士珍署理内阁总理。此后，皖系结合奉系卷土重来，王士珍内阁被打倒。1918年（民国7年）2月20日，王称病辞任。
晩年生活.1920年（民国9年）12月，王士珍任苏皖赣三省巡閲使，翌年1月初辞任。1922年（民国12年）1月，他被将军府授予“德威将军”。1925年（民国14年）2月，他任善后会议议员、军事整理委员会委员长。晩年王士珍从军政前台退居幕后。他曾以京师治安维持会会长的身分调停北方各派军阀，维护北京治安，推进慈善事业。王士珍的活动为北京免遭战祸贡献很大。1930年（民国