的性暴力也经常被用来做为拷问或是惩罚的酷刑方法。美军被证实对俘虏以及囚犯使用。参见美军虐待伊拉克战俘事件。医学折磨（Medical torture）是由行刑者利用各种方法来判断什么情况下受害者可以忍受、使用哪种方法可以增加折磨的程度的酷刑方式。约瑟夫·门格勒和石井四郎在第二次世界大战以后便因为他们进行医学折磨及谋杀而恶名昭彰。另外，在第二次世界大战时，日本的731部队亦属恶名昭彰的施行者。