级硬盘驱动器而言，磁盘碎片是个很严重的问题。因为增大差距在顺序访问速度和（以及较小程度上寻道时间）之间其上文件系统通常放置。因此，碎片是在文件系统的研究与设计的一个重要问题。碎片的遏制不仅很大程度上依赖于文件系统在磁盘上的格式，还取决于它的实现。相对于机械硬盘，文件系统碎片对固态硬盘造成的性能影响较小，因为不涉及机械。但是，文件系统还需要储存另一个元数据对于相对应的文件，每条元数据本身需要佔用空间，并且需要处理动力和处理器时间。如果达到碎片的最大极限，将会导致写入请求失败。在简单的文件系统基准测试中，往