郭丹推荐乡中贤士代其职自去。杜诗叹曰：「昔明王兴化，卿士让位，今功曹推贤，可谓至德」。杜诗遂命将郭丹的事迹写入简册，放于郡署正厅，让励后人。建武十三年（37年），大司马吴汉推举郭丹任并州牧（今山西），郭丹以清正廉洁闻名，后成为出使匈奴的中郎将，又迁左冯翊。汉明帝永平三年（60年）二月，太尉赵憙、司徒李䜣被免职。任用左冯翊郭丹为司徒。在朝廉直公正，与侯霸﹑杜林﹑张湛﹑郭伋齐名且关系很好。永平四年（61年），因查办陇西太守邓融渎职入狱一事无所据，听任奸吏所为，司空冯鲂、司徒郭丹均被免官。次年（62年