后，朱一贵部北上转攻台南，杜君英部则连夜再陷凤山县县城（今高雄市左营区），随后亦北上台南。4月30日，杜君英部的林曹已先至台南，在和清军交战后，败退竿津林。朱一贵当日则未和清军交战，而是等待杜君英的主力部队到达。5月1日，杜君英与朱一贵会拢后，合流进攻台湾府城（今台南市中西区）。杜君英率部率先攻入府城，朱一贵随后继入。水师游击将军游崇功进鹿耳门赴援，遇清朝官员台厦道梁文煊、知府王珍纷纷坐船逃往澎湖。游崇功兵入春牛埔，杜君英、朱一贵两路夹击，以把总杨泰为内应，刺杀欧阳凯，俘获刘得紫，许云、游崇功等十余人战