后又再于足利、武田、上杉的信长包围网中以甲贺郡石部城为据点，义贤、义治父子一直以反对信长为目标而持续作战，直到天正二年（1574年）石部城遭到织田军攻陷后（石部城之战），六角义治逃往甲斐依附武田家。
晚年.晚年六角义治投靠侍奉羽柴秀吉与羽柴秀次，并且出任丰臣秀赖的弓道师傅而结束一生。