最终使僖宗得以胜出李煴，重返长安。刘崇望因功为翰林学士，累迁户部侍郎、承旨，转兵部侍郎，任翰林学士四年之久。又知制诰。三年（887年）十二月，僖宗命刘崇望撰德政碑以赐宣武军节度使朱全忠。
唐昭宗年间.唐僖宗死后，弟唐昭宗继位，于龙纪元年（889年）正月任刘崇望为中书侍郎，守本官，授同中书门下平章事，拜为宰相。刘崇望在宰相任上累兼兵部、吏部尚书。大顺元年（890年）四月，同僚宰相张濬和孔纬倡议讨伐李克用，刘崇望和另一宰相杜让能反对，但徒劳。李克用击败朝廷军队迫使昭宗罢免张濬、孔纬后，