立时，龙云列入中央人民政府委员，中华人民共和国成立后1950年1月龙云从香港赴北京，加入中华人民共和国政府。历任国防委员会副主席、中国人民政治协商会议常委、民革中央副主席、西南军政委员会副主席等职。1956年曾出访苏联、罗马尼亚、捷克斯洛伐克、南斯拉夫等东欧国家。
保护西南联大.龙云主政期间予云南境内知识份子批评中央的言论自由，给西南联大提供了相当程度的保护，直到其失势下台，《炎黄春秋》杂志文章《龙云与民主堡垒西南联大》写道：《剑桥中华民国史1912-1949》下卷，也描写到龙云