梅休因条约，使葡萄牙本国的纺织业遭到了重创，同时酿酒业却畸形的迅速发展起来。这让国王推行「重商主义」的目标落空。停止召开议会，再加上“重商主义”政策，葡萄牙也像同时代的其他欧洲大陆国家一样，迈入成熟的君主专制时代。佩德罗二世于1706年去世。其独子若昂五世即位。
家庭.1668年，佩德罗与玛丽-法兰索瓦丝-伊莉莎白结婚，两人有一个女儿：伊莎贝尔·路易莎（1669年—1690年）。玛丽-法兰索瓦丝-伊莉莎白于1683年去世。1687年，佩德罗与普法尔茨-诺伊堡的玛丽·索菲结婚