色使用磷酸盐缓冲生理盐水（PBS）比使用Ringer溶液效果好。
间苯三酚染色.间苯三酚反应是确定木质化细胞壁最常用的方法，间苯三酚在酸性环境下与细胞壁中的木质素发生反应显樱桃红色或紫红色。
线粒体染色.健那绿B对线粒体专一性染色。由于线粒体中的细胞色素氧化酶作用，使健那绿B始终保持氧化状态从而呈蓝绿色。干细胞具有较高的线粒体活性，故可以用此染色法区别。