Mannen, i slutet av 40-talet, var inblandad i en bostadstvist med fogdar vid fastigheten på Stapleton Hall Road i Stroud Green.
Poliser kallades till platsen vid middagstid efter att ha fått rapporter om att mannen var beväpnad med ett vapen.
Strax efter det att de hade anlänt inträffade explosionen och lämnade honom med svåra brännskador. Tre poliser fick mindre skador.
Källaren och delar av bottenvåningen och skjulet i den bakre trädgården brann i flera timmar. Inga grannhus skadades.
Orsaken till explosionen är ännu inte känd och inga arresteringar har ägt rum. Met sa att den inte letade efter någon annan i samband med händelsen.
Vittnet Paul Pixton tweetade: "Något massivt händer på min gata, någon form av bråk på gatan följt av högljudd explosion."
En man har blivit allvarligt skadad i en explosion i ett hus i norra London.