学化学工程学系期间，曾任台大合唱团指挥及钢琴伴奏。大学毕业之后，赴德国柏林艺术大学就读，主修指挥，受教于杰利毕达克嫡传弟子Carl A. Bünte教授，同时亦获得Hans-Martin Rabenstein教授的指导。2000年初，邱君强被聘任为布拉格国家剧院的助理指挥，2002年5月首次登台，在莫札特歌剧《唐·乔望尼》首演之地城邦剧院指挥此剧，获得佳评，随后担任此剧及《魔笛》在布拉格国家剧院演出的指挥。2002年10月，邱君强并担任德国作曲家Hans W. Koch的歌剧Unbezahlbare Ari