，蒋介石在上海清党后，孔祥熙协助蒋介石在上海拉拢各方势力。1928年，孔祥熙任南京国民政府工商部长。1930年，改为国民政府实业部长。1931年九一八事变后，蒋介石辞去国民政府主席，孔祥熙亦同时请辞。1932年，奉命到欧美考察，同时秘密向德国、意大利购入武器。1933年4月6日，回国后，孔祥熙被任命为中央银行总裁。1933年10月，由于1933年的财政部已发行公债140000万多元，这加深部长宋子文与上海金融家之矛盾，吃力于筹划公债还本付息和开发财源，因此与蒋介石在军费及预算问题上激烈冲突，