7日，校名改称为「七股乡第二国民学校」，同年12月17日，再改称现在校名——后港国民学校，民国36年（1947年）全校迁入现址上课。民国48年（1959年）8月1日笃加分校奉准独立；民国49年8月1日，顶山分校亦告独立；民国53年7月，奉令开办学童营养午餐，民国57年8月1日，政府实施九年国民义务教育，奉令政制为「后港国民小学」。民国90年8月1日，顶山国小因学生数不足，裁併入后港国小，成为后港国小顶山分校。