郡治所迁回山阴县（今绍兴）。东汉末年，吴郡富春县（今杭州富阳）人孙坚及其子孙策、孙权逐步掌控包括吴郡、会稽郡在内的江东地区。汉献帝建安十三年（208年），刘备和孙权联军在赤壁大胜南侵的曹操数十万军队。222年，孙权受魏帝曹丕封为吴王，229年称帝建立吴国。期间吴国向今天浙江西部和皖南等山地的山越部落进行征抚，并且大事屯田，以增强国力。公元280年，吴降晋。永嘉五年（311年）永嘉之乱爆发，华北长期处于战乱，再加上五胡乱华，大量难民涌入江东。建兴五年（317年），司马睿在吴国故都建康建立东晋，江南又相