Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Farrell, 25, är inställd på att flytta förbi 500 internationella poäng i helgen mot Fiji, och är tvåa i England hela tiden listan bakom Wilkinson.
Wilkinson frågade om Farrell en dag kunde slå rekordet på 1.179 poäng och sade: " Jag tvivlar inte.
"Jag skulle bli mycket förvånad om Owen Farrell inte fortsätta att göra mål långt, mycket mer", berättade han BBC Sport.
"500 poäng för en kille som är 25 år gammal, du behöver inte göra matematiken men om han spelar tills han är 35, han kommer att vara på ett bra ställe."
Wilkinson har varit involverad i England lägret i år som en sparkande och skicklig konsult, och säger att han kan identifiera sig med hur Saracens flyga halva Farrell närmar sig spelet.
"Ibland när vi diskuterar saker, hör du något som du definitivt motsvarar", sa Wilkinson, som på torsdag blev en av 12 nya indukter i World Rugby Hall of Fame.
"[Att arbeta med England] är en riktigt spännande möjlighet," Wilkinson, som gjorde den vinnande drop mål i 2003 VM-finalen, fortsatte.
"Men det finns ingen berättande eller undervisning, det är typ av en delning, och därför måste det finnas utrymme i oss alla för att fortsätta växa. Jag är också där för att lära mig."
Wilkinson har också jämfört den nuvarande midfield kombinationen av Farrell, som har gjort 497 poäng för England, och flyg-halv George Ford till sitt samarbete med innecenter Will Greenwood eller Mike Catt.
"Båda dessa killar var fantastiskt viktiga för mig i min karriär, på det sätt de stödde mig, fick ut det bästa av mig, och hjälpte mig att avslöja mer om mig själv," Wilkinson förklarade.
"Med Owen och George är de båda mycket, mycket öppna individer, båda mycket ödmjuka - men inte för att de har fått lära sig vad de ska säga, men verkligen är det vilka de är.
"Det finns inte ett manus som följs här. De följer entusiasm, passion och allvarlig hängivenhet.
"Det är väldigt likt när man nämner namn som Mike Catt och Will Greenwood, det är helt logiskt. Det handlar bara om att ha bra människor där inne."
Du kan höra mer från Jonny Wilkinson på Matt Dawson Rugby Show på BBC Radio 5 live från 19:30 GMT på torsdag 17 November.
VM-vinnare Jonny Wilkinson har backat Owen Farrell för att köra om hans England poängrekord.