东南亚社会的一种干涉；而最高指导原则的创立被认为是对这种事务的反对。
批评讨论.最高指导原则在“星际旅行宇宙”中备受批评，原因在于原则的应用标准并不统一。例如在《星际旅行：初代》的“”、“”、“”、“”、“”和“”等剧集里，进取号星舰的船员们就多次干涉了外星文明的法律和社会习俗，以实现星际联邦的目标、挽救船员的生命或改善外星人民的生活。而在“星际旅行宇宙”外，针对最高指导的原则的批评也集中在上述问题。有人指出“最高指导原则”只是一个简单的剧情设置，其具体内容都由剧作家们所操控。