季风气候，年均气温15.5℃，年降水量879.1毫米。湖水多年平均水温17.3℃。
生物.抚仙湖拥有浮游藻类6门36属45种；浮游动物26属30种；底栖动物21属24种；水生植物12科15属19种；鱼类有5科19属36种，其中特有种抗浪鱼为抚仙湖知名特产。冬季有红嘴鸥等候鸟在抚仙湖过冬。湖区植被属于南亚热带常绿针阔叶混交林，主要树种是云南松和栎。然而，抚仙湖的相对隔离使得它容易受到生物入侵和污染。
生态保护.抚仙湖流域内污染的主要来源是农业、农村污