化五年（1469年），析温州府乐清县、台州府黄巖县地置太平县，隶台州府。入清以前，温州府增设一县，辖五县。
清朝.清朝时，府治仍为永嘉县。雍正六年（1728年）后，温州府范围大约等同今日的温州市（不包含泰顺县西南少数地区、乐清市少数地区、文成县大部分、洞头区大部分）以及丽水市青田县东部少数地区、福建福鼎市沙埕镇台山列岛。雍正六年（1728年），析温州府乐清县、台州府太平县地置玉环厅，为温处道直辖之直隶厅，不属温州府。至此，温州府辖五县如下：
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