实现电动机转矩的控制。HXD3B型机车设有三个IGBT辅助变流器，由主变流器中间直流环节供电，将直流电逆变为三相交流电。 正常情况下三个变流器的其中一个为恒频恒压变流器（CVCF），为水泵、油泵、空调、空气压缩机、蓄电池充电机等设备供电；二个为变频变压变流器（VVVF），向两台复合冷却塔风机和六台牵引通风机电。当机车通过分相区时，辅助变流器改由再生制动产生的电能供电。
控制系统.HXD3B型电力机车采用庞巴迪公司的“MITRAC”微机控制系统，以国际标准的列车通信网络（TCN）