各宗教的面貌打下了基础。
吴哥王朝以后.1430年，暹罗入侵柬埔寨，次年吴哥王朝迁都金边，此后柬埔寨与暹罗、缅甸、越南之间常有战争。16世纪末，柬埔寨、缅甸与暹罗之间爆发激烈战争，1594年柬埔寨战败被佔，由于暹罗人的影响，上座部佛教佔强势地位，大乘佛教和印度教逐步衰微，很多印度教建筑被替换为上座部佛教式样，林伽雕塑被取缔后安放佛像。不过印度教、大乘佛教的宗教影响并未消除，仍在民间流传。19世纪，柬埔寨沦为暹罗和越南的双重附庸。1864年，法国建立交趾支那（位于今越南南部）殖民