侦查，并于1950年1月逮捕郭琇琮、蔡孝干、吴思汉等「重要干部」。1950年5月， 中华民国国防部保密局官员与国立台湾大学校长傅斯年交涉后，再度扩大搜捕过程，其中，较为重要者有台大医院第三内科主任许强、眼科主任胡鑫麟、耳鼻喉科医师苏友鹏和皮肤科医师胡宝珍。
审判与枪决.中共台北市工委遭国防部保密局破获后，中华民国政府即举行未公开之审判，初判将读书会成员中「涉案情节重大」的郭琇琮、吴思汉、谢涌镜、邓火生、王耀勋、朱耀珈、许强、高添丁、张国雄、卢志彬等10名判为死刑。9月21日，台