Projet ANR-08-BIOT-0010 – GlycoFactory : Développement de systèmes de fermentation pour la production à large échelle d¿oligosaccharides et de Glycobricks comme outils pour la recherche
Programme : Recherche partenariale en biotechnologies pour la santé (BIOTECS) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : ELICITYL (ELICITYL)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; TPE
Montant : 654997.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : Les sucres complexes ont de nombreuses applications biomédicales. La difficulté à les obtenir en quantités raisonnables par extraction ou par synthèse contribue à freiner le développement de la glycobiologie et de leurs applications thérapeutiques et diagnostiques. Le CERMAV a développé une technologie de fermentation bactérienne inédite et brevetée permettant la production à faible coût et à large échelle (g/L) d¿une grande variété d¿oligosaccharides biologiquement actifs. Ils peuvent être directement produits par fermentation sous une forme activée (Glycobricks), les rendant utilisable comme blocks élémentaires dans des réactions de ¿click chemistry¿. ELICITYL a aquis une expérience large dans l¿extraction, la purification et la caractérisation d¿oligosaccharides. Le principal objectif de GlycoFactory est de mettre en place un projet de R&D commun supporté par un transfert de connaissances pour étendre la bibliothèque d¿oligosaccharides et de mettre en place les procédés de purification des oligosaccharides issus de la fermenation. Le but est de préparer l¿industrialisation de la technologie du CERMAV en parallèle de GlycoFactory. La technologie de fermentation sera également utilisée par ELICITYL pour développer la production de Glycobricks pour la synthèse de structures macromoléculaires. Ce projet contribuera à rendre des oligosaccharides biologiquement actifs disponibles à l¿échelle du gramme. Cette offre sans précédant pourra stimuler la recherche en glycobiologie. La production d¿oligosaccharides biologiquement actifs par fermentation bactérienne présente un avantage compétitif considérable sur les autres méthodes comme l¿isolation à partir de sources naturelles or la synthèse chimique ou enzymatique. En effet, une fois que la souche bactérienne a été génétiquement manipulée pour la production d¿un oligosaccharide spécifique, cet oligosaccharide peut être produit de façon répétée par fermentation en moins de trois jours avec un rendement qui avoisine usuellement 5 à 10 g/l. Le milieu de fermentation contient des composés peu coûteux et le procédé peut être adapté à grande échelle dans un fermenteur de grande capacité si nécessaire.
Ainsi, la diversification des souches bactériennes pour la production de nouveaux oligosaccharides biologiquement importants et l¿industrialisation de la technologie de fermentation (développement de procédés de purification et de contrôle qualité à l¿échelle industrielle, en particulier) permet le développement d'une offre inédite de mise à disposition d¿oligosaccharides biologiquement actifs à l¿échelle du gramme pour la recherche académique et industrielle. De plus, les oligosaccharides activés (Glycobriks) développés dans ce projet pourront être facilement utilisables par des scientifiques qui ont des connaissances limitées en chimie organique. Ceci permettra d¿étendre l¿utilisation de ces composés à des biologistes ou des biochimistes.
 ELICITYL a été fondée par un chercheur du CERMAV pour développer une application brevetée par le CNRS basée sur un sucre complexe. Dans le cadre d¿un accord avec le CERMAV-CNRS, ELICITYL a développé l¿industrialisation du procédé de production du sucre. Sur la base de ce transfert de technologie et de cette industrialisation réussis, ELICITYL a développé une plateforme industrielle de production et a acquis une expérience large dans la purification et la caractérisation des sucres dans un environnement de contrôle qualité.
Le CERMAV a une expertise reconnue internationalement dans la production d¿oligosaccharides par fermentation bactérienne. Cette technologie est développée au CERMAV depuis au moins dix ans et a permis de constituer, à ce jour, une collection de souches qui peuvent être utilisées pour produire au moins 70 oligosaccharides.
Les compétences respectives des partenaires, leurs relations de travail régulières conduisent immediatement à un partenariat synergique.  Le projet Glycofactory est composé de 4 taches:
TACHE 1. Extension de la bibli