一次出访北京时，他携带了自己的诗集《贞蕤稿略》。该诗集后被收录于吴省兰主编的清朝畅销书《艺海珠尘》中。1801年（纯祖元年），老论派以安东金氏为靠山，以禁止天主教为名，残酷镇压南人派，史称“辛酉邪狱”。朴齐家以其亲家尹行恁凶书案同党的罪名，被发配到图们江边的钟诚。1801年，正祖妃下令释放朴齐家，他才得以归还故里。
思想.
北学思想.针对朝鲜的小中华思想，朴齐家指出明朝被女真灭亡后，中国虽然天崩地坼，剃发胡服，但华夏之遗风余烈犹存，而且华夏优秀传统文化与夷