From: GenBank-Updates@net.bio.net
Newsgroups: bionet.molbio.genbank.updates
Subject: Amsacta entomopoxvirus spheroidin gene, complete cds, and four
Date: 22 Jan 93 19:46:10 GMT
Distribution: bionet
Checksum: 18620 17

LOCUS       AAVSPHERE    8457 bp ds-DNA             VRL       21-JAN-1993
DEFINITION  Amsacta entomopoxvirus spheroidin gene, complete cds, and four
            vaccinia related orfs.
ACCESSION   M77182 L02637
KEYWORDS    spheroidin.
SOURCE      Entomopoxvirus DNA.
  ORGANISM  Entomopoxvirus
            Viridae; ds-DNA enveloped viruses; Poxviridae.
REFERENCE   1  (sites)
  AUTHORS   Hall,R.L. and Moyer,R.W.
  TITLE     Identification, cloning, and sequencing of a fragment of Amsacta
            moorei entomopoxvirus DNA containing the spheroidin gene and three
            vaccinia virus-related open reading frames
  JOURNAL   J. Virol. 65, 6516-6527 (1991)
  STANDARD  full automatic
REFERENCE   2  (sites)
  AUTHORS   Hall,R.L. and Moyer,R.W.
  TITLE     Identification of an Amsacta spheroidin-like protein within the
            occlusion bodies of Choristoneura entomopoxviruses
  JOURNAL   Virology 192, 179-187 (1993)
  STANDARD  full automatic
COMMENT     [1] (reports bases 1 to 6768) [Unpublished (1992)] (reports bases
            6769 to 8457).
FEATURES             Location/Qualifiers
     misc_signal     1471..1476
                     /note="taaatg motif"
     misc_signal     3077..3082
                     /standard_name="late transcriptional start signal"
                     /evidence="EXPERIMENTAL"
                     /note="taaatg motif"
     misc_signal     complement(8221..8227)
                     /note="taaatg motif"
     CDS             complement(65..1459)
                     /note="vaccinia virus ORF I7 homolog;  G1L ORF"
                     /codon_start=1
                     /translation="MNNKIRRFPNKNLKMPESGINFMSMLFFSKIDNMVYFINPIKYN
                     TNANIAILEKIDDDDETRGKVTFIPIKYLEILYNELVLDPNHINNINFENNIKRKFFL
                     FWTIKKYLQDKNININTFITSKKYKGIPLVYMRKSFLKSELSKTRDFSTFATIYDDLD
                     AQIGIPPLGFNPKPKAYPRKHDKSTWLSSGDIYNCIYPLTMINTDYDYFHLILFEKTD
                     KNIATVASSMRCYKLEDRVKFFLMNDKKRFFMFPIIYNDHFTCCVIDKHFDKDKKAAY
                     FFNSSGYIPELIKQNKKYMFIESDMTIKSHKHYNSTPNTNYAYLYIDVLSEYLNDIFK
                     NVNYYFFNTFELQYDSPDCGMFNIIFLYYIVYFNIKSKFEFKKLYYSMSFIGDLLASS
                     YRGALFISRYDINSIDEFKNTLEIFNIKNKKFMELIDMYKKNSNRIMNVCSKIKNDYD
                     SYIDNEKNSLESNI"
     CDS             1474..2151
                     /note="G2R ORF"
                     /codon_start=1
                     /translation="MFLVYFNTFLIIILLFGIIGIYILTFVFNIDFLINNNKIYILSY
                     NATNINNINNLNLYDYSDIIFLTNFNINNNLLVTQANNLQDIPIFNVNNIISNQYNFY
                     SASSNNVNILLGLRKTLNINRNPFLLFRNTSLAIVFNNNETFHCYISSNQNSDVLDIV
                     SHIEFMKSRYNKYVIIGEIPVNNNISINNILNNFAIITNVRLIDKYNSIISFLNINVG
                     TLFVINP"
     CDS             complement(2239..2475)
                     /note="G3L ORF"
                     /codon_start=1
                     /translation="MSSSKKNNLGYFNNLKTEEVSQSQVFKDNYRPGYYGLDTNAANP
                     ADVYNTESNKPSTVDVWGDKRLEGKIIPKSKKKK"
     CDS             2502..2987
                     /note="capripoxvirus HM3 ORF homolog;  G4R ORF"
                     /codon_start=1
                     /translation="MSIFIYYIFNNRFYIYKRMNTVQILVVILITTALSFLVFQLWYY
                     AENYEYILRYNDTYSNLQFARSANINFDDLTVFDPNDNVFNVEEKWRCASTNNNIFYA
                     VSTFGFLSTESTGINLTYTNSRDCIIDLFSRIIKIVYDPCTVETSNDCRLLRLLMANT
                     S"
     CDS             3080..6091
                     /function="'major structural protein of the occlusion
                     body'"
                     /evidence="EXPERIMENTAL"
                     /note="'G5R ORF'"
                     /product="spheroidin"
                     /codon_start=1
                     /translation="MSNVPLATKTIRKLSNRKYEIKIYLKDENTCFERVVDMVVPLYD
                     VCNETSGVTLESCSPNIEVIELDNTHVRIKVHGDTLKEMCFELLFPCNVNEAQVWKYV
                     SRLLLDNVSHNDVKYKLANFRLTLNGKHLKLKEIDQPLFIYFVDDLGNYGLITKENIQ
                     NNNLQVNKDASFITIFPQYAYICLGRKVYLNEKVTFDVTTDATNITLDFNKSVNIAVS
                     FLDIYYEVNNNEQKDLLKDLLKRYGEFEVYNADTGLIYAKNLSIKNYDTVIQVERLPV
                     NLKVRAYTKDENGRNLCLMKITSSTEVDPEYVTSNNALLGTLRVYKKFDKSHLKIVMH
                     NRGSGNVFPLRSLYLELSNVKGYPVKASDTSRLDVGIYKLNKIYVDNDENKIILEEIE
                     AEYRCGRQVFHERVKLNKHQCKYTPKCPFQFVVNSPDTTIHLYGISNVCLKPKVPKNL
                     RLWGWILDCDTSRFIKHMADGSDDLDLDVRLNRNDICLKQAIKQHYTNVIILEYANTY
                     PNCTLSLGNNRFNNVFDMNDNKTISEYTNFTKSRQDLNNMSCILGINIGNSVNISSLP
                     GWVTPHEAKILRSGCARVREFCKSFCDLSNKRFYAMARDLVSLLFMCNYVNIEINEAV
                     CEYPGYVILFARAIKVINDLLLINGVDNLAGYSISLPIHYGSTEKTLPNEKYGGVDKK
                     FKYLFLKNKLKDLMRDADFVQPPLYISTYFRTLLDAPPTDNYEKYLVDSSVQSQDVLQ
                     GLLNTCNTIDTNARVASSVIGYVYEPCGTSEHKIGSEALCKMAKEASRLGNLGLVNRI
                     NESNYNKCNKYGYRGVYENNKLKTKYYREIFDCNPNNNNELISRYGYRIMDLHKIGEI
                     FANYDESESPCERRCHYLEDRGLLYGPEYVHHRYQESCTPNTFGNNTNCVTRNGEQHV
                     YENSCGDNATCGRRTGYGRRSRDEWNDYRKPHVYDNCADANSSSSDSCSDSSSSSESE
                     SDSDGCCDTDASLDSDIENCYQNPSKCDAGC"
     CDS             complement(6277..8223)
                     /note="NPH I homolog of Choristoneura biennis
                     entomopoxvirus;  G6L ORF"
                     /codon_start=1
                     /translation="MFALDSIVGKHINYALDKTQHLPNKIMNNITNTEITLQDYQYFV
                     SRIFIGLKNLNSMLLFWDTGMGKTLTAVYIIKYIKELFPRWIILIFIKKSLYIDPWLN
                     TIRSYISDTSNIKFIYYDSSSSLDKFNNIYRSIESSLNKKSRLLIIIDEVHKLISRTV
                     KKDNNERNFTPIYKKLIKLANFENNKILCMSATPVTNNISEFNNLIGLLRPNVMNIKE
                     EYINNGKLINFKELRETLLAICSYKRLIEADSLTETNYIDGYAKKNIFYHNIIMSDEQ
                     SKLYNMAEKYDYKTELGGLKTMRRLISSFAFYDLKIKGDLDNIEYNDMIKRKLAEFSE
                     FTKNINFSESFIESFKNDNIKIKTNLPITDINNYNILYQYSCKYIETCKIILNSRGKV
                     LIFEPLVNFEGISSLKCYFNCFNISYIEYSSKTLKTRDNELNEYNNYENNNGKKVKVC
                     IFSYAGSEGISFKCINDIIILDMPWNESELKQIIGRSIRLNSHKDLPQEYRYVNVHFL
                     ISYTNNRKSVDKEILDIIKDKQGKINVIFDLLKSSSIESIHNTYKYIEPAENEIIFDT
                     IRKTRMKEMNVSNVIINIKLYPISYCKDYDRATILKGLLNKDTNIVYKDNTAVAKLMI
                     DKDNIPIFIIENDTLIYIADDYYE"
BASE COUNT     3173 a    951 c   1006 g   3327 t
ORIGIN      
        1 agatctgatg ttctatatat agtacaaatt tgtatgatta attgatattt taaaattcaa
       61 gatattaaat attagattct aaactattct tctcattatc aatataacta tcataatcat
      121 tttttatttt actacataca ttcataattc tattactatt ttttttatac atatctatta
      181 attccataaa ctttttattt tttatattaa atatttctaa tgtattttta aattcgtcaa
      241 tactattaat atcatatcta gaaataaata atgcacctct ataactacta gccaataaat
      301 caccaataaa actcatagaa taatataatt ttttaaattc aaatttagat tttatgttga
      361 aataaactat ataatataaa aatattatat taaacatacc acaatcggga ctatcatatt
      421 gtaattcaaa agtattaaaa aagtaataat ttacattttt aaatatatca tttaaatatt
      481 ctgatagtac atcaatgtat aaataagcat aattagtatt aggagtacta ttgtagtgtt
      541 tatggctttt tatagtcata tcagattcaa taaacatata ttttttattt tgttttataa
      601 gttctggtat ataaccacta ctattaaaaa agtatgcagc ttttttatct ttatcaaagt
      661 gtttatctat tacgcaacaa gtaaaatgat cattataaat tataggaaac ataaaaaatc
      721 tttttttatc attcattaaa aaaaatttta ctctatcttc aagtttatag catctcatag
      781 atgaagctac tgtagcaata tttttatcag ttttttcaaa taaaatcaaa tgaaaataat
      841 cataatctgt attaatcata gttaatggat atatacaatt atatatatct cccgaactta
      901 accatgtaga tttatcatgt tttcttgggt aagctttagg tttaggatta aatcccaaag
      961 gcggtattcc tatttgagca tccaaatcat cataaattgt ggcaaatgta gaaaaatctc
     1021 ttgttttgga taattctgat tttagaaaag actttctcat atatactaat ggaatgcctt
     1081 tatatttttt agatgtaata aaagtattaa tatttatatt tttatcttgt aaatattttt
     1141 ttatagtcca aaatagaaaa aattttcttt taatattatt ttcaaaatta atattattaa
     1201 tatgatttgg atctaaaact aattcattat ataatatttc caagtatttt ataggtataa
     1261 atgttacttt acctcttgtt tcatcatcat catctatttt ttctaatata gctatatttg
     1321 cattagtatt atatttaata ggatttataa aatataccat attatctatt ttactaaaaa
     1381 ataacataga cataaaatta ataccagatt ctggcatttt taaattttta tttggaaatc
     1441 ttctaatttt attattcatt atttatttaa taaatgtttc tagtttattt caatacattt
     1501 ttaataataa ttttattatt tggtattata ggtatttata tattaacatt tgtgtttaat
     1561 atagattttt taataaataa taataaaata tatatattat catataacgc aactaatata
     1621 aacaatataa ataatttaaa tttatacgat tattcagata ttatattttt gacaaatttt
     1681 aacataaata ataatctttt agtaacacaa gctaataatt tacaagatat accaatattt
     1741 aatgtaaata atattatatc taatcaatat aatttttatt cagcgtctag taataatgta
     1801 aatatattat taggattaag aaaaacatta aatataaata gaaatccatt tttattattt
     1861 agaaatacat ctctagctat agttttcaat aataatgaaa cttttcactg ttatataagt
     1921 tcaaatcaaa atagtgatgt attagatata gtatcacata tagaatttat gaaatctaga
     1981 tataataaat atgtaattat aggagaaata cccgtaaata ataatatatc tattaataat
     2041 atattaaata attttgctat tataactaat gtgagattaa tagataaata taactctata
     2101 atatcatttt taaatatcaa cgtaggaaca ctttttgtca taaatccata atatttagta
     2161 ataatcacta acatattttt tattaaaatg aataaaatat atattgttat tgtcaatatt
     2221 ttatatcatt ttacagtctt attttttttt tttgctttta ggtataattt taccttctaa
     2281 acgtttatct ccccaaacat ctacagtaga tggtttatta gattctgtgt tatacacatc
     2341 tgctggattt gcggcatttg tatccaaacc ataatatcca ggtctataat tatctttaaa
     2401 aacttgggat tgagatactt cttcagtttt taaattatta aaatatccaa gattattttt
     2461 ttttgatgaa gacataattg atattataat actttataga tatgtcaata tttatctact
     2521 atattttcaa caatagattt tatatatata aaagaatgaa tactgtacaa attttagttg
     2581 tcatattaat aacaacagca ttatcttttc tagtttttca attatggtat tatgccgaaa
     2641 attacgaata tatattaaga tataatgata catattcaaa tttacaattt gcgagaagcg
     2701 caaatataaa ttttgatgat ttaactgttt ttgatcccaa cgataatgtt tttaatgttg
     2761 aagaaaaatg gcgctgtgct tcaactaata ataatatatt ttatgcagtt tcaacttttg
     2821 gatttttaag tacagaaagt actggtatta atttaacata tacaaattct agagattgta
     2881 ttatagattt attttctaga attataaaaa tagtatatga tccttgtact gtcgaaacat
     2941 ctaacgattg tagattatta agattattga tggccaatac atcataaata cattataata
     3001 ttattataat atcaatcata atttttatat atattttatc taaaaggact ttttattttt
     3061 tatatattaa taataataaa tgagtaacgt acctttagca accaaaacaa taagaaaatt
     3121 atcaaatcga aaatatgaaa taaagattta tttaaaagat gaaaatactt gtttcgaacg
     3181 tgtagtagat atggtagttc cattatatga tgtgtgtaat gaaacttctg gtgttacttt
     3241 agaatcatgt agtccaaata tagaagtaat tgaattagac aatactcatg ttagaatcaa
     3301 agttcacggc gatacattaa aagaaatgtg ttttgaatta ttgttcccgt gtaatgtaaa
     3361 cgaagcccaa gtatggaaat atgtaagtcg attattgcta gataatgtat cacataatga
     3421 cgtaaaatat aaattagcta attttagact gactcttaat ggaaaacatt taaaattaaa
     3481 agaaatcgat caaccgctat ttatttattt tgtcgatgat ttgggaaatt atggattaat
     3541 tactaaggaa aatattcaaa ataataattt acaagttaac aaagatgcat catttattac
     3601 tatatttcca caatatgcgt atatttgttt aggtagaaaa gtatatttaa atgaaaaagt
     3661 aacttttgat gtaactacag atgcaactaa tattacttta gattttaata aatctgttaa
     3721 tatcgcagta tcattccttg atatatatta cgaagttaat aataatgaac aaaaagattt
     3781 attaaaagat ttacttaaga gatacggtga atttgaagtc tataacgcag atactggatt
     3841 aatttatgct aaaaatctaa gtattaaaaa ttatgatact gtgattcaag tagaaaggtt
     3901 gccagttaat ttgaaagtta gagcatatac taaggatgaa aatggtcgca atctatgttt
     3961 gatgaaaata acatctagta cagaagtaga ccccgagtat gtaactagta ataatgcttt
     4021 attgggtacg ctcagagtat ataaaaagtt tgataaatct catttaaaaa ttgtaatgca
     4081 taacagagga agtggtaatg tatttccatt aagatcatta tatctggaat tgtctaatgt
     4141 aaaaggatat ccagttaaag catctgatac ttcgagatta gatgttggta tttacaaatt
     4201 aaataaaatt tatgtagata acgacgaaaa taaaattata ttggaagaaa ttgaagcaga
     4261 atatagatgc ggaagacaag tattccacga acgtgtaaaa cttaataaac accaatgtaa
     4321 atatactccc aaatgtccat tccaatttgt tgtaaacagc ccagatacta cgattcactt
     4381 atatggtatt tctaatgttt gtttaaaacc taaagtaccc aaaaatttaa gactttgggg
     4441 atggatttta gattgcgata cttctagatt tattaaacat atggctgatg gatctgatga
     4501 tttagatctt gacgttaggc ttaatagaaa tgatatatgt ttaaaacaag ccataaaaca
     4561 acattatact aatgtaatta tattagagta cgcaaataca tatccaaatt gcacattatc
     4621 attgggtaat aatagattta ataatgtatt tgatatgaat gataacaaaa ctatatctga
     4681 gtatactaac tttacaaaaa gtagacaaga ccttaataac atgtcatgta tattaggaat
     4741 aaacataggt aattccgtaa atattagtag tttgcctggt tgggtaacac ctcacgaagc
     4801 taaaattcta agatctggtt gtgctagagt tagagaattt tgtaaatcat tctgtgatct
     4861 ttctaataag agattctatg ctatggctag agatctcgta agtttactat ttatgtgtaa
     4921 ctatgttaat attgaaatta acgaagcagt atgcgaatat cctggatatg tcatattatt
     4981 cgcaagagct attaaagtaa ttaatgattt attattaatt aacggagtag ataatctagc
     5041 aggatattca atttccttac ctatacatta tggatctact gaaaagactc taccaaatga
     5101 aaagtatggt ggtgttgata agaaatttaa atatctattc ttaaagaata aactaaaaga
     5161 tttaatgcgt gatgctgatt ttgtccaacc tccattatat atttctactt actttagaac
     5221 tttattggat gctccaccaa ctgataatta tgaaaaatat ttggttgatt cgtccgtaca
     5281 atcacaagat gttctacagg gtctgttgaa tacatgtaat actattgata ctaatgctag
     5341 agttgcatca agtgttattg gatatgttta tgaaccatgc ggaacatcag aacataaaat
     5401 tggttcagaa gcattgtgta aaatggctaa agaagcatct agattaggaa atctaggttt
     5461 agtaaatcgt attaatgaaa gtaattacaa caaatgtaat aaatatggtt atagaggagt
     5521 atacgaaaat aacaaactaa aaacaaaata ttatagagaa atatttgatt gtaatcctaa
     5581 taataataat gaattaatat ccagatatgg atatagaata atggatttac ataaaattgg
     5641 agaaattttt gcaaattacg atgaaagtga atctccttgc gaacgaagat gtcattactt
     5701 ggaagataga ggtcttttat atggtcctga atatgtacat cacagatatc aagaatcatg
     5761 tacgcctaat acgtttggaa ataacacaaa ttgtgtaaca agaaatggtg aacaacacgt
     5821 atacgaaaat agttgtggag ataatgcaac atgtggaaga agaacaggat atggaagaag
     5881 aagtagggat gaatggaatg actatagaaa accccacgtt tatgacaatt gtgccgatgc
     5941 aaatagttca tcttcagata gctgttcaga cagtagtagt agtagtgaat ctgaatctga
     6001 ttcagatgga tgttgcgaca cagatgctag tttagattct gatattgaaa attgttatca
     6061 aaatccatca aaatgtgatg caggatgcta aatgaaattt aatattatat aatattaact
     6121 tacaagttat aaaaatcatt aaaatgattt tttaaaatga tattatcgat agttgtgata
     6181 atgtgctctt ttattttatt aattgcgatg attataatat tatcttttag atatatttaa
     6241 tattaattat aaatcgactg acaataatat ttattcctat tcataataat catctgctat
     6301 atatattaat gtatcattct ctattataaa tataggtata ttgtctttat caatcattaa
     6361 ttttgctaca gctgtattat ctttatatac tatatttgtg tctttgttta ataaaccttt
     6421 taatatagtg gctctatcat aatctttaca atatgatatg ggatataatt ttatattaat
     6481 aataacatta gatacgttca tttctttcat tctagtttta cgtattgtgt caaaaattat
     6541 ttcattttct gctggttcta tatatttata tgtgttatga atagattcga tagatgatga
     6601 ttttaataaa tcaaatataa catttatttt accttgttta tcttttataa tatctaatat
     6661 ttctttatct acagattttc tgttgttggt atatgatatt aaaaaatgaa cgttaacata
     6721 tctatattct tgtggtaaat ctttatgaga atttaatctt atagatcttc ctattatttg
     6781 ttttaattct gattcattcc acggcatatc taatataatt atatcattaa tacatttgaa
     6841 tgatatgcct tcagatccag cgtaagaaaa tatgcaaact tttacttttt taccattatt
     6901 attttcataa ttattatatt cgtttaattc attatctcta gtttttaaag ttttgctaga
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