现时东涌线的班次约为每4-12分钟一班，设计最终班次为2.25分钟一班（香港至青衣段）或4.5分钟一班（全线）。根据港铁公司所指，机场铁路两条行车线的行车方案如下：
历史.早于1989年10月，当时的香港政府已决定于大屿山的赤鱲角兴建新机场，取代已经饱和，位于九龙城区的启德机场。当时港英政府邀请地下铁路公司，即现在的港铁公司负责兴建大屿山机场铁路，以连接新机场至香港市区。当时的机场铁路共规划了10个车站位置，分别是中环香港、西九龙、大角咀、茘景、青衣、阴澳、小濠湾、大濠湾、东涌及