2010年4月1日，蒙古对日本国籍者实行免签入境，可停留30日。蒙古在日的相扑选手有朝青龙明德、白鹏翔、日马富士公平、鹤龙力三郎四名横纲，高齢的幕内初优胜达成者等众多大相扑力士涌现，是日本历代的外国人力士辈出最多的国家。除了相扑之外，像是蒙古籍的职业拳击手也在日本打败成为首位蒙古籍的世界冠军，之后也在日本的拳击馆活动了一段时间。蒙古军方与日本自卫队互动频繁，一直在向日本防卫大学派遣留学生及持续参加防卫省主持的各种讲座，2004年防卫大学校长曾对蒙古进行官方访问。2013年3月30日，日本首相安倍