免疫系统失调造成疾病（可能影响肌肉骨骼系统和软组织）、自体免疫性疾病、血管炎和遗传性结缔组织病。此外，西方医学常以是否进行手术治疗，而将专科区分为内外科相对应的分科系统，同属肌肉骨骼系统的骨外科对应的风湿科，亦常被视为骨内科。这领域常见的疾病有类风湿性关节炎、全身性红斑狼疮、骨关节炎、干癣性关节炎、僵直性嵴椎炎、痛风和骨质疏松症。许多这类的疾病属于免疫系统问题。因此，风湿病学也被认为是医学免疫学的研究和实践。自西元 2000 年代起，导入生物治疗（生物制剂、biologics；包括肿瘤坏死因子-α、