Reference number : 032-2020-2021-Q3-00035, amendment number : , agreement type : C, recipient legal name : Cytognomix Inc., recipient country : CA, recipient province : ON, recipient city : London|Londres, recipient postal code : N5X3X5, program name english : Innovation for Defence Excellence and and Security, program name french : Innovation pour la defense, l'exellence et la securite, program purpose english : nan, program purpose french : nan, agreement title english : nan, agreement title french : nan, agreement number : CPCA-0295, agreement value : 102763.0, agreement start date : 2020-11-27, agreement end date : 2021-06-01, description english : This project aims to find emerging sites of COVID19 clusters as early as possible to prevent further spread of these infections to uninfected persons. CYTOGNOMIX INC proposes a proactive approach to identify these locations using geostatistics to hone in on the most likely future hot-spots. Pinpointing these locations after community transmission would help with contact tracing of both symptomatic and asymptomatic infected persons. Early identification of hot-spots will allow self-isolation and more timely treatment of severe cases.  CytoGnomix Inc. propose to apply geostatistical dosimetry methods that it has recently pioneered to assist governments to identify potential resurgence of infected individuals in the community in the current pandemic. These methods have been established as providing statistically valid analyses of spatiotemporal data for a wide spectrum of dynamic measurements for environmental, natural resource extraction, and health trends.   
 
CytoGnomix Inc have previously shown that these approaches can produce accurate maps of radiation exposed individuals after limited, strategic sampling of potentially exposed populations in the United States (Rogan PK et al. PLoS ONE 15(4): e0232008, 2020).  This project will assess the utility of geostatistical techniques to identify geographic locations with asymmetric distributions and clusters of COVID-19 cases. It will implement a novel method to pinpoint emerging hot spots of new community transmission through changes in interpolated case counts over time.   
 
CytoGnomix Inc is partnering with the Ontario Institute of Evaluative and Clinical Sciences (IC/ES) to obtain access to the geographic COVID-19 daily incidence data and geostatistics software licenses. The Ontario Ministry of Health and Long Term Care (MOHLTC) has agreed to be a knowledge user for this project. Using publicly available, county-level US count data, CytoGnomix Inc have already demonstrated to IC/ES and MOHLTC the feasibility of applying custom program scripts to automate these tasks., description french : Ce projet vise à trouver des sites émergents de grappes COVID19 le plus tôt possible pour empêcher la propagation de ces infections aux personnes non infectées. CYTOGNOMIX INC propose une approche proactive pour identifier ces emplacements en utilisant la géostatistique pour se concentrer sur les futurs points chauds les plus probables. Le repérage de ces emplacements après la transmission communautaire aiderait à rechercher les contacts des personnes infectées symptomatiques et asymptomatiques. L'identification précoce des points chauds permettra l'auto-isolement et un traitement plus rapide des cas graves. CytoGnomix Inc. propose d'appliquer les méthodes de dosimétrie géostatistique qu'elle a récemment mises au point pour aider les gouvernements à identifier la résurgence potentielle d'individus infectés dans la communauté dans la pandémie actuelle. Ces méthodes ont été établies comme fournissant des analyses statistiquement valides de données spatio-temporelles pour un large éventail de mesures dynamiques pour l'environnement, l'extraction des ressources naturelles et les tendances sanitaires.
 
CytoGnomix Inc a précédemment montré que ces approches peuvent produire des cartes précises des individus exposés aux rayonnements après un échantillonnage stratégique limité des populations potentiellement exposées aux États-Unis (Rogan PK et al.PLoS ONE 15 (4): e0232008, 2020). Ce projet évaluera l'utilité des techniques géostatistiques pour identifier les emplacements géographiques avec des distributions asymétriques et des grappes de cas de COVID-19. Il mettra en œuvre une nouvelle méthode pour identifier les points chauds émergents de la nouvelle transmission communautaire en modifiant le nombre de cas interpolés au fil du temps.
 
CytoGnomix Inc. s'associe à l'Institut des sciences évaluatives et cliniques de l'Ontario (IC / ES) pour obtenir l'accès aux données d'incidence quotidienne géographique du COVID-19 et aux licences du logiciel de géostatistique. Le ministère de la Santé et des Soins de longue durée de l'Ontario (MSSLD) a accepté d'être un utilisateur des connaissances pour ce projet. En utilisant des données de dénombrement américaines accessibles au public au niveau des comtés, CytoGnomix Inc. a déjà démontré à IC / ES et au MSSLD la faisabilité d'appliquer des scripts de programme personnalisés pour automatiser ces tâches., expected results english : nan, expected results french : nan, additional information english : nan, additional information french : nan, owner organization : dnd-mdn, owner organization title : National Defence | Défense nationale