里发阿卜杜勒-拉赫曼·丹·阿比·巴卡尔失去民心。英国人占领南奈及利亚后，意图吞併索科托国家。英军将领卢吉率军利用索科托中央与南部酋长国的矛盾规避沿途抵抗，直抵国都索科托，遭到新任苏丹穆罕默德·阿塔希鲁一世的抵抗。英军很快取得胜利，迫使苏丹及上千名随从以希吉拉之名义逃亡外地。1903年3月13日，哈里发国的末任大维齐尔于索科托大广场宣布效忠英国统治；哈里发的头衔自此废除，仅保留苏丹头衔，穆罕默德·阿塔希鲁二世奉派为新任苏丹。哈里发国的领土併入北奈及利亚保护国。1903年7月，英军击败阿塔希鲁一世余部，并将