菌根从寄生的真菌获取其需要的有机养分。兰菌根是一种内菌根（endomycorrhiza），真菌的菌丝进入兰花体内后，会在兰花根部的细胞内形成称为菌丝团（pelotons）的卷曲状构造。大部分菌根均是互利共生的关系，真菌提供植物水分与无机盐，植物则行光合作用提供真菌有机养分，在环境中无机盐浓度很高的情况下，无机盐对植物的价值可能小于其付出的有机养分，使其交互作用倾向片利共生或寄生。兰菌根则恰好相反，只有植物单方面地获利，真菌却无利可图，兰花的种子萌发与生长高度依赖真菌，但所有形成兰菌根的真菌均可不依赖植物