南太平洋旋回の海底下堆積物から分離された深海底堆積物菌類の2新種、Penicillium pacificagyrusおよびPenicillium pacificasedimentiのゲノム特性はその生存能力を強調する
Genome characterization of two novel deep-sea sediment fungi, Penicillium pacificagyrus sp. nov. and Penicillium pacificasedimenti sp. nov., from South Pacific Gyre subseafloor sediments, highlights survivability
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)
2023年の論文/published in 2023, BMC Genomics, GC含量/GC content, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), pH適性/pH aptitude, アナモルフ菌/anamorphic fungi, クローニング/cloning, ゲノムサイズ/genome size, リグニン/lignin, リグニン分解活性/lignin degradation activity, リグニン分解菌/lignin-decomposing fungi, 二次代謝産物/secondary metabolite, 全ゲノム解析/whole genome analysis, 土壌菌/soil fungi, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 塩分濃度適性/salinity aptitude, 底泥/sediment, 採集地マッピング/collection site mapping, 新種記載/new species, 次世代シーケンシング/next generation sequencing, 水生菌/aquatic fungi, 海底堆積物/marine sediment, 海生菌/marine fungi, 生長速度/growth rate, 発酵試験/fermentation test, 資化試験/assimilation test, 酵素/enzyme
南太平洋旋回の海底下堆積物から分離された2種の菌を検討し、Penicillium pacificagyrusおよびP. pacificasedimentiとして新種記載した。
Illumina HiSeqとPacBioシーケンシング技術を用いて両種のゲノム解析を実施した。
前者には12568、後者には12271の遺伝子が予測され、難分解性炭素源などの分解に関与することが知られている遺伝子が含まれた。
Penicillium pacificagyrus★ / Penicillium pacificasedimenti★
コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi