European Athletics vill ha historiska register omskrivna på grund av bristande trovärdighet efter en dopningsskandal.
"Om det var vad som krävdes för sportens bästa då är det så jag skulle behöva gå", sade Warner.
GB: s Paula Radcliffe, som skulle förlora sitt 2003 maraton världsrekord, tidigare dubbade idén "cowardly".
Britannien Colin Jackson skulle också förlora sin 1994 inomhus 60m hinder världsrekord på 7.30 sekunder.
Radcliffe sa att European Athletics idé var "tunghänt", medan Jackson sa att rena idrottare "inte borde fastna i detta".
"De [Radcliffe och Jackson] älskar idrott och förstå det större goda är vad som är viktigt, men vi måste få till en bättre definierad uppsättning förslag, och vi är inte där ännu," Warner berättade BBC Radio 4's Today program.
Athletics världsstyrelse - International Association of Athletics Federations (IAAF) - kommer att diskutera förslagen vid ett möte i augusti.
Förslagen är ett svar på förra årets McLaren-rapport, som avslöjade utbredd dopning inom idrotten - och idrott i synnerhet. Ryska idrottare är förbjudna från internationell konkurrens om de inte kan uppfylla strikta kriterier för att visa att de är rena.
Warner tror att några av de skivor som sattes före 2005 var "inquitous", tillägger: "Dagens idrottare kan inte komma nära dem eftersom de var drogdrivna."
Ett viktigt förslag från European Athletics är att blodprover måste lagras i tio år efter det att ett register har upprättats.
IAAF har lagrat blod- och urinprov endast sedan 2005 och nuvarande register som inte uppfyller de nya kriterierna skulle finnas kvar på en "all-time-lista", men inte officiellt erkännas som register.
Warner, som tog ansvar för UKA 2007, varnade också sommarens VM i London skulle inte vara "100% ren", säger kampen mot dopning var "en kapprustning".
Han kommer att lämna UKA efter 11 år omedelbart efter VM och har redan överlämnat ordförandeuppgifter till Richard Bowker.
Utgående UK Athletics chef Ed Warner har backat upp planer på att radera världsrekord före 2005, tillägger att idrottare drabbade förstår "det större goda".