Men ITV: s dokumentär, som började en timme tidigare, slog BBC One's Antiques Roadshow, som i genomsnitt var 4,9m.
The Night Manager, en uppdaterad version av John Le Carres roman 1993, har varit en hit med tittare och på sociala medier.
Drottningens dokumentär innehöll kungligheter, politiker och kändisar.
Recensioner har varit positiva för The Night Manager, med Tom Hildleston som den gåtfulla Jonathan Pine, som går under täckmantel för att försöka avslöja aktiviteter som miljardär vapenhandlare Richard Roper, spelas av Hugh Laurie.
The Daily Telegraph kallade det "en superb klimax", samtidigt som det påpekades att slutet, där Roper förlorar sina pengar och sin frihet, skilde sig från romanens, där "Corky överlevde för att exponera Pine och krossa honom till en massa i flera dagar i sträck".
Producenterna sa till tidningen att de gjorde det för att hålla tittarna "på tårna".
Guardian beskrev serien som "litelig och diketant spionage dramat av, utan tvekan, prisbelönt briljans", men recensenten föreslog att Lauries accent var för lik en som han använde för 30 år sedan i en skiss för A Bit of Fry och Laurie, om "två testosteronladdade, Uttoxeter-baserade hälsoklubb entreprenörer".
Tom Hiddleston gjorde sin "bästa 007 imitering", enligt Huffington Post, medan Daily Mirror skrev att dramat gav tittarna "palpitationer" och Daily Mail sa att det var "en explosiv blandning av gore och subterfuge".
Vår drottning vid 90, som av Daily Telegraph beskrevs som "för lång", var ITV:s påskpynt erbjudande för påskhelgen, och inkluderade omfattande bakom kulisserna bilder av Kungafamiljen på jobbet och på spel.
Tidningen var imponerad av intervjuer med de andra medlemmarna av familjen, bland annat hertiginnan av Cambridges uppenbarelse att hon och drottningen "bands på en bortadag i Leicester".
The Daily Mail sade: "Den verkliga triumfen av denna film, att fira drottningen inte bara som en monark utan också som en privat person, var dess glimtar av hennes lediga."
Den tillade: " Scenen som sammanfattade hennes opåverkade vänlighet, och samtidigt filmades hennes kungliga charm vid Sandringhams stall. Hennes Majestät talade om varje djur som en vän, och kände dess egenheter."
BBC Ones spända thriller The Night Manager i genomsnitt 6,6 miljoner tittare för sin sista episod, slå ITV's Vår drottning på 90 av en miljon tittare för att vinna påskhelgen TV-strid.