卿还兼任滨黑铁路督办，插手铁路事业。1918年9月，张作霖任东三省巡閲使，获得了东北三省的支配权。1919年（民国8年）7月，皖系军阀、吉林督军孟恩远被撤职，鲍贵卿署吉林督军。孟恩远武力抵抗，被鲍贵卿制服。1919年8月、鲍贵卿任督办东省鉄路（东清铁路、中东铁路）公司事宜兼东省护路军总司令（11月辞第19旅旅长、滨黑铁路督办）。1920年（民国9年）1月，鲍贵卿接收管理东省铁路。3月，东省铁路的俄军武装解除，中东铁路司令（「坐办」）狄米特里·列奥尼德维奇·霍尔瓦特的解职命令下达。5月，中东铁路司法权