通常是借吸入有感染力的繁殖体而感染，但繁殖体具体的形式还不确定，目前较被接受的说法是经有性或无性过程产生的担孢子。
病原与感染形式.隐球菌病是一种伺机性感染，常感染爱滋病患者。其他易感者包括某些淋巴瘤患者（如霍奇金氏淋巴瘤）、结节病患者及长期使用糖皮质激素的患者。造成隐球菌病的病原广泛分布于全世界的土壤中。其流行因为某些原因而在近二十年内大幅增加，这些原因包括爱滋病的增加及免疫抑制药物使用的增加。在人类，隐球菌病的感染形式有三种：隐球菌型脑膜炎被认为是透过肺部的感染扩散