被纳粹德国占领，成立波希米亚和摩拉维亚保护国，斯洛伐克则成为纳粹德国之傀儡政权。二战后期1945年苏联佔领了捷克及斯洛伐克，二战之后建立了共产政权捷克斯洛伐克社会主义共和国。1948年2月，捷克斯洛伐克共产党开始实行事实上的一党专政。共产党第一书记安东宁·诺沃提尼和总书记古斯塔夫·胡萨克先后长期执政。1968年，捷克斯洛伐克发生要求民主改革的布拉格之春，但最后在苏联及华约成员包括波兰人民共和国、匈牙利人民共和国及德意志民主共和国的军事镇压下失败。直至1989年11月东欧民主化，捷克斯洛伐克最终透过天鹅绒革命