同时也负责协助世界气象组织为西北太平洋地区的热带气旋命名作决定工作。秘书长为行政首长。现任秘书长是喻纪新。
历史.台风委员会成立于1968年，秘书处设立于菲律宾马尼拉，首任秘书长由博士担任。2007年2月秘书处自菲律宾马尼拉移至澳门，由澳门特别行政区政府向秘书处提供办公用房和现金捐款，供秘书处用于支付房舍的运转和保养费用，秘书长由原澳门地球物理暨气象台台长黎梓建（Olavo Rasquinho）担任。秘书处现有气象专家、水文专家、行政秘书、财务会计共计4名工作人员。