任中共中央华东局书记处书记。文化大革命时，叶飞遭受迫害。1975年1月，叶飞任中华人民共和国交通部部长，1979年2月任中国人民解放军海军第一政治委员，次年2月任司令员。1982年8月，叶飞卸任海军司令员，并于次年起连续当选第六、七届全国人民代表大会常务委员会副委员长，并担任全国人民代表大会华侨委员会主任委员。1984年4月，叶飞当选全国侨联名誉主席。另据《美国之音》间接引述胡绩伟的说法，1989年六四事件中，叶飞及张爱萍、杨得志、萧克、陈再道、宋时轮、李聚奎等七位将军强调人民解放军的枪口不能对着人民群