京大理寺卿。嘉靖十一年，改南京吏部右侍郎。嘉靖十四年，任刑部右侍郎。次年改左侍郎。嘉靖十五年，兼任左副都御史、提督两广军务兼理巡抚；当时世宗下诏命毛伯温讨安南，潘旦上疏反对。嘉靖十六年，任南京兵部左侍郎，因严嵩、张瓒借其族父潘珍之罪，勒令连坐辞职。卒赠工部尚书。
家族.曾祖潘泽生；祖父潘贵庶；父潘傅贤，母戴氏。