爆发，徐树铮为段祺瑞起草《北洋五十将乞共和电》与《乞共和第二电》，以武力威胁，称「谨率全军将士入京，与王公剖陈利害」，迫使隆裕太后同意宣统退位。1912年至1914年，徐树铮先后任军学司司长、军马司司长、将军府事务厅长等职。1914年5月，徐树铮任陆军部次长，年仅34岁，为次长中最年轻者。12月，与粤东学堂总理梁士诒订立合同租赁校舍创办正志中学（现在首都师范大学附属中学的前身）。1915年袁世凯称帝时，因其劝段祺瑞抵制帝制，遭袁世凯罢免。1916年6月，袁世凯死后，黎元洪继任总统，段祺瑞为北洋政府国务院