两个连（营部连-料罗湾储训队、侦一连），澎湖西屿侦二连、马祖南竿侦三连各一个连，营部驻扎在金门。马祖东引侦四连于2012年3月28号精简裁撤。
历史.1949年于中华民国总统蒋中正视察金门时奉其指示成立，初名「侦察队」，装备以及训练由美国西方公司提供，其目的为收集中华民国大陆地区之情报，其所训练的突击队为中华民国国军最早期之战斗蛙人。海上突击队成立之初，曾派员至中华民国海军受远航训练并接收海军砲艇；尔后舰艇更新与海军无涉，概由陆军总司令部自行纳入装备筹补计画，故无外传「海军炮艇队为