后萧挞里之父。1010年，为西北路招讨都监，次年，封太保、北院宰相，1019年，还上京。1022年，知枢密院事。次年，封燕王、南京留守。1029年，平定兴辽大延琳之乱，改任东京留守。1037年，为北院枢密使、吴国王，主持政务，史称政赋平。辽兴宗欲南侵宋朝，萧孝穆反对，而大将萧惠全力支持。之后，宋辽达成了1042年增加岁币的协议。萧孝穆着有《宝老集》。1043年，萧孝穆病故，追封大丞相、晋国王。