寺院，以该寺隐匿反革命分子，窝藏军械及金银为由，将虚云老和尚等二十六名僧人囚禁起来拷打。虚云和尚被拘禁于方丈室内，门窗封闭，绝其饮食，大小便均不许外出，并遭四次毒打，虚云和尚肋骨折断，遂阖目不视，闭口不语，呈入定状，八日后始甦醒，虚云和尚呕心沥血所撰《楞严经玄要》、《法华经略疏》、《遗教经注释》、《圆觉经玄义》、《心经解》等着作毁失殆尽。事发后中央人民政府副主席李济深通知政务院总理周恩来斡旋，事件至1951年5月下旬，历时三个月才告一段落，海内外佛教界称之为「云门事变」。1952年参与发起中国佛教协会，