藏巴等代理政权的更替，进入西藏历史上的「各教派统治时期」。
萨迦巴.13世纪初，强悍的蒙古族在北方兴起，成立蒙古帝国。从1206年开始，成吉思汗及其后继者先后灭掉畏兀儿、西辽、西夏、金朝和大理国。1240年，蒙古大汗窝阔台的皇子阔端派遣大将多达，率军深入西藏，企图了解西藏的政治形势和众多教派的详细情况。1244年，60余岁的萨迦派高僧萨迦班智达（简称萨班）受阔端的邀请，起程前往凉州。1247年，萨班与阔端会晤，并以西域学者为译师，向阔端宣讲佛法。阔端逐渐敬信并决定免除天下僧尼的赋税