Rockstars kontroversiella spel - där spelare begår brott i den fiktiva staden Los Santos - presenterades med Game of the Year Gong vid en ceremoni i centrala London.
Sony's The Last of Us tog också två utmärkelser.
Ken Levine - mannen bakom Bioshock och System Shock 2 - belönades med en livstidsutmärkelse.
De Gyllene Joysticks är de största offentligt röstade videospel utmärkelser i världen, med i år mer än 10 miljoner människor som avger en röst.
Livstidsuppnåelsen är ett nytt tillskott till ceremonin.
Mr Levine har varit en hög profil figur i branschen ända sedan han arbetade med designer Doug Church, på den första person shooter, Thief: The Dark Project, krediteras med att vara en av de första titlarna att införa begreppet smyg i videospel.
"Det stora med den stilla-matchande naturen av videospel är att du får inspireras av arbetet av nybörjare och veteraner lika," sade han.
"Vi räknar alla ut dag för dag exakt vad mediet är kapabelt till."
Nu i sitt 31:a år, delades utmärkelserna ut först ut redan 1983, med den första Game of the Year utmärkelsen går till Jet Pac på ZX Spectrum.
Andy Robinson, redaktör för Dator och Videogames, sade att tre decennier senare, utmärkelser fortfarande "representera röst spelare över hela världen".
"Vi har förnyat kategorierna för att återspegla mångfalden av moderna spel och även lagt till den invigda Lifetime Achievement Award, som har gjort årets ceremoni den mest spännande för oss ännu," sade han.
Golden Joysticks är inte de enda stora utmärkelserna för videospelsindustrin.
Den brittiska Academy of Film and Television Arts delar ut sin Video Game Baftas på våren varje år, även om majoriteten av deras utmärkelser väljs av en panel av experter, snarare än en offentlig omröstning.
Grand Theft Auto 5, släpptes förra månaden, snabbt blev den snabbast säljande underhållning produkt någonsin, tar bara tre dagar att generera $ 1 miljard (Â £ 620m) i intäkter.
Den vuxentema brottsspel, Grand Theft Auto 5, har vunnit högsta priset på Golden Joystick utmärkelser.