界抗原的免疫耐受，可以通过诱导方法产生。诱导免疫耐受可分为中枢耐受（central tolerance）、外周耐受（peripheral tolerance）与获得耐受（acquired tolerance）三种形式。免疫耐受中的遗传缺陷会导致自体免疫性疾病的发生，如I型自体免疫性多内分泌腺病综合征（APS-1）、IPEX综合征等。