En undersökningskommission inrättades för fem år sedan för att undersöka anklagelserna kring 1999 års regeringsöverenskommelse.
Zuma avskedades som vice ordförande 2005 efter det att hans ekonomiska rådgivare hade dömts för korruption i samband med affären.
Presidenten meddelade på torsdag att utredningen inte hade funnit några bevis mot några dåtida regeringstjänstemän.
Han sade att pengar hade betalats för konsulttjänster "och inget annat".
Anklagelserna gäller regeringens köp av 30 miljarder rand (då 5 miljarder dollar) för stridsflygplan, helikoptrar, ubåtar och krigsfartyg 1999.
Zuma avskedades som vice ordförande 2005 efter det att hans dåvarande finansrådgivare Schabir Shaik hade befunnits skyldig till att ha försökt få mutor till sin chef från ett vapenföretag.
Zuma förnekade alltid anklagelserna, och 2009 lade åklagarna ned 700 anklagelser om bedrägeri, korruption och bedrägeri mot honom, bara veckor före valet som såg honom bli president.
Men hans kritiker vägrade att släppa frågan, så 2011 gick han med på att utse en kommission för att undersöka vapenaffären, som avslutade sina undersökningar i slutet av förra året.
Detta är inte den enda kontrovers han har varit inblandad i. Förra månaden bestämde Sydafrikas högsta domstol att han hade brutit mot konstitutionen genom att inte återbetala statliga pengar för en lyxig uppgradering av sin privata bostad.
Undersökningen, som tog fyra år att avsluta, fann inga bevis för utbredd bestickning, korruption och bedrägeri vid valet av den föredragna anbudsgivaren för att leverera vapnen eller för betalning av mutor till tjänstemän vid tilldelningen av affären.
Den tredelade rapporten om undersökningen, som kommer att offentliggöras, har inte gett några rekommendationer för ytterligare undersökningar, vilket har fått vissa att tro att ANC döljer för sin ledare och andra tjänstemän som var inblandade.
Oppositionen Democratic Alliance anser att vapenupphandlingskommissionen inte gjorde några verkliga ansträngningar för att undersöka anklagelserna i viktiga dokument. Den har beskrivit slutrapporten som en enorm besvikelse eftersom ingen kommer att ställas inför rätta.
Sydafrikas president Jacob Zuma säger att en undersökning av en vapenaffär värd miljarder dollar inte har funnit några bevis för korruption eller bedrägeri.