Människokroppen kryllar av tusentals arter av mikrober som påverkar hälsan.
En studie visade att transplantation av tarmbakterier från feta människor till möss ledde till att djuren gick upp i vikt, medan bakterier från magra människor höll dem smala.
Resultaten publicerades i Science.
Forskare vid Washington University School of Medicine, Missouri, tog tarmbakterier från tvillingpar - en fet, en tunn.
Bakterierna sattes sedan in i möss som hade vuxit upp i helt sterila miljöer och inte hade några egna tarmbakterier.
Möss med den feta tvillingens bakterier blev tyngre och tog på sig mer fett än möss som fick bakterier från en mager tvilling - och det var inte ner till mängden mat som äts.
Det fanns skillnader i antal och typ av bakteriearter från den magra och feta tvillingen.
Totalt sett verkade det som om de från en mager tvilling var bättre på att bryta ner fibrer till kortkedjiga fettsyror. Det innebar att kroppen tog upp mer energi från tarmen, men kemikalierna förhindrade fettvävnad från att bygga upp och ökade mängden energi som brändes.
En av forskarna, Prof Jeffrey Gordon, berättade för BBC: s Science in Action program: "Vi äter inte ensam, vi äter med biljoner vänner - vi måste överväga mikroberna som lever i vår tarm."
Men kosten var också viktig för att skapa de rätta förutsättningarna för den magra tvillingens bakterier att blomstra. En bakteriefetma terapi verkar osannolikt att fungera tillsammans med en diet av fet hamburgare.
Tror du att ni alla är människor? Du kan behöva tänka om.
För varje cell som utgör människokroppen finns det 10 bakterier som lever på och i den.
Denna mångfald av liv kallas mikrobiomet och det är ingen överraskning att det påverkar vår hälsa.
Det har till och med funnits patienter som har genomgått fekala transplantationer i ett försök att förändra arten av sina tarmbakterier.
Patienter med C. difficile infektioner har en obalans av bakterier som antibiotika ibland misslyckas med att behandla.
Vissa medicinska rapporter tyder på att prover som tas från en frisk tarm och leds in i patienten kan bota infektionen.
Hur stor påverkan mikrobiomet kan ha på våra liv diskuteras fortfarande, men det är ett spännande forskningsområde.
Har fekala transplantationer en medicinsk roll?
Första folkräkningen av insekter som lever på oss
Att hålla båda uppsättningarna möss i samma bur höll dem båda magra om de matades med en fettsnål kost med högt fiberinnehåll. Möss är koprofagiskt, vilket innebär att de äter varandras spillningar, och den magra tvillingens bakterier fördes in i mössen som började med bakterier som borde ha gjort dem feta.
Men, en fettrik, lågfiber kost innebar möss fortfarande staplade på pounds.
En behandling av fetma hos människor är inte trolig att man använder transplantationer av tusentals arter av bakterier från magert folks inälvor, eftersom den medför risken att också överföra infektionssjukdomar.
I stället är det mer troligt att man söker efter den exakta blandningen av bakterier som gynnar vikten - och rätt livsmedel för att främja deras tillväxt.
Prof Gordon sade att nästa steg på fältet skulle vara "försök att räkna ut hur allmänna dessa effekter är, vilka diet ingredienser kan främja deras positiva aktiviteter och att se fram emot en tid när mat och värdet av livsmedel beaktas i ljuset av mikrober som lever i vår tarm - att livsmedel måste utformas inifrån och ut samt från utsidan i."
Professor Julian Parkhill, från Wellcome Trust Sanger Institute, sade att han förväntade sig en framtid när manipulerande bakterier var en del av fetmabehandling.
"Det finns en hel del arbete att göra, men detta är bevis på konceptet att bakterier i tarmen kan modulera fetma hos vuxna, men det är kostberoende," sade han.
Han tillade att förändrade bakterier var ett lovande fält för andra sjukdomar.
Han sade till BBC: "Det är ett spännande nytt område, men jag tror att vi måste vara försiktiga när det gäller att främja det som ett botemedel.
"Det är tydligt i specifika områden - inflammatorisk tarmsjukdom, fetma, Crohns - mikrobiomet kommer att vara viktigt."
Bakterier som lever i våra inälvor verkar påverka våra midjelinjer och utnyttja dem kan leda till nya sätt att kasta pounds, USA: s forskning föreslår.