Real - som har vunnit 29 av dessa 38 matcher - är en brist på lika en bäst någonsin köras av en La Liga laget.
James Rodriguez fick två poäng när han gjorde en sällsynt start i frånvaro av den utvilade Cristiano Ronaldo.
Raphael Varne begav sig också hem för att få kontroll över det andra benet i Sevilla den 12 januari.
Det är ett andra ben som nu verkar en formalitet mitt i ett hektiskt schema som kunde se Real spel 21 gånger på 11 veckor.
Madrid startade en andra raka hemmamatch utan någon av sina första val front tre med Karim Benzema på substitut bänk, Ronaldo vilade och Gareth Bale sidlinjen med en långsiktig fotled skada.
Rodriguez hade tidigare sagt att han skulle tänka på sin framtid i januari efter att ha spelat en mindre roll hittills den här säsongen, men gjorde det mesta av en sällsynt start genom att göra en spektakulär långdistansöppnare och lägga sin andra från straffplatsen efter Luca Modric var befläckad av Mariano.
Real Sociedad tog också ett stort steg mot de sista åtta med Willian Jose, Carlos Vela och Mikel Oyarzabal poäng i en 3-1 seger över Villarreal.
Real Madrid förlängde sin oslagbara körning till 38 matcher med en 3-0 seger över Sevilla i första benet av deras sista-16 Copa del Rey slips på Bernabeu.