06年2月，马超俊回到香港，继续参加革命派的活动，并且组织成立了华人机器工会。此后，他以研究机械制造的名义，先后组织创办了香港研机书塾、广东机器研究公会等工会组织，作为革命派的据点。此外，马超俊在革命派举行起义之际，负责提供武器。1911年10月，武昌起义爆发，马超俊作为革命派参战。马超俊赴武昌，被湖北军政府都督黎元洪派往萨镇冰率领的清朝海军中活动，最终成功劝说海军撤退并易帜投向革命派。
追随孙中山.中华民国成立后，马超俊任黎元洪的都督府顾问。但是黎元洪不断支持袁世凯，马超俊对