轨道东侧，月台与轨道西侧出入口以跨线天桥联络。无人站（简易委託站），乘车券在站前商店发售。月台外观有着玉石积盛土式的特徴，是鬼怒川线近代化留存至今的构造物，因此获国家指定「东武铁道小佐越站月台」为登录有形文化财（建筑物）。站房在1993年配合东武世界广场开园进行改建。本站当时为该园的最近车站，在东武世界广场营业时段有开设窗口处理票务相关服务。但在2017年7月22日开设东武世界广场站后，不再派驻站员至本站。
使用情况.2019年度1日平均上下车人次为215人。近年1日平