帝命乌鲁木齐都统永铎复勘案情，属实，奎林遭到逮捕押送北京，干隆帝命诸皇子、军机大臣会同刑部审理。审判定拟奎林犯〈擅杀罪人律〉，应杖刑；海禄弹劾内容不尽真实，犯〈诬告律〉，拟流刑。干隆帝以奎林为孝贤皇后姪子而海禄弹劾并非无据，拟罪过重，改两人都革职，在尚虞备用处拜唐阿效力。五十三年（1788年），复授蓝翎侍卫。同年升任三等侍卫。再迁福建台湾镇总兵。五十五年（1790年），以台湾镇总兵加提督衔。五十六年（1791年），升授福建水师提督，仍兼台湾镇总兵。廓尔喀之役事起，授正红旗蒙古都统、驻藏办事大臣。