1949年1月5日，台湾省政府主席陈诚致电傅斯年，望其尽快赴台。1月19日晚，傅斯年飞抵台北。随后就任国立台湾大学校长，同时继续兼任中央研究院历史语言研究所所长。就任国立台湾大学校长后，傅斯年一直在邀请大陆学人加盟该大学，先后向郑天挺、汤用彤、冯友兰、叶企孙、钱三强、周一良、沈从文、陈寅恪等发出邀请，但回复者寥寥。也有一些不在“抢救”之列，却执意要走的学人，比如钱穆。因此毛泽东在1949年8月14日发表的评论《丢掉幻想，准备斗争》中，抨击了胡适、傅斯年、钱穆，称“为了侵略的必要，帝国主义给中国造成了数百