芦之湖原先是箱根火山破火山口内的中央火口丘之一。作为成层火山的神山在约3000年前的大喷发造成山崩，其土石堵塞了破火山口内的而形成芦之湖。天平宝字元年（757年），创建箱根神社后，传闻制伏了芦之湖的九头龙，并建立现在的九头龙神社本宫。江户时代，骏河国骏东郡深良村（现裾野市）名主大庭源之丞为了灌漑水源而计画开凿芦之湖贯穿箱根山外轮山（下）的隧道。在取得芦之湖水利权拥有者的许可，以及江户商人的资金协助下，1670年（寛文10年）完成供水道「」。深良用水之后被农林水产省选为之一。江户时代的箱根与深良都