队配属一支陆军支队去攻佔澎湖作为基地，以歼灭清朝在南方的剩余舰队并缉捕走私战时管制物的船只，并于隔天参照所得到的情资进行编组，最后组成的南方派遣舰队于3月12日集结于佐世保军港，因天候不佳，直到3月15日才出发。而在台湾方面，自1894年7月25日丰岛海战后，清朝曾派福建水师提督杨歧珍、广东南澳镇总兵刘永福来台守御，其中刘永福约在8月（农历七月）率广勇两营到台北，增募六营，而杨歧珍在之后（八月时）率十营兵力前来。此外南洋水师也曾应巡抚邵友濂之请，派「南琛」、「威靖」两舰前来，于7月14日抵达，但后来「威