标定位系统，纪录建筑物的梁、柱、屋顶等细部，制成透视图。2007年6月2日，由时任总统的陈水扁主持整修动土典礼，次月31日正式动工，整修经费约1160万元。工程范围包括古蹟本体三川殿、拜亭、过水廊、正殿及周围。2009年11月19日，举行竣工典礼，县长黄仲生主祭，立委颜清标、纪国栋、县议员尤碧铃、杨秋云、陈诗哲及梧栖镇长陈廷秀等担任陪祭。
十八年普.地方文史工作者王立任指出，晋江县南门外有称为「十八年普」的习俗，将祭祀圈分为十八香，每香由一到四个村落组成，轮流在农历七月十三日祭拜普