特别是蛋白质的电离中的应用。
原理.用来测量质谱的仪器称为质谱仪，可以分成三个部分：离子化器（离子化源）、质量分析器与侦测器。其基本原理是使试样中的成分在离子化器中发生电离，生成不同荷质比的带正电荷离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器。在质量分析器中，再利用电场或磁场使不同荷质比的离子在空间上或时间上分离，或是通过过泸的方式，将它们分别聚焦到侦测器而得到质谱图，从而获得质量与浓度(或分压)相关的图谱。质谱仪由工作原理的不同可区分如下：
按质