力尚未稳固他的王权之时，他又面临新的对手，他的兄弟安条克十二世趁着德米特里失去权位之后，于大马士革自立为王，内战再度爆发。尽管腓力短暂占领大马士革，但又被夺走。前83年，纳巴泰人入侵大马士革，杀了安条克十二世。差不多同时，安条克的市民引进亚美尼亚国王提格兰二世的军队，可能是市民不满腓力的统治，或是腓力的统治早些时日就已结束，总之他大约在那个时间点消失在历史舞台上。然而，他的钱币在后来罗马人时还在发行。