随后的明郑时期更在台南上建立首府，使台南发展达到颠峰。清末由于台湾发展重心北移，以及安平港的淤积而优势尽失。日治时期还是台湾第二大城，并于嘉南大圳、乌山头水库完成后，使嘉南平原成为台湾谷仓。目前由于中研院南院、工研院南院与南部科学园区的设立，以及拥有国立成功大学与国立交通大学台南校区，使得台南市成为台湾南部的产学重镇（北部为新竹市），逐渐扭转南、高之间的就业环境，使人口有所增加，为南台湾唯一人口微幅增加之都会区。近年来到访台南市的游客遽增，逐渐成为观光大城，观光方面有荷兰时期遗留的安平古堡、赤崁楼、创建