粉岭前皇后山军营，于2001年再迁移往九龙湾祥业街临时基地，最后于2003年年底迁入位于文锦渡沙岭的警犬队总部暨警察搜查队训练学校；同年，警犬队引进了一种比传统德国牧羊犬更为适合执行警务的犬种──玛莲莱犬，以执行警务。警犬队成立初期主要负责边界和郊区巡逻，时至1980年代开始训练爆炸品侦测犬，于1996年起联合冲锋队执行任务，包括执行反罪恶巡逻等等。期后职能不断扩大，警犬队驻守范围覆盖全部5个陆上总区 此外，警犬队亦为警察搜查队训练爆炸品搜索犬；自2000年代起，为了配合需要，警犬队为特别任务连及机场特