埃及各军区、机关、部队受国防部长领导的国防部所指挥，现任埃及国防部长为西德基·苏卜希上将，其副手为中将，埃及总统则拥有所赋予的武装力量最高统帅地位。埃及军队是世界上最古老的一支军队，可追溯回公元3200年前古埃及第一位将埃及统一的美尼斯王时期，并历经了法老时代、托勒密王朝、罗马、与近现代，现代埃及军的雏型则起于贾迈勒·阿卜杜-纳赛尔于1967年对进行现代化的改革。埃及军方与本国政治关系极深，亦时常加以干预，自1952年推翻法鲁克一世的君主政体以来，一直居于权力核心地位，甚至被称作是「国中之国」，君主体