民国十五年（1926年）北伐军兴，废除县公署，暂设建阳县行政委员会。民国17年奉福建省政府命令，改称县政府。设置县长、科长、科员；县辖行政机构设区长、乡长、村长等。1933年，中国共产党曾在在建阳成立短暂的苏维埃政府，与中华民国建阳县政府并存。中国共产党福建省委员会也曾经短暂设立于建阳太阳山革命根据地。抗日战争期间，大量难民涌入建阳，导致人口迅速增长。1941年，国立暨南大学迁入建阳，在考亭书院旧址办学。1942年4月，国军第三战区司令长官部及其下属机构部队转进建阳。日军因此数次轰炸建阳县城，对建阳城市