中心及培育训练人员于该中心驻守，而展开了相关的磋商和交流，并且准备了一切的交接事务。2010年4月15日，时任惩教署助理署长（行动）林国良和入境事务处助理处长（执法及酷刑声请审理）周康道在青山湾入境事务中心签署移交证书；青山湾入境事务中心正式交还入境事务处管理。至于原来驻守于青山湾入境事务中心的92名惩教署人员，则被分配到当时即将落成的罗湖惩教所。自2010年起，入境事务处重新接管此前由惩教署管理的青山湾入境事务中心后，记录到人员遇到袭击的个案，当中包括军装人员和外判医护人员等。入境事务处遂于201