湾中南部仍在进行抗日行动，所以此规划有名无实。由于抗日势力难以在短时间内平定，于是决定改行军政，之后基于〈民政支部及出张所规程〉，于8月25日将台湾县裁撤，改为「台湾民政支部」。而在此一时期，日军的攻势已到了中部一带，8月28日时已攻佔彰化。而攻打嘉义城则是10月9日的事。最初台湾民政支部底下设有嘉义、彰化、云林、苗栗、埔里社五个出张所。至于支部厅舍的位置，儿玉利国请通译吉野利喜马作评估，之后选出了鹿港街、崁仔脚（在乌日与大肚之间）、东大墩街（原台湾省城，清末为台湾府城兼台湾县城）三个地点，其中吉野