成立海洋公园公司管理海洋公园，再由赛马会拨款2亿港元成立信託基金，并且需要自负盈亏，可以尽量以商业手法经营。随后公园在1989年至1992年建成集古村、鲨鱼馆及儿童王国。于1999年，海洋公园水上乐园因为入场人数不足而关闭。1998年后，由于受到亚洲金融风暴影响，加上游客认为公园欠缺新鲜感，而且镇园之宝杀人鲸海威病逝，海洋公园开始出现亏损。虽然1999年香港海洋公园获得中国大陆有关部门同意引入两只大熊猫，但是亦未能够提升入场人次。在2000年，在威威狮令的率领之下，海洋公园的吉祥物家族正式登场。起初