铁厂；六枚炸弹落在长崎大学和医院，三枚直接命中建筑物。虽然这些炸弹造成的破坏相对较小，但是令当地人提高了警戒心，许多人（主要是学童）被疏散到较安全的农村，减少了城市的人口。长崎在8月初时拥有4个7厘米高射砲砲台和探照灯防空砲台。长崎北方有一个英联邦战俘营，其中有些人当时正在煤坑中工作，直到他们回到地面才发现长崎遭到轰炸。
原子弹轰炸.保罗·蒂贝茨上校负责指挥第二次核攻击的作战计划，首要目标是小仓市。后来为了避开从8月10日开始为期5天的恶劣天气，任务提前2天执行。当时第2枚原子