De två männen misstänktes för att ha mixtrat med rulltrappan efter incidenten, rapportera lokala medier.
En rulltrappa vid köpcentret Langham Place vände plötsligt i hög fart på söndagen och skickade ner passagerare.
Orsaken till felet är fortfarande okänd.
Tjänstemän hade kallat in de två tekniker, som arbetar för Otis Hiss Company, för att hjälpa till i utredningar timmar efter händelsen.
rulltrappan hade stängts och all personal som var inblandad i utredningen beordrades att inte röra den.
Men sent på söndagskvällen upptäckte tjänstemän att rulltrappans hjälpbromssystem hade återaktiverats, rapporterade lokala medier. Tidningen Apple Daily sade att reaktiveringen kunde ha påverkat rulltrappans dataposter.
Myndigheterna beordrade polisen att gripa de två männen på plats.
Otis har uttryckt sin förvåning över gripandena och sade att han skulle begära ett klargörande från myndigheterna.
Minst 18 personer skadades när rulltrappan, som gick upp på Langham Place, plötsligt ändrade riktning och började gå ner i snabb takt.
Videor av händelsen visar dussintals människor som förlorar balansen och tumlar ner. Flera ses staplade vid foten av rulltrappan, med en man som ligger medvetslös på golvet.
Två personer ligger fortfarande på sjukhus och är i ett stabilt tillstånd.
Stadsregeringen har beordrat omedelbara prov på alla rulltrappor som sträcker sig mer än 15 meter i höjd.
Det har ännu inte funnits någon officiell förklaring, men stadstjänstemännen sade att en skadad körkedja i rulltrappan, och en felbromsanordning, kan ha orsakat händelsen.
Rulltrappa ingenjör Charles Wong berättade för South China Morning Post att hjälpbromsar skulle ha slagit in om huvudbromsarna hade misslyckats, och att det var ovanligt att en drivkedja att bryta.
I gallerian sades det att rulltrappan senast hade inspekterats på torsdag, utan att några problem upptäckts.
Två tekniker i Hong Kong har arresterats för att ha "förvanskat rättvisans gång", efter att en oduglig rulltrappa skadat shoppare i ett köpcentrum.