真菌分類系統

真菌分類系統是關於真菌的科學分類法。19世紀至今，各學者對真菌的分類不盡相同，其中最常用的是安斯沃斯在1971年作出的分類系統。

**貝西分類系統**
1935年，恩斯特·貝西（Ernst Bessey）出版了美國第一本真菌學教科書。1950年，又出版了《真菌的形態和分類》一書，其中包含了他所創的“三綱一類”分類系統。- 菌蟲 Mycetozoa- 藻狀菌綱 Phycomyceteae- 產子實體真菌類 Capormyceteae- 子囊菌綱 Ascomyceteae
** 核菌 Pyrenomycetes- 擔子菌綱 Basidomyceteae
** 冬孢亞綱 Teliosporae
** 異擔子亞綱 Heterobasidiae
** 層菌亞綱 Hymenomyceteae
** 腹菌亞綱 Gasteromyceteae- 半知菌類 Imperfect Fungi
** 叢梗孢目 Moniliales
** 球殼孢目 Sphaeropsidales
** 黑盤孢目 Melanconiales

**馬丁分類系統**
喬治·威拉德·馬丁（George Willard Martin）繼承了“三綱一類”的分類系統，並作了細化。- 藻類 Algal group- 菌類 Fungal group
** 集胞黏菌目 Acrasiales
** 網黏菌目 Labyrinthulales
** 根腫菌目 Plasmodiophorales- 黏菌門 Myxomycetes- 真菌門 Eumycetes
** 藻狀菌綱 Phycomycetes
*** 毛菌亞綱 Trichomycetes
*** 卵菌亞綱 Oomycetes
*** 接合菌亞綱 Zygomycetes- 子囊菌綱 Ascomycetes
** 半子囊菌亞綱 Hemiascomycetidae
** 真子囊菌亞綱 Euascomycetidae
** 擔子菌綱 Basidiomycetes
*** 異擔子菌亞綱 Heterobasidiomycetes
*** 同擔子菌亞綱 Homobasidiomycetes
** 半知菌類 Fungi Imperfecti

**亞歷克索普洛斯分類系統**
亞歷克索普洛斯（Alexopoulos）對之前混亂的分類單元名稱進行了規範。其1952年的分類系統沿襲了“三綱一類”的分類系統。而1962年的分類系統開始放棄“三剛一類”的分類系統，將藻狀菌綱分為6綱。

**亞歷克索普洛斯1952年分類系統**
 黏菌門 Myxomycophyta
** 黏菌綱 Myxomyceteae- 根腫菌綱 Plasmodiophoreae- 集胞黏菌綱 Acrasieae- 真菌門 Eumycophyta- 藻狀菌綱 Phycomycetes
** 單鞭毛菌組 Uniflagellatae
** 雙鞭毛菌組 Biflagellatae
** 無鞭毛菌組 Aplanatae- 子囊菌綱 Ascomycetes
** 原子囊菌亞綱 Protoascomycetes
** 真子囊菌亞綱 Euascomycetes
*** 不整子囊菌組 Plectoascomycetes
*** 果子囊菌組 Pyenomycetes
*** 盤子囊菌組 Disomycetes- 擔子菌綱 Basidiomycetes
*** 半擔子菌亞綱 Hemibasidiomycetes
*** 無隔擔子菌亞綱 Holobasidiomycetes- 半知菌類 Deuteromycetes

**亞歷克索普洛斯1962年分類系統**
 真菌門 Mycota
** 黏菌亞門 Myxomycotina
*** 黏菌綱 Myxomycetes
** 真菌亞門 Eumycotina
*** 根腫菌綱 Plasmodiophoromycetes
*** 壺菌綱 Chytridiomycetes
*** 絲壺菌綱 Hyphochytriomycetes
*** 卵菌綱 Oomycetes
*** 接合菌綱 Zygomycetes
*** 毛菌綱 Trichomycetes
*** 子囊菌綱 Ascomycetes
**** 半子囊菌亞綱 Hemiascomycetidae
**** 真子囊菌亞綱 Euascomycetidae
***** 不整子囊菌 Plectomycetes
***** 核菌 Pyrenomycetes
***** 盤菌 Discomycetes
***** 蟲囊菌 Laboulbeniomycetes
**** 腔囊菌亞綱 Loculoascomycetidae
** 擔子菌綱 Basidiomycetes
*** 異擔子菌亞綱 Heterobasidiomycetidae
*** 同擔子菌亞綱 Homobasidiomycetidae
***** 層菌 Hymenomycetes
***** 腹菌 Gasteromycetes
**** 半知菌綱 Deuteromycetes

**亞歷克索普洛斯1979年分類系統**
 真菌界 Myceteae
** 裸菌門 Gymnomycota
*** 集胞裸菌亞門 Acrasiogymnomycotina
**** 集胞菌綱 Acrasiomycets
*** 原質體裸菌亞門 Plasmodiogymnomycotina
**** 原柄菌綱 Protosteliomycetes
**** 黏菌綱 Myxomycetes
** 鞭毛菌門 Mastigomycota
*** 單鞭毛菌亞門 Haplomastigomycotina
**** 壺菌綱 Chytridiomycetes
**** 絲壺菌綱 Hyphochytridiomycetes
**** 根腫菌綱 Plasmodiophoromycetes
*** 雙鞭毛菌亞門 Diplomastigomycotina
**** 卵菌綱 Oomycetes
** 無鞭毛菌門 Amastigomycota
*** 接合菌亞門 Zygomycotina
**** 接合菌綱 Zygomycetes
**** 毛菌綱 Trichomycetes
*** 子囊菌亞門 Ascomycotina
**** 子囊菌綱 Ascomycetes
***** 半子囊菌亞綱 Hemiascomycetidae
***** 不整子囊菌亞綱 Plectomycetidae
***** 層囊菌亞綱 Hemenoascomycetidae
****** 核菌 Pyrenomycetes
****** 盤菌 Discomycetes
***** 蟲囊菌亞綱 Laboulbeniomycetidae
***** 腔囊菌亞綱 Loculoascomycetidae
*** 擔子菌亞門 Basidiomycotina
**** 擔子菌綱 Basidiomycetes
***** 無隔擔子菌亞綱 Holobasidiomycetidae
****** 層擔子菌 Hemenomycetes
****** 腹菌 Gasteromycetes
***** 有隔擔子菌亞綱 Phragmobasidiomycetidae
***** 冬孢菌亞綱 Teliomycetidae
*** 半知菌亞門 Deuteromycotina
**** 半知菌形式綱 Deuteromycetes
***** 芽孢亞綱 Blastomycetidae
***** 絲孢亞綱 Hyphomycetidae
***** 腔孢亞綱 Coelomycetidae

**安斯沃斯分類系統**
安斯沃斯分類系統採用了五界系統學說，在20世紀七八十年代廣泛使用。安斯沃斯分類系統與亞歷克索普洛斯分類系統較相似，其區別在於建立了3個新亞門，鞭毛菌亞門、接合菌亞門和半知菌亞門，並將子囊菌分為6個綱，半知菌亞門設3個綱。- 真菌界 Fungi
** 黏菌門 Myxomycota
*** 集胞黏菌綱 Acrasiomycetes
*** 黏菌綱 Myxomycetes
*** 水生黏菌綱 Hydromyxomycetes
*** 根腫菌綱 Plasmodiophoromyecetes
** 真菌門 Eumycota
*** 鞭毛菌亞門 Mastigomycotina
**** 壺菌綱 Chytridiomycetes
**** 絲壺菌綱 Hyphochytridiomycetes
**** 卵菌綱 Oomycetes
*** 接合菌亞門 Zygomycotina
**** 接合菌綱 Zygomycetes
**** 毛菌綱 Trichomycetes
*** 子囊菌亞門 Ascomycotina
**** 半子囊菌綱 Hemiascomycetes
**** 不整子囊菌綱 Plectomycetes
**** 核菌綱 Pyrenomycetes
**** 盤菌綱 Discomycetes
**** 蟲囊菌綱 Laboulbeniomycetes
**** 腔囊菌綱 Loculoascomycetes
*** 擔子菌亞門 Basidiomycotina
**** 冬孢菌綱 Teliomycetes
**** 層菌綱 Hymenomycetes
***** 隔擔子菌亞綱 Phragmobasidiomycetidae
***** 無隔擔子菌亞綱 Holobasidiomycetidae
**** 腹菌綱 Gasteromycetes
*** 半知菌亞門 Deuteromycotina
**** 芽孢綱 Blastomycetes
**** 絲孢綱 Hyphomycetes
**** 腔孢綱 Coelomycetes

**卡弗利爾-史密斯分類系統**
卡弗利爾-史密斯分類系統是最早體現出真菌是多界演化的分類系統之一。其將半知菌歸入到其有性階段的分類單元中。- 原生動物界 Protozoa
** 菌蟲 Mycetozoa- 藻界 Chromista
** 具長短鞭毛門 Heterokonta
*真菌界 Fungi
** 古真菌門 Archemycota
*** 壺菌綱 Chytridiomycetes
*** 毛菌綱 Trichomycetes
*** 接合菌綱 Zygomycetes
** 子囊菌門 Ascomycota
** 擔子菌門 Basidiomycota

**巴爾分類系統**
唐納德·J·S·巴爾（Donald J. S. Barr）1992年提出了巴爾分類系統。- 原生動物界 Protozoa
** 黏菌門 Myxomycota
** 根腫菌門 Plasmodiophoromycota- 藻界 Chromista
** 具長短鞭毛門 Heterokonta
*** 假菌亞門 Pseudomycotina
**** 卵菌綱 Oomycetes
**** 絲壺菌綱 Hyphochytridiomycetes
*** 網黏菌亞門 Labyrinthitina
**** 網黏菌綱 Labyrinthiomycetes- 真菌界 Fungi
** 壺菌門 Chytridiomycota
** 接合菌門 Zygomycota
** 子囊菌門 Ascomycota
** 擔子菌門 Basidiomycota

**《真菌詞典》第9版分類系統**
2001年出版的《真菌詞典》第9版分類系統，根據rDNA測序等技術對第8版分類系統進行了修訂。將子囊菌門分成6個綱，55個目，291個科；擔子菌門原有的32個目合併為16個目；擔子菌類酵母菌劃分到3個不同類群中。- 原生動物界 Protozoa
** 黏菌門 Myxomycota
*** 網柱黏菌綱 Dictyosteliomycetes
*** 黏菌綱 Myxomycetes
*** 原柱黏菌綱 Protosteliomycetes
** 根腫菌門 Plasmodiophoromycota
*** 根腫菌綱 Plasmodiophoromycetes- 藻界 Chromista
** 絲壺菌門 Hyphochytriomycota
*** 絲壺菌綱 Hyphochytridiomycetes
** 網黏菌門 Labyrinthumycota
*** 網黏菌綱 Labyrinthumycetes
** 卵菌門 Oomycota
*** 卵菌綱 Oomycetes- 真菌界 Fungi
** 壺菌門 Chytridiomycota
*** 壺菌綱 Chytridiomycetes
*** 尾體菌綱 Rumpomycetes
** 接合菌門 Zygomycota
*** 接合菌綱 Zygomycetes
*** 毛菌綱 Trichomycetes
** 子囊菌門 Ascomycota
*** 子囊菌綱 Ascomycetes
*** 新床菌綱 Neolectomycetes
*** 肺炎菌綱 Pneumocyctidomycetes
*** 酵母菌綱 Saccharomycetes
*** 裂殖酵母菌綱 Schizosaccharomycetes
*** 外囊菌綱 Taphrinomycetes
** 擔子菌門 Basidiomycota
*** 擔子菌綱 Basidiomycetes
*** 鏽菌綱 Urediniomycetes
*** 黑粉菌綱 Ustilaginomycetes

**《真菌詞典》第10版分類系統**
2008年出版的《真菌詞典》第10版分類系統，對第9版的分類系統做了很大的調整，收錄了2001年～2008年之間的研究成果。該版將真菌界劃分7個門，底下分36綱、140目、560科、8283屬、97861種：- 真菌界 Fungi
** 壺菌門 Chytridiomycota
*** 尾體菌綱 Rumpomycetes
*** 壺菌綱 Chytridiomycetes
*** 單毛壺菌綱 Monoblepharidomycetes（新）
** 芽枝黴門 Blastocladiomycota（新）
*** 芽枝黴綱 Blastocladiomycetes（新）
** 新美鞭菌門 Neocallimastigomycota（新）
*** 新美鞭菌綱 Neocallimastigomycetes（新）
** 球囊菌門 Glomeromycota（新）
*** 球囊菌綱 Glomeromycetes（新）
** 接合菌門 Zygomycota
*** 毛菌綱 Trichomycetes
*** 接合菌綱 Zygomycetes
*** 地位未定 Incertae sedis（亞界）
**** 蟲黴菌亞門 Entomophthoromycotina
**** 梳黴亞門 Kickxellomycotina
**** 毛黴菌亞門 Mucoromycotina
**** 捕蟲黴菌亞門 Zoopagomycotina
** 子囊菌門 Ascomycota
*** 子囊菌綱 Ascomycetes
*** 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina）
**** 星裂菌綱 Arthoniomycetes（新）
**** 座囊菌綱 Dothideomycetes（新）
**** 散囊菌綱 Eurotiomycetes（新）
**** 蟲囊菌綱 Laboulbeniomycetes（新）
**** 茶漬菌綱 Lecanoromycetes（新）
**** 錘舌菌綱 Leotiomycetes（新）
**** 異極菌綱 Lichinomycetes（新）
**** 圓盤菌綱 Orbiliomycetes（新）
**** 盤菌綱 Pezizomycetes（新）
**** 糞殼菌綱 Sordariomycetes（新）
*** 酵母菌亞門 Saccharomycotina
**** 酵母菌綱 Saccharomycetes
*** 外囊菌亞門 Taphrinomycotina
**** 新床菌綱 Neolectomycetes（又譯無絲盤菌綱）
**** 肺炎菌綱 Pneumocystidomycetes
**** 裂殖酵母菌綱 Schizosaccharomycetes
**** 外囊菌綱 Taphrinomycetes
** 擔子菌門 Basidiomycota
*** 擔子菌綱 Basidiomycetes
*** 鏽菌綱 Urediniomycetes
*** 傘菌亞門 Agaricomycotina
**** 傘菌綱 Agaricomycetes（新）
**** 花耳綱 Dacrymycetes（新）
**** 銀耳綱 Tremellomycetes（新）
*** 柄鏽菌亞門 Pucciniomycotina
**** 傘型束梗孢菌綱 Agaricostilbomycetes（新）
**** 小紡錘菌綱 Atractiellomycetes（新）
**** Classiculomycetes Classiculomycetes（新）
**** 隱菌寄生菌綱 Cryptomycocolacomyctes（新）
**** 囊擔子菌綱 Cystobasidiomycetes（新）
**** 小葡萄菌綱 Microbotryomycetes（新）
**** 混合菌綱 Mixiomycetes（新）
**** 柄鏽菌綱 Pucciniomycetes（新）
*** 黑粉菌亞門 Ustilaginomycotina（新）
**** 黑粉菌綱 Ustilaginomycetes
*** 地位未定 Incertae sedis（亞門）
**** 節擔菌綱 Wallemiomycetes（新）

**後來加入的新分類**
 真菌界 Fungi
** 子囊菌門 Ascomycota
*** 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina）
**** 地舌菌綱 Geoglossomycetes（參自地舌菌科 Geoglossaceae，譯名待查）
*** 黑粉菌亞門 Ustilaginomycotina
**** 根腫黑粉菌綱 Entorrhizomycetes
**** 外擔子菌綱 Exobasidiomycetes

**參見**
真菌分類表（待更新）

**參考文獻 ==