国军编遣委员会委员。1931年（民国20年），任军事参议院上将参议、中国农工银行常务董事（理事）、江南铁路公司监察人等职务。抗日战争爆发后，方本仁下野，直到日本投降。他占有大量土地，在武汉同人合办长江饭店，并拥有两艘船搞运输。1953年，方本仁在天津逝世。享年74岁。