后，云南、贵州、四川等地均相传有帝为僧时往来迹。正德、万历、崇祯年间，诸位大臣请求续封建文帝，及加庙谥，均未成行。虽然《太宗实录》（成祖原庙号太宗），称建文帝被朱棣以天子礼下葬，但崇祯帝在位时却亲口承认建文并无陵墓。崇祯十七年（1644年）五月，南明的弘光帝在南京即位，于同年七月为建文帝君臣平反，上庙号「惠宗」，谥号为「嗣天章道诚懿渊功观文扬武克仁笃孝让皇帝」。清朝干隆元年，干隆帝诏廷臣集议，追谥曰「恭闵惠皇帝」，故后世也称建文帝为「明惠帝」。2008年1月，福建省宁德市金涵乡上金贝村发现的一个和尚墓被