南沿海低丘地带，陆地面积538.5平方千米，土地总面积506.24平方千米。其东北部，东部、南部濒临兴化湾、平海湾、湄洲湾。由三大海湾围成3个半岛，即埭头半岛、忠门半岛和醴泉半岛，3个半岛构成秀屿区全部辖境。秀屿区西南与泉州市泉港区隔湄洲湾相望，西北与城厢区灵川镇、荔城区黄石镇、北高镇交界；东北与涵江区交界，隔兴化湾与福清市相望。境域东西端最大距离70.2千米，南北端最大距离36.6千米，总面积684.8平方千米，其中陆地面积566.8平方千米，占82.8%；水域面积118平方千米，占17.2%。另有海域面