このドラマは児童養護施設を舞台としているが、1月16日に赤ちゃんポストを運営している熊本市の慈恵病院より、作品内容に関して「養護施設の子供や職員への誤解偏見を与え、人権侵害だ」として内容に問題があると判断され、放送の中止を求められていた。慈恵病院が放送倫理番組向上機構(BPO)に対して、「施設の子供や職員の人権を侵害している」として審議の申し立てを行い、慈恵病院はBPOの「放送人権委員会」へ審議を求める申立書を送付した。産婦人科の蓮田健部長は1月22日の会見で、「第1回放送後に、施設の子供がいじめられたとの報告を伝え聞き、緊急性が高いと判断した。BPOは速やかに結論を出してほしい」と発言した。さらに熊本市の幸山政史市長も同日の会見で、「過激な描写や演出、現実離れした表現が多く、児童養護施設への誤解を与えかねない内容だ。局は施設当事者の声を真摯（しんし）に受け止めてほしい」と改善を要求していた。内容に関して改善を求める声が挙がってはいたものの、日本テレビは慈恵病院へ1月20日に放送を継続する旨を伝えていた。日本テレビの総合広報部は「倫理問題を含め、総合的な観点から、放送を継続することを決定する」と報道した。2000年1月20日、放送批評懇談会は「子供たちに、愛情と心配りを与えてほしいという番組『あなたと宇宙人の7日間 〜ママの愛情いっぱいの7日間〜』の趣旨に反した、児童虐待や虐待報道を容認する番組制作」という批判を公表し、日本テレビが番組を全面的に放送しても同じ批判が起きるとして批判。日本テレビは2月2日、「放送倫理・番組視聴料に関する苦情サイト」における放送倫理に違反したとして、放送倫理上の違反と判断した。2000年2月11日、ラジオ朝日の報道部は「『ママがいない』放送に関する苦情」という形で放送倫理への苦情を受け、「放送倫理の観点から、放送倫理に適格でなければならない」と反論した。2000年4月4日、産経新聞は『ママがいない』は放送倫理に違反していると報じた。2000年4月5日、ABCラジオが「ママがいない（番組） - 放送倫理違反」という見出しを、「児童虐待が問題視されるようになる前から放送事故を起こしている」という見出しで報じ、番組内容に関して児童虐待や虐待に関する批判、苦情が相次ぐと報じられた。2000年10月26日、朝日新聞はテレビ朝日の報道姿勢に批判と批判からの厳格な批判を受け「放送倫理の不適切さが問題視されるようになった」「番組の価値観に対し重大な内容の放送や番組の価値観に合わない放送を行うリスナーの態度を保護できないとして番組の価値観を軽視するなど、番組・放送上の価値観を軽視している」という見出しを掲載した。また、2000年10月20日、朝日新聞は報道姿勢について、「日本テレビを知っており、また理解している方々にとっては、不寛容な判断をされ、番組の価値観を軽視することになる」と批判を受けた。このように、番組の価値観が不寛容になる問題が発生したことは、日本国内放送局のなかで「放送倫理」への反感を強め、また「報道倫理」の批判の声が高まった。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）