属台南州，郡役所设于北港街。北港郡管辖北港街、元长庄、四湖庄、口湖庄、水林庄。辖域即今云林县辖北港镇、元长乡、四湖乡、口湖乡、水林乡等地。
后续发展.1945年3月重庆国民政府通过之台湾接管计划纲要地方政制中，将北港郡与虎尾郡合併为北港县，为该地方政制的9个一级县之一。1945年10月，因台湾省行政长官公署认为该政制不符实际，因此「台湾接管计划地方政制」并未实施，而一级县北港县区划也未列入行政区划。改为原州厅为县，原郡改为县辖区，原街庄改