因是非常重要的，动物分类主要也是依照线粒体的基因。细胞体的基因组和细胞核的基因组是分离的，叶绿体和核糖体都有自己的DNA，是一种原始的DNA，核苷酸的顺序取决于由于进化而和细胞核的DNA之间产生的差异的程度。2003年出版了修订本《被子植物APG II分类法 (修订版)》，两个版本和传统分类法之间的差别主要有：括号分类能有效地将传统的依形态分类转换到新的依基因分类中来，由于依照基因分类有许多单基因的小科，在应用时不太方便。APG的作者曾经解释为“一般来说我们依照专家们的观点……但专家们经常倾向于划