在1999年10月29日，柏立基于雷丁的丹尼丁医院（Dunedin Hospital）去世，终年93岁。他是继第二任港督戴维斯爵士在1890年以95岁之龄去世后，历史上第二长寿的香港总督。柏立基逝世后，香港报章多有撰文悼念，而时任特首董建华和前布政司钟逸杰爵士也分别对其逝世表示哀悼，其丧礼随后在11月8日于伯克郡逸腾敦（Yattendon）举行，并由前港督卫奕信勋爵宣读悼文。
家庭.柏立基在1937年与在马来亚认识的柏颜露丝（Anne Black）结婚，柏颜露丝与丈夫一样来自苏格兰