矿（天青石）储量和品位为东南亚之首，六合有蓝宝石矿。南京市还有地热资源，有汤山温泉、汤泉温泉、珍珠泉温泉等。
水系.长江从江宁铜井进入南京境内，向北流至下关后折向东，从龙潭流出进入镇江，在南京境内长约95千米。江中较大的沙洲有八卦洲、江心洲等等。长江南京段在下关设有水位站，历年平均低水位为2.98米，汛期警戒水位为8.5米，百年一遇洪水水位为10.6米。秦淮河是南京最知名的地区性河流。它的南北两源分别在溧水区东庐山和句容市宝华山南麓，在江宁方山汇合后流至南京城通济门外又分为内外两支