新干线上野站延伸工程，站内新设地下通道，1983年赤羽线月台（当时为5号线，现在的7号线）移往高架。原先规划是所有路线同步高架化，但为了优先进行东北新干线建设而选择分批高架化。也因此，当时埼京线与京滨东北线须花费不少时间转乘。此外，当时宇都宫线、高崎线池袋站起迄列车行驶的东北货物线在本站前后皆为单线，因此上、下行列车在本站是使用同一月台。自1990年起，共花费约8年时间才完成车站与周边线路的高架化与交通立体化。完全高架化后，各线互相换乘更见便利。另外，本站是往山手线东西两侧方向列车的分歧站，因此月台间转乘的