帝病癒，董卓入朝拜贺的机会，让吕布成功刺杀董卓，并诛董卓三族，主簿田仪也被杀。当时长安士民都争相庆祝。
失败被杀.董卓死后，王允录尚书事，总理朝政，并与吕布共同执政。但自诛除董卓后，王允与吕布以及其他官员的关系渐渐变差，执意诛杀蔡邕一事亦失人心。同时，董卓余部多为凉州人，王允打算免去他们军职。当时有人认为他们畏惧袁绍和关东军，一旦解兵就会人人自危，建议让皇甫嵩为将军，统领他们，以作安抚，然后再和关东诸军联结，以作后谋。但王允认为这会令关东诸军起疑心，不同意。同时王允亦未议决下诏赦免