爆发后，国民政府有鑑于台湾民众对以陈仪为首的台湾省行政长官公署强烈不满，于同年4月22日行政院会议决议废除台湾省行政长官公署，并于同年5月16日将长官公署改制为台湾省政府。台湾省政府原位于台北市，当时之办公厅舍即今行政院中央大楼。中华民国政府因第二次国共内战失利，中央政府于1949年12月迁往台北后，为防范中国人民解放军渡海轰炸台北而瘫痪行政中枢，台湾省政府分别于1956、1957年将主要厅处迁移至台中县雾峰乡光复新村与南投县南投市中兴新村，至1972年当时尚在台北办公的省属机关全数迁至台中市东区干城营