航空母艦上的飛行甲板（Flight deck）是飛機在航母起飛和降落的地方，也就是一個小型的海上流動飛機場。在一些不以航空為主要任務的海軍艦艇上，直升機航空母艦上的直升機和一些垂直起降的飛機起降地也稱為飛行甲板。
發展
早期的飛行甲板
第一座飛行甲板是一條建在軍艦Forecastle上的木製傾斜坡道。美國海軍的Eugene Burton Ely是史上第一個從軍艦上起飛的飛行員，他于1910年11月14日從USS Birmingham (CL-2)上起飛。1911年1月18日，埃利首次使用著艦鉤系統，將Curtiss Model D降落在停泊于舊金山灣的USS Pennsylvania (ACR-4)的平臺上，該系統是由飛行員兼海軍工程師Hugh Robinson (aviator)設計製造。 伊利告訴記者：「這很容易。我認為這個技巧在十次中可以成功九次。」在1912年5月4日，Charles Rumney Samson海軍中校成功的從移動中的軍艦起飛。他駕駛蕭特兄弟S.27型飛機從HMS Hibernia (1905)起飛，當時的速度為10.5節。早期飛機的起飛速度並不高，因此當母艦逆風航行時，飛機就可輕易的經由短距離加速而起飛。1917年，可拆除式的「起飛平臺」首次裝在反擊號戰鬥巡洋艦上，之後其他戰列艦和巡洋艦也採用，使得飛機可以從軍艦上起飛進行偵察任務，然而這些飛機並不能降落在母艦上。
在1917年8月2日成功的駕駛Sopwith Aviation Company的Sopwith Pup降落在HMS Furious (47)的起飛平臺上。他成爲了第一位在移動的軍艦上降落的飛行員。然而五天後在他第二次嘗試降落時，機輪的爆胎使得飛機衝出飛行甲板，導致他墜海淹死。使他同時成為第一位死於航空母艦降落意外事故的飛行員。在暴怒號上降落並不容易，飛機要避開艦上的上層建築。因此，暴怒號回到船塢，在船尾安裝了一條m的甲板。然而該艦中央的上層建築並未改造，由此產生的亂流嚴重干擾後甲板上飛機的起降。
全通甲板
第一艘擁有現代構造的航空母艦是英國皇家海軍從遠洋郵輪改造的百眼巨人號航空母艦。爲了解決暴怒號上亂流乾擾的問題，她採用了覆蓋整個船體、可供飛機起降的木製全通甲板（Through Deck），沒有造成亂流的上層建築，也沒有煙囪。她的廢氣會經由船的尾部排出，然而這使得飛機降落時會受到不必要的升力影響。沒有司令塔和煙囪是個缺點，因此在百眼巨人號航空母艦實驗不同方案以求彌補。一張1917年的照片中顯示她位在右舷的「假」上部構造和煙囪（它們以帆布建造）。把上層建築和煙囪放在右舷是由於早期飛機使用的rotary engine會使飛機受到向左的力。也就是說，飛機起飛時會向船的左舷偏航，起飛會遠離艦體的上層建築。此種結構成為典型的航空母艦設計，並且被用於下兩艘英國航空母艦：競技神號和鷹號。
第一次世界大戰後，因為華盛頓海軍條約禁止新造戰鬥巡洋艦，因此英國建造中的HMS Furious (1916)、光榮級大型輕巡洋艦與美國建造中的列辛頓級戰鬥巡洋艦、薩拉托加號戰鬥巡洋艦被改造成為航空母艦。這也誤打誤撞的製造出非常優秀的航空母艦，因為她們擁有廣大空間以及移動快速的優點。相較之下，另一艘被改成航空母艦的戰列艦老鷹號則因為擁有重型裝甲而顯得笨重且無用。早期因為各國海軍都沒有運用航空母艦的經驗，因此常在航空母艦上加裝巡洋艦等級的艦炮用來對抗接近航空母艦的敵艦。然而在二次大戰中，隨著航空母艦戰鬥羣（當時稱為特混艦隊）概念的成熟，這些艦炮都被拆除，換成高射炮，航空母艦將攻擊的能力集中於艦載機上，而將防衛的任務交給其他保護航空母艦的船隻。
在航空母艦將其重心轉往艦載機上時，飛行甲板也成為航空母艦上最重要的部份，但當時的主流設計為將機庫甲板做為強力甲板，屬於艦體結構的一部分，而機庫與飛行甲板則屬於上層建築，這種設計一直沿用到1940年代末期，如美國海軍建造的艾塞克斯級航空母艦就是如此。英國皇家海軍于1936年建造的卓越級航空母艦則採取了不同的設計，其特色是將飛行甲板作為強力甲板，屬於艦體結構的一部分，飛行甲板並採用了重灌甲，以保護艦體和內藏的艦載機。卓越級航母將飛行甲板作為強力甲板的概念，是近代航母的原型。這也迫使航空母艦的噸位急速攀升，從1922年蘭利號航空母艦的13,000噸，到現在尼米茲級核動力航空母艦的100,000噸。
裝甲甲板
在航空母艦取代戰列艦成為艦隊主力后，出現了是否需要再飛行甲板上增加一層裝甲的問題。在飛行甲板上增加一層裝甲可以讓機庫中的飛機有多一層保護，然而這使得航空母艦的機庫體積減少，無法將飛機懸掛在機庫頂（高度不足），並減少機庫的飛機容量。
英國皇家海軍光輝級航空母艦即為裝甲甲板的使用者。
降落在飛行甲板
在航空母艦上降落，尤其是在夜間或在天氣不好的情況下，是最困難的飛行技巧了。以美國航空母艦為例子，降落過程是這樣的：
* 首先回歸的飛機要進入環繞母艦的環型航線以降低飛行高度和速度，有些時候可能還需要脫離等待中的降落航線去進行空中加油。
* 在降落時飛機的速度要降低到幾乎失速的地步。飛行員將放下起落架，襟翼與空氣減速板，將捕捉鉤伸出，維持一定的速度和下滑速率。航艦上的降落官指揮飛機降落，他不斷地告訴飛行員，他離最佳情況的偏差是多少。航空母艦上的燈光提示飛行員，下降時的角度是否正確。
* 在航空母艦的後部有四條攔截索。降落的飛行員必須捕捉鉤掛上其中一條。在最佳情況下他應該掛上第三條，假如他掛上前兩條，那麼他的下降角度太平，假如他掛上最後一條，那麼他的下降角度太陡。由於攔截索制動力有限，使得全武裝掛載戰鬥機在降落前需拋棄部分武器，由於現在武器價格昂貴，為減少這種浪費，美國新下水的雷根號航空母艦則僅裝有三條攔截索，其目的為每組攔截索可以安裝更大的制動裝置，提供更大的制動力。這樣就不用再拋掉過重的武器掛載。
* 在著陸時飛行員必須將飛機完全壓低，這樣他可以保證鉤住一條攔截索。同時他必須將發動機開到最大，這樣假如他沒有掛上攔截索的話他可以在最短的時間之內加速離開甲板，重新回到降落航線。攔截索是由液壓制動的，它可以在兩秒鐘和50米內使飛機停下來。飛行員會依照甲板上的地勤人員的指示將發動機的推力降低到慢車並且離開降落區。
* 在緊急情況下，比如飛機的掛鉤損壞了，飛機無法使用攔截索停下來，在甲板上可以拉起攔截網來協助飛機迫降。
斜角甲板
1944年至1945年冬季時，一個由英國皇家海軍高級官員組成的委員會決定，海軍航空的未來是噴射機，因為其速度更快，要求對航母設計進行修改以適應其需要，Dennis Campbell上尉因此發明了斜角甲板。這種甲板也稱為「傾斜甲板」或「角度甲板」，加寬了甲板的後部，並且在偏離中心線的位置上另有一條單獨的跑道。斜角甲板的設計考慮了噴氣式飛機較高的著陸速度，噴氣機降落時有中心線的全長可以使用。斜角甲板的設計使航空母艦可以同時進行飛機的起飛和降落，並使降落失敗的飛機可以在不影響停止或正在起飛飛機的情況下再加速起飛。這項設計的意義不僅是提升了航空母艦起降軍機的效率，也避免降落失敗的飛機撞上其他整備中的飛機跟設施造成火災，癱瘓航空母艦的執行。
斜向甲板導致一些其他設計和操作上的改進，包括安裝更大的艦島（改善船舶操縱和飛行控制），大幅簡化回收飛機和甲板活動（飛機從艦首起飛，從斜向甲板降落，在船中留下一個大的開放區域，用來武裝飛機和加油）和損害控制。由於其在飛行操作中的實用性，斜向甲板現在是裝備有短距起飛阻攔回收和彈射起飛的航空母艦的特徵。
斜向甲板在凱旋號航空母艦上進行了首次測試，該艦飛行甲板的中心線漆上斜角的甲板標記，測試觸地重飛。同年也在中途島號航空母艦上進行了測試。儘管有新標記，但在這兩艦的攔截索和攔截網仍然對準甲板原來的中心線。從1952年9月到12月，安提頓號航空母艦裝上簡單的sponson，用於測試真正的斜角甲板，降落時攔截著陸，斜向甲板在這段試驗期間證明了它的優越性。1953年，安提頓與美國和英國的海軍部隊一起訓練，證明了斜向甲板的價值。英國HMS Centaur (R06)于1954年改裝為懸垂的斜向甲板。美國海軍在艾塞克斯級航空母艦和中途島級航空母艦升級時也加裝了斜向甲板。1955年2月，皇家方舟號航空母艦成為第一艘出廠時採用斜向甲板的航母。同年，英國威嚴級航空母艦（墨爾本號）和美國福萊斯特級航空母艦（福萊斯特號）的首艦也採用了斜向甲板。
滑跳式甲板
滑跳式甲板是將航空母艦最前方的飛行甲板的仰角提高。這使得飛機一部份的速度轉為向上的升力。英國發明瞭滑跳式甲板，用來改良從無敵級航空母艦起飛的海鷂戰鬥攻擊機的起飛能力。相較於垂直起飛，此種方法較節省油料。它的缺點是以此種方式起飛的飛機所能攜帶的武器會少於以蒸氣彈射器起飛的飛機，同時不利於起降傳統定翼機式的預警機，預警工作必須交給改裝后的直升機擔任，而直升機不論是酬載量跟航程以及飛行效能都不如定翼機，將會限制航空母艦自身的空中預警能力。