密盛产哈密瓜、大枣、小麦、玉米、棉花、葡萄、苹果、梨等，其中哈密瓜和哈密大枣驰名中外。主要牲畜种类有牛、羊、驴、马、骆驼等，其中以巴里坤马和伊吾马比较着名。山区戈壁栖息着雪豹、雪鸡、天鹅、马鹿、野驴、黄羊、野猪、野骆驼等野生动物，生长有贝母、党参、柴胡、雪莲、麻黄、甘草等野生中草药。全市森林覆盖率0.68%。哈密矿产资源丰富、种类多、品位高、储量大，大多位于铁路、公路沿线。至2008年，已探明各类矿种76种，占新疆已发现矿产的65%，储量居全疆第一位的有17种。资源保有储量潜在价值20589.78亿元。