同时，加州政府也希望打破南加州地区的铁路垄断的格局。1897年，圣塔菲将新墨西哥州区间和南太平洋铁路交换，从而拥有了尼德尔斯至莫哈韦的线路的产权。至此，圣塔菲铁路为第一家从芝加哥直达太平洋沿岸的铁路公司。此纪录直至1909年才被从芝加哥至普吉特海湾的密尔沃基铁路所打破。接着，圣塔菲铁路在A&P的基础上进行扩张，从巴斯托修筑至圣迭戈（1885年）和洛杉矶（1887年）。1886年控制了“海湾，科罗拉多和圣塔菲铁路”（加尔维斯敦至沃思堡）。1887年修筑了威奇托至沃思堡的线路。1888年修筑了堪萨斯城至芝加