文摘和索引.该期刊的文摘和索引收录在EBSCO资讯服务（EBSCO Information Services）、PubMed、斯高帕斯数据库，以及科学网络（Web of Science）等资料库。根据2013年汤森路透期刊引证报告的报导和ISI（Web of Science）的统计，《蛋白质组研究期刊》有5.001的影响因子，位居“生物化学研究方法（Biochemical Research Methods）”类别的75种期刊中之第10位。