始安装月台门，因此于2018年10月5日退出了定期班次的运用。结束营运后，第02编（6102F）成于新木场车辆基地进行保存。
印尼雅加达让渡.报废后的6000系，被让渡到印尼的通勤线电动列车公司（以下简称PT KCI），2010年第26编成以及第15编成于东京港开始依序装船运送。随后，2011年让渡了第06、07、12、23、25、35编成。之后又让渡了第05・11、13、27、33、34编成。2016年开始让渡VVVF控制的车辆，2016年让渡了第01、08、16 ~ 1