基因间区段（英语：Intergenic region）又称基因间隔区，是指穿插在基因与基因之间的DNA序列，这些序列不生产蛋白质，在人类基因组中佔了大多数。基因间区段的少数序列会影响基因的表现，但大多数序列并没有作用，或是功能未知。