日本哺乳動物列表

日本有100種以上的哺乳類，其中約30%為特有種。

**食蟲目 Insectivora**
 蝟科 Erinaceidae
# 刺蝟 - Erinaceus europaeus (ナミハリネズミ，並針鼠) ※移入種- 鼩鼱科 Soricidae
# 本州鼩鼱 - Sorex hosonoi (アズミトガリネズミ，安曇尖鼠) ※固有種
## S. h. hosonoi (アズミトガリネズミ，安曇尖鼠)
## S. h. shiroumanus (シロウマトガリネズミ，白馬尖鼠)
# 姬鼩鼱 - Sorex minutissimus (チビトガリネズミ，禿尖鼠)
## S. m. hawkeri (トウキョウトガリネズミ，東京尖鼠)
# 細鼩鼱 - Sorex gracillimus (ヒメトガリネズミ，姫尖鼠)
# 中鼩鼱 - Sorex caecutiens (トガリネズミ，尖鼠)
## S. c. shikokensis (シコクトガリネズミ，四國尖鼠) ※固有亜種
## 日本鼩鼱 - S. c. shinto (ホンシュウトガリネズミ，本州尖鼠) ※固有亜種
## S. c. saevus (エゾトガリネズミ，蝦夷尖鼠)
# 佐渡鼩鼱 - Sorex sadonis (サドトガリネズミ，佐渡尖鼠) ※固有種
# 長爪鼩鼱 - Sorex unguiculatus (オオアシトガリネズミ，大足尖鼠)
# 西南水鼩 - Chimarrogale platycephala (カワネズミ，川鼠) ※固有種
# 小麝鼩 - Crocidura suaveolens (コジネズミ，小地鼠)
## C. s. shantungensis (チョウセンコジネズミ，朝鮮小地鼠)
# 長尾小麝鼩 - Crocidura horsfieldii (オナガジネズミ，尾長地鼠)
## C. h. watasei (ワタセジネズミ，渡瀬地鼠) ※固有亜種
# 德氏麝鼩 - Crocidura dsinezumi (ジネズミ，地鼠) ※固有種
## C. d. chisai (ホンシュウジネズミ，本州地鼠)
## C. d. dsinezumi (サイゴクジネズミ，西國地鼠)
## C. d. intermedia (タネジネズミ，種地鼠)
## C. d. okinoshimae (オキノシマジネズミ，沖ノ島地鼠)
## C. d. umbrina (ヤクジネズミ，屋久地鼠)
# 奧裡麝鼩 - Crocidura orii (オリイジネズミ，折居地鼠) ※固有種
# 臭鼩 - Suncus murinus (ジャコウネズミ，麝香鼠)
## S. m. riukiuana (リュウキュウジャコウネズミ，琉球麝香鼠)- 鼴科 Talpidae
# 毛吻鼩鼴 - Dymecodon pilirostris (ヒメヒミズ，姫日不見) ※固有種
# 日本鼩鼴 - Urotrichus talpoides (ヒミズ，日不見) ※固有種
## U. t. adversus (ツシマヒミズ，対馬日不見)
## U. t. centralis (シコクヒミズ，四國日不見)
## U. t. hondonis (ホンシュウヒミズ，本州日不見)
## U. t. minutus (オキヒミズ，隠岐日不見)
## U. t. talpoides (キュウシュウヒミズ，九州日不見)
# 本州鼴 - Euroscaptor mizura (ミズラモグラ，髻土竜) ※固有種
## E. m. hiwaensis (ヒワミズラモグラ，ひわ髻土竜)
## E. m. mizura (フジミズラモグラ，富士髻土竜)
## E. m. ohtai (シナノミズラモグラ，信濃髻土竜)
# 尖閣鼴鼠 - Nesoscaptor uchidai (センカクモグラ，尖閣土竜) ※固有種 / 1976年採取、1991年新種認定。
# Mogera imaizumii  (アズマモグラ，東土竜) ※固有種
## M. i. imaizumii (コモグラ，小土竜)
## 本州缺齒鼴 - M. i. minor (コモグラ，小土竜)
# 佐渡缺齒鼴 - Mogera tokudae (サドモグラ，佐渡土竜) ※固有種
## 倭缺齒鼴 - M. t. etigo (エチゴモグラ，越後土竜)
## 佐渡缺齒鼴 - M. t. tokudae (サドモグラ，佐渡土竜)
# 小缺齒鼴 - Mogera wogura  (コウベモグラ，神戸土竜)
## M. w. coreana (コウライモグラ，高麗土竜)
## M. w. kanai (ヤクシマモグラ，屋久島土竜)
## 日本缺齒鼴 - M. w. kobeae (コウベモグラ，神戸土竜)
## M. w. wogura (コウベモグラ，神戸土竜)

**翼手目 Chiroptera**
 狐蝠科 Pteropidae
# 琉球狐蝠 - Pteropus dasymallus (クビワオオコウモリ，首輪大蝙蝠)
## P. d. daitoensis (ダイトウオオコウモリ，大東大蝙蝠) ※天然記念物
## P. d. dasymallus (エラブオオコウモリ，永良部大蝙蝠) ※天然記念物
## P. d. inopinatus (オリイオオコウモリ，折居大蝙蝠)
## P. d. yayeyamae (ヤエヤマオオコウモリ，八重山大蝙蝠)
# Pteropus loochoensis (オキナワオオコウモリ，沖縄大蝙蝠) ※絶滅種
# 小笠原狐蝠 - Pteropus pselaphon (オガサワラオオコウモリ，小笠原大蝙蝠) ※固有種 / 天然記念物- 菊頭蝠科 Rhinolophidae
# 馬鐵菊頭蝠 - Rhinolophus ferrumequinum (キクガシラコウモリ，菊頭蝙蝠)
## R. f. nippon (ニホンキクガシラコウモリ，日本菊頭蝙蝠)
## R. f. mikadoi (ミカドキクガシラコウモリ)
# 角菊頭蝠 - Rhinolophus cornutus (コキクガシラコウモリ，小菊頭蝙蝠)
## R. c. cornutus (ニホンコキクガシラコウモリ，日本小菊頭蝙蝠)
## R. c. orii (オリイコキクガシラコウモリ，折居小菊頭蝙蝠)
# Rhinolophus pumilus (オキナワコキクガシラコウモリ，沖縄小菊頭蝙蝠) ※固有種
## R. p. miyakonis (ミヤココキクガシラコウモリ，宮古小菊頭蝙蝠)
## R. p. pumilus (オキナワコキクガシラコウモリ，沖縄小菊頭蝙蝠)
# Rhinolophus perditus (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊頭蝙蝠) ※固有種
## 伊氏菊頭蝠 - R. p. imaizumii (イリオモテコキクガシラコウモリ，西表小菊頭蝙蝠)
## R. p. perditus (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊頭蝙蝠)- 蹄蝠科 Hipposideridae
# 醜蹄蝠 - Hipposideros turpis (カグラコウモリ，神楽蝙蝠)- 蝙蝠科 Vespertilionidae
# 菲氏鼠耳蝠 - Myotis formosus (クロアカコウモリ，黒赤蝙蝠)
## M. f. tsuensis (ツシマクロアカコウモリ，対馬黒赤蝙蝠) ※固有亜種
# 大趾鼠耳蝠 - Myotis macrodactylus (モモジロコウモリ，腿白蝙蝠)
# 水鼠耳蝠 - Myotis daubentonii (ドーベントンコウモリ，ドーベントン蝙蝠)
## M. d. ussuriensis (ウスリドーベントンコウモリ，ウスリドーベントン蝙蝠)
# 須鼠耳蝠 - Myotis mystacinus (ホオヒゲコウモリ，頬髭蝙蝠)
## M. m. gracilis (ウスリホオヒゲコウモリ，ウスリ頬髭蝙蝠) 
# 伊氏鼠耳蝠 - Myotis ikonnikovi (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
## M. i. fujiensis (フジホオヒゲコウモリ，富士頬髭蝙蝠)
## 日本鼠耳蝠 - M. i. hosonoi (シナノホオヒゲコウモリ，信濃頬髭蝙蝠) 
## 伊氏鼠耳蝠 - M. i. ikonnikovi (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
## 本州鼠耳蝠 - M. i. ozensis (オゼホオヒゲコウモリ，尾瀬頬髭蝙蝠)
## M. i. yesoensis (エゾホオヒゲコウモリ，蝦夷頬髭蝙蝠)
# 霜白鼠耳蝠 - Myotis pruinosus (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠)
# Myotis yanbarensis (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠) ※固有種 / 1997年発見、1998年新種認定。
# 福建鼠耳蝠 - Myotis frater (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠)
## M. f. kaguyae (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠) ※固有亜種
# 納氏鼠耳蝠 - Myotis nattereri (ノレンコウモリ，暖簾蝙蝠)
## 嗡聲鼠耳蝠 - M. n. bombinus (ホンドノレンコウモリ，本土暖簾蝙蝠)
# 普通伏翼 - Pipistrellus abramus (アブラコウモリ，油蝙蝠)
# 本州伏翼 - Pipistrellus endoi (モリアブラコウモリ，森油蝙蝠) ※固有種
# 薩氏伏翼 - Pipistrellus savii (オオアブラコウモリ，大油蝙蝠) ※迷行種
## P. s. velox (クロオオアブラコウモリ，黒大油蝙蝠)
## P. s. coreensis (コウライオオアブラコウモリ，高麗大油蝙蝠)
# 斯氏伏翼 - Pipistrellus sturdeei (オガサワラアブラコウモリ，小笠原油蝙蝠) ※絶滅種
# 北棕蝠 - Eptesicus nilssonii (キタクビワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
## E. n. parvus (ヒメホリカワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
# Eptesicus japonensis (クビワコウモリ，首輪蝙蝠) ※固有種
# 日本山蝠 - Nyctalus aviator (ヤマコウモリ，山蝙蝠)
# Nyctalus furvus (コヤマコウモリ，小山蝙蝠)
# 大蝙蝠 - Vespertilio superans (ヒナコウモリ，雛蝙蝠)
# 普通蝙蝠 - Vespertilio murinus (ヒメヒナコウモリ，姫雛蝙蝠) ※迷行種
# 亞洲寬耳蝠 - Barbastella leucomelas (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
## B. l. darjelingensis (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
# 大耳蝠 - Plecotus auritus (ウサギコウモリ，兎蝙蝠)
## P. a. sacrimontis (ニホンウサギコウモリ，日本兎蝙蝠) ※固有亜種
# 亞洲長翼蝠 - Miniopterus fuliginosus (ユビナガコウモリ，指長蝙蝠)
# 長翼蝠 - Miniopterus fuscus (リュウキュウユビナガコウモリ，琉球指長蝙蝠) 
# 白腹管鼻蝠 - Murina leucogaster (テングコウモリ，天狗蝙蝠)
## M. l. hilgendorfi (ニホンテングコウモリ，日本天狗蝙蝠)
# Murina ryukyuana (リュウキュウテングコウモリ，琉球天狗蝙蝠) ※固有種 / 1997年発見、1998年新種認定。
# 烏蘇裡管鼻蝠 - Murina ussuriensis (コテングコウモリ，小天狗蝙蝠)
## 林管鼻蝠 - M. u. silvatica (ニホンコテングコウモリ，日本小天狗蝙蝠)
# 對馬管鼻蝠 - Murina tenebrosa (クチバテングコウモリ，口羽天狗蝙蝠) ※固有種 / 1962年発見、1970年新種記載。- 犬吻蝠科 Molossidae
# 寬耳犬吻蝠 - Tadarida insignis (オヒキコウモリ，尾曳蝙蝠)
## T. i. latouchei (スミイロオヒキコウモリ，墨色尾曳蝙蝠)

**靈長目 Primate**
Macaca fuscata- 猴科 Cercopithecidae
# 日本猴 - Macaca fuscata (ニホンザル，日本猿) ※固有種 / 天然記念物
## M. f. fuscata (ホンドザル，本土猿)
## M. f. yakui (ヤクシマザル，屋久島猿)
# 臺灣猴 - Macaca cyclopis (タイワンザル，臺灣猿) ※移入種
# 獼猴 - Macaca mulatta (アカゲザル，赤毛猿) ※移入種

**兔形目 Lagomorpha**
 鼠兔科 Ochotonidae
# 極北鼠兔 - Ochotona hyperborea (ナキウサギ，鳴兎)
## O. h. yesoensis (エゾナキウサギ，蝦夷鳴兎)- 兔科 Leporidae
# 琉球兔 - Pentalagus furnessi (アマミノクロウサギ，奄美野黒兎) ※固有種 /特別天然記念物
# 雪兔 - Lepus timidus (ユキウサギ，雪兎)
## L. t. ainu (エゾユキウサギ，蝦夷雪兎)
# 短尾兔 - Lepus brachyurus (ノウサギ，野兎) ※固有種
## L. b. angustidens (トウホクノウサギ，東北野兎)
## L. b. brachyurus (キュウシュウノウサギ，九州野兎) 
## L. b. lyoni (サドノウサギ，佐渡野兎)
## L. b. okiensis (オキノウサギ，隠岐野兎)
# 穴兔 - Oryctolagus cuniculus (アナウサギ，穴兎) ※移入種

**嚙齒目 Rodentia**
T. s. lineatus- 松鼠科 Sciuridae
# 赤腹麗松鼠 - Callosciurus erythraeus (タイワンリス，臺灣栗鼠) ※移入種
## C. e. thaiwanensis (タイワンリス，臺灣栗鼠)
# 松鼠 - Sciurus vulgaris (キタリス，北栗鼠)
## S. v. orientis (エゾリス，蝦夷栗鼠)
# 日本松鼠 - Sciurus lis (ニホンリス，日本栗鼠) ※固有種
# 花鼠 - Tamias sibiricus (シマリス，縞栗鼠)
## T. s. barberi (チョウセンシマリス，朝鮮縞栗鼠) ※移入種
## T. s. lineatus (エゾシマリス，蝦夷縞栗鼠)
# 日本飛鼠 - Pteromys momonga (ホンドモモンガ，本土モモンガ) ※固有種
# 飛鼠 - Pteromys volans (タイリクモモンガ，大陸モモンガ)
## P. v. orii (エゾモモンガ，蝦夷モモンガ) ※固有亜種
# 白頰鼯鼠 - Petaurista leucogenys (ムササビ，鼯鼠・鼺鼠) ※固有種
## P. l. leucogenys (キュウシュウムササビ，九州鼯鼠)
## P. l. nikkonis (ニッコウムササビ)
## P. l. oreas (ワカヤマムササビ，和歌山鼯鼠)- 睡鼠科 Gliridae
# 日本睡鼠 - Glirulus japonicus (ヤマネ，山鼠) ※固有種 / 天然記念物- 鼠科 Muridae
Apodemus speciosus
# 棕背䶄|棕背鼠平 - Clethrionomys rufocanus (タイリクヤチネズミ，大陸谷地鼠)
## C. r. bedfordiae (エゾヤチネズミ，蝦夷谷地鼠)
## 庫頁鼠平 - C. r. sikotanensis (シコタンヤチネズミ，色丹谷地鼠)
# Clethrionomys rex (ムクゲネズミ，尨毛鼠)
## C. r. montanus (ミヤマムクゲネズミ，御山尨毛鼠) ※固有亜種
## C. r. rex (リシリムクゲネズミ，利尻尨毛鼠) ※固有亜種
# 紅背䶄|紅背鼠平 - Clethrionomys rutilus (ヒメヤチネズミ，姫谷地鼠)
## C. r. mikado (ミカドネズミ，帝鼠) ※固有亜種
# Eothenomys andersoni (ヤチネズミ，谷地鼠) ※固有種
## E. a. andersoni (トウホクヤチネズミ，東北谷地鼠)
## E. a. niigatae (ニイガタヤチネズミ，新潟谷地鼠)
## E. a. imaizumii (ワカヤマヤチネズミ，和歌山谷地鼠)
# Eothenomys smithii (スミスネズミ，スミス鼠) ※固有種
## E. s. okiensis (オキスミスネズミ，隠岐スミス鼠)
## E. s. smithii (スミスネズミ，スミス鼠)
## E. s. kageus (カゲネズミ，鹿毛鼠)
# 日本田鼠 - Microtus montebelli (ハタネズミ，畑鼠) ※固有種
## M. m. brevicorpus (サドハタネズミ，佐渡畑鼠)
## M. m. montebelli (ハタネズミ，畑鼠)
# 麝鼠 - Ondatra zibethicus (マスクラット) ※移入種
# 巢鼠 - Micromys minutus (カヤネズミ，萱鼠)
## M. m. aokii (ツシマカヤネズミ，対馬萱鼠)
## M. m. japonicus (シコクカヤネズミ，四國萱鼠)
## M. m. hondonis (ホンシュウカヤネズミ，本州萱鼠)
# 黑線姬鼠 - Apodemus agrarius (セスジネズミ，背筋鼠)
# 日本姬鼠 - Apodemus argenteus (ヒメネズミ，姫鼠) ※固有種
## A. a. argenteus (ホンドヒメネズミ，本土姫鼠)
## A. a. celatus (オキヒメネズミ，隠岐姫鼠)
## A. a. hokkaidi (エゾヒメネズミ，蝦夷姫鼠)
## A. a. sagax (ツシマヒメネズミ，対馬姫鼠)
## A. a. tanei (タネヒメネズミ，種姫鼠)
## A. a. yakui (ヤクシマヒメネズミ，屋久島姫鼠)
# 朝鮮姬鼠 - Apodemus peninsulae (ハントウアカネズミ，半島赤鼠)
## A. p. giliacus (カラフトアカネズミ，樺太赤鼠)
# 大林姬鼠 - Apodemus speciosus (アカネズミ，赤鼠) ※固有種
## A. s. ainu (エゾアカネズミ，蝦夷赤鼠)
## A. s. dorsalis (セグロアカネズミ，背黒赤鼠)
## A. s. insperatus (オオシマアカネズミ，大島赤鼠)
## A. s. miyakensis (ミヤケアカネズミ，三宅赤鼠)
## A. s. navigator (オキアカネズミ，隠岐赤鼠)
## A. s. speciosus (ホンドアカネズミ，本土赤鼠)
## A. s. sadoensis (サドアカネズミ，佐渡赤鼠)
## A. s. tusimaensis (ツシマアカネズミ，対馬赤鼠)
# 裔鼠 - Tokudaia osimensis (トゲネズミ，棘鼠) ※固有種 / 天然記念物
## 明氏裔鼠 - T. o. muenninki (オキナワトゲネズミ，沖縄棘鼠)
## T. o. osimensis (アマミトゲネズミ，奄美棘鼠)
## 德之島刺鼠 - T. o. tokunoshimensis (トクノシマトゲネズミ，徳之島棘鼠) ※2006年新種記載（Endo and Tsuchiya, 2006）。 
# 褐家鼠 - Rattus norvegicus (ドブネズミ，溝鼠)
## R. n. caraco (ニホンドブネズミ，日本溝鼠)
## R. n. norvegicus (ヨウシュウドブネズミ，揚州溝鼠)
# 黑家鼠 - Rattus rattus (クマネズミ，熊鼠)
## R. r. diardi (マレーシアクマネズミ，マレーシア熊鼠)
## 達氏家鼠 - R. r. tanezumi (ニホンクマネズミ，日本熊鼠)
# 琉球鼠 - Diplorthrix legata (ケナガネズミ，毛長鼠) ※固有種 / 天然記念物
# 小家鼠 - Mus musculus (ハツカネズミ，廿日鼠)
## M. m. molossinus (ホンドハツカネズミ，本土廿日鼠)
## M. m. musculus (ヨウシュウハツカネズミ，揚州廿日鼠)
# 臺灣小家鼠 - Mus caroli (オキナワハツカネズミ，沖縄廿日鼠)- 河狸鼠科 Myocastoridae
# 河狸鼠 - Myocastor coypus (ヌートリア，海狸鼠・沼狸) ※移入種

**食肉目 Carnivora**
 熊科 Ursidae
# 北極熊 - Ursus maritimus (ホッキョクグマ，北極熊) ※迷行種
# 棕熊 - Ursus arctos (ヒグマ，羆)
## U. a. yesoensis (エゾヒグマ，蝦夷羆)
# 亞洲黑熊 - Ursus thibetanus (ツキノワグマ，月輪熊)
## 日本黑熊 - U. t. japonicus (ニホンツキノワグマ，日本月輪熊)- 浣熊科 Procyonidae
# 浣熊 - Procyon lotor (アライグマ) ※移入種
# 食蟹浣熊 - Procyon cancrivorus (カニクイアライグマ) ※移入種- 犬科 Canidae
N. p. viverrinus
V. v. schrencki
# 貉 - Nyctereutes procyonoides (タヌキ，狸)
## N. p. albus (エゾタヌキ，蝦夷狸)
## N. p. viverrinus (ホンドタヌキ，本土狸) ※天然記念物
# 赤狐 - Vulpes vulpes (キツネ，狐) 
## V. v. japonica (ホンドキツネ，本土狐)
## V. v. schrencki (キタキツネ，北狐)
# 狼 - Canis lupus (オオカミ，狼)
## 北海道狼 - C. l. hattai (エゾオオカミ，蝦夷狼) ※絶滅種
## 日本狼 - C. l. hodophilax (ニホンオオカミ，日本狼) ※絶滅種- 貂科 Mustelidae
M. m. anakuma
# 日本貂 - Martes melampus (テン，貂)
## M. m. melampus (ホンドテン，本土貂)
## 對馬貂 - M. m. tsuensis (ツシマテン，対馬貂) ※天然記念物
# 紫貂 - Martes zibellina (クロテン，黒貂)
## M. z. brachyura (エゾクロテン，蝦夷黒貂)
# 日本鼬 - Mustela itatsi (イタチ，鼬) ※固有種
## M. i. asaii (オオシマイタチ)
## M. i. itatsi (ホンドイタチ，本土鼬)
## 琉球鼬 - M. i. sho (コイタチ，小鼬)
# 黃鼬 - Mustela sibirica (チョウセンイタチ，朝鮮鼬)
## 朝鮮鼬 - M. s. coreana (チョウセンイタチ，朝鮮鼬)
# 伶鼬 - Mustela nivalis (イイズナ，飯綱)
## M. n. namiyei (ニホンイイズナ，日本飯綱) ※固有種
# 白鼬 - Mustela erminea (オコジョ)
## 日本白鼬 - M. e. nippon (ホンドオコジョ，本土オコジョ) ※固有亜種
## 北海道白鼬 - M. e. orientalis (エゾオコジョ，蝦夷オコジョ)
# 北美水貂 - Mustela vison (ミンク) ※移入種
# 獾 - Meles meles (アナグマ，穴熊)
## 日本獾 - M. m. anakuma (ニホンアナグマ，日本穴熊)
# 水獺 - Lutra lutra (カワウソ，川獺)
## 日本水獺 - L. l. whiteleyi (ニホンカワウソ，日本川獺) ※特別天然記念物 ※絶滅種
# 海獺 - Enhydra lutris (ラッコ，海獺・猟虎)- 靈貓科 Viverridae
# 果子狸 - Paguma larvata (ハクビシン，白鼻芯)- 獴科 Herpestidae
# 爪哇獴 - Herpestes javanicus (ジャワマングース) ※移入種- 貓科 Felidae
P. b. euptilura
# 豹貓 - Prionailurus bengalensis (ベンガルヤマネコ，ベンガル山貓)
## P. b. euptilura (ツシマヤマネコ，対馬山貓) ※天然記念物
## 西表山貓 - P. b. iriomotensis (イリオモテヤマネコ，西表山貓) ※固有種 /特別天然記念物 / 1967年新種記載。- 海獅科 Otariidae
# 加州海獅 - Zalophus californianus (アシカ，葦鹿)
## 日本海獅 -Z. c. japonicus (ニホンアシカ，日本葦鹿) ※絶滅種
# 北海獅 - Eumetopias jubatus (トド，胡獱)
# 海狗 - Callorthinus ursinus (オットセイ，膃肭臍)- 海象科 Odobenidae
# 海象 - Odobenus rosmarus (セイウチ，海象) ※迷行種- 海豹科 Phocidae
# 港海豹 - Phoca vitulina (ゼニガタアザラシ，銭形海豹)
# 斑海豹 - Phoca largha (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
## P. l. stejnegeri (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
# 環斑海豹 - Phoca hispida (ワモンアザラシ，輪紋海豹)
# 環海豹 - Histriophoca fasciata (クラカケアザラシ，鞍掛海豹)
# 髯海豹 - Erignathus barbatus (アゴヒゲアザラシ，顎鬚海豹)

**偶蹄目 Artiodactyla**
 豬科 Suidae
# 野豬 - Sus scrofa (イノシシ，豬)
## 日本野豬 - S. s. leucomystax (ニホンイノシシ，日本豬) ※固有亜種
## 琉球野豬 - S. s. riukiuanus (リュウキュウイノシシ，琉球豬) ※固有亜種- 鹿科 Cervidae
C. n. yesoensis
# 梅花鹿 - Cervus nippon (ニホンジカ，日本鹿)
## C. n. keramae (ケラマジカ，慶良間鹿) ※固有亜種 / 天然記念物
## C. n. nippon (ニホンジカ，日本鹿) ※固有亜種
## C. n. pulchellus (ツシマジカ，対馬鹿) ※固有亜種
## C. n. taiouanus (タイワンジカ，臺灣鹿) ※移入種
## C. n. yakushimae (ヤクシカ，屋久鹿) ※固有亜種
## C. n. yesoensis (エゾジカ，蝦夷鹿) ※固有亜種
# 小麂 - Muntiacus reevesi (キョン，羌) ※移入種- 牛科 Bovidae
Capricornis crispus
# 日本鬣羚 - Capricornis crispus (ニホンカモシカ，日本氈鹿) ※固有種 /特別天然記念物

**海牛目 Sirenia**
 儒艮科 Dugongidae
# 儒艮 - Dugong dugon (ジュゴン，儒艮) ※天然記念物

**鯨目 Cetacea**
 露脊鯨科 Balaenidae
# 北極鯨 - Balaena mysticetus (ホッキョククジラ，北極鯨)
# 露脊鯨 - Balaena glacialis (セミクジラ，背美鯨)- 灰鯨科 Eschrichtiidae
# 灰鯨 - Eschrichtius robustus (コククジラ，克鯨)- 鬚鯨科 Balaenopteridae
# 藍鯨 - Balaenoptera musculus (シロナガスクジラ，白長須鯨)
# 長鬚鯨 - Balaenoptera physalus (ナガスクジラ，長須鯨)
# 鰮鯨 - Balaenoptera borealis (イワシクジラ，鰯鯨)
# 鯷鯨 - Balaenoptera edeni (ニタリクジラ，似鯨)
# 小鰮鯨 - Balaenoptera acutorostrata (ミンククジラ，小鰯鯨)
# 角島鯨 - Balaenoptera omurai (ツノシマクジラ，角島鯨) ※1998年死體発見、2002年新種発表。
# 座頭鯨 - Megaptera novaeangliae (ザトウクジラ，座頭鯨)- 抹香鯨科 Physeteridae
# 抹香鯨 - Physeter marcrocephalus (マッコウクジラ，抹香鯨)- 小抹香鯨科 Kogiidae
# 小抹香鯨 - Kogia breviceps (コマッコウ，小抹香)
# 矮抹香鯨 - Kogia simus (オガワマッコウ，小川小抹香)- 喙鯨科 Ziphiidae
# 古氏劍吻鯨 - Ziphius carvirostris (アカボウクジラ，赤坊鯨)
# 太平洋劍喙鯨 - Indopacetus pacificus (タイヘイヨウアカボウモドキ，太平洋赤坊擬)
# 斯氏喙鯨 - Mesoplodon stejnegeri (オウギハクジラ，扇歯鯨)
# 卡氏喙鯨 - Mesoplodon carlhubbsi (ハッブスオウギハクジラ，ハッブス扇歯鯨)
# 瘤齒喙鯨 - Mesoplodon densirostris (コブハクジラ，瘤歯鯨)
# 杏齒喙鯨 - Mesoplodon ginkgodens (イチョウハクジラ，銀杏歯鯨)
# 拜氏鯨 - Berardius bairdii (ツチクジラ，槌鯨)- 獨角鯨科 Monodontidae
# 獨角鯨 - Monodon monoceros (イッカク，一角) ※迷行種
# 白鯨 - Delphinapterus leucas (シロイルカ，白海豚)- 海豚科 Delphinidae
# 逆戟鯨 - Orcinus orca (シャチ，鯱)
# 大吻巨頭鯨 - Globicephala macrorhynchus (コビレゴンドウ，小鰭巨頭)
# 巨頭鯨 - Globicephala melas (ヒレナガゴンドウ，鰭長巨頭) ※絶滅 (日本)
# 偽虎鯨 - Pseudorca crassidens (オキゴンドウ，沖巨頭)
# 小逆戟鯨 - Feresa attenuata (ユメゴンドウ，夢巨頭)
# 瓜頭海豚 - Peponocephala electra (カズハゴンドウ，數歯巨頭)
# 灰海豚 - Grampus griseus (ハナゴンドウ，花巨頭)
# 短吻真海豚 - Delphinus delphis (マイルカ，真海豚)
# 長吻真海豚 - Delphinus capensis (ハセイルカ)
# 藍白海豚 - Stenella coeruleoalba (スジイルカ，筋海豚)
# 弱原海豚 - Stenella attenuata (マダライルカ，斑海豚)
# 長嘴海豚 - Stenella longirostris (ハシナガイルカ，嘴長海豚)
# 寬吻海豚 - Tursiops truncatus (ハンドウイルカ，半道海豚)
# 太平洋斑紋海豚 - Lagenorhynchus obliquidens (カマイルカ，鎌海豚)
# 北鯨豚 - Lissodelphis borealis (セミイルカ，背美海豚)
# 糙齒長吻海豚 - Steno bredanensis (シワハイルカ，皺歯海豚)
# 霍氏海豚 - Lagenodelphis hosei (サラワクイルカ，サラワク海豚)- 鼠海豚科 Phocoenidae
# 大西洋鼠海豚 - Phocoena phocoena (ネズミイルカ，鼠海豚)
# 白腰鼠海豚 - Phocoenoides dalli (イシイルカ)
# 江豚 - Neophocaena phocaenoides (スナメリ，砂滑) ※天然記念物

**參考文獻**
 阿部永他，1994，『日本の哺乳類』。東海大學出版會。- 小宮輝之，2002，『フィールド ベスト図鑑 日本の哺乳類』。學習研究社。- 今泉吉典，1960，『原色日本哺乳類図鑑』。保育社。