战后因此被判处「公职追放」5年。藤原在漩涡、云、气象光学等广泛的气象领域有独创性的研究，同时也致力提拔后进。他还曾回故乡的「诹访湖」研究结冰现象。藤原晚年因专注写作及启发后进，而被人称为「天气博士」。他不但为日语发明许多气象用语，也是日本第一个研究滑翔机的科学家。作家、数学家是他的外甥。