次年又加少傅，兼太子太傅。顺治十八年（1661年），圣祖即位，成克巩复改为国史院大学士。康熙元年（1662年），调任秘书院大学士。次年乞休回籍。康熙三十年（1691年）卒，年八十四岁。克巩数次主持乡试、会试，堪称“得士”，汤斌、马世俊、张玉书、严我斯、梁化凤等，皆出于其门下。还曾充任太宗实录及太祖、太宗圣训总裁。
后代.子成亮，任翰林院编修；成光，任职武昌守道。