被提拔进入国家队。2016年8月，吴世飞和伊祖丁合作出战新加坡羽毛球国际系列赛并以2比0（21-13、21-14）的成绩击败了东道主兼4号种子的丹尼·巴瓦·克里斯南塔和亨德拉·维加亚组合，获得羽毛球生涯的首个国际赛冠军。2016年10月，吴世飞再与伊祖丁合作出战越南羽毛球国际系列赛决赛但最后以1比2（21-17、19-21、20-22）的成绩不敌东道主兼2号种子杜俊德和范鸿南组合，屈居亚军。之后，首次出战荷兰羽毛球大奖赛在准决赛中以0比2（15-21、13-21）的成绩不敌来自台湾的2号种子李哲辉/李洋