之及首次参与制作该系列的前田耕平共同担任。游戏配乐仍然由作曲家辻横由佳负责，她自系列首作以来便一直参与火焰之纹章系列的配乐创作。在开发初期，游戏被称为《火焰之纹章 暗黑巫女》，并预定适用于任天堂64及其专用扩充磁碟机64DD。1997年，游戏程式设计师宫本茂以开发标题「火焰之纹章64」向外界公佈游戏。当《暗黑巫女》的开发渐入佳境时，Intelligent Systems的内部开发体制却发生变化，加上64DD销量不佳这一因素，导致团队在2000年中止开发任天堂64版本，改为开发适用于Game Boy Adva