BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[ca] Els receptors acoblats a proteïna G són una família de proteïnes de membrana que està implicada en moltes malalties d'una gran importancia en la nostra societat actual. Degut a la manca d'estructures tridimensionals d'aquests receptors s'ha desenvolupat un protocol per tal d'estudiar-los in silico. Aquest protocol utilitza les simulacions de dinàmica molecular per a estudiar l'estructura i la funció dels GPCRs tot tenint en compte l'entorn hidrofòbic de la bicapa lipídica en el que es troben i l'efecte dels residus de serina i treonina en la conformació de les hèlixs alfa d'aquests receptors. A partir del protocol s'ha construit i validat a través del disseny racional de fàrmacs un model tridimensional per receptor 5-HT1A que a més a més és vàlid per a la majoria dels receptors de les amines biogèniques. Aquest model s'ha utilitzat per a identificar el mode d'unió dels receptors serotoninèrgics amb els seus lligands. La modelitzaió del mode d'unió dels receptors amb els seus lligans ha permès el disseny de nous lligands amb més afinitat i selectivitat. Tot el treball computacional s'ha validat a través de la síntesi i avaluació farmacològica dels lligands així com amb experiments de mutagènesi dirigida.

[en] G-protein coupled receptors (GPCRs) are membrane proteins that transduce and amplify extracellular chemical signals to the interior of the cell. Due to its prominent role in cell signalling, GPCR malfunction is involved in a wide variety of diseases. Because of the lack of X-ray resolved GPCR structures, this thesis presents a protocol to study the structure and function of these proteins in silico. This protocol is based on molecular dynamics simulations, and takes into account explicitly the hydrophobic environment of the receptors due to the surrounding cellular membrane. In addition, it considers the influence of serine and threonine residues in the global conformation of the hydrophobic transmembrane alpha-helices that constitute the structural feature common to all GPCRs. Based on this protocol, a three dimensional model for 5-HT1A receptor has been constructed, which is valid for most of the biogenic amine receptor family. The computational models of the binding site of serotoninergic receptors have been validated through the synthesis and pharmacological evaluation of new ligands, and through site-directed mutagenesis experiments. This way, these three-dimensional models have allowed to identify and characterize the binding site of the serotoninergic receptors 5-HT1A, 5-HT4 and 5-HT7, and to design new ligands with improved affinity and selectivity for these receptors.
[ca] Els objectius de la tesi són calcular la prevalença de la rigidesa arterial patològica (mesurada amb el Cardio-Ankle Vascular Index -CAVI-) en una població general mediterrània i en una població mediterrània de risc entremig i avaluar l'associació d'aquesta amb estils de vida, factors de risc cardiovascular i nivell socioeconòmic. La prevalença de CAVI patològic era elevada, sobretot en la població de risc entremig, i aquest s'associà positivament a la hipertensió i la diabetis, i negativament a l'obesitat en les dues poblacions. Només l'activitat física en els homes en la població general estava relacionada amb el CAVI patològic. Cap altre estil de vida no hi estava relacionat. A més, tenir un nivell d'estudis màxim de primària també estava associat a CAVI patològic en homes de la població de risc entremig. Per prevenir les malalties cardiovasculars cal incidir en la detecció precoç del CAVI i controlar la diabetis i la hipertensió

[en] The objectives of the thesis are to estimate the prevalence of pathological arterial stiffness (measured with the Cardio-Ankle Vascular Index –CAVI-) in a general Mediterranean population and in a Mediterranean intermediate cardiovascular risk population, and to assess the association of this condition with lifestyle, cardiovascular risk factors, and socioeconomic status. The prevalence of pathological CAVI was high, mainly in the intermediate cardiovascular risk population. Pathological CAVI was associated with hypertension and diabetes, and negatively associated with obesity in both populations. Regarding lifestyles, only physical activity in men from the general Mediterranean population was associated with pathological CAVI. Completion of instruction only up to primary education level was associated with pathological arterial stiffness in men from the intermediate cardiovascular risk population. To improve primary prevention of cardiovascular disease we should focus on the early detection of pathological CAVI, and on the control of diabetes and hypertension
[ca] Els animals estacionals realitzen variacions fisiològiques que els permeten adaptar-se als canvis ambientals anuals. Segons la teoria de la xenohormesi, els animals detecten senyals químics a les fruites per preparar-se per a la situació futura. En ser els(poli)fenols es produeixen en resposta a l'estrès; aquests podrien actuar com a senyals moleculars i les fruites podrien mostrar característiques fenòliques segons la temporada. L'objectiu d'aquesta tesi doctoral va ser dilucidar els efectes diferencials de característiques fenòliques específiques de la fruita en funció del fotoperíode. En primer lloc, es van investigar els efectes metabòlics de nous extractes estacionals enriquits amb (poli) fenols en rates F344 en diferents fotoperíodes. Alguns extractes van modular diversos marcadors metabolics de manera dependent del fotoperíode. En segon lloc aquests extractes de fruites es van estudiar en rates F344 subjectes a diferente probes metabòliques. Alguns extractes van contrarestar l'estat inflamatori depenent de l'estacionalitat de la fruita i el fotoperíode de consum, mentre que els efectes sobre el metabolisme dels lípids van ser independents de l'estacionalitat de la fruita. Finalment, es van testar dos tipus de cireres amb diferents característiques en rates F344.

[en] Seasonal animals have physiological and behavioural variations that allow them to adapt to annual environmental changes. To achieve optimal timing, seasonal rhythms need to be entrained by external cues, such as photoperiod and nutrition. Fruitsrich in (poly)phenols are known for their numerous health benefits. According to xenohormesis theory, animals sense chemical cues in fruits to prepare them for the upcoming situation. (Poly)phenols could act as molecular signals because these secondary metabolites are produced in response to stress; therefore, fruits show distinctive phenolic hallmarks depending on the environmental conditions. The aim of this PhD thesis was to elucidate the differential healthy effects of specific phenolic-fruit hallmarks depending on the photoperiod of consumption. First, metabolic effects of new phenolic-enriched extracts from seasonal fruits on healthy F344 rats exposed to different photoperiods were investigated. Some extracts modulated several biochemical markers, such as blood glucose and lipid levels, in a photoperiod-dependent manner. Second,these fruit extracts were studied in F344 rats subjected to metabolic challenge tests to mimick metabolic disorders.
[ca] Aquesta tesis doctoral es centra en el disseny i síntesis de compostos fotosensibles per tal de controlar sistemes biològics amb llum. El treball està dividit en dos blocs. El primer, format per tres capítols, dels quals, els dos primers expliquen les aproximacions i l'estratègia seguides en la síntesis de compostos fotoconmutables per controlar receptors de glutamat, basats en PTLs, però sense la utilitzacó de tècniques basades en manipulació genètica per tal que es produeixi la corresponent unió. En el tercer capítol d'aquest bloc, es descriuen els compostos obtinguts del diseny de varis PCLs derivats de benzodiazepina, per ser aplicats en la modulació de receptors GABAa òpticament, responsables de la inhibició de la neurotransmissió. En el segon bloc es descriu la metodologia seguida en el control enantioselectiu de la lipasa 2 (provinent de la familia Bacillus Thermocathenolathus) en fase sòlida. Per aconseguir-ho, hem utilitzat tècniques de ingenieria genètica, per tal d'incorporar un azobenzé i un spiropirà com a controladors òptics i estudiar el seu efecte en el sistema catalític.

[en] This thesis work is focused on the design and synthesis of photo-sensitive azo derived compounds, in order to modulate biological systems with light. In the first block three chapters are presented. The first two describe the attempted approaches followed to bestow light sensitivity into glutamate receptor channels (responsible for neuronal transmission and synapses) based on PTLs without exogenous gene expresion techniques. In the third chapter the development of photochromic benzodiazepine ligands is explained to modulate GABAa receptor channels optically, responsible for inhibition of neurotransmission. The second block describes the enantioselective optical control of lipase 2 (from Bacillus Thermocathenolatus) in solid phase. Using engineering techniques we have expressed and introduced some cysteine residues close to the active catalytic site and conjugated with azobenzene and spiropyran dyes.
[ca] En aquesta tesi hem investigat l'adequació de les dades de WGS per identificar variants genètiques o indicadors biològics associats amb els trets productius, i ampliar el nostre coneixement sobre el determinisme genètic dels trets de qualitat de la carn.Els resultats mostren que una major densitat de variants en les dades de WGS permet detectar nous QTL en comparació amb els xips de SNPs. Hem identificat múltiples variants genètiques amb potencial per a programes de selecció assistida per marcadors en desequilibri de lligament per a la deposició de greix i el contingut d'àcids grassos en el porc. També, les dades de WGS han permès dur a terme fine-mapping dels efectes de múltiples QTL dins de regions específiques, tant en gens candidats funcionals com en gens prioritzats segons altres criteris. Finalment, hem observat que el nombre de còpies d'ADN mitocondrial, un fenotip cel·lular que es pot estimar a partir de les dades de WGS, es correlaciona amb l'eficiència alimentària, la magresa i el pH final. Aquesta troballa obre una via interessant per comprendre la interacció entre el metabolisme cel·lular i els trets productius.

[en] In this thesis, we have investigated the suitability of WGS data to identify genetic variants or biological indicators associated with livestock productive traits, and increased our knowledge on the genetic determinism of meat quality traits. Our results showed that the increased variant density of WGS data enables the detection of novel quantitative trait loci compared to SNP arrays. Additionally, we uncovered multiple genetic variants that show potential for linkage disequilibrium marker-assisted selection programs for pig fat deposition and fatty acid content. Also, WGS data allowed fine-mapping of the effects of multiple QTLs within specific genomic regions, both in candidate genes from families involved in metabolic pathways or prioritized according to other criteria. Finally, we observed that mitochondrial DNA copy number, a cellular phenotype that can be estimated from WGS data, correlates with feed efficiency, leanness, and ultimate pH. This finding offers an intriguing avenue for understanding the interplay between cellular metabolism and productive traits.
[ca] La primera part d'aquest treball presenta una anàlisi acurada de les tècniques de registre 3D es rellevants, incloent tècniques d'estimació de la posició inicial, registre pairwise i registre entre múltiples vistes. S'ha proposat una nova classificació de les tècniques, depenent de les seves aplicacions i de l'estratègia utilitzada. La contribució mes important d'aquesta tesi és la proposta d'un nou mètode de registre 3D utilitzant múltiples vistes. El mètode proposat detecta regions ja visitades prèviament, obtenint cicles de vistes que s'utilitzen per tal de reduir els desalineaments en el model final deguts principalment a la propagació de l'error durant el procés de registre. Aquest mètode utilitza tant informació global com local, correlacionant les vistes mitjançant tècniques de grafs que permeten minimitzar l'error propagat i registrar les vistes de forma òptima. El mètode proposat ha estat provat utilitzant dades sintètiques i reals, per tal de mostrar i analitzar el seu comportament i demostrar la seva eficàcia.

[en] The first part of this work presents an accurate analysis of the most relevant 3D registration techniques, including initial pose estimation, pairwise registration and multiview registration strategies. A new classification has been proposed, based on both the applications and the approach of the methods that have been discussed. The main contribution of this thesis is the proposal of a new 3D multiview registration strategy. The proposed approach detects revisited regions obtaining cycles of views that are used to reduce the inaccuracies that may exist in the final model due to error propagation. The method takes advantage of both global and local information of the registration process, using graph theory techniques in order correlate multiple views and minimize the propagated error by registering the views in an optimal way. The proposed method has been tested using both synthetic and real data, in order to show and study its behavior and demonstrate its reliability.
[ca] La fotosíntesis artificial és un procés on una molècula d'aigua es transforma en oxigen i hidrogen gas. Aquest procés permet obtenir combustibles solars (hidrogen gas) a partir d'aigua i llum solar i és una metodologia alternativa per obtenir energia neta i sostenible en substitució dels combustibles fòssils tradicionals. L'objectiu d'aquesta tesi és la síntesi i estudi de catalitzadors de reducció de protó a hidrogen gas, així com la preparació d'elèctrodes i fotoelèctrodes capaços de dur a terme la reducció i l'oxidació d'aigua amb el menor cost energètic possible. Durant la realització d'aquesta tesi s'han sintetitzat tres catalitzadors de reducció d'aigua de cobalt i el seu estudi ha permès identificar els processos que limiten la reacció i el seu mecanisme. També s'han preparat elèctrodes actius amb catalitzadors moleculars adsorbits sobre grafè. Finalment s'han preparat fotoànodes i fotocàtodes capaços d'oxidar i reduir l'aigua, respectivament, per sota del potencial termodinàmic sota llum solar.

[en] Artificial photosynthesis is a process where a molecule of water is split into molecular oxygen and hydrogen. This process produces a solar fuel (hydrogen gas) from water and sunlight and it is considered a promising clean and sustainable alternative to the traditional fossil fuels. The objective of this thesis is the synthesis and study of cobalt catalysts active for hydrogen evolution reaction, as well as the preparation of electrodes and photoelectrodes active for the reduction and water oxidation of water with the lowest energy consumption. In this thesis, cobalt hydrogen evolution catalysts have been synthetized and studied allowing us to determine the limiting factors of the reaction and its mechanism. In addition, active electrodes modified with with graphene functionalized with a molecular catalyst have been prepared. Finally, photoanodes and photocathodes active for the oxidation and reduction of water, respectively, that work below the thermodynamic potential under sunlight have been prepared.
[ca] A través d'una metodologia de base arqueològica territorial i paisatgística, s'estudia la xarxa viària històrica a la zona de l'actual comarca de la Terra Alta (Tarragona) en contrast amb el poblament protohistòric de la regió. Durant el procés, s'analitza quins són els corredors naturals i camins tradicionals que es mantenen sobre espais de trànsit de possible origen antic i quina morfologia adopten. A partir dels resultats, proposem un seguit d'hipòtesis en les que s'identifiquen els possibles conductes translatius emprats per les comunitats humanes del primer mil·lenni ANE, les estratègies de desplaçament i l'impacte que l'accés a la mobilitat ha exercit envers els patrons d'assentament protohistòrics des d'una perspectiva diacrònica i integrant. En aquells espais on es poden diferenciar fenomens poblacionals i/o translatius pertinents a distints horitzons cronològics, a més, s'efectua una lectura històrica.

[en] Making use of methods coming form the landscape archaeology, we look into the historical road network in the current zone of Terra Alta (Tarrgona) matching it with the protohistoric settlements of the region. During the process, we analyze wich are the natural passages and traditional roads remaining over ancient traffic channels and the morphology they take. Basing on the results, some hypothesis has been suggested, from which we identify the translative channels potentially used by the 1st meillenium BC human communities, their travel strategies and the movement impact on the protohistoric settlement patterns from a diachronic and linking viewpoint. In spaces where it's possible to distinguish translative and population phenomena belonging to diferent time-frames, besides, we can make a historical intepretation.
[ca] Aquesta tesi consisteix en una investigació ontològica de caràcter fenomenològic-hermenèutic de l'obra Sein und Zeit (Ser i temps) de Martin Heidegger. A través d'un conjunt de meditacions amb aquesta obra magna s'arriba a l'experiència del sentit del ser i es constata la seva viabilitat ontològica. Així doncs, entenem que l'experiència del sentit del ser és la realització de l'analítica existenciària (ontologia del Dasein) a través de la qual es consuma l'ontologia fonamental. Tanmateix, la plenitud de la culminació exitosa del projecte ontològic heideggerià no es limita a l'assoliment experimental del sentit del ser, sinó en anar més enllà d'aquest, des de i en ell, accedint al mateix ser. Per això, la consumació de l'experiència del sentit del ser (l'efectuació de l'ontologia fonamental) se'ns mostra com l'ingrés en la mateixa revelació del ser com a no-res i temps protooriginari des de i en la immersió en el sentit del ser com a temporalitat extàtico-horitzontal

[en] This thesis consists of an ontological investigation of phenomenological-hermeneutic character of the work Sein und Zeit (Being and time) of Martin Heidegger. Through a set of meditations with this great work, is come to the experience of the sense of Being with which it is observed its ontological viability. So, we understand that the experience of the sense of Being is the realization of the existential analytics (ontology of the Dasein) through which the fundamental ontology is consumed. However, the fullness of the successful culmination of the Heideggerian ontological project does not lie in the experimental attainment of the sense of Being, but in going beyond it, from and in it, accessing the same Being. Therefore, the consummation of the experience of the sense of being (the realization of the fundamental ontology) is shown to us as the income in the same revelation of Being as nothing and protooriginal time from and in the immersion in the sense of Being as temporality ecstatic-horizontal
[ca] Aquesta investigació es basa en la descripció de les diferents modalitats d'ús de cocaïna i les variables socioculturals que influeixen en la salut de les persones consumidores així com en el manteniment de les seves funcions i relacions socials. S'ha realitzat treball de camp etnogràfic durant 18 mesos a Reus basat en les teories fenomenològiques i de l'interaccionisme simbòlic. També s'han realitzat 32 entrevistes en profunditat a consumidors. Els principals resultats han estat comprendre que la dimensió salut juga un paper molt important en el consum de cocaïna, però principalment pels riscos que implica la il·legalitat i l'estigmatització d'aquesta pràctica. Es proposen dos models d'anàlisi sociocultural del consum de cocaïna, el primer des de la perspectiva fenomenològica i les teories del cos com a objecte social i polític i el segon a partir dels espais de consum identificats, com a llocs que mediatitzen les condicions en què aquests consums es realitzen. Per finalitzar es realitzen propostes concretes de mesures de salut col·lectiva, basades en la formació en matèria de substàncies psicoativas i la creació d'espais d'autoorganització de consumidors i serveis per disminuir riscos i danys mentre es mantingui un mercat il·legal de psicoestimulants.

[en] This research is based on a description of the different modes of cocaine use and the socio-cultural variables affecting the health of consumers and their maintenance of roles and relationships. It follows 18 months ethnographic fieldwork, based on the phenomenological theories of symbolic interaction. This field data is augmented by 32 in-depth interviews with cocaine consumers in Reus. Results of the research indicate that the health considerations plays an important role in cocaine use, but mainly in terms of the risks associated with its illegality and the stigmatisation of this practice. Two models of socio-cultural analysis were used in this study. The first, a phenomenological perspective incorporates social and political theory, and the second examines 'consumer spaces': identified as sites that mediate conditions in which people use cocaine. Using these two models of analysis, findings suggest specific proposals in the area of public health. Training and education for both consumers and service providers in all psycho-active substances. Developing opportunities for self-organising among consumers. Partnership between consumers and services towards the reduction of risk associated with psycho-stimulant use. To collaboratively seek to develop proposals towards a regulated market for psycho-stimulants.
[ca] Els turistes s'interessen en conèixer la gastronomia de les destinacions. Aquells turistes que visiten la Costa Brava denoten confusió en el coneixement de la cuina catalana. Partint d'aquesta observació s'analitzen les pàgines web dels allotjaments de la província de Girona, per comprovar si s'hi serveix menjar típic de la regió, i s'enquesten als hotelers per saber quina és la seva disposició alhora d'oferir cuina catalana. Els resultats mostren: un cert interès a oferir cuina de la regió, però encara lluny del que és necessari per tal de que el turista conegui la gastronomia tradicional; i poca disposició en parlar de l'oferta gastronòmica a través de la xarxa, de manera que el turista pot tenir dificultats al cercar informació sobre el menjar que pot degustar a la destinació. Aquest fet es contraposa amb els esforços que els diferents agents de promoció turística fan per donar a conèixer la gastronomia catalana

[en] Tourists are interested in getting to know the gastronomy of the destinations. Those tourists who visit the Costa Brava are confused with the knowledge of Catalan cuisine. Based on this observation, the web pages of the lodgings in the province of Girona are analysed to see if the typical 2/2 regional food is served, and the hoteliers are surveyed to find out what they are offering on Catalan cuisine. The results show: little interest in offering regional cuisine, but still far from what is necessary for the tourist to know the traditional cuisine; and scarce willingness to show the gastronomic offer through the network, so the tourist may have difficulty in finding information on the food that can be enjoyed at the destination. This contrasts with the efforts made by different tourism promotion agents to publicize Catalan gastronomy