于明朝弘治年间（1488年至1505年），为区内历史悠久的庙宇。该庙曾于清朝干隆六年（1741年）、咸丰二年（1852年）、光绪廿九年（1903年）、1959年及1975年重修，已被列为香港二级历史建筑。大澳关帝古庙正殿中央供奉有关帝，神台两旁左面有张仙、周仓，右面有关平、黄灵公，正殿两侧另供奉都天王、当年太岁、华陀，正门两侧供奉土地和门官。另有供奉财帛星君、渔头大王、两神马及仆役。