长崎在7时50分曾发布空袭警报，但是随后于8点30分解除。日军在10点53分观测到两架B-29轰炸机，但是研判为侦察行动，所以没有进一步发出警告。大艺术家号机组人员在11时过后将3组带有降落伞的观测设备投下，里面包含一封未署名的信件，准备交给一位东京大学的物理学家嵯峨根辽吉，怂恿他向大众公开大规模杀伤性武器的危险性。这个讯息后来被军方发现，但是直到一个月后才交给他。其中一位作者路易斯·阿尔瓦雷茨在1949年与嵯峨根辽吉会面，并签署该文件。博克斯卡号接近长崎市上空的时候，发现80%到90%的积云覆盖