中国科学院上海生理研究所（）是一家曾经存在的科学研究机构，已在争议中被撤销。
历史.上海生理研究所的历史可追溯至1944年在重庆创建的中央研究院医学研究所筹备处。抗日战争胜利后，医学研究所（筹备处）迁至上海。随着中华人民共和国的成立，医学研究所（筹备处）调整组建为中国科学院生理生化研究所。1952年，研究所有机化学组调入中国科学院有机化学研究所。1958年，研究所的生理部分和生物化学部分开，前者变为中国科学院生理研究所，后者变为中国科学院生物化学研究所。1967年，生理研究所改名上