TP，此为投资阶段。第二阶段是甘油醛三磷酸转变成丙酮酸，过程中产生了4分子ATP和两分子NADH，是为放能阶段，最后反应净得2分子ATP和2分子NADH。
丙酮酸脱羧过程.在这一过程中，一分子的丙酮酸（CHCOCOOH）脱去一个羧基，生成一分子的二氧化碳和一分子的乙酰辅酶A。
三羧酸循环过程.二碳的乙酰辅酶A与四碳的草酰乙酸结合，生成了六碳的柠檬酸。柠檬酸经过一系列脱羧和脱氢的酶促反应，最终仍变成四碳的草酰乙酸。草酰乙酸不被消耗，仅仅用于生成中间产物而已。