售的质子交换膜的材料是全氟磺酸的含氟聚合物（PFSA），杜邦产品。Nafion是与像聚四氟乙烯全氟化主链的离聚物，有用于制造质子交换膜的离聚物许多其他的结构基序。许多使用多环芳烃聚合物而其他人使用部分氟化聚合物。质子交换膜是主要特性质子传导率（σ）、甲醇渗透率（P），和热稳定性。