莽依图遂和傅弘烈互相弹劾，康熙帝安慰两人。莽依图率兵回守梧州，引咎请罢将军，康熙帝批评后仍命其留任。康熙十八年，吴三桂之孙吴世琮进攻梧州，被莽依图与傅弘烈合兵击退，清军趁势攻占桂林。吴三桂部下马承廕以南宁全城归降，吴世琮从梧州兵败回去后，就选择力攻南宁府。此时莽依图生病，听闻战警后，督军快速驰援。莽依图派遣额楚、额赫讷率领先锋进攻，而自己则与舒恕麾大军进攻，并派遣部队在山后断吴世琮归路。叛军大败，吴世琮重伤，只带着数十骑逃跑。南宁府解围。当时，康熙帝命大军聚此，进攻吴三桂本营云南贵州，然而莽依图揣测马承