巴出发航行到尤卡坦，发现海岸上有一些石头垒砌的城堡。他们一开始跟这些玛雅城邦进行了交易，后来还是发生了冲突，他们被赶走了。不过他们向外面的西班牙人报道了尤卡坦的情况，这也引起了后来的科特斯远征。伴随西班牙人而来的，还有旧大陆的一系列烈性传染疾病，例如天花、黄热病等等。根据现代的估测，在16世纪20至30年代，整个玛雅地区由于传染病造成的的人口损失高达75%至90%。这在相当大的程度上削弱了玛雅文明的经济以及战斗力。
征服过程.1519年科特斯在尤卡坦登陆，不过没有什么大动作，而