隶山东西路，并以泰安军为泰宁军节度使支郡。至此，兖州领四县：嵫阳（旧名瑕）、曲阜（旧名仙源）、泗水、龚。大定十九年（1179年），改节镇泰宁军为泰定军，仍治兖州。大定二十九年（1189年），改龚县为宁阳县。至此，兖州领四县：嵫阳、曲阜、泗水、宁阳。大蒙古国成吉思汗十五年（1220年），佔领兖州，降为普通州，隶济州。蒙哥汗二年（1252年），升兖州为节度州，隶东平路。至元二年（1265年），併泗水县入曲阜县，宁阳县入嵫阳县。至元三年（1266年），复置泗水县。至元五年（1268年），复降兖州为普通州，隶济