“长线骗局”（The Long Con）一集中，索耶通过诡计最终取得了控制权。本季又引入新角色，包括在机舱尾部的幸存者（Tailies）以及其他岛上居民。有关舱口的疑问得到解决，它是由达摩计划以科学研究为名于数十年前建立，用来进行科学实验。一位名叫德斯蒙德·休谟的人在舱口内已经居住了3年之久，每108分钟就要按动一次按钮，以防止大灾难发生。随着有关神秘的“其他人”的真相浮出水面，迈克尔背叛了其他幸存者，坠机的原因也得到揭示。 第三季中，坠机幸存者了解了更多有关“其他人”信息以及他们在这个神秘小岛上生活的