1917年7月，孙文领导的护法运动开始，胡瑛南下参加，复归孙文阵营。1917年冬，任湘西招抚使。翌年，任靖国军第三军军长。1924年，胡瑛接受孙文之命，到北方担任联络冯玉祥的工作。此后曾参与冯玉祥的北京政变（首都革命）。国民革命军北伐开始后，胡瑛任山西阎钖山驻南京代表。此后阎钖山反蒋介石战争开始，胡任第十路总指挥。反蒋军败北后，胡瑛被通缉，逃入汉口租界。九·一八事变后，胡瑛的通缉令被取消，胡瑛复归南京国民政府。此后因患病而住进医院。1933年（民国22年）11月，胡瑛在南京病逝。享年50嵗。