Branden började vid "A list" Cirque Le Soir plats på Londons Ganton Street, strax utanför Carnaby Street vid cirka 04:55 GMT.
Stationschef Nic Myatt sa: "Ingen var inne på den tiden och det fanns inga skador." Orsaken till branden är under utredning.
Cirque le Soir, en källarlokal, beskriver sig själv som "Londons mest A-lista klubb och dekadenta cirkus".
Entertainers uppträder på fyra stadier på nattklubben, en populär plats för kändisar, med minimala utgifter börjar "från så lite som 100 pund per huvud" för en fest på 500.
London Fire Brigade sa att den lyckades begränsa branden så att den inte reste till restaurangen och kontoren ovanför den.
Mer än 50 brandmän har tagit itu med en brand på en Soho nattklubb.