主要地铁线打上颜色标签。剑桥-多切斯特隧道因剑桥端的终点站为哈佛大学，用学校的主色调绯红色将地铁命名为红线。1968年地铁南部支线被分配了不同的字母编号。A支线为昆西支线，计划延伸至南布伦特里；C支线为阿什蒙特支线；B支线可能是为规划中的布伦特里至布罗克顿支线所预留。1994年，交通局利用新的电子标志，为线路重新分配字母编号，“A”为阿什蒙特方向，“B”为布伦特里方向，“C”为灰西鲱方向。
南部海岸线.1965年7月28日，MBTA与签署合约，购买和南布伦特里之间长达的旧殖民地