助理教授、、博士候选人前往台湾进行学术研究；也提供台湾学生研习奖学金、斯拉夫研究夏令营奖学金。两国的数十所大学亦签署交流合作协议。截至2017年，台湾在捷克的留学生有120人；捷克在台湾的留学生有35人。
会展.2003年6月，台湾参加「布拉格剧场设计四年展」，但中华人民共和国坚持须更名为「台湾，中国」，未获主办单位接受，其代表于参展后提前离去，中华人民共和国大使馆并赴捷克外交部及文化部抗议。2007年11月6日，与捷克国家博物馆合作，在国立台湾博物馆展出《波希米亚偶的家－捷克