部联合颁布的《中华人民共和国海员证签发和使用范围的暂行规定》同时废止。2008年10月1日，新版海员证启用，同时停止签发旧版海员证，改版后的海员证在制作工艺方面有所升级，增设机读区，符合了国际民航组织的相关标准。2019年11月28日，中华人民共和国交通运输部宣布，将在当年12月20日启用新版的海员证，加入电子芯片，和中华人民共和国护照一致。2020年2月4日，厦门海事局成功签发辖区首本台湾船员新版海员证，这也是中国大陆签发的第一本台湾船员海员证。
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