农业现代化综合科学实验基地列为国家的重点项目之一。同年，中国科学院与湖南省、河北省和黑龙江省合作，分别在桃源县、栾城县和海伦县筹建三个农业现代化研究所。1978年4月，桃源县召开农业现代化综合科学实验基地县建设会议。1978年6月19日，经党中央和囯务院批准，中国科学院桃源农业现代化研究所正式成立。所址选择在湖南省桃源县城关镇渔父路。土壤学家李庆逵担任首任所长。研究所的任务是以桃源县为基地，探索中国南方地区农业现代化过程中的科学技术研究、中间试验、新技术应用和农业经济问题。1979年6月，研究所启动搬迁