与南梁相持，皇帝诏令薛怀吉为卢昶军司。等到卢昶战败，薛怀吉得以不连坐定罪。延昌年间，薛怀吉以本将军担任梁州刺史。延昌四年（515年），南秦氐族反叛，进逼武兴，薛怀吉派遣长史崔纂、司马韦弼、别驾范珦攻打氐族，薛怀吉率领军队在沮水击败氐族，薛怀吉进号右将军。正光初年，薛怀吉出任后将军、汾州刺史，正光四年岁次癸卯五月丙申朔十日乙未（523年7月8日），薛怀吉在汾州私人住宅中去世，虚岁五十三，朝廷赠予平北将军、并州刺史。孝昌二年岁次丙午闰十一月丙寅朔十九日甲申（526年12月8日）归葬故里汾阴县。薛怀吉原本不以