鼎盛时期，曾有两万多名僧人。觉囊寺原为觉囊派寺院，1649年五世达赖时期改宗格鲁派。该寺历史上的重要人物有觉朗贡庆、土旺西绕坚参。文化大革命中，觉囊寺受到惨重破坏，寺内文物全部散失。1981年，政府拨出专款修复该寺。有说法称，修复之后的觉囊寺恢复为觉囊派寺院。但实际上，该寺修复后，成为格鲁派的尼寺。21世纪初，寺内主供笃补巴·西饶坚赞师徒三尊塑像，住寺阿尼有18名，该寺已成为该地区及青海、四川等地佛教信徒的重要朝拜之所。每年藏历4月15日，该寺举办“时轮跳神”节宗教活动。
建