新文化运动期间发表《家族制度为专制主义之根源论》，1919年11月，吴虞在《新青年》6卷6号发表《吃人与礼教》，大力攻击「吃人的礼教」。胡适称他是“只手打翻孔家店的老英雄”。曾任《西成报》等报纸主编。但吴虞本人却抱怨女儿长大后就开始不肖。1920年他任北京大学、北京高等师范学校国文系教授。晚年，他任教于四川大学。1949年在成都病逝。