可以与游离的40S亚基结合，影响40S亚基与60S亚基及其他eIF的结合或解离等等。eIF3是一个结构中心，可以与不同的真核起始因子以及RNA结合来调控整个翻译起始进程。eIF3是一个多亚基复合物，也是最复杂的起始因子。哺乳动物中存在13种不同的亚基（a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l和m），而部分酵母中只有6个（a、b、c、g、i、j）。
功能.eIF3参与了真核翻译起始进程中大多数的反应。eIF3可以与游离的40S核糖体亚基结合，阻止40S亚基与60S核糖体