明真言百万遍石碑、手水舍、小桥、池塘、游鱼、花草、苍木，皆维持日式庭院风格。庆修院曾因岁月迭代而长年失修，分别于1964年与1972年进行较具规则的维修，仍未臻理想；1997年，庆修院获列为县定三级古蹟，并着手进行古蹟修复工程，2003年8月，由花莲县政府慎重完成具整体性的修护，把具有历史、文化及宗教价值的八十八尊佛像重新完整呈现原貌，为花莲吉安保存一座极具观光及文化价值的历史遗产。庆修院为花东地区唯一日式佛寺的国家古蹟，更是花莲县境内唯一地上建筑物的国家级古蹟，日本游客到花莲，必访的花莲观光景点之一。