艋舺龙山寺为基地，起兵近千，在台北恶斗。艋舺的泉州安溪大老白其祥出面调停，方息兵燹。1861年，林国芳因与泉州籍佃农有租约纠纷，欲将泉州人土地收回，改租漳州人。造成大台北民心大乱，又一次酿成巨斗，北至芝兰一堡（今台北市士林区），南至兴直堡（今新北市新庄区）皆有械斗，朝廷震怒，欲将林国芳捕到当时的省会福州审问。国芳探知风声，1862年心急以病逝，民间遂有「第一惊（怕）死林国芳」之说。
家族.林国芳无亲生子，由其兄国华之子林维源兼祧，以祀香火。但他的夫人不喜欢林维源兼祧，另外收养孝