Repressiv narkotika brottsbekämpning driver höga nivåer av infektion bland injektionsmissbrukare, sägs det.
Resurserna måste omdirigeras till behandling och förebyggande åtgärder.
Kommissionen uppskattade att av 16 miljoner människor världen över som injicerar droger lever 10 miljoner med hepatit C.
Detta sätter dem i riskzonen för fatal och försvagande leversjukdom.
Globala kommissionen uppmanade regeringarna att avkriminalisera användningen av narkotika och tillhandahålla system, såsom de som ger tillgång till sterila nålar, för att stoppa spridningen av sjukdomen.
Gruppen, som omfattar sju tidigare presidenter, f.d. FN-chef Kofi Annan och andra världsledare, har tidigare kopplat det "misslyckade" kriget mot droger till spridningen av hiv.
I sin senaste rapport står det i vissa länder med den hårdaste narkotikapolitiken att mer än 90 procent av de människor som injicerar droger lever med hepatit C.
Östeuropa och Centralasien har sett den snabbaste smittspridningen och det största antalet infektioner har rapporterats i Kina, Ryssland och USA.
I den senaste rapporten varnade kommissionen för en starkt påtvingad politik som kriminaliserar narkotikamissbrukare från den offentliga hälso- och sjukvården och låser in ett stort antal injektionsmissbrukare som vidmakthåller spridningen av smittan.
Hepatit C är mycket smittsam och omkring en fjärdedel av dem med kronisk infektion kommer att utveckla dödlig leversjukdom.
Men sjukdomen kan gå oupptäckt i flera år med inga eller få symptom och många människor är helt omedvetna om att de är smittade.
Regeringarna "måste omedelbart omdirigera resurser bort från "kriget mot narkotika" och till folkhälsostrategier som maximerar förebyggandet och vården av hepatit C", rekommenderades rapporten.
"Hepatit C måste vara en av de mest grovt felberäknade sjukdomar av regeringar på planeten", sade kommissionsledamot Michel Kazatchkine, som också är FN: s generalsekreterares särskilda sändebud om hiv/aids i Östeuropa och Centralasien.
"Det är en skam att knappt en handfull länder faktiskt kan visa betydande minskningar av nya infektioner av hepatit C bland människor som injicerar droger."
I rapporten framhölls Skottlands nationella handlingsplan för hepatit C som ett exempel på bästa praxis.
Strategin lanserades 2006 och har lett till en fyr- till sexfaldig ökning av tillhandahållandet av steril injektionsutrustning och en ökning av antalet människor, främst inom läkemedelstjänster och fängelser, som testas för infektionen.
De bestämmelser som införts, som också omfattar en åttafaldig ökning av antalet fångar som får behandling för hepatit C, har lett till en minskning av antalet infektioner.
Kommissionen betonar också möjligheterna till dramatiska besparingar i ländernas hälso- och välfärdsbudgetar på lång sikt för att förhindra fall av leversjukdomar.
"Kriget mot droger är ett krig mot sunt förnuft", sade kommissionsledamoten Ruth Dreifuss, som också är den tidigare presidenten i Schweiz.
"Repressiv narkotikapolitik är ineffektiv, kränker grundläggande mänskliga rättigheter, skapar våld och utsätter individer och samhällen för onödiga risker.
"Hepatit C-epidemin, helt möjlig att förebygga och bota, är ännu ett bevis på att den narkotikapolitiska status quo har svikit oss alla totalt."
The World Hepatit Alliance sade: " Det är obegripligt att hepatit C, tillsammans med hepatit B, så konsekvent ignoreras.
– Om man jämför förekomsten av hepatit C hos narkotikamissbrukare i länder med en god skademinskning och en mer upplyst narkotikapolitik med länder utan, är det tydligt att det är en hälsokatastrof att enbart när det gäller narkotikamissbruk som en brottmålsfråga. Hepatit C, dess förebyggande åtgärder, vård och behandling måste tas upp och behandlas som den hälsofråga det är."
En brittisk regeringstalesman sade: " Denna regering är fast besluten att bryta den onda cirkeln av missbruk och narkotikamissbruk förblir på sin lägsta nivå sedan rekordet började.
"Det bästa skyddet mot droger är inte att ta dem i första hand, men vi måste se till att god vård finns tillgänglig för dem som vill behandla sitt missbruk - och vi ser en ökning av antalet användare som lämnar behandlingsprogram utan droger."
Det globala kriget mot droger underblåser en hepatit C-pandemi som orsakar miljontals onödiga infektioner, har Global Commission on Drug Policy varnat.