无法返台。之后，获得美国田纳西大学政治学硕士，并于1969年取得美国南加州大学政治学博士，之后任教于美国纽约市立大学。在美期间，蔡同荣于1966年与陈以德、张灿鍙、罗福全等人成立全美台湾独立联盟。蔡同荣在美期间，曾为台湾争取到与其它国家同样每年享有二万名移民配额，并要求美国关切台湾民主与人权状况。1970年4月24日，行政院副院长蒋经国访问美国，遭康乃尔大学博士生黄文雄开枪行刺未遂，是为四二四刺杀蒋经国案；黄文雄当场被捕，但原约好要去行刺的蔡同荣不在场（后述）。1970年1月组成台湾独立建国联盟，蔡同荣也担