次年与梁起铎、申采浩、金九等人成立了秘密救国组织“”。金弼淳是新民会的核心会员之一。由于他住在西方传教士医院的宿舍，他的家因此成了独立志士的安全聚点。此外，他还对新民会核心成员提供活动资金。1907年8月1日，日本强行解散朝鲜军队，引发大规模的反日义兵运动。义兵与日军展开激烈巷战。受伤的义兵誓死都不愿去当时日本人在汉城开设的“大韩医院”。世福兰斯医院很快被大量伤员占满。由于人手不够，金弼淳动员他的母亲让还没出嫁的妹妹和侄女们出来不分昼夜地护理伤员十多天。她们此后也都投身韩国独立运动。这在当时儒家封建思想