年1月，李克农代表红军，在潼关与顾祝同进行停止内战的谈判，后在西安组织领导红军办事处。
抗日战争与第二次国共内战时期.抗日战争爆发后，先后任八路军驻上海、南京办事处处长、八路军总部秘书长、中共中央长江局秘书长。1938年5月，张国焘背叛中共，来到武汉，被李克农扣住，直到中共中央决定让张国焘自选去处。1938年11月，组建八路军驻桂林办事处，李克农任处长，开展统战工作。1941年1月皖南事变后，奉命撤回延安，任中共中央社会部副部长。1942年兼任中共中央情报部副部长，参与领导秘密情报