床”，使地铁列车经过该区段轨道时的横向振动，经轨道下弹簧的吸收后，尽可能改变成沿轨道纵向振动，从而最大程度地降低振动干扰。但即便如此，部分高精密仪器的实验效果依然会受到一定干扰，后来建设的北京地铁16号线也不得不调整规划，将原定的海淀桥站取消，并改设万泉河桥站。
站厅.北京大学东门站的两个站厅分别位于车站南北两侧，南站厅设有前往站台的直梯，北站厅则设有装饰壁画，该壁画选取了北京大学具有历史代表性的标志性元素。
站台.北京大学东门站设有1个岛式站台，位于中关