:::介导方式.尽管大量NMD机制中的蛋白在物种间并不保守，但有3个NMD因子在NMD机制通路中处于保守的核心地位，包括酵母"Saccharomyces cerevisiae"中的和、人体中发现的UPF3（含和）。这三者都是被称为上游移码蛋白（）的反式作用因子。在哺乳动物中，UPF2和UPF3为（）与在RNA剪接（）后mRNA连接的部分。其它诸如eIF4AIII、MLN51、Y14/MAGOH异质二聚体等蛋白也处于该结合处，并且参与了NMD机制。UPF1的磷酸化由SMG-1、SMG-5、SMG-6、SMG