哈佛-史密松天体物理中心下属的橡树岭天文台发现了太阳系外行星的证据。1990年发现了宇宙大尺度结构中的“长城”构造，惠普尔天文台发现了蟹状星云的伽玛射线辐射。1994年，CfA红移巡天扩展到南半球。1995年，哈佛-史密松天体物理中心的天文学家发现了超大质量黑洞存在的证据。同年，次毫米波阵列望远镜在夏威夷莫纳克亚动土兴建。1996年，惠普尔天文台发现了一类新的活动星系；安装在SOHO卫星上、由哈佛-史密松天体物理中心设计的仪器拍摄了首张太阳外层大气的照片，探测到了快、慢两种太阳风。同年，哈佛-史密松天体物理