红树巨蜥的大量死亡导致当地的椰子害虫猖獗起来。其皮可以用来制造磁鼓头，虽然这种贸易规模较小，但仍有学者认为这是一种过度利用。更多的地方只是将其当做食物，或者因其危害家养动物而将之捕杀。关岛当地有一种传统食物是用红树巨蜥的肉制成的。红树巨蜥常见于动物园中，有时也被当成宠物来贸易。其性警觉而且被驯服后容易控制。家养环境下可活20年以上。