，安纳金残忍地杀害了留在绝地圣殿的所有绝地组织成员，包括绝地幼徒。同时，达斯·西迪厄斯利用66密令（Order 66），命令克隆人杀光与其并肩作战的绝地大师及他们的学徒，只有尤达和欧比旺等极少数绝地逃过一劫。大事底定后，安纳金被派去贸易联邦的秘密总部穆斯塔法星（Mustafar）杀光分离主义者和贸易联邦领导人，以结束克隆人战争且杀人灭口。与此同时，达斯·西迪厄斯则宣布建立银河帝国，自己成为新帝国的皇帝。欧比王和尤达返回绝地圣殿后，得知了安纳金的叛变，尤达派欧比旺去消灭安纳金，自己则前去与皇帝对决。完成任务的