重整旗鼓，再战奥朗则布，其手下却背叛了他将他交给奥朗则布。奥朗则布以异教徒的罪名将他的兄弟砍头，把首级送给了沙贾汉。奥朗则布甚至杀死了最小的弟弟穆拉德·巴克什，尽管他在奥朗则布和达拉·希科的战争中间支持奥朗则布。奥朗则布获取权力之后，沙贾汉被软禁在阿格拉堡的一间能够看到泰姬陵的房间里。在被拘禁的5年里，沙贾汉只有大女儿的陪伴。相传沙贾汉曾经口渴想喝水，奥朗则布让他饮用墨水。
结局.沙贾汉于1666年去世于阿格拉堡，死后和他的妻子慕塔芝·玛哈合葬于泰姬玛哈陵。