肇庆又成立了两个南明政权：隆武帝之弟唐王朱聿鐭（1646年）继位于广州，改明年为绍武元年；桂王朱由榔（1646－1662年）称帝于肇庆，改元永历，是为明昭宗。绍武、永历二帝也不能团结，甚至大动干戈，互相攻伐。绍武政权仅存在40天就被清军消灭。揭阳的益王朱由榛（1647年）、夔州的楚王朱容藩（1649年）称监国与永历帝争立。郑成功也在南澳一度立淮王朱常清（1648年）为监国，后废。永历帝在清军进逼下逃入广西。
农民军加入.正当南明政权一个接一个地覆亡，形势万分危急之际，大顺农民军余部