缺乏相近的化石或现生生物种而有所争议，有人将其归入猪亚科，也有人将其视为一独立的亚科，鹿豚属的许多解剖构造与猪亚科的类群相当不同，且只分布于印尼的少数岛屿中，显示其于中新世中期就已与猪亚科分支。上新世时猪属物种繁盛，取代了大量猪亚科中其他属的物种，更新世时野猪在欧亚大陆与北非大量繁衍，在相对短的时间就演化出适应多种环境的能力，取代了多数猪属中的其他物种。野猪演化上成功的原因可能包括基因组中大量嗅觉受器的基因出现，的结果显示野猪基因组中有多达1301个嗅觉受器的基因，较多数哺乳类为多（相较之下人类只有45