修工程从1938年开始，1940年7月完成，一个月后佛事活动恢复。
中华人民共和国时期.中华人民共和国成立后，于1956年8月将法门寺列入省级第一批重点文物保护单位。但此后庙产还是被法门镇学校占用或征为公用。文革期间，红卫兵以破四旧之名破坏殿堂和佛像，并欲挖地开塔。寺中住持良卿法师为保护佛院地宫而自焚圆寂于真身宝塔前，用自己的生命保护了塔下珍宝。后开启地宫时，仍可见当时的遗迹。其它僧侣也被遣散和迫害，寺院成为“扶风县无产阶级造反派临时总指挥部”。1979年后，陕西省拨款重修了一