代遗传学对返祖现象的解释主要有两种，一是决定某个性状的多个基因原本已经分开，通过杂交或其他原因又重组在一起；二是决定这种性状的基因在演化过程中已经被阻遏蛋白所屏蔽，但由于某种原因导致阻遏蛋白脱落，被屏蔽的基因恢复了活性，于是又表现出了祖先的性状。在社会科学里，返祖现象指一种文化趋势——例如，现代人恢复以前的行为和思维方式。
生物学.表型上已经消失的特点在进化上并不是必然从一个有机体的DNA上消失。其基因序列经常保留下来，但是会失活。这一个无用的基因可能世世代代保留在基因组内。而