皇殿、窦真殿、鲁班殿等建筑。云岩寺飞天藏殿及殿中转轮经藏建于南宋淳熙八年（1181年）。飞天藏殿是四川省现存最古老的木构建筑，也是中国西南地区仅存的宋代木构建筑，面阔17米，进深19米，通高16.9米，重檐歇山顶。2008年汶川大地震中，云岩寺位于窦圌山顶的东岳殿、窦真殿、鲁班殿垮塌，后原址重建。2019年1月6日，云岩寺东岳殿发生火灾，过火面积120平方米，东岳殿主体建筑被烧毁。