同他人一起对约翰逊的助手鲍比·贝克（）展开调查，但沃伦委员会之后就阻止了进一步调查，库珀对此谴责这是一种“撇清”行径。1964年7月，他提议成立参议院标准和行为特别委员会，次年7月，他进入该委员会任职。1965年，库珀成为美方代表飞往马尼拉，出席设立亚洲开发银行的会议。库珀倡导小型企业和农业利益，他于1965年4月投票反对旨在扩大联邦贸易委员会权力，授权该机构规管香烟广告的法案。1966年3月，他提议为美国煤矿工人联合会支持的一项煤矿安全法案增加修正案，根据修正案，如果新法案对小型煤矿的安全改善没有助益