Projet ANR-13-BSV8-0001 – AluACA : Les ARN AluACA, une nouvelle classe d’ARN non codants à boîte H/ACA humains
Programme : Blanc - SVSE 8 - Biochimie, biologie moléculaire et structurale (Blanc SVSE 8) 2013
Année de financement : 2013
Coordinateur du projet : Monsieur Tamas KISS (Laboratoire de Biologie Moléculaire Eucaryote du CNRS)
Partenaires : Laboratoire public
Montant : 194930.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 42 mois
Résumé : Les projets de séquençage des génomes eucaryotes ont mené à une découverte surprenante : alors que la taille des génomes a augmenté très rapidement au cours de l’évolution, le nombre de gènes codant des protéines n’a subi qu’une croissance modérée. Cette découverte a abouti à la conclusion que le génome des eucaryotes supérieurs présente, en plus des gènes codant les protéines, une autre source d’information génétique. Les techniques de séquençage à haut-débit ont ensuite démontré que les génomes eucaryotes codent pour un nombre incroyable d’ARN ne codant pas pour des protéines (également appelés ARN non-codants ou ARNnc). La plupart de ces ARNnc fonctionne en tant qu’ARN régulateurs dans tous les aspects de l’expression génique, contribuant ainsi à la complexité du génome des organismes eucaryotes. Les cellules eucaryotes expriment un très grand nombre d’ARN non codant (ARNnc) qui fonctionnent en tant qu’ARN régulateurs dans tous les aspects de l’expression génique, contribuant ainsi à la complexité du génome des organismes eucaryotes. Les ARN à boîte H/ACA représentent un groupe d’ARNnc abondants, conservés au cours de l’évolution et ayant des fonctions  cellulaires diverses. Les ARN H/ACA sont notamment responsables de la pseudouridylation de diverses classes d’ARN cellulaires, du clivage nucléolytique des précurseurs des ARNr, de la synthèse de l’ADN télomérique, et certains d’entre eux servent également de précurseurs de microARN. Tous les ARN H/ACA s’associent avec quatre protéines cœur, la dyskérine, Nhp2, Nop10 et Gar1, et ils s’accumulent soit dans le nucléole, soit dans les corps de Cajal. Les ARN H/ACA spécifiques des corps de Cajal s’associent également avec la protéine Wdr79. Dans notre laboratoire, la caractérisation récente des ARN humains associés à Wdr79 a permis l’identification de plus de 400 nouveaux ARN H/ACA putatifs. En plus de certains ARN H/ACA canoniques, nous avons identifié 348 nouveaux ARN H/ACA humains codés par des éléments répétitifs Alu localisés dans les introns de gènes codant des protéines. Nous avons démontré que ces ARN H/ACA dérivant de séquences Alu, appelés ARN AluACA, sont synthétisés et maturés à partir des séquences Alu introniques de façon dépendante des boîtes H et ACA. Les RNP AluACA matures s’associent avec les quatre protéines cœur et Wdr79 mais, de façon inattendue, co-localisent avec les petits ARN nucléaires de la machinerie d’épissage dans le nucléoplasme. Les éléments Alu sont les éléments répétés les plus abondants dans le génome humain, mais leurs fonctions restent majoritairement inconnues. Dérivants du gène codant l’ARN 7SL, les éléments Alu ont été propagés par retro-transposition dans les génomes des primates. Les ARN AluACA nouvellement découverts représentent donc une nouvelle sous-classe abondante d’ARN H/ACA humains- ou primates-spécifiques. Je propose un programme de recherche visant à disséquer la biogénèse, le traffic et la fonction cellulaire de ce fascinant groupe de RNP humaines.