但碍于通讯上的障碍，导致清廷不知朱濆舰队之意，发生冲突。同年，闻官军将围剿蔡牵于台湾，朱濆自广东驾驶船只来台与蔡牵会合。与清廷于海上产生会战，同年九月，将汀州镇总兵李应贵击毙于大胆洋，进而进犯台湾，自鹿港北上淡水，活动于鸡笼港内。然而遭南澳总兵王得禄突击，大败朱濆，使朱濆逃亡噶玛兰，朱濆与当地土番合作，开垦苏澳港，以作为自身的根据地。后五围头人陈奠邦与台湾知府杨廷理通风报信，杨廷理与王得禄会师后，进攻噶玛兰，二次击溃朱濆，朱濆挟十六艘小船仓惶逃跑。 
第三次.嘉庆年(180