Förslaget om utbildning och adoption tar upp problemet med underpresterande "coasting" skolor, men tillåter mindre utmaningar eller samråd.
Arbetskamrater ville ha mer samråd för föräldrar och sade att akademistatus inte var det enda sättet att förbättra skolorna.
"Det verkar inte som om något motstånd tolereras", sade labours lord Watson.
Men regeringen överlevde ett oppositionsändringsförslag när resultatet var bundet till 219 röster på båda sidor, ett annat ändringsförslag avslogs med 14 rösters marginal.
Utbildningsminister Lord Nash sade att regeringens planer var manifest åtaganden och svaga skolor behövde brådskande förbättringar utan alltför stora procedurförseningar.
Förra veckan presenterade utbildningsminister Nicky Morgan sitt eget ändringsförslag till planerna, så att de misslyckade akademierna också skulle granskas, med förhoppningen att de skulle övertas av en annan akademikedja.
Premiärminister David Cameron har sagt att lokala myndigheter som driver skolor bör bli ett "ting av det förflutna".
Shadow Education Minister Lord Watson sade att det inte fanns några bevis för att visa akademier var i sig bättre än lokala myndighetsskolor.
Och han varnade för att ett överskott av "politiska dogmer" låg bakom kravet på akademier och att utesluta föräldrarnas åsikter skulle skapa "misstro och förbittring".
Fru Pinnock, från liberaldemokraterna, sade att regeringen inte skulle "döma" till föräldrar om förändringar i deras lokala skolor.
Men Conservative kamrat Lord True ifrågasatte varför processen att förbättra skolorna skulle stoppas av dem som tidigare hade varit ansvariga när skolorna kämpade.
Lord Harris, konservativ kamrat- och akademisponsor, sade att det alltför ofta hade varit förseningar i att ta itu med misslyckade skolor - och att stora framsteg kunde göras snabbt om regeringen tillät akademikedjor att ingripa.
Inför debatten hade Morgan skrivit att kamraterna måste välja mellan att "förbättra chanserna för barn som försummats i årtionden och ge efter för de egenintressen som motsätter sig reformer".
Utbildningssekreteraren sade att planerna skulle garantera att "alla barn får den standard på utbildning de förtjänar" - och oppositionen ändringsförslag skulle bevara "de kryphål som utnyttjas av kampanjtagare" mot akademier.
Efter det att oppositionens ändringsförslag hade förkastats sade en talesman för utbildningsdepartementet: " Vi är glada över att Lorderna har beslutat att sätta barnens intressen före alla andra i kvällens omröstningar om lagförslaget om utbildning och adoption.
"Propositionen är central för vårt engagemang för att leverera utbildningskompetens i alla delar av landet.
"Det syftar till att förbättra livschanserna för varje barn genom att ge våra bästa skolledare friheten att omvandla misslyckade skolor och införa nya åtgärder för att göra det möjligt för oss att ta itu med kustskolor på rätt sätt."
Men en allians av utbildningsorganisationer, inklusive National Guvernörs' Association, Catholic Education Service och lärare och ledande lärares fackföreningar, sade att de var "besvikna" av resultatet.
"Regeringen har fel är fel att säga att det bara finns en väg till skolförbättring.  Att bli akademi garanterar inte de högre utbildningsstandarder för barn som de säger att det gör, säger ett uttalande från utbildningsgruppen.
– Det är fel av regeringen att framställa föräldrarnas och experternas många röster som 'hämtade intressen'. Konverteringsprocessen för akademin är också för ogenomskinlig för att människor ska kunna vara säkra på att den kommer att vara rättvis.
– Bevisen visar tydligt att det inte finns något samband mellan akademistatus och automatisk skolförbättring, så det är rätt att oro tas upp och inte avfärdas bara för att de strider mot regeringens önskan. Barn bör inte riskera sin framtid genom en så svag uppsättning förslag."
Regeringen har överlevt en utmaning i överhuset för sin plan att påskynda fler kommunala skolor i England för att bli akademier.