Den Australian Crime Commission (ACC) rapport sade drogen - känd som "is" - utgjorde den största risken för australiensiska samhällen av någon olaglig substans.
Den fann också att drogens renhet hade ökat under de senaste åren, vilket gjorde den ännu farligare.
Metylamfetamin kommer i en rad olika former, med kristallen "is" sort den vanligaste i Australien.
Priset på crystal meth i Australien är bland de högsta i världen, enligt rapporten, som driver landets organiserade kriminella gäng att i allt högre grad handla med drogen.
Enligt rapporten blandade också gäng som tillhandahöll drogen in andra olagliga ämnen i crystal meth i ett försök att öka beroendenivåerna.
ACC sade att det hade skett en "betydande ökning av antalet och vikten av upptäckter vid den australiska gränsen" utan någon minskning av den inhemska produktionen.
Det sades att mexikanska narkotikakarteller i allt större utsträckning var inblandade i leveransen av drogen utomlands och arbetade med distributionsnät i andra länder som Australien.
De prekursorkemikalier som används av Australiens inhemska tillverkare för att "koka" drogen importerades i allt högre grad från Indien och Kina, fann man.
Chris Dawson, chef för ACC, sade "tillgänglighet och beroendeframkallande natur" av kristall meth hade "skapat ny efterfrågan i städer, landsbygden och missgynnade samhällen".
"Is är en förödande, lömsk drog. Det påverkar alla från användare, deras familjer, och deras samhällen, och myndigheter som hanterar användarna, "sade han.
I november förra året beslagtog polisen i New South Wales mer än 800 kilo metylamfetamin, tillsammans med två ton MDMA - värt ett sammanlagt uppskattat gatuvärde på 1,5 miljarder dollar (800 miljoner pund; 1,2 miljoner dollar).
Och tidigare denna månad upptäckte polisen 230 kilo flytande metylamfetamin i en sändning av 20.000 flaskor smaksatt vatten avsett för ett lager i Sydney.
ACC-rapporten rekommenderade ett "kollektivt nationellt svar" för att hantera läkemedlets ökande prevalens.
"Alla spelar en roll i kampen mot olagliga droger - inklusive regeringar, brottsbekämpning, hälsa, utbildning, industri, icke-statliga organisationer och samhället," Mr Dawson sade.
Mer än 60 procent av Australiens största organiserade brottslighet handlar nu med metamfetamin, en ny rapport har hittats.