高法院向台北地检署指控。另外，他还参与讨论修改《选罢法》以解决黄信介在花莲县竞选立法委员的资格问题。1993年8月，获聘为中国国民党第十四届中央评议委员。1994年1月20日，中华民国法官协会成立，王甲乙出任第一、二届理事长，直到退休后才由行政法院院长林明德接任第三届理事长。1995年4月，兼任司法院民事诉讼法研修委员会召集人。1996年6月，十大杰出青年基金会完成法人登记，正式开始对外运作，王甲乙出任第一届董事长，1999年连任第二届董事长，直到2002年8月9日该基金会第三届第一次董事、监察人联席会决定