.所有的变形菌门细菌都是革兰氏阴性菌，其外膜主要由脂多糖组成。很多种类利用鞭毛运动，但有一些非运动性的种类，或者依靠滑行来运动。此外还有一类独特的粘细菌，可以聚集形成多细胞的子实体。变形菌门包含多种代谢种类。大多数细菌营兼性或者专性厌氧及异养或者自养化能生物生活，但有很多例外。很多并非紧密相关的属可以利用光合作用储存能量。因其多数具有紫红色的色素，被称爲紫细菌。
分类.变形菌门根据rRNA序列被分爲五类（通常作爲五个纲），用希腊字母α、β、γ、δ和ε命名。其中有的类别可能是併系的