以后更名为“法渊寺”，故法渊寺的始建年代可确定为雍正十二年。日本学者佐藤长在《明代西藏八大教王考》（1962年）中称，明朝崇德九年（1434年）宗喀巴弟子、大慈法王释迦也失应明朝邀请赴内地，驻法渊寺。由此，开始有法渊寺建于明朝之说。实际上，佐藤长是将藏文“ha yan si”（“花园寺”或“华严寺”的对音，即五台山的大显通寺）误为法渊寺。明朝时，法渊寺尚不存在。
寺址.雍正十三年的内务府奏销档中记载了雍正十二年嵩祝寺及番经厂的勘测及修缮情况：“闻事雍正十二年三月，将张家胡土克图