深15米，宽22米，可容纳500人；内殿进深、宽各有15米，可容纳300人。另外礼拜殿的台子还能容纳400人。所以礼拜殿可容纳千人同时做礼拜。寺内还有宣讲楼、淋浴池、伊玛目住房、外宾接待室等等。南大寺有阿訇1名，教民1100户，他们都是遵奉哲合忍耶的回族人。2004年左右，该寺教长（阿訇）为雷发喜。1985年，南大寺被乌鲁木齐市人民政府列为乌鲁木齐市文物保护单位。很多外地人士都到该寺参观礼拜。