至2016年底，全市共有卫生事业机构5542个，平均每千人拥有医生3.22人，病床6.92张。目前共有三级甲等医院30多所，其中，武汉同济医院、武汉协和医院、武汉大学人民医院（湖北省人民医院）、武汉大学中南医院、湖北省第三人民医院（湖北省中山医院）、武汉梨园医院、中国人民解放军中部战区总医院、武汉市第一医院、武汉市中心医院、武汉市第三医院（武汉大学同仁医院）、武汉市第四医院等综合医院和武汉大学口腔医院等专科医院是华中地区一流医院。2015年中国首所全球最高等级P4生物安全实验室落户中科院武汉病毒研究所。