滴眼液的常见副作用包括刺激，视野模煳和畏光。角膜雾化和角膜上皮细胞受损也可能发生。
配方和剂量.碘苷可配制成0.5%眼用药膏或0.1％滴眼液。碘苷药膏的一般用量为日间每4小时一次和在临睡前一次。而碘苷滴眼液的一般用量为日间每小时滴结膜囊一次，夜间每2小时一次，直到病情有明显改善；然后日间每2小时滴一次，夜间每4小时一次。以荧光素染色法确认痊愈后，治疗须再持续3到4天。