负责国光计划的擎天作业室，但擎天作业室并未将计画转交给空军作战司令部，因此当海军要求空军支援时，空军作战单位并不知道此一计画。
经过.8月5日6时，海军巡防第二舰队司令胡嘉恆少将率（PCE-45/65，原美国二战时期，标准排水量890吨，满载排水量1,250吨，极速18节（33公里/小时））、章江舰（PC-118，原美国二战时期，标准排水量280吨，满载排水量450吨，极速20节（37公里/小时））及搭载工作人员，离开左营港前往东山岛，22时29分于福建省苏尖角东偏南15海里处