中港区土地属于台湾省政府之台中港务局所有，因此拜耳设厂案仍需经台湾省议会通过。拜耳案虽然经过中央与省府同意，但当时部分的台湾省议员与环保人士却对此计画案质疑，例如当时省议员杨秋兴即扬言将拜耳案搁置加以杯葛。拜耳投资计画适逢选举，以民进党籍台中县长候选人廖永来为首组成的「反拜耳设厂行动联盟」率领反对拜耳设厂的民众抗争反对。廖永来的竞选政见认为拜耳案为高污染性工业，主张以公民投票决定是否在台中港区设厂。1997年12月9日，台湾环境保护联盟发表了支持台中拜耳案公民投票声明，全力支持拜耳案公投。环盟认为，拜耳