Jeu de données : INPN - Référentiel taxonomique TAXREF
Titre : TaxRef v13 - Problème niveaux de Rang indisponibles
Date : 2020-02-25 16:38

Bonjour,
Dans le cadre de futurs rapportages de données à l'OFB, je suis en train de créer une base de données afin de stocker le comptage de différentes espèces et la mesure de différents paramètres sur le milieu marin.
J'ai donc effectuer le téléchargement d'une extraction des espèces marines métropolitaines via votre site internet, afin d'utiliser le TaxRef comme mon référentiel espèce, nos anciennes base de données ont été créer sur la base du Worms, et son identifiant AphiaID. Le problème que j'aimerais soulever ici est que de nombreuses identifications réalisées pendant nos comptages in situ ne se font pas jusqu'à l'identification de l'espèce, mais s'arrêtent à un niveau supérieur. Hors, le tableau qui m'a été donné en téléchargement ne possèdent ni les niveaux de rang "Famille" et "Genre". Ce qui me pose un problème puisque je n'ai pas d'identifiant pour lier mon comptage au référentiel espèce.
Auriez-vous une solution ? Faut-il que je télécharge directement l'ensemble du TaxRef (je ne sais pas si les rangs Famille et Genre sont alors disponibles) ? Je suis passé par cette étape tout à l'heure mais ayant vu que certaines champs avait des problèmes d'encodage (caractère spéciaux, accent, etc.) je me suis tourné vers l'extraction des espèces marines.

Bien cordialement,

X, Ingénieur au GIS Posidonie
Bonjour,
effectivement la meilleure solution est de télécharger le référentiel dans son ensemble. Les familles et les genres sont disponibles. 
Concernant l'encodage, il se peut que sous excel cela pose problème d'ouvrir les fichiers directement. Il faut ouvrir une feuille vide et passer par le menu importer et choisir utf8 comme encodage. Je vous invite à prendre contact avec X *** en charge du référentiel pour plus d'informations.

Cordialement,


Annotation : Problème de granularité  (Exploitabilité)