南明永历十五年（1661年，清顺治十八年），佛教临济宗石兴和尚从福建省兴化府莆田县湄洲天后宫分灵妈祖金身来台(今开基大妈)，以茅草建屋，奉祀于干豆（关渡）山区，但是黄富三〈北台首座妈祖庙关渡宫之起源与角色〉一文认为此一说法欠缺历史文献支持。目前就史料《诸罗县志》来说，「干豆门天妃庙」是清康熙五十一年（1712年），大鸡笼社通事赖科鸠众所建于山上；康熙五十四年（1715年）时重修，易茅以瓦，建材自厦门运来，诸罗县知县周钟瑄命名曰「灵山庙」。该庙原建于山顶上，康熙五十八年（1719年）迁到山麓；干隆四十七年（1