法网连续三年进入决赛后，以1-6, 3-6, 0-6直落三盘负于纳达尔，在温网进入决赛后，寻求前所未有的六连冠，等着他的对手正是第三度闯入决赛的纳达尔，双方再度鏖战五盘，以4-6, 4-6, 7-6, 7-6, 7-9负于纳达尔而宣告卫冕失败，在美网进入决赛后，以6-2, 4-6, 7-5, 6-1直落三盘击败英国年轻选手穆雷而卫冕成功，拿下第五座冠军与第十三座大满贯。另外，费德勒拿下3座ATP单打冠军，全是250赛冠军（埃斯托利尔、哈雷、巴塞尔），网球大师盃进入四强后，以6-4, 6-7, 5-7负于莫瑞