后授予工学学士学位，颁发北京大学毕业证书。本专业要求入学前需获得学士学位。工程硕士专业: 学制两年到五年，毕业后授予工程硕士学位，通过全国硕士研究生统一考试的学生颁发北京大学硕士研究生毕业证书。
争议.由于软件学院（并非特指北京大学软件与微电子学院）毕业后颁发工程硕士专业学位，并非其他院系的工学硕士或理学硕士，且部分非统招学生毕业后只有学位证书，没有一般硕士研究生的毕业证书。其毕业证、学位证的含金量一度遭到质疑。而那些通过参加全国研究生入学考试的学生一般在毕业后会获得毕业证与学位