不久又趁胜夺取雅揽路。1611年（万历三十九年），额亦都与何和礼、扈尔汉征伐渥集部虎尔哈路，攻克札库塔城。1613年（万历四十一年），额亦都随平乌达部。 1615年（万历四十三年），努尔哈赤创建八旗，额亦都隶属于镶黄旗。1616年（后金天命元年），努尔哈赤自称：汗王，建立后金，任命额亦都、费英东、何和礼、扈尔汉、安费扬古为五大臣，并辅国政。 1617年（天命二年），额亦都与安费扬古攻打明朝，夺取马根单、花豹冲、三岔儿等堡垒。1619年（天命四年），明朝辽东经略杨镐分兵进犯后金，代善等四大贝勒率军