大嵙崁溪分流河道成为三崃溪河道之延伸，因而形成今日三崃溪纳横榽之势。今日大汉溪主流河道已北移至南靖厝，将该地区分割成南、北两部分。
交通.国道3号经过南靖厝地区西南端，境内虽未设交流道，但三莺交流道即在东南边界外不远处的市道110号（莺歌文化路－三崃复兴路）交会口，由此往东北可前往中和、新店、深坑、汐止、基隆等地，往西南可前往大溪、龙潭、关西及中南部各地。市道110号是连络大园、新店的道路，大致以纵向经过南靖厝地区中西部。由该道路往北转西可前往莺歌市区、八德、桃园、大园等地