旣齐服阕，重诣京师补官。圣祖知其讲学向负清望，破格擢为山东布政使。旣齐感激，愈发奋勉清廉，令各地府县输款封还平余，又建历山书院，清理庶狱。两度护理巡抚。在官三年，政绩有声。康熙三十年（1691年），授顺天府尹。不久，擢都察院左副都御史，闻山西、陕西有蝗灾端倪，平阳府以南尤其严重，便疏请赈卹，反被圣祖以妄自揣测叱责。
获罪封疆.同年，授贵州巡抚。黎平府知府张潋、副将侯奇嵩报古州高洞苗人金涛藏匿罪人，杀害官吏，请求发兵进剿。旣齐上疏报闻，即派兵捕治。张潋、侯奇嵩又报称，兵至斩杀苗人