Fusarium oxysporumのエピタイプ指定 – 分類学的混沌の解消
Epitypification of Fusarium oxysporum – clearing the taxonomic chaos
Persoonia
2019年の論文/published in 2019, Agathosma属, Aloidendron属, Aspalathus属, Bouvardia属, Fusarium MLST, Fusarium-ID, GCPSR, Hoodia属, Persoonia, TreeBASE, アオイ科/Malvaceae, アカネ科/Rubiaceae, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アブラナ科/Cruciferae, アブラヤシ属/Elaeis, アマ属/Linum, アマ科/Linaceae, アラセイトウ属/Matthiola, アルゼンチン/Argentina, イタリア/Italy, イヌ属/Canis, イヌ科/Canidae, イネ科/Poaceae, ウコギ科/Araliaceae, エゾギク属/Callistephus, エピタイプ指定/epitype designation, オランダ/Netherlands, カリフォルニア州/California, ガガイモ科/Asclepiadaceae, キク属/Chrysanthemum, キク科/Asteraceae, キジカクシ科/Asparagaceae, キヅタ属/Hedera, クワズール・ナタール州/KwaZulu-Natal, グベケ州/Gbêkê, コガタペンギン属/Eudyptula, コンゴ民主共和国/Democratic Republic of the Congo, コートジボワール/Côte d’Ivoire, サツマイモ属/Ipomoea, シソ科/Lamiaceae, ススキノキ科/Xanthorrhoeaceae, タイプスタディ/type study, ダイズ属/Glycine, チューリップ属/Tulipa, テキサス州/Texas, テネシー州/Tennessee, トウモロコシ属/Zea, トケイソウ属/Passiflora, トケイソウ科/Passifloraceae, トックリラン属/Beaucarnea, ドイツ/Germany, ナス属/Solanum, ナス科/Solanaceae, ナデシコ属/Dianthus, ナデシコ科/Caryophyllaceae, ネズミ科/Muridae, バショウ属/Musa, バショウ科/Musaceae, バンダマ渓谷地方/Vallée du Bandama, バーデン＝ヴュルテンベルク州/Baden-Württemberg, パプアニューギニア/Papua New Guinea, ヒト病原菌/human pathogen, ヒルガオ科/Convolvulaceae, フロリダ州/Florida, ベルリン/Berlin, ペンギン科/Spheniscidae, マメ科/Fabaceae, ミカン科/Rutaceae, メボウキ属/Ocimum, メリーランド州/Maryland, モロッコ/Morocco, ヤシ生息菌/palmicolous fungus, ヤシ科/Arecaceae, ユリ科/Liliaceae, ライムギ属/Secale, リニアグロース/linear growth, ワタ属/Gossypium, 不稔菌糸/sterile mycelium, 中央地区（イスラエル）/Central District (Israel), 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物病原菌/animal pathogen, 北ケープ州/Northern Cape, 北ホラント州/North Holland, 北西州（南アフリカ）/North West Province (South Africa), 医真菌学/medical mycology, 南アフリカ/South Africa, 南ホラント州/South Holland, 命名法/nomenclature, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 多犯性菌/plurivorous fungus, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水試料/water sample, 獣医真菌学/veterinary mycology, 生長速度/growth rate, 畑地/farmland, 病原真菌/pathogenic fungi, 米国/USA, 糞生菌/coprophilous fungi, 系統ネットワーク/phylogenetic network, 胞子形成誘導/sporulation induction, 臨床検体/clinical specimens, 表面殺菌法/surface sterilization method, 複合種/species complex, 西ケープ州/Western Cape, 西部州（パプアニューギニア）/Western Province (Papua New Guinea), 隠蔽種/cryptic species, 食品汚染/Food contamination
経済的に重要かつ普通種であるにもかかわらず複合種であることが知られ、タイプ由来菌株が存在しないなど分類学的混乱が続いてきたFusarium oxysporumのエピタイプ標本を指定した。
ドイツ、ベルリンの畑地で採集されたジャガイモ塊茎から分離された菌株をエピタイプ標本とした。
複数遺伝子に基づく分子系統解析で21種の系統学的種が見出され、そのうち15種を新種として記載した。
Fusarium callistephi★ / Fusarium carminascens★ / Fusarium contaminatum★ / Fusarium curvatum★ / Fusarium elaeidis★ / Fusarium fabacearum★ / Fusarium glycines★ / Fusarium gossypinum★ / Fusarium hoodiae★ / Fusarium languescens★ / Fusarium libertatis★ / Fusarium nirenbergiae★ / Fusarium oxysporum / Fusarium pharetrum★ / Fusarium triseptatum★ / Fusarium veterinarium★
Fusarium callistephi / Fusarium carminascens / Fusarium contaminatum / Fusarium cugenangense / Fusarium curvatum / Fusarium elaeidis / Fusarium fabacearum / Fusarium glycines / Fusarium libertatis / Fusarium nirenbergiae / Fusarium oxysporum / Fusarium pharetrum / Fusarium triseptatum / Fusarium veterinarium
チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi