制器是在旧金山的恶魔岛上并且尤里在简报会的结尾启动了它。杜根总统立刻下令对心灵控制器展开空袭。但是所有AV-8B攻击机被击落，虽然其中一架撞入恶魔岛的核反应堆，造成设备缺电而不能启动。尽管如此，尤里启动了他的另外两个心灵控制器（分为埃及大金字塔附近和南极），地球上的大多人口迅速被尤里心灵控制了。
盟军战役剧情.盟军的故事，从指挥官（玩家）被送到旧金山而开始，保护爱因斯坦的时间机器，盟军计划使用时间机器回到战争初期以摧毁尤里的心灵控制器。但是时间机器没有足够的电力启动，因此指挥官