新选组.和近藤参加浪士组上京后，在新选组时期担任组织核心的第二队队长。由于与芹泽鸭同样握有神道无念流免许皆传的认可与实力，与芹沢为匪浅之亲交。元治元年（1864年），在沖田总司病倒、藤堂平助受伤的情况下，永仓新八仍像个狮子般和近藤勇、土方岁三在池田屋中奋力杀敌，最终成功断绝倒幕派浪人火烧京都的野心。池田屋事件后远近驰名的近藤等人，难免被世人与幕府捧的飘飘然，对队士和下属目空一切。对此感到遗憾的永仓，与原田左之助、岛田魁冒着违反局中法度切腹的风险脱离新选组住所向松平容保上书。认为