·内隆德（），她是数学家的妹妹。1912年8月1日，二人在斯劳厄尔瑟市政大厅举行结婚仪式。玻尔于婚前退出丹麦教会，他弟弟哈拉尔德也在结婚前离开教会。尼尔斯和玛格丽特伉俪情深。二人共育有6个儿子。长子克里斯蒂安1934年死于船难，幼子哈拉尔德因脑膜炎早夭。奥格继承玻尔的衣钵研究物理，并获得了1975年的诺贝尔物理学奖。汉斯、埃里克与欧内斯特则分别成为内科医生、化学工程师及律师。欧内斯特还像他的叔叔那样代表丹麦参加1948年伦敦奥运会的草地曲棍球项目的比赛。
二战前的工作.Sectio