HPP和B/D-HPP进行。其中C-HPP将分成25工作组，每个人类染色体1个工作组。而B/D-HPP将按照蛋白质的生物学和疾病相关性进行分组。
项目和工作组.当前设定的工作组列举如下（取自www.c-hpp.org ），按照染色体顺序排序。
计算资源.由Eric Deutsch领导的、美国西雅图系统生物研究所（）的小组正在提供基于MS/MS的蛋白质组学结果的数据简化、分析和验证。与抗体方法相关的数据处理由在瑞典斯德哥尔摩的Kalle von Feilit