政部立案，依法成立的公益性社团法人，属于非营利性质、全国性的社会团体。在此，台湾维基媒体协会将中华民国全国行政区域作为组织区域，其目的事业也受到事业主管机关的指导与监督。台湾维基媒体协会的最高权力机构为会员大会，并且分别设置有理事会（共9名理事）与监事会（共3名监事）。其中，会员大会的职权包括：订定与变更章程；选举及罢免理事、监事；议决入会费、常年会费、事业费、会员捐款面额及方式；议决年度工作计画、报告、预算及决算；议决会员代表除名处分；议决财产处分；议决解散协会；议决与会员权利义务有关的其他重大事项。