时代，在神户市内多地都发现旧石器时代和绳文时代的文物。进入弥生时代后，随着稻作技术和金属器的传入，神户的人口进一步增加。据日本书纪记载，神户三大神社中的生田神社和的历史都可追溯至弥生时代后期。而在古坟时代之后，随着豪族的兴起，在日本各地开始出现巨大的前方后圆坟。神户市内最为着名的古坟是，这处古坟也是兵库县内最大的古坟，也显示在这一时期神户的已经有一定程度的文明发展。在奈良时代，当时的朝廷在兵库区修建，开始神户作为港口的历史。大轮田泊是摄播五泊之一，是当时日本重要的贸易据点。然而在平安时代后期，由于国家财政无