舰炮武器系统是由通用动力公司所生产的，给予军舰防止小型而且高速的水面上舰艇突袭的保护。Mk 46砲塔是由一门30毫米链炮、一台前视红外线（FLIR）传感器、一台低光度电视影像摄像机和激光测距仪所组成。巨蝮二式链炮会以200发／分钟的射速射击，并以400发弹药借由200发双向输弹槽供弹。全口径高爆或穿甲弹以下的有效射程为2,011.68公尺（2,200码），亦可发射次口径弹药令射程得以延长。Mk 46舰炮武器系统被永久安装在圣安东尼奥级两栖船坞登陆舰（每艘2座）以上，另外亦会在自由级和独立级濒海战斗舰上各安装