军再度站领了美因茨，随后的1803年的《帝国代表重要决议》（Reichsdeputationshauptschluss）将选侯国世俗化。选侯国位于莱茵河西岸包含美因茨的领地归属于法国，东岸大多数的领土则分属于黑森领和拿骚。而艾希斯费尔德和艾福特则纳入普鲁士王国。虽然美因茨选侯国解散了，但做为首都的美因茨在法国统治下重新成立了美因茨教区至今。