九铁路的兴建，广深铁路新建了平湖至深圳区间20公里的第三线，形成了两条时速160公里（一、二线）、一条时速120公里（三线）的三线铁路。1997年2月，总投资8亿元人民币的广深线高速电气化工程全面开工。本工程与香港九广东铁採用一致电化标准（25000V交流电，50Hz；此等标准最初来自台铁纵贯铁路电化工程），以便列车在广州至香港间畅通直达。1998年5月28日，广深线高速电气化工程竣工，同年8月28日正式投入运营。1999年6月8日，广深铁路三线（普速线）电气化工程动工，并于2000年9月16日竣工，广深铁