东将军移镇建业，引纪瞻为军谘祭酒。永嘉五年（311年）司马睿进镇东大将军，纪瞻又转镇东长史。当时晋司马睿曾亲临纪瞻宅，又与他同车归去，很见亲待倚重。同年司马睿先后消灭扬州都督周馥及江州刺史华轶，纪瞻获追论两次战役之功而封都乡侯。永嘉六年（312年），石勒意图进攻建业，司马睿于寿春集结江东兵众，加纪瞻扬威将军、都督京口以南至芜湖诸军事，以抵御石勒南侵。石勒于当年退兵后，出任会稽内史，任内有人假作大将军符节收捕诸暨县令，纪瞻发觉其中有诈时县令已被捕，于是将其救出，并追问使者，果然查明是诈骗事件。建兴三年