了康熙三十八年（1699年），明郑时期郑氏家族与文武官员之墓大多迁回中国大陆，以减少台湾人民思念故朝之情，然而此墓或因地处偏远，或因二人无嗣之故，而未被迁移留了下来，与藩府曾蔡二姬墓为仅存于台的郑家之墓。该墓在清朝的方志与文献中并未被记载，日治时期方始见于连横的《雅言》一书，而在该书中还记载说在此墓不远处建有庵和塔。该墓在昭和五年（1930年）时曾整修过。二次大战后，该墓于民国四十一年（1952年）被台南市文献委员会发现并整修，民国六十四年（1975年）再修，而成今貌。民国七十四年（19