纪，华伦西亚大学分裂为支持和反对托马斯神学（即哲学学说）两派。整个华伦西亚王国议论纷纷，党派情绪白热化。校内一间馆藏27,000册的图书馆，亦在Suchet将军的命令下被毁。在芸芸名教授当中，D. Francisco Peréz Bayer博学多识，在西班牙卡洛斯三世统治时期影响深远。就在大学附近，数间为贫果学生而设的学院相继成立。首间由St. Thomas of Villanova于1561年创办，其后Doña Angela Alonsar和Mosen Pedro Martín亦参与建校。最有名的一所是C