中国科学院自动化研究所，为中国科学院下属研究机构。成立于1956年，位于北京市海淀区，是以控制科学、模式识别、分子影像等研究为主的国家科研机构。
历史沿革.1956年，中国科学院自动化及远距离操纵研究所成立。1960年，经国家科委批准定名为中国科学院自动化研究所。1968年，中国科学院自动化研究所整建制并入中国人民解放军第五研究院，并更名为空间控制技术研究所，隶属于国防科委。1970年，在原中国科学技术大学中关村分部基础上重建中国科学院自动所研究所。