新进入党的中央政治局，1986年在越共六大上当选越共中央总书记，阮文灵在这次大会上提出了革新开放政策，这也被越南官方认为是越南“革新开放”的开始。1990年9月，阮文灵和部长会议主席杜梅访问中华人民共和国四川省成都，与中共中央总书记江泽民和中国国务院总理李鹏就中越关系和柬埔寨问题进行会谈。1991年阮文灵在越共七大上退休，担任越共中央顾问。1998年4月27日，阮文灵在胡志明市病逝，越共中央、国会、国家主席、政府、祖国战线和中央军委当晚联名发表的一项特别公报说，阮文灵在70年的革命生涯中“为越南党和民族