9年12月，连接西站与老站的金华线建成投用、车站东西两端浙赣老线拆除后，老站成为一个单纯的货场，主要功能转为货物装卸、机动机车车厢存放和机车掉头及维修保养之用，原来的候车室、售票处对外出租。金华站原为上海铁路局的直属车站，管辖金华东站、金华西站和新东孝站。2005年5月，原金千铁路运营管理中心划入金华直属站的管辖范围。2006年3月21日，原金华直属站与2005年由衢州车务段、诸暨车务段合并而成的金华车务段组成新的金华车务段，金华站成为新金华车务段的下辖车站之一。2014年8月31日，婺城区政府公布