史.台湾清治末期至日治初期，番子寮地区为一街庄，称为「番仔藔庄」，隶属于下茄苳南堡。该庄西及北隔八掌溪及其支流赤兰溪与外溪洲庄、水堀头街、柳仔林庄、崎仔头庄、下六庄为界，东与三界埔庄为邻，东南边及南边为牛稠埔庄、马稠后庄、诏安厝庄。1901年（日治明治三十四年）11月，全台设置二十厅，该庄隶属于盐水港厅。1909年（明治四十二年）10月，合併二十厅为十二厅，该庄改隶属于嘉义厅。1920年（大正九年），废十二厅改设五州二厅，该庄改制为「番子寮」大字，隶属于台南州嘉义郡水上庄。战后水上庄改制为水上乡，