集中营中渡过，直至1945年战争结束才被盟国俘获。1948年法肯豪森被送往比利时受审，钱秀玲和一批比利时犹太人出面为其辩护作证；在狱期间，着名的比利时抗纳粹女英雄为他送食物（后来在他第一任妻子去世后，两人结婚）。1951年3月被控驱逐25,000名犹太人以及处死比利时俘虏而被判处12年劳动监禁，后被送往西德服刑。1955年在（依照比利时法律要求）服刑超过1/3后，鉴于有充分的证据显示他曾尽力挽救犹太人和比利时人，西德总理将其特赦。1950年法肯豪森的72岁生日，收到蒋中正的12,000元美金作为贺礼