En person dödades och tre skadades under den första skottlossningen vid universitetet i norra Arizona i början av fredagen, vilket inbegrep broderskapsmedlemmar.
Senare samma morgon lämnade en person död vid ett studentkomplex i närheten av Texas Southern University.
Angreppen kom när president Barack Obama besökte familjer till offer för en collegeskjutning i Oregon.
När han anlände till Oregon blev han hånad av vapenaktivister som motsatte sig samtal han gjorde för hårdare vapenlagar efter att nio personer dödades på Umpqua Community College, Roseburg, förra veckan.
Efter ett privat möte med familjer sa Barack Obama att han hade "starka känslor" om vapenkontroll och tillade: "Vi kommer att behöva träffas som ett land för att se hur vi kan förhindra dessa frågor från att äga rum."
I utkanten av denna lilla amerikanska trästad samlades några hundra demonstranter för att tala om för deras president att han inte var välkommen. Många bar öppet handvapen för att få fram sitt budskap.
Demonstranterna skyllde massakern här i förra veckan på två saker: ett misslyckande med att behandla psykiska hälsoproblem och utnämningen av Umpqua Community College som en vapenfri zon.
Många av dem vi talade med sade att de hade rest till Roseburg från någon annanstans i Oregon för att göra sina röster hörda.
De hade ingen brist på klagomål. Barack Obama ville ta ifrån dem vapnen, sa de. Han lade sig i statens affärer. Han förespråkade "muslimsk invandring".
Flera skyltar sa att han skulle åka hem till Kenya. En proklamerade "Christian Lives Matter", en uppenbar hänvisning till Black Lives Matter-kampanjen mot polisbrutalitet.
Fientligheten mot den demokratiska presidenten här i Republikanska landsbygden Oregon var inte bara politisk, det var personligt.
Varför vapenlagar inte kommer att förändras - varför president Obama är maktlös att förändra USA
Obamas frustration - Han säger att BBC passivitet mot vapenlagar är ett stort beklagande av hans ordförandeskap
"Routine" USA vapen våld - Hur mycket vapen brott har det varit i USA hittills?
I Arizona döpte polisen revolvermannen där till Steven Jones, en 18-årig student vid Northern Arizona University.
Mr Jones har åtalats för mord av första graden och tre fall av grov misshandel.
De fyra offren är medlemmar i Delta Chis brödraskap, men mr Jones är inte det.
Mr Jones berättade för polisen att han blev kontaktad av en grupp män och misshandlad. Han flydde, hämtade en pistol ur bilen och öppnade eld när männen kom ifatt honom, sade Arizona polisen. Vittnena berättade för polisen att offren var obeväpnade.
Universitetet har identifierat studenten som dog som Colin Brorough och sade att de tre studenter som skadades behandlas på sjukhus.
Den andra skottlossningen i Texas hände senare på fredag morgon på University Courtyard Apartments på kanten av Houston campus.
En elev dödades, universitetet bekräftade, och en annan person skadades. Två personer har häktats som misstänkta och en tredjedel är fortfarande på fri fot, sade Houstons talesman Jodi Silva.
I Arizona uttryckte universitetspresidenten chock över tragedin. "Detta kommer inte att bli en normal dag på NAU", sade Rita Cheng. "Våra hjärtan är tunga."
Representanter från Delta Chis nationella organisation sade att dess medlemmar var involverade i konfrontationen.
Maria Gonzalez, en student vid universitetet i norra Arizona, sade att hon till en början trodde att hon hörde fyrverkerier.
"Jag studerade för en examen så jag tittade ut genom fönstret och se två människor springa, och det var då jag insåg att det inte var fyrverkerier de faktiskt var skott," sade hon.
"Hur ska jag kunna känna mig trygg där jag lär mig?"
Mountain View Hall sovsal där skottlossningen ägde rum rymmer "majoriteten" av studenter som deltar i brödraskap och sorger, enligt skolans webbplats.
Arizona-lagen förbjuder vapen på campus, men de är tillåtna inuti ett låst fordon.
Arizona senator John McCain släppte ett uttalande för att säga att han ber för alla dem som "påverkas av denna fruktansvärda tragedi".
Två personer har dött efter två separata universitetsskjutningar i Texas och Arizona, bara några timmar ifrån varandra.