毕业后进入横滨正金银行。1914年，别宫秀夫通过了文官高等试验，进入内务省任职。1917年起，他先后在日本国内8个县任理事官、书记官、警察部长、学务部长、内务部长等职务。1934年来到满洲国，任安东省总务厅长、安东省次长。1939年4月，别宫秀夫任大连市市长。他也是日本统治时期大连最后一任市长。当时，日本将大连市长的地位提高到日本大都市的第三位，列入敕任官。1945年日本投降后，苏联红军于同年8月22日占领大连。同年9月23日，别宫秀夫被苏军逮捕。经审查，苏军发现他战时曾从事和平工作，便在关押三天后