南市中西区，是一间从香火袋发展而来的妈祖庙。该庙位于五条港北边哨船港南岸，是附近军工道厂与邻近船头行、郊商店铺的信仰中心。
沿革.据说原址本来是一座工寮，有人在工寮的阁楼供奉湄州妈祖香火，后来离去时忘了将香火袋带走，之后往来于五条港的船只常于夜间看见红色毫光，引导船只航行，追查后发现来源是工寮阁楼里的香火，后来信众集资建庙供奉，也因为此一典故，所以庙名取为「妈祖楼」。庙宇创立年代一般认为是古匾「圣奠鲸波」落款的干隆二十年（1755年），不过在干隆十七年（1752年）的《重修台湾县志