分病人可能会出现轻度恶心、呕吐、腹泻，存在胚胎毒性，孕妇慎用。
性质.
物理性质.青蒿素在常温下是一种无色针状晶体，密度1.3g/cm，比旋光度+68°（C=1.6，溶剂氯仿），几乎不溶于水，易溶于氯仿、乙酸乙酯和苯；常压下熔点156℃-157℃。青蒿素属于正交晶系，空间群D2-P222，晶胞参数a = 24Å b= 9.4Å c= 6.3Å。其红外光谱具有δ-内酯羰基的吸收（1745cm）和过氧键的吸收（831、881、1115cm）；其质谱具有质荷比为25