当时是个裸名，并由于缺乏官方发表而经常被错误拼写为"Futalongkosaurus"。直到2007年，才正式由卡沃、胡安·波菲里、和进行详细的叙述。模式种为杜氏富塔隆柯龙（"Futalognkosaurus dukei"）。属名来自当地的原住民语马普切语，发音为「foo-ta-logn-koh-sohr-us」，其中「futa」意为「巨大」，而loñko意指「首领」，但拉丁语中没有ñ字因此转写成gn来替代。种名以赞助化石挖掘的杜克能源阿根廷公司为名。
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