NC_001344 AY536371
   1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50
     |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||**|||||||
   1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCGAAAATTAATGAGGAATCGCTGGATAG 50

  51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100
     ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||
  51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100

 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150
     ||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||*
 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGGCTACGTACTTGGTTGTCAACACCT 150

 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200
     |||||*||**|||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||
 151 GAAAAATATAGAGGCCGAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200

 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250
     ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|
 201 AATCCAAGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGCACTAGAAAGC 250

 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300

 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350

 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||
 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCGTAGATCTCCCT 400

 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450
     |||||||||||||*|||||||||||*|||||||*|*|||||*||||||||
 401 CGCCTAGGAAATAGATTACCTGCTAGGCATCACCTTGGGAAATTGTCAGG 450

 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500
     *||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451 ATTGTATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500

 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550
     |||||||||||||||||||||||*|*||||||*|||||||||||||||||
 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATATGCAAGTAATAAATGAGTGCCCTTCC 550

 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600
     |||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||
 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600

 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650
     ||||||||||||*|||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||
 601 CTACTTTCCTGTACAGGCAGGGGTTAAAGCTAAGTATCCTGACAATGTGA 650

 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700
     ||||||||||**|||||||||||||||||||*|*||||||||||||||||
 651 TGCAGCATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700

 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**|
 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTTAAAGGTCA 750

 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800

 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850
     |||||*|||***||||||||||||||||*||||||||||||||||||*||
 801 ATGGGTCAAAGCCCAGCAAAATCAATGGGCGTGCGGAGAATCGAAGGGGG 850

 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900
     |||*|||||||||*|*|||*||||||||||||||||||||||||||||||
 851 AGAACTCCTGCTACAACAACTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900

 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950
     ||||||||||*|||||||||||||||||||||||**||||||||||||||
 901 TAACATGGTCAGGCAAATTTCCAACAATAGATCACGTATTAGACCATGTG 950

 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000
     |||||||||||||||*|||||||*||*|||*|*||*||*||*|||||*|*
 951 CAAACAATGGAGGAGATAAACACGCTCCAAAATCAAGGAGCATGGCCGGA 1000

1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050
     *|||||||||||**||***||**|*|||||||||*|||||||*||||**|
1001 AGGGGCGGGAAGGAGAGCAGGGTTAACCAATCCTGCTCCTCAAGAGATTC 1050

1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100
     |||||||**|||||||*||*||*|||||||||||||||||||||||||||
1051 CTCAGCCCAAGTGGACCCCGGAAGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100

1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150
     |||||*||*||*|||||*||*|||||||||||||||*|||||*||||*||
1101 CGTCGTTACCAGGAAGAGAGACCACCGGAAACCACCGCCATTCCTCCAAC 1150

1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200
     *||*|||||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||||||*||
1151 ATCGCCAACTCAGTGGAAACTACAACCAGGAGACGATCCACTCCTGGGAA 1200

1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGC- 1249
     ||||||||*|*||*|||||*|||||*||||||||||||||*||||||||*
1201 ACAAGTCTCTGCTAGAGACACATCCACTTTACCAGAATCCAGAGCCAGCA 1250

1250 --CGTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGG 1297
     **||||||||||||||||||||||||*|||||||||||***||||*||||
1251 GCCGTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCGCTCAAGAAGAA---AATGTCTGG 1297

1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347

1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGG 1397
     |||||||||||||||||||*||||||||**||||||||||*|||||||||
1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTAGAAATACTGAGGAGGCTAGACTGGTGGTGG 1397

1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATAC 1447
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||
1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGAGAC 1447

1448 TGGAGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCC 1497
     |||||||||||*|||||*|||*|||||||||||||||||*||||||||||
1448 TGGAGCCCAAACCTCTCCACACTACGTCGGATCCTGCCCCTGGGGATGCC 1497

1498 CAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1498 CAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547

1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTAT 1597
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*|||
1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACGGGTCTACTAT 1597

1598 TTTAGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCT 1647
     |||||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||
1598 TTTAGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCT 1647

1648 CTTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697
     |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1648 CCTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697

1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCAC 1747
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCAC 1747

1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAAT 1797
     ||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||*|||||*||
1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGCACTTTTCTACAAGAGTTAGGGAT 1797

1798 ACGCATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGAT 1847
     |||*||*||||||||*||*||||||||*||*|||||*|||||*||*||||
1798 ACGAATTAACTTTGACAAAACTACTCCATCACCTGTCAATGAGATCAGAT 1847

1848 TCCTCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGA 1897
     |||||||||||||*||||||||*||||*||*||||||*||||||||||||
1848 TCCTCGGTTACCAAATTGATCAAAAATACACGAAGATAGAAGAAAGCAGA 1897

1898 TGGATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTA 1947
     ||||**|||*||*|||||||*|||||||||||||||||*||||*||||||
1898 TGGAGTGAATTACGGACTGTAATCAAGAAAATAAAAATTGGTGAATGGTA 1947

1948 TGACTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTAC 1997
     |||*||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||||
1948 TGATTGGAAATGTATTCAGAGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTATTAC 1997

1998 CATTTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATT 2047
     |*|||||||||||||**||*||||||||||||||||||||||*||||||*
1998 CGTTTACTAAAGGTAGTATAGAAATGTTAAAACCAATGTATGATGCTATC 2047

2048 ACTAACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTA 2097
     |||*|||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||**|*||
2048 ACTCACAAAGTAAACTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGCTATA 2097

2098 CAAATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTG 2147
     ||||||||||||||||||||||||||||*|*|||**||||||||||||||
2098 CAAATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTATCGATTAAACCAAAGTCCTCTG 2147

2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATA 2197
     |||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||
2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACACCCACACATGGCGCAATA 2197

2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGA 2247
     ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||*||
2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTACTTTTACAAAGGTCAGAGA 2247

2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTA 2297
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||
2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAGGATAATGATTA 2297

2298 AACCCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347
     ||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||
2298 AACCCAGATGTATACTTTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347

2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCC 2397
     ||||||||||||||||||||||||*||*|*||||||||||||||||||||
2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAACTGCTATCTCC 2397

2398 TATACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447
     |||||***||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||
2398 TATACCAGTGTACTTTGTTCCAAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447

2448 CCAGGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497
     |||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2448 CCAGGCACAAACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497

2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCC 2547
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCC 2547

2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597

2598 GTCAGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647
     |||****|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2598 GTCGTGTTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647

2648 TATATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTG 2697
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||
2648 TATATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTGTATGATCTG 2697

2698 CCAGATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGA 2747
     ||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||
2698 CCCGATGATTTCTTTCCTAAAATTGATGATCTTGTAAGAGATGCTAAAGA 2747

2748 CGCTTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGA 2797
     |||||||||*|||||*||||||||*||*||||||||||||||||||||*|
2748 CGCTTTAGAGCCTTATTGGAAATCAGACTCAATAAAGAAACATGTTTTAA 2797

2798 TTGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAG 2847
     |*||||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||||*|||
2798 TCGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAGGATTTTTGGCAGACTACACAG 2847

2848 GGTATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCAC 2897
     ||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*||*||*||*||*||
2848 GGTATGCATGAAATCGCTGAAGCCTTAAGAGCAGTTATTCCTCCAACTAC 2897

2898 TGCTCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGA 2947
     *||*||*||*||**|*||*|||||*|||||*|||||*|||||||||||||
2898 AGCACCAGTTCCCTCAGGTTATCTTATTCAGCACGAAGAGGCTGAAGAGA 2947

2948 TACCCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTT 2997
     |*||*||*||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||*
2948 TTCCTTTGGGTGATTTATTTAAACATCAAGAAGAAAGGATAGTCAGTTTC 2997

2998 CAACCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027
     ||||||||*||||||||*||*||*||||||
2998 CAACCAGATTATCCTATCACTGCGAGAATT 3027