6月，由林务局编辑出版的《能高越岭道：穿越时空之旅》勇夺第四届国家出版奖－优良政府出版品之特优奖。2012年11月15日，吴三连奖基金会表彰杨南郡以登山为基础，研究台湾高山古道与原住民社会，对报导文学深具贡献，颁赠第35届吴三连奖文学奖报导文学类。林怀民曾赞誉其文章具备「冷静的人文关怀」，当天排除万难担任赠奖人。2014年起，因癌症进行治疗，病中仍辛勤翻译鹿野忠雄大作《东南亚细亚民族学先史学研究》，并与妻子徐如林共同写作《合欢越岭道：太鲁阁战争与天险之路》。2015年以《浸水营古道：一条走过五百