曾祖父马福、祖父马云龙、父马明卿。有两子，一名马钖，一名马銮。马钖由于看不惯其父为人，哭着劝其父改过。明亡后在南京靠算命为生，终其天年。马銮则依仗其父势力，在宫内佈置密探，监视朝廷动静。清军入南京时被杀。
轶事.马士英渡过钱塘江后，底下的黔兵各个四散潜逃，马士英乃隐居在天台寺中。后被其家丁五花大绑献给清朝的某位贝勒，贝勒细数其罪状及恶行后，将其诛杀；再将其尸体的皮剥下，中间塞草，愤怒的百姓看到马士英的下场，无不拍手称快。厌恶他的更将他与崇祯时被明思宗赐死的周延儒并称，将两人下场