向佛罗里达州围绕佛罗里达半岛至博卡格兰德（）之间、包括佛罗里达礁岛群和干龟群岛的所有地区发布了飓风警告，佛罗里达市向北至萨凡纳之间地区还收到了热带风暴警告。此外，迈亚密国际机场在艾琳途经该州期间停飞了大部分航班州长杰布·布什在气旋登陆前一天宣布全州进入紧急状态，并下令启用佛罗里达州国民警卫队协助救灾工作。艾琳接下来从佛罗里达州近海向北移动，起初的预测认为风暴会沿南卡罗莱纳州沿海登陆，美国国家飓风中心为此向该州从艾迪斯托海滩到北卡罗莱纳州哈特拉斯角（）之间地区发布了飓风警告。南卡罗莱纳州部分地区发布了自愿