Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
米国東部において小川および河川から分離された新種Phytophthora caryae
原題: Phytophthora caryae sp. nov., a new species recovered from streams and rivers in the eastern United States（Plant Pathology, 2016）
米国マサチューセッツ州およびノースカロライナ州において河川から分離された卵菌の一種を検討し、Phytophthora caryaeとして新種記載した。
本種はP. citricola複合種に含まれ、分子系統解析でP. piniおよびP. citricola IIIに近縁であり、造卵器の基部が細まることが多いことなどで特徴づけられた。
本種は接種試験でペカン属樹木に対する病原性を示した一方、クルミ属樹木には病原性を示さなかった。
報告種: Phytophthora caryae★
比較種: Phytophthora acerina / Phytophthora citricola / Phytophthora pachypleura / Phytophthora pini / Phytophthora plurivora
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2016年の論文/published in 2016, Plant Pathology, クルミ科/Juglandaceae, コッホの原則/Koch_s postulation, ノースカロライナ州/North Carolina, ペカン属/Carya, マサチューセッツ州/Massachusetts, リニアグロース/linear growth, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 卵菌類/Oomycetes, 地理的分布/geographical distribution, 地理的起源/geographical origin, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水試料/water sample, 河川/river, 淡水域/freshwater, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 立ち枯れ病/tachigare-byo (wilt), 米国/USA, 統計解析/statistical analysis, 胞子形成誘導/sporulation induction, 萎凋病/wilt, 複合種/species complex, 選択培地/selective medium, 釣菌法/baiting method
中国の亜熱帯林において小川の水から分離された新種、Phytophthora pseudopolonica
原題: Phytophthora pseudopolonica sp. nov., a new species recovered from stream water in subtropical forests of China（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017）
中国四川省の亜熱帯林において小川の水から分離された卵菌の一種を検討し、Phytophthora pseudopolonicaとして新種記載した。
本種は造卵器が平滑、造精器が側着性で時に底着性であり、厚壁胞子および球形の菌糸の膨大部を豊富に形成した。
本種の生育適温は30°Cで、分子系統解析ではクレード9の種に近縁であった。
報告種: Phytophthora pseudopolonica★
比較種: Phytophthora insolita / Phytophthora polonica
分類群: クロミスタ/Chromista, ツユカビ目/Peronosporales, ツユカビ科/Peronosporaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2017年の論文/published in 2017, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, コッホの原則/Koch_s postulation, 中国/China, 亜熱帯域/subtropics, 亜熱帯林/subtropical forest, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 卵菌類/Oomycetes, 四川省/Sichuan, 培養性状/colony characteristics, 接種試験/inoculation test, 最大生長温度/maximum growth temperature, 最小生長温度/minimum growth temperature, 森林/forest, 水生菌/aquatic fungi, 河川/river, 淡水域/freshwater, 温度適性/temperature aptitude, 選択培地/selective medium, 釣菌法/baiting method
韓国産のPhaeophyscia属地衣および類縁のアトラノリンを欠く分類群の改訂
原題: Revision of the Lichen Genus Phaeophyscia and Allied Atranorin Absent Taxa (Physciaceae) in South Korea（Microorganisms, 2019）
韓国産のPhaeophyscia属およびそれに近縁の地衣類約650標本を検討した。
新組み合わせPhysciella poeltiiを提唱し、韓国新産種として3種を報告した一方、4種を韓国産地衣類の一覧から除外した。
全世界のPhaeophyscia属およびPhysciella属地衣の検索表を掲載した。
報告種: Hyperphyscia crocata / Phaeophyscia adiastola / Phaeophyscia endococcinodes / Phaeophyscia exornatula / Phaeophyscia hirtella / Phaeophyscia hirtuosa / Phaeophyscia hispidula / Phaeophyscia hunana■ / Phaeophyscia leana■ / Phaeophyscia limbata / Phaeophyscia primaria / Phaeophyscia pyrrhophora / Phaeophyscia rubropulchra / Phaeophyscia sonorae■ / Phaeophyscia spinellosa / Phaeophyscia squarrosa / Physciella melanchra / Physciella poeltii▲
比較種: Hyperphyscia adglutinata / Hyperphyscia pandani / Phaeophyscia adiastola / Phaeophyscia ciliata / Phaeophyscia constipata / Phaeophyscia endococcina / Phaeophyscia endococcinodes / Phaeophyscia endophoenicea / Phaeophyscia erythrocardia / Phaeophyscia exornatula / Phaeophyscia fumosa / Phaeophyscia hirtella / Phaeophyscia hirtuosa / Phaeophyscia hispidula / Phaeophyscia kairamoi / Phaeophyscia laciniata / Phaeophyscia leage / Phaeophyscia leana / Phaeophyscia limbata / Phaeophyscia nashii / Phaeophyscia primaria / Phaeophyscia pyrrhophora / Phaeophyscia sciastra / Phaeophyscia sonorae / Phaeophyscia spinellosa / Phaeophyscia squarrosa / Phaeophyscia trichophora / Physcia erythrocardia / Physciella chloantha / Physciella denigrata / Physciella nepalensis
分類群: チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピンゴケ目/Caliciales, ムカデゴケ科/Physciaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Microorganisms, コケ上に生える菌/fungi on moss, コナラ属/Quercus, サクラ属/Prunus, ゼオリン類/zeorins, トリテルペン類/triterpenes, バラ科/Rosaceae, ブナ科/Fagaceae, 二次代謝産物/secondary metabolite, 亜熱帯域/subtropics, 亜熱帯林/subtropical forest, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 慶尚南道/Gyeongsangnam-do, 新産種報告/new record, 新組み合わせ提唱/new combination, 未知成分/unknown component, 森林/forest, 検索表/identification key, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 江原道/Kangwon-do, 沿岸域/coastal area, 済州特別自治道/Jeju, 稀産種/rare species, 種内変異/intraspecific variation, 葉状地衣/foliose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 誤同定/misidentification, 韓国/South Korea, 韓国新産種/South Korea_new record
セファロテコイドの殻壁を有するChaetomidium属の新種C. vicugnaeについて、およびそのケートミア科との類縁関係
原題: On a new species of Chaetomidium, C. vicugnae, with a cephalothecoid peridium and its relationships with Chaetomiaceae (Sordariales)（Ascomycete.org, 2018）
チリのアタカマ砂漠においてビクーニャの糞に生じた菌を検討し、Chaetomidium vicugnaeとして新種記載した。
本種は子嚢胞子が狭楕円形～紡錘形で2つの発芽孔を有し、殻壁の毛がごく淡色であることなどで特徴づけられた。
ケートミア科の属レベルの検索表およびセファロテコイドの殻壁を有するChaetomidium/Corynascella属の検索表を掲載した。
報告種: Chaetomidium vicugnae★
比較種: Chaetomidium arxii / Chaetomidium biapiculatum / Chaetomidium cephalothecoides / Chaetomidium hyalotrichum / Chaetomidium leptoderma / Chaetomidium megasporum / Corynascella arabica
分類群: ケタマカビ科/Chaetomiaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ目/Sordariales, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Ascomycete.org, アントファガスタ州/Antofagasta, チリ/Chile, ビクーニャ属/Vicugna, ラクダ科/Camelidae, 宿主選好性/host selectivity, 新種記載/new species, 検索表/identification key, 沿岸域/coastal area, 湿室法/moist chamber method, 砂漠/desert, 糞生菌/coprophilous fungi, 胞子の発芽/germination of spores
海産珪藻に寄生するベーサルな卵菌類の新属新種Miracula helgolandicaおよび新種Olpidiopsis drebesii、およびEctrogella属類似種の分類について
原題: Phylogeny of Miracula helgolandica gen. et sp. nov. and Olpidiopsis drebesii sp. nov., two basal oomycete parasitoids of marine diatoms, with notes on the taxonomy of Ectrogella-like species（Mycological Progress, 2017）
ドイツにおいて珪藻のPseudo-nitzschia pungensとRhizosolenia imbricataにそれぞれ寄生していた2種の卵菌を検討し、新属新種Miracula helgolandicaおよび新種Olpidiopsis drebesiiとして報告した。
前者は残りの卵菌類全てと姉妹群を形成し、後者は海産Olpidiopsis属菌のクレードに含まれたが、部分的なnrSSU配列しか得られていないので正確な系統的位置は推測不能であった。
Ectrogella属類似種とOlpidiopsis属の卵菌について議論した。
報告種: Miracula helgolandica★ / Olpidiopsis drebesii★
分類群: Miraculaceae, オルピディオプシス目/Olpidiopsidales, クロミスタ/Chromista, フクロカビモドキ科/Olpidiopsidaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Mycological Progress, Pseudo-nitzschia属, Rhizosolenia属, カナダ/Canada, クサリケイソウ科/Bacillariaceae, クローニング/cloning, シュレースヴィヒ＝ホルシュタイン州/Schleswig-Holstein, ツツガタケイソウ科/Rhizosoleniaceae, ドイツ/Germany, プリンスエドワードアイランド州/Prince Edward Island, 内部寄生菌/internal parasitic fungus, 分類未確定/classification undetermined, 卵菌類/Oomycetes, 宿主特異性/host specificity, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 水生菌/aquatic fungi, 海生菌/marine fungi, 珪藻/diatom, 藻類寄生菌/algae parasitic fungus, 藻類生息菌/algicolous fungus
イスラエルにおいてアボカドに炭疽病を引き起こす、新種を含むColletotrichum属菌の疫学、病原性、および同定
原題: Epidemiology, pathology and identification of Colletotrichum including a novel species associated with avocado (Persea americana) anthracnose in Israel（Scientific Reports, 2017）
イスラエルにおいてアボカドに炭疽病を引き起こすColletotrichum属菌の多様性調査を実施し、果実、葉、枝から分離された576菌株を検討した。
形態学的検討および分子系統解析により8種を同定し、さらにC. perseaeを新種記載して病原性を確かめた。
また、C. aenigmaのテレオモルフを記載した。
報告種: Colletotrichum aenigma / Colletotrichum perseae★
分類群: グロメレラ目/Glomerellales, グロメレラ科/Glomerellaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, RAPD解析/RAPD analysis, Scientific Reports, TreeBASE, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イスラエル/Israel, クスノキ科/Lauraceae, コッホの原則/Koch_s postulation, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, ポストハーベスト病害/post-harvest disease, リニアグロース/linear growth, ワニナシ属/Persea, 中央地区（イスラエル）/Central District (Israel), 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 北部地区（イスラエル）/Northern District (Israel), 南部地区（イスラエル）/Southern District (Israel), 単胞子分離/single spore isolation, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 多犯性菌/plurivorous fungus, 実腐病/fruit rot, 寄生菌/parasite, 感染率/infection rate, 接種試験/inoculation test, 斑点病/spot disease, 新形質報告/new character, 新病害報告/new disease, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 果実生息菌/fruit inhabiting fungus, 果樹園/orchard, 植林地/plantation, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 湿室法/moist chamber method, 炭疽病/anthracnose, 生活環/life cycle, 生物多様性調査/biodiversity survey, 生長速度/growth rate, 病害評価尺度/disease rating scale, 胞子形成誘導/sporulation induction, 茎腐病/stem rot, 表面殺菌法/surface sterilization method, 複合種/species complex, 越冬/wintering
ブラジル産のCunninghamella clavata：西半球新産種
原題: Cunninghamella clavata from Brazil: A new record for the western hemisphere（Mycotaxon, 2017）
ブラジル、ペルナンブーコ州の大西洋岸森林において土壌から分離された菌を検討し、Cunninghamella clavataと同定した。
本種は従来中国のみから報告されており、西半球における新産種として報告された。
ブラジル産Cunninghamella属菌の検索表を掲載した。
報告種: Cunninghamella clavata■
比較種: Cunninghamella echinulata / Cunninghamella intermedia
分類群: Mucoromyceta, クスダマカビ科/Cunninghamellaceae, ケカビ亜門/Mucoromycotina, ケカビ目/Mucorales, ケカビ綱/Mucoromycetes, ケカビ門/Mucoromycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Mycotaxon, アメリカ大陸新産種/Americas_new record, ブラジル/Brazil, ブラジル新産種/Brazil_new record, ペルナンブーコ州/Pernambuco, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 半乾燥地域/semi-arid area, 南米新産種/South America_new record, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 大西洋岸森林/Atlantic forest, 新産種報告/new record, 森林/forest, 検索表/identification key, 気温/temperature, 降水量/precipitation
インドの床屋の近くから分離された好地性クレードの皮膚糸状菌の新種、Nannizzia graeserae
原題: Nannizzia graeserae sp nov, a new dermatophyte of geophilic clade isolated from vicinity of a barbershop in India（Kavaka, 2018）
インド、マハーラーシュトラ州においてヘアーベイト法で土壌から分離された好ケラチン菌の一種を検討し、Nannizzia graeseraeとして新種記載した。
本種は特異な棍棒形～円筒形で粗面の大分生子を形成することなどで特徴づけられた。
本種はインドから初めて報告された皮膚糸状菌であり、37°Cで生育可能であることから動物への感染可能性が考えられた。
報告種: Nannizzia graeserae★
比較種: Nannizzia fulva / Nannizzia gallinae / Nannizzia percicolor / Nannizzia praecox
分類群: アースロデルマ科/Arthrodermataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホネタケ目/Onygenales, ユーロチウム亜綱/Eurotiomycetidae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Kavaka, アナモルフ菌/anamorphic fungi, インド/India, ヒト病原菌/human pathogen, ヘアーベイト法/hair bait method, マハーラーシュトラ州/Maharashtra, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 好ケラチン菌/kerationophillic fungus, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 生長速度/growth rate, 病原真菌/pathogenic fungi, 皮膚真菌症/dermatomycosis, 皮膚糸状菌/dermatophyte, 稀産種/rare species, 走査型電子顕微鏡/SEM, 釣菌法/baiting method
南西太平洋、ノーフォーク島に産したEugeniella属の樹皮生地衣2新種
原題: Two new corticolous species of Eugeniella (lichenized Ascomycota, Pilocarpaceae) from Norfolk Island, south-western Pacific Ocean（Australasian Lichenology, 2019）
ノーフォーク島からEugeniella pacificaおよびE. zeorinaの樹皮生地衣2新種を記載した。
前者は地衣体が灰白色疣状で子嚢胞子が狭楕円形、短楕円形、または広楕円形で3隔壁を有し、スチクチン酸を含むことなどで特徴づけられた。
後者は前者と顕微鏡的形質がほぼ同一であったが、子実下層がより厚く、子嚢胞子の形態が異なり、スチクチン酸に加えてゼオリンを豊富に含むことなどで特徴づけられた。
報告種: Eugeniella pacifica★ / Eugeniella zeorina★
比較種: Eugeniella farinosa / Eugeniella micrommata / Eugeniella pacifica / Eugeniella palleola / Eugeniella usnica / Eugeniella zeorina
分類群: チャシブゴケ目/Lecanorales, チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ピロカルポン科/Pilocarpaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Australasian Lichenology, アトラノリン類/atranorins, オキセピン類/oxepins, オーストラリア/Australia, スチクチン酸類/stictic acids, ゼオリン類/zeorins, トリテルペン類/triterpenes, ノーフォーク島/Norfolk Island, ヒドロキシ安息香酸類/hydroxybenzoic acids, 二次代謝産物/secondary metabolite, 亜熱帯域/subtropics, 亜熱帯林/subtropical forest, 亜熱帯雨林/subtropical rainforest, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 新種記載/new species, 森林/forest, 検索表/identification key, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 痂状地衣/crustose lichen, 葉上生地衣/foliicolous lichen, 蓚酸カルシウム/calcium oxalate, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
Lichen fuscatusの保存されたタイプ
原題: The conserved type of Lichen fuscatus [≡ Acarospora fuscata]（Mycotaxon, 2019）
Acarospora fuscataの基礎異名、Lichen fuscatusのホロタイプおよびアイソタイプ標本を検討した。
それらの形態学的検討のみに基づく記載文を掲載した。
また、タイプ標本から得られた塩基配列を基に分子系統解析を実施した。
報告種: Acarospora fuscata
分類群: チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホウネンゴケ亜綱/Acarosporomycetidae, ホウネンゴケ目/Acarosporales, ホウネンゴケ科/Acarosporaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Mycotaxon, ジロホール酸/gyrophoric acid, タイプスタディ/type study, 二次代謝産物/secondary metabolite, 保留名/conserved name, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 命名法/nomenclature, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 安息香酸類/benzoic acids, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 痂状地衣/crustose lichen, 種内変異/intraspecific variation, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
中国産の新種、Gliocladiopsis wuhanensis
原題: Gliocladiopsis wuhanensis sp. nov. from China（Mycotaxon, 2019）
中国湖北省において土壌から分離された菌を検討し、Gliocladiopsis wuhanensisとして新種記載した。
本種は分生子柄に三次の分枝を有することなどで特徴づけられた。
本種は近縁で形態的に類似する種とは分生子柄の分枝および分生子の長さなどが異なっていた。
報告種: Gliocladiopsis wuhanensis★
比較種: Gliocladiopsis curvata / Gliocladiopsis forsbergii / Gliocladiopsis guangdongensis / Gliocladiopsis whileyi
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, ナス属/Solanum, ナス科/Solanaceae, 中国/China, 亜熱帯域/subtropics, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌希釈法/soil dilution method, 土壌平板法/soil plate method, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 希釈平板法/dilution plate method, 新種記載/new species, 湖北省/Hubei, 畑地/farmland
DNAバーコーディングによりLodderomycesクレードにおける新属新種Nematodospora valgiおよび新種Candida cetoniaeが明らかになった
原題: DNA barcoding revealed Nematodospora valgi gen. nov., sp. nov. and Candida cetoniae sp. nov. in the Lodderomyces clade（Fungal Biology, 2016）
ブルガリアにおいて酵母の生物多様性調査を実施し、ハナムグリ亜科の甲虫から分離された酵母を新属新種Nematodospora valgiおよび新種Candida cetoniaeとして記載した。
前者は分子系統解析において、Lodderomycesクレードの基底部で独自の系統を形成した。
Nematodosporaは子嚢胞子が独特な線虫のような形状をとることなどで特徴づけられた。
報告種: Candida cetoniae★ / Nematodospora valgi★
比較種: Candida bohiensis / Candida chauliodes / Candida corydali / Candida jiufengensis / Candida pseudojiufengensis
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, デバリオマイセス科/Debaryomycetaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2016年の論文/published in 2016, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, DNAバーコーディング/DNA barcoding, Fungal Biology, Oxythyrea属, TreeBASE, Valgus属, ウレアーゼ試験/urease test, キュステンディル州/Kyustendil, コガネムシ科/Scarabaeidae, ソフィア市/Sofia, デンプン/starch, ハナムグリ属/Cetonia, ビタミン要求性/vitamin requirement, ブルガリア/Bulgaria, ヴァルナ州/Varna, 二型性/dimorphism, 交配試験/mating test, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 山地/mountains, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 散布様式/dispersal style, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 温度適性/temperature aptitude, 生物地理学/biogeography, 生物多様性調査/biodiversity survey, 発酵試験/fermentation test, 腸内生息菌/fungus in intestinal tract, 草地/grassland, 虫散布/dispersal by insects, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酵母叢/yeast flora
イランにおいて未耕作地土壌から分離されたNeocosmospora vasinfectaの初報告
原題: First report of Neocosmospora vasinfecta isolated from uncultivated soil in Iran（Rostaniha, 2018）
イラン、ケルマーンシャー州において未耕作地の土壌から分離された菌を検討した。
形態形質および分子系統解析の結果を基に、この菌をNeocosmospora vasinfectaと同定した。
本種のイランからの報告は初となった。
報告種: Neocosmospora vasinfecta■
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ニクザキン亜綱/Hypocreomycetidae, ニクザキン目/Hypocreales, ネクトリア科/Nectriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Rostaniha, イラン/Iran, イラン新産種/Iran_new record, ケルマーンシャー州/Kermanshah, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 土壌希釈法/soil dilution method, 土壌平板法/soil plate method, 土壌菌/soil fungi, 培養性状/colony characteristics, 希釈平板法/dilution plate method, 新産種報告/new record
海生ボーダーライン地衣類の隠れた多様性および新目コレモプシディウム目
原題: Hidden diversity of marine borderline lichens and a new order of fungi: Collemopsidiales (Dothideomyceta)（Fungal Diversity, 2016）
従来キサントピレニア科に含まれていたCollemopsidium属地衣に対し、新目コレモプシディウム目を提唱した。
複数遺伝子に基づく分子系統解析により、本目がDothideomycetaクレードに含まれることが示された。
化石情報による較正を用いて分岐年代を推定するとともに、GMYC法により潜在的種境界を推定した。
タグ: 2016年の論文/published in 2016, BEAST, Fungal Diversity, GMYC法/GMYC method, 側系統群/paraphyletic group, 分子時計/molecular clock, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分岐年代推定/divergence time estimation, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣内生菌/endolichenic fungus, 地衣生菌/lichenicolous fungus, 地衣類/lichen, 多系統群/polyphyletic group, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新目提唱/new order, 水生地衣類/aquatic lichen, 水生菌/aquatic fungi, 水辺/waterside, 池沼/ponds and swamps, 河川/river, 沿岸域/coastal area, 海生菌/marine fungi, 海藻/seaweed, 淡水域/freshwater, 珪質岩/siliceous rocks, 痂状地衣/crustose lichen, 石灰岩/limestone, 種の境界/species delimitation, 藍藻地衣/cyanolichen, 藻類生息菌/algicolous fungus, 被果地衣類/pyrenocarpous lichen, 走査型電子顕微鏡/SEM
パキスタン北西部に産したAmanita cinisとA. olivovaginataの2新種および新産種A. emodotrygon
原題: Amanita cinis and A. olivovaginata (Basidiomycota, Amanitaceae), two new species, and the first record of A. emodotrygon, from Northwestern Pakistan（Turkish Journal of Botany, 2019）
パキスタン北西部で採集された2種の菌を検討し、Amanita cinisおよびA. olivovaginataとして新種記載した。
前者はRoanokenses節、後者はVaginatae節に含まれた。
また、インドから知られていたA. emodotrygonをパキスタン新産種として報告した。
報告種: Amanita cinis★ / Amanita emodotrygon■ / Amanita olivovaginata★
比較種: Amanita caojizong / Amanita gymnopus / Amanita kotohiraensis / Amanita macrocarpa / Amanita magniverrucata / Amanita nana / Amanita neoovoidea / Amanita oberwinklerana / Amanita olivaceofusca / Amanita ovalispora / Amanita proxima / Amanita pseudovaginata / Amanita pyramidata / Amanita rubiginosa / Amanita subovalispora / Amanita vaginata
分類群: テングタケ科/Amanitaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Turkish Journal of Botany, UNITE, カイバル・パクトゥンクワ州/Khyber Pakhtunkhwa, パキスタン/Pakistan, パキスタン新産種/Pakistan_new record, ヒマラヤ山脈/Himalayas, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, モミ属/Abies, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 山地/mountains, 採集地マッピング/collection site mapping, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 森林/forest, 気温/temperature, 温帯域/temperate zone, 温帯林/temperate forest, 湿度/humidity, 砂質ローム土壌/sandy loam soil, 砂質土壌/sandy soil, 種内変異/intraspecific variation, 腐植土/humus, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 降水量/precipitation
トリコモナスカス科のリボフラビン産生性酵母の新属新種、Diddensiella caesifluorescens
原題: Diddensiella caesifluorescens gen. nov., sp. nov., a riboflavin-producing yeast species of the family Trichomonascaceae（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012）
ハンガリーにおいて腐朽材から分離された酵母の一種を検討し、新属新種Diddensiella caesifluorescensとして記載した。
本種はヘテロタリックであり、液体培養でリボフラビンを産生した。
また、Candida属2種をDiddensiella属に移した。
報告種: Diddensiella caesifluorescens★ / Diddensiella santjacobensis▲ / Diddensiella transvaalensis▲
比較種: Diddensiella caesifluorescens / Diddensiella santjacobensis / Diddensiella transvaalensis
分類群: Trichomonascaceae, サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 1F=1N, 2012年の論文/published in 2012, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, MALDI-TOF MS, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, コナラ属/Quercus, スライド培養法/slide culture method, デンプン/starch, トネリコ属/Fraxinus, ハンガリー/Hungary, ビタミン要求性/vitamin requirement, ビタミン類/vitamins, ブナ科/Fagaceae, メチロトローフ酵母/methylotrophic yeast, モクセイ科/Oleaceae, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, リボフラビン/riboflavin, 二型性/dimorphism, 二次代謝産物/secondary metabolite, 交配型/mating type, 交配試験/mating test, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 山地/mountains, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 最大生長温度/maximum growth temperature, 材生息菌/lignicolous fungus, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 発酵試験/fermentation test, 胞子形成誘導/sporulation induction, 資化試験/assimilation test, 質量分析法/mass spectrometry, 酵母/yeast, 酸耐性試験/acid resistance test, 集積培養/enrichment culture
ブラジルにおいて沈んだ植物残渣に生じた新種、Linkosia aquatica
原題: Linkosia aquatica sp. nov. from submerged plant debris from Brazil（Mycotaxon, 2016）
ブラジルにおいて河川に沈んだ腐朽枝に生じた菌を検討し、Linkosia aquaticaとして新種記載した。
本種は分生子が円筒形、僅かに棍棒形、時に糸状であり、頂端細胞が顕著な淡褐色類棍棒形であることなどで特徴づけられた。
Linkosia属菌の検索表を掲載した。
報告種: Linkosia aquatica★
比較種: Linkosia bacilliformis / Linkosia multisepta
分類群: 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2016年の論文/published in 2016, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, バイーア州/Bahia, ブラジル/Brazil, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 検索表/identification key, 水生不完全菌/aquatic hyphomycetes, 水生菌/aquatic fungi, 河川/river, 淡水域/freshwater, 湿室法/moist chamber method, 異隔壁/distoseptum
中国海南省産の新種、Ellisembia hainanensis
原題: Ellisembia hainanensis sp. nov. from Hainan, China（Mycotaxon, 2018）
中国海南省において腐朽葉から分離された水生不完全菌の一種を検討し、Ellisembia hainanensisとして新種記載した。
本種は分生子が褐色倒棍棒形で9-11隔壁を有し、粘液質の鞘に包まれることなどで特徴づけられた。
本種と類似のEllisembia属菌の形質比較表を掲載した。
報告種: Ellisembia hainanensis★
比較種: Ellisembia antillana / Ellisembia glubolosa / Ellisembia guangdongensis / Ellisembia minigelatinosa / Ellisembia paravaginata / Ellisembia vaginata
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, リター菌/litter fungi, 中国/China, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 山地/mountains, 新種記載/new species, 水生不完全菌/aquatic hyphomycetes, 水生菌/aquatic fungi, 海南省/Hainan, 淡水域/freshwater, 生物多様性調査/biodiversity survey
Alternaria属菌の節間分布 (5)：分生子に多数の縦隔壁を形成する種
原題: Distribution of Alternaria species among sections. 5. Species producing conidia with many longitudinal septa（Mycotaxon, 2018）
Alternaria属菌のうち、分生子に多数の縦隔壁を有する種について、既存の形態学的記述から節レベルの所属を検討した。
Alternaria節に4種、Cheiranthus節に1種、Gypsophilae節に1種、Infectoriae節に2種、Panax節に2種を新たに加えた。
Cheiranthus、Gypsophilae、Panax節の完全な種名一覧を作成した。
報告種: Alternaria
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, プレオスポラ科/Pleosporaceae, ホシゴケ亜綱/Arthoniomycetidae, ホシゴケ目/Arthoniales, ホシゴケ科/Arthoniaceae, ホシゴケ菌綱/Arthoniomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Mycotaxon, アナモルフ菌/anamorphic fungi, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 分類未確定/classification undetermined
ウガンダ新産の水生黒穂菌、Doassansiopsis tomasii
原題: Doassansiopsis tomasii, an aquatic smut fungus new to Uganda（Polish Botanical Journal, 2006）
Doassansiopsis tomasiiをウガンダ新産種として報告した。
本種の報告はエチオピアからの原記載以来であり、ウガンダにおいてはビクトリア湖においてスイレン属の一種に発生した。
また、ザンビアにおけるD. nymphoidesのNymphaea nouchaliに対する偶発的感染の事例を報告した。
報告種: Doassansiopsis nymphoides / Doassansiopsis tomasii■
比較種: Doassansiopsis nymphaeae / Doassansiopsis ticonis
分類群: ウロシスティス目/Urocystidales, クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, ドアッサンシオプシス科/Doassansiopsidaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2006年の論文/published in 2006, Polish Botanical Journal, ウガンダ/Uganda, ウガンダ新産種/Uganda_new record, スイレン属/Nymphaea, スイレン科/Nymphaeaceae, 切片/section, 地理的分布/geographical distribution, 寄生菌/parasite, 採集地マッピング/collection site mapping, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水生菌/aquatic fungi, 池沼/ponds and swamps, 淡水域/freshwater, 種内変異/intraspecific variation, 走査型電子顕微鏡/SEM, 黒穂菌/smut fungi