及民建联名单，未能取得议席。有论者认为与民协参选临立会有关，又有论者认为因选举制度改为名单比例代表制有关，当时以民主党为主的民主派拒绝「过票」于民协，导致其败选。
重返立法会.冯检基在落选后曾担任香港大学通识教育统筹主任，并与李鹏飞同为新城电台节目「战龙在野」的主持。到了2000年香港立法会选举，冯检基重回立法会，并于2004年选举和2008年选举中成功连任，代表民协的唯一议席。2005年，特首曾荫权提出政改方案，冯检基要求政府提出更民主的方案，曾宪梓指责冯检基「食咗老虎胆」。