袁世凯死后，何丰林投靠皖系卢永祥。1917年（民国6年）1月，他任浙江省宁台镇守使。1920年（民国9年），他任松沪护军使兼第6混成旅旅长。1924年（民国13年），他参加江浙战争，任浙沪联军第1军司令，因卢永祥败北而下野，逃到大连。此后，何丰林加入奉系。张作霖任大元帅时，他被任命为军事总长、安国军模范军团总司令。1927年（民国16年）4月，他任特别军事法庭裁判长，判处李大钊绞刑。国民党北伐后，他辞职，进入奉天。1931年（民国20年），他任东北边防军司令长官公署首席参议。1935年（民国24年）