43年改山东省战时行政委员会主任委员。1945年8月13日，在山东莒南担任中共领导下的山东省政府首任主席。1946年，担任新四军兼山东军区副政委、山东野战军政委，主持华东局工作。1947年1月，饶漱石结束军调处任务回到山东，黎玉改任华东军区副政委。中共中央华东局副书记。1947年2月1日，中央发出《迎接中国革命的新高潮》的党内指示，指出：因为没有放手发动群众，以致没收和分配土地都不彻底，引起群众不满意。在这些地方必须认真检查，实行填平补齐，务使无地和少地的农民都能获得土地，而豪绅恶霸分子则必须受到惩罚。