塔等歼戮杀害回民妇女1000余人，被各州县拿获杀害1000余人。清廷拆毁各地清真寺数十座。掠夺回民田产五万余亩。使得李侍尧原制定的《筹议甘肃善后事宜条款》也未能完全实施，哲合忍耶不仅继续得到传播，而且以后又有发展。布政使王亶望“罪斩，籍其家”；勒尔谨、王廷赞亦均赐自尽，陕甘总督李侍尧论斩，甘肃提督刚塔谪戍伊犁。清廷还被迫“豁免甘肃积欠籽粮二百四十五万余石，折色银三十万两，以惠边氓。”