Man undersökte framstegen i England efter införandet av en fond för bättre vård på 5,3 miljarder pund för att hjälpa lokala myndigheter att investera i tjänster för att hålla patienter borta från sjukhus.
Det säger under sitt första år, fonden har hjälpt till att förena hälso- och sjukvård och socialvård.
Men det har inte lett till den förväntade minskningen av sjukhusarbetsbördan.
Hälsodepartementet sa att det var för tidigt att bedöma fondens inverkan.
Enligt NAO infördes följande under det första året av fonden för bättre vård:
En vecka av täckning av BBC News undersöker tillståndet i NHS över hela Storbritannien som det kommer under intensiv press under sin mest trafikerade tid på året.
Den totala budgeten för fonden för bättre vård för 2015–16 var 5,3 miljarder pund (vissa lokala myndigheter lade till extra pengar till de 3,8 miljarder pund som öronmärkts av regeringen).
Man hoppades att fonden skulle betala tillbaka en besparing på cirka 500 miljoner pund under sitt första år genom att minska efterfrågan på kostsam sjukhusvård.
Med hjälp av fonden hade de lokala myndigheterna beräknat att de skulle kunna minska antalet sjukhusbesök med 106.000. I stället ökade de med 87.000 jämfört med året innan.
Antalet försenade förflyttningar av vårdfall - när en patient är frisk nog att lämna sjukhuset men inte kan göra det - var tänkt att minska med 293.000. Den ökade med 185 000.
Enligt NAO:s rapport ökar oron över kassaflödet både inom hälso- och sjukvården och inom den sociala vården, och det är fortfarande oklart om en ökad integration av tjänsterna kommer att vara till hjälp.
Den säger att regeringen bör göra en bedömning och utvärdera hur man bäst kan gå vidare.
Hälsodepartementet säger att det vill göra vården ännu mer samlad.
Sir Amyas Morse, chef för Riksrevisionen, sade: " Att integrera hälso - och sjukvården och den sociala omsorgen är en stor utmaning i normala tider, för att inte tala om tider då båda sektorerna utsätts för så hårt tryck. Hittills har fördelarna varit långt ifrån planerade, trots stora ansträngningar."
Dess direktör, Ashley McDougall, sade att det kan ta år att se resultat från integration och föreslog förväntningar bör sänkas runt effektiviteten av integration för att flytta människor från sjukhuset snabbare.
Han berättade för BBC Radio Four's Today-programmet att det inte var slöseri med pengar utan att finansieringen kunde användas bättre på annat håll.
En talesman för NHS England sade: "Att förena lokala NHS och fullmäktige tjänster kan vara värt, men är inte i sig en silverbult lösning på större tryck på hälsa och social vård."
Prof Jane Dacre, ordförande för Royal College of Physicians, sade: "Vi bör inte ta de långsamma framstegen så långt som en signal för att stoppa eller omorganisera initiativen - det tar tid att omvandla tjänster och utvärdera dem för att visa nytta, så de bör tillåtas fortsätta, men med mycket mer engagemang från lokala myndigheter i förväg i planering och genomförande, och en finansieringsökning för social vård."
James Taylor från välgörenhet Scope sade: "Över 400.000 arbetsföra, funktionshindrade människor förlitar sig på social vård, men en kronisk brist på finansiering har lämnat många helt isolerade, avskurna från samhället, glider in i kris och hamnar i A&E.
"Regeringens ambition att skapa ett land som arbetar för alla kan inte vara ett land som lämnar tusentals funktionshindrade utan den grundläggande stödnivå de behöver för att leva ett självständigt liv."
Regeringen planerar att behandla fler patienter i samhället inte minska trycket på NHS sjukhus eller spara pengar, säger Riksrevisionen.