前的俄国科学家，巴甫洛夫受到苏联政府的高度认可，且能够继续他的研究直到相当大的年纪。 巴甫洛夫承认本身并不热衷于马克思主义，但由于诺贝尔奖得奖者的身分，被视为有价值的政治资产。当他在1923年从第一次美国访问归国之后（第二次在1929年），他公然的指责共产主义，认为国际马克思主义的思想基础是错误的，并说「我不会为了你们所做的社会实验牺牲一只青蛙的后腿！」。1927年，巴甫洛夫更是写信给斯大林，称他是「俄国人的耻辱」。 1934年谢尔盖·基洛夫被谋杀后，巴甫洛夫写了几封信给莫洛托夫，批评这样的迫害，并希望重新