Riot polisen i Rio de Janeiro hade omringat området tidigt på lördagen väntar ett domstolsbeslut att vräka dem.
Byggnaden är tänkt att rivas som en del av förberedelserna inför nästa års VM.
Samhällsledare sa att de var redo att slå tillbaka med pilbågar och pilbågar.
Kampanjer säger att vräkning och rivning av den historiska byggnaden - Rios tidigare inhemska museum, byggt 1862 - är onödiga.
Samhället, känt som Aldeia Maracana (eller Maracanastammen), bosatte sig i den nedlagda byggnaden för sex år sedan.
"Turistattraktion"
Brasilianska myndigheter säger att området måste rensas för spridningen av fans under 2014 års VM.
Rios guvernör Sergio Cabral sade nyligen att rivningen krävdes av Fifa, den internationella fotbollsfederationen.
Men Fifa's kontor i Brasilien utfärdade ett brev som förnekade påståendet, säger BBC: s Julia Carneiro i Rio.
Det finns planer på att bygga en parkeringsplats i området. En närbelägen statlig skola kommer också att rivas, trots protester från föräldrar.
Flera matcher kommer att spelas i Brasiliens största och mest kända stadion, inklusive VM-finalen.
När den öppnar igen kommer den under de närmaste månaderna att ha en total kapacitet på 78.000 åskådare.
Maracana kommer också att vara värd för invignings- och avslutningsceremonierna i OS 2016.
Det gamla ursprungsmuseet, som tillhör den federala regeringen, är i akut behov av reparation. Mer än 20 familjer bor där och planterar traditionella örter och tobak.
Kampanjgrupper har försökt rädda den och bevara ursprungsbefolkningen där den har bott under de senaste sex åren.
Samhället hoppades kunna visa upp sitt sätt att leva för turister under VM.
Oppositionslagstiftaren vid Rio de Janeiros sammankomst Marcelo Freixo sade att turister " hellre skulle se en historisk byggnad bredvid stadion än en parkeringsplats eller snabbmat gemensam".
En rättslig strid har pågått i månader.
De lokala myndigheterna har misslyckats med att få domstolsbeslutet, men kampanjtagarna förväntar sig att de lokala myndigheterna fortsätter att vräkningar under de närmaste dagarna.
En brasiliansk ursprungsbefolkning som har ställts inför vräkning från en byggnad intill fotbollsarenan i Maracana har firat polisens beslut att lämna området.