SABC säger flytten, som har hyllats av lokala musiker efter år av kampanjer, kommer att främja sydafrikansk kultur och arv.
Det kommer att finnas ett särskilt fokus på jazz, kwaito (lokal husstil dansmusik), och gospel musik, säger SABC.
Det finns ingen gräns för mängden utländska musik kommersiella stationer spel.
"Vi tror att det är viktigt för folket i Sydafrika att lyssna på den musik som produceras för dem av musikerna i Sydafrika," SABC talesman Kaizer Kganyago berättade BBC, förklara beslutet.
Jazzmusiker Don Laka, en av ledarna för kvotkampanjen, firade på sin Facebook-sida och tackade SABC chefen Hlaudi Motsoeneng.
"Idag är jag stolt över att vara sydafrikan. Den här mannen Hlaudi fick mig att dela en tår för första gången på många år... äntligen frihet!"
Lokal hip-hop stjärnan Slikour beskrev det som musikindustrins version av "Nelson Mandela kommer ut ur fängelset".
Den styrande afrikanska nationalkongressen välkomnade också beslutet och sade att det kommer att stärka lokala konstnärer och hjälpa till att sprida afrikansk kultur hemma och över hela världen.
Många sydafrikaner har tagit sig till sociala medier för att fira tillkännagivandet och säger att det kommer att hjälpa till att visa upp landets musikaliska mångfald.
SABC, som har cirka 30 miljoner lyssnare i veckan till sina radiostationer, säger att beslutet kommer efter omfattande samråd med dem som är involverade i landets musikindustri.
Stationer här har tidigare kritiserats för att spela mestadels västerländsk musik och inte stödja lokala artister.
Även om detta är bara för de kommande tre månaderna - under förutsättning att lyssnarna vill att det ska vara ett permanent drag, industriinsiders hoppas att det kommer att bidra till att stärka profilen för lokala konstnärer.
Sydafrikanska musiker uppträder ofta med musiker från andra delar av kontinenten, så detta kommer att vara en chans för dessa samarbeten att höras hemma.
De nya spellistorna kommer att innehålla musik på ett antal av landets 11 språk och olika genrer.
Det är goda nyheter för lokala artister, som kan dra nytta av en ökad försäljning av sin musik.
Och även för många lyssnare tycks beslutet ha slagit rätt ton.
Sydafrikas nationella programföretag SABC har infört ett nytt kvotsystem, vilket kräver att 90 procent av den musik som spelas på dess 18 radiostationer kommer hem.