国民政府决定将国立武昌大学、省立医科大学等高校合并，并于次年2月20日正式组建国立武昌中山大学。在2月16日颁布的学校组织大纲的院系设置中，药学系即为全校17个系之一，隶属于医科。1928年组建国立武汉大学后医科分离，师生分别转入国立同济大学医学院及国立中山大学医科；创建于1923年的实习医院则几经辗转，于1943年设为新创办的湖北医学院的教学医院，后发展成为今天的武汉大学人民医院。医科分离后的国立武汉大学，一直为实现王世杰校长开办“文法理工农医”六大学院的万人大学的理想而努力着。终于在抗战胜利后，复员