金、社会住宅、健康保险以及扶助弱势。1997年苏贞昌竞选台北县长（今新北市长），林万亿协助苏拟定政见，并设计「在地人的好所在，外地人的新故乡」等选举标语。1998年林万亿参加行政院举办的一场研讨会，建议政府重视老人福利问题，获时任行政院副院长的刘兆玄注意。同年政府推行老人长期照顾宣导计画，但隔年便因政党轮替而终止。1999年，台北县长苏贞昌商请林万亿担任副县长，林万亿遂放弃台湾大学社会学系教授兼系主任的教职，协助苏贞昌治理台北县。在副县长任期内，台北县政府兴建或整顿莺歌陶瓷博物馆、渔人码头、十三