外游客出入世博园区，上海市轨道交通公司共规划了三条直接与世博会园区相连的轨道交通线路，分别为轨道交通7、8、13号线。其中直接服务于世博会的轨道交通八号线，一与二期皆已开通，包括位于世博园区浦东大门的耀华路站。此外，全线35公里、直接紧邻世博园区的轨道交通七号线也已开通；轨道交通十三号线世博专用段主要由四座地铁车站—卢浦大桥站、世博大道站、马当路站、长清路站（备车功能）和四段地铁隧道区间等组成，全长约5公里，于2009年年底基本建成，2010年世博会前投入使用。除了直接进出世博会园区的轨道交通线路以外，