布加综合征约占25%，由肝静脉外的占位性病变（如肝肿瘤）压迫血管引起，感染（如结核）、先天性静脉网形成、下腔静脉狭窄和中毒等也可继发引起布加综合征。肝静脉血栓形成和下面因素有关（按发生率排列）：1、真性红细胞增多症；2、妊娠；3、产后；4、使用口服避孕药；5、阵发性睡眠性血红蛋白尿；6、肝细胞癌。病人一般都已知有血栓形成的危险，如存在蛋白C缺乏、蛋白S缺乏、凝血因子V Leiden突变、凝血酶原G20210A基因突变的遗传倾向。和基因无关的最重要危险因素是服用含有雌激素的避孕药，其他危险因素还包括抗磷脂