芳等人在此发动抗日行动，史称「西来庵事件」（又称噍吧哖事件），是台湾史上规模最大、牺牲人数最多的武装抗日事件；2014年初，于新化区发现约3000具骨骸，疑为此事件之牺牲者。1920年地名大变革，日人顺势将语音艰涩的「噍吧哖」（"Tapani"）改为日语音近之「玉井」（"Tamai"）。并设置「玉井庄」，归台南州新化郡管辖。战后改设台南县玉井乡至2010年12月24日，2010年12月25日因市县合併而成玉井区至今。玉井在日治时期以制糖兴盛。1960年代由政府推广芒果改良种，郑罕池率先大幅种