1.2万名平民以及城外农村的26,870人被杀。不过一些历史学家有不同的看法，认为史迈斯的数字低估或夸大了真实的平民死亡人数。笠原断言调查大大低估了死亡人数，部分原因是史迈斯只调查了有人住的房屋，因此跳过了那些房屋完全破坏或无法返回的家庭的住房。相反，北村稔觉得鉴于史迈斯与中国国民政府的关系，他可能将数字有所抬升。此外，1937年12月南京的总平民人口和防御此城市的中国守军规模被用作计算死亡人数的基础，但这一问题因对这两个数字大不相同的估计而变得复杂。例如，笠原十九司声称1937年南京有40-50万平民