陆军所用），远距离潜水艇（不少载有飞机），高速潜水艇到可以携带三架晴岚攻击机的伊四〇〇型潜舰。其中还包括世界领先的五百三十三毫米九五式鱼雷。1942年（昭和17年）9月9日，潜水艇的兵曹长执行在整个战争中唯一次对北美大陆本土的空袭。有些其它潜水艇如、、伊三四、和舰艇远渡重洋到达在德国控制下的欧洲战场。伊号第一〇潜水舰，伊一六和参加从1942年（昭和17年）5月份开始的。不过总体来说日本海军潜水艇部队在战争中没有取得太大战果。很多潜艇与其对商船进行攻击，却把目标定为更加快速而且拥有更多保护措施的战舰。1942