内各地转战。除了石山合战（高屋城之战）、纪州征伐外、还以山阴方面军总大将明智光秀的与力身份相当活跃（黑井城之战）。天正5年（1577年），与光秀一同攻陷背叛信长的松永久秀所守的大和信贵山城（信贵山城之战）。天正6年（1578年），经由信长推荐下，嫡男忠兴与光秀的女儿玉结婚。以光秀的与力身份，在天正8年（1580年），长冈家单独进攻丹后国，不过遭到丹后国守护一色义道反撃而失败。后来受到光秀的增援，终于平定丹后南部，被信长认可领有丹后南半国（加佐郡、与谢郡），于是以宫津城为居城，北半国的中郡、竹野郡、熊野郡