罹患胰腺癌，在北京协和医院切除了胆囊及三分之二的肠道。出院回家休养，每周的化疗时，着手着述《黄龙周虎》、《血泪篇》两部古谱棋评，计划出全卷15册的《中国围棋古谱精解大系》，病逝前已出版7册。在病中，陈祖德仍然保持着谦虚而自持的风范。中国围棋国家队的领队华学明曾回忆说：“我对陈老最深的印像是任何时候他都不愿意麻烦别人，一次症状比较严重，需要去另一家医院拿药，陈老竟然跟爱人打了辆黑车去的，没有告诉任何人。今年8月下旬，陈老听说在一家位置有些偏僻的中医做针灸可能有疗效，他让我开车带他去，这是这么长的时间他第一次让