CATIE-AQ/frenchKEYWORDS huggingface dataset:
Le but de ce projet de recherche est de développer un modèle de régression bayésien non paramétrique issu de partitions aléatoires dans un contexte d’analyse de survie. Notre objectif final est de construire un système de prévision qui dans un premier temps consiste à regrouper les observations ayant des caractéristiques semblables. Une fois les sous-groupes formés, la survie au sein de chaque sous-groupe est évaluée à l’aide d’un modèle bayésien non paramétrique. Le nombre de sous-groupes dans la population est aléatoire. Nous proposons l’utilisation du modèle de classification de Potts (Murua, Stanberry et Stuetzle [29]) appliqué à l’espace des covariables afin de générer la formation des partitions aléatoires d’individus. Pour toute partition donnée, le modèle proposé dans ce projet suppose une régression de Cox par intervalles avec taux de risque de base Weibull au sein de chaque grappe. Cette méthodologie a été inspiré du travail de Ibrahim [18]. Les estimations et l’inférence sont effectuées à l’aide de méthodes MCMC. Nous utilisons également la méthode d’approximation de Laplace (Shun et McCullagh [36]) pour estimer certaines constantes et proposer des mises à jour de paramètres dans l’application de l’algorithme MCMC. Finalement, nous comparons les performances de notre modèle à celles d’une régression de Cox classique et au modèle bayésien non paramétrique de partition-produit indexé par des covariables, PPMx tout ceci à l’aide de nombreuses simulations. En général, notre modèle a offert des résultats comparables à ceux de ses compétiteurs et s’est avéré dans certains cas le meilleur choix.

Mots-clés : analyse de survie , modèle de Cox , classification , inférence bayésienne non paramétrique , modèles de partition aléatoire , modèle de Potts
L'étude porte sur le développement d'une procédure à base d'ondelettes afin de tester la qualité d'ajustement d'un modèle autorégressif moyenne mobile (ARMA), où l'innovation est une différence de martingales avec hétéroscédasticité conditionnelle. Dans le cadre du modèle ARMA semi-fort, les innovations ne sont pas indépendantes, mais sont présumées des différences de martingales, voir par exemple Francq et al. (2005). Conséquemment, les distributions asymptotiques de type chi-carré pour les statistiques de test de Box-Pierce-Ljung, établies sous l'hypothèse d'indépendance du terme d'erreur, ne sont pas forcément adéquates. De plus, les irrégularités saisonnières dans la densité spectrale de l'innovation pourraient affecter la puissance des tests classiques. Ceci motive l'étude des méthodes d'ondelettes dans le présent contexte, où le terme d'erreur est présumé plus général que composé de variables aléatoires indépendantes.  Afin de trouver la distribution asymptotique de nouveaux tests reposant sur les ondelettes, nous commençons par établir la distribution asymptotique des autocovariances résiduelles basées sur les résidus du modèle ajusté. La densité spectrale exprimée en base d'ondelettes repose sur des coefficients, dits coefficients d'ondelettes. Nous trouvons les distributions asymptotiques des versions empiriques de ces coefficients d'ondelettes lorsque le modèle ARMA est correctement spécifié. Nous montrons que les variances et covariances asymptotiques des coefficients d'ondelettes empiriques dépendent des coefficients du modèle ARMA ainsi que de la structure de covariance du moment d'ordre deux des innovations.  Ces résultats sont utilisés pour construire de nouveaux tests. Nous démontrons que ces statistiques de tests suivent des distributions de type chi-carré asymptotiquement. La performance des statistiques de test proposées pour plusieurs tailles d'échantillon sont étudiées par des simulations de Monte Carlo. Les résultats de nos simulations suggèrent que les nouveaux tests convergent raisonnablement rapidement vers des distributions de type chi-carré, et qu'ils offrent des propriétés de puissance avantageuses comparativement aux statistiques de test classiques, au moins pour certains modèles. Un exemple avec des données réelles illustre la méthodologie.

Mots-clés : Qualité d'ajustement , Modèle ARMA , Différence de martingales conditionnellement hétéroscédastique , Méthode d'ondelettes , Autocorrélation résiduelle , Densité spectrale
Ce mémoire a pour but de donner une introduction simple et brève à la mesure de Mahler et ses liens avec les fonctions-L de courbes elliptiques. Le point culminant de cette théorie se cache dans les conjectures de Bloch-Beı̆linson que nous tentons d’expliquer à la fin du chapitre 2, les deux premiers chapitres servant principalement à développer la matière nécessaire à leur compréhension et à introduire le problème principal de ce mémoire qui est de trouver une relation entre la mesure de Mahler de y 2 + 4xy + 2y − x 3 et la fonction-L de la courbe elliptique associée.  À cet effet, nous remarquons que la relation conjecturée par D. Boyd [1] est en fait fausse mais étudions tout de même les cycles d’homologie et les chemins d’intégration associés aux courbes elliptiques y 2 + 4xy + 2y − x 3 = 0 et (1 + x)(1 + y)(x + y) + 2xy = 0.

Mots-clés : Mesure de Mahler , Courbes elliptiques , Valeurs spéciales de fonctions-L , Polynôme tempéré , Polygone de Newton , Régulateur elliptique
Ce mémoire a pour but d'intégrer une composante adaptative au sein des algorithmes Metropolis à essais multiples (MTM) qui sont un cas particulier des méthodes de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). Les méthodes MCMC ainsi que leurs extensions adaptatives et à essais multiples sont explorées en profondeur (tant au niveau des variations possibles que de leurs propriétés théoriques) afin de bien ancrer l'étude de l'algorithme Metropolis à essais multiples adaptatif (aMTM) proposé. De plus, certains résultats dans la littérature sur les méthodes à essais multiples sont généralisés permettant alors l'obtention de résultats plus généraux à propos de l'algorithme aMTM. L'ergodicité de l'algorithme est ensuite démontrée en utilisant des résultats bien connus tirés de Roberts et Rosenthal (2007), d'Andrieu et Moulines (2006) et de Craiu et collab. (2015) et sa performance empirique est étudiée à travers une série d'expériences de simulation. L'algorithme aMTM arrive notamment à surpasser substantiellement des échantillonneurs plus simples (sans adaptation ou à un seul essai) pour des distributions cibles multimodales ou à géométrie complexe. Enfin, différentes variantes de l'algorithme sont proposées et comparées afin d'identifier des réglages particulièrement plus efficaces. Une implémentation de l'algorithme aMTM est fournie dans un progiciel R appelé aMTM disponible au https://github.com/fontaine618/aMTM.

Mots-clés : Monte Carlo par chaînes de Markov , Monte Carlo par chaînes de Markov adaptatif , Metropolis à essais multiples , Ergodicité
Dans ce travail, nous comparons par simulation diverses méthodes bootstrap d’évaluation de la précision d’une estimation d’enquête pour trois plans d’échantillonnage: le plan aléatoire simple sans remise, le plan de Poisson et le plan de Poisson conditionnel. La plupart des méthodes bootstrap ont été dérivées de manière à reproduire l’estimation habituelle de la variance dans le cas d’un paramètre linéaire comme la moyenne ou le total d’une population. Nous évaluons la méthode d’une part pour estimer la variance et d’autre part pour construire des intervalles de confiance bootstrap en utilisant quatre techniques différentes, à savoir la technique asymptotique, percentile, bootstrap de base et t-bootstrap pour un total, mais aussi un ratio, un coefficient de corrélation, une médiane et un indice de Gini. La manière de mettre en oeuvre le t-bootstrap pour plusieurs méthodes bootstrap est une contribution originale de ce mémoire.

Mots-clés : Estimation de la variance , Intervalles de confiance , t-bootstrap , Plan d'échantillonnage , Échantillonnage à probabilité inégale
Les maladies cardiovasculaires sont la principale cause de mortalité à l’échelle mondiale, dont la survenue de l’infarctus du myocarde et de la mort subite découle majoritairement de la rupture d’une plaque d’athérosclérose coronarienne vulnérable. Les modalités d’imagerie invasive contemporaines permettent d’analyser les caractéristiques anatomiques et morphologiques de la plaque d’athérome, mais ne révèlent aucune information sur la biologie de l’athérogenèse. Ainsi, l’identification des déterminant moléculaires et cellulaires définissant la plaque à haut risque de rupture est l’approche de choix afin d’améliorer nos connaissances sur la maladie coronarienne et pour l’optimisation des traitements actuels. L’objectif principal de ce projet de recherche visait à démontrer la faisabilité d’une technique d’imagerie moléculaire innovante par cathéter bimodal IVUS-NIRF couplé à l’utilisation de sondes d’imagerie ciblant spécifiquement l’inflammation (ICAM-1) et la composition de la plaque d’athérosclérose (fibres de collagène type-I non polymérisées) dans deux modèles animaux distincts de l’athérosclérose.   Les résultats préliminaires contenus dans cette thèse décrivent une technique d’imagerie intravasculaire originale et novatrice permettant la détection in vivo par cathéter de biomarqueurs de l’inflammation et de la composition de la plaque d’athérosclérose à l’aide de traceurs moléculaires fluorescents spécifiques injectés en faible concentration au sein de plaques visualisées par IVUS. Permettant de discriminer avec précision le signal NIRF, le système d’imagerie par cathéter IVUS-NIRF exploité dans ce projet de recherche permet un multiplexage précis du signal NIRF suivant l’injection simultanée de sondes couplées à des fluorophores distincts, offrant la possibilité de cibler simultanément un panel de biomarqueurs à haut risque au sein d’une même plaque d’athérosclérose. Ainsi, cette application d’imagerie moléculaire in vivo est une stratégie prometteuse dont la translation en clinique permettrait d’identifier les processus biologiques clés impliqués dans l’instabilité de la plaque d’athérosclérose coronarienne humaine, un besoin à combler dans la pratique clinique.

Mots-clés : athérosclérose , ICAM-1 , collagène de type-I non polymérisé , sondes moléculaires , fluorescence proche infrarouge (NIRF) , ultrasonographie intravasculaire (IVUS) , biomarqueurs
Ce mémoire traite successivement de prolongements-interpolations et d’approximations de certaines classes de fonctions définies sur des ensembles particuliers. Nous avons ainsi construit des prolongements de classe C m(m fini ou non) pour des fonctions définies sur certains sous-ensembles de R n (demi-espace, quart-espace, slab, ...) Aussi avons-nous prolongé une fonction analytique qui envoie un intervalle ouvert I ⊂ R sur un intervalle ouvert J ⊂ R en une fonction holomorphe envoyant un voisinage ouvert U de I sur un voisinage ouvert V de J. Relativement au volet approximation nous avons considéré avec intérêt le théorème de Burke. Il constitue une généralisation du Lemme de Walsh. Ce dernier est luimême une généralisation du théorème d’approximation de Weierstrass. Nous avons cherché, non sans difficultés, à en mettre au point une preuve plus simple que celle qui a été présentée par l’auteur. Nous avons eu recours au théorème d’approximation de Whitney après l’avoir généralisé du cas des fonctions lisses au cas des fonctions de classe C m où m est fini. Il nous a permis de prouver certaines approximations qui nous permis à la fin de terminer la preuve du théorème de Burke.

Mots-clés : Approximation , Interpolation , Universalité , Holomorphe , Prolongement , Variété
Dans un contexte d'inférence causale où l'on cherche à estimer l'effet causal moyen d'une exposition dichotomique sur une variable issue, le TMLE de M. Van der Laan et D. Rubin est une technique qui applique à une estimation initiale de l'espérance conditionnelle de l'issue une modification ayant pour but de réduire le biais dans l'estimation correspondante de l'effet causal moyen. L'étalon-or en ce qui concerne l'estimation de la variance du TMLE est un estimateur de type sandwich. Divers estimateurs alternatifs sont identifiés et comparés à l'étalon-or lorsque la taille échantillonnale est petite, lorsque les scores de propension sont grands ou petits et lorsque les estimations initiales pour le score de propension ou pour l'espérance conditionnelle de l'issue sont mauvais. À chacun des estimateurs de la variance, un intervalle de confiance pour le TMLE est construit. On trouve que l'estimateur Jackknife donne des taux de couverture équivalents ou supérieurs aux autres estimateurs dans toutes ces situations.

Mots-clés : Inférence causale , TMLE , estimation de la variance , estimateur sandwich , Jackknife
Occupant une position importante dans le paysage littéraire américain et mondial, la poésie d’Emily Dickinson fascine ses traducteurs et relève des problématiques aussi épineuses que passionnantes au sujet de la traduction poétique. En vue d’approfondir des réflexions sur ces problématiques, notre mémoire analyse le travail de trois traducteurs chinois : Yu Guangzhong, Jiang Feng et Pu Long. Nous présentons d’abord l’histoire de la traduction de Dickinson et l’état des études qui s’y rapportent en Chine. Puis nous observons comment ces traducteurs ont rendu trois caractéristiques de l’original : l’hermétisme, l’ancrage culturel y compris l’intertextualité, et la prosodie. S’inscrivant dans un cadre théorique composé des réflexions de Berman, de Folkart et des traductologues chinois comme Yu Guangzhong et Jiang Feng, notre recherche interroge les attentes à l’égard de la traduction poétique, les principes que suivent les traducteurs et les facteurs qui consacrent aux vertus et aux faiblesses des versions en question.  Le mémoire montre que Yu Guangzhong présente une version élégante, harmonieuse et relevant d’un goût propre à la littérature traditionnelle chinoise. C’est une recréation poétique de Dickinson caractérisée par le style de Yu Guangzhong. La traduction de Jiang Feng ressemble à l’original des points de vue de la forme et de l’esprit. Aussi concise et dépouillée que ce dernier, elle contient néanmoins des expressions sèches et ambiguës. Généralement fluide et claire, la version de Pu Long est parsemée d’expressions maladroites, verbeuses et contient un registre plus familier. Malgré son respect du principe de fidélité, chaque traducteur laisse une empreinte unique sur son texte, laquelle reflète sa position traductive et son projet de traduction, ainsi que des écarts entre sa pratique et ses discours traductologiques. Nous adoptons la méthodologie conçue par Berman (1995) et essayons de faire une analyse productive qui inspirerait des retraductions de Dickinson. Notre analyse corrobore deux idées : il convient de suivre une approche analogue à l’écriture du poète ; au lieu de restituer le sens et les caractéristiques formelles isolément, il faut recréer l’unité inséparable de l’esprit et de la forme, des idées et de leur expression, rendre en même temps la « robbe-corps-âme » de l’original.

Mots-clés : poésie , traduction , Emily Dickinson , Yu Guangzhong , Jiang Feng , Pu Long , hermétisme , américanité , prosodie
La présente étude s’inscrit dans le champ de la sociolinguistique et a comme objectif de comparer l’emploi des anglicismes, entre le français du Québec et le français de la Suisse, par les adolescents et les jeunes adultes dans les messages SMS. Pour ce faire, nous utilisons deux sous-corpus, un sous-corpus québécois et un sous-corpus suisse provenant du projet sms4science. Nous retenons le groupe d’âge des 12 à 25 ans pour les deux sous-corpus. Nous utilisons la grille des anglicismes proposée par l’Office québécois de la langue française (OQLF) composée de six catégories : les anglicismes intégraux, les anglicismes hybrides, les anglicismes sémantiques, les anglicismes syntaxiques, les anglicismes morphologiques et les anglicismes phraséologiques. Les résultats montrent que des six catégories d’anglicismes, ce sont les anglicismes intégraux qui sont les plus répandus tant chez les Québécois que chez les Suisses et que ce sont les jeunes de 18 et de 21 ans qui ont le plus recours aux anglicismes.

Mots-clés : Anglicismes , SMS , Français québécois , Français suisse , Adolescent , Jeune adulte , Anglicism
La collaboration en temps réel est un cas spécial de collaboration où les utilisateurs travaillent sur le même élément simultanément et sont au courant des modifications des autres utilisateurs en temps réel. Les données distribuées doivent rester disponibles et consistant tout en étant répartis sur plusieurs systèmes physiques. "Strong Consistency" est une approche qui crée un ordre total des opérations en utilisant des mécanismes tel que le "locking". Cependant, cela introduit un "bottleneck". Ces dix dernières années, les algorithmes de concurrence ont été étudiés dans le but de garder la convergence de tous les replicas sans utiliser de "locking" ni de synchronisation. "Operational Trans- formation" et "Conflict-free Replicated Data Types (CRDT)" sont utilisés dans ce but. Cependant, la complexité de ces stratégies les rend compliquées à intégrer dans des logicielles conséquents, comme les éditeurs de modèles, spécialement pour des data structures complexes comme les graphes. Les implémentations actuelles intègrent seulement des data linéaires tel que le texte. Dans ce mémoire, nous présentons CollabServer, un framework pour construire des environnements de collaboration. Il a une implémentation de CRDTs pour des data structures complexes tel que les graphes et donne la possibilité de construire ses propres data structures.

Mots-clés : Algorithme de concurrence , Data distribuée , Génie logiciel , Système distribués
L'estimation du maximum de vraisemblance des modèles basés sur l'énergie est un problème difficile à résoudre en raison de l'insolubilité du gradient du logarithmique de la vraisemblance. Dans ce travail, nous proposons d'apprendre à la fois la fonction d'énergie et un mécanisme d'échantillonnage approximatif amorti à l'aide d'un réseau de générateurs neuronaux, qui fournit une approximation efficace du gradient de la log-vraisemblance. L'objectif qui en résulte exige la maximisation de l'entropie des échantillons générés, que nous réalisons en utilisant des estimateurs d'information mutuelle non paramétriques récemment proposés. Enfin, pour stabiliser le jeu antagoniste qui en résulte, nous utilisons une pénalité du gradient, centrée en zéro, dérivée comme condition nécessaire issue de la littérature sur l'alignement des scores. La technique proposée peut générer des images nettes avec des scores d'Inception et de FID compétitifs par rapport aux techniques récentes de GAN, ne souffrant pas d'effondrement de mode, et compétitive par rapport aux techniques de détection d'anomalies les plus récentes.   Le chapitre 1 introduit les concepts essentiels à la compréhension des travaux présentés dans cette thèse, tels que les modèles graphiques fondés sur l'énergie, les méthodes de Monte-Carlo par chaînes de Markov, les réseaux antagonistes génératifs et l'estimation de l'information mutuelle. Le chapitre 2 contient un article détaillant notre travail sur l'amélioration de l'entraînement des fonctions d'énergie. Enfin, le chapitre 3 présente quelques conclusions tirées de ce travail de thèse, la portée des travaux futurs, ainsi que des questions ouvertes qui restent sans réponse.

Mots-clés : apprentissage profond , apprentissage non supervisé , modèles génératifs , modèles basés sur l'énergie
La force de la recherche fondamentale réside dans le transfert des découvertes à de réels problèmes humains, qu’ils soient médicaux, sociaux ou pratiques. Généralement, cette recherche débute par la compréhension de ce problème. L’humain a une capacité de guérison qu’on peut définir comme rapide, mais qui réside plus dans le rafistolage que dans la qualité de la guérison. Si la blessure en question est le moindrement grave, généralement, le corps humain est capable de guérir afin de maintenir l’organisme en vie, toutefois la fonction n’est pas toujours rétablie. Par exemple, dans le cas d’une amputation à un membre, la guérison va se faire par une cicatrice et former un moignon, rendant la partie amputée non fonctionnelle. Le laboratoire du Dr Roy étudie la régénération et la guérison sans cicatrice chez un modèle qui le fait de manière phénoménale, l’axolotl (Ambystoma mexicanum). Comprendre la signalisation qui permet à cet animal de régénérer parfaitement est une étape importante pour nous permettre de transférer ces découvertes à des traitements chez l’humain. Notre modèle de régulation des voies de signalisation dans le processus de régénération met la cytokine TGF-beta au cœur de notre recherche. Cette protéine est responsable de la formation du blastème, en permettant la migration et la prolifération suite à une amputation. Notre recherche a permis de montrer que lors de la première phase de la régénération, TGF-beta active SMAD2 et SMAD3, mais que le processus de guérison passe par SMAD2 puisque le niveau de SMAD3 est très faible. De plus, en bloquant uniquement SMAD3, la régénération s’opère normalement. L’importance de TGF-beta pour la formation du blastème est solidement démontrée. Par contre, son rôle pour la fermeture de plaie n’a pas encore été déterminé. La fonction de TGF-beta est associée à une multitude de processus dont celui des transitions épithéliales mésenchymateuses (EMT). Ce processus est caractérisé par des changements phénotypiques de cellules épithéliales leur permettant de migrer. Les EMTs s’opèrent lors du développement, de la progression du cancer et durant la guérison. Nous avons donc tenté de comprendre comment les EMTs pouvaient jouer un rôle dans la régénération de la patte et comment TGF-beta pouvait influencer la chose. Durant mon doctorat, nous avons déterminé que les EMTs étaient associées à la fermeture de la plaie, une étape indispensable à la régénération. De plus, leur régulation serait dépendante en partie de TGF-beta. La fermeture de la plaie serait dépendante de la voie TGF-beta/SMAD (connue comme la voie canonique) et de la voie TGF-beta/p38/JNK (une des voies non-canonique). Nous avons aussi montré que les voies p38 et JNK sont importantes pour la progression du blastème, et ce de manière indépendante de TGF-beta. Les résultats obtenus durant cette thèse nous permettent de mieux comprendre le processus de régénération parfaite.

Mots-clés : Axolotl , Régénération , Signalisation , TGF-beta