上承魏晋南北朝的制度，而有大幅度之改革，在组织上比较完备。职掌、品级、俸、禄的规定也比较具体，是秦汉以来官制的一个总结。对于之后唐朝、宋朝、元朝、明朝、清朝的官制有重大影响。但是，中枢虽五省分设，除了尚书省无事不总以外，其他各省，职掌并不十分明确，直到唐太宗的时候，才建立了分工明确的三省制度。
中枢官制.隋朝设三公：太尉、司徒、司空。官高，但多缺位，“朝之众务，总归于台阁”。炀帝时以尚书、门下、内史、秘书、殿内为五省；以御史、谒者、司隶为三台；以国子、将作、部水、少府、长秋为