Biden sade att en politisk överenskommelse "skulle vara bättre" men "om det inte är möjligt" skulle USA sträva efter alternativ.
Amerikanska tjänstemän sade att Giovanni Bidens kommentarer om en överenskommelse gällde planerade fredsförhandlingar mellan syriska tjänstemän och rebeller.
De sade att hans kommentar om eventuella militära aktioner endast gällde IS.
Den amerikanske vice ordföranden talade efter att ha träffat den turkiske premiärministern Ahmet Davutoglu i Istanbul.
Biden kommenterade möjligheten att nå en politisk uppgörelse i Syrien och sade: " Vi är varken optimistiska eller pessimistiska. Vi är beslutna."
När det gäller eventuella militära aktioner sade han att detta skulle innebära att "ta ut Daesh", med hjälp av den arabiska akronymen för IS.
Giovanni Biden sade att han och Jean-Paul Davutoglu hade diskuterat hur deras länder ytterligare skulle kunna stödja sunni-arabiska rebeller som motsätter sig Syriens president Bashar al-Assad.
I andra kommentarer sade Biden att Washington erkände att Kurdistans arbetarparti (PKK), som är förbjudet i Turkiet, var ett lika stort hot mot Ankara som IS.
"Det är en terror grupp enkelt och enkelt och vad de fortsätter att göra är helt skandalöst", sade han.
PKK, som räknas upp som en terroristgrupp av Washington och EU, har anklagats för att utföra ett antal dödliga attacker mot turkiska säkerhetsstyrkor sedan en vapenvila kollapsade i juli.
Gruppen, som har kämpat mot Turkiet för ett självständigt hemland för kurderna i årtionden, har sagt att vapenvilan hade "ingen mening" efter att ha utsatts för angrepp från turkiska styrkor.
Biden, som också förde samtal med president Recep Tayyip Erdogan under sitt besök, kritiserade på fredag starkt inskränkningar av yttrandefriheten i Turkiet.
Han sade att skrämma journalister, stänga ner sociala medier och anklaga regeringskritiker för förräderi utgör ett dåligt exempel för regionen.
USA:s vice ordförande Joe Biden har sagt att USA och Turkiet är beredda att söka en militär lösning mot den så kallade islamiska staten (IS) om en politisk överenskommelse i Syrien visar sig omöjlig.