産経新聞・毎日新聞によると、番組で問題となったことは、10年近く続いていた同じく問題となっている「科学に勝たない科学者があるかもしれない」「科学者はなぜ科学するのだろう」「科学におけるプログラミングやAI、量子計算、量子力学などといった新たに知ることが多かった分野を、人間の力を利用して研究しようということは何を目的としているのか」というテーマを扱うクイズで、番組終盤で、科学を否定する科学者の中から、「これは科学であり、人間の能力を超えた、何かが研究できる」「プログラマーにとっても科学の役に立つわけではない」といった意見が言える、全ての科学が認められないテーマを扱わなければならないという番組の本来の趣旨には反すると長村教授は説明する。この問題の内容は「科学に勝つ科学者を作ろう」というタイトルの番組であるものの、「科学におけるプログラミング、量子計算、量子力学といった新たに知ることが多かった分野を、人間の力を利用して研究しようということは何を目的としているのか」の部分と「プログラマーにとっても科学の役に立つ」という部分は、「科学におけるプログラミング、量子計算、量子力学といった新しく知ることが多かった分野を、人間の力を利用して研究しようということは何を目的としているのか」の部分にとって同じではない、という批判を受けた。しかし、長村教授はこの問題を「科学ではなく、（番組スタッフが問題を作成した）新しい科学分野であり、科学者が自分達で作り上げたものであり、「実験の捏造は問題を作り出す為に使ったことである」（番組の内容を捏造することに当てはめる）」「科学ではなく、新しい科学分野であり（（番組と）関係のない問題を捏造しては無駄だと言っている）」と批判して、「番組と関係の無い問題（「実験の捏造に当てはまらない（同じ問題でも）別問題として扱われる事もある」）」「「実験の捏造は問題を作り出す為に使ったことである」「（新しい問題ではない、別問題でもある）」という論理を出して、番組の問題と無関係の問題である「科学の捏造という意味の誤解を招く可能性」を回避して、「（同じ問題でも）別問題でない問題であっても、新しい問題であればそれなりに（問題を作り出せる、問題を作り出してしまう）」と主張した。（しかしその後番組スタッフは）これを番組の話だと思えずに「（番組の話だと思われる）別問題ではない別問題と思わせているこの誤解の話から番組が始まる」と思わなくなってしまった。一方、長村教授は「（番組の企画趣旨）は（新しい）科学分野の内容を実験のように実験してみたということだ。実験という部分を問題としてやっていっただけ」「（問題が作られている）実験の内容は、（放送局で）実験をした（実験の）実験そのものだという誤解を招くことになる」と主張した。
完全にフェイク（記事の全体をAIモデルが生成した）