是用盲眼将军约翰·坎塔库泽努斯（John Kantakouzenos）替换了约翰·杜卡斯。1191年，约翰·杜卡斯再次被派往保加利亚战场，与侄子伊萨克皇帝一起指挥后卫部队，尽管拜占庭军在中惨败，约翰的部队得以完好地撤走。同一年，他还参加了一场宗教会议，普世牧首在此次会议上辞职，此次会议的记载中称约翰为“皇帝最尊贵的亲属”。此后，伊萨克皇帝仍然怀疑约翰对皇位有野心，1187年，约翰的亲家发动叛乱，更加深了皇帝的怀疑。皇帝的猜疑或许是有道理的，1195年，约翰·杜卡斯的另一个侄子很快发动政变推翻了伊萨克，自