。883年春唐僖宗重返长安后，授朱玫同中书门下平章事，封吴兴侯。次年，僖宗改邠宁为静难。中和五年（885年）三月，田令孜与河中节度使王重荣交恶。光启二年（886年），王重荣上书列举田令孜十大罪状。田令孜调拨禁军，引鄜州（今陕西富县）、延州（今陕西延安）、灵州（今宁夏灵武）诸道军，令朱玫、凤翔节度使李昌符讨伐王重荣。朱玫反而联合李克用、王重荣、李昌符反抗田令孜。令孜乃纵火焚烧坊市和宫室，挟僖宗逃往凤翔（今陕西凤翔）。朱玫拥李煴为帝，他则自任侍中，专断朝政，又派王行瑜追击僖宗，王行瑜倒戈杀朱玫。