小国家里，人们都崇拜各自不同的神。随着美尼斯统一埃及全境，国王（新王国时期开始称为法老）开始推行各自出身地的神，使其称为主神，由全埃及共同崇拜。在古王国时期主神是鹰神荷鲁斯，后来改为太阳神拉，中王国时期则主要崇拜阿蒙，新王国时期拉和阿蒙相结合，形成主神阿蒙拉。在国家统一崇拜主神的同时，各个地方（诺姆，相当于省）仍然崇拜原来地方的神。参见埃及神话人物列表。另外，神祇也有不同的属性，有的是农业的神，有的是阴间之神，还有的是工匠技师的神（比如孟菲斯的卜塔）。而法老则是神的化身，或者是代言人，具有神的特性和神的