月19日下午15点整，98次列车由九龙站（今红磡站）发车，5月20日晚上20时55分到达北京西站，全程29小时55分。京九直通车由北京铁路局北京西客运段（京局西段）担当，採用当时最新型及高质量的25K型客车，并取代25G型客车。当时列车会停靠东莞站（今常平站）约一个小时，乘客须携带所有行李，在该站办理内地出入境手续。而乘客也可以在除常平站以外的中途站上下车，包括广州东、广州、韶关、郴州、长沙、武昌、汉口、信阳、郑州、石家庄等10个车站。京九直通车的首张车票于1997年5月12日售出。实际上，由北京开出并