局屠杀阿美族精英青壮年一百多人，迫使港口一带阿美族的搬迁，瓦解当地青壮年对朝廷的反抗势力。以及对撒奇莱雅族及噶玛兰族进行屠杀的加礼宛事件。光绪十四年（1888年），吴光亮回任台湾镇总兵，却因为「向属员函借银两」被朝廷交予台湾巡抚刘铭传查办。后吴光亮被兵部议处，得旨，降三级调用。光绪十六年（1890年）受刘铭传再度起用，二十年（1895年）受唐景崧之邀募勇来台，号「飞虎军」，其部趁危劫饷风纪不佳，至日军攻陷八卦山时溃败而离台。