各地的神灵多达上百种，其中还包括了福州典型的榕树崇拜，如照天君。 佛教在福州的地位也十分重要，它在魏晋之际传入福州，唐代福州出现了百丈怀海、黄蘗希运这样的禅宗高僧。福州佛教在宋代大为兴盛，但明末一度衰落，清代又复兴，并由福州向日本和东南亚传播。福州涌泉寺、西禅寺在东南亚都有廨院，日本黄檗宗则起源于福清黄檗山万福寺。基督宗教方面，罗马天主教被福州人称为奉教，官方统计1994年福州天主教徒超过20万。1624年底，耶稣会的艾儒略将天主教传入福州，但福州天主教在1720年至1842年的禁教时期被迫转入暗地