变为伊斯兰苏丹国，统治者称谓也从国王（"Kolano"）变为苏丹。巴布拉苏丹（Baabullah）（1570–1583在位）时期是特尔纳特苏丹国的统治顶峰，其影响力远达苏拉威西岛东部、安汶岛、斯兰岛、帝汶岛、棉兰老岛南部还有巴布亚部分地区。邻近的蒂多雷苏丹国经常与之激烈竞争以控制周围岛屿，历史学家说，特尔纳特与蒂多雷的“二元”对抗是马鲁古群岛早期历史的主题。
16世纪至今.第一批在特尔纳特停留的欧洲人是葡萄牙从马六甲起航远征的弗朗西斯科·塞拉（Francisco Serrão）