规划时没有在内地口岸区预留地方建饭堂。港铁回应指有关服务是应内地单位要求而安排，而有关招标工作已经截标，强调「如内地派驻机构确认接受招标结果，内地将承担所须费用」。
启用仪式未有邀请传媒採访.2018年9月3日晚，运输及房屋局长陈帆、广东省人民政府副秘书长林积主持内地口岸区启用仪式，不过没有邀请香港传媒採访，事前亦无公布，只有政府新闻处凌晨发稿交代。记者协会发表声明谴责港府，指严重影响公众知情权。事后行政长官林郑月娥改称当时活动不是仪式，是「工作层面的交接」，不存在「鬼祟」进行，正