鸟龙下目。因为阿瓦拉慈龙科的原始物种有许多独有特征，阿瓦拉慈龙科普遍被认为是单系群，但原始物种缺乏大部分的类似鸟类特征。这些特征中有些是被错误诠释的。阿瓦拉慈龙科与鸟类的相似处，例如有嵴的胸骨，是个结构相似的例子。进阶的阿瓦拉慈龙科的类似鸟类特征是平行演化而来的，而非两者具有共同祖先。
系统发生学.在2007年，艾伦·特纳等人提出阿瓦拉慈龙类是手盗龙类中最基底的群体，较嗜鸟龙衍化一个阶段，比似鸟龙下目更衍化两个阶段。阿瓦拉慈龙类比偷蛋龙下目原始。在1996年，诺瓦斯命名了巴