当时的金刚队队伍残破，赵仍无法使金刚起死回生。1999年转任太阳队总教练，率领太阳队以48胜3和33败战绩、五成九三胜率登上季赛王座，然而在接下来的总冠军战，却以二胜四败战绩无缘登上年度总冠军王座。不过在隔年，赵士强所带领的太阳队，获得日职前西武狮强投石井丈裕的加盟，以52胜30败3和，六成三四的超高胜率夺得例行赛冠军，并一路过关斩将，在总冠军赛时四连胜横扫年代雷公队，夺下年度总冠军桂冠。在带领太阳队登基后，赵士强正式退出球场，并接下那鲁湾职棒公司总经理的工作，虽然做的事一样是为国内棒坛，不过，却已是完