2001年由于累积亏损过多，使得银行净值成为负数，虽然中央存款保险公司进驻辅导，但由于无人愿意增资，在2002年1月28日正式由中央存款保险公司接管，并解除董事会、监察人和股东会之职权。但由于当时行政院金融重建基金预算案尚未通过，且赔付方式尚在立法院讨论中，直到2004年6月才进行标售，最终由玉山商业银行以新台币133.68亿元标下，并于2004年9月併入玉山银行。