法师在阿含学的阐扬，对中观学的诠释，以及大乘三系的教判上，对台湾的佛学界有着显着影响。佛教史学者蓝吉富誉为「玄奘以来第一人」。他早期的净土论述《念佛浅说》、《净土新论》，不被奉「明清以来净土宗」为圭臬的莲宗信众所接受，而对其净土思想产生反对声浪。据江灿腾所说：反印顺激进者，如台中李炳南居士领导的台中莲社的部份信众，曾出现烧书破魔说事件。至于其所提出的人间佛教（以及太虚大师的「人生佛教」）主张，则直接或间接地引领了近代台湾佛教的发展，例如佛光山的星云法师提出「人间佛教性格」、慈济的证严法师推展「人间菩