月16日，农会会址遭到海丰县县长率人袭击，杨其珊与陈梦等二十五名骨干被捕。后来，他经彭湃等人和进步团体救援而获释放，农民运动转入低潮后，他曾组织“十人团”，继续领导农民斗争。1925年，东征军攻入海丰，彭湃在周恩来协助下建立中共党支部；杨其珊加入中国共产党，同时恢复农会，改称县农民协会。1926年8月12日至19日，他在海丰县第二次农民代表会上当选为海丰县农会执行委员。1927年4月至5月，中国共产党第五次全国代表大会召开，他当选中央委员。中国国民党清党后，1927年9月开始，他任中共海陆县委农运委员。