上盟军守军撤退行动，均造成盟国海军的颇大损失。德国空军（Luftwaffe）摧毁了达8艘英国舰只，并击伤了7艘英舰，造成2,000名英国水兵死亡。德国空军在此战中嬴得重大胜利，证明除非皇家海军愿意承受巨大伤亡，否则绝不能在德军取得制空权的地方作战。虽然苏德战争使地中海战区变成德军一个次要的考虑场地，但是克里特岛的陷落却使轴心国势力延伸至东地中海，并加强对盟军船队的威胁。 战斗发生期间，德军2次试图由海路侵入克里特岛，但是均被皇家海军介入并阻挠成功。不过由于有义大利海军的保护，这些入侵部队的船只才得以保存