代的古希腊艺术和文化史藏品，二楼目前是临时的埃及博物馆（于2009年移至新博物馆）。柏林新博物馆建于1843年至1859年，在二战的轰炸中受损严重成为一片废墟，目前正在按照规划重建，2009年重新开放后作为埃及博物馆和莎草纸展览，展品包括着名的古埃及法老阿蒙霍特普四世的妻子奈费尔提蒂的半身像，以及阿蒙霍特普四世时期的其他艺术品。此外新博物馆也展出史前史、古代史和石器时代等的出土文物。帕加马博物馆于1930年建成，是博物馆岛上最年轻的建筑，展出的是古希腊和古罗马的雕塑，6000年悠久的中东历史、艺术和