2005年1月在深圳成立之时，美术馆在行政上直属于何香凝美术馆，隶属于国务院侨务办公室，资金由华侨城集团赞助。2012年4月正式注册成为独立的非营利性美术馆。目前，OCT当代艺术中心旗下有五家分馆：位于深圳市南山区的OCAT深圳馆和华·美术馆，位于上海市静安区的OCAT上海馆，位于西安市雁塔区的OCAT西安馆，位于北京市朝阳区的OCAT研究中心（北京馆）。