个出入口：A（西）。
运营.由于13号线西二旗站在高峰时段需要承载昌平线输送而来的大规模通勤客流，同时又有大量通勤乘客在本站下车，因此早高峰十分拥挤，经常有下车乘客被上车的人群挤回车厢。2013年西二旗站早高峰的视频被上传至YouTube，一天之内获得点击量超过33万次，登上热门视频排行首位。
历史.原西二旗站2002年9月28日随13号线西段投入使用，但在昌平线投入运营前，原西二旗站因设计规模过小，无法满足换乘需求，而于2010年12月25日关闭，旧站北侧