A、B出入口位于复兴路北侧，H、D、C1/C2出入口位于复兴路南侧，G出入口位于羊坊店路东侧。由于邻近京西宾馆，该站H出入口经常临时封闭。
运营.北京地铁9号线军事博物馆站未启用前，乘坐1号线的乘客需要出站转车前往北京西站，北京公交320路（后改为特18，2017年改回320并撤出羊坊店路）和北京公交21路一度开行往返军事博物馆站与北京西站之间的区间车，出口外揽客的“黑车”亦曾长年盘踞，经常有宰客的负面新闻爆出。2013年12月21日，9号线军事博物馆站正式启用，实现与1号线的换乘，