西安府，管理西安府、凤翔府、汉中府、延安府、兴安直隶州。右布政使治巩昌府，管理巩昌府、临洮府、庆阳府、平凉府。1664年设甘肃按察使。1665年，裁撤宁夏巡抚。1666年右布政使和甘肃巡抚改驻兰州，1667年陕西右布政使司改为甘肃布政使司。1754年，陕甘总督从西安改驻肃州。1759年，陕甘总督改为川陕总督，甘肃巡抚改为甘肃总督。次年，恢复陕甘总督和四川总督的建制，1764年，裁撤甘肃巡抚，陕甘总督兼管巡抚事务，驻兰州府。1884年，新疆建省，陕甘总督管辖陕西、甘肃、新疆三省。
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