台湾府志》一书记载朱一贵是自称「义王」，年号「永和」，以道署为王府。而为了镇压朱一贵的起义，清廷派身为水师提督施琅之子施世骠来台，有说法认为是妈祖显灵让鹿耳门潮水上涨才让大军得以顺利进入台江内海并登岸。事后随施世骠来台的南澳镇总兵蓝廷珍为感谢妈祖保佑，于雍正元年（1723年）献「神献征异」匾给大天后宫。此外巡台御史禅济布在次年，雍正二年（1724年）奏请雍正帝赐匾，后来湄洲祖庙与台湾大天后宫均在雍正四年（1726年），获得清廷颁赐「神昭海表」匾额，且自此凡是初到台湾的文武官员照例都会到大天后宫行展谒礼。雍正