联军入侵，离京至西安，于1901年，经终南山入川，转赴西藏，折至云南大理，于光绪二十九年（1903年）到达宾川鸡足山，重兴鸡足山迎祥寺（即祝圣寺）。光绪三十年前往泰国、槟城等地，考察东南亚佛教，讲经说法。
振兴佛教.1911年（宣统三年），为团结佛教徒，保护寺院，斡旋上海佛教会与南京大同会的对峙，虚云出滇至沪。接着，赴南京晋见孙中山，议定修改佛教会会章诸事宜。同年4月，因政府更迭，在见过孙中山之后，又前往北京去见袁世凯。在上海改组中国佛教会，成立中华佛教总会。1920年重兴昆明西山