Projet ANR-12-BSV7-0014 – SexChroDrive : Dissection génétique de la distorsion de ségrégation méiotique des chromosomes sexuels chez la drosophile
Programme : Blanc - SVSE 7 - Biodiversité, évolution, écologie et agronomie (Blanc SVSE 7) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Madame Catherine MONTCHAMP-MOREAU (Laboratoire Evolution, Géomes et Spéciation)
Partenaires : Évolution, Génomes, Comportement et Écologie; Génétique Quantitative et Évolution - le Moulon
Montant : 200000.0 euros
Date de début : 2012
Durée : 36 mois
Résumé : La première loi de Mendel, postulant que deux allèles d'un hétérozygote sont transmis à la génération suivante avec une égale probabilité, est parfois transgressée dans la nature. Certains  allèles ou chromosomes assurent leur transmission préférentielle en altérant la méiose ou la maturation des gamètes. Parce qu'ils perturbent le processus central de la transmission des gènes et affectent souvent la fitness de leurs porteurs, ces éléments génétiques égoïstes «distorteurs de ségrégation», sont source de conflits intra-génomiques pouvant affecter profondément l’évolution des génomes et des espèces.
Le projet a pour objectif d'identifier un ensemble de gènes impliqués dans le système de distorsion de ségrégation sex-ratio «Paris» et d’élucider leur mode d’action. Les  distorteurs sex-ratio, liés au chromosome X perturbent la méiose mâle, empêchant ainsi la transmission du chromosome Y. Les mâles produisent alors une descendance majoritairement femelle. Un tel distorteur qui se répand dans une population déclenche au sein du génome une course aux armements pour le contrôle du sexe ratio: les pressions de sélection favorisent tout allèle de gène lié au chromosome X qui renforce la distorsion, tandis que des allèles suppresseurs sont sélectionnés sur le chromosome Y et les autosomes pour rétablir une ségrégation équilibrée. La distorsion de ségrégation est courante chez organismes sexués, mais très peu de gènes distorteurs ou suppresseurs ont pu être identifiés à ce jour, en raison de la complexité génétique inhérente à ce phénomène. Découvert et décrit dans l'espèce Drosophila simulans par un des partenaires, le système Paris a des caractéristiques qui rendent possible sa dissection génétique. Trois approches complémentaires seront développées:
1) Cartographie génétique: Pour identifier les éléments distorteurs majeurs et caractériser les variants causaux, nous exploiterons la variation génétique des populations naturelles dans une étude d’association ciblée sur des régions candidates déjà finement cartographiées sur le chromosome X. Pour caractériser les suppresseurs autosomaux, nous réaliserons d’abord une cartographie générale de QTLs à l’aide de lignées recombinantes (RIAILs), puis nous chercherons à identifier le(s) QTL(s) majeur(s) par clonage positionnel ciblé sur les régions candidates. 
2) Etude de l’expression génique: Un des éléments majeurs impliqués dans la distorsion est une duplication segmentaire qui affecte l’expression testiculaire d’un facteur de transcription. Nous utiliserons donc la technologie RNAseq pour repérer, à l’échelle du génome, les gènes et réseaux de gènes dont l’expression testiculaire est modifiée chez les mâles sex-ratio. Pour documenter plus en détail la relation entre génotype, force de distorsion et le niveau de leurs transcrits, les gènes significatifs feront l’objet d’une étude approfondie par PCR en temps réel.
3) Validation fonctionnelle de gènes candidats: Les gènes candidats pertinents, fournis par la cartographie et l’étude d’expression, seront soumis à validation fonctionnelle par transgénèse, en utilisant les outils appropriés développés chez D. simulans.  
Le produit final sera un modèle moléculaire du système Paris, qui devrait améliorer notablement la compréhension générale des mécanismes moléculaire de la distorsion de ségrégation méiotique et de ses conséquences évolutives. En outre, la distorsion de ségrégation des chromosomes sexuels étant fréquemment observée chez les diptères, nos résultats pourraient ouvrir des perspectives originales pour le contrôle d’espèces nuisibles. D’une part, parce qu’ils induisent des biais de sexe ratio, les  distorteurs liés au sexe peuvent induire des réductions, voire la disparition de populations. D’autre part, ils pourraient être utilisés dans les stratégies émergentes de remplacement de population, pour introduire des gènes d’intérêt dans les populations naturelles.