James Brokenshire sade också att han kommer att påskynda lagar genom parlamentet i början av maj om en överenskommelse kan nås.
Theresa May tillkännagav en plan för att kalla till val den 8 juni. Ledarna för DUP och Sinn Féin välkomnade beslutet.
Tillkännagivandet kom under en paus i samtalen för att återupprätta decentraliserade regeringar i Nordirland.
Stormonts partier har ännu inte kommit överens om att bilda en verkställande direktör sex veckor efter valet.
Brokenshire hade varnat för att det antingen kommer att bli direktstyre från Westminster eller ett annat val om det inte finns någon överenskommelse i början av maj.
Han talade efter att planen för ett allmänt val tillkännagavs och sade: "Diskussioner mellan partierna och de brittiska och irländska regeringarna kommer att fortsätta i enlighet med den tredelade strategin.
– Utsikterna till ett kommande allmänt val i Förenade kungariket ändrar inte detta synsätt.
"Dessutom anser jag att det också är rätt att införa bestämmelser som skulle göra det möjligt att bilda en verkställande direktör i början av maj om en överenskommelse kunde nås.
"För att få denna lagstiftning i kraft i tid kommer jag att begära att dess framsteg genom parlamentet påskyndas."
Han sade också att han hade för avsikt att införa lagstiftning för att ta itu med omedelbara frågor som att fastställa en regional skattesats för att tillåta att avgiftsräkningar införs av råden.
Den irländske utrikesministern Charlie Flanagan sade att han sade till Brokenshire att han var "berört" över den inverkan valet skulle få på samtalsprocessen.
Vi tittar på ännu ett val under den värsta politiska kris som Nordirland har ställts inför under de senaste tio åren.
I det senaste valet till församlingen i mars skedde en betydande förändring i landskapet. Sinn Féin kom inom räckhåll för att bli Stormonts största parti.
Detta resultat, och den pågående debatten om Brexit, har lett till mer prat om möjligheten till ett enat Irland.
Det betyder att detta allmänna val mer än någonsin kommer att handla om facklighet kontra nationalism - orange mot grönt.
Det är osannolikt att utsikterna till ett nytt splittrande val kommer att uppmuntra partierna att kompromissa under de politiska samtalen.
Flanagan sade att även om lagstiftningen skulle kunna underlätta bildandet av en verkställande myndighet, var han "medveten om den politiska verkligheten att alla parter som deltar i samtalen nu kommer att konkurrera i ett allmänt val".
"Men det är den irländska regeringens fasta hopp att samtalsprocessen kan fortsätta och avslutas framgångsrikt under de kommande dagarna."
DUP ledare Arlene Foster sade valet var en "möjlighet att rösta på facket" medan partiets vice ledare Nigel Dodds sade att tillkännagivandet var ett "överraskning".
Han sade att valet skulle ha stor inverkan på samtalen: "De kommande sex eller sju veckorna kommer helt och hållet att domineras av frågorna i det allmänna valet.
"Jag tror att det är oundvikligt - när en premiärminister avfyrar startpistolen då blir allt annat underordnat den."
Sinn Féin ledare Gerry Adams twittrade att det var en annan chans att rösta mot Brexit och partiets norra ledare Michelle O'Neill sade att valet skulle vara "en möjlighet för väljarna att motsätta sig Brexit och avvisa Tory nedskärningar och åtstramningar".
SDLP-ledaren Colum Eastwood sade dock att premiärministerns tillkännagivande återspeglade "det förakt hon hyser för Nordirland och försök att återställa maktdelningsregeringen".
"Det säger dig allt du behöver veta om Theresa May att hon skulle kalla en snap Westminster val mitt i intensiva ansträngningar för att återställa maktdelning regeringen här," sade han.
"Från början av sin ämbetstid som brittisk premiärminister har hon visat mycket lite men ointresse och förakt för denna plats."
Han tillade: "Vi har nu en möjlighet att stärka mandatet för partier som kämpar mot och konsekvent röstade emot Brexit i Westminster."
Ulster Unionist ledare Robin Swann sade valet skulle vara "om att stärka Förenade kungarikets hand i kommande Brexit förhandlingar".
"Nordirland behöver en stark representation i Westminster nu mer än någonsin, argumenterar det bästa fallet för Nordirland," tillade han.
Tom Elliott, UUP: s riksdagsledamot för Fermanagh och South Tyrone, berättade för BBC Radio Ulster's Evening Extra att han trodde att valet betydde ett avtal på Stormont var "pretty mycket död i vattnet".
Alliansens partiledare Naomi Long sade att det skulle vara "förrädiskt" om något politiskt parti använde det förestående valet för att dra sig ur samtalsprocessen.
Hon tillade: " Chanserna för en uppgörelse på den här sidan av den 8 juni har nu blivit mer avlägsna. Trots detta har Nordirlands befolkning redan gett MLA en tydlig instruktion om att göra sitt jobb och agera ansvarsfullt för att införa progressiv och hållbar decentralisering."
I 2015 års allmänna val i Nordirland vann DUP åtta platser, Sinn Féin vann fyra, SDLP vann tre, två gick till Ulster Unionists och en oberoende valdes.
Nordirlands sekreterare har sagt att det inte kommer att ske någon förändring i Stormonts samtalsprocess trots tillkännagivandet om ett snabbt allmänt val.