Jeu de données : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Titre : Confirmes en ESMS
Date : 2020-04-15 12:10

Si cela interesse qqun les communiqués officiels du ministere de la santé font maintenant état des confirmes/possibles en EPHAD et surtout établit que les confirmés  en ESMS sont bien compris dans le total officiel

https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/point_de_situation_du_14_avril_2020.pdf

Le site ou on trouve ces CR pdf : 
https://solidarites-sante.gouv.fr/soins-et-maladies/maladies/maladies-infectieuses/coronavirus/etat-des-lieux-et-actualites/article/points-de-situation-coronavirus-covid-19
Ces données comme d'autres, comme les deces en EPHAD et les données hospitalières  sont enregistrées dans le git hub :
https://github.com/opencovid19-fr/data
qui alimente le dashboard officiel :
https://dashboard.covid19.data.gouv.fr/
justement ça tombe très bien : en cherchant une explication (vaseuse?) des écarts données hospitalières vs nouveaux etc j'ai relevé quelque chose de troublant :
sur le dashboard du gouvernement : décès +541
sur SPF : +559
avec données hospitalières : +541
avec "nouveaux" : +559

si on lit la tuile (astérisque) sur SPF, on voit que les 559 sont des décès à l'hôpital + ESMS
sauf que la différence des décès en ESMS de J et J-1 est de 221 (dashboard)
541+221=762
Que sont ces 18 de différence? Des personnes décédées sur la route entre ESMS et hôpitaux?  L'hôpital ne les considère pas comme des décès "hôpitaux". Pareil pour ESMS?
la somme totale de décès en ESMS est de 5600 (données hospitalières). Si 18 sont comptabilisés en hôpitaux alors ça fait 5600 - 18 (et moins si d'autres sont comptabilisés de la même façon depuis plus de temps)
j'ai écouté attentivement le Pr Jérôme SALOMON ce soir et quand il a parlé des 19 décès en DOM, j'ai pensé que cela pouvait être cela.
Mais ce soir on a : dashboard officiel : +514. SPF : +524
si vous avez une idée
Commentaire : normalement le sujet de cette discussion est les confirmés vs possibles en ESMS . Mais bon
Pour ma part je ne pense pas que les décédés DOM expliquent l'écart car les décédès DOM à part les 2 décès de Saint Martin sont dans les départements suivis dans les fichiers habituels.

Pour ce qui concerne les différences entre les données , j'ai précisé dans la discussion qui suit que les nouveaux hospitalisés viennent en fait du fichier incid qu'on a un peu de mal à comprendre depuis le début , mais qui semble utilisé pour le portail SPF.
De meme comme vous l'avez dit le + 559 décès  du portail correspond au fichier incid 

Donc tout se passe comme si les delta SPF etaient maintenant calculés avec ce fichier incid et plus par rapport aux données hospitalières .  
La question suivante est donc pourquoi les 2 sources (données hospitalieres et incid) ne sont elles pas cohérentes . 
Il faudrait sans doute faire comparer au ligne à ligne les données entre 2 jours du fichier données hospitalières et les nouveaux incid quand c'est possible  c'est à dire hosp dc et rad et voir si les écarts sont localisés, on va essayer d'y reflechir....
J'ai essayé une vision graphique des differents delta entre les 2  fichiers , elle montre des ecarts  sans compensation le lendemain avec incid pratiquement toujours au dessus des deltas calculés avec les deltas des données hospitalieres (les valeurs de nombre de personnes hospitalisées étant notablement plus élevées , mais dc et rad sont aussi en écart)  , donc les écarts entre ces fichiers restent pour moi toujours aussi mysterieux

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