在党外运动和民进党的领导和影响力（新潮流系成员早期因多从党外杂志编辑与社会运动途径参与政治，未参加选举成为候选人，故多无公职人员身分）；并以台湾「岛内的台湾独立运动者」（和岛外的台独运动区别）的面目出现，推动民进党增订台独党纲，但开始参与台湾政党政治。黑名单解禁后，从岛外回台湾发展的台独联盟在台湾的发展者如张灿鍙，也和新潮流保持合作关系。民进党在2006年决议「解散派系」后，新潮流名义上已经解散，但实际上在2008年转型为台湾新社会智库，以另一种型态存续。新潮流系、苏系、绿色友谊连线等三个派系关系特别密