991年12月，儿童福利联盟转型为「财团法人中华民国儿童福利联盟文教基金会」。1998年，儿福联盟与内政部儿童局共同设置「全国失踪儿童少年资料管理中心」。
置产事件.2019年11月初，以新台币3.7亿元向元大金控购买在台北市内湖区瑞光路583巷21号的内湖科技园区精华地段整层的办公室（邻近捷运西湖站的多伦多科技中心，7楼整层，登记坪数757.94坪，含14个地下平面停车位）作为服务中心。事件曝光后引发争议，12月4日召开记者会，发布了四点声明，强调该空间将作为「儿童人权与儿少福利