月18日立法院院会三读通过删除《法院组织法》第63条之1（特别侦查组设立法源），2017年1月1日将特侦组正式废除。废除后的新增配套措施，包括各地方检察署可经由台湾高等检察署检察长或检察总长指定，跨出辖区侦办。
组织.特侦组置检察官6人以上，15人以下，由最高法院检察署检察总长指定一人为主任，该组之检察官、检察事务官及其他人员，由检察总长自各级法院检察署中调至最高法院检察署办事。根据中华民国《法院组织法》第63-1条规定，最高法院检察署设特别侦查组，职司下列案件：一、涉及