化」，推测麻豆出现人类聚落的历史，应超过上千年。古代麻豆靠海，位于倒风内海岸边，可行船至此。在14、15世纪时，就有中国的渔民和商人来此与西拉雅族人做生意。
荷兰时期.荷兰统治时期，西拉雅族四大社之一的「蔴荳社」居住在此。荷治时期初期，麻豆社原住民曾反抗荷兰人统治，1629年7月13日发生麻豆溪事件，蔴荳社原住民趁荷兰东印度公司士兵欲渡河攻打海盗时偷袭，杀害52名荷兰士兵。唯因当时荷方实力仅达大员一带自保，无力直接。征伐蔴荳社。新任大员长官普特曼斯只能于1629年11月针对攻击