构，使得溴化乙锭能插入DNA碱基对之间并使相邻碱基对间距离增大，从而引起DNA框架结构的变动，并致使三联密码转录和翻译时发生较多遗传信息的改变，最终诱发移码突变。故溴化乙锭是一种强的诱变剂，可致癌或致畸。大学生物实验经常会使用此染料，操作时必须要佩戴手套并且尽可能的避免任何接触。含有溴化乙锭的废液应当经过处理才能排放，否则会对生物体造成不可逆的伤害。溴化乙锭有更安全，但也更昂贵的替代品（如）。