在敦煌设置归义军，并任命张议潮为敦煌归义军节度使。后梁末帝朱友贞干化二年（914年）敦煌迎来一位新的统治者曹议金。他主张与近邻修好并大力农牧业，使敦煌恢复了一派繁华的景象，莫高窟的开始了一个以大洞窟开凿为主的时代。北宋景祐三年（1036年）敦煌为西夏占领，统治敦煌达191年。元灭西夏后，于至元十四年（1277年）复设沙州。1280年升为沙州路总管府，隶属甘肃行中书省。明朝永乐三年（1405年）改为沙州卫，后增设罕东左卫。嘉靖七年（1528年）因叶尔羌汗国攻击，关闭嘉峪关，从此瓜州、沙州成为叶尔羌汗国