湾之后在国防医学院任教，教授解剖学。1979年9月8日，党外运动的《美丽岛杂志》在台北市中泰宾馆举行创刊酒会，郁慕明率领《疾风》杂志社成员在外举行「声讨国贼陈婉真行动大会」，引发冲突。1980年，获得中华民国十大杰出青年。1989年，参加新国民党连线的创立。1989年，当选立法委员。1993年，因反对李登辉的两岸政策，脱离中国国民党，参与新党的创立。1997年3月22日，郁慕明与新党全委会召集人陈癸淼公开记者会指出朱高正曾为国民党的情报特务，称他在德国唸书时，就拿国安局的经费替他们收集党