性取向不被日本民事法律保护，也就意味着在日本的LGBT族群在很多情况下，面临歧视的时候无法引用法律依据，比如就业、教育、住房、医疗保险、银行及公共住房。尽管同等权利法（日本）在过去十年里被修订了很多次，在这些修订中重点关注了性别歧视和工作场所中的性骚扰。同时日本政府拒绝扩大保障范围至却对性别认定上的歧视。1997年，日本同性恋运动协会在起诉东京政府禁止同性恋使用大都市青年住房的案例中胜诉。尽管没有扩大到反对其它由政府支持的性取向歧视范围，但这起案件经常被作为民权的例子在法庭上被引用。自此，东京政府