辅导委员会”主席，和其他教授闻一多、袁复礼、李继侗、曾昭抡、吴征镒等步行三千多里，艰苦跋涉两个多余终于来到昆明。国立西南联合大学成立后担任学校建设长。1938年秋西南联大增设师范学院，黄钰生被任命为院长，同时兼任师院附属中学、小学的主任。抗战胜利后，被张伯苓校长派遣回天津复校。担任天津市教育局长和南开大学秘书长。1952年三反五反运动期间，黄钰生一度蒙冤被诬陷私藏资金，经调查清白后迫于局势压力同意被调离教育岗位，委任为天津图书馆馆长。粉碎“四人帮”后担任天津市政协副主席，并任第五届和第六届全国政协委员。19