Ett misstänkt paket upptäcktes i Harewood Street, nära Victoria Gates köpcentrum, ca 08:40 GMT.
Närliggande byggnader evakuerades tills experter på bombhantering kunde förklara föremålet säkert vid ungefär middagstid.
Polisen sa att en 35-årig man som greps i samband med incidenten hölls häktad.
Ch Supt Paul Money sade: "Klart att detta orsakade betydande störningar för människor som bor och arbetar i stadens centrum och för lokala företag och vi vill tacka alla för deras tålamod och stöd under denna händelse."
En man har gripits i samband med en bomb bluff som ledde till att ett stort område av Leeds centrum spärrades av.