3年起，陆续担任过第14师团师团长、陆军航空本部长、二·二六事件后代替皇道派的柳川平助担任台湾军司令官。1937年，晋升为大将，就任陆军三长官之一的教育总监一职，成为日本陆军的首脑之一。　　
二战时.1938年2月，由于华中方面军在原司令官松井石根的率领下，发生了南京大屠杀，日军大本营迫于国内外的舆论压力，撤回松井石根，由畑俊六接任华中派遣军司令官。晚年的畑俊六曾对友人说，指挥徐州会战和武汉会战是他平生最大的遗憾：“当时，中国大陆的战争已到了见好就收的时候了，再进一步深入，