民族的势力影响，阿克苏姆王朝退出了阿拉伯半岛。并失去了贸易带来的优势。也因此和其他基督教世界降低了往来。十二世纪阿克苏姆王朝被阿高人（Agaw）取代建立了扎格维王朝。在这段期间拉利贝拉国王（Gebre Meskel - Lalibela）建造了十一座花岗岩教堂，这些教堂是直接从花岗岩脉上往下雕刻而成的。 而在之后则是由所罗门王朝取代，建立所罗门王朝的施瓦王国皇室自认是示巴女王与所罗门王的后代。今日的衣索比亚正教会依然传承着圣柜被保存在阿克苏姆的钖安的圣玛利亚教堂的说法，并由一位僧侣担任守卫且世代相传