建置调整频繁，先后多次与湖广、山陕、陕甘等总督分合。康熙七年十月庚寅（1668年11月28日），裁撤湖广总督，由四川总督兼任，改为四川湖广（川湖）总督，移驻荆州。康熙十二年（1674年）冬，三藩之乱爆发，至次年六月，吴三桂叛军已经攻克四川周边的云南、贵州、湖南三省。而四川形势也十分危急，“提督郑蛟麟，总兵谭弘、吴之茂反四川”。清廷于康熙十三年二月癸卯（1674年3月15日）重新增设四川总督，以原两广总督周有德为四川总督，以便集中当地军事力量，对抗吴三桂叛军。康熙十八年（1679年），清军克复湖广，开