905年离家赴黑龙江，起初做官，后弃官经营金矿。17岁时，孙越崎考入绍兴简易师范学校，1911年底毕业，按照当时的政府规定，到一所小学义务任教一年，在任教期间与葛采湘结婚。1913年，孙越崎进入上海复旦公学中学部学习，结识了教师邵力子、同学罗家伦、俞大维等人。1915年5月，袁世凯接受了日本政府提出的《二十一条》，孙毓麒愤而更名“越崎”，意为使中国越过崎岖而走上康庄大道。1916年，孙越崎自复旦公学中学部毕业后，进入天津北洋大学文科预备科学习，后在父亲的劝说下，于同年考入北洋大学矿冶科。1919年五