7月二次革命爆发后，张仁奎随徐宝珍的江苏陆军第四师参与镇压江苏的讨袁军。因镇压期间损失兵力较大，1913年11月，苏皖宣抚使冯国璋奉令裁撤扬州徐宝珍的江苏陆军第四师，改编为第七十五、七十六混成旅，张仁奎任第七十六混成旅旅长。1914年2月，革命党人同洪门九龙会策划在苏皖组织反袁起事。柏文蔚和江北讨袁总司令沙绍卿派孙锡五赴扬州发动瓜州、六合、天长等地的会党同时起事。但张仁奎早派密探宋锦荣等人打入九龙会，获知了起义消息。革命党人起事时，迅速被张仁奎部驻军捕获，起事失败。1914年7月，张仁奎人等随江苏都督冯