封会战等大战役。6月，炸开开封花园口黄河大堤。同年底，改任天水行营主任，驻西安。1940年调任军事委员会副总参谋，至1945年抗战胜利。
抗战胜利后.1945年战争结束，程潜任武汉行营主任，掌管华中军政。1947年，在原籍湖南省醴陵县当选为第一届国民大会代表。1948年3月，参加副总统选举，根据国民大会秘书处公布副总统候选人签署代表人数：程潜得到338票的签署支持，；国民大会主席团发布《国民大会公告（会字第二号）》，公布副总统候选人名单，计有孙科、于右任、李宗仁、程