为藏传佛教寺院的功能更加完整，干隆中期智珠寺的兴建一定程度上缓解了嵩祝寺、法渊寺在开展宗教活动、接待蒙古僧众等功能上的压力，嵩祝寺、智珠寺、法渊寺三寺共同作为蒙古章嘉活佛在京驻地的格局形成。
破坏.1931年，国立北京大学校长蒋梦麟购置了松公府（原为傅恒府）的产权，兴建了北京大学图书馆、文学院，尽北边为女生宿舍。1956年，中共中央宣传部占用北京大学旧址，并向北多占近50米，拆除嵩祝寺、法渊寺的影壁，建宿舍楼，造成嵩祝寺、法渊寺前广场全部被占，寺内广场大半被占。1950年代，嵩