故而该寺有“明寺”之称。明朝弘治九年（1496年）、万历四十一年（1613年）、清朝康熙十五年（1676年）重修。清朝康熙三十四年（1695年）到康熙三十五年（1696年）再度大修，在寺门棚面悬挂横额“敕赐礼拜寺”。民国十年（1921年）重修。中华人民共和国时期，1955年人民政府拨款全面修缮。文化大革命期间，该寺关闭。1979年到1980年，人民政府拨款重新贴金并油饰彩绘。1980年，牛街礼拜寺重新开放。1996年牛街礼拜寺进行千年纪念修缮工程。2003年，北京市投资千万元人民币再度修缮。1966