行政职，而且原定其任期至同年10月18日届满，下一任院长的遴选作业已在进行，为避免院务推动出现空窗期，授权三位副院长代理其职务，待选出新院长后最快在一、两周内办理提前交接，然而5月10日总统马英九核准他在3月29日提的辞呈，下一任院长留待即将上任的总统蔡英文圈选。2017年1月，士林地检署依贪污罪起诉。7月，被监察院以涉及8项违失通过弹劾，送交公务员惩戒委员会处理。2019年4月3日，被公惩会以8项违失成立2项记申诫，分别是以浩鼎股东郑秀珍名义和女儿持有浩鼎股票未依法申报，还有中研院和浩鼎的合作案未依利