强化子皆为成簇的强化子，控制了细胞中特定的基因表现，可能是极为相似的元件。根据目前定义，「超级强化子」一词由美国遗传学家理查德·杨的团队定义，用来描述在小鼠的胚胎干细胞中发现、长度较长、且能控制影响干细胞分化结果之基因（包括Oct-4、Sox2、Nanog、 以及 Esrrb等）表现的特定元件。干扰调控这些基因的超级强化子会严重影响这些基因的表现。超级强化子已经在一些小鼠与人类组织的基因组中，负责控制细胞分化结果之基因附近被发现。
侦测方式.超级强化子的侦测方式，大多是以染色质