西班牙人在吕宋岛修建的第一座宗教建筑，第一次修建圣奥古斯丁教堂是1571年由西班牙人用竹子和芦苇建成，但是在1574年12月中国海盗林凤逃亡到菲律宾时，进攻马尼拉并以大火毁坏圣奥古斯丁教堂。第二次修建教堂用木头建造，于1583年2月被毁，起火原因是在西班牙总督Gonzalo Ronquillo de Peñalosa的葬礼上，蜡烛点燃了棺材布。第三次修建奥古斯丁教堂时，受奥斯定会位于当时同样被西班牙殖民的墨西哥建筑设计影响，胡安·马西亚斯（Juan Macias）决定用石料重建教堂以及毗邻的修道院。工程