九一八事变后，他和在南京的其他藏族人士成立了康藏旅京同乡抗日救国会，并率西藏驻京办事处人员参加了康藏同胞抗日大游行。在南京期间，他和西藏驻京办事处其他官员一起加入了中国国民党，并于1931年参加了中国国民党第四次全国代表大会，1935年参加了中国国民党第五次全国代表大会。他还历任蒙藏委员会委员、常委，中国国民党中央执行委员会委员，立法院第三届立法委员等职务。1936年4月，他回到西藏，任布达拉宫大喇嘛，获授札萨衔。1940年，西藏噶厦任命他为外交局副局长。1944年3月8日贡觉仲尼逝世，享年61岁。