摩提纳战争，前43年）之后，他成为其兄的总督。前41年，卢基乌斯·安东尼当选为执政官（与普布利乌斯·塞尔维利乌斯·瓦蒂亚·伊萨乌里库斯共任）。前41年爆发了所谓佩卢西亚战争；马克·安东尼的妻子弗拉维娅在时任执政官的卢基乌斯·安东尼的支持下，筹集了8个军团发动反对三头成员屋大维的战争。卢基乌斯和弗拉维娅进军罗马，赶走了三头之一的雷必达，并且向罗马人民承诺将结束三头政治。然而在屋大维率军到来之后，卢基乌斯·安东尼就被迫撤退到伊特鲁里亚的佩卢西亚，在那里他受到3支军队的围困，结果不得不于当年冬天投降。卢基