幕府的将军源赖朝为了安抚安德天皇的怨灵，建立阿弥陀寺御影堂，阿弥陀寺附近的陵墓被称为阿弥陀寺陵。安德天皇后来被奉为久留米水天宫（福冈县久留米市）的祭神，成为水神、安产之神，与其生母建礼门院一起，被各地的水天宫祭祀。明治时代，阿弥陀寺改为赤间神宫（山口县下关市）。
安德天皇的传说.日本民间流传着安德天皇没有在坛之浦之战中投水身亡，而是在平家的余党保护之下隐居了起来。一说由平盛国保护着隐居到了阿波国的祖谷山（位于现在的德岛县三好市），一路逃到祖谷溪谷的深处藏匿；一说由平资盛护送到了萨摩