内战中，孙连仲与中国共产党军队交手，1945年10月北上接收河北爆发漳河战役，11战区副司令长官兼新8军军长高树勋率部投共，另一位副司令长官兼第40军军长马法五被俘，部队几乎遭到全歼，损失较抗日战争时尤大。1947年2月第十一战区长官部改组成立保定绥靖公署，负责河北一带与共军作战，石家庄战役后共军夺取石门市（今石家庄市），晋察冀边区和晋冀鲁豫边区连成一片，河北局势危急。11月合併张垣、保定两个绥靖公署成立华北剿匪总司令部，孙连仲去职。1947年7月19日，国民政府派孙连仲为河北选举事务所主任委员；国