向转换是简单的三角函数，并且没有累积误差的风险。在许多分子建模和计算化学程序中，Z-矩阵用于为分子系统创建输入文件。熟练选择内部坐标可以使结果的解释简单明了。另外，由于Z矩阵包含的分子连接性信息（虽然并不总是包含此信息）可以用于更有根据地猜测初始的黑塞矩阵，一些量子化学计算（比如结构优化）可以因此而加快速度。目前，Z矩阵通常是首选的分子表示法，因为这可以通过将某些角度设置为常数来对分子（或其部分）强制添加对称性。 Z矩阵只是以相对方式放置原子位置的一种表示形式，具有明显的便利性，即Z矩阵中使用的向量对应