批准吐鲁番入贡，之后哈密名存实亡，金印也丢失了，忠顺王拜牙郎最终不能归任了。哈密最终沦为吐鲁番所占领，而各戎部落逐步被吞并，河西地区三面围敌。而守臣每年都在防卫羌戎进攻，再也无暇顾及嘉峪关外了。嘉靖二十四年（1545年），吐鲁番统治者满速儿死后，长子沙汗嗣速鲁檀，次子马黑麻不服其辖，亦称速鲁檀，分据哈密。嘉靖三十六年（1557年），哈密卫都督米尔马黑麻要求内附，明廷让其驻屯甘肃。嘉靖三十八年（1559年），吐鲁番速鲁檀沙汗子脱列速刺复居哈密。隆庆四年（1570年），满速儿次子马黑麻回吐鲁番，嗣兄职为速鲁