支序分类学的认识，使牠们的分类作下列更新：
2006年分类.基于对多种线虫的小亚基rDNA序列几乎全长的分析，线虫被认为应该包含至少12个支序：包括秀丽隐桿线虫（"Caenorhabditis elegans"）和几乎所有主要动植物的寄生虫在内的胞管肾纲冠群，在有腺纲内非常突出。有关对线虫动物门的系统学研究仍在改进中，这包括到分析959条线虫的基因。现时世上所有线虫物种的完整列表，可参看《World Species Index:Nematoda》这本书。Section: