。清政府与八国联军议和期间，董福祥被八国指控为“首凶”，要求清政府将其处死。李鸿章、袁世凯弹劾董福祥，也请求将其处死。慈禧因其护驾有功，百般回护，最终以革职留任、永不叙用论处。董对此一决定非常不满，一度计划自行招募军队赴山西继续战斗。慈禧恐其破坏和谈，令光绪帝赐其手书“他日闻鼙鼓思将帅，舍尔其谁属哉”，要求他守时待变，以图再举，董方才回宁夏金积堡隐居。
隐居金积堡董府.董福祥在金积堡期间，促进了西北地区不同宗教和不同民族的关系，如汉族、回族、蒙古族、藏族的关系、他同阿拉善亲王塔旺布