洛斯阿拉莫斯国家实验室发生过三起主要核事故。两起临界事故分别发生于1945年8月和1946年5月，第三次事故则发生在1958年12月。1965年，洛斯阿拉莫斯国家实验室入选国家历史地标。
冷战之后.冷战结束之时，劳伦斯利佛摩国家实验室与洛斯阿拉莫斯国家实验室都对自己的研究方向进行了大幅度的扩展，以适应冷战结束后对核武器研究降低的需求。两个实验室都开始进行许多“非战争应对”的科学技术研究项目。洛斯阿拉莫斯实验室的核科研主要与计算机模拟和核武库维护相关，双轴射线成像流体动力学实验