コロンビア、メデジンにおいて爪真菌症および皮膚真菌症の症例から分離されたNeoscytalidium dimidiatumのITS rDNA遺伝子解析とMALDI-TOF MSによる同定の比較
ITS rDNA Gene Analysis Versus MALDI-TOF MS For Identification of Neoscytalidium dimidiatum Isolated from Onychomycosis and Dermatomycosis Cases in Medellin (Colombia)
Microorganisms
2019年の論文/published in 2019, DNAバーコーディング/DNA barcoding, MALDI-TOF MS, Microorganisms, アンティオキア県/Antioquia, クラスター分析/cluster analysis, コロンビア/Columbia, ヒト病原菌/human pathogen, 主成分分析/principal component analysis, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 爪真菌症/onychomycosis, 病原真菌/pathogenic fungi, 皮膚真菌症/dermatomycosis, 皮膚糸状菌/dermatophyte, 臨床検体/clinical specimens, 質量分析法/mass spectrometry
コロンビア、メデジンにおいて爪真菌症の32例と皮膚真菌症の2例から分離されたNeoscytalidium属菌を検討した。
ITS領域の配列解析とMALDI-TOF質量分析法の2手法での同定結果を比較したところ、両者の結果は一致しており、全ての菌株がN. dimidiatumと同定された。
本報告は両手法によるNeoscytalidium属臨床由来菌株の同定の初事例となった。
Neoscytalidium dimidiatum
クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ボトリオスフェリア目/Botryosphaeriales, ボトリオスフェリア科/Botryosphaeriaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi