征.圣多美和普林西比国旗中，绿色间接提到该国丰富的植物；而黄色除了代表位于热带的太阳外，也象征着当地的主要农作物可可豆。另外红色不但表示「为了争取独立所进行的斗争」，亦代表了平等；而位于黄色横条的两颗黑色五角星则象征着组成国家的两个岛屿：圣多美岛与普林西比岛。在国家层面上，该国旗的设计灵感来自于圣多美和普林西比解放运动的旗帜，这两面旗帜除了三条横条的高度比例不同以外就完全一样。当中国旗内的三条横条之高度比例是2比3比2，而解放运动旗帜的三条横条高度则为相同。此外，黄色、绿色、红色与黑色均是代表着泛非洲