始自终皆奉南明的永历帝为其正朔帝王；即使永历帝早在1662年遭吴三桂擒获后缢死，郑氏依然持续使用「永历」为年号直至1683年末代藩王郑克塽降清为止，前后共历21年。面对满清，郑氏始终以「大明中兴」、「反清复明」或「反满复汉」为其政治愿景，并在台湾推广认同明朝的儒学教育，一直保持着流亡政权的统治姿态。1683年，郑克塽便是以「延平王」的身份向施琅投降，其降表中载明缴纳「延平王金印」及「招讨大将军金印」各一。许多学者将1949年退守台湾的国民党政权类比为郑氏政权，因为他们都在大陆战败而转进台湾，同时也都宣称将以