När Alison White talade inför registrets lansering, medgav han att många lobbyister inte skulle stå med på listan.
Men hon sa att hennes jobb var att se till att reglerna genomfördes och hon skulle göra det med "extrema verve och energi."
Men en kritiker av registret sade att det var "falska" och fulla av "hål".
Lobbyister är företag eller individer som får betalt för att påverka regeringens beslut.
Koalitionen lovade att införa ett lagstadgat register över lobbyister när det kom till makten 2010, och lagstiftning antogs förra året, med ministrar som sade att flytten skulle hjälpa till att rensa upp politik.
Det nya registret kommer dock endast att omfatta konsultlobbyister och kommer inte att gälla lobbyister som arbetar internt för företag eller organisationer.
En person eller ett företag behöver bara registreras om de kontaktar en minister eller en ständig sekreterare i en statlig avdelning - vilket leder till kritik det inte kommer att komma i närheten av att återspegla omfattningen eller arten av lobbying som pågår över Whitehall.
Men White, som är oberoende av regeringen, sade att hennes uppgift var att genomföra lagen eftersom det stod klart att inte ifrågasätta de befogenheter hon hade fått.
"Vi har något som aldrig har varit på plats tidigare", berättade hon för BBC Radio 4's Today program.
"Detta är ett lagstadgat register. Industrin säger att det är en professionell bransch. Jag förväntar mig att de följer lagstiftningen. Det är mitt jobb att se till att de gör det."
White, som utsågs till registrator för konsultlobbyister i september, erkände att registret inte skulle ange olika "nivåer av lobbyverksamhet".
– Lagstiftningen utarbetades ganska snävt för att ta itu med en viss fråga, vilket var att det inte alltid var särskilt tydligt när ministrarna lobbades, som lobbyistens klient var. Det är vad registret sattes upp för att göra, sade hon.
Hon tillade: " Detta kommer att ge alla som vill få tillgång till registret möjlighet att se vem som är lobbying och att få betalt för det och vilka deras kunder är. Det är de viktigaste uppgifterna som registret kommer att innehålla.
"Om en lobbyist försöker påverka regeringens politik på något sätt, måste de registreras. Om de inte är registrerade, då skulle de inte vara överensstämmande. De måste gå i kassan innan de lobby."
White sade förra månaden att registret inte skulle ha några poster på sin lanseringsdag, men hon hade fått mer än "20 intresseanmälan" om att gå med och företag och enskilda personer skulle kunna bli tvungna att registrera sig retroaktivt.
Potentiella registranter kommer att kunna logga in och skapa ett konto för att skicka in en "informationsinlämning".
Men Tamasin Cave, från Alliance for Lobbying Transparency Coalition, sade "svårt vem som helst" i branschen skulle omfattas av bestämmelserna i den nya lagen.
"Du har en stor kommersiell lobbyverksamhet, och mycket få av dem kommer att behöva anmäla sig", berättade hon idag.
"Den andra bristen är att det inte kommer att visa interaktionen mellan lobbyister och regering, och det är vad ett register är till för.
"Det är för att visa aktiviteten - vem diskuterar vad med vem, men detta visar ingenting av denna interaktion. Det är ett falskt register."
Kvinnan som ansvarar för regeringens nya register över lobbyister har sagt att hon förväntar sig att industrin "konformerar" med det lagstadgade systemet.