被征夷大将军及幕府架空权力、甚至监控。每代将军继任由天皇发布“将军宣下”任命，但天皇实际对将军没有管制权，将军宣下只是仪式。将军领地的石高在江户时代初年大致佔有七百万石，占全国总石高四分之一，以确保对各藩国统治上的绝对优势。各藩国大名的土地均按份地由农民耕种，农民须交租、履行各种封建义务。幕府对农民实行登记制度管理，藩国共有三类：三种封地以近到远，有防御和互相监视性质。各藩藩主都必须定期到江户参谒将军。幕臣需要贡纳，幕府还垄断对外贸易；两项为中央政府主要收入，再加上将军领地的税收和矿山国营收入补充。