羁縻地区也设立都督府，一般以一个国家政权或者民族部落为一个都督府，以国王或者酋长担任都督。
元明.元文宗天历二年（1329年），始立钦察亲军都督府，后改大都督府。韩宋龙凤七年（1361年），吴国公朱元璋改改枢密院为大都督府。明太祖洪武十三年（1380年），大都督府改为五军都督府：中军都督府﹑左军都督府﹑右军都督府﹑前军都督府﹑后军都督府。
民国初年.辛亥革命后，各省设立都督府主管本省军政，如鄂军都督府、沪军都督府、云南军都督府等，后来改称督军府或省政府。Se