是基因突变。在单看特定时空范围内的族群时，来自其他族群（甚至不同物种）的基因流动也可以是多态性的来源。基因和染色体的运作方式使遗传呈颗粒性，因此父亲和母亲的性状不会在后代中混合。多态性因此可以存在。分子生物学家称多态性，常是指基因型的点突变（如单核苷酸多态性），不一定会造成性状差异。
重要性.遗传多态性是天择演化的重要基础，如果没有多态性，则每个个体的适应力都一样，天择不会偏好任何个体，因此将无法推动演化。
维持多态性的机制.天择会移除个体，因此可能造