奥斯曼帝国耶路撒冷总督穆罕默德•贝伊（Muhammad Bey）于1538年建造的，1620年，由继任耶路撒冷总督Farrukh Bey下令重建，在奥斯曼帝国苏丹苏莱曼二世统治期间完成。今天的圆顶寺主要是1620年重建的结果。这个圆顶是纪念伊斯兰教先知穆罕默德。1845年，圆顶寺又有所增建。几位穆斯林作家，最着名的是 al-Suyuti, 声称圆顶的所在地，是穆罕默德在夜行登霄升上天堂之前，带领先知和天使祈祷的地点。奥斯曼帝国时期的捐赠文件显示，阿克萨清真寺的捐赠资金的一部分，专用于维持每晚先知圆顶寺的