川藤孝跟和田惟政也率领南近江的降将前往山科七乡，织田信长用一天的时间渡湖，在24日时到达三井寺极乐院。军势则在大津的松本、马场佈阵，足利义昭同样渡江在三井寺光净院住宿泊。获知织田军即将上洛，三好三人众弃守京都，参议高仓永相父子经由八幡逃往大坂，关白近卫前久也逃往大坂，权中纳言劝修寺晴右屏居。9月26日时织田信长便带同足利义昭进入京都，在清水佈阵。织田信长也在进入京都后命令菅屋长赖制定洛中法制，派兵士护卫宫廷，维护京都的治安。但是上洛后，由松平信一率领的三河兵士跟部分织田军发生冲突，在织田信长裁决后，松平