有文理科、教育科、农科、工科、商科5科共计28系，学科齐全，居全国之首。国立东南大学教育科由南京高师教育专修科改建，设教育、体育和艺术系科以及当时兼属文理科和教育科的心理学系。1927年，国民政府定都南京，6月起开始实行大学区制，国立东南大学合并河海工科大学、上海商科大学、江苏法政大学、江苏医科大学以及南京工业专门学校、苏州工业专门学校、上海商业专门学校、南京农业学校，组建国立第四中山大学。1928年2月更名为江苏大学，遭全体师生反对后，于5月定名为国立中央大学。1929年8月大学区制废止，国立中央大学