个体的第三跖骨化石而得名。2019年，《自然》期刊公布了佛罗伦特·底特律等人对吕宋人化石的研究成果，并正式为这一新发现的物种定名“吕宋人”，和现代人类同属于人属。然而，一些科学家认为要把这种生物划分为新的物种而不是亚种需要更多证据；类似的争议同样存在于直立人和丹尼索瓦人身上。
发现.2007年5月5日，一支由菲律宾、法国和澳大利亚科学家组成的研究小组在菲律宾卡加延省发掘时发现了一块第三跖骨的化石。按照形态特征，这些化石被分到人属，成为菲律宾当时发现的最早人属化石。在2019年由佛罗