廷突然转变对德川幕府的态度，以往受孝明天皇信任的容保认为是萨长军挟持了年幼的明治天皇夺取政权，他主张与萨长一战。未久，幕府军和容保麾的下会津藩兵，在鸟羽伏见与明治新政府军展开交战（史称鸟羽伏见之战）。由于对着御锦旗（菊花旗）开火，使庆喜、容保等人相继变成朝敌，加上战况不利，庆喜暗自带容保与定敬（京都所司代）等人，脱离战场同乘幕府军舰「开阳丸」回到江户。而在江户的旧幕臣中，则出现了提出从顺明治政府的恭顺派，与反对新政府的抗战派，同样的对立也在会津藩发生。对于阵前逃走，容保率直地向战场归来的臣子道歉，也让出藩主