间见到山巖上放光但遍寻不着来源，而后发现一枚上书释迦牟尼佛、观世音菩萨名号的香火袋，地方人士遂建草庵供奉。道光十四年（1834年），大寮檀越张简立捐资，正式建庙。光绪十四年（1888年），富商「黄合春号」为之重修。日治昭和二年（1927年）、民国53年（1964年）两度重修，并开放后山，供应善信旅游观览。民国106年（2017年）4月1日，该庙举办管理会议讨论建醮、遶境及通称事宜，主委黄西井掷筊向神请示是否遶境时，筊杯黏附于桌裙上，随后亦透过11次圣筊确认通称为「清水巖清水寺」。建立通称之缘