过程中，有部分的表皮样囊肿被误诊为皮脂腺囊肿，主要原因是两者同样是在皮下发现的细小且无痛肿块。
治疗.表皮样囊肿可通过切除手术被除去。手术切除是治疗的最常用方法，至于切除的程度则由瘤囊与周围的重要组织结构的粘附性而决定的。过氧化氢凝胶 (HO) 是从前推荐治疗药物的其中一种，尤其是当囊肿位于身体穿环（耳环）上或附近。然而，凝胶因不能充分渗透囊肿而导致效用不显着，加上它可能会破坏癒伤组织。当过氧化氢凝胶在耳环附近的囊肿使用时，过氧化物可能会因意外而进入耳道而导致耳聋，因此亦被评定