Den extra perioden på två år och åtta månader infördes efter en förnyad rättegång vid Taiwans högsta domstol, där Chen frikändes från en annan korruptions anklagelse.
Han fängslades för första gången 2009.
Chen har anklagat Taiwans nuvarande regering för att förfölja honom för att vinna tjänster med Kina; han stödde starkt självständighet medan han var vid makten.
Vid sin tidigare rättegång dömdes Chen till livstids fängelse, ett straff som sänktes vid överklagandet förra året.
I detta senaste fall, Chen befanns inledningsvis skyldig till förskingring några $ 5m (Â £ 3m) från en särskild presidentfond medan han var vid makten.
Men Högsta domstolen beslutade om en ny rättegång i november förra året, med hänvisning till otillräckliga bevis.
Nu har Taiwans högsta domstol frikänt Chen från anklagelsen.
Domstolen fann honom emellertid skyldig till penningtvätt och förfalskning av handlingar och avkunnade det ytterligare tvååriga straffet. Det för hans totala straff till omkring 20 år.
Chens fru, före detta första dam Wu Shu-chen, fick ett längre straff på nästan 12 år vid rättegången, men hon kommer sannolikt inte att tillbringa någon tid i fängelse på grund av sin dåliga hälsa, säger BBC: s Cindy Sui i Taipei.
Analytiker säger att utslaget kan blidka Chens anhängare och hjälpa president Ma Ying-jeou, som söker omval i den kommande januari presidentkapplöpningen.
Men det skulle också kunna hjälpa det oppositionsparti som Chen en gång ledde, genom att ge det mer inflytande att anklaga det styrande partiet för att spela politik i åtal, säger vår korrespondent.
Chen förargade Peking under sina åtta år i ämbetet genom att driva på för Taiwans självständighet.
Taiwan har styrts separat från Kina sedan slutet av det kinesiska inbördeskriget 1949, då den besegrade Kuomintang retirerade till Taiwan för att skapa en självstyrande enhet.
Men Peking ser Taiwan som en del av sitt territorium och har hotat att använda våld om ön någonsin flyttade för att förklara formellt oberoende.
Taiwans f.d. president Chen Shui-bian - som redan sitter i fängelse för korruption - har fått ytterligare ett straff för penningtvätt och förfalskning.