幼年过世，下面有一个妹妹孙秋绮。孙家里贫穷，孙出生时，父亲已经53岁，母亲38岁，长兄孙眉与孙相差12岁。1869年10月9日，祖母黄氏去世；由于家穷，乃兄孙眉到邻乡南蓢地主程名桂家当长工。1871年9月3日，妹秋绮生；由于家计实在无法维持，孙眉赴檀香山当华工。11月12日，童年孙与姐姐妙茜上山打柴，无论从金槟榔山山顶或牦头尖山山腰，遥望珠江河口，都能看到金星门云集大批走鸦片烟土之外国商船。1872年，孙入翠亨村私塾，接受国学启蒙教育。孙说过：「革命思想之成熟固予长大后事，然革命之最初动机，则予在幼