Colin Ferrie, 52, från Waters Walk, Apperley Bridge, Bradford har också anklagats för att inneha en C-drog.
Han kommer att närvara vid Leeds Magistrates domstol den 18 augusti tillsammans med Scott Pendlebury, Daisy Fields i Bradford, som anklagas för samma brott.
Det följer på vad Mail gjorde i söndagstidningen förra året om dr Ferries påstådda narkotikamissbruk.
West Yorkshire-polisen sa att en 23-årig man från Bradford, som också greps som en del av utredningen, hade frigivits från borgen och skulle inte ställas inför några ytterligare åtgärder.
En annan man som intervjuades under försiktighet efter att frivilligt ha varit med vid en polisstation kommer inte heller att ställas inför några ytterligare åtgärder.
Leeds Teaching Hospitals NHS Trust sa att dr Ferrie, en barnneurolog som specialiserat sig på epilepsi, inte längre arbetade där.
En före detta barnläkare från Leeds General Inservary har åtalats för innehav av kokain.