03年4月1日退伍，并把三军总长一职交给伍逸松。林泉宝在2003年7月至2007年3月间担任教育部常任秘书，在就职期间监督由政府资助的大学转型成为自主大学，并重新审查这些大学的研究架构以帮助它们发展成研究型的大学。此外，他也引导新加坡国立大学和美国杜克大学共同设立杜克-国大医学研究生学院。2007年4月1日至今，林泉宝出任贸易与工业部下属的科技研究局的主席。与此同时，他也是以下机构的成员：全国资讯通信安全委员会、南洋理工大学李光前医学院董事会、国家研究基金会等等。林泉宝所获得的奖章、荣誉学位等包括：