2年（36年）12月，大司空李通辞职。马成代行大司空。数月后，再为扬武将军。《后汉书》马成传代行中郎将在建武9年（33年），与本纪、来歙传记述不合。马成传记载建武9年的明年代行大司空，本纪、李通传记载李通辞职在建武12年，建武9年为建武11年之误（根据钱大昕的考证）。建武14年（38年），驻屯常山、中山防备匈奴、乌桓、鲜卑等北方民族。建武15年（39年），建义大将军朱祜入朝，马成再领朱祜军队指挥权。次年，又代弹劾免官的骠骑大将军杜茂指挥修复障塞。西河至渭桥(咸阳近郊)，河上(左冯翊。关中东北部)至安邑(