的西周 (启蒙家)和津田真道也是最早加入共济会的日本人。二战前后，日本政府禁止了共济会活动，珍珠港事件后会所被关闭。二战后，共济会在日本重建。1950年1月5日，佐藤尚武、植原悦二郎、三岛通阳、高桥龙太郎、芝均平等成为首批重建之后的共济会会员，但处于菲律宾的旭日分会所辖之下。1951年3月29日，日本前首相鸠山一郎加入了共济会和成为第一等级ENTERED APPRENTICES。1955年3月26日，鸠山一郎被晋升第三等级MASTER MASON。1957年3月，东京共济会独立，此时日本会员数超过2500