协会承担上海浦东新区战略发展研究的重大课题，其中“上海浦东新区建立自由贸易区研究”分课题于2010年1月20日完成评审并得到高度评价。随后相关报告被呈送国务院（中央人民政府），被认为是中国（上海）自由贸易试验区的方案雏形。2013年3月，国务院总理李克强在上海调研时表示，鼓励支持上海积极探索，在现有综合保税区基础上，研究试点先行在28平方公里内建立一个自由贸易试验区，进一步扩大开放，推动完善开放型经济体制机制。2013年上半年，由商务部国际经贸关系司牵头制定了《中国（上海）自由贸易试验区总体方案》（