移交新竹地方法院，尔后由台湾总督府覆审法院（即高等法院）接收，台北帝国大学成立后，昭和2年(1937年)总督府将其档案交予该校文政学部，以作为学术研究之用。1945年，台湾进入中华民国时期，该档案转交至台大法学院，自1947年至1953年由该学院法律系戴炎辉教授命名及主持该文献整理工作。1985年再移交台大图书馆馆特藏组珍藏，而戴炎辉当年进行档案分类研究之影本，则于2005年由家属捐给中研院历史语言研究所，今藏于该所法制史研究室。戴炎辉除了将档案命名为淡新档案外，也将该之文件分为行政、民事与刑事三门；每