院长；1995年，升任校党委副书记、副校长；1999年，任校党委书记。2000年，柯尊平离开西南交大，出任四川省政府省长助理；2001年2月，当选副省长；2007年5月，任中共四川省委常委、兼省委组织部部长；2012年11月，在中共十八大上，当选候补中央委员；2013年4月，晋升省委副书记；2015年1月，在四川省政协十一届三次会议上，当选省政协主席。2018年1月，当选第十三届全国政协委员。