还资助了很多学生去日本留学。
在日慈善事业.吴锦堂在日本扩建了中华义庄（华侨墓地），捐资万国医院、孤儿养育院、盲哑院、红十字会等神户华侨慈善机构。吴锦堂与旅日侨胞联手兴办的神户中华同文学校，让在日华侨子女得以学习中华文化。日本宫城县、北海道等地发生自然灾害，吴锦堂曾多次捐巨款赈济。1908年，吴锦堂在日本小束野购入荒地愈100公顷，开发成良田，供贫苦的日本当地居民耕种，还建造房舍愈20座，解决他们的住房问题。1957年，当地人民经过公决，将其村落命名为“锦堂村”，将其水库命名为“吴