思想，学习马克思主义”，毛在回信认定了冯“过去犯过错误”，并告诫其“总以採取老实态度爲宜”，冯遂向清华大学辞去院长和系主任职务，并与1950年一段时间内被派往农村参加土改运动工作。1952年，新政权进行高校院系调整，清华大学改为理工科院校，冯友兰被调至北京大学哲学系。中华人民共和国成立后，冯多次检讨自己历史问题，在国内外数次公开表示新理学是“与马列主义毛泽东思想为敌”，是“反人民”，是“要人一心一意拥护当时半封建半殖民地的社会和国民党政权”，“我过去的着作都是没有价值的”，并“对40年代所写的几本书忏悔”。