其后又被武宗短暂恢复。内厂设置于武宗时期，首领为宦官刘瑾，刘瑾伏诛后，内厂与西厂同时被废除，仅留东厂。
其他机构.公孤官包括三公与三孤，是名义上的诸臣之首，但这些官职都是虚衔，一般授予功劳相当大的大臣以示荣耀。三公为太师、太傅、太保，三孤则是辅弼他们的少师、少傅、少保，三公三孤是皇帝名义上的老师，负责辅弼天子。另外还有太子三师及太子三少，太子三师为太子太师、太子太傅、太子太保，太子三少为太子少师、太子少傅、太子少保，三师三少是太子名义上的老师，但实际上辅导太子的机构是詹事府。詹事府