[ca] Els elements transponibles (TE) són seqüències d'ADN repetitives que es troben en tots els organismes procariotes i eucariotes. Tenen capacitat de desplaçar-se d'una localització genòmica a una altra i replicar-se, produint mutacions i reordenacions genètiques. A causa de la seva capacitat de generar variabilitat genètica, els polimorfismes dels TE estan començant a estudiar-se en les plantes de cultiu, ja que poden donar lloc a variacions fenotípiques d'importància agronòmica. La detecció dels TE es realitza mitjançant l'anàlisi computacional de les dades genòmiques, i la creixent disponibilitat d'assemblatges genòmics d'alta qualitat permet estudiar la seva dinàmica mitjançant enfocaments pangenòmics. El gènere Prunus és un dels gèneres més importants des del punt de vista econòmic que inclou molts arbres cultivables, com l'ametller o el presseguer, i dels quals recentment s'han publicat diversos acoblaments de genomes de diverses espècies d'aquest gènere. Hem utilitzat aquestes dades genòmiques públiques per identificar TE de novo en 7 arbres d'aquest gènere que pertanyen a 6 espècies diferents: P. armeniaca, P. avium, P. dulcis, P. mira, P. persica i P. salicina. Hem identificat milers de transposons intactes, que codifiquen totes les característiques estructurals i els dominis enzimàtics necessaris per a la seva transposició. Utilitzant un enfocament pangenòmic hem construït una base de dades de famílies de TE de Prunus i hem analitzat la seva presència diferencial en les sis espècies de Prunus. Observem un recent augment d'amplificació de TE en P. salicina, principalment impulsat per l'activitat dels LTR-retrotransposons durant l'últim milió d'anys. Utilitzem la nostra base de dades de Prunus per buscar polimorfismes creats per TE entre dues varietats de presseguer (Lovell i Earlygold), identificant 801 potencials insercions de TE específics de la varietat Lovell. Moltes d'aquestes insercions de TE afecten potencialment a l'activitat del gen on es troben inserits, i validem dues d'elles mitjançant enfocaments moleculars. El present treball permetrà l'estudi de les famílies de TE de Prunus utilitzant una classificació comuna i estructurada i contribuirà a la comprensió del potencial dels polimorfismes de TE en la generació de variabilitat intraespecífica lligada a trets agrícoles d'interès, com la resistència a la sequera , a les plagues, així com a la qualitat o el rendiment de la fruita.

[en] Transposable elements (TEs) are repetitive DNA sequences found in all prokaryotic and eukaryotic organisms. They are able to move from one genome location to another and replicate in the genome, producing mutations and rearrangements. Due to their capacity to generate genetic variability, TE polymorphisms are starting to be studied in crop plants as they can lead to phenotypic variations of agronomic importance. TE detection is performed by computational analysis of genomic data, and the increasing availability of high-quality genome assemblies allows to study their dynamics using pangenome approaches. The Prunus genus is one of the most economically important genera which includes many cultivated trees, such as almonds or peaches, and several Prunus genome assemblies have been released recently. We have used this public genomic data to identify TEs de novo in 7 trees of this genus belonging to 6 different species: P. armeniaca, P. avium, P. dulcis, P. mira, P. persica and P. salicina. We have identified thousands of intact transposons, which encode all the structural hallmarks and enzymatic domains necessary for its transposition. By using a pangenome approach we have built a database of Prunus TE families and analyzed their differential presence in the six Prunus species. We discovered a recent burst of TE amplification in P. salicina, mainly driven by LTR-retrotransposon activity occurred during the last million years. We used our developed Prunus database to search for TE polymorphisms between two peach varieties (Lovell and Earlygold), identifying 801 potential TE insertions specific to Lovell variety. Many of these TE insertions potentially affect gene activity, and we validated two of them by molecular approaches. The present work will enable the study of Prunus TE families using a common, structured classification and will contribute to the understanding of the potential of TE polymorphisms in the generation of intraspecific variability linked to agricultural traits of interest, such as the resistance to drought, pests, as well as fruit quality or yield.