从现代角度来看，更仔细地说明，质子是由三个价夸克（两个上夸克，一个下夸克）、胶子与短暂存在的海夸克对组成。质子的正电荷呈指数递减分佈，离质心越远，密度越低，方均根半径约为0.8飞米。在原子核里的质子与中子都被称为核子，它们被核力綑绑在原子核内部。氢元素的原子核只有一个质子；在它的所有同位素之中，最常见的是氢-1，符号为H或「H」，它的原子核不含有任何中子，是个孤寂的质子。另外还有两种较重的天然同位素，重氢H或D与超重氢H或T，它们的原子核分别拥有一个与两个中子。所有其它种元素的原子核都是由至少两个质