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Projet ANR-07-TECS-0007 – ID2U : Instrument Dextre robotisé à retour d’effort et Usage Unique, pour la chirurgie mini-invasive
Programme : Technologies pour la santé (TecSan) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : ENDOCONTROL (ENDOCONTROL)
Partenaires : Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives; PME; MUTUALITE FONCTION PUBLIQUE SERVICES; LARDOUX HERVE; Université Pierre et Marie Curie
Montant : 578072.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : L'apparition des systèmes robotisés a permis d'élargir le champ des indications de la chirurgie mini invasive à des gestes de plus en plus complexes. Mais les solutions robotiques actuels sont complexes et onéreuses. Elles ont des applications encore limitées, posent des problèmes d'asepsie et ne fournissent pas de retour d'effort à l'opérateur.
L'objectif de ce projet de recherche industrielle d'une durée de 36 mois est de développer de nouveaux instruments robotisés dextres, à retour d’effort et à usage unique pour la CMAO (Chirurgie Mini Invasive Assistée par Ordinateur). Ces instruments se doivent d'être plus polyvalents, plus faciles d'utilisation et économiquement accessibles à un plus grand nombre de centres que les systèmes existants.
L’originalité de l’approche est de proposer une conception basée sur l’utilisation de structures monolithiques flexibles intelligentes, qui offrira la possibilité d’en faire des instruments miniaturisés et à usage unique (microfabrication et injection plastique). 
L’idée du système envisagé est en outre de maintenir le chirurgien dans le champ stérile, au plus proche du patient, par opposition aux solutions actuelles de téléchirurgie. L’actionnement piézoélectrique des structures monolithiques permettra de réaliser un système sans moteur électrique, et donc suffisamment compact pour se greffer sur un instrument de laparoscopie classique. Enfin le développement conjoint de capteurs d'effort intégrés à l'instrument et d'une interface haptique intelligente devraient permettre un retour d'effort précis à l'opérateur, impossible sur les systèmes mécaniques à câbles et poulies seuls disponibles aujourd'hui.
Le projet prévoit la livraison de deux démonstrateurs, le premier visant à vérifier la compatibilité des technologies choisies et prouver la faisabilité, et le second plus abouti qui sera testé in vivo par des chirurgiens spécialistes de la chirurgie mini invasive robotisée.
Projet ANR-06-BDIV-0011 – ECOMIC-RMQS : Microbio-géographie à l'échelle de la France par application d'outils moléculaires au réseau français de mesures de la qualité des sols
Programme : Biodiversité (BDIV) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Lionel RANJARD (INRA - CENTRE DE RECHERCHE DE DIJON)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 650720.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : Le projet ECOMIC-RMQS a pour objectif de mieux définir et comprendre les processus qui génèrent et maintiennent la biodiversité microbienne des sols, notamment par une meilleure estimation et caractérisation de la diversité « beta » de ces communautés (changement de composition de la communauté à l’échelle du paysage). Pour cela, il s’appuiera sur le RMQS (Réseau de Mesure de la Qualité des Sols) pour caractériser les communautés bactériennes indigènes de sols échantillonnés à une grande échelle spatiale. La densité et la diversité/structure génétique des communautés bactériennes seront caractérisées grâce à l’utilisation d’outils moléculaires (PCR Quantitative, empreintes moléculaires, puces à ADN) directement sur l’ADN extrait des sols du RMQS. Ce réseau comprend 2200 sols échantillonnés et couvre tout le territoire Français. Pour chacun des sols, les caractéristiques physico-chimiques, le spectre proche infra-rouge de la matière organique, les paramètres climatiques environnants, les compositions floristiques, l’utilisation des terres, les pratiques agricoles et évènements antérieurs seront répertoriés. Des outils statistiques seront développés pour confronter les données microbiologiques, pédo-climatiques et les distances géographiques afin i) de caractériser les profils bio-géographiques de la diversité bactérienne des sols de France, ii) d’évaluer la contribution relative des paramètres pédo-climatiques et d’utilisation des terres sur la diversité des communautés bactériennes indigènes, iii) de calibrer l’information spectrale avec les paramètres chimiques et bactériens et iv) d’identifier des bio-indicateurs bactériens d’environnements et d’activités anthropiques spécifiques. En second lieu des expériences seront menées en conditions contrôlées sur les sols du RMQS afin de vérifier le concept de Beïjerinck « everything is everywhere and the environment selects ». Ces travaux consisteront à extraire les communautés bactériennes de différents sols et à les réinoculer et suivre leur évolution (en termes de densité, de diversité et de composition) dans des sols du RMQS préalablement stérilisés et choisis pour leur paramètres physico-chimiques structurants pour la diversité bactérienne (démontré dans l’étape précédente). Cette approche plus fondamentale nous permettra de vérifier/confirmer l’importance relative des paramètres pédo-climatiques et de la composition initiale des communautés bactériennes sur l’évolution de la diversité microbienne dans un sol.
Projet ANR-07-PNRA-0024 – QUANT'HACCP : L’appréciation quantitative des risques microbiologiques au service des mesures de maîtrise des dangers afin de respecter des objectifs de sécurité des aliments
Programme : Alimentation et nutrition humaine (PNRA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Marie CORNU (AGENCE NATIONALE DE SECURITE SANITAIRE DE L'ALIMENTATION, DE L'ENVIRONNEMENT ET DU TRAVAIL (ANSES))
Partenaires : Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail; Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture; Centre National Interprofessionnel de l'Économie Laitière; École nationale vétérinaire d'Alfort; Institut du Porc; Institut des sciences et industries du vivant et de l'environnement; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 486145.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 48 mois
Résumé : Il faut faire évoluer l'HACCP, pratique actuellement plutôt empirique et focalisée sur les dangers, vers une démarche quantitative basée sur la modélisation fondée sur les risques pour la santé publique, et utilisable par les exploitants. Ce projet vise à utiliser la méthodologie de l’appréciation quantitative des risques (AQR) pour optimiser des mesures de maîtrise des dangers microbiologiques. L’apport du projet sera de s’appuyer sur les objectifs de sécurité des aliments et les objectifs de performance, concepts nouveaux introduits par le Codex alimentarius dont les conséquences sont à peine dessinées aujourd’hui, sauf pour des cas simplistes. Une approche stochastique bayésienne sera adoptée. Deux procédés de fabrication seront modélisés en prenant en compte les incertitudes et les variabilités, ainsi que les problèmes liés à l’échantillonnage. Une démarche générique en sera déduite, elle sera validée en l’appliquant à des appréciations quantitatives des risques en voie d’achèvement pour trois autres procédés de fabrication.
Projet ANR-07-VULN-0007 – MISEEVA : Marine Inundation hazard exposure modelling and Social, Economic and Environmental Vulnerability Assessment in regard to global changes.
Programme : Vulnérabilité : climat et milieux (Vulnérabilité) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : BUREAU DE RECHERCHES GEOLOGIQUES ET MINIERES - BRGM (BUREAU DE RECHERCHES GEOLOGIQUES ET MINIERES - BRGM)
Partenaires : ARTELIA EAU & ENVIRONNEMENT; Bureau de recherches géologiques et minières; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; École nationale des ponts et chaussées; Entreprise autre que TPE ou PME; Université de Bordeaux
Montant : 711182.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Il est prévu que les changements globaux à venir (anthropiques et climatiques) entrainent une nette augmentation des risques côtiers (GIECC, 2007).  Le but de ce projet est d'étudier, à court et moyen terme (2020, 2050) la vulnérabilité côtière comme un concept transdisciplinaire (Drivers-pressure-state-impact-response), où l'évaluation de l'exposition à l'aléa submersion marine et celle de la vulnérabilité sociale, économique et environnementale se font dans une démarche commune et au regard de la spécificité de l'aléa.  Cet aléa sera défini au travers d'une plate forme de modélisation, en intégrant ses différentes composantes (élévation du niveau de la mer, marée de tempête, vagues, set-up, run- up,….), pour définir les seuils d'inondation et l'étendue spatiale et temporelle de celle-ci, pondéré par l'appréciation de la résilience physique à cet aléa.  A partir de cet aléa, la vulnérabilité à la submersion marine sera évaluée en considérant les dysfonctionnements induits, la typologie et la valeur des enjeux, et l'évaluation de fonctions de dommages pour chacun de ces types d'enjeux. L'impact sociétal et la capacité d'adaptation socio-économique seront également appréhendés. L'aléa et la vulnérabilité induite seront quantifiés autant que possible, en associant une appréciation des incertitudes et des indicateurs seront définis. MISEEVA sera réalisé aux échelles régionales et locales, afin de répondre aux objectifs de gestion intégrée du trait de côte.
Projet ANR-12-ASTR-0014 – AUCTOPUSS : Système photonique optimisé ultra-compact pour l’échantillonnage ultime de signaux micro-ondes
Programme : Accompagnement spécifique des travaux de recherches et d’innovation Défense (ASTRID) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur SYLVAIN COMBRIE (Thales Research & Technology - France)
Partenaires : Institut d'Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie; THALES; Laboratoire d'Électronique et d'Electromagnétisme
Montant : 296351.0 euros
Durée : 30 mois
Résumé : Le projet AUCTOPUSS propose d’étudier et de réaliser une fonction de numérisation de signaux à haute dynamique et à très large bande sur porteuses hyperfréquences en optimisant la fonction d’échantillonnage basée sur un photo-interrupteur à 1,5µm réalisé par utilisation de matériaux semiconducteurs nanostructurés exploitant l’absorption à deux photons. Ce projet de recherche est motivé par les résultats très prometteurs obtenus, en particulier, lors de l’étude de recherche exploratoire financée dans le cadre du Programme REI de la DGA/MRIS sur un "nano photo-interrupteur". Ces résultats ont mis en évidence que cette solution innovante ouvrait la voie aux approches optiques pour l’échantillonnage de signaux hyperfréquences ultra-large bande. Les avantages de cette technologie se déclinent aussi bien au niveau de l’extrême simplicité du dispositif photo-interrupteur que des performances de cette solution qui se situe, d’ores et déjà, très au-delà des approches électroniques conventionnelles.
Afin d’atteindre les performances de dynamique requise pour les applications civiles et militaires, en particulier dynamique hors parasites SFDR (Spurious Free Dynamic Range), et de rapport signal à bruit (SNR : Signal to Noise Ratio) ou de nombre de bits effectifs (ENOB : Effective Number Of Bits), une phase d’optimisation du commutateur est absolument nécessaire.
L’objectif du projet AUCTOPUSS est d’optimiser les performances des échantillonneurs de signaux hyperfréquence à très large bande passante, en se focalisant sur la fonction de photo-commutateur. La rupture technologique proposée dans AUCTOPUSS s’appuie sur l’utilisation de matériau semi-conducteur nanostructuré. Cette nouvelle approche permettra de disposer de durée de vie des porteurs compatible avec la fonction d’échantillonnage visée (soit quelques ps) et d’intégrer à terme la source optique impulsionnelle à très faible gigue (jitter) dans la fenêtre de 1550nm (fenêtre des télécommunications optiques) par utilisation de l’effet à deux photons. Pour optimiser un tel commutateur, il a été montré dans une étude précédente qu’il était nécessaire d’améliorer simultanément, toutes choses égales par ailleurs, les pertes d’insertion et la durée de vie des porteurs du semiconducteur utilisé pour la commutation en regard de la fréquence de répétition des impulsions optiques.
Projet ANR-06-PSPV-0001 – ARCHELIOS : Elaboration d’une base de données et réalisation d’une interface conviviale adaptée aux bureaux d’études, aux formateurs  et aux architectes pour le progiciel de dimensionnement solaire « ARCHELIOS ».
Programme : Programme National de Recherche sur le Solaire Photovoltaïque (PSPV) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CYTHELIA (CYTHELIA)
Partenaires : TPE; Université de Savoie
Montant : 62000.0 euros
Durée : 12 mois
Résumé : « ARCHELIOS » est un progiciel de gisement solaire et de dimensionnement technico-économique pour tout système solaire bio-climatique, thermique ou photovoltaïque.  
Il présente des caractéristiques qui n’existent pas dans les logiciels de dimensionnement solaire que l’on trouve actuellement sur le marché. En particulier, dans sa partie photovoltaïque, il peut travailler suivant trois modes : système connecté au réseau, système autonome sur batteries, système connecté et sécurisé sur batteries, et il couvre toute la chaîne de calcul : de la physique des données météo jusqu’au calcul économique du coût global actualisé et du temps de retour du système installé.
Le projet sera enrichi d’une base de données conséquente et d’une interface qui permettra de le rendre facilement utilisable par des organismes de recherche, des bureaux d’étude, des architectes ou des formateurs.
Projet ANR-14-CE05-0007 – UNESCOS : Etats electroniques non conventionnels et ordres de charge versus suparconductivité
Programme : Gestion des variabilités spatio-temporelles des énergies (DS0204) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Yvan SIDIS (Laboratoire Léon Brillouin)
Partenaires : Institut de Physique Théorique; Laboratoire public; Laboratoire National des Champs Magnétiques Intenses
Montant : 233978.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 48 mois
Résumé : Le projet UNESCOS propose l’exploration de nouveaux horizons en physique de la matière condensée basées sur l’interdépendance entre nouveaux états de la matière et supraconductivité dans des systèmes d’électrons fortement corrélés. Comprendre ce phénomène est une étape fondamentale vers la conception et l’élaboration de nouveaux matériaux supraconducteurs à très haute température, offrant de nouvelles solutions technologiques pour la production, le stockage et le transport de l’électricité. En s’attaquant au problème fondamentale de la mystérieuse phase dite de « pseudogap » à partir de laquelle la supraconductivité à haute température se développe dans des oxydes de cuivre supraconducteurs, le projet UNESCOS s’attache à l’étude d’instabilités associées à des ondes de densité de charges non conventionnelles et à l’apparition de supraconductivité pilotée par des phénomènes critiques quantiques. 
Le projet UNESCOS propose un programme recherche impliquant des physiciens du LNCMI, du LLB et de l’IPht, dont les travaux sur les propriétés électroniques anormales des oxydes de cuivre supraconducteurs ont reçu une importante visibilité ces dernières années. Ces travaux ont révélé des phénomènes de reconstruction de surface de fermi et stabilisation d’un ordre de charge sous champ magnétique, l’existence d’un nouveau type d’ordre magnétique associé à la phase de pseudo-gap, la possibilité de condenser de nouvelles phases électroniques au voisinage d’un point critique quantique antiferromagnétique. Pris séparément, ces travaux favorisent différentes images physiques, apparemment contradictoires. Le projet UNESCOS propose d’établir des liens entre des phénomènes supposés distincts ou antagonistes et promouvoir l’émergence d’un cadre théorique unifié, sur la base d’une théorie du pseudogap impliquant l’existence d’un paramètre d’ordre composite mélangeant ordre de charge quadrupolaire et supraconductivité de symétrie d.
Cette théorie, nouvelle, contrôlée et prédictive, sera développée, afin d’expliquer ou prédire de nouvelles observations expérimentales qui seront réalisées dans le cadre du projet UNESCOS. Les travaux théoriques seront réalisés en relation étroite avec des mesures thermodynamiques (vitesse du son), de diffraction et de spectroscopie (neutrons et rayons X), fournissant des informations précises relatives à la nature et la symétrie des états électroniques anormaux observés. Les expériences proposées requièrent des technologies disponibles uniquement dans de grandes infrastructures de recherche, telles que les sources de neutrons, les synchrotrons et les laboratoires de champ magnétique intense.
Projet ANR-14-CE10-0011 – GuidedMethylation : Methylation du génome germinal guide par de petits ARNs
Programme : Une nouvelle représentation du vivant (DS0401) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Ramesh PILLAI (European Molecular Biology Laboratory)
Partenaires : Laboratoire public; Institut national de la santé et de la recherche médicale
Montant : 329916.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 48 mois
Résumé : Les petits ARN servent de guides pour des machineries de “silencing” qui agissent au niveau post-transcriptionnel ou transcriptionnel, dans la plupart des organismes y compris les virus, les plantes et les animaux. Les lignées germinales des animaux expriment une classe spéciale de petits ARN appelés ARN Piwi-interacting (piRNAs) qui sont reconnus comme des défenseurs du génome en raison de leur rôle dans la réduction au silence d’éléments transposables endogènes. Des mutations affectant la production ou la fonction de ces ARN conduisent à l'infertilité. Chez les mammifères, il est admis que les piRNAs guident la méthylation de l'ADN des transposons cibles, mais la preuve directe de ce rôle des piRNA manque. Ce projet de recherche permettra d'identifier et de caractériser le machineries moléculaires qui produisent les piARN nucléaires, et de révéler l'identité du complexe protéique qui est guidé par ces piRNAs. Ce projet vise également à fournir une preuve directe et non ambigue du rôle des piRNAs dans le "silencing" épigénétique des transposons dans le génome des mammifères. En outre, il explorera en détail le caractère transgénérationnel de ce "silencing".
Projet ANR-15-CE40-0016 – RaCAF : Dépasser les frontières de l'aléatoire et du calculable
Programme : Fondements du numérique (DS0704) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Alexander Shen (Laboratoire d'Informatique Robotique et Microélectronique de Montpellier)
Montant : 402005.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 48 mois
Résumé : Les suites aléatoires sont cruciales pour l'informatique moderne. Utilisées pour la sécurité et la cryptographie, elles sont aussi au cœur de l'algorithmique randomisée. En pratique, on utilise des suites pseudo-aléatoires générées par ordinateur; ces suites pseudo-aléatoires ont des régularités plus ou moins gênantes suivant l'utilisation qu'on en fait. La compréhension de l'impact de leurs défauts nécessite une étude fine des liens entre calcul et aléatoire. Ces liens sont des propriétés `à l'infini' qui nous incitent à étudier des modèles de calcul étendus (sur le temps de calcul ou sur la nature des éléments de base). Depuis quelques années, les physiciens fabriquent des générateurs de nombres aléatoires `parfaits' à partir de phénomènes quantiques, combinés à des traitements algorithmiques secrets (dont la faisabilité parait douteuse). Nous projetons d'analyser ces suites en utilisant des méthodes algorithmiques évoluées issues de nos travaux théoriques ainsi que de certaines constructions d'algorithmique randomisée.
Projet ANR-15-JAMR-0003 – Combinatorials : Novel drugs and drug combinations against bacterial growth, survival and persistence from high-throughput screening to mechanism of action
Programme : Santé publique	 (JPIAMR) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Athanasios Typas (European Molecular Biology Laboratory, Genome Biology Unit)
Montant : 206496.0 euros
Date de début : 2016
Durée : 36 mois
Résumé : Control of bacterial infections is threatened by the rapid emergence of drug resistance, drug tolerance that mitigates antimicrobial efficacy, and the lack of new antibiotics in recent years. Combination treatments and/or re-purposing of known drugs can provide a cost- and time-efficient solution. We propose a comprehensive and powerful strategy to repurpose or improve FDA-approved drugs including neglected/disused (ND) antibiotics, and identify combinations to re-sensitize resistant/tolerant bacteria. Using high-throughput screening (HTS) we will test thousands of pairwise drug combinations on bacterial growth, viability and bacterial persistence in three clinically relevant pathogens: uropathogenic Escherichia coli (UPEC) Staphylococcus aureus (Sa) and Streptococcus pneumoniae (Sp). Our scope thus spans the Gram-negative/-positive divide, and targets several bacterial states implicated in both acute and chronic infections, including pneumonia, pyelonephritis, bacteremia and endocarditis. To optimize antimicrobial treatment, we will use state-of-the-art and further advance translational pharmacokinetic (PK)/ pharmacodynamic (PD) modeling. This will prioritize and validate lead combinations, which will be tested in several toxicity and animal models. In vivo PK/PD modeling will be also performed for our top leading combinations. Together, these approaches will provide invaluable pre-clinical data that will inform future drug development. In parallel, we will systematically probe for modes of action of our top 100 synergistic drug combinations using HT reverse genetic screens to provide the framework for subsequent in-depth mechanistic studies targeting processes such as the role of redox and iron homeostasis, membrane permeability/stability, drug efflux/influx and bacterial metabolism and stress responses in antimicrobial activity. We have assembled a strong team with extensive expertise in the cellular processes directly related to antimicrobial activity. For this project, we will combine HT chemical and genetic screening, large-scale data analysis, mechanistic biology, PK/PD modelling and infection models to discover and exploit antimicrobial combination therapy. The breadth and scope of our ambitious strategy will undoubtedly significantly advance the quest for novel treatment strategies against bacterial infections.