败之后，伊集院忠栋自愿剃发，前去向丰臣秀吉投降，并留在丰臣军中做人质。丰臣秀吉也同意继续保留岛津氏。丰臣秀吉非常赞赏伊集院忠栋的能力，在九州征伐之后，给予肝属一个郡作为其领地。以后作为岛津家的宿老，多次参加同丰臣家的谈判。1595年，在岛津氏领内进行检地，代领了北乡氏在日向诸县郡庄内的八万石所领。其检地的一系列行为受到了岛津家家臣等人的不满。他还强迫肝付兼盛认定自己的儿子兼三为嗣子。由于其权力日渐膨胀，岛津氏兄弟也将其视为重大威胁。1599年4月4日（庆长4年3月9日），忠栋在伏见城的岛津家邸中被岛