京津线则连接京都市和滋贺县大津市，部分列车直通运行进入地铁东西线。坂急则在京都市内有两条路线。京都本线和JR京都线、京坂本线并为连接京都和大坂的三大铁路路线。岚山线则是前往知名观光地岚山的重要交通方式。京都市内还有京福电气铁道（又称岚电，拥有岚山本线和北野线两条线路）、叡山电铁（拥有叡山本线和鞍马线两条路线）、嵯峨野观光铁道（拥有嵯峨野观光线一条路线）三家规模较小的铁路公司。这三家公司的铁路路线均通往知名旅游景区，主要服务对象为观光客。京都市内还有两条地铁路线，分别是乌丸线和东西线，均由京都市交通局运营