诺森三世曾经支持奥托，之后又反而支持菲利普。结果菲利普于1209年10月遇刺身亡，奥托才被正式确立为国王和士瓦本公爵，霍亨斯陶芬王朝对士瓦本的统治暂时中断。但奥托四世与教皇英诺森三世的冲突并未结束，不久之后两人彻底决裂。1212年教皇于纽伦堡会议封亨利六世的儿子腓特烈为新的罗马人民的国王，并将奥托四世逐出教会，奥托四世被迫回到德意志。但是腓特烈二世只在南德意志地区获得承认，包括韦尔夫家族统治的萨克森公国在内的北德意志地区，奥托四世仍然获得拥戴。但是后来奥托四世于布汶战役战败，这让奥托四世必须让出所有韦尔