了中华人民共和国政府的严厉抨击，后者认为这些传教士曾经是殖民者的帮凶，在西方国家对中国的武装掠夺中扮演了极不光彩的角色，「并且严重地损害了中国人民的利益和感情」。其他的一些批评集中在他的一些观点上。尤其是若望保禄关于性别身份和性的观点屡遭诟病。一些女性主义者批评他关于女性的社会角色的立场，同性恋权益拥护者则对他代表教会宣示同性欲望是“明显的病态”感到不满，对他反对同性婚姻尤其不满。他关于避孕的态度对于很多人来说尤其保守。若望保禄遵循传统的天主教教导，认为在有生育能力的夫妇之间的性行为的一项必不可缺的目的