4月，李先念任中央财经小组副组长。有共产党内部高官指出李先念是提前征收口粮导致信阳事件的始作俑者。
文化大革命时期.在“文革”中，他成为周恩来在主持经济工作方面的主要助手。期间中国经济徘徊不前。1967年2月，李先念被指为“二月逆流”成员受到批判，江青称其为“附和错误路线”。1968年，李先念被下放到北京市北郊木材厂劳动。1969年，中共九届一中全会上，李先念继续担任中央政治局委员。九一三事件后，李先念继续担任国务院的领导工作，并任军委办公会议成员。李先念筹划葛洲坝水利枢纽工程、