位于梳士巴利道地底，南面为收费区，设有多组扶手电梯及楼梯连接月台。商店则位于大堂西面非收费区及行人通道旁，包括便利店、面包糕饼店、咖啡店、书店、花店、银行及速递等。此外，尖东站也有不少自助服务设施包括自动柜员机、自动售卖机、自动照相机等供乘客使用，以及香港邮政邮箱，方便乘客在车站内投寄邮件。
月台.尖东站曾经是东铁线唯一的地底车站；设有两个月台，以一个岛式月台设计排列。月台设有长度为12卡列车的月台幕门。此两组月台幕门不但曾经是东铁线唯一设有月台幕门的车站，也是世界上设有月台幕门的