国军期间，李嗣昭权典河中留后事。四月，昭宗加王珂宰相衔兼侍中。十月，保义、宣武军又攻护国军，王珂求助于河东，李嗣昭受命率军三千相救，败保义、宣武军，攻王珙于陕州。因王珂有李嗣昭帮助，王珙屡败，部下也离心。三年（900年）十一月，昭宗短暂被以左军中尉刘季述为首的一伙权势宦官废黜。王珂闻讯，愤怒见于言表，屡次陈说讨贼的谋划，但尚未起兵，昭宗已因一起反政变而复位。昭宗复位后，王珂在众节度使之中首先进献方物，因而得帝宠。
败亡.同时，王珂和朱全忠之间的交恶还在继续发展，尤其是在朱全忠大