政使司衙门设置于城内（现址为中山堂），台北的都市雏形至此已初步建立。1894年，继任巡抚邵友濂正式将省会由桥孜图（今台中市南区）移至台北，奠定台北至今为台湾政治和经济中心的地位。
1895年－1945年.1895年，大淸帝国于甲午战争战败，将台湾割让给日本，台北仍作为日本统理台湾的政治中心。日治初期以原有的两座衙门作爲台湾总督府，直到1919年总督府新厅舍（今总统府）落成爲止。1900年起，日本政府拆除台北城墙及西门，在原址辟筑四条三线道路，兴建自来水及下水道系统，以原台北城内的区