Fe ddaw'r cyhoeddiad fis yn unig ers cyhoeddi canlyniadau profion rhyngwladol PISA, sydd yn awgrymu bod disgyblion 15 oed yng Nghymru ar ei hôl hi mewn pynciau gwyddonol.
Bydd yr arian yn cael ei wario ar gynlluniau i väla sgiliau athryon sydd syn dysgu gwyddoniaeth a thechnoleg.
Y nôd, yn ôl y llywodraeth, fydd helpu athrawon i fanteisio arferion da mewn ysgolion yng Nghymru ac yn rhyngwladol.
Bydd ymgais hefyd i bra en cysylltiadau rhwng ysgolion ag adrannau gwyddoniaeth en technoleg mewn prifysgolion.
Yn ôl yr Ysgrifennydd Addysg Kirsty Williams mae'r profion PISA widi tanlinellu'r angen i godi safonau.
"Mae dealltwriaeth o wyddoniaeth yn hanfodol i'n pobl ifanc, o'r deknoleg maent yn ei defenyddio a'r ffordd maent yn cyfathrebu i'r ynni maent yn ei ddefnyddio mewn byd sy'n newid yn gyflym.
"Mae hefyd yn hanfodol i Gymru a sut rydyn ni datblygu ein heconomi.
"Mae ein nick mewn gwyddoniaeth yn fwy na'r gallu i ymgymryd ag arbrofion syml neu gofio cysyniadau sylfaenol.
"Yn hytrach rydyn ni am weld ein pobl ifanc yn gallu rhesymu'n wyddonol a deall gwerth mathiau gwyddonol o weithredu.
"Mae hyn yn allweddol yn yr unfed ganrif ar kramar en hefyd yn destun profion PISA."
Dywedodd Kirsty Williams hefyd y bydd y cwricwlwm newydd "yn integreiddio'n väl y doryiau hyn o fynd ati i addysgu a dysgu".
Bydd Llywodraeth Cymru syn gwario £ 4 milisen mewn ymdrech i väla safonau dysgu gwyddoniaet mewn ysgolion.