Ganesan Nimalaruban dog och flera andra fångar, alla Tamil Tiger misstänkta, uppges ha skadats efter ett misslyckade fängelse myteri i norr.
Myndigheterna förnekar att han blev illa behandlad och säger att han dog av en hjärtattack.
De säger att fångarna arbetade med tamilska separatister utomlands.
De människorättsadvokater som arbetar med Nimalarubans föräldrar har lämnat in en framställning om dödsfallet i Högsta domstolen.
De vill upphäva ett domstolsbeslut om att han måste kremeras nära huvudstaden, Colombo.
Hans sörjande mor och far säger att de skulle föredra att ge honom de sista riterna i deras hemdistrikt, Vavuniya i norra Sri Lanka.
De avvisar myndigheternas påståenden om att en sådan begravning skulle utgöra en säkerhetsrisk.
Det var i Vavuniyafängelset som 32 fångar som är tamilska tigermisstänkta tog tre fångvaktare som gisslan i slutet av juni och höll dem kvar i 19 timmar i en protest mot fångförflyttningar.
Belägringen bröts och alla fångar flyttades.
Men rättskämpar och tamilska parlamentsledamöter säger att fängelsemyndigheterna och polisen arbetade med andra interner för att utkräva en fruktansvärd hämnd, angripa dem med stenar och vapen, fysiskt kasta dem eller bryta benen.
Nimalarubans föräldrar sa att hans kropp var täckt av blod.
Myndigheterna förnekar alla anklagelser.
Åtminstone en annan fånge rapporteras ligga i koma och på sjukhus.
Föräldrarna till en fånge som dog under oklara omständigheter i Sri Lanka är instängda i en strid med tjänstemän som säger att hans kropp inte kan föras till hans hemstad för de sista riterna.