累升至礼科都给事中。周玺为人慷慨好言，明武宗即位初期，周玺请求毁去新建的寺庙道观，并逐法王、真人，停止道士所做的祈祷礼仪，并追论太监齐玄炼丹浪费财政的罪过。不久，因为连时下雨，其与同僚弹劾侍郎李温、太监苗逵等人。同年九月，因星变，再弹劾李温与尚书崔志端、熊翀、贾斌，都御史金泽、徐源等。熊翀、李温、金泽等人被罢免。当时武宗派遣太监韦兴镇守郧阳，周玺上疏反对。之后又与同官请求改正时政弊病，没有得到批准。正德元年（1506年），周玺再次上疏，弹劾大臣贾斌等十一人，中官李兴等三人，勋戚张懋等七人，边将朱廷、解端