元开记者会发表与李敖合着的《陈水扁的真面目》，宣称陈水扁与女助理、女化妆师有外遇，但仍对外粉饰虚构与吴淑珍仍鹣鲽情深，借此骗取选民支持。陈水扁控告李庆元违反正副总统选举罢免法，法院在2012年判李庆元更三审无罪定谳，但附带本件的民事求偿却判李庆元须在《中国时报》、《联合报》、《自由时报》、《工商时报》全国版头版登报道歉。2003年，李庆元揭发房地产投资客在师大附中国中部明星学区，利用一户分割成小坪数六、七户的分户方式，赚取暴利，并造成明星学区幽灵学生呈倍数增加，李庆元要求教育局及建管处专案列管，修法限制