这个词源可追溯到1529年神圣罗马帝国，当时神圣罗马皇帝查理五世借会议推翻了1526年的决定，重申帝国境内只可以信奉天主教，并进一步镇压马丁·路德等宗教改革势力。查理五世此举最终引起会议内改革派强烈反弹，支持马丁·路德的萨克森选帝侯等六位王公和十四个帝国自由市代表在会中宣读了一篇名爲《抗议》的文件，自此教会的改革派就被称爲「抗议派」，而新教在汉语的典籍中，往往亦有「抗罗宗」、「改革教」、「更正教」、「归正教」、“誓反教”等旧式称唿。汉语文化圈中普遍以「基督教」一词直接称唿新教。「新教」这学术名称为是对应历史