（1885年），中法战争爆发，贝锦泉在镇海之役中防守舟山，挫败法国海军。同年十月，实授定海总兵。之后，随左宗棠远征新疆迪化，帮助平定新疆。但因新疆之战负伤，留下内伤，久治不愈，不久在定海总兵任上逝世，享年59岁。 翁同龢亲作墓志，清廷诰赠武正一品“建威将军”。