立志成为盖亚教救世主的Chaos Hero。在品川的弥赛亚大教堂，一行发现救世主竟然是转生的Law Heros，他拜托主人公二人消灭东京命运乐园的蛇妖厄客德娜。在途中经过盖亚教的势力范围池袋时，二人被抓捕接受审判。之后因玩家的属性，主角会被无罪释放或ChaosHero私自放出。在东京命运乐园，主人公见到已是盖亚教救世主的Chaos Hero，他准备率领盖亚教徒进攻弥赛亚大教堂。厄客德娜则道出弥赛亚大教堂的真相——那实际上是一座方舟，除了被选中的弥赛亚选民能进入方舟外，其他生命都将被神发动的大洪水清洗。