同时出兵南下回部，将吐鲁番、喀喇沙尔、叶尔羌、喀什噶尔等城置于直接统治之下，与清军控制下的哈密对峙。康熙五十五年（1716年），策妄阿拉布坦派大策零敦多布领兵六千，昼伏夜行，秘密潜入西藏。次年（1717年）十一月，大策零敦多布偷袭拉萨，杀死和硕特部首领拉藏汗，控制了藏内局势。康熙五十七年（1718年）十月，康熙帝发兵入藏。两年后（1720年），清军将准噶尔军逐出西藏，大策零敦多布逃回伊犁。清朝从此在西藏驻军，并于数年后设立驻藏大臣管理西藏。康熙皇帝撰写平定西藏记，立御制平定西藏碑于布达拉宫前。康熙六十年