子系统发生学研究进一步证实了这一点。这一研究也证明了与澳洲鹤亲缘关系更近的其实是白枕鹤，而不是形态学上相似的赤颈鹤。在之前的分类中，澳洲鹤属于鹤属。但2010年发表的一项分子系统发生学研究表明，鹤属是多系群的。所以，在之后对鹤科重新分类中，澳洲鹤、白枕鹤、赤颈鹤和沙丘鹤被移到了赤颈鹤属。赤颈鹤属这一分类最早由德国鸟类学家路德维希·赖兴巴赫于1853年提出。传统上，它一直被认为有两个亚种分化：A. r. argentea，即北澳洲鹤亚种，分布在西澳大利亚州、北领地和昆士兰州西部；A. r. rubic