。宋神宗即位，改知庐州、陕西转运使。熙宁三年（1070年），傅尧俞入京师，对王安石言新法不便，担任权盐铁副使。不久改任河北转运使、知江宁府。历任知许州、河阳、徐州。因事免官，复职，监黎阳县仓草场十年。宋哲宗即位，从明州召他为秘书少监兼侍讲，升为给事中、吏部侍郎、御史中丞。官至吏部尚书兼侍读。元祐四年（1089年）担任中书侍郎，元祐六年（1091年）傅尧俞去世，赠银青光禄大夫，谥号献简。