以外，在台湾战俘营的英国俘虏还包括海崃殖民地总督珊顿·托马斯爵士等盟军阵营的殖民地官员。 不幸的是，杨慕琦在当地受尽折腾，甚至被关进竹笼，受尽日军凌虐。 到二战后期，杨慕琦再被日方转送到满州国的奉天俘虏收容所（沈阳二战盟军战俘营）羁押。当1945年8月日本投降，人们还以为他已遭遇不测，苏联军队后来进佔中国东北，在当地集中营寻获杨慕琦。杨慕琦被日军拘留数年期间连基本饮食供应都不足，到获释时身体状况欠佳，所以他未有立即重返港督岗位，他获伦敦政府安排先回到英国疗养。至于1945年8月在香港重光之时，先由辅政司