代表机构则是巴布亚纽几内亚驻台商务代表处（Papua New Guinea Trade Office in Taiwan）。
历史.1988年12月27日，巴布亚纽几内亚外交部长索马雷与中华民国外交部长连战于台北签署《建立关系备忘录》。依据该备忘录，中华民国与巴纽分别在摩士比港与台北设立商务代表团，作为两国官方代表机构，双方机构正式人员均享有外交豁免权。1990年2月12日，在首都摩士比港设立具大使馆性质的中华民国（台湾）驻巴布亚纽几内亚商务代表团（Trade Mission