演化支的基部，是最早分支的病毒株。Rc-o319病毒的刺突蛋白中与宿主受体结合的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）有一段长9个胺基酸的缺失，为此病毒所特有，且SARS-CoV-2的RBD中与人类细胞受体血管紧张素转化酶2（ACE2）结合所需的数个重要位点，Rc-o319大都与SARS-CoV-2对应不同胺基酸，显示前者可能难以与人类的ACE2结合而造成感染。实验（pseudotyping）结果显示Rc-o319病毒只能与角菊头蝠的ACE2结合造成感染，无法结合人类