去曾运行由开往希腊塞萨洛尼基的国际列车，在2010年希腊经济危机之后，希腊国家铁路因经营上的理由暂停运行这班列车。
巴士.斯科普里中央巴士枢纽位于中央车站附近，自这里有众多开往北马其顿国内主要城市及塞尔维亚贝尔格莱德和科索沃普里什蒂纳、保加利亚索菲亚及土耳其伊斯坦布尔等巴尔干半岛各国主要都市的国际巴士发车。市内巴士则覆盖斯科普里市区全境，并延伸至郊外。2011年，较旧的84辆巴士被在乌克兰制造的新车代替。之后马其顿政府购买了220辆双层巴士，并投入斯科普里公共交通运营。2011年，