过去数十年香港不少地区出土过新石器时代的文物，其中大埔区更发现旧石器时代文物，所以深水埗也可能在新石器时代已经有人类定居和活动。随着李郑屋汉墓的出土，可以确定深水埗地区起码于东汉时代就有人类定居。据舒懋官主编的新安县志记载，清代嘉庆年间，九龙半岛的深水埗区内已有「深水莆」（亦作「深水埔」，亦即现今的深水埗）、「长沙湾」等村落。1898年英国政府与满清政府在北京签订《展拓香港界址专条》租借新界，港英政府在取得界限街以北至深圳河的土地，其后1930年代将界限街以北的深水埗、长沙湾、荔枝角及九龙塘一带归入九龙