整课纲符合程序，主要目的在于去日本化，以及符合中华民国宪法。2014年3月9日，政大台史所教授薛化元经电子邮件发起连署，在台南召开记者会，反对此次历史课纲调整，发表共同声明「我们反对违背学术专业的微调课纲」。此次声明，共有139位历史相关科系研究员与教授参与，总共包括中研院2位所长、30位研究员，以及大学历史系8位系主任、6位台湾史相关所长、系主任等加入，是台湾第一次以历史相关学者教授为主、连署最多的公开声明。2014年3月28日，中研院研究员张茂桂因为不满中华民国教育部过份干预课纲修定工作以及教育