国会议事堂站-汝矣岛站-鹭梁津站的走向变更为国会议事堂站-汝矣岛纯福音教会-MBC-汝矣岛洞-鹭梁津站的新走向。不过做出更改后，9号线无法利用5号线汝矣岛站的近60米深的车站共构结构。因此很快遭到了市民投诉，首尔市政府被迫停止更改该段路线走向。此外旧盘浦站-新盘浦站-高速巴士客运站路段（经过新盘浦路和沙平大路）也曾计划要更改路线走向，但也遭到了市民投诉，因而更改走向作罢。至于9号线经过的奥林匹克公寓区域，居民担心地铁经过后会导致城内川旁的房屋地基下沉，影响居住，因而不让9号线经过此处。为此9号线的走