因失去栖息地、受到猎杀及掠食而进入濒危的状态。玛利安娜狐蝠主要吃果实，如无花果、蕉、番石榴及木瓜等。玛利安娜狐蝠是查莫罗人的美食，并与关岛型肌萎缩性侧索硬化-帕金征群痴呆综合症有关。牠们被发现会吃大量的苏铁类种子，并像一些鹰般会在脂肪组织上积聚滴滴涕，甚至到达危险的水平。