国民政令授予蒋及何、吴敬恒、戴季陶、张伯苓、胡适等7,278人胜利勋章，方先觉、端木杰、刘膺古等1,822人忠勤勋章，肖勃、宋锷、王可襄等12人云麾勋章。10月14日，何赴徐州、郑州视察，次日在郑州召集军政长官会议后，乘机经开封返回南京。12月20日，美国总统特使马歇尔到上海飞抵南京，蒋派何赴上海迎接。
第二次国共内战.1946年4月，何任重庆行辕主任。4月23日，国民政府令：军事委员会委员长重庆行营予以恢复设置，原设成都行辕撤销，所有业务归併重庆行营办理，特派何应钦为行营主任，未