站命上，改採用令制国次一级的郡名「颈城」入名，成为了现今的「颈城大野」。
车站结构.设有木制单层站舍一座，改札口前月台部份设有屋檐，可同时供作有盖候车亭之用。与北小谷站相同，开站时只设有侧式月台1座，列车不能在此交换。就算后来北小谷站因车务需求而增设了通过路轨，本站亦未有跟随装设，是同区间中少数能够一直位处直线区间的车站。有效长度为超过4辆，其中往根知站方向约2辆的长度为后来加建，高度稍比原来的月台为高。列车靠站时，上行往南小谷方向为右侧开门，下行往纟鱼川为左侧开门。