盘退抚基金机会收受退佣，涉嫌贪污。后来司法无罪，还其清白。2011年2月24日，朱武献与苏进强担任国家展望文教基金会中国研究中心共同召集人。2015年，朱武献担任全国宗教联合发展基金会董事长。2016年12月3日，下一代幸福联盟号召群众走上台北市凯达格兰大道反对同性婚姻法案，朱武献以全国宗教联合发展基金会董事长身分发言，同性婚姻法案会让家庭婚姻制度崩溃、社会结构与传统家庭伦理荡然无存，因此他坚决反对修改《民法》使同性婚姻合法化，但他尊重同性恋者的存在，希望未来以专法保障同性恋者的权利。201