逮捕和审判之后，1527年1月5日在利马特河被以溺刑处死。他是第一位重洗派的殉道者，接着还有其他三位被处死。之后其他重洗派逃离或被驱逐出苏黎世。
瑞士邦联的宗教改革（1526–1528年）.1524年4月，琉森、乌里、施维茨、下瓦尔登和楚格等五个州形成“五国联盟”(die fünf Orte)，以对抗慈运理的改革。他们联系了马丁·路德的对手约翰·埃克，曾在1519年的莱比钖辩论和路德辩论。埃克要求举行辩论，他和慈运理都接受。然而，他们不能同意评审机关的选择、辩论的位置，还有使用瑞士