为建州卫论》。同年（1907）与何震双双归国，投奔两江总督端方幕府，从而背离了反满阵营，也放弃了无政府主义。刘师培在端方幕府中继续钻研经史，并为《国粹学报》投稿，年方二十余，巍然已为经学大宗。宣统三年辛亥（1911），任参议官，随端方领兵入川，弹压保路运动，途中，端方为乱军所戕，遂逃往成都，讲学于四川国学院。
支持帝制.民国肇造，革命元勋章太炎与蔡元培舍弃前嫌，联合发表启事，吁请刘师培出山论学。民国二年（1913），师培至山西太原阎钖山幕府，任高级顾问。民国四年（1915）至北