嵇绍复任侍中。战后王公以下都到司马颖所驻的邺城谢罪，嵇绍被司马颖免为庶人。但同年，因司马颖掌权后目无君上，骄奢日甚，安插亲信，大失众望，右卫将军陈眕和司马越等于是举兵讨伐司马颖，更带晋惠帝亲征。嵇绍在此行亦被征召，更获恢复其爵位。后来讨伐军与司马颖所派的石超军于荡阴大战，讨伐军兵败，惠帝身边的官员和侍卫全部因乱溃散逃命，但嵇绍却在乱兵和如雨的飞箭之下舍身到乘辇捍卫惠帝，当时有士兵追斩嵇绍到乘辇，惠帝试图阻止，但士兵说：「奉皇太弟（司马颖）命令，只不许伤害陛下一人而已。」于是嵇绍就在惠帝面前遇害，鲜血溅在惠帝