文学开始受各大文学奖青睐，包括凌烟的《失声画眉》、曹丽娟的《童女之舞》、林裕翼的《白雪公主》等。不过对台湾同志文学最具有重大意义的，还是要属1994年朱天文的《荒人手记》以及邱妙津的《鳄鱼手记》。之后出现了强调性别身分认同解放的「酷儿文学」，相关作家以纪大伟、洪凌和陈雪等人较为知名。另外吴继文、蒋勋、陈克华等作家亦有同志文学方面的创作。至二十一世纪以后，同志文学热潮已逐渐降温，较知名者为舞鹤的《鬼儿与阿妖》、骆以军的《遣悲怀》等等。