38年9月贝奈斯向法国建议将苏台德地区的一部分（约5000平方公里，占苏台德总地区的约18%）让给德国，并将大多数留在捷克斯洛伐克的说德语的人（按贝奈斯的估计约220万人）驱逐出境。英国和法国一开始表示同意，但后来又反对这个计划。为了避免战争，英法在慕尼黑协定中同意德国占据苏台德地区。慕尼黑协定签署后苏联曾经表示愿意向捷克斯洛伐克提供军事帮助，但是贝奈斯以不现实为由拒绝了苏联的建议。至今为止对苏联这个建议是否怀好意依然有争议。1938年10月5日贝奈斯辞职赴伦敦。他的后任埃米尔·哈查被选为捷克斯洛伐