启元曾经五次在全国政协会议上发言，唿吁加强渭河综合治理。特别是在2003年渭河华阴段发生五十年来最严重的洪灾，有人甚至唿吁停用三门峡水库确保黄河。就此，安启元曾表示，“渭河清了我才心安”。在全国政协会议上前后提案连续八年之久，终于，2005年12月国务院批复了《渭河流域重点治理规划》。该计划提出，用大约10年时间初步建成渭河流域防洪减淤体系，改善渭河干流及支流水质等问题。中央将拿出人民币155亿，透过该项规划对陕西投资；占整个计划总投资近七成 。安启元并没有就此满意。此后，他又联系其他陕西籍全国政协委员