05年8月6日，简钖堦说，台湾统独意识形态已将台湾人民区隔，统独议题早已成为「妖魔式」的对话，统独问题不能再交给政治人物或专家去谈，透过民间的对话才能了解真正问题核心所在。2006年7月15日，简钖堦、吴乃德、纪万生、张富忠、范云、吴介民、黄长玲、吴叡人、李丁赞、林国明、徐斯俭、陈明祺、郭宏治、陶仪芬与黄洛斐共同发起亲绿学者715声明〈民主政治和台湾认同的道德危机：我们对总统、执政党和台湾公民的唿吁〉，唿吁总统陈水扁辞职下台。2006年9月，时任台湾促进和平文教基金会执行长的简钖堦担任百万人民倒扁运动执