鹏接受命令时，蒙古已经出塞，于是他请求调用陕西、蓟、辽客兵八支，及宣、大三关主兵，兼募土兵进行兵备，并有所斩获。嘉靖二十三年，因总兵官郄永等战功进兵部尚书。御史曹邦辅曾经弹劾翟鹏，崔鹏亦乞求罢免，没有得到批准。同年九月，蓟州巡抚朱方请撤诸路防秋兵，兵部尚书毛伯温于是併撤宣、大、三关客兵。俺答汗趁机进犯膳房堡，被郄永抵挡，于是迂回从顺圣川至蔚州，直抵完县，京师戒严。嘉靖帝大怒，屡次下诏指责翟鹏。之后御史杨本深、兵科戴梦桂弹劾其逗遛二致使敌军进犯京畿。于是下诏狱，死于狱中。隆庆初年，恢复官职。