为延长之准备，即可实行有关重组方案。有关方案于2013年8月24日起实施，新40号来回程改为取道龙翔道、呈祥道、青山道（饶宗颐文化馆段）（丽港城方向）、蝴蝶谷道、荔枝角道（近昇悦居一段）、长茂街、长顺街和长荔街（荃湾方向）往返，途经黄大仙、钻石山及彩虹邨，不再途经新蒲岗、九龙城、石硖尾、深水埗及长沙湾（往荃湾方向途经启业邨和港铁荔枝角站），并取消青山道（深水埗段）、元州街、窝仔街、大坑东道、界限街、太子道西及太子道东沿途之巴士站；部分受影响之乘客可改乘2A、6D或296C线。同时，为补偿乘客往来