2006版.2006年12月，巴西开始发行新版本护照，是为2006版护照。为了配合南方共同市场护照标准，普通护照封面颜色改为蓝色，并同时在封面顶端标註「Mercosul」（「南方共同市场」的葡萄牙语）此外，2006版为可机读护照，取代了多年来护照资料均为手写的做法。2006版护照共有20处防伪特征，较前一版本的防伪能力有所加强。
2010版.2010年11月，巴西2010版护照开始发行，是该国第一个版本的生物特征护照。除了加入晶片外，2010版与2