水务署辖下设有客户服务科、发展科、机械及电机科、设计及建设科、运作科和财务及资讯科技科等。各科亦分多组负责管理、维修和保养水务设施。
用水供应.香港的公共用水主要分两种：淡水和咸水。淡水主要用于食用、灌溉等用途；而咸水则用作沖厕之用。由于新界部份地区仍然未有咸水供应，故仍每天使用珍贵淡水沖厕。淡水和咸水分别由两组完全独立系统所供应，不包括该地区没有咸水供应地区。香港现时共有21个泸水厂，每日可处理约480万立方米淡水。水在离开泸水厂或由海中抽取后，便由抽水机或水向低流原理输送到