真耶稣教会.这是在1917年北京设立的，初期由魏保罗、张巴拿巴、张灵生共同领导。1926年将总部设于南京 。这个教会是比较接近第一波灵恩运动的教会，虽然他们较偏向灵恩派，但是信徒相当多，在中国有一定影响力，也是比较大规模的自立教会。后来真耶稣教会也传到台湾。
耶稣家庭.另外一个很重要的自立教会耶稣家庭是很独特的教会，为山东新教徒敬奠瀛于1921年在泰安马庄那里设立的，主要是集中在农村 。当时他们提倡叫 「破家出世，参加入世」。这意思就是说我们打破原来家庭的制度，离开原来得家庭