大学毕业后，进入当时的东北人民政府和国家计划委员会工作，担任副处长、领导秘书等职务。1958年起，在整风、反右、文化大革命等陆续到来的政治运动中遭到冲击，被开除党籍。此后，朱镕基担任过国家计委业余干部学校教师、国民经济综合局工程师并被下放到湖北襄樊的“五七”干校参加劳动，直至1975年回到北京，返京后，在石油工业部下属企业从事技术工作。1978年恢复党籍后，先后在中国社会科学院工业经济研究所及新设立的国家经济委员会任职，官至国家经委副主任。1987年起，任中共上海市委副书记、市长，后于江泽民出任总书记后