览厅进行翻新工程，包括「太空科学展览厅」和「天文展览厅」。1993年开始举办「每月星空巡礼」活动。1998年，小行星6743以香港太空馆首任馆长廖庆齐命名，表扬廖庆齐对太空馆的贡献。
2000年代.2002年，太空馆与麦理浩夫人度假村合作，于村内兴建天文观测站。2005年开展工程。2008年正式完工，命名为香港太空馆西贡遥控天文台。天文台楼高3层，佔地270平方米，耗资730万元兴建。天文台内装有全香港最大的专业级天文望远镜。使用者能用这望远镜观察比肉眼能见极限暗4000倍的天