秦桧死，周葵再任直秘阁知绍兴府（治今浙江省绍兴市）。为权礼部侍郎兼国子祭酒，兼权给事中。被侍御史汤鹏举弹劾，出知信州，改提点河南刑狱公事。绍兴末年，知太平州，水坏圩堤，全部一百二十里加以修复，又浚导河道。入朝为集英殿修撰、敷文阁待制、知婺州（治今浙江省金华市）。宋孝宗即位，担任兵部侍郎兼侍讲，改权户部侍郎，拜参知政事，隆兴二年（1164年）兼权知枢密院事。他反对北伐，与丞相虞允文、陈康伯不合，自请罢职。以资政殿学士提举洞霄宫，改知泉州，告老，以资政殿大学士致仕，淳熙元年（1174年）周葵卒，赠正奉大夫，谥号