苏联相继占领削弱了爱沙尼亚的经济。战后，社会主义化使爱沙尼亚的经济和工业融入到苏联的中央计划经济体制之中。1999年，爱沙尼亚经济遭受自1991年独立以来最严峻的危机，主要原因为受到1998年8月的俄罗斯金融危机影响。爱沙尼亚于1999年9月加入世界贸易组织。仍在为能源供应、电信、铁道等国营单位进行私有化。爱沙尼亚于2004年5月1日加入欧盟。目前爱沙尼亚经济发展迅速，资讯科技发达。不少芬兰公司将部分运营部门搬入爱沙尼亚，促进经济发展。2011年1月1日，爱沙尼亚正式加入欧元区，成为欧元区第17个国