为主轴与新党赵少康、寻求连任的中国国民党黄大洲竞选，并最后赢得胜选，选举后虽传出弃保效应，但陈水扁当选首都市长显示民进党已经能够借由国民党的分裂而与其相互抗衡。1999年为因应2000年中华民国总统大选，民进党基本政策作了重大改变，通过重要的《台湾前途决议文》，认为台湾已是独立的国家，国号就是「中华民国」，争取更多的中间选民认同。并在随后推选落选的前台北市长陈水扁与美丽岛事件参与人、时任桃园县县长的吕秀莲参选正副总统选举，选战过程原本不被外界看好，但由于发生兴票案，使得宋楚瑜支持度跌至谷底，在由邱义仁、