护一性论的叙利亚和埃及都在希拉克略统治末期被阿拉伯人占领，帝国剩余的领土中正统教义都占优势，困扰帝国数个世纪的纷争从此不再成为一个重要的政治问题。关于希拉克略在军区制创立中的历史作用，现代研究中存在争议，着名历史学家认为希拉克略在安纳托利亚设置了四个军区，但也有一些学者认为军区制是在希拉克略的孙子君士坦斯二世统治时期创立的；A.A.瓦西列夫认为，希拉克略至少为亚美尼亚军区的建立做了贡献。为对抗敌人，希拉克略还设立了办公室以加强财政管理。629年，拜占庭的官方文件中第一次使用“巴西琉斯”这一头衔来称唿