。1935年1月28日设监牧区，1961年12月22日升为教区。2008年3月，宫原良治主教被调往福冈教区后悬空。2011年3月25日，教宗本笃十六世任命滨口末雄为新任主教，同年6月26日晋牧。
现况.大分教区范围包括大分县和宫崎县。2004年有教友5,764人、26个堂区、58名司铎。主教为滨口末雄。