有一口用石条凿成的大水缸。当地传说该水缸是抵御入侵者时，卓玛拉康僧众专用来贮水。至于入侵者，当地人有的说是突厥人，有的说是蒙古准噶尔人，也有的说是廓尔喀人。传说中入侵者的不同，反映出吉隆在不同时期都是藏地的边关重镇。吉隆位于中国同尼泊尔的边境线上，历史上吐蕃王国、阿里古格王国与外界交流事，均曾利用该通道。中庭位于门庭以北，平面呈长方形，有檐柱14根，面积140平方米，中央是一个露天小庭院，长6米，宽4米，庭院两侧各有配殿，内有宁玛派护法神像等壁画残迹，从黑红相间的颜色中可大致辨认出莲花生、释迦牟尼、度母