有两万居民遭到了屠杀。这个事件被称为“普拉加大屠杀”。沮丧的瓦乌雷茨基卷定往南撤回他残存的军队并在11月5日华沙被占领。11月16日，瓦乌雷茨基在拉多什茨投降。这标志着起义的结束和波兰政权的摧毁。翌年开始了第三次瓜分波兰，奥地利帝国，俄罗斯帝国和普鲁士王国吞并剩余国土。
后续.在科希丘什科起义失败后，国家灭亡了123年，而且它的一切影响被瓜分方逐渐淡化。但是起义也标志着波兰和中欧的现代政治思潮的开始。科希丘什科的波瓦涅茨宣言和极端左翼雅各宾派象征着波兰左翼运动的开始。很多在起义