蒋经国说明原委，李友邦才被释放，返台在基隆港码头受到热烈欢迎。李友邦回台湾之后，担任中国国民党台湾省党部副主任委员兼中国国民党改造委员会委员。民国四十一年（1952年），台湾省保安司令部根据「省工委匪谍案」逮捕朱谌之（化名「朱枫」）。由于朱谌之从吴石及蔡孝干等处取得重要机密文件及胶卷后并未直接离台，又拜访了几位朋友，其中及包含严秀峰，而牵扯出张志忠及季澐；另，李友邦在三青团中任职的潘华系共产党员（按其于二二八事件之前即离台，应无涉及省工委案），使其被国民党政府以「包庇窝藏中共间谍」、「早已加入中共组织」等罪