「晚晴园—孙中山南洋纪念馆」，名称沿用至今。之后晚晴园—孙中山南洋纪念馆于1997年11月暂时关闭，耗资750万新加坡元进行整修后，于2001年11月12日（孙文诞辰135周年）重新开放。2009年，新加坡中华总商会将晚晴园—孙中山南洋纪念馆委由国家文物局经营管理。晚晴园—孙中山南洋纪念馆于2010年10月再度关闭，耗资560万新元进行整修，于2011年10月8日重新开放，以纪念辛亥革命100周年。2014年，再度丰富其常设展厅的内容。更新后的展厅主要展出一系列由私人和社团机构所提供的展品，并新增3D投