日军政大学教育长、第三分校校长。1941年，调任中央军委参谋部部长，兼延安卫戍司令、防空、交通司令。后调中央情报部一室主任。1942年春，到晋绥军区第二分区任司令员兼120师独立第2旅旅长，驻山西保德。1945年8月，许光达任雁门军区副司令员，司令员为吕正操，随后指挥北线部队向平绥线进攻，并率独二旅攻占清水河、率三十六团占领和林格尔，击溃马占山的东北挺进军第五师，占领凉城、新堂。之后与傅作义的部队交战，并歼灭国民党暂十七师第一团。9月，部队南下大同，攻占口泉煤矿，随后许光达率独二旅北上商都，参加绥远战役。