导仍秉正地议论，王敦无法争论。后王导加任尚书令。同年司马睿因王敦之乱忧愤而死，遗诏王导辅政。太子司马绍继位后，王导解任扬州刺史，改拜司徒。太宁二年（324年），王敦因与司马绍作战战败愤惋而死，王敦之乱平定。司马绍回皇宫封王导为始兴郡公。后又改命王导为太保、领司徒，剑履上殿，入朝不趋、赞拜不名。
辅助成帝.太宁三年（325年），晋明帝司马绍逝世，太子司马衍继位，是为晋成帝。皇太后庾氏称制，由王导加录尚书事，与中书令庾亮和尚书令卞壸共同辅政，辅政期间以宽厚谦和而得人心。咸和元年（3