016年12月，韩国首度提升其禽流感疫情警报至最高级别。这是因为高致病性的H5N6禽流感在一个月前爆发。同月，有在香港的个案报告了有鸟粪被验出含H5N6禽流感病毒。
2017年.在澳大利亚进行的确认试验证实了在2017年8月于菲律宾邦板牙省爆发的禽流感属于H5N6。
2020年.1月以来在中国大陆新疆发生多宗H5N6禽流感疫情，其中20日农业农村部新闻办公室发布第三宗报告，位置在昌吉市玛纳斯县兰州湾镇湿地，13只发病的野生天鹅全部死亡。