关原之战后，成为德川家康次子结城秀康的领地，并由其家臣今村盛次成为领有2万6千石的城主。不过在1612年今村盛次因涉入而失势，改的本多成重成为新的丸冈城城主；之后又因为越前松平家内的纷争，1624年本多成重自越前松平家的家老身分转为独立的大名，设立丸冈藩。现在的坂井市辖区在江户时代期间除了部分区域属于丸冈藩外,也有不少区域属于福井藩或是幕府直属的领地，19世纪末明治维新后，这些区域先后改隶属新设立的丸冈县、福井县和本保县；不过在1971年底进行的第一次府县整併中，全数被整併为新设立的福井县，但当时的