联盟分别获得22席与9席。之后两党加入了由本次大选赢家捷克社会民主党所主导的执政联盟。2003年，Miroslav Kalousek成为党主席，不同于前任主席Cyril Svoboda，他採取与公民民主党结盟的右派立场。他在党主席选举，及首相弗拉迪米尔·什皮德拉辞职后面临政府重组时，两度拒绝加入执政联盟，最后在2005年2月19日，要求首相斯坦尼斯拉夫·格罗斯为他的财产丑闻下台。格罗斯以威胁解除基民盟所有内阁职位作为报复，引发政府危机。2006年选举结束后，基民盟与公民民主党和绿党组成执政联盟。