总统陈水扁受到民主进步党内部及台湾独立运动支持者的压力，亲民党主席宋楚瑜回台湾之后被中华民国政府否定代表中华民国总统陈水扁特使身份，使两岸关系进展中断。2013年10月6日第二十一届APEC领导人非正式会议在印尼巴厘岛举办前，萧万长担任中华民国总统马英九特使，与中国共产党中央委员会总书记习近平会晤，陆委会也首次被允许参与APEC会议，两岸事务协调工作也被认为是两岸关系进展大突破。2014年2月，陆委会主委王郁琦访问中国大陆，并与国台办主任张志军在南京会面（第一次-{zh-cn:张王会;zh-tw:王