高地事件后数年，弗里曼被G-Man唤醒，发现自己身处一班前往17号城的火车上。官方对于这段时间间隔有两种说法，一说是10年，另一说是将近20年。在戈登沉睡的这段时间内，另一外星势力联合军发现了在黑山事件中被开启的地球和Xen星球之间的时空通道，因而借由Xen来到了地球。由于拥有先进的科技，联合军在一场7小时的战争中就将人类抵抗全部瓦解。一些人选择和联合军合作，成为了他们管理人类的代理人，比如前黑山主管华莱士·布林（Wallace Breen）博士，成为了17号城市的主管。剩下的人类则被联合军管制起来，穿着统