带有皇帝敕令的安全通行証旅行，还是锒铛入狱，受到教会审判，以异端名义将他禁锢，胡斯受到监狱内的折磨，病苦不堪，教廷的zh-hans:康士坦斯大公会议;zh-hant:康士坦斯大公会议;判他有罪，把他绑在城门口的火刑柱上烧死示众。这导致支持他的地方贵族及信众起兵，和胡斯所在地波希米亚的罗马天主教会，以及支持天主教的神圣罗马帝国中央政府对抗，爆发了胡斯战争。胡斯的信众展开了一场场的战役，直到十五世纪才结束。后来因此在波希米亚建立了胡斯派教会，直到1620年哈布斯堡王朝征服了捷克之后，才恢复了罗马公教。