为两个完全独立的铁路系统。而且松浦铁道的运行系统也以本站为界，分为佐世保-伊万里以及伊万里-有田两个区间。
车站结构.
JR九州.侧式月台1面1线的地面车站。由负责车站业务的业务委託站。设有绿窗口、自动售票机。
松浦铁道.2面3线的地面车站。与前述的西九州线于此站形式折返式构造，月台为港湾式月台。