便搬迁至北京。1946年由于恶性通货膨胀北京大学无力支付教师工资，受朋友张我军影响，她父亲决定搬迁至台湾。孙康宜当时只有两岁。她父亲从1950年在台湾白色恐怖时期被囚禁十年。1966年毕业于东海大学，1968年毕业于国立台湾大学，1971年毕业于罗格斯大学，1972年毕业于南达科塔州立大学，1976年毕业于普林斯顿大学。1979年至1980年担任塔夫茨大学助理教授，1982年7月任教于耶鲁大学。受张光直的自传影响，她于2003年也出版回忆录《走出白色恐怖》第二版已经于2013年出版，2004年剑桥大学出