伊希滕贝格的阿美莉的独生女。由于父亲是巴西帝国皇帝，她一出生就是布拉干萨王朝巴西皇室成员，名字前还有尊称“勋爵”（）。她还是葡萄牙国王若昂六世的孙女。玛丽亚·阿梅利亚的母亲是洛伊希滕贝格公爵、法国皇帝拿破仑·波拿巴继子欧仁·德·博阿尔内的女儿；姥姥则是巴伐利亚国王马克西米利安一世的长女奥古斯塔公主。佩德罗是巴西帝国首任君主佩德罗一世，还曾是葡萄牙国王佩德罗四世。他的葡萄牙王位由首次婚姻生下的长女玛丽亚二世继承，所以玛丽亚二世也是玛丽亚·阿梅利亚同父异母的姐姐。玛丽亚二世的母亲是奥地利的玛丽亚·利奥波丁娜