杀逃将刘遇节等，以求稳定军心。前辽东经略杨镐被熊廷弼逮解进京下狱，前辽东总兵李如柏（李成梁之子，萨尔浒大败中唯一没有被歼灭的一路总兵）被召回北京后自杀。熊廷弼当时屯兵筑城，将辽东局势扭转。明光宗泰昌元年（1620年）八月，时明神宗方死，明光宗即位。努尔哈赤再率兵攻打沈阳，熊廷弼亲自督阵，击退后金，于是辽东局势初步稳定下来。九月，明光宗死，明熹宗即位。此时杨镐的叔父杨渊怪罪熊廷弼不肯保奏杨镐，反把他押解进京，所以联手与熊廷弼不睦的御史冯三元、大学士顾慥、尚书姚宗文等上疏弹劾熊廷弼，说熊廷弼在边地假名增税，