渡客流不断上升。为适应客流需要，1982年6月，市轮渡投资13万8745元人民币对南码头轮渡站进行改建。新建轮渡站建筑面积607平方米，设浮桥3座。工程于1982年11月12日建成启用。至1998年后，南南线轮渡正名为南陆线轮渡。2006年，因配合上海世博建设，位于航线上游的周南线轮渡（浦西南江路轮渡站——浦东周家渡2号轮渡站）浦东轮渡站拆除，自10月15日凌晨5：00起，航线改停南码头轮渡站西侧新建的南码头轮渡站2号轮渡码头，同时航线更名为南南线轮渡（浦西南江路轮渡站——浦东南码头轮渡站），航线为临时