893至1896年返回海军学院任教。接下来他短暂执掌惠灵号巡逻舰，然后成为忒提斯号蒸汽捕鲸船的司令官，随船在加利福尼亚州近海开展斟探作业。1897年，塞伯里升任中校。美西战争爆发后，他再度统领惠灵号在太平洋巡逻直至战争结束，具体监控范围包括阿拉斯加和阿留申群岛海域，远离加勒比和太平洋主战场，所以没有经历过重要战事。战争结束后，塞伯里转至第12灯塔区担任督察。
美属萨摩亚.1901年10月9日，塞伯里晋升上校，同时受命前往美属萨摩亚接掌阿巴伦达号煤船，并担任美国海军图图伊拉基地司令官