因清军大胜太平军，建宁府城解围，闽浙总督王懿德奏陈刘翊宸守城有功，「会同文武固守，深得民心。该绅民等屡助官军杀贼，共保危城，均堪嘉尚。」闰五月，奉旨以知府留福建补用，赏戴花翎。仍署理海防同知，随后调署福州府知府。八年（1858年）七月，善后事毕，经奏请加道员衔。九年（1859年），以巡防功，奉旨以道员补用，加盐运使衔。十二月，经闽浙总督庆端奏请，实授福州府知府。后署理福建盐法道。同治元年（1862年）正月，以候补道员署理福建按察使，加四级，覃恩从一品封典，诰授荣禄大夫。清军三路入浙，广东太平军首领汪瑞集