大三巴与大堂相继被毁，主敎座堂从而迁至玫瑰圣母堂至1847年。直至1926年，葡萄牙重新准予天主敎活动，天主敎才在澳门再度活跃。1941年发生的太平洋战争期间，天主敎致力于赈灾。到1950年代，澳门天主敎敎区开始致力于教育事务。其后，澳门敎区积极参与文化、社会福利等工作。1965年，澳门敎区按澳葡政府行政区规划，五大堂区分别为大堂区、圣安多尼堂区、望德堂区、圣老楞佐堂区及花地玛圣母堂区。1988年，林家骏神父成为澳门敎区出现首位华人主敎。据1996年的人口统计，天主教徒佔澳门人口的6.7%，约30,00