岛的三分之一，是香港面积的三分之一、是澳门的12倍、珍宝岛的500倍。平均海拔40米，地势平坦，基本处于未开发状态。全岛大面积是湿地，有些地区超过海拔40米的高地。岛上主要生长柳树、榆树、杨树、柞树和牧草。岛周围江汊纵横，水草丰盛，主要鱼类有鲤鱼、鲫鱼、鲢鱼、白鱼、鳌花几十种，是鲑鱼洄游的必经之路。中国政府在黑瞎子岛中国一侧建立了黑瞎子岛湿地公园。由于地势不高，黑瞎子岛曾被洪水淹没。
历史.1860年的中俄《北京条约》第一条确定了黑瞎子岛的归属：此后两国东界定为由什勒喀、额尔古