后建筑系解散，与赵深、陈植在上海共同组建华盖建筑师事务所。抗战爆发后1938年在重庆、贵阳设华盖建筑师事务所分所。1944年，应刘敦桢之邀抵重庆，任中央大学建筑系教授，授课之余继续华盖建筑师事务所建筑师业务；抗战胜利后迁回南京。1949年，中央大学改名南京大学后，专任南京大学建筑系教授。1952年南京大学建筑系等工学院系科独立组建南京工学院（1988年改名东南大学），任南京工学院建筑系教授。1983年3月28日逝世于南京，享年83岁。
家庭.童寯的二弟童荫是电机专家，曾任电机工