国同盟会、统一共和党、国民共进会、国民公党、共和实进会等五团体合併改组而成。在成立大会上，决定了如下主要人事安排：国民党的人事组织有理事九人、参议三十人、候补参议十人及名誉参议七人。九位理事分别是：孙中山、黄兴、宋教仁、王宠惠、王人文、王芝祥、吴景濂、张凤翙及蒙古人贡桑诺尔布，以孙中山为理事长。由于孙当时为全国铁路督办，总部在上海，而黄兴又是当时的粤川铁路督办，故实际党务由宋教仁代理。
组织.国民党本部设于北京，下设总务部、政事部、文事部、交际部、会计部、政务研宪会等机构。