祖训》载明正南偏东的「不征之国」包括大琉球（琉球国）与「不通往来，未尝入贡」的小琉球，后者是否指台湾仍未明确。不过到了明朝中叶，「流求」的名称逐渐消失在史册中，反而出现「琉球」、「东番」这两个地名，其中「东番」已确定就是今日台湾（见陈第《东番记》与沈有容的相关资料，清代的郁永河也继承其说）。