学校董会议决聘凌宪扬为代校长，以5个月为（试用）期，同时还批准了樊正康的辞职请求，并且“为酬答樊校长过去对于本校之功绩起见，议决准函请设立人会资助出国考察深造”，沪江大学对其家属的津贴大约等于樊正康一年的薪水。1946年7月4 日，沪江大学校董正式选举凌宪扬为校长。此后，樊正康离开教育界，参加了1948年成立的中华浸信会全国联会，担任执行干事。1948年2月14日至17日，中华浸信会全国联会在上海怀恩堂召开会议，浸会的主要领袖戚庆才、刘粤声、唐马太、希祝虔（Eugene L. Hill）、樊正康、金炎青