设3科，职员81人）、保安处（设3科，职员80人），原粮食管理处併入财政厅。民国32年（1943年）9月5日，省政府人员随于学忠部出鲁到达安徽阜阳。民国33年（1944年）12月，国民政府按照同年4月28日修正公佈的《省政府组织法》改组山东省政府。何思源任省政府主席，省政府机构设置未作变动，省政府驻地仍在安徽阜阳。民国34年（1945年）2月20日，何思源按战时体制对省政府机构进行改组，将民政厅、建设厅、教育厅合併为总务厅，保安处改为军事厅，秘书处、财政厅合併为政务厅。6月，省政府主席何思源率省政府