Den första vågen av flaggskeppet statligt finansierade, men oberoende skolor, omkring 24, öppnar denna termin.
Utbildningsminister Michael Gove har sagt att vinst inte behövs i fria skolor för närvarande.
Men Clegg sade att skolorna inte skulle bli "de privilegierade fås skydd".
I sitt tal i London i måndags, som syftade till att lugna liberaldemokratiska skeptiker, sade Clegg att han var övertygad om att skolorna skulle ge "rättvisare chanser" till barn från de sämst ställda.
Vissa Lib Dems har motstått dem med rädsla för att de kan vara socialt splittrande.
Clegg medgav att skolorna betraktades som kontroversiella av många och kom med risker, men sade också att de skulle förbättra standarder och integration.
"Till alla oroade att, genom att utöka mixen av leverantörer i vårt utbildningssystem, vi är på frammarsch för att infoga vinstmotivet i vårt skolsystem, återigen, låt mig lugna dig," sade han.
"Ja till större mångfald; ja till mer val för föräldrar. Men nej till att driva skolor för vinst, inte i vår statligt finansierade utbildningssektor."
Han tillade att han trodde att skattebetalarna inte skulle tycka att det var rättvist för skolorna att göra en vinst.
Clegg tillade att gratisskolor "inte får vara förbehållna de privilegierade få - att rensa bort de bästa eleverna samtidigt som de lämnar resten för att klara sig själva, vilket skapar problem för och dränerar resurser från andra närliggande skolor".
"Så låt mig ge dig min försäkran - jag skulle aldrig tolerera det", sade han.
Clegg uppmanade också de fria skolorna att ta emot minst samma andel gratis skolmatslever som det lokala genomsnittet och öppna anläggningar för lokalsamhället.
Från Norman SmithChief politisk korrespondent, BBC News Channel
Nick Cleggs tal om fria skolor är en del av hans "differentieringsstrategi" för att klargöra skillnaderna mellan hans parti och de konservativa.
Därför hävdar han att fria skolor inte bara får vara för påträngande medelklassföräldrar, utan i stället bör prioritera fattigare och mer eftersatta elever.
På samma sätt har Clegg krävt att koalitionen utesluter att vinstdrivande företag får driva fria skolor.
Det budskap han vill att hans parti och väljarna ska ta från allt detta är att Lib Dems inte pressas runt av Tories inom koalitionen, och stampar sina egna åsikter om viktiga regeringspolitik.
Den följer ett liknande tillvägagångssätt när det gäller reformen av den nordliga dimensionen, bankerna och lagstiftningen om mänskliga rättigheter.
Nu, under upptakten till Lib Dem-konferensen senare denna månad, kan vi förmodligen förvänta oss att se många fler fall av Lib Dems offentligt grälar med Tories om politik.
Men Mr Clegg varnade för att föräldrar måste "göra sin del också" för att hjälpa sina barns skolgång.
"Faktum är - om du inte intresserar dig för ditt barns utbildning, lärare kan inte kompensera bristen.
"Vi har för närvarande den mest begåvade generation av lärare detta land någonsin har sett. Men de kan inte göra allt", sade han.
Gove har förnekat att han tvingades backa av Clegg efter rapporter han skulle tillåta fria skolor att göra vinster om de konservativa bildade en regering med en total majoritet efter nästa allmänna val.
På söndagen berättade han för BBC att han var helt överens med Nick Clegg och att de båda trodde att vi inte "behöver ha vinst för tillfället".
Men Gove sade också: "Jag är pragmatist och inte ideolog, så jag har inget särskilt motstånd mot att involvera någon organisation som kommer att förbättra vår utbildning. Vi behöver dock inte ha vinstdrivande organisationer involverade för närvarande."
Fria skolor har inrättats av utbildningsorganisationer, grupper av lärare - och i ett antal fall föräldrar.
De fungerar som akademier och behöver liksom de inte följa den nationella läroplanen, kan variera lärarnas löner och villkor, finansieras direkt av staten och står utanför den lokala myndighetskontrollen.
Regeringen säger att fria skolor kommer att möta föräldrarnas efterfrågan i områden där det råder brist på platser och bidra till att driva upp standarder genom att tillhandahålla konkurrens.
Men kritiker hävdar att de kommer att ta elever och pengar från andra skolor i en tid av nedskärningar och skulle kunna bryta upp det statliga utbildningssystemet.
Martin Johnson, biträdande generalsekreterare för föreningen för lärare och lektorer (ATL), sade att regeringen verkade vara "mycket bekväm med idén att statligt finansierade skolor drivs för vinst".
"Regeringen sätter allt på plats för detta, och den enda saknade biten av pussel är en rättslig klausul," sade han.
Även om akademier och fria skolor inte kan drivas i vinstsyfte, drivs många av privata ideella organisationer, varav några driver "kedjor" av flera skolor.
The National Union of Teachers sade att Clegg hade valt att "förakta" sina egna partimedlemmar som förkastade den fria skolpolitiken och "försökte rädda en politik som varken är önskvärd eller nödvändig".
"I en tid av enorma nedskärningar i utbildningsutbudet är detta ett ganska skamligt slöseri med offentliga pengar", sade NUT generalsekreterare Christine Blower.
Chef för UCU:s lärarkår, Sally Hunt, sade: "Jag är glad att Nick Clegg har dragit en tydlig linje över vinstdrivande skolor och akademier. Det är viktigt att han nu utvidgar detta engagemang till högskolor och universitet."
Men Lib Dem kamrat och tidigare lärare talesman, Lord Willis, sade att utvidgningen av fria skolor skulle vara beroende av att låta leverantörer att göra en vinst.
"Verkligheten är att den fria skolrörelsen inte kommer att ta fart om inte vinstmotivet förs in", sa Lord Willis till BBC.
Av de 24 fria skolor som öppnar denna månad är nio trosbaserade eller har stark religiös etik, sex är föräldra- eller lärarledda och fem kommer att drivas av truster som redan driver akademier. Fyra privatskolor går över till den statliga sektorn. Vissa skolor passar in i mer än en grupp.
Regeringen säger att det vill att det totala antalet fria skolor ska "åtminstone fördubblas" nästa år.
Gove driver också på för att utöka antalet skolor med akademisk status, som liksom fria skolor verkar utanför lokal myndighetstillsyn.
Siffror som publicerades på torsdag visade att det nu finns 1.300 akademier i Storbritannien, med 40% av alla gymnasier nu antingen akademier eller håller på att konvertera.
Detta är en mer än sexfaldig ökning jämfört med 203 som var öppna innan akademilagen antogs i juli 2011.
Uppgifter från utbildningsdepartementet, som publicerades som svar på en begäran om information från BBC Freedom of Information, visade att antalet anställda vid utbildningsdepartementets akademiavdelning mer än fördubblades från 109 i maj 2010 till 262 i juli 2011.
Vice premiärminister Nick Clegg har sagt att de som driver Englands fria skolor inte kommer att kunna göra det i vinstsyfte.