海道本线是本站在来线的所属线。管辖公司方面，东海道新干线由JR东海管理，东北新干线等其他路线由JR东日本管理。所有路线皆以本站为起点，站内亦设有0公里距离标。旅客资讯使用的是后述的运行系统名称。旅客资讯上的「东北（本）线」意指中长距离列车，过去因在上野站开出，本站并不使用。现在上野东京线通车后，多使用在东海道新干线车内广播的转乘资讯中。而中央本线过去虽以本站为正式起点，但为了解除本站－神田间与东北本线重复的双重户籍路段，JR成立后将中央本线起点改为神田站。但现在站内依然有0公里距离标。JR东日本新干