Partiets infrastrukturminister Chris Hazzard och hans kollega John O'Dowd är i London för ett möte med Brexit Secretary David Davis.
DUP:s biträdande minister, Alastair Ross, är också närvarande.
Sinn Féin har dock anklagat regeringen för att behandla rådet som en "talkshop".
Tidigare i veckan sade premiärminister Theresa May att Brexit innebär att lämna EU:s tullunion.
Det möjliggör för närvarande tull- och pappersfri handel mellan Förenade kungariket och Irland.
Sinn Féin MLA John O'Dowd sade på torsdag: "Genom att göra sitt så kallade keynotetal om Brexit... denna vecka två dagar före det gemensamma ministerrådet, behandlade den brittiske premiärministern Theresa May rådet med fullständigt förakt."
Han tillade: " Det var en tydlig handling av ond tro... det är tydligt att hon är inställd på att ignorera viljan hos majoriteten av de människor i norr som röstade för att stanna kvar i EU.
"Det har kommit till det stadium där det gemensamma ministerrådet behandlas som en pratbutik av den brittiska regeringen och vi kommer att ompröva vårt engagemang i det."
DUP ser rådet som ett användbart forum för att framföra sina farhågor.
DUP och Sinn Féin förenades vid rådsmötet med ministrar från Skottland och Wales.
Ministern för Nordirlands kontor, Lord Dunlop, beskrev samtalen som "ett konstruktivt möte för att granska de decentraliserade förvaltningarnas viktiga bidrag till processen för att planera Förenade kungarikets avgång från Europeiska unionen".
"I sitt tal denna vecka betonade premiärministern vikten av att arbeta tillsammans för att uppnå en överenskommelse som fungerar för Nordirland som en del av ett Storbritannien som är fast beslutet att dra nytta av de möjligheter som lämnar EU presenterar", sade han.
Tidigare sade Hazard att Nordirland behövde en "särskild status" inom EU.
F.d. premiärminister John Bruton har sagt att Mays plan för ett tullavtal efter Brexit kommer att vara "ogenomförbar".
Sinn Féin har sagt att man genom att lämna Europeiska tullunionen skapar en "hård gräns på ön Irland".
Men DUP MP Sammy Wilson sade premiärministerns uttalande skulle ge näringslivet "mer säkerhet".
Brexit-minister David Davis har sagt att Storbritannien som lämnar EU skulle få problem med gränskontrollerna på Irland, men att eventuella problem skulle kunna lösas.
Vad är en tullunion och varför spelar den någon roll?
En tullunion är en form av handelsavtal mellan två eller flera länder.
Det innebär att de beslutar att inte införa tullar (skatter på import) på varandras varor och enas om att införa gemensamma externa tullar på varor från länder utanför deras tullunion.
Att fastställa gemensamma yttre tullar är det som skiljer en tullunion från ett frihandelsområde.
Det viktigaste argumentet för att lämna tullunionen är att den kommer att göra det möjligt för Förenade kungariket att förhandla om sina egna handelsavtal.
Läs mer här.
Sinn Féin hotar att dra sig ur det gemensamma ministerrådet över oron över förhandlingarna om att Storbritannien ska lämna EU.