年间以明经担任直隶江宁县主簿，同乡刘若宰举荐为湖广谷城县知县。崇祯十一年（1638年）正月，阮之钿尚未到部，张献忠便抢先一步攻佔谷城，后张献忠接受兵部尚书熊文灿的招抚，驻兵谷城。之钿不久到任，认为这是缓兵之计，请求速剿张献忠。熊文灿一味主抚，不采纳建议。崇祯十二年（1639年）五月，张献忠再次攻佔谷城。之钿服毒自尽，被抢救未死，独坐家中，血书绝命词。张献忠派人来索取官印，阮之钿不肯将其交出，最后被杀。朝廷闻讯后，追赠其尚宝司卿一职。