高雄成立一个政治行动委员会，统筹由中国大陆迁台之情报和秘密警察机关；当年，安全机关侦讯约1万名台湾人，又监视包括陈诚、孙立人在内所有到台高级将领。1950年上半年，又破获300件匪谍案，涉案逾3,000人；秘密警察在各政府机关、军队和企业发展秘密特务；据王昇称，期间被逮捕者有15%被枪决。吴国桢、孙立人向美国外交官抱怨逮捕大多是滥权，蒋经国手下逮捕孙立人部属。1950年1月12日，蒋得悉多数高级将领反对其聘请日本教官。3月，中央情报局台北站秘密报告华府，孙密谋政变。1953年，蒋拔擢孙为上将，翌年任孙再