纪荷兰时期，大员被引申为「热兰遮城」（今安平古堡）所在的一鲲鯓。早在荷兰人之前，汉人就在海上并且在赤崁（今台南市中西区）至魍港（今嘉义县布袋镇）一带活动，与平埔族人做贸易。
名称由来.关于大员之由来，一种普遍的说法说此词来自台湾大武壠族大湾社或台窝湾社之名转化而来。明朝万历三十年（1602年－1603年），福建连江人陈第随沈有容追捕倭寇至台湾安平外海，归后作《东番记》。文中提到闽南语音大员，说明是「东番夷人不知所自始，居彭湖外洋海岛中。起魍港、加老湾，历大员、尧港、打狗屿、