8年5月在西北联大地下党组织由杨剑秋介绍加入中国共产党。1938年10月，国民革命军第一军随军服务团解散，杨剑秋向申健传达组织决定，派去胡宗南的战时干部第四训练团受训，打入其内部工作。受训毕业后在第十战区长官部政治部工作，后任宝鸡工合事务所主任。潜伏于胡宗南属下。胡宗南有兴趣于组织训练青年的时候，就主动请缨，1941年10月，西京市三青团分团部筹备处改称西京市三青团分团部，申振民任书记。分团部内设组训、宣传、总务等股。至此已有团员两三千人。还以三青团书记的身份加入“军统”、“中统”、三青团特别联席会议成员。