性菌的细胞壁的结构和组成复杂，肽聚糖只有一薄层，在两层细胞膜之间的膜间腔中，而革兰氏阳性菌细胞壁厚得多，且只含有很多层肽聚糖。
古菌细胞壁.虽然不是真正独特，但古菌的细胞壁是不寻常的。尽管肽聚醣是所有细菌细胞壁的标准组分，但所有古菌细胞壁都缺乏肽聚醣，除了一组外[12]。 在那一组中，肽聚醣是一种与细菌中被发现的非常不同的一种改性的形式。 古菌目前已知有四种类型的细胞壁。一些古细菌的细胞壁由类似肽聚糖的构成，而另一些古菌既无肽聚糖，也无假肽聚糖，其细胞壁由多糖、糖蛋白或者蛋白构