柴油机.早期生产的DD13型柴油机车装用两台由日本国铁与新潟铁工所、、大发工业共同开发的DMF31S型柴油机。这款柴油机的前身是在1937年研制成功的DMF31H型柴油机，曾经装用于进行试验。DMF31S型柴油机是一种四冲程、六气缸、直列式、废气涡轮增压的水冷式高速柴油机，气缸直径为180毫米，活塞行程为200毫米；持续功率为370马力（275千瓦），额定转速为每分钟1300转，最高转速为每分钟1500转。考虑到加装增压装置后柴油机强化程度的提高，DMF31S型柴油机采用了铸铁制造