862年到1865年间，他在伊达尔-奥伯施泰因的一所寄宿学校读书，爱好收集自然标本。1873年，韦伯进入波恩大学，参加了弗朗茨·赖迪的自然历史课程。他对解剖学产生了兴趣，并成为了赖迪的助手。1875至1876年间，他在柏林洪堡大学跟从动物学家爱德华·冯·马滕斯学习。1877年，他回到波恩，以一篇研究蜥蜴眼部神经肌肉组织的论文获得了博士学位。1878年1月，在体检合格后，他服了一年兵役。1879年，他开始担任乌特勒支大学解剖学讲师，并在1881年参与了巴伦支海的探险活动。1883年，他成为了阿姆斯特丹