元王死后，三司官的制度被保留了下来。尚元王在位期间，琉球与明朝保持良好的外交关系，多次送还漂流至琉球境内的中国船民。1565年（嘉靖44年），倭寇过境琉球，在北山地区为琉将郑都所败。尚元王遣使将被倭寇虏获的中国人口送还明朝。尚元王也曾一度与日本萨摩藩保持良好的关系，然而在1570年至1572年，双方关系出现两次危机。1570年，萨摩岛津贵久的使者雪岑和尚至琉球，要求尚元王向萨摩朝贡，遭琉方拒绝。岛津大怒，煽动奄美大岛酋长发动叛乱，并向奄美派遣军队，给奄美的酋长提供军事上的支持。1571年，尚元率船五