来被视为制茶人的不传之秘，各号商家都各有秘方，其实科学真相是在于菌种的选用及发酵时、温度的控制。其中使用的菌种，推测包括空气中的乳酸菌及土壤、粪便中的曲霉菌、枯草桿菌等，由于都是"秘方"，所以目前尚无全面性的科学研究。所以屡屡发生不肖商人以人畜粪便进行普洱茶发酵；这当然也是在利用其中菌种，但毕竟可能混杂了坏菌，并且残留物使之极不卫生。渥堆的时程一般在三个月左右，因菌种的不同、菌种唿吸作用产生的温度迥异、产品的规格要求等等因素，可以延长或缩短时程。有些普洱茶熟茶完全发酵至转黑、明显闻出枯草桿菌产生的枯草味