开元三大士来到中国的时间，因此，他们所传授的密法，很有可能是行续与瑜伽续。在朗达玛灭佛后，西藏再度派人至印度取回佛教经典，此时印度盛行无上瑜伽续。因此，新译派皆以无上瑜伽续为主要的密宗传承。新译派形成，先有噶举派与噶当派，后有萨迦派，但它们皆源自于那洛巴在那烂陀寺的大手印传承。宁玛派虽然据说是传承自莲华生大士，但他们的九乘判教，认为无上瑜伽续才是最高的密宗，很明显的受到了后来新起的无上瑜伽续影响，最终形成了大圆满传承。但部分人士认为藏传密宗是印度佛教晚期衰落后逐渐被印度神教融合才产生，所以有许多仪轨