BSC-LT/ACAData huggingface dataset:
[en] One of the main evolutionary transitions is the origin of animal and fungal multicellularity from single-cell ancestors. To address this change, it is necessary to study the extant unicellular relatives of animals (Metazoa) and fungi, all of them forming the Opisthokonta clade. Recent data have shown that adding more taxa to the Opisthokonta tree can dramatically change our view on this transition. However, the real diversity of these organisms is mostly unknown. Therefore, the main goal of this Ph.D. was to analyse the molecular diversity of both microbial opisthokonts as well as animals, searching for genetic novelty in the form of potential novel clades, as well as trying to better understand their ecology. Using Next-Generation Sequencing data, mainly metabarcoding based on the universal marker 18S rRNA gene, I have performed phylogenetic and ecological inferences, together with graph analysis, to unravel new undescribed diversity of Opisthokonta organisms.

[es] Una de las principales transiciones evolutivas es el origen de la multicelularidad en animales y hongos a partir de sus ancestros unicelulares. Para entender este cambio es necesario estudiar a los organismos unicelulares más próximos evolutivamente a los animales (Metazoa) y hongos, formando todos ellos el clado Opisthokonta. Se ha comprobado que añadir información genética de más especies al árbol de los opistocontos puede cambiar drásticamente nuestra visión de dicha transición. Sin embargo, la diversidad real de estos linajes es prácticamente desconocida. Por tanto, el principal objetivo de este doctorado ha sido analizar la diversidad molecular de los opistocontos unicelulares y de animales para buscar novedad genética en forma de nuevos clados y, a la vez, entender su ecología. Usando datos de Secuenciación de Nueva Generación, principalmente metabarcoding del gen universal 18S rRNA, he realizado inferencias filogenéticas y ecológicas, junto con análisis de redes para descubrir nueva diversidad de organismos opistocontos desconocidos.
[en] The report herein presented is composed of two research works that although they are related, they form an independent chapter. In the first part of this research the proteome of Mycoplasma penetrans has been analyzed using the combination of two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry. A proteome reference map of this human pathogen has been constructed including the pH ranges of 4 to 11 in three windows, from 4 to 7, from 6 to 9 and from 7 to 11NL (Non lineal). With a specific phosphoprotein staining method, the phosphoproteome of this microorganism has been obtained in the pH range of 4 to 7. The specific phosphorylation sites have been characterized for two proteins, an ABC transporter and the Elongation Factor Tu. In the second part of this research, the proteome of Mycoplasma genitalium has been analyzed, extending the previous information of the proteome of this human pathogen. The proteome of this microorganism has been analyzed in the final stationary growth phase using narrow pH gradients. The phosphoproteome has been also analyzed for this microorganism using the specific phosphoprotein staining in the pH range of 4 to 7. The specific phosphorylation site has been characterized in a protein involved in adhesion, the protein P110.

[es] La memoria que se presenta está formada por dos trabajos de investigación que todo y estar relacionados entre si, forman cada uno un capítulo independiente. En la primera parte del trabajo se ha realizado un estudio del proteoma de Mycoplasma penetrans mediante electroforesis bidimensional y espectrometría de masas. Se ha generado un mapa de referencia del proteoma de este patógeno humano, que comprende el rango de pH de 4 a 11 en tres ventanas, de 4 a 7 de 6 a 9 y de 7 a 11NL (no lineal). Mediante tinción específica se ha obtenido el fosfoproteoma de este organismo en el rango de pH de 4 a 7, y también se han determinado los sitios específicos de fosforilación de dos proteínas, un transportador ABC y el Factor de elongación Tu. En la segunda parte del trabajo se ha realizado un análisis del proteoma de Mycoplasma genitalium, ampliando la información ya existente sobre el proteoma de este patógeno humano. Se ha analizado el proteoma de este organismo en la fase de crecimiento estacionaria final utilizando gradientes estrechos de pH. Para este micoplasma también se ha generado una imagen del fosfoproteoma en el rango de pH de 4 a 7, y se ha podido determinar también, el sitio específico de fosforilación de una proteína implicada en la adhesión de este micoplasma, la proteína P110.
[en] Fibre reinforced polymer (FRP) bars have emerged as an alternative to steel for reinforced concrete (RC) elements in aggressive environments due to their non-corrosive properties. This study investigates the short-term serviceability behaviour of FRP RC beams through theoretical and experimental analysis. Twenty-six RC beams reinforced with glass-FRP (GFRP) and one steel RC beam are tested under four-point loading. The experimental results are discussed and compared to some of the most representative prediction models of deflections and cracking for steel and FRP RC finding that prediction models generally provide adequate values up to the service load. Additionally, cracked section analysis (CSA) is used to analyse the flexural behaviour of the specimens until failure. CSA estimates the ultimate load with accuracy, but it underestimates the experimental deflection beyond the service load level. This increment is mainly attributed in this work to shear induced deflection and it is experimentally calculated. A discussion on the main aspects of the SLS of FRP RC is introduced: the stresses in materials, maximum crack width and the allowable deflection. A methodology for the design of FRP RC at the serviceability requirements is presented, which allows optimizing the overall depth of the element with respect to more generalised methodologies.

[es] El uso de materiales compuestos de matriz polimérica (FRP) emerge como alternativa al hormigón convencionalmente armado con acero debido a la mayor resistencia a la corrosión de dichos materiales. El presente estudio investiga el comportamiento en servicio de vigas de hormigón armadas con barras de FRP mediante un análisis teórico y experimental. Se presentan los resultados experimentales de veintiséis vigas de hormigón armadas con barras de material compuesto de fibra de vidrio (GFRP) y una armada con acero, todas ellas ensayadas a flexión de cuatro puntos. Los resultados experimentales son analizados y comparados con algunos de los modelos de predicción más significativos de flechas y fisuración, observándose, en general, una predicción adecuada del comportamiento experimental hasta cargas de servicio. El análisis de sección fisurada (CSA) estima la carga última con precisión, aunque se registra un incremento de la flecha experimental para cargas superiores a las de servicio. Esta diferencia se atribuye a la influencia de las deformaciones por esfuerzo cortante y se calcula experimentalmente. Se presentan los aspectos principales que influyen en los estados límites de servicio: tensiones de los materiales, ancho máximo de fisura y flecha máxima permitida. Se presenta una metodología para el diseño de dichos elementos bajo las condiciones de servicio. El procedimiento presentado permite optimizar las dimensiones de la sección respecto a metodologías más generales.
[en] Organic waste from livestock and urban activity substitution totally or partially the mineral fertilization and it is commonly used in fertilization plans. This thesis evaluates the effect of slurry application on short-term ammonia emissions and the effect of organic (slurry and compost) on soil quality derived from its long-term continuous use it. The fertilizer strategies as such the method and time of application reduce ammonia emissions. Fertilization with slurry in the dose recommended by the European Union, 170 kg N ha−1 year−1 of organic sources allow to maintained the diversity and activity of the earthworms of the soil, also improving different parameters of the biological and physical quality in extensive systems rainfed cereal. In intensive systems, contributions of 250 kg N ha−1 year−1 with slurry promotes the physical quality of the soil. The absence of Nicodrilus trapezoides was a bioindicator of conditions of excessive contributions to slurry and compost of long-term.

[es] Los residuos orgánicos procedentes de la actividad ganadera y urbana, sustituyen total o parcialmente a la fertilización mineral y se utilizan habitualmente en los planes de fertilización. Esta tesis evalúa el efecto de la aplicación de purín en las emisiones de amoníaco a corto plazo y el efecto de fertilizantes orgánicos (purines y compost) en la calidad del suelo, derivados de su uso continuado a largo plazo. Las estrategias de manejo (método y momento de aplicación) reducen las emisiones de amoníaco. La fertilización con purín en dosis de N recomendadas por la Unión Europea, 170 kg N haha−1 año−1 cuando su origen es orgánico permite mantener la diversidad de las lombrices del suelo en sistemas cerealistas de secano. La ausencia de Nicodrilus trapezoides fue bioindicadora de condiciones de excesivos aportes de purines y compost. Asimismo se mejoran diferentes parámetros de calidad física del suelo. En los sistemas más intensivos aportes de 250 kg N ha−1 año−1 con purín promueven també la calidad física del suelo.
[en] The present Doctoral Thesis focuses on the prevention of Cyberbullying within the educational context. After a research on the status of this matter and 21st century society regarding the use of ICT, we give a definition of the term cyberbullying that includes all the specific characteristics of the phenomenon, and a categorization of a glossary of terms that allows the curricular insertion, establishing a protocol of specific action of cyberbullying, destined to the educational centers and families. Taking into account the role of the educational psychologist, we present the design, implementation and evaluation of a cyberbullying prevention program for second and third cycle of Primary Education, arising from the needs detected by teachers, parents and students. This program inserted in the school curriculum, works both social and personal skills, as well as technological ones. The analyzes released for the assessment of the program confirm its effectiveness.

[es] La presente Tesis Doctoral se centra en la prevención del Ciberbullying dentro del contexto educativo. Tras un estudio sobre el estado de la cuestión y de la sociedad del siglo XXI en cuanto al uso de las TIC, presentamos una definición propia del término ciberbullying que incluye todas las características específicas del fenómeno, y una categorización de un glosario de términos que permite la inserción curricular, estableciendo un protocolo de actuación específico de ciberbullying, destinado a los centros y familias. Teniendo en cuenta el papel del psicólogo educativo, presentamos el diseño, implantación y evaluación de un programa de prevención del ciberbullying para segundo y tercer ciclo de la Educación Primaria, que surge de las necesidades detectadas por los docentes, padres/madres y el mismo alumnado. Dicho programa insertado en el currículo escolar, trabaja tanto habilidades sociales y personales, como tecnológicas. Los análisis realizados para la evaluación del programa, confirman la eficacia del mismo.
[en] A large proportion of the genome of most higher eukaryotes consists of transcriptionally-repressed repetitive DNA. To better understand how repressed chromatin states are inherited from one generation to the next, we performed a genome-wide RNA interference screen in Caenorhabditis elegans to identify genes required for the quantitative repression of an integrated multicopy transgene array in somatic cells. This revealed that inhibition of many components of the DNA replication machinery during early embryonic development leads to a global reduction in levels of the repressive histone post-translational modification H3K27me3 across the genome and a global increase in the levels of the active modifications H3K4me3 and H3K36me3. These results contribute to our understanding of inheritance of chromatin states.

[es] Una gran proporción del genoma de la mayoría de eucariotas superiores está formado por secuencias repetitivas de DNA que contienen señales de represión de la transcripción. Para entender mejor cómo funciona la herencia de una generación a otra de esta cromatina reprimida, llevamos a cabo un screening genómico de RNA de interferencia usando Caernorhabditis elegans con el objetivo de identificar los genes responsables de la represión cuantitativa de una secuencia integrada en el genoma de células somáticas formada por múltiples copias de un transgén. Así encontramos que la inhibición de muchos componentes de la maquinaria de replicación del DNA durante los primeros pasos del desarrollo embrionario lleva a una reducción de los niveles de metilación post-transcripcional de la histona 3 en su lisina 27 (H3K27me3) a lo largo de todo el genoma y a un aumento también global de los niveles de H3K4me3 y H3K36me3, que son modificaciones de la histona 3 relacionadas con un estado de cromatina activada. Estos resultados contribuyen a conocer mejor la herencia de los distintos estados de la cromatina.
[en] This thesis will propose a new singular, particular and autonomous maritime jurisdiction, based upon the concept and autonomy of maritime law, by way of analyzing the procedural problems linked to the current judicial resolution of the maritime disputes. Our procedural legislation does not offer all the solutions that it should for these sort of disputes, even bringing more hindrances than tools for its quick, reliable and effective resolution. Looking at the alternatives offered in the jurisdiction of England and Wales, undoubtedly the most influential one in maritime law, and that of Texas, will help us to propose a series of measures with a view of establishing a new maritime jurisdiction at the Spanish courts.

[es] El presente trabajo tiene por objeto proponer una jurisdicción marítima singular, particular y autónoma, partiendo del análisis del concepto y autonomía del Derecho marítimo así como de alguno de los problemas jurídico-procesales vinculados a la resolución judicial de las disputas marítimas. Nuestra actual legislación procesal no ofrece todas las soluciones que se debieran para este tipo de disputas llegando incluso a plantear más trabas que mecanismos para una pronta, fiable y efectiva resolución de las mismas. Observar qué alternativas se ofrecen en las jurisdicciones de Inglaterra y Gales, sin duda la más influyente en el derecho marítimo, así como la de Texas, va a ayudarnos a proponer una serie de medidas tendentes a establecer una nueva jurisdicción marítima en los tribunales españoles.
[en] This thesis examines inflammation from the perspective of systems biology in two different situations: cellular senescence resulting from unresolved tissue damage and the acute immune response to the invasion of a pathogen, particularly influenza A infection. Cellular senescence, a process marked by halted cell proliferation and inflammation, was explored through network analysis techniques, revealing key genes and their roles in senescence pathways and offering possible molecular hallmarks of senescence. In turn, the immune response to viral infection was studied from the point of view of the digital nature of interferon release and its role in acute inflammation. By investigating both individual and collective cellular behaviors, this thesis provides insights into the spatiotemporal dynamics of inflammation in mammalian tissues, the propagation of infection in cellular populations, and the antiviral response of mammalian cells. Overall, this research contributes to understanding inflammation dynamics within tissues, laying a foundation for future studies on inflammation-related disorders and disease management strategies.

[es] En esta tesis exploramos la inflamación desde dos perspectivas: la senescencia celular, consecuencia del daño tisular, y la respuesta inmune aguda ante la invasión patógena, especialmente por la influenza A. La senescencia celular fue estudiada mediante técnicas de análisis de redes, identificando genes clave y sus funciones en las vías de la senescencia, así como posibles marcadores moleculares. Además, se examinó la respuesta inmune ante la infección viral, resaltando la naturaleza digital de la secreción de interferón y su impacto en la inflamación. Finalmente, este estudio brinda valiosos descubrimientos sobre la dinámica espacio-temporal de la inflamación, la propagación de la infección y la respuesta antiviral, ofreciendo las bases para futuras investigaciones sobre trastornos inflamatorios y estrategias de manejo de enfermedades.
[en] The main aim of the thesis is to explain intercultural relations between immigrant and native families in the school context and how these reflect in their trust in local schools. For this purpose, I analyze the relationship between native and immigrant families and their relation to teachers, school staff and direction, considering school norms and the ways in which the differentiation between immigrant and natives takes place. I also look at what trust in schools means and how it is performed by native and immigrant families. For this purpose, I employ a theoretical framework that is situated at the intersection of the overlapping research between immigration studies and education. By linking the literature on intercultural relations and trust in schools, I develop my theoretical framework on the conditions that are important for enhancing school trust in an intercultural context. To obtain my data I use a qualitative methodology, semi-structured interviews and participant observation, for getting a richer picture of the settings and familiarizing with the ideas that are formed in the link between intercultural relations and trust in schools. The fieldwork is done in Barcelona where I interview native and immigrant parents as well as educational professionals in schools in two districts: Ciutat Vella and Sants-Montjuic.

[es] El objetivo principal de la tesis es explicar las relaciones interculturales entre las familias inmigrantes y nativas en el contexto escolar y cómo se reflejan en su confianza en las escuelas locales. Para este propósito, analizo la relación entre las familias nativas e inmigrantes y su relación con los maestros, el personal escolar y la dirección, considerando las normas escolares y las formas en que se lleva a cabo la diferenciación entre inmigrantes y nativos. También, investigo el significado de la confianza en las escuelas y cómo lo ven las familias nativas e inmigrantes. Para este propósito, empleo un marco teórico que se sitúa en la intersección de la investigación superpuesta entre los estudios de inmigración y la educación. Al vincular la literatura sobre las relaciones interculturales y la confianza en las escuelas, desarrollo mi marco teórico sobre las condiciones que son importantes para mejorar la confianza escolar en un contexto intercultural. Para obtener mis datos, utilizo una metodología cualitativa, entrevistas semiestructuradas y observación participante, para obtener una imagen más clara del entorno y para familiarizarme con las ideas que se forman en el vínculo entre las relaciones interculturales y la confianza en las escuelas. El trabajo de campo fue realizado en Barcelona, donde entrevisté a padres nativos e inmigrantes, así como a profesionales de la educación en escuelas de dos distritos: Ciutat Vella y Sants-Montjuic.
[en] This work started out to study the relations between the Society of Jesus and the indigenous peoples of India. The background to this research dates back to the author's first visit to India in 1997, and to 2003 with the Master's Thesis in the framework of development cooperation. Thus, the first contact with the Jesuit missionaries was also the first contact with the native inhabitants of the area, generically called Adivasis. Discovering an unknown, plundered, vulnerable, and forgotten indigenous population, to which the Jesuits had become a reference, aroused my interest in understanding the identity relations between these two groups. Thus, the research initiated in the Master's Thesis had its continuation in the present Doctoral Thesis. In it, the relationship between Adivasi and Jesuit Identities has been studied in depth from the psychosocial perspective of social psychology.

[es] Este trabajo se puso en marcha para estudiar las relaciones entre la Compañía de Jesús y la población indígena de la India. Los antecedentes de esta investigación se remontan a la primera visita de la autora a la India en el año 1997, y a 2003 con el Trabajo Fin de Máster en el marco de la cooperación al desarrollo. Así, el primer contacto con los misioneros jesuitas supuso también el primero con los habitantes autóctonos de la zona, llamados genéricamente adivasis. Descubrir a una desconocida población indígena, expoliada, vulnerable y olvidada, que había convertido a los jesuitas en un referente, despertó mi interés en comprender las relaciones identitarias entre estos dos grupos. De este modo, la investigación iniciada en el TFM tuvo su continuación en la presente Tesis Doctoral. En ella se profundiza en la relación entre las Identidades Adivasi y Jesuita desde la perspectiva psicosocial de la psicología social.
[en] The aim of this work is to analyse the cinematic representation of Barcelona in two key stages of its urban development: the era of Francoist desarrollismo, which coincides with Porcioles's municipal government (1957-1973), and the period that runs from the restoration of democracy until today. The thesis develops two main lines of inquiry related to two different ways of considering the relationship between cinema and the city: the first is the so called "cinematic urban archaelogy", based on the use of cinema as a historical source to investigate the urban, cultural and socio-economic changes experienced by the city over time; the second considers cinema as a tool capable of conditioning the perception of urban space and contributing, more or less voluntarily, to the construction of the city's image and its commercialisation in the global market. Through the comparative analysis of a corpus of films made by an international group of filmmakers that have portrayed the Catalan capital in the two chosen periods, the thesis critically explores how the film image of Barcelona has evolved in relation to the deep urban changes experienced by the city, and how cinema has participated in the construction and dissemination of the new image of post-Olympic Barcelona, thus contributing to relaunch the city as a tourist destination.

[es] Esta tesis analiza la representación cinematográfica de Barcelona en dos períodos clave de su evolución urbanística: el desarrollismo franquista, que coincide con la larga alcaldía de Porcioles, y la etapa que va desde la restauración de la democracia hasta hoy. La tesis desarrolla dos líneas de investigación que corresponden a dos distintas maneras de considerar la relación entre cine y ciudad: por un lado, la de la cinematic urban archaelogy, que utiliza el cine como fuente histórica para investigar las transformaciones urbanísticas, culturales y socioeconómicas experimentadas por la ciudad a lo largo del tiempo; por otro, la que estudia el cine como instrumento capaz de influir en la percepción del espacio urbano y contribuir, de forma más o menos voluntaria, a la construcción de la imagen de la ciudad y a su comercialización en el mercado turístico global. A través del análisis comparativo de un corpus de películas de distintas nacionalidades que han retratado la capital catalana en los dos períodos escogidos, la tesis indaga sobre cómo la imagen fílmica de Barcelona ha evolucionado en relación con las profundas transformaciones urbanísticas sufridas por la ciudad, y sobre cómo el cine ha influido en la construcción y en la difusión de la nueva imagen de la Barcelona post-olímpica, contribuyendo además a relanzar la ciudad como destino turístico.