外而内为木栓层、木栓形成层、绿皮层、韧皮部、维管束形成层、木质部、木髓。木质部通常佔最大比例，可再细分为边材和心材。边材在外侧，较年轻，具水份运输的功能，结构相对疏松，颜色较淡；心材较老，不具水份运输的功能，主要提供结构支持，颜色较深。由韧皮部以外合称为树皮。在气候变化明显的地方，树干中会有年轮。有些树，例如樱，在树干上会有皮孔协助气体交换。在热带地区，有些树的树干上会直接长出花和果实，称为干生花和干生果，例如水同木、可可树等。
单子叶植物.有些棕榈、芭蕉、龙舌兰、龙血树、芦荟