姚启圣组织团练数百人，捐纳家财十五万两白银，投效大将军正白旗都统康亲王杰书，署诸暨知县，剿平紫山土寇。康熙十四年（1675年）杰书命为浙江温处道佥事，从镶黄旗满洲都统拉哈达剿平松阳、宣平县耿军。十五年，偕同副都统沃申、总兵陈世凯等协剿耿军，复云和。耿精忠降，升为福建布政使。后来打败了明郑台湾水师部队，招抚了水师主力朱天贵，封兵部尚书、太子太保。
台湾谈判.杰书疏荐姚启圣接任福建总督，续与台湾郑氏政权进行谈判。姚于福建总督（1678年—1681年）任内，于郑经回台湾时，攻佔厦门、