权利终身，第二主犯李海婴被判处死刑、缓期两年执行，其余十名罪犯分别被判处有期徒刑三年至无期徒刑。另有六名有关官员因而被控渎职罪，判监一至三年。乔燕琴等十二人不服，提出上诉。6月27日，广东省高级人民法院作出终审裁决，驳回乔燕琴等人上诉，维持原判。依据最高人民法院授权，核准乔燕琴死刑。同日，广州市中级人民法院对涉案的官员李耀辉等五人的上诉作出终审判决，驳回上诉，维持原判。
事件影响.此前也发生过收容所员工犯法的案件，但是由于此次孙志刚身亡，并且其身份不是流浪汉而是大学生，因而产生极大