Ett regeringsdirektiv sa att de skulle överföras till Thengar Char innan de skickades hem till Myanmar.
Rättighetsgrupperna har gjort starka invändningar mot planen och sagt att den innebär en påtvingad omlokalisering.
Då är Char uppslukad av flera meter vatten vid högvatten, och har inga vägar eller översvämningsskydd.
Det bildades för ungefär ett decennium sedan av sediment från floden Meghna, och förekommer inte på de flesta kartor. Det låglänta landet ligger cirka 30 km öster om ön Hatiya, som har en befolkning på 600 000 - och nio timmars resa från de läger där Rohingya har tagit skydd.
En tjänsteman i regionen berättade för AFP nyhetsbyrån Thengar Char var "bara tillgänglig under vintern och är en fristad för pirater".
Den officiella sade träd hade planterats i ett försök att skydda marken från översvämningar, men dessa ansträngningar var åtminstone ett decennium efter slutförandet.
"Det översvämmar helt och hållet under monsunen", berättade tjänstemannen för AFP.
"Det är en hemsk idé att skicka någon att bo där."
I Myanmar nekas Rohingya medborgarskap och behandlas som olagliga invandrare från Bangladesh.
Men även i Bangladesh är de oönskade - lämnar dem förföljda, utarmade och i praktiken statslösa.
Tjänstemän säger att uppskattningsvis 65 000 Rohingya har korsat Bangladesh sedan oktober och flytt från våldet i Myanmars västra delstat Rakhine.
Omkring 232.000 – både registrerade och oregistrerade – bodde redan före denna tillströmning i Bangladesh, många i flyktingläger med fattiga anläggningar.
Nu har Bangladeshs regering inrättat en kommitté bestående av statstjänstemän för att hjälpa till att identifiera och flytta papperslösa Myanmar-medborgare.
Man skyller delvis på förslaget om att locka turister, som stöds av premiärminister Sheikh Hasina.
Cox's Bazar, som inrymmer 32.000 Rohingya i en eländig flyktingkoloni, är hem till världens längsta obrutna strand och Bangladesh största semesterort. Tjänstemän fruktar närvaron av Rohingya kan skjuta upp blivande semesterfirare.
Bangladeshs regering är på väg att flytta tiotusentals flyktingar från Rohingya till en sårbar ö i Bengaliska viken.