535年，宇文泰察知可朱浑元有二心，出兵攻打。可朱浑元率部自渭州出发，从西北乌兰津渡河，越河州、源州之境到达东方。借助灵州刘丰之力，出灵州东北入云州。高欢派平阳郡守高嵩迎可朱浑元，可朱浑元到达晋阳。封可朱浑元为元县公，任车骑大将军。可朱浑元在东雍擒获西魏仪同金祚、皇甫智达，转任并州刺史。用兵持重，善于驭下，屡有战功。547年，转任司空。550年，北齐建国，封扶风王。跟随齐文宣帝攻打山胡、柔然，立功。554年，担任大将军，557年，担任太傅，558年，转任太师。可朱浑元去世。追赠假黄钺、太宰、录尚书事。