些人事安排引起了时任卢旺达总统朱韦纳尔·哈比亚利马纳的警觉，他批评穆塞韦尼任命卢旺达人担任军中要职，穆塞韦尼在压力下被迫将卡加梅与鲁维吉耶马解雇。尽管如此，两人依然在军中发挥实质影响力，但失去原有的职位意味着两人被迫提前行动。两人加入了一个叫做卢旺达爱国阵线的组织，该组织由卢旺达难民所组成，早在1979年起便已用不同名义在运作。在加入爱国阵线后不久，鲁维吉耶马成为组织的领导人，此时他依然握有乌干达军队的资源，并和卡加梅共同完成拟定日后对卢旺达的作战计画。
卢旺达内战.1990年