机B型连杆大头孔变形、使用寿命短等问题，设计出G型连杆并通过中车公司技术鉴定。1992年，工厂为部分在中国东北使用的东风4B型机车加装增压器防喘阀，解决增压器在严寒气候下容易发生喘振的问题。1993年，大连机车车辆厂为10台东风4B型柴油机车试装由四方机车车辆厂生产的双筒式风源净化装置，以提高空气制动系统的可靠性。1995年，新造的东风4B型机车加装了轮缘润滑装置，头灯由汞氙灯改为光线较为柔和的卤钨灯，并且改用ZN290型或VTC254-13型增压器，部分机车试装和的电器设备。
高原