再参加竞选，同年12月8日任期结束，辞去知事职务。稻岭惠一反对将普天间飞行场迁移至名护市的方案，主张将机场转移到沖绳之外。在其知事任期之内沖绳发生的大事有：2000年7月21日至23日，第26次G8峰会在名护市的万国津梁馆举行；日本在该年发行新版二千日圆纸币以示纪念。此外，2004年8月13日，驻沖绳美军的一架直升机在沖绳国际大学1号馆坠毁，这就是沖国大美军直升机坠落事件。2008年11月，稻岭惠一荣获日本政府颁发的旭日重光章。