藻类（Dinoflagellate）萤光素相似，但不是全然相同，磷虾自己本身并不能生产物质，但牠们却可从含有沟鞭藻类的食物中吸取得到这种物质。磷虾的发光器官是一个复杂的器官，可以聚焦光线，亦可由肌肉转动。这种器官精确的运作人类仍未能清楚了解；牠们很可能有交配的动机，可能是社交互动的方式之一。一些研究员认为磷虾可能是用荧光来作伪装的用途，用光线来令牠们的影子变得明亮如周围的环境，令位处其下方的捕猎者更难注意得到牠们。
行为.大部分的磷虾均为群居动物；那些种族会因地区和物种的不同而其大