46年2月，中共中央东北局在梅河口召开会议，吕正操代表中共中央西满分局参会并做工作报告；黄克诚接任西满军区司令员，吕正操调东北民主联军总部搞后勤运输。后兼任东北铁路总局局长。1948年，吕正操任东北军区兼东北野战军副司令员，东北军区副司令员等职。曾任东北人民政府铁道部部长，东北铁路管理总局局长。1949年，任军委铁道兵团副司令员。
中华人民共和国成立后.中华人民共和国成立后，1955年，吕正操被授予中国人民解放军上将军衔，获颁“一级独立自由勋章”、“一级解放勋章”，是57位“开国上