五十七年（1792年）担任顺天府乡试同考官。后督贵州学政。任内为贵州各府书院购置经、史、通典、《文选》等方面图书，提高了贵州学术水平。嘉庆元年（1795年）回京师供职，入直上书房，教授皇曾孙奕纯读书。嘉庆三年（1798年）以征邪教疏为题考试翰林和詹事，洪亮吉着文，力陈内外弊政数千言，为时所忌，以弟丧辞职回乡。嘉庆四年（1799年）为大学士朱珪起用，参与编修《高宗实录》。同年，上书《乞假将归留别成亲王极言时政启》：“人才至今日消磨殆尽矣。数十年来，以模棱为晓事，以软弱为良，以钻营为进取之阶，以苟且