反刍动物的胃发酵制成）自然地存在的反式脂肪酸，风险很可能低于人造反式脂肪。人的新陈代谢要求的一些基本脂肪酸被加氢过程毁坏。这也许是特别令人关注的是被认为是在典型西方饮食短缺的奥米加3脂肪酸「部分氢化植物油」含有反式脂肪，会令有助防止血管硬化的高密度脂蛋白（HDL）减少，令引致血管梗塞的低密度脂蛋白（LDL）增加。此外，反式脂肪更容易导糖尿病等其他严重疾病。氢化脂肪增加患上冠心病风险（CHD）的原因和饱和脂肪一样，它们都会提高血液低密度脂蛋白（LDL） 的水平。它也会减少帮助从动脉清除胆固醇的高密