国有商业企业的改革重组中，南大集团实行先托管后重组，加入广百集团，推动解困重组，寻求生存和发展空间。2004年9月5日，南方大厦最后一日营业，营业额超过300万，入场人次超过15万，为平日的几十倍。2002年1月改为“南方大厦·国际电子数码城”，经营电子、数码、手机的零件、配件批发业务。2004年12月，由广东普拓经济发展有限公司与广州市南方大厦商贸发展有限公司合作，成立“广州南方大厦数码市场经营管理有限公司”，经营管理南方大厦数码城。