1964-68年，担任香港新亚研究所所长。1973年新亚中学创办后，他出任其校董会成员。1976年，香港政府建议中大改制，将学科教学的工作统一归由大学中央办理，书院仅负责学生福利及通识教育等工作。吴俊升联同新亚书院校董会其余八位董事，包括：唐君毅、李祖法、钱穆、沈亦珍、徐季良、刘汉栋、任国荣、郭正达，以此违反中文大学之「联邦制」本意为由，集体辞职抗议。吴俊升毕生致力教育，曾问学于美国着名哲学家和教育家杜威（"John Dewey"） ，对杜威教育思想有研究并受其影响，有“中国杜威”之称。他在巴黎大学