华民国在1949年政府迁台前，曾设置若干特别行政区，通常作为行政区预备改制前的过渡性区划。主要指：
未设立的特别行政区.澎金马离岛特别行政区：中华民国未来规划走向中，曾出现六星计画（未实现计画）。2008年中华民国总统选举候选人谢长廷认为各县市的国际能见度都很低，依各地的行政区编制，地方的人才以及能力也不足，主张将台湾分成六大地区（省或州），再加上澎金马合併为离岛特别行政区，中华民国的国际竞争力才能大幅地跃升。而另外前中华民国副总统吕秀莲提出过「四省两特双首都」的规划，其中也包括澎金