农民大量毒杀，同时被家畜散播的狂犬病和犬瘟热病毒传染，北海道狼于 1889 年灭绝，后由日本学者岸田久吉（英文：Kyukichi Kishida）在 1931 年将其命名为独立的狼亚种。北海道狼是生活在日本的两个狼亚种之一，另一个亚种为本州狼，分佈于本州、四国和九州。在日本，狼曾被人们当做守护神崇拜，有供奉狼的祠庙和不少关于狼的民间传说。随着日本逐渐步入现代化，狼不再被尊崇，而是由开拓使悬赏猎杀。继北海道狼灭绝后，本州狼也在 1905 年灭绝。尽管这两个狼亚种的分佈区域相邻，但在形态上，本州狼是最小的狼