领马六甲和新加坡，并入柔佛苏丹王朝的版图，马六甲苏丹王朝也就此灭亡了。1587年，葡萄牙人将天主教传入新加坡，又拿下苏丹国首都，并在1613年摧毁了新加坡这个岛屿的港口。整个城市变得荒凉、默默无闻，岛上也成了海盗的避风港。继葡萄牙人在东南亚的影响，荷兰、英国和法国殖民者也纷纷在东南亚建立贸易港口。1795年，英国人统治马六甲；1818年，英属印度总督指示总督史丹福·莱佛士于马六甲海峡寻找可助英国人在该区域立足之地。新加坡名义上是荷兰附属国廖内－柔佛苏丹国的一部分，但实际上由柔佛苏丹管辖，英国人于1819年