1940年4月，戴戟辞去了皖南行署主任职务。此后在屯溪居住。第三战区司令长官顾祝同企图派戴戟劝说叶挺脱离新四军，担任第三战区副司令长官。但戴戟拒绝为顾祝同当说客。1945年，国军联勤总部决定成立东南补给区司令部，负责调拨、分配、审核第三、第七、第九战区的军需给养及运输。上述三个战区的司令长官顾祝同、余汉谋、薛岳特派专人赴屯溪，邀请戴戟出任东南补给区司令。1945年日本投降后，戴戟辞去东南补给区司令职务，提前申请退役。1946年，戴戟拒绝当中央训练团团员。1948年，戴戟在上海参加了陈铭枢等人领导