创校初期被指受到马共渗透，因此一直遭受政府冷待，在1956年5月，新加坡当局更表示南洋大学颁授的学位将不获政府承认，使大学与政府的关系陷入不和的局面。
第一次富尔敦委员会.在这种背景下，柏立基甫上任港督后，就开始扶助一些好像是新亚书院、崇基学院和联合书院等较有名气的中文专上院校，为创立中文大学铺路。早于富尔敦委员会在1962年成立以前，富尔敦本人已率先于1959年10月应港府邀请来港，为新亚、崇基和联合三所院校制定发展路向。1960年3月，富尔敦向港府提交《香港专上学院发展报告书》