车站与附近的地名源自爱奴语中的「cikap-un-i」（鸟栖息的地方），而邻近的鹰栖村（）之地名也起源于相同的理由。
历史.近文车站的设站起源，可以回溯到明治政府时期。由于考量北方的俄罗斯南侵之隐忧，日本政府于明治32年时将陆军第7师团的驻地由札幌牵往旭川，并设置了一条营区建设资材运输所需、长4.6公里的专用线。这条专用线因为营区位在鹰栖村之故而通称为鹰栖专用线，而近文就是当时鹰栖专用线自函馆本线分岔而出的号志站（初设时名为近文信号停车场）。1906年路线的管理由转移至日本国有铁道