回鹘本信奉摩尼教，摩尼教于武周延载元年（694年）传入中土，763年传入蒙古回鹘汗国，迅速发展成为国教，其影响渗透到汗国社会、经济、外交及文化的各个方面。直至840年，回鹘汗国被之前隶属的黠嘎斯反叛而崩溃，王室部众西迁至高昌回鹘，龟兹回鹘，葱岭回鹘、及甘州回鹘一带，由于受到当地盛行的汉传佛教的影响，大批民众多改信佛教。唐代的安西都护府是汉传佛教的一大中心，已有了近700年的汉传佛教发展历史，僧徒众多、香火旺盛。这些都为后来回鹘佛教的形成与发展奠定了坚实的基础，从今天所能见到的回鹘文佛经、回鹘佛教石窟艺术