样，许多在线资源都致力于识别和分类蛋白质模体（请参阅文章结尾处的列表）。
蛋白质家族的演化.根据目前的共识，蛋白质家族以两种方式产生。 首先，将亲本物种分离为两个遗传分离的后代物种可以使基因/蛋白质独立地积累这两个谱系中的变异（突变）。 这产生了直系同源蛋白家族，通常具有保守的序列基序。 其次，基因重复可以产生基因的第二个拷贝（称为旁系同源物）。 因为原本的基因仍然能够执行其功能，所以复制的基因可以自由发散并可以获取新功能（通过随机突变）。某些基因/蛋白质家族，特别是在真核生物中，