铁四院）设计，而中国中铁股份有限公司旗下中铁大桥勘测设计院集团有限公司（大桥院）则负责铁路过江通道的设计。
历史.2003年，大桥院开始沪苏通长江大桥研究。2007年3月，铁四院编制完成《新建上海至南通铁路预可性研究》，以苏通长江公路大桥下游9千米的盾构隧道作为跨江方案。同年4月，中国国际工程咨询公司召开会议评估铁四院的研究报告，会议通过了“新建沪通铁路项目建议书”，并推荐跨江方案改为苏通大桥下游8千米的桥梁。2008年1月，铁四院完成《新建沪通铁路上海（安亭、四团）到南通段可行性