マーズ2020組み立て施設において分離されたバイオフィルム形成菌の新種、Parengyodontium torokiiのゲノム特性
Genomic Characterization of Parengyodontium torokii sp. nov., a Biofilm-Forming Fungus Isolated from Mars 2020 Assembly Facility
Journal of Fungi
2022年の論文/published in 2022, GC含量/GC content, Journal of Fungi, アナモルフ菌/anamorphic fungi, カリフォルニア州/California, クロマトグラム/chromatogram, ゲノムサイズ/genome size, コンタミ/contamination, サイトカラシン類/cytochalasins, スライド培養法/slide culture method, バイオフィルム/biofilm, バイオマス測定/biomass measurement, ヒートマップ/heatmap, プロテオーム解析/proteome analysis, メタボローム/metabolome, メラニン/melanin, 二次代謝産物/secondary metabolite, 全ゲノム解析/whole genome analysis, 共焦点レーザー顕微鏡/confocal laser microscope, 吸光度/absorbance, 培養性状/colony characteristics, 室内環境/indoor condition, 放射線耐性/radiation tolerance, 新種記載/new species, 生物劣化/biodeterioration, 米国/USA, 質量分析法/mass spectrometry, 走査型電子顕微鏡/SEM, 超高速液体クロマトグラフィー/ultra high performance liquid chromatography, 遺伝子オントロジー/gene ontology, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity, 隠蔽種/cryptic species, 高分解能質量分析装置/HRMS, 高速液体クロマトグラフィー/high performance liquid chromatography
米国カリフォルニア州の宇宙船組み立て施設クリーンルームにおいて、宇宙船のテフロン表面にバイオフィルムを形成した菌を検討し、Parengyodontium torokiiとして新種記載した。
全ゲノム解析を行い、計5334個のシングルコピーオーソロガス遺伝子を使用して、本種を含む9種のノムシタケ科菌類の最尤系統樹を作成した。
バイオフィルム形成と表面接着の関連遺伝子を特定したほか、メタボローム解析と遺伝子オントロジーに基づくプロテオーム予測の両方でサイトカラシンなどの合成に関わる遺伝子クラスターの存在を明らかにした。
Parengyodontium torokii★
Parengyodontium album / Parengyodontium americanum
チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ノムシタケ科/Cordycipitaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi