Bilen stoppades i Duncrue Street i Belfast på onsdag kväll på 20.15 GMT.
Polisen beslagtog misstänkt marijuana och kokain som ansågs vara värt en hel del.
Männen, 28 och 31 år, har både gripits för innehav och narkotikabrott.
Det Insp Tom McClure från PSNI:s Reactive and Organized Crime Branch sade: "Jag tror att detta ingripande har slagit ett slag mot verksamheten i ett organiserat gäng som är inblandade i allvarlig narkotikabrottslighet."
Polisen säger att gripandena av två män efter beslag av droger från en bil i Belfast har gett ett slag mot den organiserade brottsligheten.