04年9月，原中国人民解放军第一四一医院并入第四〇一医院，成为第四〇一医院北院区，位于青岛市李沧区；原中国人民解放军第四〇九医院（始建于1973年）转隶第四〇一医院，成为第四〇一医院崂山分院。2016年在深化国防和军队改革中，第四〇一医院转隶中国人民解放军北部战区海军后勤部。截至2014年，医院有博士后工作站联合培养专业2个，特种医学博士培养点、硕士联合培养专业26个；拥有7个青岛市重点特色学科，9个济南军区专科中心，2个全军专科中心（全军手外科医学专科中心、 全军航海病医学专科中心），1个国家实验机构