首席代表身份参加中国人民政治协商会议。10月1日，在天安门城楼参加了中华人民共和国开国大典。1950年，陈嘉庚回中国定居。接着历任中央人民政府委员，中国人民政治协商会议第一届全国委员会常务委员，中央华侨事务委员会委员，华东行政委员会副主席，中华全国归国华侨联合会主席，第一届全国人大常委会委员，政协第三届全国委员会副主席等职务。1961年8月12日，陈嘉庚病逝于北京，享年87岁。后安葬于福建集美鳌园。他的逝世，葬礼的规格极高，由周恩来总理主持，毛泽东主席亲笔题词。
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