了自己创立的公司外，吴尊贤也参与了多间公司的投资，如自立晚报、大台北瓦斯、台湾玻璃、统一企业、太子建设等。吴尊贤在1956年发现患有糖尿病，开始学习高尔夫球运动。1999年6月7日，吴尊贤在因心脏衰竭在台北市国泰医院过世。1999年6月21日，吴尊贤公祭，中华民国总统李登辉献花致意并颁褒扬令。
家庭.1937年（昭和12年），与陈玉梅结婚。两人生下五子一女。
慈善事业.1981年4月10日，吴尊贤及其家族捐出新台币一亿元股票成立吴尊贤文教公益基金会。