大垣藩（）是一个位于日本美浓国大垣（现岐阜县大垣市郭町）的藩，是大垣城。
历史.庆长6年（1601年），石川康通从上总（现千叶县山武市）2万石加增至大垣5万石，创立了大垣藩。元和2年（1616年），加增至丰后6万石，取而代之入主大垣藩的是4万石的下总主。宽永元年（1624年），移封信浓小诸4.5万石，大垣藩主改由丹波福知山藩主冈部长盛担任，5万石。宽永10年（1633年），至播磨龙野，宪良的表弟从山城淀，以6万石入主大垣，两年后加增至伊势11万石。其后，户田氏铁从摄津尼崎5万石