令故事变得更复杂及使玩家体验变差。相反，开发团队在编写重制版故事时把旧版故事尽可能地删减，这使两版本的故事形成了鲜明的对比。尽管如此，开发团队增加了数个外传章节，使玩家可以获得新角色来帮助他们通过游戏。在角色设计方面，团队邀请了漫画《攻壳机动队》的作者士郎正宗重新设计游戏两位主角马尔斯和希达及其他主要角色的外型，以及绘制一些宣传品，而其他角色的改良则交由插画家井冢大介负责。开发团队重新设计主角马尔斯的目的是为了更新及改良他的外型，同时又希望能使他忠于粉丝群的期望。游戏战斗动画内的角色模型及图像交由外部企业A