后来，大勇认日本密法不如西藏殊胜，决意率团前往西藏学法。1924年夏毕业，法尊入大勇创办的「佛教藏文学院」，进学藏文。1925年夏「留藏学法团」出发进藏，经武汉、宜昌、重庆，后到乐山，经雅安翻越大相岭到达康定。然因西藏守军疑学法团有政治作用（康藏边界纠纷）阻拦于西康。1926年春法尊法师与朗禅法师前往跑马山，依止慈愿大师学习，同时接触了宗喀巴的《比丘戒释》、《菩萨戒释》及《菩提道次第略论》等着作。1927年春行至藏边甘孜县，复为守军所阻，停于甘孜札迦寺亲近札迦大师，又研习《因明入门》、《现观