通车后，将军澳线来往北角及宝琳的列车于繁忙时段内由每小时22班大幅缩减至每小时18班，令坑口站拥挤的情况雪上加霜，更经常出现乘客无法登车的情况。因此，民主党曾两度抗议班次调整的安排，亦有部分将军澳居民对班次调整安排感到相当不满及扰民。此站上盖住宅为蔚蓝湾畔，基座商场为连理街，而车站旁边亦设有隧道的通风口。
接驳交通.坑口站是整个将军澳新市镇唯一可供新界的士驶入的港铁站，周边街道亦获放宽供新界的士上落客。上盖设有坑口站公共运输交汇处，由港铁公司负责兴建，费用则由政府支付。Se