属于的领地，田边城也因一国一城令而遭到拆除，但京极高知后来将整个丹后国分为三块分别传给三个儿子，其中三男分到此地，设立了，因此也重建了田边城。在江户时代结束前，加佐郡的大部分地区皆为丹后田边藩之领地，仅西部小部分区域隶属和幕府直属领。1869年实施版籍奉还后，丹后田边藩由于与同名之故，改使用田边城的别名为舞鹤藩，1871年实施废藩置县后加佐郡改隶属新设立的舞鹤县和宫津县，但同年立刻又被併入丰冈县，直到1876年丰冈县被废除才被併入京都府。1879年实施时，正式的设置了近代的行政区划「加佐郡」，郡役所