新界葵涌填海区兴建中学，并将何善衡的「善」字和其妻李宽德的「德」字合併，取名「佛教善德英文中学」，何氏在一生中得到多所大学授予名誉博士学位。1980年，与多位恒生银行董事注资创立「恒生商学书院」，以培训商界人才。2006年，何善衡慈善基金会向香港中文大学捐款港币1亿7000万元，成立「善衡书院」。1994年，何善衡连同梁銶琚、何添以及利国伟，各捐资港币一亿元，成立「何梁何利基金」，每年向中国内地有杰出成就的学者颁发奖金，以鼓励学者等在科技、医学及其它领域的成就。