黄竹坑站是一座架空车站，建于香叶道一段已覆盖的黄竹坑明渠之上。另外，车站旁边设有供南港岛线使用的港铁黄竹坑车厂，车厂用地前身为已清拆的黄竹坑邨，而车站本身原址为第十座，未来亦会发展上盖物业。深湾游艇会办公室大楼设有适用于该站的港铁特惠站，为使用成人八达通的乘客提供港币2元的车费回赠。
车站结构.
大堂.黄竹坑站大堂设于设于月台下方。如同海怡半岛及利东站，此站不设客务中心，大堂设有资讯台及三部自助客务机，乘客如遇票务疑难，须透过自助客务机之视像通话功能向站外