:铁离子.铁以铁（III）的形式存储在铁蛋白中。 结合位点的确切性质尚未确定。 铁似乎以水解产物的形式存在，例如FeO（OH）。 铁由转铁蛋白运输，转铁蛋白的结合位点由两种酪氨酸，一种天冬氨酸和一种组氨酸组成 。
铜离子.血浆铜蓝蛋白是血液中主要的铜携带蛋白。
钙离子.骨桥蛋白参与骨骼和牙齿的细胞外基质的矿化。
金属酶.金属酶均具有一个共同的特征，即金属离子通过一个不稳定的配合位点与蛋白质结合。 与所有酶一样，活性位点的形状是至