上缴的宅地及周边地块共计58.3公顷的基础上，为了振兴日本的现代农业技术而设立了内藤新宿试验场（）。在该试验场开展了大量的果树、蔬菜栽培及养蚕、畜牧等实验，其中包含来自西方的技术及物种。明治七年（1874年)，试验场划归内务省管辖，并新成立了农学研究所。明治十年（1877年），该研究所移设至驹场，后改称驹场农学校，是今天东京大学农学部的前身。明治十二年（1879年），新政府农业振兴政策的扩展，试验场的一部分设施移设至他处。在该地则成立了由宫内省管辖的新宿植物御苑（）。在此期间，庭园中设立了鸭池、养鱼池和