大部分流行性乙型脑炎患者可能没有症状，或是只有轻微、短暂的流感样症状，比如轻度至中度发烧、疲倦、头痛和偶尔呕吐。所以，大部分案例都很难识别，因为没有症状，或是出现的症状和其它轻微感染很相似。  预计只有少于1%的流行性乙型脑炎病毒感染者出现明显症状。  病毒潜伏期通常从5到15天不等，也就是说感染病毒后，可能在5到15天后才会出现症状。 尽管大部分案例症状轻微或完全没有症状，但是大约每250名感染者中会有1人出现严重疾病，初期症状一般为发高烧。 这是人体的一种防御机制，以减缓或抑制入侵的病毒或细菌在体内复制。不过，一旦成人体温超过39.4摄氏度（103华氏度），小孩体温超过38.3摄氏度（101华氏度），就有可能引起脑损伤。流行性乙型脑炎病毒造成高烧和脑部炎症增加，会引发其它危及生命的严重症状。  一旦出现明显症状，死亡率约30%。这种情况多发生在免疫力低下的儿童。  如果只是轻微的流行性乙型脑炎，体温可能上升约1摄氏度。情况严重的话，体温可能上升3摄氏度或更多。 与脑膜炎等其它影响大脑和（或）脊髓的感染一样，流行性乙型脑炎也会引起颈部发僵。颈项突然变得僵硬，无论从任何角度移动都受到限制，并在前屈（下巴贴近胸口）的时候，产生尤其尖锐的刺痛感或电击样痛。  当脊髓发炎，最接近脊椎的肌肉为了保护它会变得非常紧绷，这种现象被称为保护性肌僵直。所以，颈部肌肉会摸起来很僵硬，感觉像痉挛一样。 药物、按摩或脊椎按摩疗法并不能治好流行性乙型脑炎、脑膜炎和其它中枢神经系统感染引发的脖子僵硬。 脑炎和发高烧也会引发精神上的变化，比如定向障碍，神志不清，难以集中精神，甚至无法说话。行为上的变化通常相互关联，包括变得易怒和（或）乱发脾气，想要独处和回避社会接触。  这些比较严重的流行性乙型脑炎症状一旦出现，通常在几天内就会变得非常明显和严重。 严重流行性乙型脑炎引起的精神和行为变化与中风或阿尔茨海默病相似。患者会从原本健康和功能健全的状态，变成精神和身体严重衰退。 想要提高存活几率，就必须学会识别感染迹象和症状，及时接受治疗。 当流行性乙型脑炎恶化，肿胀和发烧情况加重，大脑神经元就会开始受损，并相继死去。一旦出现这些情况，神经症状就会变得明显，比如身体部位失控地颤抖（震颤），肌肉无力或瘫痪，走路和抓握东西有困难，身体协调变差，动作显得笨拙。  肌肉无力和瘫痪通常始于四肢（手和脚），然后逐渐向身体中心扩散。不过，脸部也有可能在一开始就受影响。 约70%病情严重的流行性乙型脑炎患者得以存活，其中四分之一会有永久性神经和（或）行为问题和功能障碍。 严重流行性乙型脑炎体现为大脑肿胀、发高烧、大脑神经元电活动中断或放电，这些症状最终都会引起癫痫。惊厥发作时，患者会体力不支、颤抖、肌肉抽搐、牙关紧闭，有时候还会呕吐或口吐白沫。  脑炎引发的惊厥和癫痫引起的惊厥相似，但是因为大脑受损，所以前者对人的生命威胁更大。 儿童患者比成人更容易惊厥发作，因为他们的大脑比较小，更容易受压力和体温升高所影响。  一旦惊厥发作，患者很可能会失去意识，进入昏迷状态。这种情况相当常见。
留意轻微的流感样症状。 注意是否发高烧。 留意颈部是否发僵。 留意精神或行为上的变化。 留意神经损伤。 做好准备应付惊厥。
留意轻微的流感样症状。 注意是否发高烧。 留意颈部是否发僵。 留意精神或行为上的变化。 留意神经损伤。 做好准备应付惊厥。