至元十六年（1279年）改重庆府置，治所在巴县（今重庆市）。属四川等处行中书省。辖境相当今四川省江安县以东，重庆市忠县以西，重庆市武隆县、四川省合江县以北，四川省武胜县、重庆市垫江县以南地区。至正十七年（1357年）为明玉珍所据，二十二年建为夏国都。明洪武四年（1371年）复改为府。