巴布尔手中拿下了河中，在穆罕默德·昔班尼的领导下，直接构成了对于唿罗珊的威胁。尽管巴布尔曾建议忽辛采取行动，却由于忽辛年事已高而最终放弃。乌兹别克人开始袭击唿罗珊，忽辛决心抵抗他们，然而不久之后的1506年他就去世了。帝国由于他的儿子巴迪·匝曼和穆扎法尔·忽辛之间的争位而分崩离析。起初支持忽辛的巴布尔注意到了这两兄弟之间的内斗，认定唿罗珊迟早会被攻陷。果不其然，第二年，穆罕默德·昔班尼征服了赫拉特并迫使忽辛的继承人们作鸟兽散，从而结束了在帖木儿帝国在唿罗珊的统治。