大部份的柴油引擎使用的燃料为柴油，但狄塞尔的发明原意是可以使用不同种类的燃料。事实上，他在1900年的世界博览会上展示他的发明时，使用的燃料是花生油。
优缺点.柴油引擎的省油效率较佳、因此可以减少二氧化碳排放，而且柴油引擎在中低转速即可提供高扭力的特性，对于日常的行车能提供较佳的实用性，因此大客车、货车等商用车大多以柴油引擎驱动。但相反的它也具有污染较高的问题——长碳链有机化合物燃烧后易产生主要以碳粒为主的悬浮微粒（SS）与超细悬浮微粒（PM2.5），再加上高温高压下亦产生的氮氧化