家长或监护人陪同到母婴健康院接种，而已经就读小学的学童，卫生署会按计划派员到学校为为学童进行疫苗注射。计划实行初期包括以下五种疫苗：1988年起，新增「乙型肝炎疫苗」。1990年起，为一岁幼儿接种的麻疹疫苗，由三合一的麻疹、流行性腮腺炎及德国麻疹混合疫苗（MMR疫苗）代替，而为小学六年级女生注射的德国麻疹疫苗，亦改为MMR疫苗，惟仍然只限女生接种。1996年，因为世界卫生组织指麻疹疫苗接种一次不足够，建议增加为接种两次，香港的疫苗接种计划亦将麻疹疫苗改为注射两次，因此在小学六年级不分男女学生