因处万里乡治所在地，遂于1952年1月15日更名为万里站。后又因「万里」与台北县万里乡（现新北市万里区）同名，遂于1958年6月1日改为万荣乡，本站亦随之改称万荣站延用迄今。1982年东线铁路拓宽完成，本站日治时期原有之木造房舍因过于老旧，亦同时改建为钢筋水泥站房使用迄今。
繁荣的过去.本站在1960至1970年代林田山伐木运转时最为兴盛，每日从林田山小火车转乘的旅客络绎不绝，木材货运也极为庞大。在当时与凤林、光复、瑞穗、玉里、富里、池上、关山、鹿野等站同样，皆为台东线各级列车都