蒙藏委员会委员长.1936年（民国25年）8月，吴忠信就任蒙藏委员会委员长，为流亡中国内地的九世班禅返回西藏之事进行了努力。1937年（民国26年）九世班禅在青海玉树圆寂，吴忠信促成其灵柩返回西藏。此外，考试院院长戴季陶还赴西康省致祭。1940年（民国29年）2月，十四世达赖坐床典礼在拉萨举行，吴忠信时任蒙藏委员会委员长，代表国民政府参加坐床典礼。1941年（民国30年）9月，吴忠信被任命为甘宁青区党政工作考察团团长。
新疆省政府主席.1942年赴新