程改经晓光街、秀明道、秀茂坪道、宝琳路往来宝达巴士总站，不再经联合医院一段的协和街及秀茂坪道，以将服务范围覆盖至整个秀茂坪区。九巴13M线属主要的地铁接驳巴士，因此在通用储值票推出后，有关路线的车队安装有关检票机，使乘客可利用通用储值票乘坐巴士往返秀茂坪及转乘地铁，以免除经常携带大量辅币乘车，直至八达通出现后才取消通用储值票的付款安排。因应九巴的空调巴士车队数目大增及巴士服务改善的需求，于2001年6月4日增派空调巴士行走13M线，为乘客提供空调巴士服务，全线更于2002年7月20日改为全空调服务。