系到饮用水的安全，因为水中过量的硝酸根离子会影响婴幼儿血液中的氧浓度并导致zh-hant:正铁血红蛋白血症;zh-hans:高铁血红蛋白症;或蓝婴综合征。如果，过量硝酸盐通过径流或地下水进入地表水，会导致水体的zh-hans:富营养化;;zh-tw:优养化;zh-hk:水华;，使得蓝藻菌和其它藻类大量繁殖，导致水生生物因缺氧而大量死亡。虽然不像铵一样对鱼类有毒，硝酸盐可通过富营养作用间接影响鱼类的生存。氮素已经导致了一些水体的富营养化问题。从2006年起，在英国和美国使用氮肥将受到更严厉的限