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Projet ANR-07-JCJC-0027 – SyRIM : Synthèse de Radioligands pour l'Imagerie Médicale. Applications au récepteur 5-HT7.
Programme : Jeunes chercheuses & jeunes chercheurs (JCJC) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : UNIVERSITE CLAUDE BERNARD - LYON I (UNIVERSITE CLAUDE BERNARD - LYON I)
Partenaires : Université Claude Bernard - Lyon 1
Montant : 190000.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 48 mois
Résumé : With the development of PET = positron emission tomography (or as it is more appropriate to denote it PET = positron emission tracer technique) as a general in vivo tracer method, the opportunity has opened up to perform non-perturbated observations in vivo both in research animals and in humans. PET is an imaging technique that is able to detect positron-emitters within an animal or human body. Carbon 11 and fluorine 18 are positron-emitters that can be incorporated into drug molecules to provide biochemically radiopharmaceuticals, including ligands for neurotransmitter receptors. -  These measurements can be performed at much lower drug concentrations than previously been possible, allowing various evaluations of distribution and pharmacological interventions with pharmacologically inactive tracer doses and combining information from non-perturbated systems -                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ...
Projet ANR-07-JCJC-0001 – DiSiP : Dissecting Signaling Pathways
Programme : Jeunes chercheuses & jeunes chercheurs (JCJC) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 200000.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 48 mois
Résumé : Through evolution, living organisms have developed specific responses to cope with fluctuations of their environment such as osmotic shocks, temperature shifts, oxidative damages, chemical toxicity... To do so, a single cell has to detect environmental changes (specialized sensor proteins), signal those changes to the cell's nucleus (signaling cascade) and transcribe a set of genes that will, hopefully, leads to cell adaptation. Although many signaling pathways architectures are well described in the literature, there are only few quantitative studies concerning their intrinsic timescales and their transfer of information capacity. Time is, however, crucial when responding to harsh stresses such as osmotic shocks. Using the yeast Saccharomyces cerevisiae and its HOG signaling cascade as a model pathway, the DiSiP project will ask how much Information can a given signaling pathway transmit to the nucleus; what are the parameters (physical and biological) that set the signaling timescales and to what extent it is possible to modify those timescales genetically. The DiSiP project will start by improving a prototypal micro fluidic device - designed in a recent work by the project leader [1] - to create a reliable, high frequency, fluctuating environment while allowing for microscopy imaging of fluorescent proteins. Such a tool will then be used to dissect the HOG signaling pathway by studying the frequency response of single mutant cells subjected to an oscillatory environment. This study will result in a fine quantification of the effect of mutation and protein concentrations on the dynamics of the pathway, the ultimate goal being to get insights on how to engineer faster or slower cells with respect to a given stimulus.                           ...
Projet ANR-07-NANO-0045 – NADIA : Nanocristaux de diamant, photoluminescence et croissance de couches ultraminces de diamant
Programme : Nanosciences et Nanotechnologies (PNANO) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : François TREUSSART (ECOLE NORMALE SUPERIEURE DE CACHAN)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives; École normale supérieure de Cachan; Université de Lorraine
Montant : 521177.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : La mise au point de sondes photoluminescentes nanométriques est un domaine de recherche très actif en raison des nombreux débouchés: marquage capteurs chimiques etc…La sonde idéale doit avoir une taille < 20 nm et posséder une photoluminescence intense et stable. Les boîtes quantiques semi-conductrices (« QDots ») remplissent une partie de ces exigences d’où leur succès. Cependant leur photoluminescence n'est pas stable (scintillement) et leur fonctionnalisation est difficile. - Le projet NADIA a pour objectif de développer une nouvelle nanosonde photoluminescente dans le rouge et proche infra-rouge reposant sur des impuretés (centres colorés) dans des nanocristaux de diamant que nous synthétiserons. La densité de centres colorés sera rendue maximale par optimisation (i) de la teneur en impuretés (azote pour les centres azote-lacune ou nickel) (ii) de la densité de lacunes créées par l'irradiation puis (iii) des conditions de recuit. L'optimisation sera menée sur des films modèles de diamant synthétisés en phase vapeur (CVD) et appliquée aux nanoparticules. Les nanoparticules de diamant seront fonctionnalisées pour (i) être dispersées en suspension colloïdale et - (ii) pour interagir avec des molécules d'intérêt ou des surfaces. Les suspensions colloïdales serviront aussi à améliorer la synthèse des films de diamant CVD. NADIA réunit les compétences pour maîtriser toutes les étapes de la synthèse et de la caractérisation des nanoparticules de diamant photoluminescentes. - -
Projet ANR-06-EMPB-0017 – MYOTEND : Etude approfondie d'une isoforme particulière de chaîne lourde de myosine impliquée dans la tendreté de la viande bovine
Programme : Emergence et maturation de projets de biotechnologie à fort potentiel de valorisation (EMPB) (EMPB) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : INRA-TRANSFERT (INRA-TRANSFERT)
Partenaires : PME; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 147973.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 18 mois
Résumé : Le critère de tendreté est une problématique prépondérante dans le secteur de la viande et il n’existe pas à l’heure actuelle de technique de référence simple, fiable et reproductible pour la prédire. Nos résultats préliminaires ont révélé une isoforme de chaîne lourde de myosine non identifiée jusqu’à présent chez le bovin. Les animaux « porteurs » de cette isoforme ont tous un même ancêtre en commun et ils présentent des notes de tendreté de viande élevée. Aussi, l’objectif stratégique de ce projet est de valider l’importance de cette isoforme dans le déterminisme de la tendreté de la viande et de le valoriser, à terme, en mettant sur le marché un test de diagnostic utilisable dans la filière bovine pour sélectionner des individus à viande tendre. Sur le plan opérationnel, nous proposons : (1) de compléter les travaux pour identifier plus précisément cette isoforme, expliciter les mécanismes impliqués dans la régulation de son expression et fabriquer un (ou des) anticorps spécifique. Pour cela nous conduirons des études en synergie au niveau du gène et de la protéine. Nos résultats préliminaires sur un lot de 11 taurillons, montrent que l’ARNm est exprimé chez les 11 taurillons alors que 2 seulement possèdent la protéine, ce qui suggère un mécanisme de régulation complexe et démontre la nécessité d’établir un test diagnostic au niveau protéique dans un premier temps. Par ailleurs, d’autres résultats préliminaires (analyse complémentaire de 60 descendants de l’ancêtre commun des 2 taurillons) suggèrent fortement une situation d’allélisme. L’identification du gène en cause et de l’allèle conduisant à la présence de cette isoforme sera également entreprise. (2) de mettre au point un test immunologique simple (IDR ou ELISA) permettant de rechercher cette isoforme dans un large effectif de bovins des trois principales races à viande (Charolaise, Limousine, Blonde d’Aquitaine) pour lesquels ont été mesurées différentes caractéristiques musculaires et la qualité sensorielle de la viande. Cette étude permettra d’évaluer la fréquence de cette isoforme de chaîne lourde de myosine au sein des principales races à viande françaises et de tester l’intérêt de ce nouveau marqueur biologique pour certifier le potentiel des animaux à produire une viande de qualité. Il sera ainsi possible de diriger les animaux de boucherie sur les segments de marché les plus adaptés à leur potentiel biologique et/ou de mettre en place une certification dans certaines filières.
Projet ANR-06-JCJC-0074 – GynoGenomPop : Dynamique évolutive de la gynodiÂ¿cie chez Beta vulgaris ssp maritima et Silene nutans. Des génomes aux populations
Programme : Programme "Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs" (JCJC) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES DE LILLE -LILLE 1 (UNIVERSITE DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES DE LILLE -LILLE 1)
Partenaires : Université Lille 1 - Sciences technologies
Montant : 120000.0 euros
Date de début : 2006
Durée : 36 mois
Résumé : La gynodioecie est un système de reproduction qui se caractérise par la co-existence de plantes hermaphrodites et femelles (mâle-stériles) dans les populations naturelles. Ce polymorphisme sexuel peut être interprété comme le résultat d'un conflit génétique entre le génome mitochondrial qui produit des facteurs stérilisants et le génome nucléaire producteur de facteurs de restauration de la fertilité mâle. Dans le cadre de ce projet, nous proposons de développer différentes approches complémentaires, sur deux espèces gynodioïques, la betterave sauvage, Beta vulgaris ssp maritima, et Silene nutans, en vue de mieux comprendre la dynamique évolutive de ce système de reproduction complexe : - une approche de génomique évolutive, afin de discriminer deux scénarios du maintien de la gynodioecie (sélection balancée versus épidémie) qui doivent laisser des patrons de diversité nucléotidique cytoplasmique contrastés ; - une approche de génétique des populations, puisque les flux de gènes entre populations doivent influencer la dynamique de la gynodiœcie, et qu'en retour ce système de reproduction va avoir un effet sur l'organisation de la diversité génétique ; - une approche de biologie des populations, en vue de mieux comprendre à un niveau plus fin le fonctionnement des populations gynodioïques, et de déterminer expérimentalement les différentes valeurs de succès reproducteur (mâle et femelle) associées aux différents génotypes ; - une approche théorique par modélisation, afin de prédire les conditions maintien de la gynodioecie dans les deux systèmes, d'interpréter les données empiriques et en retour de tester des scénarios plus réalistes. Ces différentes approches sur deux espèces gynodioïques, aux traits d'histoire de vie contrastés, permettront de générer une image assez générale de la dynamique évolutive de la gynodiœcie, et de décrire l'évolution du génome mitochondrial à un niveau intraspécifique.
Projet ANR-10-BLAN-1403 – CONSTRUCT : Bases neurales des structures en constituants
Programme : Sciences de la vie, de la santé et des écosystèmes :  Neurosciences (Blanc SVSE 4) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur Christophe PALLIER (INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE - DELEGATION PARIS XI)
Partenaires : Institut national de la santé et de la recherche médicale; Institut national de la santé et de la recherche médicale
Montant : 613584.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Tous les locuteurs d'une langue possèdent des intuitions sur ce qui constitue une phrase acceptable dans leur langue, et ceci indépendamment de son sens, comme l'atteste les exemples “Les borogroves meurgent dans la risse”, ou “Des idées vertes dorment furieusement”. Ces intuitions ne sont pas réductibles à la simple probabilité d'une séquences de mots. Pour expliquer cela, ainsi qu'une quantité d'autres phénomènes langagiers, les linguistes postulent que les phrases ne sont pas de simples suites de mots mais possèdent une structure hiérachique en constituants pouvant être enchassés les uns dans les autres de manière récursive. Comment ces structures sont encodées dans le cerveau demeure, à l'heure actuelle, une énigme.
Le but de notre projet est de comprendre comment des structures hiérarchiques récursives peuvent être encodées par des assemblées de neurones. Nous proposons une série d'expériences utilisant diverses techniques de neuroimagerie que nous employerons chez des volontaires sains, des patients neurologiques, de  jeunes enfants ainsi que des singes macaques. Une première série d'expériences a pour but d'analyser le réseau de compréhension des phrases en dissociant l'effet de la structure syntaxique des effets de la cohérence sémantique, de la structure prosodique et des transitions de probabilités. Nous proposons ensuite d'essayer de caractériser quantitativement la relation entre complexité de l'arbre syntaxique et activations neuronales. Ces données permettront de contraindre les modèles neuronaux de l'encodage des structures hiérarchiques.  Nous comptons également examiner l'encodage de ce type de structure dans des domaines non langagiers, la Musique et les Mathématiques et ceci dans le but de savoir s'il existe un circuit unique responsible du traitements des structures récursives quel que soit le domaine, ou bien, si des circuits distincts sont mis jeu. Les expériences de magnétoencéphalographie nous permettont d'examiner le décours temporel des activation lors de la construction des arbres, et les données d'IRMf chez les patients atteints de lésions focales nous renseigneront sur les liens causaux entre les aires du réseau impliqué dans le traitement des phrases. Finalement, en utilisant des stimuli non verbaux, nous proposons d'étudier des organismes préverbaux, jeunes enfants et singes macaques, dans le but de determiner si la capacité à représenter des structure enchassée est spécifiquement humaine.
Projet ANR-07-TECS-0025 – UltraCardio : Imagerie In Vivo des Propriétés Viscoélastiques du Coeur et des Parois Artérielles par Echographie Ultrarapide et Palpation à distance.
Programme : Technologies pour la santé (TecSan) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la santé et de la recherche médicale; Institut national de la santé et de la recherche médicale; PME
Montant : 780229.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 24 mois
Résumé : De nombreuses pathologies cardiaques se caractérisent par un changement des paramètres mécaniques du coeur. Prédire très tôt un tel changement est donc un enjeu majeur en imagerie cardiaque. En utilisant un système échographique très innovant, ces propriétés peuvent être sondées par une palpation virtuelle à distance. En effet, un faisceau ultrasonore focalisé en profondeur dans les tissus créé une force de radiation, sorte de «vent acoustique » qui déplace localement les tissus de quelques microns. Cette vibration à distance des tissus, créée à l’aide d’une sonde échographique conventionnelle engendre une onde de cisaillement dont la propagation à quelques mètres par seconde dans le muscle cardiaque va porter une information sur la viscoélasticité locale des tissus. Cette onde est imagée à l’aide de la même sonde échographique reliée à un prototype d’échographe ultrarapide unique au monde capable d’atteindre des cadences supérieures à 5000 images.s-1. Cette technique se positionne comme une extension des capacités de diagnostic actuelles des échographes et n’impose aucune modification protocolaire au médecin
lors de son examen clinique. Cette nouvelle technologie est maintenant maitrisée par la société SuperSonic Imagine créée à partir du Laboratoire Ondes et Acoustique qui a mis au point un échographe ultrarapide pour le diagnostic du cancer du sein. Forts de cette avance technologique par rapport à la concurrence internationale, notre projet vise à exploiter cet outil unique dans un autre domaine : l’imagerie cardiovasculaire. L’association de quatre partenaires reconnus internationalement, le LOA laboratoire de recherche en physique des ondes, la société SuperSonic Imagine, et deux partenaires cliniques spécialisés en cardiovasculaire devrait permettre d’aboutir à la mise au point d’un imageur révolutionnaire dans le domaine cardio-vasculaire.
Projet ANR-14-CE06-0013 – HALIGO : Donneurs d'atome d'hydrogène et liguands coopératifs issus de structures de type oxyallyle
Programme : Défi de tous les savoirs (DS10) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur David Martin (Département de Chimie Moléculaire de l'Université Joseph Fourrier)
Partenaires : Laboratoire public
Montant : 205221.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : La découverte et l’étude de versions stables d'intermédiaires réactionnels, tels que les  radicaux ou les carbènes stables, ont eu un impact profond sur la chimie moderne. Non seulement ces composés ont permis, sur le plan académique, l’émergence de nouveaux concepts  et une compréhension plus approfondie d’importantes questions fondamentales, mais ils ont également ouvert la voie au développement d’applications pratiques originales et innovantes. Dans ce projet, nous souhaitons  considérer le cas des oxyallyles, qui sont des intermédiaires postulés dans diverses réactions (cycloadditions 1,3-dipolaires, réaction de Favorskii , cyclisations de type Nazarov, etc...). 
Les oxyallyles sont des molécules dites « non-Kekulé » : bien que possédant un nombre pair d’électrons, leur système pi neutre ne peut être attribué à aucune structure de type Kekulé classique, mais seulement à des formes de résonance zwitterioniques ou biradicalaires. Pendant longtemps, les oxyallyles ont été considérés comme des espèces non observables, car la barrière d’activation de leur cyclisation, conduisant à la formation de cyclopropanones, est habituellement très faible. Cependant, il a récemment été montré que l’introduction de substituants pi-donneurs permettait de stabiliser ces composés, remettant en cause leur statut d’espèces non-isolables. Nous avons l'intention d'exploiter ce changement de paradigme et d’explorer la gamme des dérivés d’oxyallyles stables, y compris leurs formes O-protonées (cations oxyallyles) et les cations radicaux correspondants (qui peuvent être parfaitement stables à l'air !).
Nos résultats préliminaires démontrent que les motifs « oxyallyle » ont des capacités de transfert d'atome d'hydrogène et peuvent être utilisés en tant que plateformes d'oxydo-réduction multiélectroniques. Les versions stables d’oxyallyles et de leurs dérivés sont donc bien plus que des bizarreries chimiques : ils ont le potentiel de  conduire à l’émergence de nouveaux concepts et d’ouvrir la voie à des applications originales. Au-delà de la synthèse et l'étude des dérivés organiques, nous souhaitons également considérer l’introduction de motifs « oxyallyle » dans des complexes de métaux de transition, afin d’offrir de nouvelles perspectives dans le domaine de la catalyse coopérative.
Projet ANR-06-GPLA-0005 – LEGOO : LEGOO : a bioinformatics gateway towards integrative legume biology
Programme : Réseau de Génomique végétale - GENOPLANTE 2010 (GPLA) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Jérome GOUZY (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : Institut national de la recherche agronomique
Montant : 214475.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : La biologie intégrative est une approche de la biologie issue de la révolution technologique qui a rendu possible le décryptage des génomes et l'analyse fonctionnelle globale. Le rapport "Biologie Intégrative Végétale", remis à la direction de l'INRA par André Charrier et ses collaborateurs, formalise cette nouvelle approche en soulignant 3 axes d'intégration de la connaissance en biologie. Le premier correspond à donner du sens aux données produites en masse par la génomique notamment; le deuxième correspond aux différents niveaux d’organisation (du génome à la plante entière par exemple) et aux propriétés émergentes des systèmes complexes ; le troisième met en évidence l'importance de l'approche comparative inter espèces, en particulier pour le transfert des connaissances à partir des espèces modèles vers les espèces d'intérêt agronomique.  Le présent projet propose la mise en place d'un portail bioinformatique dédié à l'étude des légumineuses pour accompagner les chercheurs, et à terme les sélectionneurs, vers une biologie plus intégrative. Ce projet s'inscrit dans la continuité de notre implication dans le projet de séquençage et d'annotation du génome de Medicago truncatula (et précédemment d’ESTs de cette espèce) et a pour objectif de mettre en place un environnement bioinformatique focalisé sur le transfert de connaissance à partir de : i) l'annotation et l'analyse comparative des génomes de légumineuses ii) l'intégration des cartes génétiques des espèces d'intérêt agronomique (pois, luzerne) avec les données de séquences obtenues chez les espèces modèles iii) la structuration et la représentation des connaissances générées par les approches transcriptomiques et protéomiques pour les rendre interprétables et utilisables par des scientifiques non molécularistes (ex: eco-physiologistes). La France est l'un des pays européens où la culture des légumineuses est la plus développée et l'un des contributeurs majeurs au projet de séquençage et d'annotation de Medicago truncatula. La plateforme bioinformatique que nous proposons de mettre en place serait pour la communauté légumineuse française et européenne une ressource majeure pour l'exploitation optimale des données et des connaissances.