厂指挥官，及后才调到北非。美国内战期间，造船厂仍由北方联邦控制。部分早期的美军战舰，如缅因号及康涅狄格号，均在布鲁克林建造。第二次世界大战期间，布鲁克林造船厂建造了数艘艾塞克斯级航空母舰，与及两艘艾奥瓦级战舰：艾奥瓦号及密苏里号。战后造船厂又建造了星座号超级航空母舰。由于财政紧绌，海军在1966年关闭了布鲁克林造船厂，并在1967年出售给纽约市政府。到1971年，纽约市将船厂逐步改建为工业园，但部分船坞设施及历史建筑仍旧保留。