古虫界（学名：）是单细胞生物的一个主要超级群组，属于真核生物域，由汤玛斯·卡弗利尔-史密斯于2002年引入的一个新的支序亲缘学分类。古虫界包含了许多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人体寄生虫。古虫界过往被包括进现时被视为已弃用的生物分类原生生物界（Protista），一种基于鞭毛构造的分类，被认为是 的最 lineage。命名为「古虫」，是因为在真核生物的系统发生树处于底部位置，与古菌等外群关系较近，线粒体可能缺失或功能原始。
特性.许多古虫界的物种缺乏典型的线粒体，被称