ซากพืชและสัตว์จะเน่าสลายมีก๊าซแอมโมเนียเกิดขึ้นจุลินทรีย์บางกลุ่มจะเปลี่ยนก๊าซแอมโมเนียให้เป็นสารจำพวกไนไทรต์และไนเทรต