通常可依照发展时程，再区分为早、中及晚期三时期。其中，早期年代距今1,800年至1,000年前间，中期年代则距今1,000年至500年前，晚期则是在距今500年内。晚期的十三行文化甚至可视为平埔族凯达格兰族的文化。而除渔猎与精致农业外，该遗址发现了可用来纺织的陶纺轮，证明十三行人应会利用简单工具来制作衣服。另外，十三行人住的干栏屋则与台湾平埔族与原住民族部落的建筑十分相似。
平埔族时代（1000年－1709年－）.学者以十三行文化的种种特征，推断该文化为平埔族的活动纪录。虽说尚无文