成为首相之外的政坛第二号人物，也是自民党内最耀眼的政治明星之一，被视为热门的新首相人选。
首度拜相.2006年9月20日，安倍晋三在自由民主党总裁换届之际，以464票的高票当选第21届自民党总裁，击败了以136票居次的外务大臣麻生太郎，以及得到102票的财务大臣谷垣祯一。安倍在选后向党内国会议员说：“身为首位战后出生的内阁总理大臣，我将接下改革与理想的火炬。”随后在9月26日召集的临时国会上被正式指名就职第九十任内阁总理大臣，时年五十二岁，成为第一位二次大战后出生，也是战后以来最年