开发从1993年上半年开始。一名没有记录名称的史克威尔职员提议开发团队制作时间旅行主题游戏，但加藤最初因担心重复、无趣的游戏性而反对。在开发的初年，加藤和堀井之后每天会面数小时探讨游戏剧情编写。史克威尔最初将作品划归圣剑传说系列，并将暂定名“玛尔岛”；田中弘道（后来《穿越时空》的总监）监督鸟山明的早期设计。团队希望在任天堂计划的超级任天堂磁盘设备上发行游戏；当任天堂取消此项目后，史克威尔转而为超级任天堂卡带开发游戏，并将游戏重命名为“时空之轮”。田中相信ROM卡带平台能从场景地图无缝转换到战斗场景。青木