本书分为神代至宇多天皇的前篇20卷，与醍醐天皇至后一条天皇的后篇14卷，两者性质有很大的差别。前编神代部分全本于《日本书纪》神代纪，无所增减。神武天皇至光孝天皇部分，为六国史之抄录，但细节往往有撰者以己意加笔与省略之处，不过今本《续日本纪》被削除的桓武天皇延历4年（785年）藤原种继暗杀事件始末，与《日本后纪》阙卷部分，惟赖本书以窥梗概，因而可贵。前篇宇多天皇，与后篇醍醐天皇、朱雀天皇三朝，本之《新国史》；村上天皇至后一条天皇部分，则可能是撰者依《外记日记》等公私史料加以编辑，但叙事简略，月日疏漏，