他又出版革命刊物反对日本。1936年左右，他来到朝鲜半岛北部当游击队的书记。1945年，北韩建政，全昌哲在这段期间被委任为平壤科学院的政治部校长。1949年，又成为万景台革命学院的院长。1959年，入选为党中央委员会的委员名单。1962年，他在最高人民会议选举中当选为代议员。随后，他先后被任命为党中央委员会的审查委员会副委员长、中央党政治学校的校长、朝鲜职业总同盟委员长以及最高人民会议常任委员会书记。1971年，出任最高人民会议常设会议事务长。此外，他曾获金日成勋章。1982年3月11日，全昌哲离世