运短暂接手至该客运站拆除为止。红干线整併初期以2座候车亭（关庙国中旁及消防队旁）作为先期临时转运站。2015年9月22日在原关庙果菜市场旧址（北安一街、中正路口）进行转运站改建工程，于2016年5月25日启用。
保安转运站.保安转运站是台南市政府规划并自行办理的公车转运站，邻近台湾铁路管理局保安车站，于2013年12月20日启用。