随后于1957年、1964年分别当选为第3、5届县长，省辖台中市市歌与台中县县歌均由林鹤年谱曲。林鹤年在台中县长任内协助政府辟建公馆空军基地、完成建港计画、改组农会及社区改造。第七届县长选举时，一度使林、陈二派支持参选，最后林鹤年选择退出选举。出任华南银行监察人。