，由原国安会秘书长吴钊燮正式接任。
两国论相关论述.林碧炤在「两国论」公布后曾表示「一个中国、各自表述」及国统纲领与「特殊国与国关系」有连贯性，而且是动态的「操作性概念」，以提供两岸发展一个弹性的空间。2000年3月初中华民国总统大选期间，林碧炤表示「特殊国与国关系」和「一个中国、各自表述」并不冲突；「特殊国与国关系」是对两岸现状的描述，是将来两岸谈判的基本立场对于「一个中国、各自表述」，林碧炤解释这当中含有一个动态意涵，并提供一个「操作性概念」，也就是海崃两岸目前是一个中华民