秦天王苻坚对其亦早有听闻，于是命车载他和释道安一起去见他。苻坚与之见面并畅谈甚欢，赏赐甚多。因其脚疾不良于行，苻坚当时对诸镇的书信中就写道“昔晋氏平吴，利在二陆；今破汉南，获士裁一人有半耳。”即指二人。后来凿齿因疾而返回襄阳。太元八年（383年），淝水之战后，东晋趁势收复襄阳，凿齿遂再归东晋。当时朝廷打算召凿齿入朝掌修国史，但此时凿齿去世。
治史.其主要着作为以蜀汉为正统的《汉晋春秋》，《四库总目提要》评道：“其书（《三国志》）以魏为正统，至习凿齿作《汉晋春秋》，始立异议。自朱