9万余册在馆舍遭到炸毁前便分别疏散到新店大崎脚、大龙峒保安宫、龙山国民学校与中和庄南势角简大厝四处，仅有儿童室书籍、查禁图书与价值偏低的图书约7万余册随着馆舍毁于战火。二次大战后，馆藏书籍由山中樵转交给台湾省行政长官公署图书馆，山中樵并协助该馆范寿康、吴克刚两任馆长发展馆务。现为国立台湾图书馆。
历任馆长.台湾总督府图书馆先后共有五任馆长，不过第四任馆长若槻道隆为代理，故任期仅为两个月。历任馆长简介如下：