Utvärderingspanelen säger att WHO var för långsam att agera för att komma på toppen av det dödliga viruset som nu har dödat mer än 11.000 människor i Västafrika.
Och det krävs en brådskande översyn av organisationen.
WHO säger att den har planer för reformer.
Den har redan medgett att den väntade alltför länge med att förklara Ebola som en internationell nödsituation på folkhälsoområdet.
WHO:s generaldirektör, Margaret Chan, erkände i maj att den hade blivit "överväldigad" av Ebolautbrottet och sade att den "knäckte denna organisation till sin kärna".
Sjukdomen började sprida sig i december 2013, men det tog fram till augusti 2014 för WHO att slå larm. Vid det laget hade mer än 1.000 människor dött av viruset.
Dödssiffran uppgår nu till mer än 11.000.
Enligt rapporten saknade WHO en kultur av snabbt beslutsfattande.
I de tidiga skedena av Ebolakrisen sändes budskap om situationens allvar, men dessa " varken nådde högre ledare eller högre ledare erkände inte deras betydelse".
– Det verkar ha funnits en förhoppning om att krisen skulle kunna hanteras genom god diplomati snarare än genom att trappa upp krisåtgärderna, säger rapporten.
WHO kritiserades också för att regeringar och allmänheten inte höll jämna steg med utbrottets omfattning och allvar.
Men utvärderingen berömde WHO för att ha spelat en avgörande roll i arbetet med att hitta nya behandlingar och botemedel för ebola.
Och det sades att WHO bör få i uppgift att leda framtida akuta hälsoinsatser - vare sig det gäller ebola eller till exempel ett utbrott av pandemisk influensa.
I rapporten föreslås ett omedelbart bidrag från alla medlemsländer till en fond för insatser vid utbrott på 100 miljoner dollar, och WHO bör inrätta ett centrum för beredskap och insatser vid nödsituationer.
Panelens chef, Dame Barbara Stocking, tidigare chef för välgörenhetsorganisationen Oxfam, sade att WHO nu måste göras redo för uppgiften.
"För mig, kommer från någonstans som Oxfam som är en akut kultur, du är väldigt mycket, om du vill, på framfoten. Ni försöker alltid förhindra att en situation kommer igenom eller ta tag i den när den börjar och verkligen får den under kontroll mycket snabbt och det är några av de interna förändringar som måste göras på WHO."
WHO sade att det var "redan på väg framåt" på några av panelens rekommendationer, inklusive utvecklingen av den globala akutarbetsstyrkan och beredskapsfonden.
Det kommer att vara upp till medlemsstaterna att lämna dessa frivilliga ekonomiska bidrag.
Joanne Liu, ordförande för MSF International, ifrågasatte hur rekommendationerna skulle leda till verkliga åtgärder på fältet.
"Vi har sett så många rapporter som kräver förändring, med alla fokuserade på hur man kan förbättra framtida svar och under tiden, med 20-25 nya ebolafall per vecka i regionen, har vi fortfarande inte den nuvarande epidemin under kontroll. När det gäller Ebola gick vi från global likgiltighet, till global rädsla, till globala reaktioner och nu till global trötthet. Vi måste avsluta jobbet, sa hon.
Dr Jeremy Farrar, chef för Wellcome Trust, sade att stödet från den globala gemenskapen var avgörande om vi ska kunna avvärja en annan katastrof i Ebolas skala."
Ebolakrisen visar att Världshälsoorganisationen (WHO) saknar "kapacitet och kultur" för att hantera globala hälsokriser, säger en fördömande oberoende rapport, som beställts av WHO själv.