分、9、7号线共用部分。1号线部分与11号线部分紧密相连，11号线站台布置在原有1号线站台南侧，均沿东西方向布置。7、9号线共用部分位于1、11号线部分以东，与1、11号线部分大致垂直。
洗手间.本站设有洗手间，位于B出口旁及11号线月台。
月台.
1、11号线部分.车公庙站1号线部分位于深南大道下方，主体结构为单柱双层双跨结构与双柱双层三跨结构。采用暗挖法施工，总建筑面积12,288平方米。车站地下一层为站厅层，中间站厅为乘客办理进