民党提名参选，国新共推一席不分区立委曹寿民，而当年民进党执政不利也使得政党席次衰退力道减低，不过地方议会席次仍持续减少，亦无法重返主流政党的地位，再退至第六大党。2008年不分区立委选举，新党在区域立委与国民党合作，不分区立委得票升至4%，亲民党因国亲合作并未参与，使新党短暂恢复政党票第三大党、回升至全国第五大党的规模，至此，新党完全退出立法院。更严重的危机是，新党仍缺乏基层组织，论述亦未能与时俱进。2012年不分区立委选举，得票率仅有1.488%，甚至被绿党所超越，衰退至仅第六大党的规模，属历来最差的