学院院士、美国国家医学研究院院士和墨西哥科学院院士。他是多个环境组织的委员会成员，以及许多科学委员会的成员，比如美国总统科技顾问委员会，公共政策委员会、麦克阿瑟基金会的全球安全和可持续发展委员会和马里奥·莫利纳中心。他也已经收到超过18个荣誉学位。一颗小行星（9680 Molina）也以他的名字命名。马里奥·莫利纳与路易萨·谭·莫利纳（Luisa Tan Molina）离婚后，于2006年2月与第二任妻子，瓜达卢佩·阿尔瓦雷斯（Guadalupe Álvarez），成婚。他的唯一的儿子是一位在波士顿工作