穿后，克林贡和星联的关系得到了缓和。不久，古尔·杜卡特公开宣布卡达西加入自治同盟，自治同盟开始不断向第一象限增兵。为了应对自治同盟，西斯科和高伦代表星联和克林贡重新签订盟约。
自治同盟战争.2373年年底，为了阻止自治同盟继续向第一象限增兵，星际舰队决定让联邦星舰勇抗号在贝久虫洞口布雷以阻止自治同盟增兵。自治同盟和卡达西舰队随即对深空九号发起进攻，西斯科在坚守到勇抗号完成布雷行动后率所有星际舰队成员撤离深空九号，自治同盟战争全面爆发。在战争爆发后的三个月里，星际舰队节节败退，局势