数学系和物理系并入南开大学，津沽大学贸易系、会计系和企管系调入南开大学。南开大学由包含文、理、政经、工四个门类的综合性大学改为文理并重的苏联式综合性大学，设有14个系，3个专修科。1958年10月，南开大学物理系建成中国高校第一座实验性原子反应堆——“南开一号”。同年，南开大学的贸易、企业管理、会计、金融、财政、统计等经济管理科系调出，组建的河北财经学院。1960年，南开大学新增设立地质地理系、物理二系和哲学系，1961年地质地理系即停办。1965年，南开大学物理二系的原子核物理和放射化学两个专业师生整体并