945年回国任上海医学院教授。1949年后，历任上海第一医学院副院长兼中山医院、上海胸科医院院长。1958年调北京工作，先后任中国医学科学院院长、首都医科大学校长。
荣誉.黄家驷是中国科学院院士、苏联医学科学院院士，并曾担任中华医学会副会长，中华外科学会会长。