工团体（德国人与爱尔兰人）的纠纷以及疾病困扰不断，而因为巨岩点到哈珀斯费里之间沿波多马克河的路廊狭窄，运河公司还与巴尔的摩与俄亥俄铁路公司因此打起官司，后来双方同意共享路权。运河终于在1834年通航至哈珀斯费里与马里兰州的威廉斯波特，并于1839年通至汉考克。运河在南北战争中严重受损。战后虽然营运良好，公司也尽力偿还部分贷款，但洪水以及其他问题仍然困扰运河。在1889年发生一次大洪水，使得坎伯兰有18个月无船只航行。嗣后运河所有权落入巴尔的摩与俄亥俄铁路公司，但铁路公司的主要目的是为了避免路权落入竞争的