一个做为初学者宝可梦，而是会获得大木博士所收服的皮卡丘，与此相对，主角的劲敌的初学者宝可梦是伊布。游戏剧情和部份角色取自电视动画，例如火箭队中新增了武藏、小次郎和喵喵，宝可梦中心的医护员也改成乔伊。玩家可以随着游戏进展获得三个初学者宝可梦，即妙蛙种子、杰尼龟、小火龙。
制作.《精灵宝可梦 皮卡丘》的最初制作是在日版《精灵宝可梦 红·绿》之后。游戏的发行时间正好与《神奇宝贝剧场版：超梦的逆袭》重合。任天堂的岩田聪评论到，人们可能认为《精灵宝可梦 皮卡丘》并不是必要，这是由于即将发行的