McMullin, före detta chefsdirektör för regeringskonferensen, förväntas formellt lämna in sin kandidatur på måndag.
Han kommer sannolikt att ställas inför utmaningar när det gäller röstsedelsfrister och insamling endast tre månader före valdagen.
Den 40-årige mormonen har aldrig varit vald.
McMullin, en frispråkig kritiker av den republikanska nominerade, Donald Trump, släppte ett uttalande till ABC News.
"Det är aldrig för sent att göra det rätta, och Amerika förtjänar mycket bättre än antingen Donald Trump eller Hillary Clinton kan erbjuda oss. Jag erbjuder mig ödmjukt som en ledare som kan ge miljontals missnöjda amerikaner ett konservativt val för presidenten," sade McMullin.
Den föga kända, ogifta konservativa arbetade för CIA i 11 år innan de lämnade byrån 2010.
Han gick senare till arbete för Goldman Sachs och blev en senior rådgivare i nationell säkerhet för House utskottet för utrikesfrågor 2013.
McMullin avgick från sin tjänst vid den republikanska konferensen i House i måndags, rapporterade amerikanska medier.
Utah infödda utexaminerades från Brigham Young University och fick en master's of business administration från The Wharton School vid University of Pennsylvania, enligt hans LinkedIn sida.
Han hade bara 135 Twitter följer när hans väntande kandidatur först tillkännagavs och fick mer än 12.000 inom timmar.
McMullin har uttryckt sitt motstånd mot Trump i sociala medier och kallar honom "auktoritär" och fördömer den republikanska kandidatens attacker på den fallna kaptenens familj. Det är Humayan Khan.
I ett Facebook-inlägg fördömde McMullin Trumps antimuslimska retorik och sade "att attackera dem som grupp gör Amerika svagare, inte starkare".
McMullin går med i tredje parts kandidater Libertarian Partys Gary Johnson och Green Partys Jill Stein, som också är med i loppet för Vita huset.
McMullin står inför en rad hinder under de kommande tre månaderna, eftersom han redan har missat de tidsfrister som krävs för att genomföra omröstningen i 26 stater.
Han kommer att behöva samla tiotusentals underskrifter under de kommande dagarna för att göra den 10 augusti deadline för flera fler stater.
Men Morman kandidaten kommer att ha tid att visas på omröstningen i hans hemland Utah, där Mr Trump är djupt impopulär bland mormonernas väljare.
Senator Ted Cruz besegrade Mr Trump i Utah under primärvalet, med 69% av rösterna till 14%.
Även om McMullin sannolikt inte visas på majoriteten av statliga valsedlar över hela landet, kan han blockera Mr Trump från att ta den historiskt röda staten Utah och skala bort några av miljardärens konservativa väljare.
McMullin kommer också att behöva jaga miljontals dollar i donationer under de närmaste veckorna för att hålla jämna steg med sina motståndare i höst.
Gruppen Bättre för Amerika, som bildades av Never Trump konservativa, hade enligt uppgift sökt efter en oberoende presidentkandidat att ställa upp mot den nominerade.
Gruppen har insisterat på att viktiga republikanska givare skulle kasta sitt stöd bakom hans kandidatur, enligt ABC News.
Den framstående republikanen Rick Wilson förväntas hjälpa till att leda Mr McMullins kampanj.
Mr Wilson skrev om varför Mr Trump måste "lida ett förödmjukande nederlag" i en New York Daily News op-ed på söndag.
Han skrev: "om det finns en förlust av en smal marginal i folkomröstningen eller valhögskolan, miljontals redan förbittrade amerikaner, arbetat in i en frenesi av en skamlös ledare som säkert kommer att vägra att acceptera avkastningen, kommer att starta de kommande fyra åren övertygad om att USA är lite mer än en banan republik â € och president Hillary Clinton är oåterkalleligen olaglig".
Florida-baserade opinionsbildare och agent Joel Searby tros också arbeta på kampanjen.
McMullins kandidatur kommer efter att Nebraska Senator Ben Sasse och National Review författaren David French tidigare i år.
Tidigare CIA-agent Evan McMullin har lanserat en oberoende kampanj för Vita huset med stöd från medlemmar i Never Trump rörelsen.