于1340年（可能在8月中旬），最有可能在瑞典，尽管他出生的确切日期和地点仍然未知。哈康六世是瑞典和挪威国王马格努斯·埃里克森以及的小儿子。在1356年至1359年间，他的哥哥埃里克是瑞典王位的竞争对手，起兵反对他的父亲。哈康六世和他的家族属于瑞典的福尔孔王朝家族，后者继承瑞典的埃里克王朝和挪威的斯韦雷王朝。哈康六世是挪威国王哈康五世的曾孙（因为是他唯一婚生女儿英格堡·哈康斯多塔是哈康六世的祖母），并被挪威贵族视为可以接受的王位继承人。哈康六世的另一个值得注意的祖先，通过他的祖父南曼兰公爵埃里克·马格努松，