Préfecture de la région Bourgogne-Franche-Comté
Le préfet de région est le représentant du Premier ministre et de chacun des ministres dans la région. Il est le garant de la cohérence de l’État dans la région.

Il est responsable de l’exécution des politiques de l’État dans la région (sous réserve des compétences de l’agence régionale de santé, de la direction régionale des finances publiques et du rectorat) ainsi que des politiques communautaires qui relèvent de l’État.

Il assure le contrôle administratif de la région, de ses établissements publics, des établissements publics inter-régionaux qui ont leur siège dans la région. Il est également le préfet du département (la Côte-d'Or) où se trouve le chef-lieu de la région, Dijon.

Le secrétariat général pour les affaires régionales (SGAR), placé auprès du préfet de région, coordonne l’action interministérielle et interdépartementale des services de l’État dans la région. Il organise, en outre, la mutualisation des fonctions support.