保安警察和党卫军保安勤务处合作，镇压奥地利反纳粹人士，没收犹太人的财产并将其驱逐至东方。1939年5月1日，赛斯-英夸特出任德国不管部部长。 
二战期间.1939年9月，赛斯-英夸特出任德占波兰南部行政长官。10月12日，升任汉斯·法郎克治理下的德占波兰总督辖区的副总督。1940年5月18日，赛斯-英夸特取代亚历山大·冯·法肯豪森将军成为荷兰总督辖区总督，主管平民事务与增进德国所获利益。到任后，赛斯-英夸特开展了称之为“消灭敌手”的行动，大力扶植荷兰国家社会主义运动并授权该政党创