哥哥拓跋郁商议要杀死乙浑，事情泄露后拓跋郁被乙浑诛杀，拓跋目辰逃跑隐藏得以免死。天安元年（466年），刘宋发生内乱，魏献文帝拓跋弘派遣使持节征东大将军安定王拓跋休、侍中尚书左仆射安西大将军拓跋目辰和散骑常侍殿中尚书平北将军山阳公吕罗汉率领陇右五万人马沿着汉江向东征讨刘宋，直指襄阳，与其他各路军队定于同时汇合于秣陵。皇兴四年（470年），柔然受罗部真可汗予成入侵北魏边境，魏献文帝接见群臣商议对策，拓跋目辰进言说：“如果皇帝御亲自出征，恐怕京城会危险恐惧，不如行事慎重，固守保全自己。贼人孤军深入，没有后续运送的