人類線粒體DNA單倍體群

根據線粒體DNA建議的“走出非洲”遷徙路線。
doi-access=free (a) 餅圖。(b) 以表格形式顯示得單倍群計數。
假設的人類遷徙世界地圖，北極在中央。左上方是非洲，是人類遷徙的起點，最右側是南美洲。遷徙模式基於mtDNA的研究。字母代表單倍群，顏色和數字表示距今的千年前。
人類線粒體DNA單倍體群（Human mitochondrial DNA Haplogroup）是遺傳學上依據線粒體DNA差異而定義出來的單倍體群。單倍群用於表示線粒體系統發育樹上的主要分支點。瞭解母系血統的演化路徑，可使研究者追溯母系遺傳的人類起源，線粒體研究顯示人類起源於非洲地區。單倍群的字母名從A到Z不等，按照發現的先後順序命名，與實際的遺傳關係不相干。
線粒體單倍群起源於一個假想的女性，是所有現存人類的母系最近共同祖先，一般稱作線粒體夏娃。
線粒體DNA的變異速度稱作人線粒體分子鐘，這是尚在研究的領域，有報告稱每8000年發生一次突變。

**線性透視**
doi-access=free 數字是單倍群標籤，據http://www.phylotree.org，並給出單倍群分化的突變位置（只顯示一個分支定義標記）。單倍群分佈的主要地理特徵用顏色標出。
人mtDNA單倍群傳播路線
此進化樹來自Van Oven (2009)，2022年6月一份研究提出了單倍群L的另一種系統發育路徑。
*L（線粒體夏娃）
**L0
**L1-6
***L1
***L2-6
****L5
****L2'3'4'6
*****L2
*****L3'4'6
******L6
******L3'4
*******L4
*******L3
********M
*********M8: CZ (C, Z)
*********M9: E
*********M12'G: G
*********M29'Q: Q
*********D
********N
*********N1: I
*********N2: W
*********N9: Y
*********A
*********S
*********X
*********R
**********R0 (FMKA pre-HV)
***********HV: (H, V)
**********pre-JT或R2'JT
***********JT: (J, T)
**********R9: F
**********R11'B: B
**********P
**********U（UK改來）
***********U8: K
********* O 

**主要mtDNA單倍群**
據mtDNA單倍群估計的人類遷徙世界地圖。

**泛單倍群L**
泛單倍群 L是人mtDNA單倍群中最基本的，其他單倍群都從L3單倍群演化而來。主要分佈在非洲。- 單倍型類群 L0- L1-7
** 單倍型類群 L1
** L2-7
*** L3'4'6
**** 單倍型類群 L2
**** L346
***** L34
****** 單倍型類群 L3
****** 單倍型類群 L4
***** 單倍型類群 L6
*** L5'7
**** 單倍型類群 L5
**** 單倍型類群 L7

**泛單倍群M**
泛單倍群M主要分佈在亞洲和美洲，其後代有單倍型類群 M、單倍型類群 C、單倍型類群 Z、單倍型類群 D、單倍型類群 E、單倍型類群 G、單倍型類群 Q等。

**泛單倍群N**
泛單倍群N主要分佈在澳洲、美洲，在亞洲亦有，其後代有單倍型類群 N、單倍型類群 O、單倍型類群 A、單倍型類群 S、單倍型類群 I、單倍型類群 W、單倍型類群 X、單倍型類群 Y以及泛單倍群R。

**泛單倍群R**
泛單倍群R主要分佈在歐洲、北美、大洋洲，在亞洲和美洲亦有，其後代有單倍型類群 R、單倍型類群 B、單倍型類群 F、單倍型類群 H、單倍型類群 V、單倍型類群 J、單倍型類群 T、單倍型類群 U、單倍型類群 K。

**年代**

**地理分佈**
2004年一篇論文總結，現代西亞、北美與歐洲人群中最普遍的單倍群是H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X, W。
非洲單倍群：L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
澳洲單倍群：M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (Refs 1, 2, 3, 4, 5, 6)
亞洲單倍群：F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U many number variants to each section

**研究軟件**

**分配**
  mtHap: James Lick's tool (multiple input formats).-  YSEQ mt Clade Finder date=20240510193114 : FASTA based haplogroup tool. Replaced HAPLOFIND.-  HaploGrep date=20250210011445 : VCF based tool.-  Haplocheck date=20240510193114 : Mitoverse's tool for both WGS and WES.-  Haplotracker date=20240510193137 : A short fragment tool.-  Haplogroup Finder date=20240508235949 : Ian Logan's SNP to haplogroup tool.

**測年**
  mtDNA Mutation Computer Model date=20240616210138 : Ian Logan's mutation calculator.

**系統發生**
  FTDNA's mtDNA Haplotree date=20250305192138 : The largest mtDNA tree.-  YFull's MTree date=20250203173559 : An mtDNA tree. Faster loading (simpler).-  PhyloTreemt date=20250220165814 : A traditional mtDNA tree (last updated 2016-02-18).-  HIP date=20241203115458 : Haplogroup trees.

**地圖**

**古地圖**
  HIP Haplomap date=20241203143138 : Ancient uniparental map.-  AH DNA date=20241226131154 : Nicky Rosenblatt's ancient uniparental map.-  Ancient DNA: An aDNA map made with Map Maker.

**現代地圖**
  HRAS mtDNA date=20240508235948 : A heatmap generator.

**數據庫**

**古代**
  AmtDB date=20250216204721 : An database of ancient mtDNA samples.-  All Ancient DNA Dataset date=20250127091950 : Carlos Quiles' uniparental database (with BAM).

**現代**
  GenBank mtDNA Sequence Checker date=20240807050720 : Ian Logan's GenBank based accession matching tool.-  mitoYDNA date=20250219210452 : A uniparental database.-  MITOMAP date=20250220095341 : An mtDNA genome database.

**參看**
 遺傳系譜學- 人類Y染色體DNA單倍型類群- 群體遺傳學

**參考資料**

**外部連結**
 mtDNA .pdf mapdate=20090304100413 - Map of macro-單倍型類群 N date=20180523051015  by John S. Walden- Indian maternal gene pool, Journal of Human Genetics- The Making of the African mtDNA Landscape, American Journal of Human Genetics- Do the Four Clades of the mtDNA 單倍型類群 L2 Evolve at Different Rates?, American Journal of Human Genetics- The Matrilineal Ancestry of Ashkenazi Jewry: Portrait of a Recent Founder Event, American Journal of Human Genetics
**  List of mtDNA haplogroup projects date=20210212000010 -  MitoTool: a web server for the analysis and retrieval of human mitochondrial DNA sequence variations date=20160619111340 -  HaploGrep: mtDNA haplogroup determination based on PhyloTree.org date=20160612075145 -  HaploFind – fast automatic haplogroup assignment pipeline for human mitochondrial DNA date=20160611123801