牙医专业学院.包含牙医学系、临床牙医学研究所、口腔生物科学研究所，计一系二所。位于台北市中正区台大医院西址九西走廊（原总督府医学校旧址）
药学专业学院.包含药学系、临床药学研究所、药物研究中心，计一系二所。位于台北市中正区林森南路33号 (国立台湾大学水森馆)
公卫学院.包含公共卫生学系及七个研究所。位于台北市中正区徐州路17号，中山南路与仁爱路交叉口，9.81 公顷（原总督府医学校旧址），3楼为物理治疗学系，4楼为职能治疗学系，其余皆为公卫