主权移交后，行政会议只会向行政长官一人负责；行政长官如果不同意行政会议大多数人的决议时，只须将理由记录在案。前行政长官董建华只当行政会议为智囊团，行政会议失去原有作用；2002年董建华推行问责制后，所有问责司局长自动成为行政会议成员，作用减少。曾荫权上任后，恢复行政会议功能，增加官守和非官守成员，部分建制派立法会议员加入行政会议（一般为建制派政党代表），使身兼行政会议成员的立法会议员成为政府在立法会的代表，被批评是向立法会箝票，确保法案获得足够票数支持。
现任成员.根据《基