2年出任拉萨小学董事会董事、编审委员会委员。1956年任西藏自治区筹备委员会常委。1957年被任命为噶厦的最高长官噶伦。次年任西藏军区副司令员、西藏地方政府藏军马基（总司令），同年被授予中国人民解放军少将军衔。1959年任西藏自治区政府副主席。在同年的藏区骚乱中，他在罗布林卡被藏民用石块砸车，导致身负重伤。后出任国防委员会委员。1965年当选第四届全国政协委员。文化大革命期间才旺仁增因被指控为叛乱集团头目而受到迫害，并于1973年逝世。
家庭.其幼女桑吉德西嫁给锡金王储巴登顿珠