在明应8年（1499年）出生，家中长男。仕于土岐氏、斋藤氏。在弘治4年（1556年）4月于斋藤道三与儿子斋藤义龙的战斗（长良川之战）中属于道三一方。因此在战后，重元不在的大御堂屋敷被义龙势袭击，不过因为妻子妙海大姉、儿子重治、重矩的奋战而把其击退。在永禄元年（1558年）与儿子重治一同击破菩提山的岩手弹正忠诚，筑起新的菩提山城并以其为居城，领有6千贯知行。此后与近邻的不破氏不和，在翌年（1559年）受到不破光治袭撃，不过因为家臣竹中善左卫门的活跃而将其击退。在永禄3年（1560年）12月回应六角义治