时间，七次改组内阁，政局一片混乱，终于在1910年10月3日晚爆发了革命，曼努埃尔二世的宫殿被轰击，他于10月5日被废黜并于当天逃亡到英国海外领地直布罗陀。曼努埃尔二世后定居英国伦敦。1913年9月4日，在锡格马林根与霍亨索伦公主霍亨索伦-西格马林根的奥古斯塔·维多利亚公主结婚。没有子嗣。曼努埃尔二世是一位藏书家，并写了一本中世纪和文艺复兴时期葡萄牙文学指南。曼努埃尔二世于1932年7月2日逝世于英国托维肯汉姆。由于他没有子嗣，他认可布拉干萨公爵杜阿尔特·努诺为他的继承人。