Han hade en stor operation på sin hand i november förra året och fruktade att missa skulle ge sina rivaler på hans vikt en fördel i att plåga upp Commonwealth Games kvalificeringspoäng.
Men efter att ha testat sin högra hand i semifinalen av lördagens Championships, kom han sedan igenom finalen i en fantastisk tävling mot Glasgows Jack Turner.
Deras bantamweight titel bout var sista på kortet på finalkvällen, men det var verkligen värt att vänta på.
"Jag var uppe klockan 06:00 BST bara surrade för att slåss, jag kunde inte vänta," sade McGregor. "Jag ville bli invägd så att jag kunde tanka och vi fick inte göra det förrän kl. 12.00, så det var en lång väntan.
"Det är midnatt nu och jag är bara ute ur ringen, så det har varit en lång dag, men det har varit värt det. Jag är glad över resultatet."
McGregor, som slåss ut från Meadowbank Boxing Club och är på Storbritanniens performance program, förseglade sin andra på varandra följande skotska titel och hoppas nu lägga till en annan brittisk titel till sitt namn nästa månad.
"Jag tror att jag är bland favoriterna för den titeln", sa han. "Jag vann skotska förra året och även britterna.
"Jag gjorde dubbla förra året och jag vill göra exakt samma sak. Jag är helt säker på att göra det."
Om han gör det, kommer han med största säkerhet att göra det skotska boxningslaget för 2018 års samväldesspel i Gold Coast, Australien - och det är ett pris som andra också siktar på.
Aqeel Ahmed är fast besluten att kompensera för vad han kallar "ett otillfredsställande" Glasgow 2014 och han är verkligen imponerad när han behöll sina mäns flugviktstitel.
Keir Hardie Boxing Club fighter går nu till British Championships i Wales i hopp om att göra något som ingen skotsk amatör boxare någonsin har gjort tidigare - vinna tre på varandra följande brittiska titlar.
Och sedan, hoppas han, en chans att lösa in sig själv i Guldkusten.
"Jag stannade amatör för att få en annan chans på Samväldesspelen," Ahmed förklarade.
"Jag missade en medalj i Glasgow och jag vet hur mycket jag har blivit bättre. Jag blir besviken om jag inte medaljerar i Guldkusten och mitt mål är ganska högt på väg till nästa spel.
"Mitt yttersta mål är en guldmedalj i Guldkusten."
Aberdeenshire mellanviktaren John Docherty tog en sjätte nationell titel i rad och hoppas att gå en bättre vid nästa månads brittiska mästerskap efter att ha tagit silver förra året.
"På en bra föreställning, på en bra dag, Jag tror att jag är den bästa i Storbritannien att berätta sanningen," sade han.
"Förra året uppträdde jag riktigt dåligt och kom tvåa, slagen på en delad [beslut].
"Jag siktar definitivt på guldmedaljen och sedan är det stora målet Australien nästa år.
"Jag har vunnit Ungdomsspelen. Nu vill jag lägga till seniortiteln till det."
Samväldesspelen handlar också om Skottlands ledande kvinnliga boxare.
Efter att ha vunnit sin fjärde skotska kvinnors bantamweight titel, Stephanie Kernachan, av Cleland Boxing Club, är ivrig att göra skotsk boxning historia.
Ingen kvinnlig boxare har tidigare representerat Skottland vid ett samväldesspel.
"Det kommer att bli en enorm mängd arbete mellan då och då, så fokus ligger på britterna och få tillbaka den titeln", säger Kernachan.
"Men att göra Gold Coast laget skulle vara enorm. Det är svårt att uttrycka det i ord.
"För mig är det det största, det är så mycket högre än jag kunde ha trott.
"När jag började boxas var skotska mästerskapet det högsta man kunde få, men nu har dörrarna sprängts vida öppna."
Lynn Calder, från Springhill Boxing Club, gjorde också det fyra skotska titlar och kvinnornas lättviktsmästare vill komma in på historien-making akt.
"Jag har vuxit som boxare som ett resultat av den utveckling vi har sett i kvinnors boxning i Skottland", sade hon.
"Det är hårt arbete, resor och timmar in, men det är ett fullständigt engagemang för mig.
"Jag har dumpat nästan allt och boxning är mitt enda syfte och jag tar bara alla möjligheter."
Glenrothes' Emma McCulloch, en före detta kickboxare som bara har boxats i två år, har nu vunnit två skotska titlar på lätt flugvikt.
Den 25-årige, som har deltagit i nyligen Storbritannien träningsläger, medger att det var "lite mer press" på dessa mästerskap på grund av chansen att potentiellt gå till Samväldesspelen.
"Tydligen vill du vinna, men den här var lite extra speciell", tillade hon.
"Samväldets spel har jag tänkt på sedan förra året."
Män
Super tungvikt: Mitchell Barton (The Bronx)
Tungvikt: Connal McDonald (Bravehearts)
Lätt tungvikt: Nathaniel Collins (Hayfield)
Medelvikt: John Docherty (Byron)
Welterweight: Stephen Newns (Cleland)
Lättvikt: Sean Lazzerini (Bellahouston)
Bantamweight: Lee McGregor (Meadowbank)
Flyweight: Reece McFadden (Forgewood)
Lätt flugvikt: Aqeel Ahmed (Keir Hardie)
Lätt weltervikt: Robbie McKechnie (Greenock)
Kvinnor
Welterweight: Gardener Moore (Lochend)
Lättvikt: Lynn Calder (Springhill)
Bantamweight: Stephanie Kernachan (Kleland)
Lätt flugvikt: Emma McCulloch (Glenrothes)
Fjädervikt: Efiychia Kathopouli (Glenrothes)
Edinburgh boxare Lee McGregor medger att det fanns en tid han trodde att han inte skulle göra årets skotska mästerskap.