肌层包括一个内侧环形层和一个纵向外肌层。内侧环形层防止食物向后移动，而纵向外肌层缩短消化道。
外膜或浆膜.在胃肠道的最外层，包括数层的结缔组织。胃肠道的腹腔部分覆盖浆膜层。浆膜层包含大部分的胃，十二指肠的第一部分，以及所有的小肠、盲肠和阑尾、横结肠、乙状结肠，和直肠。