草属分为三个亚属：无翼种猪笼草亚属，真猪笼草亚属和中猪笼草亚属。赫尔曼·哈姆斯将马来王猪笼草与其他绝大多数猪笼草一起归入真猪笼草亚属；无翼种猪笼草亚属为单种亚属，而中猪笼草亚属只含3个物种。此外，赫尔曼·哈姆斯还建立了一个新分支——滴液分支，其得名于滴液猪笼草。 1976年，仓田重夫在其专着《基纳巴卢山的猪笼草》中提供了笼盖蜜腺和捕虫笼内消化腺的详细照片。他将消化腺分为“下消化腺”、“中消化腺”和“上消化腺”三类。
生化分析.生化分析已被用于确定猪笼草属物种之间的遗传分类学关系