Den offentliga åklagarmyndigheten (PPS) sade att Wells inte skulle åtalas i samband med incidenten den 23 april i Downpatrick.
Wells välkomnade beslutet som "ett viktigt steg framåt".
I ett uttalande sade PPS att det beslutades att ärendet inte uppfyllde åtalsprövningen.
"Efter en noggrann genomgång av alla tillgängliga bevis som lämnats till PPS av PSNI, har det beslutats att fallet inte uppfyller testet för åtal," PPS uttalande sade.
"Potentiella brott bedömdes enligt kungörelsen om allmän ordning (NI) 1987, särskilt ett brott enligt artikel 9 (uppvigling av hat).
"Innehållet i de bevis som undersökts av åklagare var ett 30-sekunders videoklipp som spreds i stor utsträckning på sociala medier efter att händelsen arrangerades i Downpatrick.
"Polisen gav också en längre utskrift av en inspelning av hela mannens kommentarer.
"När man undersökte tillgängliga bevis för den rapporterade händelsen, särskilt hela utskriften av mannens kommentarer, drogs slutsatsen att det inte fanns tillräckliga bevis för att bevisa att något brott begåtts."
I ett uttalande sade Wells att han hade blivit "bevisad" av beslutet.
"Denna fråga har hängt över mig under en tid och så jag är uppenbarligen glad att få luften rensad", sade han.
"Det greps av motståndare till mig och mitt parti och användes mot oss på ett helt orimligt sätt.
"Det finns många aspekter av denna händelse, och den efterföljande kampanjen, som fortsätter att ge upphov till betydande oro och som förtjänar ytterligare utredning."
DUP MLA Jim Wells kommer inte att åtalas för kommentarer om homoäktenskap under en husting händelse för Westminster valet.