Polisen larmades om en incident i Coilte Cresent i höglandsbyn omkring klockan 22:00 på söndagen.
En man som bar mörka kläder och bar något som tycktes vara en pistol gick in i huset och krävde pengar av husägaren, sade polisen.
En man greps senare i Cumbria och har bistått officerare som utreder händelsen.
En fyrasiffrig summa pengar stals från huset i Drumnadrochits Kilmore-område.
Polisen i Skottland sade: " En polisnärvaro med hög synlighet stannar kvar i området vid denna tid för att ge trygghet åt det lokala samhället.
"Polisen är angelägen om att höra från allmänheten som kan ha sett någon misstänkt aktivitet i området före händelsen.
"Dessutom skulle officerare vilja höra från någon som kan ha sett en silver VW Passat i området tidigare den dagen."
En man har gripits i Cumbria efter ett väpnat rån i ett hus i Drumnadrochit.