事件中结构未受损坏，但被大楼倒塌扬起的灰尘覆盖。E线列车服务临时延长至布鲁克林尤克利德大道车站以替代暂停运营的C线（此外A线和D线也在59街-哥伦布圆环车站以北以慢车模式运行，在夜间和周末替代C线的服务，而在145街车站或贝德福德公园林荫路车站和34街-先驱广场车站之间运行的B线则在工作日以慢车模式运行，替代C线服务。C线于9月21日恢复服务后，E线缩短至坚尼街车站，但钱伯斯街车站和百老汇-纳苏街车站一直关闭到10月1日，世界贸易中心车站一直关闭到2002年1月。
九一一事件之后.