完整的修改流程，只能作为过渡用，被称为95暂纲。杜正胜部长同时请周梁楷教授接下历史科召集人，继续进行课纲修定。由周梁楷等人编定的高中课纲，于2008年（民国97年）通过，原预计于2009年（98学年度）开始施行，又称98课纲。2007年，于教育部长杜正胜时期，委託台湾历史学会以《海洋教育与教科书用词检核计画》为名对教科书不当用词进行检核，而其检核对象含括国小、国中及高中各版本教科书，之后该学会提出报告建议应该修改与中国相关字词，教育部随即将该份计画以行政命令函转各教科书出版社参考，如「国父」得改为「先生