1947年，关麟征接替蒋介石出任中央陆军军官学校校长。1948年1月，关麟征调任中华民国陆军副总司令。1949年8月，中华民国代总统李宗仁任命关麟征为陆军总司令，并晋升陆军二级上将。
国共内战后在香港.同年11月，关见陈诚在台湾受到蒋介石重用，决意隐退，移居香港，次年被正式免去总司令职务。关麟征虽与陈诚不睦，但素与其陕西同乡、陈诚土木系中得力干将胡琏友善，并不因此影响两人之间友谊，甚至还充满自信的回答胡琏请教他的「东北战略」。关在香港期间不问世事，拒绝参加任何政治组织，以书