双旗竿伦敦会、缸瓦市伦敦会、灯市口公理会、东四五条西口公理会、孝顺胡同美以美会、石驸马桥安立甘会、鸦儿胡同长老会、交道口二条长老会）全部被焚毁。北京的数千名基督徒在东交民巷使馆区避难约2个月之久。
20世纪上半叶.1901年《辛丑条约》签订之后，基督教（新教）在北京经历了较大的发展，掀起了一波建筑教堂的高潮，城内教堂数目达到60多座。不仅被毁的原有教堂得到重建，各教派又纷纷在全城各处分设不少规模较小的新教堂。尤其是美以美会在南城得到大力扩张，后来在北京城内共设有10余座教堂（崇文门