内士兵士气大溃。因此，小西行景决定以自身性命交换城兵人民的安全。十月廿三日，小西行景向加藤清正开城投降并自刃身亡。加藤清正攻破宇土城后论功行赏，获得小西行长的领地，成为肥后五十二万石的大名。清正将宇土城当作自己的隐居城，修改了宇土城的主曲轮。但由于江户幕府于日本在元和元年（1615年）6月13日所发佈的一国一城令，由大名所居住作为政厅所在的城只能保留一个，其余的城必须全部废除。而在肥后国，除了熊本城外，宇土城和八代城等名城亦无一幸免。
构造.因一併观看中世和近世宇土城，就像仙鹤