被追放到丰后臼杵而投靠大友氏。得知兼定被追放的加久见城城主加久见左卫门，与在平时就对一条氏的老臣相当反感的依冈左京、大冢八木右卫门、江口玄蕃、桥本和泉等人合谋举兵袭击中村，并讨伐一条氏的老臣。元亲乘乱以镇定叛乱为名佔领中村。在翌年（1575年）信奉基督教，接受传教士（）的洗礼。洗礼名是"Don Paul"（）。同年7月，兼定企图再兴而借大友氏之力向土佐国进击，但是在四万十川之战中大败，于是作为战国大名的土佐一条氏灭亡。此后隐居在濑户内海的户岛，不过遭到被旧臣暗杀等苦难（被家臣入江左近暗杀，此时身负重伤）