000年6月13日，国务院批复同意撤销南市区，并入黄浦区。同年7月1日上午，上海市人民政府在黄浦区九江路700号南新雅大酒店召开由中共上海市委副书记、上海市人民政府常务副市长陈良宇主持的黄浦、南市两区“撤二建一”领导干部大会，会上由上海市人民政府副市长冯国勤宣读了《国务院关于同意上海市撤销黄浦区、南市区设立新的黄浦区的批复》。
行政区划.至南市区撤销前夕，南市区人民政府共下设五个街道办事处：小东门街道、豫园街道、老西门街道、董家渡街道、半淞园路街道。