此一旦启动方阵快炮就是敌我不分攻击目标。此外，受限于载台的限制，方阵系统的雷达只能与机砲共用同一个回旋/俯仰角，无法独立执行广域搜索，因此系统开机后只能一次攻击一个目标。这个缺点在近年来已经借由和神盾战斗系统进行整合而获得不小的改善。近年来因为新型超音速掠海反舰飞弹普及，来袭飞弹通过军舰防空武器有效拦截区域的时间大幅缩短，射程有限的机砲式系统作用日小，再加上砲弹口径过小，容易造成拦截无效这个致命的缺陷，已不少舰艇改採用海公羊等短程飞弹系统取代，但由于飞弹採购成本并非全部国家都能负荷，且对抗小型船只自杀突