治所在丹徒县（今江苏省镇江市丹徒区），后改治毗陵县。其辖境相当于今江苏省常州市、武进区、镇江市、丹阳市、无锡市、江阴市等地。
晋陵郡时期.永嘉五年（311年），因避东海王司马越世子司马毗讳，以毗陵郡改名。治所在丹徒县（今江苏省镇江市东南丹徒镇）。东晋初将东莞郡侨治在晋陵郡（江苏省常州市）东南，南齐时废除。东晋初晋陵郡移治京口（今镇江市）。义熙九年（413年）又移治晋陵县（今江苏省常州市）。户一万五千三百八十二，口八万一百一十三，下领六县：晋陵县、延陵县、无锡县、南沙县、曲阿县、