台平章事，成为宰相。武则天与宰相商议如何任命管理州县官吏，纳言李峤、夏官尚书唐休璟建议以朝中台、阁、寺、监等各部门，选择其中优秀官员，分典大州。韦嗣立带头以本官检校汴州刺史。不久韦承庆接替韦嗣立任宰相，韦嗣立转任成均祭酒（国子祭酒），兼检校魏州刺史。又徙洺州刺史。神龙元年（705年），韦承庆因坐附推张易之弟张昌宗失实，被贬流放岭南循州（今广东龙川县），韦嗣立受株连贬为饶州长史，一年后，征为太仆少卿，兼掌吏部选事。神龙二年（706年），为相州刺史，十一月，韦承庆卒，韦嗣立接任黄门侍郎。转太府卿，加修文馆学士。