上的主要兵力丧失殆尽，首都南京及金融中心上海处于解放军的直接威胁之下。民国三十八年（1949年）1月，国府行政院及各单位开始迁往广州，仅总统府仍留守南京。4月20日，解放军发起渡江战役；21日，解放军渡过长江，最终在4月23日占领南京市。中华民国政府南迁广州，后又迁重庆、成都，最后迁抵台北，中华民国政府迁台后，仍长期在官方出版的地图及教科书上将南京市记为首都。自2002年起，则不再将南京市标记为首都迄今。对中华民国首都的认定，详见中华民国首都。中国共产党建立中华人民共和国后，南京成为由中央人民政府直辖的