市位于南欧的伊比利亚半岛南部安达卢西亚自治区大西洋沿岸（俗称阳光海岸）。圣费尔南多市地处加的斯湾内部的上，通过连岛沙洲与加的斯相连。
自然.圣费尔南多市区近四分之三位于加的斯湾自然公园内。这个部分包括大片河流湿地、沼泽和盐田；在涨潮期间，一些区域会被淹没。自然公园内成立有若干个自然保护区。地中海与大西洋是决定这片湿地自然生态特征的关键。在沿海的泥淖地区，螺、螃蟹、蛤蜊和虾等物种广泛存在；在盐滩地区，有所谓的沼鱼、鳎、欧洲鲈和金头鲷等鱼类。值得一提的是，食盐的开采一直是该市经济的