帝下诏诛长安沙门，并命留守平城的太子拓跋晃下令废除全国佛教。太子虽下令焚毁了大量浮屠、伽蓝，却也有意放缓了执行法令的时间，暗中保护一些僧侣逃脱性命，并收藏了一些经文和佛像，使远近皆有所豫闻。因此四方沙门多亡匿逃脱，金银佛像及经书被秘密收藏，仅有一部分比丘被戮，而魏境内寺宇建筑却多被毁。其实鲜卑上层人士多信奉佛教，他们以太子拓跋晃为首，尽力维护佛教的利益。太子拓跋晃与拓跋焘在宗教问题上的差异，也是几年后的宫廷变乱的诱因之一，让宗爱有机会害死太子。经过拓跋焘的灭佛，北方地区佛教势力一时陷于衰落。宦官宗爱