，执行「研究型大学整合计画」，推动国内研究型大学的发展，整合的模式包括校内整合、校际整合、大学系统及整併，而此计画促成台湾联合大学系统的设立。2005年教育部公布「师范校院定位与转型发展方案」与「国立台北师范学院等六校成立转型改名教育大学筹备处」，推动国北师、新竹师院、台中师院、屏东师院、花莲师院、北市师院等六所师院转型教育大学，并与邻近大学整併。2011年1月26日大学法修正案通过，其中第七条载明教育部拟订大学合併计画，报行政院核定后，由大学执行。教育部在2012年6月22日制定「国立大学合併推动办法」，