台湾週遭争议海域的主管机制。2006年，中华民国政府为便利由台湾本岛运输补给和医疗救护，中华民国国防部开始着手构建「太平专案」（太平岛机场专案）工程，但却引发舆论质疑破坏生态。2007年3月3日，高雄市政府海洋局为保护当地活动之海龟及响应国际间对海龟保育工作的重视，依渔业法第45条规定公告划设「太平岛海龟繁殖保育区」，范围以太平岛为中心，陆域产卵栖地从沙滩至树林外侧，海域重要栖息环境自潮间带和低潮线至12浬处。11月7日，中华民国国防部部长李天羽到立法院「国防委员会」备询时提到，正在预做规划新建跑道