主祭神是在戊辰战争、佐贺之乱、西南战争等日本国内战争和甲午战争、八国联军、日俄战争、第一次世界大战、九一八事变、七七事变、第二次世界大战等对外战争中“为守护国家而牺牲”的246万6千余人的灵魂，神社方面称之为“靖国大神”。靖国神社供奉的人士包含维新志士吉田松阴、高杉晋作、坂本龙马。神社内供奉死者近二百五十万之多，故并没有骨灰或牌位，而只是将死者的姓名和资料记录在《灵玺簿》（旧称《祭神簿》）之上。死者的灵魂计算单位为「柱」，作为祭神的死者在姓名后加上「命」字尊称，如「山本五十六命」。根据靖国神社列出的