三叶虫数量的减少似乎不是无关的。三叶虫可能为这些新动物提供了丰富的食物。此外到二叠纪后期时三叶虫的数量和种类已经相当少了，仅剩下砑头虫目（Proetida），这无疑为牠们在二叠纪-三叠纪灭绝事件中灭绝提供了条件。此前的奥陶纪-志留纪灭绝事件和泥盆纪后期灭绝事件虽然没有后来的二叠纪-三叠纪灭绝事件那么严重，但是也已经大大地减少了三叶虫的多样性。而晚寒武世海洋深部缺氧也是导致三叶虫多样性下降的原因之一。今天存在与三叶虫外形最接近的动物可能是鲎或头虾纲（Cephalocarida）等动物。Sect