包括文物考古在内的部分学科的学术研究，侯仁之自此重新开始研究活动。1978年全国科学大会后，侯仁之重返西北沙区考察。1979年出版了首部个人学术论文集《历史地理学的理论与实践》。1980年，侯仁之当选为中国科学院地学部学部委员。1981年，侯仁之加入中国共产党。后来，侯仁之进一步深入研究北京历史地理，继续为北京市的城市规划提供参考，并组织于1986年完成了他久已计划的《北京历史地理图集》的编绘出版，获北京市科技进步一等奖。 他最重要的研究成果已体现在《北京城市建设总体规划方案》中。在北京城市建设的过程中