们有一个称为发光器的器官，可以发出光来。牠们的光线是通过酶促化学发光（chemiluminescence）反应造成的，其中的萤光素（luciferin）（颜料的一种）就是由荧光素酶（Luciferase）活化的。一些研究指出很多磷虾的萤光素是一种荧光的四吡咯（tetrapyrrole），跟沟鞭藻类（Dinoflagellate）萤光素相似，但不是全然相同，磷虾自己本身并不能生产物质，但牠们却可从含有沟鞭藻类的食物中吸取得到这种物质。磷虾的发光器官是一个复杂的器官，可以聚焦光线，亦可由肌肉转动。这种器官精确的