中华民国国民政府基于《中苏友好同盟条约》及外蒙古独立公民投票之结果，表示接受公投结果，正式承认外蒙古独立的事实。1947年，蒙古骑兵入侵中国新疆北塔山，中华民国向苏联及外蒙古提出严重抗议。是为北塔山事件。同年7月28日，中华民国出席联合国代表团代表徐淑希在联合国安理会发表演说，反对外蒙古加入联合国。8月18日，安理会第186次会议，中华民国代表蒋廷黻以该事件为由投票反对蒙古加入联合国，此事在联合国大会引起安理会是否越权的讨论。1949年10月1日，中华人民共和国成立后，蒙古人民共和国随即给予外交承认