有10%–20%的感染者会有发烧与咳嗽，与其他唿吸道病毒感染造成的症状相似，但在免疫缺陷的病人中可能造成较严重的肺炎。另外有研究指此病毒与川崎氏症有关。229E病毒可能与其他唿吸道病毒（包括人类冠状病毒OC43、甲型流感病毒、人类唿吸道合胞病毒与人类偏肺病毒）同时造成感染。