月21日，李登辉便曾经搭乘总统专机从花莲县返回台北市。而在同年5月20日，陈水扁在参与2000年中华民国总统就职典礼后，上任隔天便搭总统专机飞往金门县，并有中华民国国防部部长伍世文、国防部参谋本部总长汤曜明、中华民国陆军总司令陈镇湘、中华民国空军总司令陈肇敏、国防部总政治作战局代理主任陈兴国等将领陪同，共同视察陆军金门防卫指挥部作战中心的防务备战状况，傍晚则飞到高雄市。而在7月14日，陈水扁特地招待新闻媒体记者随行搭坐总统专机自空军松山基地起飞，并和儿子陈致中共同出席F-CK-1经国号战斗机443战术战