府委员兼淞沪警备司令部司令（4月）、江南剿匪司令（6月）。同年8月国民革命军开始进行编遣，三十二军缩编改变番号为国民革命军第3师，钱大钧仍续任中将师长一职。民国十八年（1929）1月7日，钱大钧因「师内高级军官擅离职守」之罪名遭到撤职，第3师师长由陈继承接任，钱大钧转调为国民革命军总司令部总参议，参加了蒋桂战争中南京政府的用兵参谋职务。3月转任国民革命军编遣委员会中央编遣区办事处委员，任务是负责整编原先新桂系的第四集团军下辖随营军官学校。该教育单位后改名为中央陆军军官学校武汉分校，钱大钧兼任该分校教育长