Utvecklingen tillkännagavs av förste minister Nicola Sturgeon under ett besök på gården på måndagen.
Hon sade att avtalet skulle skapa nya arbetstillfällen på Ferguson och säkra sysselsättningen för den befintliga 150-starka arbetskraften.
Varvet gick i konkurs för ett år sedan, men togs över av entreprenören Jim McColl som planerar att investera upp till £ 65m.
Affären, när den är slutförd, kommer att se Ferguson varvet bygga två fartyg för Caledonian Maritime Assets Ltd: s (CMAL) flotta.
Sturgeon sade: "Detta är ett utmärkt resultat för Ferguson Marine Engineering Limited, och det gläder mig att få nämna dem som föredragen anbudsgivare för kontraktet att bygga två nya färjor, de största kommersiella fartyg som byggts på Clyde sedan 2001.
"Detta kontrakt kommer att innebära att den 150-starka arbetskraften kommer att behållas och att mer personal kommer att anställas vid varvet, vilket understryker vårt åtagande att skapa de viktiga arbetstillfällen som krävs för att främja lokala ekonomier och bidra till att stimulera tillväxten i hela Skottland.
"Den skotska regeringen är fast besluten att stödja färjeanvändare runt om i Skottland genom att tillhandahålla säkra och tillförlitliga tjänster, och detta är det senaste steget för att se till att vi har en flotta som fortsätter att leverera för de samhällen som är beroende av den."
Varvet Ferguson Marine i Port Glasgow har utsetts till föredragen anbudsgivare för ett kontrakt på 97 miljoner pund om att bygga två färjor i Skottland.