毒.汉他病毒通常见于啮齿动物和鼩鼱，但在非洲科特迪瓦和塞拉利昂两国的蝙蝠体内也发现了两种病毒。这两种病毒都是负义单链RNA病毒。
亨尼巴病毒.亨尼巴病毒属属于单股反链病毒目副黏液病毒科，下属五个种，全为RNA病毒。狐蝠和一些小蝙蝠是亨尼巴病毒的自然携带者。
丝状病毒.伊波拉病毒（Ebola virus）属于丝状病毒科，自然宿主也是蝙蝠，2013年开始于西非爆发的严重伊波拉出血热疫情很可能是当地居民食用蝙蝠进而感染。此外属于丝状病毒的还有马尔堡病毒（Mar