年被公告为公共埤圳之前，佔有圳道或天然埤塘上游的家族常常丈着权势向下游使用者征收使用费，引来公愤常常起冲突。最有名的是发生在1890年代，邻近的另一个灌溉水源大湾区域（今仁爱圆环附近，边界为安和路－延吉街的天然水源）的冲突渐阶影响埤圳的管理制度。台湾总督府于 1901 年颁布〈台湾公共埤圳规则〉。雾里薛圳也就因此与瑠公圳、大坪林圳一起被公告为与公共利益有关的「公共埤圳」，受官方监督。到了1907年，更与上埤一起併入受「瑠公水利组合」（今「瑠公农田水利会」）管理。随后进行水道整併与修改，统一取水口与输水干