州龙海市角美镇白礁村）。祖籍清溪县感德镇石门村。父名吴通，母为黄月华，原居漳州，因避乱而到同安海滨的白礁结茅为屋，讨海维生。吴夲十三岁时，父亲吴通患病，但因家贫无力就医而去世，母亲黄氏后来也因忧伤去世，此事令他立志学医济世。吴夲初习捕蛇、採草药，后学针灸、汤药，医术之名声逐渐传播民间。而根据北宋元祐二年（1087年）的〈西宫檀越记〉，作者孙瑀的祖父孙天钖在天圣四年（1026年）因食用河鱼生病而到旗山上面的居士庵调养，与一名周游至此的裴姓方士（字号养真老人）相谈甚欢。后来吴夲得知裴养真在此，便前来会面，两