最后同意要是国王能在一年之内获得婚姻无效的许可，她就嫁给路易十二；几天后的9月26日，这个程序便开始了，而安妮在10月回到布列塔尼。结果，教皇亚历山大六世在考虑政治因素后，于同年年底宣布路易十二的婚姻无效，于是让娜被改封为贝利女公爵并前往公国的都城布尔日，不久后成为修女。而在几天后的1499年1月7日，安妮第三次结婚，并全力维护身为布列塔尼公国的自主权。尽管路易十二依然对布列塔尼施加影响力，他承认新妻子的女公爵头衔，并且承诺他们的第二个孩子，无论男女，会是公国的继承人。1504年11月18日，安妮再次在