发动甘肃两当兵变失败，吕剑人、许天洁被捕，并被十七路军军法处判处死刑。王菊人说服杨虎城将判决改为有期徒刑，使二人保住了性命。1936年西安事变期间，他任杨虎城机要秘书兼十七路军总指挥部政治处副处长，抗日联军临时西北军事委员会政治设计委员会委员，参与起草张学良、杨虎城的团结抗日八大主张通电，并帮助南汉宸创建十七路军抗日同志会。西安事变和平解决后，他寓居西安。1945年春，他任第一战区副司令长官兼第四集团军总司令孙蔚如的临时秘书。1946 年，中国民主同盟西北总支部成立，他出任执行委员。他曾秘密到陕甘宁边区