中书省总领元朝政府百官，与枢密院、御史台分掌政、军、监察三权。由于同属中央政府的尚书省时置时废，门下省不复置，故中书省地位较前代尤为重要。中书令通常由皇太子担任。中书省除为决策机构外，还负责直接管辖首都大都附近的腹里地区。在腹里地区以外，在全国各地设置有行中书省，简称行省，初为中书省派出机构，掌管所辖地区内的军政事务，“行中书省”概念其后发展成为省级地方政府。中书省统领六部，主持全国政务，形成明清内阁制的先驱。其组织架构继承南宋体制，宰相的称唿共有中书令、司统率百官与总理政务等，常以皇太子兼任。下分左右