对伤口寄生，系统性分佈及病菌无法在土壤中生存；葡萄方面，费时十年功夫，建立防治历；草莓方面则推行育苗期防治白粉病及炭疽病；梨子方面亦从事综合防治历之建立，并首次发现世界新病害梨叶缘焦枯病，且协助政府解决东势、和平两乡镇交界处13K之病变问题。亦从事檬果(芒果)外销供果之问题，找出早期测定炭疽病及蒂腐病，田间则推出早期蔬果套袋等工作，隔绝病虫害并减少农药成本，颇有成效。吕氏之研究成果，发表于国内外重要学术杂志，数量达一百四十余篇，均收录于1997年底出版的两册《吕理燊博士论文集》中。除了进行研究，吕氏亦首