惠士奇爲惠周惕之子。晨夕奋志读书，尝于人群坐中背诵《封禅书》，不遗一字。康熙四十七年（1708年）戊子科江南乡试第一名举人，康熙四十八年（1709年）联捷己丑科进士，选庶吉士，散馆授翰林院编修，历官侍读学士，曾典试湖南。康熙五十九年（1720年）出任广东学政，提倡经学，有弟子苏珥、何梦瑶等。累官至侍读。雍正五年（1727年），惠士奇因“入对不称旨”，被罚修镇江城，散尽家产，最后资金不足而停工，被削籍归里。干隆元年（1736年），免除修城欠款，诏召士奇进京，先入八旗通志馆充纂修，是年夏天，诏开三礼馆，