途》一文，公开声明脱离中国共产党。1928年6月24日，被中共福建临时省委开除中国共产党党籍。1928年8月，中共中央派郑超麟为巡视员到福建整顿省委组织。陈祖康得知郑超麟抵达厦门，即派人跟踪，伺机逮捕但未遂。1928年冬，陈祖康和陈卓凡一起去上海找谭平山介绍加入中华革命党（即“第三党”），并被任命为闽南地区党务筹备员，在漳州、厦门发展“第三党”的组织。1929年8月8日，朱德率红四军攻占漳平城。8月12日，红军组织群众到陈祖康家杀猪出谷，并烧毁其房屋。8月19日，红四军开往闽中，陈祖康即作为岩平宁剿