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Projet ANR-12-ISV3-0002 – MISTRAL : Conséquences du contrôle réciproque de l'infidélité de la traduction dans l'immunité anti-fongique
Programme : Blanc International II - SVSE 3 - Microbiologie, immunologie, infectiologie (Blanc Inter II - SVSE 3) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Philippe PIERRE (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale)
Partenaires : Institut national de la santé et de la recherche médicale; University of Aveiro, RNA Biology Laboratory University of Aveiro, RNA Biology Laboratory
Montant : 300560.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 36 mois
Résumé : Conséquences du contrôle réciproque de l'infidélité de la traduction dans l'immunité anti-fongique (MISTRAL), définit un nouvel axe de recherche exploratoire à l’interface de la biologie cellulaire et de l'immunologie, qui vise à la compréhension des interactions existantes entre la détection microbienne et le changement dans la fidélité de la traduction des ARNm . Nous allons nous concentrer sur les cellules dendritiques (DCs), qui orchestrent la réponse immunitaire, et le pathogène fongique Candida albicans, qui affiche d’inhabituelles propriétés immuno-modulatrices. Contrairement à ce qui est communément  accepté, la fidélité de traduction des ARNm est modifiée de façon significative au cours du stress et de la détection des agents pathogènes. Les conséquences des erreurs de traduction sont multiples et pourraient être bénéfiques tant pour les cellules infectées et que pour l'agent pathogène. MISTRAL vise à: i) Identifier et concevoir des méthodes précises pour quantifier l’erreur de traduction. ii) Identifier les molécules et les voies impliquées dans la régulation des infidélités de traduction. iii) Définir les conséquences réciproques des infidélités de traduction à la fois pour l'hôte et pour les pathogènes. MISTRAL explorera les conséquences des modifications des ARNs de transfert et des enzymes de modification associés dont l’expression est régulée dans la levure et dans DCs lors de la détection microbienne. Nous allons montrer comment Candida albicans utilise l’infidélité de la traduction pour potentialiser sa survie, son adaptation et son échappement lors de la réponse immunitaire. Alors, les DCs et les macrophages pourraient utiliser l’infidélité de la traduction pour stimuler l'immunité anti-fongique à travers la génération d'épitopes antigéniques cryptiques et la production de cytokines inflammatoires. MISTRAL utilisera  des approches multidisciplinaires combinées et basées sur l'expertise scientifique reconnue du consortium en biologie cellulaire, immunologie et dans génétique de levure. De plus ce projet est soutenu par un ensemble de données préliminaires et des outils novateurs déjà obtenus dans une collaboration précédente entre l'Université d'Aveiro et le Centre d'Immunologie de Marseille -Luminy.
Projet ANR-08-BLAN-0073 – VITESSE : Vertical Integration Technologies for Electronics and Silicon SEnsors
Programme : Blanc (BLANC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique
Montant : 1100000.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 48 mois
Résumé : Dans la continuité des objectifs de physique au LHC pour la recherche du boson de Higgs et de la super-symétrie, la communauté scientifique internationale souhaite dès à présent anticiper sur la possibilité de tirer un maximum d'avantages de l'infrastructure existant au LHC pour élargir le champs des connaissances en physique des particules. En proposant d'augmenter la luminosité de la machine d'un facteur dix dans le cadre du projet SLHC, on pourra espérer pour un coût raisonnable, atteindre une meilleure compréhension des phénomènes visibles au LHC et pouvoir disposer d'une plage en masse des particules plus large afin d'étudier les hautes échelles d'énergie. En collaboration avec nos partenaires Français et Européens, notre objectif est de nous associer à l'effort de recherche et de développement de la partie la plus interne du détecteur de l'expérience ATLAS-CERN; la zone d'étude en question est située à des rayons compris entre 6 et 12 centimètres du point de collision des faisceaux, là où les détecteurs de vertex actuels seront incapables de rendre compte sans ambiguïtés de la topologie des événements impliquant des particules à courte durée de vie créées après la collision. On a coutume de désigner les détecteurs de vertex comme des yeux en silicium qui observent avec très haute résolution (au micron près) les créations et désintégrations primaires et secondaires des particules produites au point d'interaction. Au laboratoire du LAL, les compétences existantes et reconnues dans les domaines de la conception des circuits intégrés et de l'innovation de détecteurs sont des atouts majeurs pour à mener à bien ce type de projets. Une contribution active dans cette partie interne du détecteur nous permettra d'ouvrir un nouveau champs de connaissances dans la conception de circuits intégrés en technologie CMOS 130 nm en 3 dimensions ainsi que dans le domaine des détecteurs solides à très haute résolution spatiale : les détecteurs de pixels de nouvelle génération.
Projet ANR-08-BLAN-0304 – NeMo : Network Motifs
Programme : Blanc (BLANC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE - CENTRE DE RECHERCHE DE VERSAILLES GRIGNON (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE - CENTRE DE RECHERCHE DE VERSAILLES GRIGNON)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 180000.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : Les technologies modernes produisent de plus en plus de données organisées sous forme de réseau. De nombreux domaines scientifiques tels que la physique, la sociologie ou la biologie sont concernés par cette révolution des réseaux. L'étude de sous structures, appelées ici motifs, semble particulièrement pertinente pour les réseaux biologiques dans lesquels ces briques élémentaires constituent des unités fonctionnelles qui se combinent pour assurer la régulation de la cellule. Le premier objectif est de développer des méthodes statistiques permettant d'identifier les motifs exceptionnellement fréquents dans les réseaux biologiques. Pour cela, nous proposerons des définitions biologiquement pertinentes de motifs et des algorithmes efficaces pour en énumérer les occurrences dans des réseaux de grande taille. Nous proposerons ensuite des modèles de graphes aléatoires présentant des propriétés topologiques globales semblables à celles observées dans les réseaux biologiques, ainsi que des méthodes d'inférence précises et efficaces pour en estimer les paramètres. Nous déterminerons ensuite la distribution exacte ou approchée des comptages de motifs dans ces modèles. Un logiciel rendant tous ces résultats accessibles aux biologistes sera développé. Les motifs pouvant être considérés comme les briques élémentaires des réseaux, nous développerons dans un second temps des méthodes de comparaison de réseaux fondées sur leur composition en terme de motifs. Nous utiliserons également les motifs pour confronter les réseaux avec d'autres sources d'informations comme des mesures d'expression de gènes ; les modèles graphiques gaussien constituent un cadre naturel pour cette dernière étape. Pour tous les problèmes que nous aborderons, nous adopterons un point de vue théorique, fondé sur des résultats établis mathématiquement. La plupart des méthodes proposées dans la littérature bioinformatique repose sur des approches empiriques. Notre approche sera systématiquement fondée sur une formulation mathématique du problème, une définition précise des modèles stochastiques sous-jacents et des démonstrations rigoureuses de l'efficacité des méthodes proposées. Typiquement, nous nous proposons d'obtenir des résultats analytiques afin d'éviter le recours à des procédures de ré-échantillonnage trop coûteuses en temps de calcul.
Projet ANR-06-ERAP-0001 – MuExpress : MuExpress : Isolation of key genes for kernel development through the identification, in a collection of 300 mutant lines, of Mutator insertions in genes expressed in the maize seed
Programme : Réseau de génomique végétale Genoplante 2010 - programme transnational Européen ERA-Plant Genomics (ERAPG) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Peter ROGOWSKY (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : PME; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 305919.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : Maize is essential for world nutrition and widely cultivated in France, Spain and Germany. The size and shape of the two seed compartments (embryo and endosperm) is determined during seed development, a process involving an estimated 1000 genes. Less than 10% are known today and the identification and characterisation of genes involved in seed development presents a major scientific and agronomic challenge. The project aims at the identification and functional analysis of genes involved in maize seed development via the large scale molecular characterisation of transposon induced maize seed mutants. It is based on a collection of 300 mutants selected from a much larger initial collection based on a clean 3:1 segregation of the mutant phenotype and a stable phenotype over at least 3 generations. These mutants have been selected as being particularly defective in endosperm rather than embryo formation, thus enriching for mutations in genes preferentially involved in endosperm formation. After a minimum of 2 backcrosses the material is genetically quite homogenous and genomic DNA of wildtype and mutant pools is available. In a sister group of 300 mutants the bottleneck has been the identification of the transposon copy responsible for the phenotype among the roughly 100 copies present in the genome. To circumvent the very low efficiency of the AIMS technique on genomic DNA encountered in previous experiences, we propose here to decomplexify the system and to apply the technique to seed cDNA. All FSTs will be systematically sequenced opening not only the way for the subsequent co-segregation studies that will link the phenotype to a single FST but also creating a valuable inventory of Mutator insertions in coding sequences present in the material. A strong bioanalysis of the candidate sequences using all available tools in maize as well as the synteny to rice and other cereals will provide insight into the potential molecular function of the candidate genes. Among others the expression profiles of the candidates will be extracted from existing micro-array data and the in silico map position in the maize genome compared with the positions of seed QTLs.
Projet ANR-06-PDIT-0004 – i'StARS : Integrated Starter Alternator Reversible System
Programme : Programme de Recherche et d'Innovation dans les Transports terrestres (PREDIT) : Programme « transports intelligents et utilisation des technologies de l’information et de la communication pour les transports » (PREDIT- transports intelligents…) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : VALEO EQUIPEMENTS ELECTRIQUES MOTEUR (VEEM) (VALEO EQUIPEMENTS ELECTRIQUES MOTEUR (VEEM))
Partenaires : Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux; Entreprise autre que TPE ou PME
Montant : 1713589.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : Valeo a développé la première génération de système « Stop and Start » aujourd’hui en production avec Citroën. Ce système d’alterno démarreur entraîné par courroie permet d’arrêter le moteur thermique pendant les phases d’arrêt et de le redémarrer rapidement et silencieusement. Il en résulte un absence totale de nuisances et de consommation durant les phases d’arrêt. Grâce au rendement amélioré de la machine en mode générateur cette technologie permet aussi des économies d’énergie pendant les phases de roulage.
Le but de ce projet est de développer une technologie innovante d’intégration d’électronique de puissance (IML) afin de mettre sur le marché la deuxième génération du système « Stop and Start » répondant simultanément à une demande de fort volume et de bas coût.
Le développement de cette technologie est particulièrement innovant et ambitieux, il nécessite le développement :
• D’un module de puissance « bras de pont » acceptant des courants continus de 200A allant temporairement jusqu’à 680A piloté par un ASIC de pilotage intégrant le redressement synchrone.
• D’un module de contrôle en technologie hybride intégrant un ASIC comprenant un cœur de microprocesseur et un circuit d’excitation.
Cette technologie devra en outre pouvoir :
• Assurer une parfaite Compatibilité Electro-Magnétique.
• Fonctionner dans un environnement très sévère (forte température et niveau vibratoire élevé).
• S’intégrer dans le volume d’un alternateur classique.
• Avoir un niveau de fiabilité équivalent aux alternateurs actuels (moins d’un ppm de défaillance)
Projet ANR-15-CE39-0006 – NESSYNED : Nouveaux Systèmes Scintillants pour la Détection de Neutrons
Programme : Protection des infrastructures d’importance vitale et des réseaux (DS0902) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Matthieu Hamel (CEA SACLAY)
Partenaires : Canberra France; Divers privé; Laboratoire public; Laboratoire public; Laboratoire public; SAINT GOBAIN C.R.E.E
Montant : 784318.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 36 mois
Résumé : La sécurité des biens et des personnes face au risque terroriste NRBC-E constitue une orientation de recherches d'intérêt public, confirmée par l'édition 2013 du "Livre blanc de la Défense et de la Sécurité Nationale". En particulier, les risques nucléaires ou radiologiques constituent une menace à la fois probable et grave, en fonction de l'émergence de nations suffisamment développées et propices à utiliser de façon malveillante ce genre d'armement. Dans ce contexte, il est important de pouvoir d"tecter efficacement les rayonnements ionisants. Dans notre cas, nous nous intéressons particulièrement à la détection des neutrons, signature immuable de la présence des matériaux permettant la préparation des armes nucléaires. En plus de l'aspect social, l'aspect économique est crucial parce que de tels détecteurs, contenant le gaz 3He, existent actuellement, mais leur pénurie empêche dorénavant leur déploiement dans de nombreuses infrastructures critiques. Nous souhaitons ainsi développer des matériaux polymères permettant la détection de ces neutrons aux coûts inférieurs, ainsi qu'un prototype contenant ces matériaux.
Projet ANR-16-CAPLA – CAPLA : Fragmentation du travail, marchandisation du "travail à-côté" : le capitalisme de plate-forme et ses impacts sociaux
Programme : JCJC - Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Sarah ABDELNOUR
Partenaires : Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sociologie, Économie et Science Politique
Projet ANR-14-CE10-0007 – MAGISBAC : Génèse et maintenance des chromosomes secondaire bactériens
Programme : Une nouvelle représentation du vivant (DS0401) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur francois cornet (Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires)
Partenaires : Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie; Fondation de recherche; Laboratoire public; Fondation de recherche
Montant : 580000.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 60 mois
Résumé : Les génomes bactériens sont composés de chromosomes et de plasmides. Les plasmides sont des éléments génétiques mobiles acquis par transfert horizontal entre souches ou espèces bactériennes. Leur domestication est d'une importance cruciale pour l'acquisition par leurs hôtes de nouvelles fonctions, souvent associées à la capacité des bactéries à interagir avec des Eucaryotes, par exemple dans le développement du pouvoir pathogène ou l'établissement de symbioses. Pour ce faire, les plasmides doivent êtres adaptées à la physiologie de leur hôte. Cela implique l'évolution de leur organisation générale et de leur contenu en ADN ainsi que du contrôle des machines moléculaires responsables de leur réplication et de leur ségrégation. La domestication transforme ainsi les plasmides en composante intégrante du génome de leurs hôtes jusqu'à éventuellement en faire des chromosomes secondaires. Notre projet a pour but de comprendre les mécanismes et la séquence d'événements qui conduisent à la domestication des plasmides. Nous utiliserons une approche multidisciplinaire. Analyse bioinformatique et modélisation mathématique ouvriront la voie aux stratégies expérimentales impliquant génétique moléculaire, biologie cellulaire et approches post-génomiques pour caractériser les mécanismes moléculaires discriminant les fonctions de maintient des chromosomes secondaires de celles des plasmides chez les bactéries. Les résultats seront aussi utilisés pour la conception de chromosomes artificiels.
Projet ANR-08-JCJC-0106 – BioSpace : A Uniform Approach for Stochastic Modeling with Spatial Aspects in Systems Biology
Programme : Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs (JCJC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE LILLE I [SCIENCES ET TECHNOLOGIES] (UNIVERSITE DE LILLE I [SCIENCES ET TECHNOLOGIES])
Partenaires : Université Lille 1 - Sciences technologies
Montant : 134759.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : La modélisation et la simulation stochastique des systèmes biologiques permettent de mieux comprendre le fonctionnement des réseaux de régulation génétiques. Dans ce projet, nous proposons de concevoir et d'implanter un nouveau langage de modélisation stochastique qui permettra d'aborder n'importe quel type de réseau de régulation impliquant un contrôle concurrent dépendant de la position des acteurs, quel que soit le type des données spatiales. Nous espérons aboutir à un cadre unifié accessible aux biologistes, qui étend les approches existantes à base de règles, tout en proposant notamment des compartiments à volume variable. Les méthodes de vérification et de prédiction existantes seront étendues pour s'appliquer à ce nouveau langage. Nous appliquerons notre langage à des cas d'études de biologie cellulaire, en s'intéressant aux aspects spatiaux de la régulation des gènes eucaryotes : position des chromosomes dans le noyau, apparition et maintien des compartiments, interactions croisées entre chromosomes.
Projet ANR-06-TECS-0012 – PROMOCART : Décryptage des signalisations moléculaires contrôlant la différenciation des chondrocytes: retombées pour l'ingénierie tissulaire du cartilage.
Programme : Technologies pour la Santé (TecSan) (TecSan) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE RHONE-AUVERGNE (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE RHONE-AUVERGNE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Centre national de la recherche scientifique; Hospices Civils de Lyon; Université de Caen Normandie
Montant : 709696.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 48 mois
Résumé : Le cartilage a un potentiel de réparation très limité. La transplantation de chondrocytes autologues pour le traitement de lésions du cartilage articulaire du genou consiste à isoler des chondrocytes à partir d'un prélèvement de petite taille. Cette approche, mondialement utilisée pour le traitement de lésions limitées de cartilage, implique une amplification cellulaire sur plastique. Pour combler des lésions plus importantes et en vue d’étendre la technique aux lésions arthrosiques débutantes, la technologie s’oriente vers une combinaison des chondrocytes avec des biomatériaux. Cependant, l’amplification des chondrocytes en culture monocouche s’accompagne de leur dé-différenciation. Notre recherche vise à identifier des mécanismes moléculaires qui peuvent assurer le maintien ou la restauration du phénotype différencié des chondrocytes au cours de leur amplification sur plastique et au sein d’un biomatériau de collagène. Nous utiliserons la BMP-2 comme inducteur majeur de l’expression chondrogénique et nous proposerons des essais cliniques nouveaux comme médecine régénérative du cartilage.
Projet ANR-06-TECS-0025 – GRECO : Greffes de cornée automatisées par laser femtoseconde optimisé et système de contrôle aberrométrique
Programme : Technologies pour la Santé (TecSan) (TecSan) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : ECOLE NATIONALE SUPERIEURE DES TECHNIQUES AVANCEES (ECOLE NATIONALE SUPERIEURE DES TECHNIQUES AVANCEES)
Partenaires : École nationale supérieure des techniques avancées; TPE; Institut d'Optique Graduate School; Université Paris Descartes
Montant : 803653.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : La technologie des lasers à impulsions ultra-brèves s’impose progressivement dans la chirurgie oculaire mais reste limitée au domaine de la chirurgie réfractive. Nous nous proposons de l'appliquer à la greffe de cornée pour aboutir au développement d’une greffe automatisée par laser ultra-rapide. L’application de cette technologie se heurte actuellement à plusieurs limitations techniques : la qualité de la découpe décroît rapidement lorsque le tissu est pathologique. L’apparition d’effets secondaires limite la compensation de cette baisse d’intensité par une augmentation de l’énergie. Les limites des performances des systèmes actuels peuvent néanmoins être contournées par des solutions technologiques « sur mesure ». L’objectif du présent projet est de développer un dispositif automatisé pour les greffes de la cornée basé sur un laser femtoseconde innovant avec un spectre d’émission modifié et le potentiel de réduire les effets de la diffusion optique par un facteur 5. Il comportera un système de correction qui permet de compenser le front d’onde du laser en fonction des aberrations induites par les irrégularités de la cornée.