改为“七孔流血”，并将一等人犯解送杭州府。而早年杨乃武曾举发当时是九品官吏的刘锡彤犯法，故有说刘锡彤根本对杨乃武怀恨在心，要屈打成招。由于杭州知府陈鲁严刑迫供，杨乃武多次昏死，最后供认是他给的毒药。葛毕氏被陈鲁以通姦杀夫之罪判决「杨乃武斩立决，葛毕氏凌迟处死」。同治十二年十一月初六，上报浙江按察使蒯贺荪。杨家不服，到杭州喊冤告状。杨乃武胞姐杨淑英（菊贞）曾在兵部右侍郎夏同善家做过保姆，透过夏同善与刑部分管浙江司刑狱林文忠将案卷送至军机大臣兼总理各国事务衙门大臣翁同龢手里，认为疑点重重，上呈同治帝，同