刘国梁、孔令辉、王励勤及马琳等人先后崛起，秦志戬常担任主力队员的陪练，同时亦常以双打队员的身份参加国际赛事，并曾多次夺得世乒赛双打比赛的奖牌。2001年，秦志戬与杨影合作，夺得世乒赛混合双打冠军。2005年，秦志戬与陈玘、单明杰等人组成的江苏队，于十运会乒乓球男团决赛中击败王皓领衔的八一队，首次问鼎该项赛事的冠军。其后，秦志戬正式退役，并进入中国国家队教练组，担任马龙、王励勤和许昕等主力队员的主管教练员。2017年4月，接替刘国梁担任中国国家乒乓球队男队主教练。6月，与国家队其他运动员、教练声援刘国