Han sade att man inte sökte någon fördel för Storbritanniens 264 idrottsmän i Rio.
Man har uttryckt oro över att vissa paralympiska idrottsmän avsiktligt inte stämmer överens med varandra.
Men Hollingsworth sa: "Vi är här för att vinna medaljer, men inom både bokstaven och andan av Paralympics."
Baroness Tanni Grey-Thompson, en 11-faldig paralympisk mästare, har sagt frågan "går till hjärtat av integriteten i sporten".
International Paralympic Committee (IPC) säger att systemet är alltid under översyn, medan UK Athletics sade att det kommer att se över klassificeringar efter Rio.
Paralympikerna börjar den 7 september och pågår till den 18 september.
Klassificeringssystemet sätter idrottare i grupper beroende på graden av deras funktionsnedsättning för att försöka säkerställa rättvis konkurrens.
Men brittiska T37 200m sprinter Bethany Woodward berättade för Sunday Times att hon skulle dra sig tillbaka från ParalympicsGB trupp för Rio och hade förlorat tron på hur laget valdes.
Woodward, 23, som har cerebral pares, sade: "Jag representerade mitt land under en lång tid men om jag inte kan konkurrera som jag brukade tävla, eftersom de har fört in människor som inte är som jag när det gäller funktionshinder, vad är poängen?"
UK Athletics har sagt att Woodward inte beaktade urvalet eftersom hon inte hade uppfyllt de nödvändiga kriterierna.
Det har också hävdats att vissa konkurrenter försöker manipulera sin klassificering för att konkurrera mot idrottare med svårare funktionsnedsättningar och därmed förbättra sina chanser till framgång.
En färsk IPC-rapport fann inga tydliga bevis för "avsiktlig förvrängning" efter att ha analyserat omkring 80 fall.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
IPC chef Sir Philip Craven har försvarat klassificeringssystemet men berättade BBC Radio 4's Today program det var "permanent ses över".
"Det är ett utvecklande system och en utvecklande vetenskap", sade han.
Frågade om det fanns en "risk" vissa länder var alltför angelägna om att vinna medaljer, Craven sade att han inte skulle "svara på den frågan", tillägger: "Alla länder är mycket angelägna om att prestera bra och prestera inom reglerna."
Tidigare Paralympic simmare Natalie Jones sade klassificera idrottare var ett "verkligen svårt jobb", med mer än 4.000 idrottare att testa över hela världen.
Men Hollingsworth insisterade: " Vi är mycket fokuserade på att få rätt idrottare i rätt klass. Vi har ingen som går in i spelen enligt vår uppfattning som inte har den lämpliga klassificeringen.
"Jag ifrågasätter en åsikt att det som har diskuterats under de senaste dagarna bör leda till slutsatsen att det är något i den riktningen som pågår."
Baronessan Tanni Grey-Thompson sa till BBC Radio 5 live:
Verkligheten är att idrottare kommer att falla ena sidan av linjen eller den andra och det är vad som händer när du har dessa grupperingar.
Det gamla systemet brukade vara mycket handikappspecifikt. De flyttar den till sportspecifika så det är hur din funktionsnedsättning påverkar dig att göra den sporten.
Det finns ett system på plats och idrottare måste ha tro och folk som tittar måste ha tro på att systemet har rätt. Det betyder inte att det inte utvecklas och inte förändras och behöver undersökas då och då för att kontrollera att det är okej.
Vi måste lita på att idrottarna är i rätt klass.
Påstår att klassificeringssystemet för funktionshindrade idrottare manipuleras för att öka medalj chanserna har förkastats av British Paralympic Association boss Tim Hollingsworth.