伊斯兰教是阿富汗的官方国教，约99.7％的阿富汗人口是穆斯林。约90-95％是逊尼派哈乃斐派穆斯林。而5〜10％是什叶派，阿富汗什叶派多数属于十二伊玛目派，另有少数伊斯玛仪派。
早期历史.在公元7世纪，倭马亚王朝阿拉伯人进入现代阿富汗后果断地在纳哈万德战役击败了萨珊波斯。最后萨珊王朝皇帝伊嗣俟三世，成为被追赶逃犯，向东逃去深入到中亚。此后到赫拉特，开始向当地人传播伊斯兰教。经倭马亚传教士的努力，大批阿富汗北部的居民接受了伊斯兰教。有时候，他们为赢得皈依，穆斯林领袖用钱的承诺鼓励