Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
中国において植物の葉から分離された三輪生の新種、Penicillium kongii
原題: Penicillium kongii, a new terverticillate species isolated from plant leaves in China（Mycologia, 2013）
中国において植物の葉面から分離された菌を検討し、Penicillium kongiiとして新種記載した。
本種は生長が制限され、筆状体が三輪生、分生子が卵状～楕円形で平滑～微細な粗面、赤色の可溶性色素を有することなどで特徴づけられた。
本種はBrevicompacta節に含められ、分子系統解析で独自の系統を形成した。
報告種: Penicillium kongii★
比較種: Penicillium bialowiezense / Penicillium brevicompactum / Penicillium neocrassum
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Cotoneaster属, Mycologia, アナモルフ菌/anamorphic fungi, クスノキ科/Lauraceae, クロモジ属/Lindera, チベット自治区/Tibet, バラ科/Rosaceae, 中国/China, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 水溶性色素/water-soluble pigment, 湖北省/Hubei, 生長速度/growth rate, 色素産生/pigment production, 葉面菌/leaf surface fungi, 陝西省/Shaanxi
コスタリカ産Ganoderma属菌の系統分類
原題: Taxonomy and phylogeny of the genus Ganoderma (Polyporales, Basidiomycota) in Costa Rica（MycoKeys, 2023）
コスタリカ産Ganoderma属菌の調査を実施し、Ganoderma amazonenseなど7種を認めた。
本報告は中米における本属菌の形態学的・系統学的データを統合した初の研究となり、北米産と南米産のそれぞれ1種の分布が中米まで広がっていることを初めて明らかにした。
新熱帯に分布する本属菌の検索表を掲載した。
報告種: Ganoderma amazonense / Ganoderma applanatum / Ganoderma australe / Ganoderma curtisii■ / Ganoderma ecuadorense■ / Ganoderma oerstedii / Ganoderma parvulum
比較種: Ganoderma applanatum / Ganoderma australe / Ganoderma chocoense / Ganoderma martinicense / Ganoderma mexicanum / Ganoderma multiplicatum / Ganoderma perzonatum
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, マンネンタケ科/Ganodermataceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, DNA抽出失敗/DNA extraction failure, MycoKeys, アラフエラ州/Alajuela, エレディア州/Heredia, カルタゴ州/Cartago, グアナカステ州/Guanacaste, コスタリカ/Costa Rica, コスタリカ新産種/Costa Rica_new record, コナラ属/Quercus, サンホセ州/San Jose, タイプスタディ/type study, ブナ科/Fagaceae, プンタレナス州/Puntarenas, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, モクマオウ属/Casuarina, モクマオウ科/Casuarinaceae, リモン州/Limón, 中米新産種/Central America_new record, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 収蔵標本/stored specimen, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 垂直分布/vertical distribution, 培養性状/colony characteristics, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 検索表/identification key, 標本入手不可/specimen not available, 熱帯域/tropics, 生物地理学/biogeography, 疑問種/doubtful species, 種の境界/species delimitation, 種内変異/intraspecific variation, 種概念/species concept
急性骨髄性白血病患者における侵襲性皮膚Penicillium cluniae感染の初報告例：症例報告および文献レビュー
原題: First Reported Case of Invasive Cutaneous Penicillium cluniae Infection in a Patient With Acute Myelogenous Leukemia: A Case Report and Literature Review（Open Forum Infectious Diseases, 2021）
急性骨髄性白血病の52歳男性の右脛に発症した血管侵襲性皮膚真菌感染症を報告した。
形態形質および分子同定の結果から病原菌をPenicillium cluniaeと同定したが、本種による侵襲性皮膚感染症の報告は初となった。
抗真菌薬感受性試験の結果を踏まえてポサコナゾール単剤療法を実施し、6週間の治療後ほぼ完全に回復した。
報告種: Penicillium cluniae
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2021年の論文/published in 2021, Open Forum Infectious Diseases, PAS染色/PAS staining, アゾール系抗真菌薬/azole antifungals, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ゴモリ染色/Gomori staining, スライド培養法/slide culture method, ヒト病原菌/human pathogen, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 微量液体希釈法/broth microdilution method, 抗真菌薬/antifungal drug, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 新興感染症/emerging infectious disease, 生体組織診断/biopsy, 病原真菌/pathogenic fungi, 症例報告/case report, 皮膚真菌症/dermatomycosis, 皮膚糸状菌/dermatophyte, 組織染色/histological stain, 総説・解説記事/review and overview article, 臨床検体/clinical specimens
Phytophthora属の広範なサンプリングを含む多遺伝子解析によりべと病菌の単系統性の根拠が得られた
原題: Multigene analyses with a broad sampling in Phytophthora and related genera provide evidence for the monophyly of downy mildews（Mycological Progress, 2023）
72種のPhytophthora属卵菌と全ての既知のべと病菌を含む多遺伝子解析を実施した。
その結果、全てのべと病菌が単系統群であり、絶対生体栄養の獲得が単一のイベントであったことが示された。
また、新組み合わせKawakamia cyperi-bulbosiを提唱した。
報告種: Kawakamia cyperi / Kawakamia cyperi-bulbosi▲
分類群: クロミスタ/Chromista, フハイカビ目/Pythiales, フハイカビ科/Pythiaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Mycological Progress, べと病/downy mildew, アイダホ州/Idaho, カヤツリグサ属/Cyperus, カヤツリグサ科/Cyperaceae, 共有派生形質/synapomorphy, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 卵菌類/Oomycetes, 吸器/haustorium, 多犯性菌/plurivorous fungus, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 新組み合わせ提唱/new combination, 栄養摂取様式/nutrition style, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 米国/USA, 絶対寄生菌/obligate parasite, 難培養性菌/uncultured fungi
リター分解性Ciliochorella属菌2新種の分類および進化史
原題: Taxonomy and evolution history of two new litter-decomposing Ciliochorella (Amphisphaeriales, Sporocadaceae)（MycoKeys, 2023）
中国においてリターに発生した2種の菌を検討し、Ciliochorella chinensisおよびC. savannicaとして新種記載した。
分岐年代推定により、本属菌が新生代のユーラシア大陸に起源を持つことを示した。
両種は中国で初めて報告された本属菌であり、いずれも酵素活性試験でセルラーゼやラッカーゼなどの酵素を産生した。
報告種: Ciliochorella chinensis★ / Ciliochorella savannica★
比較種: Ciliochorella phanericola
分類群: アンフィスフェリア目/Amphisphaeriales, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, ペスタロティプシス科/Pestalotiopsidaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, MycoKeys, RASP, アナモルフ菌/anamorphic fungi, サバンナ/savannah, スクリーニング/screening, セルラーゼ/cellulase, セルロース/cellulose, セルロース分解活性/cellulolytic activity, バーベンダム反応/Bavendamm test, ラッカーゼ/laccase, リグニン/lignin, リグニン分解活性/lignin degradation activity, リター菌/litter fungi, 中国/China, 分子時計/molecular clock, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分岐年代推定/divergence time estimation, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 切片/section, 吸光度/absorbance, 地理的分布/geographical distribution, 地理的起源/geographical origin, 培養性状/colony characteristics, 新生代/Cenozoic, 新種記載/new species, 熱帯域/tropics, 生物地理学/biogeography, 白亜紀/Cretaceous, 胞子の発芽/germination of spores, 腐生菌/saprobe, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity, 雲南省/Yunnan
ウメの花から分離されたバイオサーファクタント産生性子嚢菌酵母の新種、Neodothiora pruni
原題: Neodothiora pruni sp. nov., a Biosurfactant-Producing Ascomycetous Yeast Species Isolated from Flower of Prunus mume（Mycobiology, 2023）
韓国においてウメの花から分離された酵母の一種を検討し、Neodothiora pruniとして新種記載した。
本種はバイオサーファクタント産生菌のスクリーニングで見出された株で、新規化合物の産生能が既に知られていた。
本種は同じドチオラ科クレードに含まれる近縁種とは炭素源の資化能などで区別された。
報告種: Neodothiora prune★
比較種: Hormonema macrosporum / Neodothiora populina / Phaeocryptopus nudus / Rhizosphaera macrospora
分類群: クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ目/Dothideales, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ドチオラ科/Dothioraceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Mycobiology, ウレアーゼ試験/urease test, サクラ属/Prunus, スクリーニング/screening, ゼラチン液化試験/gelatin liquefaction test, タイプスタディ/type study, デンプン/starch, バイオサーファクタント/biosurfactant, バラ科/Rosaceae, ビタミン要求性/vitamin requirement, 二型性/dimorphism, 全羅南道/Jeollanam-do, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 希釈平板法/dilution plate method, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 新規化合物/novel compound, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 温度適性/temperature aptitude, 花生息菌/floricolous fungus, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 韓国/South Korea
Stictis farinosa (Propolis farinosa) の学名を保存タイプとともに保存名とする提案
原題: Proposal to conserve the name Stictis farinosa (Propolis farinosa) (Fungi, Ascomycota, Marthamycetales) with a conserved type（Taxon, 2023）
材生息性非地衣菌でPropolis farinosaとしても知られるStictis farinosaの学名を保留名とすることを提案した。
フランスのレ島で採集され、原記載に産地、基質などができるだけ近い新しい標本を本種の保存タイプとした。
本標本の塩基配列がGenBankの他の配列と一致することを示した。
報告種: Stictis farinosa
分類群: オストロパ亜綱/Ostropomycetidae, オストロパ目/Ostropales, スティクティス科/Stictidaceae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Taxon, シャラント＝マリティーム県/Charente-Maritime, タイプスタディ/type study, フランス/France, ヤナギ科/Salicaceae, ヤマナラシ属/Populus, 保存タイプ指定/conserved type designation, 保留名/conserved name, 分子同定/molecular identification, 収蔵標本/stored specimen, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 材生息菌/lignicolous fungus, 標本入手不可/specimen not available, 配列決定/sequencing
ウクライナのPinus cembraを含む原生林に産した材生息性担子菌類
原題: Some wood-inhabiting Basidiomycota from the primeval forests with Pinus cembra in Ukraine（Ukrainian Botanical Journal, 2023）
ウクライナのカルパティア山脈にあるゴルガニ自然保護区のPinus cembraを含む森林で材生息性担子菌類の調査を実施した。
そのうちAphanobasidium subnitensなど5種をウクライナ新産種として報告した。
発見された種の多くが基質の下側に発生するコウヤクタケ類であり、中には指標種として特に注目に値する種もあった。
報告種: Alloexidiopsis calcea / Amylostereum areolatum / Aphanobasidium subnitens■ / Athelia decipiens / Athelia fibulata / Botryobasidium isabellinum / Botryobasidium vagum / Brevicellicium olivascens / Ceraceomyces eludens■ / Climacocystis borealis / Cystostereum murrayi / Dacrymyces stillatus / Exidia nigricans / Fomitopsis pinicola / Hymenochaete fuliginosa / Hyphoderma occidentale■ / Hypochnicium albostramineum■ / Hypochnicium cremicolor■ / Lichenomphalia umbellifera / Mycena maculata / Neoantrodia serialis / Phellinus viticola / Piloderma byssinum / Pycnoporellus fulgens / Stereum sanguinolentum / Trichaptum abietinum / Tubulicrinis glebulosus / Veluticeps abietina / Xenasmatella vaga / Xylodon asper
分類群: Lichenomphalioideae, Pilodermataceae, Pycnoporellaceae, Radulomycetaceae, Xenasmatales, アカキクラゲ目/Dacrymycetales, アカキクラゲ科/Dacrymycetaceae, アカキクラゲ綱/Dacrymycetes, アテリア目/Atheliales, アテリア科/Atheliaceae, アナタケ科/Schizoporaceae, アミロコルティシウム科/Amylocorticiaceae, アンズタケ目/Cantharellales, ウロコタケ科/Stereaceae, キカイガラタケ目/Gloeophyllales, キカイガラタケ科/Gloeophyllaceae, キクラゲ亜綱/Auriculariomycetidae, キクラゲ目/Auriculariales, キクラゲ科/Auriculariaceae, クセナスマ科/Xenasmataceae, クヌギタケ科/Mycenaceae, シストステレウム科/Cystostereaceae, シワタケ科/Meruliaceae, タバコウロコタケ目/Hymenochaetales, タバコウロコタケ科/Hymenochaetaceae, タマチョレイタケ目/Polyporales, タマチョレイタケ科/Polyporaceae, ツガサルノコシカケ科/Fomitopsidaceae, トゥブリクリナ科/Tubulicrinaceae, トレキスポラ目/Trechisporales, ヌメリガサ科/Hygrophoraceae, ハイフォデルマ科/Hyphodermataceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ヒドノドン科/Hydnodontaceae, ヒメキクラゲ科/Exidiaceae, ベニタケ目/Russulales, ボトリオバシディウム科/Botryobasidiaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Ukrainian Botanical Journal, イヴァーノ＝フランキーウシク州/Ivano-Frankivsk, ウクライナ/Ukraine, ウクライナ新産種/Ukraine_new record, カルパティア山脈/Carpathian Mountains, コウヤクタケ類/corticioid fungi, トウヒ属/Picea, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 地衣類/lichen, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 山地/mountains, 担子菌地衣/basidiomycete lichen, 指標種/indicator species, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 生物多様性調査/biodiversity survey, 白色腐朽菌/white-rot fungi, 腐生菌/saprobe, 膠質菌/jelly fungi, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 菌類相調査/mycofloristic survey, 褐色腐朽菌/brown rot fungi
タマチョレイタケ目褐色腐朽菌の世界的多様性、分子系統、および分岐時期
原題: Global diversity, molecular phylogeny and divergence times of the brown‑rot fungi within the Polyporales（Mycosphere, 2023）
タマチョレイタケ目褐色腐朽菌の分子系統解析および分岐年代推定を実施し、本菌群の白色腐朽菌との分化が白亜紀初期に起こったことを示した。
野外調査および文献・データベース調査の結果から本目に14科69種383種の褐色腐朽菌を認めた。
新属新種Eucalyptoporia tasmanicaおよびResupinopostia sublateritiaを含む9新種を記載し、5新組み合わせを提唱した。
報告種: Cystidiopostia simanii▲ / Daedalea submodesta★ / Daedalea vinacea★ / Eucalyptoporia tasmanica★ / Fuscopostia avellanea★ / Fuscopostia persicina★ / Fuscopostia tomentosa★ / Niveoporofomes orientalis★ / Osteina subundosa▲ / Resupinopostia lateritia▲ / Resupinopostia sublateritia★ / Rhodoantrodia subtropica★ / Spongiporus japonica▲ / Spongiporus persicinus▲
比較種: Daedalea allantoidea / Daedalea americana / Daedalea fulvirubida / Daedalea modesta / Daedalea pseudodochmia / Daedalea stereoides / Daedalea stevensonii / Daedalea submodesta / Daedalea vinacea / Fuscopostia avellanea / Fuscopostia duplicata / Fuscopostia fragilis / Fuscopostia leucomallella / Fuscopostia subfragilis / Fuscopostia tomentosa / Niveoporofomes globosporus / Niveoporofomes oboensis / Niveoporofomes spraguei / Niveoporofomes widdringtoniae / Resupinopostia lateritia / Resupinopostia sublateritia / Rhodoantrodia tropica / Rhodoantrodia yunnanensis
分類群: Postiaceae, タマチョレイタケ目/Polyporales, ツガサルノコシカケ科/Fomitopsidaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Mycosphere, TreeBASE, オーストラリア/Australia, カラマツ属/Larix, クアラルンプール/Kuala Lumpur, クイーンズランド州/Queensland, クリ属/Castanea, コウヤクタケ類/corticioid fungi, シイ属/Castanopsis, シンガポール/Singapore, セランゴール州/Selangor, タスマニア州/Tasmania, チベット自治区/Tibet, トウヒ属/Picea, フトモモ科/Myrtaceae, ブナ科/Fagaceae, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, マレーシア/Malaysia, モミ属/Abies, ユーカリ属/Eucalyptus, 中国/China, 分子時計/molecular clock, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分岐年代推定/divergence time estimation, 呈色反応/chemical reaction, 四川省/Sichuan, 地理的分布/geographical distribution, 宿主選好性/host selectivity, 山地/mountains, 広東省/Guangdong, 広西チワン族自治区/Guangxi, 文献調査/literature survey, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 浙江省/Zhejiang, 湖南省/Hunan, 生物多様性調査/biodiversity survey, 白亜紀/Cretaceous, 腐生菌/saprobe, 褐色腐朽菌/brown rot fungi, 雲南省/Yunnan
北海道利尻島で採集された土壌由来の酵母の新種、Dioszegia rishiriensis
原題: Dioszegia rishiriensis sp. nov., a novel yeast species from soil collected on Rishiri Island, Hokkaido, Japan（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2011）
利尻島の土壌から分離された担子菌酵母の一種を検討し、Dioszegia rishiriensisとして新種記載した。
本種の菌株間でD1/D2領域は同一であり、ITS領域は4塩基のみが異なっていた。
本種はD. buhagiariiおよびD. hungaricaに近縁であったが、資化試験などで区別された。
報告種: Dioszegia rishiriensis★
比較種: Dioszegia buhagiarii / Dioszegia hungarica
分類群: シロキクラゲ亜綱/Tremellomycetidae, シロキクラゲ目/Tremellales, シロキクラゲ科/Tremellaceae, シロキクラゲ綱/Tremellomycetes, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, デンプン/starch, ビタミン要求性/vitamin requirement, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北海道/Hokkaido, 呈色反応/chemical reaction, 土壌平板法/soil plate method, 土壌菌/soil fungi, 担子菌酵母/basidiomycetous yeast, 新種記載/new species, 日本/Japan, 最大生長温度/maximum growth temperature, 水辺/waterside, 湿地帯/wetland, 生物多様性調査/biodiversity survey, 発酵試験/fermentation test, 種内変異/intraspecific variation, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast
コロンビア・カリブ海地域の熱帯乾燥林の都市部断片におけるハラタケ類大型菌類の新記録
原題: New records of agaricoid macrofungi (Agaricales, Basidiomycota) in an urban fragment of tropical dry forest from Colombian Caribbean Region（Check List, 2023）
コロンビア、マグダレーナ県からAgrocybe pediades、Macrocybe titans、およびPodaxis pistillarisの3種を記録した。
前2種はコロンビア・カリブ海地域、後1種はマグダレーナ県における新産種となった。
各種の記載文、生態写真、顕微鏡的形質のスケッチを掲載した。
報告種: Agrocybe pediades■ / Macrocybe titans■ / Podaxis pistillaris■
比較種: Agrocybe cubensis / Agrocybe semiobircularis / Macrocybe pachymeres
分類群: Callistosporiaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, モエギタケ科/Strophariaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Check List, GBIF, コロンビア/Columbia, マグダレーナ県/Magdalena, 乾燥地域/dry area, 半乾燥地域/semi-arid area, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 森林/forest, 民族菌類学/ethnomycology, 気温/temperature, 湿度/humidity, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 生物多様性調査/biodiversity survey, 砂漠/desert, 糞生菌/coprophilous fungi, 胞子紋/spore print, 腐生菌/saprobe, 草地/grassland, 複合種/species complex, 都市環境/urban environment, 降水量/precipitation, 食用きのこ/edible mushrooms
土壌から分離された新種の酵母、Pichia galeolataの分類学的解析
原題: Taxogenomic analysis of a novel yeast species isolated from soil, Pichia galeolata sp. nov.（Yeast, 2023）
米国フロリダ州において土壌から分離された出芽酵母の一種を検討し、Pichia galeolataとして新種記載した。
本種のゲノム全体の配列から、炭素と窒素の代謝に重要な遺伝子の存在が示唆された。
本種のゲノムを同属他種と比較し、代謝遺伝子が欠如していることが炭素源および窒素源を資化できないことと関連していることを明らかにした。
報告種: Pichia galeolata★
比較種: Pichia norvegensis
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス科/Saccharomycetaceae, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, Yeast, アーティファクト/artifact, ゲノムサイズ/genome size, フロリダ州/Florida, 二型性/dimorphism, 全ゲノム解析/whole genome analysis, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 温度適性/temperature aptitude, 生物多様性調査/biodiversity survey, 発酵試験/fermentation test, 米国/USA, 資化試験/assimilation test, 遺伝子型/genotype, 酵母/yeast, 集積培養/enrichment culture
台湾産のシンネマ形成性不完全糸状菌の新種、Podosporium elongatum
原題: Podosporium elongatum, a new synnematous hyphomycete from Taiwan（Mycological Research, 1993）
台湾新竹市においてタケの腐朽稈に発生した菌を検討し、Podosporium elongatumとして新種記載した。
SEM写真を含む形態学的検討を行った。
本種は分生子が非常に細長く、隔壁がより多い点で既知の本属菌と異なっていた。
報告種: Podosporium elongatum★
比較種: Podosporium duartei / Podosporium nilgirense / Podosporium rigidum
分類群: 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 1993年の論文/published in 1993, Mycological Research, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イネ科/Poaceae, シンネマ形成菌/synnematous fungus, タケ生息菌/bambusicolous fungus, リター菌/litter fungi, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 台湾/Taiwan, 新種記載/new species, 新竹市/Hsinchu, 走査型電子顕微鏡/SEM
ペルーの高標高域に産した地衣の新種、Pyxine tiinae
原題: Pyxine tiinae (Caliciaceae, Ascomycota), a new lichen species from high elevation in Peru（Folia Cryptogamica Estonica, 2023）
ペルーで採集された岩上生地衣の一種を検討し、Pyxine tiinaeとして新種記載した。
本種は地衣体に放射状の灰色凸形の裂片を有し、皮層と子実上層がK陰性で、2種類の未知のテルペン類を含むことなどで特徴づけられた。
本種は系統的位置が不確実であり、Culbersonia属に含めるのが自然とも思われたが、形態および地衣成分が明確に異なっていた。
報告種: Pyxine tiinae★
比較種: Culbersonia nubila / Pyxine sorediata
分類群: チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピンゴケ目/Caliciales, ピンゴケ科/Caliciaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Folia Cryptogamica Estonica, アントラキノン類/anthraquinones, ネステッドPCR/nested PCR, フニン県/Junín, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新種記載/new species, 未知成分/unknown component, 紫外線蛍光/UV fluorescence, 葉状地衣/foliose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 降水量/precipitation, 高性能薄層クロマトグラフィー/high-performance thin-layer chromatography
多相的解析により支持された米国産Paraisaria属菌の新種および新組み合わせ
原題: New species and new combinations in the genus Paraisaria (Hypocreales, Ophiocordycipitaceae) from the U.S.A., supported by polyphasic analysis（MycoKeys, 2023）
北米産Paraisaria属菌を検討し、プロファランゴプシス科の一種に寄生するP. cascadensisおよびカメムシ目の一種に寄生するP. pseudoheteropodaの2新種を記載した。
また、Ophiocordyceps insignisとO. monticolaをParaisaria属に移した。
新規の環状ペプチドファミリーであるパライサリアミド類が、DNA配列決定困難な劣化した標本の同定において化学分類学的マーカーとして有効であり、それにより142年前のタイプ標本の系統的位置が明らかになった。
報告種: Paraisaria cascadensis★ / Paraisaria insignis▲ / Paraisaria monticola▲ / Paraisaria pseudoheteropoda★
比較種: Paraisaria cascadensis / Paraisaria insignis / Paraisaria monticola / Paraisaria pseudoheteropoda
分類群: オフィオコルディセプス科/Ophiocordycipitaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Cyphoderris属, MycoKeys, TreeBASE, アラバマ州/Alabama, アーカンソー州/Arkansas, エピタイプ指定/epitype designation, カエデ属/Acer, カミキリムシ科/Cerambycidae, クロマトグラム/chromatogram, ケンタッキー州/Kentucky, コナラ属/Quercus, セミ科/Cicadidae, タイプスタディ/type study, テネシー州/Tennessee, ニレ属/Ulmus, ニレ科/Ulmaceae, ノコギリカミキリ属/Prionus, バージニア州/Virginia, フェノロジー/phenology, ブナ科/Fagaceae, プロファランゴプシス科/Prophalangopsidae, ミズーリ州/Missouri, ムクロジ科/Sapindaceae, ワシントン州/Washington, 主成分分析/principal component analysis, 冬虫夏草/entomoparasitic mushrooms, 分子ネットワーク解析/molecular network analysis, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 化学型/chemical type, 収蔵標本/stored specimen, 培養性状/colony characteristics, 太平洋岸北西部/Pacific Northwest, 寄生菌/parasite, 山地/mountains, 散布図/scatter plot, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 新規化合物/novel compound, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 森林/forest, 環状ペプチド類/cyclic peptides, 生物多様性調査/biodiversity survey, 稀産種/rare species, 米国/USA, 胞子の発芽/germination of spores, 菌核/sclerotium, 複合種/species complex, 質量分析法/mass spectrometry, 高分解能質量分析装置/HRMS
セルビア産の新種Tricholoma punctatum
原題: Tricholoma punctatum sp. nov. from Serbia（Mycotaxon, 2022）
セルビアで採集された菌を検討し、Tricholoma punctatumとして新種記載した。
本種は傘表面にほぼ黒色のしばしば隆起した点が1-3つの環紋をなし、傘の形状が裂片状になり、襞が顕著に湾生し、柄表面が繊維状であることなどで特徴づけられた。
Tricholoma属Atrosquamosa節の検索表を掲載した。
報告種: Tricholoma punctatum★
比較種: Tricholoma atrosquamosum / Tricholoma orirubens / Tricholoma rufenum / Tricholoma scalpturatum / Tricholoma scalpturatum var. atrocinctum / Tricholoma squarrulosum / Tricholoma viridilutescens
分類群: キシメジ科/Tricholomataceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2022年の論文/published in 2022, Mycotaxon, TreeBASE, UNITE, カバノキ科/Betulaceae, クマシデ属/Carpinus, コナラ属/Quercus, シュマディヤ郡/Šumadija, セルビア/Serbia, ブナ科/Fagaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 新種記載/new species, 森林/forest, 検索表/identification key, 生物多様性調査/biodiversity survey, 粘土質土壌/clayey soil, 酸性土壌/acidic soil
イラク新産種、Morchella conica
原題: Morchella conica Pers., 1818 (Pezizales, Morchellaceae): a new record from Iraq（Bulletin of the Iraq Natural History Museum, 2022）
イラク、スレイマニヤ県の混交林で採集されたMorchella conicaをイラク新産種として報告した。
本種はイラク産の2番目のMorchella属菌となった。
本種との同定は形態形質のほか分子系統解析でも確かめられた。
報告種: Morchella conica■
比較種: Morchella elata / Morchella importuna
分類群: アミガサタケ科/Morchellaceae, チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2022年の論文/published in 2022, Bulletin of the Iraq Natural History Museum, イラク/Iraq, イラク新産種/Iraq_new record, コナラ属/Quercus, スレイマニヤ県/Sulaymaniyah, ブナ科/Fagaceae, ヤナギ科/Salicaceae, ヤマナラシ属/Populus, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地理的分布/geographical distribution, 山地/mountains, 新産種報告/new record, 栄養摂取様式/nutrition style, 森林/forest, 腐生菌/saprobe
オニメヒシバに生じたミロテシウム類似菌の新種、Myxospora poaceicola
原題: Myxospora poaceicola sp. nov. (Stachybotryaceae, Hypocreales), a novel myrothecium-like fungus from Digitaria sanguinalis (Poaceae)（Phytotaxa, 2023）
中国四川省においてオニメヒシバおよび未同定のイネ科植物の茎や葉に生じた菌を検討し、Myxospora poaceicolaとして新種記載した。
本種は既知の本属菌の中で最長のシンネマを形成した。
本属菌の識別には形態形質とTEF1配列解析を組み合わせることが効果的であった。
報告種: Myxospora poaceicola★
比較種: Myxospora graminicola / Myxospora masonii
分類群: スタキボトリス科/Stachybotryaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Phytotaxa, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イネ科/Poaceae, シンネマ形成菌/synnematous fungus, メヒシバ属/Digitaria, ヨシ属/Phragmites, リター菌/litter fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 山地/mountains, 新種記載/new species, 生物多様性調査/biodiversity survey, 腐生菌/saprobe, 草地/grassland
韓国の淡水生態系からの未記録のクサレケカビ綱およびウンベロプシス綱菌類の初報告
原題: First Reports of Unrecorded Mortierellomycetes and Umbelopsidomycetes Fungi from Freshwater Ecosystems in Korea（The Korean Journal of Mycology, 2023）
韓国の川および小川において濾過した水および堆積物から分離された菌類を調査した。
韓国新産種としてDissophora globulifera、Linnemannia exigua、Mortierella rishikesha、およびUmbelopsis autotrophicaを報告した。
各種について分子データから同定結果を確かめ、記載文やコロニーの写真、光学顕微鏡およびSEM写真などを掲載した。
報告種: Dissophora globulifera■ / Linnemannia exigua■ / Mortierella rishikesha■ / Umbelopsis autotrophica■
分類群: Mortierellomycetes, Mortierellomycota, Mucoromyceta, Umbelopsidaceae, Umbelopsidales, Umbelopsidomycetes, クサレケカビ亜門/Mortierellomycotina, クサレケカビ目/Mortierellales, クサレケカビ科/Mortierellaceae, ケカビ亜門/Mucoromycotina, ケカビ門/Mucoromycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, The Korean Journal of Mycology, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 底泥/sediment, 忠清北道/Chungcheongbuk-do, 忠清南道/Chungcheongnam-do, 慶尚北道/Gyeongsangbuk-do, 新産種報告/new record, 水生菌/aquatic fungi, 水試料/water sample, 河川/river, 淡水域/freshwater, 生長速度/growth rate, 走査型電子顕微鏡/SEM, 韓国/South Korea, 韓国新産種/South Korea_new record