Hiroute Guebre Sellassie, FN:s nya sändebud för Sahel, sade att Nigeria, Libyen och Mali var värst drabbade.
Men övergripande "terroristhandlingar" i Sahel och Maghreb hade ökat med 60% under 2013, sade hon.
Hennes betänkande sade att extrem fattigdom och arbetslöshet var en del av problemet.
Förra året inträffade 230 terrorhändelser i Sahel och Maghreb, Sellassie, som utnämndes till FN:s sändebud i maj, och sade i sin rapport som han lade fram för FN:s säkerhetsråd på torsdag.
Detta var en "beväpningsökning" på 60 % jämfört med 2012 - den högsta årliga summan i regionen under de senaste 12 åren, sade hon.
Försämringen av den politiska och säkerhetsmässiga situationen i Libyen, den politiska återvändsgränden och säkerhetsutmaningarna i Mali, där franska och afrikanska trupper kastade ut islamistiska militanter från norra städer förra året, och ökande attacker och kidnappningar av nigerianska Boko Harams militanter fortsatte att påverka civila och lokala ekonomier, sägs det i rapporten.
För de flesta människor är den extremism som lyfts fram i detta betänkande dold tills något spektakulärt händer. Reportrar som jag tar ansvar för det här. Jag åkte till exempel bara till Mali när den franska armén dramatiskt drev ut våldsamma islamister från de norra städerna i början av 2013. När jag besöker Nigeria är det alltid för en Boko Haram-kris.
Men de långsamt brinnande bakgrundsfaktorerna som kan ge näring åt extremism finns där hela tiden. Kronisk arbetslöshet gör unga män särskilt sårbara för radikalisering, säger FN:s rapport.
Det beräknas att endast omkring 30 procent av människorna i västra och norra Afrika har tillgång till moderna rättssalar - och därmed möjligheten till rättvisa om de blir kränkta.
I betänkandet sägs det också, på ett utomordentligt sätt, att bara drygt hälften av alla barn i regionen officiellt är registrerade som födda - den absolut mest grundläggande förutsättningen för att bli en deltagande medborgare.
Ökningen av våldet har sammanfallit med en FN-plan för att ta itu med osäkerhet och underutveckling i regionen - kallad den integrerade FN-strategin för Sahel - som inleddes för två år sedan.
Arbetslösa unga män var särskilt utsatta för religiös radikalisering, sade Sellassie.
"Organiserade kriminella grupper dra nytta av de vidsträckta och porösa gränserna i länderna i regionen, vilket gör effektiv patrullering extremt svårt," sade rapporten.
Ökningen av islamistiskt våld i Sahel hotar stabiliteten i hela regionen söder om Saharaöknen, har ett FN-sändebud sagt till säkerhetsrådet.