经过相当程度的退化，连粒线体亦失去功能，完全仰赖昆虫、甲壳类、嵴椎动物等其他动物宿主为生，从宿主细胞中获取ATP。微孢子虫也有可能感染人类，造成。有些真菌可以感染人类，造成严重的疾病，有些感染若没有受到妥善治疗甚至可能致命。真菌感染造成的疾病包括、念珠菌症、、隐球菌病、组织胞浆菌病、与等，免疫缺陷的病人特别容易受到麴霉、念珠菌、隐球菌、组织胞浆菌与肺孢子菌等真菌的感染。另外还有些真菌会造成眼睛、皮肤、指甲与头发的浅层感染，造成与足癣等疾病。真菌的孢子也经常引发人的过敏。
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