军侵略的第9天，郭再祐集合了自己的一族和同村村民，协助朝鲜的官军防卫宜宁郡。这是万历朝鲜战争期间朝鲜民间组织的第一支义兵。他以游击战为战术，攻击日本的输送船等，取得多次成功。尤其是他曾使用影武者的战术击退了日军安国寺惠琼部，此战后他声名大噪。在第一次晋州城之战之中，郭再祐使用伏兵之计，击退了日军的包围。由于当时他身穿红色绯缎所织成的军服，故被日军称作「天降红衣将军」。战后，他多次拒绝接受朝鲜朝廷册封的官职。1613年，七庶狱事发生；次年，光海君欲杀死永昌大君，郭再祐上书为永昌大君求情，希望免其一死。