基底核的基本内部连接。纹状体（包括尾状核和壳）是基底核系统的主要输入通道。大脑皮层的诸多运动，前额叶和感觉分区投射到纹状体。如表2所示，基底核中不同核团的神经元合成不同的神经递质。谷氨酸是一种兴奋性神经递质，GABA是一种抑制性神经递质。而如下表所示，多巴胺的兴奋或抑制取决于受体的种类。来自黑质致密部的多巴胺能输入刺激纹状体内的所有多巴胺受体，但是由于间接和直接通路内的受体种类不同，多巴胺输入的效应也不同。从下表中可以看出，由于多巴胺输入对直接通路的效应是兴奋，而对间接通路的效应是抑制，该神经递质的总体功能