铁道部机务局的安排，将GKD4型机车正式定型为东风12型柴油机车，并要求资阳机车厂在1997年内另外生产三台东风12型机车以供试验。1997年12月，三台机车（DF12-0001～0003）分别配属广州铁路集团公司、北京铁路局和郑州铁路局，在株洲北站、丰台西站、郑州北站三大编组站担当调车作业任务，进行运用考核试验；其中配属广铁集团的0001号机车于1998年6月由株洲北调往广州北站（今江村站）继续运用。完成运用考核以后，0002号机车于1999年4月在铁道部科学研究院环行铁道和北京铁路局管内京秦铁路进行了鉴