善款主要用于扩展16/17基围的潮涨栖息地及兴建淡水池塘。至2011年，所筹得的善款主要用于复修米埔自然保护区内的生境地，进一步保育栖息于该区内的水鸟及其他野生生物。
2012年.香港观鸟大赛2012所筹得的善款主要用于第二期黑脸琵鹭生境地的修复工程、购买挖掘机、改善迁徙水鸟的栖息地、淡水塘的水质和维持基围生态系统的完整性。
2013年.香港观鸟大赛2013将会于国际湿地日──2013年2月2日举行。