般的市拥有更高自治权力，但不及中核市。2015年，特例市制度被废除，部分特例市将改为中核市。2017年时，日本全国共有48个中核市，36个施行时特例市。东京都并未设有任何政令指定都市、中核市及特例市。东京都东部、濒临东京湾人口最密集的地域划为23个特别区。特别区虽然和其他市、町、村一样，是具有自治权的地方公共团体，而且各区人口也将近政令指定都市，但自来水、污水、消防等公共服务则不会自行处理，改由东京都政府直接安排执行。日本过去曾经设置名为郡的地方行政机关，阶级为都道府县以下、町村以上。1920年代起