日間賀島の総面積は
東岸の里中と西岸の西浜の二つの集落があり[8]、里中は中と小戸地に、西浜は新居と寺下と浪太に分かれている[6]。日間賀島は全体がなだらかな丘陵地を形成しており、島のほぼ中央に30.2mの最高標高地点がある[8][注 2]。面積は0.77km2であり、皇居の約半分である。日間賀島の森林面積は4%に過ぎず、面積の31%が森林の佐久島、面積の24%が森林の篠島と比べて森林に乏しい[3]。篠島とは違って比較的広い耕地があり、1960年代（昭和40年代）後半から1970年代（昭和50年代）にかけてオリーブ、フキ、ウメなどの栽培がなされたが、これらは定着していない[3]。現在は三河湾三島に農業経営体は存在しない[3]。