南北长110公里；东西宽5-12公里。是泾河、清水河、葫芦河的主要发源地之一。六盘山保护区生态系统是我国黄土高原具有代表性的温带山地森林生态系统，境内生态环境优越，森林茂盛，物种资源丰富，有“西北种质资源基因库”之称。
植物.六盘山自然保护区有高等植物113科382属788种，经济价值较高的植物150种，国家重点保护野生植物名录的有水曲柳]]、秦岭冷杉，重要药用价值植物有桃儿七、黄芪、红毛七、猪苓、升麻、大叶三七、五叶子、贝母、党参、兰夏、白芷、柴胡等，六盘山特有植物有桃儿七、六盘