为堕胎药、兴奋剂（因为用后会导致失眠和神经紧张），甚至毒药，若以粉状渗进食物则不易察觉。意大利美第奇家族的一位女伯爵 Toffana 研制的毒药「Aqua toffana （aquetta di Napoli）」，就是以砒霜和西班牙苍蝇混合而成。据说，在水和酒中加入4至6滴，服后数小时内便能无痛死亡。为了证明西班牙苍蝇令人致死的药效，他们会进行测试，其中一个方式是将中毒死者的内脏分解于油中，涂在兔的脸上，以观察兔子有否出现水泡。
毒性.芫菁有很强的肾毒性，属剧毒物品。实验显示：