上已知的生物并未发现任何体内拥有PNA的个体。PNA的骨架是由重复排列的N-2-(氨乙基)-甘氨酸（N-(2-aminoethyl)-glycine）单位，经由肽键所组合而成，且硷基与骨架之间是以亚甲羰键相连。与多肽链相似的是PNA也有N端（氮端）与C端（碳端）的差别。由于PNA没有如DNA或RNA上的磷酸基团，因此PNA与DNA之间缺乏电性相斥的现象，使两者之间的结合强度大于DNA与DNA。肽核酸基团构象不同于普通核酸, 不易被蛋白酶或者核酸酶水解，且碱基配对特异性极强，热稳定性高。有一些理论认为