色球藻目（）是蓝藻门蓝藻纲的一个目，有害微生物铜绿微囊藻即属于此目。当水中悬浮物高居不下、温度上升、氧气不足、氨氮浓度升高等因素使水质恶化时，这种藻类即会出现。色球藻目现有 35个属，250种。绝大多数淡水产。色球藻目有3个科：色球藻目分布极广，在各种生境中都能生存；水生的属种多数营浮游生活，或附着于水体中的物体上；亚气生及气生的属种，多数聚集成各式团块状，粘附在各种基质（如石块、墙壁、树干、藓类以及比较大形的其他藻类植物体或其胶质分泌物）上。