决心要在日本建立工厂。归国后就任「」，俸禄也增加了200石。
内政外交.文久元年（1861年），发生俄罗斯军舰佔领对马事件，小栗奉命处理并提出三点建言：当政者却不允其所请，小栗遂愤而辞职。文久2年（1862年），小栗就任勘定奉行，掌握了幕府财政，当时幕府为强化海军，以333万6千美元以上的价格购入外国船舰44只。而小栗则委託旧识向驻日法国公使里昂・罗什（Léon Roches）提案横须贺制铁所之计画，并欲招聘美国人经营，但当时美国因南北战争之疲弊，无力援助外国，最终招聘了里昂