而母亲则被送往奥斯威辛集中营，抵达后不久即死亡。波兰斯基当时躲起来，看到他的父亲正在队伍中。他的父亲看见他，就怕儿子被德国士兵发现，驱赶他离开。波兰斯基于1943年逃出克拉科夫犹太人区，受到一些波兰天主教家庭帮助。罗曼·波兰斯基出席教会活动，学会真心向天主教祈祷，虽然他从来没有受洗。1945年战争结束的时候，波兰有五分之一的人口丧生，受害者绝大多数是平民，包含90％的犹太人。战争结束后，罗曼·波兰斯基与父亲团聚，并搬回克拉科夫。1946年12月21日，罗曼·波兰斯基父亲再婚，并于1984年死于癌症。