欧洲核子研究组织大型强子对撞机、欧洲航天局和欧洲南方天文台等国际设施，需要苏政府重新协商，也引发英国慈善机构的研究经费及国际公司对苏格兰设施的担忧。苏格兰教育部长迈克尔·拉塞尔曾表示，苏格兰大学“享誉全球”，独立后能继续吸引投资。2013年9月，阿伯丁大学校长表示，苏格兰大学可继续借由单方面研究领域，跨边境获取科研经费。斯特灵大学经济学教授大卫·贝尔却认为，跨境合作虽然可持续，但苏格兰大学会失去金融优势。苏格兰学院罗杰·库克指出，尽管苏格兰大学获得研究理事会的资金份额较高，但却比英国同行的资金依赖要少