Parlamentsledamöterna avbröts av Labour i förra veckan och bad om ursäkt till underenheterna för att de stödde uppmaningar 2014 om att Israel skulle flyttas till Förenta staterna.
Synpunkterna utlöste en bredare diskussion om påstådd antisemitism inom parten, med en undersökning som nu pågår.
Keith Vaz, utskottets ordförande, sade att Shah för närvarande inte skulle delta i kommitténs sammanträden.
Utskottet inleder en undersökning om omfattningen av antisemitismen i Storbritannien och kommer att kalla Labourledaren Jeremy Corbyn och Ken Livingstone, Londons före detta borgmästare som blev avstängd från Labour för att ha antytt att Adolf Hitler var en sionist, bland sina vittnen.
Vaz sade att Shah - ledamot av Europaparlamentet för Bradford West som valdes till parlamentet i maj 2015 - för närvarande hade begärt att inte delta i denna undersökning eller utskottets övriga verksamhet.
"Naz Shah har informerat mig och kommittén att hon vill stå åt sidan från alla sina uppgifter tills de aktuella frågorna är lösta", sade han.
"Vi har accepterat hennes beslut. Hon kommer inte att delta i några framtida frågor som rör utskottet för inrikes frågor med omedelbar verkan."
Corbyn har bett den tidigare chefen för Liberty, Shami Chakrabarti, att leda en undersökning om omfattningen av antisemitism och "andra former av rasism" i partiet. Ingen tidsram har angivits för när resultaten kommer att offentliggöras.
Shah berättade för parlamentsledamöterna i förra veckan att hon beklagade en rad Facebook-inlägg i april 2014, inklusive ett förslag om att Israel skulle flyttas till Förenta staterna som en "lösning" på den israelisk-palestinska konflikten.
Ex-Labour MP Naz Shah har "stud åt sidan" från Commons inrikes frågor välja kommitté "tills vidare".