Nick Bennett sa att en "rädsla och skuld" kultur behövde hanteras för att beskriva situationen som "groundhog dag".
Han sa att hans kontor hanterade cirka 2 000 klagomål varje år - dubbelt så många som utreddes för 10 år sedan.
Den walesiska regeringen sade att den skulle överväga resultaten och förväntade sig att alla offentliga organ skulle göra detsamma.
Den walesiska kommunförbundet sade att det fanns en proposition från public serviceombudsmannen som gick igenom församlingen, vilket den ansåg skulle leda till större enhetlighet och förbättringar i behandlingen av klagomål.
I Bennetts betänkande framhävdes den försenade och bristfälliga undersökningen av klagomål, och resultaten var "inte mindre än absurda".
Han har efterlyst en effektiv styrning i hela den walesiska offentliga sektorn, gedigen personalutbildning och förbättrade metoder för datainsamling.
"Antalet klagomål som kommer till mitt kontor om offentliga tjänster har fördubblats under det senaste årtiondet," sade han.
"Jag tror att det kommer att öka med minst 5% under nästa år. Jag har ett val, antingen kan vi hantera ett ständigt ökande antal frustrerade tjänsteanvändare i Wales, eller så kan vi försöka göra mer för att se till att saker och ting rättas till vid källan.
Bennett sade att ökningen av antalet hälsoklagomål som han hade fått troligen beror på en åldrande befolkning och att patienterna var och en har ett antal hälsoproblem, vilket ökar risken för att något går fel.
"Men jag ser fortfarande ett betydande antal hälsoklagomål som är kopplade tillbaka till klagomålshantering," tillade han.
"Detta är inte en medicinsk fråga, det har inget att göra med en föränderlig demografi - det handlar om det faktum att dessa organisationer inte demonstrerar lärandet från saker som har gått fel.
"Det finns en hel del kulturellt arbete som kan utföras av NHS och andra offentliga organ i Wales, som inte har något att göra med nedskärningar och inget att göra med utmaningen med en åldrande befolkning - det handlar om kulturen i en organisation, det handlar om ledarskap och det handlar om bättre resultat."
Sue Pink och hennes man Tim från nära Llanon, Ceredigion har kämpat för att få lämplig utbildning för sina två autistiska söner.
Deras klagomål till ombudsmannen om Ceredigionrådet bifölls för två år sedan.
Rosa sade att deras klagomål hade behandlats "mycket långsamt" och att det var "en fruktansvärd massa bevisbörda på sig själva".
Hon sade att de inte bara måste "bevisa att det de sade var korrekt, utan att det som rådet sade var felaktigt".
Herr och fru Pink har vid upprepade tillfällen framfört klagomål och tror inte att man har dragit lärdom av detta.
"Vi har upplevt samma förseningar," Mrs Pink sade.
Hon sade att det måste finnas "förbättrad kommunikation" och att människor måste ta ansvar.
Vanessa Young, chef för Wales NHS Confederation, sade att NHS chefer nyligen hade träffat ombudsmannen för att diskutera utbyte av god praxis.
"Den feedback och erfarenheter - både bra och dåliga - av patienter och deras familjer är avgörande för att hjälpa NHS Wales att ge hög standard på vård," sade hon.
"Vi vet dock att det behövs ytterligare arbete när det gäller klagomålssystemet."
En talesperson från den walesiska regeringen tillade: "Klaganden måste ha fullt förtroende för att de frågor de tar upp hanteras på ett lämpligt och känsligt sätt."
Organen för offentliga tjänster har inte lärt sig läxan på grund av att klagomål hanteras på ett otillräckligt sätt, sade ombudsmannen.