语群共同的音变是古南岛语*C、*t的合併。然而，李壬癸（2006）认为，*C、*t的合併也发生在马玻语族，是常见的音变，不足以做为分群依据。李壬癸（2006）将布农语归入南台湾南岛语族，而将东台湾南岛语族独立，分有8个语种，巴赛语、噶玛兰语、猴猴语、撒奇莱雅语、阿美语(邦查语)、西拉雅语、大满语、马卡道语等语种。其中，阿美语与撒奇莱雅语归属于高山族语，其余归属平埔族语。不过李壬癸院士研究认为阿美语及撒奇莱雅语倾向归属于平埔族语而非高山族语。一来、阿美族与撒奇莱雅族是居住于平地而非高山，二则高山族与平埔族之别