，朱元璋还制定颁布了影响深广的《申明佛教榜册》，要求各地僧司查验清理天下僧寺，欲还俗者听其还俗，使出家僧人恪受戒律清规，禅、讲、瑜伽，各归本宗。太祖亲自制定的“御制至圣百字赞”以及明皇室关于修建清真寺和保护清真寺宗教职业人员的谕旨，在一定程度上肯定了回族的宗教生活。
生殉制度.殉葬制度，在西汉初以后，逐渐在中原政权消失。朱元璋二子秦王对人民暴行(见御制纪非录)被宫人杀死，即连坐迫秦王诸妃自杀。明朝时期明孝陵以四十六妃陪葬，其中有太祖死时杀死殉葬十几名侍寝宫人，这一制度沿袭至成祖