苏省队，1991年入选国家青年队，1992年入选国家队。1997年邓亚萍等老队员从国家队退役后，李菊与王楠、杨影等人逐步成为中国女队主力队员。李菊曾是王楠之下最好女子单打选手，但球员生涯鲜有战胜王楠的纪录。2000年悉尼奥运会，李菊先与王楠合作，战胜队友孙晋/杨影夺得女双冠军，其后又在女单决赛与王楠会师，虽然一度2：1领先，但最终被王楠逆转。2001年，李菊因身体原因退役，一年后复出重返国家队，争取雅典奥运会的参赛资格，可惜未能如愿。2004年，李菊离开国家队。2005年十运会后，李菊正式挂拍退役。退役