元朝.1276年元兵南下，宋幼帝赵昰曾逃避于此。元末设嘉禾千户所。
明朝.明洪武二十年（1387年）在嘉禾里西南端筑“厦门城”——意寓国家大厦之门，“厦门”之名自此列入史册。
清朝.清顺治七年/南明永历四年（1650年）郑成功驻兵厦门，十二年（1655年）置思明州，康熙二年（1663年）改设思明县，康熙十九年（1680年）废。二十三年（1684年）设台厦兵备道，道尹驻台湾府治（雍正六年即1728年台湾府改为台湾道）；二十五年（1686年