学医院三军总医院等国军军医机关合称国防医学中心。由于学校历史悠久，毕业生参与过各大着名战役，包括抗日战争、国共内战、台海战役、越南战争、大漠计画；学校迁台后为中华民国医疗、食品、药材之研发主要力量之一，并成立了许多医疗、教育与事业单位，包括国立台湾大学护理学系、台大医院麻醉科、台北荣民总医院、台中荣民总医院、高雄荣民总医院、三军总医院、国军高雄总医院、国军台中总医院、国军花莲总医院、国军桃园总医院、国军新竹地区医院、阳明医学院（今阳明大学）、荣民制药厂、景德制药厂等。
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