最初根据这里的三座小山丘命名为三山城（Trimountaine）；后来根据移民中一些杰出人物的家乡--英格兰波士顿的名称重新命名。当时，波士顿的居民绝大多数是来自英国的清教徒。马萨诸塞湾殖民地最初的统治者约翰·温斯罗普发表过一篇着名的布道词，题为“基督徒慈善的典范”，认为波士顿与上帝之间存在着特别的契约。温斯罗普还带动了剑桥协定的签署，这份协定被认为是创建该市的关键文献。清教徒的道德规范在波士顿塑造了一个极端稳定、结构良好的社会。例如，在波士顿建立不久，清教徒就创立了美国第一所公立学校波士顿拉丁学校（163