地疏浚整修吴淞江也无法避免河流日渐萎缩的情况，但吴淞江的淤塞状况并没有到达严重的地步。直到蒙元至元十四年，外海和长江的大型商船仍能自吴淞江驶入，并直抵苏州的葑门。但此后，到大德八年（1304年），下游河道淤塞情况日趋严重。蒙元大德八年，时任海道千夫长的任仁发重新疏浚吴淞江，西起当时上海县边界的吴淞江，东抵当时嘉定县的石桥浜。工程全长三十八里八十一步三尺，水道深一丈五尺，河面宽二十五长。之后元泰定元年（1324年）、至正元年（1341年），地方官员又两次疏浚吴淞江，但始终只是解决一时的问题，吴淞江逐渐萎缩的状