Données de laboratoires pour le dépistage  (A COMPTER DU 18/05/2022) - SI-DEP
Organisation : Santé publique France
Licence : Licence Ouverte / Open Licence version 2.0
Fréquence de mise à jour : daily
Mots-clés : covid19,laboratoires

**Dans un contexte d’épidémie favorable, à compter du 1er juillet 2023, le cadre juridique actuellement en cours prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues de SI-DEP. Par conséquent, après une période transitoire d’ajustement de deux semaines, les nouveaux indicateurs de surveillance virologique seront publiés aux niveaux national, régional et départemental) à une fréquence hebdomadaire. 
Les consignes de saisie spécifiques dans SI-VIC seront levées à partir de cette date, les indicateurs hospitaliers ne seront plus disponibles. 
Santé publique France maintient la surveillance de l’épidémie à travers son dispositif multi-sources. Les indicateurs relatifs à la surveillance génomique, aux recours aux associations SOS Médecins, aux urgences hospitalières et aux décès resteront disponibles.**


🆕 **AJOUT 06/09/2022**
Mise à disposition de l'historique des données pour la couche IRIS.
Un fichier par mois de données.

⚠️ **MAJ 09/08/2022**
Santé publique France met à jour les référentiels géographiques et de population, utilisés pour la production et la diffusion des indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19. Cette actualisation sera effective le **7 juillet 2022** . Elle est amenée à être renouvelée chaque année.
De ce fait, certains intitulés de champs seront corrigés à compter du **10 août 2022** :
- Pour les fichiers `sp_metro_*` : `epci2020` devient **`epci`** 
- Pour les fichiers `sp_iris_*` : `iris2019` devient **`iris`**

**08/06/2022** Compte tenu de la tendance actuelle favorable et la baisse des principaux indicateurs, à partir du 11 juin 2022, les indicateurs COVID-19 produits par Santé publique France seront actualisés sur [Geodes](https://geodes.santepubliquefrance.fr/#c=home) et data.gouv.fr tous les jours **à l’exception** des week-end et des jours fériés. 

🆕 **A COMPTER DU 18/05/2022**, le format des ressources issus des données de laboratoires pour le dépistage (SI-DEP) évolue.

***Quelles données ? :***
Les indicateurs de surveillance virologique sont issus du système d’information de dépistage (SI-DEP), dont l’objectif est de remonter les données de tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2, ainsi que les tests antigéniques réalisés par les laboratoires, pharmaciens, médecins et infirmiers.


➡️ L'ensemble des tables et des variables qui les composent, ainsi que le descriptif des modifications sont consultables dans la note méthodologique datée du 12/05/2022 disponible **[ici](https://static.data.gouv.fr/resources/donnees-de-laboratoires-pour-le-depistage-a-compter-du-18-05-2022-si-dep/20220512-153419/2022-05-12-sidep-evol-open-data.pdf)**