09年担忧中国大陆会以其影响力限缩台湾的国际空间，且认为马的谈判不够透明。2013年服贸便在不透明不公开下签署，随后激起太阳花学运以致其被搁置至今。之后尽管台湾和中国大陆社会差异尚存，海崃两岸的政治、经济等关系仍朝和平方向发展，双方开始进行多次两岸两会高层会谈，并就定期航线等议题达成共识，但相关议题仍是中华民国与中华人民共和国政府的敏感话题。对此马英九曾提出「非国与国特殊关系」，主张主权问题无法立即解决，但中国国民党和中国共产党同意借由九二共识作为临时办法，之后他更进一步提出「一国两区」论点。不过蔡英文