工程学院校区（南京市鼓楼区水佐岗49号）为新校区，该址现为江苏省哲学社会科学界联合会、江苏省妇女联合会以及江苏省地方志编撰委员会、中国共产党江苏省委员会机关刊物《群众》杂志的办公地点。校舍由当时着名的华盖建筑师事务所兴建，现南京市仅留存大门，该大门仿法国巴黎凯旋门兴造，显示当年中央政治学校特殊的身份和地位。