双联装炮塔中装备有四门作为，则由十八门组成。和修订工作持续了一年多，而当它于1899年10月投入现役后，便立即加入德国练习舰队（）的，担任分舰队指挥官海因里希亲王的旗舰。第一分舰队在每年主要持续进行训练演习，并且多次出访其它欧洲国家，尤其是英国及瑞典-挪威。1901年，该舰在撞上波罗的海的暗礁后遭到严重破坏；这一事件促成了德国战列舰后续的设计变更，以使它们能更好的抵御水下破坏。德皇腓特烈三世号于1908年进行了广泛的现代化改造；其副炮被重新安置、亦有所削减，以缓解上部过重的情况。在1910年重返服役