分歧主要分为两派：真谛与菩提流支为代表的旧译派，将阿陀那识解说为第七识；以玄奘为代表的新译派，认为阿陀那识即是第八识阿赖耶识的异名。
阿陀那识与第七识.《摄大乘论》中，将意分为无间灭识和染污意二者，染污意恒与有身见等四烦恼相应；意识以无间灭识为等无间依而生，依止染污意而识杂染；染污意为无明和我执所依止，即使生于无想天中，仍有染污意，不得解脱。阿赖耶识有生杂染诸法功能，故而名为一切种子识，以阿赖耶识为种子依，意和转识得以生起，染污意是意识的俱有依。在《摄大乘论》中，没有将染污意或意，