1801年春，新沙皇亚历山大一世将他的朋友召回圣彼得堡。恰尔托雷斯基发现，沙皇依然处在对他父亲的被杀的自责的折磨中，而且除了与他的小圈子讨论宗教和政治外，什么也不会做。恰尔托雷斯基面对所有的抗议声，只得回应“时间还很多呢。”这时的事务大多由参议院处理；耶稣会会士皮奥特尔·瓦西里耶维奇·扎瓦多夫斯基是教育部长。
外交部长.沙皇亚历山大一世任命恰尔托雷斯基为维尔纽斯专科学院管理者（1803年4月3日），让他能够充分利用他的进步理念。但是，恰尔托雷斯基不能充分集中注意力于教育方面，因为他