表示我们经由化石认识的生物只佔所有曾经生存在世上的生物的不到1%。因此，我们看到的化石只是连续的演化过程中的一个个瞬间，过渡化石可以帮助我们了解生物分化的过程有哪些阶段，但无法补满每一步过程。化石纪录也带有偏误。通常坚硬的构造较容易成为化石，因此缺乏骨骼的生物则鲜有化石。化石纪录较完整的类群有嵴椎动物、棘皮动物、腕足动物和一些节肢动物。
重要例子.
始祖鸟.始祖鸟是兽脚亚目底下的一属恐龙，和鸟类非常近缘。第一个完整的化石在1861年发现，之后陆续发现了另1