Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
東アジアにおいて産業的に重要な黒色のコウジカビ属菌、Aspergillus luchuensis
原題: Aspergillus luchuensis, an Industrially Important Black Aspergillus in East Asia（PLOS ONE, 2013）
泡盛、焼酎、マッコリなどの醸造に用いられ、韓国の味噌（メジュ）や麹（ヌルク）、中国のプーアル茶などからも頻繁に分離されるコウジカビ属菌（黒麹・白麹）には、これまで複数の学名が与えられてきた。
本研究では菌株の形態比較や分子系統解析、RAPDなどを行った結果、3種が同種であり、近縁のAspergillus nigerおよびA. tubingensisとは分子で明瞭に区別されることが明らかになった。
3種の学名のうち、乾環が1901年に記載したAspergillus luchuensisが優先権を持ち、本論文ではこの学名で再度記載を行うとともに、本種がマイコトキシンを産生しないことを確かめた。
報告種: Aspergillus luchuensis / Aspergillus welwitschiae
比較種: Aspergillus niger / Aspergillus tubingensis
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, PLOS ONE, RAPD解析/RAPD analysis, アナモルフ菌/anamorphic fungi, シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, マイコトキシン/mycotoxin, 二次代謝産物/secondary metabolite, 優先権/priority, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 産業的に重要な菌/industrially important fungus, 発酵/fermentation, 醸造/brewing, 麹菌/kouji
タイでタケの上に発生した新属新種Gelatinomyces siamensis
原題: Gelatinomyces siamensis gen. sp. nov. (Ascomycota, Leotiomycetes, incertae sedis) on bamboo in Thailand（IMA fungus, 2013）
タイ・ペッチャブーン県において、タケの稈および枝に発生する新属新種Gelatinomyces siamensisを記載した。
分子系統解析の結果、本種はズキンタケ綱に含まれ、Collophora rubraに最も近縁だったが、はっきりと異なった系統をなし、形態や生態にも違いが見られた。
本種はCollophora属の有性世代にあたる可能性も考えられたが、形態および分子の比較により否定できると考えられた。
報告種: Gelatinomyces siamensis★
比較種: Collophora rubra / Collophora spp.
分類群: Leotiales, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ティンパニス科/Tympanidaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, IMA fungus, イネ科/Poaceae, タイ/Thailand, タケ生息菌/bambusicolous fungus, ペッチャブーン県/Phetchabun, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 色素産生/pigment production, 走査型電子顕微鏡/SEM
南西オーストラリア植物区系で発見されたヤマモガシ科に対する新属新種の病原菌Luteocirrhus shearii
原題: Luteocirrhus shearii gen. sp. nov. (Diaporthales, Cryphonectriaceae) pathogenic to Proteaceae in the south Western Australian Floristic Region（IMA fungus, 2013）
南西オーストラリア植物区系 (SWAFR) で複数のヤマモガシ科樹木に潰瘍病を起こす菌はZythiostroma属の一種とされていたが、本論文でLuteocirrhus sheariiとして新種記載した。
Luteocirrhus属は橙色の色素を欠くことや分生子果の形態などからクリフォネクトリア科の他属と分けられ、新属として提唱された。
バンクシア属樹木に対して本種の接種試験を行い、本種がコッホの原則を満たすことを確認した。
報告種: Luteocirrhus shearii★
比較種: Aurapex spp. / Aurifilum marmelostoma / Celoporthe spp. / Chrysoporthe spp. / Cryphonectria radicalis / Latrunclla aurorae
分類群: クリフォネクトリア科/Cryphonectriaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ディアポルテ目/Diaporthales, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Banksia属, IMA fungus, Lambertia属, アナモルフ菌/anamorphic fungi, オーストラリア/Australia, コッホの原則/Koch_s postulation, ヤマモガシ科/Proteaceae, リニアグロース/linear growth, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 採集地マッピング/collection site mapping, 接種試験/inoculation test, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 温度適性/temperature aptitude, 潰瘍病/canker, 生長速度/growth rate, 西オーストラリア州/Western Australia
アフリカで発見された「Myrtle rust」の病原菌、Puccinia psidii
原題: The Myrtle rust pathogen, Puccinia psidii, discovered in Africa（IMA fungus, 2013）
2013年に南アフリカでギンバイカに「Myrtle rust」を起こす菌としてPuccinia psidiiが検出された。
本種はさび菌でありながら宿主特異性が比較的弱く、ユーカリやグアバなど様々なフトモモ科樹木の病原菌として世界的に問題となっている。
本種はブラジルを原産地とし、中米、カリブ海地域、米国、ハワイ、オーストラリア、アジアなどに近年急速に広まっているが、アフリカからの報告は本研究が初となった。
報告種: Puccinia psidii■
比較種: Uredo rangelii
分類群: Uredinineae, サビキン亜門/Pucciniomycotina, サビキン目/Pucciniales, サビキン綱/Pucciniomycetes, プクシニア科/Pucciniaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, IMA fungus, Myrtle rust, さび菌/rust fungi, アフリカ新産種/Africa_new record, クワズール・ナタール州/KwaZulu-Natal, フトモモ科/Myrtaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 南アフリカ/South Africa, 南アフリカ新産種/South Africa_new record, 多犯性菌/plurivorous fungus, 寄生菌/parasite, 新産種報告/new record, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM
日本のきのこ農園から分離された新種Trichoderma mienum
原題: Trichoderma mienum sp. nov., isolated from mushroom farms in Japan（Antonie van Leeuwenhoek, 2012）
日本でシイタケおよびヒラタケ栽培の榾木からHypocrea/Trichoderma属菌を167菌株分離し、予備的な調査を行った。
そのうち5菌株の塩基配列はデータベース中に一致するものがなく、これらの菌株が未記載種である可能性が考えられた。
5菌株について3遺伝子を用いた分子系統解析と近縁種との形態比較を行い、その結果に基づいて新種Trichoderma mienumを記載した。
報告種: Trichoderma mienum★
比較種: Hypocrea ceramica / Hypocrea fomiticola / Hypocrea hunua / Hypocrea moravica / Hypocrea semiorbis / Hypocrea substipitata / Trichoderma fertile / Trichoderma oblongisporum
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Antonie van Leeuwenhoek, きのこ農園/mushroom farm, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 榾木/bed log, 温度適性/temperature aptitude
フィンランドおよびロシアにおいて針葉樹に穿孔するキクイムシに関係するGrosmannia/Leptographium属菌および新種Leptographium taigense
原題: Grosmannia and Leptographium spp. associated with conifer-infesting bark beetles in Finland and Russia, including Leptographium taigense sp. nov.（Antonie van Leeuwenhoek, 2012）
フィンランド東部とロシアにおいて、ドイツトウヒおよびヨーロッパアカマツを対象とし、12種の樹皮下キクイムシおよびその坑道からGrosmanniaおよびLeptographium属菌を分離した。
形態および分子を基に、分離された菌の同定を行ったところ、主に6つの種複合体に含まれた。
分子系統解析の結果に基づいていくつかの種および種複合体を再定義し、新種Leptographium taigenseを記載するとともに、2種について新組み合わせを提唱した。
報告種: Grosmannia olivaceapini▲ / Leptographium pinicola▲ / Leptographium taigense★
比較種: Grosmannia galeiformis / Hyalorhinocladiella spp. / Leptographium lundbergii
分類群: オフィオストマ目/Ophiostomatales, オフィオストマ科/Ophiostomataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Antonie van Leeuwenhoek, Hylurgops属, Ips属, Pityogenes属, アナモルフ菌/anamorphic fungi, オフィオストマトイド菌類/ophiostomatoid fungi, キクイムシ科/Scolytidae, シンネマ形成菌/synnematous fungus, トウヒ属/Picea, フィンランド/Finland, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, リニアグロース/linear growth, レニングラード州/Leningrad, ロシア/Russia, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 坑道/gallery, 培養性状/colony characteristics, 宿主範囲/host range, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 樹皮下キクイムシ/bark beetle, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 複合種/species complex, 走査型電子顕微鏡/SEM, 青変菌/blue stain fungi
子嚢菌門タフリナ亜門の新種Saitoella coloradoensis
原題: Saitoella coloradoensis sp. nov., a new species of the Ascomycota, subphylum Taphrinomycotina（Antonie van Leeuwenhoek, 2012）
米国コロラド州のエンゲルマントウヒから得られた虫糞から分離された菌を、新種Saitoella coloradoensisとして記載した。
D1/D2領域とEF-1α遺伝子を用いた分子系統解析では、本種はSaitoella complicataと明瞭に区別され、資化試験の結果も異なっていた。
両種はともに球形で厚壁の胞子を形成し、この胞子の形態はProtomyces属やTaphrina属のそれと類似していた。
報告種: Saitoella coloradoensis★
比較種: Protomyces spp. / Saitoella complicata / Taphrina spp.
分類群: タフリナ亜綱/Taphrinomycetidae, タフリナ目/Taphrinales, タフリナ綱/Taphrinomycetes, タフリナ菌亜門/Taphrinomycotina, プロトマイセス科/Protomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Antonie van Leeuwenhoek, コロラド州/Colorado, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 米国/USA, 虫糞/insect frass, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast
インドのバンダフガー国立公園周辺から分離されたホネタケ目の新属Auxarthronopsis
原題: Auxarthronopsis, a new genus of Onygenales isolated from the vicinity of Bandhavgarh National Park, India（Journal of Research in Medical Sciences, 2013）
インド中部で土壌からヘアーベイト法で分離されたホネタケ目の菌を、Auxarthronopsis bandhavgarhensisとして新種記載した。
本種を含む新属Auxarthronopsis属は、子嚢果の壁の菌糸に拳状に膨らむ隔壁を持つ特徴があり、類似のAuxarthron属とは分子系統や隔壁の数などで区別された。
本属は系統的にはAmauroascus、Nannizziopsis、Renispora属菌などに近縁だった。
報告種: Auxarthronopsis bandhavgarhensis★
比較種: Amauroascus purpureus / Amauroascus volatilis-patellis / Auxarthron spp. / Nannizziopsis albicans / Neogymnomyces demondreunii / Neogymnomyces virgineus / Pectinotrichum llananse / Renispora flavissima
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホネタケ目/Onygenales, ホネタケ科/Onygenaceae, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Journal of Research in Medical Sciences, インド/India, ヘアーベイト法/hair bait method, マディヤ・プラデーシュ州/Madhya Pradesh, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 好ケラチン菌/kerationophillic fungus, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 釣菌法/baiting method
屋内の空中から分離されたコウジカビ属Nigri節の2新種
原題: Two novel species of Aspergillus section Nigri from indoor air（IMA fungus, 2012）
主に屋内で空中から分離されたコウジカビ属Nigri節の56菌株について、4遺伝子を用いて分子系統解析を行った。
分子系統解析の結果を基に、新種Aspergillus floridensisおよびAspergillus trinidadensisを記載した。
2新種はいずれもマイコトキシンの一種、オクラトキシンAの産生能を欠いていた。
報告種: Aspergillus brunneoviolaceus / Aspergillus floridensis★ / Aspergillus trinidadensis★ / Aspergillus uvarum
比較種: Aspergillus aculeatinus / Aspergillus aculeatius
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, GCPSR, IMA fungus, オクラトキシン/ochratoxin, シノニム/synonym, トリニダード・トバゴ/Trinidad and Tobago, フロリダ州/Florida, マイコトキシン/mycotoxin, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 室内環境/indoor condition, 新種記載/new species, 空中真菌/air-borne fungus, 米国/USA, 質量分析法/mass spectrometry, 高速液体クロマトグラフィー/high performance liquid chromatography
Geomyces属および近縁属の系統の評価において、北米東部のコウモリの越冬場所からPseudogymnoascus destructans（新組み合わせ）の近縁種は見出されなかった
原題: Phylogenetic evaluation of Geomyces and allies reveals no close relatives of Pseudogymnoascus destructans, comb. nov., in bat hibernacula of eastern North America（Fungal Biology, 2013）
北米東部でコウモリに大量死を引き起こしてきたホワイトノーズ・シンドローム（WNS）の原因とされる菌は、従来Geomyces destructansと呼ばれてきた。
5遺伝子を用いた分子系統解析の結果、Geomyces destructansはGeomycesの基準種と系統が異なっていたことから、本論文でPseudogymnoascus属に移した。
北米東部のコウモリ越冬場所からPseudogymnoascus destructansの近縁種が見出されないことに基づき、本種が侵略的外来種であるという仮説を提唱した。
報告種: Pseudeurotium hygrophilum▲ / Pseudogymnoascus carnis▲ / Pseudogymnoascus destructans▲ / Pseudogymnoascus pannorum▲
分類群: シューデウロティウム科/Pseudeurotiaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, テレボルスキン目/Thelebolales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 1F=1N, 2013年の論文/published in 2013, Fungal Biology, ニューヨーク州/New York, 仮説提唱/hypothesis proposed, 侵略的外来種/invasive alien species, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 命名法/nomenclature, 土壌菌/soil fungi, 新組み合わせ提唱/new combination, 獣医真菌学/veterinary mycology, 病原真菌/pathogenic fungi, 白い鼻症候群/white nose syndrome, 移入種/alien species, 米国/USA, 越冬場所/wintering location
キチャワンタケ科に新属を追加
原題: The Caloscyphaceae (Pezizomycetes, Ascomycota), with a new genus（Mycological Progress, 2012）
キチャワンタケ科には従来、1属1種（キチャワンタケ）のみが含まれると考えられていたが、ユーカリ属樹木と関係を持つCaloscypha incarnataが見過ごされてきた。
本論文では、この種を形態および分子系統に基づいて再検討し、新属Kallistoskyphaに含めた。
また、分子系統解析の結果、キチャワンタケは北米西部と北米東部で系統が異なっており、それぞれの系統が強く支持された。
報告種: Kallistoskypha incarnata▲
比較種: Caloscypha fulgens
分類群: Kallistoskyphaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, フトモモ科/Myrtaceae, ユーカリ属/Eucalyptus, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 米国/USA
旱魃と酸との出会い：クロイボタケ綱クレードに属する極限環境耐性菌類の3新属
原題: Drought meets acid: three new genera in a dothidealean clade of extremotolerant fungi（Studies in Mycology, 2008）
南極・ヴィクトリアランドの岩石や地衣類から分離された黒色真菌から2種を新種記載した（Recurvomyces mirabilisおよびElasticomyces elasticus）。
分子系統解析の結果、両種はクロイボタケ綱に属し、乾燥地域の岩石に生息する他の菌類や、好塩菌や好酸性菌など、ストレス耐性を持つ菌と近縁であった。
また、Bakerらが2004年に提唱したが無効となっていたAcidomyces属を有効に記載し、Scytalidium acidophilumを本属に移した。
報告種: Acidomyces acidophilus▲ / Elasticomyces elasticus★ / Recurvomyces mirabilis★
分類群: カプノディウム目/Capnodiales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2008年の論文/published in 2008, Studies in Mycology, 乾燥耐性/xelotolerance, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 南極/Antarctic, 命名法/nomenclature, 好塩菌/halophilic fungi, 好酸性菌/acidophilic fungus, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 極限環境/extreme environment, 無効学名の再記載/redescription of invalid name, 耐塩性菌/salt-tolerant fungus
ブラジルのTithonia diversifolia（ニトベギク）の葉の斑点と関係する新種Passalora stromatica
原題: Passalora stromatica sp. nov. associated with leaf spots of Tithonia diversifolia in Brazil（IMA fungus, 2013）
ブラジル・リオデジャネイロ州でTithonia diversifolia（ニトベギク）の葉に斑点を生じるサーコスポロイドの病原菌Passalora stromaticaを新種記載した。
ニトベギクは侵略的外来種として原産地の中米以外にも広がっているが、本種に感染する病原菌はあまり知られてこなかった。
ブラジルでは、本種の存在がニトベギクの広がりを抑制する方向に働いている可能性が考えられるとして、生物農薬としての本種の利用が期待できるとした。
報告種: Passalora stromatica★
比較種: Passalora tithoniae
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, マイコスフェレラ科/Mycosphaerellaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, IMA fungus, キク科/Asteraceae, サーコスポロイド/cercosporoid fungi, ニトベギク属/Tithonia, ブラジル/Brazil, リオデジャネイロ州/Rio de Janeiro, 侵略的外来種/invasive alien species, 凍結切片/frozen section, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 生物農薬/biopesticide, 生長速度/growth rate, 移入種/alien species, 配列決定/sequencing
中国南部産の新種Phellinus castanopsidisおよびリボソームDNAの塩基配列に基づく予備的な系統解析
原題: Phellinus castanopsidis sp. nov.(Hymenochaetaceae) from southern China, with preliminary phylogeny based on rDNA sequences（Mycological Progress, 2012）
中国広東省の亜熱帯地域でシイ属の生木に発生したPhellinus castanopsidisを新種記載した。
本種はFomitiporia ellipsoideaおよびキコブタケ属の計4種と形態の多くが共通したが、形態形質や分子系統により区別可能であった。
Fomitiporia ellipsoideaをキコブタケ属に移し、新組み合わせPhellinus ellipsoideusを提唱した。
報告種: Phellinus castanopsidis★ / Phellinus ellipsoideus▲
比較種: Phellinus caribaeo-quercicolus / Phellinus castanopsidis / Phellinus ellipsoideus / Phellinus gabonensis
分類群: タバコウロコタケ目/Hymenochaetales, タバコウロコタケ科/Hymenochaetaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, シイ属/Castanopsis, ブナ科/Fagaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 広東省/Guangdong, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 腐生菌/saprobe
形態形質および分子データに基づき記載された中国南部産の新種Antrodia tropica
原題: Antrodia tropica sp. nov. from southern China inferred from morphological characters and molecular data（Mycological Progress, 2012）
中国海南島でEngelhardtia hainanensisの腐朽材から発見された菌を、形態および分子に基づいて新種Antrodia tropicaとして記載した。
本種はAntrodia属菌としては46番目、中国産のAntrodia属菌としては23番目の種となった。
本論文の分子系統解析では、先行研究と同様にAntrodia属菌の褐色腐朽菌との類縁性が示唆されるとともに、Fibroporia属菌が単系統群を形成した。
報告種: Antrodia tropica★
比較種: Antrodia aurantia / Antrodia gossypium / Antrodia huangshanensis / Antrodia infirma / Antrodia oleracea / Antrodia radiculosa / Antrodia ramentacea / Antrodia sandaliae / Antrodia sordida / Antrodia vaillantii
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, ツガサルノコシカケ科/Fomitopsidaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Engelhardtia属, Mycological Progress, クルミ科/Juglandaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 海南省/Hainan, 熱帯域/tropics, 腐生菌/saprobe, 褐色腐朽菌/brown rot fungi
貴州省の土壌から分離された新種のTrichoderma属菌、T. guizhouense
原題: A novel Trichoderma species isolated from soil in Guizhou, T. guizhouense（Mycological Progress, 2013）
中国・貴州省の重金属に汚染された土壌から、形態および分子に基づき新種Trichoderma guizhouenseを記載した。
本種は、近縁種とはフィアライドや分生子のサイズなどに違いが見られた。
報告種: Trichoderma guizhouense★
比較種: Hypocrea brunneoviridis / Hypocrea parepimyces / Hypocrea tawa / Trichoderma compactum / Trichoderma harzianum
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 貴州省/Guizhou, 重金属汚染/heavy-metal contamination
パキスタン、ラホール産の新種Lepiota vellingana
原題: Lepiota vellingana sp. nov. (Basidiomycota, Agaricales) a new species from Lahore, Pakistan（Mycological Progress, 2013）
パキスタン、ラホールからキツネノカラカサ属のLepiota vellinganaを新種記載した。
ITS領域に基づく分子系統解析の結果、本種は楕円形の胞子、傘表皮が糸状被で「短い要素」を欠くことなどで特徴づけられる「クレードI」に位置した。
「クレードI」は本属Ovisporae節の種からなり、本種の形態形質もOvisporae節の概念に合致した。
報告種: Lepiota vellingana★
比較種: Lepiota farinolens / Lepiota himalayensis
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, パキスタン/Pakistan, パンジャーブ州（パキスタン）/Punjab (Pakistan), 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 半乾燥地域/semi-arid area, 新種記載/new species
中国のカラカサタケ属菌
原題: The genus Macrolepiota (Agaricaceae, Basidiomycota) in China（Fungal Diversity, 2010）
115点の標本を基に、中国産のカラカサタケ属菌の形態および分子系統を調査した。
中国産カラカサタケ属菌として、本論文で新種記載したMacrolepiota detersaおよびMacrolepiota orientiexcoriataを含む6種を認めた。
旧Volvolepiota属に相当する、つばを持ちクランプを欠くグループに対して、分子系統解析の結果を基に、新節Volvataeを提唱した。
報告種: Macrolepiota detersa★ / Macrolepiota dolichaula / Macrolepiota mastoidea / Macrolepiota orientiexcoriata★
比較種: Chlorophyllum neomastoideum / Macrolepiota detersa / Macrolepiota dolichaula / Macrolepiota excoriata / Macrolepiota mastoidea / Macrolepiota permixta / Macrolepiota phaeodisca / Macrolepiota procera / Macrolepiota prominens / Macrolepiota rachodes
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, Fungal Diversity, チベット自治区/Tibet, モノグラフ/monograph, 中国/China, 内モンゴル自治区/Inner Mongolia, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 四川省/Sichuan, 安徽省/Anhui, 広東省/Guangdong, 新種記載/new species, 新節提唱/new section, 森林/forest, 検索表/identification key, 海南省/Hainan, 疑問種/doubtful species, 腐生菌/saprobe, 草地/grassland, 誤同定/misidentification, 雲南省/Yunnan
新属DichocladosporiumのDichocladosporium chlorocephalumによって引き起こされるボタン属の「Cladosporium leaf-blotch」および「stem rot」
原題: Cladosporium leaf-blotch and stem rot of Paeonia spp. caused by Dichocladosporium chlorocephalum gen. nov.（Studies in Mycology, 2007）
Cladosporium chlorocephalumはボタン属植物の葉に斑点を生じる病原菌で、分生子柄に二型性を持ち、それぞれの型の発生部位や発生時期が異なる。
本種の形態、分生子形成、分子系統について検討を行い、二つの型が同種であることを確かめた。
また、分子系統解析では本種は狭義のCladosporium属とは異なるクレードに位置し、形態的にも既存の属との相違点が見られたことから、本種を新属Dichocladosporiumに含めた。
報告種: Dichocladosporium chlorocephalum▲
比較種: Fusicladium spp. / Metulocladosporiella musae / Parapericoniella asterinae
分類群: カプノディウム目/Capnodiales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, ダヴィディエラ科/Davidiellaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Studies in Mycology, ボタン属/Paeonia, ボタン科/Paeoniaceae, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 植物病原菌/plant pathogenic fungi
チュニジアの病院で分離された病原性酵母の新種、Candida tunisiensisの特徴づけ
原題: Characterization of a New Clinical Yeast Species, Candida tunisiensis sp. nov., Isolated from a Strain Collection from Tunisian Hospitals（Journal of Clinical Microbiology, 2013）
チュニジアの病院で尋常性天疱瘡に罹患した50歳の男性の口腔から分離された酵母を、新種Candida tunisiensisとして記載した。
本種の同定にあたっては、MALDI-TOF MSや発芽管の形態観察、CHROMagar（色素培地）、ID 32（培養同定キット）、分子系統解析などの手法を用いた。
本種について、フローサイトメトリーによるゲノムサイズの推定、PFGEによる染色体数の推定を行い、各種抗真菌剤への感受性を調べた。
報告種: Candida tunisiensis★
比較種: Candida albicans / Dipodascus aggregatus / Galactomyces geotrichum / Sporopachydermia lactativora / Wickerhamiella domercqiae / Yarrowia lipolytica
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, EUCAST, Journal of Clinical Microbiology, MALDI-TOF MS, MIC, PFGE解析/PFGE analysis, カンジダ症/candidasis, ゲノムサイズ/genome size, チュニジア/Tunisia, チュニス県/Tunis, ヒト病原菌/human pathogen, フローサイトメトリー/flow cytometry, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 口腔カンジダ症/oral thrush, 培養同定キット/culture identification kit, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 新種記載/new species, 染色体数/chromosome number, 温度適性/temperature aptitude, 病原真菌/pathogenic fungi, 臨床検体/clinical specimens, 資化試験/assimilation test, 質量分析法/mass spectrometry, 酵母/yeast
スペイン南部、アンダルシア地方の高山から発見されたアーバスキュラー菌根菌の新種Septoglomus altomontanum
原題: Septoglomus altomontanum, a new arbuscular mycorrhizal fungus from mountainous and alpine areas in andalucia southern spain（IMA fungus, 2013）
スペイン南部、アンダルシア地方のシエラネバダ山地で発見されたアーバスキュラー菌根菌を、Septoglomus altomontanumとして新種記載した。
本種を含むSeptoglomus属全種の検索表を掲載した。
本種は他のSeptoglomus属菌とは、”subtending hyphae”の色や形をはじめとする形態や分子系統で明瞭に区別された。
報告種: Septoglomus altomontanum★
比較種: Septoglomus africanum / Septoglomus constrictum / Septoglomus deserticola / Septoglomus furcatum / Septoglomus fuscum / Septoglomus titan / Septoglomus xanthium
分類群: Mucoromyceta, グロムス目/Glomerales, グロムス科/Glomeraceae, グロムス綱/Glomeromycetes, グロムス菌亜門/Glomeromycotina, グロムス菌門/Glomeromycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, IMA fungus, アンダルシア州/Andalusia, アーバスキュラー菌根菌/arbuscular mycorrhizal fungi, キク科/Asteraceae, クローニング/cloning, シエラネバダ山脈/Sierra Nevada, スイセン属/Narcissus, スペイン/Spain, タヌキモ科/Lentibulariaceae, トラップカルチャー/trap culture, ナナカマド属/Sorbus, ハゴロモグサ属/Alchemilla, ハナヤスリ属/Ophioglossum, ハナヤスリ科/Ophioglossaceae, バラ科/Rosaceae, ヒガンバナ科/Amaryllidaceae, ムシトリスミレ属/Pinguicula, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, ヨモギ属/Artemisia, リンドウ属/Gentiana, リンドウ科/Gentianaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌pH/soil pH, 土壌菌/soil fungi, 山地/mountains, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 検索表/identification key, 草地/grassland, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 高山帯/alpine region
ギアナ高地のアワタケ属新種およびその菌根共生と子実体発生に関する記録
原題: New species of Xerocomus (Boletales) from the Guiana Shield, with notes on their mycorrhizal status and fruiting occurrence（Mycologia, 2013）
ガイアナからXerocomus cyaneibrunnescens、Xerocomus potaroensis、Xerocomus parvogracilisの3種を新種記載した。
それぞれの種について、肉眼的形質、顕微鏡的形質、生息環境のデータ、塩基配列のデータを掲載した。
3新種については複数年にわたる子実体発生のプロット調査が行われており、いずれもマメ科植物と共生関係にある外生菌根菌であることが確かめられている。
報告種: Xerocomus cyaneibrunnescens★ / Xerocomus parvogracilis★ / Xerocomus potaroensis★
比較種: Boletus havilandii / Boletus sepiola / Xerocomus amazonicus var. amazonicus / Xerocomus belizensis / Xerocomus dispersus var. dispersus / Xerocomus ferruginosporus / Xerocomus globuliger / Xerocomus hemixanthus / Xerocomus latisporus / Xerocomus lucescens / Xerocomus microcarpioides / Xerocomus pseudoboletinus / Xerocomus pseudochrysenteron / Xerocomus raphanolens / Xerocomus scrobiculatus / Xerocomus spadiceus var. gracilis / Xerocomus spinulosus / Xerocomus subspinulosus / Xerocomus sulcatipes
分類群: イグチ目/Boletales, イグチ科/Boletaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycologia, ガイアナ/Guyana, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 子実体発生調査/survey of fruiting bodies, 新種記載/new species, 菌根/mycorrhiza, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM
退化的な子座を持つ新種のアリの病原菌、Ophiocordyceps pulvinata（コブガタアリタケ）
原題: Ophiocordyceps pulvinata sp. nov., a pathogen of ants with a reduced stroma（Mycoscience, 2011）
日本の福島県から、ムネアカオオアリに発生する冬虫夏草、コブガタアリタケ（Ophiocordyceps pulvinata）を新種記載した。
本種は子座に柄を持たないこと、子嚢殻が表在性であることなどから、従来の文献にはTorrubiella sp.として掲載されてきた。
しかし、子嚢や子嚢胞子の形態、分子系統解析の結果は、本種がOphiocordyceps属に含まれることを支持した。
報告種: Ophiocordyceps pulvinata★
比較種: Ophiocordyceps cucumispora / Ophiocordyceps formicivora / Ophiocordyceps kniphofiodes / Ophiocordyceps unilateralis var. clavata / Ophiocordyceps unilateralis / Torrubiella formicarum
分類群: オフィオコルディセプス科/Ophiocordycipitaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycoscience, アリ科/Formicidae, オオアリ属/Camponotus, 冬虫夏草/entomoparasitic mushrooms, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 日本/Japan, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 福島県/Fukushima