后带惠帝乘牛车回洛阳，司马越率诸侯及鲜卑许扶历、驹次宿归等步骑护送。惠帝下诏封司马越太傅录尚书事，以下邳、济阳二郡增封。十一月庚午，晋惠帝于长安显阳殿食饼中毒逝世，可能是被司马越毒死的。皇太弟司马炽继位，是为晋怀帝，委政事于司马越。吏部郎周穆，是清河王司马覃舅父，为司马越之亲戚，与其妹夫诸葛玫共游说越废晋怀帝司马炽，立清河王司马覃，让司马越挟幼主号令天下。司马越遂叱左右斩二人。以二人世家，不再诛杀其亲族，因此上表废除夷三族法令。后晋怀帝开始亲理万机，留心庶事，司马越不悦，求引退回封地，怀帝不许。司马越遂出镇