公园南部也覆盖苏拉威西本岛上一部分丹戎克拉巴海岸（Tanjung Kelapa）。2018年8月14日，印尼版Google以首页涂鸦庆祝布纳肯国家公园成立27週年。
地质.1500至500万年前，该地区的火山爆发，使得火山凝灰岩成为这里地表的主要构成物。万鸦老图阿岛是一座海拔超过600米的锥形休眠火山，是国家公园内的最高点。布纳肯岛由火山活动和珊瑚化石堆积形成。Nain岛是一个圆顶形岛，最高海拔139米。Mantehage岛相对较为平坦，岛上有红树林森林，部分陆地被狭窄水道隔开