原名为中国科学院乌鲁木齐人造卫星观测站，1987年更名为中国科学院乌鲁木齐天文站，2001年4月更名为中国科学院国家天文台乌鲁木齐天文站，2011年1月更为现名并于当年8月正式揭牌。新疆天文台研究领域包括射电天文、光学天文与技术应用、应用天文，主要从事脉冲星、恒星形成与演化、星系宇宙学、高能天体物理、微波接收机、数字技术应用、空间目标与碎片、卫星导航等方面的研究与观测。
观测台站.
南山基地.新疆天文台南山基地始建于1991年，位于乌鲁木齐市乌鲁木齐县甘沟乡，