发现2年后即以“黄陂县盘土城遗址”的名义被列入第一批湖北省文物保护单位，1988年被列入第三批全国重点文物保护单位。湖北省人民政府于2009年颁布《盘龙城遗址保护总体规划》，将遗址规划作为大遗址保护和展示。为此，湖北省文物考古研究所、武汉市考古研究所、武汉大学、盘龙城博物馆、芝加哥大学等机构对盘龙城遗址展开联合考古。2017年，遗址被列入国家考古遗址公园，并于2018年12月试开放。2019年9月28日，遗址公园内的盘龙城遗址博物院正式对外开放，设有《江汉泱泱 商邑煌煌——盘龙城遗址陈列》基本陈列。