染过程中，化学讯号使吞噬细胞前往病原体侵入处。这些化学物质可能来自细菌，也可能来自其它已经出现的吞噬细胞。吞噬细胞透过趋化作用进行移动。当吞噬细胞与细菌接触后，其表面的受体会与细菌结合，从而引导吞噬细胞将细菌吞噬，吞噬细胞随后利用活性氧类（ROS）以及一氧化氮杀死它所吞噬的细菌。在吞噬完成后，巨噬细胞以及树突状细胞亦可参与抗原呈现的过程。在该过程中，吞噬细胞吞噬物质后会将其一部分转移到细胞表面，随后这些物质会展现给其它免疫细胞。一些吞噬细胞会移动到生物体的淋巴结，并将上述物质呈现给淋巴细胞（一种白血球），此