Jeu de données : Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19
Titre : taux de positivité des tests
Date : 2020-08-24 08:24

bonjour, 
je constate à la lecture des discussions que tous ces chiffres sont assez fragiles, dans les détails. Mais ma question concerne les grandes masses.
J'ai fait un test très simple : 
toutes tranches d'âge confondues, pour france entière, résultats hebdo, j'ai calculé le nombre de tests positifs / nb tests.
Je trouve un résultat en diminution entre S21 et S28, de 1,9% à 1,1%.
Or le site de santé publique France https://www.santepubliquefrance.fr/dossiers/coronavirus-covid-19/coronavirus-chiffres-cles-et-evolution-de-la-covid-19-en-france-et-dans-le-monde 
indique un taux de positivité de 3,6%... 
je ne comprends pas.
merci d'avance pour vos retours
Bonjour, 
La différence avec le chiffre affiché sur le sute de SPF s'explique par pas mal de facteurs :
- Le chiffre a augmenté chaque semaine depuis S28 : pour la dernière semaine connue (S33), c'est 3,1% ;
- Le chiffre de 3,6% affiché sur le site n'est pas une moyenne hebdomadaire : il correspond à un chiffre du "taux de positivité" *quotidien* 
- Le site de Santé Publique France n'est apparemment pas complètement à jour : le dernier taux de positivité quotidien connu (celui du 21 août), fourni aujourd'hui par SI-DEP, est 3,3%. (Le chiffre de 3,6% semble correspondre au 16 août.)

Cela dit, il faudrait aussi corriger la surestimation du "taux de positivité" fourni par SI-DEP et communiqué par SPF. La base de données SI-DEP le définit ainsi : 
taux de positivité = nb de tests positifs / *nb de personnes testées*
Or, le "nombre de personnes testées" est sous-évalué par rapport au nombre de personnes réellement testées. En effet, il ne comptabilise pas les personnes testées négatives ce jour-là (ou cette semaine-là) et qui avaient déjà fait un test dans le passé. Le "taux de positivité" calculé et affiché est donc surestimé par rapport au taux de positivité "réel", que l'on obtient  en calculant : nb de tests positifs / nb de tests réalisés.
En faisant le calcul de cette façon, on trouve, pour la semaine S33 : 2,7% (au lieu de 3,1%) et pour le dernier taux quotidien : 2,8% (au lieu des 3,3% calculés par SI-DEP.)

Pour plus de détails sur l'inadéquation des indicateurs de SPF avec l'utilisation qui en est faite par les autorités et les médias (chercher à mesurer l'évolution de l'épidémie et à prédire l'arrivée d'une 2nde vague), vous pouvez lire ceci : https://blogs.mediapart.fr/enzo-lolo/blog/210820/covid-19-comment-savoir-si-la-situation-sanitaire-se-degrade-ou-s-ameliore
Bonjour,
J'ai dit une bêtise. Le chiffre de 3,6% de taux de positivité affiché par Santé Publique France correspond au nombre de personnes ayant été positives, divisé par le "nombre de personnes testées" sur 7 jours "glissants", à cheval entre la semaine S32 et la semaine S33. Il n'est donc pas "quotidien" comme je l'avais cru, et il est à jour.
Et une deuxième petite bêtise : le chiffre de la semaine S33, même s'il est donné dans les tableaux de Géodes, n'est pas vraiment connu, puisqu'il n'est encore calculé que sur 5 jours. (Les données de samedi 22 et dimanche 23 ne sont pas encore consolidées.)

Annotation : Incertitude des données  (Fiabilité )