南神社占地约六千坪，包含了本殿、拜殿、手水舍、社务所、中门、仓库等设施，材料皆使用阿里山或八仙山产的桧木，并设有两座鸟居，神社入口鸟居为钢筋混凝土造，拜殿前鸟居为木造，社务所和神职宿舍则是由御遗迹所既有建物移筑而来。1923年，法人团体台南公馆（台南公会堂前身）解散，其剩余的基金便用来制作一座神马并捐献予台南神社；此神马是由大坂今村铜器铸造所制作。1924年3月，台南消防组捐献了另一座神马。
列格为官币中社 (1925).在台南神社建设时，日本内务省神社调查会基于「一神一官币社