在旧分类中，其下曾分2个亚目：为保持单系群，也有学者让其仅保留与模式属最亲近三个科，即：纵使如此，本目依然会与鲉形目杜父鱼亚目的一部分更亲近，使后两者成为并系群，于是，如果要保持本目独立，则分类学家必须将鲈形目与鲉形目拆分成更多更小的目来解决并系群问题，又或者将本目与前两目合并成为更大的单系群，而2017年《硬骨鱼系统分类》选择了后者，将三个科归类于鲈形目、杜父鱼亚目、棘背鱼下目之下。