渔业产量为98,782.21吨，占总产量的65％左右。除渔业资源外还有其他价值较高的海洋产品，例如甲壳类动物、海参、软体动物和海藻。北哈马黑拉县的渔民大多使用传统的捕鱼工具作业，例如渔网。水质好海域使得海洋水产养殖业得以发展，特别是石斑鱼、海螯虾，海藻和珍珠。不过北哈马黑拉县的水产养殖的优化和生产力一直很低。直到2002年，海洋养殖总面积达到128,110公顷，出产46.550吨，仅总产量的0.03%。可提供经济发展的基础设施如港口、银行、市场以及主要商业活动都集中在首府托贝洛。2005年的国内生产总值