蒙古与藏族.雍正二年（1724年）设置西宁办事大臣，办事大臣衙门最初设于察罕托洛亥（青海湖东南），后改驻西宁，故干隆以后又称为西宁办事大臣。雍正五年，在西藏设置驻藏大臣，加强对西藏的控制。
西南各族.废除西南少数民族原本的土司制度，改用朝廷分发的流官，史称“改土归流”，派遣官吏统治，加强对少数民族的统治及同化。
社会.雍正帝在位期间还实施“废除贱籍”一项改革。雍正帝下令为贱民开豁为民，编入正户，准许置产定居、考试，宣示废除贱民阶级，但影响有限，未能