隆盛联手令米泽藩和庄内藩归顺。战争结束后曾退出军队返回鹿儿岛，但随即在翌年1月重新被委任军职，征讨当时盘据北海道，由榎本武扬率领的旧幕府海军（自称为虾夷共和国）。箱馆战争（又称五稜郭之战）在2月份开始之时被委为公卿清水谷公考中将的参谋，并在3月率军由东京出港。途中，在宫古湾停泊时和旧幕府海军相遇，登陆北海道后担任战斗总指挥，在5月进逼箱馆城（今函馆），并于11日对箱馆发动总攻击，亲自率领少量兵力佔据城后的箱馆山，力劝榎本武扬归降，17日取下函馆城。战后黑田清隆强烈地要求新政府从宽处理榎本武扬等人，结果在