原称「巢鸭」（巢鸭村），站前现在有，车站周边与西侧、南侧也可见到许多以「巢鸭」命名的设施。车站开业后，「大冢」逐渐成为车站周边的地名，1969年实施，新设现在的「南大冢」、「北大冢」。山手线沿线同样从站名变成町名的例子还有「惠比寿」、「代代木」、「高田马场」、「目黑」等。东京都电的大冢站前停留场过去也有前往春日、上野广小路方向的路线。第二次世界大战以前，由于百货公司与花街的人潮，原先预定要在大冢建设地下铁，然而大冢站一带为低地，当时地下铁技术无法克服，因而改至南边地势较高、原先大冢站预定设站处设