到75,000年前第一批离开非洲的现代人类的分支，但也有少数意见认爲曾有数批迁徙。最有可能的迁徙路线是在海洋水位较低时用船进行“跳岛”。有迹象表明，土着在很长一段时间内与现已灭绝的澳洲巨型动物群生活在同一环境中。就基因来説，澳洲原住民为美拉尼西亚及巴布亚人的近亲，但有一部分的基因成份可能来自于和南亚人群的混血，或是近代欧洲人的影响。研究表明地理意义上的澳洲人群起源于单一的祖先族群，后代各地区组群之间分隔后，相对较少受到此后来自亚洲大陆的移民影响。其中新几内亚的巴佈亚人在约32,000年前从菲律宾的马马努