ection::::运用.1次试作车仅使用于绫瀬站～北绫瀬站间的支线运用，2014年5月被05系列取代，并终止了运营。其他的编组于千代田线绫瀬站至代代木上原站、直通运转JR常磐线（各站停车）及小田急线间营运。2017年5月12日因小田急小田原线、多摩线开始启用新标准无线电，而6000系因无改造企划，因此退出直通运转的运用。如果时刻表被打乱，并且小田急线和千代田线的直通运转停止，本型车通常不会在小田急线的代代木上原站～新宿站运行，其因是列车行先资讯无法显示新宿站(16000系已新增可显示新宿站，因此