Irfan Rabbani kommer att ansluta sig till SNP:s oppositionsgrupp i rådet, som arbetar med en majoritet på 15.
49-åringen sade att han inte skulle ställa upp i de lokala valen i maj, även om han skulle kämpa för andra SNP-kandidater.
Rabbani har representerat Glasgows Pollokshields avdelning sedan 2007. Han hade varit medlem i Labour i 20 år.
En arbetarrådsledamot i Glasgow som hade avvalts av partiet har hoppat av till SNP.