产生矛盾，贵族中亦产生支持后白河上皇的院政派与支持二条天皇的亲政派。虽二条天皇终得以逼退后白河上皇院政影响，但却形成与后白河上皇对立的局面。二条天皇驾崩后，后白河上皇仍健在，亲政派转而支持六条天皇继续与院政派对抗。六条天皇甫即位，亲政派人物关白大臣藤原氏贵族领袖近卫基実（藤原育子族兄）转而出任摂政大臣，加之藤原育子与亲政派合作，总体上朝廷仍然是亲政派主政局面，但因天皇年幼政局不安定导致后白河上皇政治影响开始回复。永万元年十一月十六日（1165年12月25日）后白河上皇册立其宠爱的第七子宪仁（二条天皇