当时木曾义仲在俱利伽罗峠和连败平家军，平家连忙派兵固守京都。教经和兄长一起，率2000余骑在宇治桥一带负责警卫工作。同年7月平家撤出京都的时候，教经也率部跟随。闰十月，义仲派足利义清为大将，前往攻打以赞岐国屋岛为大本营的平家。平重衡和奉命迎击，在备中国的水岛遭遇源氏军队。平教经身为平家方面的副大将，身先士卒，斩杀源氏方面的侍大将海野幸广，源氏方面的大将足利义清亦战死，平家大获全胜。水岛之战使木曾义仲的威望大失，同后白河法皇的对立加深，后来次年被源赖朝所灭。当时西国各地反叛平家的势力崛起，平家根据地的后院