航停飞造成了在1992年尚有42万人次的双边往来数量，在第二年就下降到了22万人次，而直到2003年才仅仅恢复到36万人次。最终，「台北驻首尔非官方代表团」成员与「首尔驻台北非官方代表团」于2004年9月1日签订了《台韩空运协定》，允许双方的飞机进入对方领空。这一协议不仅重新开通了中华民国与韩国之间的直航，还使得从韩国到东南亚的航线可以直接过境台北飞航情报区，而不需要绕道中华人民共和国或者菲律宾。当时的分析家估计，这可以让韩国的航空公司在燃油以及其它费用上节省330亿韩圆（折合当时的2,900万美元）。