共有4所，其中2所为美国圣公会所办，分别位于安庆与芜湖，此外一所为来复会与基督会合办，位于芜湖，另一所属于美以美会，位于宣城。基督会在合肥，宣道会在南陵，分别创办了女子初级中学，规模极小。安徽省无教会大学，教会中学的毕业生可以升入邻省的教会大学，如南京金陵大学、上海圣约翰大学以及武昌的文华大学。在各差会中，美北长老会对兴办教育事业的态度最为积极，而内地会对兴办教育事业的态度最为消极。1919年，安徽省共有8所教会医院，其中3所为美北长老会开办，位于怀远县和宿州。宣道会由于信仰原因，没有开设教会医院。