堡于1453年陷落之后，奥斯曼帝国的苏丹们一度控制了对君士坦丁堡牧首的任命（如不能保证信徒对苏丹忠诚要处死）。但是今天的土耳其政府仅仅要求牧首承认自己是一个土耳其公民，并且允许伊斯坦布尔市的东正教会自主召开教会会议来选举牧首。现任君士坦丁堡牧首是巴尔多禄茂。他因为积极参与环境保护运动而被人们称为「绿色牧首」。
牧首驻地.历史上君士坦丁堡牧首的驻地主要有三个。最初的也是最正统的驻地是伊斯坦布尔的圣索非亚大教堂。1206年—1264年由于第四次十字军东征摧毁了拜占庭帝国在该地的统治