5型机车相同的8240ZJC型柴油机，该型柴油机为8气缸、直列式、四冲程、废气涡轮增压的直喷式中速柴油机，采用铸焊组合机体、合金球墨铸铁曲轴，额定转速为每分钟1000转，装车功率为1320千瓦。NJ1型机车采用了柴油机变频起动，柴油机起动时由蓄电池供应直流电，经变频起动装置逆变成三相交流电后，供给交流起动发电机，通过齿轮传动箱、万向轴驱动柴油机。
传动系统.NJ1型机车的主传动系统采用架控式交—直—交流电传动方式。机车牵引时，柴油机通过法兰盘直接驱动一台三相交流同步牵引发电机，发出