2002年的喙头鳄类亲缘分支分类法研究，发现伪黄昏鳄与数种喙头鳄类的演化位置无法确定，跟喙头鳄、其他鳄形类的关系仍未定。在某份早期研究，曾将伪黄昏鳄的属名误植为"Pseudohesperosuchus"。
分类.以下为1992年美国芝加哥大学的古生物学家保罗·塞里诺（Paul C. Sereno）与德国的古生物学家鲁玻特·威尔德（Rupert Wild）在对于原美颔龙的研究论文中所做的研究：而在2000年，美国乔治华盛顿大学的古生物学家詹姆士·克拉克（James M. Clark