法缺乏进一步的人证、物证支持，蒋经国跟蒋家人都不是主谋，主要策画者是情报局的高层。
批评和影响.
违反宪法精神.一清专案是以戒严时期「取缔流氓办法」为依据，而该办法性质上是一个行政命令，且遭到逮捕者毋须经过法院的审判，便可以裁定管训，明显有违反法律保留原则及中华民国宪法第8条之虞，规避宪政体制保障人权的基本原则，被视为白色恐怖的延续。
黑社会势力洗牌.一清专案将锁定对象以黑道竹联帮为主，4,000名检肃对象中，竹联帮份子就佔三分之一。