2号种子身分出战女子双打项目。她们首圈轮空，第二圈先以2比0轻取澳大利亚组合晋级；第三圈面对12号种子、香港组合潘乐恩、谢影雪，亦以2比0（21-9、21-16）轻松胜出；但至半准决赛，她们终以0比2（17-21、17-21）不敌队友、5号种子的田卿/赵芸蕾，8强止步。赛后，马晋表示自己在关键分上没有处理好，加上两人速度配合默契较差，所以输给队友。
2016年退役.里约奥运会后，马晋在微博上公开表示会坚持到打东京奥运会，并且开始和年轻队员配合参加了丹麦公开赛和法国公开赛。然而，及至