Projet ANR-12-CHEX-0001 – ReMODEL : Cartographie des bases cellulaires de la régénération du membre: nouvelles approches dans un organisme modèle émergent
Programme : Chaires d’excellence (CHEX)
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Vincent Laudet (Institut de Génomique Fonctionnelle Lyon)
Partenaires : Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon
Montant : 713000.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Cartographie des bases cellulaires de la régénération du membre: nouvelles approches dans un organisme modèle émergentN/A
ReMODEL Enjeux et ObjectifsMalgré l'intérêt médical et biologique pour la régénération, les mécanismes moléculaires et cellulaires qui sous-tendent ce processus restent mal compris. Ceci est en partie dû à l'absence d'organismes modèles et d'outils génétiques appropriés. ReMODEL vise à établir le crustacé Parhyale hawaiensis comme un organisme modèle puissant chez lequel les bases cellulaires et moléculaires de la régénération des appendices peuvent être étudiées de façon rigoureuse et non-biaisée. Parhyale est un modèle attrayant parce qu'il combine une bonne capacité de régénération à des approches génétiques avancées.
ReMODEL Méthodes / ApprochesReMODEL comprend quatre tâches complémentaires:	Tout d‘abord, nous mènerons un vaste crible d’exon trapping pour générer des lignées exprimant un marqueur spécifique dans les tissus et les cellules en régénération. Ces lignées constitueront une ressource unique pour obtenir divers marqueurs ainsi que des promoteurs pour contrôler l'expression de gènes ainsi que la recombinaison et l'ablation des cellules, à l'aide d'une technique de remplacement de transgène que nous avons récemment établie chez Parhyale.	Dans la Tâche 2 nous utiliserons une analyse clonale pour identifier les cellules progénitrices donnant naissance aux tissus régénérés, et cartographier leur degré d'engagement dans un lignage donné. Nous utiliserons l'ablation cellulaire conditionnelle, afin d'évaluer le lignage et les fonctions des différentes populations de cellules pendant la régénération. 	Dans une troisième tâche nous utiliserons des techniques d'imagerie sur animaux vivants pour visualiser la prolifération et la généalogie cellulaire des cellules progénitrices en cours de régénération.	Enfin, nous terminerons ce projet en utilisant du tri cellulaire suivi de RNASeq pour étudier les réponses transcriptionnelles des cellules progénitrices lors de la régénération. Cette approche non-biaisée mènera à l'identification des principaux acteurs moléculaires sous-tendant la régénération, ouvrant la voie à de futures approches centrées sur ces gènes pertinants.	Ces approches constituent un cadre rigoureux pour explorer les bases cellulaires et moléculaires de la régénération des appendices.
Résumé de la soumission : Malgré l'intérêt médical et biologique pour la régénération, les mécanismes moléculaires et cellulaires qui sous-tendent ce processus restent mal compris. Ceci est en partie dû à l'absence d'organismes modèles et d'outils génétiques appropriés. ReMODEL vise à établir le crustacé Parhyale hawaiensis comme un organisme modèle puissant chez lequel les bases cellulaires et moléculaires de la régénération des appendices peuvent être étudiées de façon rigoureuse et non-biaisée. Parhyale est un modèle attrayant parce qu'il combine une bonne capacité de régénération à des approches génétiques avancées.	ReMODEL comprend quatre tâches complémentaires:	Tout d‘abord, nous mènerons un vaste crible d’exon trapping pour générer des lignées exprimant un marqueur spécifique dans les tissus et les cellules en régénération. Ces lignées constitueront une ressource unique pour obtenir divers marqueurs ainsi que des promoteurs pour contrôler l'expression de gènes ainsi que la recombinaison et l'ablation des cellules, à l'aide d'une technique de remplacement de transgène que nous avons récemment établie chez Parhyale.	Dans la Tâche 2 nous utiliserons une analyse clonale pour identifier les cellules progénitrices donnant naissance aux tissus régénérés, et cartographier leur degré d'engagement dans un lignage donné. Nous utiliserons l'ablation cellulaire conditionnelle, afin d'évaluer le lignage et les fonctions des différentes populations de cellules pendant la régénération. 	Dans une troisième tâche nous utiliserons des techniques d'imagerie sur animaux vivants pour visualiser la prolifération et la généalogie cellulaire des cellules progénitrices en cours de régénération.	Enfin, nous terminerons ce projet en utilisant du tri cellulaire suivi de RNASeq pour étudier les réponses transcriptionnelles des cellules progénitrices lors de la régénération. Cette approche non-biaisée mènera à l'identification des principaux acteurs moléculaires sous-tendant la régénération, ouvrant la voie à de futures approches centrées sur ces gènes pertinants.	Ces approches constituent un cadre rigoureux pour explorer les bases cellulaires et moléculaires de la régénération des appendices.
Résultats : L'équipe est installée depuis Janvier 2013 à l'IGFL. 
Les résultats préliminaires sont très encourageants (voir résumé anglais).
Perspectives : Le projet permet d'étudier trois questions importantes pour la régénération, voir résumé anglais.
Publications et brevets : Papiers en cours de préparation.