16年香港足总盃初级组是第 3 届香港足总盃初级组的足球赛事，一共 42 队于甲组联赛、乙组联赛及丙组联赛角逐的球队会参与赛事。第一圈赛事于2015年12月13日进行，决赛则于2016年1月24日进行。
赛制.赛事由甲组、乙组及丙组球队参赛，整个初赛赛事是以单场淘汰赛形式进，假如双方于法定 90 分钟内赛和，不会进行加时赛，而是直接以互射十二码方式来决胜负。最终获得赛事前三名球队，可获资格与 9 队超联球队角逐2015–16年香港足总盃赛事。
参赛球队.2