，一般会进行的活体组织切片。若是炎症性肠病（例如克隆氏症及溃疡性结肠炎，会频繁的进行组织切片，以确认疾病的情形，并且评估是是否可能会导致恶性肿瘤的变化。若疾病的原因不确定，或是其程度其程度或确切性质仍有疑问时，一般会在病变部位进行活体组织切片。例如血管炎常常是透过活体组织切片诊断出来的。
活体组织切片的分析.在进行切片后，会将组织分片送到病理学实验室。会由专门诊断疾病（例如癌症）的病理学家用显微镜进行检查。当实验室（参考组织学）收到切片后，会处理组织，由切片上除去极薄的组织，