成立芝山巖学堂，是台湾第一所日式现代学堂，记者写为台湾现代教育的发祥地。当时有台湾女子就读。次年元旦，学堂发生六氏先生事件。耆老吴深回忆，1928年芝山岩冒出泉水，此庙才恢复鼎盛。1955年7月30日，士林寺庙管理委员会商讨重新修建芝山岩惠济宫、士林神农宫事宜，并成立兴修士林寺庙筹备委员会。芝山岩惠济宫因年久失修，损坏不堪，经地方士绅潘光楷、林振兴、陈天钖等发动信众捐款兴建，费资新台币五十万元，历时一年，于1958年12月8日由士林寺庙会验收完毕。约1961年至1970年间再改建。1986年12月19日