民国政府刚迁至台湾后，蒋中正在台湾恢复行使总统职权前夕，以中国国民党总裁的身份再度访问菲律宾，和总统季里诺会晤。1960年，菲律宾总统贾西亚抵台访问并与蒋中正晤谈。1961年1月17日，外交部长沈昌焕赴菲律宾，参加中华民国、菲律宾、大韩民国、越南共和国四国外长会议；1月18日，会议于马尼拉举行，协商团结，应付共党。1963年3月20日，副总统陈诚代表蒋中正访问菲律宾，23日，发表联合公报，加强经济技术合作与文化交流。。1966年3月25日，总统蒋中正与菲律宾总统马可仕分别宣布：1966年为「