Konsten deco byggnaden hade en £4.2m renovering under 2013, öppna igen med en biograf, café och galleri.
Men biografen stängde i mars, medan paviljongen stängde tre dagar i veckan, vilket föranledde kampanjer för dem att öppna igen.
Prof Tony Hazell, från Penarth Arts and Crafts Ltd (PACL), som driver den, sade att paviljongen inte hade drivits på ett hållbart sätt.
Han sade att hans team hade öppnat på "full gas" i december 2013, kör landmärkesbyggnaden på den viktorianska piren sju dagar i veckan, 12 timmar om dagen, 362 dagar om året.
"Det skulle förmodligen inte vara hållbart på en kommersiell basis, än mindre en välgörenhet en," tillade han.
Hazell sade att beslutet att stänga biografen - den enda på en pir i Storbritannien - fattades efter att siffror från tidigare år visat att den inte lockade så många besökare under sommarmånaderna.
Dessutom var caféet stängt på måndagar, tisdagar och onsdagar eftersom det inte tjänade tillräckligt med pengar för att täcka kostnaderna.
Men efter att ha granskat verksamheten och fått £126.000 i lotteripengar, sade han paviljongen och dess café skulle öppna antingen fem eller sex dagar i veckan från mitten av sommaren. Den kommer förmodligen att förbli stängd varje måndag.
Han sade också att biografen skulle välkomna besökare igen från september "om inte tidigare".
"Vi letar nu efter nya idéer om hur man kan höja mer intäkter," sade han.
"I slutändan drivs denna byggnad som en välgörenhet och folk donerar egentligen inte så mycket till en byggnad som de skulle kunna till en djur välgörenhet.
"Vi har bara ett litet team av betald personal och vi förlitar oss mycket på volontärer. Men, ja, vi kommer att överleva."
Men kampanjledaren Andrew Jones, 52, som startade en petition för att öppna biografen - som hittills undertecknats av mer än 1.700 personer - sade att han inte hade förtroende för PACL.
"Det har varit en fullständig vägg av tystnad i Penarth från PACL", sade Mr Jones, som bor i Penarth.
"Filmen stängdes ner mycket plötsligt, med bara ett meddelande på sin hemsida, som inte många människor såg", tillade han.
"Jag tror verkligen inte att biografbesöket föll så mycket på sommaren."
Vale of Glamorgan Council, som driver piren och hyrde paviljongen till PACL för 125 år på en peppercorn rate, sade att det hade "tillhandahållit betydande mängder av både ekonomiska och professionella" stöd till välgörenhet.
Det gav £ 800.000 till renoveringar - förutom pengar från Heritage Lottery Fun - och en £ 100 000 bidrag under sitt första år av handel för att hjälpa till att stödja gruppen.
"Sedan detta bidrag kom till ett slut har professionellt stöd tillhandahållits av rådet för att hjälpa PACL att förbättra sin inställning till affärsplanering och ekonomisk förvaltning", tillade en talesman.
"Efter att ha stött dem i en sådan utsträckning är rådet ivrigt att se organisationen blomstra och fortsätta att tillhandahålla anläggningar som vi vet är mycket uppskattade av lokalsamhället."
Penarth Pier öppnade 1895 och röstades år 2014 av National Piers Society (NPS).
Rädslor över framtiden för den renoverade Penarth Pier Pavilion är ogrundade, den välgörenhet som kör det har sagt.