（光绪十年），中法战争后，清朝廷再度重视台湾，次年，台湾建省，1887年（光绪十三年）8月台湾省正式运作。首任巡抚刘铭传以「辖境太广，则耳目难周；控制太宽，则声气多阻。」建议重划台湾郡县，于水尾设直隶知州，称台东直隶州，原卑南厅旧治设州同一员，花莲港增设州判一员。过去设卑南厅时，便有人提议日后开发后可将此处改设为一府三县，《台湾舆图》也将卑南厅分成三段。从北到南分别是崎莱（木瓜溪以北）、秀姑峦（木瓜溪到网网溪）、卑南（网网溪以南）。而根据《台湾地舆全图》说略，当初设台东直隶州时，原本计画将州域分三段，北段设