就《办法》发表了联合声明，称这一规章“前后矛盾、逻辑混乱”，乃至“毫无道理、缺乏依据”，是压迫西藏人民的工具。其认为颁布《办法》的目的“是为了削弱和矮化藏传佛教”。2012年7月13日，藏人行政中央驻德里办事处成立的活动小组组织200多名藏人手持雪山狮子旗和标语在中国驻新德里大使馆门前游行示威，抗议中国共产党“破坏藏传佛教仪轨”并传达了流亡藏人对《办法》的“强烈反对”。随后抗议者还向大使馆递交了一份写给时任中国共产党中央委员会总书记胡锦涛的请愿信，要求尊重藏人信仰，撤销《藏传佛教活佛转世管理办法》。