选中国国民党第六届中央执行委员。 1948年，当选第一届国民大会代表，国大第一次会议主席团主席。1948年7月，出任中央警官学校校长，中将军衔。1949年，赴台湾，仍任中央警官学校校长。李士珍移居台湾后即退出警界，对中国典籍《周易》颇有研究。先后任国民大会宪政实施研讨委员会台北区修宪第一研究组召集人，国民大会主席团成员，中华民国行政院经济设计委员会委员等职务。1966年，当选国大代表，第四次会议主席团主席。 1972年，当选国大代表，第五次会议主席团主席。1973年至1977年，担任中华民国行政院经济建