部和技术人员把枪支弹药运过海，以充实琼纵的武器装备。会议经过研究，确定采取“分批偷渡与积极准备大规模强渡，两者并重进行”的方针。领导机关实行北移就近指挥。五总队也因战争的急剧发展适时抽调至琼西北加入接应掩护。1950年3月至5月，琼崖纵队接应和配合中国人民解放军渡海作战，占领海南全岛。在解放海南战役中，党中央充分尊重冯白驹的两条建议，毛泽东对华南分局及邓华兵团特别提及海南岛“有冯白驹的配合”。解放海南为止，琼纵力量约有二万人左右。1950年5月，冯白驹任海南军政委员会副主任，6月任中共海南岛区委员会书记