Före detta Humberside Police Det Ch Supt Colin Andrews påstås ha utfört våldtäkten i ett hotellrum i december 2003.
58-åringen erkänner sig inte skyldig till sju anklagelser, inklusive våldtäkt, förföljelse och trakasserier.
Manchester Crown Court hörde att han nekade att lägga handen över munnen på en kvinna medan han våldtog henne.
Åklagaren Owen Edwards sa till honom: "Du ville ha sex oavsett om hon ville ha det eller inte."
Fadern svarade: " Nej. Det är inte jag."
Mr Edwards frågade sedan: "Du kom över henne, eller hur?"
"Nej, det fanns inget sex alls, av att jag är säker. Inget sex den kvällen, absolut faktum", svarade Andrews.
Edwards sade: " När hon skrek lade du din hand på hennes mun och hade sex med henne. Är det våldtäkt?"
"Jag skulle säga det, men det var inte det som hände. Jag våldtog henne inte, det hände inte", svarade Andrews.
"Jag har aldrig lagt handen på någon kvinnas mun någonsin under sex.
"Vad hon än beskriver, så hade jag aldrig sex med henne. Jag försökte aldrig ha sex med henne. Jag har aldrig tvingat mig på någon, det skulle jag aldrig göra."
Sedan rättegången inleddes har domstolen hört Andrews beskrivas som "kontroll, manipulativ och mobbning".
Juryn har fått veta att den tilltalade höll handen över kvinnans mun medan han våldtog henne.
De hörde också anklagelser om att han förde en kampanj för att förfölja och trakassera en annan kvinna sommaren 2013, då han skickade tusentals sms och e-postmeddelanden.
Han vittnade till sitt försvar i torsdags, och den tidigare detektiven bröt ihop i rätten när han berättade för juryn om sin tidiga poliskarriär.
Domstolen hörde också hur han var styrkans mest dekorerade officer och beskrevs som "lojal och hängiven" av en före detta kollega.
Andrews förnekar också två fall av vanligt överfall, misshandel som leder till fysisk skada och hot mot vittnen.
Rättegången fortsätter.
En högre kriminalare anklagad för att ha våldtagit en kvinna efter en julfest har sagt i rätten att han aldrig tvingade mig på någon.