清华大学临床神经科学研究院”和“脑神经疾病研究所”两个神经科学研究机构，主办国家级杂志《Translational Neuroscience and Clinics（英文）》。该医院的重点学科是脑科中心，由神经外科、神经内科、精神卫生科组成，是清华大学医学院博士后流动站及博士学位授予点，也是清华大学生命科学与医学研究院脑科学与神经疾病研究所的临床治疗中心。