母亲及妹妹逃离佛罗伦斯至蒙特里久尼投靠伯父马力欧·奥狄托雷（Mario Auditore），为报家族之仇及保护家人而决定跟随伯父学习战斗技能并继承父亲遗志－为佛罗伦斯统治者洛伦佐·德·美第奇（Lorenzo de Medici）效命及刺杀策划是次阴谋之帕齐家族成员。在年轻发明家李奥纳多·达·文西（Leonardo da Vinci）及其他市民协助下，埃奇欧在往后20年间把相关成员逐一刺杀，并了解众人之首为圣殿骑士团团长罗德里哥·波吉亚（Rodrigo Borgia），目的为推翻美第奇家族以佔领佛罗伦斯，