大友宗麟而兵败自杀，种实在古处山城濒临陷落之际由家臣带出，在毛利氏的帮助下落脚于周防国山口城。永禄2年（1559年）1月、秋月氏的旧臣深津美浓守在毛利氏的支援下、将种实迎回居城，并大破佔领古处山城的大友军，将近恢复秋月家的旧领。种实的弟弟‧种冬成为高桥鑑种的养子进入了小仓城、种信继承长野氏成为丰前国马岳城城主、元种也担任香春岳城城主，纷纷对抗大友氏。秋月种实当主的时代，堪称是秋月氏之名最显扬的时候（但是也有一种说法，在永禄5年时、经由将军足利义辉的调停，大友宗麟和毛利元就暂时和睦，而秋月氏也回复旧领）。