理局管理，但分属不同的系统。国家海洋保护区域通常设立在大西洋、北冰洋、太平洋和内陆的五大湖水域，目的在于维持这些区域的可持续发展和保护这些区域的生态完整。加拿大政府已设立四个国家海洋保护区域，其中两个尚未运作。其它可能成立的区域有努纳武特的乔治亚海峡和纽芬兰岛南部海岸。
国家地标.加拿大于1978年设立了国家地标项目，但是至今只建立了一座，即冰核丘国家地标。国家地标的设立旨在保护“国家内壮观的、超乎寻常的、独一无二的、十分稀有的地方，这些景观通常十分特别并且具有科研价值”。