卢商以检校户部尚书被召回长安任兵部侍郎，再次判度支，九月，任为中书侍郎，授同平章事，为实质宰相，爵封范阳郡开国公，食邑二千户，加兼工部尚书。但卢商任相并未长久。大中元年（847年）二月，因发生了常被认为是神灵对重罚不悦之兆的旱灾，宣宗命卢商和御史中丞封敖复查长安狱中犯人的案子。卢商和封敖请求减免多人的死刑，但大理卿马植反对，上表宣宗称如此宽容会适得其反，招致神灵越发不悦。因同僚宰相白敏中的构陷，宣宗同意了马植的表文，三月，罢免卢商相位，出为鄂岳观察使，加检校兵部尚书。任上，辟卢肇为从事。朱庆余、刘得仁都