章士元（），字伯允，吴县人，直隶苏州府崑山县民籍，明朝政治人物。
生平.应天府乡试第一百十名举人。嘉靖二十三年（1544年）中式甲辰科会试第十三名，登第二甲第七名进士。
家族.曾祖章镛；祖父章泽；父章杲，母屠氏。