一号命令”，北京林学院开始迁往云南。学院北京原址分别被中国科学院、中国农业科学院、北京大学、清华大学、中国科学技术大学研究生院等单位占用。北京林学院虽名为搬迁，但实为解散，后经国务院过问免于撤销，全校于1970年集中丽江，更名为“丽江林学院”，后转迁至下关市，并再次更名为“云南林业学院”。1973年，搬迁至昆明市安宁县楸木园，同时，云南农业大学林学系并入云南林业学院。文化大革命结束后，学院在多方努力后于1979年返京复校，复名“北京林学院”。并收回部分原有土地，但总面积减少了40.5%，校内科研基地