菌伞小，是平的或凹的，其子囊果大多数没有伞柄。一般子囊果的颜色是灰棕色或者黑色。一些暗色孢科菌的子囊果沉入在其它职务的组织内。有些菌的子囊果有特殊的开放装置，一般它们有分明柔软的边，有些也明显有毛。囊盘被由多少棕色、很薄，但是细胞壁很粗的等径的细胞组成。子囊之间的膜由简单的侧丝组成。子囊一般是圆柱形或者圆锥形，很小。
生态.暗色孢科菌类在全世界都有，它们腐生或寄生在草本或木本植物上。有些暗色孢科菌类会导致经济植物疾病。
分类.暗色孢科包括以下14个属：