对跨性别成因的研究调查了跨性别的性别认同形成，特别是变性人。跨性别的性别认同与其的指定性别不符，常常导致性别不安。对性别转换症的原因已经研究了几十年。研究最多的因素是生物因素，尤其是与生物学和性取向有关的大脑结构差异。除此之外还有环境因素。对跨性别者的大脑研究都是有限的，尤其是那些对女性有性吸引力的跨性别女性，以及那些对男性有性吸引力的跨性别男性，因为这些研究仅包括了少数的被测试个体。已经发现跨性别女性的某些大脑结构与顺性别女性相似或与顺性别男性相反，而跨性别男性则与顺性别男性相似，甚至在监督下的激素使