指EVA的一个器官。在TV版第17话中，一个由人类设计的有缺陷的S²机关被安装在四号机上。当S²机关被开启时，它的防护壳分解，半径89km内的全部设施被摧毁，导致NERV第二支部消失。量产机全部都安装了S²机关。
黑之月.莉莉斯之卵，是人类灵魂的诞生地。埋于箱根的地下，被冬月耕造形容为“原本很美丽的地下球形空间”，其89%被泥土覆盖或被NERV作为基地。莉莉丝在黑之月底部。
白之月.白之月是所有使徒诞生的卵，位于南极。第二次冲击即引发于此。Sect