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Projet ANR-10-BLAN-1721 – ASTYCO : Le cerveau antérieur du poisson cavernicole aveugle Astyanax mexicanus: un modèle pour relier l’évolution du développement neural et du comportement animal
Programme : Sciences de la vie, de la santé et des écosystèmes :  Biodiversité, évolution des écosystèmes, écosystèmes productifs, agronomie (Blanc SVSE 7) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Madame Sylvie RETAUX (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD)
Partenaires : Institut des Neurosciences Paris Saclay
Montant : 275000.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : L’enjeu de ce projet est de mettre en relation les variations de morphogénèse précoce du cerveau antérieur chez des espèces apparentées, avec leurs conséquences sur la mise place des réseaux neuronaux, et sur les comportements qu’ils gouvernent. Le projet est basé sur une approche comparée et fonctionnelle et analysera des variations neuro-developpementales et comportementales qui ont été sélectionnées pendant l’adaptation de populations à leur environnement. 
Pour cela nous utiliserons un modèle animal original, le poisson Astyanax mexicanus (proche du poisson zèbre), qui présente au sein de la même espèce des populations de rivières et des populations cavernicoles aveugles se distinguant par leur morphologie, leur physiologie et leur comportement. La modulation des signaux médiés par les morphogènes Hedgehog et Fgf8, pendant le développement précoce, est en grande partie à l’origine des différences anatomiques entre populations, y compris de la perte des yeux chez les populations cavernicoles.
Nous analyserons les mécanismes dépendant de Hedgehog et Fgf8 qui gouvernent la morphogénèse de l’œil, du système olfactif et de l’hypothalamus, les trois régions du cerveau antérieur qui sont significativement différentes anatomiquement entre embryons et larves de populations cavernicoles ou de surface.
Nous analyserons de quelle manière les différences de développement de ces réseaux neuronaux hypothalamiques et olfactifs conditionnent les variations du comportement alimentaire et social décrites entre ces populations.
Enfin, nous testerons le caractère adaptatif des modifications de réseaux neuronaux et de comportement chez les poissons cavernicoles. Ceci est une condition indispensable pour soutenir notre hypothèse selon laquelle la perte des yeux chez les Astyanax cavernicoles est une conséquence indirecte de la sélection en faveur de traits avantageux pour l’adaptation à la vie dans l’obscurité.
Projet ANR-08-TECS-0001 – ALADIN-DTH : Assitant de Lutte Automatise et de Detection des Infections Nosocomiales a partir de Documents Textuels Hospitaliers
Programme : Technologies pour la santé et l’autonomie (y.c. Emergence) (TecSan) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : XEROX (XEROX)
Partenaires : Centre Hospitalier Universitaire Rouen; Université Claude Bernard - Lyon 1; PME; Entreprise autre que TPE ou PME
Montant : 927310.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : La surveillance et la détection des Infections Associées aux Soins (IAS), et plus spécifiquement des Infections Nosocomiales (IN),  représente une étape préliminaire à toute action corrective ou de prévention. En effet, seule une estimation qualitative et quantitative des phénomènes observés dans l’hôpital peut permettre d’orienter les mesures à prendre. Dans ce contexte, les hôpitaux sont en train d’expérimenter différents mécanismes de détections et de signalements des événements indésirables associés aux soins. Dans un tel contexte, le dossier médical informatisé constitue une source précieuse de données. Pourtant,  son exploitation automatisée reste difficile dans la plupart des structures hospitalières du fait de son caractère peu structuré, et de la variabilité de son format d’un service à l’autre.
Projet ANR-14-CE05-0037 – ERA : Ecoulement et Rupture des Argiles
Programme : Usage du sous-sol dans une perspective énergétique (DS0202) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Madame Elisabeth BOUCHAUD (ESPCI/Gulliver UMR 7083/Equipe Effets Collectifs en Matière Molle)
Partenaires : Laboratoire public; Laboratoire public; Laboratoire public
Montant : 340080.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 48 mois
Résumé : Afin de contribuer à l’amélioration des techniques d’exploration du sous-sol à des fins énergétiques, nous mettons au point des microsystèmes pour étudier la réponse mécanique d'argiles synthétiques et naturelles, contenant ou non des inclusions, à différentes échelles d'espace et de temps. Nous nous intéressons à la limite plastique, à la localisation des déformations, à la propagation des fissures. Nous  exploitons les avantages de la microfluidique couplée à de la microscopie optique, conventionnelle et confocale. Les champs de déformation sont évalués grâce à l’utilisation de traceurs en corrélation d’images digitales, ou grâce à la biréfringence des argiles. Notre approche expérimentale est complétée par une description théorique qui a déjà été appliquée, avec succès, à la rhéologie de matériaux vitreux. Nos microsystèmes pourront également être utilisés pour évaluer rapidement les propriétés de rupture de matériaux d’intérêt industriel produits dans de nombreux secteurs.
Projet ANR-14-CE06-0004 – CLICKREAL : Recherche de réactionsde ligation et de coupure bioorthogonale:  vers de nouveaux outils pour la chimie biologique
Programme : Défi de tous les savoirs (DS10) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Frédéric TARAN (Service de Chimie Bioorganique et de Marquage)
Partenaires : Chimie de la Matière Complexe; Laboratoire public; Laboratoire public
Montant : 457194.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : Le projet CLICKREAL vise à explorer la réaction des composés mésoioniques avec des alcynes tendus. Certains résultats obtenus récemment au laboratoire ont montré que ces dipôles hétérocycliques sont capables de réagir rapidement avec des alcynes cycliques pour conduire à 2 nouveaux produits l’un provenant de la ligation des deux partenaires réactionnels par cycloaddition [3+2], l’autre provenant d’une fragmentation par réaction de retro-Diels-Alder.  Le potentiel de ce type de réaction est très grand de part le nombre d’applications possibles que ce soit dans le domaine de la protéomique, de la bioconjugaison ou de la libération de principe actif. L’approche que nous souhaitons suivre est basée sur une conception rationnelle des réactifs en se basant sur nos résultats préliminaires obtenus sur une première famille de mésoioniques mais aussi à l’aide d’outils de calcul qui seront développés durant le projet. Les partenaires réactionnels ainsi choisis seront étudiés pour leur capacité à réagir de façon chimiosélective et bioorthogonale dans le but ultime de développer de nouvelles réactions de ligation et de coupure applicables aux milieux biologiques.
Projet ANR-16-MABCaM – MABCaM : Albédomètre multi-longueur d'onde pour la mesure des suies
Programme : PRCE - Projets de recherche collaborative - Entreprises/Public
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Weidong CHEN
Partenaires : Laboratoire de Physico-Chimie de l'Atmosphère
Projet ANR-16-supertrack – supertrack : Nanoparticules polymériques fluorescentes ultrabrillantes et biocompatibles pour l’imagerie rapide intracellulaire à haute-résolution
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Andreas REISCH
Partenaires : Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie
Projet ANR-16-ImmuNanoCaps – ImmuNanoCaps : Immunocapteurs électrochimiques à base de réseau de nanocapsules et nanoplots.
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Chantal GONDRAN
Partenaires : Département de Chimie Moléculaire
Projet ANR-16-HAIRBUNDLEMORPH – HAIRBUNDLEMORPH : Contrôle de la taille de la touffe ciliaire des cellules mécanosensorielles ciliées pour une détection auditive sélective en fréquence
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Pascal MARTIN
Partenaires : Unité Physico-Chimie Curie
Projet ANR-16-SoMuSeq-STEM – SoMuSeq-STEM : Compréhension des mutations somatiques spontanées et de leurs effets sur les tissus adultes
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Allison BARDIN
Partenaires : Génétique et Biologie du Développement
Projet ANR-16-MTBLipVir – MTBLipVir : Analyse multi-échelle et multidisciplinaire  des mécanismes intimes d'action des lipides de virulence  de l'enveloppe de Mycobacterium  tuberculosis
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Catherine ASTARIE-DEQUEKER
Partenaires : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale
Projet ANR-16-CytoRP – CytoRP : Résistance des plantes aux virus par CytoRP, un mutant d'une RNase P protéique
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Philippe GIEGÉ
Partenaires : Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
Projet ANR-16-GELULE – GELULE : Géopolitique de la lutte contre l’étalement urbain
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Max ROUSSEAU
Partenaires : Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement
Projet ANR-16-TOP-RISE – TOP-RISE : Isolant topologique et etats d'interfaces Rashba pour l'électronique de spin
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Jean-Marie GEORGE
Partenaires : Unité Mixte de Physique CNRS/Thalès
Projet ANR-16-OASIWAT – OASIWAT : Origine, mutations et dynamiques des oasis en Arabie du Sud-Est: disponibilité et gestion des ressources en eau/sol depuis les 5 derniers millénaires
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Louise PURDUE
Partenaires : Centre d'Études de la Préhistoire, de l'Antiquité et du Moyen-Age
Projet ANR-16-TIGERBRIDGE – TIGERBRIDGE : Invasion d’Ae. albopictus dans les écosystèmes forestiers d’Afrique Centrale et risque d’émergence de nouveaux virus zoonotiques
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Christophe PAUPY
Partenaires : Maladies Infectieuses et Vecteurs : Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle
Projet ANR-16-HypNeurogen – HypNeurogen : Physiopathologie de la niche neurogénique hypothalamique
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Martine MIGAUD
Partenaires : Physiologie de la Reproduction et des Comportements
Projet ANR-16-MENAX – MENAX : De nouveaux inhibiteurs de IspD comme solution contre Bacillus anthracis
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Philippe CHAIGNON
Partenaires : Institut de Chimie de Strasbourg
Projet ANR-12-JSV1-0009 – SYNOTELO : Contribution des polymorphismes synonymes de TERT à la prédisposition aux cancers
Programme : JCJC - SVSE 1 - Physiologie, physiopathologie, santé publique (JCJC SVSE 1) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur PATRICK BREST (Centre Cancer et Vieillissement)
Partenaires : Institute For Research on Cancer Ageing Of Nice
Montant : 280840.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Un grand nombre de pathologies humaines dont le cancer ont une étiologie multifactorielle qui implique à la fois des facteurs environnementaux et génétiques. Des études génomiques à grande échelle ont identifié un grand nombre de variants génétiques associés aux maladies. Toutefois, la "génopathologie" (ie. les mécanismes moléculaires associant un polymorphisme (SNP) à des processus biologiques altérés et des pathologies) de ces allèles reste à déterminer. 
Nos travaux récents (Nature Genetics) décrivent un nouveau mécanisme pouvant expliquer comment des SNP synonymes peuvent avoir une incidence sur l'expression des ARNm. Nos résultats présentent en effet la perte de reconnaissance d’un microARN pour son ARNm cible (du fait du polymorphisme) comme un modèle complexe intégrant possiblement à la fois le déterminisme génétique mais aussi les facteurs micro-environnementaux (impliqués dans la régulation de l’expression des miRNA). 
Notre ambition est de confirmer cette hypothèse de mécanisme microARN/polymorphismes, sur une nouvelle cible TERT en alliant des approches de bioinformatique, de biologie cellulaire et de biologie moléculaire in vitro et ex vivo. 
Au niveau génétique (Objectif 1), l'objectif de ce projet est d'analyser in vitro les conséquences de la perte de régulation des microARN par des polymorphismes synonymes sur un gène dont l’association avec le cancer est manifeste. 
En parallèle, dans le domaine de l’oncogenèse, les conséquences du polymorphisme synonyme sur l'expression des gènes seront étudiées ex vivo sur des cancers du poumon et le mélanome, et combinées avec le tableau clinique des patients (Objectif 2). Notre projet a pour but à terme de proposer des biomarqueurs potentiels et une approche thérapeutique personnalisée grâce à la combinaison du génotype et de l'expression tissulaire spécifique de microARN. 
Pour répondre à ces objectifs ambitieux, nous avons développé des approches complémentaires alliant des données bioinformatiques, des expériences in vitro et des validations ex vivo sur biopsies humaines. Pour se faire, ce projet sera réalisé par une équipe composée par un jeune chercheur INSERM (Investigateur principal), un post-doctorant, un technicien INSERM et un étudiant en thèse, tous à plein temps, ainsi que des chercheurs, des praticiens hospitaliers et des techniciens hospitaliers qui apporteront une aide scientifique et technique.
Projet ANR-15-CE07-0014 – CaFeCAT : CaFeO2.5 et matériaux analogues de Brownmillerites pour le remplacement des oxydes à base de cérine pour la catalyse hétérogène
Programme : Chimie Durable, produits, procédés associés (DS0304) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Madame Helena Kaper (Centre National de la Recherche Scientifique délégation Provence et Corse)
Partenaires : Laboratoire public; Laboratoire public; Entreprise autre que TPE ou PME
Montant : 450441.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 42 mois
Résumé : Le projet est consacré à la recherche fondamentale pour le développement de systèmes catalytiques pour la purification de l’air. Dans le contexte de remplacement des matériaux stratégiques comme le cérium, nous nous concentrons sur des éléments plus disponibles comme Ca, Fe, Mn, Sr, Cu , en gardant en mémoire les mécanismes qui gouvernent l'activité catalytique de cérium. Pour cela, nous avons choisi les conducteurs ioniques d'oxygène de la famille Brownmillerite CaFeO2.5, car il a été montré que la dynamique des ions d'oxygène impact l'activité catalytique. 
Pour les catalyseurs, nous essayerons de réaliser (i) - un haut degré de dispersion du métal noble, (ii) - une haute mobilité d'oxygène aux températures modérées (par exemple en introduisant des défauts) et (iii) - une haute superficie. 
Dans le projet on caractérise des matériaux en utilisant les grandes installations pour l'analyse de la structure, y compris les réactions d’échange isotopique pour la mobilité des ions oxygène.
Projet ANR-11-BS09-0040 – EPIC : Plasmas fortement électronégatifs pour l’accélération innovante des ions
Programme : Blanc - SIMI 9 - Sciences de l'ingéniérie, matériaux, procédés, énergie (Blanc SIMI 9) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Madame AANESLAND Ane (CNRS DR Ile de France Secteur Ouest et Nord)
Partenaires : Institut pour Combustion, l'Aérothermique, la Réactivité et l'Environnement; Laboratoire Paul Painlevé; Laboratoire Plasma et Conversion d'Énergie
Montant : 400000.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Pour de nombreuses applications dans le domaine des plasmas froids, il est préférable d’avoir peu d’électrons résiduels, voir aucun. En microélectronique par exemple, le procédé de gravure peut-être perturbé par des phénomènes de charges de surface liés aux électrons chauds du plasma. Les électrons nécessaires à la neutralisation du faisceau d’ions d’un propulseur à plasma sont en partie à l’origine de la charge du satellite qui peut conduire à des dégâts irréversibles. Les plasmas « sans électron », c'est-à-dire composés uniquement d’ions positifs et négatifs, sont communément appelés plasmas ion-ion. De tels plasmas peuvent être créés soit dans la post-décharge d’un plasma électronégatif (qui contient certes de nombreux ions négatifs mais reste riche en électrons) soit par un filtrage magnétique continu des électrons. Dans ce dernier cas, une ségrégation se produit au sein du plasma entre le cœur électronégatif et la région magnétisée où existe le plasma ion-ion. Une fois créés, les ions de différente polarité peuvent être extraits du plasma et accélérés vers un substrat ou bien dans le vide, pour graver un motif ou générer une poussée.
L’objectif du projet EPIC est d’étudier les mécanismes fondamentaux mis en jeu dans les processus physiques suivants :
(i) formation d’un plasma ion-ion par filtrage magnétique, 
(ii) extraction et accélération des ions vers un substrat ou une électrode, 
(iii) extraction et accélération au moyen d’un système à grilles pour la création d’un faisceau. 
Ce projet implique trois équipes dont les compétences sont parfaitement complémentaires. Les travaux seront à la fois expérimentaux, théoriques et numériques.
Projet ANR-10-CHEX-0003 – BARQ : Repousser les Limites: Abstraction, Raffinement, et Bornes de Qualité
Programme : Chaires d’excellence (CHEX) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur SCHERRER Bruno (INRIA CENTRE NANCY GRAND EST)
Partenaires : Inria Centre Nancy - Grand Est; Inria Centre Nancy - Grand Est; Inria Centre Nancy - Grand Est
Montant : 288000.0 euros
Durée : 42 mois
Résumé : Les problèmes de recherche combinatoire sont présents dans de nombreux
domaines de l'informatique. Une technique commune pour les traiter est
d'exploiter des minorants: des estimations optimistes du coût de la
transformation d'un état en une solution. Mais comment calculer de
telles estimations ? Le projet BARQ qui est proposé attaque cette
question d'une façon très interdisciplinaire incluant la planification
classique, la planification probabiliste, l'ordonnancement, et le
model checking. A notre connaissance, BARQ est le premier projet
abordant tous ces domaines à l'unison. Nous utilisons l'abstraction
pour obtenir des minorants, et nous utilisons le raffinement
d'abstraction pour améliorer incrémentalement ces minorants. Combiné
avec des méthodes de majoration, cela fournit des algorithmes anytimes
très pratiques qui garantissent des bornes sur la qualité de la
solution courante.
La technique principale sur laquelle nous nous focalisons est
l'abstraction d'état, laquelle impose une relation d'équivalence sur
les états. Nous considérons un cadre récent, l'agrégation d'états
emboîtée (NSA pour "nested state aggregation"), pour la construction
de telles abstractions. NSA incorpore une astuce de calcul permettant
une conception affinée de la relation d'équivalence en sélectionnant
des paires d'états à agréger en un seul. Il a été démontré en
planification classique que, en théorie, cette approche domine la
plupart des techniques d'abstraction connues. Ce pouvoir dépend
toutefois de la sélection parfaite des états à agréger. On ne sait à
peu près rien de la façon de faire cette sélection. BARQ comble cette
lacune. Dans ce but, nous nous appuyons sur la recherche en
planification probabiliste et en model checking, lesquels sont
concernés par l'abstraction d'état et le raffinement
d'abstraction. Ces traditions ont abordé des questions similaires,
mais pour des raisons très différentes forçant l'abstraction à
préserver l'ensemble exact de solutions. Notre recherche relâche cette
contrainte pour obtenir des méthodes de minoration à la place,
laissant ainsi apparaître plusieurs nouvelles connexions entre les
domaines abordés.  
BARQ est principalement motivé par des questions de recherche
fondamentales. Toutefois, chacun des quatre domaines abordés a une
traduction d'applications pratiques sur lesquelles nous nous
appuierons pour l'évaluation finale des techniques développées.
Projet ANR-14-CE25-0007 – RAPIDO : Raisonner et Programmer avec des Données Infinies
Programme : Fondements du numérique (DS0705) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Alexis Saurin (Preuves, Programmes, Systèmes (PPS UMR 7126))
Partenaires : Laboratoire public
Montant : 398996.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : Rapido a pour objectif de rassembler de jeunes chercheurs de manière à étudier la possibilité d'appliquer des méthodes issues de la théorie de la démonstration pour raisonner et programmer avec des structures infinies. 
Le but du projet est, d'un point de vue fondamental :
- de développer des systèmes logiques à même de capturer des preuves infinies (systèmes de preuves avec plus petits et plus grands points fixes mais également systèmes de preuves infinitaires), 
- de concevoir et d'étudier des langages de programmation pour la manipulation de données infinies aussi bien d'un point de vue sémantique que syntaxique. 
En outre, l'ambition du projet est d'appliquer les résultats fondamentaux qui auront été obtenus lors des recherches ci-dessus en vue : 
(i) de développer des outils logiciels dédiés au raisonnement sur les programmes calculant sur les données infinis (comme les streams ou plus généralement les programmes coinductifs), et 
(ii) d'étudier les propriétés des automates sur les mots et les arbres infinis d'un point de vue preuve-théorique, avec un œil vers les problèmes de model-checking.
Projet ANR-06-NANO-0040 – MIDISPPI : MicroDIspositif de test en Silicium nanoPoreux pour le Packaging Intelligent
Programme : Programme National en Nanosciences et Nanotechnologies (PNANO) (PNANO) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Institut polytechnique de Bordeaux; Divers privé; Entreprise autre que TPE ou PME; Université de Montpellier
Montant : 777407.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : L’intégration des Micro-NanoElectro-Mechanical Systems (MEMS ou NEMS) dans les systèmes électroniques devient incontournable du fait de leur maturité et de leur coût de plus en plus attractif. Cependant les opérations d’assemblage de ces composants sont très critiques car ceux-ci sont sensibles aux conditions environnementales comme les variations du taux d’humidité par exemple. Ainsi pour beaucoup d’applications le MEMS doit être maintenu dans un environnement sous vide. Ce type de conditionnement n’est pas facile à réaliser et peu de techniques de contrôle de l’herméticité sont développées.Pour les produits destinés au marché grand public (forts volumes) le test optique n'est pas envisageable à cause des contraintes économiques. La seule alternative est de réaliser des tests électriques qui nécessitent cependant de prévoir une configuration dédiée. Suite à ce constat les partenaires académiques IEF (Orsay) IXL (Bordeaux) le LIRMM (Montpellier) et la société Philips Semiconductors ont décidé de regrouper leurs forces et compétences pour étudier le packaging intelligent de MEMS. Le but ultime est d’obtenir une méthode de test la plus générique possible tout en restant compatible avec les procédés industriels. Cette méthode aidera à atteindre un test final à «zéro défaut» exigé dans les marchés de l’automobile et des applications médicales.