用户可以建立HDF5文件从而获得netCDF格式不具备的利益，比如更大的文件和多重无限制的维度。完全后向兼容，可访问旧有netCDF文件并支持以前版本的C和Fortran API。
软件.netCDF常用于气候学、气象学和海洋学应用，如天气预报、气候变化；也用于地理信息系统应用，是很多GIS应用的输入/输出格式；并用于通用科学数据交换。从它的站点引述如下：netCDF（网络公用数据格式）是用于面向数组数据访问的一组接口，和针对C、Fortran、C++、Java和其他语言的一套