兴召开代表大会，正式成立湘南苏维埃政府，陈佑魁被选为苏维埃主席。4月7日，他回长沙向省委汇报工作，当晚10时在中南大旅社被捕。4月19日遭当局杀害，得年28岁。
身后.1961年6月22日，时任最高人民法院院长、全国政协副主席谢觉哉作诗称赞他和罗学瓒：“浑身是劲陈佑魁，鞭辟入里罗学瓒。远瞩高瞻天下小，出生入死一边站。忠义之血不白流，阶级之仇彻底算。三十年前恶战场，巍然两个英雄汉。”