狱之后，谢聪敏又于1971年因台北花旗银行爆炸案被诬为台独暴力事件，与魏廷朝、李敖等一同被捕，一生中曾二度入狱。1981年，谢聪敏担任台湾人公共事务会副会长。1986年11月30日，谢聪敏、林水泉与许信良自日本成田机场搭机，意图闯关回到台湾，最后因国泰航空拒绝让他们三人登机而无法成行。在台湾，支持群众在桃园机场外声援抗议，是为桃园机场事件。1998年7月11日，谢聪敏指控，曾有民进党籍立法委员担任司法行政部调查局（法务部调查局前身）线民；此言在隔日登上《台湾日报》头条，民进党无回应。谢聪敏说，他曾争