动车组列车推出广深铁路快通卡，但由于该卡不符合铁路实名制要求而停止使用。另外广深铁路还发行有广深铁路牡丹金融IC卡。2018年2月1日起，广深和谐号开通银联闪付卡、银联手机闪付过闸乘车服务。乘坐广深和谐号的旅客可在沿线车站办理实名注册，即可以刷卡、刷手机（包括Apple Pay，Samsung Pay，HCE等平台）的形式乘坐列车。2018年11月22日起，海南环岛高铁（海南东环铁路、海南西环高速铁路）全线实行电子客票服务试点，实现乘车凭证全面无纸化和多样化，报销凭证逐步电子化。铁路部门将根据试点情