承父位成为梅克伦堡-什未林大公。即位后的弗里德里希·弗朗茨二世曾周游列国，包括俄罗斯、意大利和东洋国家。1864年的普丹战争中，弗里德里希·弗朗茨二世没有向普鲁士提供一支军队，因为一方面梅克伦堡害怕丹麦对其海岸的威胁，另一方面，丹麦国王是他的好友。普奥战争，他站在普鲁士一方。1871年的普法战争中，弗里德里希·弗朗茨二世是德意志帝国第八军的总指挥，参与了巴黎、奥尔良、勒芒的战役。弗里德里希·弗朗茨二世于1883年4月15日在什未林去世，终年60岁。长子弗里德里希·弗朗茨三世继位为梅克伦堡-什未林大公