6.2%），但RBD胺基酸序列与其相似度只有89.2%。广东穿山甲病毒RBD中的5个关键胺基酸都与SARS-CoV-2的相同，而RaTG13仅有1个与其相同。穿山甲冠状病毒在RBD与SARS-CoV-2的高度相似可能是病毒曾发生基因重组所致，也可能仅是趋同演化造成的巧合。另外穿山甲冠状病毒也不具有SARS-CoV-2刺突蛋白中S1与S2间可以被切割而增加感染效率的脯胺酸-精胺酸-精胺酸-丙胺酸（PRRA）序列。
演化.，穿山甲冠状病毒是除蝙蝠病毒外，唯一一种在其他动物身上发现的SAR