是本身肌肉组织的疾病。神经元萎缩的例子包含CMT(进行性神经性腓骨肌萎缩症)、嵴髓灰质炎、肌萎缩性嵴髓侧索硬化症(ALS)、吉巴氏综合症。肌肉萎缩的例子有肌肉萎缩症、先天性肌僵直、僵直性肌营养不良。
腺体萎缩.长期使用外在的糖皮质激素像是强的松，造成肾上腺的萎缩。乳腺的萎缩则是因为神经性厌食症或是更年期造成雌激素的减少。睪丸的萎缩是因为长期使用足够的外来性类固醇(包含雄激素和雌激素)以减少促性腺激素的分泌。
阴道萎缩.对于停经的女人，阴道的内壁会变薄(萎缩