在加藤忠广改易时流传的谣言，最终忠长的大名地位遭到除封，领国全部被没收，10月20日以暂时安置于安藤重长处的形式，受到幽禁上野国高崎的处分。同时，朝仓宣正及鸟居成次因连坐而遭到除封。在细川家史料中，曾把下场相似的德川家的忠辉（家康六子松平忠辉）、忠直（结城秀康长子、家康之孙松平忠直）和忠长相提并论。寛永十年12月6日（新历换算是1634年1月5日），忠长依据幕府的命令于高崎的大信寺自尽，得年28岁。墓所是在延宝三年（1675年）的43回忌时在大信寺建立，现在是高崎市指定史迹，另外忠长的砚箱、自尽时使用的