[ca] Els elements transponibles (TE) són seqüències d'ADN repetitives que es troben en tots els organismes procariotes i eucariotes. Tenen capacitat de desplaçar-se d'una localització genòmica a una altra i replicar-se, produint mutacions i reordenacions genètiques. A causa de la seva capacitat de generar variabilitat genètica, els polimorfismes dels TE estan començant a estudiar-se en les plantes de cultiu, ja que poden donar lloc a variacions fenotípiques d'importància agronòmica. La detecció dels TE es realitza mitjançant l'anàlisi computacional de les dades genòmiques, i la creixent disponibilitat d'assemblatges genòmics d'alta qualitat permet estudiar la seva dinàmica mitjançant enfocaments pangenòmics. El gènere Prunus és un dels gèneres més importants des del punt de vista econòmic que inclou molts arbres cultivables, com l'ametller o el presseguer, i dels quals recentment s'han publicat diversos acoblaments de genomes de diverses espècies d'aquest gènere. Hem utilitzat aquestes dades genòmiques públiques per identificar TE de novo en 7 arbres d'aquest gènere que pertanyen a 6 espècies diferents: P. armeniaca, P. avium, P. dulcis, P. mira, P. persica i P. salicina. Hem identificat milers de transposons intactes, que codifiquen totes les característiques estructurals i els dominis enzimàtics necessaris per a la seva transposició. Utilitzant un enfocament pangenòmic hem construït una base de dades de famílies de TE de Prunus i hem analitzat la seva presència diferencial en les sis espècies de Prunus. Observem un recent augment d'amplificació de TE en P. salicina, principalment impulsat per l'activitat dels LTR-retrotransposons durant l'últim milió d'anys. Utilitzem la nostra base de dades de Prunus per buscar polimorfismes creats per TE entre dues varietats de presseguer (Lovell i Earlygold), identificant 801 potencials insercions de TE específics de la varietat Lovell. Moltes d'aquestes insercions de TE afecten potencialment a l'activitat del gen on es troben inserits, i validem dues d'elles mitjançant enfocaments moleculars. El present treball permetrà l'estudi de les famílies de TE de Prunus utilitzant una classificació comuna i estructurada i contribuirà a la comprensió del potencial dels polimorfismes de TE en la generació de variabilitat intraespecífica lligada a trets agrícoles d'interès, com la resistència a la sequera , a les plagues, així com a la qualitat o el rendiment de la fruita.

[es] Los elementos transponibles (TE) son secuencias de ADN repetitivas que se encuentran en todos los organismos procariotas y eucariotas. Son capaces de desplazarse de una localización genómica a otra y replicarse en el genoma, produciendo mutaciones y reordenamientos. Debido a su capacidad de generar variabilidad genética, los polimorfismos de los TE están empezando a estudiarse en las plantas de cultivo, ya que pueden dar lugar a variaciones fenotípicas de importancia agronómica. La detección de los TE se realiza mediante el análisis computacional de los datos genómicos, y la creciente disponibilidad de ensamblajes genómicos de alta calidad permite estudiar su dinámica mediante enfoques pangenómicos. El género Prunus es uno de los géneros más importantes desde el punto de vista económico que incluye muchos árboles cultivables, como el almendro o el melocotonero, y recientemente se han publicado varios ensamblajes de genomas de múltiples especies de este género. Hemos utilizado estos datos genómicos públicos para identificar TEs de novo en 7 árboles de este género pertenecientes a 6 especies diferentes: P. armeniaca, P. avium, P. dulcis, P. mira, P. persica y P. salicina. Hemos identificado miles de transposones intactos, que codifican todas las características estructurales y los dominios enzimáticos necesarios para su transposición. Utilizando un enfoque pangenómico hemos construido una base de datos de familias de TE de Prunus y hemos analizado su presencia diferencial en las seis especies de Prunus. Descubrimos un reciente estallido de amplificación de TE en P. salicina, principalmente impulsado por la actividad de LTR-retrotransposones ocurrido durante el último millón de años. Utilizamos nuestra base de datos de Prunus para buscar polimorfismos creados por TE entre dos variedades de melocotón (Lovell y Earlygold), identificando 801 potenciales inserciones de TE específicos de la variedad Lovell. Muchas de estas inserciones de TE afectan potencialmente a la actividad del gen donde se encuentra insertados, y validamos dos de ellas mediante enfoques moleculares. El presente trabajo permitirá el estudio de las familias de TE de Prunus utilizando una clasificación común y estructurada y contribuirá a la comprensión del potencial de los polimorfismos de TE en la generación de variabilidad intraespecífica ligada a rasgos agrícolas de interés, como la resistencia a la sequía, a las plagas, así como a la calidad o el rendimiento de la fruta.