迪南及其子裔丧失了继承为西班牙国王的权利。此举使费迪南成为了奥地利哈布斯堡皇朝的首位君主。
三十年战争和皇朝挫败.1517年，德意志威登堡教士马丁·路德因不满罗马天主教的赎罪券政策，认为是敛财，发起了德意志宗教改革，创立了新教信义宗，从此喀尔文、慈运理等新教神学家各自开宗立派，欧洲迈入宗教改革。自当时的马西米连一世开始，历任哈布斯堡君主都对新教都採取容忍政策，因此新教得以在德意志广为流传，而且传到奥地利哈布斯堡王朝治下的波希米亚。但由于君主的容忍新教，哈布斯堡君主一直被选为波希米亚