根据美国古生物学家阿尔弗雷德·罗默（Alfred Sherwood Romer）的着作《"Vertebrate Paleontology"》，依照头颅骨的颞颥孔数量与不同位置，爬行纲分为四个亚纲，分别为：以上四个亚纲，除了单孔亚纲以外，目前都属于蜥形纲。
分类学.以下目级列表是根据班顿以后的研究（2014年）：
系统发生学.以下简易版的爬行动物演化树，龟鳖目曾与众多史前副爬行动物一起归类为无孔亚纲，但后来的遗传分子学研究多支持龟鳖目位于主龙类所在的双