。E线在任何时候都营运，来往的牙买加中心-帕森斯/射手和曼哈顿下城的钱伯斯街-世界贸易中心，有限度服务以179街为总站而不是牙买加中心。日间列车在皇后区以快车营运，在曼哈顿以慢车营运，深夜列车停靠全线所有车站。早期，E线列车沿罗格斯街隧道和IND卡尔弗线前往布鲁克林，但这营运模式在1940年代就已经中止了。直至1976年，此线都是途经IND福尔顿街线和IND洛克威线前往布鲁克林和皇后区。
历史.1933年8月19日皇后大道线通车，E线开始罗斯福大道-杰克森高地至钦伯斯街的服