在吴德功、吴本杰大力奔走，并发电报请刘铭传节制吴宏洛之下，才阻止战事爆发，而吴宏洛则被交由沈应奎管理。不久吴宏洛等各军撤回台北，李嘉棠之职由朱公纯接任，事件宣告结束。
影响.事件平定后，李嘉棠因丈量不公、激发民变而被查办革职。而栋军统帅林朝栋因最先起兵解围，获赏黄马褂，成为清代唯一以道员身分获得此荣誉者。至于民变参与者与主要起事的燕雾二十四庄居民，因林朝栋等人提议从宽处理，故仅由为首数人被官府捕杀，免遭到屠灭的命运。至于事件首领施九缎则为游侠义民所掩护，自始至终未被公家逮捕。