在总统层级一对一选举中前所未有之惨败。选后宣称要依选前诺言退出政坛，但却在大约两年后复出，并为此于2010年7月21日透过广播节目首度公开道歉。2010年7月25日谢长廷再度公开道歉，并坦承其当年决定退出政坛是「判断错误」。败选后，谢长廷筹组「影子政府」，并在12月9日和亲绿的电台合作，在每天下班尖峰时间，推出一个小时的广播节目。2009年3月2日，谢在各大报刊登广告，极力撇清与「吴敦义绯闻录音带」事件的关连，甚至不惜提告以维护名誉！2011年6月11日，陈春生指控谢长廷交付吴敦义绯闻录音带被判诬告