县太保市西侧，北与六脚乡相邻，西与朴子市为界，占地面积703,334平方公尺。院区三面临路，北迎嘉58线，东临嘉45线，南侧宽50公尺的故宫大道为主要联外道路。主要入口设于南侧故宫大道上，北侧故宫北路（嘉58线）另有一处辅助入口。故宫南院园区邻近嘉义县政府、高铁嘉义站及长庚医院嘉义院区，附近地区并以高铁嘉义站为中心，规划为大规模的特定计画区。
院区设施.
博物馆.博物馆位于院区西侧，主体建筑由姚仁喜设计，建筑高度29.3公尺，造型以三个流线型量体交会组成(