34.7%为单倍型类群D，另外还有O-P31 (31.7%)、O-M122 (20.1%)、C-M8 (5.4%)、C-M217 (3.1%)、NO (2.3%) 和N (1.5%)。 以此推断，就父系DNA而言，拥有单倍型类群O父系基因的部分日本人，和汉族、越南人、韩国人相似，但单倍型类群D的存在使日本人在血缘上有别于东亚其他人种，而更接近于爱奴人、藏人和安达曼群岛上的原住民。现有对于日本人与朝鲜族的Y染色体DNA单倍型类群，有个别基因类似，如高比例的单倍型类群O-M176及一定比例的单倍型类群C-M