Ross MacLean hade den bästa möjligheten av den första halvan, se hans skott räddades av Killie målvakt Jamie MacDonald när en på en.
Louis Moult hade en liknande chans i andra halvlek, men åter kunde inte hitta en väg förbi MacDonald.
Scott McDonald sköt stort, medan Killies bästa chans kom genom en Souleymane Coulibaly overhead kick.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Kilmarnock öppnade imponerande, precis som de gjorde i Aberdeen i mitten av veckan, med Jordan Jones skapa det största hotet på vänsterkanten med hans positiva löpning.
Två gånger gav han Rory McKenzie möjligheter att skjuta med snygga kors för att plocka ut honom. Hans första insats blockerades av Stephen McManus med Killie spelare hävdar för ett straff som tyder på att det kom från hans arm.
Den andra var en vänsterfotsstrejk som räddades av Craig Samson.
Hemmakapten Keith Lasley hade tur när han försökte fly från sin egen straffplats. Hans tillstånd slog hans Killie motsvarighet Stevie Smith när han försökte stänga ner honom och bollen flög inches bred av Simsons vänstra handstolpe.
Morväl blev då ett hot i andra änden. Craig Clay, som i mitten av veckan talade om sin besvikelse över att han ännu inte har gjort mål för Fir Park sida, borde verkligen ha öppnat sitt konto från 10 meter men fluffade hans skott bred MacDonald vänster hand post.
McLean sköt också brett efter att ha spelat en tvåa med Louis Moult.
Med chef Mark McGhee tittar från regissörerna rutan på grund av en två-match touchline förbud, var assistent James McFadden ansvarig för förfaranden i hemmet tekniska området. McFadden såg lugn i rollen men kommer att ha önskat sina spelare kunde ha visat lugnet han regelbundet visas framför målet.
McLean hade bara MacDonald att slå efter latching på en genomfart från McDonald, men Killie målvakt reagerade snabbt dykning till sin rätt att spara utmärkt.
Lionel Ainsworth hade den sista och bästa chansen av hälften men han sprängde brett från åtta meter när det såg lättare att göra mål.
Den tidiga delen av den andra halvan var berövad chanser tills Moult verkade få sig ur Killie försvar, men precis som "Well's bästa målskytt förbereder sig för att släppa sitt skott en perfekt timad tackling från Scott Boyd förnekade honom möjligheten.
Ivoriansk strejkare Coulibaly gillar det spektakulära och han försökte ett varumärke overhead kick från vinkeln på sex yard box, men det slutade högt över baren.
McDonald var bredvid miss-eld efter att ha satts upp av Richard Tait. Full-back avslutade en positiv körning genom att spela bollen i vägen för strejkaren precis inne i lådan, men Australiens högra fot ansträngning flög bred av posten.
Så vi bevittnade det första mållösa mötet mellan dessa sidor om fem år och medan målvakterna kommer att vara nöjda med sina rena lakan kommer att vara de frontmän som kommer att ställa frågor om sin avslutning.
Morwell manager Mark McGhee: "Det var inte en bra föreställning men jag tror att vi kantade det. Vi gjorde fyra eller fem clear-cut chanser och om du inte tar en av dem du inte kommer att vinna matcher.
"Det faktum att vi inte lyckades konvertera någon av dem, det är en enorm besvikelse. Men vi är inte slagna och fick en ren lakan så framåt och uppåt.
"Varje lag som missar ett par av sina bästa spelare påverkas och idag saknade vi Chris Cadden och Stevie Hammell. Även upp till en och en halv timme innan kick-off Scott McDonald och Louis Moult var båda tveksam.
"Vi var inte samma lag som startade mot Celtic förra veckan så de saknade spelarna gjorde effekt nivån på vår prestation men oavsett att de andra som kom in gjorde okej. Vi gjorde fortfarande chanser och vi borde ha vunnit spelet. "
Kilmarnock manager Lee Clark: "När du kommer hemifrån och få en ren blad du är vanligtvis glad, men tinged med lite besvikelse i termer av jag trodde att vi började spelet så bra, liknande tisdag mot Aberdeen.
"Vi hade möjligheter men sedan som spelet bar på Morwell kom in i det och orsakade oss ett eller två problem. De har en livlig front två av Moult och McDonald.
"Jag kände bara ibland spelet var lite skräpig med två lag som arbetar riktigt hårt, slåss och i princip visar vad ligan handlar om den här säsongen när det gäller inte mycket mellan lagen ute med de bästa tre eller fyra. Resten av oss är ganska jämn och det handlar om om du inte kan vinna dessa spel sedan inte förlora dem.
"Skönt att det är en annan ren lakan speciellt kommer från baksidan av condeding fem på tisdag. Du går tillbaka till grunderna och det är två lördagar i rad vi har rena lakan."
Matchen slutar, mamma 0, Kilmarnock 0.
Andra halvlek, mamma 0, Kilmarnock 0.
Richard Tait (Motherwell) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Dean Hawkshaw (Kilmarnock).
Hörnet, morwell. Sammankallad av Nathan Tyson.
William Boyle (Kilmarnock) visas det gula kortet för en dålig foul.
Louis Moult (Motherwell) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av William Boyle (Kilmarnock).
Ersättning, Kilmarnock. Dean Hawkshaw ersätter Jordan Jones.
Försök missade. Stephen McManus (Motherwell) vänster fotade skott från mitten av lådan är hög och bred till vänster.
Hörnet, morwell. Förföljd av Scott Boyd.
Gary Dicker (Kilmarnock) visas det gula kortet för en dålig foul.
Jake Hastie (Motherwell) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Gary Dicker (Kilmarnock).
Lee Lucas (Motherwell) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Jordan Jones (Kilmarnock).
Försök missade. Scott McDonald (Motherwell) vänster fotade skott från mitten av lådan är nära, men missar övre vänstra hörnet.
Stöld av Louis Moult (Motherwell).
Scott Boyd (Kilmarnock) vinner en frispark i anfallshalvan.
Hörnet, morwell. Sammankallad av Steven Smith.
Hörnet, Kilmarnock. Förföljd av Richard Tait.
Handboll av Scott McDonald (Motherwell).
Substitution, Moderwell. Dom Thomas ersätter Keith Lasley.
Substitution, Moderwell. Jake Hastie ersätter Lionel Ainsworth.
Försöket räddades. Souleymane Coulibaly (Kilmarnock) höger fotade skott från mitten av lådan sparas i övre vänstra hörnet.
Försök missade. Jordan Jones (Kilmarnock) vänster fotade skott från mycket nära håll är för hög.
Keith Lasley (Motherwell) visas det gula kortet för en dålig foul.
Foul av Keith Lasley (Motherwell).
Jordan Jones (Kilmarnock) vinner en frispark i defensiva halvan.
Försök missade. Souleymane Coulibaly (Kilmarnock) vänster fotade skott från mitten av lådan är för hög.
Hörnet, Kilmarnock. Förföljd av Ben Heneghan.
Försöket räddades. Scott McDonald (Motherwell) huvud från mitten av rutan sparas i mitten av målet.
Hörnet, morwell. Förföljd av Scott Boyd.
Försök blockerat. Louis Moult (Motherwell) vänster fotade skott från mitten av lådan är blockerad.
Lionel Ainsworth (Motherwell) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Steven Smith (Kilmarnock).
Stephen McManus (Motherwell) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Souleymane Coulibaly (Kilmarnock).
Hörnet, Kilmarnock. Förföljd av Keith Lasley.
Lee Lucas (Motherwell) visas det gula kortet för en dålig foul.
Morwell lämnades att rue missade chanser när de hölls till en mållös dragning hemma till Kilmarnock.