在执行微软Windows的电脑上存取。其它的随身碟允许使用者设定不同大小的加密与公开分割区。而为了Windows、MAC、Linux设计的加密软体执行档可以放在公开分割区中。有些较差的加密软体可能需要管理者权限才能执行并存取资料。新款的随身碟支援生物指纹功能来确认使用者的身份。在2005年年中，在随身碟上支援指纹功能比起标准的密码保护来说还是较贵的选择。大多数的指纹扫描装置必须依赖作业系统中的驱动程式来检验指纹，因而这些随身碟就只能用在执行微软Windows作业系统的电脑。有些厂商将随身碟作为执行认