遣日野辉资跟高仓藤永相、伊势贞兴和三渊藤英留守二条城，义昭本人则转往建在宇治川和巨椋池水域交汇处的槇岛城，倚天险为防。信长则在7月5日待大船竣工，在7月7日前往坂本，随后迅速率军由琵琶湖水路直接进入京都，足利义昭在得知信长出兵的消息后，足利义昭也让家臣一色藤长、真木岛昭光写信向一向宗法主本愿寺显如求援，希望一向一揆跟三好义继、三好康长一同抵抗信长。织田军在7月10日便直逼二条城，使二条城的足利军完全不及防备，织田家臣柴田胜家入城劝告三渊藤英，三渊藤英遂在12日开城投降，日野辉资跟高仓藤永相亦随之不战而降