牟氏水龟于4月末及6月初冬眠后繁殖。牠们会在草丛或水藓丛中筑巢。春天大部份时间都是在交配，每次会生2-5只蛋。牠们会将蛋生在草丛没有遮蔽的地方，由得它们自行孵化。孵化期为7-8星期，可能要过了寒冷季节才会孵化。幼龟只有2.7厘米长，很多时会成为鸟类及哺乳动物的猎物。牟氏水龟到了5-8岁就会达至性成熟。牠们的寿命不详，但相信可以活到30-40岁。
威胁.土地开发令牟氏水龟的栖息地被淹没。只剩下破碎化的栖地，这令牠们的族群分散。分散在各破碎栖地的亚族群难以与其他的族群有基因交流，