多，在位于S1末端、与宿主细胞受体结合的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）相似度仅约60%，低于SARS-CoV-2与SARS-CoV在此的相似度（约74%）。
争议.2020年9月，前香港大学病毒学研究员闫丽梦在美国发表未经同行评审的论文，指控SARS-CoV-2并非自然产生，而是在实验室经改造ZC45与ZXC21（或称「舟山蝙蝠病毒」）而成的人造病毒，论文指出SARS-CoV-2基因组中的许多特征不见于其他冠状病毒，且ZC45与ZXC21