市体制改革（市管县），原海属地区除沭阳外再次划归连云港市，连云港市辖境基本恢清时海州直隶州之旧境。1996年，江苏省调整市县行政区划，灌南县划入连云港市；2001年，云台区撤销，并入新浦、连云两区；2008年，东海县岗埠、浦南划入市区；2009年，灌云县板浦镇划入市区；2010年，江苏省青口盐场、江苏省东辛农场、海军某部队农副业基地划入市区。2014年，撤销连云港市新浦区、海州区，设立新的连云港市海州区；撤销赣榆县，设立连云港市赣榆区。