森氏症和亨廷顿氏症等。
命名.基底核的英文学名为“Basal ganglia”。其中的“Basal”（基底）意表起解剖位置位于大脑的深部和底部。而“Ganglia”（神经节）是一命名错误。Ganglia一词本义指周边神经系统的神经元胞体的聚集部，但实际上基底核位于中枢神经系统。中枢神经系统的神经元胞体聚集应称为“核”（“Nucleus”，例如红核：Red nucleus）。这个英文的错误命名一直沿用至今，成为习惯但是中文术语“基底核”却纠正了这个错误。
研