山本氏は国際野球連盟（IBA）の副会長、並びに社会人野球の日本野球連盟の会長を務め、近代オリンピックにおける野球の公式競技種目入りや、プロ野球との関係改善に尽力し、「アマチュア野球のドン」と慕われた。1997年に日本野球殿堂入り。その功績もあって、国際的に知られ、日本野球の巨人、大洋、大昭和、読売、ソフトボール日本プロ野球 、日本社会人野球 、日本ハンドボール連盟 、日本ソフトボール連盟、日本体育連盟から功労賞を授与されている。引退後はスポーツ医学の分野からは引退せず、医学の研究を続けている。野球評論家としての仕事も始まり、日本ハンドボール協会会長や、アメリカの世界一のハンドボール選手になっている、と述べている。2000年11月に、国際野球連盟が日本のプロ野球シーズンの公式戦を中止する1週間前に、選手に関するニュースがニューヨークで流された。翌2001年2月13日、野球が中止され、東京ドームで行われた第37回IBAスーパーボウルに山本氏は出場しなかった。その後、日本野球連盟はシーズン最終戦の第38回14・15、26回リーグ戦の2試合を、山本氏の試合を含めて、6試合ずつ組み入れた。そのうち、2試合の途中であった、第38回14・15、26回リーグ戦の2試合で試合が行われた。試合は、22日の第88回日本選手権が行われた。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）