CATIE-AQ/frenchKEYWORDS huggingface dataset:
La baisse de fertilité chez les vaches laitières est une préoccupation majeure pour l'industrie laitière au Canada car elle entraîne chaque année d'importantes pertes économiques. Cependant, les mécanismes moléculaires associés à une baisse de la fertilité ne sont pas encore complètement élucidés. Dans ce contexte, la régulation du gène Ankyrin-repeat and SOCS Box protein 9 (ASB9) dans le follicule ovarien a été rapportée pour la première fois par notre laboratoire. Nous avons identifié ASB9 comme un gène différentiellement exprimé dans les cellules de granulosa (CG) de follicules ovulatoires bovins. Toutefois, le rôle biologique d’ASB9 dans les CG était inconnu. Nous avons émis l’hypothèse que l’expression d’ASB9 serait induite par l’hormone lutéinisante (LH) dans les CG et que, par sa fonction biologique, ASB9 contribuerait au contrôle de la fonction des CG. Des CG ont été obtenues à partir de petits follicules (SF : 2-4 mm), de follicules dominants au jour 5 du cycle œstral (DF) et de follicules ovulatoires (OF) 24 heures (h) suivant une injection d’hCG. Des analyses par RT-qPCR et western blot ont démontré une induction de l’expression de l’ARNm et de la protéine ASB9 dans les CG des OF par l’hCG. L’expression d'ASB9 dans les parois folliculaires était significativement induite à partir de 12 h post-hCG, avec une induction maximale 24 h post-hCG ou 24 h suivant la libération endogène de la LH comparée à 0 h. Le criblage d’une banque d'ADNc provenant de follicules ovulatoires à l’aide du système double hybride chez la levure a permis d'identifier 10 protéines partenaires d'ASB9 dont tumor necrosis factor alpha-induced protein 6 (TNFAIP6), hypoxia inducible factor 1, alpha subunit (HIF1A) et cytochrome B (CYTB). L'inhibition d’ASB9 par l'approche CRISPR-Cas9 a entraîné une prolifération des CG et une modulation de l'expression de certains gènes dont celui de l’enzyme stéroïdogénique CYP11A1. Ces résultats confirment un rôle d'ASB9 dans le follicule ovulatoire en contrôlant la prolifération et la fonction des CG, en ciblant des protéines spécifiques susceptibles d’être dégradées et, possiblement, en contribuant à la différenciation finale des CG en cellules lutéales. Les résultats de cette étude pourraient mener à une meilleure compréhension et contrôle de la fonction ovarienne par l’identification de gènes associés à la fertilité chez les vaches laitières.

Mots-clés : ASB9 , Ovaire , Cellules de granulosa , Follicule ovulatoire , LH , hCG , Vache laitière , Fertilité , Double hybride , CRISPR-Cas9
L’hématurie correspond à un nombre augmenté d’érythrocytes dans l’urine et peut indiquer un désordre urinaire. L’importante occurrence de l’hématurie lors d’affection du bas appareil urinaire peut laisser à supposer que l’hématurie serait potentiellement un bon biomarqueur des affections du bas appareil urinaire chez le chat. Un test non-invasif de dépistage de l’hématurie féline vient de terminer son développement. Il s’agit de granules blancs, à saupoudrer sur la litière du chat, destinés à devenir bleus rapidement au contact de l’hémoglobine.  Le but de ce mémoire est de rapporter les résultats de l’étude de ce test de dépistage et de contextualiser ces derniers en traitant du suivi de l’hématurie féline dans le cadre des affections du bas appareil urinaire. Des études antérieures des prototypes du test de dépistage (Gara-Boivin, del Castillo et al. 2018, Khenifar, del Castillo et al. 2018, Khenifar, del Castillo et al. 2018) ont démontré un bon seuil de détection, d’environ 12[8-16] globules rouges par champ au fort grossissement microscopique x400. L’étude ici présentée a évalué le test avec 80 chats, à la fois en clinique vétérinaire et chez les propriétaires. Les performances du test ont été jugées très bonnes, avec une sensibilité de 91.5%, une spécificité de 90.9%, une valeur prédictive positive de 93.5% et une valeur prédictive négative de 88,2%.  Le produit chromogénique de dépistage a les caractéristiques requises pour une utilisation fiable dans un suivi clinique de l’hématurie féline. Des études sur une plus large population de chats ainsi que sur la gestion des affections du bas appareil urinaire sont actuellement en cours.

Mots-clés : hématurie , chat , maladies du tractus urinaire inférieur , test de dépistage , cystite idiopathique féline , infection du tractus urinaire , sensibilité , spécificité , valeurs prédictives
La littérature contient peu d’informations concernant la morphologie méniscale équine normale, sa dégénérescence et son rôle dans l’ostéoarthrose (OA). Les objectifs de cette étude étaient de caractériser la morphologie méniscale normale et avec lésions et d’explorer la relation entre la dégénérescence méniscale et l’OA fémorotibiale équine. Cette étude ex vivo inclue 7 articulations normales (n=14 ménisques) et 15 avec OA (n=30 ménisques). Un score macroscopique fémorotibial d’OA (dégénérescence cartilagineuse et ostéophyte) a été utilisé pour quantifier la sévérité (modifié de Olive at al 2010). Les fibrillations et déchirures méniscales macroscopiques (régions crâniale, centrale et caudale) ont été évaluées (1-4). Les fibrillations microscopiques, déchirures et la dégénérescence de la bordure interne ont aussi été gradées (0-3). Des déchirures partielles étaient localisées en surfaces fémorale et tibiale dans les trois régions, majoritairement en surface fémorale de la corne crâniale médiale. Une corrélation positive entre les scores macroscopiques globaux des ménisques médiaux et d’ostéophytes (r=0.7, p=0.002) ou de dégénérescence du cartilage (r=0.5, p=0.03) était présente dans l’articulation fémorotibiale médiale. Le score macroscopique global des ménisques médiaux était supérieur (p=0.004) dans les articulations avec OA avancée, comparativement aux contrôles. La limite principale est que plusieurs ménisques proviennent de l’abattoir et sont sans histoire clinique. Cette étude est la première décrivant la morphologie méniscale équine normale et identifiant des déchirures dans toutes les régions, sur les deux surfaces méniscales. Malgré que la dégénérescence méniscale équine soit corrélée à la sévérité d’OA dans le compartiment fémorotibial médial, la relation entre l’OA et les pathologies méniscales reste à déterminer.

Mots-clés : équin , ménisque , déchirure , fémorotibial , ostéoarthrose , Meniscus
Salmonella est l'un des agents pathogènes les plus souvent associés aux maladies d'origine alimentaire dans le monde. Les produits animaux, notamment la viande de volaille, sont considérés comme les principales sources de contamination. Chaque étape de la chaîne de production peut avoir un impact sur la prévalence de Salmonella dans les produits d’origine avicole, et ce, de la ferme à la table. De nombreuses stratégies de contrôle ont été mises au point pour réduire la contamination des carcasses de volailles par Salmonella, mais jusqu'à présent, il ne semble qu’aucune n’ait permis d'éradiquer la bactérie dans la viande de volaille issue des usines d’abattage. De plus, on possède peu de connaissances en ce qui concerne la distribution, la prévalence et les sources de contamination du produit de viande de volailles par ce pathogène dans les établissements d’abattage de poulets à griller au Canada. L’objectif de ce projet était de générer des nouvelles connaissances quant à la prévalence et la distribution de Salmonella sur les carcasses de poulets de chair et dans l’environnement de deux abattoirs de volailles au Québec. Aussi, nous voulions déterminer, à l'aide d'une caractérisation moléculaire des isolats de Salmonella récupérés dans les deux usines, les sources principales de contamination des carcasses de volailles. Huit visites ont été réalisées dans chaque abattoir au cours des 6 mois de la phase terrain du projet. Un total de 379 rinçages de carcasses ont été récupérés dans ces deux abattoirs à travers 5 grandes étapes critiques du procédé d’abattage. Des lingettes servant à l’échantillonnage de l’environnement des abattoirs ont été également utilisées pour échantillonner sept sites critiques des lieux d’abattage. Une moyenne de 42.3% des carcasses échantillonnées étaient contaminées par Salmonella. L'étape de la saignée était significativement l'étape la plus contaminée comparativement aux autres étapes critiques, avec une diminution progressive de la iii contamination au fil du processus d'abattage. De plus, la plumeuse et l’éviscérateur étaient les sites d’échantillonnage critiques les plus contaminés pour l’environnement des abattoirs suivis. Les sérotypes les plus isolés, autant à partir des carcasses que de l’environnement, et ce, pour les deux abattoirs, étaient S. Heidelberg, S. Kentucky et S. Schwarzengrund. Notre étude suggère que les oiseaux arrivant à l’établissement, par leurs statuts positifs, ainsi que l'environnement de l'usine d'abattage représentent les principales sources de contamination des carcasses à l’étape du refroidissement. Aussi, les résultats obtenus par l'analyse des courbes de fusion à haute résolution (HRM) ont montré que si un lot qui entre à l’abattoir est contaminé par le profil HRM S. Heidelberg 1-1-1, la probabilité que les carcasses après le refroidissement seront contaminées par le même profil est significativement supérieure. Finalement, le statut des carcasses d’un lot contaminé est significativement associé au statut positif du lot précédent contaminé par ce même profil HRM.

Mots-clés : Salmonella , Poulet , Abattoir , Rinçage de carcasse , HRM , Sources de contamination
La résistance aux antimicrobiens est de nos jours une préoccupation mondiale, affectant également le Québec et le Canada. Les productions animales en général, incluant les bovins, participent à ce problème complexe à travers l’usage des antimicrobiens. L’hypothèse de cette étude était que les élevages de veaux de lait constituent une source de Salmonella Dublin, Campylobacter spp et Escherichia coli résistants aux antimicrobiens au Québec. L’étude a été réalisée d’août 2016 à octobre 2017 à partir des échantillons de contenu de caecum prélevés sur les animaux abattus dans deux abattoirs sous inspection fédérale au Québec. Dans un premier temps, la prévalence et les profils de résistance aux antimicrobiens des trois bactéries ont été évalués. Les résultats ont montré chez les trois bactéries des multirésistances dont certains antimicrobiens, comme l’amoxicilline-acide clavulanique, la ceftriaxone et la ciprofloxacine, sont de haute importance pour la santé humaine.  Par la suite, l’association entre l’usage des antimicrobiens dans les élevages et la résistance chez E. coli a également été étudiée. L’usage des polypeptides (bacitracine) était significativement associé à la diminution de la résistance à l’ampicilline et la tétracycline.    Enfin, d’autres facteurs de risque associés à la présence dans les lots de veaux d’isolats d’E. coli multirésistants ont été étudiés. Les résultats ont montré que la taille des lots (les lots de petite taille) était un facteur de risque de multirésistance pour E. coli. Les résultats obtenus à partir de cette étude devraient contribuer à orienter les mesures de prévention et de contrôle de la résistance aux antimicrobiens chez les veaux de lait par les décideurs gouvernementaux et de l’industrie du veau de lait.

Mots-clés : Résistance aux antimicrobiens , Salmonella Dublin , Campylobacter spp , Escherichia coli , Usage des antimicrobiens , Facteurs de risque , Multirésistance , Antibiotiques , Antibiorésistance , Veaux de lait , Québec , Salmonella Dublin , Campylobacter spp , Escherichia coli
La lipase de l'acide 1,2-o-dilauryl-rac-glycero-3-glutarique ester (6'-méthylrésorufine) (DGGR) semble être utile pour le diagnostic ante-mortem de pancréatite et s’avère également une méthode rentable par rapport au dosage de la lipase féline spécifique du pancréas (Spec fPL). Toutefois, l’influence des comorbidités, notamment celle de l'insuffisance rénale sur la lipase DGGR, est encore méconnue chez le chat. Le but de notre étude est d'établir si la lipase DGGR est augmentée chez des chats présentant une insuffisance rénale par une étude clinique prospective et contrôlée. Trente et un chats malades ayant un test semi-quantitatif normal pour l'estimation de l'immunoréactivité pancréatique féline (SNAP fPL) et avec insuffisance rénale (groupe RI +) ou sans insuffisance rénale (groupe RI-) et 18 chats sains sans insuffisance rénale (groupe sain) ont été recrutés prospectivement. Des échantillons de sérum ont été prélevés chez ces chats et analysés pour le dosage de la lipase DGGR et de la créatinine sérique.  Nous avons trouvé que le groupe RI+ avait des concentrations sériques de lipase DGGR significativement plus élevées par rapport au groupe sain (P <0,05). La lipase DGGR était également positivement associée à la créatinine sérique (P <0,05), et la créatinine expliquait 19,6% de la variation de la lipase.  En conclusion, nos données montrent que les concentrations sériques de lipase DCGR étaient significativement plus élevées que celles des chats sains, avec 37% (6/16) des chats ayant des valeurs plus élevées que les valeurs de référence. Ainsi, même si cette différence était légère, la valeur de la lipase DGGR devrait être interprétée avec précaution en cas d’insuffisance rénale.

Mots-clés : lipase DGGR , SNAP fPL , insuffisance rénale , pancréatite
Les objectifs de cette étude étaient 1) de classifier les anomalies cutanées chez les bélugas de l’estuaire du Saint-Laurent (ESL) selon leur aspect macroscopique et 2) d’estimer la fréquence et d'explorer les causes possibles des catégories de lésions cutanées (CLC) au sein de cette population. La présence de 18 CLC fut recherchée sur 26 020 photographies prises de 2003 à 2014, représentant un échantillon aléatoire de 5 388 observations de béluga. Au moins une CLC était visible lors de la moitié des observations de nouveau-nés. Au moins une CLC était visible dans >90% des observations de bélugas gris et de bélugas blancs; deux à trois CLC étaient visibles dans >50%. Lors des observations de gris et de blancs, les « marques en dents de râteau » étaient la CLC la plus fréquemment observée, tandis qu’il s’agissait des « fissures linéaires uniques » lors des observations de nouveau-nés. Des phénomènes de mue saisonnière et post-natale furent suspectés chez les bélugas de l’ESL. Les lésions cutanées provenant de 111 carcasses échouées furent analysées microscopiquement. Mis à part la présence de corps étrangers dans certains cas de « dépressions en pointillé » ainsi qu'un gamma-herpèsvirus révélé par PCR au sein d’une plaie, la cause et la signification pour la santé de l’animal de la plupart des lésions cutanées reste incertaine. Cette étude est la première s’intéressant aux lésions cutanées chez les bélugas de l’ESL; elle fournit des données de référence pour l’utilisation des anomalies cutanées dans le suivi de la santé de la population.

Mots-clés : béluga , dermatologie , estuaire du Saint-Laurent , lésions , maladies , peau
La sclérose en plaques (SEP) est considérée comme la maladie inflammatoire prototypique du système nerveux central (SNC). Les lésions des patients atteints de la SEP sont caractérisées par une destruction de la gaine de myéline, des dommages axonaux et neuronaux et une activation des cellules gliales. Il est bien établi que le système immunitaire (SI) participe à la pathogénèse de la SEP. Néanmoins, la contribution des médiateurs immunitaires spécifiques aux insultes reste à définir.  Le NKG2D est un récepteur activateur exprimé par de multiples cellules immunitaires effectrices incluant des sous populations des lymphocytes T (LT) CD4 et CD8. Le NKG2D se lie à plusieurs ligands (NKG2DL) comprenant Rae-1 (alpha à epsilon), MULT1 et H60 (a à c) chez la souris. Les NKG2DL sont induits par des déclencheurs environnementaux (ex : inflammation) et alertent le SI de la présence de cellules anormales. Notre laboratoire a préalablement montré que des oligodendrocytes humains expriment au moins un NKG2DL dans les lésions de SEP mais pas dans les cerveaux témoins. De plus, les LT CD8 dans les lésions de SEP sont détectés à proximité des cellules exprimant les NKG2DL. Nous avons aussi établi qu’empêcher l’interaction entre le NKG2D et ses ligands inhibe la mort des oligodendrocytes humains par les cellules immunitaires effectrices activées, in vitro. Un autre groupe a montré que bloquer le NKG2D diminue la sévérité de la maladie dans un modèle murin de la SEP: l’encéphalomyélite auto-immune expérimentale (EAE). L’ensemble de ces résultats suggère que l’interaction NKG2D-NKG2DL peut contribuer à la pathogénèse de la SEP et de l’EAE.  Cependant, il n’est pas encore établi, si des NKG2DL spécifiques sont augmentés in vivo pendant le développement de l’EAE et pourraient devenir une cible thérapeutique.  Nous avons utilisé l’EAE pour évaluer l’expression des NKG2DL aux différents stades du développement de l’EAE et étudier la contribution de NKG2D. Nous avons utilisé la cytométrie en flux, la qRT-PCR, de l’immunobuvardage de type western et l’ELISA.  Nous avons observé que le MULT1, un ligand spécifique du NKG2D, était augmenté dans le SNC des souris EAE et que cette expression élevée corrèlait avec la sévérité de la maladie. De plus, MULT1 était relâché dans le liquide cérébro-spinal (LCS) pendant l’EAE et la forme soluble du MULT1 avait augmenté les propriétés effectrices des cellules immunitaires. Au contraire, l’expression des autres ligands n’avait pas varié au cours de la maladie. Finalement, le transfert de cellules T auto-immunes activées dans des souris receveuses déficientes pour le NKG2D avait induit une maladie significativement moins sévère que lorsque ces cellules avaient été transférées à des souris sauvages. La proportion de cellules ayant infiltré le SNC corrélait avec la sévérité de la maladie. Nos résultats suggèrent que le NKG2D et un de ses ligands MULT1 participent à la pathogenèse de l’EAE et potentiellement de la SEP.

Mots-clés : Sclérose en plaques , EAE , NKG2D , MULT1 , Cytométrie en flux
Plusieurs fonctions cérébrales dépendent de la capacité de générer une activité rythmique dans les circuits neuronaux. L’exemple le plus intuitif est celui des réseaux de neurones, nommés générateurs de patrons centraux (GPCs), encodant des patrons de mouvements répétitifs tels que ceux de la locomotion, de la respiration et de la mastication.  Nos travaux ont été réalisés dans le noyau sensoriel principal du trijumeau (NVsnpr) dans lequel une activité rythmique est observée uniquement dans la partie dorsale qui formerait le cœur rythmogénique du GPC de la mastication. Des travaux antérieurs ont démontré le rôle clé des interactions astrocytes-neurones pour la genèse de décharges rythmiques. En effet, l’activité rythmogénique de ces neurones dépend d’un courant sodique persistant (INaP) dont l’activation est favorisée par une baisse du calcium extracellulaire. Les astrocytes activés par les afférences au noyau interviennent dans ce processus en libérant une protéine chélatrice du calcium, le S100β, provoquant une baisse de calcium extracellulaire. Les astrocytes sont généralement couplés par des jonctions communicantes et dans de nombreux cas, la forme des réseaux astrocytaires chevauche parfaitement l’organisation neuronale sous-jacente dans les régions où celle-ci respecte une certaine cartographie. Cependant, il n’existe aucune description de l’organisation des réseaux astrocytaires dans les GPCs. Notre première hypothèse est que le couplage astrocytaire présenterait une organisation spatiale supportant la fonction rythmogénique neuronale située exclusivement dans la partie dorsale du NVsnpr. Pour cela, nous avons développé une méthode d’analyse vectorielle pour étudier l’orientation préférentielle  des réseaux astrocytaires dans le noyau. Deuxièmement, ce couplage astrocytaire pourrait jouer un rôle dans la rythmogenèse et sa coordination. Nos résultats démontrent que le couplage astrocytaire est augmenté par les stimuli induisant la rythmogenèse, cette modulation impliquant le S100β. Ces réseaux d’astrocytes présentent une étendue limitée et une organisation spatiale qui épouse les frontières de la partie dorsale du NVsnpr. Enfin, ce couplage astrocytaire est nécessaire à la rythmogenèse.    Ces résultats démontrent l’implication des réseaux astrocytaires dans la délimitation d’une frontière fonctionnelle et suggèrent qu’ils pourraient jouer un rôle important dans la coordination et/ou la synchronisation de la décharge des populations. Cette implication des réseaux astrocytaires dans une activité rythmique pourrait être observée dans d’autres circuits neuronaux comme les GPCs de la respiration ou de la locomotion.

Mots-clés : Mastication , Générateurs de patrons centraux , Noyau sensoriel principal du trijumeau , S100β , Réseaux astrocytaires , Connexines , Analyse vectorielle
Les anévrismes de l'aorte abdominale (AAA) sont des dilatations localisées et fréquentes de l'aorte. En cas de rupture, seul un traitement immédiat peut prévenir la morbidité et la mortalité. Le diamètre maximal AAA ($D_{max}$) et la croissance sont les paramètres actuels pour évaluer le risque associé et planifier l'intervention, avec des seuils inférieurs pour les femmes. Cependant, ces critères ne sont pas personnalisés ; la rupture peut se produire à un diamètre inférieur et les patients vivre avec un AAA important. Si l'on sait que la maladie est associée à une modification de la morphologie et de la circulation sanguine, à un dépôt de thrombus intra-luminal et à des symptômes cliniques, les mécanismes de croissance ne sont pas encore entièrement compris.  Dans cette étude longitudinale, une analyse morphologique et des simulations de flux sanguins sont effectuées et comparées aux sujets témoins chez 32 patients ayant reçu un diagnostic clinique d'AAA et au moins 3 tomodensitogrammes de suivi par patient. L'objectif est d'abord d'examiner quels paramètres stratifient les patients entre les groupes sains, à faible risque et à risque élevé. Les corrélations locales entre les paramètres hémodynamiques et la croissance de l'AAA sont également explorées, car la croissance hétérogène de l'AAA n'est actuellement pas comprise. Enfin, les paramètres composites sont construits à partir de données cliniques, morphologiques et hémodynamiques et de leur capacité à prédire si un patient sera soumis à un test de risque. La performance de ces modèles construits à partir de l'apprentissage supervisé est évaluée par les ROC AUC : ils sont respectivement de 0.73 ± 0.09, 0.93 ± 0.08 et 0.96 ± 0.10 . En incorporant tous les paramètres, on obtient une AUC de 0.98 ± 0.06. Pour mieux comprendre les interactions entre la croissance et la topologie de l'écoulement de l'AAA, on propose un worflow spécifique au patient pour calculer les exposants de Lyapunov en temps fini et extraire les structures lagrangiennes-cohérentes (SLC). Ce modèle de calcul a d'abord été comparé à l'imagerie par résonance magnétique (IRM) par contraste de phase 4-D chez 5 patients. Pour mieux comprendre l'impact de la topologie de l'écoulement et du transport sur la croissance de l'AAA, des SLC hyperboliques répulsives ont été calculées chez un patient au cours d'un suivi de 8 ans, avec 9 mesures morphologiques volumétriques de l'AAA par tomographie-angiographie. Les SLC ont défini les frontières du jet entrant dans l'AAA. Les domaines situés entre le SLC et le mur aortique ont été considérés comme des zones de stagnation. Leur évolution a été étudiée lors de la croissance de l'AAA. En plus des SLC hyperboliques (variétés attractives et répulsives) découvertes par FTLE, les SLC elliptiques ont également été considérées. Il s'agit de régions dominées par la rotation, ou tourbillons, qui sont de puissants outils pour comprendre les phénomènes de transport dans les AAA.

Mots-clés : Anévrismes de l'aorte abdominale , Simulation numérique , Hémodynamique , Structures lagrangiennes cohérentes