置印刷机，并用作储存书籍及档案，1997年交还予香港政府产业署管理。2000年，政府着手研究对建筑物修复的可能。2003年由香港演艺学院接手复修，耗资8,300万港元改建为电影电视学院校舍，于2007年3月完工。2008年伯大尼修院获颁发联合国教科文组织亚太区文物古蹟保护奖以表扬其复修工程。现时修院已被列为法定古蹟。
彩色玻璃窗.在重修伯大尼修院时，教堂原装有19幅彩画玻璃全部散失，工程总监苏迪基（Philip Soden）走访多个教堂，终于发现共济会「雍仁会馆」的7扇彩画玻璃窗，