关系转坏后，于1999年提出特殊两国论，认为中华民国与中华人民共和国的关系为「特殊的国与国关系」。陈水扁政府执政时，提出一边一国，亦提出「一个中国」的新解释，强调尊重中华人民共和国政权为中国正统、是唯一的中国，而台湾则是从中国正统之争中脱离。马英九政府执政时，提出维持现状，推动九二共识、一中各表，主张一个中华民国，两个地区，採行其称之的活路外交。蔡英文政府执政时，提出维持现状，不承认九二共识，尊重中华民国宪法与两岸关系条例之两岸关系定位，主张中华民国台湾是全台湾人民的共识，採行其称之的踏实外交。