，巴尼亚卢卡这个名字的来源仍然不明，有说法认为是意为总督（"ban"）的草地或崃谷（"luka"），但仍不能确定，也有说法认为是来自于"banja"（入浴）、"bajna"（值得惊讶的）和"luka"（港）组合而成。另外，也有人认为是来自于匈牙利语和斯洛伐克语中的煤矿一词等说法。
奥斯曼帝国时代.在奥斯曼帝国统治波斯尼亚时期，巴尼亚卢卡是波斯尼亚的的中心都市，今日城市的主要街道就是在这个时期修筑。巴尼亚卢卡最有名的帕夏是在1566年至1574年期间的统治者波斯尼亚人菲尔哈特·帕夏·