Germanwings planet med 150 passagerare kraschade på väg från Barcelona till Düsseldorf.
Filip Hammond sade att "på grundval av den information som vi har tillgång till" var det sannolikt att brittiska medborgare var inblandade.
Men han sade att han inte skulle spekulera om antalet inblandade britter förrän kontrollerna var klara.
"Vi har ett nära samarbete med de franska, tyska och spanska myndigheterna, och flygbolaget, för att fastställa fakta", sade han.
Han sade också att UK Air Accident Investigation Branch, och brittiska experter på identifiering av offer för katastrofer, var beredda att vid behov erbjuda hjälp till de franska myndigheterna.
En passagerare på planet namngavs som Marina Bandres Lopez-Belio - en brittisk medborgare ursprungligen från Jaca i Spanien - av borgmästaren i hennes spanska hemstad.
Borgmästaren i Jaca, Victor Barrio, sa att miss Bandres var på flyget med sin lille son Julian och hade varit i den spanska Pyrenéernas stad för att närvara vid en släktings begravning.
Men han sade att han inte visste om hennes man också var på flykt med henne.
Ms Bandres tidigare skola, Colegio Escuelas PÃ på Jaca, framförde ett budskap om "hemliga kondoleanser" till sin familj.
I Manchester Evening News rapporterades det att hon hade bott i Fallowfieldområdet i Manchester och Rochdale sedan hon kom till Storbritannien.
Airbus A320 - flyg 4U 9525 - gick ner mellan Digne och Barcelonnette.
Det finns inga överlevande, säger myndigheterna.
Frankrikes inrikesminister sade att den "svarta lådan" färdskrivaren har hittats, men orsaken till kraschen är ännu inte känd och planet skickade ingen nödsignal under en åtta minuters nedstigning.
Vissa brittiska medborgare var "sannolika troliga" att ha varit ombord på planet som kraschade i de franska Alperna, säger utrikesminister Philip Hammond.