自然条件保护较好，又由于海流因素，海水中饵料丰富，利于鱼虾繁衍。岛上地貌形态多样，适于水鸟栖息繁殖。因而，韭山列岛一带生物多样性保存完好。海底复杂的地形条件为小型鱼群和乌贼提供了食物，而这些海洋生物也使江豚在这一海域形成了较大的种群分布区。列岛附近也是大黄鱼、带鱼和曼氏无针乌贼的栖息繁殖场所。岛上共有黑嘴端凤头燕鸥、黄嘴白鹭、岩鹭三种国家二级重点保护鸟类栖息。其中的黑嘴端凤头燕鸥由于数量稀少，行踪不定而被称为“神话之鸟”，而韭山列岛是这种鸟类目前发现的全球仅存的两个栖息地之一。此外，白鹭、中白鹭、黑尾鸥、大