财务每况愈下，终于在2004年2月停刊实体报纸。2005年初，《台湾新闻报》裁撤台北办事处，停止大台北地区发报业务。2005年9月，《台湾新闻报》停止营运，总社停止发报，网站被裁撤；当时《台湾新闻报》社长高文雄说，报社内部正在改组；当时《台湾新闻报》副总经理兼台北总管理处处长宋智忱说，报社关闭的主因是内部经营不善导致无经费印报，而且发不出薪水。2007年4月起，《台湾新闻报》只维持网路版本运作，虽然副总经理宋智忱表示希望恢复出实体报，但在媒体市场规模无复甦迹象前，目前仍主要以对外广告合作案作为电子报社的收入