自给，队伍很快扩大到几十万人，成为当时抗清的主要力量之一。大顺军坚持抗清斗争达二十多年。康熙四年八月，清政府派李守戎率数万大军进山围剿，起义军伤亡惨重，最终失败。
大西军联明抗清.顺治四年(1647年)，张献忠去世后，部下李定国、孙可望、刘文秀率领大西政权余部由四川经贵州转战入云南，以昆明为中心建立农民政权，联合南明永历帝抗击清军。后迎永历帝入滇，昆明一度称滇都，继续抗清，前后坚持了16年。但是由于孙可望引起的内讧，再加上农民军没有联合东南沿海抗清的郑成功，导致局面日益恶化