Han ersätter Wang Yang, som av många betraktas som en ledande reformator.
Xinhua statliga nyhetsbyrå sa inte vad Wangs nästa jobb kan vara. Det finns inget som tyder på att han har fått sparken.
Herr Hu, 49, en protege av avgående president Hu Jintao, befordrades till politbyrån förra månaden.
Den nya Guangdong bossen, känd som "Little Hu", är en del av den så kallade "sjätte generationen" av ledare födda på 1960-talet och uppradade för att ta ansvar efter nästa maktövergång 2022.
Hu kommer att ersättas av Wang Jun som partichef i Inre Mongoliet, sade Xinhua.
Omblandningen följer Xi Jinpings bekräftelse som nationell ledare för kommunistpartiet förra månaden.
Wang Yang är också en politbyrå medlem, men missade på befordran till sin sju-medlem ständiga kommittén i år. Analytiker säger att han kan bli en vicepremiär nästa år.
Wang ansågs vara en rival till den vanärade Bo Xilai, som i år avskedades som Chongqing partisekreterare.
Partisekreterareposten i Guangdongs tillverkningsnav är en av landets mest framstående chefsjobb i provinserna.
Guangdong, Kinas folkrikaste provins, betraktas ofta som en testplats för reform.
Korrespondenterna säger att det inte är klart vilken politisk riktning Hu kommer att inta.
En av det kinesiska kommunistpartiets stigande stjärnor, Hu Chunhua, har utnämnts till partichef i kraftverksprovinsen Guangdong.