「排我纳匪案」。1997年5月，几内亚与其他10个国家先后在世界卫生大会全会中，发言反对中华民国以参与世界卫生大会。
签证.两国公民皆须申请签证方可入境对方国家。持中华民国护照的中华民国公民可由旅行社代办签证，或前往几内亚驻南非大使馆申请。持的抵台参加国际会议、运动赛事、商展活动，则可以电子签证入境中华民国，停留最多30天并不得延期。
相关警示.有鑑于2019冠状病毒病疫情，中华民国外交部的国外旅游警示分级表将几内亚归类为红色警示：不宜前往，宜尽速