圭介等人率领的幕军部队转战仙台，但却只有斋藤留在会津，并与会津藩士一起持续抵抗城外的新政府军。9月22日时，就算会津藩已经投降，斋藤也依然持续反抗，直到容保派人劝降后，他才投降。投降后，他与成为俘虏的会津藩士一起被送到最初是旧会津藩领地的，之后则被送到越后高田软禁。
斗南藩.会津藩投降后，遭到改易，会津松平家的家名虽然因此断绝，但在明治2年（1869年）11月3日被允许再次复兴。知行高则在陆奥国内并领有3万石，藩地则可以选择猪苗代或 下北半岛。但由于在东京成为俘虏的等旧藩干部，都一