赖的援军，总计动员约6万人入洛，悉数烧毁京都洛中洛外的日莲宗寺院二十一本山，京都法华宗的许多宗徒被杀（天文法难）。延历寺的势力放火导致洛中大火。此事件造成洛中的日莲教团壊灭，宗徒被流放至洛外。以后6年间，京都的日莲宗遭禁教。天文11年（1542年），天皇勅令准许返回京都，之后靠町衆之力重建日莲宗寺院十五本山。