，黄河再次溢水，明孝宗命有司赈济开封、怀庆二府及归德、宣武、睢阳三卫被灾之家。弘治五年（1492年），苏松河道淤塞，泛滥成灾。孝宗命工部侍郎徐贯主持治理，历时近三年方告完成。从此，苏松消除了水患，再度成为鱼米之乡。弘治六年（1493年），黄河又于张秋决堤，由汶水入海，漕运中绝，经朝臣推荐，孝宗命浙江左布政使刘大夏前往治理黄河，经两年时间治理，黄河自开封往东，不再向东北入山东流入渤海，而是向东南，经徐州，由洪泽湖北汇入淮河，夺淮河河道入黄海。筑长堤三百六十里，基本上抑制了黄河水患，此后漕河上下无大患者