受中共中央委派赴关中，任中共关中特委书记、关中游击队政委、关中特区司令部政委。
抗日战争.1937年10月，习仲勋任中共关中分委书记、兼分区保安司令部政委。1939年5月，习仲勋兼任关中专员公署专员。1940年，习仲勋任兼任陕甘宁边区第二师范校长、中共陕甘宁边区中央局委员。1941年8月，习仲勋任关中军分区兼警备第一旅政委，与文年生指挥八路军向国军挑衅。1942年8月，习仲勋调任中共西北中央局党校校长。1943年1月，毛泽东亲笔为习仲勋书写“党的利益在第一位”题词，予以表彰。1