河谷山地半常绿季雨林区。有记录的维管植物共有2,439种，分属222科，1,066属。其中蕨类植物43科，94属，150种，种子植物179科，972属，2,289种。植物名录中属珍稀濒危保护植物的共计216种，占保护区维管植物种类的8.86%，包括国家级保护植物18种，其中蕨类植物5种，被子植物13种。云南省级保护植物35种，均为被子植物。其他还有苔藓植物37科，83属，165种；大型真菌4个纲，22科，56属，102种。森林以热带雨林、热带季雨林为主，重要植物有桫椤、长蕊木兰、箭毒木、千果榄仁、董棕、铁杉