皇太弟，教通再任东宫傅。同年，教通将三女藤原欢子送入后宫，为女御。永承2年（1047年），教通任右大臣，仍任右近卫大将与东宫傅。宽德4年（1049年）欢子生下教通殷切盼望的皇子，却即日夭折。翌年（1050年），终于长成的兄长赖通之女藤原宽子入内，为皇后。天喜5年（1057年），教通升至从一位。康平3年（1060年）为左大臣。这期间，教通获得在大内乘辇车、牛车的宣旨。治历元年（1064年），天皇赐其左右近卫番长各一人，近卫兵士各三人为他的随身。治暦4年（1068年）后冷泉天皇在无男嗣的情况下崩御，死前立欢子为