西亚带来的阿拉伯人或其他同被称为色目人的群体也逐渐汉化。这些西域来的外族人于明朝以后融入汉族，当中一部分成为回族的先民。
明朝时期.明朝初年，由于元朝末期出现大规模的农民起义和灾荒，导致汉人数量一度减少。经过二百年的发展后，到明神宗万历二十八年（1600年），汉人的人口又增长到约1.5亿。之后由于明末饥荒、农民起义、清军入关、三藩之乱，导致汉人人口剧减。
清朝时期.明末清初，由于流寇扰乱、清兵入塞、入关战争中的屠城事年如扬州十日、嘉定三屠等与三藩之乱的关系