垩纪。茎类的珊瑚藻相信是源自埃迪卡拉纪的陡山沱组。珊瑚藻相信是在管孔藻科内进行演化的。
历史.第一个活生生的珊瑚藻应该于1世纪发现的，且是属于珊瑚藻属的。于1837年，Rodolfo Amando Philippi认为珊瑚藻并非动物，并称石叶藻属及石枝藻属为"Lithothamnium"。多年来它们都被包含在隐丝藻目中，直至1986年才被提升为珊瑚藻目。
群落生态.大部份珊瑚藻都会产生适合某些草食性无嵴椎动物幼体（如鲍鱼）附着的化学物质。幼体可以清除妨碍珊