康熙三十年（1691年）辛未科殿试一甲第二名榜眼，原置第一，康熙帝以北方久无状元，将戴有祺擢为第一，吴昺降居榜眼。授翰林院编修。康熙三十五年（1696年）任广西乡试主考。四十四年（1705年），充《御选宋金元明四朝诗》纂选官。四十五年（1706年）分校会试。官至翰林院侍讲，差任湖广学政。学术专精于《三礼》，着有《卓望山房集》、《玉堂应奉集》、《宝稼堂集》等。2007年在全椒发现吴昺亲书的《药王庙碑记》石碑。