日改制为任用机关。总部与台北捷运公司同样位于台北市中山北路二段48巷「捷运行政大楼」。台北捷运採取兴建与管理分由两个机构的方式负责，分别为负责规画与建设的台北市政府捷运工程局、与负责营运的台北捷运公司。2008年11月，台北市政府捷运工程局受託兴建台中捷运乌日文心北屯线。
局徽涵义.由于捷运系统对交通改善与环境影响处与民众皆有不可分的关系，而且捷运系统的精神标志同时兼负宣导、企业识别与公关多重任务，其设计构想：
组织变革.行政院于1986年核定台北