在2012-13赛季前签入另一位门将蒂姆·维泽后，施塔克被获准在合同期满前以自由转会的身份离开俱乐部。2012年夏天，他被德甲豪门拜仁慕尼黑签入，并获得了一份为期三年的合同。作为汉斯-约尔格·布特退役后的继任者，施塔克在拜仁的身份成为仅次于主力人选曼努埃尔·诺伊尔之后的第二门将。他代表拜仁参加的首场比赛是2012年10月31日德国杯第二轮，拜仁主场以4比0战胜凯泽斯劳滕。直至2013年4月13日，施塔克才迎来了他代表拜仁在德甲联赛的首秀，他在球队以1比0战胜老东家霍芬海姆的比赛中首发并打满全场。2013年4