如今由形态学与基因学上的研究显示叫鹤目实属于另外一个名为南鸟类的独立分支（其他成员包括隼形目、鹦形目与雀形目）。这项理论在2014年透过检验48种代表性鸟类的基因组后获得证实， 检验显示叫鹤目为南鸟类中最大的基群（隼形目仅次之）。加上非洲禽类（包含美洲鹫目、鹰形目与鸮形目）中最大的基群也都是掠食性鸟类，因此可以假定南鸟类与非洲禽类的共同祖先（陆鸟类）为顶级掠食者。不过有些研究学者如认为这项结果是针对现存种类所推论出的偏颇假设，也确实在叫鹤科中已绝种的""，被科学家普遍认为实属草食性。叫鹤目最早的化石