Den 20-åriga Frankrike internationalen bötfälldes och suspenderades fram till måndagen för saknad torsdagsutbildning, men förbudet har förlängts på obestämd tid.
Dortmund träffade Barcelonas representanter, men den spanska klubben uppfyllde inte sin värdering.
Den tyska klubben säger att Dembele flyttar till Barca är "för närvarande inte troligt".
Dortmund, fotbollschef Michael Zorc, sade: " Vårt fokus ligger nu på förberedelserna inför Bundesligas öppningsmatch i Wolfsburg [den 19 augusti]. Dembele har naturligtvis möjlighet att genomföra en individuell träning utanför gruppen."
Dortmund skrev under Dembele på ett femårigt avtal från Rennes i maj 2016.
Borussia Dortmund har avbrutit Ousmane Dembele "tills vidare", tre dagar efter att klubben avslog ett bud från Barcelona.