在16世纪和17世纪到达了繁荣的顶点。西里西亚与鲁滕尼亚和格但斯克与匈牙利之间的贸易路线均穿越雅罗斯瓦夫，每年的圣母升天日都有大量来自西班牙、英国、芬兰、亚美尼亚和波斯的商人汇聚这里。1574年，雅罗斯瓦夫建立了一所耶稣会学院。1590年代，来自奥斯曼帝国的鞑靼人占领了雅罗斯瓦夫周边地区，虽然他们一直无法攻破城市的防御，但却严重削弱了城市的经济实力。而1620年代暴发的腺鼠疫和1655年到1660年之间发生的波兰-瑞典战争进一步影响到雅罗斯瓦夫的重要性。在1700年-1721年的大北方战争中，雅罗斯瓦夫