张的立陶宛大公国吞并。1500年，诺夫哥罗德-谢韦尔斯基王公瓦西里·伊万诺维奇·舍米亚契奇携封地归顺莫斯科大公伊凡三世，使该城重归俄国人所有。但在留里克王朝绝嗣后的混乱时期（俄国历史上着名的空位时期），该城再度被波兰（当时与立陶宛组成王朝联合）占领。罗曼诺夫王朝建立初期，因国力低迷也没能夺回该城。直到沙皇阿列克谢·米哈伊洛维奇在位时期，俄国在俄波战争中获胜，才最终收复了诺夫哥罗德-谢韦尔斯基（同时夺取了第聂伯河左岸乌克兰）。