政府委员兼教育厅厅长。任内，有人状告黄昌谷大批撤换学校领导，安排家人任职，状纸被交到立法院院长胡汉民处，胡汉民将状纸转蒋介石，蒋介石签“未必尽然”。1930年，黄昌谷任湖北省建设厅厅长。任内，因擅自动用百余万元建设经费，遭湖北省政府主席湖北王何成濬致电行政院弹劾去职，并遭到通缉。当时是诬陷接下来是迫害和利用。黄昌谷一生的座右铭是: 做大事，不做大官,不置私产。还他一个清白,欲加置罪，何患无词,不要一再让政治的烟幕弹掩盖了事实。
投身教育.此后，黄昌谷离开政界，历任大冶钢铁厂、汉阳兵