建成以后，得到清朝历代皇帝的支持，从1653年至1926年，双桂堂历经破山、竹禅等七代祖师，形成七殿、八堂、八院的规模。民国时期，双桂堂以其宏传的规模、庄严的殿堂、丰富的藏经和独特的雕塑，被誉为“蜀中丛林之首”、“西南禅宗祖庭”。1958年，被列为四川省重点保护寺庙。1968年4月，原二机部313厂从北京迁来，借住双桂堂，将僧众全部赶出。“文革”期间，曾有部队驻扎，寺庙建筑受到破坏。第十五代方丈妙谈和尚以及当地宗教工作干部采取得力措施，保护双桂堂。为免遭毁灭，妙谈和尚买来围席，将佛像包裹，并刷上白石灰，