朝失去了外西北。同治三年（1864年）四月，库车回民举事，此时清政府的西北官军主力正在平定陕甘回乱。俄罗斯帝国则入侵新疆的塔城及额尔齐斯河流域，于1864年10月强迫清廷签订《中俄勘分西北界约记》，割去了新疆巴尔喀什湖以东的外西北。1864年年底，中亚浩罕汗国的阿古柏入侵新疆。1865年至1867年，阿古柏率领浩罕军队陆续消灭了天山以南各地的割据势力，在南疆地区建立了哲德沙尔汗国。同治十年（1871年），沙俄趁浩罕领导阿古柏在天山南路之际，出兵新疆伊犁地区，并攻灭伊犁苏丹国；1877年，清政府平定新疆；次年