年4月至2009年2月，赵沁平任中华人民共和国教育部副部长、党组成员。其间，2005年11月起兼任国家语言文字工作委员会主任。2008年，当选第十一届全国政协委员，代表教育界，分入第四十一组。并担任教科文卫体委员会副主任。2011年5月，当选为中国科学技术协会第八届全国委员会副主席。2013年12月，当选中国工程院信息与电子工程学部院士。2014年6月，当选为北京航空航天大学学术委员会主任委员。他还兼任虚拟现实技术与系统国家重点实验室（北京航空航天大学）主任、中国系统仿真学会理事长、中国人民解放军总装备