。1999年，她与台湾男艺人林炜在加拿大多伦多註册结婚后，婚后育有一子一女。二人于拍摄武侠剧《雪山飞狐》时结缘。林炜为其第二任丈夫。此前，她与建筑商人霍振华结婚，但在1990年代于马来西亚拍摄剧集完毕返港后发现霍氏有婚外情，所以决定离婚。龚慈恩其后与林炜到台湾生活了两三年。她曾因婚姻而淡出幕前，近年儿女渐长而复出。2012年加入银河海润演艺有限公司，主要在香港、中国大陆接拍电视剧及电影。2015年，龚慈恩的女儿林恺铃也加入娱乐圈当唱作歌手。龚慈恩于2017年以「自由身」形式拍摄邵氏兄弟剧集。她于2017