后，2014年4月开始在国家信息中心攻读网络安全博士后。但其申请清华大学博士的论文《基于博客的知识运行机制研究》被早期合作伙伴之一的周永德指称为枪手北大硕士刘双桂所写，引发媒体关注。
创业经历.1996年还在读博士的方兴东开始给戴尔写公关稿，第一次接触到了互联网，开始从事IT研究、咨询和评论。1999年创办互联网实验室，任董事长兼首席分析家。2002年他将当时欧美流行的新型网络交流方式Blog引进中国，命名为“博客”，并建立起了名为博客中国（blogchina.com）的网站。