出。。甲苯咪唑很少拿来治疗包囊虫病，因为研究显示其效果不佳。甲苯咪唑和其他苯并咪唑类药物对于线虫的幼虫和成虫阶段都有效，对于蛔虫和鞭虫也可以杀卵。虫体会慢的麻痹而死亡，可能要几天后才不会在粪便中出现。
特定族群.甲苯咪唑的怀孕分级是C，会对怀孕中的动物造成影响，但对于怀孕中妇女的影响没有足够临床研究，目前尚不知道此药是否会借哺乳影响胎儿。
不良反应.有时甲苯咪唑会造成腹泻，腹痛，和肝酶升高，在少数的案例中，甲苯咪唑会造成有危险性的低白血球计数、及脱发，