公署情报处上校秘书兼一所所长、福建省保安处谍报股上校股长（接替张超）。1938年9月，陈祖康经中国国民党福建省党部主任委员陈肇英介绍，加入中国国民党。当时福建发生了“张超事件”——军统戴笠派到福州工作的负责人张超，兼任福建省保安处谍报股股长，因与福建省政府主席陈仪有矛盾，遭陈仪借故杀害。此后军统福建工作分为闽北、闽南两站，陈祖康被戴笠任命为闽北站站长。1938年10月，陈祖康出任军统闽北站站长。此时，福州邮电检查所检到台湾军总司令牛岛满自香港寄给福建省政府主席陈仪的一封劝降信。陈祖康接报后，将此信拍照密