遭到全面查禁，直到2004年方重新正式授权出版。柏杨也积极推动有关人权事务，1994年担任国际特赦组织台湾分会创会会长。
退休.自从1994年进行心脏手术，接着一连串大病之后，柏杨的健康每况愈下。2000年5月20日接受中华民国总统陈水扁聘任为中华民国总统府国策顾问一职。2006年9月，因为年龄和健康的理由，宣佈封笔，不再在公众场合露面和接受访问。同月出版的《柏杨曰》大陆新版序成为其封笔之作。2006年，柏杨同意将56箱、共计11,745件文献、文物捐赠予中国现代文学馆，并