ストーニーハースト・カレッジとホダー学院と、どっちの方が上級学校なの?
裕福な伯父の支援でドイルは1868年にイングランド・ランカシャーにあるイエズス会系の寄宿学校ホダー学院に入学した。1870年にはその上級学校であるストーニーハースト・カレッジに進学し、同校で5年間学んだ。スポーツ万能だったドイルは同校のクリケット部主将を務めているが、後年にドイルは同校の体罰の激しさやイエズス会教師の「救いようのない頑迷さ」を批判している。1875年にはドイツ語の勉強も兼ねてオーストリア・フェルトキルヒにあるイエズス会系の学校に1年間留学した。

オーストリアから帰国したころ、母メアリーは少しでも生活費を楽にするため、ある医師を間借り人として置いていた。この間借り人の影響を受けて医師を志すようになったドイルは、1876年にエジンバラ大学医学部に進学した。