新種の岩石生息菌、Cladophialophora brunneolaのゲノムおよびトランスクリプトーム解析により岩石選好性適応が明らかになった
Genome and transcriptome reveal lithophilic adaptation of Cladophialophora brunneola, a new rock-inhabiting fungus
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)
2023年の論文/published in 2023, CAZymes, Circosプロット/Circos plotting, GC含量/GC content, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), Mycology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ゲノムサイズ/genome size, チロシナーゼ/tyrosinase, トランスクリプトームシーケンシング/transcriptome sequencing, メラニン/melanin, ラッカーゼ/laccase, 中国/China, 乾燥耐性/xelotolerance, 二次代謝産物/secondary metabolite, 全ゲノム解析/whole genome analysis, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 吸光度/absorbance, 培養性状/colony characteristics, 岩石生菌類/saxicolous fungus, 新種記載/new species, 極限環境/extreme environment, 生物多様性調査/biodiversity survey, 生長速度/growth rate, 石灰岩/limestone, 脂肪酸/fatty acid, 色素産生/pigment production, 表面殺菌法/surface sterilization method, 貴州省/Guizhou, 遺伝子オントロジー/gene ontology, 酵素/enzyme
中国貴州省のカルスト地形で採集された岩石生息菌の一種を検討し、Cladophialophora brunneolaとして新種記載した。
本種の全ゲノムでは種特異的な遺伝子が多数見出され、非岩石生息菌に比べてCAZymesおよびBGCsが少なく、分子系統解析ではケートチリウム目の初期分岐系統に位置づけられた。
また、旱魃ストレス下におけるトランスクリプトーム解析ではメラニン合成経路、細胞壁生合成、脂質代謝に関連する遺伝子の発現レベル上昇が認められ、多様なストレスと過酷な環境に対する適応が明確に示された。
Cladophialophora brunneola★
Cladophialophora humicola / Cladophialophora minutissima
ケートチリウム亜綱/Chaetothyriomycetidae, ケートチリウム目/Chaetothyriales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ヘルポトリキエラ科/Herpotrichiellaceae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi