过小孔的分子数和气体压力成正比，和分子质量成反比，因此若气体是由不同分子量的气体混合而成，可以用此方式进行部份分离。像铀的同位素就是利用多孔薄膜以此方式分离。此方式也成功的应用在上，先利用太阳能或是其他能量来源将水加热，再将产生的气体混合物以此方式分离出氢气。