坐标，用以表达化学反应的进行过程。利用简单的几何图表，加以表示单个或数个分子实体在化学反应中所经历转变的途径。这类坐标有时也可用键长、键角等参数来表示，但最常见的则是用自由能作为主要参数。一些非几何参数有时会在更复杂的反应中使用，例如是不同分子实体的键级。在过渡态理论中，反应坐标就是一组以曲线组成的坐标，用以表示某种化学实体由本身的结构，经变化成过渡态，最后演变成某结构的生成物的整个过程。在坐标中上升斜率最大的一个途径，就是该反应的速率控制步骤。