数个城市维持统治。他后来在1529年的康布雷条约中重新复归米兰。1535年弗朗西斯高死后无嗣继承，所以公国的继承权又再次惹起争议。神圣罗马帝国皇帝查理五世与法国国王都自称是公国的继承人，并因此爆发更多战争。查理五世最终掌控了公国，并将公国传给了儿子腓力二世。腓力二世的继承权最终于1559年的卡托-康布雷齐和约中得到确认。公国受西班牙管治直至18世纪末，发生西班牙王位继承战争，公国被奥地利征服。1714年结束战争的巴登条约中将米兰公国割予奥地利。奥地利统治米兰直至1796年，被拿破仑所率领的法军推翻。