日首度登陆。风暴因受陆地影响快速减弱，其中心于9月16日在墨西哥上空消失。曼努埃尔的残留继续向西北方向进入加利福尼亚湾，于次日重新组织成热带气旋。9月18日，系统开始蜿蜒向东北方向移动，并在此期间成为热带风暴。此后不久，气旋达到飓风标准，并以最高强度从库利亚坎以西不远处登陆。受墨西哥高山地形的影响，风暴在陆地上空迅速弱化，于9月20日清晨完全消散。面对风暴迫在眉睫的威胁，墨西哥多个自治区进入灾害预警状态。曼努埃尔首次登陆时就在墨西哥南部引发极其严重的洪灾，造成大范围财产和农业损失，估计有近100万人直接