Förseningar i att svara på samtal har resulterat i att hjälptelefonen använt sitt tidigare system efter bara 10 dagar.
När en lösning på problemen har hittats kommer programmet att lanseras på nytt, vilket förväntas ske i början av 2016.
Samtalshanteringen och IT-systemet - som kallas Future Programme - har visat sig vara extremt utmanande, enligt ett uttalande från NHS.
Detta trots "en enorm mängd planering, systemtester och personalutbildning".
NHS 24 verkställande direktör Ian Crichton varnade för att det skulle vara osäkert för patienterna att hålla programmet i drift på denna driftsnivå.
Han sade att han förväntade sig att antalet samtal som hjälptelefonen tar emot under helgen skulle "betydligt öka" när vintern närmar sig, vilket tyder på att tjänsten "skulle falla under acceptabla toleranser".
"Detta är inte ett beslut som vi har tagit lätt på, med tanke på den betydande investering hittills, men en som kommer att se till att vi kan fortsätta att leverera vital och säker out-of-times stöd till patienter när de behöver det mest under den kommande vintern", sade han.
NHS kommer att fortsätta att utveckla det nya systemet offline innan den rullas ut igen i början av det nya året.
Scottish Labour's public service taleskvinna Jackie Baillie anklagade den skotska regeringen för att ha en "kortfristig, hålla gips approach till NHS".
Scottish Conservative hälso talesman Jackson Carlaw kallade projektet "en misskött röra" som hade kostat skattebetalarna en förmögenhet.
Hälsominister Shona Robison sade att även om NHS 24 fortfarande var fullt fungerande, var hon besviken över att den måste återgå till det tidigare systemet.
Hon sade dock att patientsäkerhet var prioritet och "det är rätt att NHS 24 tar den tid som krävs för att förstå och åtgärda alla kvarstående problem helt".
Theresa Fyffe, Royal College of Nursing Scotland chef, sade att det var "regrettable" men "rätt beslut" för patienter och personal.
Tillkännagivandet följer en incident i oktober, då samma system kraschade och personalen var tvungen att ta till penna och papper.
En revisionsrapport från Skottland hade också tidigare gett upphov till farhågor om kostnaderna för och genomförandet av systemet.
Inledningsvis på grund av att vara klar för oktober 2013, var det försenat med två år och kostade cirka £117m - nästan £40m över den förväntade kostnaden.
Den medicinska hjälptelefonen NHS 24 har lagt ett nytt telefonsystem på £117m över rädsla för patientsäkerhet.