到日军轰炸，史带领学生在郊区建茅草校舍，为防空教室，早出晚归，坚持上课，又扩充班次，广招本县以及外地沦陷区学子入学。1941年春，学校恢复了高中部，秋后附设简易师范科。抗战后期，朱伯健接任校长，继续办学。
第二次国共内战时期.抗战胜利后，桐城中学办学规模扩大。1946年方来桐担任校长，对全校进行了制度上的改革，学校教学和生活质量有显着提高。1946-1948年，桐城中学位居南方，没有受到国共内战的影响，但同当时全国的中学与大专院校一样，学生中间也出现了反对国民党专制独裁和追求民