成典顺利连任、名列不分区的曹寿民也因而当选。2006年直辖市长选举，郝龙斌由国新共推并当选台北市长。同年，新党在台北市提名的4席市议员全垒打，全数当选连任。
2008年后.2008年中华民国立法委员选举中，新党仍与国民党合作，赖士葆、费鸿泰由国民党提名而进入国会，并未单独提名候选人。至于全国不分区部分，新党则努力争取政党选票，以前立法委员周阳山挂帅、雷倩则名列第二，重返新党竞选连任，得票38.6万，占3.95%，重回第三大党的地位，但仍未跨过5%的门槛，无法取得国会席次。至于地方议