赛季最高的35分。2016年3月21日，他在第四节拿下球队29分中的15分，包括在还剩48秒时的领先跳投，帮助夏洛特黄蜂在第二节以7比30落后的情况下，最终以91比88逆转战胜马刺。林书豪在夏洛特黄蜂的唯一赛季于季后赛首轮被热火以7场击败后结束。NBA年度最佳第六人的投票中林书豪名列第7名。在拒绝执行2016–17年赛季220万美元的球员选择权后，林书豪于7月1日成为不受限自由球员。
布鲁克林篮网（2016年–2018年）.2016年7月7日，林书豪与布鲁克林篮网签下一份3年360