Scottish Chambers of Commerce (SCC) verkställande direktör Liz Cameron betonade behovet av 11 000 nya roller varje år i Skottlands digitala och it-sektorn.
Hon varnade för att de lediga jobben inte helt och hållet kunde tillsättas av brittiska arbetstagare.
Cameron efterlyste också ett migrationssystem som svarade på Skottlands lägre befolkningstillväxt.
Hon sade att Skottlands beräknade befolkningstillväxt till 2024 endast var 3,1 %, jämfört med en beräknad ökning på 7,5 % för England under samma period.
Hon varnade för att ekonomin skulle kunna växa långsammare och inte kunna upprätthålla nivån på de offentliga tjänsterna.
Camerons kommentarer kom när premiärministern förbereder sig för att få igång Brexit-förhandlingarna.
Theresa May har fastställt en tidsfrist på den 31 mars för att åberopa artikel 50 i Lissabonfördraget och inleda officiella samtal med EU.
I ett uttalande sade Cameron: " Det är dags att argumentera för ett nytt migrationssystem som fungerar för Storbritannien, som arbetar för Skottland och framför allt arbetar för näringslivet.
"Den fria rörligheten för människor över hela Europa kan ha fått oss att känna oss nöjda med de ansträngningar som krävs för att rikta in oss på de talanger som våra företag behöver inom alla sektorer och i alla delar av Storbritannien.
"Vi måste nu planera för ett system som kommer att fokusera på att skaffa rätt talang, var i världen som finns, och i antalet som uppfyller kraven i vår ekonomi."
Att ge större kontroll över invandringen till Holyrood har varit ett viktigt krav från den skotske förste ministern Nicola Sturgeon i kölvattnet av Brexit-omröstningen.
I januari verkade dock inrikesministern utesluta möjligheten att Skottland får befogenheter över invandringen efter det att Storbritannien lämnat EU.
Amber Rudd sade att införandet av olika regler "skulle komplicera invandringssystemet, skada dess integritet" och orsaka problem för företagen.
En skotsk företagsledare har intensifierat kraven på ett migrationssystem som kan fylla kompetensluckorna efter Storbritanniens utträde ur EU.