与蹄兔目、象及索齿兽目更为接近。
化石纪录.重脚兽科首先于始新世中期出现，土耳其原始的"Palaeomasia"也是在该时期出现。重脚兽科下最后存在的属是重脚兽属，牠们首先于始新世末的法扬出现，并于渐新世早期与其他埃及重脚科一同灭绝。"Crivadiatherium"是在罗马尼亚的特兰西瓦尼亚发现，当地是雷兽出没最西边的地方。
命名.重脚兽科的学名是为纪念埃及托勒密二世的皇后阿尔西诺伊二世而取的，因为最初的重脚兽化石是在其宫殿的废墟附近发现。