家、本愿寺联手抵抗信长（有冈城之战）。另一方面，东摄津的中川清秀、高山右近却没有跟随村重反叛。十一月六日，信长命九鬼嘉隆以六艘铁甲船击破毛利水军（第二次木津川口之战）。荒木村重和石山本愿寺失去毛利军的援助，顿时陷于劣势。1579年（天正七年）六月，明智光秀攻下丹波国，八上城波多野秀治投降后被处死。同年九月，荒木村重抛弃妻子逃离有冈城。有冈城落陷后，荒木一族被处死。十月，原本亲毛利的备前的宇喜多直家臣服，织田军佔于上风。荒木村重往花隈城，结果遭到织田家重臣池田恆兴追击战败，逃往依附毛利家（花隈城之战）。