嘉庆四年（1799年）因案被召到台湾府城，路经盐水武庙时向神明祈求保佑他平安无事，而事后他案消无事，遂派人送了银4100元进行整修。另一说则是林文濬经商时，因故被帐目弄得一团乱，理不出头绪。后来有位书生造访，帮他整理了帐目，告别时此书生只说他姓关，住在嘉义县盐水港。事后林文濬欲上门答谢，却找不到人，偶然进了盐水武庙才发现那位书生就是庙里的关圣帝君，遂捐款修庙。此次重修奠定了武庙大致规模，此外还增建了后殿佛祖厅（玉莲寺）。道光八年（1828年），董事李怡成、曾长源、陈学古、苏春山、林协泰、谢源美、黄长顺、