后，他于1912年（民国元年）9月任北洋政府蒙藏事务局总裁。1906年，贡桑诺尔布亲王邀请日本学者鸟居龙藏担任王府的教师至1908年。1913年12月，他任政治会议议员。1914年（民国3年）5月，蒙藏事务局改组为蒙藏院，他仍任总裁。此外他还兼正白旗满洲都统。1917年7月张勋复辟，授理藩部尚书。1922年（民国11年）4月，他从蒙藏院总裁任上退职，转任畅威将军。1923年（民国12年）2月他又重任蒙藏院总裁，直到北洋政府时期结束。1925年（民国14年），他任善后会议会员、国宪起草委员会委员，后来任卓索图