军令部总长永野修身元帅的意见，和杉山的主战意见不同，他明确的表明了态度：“很遗憾，我的军队无力正面阻止美军的登陆。”。1945年8月15日，日本宣布无条件投降。在中国政府的指控和强烈要求之下，畑俊六被远东国际军事法庭作为甲级战犯嫌疑人逮捕，关入东京巢鸭监狱。
战后.1946年5月3日，远东国际军事法庭开始对畑俊六等28名日本甲级战犯进行公开审理。陆军元帅杉山元在作为战犯被捕之前已畏罪自杀，另一个陆军元帅寺内寿一客死南洋、因而畑俊六成为法庭被告席上唯一的一名日本元帅。 由于海军大