Reference number : GC-2017-Q1-03228, amendment number : , agreement type : G, recipient legal name : Labrie, Steve (Université Laval), recipient country : CA, recipient province : nan, recipient city : Quebec|Québec, recipient postal code : nan, program name english : Discovery Grants Program - Individual, program name french : Programme de subventions à la découverte - individuelles, program purpose english : Plus de 1 050 vari&eacute;t&eacute;s de fromages de fabrication artisanale et industrielle sont produites au Canada. Les fromages de sp&eacute;cialit&eacute; ont atteint une production record au pays en 2014 avec 155 175 tonnes m&eacute;triques fabriqu&eacute;es, soit une augmentation de production de 56,9% en 10 ans. Les probl&egrave;mes de fabrication, d&eacute;j&agrave; nombreux pour les fromages de sp&eacute;cialit&eacute;, sont d&eacute;cupl&eacute;s par ces augmentations des volumes de production. Il est g&eacute;n&eacute;ralement reconnu dans l&rsquo;industrie fromag&egrave;re que, selon la vari&eacute;t&eacute; de fromage, entre 2 et 15% de la production est affect&eacute;e par un probl&egrave;me de qualit&eacute;, ce qui occasionne des pertes &eacute;conomiques importantes. 
La levure Geotrichum candidum ( Gc ) est primordiale dans la confection de nombreux fromages affin&eacute;s en surface par son r&ocirc;le de pionnier de la microflore. Pour cette raison, la majorit&eacute; des fromages de sp&eacute;cialit&eacute; canadiens, tels que les fromages &agrave; croute fleurie (croute duveteuse blanche) et les fromages &agrave; croute lav&eacute;e (croute s&egrave;che beige &agrave; brune), sont ensemenc&eacute;s avec des cultures de Gc minutieusement s&eacute;lectionn&eacute;es. Quoique certaines activit&eacute;s biochimiques soient d&eacute;montr&eacute;es, on ne connait que tr&egrave;s peu d'activit&eacute;s aromatisantes et fonctionnelles de Gc , ainsi que les d&eacute;terminants g&eacute;n&eacute;tiques n&eacute;cessaires pour leur expression. Finalement, aucun outil g&eacute;n&eacute;tique (vecteurs, g&egrave;nes de s&eacute;lection...), et aucun protocole de modification g&eacute;n&eacute;tique chez Gc n'a &eacute;t&eacute; publi&eacute; &agrave; ce jour, ce qui laisse peu d&rsquo;options d&rsquo;&eacute;tude in vivo des g&egrave;nes et des voies m&eacute;taboliques identifi&eacute;es. 
Les objectifs g&eacute;n&eacute;raux de la pr&eacute;sente programmation sont, &agrave; long terme , la compr&eacute;hension de l'&eacute;cosyst&egrave;me des fromages affin&eacute;s en surface, des interactions entre les microorganismes et de la compl&eacute;mentarit&eacute; de leurs activit&eacute;s m&eacute;taboliques. Les objectifs &agrave; court et moyen terme de cette programmation sont [1] l&rsquo;&eacute;tude des voies m&eacute;taboliques et l'identification des g&egrave;nes-cl&eacute;s par le s&eacute;quen&ccedil;age de 15 g&eacute;nomes de Gc , [2] &eacute;tablir les diff&eacute;rences d&rsquo;expression g&eacute;niques par RNA-seq entre les souches de Gc de groupes phylog&eacute;niques diff&eacute;rents sur matrice fromag&egrave;re, incluant des conditions de r&eacute;duction de sodium, et [3] la g&eacute;n&eacute;ration de vecteurs et de m&eacute;thodes d'inactivation pour g&eacute;n&eacute;rer des mutants et inactiver des g&egrave;nes chez Gc pour ainsi aider &agrave; la compr&eacute;hension de leurs fonctions. 
Cette programmation servira &agrave; supporter le seul laboratoire universitaire canadien s'int&eacute;ressant aux levures laiti&egrave;res. Les connaissances fondamentales sur les levures laiti&egrave;res &eacute;tant rares, toutes les informations g&eacute;n&eacute;r&eacute;es se r&eacute;v&egrave;lent &ecirc;tre originales et utiles. D'un point de vue fondamental, l'&eacute;tude de Gc permettra de comprendre l'architecture g&eacute;n&eacute;tique de ces levures qui montrent des d&eacute;fis de caract&eacute;risation phylog&eacute;n&eacute;tiques et fonctionnels importants., program purpose french : Plus de 1 050 vari&eacute;t&eacute;s de fromages de fabrication artisanale et industrielle sont produites au Canada. Les fromages de sp&eacute;cialit&eacute; ont atteint une production record au pays en 2014 avec 155 175 tonnes m&eacute;triques fabriqu&eacute;es, soit une augmentation de production de 56,9% en 10 ans. Les probl&egrave;mes de fabrication, d&eacute;j&agrave; nombreux pour les fromages de sp&eacute;cialit&eacute;, sont d&eacute;cupl&eacute;s par ces augmentations des volumes de production. Il est g&eacute;n&eacute;ralement reconnu dans l&rsquo;industrie fromag&egrave;re que, selon la vari&eacute;t&eacute; de fromage, entre 2 et 15% de la production est affect&eacute;e par un probl&egrave;me de qualit&eacute;, ce qui occasionne des pertes &eacute;conomiques importantes. 
La levure Geotrichum candidum ( Gc ) est primordiale dans la confection de nombreux fromages affin&eacute;s en surface par son r&ocirc;le de pionnier de la microflore. Pour cette raison, la majorit&eacute; des fromages de sp&eacute;cialit&eacute; canadiens, tels que les fromages &agrave; croute fleurie (croute duveteuse blanche) et les fromages &agrave; croute lav&eacute;e (croute s&egrave;che beige &agrave; brune), sont ensemenc&eacute;s avec des cultures de Gc minutieusement s&eacute;lectionn&eacute;es. Quoique certaines activit&eacute;s biochimiques soient d&eacute;montr&eacute;es, on ne connait que tr&egrave;s peu d'activit&eacute;s aromatisantes et fonctionnelles de Gc , ainsi que les d&eacute;terminants g&eacute;n&eacute;tiques n&eacute;cessaires pour leur expression. Finalement, aucun outil g&eacute;n&eacute;tique (vecteurs, g&egrave;nes de s&eacute;lection...), et aucun protocole de modification g&eacute;n&eacute;tique chez Gc n'a &eacute;t&eacute; publi&eacute; &agrave; ce jour, ce qui laisse peu d&rsquo;options d&rsquo;&eacute;tude in vivo des g&egrave;nes et des voies m&eacute;taboliques identifi&eacute;es. 
Les objectifs g&eacute;n&eacute;raux de la pr&eacute;sente programmation sont, &agrave; long terme , la compr&eacute;hension de l'&eacute;cosyst&egrave;me des fromages affin&eacute;s en surface, des interactions entre les microorganismes et de la compl&eacute;mentarit&eacute; de leurs activit&eacute;s m&eacute;taboliques. Les objectifs &agrave; court et moyen terme de cette programmation sont [1] l&rsquo;&eacute;tude des voies m&eacute;taboliques et l'identification des g&egrave;nes-cl&eacute;s par le s&eacute;quen&ccedil;age de 15 g&eacute;nomes de Gc , [2] &eacute;tablir les diff&eacute;rences d&rsquo;expression g&eacute;niques par RNA-seq entre les souches de Gc de groupes phylog&eacute;niques diff&eacute;rents sur matrice fromag&egrave;re, incluant des conditions de r&eacute;duction de sodium, et [3] la g&eacute;n&eacute;ration de vecteurs et de m&eacute;thodes d'inactivation pour g&eacute;n&eacute;rer des mutants et inactiver des g&egrave;nes chez Gc pour ainsi aider &agrave; la compr&eacute;hension de leurs fonctions. 
Cette programmation servira &agrave; supporter le seul laboratoire universitaire canadien s'int&eacute;ressant aux levures laiti&egrave;res. Les connaissances fondamentales sur les levures laiti&egrave;res &eacute;tant rares, toutes les informations g&eacute;n&eacute;r&eacute;es se r&eacute;v&egrave;lent &ecirc;tre originales et utiles. D'un point de vue fondamental, l'&eacute;tude de Gc permettra de comprendre l'architecture g&eacute;n&eacute;tique de ces levures qui montrent des d&eacute;fis de caract&eacute;risation phylog&eacute;n&eacute;tiques et fonctionnels importants., agreement title english : Étude de la diversité intraspécifique de Geotrichum candidum et de son rôle dans la typicité des fromages canadiens, agreement title french : Étude de la diversité intraspécifique de Geotrichum candidum et de son rôle dans la typicité des fromages canadiens, agreement number : RGPIN, agreement value : 125000.0, agreement start date : 2017-05-10, agreement end date : nan, description english : nan, description french : nan, expected results english : nan, expected results french : nan, additional information english : Grant or Award spanning more than one fiscal year. (2017-2018 to 2022-2023), additional information french : Subvention ou bourse octroyée s'appliquant à plus d'un exercice financier. (2017-2018 à 2022-2023), owner organization : nserc-crsng, owner organization title : Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada | Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada