其中，白鱀豚较早分化，也可视为一个总科级的支系，即白鱀豚总科（Lipotoidea）；随后分化的是亚河豚和拉河豚，二者组成亚河豚总科（Inioidea）。白鱀豚与亚河豚总科组成海豚总科的姊妹群，并与海豚总科一同组成海豚形类，这表明白鱀豚、亚河豚、拉河豚与海豚、鼠海豚、独角鲸等海豚总科的关系相对亲近，而与恒河豚却十分疏远。2002年周开亚发表《白鱀豚系统发生位置的研究》一文总结道：“在经历了将近一个世纪的研究之后，淡水豚类是并系的，淡水豚类的4个现生属分别属于4个独立的科，白鱀豚类至少是一个科级的阶元，这