Gareth Clubb begärde att Neil McEvoys rådgivande panel för Wales utfrågning den 2 och 3 mars skulle skjutas upp.
Plaids vårkonferens hålls i Newport den 3 och 4 mars.
Adjudication Panel for Wales har ombetts att lämna synpunkter.
John Clubb sade att sammandrabbningen "kan leda till en urholkning av allmänhetens förtroende" i panelens arbete.
McEvoy, en Plaid AM för South Wales Central och partiets gruppledare i Cardiffrådet, står inför en domstol för anklagelser om att han har försatt myndigheten i vanrykte i sin roll som kommunalråd.
BBC Wales rapporterade i januari att ärendet, som ombudsmannen hänvisade till domstolen, uppenbarligen avser huruvida en kommentar gjordes till en rådstjänsteman på ett hotfullt sätt.
I ett brev till panelen sade herr Clubb att Fairwater-fullmäktige "kommer att tala vid konferensen och vi vill inte att hans tal ska störas av vare sig hans framträdande i en panel eller av att han måste förbereda sig för en nära förestående utfrågning".
Han sade att "kan ha hörts nästan när som helst i november till februari på ett datum som inte skulle ha varit i konflikt med ett kritiskt datum i den politiska kalendern".
Mr Clubb, som har tjänstgjort som Plaids verkställande direktör sedan i september förra året, sade att tidpunkten för utfrågningen för konferensens dag gav "uppenbarelsen av politisk inblandning, även om datumkonflikten är helt slumpmässig.
"Jag är rädd att det här testet misslyckas med att schemalägga McEvoys fall för att sammanfalla med vår vårkonferens och att det kan leda till en urholkning av allmänhetens förtroende för panelens arbete."
I brevet föreslår herr Clubb att man kan se "att panelen på ett orättvist sätt försöker förhindra [Michael McEvoys] framträdande vid konferensen".
Han sade att ett "oavsiktligt beslut" med rätta skulle fastställa att det "föreslagna datumet är uppenbart orättvist mot McEvoy".
John Clubb, som sade att datumen för konferensen hade varit allmänt kända sedan november, begärde att utfrågningsdatumet skulle ändras så att konferensen och den "formella lokalvalsperioden" undveks.
Rådets val äger rum den 4 maj.
Tidsplanen för en tribunal i beteendet hos en Plaid Cymru AM samtidigt som hans partikonferens ger intryck av politisk inblandning, har partiets verkställande direktör sagt.