仙林校区将成为学校主校区；仙林校区一期于2009年建成，全校大部分本科生在当年9月份入学时迁入该校区；南大仙林校区原说占地7000亩，后因故搁置，目前先期征地3000亩，其中一期工程建设用地约1000亩。南大仙林校区所在的仙林大学城位于南京城外东北方向，长江南岸不远处，北望栖霞山，东临宝华山，西接紫金山，分布着南师大、南财大、南邮大、南中医、南理工等校。
设施与资源.南京大学拥有丰富的教学和科研设施、设备、资源以及文物遗产。例如，南京大学植物标本室奠基于现代中国植物资源调查与标本采