链中的圣彼得皇家礼拜堂（拉丁文ad Vincula有“在锁链中”之意，因此圣彼得是监狱犯人合情合理的主保圣人）。在塔外处死的一些贵族也被埋葬在这个礼拜堂里。在塔内被按叛国罪处死的有：安妮·博林皇后在1536年因为跟五个男人偷情被砍头，英格兰国王爱德华四世的兄弟克莱伦斯公爵乔治1478年二月在塔中被（依叛国罪）处决，但并非被斩首（大概也并非如莎士比亚所写的被溺死在一大桶马姆齐酒里）。爱德华四世的两个儿子，爱德华五世和他的兄弟约克公爵，也在他们的叔父理查三世登基后被关进伦敦塔，从此失踪，一般认为被害