Flynns sida är 22:a i League Two, två punkter ovanför Hartlepool på den slutliga nedflyttningsplatsen.
En vinst kommer att säkerställa Exiles kvar i EFL, men om Pools slog titel-kramande Doncaster Rovers, kunde de återvända till National League.
"Om vi vinner, kommer det att bli den största festen i Newport under en lång tid," Flynn berättade BBC Radio Wales.
Han fortsatte: " Jag kommer inte att dra några slag eller klä upp det, det är det största spelet [i deras moderna historia] av så många skäl. Det betyder så mycket för klubben och fantastiska fans och för mig."
Newport slogs 2-1 av Carlisle United på lördag efter att ha lett i 12: e minuten i ett spel som kunde ha slagit in sin EFL överlevnad.
Flynn säger att spelet mot Notts County kommer att vara svårt att titta på men tror att hans sida kan ta segern de behöver för att hålla sig uppe.
"Det kommer att bli fasansfullt, det kommer att vara nervvrickande men jag tror verkligen att pojkarna kommer att leverera eftersom de har varit lysande och jag kan inte be om mycket mer så jag är tyst självsäker men det kommer att bli en stressig tid," sade han.
"Vi har haft några otroligt tuffa matcher med tanke på ligan och position vi var i men de har svarat på allt och varje gång vi har förlorat, vi har haft ett bra svar så jag hoppas att vi får en på lördag."
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Newport County chefen Mike Flynn säger att deras match mot Notts County är den största i klubbens senaste historia.