前一年（1615年）准备期间被琉球国尚宁王知道后，他派遣通事蔡廛通知明朝，福建巡抚黄承玄为此于万历四十四年（1616年）上疏朝廷并提拔都司沈有容担任福建水师提督。村山秋安所率领的三千多人、13艘船组成的船团在1616年5月4日从长崎出发，却在琉球遇到台风而溃散，其中村山等安所率的三艘船漂到了交趾（今越南），隔年7月才回到长崎。不过船团中由部将明石道友所率的三艘船则抵达台湾北部，其中一艘船上面的一、两百人在登陆后被原住民包围，全数被迫自杀，另外两艘船后来逃到福建北边海域的麂山、礵山、东涌（今马祖列岛的东引