继续执掌振兴社。同治元年（1862年），阿善师以七十一岁高龄，加上双目已失明，而告退休。西元1896年（光绪22年，明治29年）是台湾进入了日治时期的第二年，那年的6月13日，因为日军企图越过浊水溪进军云林西螺受到抵抗，引起日本政府的关注，这也是云林地区斗六、他里雾、西螺抗日行动的开始。当时，西螺青年组成的义勇军在浊水溪畔夜袭日军，并将所杀的两名日军军人的头颅悬挂于西螺王爷宫朝庙以示抗日决心；日军因此大举攻占西螺地区，尤其将西螺当地的武馆成员视为大敌，严令振兴社解散关闭。振兴社的门人四散躲避追缉，教授暗馆维