平清宗跟随平家一门流亡各地。元历二年（1185年）三月廿四，坛之浦之战爆发，平家灭亡。平清宗与父亲平宗盛欲投水自尽，但被源氏武士救起，作为俘虏一起押送镰仓。六月与源赖朝见面，并与平宗盛一起再被押往京都。途中的六月廿一，平宗盛在近江国的篠原（今滋贺县野洲市）被橘公长斩首，平清宗也于同日在近江国野路口（今滋贺县草津市）被堀景光斩首。二人的首级被送往京都的六条河原示众。平清宗有个异母弟平能宗，幼名副将丸，在平家灭亡不久后也被杀死。