海嵴深度在2,400至2,600公尺之间，海床沈积物以沙质为主，另外受菲律宾海板块和欧亚大陆板块地质交互作用影响，巴士海崃还是一个地震多发区。巴士海崃是西北太平洋的大浪区之一，属热带海洋性气候。受大洋和大陆间季风的影响，海洋气象特征为高温多雨，季风盛行，雷暴较多，热带气旋影响频繁，也是西太平洋生成的热带气旋进入亚洲的路径之一。巴士海崃以北衔接台湾的兰屿及台湾南端恆春半岛，以南衔接雅米岛及巴丹群岛，巴丹群岛以南为巴布延群岛，再往南则为吕宋岛，南方群岛均隶属菲律宾管辖。巴丹群岛和巴布烟群岛之间为巴林塘海崃，