与积利道行军总管郭待封，毕列道行军总管刘仁愿，海谷道行军总管金待问，同受辽东道行军大总管兼安抚大使李世勣指挥，次年正月，李世勣统领诸路大军会于新城，并占领作为基地，随后分派诸道总管出击高句丽各地。至干封三年（668年）九月，高句丽诸城池皆为唐军攻陷，都城平壤被包围，宝藏王和莫离支渊男产投降，渊男建被俘虏，高句丽灭亡。独孤卿云最后官至右威卫大将军、上柱国，汝阳郡开国公。死后追赠益州大都督。