萨利赫实行社会主义，因此，1976年1月7日采用的新国旗直接采用科摩罗全国执行委员会旗帜。旗帜的三分之二处为红色（象征社会主义），三分之一为绿色（象征伊斯兰教），新月和四星图案则位于国旗左上角。当时的国旗样式与新加坡国旗十分相似。1978年，艾哈迈德·阿卜杜拉在法国雇佣军的支持下发动政变夺权，阿里·萨利赫总统被杀，国名为“科摩罗伊斯兰联邦共和国”。这时科摩罗国旗于10月1日首次做出更改，比例改为2:3，取消红色条纹，改为全绿底旗帜，新月和四星图案放在国旗中央，而且新月开口是对国旗右下角，四星为斜线排列。