措于11月15日行至青海道附近得病圆寂，按照乱臣的处置方法，将尸体抛弃在野外。当时西藏官方亦称其在青海湖附近的公噶瑙尔圆寂。不过，有不少人怀疑他遭到了谋杀。不过，与官方史料记载截然不同的是，其他资料中却普遍记载着仓央嘉措逃脱的说法。其中一种说法是：康熙帝派人至西藏调停和硕特汗与西藏格鲁派的关系，因拉藏汗种种诋毁，钦差无可奈何，只得邀请仓央嘉措去北京辩解。行至青海地界时，康熙帝降旨责备钦差办理不善。正在钦差进退维谷的时候，仓央嘉措主动舍弃了达赖喇嘛的名位，决意遁去。钦差只得以途中得病圆寂、依照乱臣之法弃尸