屋顶（现时为浅紫色）木造建筑物。大楼内设有车站事务室、候车室和1台自动售票机（可使用橙卡，但不可购买橙卡）。此站没有自动闸机。此站是由南甲府站管理的业务委託车站，委托了东海交通事业负责车站业务。此站设有JR全线售票处，车站职员使用发售特急票，可使用信用卡支付车费。在早上、晚间、日间部分时段没有车站职员当值。另外，在早上和晚间没有车站职员当值时段中，一人控制列车会以无人车站为标准处理。
使用状况.东花轮站是山梨县内JR东海车站中最多人使用的车站（不包括甲府站的JR东日本车站。并根