在讨论中反复出现的话题，是Linux和Minix的替代品，比如GNU或者4.4BSD。塔能鲍姆的第一则贴文中，称赞GNU，不同于Linux，是一个“现代”操作系统。在他的第二则贴文中，他提到“5 年之后每个人都将在他们 200 MIPS 的 64MSPARCstation-5上运行自由的GNU 系统”。许多辩论者都不同意GNU是一个合适的替代品。凯文·布朗认为它就是个虚幻的雾件，相较而言，Linux更可能从x86平台中受益，成为一个常见而且通用的系统。早期Linux开发者曹子德说，微内核范式确实有不少优