至9月3日在哈密尔顿停留；事实证明这是一次不受欢迎的到访，因为时值苏台德危机期间，国际舆论已明显转向反对纳粹德国。为此，原定对古巴哈瓦那的访问计划被取消，埃姆登号被召回德国。在返回威廉港的途中，它于9月10日至15日在丰沙尔经停，然而在他抵达之前，《慕尼黑协定》的签署解除了危机，国际紧张局势的缓和使埃姆登号得以继续开展训练巡航。舰只遂转向南行进入地中海，随后又进入黑海。它于10月19日至23日期间在伊斯坦布尔参加了首任土耳其总统穆斯塔法·凯末尔·阿塔图尔克的葬礼。之后，埃姆登号经由罗得岛和维戈返回德国，于1