运河博物馆位于台南市安平区、台南运河畔。2003年5月13日公告为市定古蹟。该建筑在台湾日治时期是监控商船进出安平港区的台南运河安平海关，现在则是陈列先民渔具模型以及昔日关税局的相关文物等的运河博物馆。
沿革.该建筑建于日治时期大正年间，负责向往来船只征收关税并监管之，之后因台南新运河开通，海关业务于1930年移至台南运河海关，原建物设置安平水产学校。此建筑战后又改设为海关，直至民国六十七年（1978年）海关移至新安平港后闲置。后来因都市计画作为广四用地，民国九十一年(2002年)