文、理两科，学制预科两年、本科四年。考虑到福建中学毕业生水准较低，经征得陈嘉庚同意，全数先招预科生，计商学部40名、理科40名，共120名。课程设置根据师资条件，第一学期先设文法、作文、读文、文字学、英语会话、英文作文、英文文法、英文读法、法文、日文、伦理学、论理学、经济学、历史、代数、三角、化学等十七门课。厦大刚成立时教职员不上二十人，学生实到人数仅九十八人。1921年7月4日，林文庆接受陈嘉庚先生邀请继任厦门大学校长。自1921年秋季起，师范学部改为教育学部，并增设文、理两学部，全校共设文、理、