1952年，因美军在朝鲜战场进行细菌战，上海防疫制品产量需要成倍增加。同年3月，军管征用中法血清菌苗厂、新亚血清厂、民生实验生物所、文达生物化学制药厂等6家私营生物制品厂和余㵑医学化验所，职工增到600多人，生产品种增加了乙脑疫苗、精制破伤风疫苗、白喉抗毒素。此外，该所从人胎盘中提取丙种球蛋白，用于预防麻疹，这是该所制造血液制品的开始。1950年代初，该所成功研制白喉类毒素的深层培养法生产流程，为该所后来以发酵法生产各种菌苗提供了参考。1953年，该所改隶属中央人民政府卫生部，更名卫生部上海生物制品研