器与鼻系统的其它部分关系很少。爬行动物的鼻腔一般而言都会更大一些，且他们的内鼻孔要更靠后一些，位于腭顶的中部或咽喉附近。对鳄目而言，他们的鼻腔非常长，这可以帮助他们在半潜入水中时进行唿吸。爬行动物的鼻腔可以分为三部分：位于前部的、主嗅室以及位于后方的鼻咽。嗅室是由嗅上皮在其上表面所形成的结构，并拥有一系列的来增大感觉面积。蜥蜴与蛇类的犁鼻器已经非常发达，并且不再与鼻腔相连，而是直接通向上腭。而这一结构在龟类动物中较小，并且还保持着原有的与鼻腔之间的练习，同时这一结构在成年鳄目动物中完全消失。鸟类的鼻