合作开发的《星际争霸64》在任天堂64平台上发行。该版本不仅包含了《星际争霸》和《星际争霸：母巢之战》的所有任务关卡，另增加了两个教学关，和一个新的隐藏任务“Resurrection IV”（复活IV）。《复活IV》发生在《母巢之战》剧情之后，讲述了吉姆·雷诺等人在布拉西斯行星上营救被感染的斯图科夫——前地球远征军副总司令的故事。其中，《母巢之战》的任务必须使用任天堂64 4MB扩充卡才能运行。《星际争霸64》重新设计了操作界面，还提供了两个玩家控制一个种族的模式。《星际争霸64》不具备多人游戏的能力，没有