年自由党和进步党的联盟选举他为菲律宾总统。任期内他着重打击政府内的腐败和贪污。为了刺激菲律宾的经济增长，他采纳了富有的顾问的建议，允许菲律宾比索参加自由的金融贸易，这个政策使菲律宾在他统治期间每年损失上百万比索。他的改革政策被在参议会和众议会中占多数的国民党阻挡。1965年他在总统大选中败给马可仕。1979年他组织了菲律宾解放民族联盟反对马可仕政府。他的女儿格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约是第14任菲律宾总统。