1954年6月，台湾省政府改组，严家淦为台湾省政府主席兼保安司令，任内致力推动台湾财经发展，并主持省府迁往南投，仿照伦敦新市镇造镇模式，开辟建设中兴新村，顺利完成台湾省政府的疏迁工作。
回任财政部.1958年3月，财政部部长徐柏园因故去职，由严家淦回任，此后严家淦在任5年9个月，连同之前4年2个月的任期，担任财长长达约10年之久。在第2次任期当中推动更大规模的财政改革，具体形成了「十九点财政改革措施」，以及影响深远的奖励投资条例。
行政院长.1963年1