监院空间不足，监委要求整理档案，他决定成立专责小组，由前任与现任副祕书长陈吉雄、徐海泉担任召集人，他只负责阅卷与审核，并不清楚档案被销毁的事。2013年7月4日，监委马以工、刘玉山、李复甸召开记者会，宣布弹劾案通过；陈丰义在同时间召开记者会反驳。监察院院长王建煊认为，陈丰义清掉很多无归档价值的资料，造成自己被弹劾，「努力办事的人就会倒楣」。