年主宫雇佣了第一个医生，遂成为一个功能齐全的医院，是法国最重要的医院之一。由于里昂以贸易和季节性展览会着称，早期许多病人是外国旅客。 1532年，主宫医院任命前方济各会/本笃会修士出身的医生和伟大的人文主义者弗朗索瓦·拉伯雷，他在此任职期间写作了《巨人传》。在17世纪和18世纪，主宫医院大规模扩建，在其鼎盛时，甚至一直延伸到白莱果广场，今日中央邮局所在地点。主宫医院除了是里昂的一所重要医院之外，还设有博物馆。