守棘阳，而新野宰就污秽了邓晨的住宅，烧了他的祖坟。邓晨的亲戚都谴责邓晨，说：“你家本来就富足，为何要跟着妻子家族的人遭受汤镬（用开水煮）的极刑呢？”邓晨始终不觉得悔恨。更始帝刘玄即位，任命邓晨担任偏将军。他与刘秀一同攻入颖川，连夜从昆阳城出发，击败了王寻、王邑。接着又离开徇阳翟以东，至京州、密州，一路攻下了不少城池。更始帝定都洛阳，任命邓晨为常山太守。这时候，王郎造反，刘秀从蓟州逃到信都，邓晨也抄小道行至巨鹿会合，自己主动请求跟从攻打邯郸。刘秀说：“伟卿你一个人跟从我，不如你用一郡来作为我北方的主人。”