Fördelningen gjordes i början av februari.
Pengarna måste spenderas i slutet av mars 2017 enligt ett e-postmeddelande sett av BBC.
I e-postmeddelandet uppmanades medicinsk personal att hänvisa till "långa väntande patienter som är lämpliga för den oberoende sektorn".
Det sade att hänvisa till dem som behöver behandling för "spinn, höft och knä, nedre och övre extremiteter".
Nyheten kommer efter att hälsoministern sade på tisdagen att mer än £ 31m krävs för att behandla patienter som har väntat mer än ett år på vissa möten.
Michelle O'Neill sa att hon var säker på att pengarna skulle kommas överens efter valet den 2 mars.
Finansieringen till den privata sektorn omfattar inte pengar för behandling av öppenvård.
E-postmeddelandet fortsätter med att säga att den £ 1m finansiella flytten inte påverkar någon "in-house" finansiering, som förtroende mottagits under de senaste fyra månaderna, och att personalen kan fortsätta att fylla listor och utföra helgarbete när lag är tillgängliga.
Även om de flesta människor som väntar kanske inte har något emot när deras operation utförs, är det underförstått att läkare och sjuksköterskor skulle ha föredragit att ytterligare pengar investeras i hälso- och sjukvården i stället.
År 2015, när den dåvarande hälsovårdsministern tilldelade 40 miljoner pund till väntelistor, kunde pengarna inte spenderas i tid och bara hälften av beloppet i samband med operationer.
Det beror på att sjukhusen inte har kapacitet eller personal att spendera pengarna på så kort tid.
Belfast Health Trust har tilldelats 1 miljon pund för att skicka patienter som för närvarande står på väntelistor som ska behandlas i den privata sektorn istället, har BBC lärt sig.