分之一的真菌有一种以上的生殖方式。例如生殖可能会出现在真菌生命週期中二个明显不同的阶段：有性阶段（teleomorph）及无性阶段（anamorph）。 环境条件会触发由基因决定的发育状态，也会产生适合有性生殖或是无性生殖的构造。这类的构造可以有效的散播孢子或是含有孢子的繁殖体，以利于繁殖。