竹都会区大众捷运系统的优先推动方案，随后交通部高速铁路工程局随即依此展开相关规划，于同年6月完成《新竹都会区大众捷运系统先期计画－台铁内湾支线改善规划报告》，并于7月8日提报交通部审查，交通部便于8月25日召开会议同意该案，转交行政院核定，9月27日，行政院正式核定该案，并同意列入新十大建设办理。2004年11月15日，行政院环境保护署有条件通过「台铁新竹内湾支线改善计画」的环境影响评估。环境保护署通过环境影响评估后，交通部铁路改建工程局便于2004年11月12日依此进行后续推动作业，改善或新建的路段长