时，杨光先再次上书声称汤若望管理的钦天监为几年前入葬的荣亲王选择葬期、山向“俱犯杀忌”。由此鳌拜更加重了刑罚，判处汤若望和七位钦天监华人官员杜如预、杨宏量、李祖白、宋可成、宋发、朱光显、刘有泰凌迟处死。康熙四年三月一日（1665年4月15日），北京发生大地震，群臣请旨大赦。三月二日释放囚犯1200多人，但四位传教士未释放。三月二日当天下午，又发生一次地震，乃请旨开释利类思、安文思、南怀仁。当时汤若望的死刑尚未赦免，仅将凌迟改为斩监候。从三月三日到三月五日，北京又发生多次地震，顺治帝之母孝庄皇太后以天谴可畏，