UKIP-ledaren twittrade om att han stod stilla i 90 minuter medan han var på väg till torsdagens show i Bradford.
Motorvägarna i England sa att A1:an var stängd i Nottinghamshire efter en dödlig krasch.
Under 2014 missade Farage en UKIP-konferens efter att ha fastnat i trafiken på M4, som han skyllde på höga invandringsnivåer.
En talesman för UKIP sade på torsdag Mr Farage skulle köras från sitt hem i Kent till showen, som vanligtvis börjar filma omkring 20:30.
Han twittrade klockan 19:35 GMT: "Nu har varit i ett stillestånd i 90 minuter på A1. Det är tveksamt. Jäklar."
Uppdateringar från denna berättelse och mer från Nottinghamshire
Han ersattes i showen av sin vice ledare Paul Nuttall, som reste från Liverpool för att möta energiminister Amber Rudd, Labour's Shabana Mahmood, Lib Dem president Baroness Brinton och politisk journalist Isabel Oakeshott.
Det var den första stora TV-debatten efter tillkännagivandet av David Camerons förslag till EU-reformförslag.
Frågestund producenter twittrade: "Vi gjorde planer för @Nigel_Farage - men reseproblem innebär att han kommer att ersättas av @paulnuttallukip. #bbcqt."
Trots den sena line-up-ändringen sändes showen kl. 22.45, med början i en fråga om Camerons EU-reformer.
Nigel Farage skyllde på sitt misslyckande med att komma till ett mottagande med anhängare i Wales 2014 om "invandring via öppen dörr".
"Det tog mig sex timmar och 15 minuter att komma hit - det borde ha tagit tre och en halv till fyra," sade han på den tiden.
På dagen för 2010 års allmänna val var Farage inblandad i en flygolycka som lämnade honom med brutna revben.
Torsdagens förseningar kom när A1 stängdes norrut vid Coddington efter kraschen omkring 17:30, där en man dödades.
Nigel Farage missade ett framträdande på BBC Question Time efter att ha fastnat i en trafikstockning på A1.