樊正康成为已停办的沪江大学的校长。1月21日，沪大同学会（校友会）召开常务委员会议，议决另办“沪江补习学院”，并成立院务委员会，推朱博泉任主席。1月23日，“沪江补习学院”院务委员会召开第一次会议，讨论院长人选。由于樊正康拒绝出任院长，委员会决定让主席朱博泉兼任院长，并推郑章成任院务主任，负责学校的日常事务。不久，“沪江补习学院”改称“沪江书院”，实际成了沪江大学在上海的延续。1942年4月，沪江大学校董会开会讨论了沪江大学内迁的问题，但未达成一致意见。樊正康也不同意内迁，并拒绝了校董会希望他赴内地调查