科学界公认为近代中国最早的科学杂志 ，后因资金不足而停办。1902年创普通学术室及《普通学报》，除自然科学栏目外，增加了哲法史文等社会科学栏目。其后又编辑了具有革新精神的教科书《文学初阶》，为中国最早的国文教科书。此书置清廷法令于不顾，一改“三百千”(三字经、百家姓、千字文)和四书五经的传统套路，首创按语言规律循循善诱，然后由实而虚的方法，使教育生活化。抛弃了经学教育，使新式教育踏上了正道。1903年，返绍兴与人创立越郡公学。普通学书室后亦陷入困境。1904年秋，应夏瑞芳、张元济的邀请，进入商务印书馆编译所