天桥连接。紧邻站房旁的是侧式月台及4号线，岛式月台则为2号及3号线，没有1号线，但站内设有几条其他用途的侧线。新旭川所属的宗谷本线本身并没有电力列车行驶，但因旭川车站周遭的再开发计划「北彩都旭川」（）之影响，JR北海道将旗下所属的旭川运转所搬迁到北旭川车站附近。因此，为了提供回送至旭川运转所的函馆本线列车所需之电力，新旭川站内除侧线外的路线皆已全面电气化。目前为无人车站，但站内设有自动售票机及厕所。至于货运站部分，目前新旭川是JR货物车携货运（）业务的临时收发站，仅靠公路运输进行货物的运送，没有