家庭.1937年（昭和12年），与陈玉梅结婚。两人生下五子一女。
慈善事业.1981年4月10日，吴尊贤及其家族捐出新台币一亿元股票成立吴尊贤文教公益基金会。
荣誉与纪念.台南市政府将吴尊贤列名在「台南历史名人」中。2015年，吴三连与吴修齐、吴尊贤兄弟的故居被台南市政府指定为纪念建筑。
着作.《吴尊贤回忆录》。