年之内，客运量增幅超过了50万人次，这使得机场在1994年5月16日再次奠基兴建一座可年均处理350万人次的航站设施（B航站楼），并于1996年3月3日落成。随着B航站楼的启用，C航站楼正式关闭客运业务。它被转换为邮政及货物运输终端，成为德国邮政子公司DHL的货运基地及枢纽机场。经过四年的规划，在机场北部兴建一条全新的3600米长、45米宽的08L/36R跑道和兴建A14号高速公路的工程于1998年5月7日奠基建设。2000年3月24日，德国空管局的全新塔台投入使用，莱比锡/哈雷机场可以用以处理宽体飞机