上两处位于海外的天文观测设施所组成，总部位于东京都三鹰市。
历史.国立天文台的组织前身为1888年成立、隶属于东京大学的「东京天文台」，其历史最早可以追溯到江户时代后期，幕府天文方设置的「浅草天文台」。1988年，东京天文台与文部省纬度观测所、名古屋大学大气研究所第三部门等3个研究机构，整併为国立天文台，为大学共同利用机关（日本一种以提供高等院校学术研究为目的的公设机构），直属于文部科学省管辖（2001年前为文部省）。2004年，日本的公立研究机构进行组织改造，各大学共同利用机