22-åringen har gjort 13 framträdanden för Everton den här säsongen.
Everton manager Ronald Koeman förra veckan sade att spelaren skulle tillåtas att lämna för att "få speltid".
Spaniard gick Everton på lån från Barcelona för 2013-14 säsongen, vilket gör överföringen permanent i 2015 för £4.3m.
Milan meddelade ursprungligen flytten via deras officiella Twitter-konto på fredag, men det togs snabbt bort.
Denna webbplats är optimerad för moderna webbläsare, och stöder inte din webbläsare fullt ut
Everton ytter Gerard Deulofeu har gått med i italienska sidan AC Milano på lån fram till slutet av säsongen.