3年-1867年）中期，大约在同时手水钵也被发明出来。当时着名的日本茶道老师小堀远州的庭园中有水琴窟，且后来大家认为他是水琴窟的发明者。在江户时代末期，越来越少人制作水琴窟，可是在明治时期（1867年-1912年）又变得流行起来。在二十世纪初，也就是昭和年间早期，水琴窟这个名字几乎被大家所遗忘，东京农业大学平山胜藏教授在1959年的报告中指出，在日本他只能找到两座水琴窟，且都已经被泥土埋起来坏掉不能用了。不过1982年一位朝日新闻的记者写了一篇有关水琴窟的报导，而且向大家募集相关的情报，这使得更多水琴窟