于君士坦丁堡也被併吞入鄂图曼帝国，在鄂图曼的米利特制度下保加利亚的教会管理权被交到君士坦丁牧首首名下，在长年的同化下保加利亚教会逐渐的希腊化，这点显现于其仪式语言，保加利亚正教会改以希腊文进行圣事。
与天主教联合.19世纪，受到民族主义的影响保加利亚正教会使用希腊文为仪式语言的现象遭到质疑。因此引发了三波的合一行动，这些运动和民族主义者意图脱离君士坦丁牧首辖区对保加利亚教会的希腊化影响而和罗马公教合作有关连。在起初这刚形成的东仪天主教会有六万多的信徒追随，但随着在1870年，鄂图曼帝