明双亲皆受过高等教育，其父亲钟有成是台湾日本统治时期的台北帝国大学医学部第二届校友，母亲李月云毕业于日本。钟正明于1978年毕业于国立台湾大学医学系，后于美国洛克斐勒大学攻读基础医学，1983年在诺贝尔生理学或医学奖得主杰拉尔德·埃德尔曼的指导下获得病理学博士学位，之后担任该校分子生物系教员。1987年，转于美国南加州大学担任教员。
研究.干细胞学、发生学、皮肤生物学。钟正明以研究鸟类的羽毛而闻名，并以鸟类羽毛的细胞研究追溯到鸟类起源自侏儸纪时代恐龙，该研究被《科学》期刊选为