学、南开大学组成的西南联合大学分别迁回北平、天津复校，1946年马坚获聘为北京大学教授，成为北京大学东方语言文学系的创始人之一，并在该系建立了阿拉伯语专业，使阿拉伯语在中国首次进入高等教育，奠定了中国阿拉伯语教学的基础。至1949年，北京大学出版部和商务印书馆已先后出版了他译的《古兰经》上册（前8卷译本和注释），随后又出版了他写的《〈古兰经〉简介》单行本。1949年，他和清华大学、北京大学部分教授联名上书傅作义，为北平和平解放起了推动作用。1949年9月，马坚作为宗教界和少数民族的代表，参加了中国人民政