大代表，在北京市第七届人代会上批评北京市委。1979年，郭罗基在《红旗》杂志第3期上发表《思想要解放，理论要彻底》。6月24日，在《光明日报》上发表《谁之罪？》，探讨张志新案件。10月，在《人民日报》上发表的《政治问题是可以讨论的》。1982年，被调到南京大学。1989年六四事件后，被拒绝党员重新登记，教授资格被取消，也不能上课、出国。1991年，郭罗基通过法院提出起诉。1992年5月，当选“中国人权”组织理事。11月，应哥伦比亚大学之邀，郭罗基前往美国，在哥伦比亚大学东亚研究所作研究。1995年，转至哈佛