中国人民政治协商会议浦东新区委员会又相继成立。2005年6月21日，国务院总理办公会议批准浦东新区为中国大陆的第一个综合配套改革试验区，这是中国仅有的三个全面型改革试验区之一。国务院（国函〔2009〕52号）又于2009年4月24日批复同意撤销南汇区，将南汇区行政区域整体并入浦东新区，浦东新区的面积增加了一倍，成为上海最大的市辖区。
配套工程与政策.上海市对于浦东开发制定了“三个先行”的策略，即基础设施先行、金融贸易先行、高新技术产业化先行，并建立了外高桥保税区、陆家嘴金融