本地教徒俗称其为“三太子囊”。此后东大寺进入鼎盛时期，有僧人1000多人，经堂3座，佛堂99间（甘肃的拉卜楞寺也只有佛堂101间），僧宅545间，设有哲学院、续部上院、续部下院、医学院共四大学院，讲习五部大论，经院教育制度完备。僧人多赴拉萨、拉卜楞寺、佑宁寺等处深造。该寺有土地200余亩，森林几十处，牦牛382头，羊400余只，骡马41匹，水磨4盘、油坊3处，房屋63间。该寺规模仅次于拉卜楞寺，成为华锐（天祝藏族自治县的古称）藏区的藏传佛教圣地。清朝同治年间，该寺与今天祝藏族自治县境内其他寺院同遭到战火