他的事都是在浪费人才。”2272年，为了处理旅行者六号（）事件，柯克将军临时指挥了威拉德·德克尔上校指挥的进取号，后者曾监管了进取号在太空港的翻修。柯克在2282年的某个时候从星际舰队退役，但在2284年又复役，以从事星舰学院的培训。在《星际旅行II：可汗怒吼》中，柯克将军在2285年再次短暂地指挥了进取号，以阻止他的旧敌可汗·努尼恩·辛格的阴谋。在同一年，他为了找回在阻止可汗任务中牺牲的斯波克的遗体，而偷窃并毁损了进取号，还破坏了联邦星舰精进号。他因此罪名而被降级为上校，并被改任为联邦星舰进取号-A