和普通的自贸协定不同，关税同盟对从关税同盟外进口的商品统一征收关税。此外，欧盟委员会在世界贸易组织中代表关税同盟，并作为整体进行对外贸易谈判、解决贸易纠纷，而不像普通自贸协定中成员国仍单独进行国际贸易磋商。
同盟内非欧盟领域.摩纳哥和英国的阿克罗蒂里和泽凯利亚、根西，泽西和马恩岛不属于欧盟领土，但加入了欧盟关税同盟。而安道尔、圣马力诺和土耳其这三个非欧盟成员国则分别和欧盟签订了贸易协定而加入关税同盟。
未加入同盟的欧盟领域.理论上欧盟成员国都是欧盟关税同盟