大学，并在次年二月颁佈《第25/92/M号训令》（《澳门大学章程》），并以培养澳门人才为目标。大学重组后，学生人数急剧上升。截至澳门回归前夕，学生人数增至约三千人，而澳门本地学生的比重亦由创校时的39%增至80%。原属东亚大学的理工学院则独立为公立的澳门理工学院，而东亚大学的研究院和公开学院则合併为东亚公开学院（今澳门城市大学），以私营模式运作。1995年，首届硕士生毕业，同年中国银行澳门分行开始发行1995年版澳门币，其中50元纸币的正面图案为澳门大学远景。1997年，大学首位博士生毕业，葡萄牙共和国总统