文经学，太史公时尚未有古文，后由刘歆据古文经学窜改，而杂有古文学。认为刘歆既伪造《左传》，则不得不波及《史记》以为佐证。此外尚有后世妄人所增及钞胥所脱，以及传钞过程中出现的衍、倒、改、解之误，对此皆一一进行深入仔细之考辨，以「证其所本有，辨其所本无」（朱祖谋〈序〉），志在恢复《史记》原貌。
概述.全书八卷，先为序证，论说贯串全书之问题，如春秋古文、尚书古文、书序、终始五德、十二分野等事，然后分本纪、十表、八书、三十世家、七十列传一一进行考辨，除〈管蔡世家〉等十篇外，全部都有仔细深入