个较晚近的异域种化事件，尚未形成在分子层次上阻止物种间基因流动的机制，而只以行为、羽色等差异达成生殖隔离，在自然情况下这些差异已足以阻止杂交发生。粒线体DNA分析显示墨西哥鸭与关系密切，两者分支的时间相当晚近。墨西哥鸭过去因外型差异，曾有学者提出两个亚种的存在：指名亚种"Anas diazi diazi"分布于墨西哥，"Anas diazi novimexicana"则分佈于新墨西哥州，但许多研究随后证实"Anas diazi novimexicana"是无效的分类单元。
保育.