文禄二年（1593年），秀吉获得了第二子丰臣秀赖。在此之前，由于第一子鹤松仅2岁便夭折，秀吉已经几近放弃再度产子的计划。但在秀赖诞生后，秀吉为了扫除秀赖继位的障碍，于文禄四年（1595年）以涉嫌谋反的罪名把家督丰臣秀次赐死，同时族灭了秀次一家老小。此后丰臣政权自家督丰臣秀次赐死后便出现权力真空，但实际上太阁丰臣秀吉还是实际统治者，直到秀吉公于庆长三年（1598年）病逝。
庆长之役与太阁丰臣秀吉之死.由石田三成、小西行长等人主导的对明和谈，最后以秀吉不满明方提出的条件，全面决裂而告终