他一直担任该职位至1990年。期间，他升任至菲拉德尔菲亚都主教乃至迦克墩都主教。2010年5月，巴尔多禄茂牧首访问了俄罗斯，并会见了基里尔牧首与梅德韦杰夫总统。俄政府称这场会议是建设性的。2014年11月30日，巴尔多禄茂牧首与方济各教宗一起庆祝了使徒安得烈的节庆日并发表了一份共同宣言。宣言中，两方表示会继续推动促进全基督徒的合一。宣言还对中东局势、基督教与伊斯兰教的关系发表了看法。2013年5月，三名土耳其人阴谋于君士坦丁堡陷落560周年纪念日上杀害巴尔多禄茂，结果被土耳其警方破获并逮捕。2018