务部署左丞、左参议兼学部丞参上行走周自齐 担任总办，由学部员外郎范源濂和外务部候补主事唐国安担任会办。同时，由驻美公使馆参赞容揆担任驻美学生监督。最初在北京东城侯位胡同内办公，后迁入史家胡同。9月，将西直门外“清华园”移交游美学务处建设肄业馆。外务部中堂那桐选定清华园作为肄业馆场地，经批准后，开始修理建筑，原计划1910年秋即可使用，不料工人罢工数月。期间建校门（现二校门）、修缮工字厅、建造一院（清华学堂西半部）、二院、三院、同方部、北院，以及校医院，先后于1911年前后竣工，建校时校园面积450亩（27公