医师制度代替现行的实习制度，医学院的学生发起了医学生运动，纷争因此展开。在运动发起之后，抗争逐渐激烈，1968年3月12日的医学院综合中央馆、3月27日的安田讲堂一度遭到佔领，原订于隔日举行的毕业典礼也因而中止。6月15日医学院学生再度佔领安田讲堂，校长大河内一男引入警察驱离佔据讲堂的学生，这个举动引起校内极大的反弹。7月2日安田讲堂遭到封锁，校方为了开启讲堂，而遭到学生更大的反抗。学生们因此罢课，重要的建筑物大多遭到封锁。11月校长以下的全校主任辞职。佔领工学院列品馆的马列派泷泽征宏（，明治大学学生）