谢希尔等地陷入苦战，无力阻止十字军的步伐。最终，塞尔柱人丧失了地中海沿岸的大部分领土。
灭亡.1141年，西辽在卡特万之战击败塞尔柱帝国，使塞尔柱失去了对中亚的控制。1153年，乌古斯人擒获苏丹艾哈迈德·桑贾尔，并攻下古都内沙布尔，塞尔柱失去对波斯的控制，实际领土退缩至伊拉克和阿塞拜疆一带。1194年，花剌子模国王塔乞失在哈马丹打败塞尔柱末代苏丹图赫里勒三世，塞尔柱帝国灭亡，版图併入花剌子模王朝。1243年，蒙古帝国入侵小亚细亚，蒙古大将拜住在克塞山战役中击溃罗姆苏丹国的军