本外务大臣井上馨接见了鱼允中一行，在井上馨和鱼允中的斡旋下，尹致昊与另一名随员俞吉濬留在日本，进入日本名校同人社学习。1882年跟从东京帝国大学哲学教授夫人米利特和英语讲师神田乃武以及在1883年1月驻横滨的荷兰领事馆书记官学习英语。留学生活期间，他与金玉均、徐光范、朴泳孝、俞吉濬等开化派人物及日本文明开化论者福泽谕吉、中村正直等人交游。
甲申政变和流亡生活.1882年5月，《朝美修好通商条约》缔结时尹致昊作为美国首任驻朝公使福特（Foote. L. H）的翻译官，回到朝鲜。他以翻