治平专案」举行全国大扫黑，全国有八名重量级的大哥入榜，蔡永常为其中一位，当时政府修法颁布「蔡永常条款」，可以「未经审判」直接将中央级民代国大代表移送绿岛监狱，因此而入狱两年，创下中华民国史上第一位中央级民代被扫黑的记录。2002年，蔡永常投入第七届云林县财团法人北港朝天宫的董事选举，并问鼎董事长一职。其胞姐前立法委员曾蔡美佐与前国策顾问苏洪月娇，长达数十年的地方政治恩怨，在此次选举登上全国版面，而后在蔡永常的调解下，化解苏家班与蔡家长年之间的嫌隙。同年2月4日，蔡永常率团朝天宫董监事一行人前往台中大甲镇