途径来生产萜烯类化合物（"terpenes"）和类萜化合物（"terpenoids"）的合成过程时所产生的中间体。在植物里，它亦是类胡萝卜素（"carotenoids"）、赤霉素（"gibberellins"）、维生素E（"tocopherols"）和叶绿素生成的先导物。此外，它亦是香叶基香叶醇化蛋白的先导物。香叶基香叶基焦磷酸也是胆固醇合成中的中间体之一。在果蝇属中，香叶基香叶基焦磷酸是由HMG-CoA透过哥伦布基因编码而合成。香叶基香叶基焦磷酸作为生殖细胞已走过的肠 上皮细胞迁移的趋化利用。 在性腺