工学院迁至西安，合并为国立西安临时大学，黎锦熙任国文系教授、主任。1938年，西安临大迁至汉中，改称国立西北联合大学，黎锦熙继任国文系教授、主任。1939年，西北联大分出国立西北师范学院，陆续迁往兰州，黎锦熙兼任教务主任。1944年，倡导西北师院、国立女子师范学院、国立社会教育学院创办国语专修科，后来的毕业生中有100多人在中华民国接管台湾后到台湾推行国语。1945年，抗战胜利后，任西北师院院长。国民党六大召开前夕，列入朱家骅与陈立夫联名向蒋介石推荐的98名“最优秀教授党员”之一。1946年，西北师院迁回北