，马偕前往宜兰、花莲等原住民的居住地传教，1887年成立苏澳教会。
中法战争.1883年到1885年间发生中法战争（又称清法战争），1884年8月，法国远东舰队击败清朝福建水师，取得台湾海崃制海权，10月初，法舰转而进攻台湾；刘铭传放弃基隆、退守台北，10月8日法军在沪尾（淡水）抢滩登陆时被清军及台湾乡勇击退，转而从10月23日起封锁台湾各港口，直到1885年4月15日解除封锁。战争期间，教会遭到暴徒破坏，7座教会被毁，数十名教徒遇难殉道，马偕于1885年5月29日入法军佔领区巡视