序性死亡（细胞凋亡）的方式消除。因此AIRE针对自体辨识的T细胞进行。当AIRE受损时，会辨识人体自身抗原的T细胞会离开胸腺，进入血液循环，并可能导致许多的自体免疫疾病。
功能.在胸腺中，AIRE会促进一个大范围的特定器官基因的转录，并制造出只在周边组织表现的蛋白质，在胸腺中创造｢免疫的影子｣透过，将在胸腺中会和自身抗原强烈结合的T细胞消除是很重要的，否则之后他们可能会遇到能强烈结合的自身抗原，引发自体免疫反应。所以在胸腺内借由AIRE表现非当地的蛋白质，消除和自身抗原反应的T细胞