05年9月19日，《苹果日报》在头版报导陈日君主教打算在2007年1月退休。 他又说，希望可以到中国大陆或非洲教书，因为非洲的教师短缺。同为天主教徒的李柱铭指出，陈日君仍身壮力健，教宗可能会挽留他。但是，教会内与陈意见相左的派别则认为陈日君退休有助改善中梵关系。根据报道指陈日君在当时退休的机会相当低，原因主要有两个：首先教宗本笃十六世已任命陈日君成为一个主教会议委员会的成员；此外，陈日君已经晋升为枢机。枢机为一终生职衔。按照《天主教法典》第401条规定，年满75岁的教区主教须向教宗呈辞，而是否予以「挽留」，