控制装置采用了与基本番台后期车辆相同的CS22D主电阻控制器、CS23D型副电阻控制器、CS24C型励磁控制器。针对基本番台机车在电阻制动工况时MR74型电阻器容量不足的缺点，1000番台机车采用了新设计的MR146型电阻器。辅助电路系统改为采用三相异步电动机驱动，并由晶闸管逆变器和DM104型电动发电机供电。列车供电系统改为由SC14型晶闸管逆变器供电。此外，1000番台机车还采用了经过改良的MT52B型牵引电动机、PS22B型受电弓（1017号机车开始改用PS22C型），以及无摇枕结构的DT138A、D