今。1546年，圣座任命米开朗基罗为梵蒂冈圣伯多禄大殿的建筑师。米开朗基罗要为教堂设计圆顶。工程进行期间，由于米开朗基罗的高龄，有人担心他不能在有生之年完成穹顶。然而，穹顶下部支撑环建成之后，建筑的完成不再是个问题。1564年2月18日，米开朗基罗在罗马去世，享寿八十八岁。这时距离他的89岁生日只有三个星期。根据他的遗愿，遗体自罗马运回佛罗伦斯，安葬在佛罗伦斯圣十字圣殿。
最后遗作.梵蒂冈官方报章《罗马观察家报》于2007年12月6日报道，圣座在圣伯多禄大殿一间办公室内找到可能