。平时负责巡防各港口、沿岸地区、离岛查缉走私货物和毒品、犯罪逃亡的司法警察，战时亦可成为第一线精锐之战斗部队。分署人员编制，多为中华民国国军现役军人。前身为以原中部地区海岸巡防司令部改制而成的行政院海岸巡防署海岸巡防总局中部地区巡防局，分署本部设在台中市清水区，执法范围为苗栗县、台中市、彰化县、云林县及嘉义县的海岸地区，北起苗栗青天泉，南迄嘉义八掌溪，全长224.9公里。2018年4月28日改制。