顶级保密计划中取得了一大步的进展，而且急需一些助手来完成剩下的工作。弗里曼毫无疑问地被选中了。他同意到黑色高地研究所去工作，因为他希望在那里的工作能把他在天体物理和量子物理上的各种问题和疑惑解释清楚。《战慄时空》最初游戏的开始，弗里曼正在那个位于新墨西哥州某处的研究所内研究那些机密的问题。他被分配到了位于研究所最深处的反常材料部门，做一些核子和亚原子的研究。有些滑稽的是，虽然弗里曼拿到的是麻省理工学院的哲学博士头衔，但是游戏中对这些理论什么的一点也用不到。 巴尼·卡宏在战慄时空2的开头部分还拿这个事情开