基因铭印（）又译遗传印记或遗传铭印（genetic imprinting）是一种遗传学现象，指只有来自特定亲代的基因得以表达，而不遵从孟德尔定律依靠单亲传递某些遗传学性状的现象。此现象已知可见于昆虫、哺乳类动物及开花植物。在一般二倍体生物的体细胞中拥有两份基因组，通常这两份基因组中的等位基因都能表现。但少数（小于1%）的基因会受到铭印的影响，使其中一份基因失去作用。例如一种制造类胰岛素的生长因子的基因，只有来自父亲的等位基因能够表现。