BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] Various types of data have been used for sampling plant core collections, including morphological, agronomic and ecogeographical traits, and molecular and biochemical markers. However, little is known about the ability of woody perennial core collections to retain the diversity and structure of the whole collection for characters that were not considered in the selection, especially when molecular markers are used. In this study, three core subsets were established for the apple germplasm bank curated at the Public University of Navarre (UPNa, Spain): based upon the diversity found with 10 SSR markers, another based upon the diversity assessed with 12 isozyme loci; and a third based upon morpho-agronomic diversity evaluated by 23 morpho-agronomic traits. Comparisons between these three subsets and to the whole collection were assessed to determine the impact of the data used in the selection on phenotypic and genetic diversity and on their population structure. The three subsets had a similar diversity and they did not differ from the original collection, according to Nei and Shannon-Weaver indices. The allelic/class frequencies were also always maintained in the three subsets. Overall, the kind of data used to constitute a core collection had little influence on the phenotypic and genetic diversity retained, so in the case of apple collections the use of molecular markers is preferable for this task because they allow a rapid and reliable characterization.

[es] Las colecciones nucleares de plantas pueden formarse a partir de la información obtenida en caracterizaciones morfológicas, agronómicas o eco-geográficas, así como a partir de caracterizaciones bioquímicas o moleculares. Un aspecto poco estudiado de la formación y validación de colecciones nucleares es la capacidad de éstas para conservar la estructura y diversidad de la colección global en aquellos caracteres que no han sido empleados para formar la colección nuclear. En el presente estudio se determinaron tres colecciones nucleares para el Banco de Germoplasma de Manzano de la Universidad Pública de Navarra: para el primero se emplearon los datos de caracterización de 10 marcadores SSR, la segunda fue formada a partir de la caracterización hecha con 12 loci de isoenzimas, y la tercera se construyó a partir de la información proporcionada por 23 caracteres morfo-agronómicos. Se comparó la estructura y diversidad genotípica y fenotípica de las tres colecciones, entre sí y respecto de la colección original, para determinar el impacto que sobre dicha estructura y diversidad tenía el tipo de dato con que se formó la colección nuclear. Las tres colecciones conservaron una diversidad similar y no difirieron de la original en sus índices de Nei y Shannon-Weaver, y siempre se mantuvieron las frecuencias de las clases alélicas o fenotípicas. En conjunto, el tipo de caracterización empleada en la formación de la colección nuclear tuvo escasa influencia sobre la diversidad retenida, de lo que se concluye que en el manzano los microsatélites son especialmente adecuados para formar dichas colecciones.
[en] The association between terrestrial plants and arbuscular mycorrhizal (AM) fungi is one of the most widespread mutualistic plant-fungus interactions in natural and cropping systems. We studied the effect of different plant densities (70,000 and 100,000 plant ha-1) on species diversity and community structure of AM fungi associated with maize (Zea mays L.) in a long-term crop production experiment established in Martonv&aacute;s&aacute;r, Hungary. Based on the differences in small subunit (SSU)/18S ribosomal genes nested-PCR procedure was used to identify groups of AM fungi that are active in the colonization of maize roots. Shannon-Wiener diversity index of AM fungi were 1.43 &plusmn; 0.37 and 1.31 &plusmn; 0.50 at 70,000 plant ha-1 and 100,000 plant ha-1 respectively. All of sequence types we found belonging to the Glomus clade. Besides Glomus A fungi, only the members of the Glomus B group occurred, however at significantly lower frequency. There were differences in the phylogenetic group composition of AM fungi demonstrating the effect of different plant densities on the diversity of arbuscular mycorrhizal fungi.

[es] La asociaci&oacute;n entre las plantas terrestres y los hongos micorrizas arbusculares (MA) es una de las simbiosis mutualistas m&aacute;s extendidas entre plantas y hongos en los sistemas naturales y de cultivo. Se ha estudiado el efecto de diferentes densidades de la plantaci&oacute;n (70.000 y 100.000 plantas ha-1) en diversas especies y la estructura de la comunidad de hongos MA asociados con el ma&iacute;z (Zea mays L.), en un ensayo de producci&oacute;n a largo plazo en Martonv&aacute;s&aacute;r, Hungr&iacute;a. Utilizando las diferencias en la subunidad peque&ntilde;a (SSU) /18S de los genes ribosomales, se us&oacute; un procedimiento de PCR anidada para identificar los grupos de hongos MA activos en las ra&iacute;ces de ma&iacute;z colonizadas. El &iacute;ndice de diversidad de Shannon-Wiener respecto a los hongos MA fue 1,43 &plusmn; 0,37 y 1,31 &plusmn; 0,50 en los ensayos con densidades de 70.000 y 100.000 plantas ha-1, respectivamente. Todos los tipos de secuencias encontradas pertenecieron al g&eacute;nero Glomus. Adem&aacute;s de hongos del grupo Glomus A, s&oacute;lo se encontraron secuencias de especies del grupo Glomus B, pero con una frecuencia significativamente menor. Se encontraron diferencias en la composici&oacute;n de los grupos filogen&eacute;ticos de hongos MA obtenidos, demostrando el efecto de las diferentes densidades de plantas en la diversidad de hongos micorr&iacute;zicos arbusculares.
[en] The environmentally friendly plant growth stimulant and pesticide SB Plant Invigorator (SBPI, Stan Brouard Group) helps the plant to produce quality fruit. Three days after tomato plants were sprayed for the first time with SBPI (2 mL/L solution), this product seemed to be ineffective against Bemisia tabaci adults, as the numbers of dead females were practically equal on control and treated plants. After 3 days oviposition values on control plants did not differ significantly from those on treated plants. However, 31 days after the first treatment with weekly repeated treatments, new adult whiteflies started to emerge from pupae on control plants, but no L3, L4 or new adults were found on SBPI-treated plants. However, differences in the number of 1st+2nd instar larvae were not statistically significant. From these findings it can be concluded that, under these conditions, SBPI is an effective alternative product for the control of B. tabaci on tomato plants, as foliar application inhibits larval development decreasing the risk of a new whitefly generation.

[es] El estimulante del crecimiento vegetal y plaguicida respetuoso con el medio ambiente llamado SB Plant Invigorator (SBPI, Grupo Stan Brouard) incrementa la calidad de los frutos. Tres días después de que plantas de tomate fueron pulverizadas por vez primera con SBPI (2 mL/L), este producto pareció ser no efectivo frente a los adultos de Bemisia tabaci, puesto que el número de hembras muertas fue prácticamente igual en las plantas control y en las tratadas. Después de un periodo de 3 días, los valores de oviposición en las plantas control no difirieron significativamente de los obtenidos en las tratadas, aunque el valor medio de huevos puestos en las hojas tratadas con SBPI fue ligeramente mayor que el observado en las control. Sin embargo, 31 días después del primer tratamiento con tratamientos semanales, se inició la emergencia de nuevos adultos en las plantas control, mientras que no se obtuvieron L3, L4 ni nuevos adultos en las plantas tratadas con SBPI. El número de L1+L2 fue mayor en estas plantas, pero las diferencias respecto a las controles no fueron estadísticamente significativas. De estos resultados concluimos que, bajo las condiciones experimentales utilizadas, el producto SBPI es efectivo para controlar B. tabaci en plantas de tomate, ya que su aplicación foliar inhibe el desarrollo larvario del insecto, disminuyendo el riesgo de aparición de una nueva generación de esta plaga.
[en] Acridids could be an alternative nonconventional protein source for livestock industries like poultry farms. For a high acridid biomass production, selection of acridid species along with their suitable food plants is essential. The present experiment was conducted by rearing of two common Indian acridids, Oxya hyla and Spathosternum prasiniferum, to estimate which one could produce higher annual biomass when fed on three food plants, Dactyloctenium aegyptium, Brachiaria mutica and Cynodon dactylon, to determine the most favourable food plant. Fecundity, fertility, nymphal mortality and sex ratio of both acridid species fed with three different plants were estimated for the annual biomass production in terms of number. Annual biomass production in terms of wet weight, dry weight and energy content were also estimated. Among the two acridid species, O. hyla showed higher values for fecundity, fertility and both wet and dry body weight; and lower values for nymphal mortality in all the three food plant fed sets. Among the three food plants, B. mutica was found to be the most suitable for annual biomass production of both acridids. It was concluded that mass rearing of O. hyla fed on B. mutica could yield a high annual biomass in acridid farms.

[es] Los acr&iacute;didos podr&iacute;an ser una fuente de prote&iacute;nas no convencional alternativa para las granjas de aves de corral. Para una producci&oacute;n masiva de biomasa de acr&iacute;didos, es esencial seleccionar las especies adecuadas, junto con las plantas que los alimenten adecuadamente. Se llev&oacute; a cabo un experimento para criar dos acr&iacute;didos comunes en la India, Oxya hyla y Spathosternum prasiniferum y estimar cu&aacute;l de ellos puede producir una mayor biomasa anual cuando se alimentan de tres plantas, Dactyloctenium aegyptium, Brachiaria mutica y Cynodon dactylon, determinando cual de ellas es el alimento m&aacute;s favorable. Para la producci&oacute;n anual de biomasa, en t&eacute;rminos de n&uacute;mero, se estimaron las tasas de fecundidad, fertilidad, mortalidad de ninfas y el sexo de ambas especies de acr&iacute;didos alimentados con las tres diferentes plantas. Tambi&eacute;n se estimaron la producci&oacute;n de biomasa anual, en t&eacute;rminos de peso h&uacute;medo y seco, y el contenido de energ&iacute;a. Entre las dos especies, O. hyla mostr&oacute; valores m&aacute;s altos de fecundidad, fertilidad y peso corporal, tanto h&uacute;medo como seco, y valores m&aacute;s bajos de mortalidad de ninfas para las tres plantas. Entre las tres plantas utilizadas como alimento, B. mutica fue la m&aacute;s adecuada para la producci&oacute;n anual de biomasa para ambos acr&iacute;didos. Se concluye que la cr&iacute;a masiva de O. hyla aliment&aacute;ndose de B. mutica puede producir una gran biomasa anual en las granjas de acr&iacute;didos.
[en] Understanding farmer decisions on land use conversions (LUC) in rural areas has significant importance to understand and predict the patterns of land use changes in China. Many methods have been developed to search for the influencing factors on land use changes at farm household level. However, these methods have difficulty in evaluating the intertwined influences between factors and achieving farmer decision rules on LUC. Taking three regions located in Jiangsu Province as the study areas, the present work proposed a data mining method, classification and regression tree (CART), to simulate farmer decisions on LUC at farm household level. The accuracy of the simulated LUC by CART was above 85.00%, indicating that the proposed method could be used to simulate farmer decisions. The simulation results also showed that farmer decision rules on LUC presented regional characteristics. In Jiangsu Province, 20 rules were inferred for LUC using 10 factors which were related to the household resources, land market, and so on. These factors were ranked in the decreased importance on LUC as labor transfer, land market, location, resources of household, and characteristics of household. In Rudong County, the which were related factors with LUC included land market, labor transfer, and household resource, while in Changshu County, the additional factor of location was involved.

[es] Comprender las decisiones de los agricultores sobre la reconversión del uso de parcelas (LUC) en áreas rurales tiene una importancia significativa para comprender y predecir los patrones en los cambios en el uso de parcelas en China. Se han desarrollado muchos métodos para buscar los factores que influyen en los cambios del uso de parcelas a nivel agrícola familiar. Sin embargo, estos métodos presentan dificultades para evaluar las influencias entrecruzadas entre los factores y las reglas conseguidas para la decisión de los agricultores sobre la LUC. Tomando como áreas de estudio tres regiones de la provincia de Jiangsu, este trabajo propone un método de minería de datos, clasificación y árboles de regresión (CART) para simular las decisiones de los agricultores sobre el LUC a nivel familiar. Se consiguió una precisión gt;85% del LUC simulado con el CART, indicando que este método es capaz de simular las decisiones de los agricultores. Los resultados de la simulación también mostraron que las reglas de decisión de los agricultores sobre el LUC presentaban características regionales. Se dedujeron 20 reglas para el LUC en la provincia de Jiangsu utilizando 10 factores relacionados con los recursos familiares, el mercado del suelo, etc. Estos factores fueron clasificados en importancia decreciente en el LUC como transferencia de mano de obra, mercado del suelo, recursos familiares y características de las familias. En el condado de Rudong, los factores relacionados con el LUC fueron el mercado del suelo, la transferencia de mano de obra y los recursos familiares, mientras que en el condado de Changshu aparece la localización como factor adicional.
[en] Potato (Solanum tuberosum L.) is susceptible to many fungal pathogens including Rhizoctonia solani. In the present study, the potato cultivar Desirée was transformed via Agrobacterium tumefaciens strain GV3101 containing the binary plasmid pGJ132 harboring both the chitinase (chiA) and rip30 genes. The potato leaf disc was used as an explant for transformation. PCR, Southern blot and Western blot were used for characterization of the transgenic plants. In this study it was shown that not all the plants developed in selective medium were positive for the corresponding gene using the PCR technique. Southern blot analysis confirmed that transgenic plants integrated 2-3 copies of chiA and rip30 genes respectively into their genome. The expression of the CHIA and RIP30 proteins was confirmed in the leaf extracts of the transgenic clones by Western blot analysis. Transgenic potato plants expressing rip30 and chiA genes showed enhanced resistance to R. solani in a greenhouse assay.

[es] La patata (Solanum tuberosum L.) es susceptible a muchos hongos fitopatógenos, incluyendo Rhizoctonia solani. En el presente estudio, se transformó el cultivar de patata 'Desirée' mediante Agrobacterium tumefaciens, cepa GV3101, que contiene el plásmido binario pGJ132 que alberga los genes quitinasa (chiA) y rip30. Se utilizaron discos de hojas como explante para la transformación de plantas. Se utilizaron las técnicas de PCR, Southern y Western blot para la caracterización de las plantas transgénicas. En este estudio se demostró, mediante PCR, que no todas las plantas que se desarrollaron en medio selectivo fueron positivas para el gen correspondiente. El análisis de Southern blot confirmó que las plantas transgénicas integraron en su genoma 2-3 copias de los genes chiA y rip30. Se llevó a cabo un ensayo de invernadero para evaluar la resistencia a R. solani de los clones transgénicos que expresan los transgenes. Las plantas transgénicas que expresan los genes rip30 y chiA mostraron una resistencia completa a R. solani.
[en] Gibberellic acid (GA3) increases berry size of "Emperatriz" seedless grape, the response depending on the phenological stage of vine at treatment date and on the concentration applied. From berry fruit set to 21 days later, 80 mg/L GA3 increased commercial berry weight by 50%-90%, depending on the year, reaching similar size to that of "Aledo" seeded grape, used as comparison. This effect takes place through: a) a larger berry growth rate; b) an early glucose, fructose and sucrose uptake; c) an increase of absolute glucose and fructose content (mg/berry) of seedless berries up to similar values to those of seeded berries; and d) an increase of absolute berry water content but not of relative content to fresh weight, thus water potential and osmotic potential are not significantly modified by treatments. GA3 does not affect berry pericarp cell number but increases pericarp cell diameter.

[es] La aplicación de ácido giberélico (GA3) aumenta el tamaño de la baya de la vid apirena "Emperatriz", dependiendo de la época de aplicación y de la concentración aplicada. Desde el momento del cuajado y hasta 21 días más tarde, 80 mg/L de GA3 aumentaron el peso de las bayas comerciales entre un 50% y un 90%, dependiendo del año, alcanzando un tamaño similar al de las bayas de la variedad con semillas "Aledo", utilizada como comparación. Este efecto tiene lugar a través de: a) una mayor tasa de crecimiento; b) una anticipación en la acumulación de glucosa, fructosa y sacarosa; c) un aumento del contenido absoluto en glucosa y fructosa (mg/baya) en las bayas de la variedad apirena que alcanza valores similares a los de las bayas con semillas; y d) un aumento del contenido absoluto de agua de las bayas, aunque no relativo a su peso fresco, de modo que el potencial hídrico y el potencial osmótico no se ven modificados por los tratamientos. El GA3 no modifica el número de células del pericarpo, pero sí su diámetro.
[en] The Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata (Wiedemann) (Diptera: Tephritidae), is considered one of the most economically damaging pests of citrus orchards in Spain. The characterization of C. capitata population structure, at a large geographical scale, by using a combination of RAPD and ISSR markers can allow analyzing the genetic variability of this species, and provide some insight in decision making for resistance management, recently recorded in Spain. We compared six Spanish populations along the Mediterranean area (Gerona, Amposta, Tortosa, Castellón, Valencia and Málaga) with populations from other geographical areas where this pest is widely distributed (Africa, Middle East, South America and Atlantic Islands) and two laboratory strains. The results obtained with both types of molecular markers were similar. A dendrogram based on Nei genetic distances showed that all Mediterranean Spanish populations, except the population collected in Gerona, were clearly separated from the rest. However, no clear differentiation among Spanish populations was found, probably as a result of the high levels of gene flow (Nm value of 2.8 for RAPD and 3.9 for ISSR). Implications of these findings on resistance management of C. capitata are discussed.

[es] La mosca mediterránea de la fruta, Ceratitis capitata (Wiedemann) (Diptera: Tephritidae), está considerada como una de las plagas económicamente más perjudiciales de los cultivos de cítricos en España. La caracterización de la estructura poblacional de C. capitata, a gran escala, mediante el uso conjunto de marcadores RAPD e ISSR puede permitir analizar la variabilidad genética de esta especie, y proporcionar alguna información en la toma de decisiones del manejo de la resistencia, registrada recientemente en España. Se compararon seis poblaciones españolas del área mediterránea (Gerona, Amposta, Tortosa, Castellón, Valencia y Málaga) con poblaciones de otras zonas geográficas donde esta plaga está ampliamente distribuida (África, Oriente Medio, América del Sur e Islas del Atlántico) y dos líneas de laboratorio. Los resultados obtenidos con ambos tipos de marcadores moleculares fueron similares. Un dendrograma basado en las distancias genéticas de Nei mostró que todas las poblaciones mediterráneas españolas, a excepción de la población recogida en Gerona, estaban claramente separadas del resto. Sin embargo, no se encontró una diferenciación clara entre las poblaciones españolas, probablemente como resultado de los altos niveles de flujo génico (un valor de Nm de 2,8 para RAPD y 3,9 para ISSR). Se discuten las implicaciones de estos resultados en el manejo de la resistencia de C. capitata.
[en] Calving records of Holstein cows from January 1983 to December 2006 comprising 1,190 herds with 384,717 calving events were used to evaluate factors affecting the dry period length and effect of current dry days on the next productive and reproductive performances of Holstein cows. Statistical analyses of dry days, productive and reproductive traits in this study were performed as linear mixed models. Dry period length (DD) of cows was grouped into 14 classes from 130 days. Average DD was 100.46 days in Holstein cows. Primiparous cows had the lowest DD and the mean of DD decreased over the years from 1983 to 2006 and summer calvers had the shortest DD (p &lt;0.001). Cows within the DD classes of 51-60 and 61-70 had the greatest actual milk yield, mature equivalent milk yield, adjusted milk yield, adjusted fat yield, mature equivalent milk yield, adjusted protein yield and mature equivalent protein yield (p &lt;0.05). Also, cows within the DD class of 0-10 had the greatest adjusted fat percentage, mature equivalent fat percentage and adjusted protein percentage (p &lt;0.05). Our current results showed a reduction in calving interval and age at calving after cows had shorter dry days than with other longer dry period lengths (p &lt;0.05). Given the recent advocacy for shortened dry periods, it is worthwhile to emphasize that 51 to 70 DD does provide maximal performance in Holstein cows.

[es] El registro de los partos de vacas Holstein desde enero 1983 a diciembre 2006 que comprende 1190 rebaños con 384717 partos, se utilizaron para evaluar los factores que afectan la duración del período seco y el efecto de los actuales días secos en las posteriores producciones y reproducciones de las vacas Holstein iraníes. Los análisis estadísticos de los días secos y características productivas y reproductivas en este estudio se realizaron con modelos lineales mixtos. La duración del período seco (DD) de las vacas se agrupa en 14 clases desde menos de 10 días hasta &gt; 130 días. El promedio de DD fue de 100.46 días en vacas Holstein iraníes. Las vacas primíparas tuvieron el menor DD y la media de DD disminuyó a lo largo de los años de 1983 a 2006 y las de parición de verano tenían el DD más corto (p &lt;0.001). Las vacas dentro de las clases DD de 51-60 y 61-70 tuvieron el mayor rendimiento real de leche, la producción de leche en equivalente-madura, producción de leche ajustada, producción de grasa ajustada, producción de proteína y el rendimiento ajustado a equivalente-madura de proteína (p &lt;0.05 ). Además, las vacas dentro de la clase de 0-10 DD tuvo el mayor porcentaje de grasa ajustada, porcentaje de grasa en equivalente-madura y el porcentaje de proteína ajustado (p &lt;0.05). Nuestros resultados actuales muestran una reducción en el intervalo entre partos y en la edad al parto en las vacas con menor longitud de días secos que en otras con una duración del period seco más largo (p &lt;0.05). Teniendo en cuenta la reciente iniciativa de acortar los períodos secos, vale la pena destacar que con 51 a 70 DD se proporciona un rendimiento máximo en vacas Holstein iraníes.