健康问题.加拿大马鹿身上已发现了至少53种单细胞生物与寄生动物。除了少数例外，这些寄生生物在野生与圈养马鹿间很少引起重大死亡率。脑虫（"Parelaphostrongylus tenuis"，或称脑膜寄生虫）是一种寄生性的线虫动物，以侵袭加拿大马鹿等动物的嵴椎神经与脑组织着名，严重者能导致死亡。最终宿主是白尾鹿，脑虫在白尾鹿中通常不会产生负面作用。加拿大马鹿在放牧时，可能会不慎食入中间宿主－－蜗牛与蛞蝓。鹿类慢性消耗病会侵袭加拿大马鹿的脑组织，其踪迹并遍及整个加拿大马鹿在北