Keith Towler har stött ett beslut att göra rådet ansvarigt inför en styrelse under walesiska regeringens kontroll.
Det följer en kontrovers efter påståenden om att barn var inlåsta i rummen.
Towler sade att han redan hade fått en "gjuten järngaranti" att rummen nu var ur bruk.
Utbildningsminister Leighton Andrews meddelade att rådet måste svara inför Pembrokeshires ministerråd efter att ha sagt att han hade "litet förtroende" för vissa högre rådstjänstemän.
Frågan om hur Pembrokeshire skyddar vissa barn har lett till en stor rad med den walesiska regeringen.
I juni 2009 framfördes ett klagomål om att barn var inlåsta i rummet, utan naturligt ljus eller ventilation, vid elevremissenheten i Neyland.
Mr Towler berättade för BBC Radio Wales att "time-out" rummet i Neyland var "inte längre används eller något rum som".
"Jag har fått en absolut försäkran om att rummet aldrig kommer att användas igen.
"Dörren har tagits av och den används inte.
"Familjerna behöver veta att det är oacceptabelt och att situationen aldrig kommer att hända igen i Pembrokeshire," tillade han.
Han tillade att han hade träffat Pembrokeshires råd och ansåg att "vissa framsteg" redan hade gjorts, men utbildningsministerns ingripande var viktigt.
"(Att besvara den särskilda styrelsen) är ett nödvändigt steg av Leighton Andrews," sade Towler.
"Den ståndpunkt jag har intagit är att vi måste se till att alla förfaranden är så säkra och robusta som möjligt för barn och den walesiska regeringen och rådet som arbetar tillsammans kommer att bidra till att uppnå det."
När det gäller de förbättringar han hade sett sade Towler: "Rådet arbetar för att se till att alla förstår vad lyssnande till barn verkligen betyder i en skyddande mening".
Han tillade att "interna frågor" till följd av anklagelser om missbruk fortfarande måste lösas, och han ville inte kommentera dem för närvarande.
"Det är klart att det är rätt saker som händer och jag har träffat en av de familjer som är inblandade i (pupilremiss) enheten i Neyland för att försöka få en känsla av hur lokalbefolkningen känner sig."
Mr Towler sa att det inte skulle finnas någon sommarledighet för folk som arbetar för att ställa saker till rätta i rådet.
"Föräldrar måste lugnas saker görs på rätt nivå," sade han.
I september förra året sände ministrarna en expertpanel som kallade Pembrokeshires ministerråd till rådet, efter att ha utfärdat en sista varning till den lokala myndigheten.
Andrews sade i måndags vad styrelsen och en rad inspektörer sedan dess har sagt till honom "inte göra något för att dämpa vår oro".
Rådsledaren Jamie Adams sade att den lokala myndigheten "gjorde goda framsteg" i frågan.
"Vi är fast beslutna att göra allt som rimligen kan förväntas hålla barn i Pembrokeshire säkra."
Barnens kommissionär för Wales säger att familjer behöver veta att elever aldrig mer kommer att placeras i vadderade "time-out" rum efter en rad i Pembrokeshire.