要是多糖，可占细胞干重的80%-90%，其次是蛋白质和脂质。其多糖成分含有：β-(1,3)-葡聚糖、甘露醇、几丁质等。某些真菌菌丝在一定的间距可形成横隔，菌丝可以通过许多不同的方式进行分化以提供特定的功能。称为隔膜()。隔膜通常都会有一些足够让核糖体、线粒体和细胞核穿过的孔隙。有些菌丝存在有隔菌丝；有些菌丝存在无隔菌丝，即代表着它们并没有被隔膜分隔。菌丝可以生长出许多分枝，交织成团形成为菌丝体()。一般来说，每个菌丝体都是可以独立维持生命的单位，即使菌丝分离，其一部分也能继续生长。