年复线工程竣工，同时新线上的镇江新客站启用。 1958年11月，六摆渡车站划入镇江直属站管辖。1978年，车站被划入新成立的丹阳车务段管辖。2003年丹阳车务段被撤销后，车站重新改为镇江直属站管理；2006年镇江直属站合并至常州直属站；2010年沪宁城际铁路通车后改为苏州直属站管理，2011年再次被划为重新成立的镇江直属站管理。
专用线.车站设有专用线通往镇江船山石灰石矿。1962年中国冶金工业部决定在丹徒的船山地区建设石灰矿后，连接矿场和京沪铁路的专用线也由上海铁路局开始进行