派不和。1993年转任驻英国代表。1997年中叶，萧万长组阁时，据称简又新已被总统府告知将出任外交部长。当时萧万长认为，简又新与新党立委（多数是从新国民党连线出走）的恩怨不利未来建立行政院与立法院的和谐，故对简又新出任外交部长表示保留。而时任副总统的连战亦就此事向李登辉说明，结果简又新从外交部长内定名单宣佈撤换，连战与萧万长商讨的结果改由驻美国代表胡志强出任。2000年民进党执政后，被任命为总统府副秘书长。2002年游钖堃内阁成立时，简出任外交部长。任内宣布中华民国「再度承认」外蒙古独立和其主权