小巢状麴菌（异名构巢裸胞壳）已被拿来做研究许多年了，而也拿它来展示真菌的假有性生殖。最近，小巢状麴菌的基因于博劳德研究所的实验中被定序出来，为他们的创举之一。到了2008年，有七个麴霉属的物种被接续定序出来：具有工业价值的黑麴霉（两个族系）、米麴菌、土麴霉, 和病原体棒麴霉、费雪氏麴霉、黄麴霉和烟麴霉（两个族系）。费雪氏麴霉几乎不会有病原的特性，但和与其相似的烟麴霉具有高度的相关性，为了更进一步的了解烟麴霉的病源特性而将他定序出来。
有性生殖.在麴菌属的250个物种中，约有64%