天疱疮、发炎性肠病，像是克隆氏症和溃疡性结肠炎、多发性硬化症 、自体免抑性肝炎、过敏性皮肤炎、重症肌无力和其他相关疾病。
历史源流.首位将硫唑嘌呤 (Azathioprine) 带入临床应用的人是英国器官移植的先驱 。他在彼得·梅达沃和 格特鲁德·B·埃利恩 发现组织跟器官移植之排斥反应的免疫基础后，曾试验以 6-mercaptopurine 作为肾脏及心脏的移植用的免疫抑制剂。而在硫唑嘌呤被发现后，由于毒性较 6-mercaptopurine 小，Calne 便开始採用此药物