印度尼西亚的反对，不久入侵西巴布亚。1963年5月1日，联合国决定将西巴布亚主权移交印尼。此后，西巴布亚被印度尼西亚先后称为西伊里安、伊里安加雅以及巴布亚。今日，西巴布亚地区为印尼的两个省：巴布亚省和西巴布亚省。西巴布亚共和国独立的提议获得瓦努阿图和所罗门群岛的支持。2010年，瓦努阿图议会通过“”的议案，表示了瓦努阿图官方外交政策对西巴布亚独立的认可。瓦努阿图议会同时提议将西巴布亚列为和太平洋岛国论坛的观察员。今日的自由巴布亚运动便是谋求建立西巴布亚共和国。