ID   LRR_BACT_20; MATRIX.
AC   PS50500;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Bacterial 20-residue LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1061000; R2=0.0088570; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1342; N_SCORE=13.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=665; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-21,6,3,-22,4,-6,-26,-4,-26,-19,7,-11,-1,-3,15,1,-19,-29,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-23,6,2,-10,2,-1,-22,-7,-22,-17,21,-18,-5,-7,4,-5,-23,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-27,-5,4,-21,-18,4,-13,4,-16,-6,5,-16,14,9,-2,-7,-17,-20,-6,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-31,-21,14,-31,-21,21,-30,45,19,-29,-29,-21,-21,-29,-10,11,-18,2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-21,-3,8,-19,-17,-8,-18,6,-17,-12,2,-11,4,5,6,10,-13,-26,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,2,11,-22,-8,-8,-20,2,-20,-15,4,-11,2,3,9,3,-15,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,48,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,12,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-25,-10,-2,-28,-18,-19,-21,-11,-29,-20,-15,66,-10,-19,-2,-5,-26,-33,-28,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-26,22,31,-28,-16,-5,-27,5,-20,-19,3,-6,8,-1,2,-4,-22,-31,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,12,-29,-18,19,-28,46,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-19,1,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-25,-21,-20,-15,-12,-21,-15,-21,76,-11,-20,-12,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-30,-3,6,-28,-16,-7,-19,-5,-22,-13,-7,32,7,-10,-1,-6,-24,-29,-20,5;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-1,-21,-5,-1,-8,-4,-5,-20,-5,-18,-12,6,-16,-3,-3,5,-1,-17,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-25,-5,10,-17,-21,-8,-13,5,-11,-7,-5,-12,6,2,-3,3,-12,-21,-5,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-25,-8,3,-8,-19,-7,-13,-1,-13,-9,-7,-15,0,-3,-3,-3,-12,-8,4,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,3,-21,-2,-7,-8,-9,5,-17,-5,-17,-11,9,-21,-7,-3,-6,-9,-17,-14,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=20,-22,-12,-27,-22,-8,-18,-26,15,-17,2,2,-21,-21,-21,-21,-2,-1,27,-25,-13,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-21,6,3,-22,4,-6,-26,-4,-26,-19,7,-11,-1,-3,15,1,-19,-29,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-23,6,2,-10,2,-1,-22,-7,-22,-17,21,-18,-5,-7,4,-5,-23,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-27,-5,4,-21,-18,4,-13,4,-16,-6,5,-16,14,9,-2,-7,-17,-20,-6,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-31,-21,14,-31,-21,21,-30,45,19,-29,-29,-21,-21,-29,-10,11,-18,2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-21,-3,8,-19,-17,-8,-18,6,-17,-12,2,-11,4,5,6,10,-13,-26,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,2,11,-22,-8,-8,-20,2,-20,-15,4,-11,2,3,9,3,-15,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,48,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,12,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-25,-10,-2,-28,-18,-19,-21,-11,-29,-20,-15,66,-10,-19,-2,-5,-26,-33,-28,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-26,22,31,-28,-16,-5,-27,5,-20,-19,3,-6,8,-1,2,-4,-22,-31,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,12,-29,-18,19,-28,46,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-19,1,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-25,-21,-20,-15,-12,-21,-15,-21,76,-11,-20,-12,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-30,-3,6,-28,-16,-7,-19,-5,-22,-13,-7,32,7,-10,-1,-6,-24,-29,-20,5;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-1,-21,-5,-1,-8,-4,-5,-20,-5,-18,-12,6,-16,-3,-3,5,-1,-17,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-25,-5,10,-17,-21,-8,-13,5,-11,-7,-5,-12,6,2,-3,3,-12,-21,-5,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-25,-8,3,-8,-19,-7,-13,-1,-13,-9,-7,-15,0,-3,-3,-3,-12,-8,4,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,3,-21,-2,-7,-8,-9,5,-17,-5,-17,-11,9,-21,-7,-3,-6,-9,-17,-14,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=20,-22,-12,-27,-22,-8,-18,-26,15,-17,2,2,-21,-21,-21,-21,-2,-1,27,-25,-13,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-21,6,3,-22,4,-6,-26,-4,-26,-19,7,-11,-1,-3,15,1,-19,-29,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-23,6,2,-10,2,-1,-22,-7,-22,-17,21,-18,-5,-7,4,-5,-23,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-27,-5,4,-21,-18,4,-13,4,-16,-6,5,-16,14,9,-2,-7,-17,-20,-6,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-31,-21,14,-31,-21,21,-30,45,19,-29,-29,-21,-21,-29,-10,11,-18,2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-21,-3,8,-19,-17,-8,-18,6,-17,-12,2,-11,4,5,6,10,-13,-26,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,2,11,-22,-8,-8,-20,2,-20,-15,4,-11,2,3,9,3,-15,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,48,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,12,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-25,-10,-2,-28,-18,-19,-21,-11,-29,-20,-15,66,-10,-19,-2,-5,-26,-33,-28,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-26,22,31,-28,-16,-5,-27,5,-20,-19,3,-6,8,-1,2,-4,-22,-31,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,12,-29,-18,19,-28,46,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-19,1,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-25,-21,-20,-15,-12,-21,-15,-21,76,-11,-20,-12,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-30,-3,6,-28,-16,-7,-19,-5,-22,-13,-7,32,7,-10,-1,-6,-24,-29,-20,5;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-1,-21,-5,-1,-8,-4,-5,-20,-5,-18,-12,6,-16,-3,-3,5,-1,-17,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-25,-5,10,-17,-21,-8,-13,5,-11,-7,-5,-12,6,2,-3,3,-12,-21,-5,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-25,-8,3,-8,-19,-7,-13,-1,-13,-9,-7,-15,0,-3,-3,-3,-12,-8,4,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,3,-21,-2,-7,-8,-9,5,-17,-5,-17,-11,9,-21,-7,-3,-6,-9,-17,-14,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=20,-22,-12,-27,-22,-8,-18,-26,15,-17,2,2,-21,-21,-21,-21,-2,-1,27,-25,-13,-22;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_CC; MATRIX.
AC   PS50501;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Cysteine-containing LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=78;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7388000; R2=0.0112400; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=584; N_SCORE=9.3; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=335; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-18,6,5,-22,-3,-8,-23,-4,-24,-17,5,-11,2,-8,19,10,-15,-31,-15,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,0,-22,-3,-10,-18,4,1,-24,-9,-18,-11,5,-21,-8,-5,-7,-13,-22,-9,-10,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,64,-20,-20,-17,-22,-21,-23,-22,-19,-17,-10,-23,-20,-23,-1,-2,-11,-41,-22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-9,-23,-10,-6,3,-16,-7,-13,-8,-13,-10,-5,-9,-11,-5,-3,-3,-10,-19,-2,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-21,8,0,-19,-7,-1,-16,0,-14,-7,17,-16,3,2,0,-5,-18,-28,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-27,14,-33,-24,30,-28,25,18,-24,-25,-23,-23,-21,-9,22,-17,3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-17,-2,-1,-17,-15,-5,-14,-3,-17,-11,11,-12,1,-5,13,22,-11,-31,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,28,-28,38,19,-28,-14,2,-30,1,-24,-22,14,-7,1,-7,-2,-9,-25,-34,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-24,13,14,-23,-12,-5,-27,7,-25,-18,8,-7,4,7,6,-2,-21,-30,-16,8;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-9,-9,-10,-17,-1,-9,-16,-14,-15,-11,-1,-15,-10,-14,11,11,-9,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-14,-31,-25,10,-29,-22,17,-25,24,13,-29,-30,-23,-20,-23,-9,17,-8,3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-26,-2,12,-20,-19,3,-17,5,-11,-5,-1,-14,16,8,-3,-7,-19,-23,-6,13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-22,-6,0,-13,-15,-5,-11,-1,-11,-7,0,-15,-4,-5,-1,3,-9,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-21,-33,-23,18,-30,-22,20,-29,34,15,-25,-27,-23,-22,-24,-9,11,-15,4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=6,-20,-18,-25,-19,8,-8,-20,-2,-19,6,-1,-16,-22,-21,-16,-9,-5,3,-16,-5,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-22,1,3,-21,-15,3,-15,-2,-17,-10,4,-14,2,-1,6,0,-11,-30,-11,1;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-20,-5,-3,-10,-10,3,-13,5,-13,-5,3,-13,2,9,-3,-6,-12,-15,-2,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,42,-22,-19,-14,-21,-21,-15,-18,-6,-9,-13,-29,-18,-16,-8,-7,-7,-37,-19,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-27,-4,3,-24,-10,-9,-20,-4,-25,-16,-4,24,-4,-10,3,-1,-19,-31,-21,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-22,-3,-2,-16,-15,0,-18,7,-17,-9,10,-16,3,12,2,5,-16,-25,-6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-23,2,7,-23,-19,-7,-15,8,-17,-9,1,-14,9,5,1,1,-10,-28,-13,8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-25,0,12,-14,-19,14,-19,2,-16,-10,1,-14,8,5,0,-3,-18,-20,5,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,17,-31,-22,21,-29,37,16,-28,-29,-24,-21,-25,-9,15,-17,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-24,17,4,-25,-2,6,-25,-3,-26,-17,23,-15,2,-2,8,-3,-23,-34,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,12,-32,-23,26,-30,38,18,-27,-28,-22,-22,-26,-10,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-18,6,5,-22,-3,-8,-23,-4,-24,-17,5,-11,2,-8,19,10,-15,-31,-15,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,0,-22,-3,-10,-18,4,1,-24,-9,-18,-11,5,-21,-8,-5,-7,-13,-22,-9,-10,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,64,-20,-20,-17,-22,-21,-23,-22,-19,-17,-10,-23,-20,-23,-1,-2,-11,-41,-22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-9,-23,-10,-6,3,-16,-7,-13,-8,-13,-10,-5,-9,-11,-5,-3,-3,-10,-19,-2,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-21,8,0,-19,-7,-1,-16,0,-14,-7,17,-16,3,2,0,-5,-18,-28,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-27,14,-33,-24,30,-28,25,18,-24,-25,-23,-23,-21,-9,22,-17,3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-17,-2,-1,-17,-15,-5,-14,-3,-17,-11,11,-12,1,-5,13,22,-11,-31,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,28,-28,38,19,-28,-14,2,-30,1,-24,-22,14,-7,1,-7,-2,-9,-25,-34,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-24,13,14,-23,-12,-5,-27,7,-25,-18,8,-7,4,7,6,-2,-21,-30,-16,8;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-9,-9,-10,-17,-1,-9,-16,-14,-15,-11,-1,-15,-10,-14,11,11,-9,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-14,-31,-25,10,-29,-22,17,-25,24,13,-29,-30,-23,-20,-23,-9,17,-8,3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-26,-2,12,-20,-19,3,-17,5,-11,-5,-1,-14,16,8,-3,-7,-19,-23,-6,13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-22,-6,0,-13,-15,-5,-11,-1,-11,-7,0,-15,-4,-5,-1,3,-9,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-21,-33,-23,18,-30,-22,20,-29,34,15,-25,-27,-23,-22,-24,-9,11,-15,4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=6,-20,-18,-25,-19,8,-8,-20,-2,-19,6,-1,-16,-22,-21,-16,-9,-5,3,-16,-5,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-22,1,3,-21,-15,3,-15,-2,-17,-10,4,-14,2,-1,6,0,-11,-30,-11,1;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-20,-5,-3,-10,-10,3,-13,5,-13,-5,3,-13,2,9,-3,-6,-12,-15,-2,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,42,-22,-19,-14,-21,-21,-15,-18,-6,-9,-13,-29,-18,-16,-8,-7,-7,-37,-19,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-27,-4,3,-24,-10,-9,-20,-4,-25,-16,-4,24,-4,-10,3,-1,-19,-31,-21,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-22,-3,-2,-16,-15,0,-18,7,-17,-9,10,-16,3,12,2,5,-16,-25,-6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-23,2,7,-23,-19,-7,-15,8,-17,-9,1,-14,9,5,1,1,-10,-28,-13,8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-25,0,12,-14,-19,14,-19,2,-16,-10,1,-14,8,5,0,-3,-18,-20,5,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,17,-31,-22,21,-29,37,16,-28,-29,-24,-21,-25,-9,15,-17,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-24,17,4,-25,-2,6,-25,-3,-26,-17,23,-15,2,-2,8,-3,-23,-34,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,12,-32,-23,26,-30,38,18,-27,-28,-22,-22,-26,-10,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-18,6,5,-22,-3,-8,-23,-4,-24,-17,5,-11,2,-8,19,10,-15,-31,-15,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,0,-22,-3,-10,-18,4,1,-24,-9,-18,-11,5,-21,-8,-5,-7,-13,-22,-9,-10,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,64,-20,-20,-17,-22,-21,-23,-22,-19,-17,-10,-23,-20,-23,-1,-2,-11,-41,-22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-9,-23,-10,-6,3,-16,-7,-13,-8,-13,-10,-5,-9,-11,-5,-3,-3,-10,-19,-2,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-21,8,0,-19,-7,-1,-16,0,-14,-7,17,-16,3,2,0,-5,-18,-28,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-27,14,-33,-24,30,-28,25,18,-24,-25,-23,-23,-21,-9,22,-17,3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-17,-2,-1,-17,-15,-5,-14,-3,-17,-11,11,-12,1,-5,13,22,-11,-31,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,28,-28,38,19,-28,-14,2,-30,1,-24,-22,14,-7,1,-7,-2,-9,-25,-34,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-24,13,14,-23,-12,-5,-27,7,-25,-18,8,-7,4,7,6,-2,-21,-30,-16,8;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-9,-9,-10,-17,-1,-9,-16,-14,-15,-11,-1,-15,-10,-14,11,11,-9,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-14,-31,-25,10,-29,-22,17,-25,24,13,-29,-30,-23,-20,-23,-9,17,-8,3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-26,-2,12,-20,-19,3,-17,5,-11,-5,-1,-14,16,8,-3,-7,-19,-23,-6,13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-22,-6,0,-13,-15,-5,-11,-1,-11,-7,0,-15,-4,-5,-1,3,-9,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-21,-33,-23,18,-30,-22,20,-29,34,15,-25,-27,-23,-22,-24,-9,11,-15,4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=6,-20,-18,-25,-19,8,-8,-20,-2,-19,6,-1,-16,-22,-21,-16,-9,-5,3,-16,-5,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-22,1,3,-21,-15,3,-15,-2,-17,-10,4,-14,2,-1,6,0,-11,-30,-11,1;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-20,-5,-3,-10,-10,3,-13,5,-13,-5,3,-13,2,9,-3,-6,-12,-15,-2,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,42,-22,-19,-14,-21,-21,-15,-18,-6,-9,-13,-29,-18,-16,-8,-7,-7,-37,-19,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-27,-4,3,-24,-10,-9,-20,-4,-25,-16,-4,24,-4,-10,3,-1,-19,-31,-21,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-22,-3,-2,-16,-15,0,-18,7,-17,-9,10,-16,3,12,2,5,-16,-25,-6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-23,2,7,-23,-19,-7,-15,8,-17,-9,1,-14,9,5,1,1,-10,-28,-13,8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-25,0,12,-14,-19,14,-19,2,-16,-10,1,-14,8,5,0,-3,-18,-20,5,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,17,-31,-22,21,-29,37,16,-28,-29,-24,-21,-25,-9,15,-17,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-24,17,4,-25,-2,6,-25,-3,-26,-17,23,-15,2,-2,8,-3,-23,-34,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,12,-32,-23,26,-30,38,18,-27,-28,-22,-22,-26,-10,16,-18,2,-24;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_PS; MATRIX.
AC   PS50502;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Plant specific LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2134000; R2=0.0150200; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=629; N_SCORE=11.65; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=286; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-5,-4,-11,-7,-7,-16,-8,-18,-13,4,-15,-4,-6,11,4,-12,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-27,2,-1,-14,-5,-2,-21,2,-21,-12,8,-17,-3,1,-3,-8,-20,-18,-6,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,31,-17,14,-1,-20,-3,7,-18,-1,-26,-15,48,-19,1,-2,8,1,-26,-38,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-22,0,2,-19,-11,-1,-19,7,-20,-8,12,-15,6,13,6,-1,-17,-29,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-34,-25,25,-32,-22,21,-29,33,14,-26,-28,-26,-22,-25,-9,14,-13,7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-13,-4,0,-15,-10,-12,-13,-8,-19,-14,3,-12,-4,-10,22,20,-5,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-12,-21,-23,64,-20,-38,-21,-28,-19,-1,-21,-21,-20,-1,-19,-28,-18,-26,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-23,9,11,-25,-13,-10,-21,-2,-22,-16,0,7,1,-9,9,4,-17,-32,-19,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-24,-35,-26,2,-34,-26,36,-28,28,18,-24,-24,-20,-25,-21,-9,23,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-33,-8,-2,-28,-11,-18,-21,-11,-29,-20,-13,63,-9,-18,0,-3,-25,-31,-28,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-24,3,4,-24,-11,-8,-18,1,-20,-11,0,1,0,-5,0,-5,-14,-29,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-19,-5,0,-7,-10,-12,-13,-11,-10,-10,-1,-16,-6,-11,5,2,-9,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-24,-19,9,-22,-17,12,-23,19,10,-19,-24,-16,-19,-17,-9,6,-16,3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-19,-13,-15,-15,17,-17,-19,-16,-14,-12,-3,-16,-14,-16,1,-3,-14,-21,-17,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-21,-4,-3,-19,-3,-8,-17,-4,-17,-9,4,-11,1,-4,7,0,-15,-28,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-17,-13,-11,-4,-22,-16,0,-13,9,2,-10,-21,-12,-13,-10,-2,-1,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-19,0,5,-24,-10,-9,-24,11,-24,-14,6,-4,2,3,2,0,-20,-29,-17,3;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-15,-3,-3,-9,-7,-2,-14,-2,-15,-9,7,-7,-2,-2,6,5,-12,-21,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,11,-30,-21,19,-28,42,17,-28,-29,-21,-20,-25,-6,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-23,-3,5,-23,-14,-5,-14,7,-19,-8,4,-13,9,2,3,0,-13,-27,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-22,-8,-1,-11,-10,-8,-14,-2,-14,-9,-3,-16,-3,1,1,-1,-10,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-24,9,-31,-22,27,-28,35,20,-27,-28,-21,-21,-24,-8,20,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-27,16,5,-21,-15,4,-22,-2,-20,-14,9,-15,0,-3,-2,-5,-20,-18,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-31,-22,10,-26,-22,20,-28,36,15,-26,-28,-22,-21,-24,-9,12,-19,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-5,-4,-11,-7,-7,-16,-8,-18,-13,4,-15,-4,-6,11,4,-12,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-27,2,-1,-14,-5,-2,-21,2,-21,-12,8,-17,-3,1,-3,-8,-20,-18,-6,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,31,-17,14,-1,-20,-3,7,-18,-1,-26,-15,48,-19,1,-2,8,1,-26,-38,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-22,0,2,-19,-11,-1,-19,7,-20,-8,12,-15,6,13,6,-1,-17,-29,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-34,-25,25,-32,-22,21,-29,33,14,-26,-28,-26,-22,-25,-9,14,-13,7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-13,-4,0,-15,-10,-12,-13,-8,-19,-14,3,-12,-4,-10,22,20,-5,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-12,-21,-23,64,-20,-38,-21,-28,-19,-1,-21,-21,-20,-1,-19,-28,-18,-26,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-23,9,11,-25,-13,-10,-21,-2,-22,-16,0,7,1,-9,9,4,-17,-32,-19,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-24,-35,-26,2,-34,-26,36,-28,28,18,-24,-24,-20,-25,-21,-9,23,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-33,-8,-2,-28,-11,-18,-21,-11,-29,-20,-13,63,-9,-18,0,-3,-25,-31,-28,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-24,3,4,-24,-11,-8,-18,1,-20,-11,0,1,0,-5,0,-5,-14,-29,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-19,-5,0,-7,-10,-12,-13,-11,-10,-10,-1,-16,-6,-11,5,2,-9,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-24,-19,9,-22,-17,12,-23,19,10,-19,-24,-16,-19,-17,-9,6,-16,3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-19,-13,-15,-15,17,-17,-19,-16,-14,-12,-3,-16,-14,-16,1,-3,-14,-21,-17,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-21,-4,-3,-19,-3,-8,-17,-4,-17,-9,4,-11,1,-4,7,0,-15,-28,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-17,-13,-11,-4,-22,-16,0,-13,9,2,-10,-21,-12,-13,-10,-2,-1,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-19,0,5,-24,-10,-9,-24,11,-24,-14,6,-4,2,3,2,0,-20,-29,-17,3;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-15,-3,-3,-9,-7,-2,-14,-2,-15,-9,7,-7,-2,-2,6,5,-12,-21,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,11,-30,-21,19,-28,42,17,-28,-29,-21,-20,-25,-6,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-23,-3,5,-23,-14,-5,-14,7,-19,-8,4,-13,9,2,3,0,-13,-27,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-22,-8,-1,-11,-10,-8,-14,-2,-14,-9,-3,-16,-3,1,1,-1,-10,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-24,9,-31,-22,27,-28,35,20,-27,-28,-21,-21,-24,-8,20,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-27,16,5,-21,-15,4,-22,-2,-20,-14,9,-15,0,-3,-2,-5,-20,-18,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-31,-22,10,-26,-22,20,-28,36,15,-26,-28,-22,-21,-24,-9,12,-19,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-5,-4,-11,-7,-7,-16,-8,-18,-13,4,-15,-4,-6,11,4,-12,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-27,2,-1,-14,-5,-2,-21,2,-21,-12,8,-17,-3,1,-3,-8,-20,-18,-6,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,31,-17,14,-1,-20,-3,7,-18,-1,-26,-15,48,-19,1,-2,8,1,-26,-38,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-22,0,2,-19,-11,-1,-19,7,-20,-8,12,-15,6,13,6,-1,-17,-29,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-34,-25,25,-32,-22,21,-29,33,14,-26,-28,-26,-22,-25,-9,14,-13,7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-13,-4,0,-15,-10,-12,-13,-8,-19,-14,3,-12,-4,-10,22,20,-5,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-12,-21,-23,64,-20,-38,-21,-28,-19,-1,-21,-21,-20,-1,-19,-28,-18,-26,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-23,9,11,-25,-13,-10,-21,-2,-22,-16,0,7,1,-9,9,4,-17,-32,-19,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-24,-35,-26,2,-34,-26,36,-28,28,18,-24,-24,-20,-25,-21,-9,23,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-33,-8,-2,-28,-11,-18,-21,-11,-29,-20,-13,63,-9,-18,0,-3,-25,-31,-28,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-24,3,4,-24,-11,-8,-18,1,-20,-11,0,1,0,-5,0,-5,-14,-29,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-19,-5,0,-7,-10,-12,-13,-11,-10,-10,-1,-16,-6,-11,5,2,-9,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-24,-19,9,-22,-17,12,-23,19,10,-19,-24,-16,-19,-17,-9,6,-16,3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-19,-13,-15,-15,17,-17,-19,-16,-14,-12,-3,-16,-14,-16,1,-3,-14,-21,-17,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-21,-4,-3,-19,-3,-8,-17,-4,-17,-9,4,-11,1,-4,7,0,-15,-28,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-17,-13,-11,-4,-22,-16,0,-13,9,2,-10,-21,-12,-13,-10,-2,-1,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-19,0,5,-24,-10,-9,-24,11,-24,-14,6,-4,2,3,2,0,-20,-29,-17,3;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-15,-3,-3,-9,-7,-2,-14,-2,-15,-9,7,-7,-2,-2,6,5,-12,-21,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,11,-30,-21,19,-28,42,17,-28,-29,-21,-20,-25,-6,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-23,-3,5,-23,-14,-5,-14,7,-19,-8,4,-13,9,2,3,0,-13,-27,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-22,-8,-1,-11,-10,-8,-14,-2,-14,-9,-3,-16,-3,1,1,-1,-10,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-24,9,-31,-22,27,-28,35,20,-27,-28,-21,-21,-24,-8,20,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-27,16,5,-21,-15,4,-22,-2,-20,-14,9,-15,0,-3,-2,-5,-20,-18,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-31,-22,10,-26,-22,20,-28,36,15,-26,-28,-22,-21,-24,-9,12,-19,0,-22;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_RI; MATRIX.
AC   PS50503;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Ribonuclease inhibitor-like LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=84;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=79;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5085000; R2=0.0299800; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=550; N_SCORE=18.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=200; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-9;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_SDS22; MATRIX.
AC   PS50504;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   SDS22+-like LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5867000; R2=0.0153300; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=667; N_SCORE=12.8; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=255; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-2,3,-11,-1,-3,-20,-2,2,-24,-5,-24,-16,10,-17,-3,-1,10,1,-18,-31,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-26,10,0,-23,6,13,-28,-3,-25,-15,18,-17,0,-2,1,-7,-26,-28,-10,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-21,10,-3,-14,-6,8,-15,1,-23,-11,39,-20,0,0,5,-1,-23,-31,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-27,2,4,-23,-15,-7,-18,12,-16,-9,1,-15,5,14,-5,-8,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-34,-24,1,-35,-26,35,-28,25,17,-23,-14,-19,-26,-22,-10,19,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-20,-6,4,-23,-19,-12,-20,9,-21,-12,-6,5,2,7,-1,2,-15,-27,-16,2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-18,-1,-1,-21,-17,-11,-11,4,-16,-8,0,-16,-1,-1,0,-4,-5,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-24,-28,-17,0,-31,-23,24,-24,20,11,-21,-22,-16,-22,-17,-8,16,-17,-3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-17,7,14,-29,-4,-8,-28,3,-25,-17,2,-6,6,-4,4,-6,-23,-30,-20,9;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-25,3,-1,-23,9,1,-23,-8,-23,-12,14,-6,-4,-10,3,-7,-23,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-23,-23,-19,3,-25,-21,17,-26,26,11,-21,-25,-19,-21,-20,-9,10,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-24,8,10,-26,-8,-9,-21,-3,-15,-13,-2,-7,4,-8,0,-5,-17,-28,-17,7;
MA   /M: SY='A'; M=5,0,-22,-3,-1,-20,-9,-6,-17,-3,-16,-11,0,-2,-2,-9,1,-1,-15,-23,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-11,-30,-20,6,-28,-20,15,-28,41,18,-28,-29,-19,-20,-26,-10,8,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,0,-29,6,6,-25,-19,-11,-21,8,-19,-13,-5,12,0,4,-6,-4,-18,-28,-16,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-9,-3,0,-21,-13,-4,-20,3,-18,-11,11,-18,5,7,2,-2,-18,-30,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-7,-31,-23,13,-30,-22,15,-29,35,14,-28,-31,-24,-21,-25,-9,12,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-24,5,13,-23,-16,-9,-22,10,-19,-13,0,-11,5,9,1,5,-15,-27,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-8,-23,-8,0,-13,-20,3,-8,-7,-8,-5,-8,-16,-4,-9,-4,-4,-5,-19,-2,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-6,1,-23,1,-6,-3,-16,-8,-11,-12,-8,-9,-2,-19,-8,-13,-3,-5,-11,-14,0,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-32,-22,12,-29,-20,21,-27,35,19,-26,-27,-20,-20,-24,-9,13,-18,1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-2,3,-11,-1,-3,-20,-2,2,-24,-5,-24,-16,10,-17,-3,-1,10,1,-18,-31,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-26,10,0,-23,6,13,-28,-3,-25,-15,18,-17,0,-2,1,-7,-26,-28,-10,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-21,10,-3,-14,-6,8,-15,1,-23,-11,39,-20,0,0,5,-1,-23,-31,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-27,2,4,-23,-15,-7,-18,12,-16,-9,1,-15,5,14,-5,-8,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-34,-24,1,-35,-26,35,-28,25,17,-23,-14,-19,-26,-22,-10,19,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-20,-6,4,-23,-19,-12,-20,9,-21,-12,-6,5,2,7,-1,2,-15,-27,-16,2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-18,-1,-1,-21,-17,-11,-11,4,-16,-8,0,-16,-1,-1,0,-4,-5,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-24,-28,-17,0,-31,-23,24,-24,20,11,-21,-22,-16,-22,-17,-8,16,-17,-3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-17,7,14,-29,-4,-8,-28,3,-25,-17,2,-6,6,-4,4,-6,-23,-30,-20,9;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-25,3,-1,-23,9,1,-23,-8,-23,-12,14,-6,-4,-10,3,-7,-23,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-23,-23,-19,3,-25,-21,17,-26,26,11,-21,-25,-19,-21,-20,-9,10,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-24,8,10,-26,-8,-9,-21,-3,-15,-13,-2,-7,4,-8,0,-5,-17,-28,-17,7;
MA   /M: SY='A'; M=5,0,-22,-3,-1,-20,-9,-6,-17,-3,-16,-11,0,-2,-2,-9,1,-1,-15,-23,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-11,-30,-20,6,-28,-20,15,-28,41,18,-28,-29,-19,-20,-26,-10,8,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,0,-29,6,6,-25,-19,-11,-21,8,-19,-13,-5,12,0,4,-6,-4,-18,-28,-16,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-9,-3,0,-21,-13,-4,-20,3,-18,-11,11,-18,5,7,2,-2,-18,-30,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-7,-31,-23,13,-30,-22,15,-29,35,14,-28,-31,-24,-21,-25,-9,12,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-24,5,13,-23,-16,-9,-22,10,-19,-13,0,-11,5,9,1,5,-15,-27,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-8,-23,-8,0,-13,-20,3,-8,-7,-8,-5,-8,-16,-4,-9,-4,-4,-5,-19,-2,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-6,1,-23,1,-6,-3,-16,-8,-11,-12,-8,-9,-2,-19,-8,-13,-3,-5,-11,-14,0,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-32,-22,12,-29,-20,21,-27,35,19,-26,-27,-20,-20,-24,-9,13,-18,1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-2,3,-11,-1,-3,-20,-2,2,-24,-5,-24,-16,10,-17,-3,-1,10,1,-18,-31,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-26,10,0,-23,6,13,-28,-3,-25,-15,18,-17,0,-2,1,-7,-26,-28,-10,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-21,10,-3,-14,-6,8,-15,1,-23,-11,39,-20,0,0,5,-1,-23,-31,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-27,2,4,-23,-15,-7,-18,12,-16,-9,1,-15,5,14,-5,-8,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-34,-24,1,-35,-26,35,-28,25,17,-23,-14,-19,-26,-22,-10,19,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-20,-6,4,-23,-19,-12,-20,9,-21,-12,-6,5,2,7,-1,2,-15,-27,-16,2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-18,-1,-1,-21,-17,-11,-11,4,-16,-8,0,-16,-1,-1,0,-4,-5,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-24,-28,-17,0,-31,-23,24,-24,20,11,-21,-22,-16,-22,-17,-8,16,-17,-3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-17,7,14,-29,-4,-8,-28,3,-25,-17,2,-6,6,-4,4,-6,-23,-30,-20,9;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-25,3,-1,-23,9,1,-23,-8,-23,-12,14,-6,-4,-10,3,-7,-23,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-23,-23,-19,3,-25,-21,17,-26,26,11,-21,-25,-19,-21,-20,-9,10,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-24,8,10,-26,-8,-9,-21,-3,-15,-13,-2,-7,4,-8,0,-5,-17,-28,-17,7;
MA   /M: SY='A'; M=5,0,-22,-3,-1,-20,-9,-6,-17,-3,-16,-11,0,-2,-2,-9,1,-1,-15,-23,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-11,-30,-20,6,-28,-20,15,-28,41,18,-28,-29,-19,-20,-26,-10,8,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,0,-29,6,6,-25,-19,-11,-21,8,-19,-13,-5,12,0,4,-6,-4,-18,-28,-16,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-9,-3,0,-21,-13,-4,-20,3,-18,-11,11,-18,5,7,2,-2,-18,-30,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-7,-31,-23,13,-30,-22,15,-29,35,14,-28,-31,-24,-21,-25,-9,12,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-24,5,13,-23,-16,-9,-22,10,-19,-13,0,-11,5,9,1,5,-15,-27,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-8,-23,-8,0,-13,-20,3,-8,-7,-8,-5,-8,-16,-4,-9,-4,-4,-5,-19,-2,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-6,1,-23,1,-6,-3,-16,-8,-11,-12,-8,-9,-2,-19,-8,-13,-3,-5,-11,-14,0,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-32,-22,12,-29,-20,21,-27,35,19,-26,-27,-20,-20,-24,-9,13,-18,1,-21;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_TP; MATRIX.
AC   PS50505;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Treponema pallidum (Tp) LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1802000; R2=0.0142000; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=832; N_SCORE=14.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=304; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-20,2,4,-27,-4,-8,-24,7,-27,-15,5,-11,8,1,15,3,-17,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,37,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-23,0,15,-23,-19,-8,-21,13,-19,-11,-1,-10,9,12,3,5,-14,-27,-13,11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-19,-8,2,-12,-21,-3,-9,-4,-6,-2,-6,-14,-3,-6,1,11,-5,-24,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-7,-8,-28,36,-16,-33,-8,-27,-18,-1,-10,-11,-9,2,-13,-25,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-25,9,16,-19,-18,9,-21,-2,-18,-11,2,-12,13,-4,1,-5,-19,-27,-8,14;
MA   /M: SY='H'; M=-7,5,-25,2,1,-20,-6,10,-21,-3,-20,-7,10,-16,4,-1,0,-7,-21,-19,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-11,-22,-13,-15,-5,-21,-4,-13,-2,-5,-14,-14,-13,-20,4,-1,5,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,69,-30,-20,3,-30,16,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-21,6,-1,-14,-13,6,-18,-7,-12,-8,2,-16,-3,-3,3,-3,-14,-29,-7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-23,0,-8,-9,2,-12,-16,-11,-14,-12,5,-18,-12,-12,1,-5,-14,-25,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-6,6,29,-5,-12,-17,-14,-11,-20,-14,-20,-16,15,-25,-12,-14,6,4,-15,-41,-21,-12;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-8,-5,-5,-9,-2,-9,-7,-6,-9,-6,-1,-7,-3,-6,9,12,-2,-16,-8,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-23,0,3,-23,1,1,-26,5,-26,-15,11,-14,2,9,8,-3,-21,-29,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-19,-29,-19,4,-25,-21,17,-26,37,15,-26,-26,-18,-21,-22,-8,10,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-24,2,16,-24,-16,-9,-21,17,-21,-12,3,-10,5,6,-1,-3,-15,-26,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-22,0,3,-23,-7,0,-24,8,-24,-13,9,-13,7,10,8,4,-19,-28,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-35,-25,10,-34,-25,31,-29,33,18,-25,-26,-22,-24,-24,-9,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-21,-2,10,-16,-22,-14,-5,-7,-9,-8,-4,-10,-2,-11,4,10,-3,-29,-13,3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-19,-33,-24,29,-29,-22,15,-28,28,11,-25,-28,-27,-21,-22,-9,11,-11,8,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-28,-4,-1,-25,-14,-14,-17,-5,-23,-11,-9,37,-5,-13,1,-4,-19,-30,-22,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-4,13,-23,14,6,-27,-1,-6,-28,7,-28,-19,13,-13,1,3,8,-3,-22,-31,-19,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-20,2,4,-27,-4,-8,-24,7,-27,-15,5,-11,8,1,15,3,-17,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,37,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-23,0,15,-23,-19,-8,-21,13,-19,-11,-1,-10,9,12,3,5,-14,-27,-13,11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-19,-8,2,-12,-21,-3,-9,-4,-6,-2,-6,-14,-3,-6,1,11,-5,-24,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-7,-8,-28,36,-16,-33,-8,-27,-18,-1,-10,-11,-9,2,-13,-25,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-25,9,16,-19,-18,9,-21,-2,-18,-11,2,-12,13,-4,1,-5,-19,-27,-8,14;
MA   /M: SY='H'; M=-7,5,-25,2,1,-20,-6,10,-21,-3,-20,-7,10,-16,4,-1,0,-7,-21,-19,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-11,-22,-13,-15,-5,-21,-4,-13,-2,-5,-14,-14,-13,-20,4,-1,5,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,69,-30,-20,3,-30,16,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-21,6,-1,-14,-13,6,-18,-7,-12,-8,2,-16,-3,-3,3,-3,-14,-29,-7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-23,0,-8,-9,2,-12,-16,-11,-14,-12,5,-18,-12,-12,1,-5,-14,-25,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-6,6,29,-5,-12,-17,-14,-11,-20,-14,-20,-16,15,-25,-12,-14,6,4,-15,-41,-21,-12;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-8,-5,-5,-9,-2,-9,-7,-6,-9,-6,-1,-7,-3,-6,9,12,-2,-16,-8,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-23,0,3,-23,1,1,-26,5,-26,-15,11,-14,2,9,8,-3,-21,-29,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-19,-29,-19,4,-25,-21,17,-26,37,15,-26,-26,-18,-21,-22,-8,10,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-24,2,16,-24,-16,-9,-21,17,-21,-12,3,-10,5,6,-1,-3,-15,-26,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-22,0,3,-23,-7,0,-24,8,-24,-13,9,-13,7,10,8,4,-19,-28,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-35,-25,10,-34,-25,31,-29,33,18,-25,-26,-22,-24,-24,-9,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-21,-2,10,-16,-22,-14,-5,-7,-9,-8,-4,-10,-2,-11,4,10,-3,-29,-13,3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-19,-33,-24,29,-29,-22,15,-28,28,11,-25,-28,-27,-21,-22,-9,11,-11,8,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-28,-4,-1,-25,-14,-14,-17,-5,-23,-11,-9,37,-5,-13,1,-4,-19,-30,-22,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-4,13,-23,14,6,-27,-1,-6,-28,7,-28,-19,13,-13,1,3,8,-3,-22,-31,-19,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-20,2,4,-27,-4,-8,-24,7,-27,-15,5,-11,8,1,15,3,-17,-30,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,37,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-23,0,15,-23,-19,-8,-21,13,-19,-11,-1,-10,9,12,3,5,-14,-27,-13,11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-19,-8,2,-12,-21,-3,-9,-4,-6,-2,-6,-14,-3,-6,1,11,-5,-24,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-7,-8,-28,36,-16,-33,-8,-27,-18,-1,-10,-11,-9,2,-13,-25,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-25,9,16,-19,-18,9,-21,-2,-18,-11,2,-12,13,-4,1,-5,-19,-27,-8,14;
MA   /M: SY='H'; M=-7,5,-25,2,1,-20,-6,10,-21,-3,-20,-7,10,-16,4,-1,0,-7,-21,-19,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-11,-22,-13,-15,-5,-21,-4,-13,-2,-5,-14,-14,-13,-20,4,-1,5,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,69,-30,-20,3,-30,16,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-21,6,-1,-14,-13,6,-18,-7,-12,-8,2,-16,-3,-3,3,-3,-14,-29,-7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-23,0,-8,-9,2,-12,-16,-11,-14,-12,5,-18,-12,-12,1,-5,-14,-25,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-6,6,29,-5,-12,-17,-14,-11,-20,-14,-20,-16,15,-25,-12,-14,6,4,-15,-41,-21,-12;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-8,-5,-5,-9,-2,-9,-7,-6,-9,-6,-1,-7,-3,-6,9,12,-2,-16,-8,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-23,0,3,-23,1,1,-26,5,-26,-15,11,-14,2,9,8,-3,-21,-29,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-19,-29,-19,4,-25,-21,17,-26,37,15,-26,-26,-18,-21,-22,-8,10,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-24,2,16,-24,-16,-9,-21,17,-21,-12,3,-10,5,6,-1,-3,-15,-26,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-22,0,3,-23,-7,0,-24,8,-24,-13,9,-13,7,10,8,4,-19,-28,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-35,-25,10,-34,-25,31,-29,33,18,-25,-26,-22,-24,-24,-9,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-21,-2,10,-16,-22,-14,-5,-7,-9,-8,-4,-10,-2,-11,4,10,-3,-29,-13,3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-19,-33,-24,29,-29,-22,15,-28,28,11,-25,-28,-27,-21,-22,-9,11,-11,8,-24;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//
ID   LRR_TYPICAL; MATRIX.
AC   PS50506;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Typical LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5171000; R2=0.0165000; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=617; N_SCORE=12.7; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=302; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-22,4,2,-21,-6,-5,-15,-6,-19,-12,8,-14,4,-9,7,-2,-15,-26,-11,2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-27,20,12,-22,-15,33,-27,-3,-22,-14,18,-15,5,-3,-1,-7,-27,-30,-1,7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-8,12,-3,-19,-4,3,-20,-4,-27,-19,45,-20,-3,-4,12,6,-24,-40,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-27,2,12,-27,-11,15,-23,5,-20,-8,8,-13,19,3,-1,-9,-25,-27,-9,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-34,-24,11,-33,-24,29,-29,35,18,-26,-27,-22,-23,-25,-9,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-1,-21,-4,1,-16,-19,-9,-15,2,-15,-10,0,-13,2,5,7,14,-10,-24,-6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-20,-6,5,-14,-17,-8,-18,4,-16,-8,0,-12,5,9,8,9,-13,-26,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-31,-26,3,-30,-25,27,-24,25,17,-29,-29,-24,-20,-18,-5,32,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-34,-7,2,-29,-15,-4,-22,-4,-25,-13,-10,41,6,-5,-5,-7,-27,-27,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,5,-25,9,1,-26,4,-11,-25,-6,-24,-18,3,-2,-6,-8,5,-5,-18,-31,-22,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-2,-26,-1,3,-22,7,10,-27,-8,-23,-14,4,-9,1,-9,3,-6,-24,-25,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=12,-20,-16,-25,-17,-3,-19,-18,8,-18,15,8,-19,-20,-15,-19,-9,-1,8,-18,-3,-16;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-17,-25,-17,36,-21,-14,-4,-16,4,-2,-12,-22,-21,-6,-9,-4,-3,-5,11,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,7,-22,10,10,-23,-6,-2,-25,7,-22,-15,8,-12,8,15,5,-4,-20,-26,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,8,-14,5,-3,-14,11,3,-16,-5,-15,-10,11,-10,-4,-6,2,-6,-15,-16,-11,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-12,-23,-15,-7,-17,-17,1,-20,15,7,-21,-11,-12,-18,-16,-9,-3,-23,-11,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-23,-11,-4,-13,-18,-16,-14,-6,-17,-13,-9,17,-8,-5,3,7,-11,-26,-15,-8;
MA   /M: SY='N'; M=0,11,-21,1,-3,-21,-1,3,-20,3,-23,-11,21,-16,0,3,6,-3,-19,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-24,0,12,-16,-19,-6,-15,-2,-5,-8,-6,-14,4,2,-3,-3,-14,-23,-8,7;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-10,-23,-10,-2,-15,-16,7,-14,-5,-13,-7,-6,-17,5,-1,0,-5,-12,-11,0,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,6,-31,-22,27,-27,35,21,-28,-28,-20,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,4,-27,5,-2,-11,-18,8,-15,-1,-15,-9,2,-18,1,-2,-5,-7,-16,-14,13,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-30,-22,7,-29,-19,22,-26,39,24,-29,-29,-19,-19,-25,-8,17,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-22,4,2,-21,-6,-5,-15,-6,-19,-12,8,-14,4,-9,7,-2,-15,-26,-11,2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-27,20,12,-22,-15,33,-27,-3,-22,-14,18,-15,5,-3,-1,-7,-27,-30,-1,7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-8,12,-3,-19,-4,3,-20,-4,-27,-19,45,-20,-3,-4,12,6,-24,-40,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-27,2,12,-27,-11,15,-23,5,-20,-8,8,-13,19,3,-1,-9,-25,-27,-9,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-34,-24,11,-33,-24,29,-29,35,18,-26,-27,-22,-23,-25,-9,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-1,-21,-4,1,-16,-19,-9,-15,2,-15,-10,0,-13,2,5,7,14,-10,-24,-6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-20,-6,5,-14,-17,-8,-18,4,-16,-8,0,-12,5,9,8,9,-13,-26,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-31,-26,3,-30,-25,27,-24,25,17,-29,-29,-24,-20,-18,-5,32,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-34,-7,2,-29,-15,-4,-22,-4,-25,-13,-10,41,6,-5,-5,-7,-27,-27,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,5,-25,9,1,-26,4,-11,-25,-6,-24,-18,3,-2,-6,-8,5,-5,-18,-31,-22,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-2,-26,-1,3,-22,7,10,-27,-8,-23,-14,4,-9,1,-9,3,-6,-24,-25,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=12,-20,-16,-25,-17,-3,-19,-18,8,-18,15,8,-19,-20,-15,-19,-9,-1,8,-18,-3,-16;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-17,-25,-17,36,-21,-14,-4,-16,4,-2,-12,-22,-21,-6,-9,-4,-3,-5,11,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,7,-22,10,10,-23,-6,-2,-25,7,-22,-15,8,-12,8,15,5,-4,-20,-26,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,8,-14,5,-3,-14,11,3,-16,-5,-15,-10,11,-10,-4,-6,2,-6,-15,-16,-11,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-12,-23,-15,-7,-17,-17,1,-20,15,7,-21,-11,-12,-18,-16,-9,-3,-23,-11,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-23,-11,-4,-13,-18,-16,-14,-6,-17,-13,-9,17,-8,-5,3,7,-11,-26,-15,-8;
MA   /M: SY='N'; M=0,11,-21,1,-3,-21,-1,3,-20,3,-23,-11,21,-16,0,3,6,-3,-19,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-24,0,12,-16,-19,-6,-15,-2,-5,-8,-6,-14,4,2,-3,-3,-14,-23,-8,7;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-10,-23,-10,-2,-15,-16,7,-14,-5,-13,-7,-6,-17,5,-1,0,-5,-12,-11,0,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,6,-31,-22,27,-27,35,21,-28,-28,-20,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,4,-27,5,-2,-11,-18,8,-15,-1,-15,-9,2,-18,1,-2,-5,-7,-16,-14,13,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-30,-22,7,-29,-19,22,-26,39,24,-29,-29,-19,-19,-25,-8,17,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-22,4,2,-21,-6,-5,-15,-6,-19,-12,8,-14,4,-9,7,-2,-15,-26,-11,2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-27,20,12,-22,-15,33,-27,-3,-22,-14,18,-15,5,-3,-1,-7,-27,-30,-1,7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-8,12,-3,-19,-4,3,-20,-4,-27,-19,45,-20,-3,-4,12,6,-24,-40,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-27,2,12,-27,-11,15,-23,5,-20,-8,8,-13,19,3,-1,-9,-25,-27,-9,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-34,-24,11,-33,-24,29,-29,35,18,-26,-27,-22,-23,-25,-9,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-1,-21,-4,1,-16,-19,-9,-15,2,-15,-10,0,-13,2,5,7,14,-10,-24,-6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-20,-6,5,-14,-17,-8,-18,4,-16,-8,0,-12,5,9,8,9,-13,-26,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-31,-26,3,-30,-25,27,-24,25,17,-29,-29,-24,-20,-18,-5,32,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-34,-7,2,-29,-15,-4,-22,-4,-25,-13,-10,41,6,-5,-5,-7,-27,-27,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,5,-25,9,1,-26,4,-11,-25,-6,-24,-18,3,-2,-6,-8,5,-5,-18,-31,-22,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-2,-26,-1,3,-22,7,10,-27,-8,-23,-14,4,-9,1,-9,3,-6,-24,-25,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=12,-20,-16,-25,-17,-3,-19,-18,8,-18,15,8,-19,-20,-15,-19,-9,-1,8,-18,-3,-16;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-17,-25,-17,36,-21,-14,-4,-16,4,-2,-12,-22,-21,-6,-9,-4,-3,-5,11,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,7,-22,10,10,-23,-6,-2,-25,7,-22,-15,8,-12,8,15,5,-4,-20,-26,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,8,-14,5,-3,-14,11,3,-16,-5,-15,-10,11,-10,-4,-6,2,-6,-15,-16,-11,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-12,-23,-15,-7,-17,-17,1,-20,15,7,-21,-11,-12,-18,-16,-9,-3,-23,-11,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-23,-11,-4,-13,-18,-16,-14,-6,-17,-13,-9,17,-8,-5,3,7,-11,-26,-15,-8;
MA   /M: SY='N'; M=0,11,-21,1,-3,-21,-1,3,-20,3,-23,-11,21,-16,0,3,6,-3,-19,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-24,0,12,-16,-19,-6,-15,-2,-5,-8,-6,-14,4,2,-3,-3,-14,-23,-8,7;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-10,-23,-10,-2,-15,-16,7,-14,-5,-13,-7,-6,-17,5,-1,0,-5,-12,-11,0,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,6,-31,-22,27,-27,35,21,-28,-28,-20,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,4,-27,5,-2,-11,-18,8,-15,-1,-15,-9,2,-18,1,-2,-5,-7,-16,-14,13,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-30,-22,7,-29,-19,22,-26,39,24,-29,-29,-19,-19,-25,-8,17,-22,-2,-20;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//