武史也因此引咎辞职。1999年，冈田武史接受刚降入日乙联赛的札幌冈萨多的邀请担任球队主教练。札幌冈萨多提出的赛季目标是在一个赛季内升回日职，但球队最终只以第五名完成1999年赛季。2000年，在收进播户龙二等一批强援后，冈田武史终于率领球队力压浦和红钻，以日乙联赛冠军的成绩升级。2001年赛季，冈田武史率领球队保级成功后辞职。2002年，他接受NHK的邀请，担任2002年世界杯的解说嘉宾。2003年，冈田武史开始执教日职联赛球队横滨水手，在他执教的前两个赛季，横滨水手出色，两度获得日职联赛冠军。