28年）十二月，改工科给事中。崇祯二年（1629年）九月，升任工科右给事中；次年六月，改户科右给事中，崇祯四年（1631年）九月，改左给事中。同年十一月，改吏科都给事中，崇祯五年（1632年）正月，降左给事中，之后改太常寺少卿。崇祯九年（1636年）以都察院右佥都御史、巡抚山东。崇祯十一年（1638年）冬，清军经居庸关入华北，南下山东。杨嗣昌令颜继祖专防德州，济南空虚，不久清军破城，山东布政使张秉文、巡按御史宋学朱、副使周之训、翁鸿业等殉国，德王朱由被捕。事后，言官交章弹劾，颜继祖上疏归咎于杨嗣昌，自请撤