，众人不敢收尸安葬，荀闿与司马冏故吏李述等收葬司马冏，为时论所称道。永嘉之乱，与荀邃渡江，司马睿拜他为丞相军咨祭酒。晋元帝即位，任命他为右军将军，转任少府，历任侍中、尚书。封射阳公。太宁二年（324年）荀闿卒，追赠卫尉，谥定。其子荀达嗣位。荀闿与诸葛恢、蔡谟均字道明，故号称“中兴三明”。