权出任建武将军、兖州刺史。大明六年七月甲申（462年8月16日），发生了地震，鲁郡地动山摇，彭城城墙上的矮墙崩塌了一段，长有四百八十丈，房屋倾倒，兖州地裂涌出泉水，两年都没停。之后夏侯祖权在兖州刺史任内去世，谥号烈子。
其他.赵超宗夫人王氏墓志中记载自己第五女所嫁谯国夏侯朏的祖父名为夏侯祖真，孙久龙认为与夏侯祖权名字类似，或许是同族