由于冷害的侵袭，青森东南部地区在江户时代曾经多次发生饥荒。困窘的财政状况使得盛冈藩、八户藩、弘前藩在18及19世纪进行过大规模改革，并取得了一定的成效。同时饥荒还促使青森的人口开始向北海道的道南地区移民。幕末戊辰战争时期，弘前藩和盛冈藩最初都加入了奥羽越列藩同盟，但弘前藩在中途叛逃加入新政府军阵营。战后盛冈藩的领地被大幅削减，幕府在被没收的盛冈藩领地中新设斗南藩和七户藩。废藩置县前夕时，青森县内有弘前、黑石、八户、七户、斗南五藩。
青森县的成立.1871年，日本实施废藩置县。在经过