跟随其他东盟成员国不承认柬埔寨人民共和国，并曾向反抗组织提供支援。1984年，流亡海外的民主柬埔寨联合政府总理宋双访问新加坡，成为首位访新的柬埔寨政府首脑。在1993年柬埔寨恢复君主制后，首相诺罗敦·拉那烈亦在同年8月24日首访新加坡。2003年，新加坡总统塞拉潘·纳丹访问新加坡，为新加坡总统首次访柬。
经贸关系.根据经济复杂性研究中心网站上的数据，1996年至1998年间，新加坡对柬埔寨的出口额呈下降趋势，由1996年的约6亿美元降至1998年的约2亿美元。虽曾在1999年回升