旧教的德意志诸侯组织起来，成立「」，与新教同盟激烈的对立之后，他终在三十年战争大展拳脚：在战争的初期阶段，组织起2.4万傲视群邦的强大军队，成功夺取上普法尔茨领土和选帝侯的地位，这些是从1356年维特尔斯巴赫王朝分家以来一直由长系分支持有的上普法尔茨和选帝侯的地位。尽管其后新教瑞典军和反奥的法军加入三十年战争而使天主教军呈劣势，但最终在1648年，马克西米利安一世仍签署威斯特伐利亚和约保住了他的战果。但整个巴伐利亚，尤其是北部地区，在三十年战争中遭到了严重的破坏，譬如1632年瑞典人的入侵，以及1647