柏林庆祝击沈皇家橡树号后，于1939年11月16日出海。在离开基尔港后，它随即开往北海。在巡航英伦诸岛、比斯开湾和英伦海崃后，U-47再击沉了三艘商船（ "Navasota"、"Britta"和"Tajandoen"） 。在"Navasota"沉没后，英国海军驱逐舰向U-47发射深水炸弹，但U-47成功逃离，并未受损。
第四次巡逻.1940年3月11日，U-47 离开威廉港，开始第四次巡逻。在海上19天期间，U-47 在北海搜寻同盟国商船队。但它只成功在1940年3月25日向"Br