因受海盗之害所苦，无力承受塞琉古六世的挥霍，加上塞琉古六世致力于组建一支新的大军，更使税务沉重。终于叛乱爆发，塞琉古六世被包围在竞赛场内，最后塞琉古六世和他的人马在竞赛场内被烧死。 塞琉古六世还有四个兄弟，有安条克十一世、腓力一世、德米特里三世和安条克十二世，他们之后继续与安条克十世进行内战外，兄弟间也爆发战争。