其他节肢动物般身体有节，并由甲壳素及蛋白质组成的表皮覆盖。它们的身体有两个体区，即头胸部及腹部，而螨在这两部份的分隔则不可见。它们口器前有一螯肢。大部份亚类都只会以螯肢来吃食，但蜘蛛螯肢的螯爪则形成了獠牙状，大部份物种更可以从中注入毒素至猎物中。它们的循环系统是开放的，由管状的心脏将血液经血腔输送至身体其他部份。水生螯肢亚门是有鳃的，而其他的则有书肺及气管。螯肢亚门中央神经系统的神经节融合成一团，融合的程度各有不同，如最为古老及原始的中突蛛亚目神经节的融合程度则很有限。大部份螯肢亚门都有刚毛来感应振动、气流