于其钙化结构，珊瑚藻具有许多经济价值。于18世纪开始就有採集非附着的珊瑚藻（藻团粒）为土壤调理剂。在英国及法国，每年就有超过30万吨的"Phymatolithon calcareum"及"Lithothamnion corallioides"被挖出来。在巴西对出海岸的一些挖掘工作可以延绵几千公里。藻团粒也会被用作为欧洲牛及猪的食物添加剂，与及过泸酸性饮用水。在医药上最早使用珊瑚藻是作为驱虫药，于18世纪末停止了此种用途。现时会使用珊瑚藻来作为牙补骨。由于珊瑚藻含有碳酸钙，故化石化得较好，可以生成地层