明色遭控副主谋（主谋欧清石），而郭国基为营救张明色奔走，也遭指控通谋美军轰炸高雄港、炸毁高雄军事设施，并在监狱中遭「廿四名无情汉，用卅六种刑具」刑求，屈打成招之下承认接受蒋介石资金反叛日本。郭国基在一审被判无期徒刑，复审改判十年有期徒刑。在日本投降前夕保外就医。郭国基其妻铃木久代在此段期间常遭到日本右翼份子羞辱，说她是日本人竟嫁给殖民地人民为妻，而且居然还敢谋反，令铃木久代以泪洗面。
步入政坛.
战后初期.1945年，日本投降。在东港事件遭刑求的郭国基曾邀