落成前，一直是关东州的中心神社。1945年8月，日本投降后，苏联红军佔领关东州。苏军一度进入神社，但在观看了神职人员的雅乐与舞乐后，大为称赞。因而并未遭到破坏。1947年3月14日，原神社宫司水野久直将大连神社的神体、神宝带回日本本土，暂厝在福冈的筥崎宫。后水野改任赤间神宫宫司，在神宫内设了一间小祠，将大连神社的神体迁来供奉。1973年，第60次神宫式年迁宫时，接收了伊势神宫汰换的旧建材。1980年，移至现在的位置。大连神社原址现为大连外国语大学。
佈置.在威德殿内保存有神