反正，元汴与李士淳、罗万杰等响应，尚久兵败，元汴乃奉母躲避于丰顺之大田，授徒以食。居大田七年，期间曾至广州，知永历已亡，反清势力逐渐覆灭，遂谋奉母归潮州。但家已被戍兵所占，闻知潮州知府吴颖优礼贤士，作诗贻颖为请，乃得还。吴颖欲以元汴任乡饮宾，清刑部尚书杜立德与元汴是同年进士，贻书劝驾，皆不受。戊申（1668年）十一月卒，年五十七，而母尚存。着《霜山草堂诗集》，入清为禁书。弟元汉，子谢渠。