5月26日，台糖底层干部厂雷大効、洪子瑜、杨鸿松、刘景祥、黄自清等五人遭到逮捕，5月30日，人事室主任林良桐被捕，同年6月16日，沈镇南被捕，一直至6月22日为止，台糖都不停地传出有人被逮捕的迹象。台湾省保安司令部以「为叛徒供给资产未遂」的罪名，将其判处死刑，沈镇南本人多次撰写自白书来表示自己毫不知情，也从未与匪有任何联络，沈镇南夫人由于与时任台湾省主席陈诚之夫人熟识，故请託陈诚协助，然陈诚却表示爱莫能助。1950年9月18日，根据《惩治叛乱条例》，判处沈镇南及人事室主任林良桐死刑，沈的罪名是「为叛徒供