一些神职人员，怀疑圣经提到的奇迹并不是事实。比方说，圣经谈到焚而不毁的荆棘丛。《圣经其实怎样说》一书解释，许多德国神学家不认为这是原原本本的一场神迹。相反，他们说，“这象征着摩西内心的痛苦挣扎”。“火焰还可以看成是神显现的阳光下，突然盛开的花朵。”无神论者不认为神是存在的，自然没有神的行为，亦即没有神蹟。神蹟的发生，只是人类由于蒙昧和误解而产生的。而且，他们认为不少神蹟是被别有居心的人创造的。事实上，许多怀疑主义者亦认为神蹟极有可能用魔术手法人为制造，例如各种伪气功、骗术等；至于治病方面的神蹟，也是安慰