违11年的新作（第11话・第12话）的制作消息，作为系列作完结篇，将决定以『怪医黑杰克 FINAL』（下称『FINAL』）的标题发售。但因为负责系列作的导演出崎统在同年4月过世，因此将他列为「监修・系列作名誉导演」。后继的导演则由出崎以及与本作有关的桑原智负责第11话，西田正义负责第12话的制作。最终完成『FINAL』的制作并在同年12月16日发售DVD。关于『FINAL』的制作，也有少部分与当时正在与疾病奋斗的出崎有关，初次担任系列作分镜・导演的桑原，西田表示「（从出崎导演那边得到的建议）宛如BJ，