隔年另开鸡笼、打狗两港，而有正、副港之称。从清治后期起，昔日波光粼粼的台江海岸，因发生大风雨，大量河沙注入台江内海，千里汪洋尽成海埔新生地。
台湾民主国时期.1895年4月，《马关条约》签订，台湾、澎湖割予日本。5月，台湾巡抚唐景崧发布「台湾民主国独立宣言」，共和国政体的台湾民主国成立。未几，唐景崧内渡中国大陆，同年6月下旬，义勇军在台南拥立原大将军刘永福为第二任大总统，以台南为都，设总统府于大天后宫，视为「台南共和」（DaiLam Republic）或「第二共和」(Second