判中被指控为战犯，主要在三个方面：审判过程中，邓尼茨的辩护者证明他并未参与战争的发动计划。理由是，直至战争发生时，他仅仅官拜上校，根本无从置喙。因此第一项罪名起诉后被判无罪。但因为另外两项皆为成立，且被指控于1939年的下达战争令第154号，发动无限制潜艇战（后来没有正式列入他的判决中，因为美国承认对日本也採取此战术），邓尼茨最后被判处十年监禁。在审讯期间，美国军事心理学家古斯塔夫·吉尔伯特（Gustave Gilbert），被允许研究在纽伦堡审判中犯有战争罪的纳粹领导人，在德国版的韦克斯勒成人智力量表