立法院作为国会，运作主要依《中华民国宪法》、《中华民国宪法增修条文》及1999年所制定，修订之国会五法：《立法院组织法》、《立法院各委员会组织法》、《立法院职权行使法》、《立法委员行为法》、与《立法院议事规则》。
自主原则.万年国会时代的立法院院长于1986－1991年曾六次动用警察权对付在野党立委；自1992年国会全面改选后，即使面对再大的内外压力，在「国会自主」原则下，都未曾动用警察权。王金平在任期间，坚持「国会尊严」、建立朝野协商的宪政惯例，拒绝国民党中央施压动用警察权