七年四月二十九日于武英殿举行即位典礼，但次日便撤离北京。清军攻入北京后，摄政王多尔衮曾将武英殿作为其理事之所。数月后，顺治帝入关登基，起初也住在武英殿。清朝初年，武英殿用作皇帝便殿，举办小型朝贺、赏赐、祭祀等等仪典。康熙八年（1669年），太和殿、干清宫等大殿维修，康熙帝一度住在武英殿里。康熙十九年庚申（1680年），设置“武英殿造办处”，雍正七年更名为“武英殿修书处”，由监造处、校刊翰林处两部分组成，掌管刊印、装潢图书之事。康熙十九年（1680年），将武英殿左右廊房设为武英殿造办处（即日后的武英殿