为第一批由中华民国政府甄选出国深造的台湾籍人士。1952年，他获匹兹堡大学颁与公共卫生硕士学位。
推动政策.1955年，许子秋升任台湾省政府卫生处简任技正。1956年，他被调任为台湾省立钖口疗养院院长。1959年，他在台湾省公共卫生教学实验院成立后成为首任院长，并兼任台北公共卫生教学示范中心主任。1962年，台湾省政府改组，黄杰出任主席并邀请许子秋接任台湾省政府卫生处处长职位；他在任内推动霍乱扑灭、小儿麻痺症及日本脑炎控制、家庭计画等计画。1963年，许子秋获京都大学颁发医