种关系对于两者都是必须的。然而，已确定密切相关的自由生活亲缘关系与其自由生活亲缘相比（1.56Mbp对2.16Mbp），内共体具有显着降低的基因组。
基因组进化与物种形成.进化生物学的一个主要问题是基因组如何改变以创造新物种。物种形成需要行为, 形态, 生理, or 代谢（或其组合）的变化。在物种形成过程中基因组的进化只在最近才得到新一代测序技术的研究。 例如，非洲湖中的丽鱼在形态上和行为上都不同。5种物种的基因组已经揭示了序列以及许多基因的表达模式在相对短的时间（100,000至