始仍向西流，稍后转向南流至昂贡松多，汇集另一支流扎朶曲后改称扎阿曲。初为向南偏东流，稍后转向东南流至朶那松多，与扎那曲交会后始称扎曲。
河段.
青海境内河段.青海境内的主干流总长度448公里，流经杂多县、囊谦县。
西藏境内河段.扎曲在西藏自治区的昌都与昂曲汇合后始称“澜沧江”，流经昌都、察雅、左贡和芒康县，干流总长度465公里，在德钦县下盐井流入云南。西藏河段规划的水电站一共7级，包括扎曲的果多水电站，以及昌都以下的侧格、约龙、卡