Han sade till den konservativa konferensen att underskottet fortfarande var för stort och att man måste ta itu med detta "i sinom tid".
Men han sa att Brexit-rösten kan orsaka "turbulens" och affärsförtroendet skulle ligga på en "bit av en berg-och-dalbana".
Han sade att det är "det sunda förnuftet" att investera för att stödja tillväxt och sysselsättning.
I sitt anförande sade Hammond att hans företrädares politik för att minska underskottet "var den rätta för den tiden", men att tiden hade förändrats sedan omröstningen om att lämna EU, vilket han sade hade orsakat osäkerhet för näringslivet.
"När tiderna förändras måste vi förändras med dem", sade han. "Så vi kommer inte längre att sikta på ett överskott i slutet av detta parlament. Men gör inga misstag, uppgiften att konsolidera de offentliga finanserna måste fortsätta.
"Det brittiska folket valde oss på ett löfte om att återställa budgetdisciplinen. Och det är precis vad vi ska göra. Men vi kommer att göra det på ett pragmatiskt sätt som återspeglar de nya omständigheter vi står inför."
Hans tal kom mot en bakgrund av att pundet föll till sin lägsta nivå mot dollarn sedan början av juli, efter att tidsplanen för att inleda Brexit förhandlingar fastställdes på söndag.
När han talade till det trogna partiet sade han att som en del av en ny "flexibel och pragmatisk" plan, vars detaljer kommer att konkretiseras i nästa månads höstdeklaration, skulle det finnas större utrymme för investeringar för att öka ekonomin, inklusive extra lån på 2 miljarder pund för att påskynda byggandet av nya bostäder.
Hammond sade att regeringen skulle använda "alla verktyg som står till dess förfogande" för att öka antalet nya bostäder "eftersom en mer överkomlig bostad kommer att vara en viktig del av byggandet av ett land som fungerar för alla".
Analys av Laura Kuenssberg, politisk redaktör för BBC
Ute med underskottshökarna - in med de konservativa pragmatisterna.
Det kanske inte, tja, riktigt fånga på. Men det finns verkligen en känsla av att vara nere med den gamla regimen vid Torykonferensen i dag. Philip Hammond är inte bara en helt annan karaktär än den tidigare personen på jobbet, George Osborne, men han är inställd på att skrota en hel del av Mr Osbornes strategi också.
Hans mål för att bli av med underskottet dumpas. Låt oss inse det, George Osborne missade dem om och om igen i vilket fall som helst, men det är politiskt ett stort skifte för Hammond och fru May att riva upp de tidigare lånereglerna, när balansen mellan böckerna var regeringens centrala uppgift som de alla var en del av.
I stället kommer det att finnas en ny "ram" men källor nära Hammond anser att det är en dåres ärende att sätta upp specifika mål. Men med tanke på att Osbornes mål var ytterst osannolikt att uppnås är den politiska förändringen kanske större än vad den innebär i praktiken.
Hammond frågade om den offentliga investeringsplanen och vägran att fastställa en tidsplan för att eliminera underskottet markerade slutet på "åtstramningens ålder", och han sade till BBC att det fortfarande krävdes en "trovärdig plan" för att få de offentliga finanserna i svart.
Men han sade till Radio 4's Today: "När vi går in i en period där det oundvikligen kommer att finnas mer osäkerhet i ekonomin, behöver vi utrymmet för att kunna stödja ekonomin genom den perioden.
"Om vi inte gör något, om vi inte ingriper för att motverka den effekten, så kommer det med tiden att påverka jobb och tillväxt."
Filip Hammond avvisade påståendena om att det nu var liten skillnad mellan de konservativa och Labour på den ekonomiska politiken och sade att hans planer var "pragmatiska och mätta" medan oppositionen - som har lovat att låna 500 miljarder pund på Förenade kungarikets infrastruktur - bodde i "la-la mark".
Men Tory MP Sir Desmond Swayne, en minister under David Cameron, berättade för BBC att han var "nervous" om flytten som han ansåg att regeringens mål bör vara att utrota underskottet helt.
"Jag är orolig men jag är redo att lyssna och jag har stort förtroende för Philip Hammond", berättade han för Radio 4: s PM-program.
Labour sade att det välkomnade regeringens "u-turn" i fråga om lån, men sade att ministrarna fortfarande gick vidare med nedskärningar av förmåner för anställda och lokala myndigheter.
"Förutom att överge sin egen skattestadga, var detta fullt av samma tomma löften George Osborne gjorde," sade skuggkansler John McDonnell.
SNP sade att regeringen var "otroligt självbelåten" över svag inhemsk produktivitet medan Lib Dems sade att Hammond redan "förlorat den viktigaste kampen" om fortsatt medlemskap i EU:s inre marknad.
I företagens reaktion, CBI sade att det var rätt att anta en mer flexibel strategi för skattepolitik "på denna punkt" medan de brittiska handelskamrarna efterlyste "oambitiösa åtaganden för start- och landningsbanor, vägar och järnvägar".
Ekonomin står i centrum den andra dagen av Torykonferensen med Hammond, som också lovar 220 miljoner pund för att hjälpa teknikföretagen att förverkliga sina idéer i Förenade kungariket och garantera företag som säkrar finansiering från EU under flera år fram till Storbritanniens utträde att Förenade kungariket kommer att fylla luckan efter Brexit.
Tidigare i måndags lade generalsekreterare Sajid Javid fram nya åtgärder som syftar till att bygga en miljon nya bostäder till 2020, och sade att de befintliga husbyggnadsnivåerna var helt otillräckliga.
Regeringen kommer att låna 2 miljarder pund för att stödja systemet "Accelerated Construction", som syftar till att få hus byggda på offentligt ägda "brownfield" mark tillgängliga för snabb utveckling. Det kommer också att finnas en fond för bostadsbyggande på 3 miljarder pund för att tillhandahålla lån för att stimulera projekt.
May har sagt att hon kommer att sätta bollen på Brexit i slutet av nästa mars genom att formellt utlösa artikel 50 i Lissabonfördraget, vilket banar väg för Storbritannien att vara utanför EU sommaren 2019.
I ett uttalande i måndags sade Europeiska kommissionen att den skulle "arbeta konstruktivt" med Förenade kungariket när förhandlingarna om dess tillbakadragande inleddes, men att det inte skulle bli några samtal förrän den formella processen inleddes.
"När det gäller artikel 50 kommer vi att arbeta konstruktivt på grundval av en anmälan, inte av ett tal, och tills detta meddelande anländer kommer det inte att bli någon förhandling", sade en talesman.
Kansler Philip Hammond har sagt att han kommer att prioritera utgifterna för nya hem och transporter snarare än att följa sin föregångare George Osbornes mål att balansera böckerna till 2020.