在抵抗过程中遭射伤，最终被捕。深受郑柄宙器重的少校副官金五郎也在当夜的叛乱中身亡。1980年，郑柄宙被夺得政权的全斗焕方面强令退役。1989年，郑柄宙突然失踪。4天后，众人于京畿道杨州郡野外的一棵树上找到了郑柄宙的尸体。卢泰愚政府的调查结果称郑柄宙是自缢身亡，但郑柄宙是领洗的天主教徒（天主教教义不允许自杀）以及郑柄宙死前一直奔走要求还原双十二政变的真相等事实使此案带有一定疑点。