Norra irländaren kortade en tredje runda 68 för en 16-under-par total, med American Rickie Fowler hans närmaste utmanare på 10 under.
McIlroy, 25, vann från sju tillbaka på PGA Championship på Wentworth i maj.
"Jag vet att ledtrådar kan gå snabbt", sa han. "Det är därför du inte kan låta dig själv tänka på att vinna."
McIlroy var bunden med Fowler på 12 under efter 13 hål men örnar på 16: e och 18: e hjälpte honom till den största 54-håls fördel vid Open sedan Tiger Woods ledde med sex på St Andrews 2000.
Men McIlroy - vars far Gerry och tre vänner placerade en satsning £400 på 500-1 10 år sedan att han skulle vinna Open vid den tidpunkt han var 25 - är väl medveten om vad trycket av att leda en stor turnering kan göra mot en spelare, efter att ha blåst en fyra-shot bly på den sista dagen av Masters 2011 och så småningom kortade en 80.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
"Jag har varit på rätt sida av det och jag har varit på fel sida av det", sade 25-åringen, som har lett från öppningsdagen.
"Du måste bara stanna helt i ögonblicket och det är vad jag kommer att göra för alla 18 hål i morgon."
Fowler kommer att tee off med sin gamla rival i den sista parning på söndag, efter att ha kortat en tredje omgång 68, och har inte gett upp hoppet om att se över honom.
"Om jag kan få en bra start och sätta press på, det finns en hel del golf att spela," sade den 25-årige amerikanen, vars rivalitet med McIlroy går tillbaka till när de mötte varandra i 2007 Walker Cup.
"Att vara tillsammans med Rory är en fördel. Vi kommer att ha roligt, så mycket kan hända så snabbt."
Fowler drog nivå i ett skede på lördagen men snubblade ner den bakre nio innan också kardlägga en 68.
Sergio Garcia är ett skott bakom Fowler och nivå med American Dustin Johnson men spanjoren höll också ut hopp om att landa sin första stora titel.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
"Jag är lite besviken på hur jag spelade de två sista hålen", sade Garcia, vars tredje rond 69 skulle ha varit bättre men för en bogey på 17: e och en repig par på par-fem 18th.
"Det är aldrig lätt att vara ledare. Rory är en bra spelare men man vet aldrig, något kan hända.
"Men du kan inte bara attackera allt eftersom du inte kommer att träffa bra skott. Man måste attackera där man känner sig bekväm med att attackera."
Under tiden har Adam Scott inte uteslutit möjligheten att någon sätter rekord för ett stort mästerskap den sista dagen.
Den australiensiska kardade en tredje omgång 69 för att avsluta 10 skott bakom McIlroy men tror att en poäng på 62 är möjligt, om söndag levererar bra väder.
"Om vi har liknande villkor som idag, det finns låga poäng där ute", sade före detta mästare mästare Scott.
"Om du kan få det att gå för 18 hål, det finns en chans att den stora scoring rekord att brytas.
"Jag tror att ur gruppen av killarna där uppe, det finns förmodligen en låg poäng i en av dem."
Rory McIlroy tar ingenting för givet trots att han bär en sex-shot bly in i den sista omgången av Open på Royal Liverpool.