自治运动主张香港在《基本法》和一国两制大前提下，应享有真正的自治权利，并非主张香港独立。陈云根本为运动的提倡者及顾问，但于2013年6月13日，香港自治运动组织宣布与陈云根终止合作关系，原因未有解释。。现时多数的泛民主派及自决派皆争取香港有真正的自治及真普选，而非支持香港独立。
徽号.龙狮香港旗是香港自治运动的代表旗帜，旗帜构图带有经修改加上汉字「香港」二字的英殖时期香港盾徽。据香港自治运动的介绍，于原有香港盾徽中加入「香港」两字是象征同时继承中华及英国文化，而以象征自由的贵族蓝