菌毛（拉丁文pilus，复数pili）是一些细菌（包括革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌）表面的毛状物，可用于和其他同种细菌细胞接合（conjugation）。菌毛的主体由蛋白质“菌毛蛋白（pillin）”通过聚合作用（polymerisation）形成，当然其它蛋白，如菌毛与细胞膜结合处的蛋白质（anchoring proteins）和促进菌毛组合蛋白质在菌毛的结构与形成中也有重要作用。可以带给细菌接合能力的质粒一般携带有性菌毛的基因，一般不同的质粒所携带的性菌毛的基因有所不通，但有的却非常相似。在最着名