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user: 3. 结果与分析 在生物体内，不同基因相互协调行使其生物学功能，通过Pathway显著性富集能确定候选靶基因参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径。KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是有关Pathway的主要公共数据库 [ 25 ]。Pathway显著性富集分析以KEGG Pathway为单位，应用超几何检验，找出与整个基因组背景相比，在候选靶基因中显著性富集的Pathway [ 25 ]。该分析的计算公式： p = 1 − ∑ i = 0 m − 1 ( M i ) ( N − M n − i ) ( N n ) 其中，N为所有基因中具有Pathway注释的基因数目；n为N中候选靶基因的数目；M为所有基因中注释为某特定Pathway的基因数目；m为注释为某特定Pathway的候选靶基因数目。用BH的方法对p-value进行校正，得到的校正后的P-value值越小代表越显著。这里将值小于0.05的Pathway定义为在候选靶基因中显著富集的Pathway。 3.1. 差异lncRNA的筛选及富集分析 测序结果利用韦恩图显示四组间共有的差异lncRNA数目为零，如图1所示。因此以混测组(GLQ1_vs_GLQ2)所得差异表达的lncRNA为样本，对其共表达的基因进行GO富集，在混测组(GLQ1_vs_GLQ2)中差异lncRNA共计106个，其中上调52个包括lnc_000266、lnc_000276、lnc_000417、 图1. 差异表达lncRNA火山图 lnc_000510、lnc_000565、lnc_000662、lnc_000853、lnc_001155、lnc_001315、lnc_001370、lnc_001788、lnc_001827等；下调54个，包括ENST00000572151、lnc_000009、lnc_000021、lnc_000036、lnc_000115、lnc_000410、lnc_000467等(见表2)；如图2所示。在GO富集结果分类统计图中，从左往右依次为生物学过程、细胞组分、分子功能包括，如图3所示。结果显示差异lncRNA主要参与有机循环化合物代谢过程、胞内运输、细胞蛋白质定位、蛋白质的运输、有丝分裂细胞周期、细胞周期调节、DNA代谢过程的正调控、水解酶活性的调节等生物过程。如图4所示。差异lncRNA共表达mRNA的KEGG富集通路散点图如图4，主要富集的细胞通路有血小板激活、基础转录因子及补体和凝血级联等相关途径。q-value的取值范围为[0， 1]，越接近于零，表示富集结果的可信度越高。差异表达转录本(lncRNA)所对应的靶基因进行了GO富集分析，主要富集在有机循环化合物代谢过程、胞内运输、细胞蛋白质定位、蛋白质的运输、有丝分裂细胞周期、细胞周期调节、DNA代谢过程的正调控、水解酶活性的调节等生物过程。 Table 2 Mixed test group (GLQ1_vs_GLQ2) differential lncRNA screening result 转录本ID transcript_id 基因ID gene_id 基因名 gene_name 癌组织表达量 GLQ1_FPKM 癌旁组织表达量 GLQ2_FPKM log2. foldchange. pval padj ENST00000329743.3 ENSG00000185837.3 CECR5-AS1 1.321697 0 Inf 0.005694 0.456532 ENST00000412495.5 ENSG00000174403.15 C20orf166-AS1 0.055641 0.361857 −2.7012 0.031411 1 ENST00000424587.6 ENSG00000228463.9 AP006222.2 0.197026 0 Inf 0.017627 0.821515 ENST00000425112.1 ENSG00000235954.6 TTC28-AS1 0.777166 0.078821 3.30158 0.03762 1 ENST00000425271.1 ENSG00000229588.1 RP11-479J7.2 0 0.253397 Inf 0.043235 1 ENST00000426715.5 ENSG00000237737.5 DCTN1-AS1 0.094955 1.591254 −4.06678 0.002733 0.297451 ENST00000435067.2 ENSG00000235366.2 LINC01055 0.499809 0.009094 5.780278 0.019621 0.874801 ENST00000444939.1 ENSG00000235897.1 TM4SF19-AS1 0.203001 0 Inf 0.03037 1 ENST00000451837.5 ENSG00000228315.11 GUSBP11 1.596795 0.152712 3.386296 0.002744 0.297989 ENST00000463143.5 ENSG00000243701.5 DUBR 0.058796 1.161521 −4.30416 0.03242 1 ENST00000477513.1 ENSG00000205930.8 C21orf62-AS1 0 0.291069 Inf 0.03869 1 ENST00000488584.1 ENSG00000240875.5 LINC00886 0.241863 0 Inf 0.039771 1 ENST00000496389.5 ENSG00000240057.5 RP11-572M11.4 0.491534 0.051418 3.256939 0.01952 0.871556 ENST00000505149.1 ENSG00000249307.5 LINC01088 2.266866 0.068304 5.052585 0.005493 0.449092 ENST00000505844.1 ENSG00000248455.5 RP11-321E2.3 0.015737 0.329017 −4.38593 0.049939 1 ENST00000507761.1 ENSG00000249307.5 LINC01088 4.470149 0.870082 2.361099 0.030368 1 ENST00000509088.5 ENSG00000249307.5 LINC01088 10.85965 1.550521 2.808152 0.016659 0.800687 ENST00000510087.5 ENSG00000247828.7 TMEM161B-AS1 0.542471 3.541659 −2.70681 0.020203 0.891566 ENST00000521404.5 ENSG00000214548.14 MEG3 0.265479 0 Inf 0.020493 0.897167 ENST00000522747.5 ENSG00000245146.6 LINC01024 0 0.138021 Inf 0.031289 1 ENST00000540882.5 ENSG00000256193.5 LINC00507 0.015798 0.974333 −5.94665 0.022486 0.936989 ENST00000568966.2 ENSG00000260391.2 RP11-71H17.7 1.517343 0.099538 3.930152 0.006726 0.496316 ENST00000570301.5 ENSG00000262223.6 RP11-1055B8.3 0 0.872976 Inf 0.003783 0.359047 ENST00000572151.1 ENSG00000263069.5 CTD-2047H16.4 0 0.277937 Inf 0.028468 1 ENST00000580045.1 ENSG00000263766.5 RP11-580I16.2 0.034864 0.539885 −3.95284 0.017324 0.815143 ENST00000609442.5 ENSG00000186594.12 MIR22HG 0 0.744879 Inf 0.001059 0.187946 ENST00000623070.3 ENSG00000228794.8 LINC01128 0.010925 0.392027 −5.16525 0.010188 0.617517 LNC_000009 XLOC_000367 . 0.003548 0.272429 −6.26283 0.031884 1 LNC_000021 XLOC_000434 . 0 0.873833 Inf 0.038025 1 LNC_000036 XLOC_000839 . 0 0.526067 Inf 0.01673 0.800687 LNC_000115 XLOC_007755 . 0 0.258049 Inf 0.021498 0.914279 LNC_000266 XLOC_019040 . 0.259798 0 Inf 0.010122 0.61593 LNC_000269 XLOC_019813 . 0.319856 0 Inf 0.027765 1 LNC_000276 XLOC_020592 . 0.149726 0 Inf 0.023653 0.963619 LNC_000410 XLOC_032710 . 0 0.184696 Inf 0.021326 0.911866 LNC_000417 XLOC_033405 . 0.171251 0 Inf 0.027822 1 LNC_000467 XLOC_037210 . 0 0.197732 Inf 0.045953 1 LNC_000479 XLOC_037967 . 0 0.154129 Inf 0.04384 1 LNC_000494 XLOC_039296 . 0.004717 0.563647 −6.90085 0.013361 0.708158 LNC_000510 XLOC_040050 . 0.393638 0.038834 3.341487 0.038722 1 LNC_000521 XLOC_040623 . 0.042489 0.400015 −3.2349 0.042694 1 LNC_000565 XLOC_045043 . 0.264409 0 Inf 0.017004 0.807935 LNC_000570 XLOC_045448 . 0 0.177139 Inf 0.047729 1 LNC_000662 XLOC_056010 . 0.395915 0 Inf 0.006839 0.501673 LNC_000694 XLOC_060487 . 0 0.273759 Inf 0.004371 0.393991 LNC_000798 XLOC_073979 . 0 0.217494 Inf 0.045961 1 LNC_000845 XLOC_078789 . 0.465307 0.053043 3.132943 0.024325 0.974234 LNC_000853 XLOC_080147 . 0.588241 0.084005 2.80786 0.043285 1 LNC_001155 XLOC_115160 . 0.181953 0 Inf 0.03034 1 LNC_001173 XLOC_116066 . 0.045814 0.434029 −3.24394 0.033192 1 LNC_001254 XLOC_122620 . 0.005249 0.754748 −7.16795 0.022717 0.943285 LNC_001300 XLOC_124776 . 0 0.362518 Inf 0.001216 0.20293 LNC_001315 XLOC_125784 . 0.335061 0.023615 3.826649 0.023139 0.952305 LNC_001359 XLOC_129378 . 0 0.153206 Inf 0.029025 1 LNC_001370 XLOC_131364 . 0.186167 0.013987 3.734489 0.040925 1 LNC_001521 XLOC_141586 . 0 0.418985 Inf 0.00059 0.140597 LNC_001763 XLOC_161705 . 0.329112 0.006127 5.747195 0.022992 0.949315 LNC_001787 XLOC_164705 . 5.637431 0.001648 11.74011 0.005645 0.456448 LNC_001788 XLOC_164705 . 2.519544 0 Inf 0.010249 0.619682 LNC_001789 XLOC_164705 . 0 9.485185 Inf 0.002668 0.293497 LNC_001790 XLOC_164705 . 0.022131 1.497452 −6.08031 0.042932 1 LNC_001827 XLOC_168953 . 0.51866 0 Inf 0.036278 1 LNC_001934 XLOC_168978 . 0.600014 0 Inf 0.01441 0.740057 LNC_002091 XLOC_169062 . 0.386222 0.015235 4.664016 0.045734 1 LNC_002171 XLOC_169093 . 0 0.28152 Inf 0.024453 0.975955 LNC_002196 XLOC_169112 . 0.239854 0 Inf 0.02842 1 LNC_002218 XLOC_169575 . 0 0.625311 Inf 0.020923 0.904419 LNC_002436 XLOC_189417 . 0 0.134111 Inf 0.026241 1 LNC_002514 XLOC_196104 . 0 0.178863 Inf 0.045259 1 LNC_002523 XLOC_196947 . 0 0.16073 Inf 0.040958 1 LNC_002545 XLOC_198663 . 0.22451 0 Inf 0.000301 0.101765 LNC_002576 XLOC_202277 . 0.185142 0 Inf 0.037008 1 LNC_002660 XLOC_210683 . 0.175563 0 Inf 0.037318 1 LNC_002670 XLOC_211305 . 0.00305 0.235054 −6.26792 0.004193 0.383829 LNC_002738 XLOC_219310 . 1.96684 0.442293 2.152807 0.041188 1 LNC_002765 XLOC_223733 . 0 0.170617 Inf 0.047406 1 LNC_002816 XLOC_228769 . 0 0.275173 Inf 0.010921 0.642293 LNC_002819 XLOC_228781 . 0.410449 0 Inf 2.33E−05 0.021745 LNC_002830 XLOC_229641 . 0 0.354426 Inf 0.014756 0.748978 LNC_002831 XLOC_229642 . 0 0.498238 Inf 0.041203 1 LNC_002841 XLOC_230383 . 0 0.441705 Inf 0.038664 1 LNC_002927 XLOC_240626 . 0 0.342247 Inf 0.009353 0.595621 LNC_002940 XLOC_243325 . 0 0.187294 Inf 0.021126 0.909446 LNC_002965 XLOC_247874 . 0.293177 0.023328 3.651653 0.030167 1 LNC_002996 XLOC_249865 . 0.17017 0 Inf 0.044745 1 LNC_003083 XLOC_259353 . 0.301593 0 Inf 0.018348 0.839064 LNC_003092 XLOC_260368 . 0 0.181184 Inf 0.033685 1 LNC_003160 XLOC_265610 . 0.529069 0.019271 4.778952 0.009191 0.589476 LNC_003191 XLOC_268753 . 0.168433 0 Inf 0.009208 0.589747 LNC_003225 XLOC_272726 . 0.268701 0.011997 4.485256 0.025239 0.992031 LNC_003259 XLOC_276571 . 0.342624 0 Inf 0.014933 0.755263 LNC_003277 XLOC_277968 . 0.212491 0 Inf 0.01983 0.88007 LNC_003306 XLOC_282244 . 0 0.381837 Inf 0.039356 1 LNC_003371 XLOC_288937 . 0.12854 0 Inf 0.024828 0.981586 LNC_003426 XLOC_296063 . 0 0.330483 Inf 0.010965 0.642886 LNC_003482 XLOC_302093 . 0.31455 0 Inf 0.003595 0.34929 LNC_003495 XLOC_303175 . 0.174044 0 Inf 0.003122 0.321776 LNC_003498 XLOC_303273 . 0 0.080993 Inf 0.044795 1 LNC_003557 XLOC_311294 . 0.203297 0 Inf 0.03206 1 LNC_003613 XLOC_317217 . 0.849733 0.049924 4.089205 0.012542 0.684973 LNC_003671 XLOC_325487 . 0 0.125253 Inf 0.029909 1 LNC_003672 XLOC_325487 . 0.155251 0 Inf 0.032466 1 LNC_003745 XLOC_332734 . 0.344085 0.004141 6.376727 0.011558 0.655778 LNC_003874 XLOC_345209 . 0.010717 0.320129 −4.90075 0.001472 0.220468 LNC_003875 XLOC_345209 . 0.003259 0.698022 −7.74281 6.20E−05 0.040318 LNC_003988 XLOC_357378 . 0 0.386403 Inf 0.024658 0.980174 表2. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异lncRNA筛选结果 图2. 组间差异表达lncRNA韦恩图 图3. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异lncRNA共表达基因GO富集分类统计图 图4. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异lncRNA共表达基因KEGG途径富集散点图 3.2. 差异microRNA的筛选及富集分析 将多组比较的差异miRNA个数进行统计，绘制维恩图，直观展现出各个比较组共有及特有的差异miRNA数目(见图5)。如图6所示，四组建交集miRNA数目为零，因此以混测组(GLQ1_vs_GLQ2)所得结果进行后期分析。混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异microRNA共计15个(见表3)，如图6所示。其中上调8个包hsa-miR-3157-3p、hsa-miR-6761-5p、hsa-miR-3124-5p、hsa-miR-5009-5p、hsa-miR-216b-3p、hsa-miR-296-3p、novel_912、novel_328；下调7个，hsa-miR-135b-5p、hsa-miR-377-3p、hsa-miR-136-5p、hsa-miR-381-3p、hsa-miR-153-5p、hsa-miR-299-3p、hsa-miR-4473。富集的GO相关的所有差异miRNA靶基因(见表4，无确定靶基因则未列出)的分类统计图，从左往右依次为生物学过程、细胞组分、分子功能包括，如图7所示。结果显示差异miRNA主要参与细胞过程、生物调节、代谢过程、应激反应、多细胞有机体过程、细胞成分的组织或生物发生、细胞定位、信号途径、发育过程、生物过程的正调控、生物过程的负调控。如图7所示。差异miRNA靶基因的KEGG富集通路散点图如图8，主要富集的细胞通路维生素的消化吸收、肿瘤坏死因子信号通路、突触囊泡循环、唾液分泌、癌症中的蛋白多糖、蛋白质输出、癌症相关通路、胰腺癌等相关途径。(q-value的取值范围为[0， 1]，越接近于零，表示富集结果的可信度越高)。 Table 3 Mixed test group (GLQ1_vs_GLQ2) differential miRNA screening result miRNA编号 miRNA-ID 癌组织表达量 GLQ1_readcount 癌旁组织表达量 GLQ2_readcount log2FoldChange pval padj hsa-miR-135b-5p 88.99762 163.8794 −0.77662 0.004145 0.99975 hsa-miR-377-3p 75.37529 170.7388 −0.92773 0.006783 0.99975 hsa-miR-3157-3p 9.345945 3.034668 1.0028 0.013002 0.99975 hsa-miR-136-5p 632.8087 1442.705 −0.8977 0.01311 0.99975 hsa-miR-381-3p 8668.745 17737.01 −0.8269 0.01399 0.99975 novel_912 2.42883 0 0.88379 0.016828 0.99975 hsa-miR-6761-5p 7.562805 2.212444 0.9635 0.021225 0.99975 hsa-miR-3124-5p 15.3221 7.072264 0.82849 0.024967 0.99975 hsa-miR-5009-5p 1.709722 0 0.8047 0.026246 0.99975 novel_328 7.026624 2.158375 0.89549 0.032114 0.99975 hsa-miR-153-5p 19.4879 33.3998 −0.64796 0.039772 0.99975 hsa-miR-216b-3p 2.787696 0.292098 0.78371 0.041112 0.99975 hsa-miR-299-3p 79.26836 197.027 −0.81686 0.045115 0.99975 hsa-miR-4473 20.53004 44.69347 −0.7704 0.047291 0.99975 hsa-miR-296-3p 27.00353 9.479225 0.82828 0.04798 0.99975 表3. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异miRNA筛选结果 Table 4 Mixed test group (GLQ1_vs_GLQ2) differential miRNA and its target gene comparison tabl miRNA编号 miRNA-ID 靶基因编号 靶基因名称 描述 hsa-miR-3157-3p ENSG00000141738 GRB7 生长因子受体结合蛋白7 ENSG00000151353 TMEM18 跨膜蛋白18 ENSG00000161011 SQSTM1 螯合体1 ENSG00000165458 INPPL1 肌醇多磷酸磷酸酶类似物1 ENSG00000168748 CA7 碳酸酐酶7 ENSG00000183837 PNMA3 PNMA家庭成员3 hsa-miR-381-3p ENSG00000145191 EIF2B5 真核翻译起始因子2B亚基ε novel_912 ENSG00000015153 YAF2 YY1相关因子2 ENSG00000170949 ZNF160 锌指蛋白160 ENSG00000179921 GPBAR1 G蛋白偶联的胆汁酸受体1 ENSG00000188938 FAM120AOS 序列相似性为120A反向链的家族 ENSG00000281348 AC120114.4 智人16号染色体克隆CTD-2574D22完整序列 hsa-miR-6761-5p ENSG00000078070 MCCC1 甲基巴豆酰辅酶A羧化酶1 ENSG00000100578 KIAA0586 KIAA0586 ENSG00000109339 MAPK10 丝裂原激活的蛋白激酶10 ENSG00000196209 SIRPB2 信号调节蛋白β2 hsa-miR-3124-5p ENSG00000105737 GRIK5 谷氨酸离子受体的海藻酸酯型亚基5 ENSG00000107742 SPOCK2 骨结合蛋白cwcv和kazal样结构域蛋白聚糖2 novel_328 ENSG00000109917 ZPR1 ZPR1锌指 hsa-miR-299-3p ENSG00000090447 TFAP4 转录因子AP-4 ENSG00000146576 C7orf26 7号染色体开放阅读框26 ENSG00000167920 TMEM99 跨膜蛋白99 (可能) ENSG00000173638 SLC19A1 溶质载体家族19成员1 ENSG00000196345 ZKSCAN7 具有KRAB和SCAN域的锌指7 hsa-miR-296-3p ENSG00000006025 OSBPL7 氧固醇结合蛋白类似物7 ENSG00000007001 UPP2 尿苷磷酸化酶2 ENSG00000023191 RNH1 核糖核酸酶/血管生成素抑制剂1 ENSG00000068903 SIRT2 sirtuin 2 ENSG00000089041 P2RX7 嘌呤能受体P2X 7 ENSG00000089060 SLC8B1 溶质载体家族8成员B1 ENSG00000092096 SLC22A17 溶质载体家族22成员17 ENSG00000099812 MISP 有丝分裂纺锤体定位 ENSG00000100401 RANGAP1 Ran GTPase激活蛋白1 ENSG00000100985 MMP9 基质金属肽酶9 表4. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异miRNA及其靶基因对照 图5. 组间差异表达microRNA韦恩图 图6. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异microRNA火山图 图7. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异microRNA靶基因GO富集分类统计图 图8. 混测组(GLQ1_vs_GLQ2)差异microRNA KEGG途径富集散点图 3.3. lncRNA-miRNA-mRNA的关联分析 lncRNA具有广泛的调控作用，不仅能够直接调控DNA的结构、RNA的转录和翻译，而且具有miRNA结合位点，可以竞争性地结合miRNA，抑制miRNA对靶基因的调节作用，从而间接地调控基因表达。根据ceRNAs理论，筛选具有相同miRNA结合位点的lncRNA-gene 关系对，构建以lncRNA为起始、miRNA为核心、mRNA为靶标的lncRNA-miRNA-gene组合来构建ceRNA调控网络(图8~10)。在全转录组层面，通过ceRNA调控网络，揭示非编码RNA调控基因表达的机制。 统计筛选得到的lncRNA-miRNA-gene组合中上下调RNA的数目，可以直观展现不同组合中相关基因数目的变化。不同的形状代表不同的RNA种类，不同颜色代表上下调关系，不同的节点(node)的大小与此节点在通路中所处位置的重要程度(degree)成正比，即与此节点相连的边越多，它的重要程度越大，节点也就越大，这些节点在网络中可能处于较为核心的位置，与所研究的生物学问题更相关。 根据筛选所得数据，分别建立lncRNA (down)-miRNA (up)-mRNA (down)和lncRNA (up)-miRNA (down)-mRNA (up)三级互作关系网络(图9~11)。在lncRNA (down)-miRNA (up)-mRNA (down)网络中，以hsa-miR-296-3p为中间节点，上游lncRNA：LNC_002514、LNC_001173下调表达，使得hsa-miR-296-3p表达量增加，进而下游基因：MRAS (ENSG00000158186)、GABBR1 (ENSG00000204681)、AIFM3 (ENSG00000183773)、TRIM26 (ENSG00000234127)、ZNF875 (ENSG00000181666)、HNRNPUL1 (ENSG00000105323)、FOSL1 (ENSG00000175592)、INO80E (ENSG00000169592)、PDGFRB (ENSG00000113721)的表达量也随之下调(见表5)，对以上9种下调表达的基因进行KEGG富集，共到6条通路，分别为HTLV-I感染、磷脂酶D信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节、Rap1信号通路、Ras信 图9. 全部差异lncRNA-miRNA-mRNA互作图 号通路、MAPK信号通路。其中下调表达的lncRNA：LNC_001173与LNC_002436、LNC_001254分别调控两种miRNA：hsa-miR-6761-5p和hsa-miR-3157-3p的表达量上调，而相应的hsa-miR-6761-5p的靶基因KIAA0586 (ENSG00000100578)、hsa-miR-3157-3p的靶基因PNMA3 (ENSG00000183837)的表达量也随之下调。在lncRNA (up)-miRNA (down)-mRNA (up)互作网络中，8种上调表达的lncRNA：LNC_003613、LNC_003495、LNC_000853、LNC_000276、LNC_003672、LNC_002545、ENST00000509088、ENST00000505149可调控miRNA：hsa-miR-299-3p使之表达减少，并使下游基因SLC19A1 (ENSG00000173638)的表达量同步增加。 在以上数据筛选基础上，将上述结果与Targetscan数据库中已有的miRNA与靶基因的互作结合位点进行比对，在上述lncRNA (down)-miRNA (up)-mRNA (down)网络中只有FOSL1 (ENSG00000175592)与hsa-miR-296-3p有两个确定的互作位点，上游下调的两个：LNC_002514、LNC_001173均无文献数据支持，但LNC_001173在本次筛选结果中涉及内容过多，验证难度较大，因此拟建立由LNC_002514-hsa-miR-296-3p-FOSL1组成的轴向调控通路(图12)，以备后期研究验证。 Table 5 Gene ID and its Chinese and English gene name comparison tabl 基因编号Gene stable ID 基因名Gene name 描述Description ENSG00000105323 HNRNPUL1 异核核糖核蛋白U样1 ENSG00000113721 PDGFRB 血小板衍生的生长因子受体β ENSG00000158186 MRAS 肌肉RAS癌基因同源物 ENSG00000169592 INO80E INO80复合亚基E ENSG00000175592 FOSL1 FOS类似1，AP-1转录因子亚基 ENSG00000181666 ZNF875 锌指蛋白875 ENSG00000183773 AIFM3 凋亡诱导因子线粒体相关3 ENSG00000204681 GABBR1 γ-氨基丁酸B型受体亚基1 ENSG00000234127 TRIM26 Tripartite基序蛋白26 ENSG00000183837 PNMA3 副肿瘤抗原样3基因3 ENSG00000100578 KIAA0586 KIAA0586 ENSG00000173638 SLC19A1 溶质载体家族19成员1 表5. 基因ID及其中英文基因名对照表 图10. 差异lncRNA (down)-miRNA (up)-mRNA (down)互作网络图 图11. 差异lncRNA (up)-miRNA (down)-mRNA (up)互作网络图 图12. LNC_002514-hsa-miR-296-3p-FOSL1轴向调控通路图