纪时古希腊历史学家希罗多德就提到过此地。拜占庭帝国时期，该城为重要的边境城市，建有大型的堡垒。在1205年和1345年，塞雷曾先后被保加利亚人和塞尔维亚人占领。尽管1371年马里查战役后拜占庭重夺此地，塞雷仍在1383年被奥斯曼帝国征服。1912年第一次巴尔干战争期间，被保加利亚军队占领。第二次巴尔干战争中被希腊军队夺取。两次世界大战期间，又被保加利亚占领。现在塞雷为烟草、谷物等农产品的贸易中心。