96°05′、北纬27°33′-29°55之间。东与察隅县为邻，北与波密县、林芝市巴宜区相连，西与米林县、隆子县、错那县接壤，南与印度相接。平均海拔1200米。地势由北向南急剧下降，从北部高达7756米的南迦巴瓦峰，下降到南部仅155米。南迦巴瓦峰和加拉白垒峰两座山峰是东喜马拉雅山脉最高的两座山峰，雅鲁藏布江在两座山峰的夹峙中形成了雅鲁藏布江大峡谷。墨脱县境内属雅鲁藏布江下游山川河谷地貌，地势北高南低，北、东、西三面高山相环，南面由中山向低山地带过渡，。北部山地在流水侵蚀和强劲暖湿气流剥蚀下，山势陡峭，河谷