争期间，坪井加入了长州藩（“游击队”为该部队番号名）进行战斗，主要负责用船运输官军。1870年（明治3年），在木制炮舰上当二等士官。1871年（明治4年）6月，晋升为海军大尉，到日本海军第一艘铁甲舰东舰上担任副舰长。9月，到美国司令的旗舰，蒸汽巡防舰上进行实习。1872年（明治5年），罗杰斯离任回国，坪井跟随其前往美国，当年4月进入华盛顿市的哥伦比亚学院附属中学进行学习。1873年（明治6年）12月，日本下令在外的公费留学生全部回国，1874年（明治7年）7月，坪井奉命回国。8月，即担任木制