1902年发现首个包头龙的标本（即正模标本），并命名为「"Stereocephalus"」。但是这个名称已被使用，故于1910年更名为包头龙。这个名字在很多时都被误拼。牠曾一度被认为与甲龙是相同动物。模式种是卫甲包头龙（"E. tutus"）。第二个物种是"E. acutosquameus"，是于1924年被发现。虽然两个物种的尾槌形状不一样，但牠们却有可能是属同一物种。一些被认为是多智龙及甲龙的标本，亦有科学家认为是属于包头龙。在加拿大艾伯塔省及美国蒙大拿州一共发现了超过40头包头龙的化石，使得牠