质在可可粉中的含量都高于可可脂和巧克力浆。每100克可可粉含有约230毫克咖啡因和2.057克可可碱，而可可豆的其他产品大多不含这些成分。可可粉还含有 (N-caffeoyl-L-DOPA)。
黄酮类化合物.可可粉含有丰富的黄酮类化合物，该化合物的含量取决于可可粉的加工和制造过程。碱化会使其黄酮类化合物的含量大大降低。
安全性.可可粉可能含有镉。镉是一种有毒的重金属和潜在的致癌物，在一些可可生产地的土壤中发现天然的镉含量很高。2019年1月1日起，欧盟规定