管辖桃园国际机场、台北松山机场、新竹科学工业园区、台北邮局区域，负责空运进出口货物与出入境旅客行李的通关业务、新竹以北地区保税工厂与新竹科学工业园区保税业务以及苗栗以北及台东、花莲的国际邮包进出口通关业务。
历史.1969年，财政部在台北市设立「财政部台北关」，并将台北关税务司公署（今财政部关务署基隆关）所辖的驻松山机场支所、驻台北邮局支所及退税课改隶台北关。1971至1975年，增设人事室、保税组、总务室、缉私组（缉案处理组）、秘书室、会计室、业务组（进口组、出口组）、稽查组