佐举荐，进温州府知府，有善政。后升刑部右侍郎。正统五年（1440年），赈灾山东、南京等地。次年，因事连坐入狱，以疾病告辞。景泰元年（1450年），代宗起用何文渊为吏部左侍郎，次年，升吏部尚书。景泰三年（1452年），加太子太保，后因贵州民变，被给事中林聪弹劾。天顺元年（1457年）四月十一日得疾，三日后骤逝。一说景泰三年何文渊曾参与拟改立太子之诏，明英宗发动夺门之变顺利复位后，不久，又听说广东按察副使陈泰前来提问，最后何文渊畏罪自杀死，同谋黄竑与徐正被处以极刑，为此，朝廷还派人前来验尸，确定是自杀。