BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] The reactivation of the inactive X chromosome has the potential to provide a unique system to study the developmentally induced formation of euchromatin. However, insights into this process were hampered by the lack of adequate systems, which would allow the dissection of the process using high-throughput sequencing techniques. Here I describe the development of a novel induced pluripotent stem cell reprogramming system that allows the isolation of cells poised for X-reactivation, subsequently achieving near-deterministic efficiency of X-reactivation. Utilizing this novel system, we were able to reveal that the reactivation of silenced genes occurs rapidly and can be divided into distinct initiation and completion phases. Similarly, we could show that chromatin opening of the inactive X proceeds in a two-step fashion, initiating in close proximity to previously open regions, and possibly being initiated by pluripotency factors. Finally, we could show that mega-domains and TADs correspond to two different levels of three-dimensional genome organization superimposed on the Xi, independent of gene expression. We conclude that gene expression and chromatin accessibility during X-reactivation share similar kinetics, while genome organization might follow distinct principles.

[es] La reactivación del cromosoma X inactivo tiene el potencial de proporcionar un sistema único para estudiar la formación de eucromatina inducida por el desarrollo. Sin embargo, la comprensión de este proceso se vio obstaculizada por la falta de sistemas adecuados, lo que permitiría la disección del proceso utilizando técnicas de secuenciación de alto rendimiento. Aquí describo el desarrollo de un nuevo sistema de reprogramación de células madre pluripotentes inducidas que permite el aislamiento de células preparadas para la reactivación de X, logrando posteriormente la eficiencia casi determinista de la reactivación de X. Utilizando este novedoso sistema, pudimos revelar que la reactivación de genes silenciados ocurre rápidamente y puede dividirse en distintas fases de iniciación y finalización. Del mismo modo, podríamos mostrar que la apertura de cromatina de la X inactiva se realiza en dos pasos, iniciando en las proximidades de regiones previamente abiertas, y posiblemente iniciada por factores de pluripotencia. Finalmente, podríamos mostrar que los mega-domains y los TADs corresponden a dos niveles diferentes de organización del genoma tridimensional superpuestos en el Xi, independientemente de la expresión génica. Llegamos a la conclusión de que la expresión génica y la accesibilidad a la cromatina durante la reactivación X comparten una cinética similar, mientras que la organización del genoma podría seguir principios distintos.
[en] Langston Hughes is considered to be one of the most influential writers of the Harlem Renaissance movement. He was truly the forerunner of the Jazz Poetry style, and he was a passionate advocate for African American art and heritage. However, most of his work has not been translated to Spanish. The aim of this paper is to translate eight of his poems, four of which have already been translated, and to comment on the versions of other authors in order to compare different options. To achieve this aim, I have gathered information on the author, the style and the time, I have produced the first translation draft, I have commented on translations from other authors, and I have put together my final translations of the poems, taking into account the stylistic and cultural aspects of Hughes' work. As a result, I have managed to analyse the possible difficulties and peculiarities of translating Hughes to Spanish on a deeper lever, and I have created a quality and faithful translation, which has opened doors to more translations of this author's work in the future.

[es] Langston Hughes está considerado como uno de los escritores más influyentes del movimiento artístico conocido como el Renacimiento de Harlem. Fue un verdadero precursor del estilo Jazz Poetry, y un apasionado defensor del arte y patrimonio cultural afroamericano. Sin embargo, gran parte de su obra no ha sido traducida al castellano. El objetivo de este trabajo es realizar una traducción de ocho de sus poemas, de los cuales cuatro ya han sido traducidos, y comentar las versiones de los demás autores para poder contrastar opciones. Para ello, se ha llevado a cabo una documentación previa sobre el autor, el estilo y la época, se ha realizado una primera traducción de los poemas, se han comentado las traducciones de otros autores, y se ha compuesto una versión definitiva de las propuestas teniendo en cuenta los aspectos estilísticos y culturales de los poemas originales. Como resultado, se ha conseguido profundizar en las posibles dificultades y peculiaridades de la traducción de Hughes al español, y se ha realizado una traducción fiel y de calidad que ha abierto las puertas a que se realicen más traducciones de este autor en el futuro.
[en] Candida pathogenic yeasts represent a global healthcare problem. They comprise phylogenetically diverse species, including newly emerged pathogens. How human-Candida interactions vary across species, and what processes underlie the emergence of novel pathogens are poorly understood. Current thesis addresses these issues using comparative transcriptomics and bioinformatics. We established the global patterns of host-pathogen interactions between human host and the main Candida species, providing novel mechanistic insights into their interplay. We also explored lncRNAs of these pathogens, assessing their implications in infection. Further, we designed and validated a pan-Candida RNA enrichment approach, opening new possibilities for studying host-pathogen interactions in vivo. Then, we assessed the impact of hybridization on transcriptomes of hybrid yeasts, exploring the links between hybridization and virulence emergence. We also developed a new bioinformatics tool facilitating the research in the field. Altogether, results of this thesis expand our knowledge on relevant aspects of human-Candida interactions and yeast evolution.

[es] Las levaduras patógenas Candida representan un problema de salud global. Este grupo de levaduras, comprenden especies filogenéticamente diversas, e incluye patógenos emergidos recientemente. La forma en que las interacciones entre humanos y Candida varían de una especie a otra y qué procesos subyacen a la aparición de nuevos patógenos son poco conocidos. La tesis actual aborda estos problemas utilizando una aproximación de transcriptómica comparativa y bioinformática. Establecimos los patrones globales de las interacciones huésped-patógeno entre el huésped humano y las principales especies de Candida, proporcionando nuevas ideas mecanicistas sobre su interacción. También exploramos los lncRNA de estos patógenos, evaluando sus implicaciones en la infección. Además, diseñamos y validamos un enfoque de enriquecimiento de ARN pan-Candida, abriendo nuevas posibilidades para estudiar las interacciones huésped-patógeno in vivo. Luego, evaluamos el impacto de la hibridación en los transcriptomas de levaduras híbridas, explorando los vínculos entre la hibridación y la aparición de virulencia. En su conjunto, los resultados de esta tesis amplían nuestro conocimiento sobre aspectos relevantes de las interacciones humano-Candida y la evolución de las levaduras.
[en] Most well-established languages follow a common and referential model to ensure consistency in language use, especially in writing. However, interference from different variants, whether territorial or based on register, can sometimes hinder the establishment and diffusion of a unified language model. This paper aims to investigate whether the texts from the town councils of Menorca adhere to the standard Catalan model and to examine the influence of both geographical and functional variety on language use. To achieve this, a selection of texts from various genres from each town hall on the island was analyzed. The analysis identified three types of usage: those that adhere to the standard model, dialectal forms accepted within the standard, and non-standard forms. Across the twenty texts examined, it was generally observed that the standard model is respected. Nevertheless, variation exists within the texts, and, while the dialectal forms accepted by the standard model are normal in them, a significant presence of non-standard forms may indicate attitudes or ideologies opposing the standard Catalan language, such as gonellisme.

[es] La mayoría de lenguas consolidadas disponen de un modelo de lengua común y de referencia para garantizar una uniformidad en los usos, especialmente en la lengua escrita. Aun así, a veces hay interferencias de las diferentes variantes, ya sean territoriales o de registro, que pueden impedir el establecimiento y la difusión de un modelo unitario. El objetivo de este trabajo es comprobar si los textos de los ayuntamientos de Menorca siguen la propuesta estándar para el catalán, y ver qué influencia tienen tanto la variedad geográfica como la funcional en la variación de los usos. Para ello se han seleccionado una serie de textos de cada ayuntamiento, de diferentes géneros textuales, y se han detectado tres tipos de usos: los que respetan el modelo estándar, los que presentan formas propias del dialecto, pero aceptadas dentro del estándar, y, por último, los que se alejan de la propuesta de estándar. A través de los veinte textos analizados, se ha podido observar que en general se respeta el modelo de lengua estándar; aun así, existe variación en los textos, y, si esta se traduce en una alta presencia de formas no estándar, se puede relacionar con actitudes o ideologías contrarias a la lengua estándar catalana, como el gonellisme.
[en] Fully homomorphic encryption (FHE) is an encryption technique that allows computation to be performed on encrypted data without the need to decrypt it first. This has the potential to revolutionize data security and privacy, and ongoing research is focused on improving its efficiency and practicability. One limitation of FHE schemes is that, typically, they only support additions and multiplications. More complex operations, such as real number comparison, require careful design of new algorithms. In this project, we explore a recent approach based on polynomial composition for comparing two real numbers in a homomorphically encrypted setting. We study how this method can be used to sort an array of real numbers using FHE. We then apply these concepts to design and implement a fully homomorphic version of the popular Machine Learning algorithm known as k-nearest neighbours (KNN). To implement the FHE KNN algorithm, we use the CKKS scheme and the OpenFHE library, an open-source software library developed in C++. Finally, we analyse the computational performance of our implementation to evaluate its efficiency, depending on the dataset size and the number of neighbours. Our results indicate that the time complexity increases exponentially with the dataset size. Reasonable computation times are achievable for small datasets, with up to 16 training samples.

[es] El cifrado totalmente homomórfico (FHE) es una técnica de encriptación que permite realizar cálculos sobre datos encriptados sin necesidad de desencriptarlos previamente. Esto tiene el potencial de revolucionar la seguridad y privacidad de los datos, y la investigación en curso se centra en mejorar su eficiencia y practicabilidad. Una limitación de los esquemas basados en FHE es que, generalmente, solo permiten sumas y multiplicaciones. Operaciones más complejas, como la comparación de dos números reales, requieren un diseño meticuloso de nuevos algoritmos. En este proyecto, exploramos una propuesta reciente basada en la composición de polinomios para comparar dos números reales en un entorno de cifrado homomórfico. Estudiamos como este método puede ser usado para ordenar un conjunto de números reales usando FHE. A continuación, aplicamos estos conceptos para diseñar e implementar una versión totalmente homomórfica del popular algoritmo de aprendizaje automático conocido como knearest neighbours (KNN). Para implementar el algoritmo de KNN con FHE, utilizamos el esquema CKKS y la librería OpenFHE, una librería de software de código abierto desarrollada en C++. Finalmente, analizamos el rendimiento computacional de nuestra implementación para evaluar su eficiencia, en función del tamaño del conjunto de datos y del número de vecinos. Nuestros resultados indican que la complejidad temporal aumenta exponencialmente con el tamaño del conjunto de datos. Obtenemos tiempos de cálculo razonables para conjuntos de datos pequeños, con hasta 16 muestras de entrenamiento.
[en] Analysis of port innovations to reduce emissions while reducing costs while becoming a world reference. The project analyzes the innovations and environmental improvements that the port of Barcelona wants to carry out. In it, two key projects are analyzed so that the port becomes a world benchmark in sustainable energy, at the same time that it implements new technologies to reduce its production costs. With Allread, a software creation company and the Nexigen project of the port itself for the electrification of the docks. They will be analyzed to raise awareness of the importance of technology from now on and how this, together with the reduction of gasses, can turn all of Barcelona into a powerhouse.

[es] Análisis de las innovaciones del puerto para reducir sus emisiones a la vez que reducir costes mientras se convierte en una referencia mundial. El proyecto analiza las innovaciones y las mejoras medioambientales que quiere realizar el puerto de Barcelona. En el mismo se analizan dos proyectos clave para que el puerto se convierta en un referente mundial en energía sostenible, a la misma vez que implanta nuevas tecnologías para conseguir reducir sus costes de producción. Con Allread, empresa de creación de software y el proyecto Nexigen del propio puerto para la electrificación de los muelles. Se analizarán para concienciar de la importancia de la tecnología de ahora en adelante y de como esta junto a la reducción de gases pueden convertir toda barcelona en una potencia.
[en] In a game of history counter opposition, death and food come together in the Día de Muertos [Day of the Dead] ritual and in five works of contemporary artists. The goal set for this research is to explore this intrinsic relationship. In the ritualistic portion of this research, we explore two separate practices: the offerings on the altar for the dead's consumption and the exchange of sugar skulls. In contemporary art, Joseph Beuys and Marina Abramović use food and organic matter as expressive factors in works aspiring to tie the ritual to art itself. Furthermore, both Félix González-Torres and Jana Sterbak have used food in their works, thus transferring their symbolic properties to the works. Every work and aesthetic manifestations studied provides a different vision of death.

[es] En un juego de contrapesos simbólicos, la muerte y el alimento se conjugan en el ritual de Día de Muertos y en cinco obras de artistas contemporáneos. Explorar este intersticio es el objetivo que nos hemos propuesto en esta investigación. En el ritual, indagamos sobre dos prácticas diferenciadas, la ofrenda en el altar para consumo de los muertos y el intercambio de cráneos de azúcar. En el arte contemporáneo, Joseph Beuys y Marina Abramović emplean el alimento y la materia orgánica como factores expresivos en unas obras que aspiran a vincular el ritual al arte. Además, Félix González-Torres y Jana Sterbak hacen uso de alimentos en sus trabajos, de manera que estos transfieren sus propiedades simbólicas a las obras. Todas las producciones artísticas y manifestaciones estéticas estudiadas dan una visión diferente de la muerte.
[en] J.R.R. Tolkien is considered to be the father of modern fantasy literature and responsible for the popular resurgence of the high fantasy genre. As a writer, he would use poems and songs in a narrative way to tell the story. The aim of this project is to translate a selection of some of his poems in his most remarkable work, The Lord of the Rings, into Spanish. Although they have already been translated into Spanish, the poems lack the rhyme and rhythm that are present in their original forms. For that reason, the aim of this paper is to give a potential reader the full experience of reading Tolkien's poetry, and not just to translate it into prose. The inherent difficulty of translating poetry has been taken into account, and I have come to the conclusion that the feeling or idea that each poem or song transmits is what must be prioritized in the translation, although it will depend on the aim that the translation has in the target language. Eventually, a classification of the different poems that appear in the novel has been made in order to show a varied range of lines, according to their themes.

[es] J.R.R. Tolkien está considerado el padre de la literatura moderna fantástica y el responsable del resurgimiento popular del género de la alta fantasía. Como escritor, hacía un uso narrativo de los poemas y canciones para contar historias. El propósito de este trabajo es el de traducir al español una selección de poemas de su obra más relevante: El Señor de los Anillos. A pesar de que ya han sido traducidos al castellano, los poemas están faltos de rima, ritmo y métrica, que sí están presentes en las formas originales. Por este motivo, el objetivo de este estudio es el de proporcionar a un posible lector la experiencia completa al leer la poesía de Tolkien, y no tan solo traducirla como si de prosa se tratase. Se ha tenido en consideración la dificultad inherente de traducir poesía, y he llegado a la conclusión de que el sentimiento o idea que cada poema o canción transmita es aquello que debe priorizarse en la traducción, aunque, obviamente, dependerá de la función de dicha traducción. Finalmente, se ha llevado a cabo una clasificación de los distintos poemas que aparecen en la novela a modo de mostrar un repertorio variado de versos, acorde a sus temáticas.
[en] The importance of understanding cellular processes prompted the development of experimental approaches that detect protein-protein interactions. Here, we describe a software platform called PIANA (Protein Interactions And Network Analysis) that integrates interaction data from multiple sources and automates the analysis of protein interaction networks. Moreover, we describe a method that delineates interacting motifs by relying on the observation that proteins with common interaction partners tend to interact with these partners through the same interacting motif. We find that highly connected proteins (i.e., hubs) with multiple interacting motifs are more likely to be essential for cellular viability than hubs with one or two interacting motifs. Furthermore, we present a method that predicts cancer genes by integrating protein interaction networks, differential expression studies and structural, functional and evolutionary properties. For a sensitivity of 1%, the positive predictive value is 71%, which outperforms the use of any of the methods independently.

[es] La importancia de comprender los procesos biológicos ha estimulado el desarrollo de métodos para la detección de interacciones proteína-proteína. Esta tesis presenta PIANA (Protein Interactions And Network Analysis), un programa informático para la integración y el análisis de redes de interacción proteicas. Además, describimos un método que identifica motivos de interacción basándose en que las proteínas con parejas de interacción comunes tienden a interaccionar con esas parejas a través del mismo motivo de interacción. Encontramos que las proteínas altamente conectadas (i.e., hubs) con múltiples motivos tienen mayor probabilidad de ser esenciales para la viabilidad de la célula que los hubs con uno o dos motivos. Finalmente, presentamos un método que predice genes relacionados con cáncer mediante la integración de redes de interacción proteicas, datos de expresión diferenciada y propiedades estructurales, funcionales y evolutivas. El valor de predicción positiva es 71% con sensitividad del 1%, superando a otros métodos usados independientemente.
[en] As a result of the rise of far-right political parties in the political scene in recent years, the presence of ultra-conservative politicians in the media has strongly increased in many countries. The demand for interpreting services at political events, speeches and meetings of parties of this political ideology is on the rise. However, some interpreters claim that interpreting for some right-wing extremist political figures can turn out to be a challenging task. Many of the speeches by far-right speakers share a number of similarities and common features. Nevertheless, there is one person who, according to many, is considered to be the maximum representation of this political ideology: Donald Trump. This project aims at analyzing the interpretation of his speech and identifying the main difficulties and challenges of such a task. For this purpose, two interpreters from different backgrounds have performed a simultaneous interpretation of a fragment of the speech in which Trump announced his presidential campaign for the 2016 U.S. presidential election. Due to the fact that Trump is one of the most representative individuals of radical right-wing politics, the results of this paper provide an overview of the main criteria to be taken into account when interpreting a politician of his kind, as well as a more detailed view of his rhetorical style.

[es] Con el auge de la extrema derecha en el panorama político de los últimos años, la presencia de figuras políticas ultraconservadoras en los medios de comunicación se ha incrementado considerablemente en muchos países. La demanda de servicios de interpretación en eventos políticos, comparecencias y mítines de partidos de dicha ideología política es cada vez mayor. Sin embargo, existen intérpretes que aseguran que, en ocasiones, la labor de interpretación de algunas figuras políticas de la extrema derecha puede resultar ciertamente complicada. Gran parte de los discursos por parte de ponentes de la ultraderecha comparten una serie de similitudes y características en común. Existe una figura que, para muchos, es la máxima representación de dicha doctrina política: Donald Trump. Este trabajo se centra en el análisis de la interpretación de su discurso y la identificación de las principales dificultades que esta plantea. Con este fin, dos intérpretes de características diferentes han llevado a cabo la interpretación simultánea de un fragmento del discurso en el que Trump anunció su candidatura a las elecciones presidenciales de Estados Unidos de 2016. Al tratarse de una de las personas más representativas de la política de derecha radical, los resultados de este trabajo ofrecen una perspectiva general de los principales factores a tener en cuenta a la hora de interpretar a un político de sus características, así como una visión más detallada del estilo retórico de Donald Trump.
[en] Emotion prediction using physiological signals. Method pipeline that transform time-series to qualitative representations, reducing the complexity, to mine from a structural and feature-driven point of view using adopted techniques from bioinformatics and text mining tools. Method gathers diverse signals to perform multiple classification procedure simultaneously for a posterior consensus analysis, aiming the best prediction.

[es] Predicción de emociones usando señales fisiológicas. Metodología que busca transformar las secuencias temporales a representaciones cualitativas, reduciendo la complejidad, para minar desde un punto de vista estructural y de características, las señales; usando técnicas adoptadas de la microinformática y la minería de texto. La metodología reúne múltiples señales simultáneamente y realiza diversos procedimientos de clasificación para un análisis de consenso posterior, aspirando a la mejor predicción.