Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Méthodologie de la prise en compte des décès le week end
Date : 2020-04-08 14:28

Bonjour, 

J'ai remarqué que au cours des 3 dernières semaines, le nombre de morts annoncé le dimanche est anormalement bas, et celui du lundi anormalement haut. Savez-vous comment les dates de décès sont attribuées ? Est-ce la date réelle du décès, ou est-ce la date de mise à jour de la base de données. Est-il possible que le dimanche, les comptes soient arrêtés plus tôt, et reportés au lundi.

D'ailleurs, les chiffres annoncés tous les jours en début de soirée n'évoluent plus jusqu'à minuit. Hors il doit bien y avoir des décès entre 19h et minuit. Ce n'est donc sûrement pas l'heure de décès qui est prise en compte. Cela complique les analyses
Les données semblent figées à 14h chaque jour. Donc ce n est pas une journée calendaire mais 24h. 
Tous les pays font pareils
Bonjour, d'accord, merci pour l'information. Ca n'explique pas pourtant les écarts systématiques entre les chiffres du dimanche et du lundi (que l'on retrouve dans plusieurs pays d'aileurs)
Écoutez montrez moi un exemple de ce qui vous choque pour qu on parle de la même chose. 
Je ne peux pas mettre d'image, donc je vous donne un liens we transfer: https://we.tl/t-K6Jx7vGrOE
A mon avis les chiffres sont bas car une partie du personnel administratif prend une journée de repos bien méritée. Il en est de même pour le nombre de retours à domicile.
Faire des moyennes glissantes sur 7 jours permet de s’affranchir de ce phénomène et reste un bon outil pour faire apparaître les tendances.
Tout à fait d'accord sur le caractère bien mérité de la journée de repos. Je cherchais juste à comprendre cet écart pour le prendre en compte au mieux. Les moyennes glissantes font des belles courbes, donnent des tendances, mais fausses la donne quand il s'agit de les utiliser pour de la modélisation. Vieux vaut garder les données actuelles, moyenner les points agrandit les erreurs et change la forme de la courbe. Merci pour le retour ! C'est dommage qu'on ne puisse après coup avoir une base de données contenant les jours officiels de décès, plutôt que ceux administratifs
Je partage l'avis de Jeremie D  sur la moyenne glissante qui cacherait des choses

Et pour ma part , je continue à penser que les variations ne sont pas forcement adminsitrative , même après avoir regardé les  courbes sur we transfer 
J'émets l'hypothèse qu'on assiste à des vagues successives d'infection , ces cloches à l'intérieur de la courbe en cloche sont d'ailleurs décrites dans le MOOC d'épidemiologie de JHU que j'ai commencé à regarder. 
Je vois aussi des variations en semaine à coté des dimanche/lundi  et l'italie a aussi des variations interessantes du coté des entrées à l'hopital qui remontent en ce moment même si les courbes d'hospitalisation et rea baissent , il sort plus de personnes des hopitaux que celles qui rentrent , mais il en rentre encore beaucoup.
Je ne pense pas qu'on prendrait le risque de mal interpreter les données pour des pbs administratifs de saisie (quoique avec les saisies ESMS des questions se posent) 

Mais ce n'est pas le fond du probleme à mon avis.
Pour la France, si on veut regarder les variations,  bien regarder celles des nouveaux cas entrants , j'imagine que ce sera un  bon critère de sortie progressive de confinement ,   au niveau regional pour commencer
Dans le rapport du 9/4 on trouve cette phrase :
** Les nombres journaliers des nouvelles admissions de patients COVID-19 en réanimation et des nouveaux décès montrent une diminution au cours de la semaine 14 (entre le 30 mars et le 5 avril) (Figure 11). Cette diminution ne se confirme pas dans les premiers jours de la semaine 15 (6 et 7 avril). Une part de la hausse observée pour-rait être cependant liée aux rattrapages des saisies des données d’hospitalisation du week-end. Les données pour la semaine 15 permettront de confirmer cette hypothèse. **

Donc Jeremie D a sans doute raison



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