独立分舰队前往塔霍河，以在葡萄牙内战中保护英国的权益。回国后巴加在海军部任职，1841年，他离开海军部，前往东印度&中国舰队（East Indies and China Station）上任。8月10日，巴加抵达香港就任英军舰队司令，同年11月晋升为海军中将，他率英军先后攻占厦门、宁波、吴淞、上海和镇江，于1842年7月21日切断大运河航道。
晚年.1841年巴加获得从男爵爵位，1843年被授予巴斯勋章，1844年获得优秀服役退休金（good-service pension），18