。1966年“文化大革命”爆发后，彭冲遭到残酷迫害。1968年3月，彭冲经周恩来亲自点名参加学习班之后，被任命为江苏省革命委员会副主任、中共江苏省委副书记，分管抓生产。其间，他帮助中共江苏省委第一书记、江苏省革委会主任许世友指挥建设了南京长江大桥，许世友任总指挥，彭冲任常务副指挥。1974年11月起，彭冲任中共江苏省委第一书记兼南京军区第二政治委员、江苏省革命委员会主任。
文革之后.1976年10月粉碎“四人帮”后，根据中共中央的部署，彭冲到上海市任职，从1976年10月至19