大小仍然差不多，然而哺乳动物的前脑会比其它部分大很多，中脑则会变得很小。嵴椎动物的脑由非常柔软的组织构成。活的脑组织的外表呈粉红色，而内部大多为白色，包含一些细微的颜色变化。嵴椎动物的脑由一种称为脑嵴膜的结缔组织生物膜系统包裹着，间隔在颅骨和脑之间。血管通过脑嵴膜上的孔进入中枢神经系统。血管壁的细胞排列很紧密，形成了血脑屏障，阻止了许多毒素和病原体，然而也会阻止抗体和一些药物，给脑疾病的治疗带来了许多挑战。神经解剖学家们通常把嵴椎动物的脑分为6个主要部分：端脑（大脑半球）、间脑（丘脑和下丘脑）、中脑