，由于位于连结本州岛与九州岛的关键位置，山阳新干线在此设站，所有通过此站的新干线列车皆会在本站停靠，同时纵贯九州西部的鹿儿岛本线和连结九州东部的日丰本线皆通过本站。山阳本线的列车在穿过关门海崃的关门隧道抵达终点站门司车站后，也会继续驶入小仓车站；属于地方交通线的日田彦山线的列车，实际上也是以小仓车站为起点，经过城野车站后，才驶入日田彦山线开往日田。
历史.1891年九州最初的铁路路线自福冈往北延伸至此时，设立了小仓车站，最初的小仓车站是位于现在西小仓车站的位置；1895年，连结九州