立“闽厦海军警备司令部”，由海军练习舰队司令杨树庄兼任闽厦海军警备司令。约1924年初，林国赓任海军练习舰队参谋长。1924年6月，杨树庄率领海军占领厦门后，设“厦门海军警备司令部”，林国赓兼任厦门海军警备司令。1925年2月6日，北京临时执府临时执政段祺瑞任命杨树庄为海军总司令。1925年2月22日，海军上校林国赓被任命为海军总司令公署参谋长，任至1926年6月。其间，林国赓一直驻守厦门。1925年6月，林国赓被杨树庄任命为闽厦海军警备司令部参谋长，兼厦门海军警备司令。1925年7月，林国赓升为海军少将。