护浩罕商人在新疆的利益，同时直接对浩罕商人征税，从而保证浩罕汗国垄断在六城地区的贸易利益。这整个的贸易租界不仅实行浩罕的法律与自行征收关税，清政府还给予来自其他国家的商人最惠待遇。但是在张格尔之乱以后，浩罕汗国还是没有放弃其对喀什地区的野心，时常支持和卓族人的复国行动，介入新疆事务。
衰退.在浩罕汗国繁荣的背后，其国内的统治阶层逐步发生对立，哈萨克和吉尔吉斯等游牧部落的叛乱也时常发生，政权实际上很不稳定。1842年，布哈拉汗国的继承者布哈拉埃米尔国的纳斯鲁拉入侵浩罕，攻下浩罕城，