俄战争期间，车庆云和鸭绿江畔的俄军在一起，对现代战争有了进一步切身了解。日俄战争结束后，车庆云入保定陆军军官学校学习。毕业后，车庆云继续在军队任职，一直升至陆军第十三混成协第二十五标二营管带，为江苏清江浦的防御总司令。中华民国成立后，车庆云被大总统袁世凯任命为第十九师37旅旅长，旅部设在江北。任内，他曾奉命剿匪。1912年冬，车庆云获授陆军少将，并被任命为江苏都督的高级参谋。1913年秋，车庆云被任命为南京造币厂厂长，并兼代芜湖镇守使。随后，他加入张勋的部队，担任参谋长，但很快便退职。1918年春，车庆