前往堺游览没多久，即发生本能寺之变，与家康分别急速返回领地，信君在回到甲斐领地前，在宇治田原一带遭到土民杀死。其子武田信治（穴山胜千代）成为武田家家督后，天正10年6月发生天正壬午之乱，穴山众臣从于德川家康，但信治在1587年猝死，武田家家督则由家康五男信吉继嗣，穴山家也因此就此断嗣。