随即国民党县党部主委张晋相立刻证实，引起外界对蔡四结立场与动机产生质疑。最终陈水扁获得15万票。此次虽然党外阵营败选，但也为党外势力在南县建立起基础，而国民党阵营则因山海派的对抗，造成日后山派的式微。选后陈水扁阵营在关庙乡时谢票时遇到车祸，造成夫人吴淑珍遭撞重伤，终生残疾。
台南市.苏南成在上届市长选举成功连任，成为台南市首位成功连任的市长。在本届任期未满前即转任高雄市长，由陈癸淼代理。而苏南成的机要秘书、现任国大代表陈森茂则打算以无党籍身分参选本届市长选举。国民党则提名了省议员