951年独立并划归华东卫生部的原南京大学医学院更名为第五军医大学，从此原中央大学各院系踏上了独立发展的道路。调整后的工学院师生众多，因此留在当时南京最大的校园——原中央大学四牌楼本部。1952年至1953年，又有武汉大学、浙江大学、复旦大学、厦门大学、交通大学、山东工学院等校部分专业先后并入1952年夏院系调整，原南京大学物理系留下沙玉彦为首的少数教师，加上外校调入的部分物理教师，组成南京工学院物理教研组。1952年夏院系调整后，中央大学的一枚官方印章——关防印信由南京工学院保存。现藏于东南大学档案