青幽及扬州之晋陵诸军事，领徐、兖二州刺史，假节镇京口。然而，当时大司马桓温觊觎京口的军队，常说：「京口酒可饮，兵可用。」故此虽然当日以郗氏在徐兖二州有故义而由郗愔担此职，但其实内心是很不愿意由郗愔掌有京口。太和四年（369年），桓温乘慕容恪去世而北伐前燕，并请与郗愔、江州刺史桓沖和豫州刺史袁真一同北伐。当时郗愔全然不知桓温打着京口主意，还写信给桓温说要与他一同辅助晋室，修复园陵。郗愔在桓温幕下任参军的儿子郗超却深知桓温的心思，截获父亲的信并得知内容后就将信件撕毁，由自己代作一封，内容却是自称老病，不堪世