到巴黎音乐学院深造，跟过梅湘、娜笛亚布兰洁学习。1960年毕业于东京大学文学部法国文学系。其后担任东京艺术大学（1963年）及桐朋学院大学讲师（1966年）。1972年与西川由纪子结婚。1996年至2004年东京文化会馆馆长。三善晃是东京音乐大学名誉教授，音乐评论家三善清达的哥哥。三善晃与武满彻、矢代秋雄都是成长于二次大战期间的作曲家。日本着名作曲家久石让亦受到三善晃的影响。