Ananda Gopal Gagulys kropp, 70 år, hittades på ett fält nära hans tempel i västra Jhenaida. Hans huvud hade nästan skurits av från nacken.
Polisen har dödat tre misstänkta islamister i ett angrepp på extremister som anklagats för morden.
Kritiker säger att regeringen förnekar morden, av vilka de flesta har skyllts på eller hävdats av islamister.
Två påstådda medlemmar av den förbjudna Jamaat-ul-Mujahideen Bangladesh (JMB) sköts död i Dhaka när polisen plundrade ett hem i staden - polisen sade oidentifierade beväpnade män öppnade eld på dem.
En tredje - som sägs ha varit kopplad till en bombning av en moské i Ahmadiya nyligen - dödades i västra Rashahidistriktet.
Vem ligger bakom morden i Bangladesh?
Är extremismen på uppgång i Bangladesh?
Lurcha från sekularism till sekteristisk terror?
Ananda Gopal Gaguly är den tredje personen som dödats i en sådan attack de senaste två dagarna.
"Han gick hemifrån i morse och sa att han skulle till ett hinduiskt hus för att be," sa vice polischef Gopinath Kanjilal till AFP nyhetsbyrå. "Senare hittade bönderna hans nästan halshuggna kropp i ett risfält."
Den militanta gruppen i Mellanöstern säger att den utförde dödandet, men en talesman för regeringen berättade för BBC att alla de senaste attackerna var arbete av inhemska extremister.
På söndagen dödades hustrun till en högre polis som undersökte attackerna och en kristen affärsman.
Polisen säger att mer än 40 personer har dödats sedan januari förra året i vågen av attacker mot dem som av extremister ses som offensiva mot islam.
Regeringen insisterar på att Islamiska staten inte har någon närvaro i Bangladesh och har tenderat att skylla på oppositionen och lokala militanta grupper.
Kritiker har anklagat regeringen för att inte ta itu med våldet i Bangladesh på rätt sätt.
Den dystra listan över dem som har fallit offer för attacker av islamistiska militanter i Bangladesh blir allt mer varierande.
Sekulära bloggare, akademiker, homosexuella rättighetsaktivister och medlemmar av religiösa minoriteter som Shia, Sufi och Ahmadi Muslims, Kristna och Hindus har alla dödats, många av dem hackas till döds.
En universitetsprofessor vars familj sade att han inte var ateist mördades i april, vilket tyder på att listan över dem som var i riskzonen hade vidgats ytterligare.
Vem som ligger bakom attackerna är fortfarande skum. Bangladesh har otaliga extremistiska grupper och det har funnits få övertygelser om attackerna.
Bangladesh har ifrågasatt påståenden från så kallade Islamiska staten (IS) eller al-Qaida-kopplade grupper för attackerna, i stället ofta skyller oppositionspartier eller lokala islamistiska grupper.
Men tills morden upphör kommer regeringen själv att anklagas för att inte göra tillräckligt för att skydda minoriteter i den sunnidominerade nationen.
En hinduisk präst har dödats i Bangladesh, i den senaste attacken av islamistiska militanter.