北至芝兰一堡（今台北市士林区），南至兴直堡（今新北市新庄区）皆有械斗，朝廷震怒，欲将林国芳捕到当时的省会福州审问。国芳探知风声，1862年心急以病逝，民间遂有「第一惊（怕）死林国芳」之说。
家族.林国芳无亲生子，由其兄国华之子林维源兼祧，以祀香火。但他的夫人不喜欢林维源兼祧，另外收养孝廉叶化成（东谷）的儿子为螟蛉子，即通称三房的林维德（维得）。