Tentativ forskning som publicerats tidigare denna vecka föreslog upprepade rubriker under en spelares karriär kan kopplas till långsiktiga hjärnskador.
Forskningen undersökte hjärnorna hos sex spelare kända för att leda bollen - alla som senare utvecklade demens.
Fotbollsföreningen har sagt att den kommer att titta närmare på området, men ännu inte tillkännage sin egen studie.
Den europeiska fotbollens styrande organ Uefa säger att projektet, som kommer att inledas på fredag, "ska bidra till att fastställa de risker som unga spelare utsätts för under matcher och träningspass".
En Premier League klubb kommer att vara med i studien.
FA säger att det är engagerat för att stödja forskning om degenerativ hjärnsjukdom bland tidigare spelare, men myndigheter i engelsk fotboll har kritiserats för en upplevd motvilja mot att ta itu med frågan.
I april sade FA:s medicinska chef dr Ian Beasley att organisationen ville att Fifa skulle undersöka saken.
Han sade att det skulle vara "att ta några forskningsfrågor till Fifa snart" efter det avslöjades tre medlemmar av Englands Cup trupp 1966 - Martin Peters, Nobby Stiles och Ray Wilson - hade Alzheimers.
Ian St John, som spelade för Liverpool mellan 1961-71, säger sex av sina lagkamrater - från en grupp på cirka 16 spelare - nu har Alzheimers.
"Jag vet inte varför FA och PFA har täckt upp detta i åratal", sade han på Victoria Derbyshire programmet.
"Jag pratade om det med PFA för ett par år sedan, och deras svar var: "Ja, kvinnor får demens, så därför är det inte en industriell skada." Vilket är en massa nonsens är det inte?"
Före detta England och West Brom-strejkaren Jeff Astle, dog 59 år och led av tidig demens. Utredningen av hans död 2002 visade att han upprepade gånger hade gått i tung läderfotboll och bidragit till att hans hjärna hade skadats.
Hans dotter Dawn Astle, som talade med BBC Radio 5 i direktsändning, sade: " Vid rättsläkarens förhör försökte fotbollen sopa hans död under en matta. De ville inte veta, de ville inte tro att fotboll kan vara en mördare och det är det tyvärr. Det kan det vara."
I slutet han "inte ens visste att han någonsin hade varit en fotbollsspelare", sade hon, innan hon tillade: "Allt fotboll någonsin gett honom, fotboll hade tagit bort."
Uefas projekt följer liknande initiativ inom andra sporter.
I september, amerikanska fotboll National Football League (NFL) meddelade att det skulle spendera $ 100m ( £ 80m) på medicinsk och teknisk forskning för att öka skyddet för spelare, efter att ha kommit överens om en $ 1 miljard ( £ 800m) uppgörelse för att kompensera före detta spelare som hade drabbats av hjärnskador.
Den siffran avtalades i april efter en stämning av 5.000 tidigare spelare som framgångsrikt hävdade NFL dolde farorna med upprepade huvud trauma.
En undersökning av rugbyhälsan i Storbritannien undersöker redan de långsiktiga hälsoeffekterna av att spela rugby, inklusive effekterna av att ofta drabbas av hjärnskakning.
Detta följde på ett forskningsprojekt i World Rugby, som publicerade fynd av en potentiell koppling mellan frekvent hjärnskakning och hjärnskada 2015.
Men dess ledande forskare sade att det var "svårt" att dra robusta slutsatser och att lägga till "ytterligare forskning krävdes".
Forskare från University College London och Cardiff University undersökte hjärnorna hos fem personer som hade varit professionella fotbollsspelare och en som hade varit en engagerad amatör under hela sitt liv.
De hade spelat fotboll i genomsnitt 26 år och alla sex fortsatte att utveckla demens i 60-årsåldern.
När forskare utförde obduktionsundersökningar fann de i fyra fall tecken på hjärnskada som kallas kronisk traumatisk encefalopati (CTE).
CTE har kopplats till minnesförlust, depression och demens och har setts i andra kontaktsporter.
Men vetenskapen är långt ifrån klar. Varje hjärna visade också tecken på Alzheimers sjukdom och några hade blodkärlsförändringar som också kan leda till demens.
Forskare spekulerar att det var en kombination av faktorer som bidrog till demens hos dessa spelare, men de erkänner att deras forskning inte definitivt kan bevisa en koppling och kräver större studier.
Football Association välkomnade studien och sade forskning var särskilt nödvändigt för att ta reda på om degenerativ hjärnsjukdom är vanligare hos ex-fotbollare.
Dr Charlotte Cowie, av FA, tillade: "FA är fast besluten att stödja denna forskning och är också fast besluten att se till att varje forskningsprocess är oberoende, robust och grundlig, så att när resultaten dyker upp, alla i spelet kan vara säker på sina resultat."
BBC sport nyheter korrespondent Richard Conway
Många tidigare spelare har varit kritiska mot en upplevd motvilja från FA och andra att vidta åtgärder över en potentiell koppling mellan fotboll och demens.
Att bevisa en definitiv koppling är svårt, men ny forskning visar att det kan finnas ett orsakssamband mellan att leda en boll och hjärnsjukdomar i senare liv.
Men är det bara en fråga för spelare i en tidigare generation, som använde tunga läderfotbollar? Eller finns det fortfarande ett problem i modern tid?
Det behövs svar. Det är redan för sent för dem som lider, eventuellt som ett resultat av att spela spelet.
Men det kan hjälpa många att oroa sig för om de kommer att drabbas när de blir äldre.
Uefa har beställt ett forskningsprojekt som ska undersöka kopplingarna mellan demens och fotboll.