吴佩孚死后停灵于此。1949年，中国人民大学的前身华北大学随中央机关进驻北平，不久便改为中国人民大学，拈花寺被中央人民政府及北京市人民政府划拨给该大学。中国人民大学附属中学的前身曾在此办学。1953年起，拈花寺转为中国人民大学印刷厂作为厂房使用。文化大革命期间，中国人民大学停办，中国人民大学印刷厂移交北京市有关部门管理，拈花寺大殿被拆除以建设厂房。文化大革命结束后，中国人民大学复校，拈花寺产权重归中国人民大学。1984年，为落实国家的宗教政策，中国人民大学同意将拈花寺产权移交给北京市佛教协会，北京市佛教