同年9月4日，台湾警备总司令部以涉嫌叛乱罪将雷震与刘子英、马之骕、傅正等人逮捕，并随后在军事法庭上以「为匪宣传」、「知匪不报」罪名将雷震判处十年徒刑，又将傅正及马之骕判处感化三年，而「匪谍」刘子英则被判处十二年徒刑；同日，胡适向时任行政院院长陈诚发出电文：「今晨此间新闻广播雷震等被逮捕之消息，且明说雷是主持反对党运动的人。鄙意政府此举甚不明智，其不良影响所及可预言者：一则国内外舆论必认为雷等被捕，表示政府畏惧并挫折反对党运动；二则此次雷等四人被捕，《自由中国》杂志当然停刊，政府必将蒙『摧残言论自由』之恶