴建，另外新增了一个添马站（或作天马站），服务金钟北部地区。北港岛线亦为报告建议的第一阶段兴建项目，然而香港政府后来在2003年决定延期北港岛线的完工时间至2016年后。
北环线.北环线是在新界北将九广铁路东铁和西铁（今东铁线及西铁线）连接的铁路线，为使这条铁路能和东铁、西铁充分配合，建议把北环线交由九广铁路公司兴建。北环线将由西铁锦上路站开始，大致先沿西北走向伸延，经牛潭尾站、向东北方向设新田两站，然后分岔成两条支线：西面接驳东铁落马洲支线的落马洲站，