肖笃寅发掘并带入武汉梯队，在2006年进入武汉光谷一线队，年底曾经和队友周燎一起去英超球队博尔顿进行过试训，被当地媒体称为是中国的彼得·克劳奇。但由于劳工证的原因，杨昌鹏最终没能留在博尔顿。2007年因“跳级”入选中国国青队而一举成名。2008年，朱广沪出任武汉光谷主教练后打算重用杨昌鹏，但随着杨昌鹏因一次意外受伤加上武汉光谷中途退出中超联赛而未能实现。2009年杨昌鹏加盟湖北康天作为球队的主力球员参加了乙级联赛，并帮助球队打进乙级联赛决赛阶段。2010年7月的中国球员二次转会，杨昌鹏加盟成都谢菲联