岛纷争，但终于落入荷兰人控制，葡萄牙人最后只剩下帝汶岛。太平洋战争初期，日本人击败欧洲殖民者，控制马来群岛大部分地区，这个时期激发了民族主义的成长，战后英国及荷兰曾经尝试继续维持殖民统治，但该区的民族都争取独立，诞生新的国家──印度尼西亚（1949）、马来西亚（1963）、巴布亚纽几内亚（1975）和汶莱（1984）。