BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] Introduction: Q fever is a zoonotic disease caused by Coxiella burnetii, a highly infectious pathogen known for its resistance to harsh environmental conditions and its wide range of animal reservoirs. Human transmission occurs primarily through inhalation of pseudospores. Method: A comparative analysis of human Q fever between cases notified to the Spanish National Epidemiological Surveillance Network (RENAVE) and cases compiled in the Specialized Healthcare Activity Registry – Minimal Basic Data Set (RAE-CMBD) in Spain from 2016 to 2022 was performed. Individual, time and space variables were analyzed. Frequencies, percentages and notification/hospitalization rates (NR/HR) per 100,000 inhabitants were calculated. Results: A total of 2,429 cases were reported to RENAVE (NR = 0.74), while 2,991 hospitalizations were recorded in RAE-CMBD (HR = 0.91). Men accounted for 72% of the cases and mean age was 47 (RENAVE) and 54 (RAE-CMBD) years. Communities with the highest number of notifications to RENAVE were Canary Islands, Andalucia and Basque Country; those with higher RAE-CMBD registries were Andalucia, Canary Islands and Madrid Community. The highest NR/HR were observed in the Canary Islands (NR = 3.95, HR = 2.95). Conclusions: Q fever is an endemic disease in Spain, where an increasing trend is observed in the number of cases in recent years. The analysis suggests underreporting to RENAVE, highlighting the need for improved data quality and collection and enhanced surveillance efforts.

[es] Introducción: La fiebre Q es una zoonosis causada por Coxiella burnetii, un agente con alta capacidad infecciosa, extremadamente resistente a condiciones medioambientales adversas y con gran número de reservorios animales. La transmisión a humanos sucede fundamentalmente por inhalación de pseudoesporas. Método: Se realizó un análisis comparativo de casos de fiebre Q humanos notificados a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE) y casos recogidos por el Registro de Actividad de Atención Especializada – Conjunto Mínimo Básico de Datos (RAE-CMBD) en España entre 2016 y 2022. Se analizaron variables de persona, tiempo y lugar. Se calcularon frecuencias, porcentajes y tasas de notificación/hospitalización (TN/TH) por 100.000 habitantes. Resultados: Se notificaron 2.429 casos a la RENAVE (TN = 0,74) y se registraron 2.991 hospitalizaciones en el RAE-CMBD (TH = 0,91). El 72% de los casos fueron hombres y la edad media fue 47 (RENAVE) y 54 años (RAE-CMBD). Las comunidades con más notificaciones a la RENAVE fueron Canarias, Andalucía y País Vasco; aquellas con más registros en el RAE-CMBD fueron Andalucía, Canarias y Comunidad de Madrid. Las TN/TH más altas se observaron en Canarias (TN = 3,95, TH = 2,95). Conclusiones: La fiebre Q es endémica en España donde existe una tendencia ascendente del número de casos en los últimos años. El análisis realizado sugiere una infranotificación a la RENAVE y parece necesario seguir trabajando para mejorar la calidad de los datos recogidos por el sistema de vigilancia epidemiológica y el control de esta infección.
[en] Introduction: Tuberculosis (TB) has a high burden of morbidity and mortality, being the leading cause of mortality due to an infectious agent in the world, only recently surpassed by COVID-19. The aim of this study was to analyse the spatio-temporal evolution of TB mortality in Spain between 2008-2021. Method: Descriptive epidemiological analysis of TB deaths registered in the National Institute of Statistics (INE) during 2008-2021. The variables analysed were sex, age, province and year of death. A descriptive analysis of the main variables and a temporal-spatial analysis of mortality rates (MR) and standardised mortality ratios (SMR) were performed. Results: Between 2008 and 2021, 3,876 TB deaths were reported, with an average MR of 0.6 per 100,000 population. More than 60% of deaths occurred in people over 75 years old. There was a decreasing trend in the MR with an average annual percentage change (APC) of -5.2%. A higher number of deaths was observed in men (64.1%), as well as a greater decrease in their MR (PACMA -5.5% vs. -4.5% in women). All provinces decreased their MR except Palencia, Cantabria and Huesca. SMRs were distributed differently according to sex, with an excess of observed deaths over expected deaths in men. Conclusions: The TB MR in Spain has followed a downward trend since 2008, although with an unequal pattern and evolution by sex and province. Further studies are needed to explain the differences observed.

[es] Introducción: La tuberculosis (TB) presenta una elevada carga de morbimortalidad, siendo la principal causa de mortalidad por agente infeccioso en el mundo, sólo superada recientemente por la COVID-19. El objetivo de este estudio fue analizar la evolución espacio temporal de la mortalidad por TB en España entre 2008-2021. Método: Análisis epidemiológico descriptivo de los casos de defunción por TB registrados en el Instituto Nacional de Estadística (INE) durante 2008-2021. Las variables analizadas fueron sexo, edad, provincia y año de defunción. Se realizó análisis descriptivo de las variables principales y un análisis espacio temporal de las tasas de mortalidad (TM) y las razones de mortalidad estandarizadas (RME). Resultados: Del 2008 al 2021, se notificaron 3.876 decesos por TB, con una TM media de 0,6 por 100.000 habitantes. Más del 60% de las defunciones fueron en mayores de 75 años. Se observó una tendencia decreciente en las TM con un porcentaje de cambio medio anual (PCMA) de -5,2%. Se observó un mayor número de muertes en hombres (64,1%), así como una mayor disminución en sus TM (PACMA -5,5% vs -4,5% en mujeres). Todas las provincias descendieron sus TM excepto Palencia, Cantabria y Huesca. Las RME se distribuyeron de forma diferente según las provincias y según el sexo, con mayores RME en hombres. Conclusiones: La TM por TB en España ha seguido una tendencia descendente desde 2008, aunque con un patrón y evolución desigual por sexo y provincia. Es necesario realizar más estudios que permitan explicar las diferencias observadas.
[en] Introduction: Leptospirosis is a zoonotic infectious disease caused by spirochete bacteria Leptospira interrogans and transmitted to humans through direct or indirect contact with infected animals, especially rodents. The objective was to describe the epidemiology of leptospirosis in Spain during 2023 within the context of the 2015-2023 period. Method: A descriptive analysis of leptospirosis cases in Spain from 2015 to 2023 was conducted using the Spanish National Epidemiological Surveillance Network (RENAVE). The variables analysed were: sex, age, Autonomous Community, hospitalisation and death. Results: In 2023, 64 cases were reported to RENAVE with a notification rate (NR) = 0.13 From 2015 to 2023, 362 cases were reported (NR 0.09). NR peaked in 2018 (NR = 0.15). Throughout this period, the number of cases and NR were consistently higher in men (NR = 0.14) and reached their highest in the 25-34 age group (NR = 0.13). The most affected communities were Extremadura (NR = 0.39), the Basque Country and the Canary Islands (NR = 0.34). In the whole period, 62% of cases required hospitalisation and the case fatality rate was 0.84%. Conclusions: Between 2015-2023, leptospirosis NR has been relatively stable around 0.10 cases per 100,000 inhabitants. Despite this, it is important to continue implementing preventive and informative measures to avoid future outbreaks.

[es] Introducción: La leptospirosis es una enfermedad infecciosa zoonótica producida por espiroquetas patógenas del género Leptospira y transmitida al ser humano por contacto directo o indirecto con animales infectados, fundamentalmente roedores. El objetivo fue describir la epidemiología de esta enfermedad en España durante 2023, en el contexto del periodo 2015-2023. Método: Análisis descriptivo de los casos de leptospirosis en España durante los años 2015-2023, a partir de la notificación a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE). Las variables analizadas fueron: sexo, edad, comunidad autónoma, hospitalización y defunción. Resultados: En 2023 se notificaron a la RENAVE 64 casos con una tasa de notificación (TN) = 0,13. Durante el periodo 2015-2023 se registraron 362 casos y TN de 0,09. Esta tasa alcanza un máximo en 2018 (TN = 0,15). El número de casos y la TN fue mayor en hombres a lo largo de todo el periodo (TN = 0,14), y fue máxima en el grupo de 25-34 años (TN = 0,13). Las comunidades más afectadas fueron Extremadura (TN = 0,39), País Vasco y Canarias (TN = 0,34). En todo el periodo el 62% de los casos requirió hospitalización y la letalidad fue del 0,84%. Conclusiones: Entre 2015-2023, la leptospirosis ha tenido una TN relativamente estable en torno a 0,10 casos por 100.000 habitantes. A pesar de todo, es importante seguir aplicando medidas preventivas dentro del enfoque Una Salud para evitar futuros brotes.
[en] Introduction: Epidemiological analysis of invasive Haemophilus influenzae disease (IHD) in Spain during 2023 and its comparison with previous years (2015-2022). Method: Descriptive epidemiological analysis of IHD cases reported to the National Epidemiological Surveillance Network (RENAVE) in 2023. The variables analyzed were: sex, age group, date of onset of symptoms, reporting region, death, clinical manifestation, and serotype. Results: In 2023, 674 cases of IHD were reported (54% men) with a cumulative incidence rate of 1.39 (number of cases per 100,000 inhabitants). The highest incidence rates in 2023 were observed in children under 1 year of age and in the population aged 85 years and over. During this year, the typical seasonal pattern of this disease was recovered, with a higher number of cases of IHD in autumn and winter. The most frequent clinical manifestation, regardless of age, was bacteremic pneumonia (27.9% of cases). 80.4% of deaths occurred in the 65-year-old age group. The serotype of most reported cases of HIE is unknown. Discussion: In 2023, the highest cumulative incidence in the last 9 years was recorded. Improved reporting of microbiological characterization data is crucial for conducting surveillance of this disease and for evaluation of the vaccination program.

[es] Introducción: Descripción del análisis epidemiológico de la enfermedad invasiva por Haemophilus influenzae (EIH) en España durante 2023 y su comparación respecto a años anteriores (2015-2022). Método: Análisis epidemiológico descriptivo de los casos de EIH notificados a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE) en 2023. Las variables analizadas fueron: sexo, grupo de edad, fecha de inicio de síntomas, comunidad o ciudad autónoma que notifica, defunción, manifestación clínica y serotipo. Resultados: En 2023 se notificaron 674 casos de EIH (54% hombres) con una tasa de incidencia acumulada de 1,39 (número de casos por 100.000 habitantes). Las mayores tasas de incidencia en 2023 se observaron en menores de 1 año y en la población de 85 y más años. Durante este año se recuperó el patrón estacional típico de esta enfermedad, con un mayor número de casos de EIH en otoño e invierno. La manifestación clínica más frecuente independientemente de la edad fue la neumonía bacteriémica (46,1% de los casos). El 80,4 % de las defunciones ocurrieron en el grupo de 65 años o más. Se desconoce el serotipo de la mayoría de los casos de EIH notificados. Discusión: En 2023 se registró la mayor incidencia acumulada de los últimos 9 años. La mejora de la notificación de los datos de caracterización microbiológica es crucial para llevar a cabo la vigilancia de esta enfermedad y para la evaluación del programa de vacunación.
[en] Introduction: hydatidosis is a zoonosis typically diagnosed late and/or incidentally, caused by the parasite Echinococcus. The notification rate in Spain has been decreasing since it was included as a notifiable disease. The aim of this work is to describe the situation and evolution of human hydatidosis in Spain since 2015, with special emphasis in the last year 2023. Method: a descriptive analysis was conducted of the cases of hydatidosis reported to the National Epidemiological Surveillance Network (RENAVE) since 2015, with a special emphasis on the year 2023. Variables such as age, sex, autonomous community of residence, and exposure were analyzed. Frequencies, percentages, notification rates were calculated, and maps were created. Results: Between 2015 and 2023, 710 indigenous cases of hydatidosis were reported, with a peak in 2015 (154 cases) and decline until 2019, followed by a slight increase in 2021. In 2023, 71 indigenous cases were reported, of which 39.4% were hospitalizated, although no deaths were recorded. In 2023, the highest notification rates were observed in Extremadura, La Rioja, and C.F. Navarra, while the lowest rates were in the Comunitat Valenciana, País Vasco, and Cataluña. Discussion: a decrese in notification followed by an uptick suggests the effectiveness of control measures but also indicates persistent challenges. The presence of imported cases and regional variability reflects socioeconomic, cultural or environmental factors that must be considered in control and prevention strategies.

[es] Introducción: la hidatidosis es una zoonosis de diagnóstico normalmente tardío y/o casual provocada por parásitos del género Echinococcus. La tasa de notificación en España ha ido disminuyendo desde que fue incluida como enfermedad de declaración obligatoria. El objetivo de este trabajo es describir la situación y evolución de la hidatidosis humana en España desde 2015 hasta 2023. Método: se realizó un análisis descriptivo de los casos de hidatidosis notificados a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE) desde 2015, con especial hincapié en el año 2023. Se analizaron variables como edad, sexo, comunidad autónoma de residencia y exposición. Se calcularon frecuencias, porcentajes, tasas de notificación y se realizaron mapas. Resultados: entre 2015-2023, se notificaron 710 casos de hidatidosis autóctonos, con un dato máximo en 2015 (154 casos) y disminución hasta 2019, seguida de un ligero aumento en 2021. En 2023, se notificaron 71 casos autóctonos de los cuales un 39,4% estuvieron hospitalizados, aunque no se registró ningún fallecimiento. En el 2023 las tasas de notificación más altas se observaron en Extremadura, La Rioja y Región Foral de Navarra, mientras que las más bajas correspondieron a la Comunidad Valenciana, País Vasco y Cataluña. Discusión la disminución en la notificación, seguida por un repunte sugiere la efectividad de las medidas de control pero, también indica desafíos persistentes. La presencia de casos importados y la variabilidad regional implican factores socioeconómicos, culturales o ambientales que deben considerarse en las estrategias de control y prevención.
[en] Introduction: Rabies is a highly lethal zoonosis caused by various types of Lyssavirus, and transmitted to humans mainly by dogs. Spain has been free of terrestrial rabies on the peninsula and islands since 1978, but sporadic cases in animals are reported in Ceuta and Melilla, and some imported human cases. The objective was to describe the cases of this disease in humans and terrestrial animals in Spain in the 21st century. Method: A descriptive analysis of rabies cases in Spain from 2000 to 2023 was performed, based on notification to the Spanish National Epidemiology Network (RENAVE). For humans, the variables analyzed were sex, age, place of residency, type of virus, transmitting animal, vaccination, and mortality; for terrestrial animals, only the species were described. Results: During the study period, 2 human cases of rabies were reported, one in 2014 and other in 2019, both imported from Morocco. In terrestrial animals, 80 cases were declared, most in dogs, all of them in Ceuta and Melilla except for one case imported into the peninsula. Conclusions: Rabies is a controlled disease in Spain. It is important to maintain adequate prevention, surveillance and control to avoid re-emergence into our country.

[es] Introducción: La rabia es una zoonosis de alta letalidad causada por varios tipos de Lyssavirus y transmitida a los humanos principalmente por perros. España está libre de rabia terrestre en la península e islas desde 1978, pero se continúan notificando casos esporádicos en animales en Ceuta y Melilla y, esporádicamente, algún caso humano importado. El objetivo fue describir los casos de esta enfermedad en humanos y animales terrestres en España en el siglo XXI. Método: Análisis descriptivo de los casos con diagnóstico de rabia en España entre los años 2000-2023, a partir de la notificación a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE). Para humanos se analizaron las variables sexo, edad, lugar de residencia, tipo de virus, animal transmisor, vacunación y mortalidad. Para animales se describen las especies terrestres afectadas. Resultados: Durante el periodo estudiado se notificaron 2 casos de rabia humana, en 2014 y en 2019, ambos importados de Marruecos. En animales terrestres se declararon 80 casos, la mayoría en perros, y todos en Ceuta y Melilla, salvo un caso importado en la península. Conclusiones: La rabia es una enfermedad controlada en España. Es importante mantener una adecuada prevención, vigilancia y control para evitar la reemergencia en nuestro país.
[en] Introduction: varicella vaccine is available in Spain since 1998; initially was recommended for high-risk groups and their contacts. In 2005, it was recommended for susceptible adolescent, too. Since 2016, varicella vaccine is part of the childhood vaccination schedule with two doses. Method: All varicella cases reported to the National Epidemiological Surveillance Network (RENAVE) between 1997 and 2023 has been analysed. Incidence rate has been calculated for different regions, sex and age group. Vaccination history of varicella cases were analysed. Results: The varicella incidence rate ranged from 300 to 600 cases per 100,000 inhabitants before 2016. After universal childhood vaccination, incidence rate fell to 160 cases per 100,000 inhabitants. Since 2020, this figure has remained below 20 cases per 100,000 inhabitants per year. The most affected age group continues to be children between 1 and 4 years old. Overall, 6.0% of varicella reported cases had received at least one dose of the vaccine (16.3% of all the cases reported from 2017 onwards). Discussion: The universal childhood varicella vaccination has decreased varicella incidence rate. Children between 1 and 4 years of age have been most impacted. As the varicella vaccination program is consolidated, the percentage of varicella cases with a history of vaccination increases.

[es] Introducción: La vacuna de la varicela está disponible en España desde 1998 e inicialmente se recomendó en grupos de riesgo y sus contactos. En 2005 se incluyó en calendario de vacunación en adolescentes susceptibles. Desde 2016 está recomendada la vacunación universal con dos dosis en la infancia Método: Análisis epidemiológico descriptivo de los casos de varicela notificados a la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE) en el periodo comprendido entre 1997-2023. Se calcularon las tasas de incidencia acumulada (TI) total, por comunidad autónoma y por grupo de edad y sexo y se analizó el antecedente de vacunación. Resultados: Antes de 2016, la TI de varicela oscilaba entre los 300 y los 600 casos por 100.000 habitantes. Tras la introducción de la vacuna la TI descendió hasta los 160 y desde 2020 es siempre inferior a 20 casos por 100.000 habitantes al año. El grupo de edad más afectado sigue siendo el de niños de 1 a 4 años. Globalmente, el 6,0% de los casos de varicela notificados habían recibido alguna dosis de vacuna (16,3% de los casos notificados a partir de 2017). Discusión: Aunque desde 2005 se venía observando un paulatino descenso en las TI de varicela, es a partir de 2016 (con la incorporación de la vacunación sistemática en la infancia) cuando este descenso se hace muy marcado, sobre todo en el grupo diana de vacunación, los niños entre 1 y 4 años. A medida que se consolida el programa de vacunación, crece el número de casos de varicela previamente vacunados.
[en] Introduction: Throughout the COVID-19 pandemic, several outbreaks of SARS-CoV-2 in long-term care facilities (LTCF) for elderly have been reported worldwide, even after high vaccination coverage, especially with the arrival of SARS-CoV-2 Omicron variant. The aim of this study is to characterize those outbreaks reported voluntarily during the Delta and Omicron periods in Spain and to compare attack rates, hospitalised cases and deaths in residents and staff members between both periods. Method: The information has been collected following the protocol developed by the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). A descriptive analysis of outbreaks reported from June-2021 to August-2022 has been performed. Attack rates (AT) and percentage of hospitalised cases and deaths by Delta or Omicron period have been calculated for residents and staff members. Results: 405 outbreaks with 6.389 cases among residents and 1.859 cases among staff have been studied. 98,5% of resident cases and 96% of staff cases were fully vaccinated (primary series of vaccination completed). Attack rates (AT) in residents and staff members was higher during the Omicron period (25.1% vs 15.5% and 10.8% vs 5.9%, respectively). The percentage of severe cases (hospitalised cases and deaths) was lower in the Omicron period (in residents and staff members). Conclusions: Omicron period is characterized by high transmissibility with outbreaks with higher AT than Delta period, but lower severity (hospitalised cases and deaths), both for residents and staff members.

[es] Introducción: Durante toda la pandemia de COVID-19 se han notificado numerosos brotes de SARS-CoV-2 en centros residenciales de mayores a nivel mundial, incluso tras conseguirse altas coberturas vacunales, especialmente con la llegada de la variante Ómicron. El objetivo de este estudio es caracterizar aquellos brotes notificados voluntariamente durante los períodos de predominio circulante de las variantes Delta y Ómicron en España y comparar tasas de infección, hospitalización y fallecimiento en residentes y trabajadores entre ambos periodos. Método: La información ha sido recogida siguiendo el protocolo desarrollado por el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC). Se ha realizado un análisis descriptivo de brotes notificados de junio-2021 a agosto-2022. Se han calculado tasas de ataque (TA) y porcentaje de hospitalización y fallecimientos por periodo Delta u Ómicron para residentes y trabajadores. Resultados: Se han estudiado 405 brotes que afectaron a 6.389 residentes y 1.859 trabajadores. 98,5% de los casos en residentes y 96% en trabajadores tenían la pauta vacunal primaria completa. La tasa de ataque (TA) en residentes y en trabajadores fue superior durante el período Ómicron (25,1% vs 15,5% y 10,8% vs 5,9%, respectivamente). El porcentaje de casos graves (hospitalizados y exitus) fue menor en el periodo Ómicron (en residentes y trabajadores). Conclusiones: El periodo Ómicron se caracteriza por una alta transmisibilidad con brotes con mayores TA que el periodo Delta, pero menor gravedad (hospitalizaciones y exitus), tanto para residentes como para trabajadores.