孝文帝认为国库充裕，国势日隆，所以不接纳穆亮之议，遂移御永乐宫。其后车驾南迁洛阳，迁穆亮为武卫大将军，以本官董摄中军事。孝文帝南伐南齐时，以穆亮录尚书事，留下镇守洛阳。后来孝文帝将自小平泛舟去石济，穆亮劝谏阻止。孝文帝认同其言放弃此游。后来穆亮之兄长穆罴私通穆泰进行谋反之事，穆亮以府事交付司马慕容契，然后上表自我弹劾。孝文帝不许，还令穆亮处理府事。穆亮频烦地请辞，孝文帝最终接纳。后来除使持节、征北大将军、开府、仪同三司、冀州刺史。徙封顿丘郡开国公，食邑五百户，以其子穆绍袭爵。宣武帝即位，迁穆亮为定州