实含冤，便应予以平反。1972年9月9日，中国科学院大连化学物理研究所党委发表《关于萧光琰历史问题的审查结论》，否定文革期间对萧光琰的“特务”指控，把这些指控定性为诬陷，又认定他回国是出于爱国行为（萧光琰生前长期被质疑回国动机），赞扬他热爱中国共产党和社会主义制度，肯定他生前对国家有一定贡献。1978年3月11日，大连化学物理研究所礼堂举行萧光琰追悼会，研究所所长致悼辞时表示：“萧光琰同志热爱毛主席、热爱共产党、热爱社会主义，是一位有贡献、有才华的科学家。萧光琰同志的逝世，对化物所的科研工作是一个重大的损失