年，王建民就因肩关节唇撕裂施行关节镜手术，本年度日程都在复健，直到2002年6月才在1A球队复出。2002年10月，王建民接受中华成棒代表队征召参加第十四届南韩釜山亚运。其中王建民在中华队对日本的准决赛中，接替先发投手宋肇基，后援7又2/3局而无失分胜投，帮助中华队打进金牌战。2003年开始，王建民首度获邀参加大联盟春训热身赛，并升上2A球队。同年11月，他再度接受中华成棒代表队征召，参加日本札幌举办的第二十二届亚洲棒球锦标赛。王建民于中华队的先发对战南韩5局失3分而无关胜败，并取得体育补充役资格。