城厢，初步勾勒出了今徐汇区的滨江地带。至元朝至顺年间，吴淞江因河道淤积愈发难以通行，大中型船只开始改走江面更宽的黄浦江航行。吴淞江成了今天的苏州河。北宋时期，以吴淞江为界，以南仍为华亭县，以北归入昆山县，崇明地区属海门县。徐汇区区境受华亭县管辖，直到南宋灭亡。元至元十四年（公元1277年），华亭县升府，次年改称松江府，仍置华亭县，徐汇区区境继续受华亭县管辖。至元二十九年（公元1282年）松江府下设2县，南部仍为华亭县，北部新设上海县，明末再增设青浦县。徐汇区区境改辖于上海县高昌乡，直至明末。随着