民国总统马英九在地震发生后即致电日本首相菅直人转达政府与人民的慰问，并指示国内搜救队整备待命，行政院院长吴敦义亦表示同情与关切。 当时的外交部部长杨进添奉总统令指示驻日代表冯寄台以政府名义捐赠1亿880万元新台币协助日本赈灾，并告知正在台北访问的前首相海部俊树。此外，外交部赈灾专户与中央银行国库局等16个政府单位总计已经募得各界协助日本重建捐款约新台币7.5亿元，并直接拨交日方。
派遣救难团队.由台湾搜救总队等民间救难单位组成的35人救难团队于3月13日抵达千叶县成田市成田国际机场