Norra delen genomför höjningar på upp till 50 pt från den 21 maj till "ta med biljettpriser i linje med andra områden".
RMT facket sade att de "senaste biljettpriser dra av är bara ett annat exempel på kostnader som flyttas" till passagerare.
Norr, som har infört ökningar sedan september 2016, sade priser i området har varit "historiskt låga".
Järnvägsoperatören sade att det skulle bli en ökning "på högst 50 p" på majoriteten av lågtrafikdagsreturer och singlar för resor som görs inom Greater Manchester.
Det sade att det inte skulle bli någon förändring till när som helst dag singel, när som helst dag retur eller veckovis säsong biljetter och Transport för större Manchester koncessioner.
Det skulle bli sänkningar på vissa biljetter, tillade den.
Norr sade att höjningarna skulle göra biljettpriserna "rättvisa och konsekventa" över hela nätet.
RMT:s generalsekreterare Mick Cash sa: "De senaste priserna är bara ännu ett exempel på att industrikostnaderna flyttas över till passageraren."
Rochdale fullmäktigeledamot Andy Kelly sa att vandringen var "den stora järnvägen slits av" och skulle "påverka de fattigaste".
"Många pendlare säger mig att de har ändrat sina skiftmönster för att dra nytta av off-peak rabatter."
Norr sade att reseökningarna skulle gå mot sitt moderniseringsprogram som kommer att se till att det blir av med Pacer tåg till 2020.
Järnvägsarbetarna på norra, södra och Merseyrail har strejkat med det senaste den 8 april om förslag på endast förarstyrda tåg.
Järnvägspriserna för vissa off-peak nordliga tjänster i Greater Manchester kommer att höjas med upp till 10 procent - den tredje ökningen under det senaste året.