月13日，李庥牧师带着怀有身孕的妻子伊莱莎（英语 : Eliza C. Cooke，1828年-1902年，后来被信徒称为「牧师娘」）经142天左右航行抵达打狗，受到马雅各医师及众信徒欢迎。隔年，英商走私樟脑事件引发台湾民众排斥洋教、洋人的风潮；马雅各赴香港结婚不久，即有传道者被捕下狱，亦有人在旧城被活活打死，埤头礼拜堂同时遭抢劫烧毁。尔后，马雅各回台湾府城（今台南市中西区周边）宣教；李庥牧师承接打狗宣道区，并开始计画重整宣教中心旗后医馆及严重毁损的埤头礼拜堂。1869年1月31日，埤头教会重建完工后，