生殖系统（英语：reproductive system）是生物体内的和生殖密切相关的器官（生殖器）成分的总称。不过像腺体、激素、费洛蒙等也是生殖系统的一部份。同一种生物的生殖系统会依性别而有显着的差异，这也是和其他器官系统最大的不同点，二性生殖系统的差异可以从二个个体中的基因中组合出新的一组基因，可以提高后代基因的适应度。
动物.哺乳动物中的主要生殖系统包括外在的生殖器（阴茎及阴户），也包括许多在身体内的器官，包括可以产生配子的生殖腺（睪丸及卵巢）。人类有许多常见的生殖系统疾病