北京方庄东方医院，医生曾为其做开颅手术，于10月28日因6时整在院内逝世，遗体告别仪式订于同年11月3日上午11时整在北京市东郊殡仪馆举行。2007年11月3日，他的追悼会在东郊殡仪馆举行，政府对此严加戒备，限制或者阻止有关敏感人士参加。六四伤残者齐志勇因试图瞻仰包遵信遗容并参加追悼会，11月2日，星期五被警方带走。民间维权人士胡佳被严密监控，处于软禁状态。胡佳曾同齐志勇前往东方医院，试图瞻仰包遵信遗容，但未能如愿。2008年10月28日，包遵信去世一周年即举行骨灰下葬仪式，数十名各领域的民主人权人