令复生事，夺去其官职，授予副都统之职衔驻守西藏，听从福康安指挥，福康安下令鄂辉督饷。工部尚书和琳弹劾鄂辉得到廓尔喀贡表不上奏，命令夺去他副都统职衔，逮赴前藏荷校以示惩罚。干隆五十八年（1793年），命令他罢师回京，授拜唐阿。加员外郎衔，迁为热河总管。嘉庆元年（1796年），命以侍卫之职到荆州跟从剿灭白莲教教匪，立下战功，以都统衔加太子少保，授职湖南提督。屡次大破贼匪，与额勒登保等攻克石隆山，斩杀贼匪首领石柳邓，受封三等男爵。嘉庆二年（1797年），擢升云贵总督。嘉庆三年（1798年），逝世，赐谥号「恪靖