返回泸州短住，不久又被巡抚派四个指挥押解回永昌。嘉靖三十八年（1559年）七月六日，杨慎在戍所逝世，年七十二岁。临终云：「临利不敢先人，见义不敢后身」。慎去世后，当时云南巡抚、右副都御史游居敬命人为其殡殓入棺，还葬故乡新都。明穆宗隆庆初年，追赠光禄寺少卿，明熹宗天启时追谥文宪。
着作.杨慎投荒多暇，书无所不览，“奋志诵读，不出户外”。《明史》称其：“明世记诵之博，着作之富，推慎为第一。诗文外，杂着至一百余种，并行于世。”又善弹琵琶。其最具盛名的长篇弹唱叙史之作为《二十一史弹词》