江省党部党务指导委员、常务委员。南京国民政府成立后，王漱芳任国民政府训练总监部秘书主任，随后又出任国民政府交通部秘书厅主任和国民革命军总司令行营参议。1928年起，王漱芳历任中国国民党南京特别市党部监察委员、国民会议总选举事务所参事、国民会议代表，中国国民党第三次、第四次全国代表大会代表。1931年至1935年，王漱芳连任两届南京市政府秘书长。与此同时，他还兼任立法院立法委员、监察院参事。1931年，在中国国民党第四次全国代表大会南京会议上，王漱芳被提名为中央执行委员候选人，但因不满30岁，未达到中央执行委