超英撰文反对兴建香港国际机场第三条跑道，先后透过环境影响评估、城市规划和填海审批程序提出正式反对意见，2016年4月11日提出「最后回应」。4月29日港府宣布兴建第三条跑道，林超英撰文写下了向后代香港人的道歉信。2013年7月，当传媒报导发展局局长陈茂波的太太在新界东北持有土地，与其官职处理新界东北发展计划有利益冲突时，林超英在网志「草云居」中撰文，指这种说法「是对女性的侮辱」，许太有自主的生活，持有土地与陈茂波没有关系。林超英的说法被前立法会议员、资深大律师余若薇女士发表公开信反驳，林超英亦作出回应。