国后，于右任历任审计院、监察院院长，是国民政府重要决策人物，前后共任监察院院长34年。1932年秋，筹备建设国立西北农林专科学校（今西北农林科技大学)，并就任首任校长。
晚年经历.1948年4月19日，在当年3月的总统选举过后，曾参选副总统选举，然而根据当时的国民大会秘书处所公布副总统候选人签署代表人数：于右任获得512票的签署支持，仅次于孙科。在4月20日下午的首轮投票中，于右任只获得了493票，却在同时竞选的六人中排名第四，而无法进入第二轮投票。1948年6月，