901年6月8日在威廉港结束，随后舰只进行了退役处理。1902年5月3日，弗蕾亚号重新投入使用并分配至去年12月成立的火炮试验指挥部。其任务是推进火炮技术的发展，并使用巡洋舰作为试验船。舰只于1902年9月1日加入第一分舰队的巡洋舰支队。该支队由担当旗舰的大巡洋舰、维多利亚·路易丝号，以及小巡洋舰、阿玛宗号和尼俄伯号所共同组成。它们参加了1902年8－9月举行的夏季舰队演习。1905年，弗蕾亚号驶入的旱坞进行现代化改造。在改造期间，其锅炉进行了重装；而原本采用的三炉身设计也在改造过程中被替换为双烟囱样式