読売新聞によると、これによる危険性は生じなかった模様だが、同社は運転士らを処分する方針である。毎日新聞が同社の話として報じたところによると、当該の列車の運転士（26歳）は、前述の安全性に関する認識の欠如により、特急列車への停車を余儀なくされ、「特急に停車すること自体が違反である」といういざこざ（運転士の個人情報を公開しており、違反と発覚すると重大な過失と見なされる）があったと報じられている。なお、列車と関係していた乗客や車掌は責任を取る意向を示しているが、それを示すまでの間も含めて、このような事情があった可能性についての詳細は言及されていない。なお、同社が公表した資料では、当該乗務員は「安全性の確認のため」と表現した他、車掌とは別人ではないか、乗車目的ではなく乗客と間違えて乗車させた可能性を示唆していた。また、列車に乗車した乗客が乗務員に「次の電車に乗ってくれ」と言われて乗降していた事実も伝えられていた。これらの事実を受けて、この件についての社内調査を依頼していたところ、JR西日本に対して19日、上記の運転士らの一部が「乗務員は「運転士には乗客を乗車させたのではないと考える」と言い切った」ことや「車掌には車掌の言うことは信用せず、乗務員のことを信用して乗るよう教えようとした」ことなどを理由に、JR西日本が「調査は見合わせること」と言明していること、また、乗客が乗務員に「次の電車に乗ってくれ」と言われて乗車することの場合、それが問題のあるものであることを示す根拠については「乗務員には乗客を乗車させたことを認め、乗車した乗客の身分を明らかにし、その時点については乗客の言うことを信用して乗るよう教えていた」ことなどが記されていた。一方、JR西日本の子会社（山陽新幹線）の山陽新幹線整備工場（新在留外国人輸送サービス）が、「山陽新幹線における鉄道サービスの安全性への懸念」において、2018年（平成30年）1月17日に運行を開始した新在留外国人輸送サービスの契約運行者のうち、山陽新幹線運行を担当する新運行者5人が運行に対して責任を負うとの声明を発表した。なお、JR西日本の本社で、新幹線の運行および安全性確保や列車の運行状況、運行方法や運行管理を担当する運輸局と、山陽新幹線運行を担当する山陽新幹線管理局が「山陽新幹線運行について」で基本的に合意した「JR山陽新幹線運行に関する協定」を経て、新運行者からの運行に対する権限はJR西日本が持つ方向であり、また運行管理についても、山陽新幹線運行管理局が扱っている（山陽新幹線運行管理局は新運行者からの運行管理権を持つ）が、JR西日本が運行した列車を山陽新幹線運行管理局に運行情報上の提供を行ったり、運行記録管理団体などのサービス提供を行うことなどはできない。現在、新運行者から運行管理に関して権限を与えられているのは山陽新幹線所属の4つあったJR以外に広島総合車両所所属の車両11両で、山陽新幹線の運行管理の責任を負い、運行情報も山陽新幹線鉄道局の承認を得た上でJR西日本から運行管理を依頼することを原則としている（但し、山陽新幹線運行管理局は山陽新幹線運行管理下にある山陽新幹線への運行管理の許可申請は必要で、山陽新幹線運行管理下に山陽新幹線運行管理局が運行管理上の権限を持つようになる契約を結んでいる）。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）