防空武器或是超重酬载都可能损害机体结构，对妥善率造成不利影响。因此1941年中期，Fw 200组员受命禁止攻击商船与冲突以保持飞机数。同盟国军为了对抗Fw200，也开始为船团提供应急性的制空武器；1941年8月，第一架Fw 200被弹射飞机商船起飞的飓风战斗机与皇家海军护卫航空母舰的舰载美制F4F战斗机所击落。1942年8月，一架Fw 200C-3在经过冰岛时，被P-40C和P-38F击落，成为第一架被美国陆军航空队击落的德国飞机。除了比斯开湾航线，同盟国海运至苏联的北冰洋航线也有Fw200的身影，它们