使用轻量级的XML规范包装任何语言的CLI程式，从中自动生成图形使用者介面（GUI）。对于未在3D Slicer核心程式中发佈的模组，可以使用系统自动建立和分发，以便用户从3D Slicer中进行选择并下载。3D Slicer在建立过程会利用CMake自动建立必备和可选的程式库（不包括Qt）。