李鸿章经荣禄说服了慈禧，张得以保存生命，改判流放新疆。贬戍新疆时，京剧演员秦稚芬一路护送至张家口。张荫桓性格开朗，沿途与接送官员谑称：“老太太跟我开玩笑，差我到关外走一回。” 光绪二十六年（1900年）庚子拳乱，八国不满。原出于张荫桓门下的新疆巡抚饶应祺上奏请求释放张荫桓，处理外交，未准。八国联军进入京城之际，把持朝政的端郡王载漪矫旨斩张荫桓于戍所。二十七年（1901年），两宫回銮，太后召见惠潮嘉道吴永时问到张荫桓，吴永回答：「庚子某月电旨正法。」太后听闻也感到哀伤。庆亲王奕劻受李鸿章死前交代，奏准为张