1933年任国立中央大学理学院院长。1934年任国立中央研究院化学研究所第2任所长（首任是王琎）。1935年以中央研究院化学研究所所长兼评议会第1届当然评议员（当然评议员由院长、总干事、各所所长兼任，另有聘任评议员）。他和物理学研究所丁燮林（丁西林）所长与蔡元培院长关系密切，1937年芦沟桥事变后，陪蔡先生离开上海，11月27日到达英属香港的就是这2位研究员兼所长。1938年到1945年间在上海法租界里的国立北平研究院上海药物研究所（现在中国科学院上海药物研究所）做研究工作，历任特聘客座研究员