在近江的今坚田城和石山城为幕府军的据点，举起反对信长的旗帜，但数日后两城皆被攻陷。同时东方战线的武田信玄在上洛的路途中病重，武田军于4月开始撤回本国甲斐，12日信玄在回国的路途中在信浓驹场病逝。信长杀入京都，在知恩院佈开阵势。幕臣细川藤孝、摄津豪族荒木村重等人投降织田信长。但是不知道武田信玄已经病逝的足利义昭还愚蠢的死守在自己的居城乌丸中御门第想继续抵抗。信长再次提出和解，但义昭认为信长没有信用，断然拒绝。信长威胁幕臣以及义昭的支持者，声称若不投降，自己将会攻打上京并将此整个地区焚为焦土。同时包围了义昭