巴政变后，佩鲁兹离开了公学院，继任的继续雇佣贝特洛为自己的助手。
有机合成.贝特洛刚担任巴拉尔的助手不久，就发表了自己在有机化学方面的第一篇文章，证实乙醇和醋酸蒸汽通过灼热瓷片会产生苯和苯酚等多种芳香化合物。1852年，他发现松节油异构化可以得到莰烯类物质。不久后他在松节油内加入氧化剂，加热到250℃时，发现生成了樟脑，并进一步由樟脑再制成冰片。1853-1854年他通过甘油和各种酸反应，改变酸的比例后合成了多种脂肪，然后将脂肪水解又得到了甘油，他进而认为甘油类似于无机化学中的磷酸