杀刘山阳，将首级交给萧衍。他发檄文以讨伐茹法珍、梅虫儿为口号，与雍州刺史萧衍一共起兵。他拥立萧宝融于江陵即位齐和帝。中兴元年（501年），萧颖胄担任和帝的侍中、尚书令、监八州军事、荆州刺史，留守西朝。派弟弟萧颖达发兵进攻建康，平郢州、江州二州。当时巴东郡、巴西郡太守攻打荆州，萧颖胄派遣的大军被他们击败。萧颖胄在江陵忧虑发病而卒。萧颖胄死后，萧衍成为义军的唯一首领，和帝也失去与萧衍抗衡的力量，最终被迫禅位。南朝梁天监元年（502年），梁武帝代齐，追封萧颖胄巴东郡开国公，食邑三千户，谥号献武公。