食蚊鱼与各地原生鱼类进行竞争，破坏生态平衡而被世界自然保护联盟列入世界百大外来入侵种。早期香港为控制蚊患而引入食蚊鱼，但牠们却同时与本地原生物种竞争食物和生境。食蚊鱼与弓背青鳉（） 及林氏细鲫（）竞争食物和生境，甚至捕食其他鱼类的卵和卢文氏树蛙（）的蝌蚪，危及原生物种的生存。现在香港只有少数淡水生境未有发现食蚊鱼。台湾因早年食物缺乏而大量补抓青鳉鱼食用，造成蚊虫繁殖疾病流行，因此总督府约于1913年从美国引入食蚊鱼，现已普遍繁衍于全岛的淡水生境，而食蚊鱼的大量繁衍已造成卵生的青鳉鱼逐渐减少。中国亦于