Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
Corallomycetella属の改訂およびC. jatrophaeに対する新属Corallonectriaの提唱
原題: Revision of the genus Corallomycetella with Corallonectria gen. nov. for C. jatrophae (Nectriaceae, Hypocreales)（Mycosystema, 2013）
Corallomycetella属の分類学的再検討を行い、天然および培養下で根状菌糸束を形成する赤いネクトリオイドの菌を含む属として再定義した。
分子系統解析の結果、広義のC. repensのうちアジア産の標本に本種の学名を、アフリカ・アメリカ産の標本にC. elegansの学名をあてた。
また、C. jatrophaeが広義のNeonectria属菌に近縁であることを示し、新属Corallonectriaに本種を含めた。
報告種: Corallomycetella elegans▲ / Corallomycetella repens / Corallonectria jatrophae▲
比較種: Corallomycetella elegans / Corallomycetella repens
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, GCPSR, GSI (genealogical sorting index), Mycosystema, エピタイプ指定/epitype designation, シノニム/synonym, シンネマ形成菌/synnematous fungus, タイプスタディ/type study, トウダイグサ科/Euphorbiaceae, ハプロタイプネットワーク/haplotype network, パラゴムノキ属/Hevea, フランス/France, プエルトリコ/Puerto Rico, レクトタイプ指定/lectotype designation, 二次代謝産物/secondary metabolite, 仏領ギアナ/French Guiana, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 土壌菌/soil fungi, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 属概念/genus concept, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 材生息菌/lignicolous fungus, 根状菌糸束/rhizomorph, 根腐病/root rot, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 水溶性色素/water-soluble pigment, 熱帯域/tropics, 移入種/alien species, 米国/USA, 色素産生/pigment production, 複合種/species complex
スリランカ産の地衣類の新種およびスリランカ産のHeterodermia属地衣の検索表
原題: Some New Lichen Species from Sri Lanka, with a Key to the Genus Heterodermia in Sri Lanka（Cryptogamie Mycologie, 2013）
スリランカ中部州で1990年代初頭に採集された3種の地衣を新種記載した。
新種のうち2種は赤い色素を持つことで特徴づけられ、残りの1種はMegalospora属に類似していた。
また、スリランカ産のHeterodermia属の検索表を掲載した。
報告種: Heterodermia rubrotricha★ / Malmidea sanguineostigma★ / Protoparmelia megalosporoides★
比較種: Heterodermia leucomela / Heterodermia vulgaris / Malmidea chrysostigma / Megalospora spp.
分類群: Protoparmelioideae, ウメノキゴケ科/Parmeliaceae, チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピンゴケ目/Caliciales, マルミデア科/Malmideaceae, ムカデゴケ科/Physciaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Cryptogamie Mycologie, アントラキノン類/anthraquinones, スリランカ/Sri Lanka, ツバキ属/Camellia, ツバキ科/Theaceae, ホルトノキ属/Elaeocarpus, ホルトノキ科/Elaeocarpaceae, 中部州（スリランカ）/Central Province (Sri Lanka), 二次代謝産物/secondary metabolite, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 新種記載/new species, 植林地/plantation, 検索表/identification key, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 熱帯域/tropics, 紫外線蛍光/UV fluorescence, 色素産生/pigment production, 葉状地衣/foliose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
ジャーマン・シェパード・ドッグの椎間板脊椎炎からの新種Spiromastix asexualisの分離および特徴づけ、Spiromastix属のレビューと新目Spiromastixalesの提唱
原題: Isolation and characterisation of the fungus Spiromastix asexualis sp. nov. from discospondylitis in a German Shepherd dog, and review of Spiromastix with the proposal of the new order Spiromastixales（Mycoses, 2014）
米国で椎間板脊椎炎を起こしたイヌから分離された菌を、Spiromastix asexualisとして新種記載した。
Spiromastix属は土壌や動物の糞などから分離される菌として知られていたが、動物病原菌としての報告は初となった。
分子系統解析の結果に基づき、新目Spiromastixalesを提唱し、S. tentaculataに対して新属Pseudospiromastixを提唱した。
報告種: Pseudospiromastix tentaculata▲ / Spiromastix asexualis★
比較種: Chrysosporium merdarium / Spiromastix spp. / Spiromastix warcupii
分類群: Spiromastigaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホネタケ目/Onygenales, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycoses, X線検査/X-ray inspection, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アリゾナ州/Arizona, イヌ属/Canis, イヌ科/Canidae, ウレアーゼ試験/urease test, リパーゼ/lipase, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 新属提唱/new genus, 新目提唱/new order, 新科提唱/new family, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 日和見感染症/opportunistic infection, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 椎間板脊椎炎/intervertebral disc spondylitis, 水溶性色素/water-soluble pigment, 溶血活性/hemolytic activity, 獣医真菌学/veterinary mycology, 生体組織診断/biopsy, 症例報告/case report, 米国/USA, 臨床検体/clinical specimens, 致死的転帰/fatal outcome, 色素産生/pigment production, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity
揮発性の抗菌物質を産生するエンドファイトの新種Muscodor kashayum
原題: Muscodor kashayum sp. nov. – a new volatile anti-microbial producing endophytic fungus（Mycology, 2013）
インドの西ガーツでベンガルカラタチ（ベルノキ）の葉から分離されたエンドファイトを、Muscodor kashayumとして新種記載した。
本種はPDA培地でロープ状の菌糸束を形成し、菌糸体が大小の輪状になることで特徴づけられ、どの培地でも胞子形成は確認されず、顕著な芳香を発した。
本種は未知物質を含む23以上の揮発性有機化合物を産生し、in vitroでの抗真菌活性試験で75%の供試菌類、72%の供試細菌の生育を完全に阻害した。
報告種: Muscodor kashayum★
比較種: Muscodor albus / Muscodor cinnamomi / Muscodor crispans / Muscodor equiseti / Muscodor fengyangensis / Muscodor musae / Muscodor oryzae / Muscodor roseus / Muscodor suthepensis / Muscodor sutura / Muscodor vitigenus / Muscodor yucantanesis
分類群: Induratiaceae, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, クロサイワイタケ目/Xylariales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycology, アミン類/amines, アルコール類/alcohol, インド/India, エンドファイト/endophyte, ガスクロマトグラフィー/gas chromatography, ケトン類/ketones, ケララ州/Kerala, フェノール類/phenols, ベンガルカラタチ属/Aegle, マイコフミゲーション/mycofumigation, ミカン属/Citrus, ミカン科/Rutaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 固相マイクロ抽出/solid-phase microextraction, 培養性状/colony characteristics, 抗生物質/antibiotic, 抗真菌活性/antifungal activity, 抗菌活性/antibacterial activity, 揮発性有機化合物/volatile organic compound, 新種記載/new species, 森林/forest, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 表面殺菌法/surface sterilization method, 質量分析法/mass spectrometry, 走査型電子顕微鏡/SEM
ヨーロッパ産の水生子嚢菌の新種Lindgomyces griseosporusおよび新記録
原題: Lindgomyces griseosporus, a new aquatic ascomycete from Europe including new records（Mycoscience, 2014）
フランス南部の小川において沈んだ材に発生した水生菌の一種を検討し、Lindgomyces griseosporusとして新種記載した。
本種は子嚢胞子が灰色の狭紡錘形で、中央上部に一次隔壁を持ち、成熟時に粘液質の鞘も付属糸も欠くことなどで特徴づけられた。
また、L. ingoldianusとL. cinctosporaeをヨーロッパ新産種として報告した。
報告種: Lindgomyces cinctosporae■ / Lindgomyces griseosporus★ / Lindgomyces ingoldianus■
比較種: Lindgomyces cinctosporae / Lindgomyces griseosporus
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, リンドゴマイセス科/Lindgomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycoscience, アストゥリアス州/Asturias, アリエージュ県/Ariège, イソノキ属/Frangula, オート＝ガロンヌ県/Haute-Garonne, カバノキ科/Betulaceae, クロウメモドキ属/Rhamnus, クロウメモドキ科/Rhamnaceae, スズカケノキ属/Platanus, スズカケノキ科/Platanaceae, スペイン/Spain, スペイン新産種/Spain_new record, ソーヌ＝エ＝ロワール県/Saône-et-Loire, トネリコ属/Fraxinus, ドゥー＝セーヴル県/Deux-Sèvres, ハンノキ属/Alnus, フランス/France, フランス新産種/France_new record, ブナ属/Fagus, ブナ科/Fagaceae, モクセイ科/Oleaceae, モルビアン県/Morbihan, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, ヨーロッパ新産種/Europe_new record, ロワール＝アトランティック県/Loire-Atlantique, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 属概念/genus concept, 属概念の修正/genus concept_emendation, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 水生菌/aquatic fungi, 河川/river, 流水環境/lotic environment, 淡水域/freshwater, 生長速度/growth rate, 石灰質土壌/calcareous soil, 酸性土壌/acidic soil, 難培養性菌/uncultured fungi
謎の気中水生菌、Spirosphaera lignicolaの系統関係および再分類
原題: Phylogenetic relationships and reclassification of Spirosphaera lignicola, an enigmatic aeroaquatic fungus（Mycotaxon, 2011）
オーストリアで最近繰り返し採集されたSpirosphaera lignicolaの標本を用いて、本種の再検討を行った。
その結果、本種は形態的にはSpirosphaera属ではなく、明らかにDendroclathra属の概念に合致することが明らかになった。
また、複数遺伝子のデータに基づき、本種とDendroclathra caeruleofuscaを同種と見なした。
報告種: Dendroclathra lignicola▲■
分類群: 子嚢菌綱/Ascomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ウィーン/Wien, エピタイプ指定/epitype designation, オーストリア/Austria, オーストリア新産種/Austria_new record, シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, ニーダーエスターライヒ州/Niederösterreich, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 新産種報告/new record, 新組み合わせ提唱/new combination, 材生息菌/lignicolous fungus, 気中水生菌/aero-aquatic fungi, 水生菌/aquatic fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM
インドで水牛から分離された、結節状の胞子嚢柄を持つ嫌気性腸内生息菌の新種Cyllamyces icaris
原題: Cyllamyces icaris sp. nov., a new anaerobic gut fungus with nodular sporangiophores isolated from Indian water buffalo (Bubalus bubalis)（The International Journal of Current Research and Academic Review, 2014）
インドで水牛の糞から分離された嫌気性菌を、Cyllamyces icarisとして新種記載した。
本種のITS領域のモチーフ配列は独特で、Cyllamyces aberensisに類似しており、Carcomyces属菌のそれとは明瞭に区別された。
本種は仮根を持つ菌と持たない菌（Caecomyces属菌）の中間的位置にあたると考えられた。
報告種: Cyllamyces icaris★
比較種: Caecomyces communis / Caecomyces equi / Caecomyces sympodialis / Cyllamyces aberensis
分類群: Chytridiomyceta, Neocallimastigomycotina, ネオカリマスティクス目/Neocallimastigales, ネオカリマスティクス科/Neocallimastigaceae, ネオカリマスティクス綱/Neocallimastigomycetes, ネオカリマスティクス門/Neocallimastigomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, The International Journal of Current Research and Academic Review, アジアスイギュウ属/Bubalus, インド/India, ウシ科/Bovidae, キシラナーゼ/xylanase, クローニング/cloning, グルコシダーゼ/glucosidase, タミル・ナードゥ州/Tamil Nadu, ミッシングリンク/missing link, ヨウ化プロピジウム/propidium iodide, 付着器/appressorium, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 嫌気性菌/anaerobe, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 核染色/nuclear staining, 水生菌/aquatic fungi, 糞生菌/coprophilous fungi, 統計解析/statistical analysis, 腸内生息菌/fungus in intestinal tract, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity
菌類の初期系統、ロゼラ門に属する微胞子虫類似のアメーバ寄生菌
原題: Microsporidia-like parasites of amoebae belong to the early fungal lineage Rozellomycota（Parasitology Research, 2014）
アメーバの核内に寄生する、微胞子虫に顕著に類似した微細構造を持つ2種を新種記載し、新属Paramicrosporidiumに含めた。
両種は分子系統解析では、微胞子虫ではなく、菌類の系統の最基部に位置するロゼリダのクレード（本論文で「ロゼラ門」と命名）に含まれた。
本属菌は、菌類と微胞子虫の形態学的なミッシングリンクに位置する生物だと考えられた。
報告種: Paramicrosporidium saccamoebae★ / Paramicrosporidium vannellae★
分類群: 所属未確定/Incertae sedis, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, FISH, Parasitology Research, Saccamoeba属, Vannella属, アメーバ寄生菌/amoeba parasitic fungus, カルコフルオールホワイト/calcofluor white, ドイツ/Germany, ニーダーザクセン州/Niedersachsen, ノルトライン＝ヴェストファーレン州/Nordrhein-Westfalen, ハルトマネラ科/Hartmannellidae, ミッシングリンク/missing link, ヴァネラ科/Vannellidae, 二次構造/secondary structure, 共培養/coculture, 内部寄生菌/internal parasitic fungus, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 医真菌学/medical mycology, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 新門提唱/new phylum, 池沼/ponds and swamps, 臨床検体/clinical specimens, 蛍光染色/fluorescent staining, 蛍光顕微鏡/fluorescence microscope, 角膜炎/keratitis, 門概念/phylum concept
培養に基づくペルー産ゴムノキのエンドファイトの研究により、チャワンタケ亜門の新綱Xylonomycetesの存在が明らかになった
原題: Culture-based study of endophytes associated with rubber trees in Peru reveals a new class of Pezizomycotina: Xylonomycetes（Molecular phylogenetics and Evolution, 2012）
ペルーにおいてパラゴムノキ属樹木のエンドファイトを調査し、新綱Xylonomycetesを提唱した。
複数遺伝子に基づく分子系統解析で、本綱の系統は”Leotiomyceta”に由来することが示されたが、”Leotiomyceta”内部の系統関係は十分に明らかにならなかった。
本綱の菌は他の多数の葉のエンドファイトと異なり、セルロースおよびリグニンのin vitroでの分解能を欠いていた。
報告種: Xylona heveae★
比較種: Readeriella spp.
分類群: Xylonaceae, Xylonales, ザイロナ綱/Xylonomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Molecular phylogenetics and Evolution, アナモルフ菌/anamorphic fungi, エンドファイト/endophyte, サン・マルティン県/San Martín, セルロース/cellulose, セルロース分解菌/cellulolytic fungi, トウダイグサ科/Euphorbiaceae, パラゴムノキ属/Hevea, ペルー/Peru, リグニン/lignin, リグニン分解菌/lignin-decomposing fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 分離頻度/isolation frequency, 培養性状/colony characteristics, 子実体形成誘導/fruiting body induction, 宿主選好性/host selectivity, 新属提唱/new genus, 新目提唱/new order, 新科提唱/new family, 新種記載/new species, 新綱提唱/new class, 材生息菌/lignicolous fungus, 植林地/plantation, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 熱帯域/tropics, 酵素/enzyme
中国新産のTrichoderma属菌、Trichoderma koningiopsis
原題: Trichoderma koningiopsis: A New Chinese Record of the Genus Trichoderma（微生物学通報/Microbiology China, 2010）
中国東部で土壌から分離された菌をTrichoderma koningiopsisと同定した。
本種は熱帯アメリカに広く分布し、アフリカ、ヨーロッパ、北米東部~カナダでも報告されていたが、中国からは初めての報告となった。
本種はPDAおよびCMD培地ではフィアライドが垂直方向に伸長する性質が確認されたが、MA培地では確認されなかった。
報告種: Trichoderma koningiopsis■
比較種: Trichoderma gamsii / Trichoderma koningii / Trichoderma viridescens
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, アナモルフ菌/anamorphic fungi, 中国/China, 中国新産種/China_new record, 中国語/Chinese, 分子同定/molecular identification, 土壌菌/soil fungi, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 微生物学通報/Microbiology China, 新産種報告/new record, 江西省/Jiangxi, 生物農薬/biopesticide, 畑地/farmland
Lactifluus属の新組み合わせその2：Gerardii亜属
原題: New combinations in Lactifluus. 2. L. subg. Gerardii（Mycotaxon, 2012）
チチタケ属に含まれていたGerardii亜属を、Lactifluus属に移した。
Stubbe et al. (2012) に基づき、17種について新組み合わせを提唱し、本亜属には既に転属されていたLactifluus gerardiiを含めて18種が認められた。
本種は子実体がハラタケ型またはヒラタケ型で、傘と柄が褐色、襞が淡色、胞子紋が白色であることなどで特徴づけられた。
報告種: Lactifluus atrovelutinus▲ / Lactifluus bicolor▲ / Lactifluus conchatulus▲ / Lactifluus coniculus▲ / Lactifluus genevievae▲ / Lactifluus gerardii / Lactifluus hora▲ / Lactifluus leae▲ / Lactifluus leonardii▲ / Lactifluus limbatus▲ / Lactifluus ochrogalactus▲ / Lactifluus petersenii▲ / Lactifluus reticulatovenosus▲ / Lactifluus sepiaceus▲ / Lactifluus subgerardii▲ / Lactifluus uyedae▲ / Lactifluus venosus▲ / Lactifluus wirrabara▲
分類群: ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ベニタケ目/Russulales, ベニタケ科/Russulaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycotaxon, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新組み合わせ提唱/new combination, 菌根菌/mycorrhizal fungi
オーストララシア産のチチタケ属Gerardii亜属の種
原題: The Australasian species of Lactarius subgenus Gerardii (Russulales)（Fungal Diversity, 2012）
オーストララシア産のチチタケ属Gerardii亜属の種を、形態および分子系統解析に基づき検討した結果、12種を認めた。
本論文で、Lactarius horaなど5種のハラタケ型の種と、L. genevievaeなど2種のヒラタケ型の種を新種記載した。
また、複数の隠蔽種および種複合体の存在が明らかになり、特にL. wirrabaraの種認識にあたっては問題が生じた。
報告種: Lactarius atrovelutinus / Lactarius bicolor / Lactarius conchatulus★ / Lactarius coniculus★ / Lactarius genevievae★ / Lactarius hora★ / Lactarius leae★ / Lactarius leonardii★ / Lactarius limbatus★ / Lactarius ochrogalactus / Lactarius reticulatovenosus / Lactarius sepiaceus / Lactarius uyedae / Lactarius venosus / Lactarius wirrabara
比較種: Lactarius atromarginatus / Lactarius atrovelutinus / Lactarius bicolor / Lactarius brunellus / Lactarius conchatulus / Lactarius fallax / Lactarius genevievae / Lactarius gerardii / Lactarius gerardii var. subrubescens / Lactarius leae / Lactarius leonardii / Lactarius lignyotus var. marginatus / Lactarius limbatus / Lactarius linbatus / Lactarius multiceps / Lactarius ochrogalactus / Lactarius panuoides / Lactarius petersenii / Lactarius reticulatovenosus / Lactarius sepiaceus / Lactarius uyedae / Lactarius venosus / Lactarius wirrabara
分類群: ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ベニタケ目/Russulales, ベニタケ科/Russulaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Fungal Diversity, エピタイプ指定/epitype designation, オーストラリア/Australia, クイーンズランド州/Queensland, サラノキ属/Shorea, シイ属/Castanopsis, スリランカ/Sri Lanka, タイ/Thailand, タイプスタディ/type study, タスマニア州/Tasmania, チエンマイ県/Chiang Mai, ナンキョクブナ属/Nothofagus, ナンキョクブナ科/Nothofagaceae, ニュージーランド/New Zealand, ヌグリ・スンビラン州/Negeri Sembilan, ネルソン地方/Nelson, フタバガキ属/Dipterocarpus, フタバガキ科/Dipterocarpaceae, フトモモ科/Myrtaceae, ブナ科/Fagaceae, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, マテバシイ属/Lithocarpus, マレーシア/Malaysia, ユーカリ属/Eucalyptus, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北西部州（スリランカ）/North Western Province (Sri Lanka), 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 検索表/identification key, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 種概念/species concept, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 複合種/species complex, 隠蔽種/cryptic species
メキシコ産のHeliocephala属の新種およびアナモルフ属Heliocephala、Holubovaniellaの系統的位置づけの評価
原題: A new species of Heliocephala from Mexico with an assessment of the systematic positions of the anamorph genera Heliocephala and Holubovaniella（Mycologia, 2011）
メキシコ産のHeliocephala属とHolubovaniella属の中間的な形質を持つ菌を、He. triseptataとして新種記載した。
本種は倒棍棒形~紡錘形の3隔壁、嘴状の分生子を形成し、分生子柄が有限生長で分枝することなどで特徴づけられた。
分子系統解析により、Heliocephala属菌とHolubovaniella属菌が近縁であることが示され、後者を前者のシノニムと見なした。
報告種: Heliocephala elegans▲ / Heliocephala gracilis▲ / Heliocephala triseptata★
比較種: Heliocephala elegans / Heliocephala gracilis
分類群: 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycologia, アナモルフ菌/anamorphic fungi, シノニム/synonym, タバスコ州/Tabasco, メキシコ/Mexico, リター菌/litter fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 属概念/genus concept, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 検索表/identification key, 湿室法/moist chamber method
ブラジルのアマゾンの熱帯雨林で発見されたMorganella属の2新種
原題: Two new Morganella species from the Brazilian Amazon rainforest（Mycosphere, 2012）
アマゾンの熱帯雨林で発見された2種の菌を、それぞれMorganella albostipitata、M. rimosaとして新種記載した。
M. albostipitataは材に発生し、担子胞子を走査型電子顕微鏡で観察すると、基部の周囲に条線のある輪が見出された。
M. rimosaも材上生で、子実体表面に無数の亀裂が生じることなどで特徴づけられた。
報告種: Morganella albostipitata★ / Morganella rimosa★
比較種: Lycogalopsis solmsii / Morganella albina / Morganella fuliginea
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycosphere, アマゾナス州/Amazonas (Brazil), シクエストレート菌/sequestrate fungus, ブラジル/Brazil, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 根状菌糸束/rhizomorph, 森林/forest, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 腹菌類/gastromycetes, 走査型電子顕微鏡/SEM
形態および分子に基づく中国南部産のPerenniporia属新種の記載
原題: A new species of Perenniporia (Polyporales, Basidiomycota) described from southern China based on morphological and molecular characters（Mycological Progress, 2012）
中国南部で採集された木材腐朽菌を、Perenniporia nanlingensisとして新種記載した。
本種は一年生で背着生の子実体を形成し、孔口面が乾燥時帯桃黄褐色~肉桂褐色であることなどで特徴づけられた。
顕微鏡的には、本種は3菌糸型で、骨格菌糸と結合菌糸が僅かにデキストリノイドかつシアノフィリックであった。
報告種: Perenniporia nanlingensis★
比較種: Perenniporia japonica / Perenniporia roseoisabellina / Perenniporia straminea / Perenniporia subacida / Perenniporia subaurantiaca
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, タマチョレイタケ科/Polyporaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 広東省/Guangdong, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 腐生菌/saprobe
C. illuminusに近縁の類球形の胞子を持つ新種Cortinarius microglobisporus
原題: Cortinarius microglobisporus (Basidiomycota), a new species with roundish spores related to C. illuminus（Mycological Progress, 2014）
イタリア産の小型で類球形の担子胞子を形成するフウセンタケ属菌を、Cortinarius microglobisporusとして新種記載した。
ITS領域に基づく分子系統解析で、本種はC. illuminus種複合体（「Illumini節」）と近縁であった。
本種は「Illumini節」の2番目の種となり、系統関係は必ずしも明らかにならなかったが、狭義のツバフウセンタケ亜属とは明瞭に区別された。
報告種: Cortinarius microglobisporus★
比較種: Cortinarius admotus / Cortinarius balaustinus / Cortinarius diagnitus / Cortinarius illuminus / Cortinarius melleifolius / Cortinarius trossingenensis
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, フウセンタケ科/Cortinariaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycological Progress, UNITE, イタリア/Italy, エミリア＝ロマーニャ州/Emilia-Romagna, クリ属/Castanea, コナラ属/Quercus, ブナ科/Fagaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌pH/soil pH, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 珪質土/siliceous soil, 紫外線蛍光/UV fluorescence, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 誤同定/misidentification, 酸性土壌/acidic soil
稀産種・絶滅危惧種の担子菌の腹菌類Myriostoma coliformeの、パキスタンにおける初記録
原題: Myriostoma coliforme, first record of a rare and endangered gasteroid basidiomycetes from Pakistan（International Journal of Microbiology and Mycology, 2013）
パキスタン・ヒマラヤの温帯湿潤林で採集されたMyriostoma coliformeを、パキスタン新産種として報告した。
採集された標本について、形態を詳細に記録し、イラストを掲載した上で、本種についてのレビューを行った。
パキスタン各地での著者らの10年間の調査経験からしても、本種は非常に稀な種だと考えられた。
報告種: Myriostoma coliforme■
分類群: スッポンタケ亜綱/Phallomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ヒメツチグリ目/Geastrales, ヒメツチグリ科/Geastraceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, International Journal of Microbiology and Mycology, カイバル・パクトゥンクワ州/Khyber Pakhtunkhwa, シクエストレート菌/sequestrate fungus, パキスタン/Pakistan, パキスタン新産種/Pakistan_new record, ヒマラヤ山脈/Himalayas, 保全生態学/conservation ecology, 山地/mountains, 新産種報告/new record, 森林/forest, 温帯域/temperate zone, 温帯湿潤林/temperate wet forest, 稀産種/rare species, 絶滅危惧種/endangered species, 腹菌類/gastromycetes
イタリアで発見された子実層状被の傘表皮を持つ新種Lepiota sanguineofracta
原題: Lepiota sanguineofracta (Basidiomycota, Agaricales), a new species with a hymeniform pileus covering from Italy（Mycological Progress, 2013）
イタリア・トリノの植物園で採集された、子実層状被の傘表皮を持つ菌を、Lepiota sanguineofractaとして新種記載した。
本種は肉に赤変性があり、顕著な甘い臭いがあり、担子胞子に2核を含むことなどで特徴づけられた。
本種は形態的・系統的にLepiota coloratipesに近縁であったが、肉眼的形質と顕微鏡的形質の両方で区別された。
報告種: Lepiota sanguineofracta★
比較種: Lepiota coloratipes / Lepiota neophana / Lepiota neophana f. papillata / Lepiota neophana var. europaea / Lepiota psalion / Lepiota pyrochroa
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, DAPI染色/DAPI staining, Mycological Progress, イタリア/Italy, ガマズミ属/Viburnum, スイカズラ属/Lonicera, スイカズラ科/Caprifoliaceae, ピエモンテ州/Piedmont, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 新種記載/new species, 砂質土壌/sandy soil, 腐植土/humus, 蛍光染色/fluorescent staining, 蛍光顕微鏡/fluorescence microscope
水中の底泥から分離された好ケラチン菌の新種、Chrysosporium aquaticum
原題: Chrysosporium aquaticum: a New Keratinophilic Fungus from Bottom Sediments of Aquatic Habitats（Journal of Pharma & Bio Sciences, 2012）
インドのカーンプル付近で、川や池、水路など、様々な淡水中の底泥から、潜在的に病原性を持ちうる好ケラチン菌の分離を試みた。
8か所の144サンプルから、39属105種の好ケラチン菌を分離し、それぞれの分離頻度を計算して表にまとめた。
そのうち、ガンジス川の底泥から分離された好ケラチン菌を、形態に基づきChrysosporium aquaticumとして新種記載した。
報告種: Chrysosporium aquaticum★
比較種: Chrysosporium christchurchicum / Chrysosporium queenslandicum / Chrysosporium tropicum / Chrysosporium zonatum
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホネタケ目/Onygenales, ホネタケ科/Onygenaceae, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Journal of Pharma & Bio Sciences, アナモルフ菌/anamorphic fungi, インド/India, ウッタル・プラデーシュ州/Uttar Pradesh, 分離頻度/isolation frequency, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 好ケラチン菌/kerationophillic fungus, 宿主選好性/host selectivity, 底泥/sediment, 新種記載/new species, 水生菌/aquatic fungi, 釣菌法/baiting method
新種Paracoccidioides lutzii：生物学的および臨床的意義
原題: Paracoccidioides lutzii sp. nov.: biological and clinical implications（Medical Mycology, 2014）
従来Paracoccidioides brasiliensisの隠蔽種として”Pb01-like”と呼ばれていた系統を、P. lutziiとして新種記載した。
本種はP. brasiliensisよりも分生子が細長いことで特徴づけられ、分子系統解析、RAPD解析、ゲノムサイズ、トランスポゾンの有無などでも区別された。
地理的分布や地域ごとの病原性の違いなどから、P. brasiliensisではなくP. lutziiのみがパラコクシジオイデス症を引き起こすという仮説を提唱した。
報告種: Paracoccidioides lutzii★
比較種: Paracoccidioides brasiliensis
分類群: アジェロマイセス科/Ajellomycetaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホネタケ目/Onygenales, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, GCPSR, Medical Mycology, RAPD解析/RAPD analysis, エクアドル/Ecuador, グアヤス県/Guayas, ゲノムサイズ/genome size, ゴイアス州/Goias, スライド培養法/slide culture method, トランスポゾン/transposon, パラコクシジオイデス症/paracoccidioidemycosis, ヒト病原菌/human pathogen, ブラジル/Brazil, マットグロッソ・ド・スル州/Mato Grosso do Sul, マットグロッソ州/Mato Grosso, ロンドニア州/Rondonia, 二型性/dimorphism, 仮説提唱/hypothesis proposed, 全ゲノム解析/whole genome analysis, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分岐年代推定/divergence time estimation, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 日和見感染症/opportunistic infection, 病原真菌/pathogenic fungi, 種分化/speciation, 統計解析/statistical analysis, 臨床検体/clinical specimens, 血清診断法/serum diagnostic method, 遺伝子発現/gene expression, 酵母/yeast, 隠蔽種/cryptic species