Uppskattningsvis 250 personer gjorde resan från Wales till den heliga staden Mecka, nära där händelsen inträffade på torsdag.
Det muslimska rådet i Wales (MCW) hade svårt att kontakta några grupper från Cardiff, Newport och Swansea.
Alla har nu bekräftat att de är säkra.
MCW generalsekreterare Saleem Kidwai sade att han hade tagit kontakt med alla gruppledare från Wales, och alla de på pilgrimsfärderna har redovisats.
MCW: s projektledare Mohammed Alamgir sade att han nu ser till att lämpliga stödtjänster är tillgängliga för de återvändande parterna genom sitt nätverk av präster och Imams.
"Det fanns stor oro för familjer och många medlemmar av den walesiska muslimska samhället väntade ivrigt på nyheter om sina nära och kära och vänner. Böner erbjöds över hela Wales i hopp om goda nyheter, sade han på söndagen.
"Vi väntar nu alla på resultatet av den utredning som den saudiska regeringen har inlett och hoppas på ytterligare garantier för pilgrimernas säkerhet."
Tillsammans med dem som dödades skadades ytterligare 863 personer i incidenten i Mina, vilket inträffade när två miljoner pilgrimer deltog i Hajjs sista stora rit.
Alla grupper från Wales som gör pilgrimsfärden Hajj i Saudiarabien där en rasande dödad minst 717 har redovisats, har en muslimsk ledare sagt.