于1939年1月被重修以容纳国军飞机。同年6月，空军第十三航空总站在衢州机场成立，统辖附近前线机场。太平洋战争爆发后，国军于41年底扩建机场以供未来中美联合对日作战所需。1942年4月美国陆军航空队詹姆斯·哈罗德·杜立德率领B-25米切尔型轰炸机从大黄蜂号航空母舰上起飞空袭东京时，亦计划以衢州机场作为备降点，但因天气原因被迫跳伞，获农民救助。因为衢州机场为太平洋战争后距日本本土最近的盟国控制下的大型机场（当时苏日保持中立），故倍受交战双方重视，中日两军围绕衢州机场展开一系列的战役。1942年日军发动