厂调来一部装置容量6,000瓩的重油发电机组，于同年8月装设完成併联发电。这时，发电厂内之柴油发电机组共有8部以重油为燃料，总装置容量达到41,000瓩。1984年6月，澎湖发电厂由于邻近马公市区，为防止柴油机组燃烧后之排放烟物，扩散飘落市区，于是耗资新台币3,800万元，兴建一座71公尺高的集合烟囱。并在厂内设有含油废水处理设备，将全厂含油污水集中，经过油水分离等多层处理，后再增设UF过泸废水处理厂。自此澎湖发电厂的厂区土地使用已达饱和，已无空间可进行扩建，然而澎湖地区之用电量仍持续增加，必须另觅新厂