以第一顺位第一名被兴农牛队选走，为该年度选秀的状元。由于兵役问题，林益全于2008年球季并不能成为兴农牛队一军选手，而必须要成为一年代训选手，于2009年球季才能正式成为一军选手。林益全曾在2005年亚洲棒球锦标赛、2005年世界盃棒球赛、2006年洲际盃棒球赛、2007年世界盃棒球赛与2008年夏季奥运棒球最终资格排名赛等多次国际比赛中入选台湾代表队。其中于2005年亚洲棒球锦标赛时，获得全垒打王的头衔。由于当年职棒问题不断，林益全退伍时本无加盟职棒意愿，并留下「在这里（职棒），我看不到未来」的话