邀请陈水扁的「师傅」、带有浓厚独派色彩的台大荣誉教授李鸿禧之子李俊俋担任副市长。因陈与黄的支持者有高度重叠之嫌，当时的总统陈水扁决定「弃黄保陈」，故选举过程中有些冲突，但陈丽贞仍顺利当选市长。陈丽贞亦在选后，于2003年初加入民进党。而张博雅在2002年内阁改组时被换下，在立法院行使考试院正副院长同意权时，因绿委跑票未获通过，因而与扁政府渐行渐远。在2004年中华民国总统大选中，陈水扁在嘉义市取得了五成六的票数，大幅领先连战。2005年中华民国县市长暨县市议员选举时，民进党提名陈丽贞竞选连任，而国民党则