长与朱商彝即刻潜逃回大陆，而周慎源选择逃亡南部。
加入共产党.四六事件之后，名列逮捕名单之列的周慎源被通缉，1949年周慎源逃亡经由叶城松引荐加入中国共产党，周慎源受张志忠领导，并与简吉、黄培奕一起担任南崁及竹围工委会干部，与林元枝等人发展组织，周慎源领导张阿屘等，由张阿屘领导徐文风、郭承庚、柯有亮、杨阿木等共十人，并收留王子英及简文宣，由于林元枝手下庄文传企图自首遭周慎源知悉，周慎源安排张阿屘处决庄文传，但张阿屘等人拒绝而先将庄文传看管，一周后庄文传即逃脱自首并成为当局线民。