都有相关的特征，如绿色的身体及白色的眼圈。故学者认为大安地列斯群岛的亚马逊鹦鹉属都是银顶亚马逊鹦鹉的后裔，而波多黎各鹦鹉、古巴鹦鹉及白眶亚马逊鹦鹉形成一群逐步合一的类群。英国鸟类学家戴维·拉克（David Lack）认为波多黎各鹦鹉是从白眶亚马逊鹦鹉演化而来，但却被指忽略了波多黎各鹦鹉与黑嘴亚马逊鹦鹉的相似性。后来发现单靠大小及颜色不足以确定演化的关系，因为同一物种内也会出现颜色的变化。故此确定了波多黎各鹦鹉与黑嘴亚马逊鹦鹉有着同一的祖先。种系发生学的研究显示波多黎各鹦鹉较为接近白眶亚马逊鹦鹉及古巴鹦鹉