Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
まだまだある庭の「雑草」：ハキリアリの巣からの新たな菌類
原題: Yet More ‘‘Weeds’’ in the Garden: Fungal Novelties from Nests of Leaf-Cutting Ants（PLOS ONE, 2013）
Escovopsis属菌はハキリアリの菌園における「雑草のような」菌類として高い遺伝的多様性が知られてきたが、正式に記載されたのは2種のみであった。
ブラジル・ミナスジェライス州の亜熱帯林で採集された広義のEscovopsis属菌に、培養下で顕著な形態型を認め、形態学的検討と分子系統解析の結果を合わせて3新種を記載した。
また、Escovopsis属と基準種のE. weberiについて再記載を行い、4番目の形態型に対して新属Escovopsioidesを提唱した。
報告種: Escovopsioides nivea★ / Escovopsis aspergilloides / Escovopsis lentecrescens★ / Escovopsis microspora★ / Escovopsis moelleri★ / Escovopsis weberi
比較種: Escovopsis aspergilloides / Escovopsis lentecrescens / Escovopsis microspora / Escovopsis moelleri / Escovopsis weberi / Paecilomyces variotii
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, PLOS ONE, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アリの巣/ant nest, アリ科/Formicidae, タイプスタディ/type study, ヒメハキリアリ属/Acromyrmex, ブラジル/Brazil, ミナスジェライス州/Minas Gerais, 亜熱帯域/subtropics, 亜熱帯林/subtropical forest, 共進化/coevolution, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 分離頻度/isolation frequency, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 動物の巣/animal nest, 培養性状/colony characteristics, 堆肥/compost, 大西洋岸森林/Atlantic forest, 寄生菌/parasite, 属概念/genus concept, 感染率/infection rate, 散布様式/dispersal style, 新種記載/new species, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 昆虫の巣/insect nest, 未記載種/undescribed species, 森林/forest, 検索表/identification key, 生長速度/growth rate, 糞生菌/coprophilous fungi, 胞子散布/spore dispersal, 菌園/fungus garden, 菌寄生菌/mycoparasite, 虫糞/insect frass, 走査型電子顕微鏡/SEM
ブラジル・パラナ州におけるEverniastrum属の初記録
原題: First record of the genus Everniastrum Sipman (Parmeliaceae, lichenized Ascomycota) for the state of Paraná, Brazil（Acta Botanica Brasilica, 2013）
ブラジル・パラナ州から初めてEverniastrum属地衣（E. cirrhatumおよびE. vexans）を報告した。
本属はブラジルでは従来、ミナスジェライス州、リオデジャネイロ州、サンパウロ州、リオグランデ・ド・スル州でのみ知られていた。
両種は同所的に発生することもあり、基本的に裂芽の有無で区別された。
報告種: Everniastrum cirrhatum■ / Everniastrum vexans■
比較種: Everniastrum vexans
分類群: ウメノキゴケ科/Parmeliaceae, チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Acta Botanica Brasilica, コケ上に生える菌/fungi on moss, パラナ州/Parana, ブラジル/Brazil, 二次代謝産物/secondary metabolite, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 新産種報告/new record, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
イラン産のサーコスポロイドの不完全糸状菌の新記録
原題: New records of cercosporoid hyphomycetes from Iran（Mycotaxon, 2012）
イラン北部の州で100種類の宿主植物から70分類群のサーコスポロイド菌類を採集し、21分類群をイランから未報告の分類群として認めた。
本論文ではその中から、8種の宿主上に認められた7種（全てイラン新産種）を扱った。
また、Cercosporina danaicolaを顕微鏡的形質に基づきPseudocercospora属に移した。
報告種: Cercospora pantoleuca■ / Cercosporella primulae■ / Cercosporella virgaureae■ / Passalora bondartsevii■ / Pseudocercospora danaicola▲■ / Pseudocercospora paraguayensis■
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, マイコスフェレラ科/Mycosphaerellaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Danae属, Mycotaxon, イズハハコ属/Conyza, イラン/Iran, イラン新産種/Iran_new record, ウマゴヤシ属/Medicago, オオバコ属/Plantago, オオバコ科/Plantaginaceae, キク科/Asteraceae, ギーラーン州/Gilan, ゴレスターン州/Golestan, サクラソウ属/Primula, サクラソウ科/Primulaceae, サンザシ属/Crataegus, サーコスポロイド/cercosporoid fungi, バラ科/Rosaceae, フトモモ科/Myrtaceae, マメ科/Fabaceae, マーザンダラーン州/Mazandaran, ユリ科/Liliaceae, ユーカリ属/Eucalyptus, 北ホラーサーン州/North Khorasan, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新産種報告/new record, 新組み合わせ提唱/new combination, 植物病原菌/plant pathogenic fungi
Trichoderma属の新組み合わせ
原題: New combinations in Trichoderma (Hypocreaceae, Hypocreales)（Mycotaxon, 2013）
メルボルン規約に従い、Hypocrea属菌をTrichoderma属に移す措置を行った。
Trichoderma属への転属措置がとられていない種は多数存在するが、近年の論文で扱われ、GenBankにDNAデータが存在する種を中心に46種を対象とした。
各種についてクレードまたは節レベルの所属、タイプ標本や代表的な菌株、EF1-αとrpb2のGenBankアクセッションナンバー、主要な文献などの情報を掲載した。
報告種: Trichoderma albocorneum▲ / Trichoderma albofulvum▲ / Trichoderma alcalifuscescens▲ / Trichoderma americanum▲ / Trichoderma andinense▲ / Trichoderma atrogelatinosum▲ / Trichoderma avellaneum▲ / Trichoderma britdaniae▲ / Trichoderma caerulescens▲ / Trichoderma citrinum▲ / Trichoderma corneum▲ / Trichoderma costaricense▲ / Trichoderma danicum▲ / Trichoderma decipiens▲ / Trichoderma eucorticioides▲ / Trichoderma flaviconidium▲ / Trichoderma flavipes▲ / Trichoderma foliicola▲ / Trichoderma hispanicum▲ / Trichoderma hunua▲ / Trichoderma lacuwombatense▲ / Trichoderma megalocitrinum▲ / Trichoderma microcitrinum▲ / Trichoderma neorufum▲ / Trichoderma novae-zelandiae▲ / Trichoderma nybergianum▲ / Trichoderma ochroleucum▲ / Trichoderma orientale▲ / Trichoderma parapiluliferum▲ / Trichoderma parmastoi▲ / Trichoderma patella▲ / Trichoderma peltatum▲ / Trichoderma pezizoides▲ / Trichoderma protopulvinatum▲ / Trichoderma pulvinatum▲ / Trichoderma rhododendri▲ / Trichoderma rodmanii▲ / Trichoderma sambuci▲ / Trichoderma semiorbis▲ / Trichoderma spinulosum▲ / Trichoderma stellatum▲ / Trichoderma subsulphureum▲ / Trichoderma sulawesense▲ / Trichoderma sulphureum▲ / Trichoderma victoriense▲ / Trichoderma virescentiflavum▲
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 1F=1N, 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, 新組み合わせ提唱/new combination
Peterjamesia circumscripta (Leight.) D. Hawksw.：南米大陸における初記録
原題: Peterjamesia circumscripta (Leight.) D. Hawksw. (Roccellaceae: Ascomycota): First record to continental South America（Check List, 2012）
ブラジル南部、サンタカタリーナ州の沿岸域で採集されたPeterjamesia circumscriptaを報告した。
本種は従来、オーストラリア・ヨーロッパ・北アフリカ・北米・中米・ガラパゴス諸島から知られており、本報告が南米大陸における初報告となった。
本種は採集地で様々な痂状地衣とモザイク状に混ざり合って発生していたが、微小な子器が多数存在し、通常凝集して線形をなすことなどで他の地衣と区別された。
報告種: Peterjamesia circumscripta■
比較種: Peterjamesia sorediata
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホシゴケ亜綱/Arthoniomycetidae, ホシゴケ目/Arthoniales, ホシゴケ菌綱/Arthoniomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Check List, サンタカタリーナ州/Santa Catarina, ブラジル/Brazil, ブラジル新産種/Brazil_new record, 二次代謝産物/secondary metabolite, 切片/section, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新産種報告/new record, 沿岸域/coastal area, 痂状地衣/crustose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
インド、アンダマン諸島の葉生息菌
原題: Foliicolous fungi of Andaman Islands, India（Journal of Threatened Taxa, 2014）
インドのアンダマン諸島において500以上の葉生息菌を採集し、そのうち152標本を60分類群に同定した。
新属Andamanomycesを提唱し、An. fragariaeなど16新種と1新変種を記載した。
また、Meliola palmicolaをインドから初めて報告した。
報告種: Andamanomyces fragariae★ / Asteridiella anaxagoreae★ / Asteridiella colocasiae★ / Asterina eleocarpigena★ / Asterostomella dhanikariensis★ / Asterostomella farrargunjensis★ / Irenopsis andamanica★ / Meliola andamanica★ / Meliola canarifolia★ / Meliola chukrasiicola★ / Meliola harrietensis★ / Meliola myristicacearum★ / Meliola palmicola■ / Meliola parishiae★ / Meliola pithecellobii var. indica★ / Meliola savarkarii★ / Meliola ternstroemiicola★ / Schiffnerula chukrasiae★
比較種: Amazonia toquian / Asteridiella pothodis / Asteridiella subglabroides / Asterina borneensis / Asterina elaeocarpi / Asterina elaeocarpi var. ovalis / Asterina elaeocarpi-kobanmochi / Asterina eleocarpicola / Asterina gamsii / Asterostomella stipitipodia / Meliola camellicola / Meliola canarii / Meliola chukrasiae / Meliola knemae / Meliola pithecellobii / Meliola pithecellobii var. uncinata / Meliola silentvalleyensis / Schiffnerulla azadirachtae / Schiffnerulla entandrophragmatis
分類群: アステリナ目/Asterinales, アステリナ科/Asterinaceae, エングレルラ科/Englerulaceae, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, メリオラ目/Meliolales, メリオラ科/Meliolaceae, レンボシア科/Lembosiaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Anaxagorea属, Chukrasia属, Journal of Threatened Taxa, Parishia属, Tetracera属, すす病/sooty mold, アンダマン・ニコバル諸島/Andaman and Nicobar Islands, インド/India, インド新産種/India_new record, ウルシ科/Anacardiaceae, オランダイチゴ属/Fragaria, カキノキ属/Diospyros, カキノキ科/Ebenaceae, カンラン属/Canarium, カンラン科/Burseraceae, キョウチクトウ科/Apocynaceae, キンキジュ属/Pithecelobium, サンユウカ属/Tabernaemontana, シンアナモルフ/synanamorph, センダン科/Meliaceae, ツバキ科/Theaceae, ニクズク科/Myristicaceae, バラ科/Rosaceae, バンレイシ科/Annonaceae, ビワモドキ科/Dilleniaceae, ブドウ科/Vitaceae, ホルトノキ属/Elaeocarpus, ホルトノキ科/Elaeocarpaceae, マチン属/Strychnos, マチン科/Loganiaceae, マメ科/Fabaceae, マングローブ林/mangrove forest, ミツバカズラ属/Tetrastigma, モッコク属/Ternstroemia, モッコク科/Pentaphylacaceae, 付着器/appressorium, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新変種記載/new variety, 新属提唱/new genus, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 森林/forest, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 沿岸域/coastal area, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest
ワスレグサ属の栽培植物に新たに発生した葉の病害にBotrytis属の新種が関連していた
原題: A Novel Botrytis Species Is Associated with a Newly Emergent Foliar Disease in Cultivated Hemerocallis（PLOS ONE, 2014）
イギリスにおいて、ワスレグサ属栽培植物の”spring sickness”と呼ばれる病害に関連する菌類を調査した。
病変部から繰り返し分離された同一の菌を複数遺伝子に基づく分子系統解析により検討し、Botrytis deweyaeとして新種記載した。
in vitroでの病原性試験では、本種は宿主に病変を生じ、組織を迅速に壊死させることが示された。
報告種: Botrytis deweyae★
比較種: Botrytis elliptica
分類群: キンカクキン科/Sclerotiniaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ビョウタケ目/Helotiales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, MAT遺伝子/MAT gene, PLOS ONE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イギリス/United kingdom, イングランド/England, エンドファイト/endophyte, オックスフォードシャー/Oxfordshire, クローニング/cloning, コッホの原則/Koch_s postulation, ホストシフト/host shift, ワスレグサ属/Hemerocallis, ワスレグサ科/Hemerocallidaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 交配型/mating type, 交配試験/mating test, 免疫学的検査/immunological test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 宿主特異性/host specificity, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 新興感染症/emerging infectious disease, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 温室/greenhouse, 温度適性/temperature aptitude, 胞子形成誘導/sporulation induction, 花卉圃場/flower field, 菌核/sclerotium, 表面殺菌法/surface sterilization method, 走査型電子顕微鏡/SEM
アマゾン南西部の分断された森林で見出されたOudemansiella属菌2種
原題: Two Oudemansiella from a forest fragment in Southwestern Amazonia（Mycosphere, 2014）
ブラジル北部のアクレ州から、トゲ状の担子胞子を有するOudemansiella macracanthaおよびO. steffeniiを初めて報告した。
両種を判別する分類形質として、先行研究で示された形質が必ずしも適当でないことを指摘し、子実体の細長さと担子胞子の重要性について議論を行った。
具体的にはHeinemannの”index of gracility”導入により、前者の子実体が後者よりも細長いことを示すとともに、担子胞子の装飾の高さと数の違いに着目した。
報告種: Oudemansiella macracantha■ / Oudemansiella steffenii■
比較種: Oudemansiella macracantha / Oudemansiella steffenii
分類群: タマバリタケ科/Physalacriaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycosphere, ブラジル/Brazil, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 検索表/identification key, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 草地/grassland
Mycena illuminansの系統分類学的再評価
原題: Taxonomic and phylogenetic re-evaluation of Mycena illuminans（Mycologia, 2013）
マレーシアで採集されたMycena illuminansの分類学的再検討を実施した。
本種の培養性状および交配機構に関する情報を提供するため、一次菌糸および二次菌糸の純粋培養株を確立した。
また、LSUに基づく分子系統解析を行い、M. illuminansが形態的に類似するM. chlorophosのシノニムではないことを確かめた。
報告種: Mycena illuminans
比較種: Mycena amicta / Mycena chlorophos / Mycena discobasis / Mycena margarita
分類群: クヌギタケ科/Mycenaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mesquite, Mycologia, TreeBASE, シノニム/synonym, セランゴール州/Selangor, チロシナーゼ/tyrosinase, パハン州/Pahang, ペルオキシダーゼ/peroxidase, マレーシア/Malaysia, ヤシ生息菌/palmicolous fungus, ヤシ科/Arecaceae, ラッカーゼ/laccase, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 新形質報告/new character, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 生長速度/growth rate, 発光きのこ/luminous mushroom, 菌糸体発光/luminous mycelium, 走査型電子顕微鏡/SEM, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity
in vivoでのアブラムシ宿主におけるPandora neoaphidisの休眠胞子形成の初報告
原題: First report of Pandora neoaphidis resting spore formation in vivo in aphid hosts（Fungal Biology, 2012）
アルゼンチン・ブエノスアイレス州の温室において、Pandora neoaphidisの休眠胞子形成を初めて報告した。
分子生物学的手法を用いて、観察された休眠胞子が確かに本種のものであることを確かめ、光学顕微鏡とTEMによる詳細な観察を行った。
過去の文献には本種の越冬に関する仮説を提起したものがあったが、休眠胞子については言及されていなかったか、分子生物学的手法によって検証されていなかった。
報告種: Pandora neoaphidis
比較種: Pandora kondoiensis
分類群: Zoopagomyceta, ハエカビ亜門/Entomophthoromycotina, ハエカビ目/Entomophthorales, ハエカビ科/Entomophthoraceae, ハエカビ綱/Entomophthoromycetes, ハエカビ門/Entomophthoromycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Fungal Biology, Nasonovia属, アカザ科/Chenopodiaceae, アキノノゲシ属/Lactuca, アブラナ属/Brassica, アブラナ科/Cruciferae, アブラムシ科/Aphididae, アルゼンチン/Argentina, キク科/Asteraceae, チョウセンアザミ属/Cynara, トウガラシ属/Capsicum, トマト属/Lycopersicum, ナス属/Solanum, ナス科/Solanaceae, フダンソウ属/Beta, ブエノスアイレス州/Buenos Aires, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 寄生菌/parasite, 新形質報告/new character, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 温室/greenhouse, 温帯域/temperate zone, 越冬/wintering, 透過型電子顕微鏡/TEM
Legeriomyces属の新種およびハンガリーにおいて昆虫の幼生から初めて報告されたその他のハルペラ目菌類
原題: A new species of Legeriomyces and other Harpellales reported for the first time in larval insects from Hungary（Mycoscience, 2014）
ハンガリーにおいて水生昆虫の腸内に生息するトリコミセス類を初めて調査し、Legeriomyces hungaricusを新種記載した。
また、ハルペラ目のL. ramosusおよびStachylina grandisporaを報告した。
さらに、Baetis rhodaniの腸内からL. ramosusとともに、Paramoebidium属の未記載種を見出した。
報告種: Legeriomyces hungaricus★ / Legeriomyces ramosus■ / Stachylina grandispora■
比較種: Legeriomyces dolabrae / Legeriomyces hungaricus / Legeriomyces minae / Legeriomyces ramosus / Legeriomyces rarus
分類群: Harpellomycetes, Kickxellomycota, Zoopagomyceta, キクセラ亜門/Kickxellomycotina, ハルペラ目/Harpellales, ハルペラ科/Harpellaceae, レゲリオマイセス科/Legeriomycetaceae, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycoscience, コカゲロウ属/Baetis, コカゲロウ科/Baetidae, チョングラード県/Csongrád, ハンガリー/Hungary, ハンガリー新産種/Hungary_new record, バラニャ県/Baranya, フェノロジー/phenology, ユスリカ科/Chironomidae, ヴェスプレーム県/Veszprém, 付着器/appressorium, 感染率/infection rate, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 未記載種/undescribed species, 水生菌/aquatic fungi, 池沼/ponds and swamps, 河川/river, 流水環境/lotic environment, 淡水域/freshwater, 腸内生息菌/fungus in intestinal tract, 静水環境/lentic environment
新興のケカビ目菌類、Apophysomyces属の分子系統的多様性：3新種の提唱
原題: Molecular phylogenetic diversity of the emerging mucoralean fungus Apophysomyces: Proposal of three new species（Revista Iberoamericana de Micología, 2010）
ケカビ目の単型属、Apophysomycesが種複合体からなることを見出し、3新種を記載した。
A. ossiformisは骨形、A. trapeziformisは台形状、A. variabilisは様々な形状の胞子嚢胞子を有することで特徴づけられた。
3種に対して資化試験と抗真菌薬感受性試験を行い、前者では3種全てエスクリン資化能を欠くこと、後者ではアムホテリシンBおよびポサコナゾールに対する感受性が最も高いことなどが示された。
報告種: Apophysomyces elegans / Apophysomyces ossiformis★ / Apophysomyces trapeziformis★ / Apophysomyces variabilis★
比較種: Apophysomyces elegans / Apophysomyces ossiformis / Apophysomyces trapeziformis / Apophysomyces variabilis
分類群: Mucoromyceta, ケカビ亜門/Mucoromycotina, ケカビ目/Mucorales, ケカビ科/Mucoraceae, ケカビ綱/Mucoromycetes, ケカビ門/Mucoromycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, M38-A2, MEC, MIC, Revista Iberoamericana de Micología, アリゾナ州/Arizona, インド/India, オランダ/Netherlands, オーストラリア/Australia, コロラド州/Colorado, ジョージア州/Georgia, テキサス州/Texas, ノーザンテリトリー/Northern Territory, バハマ/Bahamas, ヒト病原菌/human pathogen, ミネソタ州/Minnesota, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 寄生菌/parasite, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 新種記載/new species, 新興感染症/emerging infectious disease, 日和見感染症/opportunistic infection, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 病原真菌/pathogenic fungi, 皮膚糸状菌/dermatophyte, 米国/USA, 臨床検体/clinical specimens, 蘭領アンティル/Netherlands Antilles, 蜂窩織炎/cellulitis, 複合種/species complex, 資化試験/assimilation test, 骨髄炎/osteomyelitis
リトアニアにおける侵略的さび菌Melampsoridium hiratsukanumおよびそのフシダニ科のダニとの同時発生
原題: Melampsoridium hiratsukanum – invasive rust species in Lithuania, and its co-occurrence with eriophyid mite（Acta Mycologica, 2013）
アジア原産のさび菌、Melampsoridium hiratsukanumをリトアニア国内の広範な地域で見出し、分布パターン、生態、形態形質に関する情報を掲載した。
本種はリトアニアにおいて主にAlnus incanaを宿主とし、1997年以後侵略的外来種として分布を拡大してきた。
稀にAlnus glutinosaに発生した本種は時にAcalitus brevitarsusと同時発生したが、その原因を鳥の糞による森林の富栄養化に求める仮説を提唱した。
報告種: Melampsoridium hiratsukanum
比較種: Melampsoridium alni / Melampsoridium betulinum
分類群: Melampsorineae, サビキン亜門/Pucciniomycotina, サビキン目/Pucciniales, サビキン綱/Pucciniomycetes, プクシニアストラム科/Pucciniastraceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Acalitus属, Acta Mycologica, さび菌/rust fungi, アリートゥス郡/Alytus, ウテナ郡/Utena, ウ科/Phalacrocoracidae, カウナス郡/Kaunas, カバノキ科/Betulaceae, クライペダ郡/Klaipėda, テルシェイ郡/Telšiai, ハンノキ属/Alnus, パネヴェジース郡/Panevėžys, フシダニ科/Eriophyidae, リトアニア/Lithuania, ヴィリニュス郡/Vilnius, 仮説提唱/hypothesis proposed, 侵略的外来種/invasive alien species, 動物の巣/animal nest, 地理的分布/geographical distribution, 寄生菌/parasite, 富栄養化/eutrophication, 採集地マッピング/collection site mapping, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 気候変動/climate change, 移入種/alien species, 稀産種/rare species, 鳥の巣/bird’s nest, 鳥の糞/bird droppings
昆虫病原菌の属、Metacordycepsにおけるテレオモルフの新組み合わせ
原題: New teleomorph combinations in the entomopathogenic genus Metacordyceps（Mycologia, 2012）
主に中国と日本で採集されたCordyceps属菌およびOphiocordyceps属菌の複数種を検討した。
複数遺伝子に基づく分子系統解析の結果から、Cordyceps atrovirensなど7種をMetacordyceps属に移した。
本属菌の進化、宿主範囲、属内の系統関係、アナモルフとの関係性、さらなる種の本属への転属可能性、生物的防除への利用などについて議論した。
報告種: Metacordyceps atrovirens▲ / Metacordyceps indigotica▲ / Metacordyceps khaoyaiensis▲ / Metacordyceps kusanagiensis▲ / Metacordyceps martialis▲ / Metacordyceps owariensis f. viridescens▲ / Metacordyceps owariensis▲ / Metacordyceps pseudoatrovirens▲
比較種: Metacordyceps atrovirens / Metacordyceps guniujiangensis / Metacordyceps owariensis f. viridescens / Metacordyceps owariensis / Metacordyceps pseudoatrovirens / Metacordyceps taii / Nomuraea cylindrosporae / Paecilomyces marquandii
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, バッカクキン科/Clavicipitaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycologia, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, タイプスタディ/type study, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, 中国/China, 冬虫夏草/entomoparasitic mushrooms, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 単胞子分離/single spore isolation, 収斂進化/convergent evolution, 培養性状/colony characteristics, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 属概念/genus concept, 属概念の修正/genus concept_emendation, 新組み合わせ提唱/new combination, 日本/Japan, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 根状菌糸束/rhizomorph, 生物農薬/biopesticide, 複合種/species complex, 隠蔽種/cryptic species
アラビア半島から新たに報告された砂漠生アーバスキュラー菌根菌の分離および同定
原題: Isolation and identification of desert habituated arbuscular mycorrhizal fungi newly reported from the Arabian Peninsula（Journal of Arid Land, 2014）
オマーンの砂漠での調査で得られた多数のアーバスキュラー菌根菌の単胞子分離株について、形態学的検討および分子系統解析を行った。
Claroideoglomus drummondiiなど4種を同定し、アラビア半島新産種として報告した。
分離菌株の一部が極めて乾燥した環境に由来し、乾燥への適応が示唆されたことから、これらの種には乾燥地農業における生物肥料としての利用可能性が期待された。
報告種: Claroideoglomus drummondii■ / Diversispora aurantia■ / Diversispora spurca■ / Funneliformis africanum■
比較種: Claroideoglomus walkeri / Diversispora aurantia / Diversispora spurca / Funneliformis xanthium
分類群: Mucoromyceta, クラロイデオグロムス科/Claroideoglomeraceae, グロムス目/Glomerales, グロムス科/Glomeraceae, グロムス綱/Glomeromycetes, グロムス菌亜門/Glomeromycotina, グロムス菌門/Glomeromycota, ディバーシスポラ目/Diversisporales, ディバーシスポラ科/Diversisporaceae, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Journal of Arid Land, Prosopis属, Salvadora属, Tetraena属, アーバスキュラー菌根菌/arbuscular mycorrhizal fungi, オマーン/Oman, オマーン新産種/Oman_new record, サルバドラ科/Salvadoraceae, シャルキーヤ地方/Sharqiyah (Oman), トラップカルチャー/trap culture, ナツメヤシ属/Phoenix, ハマビシ科/Zygophyllaceae, マメ科/Fabaceae, ヤシ科/Arecaceae, 乾燥地域/dry area, 乾燥耐性/xelotolerance, 保全生態学/conservation ecology, 共培養/coculture, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 地理的分布/geographical distribution, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 根圏/rhizosphere, 植林地/plantation, 生物肥料/biofertilizer, 砂地/sand, 砂漠/desert, 砂漠生菌類/desert fungus, 草地/grassland, 菌根菌/mycorrhizal fungi
スペインの伝統的なブルーチーズ、カブラレスチーズから分離された新種Candida cabralensis
原題: Candida cabralensis sp. nov., a yeast species isolated from traditional Spanish blue-veined Cabrales cheese（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2010）
スペインで伝統的手法により生産されたカブラレスチーズから分離された2菌株を基に、Candida cabralensisを新種記載した。
本種はラクトースの資化能、発酵能を欠いていた一方、チーズの発酵における主要な最終代謝産物であるDL-乳酸とエタノールを資化した。
D1/D2領域およびITS領域に基づく分子系統解析では、Pichia terricolaおよびP. fermentansが本種にごく近縁であった。
報告種: Candida cabralensis★
比較種: Pichia fermentans / Pichia terricola
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, RFLP解析/RFLP analysis, アストゥリアス州/Asturias, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, スペイン/Spain, チーズ/cheese, ビタミン要求性/vitamin requirement, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 発酵/fermentation, 発酵食品/fermented food, 胞子形成誘導/sporulation induction, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast
米国ワイオミング州の埋め立て地から分離されたAspergillus属Fumigati節の新種およびA. viridinutans複合体の改訂
原題: New species in Aspergillus section Fumigati from reclamation sites in Wyoming (U.S.A.) and revision of A. viridinutans complex（Fungal Diversity, 2013）
米国ワイオミング州の炭坑跡で土壌や糞などから種々の手法で分離された菌を検討し、Aspergillus wyomingensisなど3種の新種を含む7種を認めた。
また、A. viridinutans種複合体を再検討し、狭義のA. viridinutansおよびA. aureolusのタイプ指定を行った。
本研究ではA. udagawaeが最も高頻度で分離されたが、土壌からしばしば優占種として報告される狭義のA. fumigatusは全く分離されなかった。
報告種: Aspergillus aureolus / Aspergillus brevistipitatus★ / Aspergillus conversis★ / Aspergillus felis / Aspergillus udagawae / Aspergillus viridinutans / Aspergillus wyomingensis★
比較種: Aspergillus auratus / Aspergillus aureolus / Aspergillus brevistipitatus / Aspergillus conversis / Aspergillus felis / Aspergillus fennelliae / Aspergillus laciniosus / Aspergillus lentulus / Aspergillus multiplicatus / Aspergillus nishimurae / Aspergillus otanii / Aspergillus spathulatus / Aspergillus stramenius / Aspergillus udagawae / Aspergillus viridinutans / Aspergillus wyomingensis / Aspergilus brevipes / Aspergilus duricaulis / Aspergilus unilateralis
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 1F=1N, 2013年の論文/published in 2013, Fungal Diversity, MAT遺伝子/MAT gene, PCRフィンガープリンティング/PCR fingerprinting, TreeBASE, アナウサギ属/Oryctolagus, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アルカロイド/alkaloid, イディオモルフ/idiomorph, イネ科/Poaceae, ウサギ科/Leporidae, エピタイプ指定/epitype designation, エーリッヒ反応/Erich reaction, オーストラリア/Australia, カモジグサ属/Agropyron, ガーナ/Ghana, シクロピアゾン酸/cyclopiazonic acid, タイプスタディ/type study, ネオタイプ指定/neotype designation, ノウサギ属/Lepus, ヒト病原菌/human pathogen, ビクトリア州/Victoria, プロングホーン属/Antilocapra, プロングホーン科/Antilocapridae, マイコトキシン/mycotoxin, レクトタイプ指定/lectotype designation, ロシア/Russia, ワイオミング州/Wyoming, 中国/China, 二次代謝産物/secondary metabolite, 交配不稔性/mating sterility, 交配型/mating type, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分離頻度/isolation frequency, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 命名法/nomenclature, 土壌加熱法/soil heating method, 土壌希釈法/soil dilution method, 土壌洗浄法/soil washing method, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 好ケラチン菌/kerationophillic fungus, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 検索表/identification key, 水溶性色素/water-soluble pigment, 湿室法/moist chamber method, 生長速度/growth rate, 病原真菌/pathogenic fungi, 稀産種/rare species, 種の境界/species delimitation, 米国/USA, 糞生菌/coprophilous fungi, 耐熱性菌/heat-tolerant fungus, 臨床検体/clinical specimens, 色素産生/pigment production, 草地/grassland, 複合種/species complex, 走査型電子顕微鏡/SEM, 酸産生/acid production, 釣菌法/baiting method