。1947年，色拉寺下属热振寺的五世热振活佛被噶厦政府逮捕，吉扎仓的僧人为此组织了武装试图营救。他们与政府军在拉萨的北郊发生战斗，因寡不敌众，而被迫返寺。此事件后来被称为“热振事变”。
僧众生活.色拉寺喇嘛的一项为人熟知的功课是辩经。实际上这并非色拉寺独有，只是色拉寺的辩经功课每周一至周五下午固定进行，且向游人开放，故最为着名。比平时的辩经正式得多的是定期举行的辩经法会，由高僧们展开关于佛法的讨论乃至辩论。而每日的辩经，则是众喇嘛参悟奥义、提高修为的一种辅助方法。现在的喇嘛也并