。在2007年和2014年，为对应为渡轮公司开始使用新型高速船和大型船，函馆港启用了新的客运渡轮枢纽。
港口现状.客运是函馆港的主要机能之一。现在有两家渡轮公司经营函馆港和其他港口之间的定期航线。津轻海崃渡轮公司经营有函馆港至青森港和函馆港至大间港的航线。青森和函馆之间每天有8艘往返客船，而青森和大间之间每天有两艘往返客船。而青函渡轮则每天运营有8班往返函馆港至青森港的渡轮。在货运方面，2012年，函馆港的总贸易量达到3617万吨，其中161.7万吨是外贸，3455.3万吨是内贸。