了善化地区，陈家在府城也有庞大产业，并建有宅邸。陈家的府城宅邸，据说位在台南市中西区永福路华南银行后面，陈德聚堂北边。进士陈望曾宅第在旁边，陈子镛和他时相往来。此外刘永福曾住在台南市永福国小一带，距离陈家不远，也有所往来。光绪廿一年（1895年）台湾民主国成立，在民主国抗日的过程中，陈子镛曾独自捐了白银40万两，并出任筹防局长（一说是「粮台」）。陈子镛也募集乡勇在曾文溪南岸试图对抗日军，失败后撤回台南府城。这次行动在善化地区中有相传陈子镛部属用大砲打中一名日本军官，后来他们才知道其身分是北白川宫能久亲王