1991年9月，林山田发起「废恶法运动」，推动废止《惩治叛乱条例》与《中华民国刑法》第一百条。1992年5月，林山田担任「524反独裁废国大大游行」总领队。1992年11月，林山田担任「退报运动联盟」召集人，积极推动退《联合报》运动，被《联合报》自诉诽谤。1993年7月，台北地方法院审理退报运动联盟案，判处林山田有期徒刑5个月。1993年8月，林山田获行政院国家科学委员会资助，赴德国慕尼黑大学研究一年。1994年7月，台湾高等法院审理退报运动联盟案，改判林山田无罪。1995年7月，林山田号召叶国兴、傅云