Projet ANR-14-CE18-0002 – TriPTIC : Trichogramma pour la protection des cultures: Pangénomique, Traits d'histoire de vIe et Capacités d'établissement
Programme : Productions durables (DS0501) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Jean-Yves Rasplus (UMR 1062 Centre de Biologie et de Gestion des Populations)
Partenaires : Laboratoire public; Institut Sophia Agrobiotech; Biométrie et Biologie Évolutive
Montant : 599854.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : La France a adopté le plan Ecophyto 2018 qui recommande de développer la lutte biologique pour remplacer les pesticides. Une lutte biologique sûre et efficace contre les ravageurs nécessite de 1) caractériser génétiquement et phénotypiquement les souches d’ennemis naturels relâchés ; 2) connaitre leurs traits d’histoire de vie, stratégies d’exploitation d’hôte et dynamiques populationnelles ; 3) comprendre les processus contrôlant leur performance après lâcher. Or, ces études ne sont jamais conduites, ce qui limite notre capacité à mettre en place des programmes efficaces. Lors de ce projet, grâce à nos compétences complémentaires, nous nous attaquerons à ces sujets en abordant des questions clefs en évolution : spéciation, hybridation, adaptation, spécialisation et dynamiques d’interaction.
Nous étudierons quatre complexes d’espèces de Trichogramma (Hymenoptera), un des groupes les plus étudiés et commercialisés pour contrôler des ravageurs d’importance majeure en Europe. Ces parasitoïdes sont fréquemment relâchés sans caractérisation taxonomique, génétique, phénotypique ou comportementale ni évaluation des risques. Cette situation doit être améliorée pour répondre au décret 2012-140 adopté par la France stipulant que les organismes de lutte doivent être caractérisés avant lâcher pour assurer une traçabilité et éviter des effets collatéraux. Les complexes d’espèces de Trichogrammes sont mal connus et renferment des entités séparées par des barrières reproductives poreuses. Les souches montrent un polymorphisme de traits intra et inter populationnel influencé par l’environnement. Certains traits clefs pour la lutte biologique n’ont que peu été documentés (e.g. mouvement et capacité de dispersion). Certains symbiontes sont connus pour influer les fitness individuelles, l’isolement reproducteur et la spécialisation mais peu de données sont disponibles sur les communautés associées aux Trichogrammes. Enfin on connaît très peu l’histoire évolutive des Trichogrammes.
Grâce à des méthodes innovantes et puissantes nous proposons:
1)	de caractériser les limites d’espèces, flux génétiques et potentiels évolutifs au sein des complexes ainsi que de phénotyper leurs traits d’histoire de vie. Nous caractériserons les souches que nous échantillonnerons sur le terrain et celles commercialisées, grâce à des méthodes de génotypage, phénotypage et de screening de symbiontes haut-débit. Nous développerons des méthodes encore rarement utilisées pour la caractérisation génétique (séquençage RAD) et phénotypique (éthomique haut débit),
2)	d’étudier l’impact à l’échelle populationnelle des traits caractérisés individuellement,
3)	d’analyser les processus évolutifs en jeu lorsque des populations sont introduites dans un nouvel habitat, seules ou en combinaisons.
Comprendre les pressions sélectives en jeu (e.g. prévalence du conservatisme de niche), et développer nos connaissances sur les phénotypes, le potentiel d’hybridation des souches relâchées entre elles et avec la faune locale ainsi que l’influence de la compétition et de la facilitation entre espèces devrait nous permettre de i) sélectionner les souches les plus appropriées ii) maximiser nos chances d’introduire sans risque et durablement une souche iii) mieux anticiper son impact et modifier notre stratégie de lutte si besoin.
La lutte biologique implique souvent des partenariats public-privé essentiels car i) les souches sont produites et vendues par des firmes privées ii) l’identification de nouvelles souches candidates nécessitent des compétences scientifiques académiques. C’est pourquoi nous avons inclus un work package dédié à la maintenance des souches caractérisées et au transfert de connaissances vers les porteurs d’intérêt (écologistes, agriculteurs, firmes) via une base de données accessible en ligne. Ce groupe de travail sera organisé autour du Centre de Ressource Biologique récemment monté à l’UMR ISA et dédié à la lutte biologique utilisant des macro-organismes.