现，失去了九成的海权。为了合力抵抗塞壬，白鹰、皇家、铁血与重樱这四个阵营组成碧蓝航线阵营来阻止海洋威胁。而铁血与重樱受到塞壬的影响之下退出并且背叛碧蓝航线阵营，另组赤色中轴引发战争，人类的命运陷入了泥沼之中……。除上述四个主要阵营外，游戏中开始实装北方联合、东煌、自由鸢尾、zh-hans:维希教廷;zh-hant:维琪教廷、zh-hans:撒丁帝国;zh-hant:撒丁帝国的少数船只。
开发.因避免“政治、历史错误”，在中国大陆发行的版本当中，将象征旧日本海军的