改授工部右侍郎。绍治七年（1847年）正月，充办内阁事务。嗣德元年（1848年），尊室铪升署宁平巡抚。次年（1849年），实授巡抚，改任护理清化总督。嗣德六年（1853年），改护理安静总督。次年（1854年），升署总督。嗣德九年（1856年），改署户部尚书，充机密院大臣。嗣德十年（1857年）三月，实授户部尚书。嗣德十二年（1859年），法军入侵南圻。尊室铪出任钦差大臣、统督剿捕军务，前往嘉定省抗击法国侵略。嗣德十四年（1861年）二月，法军攻破嘉定大屯。阮廷议罪，尊室铪被贬为员外郎，充军次赞襄。十