荷兰殖民者指控叛国罪并将之处决，另有4名英国人和2名日本人被赦免。被处决的20人于1623年3月9日遭斩首，称为安汶大屠杀。事件导致英国人在安汶的定居点被摧毁。1902年12月22日，荷属新几内亚宗座监牧在安汶成立，1961年1月3日变为现在的天主教安汶教区。安汶岛是荷兰一个重要的海军基地，1942年被日军占领，1945年印度尼西亚共和国宣布独立，日本陆军武装解除。马鲁古省在二十世纪五十年代曾是南马鲁古共和国割据政权的所在地，大多数人忠于当地南马鲁古共和国的独立运动。1950年印尼政府出兵马鲁古