制度沿袭晋制。宋文帝元嘉二十九年（452年）裁撤大司农，宋孝武帝大明四年（460年）复置。大司农主管九谷六畜之供膳羞者，第三品，秩中二千石。大司农寺置丞、五官、功曹、主簿等僚佐。属官有太仓令、导官令、籍田令。梁武帝天监七年（508年）改置十二卿，改大司农为司农卿，位居春卿之末，位视散骑常侍，官班十一，主管农功仓廪。属官有太仓令、导官令、籍田令、上林令、乐游丞、北苑丞、左右中部仓丞、荚库丞、荻库丞、箬库丞、湖西诸屯主、劝农谒者。南朝陈基本沿袭梁制，司农卿为第三品，秩中二千石。下表列出南朝可考的大司农、