山、中本山、小本寺或上寺等管理寺院之下，管理直末寺、孙末寺、曾孙末寺等寺院，编成金字塔形的制度。1631年（寛永8年），禁止新寺的创建，翌年以降，各本山有提出「末寺帐」的义务。因此，各地方的古刹因幕府之命，在形式上编入特定的宗派。幕府透过各宗派设置在江户的「触头」，向宗派的末寺传达自身的意向。