根据行政院农业委员会的统计，日本是台湾农林水产食品第2大出口市场，仅次于中华人民共和国，高于香港。2019年，日本是中华民国第3大贸易伙伴、第2大进口伙伴、第4大出口伙伴，在亚洲经济体排名第2、2、3。出口至日本的金额为232亿8,210万6,655美元，年增2.106%。自日本进口的金额为440亿3,723万1,290美元，年减0.264%。贸易呈现入超（赤字）207亿5,512万4,635美元，年减2.796%；2018年，日本是中华民国第3大贸易伙伴、第2大进口伙伴、第4大出口伙伴，在亚洲经济体排