均对各自的主权主张做出相当的自我约束；未来希望从此出发，减少台日冲突的因子，达成互利共生的境地。沖绳县知事仲井真弘多于协议签署当天发表声明，称「不仅沖绳县的要求完全没有得到反映，还向台湾方面做出了大幅让步，不得不说这极其令人遗憾。」并认为该协定会激化沖绳县渔民和台湾渔船的竞争，沖绳县的水产业将不可避免地遭受重大影响。他表示今后将向中央政府提出强烈抗议。副知事高良仓吉于4月12日上午前往首相官邸会晤官房副长官杉田和博时也表示不满，杉田则称「日本政府会拿出诚意，向沖绳渔业相关人员详细说明事情经过。」农林水