等迎接失散的汉少帝和陈留王刘协，后为司徒，与太尉黄琬、司空荀爽共谏欲迁都的董卓，均遭罢免。后任太尉，向汉献帝献计离间李傕、郭汜二人。二人交战时，奉命同众官前往郭汜营中劝和，为郭汜扣留，杨彪怒斥郭汜，郭汜恼怒欲杀杨彪，中郎将杨密劝阻，郭汜才放了杨彪与大司农朱儁，二人出营相抱而哭，昏绝于地。汉献帝返回洛阳后，杨彪建议汉献帝依靠曹操。之后，因与袁术为姻亲，曹操讨平吕布后，将其诬陷下狱，经孔融力争才得以幸免。