都南京陷落，国民政府迁往重庆。在1938年宣佈实施战时政府体制，军事指挥权由国民政府主席转交国民政府军事委员会，这段时间的政治权力均掌握在担任国民政府军事委员会委员长的蒋中正手中。抗战胜利后，要求尽快行宪的唿声再起。有鑑于此，国民政府于1946年召开制宪国民大会，会中以政治协商会议宪法草案决议案为蓝本制定《中华民国宪法》，确立现今「一府五院」的中央政府架构。此外，宪法规定在中央政府之上设有国民大会，具有国会的性质。1948年，召开第一届国民大会第一次会议，1948年中华民国总统选举正式选举第一任中华民国总统