Den kvinnliga pandan Tian Tian kom till säsongen sent på onsdag kväll och hon var artificiellt inseminerad i början av torsdagen.
Väktare försökte sedan presentera henne för manliga Yang Guang men hennes hormonnivåer hade redan sjunkit och han gissade att hon inte var intresserad.
Djurparken kommer nu att hålla Tian Tian under observation under de tre månaderna i hopp om att en pandaunge kommer att följa efter.
Edinburgh zoo förvärvade pandor på lån från Kina 2011 och tidigare försök att para paret har misslyckats.
Tian Tian, som betyder Sweetie, och manliga Yang Guang (Sunshine) var de första jättepandor att leva i Storbritannien i 17 år.
De sista pandorna i Storbritannien, Ming Ming och Bao Bao, lämnade ett zoo i London 1994 efter att ha misslyckats med att para sig.
Edinburgh Zoos pandor lyckades inte para sig naturligt, det har dykt upp.