透明层的一个程序错误导致所有依赖Windows API函数GetThreadContext的32位应用程序不兼容。此类应用包括应用程序调试器、调用堆栈跟踪器（例如IDE显示调用堆栈）和使用垃圾收集（GC）引擎的应用程序。受影响最广泛的一个GC引擎是Boehm GC，它被同样流行的Mono作为默认的垃圾收集引擎。虽然Mono截至2010年10月有一种新的、可选的GC（称作SGen-GC），但它与Boehm GC执行堆栈扫描的方式相同，因此它也不兼容WoW64。截至2010年11月15日，微软没有提供修复计划或