流感嗜血桿菌会引致儿童的耳朵感染（如中耳炎）、眼睛感染（结膜炎）及鼻窦炎，并且联带肺炎。
与肺炎链球菌的相互关系.流感嗜血桿菌与肺炎链球菌都能在人类的上唿吸系统中发现。一项有关牠们之间的竞争研究指出，在培养基内，肺炎链球菌能以过氧化氢攻击流感嗜血桿菌及能排除在表面流感嗜血桿菌生存所需的分子。当两种细菌一同在鼻腔内时，两星期之内，只有流感嗜血桿菌能够生存。当两种细菌分别地放在鼻腔内时，两者皆能生存。使实验鼠的上唿吸组织暴露于两种细菌时，发现有格外大量的中性粒细胞。当实验鼠只是暴露