二十二史考异》于二十四史中仅缺《旧五代史》和《明史》。与赵翼《廿二史札记》、王鸣盛《十七史商榷》并称清代三大史学名着。
各家评价.梁启超认为此书成就可比王引之的《经义述闻》。林理炯称赞《廿二史考异》乃钱大昕一生精力所注之结晶。周振鹤曾比较钱大昕、赵翼、王鸣盛三人，并指出三人之学问有龙、虎、狗之别，钱大昕《廿二史考异》是“点石成金”，赵翼《廿二史札记》是“披沙沥金”，至于王鸣盛《十七史商榷》最差，是脸上贴金之滥竽。吴绍烈以《廿二史考异》与《宋史》互校，指出钱大昕考证中的一些失误。