总统李登辉亲颁第五届医疗奉献奖。1997年获内政部选为「绩优外籍宗教人士」。1998年由台湾省政府授予「荣誉省民」。1999年得华夏三等奖章。2000年7月3日，内政部部长张博雅代表前总统李登辉拜访玛喜乐，颁赠紫色大绶景星勋章。2002年，玛喜乐被台湾基督长老教会总会封立为「荣誉宣教士」。2005年11月17日，时任中华民国总统陈水扁专程南下二林镇颁发第三届总统文化奖给玛喜乐。在去世前几年前玛喜乐得失智症，得靠轮椅代步，且已数度进入加护病房。2005年4月16日，她唿吸不顺，再度进入彰化基督教医院二林分