二战期间.在第二次世界大战中，九龙乐善堂一名副总理因牵涉反日活动，而遭日本驻港军政府清算，使堂务及人力受到空前损失，后迁址于龙岗道，即现时九龙乐善堂总办事处。
战后.在战前及香港重光之初，乐善堂堂务犹如九龙城区的乡事中心，但亦因此而未能成为香港政府认可的慈善团体，在1946年当局勅令东华三院协助九龙城中商人重组乐善堂，并由战前的总理谭杰生、陈祖泽、顾超文等人组成具法律效力的常务总理会主理善业。常务总理会由一名首总理及两名副首总理及不多于二十五名的常务总理所组