中国国民党籍立法委员甚至干涉总预算、倒阁和发动连署罢免陈水扁等行动，开启往后民主进步党执政期间朝野恶斗的情况。对此时任首席顾问的林义雄向陈水扁提议不需要妥协，并且提到：「即使人民不支持，上帝也知道你做对了的事情，没有必要妥协、没有必要出卖灵魂。」不过司法院大法官作出司法院释字第520号解释，认为行政院并无迳行停止经立法院通过预算的重大政策执行之权限。面临高度压力的陈水扁在和林义雄、张俊雄、谢长廷、施明德和民主进步党各派系讨论后，陈水扁政府最终妥协并且在2001年2月14日由宣佈回复兴建建龙门核能发电厂、甚至