，由台南府改制的台南民政支部管辖。隔年，台南民政支部改为台南县，台东出张所改为台东支厅。1897年（日明治三十年）台东支厅升格为台东厅。过去设卑南厅时，便有人提议日后开发后可将此处改设为一府三县，《台湾舆图》也将卑南厅分成三段。从北到南分别是崎莱（木瓜溪以北）、秀姑峦（木瓜溪到网网溪）、卑南（网网溪以南）。而根据《台湾地舆全图》说略，当初设台东直隶州时，原本计画将州域分三段，北段设花莲港厅，中段是州治水尾，南段设卑南厅。然而光绪十四年（1888年）发生大庄事件（吕家望事件），在水尾驻守的清军被歼