宣教士深入原住民部落佈教，为了使原住民能更了解基督信仰，宣教士开始把宗教教育制度化。1636年5月26日，台湾史上第一所学校于新港社成立，课程除基督教教义外，并传授以拉丁字母读写原住民语言。新港办学成功后，很快也推行至西拉雅语区（约今新市区到嘉义市）及虎尾壠语区（约今虎尾镇至二林镇）等地的部落。学校依招收对象可分成儿童、成年男子、及女子三种，惟荷兰人为提升男性社会地位，只让男性接受识字教育。学校的教材有教义问答、祈祷文、讲道文等等，为求原住民容易理解，教师多以本地语言教学。然而1648年后，大员当局改推