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Newsgroups: bionet.molbio.genbank.updates
Subject: Porcine respiratory coronavirus RNA, complete cds.
Date: 3 Jan 93 22:08:08 GMT
Distribution: bionet
Checksum: 59495 8

LOCUS       POIPRCVSB    3678 bp ss-RNA             VRL       21-DEC-1992
DEFINITION  Porcine respiratory coronavirus RNA, complete cds.
ACCESSION   M94097
KEYWORDS    .
SOURCE      Porcine respiratory coronavirus (strain HOL87) RNA.
  ORGANISM  Porcine respiratory coronavirus
            Viridae; ss-RNA enveloped viruses; Positive strand RNA virus;
            Coronaviridae.
REFERENCE   1  (bases 1 to 3678)
  AUTHORS   Sanchez,C.M., Gebauer,F., Sune,C., Mendez,A., Dopazo,J. and
            Enjuanes,L.
  TITLE     Genetic evolution and tropism of transmissible gastroenteritis
            coronaviruses
  JOURNAL   Virology 190, 92-105 (1992)
  STANDARD  full automatic
FEATURES             Location/Qualifiers
     CDS             1..3678
                     /gene="S"
                     /codon_start=1
                     /translation="MKKLFVVLVVMPLIYGDKFPTSVVSNCTDQCASYVANVFTTQPG
                     GFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGADFD
                     QCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDTVSDSSFS
                     SYGEIPFGVTNGPRYCYVLYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFP
                     IDCISFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITNVTYCNSYVNNIKCSQLTANL
                     NNGFYPVSSSEVGSVNKSVVLLPSFLTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLP
                     MQDNNTDVYCVRSDQFSVYVHSTCKSALWDNVFKRNCTDVLDATAVIKTGTCPFSFDK
                     LNNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDSIVGVPSDNSG
                     LHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIY
                     SVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTITPNFYYYSIYNYTNDKTRGTP
                     IDSNDVGCEPVITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVE
                     YIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEVDSMLF
                     VSENALKLASVEAFNSSETLDPIYTQWPNIGGFWLEGLKYILPSDNSKRKYRSAIEDL
                     LFSKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANADKMTMYTASLA
                     GGITLGAFGGGAVSIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILASAFNQAIGNITQSFG
                     KVNDAIHQTSRGLTTVAKALAKVQDVVNTQGQALRHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNR
                     LDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFG
                     FCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICALDGDRTFGLVVKDVQL
                     TLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNTTVSDLPSIIPDYIDINQ
                     TVQDILENFRPNWTVPELTLDVFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNI
                     NNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCC
                     HSIFSRRQFENYEPIEKVHVH"
BASE COUNT     1079 a    639 c    735 g   1225 t
ORIGIN      
        1 atgaaaaaat tatttgtggt cttggttgta atgccattga tttatggaga caagtttcct
       61 acttccgtag tttccaattg cactgatcaa tgtgctagtt atgtggctaa tgtttttact
      121 acacagccag gaggctttat accatcagat tttagtttta ataattggtt cctcctaact
      181 aatagctcca cgttggttag tggtaaatta gttaccaaac agcctctatt agttaattgc
      241 ttatggccag tccctagctt tgaagaagca gcttctacat tttgttttga aggtgctgac
      301 tttgatcaat gtaatggtgc tgttttaaat aacactgtag acgtcattag gttcaacctt
      361 aattttacta caaatgtaca atcaggtaag ggtgctacag tgttttcatt gaacacaacg
      421 ggtggtgtca ctcttgaaat ctcatgttat aatgatacag tgagtgattc gagtttttcc
      481 agttacggtg aaattccttt cggcgtaact aatggaccac ggtactgtta cgtactctat
      541 aatggcacag ctcttaagta tctaggaaca ttaccaccta gtgtcaagga gattgctatt
      601 agtaagtggg gccattttta tattaatggt tacaatttct ttagcacatt tcctattgat
      661 tgtatatctt ttaatttgac tactggtgat agtgacgtct tctggacaat agcttacaca
      721 tcgtacactg aagcattagt acaagttgaa aacacagcta ttacaaatgt gacgtattgt
      781 aatagttatg ttaataacat taaatgctct caacttactg ctaatttgaa taatggattt
      841 tatcctgttt cttcaagtga agttggttct gtcaataaga gtgttgtgtt actacctagc
      901 tttctgacac ataccattgt taacataact attggtcttg gtatgaagcg tagtggttat
      961 ggtcaaccca tagcctcaac gctaagtaac attacactac caatgcagga taacaacacc
     1021 gatgtgtact gtgttcgttc tgaccaattt tcagtttatg ttcattctac ttgcaaaagt
     1081 gctttatggg acaatgtttt taagcgaaac tgcacggacg ttttagatgc cacagctgtt
     1141 ataaaaactg gtacttgtcc tttctcattt gataaattga acaattactt aacttttaac
     1201 aagttctgtt tgtcgttgag tcctgttggt gctaattgta agtttgatgt agctgcccgt
     1261 accagaacca atgagcaggt tgttagaagt ttgtatgtaa tatatgaaga aggagacagc
     1321 atagttggtg taccgtctga caatagtggt ttgcacgatt tgtcagtgct acacctagat
     1381 tcgtgcacag attacaatat atatggtaga actggtgttg gtattattag acaaactaac
     1441 aggacgctac ttagtggctt atattacaca tcactatctg gtgatttgtt aggttttaaa
     1501 aatgttagtg atggtgttat ctactctgta acgccatgtg atgttagcgc acaagcagct
     1561 gttattgatg gtaccatagt tggggctatc acttccatta acagtgaatt gttaggtcta
     1621 acacattgga caataacacc taatttttat tactactcta tatataatta cacaaatgat
     1681 aagactcgtg gcactccaat tgacagtaat gacgttggtt gtgaacctgt cataacctat
     1741 tctaacatag gtgtttgtaa aaatggtgct ttggttttta ttaacgtcac acattctgat
     1801 ggagacgtgc aaccaataag cactggtaat gtcacgatac ctactaactt tactatatcc
     1861 gtgcaagtcg aatacattca ggtttacact acaccagtgt caatagactg ttcaagatat
     1921 gtttgtaatg gcaaccctag gtgtaacaaa ctgttaacac aatacgtttc tgcatgtcaa
     1981 actattgagc aagcacttgc aatgggtgcc agacttgaaa acatggaagt tgattccatg
     2041 ttatttgttt ctgaaaatgc ccttaaattg gcttctgttg aagcattcaa tagttcagaa
     2101 actttagatc ctatttacac acaatggcct aatataggtg gcttttggct agaaggtcta
     2161 aaatacatac ttccgtccga taatagcaaa cgtaagtatc gttcagctat agaggacttg
     2221 cttttttcta aggttgtaac atctggttta ggtacagttg atgaagatta caaacgttgt
     2281 acaggtggtt atgacatagc tgacttagta tgtgctcaat actataatgg catcatggtg
     2341 ctacctggtg tggctaatgc tgacaaaatg actatgtata cagcatccct cgcaggtggt
     2401 ataacattag gtgcatttgg tggaggcgcc gtgtctatac cttttgcagt agcagttcag
     2461 gctcgactta attatgttgc tctacaaact gatgtattga acaaaaacca gcagatcctg
     2521 gctagtgctt ttaatcaagc tattggtaac attacacagt catttggtaa ggttaatgat
     2581 gctatacatc aaacatcacg aggtcttaca actgttgcta aagcattggc aaaagtgcaa
     2641 gatgttgtca acacacaagg tcaagcttta agacacctaa cagtacaatt gcaaaataat
     2701 ttccaagcca ttagtagttc tattagtgac atttataata ggcttgatga attgagtgct
     2761 gatgcacaag tcgacaggct gatcacagga agacttacag cacttaatgc atttgtgtct
     2821 cagactctaa ccagacaagc cgaggttagg gctagtagac aacttgctaa agacaaggtt
     2881 aatgaatgcg ttaggtctca gtctcagaga ttcggcttct gtggtaatgg tacacatttg
     2941 ttttcactcg caaatgcagc accaaatggc atgatcttct ttcacacagt gctattacca
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     3061 tttggacttg tcgttaaaga tgtccagttg actttatttc gtaatctaga tgacaagttc
     3121 tatttgacac ccagaactat gtatcagcct agagtggcaa ctagttctga ttttgttcaa
     3181 attgaagggt gcgatgtgct gtttgttaat acaactgtaa gtgatttgcc tagtattata
     3241 cctgattata ttgatattaa tcagactgtt caagacatat tagaaaattt tagaccaaat
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     3361 gaaattgatg acttagagtt taggtcagaa aagctacata acactactgt agaacttgcc
     3421 attctcattg acaacattaa caatacatta gtcaatcttg aatggcttaa tagaattgaa
     3481 acctatgtaa aatggccttg gtatgtgtgg ctactaatag gcttagtagt aatattttgc
     3541 ataccattac tgctattttg ctgttgtagt acaggttgct gtggatgtat aggttgttta
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     3661 aaagtgcacg tccattaa
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