太平洋战争爆发后，日本占领香港，颜惠庆被软禁，其间拒绝了日方要其出任亲日政府职务的要求，后被逮捕押回上海关押。1945年抗战胜利后，颜惠庆在上海任上海市参议员、联合国远东救济与复兴委员会主席，还当选为第1届中华民国立法委员。1949年2月，受代总统李宗仁派遣，前往西柏坡同中国共产党和谈。2月23日，颜惠庆等飞石家庄晤见毛泽东和周恩来，对「和平」及通航问题，「广泛交换意见」。和谈失败后，颜返回上海。5月6日，蒋经国奉蒋介石命访颜惠庆「于中山医院」。中国人民解放军攻佔上海前，他留在上海，拒绝随国民党撤离。