国王储与15岁的苏格兰女王举行了婚礼。这一连姻带有强烈的政治色彩：未来的法国国王同时也将得到苏格兰的王冠，并对英格兰的王位构成要求（玛丽一世对英格兰王位拥有继承权）。
少年国王.弗朗索瓦结婚一年后，他的父亲亨利二世去世。15岁的王储加冕为法兰西国王弗朗索瓦二世。王太后凯瑟琳·德·麦第奇担任摄政，但是据信掌握实权的人是权臣吉斯公爵弗朗索瓦和吉斯红衣主教查理（他们是苏格兰女王玛丽一世的舅舅）两兄弟，弗朗索瓦二世从未对政事进行实质干涉。在他任内，受到父亲于1559年四月与西班牙所定的和平