ine神父始建。两座钟楼高64米，建于1875年。到1925年完成时，为东亚最大的天主教堂。1945年8月9日，美国陆军航空军轰炸机将原子弹投在长崎，在浦上一带引爆，将距离原爆点仅有500米的教堂彻底摧毁。当时许多基督徒正聚集在教堂举行弥撒，庆祝圣母升天节，由于射线和倒塌的石头而全部身亡。新堂建于1959年。此前长崎市政府和教会之间进行了严肃的辩论。市政府建议保留被毁的教堂为历史遗产，另外提供地点新建教堂。然而，出于历史原因，长崎的基督徒强烈希望在原址重建他们的教堂。这个地方是他们遭受迫害和痛苦的象