AFB bekräftades på bigården i Scaniport, nära Inverness, på fredag.
Det finns ingen tillåten behandling i Storbritannien för sjukdomen, som dödar bilarver.
Den skotska regeringen sade att det fanns ett förbud mot förflyttning av bin och tillhörande utrustning från det drabbade området.
En bikupa av honungsbin har förstörts vid en bigård i höglandet efter det att insekterna befunnits vara smittade med sjukdomen, American Foulbrood (AFB).