月满洲国灭亡而关闭。毕业生共1500名。辻政信根据石原莞尔提出的「亚细亚大学」构想订下草案，关东军确保了选址的保安和设立，并与关东军以作为独立满洲国大学的自由校风作为目标。开校典礼由满洲国皇帝溥仪出席，而当时日本昭和天皇亦有可能代表东京帝国大学（今东京大学）出席。满洲国灭国后，建国大学被中华民国国民政府重组为国立长春大学，1948年内战学校解体。其文、理、法三个学院后来并入中国共产党领导的东北大学（今东北师范大学）；医学院分离出来，后并入解放军军医大学（今吉林大学白求恩医学部）；农学院并入沈阳农学院