大致佔有七百万石，占全国总石高四分之一，以确保对各藩国统治上的绝对优势。各藩国大名的土地均按份地由农民耕种，农民须交租、履行各种封建义务。幕府对农民实行登记制度管理，藩国共有三类：三种封地以近到远，有防御和互相监视性质。各藩藩主都必须定期到江户参谒将军。幕臣需要贡纳，幕府还垄断对外贸易；两项为中央政府主要收入，再加上将军领地的税收和矿山国营收入补充。全国主要矿山如佐渡、伊豆的金矿，主野、石见的银矿，都由将军直属。交通要道上的所有关所由幕府直接管理和控制，各藩不得私设关所，借以监控全国人口和物资流