属于天津市卫生局。1969年，天津市南开医院划归南开区卫生局管辖。1978年，重归天津市卫生局管理。1985年，天津市南开医院完成扩建，建成急腹症科研大楼。1991年，南开医院住院大楼落成。1995年9月，被认定为天津市唯一的以中西医结合为治疗特色的三级甲等医院。1997年，天津市南开医院增名“天津市中西医结合医院”。