在金陵大学鼓楼校址合并组建新的南京大学，其他院系相继并入南京农学院、南京师范学院、南京工学院等高等院校，原私立金陵大学校舍归南京大学，原私立金陵女子文理学院校舍归南京师范学院。在香港，校董会在上海圣约翰大学董事会主席以及岭南大学的李应林的带领下成立香港崇基学院（1963年及以后成为香港中文大学一部分），以承继包括金陵大学在内的13所大陆地区国民政府迁台前存在的着名基督教大学。
历史.金陵大学的前身是美国教会美以美会1888年在南京成立的汇文书院（The Nanking Univer