缴台北，污染留高雄」的质疑。民国105年（2016年）6月17日，中油召开董事会通过修改公司章程，将总公司从台北市改设于高雄市；同年7月27日，中油正式将公司登记地址从台北市信义计画区中油大楼（台北市信义区松仁路3号）变更至高雄炼油厂旧址（高雄市楠梓区左楠路2号），但实际营业处所仍维持中油大楼不变。
公司更名.由于中国大陆同样存在同名公司（中国石油），易混淆徒增困扰，加上陈水扁政府推行「台湾正名」政策，中油于民国96年（2007年）2月1日召开的第550次董事会通过斥资30余亿新台