1年10月武昌起义，被清政府指令率舰队前往武汉江面炮轰革命军，后发现下属同情革命，11月1日与下属告别，弃舰改乘英国商船前往上海。11月袁世凯组阁，任萨镇冰为海军部长。1920年5月-8月，代理北洋政府国务总理职。1922年任福建省省长，期间聘黄乃裳为高等顾问。1926年卸任，此后主要从事社会公益和慈善事业。1933年支持和赞助十九路军闽变，曾担任在福州成立的中华共和国人民革命政府福建省人民政府主席和延建省省长。1949年8月中国人民解放军进驻福州之际，拒绝蒋中正的邀请赴台湾，并发文拥护中国