握立法院的控制权。国民党在选后进行一连串的党务改造并和过去李登辉独台和本土化路线切割，逐渐走向蓝绿两大政治势力的竞逐局面。这也是迄今唯一一次当选者得票数未过半的总统选举。
政治背景.时任中华民国总统的李登辉于1996年首次总统直选成功连任后，动念再进行政治改革。在第三届立法委员选举中首次联手缔造三党不过半局面的民进党与新党开始合流，民进党主席施明德出面和新党领袖喝「大和解咖啡」，达成在立法院及国民大会中联手合作的共识。在立法院长选举中民进党与新党搭档竞选立法院长，但是原先被看好