，干隆十三年（1748年），干隆初幸曲阜祭孔，由继汾引驾，讲解《中庸》，颇得皇帝赏识，授内阁中书补户部广西司主事，后入选军机处行走，官至户部主事。干隆十九年，被命随军筹饷。干隆四十九年（1784年），孔继汾因编写《孔氏家仪》，被族人孔继戍告发篡改《大清会典》，获罪西戌新疆伊犁。经其次子孔广森借贷赎出后，遂云游四海。干隆五十一年（1786年）八月六日戌时卒于杭州梁同书家中。葬于曲阜城西犁铧店村南。四年之后，归葬于曲阜城西大柳村。着作有《阙里文献考》100卷，《孔氏家仪》14卷，《乐舞全谱》2卷，《匡仪纠谬