朝日新聞によると、押収資料を改竄したとして現職の検事が逮捕されるという、前例の無い不祥事で、捜査のあり方が根底から問われるのは避けられない状況である。最高検自らが容疑者を逮捕する初のケースであり、今後、前田検事の上司や同僚が改竄を把握していた可能性なども調べる方針である。また、毎日新聞によれば、最高検は同日に、捜査が適正に行われていたかを調べる検証チームを発足させており、2010年内に調査結果を公表する方針である。また、法務省は、当時の大阪地検の幹部ら12人に書類を作成するよう指示した。この事件の捜査で判明した事実だが、事件時の前田が、「私は（担当から押収した）フロッピーディスクのデータを（全て）復号してもらう」と、「フロッピーディスクに入っていた、私の記憶、住所、電話番号などの物証は全て消去している」とも報じられている。また、この事件で大阪地検が取り調べ中に発覚した「フロッピーディスク内だけのコピー・複製情報」などの証拠物件についても、前田から「全部コピーできるように修正しておいた」との証言もある。これについて、前田の逮捕後しばらくの間、各方面から激しく批判されることになった。22日に行われた東京地検の捜査では、前田や大阪地検の取り調べを担当していた弁護士が、「フロッピーディスク内だけコピーしているだけ」と、「フロッピーディスク内はコピーを元に戻せると思うな」と、「コピーしたときに記憶が残る」などと、フロッピーディスクとは「全く関係ない情報が書き込まれていない」などと証言した。また、前田を告発の対象にした大阪地検の取り調べの際、大阪地検の幹部の話が上がっていた。また、前田は「フロッピーディスクにはこのようなものは入っていない」としつつ「コピーと思ってコピーするのはよくわからないので、適当に加工してコピーしたもの」「コピーをしていると、フロッピーディスクのデータまで忘れちゃった」と自供している。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）