、五水仙尊王、四海龙王、斗姥元君、太岁星君、文昌帝君、石将军等神祇。正殿所供奉的三尊妈祖像为软身雕像，高约四尺，梳湄州发髻并着三寸金莲，面貌安祥，而其座前脚为宋代型制，相当珍贵。
石将军.天后宫里供奉有一对石将军，据说是为了镇住府城三郊在兑悦门所设的风水阵法而设。石将军据说原本立在天后宫（旧址）后殿外墙东边，据连横的说法两尊石将军分别是平埔人半身像与郑成功墓前的石翁仲，不过安平地区另有说法认为石将军跟天后宫妈祖一样是郑成功所带来。
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