佛分离令发令之前，称为「西御在所雾岛权现」。其建筑富丽堂皇有如日光东照宫，又有“西东照宫”之称。坂本龙马在日本史上第一次蜜月旅行间，造访雾岛连峰，曾至此神宫参拜。
历史.雾岛神宫曾经迁移数次。6世纪，在钦明天皇时代，在高千穗峰和火常峰之间的背门丘上，建立了最早的雾岛神宫本殿。这个神宫源自于日本传统的山岳信仰。因火山活动，旧址被毁，在天历年间，由僧人性空，将它移到高千穗河原上。后又因火山爆发而毁损，1484年（文明16年），萨摩藩主岛津忠昌下令在现址重建此神宫。其建筑为木