Arbetet, som ursprungligen ska inledas nästa månad, planeras nu att inledas i september med en upphandlingsprocess.
16,2 miljoner pund har anslagits till Translink för uppgraderingen av järnvägen.
Förra året sa Translink att en timservice på rutten var en "prioritering".
Den andra etappen av uppgraderingen innebär större omsignering mellan Derry och Coleraine och införandet av en passerloop.
Arbetet med en andra större uppgradering av järnvägslinjen Londonderry-to-Coleraine har försenats med fyra månader.