黄占元，广东香山县榄镇人，字卓南，清朝军事将领、武进士出身。光绪十五年，登己丑恩科会试第五十名进士，殿试三甲第二十一名，授蓝翎侍卫，历任广东潮州镇总兵，闽粤南澳镇总兵，特授香山县协副将。