Den 32-årige före detta Namibia kapten har gjort 113 framträdanden sedan gå Sarries 2009 och hjälpte klubben vinna två Premiership titlar.
Burger, som vann 41 kapsyler och dök upp vid VM 2015, kommer att återvända till Namibia för att bli bonde.
"Det är sorgligt att det kommer till ett slut men att spela rugby är något som jag verkligen har älskat att göra", sade han.
"När jag växte upp ville jag bli en professionell rugbyspelare och jag har haft turen att leva den drömmen."
Saracens chef för rugby Mark McCall beskrev Burger, som lämnar bara två veckor innan Champions Cup finalen och starten av Sarries Premiership play-off kampanj, som "en fantastisk spelare och person".
"Han var ett fenomenalt exempel på fältet med sitt mod och hur han gav allt han kunde i varje spel," McCall berättade klubbens webbplats.
"Han kommer alltid att bli ihågkommen som en av saracens sanna storheter."
Saracens back rad Jacques Burger kommer att dra sig tillbaka från rugby efter söndagens Premiership match mot Newcastle.