野通清、河野通信父子及丰后国的绪方惟能、臼杵惟隆、佐贺惟宪等地方势力也举兵反抗平氏。在东日本，支持平氏的佐竹氏也被源赖朝讨灭，反抗平氏的声浪在各地方兴未艾。身处此一困境的平清盛则在此时开始建立以京都为中心的新平家体制，设立了惣官、总下司等官职。随之又命越后国的城资永、城助职（长茂）率兵攻打木曾义仲。然而，平清盛却在同年二月底因为染上热病而倒下，闰二月四日在九条河原口的平盛国屋敷逝世，享年六十四岁。
死后及评价.平清盛薨后，由于其嫡子平重盛已先病死，次子平基盛也早死，领导平氏一族的大