辈自余姚迁至归安菱湖。祖父孙金鼎、父孙赐书皆为诸生。干隆二十五年（1760年），孙辰东参加浙江乡试中举。干隆三十七年（1772年）中式一甲第二名进士，授翰林院编修。奉命参纂《四库全书》。干隆四十五年（1780年），任顺天乡试同考官。同年九月初三，因疾卒于贡院，年仅四十五。归葬乌程逸村。有印章曰「其于人也，为寡发，为广颡，为多白眼」，自道其形状。