洲站分为南北两个站厅，均位于地下一层。两个站厅及两个月台无论在收费区范围以及非收费区范围均可由两条路轨下方的联络通道前往。两个站厅分别设有售票机和客务中心；同时设有自动售卡/充值机和“好易”自助服务机。
月台.本站设有两个侧式月台，位于新港东路地底。本站月台东端设有一条交叉渡线，从本站启用至2005年12月26日前本站仍为2号线终点站时便使用该渡线折返2号线列车。另外，在月台西端亦设有单渡线，当8号线琶洲至万胜围段出现故障时，往万胜围站的列车将会通过此存车线折返，以本站为临