广州人林修，在原塔基下重建千佛塔，并将佛舍利埋于塔下。北宋元符三年（1110年），苏轼被贬岭南时，从海南北归，路经广州，时净慧寺僧人慕东坡之名，力邀其为寺题字。苏东坡见寺内有六棵枝叶繁盛的古榕，便欣然提笔写下“六榕”二字，字为楷体，遒丽奇雅，厚重雍容。明成祖永乐九年（1411年）改名为六榕寺。苏轼所题匾额，今天仍高悬于寺门上。近人柳桥金保泰撰书的长联，描述了寺中景胜文物：「胜迹数名山，达摩履，东坡展，王勃碑，当年蛮海寻幽，三百钟声留过客；仔肩担大法，舍利塔，南宗像，太湖石，此时格亭得古，五千弟子有传人。