文部省管辖的官立东京大学。4月12日是现在的东京大学纪念日，同时也会在此日举行入学式。起初仅为设有法、理、文、医四学部及预备门，学生人数约1600人的专业教育、普通教育机构。虽为日本最早的近代大学，但具备学士学位授予权晚于1876年（明治9年）创立的札幌农学校（今北海道大学），是日本第二古老的高等教育机关。1886年（明治19年）根据帝国大学令改称为帝国大学，同时吸收合并了工部大学校变为法、理、文、医、工5科。将预备门分离为第一高等中学校（旧制第一高等学校）。1890年（明治23年）吸收合并东京农林大学