，侯森暂时成为球队的一号门将。2012年3月6日，他在2012年亚足联冠军联赛小组赛首轮北京国安客场1比2不敌蔚山现代的比赛中首发出场，首次代表北京国安在正式比赛出场。7月份，随着杨智的伤愈复出，他又成为球队的替补门将。2018赛季，由于杨智受伤，池文一到队时间较晚，侯森在该年中超前十轮一直首发登场，但郭全博在第11轮登场后成为国安新一代主力门将，侯森再次成为替补，赛季后期偶有首发机会。2019年，侯森在冬训期间受伤，该年7月伤愈复出。