随舅前往肇庆。1644年清军入关后，1646年南明的永历帝在肇庆即位，陈上川起兵响应。1662年永历帝被俘后，陈上川继续抗清，活跃于广东、广西一带，并被明郑政权首领郑成功封为高、廉、雷三州总兵。1673年，三藩之乱爆发。次年陈上川率部攻佔钦州，响应吴三桂。1679年三藩之乱被清朝平定后，陈上川不愿成为清朝的子民，与其副将陈安平（Trần An Bình）率三千人，乘坐五十艘战船前往广南的沱㶞港，请求得到贤主阮福濒的庇护。阮福濒嘉其忠义，不想拒绝；出于越南人南进的需求，阮主决定将他们安置在东浦（今浦岛），