核称为核孔蛋白的蛋白质所组成。核孔的分子量约125百万Da，含有约50（酵母菌）到100（嵴椎动物）个蛋白质。核孔的直径为100奈米，不过真正可让分子自由扩散的孔道只有宽9奈米，这是因为核孔中间存在一些调节系统。小型的水溶性分子可以直接通过，而大型分子如核酸与蛋白质则会受到阻碍，需要透过主动运输才能进入细胞核。典型的哺乳类细胞核膜上，拥有约3000到4000个核孔，这些核孔含有8个形状有如甜甜圈的环状对称构造，同时嵌于内外膜之中。伴随这些环状构造的核篮（"nuclear basket"），则向内延伸进入核质