始翼龙类相比，曲颌形翼龙的第五趾较小；翼龙类的第五趾被认为是支撑者两腿间的异膜。
种系发生学.Felix Plieninger在命名曲颌翼龙时，将牠们归类于翼龙目的喙嘴翼龙亚目，但没有确切的分类位置；嘴嘴翼龙亚目现在被认为是个并系群，包含一群原始翼龙类的集合体，并演化出后期翼手龙类；由于是个并系群，嘴嘴翼龙亚目现在较少出现在科学文献中，仍出现在大众科普书籍。在1928年，法兰兹·诺普乔（Franz Nopcsa）将刚改名的曲颌形翼龙，改归类于喙嘴翼龙科的喙嘴翼龙亚科。之后有段时期，