于1882年，原来以传统日本风格设计。1945年遭原子弹炸毁，在原爆中倖存的德裔日籍神父决定要重建圣堂。在教宗庇护十二世支持下，1950年圣堂开始重建，1954年祝圣启用。1959年随教区成立升为座堂。1981年教宗若望保禄二世到访。2006年被列入重要文化财。目前的座堂由村野藤吾设计，以钢铁混凝土兴建。座堂楼高三层、地底一层、三廊式巴西利卡平面，并修建了一座高45公尺的钟楼。