公署驻晋江县（今晋江市）。辖晋江、惠安、南安、安溪、永春、同安、莆田、仙游、金门10县。1950年，第五专区改名泉州专区，其后又改名晋江专区。同年，原属永安专区的德化县划入晋江专区；析晋江县城关设县级泉州市。1956年，原闽侯专区所属永泰、福清、平潭3县及永安专区所属大田县划入晋江专区。辖1市、14县。1958年，将同安县划归厦门市。1959年，将永泰、福清、平潭3县划归闽侯专区。晋江专区辖1市、10县。1963年，将大田县划归三明专区。1970年，将莆田、仙游2县划归闽侯专区；原属厦门市的