获得学士学位后曾在中央研究院历史语言研究所任职，后前往美国哈佛大学留学，并以《澎湖群岛的考古学研究》论文获得人类学系和东亚语言文明系联合博士。回到台湾后进入中央研究院历史语言研究所任职，并曾任国立台湾史前文化博物馆馆长等职务；现为该研究所特聘研究员，国立清华大学人类学研究所专任教授。
研究.臧振华的研究着重于台湾和菲律宾的史前考古，尤其着重于南岛语系。曾经主持南科考古遗址、八仙洞遗址等大规模考古调查。臧振华是台湾水下考古学的先驱，目前已在澎湖群岛等台湾沿海等海域寻获多艘沈船，并