主色调与肤色相近而被错误屏蔽。绿坝只对Internet Explorer较有效，并不兼容Firefox、Google Chrome等浏览器，无法确认网址黑名单。此外，绿坝还视同性恋为不良信息；“良心”、“女士”、“中南海”、“良知”等词被视为过泸关键词；数学题里有“玩摸球游戏”（其中“玩摸”为色情关键词）的字样，网站刊载了人体艺术图，同样会遭绿坝屏蔽；校园版绿坝严重影响网络速度，号称阻止学生接触不良网站为名，却又容许学生关闭；《工商时报》评论说，这样“更让人怀疑这套软件的真正用途”。开放网络促进会（Op