Den koptiska ortodoxa kyrkan är en av kristendomens äldsta, som grundades i Alexandria omkring år 50 e.Kr.
Men sedan president Mohammed Morsi och hans muslimska brödraskap avlägsnades från makten av militären i början av juli, har islamistiska extremister riktat in sig på Egyptens kristna minoritet och håller dem delvis ansvariga.
Den koptiska påven Tawadros II har fått dödshot, medan flera kristna har dödats.
I Sankt Markus'katedral i Kairo på söndagen samlades dussintals barn för att studera Bibeln. Säkerheten vid grindarna var hård, efter en attack där tidigare i år.
Förra tisdagen gick tioåriga Jessi Boulus hem från sin bibelklass i ett arbetarområde i huvudstaden när en revolverman dödade henne med ett enda skott i bröstet.
För Jessis föräldrar är sorgen fortfarande nästan för grov för ord. Hon var deras enda barn. Båda försöker men kan inte hålla tillbaka tårarna när de beskriver sin dotter.
Hennes mor, Phoebe, tror att hon var måltavla enbart för att hon var kristen.
BBC Religion: Koptisk ortodoxa kyrkan
"Hon var min bästa vän, mitt allt. Jessi höll just på att bli en ung kvinna, säger hon. "Varje kvinna drömmer om att bli mamma, och i 10 år hade jag turen att vara mamma. Jag kommer att sakna Jessi kalla mig mamma - jag vet att jag aldrig kommer att höra det igen."
Jessis far, Boulus, går mellan sorg och förtvivlan, när han påminner om det hat som förändrade deras liv för evigt.
"Jessi var allt för oss. Hennes mördare visste inte att Jessi var mitt liv - min framtid. De dödade vår framtid. Jag levde för henne. Det gjorde vi båda, säger han och kan inte dölja sina känslor.
Paret säger att under de senaste månaderna hade Jessi börjat oroa sig för sin egen säkerhet, medveten om spänningarna på gatorna. Familjen hade talat om att emigrera, men fattade ett medvetet beslut att stanna kvar i Egypten, deras hem.
Boulus säger emellertid att ett klimat av ökande intolerans som skapats av islamisk fundamentalism ledde till hans dotters och andra dödsfall.
"Jag säger er i väst att era skatter och statliga pengar går till att stödja dödandet här - genom att finansiera islamistiska politiska partier."
Även Muslimer och Kristna stod tillsammans på Tahrir Square i Juli, radikal Islamists har skyllt Egyptens forntida Koptisk Kristna samhälle för att hjälpa till att ta bort President Mohammed Morsi från makten.
Vid en annan kyrka i Kairo, St Cyril's, är väggarna utanför klottrade med graffiti.
Inuti ber fader Antoine Rafik Greiche för sin melkitiske grekisk - katolska hjord när han förbereder sig för kvällsgudstjänsten.
Han förklarar att korset och halvmånen har samexisterat, mestadels fredligt här, i över tusen år, särskilt den 18:e, 19:e och en stor del av de 20:e centurierna.
Men han säger också att radikala islamister nu syndabockar kristna i Egypten, liksom andra muslimer som inte håller med om sina åsikter.
– President Morsi och Muselman Brotherhoods fall var en befrielse för kristna, säger han och förklarar att många muslimer och kristna ansåg att de tidiga löftena från Morsiregeringen aldrig uppfylldes, vilket ledde till massdemonstrationer mot hans styre.
"Men samtidigt, sedan dess har det blivit farligare eftersom vissa i Muslimska brödraskapet nu vill bevisa sig genom att använda våld och våld. Vi gör vårt bästa för att bära det, men små barn och andra betalar ett högt pris."
Efter dödliga sammandrabbningar utanför Kairos koptiska katedral i april ringde Morsi till påven Tawadros för att fördöma våldet. Han krävde också en omedelbar utredning.
Men Egyptens kopter och andra kristna känner sig alltmer sårbara, liksom kristna minoriteter i många andra delar av Mellanöstern, till exempel Syrien och Irak.
De kristna utgör minst 10 procent av befolkningen i Egypten, eller mer än åtta miljoner människor.
Enligt siffror från Amnesty International var Jessi en av sju kristna som dödats i sekteristiskt våld i Egypten under de senaste månaderna, medan affärer, hem och kristna företag också har blivit måltavlor. En kyrka i centrala staden Minya brändes ner; den svarta flagga som användes av jihadistiska militanter höjdes över andra.
Diane Eltahawy, Amnesty Internationals forskare från Kairo, frågar varför kristna inte skyddas på rätt sätt.
"Vi är oroade över att dessa attacker sker i ett klimat av straffrihet, med säkerhetsstyrkor som står still medan människor dödas, medan deras fastigheter plundras", säger hon.
"De ger bara tomma ord till angrepp på kristna, och faktiskt inte vidta några konkreta åtgärder för att bekämpa den rådande diskrimineringen som finns i politiken och samhället här."
Allteftersom spänningarna ökar igen i Egypten, fruktar landets kristna ytterligare en motreaktion.