行使大赦、特赦、减刑及复权之权。在《宪法》公布施行后，历年来总统共特赦四次、对特定对象减刑八次、以罪犯减刑条例一般性减刑五次。中华民国总统得依《宪法》、《宪法增修条文》、《》及《》等法规定任免文、武官员，例如行政院院长由总统直接任命，行政院副院长、各部会首长和政务委员由行政院院长提请总统任命，司法院院长及副院长、司法院大法官、考试院院长及副院长、考试委员、监察院院长及副院长和监察委员由总统提名、经立法院行使同意权后任命，各机关初任简任、荐任、委任官等公务人员经铨叙部铨叙审定合格后签请总统任派，以及军职少