嘉庆年间白莲教与地方人民结合，引发川楚教乱颇伤清朝国力，之后在嘉庆十八年 (1813年) 发生的天理教之乱是最后一次白莲教名义的叛乱，之后逐渐消失于历史。光绪二十四年（1898年），山东义和团之扶清灭洋运动的主要团队、有部分追溯起源于白莲教的分支派八卦教。