欣澳站属开放式设计，月台并不设空气调节，月台上只有数部凉风机降温，因此夏天时非常炎热，而下雨时更会有雨水从天幕与地面间的空隙随风飘入。月台上的帐篷屋顶是以半曲轻钢结构配合聚四氟乙烯物料纤维布料，下雨天时，雨水即可自动清洗帐篷。同时在兴建时采用高度较低的月台闸门，使欣澳站成为全港首个採用月台闸门的铁路车站，这种月台闸门的高度大约是其他港铁站幕门的一半（1.5米）。而为了迁就迪士尼线的列车设计，迪士尼线的闸门较东涌线的低，大约只有1.2米。
出入口.欣澳站只设有一个出入口，通往欣澳站公共