National Institute for Health and Care Excellence säger att kvinnliga patienter bör ha fri tillgång till läkemedlet, mer känt som en anti-rynklig hjälp.
Omkring fem miljoner kvinnor i England och Wales har urininkontinens, men många lider i tystnad eftersom de är för generade för att söka hjälp.
Botox hjälper till att kontrollera den muskulära blåsväggen.
NICE säger att de med "överaktiv blåsa syndrom" som inte har svarat på rekommenderade livsstilsförändringar bör erbjudas injektionerna.
Det är inte klart vad som orsakar det, men de som påverkas av en överaktiv blåsa har en frekvent lust att urinera och kan uppleva läckage innan de kan göra det till toaletten.
Att skära ner på kaffedrycker som te och kaffe, liksom alkohol, göra bäckengolv övningar och göra schemalagda resor till toaletten kan hjälpa, men vissa människor kommer att behöva medicinsk behandling eller kirurgi.
Villkoret skiljer sig från stress inkontinens - när bäckenbotten muskler är för svaga, som kan uppstå efter förlossningen, orsakar läckor med hosta och skratt.
Med en överaktiv blåsa, det finns ett problem med hur blåsan svarar på att bli fylligare, vilket innebär att personen känner att de akut behöver urinera oftare än de flesta.
Någon med detta tillstånd kan sluta gå upp på toaletten upp till 15 gånger om dagen och tre gånger om natten, till exempel, när normen är att gå fyra till åtta gånger om dagen och upp till en gång om natten.
Det påverkar båda könen, men oftast kvinnor. NICE:s riktlinjer, som täcker England och Wales, diskuterar bara behandling av kvinnor.
Botox behandling tros hjälpa dämpa kemiska meddelanden som urinblåsan använder för att tala om för hjärnan att du behöver urinera.
Injektionerna administreras direkt till blåsväggen via en liten enhet som sätts in i urinröret - det rör du kissar igenom.
Kliniska prövningar tyder på att denna behandling kan pågå i upp till sex månader, men NICE säger att människor också måste vara medvetna om eventuella biverkningar.
Behandlingen kan göra det svårare att urinera och vissa människor kan finna att de behöver använda en kateter under en tid. Det finns också en chans att få en urininfektion.
Alla som börjar med denna behandling bör få en personlig kontroll eller granskas över telefonen inom fyra veckor, säger NICE.
Prof Mark Baker, chef för Centre for Clinical Practice vid NICE, sade: " Urininkontinens är ett smärtsamt tillstånd som påverkar livet för miljontals kvinnor i alla åldrar.
"Även om det sällan är livshotande, kan det allvarligt påverka en kvinnas fysiska, psykiska och sociala välbefinnande.
"Under årens lopp har vi sett en ökning av kvinnor som söker behandling, men många andra lider fortfarande i tystnad och inte får lämplig vård för sitt tillstånd.
"Denna uppdaterade kliniska riktlinje föreslår en rad behandlingar som kvinnor bör kunna få tillgång till för att begränsa den stress som urininkontinens kan orsaka."
Botox injektioner kan nu erbjudas som en behandling för urininkontinens, säger Englands NHS droger vakthund.