要离开，我就给他们需要的签证。”昭和十四年（1939年），他奉派到立陶宛考那斯。
第二次世界大战以后.昭和二十年（1945年）日本投降后，杉原千亩沦为战俘，与家人在收容所待了一年，于1947年自欧洲返回日本，定居于神奈川县藤泽市。由于日本外务省诬陷其与犹太人有金钱交易，而将他免职。杉原自此过着困苦生活，其么子亦在回国后不久因白血病去世。
以色列政府报恩.昭和四十三年（1968年），以色列驻日本大使馆通报寻求杉原千亩，并且与曾经接受他帮助的犹太人见面。