设苗族班、工农预科班与财经培训班，主要教学任务是以分批轮训广东省内少数民族地区的基层民族干部和初级中学的领导成员，以及招收部分少数民族干部学习文化。1961年9月，遵照中共广东省委“要把民族学院办在少数民族地区”的指导意见，学校整体迁往广东省海南黎族苗族自治州首府通什镇，迁校后开始增设升大学预科班和培养实用人才的财会班、文化班和普通话训练班，此时学生全数为广东省内少数民族学生。当地原自治州干部学校后来并入广东民族学院。
文革时期.1966年10月文化大革命爆发，学校受到冲击，陷