分居，詹姆斯三世选择住在爱丁堡，而玛格丽特则定居于斯特灵城堡。1486年7月14日，玛格丽特于斯特灵城堡病逝，并下葬于。1488年，詹姆斯三世去世后与玛格丽特合葬。修道院除了钟楼外其余建筑依旧保留，不过大部分已成为废墟。1865年，玛格丽特的后裔维多利亚女王出资修复并封闭墓地。