拆迁沿河码头，并布置沿河绿化，先行构造样板地段。1998年，市政府将沿河72家直接排污单位的排污口进行封堵，同时在上游兴建6条支流通往吴淞江的闸门。至2000年，苏州河的黑臭污染情况开始扭转。一期工程完成后，苏州河的恶臭状况在2002年左右基本消除，水质达到地表水V类的景观水标准。其次在2000年吴淞江污染最重的断面底泥中，发现昆虫的幼虫。2001年，市区段重现成群的小型鱼类，同时滨河地区的绿化、公园、亲水平台大幅增加，改善了苏州河原先两岸枯燥的市容景观。
苏州河整治二期工程.