在与侵略南宋的蒙古军、蒙古武林人士的对抗，同时着重描写主角(杨过)为了自身的感情与社会礼法习俗的对抗过程。金庸各作品大多或多或少有前后关系，《神鵰侠侣》、《射鵰英雄传》与《倚天屠龙记》背景关系尤深，被合称为「射鵰三部曲」。《射鵰英雄传》主角郭靖、黄蓉在《神雕侠侣》中已结为连理，同为当世举足轻重的武林领袖。黄蓉在《射鵰》临危受命担任江湖第一大帮丐帮帮主至《神鵰》的大胜关武林大会时，卸任前后持续协助郭靖领导襄阳城军民对抗蒙古军侵略。《神鵰》主角杨过在《射鵰》结束前刚出生，由郭靖起的名（新修版中改为黄蓉替