Francis Benali, som gjorde mer än 300 framträdanden för Southampton FC, sprang ett maratonlopp och cyklade 120 kilometer varje dag i fjorton dagar i oktober.
Stadsfullmäktige godkände enhälligt ett förslag som gav honom hedersfrihet i staden vid ett särskilt möte tidigare.
Benali, 47, beskrev att ta emot äran som "en fullständig överraskning".
"Det är bara underbart att tänka på", tillade han.
Hedern tilldelades som erkännande av Benalis fond att höja prestationer för välgörande ändamål, liksom de som en spelare och tränare på Saints, sade myndigheten.
Det ger inga rättigheter eller privilegier, såsom att köra får genom staden, och är "rent ceremoniella", tillade det.
Den 1000-milsväg som förbinder 44 fotbollsklubbar tog honom till södra Wales, Midlands och nordväst, innan han korsade landet och återvände via östra Anglia och London.
Han tog upp mer än 390 000 pund för cancerforskning.
Benali fick stående ovationer från fans när han anlände till St Mary's Stadium vid halvtid under en hemmamatch mot Burnley den 16 oktober.
Det följde en annan utmaning i 2014 som såg honom köra mellan 20 Premier League arenor och höja mer än Â£265.000 för välgörenhet.
Som ett resultat av detta delades han ut Barclays Spirit of the Game utmärkelse i december 2014, erkänd som Cancer Research UK Flame of Hope Award Vinnare 2015, Fundraising Volontär av året och även Just Ging Celebrity Fundraiser av året 2015.
Andra personer att ha fått äran i Southampton inkluderar före detta Saints chefer Ted Bates och Lawrie McMenemy, tidigare spelare Matthew Le Tissier, och första världskriget en premiärminister David Lloyd George.
En före detta fotbollsspelare i Southampton som sprang och cyklade till varje Premier League- och Championshipstadion på två veckor har beviljats stadens frihet.