年（1689年）卷入南北党争，被给事中黄六鸿检举，在康熙帝的皇后佟佳氏丧葬期间，观看伶人演出《长生殿》，触犯「大不敬」罪，洪升下刑部狱，天子不忍加害，唯革去国子监监生籍，发回乡里。晚年无官宦科举之望，抑郁无聊，1691年返居钱塘，常在西湖上游历。康熙四十三年（1704年）洪昇应江宁织造曹寅邀请至金陵，以三日三夜欣赏《长生殿》的全本演唱，是年六月初一，在浙江吴兴酒醉后登舟，落水而亡。
作品.洪昇的戏曲着作有九种，除《长生殿》外，还有《回文锦》、《回龙记》、《锦绣图》、《闹高唐