Fler organisationer är nu i svårigheter, jämfört med samma punkt förra året.
Budgettrycket kan delvis bero på att sjukhus anställer fler sjuksköterskor.
Men hälsodepartementet säger att hårda beslut om de offentliga finanserna har inneburit att det har ökat den totala NHS-budgeten.
De ekonomiska utsikterna tycks försämras för alla typer av NHS-organisationer som tillhandahåller vård i England.
Det finns 102 NHS-organisationer, främst sjukhus, som har sin ekonomi övervakad av ett nytt organ som kallas Trust Development Authority.
Senaste styrelsepapper från TDA visar 33 förväntar sig att bli överutnyttjade i slutet av mars.
Detta tyder på att ett antal kan kämpa för att visa de standarder för finansiell styrning som behövs för att bli mer oberoende stiftelser.
Bland de 147 befintliga stiftelserna är 38 redan kända för att förvänta sig överutnyttjanden, och dessa siffror kommer snart att uppdateras av deras övervakare.
En del av det ökade ekonomiska trycket kan bero på en ökning av antalet anställda sjuksköterskor.
Fram till oktober 2013 övertogs ytterligare 2 390 sjuksköterskor av truster i England.
Prof John Appleby, chefsekonom för Kings Funds tankesmedja för hälsa, sa att det fanns alla indikationer på att högre chefer satte standarden för vård först.
"Vi har haft hemska händelser som Mid Staffs. Vi har fått ett antal rapporter producerade av NHS, och självständigt, tyder på att NHS verkligen behöver få grepp om sin kvalitet på vård och tjänster.
"Och du kan se styrelser göra det valet - mellan kanske över spenderande, men upprätthålla kvalitet."
En färsk undersökning Kings Fund av finansdirektörer föreslog ett växande antal var dyster om de ekonomiska utsikterna, även om det var bara ett litet urval som svarade.
I början av räkenskapsåret förväntade sig 20 procent av alla typer av truster i England ett underskott, men det har nu ökat till 29 procent.
Nick Samuels, talesman för Foundation Trust Network, sade: " Allt vi har är att våra medlemmar finner det allt svårare ekonomiskt, och situationen förvärras snabbt.
"Alla NHS truster har ombetts att se över sina personalförhållanden som ett resultat av svaret på Francis rapporten i Mid Staffs.
– Vi vet att ett mycket stort antal truster har tvingats öka personalkostnaderna.
"För ett sjukhus, mellan 60-70% av deras kostnader är lön, och det är högre för samhället och mental hälsa truster."
Mellan nu och slutet av året kan den prognostiserade situationen antingen förbättras eller försämras ytterligare.
NHS England innehar en fond på 60 miljoner pund som kan användas för engångshjälp till ekonomiskt oroliga icke-grundade truster i år.
Det är litet i jämförelse med nettoförväntat underskott på 250 miljoner pund, men kan vara tillräckligt för att lyfta dem med de minsta finansiella problem ur underskottet.
Andy Burnham, skuggföredraganden, sade att NHS stod inför en "växande finanskris" eftersom fokus hade bytt till omorganisation.
Och han varnade: "När den ekonomiska paniken sprider sig, kommer patienterna att nekas behandling och avdelningar kommer att skära tillbaka på personalen."
Men hälsovårdsdepartementet sade att regeringen hade fattat svåra ekonomiska beslut, så att det kunde ge små reella termer ökningar till hälso- och sjukvården.
En talesman tillade: "De flesta truster har en sund ekonomisk ställning medan NHS ser fler patienter och utför fler operationer än någonsin."
Han sade att produktiviteten hade förbättrats under två år i rad, för första gången på tio år.
Nästan en av tre NHS truster i England nu förutspår att de kommer att avsluta räkenskapsåret överutnyttjade, officiella siffror visar.