2013年1月8日起定名为祁东站，原湘桂铁路祁东站则更名为祁东北站。2013年12月28日，祁东站正式投入使用，由桂林开往北京西的G530次列车成为当天在祁东站停靠的首班列车，该列车同时也是广西首班高速动车组列车。当天在祁东站停靠的还有包括K22、K538在内的另外9班列车，次日另外15班列车开始停靠新祁东站。从祁东至衡阳的时间也因高铁列车的开通而缩短至30分钟。现时，在祁东站停靠的列车已增至22对。然而在祁东站开通初期，站前广场仍未完工且施工进展缓慢，祁东站因此在2014年春运期间只停靠高速列车，