暖公园、草暖公园-淘金，三个盾构区间共三台盾构机在2006年6月26日同时始发，标志着五号线全面动工。由于五号线穿越多个地质恶劣地带，工程进展不太顺利，曾出现涌水、地陷等险情，也出现过施工意外，甚至影响到了路面交通。工程同时也对1号线，2号线的既有车站杨箕站及广州火车站进行改造，让其适应与5号线换乘的需要。2009年4月19日凌晨，西草区间右线盾构机抵达西村站，标志着五号线区间全部贯通。同年9月20日凌晨，广州地铁五号线热滑获得圆满成功。在10月15日，市民代表受邀试乘五号线。2009年12月28日上午