极任事，加上警界基层力挺，虽然经历政党轮替仍获重用。2017年9月，因世大运开幕式遭反年改团体抗争干扰，行政院针对维安缺失究责，陈国恩调任国家安全局简任副局长，结束警职生涯。
海巡署署长.2019年2月19日，陈国恩接任海洋委员会常务副主委兼任海巡署署长，成立「海巡署长室 Coast Guard」脸书专页，倾听海巡同仁心声，并常以诙谐风趣的方式行销海巡、海洋保育议题，受到网友欢迎。上任初期成功营救「稳鹏号海上喋血案」，任内更破获国内缉毒史上最大走私毒品案，以及历年最大宗走私