1999年5月25日，西藏自治区人民政府正式批准将拉鲁湿地建为西藏自治区级自然保护区。2000年，拉萨市人民政府颁布《拉萨拉鲁湿地自然保护区管理办法》，并且编制了《拉鲁湿地自然保护区总体规划》，成立拉鲁湿地保护区管理站。2005年7月23日，中华人民共和国国务院批准新建拉鲁湿地国家级自然保护区。2008年，中共拉萨市委、拉萨市人民政府将拉鲁湿地国家级自然保护区管理站升格为拉鲁湿地国家级自然保护区管理局。2017年，西藏自治区对拉鲁湿地环境进行整改，推动历史遗留问题解决。一是由拉萨市自筹资金5044.