此将逐步转型为高等教育研究所，并透过与新竹教育大学的合作继续培育教师。
宣佈中止.在经多次合併协商后，清华大学与新竹教育大学双方达成共识，但双方对于整併方式、校园名称、人事员额迟迟未有结果。2009年7月至10月，清华大学校长陈文村与新竹教育大学校长曾宪政4次拜会教育部，教育部承诺除了原先两校经费加总外，配合併校增聘师资的需求，以8年为期限逐年增加补助款，第8年时约达1.6亿元。然而清华大学不满需承诺在8年内能够进入世界学术排名前百名，该主观因素也是第9年后的经费补助及整併成效标准