幕府的使节与随行的博多或堺有力日本商人，但这期间仍然有走私贸易。后来因为足利将军家的家督之争，导致了1467年应仁之乱（日本战国时代自此开始），幕府对外的贸易权不再统一，幕府在堺港的贸易据点本来是堺的细川氏所掌控，但后来渐渐的被应仁之乱中因兵事崛起的山口新兴势力大内氏所凌驾，大内家还常常自行派出独立的使节团进行贸易。此后大内氏与细川氏常为勘合符而产生冲突事件。
事件.明武宗即位后，大内家的遣明船（勘合船）船队更独占了正德勘合符。1523年，西海路大名、左京兆大夫大内义兴任命谦道