本属致病的物种共同组成一单系群，而墨西哥孢子丝菌的致病能力较低，只造成过零星感染个案，其亲缘关系也与前述四种致病菌较远。
环境物种.除了致病真菌外，孢子丝菌属亦有许多生长在土壤与植物材料中、不感染动物的物种，许多物种曾被当作长喙壳菌属物种的。1974年，荷兰真菌学家De Hoog发表的专论中列出了本属共24种物种，其中便有13种为长喙壳菌属的无性型，而申克氏孢子丝菌也被视为"Ophiostoma stenoceras"的无性型。过去关于孢子丝菌属真菌的分类研究多只着重于致病物种