2003年被子植物APG II分类法中，原本萝藦科与夹竹桃科同样被编在龙胆目下，但因藦萝科和夹竹桃科有较高的DNA亲缘关系，2009年10月，被子植物种系发生学组（APG）在林奈学会植物学报正式发表的被子植物APG III分类法中，萝藦科改隶属于龙胆目夹竹桃科下的萝藦亚科。2016年的APG IV分类法维持不变。