他的决定，某程度上是科学界里欧本海默支持者游说的结果。欧本海默一生吸烟成瘾，在1965年底确诊罹患喉癌。手术后，他又在1966年接受放射治疗和化疗。他在1967年2月15日陷入昏迷，18日在新泽西州普林斯顿去世，终年62岁。悼念仪式在一个星期后于普林斯顿大学校舍举办。在场的六百人中，有科学、政治和军队里曾与他共事的人士，包括贝特、格罗夫斯、凯南、、拉比、史迈斯和维格纳，另外还有弟弟弗兰克等家人，以及历史学家小亚瑟·史列辛格、小说家约翰·奥哈拉和纽约市芭蕾舞团总监乔治·巴兰奇。贝特、凯南和史迈斯发表悼词。