教在印度亦会受到主流宗教极端派系的敌视。2008年夏季，极端印度教团体在奥里萨邦展开对基督徒的大规模攻击，杀害基督徒与纵火焚烧教堂、孤儿院及信徒的家。华人媒体把该团误为极端佛教徒，受到国际谴责。
祆教.祆教（琐罗亚斯德教）是古代波斯的宗教，仍在印度流传，信徒称为帕西人。许多世纪以前在今日的伊朗，祆教徒遭受到穆斯林统治者的迫害而逃到印度而被一位印度国王保护并安置他们在印度西部古吉拉特的。
犹太教.印度西海岸和地中海地区之间很早就有贸易联系，那里在公元前1世纪