入了东军，因此获赐肥后国天草郡4万石的领地，成为了德川幕府12万8千石的外样大名。庆长7年（1602年），寺泽家正式开始筑城，庆长13年（1608年）竣工。作为筑城工程的一部分，在满岛山东侧的山脚下挖掘了河道，将松浦河的入海口移动至东侧的山脚下。另外，名护屋城在秀吉殁后拆毁，各地大名使用了其建材协助了唐津城的建造，柳川堀、佐贺堀、肥后堀、萨摩堀都是因此而得名。处理藩政的御殿设置于二之丸，而武士宅邸则位于三之丸。本丸处仅建造了天守台（土石建造的基部），其后的工程应该没有实施。在宽永4年（1627年）的幕府