（1916年）二月，升署协办大学士，领户部尚书，充辅政大臣。同年四月，法国殖民政府另立启定帝，改辅政府为机密院。段廷充任机密院大臣。八月，晋封宁浪男（）。启定二年（1917年）闰二月，段廷实授协佐大学士，改领工部尚书兼兵部尚书，兼管都察院，仍充机密院大臣。启定三年（1918年）九月，获赠一枚四项高绵佩星。十一月，获赠一枚四项北斗佩星。十二月，获赠一面大项金磬。启定六年（1921年）七月，因为私通从事独立运动的革命人士，段廷被褫夺爵位，以巡抚衔强制致仕。启定九年（1924年）六月，朝廷恩准阮廷开复