科恩这时刚好回到荷兰，加入了东印度公司，在合恩镇入股的船上当起一名次级商务员(最低层的职员职位)。1607年年底，他所在的船只出航，在次年的11月抵达了麻六甲海崃。几个月后，他又来到爪哇最西端的贸易重镇万丹，随后参加了征剿远在数千里外的香料群岛(摩鹿加群岛)的战役，于1610年年底回到荷兰。他在荷兰停留了一年以上，受到了公司董事会的赏识，在1612年以25岁的年纪破格升任首席商务员带领两艘船再度起航至东印度。1613年重抵万丹后，与荷属东印度公司派在东南亚的总督建立了良好的工作关系。这年荷兰舰队