依次为山门、钟鼓楼、山门殿、东西配殿、东西配房、大雄宝殿、后殿。山门殿又称前殿，前檐正中下方镶嵌有汉白玉刻字“摩诃庵”。大雄宝殿为明式建筑，顶部为歇山式顶，顶下为一斗二升斗拱，梁上绘有旋子彩画。殿顶中部建有团龙藻井，殿四角建有角柱。殿内北侧佛台上供奉有释迦牟尼坐像以及迦叶和阿难的立像，三座造像均为鎏金铜塑像；东西两侧佛台上有十八罗汉木雕像。四周墙上有保存完好的明代壁画。后殿北侧为赵政墓，现为学校操场所在地。墓室用汉白玉砌成，墓门的门额上题写有“钦命提督五军三千营军务司设监太监赵公寿藏，大明嘉靖孟秋吉日”字样