法嗣有一百三十九人，其中又以西堂智藏、百丈怀海、南泉普愿最为闻名，号称洪州门下三大士。在道一禅师之前的禅宗祖师，多崇尚头陀行，没有自己的寺院。但从道一禅师开始，因为受到官府的支持，且门徒众多，禅宗开始建立属于自己的寺院系统，拥有自己的规矩，俗话说“马祖创丛林，百丈立清规”，他所创立的丛林制度对于后世汉传佛教的发展影响广泛。其创立的洪州宗，在宋代开衍出临济宗、沩仰宗二宗。其门下弟子言行多录于《五灯》之内。