至萨尔茨堡之间开行有发车频率为每两小时1班的欧城列车（），它在沿途经停慕尼黑东站、罗森海姆、基姆湖畔普林、特罗因斯泰因和弗赖拉辛格等站。自2008年起实施的运行图调整起，这些列车服务还会穿越萨尔茨堡交替延长至格拉茨和克拉根福终到。发车频率为每小时1班的锐捷列车（）可由慕尼黑直通奥地利维也纳及匈牙利布达佩斯，但它们在慕尼黑至萨尔茨堡区间的路段中不设停站。此外，汉堡－贝希特斯加登间每日开行一班的城际列车（）“国王湖号”也会途经这条铁路线。在慕尼黑、罗森海姆及因斯布鲁克之间还有开行频率为每两小时1班的德铁-奥铁欧