河流为额尔齐斯河及伊犁河；自20世纪80年代末，中国已有在此两条河流修筑渠道和引水，中国对额尔齐斯河的使用量佔该河流水资源总量的约40%，对伊犁河的使用量佔约70%；中国上述行动被指对哈萨克斯坦造成负面影响，如中国对伊犁河的使用量会引致以该河为水源的巴尔喀什湖出现缺水，威胁鱼类资源，亦会影响哈萨克南部供电、灌溉等的基础设施，哈萨克斯坦的水资源更在过去50年内减少了200亿立方米；纳扎尔巴耶夫更曾于上合组织峰会上公开表示不满中国在上述两条河流加大取水量。就此，中国于2001年同意与哈萨克斯坦建立联合河流委员会