加战役后获得医疗假期前往弗吉尼亚州，在当地从事日常工作并恢复体力。他的部队在没有他指挥的情况下被派去支援隆史崔特，参加诺克斯维尔战役，而布拉格余下的兵力则在查塔努加战役中被击败。隆史崔特的部下之后受到在诺克斯维尔作战期间表现欠佳的指控，巴克纳则成为拉法叶·麦克罗斯少将军事法庭的一员。1864年2月，巴克纳短暂成为约翰·贝尔·胡德所统领师的指挥官；3月8日，他又成为重新建立的东田纳西部指挥官。与其前身相比，新的东田纳西部只是个空壳，规模不到原有三分之一，装备落后，根本无力开展进攻。这段时间巴克纳对邦联几乎没有