长仍为许崇清，原岭南大学校长陈序经为副校长。此次调整经历一年多，调整后的中山大学有教职工700多人，其中教授100多人，副教授40多人，讲师近60人；在校本科生1500余人，研究生5人，专修科生40余人；图书馆藏书达200万册。2000年9月，中山大学珠海校区在珠海市唐家湾建成；2001年10月26日，中山大学与中山医科大学，原中山医科大学校址改为中山大学广州校区北校园；2004年9月，中山大学广州校区东校园在广州市番禺区的广州大学城落成。从2009年秋季开始，中山大学开始在大一实行一学年三学期的制