马共解散之际，共有约1188名活跃党员，当中部分选择回到马来西亚的故乡定居，另一部份则选择留在泰国边境的和平村内。对于回国的前马共党员，马来西亚政府向每人发放了马币八千元的补偿金，其中三千元在他们回国时发放，另五千元则在三年后发放。依照条约，时任马来亚共产党总书记陈平原本有权回到马来西亚定居，但在2005年，阿都拉巴达威政府拒绝让他入境之后，高等法院及上诉庭也在相继在2005及2008年驳回其上诉。在聆审期间，上诉庭要求他出示做为马来西亚公民的书面文件，但陈平通过代表律师表示这无法做到，原因是他的身份证