Hyacinthe Humbert作为执行建筑师，同样担任执行建筑师的还有巴黎的Antoine Hermitte，两人在1862年12月下旬从马赛登船，亲赴广州，指导教堂的具体建造工程。石室教堂的正立面是仿照巴黎第七区的圣克罗蒂德教堂而建，而中殿和半圆形后殿的内部则是参照法国的，整座教堂而言是属于19世纪兴盛于欧洲的歌德复兴式风格。由于教堂全部使用花岗石建成，而广州并不出产花岗石，教堂用尽了当时从香港九龙的牛头角及茶果岭开採出来的麻石。这些石用帆船运至广州，再用人工打凿，吊装，粘合。建造过程经历重重艰