州市城市快速轨道交通线网规划研究（最终报告）》，是当时5号线的其中一座中途站。后来本站确定与二号线首期工程一同先行建设，建成并正式投入使用则于2003年6月28日，当时是广州地铁二号线已开通段（琶洲站至三元里站区间）的东端终点。2005年12月26日，万胜围站建成并投入运营，原二号线从琶洲站向东延伸至万胜围站作为终点，琶洲站由线路终点站变为中途站。直至2010年9月21日，本站一直都是旧2号线中途站之一。同年9月22日至24日，本站随旧2号线一同停运，进行线路拆解。最终本站于2010年9月25日重新启用，并