位教宗都撤职，另立一位新教宗，然而此次会议法义的两位教宗都没有出席，各国仍自拥各自认定的教宗，因此比萨会议后形成了有三个教宗的局面。一直到公元1415年的康士坦斯大公会议，才正式取消了三个教宗的职位，消除了教会的分裂，也把教宗的权力限制在立法团体——即大公会议，但仍无法解决教廷腐败的问题。在公元1517年，在马丁路德的宗教改革中，因为马丁路德在数次与教廷的辩论中，始终坚持圣经权威高过主教权威的论点，持此观点的基督新教便由大公教会分裂出来，新教也称为、更正教、抗议宗或广泛称为基督教会。原来的大公教会，一般也称