南京市政府再不停止砍树，他会在国民党中常会提案护树”，事件终于迎来转机。次日，邱毅在国民党中常会中提案，希望透过海协会和海基会，协调南京市悬铃木砍伐事件。。而国台办在17日的新闻发布会中称相信南京市政府会妥善处理此事3月19日下午，上千南京市民在南京图书馆前集会抗议政府砍伐迁移树木，抗议人群与事先来到现场的警察并未发生大的冲突。3月20日，南京市副市长陆冰称，地铁三号线的移树工作已全面停止。而政府将公开征集民意，以进一步优化地铁建设方案，事件告一段落。