8日，日本发动太平洋战争并入侵香港，香港保卫战爆发。日军于12月18日晚上在香港岛东北岸登陆，之后向香港岛西部及南部步步进迫。12月19日，面对人力物力皆佔优的日军，港岛东旅指挥官华里士准将决定收缩防线，将守军余下的大部分兵力集中到赤柱半岛一带，以便以赤柱炮台为核心组织更有效的抵抗。驻守炮台的守军接到撤退指令后随即破坏炮台设施，避免炮台被日军利用。1945年8月香港重光，歌连臣角炮台因为没有实际需要而被废弃，炮台的设施亦被移除，炮台所在的部分地段之后被改作监狱用途，并于1958年9月建成歌连臣角惩教所，