903年（明治三十六年）6月，该庄编入「埔里社区」，隶属于南投厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，埔里社区仍隶属于南投厅。1920年（大正九年），全台地方制度大改正，废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「水头」大字，隶属于台中州能高郡埔里街。战后埔里街改制为埔里镇，隶属于台中县，大字亦改制为里。1950年10月，中、彰、投分治，埔里镇改隶属南投县。
聚落.本地区发展较早的聚落有水头、十一份、内大林（内底林）等，在日治期初期的官方地图上已有记载。此外，本地区尚有