毛文龙率领的皮岛官兵列队欢迎。此时袁祭出尚方宝剑，宣布毛文龙十二条当斩之罪，私斩毛文龙，但其实毛文龙手上也有一把尚方宝剑，但由于见袁崇焕矫诏以为是崇祯帝要杀他，只能含泪捆绑被杀。后来清朝将军鳌拜攻克毛岛上明海军旧部，鳌拜本人也被提升了三等梅勒章京，册封巴图鲁。结果袁崇焕矫诏杀毛文龙后不足一年，没有其牵制拉锯的后金如入无人之境直围京师，史称己巳之变。