吉利支丹（基督徒）的镇压政策以及对南蛮船的驱逐政策。江户幕府并不希望萨摩藩吞併琉球。对于萨摩藩成功征服琉球，德川家康虽然给予其高度赞赏，称赞此次行动「无以类比」，但萨摩藩军队强大的战斗力引起了幕府的高度警觉。就在琉球国王获释同年的九月，幕府下令西部外样大名领有的诸藩只能拥有可载重五百石的运粮大船，其余船只全部被幕府没收，集中在淡路岛。此举不仅削弱了诸藩的军事势力，也限制了诸藩的海上贸易，消除了幕府海上贸易的竞争对手。江户幕府释放琉球国王的另一个原因是，幕府不希望引起日本与明朝的外交纠纷，并且希望通过