分隔，否则会对描述魔法少女的设定造成缺陷。制作团队亦曾经研究在第10话分隔，但后来又发现没有第9话的一些情节就不能让内容成立，未必能让观众了解原有主线和过去主线的关系，结果促成了当前的安排。整体格局上的改动，包括在［前篇］删改较缓慢的角色交流（如第8话晓美焰试图杀害美树沙耶香的桥段），或让它们以回忆形式登场；在［后篇］亦刻意放慢了说话和动作的速度，修正电视播放时一些太快和过份紧凑的地方。同时，［前篇］亦删除了电视版一开始时的梦境世界，总导演表示此举是由于电视播放时需要铺垫悬念，但剧场版就不需要就着观众的去留