Konta, 25 år, jagade den största titeln av sin karriär men reprised mot den polska nummer tre frö efter en stridande första-set display.
Den 11:e fröet, som har gjort världen topp 10, kämpade tillbaka från 4-2 men kunde inte göra det 5-5 efter att ha missat en volley.
"Jag är mycket nöjd med den här veckan, det var ganska spektakulärt", sade Konta.
"Jag verkligen njuta av min resa och ser fram emot att matcher som denna mot spelare som Agnieszka," tillade hon.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Konta blev den första brittiska kvinnan i 32 år att göra världen topp 10 efter att ha nått finalen. Den sista brittiska kvinnan att uppnå det innan henne var Jo Durie 1984.
Återupplev finaldagen på China Open
I herrarnas final, Andy Murray säkrade sin femte singlar titel 2016 - och 40: e av sin karriär - genom att slå Grigor Dimitrov 6-4 7-6 (7-2).
Efter att ha släppt henne tjäna två gånger i varje set, Konta försökte även poänglinjen i den andra, driver Radwanska till två brytpunkter i den sjätte matchen.
Radwanska sköt dock en förhand för att rädda sitt servicespel.
Konta höll nästa med en förhand droppe skott, bara för hennes motståndare att sedan tjäna för titeln, avfyra hennes enda ess av matchen.
BBC tennis korrespondent Russell Fuller
Konta var väl slagen i slutet av världen nummer tre, men kommer officiellt att vara en topp-10 spelare på måndag morgon och nu har en mycket god chans att kvalificera sig för säsongens slut mästerskap i Singapore.
Konta har flyttat in i åttonde och sista kvalificeringspositionen, men har bara en 10-poängs fördel över nionde plats slovakiska Dominika Cibulkova.
Det återstår två kvalificerade veckor, med Konta på väg till Hong Kong, där hon har dragit med Britannien Naomi Broady i den första omgången.
Brittiskt nummer ett Johanna Konta övermannades 6-4 6-2 av världs nummer tre Agnieszka Radwanska i finalen av China Open.