全权交予监国世子郑克与谘议参军陈永华。1680年7月，陈永华逝世。1681年3月17日，郑经去世，要员冯钖范杀死郑克，立其弟郑克塽，导致国政日劣，人心涣散。
清朝纳台湾入版图.1683年（康熙二十二年）7月10日，清康熙帝派施琅率领水陆官兵两万余人、战船200余艘攻打台湾。经过7天激战，郑军精锐被全歼。7月20日，宁靖王朱术桂自杀殉国，郑克塽则于9月17日正式递交降书，10月3日清军进入台湾受降。次年，台湾设台湾府，辖台湾、凤山、诸罗三县，隶属于福建省台厦道，并公布「台湾编查流