咸丰十年（1860年）南台湾凤山士民在凤仪书院头门内左畔建曹公祠祭祀。同治六年（1867年）厅绅陈维英等请曹谨与曹士桂并祀名宦祠，未准。光绪二年（1876年）福建巡抚丁日昌奏请将曹谨入祀淡水厅「名宦祠」。日治时期，曹谨修筑的曹公圳等功绩为台湾总督儿玉源太郎所肯定。明治卅三年（1900年）儿玉巡视凤山时，凤仪书院被改为台南卫戍病院凤山分院。「曹公祠」破旧，祭祀中断，儿玉应凤山耆老的请求，遂捐款赞助整修，并恢复曹公祠的祭祀。明治四十四年（1911年）台南厅于凤山停车场（今凤山车站）附近建新的曹公祠，由该厅土