发动军事政变推翻戈弗雷·比奈萨后，曾短暂出任军事委员会主席（即实际上的总统），直至乌干达总统委员会组成。乌干达总统委员会在1980年5月22日至12月15日期间是乌干达的国家元首，穆万加任该委员会主席。1980年8月1日至8月25日期间，穆万加任乌干达总理。