Korallblekning har lett till en utbredd korallförsämring och förlust av livsmiljöer på världens största korallrevssystem.
Undersökningar visar att 29 % av korallerna dog 2016, vilket är mer än 22 % prognostiserade i mitten av 2016.
Det värsta området var nära Port Douglas, där 70% av grunda vattenkoraller dog, men det fanns en återhämtning av koraller i södra delen av revet.
De senaste resultaten kommer från undersökningar som genomförts av Marine Park Authority, Queensland Parks och Wildlife Service, Australian Institute of Marine Science och ARC Centre of Excellence for Coral Reef Studies.
Styrelseordföranden för Great Barrier Reef Marine Park Authority, Russell Reichelt, sade: " Som har varit fallet med rev över hela världen, har Great Barrier Reef upplevt betydande och omfattande effekter under de senaste två åren.
"Vi är mycket oroade över vad detta innebär för Stora Barriärrevet självt och vad det betyder för de samhällen och industrier som är beroende av det."
Enligt rapporter från Newpaper fick nyligen ett möte om revets framtid veta att den federala regeringen och Queenslandregeringens långsiktiga plan för att skydda revet, som tillkännagavs 2015, inte längre var möjlig.
Blekning inträffar när alger som lever på koraller utvisas på grund av stress orsakad av extrema, ihållande temperaturförändringar. Det här gör korallen vit.
Under 2017 förväntas ytterligare koralldödar från det andra året av blekning i rad, och effekterna av tropiska cyklonen Debbie, tjänstemännen sade.
Forskare säger att klimatförändringarna är en viktig drivkraft bakom korallförlusten och experter har sagt att fönstret stängs snabbt för att minska utsläppen av växthusgaser som driver upp temperaturer och skadar revet.
Australiens stora barriärrev förlorade nästan en tredjedel av sina koraller under det gångna året, har tjänstemän sagt.