别所就治（1502年－1563年）是日本战国时代武将。播磨国人别所氏当主。别所则治的孙（或者儿子）。儿子有安治、重栋、吉亲。女儿是淡河定范之妻。别名是村治、重治。官位是大藏大辅。
生平.别所氏是赤松氏的一族，但是在则治一代则突然成为赤松政则的重臣等，经歴上有很多谜团。则治被提拔为东播磨的守护代，此前一直与在赤松家中有很大势力的依藤氏斗争。一说指就治是则治的儿子，或者是则治的儿子别所则定（早逝）的儿子。最初在赤松氏之下并领有三木城，但是在主家衰退时扩大势力，之后成为战国大名并独立