分类.虽然灵龙化石是这么完整，但仍然被分类在鸟臀目的不同地方。牠原先被分类在法布尔龙科，但很多古生物学家都认为它不是有效的科。几个近期的研究，包括亲缘分支分类法分析，发现灵龙是真鸟脚类中最为原始的物种。真鸟脚类包含了所有比畸齿龙科更衍化的鸟脚下目动物。另外，畸齿龙科并非一般地被认为是鸟脚亚目，而是更为接近包含角龙亚目及肿头龙亚目的头饰龙类。在一个近期的亲缘分支分类法分析中，灵龙被发现是在一个头饰龙类的演化支里，比畸齿龙类还原始的位置。灵龙亦被认为是其他的分类，包括鸟臀目