式月台，六个出入口。本站设有半高式月台门。
车站月台.在板桥线「新埔—府中」段与土城线通车前，由于作为端点站的新埔站两端并无横渡线（剪型道岔），依设计向下行方向最近要到亚东医院站下行端才能调头，电联车换轨必须利用江子翠站上行端的横渡线进行，因此列车于站内的两个月台均採用单线双向运行、停靠的模式（两面月台墙上皆装有停站列车运行方向显示器，如同2014年10月前的小南门站，现在已经拆除）；直到后段连同土城线通车后已经恢复原有的列车行进方向设定（1号月台为上行月台；2号月台为下行月台）。