，受到侯景军包围下再败，逃回京口。三年（549年）春，萧纶与东扬州刺史萧大连救援建康，到骠骑洲，进位司空。侯景军攻陷建康台城，杀萧纶子萧坚，萧纶逃回，萧大连担心他要害自己而想害他，萧纶察觉后逃到禹穴。大宝元年（550年），萧纶入郢州，南平王萧恪让郢州刺史之位给他，萧纶不受，于是萧恪尊萧纶假黄钺、都督中外诸军事，萧纶置百官，郢州厅事为正阳殿。湘东王萧绎包围河东王萧誉于长沙，萧纶想派军救援，因为粮食补给不足未果，写信劝说萧绎，萧绎不听。萧纶改修兵器准备讨侯景。萧绎怕六哥强大，派王僧辩率水军1万逼近郢州。萧纶