Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
臨床上の関心があるSporothrix属3新種、Sporothrix brasiliensis、S. globosa、およびS. mexicana
原題: Sporothrix brasiliensis, S. globosa, and S. mexicana, Three New Sporothrix Species of Clinical Interest（Journal of Clinical Microbiology, 2007）
従来Sporothrix schenckiiとして扱われてきた127菌株を検討し、S. brasiliensis、S. globosa、およびS. mexicanaの3新種を記載した。
これらの種は単一遺伝子（カルモジュリン）に基づく分子系統解析でそれぞれS. schenckiiと異なる独自の系統を形成し、うち2種がヒトへの感染に関連していた。
これらの種は有色無柄の分生子の有無、30、35、37°Cでの生長、およびスクロース、ラフィノース、リビトールの資化能などの形質により認識された。
報告種: Sporothrix brasiliensis★ / Sporothrix globosa★ / Sporothrix mexicana★
比較種: Sporothrix albicans / Sporothrix brasiliensis / Sporothrix globosa / Sporothrix mexicana / Sporothrix schenckii
分類群: オフィオストマ目/Ophiostomatales, オフィオストマ科/Ophiostomataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Journal of Clinical Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, アラゴン州/Aragon, イギリス/United kingdom, イタリア/Italy, イネ科/Poaceae, インド/India, ウレアーゼ試験/urease test, コムギ属/Triticum, スポロトリコーシス/sporotrichosis, ナデシコ属/Dianthus, ナデシコ科/Caryophyllaceae, ヒト病原菌/human pathogen, ブラジル/Brazil, プエブラ州/Puebla, メキシコ/Mexico, ヨシ属/Phragmites, リオデジャネイロ州/Rio de Janeiro, 中国/China, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 加水分解試験/hydrolysis test, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 土壌菌/soil fungi, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 塩化マグネシウム耐性/magnesium chloride tolerance, 寄生菌/parasite, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 温度適性/temperature aptitude, 生長速度/growth rate, 病原真菌/pathogenic fungi, 皮膚真菌症/dermatomycosis, 米国/USA, 臨床検体/clinical specimens, 菌体外多糖/extracellular polysaccharide, 複合種/species complex, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酸産生/acid production
地衣類かエンドファイトか？：新科レプトシッリア科に含まれる謎の属Leptosillia、および新属Furfurella
原題: Lichens or endophytes? The enigmatic genus Leptosillia in the Leptosilliaceae fam. nov. (Xylariales), and Furfurella gen. nov. (Delonicicolaceae)（Persoonia, 2019）
分子系統解析の結果およびデロニシコラ科との形態・生態的差異に基づき、Leptosillia属に対して新科レプトシッリア科を提唱した。
地中海地域においてマメ科樹木の枯枝に発生していた3新種に対して新属Furfurellaを提唱した。
その他、複数種について転属、シノニム化、エピタイプ指定、レクトタイプ指定などの分類学的措置をとった。
報告種: Cresporhaphis rhoina / Furfurella luteostiolata★ / Furfurella nigrescens★ / Furfurella stromatica★ / Leptosillia acerina▲ / Leptosillia fusariospora▲ / Leptosillia macrospora▲● / Leptosillia muelleri▲ / Leptosillia pinicola▲ / Leptosillia pistaciae▲ / Leptosillia slaptonensis▲ / Leptosillia wienkampii▲ / Rhaphidicyrtis trichosporella
比較種: Furfurella luteostiolata / Furfurella nigrescens / Furfurella stromatica / Leptosillia acerina / Leptosillia fusariospora / Leptosillia macrospora / Leptosillia muelleri / Leptosillia slaptonensis / Leptosillia wienkampii / Pseudosagedia leptospora / Rhaphidicyrtis trichosporella
分類群: Delonicicolaceae, Leptosilliaceae, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, クロサイワイタケ目/Xylariales, ケートチリウム亜綱/Chaetothyriomycetidae, サネゴケ目/Pyrenulales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, トリコスフェリア目/Trichosphaeriales, トリコスフェリア科/Trichosphaeriaceae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Calicotome属, Chamaecytisus属, Persoonia, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アンダルシア州/Andalusia, イギリス/United kingdom, イングランド/England, ウルシ科/Anacardiaceae, エピタイプ指定/epitype designation, エンドファイト/endophyte, オーストリア/Austria, カエデ属/Acer, カバノキ科/Betulaceae, ギリシャ/Greece, クレタ地方/Crete, コナラ属/Quercus, サリー/Surrey (England), シノニム/synonym, タイプスタディ/type study, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, ニレ属/Ulmus, ニレ科/Ulmaceae, ニーダーエスターライヒ州/Niederösterreich, ヌルデ属/Rhus, ハンノキ属/Alnus, ヒトツバエニシダ属/Genista, ブナ科/Fagaceae, ブルゲンラント州/Burgenland, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, マメ科/Fabaceae, ムクロジ科/Sapindaceae, ヤナギ属/Salix, ヤナギ科/Salicaceae, レクトタイプ指定/lectotype designation, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分生子形成様式/conidial ontogeny, 分生子果不完全菌/coelomycetes, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 命名法/nomenclature, 地衣類/lichen, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新属提唱/new genus, 新科提唱/new family, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 新階級提唱/new status, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 検索表/identification key, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 樹皮生息菌/bark inhabiting fungus, 水辺/waterside, 池沼/ponds and swamps, 潰瘍病/canker, 科概念/family concept, 科概念の修正/family concept_emendation, 胞子の発芽/germination of spores, 胴枯病/dogare-byo (canker)
トルコ新産種、Inocybe sphagnophila Bandini & B. Oertel
原題: Inocybe sphagnophila Bandini & B. Oertel (Agaricales, Inocybaceae): A new record for the Turkish mycota（Mantar Dergisi, 2019）
トルコ、トラブゾン県においてPicea orientalis樹下のコケの間に生じたInocybe sphagnophilaをトルコ新産種として報告した。
本種は従来、同一亜節に含まれるI. assimilataなどと混同されていたとみられた。
本種との同定は形態学的検討のほか、ITS領域の塩基配列によっても確かめられた。
報告種: Inocybe sphagnophila■
比較種: Inocybe acuta / Inocybe assimilata / Inocybe napipes
分類群: アセタケ科/Inocybaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Mantar Dergisi, コケ上に生える菌/fungi on moss, トウヒ属/Picea, トラブゾン県/Trabzon, トルコ/Turkey, トルコ新産種/Turkey_new record, マツ科/Pinaceae, 分子同定/molecular identification, 切片/section, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新産種報告/new record, 森林/forest, 稀産種/rare species, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 配列決定/sequencing
黒穂菌の稀産種、Haradaea moenchiae-manticaeの特筆すべき分布域拡大
原題: A noteworthy range extension for Haradaea moenchiae-manticae, a rarely reported smut fungus（Mycobiota, 2017）
イベリア半島およびアフリカ（モロッコ・アルジェリア）新産種としてHaradaea moenchiae-manticaeを報告した。
また、同種はアフリカにおいては新宿主Moenchia erecta subsp. octandraに認められた。
本種の記載文、光学顕微鏡写真、SEM写真などを掲載した。
報告種: Haradaea moenchiae-manticae■
分類群: サビキン亜門/Pucciniomycotina, ミクロボトリウム目/Microbotryales, ミクロボトリウム科/Microbotryaceae, ミクロボトリウム菌亜綱/Microbotryomycetidae, ミクロボトリウム菌綱/Microbotryomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Moenchia属, Mycobiota, アフリカ新産種/Africa_new record, アルジェリア/Algeria, アルジェリア新産種/Algeria_new record, カスティーリャ・レオン州/Castilla y León, スペイン/Spain, スペイン新産種/Spain_new record, ティジ・ウズー県/Tizi Ouzou, ナデシコ科/Caryophyllaceae, フェズ＝メクネス地方/Fès-Meknès, モロッコ/Morocco, モロッコ新産種/Morocco_new record, 北アフリカ新産種/North Africa_new record, 地理的分布/geographical distribution, 寄生菌/parasite, 採集地マッピング/collection site mapping, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 稀産種/rare species, 花生息菌/floricolous fungus, 走査型電子顕微鏡/SEM, 黒穂菌/smut fungi
ヨーロッパにおけるAphanomyces frigidophilusの初の分離
原題: First isolation of Aphanomyces frigidophilus (Saprolegniales) in Europe（Mycotaxon, 2006）
スペイン、グアダラハラにおいてザリガニの病原菌Aphanomyces frigidophilusを分離した。
本種に類似する標本が既にポーランドから報告されていたが、ヨーロッパにおける本種の分離例は初となった。
不稔の菌株をITS領域の塩基配列を用いて同定し、細胞外キチナーゼの活性測定やザリガニへの接種試験などを実施した。
報告種: Aphanomyces frigidophilus■
分類群: クロミスタ/Chromista, ミズカビ目/Saprolegniales, レプトレゲニア科/Leptolegniaceae, 卵菌綱/Oomycetes, 卵菌門/Oomycota
タグ: 2006年の論文/published in 2006, Austropotamobius属, Mycotaxon, カスティーリャ・ラ・マンチャ州/Castilla-La Mancha, キチナーゼ/chitinase, ザリガニ科/Cambaridae, スペイン/Spain, スペイン新産種/Spain_new record, ヨーロッパ新産種/Europe_new record, 不稔菌糸/sterile mycelium, 保全生態学/conservation ecology, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 卵菌類/Oomycetes, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 新産種報告/new record, 日和見感染症/opportunistic infection, 水生菌/aquatic fungi, 河川/river, 淡水域/freshwater, 種の境界/species delimitation, 細胞外酵素/extracellular enzyme, 胞子の発芽/germination of spores, 腐生菌/saprobe, 致死率/mortality rate, 西欧新産種/Western Europe_new record, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity
中国産淡水生アナモルフ菌：新種Dictyosporium tetrasporumおよびExserticlava yunnanensis、中国新産種Pseudofuscophialis lignicolaおよびPseudobotrytis terrestris
原題: Anamorphic fungi from freshwater habitats in China: Dictyosporium tetrasporum and Exserticlava yunnanensis spp. nov., and two new records for Pseudofuscophialis lignicola and Pseudobotrytis terrestris（Mycoscience, 2007）
中国の小川において沈んだ材に発生した淡水生菌の調査を実施し、Dictyosporium tetrasporumおよびExserticlava yunnanensisの2新種を記載した。
前者はスポロドキアから掌状の分生子を形成する点、後者は分生子柄が直立し平滑で頂端の分生子形成細胞が漏斗状で、異隔壁を有する厚壁の分生子を形成する点などでそれぞれ特徴づけられた。
また、中国新産種としてPseudofuscophialis lignicolaおよびPseudobotrytis terrestrisを報告し、いずれも淡水環境からの初の報告であった。
報告種: Dictyosporium tetrasporum★ / Exserticlava yunnanensis★ / Pseudobotrytis terrestris■ / Pseudofuscophialis lignicola■
比較種: Dictyosporium brahmaswaroopii / Dictyosporium nigroapice / Dictyosporium schizostachyifolium / Dictyosporium tetraseriale / Exserticlava globosa / Exserticlava uniseptata
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, コニオケータ目/Coniochaetales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ディクティオスポリウム科/Dictyosporiaceae, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Mycoscience, アナモルフ菌/anamorphic fungi, 中国/China, 中国新産種/China_new record, 単胞子分離/single spore isolation, 培養性状/colony characteristics, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 水生不完全菌/aquatic hyphomycetes, 水生菌/aquatic fungi, 河川/river, 淡水域/freshwater, 生物多様性調査/biodiversity survey, 異隔壁/distoseptum, 腐生菌/saprobe, 難培養性菌/uncultured fungi, 雲南省/Yunnan
Phialophora属類似のアナモルフを有する新属Teracosphaeria
原題: A new fungal genus, Teracosphaeria, with a Phialophora-like anamorph (Sordariomycetes, Ascomycota)（Mycological Research, 2007）
ニュージーランドにおいて腐朽材に生じた菌を検討し、新属新種Teracosphaeria petroicaとして記載した。
本種は子嚢殻がceratosphaeria類似で埋生し、子嚢胞子が無色楕円形で3隔壁を有することなどで特徴づけられた。
本種はin vitroでphialophora類似のアナモルフを形成し、分生子は無色楕円形で、分子系統解析ではアナモルフのDictyochaeta cylindrosporaに近縁であった。
報告種: Teracosphaeria petroica★
比較種: Annulatascus spp. / Annulusmagnus spp. / Ceratosphaeria lampadophora / Chaetosphaeria spp. / Dictyochaeta cylindrospora / Mirannulata samuelsii
分類群: チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, Mycological Research, ウェスト・コースト地方/West Coast, ナンキョクブナ属/Nothofagus, ナンキョクブナ科/Nothofagaceae, ニュージーランド/New Zealand, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類未確定/classification undetermined, 切片/section, 単胞子分離/single spore isolation, 呈色反応/chemical reaction, 培養性状/colony characteristics, 属概念/genus concept, 新属提唱/new genus, 材生息菌/lignicolous fungus, 胞子の発芽/germination of spores
Deutzia parvifloraを宿主とするうどんこ病菌の新種、Erysiphe deutziicola
原題: Erysiphe deutziicola sp. nov., a powdery mildew species found on Deutzia parviflora（MycoKeys, 2019）
中国北京市においてDeutzia parvifloraに生じたうどんこ病菌の一種を検討し、Erysiphe deutziicolaとして新種記載した。
本種は分生子柄が非常に長く、閉子嚢殻の付属糸が菌糸状でありながら、先端が巻き毛状であることなどで特徴づけられた。
本種は分子系統解析で、形態的に類似し、アジサイ科植物を宿主とするどの他種とも異なる独自の系統を形成した。
報告種: Erysiphe deutziicola★
比較種: Erysiphe abeliae / Erysiphe braunii / Erysiphe deutziae / Erysiphe hydrangeae / Erysiphe poeltii / Erysiphe schizophragmatis / Erysiphe yanshanensis / Pseudoidium hortensiae
分類群: ウドンコカビ科/Erysiphaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ビョウタケ目/Helotiales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, MycoKeys, TreeBASE, うどんこ病/powdery mildew, アジサイ科/Hydrangeaceae, ウツギ属/Deutzia, 中国/China, 付着器/appressorium, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北京市/Beijing, 寄生菌/parasite, 山地/mountains, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 胞子の発芽/germination of spores, 葉面菌/leaf surface fungi
ベトナムの味噌（トゥーン）から分離された黒色酵母の新種Moniliella sojae、Moniliella suaveolens菌株の新種Moniliella pyrgileucinaと新種Moniliella caseiへの再割り当て、および訂正新組み合わせMoniliella macrospora
原題: Moniliella sojae sp. nov., a species of black yeasts isolated from Vietnamese soy paste (tuong), and reassignment of Moniliella suaveolens strains to Moniliella pyrgileucina sp. nov., Moniliella casei sp. nov. and Moniliella macrospora emend. comb. nov.（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018）
ベトナムの味噌（トゥーン）の異なる製造工程において分離される酵母を調査し、Moniliella sojaeを新種記載した。
また、ポルトガルおよびオランダにおいてチーズからそれぞれ分離されたM. pyrgileucinaおよびM. caseiを新種記載した。
この他に訂正新組み合わせM. macrosporaを提唱した。
報告種: Moniliella casei★ / Moniliella macrospora▲ / Moniliella pyrgileucina★ / Moniliella sojae★
比較種: Moniliella macrospora / Moniliella pyrgileucina / Moniliella sojae
分類群: Moniliellaceae, クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, モニリエラ目/Moniliellales, モニリエラ綱/Monilielliomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, CFU (Colony Forming Unit), Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, PCRフィンガープリンティング/PCR fingerprinting, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, ウレアーゼ試験/urease test, オランダ/Netherlands, セントロ地方/Centro, チーズ/cheese, デンプン/starch, ビタミン要求性/vitamin requirement, フンイエン省/Hưng Yên, ポルトガル/Portugal, マイクロサテライト/microsatellite, ユビキノン/ubiquinone, 二型性/dimorphism, 二次代謝産物/secondary metabolite, 交配試験/mating test, 味噌/miso, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 希釈平板法/dilution plate method, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 新種記載/new species, 新組み合わせ提唱/new combination, 最大生長温度/maximum growth temperature, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 発酵/fermentation, 発酵試験/fermentation test, 発酵食品/fermented food, 種概念/species concept, 種概念の修正/species concept_emendation, 耐塩性菌/salt-tolerant fungus, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast, 酸耐性試験/acid resistance test, 高性能薄層クロマトグラフィー/high-performance thin-layer chromatography, 高速液体クロマトグラフィー/high performance liquid chromatography, 黒色酵母/black yeast
エジプト新産のTomophagus属およびBattarrea属菌
原題: New records on the genus Tomophagus and Battarrea for mycobiota of Egypt（Current Research in Environmental & Applied Mycology, 2019）
Tomophagus colossusおよびBattarrea phalloidesをエジプト新産種として報告した。
両種の記載文、生態写真、走査型電子顕微鏡写真などを掲載した。
両種との同定はITS領域に基づく分子系統解析によっても確かめられた。
報告種: Battarrea phalloides■ / Tomophagus colossus■
分類群: タマチョレイタケ目/Polyporales, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, マンネンタケ科/Ganodermataceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Current Research in Environmental & Applied Mycology, イスマイリア県/Ismailia, エジプト/Egypt, エジプト新産種/Egypt_new record, シクエストレート菌/sequestrate fungus, ディムヤート県/Damietta, リター菌/litter fungi, 保全生態学/conservation ecology, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分布域の変化/changes in the distribution area, 切片/section, 地理的分布/geographical distribution, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 果樹園/orchard, 根圏/rhizosphere, 植林地/plantation, 気候変動/climate change, 稀産種/rare species, 腐生菌/saprobe, 腹菌類/gastromycetes, 走査型電子顕微鏡/SEM
トルコ新産の子嚢菌
原題: New Ascomycete Record for Turkish Mycobiota（Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 2017）
Peziza succosellaをトルコ新産種として報告した。
本種の追加により、トルコ産チャワンタケ属菌の既知種は28種となった。
トルコ産チャワンタケ属菌の一覧表を掲載した。
報告種: Peziza succosella■
比較種: Peziza michelii / Peziza succosa
分類群: チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ科/Pezizaceae, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, アイドゥン県/Aydin, トルコ/Turkey, トルコ新産種/Turkey_new record, 呈色反応/chemical reaction, 新産種報告/new record, 森林/forest, 生物多様性調査/biodiversity survey
タイ新産のホコリタケ類2種
原題: Two new records of puffballs in Thailand（Mycotaxon, 2017）
タイ新産種としてCalvatia holothurioidesおよびMorganella puiggariiを報告した。
前者は落葉樹林の土壌、後者は常緑樹林の腐朽材上にそれぞれ発生していた。
両種との同定はITS領域に基づく分子系統解析でも確かめられた。
報告種: Calvatia holothurioides■ / Morganella puiggarii■
比較種: Calvatia oblongispora / Calvatia rubroflava / Calvatia sporocristata / Morganella albostipitata / Morganella arenicola / Morganella benjaminii / Morganella compacta / Morganella fuliginea / Morganella nuda / Morganella purpurascens / Morganella pyriformis / Morganella rimosa / Morganella samoensis / Morganella stercoraria / Morganella subincarnata / Morganella sulcatostoma / Morganella velutina
分類群: Lycoperdaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Mycotaxon, シクエストレート菌/sequestrate fungus, タイ/Thailand, タイ新産種/Thailand_new record, チエンマイ県/Chiang Mai, 分子同定/molecular identification, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 新産種報告/new record, 材生息菌/lignicolous fungus, 根状菌糸束/rhizomorph, 森林/forest, 腹菌類/gastromycetes
Lecidea toensbergii：狭義Lecidea属地衣における初の粉芽形成性の種
原題: Lecidea toensbergii, the first described sorediate species in Lecidea sensu stricto（Graphis Scripta, 2018）
Lecidea leucothallinaの12標本について分子系統解析を実施し、2つの子器形成性系統および1つの粉芽形成性系統からなる計3つの単系統群を特定した。
そのうち粉芽形成性のクレードをL. toensbergiiとして新種記載し、残りの2クレードをL. leucothallinaにおける隠蔽種と考えた。
3つの単系統群のいずれにもPD陽性と陰性の標本が混在しており、パンナリンの有無が識別形質として用いられないことが示された。
報告種: Lecidea toensbergii★
比較種: Lecidea leucothallina
分類群: チャシブゴケ菌亜綱/Lecanoromycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, レキデア目/Lecideales, レキデア科/Lecideaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2018年の論文/published in 2018, Graphis Scripta, オキセピン類/oxepins, オップラン県/Oppland, スチクチン酸類/stictic acids, タイプスタディ/type study, デプシド類/depsides, ヌールラン県/Nordland, ノルウェー/Norway, パンナリン類/pannarins, ヒースランド/heathland, フィンマルク県/Finnmark, ベンゾオキセピン類/benzoxepins, ムーレ・オ・ロムスダール県/Møre og Romsdal, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 化学型/chemical type, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 山地/mountains, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新種記載/new species, 珪質岩/siliceous rocks, 痂状地衣/crustose lichen, 紫外線蛍光/UV fluorescence, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography, 隠蔽種/cryptic species, 高山帯/alpine region
新属・新組み合わせPattersoniomyces tillandsiae：パイナップル科植物を宿主とする唯一の黒穂菌の有性世代-無性世代の結びつき
原題: Pattersoniomyces tillandsiae gen. et comb. nov.: linking sexual and asexual morphs of the only known smut fungus associated with Bromeliaceae（Organisms Diversity & Evolution, 2017）
Ustilago tillandsiaeの形態・生理学的検討および分子系統解析を実施し、本種を新属Pattersoniomycesに移した。
本種はクロボキン科においてTranzscheliella属と姉妹群を形成したが、当該属とは胞子堆の発達様式や構造、黒穂胞子の装飾などに差異が見られた。
本種は南米において単一のホストジャンプによりカヤツリグサ科あるいはイネ科からパイナップル科植物へと宿主を変換したとみられた。
報告種: Pattersoniomyces tillandsiae▲■
比較種: Tranzscheliella spp.
分類群: クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン目/Ustilaginales, クロボキン科/Ustilaginaceae, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2017年の論文/published in 2017, Canistrum属, Dalmau平板培養法/Dalmau plate culture method, Organisms Diversity & Evolution, アミノ酸要求性/amino acid requirement, アラゴアス州/Alagoas, インコアナナス属/Vriesea, グアテマラ/Guatemala, グアテマラ新産種/Guatemala_new record, タイプスタディ/type study, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, デンプン/starch, パイナップル科/Bromeliaceae, ファイトテルマータ/phytotelmata, ブラジル/Brazil, ブラジル新産種/Brazil_new record, ホストシフト/host shift, ホンジュラス/Honduras, ホンジュラス新産種/Honduras_new record, ミナスジェライス州/Minas Gerais, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 収蔵標本/stored specimen, 呈色反応/chemical reaction, 地理的分布/geographical distribution, 培養性状/colony characteristics, 塩分耐性試験/salinity tolerance test, 大西洋岸森林/Atlantic forest, 寄生菌/parasite, 希釈平板法/dilution plate method, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 担子菌酵母/basidiomycetous yeast, 新属提唱/new genus, 新産種報告/new record, 新組み合わせ提唱/new combination, 森林/forest, 植物検疫/plant quarantine, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 水試料/water sample, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 淡水域/freshwater, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 生活環/life cycle, 生物地理学/biogeography, 発酵試験/fermentation test, 花生息菌/floricolous fungus, 葉圏/phyllosphere, 葉面菌/leaf surface fungi, 資化試験/assimilation test, 走査型電子顕微鏡/SEM, 酵母/yeast, 酸産生/acid production, 黒穂菌/smut fungi
インド産Diorygma属地衣の4新種
原題: Four new species of Diorygma from India（Mycotaxon, 2012）
インドからDiorygma agumbense、D. dandeliense、D. karnatakense、およびD. rupicolaの4新種を記載した。
3種はカルナータカ州において樹皮に生じ、1種はメーガーラヤ州において岩上に生じていた。
本属の検索表を掲載した。
報告種: Diorygma agumbense★ / Diorygma dandeliense★ / Diorygma karnatakense★ / Diorygma rupicola★
比較種: Diorygma africanum / Diorygma albocinerascens / Diorygma dealbatum / Diorygma erythrellum / Diorygma excipuloconvergentum / Diorygma hieroglyphicum / Diorygma hololeucum / Diorygma longilirellatum / Diorygma megasporum / Diorygma minisporum / Diorygma monophorum / Diorygma pruinosum / Diorygma reniforme / Diorygma rufopruinosum / Diorygma salvadoriense / Diorygma saxicola
分類群: オストロパ亜綱/Ostropomycetidae, チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, モジゴケ亜科/Graphidoideae, モジゴケ目/Graphidales, モジゴケ科/Graphidaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycotaxon, インド/India, オキセピン類/oxepins, カルナータカ州/Karnataka, サラジン酸類/salazinic acids, サリチル酸類/salicylic acids, シッキム州/Sikkim, スチクチン酸類/stictic acids, セトラル酸類/cetraric acids, ナガランド州/Nagaland, プロトセトラル酸類/protocetraric acids, メーガーラヤ州/Meghalaya, ラクトン類/lactones, 二次代謝産物/secondary metabolite, 亜熱帯域/subtropics, 切片/section, 呈色反応/chemical reaction, 地衣成分/lichen compound, 地衣類/lichen, 岩上生地衣/saxicolous lichen, 新形質報告/new character, 新種記載/new species, 森林/forest, 検索表/identification key, 樹上生地衣/lignicolous or corticolous lichen, 熱帯域/tropics, 痂状地衣/crustose lichen, 薄層クロマトグラフィー/thin-layer chromatography
Mycoleptodiscus属菌および形態的に類似する菌類の再検討
原題: Re-evaluation of Mycoleptodiscus species and morphologically similar fungi（Persoonia, 2019）
Mycoleptodiscus属を中心とする菌類の再検討を実施し、本属が多系統群であることを示した。
基準種のM. sphaericusをシノニムに落とし、新種M. suttoniiを記載したほか、新属新種Neomycoleptodiscus venezuelenseを記載した。
本属菌の一部をMuyocopron属やOmnidemptus属に移したほか、系統解析の結果に基づきそれらの属に計3新種を記載した。
報告種: Muyocopron alcornii★ / Muyocopron atromaculans▲ / Muyocopron coloratum▲ / Muyocopron freycineticola◆ / Muyocopron geniculatum▲ / Muyocopron laterale▲ / Muyocopron sahnii◆ / Muyocopron taiwanense▲ / Muyocopron zamiae★ / Mycoleptodiscus suttonii★ / Mycoleptodiscus terrestris / Neomycoleptodiscus venezuelense★ / Omnidemptus affinis / Omnidemptus graminis★ / Omnidemptus lunatus▲
比較種: Muyocopron alcornii / Muyocopron atromaculans / Muyocopron coloratum / Muyocopron freycineticola / Muyocopron geniculatum / Muyocopron sahnii / Muyocopron taiwanense / Muyocopron zamiae / Mycoleptodiscus disciformis / Mycoleptodiscus suttonii / Mycoleptodiscus terrestris / Omnidemptus affinis / Omnidemptus lunatus
分類群: Magnaporthales, Muyocopronaceae, Muyocopronales, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, マグナポルテ科/Magnaporthaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2019年の論文/published in 2019, Carpobrotus属, Cattleya属, Epidendrum属, Gyranthera属, Opuntia属, Persoonia, Poincianella属, Sannantha属, TreeBASE, Zamia属, アオイ科/Malvaceae, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イネ科/Poaceae, エンドファイト/endophyte, オリヅルラン属/Chlorophytum, オーストラリア/Australia, カカオ属/Theobroma, キキョウラン属/Dianella, キジカクシ科/Asparagaceae, キビ属/Panicum, クイーンズランド州/Queensland, サボテン科/Cactaceae, ザミア科/Zamiaceae, シノニム/synonym, ススキノキ科/Xanthorrhoeaceae, スペイン/Spain, タイプスタディ/type study, タコノキ科/Pandanaceae, ツルアダン属/Freycinetia, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, ナバラ州/Navarra, ハマミズナ科/Aizoaceae, バイーア州/Bahia, ヒト病原菌/human pathogen, フトモモ科/Myrtaceae, フロリダ州/Florida, ブラジル/Brazil, ベネズエラ/Venezuela, マメ科/Fabaceae, ラン科/Orchidaceae, リター菌/litter fungi, 不稔菌糸/sterile mycelium, 二次代謝産物/secondary metabolite, 付着器/appressorium, 優先権/priority, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 分類学的再検討/taxonomic re-examination, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 命名法/nomenclature, 培養性状/colony characteristics, 多系統群/polyphyletic group, 寄生菌/parasite, 属概念/genus concept, 属概念の修正/genus concept_emendation, 斑点病/spot disease, 新学名提唱/new scientific name, 新属提唱/new genus, 新形質報告/new character, 新組み合わせ提唱/new combination, 日和見感染症/opportunistic infection, 材生息菌/lignicolous fungus, 根圏/rhizosphere, 根腐病/root rot, 森林/forest, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 水溶性色素/water-soluble pigment, 水辺/waterside, 河川/river, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 生体組織診断/biopsy, 疑問種/doubtful species, 病原真菌/pathogenic fungi, 目概念/Order concept, 目概念の修正/Order concept_emendation, 科概念/family concept, 科概念の修正/family concept_emendation, 種内変異/intraspecific variation, 米国/USA, 胞子の発芽/germination of spores, 胞子形成誘導/sporulation induction, 臨床検体/clinical specimens, 色素産生/pigment production, 菌核/sclerotium, 葉枯病/leaf blotch, 褐色糸状菌症/phaeohyphomycosis