定为明太祖朱元璋的出生地，但明朝的盱眙太平乡在今安徽省明光市明光街道赵府村附近。1680年（清康熙十九年），黄河改道，经淮河入海后明祖陵完全被水淹没。清朝为安徽省泗州盱眙。民国时属于安徽省，民国二十一年（1932年）十一月，划盱眙南17个保、滁县北6个保、定远东6个保、来安西3个保，合并新置嘉山县，县治三界镇（老三界）。1955年，江苏省为了便于管理洪泽湖地区，用江苏省两县（砀山，萧县）交换安徽省的两县（泗洪，盱眙），盱眙县由安徽省划入江苏省，先后隶属淮阴专区、六合专区，现在属于地级淮安市。