河流里以及近海内的地层都有发现的记录。花粉、孢子和藻类的化石被用来界定地层岩石的顺序。残留的植物化石并不如动物化石那么普遍，然而植物化石在世界上许多地区之内，都可以有大量的发现。最早可以被明确归类于植物的化石是一种学名叫"的红藻，生活在16亿年前，发现于印度的叠层石中。绿色植物最早的化石是澳大利亚卢坡群(Roper Group)的一些微体化石，生活在15亿年－13亿年前，其结构与现代绿藻类似。最早的与现生类群有明确亲缘关系的植物化石是"，是一种生活在12亿年前的红藻。轮藻门的一些植物的细胞壁发生