印度政府在阿鲁纳恰尔邦设有25个县级行政区划。阿鲁纳恰尔邦的大部分土地为中印争议领土，其中的南赛县、长朗县、特拉普县、龙鼎县4县无领土争议；东桑朗县、下迪邦山谷县、洛西特县、安娇县4县的部分土地及其余17县的全境为中国方面所主张的领土。中国方面称之为藏南地区，并认为这些地区分别属于错那县、隆子县、墨脱县、察隅县4县。