一些植物学家将亚洲大陆上的族群划为另一个种类秃杉（""）；不过在将各地区的标本比较后，发现其所主张的不同并不一致。台湾杉在分类上仍有许多可议之处，在此处不断然决定其分类地位，更多资讯可参见《台湾植物志》等相关书籍。中华民国国家实验研究院国网中心与富士通及中华电信共同研制的超级电脑「台湾杉」命名自此植物，于2018年5月启用。中华人民共和国将台湾杉列为国家一级保护植物，予以立法保护。