澂流逃脱。1941年（民国30年），缪澂流担任胡宗南手下的西北游撃干部训练班教育长。后来，他担任中央训练团团长。第二次国共内战中，中国国民党败北，缪澄流随国民党逃往台湾。在台湾，他信仰佛教。1990年（民国79年）12月11日，缪澄流病逝于台北市。享年90岁。