时作为海防舰舰长、特设舰艇舰长或艇长、舰艇机关长等，在船团护卫、沿岸警备的第一线上活跃，另也负责征用商船在危险海域进行物资、人员运输业务。但由于旧海军的学阀偏重主义、学历至上主义，非从海军兵学校出身的预备士官，即使再为优秀，也只能在正规士官之下。太平洋战争中，高等商船学校出身者战死率远高于海军兵学校出身者，造成了之后海上保安厅（高等商船学校出身者）与海上自卫队（海军兵学校出身者）的不睦。1999年（平成11年）3月23日发生能登半岛沿海不明船事件。由于事态超过海上保安厅的能力，因此海上自卫队首次发动