萨克森公国给他的追随者叙普林根堡伯爵洛泰尔而被拒绝。尽管如此，亨利还是与统治神圣罗马帝国的萨利安王朝保持着密切的关系。1116年，亨利参加皇帝亨利五世的第二次意大利远征，夺取已故的嫂子托斯卡纳藩侯卡诺莎的玛蒂尔达的遗产。亨利九世其后在无子嗣的长兄韦尔夫二世于1120年逝世后继承他的爵位，成为巴伐利亚公爵。亨利九世对推动1122年的沃姆斯协约发挥重要作用，结束教皇与皇帝之间长期的叙任权斗争。皇帝亨利五世去世后，亨利九世于1125年的国王选举中发挥重要的作用：首先，亨利九世支持他的女婿，即霍亨斯陶芬王朝