萄牙人在日本购买日本人作为奴隶，并把他们卖到海外的各个地方，包括葡萄牙本土。许多文件提到了大规模的奴隶贸易，以及反对奴役日本人的抗议活动。1555年，教会指出，日本奴隶被认为是第一批来到欧洲的日本人，葡萄牙人购买了大量日本女奴，带到葡萄牙进行性交易。塞巴斯蒂安国王担心这会对天主教的福音传播产生负面影响，因为日本的奴隶贸易已经发展到相当大的规模，所以他在1571年下令禁止奴隶贸易。1598年，葡萄牙耶稣会士路易斯•塞奎拉在一份文件中提到，日本女奴甚至被当作小妾卖到葡萄牙船上，在日本从事交易。葡萄牙人把日本