和古花莲溪相连，形成河川袭夺现象，而瑞穗以南古花莲溪河段则形成断头河。秀姑峦溪下游河道因流量增加，侵蚀海岸山脉，切割成壮丽的崃谷。
地理环境.秀姑峦溪流域河谷平原位在花东纵谷之中段，北起花莲溪分水岭大富、大丰附近，南迄卑南溪之分水岭的大坡、池上，行政辖区包括瑞穗乡、玉里镇及富里乡等乡镇。秀姑峦溪流域河谷平原主要为沖积层及沖积扇堆积所构成，汇合清水、卓溪、它皮兰、红叶溪、富源溪等支流，贯穿纵谷中段，由瑞穗东回而循海岸山脉横谷入海，主要的沖积扇有富源沖积扇、红叶沖积扇、丰坪溪沖