陕甘宁边区高等法院分庭组织条例》的规定兼任分庭庭长。在兼任分庭庭长期间，他亲自深入群众调查并审理了封芝琴婚姻上诉案，创造了马锡五审判方式。后来陕甘宁边区的文艺工作者们根据封芝琴一案创编了鼓词《刘巧儿团圆》、剧本《刘巧儿告状》。后来这个案件还被改编成了着名评剧《刘巧儿》。此外，他还审理了曲子县苏发云三兄弟“谋财害命案”，释放了被错误关押的苏发云三兄弟，惩罚了杀人凶手。后来，他还处理了两起土地纠纷案等案件。他的司法实践受到群众欢迎，他被陇东民众誉为“马青天”。马锡五审判方式1943年初步形成，1944年在陕甘宁