栴是天启四年（1624年）的举人，次年（1625年）成进士，获授苏州推官，兼理当地兑运，调和军民交兑不和，省霞每年不必要的开支三万金，上级让他立碑纪录。不久他改任河间推官，转官职方员外郎和郧襄佥事，适逢张献忠以谷城要求招抚，熊文灿准许，他建议找林铭球、左良玉抓拿对方，反对招抚；其后混世王、整世王、常国安、王光恩、惠登相相继乞抚，他亦反对熊文灿招抚，到张献忠再次叛乱，在墙壁写下：「不受张献忠钱者，郧襄道王瑞栴一人耳。」于是他声名大噪。弘光帝继位，召用王瑞栴为太仆少卿，上陈官吏虐民，很快告归；到鲁王朱以海监