。6月7日，日军和平进入台北城。
唐景崧逃亡.6月2日，清廷全权代表李经方与台湾总督桦山资纪在日舰横滨号在海上完成台湾交接。6月3日，基隆同知方祖荫请唐景崧驻八堵，唐不从并使黄瑞德率护卫营协防。6月6日，台湾民主国总统唐景崧逃至沪尾（淡水）的德商得忌利士洋行（Douglas Lapraik & Co），并乔装成老妇，与陈季同乘德国籍运煤轮船鸭打号（Arthur）弃职逃亡至厦门；其母亲也在后来的慌乱中据闻遭抢并下落不明。
第一阶段尾声.5月29日至6