出现戏剧性的转变，聂斯脱里晚年的一部着作《大马色人纥拉克斯的记述》（The Treatise of Heraclides of Damascus）在叙利亚被发现。在该书中聂斯脱里否认以弗所会议的指责，反对马利亚为上帝之母及对马利亚的崇拜，并为自己辩护。聂斯脱里的解释与传统天主教会对他的观点不同，和迦克墩信经的基督论相近，从而有学者开始怀疑「聂斯脱里主义」是否真的是教会传统指控的「不属于三位一体范畴的教义」以及以弗所会议的结论是否客观公正。在这份聂斯脱里为自己辩护的书中，自述其接受耶稣具有神人两性，两性联结(