河，最后于顶窝西侧注入急水溪干流；其主要支流有茄苳溪、鹿寮溪等。六重溪为急水溪的另一大支流，也是本区西北部的重要河川。该溪发源于白河区与嘉义县大埔乡交界处的大冻山，流至白河区䓶桐崎后，成为与本区的界河。其后流至青叶桥注入急水溪干流。曾文溪为跨越嘉义县、台南市的一条大型河川，其中游河段流经本区东南边界，在本区内的集水区范围不大，且都位于山区。对本区而言，其重要性远不如上述河川。
气候.东山区全区纬度均在北回归线以南，依据桑士伟气候分类法，属于热带湿润气候。区内仅有东河、东原、