47年5月，任冀察热辽军区副司令员，同年冬任东满（吉林）军区副司令员，次年夏出任辽宁军区司令员，组织地方部队配合辽沈战役。辽沈战役之后，陈任东北军区参谋长。1949年5月，陈被任命为江西军区司令员。
中华人民共和国成立后.中华人民共和国成立后，陈奇涵主持江西的剿匪工作。1952年，当选为江西省各界人民代表会议协商委员会（即中国人民政治协商会议江西省委员会前身）主席。1953年，陈调北京工作，历任中国人民解放军军事审判庭庭长、军事法院院长。1955年，陈奇涵被授予上将军衔，获一级八一