散，直到9月6日上午5点，日军正式佔领他里雾。在这几天的战役中，台湾守军方面阵亡130人，日军方面仅8人阵亡与多人受伤。 虽然台湾守军方面无法与佔领台湾中部的优势日军兵力相抗衡，然而台湾守军仍以游击战方式袭击日军来让日军的补给物资短缺。台湾岛上的瘟疫疾病也持续危害着日军军士的健康。1895年9月初在彰化日军内部所爆发的疟疾疫情甚至与5个月前在澎湖所爆发的疫情更加严重，此疫情大大重创日军，共造成超过2000人死亡。
嘉义之役.10月初，自本国增援的援军登陆台湾，日本方面恢复对台湾