Table de mortalité par âge, sexe, et niveau de comorbidité pour la France hors DOM-TOM et Corse (2012 -2018)
Organisation : Centre d'Epidémiologie et de Recherche en sante des Populations  UMR1295 (CERPOP) ; Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT-O), Groupe de recherche et d'analyse en santé des populations (GAP) 
Licence : Open Data Commons Open Database License (ODbL)
Fréquence de mise à jour : irregular
Couverture temporelle : 2012-01-01 – 2018-12-31
Mots-clés : base-de-donnees-medico-administrative,egbs,multimorbidite,population-generale,systeme-national-des-donnees-de-sante,table-de-mortalite

Une description détaillée de la méthode et une discussion des choix méthodologiques fait l’objet d’un article en cours de publication dont la référence sera mise à jours dès que possible. 

Description des fichiers (1 fichier pour les hommes et 1 pour les femmes)
Age		= âge en année
CCI0		= taux de mortalité en absence de comorbidité
SxFict_FCCI0	= ordre de survie en absence de comorbidité
EV_CCI0		= espérance de vie en absence de comorbidité
CCI1		= taux de mortalité en présence d'un faible niveau de comorbidité
SxFict_FCCI1	= ordre de survie en présence d'un faible niveau de comorbidité
EV_CCI1		= espérance de vie en présence d'un faible niveau de comorbidité
CCI2		= taux de mortalité en présence d'un niveau intermédiaire de comorbidité
SxFict_FCCI2	= ordre de survie en présence d'un niveau intermédiaire de comorbidité
EV_CCI2		= espérance de vie en présence d'un niveau intermédiaire de comorbidité
CCI3		= taux de mortalité en présence d'un niveau élevé de comorbidité
SxFict_FCCI3	= ordre de survie en présence d'un niveau élevé de comorbidité
EV_CCI3		= espérance de vie en présence d'un niveau élevé de comorbidité

Données utilisées
•	Population : Echantillon généraliste des bénéficiaires simplifié (EGBs) - SNDS
•	Personnes âgées de 18 ans ou plus, vivants en France métropolitaine, hors Corse et DOM-TOM
•	Période : 2011-2018 (période maximale disponible) 

Définition et repérage des comorbidités
•	Mesure des comorbidité : Indice de comorbidité de Charlson (Charlson, Pompei et al. 1987) ; score CCI en classes (CCI=0 : « absence », CCI>0 & CCI<3 : « niveau faible », CCI≥3 et CCI<5 : « niveau intermédiaire », CCI≥5 : « niveau élevé »)
•	Repérage dans l’EGBs : des diagnostics hospitaliers et des ALD, codifiés en CIM-10, consommations médicamenteuses spécifiques et des actes médicaux discriminants ; algorithme publié (Quan, Li et al. 2011, Bannay, Chaignot et al. 2016).
•	Pour chaque année de la période, les comorbidités ont été recherchées sur une période glissante de 12 mois avant la date de décès ou une date de point aléatoire sur l’année 2018 pour les exclus vivants en 2018. 

Production de table de mortalité. 
•	Suivi homogène de 1 an avant le décès ou date d’index pour les vivants
•	Lissage des taux de mortalité bruts par âge et années ont été lissés, pour chaque sexe, à partir d’un modèle additif généralisé (GAM) de poisson logarithmique avec des tenseur (Wood 2017). Trois nœuds ont été utilisés pour les années (2012 ; 2014 ; 2017) et 10 nœuds pour l’âge, distribués de façon équilibrée entre 18 et 90 ans (18 ; 26 ; 34 ; 42 ; 50 ; 58 ; 66 ; 74 ; 82 ; 90).  

**AVERTISSEMENT : **
La méthode de calcul a consisté à calculer des taux de mortalité par tranche d'âge et par niveau de comorbidité, puis de reconstituer des cohortes par niveau de comorbidité pour l'estimation des espérances de vie par âge. De fait, nous faisons une hypothèse forte de stabilité du niveau de comorbidité au fil de temps : ainsi, l'espérance de vie fournie pour un individu de 75ans avec un niveau de comorbidité modéré est donc celle qui serait observée si cet individu conservait le même niveau de comorbidité jusqu'à son décès. Compte tenu de la nature des pathologie prise en compte, en particulier de leur chronicité, il est peu vraisemblable que celles-ci disparaissent avec le temps. Aussi, les valeurs que nous fournissons correspondent à la borne supérieure des valeurs d'espérance de vie possible pour un niveau de comorbidité donné. 
Des travaux sont en cours pour pallier cette limite à partir des données disponibles en population générale. 

REFERENCE

Bannay, A., C. Chaignot, P. O. Blotiere, M. Basson, A. Weill, P. Ricordeau and F. Alla (2016). "The Best Use of the Charlson Comorbidity Index With Electronic Health Care Database to Predict Mortality." Med Care 54(2): 188-194.
Charlson, M. E., P. Pompei, K. L. Ales and C. R. MacKenzie (1987). "A new method of classifying prognostic comorbidity in longitudinal studies: development and validation." J Chronic Dis 40(5): 373-383.
Quan, H., B. Li, C. M. Couris, K. Fushimi, P. Graham, P. Hider, J. M. Januel and V. Sundararajan (2011). "Updating and validating the Charlson comorbidity index and score for risk adjustment in hospital discharge abstracts using data from 6 countries." Am J Epidemiol 173(6): 676-682.
Wood, S. N. (2017). Generalized Additive Models: An Introduction with R, Second Edition, CRC Press.