此后，现代演化综论得到了进一步的扩展，至解释完整横跨生物层级及综合范围的：从基因至物种。此扩展，如演化发育生物学，或简称为演化发生学，强调世代之间的变化（进化）是如何影响生物个体的模式。
原理.当个体之间存在差异，这些差异可以遗传，而且有些机制在改变这些差异在族群中的频率，那么族群就会演化。
差异.个体间的差异最终都是来自突变。重组和迁徙也是带来差异的重要机制。
突变.突变是指遗传的物质发生改变。广义的突变包括染色体变异（分为染