另在原站址南约100米处重新依原来风格建造了南楼，但新楼的建筑比例与建筑材料已与原建筑大不相同，建筑水平也无法相比。青岛站于2006年11月20日至2008年7月27日间进行施工改造，新钟楼及南楼保留，北楼爆破拆除，所有到发青岛站的列车全部临时停靠四方站。2008年7月27日青岛站于北京奥运会帆船比赛前正式投入试运行，此时所有改在四方站以及沧口站始发终到的列车全部迁回青岛站。并且从2008年8月2日起，按照全新的列车时刻表，动车组列车也改为青岛站始发终到。2011年8月14日，原计划用作胶济铁路博物