大的病毒，如核质巨DNA病毒（NCLDVs, nucleocytoplasmic large DNA viruses）。2012年的有关研究表明，通过研究病毒的蛋白质折叠结构，巨型病毒如拟菌病毒是一个独立的域的生物，区别于传统三域系统分类的真核生物域，细菌域及古菌域。这项研究的结论是巨型病毒是已经进化到更复杂的生物进行他们的高度专业化的寄生形式，同其他生物域一样有着一个古老的起源。
亚病毒.亚病毒（Subviral Agents）包括卫星病毒（Satellites，或称拟病毒 Vi