998年9月16日开工，2003年启用，开通时为避免与粤海铁路的海安站重名因而在地名后加“县”字，称海安县站。新长线在海安设有一条支线通往南通，建成初期仅办理货运业务。2004年7月，车站开办客运业务，但范围仅限新长线本线。2005年7月1日，宁启铁路扬州-海安段亦建成投用，车站接入全国铁路网并开通长途列车客运业务。2009年7月车站开始电气化改造，2013年11月车站开始站房改造。电气化改造工程于2014年年底完成，新站房于2015年2月7日投入启用。2014年1月16日，海安至洋口港的海洋铁