质子性溶剂。它的毒性比其他如二甲基甲醯胺（DMF）、二甲基乙醯胺（ DMAC）、N-甲基吡咯烷酮（NMP）及六甲基磷醯胺 （HMPA）等此类溶剂低。
安全性.二甲基亚砜极易渗透皮肤。例如氰化钠的二甲基亚砜溶液可经由皮肤接触造成氰化物中毒。而二甲基亚砜本身毒性较低。二甲基亚砜亦能刺激皮肤，光滑的皮肤一般上比粗糙皮肤易受到刺激。