吴应奎（），字孟才，山东兖州府东平州人，军籍，明朝政治人物、进士出身。
生平.山东乡试第十一名，会试第一百七十二名，万历二年（1574年）登甲戌科进士第三甲第九十一名。曾祖父吴聪；祖父吴仲宏，曾任七品散官；父吴道南，曾任冠带生员。母田氏。