超过九成的预算被耗在了盖工厂、制造核裂变原料上，只有不到一成用在了研发、制造武器上。战争期间，曼哈顿计划研制出了两种不同的原子弹。一种是相对简单的枪式裂变武器，使用了铀的同位素铀-235，该同位素在自然界的丰度只有0.7%。由于铀-235与常见的铀-238原子质量几乎相等，所产生的化学反应也完全相同，人们很难将这两种同位素相互分离。为此，曼哈顿计划设计出三种不同的铀浓缩法：电磁型同位素分离法、气体扩散法和热泳法。分离工作主要在田纳西州的橡树岭进行。与此同时，人们也在研究制钚的方法。曼哈顿计划在橡树岭和汉