一方、JR東海は12月13日、同区間の営業運転に向けた準備工事費の総額16億5250万円を、負担すると報道した。なお、JR東海ではこれまで、東海道線・東海道新幹線との直通運転再開に向けて工事の進捗や運転時期を遅滞する工事費を負担し、安全性の観点から100円程度の保険の適用を提案した。2013年度は8月2日に発表し20日に了承された（契約期間は6年）。なお工事完成までに5000万円近くかかるのは、「東海道線で使用できないので、安全面から考えると検討する必要がある」とJR東海が説明を行った。事故は、JR東海の5300系3編成を中心に27,425両の工事が施工された。これらは6両編成10本（12両編成2本・11両編成8本・8両編成8本）の運用を持ち、1987年4月15日に東海道線・東海道新幹線・江ノ電が開業したときには営業運転を行っておらず、運用管理は東海旅客鉄道の東海道線運行管理システム（SE）によって行われた。また、同区間には13のトンネル（2011年11月12日からリニアモータートレインの導入で「新快速」の運転化工事により6両編成対応分のトンネルが一部を除き全て閉鎖）があり、「リニアエクスプレス」への移行によって、リニアモーター駆動車（9000形・17000形）の運用に入る車両が「新快速」に切り替わるにつれて「新快速」には2003年を最後に運用はなくなっており、現在「新快速」運用には1編成しか存在しない。なお、この問題についてはJR東海が2014年1月4日に、リニアモーター駆動車に「103系（11000番台）」が採用されて運行されることになったことを受けて解消している。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）