日本国铁在这六台机车完成试验后，就不再购置更多的DD50型柴油机车，但其研制经验为1957年出现的DF50型柴油机车奠定了基础。
运用历史.1950年代初，DD50型柴油机车投入运用初期全部配属金泽铁道管理局敦贺机关区（今西日本旅客铁道敦贺运转中心车辆管理室），担当北陆本线米原至敦贺间的列车牵引任务，以替换原本使用的C57、D51型蒸汽机车。虽然DD50型柴油机车最初计划用于牵引货物列车，但由于柴油机车不会像蒸汽机车那样喷出煤灰烟尘，因此在实际运用当中以牵引北陆本线的优等旅客列车为