装箱运输领域则居世界10名左右。商船三井的集装箱是以鳄鱼扛集装箱为标志，是个明显而有趣的特征。在《财富杂志》世界500强排名中，商船三井与马士基、日本邮船及中远集团作为仅有的四家国际航运企业入选。因应国际海运业务长期的不景气，以及前有韩进海运声请破产之鑑，商船三井决定与日本邮船、等两家航运公司合作将彼此旗下的的货柜业务整併成一家货柜航运公司，预计2017年7月7,日着手合併，2018年4月1日（日本企业多以每年4月为新的会计年度起算期）即以新的联盟运作。这家业务整併的合资公司，即是日后的。日本邮船