功能，以及编程介面和数据输出／输入功能。这些软件包是由R语言、LaTeX、Java及最常用C语言和Fortran撰写。下载的执行档版本会连同一批核心功能的软件包，而根据CRAN纪录有一万多种不同的软件包。其中有几款较为常用，例如用于经济计量、财经分析、人文科学与社会科学研究以及人工智能。
发展.生物信息学社群时常使用R进行分子生物学数据分析。计划就是让R作为基因图谱分析工具。Gnumeric开发者正和R开发者合作，改善Gnumeric计算结果的精确度。
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