因使者找不到可传递文书给高山国的人而无功而返。江户时代庆长14年（1609年），德川家康任命有马晴信晓谕土番纳贡。元和2年（1616年），德川家康任命长崎代官村山等安征服台湾，等安以次子村山秋安率领2、3千人征台，为规模最大的一次，但因遭遇风灾无功而返。寛永18年（1641年），锁国制度完成，交流渐次减少。不过在明郑时期，台湾与锁国时期的日本仍保持相当的贸易和政治往来，台日双方的贸易量在1665年到1672年达到高峰。请参见日本乞师。
原住民政权.
大肚王国.