义军惨遭日军杀戮。陈秋菊此后勤俭治产，因而致富。1907年5月（明治四十年），陈秋菊获得台湾总督府所颁授的佩绅章。虽名列搢绅，然因变节投降，时感内疚于心，平居不谈时事，1922年8月22日，抑郁而终。
身后.陈秋菊古厝(今新北市深坑区旺耽路39巷12号)