Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
パキスタン、パンジャーブ州南部、ハジルプール・フォレスト産の新種Crinipellis graminea
原題: Crinipellis graminea sp. nov. (Marasmiaceae), a novel taxon from Hasilpur forest, southern Punjab, Pakistan（Phytotaxa, 2025）
パキスタン、パンジャーブ州において路傍の草地に発生した菌を検討し、Crinipellis gramineaとして新種記載した。
本種は傘中央部が橙色でクッション形～扁平凸形、傘表面が放射状繊維紋～皺状、担子胞子が稀に倒卵状であること、縁シスチジアおよび側シスチジアの形状などで特徴づけられた。
本種は類似する同属他種と形態的に異なり、分子系統解析でも独自の系統を形成した。
報告種: Crinipellis graminea★
比較種: Crinipellis malesiana / Crinipellis nigricaulis var. macrospora / Crinipellis pseudosplachnoides / Crinipellis pseudostipitaria / Crinipellis rhizomaticola / Crinipellis scabella / Crinipellis trichialis / Crinipellis tucumanensis
分類群: Crinipellieae, Marasmiineae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ホウライタケ科/Marasmiaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, Phytotaxa, パキスタン/Pakistan, パンジャーブ州（パキスタン）/Punjab (Pakistan), 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 気温/temperature, 腐生菌/saprobe, 草地/grassland, 降水量/precipitation
イギリス新産のイッポンシメジ類、Entoloma ammophilumおよびEntoloma coracis
原題: Entoloma ammophilum and Entoloma coracis: Two New Species of Pinkgill for the UK（Field Mycology, 2025）
スコットランド北部における菌類調査で採集された2種の菌をEntoloma ammophilumおよびE. coracisと同定した。
両種は形態および分子データに基づき同定され、いずれもイギリス新産種として報告された。
後者は特に、イギリスでよく記録されているE. corvinumに非常に類似しているが、その種はアルプスに限って分布することが示されているので、実際には本種である可能性も指摘された。
報告種: Entoloma ammophilum■ / Entoloma coracis■
比較種: Entoloma corvinum
分類群: Tricholomatineae, イッポンシメジ科/Entolomataceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, Field Mycology, イギリス/United kingdom, イギリス新産種/United Kingdom_new record, スコットランド/Scotland, ハイランド/Highland, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, 分子同定/molecular identification, 固有種/endemic species, 新産種報告/new record, 森林/forest, 沿岸域/coastal area, 石灰質土壌/calcareous soil, 砂質土壌/sandy soil, 草地/grassland
Rhodocybe–Clitopilusクレードの生体栄養性および腐生性を有する菌：中国亜熱帯産の2新種と1新産種
原題: Biotrophic and saprophytic fungi from the Rhodocybe-Clitopilus clade (Entolomataceae): two new species and one new record in subtropical China（MycoKeys, 2025）
中国江蘇省で採集された2種の菌を検討し、Clitopilus parasiticusおよびRhodocybe zijinshanensisとして新種記載した。
前者はオシダ属のシダやチヂミザサの葉に発生する寄生菌である一方、地上からも発生し、後者は広葉樹林内の材に発生した木材腐朽菌であった。
また、中国新産種としてC. baroniiを報告した。
報告種: Clitopilus baronii■ / Clitopilus parasiticus★ / Rhodocybe zijinshanensis★
比較種: Clitopilus baronii / Clitopilus daamsii / Clitopilus hobsonii / Clitopilus parasiticus / Clitopilus passeckerianus / Clitopilus pinsitus / Clitopilus velutinus / Clitopilus venososulcatus / RRhodocybe gemina / Rhodocybe alutacea / Rhodocybe asyae / Rhodocybe nuciolens / Rhodocybe pseudoalutacea / Rhodocybe subasyae
分類群: Tricholomatineae, イッポンシメジ科/Entolomataceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, MycoKeys, イネ科/Poaceae, オシダ属/Dryopteris, オシダ科/Dryopteridaceae, シダ生息菌/fern inhabiting fungus, チヂミザサ, 中国/China, 中国新産種/China_new record, 亜熱帯域/subtropics, 亜熱帯林/subtropical forest, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 寄生菌/parasite, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 気温/temperature, 江蘇省/Jiangsu, 腐生菌/saprobe, 走査型電子顕微鏡/SEM, 降水量/precipitation
カキノキ円星落葉病の原因菌、Plurivorosphaerella nawaeの系統、形態、疫学、および防除戦略
原題: Phylogeny, Morphology, Epidemiology, and Control Strategies for Plurivorosphaerella nawae, the Causal Agent of Circular Leaf Spot in Persimmon（Research in Plant Disease, 2025）
韓国慶尚北道で発生したカキノキ円星落葉病の病原菌Mycosphaerella nawaeの系統、形態、疫学、および防除戦略について検討した。
また、分子系統解析の結果から、本種に対して新属Plurivorosphaerellaを提唱した。
本種の胞子散布時期、感染時期、感染葉の二次代謝物変化、および効果的な殺菌剤防除プログラムについて記述した。
報告種: Plurivorosphaerella nawae▲
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, マイコスフェレラ科/Mycosphaerellaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, Research in Plant Disease, カキノキ属/Diospyros, カキノキ科/Ebenaceae, タンニン/tannin, フェノロジー/phenology, フェノール類/phenols, フラボノイド/flavonoids, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 培養性状/colony characteristics, 多犯性菌/plurivorous fungus, 宿主範囲/host range, 寄生菌/parasite, 感染様式/mode of infection, 感染率/infection rate, 慶尚北道/Gyeongsangbuk-do, 抗酸化活性/antioxidant activity, 散布様式/dispersal style, 斑点病/spot disease, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 果樹園/orchard, 植林地/plantation, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 殺真菌剤/fungicide, 胞子の発芽/germination of spores, 胞子散布/spore dispersal, 葉面菌/leaf surface fungi, 韓国/South Korea, 韓国語
中国チベット自治区においてAlnus nepalensisの葉の斑点病および枝の潰瘍病を引き起こすDiaporthe属菌
原題: Species of Diaporthe (Diaporthaceae, Diaporthales) associated with Alnus nepalensis leaf spot and branch canker diseases in Xizang, China（MycoKeys, 2025）
中国チベット自治区においてAlnus nepalensisの葉の斑点病および枝の潰瘍病を引き起こす菌を検討し、3種を見出した。
葉の斑点からは新種Diaporthe alnicolaと既知種D. amygdali、枝からは新種D. linzhiensisが同定された。
A. nepalensisをD. amygdaliの新宿主として報告した。
報告種: Diaporthe alnicola★ / Diaporthe amygdali / Diaporthe linzhiensis★
比較種: Diaporthe alnicola / Diaporthe heterophyllae / Diaporthe virgiliae
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ディアポルテ目/Diaporthales, ディアポルテ科/Diaporthaceae, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, MycoKeys, アナモルフ菌/anamorphic fungi, カバノキ科/Betulaceae, チベット自治区/Tibet, ハンノキ属/Alnus, ペアワイズホモプラシーインデックス/pairwise homoplasy index, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 枝枯病/branch blight, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 潰瘍病/canker, 系統ネットワーク/phylogenetic network, 葉面菌/leaf surface fungi, 表面殺菌法/surface sterilization method, 複合種/species complex
形態および分子解析に基づく中国産Penicillium属2新種
原題: Two new species of Penicillium (Eurotiales, Aspergillaceae) from China based on morphological and molecular analyses（MycoKeys, 2025）
中国で採集された2種を検討し、Penicillium lentumおよびP. tibetenseとして新種記載した。
前者は北京市でハウスダストから分離され、Brevicompacta節に含まれ、生長が遅く、分生子柄が主に三輪生であることなどで特徴づけられた。
後者はチベット自治区で草本の根圏土壌から分離され、Lanata-Divaricata節に含まれ、生長が速く、分生子柄が主に二輪生であることなどで特徴づけられた。
報告種: Penicillium lentum★ / Penicillium tibetense★
比較種: Penicillium excelsum / Penicillium tularense
分類群: コウジカビ科/Aspergillaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム目/Eurotiales, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, MycoKeys, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, エールリヒ反応/Ehrlich reaction, チベット自治区/Tibet, ハウスダスト/house dust, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北京市/Beijing, 土壌希釈法/soil dilution method, 土壌平板法/soil plate method, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 室内環境/indoor condition, 希釈平板法/dilution plate method, 新種記載/new species, 根圏/rhizosphere, 生長速度/growth rate, 走査型電子顕微鏡/SEM, 酸産生/acid production
CLITOCYBE SCLEROTOIDEA：当該寄生きのこの記載およびAtractosporocybe属への転属
原題: CLITOCYBE SCLEROTOIDEA: Description of This Parasitic Mushroom and Transfer To The Genus Atractosporocybe（Spore Prints, 2025）
米国の太平洋岸北西部に分布するClitocybe sclerotoideaについて、Helvella属子嚢菌に寄生する種であることを示した。
また、担子胞子の形態を根拠に、本種をAtractosporocybe属に含まれるものとして扱った。
新鮮な標本の形態観察により、先行研究よりも大型の担子器の存在を明らかにした。
報告種: Clitocybe sclerotoidea
分類群: Clitocybaceae, Tricholomatineae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, Spore Prints, ノボリリュウ属/Helvella, ノボリリュウ科/Helvellaceae, ワシントン州/Washington, 太平洋岸北西部/Pacific Northwest, 寄生菌/parasite, 新形質報告/new character, 新組み合わせ提唱/new combination, 森林/forest, 種内変異/intraspecific variation, 米国/USA, 胞子紋/spore print, 菌寄生菌/mycoparasite
Coprinellus属菌がPsathyrella属菌であることが判明した珍奇な事例
原題: The curious case of the Coprinellus that turned out to be a Psathyrella（Field Mycology, 2025）
イギリス、ノーフォークにおいてシカの糞に発生した小型のハラタケ型菌類を検討した。
当初Coprinellus parvulusと同定されたが、DNA解析によりPsathyrella tenuiculaであることが判明した。
本種はイギリスでは1997年の記録に次ぐ2番目の記録となった。
報告種: Psathyrella tenuicula■
分類群: Agaricineae, ナヨタケ科/Psathyrellaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, DNAバーコーディング/DNA barcoding, Field Mycology, イギリス/United kingdom, イングランド/England, シカ科/Cervidae, ノーフォーク/Norfolk, 再発見/rediscovery, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 文献調査/literature survey, 新産種報告/new record, 湿室法/moist chamber method, 糞生菌/coprophilous fungi, 誤同定/misidentification
日本においてホトトギス属とスゲ属植物の間で宿主交代する新種、Puccinia speciosa
原題: Puccinia speciosa, sp. nov., host-alternates between Tricyrtis and Carex in Japan（Mycologia, 2001）
広島県で採集された、ホトトギス属複数種とショウジョウスゲの間で宿主交代を行うさび菌の一種を検討し、Puccinia speciosaとして新種記載した。
接種試験により前者で精子・さび胞子世代、後者で夏胞子・冬胞子世代を確認した。
本種はホトトギス属植物における初のさび菌であり、同じスゲ属植物を宿主とする同属他種とは夏胞子・冬胞子世代の形態が異なっていた。
報告種: Puccinia speciosa★
比較種: Puccinia breviculmis / Puccinia caricis-blepharicarpae / Puccinia caricis-conicae / Puccinia hibayamensis
分類群: Uredinineae, サビキン亜門/Pucciniomycotina, サビキン目/Pucciniales, サビキン綱/Pucciniomycetes, プクシニア科/Pucciniaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2001年の論文/published in 2001, Mycologia, さび菌/rust fungi, カヤツリグサ科/Cyperaceae, スゲ属/Carex, ホトトギス属, ユリ科/Liliaceae, 寄生菌/parasite, 広島県/Hiroshima, 接種試験/inoculation test, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新種記載/new species, 日本/Japan, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 異種寄生性/heteroecism
中国西天山山脈の野生果樹林においてPrunus divaricataとアンズにショットホール病を引き起こすWilsonomyces carpophilus分離株の形態、DNA系統、および病原性
原題: Morphology, DNA Phylogeny, and Pathogenicity of Wilsonomyces carpophilus Isolate Causing Shot-Hole Disease of Prunus divaricata and Prunus armeniaca in Wild-Fruit Forest of Western Tianshan Mountains, China（Forests, 2020）
中国西天山山脈の野生果樹林においてPrunus divaricataとアンズに発生したショットホール病を検討した。
25菌株を分離し、形態形質および分子系統解析の結果から病原菌をWilsonomyces carpophilusと同定した。
分離菌株は形態的に8グループに分類されたが、系統的グループとは一致せず高い遺伝的多様性が示され、病原性は全ての分離菌株が有していた。
報告種: Wilsonomyces carpophilus
分類群: Dothidotthiaceae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2020年の論文/published in 2020, Forests, アナモルフ菌/anamorphic fungi, コッホの原則/Koch_s postulation, サクラ属/Prunus, バラ科/Rosaceae, リニアグロース/linear growth, 中国/China, 保全生態学/conservation ecology, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 天山山脈/Tian Shan, 寄生菌/parasite, 山地/mountains, 感染率/infection rate, 接種試験/inoculation test, 新疆ウイグル自治区/Xinjiang, 果実生息菌/fruit inhabiting fungus, 森林/forest, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 生長速度/growth rate, 病原力/virulence, 種内変異/intraspecific variation, 統計解析/statistical analysis, 絶滅危惧種/endangered species, 胞子の発芽/germination of spores
タイで発見されたアナモルフ酵母の新種、Candida tanticharoeniae
原題: Candida tanticharoeniae sp. nov., a novel anamorphic yeast species found in Thailand（Journal of General and Applied Microbiology, 2010）
タイ、ソンクラー県において虫糞から分離されたアナモルフ酵母の一種を検討し、Candida tanticharoeniaeとして新種記載した。
本種は培養下で特徴的な偽菌糸を形成すること、D1/D2領域の塩基配列が最も近縁な未同定株とも34塩基異なっていることなどで特徴づけられた。
本種は最も近縁なC. savonicaとはGC含量やL-アラビニトールの資化能が異なっていた。
報告種: Candida tanticharoeniae★
比較種: Candida savonica
分類群: Pichiomycetes, Serinales, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, GC含量/GC content, Journal of General and Applied Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, スライド培養法/slide culture method, ソンクラー県/Songkhla, タイ/Thailand, デンプン/starch, ビタミン要求性/vitamin requirement, ユビキノン/ubiquinone, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 発酵試験/fermentation test, 糞生菌/coprophilous fungi, 虫糞/insect frass, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酸産生/acid production
マングローブにおいて水中に沈んだ植物基質から分離された酵母の3新種、Candida chanthaburiensis、Candida kungkrabaensis、およびCandida suratensis
原題: Candida chanthaburiensis sp. nov., Candida kungkrabaensis sp. nov. and Candida suratensis sp. nov., three novel yeast species from decaying plant materials submerged in water of mangrove forests（Antonie van Leeuwenhoek, 2010）
タイのマングローブ林において水中に沈んだ植物基質から分離された3種の酵母を検討し、Candida chanthaburiensis、C. kungkrabaensis、およびC. suratensisとして新種記載した。
これらの種はそれぞれチャンタブリー県のRhizophora apiculata樹皮、チャンタブリー県の不明樹種の枯枝、スラートターニー県の枯れ葉から分離された。
各種はD1/D2領域に基づく分子系統解析や様々な表現型形質により最も近縁な種と識別された。
報告種: Candida chanthaburiensis★ / Candida kungkrabaensis★ / Candida suratensis★
比較種: Candida intermedia / Candida nivariensis / Candida pseudohaemulonii
分類群: Pichiomycetes, Serinales, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2010年の論文/published in 2010, Antonie van Leeuwenhoek, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, スライド培養法/slide culture method, スラートターニー県/Surat Thani, タイ/Thailand, チャンタブリー県/Chanthaburi, チュムポーン県/Chumphon, デンプン/starch, トラート県/Trat, ヒルギ科/Rhizophoraceae, プラチュワップキーリーカン県/Prachuap Khiri Khan, ペッチャブリー県/Phetchaburi, マングローブ林/mangrove forest, ヤエヤマヒルギ属/Rhizophora, ユビキノン/ubiquinone, リター菌/litter fungi, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 水生菌/aquatic fungi, 沿岸域/coastal area, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 温度適性/temperature aptitude, 発酵試験/fermentation test, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 集積培養/enrichment culture
日本、台湾、タイで見出されたCandida intermediaクレードのアナモルフ酵母属Candidaの3新種
原題: Three novel species of the anamorphic yeast genus Candida in the Candida intermedia clade found in Japan（The Journal of General and Applied Microbiology, 2011）
日本、タイ、台湾で分離されたアナモルフ酵母の4菌株を検討した。
分子系統解析の結果などからCandida berkhoutiae、C. ezoensis、およびC. inulinophilaの3新種を記載した。
これらの新種はそれぞれタイ・ナコーンパトム県の虫糞、北海道利尻島のマツ林土壌、タイ・ナコーンシータンマラート県の未同定の野生きのこの子実体から分離された。
報告種: Candida berkhoutiae★ / Candida ezoensis★ / Candida inulinophila★
比較種: Candida berkhoutiae / Candida ezoensis / Candida inulinophila
分類群: Pichiomycetes, Serinales, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, GC含量/GC content, The Journal of General and Applied Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, イネ科/Poaceae, ウレアーゼ試験/urease test, スライド培養法/slide culture method, タイ/Thailand, タケ生息菌/bambusicolous fungus, デンプン/starch, ナコーンシータンマラート県/Nakhon Si Thammarat, ナコーンパトム県/Nakhon Pathom, ビタミン要求性/vitamin requirement, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, ユビキノン/ubiquinone, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北海道/Hokkaido, 台中市/Taichung, 台湾/Taiwan, 呈色反応/chemical reaction, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 日本/Japan, 最大生長温度/maximum growth temperature, 森林/forest, 発酵試験/fermentation test, 糞生菌/coprophilous fungi, 虫糞/insect frass, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酸産生/acid production
中国においてユチャに感染するペスタロチオイド菌類の多様性と病原性
原題: Diversity and pathogenicity of pestalotioid fungi infecting Camellia oleifera in China（Scientific Reports, 2025）
中国四川省のユチャ畑で発生した病害を調査し、3種のペスタロチオイド菌類を同定した。
そのうち1種をNeopestalotiopsis foliiとして新種記載し、ユチャをPestalotiopsis trachycarpicolaとP. hispanicaの新宿主として報告した。
接種試験によりこれらの種の病原性を確かめた。
報告種: Neopestalotiopsis folii★ / Pestalotiopsis hispanica / Pestalotiopsis trachycarpicola
比較種: Neopestalotiopsis vheenae
分類群: アンフィスフェリア目/Amphisphaeriales, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, ペスタロティプシス科/Pestalotiopsidaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, Scientific Reports, アナモルフ菌/anamorphic fungi, コッホの原則/Koch_s postulation, ツバキ属/Camellia, ツバキ科/Theaceae, リニアグロース/linear growth, 中国/China, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 四川省/Sichuan, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 斑点病/spot disease, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新種記載/new species, 植林地/plantation, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 炭疽病/anthracnose, 生物多様性調査/biodiversity survey, 生長速度/growth rate, 病原力/virulence, 葉面菌/leaf surface fungi, 表面殺菌法/surface sterilization method
Ciborinia camelliaeの分子特性調査により種内変異が示され、病原菌の大陸間移動が示唆される
原題: Molecular Characterization of Ciborinia camelliae Kohn Shows Intraspecific Variability and Suggests Transcontinental Movement of the Pathogen（Microorganisms, 2023）
ツバキの病原菌であるCiborinia camelliaeについて、世界13地域由来の47菌株を用いてMLST法とUP-PCR法で検討した。
ヨーロッパ産の菌株間では高い類似性が示された一方、ニュージーランドと中国由来の菌株では多様性が認められた。
フランスとニュージーランドで同一の遺伝子プロファイルが確認されたことから、感染植物の移動による病原菌の大陸間移動の可能性が示唆された。
報告種: Ciborinia camelliae
分類群: キンカクキン科/Sclerotiniaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ビョウタケ目/Helotiales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2023年の論文/published in 2023, Jaccardの類似度指数/Jaccard similarity index, Microorganisms, MLST, PCRフィンガープリンティング/PCR fingerprinting, クラスター分析/cluster analysis, コッホの原則/Koch_s postulation, ツバキ属/Camellia, ツバキ科/Theaceae, ニュージーランド/New Zealand, フランス/France, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地理的分布/geographical distribution, 地理的起源/geographical origin, 培養性状/colony characteristics, 接種試験/inoculation test, 散布図/scatter plot, 正準変量分析, 生物地理学/biogeography, 生物多様性調査/biodiversity survey, 種内変異/intraspecific variation, 花枯病, 花生息菌/floricolous fungus, 菌核病/kinkaku-byo, 表面殺菌法/surface sterilization method
南米南部産広義Peziza属菌の再検討および再配置
原題: A reexamination and realignment of Peziza sensu lato (Pezizomycetes) species in southern South America（Darwiniana nueva serie, 2022）
アルゼンチンとチリの温帯林で採集された広義Peziza属標本について、形態学的検討および分子系統解析に基づき再検討した。
その結果から、検討した種を9つの異なる属に再配置した。
Pe. gamundiaeを新種記載し、新組み合わせPhylloscypha nothofagetiを提唱したほか、Pustularia microsporaをPe. pseudosylvestrisのシノニムとした。
報告種: Daleomyces petersii / Geoscypha tenacella / Geoscypha violacea / Legaliana badia / Paragalactinia succosa / Paragalactinia succosella / Peziza bonaerensis / Peziza cerea / Peziza cf. ammophila / Peziza domiciliana / Peziza echinospora / Peziza fimeti / Peziza gamundiae★ / Peziza pseudosylvestris / Peziza repanda / Peziza sylvestris / Peziza tosta / Peziza varia / Peziza vesiculosa / Phylloscypha nothofageti▲ / Rhodopeziza tuberculata
比較種: Paragalactinia succosa / Paragalactinia succosella / Peziza arvernensis / Peziza cerea / Peziza domiciliana / Peziza oliviae / Peziza ostracoderma / Peziza praetervisa / Peziza pseudosylvestris / Peziza pseudosyvestris / Peziza sylvestris / Peziza varia / Peziza violacea
分類群: チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ科/Pezizaceae, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2022年の論文/published in 2022, Darwiniana nueva serie, アルゼンチン/Argentina, コナラ属/Quercus, シクエストレート菌/sequestrate fungus, シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, チリ/Chile, ティエラ・デル・フエゴ州/Tierra del Fuego, トガサワラ属/Pseudotsuga, ナンキョクブナ属/Nothofagus, ナンキョクブナ科/Nothofagaceae, ナンヨウスギ属/Araucaria, ナンヨウスギ科/Araucariaceae, ネウケン州/Neuquén, フェノロジー/phenology, ブナ科/Fagaceae, マガジャネス・イ・デ・ラ・アンタルティカ・チレーナ州/Magallanes y la Antártica Chilena, マツ科/Pinaceae, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, ラ・アラウカニア州/Araucanía, リオネグロ州/Río Negro (Argentina), ロス・ラゴス州/Los Lagos, ロス・リオス州/Los Ríos, 分子同定/molecular identification, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 半地下生菌/semihypogeous fungus, 呈色反応/chemical reaction, 命名法/nomenclature, 地理的分布/geographical distribution, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 属概念/genus concept, 山地/mountains, 採集地マッピング/collection site mapping, 撹乱地/disturbed place, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 未記載種/undescribed species, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 標本入手不可/specimen not available, 水辺/waterside, 沿岸域/coastal area, 海岸砂丘/coastal dune, 温帯域/temperate zone, 温帯林/temperate forest, 焼け跡菌/carbonicolous fungus, 砂丘/dune, 砂地/sand, 移入種/alien species, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 複合種/species complex
カナダにおいて木本の枝枯病と潰瘍病を引き起こすCytospora属菌調査のツールとしてのDNAバーコーディング
原題: DNA Barcoding as a Tool for Surveying Cytospora Species Associated with Branch Dieback and Canker Diseases of Woody Plants in Canada（DNA, 2025）
カナダのオンタリオ州およびサスカチュワン州において様々な樹木に枝枯病、潰瘍病を引き起こすCytospora属菌を調査した。
59菌株を分離し、DNAバーコーディングと形態観察により15種の既知種を同定した。
同定された種の多くは以前にも樹木病原菌として報告されており、C. piceaeが針葉樹以外からも分離されたことから、本属における宿主特異性の低さが示唆された。
報告種: Cytospora chrysosperma / Cytospora curvata / Cytospora euonymina / Cytospora hoffmannii / Cytospora kantschavelii / Cytospora leucosperma / Cytospora leucostoma / Cytospora nitschkeana / Cytospora piceae / Cytospora populina / Cytospora pruinopsis / Cytospora pruinosa / Cytospora ribis / Cytospora schulzeri / Cytospora sorbina
分類群: Cytosporaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ディアポルテ目/Diaporthales, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2025年の論文/published in 2025, DNA, DNAバーコーディング/DNA barcoding, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, オンタリオ州/Ontario, カエデ属/Acer, カナダ/Canada, サスカチュワン州/Saskatchewan, トウヒ属/Picea, ナナカマド属/Sorbus, ニレ属/Ulmus, ニレ科/Ulmaceae, ハシドイ属/Syringa, バラ科/Rosaceae, マツ科/Pinaceae, ムクロジ科/Sapindaceae, モクセイ科/Oleaceae, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, 不稔菌糸/sterile mycelium, 優占種/dominant species, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 多犯性菌/plurivorous fungus, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 材生息菌/lignicolous fungus, 枝枯病/branch blight, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 潰瘍病/canker, 生長速度/growth rate, 胴枯病/dogare-byo (canker), 表面殺菌法/surface sterilization method
クサカゲロウのChrysoperla comancheおよびChrysoperla carneaから分離された新種Metschnikowia chrysoperlae、新種Candida picachoensis、および新種Candida pimensis
原題: Metschnikowia chrysoperlae sp. nov.,  Candida picachoensis sp. nov. and  Candida pimensis sp. nov., isolated from the green lacewings Chrysoperla comanche and Chrysoperla carnea (Neuroptera: Chrysopidae)（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2004）
米国アリゾナ州でヒメクサカゲロウ属昆虫の消化管から分離された3種の酵母を検討し、Metschnikowia chrysoperlae、Candida picachoensis、C. pimensisとして新種記載した。
各新種はいずれもM. pulcherrimaに近縁であったが異なる系統を形成した。
M. chrysoperlaeのみ細長い子嚢と針形の子嚢胞子を形成したが、残りの2種は有性世代を形成しなかった。
報告種: Candida picachoensis★ / Candida pimensis★ / Metschnikowia chrysoperlae★
比較種: Candida picachoensis / Candida pimensis / Metschnikowia chrysoperlae / Metschnikowia pulcherrima
分類群: Pichiomycetes, Serinales, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, メチュニコウィア科/Metschnikowiaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2004年の論文/published in 2004, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, アリゾナ州/Arizona, クサカゲロウ科, デンプン/starch, ヒメクサカゲロウ属, ビタミン要求性/vitamin requirement, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 昆虫と菌の共生関係/symbiotic relationship of insects and fungi, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 発酵試験/fermentation test, 米国/USA, 腸内生息菌/fungus in intestinal tract, 資化試験/assimilation test, 遺伝子型/genotype, 酵母/yeast
中国海南省産の新種、Ellisembia appendiculata
原題: Ellisembia appendiculata sp. nov. from Hainan, China（Mycotaxon, 2022）
中国海南省で広葉樹の枯枝に発生した菌を検討し、Ellisembia appendiculataとして新種記載した。
本種は分生子柄が明瞭で分枝せず、分生子形成細胞が単出芽型、分生子が楕円形または倒棍棒形で1-2本の無色糸状で分枝することもある付属糸を有することなどで特徴づけられた。
本種と類似種との形質比較表を掲載した。
報告種: Ellisembia appendiculata★
比較種: Ellisembia brachypus / Ellisembia filia / Ellisembia flagelliformis / Ellisembia magnibrachypus
分類群: Sporidesmiales, スポリデスミウム科/Sporidesmiaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2022年の論文/published in 2022, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, 中国/China, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 気温/temperature, 海南省/Hainan, 熱帯域/tropics, 異隔壁/distoseptum, 降水量/precipitation, 難培養性菌/uncultured fungi