除了文化外，日本和瑞典的交流也涵盖学术层面。1971年在斯德哥尔摩创立的瑞日基金（）透过年度发放的奖学金、鼓励日本人赴瑞学习或从事研究，同时也在瑞典传播日本相关资讯、安排会议或研讨活动。1992年时，亦在瑞典政府、日瑞两国企业的经费资助下，成立于斯德哥尔摩经济学院内，旨在替针对日瑞两国间互动、乃至于东亚－欧洲关系等议题所开设的研究计画、教育计画提供运作平台。斯德哥尔摩、哥特堡和隆德等地的瑞典大学也有开设日语学习班，并与日本的大学共办交换学生计画。日本方面也就其与瑞典间之学术交流进行了数项企画。2001年