管理主要由yum实用程序提供，在22版后则由dnf取代。Fedora同样提供图形界面（例如"pirut"，"pup"和"puplet"），用于在更新可用时提供视觉通知。apt-rpm是yum的替代品，对于Debian类发行版的用户来说可能更熟悉。这里，APT被用于管理软件包。额外的软件仓库可以被添加到Fedora，以便安装Fedora软件仓库未提供的软件包。
软件仓库.在Fedora 7之前，有Core和Extras两个主要的仓库。Fedora Core仓库包含所有操作系统必需的基