木兰类植物在克朗奎斯特分类法中被分到木兰亚纲（）中。属于木兰纲（即双子叶植物），在旧有的演化观念之中，常被视为双子叶植物中比较原始的类群。克朗奎斯特分类法中的木兰亚纲共包括8个目：在其他分类方法中，可能包括不同的目，但都会包括木兰科。在被子植物种系发生学组（APG）的研究之中，木兰类在演化路上比单子叶植物和真双子叶植物更早分道扬镳，成为单子叶植物、真双子叶植物和金鱼藻目的外类群。APG II分类法中没有亚纲一级的分类，这些植物一般都是包括在木兰类中，其中木兰科仍然被分到木兰目中。传统的分类法都