时代时，岛尻为三山之一的南山王国的领地。1896年施行郡制，设立岛尻郡。然而，岛尻郡还包含了不被岛尻包含在内的南部离岛。1972年，原属于国头的伊平屋村和伊是名村被交给岛尻郡管理。那霸区（今那霸市）当初自岛尻郡分离出来，此后数市又脱离岛尻郡。中头的西原町的一部份现在属于那霸市。