丰臣秀吉年代开始，日本政府已经发觉西班牙及教会往往会带来的威胁，为免日本被殖民、防止西方思想传入以保障国内政治稳定及意图垄断对外贸易，于1624年与西班牙绝交，亦禁止船只往来日本及菲律宾，1633年正式颁佈锁国令，不准已出国之日本人回国，并于1638年岛原之乱后，在1639年颁行最后一次锁国令，禁止与葡萄牙贸易，今后只容许荷兰人及中国人在长崎出岛进行贸易。（对朝鲜贸易则集中在对马岛的对马府中藩、对虾夷人及西伯利亚民族的毛皮贸易则集中在北海道的松前藩、另萨摩藩在江户时代后期也和琉球进行走私活动）至于其他国家，