，之后在台湾牡丹社事件（屏东）中，受到了日本政府的器重，获日本聘任为「外交顾问」，协助日本交涉和对付台湾住民，特别是屏东原住民。在「亲善盟约」中，李仙得要求在「番界」中建筑砲台、驻扎守军，让原住民感到「威压」的存在，然而此砲台后遭清朝所废弃。终于，在同治十年（1871年）又发生琉球国人民船难事件，甚至进而引发史上着名的牡丹社事件。清廷受船难事件频传之影响，以及罗发号及牡丹社事件后美国与日本等国际压力，于1875年在恆春设立灯塔（即今着名的鹅銮鼻灯塔），保障台湾海崃东南部与巴士海崃之海上运行及作业安全