国政府限制外国的伊斯玛仪派传教士在中国公开对塔吉克族人传播伊斯玛仪教派尼扎里宗教领袖的思想。阿迦汗曾一度被禁止援助中国信徒，但近年来恢复了一定程度的交往。阿迦汗四世于2008年-2009年对新疆阿勒泰地区吉木乃县无偿援助了25万美金帮助当地牧民。伊斯玛仪派精神领袖阿迦汗四世曾于1981年访问中国。2012年4月2日至4日，阿迦汗四世正式访问中国乌鲁木齐会见新疆自治区政府主席努尔·白克力，讨论阿迦汗发展网（AKDN）和新疆维吾尔自治区人民政府之间的合作。在会议举行了建设性的会谈，并同意在扶贫、教育、旅游投