府的宗教政策，真言宗和古义真言宗、新义真言宗各派各派连合，1879年（明治12年）教王护国寺做为总本山连合。1901年（明治34年），教王护国寺和山阶派・小野派・泉涌寺（古义真言宗）连合，但又分裂，于1907年（明治40年），以教王护国寺为总本山的真言宗东寺派独立，真言宗就此解体。太平洋战争之时，因政府的宗教政策，古义真言宗派和新义真言宗派再度统合，成为大真言宗。战后，从大真言宗独立，1946年（昭和21年），回复真言宗东寺派之旧称。1963年（昭和38年），以回复教王护国寺为中心之宗派型态为目的