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2016年：伤势困扰以及长期伤退.2016年，费德勒受到膝伤困扰，自2001年以来整年没有拿下任何一座巡回赛冠军的第一年。澳网进入四强后，以1–6、2–6、6–3、3–6负于乔科维奇，法网未参赛，温网在四强时以3–6、 7–6、 6–4 、5–7 、3–6负于米洛斯·拉奥尼奇。
2017年：传奇再起，睽违五年的大满贯.2017年，费德勒选择在霍普曼盃复出。紧接着登场的澳网，费德勒名列第17种子，在外界普遍不看