7年6月设置的凤山县大湖、阿公店、打狗和凤山辨务署。1898年6月，凤山县併入恆春厅，四个辨务署则合併为阿公店和凤山辨务署。1900年4月，阿公店辨务署併入凤山辨务署，辖下共计55区；同年11月，55区整併为31区。明治三十四年(1901年)11月，台湾总督府以办务署负责地方政务，而县及厅介于总督府与办务署之间，造成行政事务上的欠缺灵活 ，而废止「三县四厅」，设「二十厅」之行政单位，划分台南县为嘉义、盐水港、台南、蕃薯藔、凤山、阿猴等六厅，凤山厅范围北起二仁溪，西至海，东临大岗山与高屏溪，厅治设于凤山，下辖