699年，柔佛的马六甲苏丹王朝血统正式断绝，柔佛宰相王朝开始。1824年的英荷条约导致柔佛宰相王朝分裂为柔佛本土以及廖内群岛。1866年，柔佛天勐公王朝正式成立，苏丹阿布巴卡迁都至丹绒布蒂里，并改名为柔佛峇鲁（新山）。1885年，柔佛王国成为大英帝国的保护国。1914年，柔佛接受顾问官制度。
合并.1946年，马来亚联邦成立，将原本分别属于不同国家、但皆为大英帝国殖民地的南马三州：马六甲（海峡殖民地）、柔佛（柔佛王国，马来属邦一员）、森美兰（马来联邦）统一管理。1948年，马来