2日改组，更名「株式会社旗舰工作室（）」。而旗舰工作室的代表董事社长由动画制作人草野启二就任，另外作为旗舰工作室的社员，龙之子制作公司出身的栃平吉和也加入行列。旗舰工作室改名初期，以制作成人动画OVA《淫兽学园》等作品起家，1993年播出至今的《可爱巧虎岛》系列开始投入一般年龄层动画的制作。1996年，由旗舰工作室的经理清水修以制作成人动画为主要业务，另外成立有限公司Arms，旗舰工作室从此停止制作成人动画，转移向别家总承包商承包分工制作，尤其以承包Studio Pierrot的作品最多。2008年