索。一些探索方法可供选择，包括（）、（），及phylogenetic ratchet。这个问题并非最大简约法独有，任何利用到最佳标准的方法均面临相同的问题，且没有简单的解决方法。
批评.最大简约法曾被断言其最主要的问题，尤其在古生物学，是其假设两物种要在相同位置共享相同核甘酸的唯一方法为此两者需有血缘关系。这宣告简约法假设所有相似性均为同源 （其他解释则为荒谬的，如主张两物种也许没有血缘关系）。但显然并非如此： 当以特征的任何型式为基础来估计亲缘关系时，简约法是利用寻找最佳亲缘关系