九洲及由喷射飞航提供前往澳门及深圳福永的境外客轮服务。而于蛇口港亦设有预办登机的服务柜台。
跨境旅游车服务.跨境巴士服务在2003年开始运作，连接各珠三角城市。机场认可的营运商包括香港中旅汽车服务、永东直通巴士、环岛大陆通、中港通及华通中港快线。现时的旅游车总站设于1号客运大楼5楼，在2019年11月28日下午十时前设于2号客运大楼3楼，设有一个集中了所有营办商的旅游车票务及服务中心。往中国大陆客车由机场定时开出，前往皇岗、深圳湾口岸、深圳、广州、东莞、惠州、佛山、中山及福建