中部的大陆棚海域，这里的宁格罗珊瑚礁（Ningaloo Reef）为鲸鲨提供了丰富的食物来源（浮游生物）。鲸鲨以浮游生物为主食，牠们会在一些海域进行季节性的觅食活动，例如西澳大利亚宁歌路珊瑚礁、宏都拉斯、菲律宾董索与八打雁（Batangas）、坦尚尼亚奔巴岛、马菲亚岛与桑吉巴、印度大卡吉盐沼地、墨西哥尤卡坦州穆赫雷斯岛及奥尔沃克斯岛、马达加斯加贝岛、印度尼西亚乌戎库隆国家公园等地，以色列埃拉特也有非常少数的鲸鲨聚集。虽然鲸鲨通常出现在近海地区，不过人类也曾经在沿岸、潟湖、珊瑚礁、河口与运河发现牠们的踪影