代人可能已相信爱德华死于疾病或因试图治愈他的尝试而亡。因缺乏硬证据，一些其他理论也被提出，其中最被广泛讨论的是他们在白金汉公爵或里奇蒙伯爵亨利·都铎（后来的亨利七世）命令下被谋害。1674年，在塔内重建一座楼梯的工人发现了据称属于两个孩子的骸骨。在查理二世命令下，它们以爱德华和理查的名字被放置在威斯敏斯特教堂的坟墓中。1933年，这两具骨架被发现不完整且已和动物骨骼埋在一起，被重新检验。这些骸骨是否为王子们尚无定论。1789年，在温莎的圣乔治礼拜堂搬运修理品的工人重新发现并意外闯入了爱德华四世和伊丽