真言宗各派各派连合，1879年（明治12年）教王护国寺做为总本山连合。1901年（明治34年），教王护国寺和山阶派・小野派・泉涌寺（古义真言宗）连合，但又分裂，于1907年（明治40年），以教王护国寺为总本山的真言宗东寺派独立，真言宗就此解体。太平洋战争之时，因政府的宗教政策，古义真言宗派和新义真言宗派再度统合，成为大真言宗。战后，从大真言宗独立，1946年（昭和21年），回复真言宗东寺派之旧称。1963年（昭和38年），以回复教王护国寺为中心之宗派型态为目的的东寺真言宗从真言宗东寺派分派独立。