《保禄的皈依》和《伯多禄被倒钉十字架》绘制于1542年至1549年，这是他成名的巅峰，但当时的观众普遍都很失望甚至视为失败。它们并不符合当时的组合惯例，主题以非正统的方式描绘。虽然小堂和壁画主题都很重要，但是湿壁画大体上受到忽视，而米开朗基罗在附近的西斯汀小堂的杰作则广受推崇。一位意大利学者通过面部叠加，在圣保禄和圣伯多禄的画作中认出了米开朗基罗的脸。