民国国民政府接管台湾，军队搭乘美军运输舰由此处抵台。战后将在台日本人强制遣送回国，也由这个码头开船。1947年，二二八事件爆发后，刘雨卿率领的国民革命军整编第21师，分成两支从基隆与高雄登陆，进行武力镇压与清乡。北方分支部队由此码头登陆。1949年，因国共内战失利撤退来台的国军部队多数在此登陆。1954年，韩战期间被俘后选择来台的中国人民志愿军亦在此登陆。此后，西二、西三码头仓库长期做为客运航厦使用，正面外墙悬有「西岸旅客码头」牌衔。2013年，基隆市政府通过都市更新案，决定拆除剩下的西二、西三两座码头