为三相交流发电机运转，通过整流器将发出的电能整流为直流电并连接到制动电阻，最大制动功率为3000千瓦。机车具有电空联合制动的协调功能，当电阻制动无法产生足够制动力时以空气制动补足。空气制动系统方面，EF500型电力机车和EF200型电力机车、DF200型柴油机车一样应用了电控空气制动，以改善货物列车制动的响应性能和协调控制。该系统通过电子信号传送制动指令，并利用电磁阀开关和电空制动阀等装置控制制动缸和制动管压力，并且具有阶段制动、阶段缓解、保压制动、快速充气的功能。基础制动装置为双侧闸瓦制动单元，并采用