Projet ANR-13-TECS-0004 – ReSynPlex : Détection et caractérisation multiplexée des pathogènes associés aux syndromes respiratoires
Programme : Technologies pour la santé et l'autonomie (TecSan) 2013
Année de financement : 2013
Coordinateur du projet : Monsieur Othello CHARTIER (AXO Science SAS)
Partenaires : AXO SCIENCE; Biologie Structurale des Interactions entre Virus et Cellule-Hôte; Institut Albert Bonniot - Ontogenèse et Oncogenèse Moléculaire; Institut de Chimie et Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires; Laboratoire Adaptation et Pathogénie des Micro-Organismes
Montant : 622514.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Les syndromes respiratoires associés aux infections sont des menaces prépondérantes pour la santé humaine. Elles se propagent sans distinction géographiques ou sociales. En France, les infections respiratoires sont la cause de 60% des décès dans la catégorie "maladies transmissibles", (source: OMS ; "la charge de morbidité mondiale 2008 ").
Les syndromes respiratoires se caractérisent par un grand nombre d'agent infectieux (virus et bactéries), ces dernières peuvent notamment devenir nosocomiales suite à leur nombreux contact avec des antibiotiques. Typiquement, au sein d'un hôpital, lorsque le clinicien suspecte qu'un patient est infecté lors d'une phase de réveil postopératoire, un diagnostique clair et rapide est nécessaire afin de prendre les mesures appropriées pour la santé du patient. Dans ce contexte, la tentative du clinicien pour caractériser l'étiologie du syndrome d'un patient est un véritable puzzle, entre le nombre de tests disponibles (identification des agents pathogènes, détection des facteurs de résistance/virulence) et le délai d'exécution de ces tests, qui retardent le diagnostic et accroissent les coûts de soin de chaque patient. Actuellement, la plupart des pathogènes sont identifiés individuellement soit par culture soit par des méthodes de PCR, et la multiplication de ces tests n'est que rarement efficace en terme de temps et de coûts (de 48 h à 7j ; et de 40 € pour chaque bactérie à 130 € pour 13 identifications PCR). Un réel fossé existe entre la multiplicité de l'information requise par le praticien et les outils de diagnostic disponibles. Récemment, les trois technologies clés permettant le diagnostic reposant sur la génétique ont évolué: des systèmes d'extraction d'acide nucléiques automatisés, des méthodes de PCR multiplexées ainsi que des outils automatisées de réalisation d'essai coexistent.
Pour aller au-delà, il est désormais nécessaire de combiner habilement ces systèmes, en considérant les besoins spécifiques des cliniciens afin de créer un outil de diagnostic à la fois simple et complet. Il est envisagé d'améliorer le processus analytique en couplant la PCR multiplex avec une méthode de détection spécifique des séquences (puce a ADN) et en permettant à travers une unique étape de PCR multiplex d'identifier les pathogènes et de caractériser leur facteurs de virulence/résistance. Le projet ReSynPlex vise à développer une plateforme automatisée pour le diagnostic rapide (moins de 4h) et complet (étiologie et résistances) des pathologies liées aux syndromes respiratoires en milieu hospitalier, à prix réduit (moins de 30€).
A travers ce projet, le clinicien aura un accès direct, rapide et clair à la connaissance de l'identité du ou des pathogènes impliqués, et de la présence de gènes conférant des résistances. ReSynPlex produira un outil de diagnostic amélioré qui conduira à une meilleure prise en charge des patients dans le milieu hospitalier, ainsi qu’à la réduction de la propagation des infections et à la diminution des coûts hospitalier. Le patient, le clinicien et le système de santé profiteront des avantages de la plateforme technologique de diagnostic créée grâce au projet ReSynPlex.
Depuis trois années (2010-2013), AXO science a conduit avec succès le programme de recherche HiFi-assays (ANR BiotecS 2010). Le projet ReSynPlex vise ici à développer un produit IVD pour l'identification poussée des agents pathogènes, profitant des recherches menées lors de HiFi-assays. En particulier, la technologie développée et brevetée semble parfaitement adaptée à l'application envisagée ici. Grâce à HiFi-assays un premier produit appliqué au génotypage étendu des groupes sanguins sera mis sur le marché. AXO science et ses partenaires historiques (ICBM et IAB) souhaitent désormais valoriser ces résultats en élargissant le champ d'application de la technologie HIFI. Le savoir-faire et l'expertise développée, ainsi que la propriété intellectuelle déposée sera mise à profit dans le projet ReSynPlex.