次拜相.大中十二年（858年）二月，夏侯孜再加兵部侍郎，充诸道盐铁转运等使。四月，夏侯孜加宰相衔同平章事，守本官，仍领使职，与同僚宰相刘瑑一同执政，兼领度支事，用分司东都洛阳的职方员外郎杨收为判官。又授集贤殿大学士。十三年（859年）八月，唐宣宗崩，唐懿宗即位，仍任夏侯孜为宰相，兼兵部尚书。夏侯孜的官爵曾为银青光禄大夫、守中书侍郎、兼刑部尚书、同中书门下平章事、充集贤殿大学士、上柱国、谯县开国男、食邑三百户，后进封门下侍郎、谯郡侯。懿宗追封母晁氏为元昭皇太后，九月，夏侯孜作其。十月，夏侯孜在工部尚书任上。