说转投威禾电影制作公司。其于1987年执导的《胭脂扣》描写人鬼之间的爱情，除了在第8届香港电影金像奖获得七个奖项外，亦获得第24届金马奖多项大奖；1989年的《人在纽约》（台湾名称：《三个女人的故事》）在《第26届金马奖》中再得八项大奖；1991年的《阮玲玉》除了在香港获奖外，亦令女主角张曼玉在1992年第42届柏林国际电影节中当上最佳女演员。此外，《阮》一作品在该年度的台湾金马奖中获得十一项奖项提名。1996年，关锦鹏借纪录片《男生女相：华语电影之性别》在威尼斯电影节上公开自己的同性恋身份。2002年