特有物种。水生植物与树木广为分布，种类繁多，形态各异，尤以波叶海菜花为着名，是湖区较为珍贵的水生植物，广布于湖泊东南面的草海，是泸沽湖最具特色的自然景观之一。草海还被誉为高原水生植物陈列馆。现今泸沽湖已被列为中华人民共和国的自然保护区，国家一类保护动物黑颈鹤亦会飞临湖区越冬。鱼类：厚唇裂腹鱼、宁蒗裂腹鱼、小口裂腹鱼、泥鳅等，其中裂腹鱼为泸沽的原种鱼，另有鲤鱼、鲢鱼、草鱼等次生鱼；禽类：红嘴鸥、野鸭、黑颈鹤、天鹅、鸬鹚、斑头雁、鸳鸯、岩鸽、画眉等；兽类：青羊、猕猴、赤鹿、林麝、穿山甲、红腹松鼠、灰腹松鼠、