北车站.第四代台北车站兴建时，即已经预先建造捷运淡水线车站的穿堂与月台。最初只通车至中山站的淡水线于1997年12月25日延伸营运至台北车站；蓝线的月台则于1999年12月24日随着板南线「市政府－龙山寺」段正式通车而启用。2001年9月17日，纳莉台风侵袭，为大台北地区带来的超大雨量已经达到「四百年防洪频率」（平均每四百年才会出现一次的洪水量），远高于捷运地下段所能承受的「两百年防洪频率」。由于防洪设施出现缺口，导致包括台北车站（两线月台）在内的数个南港线、淡水线车站严重淹水，行控中心紧急撤离（稍晚