08年的一项研究显示，南非不同种族在感染爱滋病毒方面有明显差异：有13.6%的黑人对爱滋病毒呈阳性，但只有0.3%的白人患有爱滋病。南非每年平均出现约30万宗爱滋病新增病例，而因爱滋病相关原因丧命的人亦达到27万。在2005年，南非估计分别有高达31%的孕妇以及20%以上的成年人感染了爱滋病毒。南非国民的爱滋病感染率为21.5%，至于军队中感染爱滋病病毒及爱滋病患者的比例更高达23%。前总统姆贝基及时任长期否认南非爱滋病问题，他们都坚持认为，许多南非人的死亡是由于营养不良与贫困问题，而不是爱滋病所致的。