体化学控制（stereochemical control）。由于所有氨基酸中除甘氨酸外其余都是不对称的，所以通过生物合成途径必须能以高度选择性产生是两种互为对映异构物的氨基酸中正确的一种。在各种氨基酸合成途径中，α-碳原子上的立体化学性质都是由一种有磷酸吡哆醛参与的转氨反应产生的。几乎所有催化转氨反应的转氨酶的基因都遗传自同一祖先。
氨基酸合成调节.氨基酸的生物合成途径在很大程度上是被限制的，仅当供应短缺时才会合成。氨基酸合成中高浓度的代谢最终产物（亦即合成的氨基酸）往往会抑制在该