主祭神的住吉三神在《古事记》和《日本书纪》均有记载。《古事记》中，从黄泉归来的伊邪那岐为了去除污秽，在筑紫的日向的橘的小户的阿波岐原（现宫崎县宫崎市）进行的仪式时，住吉三神便与绵津见三神一同出生。另外，神功皇后出兵朝鲜时，神託于住吉三神，最终助其成功征服新罗。在《日本书纪》中，神功皇后从朝鲜归来之际曾经进行神託，将住吉神的荒魂祀于穴门山田邑，和魂则祀于大津渟中仓长崃，前者比定为下关的（山口县下关市），后者则为大坂的住吉大社（大坂府大坂市），福冈的住吉神社则是神功皇后任命为住吉社的神主而创建的，从而推测其在三