子后二条天皇，建立龟山天皇子嗣的「大觉寺统」。镰仓末年，后醍醐天皇曾两次发动倒幕，分别为正中元年(1324)的正中之变和元弘3年(1331)的元弘之变，两次都为朝臣吉田定房所洩，在元弘之变中的笠置山・赤坂城之战中，天皇为幕府所掳，流放至隐歧岛，并立持明院统之光严天皇即位，改元正庆，是为北朝第一代天皇。但勤王势力（护良亲王、楠木正成等）仍不放弃，两年后在京都与幕府势力（主要为六波罗探题）决战，此时幕府派出的大将足利尊氏阵前倒戈，破六波罗探题军，另一勤王军新田义贞趁机攻破镰仓，镰仓幕府灭亡。后醍醐天皇也被勤