汉兵两路夹攻，杀死八十余人，其余的或降或逃。事情传到京城，朝廷赏赐大量的银子。自从缅甸叛乱，孟养、车里二宣慰已很久不上贡了。从这时起，才重新修好关系上贡，萧彦抚慰并接纳他们的贡品。不久，以副都御史抚治郧阳。万历十九年（1591年），加兵部右侍郎，总督两广军务。日本入侵朝鲜期间，暹罗入贡，使者表示愿意出兵救援朝鲜，尚书石星命暹罗发兵攻日本。萧彦认为暹罗地处西面，离日本有万里之遥，请求收回成命，石星执意不从。结果暹罗并未发一兵一卒。神宗召见萧彦，任命为户部右侍郎，不久，萧彦病逝。朝廷赠右都御史，谥定肃。