李暊已过世，储君未定，领议政李浚庆请明宗在所有侄子里面选一位立储，明宗命河城君入宫服侍，明宗二十二年（1567年），明宗驾崩，首相奉遗教迎河城君即位，是为宣祖，是朝鲜王朝第一位以旁系子孙入主的国王。他在位期间，朝鲜终于完成了长达二百年的宗系辩诬，使得明朝将正确的朝鲜宗系写进了《明会典》。（此前，明朝一直有说法认为朝鲜太祖大王李成桂是高丽权臣李仁任的儿子，这一错误说法被写进了《皇明祖训》与《明会典》。至此，宣祖趁明朝改修《明会典》的时机，改正了这一错误，朝鲜史称“宗系辩诬”。）宣祖一朝，功臣同士大夫间