Baroness Nuala O'Loan, som var Nordirlands första polisombudsman, sade att frågorna måste behandlas separat.
Hon sa att offren hölls "till lösen" under det politiska dödläget.
"Om du väljer mellan förmågan hos människor att få protes lemmar och social reform, att för mig är helt moraliskt fel," sade hon.
När hon talade om BBC:s program Good Morning Ulster anklagade hon både Westminsterregeringen och Stormonts decentraliserade regering för att inte bidra till att lösa pågående problem orsakade av problemen.
Baronessan O'Loan sade att offer som hade konfliktrelaterade skador inte fick det ekonomiska stöd som behövdes på grund av budgetraden över välfärdsreformen.
"Vi har människor idag som lider en hel del, vi behöver resurser och vi behöver framsteg i det förflutna för att möjliggöra nuet", sade hon.
Den tidigare polisombudsmannen sade också att pågående sekteristiskt våld var resultatet av att Nordirlands oroliga förflutna misslyckades.
"Folk kan tro att vi är i fred, men vi hade tre dödsfall förra året, vi hade 94 skottlossningar, vi hade 26 bombningar, 58 skjutvapen återfunna. Vi har fortfarande ett konflikttillstånd och vi måste arbeta som ett samhälle för försoning.
"Den brittiska regeringen måste spela sin roll och vår egen regering måste spela sin roll och jag tror inte heller gör det för tillfället."
Ulster Unionist ledare Mike Nesbitt sade Ms O'Loans "argument" hade "vissa meriter".
"I början av Haass samtal för två år sedan, jag hävdade att vi bör hålla oss väl från denna formel, och bankavtal som vi framsteg," sade han.
"Jag gjorde samma pitch i början av Stormont House processen, tyvärr utan framgång, och som ett resultat, offer och överlevande återigen befinner sig i limbo, lyssna på rykten om möjligheten av verkliga framsteg i tillhandahållandet av tjänster, men omedvetna om de verkliga utsikterna för faktiska leverans, inte minst i fråga om bättre psykisk hälsa och välbefinnande."
Nesbitt sade att O'Loans inlägg hade kommit "i hälarna" av spekulationer i en mediebriefing om att den brittiska regeringen överväger att genomföra enskilda aspekter av avtalet.
"Allt detta har en känsla av att mjuka upp allmänheten för en sidoaffär som förs fram över och över huvudet på de fem exekutiva partierna", sade han.
"Vår oro över sidoavtal var en av anledningarna till att Ulster Unionist Party kände sig oförmögen att fullt ut stödja Stormont House-avtalet i december förra året, och allteftersom tiden går tycks visdomen i det beslutet stärkas för varje dag."
Westminster-regeringen hade kommit överens om ett antal nya åtgärder för att ta itu med problem som uppstått under Stormont House-avtalet i december förra året.
Avtalet har dock varit i fara sedan mars, när Sinn FÃ©in drog tillbaka sitt stöd efter en rad om hur framtida välfärdskrav skulle hanteras.
Det är "omoraliskt" för regeringen att vägra att ta itu med Problem äldre problem om inte välfärdsreformen är överenskommen, en tidigare vakthund har sagt.