自设兴化分省宋末，由于蒲寿庚弃宋降元，使泉州港没有受到破坏，反而发展成国际着名的港口，市内形成大批外侨（主要是阿拉伯人和波斯人）定居的居留地“蕃坊”，当年留下的清真寺一直保留至今。天主教也于元代传入泉州，元代中国天主教仅有两个主教区，一个在泉州，建于皇庆二年（1313年），另一个在北京。蒲寿庚大力拓展泉州海外贸易，使泉州成为东方第一大港，与埃及的亚历山大港并称为"世界最大的贸易港"。1357年，亦思法杭人赛甫丁凭其所拥有的武装和市舶的财源，伙同阿迷里丁割据泉州，伺机北略兴化、福州，妄图建立“亦思法杭