关的司设专职干部负责经济动员管理工作；二级部各司设动员计划处（科），大部分军工企业设动员计划科。上述动员机构接受国家计委国民经济动员局的工作指导。后来，成立国家计划委员会国防司，负责国民经济动员工作。1998年3月国务院机构改革时，原中华人民共和国国防科学技术工业委员会改组为中国人民解放军总装备部，另成立一个属政府部门的中华人民共和国国防科学技术工业委员会。将原国防科学技术工业委员会管理国防工业的职能、国家计委国防司的职能，以及各军工总公司承担的政府职能，统归新组建的国防科学技术工业委员会管理。19