楼前有石狮子镇门，门楣刻有「妈祖阁」三字，两边分列石镌对联「德周化宇，泽润生民」，意指「妈祖恩德遍及整个宇宙，恩泽滋润所有老百姓」，牌楼上顶铺琉璃瓦嵴并以鳌鱼拱托宝珠做为装饰。山门后有另一座由花岗石建成的三间四柱冲天式牌坊，在「南国波恬」四字的左右两侧以篆书题写破体「珠光」和「宝气」，其中「光」宇以异体字「炗」代替，「炗」底部有一个「火」字以强调火光的意味，寓意祈愿庙内香火更为鼎盛。
四座古庙.
正殿.正殿又称石殿或「神山第一殿」，建于1605年（明万历三十三