悬挂之后，由于吹西北风，受到地形屏蔽，境内风势并未增强，最大平均风仅每小时38公里（相当于5级风），出现于流浮山与大老山；即使后来当百合西移至香港北面，境内转吹西南风，香港海平面风势仍然极弱。随着百合减弱为一低压区，天文台于晚上10时40分除下所有热带气旋警告信号，悬挂信号期间并未造成人员伤亡。百合是天文台有气象纪录以来，风力最弱的三号信号之一，亦是天文台最后一个以悬挂方式发出热带气旋警告信号的热带气旋。9月20日，由于百合开始逼近华南地区，澳门于当日下午2时38分录得当时最低气压992.0百帕（毫巴，