。麟嘉四年（392年），吕光派了吕纂进攻南羌彭奚念，但在盘夷大败而还。吕光遂亲率大军再攻，让吕纂及杨轨、沮渠罗仇进军左南（今青海西宁市东），逼得彭奚念凭湟河自守，然吕光还是派兵渡过湟河，攻下枹罕（今甘肃临夏市），令彭奚念败走甘松（今甘肃叠部县东南）。龙飞元年（396年），吕光称天王，以吕纂为太原公。次年，吕光攻西秦，派吕纂、杨轨及窦苟等率三万兵攻金城（今甘肃兰州市），攻陷了金城。同年，吕光杀沮渠罗仇及沮渠麴粥，令得罗仇侄沮渠蒙逊反叛。蒙逊堂兄沮渠男成也推了建康太守段业为主，吕纂奉命讨伐段业，然而因为沮渠