官学生身份加入香港政府。石智益加入港府后，最初于1937年出任第三助理辅政司，同年出任卫生局（Sanitary Department）政务助理，负责处理市政局事务。在1938年，港府委任一个委员会负责研究扩建启德机场，而石智益则获调派为委员会秘书。第二次世界大战爆发后，石智益获调派到新成立的经济战务厅（Economic Warfare Office）工作，1941年出任署理知识主任（Intellectual Officer），同年复升任为经济战务厅总监。在1941年12月，石智益一度被借调到马来亚殖民地