3年（永明元年），南齐竟陵王萧子良上表置文学官，何昌㝢担任竟陵王文学，受到厚遇。转为豫章王萧嶷扬州别驾，被萧嶷看重。转任太子中庶子，出任临川郡内史。担任庐陵王中军长史，没有任命，再任太子中庶子，兼屯骑校尉。转任吏部郎、侍中。494年（隆昌元年）、临海王萧昭秀担任荆州刺史，何昌㝢作为属下的西中郎长史、辅国将军、南郡太守，行荆州事。所历州郡皆清廉不贪，为官清白，为士林所称道。齐明帝杀害诸王，派遣徐玄庆（《南史》裴叔业）西上。徐玄庆入荆州，指使何昌㝢。何昌㝢拒絶，萧昭秀于是得以回到建康。495年（建武二年），