疗（包括早期乳腺癌术前/术后辅助治疗和晚期复发转移乳腺癌的解救治疗等）作出了巨大贡献，对乳腺癌等恶性肿瘤转移亦有创新的研究。宋尔卫曾获2009年第二届谈家桢生命科学奖创新奖、2013年何梁何利基金科学与技术创新奖，并以第一完成人身份获2015年国家自然科学奖二等奖。