1995年9月，中共十四届五中全会增补王瑞林为中央军事委员会委员。2003年3月第十届全国人民代表大会后退休。
与邓小平.王瑞林在军队长期负责组织人事工作，不少高级将领都出自其门下。据悉，上世纪九十年代担任军委副主席的迟浩田、张万年，都是王的山东同乡，由其举荐。王瑞林与邓小平情同父子。“在40多年的岁月中，他以耿耿忠心，赢得了邓小平的高度信任。”文革期间邓小平落难江西，在1973年1月即将回京时，专门到进贤县看望下放中的王瑞林。邓小平之女邓榕在《我的父亲邓小平》一书中说，父亲一向寡