From: GenBank-Updates@net.bio.net
Newsgroups: bionet.molbio.genbank.updates
Subject: Porcine transmissible gastroenteritis RNA, complete cds.
Date: 3 Jan 93 22:08:24 GMT
Distribution: bionet
Checksum: 57259 9

LOCUS       PTGPRCVSF    4344 bp ss-RNA             VRL       21-DEC-1992
DEFINITION  Porcine transmissible gastroenteritis RNA, complete cds.
ACCESSION   M94101
KEYWORDS    .
SOURCE      Porcine transmissable gastroenteritis coronavirus (strain
            PUR46-MAD) RNA.
  ORGANISM  Porcine transmissable gastroenteritis coronavirus
            Viridae; ss-RNA enveloped viruses; Positive strand RNA virus;
            Coronaviridae.
REFERENCE   1  (bases 1 to 4344)
  AUTHORS   Sanchez,C.M., Gebauer,F., Sune,C., Mendez,A., Dopazo,J. and
            Enjuanes,L.
  TITLE     Genetic evolution and tropism of transmissible gastroenteritis
            coronaviruses
  JOURNAL   Virology 190, 92-105 (1992)
  STANDARD  full automatic
FEATURES             Location/Qualifiers
     CDS             1..4344
                     /gene="S"
                     /codon_start=1
                     /translation="MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNQWNLIETFLLNYS
                     SRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENITWNHRQR
                     LNVVVNGYPYSITVTTTRNFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTCNWGSECRLNHKF
                     PICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTFGDMRATTLEV
                     AGTLVDLWWFNPVYDVSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFS
                     FNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLN
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                     GDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSHVNNIKCSQITANLNNGFYPVSSS
                     EVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDHNTDVYC
                     IRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLDATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKF
                     CLSLSPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGVHDLSVLHLD
                     SCTDYNIYGRTGVGIIRQTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQ
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                     NRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFE
                     NYEPIEKVHVH"
BASE COUNT     1278 a    756 c    876 g   1433 t      1 others
ORIGIN      
        1 atgaaaaaac tatttgtggt tttggtcgta atgccattga tttatggaga caattttcct
       61 tgttctaaat tgactaatag aactataggc aaccagtgga atctcattga aaccttcctt
      121 ctaaactata gtagtaggtt accacctaat tcagatgtgg tgttaggtga ttattttcct
      181 actgtacaac cttggtttaa ttgcattcgc aatgatagta atgaccttta tgttacactg
      241 gaaaatctta aagcattgta ttgggattat gctacagaaa atatcacttg gaatcacaga
      301 caacggttaa acgtagtcgt taatggatac ccatactcca tcacagttac aacaacccgc
      361 aattttaatt ctgctgaagg tgctattata tgcatttgta agggctcacc acctactacc
      421 accacagaat ctagtttgac ttgcaattgg ggtagtgagt gcaggttaaa ccataagttc
      481 cctatatgtc cttctaattc agaggcaaat tgtggtaata tgctgtatgg cctacaatgg
      541 tttgcagatg aggttgttgc ttatttacat ggtgctagtt accgtattag ttttgaaaat
      601 caatggtctg gcactgtcac atttggtgat atgcgtgcga caacattaga agtcgctggc
      661 acgcttgtag acctttggtg gtttaatcct gtttatgatg tcagttatta tagggttaat
      721 aataaaaatg gtactaccgt agtttccaat tgcactgatc aatgtgctag ttatgtggct
      781 aatgttttta ctacacagcc aggaggtttt ataccatcag attttagttt taataattgg
      841 ttccttctaa ctaatagctc cacgttggtt agtggtaaat tagttaccaa acagccgtta
      901 ttagttaatt gcttatggcc agtccctagc tttgaagaag cagcttctac attttgtttt
      961 gagggtgctg gctttgatca atgtaatggt gctgttttaa ataatactgt agacgtcatt
     1021 aggttcaacc ttaattttac tacaaatgta caatcaggta agggtgccac agtgttttca
     1081 ttgaacacaa cgggtggtgt cactcttgaa atttcatgtt atacagtgag tgactcgagc
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     1201 cactataatg gcacagctct taagtattta ggaacattac cacctagtgt caaggagatt
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     1321 attgattgta tatcttttaa tttgaccact ggtgatagtg acgttttctg gacaatagct
     1381 tacacatcgt acactgaagc attagtacaa gttgaaaaca cagctattac aaaggtgacg
     1441 tattgtaata gtcacgttaa taacattaaa tgctctcaaa ttactgctaa tttgaataat
     1501 ggattttatc ctgtttcttc aagtgaagtt ggtcttgtca ataagagtgt tgtgttacta
     1561 cctagctttt acacacatac cattgttaac ataactattg gtcttggtat gaagcgtagt
     1621 ggttatggtc aacccatagc ctcaacatta agtaacatca cactaccaat gcaggatcac
     1681 aacaccgatg tgtactgtat tcgttctgac caattttcag tttatgttca ttctacttgc
     1741 aaaagtgctt tatgggacaa tatttttaag cgaaactgca cggacgtttt agatgccaca
     1801 gctgttataa aaactggtac ttgtcctttc tcatttgata aattgaacaa ttacttaact
     1861 tttaacaagt tctgtttgtc gttgagtcct gttggtgcta attgtaagtt tgatgtagct
     1921 gcccgtacaa gaaccaatga gcaggttgtt agaagtttgt atgtaatata tgaagaagga
     1981 gacaacatag tgggtgtacc gtctgataat agtggtgtgc acgatttgtc agtgctacac
     2041 ctagattcct gcacagatta caatatatat ggtagaactg gtgttggtat tattagacaa
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     2161 tttaaaaatg ttagtgatgg tgtcatctac tctgtaacgc catgtgatgt aagcgcacaa
     2221 gcagctgtta ttgatggtac catagttggg gctatcactt ccattaacag tgaactgtta
     2281 ggtctaacac attggacaac aacacctaat ttttattact actctatata taattacaca
     2341 aatgatagga ctcgtggcac tgcaattgac agtaatgatg ttgattgtga acctgtcata
     2401 acctattcta acataggtgt ttgtaaaaat ggtgcttttg tttttattaa cgtcacacat
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     2701 tccatgttgt ttgtttctga aaatgccctt aaattggcat ctgttgaagc attcaatagt
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