军毛穆之领兵救援魏兴，但前锋督护赵福和袁虞等所领的一万水兵在南县败于前秦将领张绍、仇生等人，毛穆之被逼退屯巴东郡。至四月戊申日（5月28日），魏兴城破，吉挹拿刀自杀但被身边友人强行阻止。前秦军俘虏吉挹后，吉挹不发一言，绝食而死。前秦天王苻坚因而感叹：「周孟威不屈于前，丁彦远洁己于后，吉祖沖闭口而死，何晋氏之多忠臣也。」吉挹参军史颖后来返回东晋，带着吉挹临终写的上疏，在桓沖的上表之下，吉挹获朝廷追赠益州刺史。在今天陕西省安康市汉滨区吉河镇有吉挹城古战场遗址，是吉挹在太元三年至四年与前秦对战的遗址。