[en] The research focused on metabolite analysis is an analytical discipline that is currently gaining much relevance thanks to the large amount of biological information from an organism that it reveals. The increasing knowledge of metabolic and lipid profiles has revealed the prominent role played by some biological compounds in health as well as in the development of various diseases and disorders. In turn, special care must be taken in the pre-analytical stages and the pretreatment of samples that are carried out in clinical laboratories in the order to show how these procedures can condition and alter the metabolites of biological samples. For this reason, all possible parameters or variables involved both in the pre-analytical stages and the pretreatment of the samples involved must be analyzed since they can introduce inaccuracies and distort the results. It has been observed how various stimuli in the sample manipulation prior to the analysis can trigger an undesirable response in the metabolites, inducing a series of transformations such as degradation, which result in the modification of the chemical characteristics of starting samples. The analysis of these altered samples irreversibly compromises the quality of the results that can be obtained from them. For this reason, one of the main objectives of this doctoral thesis is to provide clinical laboratories with a series of reliable protocols and methodologies for the pre-analytical and sample pretreatment stages of the analysis, thus minimizing the error bias that can be introduced at these stages. These errors translate in inaccurate and incongruent values with the reality of the biological sample and it is irremediably associated with an imprecise diagnosis of the organism under study. Firstly, emphasis will be placed on the processes involved in the sample thawing stages and liquid-liquid extraction pretreatment. Furthermore, this work also aims to show how the combined use of analytical methods based on "fingerprint" techniques together with chemometric tools achieve the detection and identification of markers of different stages of the same disease in people who have an altered metabolism. In particular, this doctoral thesis has focused on obtaining the metabolic and lipid profiles through the use of infrared spectroscopy and liquid chromatography in order to distinguish and classify patients with different states of viral disease induced by the human immunodeficiency virus.

[es] La investigación centrada en los análisis de metabolitos es una disciplina analítica que actualmente está ganando mucha relevancia gracias a la enorme cantidad de información biológica que proporciona de los organismos. El creciente conocimiento de los perfiles metabólicos y lipidómicos ha revelado el prominente papel que desempeñan algunos compuestos biológicos tanto en la salud como en el desarrollo de enfermedades y trastornos. A su vez, se debe de tener especial cuidado con las etapas pre-analíticas y pretratamientos de las muestras que son llevados a cabo en los laboratorios clínicos porque estos procedimientos pueden condicionar y alterar los metabolitos de las muestras biológicas. Por este motivo, todos los posibles parámetros o variables que están involucrados tanto en las etapas pre-analíticas como en los pretratamientos de muestra deben ser analizados, ya que pueden introducir imprecisiones y distorsiones en los resultados. Se ha observado cómo diversos estímulos en la manipulación de la muestra antes de la realización del análisis pueden desencadenar una respuesta indeseable en los metabolitos, induciendo una serie de transformaciones tales como la degradación, dando como resultado la modificación de las características químicas de las muestras originales. El análisis de estas muestras alteradas irreversiblemente compromete la calidad de los resultados que pueden obtenerse de ellas. Por esta razón, uno de los principales objetivos de la presente tesis doctoral es proporcionar a los laboratorios una serie de protocolos y metodologías fiables para las etapas pre-analíticas y de preparativa de muestras para los posteriores análisis, minimizando el sesgo de error que se puede introducir en estas etapas. Estos errores se traducen en valores inexactos e incongruentes con la realidad de la muestra biológica y son irremediablemente asociados con un diagnóstico impreciso del organismo a estudio. En primer lugar, se hará hincapié en los procesos involucrados en la etapa pre-analítica de descongelación y en el tratamiento de muestra llevado a cabo en la extracción líquido-líquido. Además, este trabajo pretende mostrar cómo el uso combinado de métodos analíticos basados en técnicas de "huellas dactilares" junto con herramientas quimiométricas logra la detección e identificación de biomarcadores de diferentes estadios de la misma enfermedad en personas que tienen un metabolismo alterado. En concreto, esta tesis doctoral se ha centrado en obtener los perfiles metabólicos y lipídicos mediante el empleo de espectroscopia infrarroja y cromatografía líquida con el fin de discriminar y clasificar a pacientes con diferentes estados de enfermedad virológica inducida por el virus de la inmunodeficiencia humana.