科尔托斯坦共和国的发展历史中最早出现的人类是在旧石器时代，随后到了铜器时代该地区的人口快速的成长，而“巴什基尔”一词最早出现于西元九世纪。西元10世纪，伊斯兰教传入巴什基尔民族中，14世纪时成为支配该区域的宗教，直到16世纪时该区域被划归喀山汗国和西伯利亚汗国。而到了1554-1555年，喀山成为莫斯科公国的势力范围，巴什基尔族的族长向莫斯科表示他们是出于自由意志的希望加入莫斯科公国，最后在1865年，乌法州成为俄罗斯帝国的一部分。在十月革命之后，巴什基尔苏维埃社会主义自治共和国于1919年成立，193