Han mötte kritik på nätet efter att ha jämfört kostymdesignern Jenny Beavan med en "bag lady" när hon plockade upp sin Bafta för Mad Max: Fury Road.
Presentören insisterade senare på att Beavan var en "älskvärd vän" och hade "fått" skämtet.
Fry sa att han inte har "lammat dörren" på Twitter men sa att sajten hade blivit en "stalkplats för de skenheliga självrättfärdiga".
Skriva på sin officiella hemsida, sade han att folk behövde "grieve" för vad Twitter hade blivit, skriva: "Jag gillar att tro att jag inte har slagit igen dörren, mycket mindre förföljd i en huff kasta mina leksaker ur barnvagnen som jag går eller hur man ska formulera det.
"Det är ganska enkelt egentligen: rummet hade börjat lukta. Verkligen ganska illa."
Fry har delat ut Bafta-filmerna i 11 år och publiken har vant sig vid hans cutting wit, ofta med quips om många av de stjärnor som är inblandade.
Beavan, som vann Bafta för bästa kostym design för Mad Max: Fury Road, kom upp på scenen på Londons Royal Opera House med en svart läderjacka, vit t-shirt och mörka byxor.
Efter sitt accepttal och när hon hade lämnat scenen sa Fry: "Bara en av de stora filmiska kostymdesignerna skulle komma till utmärkelserna klädda som en påsedam."
Men han postade en bild av paret på en fest senare på kvällen för att visa sin kommentar hade inte tagits illa, bildtext: "Jenny Baglady Beavan och Stephen Ursinnig Misogynist Swine Fry på efterfesten."
Fry följde upp det genom att i en expletiv tweet säga att hans kritiker var "tragiska människor".
Hans senaste kommentar fortsatte: "En förföljare till den skenhelige självrättfärdige som älskar att tvivla, att dra förhastade slutsatser och bli förolämpad - ännu värre, att bli förolämpad för andras skull som de inte ens känner till.
"Det är så otäckt och ohälsosamt en egenskap som man kan föreställa sig. Det spelar ingen roll om de tror att de försvarar kvinnor, män, transpersoner, muslimer, humanister â € faslighet är absolut samma."
Han sade "tipppunkten hade nåtts" men tillade: "Jag känner ingenting idag förutom massiv lättnad, som ett stenblock som rullar av mitt bröst. Jag är fri, fri till slut."
Den tidigare QI värden hade mer än 12 miljoner anhängare på Twitter när han lämnade webbplatsen.
Glamour redaktör Jo Elvin var bland dem som kritiserade Fry för hans "ocoola" kommentarer, säger att hon var glad Beavan "borta vad hon ville".
Komikern Tiernan Douieb beskrev Fry som utklädd till "ett oanvänt subbutetobord".
Showbiz journalisten Beth Neil skrev: "Stephen Fry är klädd som en påse dam" skämt om vinnaren av kostym design var skrämmande. Sanna färger, där."
Fry fick dock stöd från Twitter-användare, inklusive flera kändisar.
Radio 1 Scott Mills DJ skrev: "Jag tyckte Stephen Fry var en utmärkt värd ikväll. Att ta itu med världens största stjärnor är skrämmande. Jag hittar det här. Han är en naturbegåvning."
Komikern Matt Lucas skämtade: "Stephen Fry Fick du inte PM:et? Ingen får skämta längre."
Brittiska sångerskan Adele - som har 25m anhängare - meddelade att hon lämnade Twitter 2012 på grund av kommentarer om sin nyfödde son. Hon har sedan återvänt, men avslöjade förra året att hon inte längre skickar sina egna meddelanden på grund av "drunk tweeting".
Flickor skaparen Lena Dunham sade att hon lämnar Twitter förra året för att skapa ett "säkert utrymme", efter att ha fått online missbruk för att publicera en bild på Instagram i en sportbehå. Även om hennes konto fortfarande är aktivt, tros det drivas av en medlem av hennes kreativa team.
Skådespelare och författare Matt Lucas lämnade Twitter för fyra år sedan efter att ett skämt twittrades om hans tidigare civilpartner Kevin McGees död. Sedan dess har han återkommit till platsen.
Den amerikanska sångaren Chris Brown raderade sitt konto 2012 efter att ha fått en spärreld av tweets efter ett hett utbyte med komikern Jenny Johnson. Han var tillbaka på platsen mindre än en vecka senare.
2012 slutade Kanye West på sajten genom att ta bort alla hans tweets utom en som tillkännagav utgivningsdatumet för hans Yeezus album och orden: "Var tillbaka snart." Som han lovade var han tillbaka efter en kort paus.
Fry lämnade webbplatsen för sociala medier från februari till maj 2015 utan att ange några skäl. Han vädjade också för fans att sluta skicka honom direkta meddelanden som säger "det var omöjligt" för honom att titta på dem om han ville ha "något nära ett liv."
2014 slutade Fry på sajten och sa att det var "osäkert" för honom att twittra och tillade att han filmade "på ett ställe varifrån jag har fått rådet att det är säkrast att inte twittra".
Och 2009 sa han att han skulle lämna efter en annan användare kallade sina inlägg "boring".
Baffa show värd Stephen Fry har bekräftat att han har lämnat Twitter förklara "det roliga är över".