车站构造.
JR北海道.岛式月台2面4线的地面车站。月台编号是以最靠近车站大楼的月台起计算，依序为3、4、5、6号月台。
五稜郭站前停留场.函馆市交通局函馆市电车于1955年（昭和30年）11月27日延长本线时（铁道工场前－五稜郭站前）所新设此车站。在1978年（昭和53年）11月1日废除部份本线时（瓦斯会社前－五稜郭站前）被废除。车站属于2面1线模式。并于2005年（平成17年）因为国道5号的扩建工程而被拆除。