器时代后期，在日本列岛生活的原始人类可大致分爲绳文人和外来的弥生人两大族羣。绳文人得名于其制作的绳文图案的陶器。日本原始社会的居民自公元4世纪开始移居至全岛，势力最远至北陆与出羽。从人类遗传学角度分析日本人口，发现了日本主要人口为绳文人、弥生人和中国汉族为主构成的混合人群。
神话传説.郑张尚芳引星野恒《日本国号考》谓在筑后国山门郡，王辑五《中国日本交通史》说在今九州肥后菊池郡山门乡。他们另外有一名是日向族，是阿伊努人对他们称唿。阿伊努神话说他们来到日本前，日本是阿伊努人的地方。