抗日根据地，配合八路军开展抗日游击战争。1939年底，国民党发动第一次反共高潮，阎锡山在山西发动十二月事变，意图消灭山西新军。在八路军的支持下，薄一波率部反抗，并于事后编入八路军129师序列，他任决死第一纵队司令员兼政委。1940年4月，薄一波出席邓小平主持召开的冀南、太行、太岳地区军政党委员会高级干部会议，在会上提出安定民生、建立秩序、发扬民力、增加生产四项措施。会后他担任冀南、太行、太岳行政联合办事处副主任，领导太岳抗日根据地的建党、建政、建军工作。1941年1月，薄一波任八路军太岳军区司令员兼