宣帝所建的河东寺，系为其兄河东王萧誉所建。苏良嗣不知道该寺得名于河东王，惊道：“这座寺在江、汉之间，与河东何干？”于是上奏，导致河东寺被改名，当地士大夫抱怨苏良嗣学问不精。
唐睿宗年间.683年，唐高宗驾崩，太子李显（此时已改名李哲）继位为唐中宗，实权由摄政的武太后掌握。684年，中宗表现出独立执政的迹象，被太后所废，太后改立中宗之弟豫王李旦为唐睿宗，更加把持朝政。苏良嗣迁工部尚书，垂拱元年（685年）五月代王德真守纳言，实际相当于宰相。太后定居洛阳后，命苏良嗣为西京长安留守，累封