华歆于是打算离去，适逢初平三年（192年）太傅马日磾被指命安定关东，马日磾于是辟华歆为掾。后东行至徐州，即拜豫章太守，为政清静而不混乱，得到吏民爱戴，甚至在扬州刺史刘繇病死后，他的余众都想奉华歆为主，但华歆认为为汉臣不应擅自任命而拒绝。后孙策平江东，并派虞翻游说华歆支持，华歆赏识孙策善于用兵而奉迎他；孙策亦以上宾之礼接待他。建安五年（200年），孙策遇刺身亡，而曹操与袁绍正在官渡交战，曹操上表征召华歆。孙权打算不放行，但华歆则以孙权能与曹操交好为由劝他放行。孙权于是让华歆应命。华歆走时有千余名宾客和旧友送行