6年后，不再提及军统。1950年6月，保密局恢复正式编组，于台北士林芝山岩设立局本部，持续执行情报蒐集，并参与台湾省工作委员会案及台北市工作委员会案等案件。1955年，情报机构改制，保密局改组为国防部情报局，保防侦查等业务拨归「法务部调查局」（今法务部调查局）接管。一般说来，该阶段先后实际执行者为毛人凤与蒋经国。 1984年发生江南案，当时之情报局长汪希苓亦被捕入狱，情报局再次大改组。1985年7月1日，情报局与国防部特种情报室併编成立国防部军事情报局，隶属国防部参谋本部，受参谋总长直接指挥。S