规划确定了深圳地铁网络的基本框架。
工程暂停和重新启动.1995年12月，国务院办公厅发布了《》，暂停审批除北京、上海、广州外其他城市的轨道交通项目。深圳地铁工程一度陷入停顿。1996年，以香港回归为契机，地铁工程更名为“罗湖、皇岗／落马洲口岸旅客过境轨道接驳工程”，强调该专案是为了满足深港过境客流日益增长的需要。中英关于香港和内地大型跨境基建协调委员会亦增设“增辟皇岗／落马洲口岸旅客过境通道工作小组”，深圳地铁项目被列为工作小组的一个重要内容。同时，深圳市政府通过研究，努力提高车