城下町的形式发展。战国时代，大友宗麟设立了日本第一个西洋式医院；但在1586年因为岛津家久的攻击而被烧毁，而大友氏也在岛津氏的侵略下逐渐没落，万历朝鲜战争之后，又因为大友义统的作战失误而被改封，丰后国在便被分封为许多小藩，其中现在的大分市地区被封给竹中重利，设立府内藩；17世纪中，又改由入主，直到幕府结束。
交通.
铁路.在1900年至1972年期间，曾经有由丰州电气铁道所经营的路面电车－大分交通别大线，并可连结别府市。