峦溪和卑南溪三大流域，共同塑造出纵谷内的主要地景。
地理.花莲溪、秀姑峦溪和卑南溪三大水系，盘据了花东纵谷的北、中、南段。三大流域分布甚广，交织成庞大的网络。其源头都在海拔二、三千公尺的高山上，因而形成了崃谷、瀑布、温泉、曲流、河阶、沖积扇、断层及恶地等不同的地质地形，也造就了许多独特的自然景观。其中，瀑布景观方面，以富里罗山螺仔溪上游的罗山瀑布，高达65公尺的飞瀑奇观最为壮丽。断层则以瑞穗断层为代表，瑞穗断层位于扫叭河阶东北方，又称「扫叭断层」，具有不连续地层和近乎直立之砾石层。