20年，使用海洋水产资源开发中心（现水产综合研究中心）的研究船深海丸号进行深海捕捞，在全球范围内进行深海渔场开发。这些调查发现了许多有用鱼种（如无须鳕科和小鳞犬牙南极鱼），它们现已普遍用作进口食用鱼。深海2000号等潜水研究艇也参与了对诸如大翅鲪鲉和日本叉牙鱼等深海水产鱼类的资源调查和生态研究。如上所述，通过拖网渔船调查寻获的深海鱼大多为底栖鱼。而在中层带拥有大量资源的灯笼鱼类作为对全球粮食需求增长的回应也引起了人们的关注。灯笼鱼类由于脂肪过多而被指不宜食用，但据报道许多物种的脂质组成与普通食用鱼类相同