行线车站编号为「JB 22」。
车站结构.JR东日本和东京地下铁两个站房并不相连，出入口的位置也不相同。。半藏门线位于南北方向道路（四目通）地下，而JR总武线是东西向。
JR东日本.JR东日本站区属高架车站。月台採岛式月台2面4线设计，缓行线和快速线各自使用一座岛式月台。本站北侧是快速线专用的留置线，部分快速线和特急列车会停泊于那里。原本快速线月台是3线设计（中间是通过线），但最终没有实现。而原用作下行线的北侧路轨则被纳入留置线范围。由于本站是缓行线