胞质基质中继续参与细胞的代谢，而剩余的未被分解的物质则残留在自噬溶酶体中，产生残留体。
意义.自噬体通过自噬作用循环细胞内源物，在细胞营养不良时分解较不重要的细胞结构来提供养份，可能对实现细胞代谢需要、更新某些细胞器并维持细胞内稳态有较重要的作用。但也有观点认为，自噬体是细胞程序性死亡中分解老化、损伤细胞的主体。自噬体对细胞所起的作用尚未完全阐明，包括其对癌细胞的作用。
历史.自噬体于1962年由Ashford及Porter首次在细胞中发现。