清朝初年，新设立甘肃省，雍正二年（1724年）时，将肃州卫改制为肃州(散州)，併入甘州府。到了雍正七年（1729年），肃州又独立出来成为肃州直隶州。按清朝制度，直隶州须管县份，所以又割甘州府之高台县来给「肃州直隶州」管辖肃州直隶州，编制是:「冲，繁，疲」，同时也是甘肃省安肃道的治所。又，肃州直隶州，除了自己原有的肃州直辖地之外，也只管了高台县一个县。到了民国时期，天下普遍「废州改县」，肃州于是被改为酒泉县。今日，则成为甘肃省酒泉市。