2010年7月的二次转会期间，孙祥加盟当时在中甲联赛的广州恒大并帮助球队得到冠军升入中超，随队获得中超冠军、亚冠冠军并参加国际足协世界冠军球会盃。2015年，孙祥回到上海加盟上港集团足球俱乐部。在2015赛季与申花的德比中，孙祥因掌掴并辱骂申花外援卡希尔，以及在队友关心对手倒地情况时将其拉开，而遭到广泛抨击。加之孙祥曾在出席申花俱乐部成立周年庆典时，故意穿着带有上港集团队标志的外套，因而被认为他对培养自己的申花俱乐部缺少基本的尊重。2016年孙祥在7月对阵申花的上海德比中的一次故意阻挡对手前进犯规，