进言，元叉出宿，遂解其侍中之职。未几，有人告叉及其弟爪谋反。起事有日，得其手书。孝昌二年，灵太后于是将元叉及弟元爪一同赐死于家，得年四十一岁。太后因其妹的缘故，复追赠元叉为江阳王、侍中、骠骑大将军、仪同三司、尚书令、冀州刺史。元叉死后，胡玄辉与元叉弟元罗私通。其墓志与志盖分别于1925、1935年于洛阳被发现，1974年对元乂墓进行考古发掘。