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user: 2. 实验部分 2.1. 实验药品与仪器 2.1.1. 实验药品 原料(S)-1，3-二(苄氧基)-4-(1，3-二噻烷-2-基)丁-2-酮通过已知路线 [ 8 ] 自己合成制备。CH 2 Cl 2 ，石油醚，乙酸乙酯，无水甲醇，吡啶，NaCl，NaHCO 3 ，MgSO 4 ，NaOH，Na 2 S 2 O 3 ，以上从天津市河东区广达服务部购买；醋酸酐，从天津市化学试剂供销公司购买；乙腈(99.9%超干溶剂，带分子筛)，2-碘酰基苯甲酸，草酰氯，二甲基亚砜，硅藻土，以上从百灵威公司购买；胸腺嘧啶，从Sharing Technbologies Co.，Let购买；三乙胺，四氢呋喃，从北京华威锐科化工有限公司购买；Dess-Martin氧化剂，CF 3 SiMe 3 ，氯化钯，N-溴代琥珀酰亚胺，三甲硅烷基三氟甲磺酸酯，4，4'-双甲氧基-三苯甲基-氯，N，N-二异丙基乙胺，以上从北京伊诺凯科技有限公司购买；四正丁基氟化铵，从希恩思奥普德科技有限公司购买；N，O-双(三甲基甲硅烷基)-乙酰胺，从塞墨飞实验室仪器销售中心购买；2-氰乙基N，N-二异丙基-氯代亚磷酰胺，从芜湖华仁科技有限公司购买；氢气，氩气从百思达气体有限公司购买；柱层析硅胶为青岛海洋公司生产的300~400目硅胶。 2.1.2. 实验仪器 核磁由Bruker公司AVANCE 400超导核磁共振谱仪测定；液相分析在waters公司的2695高效液相色谱分析仪上进行；质谱由waters公司的Xevo G2-XS Q-TOF质谱仪测定。 2.2. 实验方法 图1. C4'-CF 3 -α-L-脱氧胸苷亚磷酰胺单体的合成路线图 化合物2的合成。室温下将化合物1 1 g (2.7 mmol， 1 eq)溶于11 mL无水CH 2 Cl 2 ，加入Dess-Martin 1.38 g (3.2 mmol， 1.2 eq)室温反应1 h，TLC监测反应结束后，加入20 mL (1:4)的饱和Na 2 S 2 O 3 溶液和饱和NaHCO 3 溶液萃灭反应，CH 2 Cl 2 萃取，无水MgSO 4 干燥有机相，减压旋干溶剂。得到的粗产物采用柱层析(PE/EA = 15/1 – 13/1 – 10/1)分离，得到淡黄色固体2 858 mg (R f = 0.52， PE/EA = 5:1)，产率79%。 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 7.31 (m， 10H， -(C 6 H 5 ) 2 )， 4.57 (m， 2H)， 4.50 (m， 2H)， 4.41 (d， J = 18.0 Hz， 1H)， 4.30 (m， 1H，)， 4.26 (d， J = 18.2 Hz， 1H)， 4.07 (dd， J = 6.1 Hz， J = 8.8 Hz， 1H，)， 2.74 (m， 4H)， 2.22 (m， 2H)， 1.94 (m， 2H). 13 C NMR (100.6 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 208.3， 137.2， 128.6， 128.5， 128.2， 128.1， 128.0， 80.2， 73.4， 73.2， 72.9， 42.1， 37.3， 29.0， 28.7， 25.8. HRMS (ESI-TOF) m/z: [M + H] + Calcd for C 22 H 27 O 3 S 2 403.1402; Found 403.1387. 化合物3b的合成。Ar保护，室温下将化合物2 192.3 mg (0.50 mmol， 1 eq)溶于3.7 mL THF，然后缓慢滴加CF 3 SiMe 3 220 μL (1.49 mmol， 3 eq)，于15℃反应18 h，TLC监测反应物全部转化成中间产物后，加入497 μL四丁基氟化铵溶液(1 M in THF， 1 eq)，反应5 min，TLC监测中间产物全部转化成目标产物后，1 mL CH 3 OH萃灭反应，旋走THF和CH 3 OH，CH 2 Cl 2 萃取产物，无水MgSO 4 干燥有机相，减压旋干溶剂。得到的粗产物采用柱层析(PE/EA = 60/1 – 30/1 – 20/1 – 15/1)分离，得到淡黄色固体3a 31 mg (R f = 0.32， PE/EA = 10/1)，产率52%和3b 122 mg (R f = 0.30， PE/EA = 10/1)，产率52%。 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 7.37 – 7.30 (m， 10H， -(C 6 H 5 ) 2 )， 4.85 (d， J = 11.1 Hz， 1H)， 4.68 (d， J = 11.0 Hz， 1H)， 4.55 (dd， J = 12.2 Hz， J = 14.0 Hz， 2H)， 4.27 – 4.24 (m， 1H)， 4.00 (dd， J = 3.5 Hz， J = 10.9 Hz， 1H)， 3.80 (d， J = 10.0 Hz， 1H)， 3.60 (d， J = 10.0 Hz， 1H)， 3.48 (s， 1H)， 2.83 – 2.71 (m， 3H)， 2.64 – 2.57 (m， 1H)， 2.12 – 2.03 (m， 2H)， 1.93 – 1.81 (m， 2H). 13 C NMR(100.6 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 138.2， 137.1， 128.6， 128.5， 128.1， 128.0， 127.9， 127.7， 125.4 (q， J = 287.8 Hz， -CF 3 )， 76.96 (q， J = 25.5 Hz， -(CF 3 )C)， 75.8， 75.5， 73.8， 67.8， 43.3， 35.8， 30.0， 29.2， 25.9. HRMS (ESI-TOF) m/z: [M + H] + Calcd for C 23 H 28 F 3 O 3 S 2 473.1432. 3b: 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ) δ (ppm) 7.32 (m， 10H， -(C 6 H 5 ) 2 )， 4.66 (dd， J = 11.3 Hz， J = 15.4 Hz， 2H)， 4.56 (t， J = 8.3 Hz， 2H)， 4.26 (dd， J = 3.1 Hz， J = 8.8 Hz， 1H)， 3.99 (dd， J = 4.8 Hz， J = 10.0 Hz， 1H)， 3.73 (dd， J = 10.3 Hz， J = 36.1 Hz， 2H)， 3.52 (s， 1H)， 2.72 (m， 4H)， 2.23 (m， 1H)， 2.02 (m， 2H)， 1.84 (m， 1H). 13 C NMR (100.6 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 138.1， 137.1， 128.6， 128.5， 128.3， 128.1， 128.0， 127.9， 127.8， 127.6， 126.1 (q， J = 287.2 Hz， -CF 3 )， 76.5， 75.8 (q， J = 26.09 Hz， -(CF 3 )C)， 74.6， 73.9， 67.3， 44.0， 36.8， 30.1， 29.6， 25.9. HRMS (ESI-TOF) m/z: [M + H] + Calcd for C 23 H 28 F 3 O 3 S 2 473.1432; Found 473.1458. 化合物4的合成。配制6 mL 80%的CH 3 CN溶液，将NBS 980 mg (5.5 mmol， 6 eq)溶解，总共取5 mL CH 3 CN溶解化合物3b 431.7 mg (0.91 mmol， 1 eq)。Ar保护下于5℃将溶解的3b逐滴滴加到NBS中，反应10 min，TLC监测反应结束后，6 mL饱和Na 2 S 2 O 3 溶液萃灭反应，减压旋走CH 3 CN。加入CH 2 Cl 2 萃取，用饱和NaHCO 3 溶液洗涤有机相，最后用饱和NaCl溶液洗涤有机相，无水MgSO 4 干燥，减压旋干溶剂。将得到的粗产物与无水吡啶共旋两次，于室温下溶于10 mL无水吡啶中，将反应体系转移到0℃，向反应体系中逐滴滴加Ac 2 O 0.33 mL (3.45 mmol， 11 eq)。滴加完成后，室温下反应2 h，TLC监测反应结束后，旋走吡啶，加入4 mL饱和NaHCO 3 溶液萃灭反应，CH 2 Cl 2 萃取，无水MgSO 4 干燥有机相。减压旋干溶剂，得到的粗产物采用柱层析分离(PE/EA = 40/1 – 20/1 – 10/1)，最后得到白色固体4 338 mg (R f = 0.42， PE/EA = 10/1)，产率87.4%。 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 7.36 – 7.32 (m， 10H， -(C 6 H 5 ) 2 )， 6.36 (d， J = 5.2 Hz， 1H， H1′)， 4.67 – 4.53 (m， 5H， -(CH 2 ) 2 ，H3′)， 3.86 (d， J = 10.4 Hz， 1H， H5′)， 3.73 (d， J = 10.4 Hz， 1H， H5′′)， 2.53-2.46 (ddd， J = 5.4 Hz， J = 9.7 Hz， J = 15.1 Hz， 1H， H2′)， 2.29 – 2.24 (m， 1H， H2′′)， 2.02 (s， 3H， -CH 3 ). 13 CNMR(100.6 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 169.8， 137.9， 137.4， 128.5， 128.4， 128.0， 127.6， 127.5， 124.5 (q， J = 284.3 Hz， -CF 3 )， 96.5， 86.0 (q， J= 28.2 Hz， -(CF 3 )C)， 77.7， 74.0， 73.3， 67.4， 38.1， 21.0. HRMS (ESI-TOF) m/z: C 22 H 23 F 3 NaO 5 ， [M + Na] + cal. 447.1395; found， 447.1380. 化合物5a和5b的合成。Ar保护下，取胸腺嘧啶2.6 g (20.8 mmol， 1.5 eq)加入到40 mL无水CH 3 CN中，于80℃油浴回流条件下，将N，O-双(三甲基硅基)乙酰胺10.7 mL (41.6 mmol， 3 eq)加入到反应体系中反应1 h，当白色固体完全溶解后，将化合物4 5.88 g (13.9 mmol， 1 eq)用20 mL无水CH 3 CN溶解后滴加到反应体系中，最后将TMSOTf 12.67 mL (69.3 mmol， 5 eq)滴加到反应体系中，于80℃回流反应2 h，TLC监测反应结束后，减压旋干CH 3 CN，将反应体系用饱和NaHCO 3 溶液萃灭，CH 2 Cl 2 萃取，饱和NaCl溶液洗涤有机相，无水MgSO 4 干燥。减压旋干溶剂，得到的粗产物采用柱层析分离(PE/EA = 2/1 – 1/1)，得到目标产物5b 2.93 g (R f = 0.31， PE/EA = 4/1)，产率43%和另一个非对应异构体5a 2.86 g (R f = 0.29， PE/ EA = 4/1)，产率42%。5a: 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 9.33 – 8.98 (m， 1H， -NH)， 7.35 – 7.25 (m， 10H， (-C 6 H 5 ) 2 )， 7.09 (s， 1H， H6)， 6.46 (t， J = 6.6 Hz， 1H， H1′)， 4.64 – 4.55 (m， 4H， (-CH 2 ) 2 )， 4.48 (dd， J = 4.3 Hz， J = 6.4 Hz， 1H， H3′)， 3.91 (d， J = 10.6 Hz， 1H， H5′)， 3.83 (d， J = 10.4 Hz， 1H， H5′′)， 2.68 – 2.62 (m， 1H， H2′)， 2.24 – 2.17 (m， 1H， H2′′)， 1.92 (s， 3H， -CH 3 ). 13 C NMR (100.6 MHz， CDCl 3 ) δ(ppm) 163.7， 150.3， 137.5， 136.9， 134.8， 128.6， 128.4， 128.2， 127.8， 127.7， 127.6， 124.5 (q， J = 285.4 Hz， -CF 3 )， 111.8， 83.6 (q， J = 28.2 Hz， -(CF 3 )C)， 85.8， 78.1， 74.0， 73.1， 67.6， 37.8， 12.7. HRMS (ESI-TOF) m/z:C 25 H 26 F 3 N 2 O 5 ， [M + H] + cal. 491.1794; found， 491.1828. 5b 1 H NMR (400 MHz， CDCl 3 ): δ (ppm) 10.21 – 9.48 (m， 1H， -NH)， 7.73 (s， 1H， H6)， 7.43 – 7.36 (m， 10H， (-C 6 H 5 ) 2 )， 6.40 (dd， J = 6.2 Hz， J = 8.3 Hz， 1H， H1′)， 4.74 – 4.58 (m， 4H， (-CH 2 ) 2 )， 4.51 (t， J = 7.7 Hz， 1H， H3′)， 3.97 (t， J = 10.8 Hz， 2H， H5′， H5′′)， 2.68 – 2.62 (m， 1H， H2′)， 2.31 – 2.24 (m， 1H， H2′′)， 1.55 (s， 3H， -CH 3 ). 13 C NMR (100.6 MHz， CDCl 3 ) δ(ppm) 164.0， 150.7， 137.3， 137.0， 135.8， 128.7， 128.6， 128.3， 128.2， 127.9， 127.8， 124.6 (q， J = 285.2 Hz， -CF 3 )，111.9， 85.2 (q， J = 27.5 Hz， -(CF 3 )C)， 82.9， 77.6， 74.1， 73.5， 67.3，37.6， 12.1. HRMS (ESI-TOF) m/z:C 25 H 26 F 3 N 2 O 5 ， [M + H] + cal. 491.1794; found， 491.1828. 化合物6的合成。H 2 保护下，取化合物5b 1.58 g (3.2 mmol， 1 eq)溶于20 mL无水CH 3 OH中，加入 PdCl 2 2.1 g搅拌反应2 h，TLC监测反应结束后，使用硅藻土抽滤，除去不溶固体，减压旋干CH 3 OH。得到白色固体粗产物采用柱层析分离(PE/EA = 2/1-1/1-1/1.5-1/3)，得到白色固体6 945 mg (R f = 0.4， PE/ EA = 1/3)，产率95%。 1 HNMR (400 MHz， D 2 O): δ (ppm) 7.32 (s， 1H， H6)， 6.36 (t，J = 6.6 Hz， 1H， H1′)， 4.88 (t，J = 6.2 Hz， 1H， H3′)， 3.95 (d， J = 12.8 Hz， 1H， H5′)， 3.84 (d， J = 12.8 Hz， 1H， H5′′)， 2.58 – 2.44 (m， 2H， H2′， H2′′)， 1.80 (s， 3H， -CH 3 ). 13 CNMR(100.6 MHz， D 2 O): δ (ppm) 166.2， 151.7， 136.8， 124.5 (q， J = 284.4 Hz， -CF 3 )， 111.8， 86.4 (q， J= 26.5 Hz， -(CF 3 )C)，85.3， 70.7， 59.3， 37.9， 11.5. 19 FNMR (376 MHz， d 6 -DMSO): δ (ppm) -77.03.HRMS (ESI-TOF) m/z: C 11 H 13 F 3 N 2 NaO 5 ， [M + Na] + cal. 333.0674; found， 333.0661. 化合物7的合成。Ar气保护下，将化合物6 850 mg (2.74 mmol， 1 eq)溶于10 mL无水吡啶中，加入DMTr-Cl 928 mg (3.01 mmol， 1.1 eq)，常温搅拌反应4 h，TLC监测反应结束后，加入3 mL甲醇萃灭反应，旋干体系，得到的粗产物采用柱层析分离(PE/EA = 2/1 – 1/1 – 1/1.5 – 1/3，加入1%三乙胺)，最后得到白色固体7 1.39 g (R f = 0.46， PE/EA = 1/1)，产率83%。 1 H NMR (400 MHz，CDCl 3 ) : δ (ppm) 9.51 (m， 1H， -NH)， 7.43 – 7.31 (m， 9H， ArH)， 7.14 (s， 1H， H6)， 6.87 – 6.85 (m， 4H， ArH)， 6.57 (dd， J = 6.5 Hz， J = 7.8 Hz， 1H， H1′)， 4.78 (d， J = 5.7 Hz， 1H， H3′)， 3.78 (s， 6H， (-OCH 3 ) 2 )， 3.68 (d， J = 9.9 Hz，1H， H5′)， 3.43 (d， J = 9.8 Hz，1H， H5′′)， 2.49 – 2.45 (m， 1H， H 2 ′)， 2.27 – 2.20 (m， 1H， H 2 ′′)， 1.92 (s， 3H，-CH 3 ). 13 C NMR (100.6 MHz， CDCl 3 ) δ(ppm) 163.7， 158.9， 150.5， 143.6， 134.3， 129.8， 128.2， 127.7， 127.3， 124.8 (q， J = 284.4 Hz， -CF 3 )， 113.6， 112.1， 87.8， 86.9 (q， J= 26.9 Hz， -(CF 3 )C)， 85.5， 72.6， 55.2， 39.7， 12.8.HRMS (ESI-TOF) m/z:C 32 H 31 F 3 N 2 NaO 7 ， [M + Na] + cal. 635.1981; found， 635.2054. 化合物8的合成。Ar气保护下，将化合物7 1.4 g (2.28 mmol， 1 eq)溶于15 mL无水CH 2 Cl 2 中，加入DIPEA 3 mL (18.28 mmol， 8 eq)，常温搅拌3 min后，加入N，N-二异丙基氯代亚磷酰胺 2 mL (4.57 mmol， 4 eq)，常温搅拌反应30 min。TLC监测反应结束后，加入2 mL甲醇萃灭反应，减压旋干体系。将得到的粗产物采用快速柱层析分离(PE/EA = 1/1，加入1%的三乙胺)，得到粗产物1.58 g，将粗产物溶于2 mL CH 2 Cl 2 中，分别滴加到4个装有10 mL正己烷的样品瓶中沉淀，得到白色晶状固体8 1.38 g，产率75%。 1 H NMR (400 MHz，CDCl 3 ): δ (ppm) 1 H NMR (400 MHz，CDCl 3 ): δ(ppm) 7.49 – 7.20 (m， 9H， ArH)， 7.17 (s， 1H， H6)， 6.86 – 6.84 (m， 4H， ArH)， 6.52 (t， J = 6.6 Hz， 1H， H1′)， 4.83 – 4.78 (m， 1H， H3′)， 3.77 (s， 6H， (-OCH 3 ) 2 )， 3.53 – 3.47 (m， 5H)， 3.09 (s， 1H)， 2.68 – 2.62 (m， 1H， H2′)， 2.54 – 2.52 (m， 1H， H2′′)， 2.38 – 2.35 (m， 3H)， 1.96 (s， 3H， -CH 3 )， 1.06 – 1.04 (d， 12H， (-CH 3 ) 4 ). 31 P NMR (162 MHz， CDCl 3 ) δ: 150.781 (s， 1P). HRMS (ESI-TOF) m/z: C 41 H 48 F 3 N 4 NaO 8 P， [M + Na] + cal. 835.3060， found， 835.3058; C 41 H 49 F 3 N 4 O 8 P， [M + H] + cal. 813.3240， found， 813.3243.