楼迁出至金陵大学鼓楼校址。金陵大学教育系、农学院、农学院林学系、理学院电机系、化工系等系科和原南京大学等大学相关院系组建了南京师范学院（南京师范大学）、南京农学院（南京农业大学）、南京林学院（南京林业大学）、南京工学院（电机系在今东南大学，化工系在今南京工业大学）等校。电影与广播专修科迁至北京组建电影学校（今北京电影学院）。另有部分院系调至其他有关大学。在香港，上海圣约翰大学董事会主席以及岭南大学的李应林将包括金陵大学在内的13所大陆地区国民政府迁台前存在的着名基督教大学，以另组崇基学院的形式承继下去，