库氏稻鼠与稻大鼠的中间形态，故此将库氏稻鼠纳入稻大鼠之内。不过后来却发现库氏稻鼠与稻大鼠实际上是有分别，后者较为细小，颜色较灰而非褐色，而且牠们的染色体组型图也有分别。自此以后，一般都将两者看为独特的物种，而于1994年更发现牠们同时于德克萨斯州南部及墨西哥的塔毛利帕斯州生活。于1973年在佛罗里达礁岛群发现了银色稻鼠。究竟牠们是独立的物种或只是"O. palustris natator"的另一形态，仍然处于争议阶段。2005年利用微卫星DNA的研究发现牠们与埃弗格拉德斯的稻鼠只有很少的基因分野，故认为