熙四十二年（1703年），康熙帝御赐寺名“瑞应寺”，并钦赐一块题有满文、蒙古文、藏文、汉文合一的“瑞应寺”蓝底金字、金龙镶边的竖匾。道光三年（1823年），瑞应寺在给道光帝的奏折中称：“瑞应寺僧人弟子多达三千，属民八百户。”道光四年（1824年），道光帝赐瑞应寺扎萨克喇嘛（第四世察罕殿齐活佛）一枚行政印鉴，上刻有“土默特扎萨克达喇嘛察罕殿齐唿图克图之印”。同时，土默特左翼旗王爷把瑞应寺附近的17个村屯的旗民以及土地、瑞应寺附近的24座寺庙均划归瑞应寺管辖。由此，瑞应寺集行政、司法、宗教权力于一体，“政教