South Western Ambulance Service sade att den inte visste hur händelsen med mannens tanke att vara i 20 - årsåldern inträffade.
Great Western Air Ambulance flög honom till Queen Elizabeth sjukhus i Birmingham efter ambulansen ringdes vid cirka 17:10 BST.
Wiltshire Air Ambulance hade också kallats efter att mannen drabbats av betydande brännskador på Somerset platsen.
Slutliga förberedelser sker för 2016 års upplaga av festivalen som öppnar sina dörrar för allmänheten på onsdag.
En man har fått svåra brännskador på Glastonbury Festival.