大部分乘客仍要途经大堂转乘。九龙南线通车时，东铁线和西铁线都以红磡站为总站，并提供跨月台转乘。沙中线全线通车后预定改为垂直转乘。另外，沙中线当中的会展站也预定成为东铁线与将军澳线的转乘站，很可能会採用跨月台转乘。乘客可以在东涌线欣澳站跨月台转乘迪士尼线列车。不过反之不亦然，由迪士尼回到市区需要跨过天桥乘搭往香港站的列车。将军澳线康城站启用后，将军澳线坑口站、宝琳站及康城站乘客，可于将军澳站跨月台转乘，前往1号月台转乘，然而由于往宝琳站及往康城站列车俱停靠将军澳站1号月台，如乘客没有留意列车目的地