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user: 3. 结果 3.1. 岩陀有效成分的筛选 通过《中华本草》、中国知网、PubMed、TCMSP等数据库共得到岩陀治已报道的47个化学成分，根据ADME参数(OB ≥ 30%和DL ≥ 0.18)或生物活性(文献已有报道)为标准，共筛选得到9个有效成分，结果见表1。 Table 1 Related parameters of effective components of Rodgersia sambucifolia Hems Mol ID 成分 英文名 靶点数 OB (%) DL MOL002816 岩白菜素 Bergenin 110 14.11 0.34 MOL000098 槲皮素 quercetin 205 46.43 0.28 MOL002815 熊果苷 Arbutin 17 6.82 0.15 MOL000298 麦角甾醇 ergosterol 6 14.29 0.72 MOL000513 没食子酸 Gallic acid 25 31.69 0.04 MOL000263 齐墩果酸 oleanolic acid 82 29.02 0.76 MOL001807 紫丁香酸 Cedar acid 60 47.78 0.06 MOL000492 (+)-儿茶素 (+)-catechin 11 2.06 0.7 MOL000359 β-谷甾醇 β-sitosterol 103 36.91 0.75 表1. 岩陀有效成分的相关参数 3.2. 岩陀有效成分的靶点预测 将TCMSP、Swiss Target Prediction数据库检索得到的所有靶点，删除重复靶点，最终得到9个有效成分对应的靶点，共计422个靶点，结果见表1。通过Gene Cards数据库共检索整合得到962个疾病靶点。 3.3. 岩陀治疗慢性支气管炎潜在靶点的筛选 将药物靶点与疾病靶点进行取交集，得到151个交集靶点，并绘制韦恩图，结果见图1。利用String数据库(https://string-db.org/)构建PPI网络，并采用cytoscape 3.6.1软件对PPI网络进行可视化分析，得到所有节点三个拓扑参数的中位数值分别为34 (Degree)、0.0016 (Betweenness centrality)、0.5556 (Closeness centrality)，选取满足筛选标准的节点，作为潜在靶点，结果见表2；同时采用cytoscape3.6.1软件构建“潜在靶点”PPI网络，结果见图2。 图1. 岩陀治疗慢性支气管炎交集靶点韦恩图 图2. 岩陀治疗慢性支气管炎交集靶点蛋白互作网络(节点的大小和不同颜色代表Degree值的大小，节点越大Degree 值越大，Degree值越大表明靶点越相关) Table 2 Related topological parameters of the potential targets of Rodgersia sambucifolia Hemsl. in the treatment of chronic bronchiti UniProt CID Gene name Protein name Degree Closeness Centrality Betweenness Centrality P24385 CCND1 G1/S-specific cyclin-D1 82 0.6881 0.0100 P31749 AKT1 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase 106 0.7732 0.0290 Q07817 BCL2L1 Bcl-2-like protein 1 68 0.6466 0.0060 P04637 TP53 Cellular tumor antigen p53 117 0.8197 0.0500 P00533 EGFR Epidermal growth factor receptor 98 0.7426 0.0339 P01133 EGF Pro-epidermal growth factor 93 0.7246 0.0169 P01112 HRAS GTPase HRas 78 0.6726 0.0108 P15692 VEGFA Vascular endothelial growth factor A 109 0.7853 0.0378 P42574 CASP3 Caspase-3 101 0.7500 0.0236 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha 81 0.6849 0.0186 P22301 IL10 Interleukin-10 76 0.6696 0.0100 P05231 IL6 Interleukin-6 104 0.7653 0.0385 P01375 TNF Tumor necrosis factor 100 0.7500 0.0307 P60484 PTEN Phosphatidylinositol 3，4，5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN 74 0.6608 0.0081 P01584 IL1B Interleukin-1 beta 72 0.6550 0.0088 P04626 ERBB2 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 72 0.6550 0.0077 P05412 JUN Transcription factor AP-1 91 0.7143 0.0141 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 89 0.7075 0.0213 P01106 MYC Myc proto-oncogene protein 95 0.7317 0.0184 P13500 CCL2 C-C motif chemokine 2 70 0.6494 0.0070 P27361 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3 92 0.7177 0.0146 P12931 SRC Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src 86 0.6977 0.0194 P14780 MMP9 Matrix metalloproteinase-9 87 0.7042 0.0141 P08253 MMP2 72 kDa type IV collagenase 69 0.6466 0.0057 P35354 PTGS2 Prostaglandin G/H synthase 2 88 0.7042 0.0242 P04406 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 117 0.8197 0.0512 P08253 MMP2 72 kDa type IV collagenase 69 0.6466 0.0057 表2. 岩陀治疗慢性支气管炎潜在靶点的相关拓扑参数 3.4. 岩陀治疗慢性支气管炎潜在靶点网络构建 通过cytoscape3.6.1软件分别构建“岩陀–有效成分”网络、“有效成分–靶点”网络、“疾病–靶点”网络，将以上网络合并成为一个网络，最终构建“岩陀–有效成分–核心靶点–疾病”网络，结果见图3。 图3. 岩陀治疗慢性支气管炎“中药–有效成分–核心靶点–疾病”网络 3.5. GO生物过程富集分析 将27个潜在靶点导入DAVID数据库进行GO生物过程富集分析，保留P ≤ 0.01的结果。结果共富集得到76生物过程(Biological process， BP)、12分子功能(Molecular function， MF)和10细胞组分(Cellular component， CC)。根据P-value越小，显著性越高的原则，列举了排名前20的生物过程，结果见图4。结果表明岩陀治疗慢性支气管炎主要涉及的生物过程包括蛋白质磷酸化的正调控，一氧化氮生物合成过程的正调控，MAPK级联，平滑肌细胞增殖的正调控，脂多糖介导的信号通路，蛋白激酶B信号传导，对糖皮质激素的反应等。岩陀治疗慢性支气管炎可能是通过调控这些生物过程起到治疗作用。 图4. 岩陀治疗慢性支气管炎排名前20的生物过程富集结果(不同颜色代表不同的生物过程) 图5. 岩陀治疗慢性支气管炎“靶点–通路”网络(节点越大代表信号通路作用越重要，红色边代表不同靶点的相互作用，绿色边代表不同信号通路与靶点之间的相互作用) 3.6. KEGG通路富集分析 将27个潜在靶点导入DAVID数据库进行KEGG通路富集分析，保留P ≤ 0.01的结果，使用Cytoscape3.6.1软件进行可视化分析，构建“靶点-通路”网络，结果见图5。根据P-value越小，显著性越高的原则，列举了排名前20的信号通路，结果见图6。结果共富集得到85条信号通路，其中主要的信号通路包括前列腺癌，胰腺癌，TNF信号通路，非小细胞肺癌，PI3K-Akt信号通路，雌激素，MAPK信号通路，HIF-1信号通路，慢性粒细胞白血病，NOD样受体信号通路等，提示岩陀治疗慢性支气管炎可能是以上多条信号通路共同参与的结果。 图6. 岩陀治疗慢性支气管炎排名前20的KEGG通路富集结果(不同颜色代表不同的生物过程) 3.7. 岩陀治疗慢性支气管炎的通路注释图 将27个潜在靶点输入KEGG数据库的KEGG Mapper功能中，标注出潜在靶点在每条相关信号通路中所占的个数。结果显示有11个靶蛋白参与MAPK信号通路的相关调控，提示岩陀治疗慢性支气管炎与多个靶点、多条途径相关联，结果见图7。