立法及司法机关皆设在马尼拉。
总统.菲律宾总统为国家元首及政府首脑，自1987年起为单一任期六年，不能连任。不过，若总统在该单一任期中未有完成任期的一半而辞职，则可以再次参选，如埃斯特拉达。
国会.菲律宾国会实行两院制，设参议院和众议院。参议院有24席，每三年改选三分之一议席。众议院有292席，每三年改选约一半议席。