于1988年罹患帕金森氏症，2009年因甲状腺癌而开刀，2013年起长期住院。李泰祥在养病期间仍时有创作，多次参与相关音乐会。李泰祥于2008年获国家文艺奖。2012年受邀担任国立政治大学驻校艺术家。2013年李泰祥获颁发第32届行政院文化奖，云门舞集创办人林怀民担任李泰祥引言人，身体不适的李泰祥在医护人员陪同下出席颁奖典礼，展现生命的韧性。2014年1月2日晚上8点20分，李泰祥在睡梦中安详病逝于新北市新店慈济医院。2014年1月5日，李泰祥女儿李若菱和弟子许景淳等于台南市立文化中心举行「