迁至副将，晋总兵。捻军平定后，授河州镇总兵官，李鸿章荐其朴诚忠勇，留统北洋防军。历授大同、宁夏镇总兵官，均未任官。光绪十七年李鸿章奏称“实系最为得力之将。”率盛军驻守天津附近的青县，共有步队12营6000余人，马队5营1000余人，合约8000人。甲午战争爆发，卫汝贵奉命率军增援平壤，部队军纪很坏，沿途骚扰百姓，李鸿章曾警告他：“敌氛逼近，若酿成大乱，汝身家性命必不能保”。平壤之战中，卫汝贵指挥盛军在西、南两个战场激战，重创日军，惜此役清军溃败，平壤失守。衞汝贵被革职逮问，李鸿章为其说情，未成，后械送京