Mer än 220 miljoner människor immuniserades över 16 länder i kontinentens hjärnhinneinflammationsbälte.
År 2013 fanns det bara fyra fall i hela regionen, som en gång om året drabbades av tusentals dödsfall.
Det finns dock nya varningar från Världshälsoorganisationen om att "flyktiga epidemier" skulle kunna återvända om inte ett nytt vaccinationsprogram inleds.
Bältet för hjärnhinneinflammation sträcker sig över Afrika söder om Sahara från Gambia i väster till Etiopien i öster.
I den värsta epidemin, 1996-97, svepte sjukdomen över bältet och smittade mer än en kvarts miljon människor och ledde till 25 000 dödsfall.
Till skillnad från andra vacciner utformades MenAfriVac speciellt för Afrika och 2010 startades en massvaccinationskampanj.
Laboratoriebekräftade fall av meningit A har fallit sedan dess:
– Sjukdomen har praktiskt taget försvunnit från denna del av världen, säger Marie-Pierre Preziosi från Världshälsoorganisationen.
Massimmuniseringsprogrammet riktades till personer under 30 år.
Det kommer dock att krävas rutinmässig vaccination för att se till att nyfödda inte är sårbara för sjukdomen.
Prognoser, som publicerades i tidskriften Clinical Infectious Diseases, visade att sjukdomen lätt kunde återvända.
Dr Preziosi berättade för BBC News webbplats: "Vad som kan hända är en enorm epidemi som kan sopa hela området, som kan rikta hundratusentals människor med 5-10% dödsfall åtminstone.
"Det kommer att bli stora epidemier om 10 till 15 år, så uppmaningen till länder nu är, "Sluta inte dina ansträngningar - du måste införa vaccinet i rutinmässiga immuniseringsprogram."
Ett nytt vaccin har godkänts för barn mellan 9 och 18 månader. Ghana introducerar jabben och ytterligare åtta länder köar för att göra det nästa år.
Dr Mark Alderson, från den globala ideella vårdorganisationen Path, berättade för BBC: "Det är en anmärkningsvärd framgångssaga."
Men han varnade också andra typer av hjärnhinneinflammation - C, Y, W och X - var ett hot.
Han tillade: " Andra seragruppers utbrott är oförutsägbara och meningit C är Niger är ett exempel på detta.
"Om meningit A är borta kommer det att fortsätta att bli utbrott i de andra seragrupperna. Om vi verkligen vill eliminera hjärnhinneinflammation från hjärnhinneinflammationsbältet är det bästa sättet att införa ett polyvalent vaccin [mot A, C, Y, W och X]."
Meningit A slår till under torrperioden i Afrika och medan det börjar som en förkylning med huvudvärk och feber kan det snart leda till kramper, koma och död.
Följ James på Twitter.
Ett massvaccinationsprogram mot meningit A i Afrika har varit en "förbluffande framgång", säger experter.