Duon imponerade mot Nya Zeeland förra helgen när Boyce gjorde sitt första internationella mål och O'Neill har antytt att de kommer att börja igen.
"När vi har bett Josh att komma och spela genom mitten har han aldrig svikit oss", säger O'Neill.
"Liam har haft en bra säsong. Han ser mycket, mycket skarp ut i träningen."
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Däremot, Kyle Lafferty begränsade utflykter på klubbnivå denna säsong lämna honom "inte i bästa skick vi vill att han ska vara", O'Neill medgav på torsdag.
"Men för vilken del av spelet han (Lafferty) spelar, jag är säker på att han kommer att se till att han gör ett bra jobb för oss."
De nordirländska är utan Conor Washington, som ska gifta sig i helgen, medan Jamie Ward, som också gjorde i kvalet seger över Norge i mars, uteslutas av skada.
Centre-back Gareth McAuley, 37, ser ut att spela efter att ha missat Nya Zeeland spel på grund av en lårskada men Watford försvarare Craig Cathcart kommer att saknas på grund av ett knä problem.
Veteran Aaron Hughes kan ersätta Cathcart om O'Neill väljer en rygg tre men chefen kan istället välja att byta till en rygg fyra.
Nordirland slog azerbajdzjanska 4-0 i Belfast för sju månader sedan när hemmasidans set-pipess orsakade den lätta oppositionen otaliga problem.
O'Neills trupp har utan tvekan tränat sina frikickar och hörnkickar länge denna vecka, vilket inkluderade fem dagar i södra Turkiet för att acklimatisera för de förväntade höga temperaturerna i Baku.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Nordirland förlorade 2-0 i förra besöket i Baku 2013 men O'Neills team är en mycket förbättrad outfit fyra år efter att ha uppnått kvalificering för Euro 2016.
Robert Prosineckis hemmasida kommer att kunna kalla på erfarna skeppare Rashad Sadygov, som missade Windsor Park tävlingen på grund av skada.
Den brasilianska anfallaren Richard Almeida är nu också en del av Azerbajdzjans trupp medan en annan nykomling Renat Dadashov tidigare spelade för Tysklands Under-17 lag.
O'Neills sida är tvåa i grupp C, fem poäng efter ledare Tyskland, men två före den tredje orten Tjeckien.
Nordirlands chef Michael O'Neill ser ut att behålla Liam Boyce och Josh Magennis som sina strejkande i lördagens VM kval i Azerbajdzjan.