站是两家第三部门铁路公司所属的两条路线──会津线与会津鬼怒川线──的分界车站，但行驶在该路线上的列车，实际上大半都是採直通运行的方式运作，因此并没有特别的转车设施之配置。
车站构造.会津高原尾濑口车站是一地面车站，站内仅有一座岛式月台两条乘车线。除了站社附属的售票口可以买到车票外，车站楼下的物产馆内也可购得会津铁道、野岩铁道与等单位的车票。