年10月1日，仙台车辆中心2辆编组15列、秋田车辆中心2辆编组2列共计配属34辆。新造车辆部署后的调动如下：
5000番台.在奥羽本线标准轨区间(福岛-新庄，通称: 山形线)的普通列车， 作为JR集团第一个在来线标准轨车辆的番台区分。1991年，日本车辆制造新制造了2辆编组12列共24辆。配属在山形车辆中心，编组番号Y-1 - Y-12。与0番台相比主要有以下的不同点。2002年以后，除了将受电弓变更为单臂式以及排障器变更为强化排雪性能的形状之外，Y-1 - Y-6编组