C含量约为42%），CpG位点的出现概率应为0.21*0.21 = 4.41%；而人类基因组中CpG的实际含量约为1% -- 这尚未达到随机概率的四分之一。根据E Scarano等的论文，这一现象发生的原因是嵴椎动物基因组中CpG的胞嘧啶被甲基化为5-甲基胞嘧啶后再发生脱氨作用变成胸腺嘧啶，从而形成了从C到T的突变，致使CpG位点的出现概率降低。这种现象被称为（CG suppression）。
CpG岛.CpG岛是一个富含CpG位点的区域，但客观精确描述所谓“富含”的定义尚不明确。