966年）.马丁内斯在下台后，流亡危地马拉。同年危地马拉的豪尔赫·乌维科独裁政府被推翻，之后马丁内斯逃亡前往洪都拉斯居住。1966年，马丁内斯在洪都拉斯的农场里被自己的私人汽车驾驶员杀害，终年83岁。
轶闻.马丁内斯非常迷信神秘学。当天花在萨尔瓦多全境肆虐的时候，他下令城市里挂满彩色灯，因为他认为如此便能治愈这种疾病。此外，马丁内斯也相信轮回转世一说，他曾经说过“杀死一只蚂蚁的罪行比杀死一个人还要重。因为人死后能够轮回转世，蚂蚁的死则是永远。”（西班牙语：Es un crimen