至于9号线经过的奥林匹克公寓区域，居民担心地铁经过后会导致城内川旁的房屋地基下沉，影响居住，因而不让9号线经过此处。为此9号线的走向修改，不再和7号线南城站共构。此外该区域施工也改为新奥工法，从而达到减小施工噪音的效果。2003年，国会议事堂站至汝矣岛路段走向再度微调，为防止地铁运行对使用了近30年的国会议事堂建筑造成影响。国会议员希望要求将路线移动50-60米修建，但由于更改后的施工影响道路车辆通行，因而广遭市民批评。黑石站至中央大学的走向亦因经过中央大学，导致学校担心会对学校教学、实验等造成影