Mer än 2.000 grisar skulle födas upp på gården på Moys Road och flytgödsel skulle spridas på närbelägna marker.
Tusentals människor har invänt mot att det skulle påverka deras hälsa och miljön.
I en miljöredovisning sades det dock att omfattningen av den föreslagna utvecklingen inte skulle ha någon "negativ inverkan" på någondera.
BBC har försökt kontakta bonden bakom planerna, Thomas Simpson, men har ännu inte fått något svar.
Causeway Coast och Glens Council bekräftade att det har fått mer än 3.000 invändningar.
"Över 3.000 invändningar, fem framställningar med totalt nästan 14.000 underskrifter och två stödbrev har mottagits", sade en talesman för rådet.
"När alla samråd har återsänts kommer ansökan att behandlas ytterligare – med beaktande av alla materiella planeringsfrågor som tagits upp genom skrivelser och framställningar om representation."
Tusentals invändare har också undertecknat en petition online där man hävdar att den föreslagna gården skulle orsaka föroreningar och buller och påverka trafiken och floderna.
I februari skrev folkhälsobyrån och Nordirlands miljöbyrå till rådets planeringsavdelning och uttryckte sin oro.
"Vårt främsta bekymmer är fortfarande potentialen för bioaerosolutsläpp från grisuppfödning och tillhörande anaerob kokningsanläggning", säger Gerry Waldron från PHA.
Ett antal andra myndigheter - inklusive NIEA, Shared Environment Services och Transport NI - hade också problem.
Förra månaden kom dock en miljöredovisning från ett oberoende företag fram till att omfattningen av den föreslagna utvecklingen skulle ha "ingen negativ inverkan" på människors hälsa eller miljön.
I rapporten uppgavs också att 500 fler svin skulle ingå i planerna, vilket innebär att den totala siffran skulle uppgå till mer än 2.700.
Den konstaterade också att det inte längre skulle behövas ett anaerobt smältverk och att flytgödsel skulle spridas på lokala områden.
Rådet har sagt att det fortfarande överväger ansökan.
Dussintals invånare i Limavady deltog i ett möte på onsdag kväll för att diskutera deras oro.
Marcus Moore, ordförande för Roediany Limited, sade: " Detta är en katastrof som väntar på att hända. Jag tycker inte att förstörelsen av miljön är värd sex jobb."
Tidigare justitieminister och oberoende MLA Claire Sugden sade att ytterligare förtydligande var nödvändigt.
"Vi måste vara säkra på att det inte kommer att ha en skadlig inverkan på miljön", sade hon.
DUP:s Adrian McQuillan sade dock att förslaget skulle vara bra för den lokala ekonomin och skapa många arbetstillfällen i området.
Ulster Farmers' Union sade att det inte diskuterade eller kommenterade utveckling eller föreslagna utvidgningsplaner för någon jordbruksföretag.
Kampanjer som motsätter sig planer för en kontroversiell grisfarm utanför Limavady har mötts för att uttrycka sin oro.