Fyra välgörenhetsorganisationer drog sig tillbaka som officiella partner från Kiltwalken tidigare i år och dess verkställande direktör avgick några veckor senare.
Kiltwalk-scenerna sponsrade promenader över Skottland för att samla in pengar till ledande välgörenhetsorganisationer för barn.
2013 års räkenskaper visade att mer spenderades på kostnader än vad som gick till välgörenhet.
Det finns inga förslag till förordningar som har brutits.
Kiltwalk ordförande Michael Ure sade att det hade ådragit sig ytterligare kostnader på grund av en "omstrukturering".
Mr Ure och de andra förvaltarna har nu avstått.
Kiltwalken sa att en ny styrelse skulle övervaka den fortsatta utvecklingen av välgörenhet.
Gruppen har också fått stöd från en av Skottlands rikaste män, entreprenören Sir Tom Hunter, vars stiftelse har anslagit långsiktig finansiering.
Hunter sade: " Kiltwalken är ett fantastiskt koncept för att samla in välbehövliga medel till Skottlands välgörenhetsorganisationer och har vårt absoluta stöd.
"Vi har för avsikt att under de närmaste månaderna omdefiniera och förbättra modellen, som bygger på de fundament som redan finns, för att maximera avkastningen för välgörenhetsorganisationer och turboladda Skottlands Kiltwalkers för 2016."
Kiltwalken grundades 2011 i syfte att sammanföra Skottlands ledande välgörenhetsorganisationer för barn till en serie sponsrade promenader.
Det växte från 800 vandrare det året till mer än 12.000 över hela landet 2014.
Men tidigare i år drog sig fyra välgörenhetsorganisationer - CLIC Sargent, Cash for Kids, Aberlour och Edinburghs Sick Kids Friends Foundation - tillbaka som officiella partners.
CLIC Sargent och Aberlour uppgav för BBC Skottland att de var oroliga över hur mycket pengar som nådde dem från Kiltwalken.
Den senaste uppsättningen konton för Kiltwalken visade att från en inkomst på drygt 1,6 miljoner pund, Â £ 780.000 hade spenderats på löpande kostnader - mer än Â £ 776.000 som gick till välgörenhet.
En skotsk välgörenhet har ersatt hela styrelsen efter oro över hur mycket pengar den gav till välgörenhet.