条件会对整个基因组或是个体造成危害（自私DNA），此时所引起的现象称为基因组内部冲突。
核内基因间的冲突.
减数分裂驱动 (meiotic drive).在一个双倍体的细胞核基因组中，因为任一等位基因经过减数分裂的过程后，传递到配子中的机会均等，因此基因之间通常具有一致的目标与利益。然而，有一类型的基因，称为分离偏差因子 (segregation distorter)，会在配子生成的过程中驱使减数分裂偏向某一方，使此基因在配子中所占的比例比孟德尔的遗传定律所预