伤寒、中风、风温、温病、湿病、暑病等不同证候。而其中的〈天行温病论〉中认为温病都由“异气”所致，但由于兼受四时的六淫邪气不同而病名有所不同，并认为温病的治法不同于伤寒，把温毒五大症与四时、五行、经络脏腑理论相结合辨证论治，这一理论影响到了后世的温病学派。朱肱着作《南阳活人书》将《伤寒论》中的三阴三阳与《黄帝内经》的足之六经相关联，以经脉的循行及生理特征解释三阴三阳病证的发生与传变过程；强调阴阳表里虚实是辨证伤寒的基础，尤其以阴阳为先；主张脉证合参；还以方类证，提出遣方用药需要随证灵活加减。成无己着作《注解伤