05年，立法委员侯水盛等37人提起「后天免疫缺乏症候群防治条例第六条之一及第十七条条文修正草案」，以防治法不是保护法，防止无辜遭受感染为由，要求删除保障就学等权利以及不得录音等之项目。引起爱滋感染者权益促进会、台湾性别人权协会、台湾同志谘询热线、日日春关怀互助协会、妇女新知基金会、台湾国际劳工协会等团体之反对。
第7条(治疗费用).2005年2月，该法第7条作了修正，因此2006年1月1日起，爱滋病不再算是全民健康保险重大伤病范围，检验与治疗费用另由中央编列预算。2015年该法第1