，改翰林院庶吉士。光绪十五年四月，散馆，授翰林院编修。后升任监察御史、湖南岳州府知府、奉天锦州府知府，任内曾弹劾载振。中华民国成立后，1912年4月至5月，他任北京政府内务部次长。1912年11月至1913年11月，任福建民政长。1914年5月，任政事堂铨叙局局长。同年9月，任奉天巡按使。1915年9月，署内务部次长并兼任参政院参政。1916年2月，任肃政厅都肃政史。1920年5月，任经济调查局总裁。晚年，张元奇回到家乡，任福州鳌峰书院山长。民国十一年（1922年）逝世。