生命的蹂躏和无依百姓的颠沛流离；当人类在和腐海之间的对抗节节败退之余却疯狂地发动屠杀同类的残酷战争，娜乌西卡开始负起抢救生命、停止战争、探索生命之源及腐海秘密的使命。在过程中被视为蓝衣救世者的她，最后在巨神兵奥玛的帮助下进入了土鬼圣都修瓦，该地有一座巨大陵墓，储存纯净的原种以及旧世界的诸多工艺科技，在那里娜乌西卡揭开了腐海和王虫的秘密－原来那是人类在火之七日战争后所创造的一个崭新生态系统，为了把污染的环境再次净化，提供新人类居住。当世界净化完成后，人造的腐海和王虫将随即死去，所有的人类和生物都无法适应纯净的