步芳、马步青等恐被各个击破，地盘难保，乃联合拒孙，史称四马拒孙之役。四马联军约5万余人，孙殿英兵力约7万人。经过4个月激战，以孙殿英惨遭毁灭性打击而告终。1949年，他们在与解放军的战斗中失败，马鸿宾向解放军投降。而马步芳与马鸿逵追随中华民国政府转进台湾，而后辗转至他国，终老于他乡。马家军主要人物多为回族，信奉伊斯兰教。民国后，汉族逐渐进入马家军政治军事圈子。马家军后来不但士兵有相当部分是汉民，许多高级职务也由汉人担任，如青马国民革命军第八十二军副军长赵遂，骑兵第五军副军长郭全梁，宁马国民革命军第一