年增建右翼铁路警察办公室。1989年开始拆除扇形车库，但保留转车盘。1994年屋顶换成钢瓦。1995年5月站内举办「内湾线的故事」文艺季。CT152被送来参展，此后长期放在站内，后被移至苗栗铁道公园。1998年6月23日省政府审定第四代站房为省定古蹟，是台湾现存最古老的火车站房。1999年7月1日改为国定古蹟。2000年鉴于站房老旧和年久失修，经内政部编列预算，由新竹市政府整修。11月拆除新竹飞机场线。2007年2月11日松崎万长之孙、副理事长带团至新竹公园访视，赠送新竹市政府河津樱树苗，并探访车站。3月1