Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
中国におけるユーカリウッドチップ上でのOphiostoma tsotsiの発見
原題: Discovery of Ophiostoma tsotsi on Eucalyptus wood chips in China（Mycoscience, 2011）
中国広東省でユーカリの青変したウッドチップ上に見出されたOphiostoma quercus類似菌を検討した。
3遺伝子領域に基づく分子系統解析の結果、この菌はO. quercusではなく、近年アフリカから記載されたO. tsotsiと同定された。
ユーカリに発生したことから本種は移入種だとも思われたが、ベトナムの原産樹木に発生した菌由来の配列も本種クレードに含まれ、種内変異の大きさから、本種が東南アジア原産である可能性も示唆された。
報告種: Ophiostoma tsotsi■
比較種: Ophiostoma denticiliatum / Ophiostoma quercus / Pesotum australiae
分類群: オフィオストマ目/Ophiostomatales, オフィオストマ科/Ophiostomataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycoscience, ウッドチップ生息菌/wood chip inhabiting fungus, オフィオストマトイド菌類/ophiostomatoid fungi, フトモモ科/Myrtaceae, ベトナム/Vietnam, ユーカリ属/Eucalyptus, 中国/China, 中国新産種/China_new record, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 広東省/Guangdong, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 移入種/alien species, 種内変異/intraspecific variation, 青変菌/blue stain fungi
コスタリカで毛虫から見出された2新種、Penicillium mallochiiおよびP. guanacastense
原題: Penicillium mallochii and P. guanacastense, two new species isolated from Costa Rican caterpillars（Mycotaxon, 2012）
コスタリカでヤママユガ科やヤガ科のガの芋虫の腸や糞、食草などから2種のアオカビ属菌を分離した。
形態および分子の検討により、両種をPenicillium mallochiiおよびP. guanacastenseとして新種記載した。
5遺伝子に基づく分子系統解析では、両者はともに、形態的に類似するP. sclerotiorumに近縁だったが、顕著に異なる系統をなした。
報告種: Penicillium guanacastense★ / Penicillium mallochii★
比較種: Penicillium guanacastense / Penicillium mallochii / Penicillium sclerotiorum
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, ATBI, Citheronia属, DNAバーコーディング/DNA barcoding, Eutelia属, GCPSR, Mycotaxon, Rothschildia属, Spondias属, ウルシ科/Anacardiaceae, グアナカステ州/Guanacaste, コスタリカ/Costa Rica, ヤガ科/Noctuidae, ヤママユガ科/Saturniidae, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 糞生菌/coprophilous fungi, 色素産生/pigment production
タイで葉面から見出された3種のメチロトローフ酵母の3新種、Ogataea phyllophila、Candida chumphonensis、Candida mattranensis
原題: Ogataea phyllophila sp. nov., Candida chumphonensis sp. nov. and Candida mattranensis sp. nov., three methylotrophic yeast species from phylloplane in Thailand（Antonie van Leeuwenhoek, 2011）
タイで21種の植物の葉面を調査し、集積培養により分離されたメチロトローフ酵母3菌株を検討した。
形態学的・生化学的・生理学的・化学分類学的形質およびD1/D2領域に基づく分子系統解析の結果から、3新種を記載した。
報告種: Candida chumphonensis★ / Candida mattranensis★ / Ogataea phyllophila★
比較種: Ogataea cecidiorum / Ogataea dorogensis / Ogataea minuta / Ogataea phyllodendra
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス科/Saccharomycetaceae, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Antonie van Leeuwenhoek, タイ/Thailand, チュムポーン県/Chumphon, メチロトローフ酵母/methylotrophic yeast, ユビキノン/ubiquinone, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 温度適性/temperature aptitude, 葉面菌/leaf surface fungi, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 集積培養/enrichment culture
パキスタン産のインドセンダンに発生するCatenulostroma属菌の新種
原題: A New Species of Catenulostroma on Azadirachta indica from Pakistan（Pakistan Journal of Botany, 2013）
パキスタンでインドセンダンの枝から見出された菌をCatenulostroma azadirachtaとして新種記載した。
本種はTrimmatostroma属およびCatenulostroma属のいずれの既知種とも形態的に区別された。
本種は最大182.4 μmにも達する大型の分生子を形成し、他の多くの種と分生子のサイズで区別された。
報告種: Catenulostroma azadirachta★
比較種: Teratosphaeria macowanii / Timmatostroma abietina / Trimmatostroma amentorum / Trimmatostroma americana / Trimmatostroma betulinum / Trimmatostroma brencklei / Trimmatostroma eriodictyonis / Trimmatostroma fructicola / Trimmatostroma hughesii / Trimmatostroma liriodendri / Trimmatostroma padi / Trimmatostroma platense / Trimmatostroma quercinum / Trimmatostroma salicis / Trimmatostroma salinum / Trimmatostroma undulatum
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, テラトスフェリア科/Teratosphaeriaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Azadirachta属, Pakistan Journal of Botany, センダン科/Meliaceae, パキスタン/Pakistan, パンジャーブ州（パキスタン）/Punjab (Pakistan), 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus
ミシシッピ州の花卉圃場の灌漑池から見出された新種Phytophthora mississippiae
原題: Phytophthora mississippiae sp. nov., a New Species Recovered from Irrigation Reservoirs at a Plant Nursery in Mississippi（Journal of Plant Pathology & Microbiology, 2013）
米国ミシシッピ州の花卉圃場の灌漑用水から見出された菌を、Phytophthora mississippiaeとして新種記載した。
交配試験により、本種の分類株は全てA1の交配型を持つと判定された。
ITS領域およびcox1遺伝子に基づく分子系統解析では、本種はエキビョウキン属の系統の「クレード6」に含まれた。
報告種: Phytophthora mississippiae★
比較種: Phytophthora alni / Phytophthora borealis / Phytophthora cambivora / Phytophthora gibbosa / Phytophthora gonapodyides / Phytophthora katsurae / Phytophthora thermophila
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Journal of Plant Pathology & Microbiology, ポリカーボネート膜法/polycarbonate membrane method, ミシシッピ州/Mississippi, リニアグロース/linear growth, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 卵菌類/Oomycetes, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 水生菌/aquatic fungi, 淡水域/freshwater, 温度適性/temperature aptitude, 灌漑用水/irrigation water, 生長速度/growth rate, 米国/USA, 腐生菌/saprobe, 花卉圃場/flower field, 釣菌法/baiting method
米国産のEntyloma属の2新種
原題: Two new Entyloma species (Entylomatales, Ustilaginomycotina) from the USA（Mycobiota, 2013）
スウェーデンの自然史博物館の収蔵標本の調査で見出された、米国産の2種の黒穂菌を新種記載した。
Entyloma castillejaeは本属で唯一、ハマウツボ科Castilleja属の植物を宿主とする菌として報告された。
Entyloma violaeは本属で唯一、スミレ科スミレ属の植物を宿主とする菌として報告された。
報告種: Entyloma castillejae★ / Entyloma violae★
分類群: エクソバシデイウム亜綱/Exobasidiomycetidae, エクソバシデイウム綱/Exobasidiomycetes, エンティロマ目/Entylomatales, エンティロマ科/Entylomataceae, クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Castilleja属, Mycobiota, コロラド州/Colorado, スミレ属/Viola, スミレ科/Violaceae, ハマウツボ科/Orobanchaceae, 収蔵標本/stored specimen, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 米国/USA, 走査型電子顕微鏡/SEM, 黒穂菌/smut fungi
ハチを好む新種の菌、Ascosphaera callicarpaおよびヨーロッパ産Ascosphaera属菌の検索表
原題: Ascosphaera callicarpa, a New Species of Bee-Loving Fungus, with a Key to the Genus for Europe（PLOS ONE, 2013）
ハチと特異的な関係を持つ腐生菌または寄生菌である、Ascosphaera属菌の多様性および生態を研究した。
形態およびITS領域の配列類似度に基づき、デンマークで幼虫の糞から普通に見られるAscosphaera callicarpaを新種記載した。
また、Ascosphaera aggregataをドイツとスウェーデンから、Ascosphaera atraをヨーロッパから初めて報告した。
報告種: Ascosphaera aggregata■ / Ascosphaera apis / Ascosphaera atra■ / Ascosphaera callicarpa★ / Ascosphaera fimicola / Ascosphaera major / Ascosphaera proliperda / Ascosphaera tenax
比較種: Ascosphaera aggregata / Ascosphaera apis / Ascosphaera atra / Ascosphaera callicarpa / Ascosphaera fimicola / Ascosphaera major / Ascosphaera proliperda / Ascosphaera tenax
分類群: アスコスフェラ科/Ascosphaeraceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Chelostoma属, PLOS ONE, イネ科/Poaceae, シェラン地域/Zealand, スウェーデン/Sweden, スウェーデン新産種/Sweden_new record, スポアシスト/sporecyst, チョーク病/choke disease, ツツハナバチ属/Osmia, デンマーク/Denmark, ドイツ/Germany, ドイツ新産種/Germany_new record, ハキリバチ科/Megachilidae, ハチの巣/honeycomb, モノグラフ/monograph, ヨシ属/Phragmites, ヨーロッパ新産種/Europe_new record, 培養性状/colony characteristics, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 昆虫の巣/insect nest, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 検索表/identification key, 糞生菌/coprophilous fungi, 絶対寄生菌/obligate parasite, 腐生菌/saprobe, 花粉生息菌/pollen inhabiting fungus, 茅葺き屋根/thatched roof, 配列決定/sequencing
ブラジルのセラード産のPeixotoa属植物に発生するPassalora属の新種
原題: New Passalora species on Peixotoa (Malpighiaceae) from the Brazilian Cerrado（Mycological Progress, 2013）
ブラジルのセラードにおいて、キントラノオ科Peixotoa属の2種の植物に発生した4種のPassalora属菌を新種記載した。
そのうち2種はMycovellosiella節に、もう2種はPhaeoramularia節に含まれた。
また、キントラノオ科植物を宿主とするPassalora属菌の検索表を掲載した。
報告種: Passalora brasilianensis★ / Passalora cerradensis★ / Passalora peixotae-reticulatae★ / Passalora peixotoae-goianae★
比較種: Passalora brasilianensis / Passalora cerradensis / Passalora peixotae-reticulatae / Passalora peixotoae-goianae
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, マイコスフェレラ科/Mycosphaerellaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, Peixotoa属, キントラノオ科/Malpighiaceae, サバンナ/savannah, サーコスポロイド/cercosporoid fungi, ブラジリア連邦直轄区/Distrito Federal (Brazil), ブラジル/Brazil, マットグロッソ・ド・スル州/Mato Grosso do Sul, マットグロッソ州/Mato Grosso, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 検索表/identification key
韓国で昆虫標本から分離されたアオカビ属の3新記録
原題: Three New Records of Penicillium Species Isolated from Insect Specimens in Korea（Mycobiology, 2013）
韓国の江原大学校収蔵の昆虫標本に発生した3種の菌を、形態観察および分子系統解析により調査した。
3種の菌はそれぞれPenicillium steckii、Penicillium polonicum、Penicillium sp.と同定された。
報告種: Penicillium polonicum / Penicillium steckii
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycobiology, カツオゾウムシ属/Lixus, コオイムシ属/Appasus, コオイムシ科/Belostomatidae, ゾウムシ科/Curculionidae, ツチハンミョウ属/Meloe, ツチハンミョウ科/Meloidae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 収蔵標本/stored specimen, 培養性状/colony characteristics, 韓国/South Korea
米国オレゴン州のタンオーク-ダグラスファー混生林から見出された新種Phytophthora pluvialis
原題: Phytophthora pluvialis, a new species from mixed tanoak-Douglas-fir forests of western Oregon, USA（North American Fungi, 2013）
米国オレゴン州で2002年から、林内の小川、土壌および林内雨などから分離されていた菌をPhytophthora pluvialisとして新種記載した。
本種はタンオークの枝および幹に潰瘍病を起こす菌として知られており、他の植物からは知られていない。
分子系統解析では、本新種はCooke et al. (2000) によるところの「クレード3」に含まれた。
報告種: Phytophthora pluvialis★
比較種: Phytophthora ilicis / Phytophthora nemorosa / Phytophthora pseudosyringae / Phytophthora psychrophila
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2013年の論文/published in 2013, North American Fungi, Notholithocarpus属, オレゴン州/Oregon, ブナ科/Fagaceae, レイントラップ/rain trap, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 卵菌類/Oomycetes, 固有種/endemic species, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 太平洋岸北西部/Pacific Northwest, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 林内雨/forest rain, 森林/forest, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水試料/water sample, 河川/river, 潰瘍病/canker, 米国/USA, 釣菌法/baiting method
日本におけるナラの木の大量死の研究で採集されたRaffaelea quercivoraの分離株の分類学的再検討
原題: Taxonomic reevaluation of Raffaelea quercivora isolates collected from mass mortality of oak trees in Japan（Mycoscience, 2012）
日本でナラ枯れの原因菌として分離されたRaffaelea quercivoraの、タイプ由来菌株を含む15菌株について、形態学的・分子系統学的に再検討した。
形態的には、本種の分生子のサイズの範囲がより大きいことや、他のオフィオストマ科菌類のシンアナモルフにも見られる、シンポジオ状およびアネライド状伸長の2型の分生子形成様式が明らかになった。
D1/D2領域に基づく分子系統解析では、本種の系統は他のオフィオストマトイド菌類と明瞭に区別され、他の遺伝子領域を用いた研究と同様の結果が得られた。
報告種: Raffaelea quercivora
比較種: Raffaelea albimanens / Raffaelea arxii / Raffaelea montetyi / Raffaelea quercus-mongolicae
分類群: オフィオストマ目/Ophiostomatales, オフィオストマ科/Ophiostomataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, Platypus属, アンブロシア菌/ambrosia fungus, オフィオストマトイド菌類/ophiostomatoid fungi, カシノナガキクイムシ/Platypus quercivorus, コナラ属/Quercus, タイプスタディ/type study, ナガキクイムシ科/Platypodidae, ナラ枯れ/oak wilt, ブナ科/Fagaceae, 保全生態学/conservation ecology, 個体群減少/decrease population, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 樹皮下キクイムシ/bark beetle, 種概念/species concept, 萎凋病/wilt, 走査型電子顕微鏡/SEM, 隠蔽種/cryptic species
新科エラトマイセス科およびインドから最近記載された黒穂菌数種の学名の有効記載
原題: Erratomycetaceae, fam. nov., and validation of some names of smut fungi recently described from India（Mycobiota, 2013）
ナマグサクロボキン科から宿主特異性、胞子嚢と胞子の形態、分子系統解析 (Castlebury et al., 2005) の結果に基づき、新科エラトマイセス科を独立させた。
また、Gandhe (2011) によるインド産の黒穂菌の無効学名について議論し、うち4つを有効な種と認めて規約上有効に記載した。
残りの種は既知種のシノニムと見なされ、さらにAnthracocystis guoaeをSporisorium apludae-muticaeに対する新名として提唱した。
報告種: Anthracocystis guoae★ / Anthracocystis kolhapurensis★ / Eballistra punensis★ / Erratomyces patelii / Sporisorium lohagadense★ / Sporisorium mahabaleshwarense★
比較種: Anthracocystis apludae / Anthracocystis apludae-aristatae / Anthracocystis apludae-muticae / Anthracocystis guoae / Anthracocystis ischaemiana / Sporisorium apludae / Sporisorium flagellatum / Sporisorium ischaemi-anthephoroides / Sporisorium ischaemi-rugosi / Sporisorium lohagadense / Sporisorium mahabaleshwarense
分類群: Erratomycetaceae, エクソバシデイウム亜綱/Exobasidiomycetidae, エクソバシデイウム綱/Exobasidiomycetes, エバリストラ科/Eballistraceae, クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン目/Ustilaginales, クロボキン科/Ustilaginaceae, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, ジョージフィッシェリア目/Georgefischeriales, ナマグサクロボキン目/Tilletiales, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycobiota, イネ科/Poaceae, インド/India, オキナワカルカヤ属/Apluda, カモノハシ属/Ornithorhynchus, シノニム/synonym, マハーラーシュトラ州/Maharashtra, メガルカヤ属/Themeda, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 命名法/nomenclature, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新学名提唱/new scientific name, 新科提唱/new family, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 江西省/Jiangxi, 無効学名の再記載/redescription of invalid name, 黒穂菌/smut fungi
Pustula属の新種がヒマワリの白さび病を引き起こす
原題: A new species of Pustula (Oomycetes, Albuginales) is the causal agent of sunflower white rust（Mycological Progress, 2012）
南アフリカにおける深刻な病害で、近年はヨーロッパにも広がったヒマワリの白さび病の病原菌は、従来Pustula tragopogonisと同定されていたが、別種であることが明らかになった。
本論文では形態観察と以前の分子系統解析の結果を基に、ヒマワリの白さび病の病原菌をPustula helianthicolaとして新種記載した。
さらに、Pustula tragopogonisを無効学名として、新組み合わせPustula obtusataを提唱した。
報告種: Pustula helianthicola★ / Pustula obtusata▲
比較種: Pustula helianthicola / Pustula obtusata
分類群: Albuginales, クロミスタ/Chromista, シロサビキン科/Albuginaceae, ツユカビ綱/Peronosporomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, キク科/Asteraceae, タイプスタディ/type study, ドイツ/Germany, バーデン＝ヴュルテンベルク州/Baden-Württemberg, ヒマワリ属/Helianthus, レクトタイプ指定/lectotype designation, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 卵菌類/Oomycetes, 命名法/nomenclature, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 無効学名/invalid name, 白さび病/white rust
核DNA ITS領域に基づくAntrodia属（広義）の系統解析、特に根状菌糸束を有するヨーロッパの種
原題: A phylogenetic analysis of Antrodia s.l. based on nrDNA ITS sequences with emphasis on rhizomorphic European species（Mycological Progress, 2012）
従来Antrodia radiculosaと呼ばれてきたグループを調査したところ、形態および分子に基づきFibroporia属が支持された。
中央ヨーロッパに分布するAntrodia radiculosaグループの一種を、Fibroporia bohemicaとして新種記載した。
また、Antrodia citrinaに対して新組み合わせFibroporia citrinaを提唱した。
報告種: Fibroporia bohemica★ / Fibroporia citrina▲
比較種: Fibroporia bohemica / Fibroporia citrina / Fibroporia gossypium / Fibroporia radiculosa / Fibroporia vaillantii
分類群: Fibroporiaceae, タマチョレイタケ目/Polyporales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, タイプスタディ/type study, チェコ/Czech, トウヒ属/Picea, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, ヴィソチナ州/Vysočina, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 腐生菌/saprobe, 複合種/species complex, 褐色腐朽菌/brown rot fungi
ウマの”brittle tail”症候群は好ケラチン菌の新属新種、Equicapillimyces hongkongensisによって引き起こされる新興感染症である
原題: Brittle tail syndrome is an emerging infection in horses caused by a keratinolytic fungus Equicapillimyces hongkongensis gen. nov., sp. nov.（Veterinary Microbiology, 2012）
2004年に香港の競走馬から初めて報告されたウマの”brittle tail”症候群は、ウマの尾の毛が脆くなり、その結果、毛束が太く短くなって醜形を呈する病気である。
接種試験により、この病気が好ケラチン菌の感染により引き起こされる明らかにし、その原因菌を新属新種Equicapillimyces hongkongensisとして記載した。
分子系統解析の結果、本種はフンタマカビ綱菌類のクレードに含まれたが、その中で独自の系統をなした。
報告種: Equicapillimyces hongkongensis★
比較種: Ceratocystiopsis spp. / Trichophyton equinum var. equinum
分類群: オフィオストマ目/Ophiostomatales, オフィオストマ科/Ophiostomataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, brittle tail症候群/brittle tail syndrome, GCPSR, Veterinary Microbiology, アピザイム/API ZYM, ウマ属/Equus, ウマ科/Equidae, コッホの原則/Koch_s postulation, ヘマトキシリン・エオシン染色/hematoxylin and eosin staining, 中国/China, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 好ケラチン菌/kerationophillic fungus, 接種試験/inoculation test, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 温度適性/temperature aptitude, 無効学名/invalid name, 獣医真菌学/veterinary mycology, 病原真菌/pathogenic fungi, 皮膚糸状菌/dermatophyte, 組織染色/histological stain, 統計解析/statistical analysis, 臨床検体/clinical specimens, 蛍光染色/fluorescent staining, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity, 香港/Hong Kong
落葉樹の樹液から見出されたメタノール資化性菌の2新種、Komagataella populiおよびKomagataella ulmi
原題: Komagataella populi sp. nov. and Komagataella ulmi sp. nov., two new methanol assimilating yeasts from exudates of deciduous trees（Antonie van Leeuwenhoek, 2012）
米国イリノイ州で、ヤマナラシ属とニレ属の樹木の樹液から、2種のメタノール資化性菌を分離した。
両種をそれぞれ、Komagataella populiとKomagataella ulmiとして新種記載した。
両種は培養性状や資化試験・発酵試験などでは近縁種とほとんど区別できなかったことから、記載は専ら複数遺伝子に基づく分子系統解析の結果に基づいて行われた。
報告種: Komagataella populi★ / Komagataella ulmi★
比較種: Komagataella pastoris / Komagataella phaffi / Komagataella populi / Komagataella pseudopastoris / Komagataella ulmi
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス科/Saccharomycetaceae, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Antonie van Leeuwenhoek, イリノイ州/Illinois, ニレ属/Ulmus, ニレ科/Ulmaceae, メタノール資化性菌/methanol-assimilating fungi, ヤナギ科/Salicaceae, ヤマナラシ属/Populus, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 樹液/sap, 樹液酵母/sap yeast, 発酵試験/fermentation test, 米国/USA, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 隠蔽種/cryptic species, 雑種形成/hybridization
ガイアナ産のアセタケ属の新種および記録
原題: New species and reports of Inocybe (Agaricales) from Guyana（Kurtziana, 2012）
ガイアナからアセタケ属の5新種を記載し、ガイアナ新産種として2種を報告した。
新種を含むガイアナ産のアセタケ属の検索表を掲載した。
また、2種のタイプ標本の検討を行うとともに、2種について追加の情報を記載した。
報告種: Inocybe amazoniensis■ / Inocybe enigmatica★ / Inocybe epidendron / Inocybe lasseri■ / Inocybe lepidotella★ / Inocybe magnifolia★ / Inocybe marginata★ / Inocybe matrisdei / Inocybe pulchella / Inocybe rhodella★
比較種: Inocybe amazoniensis / Inocybe ayangannae / Inocybe epidendron / Inocybe fastigiata var. umbrinella / Inocybe hyperythra / Inocybe ingae / Inocybe lasseri / Inocybe lilacinosquamosa / Inocybe littoralis / Inocybe magnifolia / Inocybe marginata / Inocybe matrisdei / Inocybe mixtilis / Inocybe nothodryina / Inocybe pulchella / Inocybe rhodella / Inocybe tropicalis / Inocybe violaceolamellata / Inocybe xerophytica
分類群: アセタケ科/Inocybaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Aldina属, Dicymbe属, Kurtziana, ガイアナ/Guyana, ガイアナ新産種/Guyana_new record, タイプスタディ/type study, ポタロ・シパルニ州/Potaro-Siparuni, マメ科/Fabaceae, 二次代謝産物/secondary metabolite, 呈色反応/chemical reaction, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 検索表/identification key, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 色素産生/pigment production, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 配列決定/sequencing
新種Tuber microsphaerosporumおよびParadoxa sinensis
原題: Tuber microsphaerosporum and Paradoxa sinensis spp. nov.（Mycotaxon, 2012）
中国から形態に基づき、2種のトリュフをTuber microsphaerosporumおよびParadoxa sinensisとして新種記載した。
Tuber microsphaerosporumは1-7胞子性の子嚢と小型の子嚢胞子によって特徴づけられた。
一方、Paradoxa sinensisはP. monosporaよりも淡色で、子嚢胞子のサイズが大きかった。
報告種: Paradoxa sinensis★ / Tuber microsphaerosporum★
比較種: Paradoxa gigantospora / Paradoxa monospora / Tuber borchii var. sphaerosperma / Tuber californicum / Tuber oligospermum / Tuber sphaerosporum
分類群: セイヨウショウロ科/Tuberaceae, チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycotaxon, シクエストレート菌/sequestrate fungus, 中国/China, 商業価値のあるきのこ/mushrooms with commercial value, 地下生菌/hypogeous fungi, 新種記載/new species, 白トリュフ/white truffle, 走査型電子顕微鏡/SEM, 雲南省/Yunnan, 食用きのこ/edible mushrooms
中国産のParadoxa属様のトリュフの2種、新種Tuber glabrumおよび新学名T. sinomonosporumの系統的位置
原題: The phylogenetic position of Tuber glabrum sp. nov. and T. sinomonosporum nom. nov.（Mycological Progress, 2013）
中国産のParadoxa属に似たトリュフ2種について、形態およびITS領域に基づく分子系統を検討した。
2種の片方をTuber glabrumとして新種記載し、もう一方のParadoxa sinensisに新学名T. sinomonosporumを提唱した。
2種はいずれもT. macrosporumおよびT. canaliculatumを含むMacrosporumグループに位置し、独自の系統を形成した。
報告種: Tuber glabrum★ / Tuber sinomonosporum◆
比較種: Tuber canaliculatum / Tuber gigantosporum / Tuber glabrum / Tuber macrosporum / Tuber sinomonosporum / “Tuber sp.1″
分類群: セイヨウショウロ科/Tuberaceae, チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, シクエストレート菌/sequestrate fungus, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地下生菌/hypogeous fungi, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新学名提唱/new scientific name, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 白トリュフ/white truffle, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM, 雲南省/Yunnan, 黒トリュフ/black truffle
Penicillium glabrum種複合体の分類学的研究および新種P. subericolaの記載
原題: Taxonomic studies of the Penicillium glabrum complex and the description of a new species P. subericola（Fungal Diversity, 2011）
ポルトガルでコルクから分離された多数のアオカビ属菌のうち半数以上を占めた、Penicillium glabrumに近縁な69菌株について検討を行った。
分子系統解析で6グループに分けられたうちの一グループを、分泌物のプロファイルや生長特性に基づき、Penicillium subericolaとして新種記載した。
本新種のタイプ菌株はコルクから分離されたが、他に土壌・空中・乾燥したブドウ果実などからも見出された。
報告種: Penicillium subericola★
比較種: Penicillium glabrum / Penicillium spinulosum
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Fungal Diversity, コナラ属/Quercus, コルク/cork, ブナ科/Fagaceae, ポルトガル/Portugal, 二次代謝産物/secondary metabolite, 代謝産物プロファイル/extrolite profile, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 空中真菌/air-borne fungus, 高速液体クロマトグラフィー/high performance liquid chromatography
ペグ状の菌糸凝集を持つウスカワタケ属の3新種
原題: Three new species of Hyphodontia with peg-like hyphal aggregations（Mycological Progress, 2013）
台湾・中国南部・ベトナム北部で採集されたウスカワタケ属の3新種を記載した。
3新種はいずれも、菌糸が凝集した不稔の突出するペグ状の構造を持つことで特徴づけられたが、この特徴を持つ菌は分子系統解析で単系統群をなさなかった。
また、本論文の分子系統解析で初めて、Hyphodontia heterocystidiataおよびH. mollisの系統的位置が明らかになった。
報告種: Hyphodontia astrocystidiata★ / Hyphodontia microfasciculata★ / Hyphodontia vietnamensis★
比較種: Hyphodontia candidissima / Hyphodontia crustosa / Hyphodontia juniperi / Hyphodontia sambuci / Hyphodontia serpentiformis / Pteridomyces capitatus / Resinicium spp. / Schizopora paradoxa
分類群: Hyphodontiaceae, タバコウロコタケ目/Hymenochaetales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, ツツジ属/Rhododendron, ツツジ科/Ericaceae, ハノイ市/Hanoi, ベトナム/Vietnam, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 台湾/Taiwan, 宜蘭県/Yilan, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 白色腐朽菌/white-rot fungi, 腐生菌/saprobe, 走査型電子顕微鏡/SEM