源仍不能得到保证，而且受下游地区的沙化威胁，生态环境日益恶化。自2001年开始定期向下游实行「生态供水」，部分恢复并维持下游植被及生态环境。
动植物.塔里木河流域呈走廊状分布世界上目前面积最大的一片原始胡杨林。林中伴生诸多梭梭、甘草、柽柳、骆驼刺等沙生植物。养育着塔里木马鹿、野生双峰驼、鹅喉羚、大天鹅、鹭鸶等上百种野生动物。目前下游胡杨林带正由于塔里木河断流、水量减小而不断消失。