以来第一次现金增资，提升银行资本适足率。但2006年12月，因公股不支持而离任。2007年3月，担任中信证（今凯基证）董事长一职，当年该公司创下最佳业绩。2008年6月，在永丰金董事长何寿川的力邀之下，陈接任永丰金董事长。2008年12月，陈冲出任行政院金管会主委。2010年，内阁改组，陈冲升任行政院副院长。
行政院长.2012年2月6日，陈冲升任行政院院长，成为中华民国第四位以财经专长的阁揆。2012年2月24日，陈冲首次以行政院院长的身份赴立法院进行施政报告，初时因瘦肉