即前往救灾中心听取简报。日本所派遣的搜救队是抵台之国际援助队中人数最多的一支，也是日本史上援助海外的队伍中规模最大的一次。日本外务省表示，日本派往台湾的包括协助抢救、警戒、消防和海上保安厅与救济团体的人员。集集大地震发生4小时之后，日本负责单位即向警察厅、消防厅和海上保安厅要求派遣援助人员，9月21日中午已在东京羽田机场待命，并于当天下午和晚上抵达。。时任首相小渊惠三并代表日本人民对灾民表达慰问。穿着橘色制服的日本救难队抵台后，带着穿着鞋的警犬与高科技装备，在南投县中寮乡等地逐屋搜寻生还者。在地震发生当