皖系是北洋军阀的派系之一，主要人物是段祺瑞、徐树铮、卢永祥、吴光新、曾宗鉴、倪嗣冲、靳云鹏、段芝贵、傅良佐等。皖系领袖段祺瑞原籍安徽（皖），皖系故以此得名。段祺瑞一度曾任国务总理兼陆军总长，控制中央政府。皖系一直受到大日本帝国势力的支持。1920年直皖战争爆发，皖系被直系军队击败，北京中央政府遂被直系控制。