个种（学名"S. typhi"），是引发伤寒的病因。其他血清型如鼠伤寒沙门氏菌（学名"S. typhimurium"）可以引致一种称为沙门氏桿菌病的人类肠胃炎。 大部份的沙门氏桿菌炎是因吃了受肠道沙门氏菌所感染的食物，一般是牛及家禽，或是其他动物，如猫等。但是有研究指吸尘机内是细菌温藏，尤其当家中有人非常接近感染源头，例如在农场工作或是兽医。伤寒桿菌及鼠伤寒沙门氏菌LT2的基因组已经被确定。
伤寒桿菌.伤寒桿菌是肠道沙门氏菌的一个血清型，亦是伤寒的病因。这种细菌可以经由粪口