狱中的时间长达二十三年。黄华之后出任民主进步党组织发展部主任、台湾国会办公室主任、新世纪国会办公室总顾问等职。2000年陈水扁当选总统后，黄华出任总统府国策顾问。2005年，黄华加入台湾团结联盟。2011年7月10日，黄华与高金郎、刘重义等人另组台湾民族党，并担任党主席，持续推动台湾独立运动。2019年5月19日，黄华于台北车站一楼大厅展开以绝食方式推动「台湾共和国自决创国运动」，绝食行动由前公投护台湾联盟执行长赖芳征策划。有旅客行经台北车站目睹绝食行动后认为不妥而向新闻媒体爆料，台湾铁路管理局因此