儿子裴行俨被杀。他的小儿子是唐朝儒将裴行俭。
家世争议.《唐史论丛》第23辑李政云着《新出裴光庭墓志初探》指出《新唐书·宰相世系表》载其先祖即裴仁基曾祖父裴嵩寿任南朝梁兵部尚书，但南朝梁并无此职，未详是否以隋唐官职指代南朝梁的五兵尚书；《隋书》及裴光庭墓志又载裴伯凤曾任汾州刺史，但在北周、北齐在汾州频繁交战之际史书竟无其记载，故指裴伯凤是因羁縻得封的汾州本地山胡酋长，非河东裴氏；但<裴侠传>又称裴伯凤为其从弟。未详孰是。
文学作品中的裴仁基.《说唐》中裴仁