和峤去观察司马衷。回来报告时，荀勗大赞司马衷有德行，但和峤则说司马衷仍是老样子。后贾南风用戟掷打怀有司马衷身孕的妃妾，令她们流产；司马炎大怒，要废掉她，荀勗和冯紞又奋力营救，令贾南风免于被废。
改掌尚书.后来荀勗由领中书监改领尚书令。荀勗因任中书监己很久，专管机要之事，现在改任尚书令，像是被削夺了权力，十分不高兴。任尚书令时，对令史以下的人作出审核，凡见有人文法上有问题，或不能决断处理事情的疑点，都一律革职。司马炎对此却大为赏识，并以东汉末年的荀彧和荀攸与他比较，称荀勗有二人的长处