婚的缘故，卡洛斯二世身患多种遗传病以及智障和癫痫。因此他的第二次婚姻也没有留下孩子。最后的尸检报告也证明，他只有萎缩的睾丸，毫无性能力。当时的西班牙政治势力分为亲奥地利和亲法国派系。其中，亲法国派系由托莱多红衣大主教领导，而亲奥派系则由摄政王奥地利的玛丽亚·安娜领导，并实际控制着国家。1690年，西班牙加入了反法的奥格斯堡同盟，参与了九年战争，但这实际上是一个错误的决定：西班牙于1692年宣布破产，而法国却占领了加泰罗尼亚的大部分地区。议会内部开始反对亲奥政党，卡洛斯也驱逐了玛丽亚·安娜来自奥地利的随从