令市」或「指定都市」。其基本条件为全市人口须超过50万以上，获指定者能拥有较其他市更多的地方自治权力，是日本各城市自治制度中权力下放最多的。目前共有20市。
沿革.政令指定都市不仅能设立（派出机关，不具自治权限，相当于中华民国的区、中华人民共和国的街道），还拥有比一般城市更多的自治权限，包括民政、都市计划、文教、农业等公共行政事务。其地位类似于中国大陆的副省级市，以及台湾的准直辖市。最初在1947年，日本政府规划将大城市改为独立于府县之外的特别市（相当于中文所称的直辖市），但遭