大陆旅客（本线能连接福田口岸和罗湖口岸）和马迷（马场站在沙田马场有赛马赛事时或进行双边投注时会开放）等区外甚至境外居民乘搭，增加本线乘客量。于1990年代在往返市区和新界西北的交通网络尚未发达时，部分为避开屯门公路的挤塞情况而选择乘搭其他交通工具到上水站经本线前往市区的天水围和元朗居民亦曾为本线一大重要客源。另外自近年起本线事故频生，加上巴士公司亦积极开办和加密来往新界东至市区的特快巴士线，让不少沿线居民并开始放弃乘搭本线而改搭巴士，东铁线的乘客量随之出现轻微下跌。但由于狮子山隧道、大老山隧道、大埔公路