2016年8月，顾立雄出任行政院不当党产处理委员会首任主委，身负调查国民党不当党产的重责大任。8月31日不当党产委员会揭牌，顾立雄却因媒体争议性提问而暴怒，反呛媒体记者。2017年9月6日，顾立雄无财金背景接管中华民国金融监督管理委员会，起初受连胜文、赖士葆批评，惟最终以称职卸任。2018年5月31日，立委黄国昌疑似收到地震基金董事长陈明仁文件，爆料质疑顾立雄介入关说地震基金再保费率个案。2020年5月20日，升任国家安全会议秘书长。
争议.
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