当选为干事。同时，他还被推举为民元国会参议员，但辞而未就。民国四年（1915年），因讨袁而被陕西将军陆建章通辑，遂避居山西。陆建章被逐后，郭希仁返回陕西，历任陕西省水利局长兼林务专员、陕西省教育厅长等职。五四运动期间，他因命令各校学生在孔子诞辰日前往文庙祭孔而遭反对。民国十年（1921年）辞职，同年被冯玉祥聘为督署顾问。民国十二年（1923年）5月21日，他在西安逝世。