1948年，因冰糖销售不佳，决定停工。1949年，国营企业雍兴实业公司承租原崁子脚制糖所之土地，包括厂房、仓库、办公室等及铁道，成为当时台湾最大的纺织工厂。1972年，雍兴实业转民营併入远东纺织，原制糖工厂设施皆被拆除。原址现为远东新世纪及元智大学正门口一带。
糖厂铁道.五分车铁路从崁仔脚制糖所开始，并在今日兴仁路二段211巷内分歧成两条往龙潭及员树林的路线，前者穿越陆军专科学校，经龙冈、东社、黄泥塘到达今日龙潭台3线中兴路513巷口对面的位置；后者往东跨茄苳溪再往南经