分别在巢湖附近的凌家滩文化与太湖附近的崧泽文化形成雏形，由涵盖苏南浙北地区的良渚文化集其大成，莫角山遗址群组成了一座庞大的都邑。四川盆地的文明要晚于其余两地区，但宝墩文化突然崛起之时兴建了规模很大的龙马古城（宝墩古城），之后也陷入了芒城、双河、三道堰等城邦对峙的局面。
新生代文化.在新生代文化时期（约公元前2000年至公元前500年），长江早期文明约在前2300年良渚古国消亡而开始走向衰败，至公元前2千纪初，整个长三角区与长江中游区的文明都被新的文化所中断，四川盆地还有鱼凫古