军队攻占和屠杀。绍兴和议之后，淮水成为金国和赵宋的边界线。而今扬州市的北部郊县也成为了防御金国军队的前线。姜夔因此写作名篇《扬州慢》。13世纪，大蒙古国攻占了中国全境。元朝时扬州属河南江北等处行中书省。
明清时期的扬州.自明永乐十九年(1421年)明太宗迁都北平后，明清两代将近500年间中国的都城在北京，而农业经济中心在江浙和两湖两广地区，粮、盐的产量占据了全国产量的大多数。因此造成了中国政治中心和经济中心的分割。连接中国政治中心的和经济中心的是两条水路：长江和京杭大运河。扬州