卡尔九世打败，1599年7月24日，瑞典国会罢黜了齐格蒙，立卡尔为监国摄政王。1600年3月19日，卡尔肃清齐格蒙派，许多原支持齐格蒙的贵族被卡尔斩首，后被称为「林雪平血案」（Linköping Bloodbath）。1604年，身为摄政王的卡尔正式加冕登基，并自称为卡尔九世。理论上他应该是「卡尔三世」。因为，事实上的卡尔一世，即卡尔·斯沃克尔松是瑞典历史记载的第一个名叫卡尔的国王，只是因为传奇中称卡尔·斯沃克尔松是「第七个卡尔」。卡尔为了尊重这个传奇，于是自称「卡尔九世」。