突抑或阿以冲突经常是会议的主题，佔据了大量的与会者的辩论时间、联合国的资源，并为此推出了无数的决议。美国国务卿约翰·克里曾指责联合国人权理事会过度集中于对以色列侵犯人权的指控。联合国秘书长潘基文亦承认联合国对以色列抱有偏见。其他一些政论家如戈尔德、艾伦·德肖维茨、马克·德雷福斯、、，以及反诽谤联盟都认为联合国对于以色列在和阿拉伯及巴勒斯坦地区发生的冲突中的行为过于关注。威斯特里奇研究指出：「在过去的四十年中，联合国人权理事会（前身为人权委员会）通过的重要决议中的三分之一都是针对以色列的。相比之下，对于中国、