把美洲鹰放在鹰形目，而南美分类委员会则把美洲鹰独立成一个演化目──美洲鹰目，这里我们採用南美分类委员会的作法。在90年代初期以前，美洲鹰的分类地位还很混淆，因为，由西布利和阿奎斯特主导的DNA-DNA杂交分类法盛行于70年代末至80年代，他们认为美洲鹰和鹳科的亲缘关系比较接近，甚至把美洲鹰当成鹳科的一个亚科，如今，这种亲缘关系则未受到众人支持。无论是称唿鹰形总目或是鹰形目，这些鸟类都是非洲禽类的基群分支。分支图依据Jarvis "et al." (2014)绘制。