留期间遭到警方暴力对待，不过未实际参与行动的林义雄在面对祕密侦讯由于反对认罪而遭到许多打压，而他也被告知不能透漏有关刑求等事情。林义雄的家属也是透过许多管管道才得知被送至景美军事看守所，为了隐瞒女儿使得方素敏告诉她们的父亲前往当兵。隔年2月20日，台湾警备总司令部军法处依照叛乱罪向林义雄、黄信介、施明德、张俊宏、姚嘉文、陈菊、吕秀莲、林弘宣等8位党外运动人士提出公诉，其他30多人则在一般法庭上遭到起诉。此时遭到逮捕的林义雄等人因为涉嫌参与叛乱，因此依照《台湾省戒严令》最高可以判处死刑。不过张德铭、陈继盛等人