Regeringen hade tidigare förnekat att de saknades och sagt att alla patienter hade flyttats till en annan anläggning.
Ebolautbrottet, som har spritt sig från Guinea till Liberia, Sierra Leone och Nigeria, har dödat minst 1.145.
Världshälsoorganisationen (WHO) har efterlyst utvisning av alla resenärer från berörda länder.
Man vill ha kontroller på flygplatser, hamnar och större landkorsningar.
Flera flygbolag har redan slutat flyga till Guinea, Liberia och Sierra Leone.
Kamerun har stängt sina land-, sjö- och luftgränser med Nigeria, säger rapporterna.
Ebolautbrottet i Västafrika är världens dödligaste hittills. Sjukdomen har inget känt botemedel.
Under tiden berättade FN:s huvudkoordinator i Sierra Leone, David McLachlan-Karr, för BBC att Ebola hade spridit sig till 12 av 13 av landets distrikt.
"Medan Sierra Leone var den sista drabbade av de tre Mano River länder [Guinea, Liberia och Sierra Leone] att ha bekräftat [fall] av Ebola, nu är det landet med de flesta fall", sade han.
Enligt WHO har minst 810 fall av ebola rapporterats i Sierra Leone, däribland 348 dödsfall.
Angreppet på karantänstationen i Liberia, i Monrovias tätbefolkade West Point township, ägde rum på lördag kväll.
Det finns motstridiga rapporter om vad som utlöste upploppet, i vilket medicinska förnödenheter stals.
Biträdande hälsominister Tolbert Nyenswah sade att demonstranterna var missnöjda med att patienter togs dit från andra delar av huvudstaden.
Andra rapporter tydde på att demonstranterna hade trott att Ebola var en bluff och ville tvinga centret att stänga.
En högre polis, som talade till BBC på villkor av anonymitet, sade blodfläckade madrasser, sängkläder och medicinsk utrustning hade tagits från centrum, potentiellt främja spridningen av viruset.
På måndagen berättade Liberias informationsminister Lewis Brown för BBC att 17 av 37 interner från karantänstationen hade gått "tillbaka till sina samhällen".
Han sade att myndigheterna nu försökte spåra upp dem men sade att han var säker på att de skulle återvända.
"De flesta som gick in i denna anläggning kom dit frivilligt", berättade han för BBC.
"Så vårt intryck är att de fortfarande vill vara [där], men de tvingades bort av vandaler och plundrare, inte för att de ville lämna; så vi är säkra på att de kommer att återvända."
Han sade att attacken på karantänstationen var Liberias "största bakslag" sedan Ebolautbrottet började.
Lindis Hurum, från medicinsk välgörenhet Medecins Sans Frontieres (MSF), säger att det finns ett akut behov av en massiv kampanj för allmänhetens medvetenhet i Liberia.
"En del människor tror inte att den existerar. Definitivt, eftersom situationen blir värre och fler människor blir sjuka, fler människor börjar också att tro det, "Hon berättade för BBC.
"Men de förstår eller vet inte nödvändigtvis hur de ska förhindra det."
MSF säger att Ebolautbrottet har haft en fruktansvärd inverkan på Liberias hela hälso- och sjukvårdssystem, som man säger mer eller mindre faller sönder.
Många vårdinrättningar har stängt, med både patienter och medicinsk personal, alltför rädda för att dyka upp av rädsla för att fånga sjukdomen.
Ebolaepidemin började i Guinea i februari, innan den spred sig till andra västafrikanska länder.
Dödssiffran på 1.145 tillkännagavs på fredagen efter det att WHO hade sagt att 76 nya dödsfall hade rapporterats under de två dagarna till den 13 augusti. Totalt har 2 127 fall rapporterats.
Sjutton misstänkta Ebola patienter "missar" i Liberia efter att ett hälsocenter i huvudstaden attackerades, säger regeringen.