车轮虫科（学名：）是寡膜纲缘毛亚纲之下的一个科。
特征.本科物种呈圆筒状、高脚杯状、盘状或盔状等，顶部尖或平，口围绕度绕口，具体复杂多样，相互间以齿锥或齿钩的突起相连接，具体数一般15-40个。大核呈马蹄形。宿主广泛，主要寄生于鱼类。