Concernant les réfs décalées, je comprends mieux votre interrogation, et effectivement je constate aussi le décalage en modification "visuelle" (je ne modifie que via le code, qui est moins lisible mais plus efficace). Cependant, je ne vois pas de problème : il suffit de cliquer sur une référence pour qu'elle s'affiche, sans avoir à la chercher dans les notes de bas de page, puis de cliquer sur "Modifier" si besoin  ce n'est pas ainsi chez vous ?