克丘亚族后来来了。根据历史学家印卡·加西拉索·德拉维加，这些古代史与曼科·卡帕克和玛玛·奥克略的传说相吻合，后者从的喀喀湖水域涌现，创造了印加帝国。艾马拉文化（又称普蒂纳文化）是当地最重要，最具影响力的前西班牙文化。总督辖区时期，普诺是前往玻利维亚波托西的旅行者的必经之路。1668年，总督孔德·雷莫斯（Conde de Lemos）将圣胡安·包蒂斯塔·德普诺（San Juan Bautista de Puno）设立为波卡科拉省（Paucarcolla）的首府。后来，它被称为圣卡洛斯·德普诺，以纪