有被吞噬颗粒的吞噬体之后会与溶酶体相融合，并逐渐降解。降解过程可分为赖氧型和非赖氧型两类：除了吞噬细胞外，其它的一些细胞例如树突状细胞也可能参与到吞噬作用中来。
细胞凋亡中的吞噬作用.在细胞凋亡过程中，凋亡的细胞需要由巨噬细胞通过胞葬作用，使其被周围组织吸收。凋亡细胞的一明显特征是其细胞内的分子外翻到细胞外表面，例如钙网织蛋白、磷脂丝氨酸、膜联蛋白和氧化低密度脂蛋白等，这些分子会被巨噬细胞表面的特定受体所识别，抑或被一些可溶性受体（例如血小板反应蛋白1等）识别，而这些可溶性