Reference number : 206-2021-2022-Q2-00002, amendment number : , agreement type : C, recipient legal name : University of Guelph, recipient country : CA, recipient province : ON, recipient city : Guelph, recipient postal code : N1G 2W1, program name english : CFIA Federal Assistance Program, program name french : Programme d'aide fédéral de l'ACIA, program purpose english : The Federal Assistance Program enables the Agency to support projects and initiatives led by external organizations that advance CFIA's core responsibility for safe food and healthy plants and animals., program purpose french : Le Programme d'aide fédéral permet à l'Agence d'appuyer des projets et des initiatives dirigés par des organisations externes qui renforcent la responsabilité essentielles de l'ACIA en matière de la salubrité des aliments et végétaux et animaux sains., agreement title english : Metabarcoding of environmental DNA as early threat detection for plant and animal pests of concern in Canada, agreement title french : Le métacodage à barres de l’ADN environnemental comme outil de détection précoce des menaces liées aux phytoravageurs et aux animaux nuisibles préoccupants au Canada, agreement number : FAP 2122-001, agreement value : 300000.0, agreement start date : 2021-08-24, agreement end date : 2023-03-21, description english : This project aims to enhance industry capacity to respond to emerging threats and regulatory challenges for plant and animal health in Canada in order to strengthen trade

This project will benefit the University of Guelph - Biodiversity Institute of Ontario (UoG-BIO). It will provide opportunities to faculty and students to engage in molecular research and learning activities that leverage the scientific and technical expertise within UoG-BIO. It is expected that these activities could be applied to address challenges of protecting animal health and plant resources on behalf of Canadians., description french : Ce projet vise à améliorer la capacité de l’industrie à répondre aux menaces émergentes et aux défis réglementaires liés la santé des végétaux et des animaux au Canada afin de renforcer les échanges commerciaux.

Ce projet profitera à l’Institut de la biodiversité de l’Ontario de l’Université de Guelph (UoG-BIO). Il offrira aux professeurs et aux étudiants la possibilité de participer à des activités d’apprentissage et de recherche moléculaires qui tirent parti de l’expertise scientifique et technique de l’UoG-BIO. On s’attend à ce que la possibilité d’appliquer ces activités soit reconnue en vue de relever les défis liés à la protection de la santé des animaux et des végétaux au nom des Canadiens., expected results english : The first component will optimize and validate tools to identify multiple species of insects, bacteria and fungi from environmental samples. This will enhance the uptake of barcoding as a diagnostic or research tool in a regulatory setting. 

The second component will optimize and validate identification of environmental samples to quickly and accurately detect Hemlock Woolly Adelgid (HWA) and related species of regulatory importance. This work will ultimately garner baseline data in an efficient manner on HWA life stages and natural predators in Ontario.

The third component will process and analyze samples of various mediums like birds' nests, soil, seeds, plants and insect parts. This research will assess the risk associated with the shipping vessel pathway and will subsequently contribute to risk mitigation. 

The fourth component will identify Culicoides species from whole-DNA genome sequencing and viral and/or bacterial agents carried by individual hosts from environmental samples. Culicoides species are a known vector for many important agents of exotic diseases such as bluetongue (BT) and epizootic haemorrhagic disease (EHD). This research could ultimately lead to the creation of rapid-tests to modernize diagnostic testing for adherence to the Canadian regulatory regime and for trade purposes., expected results french : Le projet est divisé en quatre volets : 

Le premier volet optimisera et validera les outils permettant d’identifier de multiples espèces d’insectes, de bactéries et de champignons à partir d’échantillons prélevés dans l’environnement. Ce volet visera à renforcer l’adoption du code à barres en tant qu’outil diagnostique ou de recherche dans un cadre réglementaire. 

Le deuxième volet aura pour objectif d’optimiser et de valider l’identification des échantillons prélevés dans l’environnement afin de détecter rapidement et avec précision le puceron lanigère de la pruche (PLP) et les espèces connexes faisant l’objet d’une réglementation. Ce travail permettra au bout du compte de recueillir des données de référence de manière efficace sur les étapes du cycle de vie et les prédateurs naturels du PLP en Ontario.

Le troisième volet traitera et analysera des échantillons provenant de divers milieux comme les nids d’oiseaux, le sol, les graines, les plantes et les parties d’insectes. Cette recherche évaluera le risque associé au parcours des cargos et contribuera par la suite à l’atténuation des risques. 

Le quatrième volet identifiera les espèces de Culicoides à partir du séquençage du génome entier de l’ADN et des agents viraux et/ou bactériens transportés par des hôtes individuels à partir d’échantillons prélevés dans l’environnement. Les espèces de Culicoides sont les vecteurs connus de nombreux agents importants de maladies exotiques telles que la fièvre catarrhale du mouton (BT) et la maladie hémorragique épizootique (MHE). Cette recherche pourrait éventuellement mener à la création d’épreuves de dépistage rapides visant à moderniser les épreuves diagnostiques afin de respecter le régime réglementaire canadien et à des fins commerciales., additional information english : nan, additional information french : nan, owner organization : cfia-acia, owner organization title : Canadian Food Inspection Agency | Agence canadienne d'inspection des aliments