号的升级、小队成员对薛帕德的忠诚与否，以及他们在最终决战关卡中所分配到的特殊战斗职责。在中央房间，薛帕德发现收集者一直在建造一个由被绑架的殖民地人类的遗传物质制成的新的人类收割者。薛帕德摧毁了为它供电的机器并准备摧毁收集器基地。而幻影人建议用定时的放射线脉冲对基地进行消毒，以便未来用它对抗收割者。做出决定后，薛帕德摧毁了被唤醒的人类收割者，并与幸存的小队成员逃脱。如果最后没有一个小队成员幸存，那么薛帕德就无法逃脱并会死亡。回到诺曼底SR-2号，在最后一次与幻影人交谈后，薛帕德与货舱中的幸存者见面。Jok