记处候补书记兼内蒙古自治区经济委员会主任。1963年3月到1967年11月，权星垣任中共内蒙古自治区党委书记处书记。1967年11月到1970年1月，任内蒙古自治区革命委员会常委、党的核心小组成员。1970年1月到1971年6月，权星垣在中央毛泽东思想学习班接受批判。1971年6月到1973年1月，在中国人民解放军第24军军办五七干校化肥厂劳动、接受审查。1973年1月到1977年8月，在天津市第三招待所养病，等待分配。1977年8月到1979年12月，权星垣任甘肃省革命委员会副主任、工办主任。