御殿全部烧毁。1846年（弘化3年）7月26日，因为发生雷雨，除了大小天守，御殿本丸主要建筑物全部烧毁。明治4年（1871年）废藩置县，和歌山城废城，许多建筑物遭到拆除移往其他地方。其中外城在1885年被移到大坂城，从昭和6年（1931年）起被作为大坂市的迎宾馆，但是后来在昭和22年（1947年）毁于火灾。1901年（明治34年），本丸・二之丸一带开放游客参观、成为和歌山公园。和歌山城在1931年（昭和6年）被指定为国家遗址，然后在昭和10年（1935年）和歌山城天守等11栋建筑根据国保保存法被指定