现在新疆独立组织和突厥人的同情者依然使用该词。蒙古入主中原之前中国二十四史明确有帝王世系记载的在新疆建立的政权有西辽。历史上是丝绸之路的必经之地。清干隆二十四年（1759年），干隆帝平定大小和卓之乱，统一天山南北，设伊犁将军管辖西域。1760年，干隆给陕甘总督杨应琚的谕令：“新辟疆土如伊犁一带，距内地远，一切事宜难以遥制。”雍正时贵州东南部新辟疆土亦称“新疆”。1877年（光绪三年），尚在清军进兵收复新疆之际，清廷就如何处理新疆善后事宜问题，命西征军统帅左宗棠通盘筹划。左宗棠在其呈奏的《统筹新疆全局疏》