长灭亡松永久秀后，大和国大名筒井顺庆、从天正8年开始把居城从筒井城移至郡山城并开始建造新的城墙。天正11年4月，天守阁完成。（《多闻院日记》）顺庆死后，养子筒井定次转封伊贺上野城。天正13年丰臣秀吉的弟弟、拥有大和·和泉·纪伊三国100多万石领地的丰臣秀长入住郡山城。秀长为了将城扩大为适合100万石居城的大规模，重新建造七层的天守阁。因为大和国是一个石料缺乏的国家，天守台的石垣的建造使用了墓石和地藏。然后又大大地发展了城下町。町人的土地按行业和出生地划分，并且加到了町名上，这些町名现在也还保留着。秀