En talesman för Co-op sa att två av chokladfigurerna hade hittats innehålla ett litet knappcellsbatteri.
"Hälsa och säkerhet för våra kunder är vår högsta prioritet," sade talespersonen, tillade att Co-op var utreda och polisen och Food Standards Agency anmäldes.
Inga andra produkter påverkas.
De Co-op choklad som hade varit föremål för manipulering köptes på två platser, en i Suffolk och en i Essex.
Man tror att manipulationen ägde rum efter tomtarna lämnat fabriken.
Kirurger varnade nyligen för att knappbatterier utgör en potentiellt dödlig risk för små barn.
Om man råkar svälja de små, runda batterierna kan man sätta in dem i matstrupen och bränna ett hål genom fodret.
De allvarligaste fallen är förknippade med Litium knappbatterier större än 20 mm (storleken på en 10 pence bit) som kan orsaka allvarlig skada inom två timmar.
Great Ormond Street Hospital i London sade i september att det hade skett en stor ökning av antalet fall under det gångna året.
Co-op sade kunder med en av dessa produkter bör inte äta det, men ring företagets kundrelationer team för en full återbetalning.
Alla som är berörda bör ringa Freephone 0800 0686 727.
Co-op livsmedelskedja har meddelat en nationell återkallelse av 165 000 ihåliga mjölk choklad Santa siffror efter två påstådda manipulering incidenter.