Terriers gjorde 10 ändringar för resan till St Andrew har förseglat en Championship play-off plats, men EFL sade att resultatet skulle stå.
Blackburn boss Tony Mowbray senare ifrågasatte Towns line-up.
Rovers, som upptar den slutliga nedflyttningsplatsen, är två poäng bakom Harry Redknaps Blues med en match att spela.
EFL sade i ett uttalande: "Vi har idag skrivit till Huddersfield Town för att begära sina observationer i samband med lagval under deras senaste Championship match med Birmingham City och, enligt våra regler, EFL verkställande kommer att hänvisa frågan till styrelsen om det anses lämpligt att göra det.
"Det bör dock noteras att resultatet av lördagens spel kommer att stå under alla omständigheter och eventuella åtgärder skulle vidtas mot Huddersfield Town direkt."
Blackpool och Vargar bötfälldes för fältarbete mycket ändrade lag i Premier League matcher 2010 respektive 2009.
Tidigare denna säsong 12 League One och två lag bötfälldes för att spela försvagade sidor i Checkatrade Trophy, även om den tävlingen hade särskilda regler om lagval.
EFL har skrivit till Huddersfield för att "be om deras observationer angående lagval" för lördagens 2-0 nederlag av Birmingham City.