在遇到暴雨或地震时容易崩塌。在过去的120万年内，圣华金山的抬升成为了流经圣安娜山脉的溪流的一道屏障，阻挡了溪流的流动。冰川时期的气候变化使南加州的气候变得更为湿润。最近一次的变化发生在威斯康辛冰期（70,000至10,000年前），当时该地区属于温带雨林，年降雨量超过2,000毫米（80英寸）。圣胡安溪的水流量增加，有助溪流保持其原有的河道，而不是转往流向东方或西方。
水文与地下水.美国地质调查局分别在1928年至1969年及1969年至1985年这两段时期内，测量了流经圣胡