后来时功玖自费留学日本东京宏文学院，在校期间参加革命活动。他曾经担任刘成禺、李书城、程明超等出版的刊物《湖北学生界》的记者。1903年6月底《苏报》案发生后，不久清政府就释放了章炳麟。时功玖、龚炼百等人被同盟会本部派到上海迎接章炳麟出狱并到日本接任《民报》的主编。1905年7月19日孙中山到横滨后，时功玖等留学生自东京到横滨和孙中山见面，并和刘成禺、李书城、冯自由等八人在竹枝园宴请孙中山。时功玖还和刘成禺、李书城等加入了兴中会。1905年7月30日，时功玖经冯自由通知，参加了中国同盟会筹备会。8