6月26日宣布独立，斯洛文尼亚在当年10月脱离战火，而克罗地亚战争持续到1995年。这是因为克罗地亚和塞尔维亚领土相连，并且克罗地亚国内有10%以上塞族人。在随后接近10年的武装冲突中，这一地区所有的共和国逐渐完成独立过程。其中最惨烈的事件发生于波士尼亚战争。长久的战争导致联合国军事介入。1995年，北约地面和空中部队对波斯尼亚和黑塞哥维那的塞族武装发动地面和空中攻击。1999年北约轰炸南斯拉夫（包括科索沃），南斯拉夫解体分裂战争正式结束。从南斯拉夫分裂出六个受到国际承认的主权共和国：包括斯洛文尼亚