地震后，莫那能担任「九二一原住民部落工作队」召集人，鼓励灾民「黑暗并不可怕，有心就能看见」。2000年2月，莫那能担任台湾原住民族权利促进会「部落工作队」（同年5月更名「原住民族部落工作队」）委员。2004年7月19日，莫那能出席前民主进步党主席许信良创办的台湾民主学校成立记者会。2005年8月13日，夏潮联合会与社运界及知识界二十多个团体在台北市二二八和平纪念公园露天音乐台举办「世界反法西斯战争胜利暨中国抗战胜利、台湾光复六十週年纪念大会」，陈明忠、林书扬、王晓波、吴荣元、莫那能、杜继平、黄光国