南澳县属南亚热带海洋性气候，冬暖夏凉，四季温和，终年无霜冻，光热充足。年平均气温21.5℃，年均日照2325.3小时。年平均降雨量1372.5毫米，年均雾日12.1天。
灾害.南澳-南澎附近海域曾多发生过强烈地震（1600年规模7地震，1918年规模7.3地震，还有多次6级以上地震）
资源.南澳的海洋资源十分丰富，具有可供开发的渔场5万平方公里，有鱼、虾、贝、藻类1300多种。南澳处于台湾海峡喇叭口，风力资源取之不尽。年有效风时7200小时，平均风速8.2