火车票（IC卡）及储值车票，以配合公交化计划。自动售票机与地铁一样采取触碰式点击购票，可使用10元、20元、50元及100元人民币纸币。乘客在自动售票机购买IC卡车票后，经入闸机检票系统检票即可上车。2009年2月20日起，广深铁路股份有限公司与中国工商银行（深圳市分行）合作推出「广深铁路牡丹金融IC卡」，该IC卡分信用卡和借记卡两种，均属中国银联卡。持卡人可直接刷卡乘搭广深「和谐号」动车组，并可选择座席及等级。。2009年3月20日起，广深铁路公司在广深城际列车推出「广深铁路快通卡」，此储值卡的发