敬完成《水经注疏》的工作，熊会贞在《〈水经注疏〉修改意见》中所说的“文，先生三分之二，会贞三分之一”。杨守敬也对陈衍所说：“吾书幸以成，多弟子熊生助属稿”杨守敬去世后，熊会贞继续《水经注疏》稿本的誊正工作，又编成《水经注疏要删再续补》四十卷。熊会贞治郦学有极大成就，如《河水》一章，他在卷二中指出：此卷首列“河水”二字，非指黄河之水，而是指塔里木河。并且肯定戴震删“河水”二字之功。民国十九年四月，日人森鹿三多次求购其书稿不成。民国二十五年（1936年）5月25日，熊会贞在武昌逝世。1938年熊会贞之子