6月19日，麴町警察署正式迁至麴町一丁目的现址办公。1923年9月1日发生了关东大地震后，整座警署毁于祝融之灾，麴町警署被迫将业务移转到临时警局处理，1926年3月30日，才在原地建好两层高的钢筋混凝土建筑。1936年的二二六兵变中，日本陆军内部派系「皇道派」的一批官兵佔领了警视厅本部，其机能一度交由麴町警署代行，当时昭和天皇还亲自联络麴町警署的署长以掌握事态发展。1945年5月25日，美军航空部队对东京实施第二次大轰炸，大火再度袭卷了警署，把它烧到只剩下外墙。然而这道外墙在建筑修复了之后，仍继续使用了