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Projet ANR-12-BSV2-0022 – checdev : Régulation de la stabilité du génome au cours du développement embryonnaire
Programme : Blanc - SVSE 2 - Biologie cellulaire et biologie du développement (Blanc SVSE 2) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Domenico MAIORANO (UPR1142. Institut de Génétique Humaine)
Partenaires : Institut de Génétique Humaine
Montant : 292760.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Les systèmes de surveillance du génome, connus sous le nom de points de contrôle des dommages relatifs à l’ADN, ou “DNA damage checkpoints” sont cruciales pour le maintien de l’intégrité du génome. Ces checkpoints sont responsables de l’arrêt du cycle cellulaire en présence de dommages de l’ADN afin de réparer les dommages et/ou éventuellement stimuler la mort cellulaire programmée ou apoptose quand le niveau d’endommagement est trop élevé. L’inactivation des points de contrôle est une caractéristique surprenante des embryons précoces. La raison de cette dysfonction n’est pas connue à ce jour et son impact sur la stabilité du génome n’a jamais été évalué. C’est très probable que l’inactivation des points de contrôle observé au cours du développement embryonnaire est due à l’inactivation d’un régulateur majeur du checkpoint. Nous avons identifié un mécanisme responsable de cette inactivation chez les embryons de xénope qui implique l’activation constitutive d’une voie de tolérance de lésions de l’ADN.
	Le but de ce projet est de déterminer les conséquences de l’inactivation du checkpoint des dommages à l’ADN sur l’intégrité du génome au cours du développement embryonnaire. Ceci sera fait à travers la détermination du taux de mutation des embryons et l’analyse de l’intégrité du génome chez l’embryon précoce. Nous allons aussi déterminer les conséquences de la réactivation de cette régulation chez les cellules somatiques. Nous allons également obtenir la caractérisation biochimique du checkpoint de la réplication chez les vertébrés, pour identifier le facteur qui supprime l’activation de ce checkpoint. Nous anticipons que des formes mutées de ce facteur pourraient induire une forte prédisposition à développer de l’instabilité génétique chez les cellules somatiques.
Projet ANR-11-JSV3-0006 – RetroSelect : Contrôle cellulaire de la sélectivité de l’intégration rétrovirale
Programme : JCJC - SVSE 3 - Microbiologie, immunologie, infectiologie (JCJC SVSE 3) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Vincent PARISSI (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION  AQUITAINE LIMOUSIN)
Partenaires : Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
Montant : 380000.0 euros
Date de début : 2012
Durée : 48 mois
Résumé : La mobilité de l’ADN n’est pas seulement un processus crucial pour l’évolution des génomes et la réplication des pathogènes mais aussi un outil pour les transferts de gènes en thérapie génique. Une meilleure compréhension de ces mécanismes est importante pour optimiser ces stratégies. La thérapie génique vise à corriger l’expression d’un gène déficient par l’insertion ou le remplacement d’une copie active. Pour une expression optimale à long terme de cette copie son insertion dans le génome et la stabilité du locus d’intégration est importante. Pour être efficace le transgène doit être exprimé au locus d’intégration sans induire d’effet délétères pour la cellule. Ainsi, le contrôle du ciblage de l’intégration et la régulation de la stabilité du gène inséré, particulièrement par des systèmes de réparation de l’ADN de l’hôte, constituent un problème majeur dans le domaine. Ces dernières années les thérapies géniques utilisant des vecteurs lentiviraux ont rencontré de nombreux succès mais également de nombreuses limites, spécialement dues au manque de données concernant le devenir cellulaire du gène transféré. La sélectivité de l’intégration est principalement portée par l’intégrase rétrovirale et son interaction avec la chromatine de l’hôte. La stabilité du transgène est, elle, régulée par la réparation du locus. Notre projet se focalisera donc sur la compréhension de ces deux processus.
Nous avons développé récemment un système in vitro d’intégration dans une matrice chromatinisée. Ce système a été utilisé pour étudier la relation entre l’accessibilité de cette structure et l’intégration rétrovirale dans un modèle HIV. Nous montrons que la chromatine est réfractaire à l’intégration et le couplage fonctionnel entre l’intégrase et le complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF restaure et cible l’intégration dans la région nucléosomale (Lesbats et al., PLoS Pathogens, in press). Puisque ce mécanisme peut être impliqué dans le ciblage de l’intégration dans la cellule infectée ainsi que dans les procédures de transfert de gènes par vecteurs lentiviraux nous proposons d’étudier plus précisément ce processus. L’inhibition de l’intégration par les nucléosomes sera analysée dans un premier temps, puis, le mécanisme moléculaire du ciblage de l’intégration vers la chromatine sera étudié en utilisant le modèle que nous avons développé.
Projet ANR-11-MONU-0002 – ANEMOS : Advanced Numeric  for Elm's: Models and Optimized Strategies.
Programme : Modèles Numériques (MN) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Boniface NKONGA (UNIVERSITE DE NICE - SOPHIA ANTIPOLIS)
Partenaires : Institut de Recherche sur la Fusion par Confinement Magnétique; Maison de la Simulation; Outils Parallèles pour les Algorithmes Numériques et les Méthodes de Résolutions des Problèmes Essentiellement Hyperboliques; Laboratoire Jean-Alexandre Dieudonné
Montant : 839340.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 48 mois
Résumé : L'objectif principal du projet est de faire des progrès significatifs dans la compréhension de la physique inhérente  aux  stratégies de contrôle actif des instabilités MHD du bord du plasma  « Edge Localized Modes (ELM) » dans les Tokamaks. Les ELMs  représentent un danger pour la l'ensemble du système, en particulier à cause  des flux de chaleur et de particules  que les ELMs peuvent engendrer sur  les composants face au plasma.  Le contrôle des ELMs est une nécessité pour le fonctionnement optimal d’ITER. Bien que des avancées tout à fait significatives aient étés accomplies dans l’ANR ASTER(06-09) avec le code de MHD non linéaire JOREK , il est nécessaire de poursuivre cet effort, notamment en consolidant les bases et les modèles physiques,  en optimisation des composantes logiciel et  en développant des stratégies numériques auto consistantes et stables. Ces évolutions sont indispensables pour que les simulations numériques puissent aller au-delà des validations et interprétations de résultats expérimentaux  pour devenir des  données fiables et utilisables dans une stratégie prédictive. Le présent projet mettra  la modélisation numérique de la MHD non linéaire (Jorek) au service du contrôle et ELMs  dans ITER :  par  perturbation du champ magnétique « Resonant  Magnetic Perturbation (RMP) »  et par injection de  pastilles de neutres « pellets ».
Projet ANR-14-ANWA-0001 – MICHIC : Understanding mucosal immunology and co-infections in the chicken to drive vaccine strategies.
Programme : ppel à projets transnational pour la recherche sur la santé et le bien-être animal (ANIHWA 2014) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Pete Kaiser (University of Edinburgh)
Partenaires : Laboratoire public; University of Edinburgh; University of Munich
Montant : 133120.0 euros
Durée : 48 mois
Projet ANR-15-GRFL-0007 – GRIFONE : Graphitic films of group III nitrides and group II oxides: platform for fundamental studies and applications
Programme : Graphene Flagship (Graphene Flagship) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Anelia Kakanakova (Linkoping University (LiU), Department of Physics, Chemistry and Biology (IFM))
Partenaires : Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Istituto per la Microelettronica e Microsistemi (IMM); Laboratoire public; Magyar Tudományos Akadémia
Montant : 0.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : This project aims at a breakthrough in the fabrication of graphene heterostructures with semiconducting materials by establishing and developing an innovative material concept for graphitic films of group III nitrides and group II oxides with particular reference to h-AlN and h-ZnO. These novel layered materials and heterostructures offer strategic value in applications requiring fabrication of graphene heterostructures with semiconducting materials that originates from a variety of constituent elements and layer stacking, and from providing alternative opportunity for discovering electronics applications with added functionality, e.g., in nano(opto)electromechanical systems, sensors, and hydrogen storage. Therefore, the identification of these novel layered materials is done by their eligibility for high-impact applications. This material concept is envisioned to explore and integrate the approach of chemical vapor deposition of h-AlN and h-ZnO on large-area SiC-supported graphene templates. Therefore, it allows for a focused optimization and design of prospective graphitic films and heterostructures with graphene from which future devices can be created by the virtue of their band gap engineering, thermal conductivity, elasticity and piezoelectricity. A strong potential synergy between the 948 Core project and GRIFONE project is foreseen in knowledge transfer and multiplication of the team merits. The strategy of the proposed project is a means to build synergy in layered materials and nano-device research. We expand a platform for fundamental research on novel sp2 coordinated layered materials of h-AlN (group III nitrides), h-ZnO (group II oxides), and heterostructures with graphene by experimental verification and theoretical modeling. The present ambition to create new knowledge and performance enhancement for novel graphene heterostructures is motivated by our recent discoveries from basic research, and graphene-on-SiC technology take-up by industry. This consortium forms a strategic research constellation between three partners: Linköping University, Department of Physics, Chemistry and Biology, (LiU-IFM), Sweden; National Research Council of Italy, Institute for Microelectronics and Microsystems, (CNR-IMM), Italy; and Centre for Energy Research, Hungarian Academy of Sciences, Institute for Technical Physics and Materials Science, (MFA). The team of researchers is well-proven by successful conduct of strategic research.
Projet ANR-15-RTBB-0001 – RTB2 : RTB CEA
Programme : RTB 2015 (RTB) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Thierry BILLON (COMMISSARIAT A L'ENERGIE ATOMIQUE ET AUX ENERGIES ALTERNATIVES)
Partenaires : Laboratoire d'Électronique et de Technologie de l'Information
Montant : 1748000.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 24 mois
Résumé : Le programme RTB, dédié au 15000 m2 de salles blanches réparties dans sept installations nationales et un groupe de travail d'environ 400 chercheurs,apporte un fort soutien à la R & D des activités en micro et nanotechnologies, de la recherche fondamentale aux applications industrielles. Le programme RTB est un pilier essentiel de la stratégie nationale de recherche et d'innovation (SNRI) comme une infrastructure de recherche nationale.
Le programme RTB estun programme clé permettant à la France de maintenir sa position stratégique dans le domaine des nanotechnologies.
Il joue un rôle majeur :
 • dans positionnement technologique de pointe dans les domaines d'avenir tels que la nanoélectronique, la photonique, la spintronique, et les micro- et nano-systèmes, en rendant possible le développement de nouveaux matériaux, dispositifs et systèmes,
 • dans la recherche en micro- et nano-technologies en France, en mettant l'accent sur l'achat d'équipements clés dans les infrastructures de recherche sélectionnées travaillant en mode réseau au profit des communautés académiques et industrielles,
 • comme effet de levier en Europe, en induisant une contribution significative dans le taux de réussite dans le 7ème programme cadre de recherche et développement européen (PCRD), la crédibilité technologique des équipes est renforcée par la disponibilité d'équipements d'avant-garde au niveau des plates-formes de nanofabrication et technologique.
Projet ANR-16-SlideVOLC – SlideVOLC : Les déstabilisations volcaniques : de l’observation à un modèle global des déformations actives
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Aline PELTIER
Partenaires : Institut de Physique du Globe de Paris
Projet ANR-06-TCOM-0035 – MDP2 : Mesure de DAS Post Production
Programme : Programme Télécommunications (TCOM) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : SATIMO (SATIMO)
Partenaires : Institut polytechnique de Bordeaux; Institut Mines-Télécom; PME
Montant : 303589.0 euros
Durée : 24 mois
Résumé : Le développement rapide de l'utilisation des téléphones mobiles a suscité des craintes quant à d'éventuels
effets néfastes de ces technologies sur la santé. Pour répondre à ces inquiétudes, l'ICNIRP (Commission
Internationale de Protection contre les Rayonnements Non Ionisants) a publié en 1998, un « guide pour
l'établissement des limites d'exposition aux champs électrique, magnétique, et électromagnétique » [1].
Cette publication a pour objectif d'établir les limites d'exposition aux champs électromagnétiques à des
niveaux assurant la protection des personnes contre les effets nocifs connus de ces champs. Le paramètre
de référence pour quantifier l'exposition de l'utilisateur au rayonnement est le DAS (Débit d'Absorption Spécifique). Pour les téléphones mobiles, la limite de ce paramètre a été fixé en Europe à 2 W.kg-1 (DAS
local tête). Des normes spécifiques à la mesure du DAS des téléphones mobiles ont par la suite été
définies : IEEE 1528, IEC 62209 ou encore CENELEC 50361. Ces normes ne sont cependant pas
adaptées à la mesure du DAS des téléphones mobiles sur une chaîne de production : le temps nécessaire
pour la mesure d'un équipement sans fil en suivant ces protocoles normalisés peut nécessiter jusqu'à une
journée de travail. Aujourd'hui, un prototype de chaque modèle d'équipement sans fil est testé en suivant le
protocole international et la valeur de SAR mesuré est appliquée à tous les équipements sans fil du même
type. Afin d'observer une éventuelle dérive de la valeur, des échantillons sont choisis de façon aléatoire et
testés selon le protocole mais il est impossible de s'assurer que tous les équipements sans fil sortant des
chaînes de production respectent la norme internationale. Le but de ce projet est donc de concevoir un
système permettant de tester un à un l'ensemble des portables sur une chaîne et ce dans un délai
compatible avec les impératifs de la production de masse.
Projet ANR-06-ERAP-0014 – LEGRESIST : LEGRESIST : Exploiting genetic variability of resistance genes in major European food legumes to improve varieties for sustainable agriculture
Programme : Réseau de génomique végétale Genoplante 2010 - programme transnational Européen ERA-Plant Genomics (ERAPG) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Alain BARANGER (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : Institut national de la recherche agronomique; Institut national polytechnique de Toulouse
Montant : 199902.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : LEGRESIST is a consortium of 12 leading European centers for legume breeding and molecular biology, and 2 leading technology providers. In Europe, agronomical, economical and ecological benefits of legumes for the entire agro-system are notoriously under-exploited due to their unstable yield caused by the plants susceptibility to a wide range of pathogens. Despite considerable investment and progress in use of molecular tools for resistance breeding, application of Marker-Assisted Selection and Marker-Assisted Pyramiding of resistance genes to obtain durable resistance is still hampered by non-sufficient knowledge of allelic diversity in resistance genes and the lack of insight into plant-pathogen interactions responsible for the hard-to-handle quantitative nature of resistance. Moreover, affordable, modern tools for advanced resistance breeding are missing. Therefore, LEGRESIST aims at i) exploiting genetic diversity of resistance genes on the level of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) for genetic mapping of all expressed resistance genes in major crop legumes, ii) understanding quantitative resistance through characterization of the interacting transcriptomes of plants and their pathogens by SuperSAGE analysis and iii) mapping of expression(e)QTL underlying quantitative resistance. The project delivers polydimensional SNP-Arrays for rapid and cost efficient mapping of resistance genes and the Legume-Biotic-Stress-Array for eQTL mapping. Applying these modern tools, LEGRESIST will produce the most advanced expression maps for all major crop legumes. Further, exploiting synteny between the crops and the model legume Medicago truncatula, the project will result in the first comparative biotic stress map of the legumes. Such innovative tools will enable breeders to provide durable resistant, non-GMO legumes for the Multibillion Euro market for vegetable protein currently served by soybean imports. That way, novel plant biotechnology will prove its benefits likewise for European economy and ecology.
Projet ANR-15-CE14-0018 – DYSMETAF : Control normal et pathologique des genes du métabolisme par l’axe HNF4A-TAF4
Programme : Exploration des systèmes et organes leur fonctionnement normal et pathologique : physiologie, physiopathologie, vieillissement (DS0403) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Irwin Davidson (INSTITUT DE GENETIQUE ET DE BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE)
Partenaires : Laboratoire public; Laboratoire public; Laboratoire public
Montant : 616000.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 48 mois
Résumé : HNF4A régule le métabolisme à travers son contrôle de l’expression des gènes dans le foie, l’intestin et les cellules béta-pancréatiques. HNF4A joue un rôle essentiel dans le développement et l’homéostasie de ces tissus. De plus, des mutations dans HNF4A sont à l’origine du diabète de type MODY1 (Maturity Onset of Diabetes in the Young), probablement en affectant l’interaction de HNF4A avec ses partenaires. Nous avons mis en évidence une interaction physique et fonctionnelle entre le domaine de fixation au ligand de HNF4A et les sous-unités TAF4 et TAF12 du facteur général de transcription TFIID. Cette interaction est essentielle pour l’activation des gènes du métabolisme hépatique chez la souris. L’objectif de ce projet est de combiner des études biochimiques et structurales avec des études de pointe en génétique de la souris pour caractériser le rôle de l’axe HNF4A-TAF4 dans la régulation du métabolisme dans l’intestin et les cellules béta-pancréatiques adultes. Nous utiliserons pour cela des approches biochimiques et structurales pour caractériser les interactions entre HNF4A, TAF4 et TAF12, et pour déterminer si ces interactions peuvent être modulées par des mutations MODY1 et/ou par des agonistes et antagonistes synthétiques de HNF4A. Nous utiliserons une approche d’invalidation génique ciblée pour inactiver TAF4 dans les cellules béta-pancréatiques adultes ainsi que dans l’épithélium intestinal embryonnaire et adulte. L’effet de la perte de TAF4 sera évalué par des analyses histologiques, moléculaires et fonctionnelles/métaboliques. Les données structurales et d’interaction obtenues sur le complexe HNF4A-TAF4-TAF12 seront utilisées pour générer des souris exprimant des mutants de TAF4 qui s’intègrent à TFIID mais qui affaiblissent l’interaction avec HNF4A. Nous étudierons si la modulation de l’interaction de HNF4A avec la machinerie générale de transcription affecte l’expression des gènes du métabolisme dans le foie, l’épithélium intestinal et les cellules béta-pancréatiques, et induit des disfonctionnements métaboliques dans l’animal.  De par notre expérience collective et par les ressources à notre disposition, nous sommes dans une position unique pour réaliser ce projet et définir une vue intégrée de l’axe HNF4A-TAF4-TAF12 dans la régulation des gènes du métabolisme.
Projet ANR-15-CE16-0009 – NeuroInflamDyn : Etude de la dynamique et de la fonction de la neuroinflammation dans un modèle EAE combinant l'imagerie biphotonique et la cytométrie multiparamètrique ,
Programme : Étude des mécanismes de défense de l’organisme (DS0408) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Franck Debarbieux (Aix-Marseille Université_Institut de Neurosciences de la Timone)
Partenaires : Laboratoire public; Laboratoire public; Laboratoire public
Montant : 435061.0 euros
Date de début : 2016
Durée : 36 mois
Résumé : Ce projet, qui réunit des neurobiologistes et des immunologistes, a pour objectif de décrire l’interdépendance entre l’inflammation, la neurodégénération et la progression des scores cliniques dans la sclérose en plaque. L’EAE, qui recapitule la pathologie, sera induite dans des souris rapportrices “multicolores” Thy1-CFP//LysM-EGFP//CD11c-EYFP. En combinant nos  développements récents (1) de l’imagerie biphotonique spectrale in vivo, (2) de l’analyse en cytométrie de flux multiparamétrique et (3) génétique de la souris,   nous (1) caracteriserons des marqueurs d’imagerie de la progression de la maladie, (2) décrirons l’évolution des populations de cellules immunitaires dans la moelle épinière et (3) la fonction de sous populations  cellules dendritiques /monocytes impliquées, (4) explorerons les effets du VEGF sur la signature immune pour apporter la preuve de concept de l’utilité de notre méthodologie pour tester l’effet de candidats thérapeutiques.
Projet ANR-15-CE28-0003 – NUMSPA : Le royaume des représentations de Magnitude: Origines et bases neurales
Programme : Éducation et formation tout au long de la vie (DS0804) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Madame Maria Dolores de Hevia (Laboratoire Psychologie de la Percepetion)
Partenaires : Laboratoire public
Montant : 109304.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 24 mois
Résumé : L’idée de grandeur –dans ses aspects numérique, spatial et temporel--, est le fondement central des mathématiques, de la science et de la technologie. Mais les origines, leurs relations au cours du développement, et le format de représentation des concepts abstraits de nombre, d’espace et de temps sont encore débattus et mal compris. Comprendre comment les concepts de grandeur sont représentés, compris, ainsi que les intuitions qui guident leur raisonnement est essentiel pour savoir les enseigner dès la petite enfance. Faire la lumière sur ce phénomène a des implications très importantes pour notre société. En fait, les mathématiques sont au centre des programmes scolaires de l’enfant, et l’un des fondements de l’enseignement des mathématiques est la compréhension des nombres. La capacité des enfants à relier nombre et espace pourrait ainsi améliorer leur compréhension et leur maitrise d’une connaissance du nombre. Il y a un certain nombre des questions fondamentales que se pose la recherche à ce sujet : quelles sont les origines fonctionnelles des correspondances entre les différentes dimensions de grandeur : s’agit-il d’une capacité générale, ou le lien entre les représentations de l’espace, du temps et des nombres est-il spécifique à ces dimensions ? De plus, quelles sont les bases neurales de ce phénomène dans le cerveau immature ? Les taches 1 et 2 du présent projet répondent à ces deux questions fondamentales à partir des études comportementales et de neuro-imagerie chez les nouveau-nés. L’ensemble de ces études peuvent éclairer la question fondamentale de l’innéité, posée depuis l’aube de la philosophie expérimentale, de la psychologie du développement classique et de la science cognitive moderne, et auront des implications cruciales pour l’éducation et la neuropsychologie.