人将其中一票弃权，只投一票给杰斐逊，这样可以使得杰斐逊比伯尔多得一票，使他们分别成为总统与副总统。但在实施中出了一点问题，所有选举人都投下了两张选票，导致两人同获73张选举人票，按宪法规定将由众议院进行权变选举，从二人中选择一人成为总统。然而，众议院由联邦党控制，多数联邦党议员不愿投票给杰斐逊，他们试图将伯尔选为总统。结果，众议院投票陷入僵局，投票进行了35轮之后仍然未能选出总统。在联邦党人亚历山大·汉密尔顿的游说下，在第36轮投票中部分联邦党人改变了主意，才将杰斐逊送上总统宝座。汉密尔顿的做法（以及一些其