降解.脂肪酸的代谢是透过在粒线体或/及过氧化体中进行的β-氧化反应，产生乙醯辅酶A。大部份的情形中，脂肪酸氧化的机制类似脂肪酸合成的逆反应。在脱氢、水合及氧化反应后，脂肪酸会脱落二个碳，借由产生酮酸。乙醯辅酶A最后会由三羧酸循环及电子传递链，转换为三磷酸腺苷（ATP）、CO及HO。若体内没有葡萄糖或是含量不多时，三羧酸循环可以由乙醯辅酶A开始，并且分解脂肪以产生能量。脂肪酸棕榈酸酯在完全氧化后，可产生对应106个ATP的能量。不饱和脂肪酸及奇数链长的脂肪酸需要额外的酶反应才能降解。Sectio