出入口将通往长隆旅游度假区，所以在2006年5月改称「长隆站」，不过此举引起居民不满，认为站名偏帮企业，以及质疑使用此站是否会产生额外收费。在市民要求下，广州市政府在2006年8月起，再改为现在的站名「汉溪长隆站」。本站站名中「长隆」二字的英译不随长隆集团及其产业的英语译名之「Chimelong」，而是直接使用汉语拼音「Changlong」来表示。