CATIE-AQ/frenchKEYWORDS huggingface dataset:
Ce mémoire de maîtrise est une étude d’un phénomène émergent, le biohacking. Depuis 2008 et la création du groupe Boslab à Boston, le biohacking se pratique dans différents groupes autour du monde. Les biohackers se réunissent autour d’un vivant que l’on ne découvre plus mais que l’on fabrique. Ils hackent, bricolent le vivant et son code génétique, comme l’on hackerait un programme informatique. À travers une ethnographie qui suit la création du groupe de biohacking de Montréal, mais aussi à travers une ethnographie en passant dans différents groupes d’Europe et d’Amérique du Nord, je propose de comprendre le phénomène du biohacking à travers une étude médiatique du vivant. Ainsi, je propose de penser le vivant comme un medium, entendu comme un intermédiaire, un moyen, mais surtout un milieu. Un milieu qui permet de placer la notion de relation au centre de la réflexion, plutôt que sur l’objet en lui même. Un milieu dans lequel des groupes se développent, vivent et cohabitent à l’intérieur d’une communauté plus grande. Des groupes qui échangent des matériaux, des connaissances et des pratiques, entres eux, mais aussi avec les grandes institutions. Cette recherche propose de repenser notre rapport au vivant pour comprendre un phénomène à la base d’une révolution scientifique et sociale.

Mots-clés : ethnographie , réalité , biohacking , biologie de synthèse , vivant , écologie médiatique , medium , perruque , hack , Objet frontière
Dans l’Antiquité occidentale et orientale, des noms d’hommes célèbres ont été associés à des méthodes et des outils de transformation de la vision du monde et métamorphose de la personnalité. Depuis les années 1920, on assiste au même phénomène avec l’émergence de célébrités du développement personnel. Devenue une industrie florissante, la popularité, l’attractivité et l’influence que ces leaders ont sur les autres est une question d’actualité, au moins autant que les critiques et les débats véhéments qu’ils soulèvent. Intriguée par ce phénomène, et interrogeant sa propre pratique de coach professionnel, cette étude adopte une approche constitutive de la communication organisationnelle pour mieux comprendre les pratiques communicationnelles par lesquelles l’autorité d’un tel leader s’accomplit dans et par les interactions. Les résultats de recherche montrent à la fois la présence de processus déjà identifiés dans la littérature pour leur rôle dans la production et la reproduction de l’autorité dans les interactions, tels que la présentification, l’invocation et l’auteurisation ; mais aussi l’identification de nouvelles pratiques d’auto-distinction et de gestion des distances. L’accès à une organisation dirigée par un leader du développement personnel est rare et représente un contexte organisationnel unique, riche et ouvrant le champ à nombreuses pistes de recherche.

Mots-clés : Communication organisationnelle , Autorité , Interaction , Présentification , Invocation , Leader , Développement personnel
En 2014 ont eu lieu les élections les plus disputées au poste de président de la république du Brésil depuis 1989, année du premier vote direct après le retour à la démocratie au pays, suite à une dictature militaire de 21 ans. Le climat électoral a envahi les réseaux sociaux numériques, ce qui a fait des présidentielles brésiliennes le sujet le plus commenté sur Facebook dans le monde cette année-là (Facebook, s.d.). Les recherches à l’égard des interactions politiques sur les réseaux sociaux, notamment Facebook, se consacrent rarement aux conséquences qu’elles peuvent avoir sur les amitiés.  Compte tenu du constat, la question qui a émergé a été la suivante : les conversations autour des présidentielles brésiliennes sur Facebook ont-elles affecté les amitiés ? La recherche présentée dans ce mémoire cherche à explorer cette question, et à mieux comprendre le rôle des conversations politiques sur les amitiés Facebook, ainsi que ses conséquences sur les rapports interpersonnels en face à face. Cette recherche s’est élaborée sur les fondements de la théorie ancrée, une théorie qui se comprend comme une méthode empirique de collecte et d’analyse de données. La théorie ancrée présuppose que des analyses qualitatives sur des données peuvent permettre aux chercheurs de produire une « théorie », c’est-à-dire, une explication concernant des phénomènes situés, capable de mettre en lumière des contextes particuliers (Guillemette, 2006). Pour m’aider à m’aligner sur cette théorie, j’ai interviewé par Skype ou FaceTime dix brésiliens. Les entrevues ont ainsi porté sur les comportements qu’ils ont pu adopter envers ces « amis » sur Facebook et en face à face.  Les résultats suggèrent que les publications concernant la politique pendant la période électorale de 2014 au Brésil ont, en général, été considérées comme une prise de risque pouvant mener les « amis » d’un utilisateur à le supprimer, à arrêter de le suivre ou changer son statut. Les différents types d’amitié ont d’ailleurs joué, d’un point de vue qualitatif, un rôle central dans la gestion des « amis » sur la plateforme. Les résultats indiquent que les participants ont été plus tolérants avec les amis proches et ceux avec qui ils avaient des rapports en face à face. Les suppressions ont surtout ciblé les « connaissances ». Finalement, bien qu’aucun des participants de la recherche n’ait rompu de rapports interpersonnels en face à face, ils se sont  ii    néanmoins sentis influencés et, quelques fois, « déçus » par les publications de leurs « amis ». Certains participants ont reconnu que quelques rapports interpersonnels ont pu se refroidir ; d’autres ont affirmé avoir moins d’intérêt pour certaines personnes ; d’autres ont déclaré éviter de rencontrer des personnes dont les points de vue politiques, révélés sur Facebook, ont pu décevoir.

Mots-clés : Amitiés , Facebook , réseaux sociaux numériques , médias sociaux , discussion politique , élections
La reconnaissance moléculaire joue un rôle central dans tous les processus biologiques ainsi que dans le développement de nouvelles biotechnologies.  Depuis les 60 dernières années, deux mécanismes de reconnaissance moléculaire ont permis de décrire le couplage entre la liaison et le changement conformationnel observé chez les biomolécules.  Le mécanisme par ajustement induit a lieu lorsque le ligand se lie à l'état inactif de la biomolécule et induit un changement de conformation vers la forme active.  Le mécanisme par sélection conformationnelle, quant à lui, a lieu lorsque le ligand se lie directement à l'état spontanément actif de plus faible population et le stabilise, déplaçant ainsi la population de biomolécule vers cet état.  Bien que nous connaissons des exemples de protéines qui fonctionnent selon chacun de ces mécanismes, nous ne comprenons pas encore les différences entre les performances de ces mécanismes ni les déterminants moléculaires qui leur donnent lieu.  Une compréhension approfondie de ces mécanismes nous permettrait de mieux comprendre pourquoi certaines protéines ont évolué selon un mécanisme en particulier ainsi que de s'inspirer de ces mécanismes pour le développement de biotechnologies finement régulées.   Jusqu'à aujourd'hui, ces deux mécanismes ont exclusivement été étudiés dans le contexte des biomolécules naturelles, principalement des protéines, dont la complexité dynamique et structurale rend difficile la comparaison et la manipulation individuelle des différents paramètres thermodynamiques.  Il est donc particulièrement ardu de caractériser le rôle de chacun de ces paramètres quant à la sélection et la performance de ces mécanismes.  Pour contourner ces limitations expérimentales, nos travaux de recherche se sont intéressés à recréer ces mécanismes à l'aide d'interrupteurs d'ADN fluorescents pour lesquels il est possible de prédire et de modifier la structure et les propriétés thermodynamiques ainsi que d'en mesurer l'activation en temps réel.  Ce faisant, il a été possible d'observer que le mécanisme par ajustement induit est obtenu lorsque le site de liaison est partiellement accessible dans l'état inactif.  Nous avons aussi observé que ce mécanisme permet une activation et une désactivation jusqu'à 10 000 fois plus rapide que la sélection conformationnelle, qui par contraste, donne lieu à une activation plus lente ainsi qu'à un maintien prolongé de l'activation.  Ces différences cinétiques suggèrent ainsi un rôle évolutif distinct pour chacun et laissent envisager des applications en biotechnologies pour l'optimisation de la cinétique.

Mots-clés : Ajustement induit , Sélection conformationnelle , Changement conformationnel , Cinétique , Thermodynamique , Interrupteur d'ADN , Mécanisme de liaison
La dystrophie myotonique de type 1 (DM1) est une maladie dégénérative impliquant des symptômes d’atrophie musculaire et de myotonie. Au niveau moléculaire, elle est caractérisée par une expansion aberrante de CUG dans la région 3’UTR de l’ARNm de DMPK (Dystrophia Myotonica protein kinase). Ces répétitions CUG forment des agrégats toxiques (appelés foci) majoritairement nucléaires dans les cellules de patients DM1 et causent la séquestration anormale de ribonucléoprotéines (RBP), tel que le facteur «Muscleblind-like 1» (MBNL1), qui lieraient normalement les motifs CUG d’autres ARN. Les fonctions normales de ces RBPs seraient alors perturbées. En plus de leur rôle dans l’épissage alternatif, MBNL a récemment été caractérisé pour son implication dans la localisation intracellulaire de ses ARN cibles. Ceci suggèrerait que la pathogénèse de la DM1 pourrait résulter de l’effet perturbateur des répétitions CUG sur la localisation d’ARN précis et de protéines RBPs. À cet effet, un criblage basé sur de la microscopie fluorescente de 322 RBPs dans des myoblastes de patients DM1 a permis d’identifier des nouveaux facteurs qui colocaliseraient avec les expansions pathogéniques CUG. De plus, ces myoblastes DM1 ont été fractionnés et un séquençage-ARN a par la suite permis l’identification de transcrits délocalisés. Les deux banques de données ainsi générées, tant par le criblage que par le fractionnement/séquençage-ARN, pourraient ouvrir des nouvelles avenues de recherches dans la compréhension des anomalies moléculaires associées à la DM1, et potentiellement d’autres maladies à expansions microsatellites.

Mots-clés : Dystrophie myotonique type 1 , DM1 , MBNL , RBP , Localisation de l'ARN , Foci , Fractionnement , Séquençage-ARN
Récemment, une nouvelle classe d'ADN circulaire extrachromosomique (eccDNA) appelée microADN a été identifiée dans des tissus humains et murins. Ces microADNs ont une longueur de 100 à 400 pb, sont dérivés de régions génomiques non répétitives uniques et présentent un enrichissement au niveau des régions géniques et riches en GC. Bien qu'il ait été proposé qu'ils puissent provenir du métabolisme de l'ARN ou des défauts de réplication, leurs mécanismes de production et leur éventuelle fonctionnalité restent à déterminer. Grâce à l'analyse des microADNs extraits d'une série de 10 lignées cellulaires lymphoblastoïdes humaines (LCL), nous avons confirmé la distribution nonaléatoire des microADNs vers les régions actives du génome. Les microADNs identifiés présentaient des loci d'origine redondants et une périodicité de taille de 190 pb pouvant correspondre à la fragmentation de l'ADN lors de l'apoptose caspase-dépendante. L'apoptose induite de ces LCLs par des drogues chimiothérapeutiques (méthotrexate ou L-asparaginase) a entrainé la modulation de la diversité et de la taille des microADNs, suggérant qu'une partie de ces entités pourrait être des produits résiduels de la mort cellulaire apoptotique. Ainsi, bien que compatible avec l'observation initiale suggérant que les microADNs proviennent d'un processus physiologique normal, ces résultats impliquent une source de production alternative ou complémentaire.

Mots-clés : MicroADN , Méthotrexate , L-Asparaginase , Apoptose , Génomique , Pharmacogénomique
Le présent travail se veut être une tentative pour dé-couvrir un canal de dialogue interculturel et interreligieux, en prenant comme plate-forme et terrain de discussion le jihad et une perspective inspirée de la psychanalyse freudienne et lacanienne qui discute du rapport entre le sujet-chercheur et l’objet de recherche. Pour cela, la présente recherche tente de désengager une compréhension du jihad qui serait subvertie par un héritage colonial dénoncé par Edward Said sous l’appellation d’ « orientalisme », et dont l’empreinte académique circonscrirait le jihad à « ce qu’on lui permet d’être ». Ceci amène donc la recherche à questionner le statut ontologique de l’objet jihad, statut que l’articulation linguistique du présent travail fait glisser de celui de concept vers celui de signifiant. Ce signifiant est alors conceptualisé par une opération de « retour à la lettre », qui fait réapparaitre « un signifiant arabe » longuement oublié se structurant à partir de la racine trilitère JHD ainsi que l’élaboration d’un nouvel outil conceptuel dit de « nuage sémantique ». Ce signifiant est ainsi réinséré dans son environnement naturel qu’est le Qur’ān en langue arabe et dont l’analyse est utilisée pour tester l’hypothèse : Il existe dans le Qur’ān un signifiant arabe se structurant à partir de la racine JHD, déterminé par l’article al- et qui prend la forme/structuration « al-jihād ».

Mots-clés : Jihad , Orientalisme , Orientalism , Linguistique , Psychanalyse , Nuage sémantique , Arabe , Grammaire
Cette étude traite des phénomènes paranormaux au Québec. À partir d’un terrain mené de 2014 à 2015 dans la région des Laurentides, cette recherche propose un portrait de la croyance paranormale, du spiritisme et des croyants dans la province. En contextualisant les démarches de nos répondants dans l’héritage catholique local et en les interprétant à l’aide des notions de bricolage religieux, de phénoménologie et de croyances, il a été possible d’établir un profil type du croyant au surnaturel et du contexte dans lequel peut apparaître et évoluer cette croyance. Les répondants de cette recherche ont généralement vécu une expérience paranormale qu’ils ont interprétée à la lumière du décès d’une personne, analyse validée par l’intermédiaire d’un médium possédant, selon eux, un Don, celui de la communication avec l’au-delà. La croyance de la continuité de l’âme humaine après la mort du corps semble donc constituer un pilier de la croyance au paranormal. Les répondants, qui ont tous vécu des phénomènes inexplicables, ont en outre généralement peur du jugement des autres et évitent de parler de leurs croyances. Ce fait contribue à la mécompréhension des croyances paranormales et c’est à ce stade que le médium va jouer le rôle d’intermédiaire entre le répondant et le phénomène, en authentifiant l’évènement comme réel. Ce mémoire analyse donc enfin le processus de légitimation de la croyance au paranormal et de l’existence de la médiumnité, dans un contexte post-Révolution tranquille où la raison et la science ne suffisent pas à fournir toutes les réponses.

Mots-clés : Bricolage religieux , Paranormal , Surnaturel , Fantastique , Médiumnité , Croyance , Spiritisme , Don , Catholicisme
Au cours des dernières années, de nouvelles évidences semblent indiquer que, tout autant que sa séquence, l’organisation d’un génome dans l’espace et le temps est importante pour comprendre la fonction de celui-ci. Une des avancées fonda- mentales sur le sujet a été de présenter à l’échelle du génome la carte des inter- actions ADN-ADN. Ces interactions sont essentiellement de 2 types, soit entre chromosomes ou entre régions du même chromosome. Par la suite, la modélisa- tion a permis de visualiser et appréhender la structure tridimensionnelle (3D) du génome à partir des données 3C, ou d’une modélisation purement théorique. Une question importante et centrale demeure, soit de résoudre les mécanismes res- ponsables de l’organisation spatiale et fonctionnelle du génome. Notamment, une question est de savoir comment des processus nucléaires tels que la transcription affectent la structure du génome. Cependant, l’idée selon laquelle les données de types 3C capturent cette information dans la levure est remise en question par le fait que les modèles théoriques du génome récapitulent les caractéristiques mar- quantes soulignées par 3C. Pour répondre à cette question, nous avons conçu une approche qui, pour évaluer l’importance d’une interaction, se base sur la distri- bution d’interactions entre les 2 régions d’ADN mises en contacts. Nos résultats supportent l’hypothèse selon laquelle les éléments fonctionnels et propres aux données expérimentales de la structure 3D du génome se forment d’une manière spécifique à l’échelle de l’interaction et au type d’interactions. Par ailleurs, nos résultats indiquent qu’un grand nombre de facteurs de transcription induisent la proximité spatiale des gènes dont ils régulent l’expression.

Mots-clés : Structure spatiale (3D) du génome , Organisation fonctionnelle du génome , Régulation de la transcription , Correction de données 3C , Capture de la conformation des chromosomes
Les hétérocycles azotés sont d’une importance considérable dans le domaine pharmaceutique. En effet, ces composés se retrouvent dans de nombreuses structures bioactives brevetées dans les dernières années. Malgré l’utilité de ces motifs, leur synthèse nécessite souvent plusieurs étapes ou encore l’utilisation de matériaux de départ fonctionnalisés. Le présent mémoire décrit de nouvelles méthodologies pour accéder à ces structures de façon douce, chimiosélective et efficace par l’activation d’amides avec l’anhydride trifluorométhanesulfonique. Dans un premier temps, une méthode en deux étapes pour accéder aux 3-aminoindazoles à partir des amides aromatiques correspondants a été développée. La séquence comprend l’activation de l’amide, suivie de l’addition d’une hydrazine protégée pour former un intermédiaire de type amino hydrazone. Cet intermédiaire peut ensuite être cyclisé dans une réaction de type amination de liens C-H en présence d’un catalyseur de palladium pour former le 3-aminoindazole désiré. Plusieurs 3-aminoindazoles ont été ainsi obtenus dans des rendements modérés à bons. Ensuite, une nouvelle méthodologie pour la synthèse des 3-amino imidazo[1,2-a]pyridines a été étudiée. Des amides contenant un motif 2-aminopyridine ont été traités avec l’anhydride trifluorométhanesulfonique afin d’obtenir l’hétérocycle désiré dans d’excellents rendements. Les produits ainsi obtenus ont pu être davantage fonctionnalisés en utilisant des réactions d’arylation de liens C-H catalysées par des composés de ruthénium et de palladium.

Mots-clés : amides , hétérocycles , anhydride trifluorométhanesulfonique , 3-aminoindazoles , 3-aminoimidazo[1,2-a]pyridines , Anhydride
Les aérosols atmosphériques (par exemple les matières particulaires ou PM) sont une source majeure d’incertitude dans les modèles climatiques. Plusieurs études ont démontré que des concentrations élevées de PM réduisent l’espérance de vie. Les aérosols organiques secondaires (Secondary Organic Aerosols en anglais, SOA) sont formés dans l’atmosphère à partir des précurseurs gazeux à travers les réactions chimiques et les SOA représentent des composants majeurs de la masse des PM à l’échelle mondiale. Afin de mieux comprendre les processus chimiques responsables de la formation des SOA, un modèle en 0-D est élaboré pour simuler dynamiquement l’évolution des espèces organiques dans une parcelle d’air qui subit une oxydation photochimique produisant des SOA. Le modèle incorpore des paramètres récemment publiés pour la formation des SOA à partir des composés organiques volatiles (VOCs), ainsi que des composés organiques semi-volatiles et des composés organiques à volatilité intermédiaire (SVOCs et IVOCs). Le modèle est restreint par plusieurs mesures de précurseurs, incluant des mesures récemment développées qui fournissent des contraintes grandement améliorées sur les concentrations des précurseurs, et les prédictions sont comparées par rapport aux mesures des SOA prises au cours de la campagne CalNex. Lorsque les effets des pertes sur les parois des chambres à smog sont considérés pour les rendements des VOCs, la quantité et la vitesse de la formation des SOA dans le modèle sont plus en accord avec les observations. Les résultats de cette étude indiquent que les SVOCs et les IVOCs primaires sont responsables de la majorité (70 à 86 %) de la masse de SOA modélisée, accentuant leur grande contribution en tant que précurseurs des SOA. Cependant, la masse de SOA simulée est sous-estimée à des temps courts d’oxydation lorsque comparée aux données sur le terrain, mais à des temps plus longs, un accord modèle/mesures est observé. Cet écart peut être dû à un ΔIVOC/ΔCO ratio d’émission bas ou une sous-estimation basse des constantes d’oxydations des IVOCs, ce qui met en évidence la nécessité de poursuivre les études sur le terrain et dans les laboratoires de ces composés.

Mots-clés : Modèle , Qualité de l’air , Rendements des SOA , Volatilité , Oxydation Photochimique , VOCs , IVOCs , SVOCs , SOA
La codéine et l'oxycodone sont des opioïdes utilisés pour soulager la douleur. Le succès du traitement dépend du métabolisme par les enzymes CYP450. Selon les médicaments utilisés, l’altération de métabolisme peut entraîner de graves conséquences, y compris des modifications dans leurs profils d'efficacité, de sécurité et de toxicité. L'objectif de cette étude consistait à évaluer par HPLC-MS / MS (trappe ionique linéaire) l'effet de l'âge sur le métabolisme de l'enzyme CYP2D chez les rats. La codéine et l'oxycodone ainsi que leurs métabolites spécifiques, morphine (CYP2D), norcodeine (CYP3A), oxymorphone (CYP2D) et noroxycodone (CYP3A), ont été quantifiés en utilisant la méthode de dilution isotopique. Les fractions S9 de foie de rats (Sprague-Dawley) de sexe masculin âgés de 3, 6, 12 et 18 mois ont été préparées et les paramètres de Michaelis-Menten ont été déterminés pour les principales voies métaboliques. La vitesse maximale de la réaction enzymatique (Vmax) a montré une saturation rapide des sites actifs de CYP2D dans la fraction s9 de foie chez les rats âgés de 18 mois. Les valeurs de Vmax observées pour la codéine chez les rats âgés de 3, 6 et 12 mois étaient respectivement de 0,327 ± 0,027, 0,355 ± 0,021 et 0,273 ± 0,028. Concernant l'oxycodone, les valeurs étaient de 0,690 ± 0,096, 0,499 ± 0,087, 0,153 ± 0,01 respectivement. Cependant, la valeur de Vmax chez les rats âgés de 18 mois était de 0,092 ± 0,003 pour la codéine et de 0,153 ± 0,01 pour l’oxycodone. Vraisemblablement, la valeur de Vmax affecte de manière significative (P ≤ 0,05) la clairance enzymatique de ces médicaments (CLuint = Vmax / Km). Les résultats de cette étude suggèrent que l’enzyme CYP2D subit un changement conformationnel avec l'âge, particulièrement chez les rats âgés de 18 mois. Ce changement conformationnel conduit à une diminution significative du taux de formation des métabolites opioïdes actifs, ce qui entraine une diminution de la clairance enzymatique de ces médicaments. En conclusion, cette étude suggère une détérioration des CYP2D et CYP3A chez les rats vieillissants, ce qui affecte le métabolisme des médicaments.

Mots-clés : Opioïdes , Vieillissement , Métabolisme des médicaments , CYP450 , CYP2D , CYP3A , Spectrométrie de masse