持香港中立角色，严密防范和侦查国民党及共产党在香港进行颠覆和间谍活动。政治部直接参与反间谍案，包括：曾昭科间谋案、莱特事件、蒋特案、喀什米尔公主号事件、国旗风波和葛量洪案等等。特别的是1956年国民党的双十暴动以及1967年共产党的文化大革命影响香港的六七暴动，尤其双十暴动中的三合会「十四K」帮会、「和字头」派系帮会「和安乐」，警方成立部门对付黑社会，并成立特别部门，专门侦查三合会活动，因此怀疑为台湾国民政府的情报人员对此事件有人推动唆使，故从此被禁止进香港。此后香港便成为国民党及共产党继续角力场地，政府便