为大名，在周防吉敷郡、长门两国及安艺国佐伯郡获得20万石领地，建立长府藩。庆长四年（1599年）毛利秀就成为丰臣秀赖近侍，并由秀赖作为乌帽子亲元服，赐丰臣姓，受领偏讳取「秀」字及曾祖父毛利元就的名讳取「就」一字而名秀就。庆长5年（1600年），关原之战后德川家康将毛利辉元改易至周防、长门两国，而毛利氏家督可以继续存续，改易后石高大减封为37万石。其后辉元剃发出家号幻庵宗瑞，将家督让予嫡男秀就，秀就成为长州藩主。庆长9年（1604年），开始于长门国兴建萩城作为居城。庆长13年（1608年）、受大御所德