05年又决定在闵行校区兴建新馆，新馆于2006年3月11日奠基，2008年9月投入使用。新馆建筑面积约为3.5万平方米。
分馆.上海交通大学图书馆在用的分馆包括位于徐汇校区的包兆龙图书馆，位于闵行校区的包玉刚图书馆、主馆及位于卢湾校区的医学院图书馆组成。已撤并的分馆还包括徐汇校区老图书馆、农学院图书馆和文科图书馆。
已撤销馆舍.老图书馆，位于徐汇校区东部，由1916年毕业生发起，师生及社会各界募资兴建，建成于1919年，为一栋具有传统欧式风格的建筑，建筑面