复的基因可以突变出不同功能而不影响原本的功能，或是各段复制各自专精于原始功能的一部份。除了整个基因的复制，有时也会发生基中当中的一部份复制，变成更长的基因。反转录转移将信使RNA反转录成DNA并插回基因体中。反转录基因常插入到新的位置，而有了不同的基因表现和功能。嵌合基因（Chimeric genes）是当复制、删除或反转录转移造成两个不同的编码序列嵌合在一起，而形成新的基因序列。嵌合基因常造成调节过程的改变，并可能重新排列蛋白质域来产生新的功能。直接形成机制已在酵母菌、稻米、以及人类中发现