医学分院（UTMB）任职临床及解剖病理专科医师，1981年底回国，并在台北市马偕纪念医院担任检验科主任。其专长为输血医学、血液病理以及临床病理等，曾发表近130篇有关输送血液的相关论文。
遗传学争论.林妈利最受瞩目的论理就是以台湾人血液成分断定台湾族群的来源，她曾比对全球人种DNA的相关学理研究成果提出，台湾原住民祖先是在1万5000年前冰河时期结束之前，从东南亚岛屿（菲律宾、印尼）等地迁徙至台湾，在台湾岛内经过几千年长期的隔离，形成相似及一致的基因结构。台湾原住民、东南亚岛屿族群