出，马达加斯加可能是所有变色龙的发源地。该国的特有鱼类包括两个科，14个属和上百个物种，其中大部分生活在岛上的淡水湖与河流中。虽然对马达加斯加的无嵴椎动物研究进展缓慢，但研究人员已经在已知物种中发现很高比例的特有种。岛上的全部651种陆栖蜗牛，以及大部分蝴蝶、金龟子、草蛉、蜘蛛和蜻蜓都是其独有物种。
环境问题.人类活动已经威胁到马达加斯加动植物的多样性。从约2350年前人类来到岛上后，这里已经失去超过9成的原始森林。这些森林大部分都是由最早定居该国的人类使用一种名为“”的刀耕火种传