大学伯克利分校、普林斯顿大学当访问学者，并且留在澳大利亚、德国开展合作研究。1996年2月起，杨邦杰任农业部规划设计院副院长兼总工程师，农业部农业资源监测总站站长，中国农业大学博士生导师。他还兼任《农业工程学报》主编。2003年12月，杨邦杰加入中国致公党。2004年，在中国致公党十二届三中全会上，获增选为致公党中央副主席。1998年起，历任第九、十届全国政协委员。2005年3月，当选为第十届全国政协常委。杨邦杰是第十一、十二届全国人大常委会委员。