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user: 2. 量子化学理论计算在抗癌金属配合物的应用 金属配合物在抗肿瘤活性方面同样有着杰出的表现 [ 6 ] - [ 10 ]，顺铂是全世界应用最广泛的抗肿瘤药物之一。目前，针对癌症的治疗手段主要采取化疗为主，这使得许多国家在寻找和筛选具有良好抗癌活性物质方面的投入逐年上升，但是，极低的成功率不仅耗时耗力，往往还取不到理想的结果。近年来，随着计算化学的发展，利用量子化学计算方法来研究配合物结构对活性的影响已然成为热点。利用量化参数及其他常用的参数建立定量构效关系(Quantitative Structure-Activity Relationship， QSAR)模型的研究，不仅可以从结构上来解释配合物抗肿瘤活性，还对模型有一定的解释与预测能力 [ 11 ]。接下来，本文着重对量子化学理论计算在抗肿瘤金属配合物设计研发中的应用进行介绍，希望为相关研究人员提供一份参考。 2.1. 铂类抗癌金属配合物及其衍生物 众所周知，铂类抗癌药物是一类细胞周期非特异性药物。如图1所示，顺铂的抗癌机制主要是其进入肿瘤细胞后通过水合配离子的形式与DNA结构形成Pt-DNA加合物，从而介导肿瘤细胞坏死或凋亡，进而产生抗癌效果。图2为三种常见铂类药物的结构图，此类药物作为目前应用最广泛的抗肿瘤配合物，相关的量子化学计算研究也最多，本文将分别列举部分相关研究。 图1. 顺铂的水解机制 [ 12 ] 2.1.1. 顺铂及其衍生物 顺铂作为第一个上市的铂类抗肿瘤药物和应用最广的铂类配合物，最早被作为量子化学计算研究的对象。为了深入了解顺铂类抗癌药物的抗癌作用机理，许多科研人员通过对顺铂及其衍生物的水解过程以及与DNA之间的作用机理进行了系统的理论计算研究。例如，Deubel等研究人员通过采用密度泛函理论(Density functional theory， DFT)与连续介质模型(Continuum dielectric model， CDM)相结合的方法，比较了抗癌药物顺铂的三种水解反应，计算结果表明水解产物脱质子更容易形成顺式[Pt(NH 3 ) 2 (OH 2 )(OH)] + ，为顺式[Pt(NH 3 ) 2 (OH 2 )(OH)] + 是否具抗癌活性提供理论依据 [ 13 ]。Truong等人采用B3LYP方法，对cis-[PtCl 2 (Pram)(Mepz)]进行了结构优化和能量计算，对cis-[PtCl 2 (Pram)(Mepz)]与DNA的鸟嘌呤之间的相互作用进行详细的研究，通过比较不同水解的能量高低的方式来解释顺铂衍生物水解的优先次序问题，为配合物在体内的作用方式提供理论依据。Truong等人还研究了PtGMpz最稳定构象的红外光谱，观察氢键对其振动频率的影响，表明cis-[PtCl 2 (Pram)(Mepz)]在人类细胞系中的细胞毒性低于顺铂。这一结果为早期的实验研究提供了理论支持 [ 14 ]。 Grazianiv等人在B3LYP方法下计算双吡啶顺铂类似物的第一和第二水化过程的热力学和动力学参数，以及生成的一水合双吡啶类似物和二水合双吡啶类似物与鸟嘌呤的反应参数。结果表明顺铂的双吡啶类似物对水的反应性明显比顺铂低，但形成的水合物对鸟嘌呤具有良好的反应活性，从而推测顺铂的双吡啶类似物具有更好的抗癌活性 [ 15 ]。Baik等人利用密度泛函结合连续溶剂化模型，通过轨道分析解释不同垒势高度，得知鸟嘌呤相对于腺嘌呤来说具有更强的分子相互作用，从而揭示了顺铂为什么更易与鸟嘌呤结合 [ 16 ]。Alberto等人采用密度泛函理论和类导体介质连续介质模型相结合的方法，在中性和酸性条件下对铂衍生物奈达铂的水解反应过程进行了研究，获得了其作用机理的详细数据，进一步确定抗癌配合物奈达铂在体内的水解过程以及作用机理 [ 17 ]。 2.1.2. 卡铂及其衍生物 卡铂是进入临床的第二代铂类配合物，在结构上以环丁烷二羧酸取代顺铂分子上的两个氯离子，增加了配合物的水溶性，其胃肠道毒性低于顺铂，病人的耐受程度相对更高。卡铂同顺铂一样，都是通过结合DNA鸟嘌呤的N7和O6原子，从而产生细胞毒作用的，那卡铂在体内的水解过程是否也是跟顺铂一样的呢？Pavelka和Maria等人采用密度泛函理论和类导体介质连续介质模型(Conductor-like dielectric continuum model， CPCM)相结合的方法研究第二代铂类抗癌药物卡铂的水解反应机理，研究表明，卡铂在水中的分解是通过一种双相机制进行的，与顺铂并不一样，同时我们知道了卡铂与DNA反应之前经历水化过程应该是双重水化并伴随开环过程 [ 18 ]。 Janina和Jerzy等人利用密度泛函理论和超分子方法对卡铂生物转化中水解和电子驱动过程进行了一个对比研究，探索了两种完全不同的卡铂生物活化模型的途径：1) 基于卡铂水化的范例；2) 基于电子转移过程控制转化的新假设。揭示了卡铂是一种能与DNA发生细胞毒性相互作用的活性药物，不仅是烷基化剂，电子受体也一样，进而得到卡铂的杂交转化比水解更有利的结论 [ 19 ]。Rezazadeh等人研究了卡铂在气相和液相中的结构、电子分布和光谱性质，基于可极化连续介质模型(Polarizable Continuum Model， PCM)研究溶剂对配合物结构参数、前沿轨道能量和光谱参数的影响。发现了配合物在液相中更稳定，并随溶液介电常数的增大，稳定性也随之增加，偶极矩也随之增加 [ 20 ]。 2.1.3. 奥沙利铂及其衍生物 奥沙利铂是第一个明显对结肠癌有效及在体内外均有广谱抗肿瘤活性的铂类抗肿瘤药物，对耐顺铂的肿瘤细胞亦有作用。虽然奥沙利铂的水解机制目前尚未完全清楚，但可以肯定的是第三代抗癌药物奥沙利铂的水解在该化合物到达DNA前的活化过程中发挥重要作用。Lucas等人采用DFT和类导体介质连续介质模型(CPCM)相结合的方法，分别研究了水分子离去与开环进行过程所分别对应的第一水解和第二水解。计算得到的势能面表明，与中性环境相比，酸性条件有利该反应的进行，与DNA反应的应该是配合物的单水络合物 [ 21 ]。由于DNA本身就是酸性物质，这或许可以为我们解释奥沙利铂的广谱抗肿瘤活性提供依据。Carrasco等人通过分子对接、分子动力学、量子计算等手段研究了嵌入赫赛汀(曲妥珠单抗)的一种新型奥沙利铂衍生物的稳定性，为设计新的靶向铂类抗癌药物提供了一种新思路 [ 22 ]。通过这种思路，未来或许可以尝试将抗癌金属配合物与合适的载体结合，以提高靶向性，从而降低毒副作用。 图2. 常见铂类药物结构 2.2. 非铂类抗癌金属配合物 铂类抗癌金属配合物虽然在临床上广泛地使用，但目前临床应用的铂类药物的副作用使得人们不仅把目光投向铂类及其衍生物的更深层面研究中，更投向了与铂同主族或同周期的一些过渡金属或者是货币金属的身上，比如说钌、钴、锇、铜等，以期待能够研发出低毒高效的抗癌金属配合物。图3为本文所列举的几类非铂类金属配合物的结构式。 2.2.1. 金属钌配合物 钌是继铂之后最被广泛用于抗肿瘤配合物研究的过渡元素金属。Shaun等人通过采用密度泛函理论(DFT)测定钌芳烃络合物分子间的相互作用强度和几何形状，得知钌芳烃化合物更容易与DNA分子结合，同时表明随着芳烃分子的体积扩大，会导致更大的DNA畸变，导致细胞更易坏死，这可能是由于插入是发生在芳环与DNA双链之间所致 [ 23 ]。陈金灿等人采用密度泛函理论(DFT)研究一系列结构相关的钌(II)抗肿瘤复合物与DNA嘌呤碱基不同位点结合的相关热力学参数。该项目利用类导体屏蔽模型(conductor-like screening model， COSMO)模型，在B3LYP方法下计算得到了钌(II)-DNA模型复合物(化合物1)在气相与水相中的键离解焓与自由能，理论计算结果表明，鸟嘌呤N7是该系列配合物的首选位点，根据结构和热力学特征，得到相关的构效关系，从理论上解释了这一系列结构相关的抗肿瘤配合物在细胞毒性上的显著差异 [ 24 ]。Jain通过对含N，N–水杨醛–乙基二亚胺(Salenh2)的钌(II)亚硝基配合物的光动力学进行研究，结果显示出其具有良好的药物递送性能，在化疗与光疗法中都是良好的候选物质，表明该抗癌物可能会是一种良好的抗癌配合物 [ 25 ]。郑康成等人对钌配合物NAMI-A (化合物2)采用密度泛函理论(DFT)研究了咪唑和二甲亚砜的水溶剂效应，同时采用类电导介质连续介质模型(CPCM)进行计算，其理论结果为NAMI-A的水解机理提供了结构特性和详细的能量谱，有助于了解钌配合物与生物分子靶点的反应机理 [ 26 ]。 2.2.2. 其他过渡金属配合物 除了在钌配合物上的研究，量子化学理论计算也广泛应用在其他过渡金属配合物上。六核铼配合物是一种很有前途的抗肿瘤配合物，Alvarado等采用密度泛函理论(DFT)检测[Re 6 Se 8 (OH) 2 (H 2 O) 4 ]与鸟嘌呤嘌呤基的结合。采用零阶正则逼近(ZORA)-PW91水准模拟了鸟嘌呤结合物在水中的几何结构，通过计算键能，比较铼簇的顺式结构与反式结构，从而解释了[Re 6 Se 8 (OH) 2 (H 2 O) 4 ]和DNA之间可能的相互作用方式 [ 27 ]。Koray等人采用B3LYP方法对锇配合物(化合物8)的一系列量子化学性质进行计算，来确定配合物的反应活性等级跟活性位点。结果表明，锇配合物是一种很好的候选抗癌药物 [ 28 ]。 在一项探讨DNA与铜基配合物(化合物9)间的分子识别的研究中，Rodrigo等人通过量子化学计算的方法寻找DNA链与铜配合物之间的最佳结合位点。初步探讨了铜配合物作为凋亡诱导剂的机理，为今后该类药物的设计提供了指导 [ 29 ]。Dirk等人利用密度泛函理论(DFT)与连续介质模型(CDM)相结合的方法，通过对中间体与过渡态的能量计算，阐明了瓜氨酸与四羧酸铑配合物(化合物10)相结合的机理 [ 30 ]。Muhammed和Dharmasivam等人采用B3LYP方法对一类新型的吡啶基双核镍、铜、锌配合物(化合物11)进行理论计算，优化其几何构型并计算其HOMO-LUMO能级差，发现它们可作为潜在的优秀的金属抗癌药物 [ 31 ]。Judit和Leszczynski等人从量子化学计算的视角对抗癌钛新稀衍生物的作用机理进行研究，用密度泛函理论(DFT)计算五种药物候选体(化合物3~7)的水合形态。结果表明，细胞毒性的差异可能与水解产物的溶剂化性质有关，而与这些物质的气相性质无关 [ 32 ]。 图3. 非铂类金属配合物1~11的结构 [ 24 ] [ 26 ] [ 28 ] - [ 32 ]