批程序则始于1994年。由JSK建筑事务所设计的1号航站楼和2号航站楼分别于1995年及2001年开幕。后者被批评为面积过大，接连在启用当年遭遇了九一一袭击事件，和在2007年遭遇世界经济危机的影响后，导致乘客不断下滑，也引发了持续性的财政亏损。为柏林航空新建的飞机维修库于2002年落成，同年被德国汽车俱乐部（ADAC）用作重症监护运输直升机服务。2004年11月，由于起降跑道进行完全翻新的工作，机场关闭维持了4天。2005年，北莱茵-威斯特法伦州对起降跑道扩建计划的审批程序历经10年的谈判后结束。