乱平之后虽有将县城迁回兴隆庄之议，但因故未得实现，此后凤山渐取代埤头成为本地地名。凤山最初仅是一L形市街，县城迁于本地后一度成为台湾府城以南最为繁荣的市街。今凤山区的辖区在当时分属凤山县的大竹里（范围约为今高雄市中心及凤山区西侧）和凤山上里（今小港东侧和北侧及凤山东南侧）。1887年台湾建省，凤山县所属台湾府改称台南府。甲午战争后台湾割让予大日本帝国。1895年6月台湾总督府规划行政区划，台南府凤山县改为台南县凤山支厅，大竹里、凤山上里则沿用；因逢乙未战争，地方自