主要目的是打败四大天王并完成宝可梦图鑑，玩家也需要击败想要控制全地区的邪恶组织。本作所新增的元素包括双打对战与宝可梦的特性，由于GBA的功能较以前的主机强，可提供4位玩家的连线对打（以前则只能两位）。另外本作也可以连接以解锁部分隐藏元素。其后《精灵宝可梦 火红·叶绿》推出后，本作也可与之连线。《精灵宝可梦 红宝石·蓝宝石》得到的评价多为正面，相反亦有意见认为本作相较于以往的作品没有太多的变革，由于当时精灵宝可梦的人气下滑与另一游戏作品游戏王的人气上升，本作销售量比过往较差，但仍取得了商业上的成功：销售量