，北港糖厂完全终止往东方向的铁道运输，北港线停驶，留下这座孤单的北港溪铁桥矗立在北港溪上。北港溪铁桥停用后，台糖在2000年5月打算发包拆除，幸赖地方文史工作者力推保存，终于在2001年10月31日由云林县政府公告「北港溪铁桥」为历史建筑。同年，嘉义县政府也决议通过将北港溪铁桥登录为历史建筑，并于11月28日公告登录，名为「台糖嘉北线五分仔铁道暨北港溪铁桥」。可惜2002年9月12日铁桥北港端行水区上方数根桥墩遭洪水沖毁，随即封桥，虽然经有关单位出资修复，但到了2008年，铁桥又惨遭台风辛乐克洪水侵袭，