四川省的神父发函暂授神职权限。1950年4月，因为教会教产问题，尚惟善总主教面临压力，10月24日退休，由石明亮神父代理。然而在1951年，位于市中心蹇家桥（今五四路92号）的真原堂主教府建筑群被重庆市公安局占用。1951年3月8日，尚惟善总主教将董世祉神父从上海调来重庆。6月23日，董世祉在重庆市天主教徒的集会上发表“两全其美，自我牺牲”的演说，而被捕失踪。随后重庆市举行针对董世祉的批判会。同年12月，圣母军亦被作为反动组织进行镇压。1952年4月3日，尚惟善总主教以抗拒缴税及行贿的罪名被驱逐出境