隧道所面临的交通压力渐增，有人曾倡议恢复停办多年的汽车渡轮服务。现时，维多利亚港内只剩有天星小轮有限公司、新世界第一渡轮服务有限公司，富裕小轮，珊瑚海船务四间公司提供往返维多利亚港两岸的航线。另外也有不少公司提供部份航线往返维多利亚港至澳门及广东省珠三角等地。维多利亚港有多个渡轮码头、汽车渡轮码头及公众码头。有关码头主要是提供往返维多利亚港内的航线，而中环码头更提供往返维多利亚港至离岛的航线，而在北角及观塘汽车渡轮码头仍提供危险品车辆渡轮服务。维多利亚港亦设有一些公众码头供小型驳船、游艇、观光船等