コロンビアの低地アマゾン熱帯雨林におけるDNAバーコーディングを用いた土壌およびリター中のTrichoderma属の多様性調査により、新種Trichoderma strigosellumおよびその他の種が明らかにされた
DNA barcoding survey of Trichoderma diversity in soil and litter of the Colombian lowland Amazonian rainforest reveals Trichoderma strigosellum sp. nov. and other
Antonie van Leeuwenhoek
2013年の論文/published in 2013, Antonie van Leeuwenhoek, DNAバーコーディング/DNA barcoding, GCPSR, TrichoBLAST, TrichOKEY, コロンビア/Columbia, リター菌/litter fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 森林/forest, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 生長速度/growth rate, 表現型マイクロアレイ解析/phenotype microarray analysis, 資化試験/assimilation test, 走査型電子顕微鏡/SEM
コロンビア・アマゾンの一次および二次熱帯雨林において、リターおよびフクギ属樹木Garcinia macrophyllaの根圏中のTrichoderma属菌の多様性を調査した。
107の分離株にDNAバーコーディングの手法を適用したところ、71%が汎世界的な3種であり、4菌株が未記載種であると考えられた。
近縁種Trichoderma strigosumとの形態、分子系統、表現型マイクロアレイ解析の結果の違いなどに基づき、未同定菌株を新種Trichoderma strigosellumとして記載した。
Trichoderma strigosellum★
Trichoderma koningii / Trichoderma koningiopsis / Trichoderma strigosum
チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi