色有骝毛色（枣红色）、灰色、栗色、黑色及菊花青色。骝毛色、灰色及栗子色最为普遍，黑色则很少有，而菊花青色更可能并不存在。所有阿拉伯马不论甚么毛色，皮肤都是黑色的，可以保护身体免受沙漠阳光的灼伤。虽然有些阿拉伯马的毛色看似白色，但这种毛色是源自于其灰色基因，所以实际上是灰色来的。但亦有极少的阿拉伯马是白色的，有粉红色的皮肤及深色的眼睛，这可能源于DNA的无义突变（）。就一种在肩膀上有红色斑点的阿拉伯马，在贝都因人中流传着多个不同的传说。其中一个是指先知穆罕默德在一次战争中受了伤，所骑乘的灰色马救他回到