部队经三湾改编后，跟随毛泽东抵达井冈山，随后接连担任红四军第三纵队连政治委员、红十二军三十五师一零四团政委、四十四师一三零团政委，参加中央红军五次反围剿战役。宁都暴动后，任红五军团三十八师政委、十三师政委、五军团政治部地方工作部部长。1934年，参加长征，任中央纵队干部团政委，与陈赓一同率领干部团掩护中央军委强渡乌江、攻占遵义城等战役。次年5月，率部占领金沙江要渡口皎平渡，掩护红一方面军渡过金沙江。同年6月，红一方面军和红四方面军会师，干部团先后改编成红军学校特科团、随营学校、红军学校，宋任穷任政治委员