台站和1个亚洲最大的植物标本馆。研究和支撑部门包括2个国家重点实验室（系统与进化植物学国家重点实验室、植被与环境变化国家重点实验室）、3个中国科学院重点实验室（中科院植物分子生理学重点实验室、中科院光生物学重点实验室、中科院北方资源植物重点实验室）、北京植物园（含华西亚高山植物园）、文献与信息管理中心。中国科学院生态系统研究网络（CERN）生物分中心、中国科学院内蒙古草业研究中心、中国科学院太阳能光-生物转化研究中心依托植物所。
硕博培养点.植物所是首批经国务院学位委员会批准的博士、