天主教立陶宛军中教长区（、）是立陶宛一个罗马天主教军中教长区，直属圣座，负责牧养信奉天主教的立陶宛军人及其家眷。教长区成立于2000年11月25日。2004年有十七名司铎。目前教长处于出缺状态。