FN:s barnfond, Unicef, säger i en ny rapport att hoppet om en generation i Mellanöstern och Nordafrika håller på att krossas.
Det står att nästan 9 000 skolor i Syrien, Irak, Jemen och Libyen inte kan användas för utbildning.
Unicef dokumenterade också mängder av attacker mot skolor och lärare i hela regionen.
Peter Salama, regionchef för Unicef i Mellanöstern och Nordafrika, sade: " Konflikternas destruktiva effekter upplevs av barn i hela regionen.
"Det är inte bara den fysiska skada som skolor utsätts för, utan den förtvivlan som en generation skolbarn känner när deras förhoppningar och framtid krossas."
De 13,7 miljoner som inte har någon utbildning utgör omkring 40 procent av skolbarnen i Syrien, Irak, Jemen, Libyen och Sudan och FN fruktar att siffran kan uppgå till 50 procent under de kommande månaderna.
Unicef säger att det 2014 förekom 214 attacker mot skolor i Syrien, Irak, Libyen, de palestinska territorierna, Sudan och Jemen.
En av fyra skolor i Syrien har stängt sedan mars 2011, vilket drabbar mer än två miljoner barn, säger den.
Unicef's Education Under Fire rapport tillade att "dödande, bortförande och godtyckliga arresteringar av studenter, lärare och utbildningspersonal har blivit vanliga" i regionen.
Tusentals lärare har övergett sina poster i rädsla och barn tvingas ofta arbeta olagligt för att hjälpa sina familjer.
Barnen kan också bli stridande i unga år.
José Ignacio Salama sade att Unicef behövde ytterligare 300 miljoner i år för att försöka förbättra tillgången till utbildning i regionen.
FN har sagt att konflikterna i Mellanöstern berövar mer än 13 miljoner barn en utbildning.