Brondby supportrar kastade gnagare på Copenhagen försvarare Ludwig Augustinsson som han gick för att ta ett hörn.
Ledare Köpenhamn vann matchen 1-0 för att öppna upp en 13-punkts ledning över närmaste rivaler Brondby.
"Det är olyckligt att det finns några besökare som inte kunde räkna ut hur man ska bete sig ordentligt", säger Brondby sportchef Troels Bech.
Footage av händelsen visar Slovenien internationella Benjamin Verbic hjälpa lagkamrat Augustinsson rensa minst två råttor utanför planen på 28.000 kapacitet Brondby Stadium.
Brondby är 10 gånger mästare i Danmark medan FC Copenhagen, som tidigare leddes av Wolverhampton Wanderers chef Stale Solbakken, har vunnit titeln 11 gånger.
En dansk Superliga spel mellan Brondby och FC Copenhagen var Marred när hemma fans kastade döda råttor på en spelare.