理河东郡，以无为而治为原则，人民提出诉讼，杜畿只和他们说道理，然后要他们回去思考，还有不满才再来。乡邑父老亦服从，令到郡县少有诉讼。又鼓励人民畜养牛马和家畜和家禽。人民勤于务农，家家都富起来后又讲授武学和开学宫教授经书，令到河东郡有大量儒家学者。后来韩遂和马超在关中举兵反抗曹操，弘农郡和冯翊郡多个县邑都响应，但河东郡虽然邻接，人民却无异心。曹操率军与叛军对抗时，军粮就完全依靠河东郡供应，到战胜后还余下二十多万斛，曹操因而称赞杜畿，增秩中二千石。曹操征伐据守汉中的张鲁时，杜畿又派五千人运输，虽然要到战争前