结束后，荃湾宣告退出联赛, 原足主谭永泉带同数名主力球员投效花花足球会。香港足球总会为推动地区足球发展，于2003年与十八区区议会合作成立香港丙组(地区)足球联赛，荃湾遂再次组队参赛。2009–10年香港丙组(地区)足球联赛，在1980年代旧将陈庆荣与刘宝华担任教练带领下，以13战8胜2和3负得26分，获得第4名。在2010年夏天，陈庆荣带同荃湾阵中部分超龄球员，过档另一支新界地区球队葵青。荃湾在2010–11年香港丙组(地区)足球联赛，以20战10胜2和8负得32分成绩，连续两届获得第4名。2