1月，出任四川省重庆市人民政府副市长。1997年6月任重庆市人民政府副市长。1999年11月，任国务院研究室副主任、党组成员。2002年4月，任中国国际工程咨询公司党组书记、副总经理。2003年3月，任中华人民共和国国家统计局党组书记、局长。根据中国共产党中央委员会2005年11月7日中委〔2005〕255号通知，中央批准：邱晓华任中共国家统计局党组书记；免去李德水的国家统计局党组书记职务。根据中华人民共和国国务院2006年3月11日国人字〔2006〕16号通知，任命邱晓华为国家统计局局长；免去李德水的国家