校四学院图书馆及一座捐赠的图书馆组成，1388年时，第一任校长Marsilius von Inghen并于圣灵教堂建立文献档案收藏室。16世纪时，选帝侯奥托·亨利将大学自创校以来持续累积的藏书与选帝侯图书馆合併为帕勒提那图书馆，并连同继承自奥格斯堡的富格尔家族之图书，开放给民众阅读，成为当时欧洲最重要的图书馆之一。1622年，三十年战争的战火延烧至海德堡，巴伐利亚公爵马克西米利安一世攻破海德堡城，将整座帕勒提那图书馆献给教宗额我略十五世，大学的研究工作不得不中断。1804年，Salem修道院与Peter