要将古蹄兔科及黑格兽科加入到型兽亚目中。这两科以往分类在黑格兽亚目中，但系统发生学研究指若将牠们排除在型兽亚目以外，型兽亚目则会成为并系群。在型兽亚目中，中黑格兽科较为接近古蹄兔科及黑格兽科。中黑格兽科及黑格兽科都是源自于古蹄兔科。中黑格兽科下的三个亚科是Fiandraiinae、Mesotheriinae及Trachytheriinae。不过，有指Fiandraiinae下唯一的Fiandraia并非中黑格兽科，而是箭齿兽科。Trachytheriinae包含了早期的形态，而相对于Mesotherii