产后，三菱导入推力式单排气管，让百式司侦的极速略增至642公里。但是Ki-46-III在8000-10000公尺的高空飞行性能大幅改善，使陆军在侦查上仍维持有足够优势。但这次的改良除了性能不足，也还是有其它缺点，新设计的机首玻璃品质不够好，夜航时会出现漫反射现象。此外因为再度增重，起落架的强度也有隐忧。本型号没有正式通过审查，因此在官方文书中没有四型的正式编号。该型号是改良引擎增压器，将原本的一段二速机械增压加挂涡轮增压器的两段二速ハ112-IIル，Ki-46-IV在1943年5月开始制造，1943年