度依赖真菌，但所有形成兰菌根的真菌均可不依赖植物而独立生长，且可能因养分损失而使其产生的子实体较自由生活的相近物种为少。有研究指出某些兰花长出叶后可行光合作用制造有机养分，并提供部分有机物给真菌，也有研究认为当兰花供给真菌的有机养分过少时真菌可能有转为病原菌的倾象。兰菌根可能是由中有机养分流向的翻转而演化而来，也有假说认为可能是演化自病原真菌对兰科植物祖先的轻度感染。
真菌种类.形成兰菌根的真菌多属担子菌门，包括、、与红菇属等属，但也有属于子囊菌门者。这些真菌多为腐生真菌或寄生真菌