子鞭毛较四膜虫的鞭毛和纤毛更适合用作深入描述动力蛋白，后于1969年获擢升为生物物理学教授。1970年代，吉本斯和妻子芭芭拉合作，发现鞭毛动力源于微管之间的滑动，而此滑动需要动力蛋白的ATP酶水解ATP后产生的能量。他其后更把此发现延伸至哺乳类动物，确认家牛精子鞭毛的动力机制跟海胆相同。此后，他的焦点转移至动力蛋白的分子生物学。1991年，他和其团队测定动力蛋白的最大亚基的DNA序列。1993年，吉本斯成为基瓦罗海洋实验室主任。1997年，吉本斯两夫妇从夏威夷大学马诺阿分校退休，以研究科学家身份往加利福