瓦那有约8,000人死于霍乱，而墨西哥有约15,000死亡。此次大流行期间，科学界对霍乱的治病原因和机理存在分歧。法国医生认为霍乱与贫穷地区的恶劣环境有关，俄国人认为此疾病具有传染性，部分英国人则相信霍乱的发生与神的干预有关，还有人提出与地球磁场或大气层的扰动有关。直至第三次霍乱大流行期间，英国科学家约翰·斯诺最终利用科学方法证明了污染的水源是霍乱传播途径。