Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Données incid
Date : 2020-04-08 11:17

Bonjour,

Jusqu'à présent je calculais le nombre de nouvelles hospitalisations par la formule suivante : hospitalisations_cumulees_a_ce_jour - (hospitalisations_cumulees_de_la_veille - nouveaux_rad_du_jour - nouveaux_deces_du_jour)

Je viens de découvrir le nouveau fichier incid qui publie les nombres quotidiens des nouvelles hospitalisations / réa / rad / décès. J'y vois en revanche quelques incohérences si on le couple avec le fichier des données hospitalières du covid :

- Pour le département de l'Ain (01) les chiffres commencent le 18/03 avec 2 hospitalisations en cours et 1 retour à domicile cumulé. Chiffres qui ne changent pas jusqu'au 21/03 où le nombre d'hospitalisations cumulés est de 4 et les retours à domicile toujours de 1. Logiquement on devine 2 nouveaux cas d'hospitalisations, mais le fichier incid indique 4 nouvelles arrivées le 21/03 et aucun nouveaux retours à domicile / décès entre temps. 

Ce n'est qu'un exemple parmi d'autres, est ce quelqu'un saurait m'éclairer ? 

En vous remerciant

Rectificatif du précédent message : "jusqu’au 21/03 où le nombre d’hospitalisations EN COURS est de 4"

Au temps pour moi
Meme constat que vous 
Pour completer si je fais la somme de la colonne incid_rad : je trouve 99 depuis le 19/03 auquel il faudrait ajouter le 1 connu au 18/3 , ce qui donne 100 , or à aujoudhui le bilan de l'Ain est de 97 ... . 
Je vais donc deja regarder les écarts par departement en rad et dc entre les 2 fichiers . A suivre
Merci pour votre réponse. Effectivement, j'ai fait le même calcul que vous le cumul des rad. C'est à n'y rien comprendre.. Bon courage !
Au niveau réa on retrouve à peu près les chiffres nationaux annoncés ces derniers jours , 
par contre au niveau national , je trouve de gros écarts avec la methode de calcul que j'utilisais comme vous pour les nouveaux hospitalisés et ce fichier , le nouveau fichier est systematiquement plus fort  autour de 300 , parfois plus parfois moins. Il y aurait bien une explication sur les transferts qui augmenteraient les chiffres fictivement mais pourquoi tous les jours en nombre aussi important ?
Pour les déces , ce sont à peu pres les memes resultats en delta d'un jour sur l'autre 
Pour les retours à domicile , un écart plus important souvent autour de 60 toujours plus fort dans le nouveau fichier 
Peut-être que mes neurones commencent à lâcher suite à autant d'incompréhensions mais.. 

- Si on additionne les nouvelles hosp du fichiers incid du 07/04 pour toute la France, on arrive à 3277 nouvelles hospitalisations pour la journée d'hier. Si j'applique la méthode décrite dans le premier commentaire, j'arrive à 2986 nouvelles hosp. Le site dashboard.covid19.data.gouv.fr en indique 305 (ce qui équivaut à soustraire les hosp d'aujourd'hui à celle de la veille sans prendre en compte les nouveaux rad et décès). Ce qui fait quand même une différence énorme. A quelles données se fier ? 
- Même chose pour les réanimations, si on additionne les données du fichier incid pour la journée d'hier on compte 518 nouveaux cas en réa, 653 avec la méthode du premier commentaire et 59 seulement pour le site dashboard du gouvernement.

Je suis perdue.  
Je trouve aussi des écarts significatifs sur toutes les catégories, hospitalises, guéris,  deces.
Pour les rea , on n'avait rien à  ce jour que l occupation des lits de rea, donc pas de comparaison possible , car pas d entree et pas de sorties connues, maintenant on a les nouveaux du jour en rea, on peut juste en déduire le nombre de sorties de rea mais pas leur situation, décès ou hopital
J utilisais la même méthode de calcul pour les nouveaux hospitalisés,  variation d un jour sur l autre de la somme des hospitalises + guéris + decedes
J'ai contacté un de développeurs du site dashboard.covid19.data.gouv.fr, et je me permets de vous partager sa réponse concernant les "nouveaux cas" d'hospitalisation : 

"En effet depuis quelques jours Santé publique France publie 4 indicateurs supplémentaires complémentaires des anciens.
Auparavant on parlait d'hospitalisations en cours, avec une variation quotidienne que l'on pouvait calculer.
Le nouvel indicateur parle des nouvelles hospitalisations. Nous allons affiner nos discours pour que tout soit le plus clair possible.

Pour illustrer, si j'ai 400 personnes actuellement hospitalisées le jour 1, 100 sorties et 150 entrées le jour 2, j'aurais +150 nouvelles hospitalisations, et +50 hospitalisations en cours."

Il explique donc que le "+305" est la variation quotidienne et non le nombre de nouveaux cas. 
Je ne comprends pas avec vos chiffres, le + 305 correspond à 150 nouvelles hospitalisations ou pas . 
Parce que si c'est la différence entre les lits du jour et les lits de la veille, cela ne sert à  rien....
Les 150 nouvelles hospitalisations était un exemple fictif utilisé par le développeur dans son e-mail pour illustrer son propos. Le +305 est le chiffre qui apparait sur le site dashboard.covid19.data.gouv.fr, données réelles donc après explications ce n'est juste le total cumulé d'aujourd'hui - celui de la veille. 

Effectivement, je trouve que partager les "variations quotidiennes" au lieu du réel nombre de nouveaux hospitalisés n'est pas seulement peu signifiant mais surtout trompeur.
Il y a quelque chose qui ne va pas dans les chiffres .
Le delta que je calcule tous les jours tourne autour de 2500 nouveaux hospitalisés tous les jours (voir plus bas )
Le delta de lits d'hopitaux occupés était hier +302 lits d'après les données hospitalières 
La somme des nouvelles entrées pour le 7 est dans le fichier incid est de 3277 
Donc cela ressemble plus qd meme à un vrai nombre de +3277 nouveaux entrants en hopital,
Cependant dans ce fichier incid il y a 291 cas de plus que dans les données hospitamières. 

Comment comprendre cet écart , ce ne peut pas etre l'écart des lits occupés entre 2 jours , cela voudrait dire qu'on les compte 2 fois  , puisqu'ils sont déjà dans le delta entre les 2 jours des données hospitalières  ??? 

Exemple de mes calculs sur les derniers jours , peut etre avez vous les memes

04-04 	2572.0
04-05 	1846.0
04-06 	2494.0
04-07 	2986.0
Il y a des incohérences dans tous les départements et presque tous les jours entre les deux fichiers.
Il est possible que les chiffres ne soient pas arrêtés à 14h00 dans le fichier nouveaux-covid.
peut etre mais tous les fichiers ci dessus sont suffixes à la meme heure qui est une heure de publication je reconnais , mais qui aussi devrait assurer leur cohérence 
On aimerait tous avoir une réponse des animateurs du site ?
j'ai effectivement les mêmes chiffres que vous (2804 pour le 04-08). Concernant le problème dont je parle dans le premier commentaire (en prenant l'exemple de l'Ain), le développeur m'a répondu ça par mail :

"Il y a des biais. Si une personne est hospitalisée pour suspicion de COVID puis testée négative elle quitte les chiffres."
 on a déjà vu ce type de réponses dans d'autres discussions qd on s'étonnait que le nombre de gueris ou de décés baisse brutalement 
Dans ce cas il faudrait parler de suspectés covid et on n'a pas à chercher une correlation entre les entrées hopital qu'on nous propose et notre précédent calcul  qui lui devrait etre correct (quoique qd on voit les variations brutales dans les sorties?)
Je crois que dans ce fichier je vais juste regarder les entrées rea  : qu'en pensez vous ?
Je suis d'accord avec vous. C'est la seule donnée que ne permettait pas d'obtenir l'ancien tableau, dont les chiffres ont toujours correspondu avec les différentes annonces et conférences de presse.
Je continuerai de faire des soustractions pour obtenir le nombre de décès et de retours à la maison quotidiens, et une addition de ceux-ci avec le delta des hospitalisés pour obtenir le nombre de nouveaux entrants à l'hôpital.
tous sexes tous départements 8 avril 2020
**** source                                / hosp  / rea  / rad	/ dc				
**** "données hosp"                  / 3030 / 15   / 1917 / 541    
**** "données hosp nouveau" 	/ 3139 / 482 / 2022 / 562
avec pour les "données hosp"  : hosp = hospj - hospj-1 + radj-1 + dcj-1    et    rea, dc et rad = valeur j - valeur j-1
c'est cohérent pour hosp, rad et dc, 
mais pourquoi 15 réa d'un côté et 482 de l'autre ?
encore plus fort le 9/4  "données hosp" donne -82 réas ! 
Pour les rea , Les données hospitalieres ne donnent que les lits occupés . Par contre hosp nouveau donnent les nouvelles personnes envoyées en rea 
Une remarque sur votre calcul : hosp = hospj - hospj-1 + radj-1 + dcj-1 

Pour moi nvx hosp = hospj - hospj-1 + radj-radj-1 +dcj-  dcj-1 
nous sommes bien d'accord c'est ce que j'ai spécifié : dc et rad = valeur j - valeur j-1
j'accorde que j'aurais du changer les sigles pour éviter la confusion
ce qui donne d'ailleurs 
nvx hosp = hospj - hospj-1 + (radj-1 -radj-2) + (dcj-1 - dcj-2)

pour les -82 réas je viens d'entendre à la radio que c'est bien 82 postes libérés
Jean-Yves Le Stang
11 avril 2020 
J’ai fait la même démarche concernant le calcul des flux journaliers obtenus en dérivant les valeurs extraites du fichier “donnees-hospitalieres-covid19-2020-04-11-19h00.csv” …

…et en les comparants aux données brutes téléchargées sur le fichier “données-hospitalieres-nouveaux-covid19-2020-04-11-19h00.csv” qui donne directement les flux journaliers.

Il y a un décalage systématique mais irrégulier entre les courbes, le flux des décès étant environ 280 cas moindre que le calcul effectué à partir du premier fichier et les valeurs de flux de retour à domicile également moindre d’environ 750 cas. Notons que les courbes n’ont un profil (à peu près) identique qu’à partir du 23 mars.

Bizarre, bizarre…

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