1999年世界一级方程式锦标赛为国际汽车联盟举办的第50届世界一级方程式锦标赛，举办日期为1999年3月7日至10月31日，共有16场大奖赛。此次赛季的锦标赛赛历首次新增了马来西亚大奖赛。尽管、大卫·库塔和亨茨·赫拉德·弗伦岑都有机会赢得冠军，但米卡·海基宁最终仍赢得了车手世界冠军。法拉利车队赢得了车队世界冠军，这让法拉利的麦可·舒马克称霸时代首开先路。舒马克曾在因断腿而在赛季中断比赛，不过在季末仍重返赛场。
车队及车手阵容.以下的车队与车手出赛于1999年世界一级方程式锦标赛。