队旗舰的职能则被转移至新近入役的战列舰德皇威廉二世号上。
义和团运动.腓特烈·威廉选帝侯号于1900年担任了其首次重大行动，随第一支队在义和团运动期间被部署至中国。当时，中国的民族主义者正围攻北京的外国公使馆，并杀害了德国公使克林德。尽管德国在当地已有由防护巡洋舰奥古斯塔皇后号、汉萨号、赫塔号以及小巡洋舰伊伦娜号、和炮艇、鸡貂号所组成的东亚分舰队，但德皇认为仍有必要派遣远征部队去巩固已经形成的八国联军，以击败义和团。远征部队由腓特烈·威廉选帝侯号及其三艘姊妹舰、六艘巡洋舰、十艘货船