医院恢复同时使用湖北省人民医院名称。1993年1月，湖北医学院更名为湖北医科大学，医院则更名为湖北医科大学附属第一医院，并继续使用湖北省人民医院名称。同年，医院被中国卫生部评定为湖北省首批三级甲等医院之一。1995年，医院被联合国儿童基金会、世界卫生组织和中国卫生部联合授予“爱婴医院”称号。2000年8月2日，湖北医科大学与武汉大学、武汉水利电力大学、武汉测绘科技大学合并为新的武汉大学。医院则更名为武汉大学人民医院、武汉大学附属第一医院，并继续沿用湖北省人民医院名称。
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