府于2013年1月1日接管辖区内国立高级中等学校（华侨中学仍属国立），至于原高雄县、台南市、台中市辖区内国立高级中等学校，教育部原规划于2014年8月1日改隶，台中市政府于2017年元旦改隶，桃园市政府于2018年1月1日完成改隶，目前仅台南市政府与高雄市政府仍未接受。另学校改隶后将造成重复校名问题，例如台中市有国立大里高级中学与台中市立大里高级中学；新北市的国立三重高级中学与新北市立三重高级中学等。国立三重高中经过校务会议投票，已经更名为新北市立新北高级中学；国立大里高中则重启2000年因附属高中经费