有大幅度改善。最终以第六名完成球季。球季后的天皇盃，再次有突出的表现，先后击败J1球队千叶市原、新潟天鹅及甲府风林晋身四强，四强被大坂飞脚所击败。
2007年 重登巅峰.2007年球季，前大宫松鼠领队三浦俊也出任球队新领队。从甲府风林收购在天皇盃有好良表现的门将佐藤优也，在1月球队在季前9场热身赛当中保持不败。12月1日，于主场札幌巨蛋，同水户队进行J2最后例行赛（第52节）。靠着洋将Davi的两个进球，顺利取得胜利，并成为联盟顺位之首；与第二名的东京日视得共同升级至J1联赛。