随宋太宗北征北汉太原，回京后，为中书舍人，参与修纂《太祖实录》。太平兴国七年（982年），因为秦王赵廷美之案，李穆被弹劾，改为司封员外郎。太平兴国八年（983年），同知贡举，再任中书舍人。为翰林学士、知开封府，惩治奸猾、豪右。宋太宗晋升他为左谏议大夫、参知政事。太平兴国九年（984年），李穆去世，赠工部尚书。李穆为人质朴忠厚，谨言慎行，待人宽厚，好荐后进，深信佛典，善谈名理。