永享7年（1435年）南大门烧毁，虽然几度遭遇这样的火灾，但幸运的是未曾有过烧尽全山的大火灾，建筑、佛像等各时代的众多文化财产得以保存至今。庆长年间（17世纪初）的丰臣秀赖，元禄至宝永年间（17世纪末—18世纪初头）江户幕府的5代将军德川纲吉的生母桂昌院等人对伽蓝进行了修建。近代以后，受到“废佛毁释”的影响，寺院的维持变得困难，1878年（明治11年）管长千早定朝决定将圣德太子画像（唐本御影）等300余件宝物献纳当时的皇室，获得了一万元的赐与。这些宝物被称为「法隆寺献纳宝物」，其中大部分被东京国立博