原、秦部、秦许、秦常、秦胜、秦人部、秦川边、秦大藏、秦小宅、秦井手、秦中家、秦田村、秦长田、秦物集、秦泉寺、秦高桥、秦达布、秦佐此佐等分支。他们在桓武天皇时权力很大。他们对开发鸭川一带贡献很大。在平安时代部份人以为名，岛津氏亦以秦氏先祖而自称。另外，四国的长宗我部氏和也自称是秦氏后裔。姓羽田的与他们有关，日本前首相羽田孜曾公开承认自己是秦人之后。、已智、三林、长冈、山村、秦公、秦姓、国背、物集、大里、伊美吉、川胜氏、神保氏也是秦氏后人。秦氏有他们的神社：松尾大社、伏见稻荷大社、、。最有名是伏见稲荷大