栋纲投靠上野的上杉宪政，其弟矢泽赖纲则降于村上义清，此事造成日后真田氏和村上氏方对立的远因。然而，仅一个月后，信虎之子武田晴信突然将父亲流放至骏河，同时宪政趁乱攻率兵领攻入信浓，但是却早早与迎击的赖重议和而退兵。天文16年（1547年）8月，宪政打破与武田氏的同盟关系，再次出兵却在小田井原之战中败北，从此山内上杉家放弃进攻信浓，而本来希望借助上杉之力夺回旧领的幸隆等人的夙愿也因而落空。天文17年（1548年），武田氏在上田原之战中大败于村上氏后，武田信玄仍然未有放弃进佔信浓的想法，他将熟知当地地形，而且