疾、流行性感冒等是20世纪中后期咸宁地区高发的传染性疾病，20世纪60年代传染病年均发病率3.3%，70年代上升到7.55%，80年代下降到1.36%，90年代起中国不再将流感列入传染病疫情报告，同期咸宁地区传染病发病率下降到0.34%。2017年统计，肝炎、肺结核与梅毒已成为新时代咸宁市发病率最高的三种传染病，发病率分别为每十万人169.985例、96.516例、34.640例。2019年末至2020年初，中国大陆爆发新冠肺炎疫情，咸宁市共确证836例病患，821人出院、15例死亡，于2020年3月17日