Minst 48 personer dog i Nepal och 1100 skadades i tisdagens 7,3 magnitudskalv, med farhågor om att siffrorna kunde stiga. Minst 17 dog i Indien.
En amerikansk hjälphelikopter saknas också, med åtta personer ombord.
Tusentals nepalis tillbringade natten ute i det fria. Många har inte återvänt till sina hem sedan en jordbävning på 7,8 magnitud den 25 april som dödade över 8.000.
Tisdagens jordbävning var centrerad omkring 7 mil öster om huvudstaden Katmandu, nära staden Namche Bazaar.
En andra tremor av 6,3-magnitud drabbade Nepal 30 minuter senare och många andra efterskalv fortsatte in på onsdag morgon.
Huvudskalvet var känt i norra Indien, Tibet och Bangladesh. Indiens hemtjänst sade att 16 personer hade dödats i delstaten Bihar och ytterligare en i Uttar Pradesh. Tjänstemän i Kina sa att en person var död i Tibet.
Läs ögonvittnesskildringarna om jordbävningen
Nepals distrikt Dolakha och Sindhupalchowk, öster om huvudstaden, var ursprungligen listade som den värsta träffen, med tjänstemän som bekräftade 26 dödsfall, 20 av dem i staden Charikot.
Men den verkliga omfattningen av förlusterna och skadorna är fortfarande oklar.
Home Minister Bam Dev Gautam sade: "Många hus har kollapsat i Dolakha... det finns en chans att antalet döda från distriktet kommer att gå upp."
Regine Kopplow, en tysk biståndsarbetare i Charikot, sade: " Jag såg en kvinna i byggnaden som hoppade från tredje våningen och skadade hennes ben, armbåge och hand.
"Folk stannade utanför, skakningarna fortsatte. Vissa grät och kramade om varandra."
Den amerikanska militären sa att en marinkårshelikopter som var inblandad i katastrofhjälpsinsatser hade försvunnit när han arbetade i närheten av Charikot.
Pentagon sa att det fanns sex amerikanska marinsoldater och två nepalisoldater ombord. Det sades att det ännu inte fanns några tecken på en krasch och båten kan ha landat säkert, bland rapporter om bränsleproblem.
Röda korset sade att det hade fått rapporter om många dödsoffer i staden Chautara i Sindhupalchowk, där det har ett sjukhus och som har blivit ett nav för humanitärt bistånd.
Taleskvinnan Nichola Jones sade: " Hundratals människor strömmar in. De behandlar dussintals för skador och de har utfört mer än ett dussin operationer."
Minst två större byggnader rasade samman i Katmandu, och minst tre människor räddades.
Men det har förekommit andra rapporter om jordskred och fallna byggnader i städer och byar utanför huvudstaden.
Rädda Barnen sade Gorkha, nära epicentrum av den 25 April skalvet, hade drabbats av nya jordskred. En taleskvinna berättade för BBC dess personal hade varit att "dodging enorma stenar rullande utanför kullen sidan".
Invånarna i Namche Bazaar sa att det fanns en del skador där men inga rapporter om dödsfall.
BBC: s Navin Singh Khadka säger lokala tjänstemän i Everest regionen rapporterar mycket få turister är fortfarande i området efter jordbävningen den 25 april.
Många invånare i huvudstaden och andra städer tillbringade tisdagskvällen utomhus, alltför rädda för att återvända till hem.
Dipak Koirala, som bor i Ramechhap-distriktet, berättade för AFP:s nyhetsbyrå: "Jag tänkte flytta till ett hyrt rum, men idag var så skrämmande att jag inte kan riskera min familjs liv."
Sulav Singh, som bor i Katmandu, sade till Associated Press: " Jag trodde att jag skulle dö den här gången. Saker och ting höll på att bli normala igen, och vi får den här."
Politiker flydde på tisdagen Nepals parlamentskammare i Katmandu när jordbävningen drabbade.
Premiärminister Sushil Koirala sade senare: "Vid en timme av en naturkatastrof som denna måste vi möta den med mod och tålamod."
BBC:s Yogita Limaye, som befann sig i Nepals berg när den senaste jordbävningen slog till, sade: " Jorden skakade och den skakade ganska länge.
"Jag kan helt förstå känslan av panik. Vi har sett skakningar - det har gått två och en halv vecka sedan den första jordbävningen. Men den här kändes som om den pågick väldigt länge. Människor har varit skräckslagna."
Epicentrum denna gång är ca 80km (50 miles) öst-norr-öst om Katmandu, halvvägs till Everest. Den 25 april började den stora jordbävningen 80 km till nordvästra delen av huvudstaden.
I april såg vi felgränsen brista österut i 150 kilometer. Och den omedelbara bedömningen tyder på att tisdagens skalv har inträffat precis vid den östra kanten av detta misslyckande.
I detta sammanhang utlöstes denna andra jordbävning nästan säkert av de stressförändringar som orsakades av den första.
Den amerikanska Geological Survey modellering tyder på att det fanns 1-i-200 chans att en M7-7,8 händelse inträffade denna vecka.
Quakeexperter talar ofta om "seismiska luckor", som hänvisar till segment av fel som i viss mån är försenade ett skalv. Tisdagens stora skakningar kan mycket väl ha fyllt ett hål mellan vad vi såg den 25 april och några historiska händelser - såsom de 1934, som inträffade ännu längre österut.
Otröstad jord
Räddningsarbetet kommer att återupptas för att hitta offer och överlevande från den senaste dödsbringande jordbävningen i Nepal.