育王送来，因而赐额“阿育王寺”，由萧子云题字，座山也因寺得名。大同六年（540年），扩建储藏舍利塔的木浮屠，将武帝及昭明太子萧统像也藏于塔中，寺院声名大振。
唐宋.隋开皇十七年（597年），隋炀帝下令重建因战乱毁坏的阿育王寺。唐先天二年（713年），了缘修建西塔院，又称西塔寺，即今日寺址，此后西塔寺逐渐成为阿育王寺主要的宗教活动场所，而乌石岙东塔寺则逐渐冷落直至废弃。天宝二年（743年），鉴真第三次东渡失败，获救后曾住锡于阿育王寺，同行的日本僧人普照曾长时间在阿育王寺居住。会昌五年