新组织成立，总部也设于阿鲁沙。2004年，三国签订条约，成立关税同盟，于2005年1月生效。2007年6月18日，布隆迪与卢旺达两国正式加入东非共同体，成员国增至5个。东非共同体五国提出2015年合并成为统一的联邦国家（东非联邦）。该联邦将拥有共同的宪法、总统、议会和货币。但目前仍未成立。2016年3月，独立不久的南苏丹加入东非共同体获得批准，从此，东非共同体共有六个成员国。
发展沿革.1967年6月，乌干达、肯尼亚、坦噶尼喀三国决定成立东非共同体，取代东非共同事务组织；成立