长春中医药大学前身为1958年成立的长春中医学院，1970年合并入卫生部直属的吉林医科大学（即白求恩医科大学前身，并下放吉林省管辖），长春中医学院附属医院改称吉林医科大学第四附属医院。1978年3月，长春中医学院恢复。2006年更名大学，是吉林省重点高校。是吉林省一所以中医药学科为主，医、理、工、管、文等多学科协调发展的省属重点大学，受省卫生厅与省教育厅双重领导。
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体育老师性侵学生案.2018年7月29日，微博曝出长春中医药大学体育老师高雷长期性侵