宛苏维埃社会主义共和国很快地被建立起来。接着苏联开始借由政治上的镇压和红色恐怖，消灭所有的反抗。当纳粹德国于1941年6月22日入侵苏联后，一些支持立陶宛独立的组织发动反抗苏联当局的行动，他们宣布立陶宛独立并建立了。立陶宛境内两个主要的城市，考纳斯以及维尔纽斯，在德意志国防军抵达以前就被起义者佔领。德军在进攻开始一个礼拜之内就攻佔了整个立陶宛。立陶宛人视德军为将他们从苏联的压迫中救出来的解放者。他们期待德军会协助他们独立，或是允许他们有某种程度的自治（类似斯洛伐克共和国）。然而德国人没有给立陶宛人这种支持，