零星族群分佈于奈及利亚东南部、加彭与喀麦隆，也作为迷鸟在马利被发现过。
分类.2009年一项分子系统发生学研究以粒线体DNA序列分析鸭科各物种的亲缘关系，发现在鸭属中，非洲黑鸭是其他绿头鸭类（Mallard Group）物种（绿头鸭、太平洋黑鸭、、麻斑鸭、列山岛野鸭、吕宋鸭、花嘴鸭、、与墨西哥鸭）的姊妹群。因为非洲黑鸭是绿头鸭类生物演化上最早分支的物种，有研究者将其独立归入名为"Melananas"的亚属中（该亚属只有非洲黑鸭一种）。非洲黑鸭有两种亚种：另外也有人将加彭与喀麦