Avgiften avser en betalning på 44 miljoner dollar (29 miljoner pund) till den tyske bankiren Gerhard Gribkowsky från Bayern Landesbank, kopplad till försäljningen av en andel i F1.
Ecclestone förnekar att han mutade Gribkowsky och säger att pengarna var avsedda att hindra bankiren från att utsätta honom för en brittisk skatteutredning.
Mr Gribkowsky dömdes till åtta och ett halvt års fängelse i München.
Ecclestone talade till Financial Times på onsdag och sade: " Jag har just talat med mina advokater, och de har blivit åtalade. Det översätts till engelska."
"Vi försvarar det ordentligt. Det blir ett intressant fall. Det är synd att det har hänt."
Ecclestone har sex veckor på sig att svara på åtalet, sade Formel 1-gruppen i ett uttalande.
Avgifterna hänför sig till 2006 års försäljning av 47 % av Bayern Landesbanks andel i Formel 1, som hade förvärvat den från den konkursdrabbade Kirch-mediakoncernen.
Gribkowsky hade ansvarat för försäljningen till riskkapitalkoncernen CVC Capital Partners.
Bernie Ecclestone - mannen, myterna och motorerna
CVC har sedan dess minskat sin andel i en rad affärer. Den har inte kommenterat åtalet.
Vid sin rättegång förra året erkände Gribkowsky att han korrumperat tog emot 41,4 miljoner pund (26,6 miljoner pund) i bankuppdrag och en stor betalning via familjen Ecclestones Bambino Trust.
Han vidhöll att han hade fått betalt för att undervärdera aktierna.
Men Ecclestone säger att han betalade Gribkowsky för att hålla honom tyst, i tron att bankiren planerade att ge falsk information till de brittiska myndigheterna om sina skatteärenden.
Ecclestone sade vid den tidpunkten att beviset för påståendet var falskt "skulle ha varit mycket dyrt för mig".
"Skatterisken skulle ha överstigit 2 miljarder pund. Jag betalade honom för att hålla sig lugn och inte göra dumma saker, sa han.
Ecclestone har till mitten av augusti att svara på anklagelserna. Domstolen kommer sedan att avgöra om målet skall prövas - det skulle kunna prövas i mitten av september.
Han står inför en möjlig fängelsedom om han befunnits skyldig, något han tidigare sagt skulle tvinga honom att avgå som chef för F1.
Hans advokat berättade för Financial Times att åtalet till stor del baserades på uttalanden från Gribkowsky, och att Ecclestone hade för avsikt att bestrida dessa.
Tyska åklagare har åtalat Formel 1 motorracing boss Bernie Ecclestone för mutor.