靠宫北大街，面朝海河三岔河口，由东向西依次建有旗杆、牌楼、山门、前殿、八卦亭、清虚阁、北斗楼、南斗楼及三清殿等建筑组成，今仅存清虚阁。清末天津的社会动荡和战乱对玉皇阁造成灾难性破坏。中华人民共和国成立后，1954年玉皇阁被列爲天津市文物保护单位。1965年曾对玉皇阁的顶层进行维修，但投入非常有限。2003年天津政府爲配合海河综合开发改造工程而拆迁海河两岸的旧城区，玉皇阁建筑群仅存的清虚阁随之显露，文物保护管理部门予以全面整修。有专家认爲不久的将来，它会再成爲海河岸边重要的道教活动场所。