2002年9月1日，中华民国设立具大使馆性质的驻乌兰巴托台北贸易经济代表处（蒙古语：）。2003年2月17日，蒙古设立同等性质的驻台北乌兰巴托贸易经济代表处（蒙古语：）。
签证.两国公民皆须申请签证方可入境对方国家。持有中华民国护照的中华民国公民申请赴蒙古观光签证有效期限视实际停留蒙古期间而定，最长为一个月单次出入境但可申请延长；申请30天以上的签证，须有该国邀请单位的邀请函并经该国许可。持有蒙古国护照的蒙古国公民抵台参加国际会议、运动赛事、商展活动，则可以电子签证入境中华