九年（1690年），奇袭西海阿奇罗卜藏。康熙三十年（1691年），肃州协改为镇，潘育龙出任肃州镇总兵官。康熙三十一年（1692年），平降番罕笃、罗卜藏额林臣、奇齐克之乱。康熙三十四年（1695年），擒塔什兰和卓。康熙三十五年（1696年），随康熙帝征讨噶尔丹，在昭莫多一役中被zh-hans:飞弹;zh-hant:飞弹;击中负伤。同年八月奉诏入京，康熙帝亲自慰问其伤势，命御医调治，赐衣一袭，并调其出任天津镇总兵。康熙三十七年（1698年），授拖沙喇哈番（云骑尉）世职。康熙三十八年（1699年），康熙帝