十三大开始，直到2002年中共十六大，均被选为中央委员。2003年3月17日，中华人民共和国国家主席胡锦涛发布第二号中华人民共和国主席令，根据中华人民共和国第十届全国人民代表大会第一次会议的决定，张福森被任命为民政部部长。2005年被增补为中国人民政治协商会议全国委员会委员，同年，被十届全国人大常委会16次会议决定免去其司法部部长职务。2008年3月，被选为全国政协常委，并出任全国政协社会和法制委员会主任。