4.55"—23°19'28.76"与东经119°27'51.09"—119°43'4.23"之范围内划设为带状区域，海域面积35,473.33公顷，陆域面积370.29公顷，全区面积35,843.62公顷。其中部分陆域范围已于2008年公告为澎湖南海玄武岩自然保留区。 
居民.因交通不便、物资运补不易、产业转型，南方四岛人口逐渐外移，西吉屿1978年由政府辅导迁村，现在已经无人居住，其他3个岛，根据内政部海洋国家公园管理处提供资料，也只剩约50名常住人口。