续日本纪」、「万叶集」和「拾遗集」等之中，记载了进行过祓禊仪式的温泉和天皇巡幸时到过的温泉的名字，如玉造温泉、有马温泉、道后温泉、白滨温泉和秋保温泉。平安时代的「延喜式神名帐」里亦记载了几所供奉温泉神的温泉神社的名字。日本人自古以来一直视温泉为一个与宗教和信仰有关的场所，而功效方面日本部分传统药用方式和发现其疗效可能是从中国唐朝由遣唐使带来日本的，不过在鎌仓时代之后，经一遍上人等僧侣开放浴室让贫苦和患病的人入浴，入浴开始变得一般化，而温泉在医学上的实用性亦开始被重视。在鎌仓中期，大友赖康在别府温泉设置了