Labour hade flest fullmäktigeledamöter i kommunfullmäktige efter förra veckans val.
BBC Skottland avslöjade att såväl som de konservativa kommer koalitionen att förlita sig på stöd från tre oberoende. Labours Barney Crockett blir den nya rådsledaren.
SNP och Lib Dems kommer att bilda oppositionen i rådet.
En ny Independent-Conservative administration kommer att leda Moray Council.
Den oberoende fullmäktigeledamoten för Keith, Stewart Cree, har blivit vald till fullmäktigeledamot.
Samtidigt har ledaren för SNP-gruppen i Aberdeenshire Council kämpat mot en utmaning för hennes ledarskap.
Vid gruppens årsstämma tisdagen blev Joanna Strathdee utvisad som ledare av Rob Merson.
BBC Scotland förstår att Merson var i tjänst i ungefär en timme innan han avgick, att ersättas av den tidigare ledaren.
SNP är det största partiet i Aberdeenshire och fortsätter förhandlingarna om att bilda en koalition.
Labour och de konservativa har gått samman för att bilda en administration i Aberdeen.