后一直参与辅政工作，而他行事作风不拘小节，对自己委任的赵胤和贾宁等将领的犯法行为多作容忍，招到大臣不满，其他士族亦试图借此废掉王导，削弱琅琊王氏在朝中的影响力。陶侃就曾于成帝咸和年间打算起兵废掉王导，但因郗鉴反对而没有成事。咸康四年（338年），郗鉴升任太尉，征西将军庾亮想罢黜王导，并寻求郗鉴的支持，但郗鉴表示反对；庾亮再写信游说郗鉴，但郗鉴坚拒，最终庾亮亦唯有放弃。郗鉴阻止了朝中主要士族的剧烈斗争，让经历过两次大动乱的东晋能够维持安定。咸康五年八月辛卯日（339年10月8日），郗鉴病逝，享年七十一岁。