建民选择与个人投出生涯高峰的洋基队签下带逃脱条款的小联盟合约，重回熟悉的环境。4月10日，王建民在小联盟出赛。然而洋基队在开季后，始终未将王建民升上大联盟。因为无法登上大联盟，王建民在6月8日决定行使逃脱权而解除与洋基的合约，转而与同属美东球队的多伦多蓝鸟签约，于6月12日首次出场先发。6月17日，对游骑兵主投7局无失分，获得在蓝鸟队的首胜。不过在同年7月3日，对老虎投1.2局失6分退场，被球队指定派遣，后下放小联盟。2013年8月25日，王建民被叫上大联盟，对休斯顿太空人担任先发，主投3局失五分，吞败