Tidningen L'Equipe rapporterade att paret, tillsammans med ytter Juan Imhoff, testade positivt för kortikosteroider innan de spelade i juni Top 14 final.
Racing säger att fallet avser "behandling genom en godkänd kanal".
De tillade: "Vi står på lagens sida, etik och kärlek till en ren sport."
Uttalandet kom efter Carter och Rokocokos agent berättade Nya Zeeland Herald han hade försäkringar "alla dokument runt TUES var på plats".
TUES gör det möjligt för idrottsutövare att ta receptbelagda läkemedel - som annars är förbjudna för sina prestandahöjande egenskaper - om det finns ett medicinskt behov.
"Så vitt jag vet idag, fanns det ingen begäran [för TUES] görs i förväg, men människor tillåts att legalisera dessa saker efter evenemanget," franska idrottsminister Patrick Kanner sade på France Info radio.
Fly-halv Carter, 34, och ytter Rokocoko, 33, gjorde 20 poäng mellan dem som Racing Metro slog Toulon 29-21 i Barcelona.
Argentinska vinge Imhoff, som har gjort 21 försök i 35 Tester, var också en del av start line-up på Nou Camp.
Carter, man i matchen i Top 14 finalen, spelade 112 Tests för Nya Zeeland och var en del av All Blacks sida som vann 2015 rugby VM.
Han anses allmänt vara en av de största spelarna i spelets historia.
Rokocoko gjorde 46 försök i 68 tester mellan 2003 och 2010.
Franska sidan Racing 92 säger tidigare All Blacks Dan Carter och Joe Rokocoko hade inte terapeutisk användning undantag (TUEs) för "anomalous" droger tester men insisterar spelarna har inte gjort fel.