攻金国都城开封，元帅猪儿主张迁都归德（今河南商丘南），但丞相赛不和右司郎中白华等人主张入邓州。第二年，哀宗先逃至归德，又逃蔡州（今汝南县），又一次计划进入邓州，却在蔡州遭到宋、元联军的包围而未能成行，最后帝亡国灭。
元明清时期.元朝初至元十年（1273年），邓州隶属于襄阳府。至元十六年（1279年），邓州属河南江北行中书省南阳府管辖，府治在南阳（今宛城区），州治仍在穰。原领六县，有穰、南阳、内乡、淅川、西峡、顺阳等。后又领三县：穰、新野、内乡。其辖境相当于今天的邓州市及新野、内乡、