09年基隆市长.2008年11月19日获得民主进步党征召提名，参选2009年基隆市长选举。林右昌在担任幕僚期间争取参加2009年基隆市长选举。民进党中央同意征召他参选，以「改变基隆」为竞选口号，拿下65,673票，得票率42.08%，为民进党自1997年以后在基隆得票率的最高点。由于林义雄与游钖堃在民进党内的政治势力逐渐转弱，林右昌转而跟随时任党主席蔡英文。在基隆市长落选后出任中央党部民主学院主任，负责民进党干部之组训工作，并兼任民进党中央党部发言人。除了在中央的工作之外，林右昌仍积极布局基隆选举