发现了一群发生基因突变的博格人，突变允许他们在再生的时候拥有自我意识。而他们再生时所处的地方叫做零号联合矩阵。珍妮薇帮助他们抵抗博格女皇，同时医生也开发出了一种纳米病毒，这种病毒能将普及延伸至整个集合体，并让个体回到现实后也能保留自我意识。珍妮薇、贝拉娜·朵芮丝与杜沃克将纳米病毒导入了战术方块138号的中央管道区，将零号联合矩阵的成员从集体意识中分离了出来。这让整个集合体陷入了一场内战。
此后的事业.当航海家号重返第一象限后，珍妮薇被提拔为中将，并被任命为星际舰队总部的一名