洋政府攻占，林伯渠等被迫撤回广州。1919年底，南北议和，谭延闿出任湖南都督，林修梅等湘军将领被迫离开湖南，护法战争在湖南结束。此时，林参与了协助孙中山将中华革命党改组为中国国民党的工作。
国共合作与北伐.1921年1月，林经李大钊和陈独秀介绍，在上海加入中国共产党上海党小组，成为中共创始人之一。此后林奉命南下广州，任孙中山军政府参议，10月15日，林修梅病逝于广州。1922年6月16日，陈炯明炮轰总统府，林再度流亡上海。1923年1月2日，林被任命为中国国民党总务部副部长，积极推