ultispot HIV-1／HIV-2快速检测是目前唯一经FDA批准的区分这两种病毒的方法。可以识别出HIV-1、HIV-1的O组以及HIV-2的酶免疫测定，一直以来都是筛查和诊断HIV的推荐方法。如果在组合筛查中发现测试结果虽为阳性，但HIV-1免疫印迹法却无法确定结果时，则还应进行氨基酸测试等后续测试，以区分感染类型。 根据美国国立卫生研究院（NIH），当个体具有西非血统，或曾与具有该血统的其他人性接触或共用过针头时，应考虑可区分HIV-2的诊断方式。西非被列为最高风险，因为该病毒起源于这一地区。