3公里，长度约16.6公里，包括5个车站、11处路桥、1处车行地下道，10处平交道，2015年3月提报交通部。
车站.台南都会区铁路地下化计画的起点为保安站以北2.8公里，终点为大桥站以南1.3公里，全长8.55公里。除既有的台南车站改建成地下车站外，将再复设南台南车站及新设林森车站共2个区间通勤车站。铁路地下化后，台南旧站原地保留为古蹟并配合週边铁道文化资产改为铁道文化园区；台南新站将移至前锋路与北门路路口东侧附近（原为台铁台南车站铁轨股道，旧站东侧）。