到2005年前后，每年审计规模已超千亿元人民币。中国人民解放军高级将领掌控的军费也以亿元人民币计算。2001年到2004年，中国人民解放军审计系统通过对物资采购、出包工程、其他装备建设的预算审计，减少军费开支45亿元人民币。2014年，中央军委主席习近平签署命令，中国人民解放军审计署由中国人民解放军总后勤部划归中央军委建制，在中央军委领导下，主管全军审计工作，对中央军委负责并报告工作，中国人民解放军审计署党的建设、政治工作、行政管理由中央军委办公厅领导。2014年11月6日，调整中国人民解放军审计署建制