也是第二座海洋型国家公园。澎湖南方四岛是由东吉屿、西吉屿、东屿坪屿、西屿坪屿，这四个较大岛屿及周围小型岛屿与海域组成，生态资源珍贵且物种多样性高，海域珊瑚礁生长茂密，亦为适合浮潜的地点。
范围.范围以「澎湖县」的「东吉屿」、「西吉屿」、「东屿坪屿」、「西屿坪屿」等四岛及周边岛礁与海域，分别以东吉屿向东、头巾向北及向西与钟仔向南各2浬为边界，依北纬23°12'4.55"—23°19'28.76"与东经119°27'51.09"—119°43'4.23"之范围内划设为带状区域，海域面积