福康安收到消息上疏请罪。结果干隆从寛处理，停福康安十年俸禄。和琳亦因此昇为礼部侍郎。之后和琳更调往阿桂和福康安手下。两人长期在外征战，朝中武官派已经无人可以对抗和珅，所以和珅大肆迫害武官派，任九门提督兼正白旗领满洲都统，丰台大营六万军队跟随和珅指挥。嘉庆元年（1796年）福康安在镇压苗民起义时死去，和琳自领7省37万大军，镇压石柳邓领导的苗民起义，2人此时一将一相，就任干隆朝最高的文武官职，阿桂此时虽为领班军机大臣但是常年卧病在床，加上满朝文武已经附属和珅，已没有能力阻止和珅两兄弟掌握军权。但是和琳在三