但因后续争议发言、「一中同表」主张、海崃两岸立场和社会支持度下滑，被不少主流国民党员抵制。最后国民党在2015年10月17日召开全国代表大会临时会议以举手表决废止提名，成为首位通过党内初选后、却被撤销提名的参选人。在这之后，洪秀柱参与国民党于2016年的主席补选，过程中出现本土派与非本土派路线争论，最后以五成六的得票率当选为国民党史上首位正任及通过党员直选的女性党主席。2017年4月9日宣佈参与国民党主席选举竞选连任，但最终以第二高票落选，成为首位竞选连任失利的正任党主席。
早年