息地.黄眼企鹅一般在森林、斜坡或岸边筑巢，巢穴的地方往往都是在海湾的地方。巢穴都是分佈在新西兰，在南岛的东南岸、弗佛海崃、斯图尔特岛、奥克兰群岛及坎贝尔岛。
保育.黄眼企鹅是濒危物种，估计只有约4000只。牠们是世界上最稀有的企鹅之一。其主要的威胁是失去栖息地、掠食者的出现及环境变迁。牠们是所有现存企鹅中最古老的。于2007年11月，在成立了一个保育区域，以保护超过10%的黄眼企鹅数量。
健康.在及的黄眼企鹅，于2004年春天感染了不知名的疾病，死去