五分金球制胜规则——当两队总比分打成2：2之后，两队将进行第五场的单打较量，而任意一方在本次比赛中率先取得五分，该队将取得全场比赛的胜利。这一规则在乒超联赛中实行了两个赛季，于2003–2004年赛季前被取消。
队伍变动.1999年赛季的乒超联赛只升不降，男女团比赛的参赛队伍扩军至12支，位列男子甲A联赛前四名的广东东莞国梁队、四川电通寻唿队、河北万岁药业队、河南许继集团队升入乒超联赛；位列女子甲A联赛前四名的天津三星生命队、广东福地队、江苏徐州国投队、河北六通队升入乒超联赛。