举，光绪二十四年（1898年）清帝下令变法，改书院为学堂，1903年正式停办，白鹿洞交由南康府（今星子）中学堂管理，宣统二年（1910），白鹿洞书院改为江西高等林业学堂。
近代.国民政府时期，蒋介石曾计划将书院交由位于南昌的国立中正大学接管，但未实现。1927年武汉起义失败后，刘少奇曾避居白鹿洞书院内，1959年列为江西省文物保护单位后，刘少奇、周恩来、以及越南民主共和国主席胡志明等曾视察过白鹿洞书院，1979年成立庐山白鹿洞文物管理所；1988年公布为全国重点文物保护单位和国家二