忠次与大久保忠世一同担任使者前往安土城向信长解释，但忠次老实承认信件内文千真万确，完全没帮信康说情美言，导致信康遭下令切腹。此举让家康对忠次怀恨在心，也让天下统一后酒井家待遇羞辱性的低下。以后仍然作为重臣仕于家康，天正10年（1582年）6月2日本能寺之变发生后，返回冈崎城的家康计划讨伐明智光秀之际成为先阵。家康在信长横死后掌握了成为空白地带的武田遗领甲斐和信浓（天正壬午之乱），同年6月27日忠次被派遣到信浓，对信浓的国人众採取怀柔政策（『家忠日记』）。忠次经由奥三河伊那向信浓侵攻，但对于诹访赖忠和小笠