校于1949年正式创校，主校舍为单层平顶建筑物，设有12个课室及礼堂（面积约3,600平方米）。开办初期向学生象征式收取每月港币$2学费，然而香港政府初期只全费协办上午校，下午校则名为红磡街坊公立学校，乃不同行政单位，却以资助性质协办，余下的经营费用由红磡街坊福利会筹集。由于早期学额有限，教育偏向精英制度而并非每个年级也可分成甲及乙两班。学校的一二年级各有三班，而三四年级各有两班，到了五六年级只筛选余一班，直到1950 年代后期才更改成每年级平均分成甲及乙两班。早期的船坞小学学生无需穿校服，直至196