Saunders leder kronåklagaren när Keir Starmer avgår i oktober.
CPS-advokaten har övervakat några av landets viktigaste åtal och är för närvarande organisationens Londonchef.
DPP är den högsta åklagaren i England och Wales, ansvarig för mer än 6.800 anställda.
Från Clive Colemanlegal korrespondent, BBC News
Rollen som chef för offentliga åklagarämbeten (DPP) är avgörande inom det straffrättsliga systemet i England och Wales.
Crown Prosecution Service (CPS) är den organisation som kan skipa rättvisa genom att fatta självständiga beslut om huruvida det finns tillräckliga bevis för att åtala en misstänkt, och när den beslutar att det finns, genom att väcka åtal effektivt.
Det har ett nära samarbete med polisen men måste alltid ses till att fatta oberoende och opartiska beslut utifrån de bevis som samlats in.
Den kan endast väcka åtal när den drar slutsatsen att det finns tillräckliga bevis för att det finns realistiska utsikter till fällande dom och att åtalet ligger i allmänhetens intresse.
DPP är den dagliga chefen för CPS - som för närvarande förhandlar om en period av åtstramning och modernisering. Att upprätthålla allmänhetens förtroende för detta kommer att vara av avgörande betydelse.
Justitieministern, Dominic Grieve, sade: "Alison kommer att bli en utmärkt chef för offentliga åtal och är rätt person för att hjälpa kronåklagaren att möta de utmaningar den kommer att ställas inför under de kommande åren.
"Jag är särskilt glad över att Alison är den första chefen för CPS som utses från sina led som bevis på den höga kvaliteten på de yrkesverksamma som arbetar inom tjänsten.
"Jag vill också tacka Keir Starmer för hans stora bidrag - inte bara till CPS utan mer allmänt till det straffrättsliga systemet.  Han kan vara stolt över de reformer som han och hans personal har lett till att hålla vårt straffrättsliga system en av de bästa i världen."
Saunders sade: " Jag är mycket glad och privilegierad över att bli utnämnd till nästa chef för allmänna åtal. Att leda en organisation av engagerad och professionell personal är en ära, särskilt efter att ha arbetat för CPS sedan starten."
Saunders tillbringade den tidiga delen av sin karriär med att åtala i södra London innan hon arbetade med CPS-policyn för barnoffer och vittnen.
2001 blev hon chefsåklagare för Sussex och övervakade åtalet mot Roy Whiting för bortförandet och mordet på åttaåriga Sarah Payne.
Hon lämnade sedan CPS för att ansluta sig till regeringen som biträdande juridisk rådgivare till justitieministern. När hon återvände inrättade hon CPS-enheten för organiserad brottslighet som behandlar komplexa fall som människohandel, narkotika, förfalskning och penningtvätt över gränserna.
År 2009 utsågs Alison Sanders till chefsåklagare för London, som behandlar mer än 200.000 fall per år.
Hon övervakade den framgångsrika 2012 åtal av två av de män som attackerade och dödade Stephen Lawrence 1993. Hon övervakade också det enorma antalet åtal i London i samband med upploppen i augusti 2011, vilket ledde till att 1.000 personer fängslades.
Den nya åklagaren ska vara Alison Saunders, justitieministern har meddelat.