月国民党六届二中全会上，CC系发起“革新运动”，并指责政学系在政协决议问题上“出卖党国”。经此，政学系的影响趋于式微。1949年，中国国民党撤退到台湾，部份政学系成员如张群等也来到台湾。
评价.1946年7月国共和谈期间，周恩来与一位美国教授谈话时，对国民党权力结构归纳道：“国民党的最后决定权是操在蒋介石的手中，但蒋也不是孤立的，而是受他下面各集团影响的。每一个集团都在他之下，都非操有全部的权力。这权力是分割的，如党务操在CC系的手中，财务操在宋、孔的手中，军事操在黄埔系的手中