担任航校领航教员，为正连级飞行员，飞行时数超700小时。1987年，王仲才考入中国人民解放军海军广州舰艇学院飞行员舰长班，历时3年半学习后，1991年1月毕业，取得舰艇指挥专业本科学历和工学学士学位。王仲才毕业后业分配至北海舰队驱逐舰第一支队，历任四平号导弹护卫舰见习副舰长，哈尔滨号导弹驱逐舰副舰长，青岛号导弹驱逐舰副舰长。2000年后，王仲才担任杭州号导弹驱逐舰副舰长、舰长。此后，王仲才长期在东海舰队服役。2011年9月16日至12月29日，王仲才担任任务副指挥员，乘和平方舟号医院船从浙江舟山某军港启航，