行的大选，小泉领导的自民党取得胜利，连同公明党取得过半数议席，继续执政。11月19日，第2次小泉内阁组阁、就任第88届内阁总理大臣，谷垣祯一担任财务大臣、安倍晋三担任自民党干事长。2004年1月，他决定派遣日本自卫队组成的伊拉克复兴支援群前往伊国南部的萨玛沃。2004年10月，恐怖份子在伊拉克日本人被绑架事件中要求「日本自卫队从伊拉克撤退」，但是小泉纯一郎不屈于「恐怖活动」而坚决拒绝伊恐要求。被绑架日本人质香田证生之后证实遭到杀害，在野党认为应该追究小泉的责任，但是许多日本人认为他不应该前往伊拉克。同年7月