顿之间，纽约市紧邻哈德逊河，海上运输极其便利，这使其得以快速发展成为一个贸易重镇。纽约的大部分城区位于狭小的曼哈顿、史泰登岛和长岛，因此人口密度很高。哈德逊河经过哈德逊河谷流入纽约湾，是纽约市和纽泽西州的分界线。一样位在纽约市的东河流经长岛海湾，将布朗克斯和曼哈顿与长岛隔开。哈莱姆河位于东河与哈德逊河之间，分隔曼哈顿和布朗克斯两行政区。布朗克斯河流经布朗克斯和威斯特彻斯特郡，是纽约市唯一皆为淡水的河流。纽约市的大部分地区都被人为的修整过，自荷兰统治时期开始就有大量的填海造地工程在曼哈顿下城等地进行，