执政下，使派系力量式微。连国民党大老吴修齐和张文献都语重心长对陈唐山讲：「唐山仔，伫汝执政之下，台南县已经无山派，也无海派，只剩一个唐山派！」高雄市早年以移民者为派系分别，以「澎湖派」、「台南派」及「本地派」三大族群为主。「澎湖派」以首届高雄市长谢挣强为首，「台南派」则有第三届高雄市长陈武璋；到第四届市长选举时国民党提名了「本地派」的陈启川。形成派系轮流惯例。唯第六届市长选举时，国民党因提名「台南派」的陈武璋而非「澎湖派」人选，被视为违反派系轮流惯例而引起「澎湖派」反弹，导致党外势力的杨金虎意外当选市