亦爆发鼠疫，每天的死亡人数最多达100人。结果当年之内共有2,552人死于瘟疫，为数约十万名的华人离开香港，贸易额亦一度大幅下降。之后30年内，鼠疫仍然偶尔出现，1898年至1900年期间，再有1,290人死于鼠疫。
社会民生.教育方面，香港政府于1847年推行公立学校教育制度，补助中文学校的经费，于1873年将教会学校纳入在内。首间官立学校——中央书院（今皇仁书院）于1862年开办。1887年，香港西医书院成立，为香港大学医学院的前身，革命领袖孙中山是首届学生。至十九世纪末，随着