Den sjätte placerade Shrimpers hade inflytelserik midfielder Ryan Leonard skickade iväg 20 minuter från tiden när spelet var fortfarande mållös.
Men strejker från Nile Ranger och Theo Robinson och en paus-tid straff av Anthony Wordsworth såg Phil Brown sida säkra en fjärde på varandra följande seger.
Oldham skuggade något en händelselös första halvlek men misslyckades allvarligt med att testa Shrimpers debutant målvakt Christian Walton.
Latics skulle ha tyckt om sina chanser när Leonard blev avskedad för en sen utmaning på Ousmane Fane men uppsägningen verkade sätta igång Southend.
Ranger bröt dödläget i 75: e minuten när han nettade för den fjärde matchen i följd, knacka hem en korrekt korsning från Robinson.
Tre minuter senare körde Robinson hem en höger frispark från Wordsworth innan Wordsworth avslutade poängen från straffplatsen i stopptid.
Straffet utdelades efter att Peter Clarke störtade Jermaine McGlashan och Wordsworth gjorde inget misstag med en bestämd insats från 12 yards.
Matchrapport från Pressföreningen.
Matchen slutar, Southend United 3, Oldham Athletic 0.
Andra halvleken, Southend United 3, Oldham Athletic 0.
Mål!  Southend United 3, Oldham Athletic 0. Anthony Wordsworth (Southend United) konverterar straffet med en vänster fotad skott till nedre högra hörnet.
Straffet Southend United. Jermaine McGlashan drar ett brott i straffområdet.
Straff som medgavs av Peter Clarke (Oldham Athletic) efter ett brott i straffområdet.
Connor Ripley (Oldham Athletic) visas det gula kortet.
Försök missade. Oliver Banks (Oldham Athletic) höger fotade skott utanför lådan är för hög.
Theo Robinson (Southend United) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Ryan McLaughlin (Oldham Athletic).
Jermaine McGlashan (Southend United) vinner en frispark på högerkanten.
Foul av Anthony Gerrard (Oldham Athletic).
Nile Ranger (Southend United) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Peter Clarke (Oldham Athletic).
Försöket räddades. Michael Ngoo (Oldham Athletic) vänster fotade skott från utsidan rutan sparas i nedre högra hörnet.
Foul av Nile Ranger (Southend United).
Tope Obadeyi (Oldham Athletic) vinner en frispark på vänsterflygeln.
Försök missade. Lee Erwin (Oldham Athletic) höger fotade skott från utsidan lådan är hög och bred till vänster.
Substitution, Oldham Athletic. Aiden O'Neill ersätter Paul Green.
Nile Ranger (Southend United) vinner en frispark på vänsterflygeln.
Foul av Oliver Banks (Oldham Athletic).
Försök missade. Lee Erwin (Oldham Athletic) vänster fotade skott utanför lådan är bara lite för hög.
Nile Ranger (Southend United) vinner en frispark i defensiva halvan.
Foul av Peter Clarke (Oldham Athletic).
Substitution, Oldham Athletic. Ryan Flynn ersätter Josh Law.
Substitution, Oldham Athletic. Michael Ngoo ersätter Ousmane Fane.
Mål!  Southend United 2, Oldham Athletic 0. Theo Robinson (Southend United) huvud från mitten av rutan till nedre vänstra hörnet. Hjälpt av Anthony Wordsworth med ett kors.
Ryan McLaughlin (Oldham Athletic) visas det gula kortet för en dålig foul.
Jermaine McGlashan (Southend United) vinner en frispark på högerkanten.
Foul av Josh Law (Oldham Athletic).
Mål!  Southend United 1, Oldham Athletic 0. Nile Ranger (Southend United) höger fotade skott från mitten av lådan till nedre högra hörnet. Hjälpt av Theo Robinson.
Substitution, Southend United. Michael Timlin ersätter Simon Cox.
Försök missade. Oliver Banks (Oldham Athletic) vänster fotade skott utanför lådan missar till vänster.
Ryan Leonard (Southend United) visas det röda kortet.
Foul av Ryan Leonard (Southend United).
Ousmane Fane (Oldham Athletic) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Ben Coker (Southend United) visas det gula kortet.
Paul Green (Oldham Athletic) visas det gula kortet.
Ben Coker (Southend United) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Peter Clarke (Oldham Athletic).
Försök missade. Simon Cox (Southend United) höger fotade skott från mitten av lådan är bara lite för hög.
Tioman Southend grävde djupt för att säkra en dramatisk seger över Oldham på Roots Hall.