教于1841年传入香港，现有在香港的独立教会至少400所，堂会逾1500间（其中以华语宣道者约1300间），大小宗派逾70个。主要宗派有香港圣公会、中华基督教会、循道卫理联合教会、真耶稣教会、信义会、播道会、基督复临安息日会、浸信会、宣道会、、救世军、神召会和聚会处（也称小羣教会）等。基督新教出版两份每週出刊的主要报章《基督教週报》和《时代论坛》，在香港电台有定期电台节目，同时也通过媒体播放电视节目。香港基督新教两大合作团体分别是香港华人基督教联会（1915年成立）和香港基督教协进会（1954年成立）。