18年7月，他在网际网路上发表《我们当下的恐惧与期待》一文，系统性地批评中华人民共和国现行政治与社会方向、以及领导人的倒退趋势。该篇文章引起巨大的共鸣与反响，也是许章润影响力最大的文章，但造成政府的不满。同年年底起，他还先后撰写有关纪念1978年「改革开放」历史的《低头致意，天地无边》、《自由主义的五场战役》、《中国不是红色帝国》等文章。2019年3月，清华大学暂停许章润的一切教学职务和学术工作、禁止上课招生，并且启动调查程序。这次停职被怀疑是因为其在过去的文章中公开批评中华人民共和国领导人、中共中央总