。正德初年，请革近畿皇庄，不报。吏部尚书马文升致仕，朝廷官员都希望刘大夏、闵珪继任。王时中则诋毁闵珪和媚，刘大夏昏耄。两人遂各求退，焦芳遂得此职位，众人都指责王时中的错过。此后出按宣府、大同，逮捕武职贪污者百余人，为东厂太监丘聚所奏。刘瑾逮捕王时中下诏狱，荷重枷于都察院门。当时王时中正病重，其妻子看望时，遇到都御史刘宇，大哭且诟骂。刘宇不得已而向刘瑾求情，最后释放，谪戍铁岭衞。刘瑾被诛，起用为四川副使，迁湖广按察使。正德十二年，以右佥都御史巡抚宁夏。明世宗继位，召为右副都御史。父丧除服，起用故职。历