处于美国境内。尼尔逊河发源自温尼伯湖，经过644公里（400英里）进入哈德逊湾，途经Playgreen Lake、Cross Lake、Sipiwesk Lake、Split Lake和Stephens Lake。由于尼尔逊河流经温尼伯湖，因此是萨斯喀彻温河（Saskatchewan River）、红河和温尼伯河的一部分，河口流量2,066平方公尺每秒。尼尔逊河的主要支流除了温尼伯湖外，还有Grass River和Burntwood River。