相继为前秦（376年—386年）、后凉（386年—398年）、南凉（398年—414年）、西秦（414年—415年）、北凉（415年—439年）所有。南凉太初二年（398年），晋兴郡移治浩亹（今甘肃省永登县西南）。北凉承和七年（439年），晋兴郡降于北魏，郡废。