987年台湾解严之后，台权会完成「破除政治压迫」的部份阶段性目标后，则持续在司法人权上继续努力。此阶段重要的工作有救援苏建和案，。由于社会变迁，台权会目前工作除着重在司法人权改善，并监督政府是否不当滥权；如2005年中华民国内政部要求换发身分证者必须按捺指纹，后由司法院大法官判定违宪。台权会关注多面向人权，目标是提升人权标准、建立及加强人权保护机制，及关怀所有人权受到威胁、侵害的个人、团体与社群，不论阶级、地位、种族、性别、信仰、国籍或其他区别，并透过以下方法持续监督政府：
人权教育