衰败，在其西部，泰族人的素可泰王国和阿瑜陀耶王国相继崛起，此后阿瑜陀耶王国成为了高棉帝国的劲敌。1352年，阿瑜陀耶的乌通王包围并攻破了吴哥城，数年后高棉恢复独立。但在1394年，吴哥再度被阿瑜陀耶王攻破。高棉王博涅亚认为吴哥城无法防御，于1431年迁都金边，自此高棉帝国时代结束。
现代研究.吴哥文明的的衰落至今仍是个谜，其原因众说纷纭。一种说法认为，在15世纪30年代时，高棉帝国由于中世纪温暖时期结束，气候由夏季降雨稳定型态转为厄尔尼诺现象与干旱频繁的气候型态，以往为了支持吴