世纪末明治维新后，原先的幕府直属领及旗本领先后改隶属大津裁判所及大津县，其他原本属于各藩的区域则在1871年实施废藩置县后，改隶属彦根县、郡山县、宫川县、水口县、山上县；不过在仅四个月之后的府县整併中，郡内全数区域都被併入长滨县，长滨县在三个月后更名为犬上县，不过在1872年底犬上县又与滋贺县合併为新设立的滋贺县。1879年实施时，正式设置近代的行政区划「坂田郡」，并在长滨町（位于现在的长滨市）设置「坂田东浅井郡役所」，同时也负责管理坂田郡和东浅井郡。