贿赂左丰，但卢植不肯，遂令左丰向灵帝报告：「广宗的黄巾贼很易消灭，但卢中郎没有进攻，在等上天诛罚他们。」诬陷卢植作战不力。灵帝信以为真并大怒，用囚车押回卢植，得免不死，并改派东中郎将董卓接手进攻，但董卓却在下曲阳(今河北省石家庄市晋州市西)兵败。同年因皇甫嵩上书申诉而得复任尚书。
董卓入京.中平六年（189年），汉灵帝驾崩，刘辩即位，大将军何进决意要诛杀宦官，并召当时任并州牧的董卓进京以威吓反对此举的何太后。卢植知董卓凶悍难以控制，极力劝止何进但失败。随后何进事败，司隶校尉袁绍仍诛