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Projet ANR-11-BSV5-0007 – AuxiWall : Régulation par l'Auxine du  métabolisme des Xyloglucanes de la paroi
Programme : Blanc - SVSE 5 - Physique, chimie du vivant et innovations biotechnologiques (Blanc SVSE 5) 2011
Année de financement : 2011
Coordinateur du projet : Monsieur Grégory MOUILLE (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE - CENTRE DE RECHERCHE DE VERSAILLES GRIGNON)
Partenaires : Institut des Sciences du Végétal; Institut des sciences et industries du vivant et de l'environnement; Institut national de la recherche agronomique; Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay
Montant : 428582.0 euros
Date de début : 2012
Durée : 36 mois
Résumé : Les cellules de plantes sont entourées d’une matrice complexe, dynamique, constituée de polysaccharides qui jouent un rôle majeur au cours du développement de la plante notamment au cours de l’expansion cellulaire, dans le contrôle de la forme des cellules et participe à l’architecture globale de la plante, sa protection contre les agressions extérieures et représente une source de biomasse considérable.
La paroi primaire est constitué d’un réseau  de microfibrilles de cellulose connecté aux hemicelluloses (xyloglucanes) baignant dans une matrice de pectine et de divers protéines structurales et d’enzymes.
Au cours de la croissance, la paroi est constamment remodelée pour maintenir son extensibilité et permettre l’intégration de composé pariétal néosynthétisé. La croissance est controlée par des hormones, parmi lesquelles l’auxine qui joue un rôle clé dans l’expansion cellulaire.
Cependant, on connaît mal les mécanismes via lesquels l’auxine influence les modifications pariétales ayant lieu au cours de la croissance. Des données préliminaires produites par les partenaires suggèrent que le récepteur de l’Auxine ABP1 est impliqué dans le contrôle des modifications des hémicelluloses en particulier des xyloglucanes. ABP1 semble donc être un composant essentiel impliqué dans les modifications pariétales contrôlées par l’Auxine. 
Dans ce projet, nous proposons d’étudier la dynamique d’évolution de la structure des xyloglucanes au cours de l’élongation cellulaire et de déterminer l’influence de l’Auxine dans ce phénomène. L’analyse de la dynamique des modifications des xyloglucanes sera notamment effectuée via l’utilisation d’une approche d’empreinte enzymatique assistée par Maldi-TOF à haut débit et haute résolution spatiale in situ, mise en place récemment par le partenaire 1. 
Une meilleure compréhension de la dynamique du métabolisme des xyloglucanes sera aussi permise via l’utilisation de monosaccharide activé utilisé dans une approche de « Click  chemistry » permettant une visualisation in vivo du métabolisme des xyloglucanes. Les plantes présentant une perte de fonction conditionnelle d’ABP1 montrant des xyloglucanes modifiés seront combinées avec des mutants disponibles chez Arabidopsis thaliana (mutants affectés dans la voie de signalisation de l’auxine et mutants affectés dans la synthèse de xyloglucanes) afin de comprendre comment l’auxine contrôle la structure des xyloglucanes et comment la structure comment la structure de ces polymères affecte l’élongation cellulaire.
Projet ANR-10-EMMA-0027 – FluCure : Nouvelle stratégie de lutte contre la grippe et la pneumonie grippale
Programme : Emergence (Emergence) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Madame Béatrice RITEAU (UNIVERSITE CLAUDE BERNARD - LYON I)
Partenaires : INRA TRANSFERT; Institut national de la santé et de la recherche médicale; Université Claude Bernard - Lyon 1; Virologie et Pathologie Humaine
Montant : 380978.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 24 mois
Résumé : La grippe est une maladie infectieuse et contagieuse, due aux virus influenza, causant des pertes humaines et économiques importantes. Les préoccupations mondiales actuelles concernent le virus influenza aviaire de sous-type H5N1, extrêmement pathogène pour l'homme, et, plus récemment, le virus de sous-type H1N1 (2009) à l’origine de la pandémie récente. Ces infections récurrentes mettent en évidence la menace permanente causée par ces virus et le besoin de développer de nouveaux médicaments contre ses pathogènes.
 A l’heure actuelle, il existe sur le marché deux familles d’antiviraux spécifiques pour la prévention et le traitement de la grippe. Ces molécules agissent sur des protéines virales (inhibiteurs de la protéine M2 et de la neuraminidase) et inhibent la réplication des virus grippaux. Malheureusement ces médicaments donnent rapidement lieu à l’apparition de résistances, notamment lors de l’utilisation en curatif. De plus, une proportion importante des virus grippaux humains, ainsi que la majorité des virus A/H5N1 ayant circulé en 2004 et 2005 au Vietnam et en Thaïlande, sont apparus résistants à ces molécules. Aussi, il est considéré que ces antiviraux; n’auraient que peu de chances d’être efficaces vis-à-vis d’un virus pandémique qui en dériverait, et ils restent à ce jour écartés des options thérapeutiques. 
L’approche proposée dans ce projet consiste à valider des molécules antigrippales que nous avons brevetées et qui ciblent la réponse immunitaire de l’hôte et non le virus afin d’empêcher l’apparition de résistants. Ces molécules qui ont prouvées leur efficacité in vitro et in vivo chez la souris agissent en induisant la libération d’interféron, cytokine antivirale à spectre large. Ces molécules devraient donc être efficaces indépendamment de la souche virale. 
Le but de notre projet est de valider nos molécules sur des souches aviaires hautement pathogènes H5N1 et pandémiques H1N1 (2009) alors qu’elles qui ont déjà montré leur efficacité contre deux sous-types de virus influenza (A/PR8/34 H1N1 et H7N7). 
Cette approche devrait correspondre aux attentes des industries pharmaceutiques pour de nouveaux traitements anti-influenza.
Projet ANR-10-INTB-0404 – ProQuP : Paires d’atomes corrélés pour la physique quantique
Programme : Blanc international - Sciences de l'information, de la matière et de l'ingénierie : Constituants fondamentaux de la matière, physique de la matière condensée (Blanc Inter SIMI 4) 2010
Année de financement : 2010
Coordinateur du projet : Monsieur Denis Boiron (INSTITUT D'OPTIQUE (IO))
Partenaires : TU Wien; Laboratoire Charles Fabry
Montant : 280800.0 euros
Date de début : 2011
Durée : 36 mois
Résumé : Ce projet a pour partenaires deux laboratoires de recherche pionniers en optique atomique quantique et dans l’étude des gaz quantiques dégénérés à une dimension : le laboratoire Charles Fabry de l’Institut d’Optique (Institut d’Optique, CNRS, Université Paris Sud 11) à travers les montages expérimentaux « hélium métastable » et « puce atomique », et l’Atominstitut der Österreichischen Universitäten (Vienna University of Technology) à travers un montage expérimental « puce atomique ».
Le cœur du projet est l’étude d’états quantiques fortement corrélés. Ces états devraient permettre d’améliorer les performances des interféromètres atomiques et caractérisent d’autre part les états stationnaires des gaz en dimension réduite, et en particulier les gaz uni-dimensionnels.
Le projet peut être séparé en trois volets. Il s’agit d’une part d’étudier plusieurs mécanismes conduisant à la création de paires d’atomes corrélés. Les propriétés quantiques (corrélation, squeezing,…) de ces paires seront démontrées par des mesures de fonctions de corrélation à deux corps, point fort des deux laboratoires à cause des détecteurs de particules uniques qu’ils ont chacun développés. Un accent particulier est porté aux mécanismes créant des paires dans uniquement deux modes.
Le deuxième volet du projet concerne l’utilisation de ces détecteurs et de ces paires atomiques pour l’étude des gaz uni-dimensionels. On s’intéressera en particulier à la question de leur intégrabilité  et à la comparaison de leur fonction de corrélation in-situ et en temps de vol grâce à une nouvelle technique de tomographie qui sera mise en point au cours du projet.
Le troisième volet concerne un transfert de technologie. L’équipe française disposera sur son dispositif du détecteur d’atomes uniques par nappe de lumière résolu en temps mis au point par l’équipe autrichienne.
Projet ANR-08-BLAN-0006 – RMAT : Regulation of the Metaphase-Anaphase Transition
Programme : Blanc (BLANC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : Monsieur Roger KARESS (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 346320.0 euros
Date de début : 2009
Durée : 48 mois
Résumé : Le système de surveillance de l'assemblage du fuseau mitotique, appelé "checkpoint," intervient dans le contrôle de la transition métaphase-anaphase. Ce dispositif permet à la cellule d'inhiber le déclenchement de l'anaphase afin de donner assez de temps aux chromosomes et au fuseau pour s'assembler correctement. Cette inhibition est dûe en partie à l'activité de Mad2 et de BubR1, qui se fixent et inhibent Cdc20, un cofacteur de l'Anaphase Promoting Complex (APC). Lorsque le checkpoint est éteint (suite à l'attachement correct du dernier kinétochore au fuseau), Cdc20 est libéré et peut ainsi activer l'APC. L'APC entraîne ensuite la dégradation de Cycline B et Securine, et en conséquence la kinase Cdc2 est inactivée et les chromatides sœurs se séparent. Ainsi la cellule sort de mitose. Notre projet vise à mieux comprendre le fonctionnement du checkpoint, et surtout comment il est inactivé lorsque les chromosomes sont correctement attachés au fuseau. Notre approche est d'utiliser les atouts génétiques de la mouche Drosophila en combinaison avec la microscopie de cellules vivantes. Nous allons analyser in vivo le comportement des protéines clées (tels que Mad1, Mad2, BubR1, RZZ complexe, CenpE, Cdc20, Cycline B), marquées par les tags fluorescents, pendant le déroulement de la mitose normale, ou suite aux perturbations expérimentales. En particulier, nous allons tester l'hypothèse généralement admise pour l'extinction du checkpoint, selon laquelle appareil du checkpoint préalablement assemblé aux kinétochores est démantelé par le transport de Mad2 depuis les kinétochores le long de microtubules ("shedding" en anglais). Nous proposons de suivre simultanément in vivo disparition de Mad2 et la dégradation de Cycline B (qui sert comme un marqueur in vivo de l'extinction du checkpoint), et ainsi voir si les cinétiques des deux protéines sont compatibles avec le modèle. Nous allons mesurer les changements relatifs aux kinetochores de Mad2 et son récepteur Mad1 en fonction de la progression mitotique, afin de déterminer si l'enlèvement de Mad1 contribue également à l'extinction du checkpoint. Nous allons également tester la contribution éventuelle de phosphorylations au niveau de Mad2 dans l'extinction du checkpoint. Nous allons effectuer une dissection mutationnelle de deux fonctions associées à BubR1. Nous allons examiner le rôle de Cenp-Meta (homologue présumé de CenpE chez la mouche) dans la régulation de l'activité de BubR1, et investiguer son rôle dans la dynamique du "shedding" de RZZ. Enfin, nous allons entamer une analyse génétique de Cdc20, tout cela dans le but de mieux comprendre le rôle de ces protéines dans la régulation de la transition métaphase-anaphase.
Projet ANR-08-BLAN-0166 – PulsedField NMR : Développement de la résonance magnétique nucléaire sous champs magnétique pulsé.
Programme : Blanc (BLANC) 2008
Année de financement : 2008
Coordinateur du projet : CNRS DELEGATION REGIONALE MIDI-PYRE (CNRS DELEGATION REGIONALE MIDI-PYRE)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique
Montant : 398627.0 euros
Date de début : 2008
Durée : 36 mois
Résumé : Récemment la résonance magnétique nucléaire a été observée pour la première fois dans un champ magnétique pulsé, atteignant 58 Tesla, par l'équipe de J. Haase du Centre of Magnetic Resonance, à l'université de Leipzig (Allemagne). Les résultats de Haase ne représentent qu'une preuve de principe. Se basant sur ses conseils, nous avons construit un prototype d'un spectromètre RMN à 250 MHz au Laboratoire National des Champs Magnétiques Pulsés (LNCMP). Nous avons ainsi réussi à observé la RMN par 'free induction decay' dans une bobine pulsé standard du LNCMP. Dans ce projet, nous proposons de perfectionner ce prototype vers un spectromètre plus performant pour la RMN des solides dans la gamme 250 MHz - 1 GHz sous champ magnétique pulsé. Ce travail sera effectué en collaboration avec l'équipe de Haase à Leipzig. Un spectromètre à transformée de Fourier sera conçu et réalisé en utilisant des sondes et des amplificateurs cryogéniques. Des bobines pulsées de 60 Tesla, optimisés pour la RMN en termes d'homogénéité et de forme d'impulsion seront conçues et construites. Le banc de condensateur du LNCMP sera modifié afin d'augmenter la durée du champ magnétique autour du champ maximum et afin d'améliorer la reproductibilité de tir en tir. Finalement, nous envisageons d'utiliser la bobine gigogne 77 T, développée au LNCMP, pour la RMN en champ pulsé, ouvrant ainsi l'accès à la gamme de champ 60 – 80 Tesla. Pour valider le spectromètre développé dans ce projet, des expériences pilotes dans les supraconducteurs cuprates et dans les cobaltates seront réalisées. Une fois opérationnel, le système sera mis à la disposition des utilisateurs internes et externes du LNCMP, français et européens.
Projet ANR-06-EMPB-0029 – SERICAP : Microbiocapteur pour la D-sérine
Programme : Emergence et maturation de projets de biotechnologie à fort potentiel de valorisation (EMPB) (EMPB) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR SUD)
Partenaires : Centre national de la recherche scientifique; Université Claude Bernard - Lyon 1
Montant : 148000.0 euros
Date de début : 2006
Durée : 18 mois
Résumé : La D-sérine est un neuromodulateur synthétisé et libéré dans le système nerveux central par les cellules gliales[13]. Cette molécule est impliquée dans plusieurs processus pathologiques comme la schizophrénie [1], l’épilepsie[8], les tumeurs cérébrales[18] ou les accidents vasculaires cérébraux[7] et constitue une cible thérapeutique prioritaire pour l’industrie pharmaceutique. Nous avons mis au point une technique de détection électrochimique de la D-sérine in situ, utilisable dans le système nerveux central de l’animal, sur des tranches de cerveau ou dans des cultures cellulaires. Cette nouvelle technique repose sur l’utilisation de microélectrodes en fibre de carbone métallisées en recouvertes d’une enzyme spécifique de la D-sérine, la D-animo acide oxydase. Elle permettra l’étude des fonctions physiopathologiques de la D-sérine chez l’animal, l’évaluation de composés pharmacologiques susceptibles d’agir sur le métabolisme de la D-sérine, voire des applications diagnostiques chez l’homme.  Le projet de valorisation consistera à trouver un partenaire industriel capable de commercialiser cet outil vers les laboratoires intéressés par la détection de la D-sérine chez l’animal. Nous souhaitons en outre proposer aux laboratoires pharmaceutiques, la mise en place d’essais précliniques chez l’animal afin d’évaluer l’efficacité pharmacologique de nouvelles molécules actives au CNRS, au sein du laboratoire de Neurobiologie Cellulaire et Moléculaire, puis en cas de succès, au sein d’une entreprise créée dans ce but.
Projet ANR-06-ERAP-0011 – PROTEINSTORAGE : PROTEINSTORAGE : An integrated genomic and proteomic characterization of induced seed storage organelles for the optimal production of biopharmaceuticals in plants and plant cells
Programme : Réseau de génomique végétale Genoplante 2010 - programme transnational Européen ERA-Plant Genomics (ERAPG) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : Michel ROSSIGNOL (INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE)
Partenaires : Entreprise autre que TPE ou PME; Institut national de la recherche agronomique; TPE
Montant : 274378.0 euros
Date de début : 2007
Durée : 36 mois
Résumé : The scientific objectives of the Project aim towards developing a comprehensive understanding of the genome and proteome of rice and Arabidopsis, in the first tier but also tobacco, a species that has unique attributes for specific applications in the field of molecular farming. The project?s key objectives are: (1) Understand qualitative and quantitative changes in protein composition a plant undergoes during the formation of endogenous and induced storage protein bodies (PBs) at the genomic and proteomic levels; (2) characterize the final protein composition (proteome) of induced storage bodies in order to understand the mechanism of PB formation, specifically focusing on their use as production tools and delivery vehicles for molecular farming applications; (3) establish a knowledge basis, founded on proteomic and genomic characterisation, that will allow identification of genes and proteins that might influence either positively or negatively the accumulation of exogenous proteins in plants and plant cells; (4) use the above knowledge to propose more refined strategies for maximizing productivity of valuable recombinant proteins for molecular farming applications and test these using a commercially relevant protein (EGF, Epidermal Growth Factor).
Projet ANR-06-ECOT-0010 – ECODEFI : ECOconception et Développement de méthodologies
 de Fabrication Innovante de machines d’épandage
Programme : Programme Ecotechnologies et Développement Durable (PRECODD) (PRECODD) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : IRSTEA CENTRE DE CLERMONT- FERRAND (IRSTEA CENTRE DE CLERMONT- FERRAND)
Partenaires : Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement; CETIM; ETABLISSEMENTS MICHEL PICHON; Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture; SIRTEC; Université d'Orléans
Montant : 450844.0 euros
Durée : 48 mois
Résumé : Le projet porte sur l’éco-conception appliquée aux technologies de l’épandage, pour répondre à deux enjeux majeurs : 
D’une part, le recyclage des effluents organiques issus de l’industrie et de l’épuration des eaux représente 11 millions de tonnes de liquides chargés – boues – composts – granulés qui doivent pouvoir continuer à apparaître en positif dans le bilan environnemental de la filière, grâce à la valorisation agricole. 
D’autre part, ces technologies, réputées « sales », disposent de marges d’amélioration de leurs performances environnementales, permettant de réduire à la source les risques de pollution des agro-écosystèmes. 
A partir d’ACV types, l’étude vise à identifier et à hiérarchiser les impacts spécifiques par type de technologie, ce qui permettra d’élaborer le cahier des charges fonctionnel des machines (indicateurs et objectifs de performances), pour partir sur 2 voies d’études parallèles : l’évaluation des performances environnementales (éco-évaluation) et l’éco-innovation. 
La mise à l’épreuve sur cas concrets se situe au cœur du dispositif, avec les industriels en contribution et validation. Ils sont accompagnés de leur syndicat professionnel et du CETIM pour assurer l’appropriation et la diffusion des résultats.
Les carences méthodologiques (recherche finalisée) que ce projet se propose de lever : 
  - Besoin d’adaptation des méthodes d’« Analyse de Cycle de Vie » (ACV) en créant une base de données sur les impacts spécifiques (nitrates, compaction, …) 
  -  Création de protocoles spécifiques d’éco-évaluation mettant en jeu des paramètres à mesurer pour qualifier ces technologies (volet de recherche expérimentale) 
  -  Appui aux BE des constructeurs en éditant un ou des guides pratiques dédiés aux PME de ce secteur. 
Les questions de recherches (plus fondamentales) que le projet se propose de faire avancer : 
  -  Comment concilier et résoudre les contradictions d’objectifs tant environnementales qu’économiques grâce au formalisme des théories d’innovation propres à générer des technologies de rupture ? 
  -  Comment jouer sur les deux composantes majeures que sont «le matériau à épandre» et «le matériel pour épandre » ? 
  -  Comment travailler sur de nouvelles «unités fonctionnelles» en passant en particulier de la dose/ha à la dose/cible en intégrant une échelle de spatialisation pertinente ?
Projet ANR-06-ECOT-0014 – NITRADIRECT : Développement d'un capteur simple et économique pour la mesure en continu et in situ de la teneur en nitrate dans les eaux
Programme : Programme Ecotechnologies et Développement Durable (PRECODD) (PRECODD) 2006
Année de financement : 2006
Coordinateur du projet : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B  (CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - DELEGATION REGIONALE ILE-DE-FRANCE SECTEUR PARIS B)
Partenaires : Association Française pour l'Étude des Irrigations et du Drainage; Centre national de la recherche scientifique; Institut national de la recherche agronomique
Montant : 361956.0 euros
Date de début : 2006
Durée : 36 mois
Résumé : En France, la pollution par les nitrates est l’un des problèmes environnementaux majeurs. Le suivi en continu de la qualité des eaux de surface est primordial pour la gestion de la ressource en eau.
L’objet de ce projet est de développer une sonde de mesure en continu et in situ du nitrate (et nitrite), dans les eaux courantes plus ou moins chargées, pour différents types d’utilisateurs qui vont de l’agriculteur jusqu’à l’exploitant d’usine de traitement des eaux usées.
L’ensemble capteur et électronique associée devra permettre des mesures fiables sur le terrain, sans avoir à effectuer un étalonnage quotidien. La méthodologie proposée est une détection ampérométrique avec une électrode en matériau composite sensible aux nitrates et/ou aux nitrites.L’objectif à terme est de pouvoir disposer d’un capteur bon marché, fixe ou portatif, qui pourrait être installé sur un grand nombre de stations de mesure de la qualité de l’eau, qui pourront être reliés en réseau de surveillance. Ce projet a été évalué par le comité d’orientation RITEAU le 13 avril 2005. Il a été classé en première catégorie (avis favorable). Il a également été proposé dans le cadre du programme PRECODD en 2005.