寺为“圣朝无忧王寺”，并为塔提名为“大圣真身宝塔”。在文宗开成三年曾更名为法云寺，但不久仍成法门寺。唐武宗会昌灭佛时，法门寺受到了波及。唐懿宗时佛教重新获得兴盛，并举行了唐朝最后一次迎奉佛骨的活动，法门寺在这时得以重修，地宫的情况在此后就未曾改变过。唐朝皇帝曾迎奉佛骨七次，每次都对寺院大施财物，这对寺塔的扩建有所帮助。法门寺经过多次修筑增建，形成了二十四院的形制。据史载“三十年一开，则岁丰人和”，可干戈平息，国泰民安，风调雨顺。咸通十五年（874）正月四日，唐僖宗李儇最后一次送还佛骨时，按照佛教仪轨，将