国寺的保护、研究、展示职能。1996年，国家文物局批准了《保国寺总体维修保护方案》，这一工程至2003年结束，在保国寺引入消防用水，整治白蚁，增加避雷设施，减少了古建筑的安全隐患。同时，自2002年起，保国寺开始与专业机构合作，监测大殿动态数据，同时与清华大学等高校合作，对大殿进行激光扫描，获得全面的测绘数据。为了防止大殿毁于香火，寺内的宗教活动也被停止。
民间传说.传说采取灭佛政策的唐武宗死后，明州信众找到国宁寺（今天宁寺）住持可恭要求恢复灵山寺。可恭携明州剌史所撰文牒，至临潼便