行前往南京城内的江上考棚，与钦差就条约内容作最后谈判。在历次的会谈，麻恭均有参与其中。1842年8月29日，砵甸乍一方与耆英及伊里布等清廷代表于康华丽号上正式签订《南京条约》，标志着第一次鸦片战争结束。条约除了正式将香港割让英国，又令清廷赔款2,100万银圆，以及开放广州、福州、厦门、宁波和上海五处港口作为通商口岸等。战事结束后，麻恭停任驻华英军总司令副官，但仍留任公使馆秘书官。同时间，道光帝确认《南京条约》的消息于9月15日传到南京后，麻恭即受命于翌日启程把条约文本带返英国，而砵甸乍则于同年12月返抵