溪、港尾沟溪、松子脚溪及牛稠埔溪；流域面积达350.04平方公里。荷治时期称为清水溪（de Verse Rivier，英文意思：the Fresh River）。
历史.二层行溪在早期十分清澈，因当时制糖繁荣聚落二层行而得名。日治时期兴建之车路墘糖厂（现仁德糖厂，已停工，糖厂大烟囱和厂房等设备尚存，目前是「十鼓文化园区」）之厂址，亦在其支流三爷宫溪畔。1960年台湾省政府整理全台河川名称，取流经台南县仁德乡、归仁乡（今台南市仁德区及归仁区）之典故，易名二仁溪。Section::