县白思明于海岸外自宝山至浏河增筑护塘、备塘各一座。正德年间，由于棉花种植面积的扩大，境内纺织业迅速发展，大场镇等地形成土布交易市场。嘉靖十六年（1537年），兴建吴淞江守御千户所新城，十七年后改建为砖城，建县以后成为宝山县城。嘉靖三十一年（1552年），倭寇犯境，先于江东的宝山登陆劫掠，随后前往吴淞所、黄姚等地。次年，倭寇首领汪直率寇再犯，劫掠宝山、吴淞、黄姚、月浦、罗店等地，直至嘉靖三十六年（1557年）倭患逐渐弥平。同年设置协守吴淞中千户所，万历五年（1577年）更名为宝山守御千户所。万历十年（15