月11日，总统令公布政府将于10月15日第二次移往重庆办公。10月13日，代总统李宗仁由广州飞往桂林，行政院各首长由广州迁往重庆。10月15日，宣布中华民国政府正式在重庆办公。10月18日，陪都各界欢迎政府迁渝大会。11月1日，中国人民解放军攻占重庆的南泉战役打响。11月27日，中国国民党中央直接授权中统对关押于渣滓洞、白公馆的中共政治犯进行“最后解决”，400多中共政治犯被处决，被称为重庆“一一·二七”大屠杀。11月28日，中华民国政府由重庆迁往成都。11月30日，解放军攻占重庆。