日本佛教寺院列表列出日本的所有佛教寺院。
北海道
* 國泰寺（北海道厚岸郡厚岸町）
青森縣
巖手縣
* 毛越寺（巖手縣西磐井郡平泉町）
* 中尊寺（巖手縣西磐井郡平泉町）
* 正法寺（巖手縣奧州市）
宮城縣
* 瑞巖寺（宮城縣宮城郡松島町）
秋田縣
山形縣
* 立石寺（山形縣山形市）
福島縣
* 專稱寺（福島縣いわき市）
茨城縣
栃木縣
* 輪王寺（栃木縣日光市）
* 滿愿寺（栃木縣栃木市）
* 專修寺（三重縣津市、栃木縣芳賀郡二宮町）
* 鑁阿寺（栃木縣足利市）
群馬縣
埼玉縣
* 正法寺（埼玉縣東松山市）
* 喜多院（埼玉縣川越市）
千葉縣
* 萬滿寺（千葉縣松戶市）
* 本土寺（千葉縣松戶市）
* 東漸寺（千葉縣松戶市）
* 新勝寺（千葉縣成田市）→ 成田山新勝寺
東京都
* 護國寺（東京都文京區）
* 藥王院有喜寺（東京都八王子市）→ 高尾山藥王院有喜寺
* 本門寺（池上本門寺、東京都大田區）
* 普濟寺（東京都立川市）
* 禪林寺（東京都三鷹市）
* 總持寺（西新井大師、東京都足立區）
* 增上寺（東京都港區）
* 淺草寺（東京都臺東區）
* 泉岳寺（東京都港區）
* 豪德寺（東京都世田谷區）
* 寬永寺（東京都臺東區）
* 池上本門寺（東京都大田區）
神奈川縣
* 總持寺（神奈川縣橫濱市鶴見區）
* 明月院（神奈川縣鎌倉市）
* 妙本寺（神奈川縣鎌倉市）
* 長谷寺（神奈川縣鎌倉市）
* 東慶寺（神奈川縣鎌倉市）
* 瑞泉寺（神奈川縣鎌倉市）
* 青蓮寺（神奈川縣鎌倉市）
* 稱名寺（橫濱市金澤區）
* 清凈光寺（神奈川縣藤澤市）
* 壽福寺（神奈川縣鎌倉市）
* 光明寺（鎌倉市）
* 高德院（鎌倉大佛、神奈川縣鎌倉市）
* 建長寺（神奈川縣鎌倉市）
* 弘明寺（橫濱市南區）
* 覺園寺（神奈川縣鎌倉市）
* 圓覺寺（神奈川縣鎌倉市）
新潟縣
* 蓮華峰寺（新潟縣佐渡市）
* 凈興寺（新潟縣上越市）
富山縣
石川縣
福井縣
* 永平寺（福井縣永平寺町）
山梨縣
* 本遠寺（山梨縣南巨摩郡身延町）
* 久遠寺（山梨縣南巨摩郡身延町）
長野縣
* 放光寺（長野縣松本市）
* 長谷寺（長野縣長野市）
* 善光寺（長野縣長野市）
* 牛伏寺（長野縣松本市）
岐阜縣
* 華嚴寺（岐阜縣揖斐郡揖斐川町）
靜岡縣
* 大石寺（靜岡縣富士宮市）
* 修禪寺（靜岡縣伊豆市）
愛知縣
* 長興寺（愛知縣豐田市）
* 興正寺（尾張高野、名古屋市昭和區）
三重縣
* 初馬寺（三重縣津市）→ 蓮光院初馬寺
* 專修寺（三重縣津市、栃木縣芳賀郡二宮町）
* 青蓮寺（地藏院、三重縣名張市）
* 金剛證寺（三重縣伊勢市）
滋賀縣
* 三井寺（滋賀縣大津市）→ 園城寺
* 寶嚴寺（竹生島、滋賀縣東淺井郡びわ町）
* 百濟寺（滋賀縣東近江市）
* 長命寺（滋賀縣近江八幡市）
* 金剛輪寺（滋賀縣愛知郡秦莊町）
* 延歷寺（滋賀縣大津市）
* 園城寺（三井寺、滋賀縣大津市）
* 石山寺（滋賀縣大津市）
* 永源寺（滋賀縣東近江市）
京都府
* 天龍寺（京都府京都市右京區）
* 龍安寺（京都市右京區）
* 了德寺（京都市右京區）
* 三十三間堂（蓮華王院本堂、京都市東山區）
* 鹿苑寺（金閣寺、京都市右京區）
* 慈照寺（銀閣寺、京都市左京區）
* 善峰寺（京都市西京區）
* 壬生寺（京都市中京區）
* 妙心寺（京都市右京區）
* 妙法院（京都市東山區）
* 松尾寺（京都府舞鶴市）
* 曼殊院（京都市左京區）
* 萬福寺（京都府宇治市）
* 本願寺（京都市下京區）
* 西本願寺（凈土真宗本願寺派本願寺、京都市下京區）
* 東本願寺（京都市下京區）
* 本能寺（京都市中京區）
* 法然院（京都市左京區）
* 方廣寺（京都市東山區）
* 寶嚴院（京都市右京區）
* 法金剛院（京都市右京區）
* 法住寺（京都市東山區）
* 佛光寺（京都市下京區）
* 法界寺（京都市伏見區）
* 法觀寺（八坂塔、京都市東山區）
* 平等院（京都府宇治市）
* 成相寺（京都府宮津市）
* 南禪寺（京都市左京區）
* 仁和寺（御室御所）（京都市右京區）
* 東福寺（京都市東山區）
* 東寺（教王護國寺、京都市南區）
* 等持院（京都市右京區）
* 頂法寺（六角堂、京都市中京區）
* 知恩院（京都市東山區）
* 智積院（京都市東山區）
* 大報恩寺（京都市上京區）
* 大德寺（京都市北區）
* 醍醐寺（京都市伏見區）
* 大覺寺（京都市右京區）
* 禪林寺（永觀堂、京都市）
* 泉涌寺（京都市東山區）
* 清涼寺（京都市右京區）
* 隨心院（京都市山科區）
* 凈瑠璃寺（京都府木津川市加茂町）
* 神護寺（京都市右京區）
* 青蓮院（京都市東山區）
* 相國寺（京都市上京區）
* 清凈華院（京都市上京區）
* 實相院（京都市左京區）
* 寂光院（京都市左京區）
* 三室戶寺（京都府宇治市）
* 三十三間堂（妙法院蓮華王院、京都市）
* 三千院（京都市左京區）
* 六波羅蜜寺（京都市東山區）
* 西芳寺（苔寺、京都市）
* 廣隆寺（京都市右京區）
* 金戒光明寺（京都市）
* 高臺寺（京都市東山區）
* 鞍馬寺（京都市左京區）
* 建仁寺（京都市東山區）
* 光悅寺（京都市北區）
* 高山寺（京都市右京區）
* 興正寺（京都市下京區）
* 教王護國寺（京都市南區）→ 東寺
* 行愿寺（京都市中京區）
* 清水寺（京都市東山區）
* 海住山寺（京都府木津川市加茂町）
* 勸修寺（京都市山科區）
* 穴太寺（京都府龜岡市）
* 廬山寺（京都市上京區）
大阪府
* 林昌寺（大阪府泉南市）
* 野中寺（大阪府羽曳野市）
* 葛井寺（大阪府藤井寺市）
* 南宗寺（大阪府堺市）
* 道明寺（大阪府藤井寺市）
* 長慶寺（大阪府泉南市）
* 太融寺（大阪市北區）
* 大聖觀音寺（大阪市住吉區）
* 大聖勝軍寺（大阪府八尾市）
* 大唸佛寺（大阪市平野區）
* 施福寺（大阪府和泉市）
* 四天王寺（大阪市）
* 西琳寺（大阪府羽曳野市）
* 孝恩寺（大阪府貝冢市）
* 觀心寺（大阪府河內長野市）
* 勝尾寺（大阪府箕面市）
* 西江寺（大阪府箕面市）
* 叡福寺（大阪府南河內郡太子町）
兵庫縣
* 本興寺（兵庫縣尼崎市）
* 斑鳩寺（兵庫縣揖保郡太子町）
* 中山寺（兵庫縣寶冢市）
* 如意寺（兵庫縣神戶市西區）
* 能福寺（兵庫縣神戶市兵庫區）
* 朝光寺（兵庫縣加東郡社町）
* 大龍寺（兵庫縣神戶市中央區）
* 太山寺（兵庫縣神戶市西區）
* 須磨寺（福祥寺、兵庫縣神戶市須磨區）
* 凈土寺（兵庫縣小野市）
* 清荒神清澄寺（兵庫縣寶冢市）
* 清水寺（兵庫縣加東郡社町）
* 神呪寺（兵庫縣西宮市）
* 伽耶院（兵庫縣三木市）
* 鶴林寺（兵庫縣加古川市）
* 溫泉寺（兵庫縣豐岡市）
* 圓教寺（兵庫縣姫路市）
* 一乘寺（兵庫縣加西市）
奈良縣
* 大安寺（奈良縣奈良市）
* 靈山寺（奈良市）
* 藥師寺（奈良縣奈良市）
* 室生寺（奈良縣宇陀郡室生村）
* 南法華寺（壺阪寺、奈良縣高市郡高取町）
* 寶山寺（奈良縣生駒市）
* 法隆寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
* 法輪寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
* 法華寺（奈良縣奈良市）
* 法起寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
* 不退寺（奈良縣奈良市）
* 長谷寺（奈良縣櫻井市）
* 唐招提寺（奈良縣奈良市）
* 東大寺（正倉院）（奈良縣奈良市）
* 中宮寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
* 當麻寺（奈良縣葛城市）
* 橘寺（奈良縣高市郡明日香村）
* 新藥師寺（奈良縣奈良市）
* 西大寺（奈良市）
* 興福寺（奈良縣奈良市）
* 元興寺（奈良縣奈良市）
* 岡寺（奈良縣高市郡明日香村）→龍蓋寺
* 帶解寺（奈良縣奈良市）
* 秋筿寺（奈良縣奈良市）
* 飛鳥寺（安居院、奈良縣高市郡明日香村）
* 大峰山寺（奈良県吉野郡天川村）
* 大峰山龍泉寺（奈良県吉野郡天川村）
和歌山縣
* 補陀洛山寺（和歌山縣東牟婁郡那智勝浦町）
* 根來寺（和歌山縣巖出市）
* 道成寺（和歌山縣日高郡日高川町）
* 長保寺（和歌山縣海南市）
* 善福院（和歌山縣海南市）
* 青岸渡寺（和歌山縣東牟婁郡那智勝浦町）
* 凈妙寺（和歌山縣有田市）
* 金剛三昧院（和歌山縣伊都郡高野町）
* 金剛峰寺（和歌山縣伊都郡高野町）
* 粉河寺（和歌山縣那賀郡粉河町）
* 紀三井寺（和歌山縣和歌山市）
鳥取縣
* 三佛寺（鳥取縣東伯郡三朝町）
島根縣
* 一畑寺（島根縣出雲市）
岡山縣
廣島縣
* 明王院（廣島縣福山市）
* 福禪寺（對潮樓、廣島縣福山市）
山口縣
* 東光寺（山口縣萩市）
* 功山寺（山口縣下關市）
德島縣
* 靈山寺（德島縣鳴門市）
香川縣
* 善通寺（香川縣善通寺市）
愛媛縣
* 泰平寺（愛媛縣宇和島市）
高知縣
福岡縣
* 承天寺（福岡縣福岡市）
* 觀世音寺（福岡縣太宰府市）
佐賀縣
長崎縣
* 崇福寺（長崎縣長崎市）
熊本縣
大分縣
* 富貴寺（大分縣）
宮崎縣
鹿兒島縣
* 泰平寺（鹿兒島縣薩摩川內市）