Wnt信号通路对毛囊发育的调控作用主要通过对毛囊干细胞、转录因子、Wnt信号分子等的调节来实现。Wnt信号通路可以调节毛囊干细胞，例如在毛发再生期间，毛胚芽和隆突处毛囊干细胞中，β-连环蛋白的稳定表达可以活化LEF/TCF复合物，从而激活C-Myc、周期蛋白D1等下游靶基因的转录，进而促进毛囊干细胞的活化、增殖和定向分化，但是毛囊干细胞在β-连环蛋白的表达数量较少时会分化为表皮细胞。Kim等发现Dickkopfs会分泌一些富含着半胱胺酸的蛋白质，以及低密度脂蛋白受体相关蛋白，两者结合后会抑制Wnt信号传