在惊涛骇浪中小败给陈，但也证明他的确有当县长的实力。到了2001年县长选举，国民党提名时任议长的吴俊立与当时已获亲民党提名的徐庆元竞争，而民主进步党提名、时任台东市市长的赖坤成则遭边缘化，最后由徐以7000余票的差距当选。徐庆元于县长任内任用民进党籍的刘櫂豪为副县长，并退出亲民党，且于2005年县长选举放弃连任改支持刘。然而，刘仍不敌具国民党背景、以无党籍身分参选的议长吴俊立。由于吴俊立有案在身，遂于就职前一天带着时为妻子的邝丽贞去办理离婚手续，并于就职当天宣佈邝丽贞为副县长代理县长。但由于行政院在吴就