十四年（公元1616年）才得以复工，由知县杜从心主持修城。此次修城，建筑的城墙周长2800米(840丈)，高5.77米（1丈7尺3寸）。东门曰承晖门，西门曰宣义门，南门曰近薰门，小南门曰聚奎门。因整座城的形状像一只船，所以沭阳城又有“船城”的雅号。清干隆三十一年（公元1766年），知县倪学洙重修因战火、洪水及风雨侵浊而破烂不堪的沭阳城城墙。此次重修扩大了城区范围，修成后城墙周长增至2855米（855丈），城高6.7米（2丈），并在城墙里侧堆土作为戗台，使城墙比以往坚固了许多。城内筑土牛城，南城墙濒河。。