于此，《和名抄》则记录神崎郡内有垣见、小幡、神崎、高屋、神主、站家、小社七个村。在11世纪后，八日市地区逐渐发展为商业聚落，并长期由六角氏所掌控。17世纪江户时代后郡内大多数地区成为幕府直属领，此外也有部分地区为、及旗本的领地，其中也有幕府委託彦根藩管理的，而此地的幕府直属领及旗本领则是由位于滋贺郡大津的负责管理。19世纪末明治维新后，原先的幕府直属领及旗本领先后改隶属大津裁判所及大津县，其他原本属于各藩的区域则在1871年实施废藩置县后，改隶属郡山县和山上县；不过在仅四个月之后的府县整併中，郡