Projet ANR-06-PHYS-0013 – GEDEO : Dissection Genetique de l'obésité infantile
Programme : Physiopathologie des maladies humaines (Physio) (PHYSIO) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CNRS - DELEGATION REGIONALE NORD-PAS-DE-CALAIS ET PICARDIE (CNRS - DELEGATION REGIONALE NORD-PAS-DE-CALAIS ET PICARDIE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 288541.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 24 mois
Résumé : RESUME PROJET – Contexte scientifique et objectifs:"Une explosion des formes sévères d'obésité infantile est observée en raison de modifications de l'environnement, mais on attribue à cette affection une forte composante héréditaire. Une étude approfondie de la génétique de l'obésité infantile nécessite une exploration systématique du génome entier. Notre laboratoire a génotypé la puce Illumina 317K chez 813 DT2 et 742 individus non obèses, et propose d'utiliser cette technologie innovante pour élucider la susceptibilité génétique à l'obésité infantile. Nos objectifs sont 1) d'effectuer la première étude d'association génome entier (317,000 SNP) chez 742 enfants avec obésité infantile familiale et 742 individus non obèses 2) de répliquer les 384 SNP les plus prometteurs dans une 2ème cohorte indépendante de 1.800 sujets 3) d'explorer de façon extensive les 15 gènes les plus associés avec les phénotypes d'obésité chez 3.284 sujets 4) d'évaluer précisément la contribution génétique des SNP/haplotypes à risque d'obésité chez 20,000 sujets.RESUME PROJET – Description:"1) La puce génome entier Illumina Sentrix HumanHap300 sera hybridée et analysée chez 742 enfants obèses sévères avec une forte composante familiale. Les données obtenues seront comparées à celles déjà disponibles chez 742 sujets contrôle non obèses (Projet diabète de type 2 Genome Canada).  
2) Les SNP les plus associés à l'obésité infantile seront génotypés dans une seconde cohorte indépendante de 900 sujets avec obésité infantile et de 900 sujets non obèses et normoglycémiques. Le génotypage sera effectué à l'aide de la puce Illumina Golden Gate 384 SNP. Nous sélectionnerons les 384 SNP les plus prometteurs en phase I à l'aide de critères statistiques et biologiques (programme GeneSniffer). 
3) Le génotypage extensif de SNP dans les gènes répliqués d'obésité sera effectué à l'aide de la puce Illumina Golden Gate. Une procédure « tagged SNP » combinée  à la sélection des SNP inclus dans des séquences potentiellement fonctionnelles sera appliquée à environ 15 gènes associés à l'obésité. Des analyses haplotypiques et quantitatives seront appliquées pour identifier les SNPs potentiellement fonctionnels. 
4) Une étude génétique à grande échelle (N=20.000) incluant des cohortes familiales et prospectives françaises, allemandes et britanniques permettra d'évaluer précisément la contribution génétique des SNP / haplotypes au risque d'obésité et de ses complications métaboliques (non financé par cet appel d'offre).
RESUME PROJET – Resultats attendus:"Ce projet, qui se base sur les approches innovantes d'association génétique génome entier, va permettre une dissection systématique des bases génétiques de la susceptibilité à l'obésité infantile, et la découverte de nouvelles voies physiologiques impliquées dans le contrôle de la balance énergétique. Bien qu'étant une première étape vers la compréhension des mécanismes physiologiques conduisant à la prise de poids, ce projet va générer de nouvelles hypothèses et apporter de nouveaux marqueurs biologiques utiles dans une démarche de prédiction et de prévention du risque d'obésité infantile.