朝瑞、袁化中等东林党人同榜，授泉州府推官，改常州府教授。天启元年（1621年）任刑部员外郎署山东司事，刚正不阿，为魏党所忌恨，遭陷害，遂引疾归里。天启五年（1625年）起官任礼部郎中、陕西按察使，八月，广宁失陷，大章援引法律条文以为王化贞当斩，熊廷弼当戍，魏党不满，又遭陷害，五月二十六日下狱，据说狱中受一名锦衣卫与一位隐士「燕大侠」（化名，指燕都大游侠）的救护、帮助，得以不死，五君子被害后，顾大章服毒自尽，毒发而不死，痛入脏腑，后自缢死，时谓“东林六君子”，泉州人感念之，在名宦祠中祭祀他的神位。