佩兹通过吕宋南部的部分达到萨马岛。将这些岛屿命名为（西班牙王子）菲利普二世（Feripinasu）群岛，这是菲律宾当前名称的由来。1900年美菲战争，菲律宾游击战包围萨马岛北萨马Catubig。1901年9月28日菲律宾游击队攻击萨马岛东萨马，48名美军第9步兵团的成员因此遇难。美军雅各·H·史密斯将军下令报复，杀害当地的10岁以上的每个菲律宾人。在第二次世界大战中最具有决定性的海战之一－雷伊泰湾海战在萨马岛南部的雷伊泰湾发生。