习仲勋担任陕甘宁晋绥联防军区政治委员，1949年2月又担任西北军区政治委员。1949年6月，习仲勋担任中共中央西北局第三书记。
建国初期.中华人民共和国成立后，习仲勋任中央人民政府委员，中央人民政府人民革命军事委员会委员，中共中央西北局第二书记，西北军政委员会副主席、代主席，西北行政委员会副主席，第一野战军暨西北军区政治委员，长期主持西北地区党、政、军全面工作。他组织了西北地区城市接管、剿匪反霸、土地改革、镇反和“三反”“五反”及抗美援朝等工作，并妥当地解决了复杂的民族宗教问题。