999年，巩俐与陈凯歌第三次合作，出演了历史武侠电影《荆轲刺秦王》深明大义的秦王嬴政青梅竹马的伙伴赵姬一角，该片入围了戛纳电影节的主竞赛单元，并获得最佳技术大奖。
世纪之初 2000-2004.2000年，巩俐担任第50届柏林国际电影节主席，成为首位在世界三大电影节上担任评审团主席的华人；同年巩俐与第五代导演孙周合作了温情电影《漂亮妈妈》，出演一位自强不息的单身母亲孙丽英，凭借该角色巩俐在蒙特利尔国际电影节上获得了她的第二座国际A类电影节最佳女主角奖，并被授予终身成就奖，巩俐因此成