2003年8月16日，中华民国内政部部长余政宪率领行政院经建会副主委张景森、研考会副主委蔡丁贵、海岸巡防署副署长游干赐、高雄市副市长林永坚等一行人前往视察，并举行一等卫星控制点设置动土典礼。2005年，中华民国原本专责南海政策的「南海小组」，由国安会「周边海域情势会报」取代，作为处理台湾週遭争议海域的主管机制。2006年，中华民国政府为便利由台湾本岛运输补给和医疗救护，中华民国国防部开始着手构建「太平专案」（太平岛机场专案）工程，但却引发舆论质疑破坏生态。2007年3月3日，高雄市政府海洋局