铭传之改革事业，其改革事业遂中途而废。而后，于二十年（1894年）十二月邵友濂离职，代之由唐景崧就任福建台湾巡抚。　台湾建省还不到十年，中日甲午战争（1894年－1895年）后中日签订马关条约，将台湾和澎湖之主权割让给了勃兴中的日本，在经过台民与台湾民主国短暂抵抗后，进入台湾日治时期。据《清史稿》记载：「光绪...二十一年，弃台湾，省巡抚。」「日索交台湾益亟，朝旨命台湾巡抚唐景崧交台，台民汹汹欲变，并引公法力争。」
晚清治台官员.晚清治台官员有沈葆桢、王凯泰、丁日昌、吴赞诚