盟友之一的伯内特也不例外。1862年4月19日，伯内特在邦联国会发表演说，谴责戴维斯对那些同样毕业于西点军校的人士青眼相看。这场演说得到旁听者上听众极其热烈的回应，现场不得不把一些情绪激动的人员请出会场。内战结束后，伯内特希望能与昔日的国会同事安德鲁·约翰逊面谈，但约翰逊拒绝了这一请求，要求他滚回老家。伯内特在路易维尔受到叛国罪起诉，但在缴纳保释金后获释，之后也没有受到起诉。他与法官约翰·格雷斯（）合伙，继续在加的斯从事法律工作。1866年9月26日，正当壮年的亨利·科尼利厄斯·伯内特因霍乱在霍普金斯去