1648年，清军攻陷同安县，陈永华的父亲陈鼎被清军所迫而自杀，陈永华便投靠郑成功。郑成功聘他为其世子郑经的教师，但陈永华没有接受郑成功授与的官位。
郑经时期.1662年六月，郑成功逝世，这时在台湾的黄昭拥立郑成功之弟郑袭代理延平王和招讨大将军。陈永华、冯钖范等拥立郑经，郑经就带着陈永华一同进攻台湾，击败黄昭的军队，结束这场内斗。郑经继位延平王，并且任命陈永华为谘议参军。郑经于1663年回到厦门后，发现郑泰之前和黄昭有私下联系，对他产生疑心，想要逮捕郑泰。陈永华向郑经献策，要郑