元朝，任义兵元帅，勇悍善战，有弟朱亮元、朱亮宗。至正十七年（1357年），为朱元璋所俘，投降。后参与鄱阳湖水战，进军武昌，升广信卫指挥使。元至正二十七年（1367年）九月，朱元璋遣朱亮祖、汤和、吴祯、廖永忠出兵浙东讨方国珍。朱亮祖进攻台州，其部将严德破关岭山寨。洪武元年（1368年）九月，朱亮祖进攻台州，方国瑛奔黄岩。朱亮祖追至黄岩，方国瑛又逃亡海上。十月，亮祖从太平岭进克温州，方明善挈家逃走。亮祖分兵徇瑞安，守将谢伯通以城降。又随征南将军廖永忠平定两广。洪武三年（1370年），封永嘉侯。次年参