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争议.随着游戏的多次更新，游戏者与游戏的管理员（简称GM）的各种矛盾也逐渐产生，有时甚至激化到不可调解的程度，主要表现在以下几个方面：
shoot机制.由于猫游记作为网页游戏相对简单的技术含量，导致外挂程序（简称WG）较为泛滥，对游戏平衡性造成影响，GM设计了名为“shoot”的随机弹出窗口来检测游戏者是否为手动游戏，没有通过shoot检测的游戏者将增加一点挂机点数并清除该级别的所有已获得的经验值（后改为降低5%经验值），挂机点数为3点时该游戏账号将被