首场联赛在1899年9月2日作客1-0击败查塔姆（Chatham），三日后回到法顿公园主场与本地敌对球队修咸顿 友赛。首季即在28场比赛胜出20场，取得南部联赛亚军，翌年（1901/1902年）更进一步获得冠军。但朴茨茅夫在1910/11年不幸降级，从钖周三招聘卜·布朗（Bob Brown）成为领队，只一季便回升，但朴茨茅夫却债台高筑，陷入财务危机。
初升甲组.1915至1919年足球比赛因世界大战而停顿，联赛重开后朴茨茅夫随即夺得第二次南部联赛冠。1920/21年获邀加入新成立的