调设备、屋宇装备、机电及电子设备，提供操作及维修保养服务。该部别的主要客户为康乐及文化事务署、食物环境衞生署、海事处、邮政署及旅游事务署。衞生工程部负责操作及维修保养设置于公立医院、洗衣房、化验所及诊疗所的机电、电子及屋宇装备系统和设备，其中不少都是医院专用设备，例如医疗气体供应系统、消毒炉等。该部别亦负责为病人用的生物医学设备、治疗设备及临牀化验设备拟备规格、进行採购和提供维修保养服务，其主要客户为医院管理局、衞生署、政府化验所及菲腊牙科医院。
工程服务科3.工程服务科3负责