rachytherus mendocensis"，可以追溯至始新世晚期或渐新世早期，但却有质疑所属的地层应属于中新世早期。已确定最早的化石纪录属于渐新世晚期的"Anatrachytherus"及粗型兽属。中黑格兽科于中新世达至多样化的顶峰，并一直生存至更新世中期。中黑格兽科是南方有蹄目中三个生存至第四纪的科之一。
分类.中黑格兽科在南方有蹄目内被分类在型兽亚目之下。事实上，型兽亚目是为印齿兽（即中黑格兽属的异名）来命名的。除了中黑格兽科外，型兽亚目传统上包含了其他细小的南方有蹄目。