责外交、军事等涉外权力，内政则由行政院负责。而除了国民政府委员会之外，国民政府也有许多机构多採取委员制。依照《中华民国国民政府组织法》规定，国民政府委员定额早期为12至16人，1930年代之后增为24至36人，而国民政府主席、行政院院长、立法院院长、司法院院长、考试院院长、监察院院长、及其副院长均由该委员会推选。而国民政府从1930年的第一次蒋中正内阁开始共组阁过十数次。1937年抗日战争爆发后，首都南京陷落，国民政府迁往重庆。在1938年宣佈实施战时政府体制，军事指挥权由国民政府主席转交国民政府军事委员