研究对兰花的栽培、保育很有帮助，特别是对于濒临绝种的兰花种类，或香荚兰等有商业价值的物种。不过这些研究的难度很高，其中一个难点是难以分离样本中的形成菌根的真菌，与土壤中自由生长的真菌，在分子技术兴起之后这项阻碍依然存在，而某些真菌类群中，用以辨认物种的rDNA序列演化相当快速，更加剧了辨认的难度。形成兰菌根的真菌种类也受兰花生长环境影响，一项研究分析留尼旺岛上的兰科植物与共生真菌的类群，发现地生兰（生长在土壤中者）常与的真菌形成兰菌根，而附生兰（附生于其他植物者）则较常与的真菌形成菌根，另外附生兰与真菌的专