国论而对台湾採取武力恫吓或动武的话，台湾所有政党都会齐声反对（童振源 1999）。2000年，国民党候选人连战落选，失去政权，李登辉被迫辞去党主席职务，连战接任国民党主席后，国民党彻底抛弃李登辉的两国论，重新回到一中各表立场。在2012年3月，连战夫人连方瑀投书媒体，讲述在“两国论”后提出后连战与李登辉的分歧。连方瑀说，“李登辉抛出‘两国论’，属下连战无法反驳，连战原本决定出版的‘连战风云’，内容讲两岸要‘双赢’，李登辉竟要求‘停止出版’”；“2人会分道扬镳，完全无关‘个人恩怨’，是‘李先生’公开扬弃过去理