于1986年由行政院核定兴建，1988年12月开工，于1993年7月封堵蓄水，1993年11月全部完工，集水面积104平方公里，总蓄水量1亿5805万立方公尺，为台湾公共给水单一目标的水库之最大者，主要为供应台南、高雄地区之公共用水，目前管理机关为台湾自来水公司。
第二期工程.第二期工程原称为「南化水库越域引水工程计画」，因水库上游山区降雨较少，而其东侧三公里外的旗山溪因发源于玉山主峰西南坡，雨量较为丰沛，因此，此工程即于高雄市甲仙大桥上游约450公尺处设甲仙堰取水，以输水隧道将旗