杀虫制剂常被用作液体喷射在作物上，药物必须被害虫食用才能发挥效用。溶液化的毒素在幼虫易受影响的中肠细胞膜上形成孔洞，导致害虫患败血病死亡。最新的研究表明，苏云金芽孢杆菌必须在幼虫的中肠细菌存在下才能进行杀虫活动。苏云金芽孢杆菌的以色列亚种广泛用于杀灭孑孓（蚊子幼虫），该方法是蚊虫防治中的重要的环境友好方案。
遗传工程.
用途.2000年，苏云金芽孢杆菌基因改造作物种植面积超过115,000 km²，占世界转基因作物耕种面积的19%，苏菌改造作物有可能取代3