拥有最大的规模。南庭耸立高80公尺的巨大八角九重塔，向东海道显示京都的权势。但是，和其他寺院同样，因相次的灾害和院政的衰微，在应仁之乱以后废绝。一般认为现在京都市动物园大概相当于伽蓝的南半部。
尊胜寺.尊胜寺（そんしょうじ）：堀河天皇御愿，康和4年（1102年）落庆供养。
最胜寺.最胜寺（さいしょうじ）：鸟羽天皇御愿，元永元年（1118年）落庆供养。推定是现在的冈崎运动场西侧至京都会馆之间，方一町（120m四方）规模的寺院。
圆胜寺