美国独立战争爆发后，韦恩协助从宾夕法尼亚州筹集军团，为新成立的大陆军服务。由于他对军事方面一直保持着浓厚兴趣，他于1776年初成功获得了宾夕法尼亚州第4团的上校委员会成员。1776年6月8日，韦恩被派往北部协助本尼迪克特·阿诺德准将指挥的在加拿大的三河市之战，大陆军在此战役中遭到了挫败，他在提康德罗加堡接替了指挥，并将这支疲惫不堪的军队成功地撤回本土。为此他于1777年2月21日被晋升为准将，后来他跟随乔治·华盛顿将军南下，并且接管了大陆军在宾夕法尼亚的前线指挥。晋升之后的韦恩，在9月11日参战的布兰