成立中共西南联大党总支，袁永熙任总支书记，陈琏任宣传委员。1940年9月，中共云南省工委任命袁永熙为青委委员，李晨接任总支书记。在第三届西南联大学生自治会选举中，中共方面的郝诒纯当选学生代表大会主席，邢福津任学生自治会干事会主席，中共由此控制了此前由中国国民党和三青团控制的西南联大学生自治会。
隐蔽战线.1941年初，皖南事变发生。西南联大的中国国民党和三青团在壁报上攻击新四军和中国共产党。西南联大的《群声》壁报则率先在校内贴出《皖南事变剪报特辑》，抨击中国国民党方面。此时，军统特