的领导机关和党派调查室留在各级党部内，其他单位转移至各政府部门（如国民政府主计处统计局第六、七科、内政部第四处、经济部特种经济调查处），但实际还是由党通局领导。1949年5月，党通局主要职能部分改为内政部调查局。1949年4月党通局改隶属于中华民国内政部，更名为内政部调查局；同年12月随政府迁台北。1955年，调查局接收国防部军事情报局的保防侦查等业务。1956年6月1日调查局改隶司法行政部（今法务部）而更名为司法行政部调查局，1980年8月1日再随司法行政部更名为法务部而更名为法务部调查局。