始学校再次受到政治影响，说荷兰语的教授和学生要求将说法语的人士赶出学校，两方发生严重冲突。当时的比利时首相范登·博埃南不同意学校分裂，结果比利时政府中有八位弗拉芒族的大臣自主离职，导致内阁空虚；范登·博埃南无力支撑局面，不得不宣布辞职。新大选之后，比利时政府最终作出裁决：天主教鲁汶大学一分为二。1970年，天主教鲁汶大学正式分裂成两所大学：（荷兰语）天主教鲁汶大学（KUL，简称荷兰语鲁汶)与（法语）天主教鲁汶大学（UCL，简称法语鲁汶）。前者留在原址，后者绝大部分系迁往新建的新鲁汶，其医学院迁往布鲁塞尔附近