学亚太经济合作研究中心及香港经济及商业策略研究所，并任后者的主任至今。自2001年起，他亦担任校务委员会委员。2011年，王于渐成为黄干亨黄英豪基金教授。2019年4月起，再度出任香港大学暂任首席副校长，以接替突然请辞、自2015年起暂任首副的谭广亨。
公共服务.王于渐曾参与不少公共服务，包括参与外汇基金谘询委员会、香港房屋委员会、工业及科技发展局、大学教育资助委员会、中央政策组、行政长官特设创新科技委员会、策略发展委员会等。1999年，王于渐获香港特别行政区政府颁赠银