逮捕胡鼎下诏狱。锦衣卫都指挥门达称程信不当代奏。当时恰逢寇深掌管都察院，于是弹劾程信，下诏狱，降南京太仆少卿。天顺五年，召为刑部右侍郎，母忧归。成化元年（1465年），启为兵部左侍郎。四川发生民变，朝廷以襄城伯李瑾充总兵官，太监刘恒为监督，进程信为兵部尚书，随后调度有功获胜。随即兼任大理寺卿，与白圭共同掌管兵部。因言官相继弹劾，其四次上疏请求辞职，不予批准。成化六年，改南京兵部尚书，参赞机务。次年致仕，又过一年去世，赠太子少保，谥襄毅。
着作.有《中兴固本十策》、《修德疏》、《