The Daily Telegraph hävdade att Black hade gett reportrar råd om hur man mutar tjänstemän på andra klubbar.
Under en intern utredning begärde Southampton att Telegraph skulle förse dem med bevis.
I ett uttalande sade den: "Det finns inga bevis för något orätt, eftersom klubben nu anser att saken är avslutad."
Uttalandet tillade: " Trots många förfrågningar om att ge klubben bevis för anklagelsen mot Black har ingen kommit fram. "
Black, 54, gick med i Premier League Club i juni som assistent till manager Claude Puel.
Aston Villas tidigare vaktmästare och Aberdeen-strejkaren förnekade anklagelserna.
Southampton har dragit slutsatsen att det inte finns "inga bevis" för att stödja anklagelser om oegentligheter som gjorts av en tidning mot dess biträdande chef Eric Black.