485年帮助他的父亲压制了一些叛乱并对抗教皇国以守卫王国的领土。身为一个雇佣军首领，他也参与了那个时代最为重要的战争，例如1478-1480的以及1482–1484的费拉拉战争。阿方索的统治时间非常的短暂，当他父亲死时，王国的财政已经枯竭且法王查理八世的入侵已经迫在眉睫，查理八世宣称安茹家族拥有对那不勒斯的合法统治权以及耶路撒冷国王的头衔，因为特拉斯塔马拉家族对那不勒斯的治权本来就是从安茹家族最后一位女王乔万娜二世所允许的。查理八世在1494年9月入侵义大利，阿方索设法重新得到教宗亚历山大六世的