果西班牙驻菲律宾总督和他相左，西班牙政府会因而调换当地总督；当地殖民者因而无不畏惧其。当时菲律宾当地有关华侨的法令，都先经陈谦善认可才施行。由于陈谦善拥有如此权力，他曾以“中国无枪毙之刑”的理由，成功争取废除华人死刑；又极力争取禁止福建女子从事娼妓。光绪十四年（1888年），陈谦善创办菲律宾第一家华文报纸《岷埠华报》。光绪十七年（1891年），陈谦善集资向西班牙殖民当局购得马尼拉北郊荒地数百亩，辟为中华义冢（华侨义山），使在当地逝世的华侨死有葬身之地。同年，陈谦善在马尼拉倡办崇仁医院，为当地贫、病华侨施