41-åringen har spelat in 696 homeruns och satt honom på fjärde plats på listan.
Han fick ett 162-spel förbud för doping i januari 2014, vilket innebär att han missade hela 2014 säsongen.
Rodriguez sista match kommer att vara på Yankee Stadium mot Tampa Bay Rays och han kommer då att ta på sig en rådgivande roll på klubben.
Han hjälpte Yankees att vinna World Series 2009 och valdes till American Leagues mest värdefulla spelare 2003, 2005 och 2007.
"Det här är en tuff dag. Jag älskar det här spelet och jag älskar det här laget och idag säger jag adjö till båda," Rodriguez sade.
"Detta är också en stolt dag. Jag var 18 när jag bröt mig in i de stora ligorna och jag trodde aldrig att jag skulle spela i 22 år.
"Ingen spelare avslutar sin karriär som de vill, vi vill alla fortsätta spela för evigt men det fungerar inte på det sättet. Att på ett graciöst sätt acceptera slutet är en del av att vara en professionell idrottsman.
"Jag vill tacka fansen för att de låter mig spela det spel jag älskar."
New York Yankees slugger Alex Rodriguez har meddelat att han kommer att dra sig tillbaka från sporten på fredag.