BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] Tagetes is a group of plants commonly known as cempasúchil or "flower of the dead", which are mainly recognized for their use in the food industry, ornamental horticulture, therapeutic herbalism and culture. Tagetes coronopifolia and terniflora are two species plants of this genus, which are used in crop rotation to control phytopathogenic nematodes. In the curent work, 581 strains were isolated from samples of rhizosphere soil, soil attached to the root and the interior of the root at 30, 60, 90 and 120 days of growth, in greenhouse cultures. From the total isolated rhizobacteria strains, 22 presented antagonistic activity to Fusarium sp. and 53 to Stenocarpella maydis, both. pathogenic fungi in corn, while 37 strains showed antagonism to the pathogenic bacteria Clavibacter michiganensis subsp michiganensis. According to the percentage of inhibition of the phytopathogens, 10 rhizobacteria were selected for molecular identification using a fragment of approximately 1484 bp of the 16SrDNA gene. The similarity analysis using the NCBI BLAST tool, showed that the rhizobacteria belong to the genera Bacillus and Pseudomonas, which are used as biocontrol agents.

[es] El género Tagetes, es un grupo de plantas conocidas comúnmente como cempasúchil o flor del muerto, las cuales, son reconocidas principalmente por su uso en la industria alimentaria, horticultura ornamental, terapéutico herbolario y cultural. Tagetes coronopifolia y terniflora, son dos plantas de este género, empleadas en la rotación de cultivos para el control de nemátodos fitopatógenos. En este trabajo se realizó el aislamiento de 581 cepas a partir de muestras de suelo rizosférico, suelo adherido a la raíz y el interior de la raíz a los 30, 60, 90 y 120 días de crecimiento, en cultivos de invernadero. Del total de cepas de rizobacterias aisladas, 22 presentaron actividad antagónica a Fusarium sp. y 53 a Stenocarpella maydis, ambos. hongos patógenos de maíz, mientras que 37 cepas mostraron antagonismo a la bacteria fitopatógena Clavibacter michiganensis subsp michiganensis. De acuerdo con el porcentaje de inhibición de los patógenos en estudio, se seleccionaron 10 rizobacterias para su identificaron molecular utilizando un fragmento de aproximadamente 1484 pb del gen 16SrDNA. El análisis de similitud utilizando la herramienta BLAST del NCBI, arrojó como resultado que las rizobacterias pertenecen a los géneros Bacillus y Pseudomonas, géneros utilizados como agentes de biocontrol.
[en] Filamentous fungi that tolerate the presence of pharmaceutical active compounds (PhACs) have the potential application of removing them. In this work it was showed that radial growth data can be modeled and used to determine the kinetic parameters to quantify fungal growth in the presence of PhACs. The capacity of Amylomyces rouxii to grow in the presence of 12 PhACs at concentrations between 100 to 5000 µg L-1 was evaluated. The studied PhCAS were paracetamol, ibuprofen, diclofenac, naproxen, sulfamethoxazole, trimethoprim, ciprofloxacin, ofloxacin, carbamazepine, β-estradiol, triclosan, and bisphenol-A. The data of A. rouxii radial growth was modeled using the logistic equation and linear regression. The Vmax, except in cultures with βETD, and µmax values were not affected by the presence of PhACs. Growth inhibition of fungus was calculated at 24 hours. In cultures with diclofenac, triclosan and naproxen, a linear relationship was observed between concentration and radial growth inhibition. However, there was no difference in radial growth inhibition at the different assayed concentrations of ibuprofen, trimethoprim, and β-estradiol. In culture with 5000 µg carbamazepine L-1, growth of A. rouxii was completely inhibited. To the best of our knowledge, this is one the first work reporting PhACs toxicity in zygomycetes.

[es] Los hongos filamentosos que toleran la presencia de compuestos activos farmacéuticos (CAFs) podrán potencialmente removerlos. El objetivo fue mostrar que los datos de crecimiento radial pueden ser modelados y usados para determinar los parámetros cinéticos del crecimiento fúngico en presencia de CAFs y evaluar la inhibición del crecimiento por los CAFs. Se evaluó la capacidad de Amylomyces rouxii para crecer en presencia de 12 CAFs a concentraciones entre 100 a 5000 µg L-1. Los CAFs estudiados fueron paracetamol, ibuprofeno, naproxeno, sulfametoxazol, trimetoprima, ciprofloxacino, ofloxacino, carbamazepina, B-estradiol, triclosán y bisfenol A. Los datos del crecimiento radial de A. rouxii fueron modelados usando la ecuación logística y se obtuvo la tasa máxima de crecimiento. A 24 h, se calculó la inhibición del crecimiento. Ibuprofeno, trimetoprima, y B-estradiol no causaron inhibición. La carbamazepina, 5000 µg L-1, inhibió completamente el crecimiento de A. rouxii. Hasta donde sabemos, este es el primer trabajo que informa de la toxicidad de los CAFs en hongos.&nbsp;
[en] We carried out monthly samplings to determine the concentration of Naegleria fowleri in four natural water bodies of the Yaqui Valley, Sonora, Mexico. We measured the temperature, dissolved oxygen, and pH of the water. The water samples were shaken and processed to determine the concentration using the most probable number method (MPN) and seeded on non-nutritive agar plates with Escherichia coli. Each amoeba detected was isolated in a new plate to continue with the identification. MPN tables were used for the amoeba count, and the identity of the genera Naegleria and N. fowleri was used using specific primers and end-point PCR. We identified N. fowleri in all four water bodies during the summer and fall seasons, with 70 MPN L-1 as the highest concentration. We selected seven N. fowleri strains for sequencing and genotyping; all belonged to type 2. Through the results, we can affirm that due to the variations that occur in the population dynamics and the ecological diversity of the studied sites, different biotic or abiotic factors, in addition to the temperature, dissolved oxygen, and pH, influence the presence or absence of this species. This makes it difficult to predict their presence in natural aquatic environments with relatively low populations.

[es] Realizamos muestreos mensuales para determinar la concentración de Naegleria fowleri en cuatro cuerpos de agua naturales del Valle del Yaqui, Sonora, México. Medimos la temperatura, el oxígeno disuelto y el pH del agua. Las muestras de agua fueron agitadas y procesadas para determinar la concentración por el método del número más probable (NMP), y sembradas en placas de agar no nutritivo con Escherichia coli. Cada amiba detectada se aisló en una nueva placa para continuar con la identificación. Se usaron tablas de MPN para el conteo de amibas, y la identidad de los géneros Naegleria y N. fowleri fue usando cebadores específicos y PCR de punto final. Identificamos N. fowleri en los cuatro cuerpos de agua durante las temporadas de verano y otoño, con 70 MPN L-1 como la concentración más alta. Seleccionamos siete cepas de N. fowleri para secuenciación y genotipado; todos pertenecían al tipo 2. A través de los resultados podemos afirmar que debido a las variaciones que se dan en la dinámica poblacional y la diversidad ecológica de los sitios estudiados, diferentes factores bióticos o abióticos, además de la temperatura, oxígeno disuelto, y el pH, influyen en la presencia o ausencia de esta especie. Esto dificulta la predicción de su presencia en ambientes acuáticos naturales con poblaciones relativamente bajas.
[en] Solution-processing is a low-cost solution method to preparea variety of organic or inorganic thin films. For metal oxide compounds, a solution-processing solution of an organometallic compound is frequently used as a precursor to be spin coated, followed by a thermal annealing to form metal oxide. In this work, vanadium oxide powders are obtained from a simple acid-base reaction, and then they are dispersed in isopropyl alcohol to form a solution for spin-coating. Different amount of cobalt salt are also added together with VOx into isopropyl alcohol to form VOx:Co2+ solutions. After thermal annealing at 200 °C, continuous transparent thin films are obtained. Optical, structural, morphological and chemical binding energies of those films are analyzed. It is found that amorphous VO2:Co2+ compound is formed in those films with V:Co atomic ratios between 6.6:1 and 1.6:1. Optical absorption onsets of those films are around 2.3 eV. An interesting interconnected porous morphology is observed when the atomic ratio of V:Co is around 4.9:1. It is concluded that porous amorphous cobalt doped vanadium oxide thin films can be obtained from a spin-coating process at low annealing temperature from a simple solution without any complex agent.

[es] El procesamiento de soluciones es un método de bajo costo para preparar una variedad de películas delgadas orgánicas o inorgánicas. Para compuestos de óxidos metálicos, un procesamiento de solución de un compuesto organometálico se usa con frecuencia como solución precursora para ser recubierta por rotación, seguida de un tratamiento térmico para formar el óxido metálico. En este trabajo se obtienen polvos de óxido de vanadio a partir de una simple reacción ácido-base, y luego se dispersan en alcohol isopropílico para formar una solución para spin-coating. También se agregan diferentes cantidades de sal de cobalto junto con VOx en alcohol isopropílico para formar soluciones de VOx:Co2+. Después del tratamiento térmico a 200 °C, se obtienen películas delgadas transparentes. Se analizan las propiedades ópticas, estructurales, morfológicas y químicas. Se encontró que el compuesto VO2:Co2+ es amorfo y se obtiene con una relación atómica V:Co variada de 6.6:1-1.6:1. El material presenta una absorción óptica alrededor de 2.3 eV. Se observa una interesante morfología porosa interconectada cuando la relación atómica de V:Co es ~4.9:1. Se concluye que se pueden obtener películas delgadas amorfas porosas de VO2:Co2+ a partir del spin-coating a una baja temperatura de tratamiento utilizando una solución simple sin agente complejante.
[en] This study reports the effect of mango, jamaica and coffee by-products addition into formulation of starch-gelatin for elaborating a spoon-shaped bioplastic. Such additions improved the bioplastics mechanical properties due to the compatibility of their components, observed at microscopic level (hardness was increased in a range of 190 to 290 N). In the same way, the bioplastics physical properties such as the hue angle values (63-89), solubility and absorp­tion index, were modified with the by-product's addition. To obtain the spoon-shaped bioplastics conditions of maximum stability (aw≈0.4) at 35 °C, we employ the GAB equation and the moisture content corresponding to micropore volume. The different formulations exhibited an endothermic event at 180°C, associated with a melting process, as well as a high degradation rate in soil after 120 h. The by-products proved to be a reinforcement in the bioplastics formulation. The use of by-products of mango, coffee and jamaica represent an in­teresting alternative to increase their technological potential.

[es] En este trabajo se reporta el efecto de la adición de subproductos de mango, jamaica y café a una formulación de almidón-gelatina para elaborar una bioplástico en forma de cuchara. Se encontró que la adición de los subproductos mejoró las propiedades mecánicas del bioplástico debido a la compatibilidad de sus componentes observados a nivel microscópico (la dureza aumento de 190 hasta 290 N). Asimismo, las propiedades físicas de los bioplásticos como el ángulo matiz (63-89), y los índices de solubilidad y absorción en agua se modificaron por la adición de subproductos. Se observó que las condiciones de máxima estabilidad de los bioplásticos obtenidas a partir del modelado de las isotermas de adsorción a 35 °C con la ecuación de GAB y el cálculo el volumen de microporo correspondieron a una actividad de agua cercana a 0.40, independientemente del subproducto agregado. &nbsp;Las distintas formulaciones exhibieron un evento endotérmico a una temperatura de 180°C, asociado a un proceso de fusión, así como una elevada tasa de degradación en suelo después de 120 h. Los subproductos probaron ser un refuerzo en la formulación de bioplásticos. El uso de subproductos de mango, café y jamaica representan una alternativa interesante para incrementar su potencial tecnológico.
[en] Prosthechea karwinskii is an orchid endemic to southeastern Mexico used in traditional medicine. It has anti-inflammatory, antioxidant and cardioprotective activity. Given the relationship between inflammation, oxidative stress, and coagulation in the development of atherothrombosis, the objective of this research was to evaluate the potential of P. karwinskii leaves extract as a possible alternative to reduce the risk of atherothrombosis. The compounds of the extract were identified by UHPLC-ESI-qTOF-MS. The content of total phenols and flavonoids was measured, as well as its antioxidant capacity (DPPH and DCFH-DA essays) and its effect on clotting times. The results showed the presence of phenolic and flavonoid compounds in the extract, as well as their antioxidant capacity. In addition, the extract prolonged clotting times, mainly thrombin, and activated partial thromboplastin times, i.e., it inhibited the intrinsic pathway of hemostasis and the conversion of fibrinogen to fibrin. These results and the background of the extract show its potential as a treatment to reduce atherothrombotic risk, as well as for other diseases whose pathogenesis involves oxidative stress and coagulation.

[es] Prosthechea karwinskii es una orquídea endémica del sureste de México empleada en la medicina tradicional, presenta actividad antiinflamatoria, antioxidante y cardioprotección. Dada la relación que existe entre la inflamación, el estrés oxidativo y la coagulación en el desarrollo de aterotrombosis, el objetivo de esta investigación fue evaluar el potencial del extracto de hojas de P. karwinskii como posible alternativa para disminuir el riesgo de aterotrombosis. Se identificaron los compuestos del extracto por UHPLC-ESI-qTOF-MS, se midió el contenido de fenoles y flavonoides totales, su capacidad antioxidante (ensayos DPPH y DCFH-DA) y su efecto en los tiempos de coagulación. Los resultados mostraron la presencia de compuestos fenólicos y flavonoides en el extracto, así como su capacidad antioxidante. Además, el extracto prolongó los tiempos de coagulación, principalmente los tiempos de trombina y de tromboplastina parcial activada, es decir, inhibió la vía intrínseca de la hemostasia y la conversión del fibrinógeno en fibrina. Estos resultados y los antecedentes del extracto muestran su potencial como tratamiento para reducir el riesgo aterotrombótico, así como para otras enfermedades cuya patogénesis involucre al estrés oxidativo y la coagulación.
[en] The Mexican tea (Chenopodium ambrosioides L.) is used as food, condiment and medicinal. The information related to the nutritional management of the crop production for the Mexican tea is scarce, so, the objective of the study was to determine the effect of three concentrations of the Steiner nutritive solution on the growth and production of Mexican tea grown under greenhouse. The study was conducted in Cuernavaca, Morelos, México. The genotype H-1000 (Hortaflor™) was utilized. Three concentrations of the Steiner nutritive solution (50, 75 and 100 %) were applied, to evaluate the crop growth by destructive samplings at 39, 46, 53, 60, 67 and 74 days after sowing; In each sampling the foliar area, foliar area index, fresh weight, dry matter, growth rates of the crop and absolute growth, was measured and calculated. The variables under study were performed a regression analysis with the Excel® program. In general, with the concentration of the nutritive solution at 100 %, the best results were obtained in all the evaluated variables, compared to the concentration at 75 and 50 %. The highest plant height, leaf area, dry matter, crop growth rate and fresh weight were obtained with the Steiner nutritive solution at 100 %.

[es] El epazote (Chenopodium ambrosioides L.) se utiliza como alimento, condimento y medicinal. La información sobre el manejo de la nutricional para la producción de epazote es insuficiente, por lo que, el objetivo del estudio fue evaluar el efecto de tres concentraciones de la solución nutritiva Steiner sobre el crecimiento de epazote cultivado en invernadero. El estudio se realizó en Cuernavaca, Morelos, México. El genotipo utilizado fue H-1000 (Hortaflor®). Se aplicaron tres concentraciones (50, 75 y 100 %) de la solución nutritiva Steiner para evaluar el crecimiento del cultivo mediante muestreos destructivos a los 39, 46, 53, 60, 67 y 74 días después de la siembra; en cada muestreo se midió y calculó el área foliar, índice de área foliar, peso fresco, materia seca, tasas de crecimiento del cultivo y absoluta de crecimiento. A las variables se les realizó un análisis de regresión con el programa Excel®. En general, con la concentración de la solución nutritiva a 100 % se obtuvieron los mejores resultados en las variables evaluadas, en comparación a la concentración 75 y 50 %. La mayor altura, área foliar, materia seca, tasa de crecimiento del cultivo y peso fresco se obtuvieron con la solución nutritiva Steiner a 100 %.
[en] To evaluate the effect of the incorporation of L. leucocephala&nbsp;on biomass production and the chemical composition of P. maximum&nbsp;cv. Tanzania in a silvopastoral system, an experiment was established in two grasslands, established with P. maximum&nbsp;cv. Tanzania as the only crop in one of them and in the other associated with L. leucocephala&nbsp;in an arrangement of pastures in alleys. In each meadow, 12 exclusion cages of 1m3 were placed in a completely random design with 2x4 factorial arrangement, two systems (monoculture and silvopastoral) and four cutting dates (28, 56, 84 and 112 days) and three repetitions. Chemical fertilization with Phosphonitrate was applied in each of the exclusion cages for both treatments. A significant difference was observed between systems for the variables height, coverage, production of organic matter (kg/ha), production of crude protein (kg/ha)&nbsp;and the percentage of FDN, reporting the best values of the silvopastoral system. It is concluded that the use of Leucaena offers important advantages if it is considered that it is capable of producing food of high nutritional value for animals, in addition, it improves the quality and quantity of forage of the system. &nbsp;

[es] Para evaluar el efecto de la incorporación de L. leucocephala&nbsp;sobre la producción de biomasa y la composición química de P. maximum&nbsp;cv. Tanzania en un sistema silvopastoril, se estableció un experimento en dos praderas, establecidas con P. maximum cv. Tanzania como único cultivo en una de ellas y en la otra asociada con L. leucocephala&nbsp;en un arreglo de pasturas en callejones. En cada pradera fueron colocadas 12 jaulas de exclusión de 1m3&nbsp;en un diseño completamente al azar con arreglo factorial 2x4, dos sistemas (monocultivo y silvopastoril) y cuatro fechas de corte (28, 56, 84 y 112 días) y tres repeticiones. Se aplicó una fertilización química con Fosfonitrato en cada una de las jaulas de exclusión para ambos tratamientos. Se observó diferencia significativa entre sistemas para las variables altura, cobertura, producción de materia orgánica (kg/ha), producción de proteína cruda (kg/ha)&nbsp;y el porcentaje de FDN, reportando los mejores valores el sistema silvopastoril. &nbsp;Se concluye que el uso de la Leucaena&nbsp;ofrece ventajas importantes si se considera que es capaz de producir alimento de alto valor nutricional para los animales, además, mejora la calidad y cantidad de forraje del sistema. &nbsp;
[en] Ovine Enzootic Abortion (OEA) is caused by Chlamydia abortus and has recently been recognized as endemic in Mexico. Due to the impact of OEA on intensive lamb production, it is necessary to establish a sanitary control plan based on an efficient diagnosis. The loop-mediated isothermal amplification technique (LAMP) is a molecular test that can specifically identify C. abortus. The aim of this study was to standardize the LAMP technique for the specific detection of C. abortus from ovine vaginal exudate. Primers were identified and modified from an electronic database. The effective conditions of the technique were determined using synthetic DNA and positive biological samples by PCR as references. The assay detection limit was 1 × 10-5 of genetic material, equivalent to 8.5 copies. The standardized LAMP test is proposed as a novel molecular tool for the rapid and specific diagnosis of C. abortus infection from ovine vaginal exudate samples in Mexico.

[es] El Aborto Enzoótico Ovino (AEO) es causado por Chlamydia abortus y ha sido reconocido recientemente como endémico en México. Debido al impacto del AEO en la producción intensiva de corderos, es necesario establecer un plan de control sanitario basado en un diagnóstico eficiente. La técnica de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) es una prueba molecular que puede identificar específicamente a C. abortus. El objetivo de este estudio fue estandarizar la técnica de LAMP para la detección específica de C. abortus a partir de exudado vaginal ovino. Los cebadores fueron identificados y modificados a partir de una base de datos electrónica. Las condiciones efectivas de la técnica se determinaron con ADN sintético y de muestras biológicas positivas por PCR como referencia. El límite de detección de la prueba fue de 1 × 10-5 de material genético, equivalente a 8.5 copias. Se propone el test de LAMP estandarizado como una nueva herramienta molecular para el diagnóstico rápido y específico de la infección por C. abortus a partir de muestras de exudado vaginal ovino en México.
[en] Escherichia coli O157: H7 is one of the most important pathogens in ground beef, and the risk of contamination compromises its safety and quality. Thermal treatments are the main option to ensure food safety; although, the use of additional barriers such as the addition of antimicrobial agents increases safety margins against pathogens growth. In this work the effects and interactions of temperature (55-65 °C), carvacrol (0-2%) and fat (5-20%) on thermal resistance (D-value) of E. coli O157: H7 in ground beef were evaluated using response surface methodology. Temperature was the main factor of inactivation, while fat exhibited a protective effect over the pathogen survival. There was an interaction effect between fat and carvacrol, at high concentrations of fat the carvacrol favored the inactivation of the pathogen. The optimal combination of fat, carvacrol and temperatura that ensure the highest inactivation of the pathogen was 63°C, 11% fat and 1.6% carvacrol. The obtained model allow to predict the thermal resistance of E. coli O157: H7 in any combination of temperature, carvacrol and fat, within the limits studied.

[es] Escherichia coli O157: H7 es uno de los patógenos más importantes que contaminan la carne y comprometen su seguridad y calidad. Los tratamientos térmicos son la opción principal para garantizar la inocuidad; aunque el uso de barreras adicionales como la adición de agentes antimicrobianos, aumentan los márgenes de seguridad contra los patógenos. En este trabajo se evaluó el efecto y las interacciones de temperatura (55-65 °C), carvacrol (0-2%) y grasa (5-20%) sobre la resistencia térmica (valor D) de Escherichia coli O157: H7 en carne molida de res utilizando la metodología de superficie de respuesta. La temperatura fue el principal factor de inactivación y la grasa mostró un efecto protector sobre el patógeno. Hubo un efecto de interacción entre la grasa y el carvacrol, a altas concentraciones de grasa el carvacrol disminuyó la resistencia del patógeno. La combinación óptima de grasa, carvacrol y temperatura que minimizan los valores D fue 63 °C, 11% de grasa y 1.6% de carvacrol. El modelo obtenido permite predecir la resistencia térmica de E. coli O157: H7 en cualquier combinación de temperatura, carvacrol y grasa, dentro de los límites estudiados.