重要的一年。该年墨西哥有数间廉价航空公司成立，和墨航和墨西哥国际航空作竞争。有见及此，墨航成立了旗下首间廉价航空公司「Click Mexicana」，以加强本身的竞争力，并更换机队色彩。2006年7月12日，墨航宣布新增数个美国的航点，包括西雅图、底特律、夏洛特，同时以包机形式重开波多黎各航线。同年，墨航获选为「2006年拉丁美洲最佳航空公司」。2008年4月9日，寰宇一家邀请墨西哥航空加入，并于2009年11月10日连同旗下的MexicanaClick和MexicanaLink一併成为寰宇一家成员