在日治时期仍有遗迹，后来湮没不见。其中一匹石马于昭和八年（1933年）11月于新丰郡永康庄洲仔尾出土，由台南一中（今南二中）的教头盐冢、教谕前岛及本土学者石旸睢所挖掘出，置于安平史料馆。后来据说被石旸睢移置到赤嵌楼内。后来到了1977年2月16日，学者石万寿与周泰宏在南良实业公司（当时为南良纺织厂）大门进去右侧一带挖到郑其仁墓，并发现了另一匹石马（现存于盐行天后宫后方）。而这两匹石马的前腿都被打断，与传说中马腿被居民打断相符。不过前台南市文献委员杨森富曾表示，这两匹石马的腿之所会断可能是当初林爽文子弟兵的后