变当地的土壤生物化学及降低草原上原生植物多样性。如果缺乏有效控制，石茅的密度将会大幅增加，同时影响当地农作物收成。圣安东尼奥河是不少动物的栖息地。流域内常见的两栖动物包括、美国牛蛙、里奥格兰德豹蛙、、拟鳄龟及红耳龟等，而哺乳动物则包括浣熊、白尾鹿、九带犰狳、东部棉尾兔、领西貒、负鼠及郊狼等。另外，常见鱼类包括大口黑鲈、铲鮰、长耳太阳鱼及钳鱼等。河岸湿地以及圣安东尼奥市内的绿道和公园亦吸引不少林地鸟种和候鸟栖息，包括火鸡、鹌鹑、鸽子、苍鹭、鸣禽、角鸬鹚、绿头鸭及鱼鹰等。除此之外，濒危的美洲鹤及奥氏角雉亦在