浙江发配新疆。光绪三十一年（1905年）获得赦免，被安置在迪化城北的三个泉子（即吉泉子，中华民国时期属干德县，今属米泉县），以农耕为业，并继娶“兰州夫人”。宣统三年十二月（1912年1月前后），为了因应辛亥革命爆发后的新疆军事形势，清朝甘肃新疆巡抚袁大化招募回队，杨增新任回队统领，马福兴任帮统兼管带。杨增新利用回队镇压了哥老会。日后，杨增新、马福兴、刘长炳还结拜为兄弟，名为“桃园三结义”。民国2年（1913年），马福兴任玛纳斯副将，获授陆军少将。马福兴在三个泉子建造了大公馆，占地六亩余，还占良田1000