查鲻山遗址分布范围时，发现甬余公路建设过程中挖掘的排水沟中存在陶片，且堆积层厚达1米，确定该区域同为史前人类活动区域。次年9月至12月，浙江省文物考古研究所和厦门大学联合，在公路南侧对遗址展开抢救性发掘。此次发掘面积306平方米，打开探方14个，发现干栏式建筑遗迹、燧石打制石器、陶器、象牙装饰品等遗物，总数近千件。
分期与年代.考古发掘发现，鲻山遗址可分为10个地层，其中表层为耕土层，2层仅有局部分布，发现良渚文化小型墓葬，3层至10层为河姆渡文化层。根据地层关系和遗物，鲻山遗址被