开始参与曼哈顿计画。次年8月，他前往新墨西哥州的洛斯阿拉莫斯国家实验室参与原子弹研发，在犹太裔德国物理学家汉斯·贝特手下工作并负责以内爆方式引爆钚芯原子弹（即后来投在广岛的胖子）的多项重要机密计算，也曾参与氢弹的早期理论发展。二战结束后，他留在洛斯阿拉莫斯国家实验室参与十字路口行动核武试验的准备工作。1946年8月，返回英国担任英国核能研究机构理论物理部主任参与英国原子弹研发项目。富赫斯于1941-1949年间向苏联提供了包括美、英两国原子弹设计方案、计算方法和大量相关实验数据在内的大量高价值情报，大大