ジャネット・ジョンソンもウィリー・シューメーカーもサンデーサイレンスのどういった性格に嫌気を指して騎乗拒否をしましたか?
サンデーサイレンスは非常に気性が荒く、騎乗した人間の指示に従わず暴れる傾向があった。
ウィッティンガムは、厩舎一の腕を持つジャネット・ジョンソンをサンデーサイレンス担当の調教助手に指名したが、ジョンソンは気性の荒さに嫌気が差し、一度騎乗しただけで降板している。
騎手のウィリー・シューメーカーも調教のために騎乗したことがあるが、気性の荒さに激怒し、レースでの騎乗を拒否した。
ウィッティンガムによると、ヘイローの産駒は総じて気性が荒いという。
しかし、種牡馬時代のサンデーサイレンスは、メジロマックイーンがそばにいると大人しくなることが多く、サンデーサイレンスとメジロマックイーンの放牧地は隣同士に設えられていたという逸話がある。
前述のように、サンデーサイレンスは1986年11月に悪性のウイルスに感染して激しい下痢を起こし、生死の境をさまよったことがある。この闘病についてハンコックは「普通の馬だったらダメだっただろう」、「よほどの精神力がなければ、とてもじゃないがあんな経験は乗り越えられない」と述べている。