至1997年，他获港府委任为香港吸烟与健康委员会主席，任内促成港府在1997年制订《吸烟（公众衞生）条例》，落实全面禁止烟草广告和扩大法定非吸烟区范围的建议。其后，他还在1995年至2003年任职业性失聪补偿管理局首任主席，1999年至2003年任禁毒常务委员会主席，2000年至2006年当选选举委员会医学界别委员，以及担任过爱滋病科学委员会委员等职。2003年，香港爆发严重急性唿吸系统综合症疫潮，多人丧命，事后港府设立严重急性唿吸系统综合症专家委员会，负责检讨事件，李绍鸿获委任为委员之一；委员会其后提交的