姬路城主黑田职隆之子，母亲是小寺政职之养女小寺氏，其妻为之女，儿子黑田长政为筑前国福冈藩初代藩主。讳为「祐隆」（すけたか）、「孝隆」（よしたか），后改为「孝高」，通称黑田官兵卫，出家法号为黑田如水。以身为豊臣秀吉的心腹，活跃于军略、外交等工作。他与竹中重治（半兵卫）是襄赞秀吉取得天下的参谋双璧，后世并称为「两兵卫」。
播州时代.黑田家的发祥地在近江伊香郡黑田村，家系是源自鎌仓时代宇多源氏佐佐木一党（京极氏）分出的播磨源氏。孝高的祖父黑田重隆早年制售眼药，后来出仕于播磨国御着城主