可追溯至锁国时代的18世纪。瑞典植物学学者林奈的门生——卡尔·彼得·通贝里在1775年时，以荷兰东印度公司医师的身分赴日，成为最早进入日本的瑞典人之一。在日15个月内，他四处蒐集日本的植物，回国后将研究结果写成《》一书。进入19世纪后，江户幕府随着黑船来航的发生及《神奈川条约》、《安政五国条约》等不平等条约的立约，而对外开放。幕府统治终结后的1868年11月11日，瑞典-挪威联合王国与日本明治政府在横滨的荷兰公使馆签署了《大日本国瑞典国条约书》，于1869年6月10日起正式实施，这是明治政权第一次与他国