留的葡萄牙人成立澳门议事会进行葡萄牙社区的自治管理。但葡萄牙每年需付500两白银予明朝政府与其后的清政府为地租银。到1616年，卡洛告被任命为澳督，但并没有到任。直至1623年，下一任澳督马士加路也正式到澳门到任就职。由于最初只负责澳门防务，官邸亦设于大炮台。1783年4月4日葡萄牙海事暨海外部部长以葡萄牙女王名义发佈《王室制诰》后，议事会逐渐失去其大部分权力，而作为葡萄牙国家代表的澳门总督的权力则不断扩充膨胀。在1842年清政府与英国签订《南京条约》割让香港后，葡萄牙派代表与清朝钦差大臣耆英谈判，要求