同砲击关岛。约翰斯顿号在7月29日发射了超过4,000枚砲弹，她精准的砲火摧毁了数个日军的4吋（100mm）火砲阵地、许多碉堡和建筑物。约翰斯顿号随后在贝里琉战役中参与了保护护航航母的任务。
收复菲律宾.麦克阿瑟将军期待已久的菲律宾反攻终于到来。在阿德默勒尔蒂群岛的补给后，她参与了10月12日保护在雷伊泰湾执行空优任务的护航航母的任务，袭击了当地日军机场，为登陆部队提供直接火力支援，甚至在10月20日砲击摧毁了一个日军补给车队。约翰斯顿号隶属于准将（旗舰护航航母）的护航航母特混舰队