OS键角略大于OSH键角，因此硫氧化氢是一个不对称的分子。硫氧化氢的分子歪斜角为90.71°，略大于HS分子的90.6°，小于HO的115.5°；而硫氧键长为1.66埃，略大于过氧化氢的1.49埃、小于二硫化氢的2.055埃。另外，硫氧化氢同时具有过氧化氢的氢氧键和二硫化氢的硫氢键，但键长皆不相同，该分子的硫氢键长1.342埃，略短于二硫化氢的1.352埃；氢氧键0.96埃，略短于过氧化氢的0.97埃。
历史.在1973就有人推测硫氧化氢的结构，尚未有人合成进行实际的实验，19