在纳粹党掌权后，感觉他的安全受到威胁。所以他后来在1933年离开德国，前往英国。柴恩后来在剑桥大学从事研究，并在弗雷德里克·霍普金斯教授的指导下研究磷脂。他在1935年进入牛津大学担任病理学的教师，在这个时期，他的研究范围包括肿瘤的新陈代谢、蛇毒、生物化学技术与溶菌酶。柴恩在1939年与霍华德·弗洛里合作研究由微生物产生的天然抗菌物质，后来他们重新检视亚历山大·弗莱明的研究，而弗莱明曾在1929年发现青霉素。柴恩与弗洛里后来发现青霉素的医疗用途与化学组成。柴恩也研究出如何分离与浓缩青霉素的方法，他所