补给据点，后在屯门一带被明朝军队击退，史称屯门海战。当时的据点被居民称为番鬼塘（番鬼为粤语，指西洋人），一直留存至今。清朝初期，为了截断郑成功的补给而实施迁界。复界后30年即1699年才兴建了杨侯庙。1713年修建了天后庙，1741年修建关帝庙。英国人来港时，大澳称作蜑家村。国共内战及战后，大澳成为从中国大陆逃难的非法移民的首要落脚点。近年大澳的渔业日渐式微，村民单靠捕鱼难以维持生计，于是转而从事海产加工，大澳亦以此闻名。区内只剩下一所公立学校办学，大多数青年成年后都会离开大澳工作或求学。大