有发达的鳔，这可能是因为它们离海床不远并且不会承受突然的压力变化。
眼球.微弱的阳光能到达约1000米的深度（根据透明度的不同而不同），因此生活在该区域的一些深海鱼类的具有非常大的眼睛。另有至少11个深海鱼类群具有管状眼，包括珠目鱼科、褶胸鱼科和钻光鱼科。因为光经散射和折射到达深海，无论太阳的位置如何，光总是从正上方射下且直至日落光强几乎不变。除了巨尾鱼科等少数例外，大多数管状眼睛都竖直向上，以接受海平面来的光线。与深海鱼类相比，许多生存在相同黑暗条件下的穴居动物眼睛退化。深海