职责是致力与东盟及四个管辖国家的各级机关及机构加强联系，以促进香港与当地的双边经济及贸易关系。同时，经贸办亦处理香港与东盟及管辖国家在社会及文化等方面的双边事务，并在每年都积极举办及参与推广香港的活动。
处长列表.由于印尼的伊斯兰文化与香港文化大相迳庭，而当地恐怖活动亦相对活跃，故处长一职在香港官场上无人问津。因此，香港驻雅加达经贸办在2016年6月13日启用时处长一职悬空，首任处长杜彭慧仪延至同年9月13日才正式上任，而现任处长为2018年12月初上任的罗建伟。