Den 36-årige från Carrickfergus hade varit nivå på 15 med den avlidne Robert Dunlop går in i torsdagens tävlingar.
Seeley bröt sig loss för att vinna det inledande Supersport loppet före tvåan Ian Hutchinson och Martin Jessopp.
Supertwins-tävlingen övergavs efter att två ryttare skadades i en hög hastighetsolycka.
Dungannon ryttare Ryan Farquhar och Dan Cooper från Stroud kom av vid Black Hill och fördes till sjukhus.
Fyrtioårige Farquhar hade bröst- och bäckenskador medan Cooper 28 hade axelskador.
Record-breaker Seeley har vunnit minst en händelse i nordväst i nio år i rad.
Han har också vunnit minst ett Supersportlopp under vart och ett av sju på varandra följande år från 2010 till 2016.
Supersport händelsen gav en spännande start på racing på 2016 North West.
Ballymoneys Michael Dunlop, en fyrfaldig vinnare i nordväst, klarade sig inte utanför nätet på grund av mekaniska problem.
Seeley hoppade in i en tidig ledning men några uppretande action såg Fermanagh ryttare Lee Johnston, Yorkshire mannen Hutchinson och Michaels bror William Dunlop alla turas om vid fronten.
Seeley, Hutchinson och Jessopp slog alla rekordet på den sista kretsen.
"North West satte mig på kartan när jag först kom hit och nu för att nämnas i samma mening som Dunlops är otroligt", sade en upprymd Seeley.
"Det var en typisk Supersport race. Vi lyckades få en paus och clinch den 16: e seger. "
Alastair Seeley har slagit rekordet för segrar på North West 200 road races genom att uppnå sin 16: e karriär seger på det internationella mötet.