海道本线沿线车站之一。醒井在过去曾设有绿窗口，但目前已予以废除而降级成一个简易委託车站。醒井车站的周边在过去是中山道六十九次排名第61次的醒井宿之所在地，因此迄今为止还残留了一些宿场町特有的老街风情。
车站结构.地面车站。侧式月台1面1线与岛式月台1面2线，但侧式月台被封锁（所以事实上为1面2线）。
使用情况.根据「滋贺县统计书」，1日平均上车人次如下表。