幕府派出最上德内、、间宫林藏、伊能忠敬等人探险北海道、库页岛和千岛群岛地区，和人对北海道的地理状况亦有了更多了解。1799年，幕府将东虾夷地改为幕府直辖地。1807年又将西虾夷地改为幕府直辖地。不过在俄罗斯的威胁减轻之后，1821年，全虾夷地又重新成为松前藩领地。
开拓期至二战时期.1868年，明治新政府宣布设立，将北海道纳入新政府统治之内。然而在1869年1月，旧幕府军佔领五稜郭，其首领榎本武扬宣布成立虾夷共和国，并和新政府军之间爆发箱馆战争。在旧幕府军投降之后，新政府宣布在北海