由于车站局部上方为衡山路隧道，因此站厅较其他同位于地下一层的站厅更深，并且西侧比东侧更深。付费区位于站厅西侧，设有4组楼梯和一组升降电梯通往站台，付费区西北侧是通往9号线、11号线的换乘通道入口。9号线徐家汇站位于港汇广场北侧，呈东西走向，施工期间港汇广场曾让出了其两万多平方米营业面积以期望地铁带来的“虹吸效应”。9号线站厅南半部分为付费区：其中西侧设有入口与11号线站厅垂直相交，东部为通往1号线站厅的换乘通道入口。9号线站台位于地下三层，设有一个岛式站台，站台上设有4组扶梯/楼梯和1组电梯通往站厅；站