·玛丽亚继续担任摄政直到弟弟米格尔（原本于1824年因政变失败流亡国外）于1828年回到葡萄牙接任摄政。伊莎贝尔·玛丽亚一生经历过玛丽亚一世（祖母）、约翰六世（父）、佩德罗四世（兄）、玛丽亚二世（姪女）、米格尔一世（弟）、佩德罗五世（姪外孙）以及路易斯一世（姪外孙）七任葡萄牙君主。她终生未婚，死后被葬在城外圣文生修道院的。