先驱约瑟夫·鲍德温（Joseph Baldwin）于1867年创立，最初名为“北密苏里师范及商业学校”。1870年，该校成为密苏里州第一所公立师范学校，其学区覆盖密苏里州25个县。1972年，该校改名为“东北密苏里州立大学”。1985年，州长约翰·阿什克罗夫特签署法令确立该校为密苏里州唯一全州范围的人文与科学公立大学；这使得该大学从原来东北部区域性大学转变为全州性大学。到1990年代，该大学不再是单一的师范学校，已拥有全国知名的会计专业以及科学、数学、计算机科学、文学等学院。1995年，州长梅尔·卡