政府依《促进产业升级条例》的规定，于此工业区内设置专用港口，配合和平工业区在各种物料之进出口之所需，提供工业区内各厂商使用。1997年6月4日，行政院同意和平港港区范围划定。2004年3月31日，行政院函指定和平港为工业专用港。4月27日，经济部、交通部会衔公告，指定和平港专供和平工业区内厂商原物料及成品输出入之用及准许中华民国船舶及外国通商船舶出入。为配合营业需求，经与工业局协议后，乃由台湾水泥公司筹组和平港公司，与工业局和平港管理小组合作，接手后续的港口投资兴建事宜，整个港区的开发范围达到159