官立小学堂合并成立莆田官立砺青小学堂，迁往凤山寺（今东大路），林翰出任堂长。后来，林翰再次到日本，入明治大学学习政治学。宣统三年（1911年），清学部会试留日学生，林翰获优等。1911年辛亥革命爆发，此后莆田官立砺青小学堂改称莆田县立砺青小学。中华民国成立后，1912年，福建省临时议会成立，林翰当选议员，他还在福州兼任公立法政学校讲师。当时，中国同盟会的《侨南日报》编辑被杀，林翰被推举为福建省临时议会的代表之一，赴北京请愿。同年，他任北京临时参议院议员。民国2年（1913年），福建省议会成立，林翰当