统帝令人剖腹杀其子；又砍去三名皇叔的脚投于宫市示众，使得人心惶惶。皇太后阮氏玉素自高平回京，见其作为，愤而拒不入宫。后经阮辉宿的劝解，方才入宫居住。
再次失国，流亡清朝.孙士毅自从攻佔昇龙之后，日夜饮酒作乐，不以为备。与此同时，阮惠率西山军北上，在乂安进行充分休整之后，在除夕和春节期间对清军发动总攻。清军毫无防备，大败，孙士毅率残部逃回清朝境内。黎昭统帝也令人接皇太后阮氏玉素和自己的元子黎维诠，从镇南关逃入清朝境内，被安置在南宁。后黎朝遗臣黎维、丁迓衡、丁令胤等人也陆陆续续逃到南