些有机物（例如甲酸）内，氧原子和其它原子组合成为含氧酸，其中有一些是有机酸。含氧的酸性羧基可以帮助脂肪酸和甘油脱水结合成为三酸甘油酯，一种储存多余能量的方式。人体内基本上所有有机化合物都含有氧原子（碳氢化合物没有氧原子，但是人体内只有微量肠道细菌代谢后的甲烷）。
氮.虽说氮是大气层中含量最丰富的气体，但是人体无法利用氮气。人体内的有机氮来源于一些细菌经过固氮作用形成的氨。这些氨溶解于水后经过植物根部以铵的形式被吸收。氮和其它元素组成了生物碱、氨基酸和核碱基。氨基酸可以组成蛋白质，而