奥军开进华沙大公国，但却在1809年4月19日的雷兹因战役遭到波军击败，波兰人反攻夺取了西加里西亚。拿破崙自领东线指挥，并领导其军队发动对奥反攻。经过数次小型战斗，原本情势正好的奥地利军队撤出巴伐利亚，拿破崙随之攻入奥地利境内。他过早试图冒险渡过多瑙河，结果遭遇到他平生首次正面惨败，1809年5月22日的阿斯佩恩-艾斯林战役。但是奥军指挥官卡尔大公，未能继续维持胜利，使拿破崙得以在7月初攻佔了维也纳。最后拿破崙在7月5至6日的瓦格拉姆战役中重创了奥军，逼使奥地利求和。第五次反法同盟结束于申布伦条约的签