人类线粒体DNA单倍体群

根据线粒体DNA建议的“走出非洲”迁徙路线。
doi-access=free (a) 饼图。(b) 以表格形式显示得单倍群计数。
假设的人类迁徙世界地图，北极在中央。左上方是非洲，是人类迁徙的起点，最右侧是南美洲。迁徙模式基于mtDNA的研究。字母代表单倍群，颜色和数字表示距今的千年前。
人类线粒体DNA单倍体群（Human mitochondrial DNA Haplogroup）是遗传学上依据线粒体DNA差异而定义出来的单倍体群。单倍群用于表示线粒体系统发育树上的主要分支点。了解母系血统的演化路径，可使研究者追溯母系遗传的人类起源，线粒体研究显示人类起源于非洲地区。单倍群的字母名从A到Z不等，按照发现的先后顺序命名，与实际的遗传关系不相干。
线粒体单倍群起源于一个假想的女性，是所有现存人类的母系最近共同祖先，一般称作线粒体夏娃。
线粒体DNA的变异速度称作人线粒体分子钟，这是尚在研究的领域，有报告称每8000年发生一次突变。

**线性透视**
doi-access=free 数字是单倍群标签，据http://www.phylotree.org，并给出单倍群分化的突变位置（只显示一个分支定义标记）。单倍群分布的主要地理特征用颜色标出。
人mtDNA单倍群传播路线
此进化树来自Van Oven (2009)，2022年6月一份研究提出了单倍群L的另一种系统发育路径。
*L（线粒体夏娃）
**L0
**L1-6
***L1
***L2-6
****L5
****L2'3'4'6
*****L2
*****L3'4'6
******L6
******L3'4
*******L4
*******L3
********M
*********M8: CZ (C, Z)
*********M9: E
*********M12'G: G
*********M29'Q: Q
*********D
********N
*********N1: I
*********N2: W
*********N9: Y
*********A
*********S
*********X
*********R
**********R0 (FMKA pre-HV)
***********HV: (H, V)
**********pre-JT或R2'JT
***********JT: (J, T)
**********R9: F
**********R11'B: B
**********P
**********U（UK改来）
***********U8: K
********* O 

**主要mtDNA单倍群**
据mtDNA单倍群估计的人类迁徙世界地图。

**泛单倍群L**
泛单倍群 L是人mtDNA单倍群中最基本的，其他单倍群都从L3单倍群演化而来。主要分布在非洲。- 单倍型类群 L0- L1-7
** 单倍型类群 L1
** L2-7
*** L3'4'6
**** 单倍型类群 L2
**** L346
***** L34
****** 单倍型类群 L3
****** 单倍型类群 L4
***** 单倍型类群 L6
*** L5'7
**** 单倍型类群 L5
**** 单倍型类群 L7

**泛单倍群M**
泛单倍群M主要分布在亚洲和美洲，其后代有单倍型类群 M、单倍型类群 C、单倍型类群 Z、单倍型类群 D、单倍型类群 E、单倍型类群 G、单倍型类群 Q等。

**泛单倍群N**
泛单倍群N主要分布在澳洲、美洲，在亚洲亦有，其后代有单倍型类群 N、单倍型类群 O、单倍型类群 A、单倍型类群 S、单倍型类群 I、单倍型类群 W、单倍型类群 X、单倍型类群 Y以及泛单倍群R。

**泛单倍群R**
泛单倍群R主要分布在欧洲、北美、大洋洲，在亚洲和美洲亦有，其后代有单倍型类群 R、单倍型类群 B、单倍型类群 F、单倍型类群 H、单倍型类群 V、单倍型类群 J、单倍型类群 T、单倍型类群 U、单倍型类群 K。

**年代**

**地理分布**
2004年一篇论文总结，现代西亚、北美与欧洲人群中最普遍的单倍群是H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X, W。
非洲单倍群：L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
澳洲单倍群：M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (Refs 1, 2, 3, 4, 5, 6)
亚洲单倍群：F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U many number variants to each section

**研究软件**

**分配**
  mtHap: James Lick's tool (multiple input formats).-  YSEQ mt Clade Finder date=20240510193114 : FASTA based haplogroup tool. Replaced HAPLOFIND.-  HaploGrep date=20250210011445 : VCF based tool.-  Haplocheck date=20240510193114 : Mitoverse's tool for both WGS and WES.-  Haplotracker date=20240510193137 : A short fragment tool.-  Haplogroup Finder date=20240508235949 : Ian Logan's SNP to haplogroup tool.

**测年**
  mtDNA Mutation Computer Model date=20240616210138 : Ian Logan's mutation calculator.

**系统发生**
  FTDNA's mtDNA Haplotree date=20250305192138 : The largest mtDNA tree.-  YFull's MTree date=20250203173559 : An mtDNA tree. Faster loading (simpler).-  PhyloTreemt date=20250220165814 : A traditional mtDNA tree (last updated 2016-02-18).-  HIP date=20241203115458 : Haplogroup trees.

**地图**

**古地图**
  HIP Haplomap date=20241203143138 : Ancient uniparental map.-  AH DNA date=20241226131154 : Nicky Rosenblatt's ancient uniparental map.-  Ancient DNA: An aDNA map made with Map Maker.

**现代地图**
  HRAS mtDNA date=20240508235948 : A heatmap generator.

**数据库**

**古代**
  AmtDB date=20250216204721 : An database of ancient mtDNA samples.-  All Ancient DNA Dataset date=20250127091950 : Carlos Quiles' uniparental database (with BAM).

**现代**
  GenBank mtDNA Sequence Checker date=20240807050720 : Ian Logan's GenBank based accession matching tool.-  mitoYDNA date=20250219210452 : A uniparental database.-  MITOMAP date=20250220095341 : An mtDNA genome database.

**参看**
 遗传系谱学- 人类Y染色体DNA单倍型类群- 群体遗传学

**参考资料**

**外部连结**
 mtDNA .pdf mapdate=20090304100413 - Map of macro-单倍型类群 N date=20180523051015  by John S. Walden- Indian maternal gene pool, Journal of Human Genetics- The Making of the African mtDNA Landscape, American Journal of Human Genetics- Do the Four Clades of the mtDNA 单倍型类群 L2 Evolve at Different Rates?, American Journal of Human Genetics- The Matrilineal Ancestry of Ashkenazi Jewry: Portrait of a Recent Founder Event, American Journal of Human Genetics
**  List of mtDNA haplogroup projects date=20210212000010 -  MitoTool: a web server for the analysis and retrieval of human mitochondrial DNA sequence variations date=20160619111340 -  HaploGrep: mtDNA haplogroup determination based on PhyloTree.org date=20160612075145 -  HaploFind – fast automatic haplogroup assignment pipeline for human mitochondrial DNA date=20160611123801