队解散，残部编入第十方面舰队。
第一次编成.1938年（昭和13年）2月1日，日本海军为了增援中国方面舰队，决定组建第五舰队，司令长官为海军中将。随着第五舰队的建立，中国方面舰队麾下拥有着三支舰队，分别为华北的第四舰队、华中的第三舰队以及华南的第五舰队。1939年（昭和14年）11月15日，日本海军开始着手修改中国方面舰队。原有的第五舰队更名为第二遣支舰队，司令长官为海军中将。第二遣支舰队在改名前后，着手进行了大亚湾登陆作战以及海南岛攻略作战。与第一、第三遣支舰队日后规模缩小、