香港医学博物馆（英文：Hong Kong Museum of Medical Sciences，缩写：HKMMS）是香港一所以医学为主题的专题博物馆，位于香港岛中西区上环及半山区之间一带的坚巷2号，成立于1996年，收集并保存与香港医学发展有关的文物，用文献及实物展品介绍香港开埠以来的医科学术的发展历史。
历史.香港医学博物馆前身是成立于1906年3月15日正式启用的香港细菌学检验所，以应付当时流行的鼠疫。检验所作为首个香港专为医学化验而设的机构，初时对流行细菌病患作专门研究，随后