史.钟健龙的正模标本（编号 IVPP V 22775）发现于辽宁省朝阳市凌源市四合当镇的湖相岩层（Lake deposits），最初是在2009年被记载。和大多数在亚洲发现的小盗龙类恐龙（小盗龙除外）一样，钟健龙的化石出土自热河群的义县组，年代相当于白垩纪早期的阿普第阶。钟健龙属的模式种是杨氏钟健龙（），学名的完整意思是「杨钟健先生的蜥蜴」，系纪念已故中国古生物学家杨钟健，他在早期学界的贡献使他被后世视为中国古生物学的奠基者。而钟健龙被正式发表的这一年也正逢杨钟健的120岁冥诞。