囊泡融合(英文：Vesicle fusion)是囊泡与其他囊泡或细胞膜一部分的融合。在后一种情况下，这是分泌性囊泡分泌的最终阶段，在那里，其内容物通过胞吐作用从细胞中排出。囊泡还可以与其他靶细胞区室融合，例如溶体。 当分泌性囊泡暂时停靠并融合在称为多孔体的细胞质膜的杯状结构的底部时，细胞就会发生胞吐作用，这是细胞中的普遍分泌机制。在细胞内钙离子（Ca2 +）浓度增加的情况下，囊泡融合可能取决于SNARE蛋白。