Fly svärmar från Shows Waste Management webbplats i Slack Lane, Derby, har lämnat boende inför svårigheter matlagning och städning i veckor.
Miljöbyrån sade att 2 200 ton avfall nu har flyttats och "flugfrågan... har lösts".
Anläggningen har beordrats av byrån att flytta allt avfall senast den 7 juli.
Byrån hade startat en kriminell sond in i fluga angrepp, och en talesman tillade att de skulle "söka att vidta lämpliga nivåer av verkställighetsåtgärder mot berörda parter" när deras utredning av orsaken till pesten är över.
"Vi kan bekräfta att flugfrågan på webbplatsen har lösts utan rapporterade problem från samhället sedan början av juni", sade en byrå talesman.
"Vi kommer att fortsätta att övervaka och bedöma situationen tills våra krav är helt uppfyllda."
Omkring 3 000 hushåll och företag befinner sig i de drabbade områdena.
En invånare, Melissa Marriott, sade tidigare till BBC att hon inte kunnat bada utan att flugor kommit ner i vattnet, och var tvungen att köpa en elektrisk flugmördare som "får 50 flugor om dagen".
En annan invånare, Jenny Warren, sa att flugorna hade varit över hela maten och att man inte kan öppna fönster.
Den 17 maj fick Visas Avfallshantering ett beslut om avstängning av byrån och sade att inget ytterligare avfall skulle accepteras på plats.
Avfallsföretaget har sagt att det befann sig i den nuvarande situationen på grund av en tvist med ett annat företag.
Invånare vars hem har fyllts med hundratals flugor från en återvinningsanläggning i Derbyshire har fått höra att deras elände är över.