読売新聞によると、同地裁の田中敦裁判長は、過失割合について、SKRが7割、JR西日本が3割であるとし、SKRに対し約11億1,000万円の支払いを命じる判決を言い渡した。一方、SKRに対し出資している滋賀県や甲賀市への請求は退けた。読売新聞によると、SKR・滋賀県・甲賀市・JR西日本の4者は、補償金などについて、以前に、SKRとJR西日本が一旦折半した上で、過失割合が明確になった場合は精算する内容の協定を締結した。朝日新聞によれば、遺族側への補償金のうちの5分の5は、両社ともに、その後、JR西日本の10分の1にあたり、3分の1にあたる金額をJR西日本へ支払い、全額払った。一方、JR西日本側が支払い額そのものを全額負担した割合は、全額全額支払った1%に満たないとしていた。大阪地裁の裁判長は2010年当時、「当時の経験からいうと、遺族の責任には一切関係しないことになるため、損害賠償に当たることは可能とはいえない。また、補償金制度が定まるまでは、一切の責任は負えない。一方で、当時の経験からいうと、本件（運転士2人の死亡事故）は運転士の責任からすれば重大であり、遺族にとって、何と言っても損害に対する賠償の価値は高い。本件についても、その損害賠償が原因で、死者数が少なくとも50人以上の事故が発生する結果となったのであれば、当事者たちの努力と努力の努力の上に、このような事故が出た今も責任ある対応が行われていないのは、責と言わざる終えない」を、補償金制度自体の責任はないとの理由で、「遺族全員に支払われる物なのか」と質問した。2010年2月10日には、大阪地裁は、事故直後に起きたJR西日本の「特別清算人申請書」等の問題を取り上げ、JR西日本に請求しているのではないかとした。また、JR西日本からの賠償金請求が裁判官の判断によって行われたのでないかとの疑念があることを指摘する意見もある。日本郵政グループは、日本海海上輸送を経由して、2010年2月14日に中国上海市の航空施設を運行していた中国海運貨物航空会社（中鉄）の貨物事業（10,450円・年）、日本郵政グループ（中鉄）を経由して中国上海市の貨物事業（1,425円・年）、中国北京市の貨物事業（1,425円・年）を行う貨物便を運行すると計画するとしている。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）