六角形皮内成骨。横跨额骨和鼻骨区覆盖着位置对称、紧密堆叠、锥形和圆锥形的"caputegulae"。鼻骨有个明显的圆锥形头甲中央环，与上下两侧的皮内成骨对称区别开来。头骨后部由基枕骨构成的倾斜位于前上方。钉头龙的头甲酷似于同样发现于南拉腊米迪亚（新墨西哥州）的近亲结节头龙。于是叙述者将两属进行比较以证明钉头龙是有效的属。钉头龙和结节头龙确认的共同特征有吻部的锥形皮内成骨与鼻孔上方的隆甲；但也有些差异：钉头龙上眶前后的皮内成骨构成单一道高的后回结构，而结节头龙的则是小得多的分开结构。钉头龙有较小的鳞状骨角