联合定关中，奉昭宗回长安，刘仁恭以契丹正入侵为由推辞。四年（897年）九月，昭宗加王郜宰相衔同中书门下平章事，加检校司空，又进太保。十一月，朱全忠大举进攻淮南节度使杨行密但在清口之战中被击退，便说服镇海军和镇东军节度使钱镠、镇南军节度使钟传、武昌军节度使杜洪、平卢军节度使王师范指称被杨行密攻打，请求昭宗以朱全忠为都统讨伐杨行密，王郜则与护国军节度使王珂、李克用、王镕指称被朱全忠攻打，请求以杨行密为都统讨伐朱全忠。昭宗拒绝双方所请。
败逃.光化三年（900年）七月，王郜盟友河东节度使