管辖当地女真人和水达达。后来，元朝政府为了筹粮，强迫他们改渔为农，在当地实行屯田。此外，征调一部分女真人和水达达到浦岭路和肇州屯田。至治元年(1321年)三月，元朝政府明令“罢女直万户府及狗站。
明朝.明朝前期曾设置于黑龙江、乌苏里江、松花江以及嫩江流域的地方军政机构，为明政府管辖黑龙江口、乌苏里江流域的最高一级地方行政机构。治所位于黑龙江下游东岸靠近入海口的奴儿干城（元朝征东元帅府旧地，今俄罗斯尼古拉耶夫斯克特林）。据永宁寺记记载奴儿干都司与东北130多个卫所不相辖属，非常设机构