器官的资讯传递给中枢神经系统，而运动神经元则将运动指令传递到身体的随意肌。自主神经系统无论有无中枢神经系统控制皆可工作（这就是为什么被称为“自主”），并且还具有两个细分，称为交感神经和副交感神经，其将运动指令传递到人体的基本内部器官非常重要，并控制心跳，唿吸，消化和流涎等功能。自主神经与体神经不同，仅包含传出纤维。来自内脏的感觉信号通过躯体感觉神经（例如内脏疼痛）或某些特定的颅神经（例如化学敏感或机械信号）进入中枢神经系统。
神经解剖学中的方向.在一般的解剖结构中，尤其是在神经解剖