甲贸易的权力。葡萄牙也恃其强大的舰队，追击不顺从的商船，焚烧船只，并没收货物，部分印度船员甚至沦为奴隶。这种海盗式的行径，使各国的商船将进入马六甲海峡视为畏途。
宗教与文化.葡萄牙在马六甲实行歧视性政策，极力排斥伊斯兰教，宣扬天主教。葡萄牙在占领马六甲后，即强迫所有伊斯兰教徒改教，并对伊斯兰教徒进行驱逐和杀戮，同时没收、抢劫他们的财物，并实行宗教裁决。此举迫使伊斯兰教徒集中到亚齐和柔佛，成为抗击葡萄牙人的主力。马六甲成为葡萄牙宣扬天主教的基地后，在各区兴建教堂，积极传播天主教，