许电气化列车以时速130km/h高速通过。溪口隧道同样为河底隧道，路线约在原溪口一号、二号隧道东侧约35公尺处平行布设，施工方法以明挖覆盖法为主，部分区段採用钻掘工法。东改新路线自溪口站北方岔出，进入溪口隧道后依序穿越台11丙线、丰田圳沉砂池、寿丰溪、新光兆丰农场、新台9线等，出土后即接回原路线。溪口隧道总长3,800公尺，较原溪口一号、二号隧道为长，主因为细部设计时考虑到洪水的影响，而尽量将洞口设置于较远的陆域地区，以避开河川范围。其中，南口延长可避免原溪口二号隧道南口附近平林圳氾滥时，洪水灌