北里是许多重要机构的创始人，包括私立（现・东京大学医科学研究所）、（现・北里大学）、私立（现・）。此外也是北里大学校祖、庆应义塾大学医学科（现・庆应义塾大学医学部）创始人兼初代科长、初代院长、日本医师会创始人兼初代会长。
生平.嘉永五年十二月二十日（1853年1月29日），北里柴三郎出生肥后国北里村（今熊本县阿苏郡小国町）世代相传的庄园的家中。庆应二年（1866年）北里柴三郎来到熊本，进入田中司马（儒者、医学）的补习班。明治二年（1869年）12月，北里柴三郎进入熊本藩的藩校时习馆