吉·费迪南多·马西利创立。高耸的天文台（La Specola）建于1712年至1725年之间。图书馆建于1744年，由朱塞佩·安东尼奥·托里和卡洛·弗朗切斯科·多蒂设计。图像收集始于1754年。18世纪，宫殿的北侧添加了宏伟的大厅，于1756年开放。在启蒙时代，科学院是欧洲的模范研究机构，也是博洛尼亚大学的关键部分。它受到博洛尼亚教宗本笃十四世的保护。在拿破仑时期，科学院的科学设备分散到不同的院系（解剖学、光学、化学、地理、航海科学、物理学、天文学），历史藏品分散到不同的博物馆中。只有图书馆留在波吉宫，