02年机场当局开始着手新的樟宜机场高架旅客运送车及2号航厦升级计划，该升级计划在2006年9月13日完成，花了约2亿4000万新加坡元，升级内容包括内部装饰、玻璃外观及客运大楼设计。航厦的进一步升级工程在2007年9月展开，斥资5000万新元重修两条跑道及旧的滑行道。3号客运大楼亦在2007年进行测试，以准备在2008年正式营运。同时樟宜机场亦改善其保安系统，例如存取控制和监察系统，确保旅客的安全。2006年机场启用了一条较短的跑道，主要给樟宜空军基地（东）使用，及为不断增加的航班进行过渡。为了迎接