一部升降机和楼梯连接车站大堂与月台，因此繁忙时间扶手电梯和升降机都会出现人龙，而马鞍山站因连接区内两个大型商场，情况最为严重，在假日也会出现轮候人龙。港铁于2017年6月起，把马鞍山线车站月台所有旧式广告框架陆续更换成新广告架。在更换列车系统后，月台闸门在2017年12月完成安装，比原定时间提早一年。大围站3号月台及4号月台已于2016年3月中更换提示声带（「请勿靠近闸门」），至于车公庙至乌溪沙各站亦已于2018年1月更换提示声带。2020年2月14日，马鞍山线延伸至启德站，途经显径站及钻石山站，