引导上层液体流入目标器皿内。使用玻璃棒的另一个好处是可以更好地控制液体流速，这在移转一些容易发生剧烈反应的化学物质时非常重要。此方法也可用于将烧瓶或烧杯中的液体倒入试管中。在重结晶过程中，若将玻璃棒刮试管或烧杯内表面时，容易诱导结晶作用发生，另外在萃取过程中还可以打散乳浊液。建议每次使用玻璃棒后需进行清洗，避免在下次使用时污染化学品。通常可将玻璃棒放入盛满清水的烧杯中并搅拌之，将附着的污染物去除。
物理实验应用.以下2种经典物理实验皆以玻璃棒进行。
光折射