战冲突导致时局再陷动盪，包括国立北平故宫博物院在内的6个机构于是在1948年11月10日决定迁往台湾，几经改组易名，最终由国立北平故宫博物院和国立中央博物院筹备处合併为国立故宫博物院，1965年11月12日在台北现址复院开幕。此后，博物馆致力打造成为文化创意产业加值应用的虚拟博物馆，馆舍也历经多次整修扩建，位在嘉义的南部院区业于2015年12月28日启用营运。国立故宫博物院典藏为数近70万件册的艺术品和文物，大部分是原先国立北平故宫博物院、国立中央博物院筹备处和国立北平图书馆等机构所藏来自紫禁城、盛京行