De sade att 11 av kropparna hade begravts för omkring två år sedan i ett öde område omkring 40 kilometer sydost om Ciudad Juarez.
De återstående åtta offren, som hade torterats och dödats för bara några dagar sedan, hittades längs en väg nära staden Rosales.
Chihuahua är en av de stater som drabbats hårdast av narkotikarelaterat våld i Mexiko.
Alla offren var män och hade skjutits ihjäl. Många visade också tecken på tortyr.
Enligt siffror som publicerades tidigare i år av Mexikos nationella kommission för mänskliga rättigheter är 16.000 organ fortfarande oidentifierade och totalt 24.000 personer saknas.
De flesta av dem tros vara offer för strider mellan rivaliserande narkotikagäng eller militära insatser mot narkotikavåldet.
Mexikanska säkerhetsstyrkor har hittat 19 kroppar i massgravar i norra delstaten Chihuahua.