丰帝命刑部尚书柏葰前往盛京偕同善焘审讯。四年（1854年）正月，盛京刑部侍郎书元再度奏参「协领塔芬布、佐领恩合父子狼狈为奸、将军奕兴曲为袒护」，咸丰帝申明一併交柏葰、善焘审理。二月，因解任承德县知县延瑞以冤抑难伸等词呈请代奏，善焘将延瑞供词直接咨送军机处，被咸丰帝责怪不知慎密，遭降级留任。同月，会同柏葰审讯完结定拟具奏，分别将明禄、塔芬布、恩合发遣、奕兴革职交宗人府议处、书元交吏部议处；另奏请于盛京将军衙门设立谳局，被咸丰帝否决。以盛京工部侍郎充牛马税监督，善焘以军务未蒇、经费浩繁，奏请将现存牛马羡余全