当时仍是敌对关系，及因历史问题而对立，但因为冷战关系，两国意识形态同为反共，且同为美国的盟友，因此两国建立外交关系具有重要性。1972年，韩国民主运动、反对派领袖金大中在日本被绑架并回韩国长期拘禁，一度使日韩关系十分紧张。1978年，靖国神社将东条英机等14名甲级战犯合祀进来；1985年，日本内阁总理大臣中曾根康弘正式参拜靖国神社，遭到中国、韩国等亚洲各国强烈反对，也引起日本舆论批评；2001年，小泉纯一郎又以内阁总理大臣名义进行正式参拜，受到中国政府与韩国政府严厉批判。2002年，日本与韩国共