独伸出一条长长的茎，通常会高出捕虫瓶很多，避免授粉的昆虫掉进瓶中。花朵根据种类不同，直径约3~10公分，不但很吸引目光，而且还有精密的构造，可以避免自花授粉。瓶子草的花具有五个萼片，基部和三个苞片连在一起，萼片下方具有大量的花葯以及一个具有五个顶点的伞状花柱，上方悬挂着五片红色或黄色的长花瓣。整朵花是呈现上下颠倒的样子，因此这个伞状花柱可以盛住从雄蕊掉落的花粉。柱头位于伞状花柱上，接近五个顶点的地方。最主要的授粉者是蜜蜂，蜜蜂要採蜜的时候，由于花朵的构造，牠们必须先经过其中一个柱头，才能进入倒伞状的空腔部分