Scheffersomyces属酵母クレードの複数遺伝子に基づく系統学的研究およびキシロースレダクターゼ遺伝子N末端領域の特性
Multilocus Phylogenetic Study of the Scheffersomyces Yeast Clade and Characterization of the N-Terminal Region of Xylose Reductase Gene
PLOS ONE
2012年の論文/published in 2012, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, PCRフィンガープリンティング/PCR fingerprinting, PLOS ONE, RAPD解析/RAPD analysis, キシロースレダクターゼ/xylose reductase, クルミ科/Juglandaceae, コナラ属/Quercus, セロビオース/cellobiose, ビタミン要求性/vitamin requirement, ブナ科/Fagaceae, ペカン属/Carya, ルイジアナ州/Louisiana, 二型性/dimorphism, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 収斂進化/convergent evolution, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 新規プライマー設計/novel primer designation, 最大生長温度/maximum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 発酵試験/fermentation test, 祖先形質推定/ancestral character estimation, 種の境界/species delimitation, 米国/USA, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity, 隠蔽種/cryptic species
植物組織および材生息性昆虫から分離されたキシロース発酵能を有する酵母を対象に分子系統解析を行った。
広葉樹から分離されたScheffersomyces quercinusなど3新種を記載し、Candida属7種に対して新組み合わせを提唱した。
キシロースレダクターゼ遺伝子N末端の保存された領域に発酵能に関連する可能性のある変異が含まれていること、XYL1およびRPB1遺伝子が迅速同定に使用できる可能性があることなどが示唆された。
Scheffersomyces coipomoensis▲ / Scheffersomyces gosingicus▲ / Scheffersomyces illinoinensis★ / Scheffersomyces insectosa▲ / Scheffersomyces lignicola▲ / Scheffersomyces lignosus▲ / Scheffersomyces queiroziae▲ / Scheffersomyces quercinus★ / Scheffersomyces shehatae▲ / Scheffersomyces virginianus★
Scheffersomyces illinoiensis / Scheffersomyces insectosa / Scheffersomyces lignicola / Scheffersomyces lignosus / Scheffersomyces queiroziae / Scheffersomyces quercinus / Scheffersomyces shehatae / Scheffersomyces spartinae / Scheffersomyces stipitis / Scheffersomyces virginianus
サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi