与一般的准军事组织仍有差异，因此在日本国内与法律上并不将海上保安厅视为是「准军事组织」。
与海上自卫队的关系.海上保安厅是为了确保海上安全及治安所成立的国土交通省（旧运输省）机关（外局）。任务内容包含海难救助、交通安全、防灾及环境保全、治安维持等，而海洋权益（领海警备与海洋调査）也是任务之一。舰艇相关任务是由防卫省的海上自卫队负责，船舶相关任务则由海上保安厅处理。海上保安厅是1948年（昭和23年）5月以第二次世界大战结束前的高等商船学校出身旧海军预备士官为中心所成立，而海上自