新能源汽车工程中心合并为汽车学院。汽车领域专家、现为全国政协副主席、中国科技部部长的万钢出任学院首任院长。2004年，按照上海市政府建立上海国际汽车城的方案，同济大学汽车学院迁入新建成的位于上海国际汽车城的同济大学嘉定校区。2009年，中国第一座汽车整车风洞——同济大学上海地面交通工具风洞中心成立。
学科方向.同济大学汽车学院的学科方向包括汽车工程、车用动力系统、汽车电子、车身与空气动力学、汽车产品管理与营销、车用新能源技术与汽车试验技术。