丸在9月3日在近江木之本一带被木下藤吉郎捕获，于10月17日被带至关原处以磔刑，浅井久政跟浅井长政父子的首级也被送往京都狱门示众。浅井家灭亡后，织田信长将北近江小谷城封给立有大功的木下藤吉郎，领地石高约12万石，最早举长比、苅安两处城砦投效织田家的堀秀村，则获得坂田郡6万石，山本山城主阿闭贞征获得伊香郡2万5千石，矶野员昌获得高岛郡6万石，封为新庄城主。浅井久政、浅井长政父子跟朝仓义景的首级，也在天正二年（1574年）正月，织田信长于岐阜城在贺年酒宴后，在招待马回众的内宴上，三人的首级被做成金漆的薄