BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] The ongoing decline of pastoral and silvopastoral systems in the Mediterranean contrasts with their crucial role in biodiversity conservation and ecosystem services (ES) delivery. This thesis aims to address the sustainability of these social-ecological systems to foster ES provision and resilience by adopting a multi-stakeholder and multi-methodological perspective. Specifically, it relies upon four scientific articles and three case studies in the north-eastern of Spain, to assess: i) the livelihood resilience of pastoral households applying the latent class analysis, ii) the contribution of silvopastoral management practices to the provision of ES through a Delphi survey, iii) consumers' preferences for meat from these systems associated with the provision of wildfire prevention services using a discrete choice experiment and, iv) the shared understanding of stakeholders on the factors, drivers, and dynamics shaping silvopastoralism by means of fuzzy cognitive mapping. The findings draw several policy recommendations to improve the sustainability of these systems and their coupled ES.

[es] El continuo declive de los sistemas pastorales y silvopastorales del Mediterráneo contrasta con su papel crucial en la conservación de la biodiversidad y la prestación de servicios ecosistémicos (SE). Esta tesis tiene como objetivo abordar la sostenibilidad de estos sistemas socio ecológicos para fomentar la provisión de SE y la resiliencia mediante la adopción de una perspectiva de multi actor y multi metodológica. Los cuatro artículos científicos que la componen se basan en tres estudios de caso al noreste de España para evaluar: i) la resiliencia de los medios de vida de los hogares pastorales aplicando el análisis de clases latentes, ii) la contribución de las prácticas de gestión silvopastoral a la provisión de SE a través de una encuesta Delphi, iii) las preferencias de los consumidores por carne de estos sistemas asociada a la provisión de servicios de prevención de incendios forestales, utilizando un experimento de elección discreta y, iv) el conocimiento compartido de los actores sobre los factores, impulsores y dinámicas que influyen en el silvopastoralismo mediante mapas cognitivos difusos. Los resultados permiten extraer una serie de recomendaciones políticas para mejorar la sostenibilidad de estos sistemas y los SE que proporcionan.
[en] Neanderthal subsistence strategy has always been a challenging topic in the field of Paleolithic studies. In the last years, the North-east of Italy became more and more relevant in the debate, as the number of investigated deposits grew, and the quality of methodologies improved. De Nadale Caves is a key site to enlarge our knowledge about mobility patterns and subsistence strategies: thanks to the number and to the good preservation of the osteological material, an intensive zooarchaeological analysis was possible. To broaden the zooarchaeological studies, dental wear analysis and cementochronology were applied to samples from two sites nearby – San Bernardino Cave, on the Berici Hills and Fumane Cave, on the Lessini Mounts – in addition to material yielded by De Nadale Cave. We combined the two methodologies with the aim to overcome any possible lack of information, due to the use of a single method. This study is addressed to produce data supporting the interpretation of the origin of the two archaeofaunal assemblages as a result of seasonal hunting events that took place mainly in winter. In this specific geographic and environmental context, our data gain a better understanding of Neanderthal subsistence strategies and occupational patterns.

[es] Las estrategias de subsistencia de los neandertales siempre han sido un tema desafiante en el campo de los estudios paleolíticos. En los últimos años, el noreste de Italia se volvió cada vez más relevante en el debate, a medida que crecía el número de yacimientos investigados y mejoraba la calidad de las metodologías. En este escenario, De Nadale Cave es un sitio clave para ampliar nuestro conocimiento sobre patrones de movilidad y estrategias de subsistencia: gracias al número y a la buena conservación del material osteológico, fue posible un análisis zooarqueológico exhaustivo. Para ampliar los estudios zooarqueológicos, se aplicaron el análisis de desgaste dental y la cementocronología dental a muestras de dos yacimientos cercanos: San Bernardino Cave, en las colinas de Berici y Fumane Cave, en los montes Lessini, además del material de De Nadale Cave. Combinamos las dos metodologías con el objetivo de superar cualquier posible falta de información, debido al uso de un solo método. Este estudio está dirigido a producir datos que apoyen la interpretación del origen de los dos conjuntos arqueofaunísticos como resultado de eventos de caza estacional que tuvieron lugar principalmente en invierno. En este contexto geográfico y ambiental específico, nuestros datos obtienen una mejor comprensión de las estrategias de subsistencia y los patrones ocupacionales de los neandertales.
[en] In this thesis a complete and complex computational study of the reactions catalyzed by two enzymes has been carried out. The first catalytic mechanism studied corresponds to the enzyme β-Glycosidase (GH1 family) Thermus thermophillus, of which the stages of glycosidation, hydrolysis and transglycosidation have been analyzed. Subsequently, the monosaccharide transfer process catalyzed by the OleD glycosyltransferase (GT1 family) of the Streptomyces antibioticus microorganism has been analyzed. For this, it has previously been necessary to model a catalytically active conformation of the enzyme. The calculations carried out in this thesis have been based on molecular dynamics simulations, normal mode analysis and QM / MM methods. In the last chapter, the development of a new methodological protocol for obtaining Gibbs energy barriers of the stages of the catalytic mechanism is presented, a protocol that takes into account the fluctuations of the Michaelis protein-substrate complex corresponding to the so-called instantaneous disorder, presented by complex systems.

[es] En esta tesis se ha realizado un completo y complejo estudio compu-tacional de las reacciones catalizadas por dos enzimas. El primer mecanismo catalítico estudiado corresponde a la enzima β-Glicosidasa (familia GH1) Thermus thermophillus, del que se han analizado las etapas de glicosidación, hidrólisis y transglicosidación. Posteriormente, se ha analizado el proceso de transferencia de monosacárido catalizado por la glicosiltransferasa OleD (familia GT1) del microorganismo Streptomyces antibioticus.. Para ello, antes ha sido necesario modelizar una conformación catalíticamente activa de la enzima. Los cálculos realizados en esta tesis se han basado en simulaciones de dinámica molecular, análisis de modos normales y en métodos QM/MM. En el último capítulo, se presenta el desarrollo de un nuevo protocolo metodológico para la obtención de barreras de energía de Gibbs de las etapas del mecanismo catalítico, un protocolo que tiene en cuenta las fluctuaciones del complejo de Michaelis proteína-sustrato correspondientes al denominado desorden instantáneo que presentan los sistemas complejos.
[en] In this PhD thesis, the selection of Acetic acid bacteria (AAB) was carried out to perform a selective fermentation of D-glucose into D-gluconic acid, without consuming fructose. Three AAB strains were selected, two of them belonging to the Gluconobacter genus and another to Acetobacter, being the Gluconobacter strains better prepared for this oxidation. The activities of the membrane-bound dehydrogenases involved in the complete oxidation of D-glucose were measured. Furthermore, the genes encoding for these enzymes were sequenced and used to construct phylogenetic trees, obtaining as a result that Acetobacter and Gluconobacter genera grouped into different clusters. The nutritional requirements, mainly focused on nitrogen, for AAB were also studied. The growth of these bacteria was better in media with a complete combination of amino acids and ammonium. The selected strains were sequenced to improve the monitoring protocols for these bacteria in the process.

[es] En esta tesis doctoral, se realizó la selección de bacterias acéticas (BA) para llevar a cabo una fermentación selectiva de D-glucosa en ácido D-glucónico, sin consumo de fructosa. Se seleccionaron tres cepas de BA, dos de ellas pertenecientes al género Gluconobacter y otra del género Acetobacter, siendo las cepas de Gluconobacter las mejor preparadas para esta oxidación. Se midió la actividad de las deshidrogenasas de membrana que participan en la oxidación completa de la D-glucosa. Además, se secuenciaron los genes que codifican para estas enzimas y se utilizaron para construir árboles filogenéticos, obteniendo como resultado que los géneros Acetobacter y Gluconobacter quedan separados en diferentes grupos. También se estudiaron los requerimientos nutricionales de las BA, centrándose principalmente en la utilización de nitrógeno. El crecimiento de estas bacterias fue mejor en los medios con una combinación completa de aminoácidos y de amonio. Las cepas seleccionadas se secuenciaron para mejorar los protocolos de seguimiento de estas bacterias durante el proceso
[en] The thesis tested the validity and metric robustness of a specific global reputation indicator, the so-called Reptrak TM Pulse. Pulse has been shown to measure the global reputation of a business or organization regardless of gender, age or social class. Pulse has the fundamental characteristics as a global indicator (KPI), for reputation management. Pulse measures global reputation among different stakeholders, in different countries and sectors of activity.

[es] La tesis comprobó la validez y robustez métricas de un indicador global de reputación concreto, el denominado Reptrak TM Pulse. Se ha demostrado que Pulse mide la reputación global de una empresa u organización con independencia del sexo, edad o clase social. Pulse posee las características fundamentales como indicador global (KPI), para la gestión de la reputación. Pulse mide la reputación global entre diferentes stakeholders, en diferentes países y sectores de actividad.
[en] In this thesis we study cell behaviours such as cellular decision making and self-organization using the developing mouse embryo as the system of study. To be able to extract the most needed cellular dynamics from experimental data, we developed a package for the segmentation, tracking, annotation and manual correction of errors in 3d multichannel live- imaged biological samples. Then, we apply these single cell analysis together with mathematical modeling and statistical methods to four distinc problems in the context of the mouse early embryonic development. First we study the differentiatioin of ICM progenitors into epiblast and primitive endoderm. Then, focus on the generation of pulsatil dynamics in the ERK signaling pathway. In the next two chapters we focus on post-implantation development. In one of them, we characterise cell competition in the context of gastrulation. Finally, we study the differentiation of the visceral endoderm into anterior visceral endoderm. In this Thesis, We show that the spatio-temporal analysis of cellular dynamics is a key approach in the study of develping systems

[es] En esta tesis estudiamos comportamientos celulares como la toma de decisiones y la autoorganización celular utilizando el embrión de ratón como sistema de estudio. Para poder extraer la dinámica celular de los datos experimentales, desarrollamos un paquete para la segmentación, seguimiento, anotación y corrección manual de errores en imágenes biológicas 3d multicanal. A continuación, aplicamos estos métodos junto con métodos de modelización matemática y análisis estadística a cuatro problemas distintos en el contexto del desarrollo embrionario temprano del ratón. En primer lugar, estudiamos la diferenciación de blastomeros a epiblasto y endodermo primitivo. A continuación, nos centramos en la generación de la dinámica pulsatil en la vía de señalización ERK. En los dos capítulos siguientes nos centramos en el desarrollo post-implantación. En uno de ellos, caracterizamos la competencia celular en el contexto de la gastrulación. Por último, estudiamos la diferenciación del endodermo visceral en endodermo visceral anterior. En esta Tesis, demostramos que el análisis espaciotemporal de la dinámica celular es un enfoque clave en el estudio de los sistemas en desarrollo
[en] The main objective of this thesis is to gain a better understanding of the dynamics of mixed-conifer forests constituting the montane-subalpine ecotone of the Pyrenees. For this, we identified the main environmental factors that drive the dynamics of these communities to then assess how changes in these factors may affect their future structure and composition. This work was done using a multiscale approach that allowed detecting the key factors determining the dynamics of these systems across different biological scales. We have found land-use changes, climate, light availability, physiography and competitive and facilitative plant-plant interactions to be important actors in the fate of these forests. Finally, we used an individual-based, spatially-explicit model of forest dynamics (SORTIE-ND) in order to simulate the future dynamics of the studied forests. The results of the simulations support the predictions of future biome changes in the Pyrenean subalpine forests, since A. alba and P. sylvestris may find appropriate conditions for colonizing mountain pine dominated stands due to land-use change-related forest densification and climate warming, respectively.

[es] El objetivo último de esta tesis es comprender mejor la dinámica de los bosques mixtos de coníferas del ecotono entre los pisos montano y subalpino del Pirineo. Se pretende, en primer lugar, identificar los principales factores ambientales que controlan la dinámica de estas comunidades para, posteriormente, evaluar cómo afectará a su composición y estructura futuras los cambios en dichos factores. Para todo ello, se ha utilizado una aproximación a diferentes escalas espaciales. Se pudo detectar que tanto los cambios de uso del suelo como el clima, la disponibilidad de luz, la fisiografía y las interacciones planta-planta (competitivas o de facilitación) resultaron ser actores importantes para el futuro de estos bosques. Finalmente, se utilizó un modelo de dinámica forestal espacialmente explícito (SORTIE-ND) con el fin de simular la evolución de los bosques objeto de estudio de esta tesis. Los resultados de las simulaciones predicen un futuro cambio en la composición de estos bosques, ya que tanto A. alba como P. sylvestris podrían encontrar condiciones adecuadas para colonizar áreas actualmente ocupadas por P. uncinata, debido a la densificación del bosque o a un mayor crecimiento relacionado con un aumento de las temperaturas, respectivamente.
[en] This dissertation investigates the responses of European cities to irregular migrants. The first chapter uses a localist approach to understand variations in local policies and practices. A typology of urban solidarity is developed, revealing a spectrum of transformative practices and diverse contentions. The second chapter employs a relational approach, exploring factors influencing the adoption of inclusive policies for irregular migrants. Fuzzy-set Qualitative Comparative Analysis (fsQCA) is used to analyze 13 European cities, identifying necessary and sufficient conditions for municipal activism. Local alliances between the local government and local civil society organizations and political discrepancy between the local and national governments emerge as essential factors. The third chapter delves into a single case study, employing ethnographic research methods to understand the experiences of irregular migrants as targets of local policies and practices. Critical insights illuminate the (in)visibility paradox, involving institutional (in)visibility, (in)visibility as marginalization and (in)visibility as strategy based on intersectional identities of irregular migrants.

[es] Esta tesis investiga las respuestas de las ciudades europeas a la inmigración irregular. El primer capítulo se centra en comprender las variaciones a nivel de políticas y prácticas locales usando un enfoque localista. Se desarrolla una tipología de solidaridad urbana que revela un amplio espectro de prácticas transformadoras y contenciones diversas. El segundo capítulo emplea un enfoque relacional y explora los factores que influyen en la adopción de políticas inclusivas para los inmigrantes irregulares. Mediante el Análisis Cualitativo Comparativo de Conjuntos Difusos (fsQCA) se analizan 13 ciudades europeas identificando las condiciones necesarias y suficientes para el activismo municipal. Los factores esenciales identificados incluyen las alianzas locales entre el gobierno local y las organizaciones locales de la sociedad civil, así como la discrepancia política entre el gobierno local y el nacional. El tercer capítulo profundiza en un único caso de estudio empleando métodos de investigación etnográfica para comprender las experiencias de los inmigrantes irregulares como objetivos de las políticas y prácticas locales. Las reflexiones críticas derivadas de este estudio arrojan luz sobre la paradoja de la (in)visibilidad que involucra la (in)visibilidad institucional, la (in)visibilidad como marginación y la (in)visibilidad como estrategia basada en las identidades interseccionales de los migrantes irregulares.
[en] Lipoxygenases (LOXs) and Cyclooxygenases (COXs) are two families of enzymes which initiate the biosynthesis of lipid signalling compounds that are crucial for human health and are implicated in a number of diseases. Furthermore, their catalysis is highly regio- and stereospecific. In the present Thesis, the reaction mechanism of 15-LOX-1 and 5-LOX, the allosteric properties of 15-LOX-1 and the mode of inhibition of COX-2 by COXIBs have been investigated to gain molecular insights into them, with the final aim of designing new anti-inflammatory drugs which are selective for these enzymes.

[es] Las Lipoxigenasas (LOXs) y Ciclooxigenasas (COXs) son dos familias de enzimas que inician la biosíntesis de compuestos lipídicos de señalización que son cruciales para la salud humana y están implicados en un gran número de enfermedades. Además, su catálisis es muy regio- y estereoespecífica. En la presente Tesis, se han investigado el mecanismo de reacción de 15-LOX-1 y 5-LOX, las propiedades alostéricas de 15-LOX-1 y el modo de inhibición de COX-2 por COXIBs, para adquirir conocimiento a nivel molecular de ellos y poder diseñar nuevos fármacos antiinflamatorios selectivos para estas enzimas.
[en] Although modern and contemporary history has not been favorable to the medieval choir stall, in Catalonia and Mallorca a number of sets and fragments of the 14th-century are preserved in situ or dispersed, which today make up one of the oldest groups in the Iberian Peninsula. This work is a study of them, focusing on the technical, constructive and morphological questions of this characteristic liturgical-purpose furniture. Field research with the analysis of the material remains and the necessary revision of the written sources allow us to define, for the first time in historiography, the correspondence of the nomenclature of texts with the anatomical parts of the various choir stalls typologies and their constituent parts. On the other hand, the subsequent comparative study thanks to the most complete catalog of Catalan medieval choir stalls to date, makes it easier to establish links between them and also with other contemporary ensembles.

[es] A pesar de que la historia moderna y contemporánea no ha sido favorable a la sillería coral, en Catalunya y en Mallorca se conserva, in situ o dispersos, una serie de conjuntos y fragmentos del siglo XIV que hoy conforman uno grupo morfológicamente coherentes y uno de los más antiguos de la península. El presente trabajo es un estudio de los mismos, incidiendo en las cuestiones técnicas, constructivas y morfológicas de este mueble tan característico al servicio de la liturgia. La investigación de campo como el análisis de los restos materiales y la oportuna y necesaria revisión de las correspondientes fuentes, permiten definir, por primera vez en la historiografía, la correspondencia de la nomenclatura de los textos con les partes anatómicas de les diferentes tipologías de silla coral aquí propuestas por primera vez y de sus partes constitutivas. Por otro lado, el posterior estudio comparativo gracias al catálogo de sillerías medievales catalanes más completo hasta la fecha, facilita establecer vinculaciones entre ellas, así como con otros conjuntos contemporáneos.
[en] In this thesis we study different algebraic structures, lattices and monoids, in the set of discrete fuzzy numbers. In particular, we analyze in depth the bounded distributive lattice of discrete fuzzy numbers whose support is a subset of consecutive natural numbers included in the finite chain L ={0,1, ..., n}. On this lattice, different methods are also provided to build aggregation functions (t-norms, t-conorms, uninorms, nullnorms, …) from analogous aggregation functions defined on L. Moreover, this work also focuses on the study and construction of implication functions on this lattice. In particular, the four most classical types are studied. In the last part of this work, we propose two possible applications of the developed theory. Firstly, we investigate different aggregation information processes based on the extension of discrete aggregation functions. Finally, we propose different extensions of the classical concept of multiset. From these extensions, we study several properties and lattice structures.

[es] En esta tesis se estudian diferentes estructuras algebraicas, retículos y monoides, en el conjunto de números borrosos discretos. En particular, se analiza el retículo distributivo acotado de números borrosos discretos que tienen por soporte un subconjunto de números naturales consecutivos incluido en la cadena finita L={0,1,…,n}. Sobre este retículo, se proporcionan diferentes métodos para construir funciones de agregación (t-normas, t-conormas, uninormas, nulnormas, ...) a partir de funciones de agregación análogas definidas sobre L. Además, se estudian y construyen funciones de implicación sobre dicho retículo borroso. En particular, se analizan las cuatro clases más usuales de estas funciones. En la última parte de esta memoria se proponen dos posibles aplicaciones de la teoría desarrollada. En la primera, se investigan diferentes procesos de agregación de la información basados en la extensión de funciones de agregación discretas. Finalmente, se proponen diferentes extensiones del concepto clásico de multiconjunto, estudiando diferentes propiedades y estructuras reticulares.