京大屠杀而判罪者仅有身为乙丙级战犯的松井石根，罪状是未阻止南京大屠杀的进行；不过在南京军事法庭方面的审判则起诉包括百人斩见报的向井敏明、野田毅以及南京大屠杀时期担任第六师团师团长的谷寿夫等人并判决死刑，三人随后于1948年1月28日和4月26日，于南京雨花台刑场枪决伏法。出于对战争犯罪追究的恐惧，日本政府在停战后迅速展开了有组织的大规模销毁罪证的行动。1950年苏联向中国新政权移交日本战犯969人、伪满战犯约300人，与在此之前国共内战掳获的140名日本战犯，集中安置在抚顺战犯管理所和太原战犯管理所