荷兰人前往支援。麻豆人眼见荷兰人与新港社拉近关系，决定彻底逐出荷兰人，便于1629年策动麻豆溪事件，击杀63位荷军士兵。事件爆发后，目加熘湾社、萧壠社也开始攻击荷兰人，然而目加熘湾社随后被荷军击溃，麻豆社只得与荷兰人暂时停战。不过麻豆社实力依在，遂率军至魍港攻击受荷兰统治的汉人，甚至鼓动部份新港人举办被荷兰宣教士禁止的传统祭典，挑战荷兰人权威。只是麻豆社却与萧壠社爆发冲突，萧壠社转而与新港社结盟，局势逐渐对麻豆社不利。后来麻豆社与萧壠社和解，并再次结盟对抗荷兰人，然而荷兰人借着巴达维亚的援军，终究压制了麻豆