主进步党创党十八人工作小组成员，为民进党创党十八元老之一。洪奇昌为党外民主运动医师从政代表，也是民进党医师从政第一人。曾连任第一（增额）至第六届立法委员，前国民大会代表，海基会前董事长，台北医学大学董事。在民进党内辈份高，曾长期担任新潮流系总召集人，与邱义仁、吴乃仁、林浊水并称为新潮流系四大天王，为新潮流的开派元老之一。2016年3月底被新潮流系所属台湾新社会智库除去会员资格。现任台湾产经建研社理事长、台湾弘久社会关怀协会理事长。近年来较多关注两岸事务，与民进党内部主流对于两岸事务发展的见解不同，主张两岸经