部右侍郎，转左侍郎。弘治四年（1491年），代李敏为户部尚书，加太子太保。弘治五年（1492年），叶淇将开中法（纳粮开中）变为折色法（直接用白银换盐引），徽商挟其在两淮的优势迅速发展起来。弘治九年（1496年）四月退休，弘治十四年（1501年），去世。李东阳为其撰墓志铭。
家族.叶淇有从子叶贽亦登进士出身，有声名。