BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] Cross-species amplification of microsatellites is a common procedure to obtain suitable markers to be used in population genetic studies. Primers designed for one (source) species are used to amplify homologous loci in related (target) species. It is expected that phylogenetically close species will share a higher proportion of markers, and genetic distance could be a useful parameter to predict successful transferability between different taxonomic groups. We analyzed twenty-two primer pairs developed for Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze in five target species of the Araucariaceae family. The results were summarized in vectors of presence and absence of bands and compared through the Jaccard similarity index. Using the sequences of eight published genes, genetic distances between pairs of species were estimated and related to transferability rate using Pearson correlations. Successful transfer rate ranged from 31.8 to 77.3%, being these among the highest reported for plants. The highest transfer rate was observed between the South American species. The transferability was confirmed sequencing seven fragments amplified in A. araucana (Molina) K. Koch, and using the best five to estimate genetic diversity parameters in a natural population of this Andean coniferous.

[es] La transferencia de cebadores que amplifican loci microsatélites desde otras especies es una práctica habitual para obtener marcadores adecuados para estudios de genética poblacional. Los cebadores diseñados en una especie (fuente) son utilizados para amplificar loci homólogos en especies relacionadas (blanco). Se espera que especies cercanas filogenéticamente compartan un mayor número de marcadores y la distancia genética entre especies podría ser un parámetro útil para predecir el éxito de la transferencia entre diferentes grupos taxonómicos. Se analizó la transferencia de veintidós primers, desarrollados para Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze, a cinco especies blanco de la familia Araucariaceae. Los resultados se resumieron en vectores de presencia y ausencia de bandas y fueron comparados a través del índice de similitud de Jaccard. Se estimaron las distancias genéticas de a pares entre las especies analizadas utilizando las secuencias de ocho genes, y se las relacionó con el índice de transferencia utilizando correlaciones de Pearson. El éxito de la transferencia varió entre 31.8 y 77.3%, encontrándose estos valores entre los más altos reportados en plantas. El mayor índice de transferencia se verificó entre las especies sudamericanas. La transferencia fue confirmada secuenciando siete fragmentos amplificados en Araucaria araucana (Molina) K. Koch, y utilizando los cinco mejores para estimar parámetros de diversidad genética en una población natural de esta conífera andina.
[en] This manuscript provides an overview on the use of genomics to study pine adaptation to environmental conditions, such as drought or photoperiod. We briefly discuss molecular tools that permit to acquire a comprehensive view of pine genome, such as cytogenetic and genetic linkage maps. We will also discuss the application of two complementary strategies to dissect complex adaptive traits based on linkage disequilibrium between neutral molecular markers and quantitative trait loci: QTL mapping and association analysis. An important step in these studies is the identification of candidate genes involved in the response of pine trees to environmental variation using functional genomic approaches.

[es] Este art&iacute;culo constituye una revisi&oacute;n de las aplicaciones de la gen&oacute;mica en el estudio de la adaptaci&oacute;n de los pinos a diferentes condiciones medioambientales, tales como la sequ&iacute;a o el fotoper&iacute;odo. Discutiremos brevemente las herramientas moleculares desarrolladas para adquirir una visi&oacute;n integrada del genoma de pino como por ejemplo la proporcionada por los mapas citol&oacute;gicos y gen&eacute;ticos. Tambi&eacute;n discutiremos la aplicaci&oacute;n de dos estrategias complementarias para diseccionar caracteres cuantitativos complejos, basadas en el desequilibrio de ligamiento entre marcadores moleculares neutrales y los loci que causan variaci&oacute;n cuantitativa: mapeo de QTLs y estudios de asociaci&oacute;n. Otro aspecto importante en estos estudios es la identificaci&oacute;n de genes candidatos involucrados en la respuesta de los pinos a variaciones ambientales empleando estrategias de gen&oacute;mica funcional.
[en] Genetic structure of a breeding population and three naturalised populations of Juglans regia L., was investigated by means of starch gel electrophoresis for 4 enzyme systems. This study reveals variability preservation in the breeding population of first generation respect to the naturalised populations, since heterocigosity levels in the breeding population (0.197) are higher than in naturalised populations of the same geographic area (0.177). Isozyme electrophoretic technique is emphasised as well as an useful tool in the genotype differentiation of J. regia, and it should be advisable to include in the identification of the breeding population some polymorphic isozyme system, like diaforasa, which improve the resolution of this identification technique. As far as molecular marker election to better study of variability, it has been proved that the diversity values are higher with isozymes (0.202) than RAPDs (0.060), although with RAPDs greater number of individuals has been discriminated. Moreover, the joint use of both markers allow individualised identification of studied genotypes. So, the use of both techniques together is considered important for individual identification in the breeding population process, including selection and certification of clones to protect the obtaining rights of it.

[es] En el presente trabajo se ha llevado a cabo la caracterizaci&oacute;n gen&eacute;tica de una poblaci&oacute;n de mejora de Juglans regia L., mediante la t&eacute;cnica de electroforesis con 4 sistemas enzim&aacute;ticos. Este estudio demuestra el mantenimiento de variabilidad en la poblaci&oacute;n de mejora de primera generaci&oacute;n respecto a las poblaciones naturalizadas de un &aacute;rea geogr&aacute;fica pr&oacute;xima, ya que se han obtenido niveles de heterocigosidad en la poblaci&oacute;n de mejora ligeramente superiores (0,197) a los de poblaciones naturalizadas de una zona geogr&aacute;fica cercana (0,177). Por otro lado, tambi&eacute;n se destaca la t&eacute;cnica de electroforesis con isoenzimas como una herramienta &uacute;til en la diferenciaci&oacute;n de genotipos de J. regia, aunque ser&iacute;a aconsejable incluir en la identificaci&oacute;n de la poblaci&oacute;n de mejora alg&uacute;n otro sistema enzim&aacute;tico polim&oacute;rfico como podr&iacute;a ser diaforasa, que mejora el poder resolutivo de esta t&eacute;cnica de identificaci&oacute;n. En cuanto a la elecci&oacute;n de un marcador para un mejor estudio de la variabilidad, se ha comprobado que los valores de variabilidad son superiores para isoenzimas (0,202) que para RAPDs (0,060), aunque los RAPDs han discriminado un mayor numero de genotipos. Adem&aacute;s la utilizaci&oacute;n conjunta de ambos marcadores ha permitido la identificaci&oacute;n individualizada de todos los genotipos estudiados. Por lo tanto, se considera importante la utilizaci&oacute;n conjunta de ambas t&eacute;cnicas con el objetivo de identificar individuos en los procesos de manejo de la poblaci&oacute;n de mejora, incluida la selecci&oacute;n y certificaci&oacute;n de clones para la protecci&oacute;n de los derechos de obtenci&oacute;n de los mismos.
[en] Models for predicting parameter behaviour in the 2-parameter Weibull function in even-aged Pinus pinea stands of Valladolid (Spain) have been adjusted. From data out of 131 plots (20 trees per plot), real distribution parameters have been adjusted, using the percentile method, as well as non-linear regression. Next, predictive models of calculated parameters were adjusted, using stand variables. Parameter "b" is deeply related to mean cuadratic diameter (dg), while parameter "c", which was more difficult to model, is related to dg and other variable (Age or Canopy cover).

[es] Se han obtenido modelos explicativos de los par&aacute;metros de la funci&oacute;n Weibull biparam&eacute;trica para modelizar las distribuciones diam&eacute;tricas en masas regulares de Pinus pinea L. en la provincia de Valladolid (Espa&ntilde;a). A partir de datos experimentales tomados en 131 parcelas (20 &aacute;rboles/parcela), se han determinado inicialmente los par&aacute;metros de la distribuci&oacute;n te&oacute;rica ajustada a las distribuciones reales mediante el m&eacute;todo de los percentiles y regresi&oacute;n no lineal. A continuaci&oacute;n se han ajustado modelos lineales predictivos de los par&aacute;metros calculados, que incluyen variables de masa. El par&aacute;metro &laquo;b&raquo; se asocia muy estrechamente con el di&aacute;metro medio cuadr&aacute;tico (dg), mientras que el par&aacute;metro &laquo;c&raquo; presenta una mayor dificultad de ajuste, relacion&aacute;ndose con dg y una segunda variable (edad o fracci&oacute;n de cabida cubierta).
[en] This paper develops a map of the natural area of Pinus nigra Arn. ssp. salzmanni in the Beticas Mountain Range based on the Digital version of the Forestry Vegetation Map of Spain. This map has been compared with the most commonly used Potential Vegetation, Geology and Lithology maps. A bibliographic research has been carried out with a selection of Holocene deposits where Pinus nigra pollen, wood or charcoal has been found. With this information collected, a discussion about the natural distribution of Pinus nigra at the Béticas Mountain Range and the difficulty of matching this distribution within the most common phytosociological models has been posed. Ecological and palaeoecological data have been given to stress the importance of developing more complex models, considering factors beyond climate and soil, to explain the forest dynamics. It has been confirmed the hypothesis about the existence of Pinus nigra in the Holocene in two Andalousian Mountain Range (Gádor in the province of Almeria and Sierras Sub-Béticas in the province of Córdoba), where this species are currently extinguished. Considering all these data it is emphasized the interest and importance of conservation of natural salzmann pine forests in this area.

[es] En este trabajo se ha analizado la cartograf&iacute;a del &aacute;rea natural de Pinus nigra Arn. ssp. salzmannii en las Sierras B&eacute;ticas (sureste de Espa&ntilde;a) a partir del Mapa Forestal de Espa&ntilde;a en su versi&oacute;n digital y se han descrito las caracter&iacute;sticas geol&oacute;gicas y litol&oacute;gicas de las zonas que ocupa utilizando para ello la cartograf&iacute;a correspondiente. El &aacute;rea natural de la especie se ha comparado con los Mapas de Series de Vegetaci&oacute;n m&aacute;s utilizados. Posteriormente se ha realizado una b&uacute;squeda bibliogr&aacute;fica seleccionando las citas significativas de yacimientos holocenos en el Sureste peninsular en los que se han encontrado evidencias paleoecol&oacute;gicas (p&oacute;lenes, madera, carb&oacute;n, etc.) de la presencia de Pinus nigra en estos enclaves. A partir de los datos obtenidos se ha discutido acerca de la presencia natural de Pinus nigra Arn. en las Sierras B&eacute;ticas y su dif&iacute;cil encaje en los modelos fitosociol&oacute;gicos m&aacute;s utilizados, aportando datos ecol&oacute;gicos y paleoecol&oacute;gicos que inciden en la importancia de elaborar modelos m&aacute;s complejos que consideren factores m&aacute;s all&aacute; de la climatolog&iacute;a y el suelo para explicar la din&aacute;mica vegetal. Se confirman o elaboran hip&oacute;tesis acerca de la presencia de pino salgare&ntilde;o durante el Holoceno en dos zonas en las que actualmente se encuentra extinguido: la Sierra de G&aacute;dor (Almer&iacute;a) y las Sierras Subb&eacute;ticas de C&oacute;rdoba, y acerca de su mayor presencia en &eacute;pocas pasadas. Como consecuencia de los resultados se incide en la importancia que tiene en la gesti&oacute;n forestal la consideraci&oacute;n y conservaci&oacute;n de las poblaciones de pino salgare&ntilde;o.
[en] As part of the Spanish breeding programme against Dutch elm disease, investigations were undertaken on reproduction of Ulmus minor by means of tissue culture. Microshoots were obtained from nodal segments, collected from terminal twigs of 4-year-old ramets of selected clones of this species and of U. minor x U. pumila, and cultured on a modified Murashige &amp; Skoog medium containing 6-Benzylaminopurine (BA). When subcultured, the microshoots or nodal segments excised from these, formed new shoots, their maximum numbers per explant (1.94 to 2) being obtained with the hybrid clone M-TC2 on media containing 3.5 to 8.8 μM BA. The number of microshoots obtained was highest with subcultures of the whole shoot, e.g. 6.9 times superior to control, against 1.5 with nodal segments of VJR1 in presence of 8.8 μM BA. The addition of 0.5 to 5.3 μM indole-acetic acid of α-naphthaleneacetic acid to the medium induced the highest percentage of root formation from the shoots. Both shoot and root formation varied greatly among clones.

[es] En el presente trabajo se describen los trabajos sobre reproducci&oacute;n de Ulmus minor mediante las t&eacute;cnicas de cultivo de tejidos, llevados a cabo en el marco del Programa de Mejora Gen&eacute;tica Espa&ntilde;ol de los Olmos Frente a la Grafiosis. Brotes obtenidos a partir de segmentos nodales de ramillos terminales de ramets de 4 a&ntilde;os de edad, pertenecientes a clones seleccionados de esta especie y de U. minor x U. pumila, fueron cultivados en el medio de Murashige &amp; Skoog modificado conteniendo 6-Bencilaminopurina (BA). Una vez subcultivados los brotes enteros o los segmentos nodales obtenidos a partir del material vegetal in vitro, se originaron nuevos brotes, y fue el clon h&iacute;brido MTC2 el que proporcion&oacute; un mayor n&uacute;mero por explanto (1,94 a 2) sobre medio conteniendo 3,5 a 8,8 &mu;M BA. El n&uacute;mero de brotes obtenidos fue mayor cuando todo el brote fue subcultivado, e.g. 6,9 veces superior al control, frente a 1,5 con segmentos nodales de V-JR1 en presencia de 8,8 &mu;M BA. La adici&oacute;n de 0,5 a 5,3 mm de &aacute;cido indolac&eacute;tico o &alpha;-naftalenac&eacute;tico al medio, provoc&oacute; el mayor porcentaje de formaci&oacute;n de ra&iacute;z en los brotes. Tanto la formaci&oacute;n de brotes como la formaci&oacute;n de ra&iacute;z fue muy variable entre clones.
[en] In the last few years there has been an increasing tendency to consider forest ecosystems as possible sinks of carbon dioxide. In this way, it is attempted to mitigate the dramatic increase of global emissions of this gas in the industrialised countries. This new context implies modifications in basic aspects of the forest management discipline, like the determination of the forest optimal forest rotation, including the new European grants. In this paper, some recent experiences in this direction will be critically reviewed and some new ideas will be considered. With this purpose in mind three cases are studied: one species of short rotation (Populus sp.), another one of medium rotation (Pinus radiata D. Don.) and finally one species of long rotation (Pinus sylvestris L.).

[es] En los &uacute;ltimos a&ntilde;os ha habido una tendencia creciente de considerar a los ecosistemas forestales como posibles sumideros de di&oacute;xido de carbono. En este sentido, se intenta mitigar el importante incremento de las emisiones de este gas en los pa&iacute;ses industrializados. Este nuevo contexto implica modificaciones en aspectos b&aacute;sicos de la gesti&oacute;n forestal, como la determinaci&oacute;n del per&iacute;odo &oacute;ptimo de rotaci&oacute;n, incluyendo las nuevas subvenciones europeas. En este art&iacute;culo se hace una revisi&oacute;n cr&iacute;tica de algunas experiencias recientes, y se consideran nuevas ideas. Con este prop&oacute;sito se estudian tres casos: una especie con per&iacute;odo de rotaci&oacute;n corto (Populus sp.), otra especie con un per&iacute;odo de rotaci&oacute;n medio (Pinus radiata D. Don.), y finalmente una especie con un per&iacute;odo de rotaci&oacute;n largo (Pinus sylvestris L.).
[en] It is studied the use of the Map of Forest Potential Productivity of Spain as information in base to which classify an Indian IRS-1C WiFS satellite image in Los Alcornocales Natural Park (Andalucía, Spain), a large forest area covered by natural forests of Mediterranean broadleaved species, mainly cork oak (Quercus suber L.). Grouping the classes of climatic potential productivity of this map were obtained three macroclasses that resulted significantly different among them at the 99% confidence level for the visible and the Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) of theWiFS image. It was built a classifier using these macroclasses of climatic potential productivity as ground truth areas. By maximum likelihood supervised classification of the NDVI were obtained classes who resulted significantly different among them at the 90%confidence level for the basal area from the Second Spanish National Forest Inventory ground plots located in the park.

[es] Se estudia el uso del Mapa de la Productividad Potencial Forestal de Espa&ntilde;a como fuente de informaci&oacute;n en base a la que clasificar una imagen captada por el sensor WiFS del sat&eacute;lite hind&uacute; IRS-1C en el Parque Natural Los Alcornocales (Andaluc&iacute;a, Espa&ntilde;a), una extensa &aacute;rea protegida y cubierta por bosques naturales de querc&iacute;neas mediterr&aacute;neas, principalmente alcornoque (Quercus suber L.). Se han agrupado las clases de productividad potencial clim&aacute;tica de esta cartograf&iacute;a en tres macroclases que han resultado significativamente diferentes entre s&iacute; al 99% de probabilidad fiducial respecto al visible y el &Iacute;ndice de Vegetaci&oacute;n Normalizado (NDVI) de la imagen WiFS empleada. Mediante clasificaci&oacute;n supervisada de m&aacute;xima verosimilitud del NDVI de esta imagen, utilizando las macroclases de productividad potencial clim&aacute;tica como &aacute;reas de verdad de campo, se han obtenido clases que son significativamente diferentes entre s&iacute; al 90% respecto al &aacute;rea basim&eacute;trica de las parcelas de campo del Segundo Inventario Forestal de Espa&ntilde;a situadas en el Parque.
[en] Sustainable territorial management requires reliable assessment of the impact of conservation policies on landscape structure and dynamics. Euro-Mediterranean regions present a remarkable biodiversity which is linked in part to traditional land use practices and which is currently threatened by global change. The effectiveness of one-decade conservation policies against land use changes was examined in Central Spain (Madrid Autonomous Community). A Markov model of landscape dynamics was parameterized with CORINE Land Cover information and transition matrices were obtained. The methods were applied in both protected and unprotected areas to examine whether the intensity and direction of key land use changes —urbanisation, agricultural intensification and land abandonment— differed significantly depending on the protection status of those areas. Protected areas experienced slower rates of agricultural intensification processes and faster rates of land abandonment, with respect to those which occurred in unprotected areas. It illustrates how simple mathematical tools and models —parameterized with available data— can provide to managers and policy makers useful indicators for conservation policy assessment and identification of land use transitions.

[es] La gestión sostenible del territorio requiere de análisis realistas sobre el impacto de las políticas de conservación en la estructura y dinámica del paisaje. La región Euro-Mediterránea presenta una biodiversidad remarcable que está unida en parte a las prácticas tradicionales del uso del suelo y que actualmente está amenazada por el cambio global. La efectividad de la implantación de políticas de conservación frente a los cambios en el uso del suelo fue examinada en el centro de España (Comunidad Autónoma de Madrid). Se usaron modelos de Markov para analizar la dinámica del paisaje parametrizados con información del CORINE Land Cover y se obtuvieron las matrices de transición. La metodología se aplicó en áreas protegidas y no protegidas para examinar si la intensidad y dirección de los cambios del uso del suelo claves —urbanización, intensificación agrícola y abandono— difieren significativamente en función del grado de protección. Las áreas protegidas experimentaron menores tasas en el proceso de intensificación agrícola y mayores en el abandono con respecto a las ocurridas en zonas sin protección. Se demuestra cómo modelos y herramientas matemáticas —parametrizados con los datos disponibles— pueden proporcionar a gestores y políticos indicadores útiles para la evaluación de políticas de conservación e identificación de transiciones de uso del suelo.
[en] This paper analyses the performance of 52 provenances of Pinus pinaster (44 Spanish, three french, two portuguese, two moroccan and one italian) planted in five sites in Central Spain. The design used is a randomized complete block design, with four blocks and 16 trees/plot. The traits measured and analysed at 18 years after planting were survival, total height, diameter, volume and frequency of polycyclysm. The heritabilities for all the traits were above 0.5. The site factor has a lower importance in polycyclysm and survival than in the other traits. The component due to the provenance-site interaction stresses the existence of a diferential performance among provenances. Pinus pinaster displays a high genetic variation among provenances in all the traits analysed. The Atlantic provenances have the highest height and diameter growth with a low degree of polycyclysm, but are poorly adapted to the sites with the longest dry period. Mountain provenances (AV1, SO1, CU), have a good performance in all the five sites, as well as two artificial provenances (CR and GR2). Several artificial populations widely used for afforestation purposes in Spain (SG3, LE) display a poor height growth, below the mean of all the provenances analysed.

[es] En el presente trabajo se analiza el comportamiento de 52 procedencias de Pino negral (44 procedencias nacionales y 8 extranjeras) situadas en cinco localidades del centro de España. El diseño empleado es el Aleatorizado en Bloques Completos con cuatro repeticiones. Los caracteres medidos a los 18 años de la plantación son la supervivencia, altura total, diámetro normal y frecuencia de años en que se presentan dos ciclos de crecimiento. El análisis realizado permite comcluir que las heredabilidades obtenidas para los caracteres analizados son superiores a 0,5. El factor localidad tiene una menor importancia en la expresión del policiclismo y la supervivencia que en la altura, el diámetro y el volumen. La importancia del componente debido a la interacción procedencia x localidad apunta la existencia de comportamientos diferenciales entre las procedencias. El Pino negral manifiesta una notable variación genética entre sus poblaciones en los caracteres analizados. Las procedencias atlánticas tienen un mayor crecimiento en altura y diámetro con una tendencia baja al policiclismo, pero parecen estar peor adaptadas a las localidades que presentan un período seco prolongado. Las procedencias de media montaña (como AV1, SO1 y CU), presentan unos resultados aceptables en el conjunto de las localidades. Es de destacar el crecimiento de las procedencias CR1 y GR2, obtenidas de repoblaciones. Algunas fuentes de semilla ampliamente utilizadas en repoblaciones (Coca, Montes del Teleno), manifiestan un crecimiento por debajo del promedio de todas las poblaciones estudiadas.