钓是令黑眉信天翁数量减少的主因。事实上，黑眉信天翁是最易被渔业所杀死。另外，拖网捕渔也令黑眉信天翁的数量减少，特别是在巴塔哥尼亚架及南非附近。黑眉信天翁受到《波昂公约》及《信天翁及海燕保育公约》的保护，其数量受到监察，而繁殖地也受到保护。赫德岛、麦克唐纳群岛、麦夸里岛及新西兰等都被列为世界遗产而获得加以保护。