护国庇民妙灵昭应宏仁普济福佑群生诚感咸孚显神赞顺天后」。被称为「新祖宫」，是要与鹿港原来就已经存在的妈祖庙鹿港天后宫作为区别，而后者也因此又名「旧祖宫」。此外，鹿港另有第三间妈祖庙鹿港兴安宫，是三间妈祖庙之中年代最久的。新祖宫于嘉庆十一年（1806年）及道光十四年（1834年）两度重修，于台湾日治时期因战争遭炮火破坏，至1970年再度重修。
特色.新祖宫中祭祀的妈祖神像为「软身妈」，意即虽然头手颈是木雕，但是身体是藤编，所以可以转动手脚换穿衣服。另外，于妈祖两旁的副神「金将军千里眼