963年10月1日，改为奈及利亚联邦共和国。其后军事政变多次发生，军人长期掌权。1998年6月8日，军政府首脑阿巴查在自家别墅去世，接任者决定还权给民选政府。1967年5月30日，伊博族人宣布退出奈及利亚联邦共和国，成立比亚法拉共和国；同年7月，以戈翁为首的联邦政府出兵镇压，内战爆发；至1970年1月，比亚法拉军队战败。1999年2月的总统选举中，奥卢塞贡·奥巴桑乔当选。2007年4月21日，举行总统和国民议会选举。奥马鲁·亚拉杜瓦当选总统。2010年5月5日奥马鲁·亚拉杜瓦病逝，副总统古德勒