怪兽再次入侵地球，但因为受立雯干预而使纽顿逃跑，立雯也及时引爆所有无人机甲并制止突破点开启，但仍有三只强大怪兽「雷神」、「白蛇」和「伯劳刺」入侵地球。莫玉兰基地同样受袭并失去领袖泉元帅，赫曼和立雯赶到基地后预计三只怪兽即将一同登陆日本东京，爬上富士山将其通过怪兽体内带有毒素的蓝血促成爆发，乃至点燃整片环太平洋火山带来消灭人类。众人争分夺秒修复四架仅存机甲：铠甲凤凰、军刀雅典娜、守护者布拉沃和吉普赛复仇者，杰克担起领导者职责带领艾玛拉等所有学员准备好拯救世界。由于运送直升机均毁，杰克的队伍