到了京师，上书陈事。汉桓帝特诏召刘瑜问灾咎之征，指事案经谶回答。执政官员想要刘瑜闪烁其辞，改谈其它事情。刘瑜结果全心回答，一共八千余言，贴切当时的情况，汉桓帝最终没有采纳。后拜为议郎。汉桓帝崩，大将军窦武想要诛杀宦官，于是引用刘瑜为侍中，又以侍中尹勋为尚书令，共同谋划。窦武失败，刘瑜、尹勋一同被害。刘瑜被杀后，宦官把他的上书全部焚烧，说是讹言。刘瑜子刘琬，传刘瑜之学，明占候，能着灾异。举方正，没有接受。