、下游建有许多水利工程，以灌溉包括本市在内的新竹平原农地。客雅溪发源于竹东丘陵，全长约24公里，流经本市闹区南侧而于罟寮附近入海。盐港溪也是发源于竹东丘陵，流经本市最南端的内湖地区而于灰窑附近入海。
气候.新竹市属于海洋性副热带季风气候，全年有雨，但夏冬两季较易缺水，夏季的降水贡献，主要来自在西太平洋形成的台风，其次是午后对流雨，冬春两季以锋面雨较多。全年无雪，在2016年1月24日有下冰霰的纪录。竹风兰雨是台湾北部秋冬的气候特色，自苗栗县到新北市为风区，新北市到宜兰县为雨区，两者