Kommissionen för vårdkvalitet fann att tre fjärdedelar av de 79 sjukhusförvaltningar som besöktes inom ramen för det nya inspektionssystemet hittills hade säkerhetsproblem.
Över 40 % av vård- och omsorgshemmen och hemvården och en av tre GP-tjänster hade också problem med säkerheten.
Brist på personal – i fråga om kompetens och antal – identifierades som en viktig fråga.
Det sätt på vilket läkemedel hanterades och hur misstag undersöktes och lärdes av belystes också.
Bland de enskilda fall som uppmärksammades var följande:
Resultaten - som finns med i CQC:s årsrapport - är i själva verket en uppdatering efter halva tiden av det nya hårdare inspektionssystemet i Ofsted-stil.
De omfattar de första 14 månaderna av inspektionsprogrammet, som inleddes i april 2014 och förväntas till stor del vara slutfört i april 2016.
Hittills har mer än 5 000 organisationer inspekterats - nästan hälften av sjukhusen, 17 procent av vården och 11 procent av GP-operationerna och de som tillhandahåller tjänster utanför hemmet.
De som anses vara mest riskutsatta har dock i första hand varit målinriktade, så graden av misslyckande är inte nödvändigtvis representativ för den totala sektorn.
I enlighet med artikel 5 i förordning (EU) nr 1307/2013 ska kommissionen, i enlighet med artikel 5 i förordning (EU) nr 1307/2013, anta delegerade akter i enlighet med artikel 264 i förordning (EU) nr 1303/2013, för att se till att det finns ett tillräckligt med utrymme för skönsmässig bedömning i enlighet med artikel 5 i förordning (EU) nr 1303/2013.
inspekterade organisationer
14 månader
i 24-månaders inspektionsprogram
47 % av de undersökta sjukhusen
17 % av socialvården
11 % av GP-tjänsterna
Under inspektionerna tittar CQC-experter på en rad olika frågor, bland annat kvaliteten på ledningen, om personalen bryr sig och om säkerheten.
Varje organisation - från GP kirurgi till sjukhus - får ett betyg för varje, vilket resulterar i en övergripande bedömning av otillräcklig, kräver förbättring, bra eller enastående.
Resultaten av dessa publiceras i stor utsträckning under året, medan man i denna rapport tar upp några av de gemensamma problem som identifierats under hela processen.
Av alla de frågor som behandlades sade CQC att de flesta farhågor hade väckts om säkerheten.
Omkring 13 % av sjukhusen bedömdes som osäkra, 10 % av de sociala tjänsterna och 6 % av de allmänna sjukvårdstjänsterna.
När de som bedöms inte vara säkra nog ingår, det ger siffrorna med säkerhetsproblem till 74% för sjukhus, 43% för socialvård och 31% för allmänläkare.
I betänkandet sades det att ett förbättrat ledarskap var nyckeln till att ta itu med problemen.
David Behan, CQC:s verkställande direktör, berättade för Radio 4's Today-programmet: "Det vi vet från vår rapport och från annan forskning är att ledarskapet i en organisation sätter kulturen i den organisationen.
– Om ledarskapet säger att det viktiga här är kvalitet och säkerhet så är det vad folk tar hand om.
Royal College of Nursing generalsekreterare Janet Davies anser att ekonomiska problem är en viktig faktor - förra veckan avslöjades att truster redan hade rasat upp ett underskott på nästan 1 miljard pund under de första tre månaderna av detta räkenskapsår, större än överskjutande för hela 2014-15.
Hon tillade att vården, vare sig på sjukhus, vårdhem eller i samhället, var beroende av att ha rätt antal anställda med rätt kompetens och stöd.
Hon tillade: "Det måste investeras mer i att utbilda sjuksköterskor, hålla sjuksköterskor och lyssna på sjuksköterskor."
Katherine Rake, chef för Healthwatch England, patienten vakthund, sade att det var viktigt att lära av misstag, beskriva de problem som lyfts fram som "oacceptabel".
"Vi vill nu se alla tjänster fungera med rätt kultur av öppenhet och insyn när saker går fel", sade hon.
Men Rob Webster, NHS Confederation, som representerar truster, varnade för det ekonomiska trycket och den negativa publiciteten som skapade en "toxisk miljö", som i sin tur hade orsakat en "revolverande dörr för NHS ledarskap".
"[Detta] är dåligt för hälso-och sjukvården, och dåligt för patienterna", sade han.
Säkerhet inom NHS- och vårdsektorerna i England är en "betydande oro", med särskilda problem på sjukhus, inspektörer varnar.