在1944年11月7日被安排登上特设巡洋舰护国丸，由基隆港出发航往吴军港；不幸却在1944年11月10日凌晨，护国丸航行至九州外海古志岐岛灯塔海域附近时，遭盟军潜舰Barb号以鱼雷击沉，事后清点乘员名单，有台湾籍士兵212名就此失踪判定阵亡。由于雷伊泰湾海战大败后，日本海军的制海权与制空权旁落，终导致台湾各港口机能的丧失与海域遭受封锁，因此第三期结训后已无法进行外派，全部均留在台湾战区的海军各部队服役。日本当局面临即使如此，对台湾籍海军特别志愿兵的组训工作仍然持续不辍，紧接着第四期在11月之际召募入伍，