，此时惠帝朱允炆接受黄子澄的建议，撤换耿炳文，以李文忠之子曹国公李景隆接任，齐泰坚决反对却不被采纳，由景隆调兵五十万伐燕，战事遂不可为。
去世.明成祖朱棣夺权成功后，登基称帝。耿炳文被罢免职务，赋闲在家。刑部尚书郑赐、御史陈瑛在永乐元年（1403年）弹劾耿炳文「衣服器皿有龙凤饰，玉带用红鞓，僭妄不道」，耿炳文上吊自杀，终年七十岁。耿炳文的三个儿子前军都督佥事耿璇、后军都督佥事耿瓛、尚宝司卿耿瑄也都受到牵连被杀。但是，根据顾诚在《靖难之役和耿炳文、沐晟家族——婚姻关系在封建政治中