1999年，1998年至2004年，世界自然基金会执行了吉仙国家公园保育计画（Cat Tien National Park Conservation Project, CTNPCP），其中越南爪哇犀牛便是计划的一旗舰种，有两支犀牛监测小队先后成立，并以相机陷阱拍摄到数张越南爪哇犀牛的相片，为史上首次拍摄到此亚种的纪录。研究人员多次透过分析犀牛粪便中的基因序列，判定当地犀牛族群为1-6只不等。另外亦有计画将吉禄保护区范围内的四个村庄迁村，2003年至2006年有两个村庄成功迁走，但另两村因政府与国际组织未