偏好水果、柔软阔叶蕨类和灌木植物的食草动物则灭亡。有多种生物具备这种明显的模式。偏好食用低矮植物的马繁盛，同时偏好食用高大植物的马则灭绝。在早期骆驼之中，种存活，而拥有较短牙齿的种类则消失。除了陆地上的变化之外，海洋中也在此段时期形成了新的生态系。海藻林在此时首次形成，海獭等生活于此的生物也开始出现。但与此同时，曾生活在中新世早期至中期，分布于欧洲、美洲、澳洲等地区的剑吻古豚，也在中新世中期大量消失，并被其他后生的种类所取代。