坡自治邦政府采取行动，逮捕了新加坡的多名马共高层。新马合併后，马来西亚联邦政府与新加坡自治邦政府在经济等多项政策上很快就产生严重的分歧。1964年，新加坡发生种族骚乱，李光耀政府籍此指责马来西亚首相东姑阿都拉曼与联邦政府试图推行「种族沙文主义」，使马来人在联邦内享有特殊的高等待遇，并在幕后煽动在新加坡的马来人反对新加坡自治邦政府。而联邦政府高层则对此十分反感，也因随后双方多次协商未果，导致新加坡最终在1965年被驱逐出马来西亚联邦，并于8月9日被迫宣布独立，李光耀为此落泪。新加坡独立后，李光耀积极的