CATIE-AQ/frenchKEYWORDS huggingface dataset:
La population canadienne vieillit depuis le début du XXe siècle. La naissance des cohortes nombreuses du baby-boom a d’abord ralenti ce phénomène. Mais le vieillissement de ces générations nombreuses pose plusieurs questions quant à la capacité de la société à supporter le poids de ces individus dans le domaine de la santé et dans le domaine de la viabilité des régimes de retraite. De plus, les projections de Statistique Canada montrent que le rapport de dépendance des personnes âgées va augmenter de 82% entre 2015 et 2061. Cependant, cet indicateur est contestable puisqu’il se base uniquement sur l’âge. De nombreux indicateurs de mesure du vieillissement démographique sont depuis plusieurs années élaborés pour prendre en compte l’évolution du cycle de vie, la santé et la qualité de vie des individus afin de s’approcher au plus près de l’impact réel du vieillissement démographique sur la société. C’est dans ce contexte que nous proposons notre indicateur, appelé « fardeau de la mortalité ». En le comparant au rapport de dépendance classique nous mettrons en évidence l’influence de l’évolution des comportements des populations vis-à-vis du marché du travail et la capacité de la population en emploi de soutenir la population dépendante. Notre indicateur, qui rapporte l’effectif d’individus à qui il reste 15 ans et moins à vivre à la population occupant un emploi, a connu de nombreuses variations depuis 1921. En 1921, 100 individus en emploi soutenaient 48 personnes ayant moins de 15 ans à vivre. Le fardeau de la mortalité a diminué pour atteindre un minimum en 2008 (22%), puis a débuté une période de croissance qui correspond au vieillissement des générations du baby-boom. Cependant, nos projections montrent que le fardeau de la mortalité devrait atteindre un plafond autour de 30% à l’horizon 2047. L’évolution du cycle de vie professionnel des individus, tant chez les hommes que chez les femmes, mais principalement chez ces dernières, tempère l’effet de « fardeau » de la population qui va décéder.

Mots-clés : vieillissement , mortalité , fardeau , cycle de vie , Canada , projections , projection
Contexte et objectifs: Le Tai Chi (TC) a été rapporté comme bénéfique pour améliorer l'équilibre suite à un accident vasculaire cérébral (AVC), mais son utilisation pour la réadaptation du membre supérieur reste inconnue. Le but de cette étude était d’évaluer la faisabilité et l'efficacité du TC pour la réadaptation du membre supérieur post-AVC. Méthode: Douze personnes ayant un AVC en phase chronique avec une parésie persistante ont participé à des sessions de 60 minutes de TC adaptées deux fois par semaine pendant 8 semaines et au suivi à 12 semaines. Un programme à domicile de 10 minutes de TC a été recommandé pour les jours sans session. Le niveau de performance du TC, les mouvements adaptés utilisés, la participation aux sessions et la durée de pratique à domicile ont été documentés. La douleur à l’épaule (Visual Analogue Scale (VAS)), la fonction motrice du bras parétique ((Fugl-Meyer Assessment upper-limb section (FMA-UL), Wolf Motor Function Test (WMFT)) et l'utilisation du bras parétique dans la vie quotidienne (Motor Activity Log (MAL)) ont été mesurées au départ, après le traitement et au suivi (4 semaines post-traitement). Un questionnaire de rétroaction a été utilisé pour évaluer la perception des participants sur l'utilisation du TC lors du suivi. Résultats: Onze participants ont terminé l'étude de 8 semaines. Un algorithme de raisonnement clinique qui sous-tend l’adaptation du TC a été développé sur la base des niveaux fonctionnels des participants. Les participants ayant des profils différents, y compris le membre supérieur sévèrement atteint, l'équilibre atteint, de la douleur à l'épaule et de la spasticité sévère étaient non seulement capables de pratiquer le TC adapté, mais ont participé à l'ensemble des 16 sessions et pratiquaient le TC à la maison plus que recommandé (un total de 16.51 ± 9.21 heures). La quantité de pratique à domicile des sous-groupes avec la fonction inférieure du membre supérieur, de la douleur à l'épaule ou de la spasticité modérée-à-sévère, était similaire aux sous-groupes avec une fonction supérieure du membre supérieur, sans douleur à l'épaule et une spasticité minimale ou non-présente. Les participants ont montré une amélioration significative au fil du temps selon le FMA -UL (p=.009), l’échelle fonctionnelle du WMFT (p=.003), le temps de performance du WMFT (p=.048) et l’échelle du montant de l’utilisation du MAL (p=.02). La douleur à l'épaule des quatre participants a diminué suite au TC (VAS 5.5±3, 3±2.8, 2.5±2.5 pour la période de pré-traitement, post-traitement et suivi). En outre, les participants ont confirmé l'utilité et la facilité de la pratique du TC adapté. Conclusion: Le TC adapté est faisable, acceptable et efficace pour la réadaptation du membre supérieur après un AVC. Une fonction diminuée au membre supérieur, l’équilibre insuffisant, la spasticité et la douleur à l'épaule ne semblent pas empêcher la pratique du TC. Plus d’essais randomisés à grande échelle sont nécessaire pour évaluer l’effet du TC sur la réadaptation du membre supérieur.

Mots-clés : Tai Chi , Réadaptation , Faisabilité , Accident vasculaire cérébral , Membre supérieur , Récupération motrice
Les microARN (miARN) sont des petits ARN non-codants pour des protéines qui permettent d’inhiber la traduction d’ARN messagers. Pour obtenir un miARN, un gène de miARN passe à travers une voie de maturation dans laquelle il sera coupé à deux reprises par les enzymes Drosha et Dicer. Pour interagir avec les enzymes, les gènes de miARN possèdent une structure générale en tige-boucle. Cependant, les détails de cette structure sont encore peu connus. L’objectif principal de ce projet était d’établir s’il y a une relation entre l’efficacité de maturation et la dynamique de la structure. Pour cela, l’efficacité de maturation de plusieurs variants de miARN a été évaluée par Northern Blot. La dynamique de la structure a été mesurée par un programme informatique à partir de l’information de la séquence. Une corrélation de 0,74 avec une valeur p de 0,02206 a été obtenue entre les dynamiques et les ratios d’efficacités de maturation de miARN. Cette corrélation est supérieure à celle obtenue basée sur l’énergie libre des structures prédites les plus stables qui n’atteignent pas 0,6. Les mutants de miR128-1 et miR188 ont été découverts comme diminuant la maturation. De plus, les mutants de miR125a, miR188 et miR330 affectent le site de clivage de Drosha. Une meilleure connaissance de la dynamique de l’ARN impliquée dans la maturation permettrait de définir l’impact des mutations dans les séquences de miARN ou encore de prédire les séquences pouvant générer des miARN.

Mots-clés : ARN , miARN , maturation , Dicer , Drosha , structure , dynamique , Northern Blot
L’anémie falciforme est l’une des maladies du sang les plus répandues chez l’homme. Les complications liées à la maladie sont systémiques. Influant virtuellement tous les organes du corps, cette affection provoque des crises de douleurs imprévisibles et aigües dont les complications mènent parfois à la mort. Le processus à travers lequel un globule rouge sain prend la forme d’une faucille est bien décrit dans la littérature; sous désoxygénation, l’eau et les solutés se retirent des globules rouges, la concentration d’hémoglobine S augmente et nous donne des globules rouges denses et déshydratés qui par la suite deviennent falciformes. Les traitements d’aujourd’hui sont pour la plupart expérimentaux et coûteux. De plus, leurs efficacités à long terme varient d’un patient à l’autre. Il est donc impératif de trouver un biomarqueur qui est à la fois abordable et qui améliore la santé des malades de façon systématique. La densité des globules rouges est un biomarqueur largement ignoré par la communauté médicale dans le contexte de la drépanocytose. Aborder l’étude de la sévérité de cette maladie en se concentrant sur la densité des globules rouges nous met en position d’identifier des traitements pour réhydrater les érythrocytes et leur rendre leur forme originale de disque biconcave. Plusieurs études cliniques et physiologiques se sont penchées sur ce biomarqueur sans explorer le volet génétique. Nous avons cherché à éclaircir cet aspect en menant une étude d’association pangénomique et en examinant les séquences exomiques d’individus avec des mesures de densité extrême. Notre étude d’association pangénomique n’a pas conduit à la découverte de nouveau loci, probablement parce que la taille de notre échantillon, et donc notre puissance statistique, était limitée. En revanche, à travers notre approche de priorisation, nous avons découvert un marqueur intronique qui contrôle l’expression d’ATP2B4, la protéine principale de transport de calcium dans les hématies. Notre séquençage exomique a identifié deux mutations rares faux-sens chez un même patient; l’une dans ATP1B2, un transporteur de Na+/K+, et l’autre dans SPTB, le gène du β-spectrin. Ces mutations expliqueraient pourquoi ce patient a le pourcentage de densité le plus élevé parmi tous nos patients séquencés, et pourquoi il vit avec plusieurs complications de la maladie. Finalement, nous avons localisé une mutation faux-sens rare chez deux patients avec un indice élevé de densité de globule rouge, dans PIEZO1, le canal ionique mécano-sensitif. La mutation est prédite délétère par deux algorithmes de prédiction de fonction protéique.

Mots-clés : Analyse pangénomique , Séquençage d’exome , Anémie falciforme , Densité des globules rouges , Hydratation des hématies , EQTL
La génération des cellules hématopoïétiques, aussi connue sous le nom d'hématopoïèse, est contrôlée par l’activité conjuguée de facteurs de transcription lignée-spécifiques permettant l’expression, en temps et lieu, de gènes spécifiques nécessaires pour le développement cellulaire. Dans le cadre de notre étude, nous avons étudié les facteurs de transcription KLF2 et KLF4 qui jouent des rôles cruciaux dans la formation des lymphocytes B et T. KLF2 et KLF4 activent la transcription de gènes spécifiques via leur interaction avec le co-activateur (CBP). Leurs interactions avec CBP requièrent le domaine de transactivation (TAD) qui est localisé dans la région N-terminal des facteurs KLF2 et KLF4.  Des études préalables ont montré que des domaines TAD sont aussi présents chez la protéine suppresseur de tumeur p53 et que ces domaines sont requis pour les interactions entre la protéine p53 et le co-activateur CBP. Récemment, plusieurs structures des TADs de p53 en complexe avec les domaines TAZ2 et KIX de CBP ont permis de démontrer que ces TADs sont de nature acide et contiennent un motif ΦΧΧΦΦ crucial pour la formation des interactions. De plus, il s’avère que ces TADs sont similaires aux TADs de KLF2 et KLF4.  L’étude présentée dans ce mémoire relate la caractérisation structurelle et fonctionnelle des interactions formées par les facteurs de transcription KLF2 et KLF4 avec leur partenaire d'interaction, CBP, pour activer la transcription de gènes spécifiques. Nos analyses ont été faites en utilisant différentes techniques telles que le titrage calorimétrique isotherme (ITC), la résonance magnétique nucléaire (RMN) ainsi que des expériences de transactivation chez la levure. Notre étude permet une meilleure compréhension des rôles opposés mais complémentaires qu'ont les protéines KLF2 et KLF4 au cours du développement et de la différentiation des lymphocytes B et T en plus de fournir les détails mécanistiques à la base de leurs interactions. Ces informations seront potentiellement utiles pour le développement d'outils à des fins thérapeutiques dans le cadre des leucémies, notamment.

Mots-clés : Facteur Kruppel-like (KLF) , Protéine se fixant au CRE (CBP) , Titrage calorimétrique isotherme (ITC , Résonance magnétique nucléaire (RMN) , Interaction protéine-protéine , Domaine de transactivation , Hématopoïèse , Hematopoiesis
Les granulocytes de faible densité (LDGs) sont un sous-type de neutrophiles mis en évidence initialement dans le sang de patients atteints de différentes maladies telles que le lupus érythémateux systémique ou le psoriasis. Cependant, des études rapportent également leur présence chez des individus sains. On connait mal à ce jour les caractéristiques des LDGs, notamment en ce qui a trait à leur profil inflammatoire. De plus, leur biogenèse demeure toujours mal connue. Mes travaux de maîtrise visaient à comparer les propriétés des LDGs à celles des neutrophiles de densité normale (NDNs). Pour ce faire, 8 chevaux atteints d’asthme équin sévère et 11 chevaux sains bien caractérisés ont été sélectionnés pour l’étude et sur lesquels des isolations de NDNs ainsi que des LDGs ont été réalisées. La morphologie des neutrophiles a ensuite été évaluée par microscopie optique. Le contenu en myéloperoxidase, un composant des granules primaires azurophiles des neutrophiles, et la présence de récepteurs du N-formylméthionine-leucyl-phénylalanine (fMLP-R) ont été évalués par cytométrie de flux et immunofluorescence, respectivement. Enfin, la capacité fonctionnelle de ces cellules à produire spontanément des pièges extracellulaires des neutrophiles (NETs) a été étudiée in vitro par microscopie confocale. Les résultats démontrent que le nombre de LDGs est augmenté dans le sang des chevaux asthmatiques lors d'exacerbation de la maladie. De plus, ces cellules présentent une morphologie différente puisqu’elles sont de taille plus petite et contiennent plus de fMLP-R que les NDNs. Le contenu en myéloperoxidase est cependant similaire dans les deux populations de neutrophiles. Enfin, les LDGs produisent plus de NETs, et sont plus sensibles aux stimuli activateurs que les NDNs. Ces caractéristiques sont similaires dans les 2 groupes de chevaux suggérant ainsi que ce sont des propriétés intrinsèques des LDGs et qu’ils représentent une population cellulaire préactivée et qui de plus, est majoritairement mature. Cette étude caractérise et compare pour la première fois les LDGs chez des animaux sains et ceux retrouvés chez des animaux atteints d’une maladie inflammatoire chronique.

Mots-clés : Neutrophiles , Granulocytes de faible densité (LDGs) , Pièges extracellulaires des neutrophiles (NETs) , Asthme , Asthma , Chevaux
Les expériences de séquençage à haut débit ont permis de démontrer que la transcription ne se limite pas aux régions codantes et qu’une grande partie du génome est transcrite en ARN non-codants (ARNnc). Parmi eux, les transcrits cryptiques sont initiés à l’intérieur des régions codantes. Des études faites chez la levure Saccharomyces cerevisiae, ont pu identifier plusieurs facteurs qui répriment la transcription cryptique. Un de ces facteurs est Spt6, une chaperonne d’histones requise pour le maintien d’un bon niveau de nucléosomes le long des gènes transcrits. Lorsque Spt6 est muté, on observe une déplétion des nucléosomes conduisant à l’activation des promoteurs cryptiques. Cependant, le mécanisme par lequel ces transcrits cryptiques sont régulés n’est pas encore clair.  Dans ce mémoire, nous présentons un travail dans lequel nous avons développé une méthode probabiliste dans le but de caractériser les transcrits cryptiques à partir de données de RNA-Seq. Cette méthode est basée sur une cumulation des données et permet de tenir compte des variations dans l’expression et dans la longueur des gènes, grâce à une étape de randomisation des données. Les résultats démontrent que notre méthode est au moins aussi efficace que les méthodes précédemment décrites dans la littérature et offre un bon compromis entre le taux de faux positifs et de faux négatifs. Enfin, le plus important est que cette méthode permet de prédire les régions génomiques où les transcrits cryptiques sont initiés.  Nous avons mis en évidence la présence de transcrits cryptiques sur les brins sens et antisens par rapport au gène. Nous avons également montré que les promoteurs cryptiques sens et antisens sont enrichis en motif TATA et que les transcrits cryptiques sont polyadénylés, ce qui suggère qu’ils peuvent être régulés par les mêmes mécanismes qui régulent les gènes. Alors que les transcrits cryptiques sur le brin sens se terminent à la même position que les gènes dont ils sont issus, les transcrits cryptiques sur le brin antisens terminent préférablement aux extrémités 3’ des gènes situés en amont. Nous proposons donc que les terminateurs chez S. cerevisiae ont évolué pour terminer la transcription de manière bidirectionnelle afin d’empêcher une transcription aberrante qui pourrait envahir les gènes voisins.

Mots-clés : Transcription cryptique , Terminateurs bidirectionnels , RNA-Seq , Spt6
L’élimination des cellules sénescentes met en jeu le SASP et les cellules immunitaires de l’immunité innée et adaptative tels que les macrophages (Mφ). Dans le cadre de ce projet, nous rapportons que le SASP a un effet pléiotropique sur l’activité des cellules immunitaires incluant leur recrutement, leur activation et leur différenciation. Nos données montrent que les Mφ humains mis en culture avec le SASP de fibroblastes humains développement un profil inflammatoire spécifique au SASP caractérisé par une sécrétion pro-inflammatoire (M1) (ex : IL- 1β, GM-CSF) et des marqueurs de surface anti-inflammatoires (M2) (cellules CD23+CD206+). Le SASP est aussi capable d’augmenter les capacités d’invasion des Mφ, tel que montré via des essais d’invasion, mais n’a pas d’effet sur la différentiation des monocytes. Nos modèles de co- culture montrent que, quoique les cellules NK sont probablement responsables de l’élimination directe et spécifique des cellules sénescentes, leur activité peut être modulée par d’autres cellules immunitaires tels que les Mφ qui réduisent l’élimination faite par les cellules NK, suggérant un profil M2. Les lymphocytes T CD8+ sont aussi essentiels pour l’élimination des cellules sénescentes puisque leur retrait retarde le processus. De plus, nous démontrons que les cellules T CD4+ mises en culture pendant 48h dans le SASP sécrètent de hauts niveaux d’IL-4, indiquant une polarisation Th2. Somme toute, ces données montrent que le SASP peut moduler l’activité des Mφ tout comme celle d’autres cellules immunitaires impliquées dans l’élimination des cellules sénescentes et peut promouvoir, étonnamment, une réponse immunosuppressive pouvant être importante pendant la réparation tissulaire.

Mots-clés : Macrophages , Sénescence , Maladies liées au vieillissement , SASP , Élimination des cellules sénescentes , Cellules tueuses naturelles (NK) , Lymphocytes T CD8+
De récentes études ont identifié la créativité tactique (CT) comme un élément essentiel de la performance en sport, plus particulièrement dans les sports d’équipe où il faut envahir le  camp adverse pour marquer un point (Memmert, Baker & Bertsch, 2010 ; Altavilla & Raiola, 2015). En effet, la dynamique continue du jeu confronte l’athlète à de nouvelles situations pour lesquelles il n’a pas appris de séquences d’action prédéterminées. L’athlète créatif est donc celui qui est capable de générer des solutions originales, flexibles et variées dans des situations de jeu spécifiques (Memmert & Roth, 2007 ; Greco, Memmert & Morales, 2010). Cette étude qualitative a pour but d’explorer le phénomène de la créativité tactique telle qu’elle est perçue et vécue par des athlètes et des entraîneurs de niveau universitaire évoluant dans certains sports d’invasion. Des entrevues semi-structurées ont été menées avec les entraîneurs-chefs et leurs athlètes identifiés comme étant des joueurs créatifs. Les transcriptions ont été soumises à une analyse de contenu. Les résultats suggèrent que les athlètes créatifs partagent des caractéristiques communes, les plus importantes étant la vision du jeu, la non-conformité/nouveauté et la rapidité de la prise de décision. Dans une perspective développementale, la CT est liée à la diversification entre et dans les sports ainsi qu’un volume élevé d’expérience. La microstructure des activités d’entraînement contribue également au développement d’habiletés créatives, plus particulièrement les exercices centrés sur le jeu qui favorise la résolution de problèmes et la prise de décision. Contrairement aux études précédentes, nos résultats révèlent que le coaching soutenant l’autonomie et une relation positive entre l’athlète et l’entraîneur facilite le développement de la créativité ce qui nous permet de faire des liens avec la théorie de l’autodétermination. Enfin, la CT est associée à des conséquences tant au niveau social que de la performance. Bien qu’inattendu, la CT semble jouer un rôle fonctionnel dans l’utilisation de stratégies de coping adaptées. Les implications pratiques se définissent en deux axes. D’une part, fournir aux entraîneurs des lignes directrices pour créer un environnement idéal afin d’améliorer le développement de la CT. D’autre part, conscientiser les athlètes quant à l’importance de certains facteurs environnementaux et développementaux qui contribuent à maximiser leur potentiel créatif.

Mots-clés : créativité tactique , sports d'invasion , athlètes , expériences développementales
Deux décennies après l’adoption de la Convention relative au statut des réfugiés en 1951, l’affluence du nombre de réfugiés réclamant l’asile aux frontières occidentales a mené les États européens à instaurer des règles restrictives pour dissuader les demandeurs d’asile à se réclamer de cette protection internationale au sein de leurs territoires respectifs. Une des mesures préventives récentes est la directive sur « Pays d’origine sûrs » (POS) dont l’objectif est d’identifier les requérants non éligibles à recevoir la protection internationale, car issus de pays considérés sécuritaires. Ce travail de recherche propose une étude comparative entre les directives de l’Union européenne adoptées en 2005, puis réformées en 2013 et la Loi sur l’immigration et la protection des réfugiés en vigueur au Canada. D’une part, nous analysons l’impact néfaste de cette directive dissuasive sur les droits fondamentaux des demandeurs d’asile en provenance de pays d’origine désignés, notamment en ce qui a trait à leur droit à une entrevue individuelle ainsi que leur droit d’en appeler de la décision qui a été prise et leur refusant l’asile. D’autre part, nous démontrerons comment l’étendue des limites substantielles à l’égard des droits fondamentaux des demandeurs d’asile en provenance des POS est contradictoire avec les obligations constitutionnelles de l’UE et du Canada, notamment celles formulées dans la Charte des droits fondamentaux de l’Union européenne, la Convention européenne des droits de l’homme et la Charte canadienne des droits et libertés. Bien que l’élaboration et l’application des règles adoptées par les systèmes juridiques mentionnés souffrent de plusieurs défauts violant les droits fondamentaux des demandeurs d’asile en provenance de pays d’origine désignés, nous démontrerons que l’approche du Canada a des conséquences plus draconiennes sur des demandeurs d’asile en provenance de POS que celles découlant de la loi commune applicable dans l’UE. Finalement, nous conclurons que les États occidentaux ne devraient pas se limiter à une solution à court terme telle celle du POS. Ces États devraient avoir plus de responsabilités et offrir une protection internationale accrue en soutenant les pays près de zones de conflits tout en établissant un programme réaliste permettant d’accueillir un nombre précis de réfugiés tous les ans. Mots Clés : Pays d’origine sûrs – Pays d’origine désignés – Droits humains – Droits procéduraux – Droit à l’entrevue individuelle – Droit d’appel – l’Union européenne – Canada – Réfugiés requérants – Demandeurs d’asile

Mots-clés : Pays d'origine sûrs , Pays d'origine désignés , Droits humains , Droits procéduraux , Droit à l'entrevue individuelle , Droit d'appel , l'Union européenne , Canada , Réfugiés requérants , Demandeurs d'asile , Canada