司.共有六家航空公司将昆明长水国际机场作为基地机场使用，分别为中国东方航空云南公司，祥鹏航空，四川航空，昆明航空，瑞丽航空，以及红土航空。在2013年7月至9月之间的数据显示。 长水机场出港航班中东航第一 占40.77%，祥鹏第二 占12.06%，中国南方航空第三 占11.82%，昆航第四 占7.27%，川航第五 占7.11%；而在进港方面东航第一 占41.08%，南航第二 占11.97%，祥鹏第三 占11.90%，昆航第四 占7.35%，川航第五 占7.00%。有消息指中国南方航空已经向中国民航西南地