上有很多地方和日语相似，但基础词汇有很大不同。在音韵方面，虽然日语和朝鲜语都具有固有词汇开头不出现流音和元音和谐律等和上述的阿尔泰语系语言共同的类似点，但也有一些重大的不同，例如：朝鲜语有闭音节及复辅音的存在，没有清音、浊音的区别。虽然日语和朝鲜的死语高句丽语在数词上有相似的词汇，然而高句丽语的实际情况人们所知甚少，目前还难以成为语系的判断依据。有学者认为琉球群岛（旧琉球王国）的语言是日语的一种方言（琉球方言），也认为其虽然和日语语系相同但是另外一门语言（琉球语），并将琉球语定位和日语同属于日本语系，不