是重庆交通大学的主校区，行政中心和主要科研设施均在此校区。目前南岸校区主要承担本科三、四年级和研究生的教学科研功能。南岸校区中有明德楼、第1-4教学楼、语音楼等教学科研区以及慧园、知园等住宿小区。
双福校区.双福校区位于重庆市江津区双福新区，2011年基本建成并迎来首批新生驻校。校区主要完成学校本科一、二年级的教学、教育任务。校区地形为浅丘陵，地势较为平缓，地块内有水体面积约115亩的李子湖。规划2500亩教学科研用地，总建筑面积85万平方米，拟以出让方式征用400～500亩生活用