党内初选的赖清德在脸书指出，台湾已经是个主权独立的国家，名字叫中华民国，不必另外宣布台湾独立。在传统独派眼中，赖清德的说法不是台独，而是「华独」。
陈水扁案.赖清德于2013年11月表示，与其同党之前的总统陈水扁涉入的陈水扁家庭密帐案审判不公，又陈水扁身体不佳，应使之保外就医。2014年8月6日特侦组宣佈该案的确查无不法实据并签结，惟陈水扁仍因其他案件入狱。对此，赖在2014年11月称释放阿扁「有助于缓和朝野氛围」。
蒋中正铜像去留.2015年台南市的