天主教印度尼西亚军中教长区（、）是印度尼西亚一个罗马天主教军中教长区，直属圣座，负责牧养信奉天主教的印度尼西亚军人及其家眷。1949年12月25日成立军中代牧区，1986年7月21日被升为教长区。1999年有九名司铎。现任教长为伊纳休斯·苏哈约·海德约阿莫迪约。