而急攻尹纬，而尹纬却大败苻登，兵众溃散，苻登单骑逃返原由其弟苻广留守的雍城（今陕西凤翔县南）却发现苻广已弃城，另一根据地胡空堡亦遭留守的太子苻崇所弃，苻登无处容身，只有逃到平凉（今甘肃平凉市），收集部众据守马髦山。苻登及后向乞伏干归求救，得其命乞伏益州领兵救援，却就在七月苻登率兵迎接乞伏益州时就遇上后秦军，苻登被生擒并处决，享年五十二岁。其子苻崇在湟中称帝，追谥苻登为高皇帝，上庙号太宗。
逸事.苻登与后秦军作战多年，其为史传所载的生平事迹多为他在军旅中的事迹。