2站台（原6-7站台）办理京九铁路方向长途列车到发。车站东咽喉设有6条股道，自北向南分别为广深铁路Ⅲ线、Ⅳ线（广深铁路普速）、Ⅰ线、Ⅱ线（广深铁路城际）、客Ⅰ线和客Ⅱ线（石牌客整所出入库线）。
旅客列车目的地.广州东站主要始发广深铁路、京九铁路的列车，其中广深动车组列车超过80%的车次在本站始发终到，同时本站也辅助广州站接发部分经由京广铁路、广茂铁路的列车。
过路列车.广州东站目前停靠少数由广州站始发终到的广深动车组列车等列车。京九直通车、沪九直通车虽然在本