Amir Begum结婚，但两人一直分开居住。直到布托后来成为总统，来自保守家庭的Shireen Amir Begum不愿意搬到首都居住和在外面公开露脸。1951年9月8日，布托和伊朗库尔德人努斯拉特·伊斯凡尼结婚。努斯拉特的父亲是一位商人，印巴分治后从孟买搬到卡拉奇。努斯拉特婚后诞下两子两女，长女是日后成为总理的贝娜齐尔。有报道称布托在1971年娶了第三位妻子，孟加拉裔的Husna Sheikh。后者在离婚后嫁给布托，而布托由于努斯拉特的不满也一直没有公开他第三段婚姻。