和控制混乱，陆军飞行战队和海军彼此缺乏通讯和协调，导致部队无法应对突袭。日本城市民防薄弱，而且城市设计极易遭受燃烧弹重创。城区通常十分拥挤，大部分建筑是用纸、木等易燃材料打造。此外，城区工业和军事设施周围往往是人口密集的住宅区。绝大多数城市没有职业消防员，全靠志愿者灭火，消防队还缺乏现代消防装备，灭火方法过时。东京和大坂自从1928年就开始举办空袭演习，日本政府1937年起就要求地方政府向平民提供应对空袭指导手册。太平洋战争爆发前，日本列岛修建的防空洞及其他民用空防设施很少。
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