Den okuvliga lejon, som lyfte trofén på söndagen efter att ha slagit Egypten 2-1 i finalen i Gabon, deltog i en ceremoni i Yaounde på onsdag.
De presenterade Nations Cup-trofén för president Biya på Unity Palace.
Senare reste de i öppna fordon genom gatorna i huvudstaden för att paradera trofén till fans.
Kameruns spelare fick medaljer av presidenten, som sade att deras seger skulle firas av kamerunerna som en nation.
I slutet av ceremonin Kamerun Första Lady Chantal Biya poserade för en serie bilder med spelarna - vid ett tillfälle använde hon Fabrice Ondoas telefon för att ta en "selfie" med dem.
Kameruns framgång i Gabon avslutade en 15-årig väntan för att vinna turneringen igen och gav dem sin femte titel.
Landet kommer att vara värd för nästa upplaga av Nations Cup 2019.
Kameruns Afrika Cup av Nations-vinnande trupp har fått ett särskilt statligt mottagande av landets president Paul Biya.