的定义哪些原子的组合稳定到可以视为是分子的程度，而UPAC的建议是「需对应势能面的一个低坑，而且要深到可以限制至少一个振动态。」。此定义和原子之间交互关系的本质无关，和交互关系的强度有关。事实上，这也包括一些弱键结，以往不会视为是分子的一些原子团，例如氦二聚体<chem>He2</chem>，有一个振动束缚态，其键结非常松散，可能只能在非常低温时才可以观测到。原子的组合是否够稳定到可视为分子，在本质上是操作性的定义。在哲学上，分子不是一个基本实体（相反的，基本粒子就是基本实体），分子的概念可以视为是化学