昌内阁教育总长兼学术委员长。民国四年（1915年），袁世凯称帝，汤化龙不愿出力。9月他称病避居天津，10月，正式辞任教育总长。12月，到上海参加反袁活动。民国五年（1916年）3月19日，汤化龙电请袁世凯退位（3日后袁退位）。同年5月，其弟湖南将军汤芗铭反袁独立。
皖系政客.民国五年（1916年）6月6日，袁世凯病逝。汤化龙作为段祺瑞领导的皖系的政客活动。8月国会重开，他重任衆议院议长。9月，国民党议员组织了「宪政商榷会」，汤化龙在梁启超的支持下同刘崇佑等人组织了与之对抗的「宪