Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
スペイン、カナリア諸島、ラ・パルマ島産の広義シメジ属2新種
原題: Two new species of Lyophyllum s.l. (Basidiomycota, Agaricomycetes) from La Palma (Canary Islands, Spain)（Mycotaxon, 2011）
カナリア諸島、ラ・パルマ島で採集された2種の菌を検討し、Lyophyllum fuscobrunneumおよびL. impudicumとして新種記載した。
前者はゴジアオイ属植物の近傍に群生し、傘が暗褐色で、子実体に穀粉臭があり、担子器がややヌメリガサ型、担子胞子が広楕円形～楕円形であることなどで特徴づけられた。
後者は子実体に悪臭があり、肉に変色性がなく、担子器が4胞子性、担子胞子が楕円形であることなどで特徴づけられた。
報告種: Lyophyllum fuscobrunneum★ / Lyophyllum impudicum★
比較種: Lyophyllum bonii / Lyophyllum brunneo-ochrascens / Lyophyllum chamaeleon / Lyophyllum fistulosum / Lyophyllum gracile / Lyophyllum ignobile / Lyophyllum pulvis-horrei
分類群: シメジ科/Lyophyllaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycotaxon, カナリア諸島/Canary Islands, ゴジアオイ属/Cistus, スペイン/Spain, ハンニチバナ科/Cistaceae, マカロネシア/Macaronesia, 呈色反応/chemical reaction, 新種記載/new species, 森林/forest, 生物多様性調査/biodiversity survey, 胞子紋/spore print
形態学的観察および分子系統解析を基に推論されたPreussia属のエンドファイトの1新種
原題: A new endophytic species of Preussia (Sporormiaceae) inferred from morphological observations and molecular phylogenetic analysis（Fungal Diversity, 2007）
スペインにおいてエンドファイトとして分離された菌を検討し、Preussia mediterraneaとして新種記載した。
本種はコナラ属、ゴジアオイ属、ハンノキ属、およびジンチョウゲ属植物の材や生葉から分離された。
本種は形態的にはP. australisなどに類似していた一方、分子系統解析ではP. minimaおよびP. isabellaeと姉妹群を形成した。
報告種: Preussia mediterranea★
比較種: Preussia africana / Preussia australis / Preussia intermedia / Preussia isabellae / Preussia minima / Preussia similis
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, スポローミア科/Sporormiaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Fungal Diversity, エストレマドゥーラ州/Extremadura, エンドファイト/endophyte, カスティーリャ・ラ・マンチャ州/Castilla-La Mancha, カバノキ科/Betulaceae, コナラ属/Quercus, ゴジアオイ属/Cistus, ジンチョウゲ属/Daphne, ジンチョウゲ科/Thymelaeaceae, スペイン/Spain, ハンニチバナ科/Cistaceae, ハンノキ属/Alnus, ブナ科/Fagaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 子実体原基/fruiting body primordium, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 硬葉樹林/sclerophyll forest, 表面殺菌法/surface sterilization method
スカンジナビアおよびアパラチア山脈新産種、Hypogymnia incurvoides
原題: Hypogymnia incurvoides new to Scandinavia and the Appalachian Mountains（Graphis Scripta, 2007）
ノルウェーおよびスウェーデンで採集されたHypogymnia incurvoidesをスカンジナビア新産種として報告した。
また、本種を米国からアパラチア山脈新産種としても報告した。
本種は沼地の森林や川辺などにおいてトウヒ属、ハンノキ属樹木の幹などに発生していた。
報告種: Hypogymnia incurvoides■
比較種: Hypogymnia krogiae / Hypogymnia physodes
分類群: ウメノキゴケ科/Parmeliaceae, チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Graphis Scripta, アパラチア山脈/Appalachian Mountains, オスロ/Oslo, カバノキ科/Betulaceae, スウェーデン/Sweden, スウェーデン新産種/Sweden_new record, トウヒ属/Picea, ヌール・トロンデラーグ県/Nord-Trøndelag, ノルウェー/Norway, ノルウェー新産種/Norway_new record, ハンノキ属/Alnus, マツ科/Pinaceae, メイン州/Maine, ヴェストラ・イェータランド県/Västra Götaland, 収蔵標本/stored specimen, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 新産種報告/new record, 森林/forest, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 水辺/waterside, 池沼/ponds and swamps, 河川/river, 稀産種/rare species, 米国/USA, 葉状地衣/foliose lichen
中国においてヤナギバグミに潰瘍病を引き起こす新種、Cytospora elaeagnicola
原題: Cytospora elaeagnicola sp. nov. Associated with Narrow-leaved Oleaster Canker Disease in China（Mycobiology, 2019）
中国、新疆ウイグル自治区において潰瘍病に罹病したヤナギバグミに生じた菌を検討し、Cytospora elaeagnicolaとして新種記載した。
本種は分生子殻が扁平で、分生子が無色ソーセージ形であることなどで特徴づけられた。
本種は複数遺伝子座に基づく分子系統解析でも独自の系統を形成し、近縁種とは分生子のサイズやコロニーの色などについて形態的差異を認めた。
報告種: Cytospora elaeagnicola★
比較種: Cytospora elaeagni / Cytospora nivea / Cytospora spiraeae
分類群: Cytosporaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ディアポルテ目/Diaporthales, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Mycobiology, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, グミ属/Elaeagnus, グミ科/Elaeagnaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新疆ウイグル自治区/Xinjiang, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 潰瘍病/canker
リボソームITSおよびRPB2配列に基づく新種Nemania plumbeaおよび類縁分類群の系統関係
原題: Phylogenetic relationships of Nemania plumbea sp. nov. and related taxa based on ribosomal ITS and RPB2 sequences（Mycological Research, 2007）
タイ、チエンマイ県で採集された菌を検討し、Nemania plumbeaとして新種記載した。
本種は子座が灰色で柔らかく、子嚢胞子が淡褐色で短い発芽溝を有し、培養下でGeniculosporium属類似アナモルフを形成することなどで特徴づけられた。
ITS+RPB2に基づく分子系統解析では、本種はN. aeneaなどに近縁であることが示された。
報告種: Nemania plumbea★
比較種: Nemania aenea / Nemania aenea var. macrospora / Nemania chestersii / Nemania diffusa / Nemania gwyneddii / Nemania latissima / Nemania quadrata / Nemania serpens / Nemania subaenea
分類群: クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, クロサイワイタケ目/Xylariales, クロサイワイタケ科/Xylariaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Mycological Research, TreeBASE, タイ/Thailand, チエンマイ県/Chiang Mai, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 生物多様性調査/biodiversity survey, 腐生菌/saprobe
オマーンおよびパキスタン産の壊滅的なマンゴーの萎凋病を引き起こす新種Ceratocystis manginecans
原題: Ceratocystis manginecans sp. nov., causal agent of a destructive mango wilt disease in Oman and Pakistan（Fungal Diversity, 2007）
オマーンおよびパキスタンにおいてマンゴーに深刻な病害を引き起こしている病原菌を検討し、Ceratocystis manginecansとして新種記載した。
本種は広義のC. fimbriata複合種とは形態的に異なり、分子系統解析でも異なる系統を形成した。
本種と比較したブラジル産の標本もこの複合種の別の隠蔽種とみられたが、2菌株しか検討していないことから新種記載しなかった。
報告種: Ceratocystis manginecans★
比較種: Ceratocystis fimbriata / Ceratocystis platani
分類群: セラトシスティス科/Ceratocystidaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, ミクロアスカス目/Microascales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Fungal Diversity, Hypocryphalus属, ウルシ科/Anacardiaceae, オマーン/Oman, キクイムシ科/Scolytidae, パキスタン/Pakistan, ブラジル/Brazil, マンゴー属/Mangifera, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 散布様式/dispersal style, 新種記載/new species, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 未記載種/undescribed species, 材生息菌/lignicolous fungus, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮下キクイムシ/bark beetle, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 温度適性/temperature aptitude, 生物地理学/biogeography, 移入種/alien species, 萎凋病/wilt, 虫散布/dispersal by insects, 複合種/species complex, 隠蔽種/cryptic species
カリフォルニアにおいてブドウおよびその他の果実やナッツの作物の罹病根に関連するcylindrocarpon類似種の分類および複数遺伝子座に基づく系統解析
原題: Taxonomy and multi-locus phylogeny of cylindrocarpon-like species associated with diseased roots of grapevine and other fruit and nut crops in California（Fungal Systematics and Evolution, 2019）
米国カリフォルニア州においてブドウの”black foot”病およびその他の果実やナッツの根病害を調査し、5属12種のcylindrocarpon類似種を認めた。
カイノキ属樹木を宿主とするNeonectria californicaおよびオリーブ属樹木とモモを宿主とするThelonectria aureaの2新種を記載した。
Dactylonectria属のほとんどの種においては、同定のためにHISマーカーが必須であった。
報告種: Campylocarpon fasciculare / Dactylonectria alcacerensis / Dactylonectria ecuadoriensis / Dactylonectria macrodidyma / Dactylonectria novozelandica / Dactylonectria torresensis / Dactylonectria valentina / Ilyonectria capensis / Ilyonectria liriodendri / Ilyonectria robusta / Neonectria californica★ / Thelonectria aurea★
比較種: Neonectria ditissima / Neonectria major / Neonectria neomacrospora / Thelonectria truncata
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌綱/Ascomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Fungal Systematics and Evolution, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ウルシ科/Anacardiaceae, オリーブ属/Olea, カイノキ属/Pistacia, カリフォルニア州/California, クルミ属/Juglans, クルミ科/Juglandaceae, サクラ属/Prunus, バラ科/Rosaceae, ブドウ属/Vitis, ブドウ科/Vitaceae, マタタビ属/Actinidia, マタタビ科/Actinidiaceae, モクセイ科/Oleaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 多犯性菌/plurivorous fungus, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 果樹園/orchard, 根圏/rhizosphere, 根腐病/root rot, 植林地/plantation, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 温度適性/temperature aptitude, 生物多様性調査/biodiversity survey, 米国/USA, 表面殺菌法/surface sterilization method
新種Kirschsteiniothelia arasbaranicaおよびキルシュシュタイニオテリア科の修正
原題: Kirschsteiniothelia arasbaranica sp. nov., and an emendation of the Kirschsteiniotheliaceae（Cryptogamie Mycologie, 2017）
イランにおいてコナラ属樹木の枯枝に生じた菌を検討し、Kirschsteiniothelia arasbaranicaとして新種記載した。
本種は子嚢が円筒状棍棒形で8胞子性、子嚢胞子が狭楕円形～広楕円形で1隔壁を有し、顕著な粘液質の鞘に包まれることなどで特徴づけられ、アナモルフは形成しなかった。
また、キルシュシュタイニオテリア科の科概念を修正し、20種を含む検索表を掲載した。
報告種: Kirschsteiniothelia arasbaranica★
比較種: Kirschsteiniothelia dolioloides / Kirschsteiniothelia thujina
分類群: Kirschsteiniotheliales, キルシュシュタイニオテリア科/Kirschsteiniotheliaceae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Cryptogamie Mycologie, イラン/Iran, コナラ属/Quercus, ブナ科/Fagaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 東アーザルバーイジャーン州/East Azerbaijan, 森林/forest, 検索表/identification key, 生長速度/growth rate, 科概念/family concept, 科概念の修正/family concept_emendation, 腐生菌/saprobe
新種Orbilia vermiformisおよびそのアナモルフ
原題: Orbilia vermiformis sp. nov. and its anamorph（Mycotaxon, 2007）
中国雲南省において広葉樹の腐朽した根に生じた菌を検討し、Orbilia vermiformisとして新種記載した。
本種は培養下でアナモルフを形成したが、線虫捕捉構造は誘導されなかった。
アナモルフをDactylella vermiformisとして新種記載した。
報告種: Dactylella vermiformis★ / Orbilia vermiformis★
比較種: Dactylella arrhenopa / Dactylella polyctona / Dactylella pseudoclavata / Orbilia crystallina
分類群: Arthrobotryaceae, オルビリアキン亜綱/Orbiliomycetidae, オルビリアキン目/Orbiliales, オルビリアキン綱/Orbiliomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Mycotaxon, vital taxonomy, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, フランス/France, マルティニーク/Martinique, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 根圏/rhizosphere, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 生長速度/growth rate, 西インド諸島/The West Indies, 雲南省/Yunnan
クロアチア、ヴェテルニツァ洞窟のモニタリング調査におけるPolycephalomyces属菌および分離された新属Perennicordyceps
原題: The genus Polycephalomyces (Hypocreales) in the frame of monitoring Veternica cave (Croatia) with a new segregate genus Perennicordyceps（Ascomycete.org, 2014）
クロアチア、ヴェテルニツァ洞窟においてトゲハネバエ科の一種の成虫に発生したシンネマ形成性寄生菌の一種を検討し、Polycephalomyces ramosusと同定した。
また、新属Perennicordyceps属を提唱し、Polycephalomyces属の4種を本新属に移した。
PerennicordycepsおよびPolycephalomyces属の検索表を掲載した。
報告種: Perennicordyceps cuboidea▲ / Perennicordyceps paracuboidea▲ / Perennicordyceps prolifica▲ / Perennicordyceps ryogamiensis▲ / Polycephalomyces ramosus
比較種: Perennicordyceps cuboidea / Perennicordyceps paracuboidea / Polycephalomyces formosus
分類群: オフィオコルディセプス科/Ophiocordycipitaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Ascomycete.org, Heteromyza属, vital taxonomy, アナモルフ菌/anamorphic fungi, クロアチア/Croatia, ザグレブ市/Zagreb, シンネマ形成菌/synnematous fungus, トゲハネバエ科/Heleomyzidae, 二酸化炭素濃度/carbon dioxide concentration, 冬虫夏草/entomoparasitic mushrooms, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 呈色反応/chemical reaction, 地下生菌/hypogeous fungi, 地理的分布/geographical distribution, 寄生菌/parasite, 属概念/genus concept, 属概念の修正/genus concept_emendation, 山地/mountains, 採集地マッピング/collection site mapping, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 昆虫寄生菌/entomoparasitic fungus, 昆虫病原菌/entomopathogenic fungus, 材生息菌/lignicolous fungus, 検索表/identification key, 洞窟/cave, 気温/temperature, 湿度/humidity, 石灰岩/limestone
ドイツ新産のコケ寄生性盤菌の2種、Lamprospora hispanicaおよびLamprospora tuberculatella
原題: Lamprospora hispanica und Lamprospora tuberculatella – zwei bryoparasitische Discomyceten (Ascomycota, Pezizales) neu für Deutschland（Zeitschrift für Mykologie, 2014）
コケ寄生性盤菌のLamprospora hispanicaおよびL. tuberculatellaをドイツ新産種として報告した。
前者はAloina aloidesおよび新宿主のTrichostomum crispulum、後者はおそらくコゴケ属の一種をそれぞれ宿主としていた。
両種が発生していた環境は土地利用の変化に伴いドイツ全土で危機に瀕していることから、両種も絶滅が危惧されると考えられた。
報告種: Lamprospora hispanica■ / Lamprospora tuberculatella■
比較種: Lamprospora ascoboloides / Lamprospora cailletii / Lamprospora maireana / Lamprospora norvegica / Lamprospora rehmii / Lamprospora seaveri / Lamprospora tuberculata
分類群: チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, ピロネマキン科/Pyronemataceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2014年の論文/published in 2014, Zeitschrift für Mykologie, クチヒゲゴケ属/Trichostomum, コケ寄生菌/bryoparasitic fungus, コゴケ属/Weissia, ザクセン＝アンハルト州/Sachsen-Anhalt, センボンゴケ科/Pottiaceae, テューリンゲン州/Thüringen, ドイツ/Germany, ドイツ新産種/Germany_new record, ドイツ語/German, ニーダーザクセン州/Niedersachsen, ロカイゴケ属/Aloina, 保全生態学/conservation ecology, 半乾燥地域/semi-arid area, 寄生菌/parasite, 撹乱地/disturbed place, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 稀産種/rare species, 粘土質土壌/clayey soil, 絶滅危惧種/endangered species, 草地/grassland, 走査型電子顕微鏡/SEM
メキシコの雲霧林に産した新種Leucodermia guzmaniana、およびメキシコ産Leucodermia属地衣の検索表
原題: Leucodermia guzmaniana sp. nov. (Physciaceae, Lecanorales), a new species from Mexican cloud forest, and a key to Leucodermia in Mexico（Asian Journal of Mycology, 2019）
メキシコ、ベラクルス州の雲霧林に産した樹上生葉状～亜樹状地衣の一種を検討し、Leucodermia guzmanianaとして新種記載した。
本種は粉芽が末端生で、葉縁の白色のシリアにK+紫色の赤色色素を伴うことなどで特徴づけられた。
本新種を含むメキシコ産Leucodermia属地衣全種の検索表を掲載した。
報告種: Leucodermia guzmaniana★
比較種: Heterodermia arvidssonii / Heterodermia kurokawae / Heterodermia linearis / Heterodermia rubrotricha / Leucodermia appalachensis / Leucodermia leucomelos
分類群: チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピンゴケ目/Caliciales, ムカデゴケ科/Physciaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Asian Journal of Mycology, アカネ科/Rubiaceae, アトラノリン類/atranorins, カエンボク属/Spathodea, クチナシ属/Gardenia, コケ上に生える菌/fungi on moss, コナラ属/Quercus, サラジン酸類/salazinic acids, サリチル酸類/salicylic acids, ツツジ属/Rhododendron, ツツジ科/Ericaceae, ノウゼンカズラ科/Bignoniaceae, ヒドロキシ安息香酸類/hydroxybenzoic acids, フウ属/Liquidambar, フウ科/Altingiaceae, ブナ科/Fagaceae, ベラクルス州/Veracruz, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, メキシコ/Mexico, ラクトン類/lactones, 二次代謝産物/secondary metabolite, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 新種記載/new species, 森林/forest, 検索表/identification key, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 樹状地衣/fruticose lichen, 紫外線蛍光/UV fluorescence, 葉状地衣/foliose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 雲霧林/cloud forest
ヒト呼吸器試料から分離された潜在的病原菌の新種、Fusarium volatile
原題: Fusarium volatile, a new potential pathogen from a human respiratory sample（Fungal Systematics and Evolution, 2019）
仏領ギアナ在住の22歳女性の気管支肺胞洗浄液から分離された菌を検討し、Fusarium volatileとして新種記載した。
本種は分子系統解析でF. fujikuroi複合種のアフリカクレードに含まれた。
本種は抗真菌薬感受性試験ではエキノキャンディンなどに耐性を示した一方、アムホテリシンBなどに対するMICは低値であった。
報告種: Fusarium volatile★
比較種: Fusarium acutatum / Fusarium coicis / Fusarium fujikuroi / Fusarium nygamai / Fusarium proliferatum / Fusarium ramigenum / Fusarium sacchari / Fusarium verticillioides
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Fungal Systematics and Evolution, MIC, アゾール系抗真菌薬/azole antifungals, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イネ属/Oryza, イネ科/Poaceae, ナイジェリア/Nigeria, ヒト病原菌/human pathogen, フランス/France, 仏領ギアナ/French Guiana, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 感染様式/mode of infection, 抗真菌薬/antifungal drug, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 抗真菌薬耐性/antifungal drug resistance, 日和見感染症/opportunistic infection, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 検索表/identification key, 気管支肺胞洗浄液/bronchoalveolar lavage fluid, 水試料/water sample, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 病原真菌/pathogenic fungi, 症例報告/case report, 肺フザリウム症/pulmonary fusariosis, 臨床検体/clinical specimens, 複合種/species complex
台湾産の子実体が青色で子実層托が管孔状のクヌギタケ属1新種
原題: A new Mycena species with blue basidiomata and porioid hymenophore from Taiwan（Mycoscience, 2019）
台湾において枯死したトウ属植物に生じた菌を検討し、Mycena indigoticaとして新種記載した。
本種は子実体全体が青色で、管孔を有することなどで特徴づけられた。
本種は分子系統解析ではM. illuminansに最も近縁とみられ、本種はこのクレードにおいて管孔を有する初の種であった。
報告種: Mycena indigotica★
比較種: Favolaschia calamicola / Favolaschia spp. / Mycena cyanorhiza / Mycena illuminans / Mycena interrupta / Mycena lazulina
分類群: クヌギタケ科/Mycenaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Mycoscience, TreeBASE, トウ属/Calamus, ヤシ生息菌/palmicolous fungus, ヤシ科/Arecaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 台湾/Taiwan, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 新北市/New Taipei, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus
ロシア、ノヴゴロド州新産のハラタケ類
原題: Agaricoid Fungi New to Novgorod Region, Russia（Botanica, 2019）
ロシア、ノヴゴロド州新産種として23種のハラタケ類を報告した。
そのうちGamundia striatulaなど5種はヨーロッパ・ロシア北西部における新産種であった。
また、Baeospora myriadophyllaなど3種は絶滅危惧種であった。
報告種: Baeospora myriadophylla■ / Coprinopsis urticicola■ / Cortinarius bibulus■ / Crepidotus applanatus■ / Crepidotus crocophyllus■ / Delicatula integrella■ / Entoloma strigosissimum■ / Galerina jaapii■ / Gamundia striatula■ / Lacrymaria lacrymabunda■ / Lentinus tigrinus■ / Lepiota felina■ / Marasmius cohaerens■ / Mycena erubescens■ / Mycena renati■ / Mycena tenerrima■ / Mycenella margaritispora■ / Mycetinis querceus■ / Pholiotina brunnea■ / Pluteus hispidulus■ / Pluteus inquilinus■ / Sagaranella tylicolor■ / Xerocomellus ripariellus■
比較種: Xerocomellus rubellus
分類群: Crepidotaceae, イグチ目/Boletales, イグチ科/Boletaceae, イッポンシメジ科/Entolomataceae, ウラベニガサ科/Pluteaceae, オキナタケ科/Bolbitiaceae, キシメジ科/Tricholomataceae, クヌギタケ科/Mycenaceae, シメジ科/Lyophyllaceae, タマチョレイタケ目/Polyporales, タマチョレイタケ科/Polyporaceae, ツキヨタケ科/Omphalotaceae, ナヨタケ科/Psathyrellaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, フウセンタケ科/Cortinariaceae, フウリンタケ科/Cyphellaceae, ホウライタケ科/Marasmiaceae, モエギタケ科/Strophariaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Botanica, アンモニア菌/ammonia fungi, コケ上に生える菌/fungi on moss, コナラ属/Quercus, ノヴゴロド州/Novgorod, ブナ科/Fagaceae, リター菌/litter fungi, ロシア/Russia, 保全生態学/conservation ecology, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 果実生息菌/fruit inhabiting fungus, 森林/forest, 生物多様性調査/biodiversity survey, 稀産種/rare species, 絶滅危惧種/endangered species, 草地/grassland, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 菌類相調査/mycofloristic survey
Usnea confusaのレクトタイプ指定
原題: Lectotypification of Usnea confusa (Parmeliaceae, Ascomycota)（Bulletin of the National Museum of Nature and Science Series B Botany, 2019）
Usnea confusaを再検討し、本種のレクトタイプ標本を指定した。
タイプ標本が異質な10標本で構成されていたことから、分類学的混乱を避けるため、粉芽塊に”isidiofibrils”を多数伴う単一の地衣体を選定した。
日本および台湾産の標本を基に分子系統解析を実施したところ、本種はU. cornutaコアグループに含まれたが、両種が同種かどうかは確定できないとした。
報告種: Usnea confusa
比較種: Usnea cornuta
分類群: ウメノキゴケ科/Parmeliaceae, チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Bulletin of the National Museum of Nature and Science Series B Botany, ウスニン酸類/usnic acids, オキセピン類/oxepins, カバノキ属/Betula, カバノキ科/Betulaceae, サクラ属/Prunus, サラジン酸類/salazinic acids, サリチル酸類/salicylic acids, スギ属/Cryptomeria, スチクチン酸類/stictic acids, セトラル酸類/cetraric acids, タイプスタディ/type study, ツガ属/Tsuga, バラ科/Rosaceae, ヒノキ属/Chamaecyparis, ヒノキ科/Cupressaceae, ビャクシン属/Juniperus, プロトセトラル酸類/protocetraric acids, ベンゾフラン類/benzofurans, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, モミ属/Abies, ラクトン類/lactones, レクトタイプ指定/lectotype designation, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 分類未確定/classification undetermined, 切片/section, 収蔵標本/stored specimen, 台湾/Taiwan, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 日本/Japan, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 樹状地衣/fruticose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
イタリアおよびロシアにおいて草本に発生したParastagonospora属2新種
原題: Two novel species of Parastagonospora (Phaeosphaeriaceae, Pleosporales) on grasses from Italy and Russia（Asian Journal of Mycology, 2019）
イネ科植物に生じた腐生菌2種を検討し、Parastagonospora elymiおよびP. macrouniseptataとして新種記載した。
前者はロシアにおいてシバムギの枯稈に生じ、子嚢果が類球形～円錐形、子嚢胞子が無色紡錘形で成熟時3隔壁を有することなどで特徴づけられた。
後者はイタリアにおいてカモガヤの枯稈に生じ、分生子果不完全菌であり、分子絵師が無色類円筒形～円筒形で平滑、1隔壁を有することなどで特徴づけられた。
報告種: Parastagonospora elymi★ / Parastagonospora macrouniseptata★
比較種: Parastagonospora allouniseptata / Parastagonospora avenae / Parastagonospora uniseptata
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フェオスフェリア科/Phaeosphaeriaceae, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Asian Journal of Mycology, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イタリア/Italy, イネ科/Poaceae, エゾムギ属/Elymus, エミリア＝ロマーニャ州/Emilia-Romagna, カモガヤ属/Dactylis, リター菌/litter fungi, ロシア/Russia, ロストフ州/Rostov, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 森林/forest, 植林地/plantation, 腐生菌/saprobe
Melanops属の基準種、Melanops tulasneiの分類、系統、およびエピタイプ指定
原題: Taxonomy, phylogeny, and epitypification of Melanops tulasnei, the type species of Melanops（Fungal Diversity, 2009）
ドイツ、ミュンヘンにおいてコナラ属樹木の枝に生じたMelanops tulasneiについて、形態学的検討および分子系統解析を実施した。
本標本の形態はネオタイプ標本とよく一致し、分子系統解析で本種はボトリオスフェリア科クレードの基部付近に位置した。
本種のエピタイプ標本を指定し、エピタイプ由来菌株をCBSに寄託した。
報告種: Melanops tulasnei
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ボトリオスフェリア目/Botryosphaeriales, ボトリオスフェリア科/Botryosphaeriaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2009年の論文/published in 2009, Fungal Diversity, TreeBASE, エピタイプ指定/epitype designation, コナラ属/Quercus, タイプスタディ/type study, ドイツ/Germany, バイエルン州/Bayern, ブナ科/Fagaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 種内変異/intraspecific variation, 胞子形成誘導/sporulation induction
チェコ産コウヤクタケ類について (2)：Athelidium caucasicum
原題: Notes on corticioid fungi of the Czech Republic. II. Athelidium caucasicum (Stephanosporaceae, Agaricales)（Czech Mycology, 2019）
チェコからAthelidium caucasicumを報告し、記載文、写真、スケッチなどを掲載した。
本報告はロシア、コーカサスからの原記載以来2番目の報告となった。
本種は原記載のヤナギ属ではなくトネリコ属植物の材に発生していた。
報告種: Athelidium caucasicum■
比較種: Athelia phycophila / Athelidium aurantiacum
分類群: ステファノスポラ科/Stephanosporaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Czech Mycology, コウヤクタケ類/corticioid fungi, チェコ/Czech, チェコ新産種/Czech_new record, トネリコ属/Fraxinus, モクセイ科/Oleaceae, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 稀産種/rare species, 種内変異/intraspecific variation