大友贞顺（近江次郎）等勤王势力后，尊氏在进军京都的途中获得了光严上皇的院宣，西国的武士纷纷投到尊氏的麾下。此后在5月25日凑川之战中击破新田义贞和楠木正成，6月再次攻佔京都。足利尊氏试图与逃往比叡山的后醍醐天皇进行谈判，最终后醍醐天皇于11月2日将三神器交还京都，由光严上皇的弟弟光明天皇继承皇位。此后在11月7日，足利尊氏制定了施政的基本方针建武式目十七条，在京都建立新的武家政权。足利尊氏与镰仓幕府建立者源赖朝一样，都被任命为权大纳言，自称「镰仓殿」。另一方面，后醍醐天皇于12月逃往吉野（今奈良县吉野郡