态物是可溶性分子，可以通过浓度梯度传播和携带控制细胞分化的信号。形态细胞通常通过与特定的蛋白受体结合而发挥作用。参与形态发生的一类重要分子是转录因子蛋白，通过与DNA的相互作用来决定细胞的命运。这些基因可以通过主管调控基因进行编码，并激活或破坏其他基因的转录；反过来，这些次级基因产物可以调节在基因调控网络的调控级联中的其他基因的表达。在这个级联的末端是控制细胞迁移等细胞行为的分子类，或者更广泛地说，它们的特性，如细胞粘附或细胞收缩。例如，在调节过程中，干细胞簇脱离细胞与细胞的粘附，成为迁移，在胚胎中重新激活