汶领导人要求其帮助为由，出兵东帝汶并实施占领。到了1979年，几乎所有东帝汶武装抵抗力量都遭到其摧毁。印度尼西亚遵照所谓“公民大会”不真实的自决，宣布东帝汶领土成为其第27个省。24年来，东帝汶人民遭受到印尼有组织有系统的法外处决、酷刑、屠杀、强暴、瘟疫以及人为制造的饥荒的折磨。1991年，东帝汶发生了让世界为之震怒的事件，诸如此类残杀的报道更是不计其数。东帝汶始终对印尼的统治进行着强烈的反抗。 1996年，来自东帝汶的若泽·拉莫斯·奥尔塔和卡洛斯·菲利普·西门内斯·贝洛被授予诺贝尔和平奖，以表彰他