Den nya Velvet Edition mörk choklad barer går till försäljning i Storbritannien denna månad.
I stället för Fairtrade märket, bär den Cocoa Life certifiering, som inrättats av Mondelez International, ägaren av Green & Black's.
Mondelez kallar Cocoa Life "ett holistiskt hållbarhetsprogram för kakao i samarbete med Fairtrade".
Och till skillnad från alla andra Green & Blacks barer finns det ingen ekologisk etikett.
Glenn Caton, Nordeuropas president i Mondelez, sade: "Dessa bönor är inte tillgängliga i ekologisk skala i den skala som krävs för Green och Black's, men jag är stolt över att de är hållbart framställda, oberoende verifierade bönor från Cocoa Life-programmet, där Fairtrade kommer att se till att vi förblir en ansvarig partner för jordbrukare."
Green & Black's grundades 1991 på Portobello Road i London av Craig Sams och Jo Fairley. Tre år senare var Maya Gold-baren den första chokladen i Storbritannien som tilldelades Fairtrade-märket.
Den hämtar sin ekologiska kakao från Dominikanska republiken.
Alla dess sortiment, förutom Velvet Edition, kommer att fortsätta att vara ekologiska och bära Fairtrade-logotypen, som anses vara ett av de mest erkända och pålitliga etiska varumärkena i världen.
Mondelez, tidigare Kraft Foods, äger Green & Black's genom Cadbury's, som köpte Green & Black's 2005, innan de köpte sig av Kraft 2010.
Varumärket Cocoa Life ersätter nu snabbt Fairtrade-logotypen för alla sina chokladprodukter.  2019 kommer Cadburys hela chokladsortiment i Storbritannien och Irland - inklusive Flake, Twirl och Wispa - att visa Cocoa Life-logotypen.
Green & Blacks sade i ett uttalande: " Cocoa Life, som är oberoende verifierat, betyder Green and Blacks kommer att bygga mer och starkare relationer med jordbrukssamhällen och bli en ansvarig partner, inte bara en köpare. "
Det brittiska Fairtrade-märket administreras av Fairtrade Foundation, en oberoende ideell organisation, och förekommer på omkring 5 000 produkter.
Man hävdar att det finns mer än 1,65 miljoner jordbrukare och arbetstagare i 1 226 producentorganisationer i hela Fairtrade-systemet, vilket garanterar anständiga arbetsvillkor och ett minimipris för produkter.
Förra året gick man in i ett partnerskap med Cocoa Life för att skapa "större skala och effekter för kakaobönderna och deras samhällen".
Det står att partnerskapet innebär att fem gånger så mycket Cadbury choklad nu kommer att tillverkas med hållbart producerad kakao.
Fairtrade medgav: "Caco för Cadbury produkter i Storbritannien och Irland under Cocoa Life kommer inte att handlas enligt Fairtrade standarder för certifiering."
Men man insisterar på att jordbrukarna inte kommer att förlora: "De kommer i stället att få ett konkurrenskraftigt pris för kakaon, ytterligare lojalitetsbetalningar plus ytterligare investeringar i projekt och stöd för att förbättra sina jordbruksmetoder och genomföra gemenskapens handlingsplaner.
"Värdet på allt detta kommer åtminstone att motsvara det som tidigare levererats under Fairtrade."
Green & Black's, som banade väg för ekologisk Fairtrade-choklad, lanserar sin första brittiska produkt utan en Fairtrade eller ekologisk etikett.