设立国教，教会在政府施政时也不会享有优惠及特权。宗教与政治势力不互相干涉，政治决定不受宗教势力所影响。政教分离对保障宗教自由有一定程度的帮助，确保不同的宗教可以有信仰自由空间，同时不受政府干涉。但在世界上不少国家，仍然有宗教背景浓厚的政党，不论是佛教、基督教、伊斯兰教等。宗教组织仍对政府有影响力，不少政治人物也与宗教团体有一定程度上的关系。宗教团体仍有力影响政府，政府亦会对宗教组织提供税务宽免（例如教会所收取的奉献金额不用上缴政府），亦会用公帑去资助宗教办学团体，宗教组织亦继续提供医疗和教育等社会福利的服务