其举办追悼法会，之后至1584年以前均拒绝羽柴秀吉的召见。三劫、法会与拒见此事近代考证后，认为是本因坊家自行杜撰的，但此局仍被视为日本围棋史上极着名的对局。1585年丰臣秀吉恢复日渊一派名誉，同年日海于秀吉御前首次下「御碁」，日海胜，授予四石俸禄。1588年秀吉举办围棋全国大会，由日海及当代许多高手互相对弈，日海表现优异，赐予朱印，俸禄二十石、十人扶持。同时受命制定棋类相关规则、制度，位列棋士领头，被认为是碁所的发端。
本因坊时期.1598年日渊辞去寂光寺住持，日海接任