，只上奏废掉司马晞和他三名儿子，并流放其家属。
忧愤辞世.桓温既行废立，亦诛灭了与司马皇室亲密的殷氏和庾氏，威势达至高峯。不过，桓温在当时仍受制于以王坦之为首的太原王氏及谢安为首的陈郡谢氏世族力量，有篡位心而不能得逞。而司马昱虽天子，其实如同傀儡皇帝，未敢多言，更怕又被桓温所废。当时司马昱见荧惑入太微垣，因晋废帝被废时亦有同样天象，故此十分不安，甚至对桓温亲信也是自己昔日僚属的郗超问桓温会否再行废立之事。郗超断言桓温不会这样作，司马昱仍十分感慨，并咏庾阐之诗：「志士痛朝危，忠臣哀主