特总统时期，哈德利是国家安全委员会的成员。他在1989年至1993年之间任美国国防部负责国际安全政策的部长助理。在这个职位上，哈德利负责掌管北约和西欧的防务政策、核武器和弹道导弹防御、军备控制等等。他也参与制定关于武器出口限制和太空利用的政策。哈德利在国务卿詹姆斯·贝克领导的与苏联签署START-1和START-2的谈判中是美国国防部长切尼的个人代表。哈德利在2000年美国总统选举时是共和党候选人乔治·沃克·布什（当时是得克萨斯州州长）的高级外交与防务政策顾问。在布什政府的过渡时期，他供职于国家安全委员