爲时在狱中的表兄王崑崙求情。1979年，因其五弟顾毓瑞将赴大陆讲学，便託人主动向中华民国国民大会辞去代表职务，但因种种误解，最终被中华民国政府註销国大代表资格及中研院院士，一度无法进入台湾。1990年5月，顾毓琇主动写信请求他过去学生、时任副总统的李元簇，希望恢复他中研院院士身分，得愿。后于1992年7月来到了阔别了十四年的台湾，顾自谓“不胜感慨”，并赴慈湖、头寮向蒋氏父子灵位行礼。2002年，顾毓琇病重后与夫人王婉靖迁离费城到俄克拉何马州的女儿顾慰民处居住。
逝世.200