波兰地区，纳粹对波兰教会的政策最为严苛。纳粹在直接管辖的领土上系统地解散教会——逮捕教会领导人，驱逐神职人员，关闭教堂和修道院。许多神职人员和修女被杀害，或被送往集中营与劳改营。早在1939年，瓦尔特兰大区就有80％的天主教神职人员被驱逐到集中营。波兰主教长枢机主教向梵蒂冈提交了一份关于波兰教会遭受迫害的正式记述。在为教宗庇护十二世提供的最终观察中，霍隆德写道：“希特勒主义意在系统地、彻底地摧毁……被并入帝国的波兰领土上的天主教会……”波兰较小规模的福音派教会同样不幸蒙难。的所有新教神职人员被捕，并被放逐到