政府确立了对西藏的实际控制。军事上，发生了金门炮战及中印边界冲突。但是，中共在1958年开始大跃进政策，导致经济受到挫折，发生了三年大饥荒。1966年-1970年代由毛泽东发动的文化大革命，更重挫当地的传统文化、社会秩序、法律和教育体系。在台湾，中华民国政府陆续将部队重心放在台湾、澎湖、金门、马祖上，并坚持对中国共产党实际控制的中国大陆地区拥有主权。政治上，政府严格控管言论，并压制反对势力，史称台湾白色恐怖时期。在经济上则推行一系列改革，推动《耕地三七五减租条例》、公地放领和耕者有其田等土地改革政策稳定