新规划与改建，并于2005年8月成立瑞穗生态教育馆正式开馆营运。改建后的主要目的是用于介绍位于中央山脉的玉里野生动物保护区、进行保育宣导以及增加游憩休息空间，可提供国、中小学生户外教学及一般民众前往参观游憩或生态解说之场所。位于花莲县瑞穗乡的温泉路上，瑞穗车站西侧约200公尺，瑞穗国小的对面。
位置.花莲县瑞穗乡温泉路一段58号(瑞穗国小对面)
特展与主题活动.定期更换主题特展，及举办生态教育之主题活动。主题特展为馆内展示，主题活动则会搭配户外环境教育