肺结核在浙江大学医院养病四个月后，龚昇回上海家中继续休养。期间，因院系调整，浙江大学数学系被并入复旦大学。1953年4月，龚昇回到复旦大学接着跟随陈建功学习至1954年11月完成学业。1954年，龚昇前往北京，开始跟随华罗庚进行学习多复变函数论，与陆启铿主要参与了多复变函数讨论班。1955年，被推选参与全国青年社会主义建设积极分子大会。1956年，龚昇升任助理研究员。1958年8月，调入中国科学技术大学担任讲师兼任数学教研室秘书，协助华罗庚筹建中国科学技术大学应用数学与计算技术系。1959年晋升副教