选中华民国总统后，他随即宣布「不入府、不入阁」。
2008年总统大选时期.2008年7月前往香港中文大学成为访问学人；他接受《壹週刊》访问时明言，希望此举能使马英九用人唯材、不必拘泥是否出身选举团队。2009年2月16日出任壹传媒电视筹划行政总裁。但电视台尚未开播，就传出金溥聪与黎智英因「歧见」而拆伙的消息， 后并确认金当时即已「拂袖而去」，该歧见主因是金溥聪反对电视台用动画方式处理新闻，且不赞成社会新闻以狗仔八卦、羶色腥路线为主轴，电视新闻尺度是最大关键。 金并透过媒体表示，「