R东海的分类上，沼津车站是设有站长与站员的直营车站，除此之外沼津也负责东海道本线上两个相邻的小车站、片滨与原的运务代管。由于负责御殿场线上行驶列车维护工作的沼津运输区就位在站区东侧，因此站内设有大量调度用途的停车线。在过去的日本国铁时代，站区北侧曾设有铁路机车调度用的沼津机关区，但目前场区已经拆除转作为商业区的开发用途。
JR货物.除了客运业务外，在JR东海的客运站西侧约1公里处，可以见到隶属于JR货物的货运车站。站内设有三座货柜装卸月台，可以负担六条装卸路线的操作。货运站北侧设有