近藤勇、土方岁三等13人收入麾下（壬生浪士组，即后来的新选组），此后壬生浪士组协助会津藩维持治安。当时京都尊攘过激派（长州藩）横行，激进派屡次联同公卿发出假诏，此举令孝明天皇苦恼不已，于是他颁下密诏，命、会津（松平容保）及萨摩藩（岛津久光）协助发动八月十八日政变（又称禁门政变或文久政变），借此排除激进派公卿。元治元年（1864年）六月，政变之后的激进派不甘在朝势力尽失，聚集商讨下一步对策。其中一次不巧被新选组撞破，因而发生了池田屋事件，之后激进派终于按捺不住，于七月发动禁门之变。最后结果为激进派长州大败。尊