处及争议.2011年8月30日，台大医院及成大医院分别提出「HIV阳性器官移植事件检讨报告」。监察院对这一事故的原因进行调查，在对卫生署和台大医院诸多制度缺失进行纠正的同时，认为柯文哲应负主要责任。2012年8月14日，事件发生近一年后，柯文哲遭监察院弹劾，并移送司法院公务员惩戒委员会。弹劾案文说，柯文哲身为台大医院器官移植之负责人，却疏于检讨器官捐赠检体检验结果的判读机制，又未依据医疗作业常规判读，且未对小组协调师规划完整的训练课程，在无督导考核协调师的学习成效下，就授权专业经验浅的协调师，去执行重