海陵王迁都之后成为金朝的首都。1990年兴建住宅楼时，施工方发现了此处遗址，文物部门随后进行了发掘，最后确认发现的遗址是金中都水关遗址。该发现入选1990年的全国十大考古新发现。金中都水关遗址是中国目前最大的都城水关遗址，1995年列为第五批北京市文物保护单位，2001年被列入第五批全国重点文物保护单位。1991年，政府决定在遗址上兴建博物馆加以保护。1995年4月23日，建成的北京辽金城垣博物馆正式对社会开放。该博物馆北靠住宅区，南临凉水河。
展览.博物馆的建筑面积为25