Det förväntas hämta upp till 1,2 miljoner pund som en del av Christie's Post-War och Contemporary Art försäljning.
Det kontroversiella stycket, som nominerades till Turnerpriset 1999, ger en ögonblicksbild av Emins liv efter ett traumatiskt förhållande.
Den säljs av konstsamlare Charles Saatchi, som köpte den för 150 000 pund 2000.
Efter att ha installerat sängen hos Christie's berättade Emin för BBC News arts korrespondent Tim Masters vad det fortfarande betyder för henne 16 år senare.
Det känns annorlunda att veta att det kommer att försvinna. Förut, när jag har installerat det, finns det en nivå av nostalgi varje gång. Men den här gången var jag verkligen ledsen, för jag vet inte vart den är på väg.
Det är ganska läskigt, det är helt utom min kontroll. Inte för att jag är ett stort kontrollfreak. Men jag bryr mig verkligen om sängen, och jag älskar den.
Jag inser att det betyder mycket att vara här i dag. Det har alltid betytt mycket för mig, men jag insåg inte hur passionerad jag var över det.
Det bästa möjliga resultatet är att en fantastisk välgörare köper den och sedan donerar den till ett museum.
Jag har ingen aning om var det kommer att sluta - eller hur mycket någon kommer att betala för det. Det har aldrig varit något liknande till salu på en konstauktion förut.
Alla täcken var inlindade, och allt var i lufttäta behållare.  Det såg ut som en brottsplats eller ett vetenskapligt projekt.
Idag när jag tog ut täcket var det platt. Och när jag kastade den på sängen, såg det inte rätt ut. Så jag fluffade upp det, och det såg fortfarande inte rätt ut.
Så jag bäddade faktiskt sängen och klev in och knuffade tillbaka locket så det hade den naturliga känslan att en kropp har varit i det.
Det är konstigt eftersom det fortfarande har samma lukt som den hade för 16 år sedan.
Det är uppenbart att fläckarna och allt annat rör mig, och det är som att bli rörd av ett spöke av sig själv.
Mina amerikanska vänner kom för att se mig installera det i morse, och de såg madrassen och de sade: "Tracey!"
Jag tror att folk är så vana vid att se det som en bild att de glömmer att det är verkligt.
När de ser det på riktigt, väcker det fortfarande dessa känslor inuti dem eftersom man kan se spåren av en människa där inne.
Det är som självporträtt av någon som är borta. Det är som en tidskapsel, och många människor relaterar till det på något sätt.
Ganska bra. Speciellt att vara en kvinna och vara en del av konsthistoria. Det gläder mig. Om jag aldrig gör något annat bra och seminal igen, som sängen, har jag gjort det. Och det gör mig lycklig.
Nu kan jag bara gå vidare med mitt liv och göra det som är viktigt för mig - och det är att göra konst.
Min säng säljs som en del av Christie's Post-War och Contemporary Art försäljning den 1 juli, vilket inkluderar verk av Francis Bacon, Peter Doig, Andy Warhol och Jackson Pollock.
Tracey Emins mest kända konstverk My Bed (1998), som innehåller färgade lakan, cigarettpaket och kasserade kondomer, auktioneras ut i London på tisdag.