北婆罗洲总督，是指1881年至1963年间北婆罗洲的政府首脑。总督一职一开始由北婆罗洲渣打公司委任，当时北婆罗洲是大英帝国的保护国。1946年第二次世界大战后，北婆罗洲成为大英帝国的直辖殖民地，总督一职便开始由官方、即英国政府任命。