却吉僧格及其众位弟子宣传，直到15世纪，桑浦寺一直为西藏讲因明的重要寺院。除此之外，般若（以《现观庄严论》及注疏为主）、中观（以《入中论》及注疏为主）等学也大多由桑浦寺传播。恰巴·却吉僧格之后，桑浦寺分成了上、下两院。萨迦派掌权时期，曾将桑浦寺的几个扎仓划归萨迦派管辖。15世纪，格鲁派兴起后，桑浦寺随其他噶当派寺院先后改奉格鲁派，成为格鲁派寺院。桑浦寺夏学一般在藏历每年3月30日至5月15日举行。鼎盛时期，在此学经的僧人约两万。许多信众在寺内捡小毛球回家制熏香，这些小毛球是羊毛袈裟与其他服装相互摩擦