指导意见，上海市高级人民法院研究制定了跨行政区划法院相关案件管辖的暂行规定等。上海市第三中级人民法院依法管辖以市级人民政府为被告的一审行政案件，以市级行政机关为上诉人、被上诉人的二审行政案件（不包括知识产权行政案件）。2014年12月28日，上海市高级人民法院关于上海市第三中级人民法院履职的公告称：
机构设置.按照“审判独立、行政（党务）合署”的原则，实行“三块牌子一个机构”。成立初期先行设立4个审判业务内设机构，其他内设机构将在中央机构编制委员会办公室明确限额内再进行设定。设一