种以珊瑚虫为食的动物造成的。有人认为，珊瑚之所以受到了营养物质过剩的影响，背后的原因是海藻导致了光照和氧气竞争的加剧。除非植食生物出现异常性减少，大堡礁的珊瑚被海藻所替代的情况就不可能出现。也有人指出，水质在营养物质过剩的环境下不断恶化，促使了传染病在珊瑚间的蔓延。大堡礁的珊瑚发病率总体呈较低的水平。Skeletal Eroding Band是一种由原生动物Halofolliculina corallasia引起的疾病，会感染珊瑚群落里6科31种珊瑚。尽管人为污染是否引发了大堡礁的珊瑚疾病还尚存争议