和“禁门之变”等真实历史事件背景上将幕末维新运动中倒幕尊王派和幕府新选组之间的争斗、剑心自身的成长、与雪代巴之间的感情变化以及倒幕派内部查找内奸，多线交织组成整个故事架构。整个故事情节在主线背后同时开展了另外多条线索。其中，剑心的成长贯穿始终，被以插叙和倒叙等叙事手法交代给观众。在1864年从春末剑心杀死清里一行人到这一年冬天大雪封山时击败“暗乃武”团伙并误杀雪代巴的主时间轴中，巧妙安插了剑心回忆自己与师父为下山出世而争执、在高杉晋作的奇兵队被桂小五郎发掘、到京都为维新派执行刺杀活动等片段。除此之外，导