Kommissionen hade lagt fram planer för en ny tillfällig anläggning nära Glasgows flygplats, som skulle ha ersatt Lanarkshires fångläger.
Men Renfrewshire Council avslog ansökan om planering för den nya anläggningen.
Som ett resultat, Home Office sade att det kommer att behålla Dungavel House för människor som står inför avlägsnande.
Inrikesdepartementet sa att det hade "upphävts" genom rådets beslut att blockera ett nytt holdingcenter.
Det sägs att Glasgows flygplatsplan skulle ha skapat en "modern och säker anläggning" för "de som inte har rätt att vara i Storbritannien".
En talesman sade: " Vi har alltid klargjort att stängningen av flyttcentret för invandring från Dungavel var beroende av öppnandet av en ny tillfällig anläggning i Skottland.
"Eftersom ansökan om en ny anläggning i Paisley avslogs, kommer Dungavel att förbli öppen."
Ersättningen skulle ha använts för att kvarhålla personer med invandringsbefogenheter i upp till sju dagar innan de flyttades till en flygplats för utvisning eller till ett centrum för avlägsnande av invandring.
Inrikesministeriet har sagt att den anser att frihetsberövande och avlägsnande är viktiga delar av effektiva invandringskontroller, men insisterar på att de utförs med värdighet och respekt.
Tjänstemännen säger att när människor hålls fängslade är det så länge som möjligt.
De påpekade den senaste inspektionen av Dungavel av Hennes Majestäts kriminalinspektör fann att centret var en säker plats där fångar får det stöd och den hjälp de behöver.
Lanarkshires fångläger har dragit till sig protester från motståndare som beskrev det som "rasistiskt och omänskligt".
Inrikesministeriet har övergett planerna på att ersätta flyttcentret i Dungavel House.