区改正计画，而导致原本后半部所有的殿舍以及旁边的公馆遭到拆毁，神像移到原本的官厅。后来在大正十三年（1924年）时，当地的士绅集资在原官厅地点之上重建，而成今之风神庙。而在那之后仍进行了几次整修，如民国81年（1992年）时。2016年2月6日的高雄美浓地震，造成日治时期建的石造钟楼倒塌，鼓楼结构也有受损，为该次地震中台南古蹟受创最严重者。之后经过相关考据，于2017年9月18日举行风神庙修复工程的开工祭拜仪式，预计于2019年10月5日举行入火安座仪式。
建筑特色.现今之风神