Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Correlation Météorologique Accélération de l'épidémie
Date : 2020-04-19 11:16

Bonjour,
Une interrogation importante pour l'évolution est l'effet métérologique sur l'épidémie actuelle (témpérature +/- hygrométrie). Une étude italienne en évoque cette possibilité (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.10.20059337v1).
J'aimerai savoir si vous pensez qu'il est possible de croiser les données data.gouv avec celle de la météo.
Les entrées en réanimation sont une donnée qui me semble assez exhaustive. Elle a la particularité de correspondre à une évolution défavorable de la maladie pour une nombre de jour avec un faible écart type (J8 avec pour la contamination + 4J d'incubation).
Pour avoir une idée de l'impact propre de la météo je pense qu'il faut mesure l'accélération de l'épidémie en essayant de normalisé sur les paramètres confondants. 
Soit pour une date cible l'incidence d'entrée en réanimation rapporté à la population à risque de référence (population totale du département ou région), évolution local de la maladie ( le nombre de cas cumulé en réanimation à la date cible rapporté à la population de référence me semble un bon marqueur), age moyen de la  population de référence, densité de population.
La présence d'une corrélation géographique entre ce paramètre et la météo à J-12 permettrait de suggérer un impact climatique. 
Je n'ai pu lire que le résumé de l'étude , mais si je comprends bien elle est basée sur la température moyenne et ils essayent d'établir une correlation epidemie température entre differentes regions , mais ce n'est pas forcement encore validé ?. 

Pas forcement simple , en tous cas pour ce qui me concerne, mais si la méteo a une influence , quels parametres sont réellement influents pourquoi se limiter à la température , pourquoi pas aussi la pression , l'hygrometrie ou la pollution . 
Et en quoi la température est influente , si il fait chaud les gens sortent plus ou est ce un vecteur de propagation ?
Je me méfie un peu des corrélations de ce type s'il n'y a pas une théorie un peu plus poussée ( mais j'ai peut etre mal lu)

Je viens de parcourir le pdf . Bon ...
Je viens de relire , mais pas plus convaincu , on dirait que l'hypothese est que le virus est uniformément répandu dans le pays et qu'il se développe plus ou moins en fonction de la température . Cette première hypothèse d'uniformité me parait très douteuse . 
Ensuite en Italie il y a d'autres regions proches de la Lombardie qui n'ont pas été touchées avec la meme intensité 
Puis les éléments disseminateurs comme les rencontres religieuses (Corée, Mulhouse) ou Foot (Bergame) n'ont elles pas une influence plus majeure sur la suite pour un virus très virulent, en tous cas d'un ordre supérieur à celui de la température moyenne ( et pourtant il fait chaud dans les stades et les bars).
J'aimerais qd meme voir les résultats pour la France (à mon avis plus intéressante que l'Allemagne du point de vue diversité climatique ce qui du coup ne prouve pas grand chose si les mesures préventives sont d'ordre 1) , cela montrerait sans doute la difference entre Strasbourg et Marseille qui nous intrigue en ce moment , mais l'Ile de France ne me parait pas très basse en température.
Et surtout que fait on de ces résultats basés sur un paramètre sur lequel nous n'avons aucune prise : faudrait il vacciner en fonction de la température d'une ville ? faudrait il confiner en dessous d'une certaine température ? 
Y avez vous trouvé de votre coté des éléments plus intéressants ? 
Je partage vos réserves sur les conclusions que l'on peut retirer d'une telle étude, on sent que les exemples ont été sélectionnés afin de confirmer une idée, avec de nombreux biais de confusion possibles.

Le rationnel de l'impact de la meteorologie repose sur l'analogie avec les autres viroses respiratoire ou la saisonnalité est bien  établit, il semble en effet que l'impact soit plus en lien avec modifications de nos comportements (moins de regroupement en espace confinement, plus d'aération des surfaces).
Le virus étant sensible aux UV et chaleur il ne paraitrait pas insensé que la demi vie de charge virale sur une surface extérieur soit raccourci et diminuai ainsi la probabilité d'un comptage.
L’intérêt pourrait plutôt d'être d'anticiper nos comportement et le degré de confinement en fonction des évolutions climatiques. 

Je comprends la théorie de l'influence de la  température et des UV que vous exposez.

Il existe cependant aussi des cas dans les pays plus chauds et pour lesquels les gens vivent souvent à l'exterieur me semble t il avec à l'inverse le risque de contact, donc où est l'équilibre  entre des facteurs propres aux régions 'froides ' et des régions 'chaudes'  : mauvaise aeration , temperature favorable , mais aussi contacts plus limités  contre bonne aération, température et plus de mélanges de population car on vit dehors ? mais le soir les gens rentrent chez eux , il fait moins chaud et ils rééchangent leur virus ? 
Donc comme vous je ne comprends pas ce type d' étude, qui certes peut donner des pistes de recherches, mais me semble effleurer un sujet serieux (les choses les plus simples sont parfois les plus efficaces , mais regarder la correlation entre 2 courbes me parait un peu faible, surtout qd on parle d'une mesure aussi incertaine que les contaminés qui ne donne meme pas l'intensité de la contamination, je veux parler de la charge virale )   mais qui ne semble pas creuser le pourquoi des variations et en reste à un constat sans compréhension du phénomene et sans action possible. 
Ils auraient très bien pu trouver une correlation avec la couverture nuageuse  ou la pluviometrie ou que sais je ? 

mais j'insiste aussi sur le constat que les épidemies ont dans de nombreux pays un foyer actif de depart qui irradie le reste du pays et cette influence ne semble pas prise en compte en prenant comme fait acquis que le virus est présent partout et on regarde comment la température agit sur son developpement regional , c'est très surprenant

Mais après tout on a bien appris que les masques servent finalement à quelque chose , donc les chercheurs vont peut etre tirer quelque chose de leurs courbes et nous aider à la comprehension du phénomene et en plus on aimerait bien qu'ils aient raison ca justifierait que tout le monde puisse partir en vacances dans le Sud rapidement pour tuer le virus !

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