环境之变迁，淡水河流域河道逐渐淤积，渐渐无法胜任航运的需求。目前淡水河水运集中在大稻埕码头、关渡码头，以及淡水与八里渡船头之间两岸居民联络交通。以下列出目前淡水河河段的码头与航线。
文化资产.淡水河主河道自清朝前即为移民进入台北盆地的重要入口，后来更为进出口贸易的交通动脉，淡水河主河道两岸皆为台北市知名的历史聚落，如艋舺、大稻埕等，累积了极为丰富的文化资产，包括传统产业、宗教庙宇、民俗文化与原住民活动等，这些都是淡水河水系丰富的人文面貌与水岸游憩文化资产。Section:::