以会晤并指导，如此维持了五至六年。随后，圣安东尼退隐到尼罗河与红海间的克津山（Mt. Colzim）旷野，在那里度过他最后的45年半独修生活。虽然圣安东尼重视独修，然而他也关怀其他基督徒的生命，因此他时常往来于自己的小室与庇斯比尔山之间。罗马皇帝马克西米努斯于311年兴起教难期间，圣安东尼两度前往亚历山大城，愿与当时受到迫害的基督徒同殉道。他走访并安慰那些被囚禁的基督徒。当总督看到圣安东尼不顾生死地宣扬他的信仰时，命令圣安东尼离开亚历山大城，甚至要加诸刑罚，然而圣安东尼仍坚定地与总督辩论，最终此事平息，