可能涉及口腔健康法弊案。最后，司法机关因口腔健康法立法案并没有积极推动立法，也无期约对价事证、或能证明属政治献金，认定无贪渎行为，赖清德获签结不起诉。
台南市长.
第一任市长时期.2009年1月21日，民主进步党第13届第五次中执会正式通过由赖代表参选2009年台南市长选举。俄而逢大台南市县合併，改制为直辖市一案通过，于民主进步党「台南市长党内民意调查」顺利出线，确定代表该党出征2010年改制后大台南市长选举，赖清德旋即宣布投入第一届台南直辖市长党内初选。