，李芳远被李芳果册立为王世子，其手下的办事机构称“仁寿府”。太上王李成桂所居宫殿则改名德寿宫，供奉机构名“承宁府”，并上尊号为“启运神武太上王”，献玉册金宝。当年十一月十一日，李芳远从李芳果手里接过了王位，同月十三日，李芳远于寿昌宫即位，即李朝第三代国王太宗。两次王子之乱反映了朝鲜王朝早期政制紊乱、宫廷倾轧的状况。李芳远即位后，吸取教训，废除了由王子统领私兵的制度，并确立了王位父子相传与嫡子优先的继承法则。
咸兴差使.第二次王子之乱后，李芳远即位后，李成桂多次前往汉城、宝盖