Byrån säger att mer än 700 dykare har besökt platsen, 4000 meter under vatten utanför Kanadas kust.
Fartyget kommer att omfattas av 2001 års konvention om skydd av undervattenskulturarv när det passerar 100-årsjubileet av sin förlisning den 15 april.
Konventionen syftar till att förhindra ovetenskaplig eller oetisk utforskning.
Irina Bokova, generaldirektör för Unesco, sade att Titanics förlisning var "anchored in the memory of humanity" och det var viktigt att skydda platsen där 1.500 människor förlorade sina liv.
"Det finns tusentals andra skeppsbrott som behöver skyddas också... Vi tolererar inte plundring av kulturella platser på land, och detsamma bör gälla för vårt sjunkna arv", tillade hon.
2001 års konvention skyddar bara fartyg som sjönk för mer än hundra år sedan.
Titanic, som byggdes i Belfast, sjönk på sin jungfruresa efter att ha gett sig av från den brittiska hamnen i Southampton.
Den träffade ett isberg utanför Newfoundlands kust i Kanada på väg till New York och sjönk två och en halv timme senare.
Förlisningen av Titanic kommer att komma under beskydd av FN: s kulturbyrå Unesco.