二及第三届行政长官由800人组成的选委选出，正正是1997年后特区政制发展的安排。查氏方案中关于第三届行政长官任内，进行一次全体选民投票，以决定第四届行政长官是否普选，以及第五届以后的立法会是否全面直选的提议，则未有写入《基本法》。虽然金庸在其报章《明报》发表社评为「协调方案」辩护，但民主派批评案该方极度保守、窒碍民主发展，继而拒绝支持。故此提案的查良镛当年备受恶评，更曾发生有学生到《明报》报社外焚烧报纸抗议的历史性事件。1989年中国大陆爆发民运，获得通过的该案二稿因此被抽起，查良镛亦于六月前夕辞