月3日，林文察请假回台保乡兼平定乱事，并于八月与九月之间返回台湾。他以福甯镇总兵的身分指挥南路各军，并命林文明南下收复沿海一带，并与他、徐忠标等军会师麦寮，然后直攻彰化城。12月1日，彰化收复，林文明前往八里杙断水沙连等对敌军的援助，并防范戴军四块厝庄林日成骚扰。而后，林文明请求林文察率军支援四块厝庄战事，两人则于1865年1月19日发动攻击，经过一番苦战后，林文察架砲台连日砲轰，于2月6日斩杀林日成，大致平定戴潮春事件。此战林文明表现杰出，晋升为副将，并赏戴花翎。1864年，林文察将平定内山的军务交付