确保她自己和凯撒里昂的政治地位安全，克丽奥佩脱拉唆使安东尼下令杀了她的妹妹阿尔西诺伊四世，她妹妹此时正避居于罗马控制下以弗所的阿耳忒弥斯神庙中，阿尔西诺伊便在神庙的阶梯上被杀，这大大震惊罗马人，因神庙有神圣的庇护权。克丽奥佩脱拉也处决了她的赛普勒斯将军塞拉皮翁，因他曾经支持卡西乌斯来与她对抗。然而，当安东尼因战事离开埃及后，她们俩的恋情逐渐转淡。安东尼为了和屋大维重修和好，娶了屋大维的姐姐小屋大薇为妻。在前40年12月25日，克丽奥佩脱拉为安东尼生下一对双胞胎亚历山大·赫利俄斯和克丽奥佩脱拉·塞勒涅二世