农学校创建于1876年，并在1918年升格为北海道帝国大学，是日本本土的七个帝国大学之一，亦是北海道教学研究水准最顶尖的高等学府。北海道大学现在拥有札幌和函馆两个校区，12个学院，本科学生超过11,000人，硕士和博士学生超过6,000人。2010年诺贝尔化学奖得主铃木章曾就读并执教于北海道大学，现在是北海道大学的名誉教授。除了北海道大学之外，北海道还有北海道教育大学、室兰工业大学、小樽商科大学、带广畜产大学、旭川医科大学、北见工业大学等六所国立大学和钏路公立大学等五所公立大学。北海道亦拥有26所私立大学，