白腐真菌。 由不同真菌作用分解的残留物具有不同的pH、溶解度和氧化还原电势，这些残留物最后会变成土壤中沈积物中，随着时间的累积，可能对该地区的环境产生显着影响。目前全世界约有5,000余种木腐真菌。
褐腐真菌.褐腐真菌只能分解半纤维素和纤维素，而无法分解木质素。此类真菌在分解木材时仅少部分依赖纤维素酶，主要是借由半纤维素分解过程中产生的过氧化氢（强氧化剂）(HO)。 由于过氧化氢的分子小，因此能在木材中迅速扩散并破坏纤维素，从而导致木材腐烂。这种分解方式并不局限于真菌菌丝的周围，不