16年1月10日金温新双线后，苍南站增开一对始发进京列车G164/3次，从而得以直通丽水、义乌等地。截止2017年11月，每天共有64班次列车在该站停靠，往返于上海、杭州、宁波、福州、泉州、厦门、汕头、深圳等城市。车站客流辐射苍南周边的平阳北港片区、泰顺、文成五个县市及闽东北的福鼎、柘荣等地区，日均客流量为7000人次，高峰期时日均客流量达到1.5万人次，是全中国停靠动车组最多的县级客运，也是上海铁路局管辖内客流量最大的县级站。2020年12月改扩建后的苍南站日图定办客列车已增加至63列，其中始发车