细胞理论、胚胎学和生源理论.显微镜学的进步也给生物学思想带来了深远的影响。在19世纪早期，大量生物学家都指出了细胞的重要性。1838至1839年，许莱登和施旺开始提出理论：（1）细胞是生物体的基本单位；（2）单个细胞拥有所有的生命特征，虽然他们反对；（3）所有细胞都来自其它细胞的分化。但是，由于罗伯特·雷马克和鲁道夫·菲尔绍的工作，到1860年代多数生物学家都授受了以上三点原则，并称之为“细胞学说”。细胞学说使生物学家将独立的生命体重新想象成单一细胞的相互装配。新兴领域细胞生