Siffran är en stor ökning av de 89 bortföranden av barn som Unicef rapporterade förra månaden.
Deras senaste uttalande skyllde på en milisgrupp som var allierad med regeringen.
Sydsudan befinner sig i ett inbördeskrig med styrkor som är lojala mot president Salva Kiir och kämpar mot rebeller under ledning av den tidigare vicepresidenten Riek Makar.
Kampanjgruppen Human Rights Watch har anklagat båda sidor för att använda barnsoldater.
Unicef sa att pojkarna kidnappades av Shilluk Militia, under kontroll av Johnson Oloni. Regeringen har tidigare sagt att den inte har någon kontroll över gruppen.
"Vi fruktar [barnen] går från klassrummet till frontlinjen", sade Unicefs representant i Sydsudan, Jonathan Veitch.
Vittnen rapporterar att de ser barn som är så unga som 12 och bär vapen, enligt FN.
Övertagandet av pojkarna skedde i ett område som kallas Wau Shilluk, i oljerika Upper Nile-staten.
FN tror att 12 000 barn användes som barnsoldater över hela Sydsudan förra året.
Omkring 1,5 miljoner människor har fördrivits av striderna i landet och 2,5 miljoner människor lider av allvarlig livsmedelsbrist.
Hundratals pojkar i Sydsudan har kidnappats och tvingats bli barnsoldater, säger FN:s barnbyrå.