超军于潼关，与后来的曹操大破马超。后苏伯、田银叛变，任曹仁行骁骑将军，统率七军讨伐叛军，攻克。彼再转回征南将军，假节，屯兵樊城，镇守荆州。侯音在宛叛变，曹仁率军大败侯音，并将其斩首，还屯樊城，拜为征南将军。
据守樊城.219年，关羽北伐至樊城，汉水暴涨，于禁援军被大水淹没，樊城也受连累。曹仁惟有以数千人守城，在城中没有淹没的地方安上木板，关羽乘船围城，粮食就尽，救兵又不至，樊城外内断绝，曹军士气低落，曹仁本有意退兵，满宠便以樊城之重要性劝谏曹仁死守、等待援军，曹仁激厉将士，要以必死