日本寺院列表是日本的佛教寺院之列表。本列表之寺院列出标准为近代以前所成立的佛教各宗派之总本山、大本山级之寺院，且在日本的佛教史、文化史、美术史上佔有重要地位、及拥有国宝级等之重要的文化财，并拥有广大信仰、与对日本文化上有重大影响之一系列寺院。本列表以日本都道府县排列。