Orienten var skyldig pengar till fyra fordringsägare på petitionen, efter att ha löst obetalda skatter med HM Revenue & Customs.
Ägaren Francesco Becchetti gavs fram till måndagen för att betala av skulder eller sälja den förlegade klubben League Two efter en tidigare domstolsförhandling i mars.
Borgenärerna i ansökan har betalats, även om det är förstått att andra borgenärer finns kvar.
Det finns inget som tyder på hur många andra borgenärer det finns, men de stödde inte likvidationsansökan.
Utanför High Court på måndagen kunde Orient fans höras protestera mot Becchetti, som tog över klubben från Barry Hearn kort efter att de förlorat League One play-off finalen till Rotherham United på Wembley 2014.
Efter uppsägningen av petitionen, Matt Roper från Leyton Orient Fans' Trust (LOFT) uppmanade italienska Becchetti att sälja klubben "brådskande till någon ny ansvarig ägare".
Han sade till BBC Sport: "Vi använder ett ord överleva [efter att petitionen avfärdades] men det är nästan ett ord du inte kan använda. Vår överlevnad är nästan vecka till vecka just nu.
"Vår framtid spelas ut i High Court, vi har en mycket tunn trupp, det finns inga garantier för att vi faktiskt kan sätta ut ett lag nästa år. Så överlevnad, ja, men i ordets allra tunnaste bemärkelse."
Omer Riza, klubbens 11: e manager under Becchetti, kontrakteras endast till den 30 juni och klubben har förlorat det mesta av förra säsongens trupp, vilket lämnar osäkerhet kring klubben på planen också.
Adam Michaelson, juridisk rådgivare åt LOFT, sade: " Vi kan inte säga vad som pågår. Kommunikationen vi har haft är helt noll.
"Allt vi vet är vad vi kan se, som är nio juniorproffs, inga seniorer, ingen tillgång till en träningsplats, inga skjortor, inga träningstoppar, och de ska vara tillbaka i försäsongen i första veckan i juli."
Orienten förvisades till non-legue den här säsongen, deras andra nedflyttning under de tre åren under Becchetti, avslutar deras 112-års vistelse i fotbollsligan.
Efter att klubbens personal inte betalades i mars, Hearn avgick från sin tjänst som hederspresident och den engelska fotbollsligan sade att det var "exceptionellt bekymrad" över klubbens situation.
Vid den förra domstolsförhandlingen den månaden, gav verkställande direktören Alessandro Angelieri domstolen ett uttalande som säger Becchetti, som i januari sade att han skulle vara villig att överväga att sälja klubben, skulle investera 1 miljon pund för att betala av återstående skulder i åtta till 10 veckor.
Orient meddelade i april att de hade betalat alla löner och löst sina skulder med HRMC.
En likvidationsansökan mot Leyton Orient har avskrivits vid en domstolförhandling i London.