轨，并在攻下石城后继续与诸将追击北走的鲁轨、司马休之等人。刘裕念及蒯恩前后出征的功劳，进封他为新宁县男，食邑五百户。后又转任刘裕世子刘义符的中兵参军。后又改任谘议参军，转辅国将军、淮南太守。义熙十四年（418年），因留守关中的刘义真无力治下，以及夏国的军事威胁，刘裕命蒯恩到关中召义真回朝，改派朱龄石驻镇关中。然而义真东归时却被夏将赫连璝追击，又因义真不肯放弃辎重，夏军还是追上晋军，蒯恩与傅弘之断后奋战数日，但至青泥时晋军大败，蒯恩身边士兵死尽，自己亦被擒，后死在夏国。