琦卸任巴贝多总督一职， 随即调往坦噶尼喀地区，自1938年7月8日至1941年6月19日出任坦噶尼喀地区总督兼三军总司令。
坦噶尼喀地区总督.位于东非的坦噶尼喀地区早自1885年起由德国佔领，一直到德国在第一次世界大战战败后，国际联盟才于1919年将之拨交英国统治，所以英国在坦噶尼喀地区的统治根基较其他英属殖民地要浅。 杨慕琦上任坦噶尼喀地区总督之时，由于英国的张伯伦政府正积极向纳粹德国推行绥靖政策，舆论担心英国会将坦噶尼喀送还德国，作为绥靖政策的一部份，使到当地一度民心散涣，士气