浙闽沿海沿岸流交汇于此，在岛屿崎岖地形下形成上升流和涡流，大量营养物质上浮到表层海水，促进了海域周围浮游生物繁殖，因此附近渔业产量较高，物种资源也较为丰富。同时七星岛区域还兼具温带和热带两种气候特征。保护区内主要鱼类种类组成以沿岸海域常见种为主，其中以龙头鱼分布数量最多，鱼群受洄游影响呈现季节性变化，春季多以浮游生物为食的鱼类，而到了秋季则多是如带鱼的肉食类、杂食类鱼类。由于长期作为浙闽两省渔民的传统作业场所，七星岛附近海域海洋捕捞活动强度过大，因此近年来渔业资源呈现衰退趋势。
候鸟