时期制造的列车也在外观上有少许差别。与上一代车辆比较，E231系安装了较大的排障器。2005年起，随着新设计（V字型）的强化型排障器开始制造，新制列车（均为近郊型）均改用新型排障器。而已开始营运的列车也于2007年起陆续更换新型排障器，以减低列车在平交道事故中所受的损害。
机件.第一代新系列车辆有两个型号：209系和E217系。作为通勤型列车的209系，为了拥有在市区行驶时需要的足够加速度，牺牲了最高速度（齿轮比：7.07，最高速度：每小时110公里，起动加速度：每秒2.5公里