政府公佈社会福利署、民政事务署及医院管理局将会为到每一位需要帮助的家庭和个人，提供一位专门负责的支援联络主任，直接和相关家属或者伤者联络，并且协调各香港政府部门跟进他们的个案，为他们提供善后服务。其后，南丫四号被拖往牙较湾，以便警务处、政府化验所法证事务部及消防处人员先后蒐证，又在船上的四周围上防污带，防止洩漏燃油。因为船只没有准确的乘客名单（只有大约的人数），故此失踪人数迟迟未有确定。为此，消防处唿吁如果有人怀疑人士从事故中失踪，应该尽快与警务处联络。直至10月5日晚上，警察表示已经核对清楚港灯公