卡片成本，封闭的卡片标准和漫长的供货周期（最长为四个月），在2006年至2007年间便经常出现供应短缺的情况，直至2007年12月，深圳通有限公司决定改用由中国内地握奇数据系统有限公司生产，使用德国英飞凌提供的TimeCOS®FLY芯片，符合ISO/IEC 14443标准的Type A卡之后（2008年1月15日起推出），「深圳通」卡供不应求的情况才有所改善。不过深圳通和八达通的联名卡 - 「互通行」则仍然使用Sony公司FeliCa的RFID晶片卡，以配合该卡「一卡一芯双钱包」运作方式，其中深蓝色款的