Robert Huey talade efter ett misstänkt fall av "galen kosjukdom" identifierades i Republiken Irland.
Ytterligare tester genomförs, men om det bekräftas skulle det vara det första fallet med BSE (bovin spongiform encefalopati) i Irland sedan 2013.
Huey sade trots utvecklingen att det var som vanligt för nötköttsindustrin i Nordirland.
"Kontrollerna vi har på plats är robusta och ser till att nötkött från norr är säkert att äta", sade han.
"Det är väldigt mycket bara affärer som vanligt. Vi har våra kontroller, vi har våra kontroller av köttväxter, vi har våra kontroller av kött- och benmjöl, vi har vår övervakning och dessa är robusta.
"De är samma kontroller som skyddar folkhälsan och djurhälsan i hela Europa och jag är säker på att de är tillräckliga för att se till att de, om det händer, är sporadiska och bara en engångsföreteelse."
Det djur som är inblandat i incidenten i Republiken Irland är en femårig ko från en mjölkgård i länet Louth.
Det irländska jordbruks-, livsmedels- och marinministeriet (DAFM) sade att kon inte var framlagd för slakt och inte gick in i näringskedjan.
Huey sade att det visade sig att de befintliga skyddsåtgärderna var effektiva.
"Det bevisar att den övervakning som finns i hela Europa faktiskt fungerar", sade han.
"Vi har alltid misstänkt att det kan vara ett enstaka sporadiskt utbrott i ett enskilt djur och det är vad vi verkar ha här."
Chefsveterinären för Nordirland har sagt att NI-kött är säkert att äta.