未满一半必须进行补选。该次县长补选，泛蓝共推曾任行政院劳委会主委、行政院秘书长、河洛籍谢深山参选，民进党提名游盈隆第三次出征。前县长吴国栋则以无党籍参选，并获亲民党一些基层组织的支持。三方鼎足而立，互不相让。最后由谢深山以七万多票获胜。同年2001年中华民国立法委员选举，分别由亲民党傅崐萁及民进党卢博基当选，为国民党首次无花莲县区域立委之纪录。而后2004年中华民国立法委员选举，亲民党傅崐萁及民进党卢博基连任成功，国民党则未提名任何人选。在2005年中华民国县市长选举中，虽然泛蓝再度分裂，但谢深山仍然以