苏的鄂垒扎拉图被叛军达什策凌围困。兆惠夜间率军突围，苦战后退至迪化，得知迪化已经失陷，继续向东撤退。途中遇雅尔哈善派出的援军，于次年二月退回巴里坤。干隆二十二年（1757年），阿布赉与阿睦尔撒纳反目相攻，阿布赉归降清廷，称臣纳贡。六月，阿睦尔撒纳逃入俄国，年底染天花而死。干隆二十三年（1758年）正月，俄国遣使告知阿睦尔撒纳已死。清廷派人前往边界验看尸首。干隆帝以平定阿睦尔撒纳，宣谕中外。干隆二十四年（1759年），清军剿除了叛军残部及逃亡的玛哈沁，天山北路底定。不久后又平定天山南路，将整个新疆纳入版图