，1000番台的运转台仪表也作出了一些的调动。空调改用"WAU702B"型。当初基本设计为6辆+附属2辆共8辆编组。现在已改为和0番台一样型式的4辆×19编组（T编组）及3辆×54编组（S编组）。（S54/55为后藤总合车辆所制造）。S18编组是福知山线事故中列车后面的3辆，现在被警察收押。
100＋500＋1500番台.属改良版（并不是新制车），在1996年诞生。由0番台3辆，1000番台1辆混结组成。为准备JR东西线开业，全部编组统一为4辆+附属3辆为令1000番台的组