张知本虽对西山会议派的思想倾向予以支持，但对西山会议派领导人招其赴北京参加该派活动持消极态度。而且，中国国民党主流派听取情况时，张知本本人也否认自己是西山会议派的一员。即便如此，中国国民党主流派仍认定张知本是西山会议派的主要成员，结果翌年1月中国国民党第二次全国代表大会对西山会议派的林森、居正、张知本等人共同作出开除党籍处分。
同蒋介石的对立.1927年（民国16年）春，随着上海法政大学再开，张知本仍任该大学董事兼校长。蒋介石掌权，武汉国民政府与其合流后的9月，张知本复归政界，任湖