、壹岐岛和五岛列岛三个部分。壹岐岛本岛和属岛面积共有139平方公里，全岛是平坦的熔岩台地。自该岛出发可乘坐高速船在一小时内到达福冈市。对马岛面积698平方公里，是长崎县面积最大的岛屿。对马也是日本距朝鲜半岛最近的领土，距离釜山市只有40公里。五岛列岛由中通岛、若松岛、奈留岛、久贺岛、福江岛五个主岛和约200个属岛构成，面积638平方公里。五岛列岛在古代是日本距中国最近的地点，因此是遣唐使的出发地和倭寇的根据地。近世时则以基督教文化而着称。长崎县拥有两个国立公园和两个国定公园。云仙天草国立公园以火山景观为主