委员会总书记后中华人民共和国曾实质停止宣传一国两制。其中在中华人民共和国新制定的《反分裂国家法》中便未提到一国两制原则，相对地其假设台湾採取中立并且不自行宣布独立。而在2005年中国国民党和平之旅之后中共开始进行海崃两岸双方交流与谈判，到了2008年中国国民党重新执政后两岸官方会谈重新展开，其中马英九政府在处理海崃两岸关系上决定採取「不统不独不武」的政策。中华人民共和国政府则在九二共识的基础上开始与中华民国政府进行官方交流，之后陆续设立两岸定期航线、开放大陆居民赴台湾旅游以及双方共同签署《海崃两岸经济合作架