酸与另一条链上的核苷酸成对配对。 二级结构负责核酸所承受的形状。DNA中的碱基被分类为嘌呤和嘧啶。嘌呤是腺嘌呤和鸟嘌呤。嘌呤由双环结构，含氮的六元环和五元环组成。嘧啶是胞嘧啶和胸腺嘧啶。它有一个单一的环状结构，有一个含氮六元环。嘌呤碱基总是与嘧啶碱基（鸟嘌呤（G）与胞嘧啶（C），与腺嘌呤（A）与胸腺嘧啶（T）或尿嘧啶（U））配对。DNA的二级结构主要通过彼此缠绕的两条多核苷酸链的碱基对来确定，以形成双股螺旋。
三级结构.三级结构是指原子在三维空间中的位置，考虑到几何和位阻效应空间限