光荣时代 (1945年－1948年).1945年8月15日，轴心国日本宣布无条件投降，第二次世界大战由此告终。国民政府基于辅大师生于抗战期间忠贞爱国，孤立于敌佔区仍抵抗不屈的事实，除明令嘉奖外，乃破例追认北平沦陷时期的辅大学生之学籍，司铎书院学生同时获准併入辅大。辅大理学院经过未曾中断的十余年发展，及至此时其学术声誉已名满全国。钱思亮、王普均等名教授均曾于辅大任教，日后享有世界性声誉的原子能科学家──邓昌黎、冯彦雄二氏此时即为辅大物理学系与化学系的毕业生。同年12月24日，校董