Han återvände till sin hemstad Middlesbrough för ceremonin, där han blev hedersdoktor i professionella prestationer.
Mortimer hyllade området för dess "tydliga, torra sinne för humor".
Många av de karaktärer som skapades i hans dubbelakt med Vic Reeves var baserade på lokalbefolkningen, avslöjade han.
Han sade: " Jag var här tills jag var 25 år, och de människor ni träffar stannar kvar hos er mycket längre än de ni träffar när ni är äldre.
"Det gör mig alltid ledsen när jag kommer hem, på så trevligt sätt, eftersom jag har så många kära minnen av platsen."
När han tillfrågades om han trodde Middlesbrough FC skulle vinna befordran tillbaka till Premier League, sade han att han inte skulle förbanna dem med en förutsägelse.
När det gäller hans doktorsexamen, sade han: "Jag kommer att rama in den och sätta den ovanför min sons säng för att bevisa för honom att jag gjorde något."
TV-komikern Bob Mortimer har fått hedersexamen från Teesside University.