Merseyside polisen kallades till Kreta Towers på Jason Street, Everton, på tisdag morgon efter att någon märkt en stark lukt som kommer från byggnaden.
Det kommer två veckor efter att en av de största cannabisodlingarna någonsin i Liverpool hittades på samma gata.
Polisen uppskattar att den totala grödan hade ett gatuvärde på mer än 1,3 miljoner pund och beskrev gårdarna "ett sofistikerat och industriellt kriminellt upplägg".
Det Insp Lee Wilkinson sade: " Detta var en detaljerad serie av cannabisodlingar spridda över fyra separata lägenheter.
"Vi upptäckte totalt 339 växter men tror att mycket mer kunde ha odlats."
Fyra cannabisodlingar har hittats i lägenheter vid ett torn i Liverpool.