NFU Skottland har uppmanat ett skotskt parlamentsutskott att hålla ett extra sammanträde i frågan.
Unionen sade att den inte trodde utbetalningar enligt det nya systemet för grundstöd skulle levereras i den normala december fönster.
Den skotska regeringen sade att det fortsatte "att arbeta platt" mot att börja betalningar i slutet av 2015.
Systemet med grundstöd är det viktigaste EU-stöd som finns tillgängligt för jordbrukare i Skottland och tilldelas av den skotska regeringen efter reformer av den gemensamma jordbrukspolitiken.
NFU Skottland sade att "trots skotska regeringens uttalanden om motsatsen", trodde man inte att det var "sannolikt" att betalningar skulle levereras i december.
Man vill nu att jordbruksminister Richard Lochhead ska göra ett offentligt uttalande om när jordbrukarna kommer att få sina betalningar och vad deras värde kommer att bli.
Unionen har också skrivit till utskottet för landsbygdsfrågor, klimatförändringar och miljö och bett den att hålla ett extraordinärt möte för att fastställa den förväntade tidsplanen för betalningar.
NFU Scotland president Allan Bowie, sade: "Whilst kabinett sekreterare har försökt dämpa rädsla för att betalningsschemat kommer att halka, har den skotska regeringens budskap förändrats från betalningar som levereras i "tidiga december" till "slutet av december", och vi är nu övertygade om att dessa betalningar kommer att göras först 2016.
"Vi noterar också med intresse att... Rural Payments Agency gjorde ett otvetydigt uttalande... att det kommer att börja betala det nya grundbetalningssystemet i sin helhet till jordbrukare i England i december, med de flesta som erhåller utbetalning i slutet av den månaden och de allra flesta betalningar som är avslutade i slutet av januari.
"Skottiska jordbrukare och torpare - och alla dem som tillhandahåller varor och tjänster till våra sektorer - skulle ha stor nytta av ett liknande tydligt uttalande om betalningstidtabeller för Skottland så att de kan planera sin verksamhet i enlighet med detta."
Under tiden meddelade herr Lochhead att jordbrukare och andra markförvaltare kommer att börja få sin andel på 6,7 miljoner pund av stödet för landsbygdsutveckling från och med nästa vecka.
Han sade att den skotska regeringens avdelning för landsbygdsbetalningar och inspektioner hade börjat behandla mer än 5 000 markförvaltare Alternativbetalningar som omfattar 2014.
Systemet stöder miljöåtgärder inom jordbruket samt åtgärder för djurhälsa och djurskydd.
Den stora majoriteten av utbetalningarna från LMO förväntas betalas inom två veckor.
Joachim Lochhead sade: "Dagens tillkännagivande visar hur den skotska regeringen levererar till Skottlands jordbrukare när vi tar itu med utmaningen med att genomföra den största reformen av den gemensamma jordbrukspolitiken under en generation.
"Vi fortsätter att arbeta plant för att kunna börja göra basbetalningar i slutet av året."
Pressen ökar på den skotska regeringen att bekräfta när EU:s stödbetalningar kommer att levereras till jordbrukarna.