蕃客，成为回回人的一部分。明代仍习惯地沿袭这种称唿，把伊斯兰教称作回回教门、回回教，后又被简称为回教。
中国化.明朝政府对穆斯林采用歧视政策。朱元璋推行民族同化政策，蒙古人、色目人同族不得自相嫁娶的诏令，洪武六年闰十一月颁定《大明律》时，将此诏收入其中，强行推行。与此同时，朱元璋又下诏“复衣冠如唐制”，对蒙古、色目等少数民族的“辫发椎髻、胡服、胡语、胡姓一切禁止”。在这种政策下，留居中国的回回人，逐渐和汉人融合，以汉话为母语，改为汉姓，不少清真寺亦貌似中国建筑，但这些族群依然保留着