政部长埃利泽·卡普兰去世后他接任财政部长。此后他作为劳动党的杰出的人物被戴维·本-古里安总理指定为他的继任者。
总理.1963年6月建国总理本-古里安辞职后，艾希科尔当选党主席，随后被任命为总理。然而不久他因本-古里安坚持调查拉冯事件（十年前以色列在埃及的秘密行动）两人关系发生激烈对立。本-古里安在1965年6月率领自己的学生退党另立拉菲党（Rafi）。与此同时，艾希科尔的劳动党与劳工团结党（Ahdut HaAvoda）合并为结盟党（HaMa'arakh），艾希科尔任党首。1965