能使用PC Engine的软体和配件，属于两个系统。与PCE再没有关系的PC-FX，反而跟PC-98系列拉上关系。NEC曾经更为PC-98不带有光碟机的机种推出过一个SCSI转接器，可让PC-FX充当作外置光碟机；另外，在PC-FX的晚期更推出可让个人电脑与PC-FX连动的ISA/C-BUS介面卡「PC-FXGA」，能够让玩家在个人电脑上开发简单的游戏。
动画机能成最大卖点.PC Engine的最大资产是大量动漫、美少女游戏。过去，CD ROM年代的游戏大多会在每关之间加插所谓