成为问责制实行以来第四位请辞的政治任命官员。同年3月董建华辞职下台。2006年3月获聘任为奥运马术有限公司行政总裁，负责2008年奥运马术项目的统筹工作。2010年1月获委任为平等机会委员会主席。2012年6月29日，获候任行政长官梁振英委任为行政会议召集人，并于2012年7月1日正式就任至2017年6月30日。2012年7月11日，身兼行政会议召集人的林焕光决定继续留任平等机会委员会主席至2013年1月底约满为止。但他的决定却遭到身兼民协立法会议员的平等机会委员会委员冯检基的反对，认为林担任两