分歧的六家线；为了让六家线的电气化列车可行驶至位于市区的新竹车站，因此将本路线的新竹~竹中段进行高架双轨电气化工程，使六家线列车可与内湾线的新竹~竹中段进行直通运转，开行新竹车站~六家往返由通勤电车(EMU600型或EMU500型1组4辆行驶)所运行的区间车，并且新设3座通勤车站。本工程已于2011年完工，有效提升新竹市区往返新竹高铁站的便利性。自2020年12月23日南回铁路全线电气化完工通车后，内湾线成为台铁所有营运路线中唯一同时拥有电气化及非电气化的铁道路线。
营运概况.