表示支持。然而弗莱堡作为一个传统的天主教城市，市议会发起了查抄，并将两千余本新教书籍在大教堂广场焚毁。在斐迪南大公1524年5月13日访问学校时，则明确建议驱逐新教学生房客。与此同期的1529年，巴塞尔的新教改革运动随着毁坏圣像达到了顶峰，伊拉斯谟和巴塞尔大学的许多天主教教授都来到了弗莱堡。
高卢学院.1679年弗莱堡成为法国城市。法王路易十四不喜欢奥地利制大学，将建设大学的资金和责任一同委托给天主教耶稣会。1684年11月6日，改名为高卢学院（）的弗莱堡大学开始设立双语项目。16