经略后山，将今日中央山脉以东，今宜兰县南侧、花莲县、台东县，以及屏东县牡丹乡、满州乡东侧滨海，划为卑南厅，归属台湾府，厅治设于今台东市。有鉴于台湾西部清领区对东部联络艰难，沈葆桢由北至南连开数条道路横贯台湾本岛，自此打开东部对外的联系。1874年开辟崑崙岰古道，总长约105公里，起自屏东县来义，翻越中央山脉，至台东县金崙。在开路的同时，沈葆桢从福建招来的移民也搭乘帆船登陆台东，今台东市宝桑里一带是东部最早的汉人移民据点。1867年，今台东地区长滨乡的平埔族人自行开设水圳，引石坑溪水灌溉长滨沖积扇的长滨、成功