从事的课题有近代中国社会变迁与渐进变革思潮等。在中国思想界，朱学勤被视为自由主义代表人物。在网络上，朱学勤被视为南方系重要的人物。近年来，多次出访欧美、港台，先后作为访问学者在台湾中央研究院、哈佛大学、香港中文大学进行学术研究，并应邀赴普林斯顿大学，耶鲁大学，迪金森学院作学术讲演，赴瑞典斯德哥尔摩大学参加国际学术讨论会并作大会主题发言。
争议.关于朱学勤的争议有“天谴论”事件和朱学勤涉嫌抄袭事件。2008年汶川大地震发生后，5月14日，朱学勤在《南方都市报》上发表有关地震“天