任作战科科长。1940年3月至7月在北方局党校第三期学习。1940年7月任八路军前总作战科科长。1943年3月7日在麻田八路军副司令彭德怀命令王政柱回延安时把八路军前总积攒的190两黄金和8斤金银首饰带给党中央。1943年5月17日到达延安，11月入中共中央党校二部第十支部学习，参加整风运动。1944年7月任军委一局第二处副处长兼第三科科长。1944年9月奉命同美军驻延安观察组进行联络。1944年底，西北局评出74名陕甘宁边区特等劳动模范，王政柱荣获“特等模范工作者”称号。第二次国共内战中，1946年6