，曾经繁华一时。日治时代分别在岛上南北两端兴建军营及灯塔，并派兵驻守，控制邻近海域。当地居民放牧羊群，从北方的山头俯眺，红瓦白墙的古厝衬托着青草及黑白相间的羊群，景色颇为怡人。东吉屿西北侧相距500公尺处为锄头屿，是一座无人岛。西方约4.5公里处有西吉屿，本岛涨潮时面积为1.5423平方公里，退潮时面积为1.9045平方公里。东吉屿虽属澎湖县，但距本岛之台南市仅约40公里、与县治马公市距离相差不远，昔日即已往来密切。2002年东吉屿居民曾一度争取改归台南市管辖，但当时遭澎湖县府反对，全案无下文。