设计师宫本茂以开发标题「火焰之纹章64」向外界公佈游戏。当《暗黑巫女》的开发渐入佳境时，Intelligent Systems的内部开发体制却发生变化，加上64DD销量不佳这一因素，导致团队在2000年中止开发任天堂64版本，改为开发适用于Game Boy Advance的游戏版本。在这样的变革中，只有极少数原先任天堂64的游戏概念被保留下来。除了罗伊、卡雷尔和暗黑巫女（伊冬），绝大多数原定角色都被弃用。2001年前，游戏副标题仍然是「暗黑巫女」，但后来开发团队把它更改为现时的副标题「封印之剑」。而开发团队