南京的蒋介石合作，应蒋介石之要求，达成协议“分共、清党”。冯将他军队中的共产党员和他管辖地区内的共产党员干部全部“礼送”出境。
中原毁佛.1927年，笃信基督教的冯玉祥在河南废寺逐僧，将大相国寺改成市场。并发动全省毁佛运动，所有比丘、比丘尼一律驱逐。所有寺产没收，寺院改为学校，或作救济院、图书馆，或成为娱乐场所。继河南之后，直、鲁、秦等各行省，也都纷纷跟从，华北佛教因此几乎衰绝。
与国民党中央的关系.1928年2月14日，冯玉祥在友人邵力子的撮合下与蒋介石