从弟李轶相谈，支援南阳刘氏从事反新活动。李通派遣李轶到刘秀属下，李通联合南阳郡舂陵刘縯（刘秀的哥哥）、准备在宛县起兵。事发后，李通逃走，在长安的李守宗族64人全被处死。李通与刘縯、刘秀兄弟联合流，地皇四年（23年）正月，泚水之战，击败新前队大夫（新制南阳太守）甄阜、属正（新制都尉）梁丘赐。
更始时期.更始元年（23年）2月，更始帝刘玄即位，任命李通为柱国大将军，封辅汉侯。更始二年（24年）2月，更始帝迁都长安，李通为大将军、西平王。李通被更始帝授予符节镇抚荆州，与刘秀妹刘伯姬成婚。