换乘通道长达200米，通道中有数个售卖食物和衣物的商铺。通道仅设有两组楼梯，没有扶梯及垂直电梯。因此不适合携带大件行李的人士及伤残人士换乘。三期线路中亦有多种换乘方式，如红树湾南站和车公庙站7，9号线同向的同台换乘/跨月台换乘，红岭北站的十字换乘，赤湾站的站厅短通道换乘以及后海站的站厅长通道换乘等。2016年，深圳地铁首次在车公庙站引入换乘层，位于7号线、9号线月台和站厅之间的楼层，让两线不同方向换乘的乘客只需在换乘层转车，不需要上两层到站厅再下两层换乘，节省时间。而上梅林站其中一条换乘长通道则连接4号