事机关，国安会主席由总统兼任，下设国家安全局，以执行情报、特种勤务等国家安全相关工作。行政院为国家最高行政机关，置院长1人，俗称阁揆，由总统直接任命；副院长1人，俗称副阁揆。副院长、部会首长、政务委员7-9人，均由行政院院长提请总统任命，共同组成行政院会议，以院长为主席，议决重大施政方针及向立法院提出法律、预算、戒严、大赦、宣战、媾和、条约等案。行政院必须对立法院负责。行政院之地位，等同于其他议会制国家之内阁，行政院院长即等同于总理，但现在的体制为总统真正掌握全部的行政权。其管辖的中央政府机构，目前共有