3月9日，2012奥运足球亚洲区预赛首轮第一回合作客约旦，周子轩因为身分证办理不及而无法参与；第二回合，中华台北U23主场对约旦的比赛，周子轩首次代表中华台北U23出赛，最终以0-2见负，总比数0-3被淘汰。2012年2月29日，中华台北作客香港旺角大球场对香港足球代表队的国际友谊赛中，周子轩替补出赛、首次参与国际赛，是役最终以1-5惨败。2013年10月，在菲律宾举办的和平杯足球邀请赛上，周子轩接受征召，替补踢了两场中华队比赛帮助战胜地主国菲律宾。周子轩也顺利入选2014年菲律宾和平盃中华队后备球员