将领以浪人身份为丰臣军而战（真田信繁、毛利胜永、明石全登等）以挽回自己的名誉。最后，大坂城被德川攻佔，丰臣氏正式灭亡。德川幕府自此建立长达250年的统治。关原之战后对各大名的处理对二百多年后的倒幕运动亦有所影响。土佐领内的大名山内一丰将失格的浪人提升为乡士，这些乡士多数为长宗我部氏的旧臣，论地位仍然与山内原有的家臣上士地位不及，造成部份乡士对幕府没有好感。因此，土佐地区成为了倒幕运动的主要地区之一。萨摩地区的大名知道关原之战的败因是情报能力不足。于是他们加紧了对情报的搜集和保密，因此拥有了胜于幕府的财力。