法国航空把部分股份数目由降低，然后突尼斯政府就成为最大股东。1990年，突尼斯航空买了2架空中巴士A320，并保持以前的涂装。1993年-1998年期间，突尼斯航空开始扩展业务至欧洲，增加了往布拉格、布达佩斯、华沙、布拉迪斯拉发、里斯本、林兹、萨尔茨堡、格拉茨、莫斯科、贝鲁特和斯德哥尔摩。但只有往贝鲁特和斯德哥尔摩是正常的定期班次，往里斯本是季节性班次，其他欧洲目的地都是包机班次。之后往莫斯科的航班还中止了。1998年10月21日，突尼斯航空庆祝50周年成立，同时也开始了使用波音727型飞机。