。文禄2年（1593），丰臣秀吉对朝鲜出兵（文禄庆长之役），黑田孝高与五奉行之一的石田三成产生争执，惹怒丰臣秀吉，黑田孝高以「如水圆清」法号出家。
关原之役与晩年.丰臣秀吉逝世（1598年9月18日）后的庆长5年（1600），五大老之一的德川家康向东讨伐会津的上杉景胜，石田三成却于关原率西军讨伐德川家康。黑田长政隶属东军正于关原作战，黑田孝高在九州丰前国中津城率九千黑田军，击破得到毛利家支援企图恢复旧领的大友义统，并认为上洛与取得天下不是难事而燃起野心，隐藏在东军德川家康名义下以夺