Ett antal rökbomber kastades på fältet Marring Forfar övergivna skotska Cup respel mot Linlithgow Rose på tisdag kväll.
"Jag är inte helt säker skotsk fotboll kan göra något för att utrota det," Donald berättade BBC Skottland.
"De här små missilerna som kommer in är lika stora som en cigarettändare."
Den fjärde omgången avbröts på grund av ljusavbrott på Station Park, med en "distraherad" Donald som sa att han inte hade förutsett några problem eller pyroteknik från supportrar.
"Hade detta varit en högre profil spel, skulle vi förmodligen ha satt åtgärder på plats," sade han. "Men eftersom vi redan spelat en gång och det gick helt sömlöst, du gör din riskbedömning och vi tyckte att vi hade tillräckligt med skydd.
"Vi kanske kunde ha hanterat det bättre och kanske vi borde ha varit mer förberedda, men jag tror att när du sätter dig ner, gör din analys av fakta innan spelet, Detta är förmodligen så låg risk ett spel som du kan få.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
De 42 SPFL medlemsklubbarna träffades på tisdag, med ansiktsigenkänning teknik nämns som en potentiell metod för att identifiera fans som engagerar sig i antisocialt beteende.
"Jag är öppen för förslag från människor - hur skulle du kontrollera det?" tillade Donald. "Om du har 500-600 människor i en innesluten miljö och de är fan-böj på att sätta en flamma av, du skulle behöva ha en förvaltare för var tre eller fyra åskådare för att stoppa det, och det kommer aldrig att hända.
"Det är verkligen beklagligt och det är något som händer allt oftare. Det är ett större problem som blir alldeles för vanligt."
Linlithgow Rose manager David McGlynn sa att klubben skulle försöka spåra de ansvariga för att kasta rökbomber, medan klubbpresident Les Donaldson försökte utmana förövarna på Station Park.
"Det är bara chockerande att tänka att en klubb som har försökt så hårt att gå framåt, att göra anläggningar så bra för varje person som kommer med så småningom tas ner av ett gäng huliganer som inte har något intresse av att titta på fotboll, allt de var där för orsakade problem," Donaldson berättade BBC Radio Skottland på onsdag.
"Allt jag ville göra var att försöka visa solidaritet med förvaltare och polis och försöka få dessa människor att inse hur de svek en klubb som aldrig har varit i trubbel tidigare.
"Att ställas inför detta gäng idioter igår kväll - de är inte sanna Linlithgow supportrar - vi är bara på en förlust vad vi ska göra."
Forfar Athletic ordförande Alastair Donald har medgett att han inte har någon lösning på den senaste tidens spat i facklor och rökbomber kastas av supportrar.