修道院曾两度被取缔，一次是在1792年法国大革命期间，另一次是在1874年，由于瑞士政府与罗马天主教会之间的冲突，被称为文化斗争（Kulturkampf）,此后修士们被迫流亡，先是去法国的代勒，1902年，由于法国的法律变化，又遭驱逐。一度在奥地利哈莱因附近的德恩贝格，最后在奥地利的布雷根茨。当布雷根茨的修道院被盖世太保关闭时，修士们回到马里亚斯泰因，他们于1941年获得庇护。1971年，修道院正式重建。