上古音系》是郑张尚芳在上古汉语研究领域最主要的着作，以1981年《上古音系表解》为基础不断补充完善而来。郑张与其弟子潘悟云合作编写了《汉字字音演变大字典》，作为《汉字形音义演变大字典》系列的一部分，不仅收录了郑张拟音和潘悟云拟音，还收录了王力、李方桂、高本汉等人的拟音。在温州方言方面，郑张尚芳写作了具有权威性的专业志《温州方言志》；《温州方言文献集成》则由他与沈克成合着，收录了其花大半辈子时间收集和整理来的温州方言，直到郑张尚芳离世，这套书尚未完全出版。郑张尚芳一生在各类期刊上发表了百余篇论文，其中几十