鲁瓦超过半数的居民皈依新教，当地于1520年出现了第一个信义宗派会，特鲁瓦主教卡拉肖尔（）曾支持新教在当地的发展，但在圣巴多罗买大屠杀期间，保守天主教及皇家军队在特鲁瓦杀害了大批新教徒，使得当地的两个宗教的居民间长期处于仇恨与对立之中，直到1598年《南特敕令》颁布。文艺复兴期间，特鲁瓦出现了大批新居民区及公共建筑，是这一时期当地标志性的建筑。18世纪中后期，手工纺织业成为特鲁瓦的重要生产部门。1787年，法兰西王国曾迁至特鲁瓦。
近代.法国大革命期间，特鲁瓦市长因被怀疑串通境