设国家海洋公园构想，并登上中洲礁竖立中华民国国旗宣示主权。同年10月召开南海会议，审慎检讨南海主权维护工作。目前，中华民国实际控制太平岛及中洲礁，隶属高雄市旗津区代管，由行政院海岸巡防署驻守。2016年1月28日，马英九登上太平岛宣示主权，称太平岛是岛屿不是岩礁。3月23日，中华民国外交部首度率外媒登太平岛，并于登岛前夕公布中、英文版「中华民国南海政策说帖」，据南海诸岛历史、地理，并从国际法等面向证明中华民国对南海诸岛主权，并阐述南海和平倡议主张。同年5月5日，马英九卸任前夕，邀请多位台湾以前的高级官员