分类.乙型冠状病毒属中，牛冠状病毒与猪凝血性脑嵴髓炎病毒（porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus、PHEV）和人类冠状病毒OC43的关系较为接近，这些病毒被国际病毒分类委员会归为同种，合称乙型冠状病毒1型（"Betacoronavirus 1"）。乙型冠状病毒属1型的病毒皆以9-O-乙酰基唾液酸（9-O-acetylated sialic acids、9-O-Ac-Sias）为受体感染细胞。刺突蛋白序列的分子钟分析显示牛冠状病毒与人类冠状病毒O