阿兹·吉恩让李维拉担任此届明星赛的终结者。李维拉顺利于本次明星赛救援成功，也是李维拉生涯第三次于明星赛救援成功，史上仅有他与丹尼斯·艾克斯利达成此里程碑。2006年6月20日，李维拉生涯第一次打击，但遭到三振。2006年7月16日，李维拉对上芝加哥白袜救援成功，成为史上第四位400次救援成功的选手。2006年9月初，李维拉因投球臂肘部肌群伤害而无法出赛，而当时美联东区的排名，洋基领先红袜达10场，所以球队决定让李维拉休息整个9月，该季李维拉的成绩为37次救援机会中34次救援成功、1.80的自责分