年底遭中国国民党以违反党纪参选为由开除党籍，后来2005年恢复党籍。林洋港在全台县市只在南投县以46.5%的选票居首。林洋港从此淡出政坛，搬到台中，深居简出，不过问政坛事。
逝世.2013年3月下旬，林洋港因肠梗阻而送往国军台中总医院，但情况未见好转，4月13日晚上，院方发出病危通知，家属决定放弃侵入性治疗，拔管后接回大坑家中，11时31分在家中安祥辞世，享寿85岁，同年5月15日举行告别式，荣获总统褒扬令及国旗、党旗覆棺荣誉，葬于南投草屯佳佳花园公墓。