5号州际公路和原来的99号美国国道在加州中谷地区开始分道扬镳。为了提供更快捷的南北通道，5号州际公路作为一条全新的高速公路，在99号国道西侧进行修建，它并不经过更为繁忙的弗雷斯诺、贝克斯菲尔德等城镇。原有的99号国道在这一区域的路段后来降级为99号加利福尼亚州州道，不过如今99号州道在萨克拉门托以南的路段经过扩建和整修，目前也全段符合高速公路标准。5号州际公路在萨克拉门托以南新修的路段是整个5号州际公路最晚建成的路段。1979年10月12日，5号州际公路在斯托克顿附近的路段开始通车。当时来自加拿大和墨西哥