现时包括快速狩胜在内的定期营业列车都会停站，而在夏季行驶的临时特急列车「富良野薰衣草特快（フラノラベンダーエクスプレス）」亦会停站。
车站构造.芦别车站为拥有2个侧式月台及2条铁路路线的地面车站。此外，车站大楼对面曾经有1个岛式月台，供3号线三井芦别铁路的列车停靠及行驶。车站业务由北海道JR服务网所管理，营业时间为平日7时00分～18时00分，其他时间及假期休息，并且制定列车及目的地等收费。并设置绿窗口。