日本陆上防卫队（本游戏对陆上自卫队的称唿）关东方面队第8普通科连队佔据了国会议事堂，胁持了包括日本首相在内的12位国会议员，并开始发动政变。而在前一年（2004年），日本亦先后发生了五次大型事故——包括秋叶原枪击案、不明来历船只企图进入日本领海、指定暴力团「极道会」佔据地铁站、激进份子佔据机场以及恐怖份子佔据核电厂，这五宗事件已令到市民人心惶惶；幸好有一班被称为「正义的英雄」的人们—包括警察、海洋保安厅（本游戏对海上保安厅的称唿）人员以及陆上防卫队队员，都一一地解决了。而今次关乎到国家未来的政变，能否一