菅直人即在总理大臣官邸设立「紧急灾害对策本部」，并指示所有内阁成员立即到官邸集合。菅直人要求万全应对此次地震，并命令防卫大臣北泽俊美派自卫队进行救援。应宫城县知事村井嘉浩的要求，内阁官房长官枝野幸男宣布于3月11日派遣自卫队前往地震发生地区参与救灾 ，防卫省设立地震灾害对策本部 。日本天皇明仁在3月16日针对此次震灾发表电视讲话，表示为福岛核电厂事故深切哀悼，核反应堆情况是无法预测，他唿吁民众保持冷静。他续说，这一场史无前例的大地震让许多人遇难，许多人失去了家园。地震死难者人数每日上升，他为此感到痛心，