中。真菌病毒可以在宿主的有性孢子、无性孢子、甚至中出现，其中以无性孢子传播的效率较以有性孢子的为高。大部分真菌病毒可能缺乏从外界进入真菌细胞的感染机制。有研究显示感染、与的真菌病毒可以在同属的不同种真菌间传播，也有研究将镰孢菌属与麴霉属的真菌各自处理成原生质体后一起培养，发现真菌病毒可以从前者传播到后者中，显示自然界中真菌病毒也有可能在不同属的真菌间传播，惟具体机制仍不明。有些从真菌病毒衍生，而本身没有传播能力的类病毒物质可能会随真菌病毒一起传播，有研究发生感染灰葡萄孢菌的BcMV1（Botrytiscin