熊克武为四川招讨使。滇军攻占宜宾后，卢师谛部及中华革命军川南区司令吕超部前往宜宾，被编为四川招讨军，熊克武任司令，卢师谛任参谋长。招讨军同蔡锷的滇军协同作战，其中招讨军的团长朱德指挥了纳溪棉花坡战斗。1916年3月22日，袁世凯宣布取消帝制，命令四川将军陈宧停战。卢师谛、刘永凯、方朝珍等赴成都说服陈宧于5月22日宣布独立。
同滇军的斗争.1916年8月1日，蔡锷任四川督军，四川招讨军被编蔡锷领导的四川护国军，卢师谛任四川护国军第四师师长，下辖第八旅（旅长周炯伯），十三团（团长汤有光