度量土地，将空闲田地分给贫民耕种，划分村社，增设钱海县和金山县。明命十一年（1830年），阮公着升署工部右参知，权掌刑部印篆。明命十二年（1831年），遭到户部侍郎黄烱弹劾而被革职，降二级，补京县知县。随后改任内务府郎中。翌年（1832年），起复为署海阳布政使，寻陞巡抚，署理海安总督。后因镇压海阳匪张严、郑伯瑶有功而获得褒奖。明命十四年（1833年），农文云在宣光发动叛乱。明命帝派山兴宣总督黎文德为三宣总督军务，派海安署理总督阮公着为参赞，会同宁太总督阮廷普前去镇压。翌年，叛乱平定。班师后，阮公着自