大的科。仓鼠科的定义在生物分类学历史中曾多次变化。今天这个科与鼠总科的其他的其他科一起并列。过去曾经有多个其他鼠总科的动物被列入仓鼠科，如丽仓鼠属、沙鼠、冠鼠、鼢鼠等。基因学分析表明这些鼠类不属于仓鼠科。
分类.仓鼠科分五个亚科、112个属和约580个种，还有一个化石亚科，分别如下：