天桥、公路和引路，把前往不同地方的车辆分开。工程在2006年竣工，增强疏导交通效果之余，交通意外亦明显减少。
未来发展.
增设巴士转乘站.将军澳隧道以往是本港少数不设巴士转乘站的行车隧道，因应政府推动安达臣道发展计划和巴士转乘计划，在2017年初动工兴建将军澳隧道巴士转乘站，斥资约1,300万，在多番延误才于2020年10月2日率先启用东行方向转乘站。新巴、城巴及九巴大部分路线均会停靠此站，并提供转乘优惠。
免收隧道费.政府于2019