Endast tre av brasilianska klubbens spelare överlevde novemberkraschen, då 71 av 77 personer ombord dog.
Toppklubbar från Brasilien och Argentina erbjöd sig att låna ut spelare till Chapocense, som undertecknade 25 nya spelare den här säsongen och främjade nio från ungdomslaget.
De lyfte Santa Catarina delstatsmästerskapet på söndag för andra raka året, trots att förlora till Avai.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Chapeconse slogs 1-0 i söndagens sista play-off, men deras 1-0 seger i första benet innebar deras bättre rekord under loppet av säsongen var avgörande.
Klubben tillägnade segern till dem som dödades, med nya tränare Vagner Mancini säger: "Vi visste att Chape skulle ha en hel del svårigheter på grund av återuppbyggnaden av laget, men på grund av arbetet vi nådde titeln, slå motståndare som är rivaler och svåra att slå."
Kraschen inträffade den 29 november när truppen reste för att möta colombianska sidan Atletico Nacional i finalen av Copa Sudamericana. Nitton spelare och personal dog.
Chapecoense har vunnit sin första titel sedan de flesta av deras team dödades i en flygkrasch.