2016年.国民党中央委员会在2015年10月17日召开临时全国代表大会，废止洪秀柱总统选举提名资格，征召朱立伦参选2016年中华民国总统选举，又一次与民进党主席蔡英文对垒。不同于上次争夺新北市长的副揆之战，这次总统大选被戏称为英伦之战（双关于二次大战的英伦空战）。2015年10月19日，朱立伦宣佈请假3个月带职参选2016年中华民国总统选举，由新北市副市长侯友宜代理市长，结束选战后，朱立伦回归新北市政府。2016年1月16日，以3,813,365票、31.04%得票率落选总