入血液；视网膜和胃肠道则产生旁泌性荷尔蒙。下丘脑的会由视网膜接收每日光暗的规律，从而影响褪黑素的制造。在人体内，5-羟色胺（又称为血清素）在N-乙酰基转移酶催化下与乙酰辅酶A反应转化为N-乙酰-5-羟色胺，然后N-乙酰-5-羟色胺再在催化下被"S"-腺苷甲硫氨酸甲基化为褪黑素。有些植物，例如稻米，也会制造褪黑素，哺乳类动物进食含有褪黑素的食物后，褪黑素会被吸收，溶入体内的褪黑素。
功效.
生理时钟.在动物中，褪黑激素参与同步昼夜节律，包括睡眠 - 觉醒