东京的地下铁系统，13条路线中就有10条实施直通运行，庞大的运输规模使其成为全世界规模最大的都市铁路系统。
韩国.zh-hant:; zh-hans:;在韩国首尔的首都圈电铁也属于直通运行的情况，这种直通运行称为「运行系统」，比如首都圈电铁3号线是由首尔地铁3号线和一山线直通运行的名字，韩国首都圈电铁的好几条线路都是多条线路直通运行并给予了运行系统的名字。此外，韩国高铁亦曾有数处路段与既有传统铁路直通运行，导致营运速度上的提升困难，直至高速化专用路段完工之后才得以改善。