是派兵攻击代国，时什翼犍患病无法统军，所派的白部、独狐部及刘库仁都不能挡住前秦军队，于是只得率各部避走阴山以北。可是其时高车各族乘时叛变，并抄略代国部众，什翼犍逼于无奈，只好南返漠南，后因秦军稍稍退而在其年十二月回到云中。拓跋孤之子拓跋斤正为了不能继其父之职而心怀怨恨，因而向什翼犍之庶长子拓跋寔君谎称寔君诸弟将加害寔君，并令他尽杀诸弟及什翼犍。前秦趁代国大乱的机会发动攻击，代国遂灭。398年，什翼犍之孙北魏道武帝拓跋珪称帝时，将什翼犍追谥为昭成皇帝，庙