之后，改翰林院侍读学士，兼祭酒如故。顺治二年（1645年），请更定孔子神牌，恢复元朝制度，称“大成至圣文宣王”，下礼部议，定称“大成至圣先师”。再迁礼部侍郎。顺治五年（1648年），进礼部尚书，次年，加太子太保。顺治七年（1650年），多尔衮死。次年，顺治帝开始审定各部汉官，大学士冯铨被勒令致仕，李若琳因与冯铨“交结亲密，朋比为奸”，革职为民，永不叙用。不久卒。
事迹.清朝入关以来，汉官逐渐形成南北二党。北党以冯铨为首。顺治二年（1645年）八月，给事中许作梅、庄宪祖、杜立德、御史