1946年夏，朱瑞任东北军政大学副校长兼东北炮校校长。10月，朱瑞任东北民主联军炮兵司令员，建立了一支独立建制的炮兵部队，在第二次国共内战中立下战功。1948年1月，朱瑞任东北军区兼东北野战军炮兵司令员。1948年10月1日，朱瑞在辽沈战役中率部攻克锦州义县，战后在前往前沿阵地时触地雷身亡。当时朱瑞只有四十四岁。