被任命为陇南镇守使。1924年3月15日，孔繁锦被授予将军府铭威将军头衔。1925年2月，孔繁锦出任善后会议会员。1926年8月，孔繁锦与国民革命军在甘肃东部附近发生战争；孔繁锦遭击败并撤离甘肃。后来，孔繁锦曾任陕甘边防督办等职务，并在北洋政府被国民政府取代后离职闲居。1951年秋，孔繁锦病逝于甘肃天水。
后代.大儿子孔祥淦，二儿子为曹氏风筝传人孔祥泽。 孙子孔令民、孔炳彰、缪伯刚。曾外孙钮承泽。