Den tidigare Forest Green Rovers anfallare, 26, har netts 28 gånger i alla tävlingar för Rovers denna säsong.
Hans mål har hjälpt klubben upp till fjärde inför säsongens sista dag.
"Vi har en förståelse för att, om han kommer till oss och han har ett erbjudande, vi har en chans att matcha det erbjudandet," Hamer berättade BBC Radio Bristol.
"Om det erbjudandet, tyvärr, är så otroligt bra för Matty men inte särskilt bra för Bristol Rovers Football Club, skulle vi förmodligen behöva avstå från att matcha det.
"För om du är så sned kan det destabilisera resten av gruppen eftersom någon är på en summa pengar.
"Han har en agent som gör sitt bästa för honom. Men det är inte att säga att vi kommer att ge upp den utan att slåss. "
Hamer avslöjade också att klubben skulle diskutera ett nytt kontrakt med chef Darrell Clarke i slutet av säsongen, med Rovers garanterade åtminstone en play-off plats, ligger en punkt utanför de tre bästa före lördagens besök av förvisade Dagenham & Redbridge.
"För tillfället, vi inte distrahera honom (Clarke) från jobbet i hand," Hamer sade.
"Så fort det är över sätter vi oss ner och pratar med honom. Det finns ingen anledning till varför vi inte kan komma på något som kommer att behaga honom och oss.
"Det arbete han har gjort är anmärkningsvärt. Efter att ha lärt känna honom, tror jag att han kan gå långt i det här spelet. Han är taktiskt mycket medveten.
"Det skulle vara trevligt att tro att han kan ta sig dit Eddie Howe är på Bournemouth. Det finns inga skäl till varför han inte kan.
"Jag skulle vilja tro att han kommer med oss på en spännande resa som vi har framåt, men vem vet?"
Clarke säger att Rovers rivaler har "allt att förlora" på lördag och hans sida skulle vara "mycket olyckligt" att inte gå upp om de slutar på 85 poäng.
Bristol Rovers kommer att få chansen att matcha erbjudanden från andra klubbar för League Twos bästa målskytt Matty Taylor i sommar, säger ordförande Steve Hamer.