越来越担心各州不团结，中央政府软弱。麦迪逊写道：“危机来临了，看美国实验是对世界的祝福，还是要辜负所有共和希望。”他特别担心国会无力主导外交事务，威胁美国贸易以及在阿巴拉契亚山脉和密西西比河地带居住扩张。麦迪逊协助组织1785年弗农山庄会议，协调波托马克河导航权，成为未来州际会议榜样。在1786年安纳波利斯会议后，他支持再度召集会议，修订邦联条例。麦迪逊在连任议员后，说服其他议员批准费城会议修宪。但麦迪逊认为失灵的邦联条例得用新宪法替换，随即准备提议。乔治·华盛顿受举国爱戴，罗伯特·莫里斯在关键的宾夕法