花无花被，顶生穗状花序；果实为有长柄和有悬垂的种子。本科植物原来被分到眼子菜科中的一属，1981年的克朗奎斯特分类法将其单独列为一个科，放到茨藻目中，1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法将其合并到泽泻目中。本科植物和同是生长在咸水中的丝粉藻科和波喜荡草科亲缘较近，根据AP-网站这三科是同源类植物。