8年（1603年）9月11日，信吉在没有子嗣的情况下，以二十一岁的年龄病故。墓在水户常福寺，法名是净鑑院。由于后嗣断绝，家康安排十男赖将入主水户。1609年赖宣移封到骏府藩。由家康十一男赖房（当时未元服仍为鹤千代丸）成为藩主而信吉的正室天祥院的父亲木下胜俊，则是丰臣秀吉的正室北政所的兄长，木下家定的儿子。