授后，伊萨科夫即花了他大量的时间研究海军战术与战略学。1932至1933年间，伊萨科夫参与了苏军对德国海军的调查，尤其特别关注其潜艇以及在第一次世界大战中使用的战术。1937年，伊萨科夫在他成功答辩了关于其青岛战役中德军对日军的攻防内容后，他获得了「全博士学位」。在纳粹德国于1941年对苏联发动入侵后，苏联海军的人力骤减，纷纷调往陆上对抗德军。尽管如此，伊萨科夫仍暂时服役于「红旗北方舰队」至1942年，而之后转往北高加索方面军，1944年3月31日，伊萨科夫晋升为「海军元帅」，为苏联海军史上仅有此军衔的三人