达成在沦陷区内共同遵守三项原则的决定：1938年，辅大继续招收文学、教育与数学系，圣神修女会主办女院，为辅大招收女生之始。翌年，理学院各系也开始招收女生，并增设家政学系。1941年，辅大校内中外人士鑑于国际风云越趋险恶，预知美日冲突必不可免，乃将美国籍教职员陆续撤退，由德国籍人士渐次递补。12月8日太平洋战争爆发，一日之间燕京大学、协和医学院等校旋遭日本强制接收。未能及时撤退的少数辅大美国籍教职员被投入山东滩县之集中营。由于日德义三国结盟（轴心国），故德国籍教职员未遭迫害。同时辅大主持单位已改为德国