行政院农业委员会农田水利署（简称农水署）是行政院农业委员会的直属机关，负责台湾的农田水利管理，也是《农田水利法》的主管机关。该署前身为2004年成立之行政院农业委员会农田水利处，2020年10月1日，该处与农田水利会整合升格为农田水利署，期限至农业部农村及农田水利署成立为止。
历史.2004年1月14日，《行政院农业委员会组织条例》修正公布，修正条文中确立增设「农田水利处」。1月30日，「行政院农业委员会农田水利处」成立。2018年1月17日，立法院三读通过《农田水利会组织通则