一起守庚申，超子扶着椅子睡着了，到了白天也不曾醒来，竟就此死去。享年在28岁左右。入葬藤原氏一族的族墓「宇治陵」。其成活的3子后皆有父亲兼家抚养，兼家最爱居贞亲王，常说这个孙儿最像他。在超子之妹诠子所生的一条天皇即位后，在兼家的主持下居贞亲王被立为一条天皇的东宫。一条天皇在位25年，堪称日久，所以居贞亲王最终登基时年已30多岁，是为三条天皇。三条天皇追封母亲超子为皇太后，诏书写道：
轶事.在超子因彻夜守庚申去世后，传说自此其家族不再让女子参与守庚申的之事。