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化石材料.刺猬鳄的正模标本（编号IGM 100/1321）是由天然状态的头颅骨前部、下颌、颈椎、前肢、以及皮内成骨（Osteoderms）所构成。
分类系统.Pol与诺瑞尔在2004年发现刺猬鳄是戈壁鳄的姐妹分类，拥有14个共有衍征，主要来自于头颅骨，两者共同形成戈壁鳄科。