上因肺水肿在东京的医院去世，享年56岁。逝后在她的告别式放置了生前声演角色的特制布偶（有《机动战士钢弹》的吉卡·北本、Haro），仪式的所有流程由弟弟进行。井上死后，《游☆戏☆王 怪兽之决斗》登场的獏良了由原本代替配音的松本梨香继承。另外，任天堂GameCube发行游戏《》登场的钢弹女主角雪拉·玛丝因为是井上最后参加的配音作品，所以在该游戏的片尾曲工作人员表中附上了追思文。
逸事.井上瑶有着一张童颜的面孔，身形相当瘦小，只有150cm，因此她在25歳到30岁之间经常被误认为是小