Ett signalsystem på Diss har skadats, vilket lett till att Stora Anglia-tjänsterna mellan Norwich och London har ställts in.
Tjänster från Norwich till Cambridge och Norwich till Sheringham har också blivit avstängda eller försenade.
Järnvägsföretaget ger passagerarna råd om alternativa resealternativ och om dess återbetalningspolicy för förseningar.
Större Anglia sade avbrott på Norwich till London Liverpool Street linje förväntas fram till 21:00 BST.
Det sade tjänster är oförmögna att avgå från Norwich mot Diss och Ipswich och från Diss mot Norwich medan Network Rail ingenjörer undersöka linjen.
Det finns för närvarande inga ersättningsbussar tillgängliga att köra mellan Norwich och Diss, sade det.
Större Anglia har bett om ursäkt för eventuella olägenheter.
Alla linjer var block på Norwich till Cambridge linjen efter blixtnedslag mellan Attleborough och Ely.
Störning förväntas fram till dagens slut.
Större Anglia sade Network Rail personal är på plats och reparerar signalsystemet men det finns för närvarande ingen uppskattning för linjen återöppnande
East Midlands tågtrafik mellan Norwich och Liverpool Lime St påverkas också.
Blixtnedslag på järnvägsrutter genom östra Anglia har utlöst resekaos.