，水鼠耳蝠夜间会利用动物回声定位找寻猎物。牠们会用这种方法画出一幅「声纳图」，所发出的频率大约 32 至 85 kHz， 一般的叫声以 45 到 50 kHz 为最高，有 3.3 ms 这样久。牠们主要是食虫性，以苍蝇，蜉蝣等昆虫等为食物，但也有捕捉鱼的记录。牠们会用脚捉着往水面的鱼，而且可以一边飞一边吃。外国研究显示，一只7克重的水鼠耳蝠经过一个小时猎食后，体重可增加至11克，相当于本身体重的57%。
繁殖.于外国，水鼠耳蝠主要在秋天时候交配，至春天生产。牠们通常一胎一只，蝙