药酒厂改名为同仁堂药酒厂。1991年，同仁堂晋升为国家一级企业。1998年，中国全国总工会授予同仁堂“全国五一奖状”。1997年，同仁堂在上海证券交易所上市。1999年，同仁堂成立“同仁堂发展委员会”。2000年10月，同仁堂分拆同仁堂科技在香港创业板上市。2011年，台湾上柜公司众星国际代销同仁堂中药酒。2016年1月26日，同仁堂党委书记、董事长梅群表示在十三五期间，同仁堂所有制药工厂将迁往河北和安徽亳州，而北京只保留同仁堂总部和少数项目。2018年12月，北京同仁堂旗下