将丸之内南口做为乘车口、丸之内北口做为下车口。中央玄关为皇室专用，与东西一般出入口之间各有一个出入口以搬运行李。东京站原始的设计是由赴日协助建设东京市区铁道路网的德国工程师负责。对日本传统建筑怀有兴趣的巴尔策，将车站建筑（丸之内站房）设计为带有入母屋破风与唐破风屋顶的和式建筑；但该设计在当时日本崇尚欧风的氛围下饱受批评，最后不被採用。后来车站建筑的设计工作由辰野金吾等人接手主导，转为以西洋式设计为基调，现今所见之丸之内站房，即为辰野经过三次设计后所定案的结果。惟东京站整体的场站布局，仍一定程度沿用巴尔策