博物馆遇到了约翰·爱德华·格雷，并再次结识奥杜邦。在1828年他全家迁往罗马。在1832年和1841年间波拿巴发表了他关于意大利动物的作品《Iconografia della Fauna Italica》。在1849年他被选入罗马议会，参与创建了罗马共和国。按照Jasper Ridley所说，当议会第一次召开时：“当维泰博人卡洛·波拿巴被点到名时，他这样回应：‘共和国万岁！’（"Viva la Repubblica!"）”他参加了保卫罗马的战争，对抗由其堂弟路易-拿破仑·波拿巴派遣的4万法军。在1849