Gruppen, känd som Iffley Open House, hade tidigare ockuperat ett tidigare bilvisningsrum på Iffley Road, som ägs av Wadham College, på nyårsafton.
De ombads att ge sig av och flyttade sedan in i den nedlagda Osney Mill platsen i februari.
Universitetet sa att det tidigare kraftverket var osäkert vann ett domstolsbeslut att vräka gruppen.
Kreativa lösningar
Det tillade att byggnaden skulle byggas om av Said Business School.
Några av husockupanterna sade att de erbjöds sovplats i en lokal kyrka, men de flesta kommer nu att vara tillbaka på gatorna, sade gruppen.
Volontär Miranda Shaw sade: " En bra sak är att det har skapat tillräckligt med uppståndelse för att det skall bli stora samtal.
– Vi kommer att träffas under de kommande veckorna för att träffa kyrkor, råd, universitet, serviceleverantörer och polis.  Avsikten är att hitta kreativa lösningar."
Oxford University har alltid hävdat att det sympatiserar med de hemlösas svåra situation och har arbetat för att lösa situationen.
Squatters som hade tagit över ett kasserat kraftverk som ägs av Oxford University har lämnat byggnaden.