城市快速轨道交通建设规划（2006-2015）》增加了五乡西站，更改了部分线位，并将原规划中位于北仑区通山村的停车场东移至朱塘村。与一期类似，二期同样没有完全依照批复的规划实施，在工程项目实施的过程中规划陆续进行了修改。2013年8月，线路东端增加闽江路站，成为1号线东端的新起点。
工程建设.2012年4月10日，二期工程试验站五乡西站开工建设。4月25日，东环南路站往五乡西站方向开始隧道盾构施工。2013年2月2日，二期首条隧道东环南路–五乡西区间右线隧道贯通。高架段则于20