以下为上海航空的航点（截至2012年12月）。
国际和地区航点.除了上述航班外，东航浦东至墨尔本MU737/738航班、浦东至奥克兰MU779/MU880以及部分浦东至新加坡和莫斯科的航班是由上海航空所执飞的。