一号隧道完工后，于北侧舞鹤车站旁设置「东线铁路拓宽工程殉职人员纪念碑」，纪念殉职的六名人员。本隧道南口外，东拓后新路线恰穿越东拓前旧线的红砖桥台之间，惟因电气化兴建第二代自强隧道施工需要，已拆除西侧桥台。
电气化及停用.台东线电气化时，因第一代自强隧道为单线且净空不足，决定于西侧另建双线隧道（第二代自强隧道）。然而第二代隧道同样因地质问题无法如期配合电气化于2014年6月以前完工通车，因此于第一代隧道顶部加设架空电车线，暂供电气化列车通行。2017年9月25日深夜办理第