教科文组织随后向澳门政府发出警告，前澳门特首何厚铧后来签署第83/2008号行政长官批示（俗称「限高批示」），限制东望洋灯塔周边兴建的楼宇的高度，然而与《外港及新填海区都市规划章程》及《南湾重整细则章程》被特区政府废除前的澳葡时期比较，高度限制实际上在澳门回归后被全面放宽，当局被批评以限高为名，实际上是大幅放宽了灯塔范围内2.8平方公里楼宇的高度。另外，尽管中联办在被抗议后作出让步，将原计划的99.9米降低至88米高，然而客观结果是灯塔的景观一样被严重破坏（根据「限高批示」，中联办大楼所在位置的限高为90米