（1545年），毛纪病卒，朝廷追赠太保，谥文简。其子毛渠也为进士，官至太仆寺卿。
着作.毛纪着有《鳌峰类稿》二十六卷，还有《密勿稿》、《辞荣录》、《联句私钞》、《归田杂识》等。
墓葬.葬于山东省莱州市永安路街道西山张家村，毛纪及其父毛敏的墓葬现为山东省文物保护单位。
文学作品上的毛纪.《聊斋志异》上有一篇《姊妹易嫁》的主人公就是毛纪。