开始了2009的比赛，后以比分6-7, 6-2, 6-2的比分被穆雷逆转。他赢得了库扬精英赛，打败了莫亚（比分：6-2, 6-3）和沃达斯科（比分：6-3, 3-6, 7-6），并在决赛打败北京奥运男双金牌搭档同胞瓦林卡（比分：6-1, 6-3）。在澳网男单第一轮，费德勒以比分6-1, 7-6, 7-5击败了塞皮。 接着的第二轮，他遭遇大力发球的俄罗斯人科罗乐夫，他轻松的以比分6-2, 6-3, 6-1赢得比赛。 第三轮他遇到俄罗斯老将萨芬，他以比分6-3, 6-2, 7-6直落三盘击败了对手。 第四轮