太人在波恩并不受欢迎。1288年另一场屠杀导致100名犹太市民被杀。19世纪犹太人在波恩人口中占到多于2%，1879年在莱茵河岸一所新的犹太教堂建成。此教堂在纳粹时期被烧毁。现只剩下很小的一部分地基。 超过700名犹太人在纳粹党统治下惨遭杀害。第二次世界大战以后只剩下很少的犹太人。1959年5月26日在现在的Tempel街一所新的犹太教堂建成。1970年的犹太教会有159名成员。这一数字因为从前苏联返回的部分信徒而显着增加。到2001年接近900人。
伊斯兰教.在波恩有约1万8