4年12月28日，十二届全国人大常委会第十二次会议表决通过罢免代表案。2014年9月21日，因涉嫌严重违纪违法，被免去河南省人大常委会党组书记职务，采取双规措施，并立案审查。他是中共十八大后首个被查的河南省部级官员。媒体称秦玉海的落马标志着发轫于“皇家一号”夜总会案的河南省公安系统集体贪腐案件进入更深阶段。2015年2月13日，因涉嫌占用公物、挥霍浪费公共财产；滥用职权、受贿、通奸，被开除党籍、公职；移送司法机关。2016年11月28日，山东省淄博市中级人民法院公开宣判，对秦玉海以受贿罪判处有期徒刑