辖区分别改设绥远、热河、察哈尔三个特别区，为将来改省做准备。特别区下设道，道下辖县，道尹掌管民政，兼理蒙旗事务。特别区的长官都统由袁世凯任命，执掌区内军政大权。1914年起，北洋政府出台一系列规定，开始放垦蒙地，设置设治局并渐渐升为县。1912年春，哲里木盟科尔沁右翼前旗札萨克郡王乌泰派遣使节前往库伦，表示响应独立，希望获得援助。哲布尊丹巴任命乌泰为进攻中华民国第一路军总司令。1912年8月20日，乌泰发表《东蒙古独立宣言》，出兵进攻洮南、开通、突泉等地。科尔沁右翼后旗拉喜敏珠尔跟随乌泰发兵，也宣布独立。