到1,105亿港元，并在后来逐步增加，到了2013年交易额为146.5亿美元。马来西亚在2009年也成为香港的第18大外资国，内向直接投资（IDI）股票达165亿港元，而香港对马来西亚的投资总额则达439亿港元。2010年，香港成为马来西亚第三大外商直接投资地区（FDI），一共涉及11个项目，总价值27.7亿令吉，其中包括9个新项目和另外2个扩展及多元化项目。马来西亚企业在香港一共设有7个地区总部、19个地区办事处和33个地方办事处。2012年，双方也签署了节税和防止逃税协议。