Det nederländska företaget avbröt leveranserna förra månaden efter att ha förlorat finansieringen.
Det hade levererat ungefär 3m brev varje vecka i de tre städerna, i direkt konkurrens med Royal Mail.
Lloyds banks private equity-arm beslutade att inte investera, vilket utlöste en översyn.
Modergruppen PostNL sade att företaget hade inlett ett samråd med berörd personal "för att minimera konsekvenserna av beslutet".
Företaget påpekade också att det skulle fortsätta att samla 80m objekt i veckan för att matas in i Royal Mail systemet för slutlig leverans.
I ett uttalande från PostNL sades det: "Efter att diskussionerna om den föreslagna investeringen i Whistl UK avslutats för att finansiera den fortsatta utbyggnaden av dess nuvarande end-to-end-verksamhet (E2E) har vi bedömt alternativa scenarier för Whistls E2E-verksamhet.
"Vid sidan av denna bedömning har man beslutat att avsluta Whistls E2E-verksamhet.
"Whistl är fortfarande fast beslutet att vidareutveckla sin framgångsrika verksamhet i Storbritannien, inklusive DSA-tjänst, dörrdroppar, paket och paket samt logistik."
Omkring 1.800 arbetare var anställda av Whistl, med många kontrakt på nolltimmar.
Whistl är den näst största postoperatören i Storbritannien.
Postbranschen Whistl har bekräftat att den avslutar sin hemleveranstjänst i London, Liverpool och Manchester, och sätter upp till 1.800 arbetstillfällen i riskzonen.