在世界范围流行的新型冠状病毒感染症（COVID-19）指定为感染症法上的指定感染症（感染症法6条8项）及上的检疫感染症。由于政府表示这一感染症不属于本法规定的「新感染症」，在修例前，本法无法规管COVID-19（有关讨论见后）。2020年3月2日，安倍晋三首相在的参议院上表示将修例，令本法可适用于COVID-19，并在3月4日同委员会的一般审议上表示修例后可依本法32条发出紧急事态宣言。2020年3月10日，内阁通过「新型冠状病毒等对策特别措置法一部改正法律案」（），指考虑到新型冠状病毒感染症发生及