横跨台湾东西部的高速公路，大致以北北西—南南东走向转纵向蜿蜒经过三十九结地区东北部边界外不远处。邻近未设交流道，北侧最近的是省道台9线交会口南边的头城交流道，南侧最近的是省道台7线交会口的宜兰交流道。由该道路向北可前往头城西南部、坪林、石碇、南港并止于国道3号南港系统交流道，向南可前往宜兰、罗东、苏澳等地。乡道宜6线（七结路）是林美至车路头的道路，大致以西北—东南走向经过本地区西南部。由该道路向西北可前往七结、十六结、林尾并止于佛光大学叉路路口，向东南可前往茅埔南部、车路头并止于县道192号路口。