酸也可能相同。例如，"GCC"和"GCA"均是丙氨酸的密码子。因此，许多可能的只有一个核酸的改变可能实际上是“沉默的”或者“不表达的”(参见：)，在生物学上被认为是作用极小或者没有作用的。建立在中性演化理论基础上的第二个假说即是：多数的进化实际上是等位基因遗传漂变的结果，而并不是诸如非中性基因的遗传连锁造成的等原因造成的。突变出现后，中性的等位基因可能通过遗传漂变在族群里根据普遍。但通常情况下，突变会消失，少数情况下会被下来，成为族群较为“标准”的基因。这一随机过程可以被抽样事件的形式描述，并遵从描述随