构造.凤林是一设置有岛式月台、侧式月台各一座的地面车站，站房与岛式月台间是以行人地下道连结。
营运状况.凤林车站是台东线沿线的主要车站之一，根据台铁的分级属三等站等级，包含普悠玛号、太鲁阁号、自强号、莒光号等对号车次与一般的区间车皆有停靠，但并没有观光列车，团体列车停靠。以台东线而言设施较为完备的凤林车站站内除了设有一台自动售票机与三具投币/卡式两用的公共电话。2016年时配合沿线票务设施的升级，本站开放使用悠游卡、一卡通、icash 2.0、HappyCash付费。