环抱的高位山间盆地，海拔在1323米－6995米之间。南边是天山的主脉，阻挡着南疆沙漠吹来的干热风，；北面是山体较矮的乌孙山；西边为查旦尔山，形成南、西、北三面高、东部略低的盆地。西南边的汗腾格里峰是天山山脉第二大高峰，是特克斯河的主要水源，特克斯河是伊犁河最大的支流。昭苏是新疆境内唯一一个没有荒漠的县。
行政区划.下辖5个镇、2个乡、3个民族乡：