54年之后，她和华生与克里克之间的关系开始有所改善，华生一方面成为她在病毒研究上的讨论伙伴，一方面也援助富兰克林的研究经费。富兰克林经常到剑桥大学与克里克讨论研究，并且曾经与克里克夫妇一同到西班牙旅游。后来的几年，富兰克林仍然继续将心力专注在TMV等病毒之上。她的团队在1955年完成了TMV模型。此外她也研究了病毒对植物（包括马铃薯、芜菁、番茄与豌豆）的感染，以及TMV病毒中的核糖核酸（RNA）。1956年夏天，富兰克林在前往美国进行与工作有关的旅行时，察觉了健康问题，并且在同年9月发现腹部有两颗肿