攻击宿雾港，使得还留在岛上的探险队20多名成员被杀害。5月1日，船队离开宿雾港时已经只有110多人，此时卡尔瓦柳为舰队指挥，埃斯皮诺萨为维多利亚号船长。因为舰队伤病号太多，人员不足，破旧的康塞普西翁号被遗弃并烧毁，舰队仅有的两艘船继续寻找香料群岛。舰队在印尼大巽他群岛一带盲目的寻找了几个月都没有找到香料群岛，卡尔瓦柳因此被解职，埃斯皮诺萨继任指挥，原康塞普西翁号的助理舵手埃尔卡诺成为维多利亚号的新船长。埃尔卡诺曾参加过在圣胡安港的叛乱，但得到了麦哲伦的宽恕。船队在10月底找到一个当地人领航，终于在11月6日