决定改与殖民政府合作，并参加奉行合作路线的组织组成的统一战线组织「印度尼西亚政治联盟」（）。有的党员坚持不合作路线，反对这个决定，并决定退出伊斯兰联盟党；后来发起伊斯兰之家运动的瑟卡马吉·马利占·卡尔多苏威罗就是其中之一。印度尼西亚政治联盟一方面在反法西斯主义这方面和荷兰合作，另一方面则要求荷兰殖民政府准许东印度群岛自治，并设立一个完整的议会，却被荷兰殖民政府拒绝，延续一向以来民族主义者无法成功和荷兰殖民政府合作的局面。最终，荷兰殖民政府在1940年5月禁止伊斯兰联盟党运作。
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