面积5200公顷的海洋保护区。对于工程对渔业的影响，当局建议在拟定的海岸公园敷设人工鱼礁以吸引稚鱼，使渔业资源得以恢复，并且推行渔业优化策略，包括成立渔业提升基金。
财政.
融资.香港机场管理局将会透过借贷承担三跑道系统当中1/3工程费用，余下2/3建筑费用将透过停止向政府派息、向旅客征收每人180元的机场建设费、以及增加航空公司收费等方式筹措。外界预料乘客除直接缴付建设费外，航空公司征费增加最终亦转嫁给乘客，乘客变相双重付费。有立法会议员质疑机管局向乘客