学思源堂西南的钟亭中，并以四根弓形梁柱做支架悬挂于两米高的台基之上，每逢南开大学毕业典礼时便呜钟纪念。1937年7月28日，日军进攻天津，驻扎在海光寺的日军将炮口直接对准南开大学。7月30日，海光寺大钟被日军劫掠，战后，张伯苓校长曾致函中国驻日代表团团长商震将军在日本的掠夺物品集中地搜寻这座大钟，但终究下落不明。1997年7月28日，为纪念南开大学被侵华日军轰炸60周年，南开大学校方重铸了一口重达3000多公斤，高1.937米的校钟。