度前往日本，先到台湾，1899年六月前往日本本土，在京都、东京活动，认识孙文，不久后回中国，担任上海《亚东时报》主笔。1901年，至苏州东吴大学任教，宣扬民族民主革命，引起江苏巡抚恩铭注意。1902年，为避追捕，于二月第二次渡日本，曾计划在东京举办「支那亡国二百四十二年纪念会」。「支那亡国」意指南明永历帝政权的灭亡，预定的举办日期为明思宗殉国之日，但是纪念会在清廷向日本政府施压下被禁止。此次东渡，章太炎住在梁启超主持的新民丛报馆，为《新民丛报》润色译文，并曾试图调解孙逸仙、康南海二派的关系。当年夏回上海