设计院修改原设计。1992年8月，徐州新客站工程正式开工，车站改造期间客运被分流至徐州西站和徐州站西运转场处理。1996年新客站竣工并投入使用，徐州站站房通过白色贴砖外立面、青色滤光玻璃、拱形天顶组成了类似风帆的造型，颇有即“一路顺风”的寓意，站名则由李可染题写。　2007年年初，徐州站1、3站台由低站台改造为高站台。2007年4月18日，京沪铁路开行动车组列车，但运行初期并没有列车停靠徐州站。6月1日开始，D31/32次列车停靠徐州站。9月10日开始，开行到的D88/5、D82/3次列车，徐州站是其中