德国在1945年5月投降后，攻击目标变更为日本。曼哈顿计划在洛斯阿拉莫斯国家实验室主任罗伯特·奥本海默的指挥下，终于成功研发出两种原子弹。其中一种採用鎗式设计，使用铀-235来引发核子连锁反应，例如投掷在广岛的小男孩原子弹。而另一种则内爆式钸弹，使用雷管引爆中央的球形钚，例如投掷在长崎的胖子原子弹。新墨西哥州索科罗于1945年7月16日完成的三位一体核试也是内爆式钚弹。
准备.
组织.509混合部队于1944年12月9日成立，1944年12月17日在犹他州