调为登莱总兵，于任上大肆敛财，并参名将毛文龙十大罪，崇祯二年（1629年）调任通州总兵，顺治元年降清，后无考。
事迹.
参加平乱.天启二年（1622年），山东生员徐鸿儒率白莲教徒反叛，明山东巡抚赵彦、总兵杨肇基等调兵遣将平乱，杨国栋也参加了平乱，因战功升参将，但随后在围攻邹县的战役中因为争功导致大败，被责令戴罪立功，后又打败叛军而复职。天启五年（1625年）十二月，杨国栋升任山海关南海口总兵，天启六年（1626年）三月，调任登莱总兵。