投资了台湾高铁公司等企业。台糖在2004年时已建构量贩、生物科技、精致农业、畜殖、商品行销、油品、休闲游憩、砂糖等八大事业部，并规划将砂糖以外的其他事业部进行公司化，以控股公司型态为未来的经营方向。
总部南迁深耕.由于过去南糖北米政策，致使台糖各事业部多位于台中以南，总管理处位于台北，在联系时效上有所不足。台糖在2005年6月成立台糖总公司南迁评估小组，做出总管理处南迁的评效，其中对于重塑企业文化、营造组织精神、强化指挥体系、畅通管理机制、活化公司资产等项都有呈现出正面的指向，