长官后藤新平（当时为总督府卫生顾问），为军事及港口用水需要，与防止各种传染病之蔓延，认为有必要解决饮用水的问题。推荐替日本设计自来水系统的苏格兰人巴尔顿（W.K.Burton）来台作「卫生工事评估」，决定以台北为卫生工事优先建设地区，于1899年先完成淡水镇的自来水设施系统（沪尾水道）。同年巴尔顿病逝后，建设工作由其学生滨野弥四郎接续。1902年，基隆的自来水系统完成，为全台第二个有自来水的城市，同时是台湾最早採用沉淀过泸的净水厂。1907年，台北自来水工程以新店溪为水源开始动工兴建，1909年4月