Dess rörelseresultat var $559m under de tre månaderna till 30 Juni, minskning 2,5% på samma period förra året.
Företaget fann sin kärnverksamhet sökmotorverksamhet mindre lönsam på en mer konkurrensutsatt marknad.
Baidu meddelade förra månaden att det skulle investera mer i sin e-handel och elektroniska plånböcker.
Forsknings- och utvecklingskostnader hänförda till sina nya investeringar steg 56,2% i sitt andra kvartal till $437m.
Företaget hade en omsättning på $ 2,67 miljarder under sitt andra kvartal, vilket är en ökning på 38,5 % jämfört med förra året.
Baidus ekonomichef sade: "Vi fortsätter att investera beslutsamt i "Next Baidu". Vi är glada över de framsteg vi har gjort och är övertygade om att dessa investeringar kommer att generera långsiktigt aktieägarvärde."
Kinas största online sökmotor Baidu missade analytikers förväntningar som vinster tog en hit från investeringar omdirigeras någon annanstans.