府决定「幕府领地、佐贺领地均不干涉端岛」，使得端岛归属未定。1889年4月1日，日本实施町村制之后，端岛属西彼杵郡高滨村。1955年4月1日，高滨村和野母村、脇岬村、桦岛村合併为野母崎町时，端岛自高滨村分出，划入高岛町。2005年1月4日，高岛町被划入长崎市，端岛也因此成为长崎市的一部分。
岛内建筑.端岛现存的集体住宅中，有数座建筑比因保存运动而成为话题的历史更加古老。30号楼高7层，修建于1916年，是日本首栋钢筋混凝土高层公寓（竣工当时高4层）。端岛在30号楼竣工后还兴建了日薪