在莫斯科动力学院水电系，四人分别报了勘探、设计、施工、机电四个专业。1954年毕业后，崔军回国，任中华人民共和国电力工业部北京（水电）勘测设计院主任工程师。1955年，崔军向组织写书面报告，要求离开北京，到重庆狮子滩水电站建设一线工作。经水电总局局长李锐直接安排，1955年10月5日，崔军到达狮子滩水电站工地，任厂房工区副主任兼狮子滩水电工程局主任工程师。1958年，狮子滩工程竣工，崔军被调往下硐电站任工区副主任兼设计和施工的总工程师。1961年，下硐电站建成发电，崔军随同工区原班人马转调到紫坪埔工地，