[ca] Quan es va dissenyar el present estudi, la tecnologia array s'havia implementat i estava en estudi per a la seva aplicabilitat i el seu rendiment en comparació amb les tècniques de citogenètica estàndard en l'entorn prenatal. Primer es van oferir arrays en cas de malformació estructural molt específica i després es van anar introduint progressivament per a més indicacions.Aquest treball pot ajudar a determinar algunes anomalies genètiques diagnosticades per array-CGH en anomalies estructurals específiques, encara per determinar o objecte de debat. La detecció d'un nombre contínuament creixent de CNV relacionats amb anomalies estructurals específiques permet reclassificar com a patògenes algunes anomalies genètiques que abans es consideraven d'importància desconeguda. Permet el descobriment de nous gens relacionats amb malalties i conèixer l'etiologia genètica d'un nombre creixent de condicions clíniques. OBJECTIUS. L'objectiu principal del projecte va ser avaluar la prevalença d'alteracions d'array CGH en fetus amb anomalies estructurals. Els objectius secundaris van ser: Descriure la prevalença de CNV patògens i VUS en fetus amb anomalies estructurals en òrgans/sistemes específics. Descriure la prevalença de CNV patògens i VUS en subgrups específics d'anomalies. Descriure si la prevalença de CNV patògens i VUS canvia en defectes aïllats o en associació amb altres defectes estructurals o restricció del creixement fetal. Descriure si hi ha patrons de CNV que són recurrents en determinades malformacions o sistemes. MÈTODES. Es tracta d'un estudi observacional retrospectiu unicèntric en 648 fetus amb anomalies d'ecografia en els quals s'havia realitzat un array-CGH. Es van informar de CNV patògens i variants de significat desconegut (VUS). L'estudi es va realitzar al Departament de Medicina Materno-Fetal en col·laboració amb el Departament de Genètica Clínica i Molecular de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron de Barcelona, Espanya, entre gener de 2009 i desembre de 2017. Els sistemes inclosos van ser: Nerviós Central Sistema, cardíac, toràcic, gastrointestinal, urinari, facial, genital i esquelètic amb o sense restricció del creixement fetal o hidrops associada. RESULTATS. Tenint en compte la cohort total d'anomalies incloses en el nostre estudi, la prevalença global de CNVs patògenasva ser del 8,3%, mentre que la prevalença de VUS va ser del 4,3%. En el 87,3% dels casos, el array va acabar amb un resultat normal.La prevalença de CNV patògens va variar entre diferents grups de malformacions. La prevalença més baixa es va trobar en cas d'anomalies gastrointestinals amb un 5,6% de CNV patògens; la prevalença més alta es va trobar en cas d'anomalies genitals amb un 14,8 % de CNV patògens.La prevalença de variants de significació desconeguda va variar des de la més baixa en cas d'anomalies urològiques, amb un 1,5% de VUS detectat, fins a la més alta en cas d'anomalies del sistema nerviós central i hidrops amb un 8% i 8,7%, respectivament, de VUS. Si només es tenen en compte els casos aïllats, la major prevalença de resultats patògens es va trobar en cas d'anomalies cardíaques amb un 10,4% de CNV patògenas, i en anomalies esquelètiques amb un 10,8% de resultats patògens. La prevalença de VUS en casos aïllats va variar des de la més baixa en cas d'anomalies facials, anomalies genitals i hidrops fetal sense variants de significació desconeguda detectada, fins a la més alta en cas d'anomalies del sistema nerviós central amb un 7,7% de VUS detectats. CONCLUSIÓ. Els resultats del nostre estudi aporten una forta evidència per a la realització d'una prova d'array en cas d'anomalies ecològiques en diferents sistemes: sistema nerviós central, cardíac toràcic, gastrointestinal, facial, urinari, genital, esquelètic i hidrops. La prevalença de CNV patògens en cas d'anomalies associades va ser més elevada que en aquells casos d'anomalies aïllades per a tots els sistemes considerats.

[en] When the present study was designed, the array technology had been implemented and was under study for its applicability and its performance compared with standard cytogenetics techniques in the prenatal setting. Arrays were first offered in case of very specific structural malformation and then were progressively being introduced for more indications. This work may help determine some genetic abnormalities diagnosed by array-CGH in specific structural abnormalities, still to be determined or object of debate. The detection of a continuously growing number of copy number variants (CNV) related to specific structural anomalies allows reclassifying some genetic anomalies previously considered of unknown significance as pathogenic. It permits the discovery of new genes related to diseases and to know the genetic etiology of a growing number of clinical conditions. OBJECTIVE.The main objective of the project was to evaluate the prevalence of array CGH alterations in fetuses with structural abnormalities. Secondary objectives were: To describe the prevalence of pathogenic CNV and variants of unknown significance (VUS) in fetuses with structural abnormalities in specific organs/systems. To describe the prevalence of pathogenic CNV and VUS in specific subgroups of anomalies. To describe if the prevalence of pathogenic CNVs and VUS changes in isolated defects or in association with other structural defects or fetal growth restriction. To describe whether there are patterns of CNVs that are recurring in certain malformations or systems. METHODS. This is an observational retrospective single-center study in 648 fetuses with ultrasound anomalies in which an array-CGH had been performed. Pathogenic CNV and variants of unknown significance (VUS) were reported. The study was held at the Department of Maternal-Fetal Medicine in a collaborative effort with the Department of Clinical and Molecular Genetics of the Vall d'Hebron University Hospital in Barcelona, Spain, between January 2009 and December 2017. Systems included were: Central Nervous System, cardiac, thoracic, gastrointestinal, urinary, facial, genital, and skeletal with or without associated fetal growth restriction or hydrops .RESULTS. Considering the total cohort of anomalies included in our study, the overall prevalence of pathogenic CNV was 8.3%, while the prevalence of VUS was 4.3 %. In the 87.3% of cases the array ended up in a normal result. The prevalence of pathogenic CNVs varied between different groups of malformations. The lowest prevalence was found in case in case of gastrointestinal anomalies with 5.6% of pathogenic CNVs; the highest prevalence was found in case of genital anomalies with a 14.8 % of pathogenic CNVs. The prevalence of variants of unknown significance varied from the lowest in case of urologic anomalies, with 1.5% of VUS detected, to the highest in case of central nervous system anomalies and hydrops with an 8% and 8.7% respectively of VUS. If only isolated cases are considered, the highest prevalence of pathogenic results was found in case of cardiac anomalies with 10.4% of pathogenic CNV, and in skeletal anomalies with 10.8% of pathogenic results. The prevalence of VUS in isolated cases varied from the lowest in case of facial anomalies, genital anomalies, and fetal hydrops with no variants of unknown significance detected, to the highest in case of central nervous system anomalies with 7.7% of VUS detected. CONCLUSION. The results of our study provide strong evidence towards performing an array test in case of ultrasound anomalies in different systems: central nervous system, cardiac thoracic, gastrointestinal, facial, urinary, genital, skeletal and hydrops. The prevalence of pathogenic CNVs in case of associated anomalies was higher than in those cases of isolated anomalies for all the systems considered.