发育成雌性（XX）还是雄性（XY）。卵子所携带的一般是X染色体；而精子则有一半机会携带Y染色体，另有一半携带X染色体，故此后代的性别将由男性方的精子决定。不过这也有可能产生性染色体不属上述两者的后代。X或Y染色体特有的基因即为性连锁基因。最常发生红绿色盲的相关隐性遗传基因位于X染色体上。男性只有一条X染色体，而女性则有两条X染色体，缺失的基因可以由另一条补足，故此男性比女性容易有色盲。 人类的XY系统并非世上唯一的性别决定系统。鸟类的情况跟人类相反，牠们以ZW系统决定性别—— ZZ为雄性，ZW为雌性