组成捷克斯洛伐克，斯洛伐克足球员再次参与捷克斯洛伐克国家足球队，并在1962年再次取得世界杯亚军。在捷克与斯洛伐克于1992年分家后，斯洛伐克重新独立参与国际赛，第一次在1992年10月14日于维尔纽斯，以1比0小胜立陶宛。斯洛伐克于2006年打入世界盃附加赛，对西班牙仅一和一负，未能晋级。于2010年世界盃首次晋身决赛周，并在首圈分组赛爆冷撃败意大利，成功进入16强，最后被荷兰淘汰，但之后斯洛伐克在2014年及2018年世界盃皆未能晋身决赛周。2016年，球队首次晋级欧洲杯，最终进入16强，最后以0-