设置两台110/35千伏主变压器。
控制中心.3号线与其他线路共用一座控制中心，线路的指挥控制、运营管理、制票清分作业均在控制中心完成，其中二期工程初期纳入5号线管理。中心位于陈郎桥江以东，浦港路以西，宁穿路以北，靠近1号线东环南路站，占地面积24195平方米，总建筑面积81068平方米，由广州地铁设计院设计。
信号与综合控制系统.3号线采用由上海电气泰雷兹提供的CBTC信号系统。综合监控系统、环境与设备监控系统、火灾自动报警系统、变电所综合自动化系统、气