中林思齐是家中次子。林思齐的长兄林思显博士（1922年－2008年）先后担任过香港市政局议员和立法局非官守议员、嘉华银行董事局主席和香港浸会大学校董会主席等职。林思齐少时居于九龙塘，入读香港培正小学，中学就读于民生书院。1936年，本身已懂广东话和潮州话的林思齐随父母到福建鼓浪屿参加《圣经》查经班，逗留数月，学会了国语和闽南话。在1940年，他奉父亲之命到越南西贡公干，期间被法国军车意外撞倒，腿部受伤一度有生命危险。返港后，林思齐入读广州岭南大学，主修经济，1947年毕业。他在毕业后负笈美国宾夕凡尼亚州