10月14日宣布退休。2004年成为中日龙队监督。2007年率领中日龙拿下暌违半世纪多的日本职棒总冠军，并在2004、2006、2010、2011年取得中央联盟总冠军。在日本职棒中，落合是极少见的贯彻个人风格选手。进入职棒的早期时，打击姿势被前监督金田正一多次当面严重批评，因此落合拒绝加入由金田正一主持的名球会。(名球会的入选条件为：「在昭和年代出生，投手生涯成绩200胜或250次救援成功，或是野手生涯2000支安打」)此外，落合也很明白的指出「职棒选手就是为了钱而打球的」、「哪边出的年薪最高，我就到哪