的儿子茂仁王为新的天皇，是为后堀河天皇；守贞亲王则以太上天皇的身份执掌院政，是为后高仓院。自此后，幕府开始拥有控制与决定天皇皇位继承的大权。
镰仓幕府的末日.1318年，后醍醐天皇即位，决心恢复皇室权威，废黜武家院政，开始亲政。正中元年（1324年），后醍醐天皇密谋倒幕，但计划被幕府得知，主要大臣遭到流放，第一次倒幕运动失败，史称「正中之变」。1331年，后醍醐天皇再次密谋倒幕，倒幕军被幕府军打败，史称「元弘之乱」，后醍醐天皇被流放，第二次倒幕运动失败。元弘之乱后，近畿、东国为