Dr Tom Frieden, chef för Center for Disease Control (CDC), vittnade inför politiker i Washington.
Han sade att data från fall av två spädbarn i Brasilien som dog strax efter födseln indikerade att viruset hade passerat från mor till barn.
Han sade dock att den misstänkta kopplingen fortfarande inte var definitiv.
Det tros ha förekommit mer än 4.000 fall enbart i Brasilien av barn födda med mikrocefali - onormalt små hjärnor - och där överföring av zikavirus från mor till barn misstänks vara orsaken.
Dr Frieden sa att intensiv forskning pågick för att ta reda på mycket mer om det myggburna viruset och för att utveckla ett vaccin för det, även om han varnade för att det fortfarande kan vara flera år bort.
"Vi kommer sannolikt att se betydande antal [Zika] fall i Puerto Rico och andra amerikanska territorier," Dr Frieden varnade.
Han sade att CDC skulle utfärda bidrag till amerikanska stater som riskerar att Zika för att bättre kontrollera myggor.
Även på onsdagen gav Världshälsoorganisationen (WHO), som har kallat utbrottet en "global folkhälsokris", vägledning för kvinnor om hur de ska skydda sig.
Det sade att tills mer är känt om sexuell kontakt kan överföra Zika, "alla män och kvinnor som bor i eller återvänder från ett område där Zika är närvarande - särskilt gravida kvinnor och deras partner - bör ges råd om de potentiella riskerna för sexuell överföring och säkerställa säkra sexuella metoder".
"Dessa inkluderar korrekt och konsekvent användning av kondomer, en av de mest effektiva metoderna för skydd mot alla sexuellt överförbara infektioner," WHO sade.
Användningen av preventivmedel är en kontroversiell fråga i regionen på grund av katolska kyrkans inställning mot det.
Men kyrkan har avvisat uppmaningar från liberala katoliker om att mildra sin ståndpunkt i frågan mot bakgrund av utbrottet.
"Mikrocefali har förekommit i Brasilien i åratal. De utnyttjar detta ögonblick för att återinföra abortämnet", berättade biskop Leonardo Ulrich Steiner, generalsekreterare för Brasiliens biskopskonferens, för tidningen Estado de Sao Paulo.
WHO sade att det inte förespråkade reserestriktioner till området utan rådde gravida kvinnor, eller de som försöker bli gravida, att söka medicinsk rådgivning innan de reser till områden där Zika är närvarande.
Mikrocefali: Varför det inte är världens undergång
Vad du behöver veta Viktiga frågor som besvaras om viruset och dess spridning
Reserådgivning Länder som berörs och vad du bör göra
Myggan bakom virusets spridning Vad vi vet om insekten
Abort dilemma Lagar och praxis i det katolska Latinamerika
En av USA:s högsta tjänstemän på folkhälsoområdet har avslöjat de "starkaste bevisen hittills" för effekten på barn av zikaviruset.