8年底复工，与广东兵工厂、四川兵工厂等制火药厂合併成兵工署第23兵工厂，使用原本原料生产设备改产无烟火药及硝化棉提供内迁的兵工单位炸药与火药，停止化学兵器的研制。1947年，第23兵工厂与第2兵工厂合併；1948年，中华民国国民政府将其应用化学所迁往台湾，由此奠定了中华民国现行化学武器的发展基础。23兵工厂设备则在1949年11月底中国人民解放军攻入泸州市时完整移交，后改名泸州化工厂（现泸州北方化学工业）。
迁台后.1949年，中华民国政府撤入台湾后，美国海军在1955年借用国