期运用结束，最后运行班次为「超级梓号33号」。2018年4月7日，S3+S23执行「ありがとうE351系 松本～新宿ラストランの旅」，本车系运转结束。
事故.1997年10月21日，S3+S23编组运行「超级梓号13号」于大月站撞击调度中的201系（该列车ATS未使用），列车脱轨翻覆，S3编组中的5辆车厢由于受损严重而解体，事后日立制作所以新造名义修复此编组，期间部分班次以189系11辆编组替代行驶。