日，军事委员会任命刘文辉为陆军第二十四军军长。1937年9月，获授陆军上将衔，被任命为第五军团军团长。1939年1月，西康省正式成立，刘文辉被任命为西康省政府主席兼全省保安司令。历任中国国民党中央执行委员兼西康省党部主任、川康绥靖公署副主任。此后，第二次国共内战末期，刘文辉未随中国国民党逃往台湾。1944年加入中国民主同盟。1947年（民国三十六年）7月19日，国民政府派刘文辉为西康选举事务所主任委员；国民政府同时派定其为国民大会代表，立法院立法委员。
在北京.1949年12月