了对俄罗斯显示诚意请求天皇到京都紧急出行。明治天皇立刻命令威仁亲王于尼古拉身边警备，并立刻派北白川宫能久亲王先到京都。5月12日早晨，明治天皇从新桥站乘火车，同日夜晚到达了京都探望尼古拉。不过，尼古拉的主治医师请求延期至次日，所以天皇暂于京都行宫（二条城）投宿。威仁亲王的兄长有栖川宫炽仁亲王，也在天皇之后火速奔赴京都。5月13日，尽管重臣们进言担忧明治天皇可能会遇到绑架，但明治天皇不顾反对，亲自去尼古拉下塌的常盘宾馆探望，并带领炽仁、威仁、能久三亲王到神户送行。尼古拉皇太子遇刺受伤，使日本人恐惧