来李封病死，左氏博士又再次废止。陈元以才高着名，升迁到司空李通府。建武七年（31年），大司农江冯上言，建议让司隶校尉督察三公。陈元上疏反对司隶校尉督三公，陈元说：「臣听说，将臣子当作老师的，是帝王；将臣子当作朋友的，是霸王，所以周武王以姜太公为师，齐桓公以管夷吾为仲父。孔子说过：『百官总己听于冢宰。』汉高祖有优待相国之礼，汉文帝允许宰相申屠嘉传讯邓通，这叫做『假权』，王莽时期，汉室中衰，专操国柄，窃得天下，王莽常以自己为例，不信群臣。剥夺三公职责、损害宰相的威严，把揭发别人的隐私当作是正直之道。部属控告