，为了观察骨骼，自古以来就开始以物理方式去除骨骼以外的软组织去制作骨骼标本。不过，很难为小鱼和发育中的胚胎制作骨骼标本。因为无法避免对骨骼，尚未发育的软骨组织和精细骨骼之间的三维排列的伤害。虽然X光摄影也可用于观察精细骨骼，但是难以观察到三维结构以及软骨。在透明骨架标本中，通常骨头用茜素染色，软骨是由透明软组织与，或双染色进行染色后获得的。在其透明构造中可以清楚观察到肉体中染色的骨架，这就可以克服上述缺点。此外，组织的透明化处理不仅限在骨骼样品上，而是通用于各种技术的样品上，例如免疫染色和萤光观