Tidningen hade rapporterat anklagelser om att Melania Trump en gång arbetade som eskort, men senare drog tillbaka påståendena.
Historien publicerades under den amerikanska valkampanjen förra året.
Mrs Trump accepterade skadestånd och en ursäkt från tidningen vid Londons högsta domstol.
Artikeln publicerades av tidningen Daily Mail och senare tidningens digitala drift Mail Online.
I ett uttalande sa Trumps advokat att hon är "mycket nöjd" och "kommer att förbli vaksamma för att skydda hennes goda namn och rykte från dem som gör falska och ärekränkande uttalanden om henne".
Mrs Trump lämnade in en stämningsansökan mot Daily Mail i Storbritannien, och lämnade in mot Mail Online i USA.
Utbetalningen avgör fallet både i New York och Storbritannien, trots Londons High Court har ingen jurisdiktion i USA.
Den amerikanska stämningen, inlämnad förra året, sökte skador på $150m (Â £120m). Det belopp som godkändes av Trump i London avslöjades inte i domstol.
Rapporter tyder dock på att utbetalningen var närmare $ 3m, inklusive rättsliga kostnader och skador.
I sin ursäkt erkände Daily Mail att den hade publicerat "alegationer om att hon tillhandahöll tjänster utöver att bara modellera".
Artikeln hävdade också att Mr och Mrs Trump kan ha träffats tre år innan de faktiskt gjorde, och senare "iscensatt" sitt första möte.
"Vi accepterar att dessa anklagelser om Mrs Trump är inte sant", sade tidningen.
En advokat för Mrs Trump berättade Londondomstolen anklagelserna "slå i hjärtat av den sökandes personliga integritet och värdighet".
Hennes advokat sade dubbelsidan sprids i augusti förra året, med titeln "Racy bilder och oroande frågor om hans frus förflutna som kunde spåra Trump", presenterade en gammal naken foto av Mrs Trump från hennes modellkarriär.
"Läsare av tidningen den dagen kunde inte undgå att missa artikeln", sade han.
Och så de mäktiga brevtitlar har Trumped.
Nästan. Det finns människor i juristyrket flabbergasted på storleken av de skador som Melania Trump har fått från Associated Newspapers.
Men med tanke på några av de siffror som bandierade om när detta fall först uppstod, det är inte så illa som vissa i Mail gruppen kan ha fruktat.
Dessutom påpekar The Mail att de håller fast vid vissa aspekter av sin ursprungliga historia, men accepterar fel på den mest välgörande: att Första damen var en eskort.
Det kommer att bli intressant att se om denna lösning uppmuntrar andra att vara mer aggressiva mot brittiska tidningar, och även om det bidrar till att sprida trenden för rättsliga åtgärder över flera jurisdiktioner.
Charles Harder, fru Trumps advokat, agerade också för Hulk Hogan när brottaren tog sin $ 140m (112m) fall mot Gawker Media, tvingar sin försäljning.
Jämfört med det, är denna åtgärd liten stek.
Fru Trump stämning inledningsvis sade att Mrs Trump hade "unik, en gång i livet möjlighet... att lansera en bred-baserade kommersiella varumärke i flera produktkategorier, som var och en kunde ha samlat flera miljoner dollar affärsrelationer för en flerårig mandatperiod under vilken [hon] är en av de mest fotograferade kvinnor i världen".
Kritiker använde frasen för att ifrågasätta om Trump hade planer på att göra ekonomiska vinster från sin position som första dam.
En andra version av kostymen, återgiven veckor senare, tappade den kontroversiella formuleringen.
Mrs Trump föddes Melanija Knavs, i Sevnica, en liten stad ungefär en timmes bilresa från Sloveniens huvudstad Ljubljana.
Hon var signerad till en modellbyrå i hennes sena tonår, och började flyga runt i Europa och USA, visas i hög profil reklamkampanjer.
Hon träffade Donald Trump 1998, när hon var 28 år gammal, på en fest under New York Fashion vecka.
De gifte sig sju år senare.
Registrera dig för att få nyheter från BBC i din inkorg, varje vardag morgon
Den brittiska tidningen Daily Mail har gått med på att betala skadestånd och kostnader till USA:s första dam över en artikel om hennes modellkarriär.