该学院正式开讲《广论》。1989年，华藏讲堂正式成立「《广论》研讨班」。日常法师发行《广论教学录音带》50卷，最后增至160卷。1992年，日常法师成立福智僧团。1993年，日常法师开始讲授《法华经》、《了凡四训》、《俞净意公遇灶神记》、《阿底崃尊者传》等，并成立财团法人福智寺；同年九月，他接受心圣尼师供养，率领男众僧团进驻新竹县凤山寺并随即建立佛学院，由其师长十四世达赖喇嘛亲授予「正法林佛学院」名称。2000年，凤山寺首次传授三坛大戒。2001年，首次为在家居士授五戒，并在同年七月邀请