Reference number : 172-2021-2022-Q4-988599, amendment number : , agreement type : G, recipient legal name : The Governing Council of the University of Toronto, recipient country : CA, recipient province : ON, recipient city : Toronto|Toronto, recipient postal code : M5S 1A1, program name english : Collaborative Science, Technology and Innovation Program - Collaborative R&D Initiatives, program name french : Programme de collaboration en science, en technologie et en innovation - Initiatives de collaboration en R-D, program purpose english : Collaborate on multiparty research and development programs to catalyze transformative, high-risk, high-reward research with the potential for game-changing scientific discoveries and technological breakthroughs in priority areas., program purpose french : Collaborer à des programmes multipartites de recherche-développement dans le but de profiter de la synergie entre la recherche transformatrice à haut risque et à haut rendement et le potentiel de découvertes scientifiques et de percées technologiques révolutionnaires dans des secteurs d’intervention prioritaires., agreement title english : Optimizing the development of sgRNA array library: a PoC study, agreement title french : Optimisation d’une banque de jeux ordonnés d’ARN simples guides (sgRNA) : étude de validation de concept, agreement number : 988599, agreement value : 27500.0, agreement start date : 2022-03-28, agreement end date : 2023-03-31, description english : The CRISPR/Cas system has revolutionized the analysis of gene function in mammalian cells. Cas cuts DNA at specific genomic region by associating with a single guide RNA (sgRNA) molecule whose sequence is complimentary to the genomic DNA to be targeted. This system was rapidly adopted by the functional genomic community to perform pooled screens because of its simplicity and efficiency. However, current pooled screen read-outs are limited to assays with strong selective ressure, but are ill fitted to measure phenotypic effect on state and differentiation of targeted cells. As such, arrayed screens are better suited for primary cells, such as iPSCs, neurons, and immune cells. Thus, the lack of a “whole-genome” arrayed sgRNA libraries, especially ribonucleoprotein (RNP) compatible, has impeded the functional characterization of multiple disease models targeted by the Cell and Gene Therapy (CGT) program. This proof of concept proof of concept (PoC) study seeks to develop a sgRNA arrayed library for use in cell types relevant to the CGT program., description french : Le système CRISPR/Cas a révolutionné l’analyse du fonctionnement des gènes dans les cellules des mammifères. Les enzymes Cas coupent l’ADN à un endroit précis, visé par un ARN simple guide (sgRNA ou single guide RNA) complémentaire au site qu’on souhaite modifier. En raison de sa simplicité et de son efficacité, les chercheurs en génomique fonctionnelle ont vite adopté ce système pour effectuer des criblages groupés. Cependant, ces criblages se bornent actuellement aux essais associés à une forte pression sélective et se prêtent mal à la quantification des effets phénotypiques qui permettraient d’établir l’état et la différenciation des cellules ciblées. Le criblage en réseau donne de meilleurs résultats avec les cellules primaires comme les CSPI, les neurones et les cellules immunitaires. Malheureusement, l’absence de banque de sgRNA en réseau pour l’ensemble du génome, surtout de banques de ribonucléoprotéines (RNP), sans introduction de fragments d’ADN étranger, entrave la caractérisation fonctionnelle des modèles de nombreuses maladies recensées dans le programme Défi « Technologies de rupture au service des thérapies cellulaires et géniques » (TCG). Cette étude de validation de concept mènera à l’élaboration d’une banque de sgRNA en réseau applicable aux cellules d’intérêt pour le programme TCG., expected results english : In the short term, anticipated outcomes will be strengthened collaborations across industry, academia, and government to support research excellence. In the medium term, anticipated outcomes will be the development of new and potentially disruptive technologies with collaborators. In the long term, find collaborative solutions to public policy challenges and create stronger innovation systems., expected results french : À court terme, les résultats prévus seront des collaborations renforcées entre l'industrie, le milieu universitaire et le gouvernement pour soutenir l'excellence en recherche. À moyen terme, les résultats attendus seront le développement de nouvelles technologies potentiellement perturbatrices avec des collaborateurs. À long terme, trouver des solutions collaboratives aux défis des politiques publiques et créer des systèmes d'innovation plus solides., additional information english : nan, additional information french : nan, owner organization : nrc-cnrc, owner organization title : National Research Council Canada | Conseil national de recherches Canada