28年，李盛铎将档案转卖给中央研究院历史语言研究所（简称“史语所”），售价1.8万元，约10万斤，其中完整的约有五分之一。史语所从中选择、编辑出版了《史料丛刊》和40册明清史料。中日战争前夕，史语所将部分档案携至南京，后迁到台湾。史语所未运部分名义上归北京大学文科研究所，1952年移交故宫档案馆。卖出八千麻袋后，历史博物馆仍存有部分档案，1922年5月12日，北京大学校方呈公函于教育部，请求接管这批档案。经校长蔡元培斡旋，教育次长陈垣代表教育总长黄炎培（未到职）办理，北大接管一批档案，共62箱1502麻