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Projet ANR-06-BLAN-0054 – METHISTONARA : Epigenetic role of histone methylation in environmental adaptation in Arabidopsis
Programme : Programme blanc (BLANC) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CNRS DELEGATION REGIONALE ALSACE (CNRS DELEGATION REGIONALE ALSACE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 200000.0 euros
Date de début : 2006
Durée : 36 mois
Résumé : Les histones, composants protéiques majeurs de la chromatine, sont soumises à divers types de modification chimique dont un particulier est la méthylation. La méthylation d'histones joue des rôles complexes dans l'activation ou la répression de transcription, en fonction du résidu d'acide aminé méthylé et du degré (mono, di ou tri) de méthylation, elle affecte non seulement d'autres types de modification d'histones mais également la méthylation d'ADN, et suscite ainsi un intérêt croissant de la recherche actuelle en Europe et aux USA. De même que la methylation d'ADN, la méthylation d'histones semble constituer un élément clé pour la compréhension des mécanismes de transmissions des informations épigénétiques chez les eucaryotes. Il a été longtemps supposé que des facteurs environnementaux puissent affecter l'épigénome, avec comme avantages une régulation simultanée d'une batterie de gènes et/ou la transmission aux cellules filles après division mitotique voire, chez les végétaux, à la descendance.  Nos travaux récents ont identifié le gène SET DOMAIN GROUP8 (SDG8) comme étant responsable d'une méthylation au niveau de H3K36 (lysine 36 sur l'histone H3), laquelle s'avère nécessaire à l'expression de FLOWERING LOCUS C (FLC), un répresseur de floraison chez Arabidopsis. FLC joue un rôle clé dans la réponse à la vernalisation, le processus épigénétique le mieux étudié à cause de son importance agronomique et de son aspect de signalisation de réponse au froid. Nos résultats non publiés montrent que le promoteur de SDG8 est induit par blessures et probablement aussi par pathogènes, et que de nombreux gènes potentiellement impliqués dans la réponse aux stress sont réprimés chez le mutant nul sdg8. L'ensemble de ces résultats font de SDG8 un gène modèle très original pour appréhender le rôle de la méthylation d'histones dans l'adaptation environnementale des plantes. Notre projet de recherche porte sur : (1) des caractérisations approfondies de l'expression de SDG8 à la réponse à divers facteurs biotiques et abiotiques ; (2) des études comparatives entre le mutant sdg8 et le sauvage pour leur réponse aux stress ; 3) des analyses de profils de méthylation d'histones en réponse aux stress chez le sauvage et le mutant sdg8, à la fois au niveau des régions gène-spécifiques et à l'échelle du chromosome entier. Une comparaison des données de type 'ChIP-CHIP' et de transcriptome nous permettra de vérifier la corrélation entre la méthylation d'histones et la transcription sous différentes conditions environnementales.
Projet ANR-06-PDIT-0002 – DIESOPTI : Optimisation du moteur diesel dans une perspective Euro-6
Programme : Programme de Recherche et d'Innovation dans les Transports terrestres (PREDIT) : Programme « transports intelligents et utilisation des technologies de l’information et de la communication pour les transports » (PREDIT- transports intelligents…) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : GROUPEMENT SCIENTIFIQUE MOTEURS G.S.M. (GROUPEMENT SCIENTIFIQUE MOTEURS G.S.M.)
Partenaires : Entreprise autre que TPE ou PME
Montant : 1784400.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : Le programme porte principalement sur la réduction de la consommation en carburant des moteurs diesel, sur la réduction des émissions de polluants et de bruit afin d'anticiper la mise en place des futures normes de dépollution Euro-6 et sur l'amélioration des performances globales du moteur de façon à optimiser l'utilisation du groupe motopropulseur en fonction de l'usage réel.
Il est structuré suivant quatre axes :
- Évaluation de concepts de combustion diesel : la maîtrise de la combustion demeure une étape primordiale qui est abordée par l'analyse du potentiel d'un très fort "downsizing" avec des systèmes de combustion conventionnels et par l'évaluation de systèmes de combustion "bas NOx" vis à vis des performances de dépollution, de leur robustesse et de leur capacité de pleine charge ;
- Évaluation des mécanismes de formation des polluants diesel : les modes de combustion "bas NOx" sont particulièrement affectés par leur grande sensibilité aux émissions de HC, CO, voire de CH4 ; les causes majeures de ces émissions sont examinée en détail au moyen de diagnostics optiques sur moteur transparent et en cellule haute pression ;
- Évaluation des phases de démarrage et de mise en action diesel : l'évolution inexorable vers la réduction des rapports volumétriques diesel s'accompagne de difficultés significatives de démarrage à froid ; l'analyse des mécanismes liés à cette phase de fonctionnement est proposée avec une approche expérimentale et la modélisation 3D ;
- Capitalisation dans l'outil de modélisation 3D : la modélisation 3D fait partie intégrante de la démarche de conception des systèmes de combustion pour les constructeurs ; l'intégration des résultats du programme dans cet outil représente donc une étape indispensable de capitalisation.
Projet ANR-12-RPIB-0017 – OREGA-17 : Developpement de nouveaux antagonistes de l'IL-17 en oncologie
Programme : RECHERCHES PARTENARIALES ET INNOVATION BIOMEDICALE (RPIB) 2012
Année de financement : 2012
Coordinateur du projet : Monsieur Jeremy BASTID (OREGA Biotech)
Partenaires : Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier; Immunologie, Dermatologie, Oncologie; OREGA BIOTECH
Montant : 1288187.0 euros
Date de début : 2013
Durée : 42 mois
Résumé : L’IL-17A ou les cellules productrices d’IL-17A (par ex., les cellules Th17) sont élevées dans de nombreuses tumeurs solides et hématologiques. Cette augmentation est souvent associée à un pronostic péjoratif ou à la présence de métastases. L’IL-17A possède de nombreuses propriétés pro-oncogéniques et favorise la prolifération, la résistance aux chimiothérapies et la dissémination des cellules cancéreuses. L’inhibition de l’IL-17A (anticorps et modèles murins Knockout) conduit à une diminution des tumeurs primaires et des métastases dans de nombreux modèles précliniques.
Bien que les propriétés oncogéniques des autres isoformes de la famille IL-17, c.à.d. IL-17B, IL-17C, IL-17D, IL-17E et IL-17F, n’aient pas été évaluées, elles sont également considérées comme des cibles thérapeutiques car elles activent des voies de signalisation et des cytokines telles que NFkB, Stat3 et IL-6 qui sont impliquées dans la croissance tumorale, la résistance aux chimiothérapies et la dissémination des cellules cancéreuses. Par ailleurs, nous avons montré pour la premières fois que ces isoformes sont également exprimées dans certains cancers et lignées tumorales humaines et possèdent des propriétés oncogéniques similaires à l’IL-17A.
Nous avons générés 14 anticorps monoclonaux ciblant spécifiquement et neutralisant l’IL-17A et un anticorps qui lie un épitope conservé et neutralise l’ensemble des isoformes de la famille. Les Preuves de Concept (PdC) in vitro et in vivo sont en cours (en date de Mars 2012). L’objectif de ce programme est de développer (depuis l’humanisation de l’anticorps jusqu’aux études de toxicologie réglementaires) un anticorps antagoniste de l’IL-17A ou un anticorps antagoniste de toutes les isoformes IL-17 (selon les résultats des PdC in vitro et in vivo) pour le traitement des tumeurs humaines.
Projet ANR-08-BLAN-0275 – VFSitCom : Volumes Finis pour Situations Complexes
Programme : Blanc (BLANC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : UNIVERSITE DE MONTPELLIER II [SCIENCES   TECHNIQUES DU LANGUEDOC] (UNIVERSITE DE MONTPELLIER II [SCIENCES   TECHNIQUES DU LANGUEDOC])
Partenaires : Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives; Institut français du pétrole Energies nouvelles; Aix-Marseille université; Université de Montpellier
Montant : 180000.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 36 mois
Résumé : Le but du projet est de déveloper des schémas de type volume fini pour la simulation numérique de situations complexes survenant dans la modélisation de problèmes du monde réel. En se basant sur les travaux récents dédiés à la conception et à l'etude mathématique de schémas volumes finis pour des applications complexes (anisotropes et hétérogènes, non-linéaires, couplées, etc.), VFSitCom souhaite développer de nouveaux schémas ayant à la fois de bonne propriétés théoriques et une efficacité dans le cadre industriel; notre ambition est d'étudier des outils numériques révolutionnaires depuis leurs bases mathématiques jusqu'à leur implémentation dans des situations concrètes faisant intervenir les difficultés précédemment mentionnées, et tout autre pouvant apparaitre au cours du projet. Nous souhaitons donc développer des méthodes non seulement capables de traiter l'anisotropie et l'hétérogénéité du milieu, les fortes non-linéarités (apparaissant par exemple au travers de couplages) et les grilles irrégulières ou déformées - certaines de ces problématiques étant toujours ouvertes malgrè la littérature récente (voir "Sample specific problems" dans la description du projet) -, mais qui pourront être et seront aussi implémentées avec succès dans des codes industriels pour diverses applications, comme par exemple celles de l'IFP (Institut Francais du Pétrole) ou du CEA (Commissariat à l'Energie Atomique). Partir de méthodes de volume finis est assez naturel puisqu'elles sont largement utilisées dans le milieu industriel visé par les applications du projet. Mais, pour atteindre les objectifs de VFSitCom, les membres du projet ne se restreindront pas à une seule méthode numérique pour EDP, et s'investiront dans toutes les techniques connues (comme les schémas de Galerkin discontinus, les méthodes Mimetic Finite Difference, Expanded Mixed Finite Element, etc.; voir les références) afin de franchir les frontières entre celles-ci et d'aboutir à une nouvelle vision de l'analyse numérique des EDP.
Projet ANR-06-JCJC-0140 – POLAREX : POLARization of EXotic nuclei with On-Line Nuclear Orientation at ALTO
Programme : Programme "Jeunes chercheuses et jeunes chercheurs" (JCJC) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 150000.0 euros
Date de début : 2006
Durée : 36 mois
Résumé : La clé pour comprendre l'interaction nucléaire repose sur l'étude des noyaux exotiques qui présentent des propriétés radicalement différentes de celles de leurs cousins conventionnels le long de la vallée de la stabilité. Pour compléter la tendance actuelle sur l'étude de la dynamique nucléaire par réaction avec des noyaux exotiques, il est nécessaire et indispensable de déterminer les propriétés de l'état fondamental : spin, demi-vie, masse et forme. Les mesures de ces propriétés fondamentales sur un grand domaine de la carte nucléaire permettraient de tester l'efficacité des modèles théoriques. Les propriétés des particules célibataires dans le noyau sont décisives pour de telles déterminations, et un des outils particulièrement puissant pour leur élucidation est la préparation des noyaux exotiques dans des états de spin orienté qui peuvent ensuite être utilisés pour mesurer les moments magnétiques nucléaires et le spin de l'état fondamental. Les noyaux polarisés peuvent aussi être utilisés dans des études d'interactions fondamentales mettant en jeu, par exemple, l'asymétrie bêta et le mélange d'isospin.  Tous les efforts faits dans le développement des installations de prochaines générations (SPIRAL-2, EURISOL, GSI-FAIR) ont aussi besoin d'être soutenus par le développement de diverses techniques expérimentales. Le but de ce projet est d'y participer en créant une nouvelle infrastructure pour l'orientation en ligne de noyaux exotiques. La méthode d'Orientation Nucléaire En-Ligne (OLNO) est l'association de la technique acquise de « Low Temperature Nuclear Orientation » (afin de polariser le noyau) avec l'implantation en ligne d'un faisceau radioactif. L'orientation à basse température est obtenue à l'aide d'un réfrigérateur à dilution qui représente la partie principale du système et que TRIUMF s'est engagé à nous céder. Les noyaux riches en neutrons seront produits à la nouvelle installation commissionnée au seuil de notre laboratoire : ALTO à Orsay. Avec la fermeture du séparateur de masses OSIRIS de Studsvik, et la nouvelle priorité donnée aux faisceaux de TRIUMF, cette nouvelle expérience  la première de la sorte en France  sera en compétition seulement avec NICOLE à ISOLDE. De plus, grâce à la méthode de production par photo-fission d'ALTO, la nouvelle installation d'orientation sera unique au monde pour ce qui est des noyaux disponibles, et pourra aussi être utilisée à la future installation SPIRAL-2.
Projet ANR-06-PDIT-0017 – ROSA : Rail Optimisation Safety Analysis
Programme : Programme de Recherche et d'Innovation dans les Transports terrestres (PREDIT) : Programme « transports intelligents et utilisation des technologies de l’information et de la communication pour les transports » (PREDIT- transports intelligents…) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : SOCIETE NATIONALE DES CHEMINS DE FER FRANCAIS (SNCF) (SOCIETE NATIONALE DES CHEMINS DE FER FRANCAIS (SNCF))
Partenaires : Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux; Entreprise autre que TPE ou PME
Montant : 212267.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 33 mois
Résumé : Le projet ROSA se propose d’établir l’analyse de risque du système ferroviaire dans sa globalité pour le système français et allemand à partir notamment de l’architecture fonctionnelle de l’AEIF, d’outiller cette analyse de risque à l’aide d’un logiciel permettant de visualiser les niveaux de sécurité quantifiés des fonctions et d’en évaluer les répercussions lors de la recherche d’un optimum.
Une telle analyse bénéficiant de l’expérience des réseaux majeurs en Europe permettra l’ajout de nouvelles fonctions de sécurité dans l’architecture fonctionnelle et d’en apprécier l’impact d’un objectif de sécurité donné depuis le niveau le plus élémentaire jusqu’au niveau le plus global. 
Outre à l’analyse de risque globale, le projet prévoit la présentation de l’état de l’art concernant les méthodes d’analyse coût – bénéfice visant à atteindre les meilleurs résultats de sécurité pour des niveaux d’investissements donnés.
Le projet ROSA se positionne comme la suite directe de SAMRAIL (dans lequel la SNCF, DB, INRETS et TUD ont participé), il intègre les dernières découvertes scientifiques en matière de recherche sur la sécurité ainsi que l’expérience de la SNCF et de la DB en matière de technique d’exploitation.
Ce projet fournira donc une analyse structurelle qui permettra aux industriels, exploitants, responsables d’infrastructure et autres institutions scientifiques d’introduire des modules de décomposition complémentaires. L’intention de cette approche est de faciliter la création d’outils logiciels ainsi qu’un cadre de travail scientifique qui pourrait être développé continûment,  jusqu’à n’importe quelle profondeur de décomposition maîtrisée.
De plus la définition d’une analyse de risque globale du mode de transport ferroviaire pourra permettre à l’Agence Ferroviaire Européenne d’aborder la définition d’Objectifs Communs de Sécurité avec un pragmatisme garantissant le réalisme et la faisabilité des systèmes techniques jusqu’au niveau le plus bas.
Projet ANR-11-IS01-0002 – SURFACES : Surfaces et interfaces dans les variétés: aspects analytiques et géométriques
Programme : Blanc International II - SIMI 1 - Mathématiques & Interactions (Blanc Inter II SIMI 1) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Laurent HAUSWIRTH (UNIVERSITE PARIS-EST MARNE LA VALLEE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; École polytechnique; Université Paris-Est Marne-la-Vallée
Montant : 201760.0 euros
Date de début : 2012
Durée : 36 mois
Résumé : Ce projet est centré sur la géométrie globale des surfaces minimales et des surfaces à courbure moyenne constante dans les variétés Riemanniennes et sur le rôle que ces surfaces jouent dans l'étude de certaines équations aux dérivées partielles. Différents aspects de la théorie des surfaces seront abordés dans ce projet. 
Nous souhaitons en particulier comprendre la théorie des surfaces minimales et des surfaces à courbure moyenne constante qui sont plongées dans les variétés homogènes et plus généralement dans n'importe quelle variété Riemannienne. Il y a d'imporants problèmes de classification, de construction, de caractérisation de ces objets géométriques. 
Nous nous proposons également d'étudier une nouvelle famille de sous-variétés à courbure moyenne constante dont la codimension est arbitraire, ces sous variétés sont des sous variétés à "courbure moyenne constante" au sens de Almgren (i.e. problèmes isopérimétriques pour les sous variétés de toute codimension). 
Les liens qui unissent d'une part les surfaces minimales et les surfaces à courbure moyenne constante et d'autre part les solutions des équations modélisant les phénomènes de transition de phase ont permis, ces dernières années, d'ouvrir un nouveau champ de recherches. Les idées et les techniques issues de la théorie des surfaces minimales se sont révélées particulièrement fructueuses et ont donné lieu à la construction de nombreuses solutions d'équations elliptiques non linéaires (équation de type Allen Cahn) et de solutions de problèmes surdéterminés (problèmes à frontières libres). Nous nous proposons d'étudier et de classifier ces solutions.
Projet ANR-15-MRSE-0016 – COLOSAL : Contrôle et manipulation du spin à l'échelle atomique
Programme : Montage de Réseaux Scientifiques Européens ou Internationaux (MRSEI) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Cyrille BARRETEAU (Service de Physique de l'Etat Condensé)
Montant : 30000.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 18 mois
Résumé : Notre société de l'information est très largement basée sur le développement de composants électronique où le spin joue un rôle prépondérant et est utilisé comme une brique de base des composants électroniques pour le stockage de données ou la logique élémentaire. La miniaturisation constante des composants nécessite de développer de nouvelles approches pour manipuler l'aimantation dans des nano-structures individuelles.
Ce projet multi-disciplinaire réunira des équipes de théoriciens et expérimentateurs en physique et chimie pour étudier de nouveaux mécanismes pour manipuler le spin à l'échelle atomique en vue de moduler le transport électronique (ou le magnétisme intrinsèque)  de nano-composants élémentaires en leur conférant des propriétés nouvelles ou exacerbées. Les systèmes considérés seront en général des molécules organiques (ou organo-métalliques) entre deux électrodes inorganiques (magnétiques). Les techniques expérimentales utilisées seront basées sur la microscopie tunnel et la modélisation des systèmes utilisera grandement les méthodes ab-initio de transport électronique hors d'équilibre. 
Notre objectif final étant d'identifier les jonctions moléculaires pouvant fonctionner dans des conditions réalistes et les plus prometteuses la nano spintronique du futur.
Projet ANR-15-MRSE-0032 – R2E2 : Recurrences of Rare and Extreme Events
Programme : Montage de Réseaux Scientifiques Européens ou Internationaux (MRSEI) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Pascal YIOU (Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement)
Montant : 30000.0 euros
Date de début : 2015
Durée : 18 mois
Résumé : Nous envisageons d'organiser un consortium de partenaires européens pour soumettre un projet à l'appel FET OPEN en septembre 2017. Le but du projet FET sera de rassembler et adapter des résultats mathématiques récents en systèmes dynamiques et en théorie des valeurs extrêmes pour modéliser l'apparition et la dynamique d'événements climatiques rares ou extrêmes, et permettre à des décideurs et des acteurs économiques d'utiliser de tels résultats pour l'adaptation au changement climatique. Le projet FET open valorisera les simulations climatiques obtenues dans le projet CMIP5 (du précédent rapport du GIEC), et les simulations CMIP6 à venir. La détermination des extrêmes et leurs incertitudes sera effectuée dans le cadre de ces simulations numériques. La valeur ajoutée du projet, par rapport aux avancées théoriques, sera l'inférence des grandeurs mathématiques importantes pour les extrêmes, dans le cadre de données finies (en temps), à partir de simulations de contrôle, historiques et scénarios.
Ce projet d'ANR a pour but d'organiser des réunions d'échanges pour construire le réseau de partenaires, formuler les défis et verrous scientifiques, et proposer un plan de dissémination des résultats scientifiques auprès de décideurs et acteurs économiques. Des groupes d'acteurs économiques seront invités aux réunion pour permettre une co-construction d'outils d'évaluation d'événements extrêmes.
Projet ANR-16-FROG – FROG : Réponses fonctionnelles des aquifères souterrains aux pratiques d'infiltration en milieu urbain
Programme : PRC - Projets de recherche collaborative
Année de financement : 2016
Coordinateur du projet : Florian MERMILLOD-BLONDIN
Partenaires : Laboratoire d'Écologie des Hydrosystemes Naturels et Anthropisés
Projet ANR-10-JCJC-0806 – PolarChem : Physicochimie aux interfaces de systèmes vitreux à charge d’espace
Programme : JCJC : Sciences de l'information, de la matière et de l'ingénierie :  Chimie du solide, colloïdes, physicochimie (JCJC SIMI 8) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur Marc DUSSAUZE (UNIVERSITE BORDEAUX I)
Partenaires : Institut des Sciences Moléculaires
Montant : 165000.0 euros
Date de début : 2010
Durée : 36 mois
Résumé : Le projet PolarChem est basé sur une approche scientifique multidisciplinaire regroupant des expertises en chimie des verres, chimie de surface, polarisation thermique et optique non linéaire. L’idée principale à la base du projet est d’utiliser la technique de polarisation thermique pour créer des surfaces de verres « actives » pouvant servir de base à une étape de chimie de surface. 
Un traitement de polarisation thermique permet d’induire une charge d’espace à la surface de verre inorganique avec des champs électriques pouvant aller jusqu’à 10^9V/m. Certains de nos résultats préliminaires ont permis d’envisager un réel contrôle des mécanismes mis en jeu lors de la polarisation d’un verre. De ce fait, il est désormais possible en maitrisant à la fois les paramètres du traitement et la composition vitreuse mis en jeu d’induire localement une charge d’espace ainsi que des groupements hydroxyles pouvant servir de base à une étape de chimie de surface.
Sur la base de ces résultats préliminaires, PolarChem prévoit une étude fondamentale sur des zones macroscopiques devant permettre à la fois (i) une optimisation de la composition vitreuse et des paramètres de poling et (ii) une caractérisation de l’influence de la charge d’espace sur les étapes de chimie de surface et notamment la réactivité et l’organisation des molécules fonctionnalisées. En parallèle, une étude technique visera à appliquer cette stratégie d’activation de surface en microscopie dans le but de fabriquer des surfaces de verres micro-fonctionnalisées à des échelles micrométriques.