但自1683年清治时期开始至1874年的牡丹社事件约二百年的期间里，清廷并未对雄镇北门砲台有较积极的治理经营，这样的情形一直持续到牡丹社事件之后才有转变。
牡丹社事件.同治十三年（1874年）日军以琉球漂流难民被杀事件为借口登陆恆春，即「牡丹社事件」，于是清廷命沈葆桢来台办理海防事务。光绪元年（1875年），沈葆桢派淮军提督唐定奎和副将王福禄督造，并聘法国技师设计（另一说为英籍技师），同时打造雄镇北门砲台、旗后砲台以扼守打狗港，于光绪二年（1876年）年完工。完工后的打狗港区共