Vatten Storbritannien, som representerar alla stora brittiska vattenleverantörer, sade skiffergas utvinningsmetoden utgjorde ett hot om inte " varsamt planerat och genomfört".
Det varnade också fracking s "höge" användning av vatten kan orsaka brist i områden med låg tillgång, som South East England.
Shale gasföretaget Cuadrilla sa att det inte fanns några bevisade fall av akvifers som kontamineras genom fracking.
Dr Jim Marshall, av Water UK, uppmanade fracking företag att hålla "framsida diskussioner" med vattenföretag "innan fracking blir utbredd i Storbritannien".
Han sade att vattenindustrin inte "tog parti" i den frackande debatten, utan ville se till att "hörnarna inte skärs ned och standarderna äventyras, vilket lämnar oss alla att räkna kostnaderna för kommande år".
Fracking - kort för "hydraulisk spräckning" - innebär att borra djupt under jord och släppa en högtrycksmix av vatten, sand och kemikalier för att knäcka stenar och släppa gas lagrad inuti.
Vattenföretagen är oroliga för att processen kan förorena dricksvattenakviferer som ligger ovanför skiffergasreserverna.
Vatten Förenade kungariket sade att detta kan hända genom gaser som metan som tränger in i vattenkällor från bergarter där det tidigare var begränsat, kemikalier som kommer in genom sprickor som skapats av fracking processen, eller genom dålig hantering av avloppsvatten på ytan.
En talesman för Cuadrilla, som utför testborrning i Lancashire, sade: "Det har utförts över två miljoner hydrauliska frakturbehandlingar globalt, majoriteten i USA, och från den verksamheten är vi inte medvetna om ett enda verifierat fall av spräckning vätska förorena akviferer."
Talaren sade att firman, som också vill borra på en plats i West Sussex, var "engagerad till de högsta normerna för brunnsintegritet".
Han tillade att Cuadrilla var i "regelbunden kontakt" med vattenleverantörer och dess vattenförsörjning "kommer aldrig att prioriteras framför människors hus eller jordbruk".
En gemensam rapport från Royal Society och Royal Academy of Engineering som publicerades förra året sade att riskerna kunde hanteras effektivt genom "stark reglering".
Joseph Dutton, vid universitetet i Leicester, berättade för BBC fracking presenterade "minimala fara" av vattenföroreningar om de gjordes korrekt, som sprickor den skapade var mycket djupare under jord än akviferer.
Han sa att läckor i brunnshöljen nära ytan, orsakade av "dåligt utförande" eller skakningar i samband med fracking, var den mest sannolika orsaken till förorening.
Han sade dock att regeringen "vill skynda på processen" och varnade för att en uppluckring av miljökontrollerna, som skedde i USA, skulle öka riskerna.
Mr Dutton sade att mängden vatten som används i fracking varierar, men varje brunn använder minst en miljon liter.
Department for Energy and Climate Change sade vattenföretag "kommer att bedöma mängden vatten som finns tillgängligt innan de ger det till operatörer".
På tal om risken för vattenkvaliteten sa en talesman att det inte fanns "några bevis från USA för att fracking orsakar förorening av grundvattnet".
Han sade att miljöbyrån skulle reglera användningen av kemikalier i Förenade kungariket på "plats för plats" och skulle beordra fracking att upphöra om en risk för grundvattnet identifierades.
Bred spridning har inte börjat i Storbritannien ännu, men Cuadrilla började undersöka borrning i Lancashire 2011 och många andra möjliga platser har identifierats.
BBC branschkorrespondent John Moylan sade att han förväntade sig skapandet av 40 till 50 fracking brunnar under de kommande två åren.
Storskalig fracking har minskat energiräkningen i USA, men det pågår en debatt om huruvida samma sak skulle hända i Storbritannien.
Kansler George Osborne, som tidigare tillkännagav skattelättnader för att främja fracking, sade att det hade "potentialen att skapa tusentals arbetstillfällen och hålla energiräkningar låga för miljontals människor".
Men Jordens vänner sade att regeringens "vildögda vördnad för den nya guden av skiffer är helt missriktad" och sade att det fanns "inga bevis" det skulle minska energiräkningar.
Dricksvatten kan vara förorenat med metangas och kemikalier på grund av fracking, vattenföretag har varnat.