国铁）时代，五反田－目白段为东京西铁道管理局管辖，池袋－秋叶原段为东京北铁道管理局管辖，神田－大崎段为东京南铁道管理局管辖。另外，全线根据都包括在大都市近郊区间的「东京近郊区间」，东京地区的（），特定都区市内制度下「东京都区内」（）与IC乘车卡「Suica」的首都圈地域。另外，山手线在车费计算上也是一条特殊的路线，也受到「东京山手线内」（）的指定，山手线内的车站上下车的乘客，在车费计算的特例也会受到影响。
运行方式与特色.山手线电车在环状的运行路线上，都是循固定方向往复