9月27日，在上海缪斌被军统逮捕。缪在狱中写下《我的对日工作》试图辩明。1946年（民国35年）4月3日，江苏高等法院开始审理，5日后的4月8日以汉奸罪）判处其死刑。缪斌不服判决并上诉，但同年5月21日他被江苏高等法院特种刑事法庭宣布维持原判，缪斌在苏州狮子口第3监狱被枪决。享年48岁。缪斌的处决比陈公博都快（陈公博于同年6月3日被处决）。缪斌的遗体安葬在苏州郊外，文化大革命期间其墓被破坏，遗骨不明去向。