日本大学在外加橄榄球争议下也被减少35%的补助款。
入学弊案.2018年，日本文部科学省前科学技术・学术政策局长佐野太，利用职务，在挑选文部省支援私立大学名单时，与东京医科大学疑似利益交换，令其子得以入学，已被东京地方检察厅特别搜查部以收受贿赂罪名的嫌疑逮捕，而东京医科大学在不当获得进入文部省支援私立大学名单机会的同时，该校前理事长臼井正彦及前校长铃木卫也被调查中。除了以上之外，东京医科大学以往每年皆会公布的入学合格名单及入学合格分数，在2018年入学年度时，突然决定不公开入学合格