头骨及身体、加上类似梁龙科的颌部，一度被认为是个嵌合体（McIntosh, 1990；Jacobs "et al.", 1993；Upchurch, 1999）。
分类.博妮塔龙在原始叙述文献中被分类成纳摩盖吐龙科，但后来的系统发生学分析和叙述都认为牠属于泰坦巨龙类中，一个包含林孔龙类与隆柯龙类的演化支（巨像龙类）。