再委託顾问公司办理后续细节设计的《高雄都会区大众运输系统工程计画长期路网规划作业》专案，并于2005年2月交通部审定。该专案中，评估右昌居民向南去左营市区较符合居民习惯，且可连结正在兴建的高铁左营站。因此绿线右昌段改线并独立成一线，绿线北端改为终于红线后劲站。而该专案纳入了新计划的凤山线，凤山线南侧亦进入五甲地区；该专案认为凤山线行驶的保泰路与绿线行驶的五甲路平行且过近，因此绿线于瑞隆东路以南的站点均删除。而以北至大东站间的站点，则另外新增了国泰、中山路口两个站点。此时绿线全线长16.146公里，採平面轻轨