玉“兵大乱，下马渡沟，僵仆溪谷中”，“弃马骡万匹，器械无算”。不敢同闯军主力作战，故技重演，率部顺江东窜，撤兵至武昌。左良玉向楚王要兵粮，未得补给，遂掠夺武昌而去。
南明时期.崇祯十七年（1644年），三月封宁南伯，北京城破，崇祯帝自缢，左良玉尽出己掳掠所藏金银财物，价值二三万金，散给诸将，才稳住军心。弘光帝立，晋升为宁南侯。弘光元年（1645年）李自成的大顺军被清军在西北击败后南下。左良玉为了避战，借机南京崇祯太子案爆发，以「奉太子传国密诏」、「清君侧」为名，传檄讨马士英、阮大鋮