《默克索引》（）是由美国默克公司出版的记录化学品、药物和生理性物质的综合性百科全书，收录超过一万多条有关个别的物质和其相关化合物的专题文章。本书亦于附录中收录有关有机化学的人名反应。默克索引亦设有订阅的电子检索形式，普遍被参考图书馆所採纳，以及在网上查阅的形式。有中译本。默克索引于1889年首次出版，2013年起改由英国皇家化学学会（Royal Society of Chemistry）发行第15版，但仍维持原书名。默克索引的专题文章函盖范围包括：