在象鼻山设立炮台、灯塔的要求，为出席的清廷台湾兵备道吴大廷、台湾镇总兵刘明灯否决，造成日后美方直接绕过清廷与排湾族「亲善盟约」的另一项因素。李仙得10月23日回到厦门。同治八年（1869年）2月，李仙得再度来台确认原住民是否遵守该条约，2月28日与卓杞笃再度会面，双方正式签订了「南岬之盟」的书面协议，建筑砲台、驻扎守军、建设灯塔，并保证不攻击杀害西洋船难者，罗发号事件始告落幕。