川滇边务大臣傅嵩炑奏告获准后，改设「义敦县」，县长官改称为委员，隶属康安道。辛亥时期，驻藏川军哗变，西藏进犯川边。民国元年（1912年），陷察木多等地，围巴塘。约7月底，川边巡防军统领顾占文率巴塘军民奋力战斗，击败藏军。在此前的6月24日，袁世凯令尹昌衡率军平乱入藏。1912年，尹昌衡废府、厅、州及理事官、委员之职， 一律改为县，设县知事。民国三年（1914年），尹昌衡建川边特别行政区，所辖范围大致如赵氏在川边时的范围。义敦县是其区内33县之一。民国6年（1917年）， 西藏地方政府指挥藏军越过金沙江，