019年两轮公交改革，不再实施“市区-跨镇-镇内”三级体系和每个镇均设置公交公司的“一镇一公汽”模式，改为按片区统筹一体化运营。全市分为城区片区、滨海湾片区、松山湖功能区、东部公交运营片区、水乡功能区，分别由东莞城巴、东莞小巴、滨海湾公交、松山湖公交、东莞巴士东部分公司、水乡新城公汽运营。2020年1月1日，全市公交实现100%纯电动。除水乡新城公汽外，其余公司均为东莞巴士分公司或控股子公司，形成了全市公交行业由国有主导、民营参与的良好统一局面。另有佰通运输运营的全省首条公交化客运班线“莞深001线”。