Den 66-åriga republikanen från County Louth förnekar nio skattefusk.
Åklagarsidans fall är att han hade betydande affärer i förhållande till boskap och mark och fick jordbruksbidrag, men misslyckades med att göra skattedeklarationer.
En domstol i Dublin hörde en tredje dag av avslutande inlagor på tisdagen.
Murphys försvarsadvokat sa till den särskilda brottmålsdomstolen att "rättvis analys" av bevisen skulle leda till slutsatsen att det var den anklagades bror Patrick Murphy, som drev jordbruksverksamheten och kontrollerade ekonomin.
"Jag föreslår att den person som ansvarar för detta jordbruksföretag var Patrick Murphy; att profitören var Patrick Murphy; att den utkrävbara personen var Patrick Murphy," advokaten sade.
"Jag menar inte att Thomas Murphy inte handlade om gården. Men det finns en stor skillnad mellan att växa upp i en jordbruksmiljö och att vara på den plats där man gör bitar och bobs och att vara den utkrävbara personen, att vara den verkliga jordbrukaren som bestämmer."
De tre domarna i rättegången mot icke-juryn fick veta att fallet har byggts på hörsägen bevis och att viktiga finansiella dokument som hittades i Patrick Murphys hus hade faktiskt "begravts" eftersom de "inte passade".
"När du skrapar under ytan den rimliga tvivel lurar strax under ytan, och det gör Patrick Murphy", sa försvarsadvokaten.
Det hävdades också att staten försökte "galvanisera" förslaget Thomas Murphy fick en jordbruksinkomst.
"Det är helt enkelt inte där", sade advokaten.
Att inkludera "affärsritningar" för föremål som mat, presenter, titta på reparationer, stövlar och biljetter till Paris bör också sätta tvivel i domarnas sinnen, sade advokaten.
"Det är höjden av åtalet. Det nådde det stadiet att det var fullständigt löjeväckande", tillade han.
Påståenden om att Murphy i Ballybinaby, Hackballscross, hade tillgång till stora kontantkällor avslogs också.
Rättegången fortsätter.
Fallet mot Thomas "Slab" Murphy är baserat på "lite skrattretande" dokumentation som försöker koppla honom till en icke-existerande jordbruksinkomst, har hans försvarsadvokat sagt.