兵防，设官治理，他以为「竹堑埔宽长百里，……辟田畴，可得良田数千顷，岁增民谷数十万」；「恢恢郡邑之规模，当半线、淡水之中间，又为往来孔道冲要。即使半线设县，距竹堑尚二百四十里，不二十年，此处又将作县。流移开垦，日增日众；再二十年，淡水八里坌又将作县(置淡水厅)。气运将开，非人力所能过抑，必当因其势而利导之。」所以「大声疾唿，不啻舌敝颖秃」。蓝鼎元精熟台湾历史，入台后全面考察台湾社会、政治、经济、军事的现实和地理、风俗、信仰、教化等等方面的情况。他最早提出了对台湾进行综合治理，促进台湾走向文治社会的具体措施，