联合政府后，沙龙曾指命内塔尼亚胡为外交部长。内塔尼亚胡曾对沙龙的利库德集团党魁地位提出挑战，但是占下风。2003年大选后内塔尼亚胡接受了新的沙龙政府财政部长的职务。作为财政部长，内塔尼亚胡试图重建在阿克萨起义中受到打击严重的以色列经济。这个计划包括自由市场，但许多人反对这个计划。内塔尼亚胡还实行了一系列一推再推的改革计划，包括对银行系统的重要的改革。这些措施使以色列国民生产总值明显提高。2004年，内塔尼亚胡威胁假如不将加沙撤军计划改为一个备忘录的话他将辞职，但后来他又延长了他的最后通牒。2005年