能又与长宗我部家切断关系，重新投降西园寺公广。天正12年（1584年）10月，长宗我部元亲率兵勐攻西园寺公广的居城黑濑城，西园寺公广被迫降伏，翌天正13年（1585年）、西园寺公广透过大友宗麟向丰臣秀吉的家臣蜂须贺正胜、黑田孝高表示请降，在秀吉发起四国征伐后便降伏于登陆四国的小早川隆景军，后来也从属于新领主小早川隆景属出兵九州。天正15年（1587年）、秀吉任命家臣户田胜隆担任新的宇和领主，西园寺公广被胜隆诱入宅邸中谋杀，享年51岁。西园寺家完全灭亡。