水扁聘为总统府国策顾问。2000年7月20日，与许文彬、施振荣、郭衣洞（柏杨）等十四位总统府国策顾问联名向陈水扁提出「国是建言书」，表示：台湾海崃两岸关系僵局的关键在于两岸政府对于「一个中国」认知的歧见，建请陈水扁宣示认同「《中华民国宪法》架构下的一个中国」原则，以开启两岸接触对话、平等协商的契机。之后陈水扁宣示认同以「中华民国宪法架构下的一个中国」原则开启两岸接触对话、平等协商的契机，但没有得到中华人民共和国政府的回应，当时在野党领导者如马英九等人也表示反对。2010年12月，担任总统府人权谘询委