95年，台湾进入日治时期后，该抚垦局随政权更迭而裁撤。
简介.1885年，台湾建省。为了确实管理台湾山地与所居台湾原住民之事务，首任巡抚刘铭传特地成立抚垦局，自任长官，是为督办台湾抚垦大臣，刘建请朝廷，任命板桥林家士绅林维源以太常寺少卿身份，派为帮办台湾抚垦大臣。另一方面，抚垦局亦也为台湾山地地区的行政区划。而在地方辖区方面，台湾抚垦局于大嵙崁设「抚垦总局」，统辖全台之抚垦事务。「抚垦总局」辖下还设有大嵙崁抚垦局、东势角抚垦局、埔里社抚垦局、叭哩沙抚垦局、林圯埔抚垦局、蕃薯寮抚