目前下设有北京市病毒传染病防治研究中心、北京市艾滋病临床研究中心和首都医科大学传染病研究所等机构。
历史.地坛医院将1938年日本设立的日本同仁会医院第二分院视为前身。1938年，日本驻华使馆从世界红十字会中华总会手中买下北平安定门内大佛寺西街十一号荣寿固伦公主府的地产，设立日本同仁会医院第二分院，设有30张床位。日本战败后，国民政府在1945年10月15日接收了医院，将其改名为北平市立第三医院分院。11月1日，医院改名为北平市立肺病疗养院。1946年3月1日，根据政府命令，医