当选主任委员。1949年8月，他赴北平出席了中国人民政治协商会议第一届全体会议，并被选为政协第一届全国委员会委员。1950年后，他历任西北军政委员会委员兼文教委员会主任、西北行政委员会副主席兼文教委员会主任、《光明日报》社社长。1958年11月在中国民主同盟第三次代表大会上被选为民盟中央副主席，1963年，沈钧儒逝世后接任民盟中央主席。1965年在第三届全国人民代表大会第一次会议上，当选为全国人大常务委员会副委员长。他还是第一、二届全国人大常委会委员。1967年8月22日，杨明轩在北京病逝。