一部分，已不燃烧金纸。另在庙庭左侧停车场上新建金炉。2002年于庙庭前端兴建牌楼一座。学甲慈济宫的三川殿屋嵴为三嵴形式，屋顶为硬山式单檐造型，房屋的栋架採曲三柱式，架内结构为三通三抱斗的形式，殿前的石鼓与石枕为咸丰年间修建时所造。正殿屋嵴为一条龙并有燕尾，屋顶同为硬山单檐的形式，在结构上，前步口为二通二狮座，栋架内则为典型的三通五瓜。后拜亭为四垂式屋顶。至于后殿屋顶形式则与正殿相同，栋架内亦为三通五瓜。左右两边有护龙，前部两侧于1977年增建为钟鼓楼，为六角楼，目前左厢除办公室外，设有拜斗厅、太岁厅