，15世纪中期以前时期，建立「乌兹别克汗国。」后来朮赤系的克烈汗和贾尼别克与阿布海尔汗闹翻逃亡蒙兀儿斯坦，另建哈萨克汗国，而今天的乌孜别克斯坦却是帖木儿帝国的领土。乌兹别克汗国解体后一部分人随穆罕默德·昔班尼汗南下，前往河中农业区定居下来，征服了当地的撒尔塔人并与他们融合。形成了今天的乌孜别克族。16世纪至17世纪，他们来到南疆塔里木盆地通商，称为布哈拉人、浩罕人或安集延人，主要从事商业活动，乌孜别克的意思是“自己的领袖”。到清宣宗时代，旗人认为已与卡内回民（维吾尔人）无异。乌兹别克族是由粟特人和突厥人