488平方公里，地跨云南省文山州砚山县、丘北县、广南县，曲靖市师宗县、罗平县以及广西壮族自治区西林县，北接南盘江干流，南部与红河流域的盘龙河、南利河水系相邻。地势南高北低。流域内碳酸盐岩溶形态齐全，多孤峰、溶蚀洼地、落水洞和暗河。上游多丘陵峰丛，分布有普者黑湖泊群。中下游为中低山地貌，坡陡谷深。流域内森林植被主要是云南松、杉木，森林覆盖率为25.8%。流域属中亚热带气候，平均年降水量1065毫米。清水江流域水力资源理论蕴藏量22.89万千瓦，技术可开发量6.35万千瓦。已建有听湖水库和红旗水库两座中