利亚公主殿下医院来纪念女儿，这所医院至今依然屹立。艾米丽还把巴伐利亚的财产留给大公马克西米利安，“（她）会对能够有这么个女婿（感到）高兴，因为天神已经把她深爱的女儿玛丽亚·阿梅利亚保藏起来。”马克西米利安大公一直对玛丽亚·阿梅利亚念念不忘，迎娶比利时的夏洛特后，他于1859至1860年前往多个同玛丽亚·阿梅利亚有关的地点朝圣。前往马德拉岛期间，他在日记中写道：“巴西皇后唯一的女儿，极具天赋的精灵，于1853年2月4日因肺结核在此去世。她离开这个充满瑕疵的世界，像纯洁的天使一样返回天堂，（那里才是）她真正