干部、战士1700多人、骡马1000多匹，组成辎重团，调归第十八军，以支援第十八军进军西藏。此后，第十三军在云南开展剿匪作战，剿灭土匪318股共5.5万人。1950年6月，第十三军警卫团调归第十五军，并且另外抽调干部、战士1万多人，组成补训师，调归中国人民志愿军第十五军赴朝鲜参加朝鲜战争。1950年春夏，第十三军开始参加援越抗法斗争，协助越方歼灭越匪以及逃到越南境内的中华民国国军3000多人。为配合《中华人民共和国政府和缅甸联邦政府关于两国边界问题的协定》的执行，第十三军在云南省军区部队的配合下，于19