瀛洲复任司法行政部常任次长。1947年，任第一届国民大会代表、国民大会主席团成员。1947年9月18日至1948年7月20日，任台湾省政府秘书长。1948年7月13日，任最高法院院长。1949年10月，谢瀛洲赴台湾，历任国立台湾大学、国立政治大学、东吴大学等校教授。司法院副院长傅秉常于1965年7月20日病逝后，谢瀛洲接任司法院副院长。1972年4月20日，谢瀛洲在台北病逝。司法院副院长一职由戴炎辉接任。