南边及北边，刚果河中总有一部份区域的气候是在雨季，因为刚果河的流量相对而言算是稳定。
源头和上游.刚果河的源头位于赞比亚境内东非大裂谷的高地山区，源头称谦比西河，经过姆韦鲁湖后称卢阿普拉河，向北与发源于坦噶尼喀湖及姆韦鲁湖的卢阿拉巴河汇合后，过了基桑加尼附近的斯坦利瀑布后称为刚果河，上游河段全长约2200公里，后折向西流，进入中游河段。
中游和湖泊.进入中游后，刚果河逐渐改向西南，接纳多条支流，最后与乌班吉河合并，进入斯坦利湖。中游河段主要位于刚果盆地中部