岩和火山物质见于西沙群岛的高尖石，南沙群岛的赤瓜礁、石盘仔和无乜礁。 南海深海盆具有大洋型地壳（硅镁壳），为基性玄武岩类所组成，地壳较薄，厚6～10千米，莫霍面深10～14千米，沉积层亦较薄。海盆中分布有海山或火山，上覆珊瑚礁，如黄岩岛（民主礁）和宪法暗沙。
气候.南海诸岛属热带季风气候。年平均气温东沙为25.3℃，永兴岛26.5℃，太平岛27.9℃。年温差小，由东沙岛的8℃，永兴岛的6.1℃递减到太平岛的2.2℃。极端低温东沙岛约10℃，永兴岛13.9℃，太平岛22.4℃。表