战结束后，国防部审判战犯军事法庭（南京军事法庭）曾进行对日本军发动南京大屠杀的审判。中华民国国军于2013年爆发洪仲丘事件，25万人集结于在总统府前的台北市凯达格兰大道抗议后，促成立法院三日内修正《》，将军人案件审判权在承平时期（未经总统宣战时期、非戒严时期），全部移至司法机关（普通法院、普通法院检察署）审理，以避免军检、军法官介入军人案件审判，产生利益冲突。自此军法官、军事检察官形同走入历史。
参考文献.
来源.本条目部分内容摘译自英语版维基百科条目。