自治区于1925年2月26日建立，最初的名称为科米-彼尔米亚克民族区。1938年彼尔姆州成立后，科米-彼尔米亚克民族区隶属于该州。1977年，更名为科米-彼尔米亚克自治区。2005年12月1日，科米-彼尔米亚克自治区与彼尔姆州被撤销，併入新设立的彼尔姆边疆区。现为彼尔姆边疆区的科米-彼尔米亚克区。