第二阶段公众参与的咨询文件中提出，建议屯马线由屯门站起向南延伸，到达屯门码头一带，此段车程约需4分钟，预计2030年落成。2020年5月，运输及房屋局向立法会呈交屯门南延线报告，提到港铁建议在屯门站和屯门南站之间的屯门第16区加设一个车站，并预留向龙鼓滩延伸的条件，以配合未来的屯门西发展。
洪水桥站.政府在「我们未来的铁路」第二阶段公众参与的咨询文件中提出，建议兴建洪水桥站，该车站位于天水围站至兆康站之间，以配合洪水桥新市镇发展，不过兴建后由于屯马线车程延长，顾问估计西铁乘客量