厂商大幅迁出，区域及人口发展进入停滞，1999年，楠梓区人口再度被左营区反超。2013年，高雄市政府辅助及重新打造园内产业转型，使加工区产业转型为科技发展且规划楠梓第二园区，重新带回厂商进驻、就业机会及人口移入，2019年11月底，楠梓区人口正式超越前镇区，成为高雄市的第四大区，但由于土地利用趋近饱和，使得本区的人口成长率已逐渐趋缓。楠梓区目前是高雄市境内大学设立最多的区域，区内西北侧为国立高雄大学、东侧为国立高雄科技大学第一校区、中间则为国立高雄科技大学楠梓校区。庞大的大学人口成为楠梓商圈发展及消费