参与三藩战役之际，陈永华聘请他担任计事，郑得潇推辞；不久，郑经亲自聘请他担任从事，又推辞。后来，郑得潇出任中书科之中书舍人，掌理文书要职。1680年，郑得潇随郑经败返东宁。1681年，郑经薨殂，发生东宁之变，由二王子郑克塽即位。1683年，大清国水师提督施琅在澎湖海战中取胜，攻陷澎湖群岛。建威中镇将领黄良骥上奏郑克塽，请求南下夺取吕宋以永续国祚，郑得潇十分赞同这项进谏，因而撰千字上奏。然而，于中提督刘国轩强力阻挡之下，郑克塽选择投降，并命令郑得潇修写降表。