45期之后于1927年4月2日停刊。除“甲寅派”的首领章士钊之外，后期“甲寅派”的主要成员还有梁家义、瞿宣颖、唐庆增、汪吟龙、陈筅枢、杨定襄、陈拔、董时进、龚张斧等人。汪吟龙在《甲寅》周刊发表了《白话与科举》、《文中子考信》等文章。1930年5月，中原大战爆发，阎锡山控制华北，南京国民政府任命的国立清华大学校长罗家伦遭阎锡山势力驱逐。1930年5月22日，罗家伦辞职离开清华大学。一个月后，阎锡山派乔万选接管清华大学，受到清华大学师生抵制。乔万选不甘失败，无视清华大学在冯友兰为首的校务会议领导下的正常运作