倡议推动中小学以小班教学解决适龄人口下降的危机，并对教育改革的弊端直言无讳，引起当时教育统筹局（现为教育局）高官的不满，并要求教院校长莫礼时将他辞退，是为轰动一时的教院风波。2007至2009年，叶建源出任香港兆基创意书院校长。2012年出任香港教育专业人员协会总干事，后来代表教协出选2012年立法会选举，并成为立法会（教育界）议员。叶建源曾是民主党成员，至2006年退党。他是同时是教协会员，历时超过20年。
香港教育学院风波.2006年，叶建源担任香港教育学院讲师，因被时