美军战争期间估计全厂产量约每日3,000到5,000桶。高雄厂在1944年完成两座原油蒸馏工厂建厂工程，但是台湾空战毁坏了部分设备，原本寄望从婆罗洲北运的原油油轮则遭到同盟国潜舰击沉，因此高雄厂在1944年开工后多度停工，日军并动员民间人力开凿挖空半屏山，计画将重要的炼油设备藏匿其中。日本战败后，中华民国政府接收台湾各项产业，第六燃料厂最初由中华民国海军接收，相关器材在1946年6月1日移交给资源委员会，资委会则将所有石油、天然气相关接收日产合组为中国石油公司，拨款修复设备。六燃厂也在此时更名为高雄炼油