Fellow center Duncan Taylor, från Saracens, är tillbaka efter att ha missat höstens tester genom skada.
Uncappad Edinburgh framåt Simon Berghan och Cornell du Preez ingår men David Denton inte passar.
Alasdair Dickinson är också frånvarande genom skada, medan kollega Edinburgh prop WP Nel listas men är ett tvivel med ett nackproblem.
Nel varade bara 27 minuter av sin återkomst från en lång skada permittering på helgen och väntar på resultaten av en scan.
Årets mästerskap kommer att vara Nya Zeelander Cotters sista ansvarig för den nationella sidan.
Han kommer att ta över som Montpellier coach i sommar och kommer att ersättas av Glasgow Warriors' Gregor Townsend.
Scoterna inleder sin sexnationers kampanj hemma i Irland den 4 februari innan de möter Frankrike åtta dagar senare.
Med Dickinson saknas och tvivel om Nel, Newcastle front-rower Jon Welsh återvänder för första gången sedan 2015 VM.
John Hardie, som startade alla fem matcher i förra årets turnering, är en annan Edinburgh spelare i Cotter planer arbetar sig tillbaka till kondition.
Edinburgh lås Ben Toolis är också valt att inte ha dykt upp sedan Six Nations av 2015.
"Det är en välbalanserad och spännande grupp som har spelat en hel del rugby tillsammans, känner varandra väl och är ambitiösa att göra bra i en Scotland jersey", säger Cotter.
"Jag tror att om vi får vår inställning rätt kan vi vara konkurrenskraftiga och driva på för vinster i varje spel i denna kampanj."
Förra året slutade Skottland fjärde i mästerskapet efter segrar mot Italien och Frankrike.
I novembers hösttest slog skottarna Argentina och Georgien efter ett snävt nederlag för Australien.
BBC Skottlands Tom Engelska
Tävlingen i Skottlands mittfält är nu hård. Detta är förmodligen - nästan säkert - den bästa uppsättningen centra som landet någonsin har haft. Cotter har döpt fem Mark Bennett, Alex Dunbar, Huw Jones, Matt Scott och Duncan Taylor.
Alasdair Dickinsons skada är ett slag. Skottland kan behöva sin erfarenhet av lösa trådar.
Scotland-truppen:
Framåt: Alex Allan, Zander Fagerson, Gordon Reid (alla Glasgow Warriors), Simon Berghan, Allan Dell, Willem Nel (alla Edinburgh Rugby), Jon Welsh (Newcastle Falcons), Fraser Brown (Glasgow Warriors), Ross Ford, Stuart McInally (båda Edinburgh Rugby), Jonny Gray (Glasgow Warriors), Richie Gray (Toulouse), Grant Gilchrist (Edinburgh Rugby), Tim Swinson (Glasgow Warriors), Ben Toolis (Edinburgh Rugby), John Barclay (Scarlets), Cornell Du Preez, John Hardie, Hamish Watson (alla Edinburgh Rugby), Rob Harley, Josh Strauss, Ryan Wilson (alla Glasgow Warriors)
Baksidor: Greig Laidlaw (Gloucester), Ali Price, Henry Pyrgos, Finn Russell (alla Glasgow Warriors), Duncan Weir (Edinburgh Rugby), Mark Bennett, Alex Dunbar (Glasgow Warriors), Huw Jones (Stormers), Matt Scott (Gloucester), Duncan Taylor (Saracens), Stuart Hogg (Glasgow Warriors), Damien Hoyland (Edinburgh Rugby), Sean Maitland (Saracens), Tommy Seymour (Glasgow Warriors), Tim Vissser (Harlequins)
4 februari — Skottland mot Irland (14:25)
12 februari - Frankrike mot Skottland (15:00)
25 februari - Skottland mot Wales (14:25)
11 mars - England mot Skottland (16:00)
18 mars - Skottland mot Italien (12:30)
Scotland huvudtränare Vern Cotter har återkallat Gloucester center Matt Scott till sin trupp före Six Nations.