车站建于1995年，原名高河埠站，设计为二等编组站。1998年9月25日开工增建3条股道，当年12月竣工，随后怀宁县城因铁路发展搬迁至车站附近的高河镇。2000年10月10日车站更名为安庆西站；2020年11月20日起又更名为怀宁站，安庆西站一名用于合安高铁车站。
车站结构.怀宁站站房北侧为售票厅，面积350平方，内设6个售票窗口和5台自动售票机；设有总面积820平方米的候车室共2个，总共可容纳800名旅客。
站线配置.怀宁站现有7条股道，另设有2条货物线