信会和美国圣公会等也陆续抵达苏州，建立起自己的传教、教育和医疗事业。1869年，美南监理会蓝柏和华人曹子实在十全街五号殷勤山屋设堂布道并建存养书院。1872年，美南长老会杜步西夫妇亦来苏，在葑门城桥头设学，并在养育巷购地自建教堂（1925年重建，名思杜堂）。民国时期，苏州教会发展日益迅速。五卅惨案前后，爱国人士不满帝国主义奴役中国，发起非基督同盟运动，遭官方查禁。在这同时，基督教内部也开展本色运动，发起了请求和平活动。教会中有识之士也适应潮流，聘华人任教会学校和医院负责人。1928年，杨永清任东吴大