苏贞昌偕同夫人于民进党中央党部登记参加第十四届主席选举。5月27日选举结果，苏贞昌以50.47%的过半得票率当选。面对团结质疑，苏贞昌于胜选当晚表示：「选后的民进党一定是团结的」、「今晚所有民进党员都是最大赢家」。。2012年9月18日，民主进步党立法院党团对行政院院长陈冲提出「不信任案」，苏贞昌表示民间「换内阁，救经济」唿声高，他支持民进党立法院党团的决议。9月22日上午十一时立法院记名投票表决结果，赞成四十六票，反对六十六票，「不信任案」遭否决；2013年10月10日上午，苏贞昌于民进党中央党部宣布