扩编为第五十二师（今中国人民解放军第十三军第一四九师）；并编入由豫皖苏军区部队组成的第四十八师；于4月参与渡江战役。1949年8月，以第五兵团先锋向中国西南进军，并于11月占领贵阳。后又进军四川，参与成都战役。1950年1月，奉命回师贵州与未撤离到台湾的国军作战。
中华人民共和国成立后.中华人民共和国成立后，第十六军于1951年4月北上河北进行整训，留下第四十八师以及少数部队继续和贵州的国民革命军作战，后编入原第六十二军所辖一八六师。第十六军留在贵州的两个步兵团后被组建为第四十九师