Wenger, 67, har kritiserats av några fans efter Arsenal halkade till sjätte i Premier League efter fyra nederlag i sina senaste fem matcher.
En total förlust på 10-2 till Bayern München i Champions League ökade trycket och Wenger säger att han kommer att fatta ett beslut om sin framtid "mycket snart".
"Han är en stor man enligt min åsikt", sade Iwobi, 20. "Jag vill att han stannar."
Wengers kontrakt löper ut i slutet av säsongen men han har erbjudits ett nytt tvåårigt avtal.
"Han har alltid hjälpt mig och utvecklat mig som spelare," Iwobi berättade BBC: s World Football program.
"Jag tycker inte att det är rättvist hur alla kritiserar honom. Det är orättvist med tanke på vad han har gjort.
"Han har alltid uppnått fjärde plats, varit i Champions League och varit där uppe med titeln utmanare."
Avtalsförhandlingar med två av Arsenals stjärnnamn, Alexis Sanchez och Mesut Ozil, har lagts på is fram till sommaren, och Iwobi hoppas att en överenskommelse kan nås om deras framtid.
"Som du kan se från statistik, mål och chanser de skapar de är nyckelspelare i vårt team," sade han.
"Allt går nästan genom dem. Även om vi har andra spelare är de i världsklass.
"För klubben skulle det vara bra för dem att stanna, men i slutet av dagen är det deras beslut."
Arsenal framåt Alex Iwobi vill Arsene Wenger att förbli chef och säger att kritik av fransmannen är "orättvist".