"Företaget bekräftade att det fick en stämning från SEC i det fjärde kvartalet 2015," säger Valeant taleskvinna Laurie Little.
Valeant, som har kämpat för att upprätthålla investerarnas förtroende under ökande skandaler, sade SEC sonden var en av "flera pågående undersökningar".
Byråns aktier stängde 18%.
Uttalandet kommer en dag efter att företaget meddelat att dess verkställande direktör J. Michael Pearson har återvänt från sjukledigheten.
Det sade också att det skulle skjuta upp offentliggörandet av sitt fjärde kvartal resultat och skrota sin tidigare finansiella prognos.
Företaget ställde också in ett planerat samtal med investerare.
Undersökningen är skild från den som gällde köp av Salix Pharmaceuticals som offentliggjordes förra året.
Ms Little sa: "Valeant bekräftar att det har flera pågående utredningar, inklusive utredningar av den amerikanska åklagarmyndigheten för Massachusetts och södra distriktet av New York, SEC, och kongressen."
US Securities and Exchange Commission (SEC) undersöker redan separat om Salix Pharmaceuticals – som Valeant köpte 2015 – vilseledde investerare om sina lagernivåer 2014.
Valeant granskas också för sin anslutning till specialapotekskedjan Philidor RX Services. Valeant bröt banden med apoteket i oktober, efter att ha anklagats för att använda apoteket för att förfalska försäljningen för att öka priserna.
Valeant Pharmaceuticals undersöks av Securities and Exchange Commission, det har bekräftats.