三之丸设于山麓下，其中本丸也是长州藩藩主的居馆兼长州藩的政厅；南侧接三角洲的平原区域，也是城下町的位置。1874年颁布后萩城遭到拆除，仅留下石垣和水堀，目前为发展观光已依据过去的照片重建了部分的二之丸土塀及三之丸总门，但由于是政府的财源不足，并未重建天守；而整个旧城的区域也被设立为指月公园．成为萩市内的观光景点。
历史.在16世纪曾是大内氏家臣的领地，吉见氏的津和野城也曾在此设有出城；16世纪末转与毛利氏合作的吉见正赖在引退后即居住于此至过世。1600年由于毛利氏家主毛利辉