Producenten av en av Storbritanniens mest populära lager, hans verksamhet hade vuxit för snabbt och överexpanderat sig själv. Den gjorde en förlust, och hade byggt upp betydande skulder som den kämpade för att tjäna.
Även om denna situation kan ha förbättrats under gynnsamma ekonomiska förhållanden, innebar den globala finanskrisen som exploderade 2008 att Cobra var tvungen att sälja sig själv i november det året.
"Vi hade massor av skulder och vi såg inte krisen komma", säger Lord Bilimoria, som talade på Cobras huvudkontor i London.
Vid den tiden hade företaget vuxit med i genomsnitt 40 % varje år sedan det grundades 1989.
Alla potentiella vinster hade investerats tillbaka till att fortsätta att växa företaget, så dess kassareserver var mycket låg vid en tidpunkt då Lord Bilimoria säger "kontant blev inte bara kung - det blev kejsare".
Han tillägger: " Vad jag kunde ha gjort - borde ha gjort, med efterklokhet - är bevisat lönsamheten [i verksamheten] i två eller tre år, och bromsat tillväxten. Men i det skedet... tankesättet när du växer med 40% är att du är på en rulle. "
Cobra räddades i maj 2009 när Lord Bilimoria under en så kallad "pre-pack administration" affär - ett avtal i förväg som såg företaget gå snabbt in och ut ur administrationen - köpte företaget tillbaka i ett joint venture med den nordamerikanska bryggjätten Molson Coors.
Affären utplånade Cobras skulder och lämnade fordringsägarna 71 miljoner i fickan.
Men lord Bilimoria, som är Cobras ordförande, säger att han betalar tillbaka varje enskild person, trots att han inte har något rättsligt krav på att göra det.
"Det är min övertygelse att om man går igenom en tuff tid så är det inte bara vad man gör, utan hur man gör det", säger han.
Karan Bilimoria, född 1961 i Indien, är son till en general i den indiska armén.
Hans far, Faridoon Bilimoria, ledde ett regemente av Gurkhas när Indien kämpade på Bangladesh sida i dess östra grannes 1971 krig av självständighet från Pakistan.
När generallöjtnant Bilimoria drog sig tillbaka var han chefsbefälhavare för den centrala indiska armén, med 350.000 man under hans befäl.
Det var som tonåring som lord Bilimoria bestämde sig för att göra affärer i stället för att gå med i armén som sin far.
"Jag bestämde mig för att armén för mig skulle ha varit alltför begränsande. Och om jag hade följt i min fars fotspår var jag orolig för att jag alltid skulle bli jämförd med honom och vara i hans skugga, säger han.
"Jag ville också ha mer blå himmel, och en karriär i näringslivet gav mig en mycket bredare möjlighet."
Efter att ha fått en examen i handel vid universitetet i Hyderabad flyttade lord Bilimoria till London, där han blev kvalificerad som auktoriserad revisor.
Han avlade sedan en juristexamen vid Cambridge University i slutet av 1980-talet, vilket var när han kom på idén för Cobra.
En älskare av öl sedan tonåren, Lord Bilimoria var missnöjd med kvaliteten på brittisk lager, särskilt när man drack den med en curry.
Han säger: " Lagern var för vag, för hård och för uppsvälld. Det betydde att jag inte kunde äta eller dricka så mycket jag ville.
"Samtidigt fann jag en riktig öl som var bra på en pub, men för bitter och tung med mat.  Så jag kom på idén att skapa en öl med förfriskning av en lager, men med smidigheten i en öl.
"Jag ville att det inte bara skulle vara drickbart i sig, utan ett stort ackompanjemang till all mat, och särskilt indisk mat."
Oavskräckt av att inte ha någon erfarenhet av ölindustrin, gick Lord Bilimoria till huvudbryggaren på vad som då var Indiens största oberoende bryggeri, och tillsammans utvecklade de receptet för Cobra.
Och så föddes Cobra Beer 1989, med de första leveranser från Indien anländer med containerfartyg till Storbritannien 1990.
Basing sig på ett kontor i Fulham området i sydvästra London, för första året Lord Bilimoria levererade flaskor av Cobra dörr till dörr i hans Citroen 2CV, som riktar sig till indiska restauranger.
Inledningsvis Cobra var endast tillgänglig i stora 660ml flaskor, eftersom en sådan stor storlek är den mest populära i Indien.
Lord Bilimoria säger att det gav företaget en omedelbar fördel, eftersom flaskorna stod ut i curry hus.
"Folk som sitter vid andra bord skulle se flaskan och säga: "Vad är det?" Populariteten spred sig som en löpeld, folk älskade smaken, och vi fick 99% ombeställningar."
I och med att verksamheten växte snabbt byttes bryggningen 1997 till Storbritannien från Indien för att tillgodose efterfrågan.
"Vi kollade först med konsumenterna, som sa att de inte hade något emot var vi bryggde. Detta är logiskt eftersom den indiska mat du äter här inte flyger över från Delhi, säger Lord Bilimoria.
Ridde 2004 för sina tjänster till företag och entreprenörskap, han utsågs till House of Lords två år senare.
Trots Cobras ekonomiska problem 2008 vill han gärna betona att ölproduktionen aldrig påverkades.
"Under hela krisen sjönk försäljningen aldrig, och vi behöll ett sömlöst förråd."
Med Molson Coors äger en majoritetsandel i verksamheten sedan 2009 har försäljningen av Cobra fortsatt att växa kraftigt, om än i genomsnitt "antingen hög ensiffrig eller 10%". Och det är Molsons mest lönsamma brittiska varumärke.
Medan Cobra fortsätter att dominera den brittiska restaurangmarknaden i Indien, som säljs på mer än 98 % av de licensierade curryhusen, är den nu också tillgänglig på alla de största snabbköpen.
"Jag är väldigt stolt över ölen", säger lord Bilimoria.
Och med planer på en förnyad push för att få in Cobra i fler brittiska pubar och barer, är han övertygad om att varumärket har en ljus framtid.
Lord Bilimoria talar öppet och ärligt om de svårigheter hans företag Cobra Beer stod inför 2008.