留下妇孺和其他的平民。他先后于1987年和1988年3月16日至少两次命令伊军战机和直升飞机向库尔德人聚居的城市和村庄大量投掷包括芥子气、神经毒气和沙林等国际公约禁用的化学武器，长达五个小时。此次作战共造成近18万库尔德人死亡（包括大量妇女儿童，以及在性别灭绝中秘密屠杀的库尔德年轻男子），约2000条村庄被捣毁，以及整个伊拉克北部地区大范围的彻底人口迫迁。在一盘1988年5月26日录制的录像带里，在主持一个会议的马吉德发言说：“我要连续15天用化学武器来攻击他们！然后，我会宣布，缴枪不杀，如不缴枪，他们就会