2波箱。由第三批巴士开始，上层车头的报站机外壳由灰色改为白色，而所有连接天花和座椅的扶手俱装设下车钟（首批120部车辆上层只于右边扶手设下车钟）。而第四批巴士车厢则改用透光度较高的光管罩。由于2003年九广西铁（今西铁线）和2004年马鞍山铁路（今马鞍山线）启用，运输署要求九龙巴士减少车队数量；因此这两批Enviro 500抵港后需要延迟登记，并停放在各车厂。其中112辆巴士在2003年11月到2005年6月全数出牌及投入服务，而余下的3辆巴士已于2005年8月出牌前转让予同母公司的龙运巴士成为801-