此次国务院机构改革中，原属国家发改委的组织编制主体功能区规划职责整合到新组建的自然资源部；应对气候变化和减排职责整合到新组建的生态环境部；农业投资项目整合到新组建的农业农村部；重大项目稽察职责划入审计署；价格监督检查与反垄断执法职责整合到新组建的国家市场监督管理总局；药品和医疗服务价格管理职责整合到新组建的国家医疗保障局。改革后，国家发改委发展规划司调整为发展战略和规划司；经济体制综合改革司调整为体制综合改革司；西部开发司调整为区域开放司；东北等老工业基地振兴司调整为地区振兴司；高技术产业司调整为创新和高技