于香港道教联合会纯阳小学（2004年小六）和香港中文大学校友会联会陈震夏中学（2009年第三届中五）。2010年，他代表香港参加亚洲运动会赛艇比赛，伙拍梁俊硕、关骐昌和廖顺贤，出战男子轻量级四人单桨无舵手项目，夺得铜牌。2011年6月，邓超萌参加德国汉堡举行的国际赛艇联会赛艇世界杯赛事，伙拍关骐昌赢得男子轻量级双人项目亚军；这亦是香港赛艇代表队首个世界杯奖牌。自2016年3月起，邓超萌开始与21岁的赵显臻合作双人艇，二人都属于力量型选手。他们首次出战澳洲公开赛，便已夺得亚军，其后又在4月进行的资格赛