006年4月，为进一步完善中国足球产业的市场化进程，中国足球协会与所有中超联赛参赛俱乐部共同出资成立了中超联赛有限责任公司负责运营中超联赛。中国足球协会出资72万元，持有中超联赛36%的股份，是中超联赛有限责任公司第一大股东。2007年由于上海联城和上海申花的合并，总共有15支俱乐部队参加2007赛季中超联赛。2008年，第一次有16支队伍参加中超联赛，但是于10月初，武汉光谷因称中国足协违反程序对其进行不公处罚而退出中超联赛。因为国家队长期成绩不佳，加上中国足球各级联赛均存在管理腐败，赌球成风问题