同年6月，冯玉祥附和蒋介石清党，杜斌丞遂离开西安，先后到洛阳、武汉、南京、上海等地考察。后来他在北平闲居了两三年，其间结识了侯外庐（历史学家）、李仪祉（水利学家）等学者。
陕西省政与西安事变.1930年11月，应陕西省政府主席杨虎城的邀请，杜斌丞回到陕西，任陕西省政府高级参议。后来，他又任陕西省清乡局副局长。任内，他推荐李仪祉任陕西省建设厅厅长，兴修了渭惠渠、泾惠渠、洛惠渠等。他还营救过被逮捕的中国共产党党员刘志丹、刘澜涛、张德生，并曾资助中国工农红军陕甘游击队枪支弹药及物资。