湾地区部分领地外，也于1673年－1680年三藩之乱期间，以军力占拥有对岸大陆闽南地区的漳州、泉州、兴化，和广东的潮州、惠州等部分领土，后来逐步沦丧。
行政区划.地方行政方面，可分为两个阶段：郑成功时期与郑经时期。1661年，郑成功击败荷兰东印度公司，五月佔普罗民遮城，改赤崁地方为东都明京，台湾总地号为「东都」。还实施郡县制度，设置了「一府二县」，承天府、天兴县以及万年县，并以承天府安平镇为京畿。其中，天兴县县治设于佳里兴（今台南市佳里区），而万年县县治则设于二赞行（今台南市仁德区