台湾为太平洋鸟类迁徙路线的中间站，关渡平原则成为其中的候鸟休息点或渡冬地。最好的赏鸟时机为秋冬两季，有各种鹬鸻科、雁鸭科等冬候鸟，在秋季休息再南飞或定居渡冬。到了春季则陆续北返。夏季的夏候鸟主要为燕子。其他常见的留鸟有红冠水鸡、乌秋、鹭鸶、矶鹬及白腹秧鸡等等。
红树林.在关渡堤防外侧为一片由水笔仔（"Kandelia candel"）所构成的红树林纯林。水笔仔是台湾现存4种红树林植物中唯一能够生长在台湾北部的植物种类。红树林植物生长在河海交界、潮汐往返的高盐湿地。而水笔仔为了