天主教圣胡安包蒂斯塔教区（、）是巴拉圭一个罗马天主教教区，属亚松森总教区。教区成立于1957年1月19日，包括米西奥内斯省和涅恩布库省。2004年有教友214,000人（佔辖区总人口98.2%）、三十个堂区、廿六名司铎。现任教区主教为马里奥·梅迪纳·萨利纳斯。