有柑橘、枇杷、油桐、油茶、棕榈、茶、乌桕、杉木、马尾松和柏木等。暖温带或高山特征的常绿阔叶木本植物在南坡多出现在海拔1000～1500米。1500米以上多为针叶阔叶混交林。黄棕壤仅见于1500米以下的缓坡面，发育在冲积层上。秦岭是中国动物地理区划中古北界和东洋界的分界线，也是中国重要的生态过渡带，是中国生物多样性分布的中心地区之一，被《中国生物多样性保护战略与行动计划》(2011–2030)列为生物多样性保护优先区域之一。
交通.秦岭向来是关中和巴蜀之间交通的一个巨大阻碍。李白