事务会执行长蔡明耀因「误判事件」而自请处分，中华民国前总统陈水扁在外交部体制、亚太司之外设立的日本事务会亦被裁撤。此外，驻日代表许世楷被指责在「联合号」海钓船撞击沉没事件中被质疑拥有日本居留权，不能有效传达政府立场和争取台湾权益，加上许世楷不满部份国民党籍立委的言论，认为有谩骂成份，于是取消赴立法院外交及国防委员会的报告行程，另行召开记者会表示希望外交部批准自己几週前递出的辞呈。2008年至2014年中华人民共和国开始派各式船舰与飞机持续多次驶进钓鱼岛。2012年日本国有化钓鱼台列岛。201