明命十九年（1838年），升礼部左侍郎，充办阁务，特赐按从二品领俸禄。明命二十年（1839年），加参知衔。明命二十一年（1840年），权署南义巡抚。阮知方在巡抚任内，在沱㶞增设炮台，筹备海防，获得明命帝嘉奖。不久升工部左参知。绍治元年（1841年），真腊和南圻地区发生叛乱，暹罗发兵支持叛军。阮知方护理安河总督，奉命驻守前江地区，配合黎文德、范文典等部，击退了暹罗军。绍治帝赐阮知方御制诗一首，嘉奖战功。不久，阮知方改署隆祥总督。绍治五年（1845年），阮知方、尹蕴、尊室议三人在嘉定会合武文解部，进