埃尔的早年生活记载甚少。由于曼努埃尔并不支持其父安德洛尼卡夺取拜占庭皇位的行动，且姓名首字母不符合当时流行的AIMA预言，尽管他是长子，他并没有被父亲指定为继承人。曼努埃尔大约在1180年前后娶了格鲁吉亚国王的女儿，他也因此成为了后来的格鲁吉亚女王塔玛丽的联姻兄弟。1185年9月，曼努埃尔的父亲被伊萨克二世废黜、篡位并杀害，他也被致盲。在1185年之后曼努埃尔再也没出现在历史记载中，他可能正是因被致盲引发伤口感染而死。
家庭成员.通过与鲁苏丹的婚姻，他们共有两子：1.阿