覆发生，较少散播到邻近果园中。土壤中的棕垫炭豆菌菌丝可穿透植物的根部以造成感染，植物的根部初被此真菌感染时，植株地上部的症状尚不明显，常造成感染鑑定的困难，后期地上部症状与和蜜环菌等感染造成的类似，包括芽停止生长、叶黄化、叶变小、落叶、凋萎、果实干瘪等，树皮下出现明显的菌丝层，根部则会腐烂并长出白色棉花状的菌丝，在叶症状出现的数週内即可造成植物死亡，但也可能继续存活两至三年。
真菌病毒.已知多种真菌病毒可感染棕垫炭豆菌。巨型双核糖核酸病毒科的RnMBV1病毒（该科唯一一种病毒）、唿