其中万华分局辖内有数百家阿公店，拘留所人满为患，最高曾收容近40人，连睡觉都无法翻身；中山分局拘留所甚至曾因收容人数爆满，发生闹房事件。公视报导称，台湾每处理一位偷渡客需花费公帑约十万台币。而採取原船遣返方式，屡发生船员不愿返回大陆之情形，如待船开出基隆港后，即改航至宜兰上岸，或由宜兰航行至他处再跳船上岸。台湾执行单位其后採用集中五十名以上大陆偷渡客之后，统筹一艘渔船遣返，又为防止航行途中为争夺返家航道的斗殴，或改航他处情事，于是将多数人封舱拘禁于船舱后再遣送出海。台湾方面称“行之有年、尚称顺利”。