义州牧使受到牵连而被下狱，但是最终被判无罪。日本丰臣秀吉侵略朝鲜，在柳成龙的推荐下，权慄出任光州牧使。权慄在全罗道巡察使李洸麾下作战，与五万多来自南方的勤王军准备北上攻打汉城。然而，李洸最终在龙仁被日军击败。权慄退往光州，并组织了一千名民兵。日军到达锦山以后，全罗道的治所移往全州。权慄率军前往全州的大门梨峙，以遏日军兵锋。小早川隆景率一万日军袭击梨峙，权慄以一千民兵抵挡日军的进攻。权慄亲自监阵，如有退却，立即斩首。民兵首领黄进被火铳击中，依然奋勇战斗。权慄战胜了日军，并收复了全罗道。朝鲜朝廷嘉奖了权