1500年，尚真王消灭先岛按司远弥计赤蜂之后，对该信仰进行禁止。但该地区的人仍进行秘密祭祀。主要的秘祭有：
琉球人的其他宗教信仰.除琉球神道外，琉球人也信仰佛教，建有广严寺、普门寺、天龙寺等佛教寺院，也过中元节。作为汉字文化圈的成员之一，琉球深受儒家思想的影响，建有文庙，并出现向象贤、程顺则、蔡温等琉球儒家代表人物。蔡夫人（蔡红亨）信仰，其父为琉球国耳目大夫蔡金城，系闽人三十六姓蔡姓后裔。蔡红亨精通刺绣，曾巧织龙袍入贡明朝，受万历帝赏识，在她死后追封「精巧妙明懿德夫人」