郊客运线的第一期先行兴建，近郊客运线的第二期（北环线）则暂时搁置。而西部走廊铁路的长途客运线后来被分拆为广深港高速铁路（前称区域快线），并採用专用通道方案，不与西部走廊铁路的近郊客运线共轨。1996年末，行政局把西铁兴建权批予九铁公司。主权移交后，特区政府积极推动基建的政策下，经走线重组及处理财务安排，终于在1998年授权九广铁路公司兴建西铁。原先路线在节省成本的前提下，只连接天水围新市镇至深水埗新填海区的新车站，而延伸至屯门的铁路，当局认为在轻铁的帮助下，押后至第二期再作研究。然而，在屯门区居民强烈反