日军投降，三年零八个月的日据时期正式开始。战时，东华三院派出了救护车接送周寿臣到东亚银行地库，逃避日军飞机的轰炸。日军佔领香港后，便採用「以华制华」的策略，招抚当时仍留在香港的华人领袖，达至稳定人心。身为华人领袖的周寿臣别无他选的情况下，与罗旭龢、罗文锦、邓肇坚等人在日军指示下成立「香港善后处理委员会」，处理粮食、治安等问题。矶谷廉介于1942年上任后便解散了委员会，改为成立香港华民代表会及香港华民各界协议会，成为日方与华人的沟通桥樑，而周寿臣为香港华民各界协议会主席。华人领袖凭自身的特殊地位，协助华人