Finnen, som vann världstiteln med Ferrari 2007 men ersattes av Alonso i slutet av 2009, har tecknat ett ettårigt avtal med en option för 2015.
Ferrari, som nu kommer att ha utan tvekan den starkaste föraren line-up i Formel 1, har ännu inte meddelat affären men förväntas göra det snart.
Raikkonen, 33, kommer att ersätta Felipe Massa, som meddelade på Twitter att han kommer att lämna i slutet av säsongen.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Den brasilianska, som tidigare hade informerats om Ferrari beslut och har kört för den italienska outfit sedan 2006, sade: "Från 2014 kommer jag inte längre att köra för Ferrari.
"Jag vill tacka laget för alla segrar och otroliga stunder tillsammans.
"Just nu vill jag driva så hårt som möjligt med Ferrari för de återstående sju tävlingarna.
"För nästa år, Jag vill hitta ett lag som kan ge mig en konkurrenskraftig bil för att vinna många fler tävlingar och utmaning för mästerskapet, vilket förblir mitt största mål!"
Massa kom plågsamt nära att vinna titeln 2008, när han vann den brasilianska Grand Prix, bara för att berövas mästerskapet när Lewis Hamilton flyttade upp till den femte plats han krävde på näst sista hörnet av sista varvet.
Han har kopplats till ett drag till Lotus, som också överväger Sauber förare Nico Hulkenberg, en annan man som var i ramen på Ferrari innan de bestämde sig för Raikkonen.
Beslutet att samarbeta med Alonso med Raikkonen är en dramatisk förändring i filosofin av Ferrari, som tidigare har arbetat med en tydlig nummer ett förare, både med Michael Schumacher från 1996-2006 och sedan med Alonso under de senaste fyra åren.
Ferrari har nu beslutat att ha två ledande förare kommer att vara ett mer effektivt sätt att säkra framgång - detta var deras politik när Raikkonen och Massa var lagkamrater under 2007-9.
Beslutet kommer att tolkas i vissa delar som en snobb till Alonso, men spanjoren har fått höra om Ferrari beslut och sägs ha accepterat det.
Partnerskapet och rivaliteten mellan de två männen kommer ivrigt att förutses - Alonso och Raikkonen är allmänt erkända som två av de fyra bästa förarna i världen, tillsammans med Mercedes Lewis Hamilton och Red Bulls Sebastian Vettel.
Alonsos relation med McLaren, när han var lagkamrater med Hamilton 2007, var känd turbulent, och ructions ledde till att han lämnar laget bara ett år in i ett treårigt kontrakt.
Alonso har sedan dess gjort klart att hans problem på den tiden inte var med Hamilton men med laget inte leverera på löften som hade gjorts till honom om hans status.
Affären om att Raikkonen skulle återförenas med Ferrari slutfördes på måndagen.
Ferrari ville ersätta Massa med någon som skulle ge mer tillförlitliga prestanda och har under en tid ansett Raikkonen vara den bästa kandidaten.
Men beslutet måste godkännas av Ferrari president Luca Di Montezemolo.
Raikkonen hade möjlighet att stanna kvar på Lotus men laget kunde inte ge honom de försäkringar han begärde att de skulle ha tekniska och ekonomiska resurser för att kunna konkurrera på fronten nästa år.
De har förlorat sin högt rankade tidigare tekniska direktör James Allison till Ferrari och det har varit förseningar att betala Raikkonens lön i år.
Raikkonen är den första föraren att återvända till Ferrari efter en tidigare trollformel sedan österrikiska Gerhard Berger återförenade dem 1993 efter att ha lämnat dem i slutet av 1989 för att gå McLaren.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
När Raikkonen lämnade Ferrari i slutet av 2009 hade han fortfarande ett år på sitt kontrakt, men laget behövde göra sig av med antingen honom eller Massa för att göra plats för Alonso.
Då föredrog laget att behålla Massa. Den brasilianska hade out-scored Raikkonen på punkter 2008 och fram till 2009 tills han drabbades av en fraktur skalle i en olycka vid det årets ungerska Grand Prix.
Även om det fanns frågetecken om hans tillfrisknande, ansåg laget att de inte kunde kasta Brasilien på drift under omständigheterna.
Ferrari, som hade anställt Raikkonen som den man de förväntade sig att ta över från Michael Schumacher, ansåg också att finländarna inte hade visat det nödvändiga ledarskapet. De kände att Alonsos mer kraftfulla natur skulle ge dem det som Raikkonen inte hade.
Men spänningarna har ökat mellan Alonso och Ferrari i år efter att ha missat att vinna titeln både 2010 och 2012.
Ferrari tror att Raikkonen kommer att ge mer konsekvent stöd till Alonso och förhindra alla möjligheter att spanjoren inte producerar sitt bästa.
Kimi Raikkonen kommer att ansluta sig till Fernando Alonso på Ferrari 2014.