孙宣佈就职，辖区仅有广东，实权在陈炯明之手。第二次护法运动开始。7月24日，孙与宋庆龄在广州出席「出征军人慰劳会」。10月，广州非常国会批准孙北伐计划。1922年4月，孙不满广东省政府不支持北伐，决定罢黜陈炯明广东省长和粤军总司令职位。5月，直奉战争奉系遭直系击败。6月2日，徐世昌在压力下退让，宣布辞职。直系恢复约法和国会。在粤国会议员纷纷北上。孙就任非常大总统，积极策划北伐，陈炯明志在割据，多方阻挠。陈炯明主张停战，实行联省自治，而孙主张继续北伐，最终产生激烈冲突。1922年夏，孙自桂回粤，免陈炯明职