解散，巴布扎布回到彰武县，此后任巡警局长。1911年辛亥革命爆发之后，外蒙古独立，建立博克多汗国。内蒙古的一些蒙古人也前往投奔。1912年8月28日夜晚，巴布扎布一家率数十名士兵离开大冷营子，前往投奔奉博克多汗命令进行征兵的科尔沁右翼前旗辅国公那逊阿尔毕吉唿（常称作阿尔花公），被任命为南方方面的营长。此后参与开鲁县的武装暴动。1912年12月，巴布扎布一行抵达库伦。此后巴布扎布申请脱离阿尔花公管辖，要求独立的指挥权，获得政府认可。1913年库伦政权进攻内蒙古时，巴布扎布是5个方面军的指挥之一，统管东南方