控制系统.HXD3B型电力机车采用庞巴迪公司的“MITRAC”微机控制系统，以国际标准的列车通信网络（TCN）和以太网作为通信网络。网络控制系统为分布式计算机体系，采用zh-hans:32位; zh-hant:32位元微处理器，按功能可划分为列车控制级、机车控制级以及驱动控制级，包括了机车控制单元、牵引控制单元、司机显示单元、制动控制单元、以太网交换单元、网关等设备。TCN采用二层总线结构，分别为多功能车辆总线（MVB）和绞线式列车总线（WTB），其中MVB负责单节机车内部