日喀则市聂拉木县西南希夏邦马峰北麓，向东流经定日县、定结县，在定结县西南陈塘镇南进入尼泊尔境内。其中朋曲与甘马藏布汇合处至朋曲与错岗青波河汇合处之间一段为中、尼两国界河。进入尼泊尔境内始称阿龙河。朋曲的支流众多，其中叶如藏布流域遍及定结县、萨迦县、岗巴县三县。