行宪立法委员之当选资格。4月20日，副总统候选人孙科、程潜等分别招待国民大会代表，发表演说，竞选副总统。4月21日，孙科正式宣称：「余本人已辞去已当选之立法委员一职，以是，行宪立法院院长之竞选，余决不参加。」5月，孙科在副总统竞选中败于李宗仁后再被任为立法院长。
再次组阁.1948年11月26日，行政院长翁文灏请辞获准，蒋提名孙科继任；次日，立法院投票，同意孙科为行政院长。12月23日，行政院长孙科正式视事，主持首次内阁会议，发表施政纲领，宣布继续「戡乱」，作战到底