贻谷贪污等罪，随后贻谷也上奏称文哲珲侵吞库银。光绪三十四年四月，清廷派军机大臣鹿传霖抵绥远查办，贻谷被判“二误四罪”，革职解入北京，文哲珲也被削职。此后，派信勤接任督办蒙旗垦务大臣兼绥远城将军，三多接任归化城副都统。1912年4月10日，袁世凯任命张元奇为内务部次长，负责蒙藏事务。同年5月12日，免去张元奇的内务部次长职务，在内务部下设立蒙藏事务处，由文哲珲担任总办，吴燕绍任帮办。蒙藏事务处下设有四个科，直隶于国务院。同年7月24日，参议院决定将蒙藏事务处改为蒙藏事务局，公布官制，蒙藏事务局直隶于国务总