受到1950年代初中国反美运动的干扰，在以独特的方式参与了政府组织的爱国运动，如反美游行、政治学习、包括控诉运动后，仍然享有一定程度的宗教自由，可以继续向外传福音，信徒人数仍在稳步增长，并在1950年代兴建了鼓楼头条巷聚会所。1951年4月，中央人民政府政务院在北京召开“处理接受美国津贴的基督教团体会议”，倪柝声应邀参加，此后地方教会的信徒加入三自爱国运动。但是在随后立即开始的控诉运动中，南京地方教会（祠堂巷聚会处）与杨绍唐主持的黄泥岗教会一同受到冲击，雷智伯、季永同、丁荣施、马宗符四位长老被控“一贯散