伊朗议会在巴尼萨德尔缺席的情况下对他进行了弹劾。据说与他得罪了某些有权的教士有关。因为霍梅尼本人在第二天便签署了这一文件，所以有人认为霍梅尼可能也是弹劾的支持者。同年7月，巴尼萨德尔同拉贾维（Masud Rajavi）一同逃亡法国，组建反对霍梅尼统治的流亡政府并自任总统。1997年，巴尼萨德尔在德国柏林的一个法庭上指证伊朗政府，这一审判控告伊朗政府试图谋杀自己的反对者。2009年，他公开批评伊朗的总统选举中存在舞弊。2019年，86岁高龄的阿布-哈桑·巴尼萨德尔再一次公开批评伊朗伊斯兰共和国的政体是独裁