BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[ca] Les tecnologies òmiques prometen una nova aproximació sistèmica a la biologia. Malgrat que ja coneixem el genoma de moltes espècies, i una aproximació del nombre de proteïnes, no sabem quants metabòlits hi ha en una mostra biológica, o en un organisme. Ni tan sols amb la tècnica més efectiva per a detectar el major nombre de metabòlits tenim alguna estimació, sovint només s'aconsegueixen identificar 20-30 metabolíts després d'un llarg treball manual. Em desenvolupat un algorisme, CliqueMS, que soluciona un dels problemes més grans per a anotar un experiment de metabolòmica, la correcta identificació de senyals múltiples per un mateix metabolit. En altres treballs de la tesi, explorem com combinar diferents dades òmiques en un cas pràctic, l'estudi dels efectes terapèutics de l'hibiscus analitzant la resposta metabòlica i l'expressió génica posterior a la seva ingestió. També abordem un procés complex biológic com la trombosi, per a estudiar el rol de diferents models en la interpretació i la predicció de l'acumulació de plaquetes. Mitjançant aquests models som capaços de predir l'acumulació de plaquetes en una nova mostra, demostrant una possible aplicació clinica en un cas hipotètic cas on estimem un model a partir d'una sèrie de pacients per a aplicar-ho a predir una variable difícil de mesurar (com l'acumulació de plaquetes) en nou pacient. predir una variable difícil de mesurar (com l'acumulació de plaquetes) en nou pacient.

[en] Omics technologies arise a new systemic approach towards biology. We already know the genome of many species, and an approximated number of proteins, but we do not know how many metabolites are present in an organism or in a biological sample. With the most suited technique for metabolite identification, usually only 20-30 metabolites are identified after hard manual work. To solve this problem, we have developed CliqueMS, that tackles one of the main bottlenecks for the annotation of metabolomic experiments, the correct grouping and annotation of the multiple signals produced by a metabolite. In another investigation of the thesis, we explore how to combine several sources of omics data. In a practical application we study the therapeutic effect of hibiscus, by analyzing the response in metabolism and in gene expression, after its ingestion. The last investigation included in this thesis tackles a complex biological process, thrombosis. We study how changes interpretation and prediction of platelet deposition by using different computational models. By this models we demonstrate that platelet deposition can be predicted by measuring platelet concentration, the vessel tissue and some other variables. This models can be used to predict variables that are very difficult to measure, as it is platelet deposition
[ca] Aquesta tesi és un estudi al voltant de la persona de Miquel Mai, politic, jurista, bibliòfil i col•leccionista d'art a la Barcelona de la primera meitat del segle XVI. La tesi presenta a Miquel Mai a partir del seu relat biogràfic, posant especial èmfasi en els principals capítols polítics en els que va participar. Seguidament es desenvolupa un capítol dedicat a la possible definició de Miquel Mai com a erasmista i la influència que aquest corrent espiritual va jugar al llarg de la seva vida. En tercer lloc s'analitza els inventaris de béns i tota la relació d'objectes artístics que va acumular amb el pas del temps. Un quart aspecte gira entorn a l'extensa biblioteca (més de 2000 llibres) que Miquel Mai va formar a la seva residència de la plaça de la Cucurulla de Barcelona. I en cinquè lloc es posa de manifest la relació directe entre els béns artístics que decoraven la biblioteca i les lectures que precisament es trobaven en aquesta biblioteca.

[en] The doctoral thesis was an study about Miquel Mai, a polític, jurist, bibliophile and art collector in Barcelona in the first half of the XVI century. The thesis presents the figure of Miquel Mai by his biographic history, with emphasis in the principals chapters that he was participant. After, there was a chapter whose principal theme its the connection between Miquel Mai and the Erasmism movement. Third, it was an analysis of all the art objects that Miquel Mai accumulates. Fourth, the thesis explores the library (formed by more than 2000 books). And finally, we studied the relationship between the art objects who decorate the library and the same books that was in the library.
[ca] L'impacte de la música pop de l'Àsia Oriental a l'Amèrica Llatina. Estudi de cas de Mayday (Taiwan-Xina) i Super Junior (Corea del Sud) a Argentina L'objectiu d'aquesta recerca és l'anàlisi de la recepció de la música pop d'Àsia Oriental a l'Argentina com un estudi de cas on s'interrelaciona la globalització amb les indústries culturals i les seves conseqüències en les dinàmiques interculturals a causa de la seva influència i impacte en les audiències. El desenvolupament de noves tecnologies en l'era de la comunicació permet que la música popular expandeixi el seu abast i atracció, en particular com a catalitzadora d'usos, costums i valors. La presència de les indústries culturals asiàtiques a Amèrica Llatina és un fet tangible i des de l'any 2000 ha cobrat un clar impuls guiat per la hallyu -cultura popular coreana- i especialment per la música k-pop i c-pop. Els joves a l'Argentina organitzen concursos, festivals i altres relacionats amb aquesta música, sent seguidors de determinats grups. Mitjançant l'anàlisi comparativa de l'evolució i característiques de dos conjunts musicals, Mayday (Taiwan-Xina) i Super Junior (Corea del Sud), s'analitzen els continguts transmesos i els valors confucians associats a ells, així com la seva influència i impacte en l'audiència, i la particular atracció entre els fans i les seves famílies.

[en] The Impact of East Asian Pop Music on Latin America. Case study of Mayday (Taiwan-China) and Super Junior (South Korea) in Argentina The objective of this investigation is to analyze the reception of East Asian pop music in Argentina as a case study that interrelates globalization and cultural industries and the consequences for intercultural dynamics due to their impact and influence on audiences. The development of new technologies in the Era of Communication allows popular music to expand its reach and attraction, as a catalyst for uses, customs and values. The presence of Asian cultural industries in Latin America is a fact and since the year 2000 has clearly gained momentum led by the Hallyu -Korean popular culture- and especially by k-pop and c-pop music. In Argentina, young people organize competitions, festivals and other activities related to this music. They also are fans of certain music groups. A comparative analysis of the evolution and characteristics of two music groups, Mayday (Taiwan-China) and Super Junior (South Korea) examines the contents conveyed and the Confucian values associated with them together with their influence and impact on audiences, including the special attraction they have for fans and their families.
[ca] Aquesta tesi doctoral se centra en l'estudi de l'aplicació de pèptids antimicrobians en la lluita contra agents patògens de cultius de plantes d'interès econòmic.L'estratègia sintètica s'ha portat a terme utilitzant metodologies convencionals de síntesi de pèptids en fase sòlida com l'estratègia tridimensional ortogonal Fmoc/tBut/Allyl. Ha calgut fer la recerca de les condicions òptimes per a l'eliminació del grup Allyl i la ciclació. D'entre els pèptids cíclics de 4-10 aminoacids sintetitzats, el decapèptid c(Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Lys-Leu-Gln) ha resultat ésser el més efectiu i s'ha pres com a base per al disseny d'una quimioteca de 56 pèptids. Dels resultats obtinguts s'ha sintetitzat una segona quimioteca basada en l'estructura general c(X1-X2-X3-X4-Lys-Phe-Lys-Lys-Leu-Gln) determinada com la que posseix el millor perfil d'activitat. Els pèptids més efectius obtinguts constituixen els primers exemples de pèptids cíclics actius contra E. amylovora i poden ser considerats com a bons candidats pel desenvolupament d'agents antimicrobians efectius en protecció vegetal.

[en] This PhD thesis was centred on the study of the application of de novo designed head-to-tail cationic cyclic peptides as inhibitors of the plant pathogenic microorganisms responsible for diseases in plants of great economic importance. The solid-phase synthesis of the cyclopeptides was carried out using a three-dimensional orthogonal Fmoc/tBut/Allyl strategy. The optimisation study of the allyl group removal and of the head-to-tail cyclization of linear peptides on SynPhase Lanterns was required for the syntheses. From the synthesized cyclic peptides of 4 to 10 residues, the cyclodecapeptide c(Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Lys-Leu-Gln) was the most active and has been used as parent peptide in a using a combinatorial chemistry approach. From the results, a second library based on the structure c(X1-X2-X3-X4-Lys-Phe-Lys-Lys-Leu-Gln) has been synthesized. The best cyclodecapeptides are the first examples of cyclic peptides effective against E. amylovora and make them potential candidates for the development of antimicrobial agents for use in plant protection.
[ca] Al 1985, Kroto, Curl i Smalley van sintetitzar per primera vegada la molècula C60, i la van anomenar "Buckminsterful·lerè" degut a la similitud entre la seva estructura i la famosa cúpula geodèsica dissenyada per l'arquitecte Richard Buckminster Fuller. Un tipus de ful·lerens molt interessants són els anomenats (metalo)ful·lerens endohèdrics, que són aquells que contenen àtoms, molècules petites o agregats metàl·lics encapusulats al seu interior. Des del seu descobriment s'ha despertat un enorme interès en aquestes molècules degut a les seves potencials aplicacions en camps molt diferents, com per exemple en (bio)medicina per al seu ús com a agents de contrast en imatge per ressonància magnètica, o en el camp de l'energia fotovoltaica per a la fabricació de noves cèl·lules solars. Per aquesta raó, és imprescindible conèixer i entendre la seva estructura i reactivitat química per tal de garantir el seu ús amb finalitats (bio)mèdiques i per modificar les seves propietats per desenvolupar nous (bio)materials basats en ful·lerens. En aquesta tesi, l'estructura química i la reactivitat dels (metalo)ful·lerens endohèdrics s'estudien en detall utilitzant les eines de la química computacional

[en] It all started in 1985, when Kroto, Smalley and Curl discovered by serendipity a new carbon allotrope. They synthesized for the first time the C60 molecule, and named it as "Buckminsterfullerene", because of the similarity between its structure and the famous geodesic dome designed by the architect Richard Buckminster Fuller. An interesting type of fullerenes are the so-called endohedral (metallo)fullerenes, which are fullerenes containing atoms, small molecules or metallic clusters inside. A huge interest in this new class of molecules has been awakened mainly due to their potential applications in many different fields, for example in (bio)medicine as a magnetic resonance imaging contrast agents, or in photovoltaics as a new and more efficient dye sensitized solar cells. To that end, it is essential to know and understand their chemical structure and reactivity to ensure their use for (bio)medical purposes and to modify their properties to develop new fullerene-based technology devices or biomaterials. In this thesis the chemical structure and reactivity of endohedral (metallo)fullerenes is studied in detail using state-of-the-art computational tools
[ca] A causa dels avenços tecnològics, els robots aviat formaran part de la nostra vida diària i interactuaran amb nosaltres de forma freqüent. Que els robots siguin ben rebuts és important, ja que determina si els usuaris voldran interactuar amb ells o no. Argumentem que la plausibilitat psicològica dels robots és fonamental per a la seva acceptació i que un repte que sorgeix és entendre, mesurar i identi car qué afecta aquesta plausibilitat. Proposem una taxonomia de quatre criteris psicològics que es poden aplicar per tal d'avaluar els components de conducta dels robots i com afecten la seva acceptació: competència social, competència funcional, autonomia i morfologia. Descomposant la plausibilitat en parts discretes, i avaluant-les de forma empírica, podem fer-ne un ús pràctic de les interaccions per al disseny i desenvolupament de robots socials. En aquesta tesi hem identi cat comportaments conductuals que són rellevants per a la taxonomia proposada i que han estat avaluats en una sèrie d'estudis. Mostrem que és possible utilitzar la taxonomia proposada per tal d'avaluar un robot i la interacció amb aquest. Mitjançant una avaluació sistemàtica de les caracterítiques conductuals dels robots, obtenim una sèrie d'idees útils que hem aplicat al nostre robot H5WRobot, i que posteriorment validem en un context de tutoria. Demostrem que el nostre robot és acceptat pels estudiants i fem palès que la taxonomia que proposem pot proporcionar observacions útils per a l'establiment de futures avaluacions per a la interacció entre humans i robots.

[en] Due to technological advancements, robots will soon become part of our daily lives and interact with us on a frequent basis. Robot acceptance is important, as it delineates whether users will potentially interact with them or not. We argue that psychological plausibility is a key determinant of acceptance and the challenge that rises is to understand, measure and identify what a ects plausibility. Here, we propose a taxonomy of four psychological benchmarks that one can apply to evaluate the behavioural components of robots and assess how they a ect acceptance: social competence, task competence, autonomy and morphology. By decomposing plausibility to discrete parts and empirically test them, we can use their interactions in practice for the meaningful design and development of social robots. In this thesis, we have identi ed behavioural components that are relevant to the proposed taxonomy and evaluated them in a series of studies. We show that it is possible to use the proposed taxonomy to evaluate the interaction and the robot. By systematically assessing the behavioural features of the robot, we gain useful insights that we apply to our H5WRobot that we later validate in the domain of tutoring. We show that our robot is accepted by students and stress that our proposed taxonomy might provide useful insights regarding the establishment of future assessments for HRI.
[ca] S'ha estudiat la variabilitat genètica de les poblacions del nord d'Àfrica a partir de l'anàlisi de diverses regions genòmiques per tal d'entendre les poblacions analitzades d'una banda, i comprendre la dinàmica del genoma per l'altra. Els resultats obtinguts ens han permès verificar diferents hipòtesis sobre la història de les poblacions d'aquesta regió com són l'efecte paral·lel i independent de l'onada de difusió del neolític des de l'Orient Mitjà al llarg d'ambdues ribes de la Mediterrànea; i l'efecte de l'arabització. S'ha pogut estimar també la contribució genètica masculina nord africana a la península ibèrica i detectat certa contribució genètica del pobles sub-saharians a les poblacions nordafricanes. Per altra banda, el tipatge de marcadors genètics que evolucionen a velocitats diferents al cromosoma Y ha permès mostrar que el background genètic predomina sobre el background poblacional en l'estructura de la variació genètica dels microsatèl·lits en la regió no recombinant del cromosoma Y humà.

[en] The genetic variability of the North African populations has been studied through the analysis of different genomic regions in order to understand both the analysed populations and the dynamics of the genome. The obtained results allow us to verify different hypotheses about the population history of this region including the parallel and independent effect of the Neolithic wave of advance from the Middle East and along both Mediterranean coasts; and the effect of Arabization phenomena. We also tried to estimate the North African male genetic contribution to the Iberian peninsula and detected Sub-Saharian genetic influences to the North African peoples. Moreover, the typing of genetic markers with different evolutionary rates on the Y chromosome allowed us to demonstrate that variation in microsatellites is deeply structured by genetic background on the non-recombining region of the human Y chromosome.
[ca] Diàriament, milions de persones sense coneixements tècnics publiquen contingut a la web a blogs, wikis, xarxes socials, etc. Tot i que existeixen recomanacions d'accessibilitat, com les pautes WCAG i ATAG de la W3A i que aquestes s'han convertit en normativa (la norma ISO/IEC 40500:2012, la norma UNE 139803:2012 a Espanya, o la Secció 508 als Estats Units) i a més hi ha lleis d'obligat compliment, l'accessibilitat de la web és encara una característica rarament implementada avui en dia. Els usuaris, inconscientment, segueixen publicant continguts que presenten barreres per a les persones amb discapacitat i que afecta als seus drets civils. Aquesta tesi doctoral explora aquest problemàtica i, amb la intenció de solucionar-la, posa el focus en la comunicació de les barreres d'accessibilitat a les persones que publiquen contingut a la web sense coneixement tècnics. La hipòtesis que fonamenta la tesi és que " reduint la complexitat de la informació relacionada amb l'accessibilitat, es propiciaria l'aplicació de criteris d'autoria accessibles, augmentant la qualitat general del contingut web". A partir de tècniques relacionades amb el DCU i l'Enginyeria Semiòtica (IngSem) es fa una proposta de comunicació de les barreres d'accessibilitat, que es demostra en una prova de concepte, el sistema Emphatic Editor for Accessibility (EE4A).

[en] Every day, thousands of users with non-technical knowledge publish web content on blogs, wikis, social networks, etc. Although there are accessibility recommendations, such as WCAG and ATAG W3C guidelines, and that they have become standards (ISO/IEC 40500: 2012, UNE 139803: 2012 in Spain, or Section 508 in United States) and even mandatory laws, web accessibility is still a feature rarely implemented today. Users, unconscious of accessibility requirements, keep on publishing content which presents barriers to people with disabilities, and which impact their civil rights. This PhD explores this issue, aiming at find a solution, and puts the focus on the communication of accessibility barriers to people who publish web content without technical knowledge. The hypothesis underlying the thesis is that "reducing the complexity of the information related with accessibility would help the application of accessible criteria in authoring, and would increase the overall quality of web content". With techniques related with DCU and Semiotics Engineering (IngSem), the PhD thesis makes a proposal of communication of accessibility barriers, demonstrated through a proof of concept, the Emphatic Editor for Accessibility (EE4A).
[ca] El treball descrit en aquesta dissertació es centra en la implementació d'estratègies organocatalítiques per superar les limitacions de processos fotoquímics establerts. Específicament, dues transformacions impulsades per la llum han estat estudiades: (i) la fotoenolizació de 2-alquilbenzofenones per accedir a intermedis enòlics transitoris (fotoenols), i (ii) la ruptura homolítica fotoinduïda de derivats ditiocarbonílics per produir radicals. Per un costat, el procés de fotoenolizació acoblat amb la reactivitat de tipus Diels-Alder (seqüència fotoenolizació/ Diels-Alder) és una reacció fotoquímica històrica amb aplicacions conegudes en síntesi total. Malgrat això, una variant asimètrica d'aquest procés no ha estat encara reportada. Els Capítols II i III demostren com l'organocatàlisi asimètrica proporciona eines simples i efectives per fer participar a les espècies fotoenòliques en processos de tipus Diels-Alder i aldòlics altament estereoselectius. Per un altre costat, la ruptura fotolítica de espècies ditiocarboníliques capaces d'absorbir la llum visible, és un mètode conegut per la generació de radicals sota condicions suaus de reacció. Aquesta tecnologia fa ús de quantitats estequiomètriques de compostos ditiocarbonílics fàcilment accessibles. Encara que aquesta estratègia ha millorat considerablement les condicions per accedir a la reactivitat de tipus radicalària, aquesta requereix la síntesi prèvia de compostos que continguin la funcionalitat ditiocarbonílica. El Capítol IV detalla com aquest mètode de generació de radicals pot ser realitzat catalíticament, mitjançant el disseny d'un catalitzador

[en] The work described in this dissertation focuses on the implementation of organocatalytic strategies to overcome limitations of established photochemical processes. Specifically, two known light-driven transformations have been studied: (i) the photoenolization of 2-alkyl-benzophenones to access transient enol-intermediates (photoenols), and (ii) the photoinduced homolytic cleavage of stoichiometric dithiocarbonyl derivatives to produce radicals. On the one hand, the photoenolization process coupled with classical Diels-Alder chemistry (photoenolization/Diels- Alder sequence) is an historical photochemical reaction with known applications in total synthesis. However, an asymmetric catalytic variant of this light-driven transformation has remained elusive over the years. Chapter II and Chapter III demonstrate how asymmetric organocatalysis provides simple but effective catalytic tools to engage photoenols in highly stereoselective Diels-Alder and Aldol-type processes, respectively. On the other hand, the photolytic cleavage of visible-light-absorbing dithiocarbonyl-based compounds is a known effective method for the mild generation of radicals. This technology uses stoichiometric amounts of easy-to make dithiocarbonyl-based substrates, capable of triggering the formation of open-shell intermediates upon direct light-excitation. Although this strategy has greatly enhanced the conditions to access radical-type reactivity, it still relies on purposely designed stoichiometric reagents.