亏为盈，爱尔兰航空在穆勒的领导下变成一个强稳且持续赚钱和拥有韧性商业模式的航空公司。2015年，穆勒在马来西亚政府以及国库控股邀请下加入马来西亚航空并担任该公司的首席执行长，以协助国库控股执行马航的一系列业务重组计划。。2016年4月，穆勒因私人理由向国库控股提呈辞职信，希望提早与马航解约并回到德国。国库控股在审查该辞职信后批准了该请求，穆勒现为马航的非执行董事以便在过渡期期间监督于7月上任的新任首席执行中彼得·贝勒。穆勒预计将在2016年9月正式离开马航以及马航董事局。除此之外，穆勒曾担任无数家航空公