藏大师曾「讲三论一百余遍，法华三百余遍，大品、智论、华严、维摩等各数十遍。并着玄疏盛流于世。」三论宗之名，始见于日僧凝然（1240-1321）所作《八宗纲要钞》与《三国佛法传通源起》，在《八宗纲要钞》书中也定下三论宗的传承祖脉。认为印度祖师之血脉以文殊菩萨为高祖，马鸣为次祖，龙树为三祖。龙树有二弟子，分二流，一者由龙树传龙智、清辨、智光、师子光；一者由龙树传提婆、罗睺罗多、沙车王子至鸠摩罗什。中国祖师起于罗什，传道生、僧肇、法融、僧叡、昙影、慧观、道恆、昙济。昙济传道朗、僧诠、法朗、吉藏，后传至高丽僧慧