开招聘校长。他在未有知会校方的情况下应征，并成功获聘。这件事使城大校方非常狼狈，需要在短时间内聘请其他人接任。
民调风波.事缘香港主权移交后，香港大学民意研究计划的民意调查指首任特首董建华的民望不断创新低点。特首办高级特别助理路祥安曾会见郑耀宗和副校长，要求港大停止发布对特首施政不利的消息。就此，郑耀宗向民意研究计划主任钟庭耀施压，威胁会「阴干」（逐渐收紧）他们的经费。钟庭耀其后公开事件，引起干预学术自由的争议。最终郑耀宗及副校长黄绍伦在公众压力下辞去校长及副校长职务，成为第一位在