阶俊博加入了保守党，并被新任联合内阁的总理森喜朗留任；同年7月，他出任保守党的国会对策委员长，隔年更担任了保守党干事长。2002年，保守党改组为保守新党，他担任了保守新党干事长。翌年，保守党被自民党并入，而成为了自民党的一个派系，这个派系由他领导。2004年9月，他担任了自民党总务局长。隔年的日本国会大选，因为他的选战策略对自民党获得众议院大选胜利有重大作用，同时还领导派系在大选中获得重大胜利，派系成员扩大3倍。在同年的内阁改组中，被首相小泉纯一郎论功行赏，出任经济产业大臣的重要职务。2006年9月，安