订于2009年12月5日举行的台南县市长选举也因此取消。在2009年三合一选举落幕后不久，台南县长苏焕智、台南市长许添财、前总统府秘书长陈唐山、立委赖清德、李俊毅、叶宜津等六人并表态争取2010年大台南直辖市长党内提名。不过在2010年1月19日，陈唐山以顾及党内团结与不愿意再浪费民进党党内的资源为由，宣佈退出大台南直辖市长党内初选。而在2010年1月24日，民进党临时全国代表大会通过了「民进党 2010 年直辖市长提名特别条例」，由中执会成立「提名协调小组」，其中执政的二都提名（包含台南市在内）採登记