BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[ca] L'espectroscòpia de Ressonància Magnètica Nuclear (RMN) és una eina indispensable en el modern arsenal de químics analítics i biòlegs estructurals.La present tesi és un estudi computacional dels desplaçaments químics de RMN en un nombre de compostos químics d'interès, usant aproximacions estàtiques i dinàmiques mitjançant la teoria del funcional de la densitat, la qual ajudarà a predir, a confirmar i/o a complementar dades obtingudes experimentalment. S'ha donat especial atenció en casos on existeixen fortes interaccions substrat-solvent. Addicionalment, aquesta tesi aborda altres problemes metodològics que afecten la qualitat dels desplaçaments químics teòrics com el nivell de teoria, la inclusió explícita de molècules de solvent, l'elecció de la molècula de referència, així com els efectes relativistes en compostos que contenen àtoms pesats

[en] Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy is an indispensable structural tool in the modern analytical arsenal of chemists and structural biologists. The present thesis is a computational study of the NMR shift constants in a number of chemical systems of interest, using both static and dynamic approaches via Density Functional Theory, to predict, confirm the presence of transient species, and/or explain ambiguous signals in the NMR spectra. Special attention was put on cases where there are strong interactions between the solvent and the molecule studied. In addition, this thesis addresses other methodological issues that influence the quality of the calculated NMR chemical shifts such as the level of theory, the explicit inclusion of solvent molecules, the choice of the reference molecule, as well as the relativistic effects for heavy element compounds
[ca] La present Tesi doctoral conté una anàlisi quantitativa i qualitativa dels canvis en la forma i el paisatge urbans a les Comarques Gironines entre 1979 i 2006. La part teòrica situa la recerca en el marc del fenomen de la ciutat dispersa i parteix de la hipòtesi de la convergència cap a un model urbà global. La part empírica demostra aquest pressupost a través de l'estudi dels 522 plans parcials d'urbanisme aprovats durant aquest període. Els resultats permeten validar la consolidació del fenomen de la ciutat dispersa en tant que explosió de l'espai urbanitzat, difusió de la urbanització sobre el territori i aparició d'un nou paisatge cada cop més genèric, format per tres grans tipologies morfològiques: eixamples, urbanitzacions i polígons d'activitat econòmica. Tot plegat posa de manifest les carències que ha tingut el planejament per ordenar el creixement urbà, el debilitament de la ciutat com a projecte públic i una degradació del model de ciutat mediterrània.

[en] This doctoral thesis offers a quantitative and qualitative analysis of the changes in the urban shape and landscape of the Girona Counties between 1979 and 2006. The theoretical part of the research lies within the framework of the dispersed city phenomenon, and is based on the hypothesis of convergence towards a global urban model. The empirical part demonstrates this proposition with a study of 522 zone development plans in the Girona Counties. The results point to the consolidation of the dispersed city phenomenon, as shown by the sudden increase in built-up space, the spread of urban development throughout the territory, and the emergence of a new, increasingly generic landscape comprising three major morphological types: urban extensions, low density residential estates and industrial zones. This reveals shortcomings of planning for urban growth, weakening of the city as a public project, and a certain degradation of the Mediterranean city model.
[ca] Les proteïnes d'unió a l'ADN (PUA) són components essencials de molts processos biològics. La seva capacitat de reconèixer i unir-se estretament a l'ADN d'una manera específica o no específica de la seqüència, els converteix en candidats ideals com a elements de bio-reconeixement. Aquest treball explora diferents aplicacions d'aquestes proteïnes en la detecció d'ADN. Es van utilitzar materials sintètics i naturals per immobilitzar les PUA i facilitar la captura i detecció d'ADN objectiu: nanopartícules de carboni (NPC), partícules magnètiques (PM), l'enzim peroxidasa de rave picant (HRP), microplaques i membrana de nitrocel·lulosa (NC). Les proteïnes van ser dissenyades i produïdes de manera recombinant en Escherichia coli. La PUA homodimèrica Cro, amb especificitat de seqüència, del bacteriòfag lambda es va immobilitzar en NPC i es va utilitzar per detectar productes de PCR múltiple amb tires de flux lateral (TFL). Quan es va immobilitzar en PM, es va demostrar que captura, detecta i purifica els amplicons de PCR d'ADN de doble cadena (ADNdc), de manera similar a l amplament establerta estreptavidina-PM, però sense interferències significatives de ADN monocatenari (ADNmc).

[en] microplacas o en PM se usó junto con HU-HRP para detectar ADNbc no marcado. También fue inmovilizada en NC y utilizada en un TFL con HU-NPC para el mismo propósito. Todos estos ejemplos ponen de relieve la versatilidad de estas biomoléculas y su gran potencial en el campo de los biosensores de ADN. DNA binding proteins (DBPs) are essential components of many biological processes. Their ability to recognize and bind tightly to DNA in a sequence-specific or non-sequence specific manner makes them ideal candidates as biorecognition elements. This work sought to explore different applications for these proteins in DNA detection. Synthetic and natural materials were used to immobilize the DBPs and facilitate target DNA capture and detection: carbon nanoparticles (CNPs), magnetic beads (MB), the horseradish peroxidase (HRP) enzyme, microtiter plates, and nitrocellulose membrane (NC). The proteins were engineered and produced recombinantly in Escherichia coli. The sequence-specific homodimeric Cro DBP from bacteriophage lambda was immobilized on CNPs and was used to detect multiplex PCR products with lateral flow dipsticks (LFDs). When immobilized on MB, it was demonstrated to capture, detect and purify double stranded DNA (dsDNA) PCR amplicons, similarly to the well-established streptavidin-MB, but without significant interference from single stranded DNA (ssDNA). For these applications, the specific DNA binding sequence of the DBP was incorporated in one of the PCR primers.
[ca] La solidaritat té una història que es pot datar des de la mateixa existència de la intersubjectivitat humana. En aquest sentit, la solidaritat reflecteix una manera de relacionar-se des de la vida i la supervivència que es tradueix en l'acció responsable sobretot davant de l'alteritat vulnerable o patint. Tot i això, la teorització moderna va proposar una visió reductiva de la relacionalitat que va propiciar pràctiques i discursos paternalistes i assistencialistes que s'estenen fins al present perquè parteixen des de la idea d'un subjecte privilegiat d'acció. La política de la solidaritat suposa la potencialitat discursiva i de praxi de tots els agents en una acció responsable que des d'una consciència crítica, discursiva, analèctica i imaginativa creen altres possibilitats vitals per construir un nou ordre social just.

[en] Solidarity has a history that can be dated back to the very existence of human intersubjectivity. In this sense, solidarity reflects a way of relating from life and survival that translates into responsible action, especially in the face of vulnerable or suffering otherness. However, modern theorization proposed a reductive vision of relationality that fostered paternalistic and welfare practices and discourses that extend to the present because they start from the idea of a privileged subject of action. The politics of solidarity supposes the discursive and praxis potential of all agents in responsible action that, from a critical, discursive, analectical and imaginative consciousness, create other vital possibilities to build a new just social order.
[ca] L'orella interna dels vertebrats és una estructura altament organitzada i complexa on cadascun dels específics tipus cel•lulars és generat a dominis concrets. Per aquest motiu, l'especificació cel•lular i la seva organització espaciotemporal està lligada a la morfogènesis de tot l'òrgan. En aquest projecte analitzen en detall la regulació espaciotemporal durant la formació dels dominis sensorial i neurogènic de l'orella interna i la relació entre els gens proneurals i la via de senyalització de Notch. Diferents estudis han mostrat l'expressió dels gens proneurals i l'especificació dels progenitors neuronals. No obstant, la dinàmica de la neurogènesis i els comportaments cel•lulars involucrats en aquest procés romanen desconeguts. Per aquest motiu, analitzem en detall la formació del domini neurogènic. Mitjançant una quantificació dinàmica de l'expressió del gen proneural juntament amb l'anàlisi 4D dels comportaments cel•lulars, revelem el mecanisme d'iniciació del procés de neurogènesis òtica, el qual depèn de la dinàmica cel•lular i de la senyalització de FGF.

[en] The vertebrate inner ear is a highly ordered and complex structure, in which specialized cell types originate at distinct but specific domains. Therefore, patterning and cell fate specification must be coupled with morphogenesis of the entire organ. In this work we analyze in detail the spatiotemporal regulation of the formation of the inner ear sensory and neurogenic domains and the relation of proneural genes and Notch signaling. Although several studies have reported the expression of proneural genes and specification of neuronal progenitors, the dynamics of neurogenesis and cell behaviors involved in this process are still elusive. Moreover, we focus in more detail on the formation of the neurogenic domain. We perform a dynamic quantification of proneural gene expression combined with a 4D analysis of cell behaviors, and unveil the mechanisms of initiation of otic neurogenesis, which relies on both cell dynamics and FGF pathway.
[ca] Els càtodes desnitrificants s'utilitzen per tractar aigües contaminades amb compostos de nitrogen. En la present tesi doctoral, s'han identificat les famílies bacterianes amb un paper rellevant en la desnitrificació. Es van utilitzar diferents condicions d'operació, diferents acceptors d'electrons: nitrat i nitrit; i donadors d'electrons: matèria orgànica. L'ús de marcadors específics per gens funcionals, va permetre identificar la família Bradyrhizobiaceae com a clau en la desnitrificació autotròfica ja que mantenia la seva dominància utilitzant diferents acceptors d'electrons, així com també en els processos de reducció de nitrit i d'òxid nitrós. Es van aïllar cinc bacteris representatius d'aquesta família per determinar la seva capacitat electrotròfica. Tots els aïllats tenien característiques fisiològiques similars: reduir el nitrit a nitrogen gas autotròficament, però només tres aïllats podíen reduir el nitrit electroquímicament. Els altres dos, presentàven pics d'activitat electroquímica associats a la producció biològica d'hidrogen. Suggerint la interacció de diferents bacteris en la desnitrificació en els càtodes.

[en] Denitrifying biocathodes are used to treat nitrogen contaminated water resources. The present PhD dissertation have been characterized different bacterial families with a relevant role in denitrification process. Different operational conditions were used, different electron acceptors: nitrate and nitrite, and alternative electron donors: organic matter. The use of functional genes as specific target, allowed to identify Bradyrhizobiaceae as a key family in autotrophic denitrification. The dominance of this family were observed using different electron acceptors and also in nitrite and nitrous oxide reduction reactions. Five representative isolates were obtained to determine the role of this bacteria in electrotrophic processes. All of them had the ability to reduce nitrite to nitrogen gas under autotrophic conditions, besides this similar physiological characteristics, only three isolates could reduce nitrite electrochemically. The other two isolates had midpoint potentials associated to biological hydrogen production. The results suggest the interaction between different bacteria in cathodic denitrification.
[ca] Aquesta tesi se centra en la qüestió de l'estructura del ﬁnançament bancari i les seves implicacions per a la inestabilitat ﬁnancera. El primer capítol investiga com la interacció dinàmica entre el regulador i els bancs pot conduir, endògenament, a inestabilitat ﬁnancera i generar cicles econòmics. El model és capaç de captar l'apalancament bancari pro-cícllic, els cicles de crèdit asimètrics i el moment de Minsky en un marc uniﬁcat. El segon capítol proporciona un model teòric per entendre el fenomen d'"asset encumbrance" dels actius bancaris i les seves implicacions per a l'estabilitat ﬁnancera. Mostrem teòricament que l'efecte depèn dels nivells de sobrecollatilització als que s'enfronten els bancs, i proporcionem evidència empírica consistent amb les prediccions del model. El tercer capítol revisita una pregunta clàssica en la literatura bancària: les vendes de préstecs ("loan sales") debiliten el rol de producció d'informació dels bancs? Destaquem el risc d'insolvència dels bancs i constatem que les vendes de prèstecs poden millorar, en lloc de debilitar, els incentius de cribratge dels bancs.

[en] This thesis focuses on the issue of bank funding structure and its implications for ﬁnancial instability. The ﬁrst chapter investigates how the dynamic interaction between the regulator and banks can endogenously lead to ﬁnancial instability and generate boom-bust cycles. The model is able to capture pro-cyclical bank leverage, asymmetric credit cycles, and the Minsky moment in a uniﬁed framework. The second chapter provides a simple theoretical model to understand bank asset encumbrance and its implications for ﬁnancial stability. I show that the effect of encumbrance depends on rates of over-collateralization faced by the banks, and I also demonstrate empirical evidence consistent with the predictions of the model. The third chapter revisits a classical issue in the banking literature: would loan sales undermine banks' special role of information production? I highlight the role of banks' insolvency risk and ﬁnd that loan sales may improve, rather than weaken, banks' screening incentives.
[ca] Tenir una bona cultura matemàtica farà ciutadans més ben preparats per assumir el compromís i la responsabilitat socials que el món canviant i complex en què vivim necessita. Aquesta tesi es proposa de connectar l'educació matemàtica, concretament, amb l'educació per al desenvolupament sostenible, que ens dóna eines adequades perquè la matemàtica sigui verdaderament una disciplina per a la vida. En l'estudi he determinat espais d'acció i de recerca comuns entre l'educació matemàtica i l'educació per a la sostenibilitat. El marc teòric que m'ha servit per fer-ho és el paraigua del paradigma de la complexitat, la perspectiva sociocultural de l'aprenentatge i l'aprenentatge realista. El resultat és la redacció en 20 punts d'un perfil de mestre en educació matemàtica. Són 20 punts que indiquen en què ha d'estar capacitat un mestre per treballar l'educació matemàtica en connexió amb els criteris de l'educació per a la sostenibilitat

[en] Citizens with good mathematical knowledge will be better prepared to make social commitments and accept the social responsibilities presented by a changing and complex world. This thesis proposes to link mathematics education with education for sustainable development, a proposal that will provide the right tools to really make mathematics a discipline for life. In the study I define common areas for action and investigation in mathematics education and education for sustainability. The theoretical framework used to explore them encompasses the paradigm of complexity, a socio-cultural perspective on learning and realistic learning. The result is a compilation of 20 points that define a model teacher in mathematics education. These points indicate the skills, in line with education for sustainability criteria that a teacher should have to work in mathematics education
[ca] Objectiu: Avaluar l'impacte d'una intervenció multimodal d'higiene de mans (HM) dels professionals de la salut en el compliment, la contaminació de les mans i la infecció relacionada amb l'atenció sanitària (IRAS) en els serveis de Medicina. Mètodes:Estudi d'intervenció amb mesures pre i post. Es va implementar una intervenció multimodal basada en la OMS. Es van comparar els resultats abans i després de la intervenció respecte: compliment higiene de mans, consum de preparats de base alcohòlica (PBA), percepcions i creences d'HM, densitat d'incidència de les infeccions relacionades amb l'atenció sanitària (IRAS) i contaminació de les mans dels professionals. Resultats: El 98,4% dels professionals van assistir a les sessions grupals. El compliment d'HM va passar de 54,3% a 75,8% (p=0,005) i 75,8% un any després. Es van analitzar 85 qüestionaris aparellats identificant una millora en l'actitud d'intenció de compliment d'HM. La densitat d'incidència de les IRAS va passar de 6,93 a 6,96/1000 dies ingrés i la colonització per SARM nosocomial de 0,92 a 0,25/1000 dies ingrés (p=0,2). En el post es va reduir significativament el nombre d'unitats formadores de colònies de les mans i la presencia de factors de risc de contaminació. Conclusions: La intervenció multimodal ha aconseguit un canvi de comportament i paral•lelament s'ha reduït la contaminació de les mans del professionals durant la pràctica assistencial.

[en] Objective: To evaluate the impact of a multimodal intervention on hand hygiene (HH) in HH compliance, HCW hand contamination and healthcare-associated infections (HAI) in internal medicine wards. Methods: A before-after intervention study was carried. We implemented a multimodal intervention based on the WHO recommendations. The results were compared before and after the intervention regarding: incidence density of healthcare associated infections (HAI), HH compliance, alcohol-based handrub consumption, perceptions and beliefs about HH and the HCWs hand contamination. Results: The 98,4% of the HCWs participated in the group sessions. HH compliance increased from 54.3% to 75.8% (p=0.005) and 75.8% a year later. We analyzed 85 paired questionnaires identifying an improvement in the HH compliance intention. The incidence density of HAIs was 6.93 and 6.96/1000 hospital-day in pre and post intervention periods and HA-MRSA was 0.92 and 0.25/1000 hospital-day (p=0.2). In the post significantly decreased the number of colony forming units of the hands and the presence of risk factors for hand contamination. Conclusions:The multimodal intervention has achieved a behavior change and in parallel a HCWs hand contamination has been reduced during routine care.
[ca] La investigació/recerca sobre la influència de les emocions en la cognició i el comportament humà constitueix un repte científic des de fa molt temps. Fins ara el mètode més popular per a investigar aquest fenòmen ha estat el d'observar els processos cerebrals i el comportament. En l'última dècada el camp de la neurociència computacional ha proposat una nova metodologia: la construcció dels models incorporats d'emocions i la seva verificació en entorns del món real. En aquesta tesi presentem diferents estudis que han utilitzat models computacionals de les emocions per controlar el comportament i les expressions d'agents localitzats. Utilitzant diferents metodologies, hem avaluat tant el rendiment d'aquests models així com les respostes conductuals dels éssers humans que han interactuen amb ells.Els nostres resultats se sumen a una comprensió més profunda dels fenòmens multidimensionals de les emocions en tres nivells: la percepció, la interacció i com el processament dels senyals emocionals influeixen en l'aprenentatge i el comportament

[en] The investigation of the influence of emotions on human cognition and behavior challenges scientist since a long time. So far the most popular approach to investigate this phenomenon was to observe brain processes and behavior. In the recent decade the field of computational neuroscience proposed a new methodology: the construction of embodied models of emotions and their verification in real world environments. In this thesis we present different studies that use computational models of emotions to control the behavior and the expressions of situated agents. Using different methodologies we evaluate both, the performance of the models and the behavioral responses of humans interacting with them. Our results add to a deeper understanding of the multidimensional phenomena of emotions on three levels: Perception, interaction and how the processing of emotional cues influences learning and behavior
[ca] Les cèl·lules isogèniques mostren un gran grau d' heterogenietat cel·lular en la seva taxa de proliferació, amb una subpoblació de cèl·lules creixent de manera substancialment lenta. Hem realitzat un assaig de microsopia d'alt rendiment (high-throughput) i hem determinat les distribucions de proliferació d'un conjunt de més de 1590 delecions de gens individuals i de soques wild type de Saccharomyces cerevisiae. Hem trobat que la disfunció mitocondrial és una causa primària del creixement lent dins d'una població isogènica i hem observat que un potencial alt de la membrana mitocondrial ens permet predir la reducció del creixement i la deficiència respiratòria. Hem mostrat que aquesta reducció es pot revertir en determinades circumstàncies i que la deficiència respiratòria temporal és un tret comú en moltes soques. També hem relacionat la dinàmica de la capacitat respiratòria d'una cèl·lula amb l'estat del seu ADN mitocondrial. Finalment, hem mostrat que el creixement en presència d'agents antifúngics augmenta el nombre de cèl·lules amb deficiència temporal respiratòria, suggerint que aquest fenotip pot ser una forma de protecció (subpoblació resistent als fàrmacs amb ADN mitocondrial intacte).

[en] Isogenic cells exhibit a large degree of cell-to-cell heterogeneity in proliferation, with a subpopulation of cells growing at a substantially lower rate. We conducted a high throughput microscopy screen to determine the proliferation distributions for a collection of wild isolates and 1592 single gene deletions in S. cerevisiae. We found that mitochondrial impairment is a primary cause of slow growth within an isogenic population and that high mitochondrial membrane potential is predictive of reduced growth and respiratory deficiency. We showed that respiratory deficiency can be recovered and that temporary respiratory deficiency is a common trait present in many genetic backgrounds. We developed a mathematical model that predicts the dynamics of the respiratory capacity of single cells within a population as a function of mtDNA state. Finally, we showed that growth in the antifungal agent fluconazole enriches for temporarily respiratory deficient cells, suggesting that this phenotype may be a form of bet-hedging in which a slow growing drug-resistant respiratory deficient cell with low mtDNA content can produce progeny with fast growth and fully functioning mitochondria.