十九年（1550年）和三十五年（1556年），学宫两次迁移。嘉靖三十九年（1560年），知县范性相又建启圣宫、敬一亭及名宦祠、乡贤祠。万历六年（1530年）和十六年（1530年），学宫再次两移其址。万历二十七年（1599年），知县李官重修大成殿、两庑、棂星门及泮池等建筑，池上建桥，名为“飞虹”。两年后，知县张世臣筑起“万仞宫墙”，修东西庑与博文、约礼二斋。万历四十五年（1617年），知县袁仲钖建腾蛟起凤、兴贤仰圣二坊，并在泮池左右增建“奋龙”、“飞凤”二桥。天启二年（1622年），知县唐世涵改建学宫于城