塞莱斯廷预言》也受到了一些批评。大多数批评来自文学团体，他们认为本书的故事情节没有得到很好的发展，仅仅是传递作者关于灵性的观点的工具。詹姆士‧雷德非承认了这点，但他认为这本书不是小说，他的目的是将故事写成寓言的形式。批评还指向作者大量使用主观验证和具体化来处理推动剧情的偶然事件，过多地解释精神的理念而不是传统地声如角色和剧情的发展。也有人批评作者使用了不合理的解释，以及有些情况下使用了完全没有解释的“事实”。例如玛雅文明的位置是现代的秘鲁，而不是中美洲，而且手稿写于公元前600年的秘鲁的丛林中，但却