方尔谦晚年寓居天津，李盛铎死后，400余件敦煌遗书由其后代拿到日本，经敦煌学家羽田亨鉴定，全部入藏杏雨书屋。杏雨书屋现收藏总数已达700多号，成为日本收藏敦煌遗书最多的单位。敦煌遗书后来流散于天津，一部分由周叔弢、张叔诚等人收藏。周叔弢捐献256卷给天津博物馆。目前英国国家图书馆藏13000余件，占三分之一强；俄罗斯科学院东方学研究所圣彼得堡分所藏10800余件，亦占三分之一强；其他还有法国国家图书馆藏5700余件。