太湖流域和宁绍地区与岭南等地一样，是罪犯流放之地。到东汉时期（25年－220年），会稽郡治所迁往山阴（今绍兴），苏州成为新设的吴郡治所。秦国占领浙江后，将原越国本部设立会稽郡，行政中心位于今天的苏州，此前相继为吴国、越国的故都。浙江省当时主要属会稽郡，西北一部属丹杨郡，南部温台丽地区属于东瓯国，大片地区仍未为郡县覆盖。下面是位于浙江省内的郡县。
六朝.东汉末年，浙江曾为军阀王朗和严白虎所据，后来吴郡富春(今浙江富阳)人孙坚及其子孙策、孙权逐步统一长江下游地区。此后直到589年