乐部仍为他挂出了405万元的高价，最终以210万成交。 后来郭辉透露辽足是由于财政问题才将他出售。 转会国安后他的生涯并不顺利，第一个赛季的第18轮他才打破了进球荒。 2008年11月12日中超联赛主场对阵天津康师傅的比赛赛后，双方球员爆发冲突，郭辉与谭望嵩口角，随后发生肢体冲突。事后两人相互指责对方口出恶言。 同时亦有谣传称郭辉因后脑被打造成脑震荡入院。 足协最终认定郭辉没有还手，处罚了谭望嵩。 由于位置重叠、年龄大、伤病困扰，郭辉的出场机会不多，但是他经常打入关键入球，被誉为“绝杀先生”，他还在2009