病毒的Acyclovir之外，目前有效的抗病毒药物种类很少。所以支持性治疗（例如：唿吸器）对重症患者来说者便相当重要。皮质类固醇类药物（corticosteroids）用来减少脑部肿胀发炎。若患者太过燥动则可考虑给予镇静剂。 若为霉浆菌感染，可给予口服四环霉素类。弓型虫造成的脑炎则以 pyrimethamine 和 sulphadimidine 合併治疗。
预防.到现在并无有方法可以预防。