2009年12月再度代表中国国民党参选第八届嘉义市长，最后成功连任。2014年中国国民党在2014年中华民国地方公职人员选举大败，继任行政院长毛治国属意由卸任嘉义市长黄敏惠担任副院长一职，不过遭婉拒。2016年中国国民党在2016年中华民国总统副总统及立法委员选举空前挫败，党主席朱立伦及败选立委的副主席郝龙斌请辞，并于1月18日代理党主席一职，成为首位女性党主席（代理）。同月26日，託时任行政院副秘书长徐中雄领表登记参选党主席，最后获得不足三分之一的得票，以第二高票败给了前立法院副院长洪秀柱。