Bashir Naderi, 20 år, har bott i Wales i tio år, efter att hans mamma betalat smugglare för att ta honom till Storbritannien.
Hans deportation stoppades tillfälligt av en domare timmar innan han skulle gå ombord på planet i oktober och en 14 000-signatur petition överlämnades till inrikesministeriet i januari.
Men flickvännen Nicole Cooper sa att de är "avvanda" hans ledighet för att stanna kvar i Storbritannien har vägrats.
Hon lade till deras advokat levererade nyheten på onsdag men paret väntar fortfarande på att se Home Office dokument.
Inrikesministeriet sade att den inte kommenterade enskilda fall.
"Jag var på jobbet och min mamma ringde mig på 3:00 för att säga att advokaten hade kontaktat Bash," Miss Cooper berättade BBC Wales.
"Vi fick ett samtal från advokaten som gav mer detaljer, hon var i London. Det var att han inte hade beviljats ledighet av inrikesministeriet. Vi väntar på att få se dokumentet hon fick.
"Bashs advokat kämpar fortfarande mot detta, det finns skäl för en annan vädjan."
Han flydde från Afghanistan när han var tio år efter det att hans far hade dödats av talibanerna.
Han gick i skolan i Cardiff och talar med lokal accent.
"Han har inte tagit det bra", tillade miss Cooper. "Han är förkrossad och har varit upprörd över allt.
"Vi väntade oss verkligen inte det, vi trodde att vi hade en bra chans."
Bland de tusentals människor som undertecknade petitionen fanns walesiska sångare Charlotte Church och Cerys Matthews, liksom lokala MP Jo Stevens.
Ett försök att hindra en Cardiff-man från att deporteras till Afghanistan har misslyckats.