二水灾」重创，造成地下厂房淹水，水轮发电机、主变压器、控制室及开关场等设备皆泡水损坏，严重受损。复建可行性计画已于2008年（民国97年）6月3日奉行政院同意办理，并在2008年10月27日通过环保署环评审查，2009年11月展开复建工程，总经费达新台币一百七十多亿元，主要工程于2010年6月开工，2013年8月7日青山分厂新辟的尾水隧道竣工贯通，长度2,060公尺，并将尾水隧道延长至谷关水坝，青山电厂预计2015年12月重新商转。预计新机组之总装机容量达36万8千千瓦（368MW），比旧的四部机组增加