后参加工作，进入中华人民共和国农牧渔业部，并长年在该部工作。初时唐仁健在政策法规司担任科员，并在1984年3月至1985年1月赴北京市平谷县大华山乡下乡锻炼。1987年3月，他在该司升任副主任科员，后为主任科员。1989年5月，提拔至领导岗位，就任农业部政策法规司产业政策处副处长；1990年11月调为政策体改法规司经济调节处副处长、后为处长。1991年3月加入中国共产党。1994年11月，调到农业部办公厅部长办公室任正处级副主任。1994年11月回到政策体改法规司，升任副司长；1998年7月调至产业政策