馆变成新设教育厅的所属机关（陈仪时期是和教育处平行的行政长官公署所属机关），改名「台湾省立博物馆」（现国立台湾博物馆，1999年7月1日起直属行政院文化建设委员会），他仍担任馆长。1955年4月去职，任馆长10年，奠定初步规模。1956年转任台中市东海大学生物学系教授兼主任，1966年退休。1972年移民美国。1982年回到中国大陆，1988年在上海病逝；期间曾任第六届全国政协委员。