Muhammadu Buhari sade att om en trovärdig Boko Haram ledarskap kunde identifieras då var han beredd att tala med dem utan villkor.
Men han sa att han inte hade någon information om flickornas vistelseort eller hälsa.
Boko Haram grep flickorna från deras sovsalar i den nordöstra staden Chibok i april 2014.
"Om en trovärdig ledare för Boko Haram kan etableras och de berättar för oss var dessa flickor är, är vi beredda att förhandla med dem, utan några som helst villkor", sade Buhari.
Försök att förhandla med Boko Haram under den tidigare presidenten Goodluck Jonathans styre misslyckades eftersom tjänstemän talade med fel personer i den fragmenterade militanta gruppen.
BBC Nigeria analytiker Naziru Mikalu säger Mr Buharis erbjudande att återuppliva samtal visar att Boko Haram förblir en kraft, trots hans påstående förra veckan att gruppen hade "tekniskt" besegrats.
Det finns få utsikter till att Boko Haram går med på att förhandla om frigivningen av flickorna, tillägger han.
De militanta betraktar flickorna som deras mest ovärderliga fångar och deras ledare, Abubakar Shekau, sade förra året att de flesta av dem hade konverterat till islam och hade varit gifta bort.
Vissa nigerianer i sociala medier uttryckte ilska mot presidenten för att han sade att regeringen inte hade någon aning om var flickorna hölls fångna, och att det tydde på att underrättelsetjänsten hade misslyckats.
Buhari tillträdde i maj med ett löfte om att besegra gruppen och gav militären en tidsfrist i slutet av året för att avsluta sexårsupproret.
Även om Boko Haram har fördrivits från de flesta av de områden som den kontrollerade i nordöstra Nigeria har landet fortsatt att genomföra självmordsbombningar och räder mot grannlandet Kamerun, Tchad och Niger.
Militären har lyckats befria hundratals Boko Haram-fångar under de senaste månaderna.
Men de inkluderade inte någon av Chibok flickorna.
Använda fotboll för att tackla Boko Haram
Varför Boko Haram fortfarande är ett hot
Nigerias president har sagt att han är beredd att förhandla med Boko Harams militanter för att säkra frigivningen av omkring 200 skolflickor.