宋朝的琴以“扁”着称，在清朝初年被与唐琴合称“唐圆宋扁”。 北宋时宋徽宗御制名琴松石间意在2010年以1.3664亿元拍卖，成爲当时拍卖价格最高的古琴、世界最贵乐器之一。宋元时期，琴开始出现明确的流派传承。第一个古琴流派，即浙派出现于南宋晚期，创始人是郭沔。南宋姜夔作琴歌《古怨》，是现存最早的琴歌。期间着名琴人有范仲淹、欧阳修、苏轼、夷中、知白、义海、则全、倪云林、耶律楚材和苗实等。宋季金元时期，琴已在契丹族、女真族、蒙古贵族的文人间广为流传。
明清.明朝琴学发展到顶峰，流派纷呈