[ca] L'estructura tridimensional de la cromatina és una característica clau en la regulació del control de l'expressió gènica. Comprendre les interaccions de llarg abast entre els promotors gènics i els elements reguladors, com els enhancers, és crucial per comprendre l'estreta interacció en el control transcripcional dels gens esmentats i, si s'altera, pot donar lloc a malalties, incloses neoplàsies hematopoètiques. Tot i això, els mètodes convencionals d'estudi exigeixen grans quantitats de material de partida, cosa que resulta poc pràctica per als escenaris clínics i l'anàlisi de poblacions cel·lulars poc freqüents. Per abordar aquesta qüestió, en aquesta tesi hem desenvolupat un mètode rendible i flexible anomenat Low Input Capture Hi-C (liCHi-C), que permet el mapeig detallat i la comparació d'interactomes de promotors a alta resolució utilitzant tan sols 50.000 cèl·lules. Per demostrar la seva versatilitat, hem aplicat liCHi-C per investigar la jerarquia hematopoètica humana normal i maligna utilitzant mostres clíniques. A través d'aquest mètode, hem revelat l'arquitectura dinàmica dels promotors durant l'hematopoesi humana, que ajuda a identificar les vies de desenvolupament i regeix els canvis transcripcionals durant el compromís del destí cel·lular. A més, liCHi-C ha mostrat ser vàlid per identificar tipus cel·lulars, gens i vies rellevants per a malalties que es poden veure afectats per alteracions no codificants en elements reguladors distals. Finalment, hem demostrat el potencial de liCHi-C per descobrir variants estructurals a tot el genoma, determinar-ne els punts de ruptura i inferir-ne els possibles efectes patogènics. El nostre mètode optimitzat liCHi-C amplia enormement l'exploració de l'organització tridimensional de la cromatina a poblacions cel·lulars escasses, oferint l'oportunitat de descobrir factors clau i xarxes reguladores implicades en la patogènesi de malalties.

[es] La estructura tridimensional de la cromatina es una característica clave en la regulación del control de la expresión génica. Comprender las interacciones de largo alcance entre los promotores génicos y los elementos reguladores, como los enhancers, es crucial para comprender la estrecha interacción en el control transcripcional de dichos genes y, si se altera, puede dar lugar a enfermedades, incluidas neoplasias hematopoyéticas. Sin embargo, los métodos convencionales de estudio exigen grandes cantidades de material de partida, lo que resulta poco práctico para los escenarios clínicos y el análisis de poblaciones celulares poco frecuentes. Para abordar esta cuestión, en la presente tesis hemos desarrollado un método rentable y flexible denominado Low Input Capture Hi-C (liCHi-C), que permite el mapeo detallado y la comparación de interactomas de promotores a alta resolución utilizando tan solo 50.000 células. Para demostrar su versatilidad, hemos aplicado liCHi-C para investigar la jerarquía hematopoyética humana normal y maligna utilizando muestras clínicas. A través de este método, hemos revelado la arquitectura dinámica de los promotores durante la hematopoyesis humana, que ayuda a identificar las vías de desarrollo y rige los cambios transcripcionales durante el compromiso del destino celular. Además, liCHi-C ha demostrado ser válido para identificar tipos celulares, genes y vías relevantes para enfermedades que pueden verse afectados por alteraciones no codificantes en elementos reguladores distales. Además, hemos demostrado el potencial de liCHi-C para descubrir variantes estructurales en todo el genoma, determinar sus puntos de ruptura e inferir sus posibles efectos patogénicos. Nuestro método optimizado liCHi-C amplía enormemente la exploración de la organización tridimensional de la cromatina a poblaciones celulares escasas, ofreciendo la oportunidad de descubrir factores clave y redes reguladoras implicadas en la patogénesis de enfermedades.