他取人心、眼睛来制药的谣言出现，受到挑拨的民众，包围医馆，扬言拆除礼拜堂，并出手攻击教会的人，终至引发大暴动，是为「看西街事件」，知县请马雅各在 3 日内撤离。马雅各在府城落脚才短短23天，不得不转移阵地。
苏格兰长老教会.约翰·诺克斯（1514年－1572年11月24日）是苏格兰长老会的创立者，他领导宗教改革，导致1560年苏格兰宣佈废除天主教信仰，接纳新教。1561年起，约翰·诺克斯曾于爱丁堡住了11年。长老教会主义在苏格兰形成的过程并不顺畅，大约经过130年大量流血和牺牲，甚