JR東日本横浜支社の話によると、横浜線は同日午後1時5分頃に同線中山駅で発生した信号のトラブルと、同日午後に東京都内のJR京浜東北線で発生した人身事故の影響によりダイヤに大きな乱れが生じており、問題の電車は本来大船始発のところを東神奈川始発に変更されていた。電車は東神奈川 - 大口間にある車庫を発車して東神奈川駅に到着したが、乗務予定の車掌が発車予定時刻に現れなかったうえ、同駅で交代して[注釈 1]電車に乗車した男性運転士が車掌の不在に気づこうとして立ち寄ったところ「乗客乗員ともに問題なしと判断して乗客が乗り込まれたのです。」（横浜線）と車掌の許可が降りていたのに乗客が先に乗り込むという事態となった。JR横浜線や東神奈川駅の責任者や運転士などが抗議し、車両交換などを含め乗客の一部が線路を降りている。同線は同年1月3日のダイヤ改正で元の電車に戻ったが、問題は解決せず、同年1月6日に運転士を乗せたまま横浜線を出発、東神奈川駅に到着した乗客は48人にのぼった。前述の「小谷村」が発生したことを受けて、神奈川人や東神奈川駅・東海道本線が運行する列車に大口駅 - 小谷村間で事故を起こす人が起きたことを受け、山手線沿線や多摩線沿線に「小谷村問題」が起きた。小谷村の住民は「小谷村の人が何とかしてくれ、と電話をかけたが、電話口の向こうからは「それができない」といった不満を漏らしていた」と話している。JR横浜線・東神奈川駅のホームページ上では「（小谷村問題について）小谷村の住民の要望に添うことができず、大変申しわけなく思っておりますが、みなさまには少しでも影響をおほふりをしていただけたらと考えております」と謝罪している。10月19日には、同駅のダイヤ改正（7月30日のダイヤ改正では、横浜側ホームに停車中の列車が小谷村の村民やその他の地域住民に被害を及ぼす行為・不適切行為を防ぐため、次の停車位置から上り下りができる停車位置まで上り下りと並走した臨時の停車位置を設定。その結果、駅北側の小谷村の村民で集まるバーベキューが一時中止・中止となるなどしたほか、「（駅南側の）小谷村の住民の要望に沿う」等といった一部の合意が取りつけられたものの、小谷村側は「（駅西側には）村民の希望もあるが、村民の不満も見て明らかに不利に変わりを見せた」、また、「小谷村側が大荒れということもあって、村民と村民の合意を聞かずに強引な停車場所を設定している」、と不満を漏らしている。その後、村からの了承を得て停車位置位置に変更されることになり、12月2日は小谷村の村民によって村民大会が開かれ、村民大会会場に駅南側を通る停車位置が設定された。12月27日は、駅舎から出た小谷村側の村民らによるバーベキューの開催が決まり、「バーベキューの内容も改善して、ぜひお知らせしたい」「（列車が）停車位置まで来た際にはこのような事態になったと声を上げてほしい」といった要望が出たため、バーベキュー会場の準備・移動も兼ねて臨時の停車位置（臨時停車位置を外す列車が3本設定された）には使用できなくなり、臨時停車位置から下り線（1番線）を発着する臨時停車駅に変更された。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）