入了孤立状态。而且邦良亲王病死后，镰仓幕府指定持明院统的量仁亲王为皇太子，后醍醐天皇的皇位岌岌可危。元弘元年（1331年）后醍醐天皇再次计划倒幕，但被身边的吉田定房告发；后醍醐天皇携带三神器逃出京都，以比叡山为据点，举兵讨幕。但最后被包围在了笠置山（今京都府相乐郡笠置町内）。幕府以绝对的兵力优势攻陷了该城并逮捕了天皇。这就是元弘之变。
流放和复归.镰仓幕府将策划倒幕的后醍醐天皇废黜，拥立持明院统的量仁亲王即位，是为光严天皇。而镰仓幕府则商议，以承久之乱中策划倒幕的后鸟羽上皇被流放隐