Jeu de données : Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19
Titre : Intégrité des données de 14/10/2020
Date : 2020-10-15 08:09

Je vois sur Linkedin que nous sommes plusieurs à nous interroger sur l'intégrité des données publiées le 14/10 et qui sont les premières données avec toutes la semaine 41. Il y a plusieurs choses qui posent questions comme une progression de +54% en métropole qui est possible mais étonnante, exactement la même courbe de progression dans tous les départements,...
Etes-vous vraiment certains de votre publication ?
Bonjour,
N'hésitez pas à poser la question à Santé Publique France via le lien "contact" de Geodes : https://casa.santepubliquefrance.fr/index.php/563362


Bonsoir,

Savez-vous si les données du 15/10/2020 seront publiées ce soir ?
Bonjour,

Vu que les données sont à jour sur GEODES, cela devrait arriver. R2ponse plus complète sur le fil "données hospitalières".
Par contre là (tout comme sur le suivi des urgences mais je ne l'ai vu qu'après) il aurait fallu ouvrir un e nouvelle discussion : cette discussion concerne l'intégrité des données du 14 octobre. Vous l'absence des données du 15 octobre. Les 2 sujets n'ont pas de rapport.
Pas de données le 15 juin le jour de la conférence de presse du 1 ier ministre. Faut il y voir une corrélation ?
Bonjour,

Comme indiqué 2 lignes au-dessus : si vous aviez lu la réponse plus complète sur le fil 'données  hospitalières' vous auriez déjà la réponse.

Donc je reprends :

à chaque fois qu’il y a une intervention de notre Président et/ou du 1e Ministre et/ou du Ministre de la Santé les mises à jour sont retardées.
En l’occurrence hier il a fallu mettre en place un suivi des métropoles. "Indicateurs de l’activité épidémique: taux d'incidence de l'épidémie de COVID-19 par métropole" (https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/indicateurs-de-lactivite-epidemique-taux-dincidence-de-lepidemie-de-covid-19-par-metropole/)
Merci Mr X pour toutes ces réponses. C'est dommage que l'indicateur des metropoles ne contienne que le taux sans contenir le nombre de cas positifs, le nombre de dépistage et la population, finalement comme il existe pour les départements. Cela aurait permis de faire un taux métropole et un taux département hors métropole, ce qui est vraiment intéressant et apporte un vraie lisibilité, par exemple pour le site du Syndicat des biologistes : https://www.sdbio.eu/actualites/carte/covid-19-la-video-de-l-evolution-des-cas-positifs-en-france-depuis-du-22-mai-au-30-aout
Et oui! En France la granularité max que l'on nous met à disposition est le département. Là les métropoles (quelques unes) parce qu'il y a une inquiétude pour mais sinon effectivement on n'a pas.
Aux États-Unis par contre on peut faire ville par ville. Comme je suis les USAs depuis pas mal de temps maintenant j'ai vu ça. Mais cela fait des fichiers monstrueux à gérer. À la fois pour les mettre à disposition mais aussi pour les traiter. Imaginez : toutes les villes de tous les états d'un pays grand comme les USAs avec des données chaque jour depuis le 29 février ou aux alentours. Du coup ils agrègent pour avoir par état puis pour le pays.  Ils doivent aussi pouvoir faire par comté.
Pour info la liste des villes sous couvre-feu à partir de la nuit prochaine est ici 
https://www.rtl.fr/actu/debats-societe/coronavirus-la-liste-des-1-683-communes-ou-le-couvre-feu-s-applique-7800904587
Je ne l'ai pas encore vu sur ETALAB ou SPF ou ailleurs sur un site 'officiel'
Comme M. Payeur, je trouve dommage que le nouvel indicateur soit basé sur le taux d'incidence (nb de cas positifs détectés pendant une période donnée pour 100.000 habitants), qui est directement sensible (proportionnel) au nombre de tests réalisés, et dont on ne peut donc pas savoir ce qu'il exprmie. En effet, il mesure à la fois la situation sanitaire et la politique de tests, et à moins d'aller chercher d'autres indicateurs, tels que le  nombre de tests réalisés — qui ne sont d'ailleurs pas disponibles pour les métropoles —  on ne pourra pas faire la part des choses.

Le taux de positivité, bien que très imparfait, aurait été plus lisible.
Alors, conformément à ce que je dis depuis des mois, ETALAB ne nous répond pour ainsi dire pas quand on leur pose des questions, pour autant, ils nous lisent et remontent un certain nombre de points.
Si vous insistez suffisamment, il est possible que vous ayez ce que vous demandez. Pour exemple, au printemps, quelqu'un a demandé à avoir la liste/le nombre de personnes qui avaient été envoyées à l'étranger. Les mouvements de patients entre les départements etc. Après plusieurs demandes/relances, il a fini par les avoir.
Donc si le besoin est remonté, il est possible qu'il soit satisfait ...
Alors à vos claviers ...
Bonjour,



Pour ajouter un peu d’eau au moulin : les 9 villes (métropoles) sous couvre-feu concernent déjà 20 millions d’habitants (si l’on en croit ce que disent les journalistes, je n’ai pas vérifié, il faudrait additionner la population des 1683 communes concernées et je n’en ai ni l’envie ni le temps). Est-ce que ça vaut vraiment le coup de connaître le TI en dehors?
Je parle du ROI sur ce genre d’étude.
Connaitre au niveau du département doit être largement suffisant pour prendre des décisions 'globales'
Après, bien sûr, pour les sujets d'études, cela peut être pertinent.
Mais les hôpitaux étant dans les grandes villes ...
Hello,
What is the data dictionary for region variable (1 to 94)?  Thanks.
Hello,

You can find them there https://fr.m.wikipedia.org/wiki/R%C3%A9gion_fran%C3%A7aise#Niveau_national
Or there https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/code-officiel-geographique-cog/
For the 1st link, go back to the top, find the 1st table, region code is in 3rd column, region name in 4th
bonjour
pourquoi dans le fichier par regions ont trouve des regions 5, 7 et 8 ???
cela ne colle pas avec la liste officielle des régions 
Bonjour,

Explications déjà données ici : https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-aux-resultats-des-tests-virologiques-covid-19/#discussion-5f7d8f8f8ead5775eca7350e-5
Si on peut dire que ce sont des explications ...
bonjour
merci bien :)
décidément champions les codeurs
du coup 5 => 975 ?
merci
Oui : correspond à Saint Pierre et Miquelon
La difficulté n'est pas vraiment là : là où c'est dur de suivre c'est quand il y a des fichiers avec 975 977 978 mais pas d'autres, quand il y a des fichiers classes d'âge avec les classes d'âge tous les 10 ans et une autre plus "exotique" etc. Ça devient difficile voire impossible de faire des recoupements 
merci
oui effectivement on peut faire pire :)
bon courage

Annotation : Incertitude des données  (Fiabilité )