在双方展开第二波争讼的期间，社运圈跟当地居民除了一面诉诸法律途径外，另一面也透过更多的体制外管道如行动剧等等提升抗争强度逼使环保署让步。而当地居民也主张中科三期进驻的行为已经对健康造成影响，如律师施淑贞指出68名接受血液检验的民众里，就有18人血液中戴奥辛浓度超过标准。中科三期开发后，后里农民血液中戴奥辛超标者达22％，超过世界卫生组织标准便是一例。法界人士如李建良教授亦为文抨击环保署边动工边补做环评的行为践踏法律尊严，开发至上的想法也架空环评制度的预警功能，值得批评。但亦有官员和立委则认为厂商开发的