后与家人迁往东京市。1873年进入庆应义塾大学学习英文，之后于1882年毕业于东京帝国大学，并获得物理学学位。1885年田中馆爱橘发明了将日文转写为拉丁字母的日本式罗马字。田中馆爱橘曾多次前往欧洲，并且在1888到1890年间在苏格兰格拉斯哥大学跟随开尔文男爵学习，并且曾在德国柏林洪堡大学学习物理学。1893到1896年间，田中馆爱橘在日本各地测定重力场和地磁场的值，作为地球物理学研究之用。他并且在东京大学建立了地震学研究所。他还曾经建议在日本设立的其中一个观测站，之后于1899年在水泽市成立纬度观测站