，而蔡仲南未在世界盃与日本对战也减少了日本职棒球队争取的积极度。在出国打球的理想未能实现的情形下，蔡仲南「退而求其次」选择参加中华职棒季初选秀，在第一轮便被第一顺位的兴农牛挑选，成为「选秀状元」，但却也犹豫了一段时间才与兴农牛队洽谈加盟事宜，最后以新台币600万，月薪14万元加盟，成为当时中华职棒最高签约金的球员。
新人王与王牌投手.2002年3月8日，蔡仲南生涯初登板先发面中信鲸，便以134球完投九局失三分，获得生涯首胜，至四月中旬为止创下开季六连胜纪录，以新人之姿获得3月份