认为是当权宦官仇士良主使的对宰相李石的刺杀，崔珙因不能抓获凶手，被罚俸，声望也略有衰落。四年（839年）三月之前卸任京兆尹。
唐武宗年间.唐文宗于开成五年（840年）正月驾崩，弟唐武宗继位。崔珙和实质上为首相的李德裕相善，累迁户部侍郎，进刑部尚书、充诸道盐铁转运等使。进阶银青光禄大夫。五月，崔珙被授同平章事，为实质宰相，兼盐铁转运使，兼门下侍郎（《新唐书》作拜中书侍郎），后又兼尚书左仆射。增江淮茶税。会昌元年（841年）三月，武宗认为前宰相杨嗣复和李珏反对他继位而分别意图拥立当时已