亨利参加皇帝亨利五世的第二次意大利远征，夺取已故的嫂子托斯卡纳藩侯卡诺莎的玛蒂尔达的遗产。亨利九世其后在无子嗣的长兄韦尔夫二世于1120年逝世后继承他的爵位，成为巴伐利亚公爵。亨利九世对推动1122年的沃姆斯协约发挥重要作用，结束教皇与皇帝之间长期的叙任权斗争。皇帝亨利五世去世后，亨利九世于1125年的国王选举中发挥重要的作用：首先，亨利九世支持他的女婿，即霍亨斯陶芬王朝的士瓦本公爵腓特烈二世，后来他转而效忠于他的老对手萨克森公爵洛泰尔，因为洛泰尔承诺将他的独生女和继承人格特鲁德嫁给亨利九世的儿子（骄傲