个子层（固有层及上皮）分为二层计算。上皮细胞上的黏液是由子宫颈以及子宫所分泌的。上皮皱褶形成了复杂的表面，其表面积达到360 cm。因为阴道上皮表面面积大，因此有些药物可以由阴道给药，透过上皮吸收。在生殖週期中，阴道上皮会有正常的週期性变化，是因为雌激素造成的，随着激素浓度的上昇，阴道上皮会增殖，细胞的层数也会增加，当细胞增殖及成熟时，部份细胞会角化。女性生殖系统的其他组织和器官也会因为激素而变化，不过阴道上皮的变化灵敏度最高，其结构也是雌激素浓度的指标。在阴道上皮中也有一些朗格汉斯细胞及黑素细胞。子宫