任国民党主席与总统候选人连战，泛绿方面认为他立场与背景明显偏袒泛蓝，怀有偏见，论据不足採信。仍宜以检调和刑事局等专业和有公权力机构之调查为准。
三週年.2007年3月，由立法院协调组成的三一九枪击事件真相调查特别委员会召集人王清峰在事件三週年前夕指出，释宪后的真调会为合法的立院调查权行使机构，行政部门三年来皆拒为配合。但王清峰认为，该会虽受行政单位违法妨碍执行公务，仍能得出政府「破案」无理之结论，但本案至今未曾宣佈破案。2007年4月，副总统吕秀莲接受台湾媒体访问时公开指出，