体衰后返回日本，过世前嘱咐妻子将一半骨灰安置台湾，目前放置在台湾新北市树林海明寺中。到了2017年白团成员还有36人在世，在日本仍会以「冈村宁次同志会」名义进行联谊聚会。
根本博事件.眼见蒋介石在国共内战中兵败如山倒，根本博与冈村宁次等人有志一同，都愿意帮助蒋介石，以合作共同反共，此即为白团（日军顾问团）的雏型。1949年，根本博率领吉川源三、浅田哲等七名日军军人，至台湾拜会蒋介石，意欲提供协助，蒋託付根本博等人至金门参与古宁头战役，为国军制定谋略。根本博不负所託，以口袋战术打