万兴建大专会堂，惟会堂要到1978年5月，即林子丰身故后七年才告落成。除了浸会书院，浸联会有鑑于广州的两广浸信会联会神道学校因政局变迁在1950年被迫关闭，遂研究在香港兴办神学院。有关构思获得林子丰大力支持，并由他本人出任浸会神学院筹委会主席，香港浸信会神学院在1951年正式成立后，继续由他一直出任董事会主席及神学部部长一职。神学院原设于九龙城「博爱村」，其后于1959年迁往何文田山道，1999年再迁到西贡以北的西澳。另外，浸联会于1952年提倡设立一所浸信会诊疗所服务大众，并推举林子丰第六子林思安医生