更远离市区，相对地也更花费交通往返的时间与金钱；在台湾高铁通车后，这些缺点更是彰显出来。且该机场只有往台北的航线，距离高雄国际机场又过近，当地民众多前往高雄国际机场，造成该机场使用人次过低2011年8月11日，民用航班停飞。2011年9月1日，交通部民用航空局终止屏东航空站民航营运及裁撤，并全面移交国防部空军司令部使用。
交通.
铁路.台湾铁路管理局曾设有屏东飞机场线，联络西部干线屏东线屏东站与屏东机场之间，该线于1997年7月1日起停用。