宫事务大臣出缺，由理藩院尚书、左右侍郎联衔开列清单，请旨简派。领雍和宫事务大臣之下设有“总理雍和宫东书院后佛楼事务大臣”（简称“总理雍和宫大臣”），人数不定，通常从王公或者一、二品文武官员中选派。蒙藏院兼领雍和宫事务员<br>1914年，北洋政府蒙藏院出台《管理雍和宫办事细则》。1917年8月，蒙藏院又出台《管理雍和宫办事规则》，规定雍和宫行政管理由蒙藏院兼领雍和宫事务员会同雍和宫的得木齐管理，“蒙藏院兼领雍和宫事务员秉承蒙藏院长官管理该庙全体事务，但是应该由该庙例应呈报喇嘛印务处事件仍由该管庙喇嘛照