雄县东南边交界处，大坪顶一带的凤山丘陵（凤山水库建于其上），其中柴山与半屏山皆因珊瑚礁隆起而形成。位于市区西南侧，隔着高雄港狭长水道与前镇相对的旗津，原本是一座沙洲半岛，后来南端因兴建第二港口，而以水道与红毛港分割。此外，高雄港大致是基于该区域过去原始的潟湖地形整建而来。属于高雄市辖下的东沙群岛，包括3个珊瑚环礁，分别为北卫滩、南卫滩与东沙环礁。前两者为沉水环礁，后者为出水环礁。位于东沙环礁西侧的东沙岛，为近期堆积层，几乎没有土壤化育，表层覆盖着贝壳风化成的白沙，有些地方的中层则是由鸟粪堆积成的磷矿层；