Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
ヒメシロタモギタケの類似種、Ossicaulis lachnopusが形態および分子を用いた手法により確かめられた
原題: Ossicaulis lachnopus (Agaricales, Lyophyllaceae), a species similar to O. lignatilis, is verified by morphological and molecular methods（Mycological Progress, 2012）
ヒメシロタモギタケ (Ossicaulis lignatilis) はよく知られた種だが、類似するOssicaulis lachnopusはほとんど認知されてこなかった。
O. lachnopusはFriesがAgaricus属菌として記載した種で、Contu (2000, 2007) によって現代菌類学に「復活」させられた種である。
ヨーロッパの6か国で採集された32標本について形態比較および分子系統解析を行った結果、O. lachnopusが種として確かに認められることが明らかになった。
報告種: Ossicaulis lachnopus / Ossicaulis lignatilis
比較種: Ossicaulis lachnopus / Ossicaulis lignatilis
分類群: シメジ科/Lyophyllaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, ウクライナ/Ukraine, カエデ属/Acer, カバノキ科/Betulaceae, クマシデ属/Carpinus, コナラ属/Quercus, スウェーデン/Sweden, スロバキア/Slovakia, チェコ/Czech, トウヒ属/Picea, トチノキ属/Aesculus, トネリコ属/Fraxinus, ドイツ/Germany, ニレ属/Ulmus, ニレ科/Ulmaceae, ブナ属/Fagus, ブナ科/Fagaceae, ブルガリア/Bulgaria, マツ科/Pinaceae, ムクロジ科/Sapindaceae, モクセイ科/Oleaceae, モミ属/Abies, ヤナギ科/Salicaceae, ヤマナラシ属/Populus, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 地理的分布/geographical distribution, 山地/mountains, 散布図/scatter plot, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 検索表/identification key, 腐生菌/saprobe
形態および分子データに基づき記載された中国産のPerenniporia属の3新種
原題: Three new Perenniporia (Polyporales, Basidiomycota) species from China based on morphological and molecular data（Mycoscience, 2012）
中国からPerenniporia lacerata, P. luteola、P. tianmuensisの3種を新種記載した。
ITSおよびLSUに基づく分子系統解析の結果、本属菌の29種は5つのクレードに分かれた。
報告種: Perenniporia lacerata★ / Perenniporia luteola★ / Perenniporia tianmuensis★
比較種: Perenniporia bannaensis / Perenniporia chromatica / Perenniporia contraria / Perenniporia fergusii / Perenniporia medulla-panis / Perenniporia pyricola / Perenniporia rhizomorpha / Perenniporia rosmarini / Perenniporia subacida / Perenniporia subannosa / Perenniporia subaurantiaca / Perenniporia tenuis / Perenniporia tibetica / Perenniporia truncatospora
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, タマチョレイタケ科/Polyporaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 河南省/Henan, 浙江省/Zhejiang, 湖南省/Hunan, 腐生菌/saprobe
ペルー産のダニ寄生菌の新種、Hirsutella tunicataの系統および形態
原題: Phylogeny and morphology of Hirsutella tunicata sp. nov. (Ophiocordycipitaceae), a novel mite parasite from Peru（Mycoscience, 2013）
ペルー北部でアスパラガスの根圏から採集されたダニに寄生する菌を、Hirsutella tunicataとして新種記載した。
本種のrRNAの解析により、進化の過程で遺伝的組換えが起こったことや、逆位挿入が起こったことが明らかになった。
また、本新種を含む、シンネマを形成しないHirsutella属菌の分類についてまとめた。
報告種: Hirsutella tunicata★
比較種: Hirsutella abietina / Hirsutella acridiorum / Hirsutella aphidis / Hirsutella besseyi / Hirsutella gregis / Hirsutella kirchneri / Hirsutella necatrix / Hirsutella nodulosa / Hirsutella rhossiliensis / Hirsutella satumaensis / Hirsutella tydeicola / Hirsutella vermicola / Ophiocordyceps cochlidiicola
分類群: オフィオコルディセプス科/Ophiocordycipitaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycoscience, エラッタ/errata, クサスギカズラ属/Asparagus, キジカクシ科/Asparagaceae, ダニ寄生菌/mite parasitic fungus, ペルー/Peru, ラ・リベルタ県/La Libertad, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 土壌菌/soil fungi, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 走査型電子顕微鏡/SEM, 遺伝的組換え/genetic recombination
カゲロウの脱皮殻から見出された日本新産種のBojamyces repens
原題: Bojamyces repens (Harpellales) from exuviae of mayfly, a new record from Japan（Mycoscience, 2013）
筑波山でトビイロカゲロウ属の脱皮殻からBojamyces repensが発見され、米国、スペインに次ぐ3番目の記録となった。
また、本報告は、日本における本属菌の初の記録となった。
本種の成熟したトリコスポアの細胞質中には「スポアボディ」が観察され、他のハルペラ目菌類と同様の感染戦略をとっていることが示唆された。
報告種: Bojamyces repens■
比較種: Bojamyces olmecensis / Bojamyces tramsfuga
分類群: Harpellomycetes, Kickxellomycota, Zoopagomyceta, キクセラ亜門/Kickxellomycotina, ハルペラ目/Harpellales, レゲリオマイセス科/Legeriomycetaceae, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycoscience, トビイロカゲロウ属/Paraleptophlebia, トビイロカゲロウ科/Leptophlebiidae, 寄生菌/parasite, 感染戦略/infection strategy, 新産種報告/new record, 日本/Japan, 日本新産種/Japan_new record, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 水生昆虫/aquatic insect, 脱皮殻/exuvia, 茨城県/Ibaraki
氷食谷で子実体を形成するTomentella alpinaおよびその他のトメンテロイドの分類群
原題: Tomentella alpina and other tomentelloid taxa fruiting in a glacier valley（Mycological Progress, 2012）
これまでTomentella属の子実体が極地や高山から報告されたことはなかったが、オーストリア・チロル地方の高山から8種の子実体形成を報告した。
Kobresia myosuroide、Bistorta vivipara、Salix herbaceaなどと菌根を形成するTomentella alpinaを新種記載した。
また、これまでTomentella bresadolaeのシノニムとされてきたTomentella fungicolaを、タイプ標本の形態観察に基づき独立種として認めた。
報告種: Pseudotomentella tristis / Thelephora caryophyllea / Thelephora terrestris f. resupinata / Tomentella alpina★ / Tomentella atramentaria / Tomentella ferruginella / Tomentella fibrosa / Tomentella fungicola / Tomentella lapida / Tomentella stuposa
比較種: Tomentella alpina / Tomentella bryophila / Tomentella stuposa
分類群: イボタケ目/Thelephorales, イボタケ科/Thelephoraceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, アルプス山脈/Alps, オーストリア/Austria, シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, チロル州/Tirol (Austria), トメンテロイド菌類/tomentelloid fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 山地/mountains, 新種記載/new species, 氷食谷/glaciated valley, 独立種/independent species, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 複合種/species complex, 高山帯/alpine region
ウロシスティス目の新属Melanoxa
原題: Melanoxa, a new genus in the Urocystidales (Ustilaginomycotina)（Mycological Progress, 2012）
スロベニア産のコミヤマカタバミに寄生する黒穂菌を新属新種Melanoxa oxalidiellaeとして記載した。
本属は同じウロシスティス科の他のどの属とも異なり、黒穂胞子の壁が多層という特徴を持っている。
また、米国で同じカタバミ属のOxalis oreganaに寄生するMelanotaenium oxalidisを新属に移した。
報告種: Melanoxa oxalidiellae★ / Melanoxa oxalidis▲
比較種: Melanoxa oxalidiellae / Melanoxa oxalidis
分類群: ウロシスティス目/Urocystidales, ウロシスティス科/Urocystidaceae, クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, カタバミ属/Oxalis, カタバミ科/Oxalidaceae, スロベニア/Slovenia, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 検索表/identification key, 米国/USA, 走査型電子顕微鏡/SEM, 透過型電子顕微鏡/TEM, 黒穂菌/smut fungi
ヨーロッパの著者らにより誤ってLepiota rufipesと呼ばれていた新種Lepiota coloratipes
原題: Lepiota coloratipes, a new species for Lepiota rufipes ss. Auct. europ. non ss. orig.（Mycological Progress, 2013）
ヨーロッパでLepiota rufipesの学名で誤って呼ばれてきた菌をLepiota coloratipesとして新種記載した。
本種はヨーロッパおよび中国産の標本の形態および分子系統の検討により、Lepiota rufipesとは別種と認められた。
なお、北米産の本来のLepiota rufipesは、Vellinga (2010) によりCystolepiota seminudaのシノニムとされている。
報告種: Lepiota coloratipes★
比較種: Lepiota apatelia / Lepiota cristatoides / Lepiota neophana f. papillata / Lepiota neophana var. europaea / Lepiota psalion / Lepiota pyrochroa / Lepiota thiersii
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, スペイン/Spain, バレンシア州/Valencia, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 新種記載/new species
チリ南部の温帯雨林で見出された複数のアナモルフを持つ新種、Cordyceps cuncunae
原題: Cordyceps cuncunae (Ascomycota, Hypocreales), a new pleoanamorphic species from temperate rainforest in southern Chile（Mycological Progress, 2012）
チリ南部のバルディビアの温帯雨林において見出された、未同定のコウモリガ科の幼生に寄生する菌をCordyceps cuncunaeとして新種記載した。
本種は培養下で、Lecanicillium型のアナモルフのほか、円柱形で頂部に黄褐色の分生子塊を持つ特徴的な大分生子柄を形成した。
本種はチリ固有のCordyceps属菌として初の記録となった。
報告種: Cordyceps cuncunae★
比較種: Cordyceps gracilis / Cordyceps militaris
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ノムシタケ科/Cordycipitaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, コウモリガ科/Hepialidae, シンアナモルフ/synanamorph, シンネマ形成菌/synnematous fungus, チリ/Chile, ラ・アラウカニア州/Araucanía, 冬虫夏草/entomoparasitic mushrooms, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 森林/forest, 温帯域/temperate zone, 温帯林/temperate forest
韓国新産の地衣Dirinaria picta
原題: The Lichen Dirinaria picta New to South Korea（Mycobiology, 2013）
韓国南部からDirinaria applanataおよびDirinaria pictaの2種を記録した。
そのうち、Dirinaria pictaは韓国からは初の報告となった。
報告種: Dirinaria applanata / Dirinaria picta■
比較種: Dirinaria applanata / Dirinaria picta
分類群: チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピンゴケ目/Caliciales, ピンゴケ科/Caliciaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycobiology, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 新産種報告/new record, 検索表/identification key, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 韓国/South Korea
黒色穎粒菌腫の原因となるMadurella属の新種
原題: New species of Madurella, causative agents of black-grain mycetoma（Journal of Clinical Microbiology, 2012）
スーダンとインドネシアで分離された黒色穎粒菌腫の原因菌を、それぞれMadurella fahalii、M. tropicanaとして新種記載した。
Madurella fahaliiは生長適温が30°Cと低く、真菌腫の治療法として唯一用いられるアゾール系抗真菌薬に対する感受性が他の本属菌よりも低かった。
また、本論文ではM. pseudomycetomatisを規約上有効に記載するとともに、M. ikedaeをM. mycetomatisのシノニムとした。
報告種: Madurella fahalii★ / Madurella pseudomycetomatis★ / Madurella tropicana★
比較種: Madurella fahalii / Madurella grisea / Madurella mycetomatis / Madurella pseudomycetomatis / Madurella tropicana
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ目/Sordariales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Journal of Clinical Microbiology, アゾール系抗真菌薬/azole antifungals, インドネシア/Indonesia, シノニム/synonym, スーダン/Sudan, ヒト病原菌/human pathogen, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 抗真菌薬/antifungal drug, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 新種記載/new species, 温度適性/temperature aptitude, 無効学名の再記載/redescription of invalid name, 菌腫/mycetoma
ユーラシア産の新種Hainesia peltigeraeおよびその他の興味深い地衣生菌類
原題: Hainesia peltigerae sp. nov. and some other interesting lichenicolous fungi from Eurasia（Graphis Scripta, 2013）
シベリアでアカツメゴケ (Peltigera rufescens) の地衣体に発生する菌をHainesia peltigeraeとして新種記載した。
ベトナムでサルオガセ属に発生したEndococcus apiciicola、ロシアでCollema polycarponに発生したEndococcus pseudocarpusを新産種報告した。
また、ロシアで2番目の記録となるPhaeoseptoria peltigeraeについて、形態の変異について議論した。
報告種: Endococcus apiciicola■ / Endococcus pseudocarpus■ / Hainesia peltigerae★
比較種: Epithamnolia karatyginii / Hainesia pertusariae / Hainesia xanthoriae / “Hainesia peltigericola”
分類群: Chaetomellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ目/Dothideales, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, ケートメラ科/Chaetomellaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Graphis Scripta, アルタイ共和国/Altai Republic, ベトナム/Vietnam, ロシア/Russia, 地衣生菌/lichenicolous fungus, 新産種報告/new record, 新種記載/new species
タイの土壌から見出された新種Aspergillus siamensis
原題: Aspergillus siamensis sp. nov. from soil in Thailand（Mycoscience, 2013）
タイ東部の土壌から分離されたコウジカビ属Fumigati節の菌をAspergillus siamensisとして新種記載した。
β-チューブリン、カルモジュリン、アクチンの各遺伝子を用いた分子系統解析で、本種は近縁種と明瞭に区別された。
報告種: Aspergillus siamensis★
比較種: Aspergillus viridinutans / Neosartorya aureola / Neosartorya indohii / Neosartorya paulistensis / Neosartorya udagawae
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycoscience, タイ/Thailand, チョンブリー県/Chon Buri, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 走査型電子顕微鏡/SEM
Tinctoporellus属の2新種の形態学的およびITS rDNAに基づく系統学的同定
原題: Morphological and ITS rDNA-based phylogenetic identification of two new species in Tinctoporellus（Mycological Progress, 2012）
中国・広西チワン族自治区から形態および分子に基づき、Tinctoporellus bubalinusおよびT. hinnuleusを新種記載した。
また、2新種を含むTinctoporellus属菌の検索表を掲載した。
報告種: Tinctoporellus bubalinus★ / Tinctoporellus hinnuleus★
比較種: Erythromyces crocicreas / Porogramme spp. / Tinctoporellus bubalinus / Tinctoporellus epimiltinus / Tinctoporellus hinnuleus / Tinctoporellus isabellinus
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, タマチョレイタケ科/Polyporaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 広西チワン族自治区/Guangxi, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 検索表/identification key, 腐生菌/saprobe
西オーストラリアでのRubus anglocandicansの減少に関係する新種Phytophthora bilorbang
原題: Phytophthora bilorbang sp. nov., a new species associated with the decline of Rubus anglocandicans (European blackberry) in Western Australia（European journal of Plant Pathology, 2012）
オーストラリアのRubus anglocandicans減少地域で、根および根圏土壌から分離された菌をPhytophthora bilorbangとして新種記載した。
本種は接種試験で萎凋や病斑の症状を起こし、コッホの原則が満たされたことから、本種がRubus anglocandicansの減少の原因である可能性が示唆された。
また、本種とほぼ同一の塩基配列が米国、英国、フランス、ポーランドなど世界各地で報告されていることから、本種が移入種である可能性も考えられた。
報告種: Phytophthora bilorbang★
比較種: Phytophthora gibbosa / Phytophthora gregata / Phytophthora megasperma
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2012年の論文/published in 2012, European journal of Plant Pathology, オーストラリア/Australia, キイチゴ属/Rubus, コッホの原則/Koch_s postulation, バラ科/Rosaceae, 保全生態学/conservation ecology, 個体群減少/decrease population, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 萎凋病/wilt, 西オーストラリア州/Western Australia
タイでナガバジャスミンから分離された、カルボキシメチルセルラーゼ産生能のある新種の酵母Candida konsanensis
原題: Candida konsanensis sp. nov., a new yeast species isolated from Jasminum adenophyllum in Thailand with potentially carboxymethyl cellulase-producing capability（World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2013）
タイでナガバジャスミン (Jasminum adenophyllum) の花から分離された酵母をCandida konsanensisとして新種記載した。
D1/D2領域を用いた分子系統解析、生理学的・生化学的試験を行った結果、本種は近縁種のCandida chanthaburiensisと別種と見なされた。
本種をカルボキシメチルセルロース添加YP培地で培養したところ、カルボキシメチルセルラーゼを産生する能力が確認された。
報告種: Candida konsanensis★
比較種: Candida chanthaburiensis
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, World Journal of Microbiology and Biotechnology, カルボキシメチルセルラーゼ/carboxymethyl cellulase, セルラーゼ/cellulase, セルロース分解菌/cellulolytic fungi, ソケイ属/Jasminum, タイ/Thailand, チャイヤプーム県/Chaiyaphum, モクセイ科/Oleaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 花生息菌/floricolous fungus, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酵素/enzyme
中国南西部産の新種Russula atroaerugineaおよびR. sichuanensis
原題: Russula atroaeruginea and R. sichuanensis spp. nov. from southwest China（Mycotaxon, 2013）
中国南西部から、形態およびITS領域を用いた分子系統解析の結果に基づいて2新種を記載した。
四川省のトウヒ林で発見されたRussula atroaerugineaは分子系統解析ではGriseinae節のクレードに含まれた。
Russula sichuanensisは旧Macowanites属に相当する半地下生の菌で、分子系統解析ではLarcinae節のクレードに含まれた。
報告種: Russula atroaeruginea★ / Russula sichuanensis★
比較種: Macowanites arenicola / Macowanites chlorinosmus / Macowanites citrinus / Macowanites luteolus / Macowanites subolivaceus / Macowanites yunnanensis / Russuka pseudoaeruginea / Russula aeruginea / Russula anatina / Russula cyanoxantha f. peltereaui / Russula cyanoxantha / Russula galbana / Russula grisea / Russula kermesina / Russula luteirosea / Russula medullata / Russula stenotricha / Russula viridirubrolimbata
分類群: ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ベニタケ目/Russulales, ベニタケ科/Russulaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, シクエストレート菌/sequestrate fungus, セコティオイド菌類/secotioid fungus, トウヒ属/Picea, マツ科/Pinaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 四川省/Sichuan, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新疆ウイグル自治区/Xinjiang, 新種記載/new species, 森林/forest, 水辺/waterside, 河川/river, 胞子紋/spore print, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM, 雲南省/Yunnan
Lenzitopsis属の新種およびその系統的位置
原題: A new species of Lenzitopsis (Thelephorales, Basidiomycota) and its phylogenetic placement（Mycoscience, 2012）
Lenzitopsis属は従来L. oxycedriのみを含む単型属だったが、新たに中国四川省からイブキに発生するL. daiiを記載した。
本種は木材腐朽菌だが、他のイボタケ目菌類の多くは外生菌根菌であることから、共生関係の進化を明らかにするために本種の系統的位置の解明が重要だとした。
形態比較、nLSUに基づく分子系統解析、ITS領域の塩基配列により、本種はL. oxycedriと明瞭に区別された。
報告種: Lenzitopsis daii★
比較種: Daedaleopsis tricolor / Gloeophyllum sepiarium / Lenzitopsis oxycedri
分類群: イボタケ目/Thelephorales, イボタケ科/Thelephoraceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, ヒノキ科/Cupressaceae, ビャクシン属/Juniperus, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 四川省/Sichuan, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 宿主選好性/host selectivity, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 腐生菌/saprobe, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 菌根菌の進化/evolution of mycorrhizal fungi
ジャノヒゲに発生した新種Phyllosticta ophiopogonis
原題: Phyllosticta ophiopogonis sp. nov. from Ophiopogon japonicus (Liliaceae).（Saudi Journal of Biological Sciences, 2012）
タイ各地でジャノヒゲの園芸品種の葉に斑点病が確認され、病斑から常にPhyllosticta属菌が分離された。
分生子殻や分生子などの形態に基づき、本種をPhyllosticta ophiopogonisとして新種記載した。
本種の有性世代は天然でも培養下でも確認されなかった。
報告種: Phyllosticta ophiopogonis★
比較種: Phyllosticta aspidistricola / Phyllosticta cruenta var. discincta / Phyllosticta crypta / Phyllosticta cumminsii / Phyllosticta discincta / Phyllosticta hemerocallidis / Phyllosticta hypoglossi / Phyllosticta subeffusa / Phyllosticta yuccae
分類群: Phyllostictaceae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ボトリオスフェリア目/Botryosphaeriales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Saudi Journal of Biological Sciences, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ジャノヒゲ属/Ophiopogon, タイ/Thailand, チエンラーイ県/Chiang Rai, ユリ科/Liliaceae, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi
カンキツにせ黄斑病の原因酵母の再分類およびSporobolomyces productusとS. corallinusの2新種の提唱
原題: Reclassification of citrus pseudo greasy spot causal yeasts, and a proposal of two new species, Sporobolomyces productus sp. nov. and S. corallinus sp. nov.（Mycoscience, 2012）
日本で柑橘類に発生するカンキツにせ黄斑病 (PGS) は、カンキツ黄斑病 (CGS) とは原因菌も防除法も異なるが、しばしば混同されるため、原因菌の判別法の開発が必要である。
カンキツにせ黄斑病を起こす酵母は1986年にSporobolomyces roseusと同定されていたが、本研究で同定の誤りが明らかになった。
本研究では、分類学的再検討の結果に基づいて2新種を記載するとともに、接種試験により、それらの菌が確かにカンキツにせ黄斑病の主な原因菌であることを示した。
報告種: Sporobolomyces corallinus★ / Sporobolomyces productus★
比較種: Sporobolomyces dimmenae / Sporobolomyces roseus / Sporobolomyces subbrunneus
分類群: サビキン亜門/Pucciniomycotina, スポリディオボルス目/Sporidiobolales, スポリディオボルス科/Sporidiobolaceae, ミクロボトリウム菌綱/Microbotryomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, コッホの原則/Koch_s postulation, ミカン属/Citrus, ミカン科/Rutaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 宮崎県/Miyazaki, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 日本/Japan, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 温度適性/temperature aptitude, 資化試験/assimilation test, 鹿児島県/Kagoshima
インド・熱帯地域産のアセタケ科の新種Auritella foveata
原題: Auritella foveata, a new species of Inocybaceae (Agaricales) from tropical India（Kew Bulletin, 2012）
インドの熱帯地域の常緑樹林で採集された菌を、Auritella foveataとして新種記載した。
また、Auritella属8種を含む検索表を掲載した。
従来アフリカ・オーストラリアで知られていた本属菌がインドでも発見されたことから、本属菌がゴンドワナ要素の生物であるという仮説が立てられた。
報告種: Auritella foveata★
比較種: Auritella aureoplumosa / Auritella erythroxa
分類群: アセタケ科/Inocybaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Kew Bulletin, インド/India, ケララ州/Kerala, ゴンドワナ要素/Gondwana element, フタバガキ科/Dipterocarpaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地理的分布/geographical distribution, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 森林/forest, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 菌根菌/mycorrhizal fungi
天然環境から分離されたケートチリウム目の新種、Cladophialophora abundans
原題: Cladophialophora abundans, a novel species of Chaetothyriales isolated from the natural environment（Mycological Progress, 2013）
ブラジルのマングローブ林でスナガニの巣、植物、土壌などから分離された菌をCladophialophora abundansとして新種記載した。
本種はヒトの病原菌として知られるCladophialophora bantianaに特に形態が類似していたが、最大生長温度は36°Cであるため、腐生菌だと考えられた。
ITS領域に基づく分子系統解析では、本種はC. bantianaと異なる「carrioniiクレード」に位置した。
報告種: Cladophialophora abundans★
比較種: Cladophialophora bantiana / Cladophialophora psammophila
分類群: ケートチリウム亜綱/Chaetothyriomycetidae, ケートチリウム目/Chaetothyriales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ヘルポトリキエラ科/Herpotrichiellaceae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, Ucides属, アナモルフ菌/anamorphic fungi, カニの巣/nest of crab, サルトリイバラ科/Smilacaceae, シオデ属/Smilax, スナガニ科/Ocypodidae, バイーア州/Bahia, ブラジル/Brazil, マラニョン州/Maranhão, マングローブ林/mangrove forest, メラニン/melanin, ヤマノイモ属/Dioscorea, ヤマノイモ科/Dioscoreaceae, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物の巣/animal nest, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 森林/forest, 沿岸域/coastal area, 温度適性/temperature aptitude, 腐生菌/saprobe, 酵母/yeast, 黒色酵母/black yeast
タイで葉面から発見されたメチロトローフ酵母の2新種Ogataea kanchanaburiensisおよびOgataea wangdongensis
原題: Ogataea kanchanaburiensis sp. nov. and Ogataea wangdongensis sp. nov., two novel methylotrophic yeast species from phylloplane in Thailand（Antonie van Leeuwenhoek, 2013）
タイ・カーンチャナブリー県でマンゴーおよびブドウの葉から分離された酵母をOgataea kanchanaburiensisおよびO. wangdongensisとして新種記載した。
両種は3回連続のメタノールYNB培地での集積培養により分離されたメチロトローフ酵母である。
D1/D2およびITS領域に基づく分子系統解析および資化試験で、両種は近縁種と明瞭に区別された。
報告種: Ogataea kanchanaburiensis★ / Ogataea wangdongensis★
比較種: Candida nanaspora / Candida nitratophila / Candida suzukii / Ogataea wickerhamii
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス科/Saccharomycetaceae, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Antonie van Leeuwenhoek, ウルシ科/Anacardiaceae, カーンチャナブリー県/Kanchanaburi, タイ/Thailand, ブドウ属/Vitis, ブドウ科/Vitaceae, マンゴー属/Mangifera, メチロトローフ酵母/methylotrophic yeast, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 葉面菌/leaf surface fungi, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 集積培養/enrichment culture
ハナミズキの輪紋葉枯れ病の原因菌である新属新種Haradamyces foliicola
原題: Haradamyces foliicola anam. gen. et sp. nov., a cause of zonate leaf blight disease in Cornus florida in Japan（Mycological Research, 2009）
日本で様々な落葉樹や常緑樹の葉に輪紋葉枯れ病 (ZLB) を起こす病原菌をHaradamyces foliicolaとして新種記載した。
本種は葉の組織に菌核様構造を形成し、その複数の菌糸に由来する盤状の多細胞の散布体を、葉の両面に形成することを特徴とする。
nSSUおよびITS領域に基づく分子系統解析により、本種のキンカクキン科菌類との類縁性が明らかになったが、形態および配列データはいかなる既知のアナモルフ菌にも合致しなかった。
報告種: Haradamyces foliicola★
比較種: Cristulariella spp. / Dactuliophora spp. / Hinomyces spp. / Mycopappus alni / Mycopappus quercus / Pulvinella spp. / Valdensia spp. / Verdipulvinus spp.
分類群: ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ビョウタケ目/Helotiales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2009年の論文/published in 2009, Mycological Research, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ミズキ属/Cornus, ミズキ科/Cornaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 日本/Japan, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 茨城県/Ibaraki, 菌核/sclerotium, 葉枯病/leaf blotch
ブラジル・パライバ州産の印象的な新種Hydropus griseolazulinus
原題: Hydropus griseolazulinus, a striking new species from Paraiba, Brazil（Mycosphere, 2013）
ブラジル・パライバ州からHydropus griseolazulinusを新種記載した。
本種は傘が帯灰青色、襞が青色で、本属で唯一子実体が青色を帯びる種となった。
本種はHydropus属のMycenoides節Anthidepas亜節に属すると考えられた。
報告種: Hydropus griseolazulinus★
比較種: Hydropus terraefirmae / Trogia subviride
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ホウライタケ科/Marasmiaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycosphere, パライバ州/Paraiba, ブラジル/Brazil, 呈色反応/chemical reaction, 大西洋岸森林/Atlantic forest, 新種記載/new species, 根状菌糸束/rhizomorph, 森林/forest, 砂質土壌/sandy soil