新界南区（包括荔枝角、下葵涌、青衣、荃湾及东涌）的居民提供服务。随着香港国际机场于1998年7月落成启用，玛嘉烈医院除为访港旅客提供紧急医疗护理外，如机场发生灾难事故，是接收伤者的主要医院之一。玛嘉烈医院同时是香港医学专科学院认可的专科训练中心，为香港大学及香港中文大学医科学生提供临床教育训练及为毕业生安排实习。
现况.玛嘉烈医院现设联网肿瘤科中心、严重创伤中心、肾脏移植及透析中心、联网碎石中心、联网胸肺内科及肺结核治疗、联网高危产科、儿童及初生婴儿深切治疗服务等等。受禽流感威