1年，机场快线及东涌线各一列列车在调车机车牵引下，前往九龙湾车厂担当「第一代载客列车退役仪式」的典礼用车。在运送期间，由于市区线隧道限界太窄，导致包在车上的发泡胶出现磨损。因此，机铁列车在是次典礼完结并送回机铁以后，不曾再驶入市区线区段。2008年，港铁斥资港币2700万元翻新机场快线11列列车车厢内部，其中包括把丝绒座位更换成皮制座位，将椅背小型电视拆除，改在每列客卡加装四个23吋大液晶体电视，并于椅背上装上独立喇叭及设有音量掣（唯列车80%座位会辟作静音区（即E卡及其他客卡除中间部分的两成座位外均为