国家机关及有关事项的通知》，中央人民政府水利部即告结束。国务院按照《国务院组织法》的规定，将原中央人民政府水利部改为中华人民共和国水利部，接替相关工作，成为国务院的组成部门。
部门工作.按照相关规定，中央人民政府水利部在政务院财政经济委员会的指导下展开工作。中央人民政府水利部作为国家行政机构，对全国范围内的水利事业进行统一领导和管理。
组织结构.1949年设立时，中央人民政府水利部机关设置为办公厅和1委3司1局：此外，中央人民政府水利部还下设4个流域