分布.港湾鼠海豚喜欢浅水，春季它在海岸附近活动，秋季则比较远离海岸。其分布地区包括北半球的大部分地区。在美州太平洋海岸从洛杉矶到马更些河注入波弗特海的入海口、在亚洲太平洋海岸从黄海到楚科奇海、在北大西洋沿美洲东海岸从鳕鱼角到格陵兰岛海岸，有时甚至到夸那均有分布。在东大西洋海岸港湾鼠海豚从非洲北部（塞内加尔、毛里塔尼亚、摩洛哥）沿欧洲海岸一直到斯匹兹卑尔根均有分布。通过卡特加特海湾和斯卡格拉克海峡它们也进入波罗的海。波罗的海与北海之间的交换非常频繁。地中海中没有定居的港湾鼠海豚