其精神当由时任国民党理事长的宋教仁出任内阁总理。3月，国会召开前夕，宋教仁「被袁世凯指使赵秉钧派人刺死于上海」。而当时外界诸多猜疑，认为赵秉均的行为乃是袁世凯授意，然并没有实质证据可以证明此一论定，但当时绝大多数人相信这个说法。3月20日，宋教仁在上海沪宁车站遇刺，两天后去世。凶手在上海公共租界被捕获，学者张耀杰在其着作中称宋案的直接凶手武士英，在租界西捕房安然无恙，刚转进陈其美老部队改编的军营中，还未仔细审讯，就离奇死亡。史学界一般认为袁世凯是暗杀主谋的可能性较大。还有观点认为宋教仁案的真正凶手是陈其美。