2005年1月重新设计了解析和渲染程序，这带来了显着的性能改进，使得DokuWiki可以应用于更大的文档项目。同时也为DokuWiki引入了一种通用的插件接口，简化了插件的开发和管理。2005年4月和7月，Linux发行版Debian和Gentoo Linux引入DokuWiki，提高了其知名度。2012年1月发布的新版本使用jQuery重写了核心代码，从旧版本升级的用户可能会遇到不少兼容性问题。2012年10月发布的新版本兼容HTML5标准。维基农场被集成到DokuWiki核心中，可以方便