Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
コロンビアの低地アマゾン熱帯雨林におけるDNAバーコーディングを用いた土壌およびリター中のTrichoderma属の多様性調査により、新種Trichoderma strigosellumおよびその他の種が明らかにされた
原題: DNA barcoding survey of Trichoderma diversity in soil and litter of the Colombian lowland Amazonian rainforest reveals Trichoderma strigosellum sp. nov. and other（Antonie van Leeuwenhoek, 2013）
コロンビア・アマゾンの一次および二次熱帯雨林において、リターおよびフクギ属樹木Garcinia macrophyllaの根圏中のTrichoderma属菌の多様性を調査した。
107の分離株にDNAバーコーディングの手法を適用したところ、71%が汎世界的な3種であり、4菌株が未記載種であると考えられた。
近縁種Trichoderma strigosumとの形態、分子系統、表現型マイクロアレイ解析の結果の違いなどに基づき、未同定菌株を新種Trichoderma strigosellumとして記載した。
報告種: Trichoderma strigosellum★
比較種: Trichoderma koningii / Trichoderma koningiopsis / Trichoderma strigosum
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ニクザキン科/Hypocreaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Antonie van Leeuwenhoek, DNAバーコーディング/DNA barcoding, GCPSR, TrichoBLAST, TrichOKEY, コロンビア/Columbia, リター菌/litter fungi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 森林/forest, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 生長速度/growth rate, 表現型マイクロアレイ解析/phenotype microarray analysis, 資化試験/assimilation test, 走査型電子顕微鏡/SEM
クチン分解性を持つクロボキン綱酵母の新種Pseudozyma japonicaによるポリ（ε-カプロラクトン） (PCL) フィルムおよびフォームプラスチックの生分解
原題: Biodegradation of poly (ε-caprolactone) (PCL) film and foam plastic by Pseudozyma japonica sp. nov., a novel cutinolytic ustilaginomycetous yeast species（3 Biotech, 2013）
Hyoscyamus muticusから分離された酵母の新種Pseudozyma japonicaの生理活性を評価した。
本種はポリカプロラクトン (PCL) を含む培地で生長が促進され、酵素活性も高くなった。
本種は細胞外にクチナーゼを産生し、PCLフィルムおよびフォームプラスチックの分解能が確認されたことから、廃プラスチックの生分解に有用である可能性がある。
報告種: Pseudozyma japonica★
分類群: クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン目/Ustilaginales, クロボキン科/Ustilaginaceae, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, 3 Biotech, pH適性/pH aptitude, クチナーゼ/cutinase, フォームプラスチック/form plastic, プラスチック分解/plastic decomposition, ポリカプロラクトン/polycaprolactone, 加水分解試験/hydrolysis test, 加水分解酵素/hydrolase, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 担子菌酵母/basidiomycetous yeast, 新種記載/new species, 濁度測定/turbidity measurement, 無効学名/invalid name, 生長速度/growth rate, 細胞外酵素/extracellular enzyme, 酵母/yeast, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity
ヤシ科に”dry basal stem rot”を起こす新種Ilyonectria palmarum
原題: Ilyonectria palmarum sp. nov. causing dry basal stem rot of Arecaceae（European journal of Plant Pathology, 2013）
シチリア島東部で複数のヤシに”dry basal stem rot”とそれに伴う幹の屈曲が確認され、病変部から常にCylindrocapron状の菌が分離された。
形態比較および複数遺伝子を用いた分子系統解析に基づき、この菌をIlyonectria palmarumとして新種記載した。
接種試験の結果、全ての分離株が4種のヤシ科樹木に”dry basal stem rot”の症状を起こし、本種が病原菌であることが確かめられた。
報告種: Ilyonectria palmarum★
比較種: Ilyonectria liriodendri / Ilyonectria radicicola
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Brahea属, European journal of Plant Pathology, イタリア/Italy, ケンチャヤシ属/Howea, コッホの原則/Koch_s postulation, シチリア州/Sicily, シュロ属/Trachycarpus, ヤシ生息菌/palmicolous fungus, ヤシ科/Arecaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 根腐病/root rot, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 花卉圃場/flower field, 表面殺菌法/surface sterilization method
旧熱帯産の栽培可能性のある新種Agaricus flocculosipes
原題: Agaricus flocculosipes sp. nov., a new potentially cultivatable species from the palaeotropics（Mycoscience, 2012）
タイ北部と仏領マヨットから形態比較および分子系統解析に基づいてAgaricus flocculosipesを新種記載した。
本種はシロオオハラタケやニセモリノカサ（アガリクス）など食用菌を含むArvenses節に属し、人工栽培できる可能性が示唆された。
本種はヘテロタリックであると推測され、種内で高い遺伝的多様性が示された。
報告種: Agaricus flocculosipes★
比較種: Agaricus albidoperonatus / Agaricus arvensis / Agaricus augustus / Agaricus ochraceosquamulosus / Agaricus subrufescens / Agaricus tornocephalus
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, きのこ栽培/mushroom cultivation, タイ/Thailand, チエンマイ県/Chiang Mai, フランス/France, マヨット/Mayotte, 人工栽培/artificial cultivation, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 熱帯域/tropics, 種内変異/intraspecific variation, 食用きのこ/edible mushrooms
オーストラリアでツルナ属に発生する黒穂菌の新属Aizoagoおよび2新種
原題: Aizoago, a new genus, and two new species of smut fungi (Ustilaginales) on Tetragonia (Aizoaceae) in Australia（Mycobiota, 2013）
オーストラリアでハマミズナ科ツルナ属に発生する黒穂菌の新属Aizoagoを提唱した。
Tetragonia dipteraに発生するAizoago tetragoniaeとツルナに発生するAizoago tetragonioidesを新種記載した。
Walker (2007) は、無色の分生子や1-2細胞の暗褐色の分生子が混じるとしてこの菌がConidiosporomyces属であることを示唆したが、それはコンタミではないかと考えられた。
報告種: Aizoago tetragoniae★ / Aizoago tetragonioides★
比較種: Aizoago tetragoniae / Aizoago tetragonioides
分類群: クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycobiota, オーストラリア/Australia, ニューサウスウェールズ州/New South Wales, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 検索表/identification key, 西オーストラリア州/Western Australia, 走査型電子顕微鏡/SEM, 黒穂菌/smut fungi
中国でインドゴムノキにすす点病 (Sooty blotch and flyspeck) を起こすDevriesia属の新種
原題: A new species of Devriesia causing sooty blotch and flyspeck on Rubber Trees in China（Mycological Progress, 2013）
中国海南省でインドゴムノキ (Ficus elastica) の幹にすす点病 (Sooty blotch and flyspeck) を起こす新種Devriesia ficusを記載した。
ITS領域に基づく分子系統解析で、本種はDevriesia strelitziaeに近縁だったが、分生子の形態や厚壁胞子の有無で区別された。
報告種: Devriesia ficus★
比較種: Devriesia pseudoamericana / Devriesia strelitziae
分類群: 子嚢菌綱/Ascomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, すす点病/sooty blotch, イチジク属/Ficus, クワ科/Moraceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 海南省/Hainan
形態およびITS配列データに基づくイヌマキのエンドファイトの新種、Pestalotiopsis yunnanensisの記載
原題: Pestalotiopsis yunnanensis sp. nov., an endophyte from Podocarpus macrophyllus (Podocarpaceae) based on morphology and ITS sequence data（Mycological Progress, 2013）
中国雲南省昆明でイヌマキの枝からエンドファイトとして分離された菌をPestalotiopsis yunnanensisとして新種記載した。
本種は近縁な同属菌と異なり、分生子果が分生子殻状になり、分生子やその付属糸の形態でも区別された。
マキ属に発生する26種のPestalotiopsis属菌の検索表を掲載した。
報告種: Pestalotiopsis yunnanensis★
比較種: Pestalotiopsis funerea / Pestalotiopsis funereoides / Pestalotiopsis thujae
分類群: アンフィスフェリア目/Amphisphaeriales, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, ペスタロティプシス科/Pestalotiopsidaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, すす点病/sooty blotch, アナモルフ菌/anamorphic fungi, エンドファイト/endophyte, マキ属/Podocarpus, マキ科/Podocarpaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 検索表/identification key, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 雲南省/Yunnan
中国のカザンマツに発生する新種Coccomyces pinicola
原題: Coccomyces pinicola sp. nov. on Pinus armandii from China（Mycotaxon, 2013）
中国・雲南省においてカザンマツ (Pinus armandii) の枝に発生した菌を検討し、Coccomyces pinicolaとして新種記載した。
本種はマツの枝に発生する他の菌よりも子嚢果がずっと小さく、有柄である点などで特徴づけられた。
本種はCoccomyces属に含まれたが、ITS領域に基づく分子系統解析ではColpoma quercinumに最も近縁であった。
報告種: Coccomyces pinicola★
比較種: Coccomyces cembrae / Coccomyces guizhouensis / Coccomyces irretitus / Coccomyces lijiangensis / Coccomyces papillatus / Coccomyces parvulus / Coccomyces strobi / Colpoma quercinum / Therrya abieticola
分類群: ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, リティスマ目/Rhytismatales, リティスマ科/Rhytismataceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 腐生菌/saprobe, 雲南省/Yunnan
中国・北京産のハラタケ類のアンモニア菌の新種、Coprinopsis novorugosobispora
原題: Coprinopsis novorugosobispora sp. nov., an agaric ammonia fungus from Beijing, China（Mycoscience, 2012）
中国・北京の土壌に尿素施与処理をして発生したアンモニア菌のCoprinopsis novorugosobisporaを新種記載した。
本種はCoprinopsis rugosobisporaに類似するが、担子胞子のサイズや表面の性状などが異なっていた。
本種は中国本土から初めて報告されたアンモニア菌となった。
報告種: Coprinopsis novorugosobispora★
比較種: Coprinopsis rugosobispora
分類群: ナヨタケ科/Psathyrellaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, アンモニア菌/ammonia fungi, 中国/China, 北京市/Beijing, 尿素施与/urea application, 新種記載/new species, 走査型電子顕微鏡/SEM
Antrodiella americana種複合体における中国産の代表種、新種Antrodiella chinensis
原題: Antrodiella chinensis sp. nov., a Chinese representative of the Antrodiella americana complex（Mycological Progress, 2013）
中国吉林省で採集された菌について形態学的検討および分子系統解析を行い、Antrodiella chinensisとして新種記載した。
本種はAntrodiella americana種複合体に属する3種の中で、唯一中国北東部に分布する種とされた。
同じ種複合体の他の2種とは顕微鏡的形質が類似していたが、孔口の大きさやグレオシスチジアのサイズ、ITSに基づく分子系統などで区別された。
報告種: Antrodiella chinensis★
比較種: Antrodiella americana / Antrodiella niemelaei
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, マクカワタケ科/Phanerochaetaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, successor species, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 吉林省/Jilin, 山地/mountains, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 腐生菌/saprobe, 複合種/species complex, 長白山脈/Changbai Mountains
韓国でキキョウから分離された新種Stemphylium platycodontis
原題: Stemphylium platycodontis sp. nov., isolated from Platycodon grandiflorus in Korea（Mycological Progress, 2013）
韓国でキキョウの葉と花に枯死を起こす菌を新種Stemphylium platycodontisとして記載した。
本種は他の本属菌に比べて分生子が大きく、PDA培地で褐色の色素を分泌しないなどの特徴を持つ。
報告種: Stemphylium platycodontis★
比較種: Stemphylium lancipes / Stemphylium lycopersici / Stemphylium subglobuliferum / Stemphylium xanthosomatis
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, プレオスポラ科/Pleosporaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, GCPSR, Mycological Progress, キキョウ属/Platycodon, キキョウ科/Campanulaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 大田広域市/Daejeon, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 韓国/South Korea
アラスカ産のコウヤクタケ類の新属新種Tsugacorticium kenaicum
原題: Tsugacorticium kenaicum (Hymenochaetales, Basidiomycota) a new corticioid genus and species from Alaska（North American Fungi, 2012）
アラスカ・ケナイ半島のツガ属、シトカトウヒなどの生木樹皮や枯れ枝に発生するコウヤクタケ類の新属新種Tsugacorticium kenaicumを記載した。
本種は形態的にはDendrothele属やDendrocorticium属などに類似しており、以前はDendrothele incrustansと誤同定されていた。
LSUを用いた分子系統解析では、本種はどちらの属とも異なるヒナノヒガサ科クレードに含まれた。
報告種: Tsugacorticium kenaicum★
比較種: Corticium spp. / Dendrocorticium spp. / Dendrothele incrustans / Dendrothele spp. / Dentocorticium spp. / Ginnsia viticola / Leptocorticium spp.
分類群: タバコウロコタケ目/Hymenochaetales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ヒナノヒガサ科/Rickenellaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, North American Fungi, アラスカ州/Alaska, コウヤクタケ類/corticioid fungi, ツガ属/Tsuga, トウヒ属/Picea, マツ科/Pinaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 米国/USA, 腐生菌/saprobe, 誤同定/misidentification
形態および分子系統によって同定された中国の土壌由来のStachybotrys属
原題: Stachybotrys from soil in China, identified by morphology and molecular phylogeny（Mycological Progress, 2012）
中国各地の土壌から、形態的にStachybotrys属の特徴に合致する4菌株を分離した。
形態比較およびITS、tef1、rpb2を用いた分子系統解析を行い、うち1菌株を基に新種Stachybotrys subcylindrosporaを記載した。
残りの菌株は形態および分子に基づきStachybotrys cf. elegansおよびStachybotrys sansevieriaeと同定された。
報告種: Stachybotrys subcylindrospora★
比較種: Stachybotrys eucylindrospora / Stachybotrys longispora / Stachybotrys sansevieriae
分類群: スタキボトリス科/Stachybotryaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, TreeBASE, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 森林/forest, 海南省/Hainan, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest
Tubariomyces属の新規隠蔽種
原題: A new cryptic species in the genus Tubariomyces Inocybaceae, Agaricales（Mycological Progress, 2013）
イタリア・トスカーナ州でゴジアオイ属植物の樹下から見出されたTubariomyces属の新種、Tubariomyces similisを記載した。
本種は、Alvarado et al. (2010) が”Tubariomyces sp_1″として記録していた、スペインでゴジアオイ属樹下で発見された未記載種と同種と考えられた。
本種は形態的にはTubariomyces hygrophoroidesに酷似しているが、ITS領域およびLSUを用いた分子系統解析で異なる系統をなした。
報告種: Tubariomyces similis★
比較種: Tubariomyces hygrophoroides / Tubariomyces inexpectatus
分類群: アセタケ科/Inocybaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, イタリア/Italy, ゴジアオイ属/Cistus, トスカーナ州/Tuscany, ハンニチバナ科/Cistaceae, 仮称で呼ばれてきた菌の正式記載/formal description of provisional name, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 新種記載/new species, 砂丘/dune, 砂地/sand, 砂質土壌/sandy soil, 隠蔽種/cryptic species
インド産の地衣化していない子嚢果を形成する新種
原題: A new species of non-lichenized ascomata from India（Mycosphere, 2013）
インドのタミル・ナードゥ州でイチジク属樹木の樹皮上に多数発見された菌を検討し、Hysterographium palamalaienseとして新種記載した。
本種は舟形の子宮形子嚢殻や石垣状の子嚢胞子を有することなどで特徴づけられた。
本種の子嚢果の断面には藻類の細胞が見出されなかった。
報告種: Hysterographium palamalaiense★
比較種: Opegrapha spp.
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ヒステリウム目/Hysteriales, ヒステリウム科/Hysteriaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycosphere, イチジク属/Ficus, インド/India, クワ科/Moraceae, タミル・ナードゥ州/Tamil Nadu, 呈色反応/chemical reaction, 新種記載/new species, 森林/forest, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus
ムギワラギクにべと病を起こす新種Plasmopara invertifolia
原題: Plasmopara invertifolia sp. nov. causing downy mildew on Helichrysum bracteatum (Asteraceae)（Mycological Progress, 2014）
ブラジルにおいてムギワラギクの葉に重度の変形や壊死を起こした病原菌を検討し、Plasmopara invertifoliaとして新種記載した。
本種は同属他種とは胞子嚢が小さく、胞子嚢柄が大きい点などで区別された。
cox2遺伝子に基づく分子系統解析では、本種はPlasmopara halstediiの種複合体に近縁であった。
報告種: Plasmopara invertifolia★
比較種: Bremia spp. / Paraperonospora helichrysi / Plasmopara affinis / Plasmopara angustiterminalis / Plasmopara asterea / Plasmopara domingensis / Plasmopara galinsogae / Plasmopara halstedii / Plasmopara lactucae-radicis / Plasmopara palmii / Plasmopara petasitidis / Plasmopara siegesbeckiae / Plasmopara solidaginis / Plasmopara spilanthicola / Plasmopara vernoniae-chinensis / Plasmopara yunnanensis
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Mycological Progress, べと病/downy mildew, キク科/Asteraceae, ブラジル/Brazil, ミナスジェライス州/Minas Gerais, ムギワラギク属/Helichrysum, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi
土壌および甲虫から分離された無性世代の担子菌酵母の新種Trichosporon vanderwaltii
原題: Trichosporon vanderwaltii sp. nov., an asexual basidiomycetous yeast isolated from soil and beetles（Antonie van Leeuwenhoek, 2013）
南アフリカの土壌から分離された酵母、米国で甲虫の腸から分離された酵母、台湾の森林土壌から分離された酵母のD1/D2配列が100%一致し、既知の種と異なっていた。
表現型の検討やD1/D2およびITS領域を用いた分子系統解析に基づき、新種Trichosporon vanderwaltiiを記載した。
本種は他のTrichosporon属菌とは資化試験の結果やビタミン要求性を欠くこと、細胞外にデンプンを分泌することなどが異なっていた。
報告種: Trichosporon vanderwaltii★
比較種: Trichosporon brassicae / Trichosporon dehoogii / Trichosporon domesticum / Trichosporon dulcitum / Trichosporon gamsii / Trichosporon gracile / Trichosporon laibachii / Trichosporon lignicola / Trichosporon louberi / Trichosporon montevideense / Trichosporon mycotoxinivorans / Trichosporon porosum / Trichosporon scarabaeorum / Trichosporon siamense / Trichosporon sporotrichoides / Trichosporon vadense / Trichosporon veenhuisii / Trichosporon wieringae
分類群: シロキクラゲ綱/Tremellomycetes, トリコスポロン目/Trichosporonales, トリコスポロン科/Trichosporonaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Antonie van Leeuwenhoek, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, Megalodacne属, Platydema属, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, オオキノコムシ科/Erotylidae, ケシキスイ科/Nitidulidae, ゴミムシダマシ科/Tenebrionidae, ジョージア州/Georgia, デンプン/starch, ヒゲナガゾウムシ科/Anthribidae, ビタミン要求性/vitamin requirement, ルイジアナ州/Louisiana, 二型性/dimorphism, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 南アフリカ/South Africa, 南投県/Nantou, 台中市/Taichung, 台湾/Taiwan, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 森林/forest, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 米国/USA, 腸内生息菌/fungus in intestinal tract, 資化試験/assimilation test, 走査型電子顕微鏡/SEM, 高雄市/Kaohsiung
「人類のゆりかご」で見出されたクロイボタケ目の分生子殻形成菌の新属Homortomyces
原題: Homortomyces gen. nov., a new dothidealean pycnidial fungus from the Cradle of Humankind（IMA fungus, 2012）
「人類のゆりかご」と呼ばれるスタークフォンテン洞窟がある南アフリカのマロペン地域において菌類の調査を行った。
そこでシクンシ科の樹木Combretum erythrophyllumの病害の原因と思われる菌を発見し、新属新種Homortomyces combretiとして記載した。
本属はStilbospora属に類似しているが形態および系統が異なり、採集地にちなんで「人類の起源の菌」を意味する”Homortomyces“の名が与えられた。
報告種: Homortomyces combreti★
比較種: Angiopomopsis spp. / Ceratopycnis spp. / Endocoryneum spp. / Hendersoniopsis spp. / Stilbospora spp.
分類群: Homortomycetaceae, Homortomycetales, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Combretum属, IMA fungus, シクンシ科/Combretaceae, ハウテン州/Gauteng, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類未確定/classification undetermined, 南アフリカ/South Africa, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 潰瘍病/canker
カリフォルニア州および太平洋岸北西部に分布する新種Amanita augusta
原題: Amanita augusta, a new species from California and the Pacific Northwest（North American Fungi, 2013）
米国西海岸に分布するAmanita augustaを新種記載した。
本種には従来、誤ってヨーロッパのAmanita franchetiiの学名があてられていたが、両者の形態および系統の比較により、別種であることが示された。
本種は食用になる可能性があり、特に中毒を起こさなかった例もあるが、同亜節のAmanita rubescensが溶血性の毒素ルベスケンスリシンを含むことや、テングタケと混同しやすいことなどから、注意が必要である。
報告種: Amanita augusta★
比較種: Amanita franchetii / Amanita franchetii f. queletii / Amanita spissa
分類群: テングタケ科/Amanitaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, North American Fungi, Notholithocarpus属, アラスカ州/Alaska, オレゴン州/Oregon, カリフォルニア州/California, コナラ属/Quercus, ツガ属/Tsuga, トウヒ属/Picea, トガサワラ属/Pseudotsuga, ブナ科/Fagaceae, マツ科/Pinaceae, ワシントン州/Washington, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地理的分布/geographical distribution, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 太平洋岸北西部/Pacific Northwest, 採集地マッピング/collection site mapping, 新種記載/new species, 森林/forest, 沿岸域/coastal area, 米国/USA, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 食毒不明/edibility unknown
中国産の黒穂菌の新属Yunchangia
原題: Yunchangia, a new genus of smut fungi (Ustilaginaceae) from China（Mycotaxon, 2013）
中国の新疆ウイグル自治区、タクラマカン砂漠で発見された黒穂菌の一種を、新属新種Yunchangia puccinelliaeを記載した。
本種はイネ科チシマドジョウツナギ属の草本Puccinellia glaucaを宿主としていた。
Yunchangia属は植物病理学者の王云章に因んで命名され、Ustilago属とは胞子堆に菌糸と黒穂胞子の両方を含む点で異なるとされた。
報告種: Yunchangia puccinelliae★
比較種: Ustilago striiformis
分類群: クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン目/Ustilaginales, クロボキン科/Ustilaginaceae, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, イネ科/Poaceae, タクラマカン砂漠/Taklamakan Desert, 中国/China, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新疆ウイグル自治区/Xinjiang, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 砂漠/desert
韓国の伝統的な味噌玉（メジュ）から分離された新種Aspergillus cibarius
原題: Aspergillus cibarius sp. nov., from traditional meju in Korea（Journal of Microbiology, 2012）
韓国京畿道で味噌玉（メジュ）から分離された菌をAspergillus cibariusとして新種記載した。
本種はこの他、オランダのブラックビーン、パン、サラミからも分離されている。
本種は培養下でEurotium型の子嚢果を形成し、旧命名規約でのEurotium属に相当する。
報告種: Aspergillus cibarius★
比較種: Eurotium amstelodami / Eurotium herbariorum
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Journal of Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, オランダ/Netherlands, 京畿道/Gyeonggi-do, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 味噌/miso, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 発酵/fermentation, 発酵食品/fermented food, 走査型電子顕微鏡/SEM, 韓国/South Korea, 食品汚染/Food contamination
タイから分離されたHyphopichiaクレードのアナモルフ酵母の新種、Candida wangnamkhiaoensis
原題: Candida wangnamkhiaoensis sp. nov., an anamorphic yeast species in the Hyphopichia clade isolated in Thailand（Antonie van Leeuwenhoek, 2012）
タイにおいてシクンシ科樹木Calycopteris floribundaの花および虫糞から分離された酵母を、新種Candida wangnamkhiaoensisとして記載した。
本種はHyphopichiaクレードに含まれ、Hyphopichia pseudoburtoniiと最も近縁であった。
報告種: Candida wangnamkhiaoensis★
比較種: Hyphopichia pseudoburtonii
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Antonie van Leeuwenhoek, タイ/Thailand, ナコーンラーチャシーマー県/Nakhon Ratchasima, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 温度適性/temperature aptitude, 資化試験/assimilation test
チリ産のコウヤクタケ類の新種および初のチェックリスト
原題: Some new species and a first checklist of corticioid fungi (Basidiomycota) from Chile（Mycological Progress, 2013）
チリ・パタゴニアから4種のコウヤクタケ類の新種を記載した。
チリにおいて初めてコウヤクタケ類のチェックリストを作成し、94種の分布、生態を記録した。
チェックリストはWebサイトで公開し、定期的に更新する予定である。
報告種: Gloeocystidiellum rajchenbergii★ / Hypochnicium patagonicum★ / Pteridomyces valdivianus★ / Stereum greslebinii★
比較種: Athelocystis spp. / Conferticium spp. / Gloeocystidiellum aspellum / Gloeocystidiellum compactum / Gloeocystidiellum formosanum / Gloeocystidiellum tabacinum / Hypochnicium aotearoae / Hypochnicium cystidiatum / Hypochnicium guineensis / Hypochnicium punctulatum / Nodotia aspera / Pteridomyces bisporus / Stereum gausapatum
分類群: ウロコタケ科/Stereaceae, グレオシスチディエルム科/Gloeocystidiellaceae, シワタケ科/Meruliaceae, タマチョレイタケ目/Polyporales, トレキスポラ目/Trechisporales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ヒドノドン科/Hydnodontaceae, ベニタケ目/Russulales, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, コウヤクタケ類/corticioid fungi, チリ/Chile, パタゴニア/Patagonia, ロス・ラゴス州/Los Lagos, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 生物多様性調査/biodiversity survey, 菌類相調査/mycofloristic survey
クヌギタケ属チシオタケ節：2新種および既知種の検索表、節の境界に関する記録
原題: Mycena sect. Galactopoda: two new species, a key to the known species and a note on the circumscription of the section（Mycosphere, 2013）
インドのケララ州から、クヌギタケ属チシオタケ節に属する新種Mycena lohithaおよびMycena babrukaを記載した。
また、チシオタケ節の全既知種を網羅する検索表を掲載した。
現在本節に含まれている菌の中には、Maas Geesteranus (1988) の概念に当てはまらない種も多いことから、本節の概念の拡張が必要だと提言した。
報告種: Mycena babruka★ / Mycena lohitha★
比較種: Mycena babruka / Mycena haematopus / Mycena insueta / Mycena kuurkacea / Mycena lohitha / Mycena mariae / Mycena parsonsiae / Mycena rubrofarcta / Mycena toyerlaricola / Mycena ura / 本種以外のチシオタケ節菌
分類群: クヌギタケ科/Mycenaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycosphere, インド/India, ケララ州/Kerala, 新種記載/new species, 検索表/identification key, 節概念/section concept
新組み合わせScheffersomyces amazonensisおよびS. ergatensis
原題: New combinations, Scheffersomyces amazonensis and S. ergatensis（Mycotaxon, 2013）
Urbina & Blackwell (2012) の複数遺伝子に基づく系統解析に基づきScheffersomyces属には7つの新組み合わせが提唱され、3つの新種が記載された。
本論文ではその分子系統解析の結果に基づき、さらにCandida amazonensisとC. ergatensisをScheffersomyces属に移した。
S. amazonensisはUrbina & Blackwell (2012) 以降のCadete et al. (2012) で新種記載された種であり、S. ergatensisは誤ってUrbina & Blackwell (2012) での記載から漏れていた。
報告種: Scheffersomyces amazonensis▲ / Scheffersomyces ergatensis▲
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新組み合わせ提唱/new combination, 材生息菌/lignicolous fungus, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast