BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] Our objective was to determine plasma and CSF lipids and oxidative protein damage markers associated with Alzheimer's disease (AD) pathology and progression from mild cognitive impairment to AD. Lipidome and oxidative protein damage markers were determined by chromatography coupled to mass spectrometry for 290 subjects (AD, MCI, control). In CSF and plasma, the lipids most associated with amyloid pathology were from PL, SM, and TG classes. Our CSF data related SM30:1 to tau pathology, and in plasma the levels of FAHFA(34:0) and PC(O-34:3) were associated with pathological levels of Ttau in CSF. Both our CSF and plasma data indicated that ether-linked TGs have predictive power regarding progression and rate of progression. Neither in CSF nor in plasma were the levels of oxidative protein damage markers associated with AD pathology, or progression. Finally, neutral lipids could play an important role in pathological processes of AD progression and, affect time to progression.

[es] El objetivo era determinar el lipidoma plasmático y de LCR y el daño oxidativo proteico asociado a la patología de enfermedad de Alzheimer (EA) y su progresión. Se utilizó técnicas de cromatografía combinada con espectrometría de masas para analizar muestras de 290 individuos. Los lípidos más asociados a la patología amiloide eran de las clases PL, SM y TG. SM30:1 en LCR se asoció con la patología tau, y en el plasma FAHFA(34:0) y PC(O-34:3) se asociaron con Ttau. Los éteres de TG mostraron poder predictivo en cuanto a progresión y velocidad de progresión. Ni en el LCR ni en el plasma los marcadores de daño oxidativo proteico se asociaron a la patología de la EA o la progresión. Por último, los lípidos neutrales podrían desempeñar un papel importante en los procesos patológicos de progresión del EA y, afectar el tiempo hasta la progresión.
[en] In the current era, international immigration is one of the most important, complex and disquieting phenomenon world-wide. As a consequence of its growth, it confronts challenges in the field of: economies, politics, societies, cultures, morals, demographics and ecologies. The study needs to be discussed from different, but complementary points of view. In this sense, our investigation has the goal to identify and analyze, from a qualitative and interdisciplinary perspective – discourse analysis, social psychology and political science – the imaginary socio-discourse of Latin-American immigrants in Catalonia. Through an institutionalized sample, composed with the help of the qualitative discourse group technique, we united 53 Latin-American immigrants (arranged in groups of 9) in order that they alternately speak about their objectives and motivations of their immigration, their experiences, opinions and appreciation with regard to the chosen society, both autochthons as well as the own view of immigrants. In addition we discuss their demands, ambitions and ideals in social life within the Catalan society. We found in the study of imaginary that the integration of Latin-American immigrants in the Catalan society needs to be recognized and it should have the same conditions of equalities before the law, social obligations, cultural, economic and politic equalities with respect to autochthons.

[es] La inmigración internacional es uno de los fenómenos mundiales más importantes, complejos e inquietantes en la época actual a consecuencia de su crecimiento y de los retos sin precedentes que afronta: económicos, políticos, sociales, culturales, morales, demográficos, ecológicos. Su estudio requiere ser abordado desde visiones diferentes pero complementarias. En este sentido, nuestra investigación tiene como objetivo identificar y analizar, desde una perspectiva cualitativa e interdisciplinaria –análisis del discurso, psicología social y ciencia política–, el imaginario sociodiscursivo de inmigrantes latinoamericanos en Catalunya, a través de un corpus instituido mediante el uso de la técnica cualititativa grupos de discusión, en el que reunimos a 53 inmigrantes latinoamericanos (en 9 agrupaciones) para que conversaran en torno a los objetivos, motivaciones de su migración, sus experiencias, opiniones y apreciaciones acerca de la sociedad de acogida, de los autóctonos y de los propios inmigrantes, además de sus demandas, anhelos e ideales en la vida social dentro de la sociedad catalana. Hallamos en el imaginario que la integración de los inmigrantes latinoamericanos en la sociedad catalana significa ser reconocidos y estar en las mismas condiciones de igualdad de derechos y obligaciones sociales, culturales, económicas y políticas con respecto a los autóctonos.
[en] The aim of this thesis is the development and implementation of a set of data mining tools to aid in the reconstruction of biological circuits through analysis and integration of large biological datasets. These circuits are important because they regulate and maintain life and health in organisms. The main part of the thesis is focused on analyzing bibliomic data for which I develop two tools, Biblio-MetReS for the reconstruction of PPIs networks and to identify the processes in which the networks are involved, and CheNER for the identification of chemical compounds names. The final tool developed focuses on the integration of methods for structural analysis and modeling of proteins with docking methods for prediction of native protein-protein physical complexes.

[es] El objetivo de esta tesis es desarrollar e implementar un conjunto de herramientas de minería de datos para ayudar en la reconstrucción de circuitos biológicos a través del análisis y la integración de grandes conjuntos de datos biológicos. Estos circuitos son importantes porque regulan todos los procesos que controlan la vida y la salud de los organismos. El trabajo principal de la tesis se centra en el análisis de los datos bibliómicos, desarrollándose con este fin dos herramientas diferentes, Biblio-MetReS para la reconstrucción de redes PPIs y la identificación de los procesos en que intervienen estas redes, y CheNER para la identificación de nombres de compuestos químicos. La herramienta final que he desarrollado se centra en la integración de métodos para el análisis estructural y modelado de proteínas con métodos de acoplamiento para la predicción de complejos físicos de proteína-proteína.
[en] Ptf1a/p48 is a pancreas specific bHLH transcription factor that is required at early stages of embryonic development for pancreas formation and, during adulthood, for the proper exocrine pancreatic function. P48 also exerts an antiproliferative effect, which may exert a tumor suppressor activity. In this study, based on a yeast two-hybrid approach, we have identified new p48 partners that modulate the activity of p48. Among the newly identified putative interactors we found p/CAF, which is a coactivator that potentiates its transcriptional activity, and ICAT, an inhibitor of the &#946;-catenin/TCF signaling pathway. ICAT binds to p48 and is coexpressed with it in the pancreas during development and postnatally. Using different cellular models, ICAT overexpression in acinar tumor cells resulted in changes of the pancreatic specific gene expression pattern. Furthermore, high levels of ICAT inhibited the interaction between p48 and p/CAF. While this hetero-oligomeric complex is required for the acinar gene expression, ICAT itself is shown to be present in a reconstituted PTF1 complex in vivo. Importantly, altered ICAT expression is demonstrated in several histological types of pancreatic tumors, possibly contributing to their differentiation phenotype and neoplastic properties.

[es] Ptf1a/p48 es un factor de transcripción bHLH específico del páncreas necesario durante los estadios tempranos del desarrollo embrionario para la formación del mismo, y para el correcto funcionamiento del páncreas exocrino en el adulto. P48 desempeña también una función antiproliferativa, la cual puede resultar en una actividad de supresión tumoral. En el presente estudio, basado en una estrategia de cribado de doble-híbrido en levadura, han sido identificadas nuevas proteínas que interaccionan y que modulan la actividad específica de p48. Entre las posibles proteínas que interaccionan y han sido identificadas de novo se encuentra p/CAF, un co-activador que potencia la actividad transcripcional de p48, y ICAT, un inhibidor de la vía de señalización de la &#946;-catenina. Se ha demostrado que ICAT se une a p48 y ambos son co-expresados en el páncreas durante el desarrollo y en el adulto. Utilizando diferentes modelos celulares, la sobreexpresión de ICAT en células tumorales acinares resultó en un cambio en el patrón de expresión de genes específicos del páncreas. Al mismo tiempo, se observó que niveles elevados de ICAT inhiben la interacción entre p48 y su co-activador p/CAF. Mientras que este complejo hetero-oligomérico es necesario para la expresión de los genes acinares, se demostró que ICAT está presente en un complejo PTF1 reconstituido in vivo. Finalmente, se observaron alteraciones en la expresión de ICAT en varios tipos histológicos de tumores pancreáticos, que posiblemente contribuyen a su fenotipo de diferenciación y propiedades neoplásicas.
[en] The constant demand for enantiomerically pure compounds (drugs, agrochemicals, additives ...) has driven the development of asymmetric catalysis using chiral organometallic compounds as catalysts. In this context, the synthesis of new chiral ligands is essential to discover good catalytic systems in asymmetric catalysis. This thesis has focused on the development of three new heterodonating chiral ligand libraries and their application to Pd-catalyzed allylic substitutions. These are ligand libraries stable in the air, easy to handle and have been synthesized in a few steps from readily available products and at low price. Combining theoretical studies and NMR spectroscopy, we were able to rationally fine-tune the ligands, improve enantioselectivity, and identify the species responsible for catalytic performance. In addition, the resulting allylic substitution products were successfully used for the synthesis of more complex molecules.

[es] La demanda constante de compuestos enantioméricamente puros (fármacos, agroquímicos, aditivos...) ha impulsado el desarrollo de la catálisis asimétrica empleando compuestos organometálicos quiral como catalizadores. En este contexto, la síntesis de nuevos ligandos quirales es esencial para descubrir buenos sistemas catalíticos en catálisis asimétrica. Esta tesis se ha centrado en el desarrollo de tres nuevas ligandotecas quirales heterodadoras y su aplicación a la sustitución alílica catalizada por paladio. Se trata de ligandotecas estables al aire, de fácil manipulación y que se han sintetizado en pocas etapas a partir de productos de elevada disponibilidad y bajo precio. Combinando estudios teóricos y espectroscopia de RMN, hemos podido afinar racionalmente a los ligandos, mejorar la enantioselectividad e identificar las especies responsables de los resultados catalíticos. Además, los productos de sustitución alílica resultantes se utilizaron exitosamente para la síntesis de moléculas más complejas.
[en] The depiction of masculinities in interaction with racist stereotypes in the Centro Habana Cycle by the Cuban writer Pedro Juan Gutiérrez embodies a field of discussion in which different images of "race", mestizaje and sexuality converge. Our research examines the discursive plots that, since hyperbole, establish the distinctions, between different characters, that reinforce the idea of subalternity in terms of the conception of the masculinity of the black man and mulatto. In this order we will resort to discussing with the daily processes of enunciations, present in the novels, within the Special Period, which point to the boundaries that visualize the conflicting relationship between racial and gender identities.

[es] La representación de las masculinidades en interacción con los estereotipos racistas en el Ciclo de Centro Habana del escritor cubano Pedro Juan Gutiérrez personifica un campo de discusión en el que convergen diferentes imágenes sobre la "raza", el mestizaje y la sexualidad. Nuestra investigación examina las tramas discursivas que desde la hipérbole, establecen las distinciones, entre diferentes personajes, que refuerzan la idea de subalternidad en cuanto a la concepción de la masculinidad del hombre negro y mulato. En ese orden recurriremos a debatir con los procesos cotidianos de enunciación, presente en las obras, dentro del Periodo Especial, que señalan las fronteras que visualizan la relación conflictiva entre las identidades raciales y de género.
[en] The hypothesis of the research is that networks of cities generate external network economies. Therefore, the objective of this research is to advance the study of whether networks of cities generate external economies that influence economic growth and development. The unit of analysis is the urban unit. The urban unit (city, municipality) is an intermediate economic unit between the productive process and the economic system as whole. The research is structured in four parts: the first part, of theoretical nature, introduces the paradigm of networks of cities (chapter 1), the foundations of the network economies (chapter 2), and a collection of documented cases of networks of cities (chapter 3); the second part is dedicated to the design of methodologies for the identification of networks of cities (chapter 4), and its application to a case study of the municipalities of Catalonia (chapter 5); the third part is dedicated to the design of methodologies for the measurement of the external network economies (chapter 6), and its application to the case study (chapter 7); chapter 8 introduces the economic policy associated to the networks of cities, and chapter 9 offers the general conclusions of the research. The main conclusion is that there is a causal relationship between the organization of the economic units forming networks of cities and the generation of external economies that influence economic growth.

[es] La hipótesis de la investigación es que en las redes de ciudades se generan economías externas de red. Por tanto, el objetivo de la investigación es avanzar en el estudio de la relación entre las redes de ciudades y la generación de economías externas que afectan al crecimiento y al desarrollo económico. La unidad de análisis es la unidad urbana. La unidad urbana (ciudad, municipio) es una unidad económica intermedia entre el proceso productivo y el conjunto del sistema económico. La investigación se estructura en cuatro bloques: el primero, de naturaleza teórica, introduce el paradigma de las redes de ciudades (capítulo 1), los fundamentos de las economías de red (capítulo 2), y una colección de casos documentados de redes de ciudades (capítulo 3); el segundo bloque se dedica al diseño de metodologías para la identificación de redes de ciudades (capítulo 4), y a su aplicación sobre el caso de estudio: los municipios de Cataluña (capítulo 5); el tercer bloque se dedica al diseño de metodologías para la medición de las economías externas de red (capítulo 6), y su aplicación sobre el caso de estudio (capítulo 7); el capítulo 8 introduce brevemente las políticas económicas asociadas a las redes de ciudades, y en el capítulo 9 se ofrecen las conclusiones generales de la investigación. La principal conclusión es que existe una relación causal entre la organización de las unidades urbanas formando redes de ciudades y la generación de economías externas que afectan al crecimiento y desarrollo económico.
[en] This thesis investigates the design process of mobile-based narratives to verify whether the affordances and constraints of the supporting medium have contributed to shaping specific discursive strategies and particular participation modes. Have properties such as connectivity, location-awareness, portability and multimodality enabled narrative formats that gained force by contesting traditional patterns and classic narrativity notions? The unveiling of the research inquiry happens through a bricolage of methods from artistic and scientific domains. The study of the phenomenon comprises three correlated stages: 1) theoretical literature review that investigates the artistic use of locative and mobile media, and their influence in the basic principles governing narratives, 2) case study of Blast Theory artistic practice grounded in the ethnographic approach of a site-visit, and resulting in a qualitative analysis of four of their projects, 3) applied-theory activities that lead to the collaborative development of a geolocated narrative which serves to evaluate participant's experience.

[es] Esta tesis explora el diseño de las narrativas basadas en dispositivos móviles observando si los recursos expresivos y las limitaciones del medio contribuyen a la formación de estrategias discursivas y modos de participación particulares y específicos. La conectividad, la geolocalización, la portabilidad y la multimodalidad han permitido la aparición de nuevos formatos narrativos que ganan fuerza disputando los patrones y las nociones clásicas de la narratividad? El estudio comprende tres etapas: 1) revisión de la literatura teórica que investiga el uso artístico de los locative media y su influencia en los principios básicos que rigen las narrativas, 2) estudio de caso de la práctica artística del colectivo Blast Theory, basada en el abordaje etnográfico de una visita de campo y posterior análisis cualitativo de cuatro de sus obras, 3) actividades de teoría aplicada que incluyen el desarrollo colaborativo de una narrativa geolocalizada que sirve para evaluar la experiencia de los participantes.
[en] There are two main subjects in this thesis: the first one deals with the numerical simulation of shallow water equations, the other one is the resolution of some problems in image processing The first part of this dissertation is devoted to the shallow waters. We propose a combined scheme which uses the Marquina's double flux decomposition (extended to the non homogeneous case) when adjacent states are not close and a single decomposition otherwise. This combined scheme satisfies the exact C property. Furthermore, we propose a special treatment of the numerical scheme at dry zones. The second subject is the digital simulation of the Day for Night (or American Night in Europe). The proposed algorithm simulates a night image coming from a day image and considers some aspects of night perception. In order to simulate the loss of visual acuity we introduce a partial differential equation that simulates the spatial summation principle of the photoreceptors in the retina. The gap restoration (inpainting) on surfaces is the object of the third part. For that, we propose some geometrical approaches based on the mean curvature. Then, we also use two interpolation methods: the resolution of the Laplace equation, and an Absolutely Minimizing Lipschitz Extension (AMLE). Finally, we solve the restoration problem of satellite images. The variational problem that we propose manages to do irregular to regular sampling, denoising, deconvolution and zoom at the same time.

[es] Los temas tratados en esta tesis son, por un lado, la simulación numérica de las ecuaciones de aguas someras ("shallow waters") y por otro, la resolución de algunos problemas de procesamiento de imágenes. En la primera parte de la tesis, dedicada a las aguas someras, proponemos un esquema combinado que usa la técnica de doble descomposición de flujos de Marquina (extendida al caso no homogéneo) cuando los dos estados adyacentes no están próximos y una única descomposición en caso contrario. El esquema combinado verifica la propiedad C exacta. Por otro lado, proponemos un tratamiento especial en las zonas secas. El segundo tema tratado es la simulación digital de la Noche Americana ("Day for Night"). El algoritmo propuesto simula una imagen nocturna a partir de una imagen diurna considerando varios aspectos de la percepción visual nocturna. Para simular la pérdida de agudeza visual se propone una ecuación en derivadas parciales que simula el principio de sumación espacial de los fotoreceptores situados en la retina. La restauración de agujeros ("inpainting") en superficies es objeto de la tercera parte. Para ello se proponen varios enfoques geométricos basados en la curvatura media. También se utilizan dos métodos de interpolación: la resolución de la ecuación de Laplace y el método AMLE (Absolutely Minimization Lipschitz Extension). Por último, tratamos la restauración de imágenes satelitales. El método propuesto consigue obtener una colección de muestras regulares a partir de un muestreo irregular, eliminando a la vez el ruido, deconvolucinando la imagen y haciendo un zoom.
[en] The main aim of this dissertation is to study the depiction of the posthuman in the science fiction genre. Taking into consideration the significance of the genre's history, this thesis will contend that the posthuman flourishes after the eighties and nineties. Evolving from the cyborg, the posthuman portrays the ways in which technoscience may alter and improve humanity. Broadly, it will be defined as an enhanced human —normally through technological means but also as the result of natural phenomena— that becomes the next stage in human evolution. In addition, this thesis will look into the interrelation between science fiction and the field of posthumanism, the key area in the debate of how technology is changing our society, culture and identity, and how it can even shape our future as a species. The subject of study, then, will be the science fiction literature written in English from the period 1995-2015, taking also into account the development of posthuman fiction during the genre's history. Five specific case studies will illustrate the topics discussed: the novels Old Man's War (2005) by John Scalzi, Richard Morgan's Altered Carbon (2002), Paolo Bacigalupi's The Windup Girl (2009), Paul McAuley's Fairyland (1995), and Greg Bear's Darwin's Children (2003).

[es] El principal objetivo de esta tesis es estudiar la representación del posthumano en la ciencia ficción. Teniendo en cuenta la influencia de distintas corrientes en la historia del género, se expondrá que el posthumano se consolida como un icono de la ciencia ficción a partir de los años ochenta y noventa. Separándose del cyborg, el posthumano representa de forma más específica cómo la tecnociencia puede transformar nuestra especie. A rasgos generales será definido como el icono que, partiendo del concepto del mejoramiento humano, imagina la evolución o creación de una nueva versión del ser humano, normalmente a través de medios tecnológicos pero a veces también a causa de fenómenos naturales, y que plantea un conflicto con nuestro concepto de la identidad humana. Asimismo, se pretende estudiar la relación y el encaje entre la ciencia ficción y el campo interdisciplinario del posthumanismo, que en la actualidad constituye un ámbito clave para interrogar el impacto de la tecnología en nuestra sociedad, cultura, identidad e incluso nuestro futuro como especie. Para ello se abordarán distintos aspectos de la representación del posthumano compartidos por el posthumanismo y la ciencia ficción. El objeto de estudio principal será la literatura de ciencia ficción escrita en inglés, del periodo 1995 a 2015, sin ignorar el desarrollo de la idea del posthumano en la historia del género. Cinco casos de estudio específicos ilustrarán los aspectos tratados: las novelas Old Man's War (2005) de John Scalzi, Altered Carbon (2002) de Richard Morgan, The Windup Girl (2009) de Paolo Bacigalupi, Fairyland (1995) de Paul McAuley, y Darwin's Children (2003) de Greg Bear.