熙年间（至少不晚于清朝干隆年间），清河镇居住的大批穆斯林集资兴建了一座规模较小的清真寺，起初位于原清河大桥南端。因桥南地势低洼，每年夏季河水上涨，清真寺周围时常积水。约清朝光绪二十七年（1901年），迁建到清河大桥北侧。迁建后的清真寺，主要建筑采用传统四合院布局，设有大门、二门、水房、礼拜大殿、南讲堂、北讲堂等建筑。民国二十九年（1940年），居住在清河镇的丁、高、李、夏、安、白等姓的穆斯林群众集资重修清河清真寺。中华民国时期，全国各地废除私塾，兴办学堂，北平的穆斯林聚居区马甸、清河、安河桥等地都在清真