此，两者之间还是有些许差异，例如巖通常比佛寺规模小，巖仔建筑多燕尾嵴，巖可由在家众主持，巖不可如寺般设纳骨塔等等。不过在1945年大型巖仔出现后，这种设限已不明显。现下台湾，不包含祭祀道教主神的巖仔约有70间。较为出名的有台北市芝山巖、康熙年间建的宝藏巖、18世纪所建的慈云巖、桃园市的寿山巖、台中市的清水紫云巖、及高雄三大巖的林园清水巖、大社翠屏巖与阿莲大岗山巖。台湾知名宗教学者林美容将这些现下影响力相当深、与中国佛教多所差异的巖仔，称为「民间佛教」，不过台湾知名佛教史学者江灿腾则认为巖仔仅为「民间佛教