科院在仿制过程当中曾发生问题，所以引进两艘原装货回来研究便留下服役，时至今日两艘毒蜂级都已除役。 此外，海鸥级的两艘中科院原型艇并未真正服役（原型艇的主桅是方柱型，与量产艇的格架型桅桿不一样；并且飞弹发射箱的位置也比较靠近艇尾）。 由于当初採用铝合金材质，服役已久海鸥级的艇身已经出现无法修补的金属疲劳，舰身寿限问题海蛟大队面临换装压力。目前取代海鸥级的新船为2009年开始服役的光华六号飞弹快艇，已于2011年12月2日完成，全面汰换现有服役逾20年的50吨级、海鸥级飞弹快艇3个中队，原有海鸥级飞弹快