Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Colomne Sex
Date : 2021-01-10 18:34

Bonjour,

J'ai voulu savoir le détails derrière le codage de 0, 1 et 2 pour la colonne sexe.

En vous remerciant d'avance
Bonjour,

1 pour les hommes
2 pour les femmes
0 pour les 2 (attention 1+2 est différent de 0 car certains patients ne sont pas référencés homme ou femme)
Bonjour , la repone de X est importante.
Quand vous utilisez des données , ayez des doutes. Le prelevement de donnée est soumis à des erreurs.
Le sexe peut parfois etre inconnu , non pas pour des raisons transgenre, simplement car le document original n'a pas été précis ou une erreur de reporting.
De plus , une heure de sortie , un nombre de personnes hospitalisées , un deces  ... sont des evemenemt differents avec des heures approximatives .
Bref , a 19 h on ne sait pas completement la situation , des choses peuvent etre reportées sur le lendemain.
Ceci est vrai dans tous les domaines où on tente d'avoir une situation precise a l'instant T.
Par contre , un chu est quand meme censé savoir a peu pres combien de personnes sont la et les motivations de depart.
Bonnant malant , ces chiffres sont corrects sur plusieurs jours (une personne arrivée un jour non saisie le sera qq heures apres) 
Ensuite , j'ai vu des correctif "brutaux". Le vrai probleme est que ces correctifs concernent des notion du passé.
Par exemple ,"declassifier" des gens covid ou recevoir des données d'un hopital qui ne les communiquait pas , peu importe la raison, ce sont des erreurs. Sauf que ces erreurs sont datée du jour courant (par choix) pour ne pas perturber le passé , des fois on peut avoir des trucs bizarre. Faut faire avec quand y'a des trucs louches assez importants , les raisons on ne les connait pas.   
Dans l'ensemble , les données hospitalieres me paraissent consistantes et seraient tres difficiles a falsifier sur la durée.
Le -1 mort , je l'ai vu, ca me choque pas.
Reste , la classification Covid à l'hopital , on peut supposer qu'un accidenté de la route n'est pas classé covid (sinon on a un gros probleme) , une personne ayant une grippe ou une autre truc serieux, c'est plus ambigue. 
C'est comme ca , les chiffres sont imparfaits dans tous les domaines quand on regarde un systeme qui evolue au cours du temps , y compris ici. 
L'inetret des données hospitaliere est que la personne qui y entre , c'est pas pour son plaisir alors c'est traité de facon serieuse.


Bonjour, 

C'est d'autant plus vrai que les données sont "arrêtées" à 14h pour diffusion à 19h. Ça a provoqué des quiproquos au début car certains journalistes (mars avril) avaient des chiffres différents. Normal : le journaliste passera journée à  l'hôpital (ou pour le moins contacte l'hôpital ou les hôpitaux en fin de journée) et trouve 3 décès (par exemple). Dans les fichiers fournis ici, seulement 1 décès. Le "truc" c'est qu'à 14h (dans la matinée donc) il n'y avait eu qu'un décès à déplorer. Mais après 14h 2 décès. Non pris en compte le jour même mais dans le fichier du lendemain. Après tout dépend du besoin : si on fait juste des statistiques, des prévisions etc. j ou j-1 ou j+1 ne change pas grand chose. Par contre si on est responsable de service de réa, il faut avoir les chiffres au jour le jour pour savoir comment réorganiser son service. Et là on est même dans le cas "réorganisation des services" puisque certains sont transformés en service de réanimation alors qu'ils ne l'étaient pas. Les impacts sont importants. 
Autre point : si une personne a des symptômes de la covid-19, elle est notée "covid probable". Ensuite il y a un test PCR, pour la plupart, qui est pratiqué.  Si jamais le test s'avère négatif, la personne est retirée. Mais 3 jours plus tard (temps moyen d'obtention d'un résultat de test PCR, en tout cas jusqu'à l'automne). Les autorités ont, probablement, décidé de faire comme cela pour éviter les remarques genre "vous trafiquez les données" si jamais on revenait 3 jours en arrière en disant "finalement il n'y a pas eu x hospitalisations le y mais z". Mais il faut le savoir sinon on a des valeurs négatives principalement pour les départements qui ont très peu de cas. Le souci c'est quand un hôpital garde ces corrections plus de 6 mois et envoie tout d'un coup : ça fait -50 cas en une seule fois. Quand on est dans un creux de "vague", ça se voit.
Bonjour,

Tout ça serait bien moins problématique si, comme ça se fait ailleurs (Suisse par ex.), tous les patients entrant à l'hôpital pour Covid (suspecté ou confirmé) étaient enregistrés individuellement de manière anonymisée dans une base de données dont des colonnes contiendraient leur âge et leur sexe, leur lieu de résidence (au moins au niveau département), l'identifiant de l'hôpital où ils sont admis, et les dates exactes de tous les événements les concernant (admission à l'hôpital, entrée en réa, sortie de réa, décès, retour à domicile). 
Un fichier pourrait être produit quotidiennement par export de cette base de données. Inconvénient : rien que pour la Suisse, 8 millions d'habitants, ce fichier est énorme (je l'ai téléchargé une fois mais ne recommencerai pas vu la façon dont mon tableur ramait). Mais ça pourrait se gérer en n'exportant que des enregistrements créés ou modifiés depuis la journée précédente).
Avec un système bien conçu, la charge de travail nécessaire pour mettre à jour cette base ne serait probablement pas plus importante pour les hôpitaux qu'actuellement. 

Mais je suppose que si c'est possible en Suisse (dans un pays pourtant moins centralisé), c'est parce que les systèmes informatiques des hôpitaux y sont moins hétéroclites et/ou moins archaïques qu'en France. Et sans-doute aussi parce que l'administration fédérale suisse avait compris ce besoin avant le Covid et mis en place les moyens nécessaires pour assurer le suivi d'autres épidémies. Alors qu'en France… En tant qu'ex-informaticien, je suis effaré par ce que je constate depuis que je m'intéresse à la question; et en tant que citoyen par le manque d'efficacité de notre système de santé (pourtant largement grevé par les coûts administratifs) quand il s'agit de partager des données pourtant essentielles.

Remarque, dans un domaine beaucoup plus pointu, ça a l'air encore pire à propos des données de séquençage du génome du virus, que les hôpitaux français soit ne produisent pas (parce que ça coûte et/ou que ça n'intéresse personne dans les services concernés), soit ne partagent pas (je ne sais pas si c'est parce que chaque chercheur conserve jalousement ses résultats pour pouvoir publier avant ses collèges/concurrents, ou si c'est simplement parce qu'aucune organisation n'a été mise en place pour cela).

Annotation : Descriptions imprécises  (Compréhension)