以索尼为首的四辅政大臣继承了福临，在康熙帝未成年时掌管国政。鳌拜辅政时期，议政王大臣会议成了“最显着的满洲机构”。为保持自己在议政王大臣会议中的席位，辅政大臣限制满洲都统和蒙古都统及六部满尚书和蒙古尚书成为议政大臣。他们还决定授予议政王大臣会议成员掌管理藩院的资格，此前顺治帝迫于武力，将理藩院从礼部独立出来。到了1662年，议政王大臣会议成员被裁减至31名，这些成员主要是有着丰富军事和民政经验的满洲领袖。康熙帝在1669年后将鳌拜派系的许多官僚改革废除，但继续依靠议政王大臣会议，在各种各样的军事和民事事