特朗普上台以后，二次安检的出现频率明显增高，自2017年以来，每天会有超过32万名乘客受到影响。因此这个政策引致很多乘客的不满。此外，尽管TSA宣称没有任何未成年人身处二次安检名单内，至今仍有很多未成年人因为和名单上的人重名而需要接受二次安检。美国公民自由联盟认为二次安检是种族主义行为。也有一些社会活动人士相信美国政府将一些异见人士放在二次安检名单之上，以故意为他们的生活制造不便。由于二次安检可能导致登机时间被严重拉长，一些航空公司建议乘客至少提前三小时进行安检，以避免错过航班。