于拥立福王有所顾忌。因为此前明神宗曾经想要废太子，改立朱常洵（福忠王，朱由崧的父亲），遭到东林党人的反对而作罢，是为国本之争，故东林党、复社人士害怕福王一旦登基，自己恐怕难逃排挤与报复，于是亦有许多人支持拥立潞王称帝。南京朝廷的首席重臣史可法的恩师左光斗为东林党人，史可法本身的政治理念也较偏向东林、复社人士，但是考虑到诸位藩王王地位的亲疏，仍以立福王最具正当性，于是史可法为此积极奔走、试图找寻折衷的办法。在史可法仍在联络各方人士的过程中，马士英与高杰、黄得功、刘良佐、刘泽清等人则抢先一步推举福王担任监国