强海上军事整备，大举兴建卫城、千户所城、巡检司及烽堠等防卫体系。1388年（洪武21年），设立金门千户所城及五个巡检司寨城，其中峰上、陈坑（今名成功）2个巡检司即位在金湖地区。明朝末年，郑芝龙称雄闽台海域，以金门、厦门为基地，树旗招兵。1645年（清顺治2年）郑芝龙降清后，先派其弟郑鸿逵屯金门。不久，金、厦为拥护鲁王朱以海的郑联、郑彩兄弟所据。1650年（顺治7年；南明永历4年），郑成功驱逐郑氏兄弟，金厦成为其抗清基地之一。1663年（康熙2年；永历17年）11月，耿继茂、李率泰督清军及明郑降兵攻取金门