功军队围困9个月后，城内严重缺乏食物和饮用水，许多人死于水肿、腹泻和坏血病，教堂和仓库里到处是生病和受伤的人，被迫投降而缔和。揆一带着1000多名荷兰人与其眷属离开台湾，陆续回到巴达维亚（今雅加达），揆一立即受到军事审判，以失去公司重要财产之罪，被判终身流放到班达群岛以西的艾一岛（Pulau Ai），直到12年后（1674年）揆一的子女、朋友向威廉三世陈情，并以25000荷兰盾（约合白银7000两，银元9700元）赎出揆一，在威廉特赦下回到荷兰，同时要求揆一不得再过问任何与东印度公司有关事务，以后住在阿姆斯