裸鰓類的譜系學分類

Acanthodoris lutea在美國加利福尼亞的潮池中產卵。
裸鰓類的譜系學分類仍在研究中。一般來說，本支序的物種大致可以分為有角鰓類和無角鰓類兩大類，但若以物種的豐盛度來看，則以海牛類 (裸鰓類)及簑海牛類兩大分類最豐富。不同的文獻對這兩大分類所包含的物種有所出入。以下為最新的分類及過往歷史上曾經出現的主流分類。

**概說**
裸鰓目原是後鰓目的成員，其科學分類到現在仍在研究中，仍不時會有改動。從18S核醣體DNA的資料顯示，裸鰓類應該是一個單系群。傳統上，裸鰓類的分類如下：- 花鰓類 Anthobranchia
** 海牛總科 Doridoidea：又名隱鰓類
** Doridoxoidea
** Onchidoridoidea
** 多角總科 Polyceroidea- 枝鰓類 Cladobranchia
** 蓑海牛總科 Aeolidioidea
** 片鰓海蛞蝓總科 Arminoidea
** 枝背海牛總科 Dendronotoidea
** 後片鰓海蛞蝓總科 Metarminoidea
另一項2001年的研究卻發現裸鰓類應該分為兩個主要分支：- Anthobranchia（只包括Bathydoridoidea及海牛總科 Doridoidea）- Dexiarchia nom. nov.（Doridoxoidea、Dendronotoidea、Aeolidoidea及Arminoidea）

**2005年分類**
裸鰓類是異鰓類內物種分類最複雜的：單單是總科以上的就有六個支序。根據2005年的《布歇特和洛克羅伊的腹足類分類》Bouchet 2005，裸鰓類裸鰓類亞支序（Nudibranchia）大致可以分為下列三個部份：- 有角鰓類支序（Euctinidiacea）- 無角鰓類支序（Dexiarchia）- 總科地位未定
**Family Rhodopidae

**總科與科**
 枝背海牛總科 Dendronotina
** 三歧海牛科 Tritoniidae Lamarck, 1809
** Marianinidae
** Lomanotidae
** Scyllaeidae
** Hancockiidae
** 枝背海牛科 Dendronotidae
** 二列鰓海牛科 Bornellidae
** Tethyidae
** Dotoidae
** Phylliroidae- 片鰓海蛞蝓總科 Arminoidealesmart
** Pachygnatha
*** Madrellidae
*** Dironidae
*** Zephyrinidae
** Leptognatha
*** Goniaeolididae
*** Charcotiidae
*** Heroidae
** Euarminiacea
*** Heterodorididae
*** Doridomorphidae
*** 片鰓海蛞蝓科 Arminidaelesmart
*** Lemindidae- 蓑海牛總科 Aeolidioidea
** Pleuroprocta
*** Notaeolidiidae
*** Coryphellidae
*** Nossidae
*** 扇羽鰓科 Flabellinidae Bergh, 1889
*** Protaeolidiellidae
*** Pleurolidiidae
** Acleioprocta
*** Pseudovermidae
*** Tergipedidae
*** 菲納鰓科 Fionidae Gray, 1857
*** Calmidae
*** Eubranchidae
**** Cumanotinae
**** Eubranchinae
** Cleioprocta
*** 蓑海牛科 Aeolidiidae
*** Myrrhinidae
*** 海神鰓科 Glaucidae
**** Babakininae
**** 灰翼亞科 Facelininae
**** Favorininae
**** Pteraeolidiinae
**** Glaucinae
**** Crateninae
**** Herviellinae

**2017年分類**
根據2017年12月出版的最新分類，裸鰓類從原來的不分等支序改為目級分類單元，依然是裸側類支序的成員，而裸側類亦升為總目級分類單元；但在本分類裸側類不再是直接隸屬直神經類，而是與露齒螺總目共同組成Ringipleura Subterclass這個新成立的分類單元WoRMS_1057249。裸鰓類依然分為枝鰓亞目和海牛亞目兩個亞目WoRMS_1762：- 枝鰓亞目 Cladobranchia
** ?
*** Marianinidae
*** Hancockiidae
**Aeolidioidea Aeolidioidea Gray, 1827
**片鰓海蛞蝓總科 Arminoidea Iredale & O'Donoghue, 1923 (1841)
**枝背海牛總科 Dendronotoidea Allman, 1845：原來的枝背海牛類（Dendronotina）
*** 枝背海牛科 Dendronotidae Allman, 1845
*** Dotidae Gray, 1853
*** Hancockiidae MacFarland, 1923
*** Lomanotidae Bergh, 1890
*** Scyllaeidae Alder & Hancock, 1855
*** Tethydidae Rafinesque, 1815
**Superfamily Doridoxoidea Bergh, 1899
**菲納鰓總科 Fionoidea Gray, 1857
**扇羽鰓總科 Flabellinoidea Bergh, 1889
**Superfamily Proctonotoidea Gray, 1853
**三歧海牛總科 Tritonioidea Lamarck, 1809
**總科地位未定
***二列鰓海牛科 Bornellidae- 海牛亞目 Doridina
**Infraorder Bathydoridoidei
*** Superfamily Bathydoridoidea Bergh, 1891
**海牛下目 Doridoidei
*** 海牛總科 Doridoidea Rafinesque, 1815
**** Family Actinocyclidae O'Donoghue, 1929
**** Family Cadlinidae Bergh, 1891
**** 多彩海麒麟科 Chromodorididae Bergh, 1891
****Family Discodorididae Bergh, 1891
**** Family Dorididae Rafinesque, 1815
**** Subfamily Miamirinae Bergh, 1891
*** Superfamily Onchidoridoidea Gray, 1827（= Phanerobranchiata Suctoria）
**** Family Akiodorididae Millen & Martynov, 2005
**** Family Calycidorididae Roginskaya, 1972
**** Family Corambidae Bergh, 1871
**** Family Goniodorididae H. Adams & A. Adams, 1854
**** Family Onchidorididae Gray, 1827
*** 葉海牛總科 Phyllidioidea Rafinesque, 1814
**** 枝鰓海麒麟科shelldoc_000161 Dendrodorididae O'Donoghue, 1924 (1864)
**** Family Mandeliidae Valdés & Gosliner, 1999
**** 葉海牛科 Phyllidiidae Rafinesque, 1814
*** 多角總科 Polyceroidea Alder & Hancock, 1845（= lang|la|Phanerobranchiata Non Suctoria）
**** Family Aegiridae
**** 六鰓海麒麟科 Hexabranchidaeshelldoc_000161：又名六鰓海牛科shelldoc_200142
**** 優美海麒麟科 Okadaiidae
**** 多角海牛科 Polyceridae Alder & Hancock, 1845：又名多角海麒麟科shelldoc_000161)，併入了Gymnodorididae Odhner, 1941。

**參考文獻**

**參看**
腹足綱的譜系學分類