“南京大学气象学院”，后于1963年5月改名为“南京气象学院”；1978年被列为中国全国重点高校，同年被批准招收硕士研究生，1993年获得博士学位授予权，同年经联合国世界气象组织批准，学校正式成立“世界气象组织区域气象培训中心”。1995年被批准招收港澳台和外国留学生。1999年3月，设立大气科学博士后流动站。1999年，北京气象学院并入南京气象学院，2003年4月成立北京分部。2000年学校由原隶属中国气象局管理划转为江苏省管理。2004年5月经江苏省政府、教育部批准更名为南京信息工程大学。2021年