控制的恰克图，但不久又失陷被红军佔领外蒙古，并使他在7月6日被逐出库伦。8月21日，他被其蒙古盟友出卖、逮捕，随之被送交红军。1921年9月15日，叶梅利扬·米哈伊洛维奇·雅罗斯拉夫斯基担任检察官，经过6小时的摆样子公审后，恩琴被判以反革命罪，在新西伯利亚被处决。