造型商标扯上关系。山下也用了一个使之有像地球一样观感的手法。当初有人倾向保留旧的Logo，所以最后採取了折衷方案：旧标志仅作稍微修改，然后背景放上一颗苹果。SEELE的标志也设计了新的。零在片中时常阅读着王尔德的名着《快乐王子》，书籍设计由庵野的妻子安野梦洋子负责。
使徒、屋岛作战.团队在制作第4使徒会发光的核时，透过CG技术进行叠图，使用的图片包含一束光映在广阔水面上的照片和银河系的影像。第5使徒的登场是曾出现在TV版第3话的场面，制作团队大改了其造型和诠释方式，将身体加上发光素