子生殖，形成二倍体配子。再经过减数分裂形成新的单倍体变形虫，重回无性生殖週期。有些细胞则会组成子实体，生产并释放单倍体孢子。孢子外壳破裂放出单一细胞，完成一次生命週期。
黏菌的性别决定.黏菌的配子也叫做性细胞，其性别决定于3个基因座（locus）上的基因，分别是matA、matB与matC。因此每一株黏菌皆可形成8种性别的性细胞。此外这3个基因座上的基因皆有多种变化，目前已知matA与matB各有13种变型，而matC则拥有3种变型。由这些已知的变化，可以排列组合出500种以上