日当晚成立并对抢救工作进行紧急部署，此前的现场抢救则由上海市卫生局领导小组直接指挥。在抢救过程中，上海市血液中心站提供血液6万余毫升。事故现场于3月25日凌晨4时已基本清理完毕，沪杭线也于25日中午恢复运行。日本伤员也于3月25日分别被转移到上海市第一人民医院、长征医院、中山医院、华东医院、华山医院等位于市区的大医院继续抢救。旅行团中未受伤的129名师生和12名受轻伤的学生则于3月25日晚乘飞机返回日本。遇难者的遗体于3月25日16时30分以后被陆续运到上海市龙华殡仪馆，其中3人的遗体于3月26日被火化