7月支持“二次革命”，反对袁世凯独裁；10月，和国民党的张耀曾等人组织民宪党，不久袁世凯解散国会。此外，他还和张东荪共同编辑出版《中国雑志》。1915年（民国4年）袁世凯称帝，丁佛言到上海进行反袁活动。袁世凯死后的1916年（民国5年）8月，大总统黎元洪任命丁佛言为总统府秘书长。1917年2月他辞职归郷，研究古文字学。1922年（民国11年），曹锟贿选当选大总统，时任国会议员的丁佛言拒绝受贿，辞职，并痛斥曹锟，遂遭到曹锟逮捕拘禁。1924年（民国13年）北京政变（首都革命）后，曹锟失势，丁佛言获得释放。