前者无水，而后者是二水合物。一般的异麦芽酮糖醇分别含有43%重的GPS与57%的GPM。两种化合物能透过分离。
使用与影响.异麦芽酮糖醇的吸湿性不佳，利于储存，也不会在口中造成黏腻感，因此广泛应用在甜食、喉片等物。异麦芽酮糖醇对血糖的影响小，所以成为糖尿病患者替代饮食中糖分的诸多选择之一；由于难以被口腔中的细菌分解，导致蛀牙的风险也低。不过其甜度和供应热量的比例接近蔗糖，对欲以其代替砂糖减少热量摄取者效果不大。异麦芽酮糖醇属于糖醇，不容易被人体消化吸收，此特性如同膳食纤维，可以刺激