二世之子康拉德四世权力的哈布斯堡鲁道夫伯爵的质疑。史特拉斯堡逐渐发展，成为该地区人口最稠密且重要的商业城镇。1262年，在经历与主教的长期斗争之后，史特拉斯堡获得了帝国自由城市的地位。斯特拉斯堡身为巴黎-维也纳-东洋贸易路线的中继站，以及连结南德、瑞士、荷兰、英格兰、斯堪地纳维亚的莱茵河航线中的一个港口，逐渐成为该地区的政治与经济中心。科尔马和阿格诺等城市的经济重要性也逐渐上升，并组成「十城联盟」（Décapole）。亚尔萨斯的繁荣在14世纪一连串严冬、欠收和黑死病的侵袭下结束。这些天灾被归咎于是犹太人