年团、交通安全队及风笛军鼓乐团。另外，学生会设有干事会和代表会，全体学生分属四社，分别或联合举办多项活动，培养学生理性及独立思维和协作能力。
学生成就.
会考方面.2004年7月，燕京书院学生洪亮斌于香港高级程度会考考获5科A级成绩，成为「高考状元」，获香港大学李嘉诚医学院取录。
体育方面.2019年3月9日，燕京书院于葵涌兴芳路足球场以互射七码击败赛马会体艺中学，勇夺创校后第一项全港中学校际女子足球比赛冠军。