最高点海拔200米，位于市镇巴特贝尔齐希以西的，最低点海拔28米，位于哈弗尔塞附近的哈弗尔河。全县约42％的面积是森林，50%为农业用地，其中约2700公顷种植水果，2000公顷种植芦笋。其余7%的面积为建筑用地。波茨坦-米特尔马克县内的主要河流为哈弗尔河及其支流尼普利茨河、努特河、、普拉讷河与布考河，主要湖泊有、大塞丁湖、施维洛湖与滕普林湖。有三个全部或部分位于县内，分别为、与。除此之外县内还有多个自然保护区。该县有五块飞地位于萨克森-安哈尔特州的市镇默肯，这些飞地归属于布考塔尔和齐萨尔。而默肯也