又拟调蔡时鼎为尚宝司丞，仍不获准。万历二十年（1592年），蔡时鼎卒于官。家贫无以下葬，士大夫出钱为他治丧，都为他感到可惜。蔡时鼎平时极力研读经史并写作，从经史百家以至阴阳、医卜无不研究，尤其嗜好《周易》——他曾为该书注疏解释，但未有成书。太史林偕春为其撰写《蔡公时鼎传》。