满着棉状的软组织，但成熟会会逐渐变为中空。总体来说这种蕈十分脆弱，孢子印为黄色，菌髓为白色。和其他典型真菌物种比起来，皱盖钟菌的子囊孢子非常巨大，可长至60－80微米，宽15－18微米，其为椭圆形，平坦，有时则会弯曲，呈透明至浅黄色。多数子囊菌的每个子囊中有八个子囊孢子，而皱盖钟菌的子囊只有两个孢子（少数为三个）是本种特色之一，平坦、椭圆的子囊长275－350微米，宽16－23微米。英裔加拿大真菌学家认为皱盖钟菌的子囊有，即其会朝光线弯曲，他描述：「我对菌盖进行横切，将片段放在显微镜下观察，并发现在所有