Tjugo andra drabbades också efter en bubbelpool på JTF lager i Stoke-on-Trent exponerade människor för skadliga nivåer av Legionella bakterier.
Richard Griffin, Harry Cadman, 71, från Stoke-on-Trent och William Hammersley, 79, Chesterton dog 2012.
JTF kommer att dömas i Stafford Crown Court på måndag.
Den erkände att den underlät att garantera säkerheten för anställda och kunder enligt lagen om hälsa och säkerhet på arbetsplatsen.
Fler uppdateringar om denna berättelse
Icke-skyldiga domar över två företagsmordsanklagelser godtogs av domaren vid Stafford Crown Court och tre andra hälso- och säkerhetsanklagelser tilläts ligga i akten.
En rapport från Health Protection Agency (HPA) 2012 sade att bubbelpoolen var den troliga källan till det "betydande" utbrottet.
År 2015 visade det sig att mer än 200.000 pund har tilldelats familjer efter dödsfallen.
Mr Griffin, 64 år, fick sjukdomen när han levererade kött till ett kafé i Fenton.
Till en början led han av huvudvärk och hallucinationer och förlorade senare medvetandet i sitt hem i Clayton. Han dog på sjukhus på grund av organsvikt.
Hans familj sa att han aldrig tagit ledigt på 30 år.
Ett företag har erkänt en hälso- och säkerhetsöverträdelse efter ett utbrott av legionärssjukdom i en bubbelpool orsakade tre mäns död.