疆的国民党特务及主战军官表示愿将部队交出，自己逃往印度。9月24日，胡宗南打电报给其部队，要求除掉刘孟纯等人后将部队带往南疆。但该命令已来不及执行。9月25日、26日，陶峙岳和包尔汉先后通电宣布同国民政府断绝关系，接受和平条款，听候中央人民政府命令。新疆和平解放实现。
共和国时期.1949年12月16日，中央人民广播电台广播了经中共中央批准，中央人民政府第十一次政务会议通过的新疆省人民政府组成人员名单，刘孟纯被发表为新疆省新政府委员兼秘书长。1950年初，中共中央派出专机将刘孟纯全