7日，矢内原忠雄出生于日本四国地区爱媛县越智郡富田村；其父曾到京都府学习近代西方医学，是爱媛县内第一位西医。11岁时读神户小学校高等科（高等小学），隔年考上兵库县立神户中学校（兵库县立神户高等学校的前身，当时是5年制中学男校）。1910年，考上旧制第一高等学校（今东京大学教养学部），在学长川西介绍下参加校长新渡户稻造举办的读书会；隔年参加内村鑑三每週日于自宅举行的圣经研究会，后来并终身信仰其所提倡的基督教无教会主义。 1913年9月，进入东京帝国大学法科就读，受新渡户影响攻读经济学并钻研政治学。就读