条天皇发现上皇欲立宪仁为太子，立即将院政派的主要人物平时忠、平教盛、藤原成亲、藤原信隆罢免官职，并废除了上皇的院政。次年召还了亲政派的藤原经宗等人，并将院政派的平时忠、源资贤等罢官流放，巩固了自己的统治地位。此后，二条天皇大刀阔斧地进行改革，对僧兵和神社庄园进行整治，沿袭了信西（藤原通宪）的一些积极的政策。后白河上皇则被他彻底地从政治上排除，投身于佛教信仰之中，但仍试图恢复院政。二条天皇对上皇抱有非常大的戒备之心。长宽3年（1165年）2月，在亲政派重臣太政大臣藤原伊通逝世后，二条天皇也病重。6月让