战爆发后，刘子山指示东莱银行紧缩业务，拒绝与日本人合作。1945年抗战结束后银行复业。1946年刘子山家族曾被中统以汉奸罪名诬陷，最终因查不出证据而被法院结案。此后刘子山体衰多病，银行业务等多交予长子刘少山处理。1948年10月12日，刘子山病逝于上海静安寺路寓所。