斗六郡管辖斗六街、斗南街、古坑庄、大埤庄、莿桐庄。辖域即今云林县斗六市、斗南镇、林内乡、古坑乡、大埤乡、莿桐乡等地。
后续发展.1945年3月重庆国民政府通过之台湾接管计划纲要地方政制中，计画将斗六郡与台中州的竹山郡、新高郡合併为斗六县，为该地方政制的30个县之一。1945年10月，因台湾省行政长官公署认为该政制不符实际，因此「台湾接管计划地方政制」并未实施，仅将州厅－郡－街、庄改称县－区－镇、乡，斗六郡改制为斗六区。1950年，斗六区与虎尾区、