Projet ANR-15-CE20-0014 – Deffilait : Améliorer l’efficacité alimentaire des vaches laitières : comprendre les déterminants grace à de nouveaux outils de phénotypage pour mieux l’évaluer et élaborer des stratégies de sélection génétique en fonction des conditions d’élevage
Programme : Biologie des animaux, des végétaux, des micro-organismes et adaptation aux changements environnementaux (DS0501) 2015
Année de financement : 2015
Coordinateur du projet : Monsieur Philippe FAVERDIN (UMR 1348 Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage)
Partenaires : PME; Divers privé; Laboratoire public; Laboratoire public; Génétique Animale et Biologie Intégrative; Laboratoire public
Montant : 703428.0 euros
Durée : 48 mois
Résumé : Le secteur des productions animales est particulièrement sensible au contexte alimentaire mondial, à la fois par l’augmentation attendue de la demande des produits animaux, dont le lait, et par son empreinte écologique qui doit être réduite. L’amélioration de l’efficacité alimentaire (FE) des vaches laitières contribuerait à réduire certaines des émissions directes de GES grâce à la meilleure conversion des aliments, mais aurait aussi un impact positif sur les émissions induites associées aux grandes cultures. L’amélioration génétique de la FE constitue une stratégie particulièrement intéressante car elle peut concerner la plupart des élevages laitiers avec un coût limité. La diminution de l’utilisation d’aliments grâce à ces gains d’efficacité donnera un avantage compétitif au secteur de la production laitière, mais contribuera également à réduire ses impacts sur l’environnement. Ainsi, ce projet devrait fournir des éléments essentiels à des stratégies de sélection génétique sur la FE des vaches laitières. Il correspond au 5ème défi sociétal majeur de l’ANR et à la priorité de recherche d’APIS-GENE sur l’efficacité alimentaire et la réduction des émissions de GES par les ruminants.
Sélectionner sur la FE est plus difficile qu’il n’y parait. La robustesse et la capacité adaptative, en particulier pour les femelles reproductrices, peuvent être contre-sélectionnées par des stratégies d’amélioration de l’efficacité alimentaire. Ainsi, le choix des indicateurs utilisés pour estimer la FE est particulièrement important, et il est essentiel de vérifier et de valider les bénéfices escomptés de telles stratégies sur l’amélioration à long terme de l’efficience. Un autre enjeu majeur consiste à mieux valoriser les nouvelles possibilités de mesure afin de cibler les caractères qui contribuent à la FE. Ces caractères ont rarement été étudiés car ils sont difficiles à phénotyper. Ce projet va ainsi utiliser de nouvelles technologies de phénotypage pour développer une sélection sur l’utilisation efficiente des réserves corporelles, tout en limitant les effets indésirables sur les autres fonctions.
Deffilait va tout d’abord développer de nouvelles méthodes de phénotypage à haut-débit pour les caractères biologiques qui sont directement impliqués dans la FE. Il va produire de nouveaux outils pour caractériser l’état corporel, la morphologie et l’efficacité digestive pour des études avec des effectifs d’animaux importants. Ces mesures phénotypiques permettront aussi d’améliorer les possibilités de conseil en fermes, de monitoring dans les élevages qui sont autant de leviers de l’amélioration de l’efficience à l’échelle de l’exploitation laitière. Pour étudier les déterminants majeurs de la FE, le projet élaborera une base de données originale de lactations de vaches laitières incluant de nombreux phénotypes capables de décrire les principales sources de transformation de l’énergie, pour expliquer la variabilité de FE observée entre animaux. Cette base de données sera ensuite utilisée pour  quantifier la contribution des différents mécanismes dans la variabilité de FE et pour tester l’aptitude de différents indicateurs et stratégies pour l’amélioration de la FE. La mobilisation des réserves corporelles en début de lactation fera l’objet d’un focus spécial pour évaluer ses composantes génétiques et les corrélations avec les autres caractères en utilisant une grande base de données impliquant des fermes commerciales. Le projet développera ensuite des outils de simulation pour prédire les conséquences à court et long terme de différentes stratégies de sélection dans différents environnements d’élevage. Les résultats attendus contribueront à une meilleure définition des stratégies de sélection combinant efficience et robustesse. Ce projet fournira un cadre cohérent pour entreprendre une sélection génétique équilibrée sur ces caractères et apportera ainsi une contribution significative et durable à l’amélioration de l’efficacité alimentaire.