Steyn lämnade planen mitt över två gånger på dag tre och togs för skanningar men de visade inga tecken på en muskel tår.
Världens topprankade bowlare hade ett morgongymnastiktest på Kingsmead men kände återigen obehag.
Den 32-årige kommer att ha fler tester för att se om han kommer att vara lämplig för det andra testet, som börjar den 2 januari.
Tvivlen om Steyns kondition ökade problemen för Sydafrika, som följde England med 261 körs innan den fjärde dagen av serien öppnare och stod inför en kamp för att rädda spelet.
Den högra arm bowlaren hade just återvänt till Proteas sida efter att ha missat majoriteten av sin turné i Indien med en ljumskeskada.
Sydafrika har också störts av spekulationer om framtiden för stjärnan Batsman AB de Villiers.
Den 31-årige, som också håller Wicket under detta test, sade på måndagen att han var ute efter att minska sin arbetsbörda bland rykten han överväger att gå i pension.
"Det finns en hel del rykten flyger runt jag hör, men under de senaste två till tre åren det enda samtal jag har gjort är att hålla mig fräsch och att ha lite vila här och där," sade De Villiers, som rankas nummer tre Test fladdermöss i världen.
"Det har alltid varit det viktigaste för mig att njuta av min cricket. Det är bara viktigt att titta på schemat och för mig kanske inte spela alla typer av cricket.
"Det är det enda jag har pratat om. Att hålla mig fräsch och att fortsätta njuta av spelet. Jag älskar att representera mitt land och ingenting har förändrats."
Sydafrika pace bowler Dale Steyn kommer inte skåla igen i det första testet mot England på grund av en höger axel spasm.