其中立性颇受质疑。其于2005年8月对有线电视、卫星电视频道进行审核执照。最后有七个频道未通过审核，后龙祥电影台、东森新闻S台提起诉愿，行政院诉愿委员会皆裁定新闻局败诉，龙祥育乐多媒体与东森电视皆声称要提起国家赔偿，金额达新台币十几亿元。前新闻局长姚文智对此表示，当初不同意换照，是新闻局频道审议委员会合议的决定，并非他个人看法。
委员名单.1.交通部电信总局副局长吴嘉辉2.行政院新闻局广播电视事业处副处长曾一弘3.行政院消费者保护委员会督导组组长刘清芳4.国立台湾科