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user: 3. 实验结果 3.1. 大柴胡汤化学成分及其预测靶标分析 首先，基于TCMIP平台，收集大柴胡汤组方中药成分及靶标数量，研究结果如表1所示，大柴胡汤共有8味中药组成，共有中药成分543个，预测靶标共有3650个；通过单味药材间共有靶标分析，结果说明大柴胡汤中药成分彼此间存在协同或拮抗作用(如表2所示)。 Table 1 Basic information on “Traditional Chinese Medicine-Ingredient-Target” of Da-Chai-Hu-Tan 中药名称 成分数量 预测靶标数量 柴胡 62 657 黄芩 54 524 白芍 50 169 半夏 41 237 生姜 127 257 枳实 49 51 大枣 72 1172 大黄 88 583 表1. 大柴胡汤“中药–成分–靶标”基本信息 Table 2 Common targets of single herbs in Da-Chai-Hu-Tan 柴胡 (95) 生姜 (133) 黄芩 (133) 大黄 (83) 枳实 (21) 大枣 (429) 白芍 (119) 半夏 (196) 柴胡(95) - 8 64 20 15 79 49 22 生姜(133) 8 - 3 3 0 89 2 5 黄芩(133) 64 3 - 69 18 128 94 19 大黄(83) 20 3 69 - 21 69 72 18 枳实(21) 15 0 18 21 - 18 17 12 大枣(429) 79 89 128 69 18 - 101 28 白芍(119) 49 2 94 72 17 101 - 24 半夏(196) 22 5 19 18 12 28 24 - 表2. 大柴胡汤中单味药材间共有靶标分析 3.2. 大柴胡汤候选靶基因功能及所参与的通路分析 继而，本研究对大柴胡汤的潜在药靶进行GO基因功能分析，筛选P-Value值前20的主要基因功能信息，结果如表3所示，我们不难发现，大柴胡汤候选靶基因主要参与了谷氨酸转运、线粒体电子传输、能量代谢、细胞色素c氧化等生物信息功能。其次，对大柴胡汤的潜在药靶进行KEGG通路富集分析，选择P-Value值前15的关键通路信息，结果显示，大柴胡汤候选靶基因主要参与了谷氨酸、丙氨酸、天冬氨酸等氨基酸合成代谢、嘌呤代谢等生物学信号通路(如表4所示)。 3.3. 大柴胡汤防治肝癌的核心靶标网络、基因功能和通路富集分析 3.3.1. 大柴胡汤防治肝癌的核心靶标网络 根据条件筛选大柴胡汤关键靶标，筛选得到528个关键靶标，其中药物直接作用靶标156个，已知的疾病靶标89个，疾病与药物间的直接靶标3个，间接靶标280个。根据degree值，图1显示前100个靶点的PPI蛋白互作网络，图中节点大小与degree值呈正相关，红色代表药物靶标，黄色代表疾病靶标，灰色代表其他靶标。 3.3.2. 大柴胡汤防治肝癌的GO基因功能及KEGG通路富集分析 基于TCMIP的疾病靶标信息，对大柴胡汤防治肝癌进行GO基因功能分析，筛选P-Value值前20的主要基因功能信息，结果显示，大柴胡汤减缓肝癌发生发展过程的主要基因体现在线粒体电子传输、能量代谢、细胞色素C传递、脂质代谢、RNA聚合酶合成等过程(如表5所示)。继而，本研究分析大柴胡汤防治肝癌的KEGG通路富集信息，选择P-Value值前15的关键通路，结果如表6所示，主要集中于胆汁分泌、能量代谢、脂质代谢等过程，调控循环系统、内分泌系统、神经系统等微环境，从而干预肝癌发生发展的进程。 Table 3 The gene function information of candidate target of Da-Chai-Hu-Tan ID 条目 数目 P-Value GO:0005234 extracellular-glutamate-gated ion channel activity 18 3.43e−031 GO:0035235 ionotropic glutamate receptor signaling pathway 18 4.12e−026 GO:0005829 cytosol 149 3.99e−022 GO:0005739 mitochondrion 76 6.69e−018 GO:0005524 ATP binding 84 1.21e−017 GO:0006418 tRNA aminoacylation for protein translation 14 5.43e−015 GO:0070062 extracellular exosome 116 1.59e−014 GO:0004129 cytochrome-c oxidase activity 13 2.62e−014 GO:0007215 glutamate receptor signaling pathway 10 3.60e−014 GO:0006123 mitochondrial electron transport， cytochrome c to oxygen 11 3.78e−014 GO:0005759 mitochondrial matrix 32 2.98e−013 GO:0003924 GTPase activity 27 3.13e−013 GO:0016594 glycine binding 9 1.18e−012 GO:0015171 amino acid transmembrane transporter activity 13 2.25e−012 GO:0007268 chemical synaptic transmission 25 7.47e−012 GO:0045211 postsynaptic membrane 24 9.63e−012 GO:0004972 NMDA glutamate receptor activity 7 1.23e−011 GO:0006810 transport 28 2.70e−011 GO:0006091 generation of precursor metabolites and energy 13 3.29e−011 GO:0089711 L-glutamate transmembrane transport 8 3.75e−011 表3. 大柴胡汤候选靶标具有的基因功能信息 Table 4 The pathway information of candidate target of Da-Chai-Hu-Tan ID 条目 数目 P-Value hsa04724 Glutamatergic synapse 36 1.38e−021 # Nervous system 58 7.07e−013 hsa00250 Alanine， aspartate and glutamate metabolism 15 8.70e−012 hsa00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 19 2.95e−011 hsa05031 Amphetamine addiction 17 3.71e−009 # Amino acid metabolism 35 1.03e−008 hsa05030 Cocaine addiction 14 1.89e−008 hsa04720 Long-term potentiation 16 2.21e−008 hsa00330 Arginine and proline metabolism 15 2.46e−008 # Nucleotide metabolism 26 7.11e−007 hsa05014 Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) 12 1.57e−006 hsa00230 Purine metabolism 23 1.79e−006 hsa00471 D-Glutamine and D-glutamate metabolism 4 3.81e−006 # Neurodegenerative diseases 34 7.13e−006 hsa01230 Biosynthesis of amino acids 13 1.57e−005 表4. 大柴胡汤候选靶标参与的通路信息 图1. 大柴胡汤治疗肝癌的候选靶标网络 Table 5 The gene function information of key target of Da-Chai-Hu-Tang for liver cance ID 条目 数目 P-Value GO:0004129 cytochrome-c oxidase activity 13 2.19e−022 GO:0006123 mitochondrial electron transport， cytochrome c to oxygen 11 5.46e−021 GO:1902600 hydrogen ion transmembrane transport 13 1.71e−017 GO:0006091 generation of precursor metabolites and energy 10 9.81e−014 GO:0045277 respiratory chain complex IV 4 3.17e−009 GO:0005751 mitochondrial respiratory chain complex IV 5 3.88e−009 GO:0005743 mitochondrial inner membrane 14 2.96e−008 GO:0005739 mitochondrion 22 1.99e−007 GO:0006629 lipid metabolic process 8 2.18e−007 GO:0004879 RNA polymerase II transcription factor activity， ligand-activated sequence-specific DNA binding 5 7.71e−007 GO:0006367 transcription initiation from RNA polymerase II promoter 8 1.10e−006 GO:0030522 intracellular receptor signaling pathway 5 1.56e−006 GO:0070542 response to fatty acid 4 3.56e−006 GO:0003707 steroid hormone receptor activity 5 7.36e−006 GO:0008289 lipid binding 7 8.57e−006 表5. 大柴胡汤治疗肝癌关键靶标具有的基因功能信息 Table 6 The pathway information of key target of Da-Chai-Hu-Tang for liver cance ID 条目 数目 P-Value hsa04260 Cardiac muscle contraction 12 2.90e−011 # Circulatory system 18 2.42e−010 hsa00190 Oxidative phosphorylation 13 1.39e−009 # Energy metabolism 13 1.36e−008 # Neurodegenerative diseases 17 1.08e−007 hsa04932 Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) 11 6.01e−007 # Endocrine and metabolic diseases 13 1.37e−006 # Endocrine system 20 2.67e−005 hsa04911 Insulin secretion 7 3.82e−005 hsa03320 PPAR signaling pathway 6 9.76e−005 hsa04913 Ovarian Steroidogenesis 5 2.18e−004 # Lipid metabolism 12 6.71e−004 hsa04976 Bile secretion 5 1.09e−003 hsa01212 Fatty acid metabolism 4 1.79e−003 hsa04961 Endocrine and other factor-regulated calcium reabsorption 4 1.79e−003 表6. 大柴胡汤治疗肝癌关键靶标所参与的通路信息 3.4. 大柴胡汤防治肝癌的“中药–核心成分–关键靶标–主要通路”多维网络关系分析 运用平台的关键靶标分析功能，对大柴胡汤核心靶标网络进行可视化分析、关键靶标功能富集分析、关键靶标的通路富集分析、中药–核心成分–关键药靶–通路网络可视化分析，结果如图2所示，绿色表示中药，紫色表示化学成分，蓝色表示药物靶标，红色表示信号通路。由图2可见，大柴胡汤抗肝癌的作用主要与138个化学成分相关联，作用于30条主要作用通路的51个核心靶标，这是该方发挥防治肝癌药效的核心所在，也体现了多成分与多靶点之间共同作用的机制，符合中医复方作用的特点。由图2可见，大柴胡汤抗肝癌的作用主要与138个化学成分相关联，作用于30条主要作用通路的51个核心靶标，这是该方发挥防治肝癌药效的核心所在，也体现了多成分与多靶点之间共同作用的机制，符合中医复方作用的特点。