南朝的成立和南北朝併立.后醍醐天皇从京都逃到吉野并主张光明天皇所持有的神器是伪造物，并宣称自己是正统，于是南北朝成立。以后，吉野朝廷被称作南朝，京都朝廷被称作北朝。
后龟山天皇和南北朝统一.1391年山名氏清和山名满幸发动的明德之乱失败。1392年（元中9年/明徳3年）后龟山天皇前往京都转让了神器给后小松天皇，南朝灭亡，南北朝统一（明德和约）。