佛教发生一定融合。日本结束锁国后，天主教会得以在日本重建。大部分的隐匿基督徒在日本放宽对基督教限制后，重回了正统的天主教会。也有一部分隐匿基督徒选择坚持已融合日本本土宗教的旧有信仰，他们直到今天仍然存在。2018年，与隐匿基督徒相关的长崎与天草地方的潜伏基督徒相关遗产获选为世界文化遗产。
历史.在德川幕府于1612年下达严苛的后，对基督教的禁止与迫害在其后数十年里不断加强，并在岛原之乱后达到极点。拒绝改信的基督徒会被处以酷刑。而改信的基督徒先是需要进行踩踏圣母玛丽亚画像的“弃教