玛斯·卡弗利尔-史密斯、帕特里克 J. 基林（Patrick J. Keeling）、阿拉斯泰尔 G. B. 辛普森（Alastair G. B. Simpson）和Fabien Burki各自所带领的研究组的研究显示，原本定义的原始色素体生物可能不是单系群。前三者的分子系统学的结果均显示，一类称为（学名：Picozoa或Picozomas，同物异名）的原生生物嵌在了原始色素体生物的演化支中，并与红藻类构成姊妹群，隐藻生物的分类地位尚不明确。四个研究组的详细结果如下表：