跸东京，此后明治天皇就以东京为新居所。1889年（明治22年），日本的皇室典范规定天皇即位典礼和大尝祭必须在京都举行。
统治台湾.1894年8月1日，中日甲午战争爆发。1895年2月，签订《马关条约》，大日本帝国在此条约中获得了台湾和澎湖群岛的主权以及二亿两白银的巨额赔款。明治天皇成为台湾最高统治者。1891年（明治24年），京都御所改称为京都皇宫。1909年（明治42年），登极令（昭和22年废除）规定大尝祭的斋田，京都以东以南为悠纪，以西以北为主基。