阿弥陀佛或弥陀三尊（阿弥陀佛与观音、势至）为本尊。日本净土真宗则于绘像、木像为本尊之外，另以名号为本尊。其名号有六字（南无阿弥陀佛）、九字（南无不可思议光如来）、十字（归命尽十方无碍光如来）等三种。日本日莲宗专崇法华经，故以《法华经》之题目「南无妙法莲华经」为本尊，或以日莲所绘的「十界劝请大曼荼罗」为本尊，或以本门之释迦及本化之四菩萨相为本尊。
分类.在曼荼罗中的佛菩萨，若以禅坐的慈容外形出现，称为寂静尊（正法轮身）；若以外形威勐恐怖的明王相出现，称为忿怒尊（教令轮身）。无