学校后，施儒珍在新竹州厅担任技工，同时，由于受到黄旺成的思想感召，他暗自率领十多位青年谋划抗日活动并打算前往中国；但是，事迹不久就洩漏出去，他也遭警方逮捕并被处以有期徒刑六年。在国民政府接收台湾后，对于台湾省行政长官公署的腐败统治逐渐感到不满。在二二八事件发生期间（1947年3月2日下午2时）遭流弹击中右腿；当时，他因惧怕就医遭人发现而自行返家敷以民俗草药，因此导致右腿终生残废。此后，他对国民政府感到澈底绝望；同时，他也开始参与左翼读书会活动，并企图谋画推翻统治当局。此时，施儒珍的妻子因两人感情不睦离家