Offre d'emploi :  Ingénieur d'études en bio-informatique, bioanalyse et développement H/F
Employeur : INSTITUT DE RECHERCHE POUR LE DEVELOPPEMENT

L'IRD est un établissement public français placé sous la double tutelle des ministères de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation et de l’Europe et des Affaires étrangères. Il porte une démarche originale de recherche, d’expertise, de formation et de partage des savoirs au bénéfice des territoires et pays qui font de la science et de l’innovation un des premiers leviers de leur développement.
Organisme de rattachement : Institut de Recherche pour le Développement
Versant : Fonction Publique de l'Etat
Métier : Experte / Expert en calcul scientifique
Catégorie : Catégorie A (cadre)
Statut du poste : Vacant
Nature de l'emploi : Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
Localisation : Hérault (34)
Lieu d'affectation : 911 Avenue d'Agropolis
Télétravail :  Oui
Management :  Non
Temps plein :  Oui
Date de vacance de l'emploi : 01/06/2022
Compétences attendues : - Connaissances approfondies dans le domaine de la bio-informatique et les problématiques liées à l'analyse de données biologiques (échantillonnage, répétitions et variabilité biologique, contraintes expérimentales, big data…).
- Expérience dans l'analyse de données NGS de deuxième et troisième génération (détection de variants intra-hôte, expression différentielle (transcriptomique), métagénomique (amplicons barcoding, shotgun), génomique comparative, assemblage et reconstruction de génomes sur des microorganismes (virus, bactéries) et des plantes.
- Maîtrise d'au moins un langage de programmation (Python/Perl, R), des outils nécessaires à la reproductibilité (Rshiny, Jupyter lab, git, Singularity) et à la création de pipelines (Snakemake/NextFlow).
- Maîtriser les systèmes d'exploitation Linux et infrastructure de calcul (SLURM).
- Avoir des notions en biologie moléculaire, microbiologie, génomique, statistiques.
- Savoir formuler une problématique scientifique en termes techniques.
Documents à transmettre : L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire