1982年，受聘为《中国大百科气全书》分编委委员；《中国历史大辞典》云南省编委会副主编、主编。 1983年，主持编写的《云南简史》出版，次年该书获中国出版界、史学界颁发的“全国爱国主义优秀通俗历史读物优秀奖”。1985年，恢复了从1931年起的中共党籍。1989年，以马曜为主编的7人编写组历时5年，编写了《云南民族工作四十年》，此书后来成为全面介绍云南民族情况和民族工作的“百科全书”，并获1993-1994年度滇版图书一等奖、国家民委民族政策研究优秀成果奖。1992年，中国国务院表彰马曜为