爪龙的化石较完整，比破碎的棘龙更适合当作科的模式属，而且也没发现彼此有足够显着的相似性。2004年，霍茨和同事将重爪龙科列为棘龙科的异名。1990年代的发现为重爪龙的亲缘关系提供了更进一步的线索。1996年，一个来自摩洛哥的吻部化石被归入棘龙，而来自巴西的激龙和崇高龙（彼此可能是异名）也被命名。1998年，根据尼日的化石建立了嵴饰龙和似鳄龙。在塞里诺等人叙述似鳄龙的论文中，将前者和重爪龙放入棘龙科内新成立的演化支重爪龙亚科（Baryonychinae），而棘龙和激龙则属于棘龙亚科（Spinosaurin