加盟英超球会曼联，签约五年；并再度成为全球身价最高的后卫（前纪录一度于2001年被利利安·图拉姆打破）。这笔转会交易账面牵涉达3,400万英镑，但由于列斯联急需现金以应付财政危机，他们最终收下的转会费其实不足3,000万英镑。费迪南的加盟解决了曼联在雅普·斯塔姆离队后，后防不稳的毛病；在效力曼联的首个赛季，他已成功为球队重夺联赛冠军。2003年9月，费迪南因故缺席赛会举行的药物检查（他事后声称因专注迁居事宜而忘记药检），英格兰足总纪律委员会主席裁定他从2004年1月起停赛8个月，期间不得参加任何球会和国