上，笨港因依畔笨港溪而兴起，康熙年诸罗县志即记称：「笨港街、台属街市，此为最大」，干隆年府志更记称：「笨港街、俗称小台湾。」，除此之外也有「一府二笨」、「一府二笨三鹿港」之说。满清治台，民变不断，多次波及「笨港」因林爽文事变而建「旌义亭」。同治年戴万生之变殉难人士亦合祀于「旌义亭」，并改称「义民庙」。北港溪一如台湾其他溪河，非潦即旱；加上河道日益淤浅，离海愈远。1750年因河道南移，将古笨港街一分为二。北街（即北港镇）商业繁荣，南街（今嘉义县新港乡）则为官衙兵营所在地。至日治时期，海关撤站始丧失贸易