根菌纲真菌的菌丝体生长缓慢，其菌丝具有两层细胞壁，表面有一些分泌物，直径1-2微米，且可能会形成直径3-6微米的厚垣孢子。本纲物种虽常出现在植物根部，但没有证据显示它们可以与植物形成菌根，也没有证据表明它们是植物病原菌，因此其出现于根部可能是与其他种形成菌根的真菌互动，而非与植物互动所致，且因其可于仅含葡萄糖或仅含纤维素的培养基生长，也可能属于不直接依赖植物供给有机物的腐生菌，因其生态地位不甚明朗，发现者之一的密西根大学真菌学家提姆西‧詹姆士（Timothy James）称其为「一种有点无趣的真菌」。古根菌