在1883年，已经在马其顿设立宗座代牧区，直至1922年或1924年。而当时该教会是保加利亚希腊礼天主教会的一部分。在第一次世界大战结束和南斯拉夫管治期间，代牧区被併入拜占庭礼天主教克里热夫齐教区。2000年5月24日，圣座从普里兹伦宗座署理区中，分出罗马礼斯科普里教区。2001年，任命以上教区主教兼任马其顿宗座代牧区宗座代牧。 2008年，宗座代牧区由拜占庭礼天主教克里热夫齐教区中，正式分出。2018年3月31日，该教会唯一一个的宗座代牧区升格为教区并易名。
现况.现在马其顿