正电的质子两者数量相等，总电荷量为零。例如，中性的氯原子有17 个质子和17 个电子，而带负电的氯离子则有17 个质子和18 个电子，总电荷量为 −1。虽然两个原子同属一个元素，它们未必完全相同，因为它们可能分属中子数不同的同位素，以及能级不同的核同质异能素。例如，氯有两种稳定的同位素：有35 − 17 = 18 个中子，而则有37 − 17 = 20 个中子。
氢离子.在化学里，“质子”这术语指的是氢离子。因为氢的原子序数是 1，氢离子不带电子，它的原子核只含有一个质子（并且