官渡之战中，无力抽身，任命刘馥为刺史，以稳定江淮地区，州治寿春（今安徽省寿县）和合肥（今安徽合肥西北）。建安十三年（208年），刘馥逝世，曹操命温恢继任。扬州长江以南地区则在江东孙氏政权（后来三国之一的吴国）的统治之下。治所先后在吴郡吴县（今江苏省苏州市）、京口（今江苏省镇江市）及建业（今江苏省南京市）。直到曹魏、孙吴先后建国，扬州便正式分为两部分。