180年（治承四年）以仁王举兵的时候，以仁王出奔园城寺，平家怀疑圆惠法亲王与以仁王是一党，将其逮捕，并终止了四天王寺检校的职务。此后随伺候法皇身边。1184年，源义仲攻击法住寺殿时率兵抵抗，战败逃跑，在华山寺附近被射杀。身为皇族的圆惠法亲王以及天台座主明云的被杀，令九条兼实感叹道：「如此高贵的僧人遭到如此的劫难，真是闻所未闻。」（《玉叶》）