在同治十一年（1872年）落成。到了日治时期，由于大正十二年（1923年）的街道改正措施，朝天宫被以阻碍交通的理由遭到拆毁。后来因为新化太子宫的信徒捐献庙地，朝天宫才于现址重建（1926年─1927年）。二次大战后，因为民国卅五年（1946年）的地震，导致朝天宫前殿倒塌，只剩下后殿。到了民国六十一年（1972年）才在境民倡议下修建，于两年后（1974年）完工，并举行甲寅科落成祈安清醮。
传说.传说过去新化有着「八卦蜘蛛穴」，其中心在中山路与中正路交会处，里头有蜘蛛精会出来作