去中央政治大学校长职务后被聘为名誉校长之例解决这一问题。于是，陈序经、黄钰生等人遂发起挽留张伯苓并请其就任名誉校长的活动。1948年7月，张伯苓到南京就职后，见政治糜烂，心情很不愉快。1948年9月，天津市长杜建时将拟聘张伯苓为国立南开大学名誉校长，改派何廉代理校长一事告知正在北平的蒋中正。10月20日，行政院正式发布张伯苓辞职、由何廉出任南开新校长的命令，并无如前所议张氏转任名誉校长一事，致何廉给朱家骅写信抗议，但未获回应。同年年末，张伯苓以“体弱需静养”为借口，离开了南京的考试院，回到重庆沙坪坝南开中学