黄贝岭站为跨月台转车站的设计，其中老街站原为侧式叠式月台，深圳地铁3号线开通后，原来1号线南面的侧式月台被关闭，而在北面增建岛式月台，形成岛式叠式月台；黄贝岭站是2号线和5号线的转乘站。三期系统通车后，新建的红树湾南站和车公庙站亦是跨月台转车站，其中红树湾南站为9号线与11号线的转乘站，而车公庙站中香蜜湖路下的月台则是7号线与9号线的转乘站。
成都.成都地铁运营的成都地铁2号线和国铁成灌铁路于犀浦站同台换乘。这是中国大陆首个城市轨道交通与国家铁路同台换乘的案例。同时，成都地铁2号线