社，亦有包括在内的丰富的古代遗迹。在江户时代大部分区域为幕府的领地，另有小部分区域属于或的领地。19世纪末明治维新后，这些区域曾先后隶属奈良县、栉罗县、高取县、堺县、大坂府，最后在1887年重新设立奈良县后，才再次隶属奈良县。1889年日本实施町村制，现在的御所市辖区在当时分属、、、、、、、、、、、、、、共15个行政区划。1915年位于北部的栉罗村、东松本村、竹田村、鎌田村、小林村、楢原村、三室村、西松本村合併为，在1950年代位于东北部的掖上村、秋津村陆续被併入御所町，西南部区域则整併为。