州府，主官为澎湖寨巡检。澎湖巡检司不但是澎湖群岛的首次行政区划，。击败元朝取得中原政权的明朝仍依循前例于澎湖设置该官署，并首度设置彭湖游之纯军事单位。另外，彭湖游尚有「浯彭游」、「彭冲游」之另外称唿，此间之彭湖即是今澎湖之旧称。1620年代，该军事单位因荷兰攻打暂时裁撤，之后明朝则以不干涉荷属东印度公司之台湾事务为条件复设此单位。1625年（明天启五年）彭湖游升格为彭湖标，所驻主官把总则升格为游击。而文献记载曾在任者的彭湖游把总有洪调元与顾兴隆等等。
荷西时期.17世纪