袁术任用陈瑀接替已故的陈温为扬州刺史，之后袁术在封丘之战被曹操打败南逃寿春，然而陈瑀不接纳袁术，袁术退守阴陵并向陈瑀示好，陈瑀不知权变又胆怯，没有立即攻打袁术，袁术遂于淮北聚集军队要取寿春，陈瑀感到畏惧，派弟弟陈琮向袁术请和反被扣留，使陈瑀逃到下邳。建安二年（197年），陈瑀受任为吴郡太守、安东将军，屯守海西，与严白虎结合。孙策讨伐严白虎，到达钱塘，奉命与陈瑀合作讨伐袁术，陈瑀却袭击孙策，派遣都尉万演等人密渡长江，使他持印传三十馀纽与丹杨县、宣城县、泾县、陵阳县、始安县、黟县、歙县诸县，大帅祖郎、焦已和