沙漠地区，是中亚着名内流河。锡尔河发源于天山山脉，分两源，右源纳伦河和左源卡拉达里亚河，纳伦河为正源，发源于吉尔吉斯斯坦。两河在纳曼干附近汇合后向西流入费尔干纳谷地，在塔吉克斯坦苦盏出谷，流至别卡巴德后转而向西北，流经乌兹别克斯坦和哈萨克斯坦后，注入咸海。全长2212公里，流域面积21.9万平方公里，河口多年平均流量500立方米/秒，年均径流量336亿立方米。锡尔河主要支流有阿汉加兰河、奇尔奇克河、克列斯河和阿雷斯河。