杭、宁安等多条高速铁路线路的客运枢纽站，也是京沪高速铁路五大始发站之一，并与地铁南京南站共构。总建筑面积约45.8万平方米，其中主站房面积达28.15万平方米，是亚洲最大的铁路车站之一。
历史.在原铁道部于1991年规划修建京沪高速铁路之初，南京段的选址出现了铁路与地方上的分歧。铁道部从与既有线的衔接、职工通勤便利的角度出发，倾向于从既有南京站过境，从上元门经地下隧道过江的北线方案；而南京当地为发展主城区南部，提出从大胜关长江大桥过江的南线方案。虽然两种方案造价相当，但南京当地提出