2016年3月，病毒穿入巴西的特殊事件才明朗。巴西研究人员认为，寨卡病毒在2014年世界杯足球赛期间登陆的。而法国研究人员推测则病毒是在不久后的2014年8月登陆的，当时到里约热内卢参加世界皮划艇短距离锦标赛的队员，来自的法属波利尼西亚、新喀里多尼亚、复活节岛和库克群岛。然而，法属波利尼西亚的疫情到2014年2月达到顶峰并急剧下降，不禁令人怀疑病毒是在当年晚些时候由观众和参赛选手来到巴西的推测。2016年3月，《科学》杂志发表了一篇基于样本相对较小的病毒突变数目的“”研究报告，认为寨卡病毒是在2013年5月