而早期的有蹄类并无这种独有的特征。这样的融合可以防止有蹄类从前肢倒下。陆生有蹄类为植食性或杂食性，而鲸豚类为肉食性，甚至是掠食者。从解剖及基因的观点上一直争议着有蹄类之间的近亲关系。分子遗传学研究指有蹄类与勐兽类（包含食肉目、鳞甲目等）最亲近，而非近蹄类。一些学者基于分子及 DNA 分析将假有蹄类与非洲猬目组成了非洲兽总目。这显示牠们并不接近其他有蹄类。南美洲已灭绝的有蹄类（南蹄目）是于古新世中至晚期因南美洲的孤立而出现，早年的研究观点认为南蹄目和非洲兽总目的关系最近。然而在近年的种系发生学蛋白质组