驯兽师之王》、《数码宝贝无限地带》从2000年至2002年陆续播出，至此前四作动画系列暂时告一段落。2003年，X抗体数码宝贝登场。2005年，新携带机加速器的登场又为数码宝贝增加了活力，同时携带机系列机种全球总销量达到2400万台。以TV特别篇《数码宝贝X进化》为开端，系列又迎来漫画《数码宝贝次世代》和TV动画《数码宝贝拯救者》。系列也在各大主流家用机、掌机平台以及电脑上推出了多款电子游戏作品。2007年，官方举办了数码宝贝系列10周年纪念活动。2010年代开始，携带机系列机种全球总销量突破2500万