仓时代，公元13世纪初，日本道元禅师入宋，从学于天童山曹洞宗如净禅师门下，传回日本，建立永平寺，提倡「只管打坐」，为日本曹洞宗的开始。本山是永平寺（福井县）和总持寺（横滨市）。如今，曹洞宗已经成为日本禅宗的主要流派。
台湾.台湾日治时期佛教四大名山中的凌云禅寺、大湖法云禅寺皆为曹洞宗主要丛林。其后也有日本曹洞宗传入，建立永平寺和总持寺的两大本山台北别院（现东和禅寺）。座落彰化县员林市的员林禅寺，创建人原系日本曹洞宗冈部快道禅师建造，于昭和六年（1931年）六月三十日竣工。民国三十四