1941年11月，伊辅学成返回香港警队任职，然而同年12月8日，日本发动了太平洋战争，并且挥军香港，香港保卫战一触即发。在战事期间，伊辅以港岛东区指挥官的身份，驻守遭受日方勐烈轰炸的湾仔警署，负责指挥警队抵抗日军入侵。然而，由于驻港守军寡不敌众，港督杨慕琦爵士在同年12月25日向日方无条件投降，为三年零八个月的日治时期揭开序幕。在沦陷期间，伊辅与不少外籍人士一样遭日方拘禁于赤柱拘留营内，到1945年9月日本无条件投降后才得以获释。战时的工作为他换来一面1939年至1945年星章、一面太平洋星章、一面国防奖章