Reference number : 172-2020-2021-Q4-967269, amendment number : , agreement type : G, recipient legal name : Thompson Rivers University, recipient country : CA, recipient province : BC, recipient city : Kamloops|Kamloops, recipient postal code : V2C 0C8, program name english : Collaborative Science, Technology and Innovation Program – Ideation Fund, program name french : Programme de collaboration en science, en technologie et en innovation – Fonds d’idéation, program purpose english : The Ideation Fund is intended to encourage, test and validate transformative research ideas generated by teams of NRC scientific personnel and external collaborators with complementary capabilities, acting as a demonstration phase for a continually-evolving suite of research and development (R&D) deliverables at the NRC. The fund supports exploratory research through two mechanisms: the New Beginnings Initiative and the Small Teams Initiative., program purpose french : Le Fonds d’idéation vise à encourager, à mettre à l’essai et à valider les idées de recherche transformatrice des équipes scientifiques du CNRC et des collaborateurs externes dotés de capacités complémentaires. Il servira ainsi de plateforme de démonstration d’une série de produits livrables en matière de recherche-développement (R-D) en constante évolution au CNRC. Le Fonds appuie la recherche exploratoire au moyen de deux mécanismes : l’Initiative « Nouveaux débuts » et l’Initiative « Petites équipes »., agreement title english : Mechanistic Understanding of Acidophilic Electroactive Biofilms, agreement title french : Étude mécaniste des biopellicules électroactives acidophiles, agreement number : 967269, agreement value : 25000.0, agreement start date : 2021-03-23, agreement end date : 2022-09-30, description english : Electroactive microorganisms possess unique features enabling them to use solid-state electron donors or acceptors located outside the cell. Acidophilic electroactive biofilms participate in acid rock drainage generation and although this process is of primary concern in mine waste management, the role of extracellular electron transfer (EET) in sulfide mineral oxidation has not been investigated yet. This project will use multi-omics and bioinformatics to elucidate the microbial components involved in biofilm formation and sulfide oxidation, with particular emphasis on EET. Nucleic acids and proteins will be extracted from biofilms growing on pyrite and sequencing libraries will be constructed. Metagenomics will give insight on the microbial composition of the biofilm. Metatranscriptomics and metaproteomics will identify changes in functional gene expression and surface protein composition as a function of biofilm development stage and metal solubilization, providing fundamental knowledge on how biofilm cells transfer electrons across the mineral-attached multilayered community., description french : Les microorganismes électroactifs possèdent des caractéristiques uniques qui leur permettent d’utiliser des donneurs ou des accepteurs d’électrons solides situés à l’extérieur de la cellule. Les biofilms électroactifs acidophiles participent à l’exhaure des roches acides et bien que ce phénomène soit une préoccupation majeure dans le cadre de la gestion des déchets miniers, le rôle du transfert extracellulaire d’électrons lors de l’oxydation des minéraux sulfurés n’a pas encore été étudié. Le présent projet s’appuiera sur la multi-omique et la bio-informatique pour déterminer les composants microbiens qui participent à la formation des biofilms et à l’oxydation des sulfures, en prêtant une attention particulière au transfert extracellulaire d’électrons. Les protéines et les acides nucléiques présents dans les biofilms qui se développent sur la pyrite seront extraits et des bibliothèques de séquençage seront construites. La métagénomique permettra d’obtenir des renseignements sur la composition microbienne du biofilm. La métatranscriptomique et la métaprotéomique permettront de repérer d’éventuels changements dans l’expression des gènes fonctionnels et la composition des protéines de surface en fonction du stade de développement du biofilm et de la solubilisation des métaux, offrant ainsi des renseignements précieux sur la manière dont les cellules du biofilm transfèrent des électrons à travers la communauté multicouche attachée au minéral., expected results english : In the short term, anticipated outcomes will be strengthened collaborations across industry, academia, and government to support research excellence. In the medium term, anticipated outcomes will be the development of new and potentially disruptive technologies with collaborators., expected results french : À court terme, les résultats prévus sont des collaborations renforcées dans l’ensemble de l’industrie, du milieu universitaire et du gouvernement afin d’appuyer l’excellence en recherche. À moyen terme, les résultats prévus sont le développement de technologies potentiellement perturbatrices avec des collaborateurs., additional information english : nan, additional information french : nan, owner organization : nrc-cnrc, owner organization title : National Research Council Canada | Conseil national de recherches Canada