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Projet ANR-10-BLAN-1534 – Nico_chimera : Caracterisation structurale  complete des formes ouverte et fermee d'un canal ionique de la famille des recepteurs cys-loop et mecanisme moleculaire de la transition
Programme : Sciences de la vie, de la santé et des écosystèmes :  Physique, chimie du vivant et innovations biotechnologiques (Blanc SVSE 5) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur Marc DELARUE (INSTITUT PASTEUR)
Partenaires : Laboratoire de Biochimie Théorique; Institut Pasteur; Institut Pasteur
Montant : 449280.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 36 mois
Résumé : Notre but est d'obtenir experimentalement la structure a la fois de la forme ouverte et de la forme fermee d'au moins une meme molecule de la famille des canaux ioniques pentameriques declenches par un ligand, appreles CysLoop recepteurs; pour cela, nous voulons intensifier nos etudes structurales sur des dizaines de constructions differentes, essentiellement des chimeres entre eukaryotes et procaryotes en combinant leurs domaines extra-cellulaire et transmembranaire (ECD et TMD), mais aussi en manipulant le site de fixation de l'agoniste (Loops A,B,C,D,E,F). Les constructions seront guidees par des etudes de modelisation par homologie effectuees au prealable et guidees par la structure que nous avons recemment resolue au laboratoire (appelee GLIC; voir Bocquet et al., Nature, 2009), afin de se focaliser sur des molecules stereochimiquement plausibles. Elles seront testees fonctionnellement par electrophysiologie sur oocyte, pour verifier si le canal peut s'ouvrir sous l'effet de l'agoniste prevu. Puis, celles qui seront fonctionnelles seront testees en cristallisation par robot et leur structure resolue. Nous possedons deja au moins une construction chimere fonctionnelle, et qui donne des cristaux qui diffractent a basse resolution. Ce travail associera de facon tres proche une approche experimentale et computationnelle.
Les constructions de chimere seront testees en cristallisation en presence de l'agoniste et aussi en presence d'inhibiteurs du type anesthesique. Nous avons recemment montre la faisabilite d'une telle etude car nous avons resolu deja la structure a 3.2 Angstrom de GLIC en presence de deux anesthesiques differents, qui sont effectivement des inhibiteurs de l'ouverture de GLIC. Parallement, nous poursuivrons nos efforts pour tenter de comprendre l'activation de GLIC par les protons, ce qui demande des calculs assez sophistiques d'electrostatique dans un systeme membranaire. A cet effet, nous avons aussi recemment termine une etude par dynamique moleculaire de GLIC a pH neutre pendant 1 micro-seconde, dont l'analyse sera poursuivie et affinee. Enfin, lorsque nous disposerons d'une paire de structures dans les deux conformations extremes, nous lancerons des etudes de prediction de chemin de transition entre les deux formes, en particulier grace a une methode originale recemment mise au point par l'un d'entre nous, qui devrait permettre de predire quelles mutations seraient susceptibles de modifier la cinetique d'ouverture du canal. Ces predictions seront soumises a une verification experimentale.
Projet ANR-16-FORFUNIGO – FORFUNIGO : Forces et Croissance fongique Invasive Filamenteuse
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Robert ARKOWITZ
Partenaires : Institut de Biologie de Valrose
Projet ANR-16-AnBiCyst – AnBiCyst : Caractérisation fonctionnelle du complexe ANKS6/ANKS3/BICC1 dans les maladies kystiques rénales
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Sophie SAUNIER
Partenaires : IHU Imagine - Institut des Maladies Génétiques
Projet ANR-16-ALECTOR – ALECTOR : Aide à la LECTure pour améliORer l'accès aux documents pour enfants dyslexiques
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Nuria GALA
Partenaires : Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Marseille
Projet ANR-16-DenseQCDatLHC – DenseQCDatLHC : Etude du régime de haute densité partonique de QCD dans les collisions hadroniques au LHC
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Edmond IANCU
Partenaires : Institut de Physique Théorique
Projet ANR-16-DiPTiCC – DiPTiCC : Diversité et Productivité des forêTs impactées par le Changement Climatique
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Hervé JACTEL
Partenaires : Biodiversité, Gènes et Communautés
Projet ANR-06-CEXC-0007 – THEMODMET : Théorie des modèles et indépendance dans les structures
Programme : Programme "Chaires d'excellence" (CEXC) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : UNIVERSITE CLAUDE BERNARD - LYON I (UNIVERSITE CLAUDE BERNARD - LYON I)
Partenaires : Université Claude Bernard - Lyon 1
Montant : 377000.0 euros
Durée : 48 mois
Résumé : Ce projet cherche à élargir le champ d'application des outils de la théorie des modèles à des classes de structures métriques, notamment des structures provenant de l'analyse fonctionnelle et de la théorie des probabilités, en étudiant : - la logique continue de premier ordre en tant que cadre pour l'étude modèle-théorique de classes de structures métriques. - la théorie de modèles continue abstraite: superstabilité, catégoricité et nombre de modèles à isomorphisme près de théories continues. - les perturbations de structures métriques; catégoricité et modèles premiers à perturbation près. - les propriétés modèle-théoriques (notamment stabilité et notions d'indépendance) de classes particulières de structures métriques, e.g., treillis de Banach, représentations unitaires de groupes topologiques, corps munis d'une valuation, espaces de probabilités, algèbres de von Neumann munies d'une trace normalisée, etc.
Projet ANR-07-PETB-0002 – PECARDI : New peptides for cardiovascular diagnosis
Programme : Programme de recherche transnational EuroTransBio (PETB) 2007
Année de financement : 2007
Partenaires : Institut national de la santé et de la recherche médicale
Montant : 122720.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 24 mois
Résumé : The overall goal of the proposal is to define peptides being related in atherosclerotic patients to progression of atherosclerosis towards atherothrombosis or towards aneurysm formation, to obtain assay systems to determine levels of these peptides in circulation, to use these peptides for imaging and to analyze a possible role of these peptides for the disease using animal models.  Specifically (i) to determine pepdides by means of proteomic analysis differently present in stable vs. unstable vs. thrombotic plaque and normal vs. aneurysm vessel walls; (ii) use these peptides to obtain specific monoclonal antibodies and to develop suitable assay systems to determine levels of these peptides in plasma and tissue samples; (iii) use peptides and specific antibodies to design reagents for functional imaging; (iv) use the assays and reagents for analyzing human samples and patients and (v) design and use animal experiments to analyze the relevance of these peptides, the substrates where the peptides originate from and the proteases releasing the peptides to in a later stage develop interfering drugs.
Projet ANR-07-PDIT-0003 – EMELINE : Roulement Passe-courant, une technologie innovante pour l'alterno-démarreur des nouveaux véhicules économes
Programme : Transports terrestres Véhicule propre et économe (PDIT) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : SOCIETE VENDEENNE DE ROULEMENTS (SOCIETE VENDEENNE DE ROULEMENTS)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Divers privé
Montant : 738746.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 28 mois
Résumé : L'objet de notre projet est d'utiliser les roulements d'un alterno-démarreur pour transférer le courant continu du rotor au circuit et vis-versa, en lieu et place des collecteurs et balais utilisés aujourd'hui pour cette fonction.
Projet ANR-07-SUDS-0007 – EAD : L'efficacité de l'aide au développement: une perspective élargie
Programme : Les Suds aujourd'hui (SUDS) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : UNIVERSITE D'AUVERGNE - CLERMONT-FERRAND I (UNIVERSITE D'AUVERGNE - CLERMONT-FERRAND I)
Partenaires : Université d'Auvergne
Montant : 235000.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Identifier les principales difficultés pour accroître l’efficacité de l’aide reçue par les PED. A partir des résultats obtenus, dégager de nouvelles modalités de l’aide (allocation géographique optimale, caractéristiques de la conditionnalité, rôle d’assurance de l’aide, aide dans les Etats fragiles, rôle des institutions régionales et des collectivités décentralisées).
Projet ANR-07-NANO-0002 – BIOCAPS : Nano-engineered capsules based on chemically modified polysaccharides as multicompartment drug carriers
Programme : Nanosciences et Nanotechnologies (PNANO) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Rachel AUZELY-VELTY (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE RHONE-ALPES SECTEUR ALPES)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique
Montant : 452050.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Ce projet porte sur le développement de capsules biocompatibles et biodégradables élaborées par dépôt couche-par-couche de biopolymères sur un support colloïdal suivi de sa décomposition et destinées à la vectorisation de molécules anti-virales. La mise au point de capsules "sur-mesure " sera réalisée par des modifications chimiques sélectives de biopolymères afin de pouvoir contrôler à l’échelle nanométrique 1) les propriétés mécaniques et la biodégradabilité des parois des capsules en les réticulant chimiquement 2) l’encapsulation et la libération des molécules bioactives dans le cœur et/ou la paroi rendues possible par le greffage de chaînes alkyle et de cyclodextrines sur les polymères pour former des nanocavités hydrophobes et 3) l’interaction avec des cellules phagocytiques modulée par la présence de chaînes poly(éthylène glycol) pour créer une barrière stérique empêchant l’adsorption de protéines plasmatiques sur les capsules. Les propriétés de la paroi des capsules seront étudiées et optimisées à partir de films plans. La capacité des capsules à transporter les agents anti-viraux vers les cellules cibles sera évaluée par des tests biologiques. - -
Projet ANR-08-TECS-0013 – OPTIM-HOME : OPTIMisation de la prise en charge de patients insuffisants cardiaques de l’hôpital à leur domicile par HOME Monitoring
Programme : Technologies pour la santé et l’autonomie (y.c. Emergence) (TecSan) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE RENNES I (UNIVERSITE DE RENNES I)
Partenaires : Centre Hospitalier Universitaire Pontchaillou; Divers privé; Entreprise autre que TPE ou PME; Université de Rennes 1
Montant : 915799.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : L’insuffisance cardiaque, avec une incidence de 150000 nouveaux cas chaque année et près de 32000 décès, représente un axe de recherche important de la stimulation et de la défibrillation cardiaque implantable. Les enjeux en terme de santé publique sont majeurs car on dénombre en France 1 million d’insuffisants cardiaques. Les coûts de santé liés à l’insuffisance cardiaque s’élèveraient à 1 milliard d'euros par an (soit 1% des dépenses de santé globale), dont les trois quarts pour l’hospitalisation. Les enjeux sont  aussi importants pour les parts de marché des industriels concernés. Le marché de la resynchronisation cardiaque est effectivement en pleine croissance avec une évolution de 10.8 % soit un montant global estimé à 2106 millions de $ pour 2008.
Projet ANR-15-CE07-0016 – FurCab : Procédé éco-compatible et éco-efficent pour  la conversion en one pot de sucres en biosolvants via la plateforme furanique.
Programme : Chimie Durable, produits, procédés associés (DS0304) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Madame Karine De Oliveira Vigier (Institut de Chimie des Milieux et matériaux de Poitiers)
Partenaires : Laboratoire public; Laboratoire public; Laboratoire public
Montant : 516880.0 euros
Durée : 48 mois
Résumé : L’épuisement des ressources pétrolières et le réchauffement climatique conduisent à la valorisation de la biomasse. La biomasse lignocellulosique est constituée majoritairement de sucres (75%) et de lignine. De nombreuses recherches sont dédiées à la valorisation des sucres de la biomasse lignocellulosique. Les dérivés furaniques, X-furfural (X = H, CH2OH), sont obtenus par hydrolyse/déshydratation des sucres (cellulose, hémicellulose..). Parmi ces dérives furaniques, nous pouvons citer le furfural, actuellement produit à l'échelle industrielle (400 000 t/an) et le 5-hydroxyméthylfurfural (HMF) dont la production industrielle n’a pas encore vu le jour, suite à son coût élevé. En effet, la sélectivité des procédés et la difficulté d’isolation de l’HMF reste un frein à sont utilisation comme molécule plateforme. 
Dans ce projet, le but principal est la conception d’une boîte à outils pour la synthèse one pot de molécules cibles à partir de différents sucres. Les molécules cibles qui ont été sélectionnées en accord avec leur marché éventuel (propriétés évaluées par des méthodes prédictives) sont les aminoalkyl tetrahydrofuranes, les amidoalkyltétrahydrofuranes et les aklytétrahydrofuranes cétones…. Ces molécules issues des furanes auront des applications dans l’industrie des solvants. Une attention particulière sera portée sur l’éco-compatibilité et l’éco-efficience des procédés mis en oeuvre. La boite à outils développé permettra de déterminer la nature du catalyseur, du solvant et des conditions de température et de pression pour mener à bien ces réactions. Le contrôle de la sélectivité lors des réactions successives sera primordial. Une attention particulière sera portée sur l’éco-compatibilité et l’éco-efficience des procédés mis en oeuvre. Le cycle de vie du procédé et des produits formés et du procédé seront évalués. Le but final de ce projet est la définition d’un procédé permettant la synthèse de biosolvantst à partir des sucres. Ce projet est un projet de recherche collaboratif entre l'IC2MP (Institut de Chimie des Milieux et Matériaux de Poitiers), l'ICBMS (Institut de Chimie et Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires) et E2P2L (Eco-Efficient Products and Processes Laboratory).
Projet ANR-14-CE05-0014 – CATMEC : Facteurs contrôlant la catalyse moléculaire dans des films electroactifs: clefs pour l'optimisation de réactions pour le stockage de l'énergie.
Programme : Transformations et inter-conversions énergétiques (DS0203) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Cyrille COSTENTIN (Laboratoire d'Electrochimie Moléculaire)
Partenaires : Harvard University Department of Chemistry and Chemical Biology; Laboratoire public
Montant : 152360.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 36 mois
Résumé : Afin de répondre à la demande croissante en énergie, des sources d’énergie alternatives doivent être exploitées et l’énergie ainsi obtenue doit pouvoir être stockée. La photoélectrolyse de l’eau est un moyen prometteur de stocker l’énergie solaire dans des liaisons chimiques. Cependant, pour être efficaces, les réactions d’oxydo-réduction de l’eau nécessitent l’utilisation de catalyseurs le plus souvent sous la forme de couches minces déposées à la surface des électrodes. L’identification des facteurs contrôlant le fonctionnement de tels systèmes et la compréhension de l’interdépendance des différents paramètres est donc nécessaire pour l’optimisation des performances de systèmes d’électrolyse de l’eau. 
En plus de la réaction catalytique elle-même, il apparaît que les deux paramètres principaux contrôlant de tels systèmes sont le transport des électrons de ou vers l’électrode pour générer la forme active du catalyseur et le transport du substrat à travers le film. Des protons étant consommés ou produits dans ces réactions, le transfert couplé électron-proton joue un rôle important dans le cycle catalytique. Aussi, le transport des protons et/ou des formes acides ou basiques du tampon peut influencer la réponses catalytique. Ainsi dans de tels systèmes, il est important de considérer que le transport des électrons dans le film peut être couplé au transport des protons et d’en comprendre le mécanisme. 
Le présent projet propose un programme général visant à l’analyse les différents aspects des problèmes décrits ci-dessus. Ceci va être mené à bien selon la stratégie suivante : modélisation théorique pour étendre notre modèle déjà existant et décrivant les courbes intensité-potentiel en régime stationnaire pour des films électrocatalytiques impliquant un simple couple rédox couplé à un transfert de proton à d’autres types de mécanismes; étude des caractéristiques intrinsèques du transport électron-proton ; étude du rôle cinétique de la base du tampon ainsi que celle du rôle des ions de l’électrolyte incorporé dans le film électrolytique; extension des études menées sur le catalyseur Co-OEC (filme d’oxyde de cobalt électrodéposé) à d’autres films d’oxydes tels que Ni-OEC ou Mn-OEC en suivant la même méthodologie et en utilisant le modèle développé de sorte à aboutir à une comparaison raisonnée des performances catalytiques des films d’oxydes métalliques pour l’oxydation de l’eau; étudier expérimentalement et théoriquement la possibilité d’accroître l’activité catalytique en incluant dans les films un matériau permettant une conduction ohmique des électrons.
Projet ANR-16-DIVinHD – DIVinHD : Imagerie super-résolue de la division bactérienne
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Cecile MORLOT
Partenaires : Institut de Biologie Structurale
Projet ANR-16-RIBOSTAPH – RIBOSTAPH : La traduction et son contrôle chez Staphylococcus aureus: conséquences sur la virulence et la réponse aux stress
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Pascale ROMBY
Partenaires : Architecture et Réactivité de l'Arn
Projet ANR-16-MITOXDRUGS – MITOXDRUGS : Toxicité mitochondriale des médicaments et stéatose hépatique. Généralisation de la relation causale pour le développement de nouveaux tests prédictifs.
Programme : PRCE - Projets de recherche collaborative - Entreprises/Public
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Bernard FROMENTY
Partenaires : Foie, Métabolismes et Cancer
Projet ANR-16-ELECSPIN – ELECSPIN : Dispositifs Spintronique assistés par champ électrique
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Hélène BÉA
Partenaires : Spintronique et Technologie des Composants
Projet ANR-16-ACCURATE – ACCURATE : Une théorie computationnelle de la reconstruction de l'image humaine des scènes naturelles
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Peter NERI
Partenaires : Laboratoire des Systèmes Perceptifs
Projet ANR-11-BS10-0013 – MagWires : Boîtes quantiques à base de semiconducteurs magnétiques dans des nanofils
Programme : Blanc - SIMI 10 - Nanosciences (Blanc SIMI 10) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Kuntheak KHENG (COMMISSARIAT A L'ENERGIE ATOMIQUE ET AUX ENERGIES ALTERNATIVES - CENTRE D'ETUDES NUCLEAIRES SACLAY)
Partenaires : Institut des Matériaux, de Microélectronique et des Nanosciences de Provence; Institut Neel; Institut Nanosciences et Cryogénie
Montant : 642775.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 48 mois
Résumé : Les boîtes quantiques à base de semiconducteurs magnétiques sont éléments de base prometteurs pour le développement des futurs dispositifs spintronique ou spin-photonique. Une approche élégante pour contrôler les effets de spin dans ces nanostructures est d’utiliser la lumière pour générer, manipuler ou lire l’état de spin. Le couplage des porteurs de charge (électron, trou ou exciton) avec les ions magnétiques localisés conduit à la formation du polaron magnétique. Ce projet à pour but e développer une nouvelle classe de boîtes quantiques magnétiques basées sur les nanofils et à explorer à la fois les propriétés intrinsèques du polaron magnétique et les possibilités et limites de leur stabilisation dans des géométries confinées.
Pour cela nous allons développer la croissance de nanofils dans le système de matériaux CdTe/ZnTe et l’incorporation du manganèse dans des boîtes CdTe et CdSe insérées dans des nanofils ZnTe et ZnSe. En prenant avantage de la géométrie de nanofil, des structures de type cœur-coquille vont élaborée pour contrôler l’injection de porteurs et former des polarons magnétiques de grande durée de vie. Les propriétés structurales et de composition seront analysées avec des techniques complémentaires de microscopie électronique en  transmission haute résolution et par sonde atomique tomographique, un outil unique qui permet d’analyser les matériaux en 3 dimensions à l’échelle atomique. Les propriétés intrinsèques du polaron magnétique excitonique seront étudiées en détail par des méthodes spectroscopiques de grande sensibilité (magnéto-optique, spectroscopie de boîtes uniques) et ses propriétés dynamiques par la spectroscopie résolues en temps.
L’étude de propriétés nano-magnétiques aussi riches demandera des efforts combinées de synthèse de nanostructures, de caractérisation de matériau avec une haute résolution spatiale, des études optiques fines et une compréhension théorique. Ce projet, en s’attaquant à des questions de physique fondamentale, conduira indirectement à un élargissement de nos connaissances sur des questions de nano-matériaux et de nano-caractérisations.
Projet ANR-06-TECS-0013 – DIAPRECA : Symbiose Imagerie et spectroscopies (fluorescence, réflectance et raman) appliquée au diagnostic in vitro et in vivo de la nature précancéreuse de polypes (adénomes) et cancers débutants (carcinomes) du colon.
Programme : Technologies pour la Santé (TecSan) (TecSan) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE RENNES I (UNIVERSITE DE RENNES I)
Partenaires : Centre Hospitalier Régional et Universitaire de Brest; PME; Université de Rennes 1; Université de Rennes 1; Université de Rennes 1
Montant : 824887.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : En France, 36 000 cancer colorectal sont diagnostiqués par an entraînant 16 000 décès alors que 1,25 millions d’endoscopies digestives coliques ont été réalisées en 2005 avec dans 33% des cas présence de polypes qui après ablation ou polypectomie associées aux biopsies diagnostiques ont entraîné l’analyse de 810 000 polypes. Le coût de ces cancers pour la première année varie de 17 000 à 36 600 € selon le stade intra-muqueux, ss-muqueux ou invasif. Les méthodes de biopsies optiques pour différencier les polypes non néoplasiques et caractériser les adénomes à haut risque est un secteur en pleine expansion.  Le Projet Diapreca vise par une approche multimodale un prototype pouvant par per endoscopie aider au dignostic précoce du cancer du colon par discrimination de zones saines, précancéreuses ou cancéreuses. Le projet fusionnera des approches d'imagerie et de spectroscopie.