起事，部分成员于1854年转而来台，滋扰北台湾沿海，并趁势攻佔鸡笼（今基隆市）。北路协副将曾玉明征召林文察助战。林文察选择与客家人和解，并与义民军合作共同抵御。同治元年（1862），台湾亦爆发戴潮春之乱，此乃继朱一贵、林爽文之后的大乱事。同治二年六月，林文察升至陆路提督，带兵返台平乱, 至同治四年方渐平息。由于抗清领袖均系林家族敌，因此乱事渐平后，其他大族没落，戴潮春事件时林文察收购或佔有大量房屋土地，使林家田产倍增，并因平定戴潮春事件有功，得清廷赏赐全福建省（当时包含台湾）的樟脑专卖权, 林家蜕变为中部第