Projet ANR-07-PRIB-0012 – PhosphoProteomeArray : Développement des micropuces à protéines à haute performance pour l'analyse du phosphoprotéome et la recherche de médicaments contre le cancer
Programme : Recherche et innovation en biotechnologie (RIB) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : PROTNETEOMIX (PROTNETEOMIX)
Partenaires : Institut national de la recherche agronomique; TPE; Université de Nantes; Université de Reims Champagne-Ardenne
Montant : 434861.0 euros
Durée : 24 mois
Résumé : Le rôle des protéines impliquées dans les voies de signalisation et leurs réseaux d'interactions sont loin d'être actuellement bien compris dans la carcinogenèse. La technologie des micropuces à protéines et à anticorps ouvre une nouvelle voie pour l'étude comparative et quantitative d'un très grand nombre d'échantillons déposés sous la forme de micro-spots. Le premier objectif de ce projet est le développement et la commercialisation de puces à anticorps originales, ciblant le phosphoprotéome humain. Nous porterons une attention particulière aux conséquences du « blocage » de certaines protéines kinases, sur les voies de signalisation impliquées dans le cancer du sein et la leucémie. Cette approche nous permettra de mettre en évidence le rôle de ces nouveaux outils dans l'évaluation précoce des effets bénéfiques ou des effets secondaires d'agents thérapeutiques potentiels. Le deuxième objectif de ce projet est d'appliquer la technologie des puces à protéines à la recherche de nouveaux agents thérapeutiques en ciblant à haut débit des inhibiteurs de la dimérisation des protéines ErbB appartenant à la famille des récepteurs des tyrosine kinases. Les petites molécules inhibitrices sélectionnées devraient nous permettre de repérer et d'évaluer, en aval des voies de signalisation, l'impact des taux de phosphorylation et ses conséquences thérapeutiques dans le retard du développement des cellules du cancer du sein. //Ce projet est destiné à concevoir et à mettre sur le marché deux micropuces, originales et inexistantes à ce jour, pour la recherche sur le cancer. La première se propose d'analyser les protéines impliquées dans la réparation de l'ADN et les voies de signalisation apparentées, la seconde appréhendera un ensemble de protéines engagées dans les voies de signalisation et de régulation, dont le dysfonctionnement est impliqué dans le développement de tumeurs. Ces approches seront rendues possibles grâce à deux innovations technologiques, un nouveau support 3D et des nanocristaux fluorescents dans le visible et dans l'UV. Ces nouveaux outils renforceront les performances des puces à anticorps. De plus, nous développerons une nouvelle méthode de criblage des inhibiteurs de dimérisation des protéines sur la base de micropuces auto-assemblées. En effet, notre système permettra de détecter l'effet inhibiteur des petites molécules, en amont du processus de dimérisation, lors du décrochage du polypeptide natif des ribosomes. Cette approche nous permettra de sélectionner un nouveau type d'inhibiteur dirigé contre la famille des récepteurs ErbB. Nous envisageons d'identifier des petites molécules à haute affinité, efficaces dans le traitement du cancer du sein. Nous sommes persuadés que la mise à disposition de nos micropuces à anticorps et à protéines autoassemblées aura un fort  impact  dans le développement de nouveaux agents thérapeutiques.//Le Coordinateur (ProtNeteomix SAS) est spécialisé dans la fabrication des puces à protéines et à anticorps et des puces à petites molécules pour le criblage des chimiothéques et leurs applications pour la recherche sur le cancer. Le Coordinateur a déjà démontré sa maturité par le lancement en 2006 d'une puce à anticorps, MAGYarray. Le Partenaire 2 (Université de Nantes) développe des micropuces à protéines pour des applications biomédicales; ses principales activités concernent les interactions protéines-protéines, la réparation de l'ADN et les voies de signalisation dans les cancers. Le Partenaire 3 ( Université de Reims Champagne-Ardenne), un des pionniers de la nano-biotechnologie, développe des nouveaux types de sondes afin d'améliorer la détection par fluorescence dans les applications médicales. Le Partenaire 4 (Université de Tours) est spécialisé dans les récepteurs biologiques et les voies de signalisation.//WP1: Nous allons fabriquer deux micropuces à anticorps à haute performance. Nous étudierons les aspects qualitatifs et quantitatifs de l'analyse du phosphoprotéome du cancer du s