Mr LaBeouf greps efter en konfrontation vid sitt livestreamade videoprojekt i New York och åtalades för överfall och trakasserier.
De anklagelserna har nu lagts ned.
En talesman för distriktsåklagaren i New Yorks Queen's District berättade för amerikanska medier att fallet skulle avfärdas på grund av otillräckliga bevis.
Mr LaBeoufs konstprojekt, en 24-timmars stream som heter Han kommer inte att splittra oss, uppmuntrade allmänheten att säga dessa ord i en kamera utanför New Yorks Museum of the Moving Image.
Men LaBeouf och en medlem av allmänheten påstås ha deltagit i en dispyt under en direktsändning i januari.  Museet sade senare att platsen hade blivit "en flampunkt för våld".
Liveströmmen planerades fortsätta under de fyra åren av Trumps ordförandeskap, men museet drog stöd för projektet i början av februari.
Projektet tvingades flytta plats två gånger i USA, efter att motståndarna försökte störa det.
Den kom sedan i en ny form i Liverpool i Storbritannien - men ställdes inför liknande problem.
Liverpools Fact arts center hade livestreamat en flagga med orden, men ställde in projektet efter att folk klättrat på taket för att försöka ta bort flaggan.
Förutom sin performancekonst är LaBeouf mest känd för filmer som Transformers, Indiana Jones och kungariket Crystal Skull och Wall Street: Pengar sover aldrig.
Skådespelerskan Shia LaBeouf kommer inte längre att åtalas för överfall över en januariincident på sin anti-Donald Trump konstinstallation.