复合物I（质子泵）.即NADH脱氢酶，或称NADH-辅酶Q还原酶，以黄素单核苷酸和铁硫簇爲辅酶，用NADH将辅酶Q还原爲QH，同时泵出质子。
复合物II.即琥珀酸-辅酶Q还原酶，是个跨膜蛋白复合物，是三羧酸循环的一部分，用琥珀酸以共价结合的FAD爲辅酶将辅酶Q还原为QH，不泵出质子。
复合物III（质子泵）.即辅酶Q-细胞色素c还原酶。细胞色素c是重要的电子载体，在复合物Ⅲ和Ⅳ之间传递电子。
复合物IV（质子泵）