英语和小语种摆在同等重要之位置，安排比英语班略多的课时，配备较好的师资力量进行教学。学生自中预年级（六年级）起即两门语言同时学习，且英语的教学水平应不逊于英语班学生。
理科类.与上海市“四大名校”（复旦附中、上海中学、华东师范大学第二附属中学、交大附中）不同，上外附中不开设所谓“理科班”，只在高一、高二年级开设具有选修课性质的理科加强班，包括微积分、物理、化学、应用数学4科。尽管如此，该校在理科竞赛方面仍颇有成绩。作为上海市为数不多的选拔学生组队参与HiMCM（非官方译名：美国