Lönerna skulle betalas den 28 oktober men ägaren Diego Lemos sade förra veckan att "oväntade kassaflödesproblem" hade förhindrat att det hände.
"Alla löner har nu betalats och återigen ber jag varje anställd om ursäkt för förseningen i betalningen," Lemos berättade klubbens webbplats.
Räkor Tom Barkhuizen, under tiden, har ömsesidigt gått med på att avbryta sitt avtal.
Den 23-årige framåt gick 2015 från Blackpool och Morecambe har sagt att de behåller rätten till ersättning för spelaren.
Shrimps boss Jim Bentley hade berättat BBC Radio Lancashire ett alternativ de hade övervägt var att sälja en spelare för att samla in pengar, medan Professional Footballers' Association hade hanterat lönesituationen.
Den brasilianske affärsmannen Lemos köpte räkorna den 1 september och tog över från Peter McGuigan.
League Two sida Morecambe har bekräftat att alla spelare och personal har betalats efter en försening.