等人先于邓禹赶到，但作战失利，退保城池，被敌人所围困。邓禹于是进兵与敌人作战，击破敌军并生擒其大将。跟随光武帝追击敌军直到蒲阳，接连取得重大胜利，北州得以大致平定。
平定河东.更始三年（公元25年）正月，光武帝刘秀想趁赤眉军、绿林军反目之际兼并关中，因为邓禹深沉有大度，所以授予他西征战略，拜为前将军持节，分给他麾下精兵二万人，令其西入关中，并让他自行选拔偏、裨以下的人与其同去。邓禹于是以韩歆为军师，李文、李春、程虑为祭酒，冯愔为积弩将军，樊崇为骁骑将军，宗歆为车骑将军，邓寻为建威将