号上25毫米炮的数量增加至32管。
在菲律宾的战斗.1944年3月28日，能代号的改装全部完成。1944年4月5日,能代号和第四舰队的爱宕号重巡洋舰，高雄号重巡洋舰，鸟海号重巡洋舰及第五舰队的妙高号重巡洋舰，羽黑号重巡洋舰，春雨号驱逐舰启程前往达沃市和林加群岛。这支巡洋舰舰队被美国海军和的发现，不过前者发射的六枚鱼雷均未命中，后者没有发动攻击。1944年4月7日，美国海军在达沃湾发现这支舰队正在驶离海湾，不过潜艇没能进行攻击。1944年5月18日，美国海军同时向该舰队发射了舰首全部