长江南路站设有两个侧式站台，为3号线使用。其中西侧站台为3号线列车往上海南站站方向列车使用；东侧站台为3号线列车往江杨北路站方向列车使用。每个站台均设有半高屏蔽门和候车座椅，并有2个楼梯通往站厅层，其中站台中部设有无障碍电梯通往站厅。长江南路站是上海轨道交通3号线小交路列车终点站，车站北侧设有折返线供3号线小交路列车折返。
接驳交通.
公交换乘.51、51区间、52、116、302、502、552、552区间、713、751、810、848