木达·哈新履行承诺，委任他为砂拉越总督。1842年7月，汶莱苏丹奥玛·阿里（Omar Ali）承认了这一任命，布鲁克于同年8月18日正式上任，但苏丹旧总督班根丁·马哥达感到不满，开始进行敌对活动。1843年10月，布鲁克在皇家海军的协助之下，将哈新扶植为汶莱首相。布鲁克确立了自己的地位后，他委任亨利·怀斯（Henry Wise）为代表，在伦敦游说英国政府承认砂拉越的地位，并且引起普通投资者的兴趣。1848年，怀斯创办了东方群岛公司（Eastern Archipelago Company），开发砂拉越和纳闽。