海港夏洛特阿马利亚和克里斯琴斯特德着称。大多数岛屿，包括圣托马斯岛，都是火山岛，多山。最高点位于圣托马斯岛上，海拔474公尺。圣克罗伊岛是面积最大的岛，位于群岛的南部，地势比较平缓。美国国家公园管理局拥有圣约翰岛的大半部分、哈塞尔岛的几乎全部面积和许多珊瑚礁。美属维京群岛位于北美洲板块和加勒比板块的接缝上。当地的自然灾害包括地震和热带气旋。
气候.美属维尔京群岛属于热带海洋性气候，终年常受副热带高压带来的偏东信风控制，气温变化不大。在夏秋两季偶尔受到在非洲以西，大西洋上形成的飓