后醍醐天皇逃往比叡山抵抗。足利尊氏建议达成和解，后醍醐天皇将三神器交出。尊氏让光严上皇开设院政，并由持明院统的光明天皇即位，制定建武式目，开设室町幕府。后醍醐天皇从幽禁地花山院中逃出，声称交给足利尊氏的三神器是赝品，自己本人逃到了大和国的吉野（今奈良县吉野郡吉野町），开设南朝朝廷，从此开始了日本的南北朝时代。后醍醐天皇让新田义贞奉尊良亲王和恒良亲王前往北陆；怀良亲王为征西将军，前往九州；宗良亲王前往东国；义良亲王前往陆奥。向各地送出皇子镇守，与北朝和室町幕府对抗。延元四年/历应二年（1339年）八月