Andrew Bedford, 27, från Huntingdon, sågs senast kl 18:20 BST fredagen den 28 september 1990 på Factory Bank, utanför Great Whyte, Ramsey.
Tre personer greps då, men ingen åtalades.
Specialutrustning används för att identifiera störningar i jorden nära Stocking Fen Road i Ramsey.
Utredningen av mr Bedfords försvinnande inleddes på nytt som en mordutredning på fredag.
Polisen tror nu att han sköts död någon gång under kvällen han sågs senast.
Det Sgt Gordon Blair sade: " Nya underrättelser har gjort det möjligt för oss att identifiera detta område [Stocking Fen Road] som en livskraftig plats att söka i syfte att återvinna potentiella bevis.
"Detta kan innefatta bevis på hur Andrew dödades eller var hans kvarlevor finns idag."
Mr Bedford sågs senast äta en hämtmat i en ljusblå Ford Cortina bil.
Han bar overall, en khaki hoppare, jeans och tränare. Han beskrevs som 5ft 8in (1,72m), medelstor byggnad med musigt blont, lockigt, axellångt hår och hade ett antal tatueringar.
Den huvudmisstänkte för skottlossningen är nu död, "men andra inblandade har aldrig ställts inför rätta", sade en talesman för polisen.
Poliser som utreder ett mord på en man i Cambridgeshire för 25 år sen har börjat gräva i ett område nära där han senast sågs levande.