求救电话的卫星无线电信号只能两个星期发送一次，于是决定留在小屋。隔日，爷爷带领众人来到埋藏在丛林深处的失落之地亚特兰提斯遗址。神秘岛原来受火山地壳激烈变动影响，每一百四十年会周期性的陆沉与上升，距下一段周期开始还有多年时间。汉克注意到岛屿正加剧发生土壤液化的现象，证实结论是错误的，而岛屿在数天内将完全沉没。众人开始展开逃出岛屿的旅程，找到《海底两万里》里尼莫船长的坟墓，记载着潜艇鹦鹉螺号的所在地，能顺利逃出的唯一希望。前往寻找鹦鹉螺号途中，遭遇许多危险的重重阻碍，众人搭载巨型蜜蜂穿越山岭，遭到巨大蜂鸟的