土本武司在1957年毕业于中央大学法学院，之后进入东京大学大学院学习。在大学就读期间，以为师，后在律师资格考试中通过。在后来的工作中周密的提出了着名的刑事诉讼法理论。1991年7月11日发生了《撒旦诗篇》日文版译者被杀事件，土本武司是第一时间发现了五十岚一的尸体并报警。2011年10月在对在2009年发生的进行审判，土本武司作为辩护方的证人出庭，尽管土本武司对死刑制度表示支持，但他主张不应对嫌疑人判处绞刑，而且他还说出了“绞刑无法令人正视，实在过于残忍”的证言。