虽有保育措施，如国际大西洋吞拿鱼保护委员会宣布削减蓝鳍吞拿鱼的捕捞量至2011年的二万吨以下，并缩短捕捞季节至四个月，但仍被批评措施力度不足。摩纳哥于2009年10月16日正式建议，列濒危的北方蓝鳍金枪鱼为濒危野生动植物种国际贸易公约附录I物种，禁止其国际贸易。现北方蓝鳍金枪鱼被列入联合国海洋法公约附录I中。
养殖.人工饲养北方蓝鳍金枪鱼于2009年首次成功繁殖并从幼鱼阶段生长到鱼苗阶段。但以此取代野生蓝鳍金枪鱼供应市场的目标仍然遥远，自然种群的损失，以至崩溃似乎已不可避免。