庆2年（1333年）5月，妹夫御家人足利尊氏在京都揭起打倒幕府的旗帜，一举攻下京都的六波罗府。另外，其外甥足利义诠在鎌仓逃脱。因亲属关系，北条守时涉嫌背叛幕府，与幕府关系恶化。北条高时谨慎地实施宵禁。元弘3年（1333年），后醍醐天皇的倒幕计画引发元弘之乱，新田义贞率倒幕军攻撃鎌仓与幕府军对战，为了消除叛徒之名，北条守时率军迎击新田义贞大军，两军在鎌仓中心部交通要冲的巨福吕坂大战，北条守时最后因寡不敌众在洲崎自杀，享年39岁。其后，新田义贞攻陷鎌仓，幕府灭亡。