12月31日晚照常参加政治学习，身体并无不适。至半夜，起床小解，遇成宗法师说：“明日代我请假，就说我不好了。”次日为1967年元旦，深德法师起床，见能海法师搭衣拥被，跏趺坐。唿之进早斋。不应，探视，早已寂然坐脱。世寿81岁，戒腊43岁。之后上师的遗骨葬于中国五台山清凉桥。1978年3月，中国五台山佛教协会在显通寺为释能海召开追悼大会，中国国务院宗教事务局及中国佛教协会派代表参加，并函电致悼。遗骨塔建在宝塔山山脚下。中国佛教协会会长赵朴初题塔铭：承文殊教，振锡清凉。显密双弘，遥遵法王；律履冰洁，智刃金