兽孔目的颞颥孔远比盘龙目的大。兽孔目可能在二叠纪中或晚期演化出热量调节能力（温血动物）。兽孔目可能拥有皮腺，较类似哺乳类，而非爬行动物的鳞片。早期兽孔目没有皮毛；晚二叠纪演化出的兽齿类可能是目前所知唯一拥有皮毛的兽孔目。兽孔目由三个主要的演化支组成，恐头兽亚目、草食性的异齿亚目、还有大多是肉食性的兽齿类，而肉食性的巴莫鳄亚目是个原始物种的并系群集合。在一阵短期的多样性辐射演化后，恐头兽亚目在二叠纪中期（瓜达鹿白阶晚期）消失，但异齿亚目的二齿兽类与兽齿类的丽齿兽类与兽头类开始繁盛。在二叠纪末期，第一批犬齿兽类