为优先路网串接起平实转运站及台南市议会，长11.9公里，设17站及1座安平机厂，採全高架化形式兴建，预算新台币220.3亿，预估于2021年动工、2025年通车。目前，台南捷运绿线已于2016年10月正式提报交通部审查，并与台南捷运蓝线共同纳入前瞻基础建设计画。2018年10月可行性研究报告交通部初审通过。2019年台南市议会裁决绿线五千万元规划费垫付案退回，市府下次定期会再提送审议，红线一千二百万元可行性研究费垫付案送联席会审查。绿线规划费垫付案在议会卡关的主因为2019年3至4月办理8场民众说明