马克思主义分支分别在叙利亚和伊拉克成为党内多数派。阿弗拉克面对的另一问题是他的一些支持者没有入选领导层，例如比塔尔未能再次进入党的民族领导机构。一个由军官组成的新的领导层逐渐崛起，代替了原有的文职领导层；叙利亚的贾迪德与阿明·哈菲兹以及伊拉克的艾哈迈德·哈桑·贝克尔与萨利赫·迈赫迪·阿马什都进入了党的民族领导机构。军事委员会实际上从文职领导层手中夺取了党政大权，他们对于军人掌权的批评是敏感的，并在一本理论小册子中回应说，要实现社会主义改造的目标，军民共生是非常重要的。而在外界看来阿弗拉克似乎依然大权在握，就