工程质量.兰新二线由于经过路段地形条件复杂，投入运营后多个路段曾出现因盐渍土地、大温差、极端低温而导致的路基溶陷、变形、沉降、冻胀、道床板混凝土开裂等病害。
张家庄隧道.张家庄隧道位于青海省乐都县境内、民和南站至乐都南站区间，为全长3769米的双线隧道。隧道洞身地层岩性为泥岩夹砂岩，局部为石膏岩，地表覆盖层为黄土。2016年1月18日张家庄隧道所在山体开裂，受此影响，经由这路段的列车暂停运行或改经兰青铁路或者兰新铁路运行。经过三个月抢修，该路段于2016年5