濒危品种黑脸琵鹭亦会在香港过境。位于新界西北部的米埔沼泽区最多候鸟栖息，所属的后海湾湿地自1995年根据《拉姆萨尔公约》列为国际重要湿地。邻近约61公顷土地于2000年起划为湿地公园，供游客观赏自然生态。两栖类及爬行类动物则分别有25种和90种，其中蛇佔50多种，蜥蜴佔20多种，另有约24种两栖类及约10种龟鳖类动物。香港特有种包括鲍氏双足蜥（"）和卢文氏树蛙，连同其他动物受到《野生动物保护条例》保护。在南丫岛深湾繁殖的绿海龟，则是唯一在香港繁殖的海龟。香港境内昆虫亦种类繁多，包括超过230种蝴蝶、11