来的屯门河溪相连，形成现在的屯门河道。当年香港政府保留屯门河的目的，是为了收集雨水及美化环境，后来受到住宅，工业及农业污水影响，水质受到严重污染。随着香港工业减少，农业式微及重新接驳住宅污水渠，近年屯门河的水质已大有改善，亦常见有大大小小的鱼畅泳，兆康苑及港铁屯门站以南附近甚至可见到有水鸟觅食。虽然如此，屯门河仍然有大量淤泥因重金属含量超标而不能弃置于公海，只能留在河床。屯门河之上建有港铁屯门站和兆康站，是全香港唯一上建有铁路车站的河道。
水质问题.1960至70年代，香港