该湾由纽约湾海峡与下纽约湾相连，由凡库尔水道与纽华克湾相连，并通过东河连接至实为潮汐海峡的长岛海峡。该湾为哈德逊河流入纽约湾海峡的主要水道。经过港湾的哈德逊河航道被称为安克雷奇航道，它在港湾中点的深度约为。湾内有众多岛屿，包括位于东河河口附近的总督岛、埃利斯岛、自由岛及支撑在港湾内新泽西一侧的巨大水下暗礁上的罗宾斯礁。罗宾斯礁曾是世界最大的牡蛎养殖场之一，它一直为纽约市民提供日常美食，直至19世纪末由于污染被迫关闭。上纽约湾曾在纽约市的贸易中扮演极重要角色。从进入上湾的客船上能看见自由女神像的第