分苦恼、自责，他开始怀疑自己存在的价值和意义以及询问自己乘上EVA战斗的理由。人类补完计划发动，真嗣开始内心的补完。真嗣意识到现实世界拥有众多可能性，开始觉得自己过去拒绝的现实或许也没那么糟。这时候，真嗣的世界豁然开朗，大家都向真嗣祝福「恭喜你」。 在剧场版中，乘上EVA初号机的真嗣看到明日香的EVA贰号机被EVA量产机破坏后的残骸，因为恐惧、混乱、愤怒等负面感情而大叫。他的大叫唤回插在月球的朗基努斯之枪。之后，九体EVA量产机围绕并抓住他驾驶的初号机，开始人类补完的仪式。然而，真嗣最终拒绝了所有人合而为一