赛29场，仅有5胜8败、防御率6.50的不及格成绩，后来受伤动了Tommy John手术，休息1年后一直养伤复健到2006年10月2日对现代独角兽比赛才再度在一军登板。在06年季末代表韩职三星狮队参加了第二届亚洲职棒大赛，当时对La new熊于6局下被林智胜击出全垒打，成为败战投手。虽然前两年几乎完全没有表现，三星狮还是对伤癒复出的林昌勇相当有信心。2007年又与林昌勇续约1年、年薪维持在5亿韩币(约合新台币1769万元)，2007年底，林昌勇和日本职棒东京养乐多燕子队签下了一纸两年8900万日圆的合约。