1946年2月18日，在罗马圣伯多禄大教堂，田耕莘由教宗庇护十二世祝圣为远东首任枢机。同年4月11日，田耕莘的建议被教廷批准，在中国成立正式的圣统制，田耕莘任北平总主教。由于田耕莘违抗教宗命令擅自逃离中国大陆，1948年5月，避难在北平的天主教献县教区赵振声主教接替田耕莘任北京总教区代理总主教。1958年10月，田耕莘赴梵蒂冈，成为第一位参与教宗选举秘密会议的华人。1960年任台北教区署理总主教。1963年，教宗若望廿三世逝世后，田耕莘枢机再度参与选举教宗。1966年3月1日，田耕莘退休，定居嘉义市