2012–13年歐霸杯將會是第 4 屆歐霸杯，若從歐洲足協盃時代算起，則是第 42 屆賽事。這屆賽事的決賽將會在荷蘭阿姆斯特丹的阿姆斯特丹球場舉行。從這屆賽事開始，歐足聯積分排名前六位聯賽的杯賽冠軍可以直接進入小組賽階段的賽事。
參賽席位
本屆比賽一共有 193 支球隊，分別來自歐洲足協的 53 個成員國參賽，每國獲得的參賽席位數根據2011年歐洲足聯聯賽排名（UEFA league coefficient）決定，這數據是根據歐洲各國球會於 2006–07 球季至 2010–11 球季期間，在歐洲賽的成績來定出。以下是本屆賽事各國席位數目的分佈大綱：
* 聯賽排名 1–6 位的聯賽將有 3 隊參加
* 聯賽排名 7–9 位的聯賽將有 4 隊參加
* 聯賽排名 10–51 位的聯賽將有 3 隊參加（列支敦士登只有 1 隊參加）
* 聯賽排名 52–53 位的聯賽將有 2 隊參加
* 于 2010–11 歐洲公平競技排名前 3 名的聯賽分別可獲得 1 個參賽席位
* 另外，33 支于2012–13年歐洲冠軍聯賽被淘汰的球隊可轉戰今屆歐霸杯
本來衛冕冠軍球隊會獲得一個自動參賽席位，但由於上屆賽事冠軍馬德里體育會已憑其本土聯賽的成績獲得參賽資格，因此這「衛冕席位」並未需要提供。
協會排名
備註
* （FP）：額外的公平競技席位（挪威、芬蘭、荷蘭）
* （UCL）：從2012–13年歐洲冠軍聯賽轉戰的球隊
席位分佈
由於以下的原因所致：
* 衛冕冠軍球隊馬德里體育會並未得到參加2012–13年歐洲冠軍聯賽的資格，因此該隊會肯定獲得今屆賽事的衛冕資格。可是由於球隊本身已憑其本土聯賽成績（第 5 名）成功得到本屆賽事的參賽資格，加上 2011–12 西班牙國王杯冠軍巴塞羅拿可參加歐洲聯賽冠軍盃賽事；因而這個席位會被刪減；
* 2012–13年歐洲冠軍聯賽外圍賽第三圈只會有 14 隊負方（原先會有 15 隊）轉戰本項賽事的決賽圈。
爲了配合以上 2 個席位被減去，賽會會作出以下調整：
* 成員國 7（俄羅斯）之杯賽冠軍，會由原先於附加賽圈開始參賽，改由直接晉身份組賽。
* 成員國 16 和 17（瑞士和以色列）之杯賽冠軍，會由原先於外圍賽第三圈開始參賽，改由直接晉身附加賽圈。
* 成員國 19 和 20（奧地利和塞浦路斯）之杯賽冠軍，會由原先於外圍賽第二圈開始參賽，改由直接晉身外圍賽第三圈。
* 成員國 33、34、35 和 36（摩爾多瓦、立陶宛、拉脫維亞和格魯吉亞）之杯賽冠軍，會由原先於外圍賽第一圈開始參賽，改由直接晉身外圍賽第二圈。
參賽球隊
括號內代表該隊于上季的本土聯賽或盃賽成績，而得到參賽資格：
* TH – 代表衛冕球隊
* CW – 代表盃賽冠軍
* CR – 代表盃賽亞軍
* LC – 代表聯賽盃冠軍
* Nth – 代表聯賽排名
* P- – 代表聯賽之季後賽（排名／冠軍）
* FP – 代表公平競技獎
* UCL – 從歐聯轉戰
 * UCL GS – 代表分組賽第 3 名
 * UCL PO – 代表附加賽負方
 * UCL Q3 – 代表外圍賽第三圈負方
備註
* （CZE）：奧洛穆茨（2011–12年捷克杯冠軍）因涉及賄賂醜聞，因而被歐洲足協禁止參與本屆賽事，同時該會亦決定不會作出上訴。所以，布拉格斯巴達（2011–12年捷克甲級足球聯賽第 2 位）將取代奧洛穆茨原本的外圍賽第三圈參賽資格，而博萊斯拉夫（2011–12年捷克甲級足球聯賽第 4 位）則會得到外圍賽第二圈參賽權。
* （ENG）：熱刺（2011–12年英格蘭超級足球聯賽第 4 位）原本可參加2012–13年歐洲冠軍聯賽，但因車路士（聯賽第 6 位）贏得2011–12年歐洲冠軍聯賽，因而獲得來屆歐聯的自動參賽權。受到每國最多派遣四隊參加歐聯的限制所影響，熱刺最終只能參與本項賽事的分組賽。
* （GRE）：AEK雅典（2011–12年希臘超級足球聯賽第 3 位）因財政上出現問題，而未能獲得本屆賽事的參賽權。所以，艾杜美圖斯（聯賽第 4 位）和PAOK沙朗歷基（聯賽第 5 位）會分別由原先於外圍賽第三圈和外圍賽第二圈開始參賽，改由附加賽圈和外圍賽第三圈起開始角逐，而卓普利斯（聯賽第 6 位）則會得到外圍賽第二圈的參賽權。
* （HUN）：吉奧利（2011–12年匈牙利甲級足球聯賽第 3 位）因違反規則，被歐洲足協禁止於 2011–12 至 2013–14 球季中出席任何歐洲賽事。所以，漢維特（聯賽第 4 位）會得到外圍賽第一圈的參賽權。
* （IRL）：德利城（2011年愛爾蘭超級足球聯賽第 3 位）因於兩年前球會宣佈清盤，因而被歐洲足協禁止參與歐洲賽事三年。所以，波希米亞人（聯賽第 5 位）會得到外圍賽第一圈的參賽權。
* （SCO）：格拉斯哥流浪雖然得到 2011–12年蘇格蘭超級足球聯賽第 2 位，但該隊未能及時解除行政監管，因而未能得到歐洲足協準許參加 2012–13 球季的歐洲賽事。所以，馬瑟韋爾（聯賽第 3 位）取代格拉斯哥流浪參加2012–13年歐洲冠軍聯賽，而登地聯（聯賽第 4 位）會由原先參加本屆賽事之外圍賽第二圈，改由外圍賽第三圈起開始角逐；聖莊士東（聯賽第 6 位）則會得到外圍賽第二圈的參賽權（因聯賽第 5 位的赫斯已憑奪得 2011–12 蘇格蘭足總盃而獲得本屆賽事之附加賽圈資格）。
* （TUR）：比錫達斯（2011–12年土耳其足球超級聯賽第 4 位）因為財政問題而被歐洲足協禁止參加 2012–13 球季的歐洲賽事。所以，聯賽第 5 位的貝沙（同時為 2011–12 土耳其杯亞軍）會取代比錫達斯，得到本屆賽的外圍賽第三圈參賽權（貝沙最初沖亦曾被禁賽，但其後國際體育仲裁院推翻了裁決）。艾斯基沙希（聯賽第 6 位）則會得到外圍賽第二圈的參賽資格。
賽程表
除了分組賽抽籤儀式會於摩納哥舉行外，其餘階段的抽籤都會於歐洲足球協會聯盟總部瑞士尼翁舉行。
外圍賽
于外圍賽和附加賽圈，參賽球隊會根據其 2012年的歐洲足協球會係數被分為「種子隊」和「非種子隊」，然後會以兩回合的主客制進行比賽，同國家球隊不會互相對壘對。
外圍賽第一圈
備註
* 注 1: 主客場出賽次序，與最初抽籤時作出對調
外圍賽第二圈
備註
* 注 2: 主客場出賽次序，與最初抽籤時作出對調
外圍賽第三圈
以下 58 隊會參加外圍賽第三圈：40 隊外圍賽第二圈勝方、18 隊於此圈開始參賽。
備註
* 注 3: 主客場次場出賽次序，與最初抽籤時作出對調
* 注 4：基輔阿仙奴于首回合對梅拿05的比賽，因派出不合規格球員，被歐洲足協判以 0–3 落敗。
* 注 5：該場比賽進行至 82 因主隊安羅科薩斯球迷發生騷亂而腰斬，當時客隊迪拿哥里以 3–0 領先。而歐洲足協最終宣佈該場比賽保留迪拿哥里以 3–0 獲勝。
附加賽
以下 62 隊會參加附加賽：29 隊外圍賽第三圈勝方、19 隊於此圈開始參賽、14 隊2012–13年歐洲冠軍聯賽外圍賽第三圈負方（10 隊聯賽冠軍、4 隊非聯賽冠軍）。
備註
* 注 6: 主客場次場出賽次序，與最初抽籤時作出對調
分組賽
48 隊會被分成 12 組，每組 4 隊。小組首名和小組次名可晉級，聯同 8 隊2012–13年歐洲冠軍聯賽分組賽第三名一同於三十二強角逐。
A組
B組
C組
D組
E組
F組
G組
H組
I組
J組
K組
L組
淘汰賽
晉級圖
三十二強
三十二強抽籤于2012年12月20日進行。首回合賽事于2013年2月14日進行，而次回合賽事于2013年2月21日進行。
十六強
首回合賽事于2013年3月7日進行，而次回合賽事于2013年3月14日進行。
半準決賽
半準決賽抽籤于2013年3月15日進行。首回合賽事于2013年4月4日進行，而次回合賽事于2013年4月11日進行。
準決賽
準決賽抽籤于2013年4月12日進行。首回合賽事于2013年4月25日進行，而次回合賽事于2013年5月2日進行。
決賽
決賽于2013年5月15日，于阿姆斯特丹阿姆斯特丹球場進行。本屆決賽自2000年、2002年及2009年後第 4 次由當屆歐洲聯賽冠軍盃小組第三的兩支球會對壘，也是改制和改名為歐霸杯後的首次。