后法军多次以小股兵力袭击，但皆被林朝栋击退。3月4日，法军派出1280名兵力再度攻打暖暖防线，双方爆发第二次月眉山战战役。这次法军截断清军战线，并一举攻佔月眉山顶，而以大砲轰炸林朝栋等营，最后清军溃败，仅有林朝栋率领乡勇稳住阵脚，成功协助清军主力撤退至基隆河南岸。而得胜的法军因弹药用完，且3月7日的大雨导致河水暴涨，因此未渡河攻入暖暖。之后，两军持续对峙，直到1885年6月13日法军撤离为止。5月12日，林朝栋因助战有功，被奖叙道员进先补用。虽然获得功勋不高，但此战表现深得刘铭传青睐，因此战后全台30多