中，是鹤立鸡群的，引起市民的极大兴趣，并被作为南京的地理标志。所以“三层楼”就成了钟楼的代名词。当时行人问路、雇车，问汇文书院，不知，问“三层楼”，皆知。
重建.1917年9月屋顶失火，由美国美以美会拨款重建。1921年，金陵大学迁入鼓楼新校区，汇文书院钟楼交由金陵中学使用至今。20世纪20年代-30年代，钟楼作为上世纪二、三十年代中国教育电影协会的高级会议室，蔡元培、徐悲鸿、宗白华、魏学仁等人常在三楼的空闲房间中聚会交谈。当时南京几乎所有建筑内都没有取暖设备，在这套房间里