被改作兴建昂船洲海军基地。1863年港督罗便臣决定在岛上兴建了一所监狱，以舒缓域多利监狱的挤迫情况。发生在1874年9月22日至24日的甲戌风灾中，昂船洲监狱全座被毁，事后在昂船洲沿岸捞获尸骸高达三千具。数年后仍发现有百余具遗骸暴露于昂船洲。1880年东华医院得到港督轩尼诗（John Hope Hennessy）捐助，将这些尸体与其他罹难者一併合葬鸡笼湾坟场，称为「遭风义冢」。全岛自1890年至第二次世界大战初期由英国部队接管。1941年12月11日第二次世界大战期间，日军使用重型炮弹炮攻击来夺取昂船洲