时中国没有国会，所以此届内阁的国务总理和阁员的任命都没有经过国会的批准，所以徐世昌大总统命令内阁署理行之。内阁成员一律带有「特任」的字样。正因此此届内阁的合法性受到质疑。靳云鹏在第二次内阁时得罪了旧交通系的领袖梁士诒，梁士诒于是决意扳倒靳云鹏，他从张作霖和徐世昌两方面分化总统府、政府、军阀的关系。靳云鹏因为未能满足张作霖安插亲信的要求而和张作霖闹翻，后来又因为冷言讽刺徐世昌总统和北京税收问题而和徐世昌对立。最终，靳云鹏被迫辞职，梁士诒在张作霖推荐下继任总理。