子，后来过继给九条道教为养子。建武二年（1335年）元服，历应元年（1338年）叙从三位，位列北朝的公卿。贞和三年（1347年）任右大臣，后转任左大臣。文和四年（1355年）叙从一位，至延文三年（1358年）接替成为关白。应永二年（1395年）室町幕府第三代将军足利义满出家，九条经教也跟随出家，法名祐圆，到应永七年（1400年）逝世，享年69岁。