县委书记发展地下组织协助张志忠建立南崁及竹围两个省工委支部，林元枝召集旧日相熟好友吴敦仁、吕乔木、曾阿华与道上兄弟游阿添、黄阿能、杨树发、谢万福等加入省工委。1948年林器聪遭逮捕，林元枝与张阿屘等人前往台北躲藏于亲戚家中。1949年4月林元枝返回南崁，简吉将南崁支部交与林元枝，实际上仍由张志忠领导。
成立武工队.1949年10月张志忠、陈福星于十三份成立武装工作队，林元枝于笔录中表示，成立武装工作队的目的是计画抢劫、绑架地主富商来开展省工委财源，例如绑架桃园名人陈希达、游姓肉商等