慧禅师也被封国师，宋神宗御赐“下马石碑”，敕令“文官下轿，武官下马”，以示尊敬。宋徽宗崇宁三年（1104年），密印寺被大火焚毁，空印法师重修密印寺。
明朝.明朝洪武三年（1370年），密印寺被大火焚毁，彻当法师重修万佛殿。明神宗万历四十七年（1619年），密印寺再度被大火焚毁。
清朝.顺治十二年（1655年），慧山超海修复密印寺，将密印寺改为临济宗。雍正十一年（1733年），《沩山语录》进入皇室龙藏，雍正帝给《沩山语录》和《仰山语录》做序，封沩山灵佑为