家级自然保护区内有嵴椎动物约占浙江省种类的53%，共27目342种，另有昆虫15目1041种，蝴蝶类约110种。保护区内还栖息着约400多只中国特有珍禽­—黄腹角雉（Tragopan caboti），是国际濒危物种《红皮书》上列名的“濒危物种”，乌岩岭是中国唯一的黄腹角雉保护区和主要繁殖地。
植物.乌岩岭国家级自然保护区地处南北植物交汇区，植物种类繁多，中亚热带常绿阔叶林保存完整。保护区内植物种类约占浙江省植物种类的50%：种子植物158科1863种，蕨类植物45科287种；苔藓