日本就琉球问题交涉，史称琉球案。但最终由于中日双方的观点不和而遭搁置。1894年，清朝在甲午战争中战败，琉球人的复国愿望破灭。琉球末代君主尚泰王的儿子尚寅、尚顺等人发起让琉球成为独立自治的一个县的运动，史称公同会运动，但最终失败。1945年，太平洋战争之沖绳战役爆发。数万名当地平民丧生、受伤或被迫自杀。详参沖绳岛战役中的集体自杀条目。
美国统治时期.1945年，根据《波茨坦公告》，日本放弃了除日本四岛以外的所有领土。琉球群岛（包括现今沖绳县和鹿儿岛县的奄美群岛）被美国军事佔