馆宣称它们是古代美洲阿兹特克或玛雅人制作的，但实际上是19世纪中叶以后的产物。尽管水晶头骨在通俗文学中被渲染成具有通灵作用的神秘媒介，然而在玛雅神话和其他的中美洲土着文化中却从没有相关的记载。在新纪元运动中，一些人经常宣称水晶头骨蕴含着超自然能力，并且在小说中常会有类似的描绘。在2008年的电影印地安纳·琼斯和水晶头骨王国对水晶头骨的神秘渲染令人印象颇深。毫无疑问水晶头骨已成为当今在无数科幻影视、文学作品以及电子游戏中最为流行的元素之一。至今尚未有经由考古学家挖掘出来的模型。
水晶头