卓耀国有更多机会接触本地足球。他的叔叔也经常带着他入场观看陈志康的比赛，故让他对成为球员产生兴趣。适逢陈志康在挂靴后，继续留在球坛担任青年军教头和助教，令卓耀国当时就获陈志康介绍而得到杰志青年军的试脚机会，并入选青年军。他很快就成为阵中主力，也迅速获选入香港青年代表队。2009年，卓耀国与另外5位香港青年代表获英华书院招揽，包括同样当上职业球员的罗晓聪，转到该学继续学业并代表该校参与学界足球赛事。两年后的2011–12学年，再连同另外6位当时效力香港甲组联赛球会深水埗的年青球员转到荃湾遵理学校，该届校队