Representanthuset passerade HJ Res 43 på torsdag med en majoritet partilinje röst 230 till 188.
Upphävningen förslaget förväntas passera senaten och undertecknas i lag av president Donald Trump.
Ett antal åtgärder för att begränsa tillgången till abort har införts av amerikanska statliga lagstiftare redan i år.
Republikanerna har lovat att "defundera" Planerat föräldraskap, en kvinnlig organisation för reproduktiv hälsa som tillhandahåller preventivmedel, STD-test, cancerscreening, bröstundersökningar och graviditetsavslutningar.
HJ Res 43 skulle upphäva en regel som infördes två dagar innan Mr Trump kom till makten.
Obamas administrativa åtgärd förbjöd stater från att undanhålla federala dollar från grupper som tillhandahåller aborter.
Regeln infördes efter att mer än ett dussin konservativa stater nekat medel till Planned Parenthood genom ett Nixon-era familjeplaneringsprogram som kallas Title X.
Planerat föräldraskap får hundratals miljoner dollar om året i finansiering från den federala regeringen, men det är förbjudet enligt lag att använda någon av dessa pengar för att finansiera aborter.
Republikanerna mot abort jublade det första steget mot att störta Obamas regering.
New Jersey Representant Chris Smith sade: "Planerat föräldraskap är Child Abuse Inc," hänvisar till i hemlighet inspelade bilder av anställda vid gruppen diskuterar fostervävnad donation.
Men kritiker varnade för att låginkomsttagare och unga kvinnor skulle få bära bördan av HJ Res 43.
De demokratiska kongresskvinnorna Diana DeGette sade: "Trots sitt löfte att fokusera på jobb och ekonomin, har republikanska ledare gjort attacker kvinnors sjukvård till sin högsta prioritet."
Planerad föräldraskap president Cecile Richards fördömde republikanska "extremister" som hade stött HJ Res 43.
Den här veckan passerade Oklahoma förslaget, som skulle tvinga kvinnor att få tillstånd från sin sexuella partner för en abort, sitt första hinder.
Republikanerna har med överväldigande majoritet godkänt en resolution som tillåter stater att hålla inne medel från abortleverantörer som Planned Parenthood.