特征与其阴茎的长度的关系，比较可信的解释是阴茎在胚胎时的生长就被某些Hox基因控制着，尤其是HOXA13和HOXD13，正如同它们也控制着四肢的生长一样。Hox基因的突变可以导致生殖器畸形，但近来的一些研究没能找到双脚的尺码和阴茎长度的联系。即使很多基因都控制着人体身形的生长发育，和幼年或成年时期的激素分泌，但却不太有可能可以从人身体的某些部位推测出阴茎的精确长度。关于阴茎长度的其他一些研究得出了一些有争议的结论。如金赛性学报告中就说在数据上男同性恋者的阴茎要比异性恋者更长。有解释说这是因为在胚胎发