含G的pre-miRNA可以潜在地利用G-四联体，来替代典型的茎-环结构。 例如，人的pre-miRNA 92B就使用G-四联体，来抵抗Dicer在细胞质中的介导切割。 虽然双链体的任一链，皆可作为潜在作用的功能miRNA，但通常只有一条链会掺入RNA诱导沉默复合体（RISC）中，在其中该miRNA会与其目标mRNA相互作用。
植物中的生物合成.在植物中miRNA的生物合成与动物的最大差异，主要是在于核加工和输出的过程中：其不像动物使用两种不同的切割酶(一种位于核内部、一种位于核外部