邓玉麟随军改驻武昌，不久改投三十一标并担任正目。光绪三十四年（1908年）冬，孙武、焦达峰等人自日本回到中国，于宣统元年（1909年）在武汉成立了共进会。宣统二年（1910年）春，邓玉麟参加共进会。此后，邓玉麟接受共进会派遣，在随军赴南京、镇江期间发展共进会的组织。经过汪定忠的介绍，邓玉麟被补入两江总督卫队营，经常赴镇江盐务缉私营以及巡防营开展革命工作。1911年，邓玉麟奉命回到湖北，充当孙武联络军队的中间人。经邓玉麟建议，孙武拨款给他开办“同兴酒楼”作为革命联络机关，并请共进会会员郭寄生管理账目。19