与标本采集工作，写出了《中国西北地区植物地理概论》与《中国南部及西南部植物地理概要》。1936年他带领植物学研究所迁往武功，与国立西北农学院联合成立中国西北植物调查所。1941年他又随北平研究院迁往昆明。抗战结束后回到北平，继续从事植物学研究。中华人民共和国成立后，刘慎谔于1950年出任东北农学院植物调查所所长。1954年调任中国科学院林业土壤研究所副所长、植物研究室主任。此后他还曾前往苏联、朝鲜等地进行考察。1963年他编写了《动态地植物学》、《历史植物地理学》，并提出了地带性顶极与非地带性顶级的观点