之后升任左都督，担任总兵官，镇守宣府。景泰元年（1451年），在关子口抵御也先的四次连续进犯，不得不退兵，都督江福援救亦失利。朱谦不得不力战抵御。之后接连作战，抵御成功，论功封抚宁伯。当时，瓦剌意图攻佔宣府、大同，认为两城可旦夕取下。然而朱谦守宣府、郭登守大同，均屡次挫败瓦剌进攻。也先认为两城无法攻下，只好一意归还被俘的明英宗。同年八月，英宗归还，经过宣府，朱谦率子朱永出见，厚犒使者。次年二月，死于宣府，赠侯。子朱永袭。成化年间，谥武襄。