。2014年，发现古根菌纲的研究团队又发表了本纲的第二个物种"Archaeorhizomyces borealis"，并根据公开资料库中的DNA序列资料，估计本纲可能有超过500种未被描述的物种，且这篇研究也做出了外囊菌亚门新的演化树，其中古根菌纲与粒毛盘菌纲互为姊妹群，两者皆是外囊菌亚门演化上最早分支的类群。