拉塞福散射实验里，主角是原子核，而电子并不重要，因此拉塞福不能无凭无据地给出原子的电子组态，也无法用这模型对于化学结合、元素列表、原子光谱给出解释。尽管拉塞福模型并不完备，它为后来的波耳模型奠定了良好的基础。1912年至1913年间，丹麦物理学家尼尔斯·玻尔指出，原子的稳定性问题不能在经典电动力学的框架下解决，而唯有依靠量子化的方法。玻尔从氢原子光谱的巴耳末公式和约翰尼斯·斯塔克的价电子跃迁辐射等概念受到启发，对围绕原子核运动的电子轨道进行了量子化，而原子核和电子之间的动力学则依然遵守经典力学，因此一般