其境内的巍宝山而得名。巍山县是南诏国的发祥地，1994年被评为中国国家历史文化名城。
历史.古代属滇国地。西汉遥置邪龙县。唐代时，南诏国在此创始，并为其早期都城。大理国时设蒙舍镇开南县。元至元十一年（1274年）升开南县置蒙化府，属大理路。十四年升为蒙化路，二十年降为蒙化州。明正统十三年（1448年）复升为府。清干隆三十五年（1770年）降为蒙化厅。1912年改蒙化县，1954年6月30日，中央人民政府内务部批准更名为巍山县。1956年11月9日，中华人民共和国国务院第四十次会