正式编配路线号予旗下巴士路线。屿巴成立时，开办了多条巴士路线，由于当时大屿山市民对外主要靠梅窝码头的船务往返香港岛，故绝大部份屿巴路线是以梅窝码头作为起讫点。早期新大屿山巴士路线如下：
1990年代.屿巴于1992年1月被冠忠巴士集团以4000万港元全面收购，巴士亦开始更换为以日本五十铃单层空调巴士为主力。1997年东涌新市镇首期落成及青马大桥通车，以及1998年地铁（2007年与九铁合併为港铁）东涌线通车，大大缩短由香港市区往大屿山的时间及路程。屿巴遂大力拓展往来东涌新市镇