教育委员会接下了学校的掌控权。 同一年密西根州农业学院改名为州立农业学院（State Agricultural College）并毕业第一届的学生。然而，当时因为美国爆发南北战争的缘故并没有举行毕业典礼，而第一届的毕业生全被征召入伍。第二年美国总统亚伯拉罕·林肯签署了第一条1862年土地拨赠法案，使得州立农业学院成为全国的赠地大学制度典范。但是约瑟夫·威廉已在前一年病逝、并没有活着看到他的理想成真。
男女合校.虽然当时学校里并没有设立女生专属宿舍，州立农业学院从1870年开始接受女