中华民国对外贸易发展协会（外贸协会）于奈及利亚第1大城拉哥斯设立台湾贸易中心。2015年7月2日，经济部国际贸易局则在首都阿布加设立驻奈及利亚代表处经济组，2017年12月8日，搬迁至拉哥斯。2019年，奈及利亚是中华民国第59大贸易伙伴、第58大进口伙伴、第49大出口伙伴，在非洲经济体排名第3、4、3。出口至奈及利亚的金额为2亿3,652万1,489美元，年增106.919%。自奈及利亚进口的金额为1亿2,031万9,917美元，年减31.590%。贸易呈现出超（盈余）1亿1,620万1,572美元