主要保护对象为中元古界、上元古界的标准剖面。该保护区拥有地学资料、自然景观、学术研究等科学研究价值。1959年，在中国地质会议上，蓟州区剖面被确定为中国中、上元古的标准剖面。联合国教科文组织的分支机构地质科学联合会也把蓟州区中上元古界的标准地层作为前寒武纪地质研究的重要保护区之一。1989年，建立了中上元古界地质陈列馆。