设两条辅助线及一条假日线：64P线，只于星期一至五下午繁忙时间，由大埔墟站单向前往嘉道理农场。此编号已是第二次使用，第1代64P线于是由来往元朗（西）及大埔墟站的晨早特别路线，只于星期一至六早上对开一班。与主线不同的是此路线来回程取道锦田公路，不经锦上路及锦上路站；而往元朗方向亦不停安慈路分站，于1993年至2014年间提供服务。64S线，只于星期一至五上午繁忙时间由上村单向开出两班往锦上路站。此编号已是第二次使用，第一代64S于2000年11月28日，因锦田公路近锦田市发生兴建中的九广西铁