Dow Jones Industrial Genomsnitt steg 2.47 poäng till 17789.67, medan det bredare S&P 500 indexet ökade 2.37 till 2099.33.
Den tech-fokuserade Nasdaq kantade upp 4,2 poäng till 4952,25.
En större nedgång i bilförsäljningen än väntat har dock lett till att andelen amerikanska biltillverkare har minskat.
Fords aktier förlorade 2,8 % efter att ha rapporterat en nedgång på 5,9 % i försäljningen i maj.
På samma sätt sjönk General Motors med 3,4 % efter det att den amerikanska biltillverkaren rapporterade att försäljningen i maj minskade med 18 % jämfört med föregående år.
Uppgifterna visade att den globala tillverkningsindustrin halkade ytterligare en månad, men amerikanska investerare väntar på sysselsättningsdata från fredag för att få en bättre känsla av om Federal Reserve kommer att höja räntorna i juni.
"Det finns ett överflöd av ekonomiska data denna vecka att investerare är förvirrade om hur man ska smälta", säger Jonathan Corpina, senior managing partner för Meridian Equity Partners.
E-handelsföretaget Alibaba föll 6,5% efter att dess största investerare tillkännagav en plan för att sälja sina aktier. Japans SoftBank sa att den skulle sälja aktier till ett värde av 7,9 miljarder dollar för att betala av en del av sin egen skuld.
Sportswear företag Under Armour såg sina aktier falla 4%. Företaget varnade investerare på onsdag att dess resultat skulle skadas av konkursen i sportaffärskedjan Sport Authority.
Aktierna i Michael Kors steg 6,6% till 44,85% efter handväskan och tillbehör återförsäljaren rapporterade en stor ökning av fjärde kvartalet intäkter.
Intäkterna under de tre månaderna till den 2 april ökade med 10,9% till 1,2 miljarder dollar, även om detta underlättades av öppnandet av 142 nya butiker under det senaste året.
Försäljning i samma butik - ses som ett bättre mått på underliggande styrka - ökade med 0,3 %, vilket Neil Saunders, av detaljhandeln analytiker Conlumino, beskrivs som " anemisk".
(Stängd): Wall Street-marknaderna steg på onsdag trots dåliga uppgifter från tillverknings-, bostads- och bilbranschen.