25-åringen, som ännu inte har spelat i en internationell tävling, har vunnit två kapsyler, båda i vänskapliga matcher mot Nederländerna.
"Han vill inte spela internationell fotboll, vilket är en besvikelse ur vår synvinkel", sade Wales manager Chris Coleman.
"Men han har fattat det beslutet, och vi måste hålla oss till det."
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Wales är tredje i VM-kvalificerande grupp D, fyra poäng efter ledare Serbien.
De reser till Serbien för sin nästa kval på söndagen den 11 juni efter att ha namngett en ungdomlig förmatch träningsläger som inkluderade Exeters 16-åriga Ethan Ampadu.
Coleman tillade: " Vi kommer att fortsätta med gruppen av spelare, gruppen som vill spela och representera Wales.
"Det finns inget vi kan göra med Paul, som har beslutat att internationell fotboll inte är den väg han vill gå."
Newcastle-born Dummett ingick i en före-Euro 2016 träningsläger men valdes inte i truppen för turneringen i Frankrike. Han har inte deltagit alls under den aktuella VM-kvalificeringskampanjen.
"Ibland måste du ha tålamod, särskilt eftersom laget vi har just nu har varit enormt framgångsrikt," Coleman tillade.
"Det är synd eftersom han är en bra spelare. Jag har inte pratat med Paul. Hans agent ringde upp mig för att ge mig nyheterna.
"Jag blev besviken, men om han inte vill hålla ut med det så är det hans val. Vi måste ta hand om spelarna som vill spela för oss."
Newcastle United försvarare Paul Dummett har gjort sig otillgänglig för att spela för Wales.