清军南下，南京危急，穿戴衰服领兵北上南京，当抵钱塘（今杭州）时，被清兵所俘虏。清军将领许以爵位，王业泰说：“世受国恩，义不改节。得死，报君父于地下足矣！”，清军遂将其杀死。另说，顺治二年（1646年），与南明阁臣方逢年、张国维、谢三宾，尚书宋之普、商周祚等一道降清，后事不明。