由于位于京都前往山阴道的要冲，江户时代初期由德川家康指派松平康重在此新建篠山城取代原本的八上城，同时设立；此后篠山藩虽然经历多次转封，但藩主皆由谱代大名担任。19世纪末江户时代结束之际，多纪郡全境都为的领地。随着1868年幕府的结束及接着实施的废藩置县政策，改隶属篠山县，1871年全数被整併到丰冈县内，1876年再次整併到兵库县。1879年实施，正式的设置了近代的行政区划「多纪郡」，郡役所设于篠山。