众年轻球员好好磨练的机会。球会再次失落大型比赛锦标和在联赛盃决赛对切尔西的伦敦打吡以1:2落败。不过，法比加斯逐渐显示出自己的重要性，在每场比赛担当作关键创造性球员。2006/07赛季欧洲联赛冠军盃中，法比加斯为阿仙奴取得个好开始，在第三圈外围赛对萨格勒布戴拿模梅开二度，助球会轻取对手3:0。在英超联赛，他贡献了13次助攻，为联赛中第二高的。该季他取得多项个人荣誉，包括意大利报章都灵体育报所举办的金童奖，为欧洲的着名编辑投票选出。他亦入选 和当选2007年1月FA英超。此外，他亦被提名为英格兰球员先生和PF