于获准到蒙特利尔养伤，由准将接替。另外，双方在乡郊招募的民兵，曾在3月25日引发圣皮埃尔之战，但除此以外就别无战事。汤马士接掌指挥后，发现围城战已不能继续下去。大陆军不但士气低落，而且饱受天花威胁（汤马士在6月也因天花而死）。5月3日反叛一方曾派一艘火船攻击魁北克市港口，但未有成功。到5月6日，英国一支小型舰队抵达，并带同200名正规军增援。卡尔顿即时派守军出击，而大陆军则开始溃散而逃，围城就此结束。
后续影响.魁北克战役后，大陆军撤回蒙特利尔；而卡尔顿则因战功而在7月获封爵士