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user: 3. 甘薯主要的苯丙烷类代谢相关酶基因研究进展 苯丙氨酸解氨酶催化L-苯丙氨酸脱去氨基形成反式肉桂酸，并在肉桂酸-4-羟化酶作用下羟基化形成反式-4-香豆酸，此为苯丙烷类代谢的核心途径。随后分别在香豆酸-3-羟化酶，4-香豆酸辅酶A连接酶、乙酰转移酶、查尔酮合成酶等酶作用下进入木质素、绿原酸以及黄酮类化合物(花青素等)合成的代谢途径。 3.1. 苯丙烷类代谢核心途径相关酶基因的研究 苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanin ammonia-lyase， PAL)，催化L-苯丙氨酸脱去氨基生成反式肉桂酸，是苯丙烷类公共代谢的第一步关键酶和限速酶，连接初级代谢与苯丙烷代谢。因此，PAL是苯丙烷代谢途径相关酶基因研究中研究最多的酶。Tanaka等克隆了甘薯PAL的cDNA序列，包含一个长为2121 bp的开放阅读框、编码707个氨基酸、22 bp的5′非编码区和207 bp的3′非编码区，并且推测PAL对甘薯受伤做出应答 [ 36 ]。研究表明，甘薯PAL功能还体现在抗病性上，青枯病和黑斑病病原菌侵入甘薯体内会导致PAL酶活性明显升高，因此，PAL活性可作为甘薯青枯病和黑斑病的一个检测指标 [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]。 肉桂酸-4-羟化酶(Cinnamate-4-hydroxylase， C4H)：苯丙烷类物质公共代谢途径中第二步酶，催化苯丙氨酸代谢途径的第一个氧化反应，即催化肉桂酸羟基化形成反式-4-香豆酸。C4H是第一个被发现并成功克隆鉴定的编码P450单加氧酶的基因。杨春贤等利用RACE技术首次从甘薯中得到编码C4H的基因，命名为IbC4H [ 40 ]。经序列分析显示，此甘薯IbC4H长1668 bp，编码505个氨基酸。王爱民等从紫甘薯中成功克隆的IbC4H可响应逆境信号，提高甘薯的抗旱性 [ 41 ]。 3.2. 甘薯花青素的合成通路相关酶基因的研究 3.2.1. 甘薯花青素合成途径中相关酶基因的研究 花青素的合成代谢是类黄酮代谢途径中最重要的分支，由4-香豆酰–CoA连接酶催化香豆酸生成丙二酰辅酶A进入花青素合成，经查尔酮、黄酮醇柚皮素、二氢黄烷醇、二氢杨梅酮后合成各种花色素苷。甘薯花青素合成通路中已被克隆的相关酶基因包括查尔酮合成酶、查尔酮异构酶、类黄酮3′-羟化酶、二羟基黄酮醇还原酶、花青素合成酶、花青素还原酶和花青素3-O-糖苷-2″-葡萄糖基转移酶等。植物中花青素生物合成途径，如图2所示： 图2. 植物中花青素生物合成途径 [ 59 ] 查尔酮合成酶(Chalcone synthase， CHS)催化丙二酰辅酶A与香豆酰辅酶A生成柚皮素查尔酮，为黄酮类次级代谢提供原料。CHS不仅参与色素的形成，而且还与植物体内多种生理过程密切相关。甘薯中克隆得到的查尔酮合成酶基因，命名为IbCHS1，其cDNA全长1556 bp，其中包含编码388个氨基酸的1167 bp的开放阅读框。研究表明，IbCHS1基因主要在紫甘薯中表达，其表达水平与不同品种的甘薯花青素的含量呈正相关 [ 42 ]。 查尔酮异构酶(Chalcone isomerase， CHI)是合成花青素途径的一个上游关键酶，催化查尔酮异构化形成黄酮醇柚皮素。查尔酮异构酶超家族包括四种类型的CHI蛋白，即具有CHI蛋白酶活性的Ⅰ型、Ⅱ型，脂肪酸结合蛋白Ⅲ型和目前尚未具体了解其功能的IV型 [ 43 ]。甘薯中已被报道的两种CHI基因都属于Ⅰ型。徐靖等利用RT-PCR技术克隆了IbCHIL1， cDNA全长857 bp，包含编码206个氨基酸残基长621 bp的开放阅读框。IbCHIL1主要在紫肉甘薯中表达，其表达水平与花青素积累呈正相关 [ 44 ]。Guo等从紫甘薯中分离克隆的CHI基因全长cDNA序列，并命名为IbCHI，该基因包含一个732 bp的开放阅读框，编码一个243氨基酸多肽，并进一步表明IbCHI是负责甘薯花青素早期阶段合成通路中的关键酶 [ 45 ]。 类黄酮3′-羟化酶(Flavonoid 3'-hydroxylase， F3′H)是一个细胞色素P450依赖酶，在花青素合成中的羟基化起着重要作用，催化黄酮醇柚皮素(Naringenin)转化酶为二氢黄烷醇(Dihydrokaempferol)。Zhou等克隆了甘薯IbF3′H，cDNA全长1789 bp，含1554 bp的开放阅读框，编码518个氨基酸。研究表明，在花青素积累较多紫甘薯块根中，IbF3′H具有较高水平的表达，而IbF3′H不表达的白心甘薯块茎中花青素含量远低于紫薯块茎 [ 46 ]。 二羟基黄酮醇还原酶(Dihydroflavonol-4-Reductase， DFR)是合成花青素途径的一个下游关键酶，催化二羟基黄烷醇还原成无色花青素，与植物花色的修饰相关。赵宝杰等从紫甘薯块根中克隆的IbDFR基因，其cDNA全长l232 bp，编码398个氨基酸 [ 47 ]。有研究表明，甘薯在受冷害、损伤时，IbDFR的表达明显升高。IbDFR不仅在类黄酮代谢中承担角色，还有助于提高花青素在胁迫条件下清除活性氧自由基的能力 [ 48 ]。 花青素合成酶(Anthocyanin synthesis， ANS)是合成花青素途径倒数第二步的关键酶，催化无色花青素着色变成有色花青素。zhou等从紫肉甘薯中分离出IbANS全长cDNA序列，该基因包含了一个长1086 bp，编码362个氨基酸的开放阅读框 [ 49 ]。Liu等研究还发现，IbANS的表达与花青素的含量呈正相关，且在紫甘薯块根的表达水平远高于茎、叶等器官 [ 50 ]。 花青素还原酶(Anthocyanidin reductase， ANR)是原花青素代谢途径上的关键酶，催化矢车菊素转化成表儿茶素(2，3-顺式黄烷-3-醇)，进一步向液泡中转运并聚合成原花青素。武传建等从徐薯3号中克隆出了一个编码ANR的IbANR基因，并发现了该基因的内含子多态性较高 [ 51 ]。 花青素3-O-糖苷-2″-葡萄糖基转移酶(3-O-glucoside-2″-O-glucosyltransferase， 3GGT)催化花青素3-O-糖苷转化为花青素3-O-槐糖苷。现已从甘薯cDNA库中鉴定出全长为1380 bp，编码459个氨基酸的基因序列。Ib3GGT糖基化发生在细胞质基质，并且受到IbMYB1转录因子基因的调控。Ib3GGT利用尿苷二磷酸葡萄糖(UDP-glucose)作为糖供体催化花青素3-O-糖苷转化为花青素3-O-槐糖苷。Ib3GGT上的138号苏氨酸(Thr-138)残基用以选择性识别糖供体，从而维持花青素的多样性与稳定性 [ 52 ]。 类黄酮3-葡萄糖基转移酶(UDP-glucose: flavonoid 3-O-glucosyltransferase， UF3GT)催化葡萄糖基转移到花青素的3-羟基，在花青素生物合成途径中产生第一个稳定的中间体。从甘薯分离鉴定出IbUF3GT的全长cDNA序列1541 bp，包含1359 bp的开放阅读框，编码452个氨基酸。并进一步克隆了IbUF3GT的启动子序列，实验结果表明其转录启动活性的关键元件位于−758至−633 bp的区域，其转录水平可能受转录调控因子MYB、MYC和光、水杨酸及赤霉素的调控 [ 53 ]。 3.2.2. 甘薯花青素合成转录调控因子 现已经明确，调控花青素合成的转录因子主要有MYB家族、BHLH家族、WD40家族。Dong等从紫肉甘薯中克隆的IbWD40，全长1427 bp，含1032 bp开放阅读框，编码含343个氨基酸的多肽链。IbWD40主要位于细胞核中参与转录调控，在花青素等类黄酮物质的合成调控中起着至关重要的作用 [ 54 ]。从紫甘薯中分离的MYB类转录因子IbMYB1的cDNA序列长1186 bp，该转录因子可以激活花青素合成途径中的结构基因的表达从而调控甘薯块根中花青素的生物合成 [ 55 ] [ 56 ] [ 57 ]。根据甘薯转录组数据，徐靖等采用RT-PCR技术从甘薯中克隆了长度为2120 bp的bHLH转录因子家族的IbGL3基因，该基因包含一个编码625个氨基酸、长度1878 bp的开放阅读框。IbGL3属于Ⅲf亚类成员，其表达水平与花青素积累呈正相关，在紫肉甘薯中的表达量最高，其次是浅紫肉甘薯，在白肉甘薯中的表达量最低 [ 58 ]。 3.3. 绿原酸及木质素的合成通路相关酶基因的研究 3.3.1. 甘薯绿原酸合成通路的研究 绿原酸合成过程中主要涉及两个关键酶：一是奎宁酸肉桂酸羟基化转移酶(Quinatehydroxylcinnamoyl transferase， HQT)，该酶催化咖啡酰辅酶A与奎宁酸反应生成咖啡酰奎宁酸(绿原酸)；二是乙酰转移酶(Hydroxylcinnamoyl transferase， HCT），该酶催化羟基化香豆酰辅酶A与香豆酰莽草酸或香豆酰奎宁酸反应，生成绿原酸。绿原酸生物合成途径研究主要集中在茄科作物中，甘薯中绿原酸的生物合成途径及调控尚未见报道，参与其合成过程中重要的酶、关键基因、调控因子，都有待进行深入研究。 3.3.2. 甘薯木质素合成通路的研究 植物中主要存在三种木质素，即H-木质素、G-木质素、S-木质素，其合成过程中主要有3个关键酶，即4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate coenzyme A ligase， 4CL)、肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase， CCR)和肉桂醇脱氢酶(Cinnamyl alcohol dehydrogenase， CAD)。目前没有甘薯木质素合成途径中相关酶的研究报道，而其合成调控因子可以找到相关研究。miR828通过调节下游靶基因IbMYB和IbTLD的表达而增加了木质素的合成 [ 60 ]。在甘薯中关于木质素的合成代谢及其调控因子的研究仍需进一步扩充。