Det väcker frågor om uppförandet av en av Förenade kungarikets näst största skjutvapenenhet vid en tidpunkt då Manchester nyligen har drabbats av en terrorattack.
En offentlig utredning om en av dödsfallen har hört talas om bristfällig intelligens, en högre officer som förstör anteckningar och anställning av en officer som är disciplinerad för misshandel.
Dess tidigare utbildningschef, John Foxcroft, sa att han lämnade vapenenheten på grund av dess "aggressiva" taktik.
Många av officerarna i fallen tjänar fortfarande.
Greater Manchester Police (GMP) sade sina skjutvapen officerare "volunter för rollen och gör ett mycket svårt arbete, helt riktigt under de högsta nivåerna av granskning".
Här är berättelsen om de tre dödsolyckorna, med nya upptäckter av Victoria Derbyshire-programmets utredning.
"Han var en vacker person in och ut", säger Anthony Graingers partner Gail.
Paret bodde tillsammans med sina två små barn.
"Jag minns att jag tänkte: "Mitt liv är perfekt." Sen kvävdes han - och han kom inte hem."
Anthony Grainger var obeväpnad i en bil när han sköts av polisen i Cheshire i mars 2012.
Polisens underrättelsetjänst hade föreslagit att han skulle genomföra ett väpnat rån med två medarbetare, även i bilen.
Mr Grainger hade tidigare befunnits skyldig till att ha hanterat stulna bilar, men hade ingen fällande dom för våld.
De två andra männen hade övertygelser om våld. Polisen såg en som mycket farlig.
Mr Grainger dödades på en parkeringsplats en livlig lördagskväll i byn Culcheth.
Beväpnade officerare sa att de såg honom släppa sina händer i ett drag tolkas som att han kommer att ta ett vapen - han sköts en gång, dödligt.
Men en annan man i bilen, David Totton, sa att ingen varning gavs innan skottet avlossades.
Alla tre männen i bilen var obeväpnade.
På dagen för operationen hade vapenteamet varit i tjänst i 14 timmar när de blev tillsagda att flytta in.
Det var 16 vapenofficerare. Flera hade misslyckats med utbildningarna och det hävdades under den offentliga undersökningen att de inte borde ha varit med om operationen, vilket Greater Manchester Police ifrågasatte.
En officer, känd som X7 - som hade regisserat operationen på marken - hade misslyckats med en vapenkurs med Metpolisen, som tog bort honom tidigt som hans prestation var "motvilligt påverka andra studenter."
En annan, känd som Z15, hade misslyckats med en säkerhetskurs strax före operationen efter tre extrema säkerhetsöverträdelser i potentiellt livshotande situationer.
En vapenexpert berättade för utredningen att dessa var så "grundläggande och i sig farliga" att det borde ha lett till Z15:s "omedelbara avstängning".
Martin Harding, en före detta överintendent och vapenofficer med större Manchester polisen, sade till BBC: "En kraft som Manchester har fått motståndskraft, så det borde inte finnas någon anledning till varför du skulle ha någon på ett jobb som inte var tränad att utföra sin roll."
Under den offentliga utredningen framkom det att den polis som avfyrade vapnet - som kallades Q9 - allvarligt hade skadat en misstänkt under ett tidigare gripande.
Han hade också blivit tillrättavisad för att ha misshandlat två personer. Han friades från tio andra anklagelser - och förblev vapenofficer.
Detta var inte det sista allvarliga fallet som Q9 var inblandad i, vi har upptäckt att det fanns en annan incident där hans beteende ifrågasattes.
Alla vapenofficerare i Grainger-fallet beviljades anonymitet så kommer inte att tala om denna andra incident i detalj.
Frågor om mr Graingers död går till toppen av större Manchesterpolisen.
Under den offentliga utredningen bad en biträdande polischef om ursäkt för att han ändrade sitt register över operationen som ledde fram till Anthony Graingers död, och det upptäcktes att chefen för vapenenheten hade förstört sina anteckningar när han gick i pension - ett år efter skottlossningen.
Polisens vakthund har inlett en ny utredning av fallet.
Det är andra gången som den oberoende polisklagomålskommissionen (IPCC) har undersökt fallet - vilket är ytterst sällsynt. Den berättade för oss att den undersöker bevis som ges vid den offentliga utredningen.
Ian Terry var vapenofficer hos polisen i Manchester.
Under en övning på en kasserad fabrik 2008 erbjöd han sig frivilligt att spela rollen som en brottsling som flydde i en bil.
Ovanligt nog hade beslutet - som fattades just den morgonen - fattats att använda liverundor för att göra övningen mer realistisk.
Mr Terry sköts av en polis med ett hagelgevär laddat med en så kallad Rip rund patron - dödligt på nära håll. Han dog inom några minuter.
Tvåbarnspappan hade ingen skyddsväst.
Hans far, Roy Terry, sa att familjen fick höra att han hade varit inblandad i en olycka på jobbet.
"Vi fick lov att tro att det var en hemsk olycka från början, som till slut visade sig att det inte var riktigt."
IPCC var svidande, kallar fallet "en chockerande väckarklocka för större Manchester Polisens vapenenhet".
En undersökningsjury 2010 styrde att Ian Terry hade blivit olagligt dödad och att han "skulle ha räddats" om utbildningen hade förberetts ordentligt.
Hans far Roy Terry sa att övningen hade gjorts "för farlig".
"Vi fick intrycket att skjutvapen officerarna var mer eller mindre tillåtna bara för att komma på och göra sin egen sak", tillade han.
John Foxcroft, som ledde vapenutbildningsenheten vid Greater Manchester Police fram till 2006, innan han gick i pension 2008, berättade för programmet att han lämnade positionen i tron att styrkan "fick lite för mycket in i den aggressiva taktiken".
"Ju mer aggressiv du blir, desto mer sannolikt är det att du blir skjuten."
Crown Prosecution Service sade att det inte fanns tillräckligt med bevis för att väcka åtal mot några officerare, men Greater Manchester Police bötfälldes för hälso- och säkerhetsbrott.
År 2014 avfyrades en av de officerare som organiserade utbildningen från kåren.
Mannen som sköt Ian Terry var disciplinerad men jobbar fortfarande för polisen.
Roy Terry sa att det var "inte helt tillfredsställande, men allt vi skulle få".
BBC har nu upptäckt att det finns en ny utredning av IPCC i fallet, nio år efter Ian Terrys död.
Polisen vakthund sade att det har startat en utredning som undersöker bevis som getts av ett antal officerare till IPCC, till förhöret om PC Terrys död, och till en efterföljande Health and Safety Executive (HSE) kronrättegång.
GMP: s Det Ch Supt Paul Rumney sade att styrkan "kommer att överväga eventuella rekommendationer" av den offentliga utredningen.
Jordan Begley var 23 år. Han arbetade i en glassfabrik nära sitt hem i Gorton i Manchester.
På natten för hans död, i juli 2013, hade han varit inblandad i ett fyllo gräl med sina grannar, och hotade att attackera dem med en kniv. Hans mamma ringde polisen.
"Jag behöver polisen här. Du måste få hit polisen. Jordan stanna här, du ska inte gå ut, "Hon kan höras säga i inspelningen 999 samtal.
En patrullofficer lugnade ner honom - sedan andra officerare kom, totalt 11, inklusive beväpnade poliser.
Mr Begley var elfenbent och hindrad av beväpnade officerare. Han blev slagen när han var på marken och dog av hjärtsvikt.
"Det var en chock. De behövde inte så många officerare för en person. Han var harmlös", förklarade hans kusin Conor Turner.
Vid en utredning 2015 fann juryn att polismisslyckanden spelade en roll i hans död och sade att han hade blivit olagligt dödad.
Det sades att kraften "olämpligt och orimligt" använde elpistolen längre än nödvändigt, när han väl var på golvet,+ att skjutvapenofficerarna inte försökte fastställa om han var medveten, och att under återhållsamhet Mr Begley " erbjöd minimalt motstånd" med "inget behov" att slå honom två gånger.
Polisen friades från all skuld, men efter förhöret bröt vakthunden sin första rapport och inledde en ny utredning - som aldrig hade gjorts tidigare.
Se Victoria Derbyshire-programmet på vardagar mellan 09:00 och 11:00 på BBC Two och BBC News-kanalen.
Större Manchester Polisen står inför nya utredningar av polisen vakthund över tre separata dödliga skjutvapen incidenter, Victoria Derbyshire programmet har lärt sig.