。2018年5月13日，影片在立陶宛维尔纽斯拍摄，由于保持前苏联的风格，该地用来描绘普里皮亚季。为了搭建人员撤退的场景，剧组密集地搭建了活动板房公寓、导演约翰·伦克抨击房子各式各样现代风格窗户很让人出戏，但是不考虑用后期抹掉。3月底，剧组移师到立陶宛维萨吉纳斯拍摄伊格纳利纳核电站的内景和外景，由于两者的设计极其相似，这座退役了的核电站时不时被称作“切尔诺贝利的姐妹”。2018年6月初，剧组移师到乌克兰拍摄最后的戏，拍摄总共花了16个星期。
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