Sturridge, 25 år, är inte i Hodgsons senaste trupp efter att ha drabbats av en lårbelastning på Englands tjänst förra månaden.
Reds boss Brendan Rodgers kritiserade Englands hantering av spelaren, och ville inte att han skulle kallas upp för spel mot San Marino och Estland.
"Det är helt enkelt ett faktum, ett olyckligt faktum, att han inte återhämtat sig," Hodgson sade om Sturridges frånvaro.
"Det finns inga problem eller konflikter där alls."
Sturridge har missat Liverpools senaste sex matcher men det finns en chans att han kan återvända på lördag, mot West Brom i Premier League.
Men Rodgers sa att han inte skulle kunna spela i Euro 2016 kval med San Marino torsdagen den 9 oktober och tre dagar senare mot Estland.
"Jag har haft bra kommunikation med Roy och vi talade länge om situationen", sade Rodgers, vars sida slogs 1-0 av Basel i Champions League på onsdag. "Det var vänskapligt. Det är inget problem.
"Vi hade kommit överens om att det förmodligen var för tidigt för Daniel att träffa England oavsett om han var inblandad i helgen eller inte.
"Varje enskild spelare är annorlunda. Jag respekterar att han (Hodgson) hade arbete att göra internationellt men mina tankar är med Liverpool spelare och vad deras behov är.
"Daniel har inte tränat med laget alls sedan skadan med dem och det var förmodligen inte rätt tid att gå med dem.
"Jag har inte pratat med Daniel. Mitt fokus är Liverpool, inte England. Jag talade med honom om att vara tillgänglig för Liverpool men jag kan inte tänka på England när han inte är redo att spela för Liverpool."
Hodgson sa att det hade varit "ingen fråga" om att välja Sturridge för dubbelhuvudet.
"Han har inte spelat för Liverpool alls sedan han plockade upp skadan med oss. Som jag förstår det har han fortfarande lite arbete att göra innan han är helt frisk," Hodgson sade.
"Det är ett stort slag för oss, Liverpool och spelaren, eftersom han var angelägen om att vara en del av dessa två spel."
Sturridge har gjort 16 framträdanden för England sedan han gjorde sin debut för nästan tre år sedan, poäng fem mål - hans senaste kommer i 2-1 nederlag av Italien vid VM i juni.
England vann sin öppning Euro 2016 kval 2-0 mot Schweiz förra månaden.
Englands chef Roy Hodgson har avvisat pratet om en spricka med Liverpool över den skadade anfallaren Daniel Sturridge.