，钟期光任军事学院政治委员。1958年“反对教条主义”运动中，军事学院被诬称为“教条主义的大本营”。刘伯承、钟期光等被追究政治责任。不久，钟期光被免去政治委员职务，后又降职调离。 1960年12月，钟期光任军事科学院副政委，后兼任战史研究部部长。在叶剑英元帅领导下，贯彻军委的科研方针；根据毛泽东主席的指示，他和其他院领导一起带领全院开展以编写解放军军令条例和战史为中心的各项学术研究工作。期间，他主张并提出“学习毛泽东思想的立场、观点和方法，而不是单纯引用语录”，“学习毛泽东思想要与创造相结合”，“不要光