Den liberaldemokratiske ledaren Tim Farron kallade Labour för vårdslös för att spendera Europeiska unionens (EU) pengar på icke stödberättigande projekt och de konservativa "mean-anded" för att använda översvämningshjälppengar för att betala tillbaka felaktigt använda medel.
Regeringen skyllde Labours "misshushållning" av pengarna.
Labour har kontaktats för kommentarer.
Kommunminister Andrew Percy, avslöjade i ett skriftligt uttalande att 15 miljoner pund i EU:s solidaritetsfinansiering för översvämningarna under vintern 2015–2016 skulle bli "offset" genom återbetalningen på 14,5 miljoner pund.
Förenade kungariket var "lagligt förpliktat" att göra återbetalningen eftersom det hade funnits "oberättigade utgifter inom Labouradministrationen" av 2007 års finansiering.
Den återstående £ 500.000 var "endast berättigad att ersätta" regeringen för ekonomiskt stöd som ges till drabbade områden, sade han.
Westmorland och Lonsdale, ledamot av Europaparlamentet, Farron sade att de två parterna hade "kombinerat för att beröva områden som drabbats av översvämningar mycket väl behövliga medel".
"Arbetstagarnas överutnyttjande har skadat Norden och alla de som drabbades av förra årets översvämningar", sade han.
"Men det är den konservativas elakhet som innebär att de har valt att använda dessa pengar för att betala böterna, i stället för att överföra dessa pengar till översvämningsdrabbade områden och betala böterna från statskassan."
Som svar sade Percy att regeringen hade levererat 300 miljoner pund för att hjälpa översvämningsdrabbade samhällen.
"Liberal Democrats vilseleder allmänheten genom att föreslå att det finns några EU magiska pengar träd," sade han.
Omkring 15 miljoner pund av medel avsedda för brittiska samhällen som drabbades av översvämningar förra vintern kommer istället att användas för att täcka en "fin" för att missa ett tidigare bidrag.