Kolonie spolu mohou být spojené. Nalijte k nim trochu kombuchového nápoje a misku zakryjte, aby se kultury nepoškodily. Můžete a nemusíte lahve plnit až po víčko. Pokud to neuděláte, bude trvat velmi dlouho, než se nápoj stane perlivým. Také můžete zkusit dolít mezery džusem nebo čerstvým čajem, jen pozor, abyste kombuchový nápoj příliš nenaředili. Nechte si asi 10% fermentovaného nápoje stranou a vraťte ho do nádoby, kde necháváte kombuchu fermentovat. Můžete tak začít celý cyklus od začátku – přilijte čerstvě vylouhovaný čaj, dejte do něj kulturu kombuchy, a tak dále.  Každou nově utvořenou vrstvu kultury kombuchy můžete použít k přípravě nové dávky čaje. Někdo doporučuje vždy použít novou vrstvu a starou zahodit. Není nezbytné, dávat do nové várky obě vrstvy kombuchy, jedna bohatě postačí. Každý fermentační cyklus vytvoří novou dceřinou kolonii z původní mateřské. Po první dávce tedy budete mít dvě mateřské kolonie – jednu původní a druhou, která vznikla z dceřiné. Toto rozmnožení proběhne s každým dalším cyklem fermentace. Je bezpečnější, zakrýt je jen volně, aby mohl unikat vytvořený vzduch, pokud je zavíčkujete pevně, nápoj bude šumivý. Nechejte je asi 2-5 dní odpočinout v pokojové teplotě. Kombucha nejlépe chutná vychlazená.
Mateřskou kulturu, i dceřiné kultury teď opatrně přesuňte čistýma rukama (můžete si obléct rukavice bez příměsi latexu) do vypláchnuté misky. Trychtýřem přelijte většinu hotového čajového nápoje do lahví, ve kterých jej chcete skladovat. Zavíčkujte lahve s hotovým nápojem z kombuchy. Skladujte lahve v lednici.
Mateřskou kulturu, i dceřiné kultury teď opatrně přesuňte čistýma rukama (můžete si obléct rukavice bez příměsi latexu) do vypláchnuté misky. Trychtýřem přelijte většinu hotového čajového nápoje do lahví, ve kterých jej chcete skladovat. Zavíčkujte lahve s hotovým nápojem z kombuchy. Skladujte lahve v lednici.