敦煌医学文献是一批医学文献，大部分写于六朝及其以前，但也有部分是隋唐时期的作品。主要由甘肃省敦煌莫高窟的医学卷子本为主，此外，新疆、青海、四川等地也发现了许多古卷写本，其中有少量属于医学文献，而这些文献也被现代学者归为了敦煌医学文献并进行研究。它们可被分为93种，内容涉及到了伤寒、本草、针灸、五脏等方面。许多学者都对这些文献作了研究和整理并取得了丰硕的成果，最终还促成了敦煌学的形成。
发掘与研究.1900年，人们在敦煌莫高窟内发现了4万余件医学文献，大部分都是手写本，但也有少量木刻