给了查尔斯·斯图亚特（达恩利的兄弟）并育有一女，阿尔贝拉小姐。詹姆士·赫伯恩则被囚禁在了丹麦，患上了精神病，最后在1578年死于狱中。1580年，软禁玛丽的责任被转交到了阿米爱斯伯勒特手中。玛丽在他的关怀下度过了余生。不管如何，1570年，法国国王查理九世派代表劝说伊丽莎白许诺帮助玛丽重新获得她的王位，作为前提条件，玛丽要接受她仍不十分赞同的爱丁堡条约，正式放弃英格兰的女王名号。不过，威廉·塞西尔，一世伯利作为伊丽莎白的代表与玛丽协商。两位女王始终没有见过面。其间玛丽曾提出和儿子詹姆士六世共同治理苏