长44.87公里，设车站29座，全程用时约72分钟。线路行经浦口区、鼓楼区、玄武区、秦淮区、雨花台区和江宁区，在主城的走向与1号线大致平行。3号线在泰冯路站与S8号线换乘，在南京站与1号线换乘，在大行宫站与2号线换乘，在南京南站与1号线、S1号线、S3号线换乘。3号线共配车46列，每列车采用6辆鼓形A型车编组，设计最高速度80公里每小时。3号线在高峰期开行大交路（林场站↔秣周东路站）和小交路（林场站↔胜太西路站），大小交路以1:1的比例间隔发车，在平峰期和低峰期只开行大交路。工作日早高峰时段（7:2