苏木之间，因各国行政区制度不同，而有明显差异。后金皇太极时期，漠南蒙古部落或被征服，或被兼并。后金将广大的地域纳入版图后，仿照八旗将蒙古部落编为旗分，实行建旗划界的管理策略。据《清史稿》记载，蒙古诸旗以扎萨克为旗长，等同于都统，下属有旗章京、副章京、参领、佐领。蒙古语中，称旗章京为梅楞，称参领为札兰，佐领既是苏木。而随着蒙古诸旗管辖牧地的固定，旗、苏木亦成为蒙古地区特有的基层行政区单位。即《清史稿》所记，“苏木实分治土地人民”，各旗佐领（苏木）数额迥异，多者四十六，少者三。
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