3年对SARS有重大的研究及指挥。2003年6月24日3点零8分，世界卫生组织西太区主任尾身茂在北京宣布，解除对北京旅游警告，同时北京也从SARS疫区名单中被删除。2006年5月，日本政府宣佈推荐尾身茂角逐世界卫生组织总干事一职，以接替同年5月逝世的李钟郁。11月6日，世界卫生组织执委会把尾身茂列入总干事最后候选人(共有五名)名单之中；而他的主要对手包括有大热门墨西哥的弗伦克及中国香港的陈冯富珍。他一向被视为最热门的候选人陈冯富珍的强力对手，但却在最后以一票之差大热倒灶。