人一同转任京都帝国大学，并将加速器之主设备携回日本内地，但留下了相关的次要设备，成为台大日后重建该加速器的重要基础。然而，太田赖常则留在台湾，物理学讲座由专长于宇宙射线物理的河田末吉接手。为了在荒胜文策离任后能够持续进行核物理实验，太田赖常收藏了实验用抽真空的油与其他相关资料及材料，并自费聘任伊藤贡。然而，由于太田赖常仅具理学士学位而缺乏博士学位，无法接任荒胜文策的讲座教授职位，仅能继续担任助教授一职。为此，太田赖常多次建议河田末吉重建原子核实验用加速器，但他的提议并未被採纳。在这段时期，太田赖常多次被河田