斯顿支线归到伦敦和东北铁路公司名下，然后伯肯黑德铁路和默西铁路未受任何影响，直至1948年被国有化。经过一些列整合和电气化，1938年3月起，西柯比和新布赖顿开出的列车可以直接通往利物浦市中心，乘客无需再通过伯肯黑德公园站转车前往利物浦市中心。第二次世界大战期间，1940年至1941年的利物浦大空袭给默西铁路造成了严重损坏，地面列车服务几度中断，而地下列车服务一直持续。空袭还导致了对伯肯黑德公园站的损坏并导致了列车损毁。在此期间，线路上出现了从伦敦汉默史密斯及城市线临时调运来的地铁列车，但从未再威勒尔铁