琉璃」，也写作“瑠璃”，是梵语“琉璃”的略译，是一种极希有的宝物。「本愿功德」，愿是愿欲，本愿即菩萨所发弘愿。
传译.本经传来中国，共有四次翻译：西藏译本有二种，一种相当于玄奘所译，另一译相当于义净译本。一九三一年在吉尔吉特附近一个卒塔婆中，考古学家发现了几部梵本《药师经》。
内容.本经为佛应曼殊室利（文殊师利菩萨）的启请，说明东方净琉璃世界药师如来的功德，并详述药师如来因地所发的十二大愿：生佛平等愿、开晓事业愿、无尽资生愿、安立大道愿、戒行清净