分子在费尔干纳谷地对麦斯赫特土耳其人实施大规模屠杀。据统计，有97人死亡，1,000多人受伤，752栋房屋被烧毁。而在大屠杀之前，约有100000麦斯赫特土耳其人居住在乌兹别克斯坦。
事后.莫斯科和塔什干当局迅速声称，骚乱是由黑手党、戈尔巴乔夫的政治敌人或乌兹别克民族主义者策划的。在此事件之后，大约70,000名麦斯赫特土耳其人前往阿塞拜疆，其余的流向了俄罗斯各个地区（特别是克拉斯诺达尔边疆区）、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦和乌克兰。许多布哈拉犹太人同时也逃到了以色列。