舍完工，10月20日举行落成典礼。学校位在台北城南门前，后方则是总督官邸与台北新公园，另一边为总督府法院本院。1898年（明治31年）7月28日《台湾公学校令》发布后，于8月16日以告示第53号公布附属学校之改废。第一附属学校及第三附属学校废止改办公学校，第二附属学校改称第一附属学校，第四附属学校改称第二附属学校，而第一附属学校女子分教场则改制为第三附属学校。1902年（明治35年）3月30日，以告示第34号及第35号公布附属学校之改废。第二附属学校废止改办小学校，第三附属学校改称第二附属学校。