WAV、MPEG-4、AAC与Apple Lossless之间。iTunes也能播放任何QuickTime能播放的（甚至是一些视讯格式），包括来自iTunes Store与Audible.com有声书的受保护的AAC档案。为了播放其他格式，例如内含Ogg的Vorbis或Speex编码，iTunes需要安装Xiph QuickTime元件。曾经有一些对苹果公司MP3编码器对于以可变位元率编码的品质评论。在2004年1月，双重匿名的六种MP3以128 kbit/s编码的编码器，由Roberto Amor