死亡而显得较淡。则可观察到黑质的神经元数量减少，并在残余细胞中存有；同时，星状细胞会伴随着神经元一起死亡，则会活化以清除细胞残骸。其中路易氏体为帕金森氏症最具鑑别性的病理特征。
病理生理学.帕金森氏症的主要症状大多肇因于黑质的多巴胺性神经元退化。大脑基底核与外界联系的路径大致依其投射位置可分为五条，分别为、、联合皮质回路、边缘系统回路和眼眶额叶皮质回路。由于帕金森氏症会影响基底核上游信息的传递，因此前述的所有回路都会受到波及，使得帕金森氏症患者会出现动作、注意力和学习上的障碍。