4年重归西班牙控制，珍宝船队在大西洋和太平洋恢复了航行。1765年，西班牙国王卡洛斯三世开始逐渐放松贸易管制。1780年后，西班牙开放了殖民地自由贸易。1790年，负责管理殖民地贸易的机构关闭，这一年也是珍宝船队定期出航的最后一年，之后的运输任务则由海军船只单独、分散承担。尽管很多人认为有大量的西班牙运输船只被英国或荷兰摧毁或夺取，但实际上只有很少的船只遭此命运。只有荷兰人（Piet Hein）于1628年马坦萨斯湾海战中成功夺取了西班牙珍宝船队并将货物安全运回了荷兰。1656年和1657年，英国海