特的圆形使其无法如线形轨道交通线一样用终点站来表示列车方向，而是采用“内圈”和“外圈”表示列车行进的不同方向，“内圈”是顺时针运行方向，“外圈”是逆时针运行方向。4号线与1号线，2号线组成「申」字，构筑起上海轨道交通的基本框架。此外，4号线在虹桥路站和宝山路站之间共9个站点与3号线采取城市轨道交通系统的「共线营运」方式，即两条线共用同一条轨道，虽然节约了不少投资，但同时牺牲了相互之间的运输能力也提高了自动控制的复杂程度。4号线的线路标识色为PANTONE 267C（C=86 M=100 Y=3 K=1）