鲁士人所发起的多次起义都被条顿骑士团镇压下去了，其中1286年的起义规模最大。1243年，教廷使节摩德纳的威廉将普鲁士划为四个主教区——库尔姆、波美萨尼亚、厄尔姆兰、和萨姆兰，四个教区由里加主教区统辖。普鲁士人在马格德堡大主教区受洗，而德意志移民和荷兰移民来到普鲁士原住民的土地殖民，波兰人和立陶宛人也分别在普鲁士的南部和东部定居。在整个普鲁士，以及在现在被称为加里宁格勒州的地方中，古普鲁士人的重要定居点离散地分布在德意志人定居区的夹缝中。他们的语言最终随着这个孤立的族群一并灭亡了。条顿骑士团的修士和