年（1661年），郑成功率军入台，5月改赤崁地方为东都明京，设一府二县，一府即承天府，二县即天兴县、万年县，永历十八年（1664年）后，郑经提升天兴、万年二县政治层级，天兴县改为天兴州。永历三十七年（1683年）郑氏降清，康熙二十三年（1684年）将台湾纳入版图，属福建省台湾府，辖三县，即台湾县、凤山县、诸罗县。诸罗县在新港溪以北，故太保属诸罗县。雍正十二年（1734年）起，太保归属诸罗山保、柴头港保，林爽文事件后，自干隆五十三年（1788年）起，诸罗山保改名嘉义保。日治时期，台湾分三县一厅，太保属台南