规模、长期生态调查的数据目前非常匮乏。与调查单个物种的手段取得的进步相反，研究整体生态的手段仍然落后。拖网的轻微改进会导致完全不同的捕获结果，因此需要建立统一的采样方法。
深海鱼类分布.
水平分布.海洋以大陆架的边缘为界水平划分为靠近陆地的沿岸区和远离陆地的远洋。由于深海中没有初级生产者如光合植物，作为深海生物能量来源的有机物主要来自浅海和陆地。因此，深海生物一般在靠近陆地的水域中含量较高。热带远洋不发生对流使得表层生物很少，缺乏有机沉积物导致荒凉海床广布。