中华民国海军反潜航空大队原为海军舰队直昇机队，1977年9月1日于高雄市左营成立。编配有500MD/ASW型防卫者式反潜直昇机9架和S-70(M)-1/2海鹰反潜直昇机18架，隶属海军舰队司令部，复于1991年7月1日奉令扩编为直昇机大队，并接收新型S-70C(M)-1型神鹰反潜直昇机。于1992年3月15日东迁进驻台湾花莲神鹰基地。1995年9月1日台湾花莲基地指挥部裁撤，于1996年4月25日将位于台湾高雄左营之「海军反潜作战发展指挥部」移驻台湾花莲基地。反潜指挥部于1999年4月1日奉令裁撤，同时于台