。泛蓝方面，国民党则表示中华民国并非亲中反日，相反，非常重视与日本的外交，但马英九认为，钓鱼台列屿是台湾的属岛，中华民国的领土，职责上不可推卸。日本外相高村正彦于事件后，针对最近日本巡逻船在钓鱼台海域附近撞沈台湾海钓船联合号一事，对中华民国总统马英九的处理方式，表示肯定。高村指出，这次是政府大船撞沈小船的事件，更何况是与外国船相撞，且发生地点又在双方都主张拥有领土主权的敏感地方。不管那一个政府都得去面对。。日本拓殖大学教授涩谷司也在指出，过去陈水扁政府在处理类似钓鱼台的事件，是采取抑制式的行动。马总