2006年7月19日浙赣铁路的起点由杭州站移至笕桥站，原经过杭州东站的浙赣绕行线改为正线，经杭州站前往白鹿塘站的线路改为绕行线；但浙赣线与沪杭线又于同年12月31日18时起合并为沪昆线。2009年车站修建了连接沪杭高铁的联络线，使得沪杭高铁的列车在杭州东站尚未完工的情况下可通过该联络线驶入杭州站。
运营状况.目前车站不办理客运业务；负责办理笕桥机场军用物资到发；同时站内还设有两条专用线，一条通往中铁二十四局集团浙江工程有限公司，另一条为笕桥工务专用线，两条专用线均以办理建筑材料