舰及“千岛湖”号综合补给舰组成中国海军第三批护航编队，从浙江省舟山市起航，前往亚丁湾和索马里海域执行护航任务。该次护航历时158天，在完成了53批护航任务，安全护送中外船舶582艘后，编队于2009年12月20日返回浙江舟山某军港。舟山舰等在返航途中对新加坡和马来西亚进行了访问，并于12月14日至17日停靠香港，接待了7000余名香港各界人士登舰参观。2010年11月2日，“舟山”号导弹护卫舰、“徐州”号导弹护卫舰及“千岛湖”号综合补给舰组成中国海军第七批护航编队，从浙江省舟山市起航，前往亚丁湾和索马里