求离开上海去中央苏区。1934年2月5日抵达瑞金后，在中华苏维埃共和国人民委员会教育部视事，任中华苏维埃共和国中央执委会委员、人民教育委员会委员、中华苏维埃共和国中央政府教育部部长等职。瞿秋白上任后，主持制定了《苏维埃教育法规》，还兼任苏维埃大学校长。冯雪峰曾回忆说：“那时，毛主席对瞿秋白很有感情。有一次，他们彼此谈了一个通宵，话很投机，两个都是王明路线的排挤对象，有许多共同语言。后来瞿秋白死了，毛主席认为这是王明、博古他们有意把瞿秋白当作包袱甩给敌人造成的。”中央红军长征前夕，瞿秋白再三请求参加长征，但当