（1561年）冬，任吏部尚书。嘉靖四十二年（1563年）三月，守父丧，嘉靖四十四年（1565年）四月，夺情视事。嘉靖四十五年（1566年）三月，兼任武英殿大学士。隆庆元年（1567年）九月，致仕回籍，隐居安阳东郊。万历二十一年（1593年）五月十八日卒。追赠太傅，谥文简。。翌年十一月二日葬于韩陵之阳（山南）。
纪念.安阳城内建有郭朴祠，建筑至今尚存，为安阳市文物保护单位。