Resolutionen är den första som antogs av säkerhetsrådet för att ta itu med sexuella övergrepp mot fredsbevarare.
Det passerades av 14 av 15-medlems kropp, med Egypten avstod från att rösta.
Förra året framfördes 69 anklagelser om våldtäkt mot barn och andra sexuella brott av fredsbevarare från tio uppdrag. Antalet steg från 52 år 2014.
Påståendena gäller militär personal, internationell polis, annan personal och frivilliga.
Enligt FN:s regler är det upp till landet att hjälpa fredsbevararna att utreda och åtala alla soldater som anklagas för tjänstefel under FN:s flagg.
Men organisationen har kritiserats för att ha underlåtit att agera snabbt mot anklagelser om sexuella övergrepp mot fredsbevarare.
FN:s säkerhetsråds resolution, som utarbetats av USA, den största finansiären av FN:s fredsbevarande uppdrag, stöder ett beslut nyligen av FN:s generalsekreterare Ban Ki-moon om att sända tillbaka militära eller polisiära enheter där det finns trovärdiga bevis för sexuella övergrepp.
I resolutionen uppmanas också FN att ersätta kontingenter där anklagelserna inte undersöks ordentligt.
Egypten lade fram ett ändringsförslag i sista minuten som skulle ha lagt till kriterier för repatriering av hela kontingenter, ett drag USA: s ambassadör Samantha Power sade skulle ha "vattna ner" resolutionen.
Ändringsförslaget stöddes av Angola, Ryssland, Kina, Egypten, Venezuela men saknade de nio röster som krävdes för att godkännas.
Vissa länder har uttryckt oro över att soldater som är oskyldiga till varje orätt handling kan bli offer för kollektivt straff.
I augusti förra året fick FN:s sändebud i Centralafrikanska republiken (CAR), Babacar Gaye, sparken bland flera anklagelser om sexuella övergrepp från fredsbevarare.
Det kom efter Amnesty International hävdade att en 12-årig flicka våldtogs av en FN-fredsbevarare.
Den 10 000 starka FN-styrkan, som utplacerades 2014 för att hjälpa till att återställa ordningen i Centralafrikanska republiken, har också utsatts för anklagelser om sexuellt utnyttjande av gatubarn.
I december förra året kallade en oberoende panel FN:s svar på anklagelserna i Centralafrikanska republiken "allvarligt bristfälliga" och ett "bruttoinstitutionellt misslyckande".
Det anklagade högre FN-tjänstemän för att ha missbrukat sin auktoritet genom att inte vidta åtgärder mot anklagelser om övergrepp från soldater från Frankrike, Ekvatorialguinea och Tchad.
FN:s säkerhetsråd har antagit en resolution där man kräver repatriering av fredsbevarande enheter vars soldater anklagas för sexuella övergrepp.