代王长子朱鼎渭举发其父废长立幼，麻僖弹劾代王目无君长、鼎渭心无父母。万历四十年（1612年）上疏陈纳谏诤、举枚卜、补大僚、登遗佚、速考选等事，谏章被太监扣压未报。后又上疏，指斥国防虚弱、军备废弛等弊端。建议垦荒屯田、充实边饷等策略，皆未被采纳。辽东巡抚杨镐请求重新任用李如梅做大将，麻僖建言改用张承荫，承荫还未到任而镇远堡、曹庄等地相继沦陷，杨镐均不据实以报，被麻僖上两道奏疏弹劾，杨镐遂辞职归乡。后来与同僚孙振基等人弹劾熊廷弼杀人媚人，又说汤宾尹录用韩敬为状元，很明显是在暗中说人情、行贿勾通官吏。