院院长取代国务总理，并设置行政院成为全国最高行政机关。10月8日选任谭延闿为首任行政院院长。10月25日行政院成立，正式办公。《中华民国宪法》在1946年起草时，依据中国民主社会党籍知名学者张君劢等人的原意，设计偏向内阁制，行政院院长由总统提名，经立法院同意任命之。总统政令以行政院院长副署为条件，近似内阁总理。由于第二次国共内战爆发，国民政府实行动员戡乱，宪法增设临时条款赋予总统大权；1949年中华民国政府因国共内战失利，播迁台湾后，中国国民党总裁蒋中正长期担任总统，并以军事戒严的《动员戡乱时期临时条款