2002年，奥地利联邦内务部把GEK改名为EKO Cobra并一直沿用至今。目前眼镜蛇作战司令部共有450名作战人员，并经常地与世界各地的精锐反恐特种部队一起训练。
知名行动.眼镜蛇作战司令部于1996年参与了在格拉茨-卡路监狱的人质救援任务以及数之不尽的其他行动。1996年10月17日，4名眼镜蛇作战司令部的人员登上了一架载有即将被驱逐出境的犯人，并准备飞往拉格斯的图-154客机。当时一名尼日利亚犯人以一把刀威胁机组人员，要求他们把客机飞往德国或南非。该犯人随即被部队制服，并