[en] There is a perfect harmonious condition between the healthy individual and the microbial community that colonizes it. Millions of microorganisms reside within the organism gathered in communities, which survive thanks to the microenvironment that they are provided. The discovery of the microbiome, whose study has revealed the importance of micro pathogens on inflammatory diseases development, such as ulcerative colitis and Crohn's disease, has opened a promising line of biomedical research. Genomic sequencing techniques are revealing as going to be extremely helpful tools in order to know precisely the microbiota´s composition, making it possible to develop targeted therapies, which could so to re-establish intestinal homeostasis. This review is focused on how the alterations on microbiota´s composition, known as dysbiosis, have an effect on the homeostasis of the immune system, leading to an environment susceptible to inflammation. To this aim, published information for the past ten years (including bibliographic reviews, reports and research articles) has been considered.This work is organized into three sections. Along the first section, the most relevant characteristics of human microbiota are explained, with special emphasis on the intestinal mucosae and the alterations found in patients affected by EII. In the second section, the organization of the immune response in the digestive tract is described (the intestinal epithelium characteristics and its produced defensines, immune cells responsible for the innate immune response and their receptors for the recognition of pathogens; the adaptive immune response). Finally, the consequences of a miss-functioning of elements previously mentioned, which results in the onset of inflammatory bowel disease, are presented.

[es] Existe un estado de armonía perfecto entre el individuo sano y la comunidad microbiana que lo coloniza. Ésta la componen millones de microorganismos agrupados en comunidades que sobreviven gracias al microambiente que les proporcionamos. Su caracterización a través de la secuenciación de su genoma ("microbioma"), ha revelado el importante papel patogénico de algunos de estos microorganismos en el desarrollo de enfermedades inflamatorias intestinales (EII), como son la Colitis Ulcerosa (CU) y la Enfermedad de Crohn (EC). Ello ha abierto una prometedora línea de investigación biomédica para desarrollar terapias dirigidas a manipular la microbiota para reestablecer la homeostasis intestinal. Las técnicas de secuenciación genómica están mostrando ser ponderosas herramientas para conocer la precisa composición de la microbiota, haciendo posible el desarrollo de terapias dirigidas a reestablecer la homeostasis intestinal. El objetivo general de este trabajo es describir cómo las alteraciones en la composición de la microbiota, denominadas "disbiosis", repercuten en la homeostasis del sistema inmunológico, creando un ambiente susceptible a la inflamación. Para ello se ha recogido información de varias publicaciones, revisiones bibliográficas y artículos de investigación, publicados en los últimos 10 años.En el primer capítulo se exponen las principales características de la microbiota humana, especialmente en la mucosa intestinal, y las alteraciones observadas en ella en pacientes con EII. Seguidamente se describe la organización celular y funcional de la respuesta inmunitaria en el tubo digestivo (epitelio intestinal y defensinas producidas; peculiaridades de las células de la respuesta inmune innata y de sus receptores para el reconocimiento de los patógenos; la respuesta inmune adaptativa). Finalmente se exponen las consecuencias de un mal funcionamiento de los elementos anteriormente expuestos, en el desencadenamiento de la EII.