池府千岁成为寺庙主神，使「普济寺」改称为「普济庙」，后改为「普济殿」。 风水传说此殿附近街道四通八达，呈现八卦网状，此殿位置因而称为「蜘蛛结网穴」，可网住别称「凤凰城」的台南城。
历史.
清治时期.台湾清治时期，康熙二十五年（1686年），寺庙初次重建落成，由坐南朝北改为坐北朝南。为台南府城最早的王爷庙。康熙末年陈文达《台湾县志》载：「竹林寺，堂祀观音。周围环以竹，遍植花果；寺虽窄狭，别具幽雅之致。」，并记寺庙在镇北坊，石万寿研究此「竹林寺」当即普济殿