DNAバーコーディングによるCladia aggregataグループの種同定
Identification of species in the Cladia aggregata group using DNA barcoding (Ascomycota: Lecanorales)
Phytotaxa
2013年の論文/published in 2013, DNAバーコーディング/DNA barcoding, Phytotaxa, ウェスト・コースト地方/West Coast, オキセピン類/oxepins, オタゴ地方/Otago, オークランド地方/Auckland, オーストラリア/Australia, オーストラリア首都特別地域/Australian Capital Territory, サウスランド地方/Southland, スチクチン酸類/stictic acids, セトラル酸類/cetraric acids, タイプスタディ/type study, タスマニア州/Tasmania, ニュージーランド/New Zealand, バルバチン酸類/barbatic acids, フタル酸類/phthalates, フマル酸類/fumarates, ペナン州/Penang, マレーシア/Malaysia, レクトタイプ指定/lectotype designation, 二次代謝産物/secondary metabolite, 仮称で呼ばれてきた菌の正式記載/formal description of provisional name, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 南オーストラリア州/South Australia, 地上生地衣/terricolous lichen, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 森林/forest, 樹状地衣/fruticose lichen, 硬葉樹林/sclerophyll forest, 種の境界/species delimitation, 種内変異/intraspecific variation, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 複合種/species complex, 酸性土壌/acidic soil, 隠蔽種/cryptic species
Cladia aggregata種複合体を対象として、DNAバーコーディングにおけるITS領域の有用性を検証した。
複数遺伝子の分子系統解析に基づき12種を想定した上で、ITS領域の種内変異と種間変異の比を評価したところ、当該領域を全種の識別に用いることができることが示された。
この結果に基づき、C. blanchoniiなど3新種を記載したほか、3新組み合わせを提唱した。
Cladia blanchonii★ / Cladia cryptica★ / Cladia gorgonea▲ / Cladia neocaledonica▲ / Cladia tasmanica★ / Cladia terebrata▲
Cladia aggregata / Cladia blanchonii / Cladia cryptica / Cladia deformis / Cladia dumicola / Cladia gorgonea / Cladia inflata / Cladia neocaledonica / Cladia tasmanica / Cladia terebrata
チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ハナゴケ科/Cladoniaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi