出的朱子学，称为「新儒学」。这哲学主要提出阶级有序和强调历史的思想，反而让武士想起了真正的国家元首是天皇。另一方面，日本本土的神道教在幕末时代复兴。神道教的神职人员从古代的日本诗歌发现，日本的执政者理应是天皇，而非幕府将军。这成为尊王攘夷的理据。幕末，幕藩体制陷入危机，亦面临外国侵略威胁，武士阶层指责且屏斥江户幕府的军政，唿吁应奉还天皇实权，以抵抗侵犯日本的外夷，也就是对强行叩关的外国人予以征讨，此种政治诉求活动即尊王攘夷，又称尊皇攘夷，「皇」出自「天皇」。长州藩是尊王攘夷运动的中心，代表人物有吉田松阴