Props Samson Lee och Paul James har kalv oro och Aaron Jarvis är också en oro. Huvudtränaren Warren Gatland säger att han måste ringa på första parkett.
Allen gjorde en första halv hatt-trick men togs av i den andra med en "betydande" hamstring skada.
Men Liam Williams lårskada anses inte vara allvarlig.
Flanker Dan Lydiate togs också av för att bedömas för en huvudskada, men den brittiska och irländska Lions spelare klarade huvudskada tester.
"Det ser ut som Cory har en betydande tår i sin hamstring och det ser i detta skede som han måste ersättas," sade Gatland.
"Han skannas i morgon. Liam kommer också att bli skannad i morgon.
"Liam fick en knackning på låret men det är för tidigt att se för nästa vecka. Vi får vänta i 24 timmar för att göra en bedömning."
Gatland tillsatt tight-head Lee och lös-head James kämpar båda med "tight kalvar", medan Jarvis skadade ett revben brosk.
"Vi kanske måste fatta ett tufft beslut när det gäller rekvisita, eftersom vi måste ha fem rekvisita", säger Gatland.
"För tillfället har vi bara tre som kan ta fältet och vi måste ha fyra."
Wales centrum Cory Allen är inställd på att missa resten av VM efter att ha skadat sin skinka i öppningen 54-9 seger mot Uruguay.