岛的西部成为荷属东印度群岛的一部分。1828年荷兰人试图在Lobo（今凯马纳附近）建立定居点，也以失败告终。1855年2月，德国人在马诺夸里附近的海岛建立了西巴布亚第一个传教定居点。虽然荷兰人分别在1828和1848年宣称拥有东经141°以西的南海岸和洪堡湾以西的北海岸，但是他们在1896年才试图再次开发该地区，在马诺夸里和法克法克附近建立居民点，以响应澳大利亚对新几内亚岛东部的主权要求。荷兰殖民活动收效甚微，大多数人回到爪哇，1938年时，荷兰仅在荷兰地亚有50名定居者、马诺夸里有258名定居者。Se