会决定开始西迁，学校先走水路到湖南衡阳，再乘火车至桂林，桂林校友会和广西大学为华中大学提供了许多帮助，但是随着形势变化，10月份，广东和湖北相继沦陷，桂林成为了政治军事中心，连日遭到日军轰炸，学校不得不再次西迁。1939年元月，学校的师生员工借道越南前往云南昆明。经云南省教育厅龚自知厅长推荐和韦卓民校长实地考察，华中大学决定迁至大理喜洲。在喜洲租借民房作为教学生活建筑，并曾短暂地与广州协和神学院合作办学。在桂林与喜洲期间，华中大学曾分别发行校刊《华大桂声》和《华大滇声》。其中前者恰好与后来的华中师范大学