在地表下的大理岩，以及含有石墨的片岩，分布于香港西北部。2亿9,000万年前的二叠纪时期，香港再次被浅海所淹，沉积物混入砂砾、海洋动物及珊瑚的残骸，经过沉埋、压迫，岩石被巨大的地壳力量扭曲及变形，形成折曲、拱起或断层的状态。这类岩石分布于吐露港的马屎洲和丫洲。1亿6,400万至1亿4,000万年前的侏罗纪时期，香港发生多次火山爆炸，喷出大量熔岩及火山灰。香港的岩石约有一半由火山岩所形成。1亿4,000万年前，粮船湾超级火山爆发，喷至火山口边的火山灰冷却凝固后，成为切面是六边形的石柱，可见于果洲群岛及破边洲