还内阁，张璁等欲起用王琼，廖纪则举荐彭泽、王守仁，世宗没有批准。此后则以邓璋、王宪名上，竟用王宪。嘉靖五年正月，御史张衮、喻茂坚、朱实昌以世庙礼成，请宽恕大礼议中得罪的诸臣，张璁、桂萼亦以为请，奏章俱下吏部。廖纪等人列上四十七人，但世宗却没有批准。御史魏有本以劾郭勋而救马永被谪官，给事中沈汉等论救。廖纪从容对答，并举荐马永和杨锐，得到世宗批准。廖纪此后因老辞职，得到批准。历加太子太保、进少保，赐敕乘传。卒赠少傅，谥僖靖。
家族.曾祖廖召兴；祖父廖有能；父廖瑄，前母陈氏；王氏。