因为原槐叶萍藻通常是依压型化石的型式来保存的，所以很难决定它的解剖学较像是植物还是藻类。有些生化上的证据较偏向于将原槐叶萍藻解译成是藻类，但在叶状体内发现的孢子群则偏向将其解译成是植物。原槐叶萍藻的表面缺乏气孔并不能决定其为植物，亦或是藻类，因为所有的苔藓植物在其主体上也一样缺乏气孔。直到现在，原槐叶萍藻在生物学上的位置依然未知。