系66个专业的万余名学生进驻。在新校区建设中存在一些腐败问题，如2011年9月，原郑州大学新校区建设办公室副主任李大林因收受承建单位所送贿赂人民币11万余元、2万美元被郑州高新技术产业开发区法院以受贿罪判有期徒刑十年。2004年2月27日，教育部部长周济与河南省省长李成玉在省部共建郑州大学协议书上签字，郑州大学正式成为国家教育部与河南省人民政府共同建设重点大学，也由此成为全国第一所省部共建大学。同年七月，与北京大学签订合作办学协议。2007年5月30日，郑大通过教育部本科评估工作，成为教育部本科评估优秀