898年，约翰霍普金斯大学的医学生班杰明‧申克（）从一名病人手指的溃伤中取样本进行培养，并将长出的真菌送交专家鑑定，认为可能属于侧孢霉属（"Sporotrichum"）。1900年，数名芝加哥的医师报导了孢子丝菌病的第二例病例，并进而描述发表了本属与其模式种申克氏孢子丝菌，但未提供具体的属级特征，因此一度被视为无效名，直到1960年代，有分类学家指出申克氏孢子丝菌与侧孢霉属的模式种黄金侧孢霉（"Sporotrichum aureum"）外形相差甚远（后者后来被归入担子菌门），而又将其归入孢子丝菌属（"Spo