提名时，塔夫脱的支持者宣称罗斯福当年不起诉之举失当，罗斯福非常愤怒，指责塔夫脱等到三年半后面对挑战时旧事重提，对当年他也支持的决定出尔反尔。
平肖－巴林杰之争.罗斯福热心环保，他任命的内政部长詹姆斯·鲁道夫·加菲尔德（，）和国家森林局局长吉福德·平肖（）等官员对此有志一同。塔夫脱认同环保需要，但觉得应由立法而非行政命令推动。他没有保留俄亥俄州同乡加菲尔德的部长职位，改为任命来自西海岸的前西雅图市长理查德·巴林杰（）。罗斯福以为塔夫脱之前承诺保留加菲尔德的职位，对内政部长换人颇感意外