门县因为仍属战地，进入临时戒严。民国81年（1992年）11月7日，随着两岸关系趋向和缓，加上各界力促金马解严，国防部宣佈金门县解除戒严，正式结束长达四十三年之久的戒严与实施三十六年的战地政务实验。民国84年（1995年）10月18日，成立「金门国家公园」，是中华民国第六座国家公园，是首座位于金马的国家公园，也是首座以维护历史文化资产、战役纪念为主，并兼具自然资源的国家公园。民国85年（1996年）1月15日，福建省政府迁回金门县办公，但省政府维持原精简化之编制。民国90年（2001年）2月