Han är den andra belgiska cyklister att dö i lika många dagar efter Antoine Demoitie drabbades av en motorcykel under Belgiens Gent-Wevegem ras.
Myngheer, som blev professionell förra året, hade varit i koma.
Hans team, Roubaix Metropole Lille, sa i ett uttalande: "Han förlorade sin sista tävling efter att ha kämpat som en mästare."
Myngheer drog upp i svårigheter 20 miles från linjen i första etappen av loppet i Porto-Vecchio på lördag.
Han drabbades av hjärtattacken i en ambulans, innan han förflyttades med helikopter till sjukhus, där han sattes på konstgjord andning och föll i koma. Enligt hans team har Myngheers organ donerats.
Den brittiske cyklisten Mark Cavendish tweetade: " Sådana fruktansvärt sorgliga dagar i den professionella cykelvärlden. Ännu en tragisk förlust.
"RIP Daan Myngheer. Mina tankar är hos dina nära och kära."
Trek-Segafredo laget tillade: " Cykelfamiljen förlorar en annan ung talang. Våra tankar går till de nära och kära i Daan Myngheer."
Den senaste tragedin kommer efter att Demoitie, 25, dödades när han blev påkörd av en motorcykel på måndagen.
Olyckan inträffade efter att flera ryttare kraschade när de passerade genom norra Frankrike under söndagens Gent-Wevegem endagslopp.
Demoitie, som red för Wanty-Gobert laget, fördes till sjukhus i Lille men dog någon gång senare.
I januari skadades sex åkare från Giant-Alpecin laget, inklusive tyska John Degenkolb och fransmannen Warren Barguil, i en kollision med en bil under en träningsresa söder om Valencia.
Cyclist Daan Myngheer, 22 år, har avlidit på sjukhus efter en hjärtattack under det första stadiet av Criterium International på Korsika.