大队连合指挥长则选任由别府晋介担任、桐野则是为四号大队指挥长兼总司令。2月20日、先发的别府晋介的部队到达川尻并且和熊本镇台的侦察队发生冲突、这也是西南战争的开始。22日，相继到达的萨军大队对熊本镇台进行包围攻撃。桐野则与池上一起指挥正面军、但因为熊本城相当坚固而无法快速攻下。因此本营军议中，桐野・篠原的全军攻城主张，与池上四郎・野村忍介・西乡小兵卫提出的各种分别攻击主张发生冲突而且双方互不退让、在军议还在开会的期间、政府军的第一旅团（野津镇雄）・第二旅团（三好重臣）开始南下。为了应付这个行动、由池上负