天主教朱巴总教区（）是罗马天主教会以南苏丹共和国首都朱巴为中心的一个教省总教区，下辖六个教区。总教区范围包括该国南部和中赤道省大部分地区；2006年时有459,703名教友，十一个堂区和三十八名司铎。现任总主教为，辅理主教为，荣休总主教为。主教座堂为圣德勒撒主教座堂。杰贝勒河宗座监牧区于1927年7月14日设立，1951年4月12日升为宗座代牧区，1961年5月26日易名为朱巴宗座代牧区。1974年12月12日升格为总教区。