在三乘经典中一再开示的法界实相，不生不灭，不与意识境界相应的第八识真心如来藏。他指责当代许多有名佛教人士认为各种意识状态为证悟境界。
关于藏传佛教.约在2003年之后，萧平实对藏传佛教(喇嘛教)的批评由哲学看法而转向藏传佛教中的密宗修行方式。他认为藏传佛教依于印度教性力派怛特罗﹙"Tantra"﹚密续教义修行的无上瑜伽续，以男女双身法修行做为最究竟成佛法门，完全不同于世尊在三乘经典中所教导的清净离欲修行，因此认定藏传佛教不是佛教，并批评密宗法义和道理都不正确，却敢公开地贬抑显教佛菩