也是致癌物，可能污染食物如坚果。烟麴霉菌和可造成过敏疾病。某些麴菌属菌种可造成谷类作物疾病，尤其是玉蜀黍，并合成黄麴毒素等霉菌毒素。麴菌症是麴菌属引起的一组疾病。症状有发烧、咳嗽、胸痛、唿吸急促。通常只有免疫系统衰弱或其他肺部疾病的患者才容易感染。烟曲霉（Aspergillus fumigatus）的孢子在大气中普遍存在。烟曲霉是一种机会性致病菌。它可能在免疫功能低下的个体中引起潜在致命的侵袭性感染 。烟曲霉具有完整的有性世代，可产生闭囊壳（cleistothecia）和子囊孢子。Section::