合署搬迁后用途未能确定故未有包括在计划内。慈云山和黄埔花园地区的自动行人系统，分别以改善该区行人通道及以观塘线延线替代。港铁于2008年获政府批准进行详细设计，原计划大围至红磡段和观塘线延线在2015年启用，而过海段因需要迁就湾仔填海计划第二期及中环湾仔绕道的规划及兴建，到2019年才落成。一年后，港铁公佈修订方案，加入显径站和修改土瓜湾一带的走线，使土瓜湾站（今宋皇台站）及马头围站（今土瓜湾站）更贴近已发展区服务更多乘客。近年建材价格上升使沙中线的建造成本大增，各地区因铁路通风楼、走线及列车停放处