为物流仓储运筹中心。2017年3月29日，台湾港务公司与高雄市政府合资成立「高雄港区土地开发公司」，资本额新台币一亿元（台湾港务公司51%、高雄市政府49%），总部设于驳二艺术特区的共创基地。2017年11月，台湾港务公司决定配合新南向政策，与阳明海运于印尼泗水港和当地业者合资货柜码头与货运承揽，此为台湾港务公司改制成国营公司后首宗海外投资案。
组织.依照《国营港务股份有限公司设置条例》，副总经理（不含）以下之从业人员不具公务员身分。总公司之下，设有若干分支机构以管理旗下之