2010年3月，教育部部长袁贵仁与天津市市长黄兴国签署了教育部、天津市共建天津大学、南开大学新校区和共建国家职业教育改革创新示范区的两份共建协议，对海河教育园区两期的建设问题进行了约定。海河教育园区的二期工程即为“教育部直属高校示范区”，即南开大学和天津大学的新校区和天津市高端科技研发创新示范区。2015年9月5日，南开大学津南校区正式启用。2016年3月，网络上逐渐曝出南开大学津南校区廊桥沉降、建筑表面返碱、石材脱落等建筑质量问题，引发在校师生及校友的关注与讨论。4月，校方开始组织检修整改。