日记》中纪录，红木埕为「红毛城」的讹音。明朝天启二年（1622年），荷兰东印度公司寻求远东贸易据点攻佔葡萄牙人盘据的澳门未果，雷尔生（Cornelis Reijersen）率舰队就近佔领澎湖群岛。天启四年（1624年）荷军撤离澎湖转往台湾之前，荷军在风柜尾蛇头山筑城，而明军为了与驱逐荷军，便在红木埕、瓦硐港建造碉堡或砲台，而红木埕高地处的城池建筑周围约一百二十丈。当时玄武岩堆砌而成的城基，直到日治时代初期尚能窥见城迹之一二，但日治时代末期，城墙石块被挪去做防风墙之用，在关帝庙后方仅剩纵深八十公尺的城垣残存，