成化晚年，朝廷依然能有条不紊地对天灾人祸有迅速的应对，因此仍幸称歌舞升平，太平无事。成化初年，土地兼併严重，造成大量流民依山据险，光是荆州、襄州、安州、沔州之间，“流民不下百万”。湖广荆襄地区成为流民的聚居区，贼盗啸聚。成化元年（1465）三月刘通、石龙、冯子龙等于房县大石厂立黄旗起义，拥众数十万。成化六年十一月，又有刘通旧部李原、小王洪起义，流民附和者达百万人。史称郧阳民变。
去世.成化二十三年（1487年）春，万贵妃去世，宪宗过于悲痛而患病，长叹说：「万氏长去了，我亦将去矣