有司机操纵台，右侧设有副司机座席及手制动手柄，司机室两侧设有供乘务员乘降的侧门。车体中部是动力室和冷却室，并设有贯通式双侧内走廊连接两端司机室。车内还设有一台为旅客列车供暖的蒸汽锅炉。车体下方吊挂有燃油箱和锅炉水箱。DD91型柴油机车采用特殊的B-1-B轴式配置，包括两台装有车轴齿轮箱的两端转向架、一台只承受车体重量的中间单轴转向架。DD91型柴油机车装用一台从西德引进的迈巴赫MD870型柴油机（MTU公司的新型号为MD 16 V 538 TB型），这是一种四冲程、16气缸、水冷式、涡轮增压、带中间冷却