担任主教练，但仍然是球队的主席和重要决策者。2009年8月1日，带领全部由上海东亚球员组成的上海全运男子足球队获得第十一届全国运动会男子足球A组金牌。
青少年训练.徐根宝长年关注青少年球员的训练，1995年他成立了着名的上海有线02，培养出了杜威、孙吉、孙祥、于涛等球员。2002年离开联赛主帅位置后，他投入设立于崇明岛的根宝足球基地，已为中国各级男子足球队输送了不少球员，包括张琳芃、武磊、王佳玉、曹赟定、顾超、王云龙、唐佳庶、张成林、吕文君、颜骏凌、柏佳骏、姜至鹏、姜嘉俊、