Kampanjen startades av popkultur webbplats Junkee, som kallade det en show av stöd för Indigenous Australians.
Den har inspirerats av den amerikanska fotbollsspelaren Colin Kaepernick.
Spelaren har vägrat att stå för den amerikanska hymnen före matcher som en protest mot rasskillnader.
Paul Gorrie, en urgammal australisk aktivist som var inblandad i Junkee-kampanjen, sa att Kaepernicks protest fick honom att tänka "varför skulle vi inte göra det här?"
Han sade den australiensiska hymnen, Advance Australia Fair, "skrevs 1878 när mark fortfarande stals och svarta fortfarande massakrerades".
Det och den senaste tidens dödsfall av urbefolkningens australiensare i polisförvar var "effekterna av vår koloniala historia och den rasism som fortsätter än i dag", sade han.
"Detta är en uppmaning till handling för ALLA spelare att visa solidaritet genom att inte sjunga och ta en knäböj under nationalsången i helgen på NRL och AFL grand final."
Anthony Mundine, en före detta rugby ligastjärna förvandlad boxare, har sedan dess delat videon på Facebook och skrivit att han "har sagt detta i åratal".
"Alla spelare Aboriginal och icke-Aborigin bör bojkotta hymnen och börja förändra Australiens okunniga mentalitet", skrev han.
Australisk idrott, i synnerhet Aussie Rules fotboll, har fördärvats av rasism mot inhemska spelare.
Adam Goodes, en Indigenous Australian som spelade för Swans och har sedan pensionerat sig, buade upprepade gånger på fältet och förra året togs en rivaliserande fan bort för att han påstås säga åt honom att "gå tillbaka till djurparken".
Australien har också upplevt en livlig diskussion om huruvida landet bör erkänna ursprungsbefolkningar i sin konstitution, upphäva klausuler som hindrar människor av en viss ras från att rösta och tillåta lagar som bygger på ras.
Kampanjen har gett ett blandat svar.
Lance "Buddy" Franklin, en av AFL: s mest uppmärksammade Aboriginal spelare, sa att det fanns "ingen chans" att han skulle gå med i en hym bojkott.
"Först har jag hört talas om det", sa Franklin vid AFL stora slutparaden i Melbourne på fredag.
"Personligt tycker jag att det är ganska dumt egentligen. Det är den australiska nationalsången, det är en del av vår sport, vår historia."
Premiärminister Malcolm Turnbull har beskrivit kampanjen som "divisiv".
"Detta är en helg där alla kommer tillsammans," sa han 3AW Radio.
"De två stora koderna, NRL och AFL, arbetar hårt för att vara inkluderande och omfamna moderna Australien och all dess mångfald.
"Sport är en riktigt underbar inkluderande institution i Australien. Det splittrar oss i den meningen att vi stöder olika lag, men bara på ett ganska godmodigt sätt, men framför allt drar det oss samman. Det är därför vi alla ska sjunga."
Tidigare rugbyligan Joe Williams har varit en av de högljuddaste rösterna bakom kampanjen.
Williams, som är Aboriginal, har dragit till sig kontroverser innan han stannade kvar under hymnen, under en australiensisk dagsceremoni med erkännande av sitt samhällsarbete.
"Varför ska vi sjunga något som inte representerar oss?" berättade han för BBC.
"Skulle Malcolm Turnbull känna sig bekväm om han fick lov att sjunga Gud rädda drottningen?"
Han avfärdade förslag om att landets största idrottsevenemang var olämpliga arenor för att göra ett politiskt uttalande.
"Du är en svart man tills du dör", sa han.
"Du är bara en fotbollsspelare för en kort tid."
Australiska idrottsstjärnor uppmanas att inte stå för nationalsången under helgens stora rugbyliga och Aussie Rules finaler, som en protest mot rasism.