尚未架设电信设备，加上当时该地区的交通联系尚未开拓，导致台湾总督府决定延后开设东海岸两座气象站的时间。1901年1月1日，台湾总督府终于在今日台东气象站的位置成立气象观测站，当时称为台东测候所，并且直接隶属在台湾总督府之下。而初期，台东测候所曾借用台东厅第一室来充当办公室进行气象数据的监测与分析，每天固定定时观测6次。台东测候所的成立，也成为了台湾东部地区正式首度拥有气象观测业务。1943年，台东测候所从原先每日观测6次改为每天观测3次。
战后至今.1945年10月，第二次