又可分为可分病原性（pathogenic）及伺机感染性（oppurtunistic）两种，遍及血液、肺、脑嵴髓液、耳、眼、尿道等，有致命的危险。长期服用抗生素的患者为高危险群，因为抗生素不仅杀死致病的菌种，也杀死正常存在人体的细菌，改变了口腔、肠道及阴道菌丛内的微生物平衡，并造成真菌的过度生长。爱滋病患者、糖尿病患者、癌症患者、接受器官移植者、接受甾体治疗者及接受化疗者等免疫缺乏者受到全身性感染的风险也较高。
病原性真菌.造成病原性感染的真菌可感染免疫力正常的人群，其感染通常从肺部