一般士大夫则不太重视此书，范晔指《太平经》「以阴阳五行为家，而多巫觋杂语」。《太平经》思想其实并无新意，无创新之处，都是固有观念，却能整合各种道教思想与神仙方术，开创一套更有系统的神仙理论，为太平道奉为主要典籍，太平道治病，教人跪拜认罪「首过」，以符水和咒语治病，都本于《太平经》。经中许多观念，包括上章、首过、身神、承负等，亦为后世道教所承继；经文发展了「存思」与「守一」的冥想法，使道教的冥想法更有系统；经中指出犯错神仙会被贬下凡，则成为后世谪仙传说的源头。