朝鲜总督府医院助手，1918年4月开始担任朝鲜总督府医院儿科医生并承担教学工作。1929年7月，他再次赴九州帝国大学深造，师从着名生物化学家儿玉桂三和内科学家金子廉次郎。读博士期间，卢基舜选择了治疗痛风的尿酸氧化酶课题为研究对象，并填补了尿酸酶比较生物化学研究领域的一项空白。1931年，他完成了《关于尿酸酶》、《尿囊素的比色定量法》、《关于尿馕素酶》和《新生儿尿、孕妇尿及羊水中尿囊素的含量》四篇论文。他在研究成果于《福冈医科大学杂志》发表后，又将其翻译成德文发表在《日本生物化学杂志》英文版（）第14卷（