，朝廷征召邦华出任天津巡抚。迁光禄少卿，擢右佥都御史。后被魏党削官。崇祯元年（1628年）四月，起工部右侍郎，不久改兵部。崇祯二年（1629）四月为兵部尚书，综理京营戎政，同年九月，“汰京军虚冒者四千五十余人”。十二年（1639年）四月，起用为南京兵部尚书。崇祯十五年冬，代刘宗周担任左都御史，十六年三月抵九江。安抚宣称要就食南京的左良玉，权宜发九江库银十五万及粮食六个月，遂退其兵。崇祯十七年（1644年）二月，李自成陷山西。邦华请帝固守京师，未得反应。十八日，外城陷，逃至文信国祠，十九日，内城亦陷，