线上依次为影壁、大门、二门、大殿、望月楼和后配殿，一进院内设南北讲堂各三间，现分别作为阿訇室（其后跨院内设有沐浴室）和寺管委会办公室，二进院内设南北讲堂各五间和配房各两间，其中讲堂现分别作为接待室和教长室，配房现为阿訇居室。大殿前出卷棚顶抱厦（其中悬有李鸿章所书的“清真古教”匾额一方），纵深方向由前殿、中殿和后殿勾连搭组合而成，总面积约900平方米，以中殿顶端可登梯而上的亭阁式望月楼作为全殿中心。寺内后配殿现亦设有伊斯兰教职人员培训中心。