研究显示波多黎各鹦鹉较为接近白眶亚马逊鹦鹉及古巴鹦鹉。
特征.波多黎各鹦鹉长28-30厘米，重250-300克。牠们在亚马逊鹦鹉属算为细小，但在大安地列斯群岛类群中算为正常。牠们并没有两性异形，雄鸟及雌鸟主要都是呈绿色，有蓝色的羽毛边。初级飞羽及主要翼毛都是深蓝色的。羽毛的颜色在不同部位有所不同：翼底为鲜蓝色，尾羽底为黄绿色，上身的较淡色，前额红色，眼圈白色。瞳孔褐色，喙呈灰色，脚呈黄色。除了DNA测试外，雄鸟及雌鸟只有从繁殖季节的行为差异来辨认。雏鸟的羽毛像成鸟。Sectio