在签约后，苏俄并未履行条约的某些项目。例如，塔尔图大学的博物馆学收藏品至今仍未从沃罗涅日归还， 而爱沙尼亚人的迁移被阻止了。二战期间苏德互不侵犯条约签署后，爱沙尼亚又被苏联佔领，并于1940年成立爱沙尼亚苏维埃社会主义共和国。1944年，俄罗斯苏维埃联邦社会主义共和国夺取了塔尔图和约中原本归属爱沙尼亚的今列宁格勒州和普斯科夫州部分土地。1991年第二次爱沙尼亚独立后，爱沙尼亚和俄罗斯并未恢复塔尔图和约规定的两国国界。俄政府认为塔尔图和约已经是没有法律效力的历史文件，而爱沙尼亚议会议长在2020年新年贺词中