发御家骚动，最终在幕府介入下，松代10万石归信政，沼田3万石归。松代藩领由水内郡约4万石、约3万5千石、约1万石和埴科郡约1万5千石组成，直至明治维新为止再没有任何变化。沼田藩则由于信利过于严苛的检地和爆发一揆，加上江户普请上处理不善而被幕府追究，最终在天和元年（1681年）被改易。万治元年（1658年）2月，年仅两岁的继任成为第3代藩主，任内真田氏积极参与江户城和日光东照宫的普请、越后高田藩和信浓高远藩的检地、重建善光寺和宝永大喷发的灾后重建等事务，花费了大量资金，加上在享保2年（1717年），松代城