规模排序依次为：国立台湾大学、国立成功大学、国立清华大学、国立交通大学、国立中央大学、国立中山大学、国立阳明大学、国立中兴大学、长庚大学、国立政治大学、国立台湾科技大学、国立台湾师范大学。。另外5所大学包括5个研究中心获得特别补助：国立台湾海洋大学、国立中正大学、中国医药大学、台北医学大学、元智大学。除本计画外，教育部对技职体系之大专院校，设有「发展典范科技大学计画」；与奖助提升教学品质的「奖励大学教学卓越计画」。
各校每年补助金额与重点发展领域.
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