本土沦陷后。日本驻巴达维亚领事在向荷印经济局长Van Mook表示哀弔外，更进一步向荷印当局提出「勒索」资源的要求，即石油、橡胶、钖、废铁等十三项输出日本的最低数量。太平洋战争爆发期间，亦有台籍日本兵随军进入荷属印尼。第二次世界大战太平洋战争时期，大日本帝国为迅速取得南洋地区的统治权，因而加速对东南亚的攻击，为此日本在台湾开始征招军人、军伕以及高砂义勇队。这些被征召来的台湾兵被分发到东南亚各地，其中也包括印尼的爪哇、苏门答腊、婆罗洲、新几内亚、帝汶岛等处。1974年，印尼摩鹿加群岛摩罗泰岛居民通报当地警方