北划归淡水厅。1787年（干隆52年）平定林爽文起义后，将诸罗县改为嘉义县。1811年（嘉庆16年）增设噶玛兰厅1875年（光绪元年）分北部为台北府，辖宜兰县、基隆厅、淡水县、新竹县；台湾府辖台湾县、嘉义县、凤山县、彰化县、澎湖厅、恆春县、卑南厅、埔里社厅；台湾道共设二府八县五厅。
福建台湾省时期.1885年（光绪11年）朝廷敕命台湾建省，设一道二府八县五厅。1887年（光绪13年）台湾才独立设省，因为与福建省仍有部分行政业务，因此官方正式名称称为福建台湾省，不过一般仍称分治后