Rt Rev James Jones, som var ordförande för Hillsborough Independent Panel, sade att han kände "stor stolthet" över att bli erkänd på drottningens nyårslista.
Författaren Phil Scraton, som ledde panelens forskargrupp, avböjde en OBE i protest mot dem han sade inte hade hjälpt 1989 års katastrof överlevande.
Under tiden har Merseyside-polisens enda Sikh-officer utsetts till MBE.
Och Liverpools komedilegenden Ken Dodd, 89, har tilldelats ett riddarskap för tjänster till underhållning och välgörenhet.
Biskop Jones, nu biträdande biskop i stiftet i York, sade att hans stolthet var "blandad med sorg" på grund av "den bestående sorgen hos de familjer som har fortsatt att känna förlusten av sina nära och kära i Hillsborough".
Han fortsatte: " Jag lärde känna familjerna mycket väl under Hillsborough Independent Panel process. Och genom åren har jag kommit att förstå något av deras smärta.
"Jag tycker att familjerna har visat utomordentlig fördragsamhet under årens lopp då de har kämpat för att få folk att bara lyssna på dem.
"Så, när jag tar emot denna ära, hälsar jag också deras fördragsamhet."
Han sa att panelens arbete var "Climax i min tjänst som biskop av Liverpool".
Det var panelens rapport som ledde till att de ursprungliga undersökningarna upphävdes och till att nya undersökningar upprättades, vilket i slutändan ledde till den olagliga dödsdomen för 96 fotbollsfans som omkom i tragedin.
Merseyside Police's Det Insp Sarbjit Kaur tilldelades sin ära för arbete med att avslöja hedersbaserat våld och tvångsäktenskap.
43-åringen sa att hon var "extremt ödmjuk".
"Jag tror att alla har rätt att leva sitt liv fritt från övergrepp och har friheten att välja vem de vill gifta sig med", sade hon.
Polischefen Andy Cooke berömde Det Insp Kaurs arbete och sa att hon var "en fantastisk förebild".
Han tillade att han hoppades att hon skulle "uppmuntra kvinnor från en liknande bakgrund att gå med i polisen och skydda de mest utsatta i våra samhällen".
Liverpools f.d. biskop har utsetts till örlogskapten för sina tjänster i Hillsborough-utredningen.