要求乃木希典于辞退该等人员之外，也顺势罢免高野孟矩的台湾总督府法务部长与高等法院院长职位。被罢免两项职务的高野孟矩对此表示不服。他认为大日本帝国宪法中保障司法官的任期与权利，总督府并不可以在罢免法务部长同时也免除他法院院长职务，而乃木希典则认为实施六三法的台湾并不受日本宪法约束。对院长免除命令不服的高野，仍照常至高院上班，随即遭法院法警驱离，而支持高野的台北地方法院、新竹地方法院两院院长及多位司法人员也相继辞职离台返回日本。