迁请求，前往广济龙坪镇创办江汉书院讲学。瞿九思撰《乐章》及《万历武功录》，派次子瞿罕进呈。万历四十五年（1617年）瞿九思逝世，享寿七十一岁。
轶事.
师事李时珍.潘克溥《蕲州志》、《》均有提及瞿九思师事李时珍，而《明史》及《黄梅县志》未见纪载此事。王吉民《李时珍年谱》直接记载珍有得意门生有二人：一为庞鹿门，是传他的医学，一为瞿九思，是传他的理学和文学。
缠足御虏.瞿九思认为鞑靼远离家乡入侵他国，是因为北方没有美人，想要制驭他们，只有让