地区信奉新教的宗教难民涌入共和国内。 共和国最初的几年因为喀尔文宗出现相当大的争议，而争议的主题是关于预选说教义，最出名的事件就是荷兰喀尔文宗于1618年发动政变，召开多特会议，而后喀尔文主义者实施对阿民念主义者的迫害和限制。在共和国时代任何人想进入公家服务，就必须在喀尔文宗的教会宣示，当时天主教徒成了教会的敌人，在十七世纪的莱顿，倘若任命旧教信徒，则会被罚款一百荷兰盾（相当一个商人一年的收入），这可以看出人身以及宗教仍然不是那么的开放，在18世纪初情势有所改变，从原本或多或少的宗教迫害到国教政策，