李绍鸿身后在2014年1月15日在香港殡仪馆设灵，晚上举行守夜祈祷礼，高永文、香港中文大学校长沈祖尧、医院管理局主席梁智仁与行政总裁梁栢贤、劳工及福利局局长张建宗和香港大学医学院院长梁卓伟等均有到场弔唁。在场佈置逾300个由行政长官梁振英、政务司司长林郑月娥和民政事务局局长曾德成等各界人士送赠的花牌，而世界卫生组织总干事陈冯富珍和高永文等都有撰写輓词。翌日，李绍鸿的安息礼拜在中环圣约翰座堂举行，出席者包括前食物及卫生局局长周一岳医生等多名前政府官员和医学界人士。
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