持续不断发生，包含小兰、灰原与等1000名以上的观众，就这样不知不觉中被困在音乐厅内部而成为人质。此时，小兰察觉到了一件事。她发现现场演奏的旋律，是她和新一就读国中时曾经听过的旋律。这首曲子是否就是破解事件真相的关键？柯南在醒来后，也随即赶去寻找小兰。柯南能否顺利解救小兰等人脱困？而在这道旋律的背后，又到底隐藏着什么样的真相呢？
音乐.在本剧中被演奏的名曲：此外，本剧中由木村聪子演唱的《Mein Herz ist noch bei Dir》为大野克夫自己谱曲的歌曲。