加强照顾台湾南部地区荣民、荣眷及一般民众的医疗服务，促进医学发展，于1984年正式筹建「台北荣民总医院高雄分院」，并列为行政院「十四项重要建设计画」子项目之一。
分院.
高雄荣民总医院屏东分院.地址为屏东县内埔乡龙潭村昭胜路安平1巷1号，2010年由龙泉荣民医院改制
高雄荣民总医院台南分院.地址为台南市永康区复兴路427号，2012年由永康荣民医院改制
高雄荣民总医院屏东大武分院.地址为屏东县屏东市陆军航