以李太后对该观多有布施。崇祯八年（1635），仓场侍郎程注、管河御史禹好善共同重修该观。清朝顺治八年（1651年），顺治帝慕名来到佑民观，亲自来观中上香求子，并赏银五百两，又经通州士绅田文孝募捐三百两银子，用于修缮该馆以及香火之资。后来，该观在干隆、光绪、中华民国等时期多次修葺。清末民初，佑民观共有十多位道士，庙产有十多顷，此外还有骡马、大车、雇工。该馆还有分观，比如潞应观（今属张家湾镇北大化村）。该观十分富有，成为宗教地主。 中华民国时期，该观财产耗尽，日渐衰落。佑民观为北京市通州区文物保护单