，被蒙古亡国的花剌子模王朝在逃亡途中占领耶路撒冷，1247年，花剌子模被埃及人驱逐。1248年—1254年，教宗依诺增爵四世发动第七次十字军，但无法夺回耶路撒冷。1253年，蒙古第三次西征，击破多个伊斯兰国家，1260年，蒙古军入侵巴勒斯坦，消灭阿尤布王朝，到达加沙，而一些历史学者认为蒙古人的侵掠延伸至耶路撒冷城内，另一些人认为该城未有被攻下，甚至没有被围城。后来埃及马木留克王朝在阿音札鲁特战役中击败西征之蒙古军并夺取耶路撒冷，该城的犹太人不得不逃到周围的村庄避难。1291年耶路撒冷王国的最后一个据点阿