八年（1291年），析华亭县东部为上海县，吴淞江南岸为上海县。大德八年（1304年），任仁发疏浚境内吴淞江。明永乐三年（1405年），夏元吉主持区境南段范家浜的河道治理，并引导黄浦由此入海。嘉靖二十三年（1544年），倭寇入侵江湾等地，导致全镇被焚。隆庆三年（1569年），海瑞主持吴淞江疏浚，吴淞江下游沿今河道进入黄浦江。此后全区均位于吴淞江北岸。清康熙年间，乡民兴建吴淞江头坝义渡。雍正三年（1725），宝山县设立，原吴淞江故道北侧则改属宝山县。干隆年间，上海浦（今虹口港）北段入黄浦江处称为“洪口”