幸的长男真田信之加入德川军。因此该领地实则没受到任何领土惩罚。1616年信之被移封至沼田藩，指派长男真田信吉为藩主。1622年信之被封为松代藩藩主。其后仙石忠政由小诸藩移封。最初石高6万石。后来缩减到5万8千石。1706年，第三代藩主仙石政明移封至但马国出石藩。接着松平信周成为上田藩主。最初石高为5万8千石，1728年，松平忠爱继承领土。其弟松平忠容获得川中岛内5千石。1761年爆发百姓一揆。在幕府末期，藩领因为藩政的恶化，而失去了主导权，引起藩内的纷争。1871年实行废藩置县，成为了上田县，187