密的热带雨林，包括棕榈植物和多种富有经济价值的植物，例如：用来提取橡胶、珍贵的红木和药用植物。北部和东部地区低地较为干燥，有着大片的落叶树木，在海拔1500至2800公尺的山坡则覆盖热带植物，以竹子、树状的蕨类最多。海拔2800公尺以上的地区则有常绿的麻栎属、古南科灌木丛和矮生竹的丛林。3500公尺以上地区还有禾本科、和苔藓植物。加勒比海沿海低地有生长茂密芦苇的沼泽，海岸则有红树科丛林。总计有32个陆地生物群落和314种类型的生态系统，其中一个是仅存在厄瓜多、哥伦比亚和委内瑞拉境内安地斯山上的特殊「」生态系