历任分队长、除暴组侦查员、除暴组长，曾率队成功围捕梁国恺、王邦驹、张瑞东等多名枪击要犯，因侦破多起重大刑案及参与执行一清专案扫荡黑帮而崭露头角。1985年，侦破林宗诚杀警夺枪案。1986年，升为「检肃扒窃组」组长，负责侦讯有1980年代最冷酷杀手之称的刘焕荣，据侯友宜好友叶毓兰所述，当时侯友宜天天带着刘焕荣最爱吃的鱼下巴、鸭舌去牢里看他，又协助安排刘母到牢中会面，才突破刘焕荣心防，配合交代涉案情节，狱中还绘制一幅钟馗图致赠侯友宜。1988年，升中山分局刑事组长。1989年，郑南榕被依叛乱罪传讯，侯友宜奉