二战期间，卢托斯瓦夫斯基应召入伍，在波兰军队中担当电台讯号员。同时他仍没有放弃创作，他于1939年完成的作品「交响变奏曲」（"Symphonic Variations"）由菲度伯格（Fitelberg）指挥波兰广播交响乐团首演，并于1939年3月9日在广播中进行了播出。和大多数年轻的波兰作曲家一样，卢托斯瓦夫斯基本来希望到巴黎继续进修音乐，但到了1939年9月发生了纳粹德军入侵西波兰和苏联入侵东波兰，波兰被瓜分为东西两半，导致他继续学习音乐的计划被打破了。之后，卢托斯瓦夫斯基被调往克拉科夫军的无线电部队，