1年后，牛剑锋再次无缘得奖，这次她于全国锦标赛中，女单赛事排名第5、女团项目殿军。1999年，牛剑锋与高伟合拍取全国锦标赛混双亚军。1年后，在瑞典公开赛中的女单项目四强出局，但却赢得了女双冠军，又在鲁能超级联赛中赢得了女团冠军。2001年，牛剑锋于克罗地亚公开赛的女单赛事四强出局，女双赛事赢得冠军、中国公开赛女双赛取得冠军、美国公开赛女单与女双冠军得主、荷兰公开赛中，于女单项目八强出局、女双赛冠军、世乒赛女单项目八强出局、国际乒联巡回赛女单赛事得到亚军、九运会三料亚军：女团、女双以及混双项目。200