基督教循道会决定将两所医院合并。1928年4月，合并后的新医院定名为汉口协和医院（英文为Hankow Union Hospital），有病床135张，位于汉口西满路（今解放大道现址）。此为医院第一次合并。花楼总堂也在1931年迁往模范区云樵路，改名格非堂，原址后来建起了四明银行大楼。1937年，医院有病床220张。从1938年日军攻打武汉到1945年中国抗日战争胜利，医院在炮火中坚持开诊，但受损严重。1949年，中国共产党正式接管武汉。此时，汉口协和医院有病床249张，成为当时武汉病床最多的