林肯为拜登的一员，协助拜登争取民主党总统提名。在奥巴马及拜登当选正副总统后，他是团队的一员。
奥巴马时期.2009年至2013年间，布林肯担任总统奥巴马的副助理和副总统拜登的国家安全顾问。在职期间，他协助政府制定美国对阿富汗、巴基斯坦及伊朗核计划的政策。在奥巴马于2012年总统选举取得连任后，布林肯于第二任政府任期开始时转任国家安全副顾问一职。2014年11月，奥巴马提名布林肯担任副国务卿，接替离职的威廉·约瑟夫·伯恩斯。翌月，参议院以55票对38票的投票结果确认布林肯的提名。