谥孔子为“大成至圣文宣王”，此诏书石碑，现仍立于大成门前。至顺二年（1331年）诏令孔庙配享皇宫规制，于四隅建角楼。元末战乱，孔庙荒废。明永乐九年（1411年）重修；嘉靖九年（1530年）改革礼制，增建崇圣祠。清干隆二年（1737年）高宗谕改各殿顶为黄琉璃瓦，崇圣祠用绿琉璃瓦。光绪三十二年（1906年）将祭孔礼仪升为大祀，并对孔庙进行了大规模修缮，将原来七间三进的大成殿改为九间五进，工程持续到民国五年（1916年）方告竣工。民国十七年（1928年），孔庙始对各界开放。中华人民共和国成立后，孔庙由首都博物馆使