中，日本沿海的对马、壹岐、松浦、五岛列岛的居民中也作为有敌意的日军而惨遭蒙古人杀害。元末，中国天下大乱，日本海上强盗开始骚扰朝鲜和中国，通称前期倭寇。明朝初期永乐年间，明成祖派遣郑和率船队十余万人抵达日本，传明成祖旨意提出朝贡要求，日本室町幕府将军足利义满回书明成祖，答应向明朝遣使朝贡，并受封“日本国王”，并献上倭寇数十名，两国政治贸易关系加强，前期倭寇时期结束。明朝中后期，皇帝腐败无能，海防废弛。同期日本由于幕府无权而陷入了内乱，内乱当中，流浪武士和明朝沿海的奸商相勾结，侵扰中国和朝鲜沿海，此为后期倭