8月，东北九省保安司令部併入国民政府任东北行辕，任副主任。1948年3月，当选国民大会代表，6月任徐州剿匪总司令部副总司令兼第二兵团司令官，9月，转任东北剿匪总司令部副总司令兼冀热辽边区司令官，11月指挥东北国军从葫芦岛撤退。1948年11月6日，淮海战役开始，杜聿明回任徐州剿匪总司令部副总司令兼前进指挥部主任。12月17日，毛泽东爲中国人民解放军中原野战军及华东野战军两个司令部，写了一个《敦促杜聿明等投降书》广播稿。12月25日，新华社发佈43名国民党战犯名单，杜聿明为第三十六号"战犯"。12月30日