庄国荣以主任秘书身份站在第一线指挥，并以强硬的态度与措辞，乃至情绪性字眼被媒体大肆报导。2007年12月庄国荣的「就德国女人的观点来看，马英九很娘啊」言论造成社会哗然，引起两性专家和同性恋团体反弹。2008年3月16日，庄国荣在台中参加谢长廷与苏贞昌的总统选举造势活动时，讽刺马英九父亲马鹤凌私生活，引起蓝营人士不满。庄国荣当晚请辞教育部主任秘书一职，并获得部长杜正胜立即批准。总统候选人谢长廷落败，舆论认为庄国荣难辞其咎2008年3月16日，庄国荣出席民进党「长（谢长廷）昌（苏贞昌）」台中市竞选总