斐如回到台湾，被任命为台湾省行政长官公署教育处副处长，是二战后初期长官公署高层官员中极少数的台湾人（台籍人士先暂安排文教新闻职缺，层级较高的另有3位：《台湾新生报》社长李万居、台湾广播电台台长林忠、参议杨友濂、宋李林都是随国府回台的台湾人，杨云萍是好友许寿裳力保的和国府没有渊源的留日台人）。1945年12月，宋斐如与郑明禄、苏新（《人民导报》总编辑，活跃台共分子）等人创办《人民导报》，宋斐如并担任社长。1946年，《人民导报》刊登有关国共和谈敏感文章、批评陈仪施政等，引发台湾省行政长官陈仪不满、要求宋斐