光染剂）的发射波长，仅有少部分重叠，研究员可以善用这项特性在单一的样品上进行多重萤光染色。如果需要十分精确的分析，可以使用光谱去混合（spectral unmixing）技术计算此一影响。
吸收模型.2013年，有研究者以与等电位聚焦的描述了DAPI与DNA结合与发出萤光的机制，此一量子力学模型解释了DAPI与DNA结合后吸收与发射光谱的现象，与DNA的结合会使DAPI分子因位向限制导致几何弹性降低，且周围环境的极性甚低会导致DAPI分子的极性降低。
用途.