据珍岛，拥立承化侯王温为国王，公开与蒙古、高丽朝廷决裂。高丽朝廷并没有镇压三别抄军，而是建议蒙古大汗忽必烈攻打日本，并借机在1271年求得了蒙古的军事支持，攻陷珍岛。裴仲孙和王温都在这场战役中被杀，但金通精没有死，率领残部逃往济州岛，随后驱逐了该岛的耽罗国王，据岛抗击蒙古，给予了高丽、元朝联军以巨大损失。但1273年4月，联军终于攻陷了济州岛，金通精自杀，三别抄军随即彻底覆灭。由于金通精率领三别抄军反抗蒙古，现在被韩国学者颂扬为救国英雄。另一方面，金通精的军事抵抗也使忽必烈远征日本大大地推迟了。