高度异质性。抗菌肽家族的成员可通过一个高度稳定的区域（即凯萨林域（cathelin domain））和另一个高度可变的域来表征。哺乳动物的各个种的抗菌肽之间是互相孤立的。最初，科学家在中性粒细胞中发现了抗菌肽，不过，随后，科学家发现，在经过细菌或病毒或骨化三醇（维生素D的活性形式）的刺激后，上皮细胞和巨噬细胞中亦会产生抗菌肽。
特征.抗菌肽的长度范围很大，其长度可从12个氨基酸残基到80个氨基酸残基。它们的结构也千变万化。大部分的抗菌肽均爲折叠成两亲性的α螺旋的长爲23-3