遵照中共中央指示，离开北伐军赴上海，参与组织指挥上海工人第三次武装起义。后任武汉国民政府武汉三镇保安总队长。七一五事变后，离开武汉到贺龙的第二十军任教导团团长，并参加南昌起义。1927年8月1日，侯镜如时在贺龙的第20军任教导员团团长，随部队参加了南昌起义。1931年，与中共中央失去联系。
抗战时期.1932年后，任国民党军第三十军第三十师参谋长、第三十师第八十九旅旅长。1935年4月，国民政府授予侯镜如陆军少将军衔，担任国民革命军第三十军第三十师参谋长，后又调任第三十师第八十