天皇逃出隐岐，在伯耆国船上山起兵讨幕（船上山之战）。高氏再次接受幕府命令，与镇压西国的名越高家一起前往京都。高氏妻子登子和儿子千寿王（足利义诠）被幕府扣作人质，留在镰仓。结果名越高家阵亡，高氏在后醍醐天皇的劝诱下决定倒戈支持天皇。4月29日在自己的领地丹波国篠村八幡宫（今京都府龟冈市）举兵讨幕。同时煽动各地的武士反对幕府。播磨国的赤松圆心、近江国的佐佐木道誉纷纷起兵响应并合力攻入京都。5月7日灭亡幕府设在京都的六波罗探题。同时千寿王逃出镰仓投奔新田义贞，高氏的庶长子竹若丸却在逃出镰仓的途中被北条氏逮捕杀害。