闽南商户祭祀与集会之处，在梧栖可称为「外妈祖庙」，以别于由客家人祭祀、称为「内妈祖庙」的大庄浩天宫，至于当地闽南农户祭祀的则是鸭母寮永天宫。同治三年（1864年），梧栖朝元宫迁建现址，即中和里梧栖路140号，旧址曾作为梧栖海关。与梧栖真武宫位在同一里。1910年，庙方委请泉州师傅雕刻凤辇乙座、鹿港师傅雕造七十二执事，包括木制兵器六十把、执事牌有「风雨免朝」、「诸神免参」及两组长脚牌「朝元宫天上圣母」、「勅封与天同功」、「湄洲进香」、「肃静」、「回避」等。1935年新竹－台中地震受损，