889年）在原址重建。《天咫偶闻》载：“于忠肃祠，在裱褙胡同。芜废已久，近始重修。浙人逢春秋闱，居为试馆。”这说明于谦祠在清朝末年曾充当浙江举子的会馆。光绪二十六年四月，义和团进入北京，在此设坛口教习拳艺。后来，于谦祠成了居民杂居的大杂院。1976年唐山大地震波及北京，于谦祠内的奎星阁被震毁，随后奎星阁遭到拆除。1984年，于谦祠被公布为北京市文物保护单位。2004年，西裱褙胡同被拆除，该胡同内多处历史遗迹除于谦祠被保留外，戏剧理论家齐如山故居、“汉园三诗人”之一的何其芳故居均被拆除。2000年代，于谦