，港口逐渐淤塞，至清末船只难于入港，航运功能渐失。如今港湾泥沙淤积，部分港湾内今日己被垦为良田及池塘，目前仅在下游有规模很小的渔港。
红毛港考古遗址.1953年5月，新竹县文献会委员郭辉在红毛港发现黑色「磨制石刀」断片及史前绳纹陶器碎片，深受考古学界重视，文化遗物主要是红色、褐色、淡褐色的夹沙陶。器型为侈口鼓腹的罐形器，口缘通常外侈低矮，少量带有圈足，通常从颈部以下器身佈满拍印的绳纹。石器以农业用具日常生活用具为主。应属于新石器时代中期广义的「绳纹红陶文化时期」，为新竹地区所发现最