保健所政令市（或称保健所设置市）是日本依据其《地域保健法》所指定的城市，被指定的城市可以设置自己的保健所。保健所是支援地区居民健康和公共卫生的一种政府机关。依据日本《地域保健法》规定，地方政府中的都道府县、政令指定都市、中核市及其他城市和特别区可以依据法令设置保健所。
保健所政令市列表.目前山形县、茨城县、山梨县、福井县、奈良县、和歌山县、鸟取县、岛根县、德岛县、佐贺县及沖绳县辖下无任何保健所政令市存在。