线。秀吉的大规模改造使得京都由两个分裂的部份重新统合为一个整体的城市，城市空间的格局也从中世都市转变为近世城下町。进入17世纪后，德川家康取代丰臣家，成为日本的统治者。德川家康将幕府设在江户（今东京），但京都仍然是日本的国都所在地。德川家康虽然新建二条城并以其作为京都新的都市核心，然而京都整体的都市空间仍然维持丰臣秀吉时期的格局。1788年，京都市内发生天明大火，是为京都史上最大的一次火灾，市区几乎完全被毁。然而之后京都很快实现复兴。位于众多街道交汇点的京都是当时日本全国的商业物流中心之一，众多豪商巨贾