年度，函馆市收入1403亿日元，支出1375亿日元，结余28亿日元。自2013年以来，函馆市已连续三年实现财政结余。但函馆市的财政力指数只有0.457，财政状况仍十分严峻。由于函馆是道南的中心都市，因此函馆的政府机构较普通的非县厅所在地城市更多，不仅设有海关等中央政府的机构，北海道政府的渡岛合同厅舍也位于函馆市。
经济.2013年度，函馆市内生产总值有8541.5515亿日元，人均市民所得233.5万日元。
第一产业.2015年，函馆市总农家数有369户，农