溪境内属河谷地形，流向自西南向东北，水系以主流为排水主干，支流由永丰圳及其6条支流组成，源自新北市新店区双城里，标高465公尺，流经三城、二城、头城、大茅埔、安坑、柴埕、猪肚山，大湳坑等地，于中安大桥下汇入新店溪。五重溪位于新北市新店区西侧之安坑地区，为新店地区重要排水之一，集水区境内有90%以上属山坡地。由于安坑溪的上游逐渐侵入二十六份分水岭以南之横溪河谷，形成谷分水的袭夺现象，分水岭高度会逐渐降低，分水点也会向横溪所在的三崃方向移动。