长冈藩（）是日本江户时代的一个藩。位在越后国，统治古志郡全域及三岛郡东北部、蒲原郡西部。现在的新潟县长冈市・新潟市。藩厅是长冈城。为了区别山城长冈藩，所以也称作越后长冈藩。
沿革.元和2年（1616年），高田藩主松平忠辉被除封后，外様大名堀直寄以8万石入封古志郡的旧藏王堂藩领，在长冈（现长冈车站周边）筑城，长冈藩立藩。元和4年（1618年），直寄转封越后村上，谱代大名牧野忠成由长峰藩5万石入封长冈，加增为6万2000石。牧野家的统治持续到幕末，河井继之助在幕末期庆应年间进行藩政改革