Institutionerna inrymde kvinnor och flickor som blev gravida utanför äktenskapet.
En undersökningswebbplats har funnit att dödligheten bland barn som fötts utanför äktenskapet år 1942 var dubbelt så hög som bland barn som fötts av gifta föräldrar.
Detaljens forskning visar också att många spädbarns död i hemmen orsakades av "allvarlig undernäring".
Webbplatsen sammanställde sin forskning genom att granska dödsattester och arkivfiler vid Public Record Office of Northern Ireland (PRONI).
Man analyserade också begravningsböcker för kyrkogården i Milltown, Belfasts största katolska begravningsplats.
Katolska kyrkans Down och Connor Diocese, som äger begravningsböckerna, sade webbplatsens avslöjanden "lägga ytterligare till vår skam".
"Dessa fynd visar hur, som en kyrka och som ett samhälle, vi har misslyckats med att skydda de mest sårbara medlemmarna i vårt samhälle," ett stift uttalande sade.
Inte alla hem var katolska; några drevs av den irländska kyrkan och Frälsningsarmén.
Tidigare invånare vid Nordirlands institutioner inleder en kampanj för en särskild offentlig undersökning av behandlingen av kvinnor och barn i hemmen.
Några av de flickor som skickades till hemmen var så unga som 13 år, men de flesta var äldre tonåringar.
Många mödrar som födde barn i hemmen uteslöts från Stormonts nyligen genomförda HIA-utredning, eftersom den bara fokuserade på offer som var under 18 år.
Kampanjen stöds av människorättsorganisationen Amnesty International.
Detaljen sade Amnesty International kräver en "rättviselig offentlig utredning om mänskliga rättigheter" efter det att den fått anklagelser om "tvångsarbete, godtycklig internering, dålig behandling och olaglig adoption av barn i tidigare mor- och barnhem".
Stormonts Executive Office inrättade nyligen en arbetsgrupp för att undersöka anklagelser om övergrepp i mor- och barnhem.
Det fokuserar på invånare över 18 år från mor- och barnhem och Magdalena tvätterier som föll utanför HIA-utredningens ansvarsområde.
Gruppen höll sitt första sammanträde i mars.
De hårda förhållandena i mamma- och barnhemmen har nyligen fått internationell uppmärksamhet på grund av Tuams barnskandalen i Republiken Irland.
För tre månader sedan bekräftade en irländsk offentlig undersökning att "betydande mängder" mänskliga kvarlevor hade upptäckts på platsen för ett tidigare hem i Tuam, County Galway.
Den irländska regeringen gick med på att inleda undersökningen 2014 efter anklagelser om 800 spädbarns död i Tuam och det sätt på vilket de begravdes.
Frågan fördes fram i förgrunden av grevskapet Galways historiker Catherine Corless, vars personliga forskning om hundratals dödsattester väckte frågor om var barnen hade begravts.
Utgrävningen av platsen av Mor och Baby Homes kommissionen för utredning inleddes i oktober 2016.
I mars bekräftade utredarna att mänskliga kvarlevor hittades i "minst 17 av de 20 underjordiska kammare som undersöktes".
Tuamhemmet opererade från 1925 till 1961 och ett barn dog i hemmet nästan varannan vecka mellan mitten av 1920-talet och 1960-talet.
De flesta dödsfallen tros bero på naturliga orsaker, eftersom sjukdomar och hög spädbarnsdödlighet var en del av institutionerna.
Byggnaden har sedan rivits och på 1970-talet byggdes ett bostadshus på marken.
Tidigare invånare i mor- och barnhem och deras barn, de goda herdesystrarna, Frälsningsarmén, systrarna från Nasaret och Down och Connor Diocese har alla bekräftat att de skulle vara villiga att samarbeta med en offentlig utredning om Executive Office samtycker till att en äger rum.
Ny forskning om spädbarnsdödlighet vid tidigare moder- och barnhem i Nordirland har ökat vikten av att kräva en offentlig undersökning.