成立后，他任大总统黎元洪手下的大总统府顾问。此后，他参加孙文（孙中山）领导的护法运动，任大元帅府参议。以后，他历任广东省盐务水陆缉私统领、广东沙田清理处处长、胶济铁路管理局委员、胶济铁路管理局局长。1935年（民国24年）11月，他任北宁铁路专员。汪精卫的南京国民政府成立前，彭东原任广东治安维持会委员长。汪精卫政权成立后的1940年（民国29年）4月，彭任广东省政府委员、广州特别市首任市长。翌年1月，他辞去职务。以后，彭东原蛰居于上海，香港。最终卒于香港青山，享年七十六岁。