Projet ANR-14-CE16-0002 – ECLAIRE : Etablissement par reprogrammation somatique de lignées cellulaires compétentes pour la réplication vaccinale virale
Programme : Innovation biomédicale (DS0404) 2014
Année de financement : 2014
Coordinateur du projet : Monsieur Bertrand PAIN (U846, INSERM, USC1361, INRA,)
Partenaires : MERIAL; SANOFI PASTEUR; Laboratoire public
Montant : 256365.0 euros
Date de début : 2014
Durée : 48 mois
Résumé : La production de vaccins demeure l'un des plus grand défi pour l'industrie pharmaceutique. De nombreux vaccins ont été développés au fil des ans, mais malgré des progrès importants dans la standardisation et la production in vitro, des virus spécifiques sont encore en attente de substrats adéquats pour une production à l’échelle industrielle. Le projet vise à combiner l'avantage de la technologie innovante de la reprogrammation somatique pour produire de nouvelles lignées cellulaires avec des tests de réplication virale pour générer de nouveaux substrats innovants.
La plupart des vaccins sont actuellement produits sur une petite douzaine de lignées cellulaires adaptées de différentes origines animales. Parmi les avantages de ces lignées établies, on trouve leur amplification facile, leur caractérisation complète et leur reconnaissance et agrément par les autorités réglementaires. Cependant, ces lignées présentent aussi des inconvénients : certaines sont incapables de répliquer des virus spécifiques ou avec des titres qui sont trop limités pour permettre une production industrielle rentable. Le tropisme viral pour un certain nombre de virus n'est pas toujours initialement compatible avec les phénotypes définis des lignées cellulaires existantes. Les efforts pour adapter le virus à la cellule peuvent soit échouer soit conduire à des modifications telles qu'elles diminuent la capacité de l'immunogénicité des antigènes viraux, rendant ineffectif le vaccin. Dans le cadre du projet,  deux virus bien connus responsables de grandes maladies contagieuses ainsi que deux nouveaux virus émergents sont les candidats pour lesquels un type de cellule adaptée est activement recherchée. Pour des raisons de confidentialité, le nom précis des virus ne peut pas être divulgué publiquement en raison de développements industriels potentiels. 
Le projet utilisera une espèce mammifère et une espèce aviaire pour générer les lignées cellulaires. En partant de fibroblastes embryonnaires obtenues à partir d'animaux maintenus dans des installations SPF , les cellules seront modifiées avec la technologie de reprogrammation somatique. Avec des cocktails définis et originaux de gènes, différentes lignées cellulaires seront obtenues. Les cellules présentant un phénotype épithélial en fonction des conditions de culture utilisées seront choisies pour les tests de réplication virale. Selon les résultats, les lignées qui donneront les meilleurs résultats seront caractérisées par des analyses moléculaires et biochimiques (marqueurs, anticorps, ….) et des essais d’adaptation à des conditions de culture industrielle seront réalisés par valider le choix des lignées sélectionnées. 
Le consortium regroupe comme partenaire le laboratoire académique U846 INSERM, avec son expertise dans les cellules souches et reprogrammation somatique et les laboratoires Merial et Sanofi Pasteur avec leur expertise dans la production de vaccin animaux et humains.