九条家分出二条家和一条家，近卫家、鹰司家、九条家、二条家、一条家被称为五摄家。而近卫、鹰司、一条三家在江户时代，由于曾从日本皇室成员中过继继承人，便被称为皇别摄家。
其他分家.除五摄家外，藤原氏仍有为很多支流，如：、西园寺家、花山院家、、、、、、等。各地也有以藤原氏为本家的分支，如近藤、远藤、安藤、加藤、佐藤、齐藤、斋藤、武藤。而藤原北家的各个分支是堂上家的主体。
现况.在明治维新时，因为明治天皇下了，以便订定户籍，所有人民都要有姓氏，有部份地区人改姓