，‘聚而殓之，埋其余烬’，合葬立碑。后广州再次成为广东省会、广州府及番禺与南海县治。1680年（康熙十九年）削藩后，朝廷又加设广州将军一职，统领驻扎在广州的八旗官兵，并节制广东全省绿营兵。1646年（清顺治三年十一月初五），清军占领中原后，南明绍武帝朱聿讁在广州建都，这是广州在历史上第三次建都；同年十二月十五日，清兵攻入城内，绍武帝自缢而死（一说被杀）。1650年（清顺治七年），平南王尚可喜与靖南王耿继茂指挥清军的汉军镶蓝旗，围攻广州城达10个月之久，动用荷兰炮手及楼车攻城，终于在11月24日攻