[ca] El porc és una espècie important en la producció i la investigació, ja que la carn de porc és una de les més demandades arreu del món i aquesta espècie és clau per a diferents camps d'investigació humana. Per tant, és important aprofundir en el coneixement de les complexes interaccions entre l'expressió gènica en diferents teixits, la microbiota intestinal i la composició d'àcids grassos (AG) en els porcs. Vam realitzar una anàlisi WGCNA i vam identificar mòduls de gens coexpressats en el teixit muscular, revelant correlacions significatives amb els perfils d'AG. Notablement, dos mòduls gènics es van correlacionar positivament amb els AG saturats i monoinsaturats, i negativament amb els AG poliinsaturats i la relació omega-6/omega-3, destacant vies relacionades amb la biosíntesi d'AG insaturats i el metabolisme d'AG. Per contra, altres dos mòduls van mostrar correlacions positives amb els AG poliinsaturats i la relació omega-6/omega-3, i correlacions negatives amb els AG saturats i monoinsaturats, vinculats a vies de degradació d'àcids grassos i fosforilació oxidativa. A més, vam explorar el paper de la microbiota intestinal en el metabolisme de l'hoste, particularment la producció d'àcids grassos de cadena curta (AGCC) a partir de compostos no digeribles, i la seva posterior acumulació als teixits. Es van trobar associacions significatives entre gèneres bacterians i arqueals amb els perfils d'AG en el contingut rectal, el greix dorsal i el múscul. Específicament, l'abundància d'àcid n-butíric es va correlacionar positivament amb el gènere bacterià Prevotella i negativament amb Akkermansia, mentre que l'àcid acètic va mostrar la tendència oposada. A més, Rikenellaceae RC9 gut group es va associar positivament amb l'àcid palmític en el múscul i negativament amb l'àcid esteàric en el greix dorsal i l'àcid oleic en el múscul, suggerint el paper indirecte de la microbiota en la modulació de la composició d'AG. Després, vam estudiar les diferències entre el metagenoma i el metatranscriptoma de porcs amb diferències extremes en el perfil d'AGCC en el seu contingut rectal. A nivell de gènere, Clostridium va ser el més actiu, malgrat ser el tercer en abundància. Els gèneres més abundants van ser Bacteroides i Prevotella, tot i que Treponema va ser el segon gènere més actiu. A més, alguns gèneres com Dorea, Dysgonomonas i Butyricicoccus van ser més actius que abundants. A nivell de fílum, Spirochaetota va mostrar una activitat d'expressió superior a l'esperada en relació amb la seva abundància. L'anàlisi diferencial metatranscriptòmic va revelar que les espècies de Lactobacillus i Pediococcus eren més actives en mostres amb alt contingut d'àcid acètic i baix contingut d'àcid propiónic. A més, es va identificar Akkermansia glycaniphila com a productora d'acetat, mentre que Prevotella copri va ser més activa en mostres amb alt contingut d'àcid butíric, donant suport al seu paper en la producció de butirat a través de la via del butiril-CoA. L'anàlisi funcional va destacar una expressió significativa de proteïnes relacionades amb espores i activitat de bacteriòfags, com antB. Finalment, vam investigar el paper crucial del fetge en el metabolisme d'AG i la seva interacció amb la microbiota intestinal i la funció immunitària. Vam identificar diversos gèneres bacterians, com Agathobaculum, Collinsella, Floccifex, Phascolarctobacterium, SFLA01 i Streptococcus, que potencialment influeixen en l'expressió de gens clau del fetge relacionats amb el metabolisme energètic. Es van identificar gens com ABCD3, CXCL8, CYP8B1, DEFB1, ELOVL2, FADS2, HMGCS2, MZB1 i SCD que són modulats per aquests predictors microbians, suggerint possibles vies per a la modulació de l'expressió gènica basada en la microbiota. En resum, aquest treball proporciona una visió integral de les connexions entre les xarxes gèniques, el microbioma intestinal i el metabolisme de lípids, oferint estratègies potencials per millorar la qualitat de la carn a través d'intervencions genètiques i microbianes.

[es] El cerdo es una especie importante en la producción y la investigación, ya que la carne de cerdo es una de las más demandadas en todo el mundo y esta especie es clave para diferentes campos de investigación humana. Por tanto, es importante profundizar en el conocimiento de las complejas interacciones entre la expresión génica en diferentes tejidos, la microbiota intestinal y la composición de ácidos grasos (AG) en cerdos. Realizamos un análisis WGCNA e identificamos módulos de genes coexpresados en el tejido muscular, revelando correlaciones significativas con los perfiles de AG. Notablemente, dos módulos génicos se correlacionaron positivamente con los AG saturados y monoinsaturados, y negativamente con los AG poliinsaturados y la relación omega-6/omega-3, destacando vías relacionadas con la biosíntesis de AG insaturados y el metabolismo de AG. Por el contrario, otros dos módulos mostraron correlaciones positivas con los AG poliinsaturados y la relación omega-6/omega-3, y correlaciones negativas con los AG saturados y monoinsaturados, vinculados a vías que implican la degradación de ácidos grasos y la fosforilación oxidativa. Además, exploramos el papel de la microbiota intestinal en el metabolismo del huésped, particularmente la producción de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) a partir de compuestos no digeribles, y su posterior acumulación en los tejidos. Se encontraron asociaciones significativas entre géneros bacterianos y de arqueas con los perfiles de AG en el contenido rectal, la grasa dorsal y el músculo. Específicamente, la abundancia de ácido n-butírico se correlacionó positivamente con el género bacteriano Prevotella y negativamente con Akkermansia, mientras que el ácido acético mostró la tendencia opuesta. Además, Rikenellaceae RC9 gut group se asoció positivamente con el ácido palmítico en el músculo y negativamente con el ácido esteárico en la grasa dorsal y el ácido oleico en el músculo, sugiriendo el papel indirecto de la microbiota en la modulación de la composición de AG. Luego, estudiamos las diferencias entre el metagenoma y el metatranscriptoma de cerdos con diferencias extremas en el perfil de AGCC en su contenido rectal. A nivel de género, Clostridium fue el más activo, a pesar de ser el tercero en abundancia. Los géneros más abundantes fueron Bacteroides y Prevotella, aunque Treponema fue el segundo género más activo. Además, algunos géneros como Dorea, Dysgonomonas y Butyricicoccus fueron más activos que abundantes. A nivel de filo, Spirochaetota mostró una actividad de expresión superior a la esperada en relación con su abundancia. El análisis diferencial metatranscriptómico reveló que las especies de Lactobacillus y Pediococcus eran más activas en muestras con alto contenido de ácido acético y bajo contenido de ácido propiónico. Además, se identificó Akkermansia glycaniphila como productora de acetato, mientras que Prevotella copri fue más activa en muestras con alto contenido de ácido butírico, apoyando su papel en la producción de butirato a través de la vía del butiril-CoA. El análisis funcional destacó una expresión significativa de proteínas relacionadas con esporas y actividad de bacteriófagos, como antB. Finalmente, investigamos el papel crucial del hígado en el metabolismo de AG y su interacción con la microbiota intestinal y la función inmunológica. Identificamos varios géneros bacterianos, como Agathobaculum, Collinsella, Floccifex, Phascolarctobacterium, SFLA01 y Streptococcus, que potencialmente influyen en la expresión de genes clave del hígado relacionados con el metabolismo energético. Se identificaron genes como ABCD3, CXCL8, CYP8B1, DEFB1, ELOVL2, FADS2, HMGCS2, MZB1 y SCD que son modulados por estos predictores microbianos, sugiriendo posibles vías para la modulación de la expresión génica basada en la microbiota. En resumen, este trabajo proporciona una visión integral de las conexiones entre las redes génicas, el microbioma intestinal y el metabolismo de lípidos, ofreciendo estrategias potenciales para mejorar la calidad de la carne a través de intervenciones genéticas y microbianas.