喇嘛土登嘉措发生冲突后，他自己寺庙的喇嘛被禁止在拉萨的噶厦政府担任任何要职，而且他的官员在拉萨遭到囚禁；班禅喇嘛觉查到对自身的威胁，他借沐浴之期从藏北高原经甘州、凉州逃亡到了内蒙古。在内蒙古期间，班禅喇嘛致力于规划西藏的现代发展路线。他抵达北京，向大总统曹锟报告了西藏政局和整饬边防的意见，候命期间到山东、南京、上海、杭州、甘肃、青海、东北、内蒙等地游历讲佛。1929年，在南京设立班禅驻南京办事处，之后又在北平、四川、西康、山西、绥远、青海等地设立办事处。1931年，参加国民会议，国民政府赐予他护国宣化广