间入狱。由于高的牧师身分，他被捕曾引起梵谛冈关注，教宗若望保禄二世更曾派驻台特使探监。在狱中所写的诗词《莿帕互火烧》在2006年获得第17届金曲奖传统暨艺术音乐作品类最佳作词人。1984年8月出狱。
出狱后.1989年担任台湾基督长老教会松年大学校长迄今，2000年陈水扁当选总统后担任中华民国总统府国策顾问。2006年，高俊明在百万人民倒扁运动风潮中支持陈水扁。他唿吁，「疼惜台湾」的人要全力相挺陈水扁及吴淑珍。为此遭施明德攻击其担任总统府资政是「吃人嘴软、拿人手短」。201