一位虔诚的正教会信徒，他通过普世牧首约翰二世修复与罗马公教会的关系， 最终于519年3月底结束教会分裂状态，此后查士丁统治时期教会基本保持着相对和平稳定的状态。在525年查士丁一世废除了禁止宫廷官员与底层人民通婚的法律，这可能是查士丁尼在背后推动的，而狄奥多拉也因此被允许与查士丁尼结婚。在查士丁一世统治的最后几年，帝国与周边国家冲突不断。在意大利半岛，东哥特国王狄奥多里克怀疑帝国对其图谋不轨，在国内迫害亲罗马派，甚至以暗通帝国谋反为名通过罗马元老院处死了着名哲学家波爱修斯， 直到526年狄奥多里克去世才