在2014年，南非全国各地机场的旅客超过3,500万人次。南非最繁忙机场依序为奥利弗·坦博国际机场、开普敦国际机场、沙卡国王国际机场、伊莉莎白港机场及东伦敦机场。南非航空是南非的国营航空公司，提供往返约翰内斯堡与开普敦的航班。而其他的主要国际航空公司如英国航空、荷兰皇家航空、汉莎航空／瑞士航空、西班牙航空以及法国航空亦有提供每日往返该两个国际机场的航班。此外，有几家航空公司如南非连接航空、康姆航空、库鲁拉航空、芒果航空、纳米比亚航空、萨法航空以及南非快运航空则提供往返南非国内或飞往邻国的航班。至于南非较小的