Ben Gilkes, 25, av Stratford Road, Sparkhill, kommer att visas vid Birmingham Magistrates Court, West Midlands Polisen sade.
En man greps i fredags efter att barnet förts till barnsjukhuset i Birmingham med allvarliga skallskador, sade polisen.
Barnet är fortfarande allvarligt sjuk sedan angreppet i Hall Green på fredag, tillade de.
En man ska åtalas för överfall på en fyra veckor gammal pojke.