共设置2,045个县。县之下划分为乡、镇。现实中，中国共产党革命根据地割据或边疆地区的县份，中华民国中央政府并不能实行有效管理。如中共政权在1935年攻占陕西省保安县县城，于1936年设置志丹县。中华民国政府虽坚持沿用保安县名，但随着中国共产党取得第二次国共内战胜利，志丹县最终彻底取代保安县。1945年中华民国接管台湾后，为调和中日两国之行政区划制度差异，另由台湾省政府颁布《台湾省各县市实施地方自治纲要》来规范台湾的县制，与大陆地区的县制不尽相同。直到1994年颁布《省县自治法》后，县自治方取得法律授权