En begäran om informationsfrihet från Huffington Post UK fann att kostnaden för en resa med enbart statliga dokument ofta hade överskridit 100 pund.
Den totala räkningen skulle kunna vara högre eftersom det inte fanns några siffror för ytterligare resor med poolbilar.
Regeringen sade att det hade skett en "väsentlig minskning" av kostnaderna för ministerbilar sedan 2011.
David Cameron tillkännagav planer på att krympa räkningen för ministerbilar kort efter att ha kommit till ämbetet 2010, och antalet ministrar med tillgång till sin egen chaufför-driven bil minskade.
Bruket att bära ministrarnas "röda lådor" i officiella bilar används för känslig dokumentation.
2010 skrev journalisten Sarah Vine, fru till den dåvarande utbildningssekreteraren Michael Gove, att medan hennes man kunde resa hem med kollektivtrafik, hans röda låda skulle resa separat "i luftkonditionerad prakt, välbekant och säker i baksidan av en låst bil".
De röda lådorna reste ensamma med hjälp av den statliga biltjänsten 1 910 gånger mellan 2012-13 och 2014-15, med antalet resor ökar under de tre åren.
2011-12 £110,865
2012-13 £ 65,447,70
2013-14 £56,581,28
2014-15 £79,426,23
2015-16 £41,520.58
Källa: Begäran om information till transportministeriet
Sedan 2012, pool bilar har också använts av avdelningar men deras användning registreras inte av DfT, avdelningen sade.
Labour MP Graham Jones sade till Huffington Post: "The Tories sade att de skulle slå ner på slösaktiga utgifter men de fortfarande tillåter hundratusentals pounds av skattebetalarnas pengar att spendera färja runt portföljer i chaufför-drivna bilar."
Men transportministeriet sade att den totala kostnaden för att bära ministrarnas pappersarbete bara var 5 procent av den totala kostnaden för regeringens biltjänst och att man åtog sig att se till att tjänsten gav valuta för pengarna.
En taleskvinna tillade: " Det är därför som antalet bilar som utgör tjänsten sedan 2010 har minskat från 227 till 78.
– Vi har också arbetat hårt för att minska våra driftskostnader för att ytterligare minska kostnaden för statskassan.
"Innan april 2012 var alla bilar en del av en statlig bilpool och kunde bokas separat av ministrarna. Efter april 2012 anslogs bilar till departementen som poolbilar för ministrarnas bruk. Dessa bilar sköts av varje avdelning."
Chauffeuring ministrarnas papper runt Whitehall har kostat mer än £ 350.000 sedan 2011, siffrorna visar.