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Projet ANR-06-PHYS-0026 – MUSCLE BIOENERGETICS : "AMP-activated" et S6 kinases: roles opposés dans l'adaptation du muscle squelettique à l'état nutritionnel et à l'exercise
Programme : Physiopathologie des maladies humaines (Physio) (PHYSIO) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : INSERM - DÉLÉGATION RÉGIONALE PARIS V (INSERM - Délégation régionale Paris V)
Partenaires : Institut national de la santé et de la recherche médicale; Institut national de la santé et de la recherche médicale
Montant : 280000.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : RESUME PROJET – Contexte scientifique et objectifs:"L¿état nutritionnel et l¿activité physique ont d¿importants effets sur le métabolisme et la croissance du muscle squelettique. De nombreux résultats suggèrent que des dysfonctionnements dans ces mécanismes de régulation pourraient jouer un rôle crucial dans le développement de l¿obésité et du diabète de type 2. Plusieurs groupes dont les nôtres ont identifié deux voies de signalisation intracellulaire majeures dans le contrôle de la croissance musculaire et l¿homéostasie énergétique. La voie mTOR/S6 kinase (S6K) intervient dans les réponses anaboliques en réponse aux nutriments, à l¿insuline, à l¿IGF et à l¿exercice aigu de résistance. Inversement, au cours du jeûne et de l¿exercice d¿endurance, la protéine kinase activée par l¿AMP (AMPK) est activée pour mettre en place des processus d¿épargne énergétique. Dans ce projet de recherche, nous prévoyons d¿étudier les relations entre ces deux voies de signalisation et les conséquences fonctionnelles pour la physiopathologie musculaire.RESUME PROJET – Description:"Dans ce but, les deux équipes de recherche ont développé un ensemble de modèles animaux et de systèmes in vitro permettant des altérations spécifiques de l¿activité de ces kinases. Notre hypothèse propose la S6K et l¿AMPK comme deux activités mutuellement exclusives contrôlant les programmes d¿adaptation à l¿état nutritionnel et à l¿exercice. Nos résultats préliminaires suggèrent qu¿une délétion de la S6K est suffisante pour augmenter le rapport AMP/ATP aboutissant à l¿activation de l¿AMPK. Nous analyserons les causes relatives à cet état de stress énergétique. Ensuite, nous mesurerons plusieurs réponses métaboliques ainsi que la croissance de cellules musculaires déficientes en S6K et établirons dans quelle mesure elles résultent d¿une activation de l¿AMPK. Le phénotype des souris délétées pour la S6K sera comparé à celui des souris délétées des deux sous-unités alpha1 et alpha2 de l¿AMPK dans le muscle squelettique. Enfin, le rôle des substrats communs à l¿AMPK et à la S6K dans le contrôle des programmes d¿adaptation musculaire sera évalué. RESUME PROJET – Resultats attendus:"Ces travaux devraient permettre de mettre en évidence les mécanismes moléculaires impliqués dans l¿apparition des syndromes métaboliques.
Projet ANR-06-PADD-0016 – PROPOCID : La production des politiques de développement rural durable dans leurs contextes
 Construction de compromis institutionnels et ajustements temporels entre le global et le local
Programme : Programme fédérateur "Agriculture et Développement Durable" (ADD) (ADD) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Philippe BONNAL (CENTRE DE COOPERATION INTERNATIONALE EN RECHERCHE AGRONOMIQUE POUR LE DEVELOPPEMENT - CIRAD - DEPARTEMENT ES)
Partenaires : Institut national supérieur des sciences agronomiques, de l'alimentation et de l'environnement; Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique; Université Paris 8 - Vincennes - Saint-Denis
Montant : 254000.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : Partant du constat que les questions globales soulevées par l'émergence de la durabilité dans l'arène internationale se déclinent de façon spécifique au niveau national, cette recherche comparée sur les politiques publiques dans six contextes nationaux, vise à identifier les niveaux pertinents de production (international, national, régional, local) et les modalités selon lesquelles les politiques de développement rural durable sont conçues, négociées et mises en oeuvre
Projet ANR-07-NANO-0005 – GEMINI : GEneration of quantum correlated photons from multiple Microcavities and photoNIc microstructures
Programme : Nanosciences et Nanotechnologies (PNANO) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Jacqueline BLOCH (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR OUEST ET NORD)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique
Montant : 633030.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Nous proposons de développer une source de faisceaux quantiquement corrélés et de paires de photons corrélés basée sur des microcavités à semiconducteurs. Nous avons récemment démontré dans une microcavité triple maintenue à 10 K l'émission de faisceaux jumeaux tels que la différence entre l’intensité du signal et celle du complémentaire est 6 % inférieure à la limite quantique standard. Le premier volet de ce projet est consacré à la poursuite de ces expériences pionnières d'optique quantique dans les semiconducteurs: l’objectif est d'obtenir à basse température et sous pompage optique des paires de photons beaucoup plus fortement corrélées et de démontrer l'émission de paires de photons intriquées. Un couplage constant avec la modélisation théorique permettra de réaliser les structures à microcavité optimales. Dans un deuxième volet nous orienterons nos efforts vers des conditions de fonctionnement plus favorables aux applications. Il s’agit de démontrer l’émission de paires de photons et les corrélations quantiques à plus haute température. Enfin nous réaliserons de nouvelles structures pour l’émission de photons corrélés quantiquement sous injection électrique objectif à ce jour jamais atteint dans aucun système alternatif. - -
Projet ANR-07-GPLA-0004 – GnpAnnot : Plate-forme d’annotation structurale, fonctionnelle et comparative dédiée aux génomes de plantes et de leurs bioagresseurs
Programme : Genoplante (GPLA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Madame Stéphanie SIDIBE-BOCS (CENTRE DE COOPERATION INTERNATIONALE EN RECHERCHE AGRONOMIQUE POUR LE DEVELOPPEMENT - CIRAD -)
Partenaires : Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 512965.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Les produits végétaux sont la source majeure de l’alimentation. A l'échelle mondiale, environ 30% des cultures sont perdues à cause des insectes nuisibles et des pathogènes. Face à ces enjeux, un effort considérable est accompli pour le décryptage des génomes de plantes et de leurs bioagresseurs. L’annotation de gènes est l’étape primordiale de l’analyse de séquences nucléiques et nécessite de définir la structure des gènes, la fonction des protéines et les relations d’homologie. Même s’il existe de grandes variations entre les espèces eucaryotes, on retiendra que l’annotation des génomes est difficile pour plusieurs raisons : polyploïdie, proportion importante de régions non codantes et de régions répétées, structure des gènes morcelée en intron/exon. Des logiciels de prédiction automatique de gènes ont été développés mais ils ne peuvent remplacer l’annotation manuelle si l’on veut des annotations de haute qualité. Aucun des systèmes développés pour gérer cette masse d’information n’offre l’ensemble des fonctionnalités requises à savoir : (i) annotation manuelle structurale, fonctionnelle et comparative de gènes eucaryotes, (ii) base de données, pipelines d’analyse et interfaces Web annotateur, (iii) généricité, modularité, portabilité, durabilité et compatibilité. Le CIRAD, l’INRA et Bioversity International qui ont déjà travaillé ensemble, proposent de mutualiser leurs moyens et leur savoir-faire pour développer et utiliser une plate-forme qui permettra aux utilisateurs d’annoter automatiquement et manuellement les génomes, de naviguer dans ces génomes et d’effectuer des comparaisons entre génomes. Le travail sera organisé en cinq lots de travaux : (i) gestion de base de données, (ii) développement d’interfaces annotateur, (iii) interopérabilité avec d’autres systèmes, (iv) exploitation des séquences et mise en production de la plate-forme et (v) annotation manuelle et validation de la plate-forme. Cette plate-forme sera exploitée immédiatement dans le cadre de projets de séquençage identifiés étudiant la structure et l’évolution de génomes et/ou recherchant des gènes d’intérêt agronomique. Quatre instances de la plate-forme seront mises en production sur trois sites : monocotylédones (Montpellier), insectes (Rennes), champignons (Evry) et blé-vigne (Evry).
Projet ANR-07-GPLA-0005 – GnpIntegr : Plate-forme intégrative en génomique : interopérabilité entre les bases de données, les banques de données et les outils, mise en place d’un environnement collaboratif de développement logiciel, support de projets scientifiques de grande envergure.
Programme : Genoplante (GPLA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : Institut national de la recherche agronomique
Montant : 74000.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 12 mois
Résumé : Genoplante-Info est une plate-forme bioinformatique au service de la communauté génomique végétale. Elle centralise, intègre et analyse les données et fournit des outils à ses utilisateurs depuis maintenant 7 années. Son système d’information GnpIs a permis aux chercheurs de mettre en évidence des cibles pour des recherches de gènes candidats, de synthétiser dans une même interface graphique des données de cartes génétiques avec des données publiques et privées, de mettre en évidence des co-localisations entre des gènes et des QTLs, de gérer des listes de gènes surexprimés et sous exprimés issus d’analyse d’expériences de transcriptomique et de pouvoir lister et voir graphiquement positionnés sur le génomique tous les allèles d’un gène dans un ensemble de lignées étudiées.  Ce système d’information repose sur une plateforme informatique robuste matérielle et logicielle qui doit évoluer pour assurer l’arrivée continuelle de nouveaux projets. Les nouveaux résultats obtenus dans les programmes ont mis en évidence le besoin actuel urgent de lier les données de génomique avec des données de diversité moléculaire pour permettre la découverte de nouveaux allèles d’intérêt.  L’intégration des données et la réalisation de l’interopérabilité est à présent devenue une étape cruciale qui doit se traduire par un ajout de nouveaux modules à l’entrepôt de données génomique mais également par une meilleure interaction et la création de liens entre les modules.  La réalisation de cette interopérabilité est un projet ambitieux qui ne peut être effectuée que par la mise en place d’une organisation sur la plateforme permettant l’accueil de projets scientifiques, le suivi des projets et la mise en place d’un environnement de travail collaboratif entre les bioinformaticiens de la plateforme, les bioinformaticiens locaux et les biologistes responsables des projets. Cela passe aussi par un renforcement dans l’utilisation des média de communication, par un serveur Web au contenu riche et de consultation conviviale, avec un maximum de tutoriaux, et la mise en place de formation aux outils de la plateforme pour en tirer son exploitation maximale.
Projet ANR-07-NANO-0028 – MNGE-SPIN : Synthèse par épitaxie d'hétérostructures Mn5Ge3/Ge pour applications en spintronique
Programme : Nanosciences et Nanotechnologies (PNANO) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Vinh LE THANH (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE PROVENCE CORSE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique
Montant : 406616.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : L’objectif du projet consiste à synthétiser par épitaxie par jets moléculaires des hétérostructures basées sur le composé ferromagnétique Mn5Ge3 déposées sur un substrat de Ge et d’en étudier des propriétés structurales magnétiques et de transport. Tandis qu’à l’heure actuelle il n’existe pas de façon certaine et reproductible de semi-conducteurs ferromagnétiques à haute température, les hétéro-structures Mn5Ge3/Ge par le caractère métallique et ferromagnétique à température ambiante de Mn5Ge3 se représentent comme un candidat unique pour l’étude d’injection du courant polarisé en spin dans les semi-conducteurs du groupe IV (Ge Si) par effet tunnel à travers la barrière Schottky. Nous proposons de mettre en œuvre deux techniques de croissance pour maîtriser la qualité cristalline et d’interface: la ‘Solid Phase Epitaxy’ (SPE) qui consiste à déposer du Mn à froid suivi par des recuits thermiques et la ‘Reactive Deposition Epitaxy’ (RDE) durant laquelle un co-dépôt de Mn et Ge à stœchiométrie parfaitement contrôlée est effectué. Nos récents résultats obtenus par la technique RDE ont montré qu’il est possible d’obtenir des hétérostructures ayant une interface abrupte à l’échelle atomique. Finalement nous proposons de réaliser des structures de test pour mesurer les effets d’accumulation de spin à l’interface et de magnéto-résistance tunnel. - -
Projet ANR-07-BIOE-0008 – LIPICAERO : Production microbienne de LIPIdes spécifiques à usage bioCarburant pour l AEROnautique : Approche intégrée de Physiologie au Procédé
Programme : Bioénergies (Bio-E) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : MOLINA-JOUVE CAROLE (INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES - INSA TOULOUSE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national des sciences appliquées de Toulouse; Institut national polytechnique de Toulouse; LESAFFRE INTERNATIONAL
Montant : 955113.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Dans une démarche d’utilisation du carbone renouvelable pour l’élaboration de molécules additifs au kérosène, le projet concerne la production microbienne de molécules selon des critères de titres et rendements compatibles avec une transposition industrielle réaliste. Les molécules ciblées sont des lipides microbiens spécifiques dont le profil est modulé afin de les qualifier pour une utilisation en mélange et/ou en substitution au kérosène. Ce projet associe l’élaboration de souches modifiées en vue d’amplifier l’accumulation des lipides et moduler leur profil, la maîtrise des flux carbonés par une démarche de génie métabolique, la définition (déductive) et la mise en œuvre de stratégies de fermentation de substrats amylacés et/ou de glycérol, l’extraction, la séparation et la purification des lipides par transposition des techniques traditionnelles (lyse cellulaire) et de pointe (CO2 supercritique) dans une démarche de bioraffinerie. Les attendues du projet concernent le renforcement de la compétitivité des industries aéronautiques par la réduction des émissions de gaz à effet de serre et de rationalisation de l’utilisation du carbone fossile.
Projet ANR-07-BDIV-0015 – AQUAPHAGE : Relations entre diversité procaryotique et virale au sein de différents environnements aquatiques
Programme : Biodiversité (BDIV) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Markus WEINBAUER (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE COTE D'AZUR)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la recherche agronomique; Université Paris-Sud
Montant : 650000.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Les virus constituent l’entité biologique la plus abondante des écosystèmes aquatiques. Il est aujourd’hui reconnu que leur rôle puisse être essentiel dans le contrôle de la diversité des organismes procaryotes. Cependant, l'étude des phages à l’échelle des communautés naturelles reste limitée. C’est dans ce cadre scientifique que se situent les objectifs spécifiques d’AQUAPHAGE:
1) déterminer l’effet des virus (par comparaison avec celui des prédateurs) sur la dynamique et la biodiversité des procaryotes ;
2) relier la nature du cycle de vie (cycles lysogénique vs. lytique) à la diversité des phages ;
3) valider le modèle mathématique dit du « phage kills the winner », entre autres ; 
4) conduire des expériences in situ de co-variation entre biodiversité virale et biodiversité des hôtes. La mise en oeuvre d'approches métagénomiques permettra de tester la robustesse du modèle cité.
Les études seront menées dans des environnements aquatiques contrastés (approche écologique comparative), ce qui permettra de relier biodiversité virale et productivité des écosystèmes.
Projet ANR-07-CEXC-0011 – DualSugraString : Dualités et compactifications généralisées en supergravité et théorie des cordes
Programme : Chaires d'excellence (CEXC) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Monsieur Henning Samtleben (ECOLE NORMALE SUPERIEURE DE LYON)
Partenaires : École normale supérieure de Lyon
Montant : 183000.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : La théorie des cordes a pour but de décrire la nature aux très petites longueurs en remplaçant le concept de particules élémentaires ponctuelles par des cordes étendues. Pour être cohérent, elle requiert un espace-temps à dix dimensions. À basse énergie, et après compactification des dimensions spatiales supplémentaires, on obtient des théories des champs effectives qui sont des théories de supergravité. La géométrie des dimensions supplémentaires compactifiées est alors importante car elle se reflète dans le comportement phénoménologique (constantes de couplage, masses et symétries) de ces théories effectives. Récemment, l’attention s’est portée sur l’analyse de géométries généralisées et de configurations non-géométriques à cause des propriétés phénoménologiques désirables des théories effectives associées. Le but de ce projet est d’étudier ces théories de supergravité et leurs relations avec la géométrie de l’espace interne tant du point de vue phénoménologique (stabilisation des champs scalaires en présence d’une constante cosmologique positive) que fondamental (comme étape indispensable pour la recherche de la symétrie fondamentale de la théorie M encore inconnue unifiant les diverses théories consistantes de cordes). Les symétries de dualité sous-jacentes aux théories de cordes et de supergravité joueront un rôle fondamental pour ces deux aspects.
Projet ANR-07-PNRA-0020 – INTESMETAPRO : Acides aminés et métabolisme protéique intestinal : étude des mécanismes.
Programme : Alimentation et nutrition humaine (PNRA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Moïse COËFFIER (UNIVERSITE DE ROUEN [HAUTE-NORMANDIE])
Partenaires : Centre Hospitalier Universitaire Rouen; Institut national de la recherche agronomique; Université de Rouen
Montant : 251156.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Le métabolisme protéique intestinal, qui peut être influencé par la quantité et la qualité de l’apport alimentaire en protéines, régule de nombreuses fonctions physiologiques telles que la fonction de barrière intestinale et représente une part importante du renouvellement protéique totale de l’organisme. Au niveau intestinal, les voies de signalisation permettant de comprendre les effets de certains acides aminés ne sont pas connues chez l’homme. Le but de ce projet est donc d’évaluer et de comprendre les effets de certains acides aminés (glutamine, leucine) sur le métabolisme protéique intestinal (synthèse et dégradation) chez des jeunes adultes sains. Les voies de signalisation telle que mTOR, p70 S6 kinase ou les facteurs d’initiation ou d’élongation de la traduction seront étudiées, ainsi que la fonction mitochondriale. La synthèse protéique sera également évaluée par l’incorporation d’acides aminés marqués avec des isotopes stables et la protéolyse par la mesure des activités des voies protéolytiques. Ce projet devrait contribuer à une meilleure compréhension des effets des acides aminés sur le métabolisme protéique intestinal chez l’homme.
Projet ANR-07-STKE-0009 – PULSSE : Programme pour l'Utilisation de la Lumière Synchrotron dans le domaine du Stockage de l'Energie
Programme : Stockages innovants de l'énergie (Stock-E) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE BRETAGNE ET PAYS- DE-LA-LOIRE (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE BRETAGNE ET PAYS- DE-LA-LOIRE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; PME
Montant : 375009.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Même si, bien évidemment, les faiblesses, voire la fin, d'une batterie au lithium, apparaissent au cours de son fonctionnement, très peu d'études ont permis de caractériser à ce jour des batteries au lithium au cours de leur fonctionnement, hormis bien sûr les caractérisations électrochimiques. Ce projet vise à combler partiellement cette lacune en caractérisant les matériaux de batteries pendant leur cyclage, en mettant en oeuvre deux méthodes qui ont fait leurs preuves pour la détermination des structures atomiques et électroniques : la diffraction des rayons X (DRX) et la spectroscopie d'absorption X (XAS). En effet, les capacités des sources de synchrotron de 3ème génération, autorisent désormais des résolutions temporelles pour ces méthodes de l'ordre de la seconde, voire moins, et des résolutions spatiales de l'ordre du micromètre. Plus précisément, nous caractériserons la diffusion du lithium et des électrons dans les électrodes et ses conséquences en termes de polarisation, relaxation,  inhomogénéité, perte de capacité. Les partenaires du projet sont donc des laboratoires d'électrochimie du solide (IMN et LRCS) et le synchrotron Soleil.