守着九龙城和黄大仙席，屯门区4名时任区议员中有两人连任失败包括：富新戴贤招和悦湖官东荣，甚至转投建制阵营，民协在屯门区的势力大大削弱。2007年区选失利后，出任了主席18年的冯检基引咎辞职，依会章由副主席廖成利署理主席一职。2008年立法会选举，在黄毓民参选及被公民党及民主党加入夹击的情况下，冯检基成功保住其在九龙西的立法会议席。2010年，民协与民主党、一众温和民主派学者组织普选联，向政府争取更进步的政改方案。
二零一零年代.2012年香港立法会选举中，民协派出冯检基出选