变。一些包含在UTRs的功能性序列，常能形成一些有特性的二级结构，这些造成二级结构也牵扯到调节mRNA本身。某些序列，。。另外，。换句话说，mRNA分子可以进行自我调控。
反义RNA（anti-sense RNA）.在许多真核生物中，当反义RNA上的硷基与基因的某段mRNA互补时，反义RNA可以抑制转译。反义RNA存在于细胞中之时，其互补的基因就不会合成蛋白质。这也许是一种对抗反转录转座子或病毒复制的一种机制（retrotransposons是以双股RNA作中介状态的转座子），