干城章嘉国家公园内的植被包括和由橡树、冷杉、桦树、枫树、柳树等组成的温带阔叶林与混合林，以及包括由许多高海拔香草、药用植物、灌木丛等组成的高山植物。园区内有多种稀有动物栖息着，包括麝鹿、雪豹、喜玛拉雅塔尔羊、豺属、懒熊、麝猫、、小猫熊、西藏野驴、喜马拉雅蓝羊、鬣羚、斑羚属、羚牛等哺乳动物，以及包括和山蝰等爬行动物。最新的一项研究显示，亚洲豺犬在该园区内变得非常罕见，而干城章嘉生物圈保护区内的亚洲豺犬被认为属于遗传上较稀有的喜马拉雅亚种。目前在园区内共发现约550种鸟类，包括血雉、红胸角雉、鱼鹰、高山兀鹫