主教有权革除其教籍（历史上，教会并无权力革除皇帝的教籍，而皇帝则多次指派宦官充任教会牧首）。支持东正教的神学学者，宁愿用「和谐」（symphon）来代替「皇帝兼牧首制度」。和谐的意思是指宗教和政治权力互相支持，教会让信奉基督的领袖管理国家；但整个社会是由上帝眷顾的，君权神授，皇帝的大权亦是由上帝赐予的。「皇帝兼牧首制度」的指控，是东西方教会分裂过程中一个重要事件。而当时的西方教会在数百年来，亦努力令教权高于政权。
教会.与天主教以罗马教廷为领导中心的形式不同，东正教由一些称爲「自主