城归附北魏，皇帝敕令薛初古拔前往彭城慰劳迎接。薛初古拔被授任冠军将军、南豫州刺史。延兴二年（472年），薛初古拔被授任镇西大将军、开府，进爵为平阳公。延兴三年（473年），薛初古拔与南兖州刺史游明根、南阳平郡太守许含等人以治理百姓而着称，被征召到京城，魏献文帝拓跋弘亲自慰劳他们，又命令薛初古拔回到南豫州。太和六年（482年），薛初古拔的爵位改为河东公。太和八年（484年）三月，薛初古拔被征召回朝，突然生病去世，虚岁五十八，朝廷赠予左光禄大夫，谥号康。