水区提供了二聚化的区域，使得基序可以像“拉链”一样拉起来。此外，疏水亮氨酸区域对于其结合到DNA是不可或缺的。
结构.亮氨酸拉链结构域的主要特征是七肽重复的"d"位上大部分都是常见氨基酸氨基酸亮氨酸。通过对特定的一些转录因子的序列比对，发现这些转录因子形式都是每七个氨基酸出现一个亮氨酸，于是亮氨酸拉链首次鉴定出来。后来发现这些亮氨酸形成了卷曲螺旋的疏水核心。亮氨酸拉链的每一半都是由每七个位置一个亮氨酸的短α-螺旋组成。标准的每一转3.6个残基的α-螺旋结构在亮氨酸拉链中发生了轻