为九铁公司的沙中线会浪费资源的意见，或认为会构成恶性竞争。两铁合併之说亦因此而有所增长，是造成两铁合併的因素之一。但整体来说，这可使一直有盈余的东铁为九铁带来可观利益。日后东铁列车离开旺角东站后，将会从靠近爱民邨的现有隧道驶入地底，到达红磡站新建的地底车站月台。
两铁合併带来的变数.沙中线兴建的另一变数，是九广铁路公司与地铁公司计划合併，该线将于不久作出重大变化，融合两铁的现有系统再作规划。而立法会交通事务委员会财经事务委员会一份名为「两铁合併─建议的未来路向」的文件亦建议沙中线以