叶菊兰和台北市市长郝龙斌共同主持揭牌仪式，另外当时担任台北市市议会副议长的周柏雅以及民主进步党籍立委姚文智等人也出席现场。之后郑南榕基金会则表示将继续争取将纪念馆列入「国家文化资产」，希望能够借此保留国家民主化与社会自由化的共同象征。2013年，国立成功大学举行校内学生投票而决定将新广场命名为南榕广场。不过之后于2014年1月15日时校务会议以名称具有政治意涵为由决定取消广场命名，同时当时会议也由于出现争议性言论而引起外界批评。2014年4月，台南市政府将安平区东哲街、西科街合併命名为「南榕大道」。