有大发光器，照亮了它们的视野。另有许多深海鱼会发光以吸引食物。角亚目通过拟饵体顶部的共生发光吸引猎物，须角鮟鱇科颚部的多叉胡须则含有自发光器官。此外，褶胸鱼属和黑线岩鲈属等类群的发光器官则在口腔中。
沟通.生活在浅海中的鱼在集群时会观察反射光。与之相似，人们认为深海鱼利用生物发光维持集群。在中层带集群的灯笼鱼科，除为反照明而在腹部具有发光器，头部和尾部也有发光器。发光器的大小，位置和数目显示两性异形，可能用于两性沟通。巨口鱼科雄鱼的眼后发光器通常比雌性大。Section::