然而黄河对于济宁水系的影响却不止于此。自古汶水自东而来，至梁山下转向东北注入渤海，是为大清河，也就是济水。明朝治理运河，自南旺而北至梁山、张秋，与济水相交。清咸丰五年（1855年）黄河于兰阳（今兰考）铜瓦厢决口，其中一熘一路向东北于张秋冲决运河大堤注入大清河，这条水道后来成为黄河入海主要通道，南流入淮的故道逐渐废弃。
大汶河.大汶河即汶水，东起鲁山，西至东平湖，最终注入黄河。汶水于左传中多有记载。元明两代开掘运河，汶水即为济州河主要水源。元时筑堽城坝引汶水入洸河，于济宁天井闸（会源