被罢免，何孟春遂代理掌管吏部事务。何孟春在云南时，大礼议事件已经逐渐升温，他曾上疏反对世宗改变皇考。等到他抵达吏部时，世宗已经尊生父母为兴献帝、兴国太后，继而又改称本生皇考恭穆献皇帝、本生圣母章圣皇太后。何孟春遂连续三次上疏反对，均没有得到批复。当时张璁、桂萼因支持世宗，而列上礼官欺妄十三事，何孟春上疏抗议。两派剑拔弩张，矛盾激化。当时，詹事府詹事、翰林、给事中、御史以及六部各司官员群臣各自上疏争论，情绪激昂。正逢早朝刚结束，何孟春倡导众人道：“宪宗时，百官在文华门前哭请，争慈懿皇太后下葬礼节，宪宗