文件版本（如Windows 2000中的 v5.0）和NTFS磁盘格式版本（如Windows XP开始的v3.1）相混淆。后续的Windows的版本更新增加了许多文件系统相关的功能，但并没有改变NTFS本身。例如Windows Vista增加了NTFS符号链接、事务NTFS、磁盘收缩和自我修复，但除了符号链接外其他功能其实都由操作系统实现。
功能.相对于之前的版本，NTFS v3.0包含若干新功能：磁盘使用限额、稀疏文件支持、重解析点、分布链接跟踪，以及文件级加密（即“加密文件