有次被清水军集中优势兵力围击于南澳附近海面时，朱濆面临多于自己数倍的武装力量，展开迂回海战，清军战船蜂拥而来，座船于礁缝间绕行通过阻礁，使清军奈何不得。
第二次.嘉庆十二年初（1807年），朱濆本想转投广东澄海，然而不幸的是在黑水沟遭遇清军。纵使有投诚之意，但碍于通讯上的障碍，导致清廷不知朱濆舰队之意，发生冲突。同年，闻官军将围剿蔡牵于台湾，朱濆自广东驾驶船只来台与蔡牵会合。与清廷于海上产生会战，同年九月，将汀州镇总兵李应贵击毙于大胆洋，进而进犯台湾，自鹿港北上淡水，活动于鸡笼