着作，即《素问》，《针经》（即《灵枢》），《明堂孔穴针灸治要》，综合编着成《黄帝三部鍼灸甲乙经》，共10卷，乃中国针灸学名着。到了南北朝，才被改为12卷本。。另着《帝王世纪》、《高士传》、《列女传》、《玄晏春秋》、《年历》等。
故里之争.近年来，甘肃省平凉市灵台县对皇甫谧的籍地有了争议，主要是因为明末清初顾祖禹的笔误，朝那县位于固原东南误写为平凉府东南。