Sändaren marknadsför fortfarande trailers, klipp och intervjuer på webbplatsen men användare som försöker komma åt shower möts istället med ett uttalande.
"Som ett icke-vinstdrivande programföretag finansierat av reklam, lägger vi våra pengar tillbaka i programmen själva", lyder det.
Den säger att den riktar tittarna till sina 4oD-upphämtningstjänster istället.
Uttalandet tillägger: "För att göra det bästa av denna investering, har vi beslutat att fokusera på att ta online-tittare av våra fullängdsshower till våra egna 4oD-appar - såsom de på iOS, Android och kanal4.com.
"Dessa appar gör också att vi kan uppmuntra fler tittare genom att rekommendera program som vi tror att människor kommer att uppskatta och ge tittarna ytterligare tjänster."
Program på 4oD är fortfarande tillgängliga på en rad olika plattformar, inklusive Sky, Virgin Media och Freesat, på konsoler som Sonys PS3 och Microsofts Xbox One och på appar för Windows 8, Windows Phone, iOS och Android-enheter.
TV-märket säger att det fortfarande kommer att finnas kvar på YouTube, med ett pressmeddelande som avslöjar några av sina planer.
"Om vi reflekterar över hur våra tittare konsumerar innehåll från Channel 4 över digitala och mobila plattformar, kommer vår relation med YouTube nu att fokusera på kortformigt innehåll", säger den.
Flytten avslutar den tidigare affären Channel 4 hade med online streaming-tjänsten, där dess 4oD catch-up-tjänst var tillgänglig på YouTubes brittiska webbplats.
År 2009, när partnerskapet tillkännagavs, sades det i ett gemensamt uttalande att det var "första gången ett programföretag någonstans i världen har gjort en omfattande upphämtningsplan tillgänglig".
Populär Channel 4 serien inklusive Peep Show, Skins och Misfits hade varit tillgängliga för att se gratis, liksom andra program från sina systerstationer, inklusive E4.
Enligt affären tog varje företag en del av intäkterna från all reklam som såldes runt programmen.
YouTube, som köptes av Google 2006, är den största video-streaming webbplatsen i världen.
Andra brittiska programföretag, inklusive BBC och ITV, gör för närvarande klipp tillgängliga på videodelningswebbplatsen.
Channel 4 var det första brittiska programföretaget som lanserade en video on demand-tjänst i slutet av 2006 och var också det första som sålde reklam om TV-innehåll på nätet.
Följ @BBCNewsbeat på Twitter
Channel 4 har tagit bort alla sina fullängdsprogram från video-streaming webbplatsen YouTube.