次九州占64.8%，本州有63.6%，北海道最低，为49%。日本全国最高峰则是位于太平洋沿岸山梨县及静冈县交界的富士山，根据日本国土交通省国土地理院山岳标高资料，富士山的海拔高度达3,776米。富士山自1708年之后就没有再大规模喷发过，不过仍然是一座活火山。日本国内平原面积不大，大多都是小规模的沖积平原、海岸平原和洪积台地。当中最大的是首都东京所在的关东平原，面积约13,000km²。其他规模较大平原则包括爱知县名古屋市一带的浓尾平原、大坂及京都两府附近的近畿平原、本州东北部宫城县的仙台平原，以及北海