主权移交后，谭耀宗被首任行政长官董建华委任加入行政会议。2002年，主席曾钰成被行政长官董建华委任替代谭耀宗加入行政会议，正式加入执政联盟。由于立法会不能顺利过渡，主权移交后遂改由临时立法会负责立法工作，香港立法会的选举办法也作出变更，取消了彭定康的「新九组」，改为其他功能组别；地区直选方面，由单议席单票制改为名单比例代表制，扭转民建联长期以来因整体支持度及议席较低的情况，同时立法会表决改为直选组别及功能组别分组点票，加强政府对议案表决的控制权。在1998年香港立法会选举中，民建联获得9席，地方选区五区