辉而被杀死的政所头人（执事）伊势贞孝的孙儿伊势虎福丸（后来的伊势贞为）归返，承认伊势氏宗家的再兴。更提拔三好三人众之一的三好长逸为御供众。另一方面，伊势贞孝的后任头人摄津晴门和负责政所实务的奉行众，则厌恶推举许多杀死义辉的三好三人众的义荣，部份人在前往越前国与义昭交往后，再没有返回。当时，室町幕府的幕臣有执行武家故实而仕官的阶层，以及裁许辩论和执行行政事务而仕官的阶层（奉行衆），义荣虽然成功得到伊势氏、大舘氏等武家故实阶层，但是没能得到诹方氏、饭尾氏、松田氏等奉行众阶层，于是在就任将军后，造成再建幕府机构的