些物质在药用植物中的含量和已知的药理活性是它们在现代医学中使用的科学依据。例如，水仙（Narcissus）含有九组生物硷，包括加兰他敏，许可用于治疗阿尔茨海默症。生物硷是苦味和有毒的，并且浓缩在植物的部分，例如最容易被食草动物吃掉的茎; 他们也可以防止寄生虫。药用植物转录组学数据库正在系统化药用植物的现代知识，该数据库于2011年为约30种物种的转录组提供了序列参考。，药理学活性的主要种类的植物化学物质如下所述，与包含它们的药用植物的实例。
生物碱.具有生物活性成分的含氮有机化