里宁格勒州的大部分位于普列戈利亚河流域，西部及西南部环绕着波罗的海和波罗的湾。地形以低平原、沼泽和平缓丘陵为主，百分之二十的土地生长着混生林。受海洋影响，气候湿润，年降雨量600-700毫米。1月平均气温-9℃，7月17℃。土壤以灰化土为主。矿藏有石油、褐煤、泥炭等。种植业不发达，唯亚麻种植较多。畜牧、家禽业较为发达。加里宁格勒州内主要的河流有涅曼河、普列戈利亚河。在该州境内还分布着大大小小的湖泊一百多个，还有许多沼泽地。加里宁格勒州的气候已由海洋性气候向温带大陆性气候逐渐过渡。
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