港第二及第三高的山岭，分别是凤凰山（934米）及大东山（869米）。大屿山的主要海湾有东涌湾、阴澳湾、大白湾、银矿湾、贝澳湾、芝麻湾、水口湾、分流东湾和分流西湾。地质方面，大屿山的岩石以火成岩为主，大屿山东部有很多花岗岩。石英二长岩则见于大屿山南部的塘福、梅窝、贝澳等地。大部分香港有记录的物种类都在大屿山，包括：70%的两栖类及爬虫类、60%的蜻蜓、55%的蝴蝶及超过50%的淡水鱼类。好像大屿山以北海域则是中华白海豚经常出没的地方，但是却面对机场所带来的种种威胁，如污水处理、生境地丧失、航行船只增加