喉和霍乱等传染病在香港仍然是十分普遍，而为公众预防传染病遂成为他的主要工作之一。有见及此，他延续和继续推动医务卫生署既有的多项政策，包括加强港口检疫、向公众宣传和教导防治传染病的常识、到地区展开医学调查、向高危人士派发药品，以及积极鼓励市民免费接种卡介苗等防治传染病的疫苗。其中，麦敬时在任内着力推广向儿童免费接种卡介苗，及至1961年，多达80%的产妇在医院分娩后，同意让出生48小时的婴儿接种卡介苗，有关措施使五岁以下儿童的结核病感染比率和死亡比率均录得明显下降。另一方面，当时香港面对霍乱的严峻威胁