津氏打败的伊东氏，因伊东祐兵早就成为丰臣秀吉的家臣，并曾参与山崎之战等战役，顺利回归旧领，拥有日向饫肥3万6千石的领地。
影响.丰臣秀吉将九州平定以后，巩固了丰臣的威权统治，更获得了地利与外国通商，更展开大规模的检地，在肥后的佐佐成政亦进行检地，但是遭到部份国人反对，引发肥后国人一揆。佐佐成政被处死后，北肥后归加藤清正管辖，南肥后归小西行长、相良赖房管辖，但仍爆发了天草国人一揆，最后被小西行长跟加藤清正合力消灭，而丰前国也有城井镇房跟野中镇兼等势力拒绝接受黑田家统治的反抗动作，最后