首任站长，1922－1936年任国际纬度服务（ILS）中央局局长。主要从事纬度观测和极移的研究。1902年从世界纬度观测资料中发现公共的纬度非极变化项，即“Z项”，后来被命名为“木村项”。他也因此于1911年获得日本学士院恩赐奖。1936年获得英国皇家天文学会金质奖章，1937年获得日本文化勋章。