月台设置月台闸门工程已于2017年12月8日完成。为尽量增加月台空间，只有简单上色钢柱支撑庞大的月台上盖。沙田围站至乌溪沙站月台以岛式月台设计，路轨置于左右两边；至于大围站和车公庙站则将两组对行路轨置中，两个侧式月台设于左右两边。值得一提，马鞍山线是港铁唯一全线靠路轨右侧行驶的铁路，行车方向为「右上左下」（与观塘线延线及屯马线（大围 - 土瓜湾段）相同），有别于港铁大部分线路的行车方向「左上右下」，原因是当年九铁兴建马铁时需要迁就大围站设计，方便乘客于大围站下车后通过连接桥以最短距离到达东铁线往红磡方向