助菌群发酵的位置。食糜达到结肠的时候，大部分的营养物质和90％的水已经被人体​​吸收。在这时，剩下的是一些电解质如钠，镁，氯以及摄入食物中不能消化的部分（例如，摄入的直链淀粉的很大一部分，迄今尚未消化的蛋白质，以及主要是可溶性或不溶性的碳水化合物的膳食纤维）。由于通过大肠的的肌肉移动食糜，剩余的水大部分被吸收，而食糜混有粘液和细菌（称为肠道菌群），成为粪便。当粪便进入升结肠时尚算是液体。结肠肌肉将含水量高的粪便向前移动，并慢慢地吸收所有多余的水份。当粪便进入降结肠时已成为半固态。其中细菌分解食物纤维为自