Det ägde rum i tre områden i Deeside på torsdag efter klagomål på att män hade hållits "virtuella fångar" i upp till tre år.
North Wales-polisen sa att förhållandena de levde i var "färligt hemska".
Den arresterade mannen är lokal till området och kommer att förhöras av detektiver.
En annan man kommer att bli "frivilligt intervjuad" vid ett senare tillfälle.
Torsdagens operation är en del av en mer omfattande operation som syftar till att ta itu med allvarlig och organiserad brottslighet i norra Wales, med särskild inriktning på mänsklig exploatering.
Det Ch Insp Neil Harrison sade: "Som ett resultat av morgonens operation har vi skyddat, eller helt enkelt befriat, minst tre personer som nu utvärderas."
Ett skjutvapen, en stulen egendom och en "betydande summa oförutsebara kontanter" återfanns också och kommer att ingå i utredningen.
Ch Supt Sasha Hatchett, som övervakade operationen, sade: " Ibland är det en vanlig missuppfattning att modernt slaveri är en fråga för andra delar av världen.
"I verkligheten existerar människohandel här på våra tröskelplatser i samhällen i norra Wales."
Polisen har arresterat en man för människohandelsbrott och fört tre personer till en "säkerhetsplats" under en gemensam operation i Flintshire.