2016年夏季奥林匹克运动会吉布提代表团是吉布提所派出的2016年夏季奥林匹克运动会代表团，这是该国第8次参加奥运。
田径.吉布提队在田径项目上获得以下参赛席位（每个小项最多3名来自同一代表团的选手参加比赛）：
柔道.吉布提有一名柔道运动员获三方委员会邀请，得以参加奥运。
游泳.吉布提有一名游泳运动员获外卡邀请，取得奥运参赛资格。