全氟辛烷磺酸与全氟辛酸存在于母乳和新生儿的血液中。一项2013年的调查表明，地下水与土壤中的全氟烷磺酸与人类活动有一些相关性，但是并没有明确的结果表明哪一种化学物质会占主导地位；较高的全氟辛烷磺酸和较高全氟辛酸呈现相关性。在人体内，全氟烷磺酸会与诸如血清白蛋白等的蛋白质相结合，并且具有在通过肾脏排出之前在人体内的肝脏和血液中聚集的趋势。大剂量的全氟辛烷磺酸和全氟辛酸可以导致癌症，并且导致新生幼鼠的死亡，但是还没有关于在当前的暴露水平下其对人影响的人体研究。