的已有160年的历史，在二战时期生产了武藏号等军舰和有「太平洋女王」之称的等大型客轮。战后的长崎造船厂更曾一度是世界最大的造船厂。1970年代第一次石油危机导致大型油轮需求减少之后，以生产大型船为主的三菱造船厂陷入萧条，改从生产大型客轮中求生，生产了钻石公主号等大型客轮。然而近年由于大型客轮业务严重亏损，三菱造船厂也陷入困境，被迫缩小规模，对长崎经济造成负面影响。长崎造船厂还是日本重要的发电机生产企业，近年更进军地热发电、风力发电等新领域。重工业以外的产业中，食品制造业从业者佔长崎市制造业从业者的约六分之一