DreamHost hade hävdat att DoJs fullmakt skulle ha avslöjat 1,3 miljoner IP-adresser.
DoJ har nu minskat omfattningen av sin efterfrågan.
Disruptj20.org inrättades för att hjälpa till att ordna en protest vid president Trumps invigning.
"Regeringen har inget intresse av poster som rör 1,3 miljoner IP-adresser som nämns i DreamHosts många pressmeddelanden och oppositionsbrief," åklagare sade i den nya begäran.
De var fokuserade på att använda webbplatsen för att planera och genomföra en brottslig handling - en "riot" - inte "lagliga aktiviteter fredliga demonstranter", sade de.
Arresteringsordern kräver nu inte vissa åtkomst- och felloggar, vilket, säger DreamHost, betyder att besökarnas IP-adresser är "i stort sett säkra".
"Vi ser detta som en enorm vinst för internet integritet, och vi uppskattar absolut DoJ: s villighet att titta på och ompröva både omfattningen och djupet av deras ursprungliga begäran om skivor," DreamHost sade i ett blogginlägg.
Den avser dock fortfarande att utmana justitiedepartementet i andra aspekter av dess begäran.
Åklagarna undertecknade den ursprungliga häktningsordern till DreamHost i juli och hävdade att disruptj20.org hade använts för att organisera "våldsprotester" i Washington DC.
DreamHost och integritet förespråkare hävdade att uppgick till en "digital dragnet".
I sin uppdaterade fullmakt sade DoJ att hela omfattningen av den ursprungliga begäran - kritiserad av DreamHost i sina offentliga uttalanden - hade varit "okänd för regeringen och domstolen vid den tidpunkt då häktningsordern utfärdades".
Data som fortfarande krävs enligt den ändrade fullmakten inkluderar filer och databaser lagrade av DreamHost.
Mer än 200 personer har åtalats för upplopp vid invigningen.
Besökare på en anti-Trump webbplats kommer förmodligen inte att ha sina internet protokoll adresser överlämnas till Justitiedepartementet, efter en rättslig standoff med ett amerikanskt webbföretag.