编译器优化技术以产生优佳的目的码，现今的优化编译器都对向量化（Vectorization）、程式回圈、记忆体阶层及数据局部性进行优化。此外，优化编译器都以高层次的中间表示（Intermediate Representation）优化程式 － 包括Open64编译器的WHIRL、IBM XL编译器的Wcode。
数学函数库.超级计算机主要执行科学运算等拥有大量向量及矩阵浮点计算的程式，因此优化常用的数学函数会提高运算效能。BLAS函数库使向量及矩阵浮点计算效能大大提高，而优佳化数