时奴儿干都司重新恢复，明英宗时期在今库页岛的北半部地区设立卫所管辖，而且明朝官方仍然在东北地区由极高的统治权，可以发配审判当地各民族罪犯
后续.1616年，努尔哈赤在东北建立后金，明朝灭亡后，原属奴儿干地区为清朝管辖。后来其中乌苏里江以东部分地区于1860年第二次鸦片战争后被迫割让给沙皇俄国。今着名城市有伯力（俄称哈巴罗夫斯克）、阿穆尔河（黑龙江）畔共青城等。亦永宁寺碑，清代乌苏里江以东领土割让给沙俄后，1885年曹廷杰曾冒险拓回碑文，1904年归于海参崴的两个博物馆。