原生地破坏是暗色猪笼草在野外面临的最为严重的威胁。因暗色猪笼草没有什么特别之处，食虫植物爱好者对其并不特别感兴趣。同时，暗色猪笼草通常附生于高大的树干上，所以植物采集者很少会采集暗色猪笼草。
相关物种.暗色猪笼草与婆罗洲的附生猪笼草、胡瑞尔猪笼草、宽唇猪笼草、窄叶猪笼草和佛氏猪笼草间存在着最为密切的近缘关系。而在一定程度上，其也与大猪笼草系物种之间存在着近缘关系，其包括博世猪笼草、陈氏猪笼草、艾玛猪笼草、法萨猪笼草、克洛斯猪笼草及大猪笼草部分学者认为柔毛猪笼草与胡瑞尔猪笼草为同一