由法务大臣（法务相）签署执行令后方可执行。而多数法务大臣因为政治主张或其他个人原因，普遍不愿意充当刽子手的角色，拒签执行令，从而导致日本国实际执行死刑的案例非常之少。截至2018年7月，日本全国仍有超过100名死囚尚待处决。在日本，执行死刑的手段类似英国曾经使用过的长距坠落绞刑法，具体执行器具规格则参照明治六年（1873年）公布的《》。死囚行刑前会被单独囚禁于全国七所指定看守所（札幌、仙台、东京、名古屋、大坂、广岛、福冈），而非监狱（根据日本法律，监狱只执行监禁刑罚，不适用于死囚），由刑务官全日24小时