妻子静子与母亲寿子同行。乃木希典担任第3任台湾总督期间，制定了三段警备制，确立了「以台制台」策略。然任内发生高野孟矩事件，导致「大日本帝国宪法是否适用于台湾」的争议。1896年12月，爆发陆军少尉结城亨与其部下21人于花莲新城遭到太鲁阁族歼灭，史称新城事件。另外，在他担任总督期间在主要都市设置意见箱，以听取台湾人用投书方式表露心声。1897年春，乃木希典利用回国之机向当时的日本首相松方正义及军界、政界的少数要人谈了日本在台湾的处境及自己的想法，他认为应把台湾卖给其他国家。他在对友人的信中抱怨日本统治