是生物细胞中的一类化学物质，它们因为一些特殊的化学结构，能够对光线造成反射、干涉、散射或是吸收等效果。动物的皮肤、毛发、眼睛等部位具有不同种类色素细胞。
常见的生物色素.
以卟啉为基本的生物色素.血红素、叶绿素、胆色素（bilirubin）、血青蛋白、血红蛋白、 肌红蛋白。
发光色素.萤光素（luciferin）。
光合色素.叶绿素、藻胆蛋白（phycobiliproteins）。