用作关于其身份的信息。这种分离步骤不是强制性的，通常在核磁共振和基于“霰弹枪”的方法如(Shotgun lipidomics)中被省略。
检测方法.核磁共振波谱法和质谱法两大分析技术是用于检测代谢物最主要的手段，它们也通常和色谱法联合使用以提高灵敏度和准确度。
核磁共振波谱技术.迄今为止，核磁共振波谱技术(Nuclear magnetic resonance spectroscopy)在代谢物组学得到了非常广泛的应用，其显着优势是可以一次观测到多种代谢物