除了极少数无名氏作品是南曲。其排列次序则资这宫调曲牌排列顺序：北曲排列依李玉《北词广正谱》，附录南曲则根据沈璟《南曲谱》排列。《全元散曲》相关资料取舍上共参考、校阅了元、明两代的散曲总集和别集，以及相关曲谱、曲话、文集、词集、词话、史书、方志、笔记、类书道藏及有关书目/材料约117种。除此之外，作者还採用天一阁《小山乐府》、《笔花集》、稿本《南北词广韵选》、残本《北宫词纪外集》等珍本，加以补充和校勘。此书书前有自序与引用书目；末尾附有《作家姓名别号索引》及《作品曲牌索引》，这两个索引对于专门研究者有极广