城内有俄军826人及12门大炮。6月4日清军攻城未果，于是掘堑筑垒，围困雅克萨城长达10个月。城中俄军接近弹尽粮绝，除战死病死外仅剩下150余人。此时索菲亚派特使在 尼布楚和中国议和，康熙帝命令萨布素撤兵。1689年，中俄双方达成和议，签定中俄《尼布楚条约》，俄军撤出雅克萨，毁掉雅克萨城，划定中俄边界，整个外满洲（外东北）归中国所有。此前在1650年代，朝鲜两度支援清朝抗击俄国，朝鲜称之为罗禅征伐。
评价.复旦大学历史地理研究所教授侯杨方指出，当时在尼布楚地区游牧的蒙古布里