Stadsfullmäktige kommer att bidra med 4,4 miljoner pund medan £12,6 miljoner kommer från FA, Premier League och Sport England.
Fyra "hubs" kommer att bildas på nuvarande platser för att minska ett beroende av rådsstöd, sade en myndighet talesman.
FA har sagt att det kommer att investera ett rekord £260m i gräsrotsfotboll till 2019.
Ledaren för Liverpools liberala demokratiska opposition Richard Kemp har dock varnat för att affären kan orsaka "stora problem".
Han sade att lokalbefolkningen inte hade rådfrågats av FA och Liverpools stadsfullmäktige, och att "praktiker inte hade arbetats igenom" inklusive förekomsten av strålkastare nära lokala bostäder.
Han ifrågasatte också om rådet skulle bidra med medel när det kämpade för att upprätthålla parker på grund av nedskärningar i finansieringen, och när FA var "en av de rikaste idrottsorganisationerna i världen".
En talesman för rådet sade att allmänheten skulle rådfrågas efter det att de planerade ansökningarna lämnats in inom de "nästa månaderna".
Borgmästare Joe Anderson sa att det var en "riktig kupp" för staden eftersom fullmäktige hade "mycket mindre pengar än vi brukade".
Var kommer fotbollen på gräsrotsnivå att vara?
Platserna i programmets första fas omfattar följande:
En talesman för kommunfullmäktige sade att diskussioner hölls med Merseyside Youth Association, som har drivit tre av platserna i nästan 100 år, för att omstrukturera sina hyresavtal.
FA:s verkställande direktör, Martin Glenn, sade att FA hade för avsikt att inrätta fotbollshubbar i 30 städer under de kommande fyra åren för att stödja sin ungdomsutveckling.
Sheffield valdes för landets första FA-finansierade gräsrotsfotboll "hubs" 2014, när en £ 9,6m fond utlovades.
Liverpool har valts som mottagare av den största investeringen i fotboll på gräsrotsnivå efter det att ett avtal på 17 miljoner pund har ingåtts.