国会暂不休会，直到司法委员会递交报告。史蒂文斯反对约翰逊，但这不影响他在双方都支持的事务上与行政部门合作，他为购买阿拉斯加争取拨款，还促请国务聊苏厄德寻找其他领土继续扩张。大部分内阁成员支持总统，但战争部长斯坦顿例外，他和陆军上将、战争英雄尤利西斯·辛普森·格兰特合作破坏约翰逊的重建政策。约翰逊遵守国会通过的法律，其中有些是在他否决后又被国会推翻否决颁布，但他经常有意按与国会意图相反的方向解读法律。1867年8月总统要求战争部长辞职被拒，约翰逊于是凭借《任期法》准许将斯坦顿停职，任命格兰特将军担任临时战