府军事委员会召开联席会议，决议特派汪精卫、许崇智、蒋介石组织特别委员会，授以政治、军事、警察全权，负责处理廖案。1925年8月25日，国民政府下命令设审理廖案特别法庭。根据调查审讯，认定刺杀廖仲恺的主使为朱卓文、胡毅生、魏邦平、梁鸿楷、林直勉等人，胡汉民、许崇智涉嫌。国民政府发布了对朱卓文、胡毅生、林直勉的通缉令，但警察最终只捉到林直勉一个人。林直勉被捕后坚决不承认自己与暗杀廖仲恺事件有任何关系，他说：“我反对廖先生不假，但从来就不想用暗杀手段倒廖，与廖案也没有任何关系。”林直勉曾被送上一个特别法庭