脂蛋白E为涉及包括胆固醇在内的许多脂质运输的一种蛋白，并而能调节中枢神经系统中能含有多少的脑硫脂，且介导系统的稳态结构。业已发现，较高水平的载脂蛋白E与较大的脑硫脂耗损呈正相关。 载脂蛋白E的相关蛋白从髓磷脂取得脑硫脂，然后降解脑硫脂成各种化合物，例如硫酸盐。当载脂蛋白E增加时，取自髓磷脂的脑硫脂量也增加；因此，有更多的脑硫脂耗损。脑硫脂还涉入乙型淀粉样蛋白(Amyloid beta)肽的清除。乙型淀粉样蛋白肽是阿兹海默病的标志之一。当它们没有适当的降低，这些肽积聚并产生斑块，这些斑块是乙型淀粉样蛋白肽