氧性细菌细胞消化之物质，当为好氧性细菌者之十倍以上，此即为高浓度之有机废水或污泥常利用厌氧消化法处理之原因所在，且因此厌氧消化所需之营养剂如氮、磷等均较少，而消化后之污泥也相对减少。
过程.许多微生物会影响厌氧消化，包括乙酸形成细菌（）和甲烷形成古菌（）。这些微生物促进生物质转化成沼气的一些化学过程。
过程阶段.厌氧消化的四个关键阶段包括水解，，和甲烷生成。整个过程可以通过化学反应来被描述，其中有机材料例如葡萄糖被厌氧微生物生物化学的消化成二氧化碳（C