1905年（光绪31年），清朝的巡警部成立，经袁世凯推荐，赵秉钧被任命为巡警部右侍郎。由此，赵秉钧掌握了巡警部的实权。而且袁世凯将巡警部当作一种特务机关开展活动。1909年（宣统元年）1月，袁世凯一时失势，赵秉钧遂被罢免。1911年（宣统3年）10月辛亥革命爆发，袁世凯内阁组建，赵秉钧被任命为民政部大臣。
国务总理.中华民国成立后的1912年（民国元年）3月，唐绍仪内阁成立，赵秉钧任内务总长。其后，赵秉钧奉袁世凯之命开展反唐运动，唐绍仪被迫辞职。在随之成立的陆征祥内阁中，赵秉钧继