观察家指出，中共高层对法轮功的态度存在分歧。在中共中央总书记江泽民发动镇压前一年，刚退休的前全国人大常委会委员长乔石发起并亲自率团独立调查法轮功数月，做出「法轮功于国于民，有百利而无一害」的结论报告提交中共中央政治局。江泽民镇压时，1999年7月22日民政部称法轮大法研究会为非法组织。但是，在中华人民共和国公安部2000年发布的公文：《中华人民共和国公安部关于认定和取缔邪教组织若干问题的通知》（公通字[2000]39号）中，里头对于「现已认定的邪教组织情况」，列出中央办公厅、国务院办公厅文件明确的邪教组