年至1979年间，井上担任参议院情报委员会主席。1987年至1995年及2001年至2003年间，井上担任参议院印地安事务委员会主席。1987年至1989年间，井上出任伊朗-尼游军售丑闻的参议院调查委员会主席。在2004年的选举中，井上轻松击败他的共和党竞选对手坎贝尔·卡瓦索，连续第八次出任联邦参议员。2005年5月23日，井上与其他13位温和派议员（7位共和党、6位民主党）共同要求民主党立刻停止对上诉法庭法官提名人资格审查的冗长杯葛，以防止共和党参院领袖提出名为「核选择」的终结辩论动议。在达成协议之后