只会有少数货物列车停靠以避让旅客列车。
城际.石龙站城际车站大楼为三层高中国式建筑物，地面的一层设有售票处（已设有自动售票机）、候车间、商店和自动检票机。候车间后有行人通道通往与车站大楼有一段距离的各个月台。车站大楼设有往石龙、石碣两个出口。第二层月台为高速列车站场，广深铁路一线及二线（高速线）在此通过。设有三站台和四站台两个侧式月台，位于地面高二至三层的高架桥上，已电气化。第二层只有双线（2条正线，不设到发线），相向运行的列车可以同时进站。月台设有屋檐和防止乘客堕轨的月台幕门