影响.飓风艾琳一共造成18人死亡（其中15人属间接导致），经济损失8亿美元（1999年美元，相当于年的美元）。大部分破坏和人员丧生都是因风暴引发的倾盆大雨导致。
古巴.艾琳途经古巴期间产生了暴雨，局部降雨量高达905毫米。马坦萨斯省的吉隆滩（）记录下303毫米降水，哈瓦那也记录下了122毫米，还有其他多个地点记录下超过178毫米降雨量。此外，哈瓦那记录下的最强阵风时速为126公里。风暴引发的洪灾破坏了超过1900平方公里甘蔗种植园和158平方公里香蕉种植园，降雨还导致烟田被淹