回成命。由于连谋的人品和才干，于1942年3月被任命为财政部缉私总署监察处处长。时过不久又兼任军委会水陆交通统一检查处督察长，晋升少将军衔（军统局的最高军阶），后又调为「川康缉私处」处长。 1943年夏至1944年，戴笠等为了进一步培养连谋，特派他到印度加尔各答的兰姆珈，在美国史迪威倡办的参谋大学特训班受训。训练期间，国民政府组成远征军进入缅甸，因此也通知连谋参加抗击侵缅日军的中国远征军。1945年，抗日战争即将胜利，为了培养党政高级干部，国民党创办“中央训练团党政高级班”，连谋被调回受训并兼任队长。