进圣天使城堡中。为了使监禁卡特琳娜正当化，教宗亚历山大六世指控于1499年11月当教宗去信剥夺卡特琳娜对封地的权利时，卡特琳娜的回信中含有剧毒，试图毒杀他。时至今日我们仍不能确定这项指控是否为真，但马基维利确信卡特琳娜要毒害教宗，其他历史学者如雅各·布克哈特和则抱持不确定的态度。即使如此，教宗仍对卡特琳娜进行审判并判决继续监禁她，曼托瓦大使在书信中有提及卡特琳娜在监牢里深陷苦闷之中且看起来像病了，而她的两位儿子在卡特琳娜被囚禁时竟然只关心卡特琳娜是否能为其争取枢机职位，后来甚至拒绝支付生活费给卡特琳娜。