与原作差异不算太大；《忍者杀手 杀》由关根光太郎担任作画，偏向少年漫画的创作方式，大量描绘激烈、热血的搏斗场面，在剧情方面只画到原作第一部「火烧新埼玉」的后半部就完结了。由余湖裕辉作画的「无印版」漫画最早于2013年7月开始在Comptiq与月刊Comp Ace杂志连载，两本杂志连载的内容毫无差别。直到2016年4月，月刊Comp Ace突然开始连载不同的剧情篇章，直接跳到原作第二部「杀伐都市京都」的剧情，当时Comptiq杂志的进度仍在原作第一部「火烧新埼玉」的剧情。2016年11月，随着篇章「艺伎，