他治学热衷于朱子学，庆长9年（1604年）时遇到藤原惺窝，学问受其影响甚大。藤原亦对林罗山的聪颖相当欣赏，因而于次年的1605年将他推荐给德川家康，以二十三岁的年轻少年身份，成为德川的智库。1607年他在江户为第二代将军德川秀忠（家康的三子）讲学。宽永元年（1624年）时他成了第三代将军德川家光（秀忠的长子）的老师、以后幕府的相关政治、公文文书起草他多有参与。德川家康重用儒家学者，使儒学越发兴隆。例如林罗山为《公羊传》加上训读读音，以便传习和教授。宽永12年（1635年）他起草了武家诸法度一书、次年1