类似，但由于含量不受限制且普遍存在，因此不归类为辅因子。辅因子可以被分类为或称为"辅酶"的复合有机分子，后者主要衍生自少量的维生素和其他有机必需营养素。一个不含辅因子的酶称为脱辅基酶（apoenzyme），脱辅基酶加上辅因子并产生完整作用时，称为全酶（holoenzyme）：金属离子是常见的辅因子，这些金属离子反映在生物必须的微量元素名单当中。例如钙、镁、锰、铁、钴、镍、铜、锌与钼等。除了这些无机化学物之外，辅因子也包括一些有机物质，例如血红蛋白中与铁结合的血红素。另外有些维生素也可作为辅因子，