成立「死囚平反大队」，发起「反刑求，救无辜，重建司法正义」活动抢救于1991年遭刑求逼供判处死刑定谳入狱的苏建和等三人；同月，反制教育部「暂时性疼痛管教草案」；9月，台中及高雄办公室致力于推动当地「新制家长会」。1997年5月，参与五月民运「504悼晓燕，为台湾而走」大游行、「518用脚爱台湾」大游行及「524陪台湾到天亮」活动。1998年11月，《人本教育札记》获得金鼎奖；12月，「青少年活水工程」专案开办，为增加人力协助青少年，基金会筹积极募经费，并培训青少年义工参与人本及其他团体青少年事务。