荷兰商馆正在进行修复工程，期待能重现17世纪时的风貌。长崎市的东山手和南山手地区是重要传统的建造物群保存地区。哥拉巴园集中了众多兴建于19世纪后期的西洋式住宅。其中兴建于1860年代的旧哥拉巴住宅是日本历史最古老的现存木造洋馆，在当时是英国商人汤玛士·布雷克·哥拉巴的邸宅。长崎市内还有旧长崎英国领事馆、旧香港上海银行长崎支店等西洋式建筑。江户时代的外国人居住区出岛也有部分建筑得到复原。长崎市内还有多座中国风格的建筑。崇福寺、福济寺、兴福寺并称为，其中崇福寺的第一峰门和大雄宝殿是日本国宝。眼镜桥由明代渡日高僧