嵴椎动物具有共同祖先的理论。举例而言，虽然人类、猫、鲸鱼与蝙蝠的五趾肢在型态上有所差异，但是主要架构都很相似。这些「同源」的构造，适应了不同的功能，如抓握、行走、游泳与飞行。此外有一些构造在功能上相似，但却具有不同的型态。例如蝙蝠、鸟类与昆虫的翅膀；昆虫与嵴椎动物的腿；章鱼与嵴椎动物的眼睛；鱼类、鲸鱼与龙虾的鳍等。这类「异源」的构造，适应了相同的功能，如飞行、行走、感光与游泳。
发育过程.所有的嵴椎动物胚胎在发育初期都非常相似，在发育的过程中，这样的相似会逐渐减少，最后形成各物