站编号是M 23。此站的后乐园方向设有。
历史.计划时的临时名称採用邻近的清水谷町命名为清水谷站，当时状态是距离当地最近是都电的教育大学前停留所（1910年 - 1971年），及与之相邻的清水谷町停留所两个车站。当地居民与拓殖大学所在地的地名陈情希望改名「茗荷谷站」，最后为了纪念埋于茗荷谷地下的车辆基地而命名为茗荷谷站。另外，所有町名在实施后都成为小日向。
车站结构.设有相对式月台2面2线的地下车站。月台在地下铁隧道出口，本站～后乐园站间为地面线路。月