母宋氏所抚养，很早就懂事，六岁时祖母去世，崔仲哲痛哭不已，见到的人都为他感到伤心。崔仲哲生性心胸阔达，经常自称有用兵的谋略。朝廷征辟他担任司徒行参军，代理宁朔将军、统军，跟随广阳王元渊北伐，攻打柔玄的叛军，取得胜利，朝廷赐予崔仲哲安平县男的爵位。崔秉被杜洛周围困在燕州后，崔仲哲在朝堂上哭诉，朝廷下令崔仲哲担任别将，跟随都督元谭赶去救援。孝昌二年（526年），北魏在安州石离、冗城、斛盐三个据点的军人叛变，勾结杜洛周，有两万多人从松岍投靠杜洛周，行台常景派遣崔仲哲等人拦截在军都关等待叛军，崔仲哲在当地战死，虚岁