同年，把家督让予嫡子长房，不过只是在形式上退位，实际上没有隐居，继续政务上的活动。
晚年.文禄元年（1592年），在文禄之役中，驻守肥前国名护屋城，虽然请求渡海参战，不过没有被允许（『吉川家文书』）。文禄2年（1593年），在大友义统被改易后，与山口宗弘一同负责在丰后国的检地。同年，在因幡国巨浓郡蒲生乡荒井村开拓，受秀吉委任经营银山。文禄3年（1594年），参加伏见城的，并在这段时期，知行加增至8万1千石。庆长元年（1596年），因为高齢而隐居。晩年，成为秀吉的御伽众，负责与秀吉讨