Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Hospitalisations élevées dans l'Indre (36), mise à jour dans SI-VIC ?
Date : 2020-07-18 10:55

Bonjour,

Le nombre d'hospitalisations dans l'Indre (36) ne diminue guère depuis 2 mois... On reste autour de 80-90 hospitalisations, soit 36,4 pour 100 000 habitants (79 hosp. le 17/07/2020, pour 217 000 hab.). Alors que cette incidence a bien diminué partout ailleurs, certes lentement, mais elle diminue régulièrement.

L'Indre a désormais l'incidence la plus élevée en métropole (hors petite couronne où le 92 est à 37 hosp. / 100 000 hab., le 93 et 94 sont eux à 35 Hosp. / 100 000 hab.), un peu surprenant de voir ce chiffre constant sur 2 mois puisque ce département est en vert sur tous les indicateurs. 

S'agit-il d'hospitalisations en soins de suite et réadaptation, dont la durée en moyen séjour est longue et explique que les patients restent étiquetés COVID dans SI-VIC ?

C'est beaucoup en tout cas (un peu outlier en plein centre de la France) et comme ce chiffre ne bouge quasiment pas, je me demande si SI-VIC est bien mis à jour par les établissements du département ? (indiquer que les patients sont sortis).

Je ne sais pas si je m'adresse au bon endroit cela dit, difficile d'interagir mais je tente quand même.


Bonjour,

SI-VIC a été réutilisé car il n'y avait pas d'autre outil au début de l'épidémie. Il n'était pas vraiment adapté au besoin mais avait le mérité d'exister.
Aujourd'hui, depuis fin mai en réalité, il faut se baser sur le système de suivi SI-DEP (DEPistage)
Plutôt que de vous donner des URLs, je préfère vous donner une méthode pour trouver ce dont vous avez besoin : en haut de la page vous avez un cadre blanc sur une barre bleue qui traverse toute la page, dedans tapez 'covid-19' (ou coronavirus mais vous aurez plus de réponses avec 'covid-19') et prenez les réponses avec des logos 'officiels (etalab, SPF, Ministères ...)
Vous devriez trouver votre bonheur là-dedans.
Et dans une des URLs il est expliqué que le système passe de SI-VIC à SI-DEP
Est-ce que cela éclaircira votre souci, ça c'est une autre affaire ...
Bonjour,

Merci beaucoup de votre réponse.

Je suis d'accord que SI-DEP est plus d'actualité vue la forte proportion de patients pris en charge pour prélèvement uniquement, sans hospitalisation, ni passage réa. 
(j'avais bien trouvé les multiples indicateurs SPF que vous indiquez dont SI-DEP, et le dashboard etalab; mieux vaut éviter les URL...). Je n'ai pas trouvé d'agrégat pour les données Oscour en revanche qui servent au calcul du R (passage aux urgences pour suspicion de COVID-19). Peu importe.

Je m'interroge cela dit sur le devenir de SI-VIC : les hôpitaux le remplisse toujours quotidiennement car des patients sont toujours hospitalisés, et de nouveaux patients pourraient revenir (deuxième vague). Dans votre propos on comprend que SI-VIC n'a plus d'intérêt mais c'est le seul système qui décrit les hospitalisations et réanimation actuellement (?). 

Je voulais juste indiquer ou alerter sur le fait que le suivi pour l'Indre (36) semble erroné alors que dans les autres départements il est cohérent avec les autres indicateurs, ça baisse bien (à cette date). 
Pas d'impact car peu de patients en réa sur ce département donc l'indicateur "rouge / vert" sur l'occupation réa (sae) n'est pas faussé.

Il me semble en tout cas que le système utilise conjointement SI-DEP et SI-VIC puisque certains indicateurs comme la réa proviennent de SI-VIC ?

Pour visualiser le cas de l'Indre, activer le ratio de population ici :  
https://guillaumepressiat.shinyapps.io/covidfrance/

Bonne journée,
Bonjour,

JE ne faisais que reprendre la communication d'ETALAB (et probablement à travers eux SPF) du site sur les tests des labo de villes :

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Point d'attention

Depuis le 29 mai 2020, ce jeu de données n'est plus mis à jour. Le système d’information national (SIDEP) de dépistage du Covid-19 est désormais le système qui fait référence. Vous pouvez retrouver les données de résultats de tests sur le jeu de données "Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19".
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SI-VIC a, malheureusement, de belles années devant lui

Pour le taux R agrégé vous l'avez ici : https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/indicateurs-de-suivi-de-lepidemie-de-covid-19/
Sinon vous pouvez le calculer avec les fichiers 'sursaud'
Si vous continuez à avoir des doutes sur les chiffres de l'Indre, vous pouvez aussi contacter l'ARS de la Région Centre Val De Loire, vous aurez plus de chances d'avoir une réponse qu'ici sur ce type de sujet
Bonjour,

Vu pour le R, merci pour les données "sursaud".

Pour SI-VIC, ce fichier que j'utilise justement pour l'Indre semble bien toujours être mis à jour quotidiennement (19h00) ? je ne vois pas de phrase point d'attention pour ce fichier.
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-hospitalieres-relatives-a-lepidemie-de-covid-19/

pour moi la phrase "Point d'attention" que vous citez fait référence aux prélèvements en labo de ville, pas à SI-VIC sur les hospit., la phrase est ici
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-aux-tests-de-depistage-de-covid-19-realises-en-laboratoire-de-ville/
Les données SI-DEP remplace l'ancien fichier que n'était vraiment pas exhaustif effectivement.

Merci

Cordialement,

oui pardon : je me rends compte que j'ai été peu clair et que ce qui parait une évidence pour moi ne l'est peut-être en fait pas : au début  de l'épidémie tous les cas de covid-19 étaient détectés par les hôpitaux (pour faire court)
Les test de ville étaient quasiment à 0 (moins de 500 certains jours pour l'ensemble du territoire, incluant la Métropole et les DOM-TOM, ce qui est dérisoire)
La référence à prendre en compte pour la circulation du virus était donc aisée à choisir ; il n'y en avait qu'une : l'hôpital et donc les fichiers sursaud ici mis à disposition
Depuis le 11 Mai et la grande annonce, les hôpitaux font de moins en moins de tests et il y en a de plus en plus faits par les labo. Il faut donc faire un mix entre hôpital et labo pour avoir un vrai décompte
Sauf qu'il ne faut plus aller sur le lien 'labo de villes' mais aller sur le lien du SI-DEP
Sauf qu'il y a plusieurs références et je ne sais pas laquelle est la bonne : 
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/capacite-analytique-de-tests-virologiques-dans-le-cadre-de-lepidemie-covid-19/
ou
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/taux-dincidence-de-lepidemie-de-covid-19/
sans compter :
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/indicateurs-de-suivi-de-lepidemie-de-covid-19/
ou
https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-de-la-carte-de-vigilance-covid-19/
...
j'arrête là : il y en a plein d'autres

Mais les 2 1er ne sont pas 'raccord' ... en tout cas ne l'étaient pas quand j'ai commencé à les analyser

Pour revenir à votre 1er question : le site des tests de labo de ville ne devait plus être mis à jour au profit de SI-DEP et pourtant, pendant pas mal de jours il a été maintenu.
Peut-être L'Indre a cessé de le mettre à jour (je parle de SI-VIC) au profit de SI-DEP alors que les autres départements ont continué. à creuser : ce n'est qu'une hypothèse et qui n'engage que moi
Je travaille dans les données de santé dans un CHU donc j'arrive à peu près à suivre !

je suis assez d'accord avec votre hypothèse pour l'Indre, c'est ce que je pense, et je cherchais un moyen de l'évoquer. Resterait à contacter l'ARS donc... 
 
Bonjour,

uste pour dire que je n'ai pas contacté l'ARS car ce n'est pas mon rôle et je n'ai pas de position pour mettre en doute leur travail.

Mais, pour revenir sur ce sujet, faire un retour ici, je constate que dans les données, entre le 4 août et le 6 août :

- 04/08/2020 : 73 patients hospitalisés dans l'Indre
- 05/08/2020 : 54 patients hospitalisés dans l'Indre
- 06/08/2020 : 41 patients hospitalisés dans l'Indre

ce qui ferait 32 patients sortis en deux jours.
Entre temps, le nombre de décès lui reste stable (+1).



Bonjour,

Visiblement le problème a bien est identifié (non saisie pendant les vacances) et est en cours de résolution :

voir presse locale ce jour
https://www.lanouvellerepublique.fr/chateauroux/indre-les-chiffres-alarmants-des-hospitalisation-covid-sont-errones

DELETED

Annotation : Absence de mise à jour (Actualisation )