左营区。国防部海军司令部，负责办理海军军事事务的规划、督导及执行。下辖政治作战室、督察室、人事军务处、军事情报处、战备训练处、后勤处、计划处、战斗系统处、主计处等幕僚部门。海军舰艇兵有自己专属的新兵训练中心，全名「海军新兵训练中心」，位于高雄市左营区，而海军陆战队则由海军陆战队新兵训练中心受训，位于台湾省屏东县内埔乡的龙泉营区，是目前中华民国唯一的海军陆战队新训中心。海军陆战队的志愿役军官，如果是军校毕业的，大都毕业于陆军军官学校，少数毕业于海军军官学校。一些海军舰艇兵和海军陆战队成员会分发至海巡署