与毛发，表皮癣菌则只感染皮肤及指甲。皮肤真菌的感染侷限于皮肤、指甲与毛发等部位，即使在免疫缺乏的病人体内也不会扩及其他部位而造成全身性感染。
皮下感染.皮下感染（Subcutaneous mycoses）的真菌病可感染皮下组织及肌肉等，造成溃伤或肿块，在这类感染中，真菌通常是透过皮肤上的伤口进入皮下组织，常为慢性感染且不易治疗，有时甚至得动用如的手术治疗。皮下感染型真菌包括许多属，所引发的疾病包括、、及孢子丝菌症等，其中前三种都只发生在热带地区。孢子丝菌病则是申克氏孢子丝菌从手部伤