丁堡，尼基塔斯·霍尼亚提斯记载“兄弟和解比战争胜利更让皇帝高兴”。但1139年，伊萨克的长子约翰叛逃到突厥人那里，不久之后，伊萨克被流放到以加防备。1143年4月，约翰二世去世，他指定幼子曼努埃尔继位，而不是存活的第三子（长、次子已去世），“”伊萨克·科穆宁。因此，曼努埃尔未能立即稳固地位，宫廷内部产生了争斗，老伊萨克·科穆宁在斗争中决定支持年长的同名侄子，但掌握军队的支持曼努埃尔，帮助他稳定了局面。约翰下令逮捕过着流放生活的老伊萨克。局面稳定后，曼努埃尔决定释放他的叔叔和哥哥，二人参加了1143年11