由于画作体积大，导致它一移动就会弯曲。从完成的那一刻起，它就开始恶化。在1857年上展出后，它被人认为状况太差，不适合公开展出，于是被长期存放在曼彻斯特皇家学院的档案室中。1882年，曼彻斯特皇家学院的建筑及藏品依据曼彻斯特当地议会法令移交给如今的曼彻斯特美术馆，画作因而改归后者所藏。20世纪中，人们曾多次尝试修复《海妖与尤利西斯》，但均未成功，反而在一次尝试清洁画作的过程当中，无意地进一步损坏了颜料。2003年，曼彻斯特美术馆的工作人员认定，如果不进行保护工作，这幅画很快就会无法修复。和AXA艺术品保