家关系良好，被视为是「夫人派」、「官邸派」的外交官员，也因此不论是担任外交部长或是卸职转任其他职务，皆能一手主导中华民国的外交系统与外交事务，前后长达将近30年，因此得到「外交教父」之别称。沈昌焕坚持「汉贼不两立」的态度，强硬反对与所有共产国家及中国共产党进行任何交流接触。坚守中华民国唯代表中国唯一合法政府的立场，并以此为外交国策，也使得1970、80年代的中华民国外交关系呈现低迷状态。最后由于与时任总统的李登辉及主流意见不合，总统府秘书长职务遭到解除，转任资政，结束长期在外交部门的服务。中华民国参