神道及大金门等，仍有相当的规模。明孝陵是全国重点文物保护单位，被列入《世界遗产名录》，周边附葬的5座明代功臣墓也被划入世界遗产保护范围。南京是明代郑和下西洋的出发港，有多处与郑和以及下西洋有关的历史遗迹。建造郑和宝船的龙江宝船厂在河西龙江，现存作塘（船坞）遗址。下关天妃宫是明成祖在郑和第一次下西洋后敕建的奉祀妈祖的庙宇，2005年重建，现存明成祖撰文的《天妃宫碑》。紧邻天妃宫的静海寺也是明成祖为下西洋敕建的，清代第一次鸦片战争时为《南京条约》议约地，1980年代以来在清代偏殿基础上复建并多次扩建。郑和在