黄锡全离开湖北省博物馆，考取了吉林大学历史系的研究生，师从于省吾教授，其后分别于1981年和1984年获历史学硕士和博士学位。1985年，黄锡全到武汉大学历史系执教，任考古专业教研室副主任及研究生导师，分别于1988年8月和1993年5月晋升副教授和教授。1993年10月，离开武汉大学。在武大期间，黄锡全到杭州参加了《殷墟甲骨刻辞摹释总集》和《殷墟甲骨刻辞类纂》编纂项目。1993年11月，黄锡全进入中国钱币博物馆工作。其后历任中国钱币博物馆副馆长、馆长，中国钱币学会学术委员会副主任，中国钱币学会副理