以接受高级潜水训练。2000年水陆两队合併后，表现优秀的攻击队人员会被提拔接受高级潜水训练，促使特别任务连的海事能力获得大幅度地提升。然而，经过几年水陆两队合併后的运作经验及详细检讨后，特别任务连认为有需要建立比较当前更为高层次的精英制度。在香港政府财政资源充足下，除了继续提拔攻击队人员接受高级潜水训练外，特别任务连亦成立海事反恐怖活动小艇队，定位及规模均比较水上攻击队高，训练内容比较水上攻击队更为广泛。
协助中华人民共和国建立首支两栖特警队.2007年，为了配合香港先后举办200