8年以前流亡海外多年，在美国时曾经是台湾独立运动的重要推手。返国后，任教于静宜大学；后来应施明德之邀，投身政治，任民进党文宣部主任。在许信良为负责县市长选举未达预期目标而辞职后，一同去职，应李家同之邀赴国立暨南国际大学任教。在文学上与曾经有所批判的余光中、洛夫修好，并在政大台文所所长任内举办余光中研讨会。2006年，因不满民进党籍总统陈水扁执政后期的表现，表示：「我不会因为我是『绿色』（泛绿）支持者，就看不到绿色的缺点！」持续以「台湾独立」意识，批判陈水扁总统。陈芳明的政治立场也为他带来争议，譬如2