Claviceps purpurea内部における隠蔽種の境界
Delimitation of cryptic species inside Claviceps purpurea
Fungal Biology
2015年の論文/published in 2015, BEAST, Distichlis属, Fungal Biology, GSI (genealogical sorting index), Molinia属, PCRフィンガープリンティング/PCR fingerprinting, Sesleria属, Spartina属, イネ科/Poaceae, エピタイプ指定/epitype designation, カモガヤ属/Dactylis, クサヨシ属/Phalaris, コメガヤ属/Melica, コメススキ属/Deschampsia, コンタミ/contamination, シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, チェコ/Czech, ドイツ/Germany, ネオタイプ指定/neotype designation, バイエルン州/Bayern, フェノロジー/phenology, マイコトキシン/mycotoxin, ヨシ属/Phragmites, リニアグロース/linear growth, 中央ボヘミア州/Central Bohemian, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子同定/molecular identification, 分子時計/molecular clock, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分岐年代推定/divergence time estimation, 南ボヘミア州/South Bohemian, 命名法/nomenclature, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 宿主特異性/host specificity, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 散布図/scatter plot, 新学名提唱/new scientific name, 新種記載/new species, 新規プライマー設計/novel primer designation, 新階級提唱/new status, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水溶性色素/water-soluble pigment, 水辺/waterside, 池沼/ponds and swamps, 沿岸域/coastal area, 温帯域/temperate zone, 温度適性/temperature aptitude, 湿地帯/wetland, 湿室法/moist chamber method, 生活環/life cycle, 生長速度/growth rate, 疑問種/doubtful species, 移入種/alien species, 種の境界/species delimitation, 種内変異/intraspecific variation, 種分化/speciation, 種概念/species concept, 色素産生/pigment production, 草地/grassland, 菌核/sclerotium, 隠蔽種/cryptic species, 食品汚染/Food contamination
麦角菌 (Claviceps purpurea) の種内において、従来から認められていた3グループと、ヨシ属およびMolinia属を宿主とするグループの生殖的隔離を検討した。
狭義の本種をG1グループ、クサヨシ属などを宿主とするG2グループをC. humidiphila（新学名）、塩沼の特定の宿主に特異性を有するG3グループをC. spartinaeとした。
また、TulasneのC. microcephalaの概念に相当する系統（グループ2a）をC. arundinisとして新種記載し、各種の分岐年代と識別手段について議論した。
Claviceps arundinis★ / Claviceps humidiphila◆ / Claviceps purpurea / Claviceps spartinae●
Claviceps arundinis / Claviceps humidiphila / Claviceps purpurea / Claviceps spartinae
チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, バッカクキン科/Clavicipitaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi