十六年（1900年）改建为砖木结构，共有三进，前两进为五开间，第三进为小三开间，两边二进为两层楼，中间正殿设须弥座供奉佛像。抗日战争中原寺被毁，1953年修缮。1966年公布为桂林市文物保护单位。后因白蚁成灾，于1979年重建，为钢筋水泥仿古建筑，作为太平天国遗迹加以保护，总面积为1852.6平方米。现为云峰寺陈列馆，有“太平天国革命在桂林”史迹陈列，该寺现在是象山景区的一部分。