皇帝裁夺；谳大狱，参与重大案件审拟；参与对重要官员的任免和考核；随侍皇帝出巡，奉旨出京查办事件等，用字寄上谕的名义对各地各部官员发布指令，凡特旨简放大员，如大学士、六部、九卿、督抚、将军、提督、学差、主考及驻外使臣，皆由军机处开单请旨。《清史稿》载，嘉庆四年一月，上命成亲王永瑆在军机处行走，十月，以“非祖制”罢值。谕曰：「自设军机处，无诸王行走。因军务较繁，暂令永瑆入直，究与国家定制未符，罢军机处行走」。不过在雍正皇帝执政时军机房创设之初，雍正皇帝的怡亲王允祥即是重要成员之一，干隆、嘉庆、道光三大朝皆能