设置了卫所这一地方军事行政机构，册封阿哈出（赐名李承善）为建州卫指挥使，勐哥帖木儿为建州卫左都督。其后1416年又建立建州左卫，以勐哥帖木儿为指挥使，并赐姓童。建州卫早期归属奴儿干都司，奴儿干都司废除后改属辽东都司。勐哥帖木儿在被野人女真所杀后，其弟凡察与子董山被迫率众南移，最后定居赫图阿拉（今辽宁新宾），併入建州卫内。1442年，明朝又从建州左卫分立出右卫，以凡察领导右卫、董山领导左卫，形成建州三卫，三卫首领也是世袭制，但须经明朝政府认可后方生效。由于建州三卫对明朝过度干预女真产生不满，因而逐渐不