亚爪龙，让原始的阿瓦拉慈龙与进阶的单爪龙之间产生了连结，并釐清了牠们的互相关系。小驰龙在同一年被发现，并被分类于个别的小驰龙科。而鸟面龙则是在1998年被发现。以上各属开始被归类于阿瓦拉慈龙科，并设置了单爪龙亚科。阿瓦拉慈龙科与似鸟龙下目可能是姐妹演化支，共同属于夹跖龙类（托马斯·霍兹所建）或似鸟龙形类（保罗·塞里诺所建）。因为目前所发现的化石，都来自于晚白垩纪的非常衍化物种，提供较少关于早期物种的资讯，所以阿瓦拉慈龙科的分类非常困难。近年发现的简手龙，具有阿瓦拉慈龙科、其他手盗龙类的过渡特征，尤其是头