污染产生的非专一性序列影响，也比PCR更能忍受目标序列变异造成的影响 ，目前常用于监控HIV及HCV病毒载量。
原理.在固定支撑物上(如96孔盘)固定捕捉探针，再加入叫抓取扩展分子(Capture extender,CEs)的寡核苷酸，它用来抓取目标物并将其固定在固定支撑物，之后加入样品让CEs杂交抓取固定住，接着加入标签扩展分子(Label extenders,LEs)(为靶序列专一性寡核甘酸)结合标定。此技术可分为一代及二代、三代，第一代中，LEs结合分枝DNA讯号放大分子