建台湾糖业关键的一员。1945年，于「台湾省特派员办公室」担任专门委员兼糖业组组长、「台湾糖业监理委员会」担任主任监理委员。隔年，糖业从监理期进入接管期，沈镇南任「台湾糖业接管委员会」的主任接管委员。1946年5月1日，台湾糖业公司确定由资委会及台湾省行政长官公署联合办理，沈镇南奉命成为其第一任总经理。
在台糖的生涯.糖业是台湾在日治时期最大的工业，他的产值占总工业产值的65%，但是，在第二次世界大战时，几乎所有的制糖设施及工厂等皆遭破坏殆尽。在1945年日本无条件投降后，沈镇南受