至扬言要吊死叛乱的邦联人士，但在继任林肯为总统之后，詹森採取了更为温和的措施，赦免了大多数的邦联领袖和前邦联人士，让他们得以维持对南方各州政府、南方土地和黑人的控制。邦联总统杰佛逊·戴维斯入狱两年，但其他邦联领导人则未受追究；叛国罪审判也从未进行。只有乔治亚州安德森维尔（Andersonville）集中营的指挥官亨利·沃兹上尉（Henry Wirz）因战争罪被处死。
黑人法令与反非裔白人恐慌.南方各州政府随即颁布限制性的黑人法令，这些法令给予自由人的权利比内战前的自由黑人更多，但他