障碍在官方ICD-9及ICD-10诊断中有着各专家共识的名称。诊断必须是跨学科的评估，以评定4个主要的特征。一般来说，医生会检查生长迟缓及胎儿酒精综合症的面部特征。而合资格的医生会检查中枢神经系统的结构性异常或神经问题，中枢神经系统的破坏会以心理评估、言语治疗及职业治疗来评定的。生前酒精暴露风险亦可以由合资格的医生、心理学家、社工或健康顾问来评定。这些专家可以互相配合来评定及解释数据，并且定立一个综合、跨学科的诊断报告。以下4个标准必须同时满足才能确定是胎儿酒精综合症：
鑑别诊断