Den 21-åriga, en del av Storbritanniens C1-lag händelse vinnare på fredag, avslutade mer än två sekunder före Tjeckiens Tereza Fiserova i Tacen, Slovenien på lördag.
"Att vinna två guld i helgen är riktigt spännande", säger Woods.
Det var en andra europeisk singlar guldmedalj för Woods efter hennes 2015 framgång.
Storbritanniens Kimberley Woods vann en andra Kanot Slalom EM guld på två dagar med seger i C1 kvinnors kanot singlar.