任遵义劝学、团溪国立两等小学校长。在团溪任国立两等小学校长期间，吴作棻请胡启詹、沈茂林、李世先等人当教员，倡导语体文即白话文教学，并自编《乡土地理》教材。后来，吴作棻回到贵阳，任贵阳商业养成所、时敏学堂、乐群学堂、广益学堂等校教员。吴作棻撰文唿吁开通乌江航运，修建马路（公路）等。因受《勐回头》等书影响，吴作棻、沈茂林和盘县人张光炜加入中国同盟会，成为贵州同盟会激烈派要人（贵州同盟会分为和平派、激烈派）。1909年，贵州咨议局成立，吴作棻当选议员。1911年12月，贵州的宪政会职员改选，吴作棻当选为宪