008年，大同市二医院与古巴国家医疗服务中心合作，共建“大同中古友好眼科医院”，医院在2009年9月投入运行，被卫生部评为三级眼科医院，也是晋北最大的眼科医院。 大同中古友好眼科医院是全国第三家、华北地区首家中古友好合作医院。医院引进了国外医疗设备，并由古巴专家坐诊。2009年，大同市二医院与大同市肿瘤医院合并，仍使用大同市二医院、肿瘤医院的名称。2013年，大同市二医院搬离原首善医院旧址，首善医院旧址将进行整体保护。