保护区东部山脉的山坡一直延伸到下层的草原和草地。
气候与生态.巴什基尔斯基处在“乌拉尔山地森林和苔原”生态区的南端，这是欧洲和亚洲植被区（穿过乌拉尔河）之间的过渡区域。（WWF ID＃610）。巴什基尔斯基的气候属于温带大陆性湿润气候（柯本气候分类为“Dfc”），其特点是每年等温差很大，一天之内的温差也很大，夏季凉爽，冬季寒冷，全年降水量相对均匀。
植物群和动物群.由于该保护区位于几个生态区的交汇处，因此其生物多样性很高。植被包括了西伯利亚和欧洲、中亚