慈运理在1499年的活动目前仍不清楚。但他在1500年的夏季学期重新回到学校，继续在维也纳的研究。1502年之后他前往巴塞尔大学，在1506年获得文学硕士学位(M.A.)。1506年9月29日，慈运理在康士坦兹被任命为当地教区的宗座，并在他的家乡维尔德豪斯庆祝他的第一场弥撒。做为一名年轻的神父，慈运理学过一些神学，不过这在当时并不会被认为是不寻常的。他的第一个教会职务是格拉鲁斯镇的神父，在那里待了十年之久。就是在格拉鲁斯，许多的士兵都在欧洲当佣兵，慈运理也因此开始参与政治。当时瑞士邦联被卷入邻国(法国、