4月7日，郭茂林因急性肾衰竭病逝于东京杉并区自宅，享寿90岁。为纪念郭茂林对台湾与日本建筑业界的贡献，郭茂林的友人在其生前筹拍纪录片《巨塔之男——郭茂林》（），由酒井充子导演，于其逝世后半年后的2012年10月在东京国际电影节上映。2016年4月，获中华民国政府颁赠褒扬令。