十三营之变后袁崇焕打算重新布局战场给将领掌管，向崇祯帝建议分成扼守关内山海关、一片石的平辽将军，及关外宁远、锦州的征辽前锋将军两部。其中建议以何可纲专防宁远城，并且称赞「仁而有勇，廉而能勤，事至善谋，其才不在臣下。臣向所建竖，实可纲力。」。袁崇焕又说，赵率教、祖大寿与何可纲这三人是抗清三将，不论成败都愿意与此三人同生共死。崇祯帝听从他的建议后，让何可纲协助崇焕更新军制，该年节省军饷居然有一百二十万有余，可见何可纲的能力甚佳。之后崇祯帝认为何可纲以春秋二防有功，进职右都督。 　　
己巳