Hughes, 19 år, föddes på det brittiska utomeuropeiska territoriet Anguilla, men har haft brittiskt pass sedan födseln.
"Jag har alltid vetat att om jag skulle köra på OS skulle det vara i en brittisk väst", sade han.
I mars 2014, Hughes bröt jamaicanska sprinter Yohan Blakes 100m junior rekord med en tid på 10.12 sekunder och nästan slå Bolt på 200m nyligen.
Han var kantad ut på New York Diamond League möte i juni med jamaicanska 100m och 200m olympiska mästare Usain Bolt klockar en tid av 20,29.
Anguillans kan tävla på Samväldesspelen och VM, men idrottare från ön kan inte delta i OS eftersom Anguilla inte erkänns av Internationella olympiska kommittén.
Hughes sa 2014 att tävla om Team GB "skulle vara det bästa valet", något som han nu är berättigad till.
Amerikanska Cindy Ofili (100m hinderare) har också haft brittisk nationalitet sedan födseln, medan landsmän Shante Little (400m hinderare) och Montene Speight (400m löpare), plus svenskfödd hög hoppare Victoria Dronsfield, alla innehar brittisk nationalitet.
Ofili, den yngre systern till hinderar Tiffany Porter, sprang ett personligt bäst av 12,60 sekunder i Eugune i juni - den sjunde snabbaste tiden i världen i år.
Tillkännagivandet kritiserades dock av den brittiske idrottsmannen Richard Kilty, medan före detta heptathlete Kelly Sotherton sade att hon var "inte säker på det".
Högklassad sprinter Zharnel Hughes har bedömts vara berättigad att tävla om Team GB.