原本设有2面3线的混合式月台（岛式与单式月台），设有中线。现时岛式月台一边（2号月台，车站大楼对面）设置了栅栏，变成了只有2面2线的单式月台。车站大楼位于岛式月台1号月台，各月台与车站大楼均设有跨线桥连接。此站由管理，为无人车站。在2005年前为业务委託车站，并曾经设有绿色窗口。在成为无人车站前，逢星期三和四柜台整日关闭。车站现时设有自动售票机。在车站旁边前往厕所的通道中，设有一座开始老化的小纪念碑，书写了「柳井港站急行停车纪念」（）。
使用状况.以下为近年1日平均乘车人