Investerarna ryckte av uppgifter som visade att de centrala konsumentpriserna sjönk med 0,1 % i augusti jämfört med året innan - den första årliga nedgången sedan april 2013.
Prisnedgången, som omfattar oljeprodukter men inte färska livsmedel, hade förväntats av ekonomer.
Japans referensindex Nikkei-index hamnade på 1,8 % på 17 880.51.
Aktierna i Sharp föll så mycket som 10% efter Nikkei-affären dagligen sade att det var troligt att rapportera en halvårsförlust på 30 miljarder yen ($250m; £163m) som ett resultat av svag försäljning av LCD-paneler för smartphones.
På valutamarknaderna steg US-dollarn i handeln med Asien efter chefen för US Federal Reserve Janet Yellen sade att centralbanken fortfarande var på rätt spår för att höja räntorna senare i år.
Dollarn var upp till 120.32 yen från omkring 120.00 yen före hennes tal.
I Kina fortsatte investerarna att smälta de blandade nyheter som kom ut ur ekonomin denna vecka.
En preliminär läsning av Kinas fabriksverksamhet sjönk till den svagaste nivån sedan 2009, men hempriserna steg för fjärde månaden, vilket tyder på tillväxt.
Shanghai Composite stängde 1,6% vid 3.092.35, medan Hong Kongs Hang Seng index steg 0,4% till 21.186.32.
I Australien stängde S&P/ASX 200-indexet 0,6 % vid 5,042,10.
Sydkoreanska aktier föll trots en centralbanksundersökning som visade att konsumenternas känslor hade nått en fyra månaders hög i september.
Riktmärket Kospi slutade ner 0,2% vid 1.942.85.
Japanska aktier slutade högre på fredag, vilket återvann en del av förlusterna under föregående session när marknaden förlorade nästan 3%.