政厅厅长严家淦曾到中央政府办美援，其间由马寿华代理）。此后，陈诚催马寿华接任台湾土地银行董事长，马寿华乃就任。马寿华还受聘为台湾全省美术展览国画组审查委员，参加台湾全省美术展览。1950年，在台北市中山堂三楼画廊举办个人画展。1951年，马寿华应司法院院长王宠惠之邀，任司法院秘书长。1952年到1965年，任行政法院院长。1965年，出任公务员惩戒委员会委员长。1953年，获聘为中华民国教育部中华民国参加菲律宾国际博览会国画作品审查委员，参加菲律宾国际博览会展览，获颁奖。1954年初，美国史都邦水晶