水城以及邻近的查尔斯镇分隔开来，向东面是波士顿港和波士顿港岛国家休闲区。尼本赛特河构成波士顿南区与昆西、米尔顿2市的界河。神秘河则将查尔斯镇与切尔西和艾弗瑞分开，而切尔西溪与波士顿港将波士顿和东波士顿分开。
气候.波士顿和整个新英格兰地区一样，属于大陆性气候。但是由于濒临大西洋的地理位置，气候也明显受到海洋的影响。冬季较冷，微潮，时而偏向寒冷。城市最热的月份为7月，平均气温为，极端最高气温（1911年7月4日）。最冷月份为1月，平均气温，极端最低气温（1934年2月9日）。冬日