Påståenden om illdåd under krigets slutskede har fått regeringen att framhärda ända sedan dess slut. Rebellerna anklagades också för övergrepp.
Regeringen har ihärdigt förnekat sådana anklagelser och insisterat på att de är på väg mot försoning och återuppbyggnad av Sri Lankas norra del.
Efter självständigheten från det brittiska styret började allt mer självsäkra Sinhalanationalister, förbittrade över vad de såg som brittisk favorisering mot minoriteten Tamiler, att underblåsa den etniska splittringens lågor.
En tamilsk separatiströrelse tog fart under 1970-talet, då ett antal beväpnade tamilska grupper uppstod i norr och delar av östra Sri Lanka.
Men 1983 förvandlades upproret efter en brutal anti-Tamil-backlash efter rebellernas mord på 13 soldater som spreds över hela landet.
Tamil Eelams befrielsetigrar (LTTE) framträdde under Velupillai Prabhakarans ledning som en hänsynslös och mycket effektiv stridsstyrka. Den kom att driva vad som i själva verket var en skuggstat i norr och öster.
Gruppen använde självmordsbombningar och andra attacker till förödande effekt i huvudstaden Colombo och på andra håll under 1990-talet. Den dödade också framstående personer, däribland Indiens premiärminister Rajiv Gandhi och Sri Lankas president Ranasinghe Premadasa.
Efter att olika fredsinitiativ och eldupphör misslyckats inledde regeringen 2009 en sista offensiv och besegrade tigrarna.
Fram till krigets sista månader beräknades antalet dödsoffer i mer än 25 års konflikt uppgå till omkring 70.000.
Men den sista fasen, när regeringen och rebellerna slogs ut när tusentals civila blev instängda i en liten landremsa på nordöstra kusten, har varit föremål för den största granskningen.
Uppskattningar sträcker sig från 20000-75.000 döda i den slutliga attacken, men en statlig uppskattning sätter siffran på omkring 9.000.
I en FN-rapport från 2011 sades det att sjukhus, FN-centrum och fartyg tillhörande Röda korset avsiktligt riktades mot armén.
Regeringen anklagades för att använda tunga vapen och FN-bilder som erhållits av BBC verkade visa granatskador i en av regeringen uppförd "säker zon" för civila.
I rapporten anklagades också de tamilska tigrarna för att använda civila som mänskliga sköldar, enligt vilka rebellerna sköt dem som försökte fly. Det sades också att rebellerna placerade tunga vapen på sjukhus.
Sri Lanka avvisade påståendena i betänkandet som partiska och bedrägliga.
Kritiker säger att det hittills inte har gjorts några allvarliga försök att göra detta.
Regeringen utsåg en Lessons Learn and Reconciliation Commission, som godkände militären för anklagelser om att den avsiktligt hade attackerat civila.
Rättighetsgrupperna avfärdade undersökningen som "flammerad".
I september 2013 höll regeringen val till ett halvsjälvständigt råd i öns tamilska majoritet norrut, ett drag som man sade var ett viktigt steg i försoningsprocessen.
Tamil National Alliance (TNA) vann 30 platser i 38-medlemsrådet och bildar nu den första fungerande provinsregeringen i norr.
TNA:s 80-åriga ledare, Rajavarotiam Sampanthan, sade att segern var en chans för alla att "tänka på nytt om framtiden".
Den överväldigande majoriteten av analytikerna är överens om att åtminstone på kort sikt är svaret ett rungande nej.
Efter så många års krig är många tamilska tamiler krigströtta och kämpar för att försörja sig.
Men många varnar också för att regeringen riskerar att stöta bort minoriteten om den inte agerar för politisk försoning.
Sri Lankas armé besegrade separatisten Tamil Tiger rebeller i maj 2009 efter 26 år av inbördeskrig.