Ett privatsjukhus sa till BBC att 90 personer stod på väntelistan efter att förråden tog slut förra veckan.
Hundratusentals människor har undertecknat en nationell petition om att jabben ska erbjudas alla barn
Det följer ett fall i England där en mor delade bilder på sin dotter som dog på sjukhus på grund av sjukdomen.
Enligt nationella riktlinjer är vaccinet endast tillgängligt för spädbarn.
Alla spädbarn i Storbritannien erbjuds ett potentiellt livräddande vaccin mot meningit B som en del av ett nationellt immuniseringsprogram.
Man har dock efterlyst att åldersgränsen skall utsträckas till att omfatta barn och tonåringar.
Privata sjukhus i Nordirland rapporterar en ökning av antalet förfrågningar från allmänheten om att få Meningitis B-vaccinet.