。2002年12月，发起对四川藏区阿安扎西活佛案的签名请愿活动，唿吁当局公正审理。2003年2月，因政府方面的命令，时任“自然之友”理事的王力雄被自然之友除名。2004年，由台湾大块文化出版《递进民主——中国的第三条道路》。2004年底，与藏族女作家唯色结婚。2007年10月，经过历时九年的调查和思考，在台湾大块文化出版新疆问题着作《我的西域，你的东土》。2014年4月，原本受邀打算到香港中文大学出席研讨会，但临时因为被阻止赴港而取消。2019年12月23日，在YouTube创建「绝地今书」