988年（昭和63年）2月，政府税制调査会设立「纳税者番号等検讨小委员会，此委员会与同年的12月发表了报告书。另外1989年（平成元年）2月，14省厅关联的负责人发起了「于税务等行政分野使用的共通编码制度的关系省厅联络检讨会议」。1994年（平成6年）自治省设置了「有关构筑住民记録系统网络的研究会」。该研究会中也进行了有关住民编号以及纳税者编号制度的讨论。1997年（平成9年）1月，日本厚生省导入了基础年金番号。1999年（平成11年），小渕内阁于日本第145回国会提出的的修正法案通过了立法。根据此