Uppskattningsvis 1 000 fastigheter är i riskzonen i Kendal och cirka 600 i Egremont efter att flodnivåerna steg.
Övernattning regn var inte så tung som förväntat sade miljöbyrån, men dess 12 allvarliga översvämning varningar för Cumbria och Lancashire kvar på plats på söndagen.
Människor i delar av Kendal och Egremont har fått rådet att ge sig av och stanna hos sin familj eller sina vänner.
Polisen i Cumbria har varnat för att undvika onödiga resor.
BBC reporter Andy Gill, i Grasmere, sade att många vägar i området hade mindre översvämningar.
En allvarlig översvämningsvarning visar på en fara för livet. Varningar och varningar om översvämningar på lägre nivå har utfärdats för stora delar av norra England och Wales.
Ytterligare kraftigt regn väntas över Cumbria, andra delar av nordvästra England och sydvästra Skottland på söndagen.
Det regnet kommer att falla på redan mättad mark, vilket ökar översvämningsrisken.
Receptionscentrum öppnade på Kendals stadshus och West Lakes Academy i Egremont hela lördagskvällen, men Dave Hughes, ordförande för Kendal Mountain Rescue, sade att inte alla hade varit villiga att lämna sina hem.
"En del bestämde sig för att stanna hemma. Du kan förstå att människor kan vara ovilliga att lämna sina sängar, "sade han.
Hundratals hem hotas av översvämningar i två städer i Cumbrien.