再用胰蛋白酶处理，以去除多余的蛋白质。之后用Giemsa染色，可以得到G显带条纹。这些条纹看上去与Q显带相似，但是原理却不一样。G显带因其高分辨率而更受欢迎。G显带技术细节，即究竟是DNA还是蛋白质被染色至今未明。但是普遍认为，G显带染色过程中使得某些蛋白质从染色体中分离。DNA蛋白质之间的相互关系会因为染色体不同的碱基构成而有别。在蛋白质-二硫化物丰富的部分，Giemsa染色受阻，此段就会成为亮纹，称阳性G显带。相反阴性G显带则出现在巯基（-SH）丰富的区段。