为主，重要植物有桫椤、长蕊木兰、箭毒木、千果榄仁、董棕、铁杉、铁力木、四数木、云南石梓等。动物地理区划上，南滚河保护区属于东洋界、中印亚界、华南区的滇南山地亚区，是热带动物科属分布的北界，按生态类型划分属热带森林、灌木、草地——农田生态地理动物群。哺乳动物有10目，30科，79属，102种；两栖动物3目8科19属26种，爬行动物2目12科30属40种；鸟类18目43科264种；鱼类6目10科29属40种；昆虫10目84科610种。其中被列入国家重点保护野生动物名单的共计63种。保护区内栖息有亚洲象、孟加