[en] In this PhD work, we analyze the population structure of Spanish Trotter Horses (STH) and the procedures for genetic evaluation developed within the official breeding programme; in addition, other methodologies for genetic evaluation are presented in order to present horse breeders with more complete information when selecting future reproducers. Since its admission as an official breed, the population of STH has undergone phenotypic selection of its reproducers, based on the functional performance of the animals in the races held in the different countries. The rapid improvements achieved are mainly due to importing semen and reproducers from other countries, whose descendants have been registered in the STH stud-book at birth, and by the improvement of the environmental conditions (nutrition, management, quality of the tracks, and so on). The massive use of high-quality genetic material originating from the other populations of trotter horses all around the world, mainly French and American Trotters, has stimulated genetic progress in this population, contributing to the maintenance of genetic variability and avoiding inbreeding. Besides, there are important genetic and genealogical connections between the different trotter populations in the world, which makes it possible to make an international genetic evaluation for trotter performance, in which the STH could be considered as a connective population...

[es] En esta Tesis Doctoral se hace un estudio de la estructura poblacional del Caballo Trotador Español (CTE), los procedimientos de evaluación genética desarrollados en su Programa de Mejora oficial y se ponen a punto otras metodologías de valoración genética que proporcionan información más completa en la que basar la selección de los futuros reproductores. Desde su reconocimiento como Raza, la población del CTE se ha sometido una selección fenotípica de los reproductores, basada en el rendimiento funcional de los animales en las carreras celebradas en diferentes países. La rápida mejora se ha conseguido principalmente mediante la importación de semen y de reproductores procedentes de otros países, cuyos descendientes se han registrado al nacimiento en el Libro Genealógico del CTE, y mediante la mejora del medio (alimentación, manejo, calidad de las pistas…). La utilización masiva de material genético de alta calidad procedente de otras poblaciones de caballos trotadores en el mundo, principalmente el Caballo Trotador Francés y Americano, ha favorecido el progreso genético de esta población, contribuyendo a mantener la variabilidad genética y evitando la consanguinidad. Además, esta importación ha permitido una importante conexión genética entre las distintas poblaciones de caballos de trote a nivel mundial, que puede favorecer la realización de una evaluación genética internacional para la aptitud funcional del trote, en la que el CTE podría ser considerado como una población conectora. En esta Tesis Doctoral se analizan los procedimientos de evaluación genética de rutina que se están llevando a cabo sobre el CTE mediante la aplicación de una metodología BLUP modelo animal multivariable con repetibilidad y se comparan con las metodologías desarrolladas en otros países. Actualmente, el CTE se selecciona en base a cuatro variables que, tomadas en conjunto, evidencian la capacidad de rendimiento funcional de un animal en la pista. Estas variables son: las ganancias anuales (con transformación logarítmica), el porcentaje de primeros puestos anuales (con transformación raíz cuadrada), el tiempo por kilómetro y el mejor tiempo por hipódromo y modo de salida. Para el análisis de las ganancias anuales y el porcentaje de primeros puestos anuales, el modelo ha incluido el sexo, el año de nacimiento y el año de carrera como efectos fijos; y el número de participaciones como covariable. El modelo para la variable tiempo por kilómetro ha incluido el sexo, la edad-experiencia de carrera, el año-estación-hipódromo y el tipo de salida como efectos fijos; y la distancia como covariable. Y para el mejor tiempo por hipódromo y modo de salida, el sexo, la edad-experiencia de carrera, el año-estación-hipódromo, el tipo de salida y la clase de distancia se han incluido como efectos fijos...