掳后也在寺中囚禁过一段时间。元末明初寺院毁于战火，明正统二年（1437年）重建后更名为崇福寺。清朝雍正十二年（1734年）进行了大修，钦定为专司戒事的皇家律宗寺院，并赐名为法源寺。此后的干隆四十三年（1778年）至四十五年（1780年）又有过较大修整，干隆帝在大修完工后亲临法源寺，赠送了“法海真源”牌匾。中华民国时期，法源寺是北京城最大的停灵寺院之一。中华人民共和国成立后进行了多次修葺，1956年更将中国佛学院设在这里。文化大革命时，寺院遭到严重破坏，建筑、碑刻、佛像、藏经等大量被毁，直到1978年才恢