当时水尾一带只有四、五家居民，都是粤人。1888年（光绪十四年）12月7日裁撤原驻扎卑南的台湾府南路抚民理番同知，正式设立台东直隶州。后移治今台湾台东县西北卑南乡。属福建台湾省。
日治时期.1895年（光绪二十一年）台湾根据《马关条约》割让给日本后，台湾总督府将台东州降格成与西部县等同的出张所，由台南府改制的台南民政支部管辖。隔年，台南民政支部改为台南县，台东出张所改为台东支厅。1897年（日明治三十年）台东支厅升格为台东厅。1897年台东支厅升格为台东厅，下设三辨务署，分别为管辖