朝时属挹娄，南北朝时属柔然，隋朝、唐朝时先属勿吉、后属忽开洲。金朝该地隶属会宁府，元朝该地隶属合兰府。明朝时该地属胡尔哈部，清朝时该地属吉林将军辖区。清光绪三十二年（1906年），该地改属大通县管辖。清宣统元年四月十五日（1909年6月2日）设县，隶属依兰府，县治所初设于松花江北岸三站，后该站投归黑龙江省，故县治所迁松花江南岸旗产公田地界，以县城北方正泡命名为方正县，县治所在方正泡街。民国三年六月（1914年6月），方正县划归吉林省依兰道。民国十八年（1929年）东北政务委员会成立并废除道制，方正县归吉林省