侵害。病原体通过宿主的进入身体，这些界面通常就是口腔、鼻子、眼睛、生殖器、肛门等身体孔口上的粘膜，或者微生物也可透过开放性伤口进入身体。有少数微生物可在进入人体的初始位置上生长，但许多生物会迁移，并在不同器官中引起器官系统的感染。一些病原体在宿主细胞内（胞内）生长，而其他病原体则在体液中自由生长。伤口移生是指伤口之内尚未有复制的微生物，但是在感染的伤口上存在复制中的微生物，伤口的组织受损。 所有多细胞生物都在某种程度上被外来生物所移生，其中绝大多数与宿主之间存有互利共生的关系，或者是偏利共生的关系。前者的