事后教众分三路攻掠：林清攻直隶、李文成攻河南，冯克善攻山东，各省教徒响应。九月十五日，北路首领林清于癸酉之变攻入皇宫，二日后遭捕杀；至十二月，钦差大臣那彦成、提督杨遇春完全平定各路乱军。嘉庆十九年（1814年）伴随后续善后与审判，嘉庆帝敕军机大臣托津等人撰修，二十一年（1816年）成书进御。
参与编修人员.《钦定平定教匪纪略》卷首〈总裁总纂提调收掌纂修诸臣职名〉详列姓名与官衔。