，并开始攻读神学，受教于约翰·梅尔（John Major 或作John Mair）门下。1546年3月2日，新教领袖乔治·魏沙特(George Wishart, 1513-1546)被红衣主教比屯（David Beaton, 1494-1546）定罪火刑焚死。不久，1546年5月29日，比屯也遭到杀害，一部分是为报复魏莎特之死，一部分也是反对他的亲法政策。谋杀党纠结新教同志将圣安德鲁斯城堡佔领。1547年，诺克斯作为被官方追捕的新教传教士到此避难，作了他们的属灵导师，是苏格兰宗教改革运动的领袖。