一方面，重要文化财的拥有、转让、继承、赠与等情况下，其固定资产税、所得税、遗产税、赠与税等方面都会有一定的减免税优惠措施（第34条、第40条之2等）。另一方面，重要文化财的拍卖转让，当初并没有为立法者顾及，因此并不受限制。例如2009年5月（滋贺县大津市）中经指定为重文的建筑被申请拍卖。对此，文化厅认为“重文因拍卖而转移其所有权，并不妥当”，主张应当采取相应措施进行规范。
下落不明的重要文化财.2016年5月，文化厅发表了2016年3月末重要文化财的现状确认调查结果。根据报告，