末代天皇后龟山上皇及其皇子小仓宫。但在被室町幕府讨伐后接受和解，上皇2年后返回京城。后龟山上皇驾崩4年后的1428年（正长元年），由于没有嗣子的称光天皇驾崩，北朝的嫡流断绝。后小松上皇欲从北朝的旁流（但是是持明院统原来的嫡流）的伏见宫家选彦仁王（后花园天皇）为继任者，南朝方面认为北朝因皇统断绝而失去了皇位继承权，并因此开始激烈地反抗。北畠满雅再次拥立小仓宫圣承（后龟山的皇子小仓宫恒敦的王子），在伊势举兵，与幕府军作战，战败身亡。从此事件开始直到应仁之乱为止，南朝的子孙们被反幕势力所拥立，断断续续地进