执委与俄共突厥斯坦委员会委员。1920年9月，伏龙芝被任命为南方面军司令员，击破了弗兰格尔白军对顿巴斯的进攻，成功地强渡锡瓦什湖全歼克里木半岛的白军，这标志着国内战争大规模战斗行动的胜利结束。1920年至1924年任革命军事委员会驻乌克兰特派员指挥乌克兰与克里木的武装部队、乌克兰共产党中央政治局委员、乌克兰人民委员会副主席、乌克兰经济委员会副主席。1924年3月苏联共产党中央任命伏龙芝为苏联革命军事委员会副主席与副陆海军人民委员，以削弱托洛茨基对苏联军队的掌握。同年4月兼任苏联工农红军总参谋长、军事学院