从五位下飞驒守。其原名内藤忠俊，「如安」是其教名「Joan」的日本语音译。全称小西飞驒守如安，明朝和朝鲜王朝的史料中误将他记作「小西飞」。内藤如安的父亲内藤宗胜，原名松永长赖，是三好氏重臣松永久秀的弟弟。三好氏在三好长庆时代称雄于畿内，在三好氏攻打丹波国的时候，松永长赖崭露头角，成为八木城的城主。为了巩固人心，松永长赖娶丹波守护代内藤国贞的女儿为妻，并继承了内藤氏的名号，改名内藤宗胜。内藤如安就是松永长赖与内藤国贞的女儿所生的儿子。永禄七年（1564年），内藤如安在路易斯·弗洛伊斯的介绍下，昄依了基