到了1929年，中国工农红军第四军（红四军）进军福建，福音医院成为中央苏区首座为中国工农红军服务的医院。数十名红四军伤兵获福音医院提供治疗，而傅连暲也鼓励医院的医务人员参与红军，以组织红军医疗队；此外，由于当时福建西部有天花疫情，傅连暲主动向红四军军长朱德提议为全体红四军官兵接种牛痘。1931年，中华民国政府对中央苏区实施经济封锁，导致药品供应紧张；红四军领导人毛泽东便指示傅连暲派员到上海购买药品，并在上海、上杭、峰市镇、汕头等地开设地下药店。同年，傅连暲在福音医院创立「中国工农红军看护学校」，为中国