“德国舰炮之父”美誉的在巴伐利亚号舰上进行了首次远程射击实验。然而由于炮管高程不足（炮管撞到了顶部），射击未能达到预期的效果。1886年5月15日，舰只因应进行大型机件维修而暂时退役。此次维修除了更换鱼雷管外，还使巴伐利亚号成为了帝国海军第一艘搭载西门子和哈尔斯克电气内部照明的军舰。在当年的演习中，巴伐利亚号的三艘姊妹舰及新近入役的奥尔登堡号加入了新组建的演习分舰队（即公海舰队前身）第一总队。1887年，巴伐利亚号出席了连接基尔和北海的威廉皇帝运河开凿典礼。它于1888年重返现役，随即陪同新加冕的德皇威廉二