最早在2004年10月21日凌晨，于该线内狮车站北方的嘉和遮体附近发现不明的铁块。两个月后的12月21日，内狮车站南方（往台东方向）的铁路桥上方铁轨的遭到破坏，所幸没有列车通过，台铁也因此加强巡逻。2005年6月21日，末班2057次高雄往台东的自强号列车行经内狮车站时因铁路的鱼尾钣遭破坏，列车因而出轨。此次列车虽然只有出轨倾斜，但也造成旅客受伤；同年8月21日电缆线遭破坏。2006年3月17日，台东往高雄的96次莒光号列车行经内狮车站与枋山车站间，又因铁轨遭破坏而出轨，车头R104严重损毁，因无