南宋宋高宗时，为了集中政务以应付军政急务，将三省合併为一，改左、右仆射为左、右丞相。宋哲宗时设平章军国重事或同平章军国事，以处「老臣硕德」，位居宰相之上，每数日一朝，非朝日不到都堂。宋宁宗时，韩侂胄任「平章军国事」，每三日一朝，宰相不再掌印。南宋末年，贾似道专权，任「平章军国重事」，左、右丞相实际上屈居于类似副宰相的地位。枢密院作为全国军政的最高机关，长官为枢密使或知枢密院事，以谏议大夫以上至六部尚书等官充任，副长官为枢密副使或同知知枢密院事，以起居舍人以上至尚书左右丞等官充任。资历浅者，称签书枢密院事