（PEDV）的亲缘关系较为接近，两者可能曾有重组发生。
基因组.高头蝠冠状病毒512为正链单股RNA病毒，具有外膜，其基因组长约28.2kb，编码冠状病毒皆有的复制酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）与衣壳蛋白（N）等四种结构蛋白，另外还有两开放阅读框编码辅助蛋白，分别是位于刺突蛋白与外膜蛋白基因间的ORF3，与位于基因组最3端（衣壳蛋白基因下游）的ORF10，后者为此病毒所特有，编码一长129个胺基酸的辅助蛋白，未能在其他病毒中找到与之同源的序列。