次，最终于2016年突破当初预测的日均70万人次的水平。因6号线未能直接连接重点商业区，首期沿线通勤客流大部分均需通过换乘其它市区线路来往工作岗位，使得6号线首期客流以短途乘客为主，同时也推高其它线路的换乘客流。二期通勤客流则以沿线来往中心城区以及来往科学城上班的乘客为主。现时二期开通后，6号线日均客流量接近90万人次，早晚高峰时段列车时常出现挤迫的情况；车站月台，特别是换乘站因车站规模狭小空间不足，更经常出现拥堵（如黄沙、海珠广场、东山口、区庄等）。2019年五一假期期间，6号线单日客流终突破100万