对中国的经济、教育、社会问题做了大量调查研究。1980年代，陈一咨积极推动中国改革，为改革开放出谋划策，策划成立中国经济体制改革研究所并担任所长，中国经济体制改革研究所与农村研究发展中心、中信国际所和北京青年经济学会，此「三所一会」是时任中共总书记赵紫阳的四大核心幕僚机构。1989年八九民运爆发后，陈一咨联合各界人士反对武力镇压，并以「三所一会」的名义发表了《关于时局的六点声明》；学运遭武力镇压后，陈一咨被李鹏定为赵紫阳的“黑线”和学生运动之“黑手的枢纽”而成为头号秘密通缉犯。6月4日凌晨3时，在镇