「刚介寡交」，故而「不得大用」。朝廷将战功全归郑见龙，拜其为咸镜道兵使；而郑文孚仅仅只被认定诛杀叛民有功，拜吉州府使。当地军民纷纷推荐由郑文孚担任兵使，但被朝廷拒绝了。1611年，充南原府使。此时光海君得知郑文孚在壬辰倭乱期间深得北道地区的人心，在李恒福的推荐下，用其为吉州牧使。1616年，任兵曹分总管。1617年，任兵曹参判。但他不附当权的韩缵男，故而不被重用。1623年仁祖反正之后，受到李元翼的推荐，郑文孚受到朝鲜仁祖的重用，拜全州府尹。不久郑文孚因母丁忧，告假回乡。有一勋臣因与郑文孚相善，前去