化下核苷酸的分子内环化可产生几种重要的生物分子。 这些环化通常通过氧碳鎓中间体进行。 该反应的一个例子是环ADP核糖的环化。 
糖苷酶.糖苷酶是一种催化糖苷键断裂的酶，它能使底物糖分解产生两个较小的糖分子 。 这个过程对动物体内糖原等储能物质的利用以及植食生物进行纤维素的分解具有重要意义。 通常，酶的活性位点上的天冬氨酸或谷氨酸残基可以催化糖苷键的水解。 这些酶的机制涉及氧碳鎓离子中间体，其一般实例如下所示。