趋恶化的交通挤塞问题，运输署于1995年计划推出两专线小巴路线，提供屯门码头渡轮接驳服务，此路线乃其中一条。本路线于1997年投入服务，是伟文发展投得的首条屯门区内专线小巴路线（初时来往屯门码头至岭南学院，并驶经景峰径）。岭南学院于1999年升级为岭南大学后，本线缩短至屯门市中心。2001年配合本线的副线（46A）投入服务而不再驶经景峰径。2009年10月2日起增设特别班次由岭南大学往屯门市中心，服务时间为星期一至五早上7时至10时，每15分钟一班，以配合叠茵庭来往屯门市中心的非法邨巴服务于10