双孔亚目（学名：）是昆虫在鳞翅目底下的演化支包含蝴蝶和蛾。「双孔」一名是指雌性具有两个性开口，一个用于交配，另一个用于产卵，这特征与单孔亚目相异。鳞翅目中约有98％的物种属于双孔亚目。可以分为原始但有并系群的微鳞翅目（）和衍生的单系群，主要包括较大的飞蛾和蝴蝶。有背心血管的属于木蠹蛾派。 其他具有腹心血管的属于蕈蛾派。虽然很难确定其演化之间的关系的起源，但有助于了解双孔亚目的巨大多样性。