小6岁的他在日本国内一度被认为是后者的接班人，小林祐希由东京绿茵少年队出身，并曾入选各年代级别的代表队。2010年，同时被注册为青年队及一队球员，在日乙有4次出场机会。带领青年队夺得东京都足球锦标赛冠军，并以东京都冠军身份，带领东京绿茵青年队参与第9届天皇杯。2010年东京绿茵遭遇经济危机，险些因此解散。当时还在青年队的小林祐希在球衣里面的T恤中写着ALL FOR VERDY，那年的天皇杯东京绿茵青年队闯进正赛，但首轮即被驹泽大学淘汰，赛后小林祐希说若赢了就可以和FC东京上演另类东京都德比。2011