人物蔡锷、唐继尧秘密联络，随后参加了同年12月25日开始的护国战争。罗佩金任护国军第1军总参谋长，辅佐第1军司令蔡锷出击四川。罗佩金将家产献给云南殖边银行，以支援护国军的组织及运营。起初，蔡锷、罗佩金同数量占压倒优势的北京政府的军队作战。翌年，广西将军陆荣廷发表反袁独立宣言，形势逆转。同年3月22日，袁世凯取消即皇帝位，6月6日死去。
败于唐继尧.袁世凯死后，罗佩金被北京政府授为上将。不久，四川督军兼省长蔡锷在日本病逝，罗佩金护理四川督军，戴戡署理四川省长。其后，他们同川军刘存厚部