后至1960年代，即使先后受到九巴、星岛等球队挑战，但南华整体上仍能雄霸球坛。不过踏入1970年代，自从精工的崛起取代霸主地位，南华于1980年代初期更陷入低谷，被精工创下破纪录的联赛七连霸佳绩，数次更要护级，更引发两次大规模足球流氓扰乱治安事件，获香港足球总会挽留才免于降班。到了1990年代，虽则是东方的全盛期，创下「东方王朝」，南华更曾大败 0–5。不过，南华却在1994年首次杀入亚洲盃赛冠军盃决赛，虽然最终不敌沙特阿拉伯球会艾卡迪沙屈居亚军，但已是香港球会在亚洲盃赛的历来最佳成绩。南华千禧年代初则在「