出奔广治省，据守山区对抗法军，后兵败出奔清朝。与此同时，阮文祥选择继续留在顺化京城，以辅政大臣的身份和法国人合作。
流放海外.五月二十七日，法国人给阮文祥两个月的时间，要求他平定国内动乱。但阮文祥没有完成法国人的任务，国内响应勤王运动的人越来越多。同年七月二十七日（1885年9月6日），法国的中圻钦使参哺以两个月期满，阮文祥未能完成任务为由，将他押送至西贡，随后和尊室说的父亲尊室订、范慎遹一起关押在了崑崙岛。阮文祥在监狱里图谋东山再起，向士绅发出檄文讨伐法国人，但被发现。法国人没收