市委还是坚持拆除的意见，时任济南市长的谢玉堂以“它是殖民主义的象征，看到它就想起中国人民受欺压的岁月，以及“那钟楼的绿顶子（穹隆顶）像是希特勒军队的钢盔，有什么好看的”作为拆除的理由。1990年1月，时任济南铁路局局长张同生在陪同前来视察的铁道部长李森茂时，提出了重建站房的计划，并当即得到“可以重建”的答复。随后，济南铁路局就钟楼的去留问题请示了山东省和济南市两级政府，两方都表示不再保留；1991年4月，铁道部也批准了老站房的拆除计划。在拆除即将开始前，济南市人大和政协曾提出过质疑，但是在看到多个部