石灰石是县内储量最大的矿产资源，除路南坝外其他大部分地区都是石灰岩的分布区，石灰岩分布面积占全县面积的62.9%，大都出露于泥盆、石炭、二叠系的灰岩层，质较纯，是优良的石料、石灰、电石及水泥原料。
自然灾害.石林县主要自然灾害有干旱、洪涝、低温、霜冻、冰雹等，旱涝灾害最为频繁，旱灾几乎每二年发生一次，旱灾过后通常是区域性的洪涝。民国14年（1925年）曾发生特大霜灾，全县51%的农田、47%的农户受灾，灾民超过4万人，此次灾害导致3,127人死亡。1950年先旱后涝，仅圭山区、竹山