司令部和各分队，司令部是商团的作战指挥及后勤保障机构，主要由司令、参谋、牧师及军医等组成。在司令部下，设有A、B、C、骑兵、特种兵、炮兵六个大队。A大队下辖甲队、乙队、上海苏格兰队、犹太队以及防空队。B大队包括美国队、葡萄牙队、美国后备队、美国机枪队和菲律宾队。C大队，俗称俄国联队，是商团内唯一一支常备军队，下辖俄国常备队和俄国义勇队。骑兵大队，分上海骑兵队和美国骑兵队。特种兵大队，主要包括上海工程队、装甲车队、中华队、日本队、译员队、运输队和通讯队。炮兵大队则辖有上海重炮队和上海轻炮队，该队持续到1935