1966年，国际汽联强制推行新的3升引擎规则，莲花车队开始走下坡路。克拉克驾驶着配备的2L引擎的开始了该赛季。直到英国站，他都没有能够得分。但是在随后的荷兰大奖赛上，他获得第三。从意大利大奖赛开始，莲花车队决定使用配备的。克拉克驾驶着这辆赛车赢得了美国大奖赛。那一年他再次获得印第安纳波利斯500亚军，这次的冠军是格拉汉姆﹒希尔.1967年，莲花车队和克拉克使用了三种完全不同的赛车和引擎。在该赛季的第一场比赛--中，表现得非常不好，因此克拉克开始驾驶旧款赛车--参加随后的摩纳哥大奖赛，结果因为悬架问题而