食脑变形虫感染甚少发生，症状与病毒性或细菌性脑膜炎非常相似，很难引起医护人员的注意，然而一旦发生，结果通常是死亡，其病死率高于95%。
前兆与症状.症状通常于感染后一到九天内出现（平均是5天）。 初期的症状包括：头痛、发烧、恶心、和呕吐。初期过后，第二期的症状会加上：背痛、颈部僵硬、味觉和嗅觉的改变、、幻觉、注意力不集中（难以专心）、肌肉失调、失去平衡、癫痫发作、和抽筋等脑炎症状。初期的症状出现之后，病程随即在未来三到七天内加速发展，死亡通常在初期的症状出现之后的七到十四天