鲁总统阿兰·加西亚·佩雷斯将每年的4月3日定为“日秘友好日”。
1990年以后的日秘关系.1990年，阿尔韦托·藤森（藤森谦也）成为第一个日裔秘鲁总统，作为日侨，他非常重视发展与日本的关系。1996年12月17日，在秘鲁首都利马，14名(Túpac Amaru Revolutionary Movement，简称MRTA)成员挟持了正在日本驻秘鲁大使官邸参加明仁天皇诞辰63周年庆祝活动的数百名包括日本大使在内的高级外交官、政府和军方官员以及企业高管。这一事件被称为“日本大使馆人质