未敢把英国法律延伸至九龙城，直接管治；清廷则坚持对九龙城的合法管辖权，但同时已没有足够国力可恢复统治九龙城。清朝灭亡前，九龙城遂成为非常特殊的三不管地带。
日军佔领.1941年至1945年，日军在香港期间，为了扩建原名龙津河的启德明渠，拆毁了全部城墙。二战后，露宿者开始在九龙寨城聚居。二战香港重光后，1947年时任宝安县长的林子侠向外交部驻两广特派员郭德华建议恢复九龙城设治，并设民选镇长，同时为承认港九为永久割让地以向英国示好，在城内设「中华民国驻香港总领事馆」，但遭港府拒绝。