电子会因吸收能量而从基态跃升为激发态. 发色团在生物的分子中则是充当捕捉或侦测光的作用,因为当光传递能量给分子时，发色团就是造成构型改变的部分。
共轭π键系统下的发色团.在有共轭情形的发色团中, 电子跃升到中,而这是由一系列单键与双键的转换造成的,且常发生在含苯环的分子里。 常见的例子有视黄醛 (眼睛里用来侦测光的分子),许多食用色素,纤维染剂(偶氮化合物), 酸硷指示剂, 茄红素,β-胡萝卜素,和花青素。而发色团中的许多不同的结构是造成发色团吸收光谱特定范围波长的因素。增长或