，总期拿获滋事之人，赔偿所失之物，以便迅速了结，免致彼国借此要挟，丛生枝节”，同时也要求马新贻、英翰两人快速结案。最终，两人和英法方面签署了《南京协定》，内容主要有：
影响.同治九年正月二十四日(1870年2月23日)，英国公使威妥玛照会总理衙门，要求处理安庆教案中相关官员。同年阴历四月，马新贻、英翰两人在安庆立石碑，表明教会可以自由买卖土地，地方官员处理此类事件时需迅速公平办案，民教和睦相处。《南京协定》赔偿给法国耶稣会的4000银元中有2000银元由安庆知府代为购买建立教堂的