当中以1071年「圣城」耶路撒冷的失守最具代表性，在耶路萨冷陷落后，塞尔柱军对该城的洗劫间接引发了后来的基督教国家的十字军东征。除了与塞尔柱人交战失利外，穆斯坦绥尔也不敌诺曼人的骚扰，失去了西西里岛及马尔他岛。1073年，穆斯坦绥尔为打败政敌，任命亚美尼亚将军为维齐，并将埃及的军权私下授与他。拜德尔打败各个军事派别，处死许多政治家，使埃及恢复了相对的平静和繁荣。然而，随着实权落入拜德尔和他后任的其他军事将领手中，法蒂玛王朝在埃及以外地区的影响日益衰微，大部分的北非地区也在此后逐渐摆脱王朝的控制。