总建坪数2,050坪。一楼为可容纳二千人的大餐厅，二楼为太子殿，三楼为观音殿，顶楼为凌宵宝殿。主祀中坛元帅，配祀莲花太子、福德正神、註生娘娘、观音佛祖、善财、龙女、李府千岁、池府千岁、吴府千岁、关圣帝君、关平、周仓、文昌帝君、剑童、书童、玉皇上帝、三官大帝、南斗星君、北斗星君、太岁星君等。麻豆太子宫除了供奉一般武身中坛元帅，还有供奉身座莲花的莲花太子。莲花太子丰容真诚，饰以耳环，配戴手镯并为穿红兜，造型与台湾太子爷神像大异其趣。其外还有供奉太子爷的师父太乙真人，在小说《封神榜》中太乙真人曾经帮死