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货仓.货舱占据轨道器的大部分机身，为航天飞机有效载荷提供货运空间。货舱长18米，宽4.6米，能容纳直径最大为4.6米的圆柱形负载。货舱两边各铰接两扇舱门，提供相对气密的密封空间，能在起飞和再入时防止货物因高温损坏。舱内货物在纵樑的附着口上固定，舱门还能用于散发轨道器的热量，抵达轨道时就能打开来排热。根据任务需求，轨道器能结合各种附加部件，如轨道实验室、用于把货物运到更远位置的助推器、遥控机械臂系统，以及延长任务时间需要的部件。为减少轨道器与国际空间站对接时的燃料损耗，科学家