Frankrike internationella Sissoko, 27, gjorde inte ens bänken för Spurs 2-1 nederlag i Chelsea på lördag.
"Fotboll handlar inte om pengar", sade Pochettino.
"Du måste visa på träningsplatsen att du är bättre än en annan lagkamrat och du förtjänar att vara inblandad."
Sissoko gick med i Spurs på ett femårigt kontrakt efter att de matchat Evertons bud på transferdag i september.
Han har gjort fem starter i alla tävlingar, plus fem fler framträdanden som ersättning.
Han har dock inte spelat i Premier League sedan han fick ett tre-match förbud för armbåge Bournemouths Harry Arter den 22 oktober.
Den tidigare Toulouse spelaren missade EFL Cup slips mot Liverpool samt ligamatcher mot Leicester och Arsenal, men var inte inblandad mot West Ham den 19 november.
"Om du signerar en spelare och du förväntar dig något och du inte hittar vad du förväntar dig och om en annan förtjänar att vara involverad, som (Georges-Kevin) Nkoudou eller (Vincent) Janssen - varför? Eftersom vi betalade pengar måste vi sätta spelaren att spela?" tillade Argentine Pochettino.
"Självklart måste han arbeta hårt och visa i framtiden att han förtjänar att vara med i laget.
"Jag måste fatta ett beslut och jag tror att spelarna som börjar på bänken förtjänar att vara inblandade."
Tottenham midfielder Moussa Sissoko har misslyckats med att leva upp till förväntningarna efter hans 30 miljoner pund flytt från Newcastle, säger manager Mauricio Pochettino.