目昆虫（世界第二），还存在359种濒临灭绝的动物（2014年数据）、30万种无嵴椎动物。哥伦比亚的维管束植物有51,220种，排名世界第二，兰科植物的种类更是世界第一。哥伦比亚南部低地和西部海拔1000至1500公尺的山坡，覆盖茂密的热带雨林，包括棕榈植物和多种富有经济价值的植物，例如：用来提取橡胶、珍贵的红木和药用植物。北部和东部地区低地较为干燥，有着大片的落叶树木，在海拔1500至2800公尺的山坡则覆盖热带植物，以竹子、树状的蕨类最多。海拔2800公尺以上的地区则有常绿的麻栎属、古南科灌木丛和矮生