Beslutet kommer när vissa kliniker varnade för att det skulle kunna sätta patienterna i riskzonen.
Enheten skulle utföra komplexa vaskulära operationer för potentiellt livshotande tillstånd som bukaortaaneurysmer.
Betsi Cadwaladr University Health Board sade dock att detta endast representerade cirka 20% av dess vaskulära behandlingar.
Hälsostyrelsen insisterade på att majoriteten av dess vaskulära tjänster fortfarande skulle utföras på de andra sjukhusen i norra Wales, inklusive Ysbyty Gwynedd i Bangor och Wrexham Maelor Hospital.
"För närvarande utförs cirka 300 komplexa vaskulära operationer varje år i norra Wales - vilket representerar cirka 20% av vår vaskulära aktivitet - och vi är fast beslutna att fortsätta huvuddelen av vårt arbete på Ysbyty Gwynedd, Ysbyty Glan Clwyd och Wrexham Maelor sjukhus", säger Dr Evan Moore, styrelsen verkställande medicinsk chef.
"Units som dessa - som ger ett nav för större vaskulär arteriell verksamhet - skapas i hela Storbritannien, och det finns starka bevis för att sådana platser förbättrar kliniska resultat och patientsäkerhet, samtidigt som de attraherar den bästa personalen och hjälper till att utveckla den bästa infrastrukturen."
Blodkärlsmedicin täcker ett brett spektrum av medicinska ingrepp och ingrepp, från screening för risker för aneurysm - där försvagade väggar av större blodkärl kan brista - till behandling av åderbråck, strokeförebyggande och säkerställa dialys patienter kan fortsätta sin behandling.
Men när en konsultläkare vid Ysbyty Gwynedd talade före tillkännagivandet, väckte han oro.
"Detta är en integrerad tjänst, och andra aspekter av vad vi gör här skulle hotas - radiologi, urologi och gastroenterologi för att bara nämna några," Dr Mahdi Jibani berättade BBC Wales.
Ken Jones från North Wales Kidney Association tillade: "Om denna tjänst går, kommer det att kosta liv, det finns inga två sätt om det."
Arfon församlingsmedlem Sian Gwenllian sade att det representerade "ännu ett exempel på tjänster krypande österut".
Men dr Moore hävdade att vaskulära tjänster långt ifrån att slå tjänster på andra sjukhus i regionen skulle gynnas av ett specialiserat nav.
"Hubs som den vi har planerat, bygger på den stora kunskap, kompetens och praxis som redan finns här, skulle skydda uppkopplade tjänster på dessa platser.
"Dessa inkluderar öppenvårdskonsultationer, undersökningar, diagnostiska procedurer, åderbråck och dagfallsoperationer. Det kommer också att säkerställa ett starkt stöd för andra tjänster som olycksfall och nödsituationer, urologikirurgi och njurterapi."
Hälsochefer i norra Wales har bekräftat planer på att placera en vaskulär specialistenhet vid Glan Clwyd Hospital i Denbighshire.