撤销中共港澳工委，分别成立中共中央直接领导的中国共产党香港工作委员会（中共香港工委）和中国共产党澳门工作委员会（中共澳门工委）。两个工委不属于中共中央直属机关。在1995年至2002年间，两个工委分别改为中共中央香港工作委员会（中央香港工委）、中共中央澳门工作委员会（中央澳门工委），作为中共中央派出机构，列入中共中央直属机关序列。中共香港工委（后为中央香港工委）与新华社香港分社实行一个机构两块牌子。
香港回归后.2000年1月设立中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室后，改与中央人