James Chadwicks kropp, 37, hittades på en adress på Holland Street i onsdags.
Vid Aberdeens sheriffdomstol åtalades Ryan Gibb och Cameron Laurie för mord och försökte besegra rättvisan.
De vädjade inte och blev häktade. De ska infinna sig i rätten igen nästa vecka.
Två män är åtalade för mordet på en man i Aberdeen.