Den anonyma 72-åringen sa att broder Lawrence Murphy tog in honom i sovrummet två gånger och tvingade honom att utföra sexakter.
Om jag hade berättat för någon, skulle jag ha fått bältet, sa han.
Castledare barnhem nära Perth, som drivs av Christian Brothers order, var som "en laglig pedofil ring", sade han.
Vittnet berättade för utredningen: " Om någon gjorde det offentligt, skulle han gå till domstol, han skulle bli dömd och han skulle avtjäna tid.
"Om han hade en vana på, om du är en kristen broder då verkade det vara en fri-för-all.
"Vi visste vad som skulle hända om du berättade för någon, särskilt med auktoritet, de skulle säga "detta händer inte här."
Missbruksskandalen av de brittiska barn som skickades utomlands
"Namn på skurkarna", sa missbruksutredningen.
Han fortsatte med att hävda att broder Murphy senare "förflyttades från plats till plats" för att effektivt gömma honom.
Han sa att hans tid på barnhemmet fortfarande hemsökte honom och var "troligen något jag aldrig kommer att glömma".
Han hade buteljerat den i nästan 30 år och hade bara valt att tala ut när han fick reda på utredningen, tillade han.
Livet för föräldralösa barn innebar hårt fysiskt arbete, bland annat att dra ner träd, röja mark, gräva ut en simbassäng och bygga en handbollsbana genom att flisa tegelstenar.
"Du var tvungen att chip X mängd tegel innan du kan sluta, innan du hade något att äta," sade han till utredningen, som undersöker missbruk i England och Wales.
Pojkarna bar bara en grå skjorta och shorts, oavsett väder, sade han.
Det fanns inga kalsonger och skor bars bara när någon viktig besökte, annars fötter var bar, tillade han.
Bröder skulle vara fullt klädda med skor och handskar medan pojkarna skakade i kylan, sade han.
Undersökningen har också hört från en annan tidigare barnmigrant, Oliver Cosgrove, som nu är i slutet av sextiotalet och som också bodde på Castledare.
Han sade att de kristna bröderna, som drev hemmet, skulle besöka barnens sängar på natten.
"Vi fick höra på Castledare att vi alltid var tvungna att sova på vår högra sida så att hjärtat var närmare himlen", sade han.
Broder Murray hade smekt honom och hade också "kom till min säng och tvingade mig att ge honom oralsex," Utredningen berättades.
Mr Cosgrove kom bara helt ihåg en del av övergreppet 2014 efter att ha läst dokument som är kopplade till en australiensisk missbruksutredning.
Han sade: " Minnet av detta fick mig att ha flera dagars snyftande i min lägenhet, bostadsväggarna är inte särskilt tjocka. Jag brukade köra ner till ett flodområde som ligger i närheten och bara snyfta i flera timmar på natten."
Hur kommer utredningen att fungera?
Den första fasen i den oberoende undersökningen om sexuella övergrepp mot barn är att titta på hur organisationer har skyddat barn utanför Storbritannien.
Mellan 7.000 och 10.000 barn flyttades från Storbritannien till Australien efter andra världskriget.
De rekryterades av religiösa institutioner från både anglikanska och katolska kyrkor, eller välgörenhetsorganisationer, inklusive Barnardos och Fairbridge Society, i syfte att ge dem ett bättre liv.
Utredningen, nu in på sin tredje dag, kommer att få höra vittnesmål från barnmigranter under två veckor.
En tidigare barnmigrant, som skickades från Wales till ett australiskt barnhem, har berättat för en barnmisshandelsutredning att det var en "fest för barn" för pedofiler som arbetar där.