2年恢复工作后；历任信阳地区农科所技术员，河南省农林科学院研究员、人事教育处副处长、农科院副院长、党委书记等职。1992年，黄晴宜转为党工干部，出任中共河南省委组织部副部长；1995年当选河南省委常委，晋升省委组织部部长；1998年，升任中共河南省委副书记；前后历经侯宗宾、李长春、马忠臣三任省委书记。1999年调中央，出任中组部副部长，成为曾庆红的副手。2002年12月，黄晴宜转任中华全国妇女联合会副主席、党组书记、书记处书记；2003年8月，在全国妇联换届选举中，接替顾秀莲出任全国妇联书记处第一书记。