氨基酸残基提供的供体基团外，许多有机辅因子还起配体的作用。 也许最着名的是并入血基质蛋白中的四齿N大环配体。 无机配体如硫化物和氧化物也是常见的。
存储与运输相关的金属蛋白.
氧载体.作为人类主要氧载体的血红蛋白具有四个亚基，其中铁（II）离子由平面大环配体原卟啉IX（PIX）和组氨酸残基的咪唑氮原子配位。第六配位位点含有一个水分子或二氧分子。 相比之下，在肌肉细胞中发现的蛋白质肌红蛋白只有一个这样的单位。活性位点位于疏水口袋中。这是重要的，因为没有它，铁（I