谋部、国家计委、商业部、交通部、农林部、财政部、水利电力部组成。指挥部办公室设在水利电力部，日常工作由水利电力部抓总。长江中下游和黄河防汛指挥部机构仍按国务院1969年防汛工作的通知规定不变。1985年7月2日，重新恢复中央防汛总指挥部，国务院副总理李鹏，水利部部长钱正英分任总指挥和副总指挥。1977年3月，成立国务院抗旱领导小组，负责协调相关部门的抗旱工作。1988年8月11日《国务院关于非常设机构设置问题的通知》（国发〔1988〕56号）将国家防汛总指挥部列为国务院非常设机构，总指挥田纪云、顾问