朱物华受聘到上海交通大学电机系执教。中华人民共和国成立后，朱物华先后被任命为交通大学工学院院长、副教务长。1955年至1961年，朱物华北上哈尔滨担任哈尔滨工业大学教务长、副校长。1955年，中国科学院选聘他为学部委员（后改称为中国科学院院士）。文化大革命期间，朱物华被批斗为“反动学术权威”，受到冲击。文化大革命结束后，1978年，朱物华担任上海交通大学校长，在全校范围内开展了以管理体制改革为中心内容的全面改革。在他的推动下，学校恢复了教学研究科，成立了教学法委员会，推行贯彻因材施教的原则，抓点带面试行