。若正式定为古蹟，则可能要修改机厂用地规划，或另行觅地兴建机厂。由于少数汉生病的院民不愿搬迁，引发支持保存疗养院建筑的学者及其他人士，与地方民意代表、工程单位间的争议，新庄线的预定通车时程也因此延后。目前「新庄线捷运工程与乐生疗养院保存计画」已经获行政院核定，预定保留41.6%的院区，并与新庄机厂共构。不过「青年乐生联盟」等组织与部份专业人士仍反对此方案，要求採用行政院文化建设委员会保留90%院区的方案。他们认为文建会方案较能保障弱势权益，而且不会延误新庄线通车时程。台北县政府则于2008年12月3日依