府迁至重庆北碚，为了同省地质调查所相区别，1941年正式定名为中央地质调查所。1930年代起，翁文灏、黄汲清、尹赞勋、李春昱等人先后担任所长。抗日战争胜利后，中央地质调查所迁回南京。1949年中华人民共和国建立后，中央地质调查所被接收（1978年，在台湾的中华民国政府恢复设置中央地质调查所，即今之经济部中央地质调查所）。1950年8月，中华人民共和国政府决定成立中国地质工作计划指导委员会，任命李四光为主任委员，尹赞勋、谢家荣为副主任委员，统一领导全中国的地质工作，全国地质机构开始大规模调整，中央地质调查