于本站站体位于前镇区新草衙与凤山区五甲的交接处，亦可服务凤山五甲地区，曾加註「五甲」副站名，然而随着黄线开始规划，在海科大与第一科大整併后，与后劲站、青埔站的副站名一併取消，等到高雄捷运黄线、高雄捷运绿线营运后，成为三线的转乘站。车站构造为地下两层岛式月台车站，共有3个出口。车站代码为R5。2017年3月23日，行政院宣布前瞻基础建设计画列入高雄捷运黄线之新版路线规划，预定採用地下化之中运量捷运系统，初步路线规划中本站将会设站。
车站出口.出口1位于车站南端、出口2、3位于