掌政，在倒幕派皆对政务运作不熟悉之时，派遣家臣进入政府，借协助之名掌控政治。倒幕派对于这样的结果很不甘心，但是由于武力倒幕的正当性锐减，因此只好暂时按兵不动。后来，政府内倒幕派与德川派的斗争渐趋白热化。1868年1月3日，明治天皇颁布“王政复古大号令”，宣布废除幕府，并命令德川庆喜“辞官纳地”，将一切权力重新归于天皇。当倒幕派得知德川庆喜决定从大坂（今大坂）出兵进攻时，旋即派出以萨摩藩、长州藩成员为主力的军队，在京都附近的鸟羽、伏见两地展开激烈战斗。经过三天的交战，以寡击众的新政府，在新