京帝国大学教授白鸟库吉在后藤新平的支持下，于南满洲铁道会社设置满鲜历史地理调查部，主要研究满洲与朝鲜的历史，箭内亘便是调查部其中一名人员。在调查部提出的研究成果如《满洲历史地理》、《朝鲜历史地理》、《满鲜地理历史研究报告》中，箭内亘就是负责汉魏南北朝以及元明时代部分。1919年，箭内亘任职东京帝国大学东洋史历史系助理教授，直到1925年，白鸟库吉退休，箭内亘接任「东京帝国大学文科大学史学科」东洋史学第一讲座。1926年，箭内亘病逝，享年52岁。
学术争议.箭内亘指出《元史》，《