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Projet ANR-06-ECOT-0012 – HYBIOX : Procédés biologiques hybrides pour l’amélioration de la dégradation des composés xénobiotiques et substances dangereuses
Programme : Programme Ecotechnologies et Développement Durable (PRECODD) (PRECODD) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES - INSA TOULOUSE  (INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES - INSA TOULOUSE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Institut national des sciences appliquées de Toulouse; Entreprise autre que TPE ou PME; Entreprise autre que TPE ou PME; Divers privé
Montant : 674962.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Les évolutions législatives concernant les substances prioritaires dangereuses pour l’Environnement (DCE 2000/60/CE), vont nécessiter une ré-évaluation de l’ensemble des procédés d’épuration des eaux. Les acteurs de l’industrie pétrochimique et chimique souhaitent prendre en compte et anticiper ces futurs objectifs. 
La finalité du projet est de proposer des solutions technologiques (procédé d’épuration) permettant de réduire les émissions de ces substances provenant des effluents liquides industriels. En particulier, l’objectif sera de minimiser le transfert vers les phases gaz, solide (boues) ou liquide, et de favoriser la biodégradation des molécules organiques difficilement biodégradables (projet ciblé ici vers les aromatiques HAP, BTEX et Phénols).
Le projet évaluera des « bioréacteurs hybrides », basés sur l’ajout de Supports Mobiles (BHSM), et/ou de Supports Adsorbants (BHSA) dans des bioréacteurs à biomasse floculée. Dans ces procédés (moins énergivores que certains systèmes alternatifs), il s’agit (1) d’augmenter la diversité microbienne en diversifiant les habitats (flocs+biofilm) au sein des mêmes réacteurs, (2) d’optimiser les capacités de sorption (adsorption, biosorption) des molécules par le milieu biomasse+support. 
Le projet s’appuiera sur un consortium de quatre partenaires complémentaires : deux industriels majeurs de l’industrie pétrochimique (TOTAL) et du traitement des eaux (VEOLIA) avec deux partenaires universitaires des domaines du génie des procédés (INSA-LIPE) et d’écologie microbienne (UMR CNRS 5005 groupe Génomique Microbienne Environnementale (LME) intégrant le laboratoire CEGELY futur AMPERE). 
Organisé sur 3 ans, le projet inclue une phase d’étude en laboratoire, avec 2 axes scientifiques majeurs (transfert des polluants et biodégradation) et une phase d’étude sur site à l’échelle semi-industrielle avec une évaluation technico-économique. Les retombées envisagées sont aussi bien : (1) scientifiques, concernant les relations habitats-microorganismes-fonctionnalités dans l’épuration des eaux, ainsi que sur les phénomènes de transfert-sorption des polluants organiques dans les matrices ou agrégats biologiques, (2) industrielles et économiques, cette étude conduisant au développement de procédés innovants, applicables à un large type d’effluents pour la réhabilitation de sites existant et pour la conception de nouvelles installations. Les secteurs industriels concernés représentent un marché très important
Projet ANR-08-CREA-0031 – CREATIVITE INSTRUMENTALE : Etude du processus de création dans les arts instrumentaux du temps dans le contexte des Technologies de l'Information et de la Communication
Programme : La création : acteurs, objets, contextes (CREA) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE GRENOBLE - INPG (INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE GRENOBLE - INPG)
Partenaires : École européenne supérieure de l'image; Grenoble INP
Montant : 190000.0 euros
Durée : 30 mois
Résumé : Le domaine artistique dans lequel se situe  ce projet est celui des « arts instrumentaux du temps »: arts musicaux, arts visuels dynamiques, arts chorégraphiques, qui ont tous en commun d'être des arts du mouvement (audible, visible et kinesthésique) et qui nécessitent tous un intermédiaire matériel  - un instrument - pour s'exercer. L’enjeu majeur de ce projet est de saisir l’opportunité de la mutation des outils proposés par l’informatique et le numérique, en « partenariat » avec les technologies traditionnelles, et en s’appuyant sur un certain nombre de connaissances et de méthodologies issues des sciences cognitives ainsi que sur de nombreuses expériences de pédagogie et de création, pour éclairer le processus de création d’une manière nouvelle et ainsi mieux en comprendre les composantes et leurs articulations. Dans ce projet, nous proposons de considérer ces nouvelles conditions techniques de production comme un véritable laboratoire/observatoire du processus de création. Une retombée fondamentale attendue est alors la mise en perspective de dispositifs technologiques, pédagogiques et institutionnels pour le développement de l’éducation de la créativité.
Projet ANR-15-CE13-0014 – MorphoGenetics : Morphogenèse du corps des insectes: analyse génétique et imagerie cellulaire dans un organisme modèle émergent
Programme : Décryptage des fonctions biologiques élémentaires et de leur intégration (DS0402) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Michalis Averof (Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon)
Montant : 255216.0 euros
Durée : 48 mois
Résumé : Les organes de notre corps se composent de millions de cellules. Lorsque ces organes se forment, au cours du développement embryonnaire, les comportements collectifs de ces cellules – leur prolifération, réarrangement, leur forme et leurs dimensions – déterminent la forme finale de chaque organe. La plupart de nos connaissances sur les mécanismes de cette chorégraphie cellulaire viennent de certains organismes modèles, tels que la Drosophile et la souris. Cependant, certains mécanismes ne peuvent pas être étudiés expérimentalement dans ces modèles car ils sont absents (ou fortement modifiés) dans ces espèces. Par exemple, la plupart des insectes développent leur corps par addition successive de nouveaux segments; ce processus présente des similarités intéressantes à la formation des somites vertébrés mais il est absent à la Drosophile, l’organisme modèle insecte le plus étudié. Le projet MorphoGenetics étudiera le développement embryonnaire et la morphogenèse dans un organisme modèle émergent, le coléoptère Tribolium castaneum, qui présente un mode de développement typique pour les insectes. Le projet appliquera quatre approches expérimentales dans ce modèle – criblage génétique par RNAi, l’analyse clonale, le ciblage génique par CRISPR, et l'imagerie en direct – pour étudier le contrôle génétique de la morphogenèse chez Tribolium. Notre recherche permettra la découverte des mécanismes morphogénétiques d’un embryon d’insecte typique, fondée sur une compréhension du comportement des cellules et de la fonction génique.
Projet ANR-14-CE11-0002 – DIVACEN : Divisions avec ou sans Centrosomes
Programme : Une nouvelle représentation du vivant (DS0401) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Madame Marie-Hélène VERLHAC (Equipe "Divisions asymétriques ovocytaires")
Partenaires : Laboratoire public; Fondation de recherche
Montant : 449225.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : Les centrosomes sont les centres majeurs d'organisation des microtubules (MTOCs) dans les cellules animales. Ils augmentent l'efficacité d'assemblage du fuseau de division et via la nucléation de microtubules astraux, permettent de contrôler finement l'orientation de ces fuseaux dans la cellule. Des défauts du nombre de centrosomes sont associés à un grand nombre de maladies, tel le cancer ou des problèmes de développement neurologique, comme la microcéphalie et la lisencéphalie. Bien que la plupart des cellules animales contiennent des centrosomes, la perte totale des centrioles est une caractéristique des ovocytes, imposant des modes d'assemblage et de positionnement des fuseaux méiotiques particuliers. Dans l'ovocyte de souris, de nombreux MTOCs dépourvus de centrioles (aMTOCs) se regroupent aux pôles des fuseaux afin de former un fuseau méiotique bipolaire fonctionnel. Ces fuseaux sans centrosomes sont positionnés de manière asymétrique dans l'ovocyte et ségrègent des chromosomes correctement. Les mécanismes de regroupement des MTOCs acentriolaires dans l'ovocyte de souris sont partagés avec les mécanismes permettant le regroupement des centrosomes surnuméraires de certaines cellules cancéreuses, leur permettant d'assembler des fuseaux bipolaires et de se diviser. Dans ce projet nous voulons répondre à deux questions fondamentales: quels sont les mécanismes qui régulent assemblage et positionnement des fuseaux méiotiques d'ovocyte de souris en absence de centrosomes canoniques? Quelles seraient les conséquences d'un ajout de centrosomes dans les ovocytes de souris? Pour répondre à ces questions, nous utiliserons des approches et de systèmes modèles complémentaires afin d'élucider les voies impliquées in vivo dans le tri et le regroupement des centrosomes surnuméraires. Les cellules souches neurales qui sur-expriment Plk4 et qui présentent  des centrosomes surnuméraires, seront utilisées afin d'identifier des nouveaux acteurs du regroupement des centrosomes. Ces nouveaux acteurs, ainsi que des gènes candidates sont testés en parallèle dans les divisions méiotiques ovocytaires chez la souris afin d'identifier les voies requises pour le tri et le regroupement des MTOCs acentriolaires. De plus nous tenterons, par des voies génétiques, de remettre des centrosomes canoniques (avec centrioles) dans les ovocytes de souris afin d'en déterminer les conséquences sur le développement de ces gamètes.
Projet ANR-16-EPIBONE – EPIBONE : Rôle des protéines à bromodomaines dans la physiologie osseuse normale
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Benjamin ORY
Partenaires : Laboratoire de Physiopathologie de la Résorption Osseuse et Thérapie des Tumeurs Osseuses Primitives
Projet ANR-16-LIVEPLOIDY – LIVEPLOIDY : PLOIDIE CELLULAIRE ET PHYSIOPATHOLOGIE HEPATIQUE
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Chantal DESDOUETS
Partenaires : Institut Cochin
Projet ANR-16-nicostress – nicostress : Réseaux neuronaux sous-tendant l'intéraction entre stress et nicotine dans le cadre des troubles psychiatriques
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Philippe FAURE
Partenaires : Neurosciences Paris-Seine
Projet ANR-14-CE30-0010 – TriLogMean : Logiques trivalentes et signification dans les langues naturelles
Programme : Défi de tous les savoirs (DS10) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Benjamin Spector (Institut Jean-Nicod)
Partenaires : Laboratoire public
Montant : 211952.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 48 mois
Résumé : Une hypothèse centrale de la sémantique formelle classique est que toute phrase déclarative est en principe soit vraie soit fausse. Mais lorsque l’on étudie des langues naturelles, il y a de bonnes raisons de rejeter cette hypothèse et d’adopter les outils des logiques trivalentes, dans lesquelles une phrase peut recevoir une valeur de vérité non-standard (“ni vrai ni faux”). Ainsi, les phrases qui contiennent des expressions vagues (Marie est grande) sont vues comme ni vraies ni fausses dans les cas tangents (par exemple si Marie est tout juste un peu plus grande que la moyenne. Et les phrases dites présuppositionnelles (par exemple ‘Pierre a arrêté de fumer’, qui présuppose que Pierre a été fumeur) seraient aussi ni vraies ni fausses quand leurs présuppositions ne sont pas satisfaites. Si les approches bivalentes ont été appliquées à un grand nombre de phénomènes (présuppositions, vagues, conditionnels, cf. l'introduction par Cobreros, Egré, Ripley et van Rooij à un numéro spécial sous presse du Journal of Non-Classical Applied Logics), il n'existe pour l'instant pas de modèle unifié de l'ensemble de ces phénomènes. 
Nous visons à développer une théorie unifiée, fondée sur une sémantique trivalente, qui puisse rendre de ces phénomènes ensemble, notamment dans les cas où ils interagissent (comme dans le cas de phases contenant à la fois des expressions vagues et présuppositionnelles). En outre, nous tâcherons d'étendre l'usage des logiques trivalentes à des domaines empiriques dans lesquels elles n'ont pas été beaucoup utilisées, comme la sémantique des expressions plurielles et des phrases interrogatives.
Notre but sera de construire un  tel modèle en explorant de façon systématique les prédictions de plusieurs types de systèmes trivalents. Ce projet a donc à la fois une dimension formelle, qui déterminera les prédictions de différents systèmes formels, et une dimension empirique, qui concerne les phénomènes spécifiques qui peuvent motiver l’usage de sémantiques trivalentes. Cette dimension empirique impliquera l'usage de méthodes expérimentales (questionnaires en ligne). Les phénomènes auxquels nous allons nous intéresser incluent les présuppositions, le vague, l’interprétation des expressions plurielles et celles des phrases interrogatives et conditionnelles. 
Si ce projet est mené à bien, il aboutira à un cadre unifié pour un grand nombre de phénomènes linguistiques qui expriment certains aspects fondamentaux de la capacité linguistique humaine. Il rapprochera au moins trois domaines de recherche distincts: la logique, la sémantique formelle et la pragmatique.
Projet ANR-14-NEUR-0007 – Meltra-BBB : MEchanisms of Lymphocytes TRansmigration Across the Blood Brain Barrier
Programme : Défi de tous les savoirs (NEURON 2014) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Ari Waisman (University Medical center Mainz)
Partenaires : Laboratoire public; Georg-August-Universität Göttingen Georg-August-Universität Göttingen; Université de Montréal; University of Vienna University of Vienna
Montant : 234000.0 euros
Durée : 48 mois
Projet ANR-07-RIAM-0010 – VIDEOSTEPS : VIDEOSTEPS porte sur les problématiques de fatigue visuelle liée à la diffusion de films reliefs. Le projet doit aboutir à des propositions de normes de diffusion du relief, mais également des préconisations en terme de prises de vues.
Programme : Audiovisuel et multimédia (AM) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : NICEPHORE CITE (NICEPHORE CITE)
Partenaires : École nationale supérieure d'arts et métiers; NICEPHORE CITE; Université de Bourgogne; Université Paris 8 - Vincennes - Saint-Denis
Montant : 392462.0 euros
Durée : 24 mois
Résumé : Le projet « STEREOSTEPS » vise plus précisément deux objectifs :    -Tout d'abord, celui de réaliser une étude portant sur les disparités simultanées et alternatives de la stéréoscopie en prise de vues et en diffusion. Cette étude devra notamment ab
Projet ANR-06-CORP-0005 – MPF : Mobilités, Populations et Familles dans la France du Nord de la fin du XVIIe siècle à la
fin du XIXe siècle
Programme : Corpus et outils de la recherche en sciences humaines et sociales (CORP) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE BORDEAUX III (UNIVERSITE DE BORDEAUX III)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Université Bordeaux-Montaigne; Université de Picardie Jules-Verne
Montant : 250000.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 48 mois
Résumé : Le projet MPF est axé autour de l’exploitation des recensements annuels effectués par les autorités municipales de Charleville de la fin du XVIIe à la fin du XIXe siècles qui sont une source unique en Europe. Il vise à reconstituer sur une dizaine de générations l’évolution démographique et sociale des familles observés ainsi que leurs migrations qui, sur deux siècles, se déploient à l’échelle de la France du Nord et de l’Europe.
Projet ANR-11-JS01-0010 – Hameo : Homéomorphismes symplectiques et hamiltoniens
Programme : JCJC - SIMI 1 - Mathématiques et interactions (JCJC SIMI 1) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Vincent HUMILIÈRE (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B)
Partenaires : Institut de Mathématiques de Jussieu - Paris Rive Gauche
Montant : 60000.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 48 mois
Résumé : Ce projet propose de rapprocher plusieurs mathématiciens issus de domaines mathématiques différents: géométrie symplectique pour V. Humilière et E. Opshtein, systèmes dynamiques topologiques pour F. Le Roux. L'objectif de ce rapprochement est d'étudier un certain nombre de problèmes où ces domaines interagissent et que nous allons décrire maintenant.
Le premier problème est l'étude de ce qui est appelé “géométrie symplectique C^0”. Il s'agit d'étudier les propriétés de rigidité pour la topologie C^0 qui apparaissent de manière surprenante dans le contexte purement différentiable qu'est la géométrie symplectique. En particulier, il existe des notions assez naturelles d'homéomorphismes symplectiques (issus des travaux de Gromov et Eliashberg) et d'homéomorphismes hamiltoniens (introduits par Müller et Oh), mais ces objets sont très mal compris. Notre deuxième problème est l'étude des groupes de transformations de surfaces préservant l'aire. La structure de ces groupes reste encore largement incomprise mais divers travaux récents (notamment de Polterovich, Entov-Polterovich, Franks-Handel, Oh) ont permis certaines avancées, donnant lieu à de nouvelles directions de recherche. Ces deux problèmes sont en fait très reliés. En particulier, les notions d'homéomorphismes symplectiques et hamiltoniens mentionnées plus haut interviennent dans les deux cas. Leur étude fait également apparaître à plusieurs endroits un objet encore bien mystérieux: l'énergie de Hofer des isotopies.
Nous espérons exploiter la complémentarité de nos cultures mathématiques pour effectuer des avancées substantielles sur ces problèmes. Nous proposons également d'organiser une conférence internationale regroupant des spécialistes des différents domaines, autour de ces thématiques.
Projet ANR-12-JS08-0001 – VAHIIA : Analyse de volatiles issus du réchauffement d’analogues de glaces interstellaires
Programme : JCJC - SIMI 8 - Chimie du solide, colloïdes, physicochimie (JCJC SIMI 8) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Grégoire Danger (Laboratoire de Physique des Interactions Ioniques et Moléculaires)
Partenaires : Physique des Interactions Ioniques et Moléculaires
Montant : 247520.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Les défis de ce projet consistent à simuler par le biais d'expériences de laboratoire, l'évolution chimique de glaces et grains interstellaires/cométaires, de manière à comprendre l'évolution de la matière organique au cours du cycle de vie des grains interstellaires. Actuellement, notre équipe développe deux approches complémentaires pour étudier cette évolution. Tout d'abord, nous étudions la réactivité chimique qui peut se produire au sein des analogues de glaces interstellaires ou cométaires, en travaillant sur des systèmes de petite taille (deux ou trois réactifs). Deuxièmement, nous étudions la caractérisation des résidus réfractaires formés pendant la photolyse et le réchauffement d'analogues de glaces, sans aucune dégradation à l'aide de l'Orbitrap. Nous proposons de développer une nouvelle approche, qui consiste à mettre en œuvre un système analytique pour l'analyses de volatils provenant du réchauffement d'analogues de glace interstellaire, le projet VAHIIA. Ce nouveau dispositif nous aidera à obtenir une meilleure compréhension des réactions chimiques qui conduisent à la formation des résidus réfractaires. Il donnera également des informations cruciales sur les espèces qui subliment pendant le réchauffement du noyau cométaire. Ce système consistera à coupler à un système cryogénique ultra-vide , un système de chromatographie en phase gazeuse couplé un spectromètre de masse afin d'analyser les espèces gazeuses sublimant lors du réchauffement d'analogues de glaces. Par conséquent, le projet VAHIIA sera le chaînon manquant entre les deux projets existants, et l'ensemble fournira une approche globale expérimentale visant à retracer l'histoire chimique de tels analogues en étudiant la réactivité de la glace à basse température, l'analyse des espèces volatiles sublimant  au cours de leur réchauffement, et la caractérisation des résidus réfractaires résultant de ce réchauffement. Le projet VAHIIA a déjà été soumis en 2011. Le programme scientifique de la demande de 2012 est le même que celui de la demande précédente. Les principales modifications sont présentes dans la description par tâches de cette demande, et dans la partie financement. Nous demandons notamment un financement pour le recrutement d'un post-docteur sur deux années, dont les objectifs seront de participer aux développements et à l'analyse GC-MS. Par ailleurs, une réponse détaillée aux «Retour au coordinateur" est donnée dans la section 3 du document annexe.
Projet ANR-12-PDOC-0030 – FROMA-GEN : Adaptation génomique chez les champignons du fromage (Penicillium)
Programme : Retour Post-Doctorants (RPDOC) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Antoine BRANCA (Laboratoire Ecologie, Systématique, Evolution)
Partenaires : Écologie, Systématique et Évolution
Montant : 308743.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Le fromage est environnement riche en élément nutritif et d’une biochimie complexe, où les bactéries et les champignons sont en compétition intense d’accès aux nutriments. En domestiquant ce microcosme, l'homme a pu générer la grande variété de saveurs fromagères que la plupart d'entre nous aiment déguster au déjeuner ou au dîner. Comme il est observé pour les macro-organismes comme les plantes ou le bétail, la domestication des micro-organismes est accompagnée d'importants changements dans la physiologie de ces derniers. En effet, la découverte du processus de fabrication du fromage, il y a environ 2000 ans, a été composée d’étapes successives de sélection des meilleures souches de champignons et de bactéries, sélection qui a grandement remodelé le génome de ces micro-organismes. Dans ce projet, nous proposons d'éclaircir les changements génomiques qui ont eu lieu au cours de la domestication du champignon associé au fromage Penicillium. Tout d'abord, la comparaison entre les génomes de plusieurs espèces de Penicillium, adaptées à l’environnement fromager ou bien  provenant d’habitats naturels, permettra de révéler l'organisation spécifique des génomes des espèces adaptées aux fromages. Deuxièmement, nous projetons d’étudier la diversité du génome du champignon associé au fromage à pâte persillée, Penicillium roqueforti. Les génomes des populations adaptées au fromage seront comparés au génome des populations venant d’habitats naturels. Le projet vise à utiliser les techniques de biologie moléculaires et de bioinformatique les plus récentes pour capturer les traces laissées par la divergence adaptative chez les champignons, organismes généralement peu étudiés dans ce contexte. En outre, un tel projet a le potentiel d’aider au développement des biotechnologies dans la production fromagère, l'un des secteurs les plus importants et les plus renommées de l'agriculture française.