植物生产生质柴油，还是有降低粮食生产的可能性，因为有些第三世界国家的农民会在经济利益的驱使下，将原本用来种植作物的土地给拿来改种痲疯树。另一种可行方案是种植辣木。利用废弃物（例如废油）生产生物柴油几乎无环保及道德上的缺点；还可以减少商人使用回锅油及地沟油的诱因。但是回收废油及废油内部不纯物仍然是问题。
未来发展.未来可能利用藻类（如海藻）生产生质柴油，以增加生质能源效率，和减轻生质能源可能对农产品价格的影响。但除了技术上还需突破外，由于生产的藻类很可能是基因改造品种，因此预防这