发生，又内迁广东老隆，重庆松堡。1947年返回桥头，重建校园。1948年，中华三育研究社再度南迁九龙清水湾，与广州华南三育研究社合办，仍称中华华南三育研究社。1950年返回，改名三育神学院。1951年三育神学院停办，校舍被中共政府接收，改办农校。现为南京财经大学红山学院。目前中华三育研究社旧址尚存21幢老建筑，2007年，中华三育研究社旧址被列为第七批镇江市文物保护单位。