[en] Ovarian cancer is one of the most lethal gynecological malignancies worldwide due to the lack of early diagnostic methods. In this regard, HMGB family members, HMGB1 and HMGB2, as well as long non-coding RNAs (lncRNAs), participate in the malignant transformation by regulating gene expression and, therefore, their study represents an opportunity to progress towards a better understanding of the disease and the development of novel clinical strategies. The main objective of this work was to identify lncRNAs in epithelial ovarian cancer that are deregulated and/or associated with HMGB1 and/or HMGB2 because of their potential value as novel diagnostic biomarkers and therapeutic targets. The determination of new RNA interactions of these proteins would allow a better understanding of their mechanism of action and their role in ovarian cancer pathology. We performed a meta-analysis on transcriptomic profiling expression data from epithelial ovarian cancer patients that are publicly available. By this approach, we identified several lncRNAs previously unrelated to epithelial ovarian cancer, with diagnostic and prognostic values, and associated with metastasis, chemoresistance, or histological subtype. Then, the RNA interactome of HMGB1 and HMGB2 was determined by applying in silico binding predictions, as well as two immunoprecipitation-based techniques, RIP-Seq and eCLIP in a high-grade serous epithelial ovarian cancer cell line, PEO1. The identified lncRNAs and messenger RNAs (mRNAs) are related to previous information present in scientific literature and gene ontologies regarding biological processes, respectively. Finally, HMGB1 and HMGB2 silencing was carried out using an siRNA-based approach and their effects on PEO1 transcriptome were analyzed. Their role in signaling pathways and biological processes in addition to the HMGB-regulated lncRNAs were assessed.

[es] El cáncer de ovario es uno de los cánceres ginecológicos más letales en todo el mundo debido a la falta de métodos de diagnóstico precoz. En este sentido, los miembros de la familia High Mobility Group Box (HMGB), HMGB1 y HMGB2, así como los ARNs largos no codificantes (lncRNAs), participan en el proceso de malignización regulando la expresión génica y, por tanto, su estudio representa una oportunidad para avanzar hacia una mejor comprensión de la enfermedad y el desarrollo de nuevas estrategias clínicas. El objetivo principal de este trabajo consistió en identificar lncRNAs en cáncer de ovario epitelial que estén desregulados y/o asociados a HMGB1 y/o HMGB2, debido a su potencial valor como nuevos biomarcadores diagnósticos y dianas terapéuticas. La determinación de nuevas interacciones de estas proteínas con ARNs permitirá una mejor comprensión de su mecanismo de acción y su papel en la patología del cáncer de ovario. Realizamos un metaanálisis de datos disponibles públicamente de transcriptomas de pacientes con cáncer de ovario epitelial. Mediante esta aproximación, identificamos varios lncRNAs que no estaban previamente relacionados con el cáncer de ovario epitelial, y que tienen valor diagnóstico y pronóstico, o están asociados a metástasis, resistencia a quimioterapia o subtipo histológico. A continuación, se determinó el interactoma de ARN para HMGB1 y HMGB2 aplicando predicciones de unión in silico, así como dos técnicas basadas en inmunoprecipitación, RIP-Seq y eCLIP en la línea celular de cáncer de ovario epitelial seroso de alto grado, PEO1. Los lncRNAs y ARN mensajeros (ARNm) identificados se relacionaron con información previa presente en la bibliografía científica y ontologías génicas relativas a procesos biológicos, respectivamente. Por último, se llevó a cabo el silenciamiento de HMGB1 y HMGB2 utilizando una aproximación basada en siRNA y se estudiaron sus efectos en el transcriptoma de PEO1. Se evaluó su papel en vías de señalización y procesos biológicos, así como los lncRNAs regulados por HMGBs