Projet ANR-10-BIOT-0006 – DbaitTherap : Preuve de concept clinique d'une nouvelle classe d’inhibiteur de la réparation de cassures double brin de l'ADN pour la thérapie anticancéreuse
Programme : Biotechnologie pour la Santé (BIOTECS) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur Jian-Sheng SUN (DNA THERAPEUTICS)
Partenaires : Assistance Publique Hôpitaux de Paris; DNA THERAPEUTICS; Institut Curie; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
Montant : 772504.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 24 mois
Résumé : Depuis les années 2000, les données structurales sont en fortes croissances (10 000 structures en 2000, 64 000 à ce jour) et sont à l’origine de plusieurs succès dans l’étude du fonctionnement des systèmes biologiques complexes et dans la découverte et le développement de nouveaux médicaments. L’analyse et la comparaison de ces structures fournissent les bases chimiques solides qui permettent d’identifier et de façonner les interactions avec des composés. 
Cependant, la quasi-totalité des outils existants ne permet de comparer ces structures que sur la base de ressemblance « globale » (structure tertiaire), ce qui ne permet pas toujours d’expliquer les différences de fonctions observées. Dans ce projet, BIONEXT S.A., en collaboration avec des laboratoires d’excellence, propose de développer, d’améliorer et d’apporter les preuves expérimentales de procédés innovants de criblages virtuels de molécules basés sur la comparaison de régions structurales. Cette nouvelle description des structures moléculaires en régions contigües permet d’identifier les différences fines entre sites de liaisons et d’expliquer d’une part pourquoi des molécules chimiquement très proches ne partagent pas la même fonction et d’autre part, pourquoi des molécules chimiquement très différentes sont capables de partager une même fonction. 
    Le criblage de ces régions moléculaires apporte de plus plusieurs avantages : (1) les régions sont les plus petites unités fonctionnelles d’une molécule ; (2) il est possible de retrouver l’ensemble des molécules partageant une région fonctionnelle (logique de BLAST structuraux), indépendamment de la taille et de la ressemblance de leurs séquences et de leurs structures secondaires ou tertiaires ; (3) il est possible de retrouver des partenaires moléculaires (y compris des protéines et ARN) en cherchant les molécules portant des régions complémentaires; (4) l’identification d’un « code structurale » à partir de ces régions permet de caractériser fonctionnellement une molécule à partir de sa seule structure, en précisant notamment ses sites de liaisons et partenaires. 
    La concrétisation de ce projet permettra de porter un regard nouveau sur l’analyse moléculaire et de commercialiser des solutions innovantes répondant à des interrogations majeurs des milieux académiques et industriels, notamment : (1) quelle est la spécificité (la fréquence) d’une région moléculaire dans un contexte cellulaire (problème d’efficacité en drug design); (2) quelles sont les cibles moléculaires d’un composé (mode d’action des médicaments); (3) quelles sont les causes moléculaires de certaines formes de toxicité (réglementation REACH).