变形菌门（Proteobacteria）是细菌中主要的一门，包括很多病原菌，如大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、绿脓杆菌、霍乱弧菌、鼠疫杆菌、脑膜炎双球菌、淋球菌、空肠弯曲菌、幽门螺杆菌等着名的属。也有自由生活（非寄生）的种类，包括很多可以进行固氮的细菌。卡尔·乌斯于1987年建立这个群组，非正式的称这是“紫细菌及其亲属”。变形菌门主要是由核糖体RNA序列定义的，名称取自希腊神话中能够变形的神普罗透斯（这同时也是变形菌门中变形桿菌属的名字），因爲该门细菌的形状具有极爲多样的形状。
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