平定，其后路易一世对此地採取高压政策管治。英法百年战争期间，路易一世臣从于法王与英国交战，他更封锁海路贸易，招致敦克尔克市民再次暴动。1346年，路易一世在克雷西会战中阵亡，其子继位。他与英国讲和，使贸易再度兴盛，敦克尔克的港口也爲之扩张。但是天主教会大分裂当中，教宗乌尔巴诺六世的英国支持者登陆此地，攻陷本城并水灌附近的村落。尽管其后法王查理六世驱逐了入侵者，敦克尔克内外都遭到严重破坏。1384年，路易二世逝世，由于他没有子嗣，弗兰德家族断绝，敦克尔克由勃艮第伯爵菲利普二世获得。他扩建了本城的防御工