亚洲黑熊、青鼬、水獭、大灵猫、小灵猫、斑灵狸、林麝、鬣羚、斑羚、中国大鲵、虎纹蛙、细痣疣螈，国家重点保护鸟类：（黑）鸢、普通鵟、白尾鹞、红隼、红腹角雉、白鹇、白冠长尾雉、红腹锦鸡、领角鸮、斑头鸺鹠、灰林鸮。国家重点保护动物共29种。省重点保护动物有小麂、赤麂、毛冠鹿、啄木鸟、黑枕绿啄木鸟、大斑啄木鸟、鹰鹃、四声杜鹃。区内有国家一级保护植物桫椤、南方红豆杉、香果树、银杏、珙桐共5种，二级保护植物福建柏、杜仲、闽楠、楠木、红豆树、鹅掌楸、厚朴、水青冈、刺楸、花榈木共10种。