0至2500米深处，是目前世界上最深的地下实验室。实验室约40米长、6米多宽、7米多高，呈“T”形结构，整体由上海交大和清华大学的公共区域、一个狭长的走廊和暗物质实验室组成。中国锦屏地下实验室的μ子通量为每年每平方米66次事件，相较于LUX所在的美国南达科他州霍姆斯特克矿每年每平方米950次事件以及XENO所使用的意大利格兰萨索实验室每年每平方米8,030事件。实验室的深度使PandaX相比于其他同类型暗物质探测器能更好地屏蔽宇宙射线的干扰，使可能获得的暗物质信号更易被放大。锦屏山的大理石也比霍姆斯特克和格