于朱熹，朱熹以「穷究根源」勉之。庆元五年（1199）冬天，再次拜见朱熹，再以「下学工夫」勉之。朱熹死后，陈淳寓居南緅讲学。由于世居龙江北溪之滨，学者称为北溪先生。《北溪字义》一书，系陈淳晚年讲学内容，由其弟子王隽整理。嘉定十五年（1222），获任命为安溪主簿，未到任，嘉定十六年（1223）四月卒。另撰有《小学诗礼》。