Hans 14-minutersvolley, i sista matchen av hans nödlån från Celtic, var tillräckligt för att se från en bestämd Dumbarton sida.
Värdarna skapade flera öppningar och kommer att undra hur Christian Nade misslyckades med att göra mål på nära håll.
Det var inte vintage från Hibs, men en potentiellt viktig seger i titeltävlingen som Dundee United bara kunde dra.
Tekniken var inte tillräcklig för att separera Hibs från hemmasidan - och både Martin Boyle och Chris Humphrey hittade tidiga körningar påverkas av en bobbly yta och Marvin Bartley var tvungen att hacka en Gary Fleming skott från insidan av området.
Besökarna var tvungna att vara påhittiga och deras klokaste, mest säkra figur levererade oundvikligen ett talande ögonblick. När Humphreys kors var på väg ut i området, föll bollen ner till Commons och han styrde försiktigt bollen in i nedre hörnet.
Målet borde ha gett Hibs makt, men de kunde inte ta kommandot över spelet.
Hemsidan visade sig i stället vara ihärdig och Lewis Vaughan steg kort till en framträdande plats.
Först skapade han en chans för Robert Thomson med god skicklighet, bara för Hibs kapten David Gray att göra en målbesparande tackling, och sedan drog en bra räddning från Ross Laidlaw med ett kraftfullt skott från 25 meter.
Hibs var mer bestämd efter pausen, med Boyle gör flera forays ner till vänster med sin snabba och direkta löpning. Lewis Stevenson såg också en strejk buntad bort av Dumbarton målvakt Alan Martin, med Humphrey sedan skjuta brett
Hemsidan förblev dock ambitiös, och några fina färdigheter från Vaughan såg honom hoppa förbi två Hibs försvarare bara för Laidlaw att rusa ut och kväva bollen vid hans fötter. Gray var tvungen att göra ett nytt försök.
På ett sällsynt foray-fält vid Hibs slutade en attack med att Dumbartons försvarare David Smith röjde ur linjen. Ögonblick senare, Nade borde ha utjämnat på baksidan post, men misslyckades med att ansluta.
Dumbarton manager Steve Aitken: "Mitt team var magnifikt. De var emot en stark sida, en stor klubb och Neil kommer att få dem över linjen, men vi matchade dem och för trollformler var bättre. En annan dag hade vi tagit mer.
"Vi hade chanser, Christian har förmodligen kommit för snabbt på honom.
"Om de kan fortsätta att ge mig den nivån, klarar vi oss."
Hibernisk huvudtränare Neil Lennon: "Det var väldigt tufft. Dumbarton är på upp, Stevie går ett bra jobb, [och det var] svåra förhållanden.
"Det är en fantastisk seger och i slutändan missade vi några bra chanser att sätta en mer smickrande poänglinje på det.
"Dumbarton satte oss under press under perioder av spelet och vi var tvungna att se det ut. I slutändan förtjänade vi nästan att tippa över linjen."
Matchen slutar, Dumbarton 0, Hibernian 1.
Andra halvlek, Dumbarton 0, Hibernian 1.
Hörnet, Hibernian. Förhörd av Tom Lang.
Försök missade. Christian Nade (Dumbarton) höger fotad skott från höger sida av sex yard box är nära, men missar till höger.
Försök blockerat. Tom Lang (Dumbarton) höger fotade skott utanför lådan är blockerad.
Lewis Vaughan (Dumbarton) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Marvin Bartley (Hibernian).
Hörnet, Hibernian. Förföljd av Darren Barr.
Försök blockerat. John McGinn (Hibernian) vänster fotade skott utanför lådan är blockerad.
Hörnet, Hibernian. Förföljd av Daniel Harvie.
Substitution, Dumbarton. Tom Lang ersätter Stuart Carswell.
Foul av Christian Nade (Dumbarton).
Jordan Forster (Hibernian) vinner en frispark i anfallshalvan.
Försök missade. John McGinn (Hibernian) vänster fotade skott från utsidan av lådan är nära, men missar övre högra hörnet från en direkt frispark.
Foul av Darren Barr (Dumbarton).
John McGinn (Hibernian) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Försök missade. Martin Boyle (Hibernian) vänster fotade skott från vänster sida av lådan missar till höger.
Substitution, Hibernian. Jordan Forster ersätter Kris Commons.
Foul av Daniel Harvie (Dumbarton).
Martin Boyle (Hibernian) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Hörnet, Dumbarton. Förföljd av Grant Holt.
Hörnet, Dumbarton. Förföljd av Marvin Bartley.
Försök blockerat. Lewis Vaughan (Dumbarton) höger fotade skott från lång räckvidd till vänster är blockerad.
David Gray (Hibernian) visas det gula kortet för en dålig foul.
Andy Stirling (Dumbarton) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av David Gray (Hibernian).
Foul av Christian Nade (Dumbarton).
Darren McGregor (Hibernian) vinner en frispark i anfallshalvan.
Daniel Harvie (Dumbarton) vinner en frispark på högerkanten.
Foul av Martin Boyle (Hibernian).
Försök missade. Mark Docherty (Dumbarton) vänster fotade skott utanför lådan missar till höger.
Försök missade. Grant Holt (Hibernian) header från mitten av lådan är för hög efter ett hörn.
Hörnet, Hibernian. Förföljd av Gregor Buchanan.
Substitution, Hibernian. Grant Holt ersätter Jason Cummings.
Substitution, Hibernian. John McGinn ersätter Chris Humphrey.
Substitution, Dumbarton. Christian Nade ersätter Robert Thomson.
Hörnet, Dumbarton. Förföljd av David Gray.
Marvin Bartley (Hibernian) visas det gula kortet för en dålig foul.
Mark Docherty (Dumbarton) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Marvin Bartley (Hibernian).
Kris Commons knäcktes i det enda målet när Hibernian sträckte sin ledning i mästerskapet till sex poäng.