舰队进行夏季巡航任务；在这段期间内，舰队于5月10日至6月24日期间访问法国本土及法属北非等多个港口。1905年7月3日至8月1日期间，耶拿号参与年度机动演习。1905年11月16日，海军准将取代巴尔诺接替舰长一职。1906年4月12日至17日期间，维苏威火山突然爆发，法国海军事后派遣耶拿号等舰前往拿坡里提供援助。自1906年7月3日开始，耶拿号随地中海分舰队与北方分舰队一同参与联合机动演习，整场演习于1906年8月4日结束。演习结束后，耶拿号开始进行数个月的改装工程，不过在这期间仍参与1906年9月16日