JFLによると、三菱水島FCは9月30日付け（UTC+9）でJFLにリーグ脱退届けの文章を提出していた。その理由として、「経済不況、およびその他諸事情からチームを運営する三菱自工・水島製作所の判断でJFLでの活動を続けるのが困難になった」としている。これを受けてJFLは臨時評議会を開催し、JFLでの成績に関係なく2009年を最後にJFLでの活動を終えることを承認した。読売新聞によると、三菱水島FCは2009年JFLでは現在最下位。JFL加盟チームの撤退は2003年のジヤトコ（経済不況の影響）、2004年の国士舘大学（部員不祥事の影響）、2008年の高知工業大学 (2006 年からJFA に昇格。2010年はJFAに復帰）、2009年JFLで最下位になった福岡大学（リーグ戦での実績がなく降格）と同様の結果である。また、2018年からは新たにJFA選抜へ降格し、2019年2月にはリーグから離脱することが明らかになった。なお 、三菱水島FCは、2008年3月にJFLへリーグからの脱退を申請した。2011年、JFAは1チームをJFLチームとし、その最下位クラブに降格を通知する方式を採用した。JFLの最下位クラブとJFA及び各選手会は、JFLのリーグ・マスコットや組織誌、マスコットキャラクターとの共演がある（後述）。
部分的にフェイク（記事の後半をAIモデルが生成した）