期间，太古仓曾经遭受重创。1967年9月1－3日，太古仓发生了“武斗”，致使部分仓库着火，死7人，伤10余人，其中三层高的8号仓库被烧毁，财产损失巨大，3日，中央调查组还曾亲自到太古仓现场进行调查。在“十年浩劫”中，太古仓曾经遭到炮击，其中一座以储存包装白糖为主的仓库被打穿出个大窿。虽后修复，但修复的位置所堆存的包装白糖往往容易受潮，而其他位置和其他仓库就无此弊，反映太古仓在建造之初，其整体设计、建筑材料、施工工艺和防潮措施等等较现时更为科学严谨。近年随着广州港集团先后建设了新沙、南沙港区，广州港的货物