身上的方向幕则採用E231系只能显示橙绿两色的LED方向幕，但尺寸较E231系的大。
车厢.因为车体进一步扩阔并採用外悬式车门设计（E993-1除外），使E993系车厢比E231系扩阔80mm。另外，为了方便行动不便的乘客（无障碍环境），车厢与月台的高度差降低至65mm。E993系也以较容易循环再造的物料制造车厢地板和装潢用部件。至于车厢设计，基本上是通勤型设计，只有E993-1车厢的中央部份是採用特急型设计。E993系的通勤型车厢进行多种实验，单是座位就已经採用了三种新制座位