在玛丽在英格兰被囚期间，将她的继承人的问题一推再推。与此同时，她仍有可能结婚。她曾考虑过在众多法国王子中找个丈夫。第一个建议是比她小20岁的奥尔良公爵亨利（后来的法王亨利三世），当时法王查理九世的弟弟。当这项建议被拒绝后，她还考虑过法王更年轻的弟弟阿朗松公爵法兰索瓦，但法兰索瓦的早夭使这个计划也破产了。1568年，最后一个有资格做她的继承人的英格兰人－凯瑟琳·格蕾夫人去世了，伊丽莎白被迫再次考虑苏格兰女王玛丽。伊丽莎白建议玛丽与莱斯特伯爵结婚，但玛丽拒绝这个建议。不过这时玛丽的儿子詹姆士已经受了新教