年（1582年）6月，信长在本能寺之变中死去，于是嘉隆转仕于羽柴秀吉，与信长时期的水军头领一起被重用。于天正15年（1587年）的九州征伐、天正18年（1590年）的小田原征伐等战斗中亦有参阵。在天正13年（1585年）任从五位下大隅守。同时决定以答志郡鸟羽（鸟羽市鸟羽）之地为本据地，开始着手建筑鸟羽城。由天正20年（1592年）开始的文禄庆长之役中，因为在5月至6月被李舜臣率领的朝鲜水军攻撃，在釜山西方展开的水陆诸部队受到的损害增加，在7月，嘉隆、脇坂安治、加藤嘉明3个大名被编成水军并与其对抗。但