前往清国解决事件，但清日双方一直争持不下，互不让步。最后在驻清英国公使威妥玛之仲裁下，双方达成协定，并于九月廿二（10月31日）签订《北京专约》，共有三条：《北京专约》签订后，以西乡从道为首的征台日军依约准备撤出台湾的前夕，日本陆军少佐福岛九成与书记吴硕向沈葆桢提出五条办法，其中一条为「我国人民，在生番被杀死者，遗骸现就当时收埋之旧址，更建墓碑表之。将来如有亲戚朋友人等航客就近港口之际，若欲借便登岸扫祭者， 务望使其即日登岸拜奠而归」。沈葆桢以为墓冢是为阵亡日军所建，便答应日本代表的请求。至墓冢即将完工