Clare Shillington och Laura Delany båda gjorde 37 som Irland skålades ut för 144 efter 47,1 overs av deras innings.
Bangladesh svarade med 145-3 off 39,1 overs för att vinna med 65 bollar till reserv, Sharmin Akhter topp-skorning med 52.
Irland måste vinna sina återstående två matcher mot Pakistan och Sydafrika för att upprätthålla kvalificeringshopp.
Irland behöll sin internationella status en dag genom att göra Super Six, från vilken de fyra bästa kvalificerar sig för VM i sommar.
Efter att ha satts i fladdermöss av Bangladesh på Colombo Cricket Club, de irländska kvinnorna fick ett tidigt slag som Cecilia Joyce (3) och Kim Garth (0) båda gick billigt.
Meg Kendal återvände från sin hamstring skada för att göra 16, dela i en tredje wicket stativ på 45 med Shillington, som slog fyra gränser och rensade rep två gånger i en underhållande 37 från 36 bollar.
Båda föll i snabb följd och det lämnades till skeppare Delany och Isobel Joyce (24) att bygga om innings med en monter på 44.
Efter att ha nått 106-4 med 19 overs kvar, Irland tittade på totalt närmar sig 200, men innings vacklade i den sista tredje, eftersom de sjönk till 144 alla ut.
Jahanara Alam (3-21), Panna Ghosh (2-16) och Khadija Tul Kubra (2-26) var bäst med bollen för Bangladesh.
Irland behövde snabba wickets i Bangladesh jakten, men deras attack avtrubbades av ett stadigt öppningsstånd på 40 mellan Sharmin Sultana (22) och Sharmin Akhter.
Gaby Lewis (1-31) avfärdade Sultana, och när Isobel Joyce sprang ut Islam för 2, Irland var tillbaka i tävlingen vid 52-2.
Men Akhter slog en fin halvsekel från 86 bollar, lägga 53 med Morgana Hoque, för att säkerställa Bangladesh snabbt återfåd kontroll.
Även om Akhter avskedades av Ciara Metcalfe (1-33), vid den scenen bara 39 behövdes, och Hoque (34 inte ute) i samband med Rumana Ahmed (24 inte ute) styrde sin sida säkert hem.
Irland är nästa i aktion när de möter Pakistan på fredag, innan de tar på Sydafrika på söndag.
Irlands förhoppningar om att kvalificera sig för VM verkar avlägsen efter att ha lidit en sju-wicket nederlag av Bangladesh i deras öppning Super Six match.