Den 26-årige, som anslöt sig till Hammers från Pachuca för £12m 2014 hade hållit samtal med Swansea på onsdag.
Men han kommer nu att knyta an till tofféerna när han återvänder från sin internationella tjänst med Ecuador.
Valencia hade gjort sex framträdanden denna säsong men stod inför konkurrens från nya Hammers signering Simone Zaza.
Under tiden har Everton undertecknat Sheffield United framåt Dominic Calvert-Lewin för en oanmäld avgift på ett fyraårigt avtal.
Den 19-årige gjorde 11 liga framträdanden för Blades, misslyckas med att göra mål.
Prenumerera på BBC Sport nyhetsbrev för att få vårt tips på nyheter, funktioner och video skickas till din inkorg.
Everton har tecknat West Ham strejkaren Enner Valencia på en säsong lång lån, med möjlighet till en permanent £14.5m flytta nästa sommar.