部上方有高嵴冠，嵴冠从鼻孔前方开始隆起，在眼眶后方结束、上颌骨向两侧与后方延伸、颌部前段缺乏牙齿、上颌的最大型牙齿位于颌部后段、牙齿基部呈宽椭圆形。克尔纳也指出，准噶尔翼龙以外的物种，化石都相当破碎，所以各属都确定具有的特征只有最后一个。都迷科翼龙、枪颌翼龙也曾被归类于准噶尔翼龙科，牠们都是中型翼龙类，牙齿适合咬碎外壳坚硬的动物。同样在2003年，大卫·安文（David Unwin）提出稍微不同的定义：准噶尔翼龙、湖翼龙的最近共同祖先，与其最近共同祖先的所有后代。准噶尔翼龙科的生存年代从侏罗纪晚期