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Projet ANR-08-JCJC-0090 – ACTOGREEN : Activation de l'oxygène moléculaire pour la synthèse propre de produits fonctionnels oxygénés
Programme : Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs (JCJC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE RHONE-AUVERGNE (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE RHONE-AUVERGNE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 172120.0 euros
Durée : 36 mois
Résumé : Les molécules oxygénées sont des intermédiaires de base de la chimie fine (produits pharmaceutiques, cosmétiques…). Cependant, leur synthèse à partir d'hydrocarbures a actuellement un impact fortement négatif sur notre environnement car elle nécessite l'utilisation d'acides polluants ou de peroxydes instables. Des progrès vers le développement durable peuvent être envisagés en remplaçant ces procédés polluants par des transformations aérobies, c'est-à-dire qui utilisent l'oxygène de l'air comme oxydant principal. Le projet ACTOGREEN vise à acquérir les connaissances nécessaires à la mise au point de procédés propres d'oxydation sélective aérobie en phase liquide. Il s'intéresse aux potentiels uniques des nanostructures d'or supportées dans ce type de réactions et se focalisera sur l'élucidation des mécanismes d'activation de l'oxygène moléculaire dans les époxydations catalytiques de quelques alcènes substitués. La stratégie choisie consiste à élaborer des méthodes chimiques de synthèse pour la préparation de catalyseurs « sur-mesure » qui permettront l'étude des effets de support et de taille de particules dans les oxydations sélectives d'alcènes modèles en phases gazeuse et liquide. Ainsi, en combinant l'expérience de cinq jeunes chercheurs en synthèse de nanoparticules supportées, cinétique et réactions catalytiques, caractérisation (à la fois des particules métalliques / supports inorganiques et des intermédiaires réactionnels), réactivité de surface et modélisation moléculaire, l'équipe identifiera les intermédiaires de réaction en phase liquide, les sites d'adsorption et sites actifs sur le catalyseur solide et proposera en fin de projet, un mécanisme réactionnel. Ce travail sera effectué dans les locaux de l'Institut de recherche sur la catalyse et l'environnement de Lyon (IRCELYON) et de l'Unité pour la Catalyse et la Chimie du Solide de Lille (UCCS). Ceci garantit un large accès a de nombreuses techniques de caractérisation des solides, liquides et gaz (notamment tomographie, résonance paramagnétique électronique et EXAFS/XANES in-situ/operando). Un doctorant viendra renforcer l'équipe constituée de trois chargés de recherche (IRCELYON), d'un maître de conférence et d'un jeune professeur (UCCS), tout au long des 36 mois du projet.
Projet ANR-13-JS02-0009 – CABeRneT : Compréhension Automatique de Textes Biomédicaux pour la Recherche Translationnelle.
Programme : JCJC - SIMI 2 - Science informatique et applications (JCJC SIMI 2) 2013
Année de financement : 2013
Coordinateur du projet : Madame Aurelie NEVEOL (Laboratoire d'Informatique pour la Mécanique et les Sciences de l'Ingénieur)
Partenaires : Laboratoire d'Informatique pour la Mécanique et les Sciences de l'Ingénieur
Montant : 225853.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 48 mois
Résumé : Dans le domaine biomédical, les informations cliniques et institutionnelles sont contenues dans le texte de publications scientifiques ou de dossiers patients et ne sont pas directement accessibles à des fins de traitement automatique. Pour pallier cela, des méthodes de Traitement Automatique de Langue Naturelle (TALN) ont été développées avec succès afin d’extraire des informations pertinentes des textes libres et de les convertir en représentations formelles exploitables par l’homme et par la machine. Ce projet propose une analyse qui va au dela de la simple extraction de concepts isolés en permettant d’inclure le contexte d’occurrence ainsi que les relations entre concepts. Par ailleurs, nombre de travaux antérieurs sont limités à l’analyse de textes du domaine biomédical rédigés en anglais. Ce projet participera au nécessaire développement de méthodes permettant d’analyser les dossiers électroniques patient en français afin d’en extraire des représentations formelles compatibles avec celles disponibles pour l’anglais.
Ce projet de recherche se donne pour objectif de: 
1. Mettre à disposition de la communauté scientifique des ressources dans un domaine de spécialité (le domaine biomédical) en français 
2. Étudier l’adaptation en domaine de spécialité d’outils développés pour la langue générale
3. Appliquer ces outils à l’analyse automatique de dossiers électroniques patient et à la detection de liens entre données cliniques et littérature
Ce projet innovant permettra une analyse fine du contenu des textes du domaine biomedical, et en particuliers les textes cliniques. Il repose sur des principes issus de la linguistique et sera guide par des applications en medicine personnalisée. Une approche globale des problématiques de TAL sous l’angle de l’adaptation permettra d’assurer la portabilité des méthodes utilisées à d’autres applications dans le domaine biomédical.
Projet ANR-06-PNRA-0005 – COGINUT : COGINUT : Cognition, anti-oxydants, acides gras: approche interdisciplinaire du rôle de la nutrition dans le vieillissement du cerveau
Programme : Programme National de Recherches en Alimentation et Nutrition Humaine (PNRA) (PNRA) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Madame Pascale BARBERGER-GATEAU (UNIVERSITE BORDEAUX II (VICTOR SEGALEN))
Partenaires : CANOVAS FRANCOIS; Divers privé; Institut national de la recherche agronomique; Université de Bordeaux; Université de Bordeaux; Université de Bordeaux
Montant : 801417.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : L’objectif du projet COGINUT (Cognition, anti-Oxydants, acides Gras : approche Interdisciplinaire de le NUTrition dans le vieillissement cérébral) est d’étudier l’impact du statut nutritionnel en acides gras poly-insaturés (AGPI) et anti-oxydants sur le vieillissement cérébral (démence, déclin cognitif, troubles de l’humeur) chez les personnes âgées. Nous analyserons plus particulièrement l’effet des AGPI sur l’inflammation et la voie de signalisation des rétinoïdes. Notre programme de travail est organisé en cinq unités de projet autour de la cohorte épidémiologique des 3 Cités (3C).
L’étude 3C a inclus 9294 personnes âgées de 65 ans et plus à Bordeaux, Dijon et Montpellier en 1999-2000. Les participants ont été revus 2 et 4 ans plus tard, un nouveau suivi sera réalisé à 7 ans chez environ 3000 sujets de Bordeaux et Montpellier. A chaque visite les participants ont eu un bilan neuropsychologique complet et un examen médical avec recherche active des cas de démence. La symptomatologie dépressive a été évaluée. Les mêmes examens seront réalisés lors du suivi à 7 ans. Une biothèque a été constituée à l’inclusion. Un questionnaire de fréquence de consommation alimentaire a été administré à tous les participants et les sujets de Bordeaux ont eu en plus une enquête diététique. Une étude cas-témoin nichée dans la cohorte 3C sera réalisée à partir de la biothèque chez environ 600 sujets (200 déments incidents, 200 déclins cognitifs légers et 200 normaux appariés).  Nous y mesurerons le profil en acides gras des membranes des globules rouges, les anti-oxydants plasmatiques, les marqueurs du stress oxydant et de l’inflammation. La relation entre AGPI, inflammation, bien-être et troubles neuro-psychiatriques sera étudiée chez 300 sujets de Bordeaux. L’expression des récepteurs nucléaires RAR, RXR et PPAR sera mesurée par RT-PCR en temps réel dans les monocytes sanguins en fonction de la consommation d’AGPI, et nous analyserons sa relation avec les performances cognitives et le statut en acides gras dans un sous-échantillon de 80 sujet.
Nos résultats pourraient contribuer à retarder le vieillissement cérébral pathologique et à diminuer le fardeau socio-économique associé par des recommandations nutritionnelles, des produits agro-alimentaires adaptés ou des compléments nutritionnels.
Projet ANR-07-PNRA-0023 – OVONUTRIAL : Impact des procédés technologiques sur la valeur nutritionnelle et l'allergénicité des protéines d'œuf
Programme : Alimentation et nutrition humaine (PNRA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : Madame Françoise NAU (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail; Assistance Publique Hôpitaux de Paris; Centre Hospitalier Universitaire d'Angers; Centre Hospitalier Universitaire de Nantes; CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE TOULOUSE; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 476885.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Le projet vise à évaluer l'impact de quelques procédés industriels majeurs (pasteurisation, séchage, étuvage de poudres) sur la valeur nutritionnelle et le caractère antigénique des protéines d'œuf, en relation avec les modifications induites sur les structures protéiques. Le projet se caractérise ainsi par l'étude de matrices alimentaires complexes (oeuf entier) vis-à-vis de traitements technologiques réalistes (industriellement mis en oeuvre). Le projet vise également à réactualiser et compléter les données de la littérature par le recours aux méthodes les plus récentes. Les propriétés nutritionnelles des protéines d'oeuf seront évaluées par approche dynamique en phase postprandiale chez l'homme. Les profils de réactivité de sérums de patients allergiques vis-à-vis des protéines majeures et mineures de l'oeuf seront analysés en regard des tableaux cliniques et de leur évolution grâce au suivi d'une cohorte de patients. Le projet rassemble en une action structurante des équipes spécialistes en biochimie et technologie de l'oeuf, nutrition humaine, immunochimie et allergologie alimentaire.
Projet ANR-07-TSFA-0003 – DEXTRE : Les Déficits Exécutifs chez les personnes cérébrolésées : étude en simulation et en situation réelle de conduite
Programme : Transports terrestres Transports intelligents et utilisation des technologies de l'information dans les transports (TSFA) 2007
Année de financement : 2007
Coordinateur du projet : INSTITUT FRANÇAIS DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES DES TRANSPORTS,  DE L  AMENAGEMENT ET DES RESEAUX  ( IFSTTAR) (INSTITUT Français DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES DES TRANSPORTS,  DE L  AMENAGEMENT ET DES RESEAUX  ( IFSTTAR))
Partenaires : Hospices Civils de Lyon; Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux; Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux
Montant : 327279.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Le projet s’inscrit dans une ligne de travaux destinés à établir une meilleure compréhension des déficits exécutifs pour des populations de cérébrolésés,dans le but de proposer à plus long terme de meilleures méthodes de réadaptation de la compétence de conduite des patients dysexécutifs. Il permettra de fournir à partir des éléments d'analyse recueillis chez des conducteurs atteints de pathologies cognitives, une meilleure compréhension du fonctionnement cognitif normal. Il comprend deux volets expérimentaux, l’un mettant en œuvre un simulateur de conduite et l’autre consistant en une étude en situation réelle de conduite sur route.
L’expérimentation sur simulateur permettra d’étudier les capacités exécutives de patients cérébrolésés en fin de séjour en centre de réadaptation, leurs mécanismes de recherche d'information, dans une optique de concevoir des programmes de stimulations perceptivo-cognitive qui renforceraient l'efficacité de la prise et du traitement de l'information en situation de conduite. L’expérimentation sur route a pour objectif de mettre en évidence la mise en œuvre (ou au contraire l'absence) de stratégies adaptatives .
Projet ANR-15-CE07-0020 – CyProt : Synthèse chimique  de protéines cycliques en phase solide
Programme : Chimie Durable, produits, procédés associés (DS0304) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Oleg Melnyk (Mécanismes de la tumorigenèse et thérapies ciblées)
Montant : 343993.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 36 mois
Résumé : L'un des grands défis dans le développement des petites protéines thérapeutiques est l’introduction de modifications qui permettent d'augmenter leur temps de demi-vie dans les fluides biologiques, le rendement de production et de repliement. La cyclisation des peptides s’est fortement développée dans ce but aujourd'hui. Comparativement, la cyclisation de longs polypeptides ou des protéines reste encore peu exploitée car leur production par les systèmes vivants est complexe. Etant donné la forte croissance du marché des longs peptides et des protéines thérapeutiques, il est essentiel de concevoir des méthodes qui permettent la synthèse totale parallélisée d’analogues cycliques. L'objectif de ce projet est de développer un tel procédé par assemblage séquentiel de segments peptidiques purifiés et déprotégés. Ce procédé est conçu pour permettre une auto-purification des protéines cycliques. Le procédé sera automatisé en adaptant un synthétiseur multiple disponible commercialement. Il sera utilisé pour optimiser une protéine de moins de 100 acides aminés actuellement en développement à Lille pour sa capacité à mimer les propriétés régénératrices du facteur de croissance des hépatocytes (HGF), i.e; le ligand naturel du récepteur à tyrosine kinase MET. De tels agonistes puissants du récepteur MET ont un grand intérêt thérapeutique en médecine régénératrice, notamment pour prévenir l’hépatite fulminante, l'application thérapeutique qui est principalement visée dans ce projet.
Projet ANR-15-CE10-0004 – SEAHAND : Main marinisée mobile pour la saisie robuste en environnement  sous-marin
Programme : Usine du futur - système, produit, process (DS0302) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Saïd ZEGHLOUL (Institut PPRIME CNRS UPR 3346 - Département GMSC - Axe RoBIOSS)
Partenaires : TPE; Divers public; Laboratoire public; Laboratoire public; TPE
Montant : 471419.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 42 mois
Résumé : Dans un contexte lié à l’archéologie sous-marine et à la protection des épaves situées en grande profondeur, le projet SEAHAND vise à développer un préhenseur robotique marinisé porté par un mini-véhicule sous-marin. Ce préhenseur sera doté de capacités de saisie adaptative et exploité dans un contexte de télé-opération à 2000m de profondeur. Il fournira à l'utilisateur un retour d'effort sur tous les degrés de liberté, y compris la pression exercée par chaque doigt. Les partenaires chercheront à travers une démarche de conception intégrée à établir une synergie entre la définition architecturale de la main et sa commande, afin de répondre aux contraintes de l’environnement marin à haute pression et de sécuriser la manipulation d’objets fragiles via une commande télé-opérée à retour d’efforts. L’implication des partenaires, spécialistes des mini sous-marins, de la télémanipulation, de la commande et des mains robotiques, mais aussi des archéologues sous-marins du DRASSM, permettront une valorisation en situation réelle.
Projet ANR-15-CE12-0013 – NucleoReg : Régulation transcriptionnelle par séquestration nucléolaire
Programme : Génétique et génomique: relation génotype-phénotype, interactions génome-environnement, épigénétique (DS0405) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur frédéric pontvianne (Laboratoire Génome et Développement des Plantes)
Montant : 229107.0 euros
Date de début : 2016
Durée : 42 mois
Résumé : Plusieurs niveaux de régulation influent sur l’expression des gènes. Ainsi, la position relative d’un gène au sein du noyau impacte sur son expression. Ce projet a pour but de mettre à jour le rôle du nucléole dans l'expression de certains gènes lors du développement et en réponse aux stress chez les plantes. Le nucléole est un large compartiment nucléaire qui créer un grand volume d'où l'ARN polymérase II est exclue. Cependant, des régions chromosomiques autres que celles possédant les gènes d'ARN ribosomiques sont associées au nucléole (NAD pour Nucleolus-Associated Domains). Par de nouvelles techniques permettant d’isoler les nucléoles provenant de différents tissus de la plante, j’ai identifié les NADs dans des cellules de feuilles. A l’instar d’éléments répétés provenant de régions péri-centromériques, des NADs contenant des gènes non-exprimés dans les feuilles ont été découverts. L’ARN polymérase II étant exclue du nucléole, cela suggère que ces gènes sont séquestrés dans le nucléole pour empêcher leur transcription. L’organisation nucléaire étant très dynamique, je propose d’identifier les NADs dans différents types cellulaires et au cours du développement. Par ailleurs, en cas de stress, les plantes n'ont pas d'autres alternatives que de faire face et de s'adapter à leur environnement car leur survie en dépend. Au niveau moléculaire, cette réponse se traduit notamment par une réorganisation nucléaire et une variation de l'expression des gènes. En conséquence, nous étudierons l’impact de la régulation transcriptionnelle par séquestration nucléolaire en cas de stress.
Afin de valider les résultats obtenus via ces approches globales, le positionnement de ces NADs sera ensuite étudié à l’échelle de la cellule. Pour cela, je propose de développer de nouvelles techniques d’imagerie réalisables in planta qui permettront de détecter le positionnement d’un gène simple copie. Parmi les gènes présents dans le NADs, nombreux sont ceux exprimés dans d’autres types cellulaires ou après un stimuli biotique ou abiotique.
Grâce aux protocoles d’imagerie développés dans ce projet, nous pourrons suivre en temps réel la position d’un gène lors de son activation transcriptionnelle, comme en cas de stress, et ainsi valider que cette activation est bien liée à la perte de son association physique au nucléole. Un crible génétique complètera cette étude et permettra d’identifier les facteurs impliqués dans la séquestration des NADs.
En résumé, ce projet pourrait révéler l’existence d’une nouvelle voie de régulation transcriptionnelle des gènes par séquestration nucléolaire et de démontrer l’impact de cette voie lors du développement et de l’adaptation des plantes.
Projet ANR-15-CE28-0007 – CAREER : Ecart de déroulement de carrières des hommes et des femmes au sein d’un grand groupe français
Programme : Mutations du travail, égalité professionnelle (DS0803) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Madame Dominique MEURS (EconomiX UMR 7235)
Partenaires : Divers public; Laboratoire public; Institut national d'études démographiques
Montant : 89539.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 48 mois
Résumé : Ce projet de recherche a pour objectif d’étudier les carrières des hommes et des femmes au sein d'une grande entreprise française (L’Oréal). Notre analyse s'appuie sur une collaboration unique avec ce groupe qui nous donne accès à ses fichiers de paie (anonymisés) depuis 2007, soit un panel de 11 ans à la fin du projet ANR. Nous développons une nouvelle approche quantitative pour étudier les écarts de carrières selon le type de diplôme et l’ancienneté. Comme nous sommes en mesure de suivre les trajectoires de tous les salariés, y compris des  expatriés, nous pouvons identifier les meilleures trajectoires et les inégalités d’accès entre les sexes. Nous pouvons également évaluer  le poids du congé parental dans les  carrières. Notre analyse est fondamentale pour comprendre la persistance constatée des salaires entre hommes et femmes dans l'entreprise. Elle pourra servir aux décideurs politiques et aux gestionnaires pour l’élaboration de politiques plus efficaces d'égalité des chances.
Projet ANR-12-PDOC-0026 – CerID-Gene : Mécanismes génétiques et physiopathologiques responsables de déficiences intellectuelles associées à une malformation cérébelleuse
Programme : Retour Post-Doctorants (RPDOC) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Vincent Cantagrel (Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement)
Partenaires : Physiopathologie Moléculaire et Nouveaux Traitements des Hépatites Virales; Laboratoire public
Montant : 529137.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : • La déficience intellectuelle (DI) ou retard mental affecte 1-3% de la population dans les pays développés. La méconnaissance qui les entoure comme les retards de diagnostic engendrent des prises en charge inadaptées et coûteuses avec des effets dévastateurs sur les plans émotionnel et social pour les familles. Malgré les progrès récents dans les domaines de la cytogénétique et de la génétique moléculaire, la cause du handicap mental reste inexpliquée dans 40% des cas, laissant les familles sans diagnostic précis ni conseil génétique. Comprendre les bases biologiques de ces troubles est donc un défi médical important pour les prochaines années. Par ailleurs, l’identification des bases moléculaires et physiopathologiques de la déficience intellectuelle devraient mettre en évidence les voies moléculaires et cellulaires impliquées dans la cognition.
• Ces dernières décennies ont vu l’émergence de la contribution du cervelet à la fonction cognitive et la maîtrise des émotions, en plus de son rôle bien établie dans la coordination motrice. Cependant des études supplémentaires sont clairement nécessaires pour élucider la nature des processus liés à la médiation cérébelleuse des mécanismes cognitifs. Par ailleurs, l'utilisation intégrée des systèmes humain et murin devrait faire progresser notre connaissance des processus développementaux du cervelet normal et pathologique.
• Cette étude est construite autour d’un projet original basé sur une approche multidisciplinaire qui a pour but de:
1- Caractériser la base génétique responsable de DI associées à des malformations du cervelet.
2- Comprendre le rôle des gènes identifiés dans la première étape au cours du développement du cervelet.
3- Caractériser un mutant conditionnel de souris pour un gène responsable  d’un syndrome cérébelleux par défaut de N-glycosylation des protéines. Ce modèle permettra de mieux comprendre le rôle du N-glycome et la contribution du cervelet dans la fonction cognitive.
• Les résultats attendus devraient apporter un nouvel éclairage quant aux bases moléculaires et cellulaires du développement cérébelleux, apporter des éléments de compréhension sur le rôle du cervelet dans la cognition et, fournir un modèle utile pour développer de nouveaux essais thérapeutiques visant à atténuer les défauts de glycosylation et améliorer la prise en charge des patients.
Projet ANR-12-SEAS-0005 – EMOSEM : Ecosystem Models as Support to Eutrophication Management in the North Atlantic Ocean
Programme : Joint Call in the Atlantic and Mediterranean regions (SEAS ERA) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Gilles BILLEN (Université Pierre et Marie Curie-Paris 6)
Partenaires : IMAR Institue of Marine Research; Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer; Museum of Natural Sciences; ULB Université Libre de Bruxelles; Université Pierre et Marie Curie
Montant : 232500.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Résumé