用大型柴电机车作为货物列车或客车的牵引机车，在DR1000型柴油客车引进前也使用干线使用的普通客车做客运列车编组。另外因路线标准高的缘故，因此DR2800、DR2900、DR3000型干线自强号柴联车都有因活动包车进入内湾线行驶的纪录。目前本路线仅运行区间车，但仍会不定时配合活动及运用需要开行蒸气机车以及柴电机车牵引的客车/货车编组、或行驶自强号柴联车编组。
车站列表.内湾线自北新竹站以北分歧后，向东一路至内湾。<br>（註：车站等级：分为特等、一等、二等、三等、甲简、乙