系统开始濒临危机。数个鸟类种类被猎至绝灭；然而，大部份的破坏由人类带来的其他哺乳动物所造成，尤其是老鼠，另外还有狗、猫、鼬、刺猬和澳洲袋貂等，对于无法飞行的鸟类（特别是地面鸟类）最具有绝灭的危机。约2/3的鸟类绝灭发生在毛利人到来之后，其他的则发生在白人到来后。