制为县下支厅，而台东直隶州遭降级成与西部县等同的支厅，预计设立台南县台东支厅。但总督府实际上未统治中南东部，8月改为派出性质的台南民政支部台东出张所。1896年4月，总督府正式统治东部，才正式设立台南县台东支厅。1897年6月台东支厅自台南县分出升格为台东厅，并依当初台东直隶州预计划设的三个行政区，于厅下设卑南（今台东县不含池上关山）、水尾（今花莲县寿丰乡以南，以及台东县池上关山）、奇莱（今花莲县寿丰乡以北）等三个辨务署。1898年6月，废辨务署；8月设派出性质的花莲港出张所，辖今花莲县瑞穗乡以北。1900