港深马拉松）.由香港上水起步，经过落马洲皇岗，并以深圳为终点。
1998年（渣打新机场马拉松）.由青马大桥起步，并以香港国际机场跑道作终点。
1999年.于中环作起点，途经西区海底隧道与长青隧道，并以九龙深水埗运动场为终点。
2000年.由尖沙咀香港文化中心出发，途经尖沙咀海滨花园、多个位于九龙的公共屋邨及横跨汀九桥，以深水埗运动场为终点。
2001年至2007年.赛事在九龙尖沙咀弥敦道近美丽华酒店起步