国政府退居台湾，继续控制东沙，1990年7月将此地连同南沙群岛划归高雄市管辖。中华人民共和国则将此地仍归广东省。目前东沙群岛为中华民国政府实际控制，并由海岸巡防署管理。1995年由中央研究院历史语言研究所陈仲玉教授所发掘的“东沙遗址”，位置在东沙岛内潟湖的北岸，该处在数百年前应可停泊小船或舢舨。虽然没有发现明显居屋的遗蹟，但从出土的铁钉可窥知可能有临时性木造建筑。遗址至少有50公尺长，20公尺宽的范围，其有明显的火、火堆木炭、煤渣、打火燧石、动物骨骸等，显然有炊食的活动，绝非临时的小型露营场地。从出土大