一共有8册，由小学馆出版，分为普通版和豪华版。豪华版仿照原作《原子小金刚》当年由河童漫画出版的单行本，採用较普通版大的版型。豪华版大多比普通版还要早上市，且附有额外内容。第一册于2004年9月30日出版，最后一册在2009年6月问世。台湾中文版由东立出版社出版，第一册于2006年8月9日出版，最后一册于2010年1月8日上市。除了中文版以外，本作也被翻译成多种语言，包含英语、法语、韩文、义大利语、西班牙语等。
回响.截止至2010年10月21日，本作的单行本发行量已突破850万