伦·杜卡伊娜·科穆宁娜，嫁给了的雅典公爵，使得雅典公爵也具有了科穆宁家族的血统。安德洛尼卡一世统治期间，科穆宁家族内的背叛了安德洛尼卡，1184年他使得塞浦路斯独立并自称皇帝。伊萨克在塞浦路斯的统治持续到1191年，在第三次十字军东征期间英格兰国王理查一世夺取了塞浦路斯。第四次十字军东征后拉斯卡利斯家族建立了尼西亚帝国。1261年尼西亚帝国收复君士坦丁堡，重建了拜占庭帝国，这时帝国的统治家族是与科穆宁家族有紧密血缘联系的巴列奥略家族。巴列奥略家族一直统治着重建的帝国直到1453年帝国被奥斯曼帝国灭亡