有事，派遣两艘航空母舰巡防台湾海崃。选举就在「第三次台湾海崃危机」中完成，结果李登辉与连战以54.0%的得票率，赢得了中华民国第九任总统、副总统职位，也是华人历史上首次由公民直选产生的国家元首(参见：1996年中华民国总统大选)。国会全面改选与成功的总统直接民选也更加巩固中华民国的民主制度。1996年，李登辉当选成为中华民国第一位民选总统后，由于受到中共当局的政治压迫，李登辉对两岸关系的态度逐渐发生了变化，也愈发倾向台湾独立。1999年7月9日，他在接受德国之声录影专访的时候，提到海崃两岸的关系，表示“