受到全面禁止，大多数教堂挪作他用或遭拆毁，教会活动转入地下进行。1978年起，改革开放以来，宗教活动逐步获得解禁，教堂亦逐渐复堂。目前海外传教差会派遣传教士来华传教的方式和中国自发教会组织跨地区传教仍然受到禁止。由于“文革”的历史遗留以及一些人不认可中共控制的三自教会，许多信徒自组教会，称为「家庭教会」或者「地下教会」（所谓“地下天国”）。而因为家庭教会不符合「三自」要求，一直以来都处于灰色地带，在部分地区甚至遭到政府打压，多个家庭教会遭到取缔，信徒被拘留。对自发教会的禁止，成为一个困扰中国人权状况的问