992年7月，任中共长沙市委常委、浏阳县（市）委书记。1994年9月，梅克保任中共郴州地委书记。1995年4月，任中共郴州市委书记（1993年3月—1995年12月，在中南工业大学工商管理系管理工程专业学习，获工学硕士学位）。1999年2月，任中共衡阳市委书记。2001年8月，任中共长沙市委书记。2001年11月，任中共湖南省委常委、长沙市委书记（1999年9月—2002年6月，在中南大学工商管理学院管理科学与工程专业学习，获管理学博士学位），晋升副部级。2006年11月，升任中共湖南省委副书记﻿。