区分短吻鳄与其他鳄鱼最简单的办法就是查看吻部。短吻鳄吻部宽而圆厚，呈“U”字型，而且鼻子大；而其他品种的鳄鱼吻部更狭长、更薄，呈“V”字型，鼻子较小。短吻鳄吻部通常比其他品种的鳄鱼吻部短。 短吻鳄宽大的鼻子使它比其他鳄鱼更有力量。相比其他鳄鱼，短吻鳄更容易咬碎龟等硬壳猎物，而其他鳄鱼则更倾向于吃鱼类和哺乳类。 其他品种的鳄鱼上下颚几乎等宽，因此，它上下颚的牙齿沿着颌线像锁链一样咬合在一起，即使闭嘴时也不例外。短吻鳄上颚比下颚宽，因此，当它闭嘴时，下颚牙齿会陷入上颚牙槽里，导致无法看见，只有上颚牙齿沿着下颌线露出嘴外。  短吻鳄上颚比下颚宽，所以能把下颚完全盖住。当它闭嘴时，下颚牙齿就被上颚完全盖住，而无法看见。 其他品种的鳄鱼上下颚几乎等宽，当它们闭嘴时，上下颚牙齿像锁链一样咬合在一起，并且有些牙齿突露于嘴外。当下颚两侧的第四颗牙齿尖耸突出于上唇外时，它看起来就像是在微笑一样。 短吻鳄皮肤颜色比其他品种的鳄鱼深。其他鳄鱼肤色较浅，通常是橄榄绿或棕色；而短吻鳄肤色更深，通常是黑灰色。短吻鳄的身体比其他鳄鱼短。其他品种的成年鳄鱼平均体长6米，而成年短吻鳄平均体长3米。  成年短吻鳄平均体重360至450公斤，而其他品种的成年鳄鱼能长得更重些，平均体重450至900公斤。  短吻鳄平均寿命30至50岁，而其他品种的鳄鱼平均寿命70至100岁。 绝大多数的鳄鱼后腿和脚上都有饰边皮纹，而短吻鳄没有。此外，短吻鳄的脚掌有蹼，而其他品种的鳄鱼没有。
查看吻部。 留意牙齿的差异。 观察身体的差异。 留意腿脚的差异。
查看吻部。 留意牙齿的差异。 观察身体的差异。 留意腿脚的差异。