ทั้งสองประเทศให้ความสำคัญกับประเด็นทางเศรษฐกิจปัจจุบันญี่ปุ่นและเยอรมนีมีเศรษฐกิจดีที่สุดอันดับสามและสี่ของโลกตามลำดับและได้ผลประโยชน์จากการร่วมมือทางการ