进攻大理国的时候，摩娑诏君主阿琮阿良归降蒙古，受封云南等处行中书省丽江路宣抚使之职，其后代世袭此职。1381年明军攻入云南，阿甲阿得归降明军，被明太祖任命为云南承宣布政使司丽江府知府，赐予木姓。丽江木氏土司历代都接受中原朝廷的册封，并不断对外扩张。在木增在位期间，丽江土司的势力达到鼎盛。清军攻入云南之际，土司木懿归降清廷，被允许继续世袭土司之职。三藩之乱爆发的时候，丽江土司拒绝响应吴三桂的反清战争。雍正元年（1723年）改土归流，末代土司木钟被罢免丽江知府的职位，以流官代替。丽江木氏共传十九位知府，