Willett, 29, berodde på partner Lee Westwood när 72-hålsturneringen börjar i Melbourne den 24 november.
Men mästaren vill inte riskera att förvärra frågan som såg honom missa Oktobers brittiska mästare.
"Med tanke på allt, inklusive mängden resor inblandade och extra belastning, bestämde jag att det inte var i mitt bästa intresse," Willett sade.
Den fyra-dagars tävlingen skulle ha varit den femte turneringen i följd veckor för Willett, som har hoppat av världen topp 10 för första gången sedan hans Masters seger i april.
Willett är tvåa i loppet till Dubai och är bunden för 54th i näst sista turneringen, Nedbank Golf Challenge, efter en runda på 74 på Sun City.
Vi har lanserat ett nytt BBC Sport nyhetsbrev, med alla de bästa berättelserna, funktioner och video direkt till din inkorg. Du kan anmäla dig här.
Englands Danny Willett har dragit sig tillbaka från VM i Australien för att undvika att förvärra hans ryggproblem.