车到待遇较低的台湾省农林厅工作。因为他的恩师徐庆钟先生是农林厅长。当时台北的一碗牛肉面大约新台币两块钱，农林厅月薪约为新台币500元。农复会月薪为美金200元，折合新台币约8,000元。李登辉好几年后才转职到农复会。李登辉在康乃尔大学留学时，曾获得世界银行的高薪聘约，当时被农复会沈宗瀚得知，沈宗瀚即刻飞到美国与李登辉恳谈，希望李登辉回台湾，继续为台湾农业服务。李登辉认为沈宗瀚对自己有提携之情，就放弃了高薪，学成之后，立刻返台。
警总两度拘捕.据说1950年李登辉曾被警总拘捕拷问