1977年6月27日，即该国脱离法国殖民统治宣布独立当日，是一面由蓝（象征海洋和亲索马里的伊萨人）、绿（象征土地和亲埃塞俄比亚的阿法尔人）两横条和一白色等腰三角形（象征吉布提实现永久和平）组成的旗帜。三角形中间有一红色（象征反殖民主义烈士们的鲜血）五角星，其五个角分别代表索马里族居住的法属索马里（即吉布提共和国）、欧加登（属埃塞俄比亚）、英属索马里 （即今索马里兰，1991年单方面宣布脱离索马里民主共和国独立）、意属索马里和肯尼亚东北部，是吉布提与索马里两国关系特殊性的体现。