1937年平津沦陷。北京大学、清华大学、南开大学奉命南迁，于长沙组成长沙临时大学。1938年春，长沙临时大学迁往昆明，改校名为国立西南联合大学。在此期间，原北京大学法律学系的部分师生奔赴抗日前线，部分师生则编入西南联合大学法商学院。法商学院由法律学系、政治学系、经济学系、社会学系、商学系组成。由于组成西南联合大学的三所学校中，只有北京大学有法律学系，因此西南联大法商学院的法律学系即为原北京大学法律学系。直至八年抗战终结，西南联合大学解散，北京大学、清华大学、南开大学各自复校，北京大学法学院亦重新复员。