萨摩藩一起组织官军上京，王政复古的政变成功。1868年5月上京拜见明治天皇，获封左近卫权中将一职并返回山口。
晚年和临终.1869年1月，毛利敬亲与萨摩藩岛津忠义、土佐藩山内丰诚、肥前藩锅岛直正联名上书，请求奉还版籍。6月获封权大纳言，同养嗣子毛利元德一起获得10万石俸禄。4日将家督之位让给元德并隐居。1871年3月，在山口藩厅内殿逝世，享年53岁。
评价.相对于萨摩藩的岛津齐彬，土佐藩的山内容堂，毛利敬亲并没有被列在贤侯之中。其中一个原因是他缺乏坚定的主