于光学，1672年牛顿在皇家学会阐述自己的观点，认为白光经过棱镜产生色散，分成七色光，他将其解释为不同颜色微粒的混合与分开，遭到主张光波动说的胡克的尖锐批评。牛顿大怒，称胡克完全没有理解自己这一划时代发现的意义，并威胁要离开皇家学会。这使得主张光微粒说的牛顿一直将已完成的着作《光学》延迟到胡克过世后才出版。光学出版后，奠定了光微粒说的统治地位，直到一百多年以后的菲涅耳才重新发现胡克的光波动说。1674年－1679年间两人曾通信讨论物体的圆周运动问题，胡克给牛顿写信，说明了他从1660年以后就有的平方反比