团开始分裂。与父亲的二头政治亦开始出现弊端，与父亲对立，令大友家的内纷更加强烈。天正8年（1580年），有力庶家田原亲贯和田北绍铁发起叛乱，并与秋月种实内通，于是为了镇压而一时间被迫返回府内。天正13年（1585年），重臣立花道雪病死。此外，与肥后国方面的领主志贺氏变得疏远。大友氏的领地肥后、筑后国、筑前国逐渐被肥前国的龙造寺氏和萨摩国的岛津氏攻略。天正14年（1586年），在岛津义久开始侵攻丰后国（丰萨合战）后，失去忠诚心的家臣们相继离反，还有高桥绍运在战死（岩屋城之战）等，大友氏陷入灭亡危机