皇投水之后也跳水自杀，但被源氏方面的武士救起，送往京都。根据《平家物语》的说法，坛之浦之战后，神玺和神镜都被源氏武士获得，送回京都。而神剑同安德天皇永远沉入了海底。另有传闻称坛之浦之战发生的翌日，安德天皇的遗体被渔夫打捞上岸。坛之浦之战一年后，镰仓幕府的将军源赖朝为了安抚安德天皇的怨灵，建立阿弥陀寺御影堂，阿弥陀寺附近的陵墓被称为阿弥陀寺陵。安德天皇后来被奉为久留米水天宫（福冈县久留米市）的祭神，成为水神、安产之神，与其生母建礼门院一起，被各地的水天宫祭祀。明治时代，阿弥陀寺改为赤间神宫（山口县下关