お吉泉で藻体が一時的に見られなくなったのは何年頃でしたか?
本種は環境の変化に非常に敏感であり、生育地周辺の水質の悪化や水量の減少、日陰を作る樹木の伐採や水草の繁茂などによって、多くの生育地で生育量の減少や絶滅が報告されている。
天然記念物に指定されている3か所うち、土黒川では1985年頃から見られなくなり、志津川でも急速に生育量が減少しつつある。
お吉泉でも1973年頃から見られなくなり、一時は絶滅したものと考えられていたが、その後の日照調整や流路改修などの保護対策によって2001年(平成13年)以降発生が再確認された。
ただしこれは熊本県からの移植された藻体が定着したものではないかと考えられている。
このような状況から、現在オキチモズクは環境省のレッドデータブックで「絶滅の危機に瀕している種」(絶滅危惧I類)に指定されている。