雄校区.民雄校区位在嘉义县民雄乡，1992年因嘉义师范学院行政中心及大部分学系自林森校区迁移至该校区。现设有人文艺术学院、师范学院在该校区。
新民校区.新民校区原称民生校区，座落于嘉义市西区，1938年嘉义农林学校由山仔顶（嘉义公园旁、今嘉义高商现址）迁校至该校区。现设有管理学院以及兽医学院。
林森校区.林森校区位在嘉义市东区，1957年嘉义师范学校（嘉义师范学院前身）在该校区创校。目前该校区设有产学营运及推广处、师资学分班、国立空中大学嘉义学习指导中心