多数鱼类一样，异鳉科的鱼一般採用体外受精的方式繁殖。但是其中有个种会採用体内受精的方法繁育后代（例如青鳉），并在幼鱼将要孵出时产卵。 一些异鳉科的鱼会将鱼卵携带在腹鳍之间。基因研究显示，异鳉科的鱼最早发源于苏拉威西岛，并逐渐扩展到亚洲大陆。而所谓的异色鳉属（"Xenopoecilus"）与该科的关系并不明显。