世后，法兰西斯科被詹姆斯党认为是英格兰、苏格兰和爱尔兰的王位继承人“弗朗西斯一世”。他死后，弟弟的女儿奥地利-埃斯特的玛丽亚·特雷西亚成为了詹姆斯党继承人。1841年，法兰西斯科又获得萨伏伊至圣报喜勋位大链章。1842年3月30日，法兰西斯科在慕尼黑王宫娶巴伐利亚国王路德维希一世和萨克森-希尔德堡豪森的特丽莎公主夫妇的第三女阿德尔冈德为妻。慕尼黑-弗莱兴总主教主持了他们的婚配圣事。他们只有一个孩子安妮·碧翠丝公主（1848年10月19日生于博尔察诺的格里斯 - 1849年7月8日卒于摩德纳）。1