举中，失去地方多数执政权；2006年更引发出要求陈水扁下台的百万人民倒扁运动，导致民主进步党在两年后失去中央政权与立法院多数席次。
马英九政府.2008年，总统与国会选举从该年起开始在同年举行：1月的第七届立委选举首次採用单一选区两票制，中国国民党取得超过三分之二的席次，但选制的改变也使得小型政党未能获得席位而难以发展，部分弱势群体代表无法在国会殿堂为所属群体发声；3月的第十二任总统选举，中国国民党籍的马英九与萧万长分别当选总统、副总统，达成第二次政党轮替，也使中国国民党在1996