Projet ANR-06-EMPB-0008 – D.E.T.S.C.A.N. : Détection Electrochimique en Temps réel de Séquences Cibles d’Acides Nucléiques
Programme : Emergence et maturation de projets de biotechnologie à fort potentiel de valorisation (EMPB) (EMPB) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE PARIS VII [DENIS DIDEROT] (UNIVERSITE DE PARIS VII [DENIS DIDEROT])
Partenaires : Université de Bourgogne; Université Paris Diderot
Montant : 148435.0 euros
Durée : 18 mois
Résumé : révolutionné le monde du diagnostic médical grâce à leurs sensibilités et spécificités extrêmes. Une nouvelle étape vient d’être franchie avec les dernières générations d’appareils combinant amplification d’ADN et détection. On peut citer le LightCycler® 2.0 System de chez Roche Applied Science, la série de MyiQ™ System de chez Bio-Rad, ABI Prism® de chez Applied Biosystems ou encore le SmartCycler® Technology de chez Cepheid. Leur succès considérable repose à la fois sur d’importantes économies en moyens humains et techniques, mais aussi sur de nets progrès en termes de quantification, fiabilité, sensibilité et réduction de la durée d’une analyse. On peut également noter l’absence de contaminations croisées en raison de la suppression des manipulations entre les étapes d’amplification et de détection. Le marché actuel est estimé à 1,5 Mds$ et suit une croissance à deux chiffres (investisor presentation, Stratagene, sept 2005). Il reste que le mode de détection de ces techniques dites en temps réel repose sur une mesure optique, ce qui en fait des techniques peu robustes, relativement chères et difficilement transportables. Pour remédier à ces inconvénients, nous avons développé une méthode inédite de détection électrochimique en temps réel intégrée à un processus d’amplification d’ADN, méthode qui a fait l’objet d’une demande récente de brevet : dépôt national français, n° d’enregistrement INPI 06/01936. Notre approche repose sur un principe extrêmement simple qui consiste à mesurer la disparition du dGTP au cours de la réplication d’un fragment d’ADN par PCR. A chaque cycle d’amplification, une mesure électrochimique de la concentration de ce nucléotide en solution est effectuée en présence d’une molécule redox (médiateur) catalysant son oxydation au niveau du résidu guanidique. Une diminution de courant traduit alors un abaissement de la concentration en dGTP, conséquence de son incorporation dans l’ADN cible amplifié. Cette méthode de par sa simplicité et son faible coût instrumental permet d’envisager une réduction des coûts d’analyses. D’autre part, en raison de sa robustesse, de sa miniaturisation et de son intégration aisée aux techniques PCR déjà existantes, elle devrait à terme permettre de répondre aux besoins croissants de portabilité et flexibilité demandés dans les secteurs de la santé, de l’industrie alimentaire, du traitement des eaux, de la lutte contre le bioterrorisme ou encore de la traçabilité par marquage à l’ADN. Le financement demandé doit donc nous permettre de franchir l’étape supplémentaire qui consiste à réaliser un premier prototype utilisable en routine pour la détection d’un ADN cible, que nous avons choisi dans le cadre de cette étude d’origine virale. Ce passage du stade de l’invention laboratoire au stade prototype est fondamental, car il devrait nous permettre de trouver à terme les partenaires industriels et financiers indispensables aux développements d’un dispositif commercialisable et à la création d’une société basée sur notre technologie.