河岸向北略有抬升，全境海拔在2到52米之间。
地质.南特市区所处的卢瓦尔河口在中新世以前为一片海域，地质史上称其为，现代则是法国本土最大的冲积平原之一，其地表主要覆盖有现代河流冲积物。
水文.南特位于卢瓦尔河畔，该河是法国第一长河，在南特附近形成了多个河心岛，其中面积达4.6平方公里，该岛自二战后得到大规模开发，现已成为重要的商务及现代办公区域。卢瓦尔河的三条一级支流在南特与其交汇：来自右岸的埃德尔河在南特市区经人工改造形成多个湖泊，部分河段表面被人工