。但是这些战役已经损害了他的健康，他放弃了指挥权。在1603年的瑟姆中，针对国王发起的政府改革与强化王权方案，扎莫厄斯基领导反对派进行坚决抵制，他同时也反对齐格蒙特对俄罗斯的侵略战争。直到1605年的一月瑟姆中，他仍与国王持续作对，并在同年6月3日因中风而突然病逝，大笔财产由独生子汤玛斯·扎莫厄斯基继承。他死后，国王得以发动对俄战争。
影响.1580年，他建立了扎莫希奇，这座城市由意大利建筑师贝尔南多·莫兰多设计建造为文艺复兴时期的“理想城市”（""）。扎莫厄斯基积攒了大量的财