6日正式公布新庄武圣庙、新庄慈佑宫、新庄文昌祠为台闽地区三级古蹟，而同地的新庄广福宫为二级。1999年5月24日，此庙修复工程开工，县议员许炳崑、徐陈丽华及县民政局及新庄市公所人员到场祭拜。总经费三千万元，由内政部补助四分之三经费，其余由县府负担。921大地震使正在修复的此庙中殿屋嵴塌毁、墙壁龟裂。2000年3月8日，庙方新建图书馆文化大楼举行奠基典礼，由台北县长苏贞昌和新庄市长黄林玲玲主持动土仪式。庙方以名为「有庙有教」的教育理念提供此六楼高的图书馆供学子读书。也会在此大楼举行文物展。2001年