35-åringen, som missade andra halvan av förra säsongen med en knäskada, har förbundit sig till schweiziska inomhus fram till 2019.
Federer, som återvände till aktion i januari, vann sin första Grand Slam titel sedan 2012 och sin 18: e totalt med seger i Australian Open.
"Spela i Basel är alltid en höjdpunkt på året", sade han.
Han har vunnit schweiziska Indoors sju gånger sedan han gjorde sin debut i turneringen 1998.
Han är planerad att återvända till handling nästa vecka på Dubai Duty Free Championships.
"Om jag skonas igen av skadorna, är jag övertygad om att jag fortfarande kan slå de bästa spelarna i världen i de stora turneringarna," sade han i januari.
Tenniskorrespondent Russell Fuller
Federers första framträdande i sin hemmaturnering var 1998, där han som 17-åring blev slagen i raka uppsättningar av Andre Agassi.
Det finns naturligtvis ingen garanti för att Federer kommer att vara med i spelorden 2019, men detta är ännu en påminnelse om hans långsiktiga tänkande.
Han missade de sista sex månaderna 2016, inte bara för att låta knät återhämta sig, utan också med bevarandet av kroppen i åtanke. I ett skede kretsade samtalet kring om Federer skulle ta sig till OS i Rio. Det är dags att inleda debatten om Tokyo.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Roger Federer har tecknat ett treårigt avtal att spela på sin hemstad händelse i Basel fram till 38 års ålder.