名称的由来，有许多种说法。1719年印行的《中山传信录》中记载，『八重山，一名北木山，土名彜师加纪「いしかき。汉字借字即石垣(いしがき)」，又名爷马「やま(山)」。』
行政区划.目前八重山群岛的行政划分属于日本沖绳县，分别属于石垣市、八重山郡竹富町及与那国町，另设有八重山支厅协助办理县厅在八重山区域的事务。