为四宗兼学之寺。明治五年，太政官布告建议「真言宗」、「净土宗」等大宗派统合，结果法隆寺一度被「真言宗」所辖，法隆寺与兴福寺传统上成为共通信仰「法相宗」的寺庙。现在法隆寺宗派上现在是圣德宗本山，但是1951年（昭和26年）之前，法隆寺是与兴福寺、药师寺、清水寺（清水寺在这一年也脱离法相宗自立北法相宗）同属法相宗的寺院，从此法隆寺脱离了长期有藤原一门为后盾的兴福寺的支配。作为圣德宗独立以后，作为法隆寺下属分寺的有中宫寺、法轮寺、法起寺等合计二十九寺。
法隆寺的美学影响.法隆寺在伽蓝配置