与桥本进吉、小仓进平、金田一京助一起师从新村出。1906年归乡之后，出任沖绳县立图书馆馆长，尽力收集沖绳研究的相关资料。此时，历史学家比嘉春潮等人正在学习世界语，研究圣经。在比嘉春潮等人的影响下，伊波的学问领域开始扩大，关于沖绳的研究领域扩展到语言学、民俗学、文化人类学、宗教学等多个方面。伊波对琉歌大集《おもろさうし》研究颇深，并于1911年出版了《古琉球》一书，从此创立了一门新的科学——沖绳学，伊波因此被后世称为「沖绳学之父」。伊波普猷在研究琉球的同时也研究日本，对琉球族的形成进行研究，支持「日琉同祖