张家口建立政权，汪兆铭附之。此后五年，战势稍缓，日军陷南昌、南宁、宜昌，政府成功防守长沙。1940年，国民政府第89军发动黄桥战役，为中共新四军歼灭，1941年，顾祝同击败新四军，扣押叶挺，是为皖南事变。日军轰炸重庆造成惨案。苏联签订日苏中立条约，承认满洲国换取日本承认外蒙独立，中共认可，国民政府激烈反对。1942年，日侵缅甸意图切断英援补给，中国远征军赴缅。1943年，政府与英美废除不平等条约，欧洲各国和加拿大陆续取消在华特权。1944年，日军发动豫湘桂战役，一度佔领三省大部。苏联策划伊宁事变，最高苏维埃