立是为了管理闽粤械斗事件，随着民情日趋稳定，遂无设置万丹支厅的必要性，万丹支厅于是在1903年4月废止。1904年4月13日，阿缑厅将原有街庄整併，并公告「区」之划分；同月15日，潮州庄支厅改称「潮州支厅」，盐埔区亦同时改编入阿里港支厅。内埔支厅所管辖的六堆地区，亦因械斗事件在日本领台后不常发生，且内埔支厅管辖的人口和土地面积相较其他支厅少，内埔支厅于是在1905年3月31日併入潮州支厅；同时，直辖的内凤山厝庄、沟仔墘庄改编入潮州支厅。1909年10月，台湾总督府将原有之二十厅，废止合为十二厅，阿缑厅合