于《圣火降魔录 纹章之谜》的原有内容，并增设了一名可供玩家自行创作的主角，会与《火焰之纹章 暗黑龙与光之剑》的英雄马尔斯一行人并肩作战。另外，本作亦以额外故事章节「新·阿卡内亚战记」的形式收录了1997年于Satellaview平台上发行的《BS火焰之纹章 阿卡内亚战记》。2008年，在《圣火降魔录 暗黑龙与光之剑》任天堂DS重制版本《火焰之纹章 新·暗黑龙与光之剑》的开发过程中，同时亦开展了《圣火降魔录 纹章之谜》重制版本的准备工作。开发团队其后选择重新开始，并以旧版的《圣火降魔录 纹章之谜》作为故事