东铁列车在2003年改用自动列车运转装置（TBL 2 ATO，以比利时TBL讯号系统为基础）后，对列车组件增加达1倍的压力。而且部分焊接位焊接不妥，要剷走油渍才发现裂纹。另外，车轮与路轨的接口并非完全吻合而产生震动，令列车悬挂系统可能产生裂纹。九铁主席田北辰于2006年1月14日表示，管理局将每晚开会，确保东铁可以安全行驶后才会开车，并承诺如再有主要组件或其綑绑的尼龙索带松脱，九铁将即时决定东铁全线停驶。最后，九铁于2006年1月15日获政府批准，使东铁改以人手操作，但东铁由罗湖至尖东的行车时间会增加1.5