门等地通商，直到1937年中日战争爆发，日本政府限制与中国沿海岸口的贸易行为，连带影响行郊出口贸易量紧缩。而1949年后，台海两岸更呈现军事上长期的对峙，更导致日后的衰落、甚至解散。不过，由于行郊组织的办公会馆常合併用于寺庙，少数行郊如澎湖的台厦郊会馆和台南的水仙宫等，尚有保存原行郊组织的祭祀功能迄今。