第安战争时期将领威廉·塞尔比·哈尼。原本居住于哈尼县的美国土着为派尤特人。当时，与派尤特人争夺土地的原住民则为特奈诺人和沃斯科人。 于1826年到达哈尼县一带的彼得·奥格登是首个来到哈尼县的欧洲人。哈尼县成立于1889年2月25日，并且是独立自格兰特县的。于1890年，柏恩斯成为了哈尼县的县治。
地理.根据2000年人口普查，哈尼县的面积为，其中有，即99.1%为陆地；，即0.9%为水域。斯典萨山是县内的最高点，其海拔为。而斯典萨山的东南面则是阿尔沃德沙漠，俄勒冈州中最干旱