理国政，多委由宰辅陈永华掌理。1665年9月，陈永华认为开辟屯垦略显成果，启奏郑经请求兴建圣庙、普设学校；起初，郑经以「荒服新创，不但地方侷促，而且人民稀少，姑暂待之将来」等语推辞，但在听完陈永华以下言论之后，郑经立刻下令择地兴建圣庙。陈永华选定于承天府宁南坊鬼仔埔兴建圣庙，命名为「先师圣庙」，并採行「庙学制」于旁设立明伦堂作为国子监。明伦堂为平时之教学场域，此外亦作为饮射、读法、宾贤学习礼仪之处。圣庙落成之日，郑经率领文武百官，亲诣圣庙举行祭祀至圣先师释菜礼，圣庙四周围绕上千东宁士庶，已深具儒家风气。