时彼得罗巴甫洛夫斯克号遭逢风暴，不过展现出了良好的适航性。尽管风暴中战舰以10-12秒的频率出现幅度达20°的横摇，依然能在风浪中平安行驶；不过这次风暴也暴露出舰艏甲板位置较低的问题。1900年5月10日抵达旅顺港（俄方称为亚瑟港），并成为海军中将的旗舰，参与了一系列的舰队训练等。同年中国爆发义和团起义，彼得罗巴甫洛夫斯克号作为海军少将的旗舰参加了俄军的镇压行动。1901年6月24日（俄历6月11日）叶夫根尼·伊万诺维奇·阿列克谢耶夫海军中将代替韦谢拉戈接过指挥权，坐镇彼得罗巴甫洛夫斯克号指挥俄军在华行