Reference number : 172-2021-2022-Q2-978650, amendment number : , agreement type : G, recipient legal name : McMaster University, recipient country : CA, recipient province : ON, recipient city : Hamilton|Hamilton, recipient postal code : L8S 4L8, program name english : Collaborative Science, Technology and Innovation Program - Collaborative R&D Initiatives, program name french : Programme de collaboration en science, en technologie et en innovation - Initiatives de collaboration en R-D, program purpose english : Collaborate on multiparty research and development programs to catalyze transformative, high-risk, high-reward research with the potential for game-changing scientific discoveries and technological breakthroughs in priority areas., program purpose french : Collaborer à des programmes multipartites de recherche-développement dans le but de profiter de la synergie entre la recherche transformatrice à haut risque et à haut rendement et le potentiel de découvertes scientifiques et de percées technologiques révolutionnaires dans des secteurs d’intervention prioritaires., agreement title english : Digital droplet PCR assay development for single cell analytics, agreement title french : Mise au point d’un test PCR à base de gouttelettes numérique pour l’analyse de cellules uniques, agreement number : 978650, agreement value : 99500.0, agreement start date : 2021-09-01, agreement end date : 2022-08-31, description english : This project aims to develop an analytical method to measure transduction efficiency at the single-cell level in a gene-modified, viral-vector based immunotherapy model. The method will employ digital droplet PCR (ddPCR) implemented in polymer microfluidic devices to encapsulate engineered cells with appropriate reagents (lysis and PCR master mix), including vector specific primers and hydrolysis probes, as well primers and probes for the reference gene. The encapsulated droplets will then be subjected to thermal cycling and subsequently arrayed in a monolayer format for fluorescence imaging. Image analysis and count of positive droplets for each fluorophore will allow accurate assessment of the transduction efficiency. This one-step lysis and digital PCR system aims at facilitating and streamlining the assessment of the viral transduction efficiency, an important step in the manufacturing of engineered T cell therapies., description french : Dans le cadre de ce projet, une méthode analytique sera mise au point pour mesurer l’efficacité de la transduction au niveau de la cellule unique dans un modèle d’immunothérapie basé sur des vecteurs viraux modifiés génétiquement. La méthode recourra à l’amplification en chaîne par polymère (PCR) numérique à base de gouttelettes (ddPCR) mise en œuvre dans des dispositifs microfluidiques en polymère pour encapsuler les cellules modifiées avec des réactifs appropriés (lyse et mélange principal PCR), y compris les amorces et les sondes d’hydrolyse spécifiques au vecteur, ainsi que les amorces et les sondes pour le gène de référence. Les gouttelettes encapsulées seront ensuite soumises à un cycle thermique, puis disposées en monocouche pour l’imagerie par fluorescence. L’analyse des images et le comptage des gouttelettes positives pour chaque fluorophore permettront d’évaluer précisément l’efficacité de la transduction. Ce système de lyse et de PCR numérique en une seule étape vise à faciliter et à rationaliser l’évaluation de l’efficacité de la transduction virale, une étape importante dans la fabrication de thérapies par cellules T modifiées., expected results english : In the short term, anticipated outcomes will be strengthened collaborations across industry, academia, and government to support research excellence. In the medium term, anticipated outcomes will be the development of new and potentially disruptive technologies with collaborators. In the long term, find collaborative solutions to public policy challenges and create stronger innovation systems., expected results french : À court terme, les résultats prévus seront des collaborations renforcées entre l'industrie, le milieu universitaire et le gouvernement pour soutenir l'excellence en recherche. À moyen terme, les résultats attendus seront le développement de nouvelles technologies potentiellement perturbatrices avec des collaborateurs. À long terme, trouver des solutions collaboratives aux défis des politiques publiques et créer des systèmes d'innovation plus solides., additional information english : nan, additional information french : nan, owner organization : nrc-cnrc, owner organization title : National Research Council Canada | Conseil national de recherches Canada