编号JY-AEE的707-321C，替摩洛哥皇家航空执行包机航班，从巴黎飞往阿加迪尔。飞机下降时比预定高度低，导致飞机撞山，机上188人全数罹难，是波音707最严重的意外。波音707亦遭受到数次恐怖袭击。1970年9月13日道森机场劫机事件，解放巴勒斯坦人民阵线劫机并炸了两架波音707客机及另外三架客机，并炸毁其中三架。中东航空共拥有32架波音707，其中14架在服役期间报废，当中只有一架是因为飞行意外而报废，其它飞机则被战火摧毁。1978年4月20日，大韩航空的707-321B因误闯苏联领空而被拦截迫