隧道的施工，清华园在10月31日之后撤销关闭。清华园站的售票业务于10月28日下午二时停止办理。而在清华园站停运的消息发布后，大量北京市民和来自全中国各地的铁道迷蜂拥至清华园车站以留下最后的纪念。停靠清华园站的最后一班非市郊列车，即10月31日开往北京北站方向的4472次列车车票早在半个月前（10月17日开售当天）便告售罄；尽管没有买到车票，但依旧有很多乘客选择来到车站拍照留念，更有部分乘客在清华园站乘坐这一并上车补票。10月31日22时53分，清华园车站停靠的最后一班列车S232次列车进站。22时55