司局长（包括教育统筹局局长）改由政治委任，并担任行政会议的官守成员。与此同时，司局长等人的任期将会在行政长官离职后自动完结。问责制推行前，所有局长职级都是公务员职位，局长亦非行政会议的成员。但在1991年之前，担任这些职位的公务员可能会被总督任命为立法局的官守成员。另外问责制实行的同时，教育统筹局有架构重整，所有劳工事务改由前身是经济司的经济发展及劳工局局长负责。曾荫权成功连任行政长官后，提出对教统局进行特区成立后第二次架构重整。2007年7月1日起，教统局所负责的人力资源事务将改由劳工及福利局