Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese huggingface dataset:
シロガネヨシ属およびドラセナ属の枯れ葉上に発生する新種Zygosporium bioblitzi
原題: Zygosporium bioblitzi sp. nov. on dead leaves of Cortaderia and Dracaena（New Zealand Journal of Botany, 2007）
ニュージーランドで移入種のCortaderia selloanaの枯れ葉上に発生した菌をZygosporium bioblitziとして新種記載した。
本種は、Auckland BioBlitz 2006という都市部の生物多様性調査において発見され、そのことを記念した種小名が与えられた。
本種は、タイ・チエンマイ県でDracaena loureiriの枯れ葉上からも見出された。
報告種: Zygosporium bioblitzi★
比較種: Zygosporium geminatum / Zygosporium pacificum / Zygosporium pandanicola
分類群: Zygosporiaceae, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, クロサイワイタケ目/Xylariales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, New Zealand Journal of Botany, アナモルフ菌/anamorphic fungi, イネ科/Poaceae, オークランド地方/Auckland, キジカクシ科/Asparagaceae, シロガネヨシ属/Cortaderia, タイ/Thailand, チエンマイ県/Chiang Mai, ニュージーランド/New Zealand, リター菌/litter fungi, リュウケツジュ属/Dracaena, 新種記載/new species, 生物多様性調査/biodiversity survey, 移入種/alien species
スペイン産のシロカラカサタケ属Piloselli節の新種
原題: A new Leucoagaricus species of section Piloselli (Agaricales, Agaricaceae) from spain（IMA fungus, 2012）
スペイン・アラゴン州の公園から、形態および分子の形質を基にLeucoagaricus variicolorを新種記載した。
本種は種小名の通り、傘の色が生長段階や乾湿などにより様々に変化することなどで特徴づけられた。
報告種: Leucoagaricus variicolor★
比較種: Lepiota decorata / Leucoagaricus cupresseus / Leucoagaricus pseudopilatianus
分類群: ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ科/Agaricaceae, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, IMA fungus, アラゴン州/Aragon, スペイン/Spain, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species
スロバキアおよびヨーロッパでの新記録となるConiochaeta prunicola
原題: Coniochaeta prunicola – first record for Slovakia and Europe（Central European Journal of Biology, 2013）
スロバキアで、葉枯れおよび枝枯れの症状を起こしたセイヨウバクチノキから分離されたConiochaeta prunicolaを記録した。
本種は南アフリカから記載された種であり、本報告はヨーロッパからの初の記録となったほか、セイヨウバクチノキからの初の記録ともなった。
本種の感染を受けたと見られる樹木には、比較的激しい損傷が確認された。
報告種: Coniochaeta prunicola■
比較種: Coniochaeta velutina
分類群: コニオケータ目/Coniochaetales, コニオケータ科/Coniochaetaceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ亜綱/Sordariomycetidae, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Central European Journal of Biology, サクラ属/Prunus, スロバキア/Slovakia, スロバキア新産種/Slovakia_new record, バラ科/Rosaceae, ヨーロッパ新産種/Europe_new record, 寄生菌/parasite, 新基質_新宿主報告/new substrate_host, 新産種報告/new record, 枝枯病/branch blight, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 葉枯病/leaf blotch
ヨーロッパから新種記載および配列決定されたAmplistroma longicollisおよびそのアナモルフ
原題: Amplistroma longicollis, a new species and its anamorph state described and sequenced from Europe（Mycological Progress, 2012）
スペインのマツ林から、Acrodontium様のアナモルフを持つAmplistroma longicollisを新種記載した。
LSUに基づく分子系統解析では、本種は同属菌よりも別属のWallrothiella congregataに近縁だった。
その結果から、アンプリストロマ科の属レベルの分類形質として子座の有無という単一の形態形質が用いられることに疑問が生じたため、将来的に再整理が必要だとされた。
報告種: Amplistroma longicollis★
比較種: Amplistoma ravum / Amplistroma diminutisporum / Amplistroma guianense / Amplistroma xylarioides / Wallrothiella congregata
分類群: Amplistromatales, アンピストロマ科/Amplistromataceae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, スペイン/Spain, テレオモルフ_アナモルフ関係/teleomorph_anamorph relationship, バスク自治州/Basque Country, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 切片/section, 培養性状/colony characteristics, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 走査型電子顕微鏡/SEM
オレゴン州産のSarcogyne属の新種
原題: A new squamulose Sarcogyne from Oregon（North American Fungi, 2013）
米国オレゴン州の灌木ステップから、岩の上に発生するSarcogyne squamosaを新種記載した。
本種は地衣体が鱗片状で、破出状の無柄の子嚢盤を形成する独特の形質で特徴づけられた。
報告種: Sarcogyne squamosa★
比較種: Sarcogyne brunnea / Sarcogyne crustacea / Sarcogyne mitziae
分類群: チャシブゴケ菌綱/Lecanoromycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ホウネンゴケ亜綱/Acarosporomycetidae, ホウネンゴケ目/Acarosporales, ホウネンゴケ科/Acarosporaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, North American Fungi, オレゴン州/Oregon, 切片/section, 地衣類/lichen, 岩石生菌類/saxicolous fungus, 新種記載/new species, 痂状地衣/crustose lichen, 米国/USA
Tricharina属およびGeopora属に近縁なピロネマキン科の明色杯状の新属、Hoffmannoscypha
原題: Hoffmannoscypha, a novel genus of brightly coloured, cupulate Pyronemataceae closely related to Tricharina and Geopora（Mycological Progress, 2012）
分子系統解析の結果および形態に基づき、Geopora pellitaに対して新属Hoffmannoscyphaを提唱した。
また、本論文ではGeopora属が側系統群であり、帯灰色から帯褐色の杯状の子嚢盤を形成する種はSepultaria属に移されるべきだとした。
新属に形態的に類似しているTricharina属も、分子系統解析により多系統群であることが示された。
報告種: Hoffmannoscypha pellita▲
比較種: Geopora spp. / Tricharina spp.
分類群: チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, ピロネマキン科/Pyronemataceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, FE-SEM, Mycological Progress, エピタイプ指定/epitype designation, タイプスタディ/type study, 側系統群/paraphyletic group, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 多系統群/polyphyletic group, 新属提唱/new genus, 新組み合わせ提唱/new combination, 走査型電子顕微鏡/SEM
Guineo-Congolian熱帯雨林産の管孔を持つタバコウロコタケ科菌類: ガボン産の新種Phellinus gabonensisの分類および系統関係
原題: Poroid Hymenochaetaceae from Guineo-Congolian rainforest: Phellinus gabonensis sp. nov. from Gabon – taxonomy and phylogenetic relationships（Mycological Progress, 2011）
ガボンの熱帯雨林から採集された菌をPhellinus gabonensisとして新種記載した。
LSUに基づく分子系統解析では、本種はPhellinus caribaeo-quercicolusに近縁であった。
報告種: Phellinus gabonensis★
比較種: Phellinus caribaeo-quercicolus / Phellinus chocolatus / Phellinus glaucescens / Phellinus setulosus
分類群: タバコウロコタケ目/Hymenochaetales, タバコウロコタケ科/Hymenochaetaceae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2011年の論文/published in 2011, Mycological Progress, ガボン/Gabon, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 木材腐朽菌/wood decaying fungi, 材生息菌/lignicolous fungus, 森林/forest, 熱帯域/tropics, 熱帯林/tropical forest, 熱帯雨林/tropical rainforest, 腐生菌/saprobe
イタリア産の標本に基づくHydnum ovoideisporumの変異の検出および新種H. magnorufescens
原題: Detecting the variability of Hydnum ovoideisporum (Agaricomycetes, Cantharellales) on the basis of Italian collections, and H. magnorufescens sp. nov.（Mycosphere, 2013）
イタリア南部から採集されたHydnum rufescens種複合体の4標本を、形態および分子のデータに基づき解析した。
3標本は近年スペインから新種記載されたH. ovoideisporumと同定されたが、担子胞子の形状など一部の形質が異なっており、うち子実層面が平滑なものを新品種として記載した。
また、残りの1標本を基にH. magnorufescensを新種記載し、当該クレードにはスペイン、スロベニア、中国産の標本も含まれたが、それらが同種かどうかの判断は保留とされた。
報告種: Hydnum magnorufescens★ / Hydnum ovoideisporum / Hydnum ovoideisporum f. depauperatum★
比較種: Hydnum ovoideisporum / Hydnum rufescens
分類群: アンズタケ目/Cantharellales, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ハリタケ科/Hydnaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycosphere, イタリア/Italy, カンパニア州/Campania, コナラ属/Quercus, ブナ科/Fagaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新品種記載/new forma, 新種記載/new species, 種内変異/intraspecific variation
中国産のPhyllosticta属2新種の形態学的・系統学的特徴
原題: Morphological and phylogenetic characterisation of two new species of Phyllosticta from China（Mycological Progress, 2012）
中国・雲南省からエゴノキ属のStyrax grandiflorusの葉に寄生するPhyllosticta styracicolaを新種記載した。
また、湖北省からガマズミ属のViburnum odoratissimumの葉に寄生するPhyllosticta hubeiensisを新種記載した。
ITS、TEF1、ACT、GAPDHの各遺伝子を用いた分子系統解析および形態比較の結果から、2種は近縁種と明瞭に区別された。
報告種: Phyllosticta hubeiensis★ / Phyllosticta styracicola★
比較種: Guignardia bidwellii / Guignardia gaultheriae / Guignardia philoprina / Phyllosticta brazilianine / Phyllosticta ilicis-aquifolii / Phyllosticta schimae / Phyllosticta styracina
分類群: Phyllostictaceae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ボトリオスフェリア目/Botryosphaeriales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, エゴノキ属/Styrax, エゴノキ科/Styracaceae, ガマズミ属/Viburnum, レンプクソウ科/Adoxaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 湖北省/Hubei, 雲南省/Yunnan
Candida haemulonii種複合体の再分類: ヒト病原性の多剤耐性酵母、Candida haemulonii（Candida haemuloniiグループI） 、新種C. duobushaemulonii（Candida haemuloniiグループII） 、新変種C. haemulonii var. vulnera
原題: Reclassification of the Candida haemulonii Complex as Candida haemulonii (C. haemulonii Group I), C. duobushaemulonii sp. nov.(C. haemulonii Group II), and C. haemulonii var. vulnera var. nov.: Three Multiresistant Human Pathogenic Yeasts（Journal of Clinical Microbiology, 2012）
分子系統解析の結果および表現型に基づき、Candida haemulonii種複合体に2種と1変種を認めた。
これらの分類群は、近縁なCandida aurisおよびCandida pseudohaemuloniiとは市販の同定キットで区別できなかった。
また、2種と1変種はアムホテリシンに対する耐性やアゾール系薬剤に対する交叉耐性を有していた。
報告種: Candida duobushaemulonii★ / Candida haemulonii var. vulnera★
比較種: Candida auris / Candida haemulonii / Candida haemulonii var. vulnera / Candida pseudohaemulonii
分類群: サッカロマイセス亜綱/Saccharomycetidae, サッカロマイセス亜門/Saccharomycotina, サッカロマイセス目/Saccharomycetales, サッカロマイセス綱/Saccharomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, AFLP分析/AFLP analysis, Journal of Clinical Microbiology, MALDI-TOF MS, MIC, アラバマ州/Alabama, イーグル効果/Eagle effect, カスティーリャ・レオン州/Castilla y León, スペイン/Spain, バイオフィルム/biofilm, ヒト病原菌/human pathogen, ビタミン要求性/vitamin requirement, プロテオーム解析/proteome analysis, 交叉耐性/cross-resistance, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養同定キット/culture identification kit, 多剤耐性菌/multidrug-resistant fungus, 寄生菌/parasite, 抗真菌薬感受性試験/antifungal susceptibility test, 抗真菌薬耐性/antifungal drug resistance, 新変種記載/new variety, 新種記載/new species, 最大生長温度/maximum growth temperature, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 発酵試験/fermentation test, 真菌血症/mycohaemia, 米国/USA, 複合種/species complex, 資化試験/assimilation test, 質量分析法/mass spectrometry, 酵母/yeast
Alternariaster属の再評価
原題: Reappraisal of the genus Alternariaster (Dothideomycetes)（Persoonia, 2013）
Simmons (2007) により、主に分生子の形状を基にAlternaria属から分けられた単型属、Alternariaster属の再評価を行った。
また、ブラジルでキバナコスモスの葉に斑点を生じる菌は分子系統解析の結果、Alternariaster helianthiにごく近縁で、接種試験の結果でも明瞭に区別された。
この菌をAlternariaster bidentisとして新種記載するとともに、Alternariaster属はプレオスポラ科ではなくレプトスフェリア科に含まれるとした。
報告種: Alternariaster bidentis★ / Alternariaster helianthi
比較種: Alternariaster bidentis / Alternariaster helianthi
分類群: クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, レプトスフェリア科/Leptosphaeriaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Persoonia, キク科/Asteraceae, コッホの原則/Koch_s postulation, センダングサ属/Bidens, ブラジル/Brazil, ミナスジェライス州/Minas Gerais, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 表面殺菌法/surface sterilization method
亜南極のオークランド諸島産の新種Rhytidiella hebes
原題: Rhytidiella hebes sp. nov. from the subantarctic Auckland Islands（New Zealand Journal of Botany, 2007）
ゴマノハグサ科のHebe ellipticaの生木の枝に形成されたゴールおよび露出した根から分離された菌をRhytidiella hebesとして新種記載した。
本種は他の本属菌とは、宿主植物や子嚢胞子の幅などが異なっていた。
報告種: Rhytidiella hebes★
比較種: Rhytidiella baranyayii / Rhytidiella beloniza / Rhytidiella moriformis
分類群: ククルビタリア科/Cucurbitariaceae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, プレオスポラ亜綱/Pleosporomycetidae, プレオスポラ目/Pleosporales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2007年の論文/published in 2007, New Zealand Journal of Botany, オークランド諸島/Auckland Islands, ゴマノハグサ科/Scrophulariaceae, ゴール/gall, ニュージーランド/New Zealand, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi
マカロネシア産の新種Sistotremastrum guttuliferum
原題: Sistotremastrum guttuliferum: a new species from the Macaronesian islands（Mycological Progress, 2013）
アゾレス諸島・マデイラ諸島・カナリア諸島で採集された菌をSistotremastrum guttuliferumとして新種記載した。
形態比較およびITSとLSUに基づく分子系統解析の結果で、本種は近縁種と明瞭に区別された。
また、本新種を含むSistotremastrum属の検索表を掲載した。
報告種: Sistotremastrum guttuliferum★
比較種: Sistotremastrum niveocremeum / Sistotremastrum suecicum
分類群: Sistotremastraceae, Sistotrematales, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, アゾレス諸島/Azores islands, カナリア諸島/Canary Islands, スペイン/Spain, ポルトガル/Portugal, マカロネシア/Macaronesia, マデイラ諸島/Madeira, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 検索表/identification key
タイで葉面から分離されたクロボキン綱のアナモルフ酵母の新種、Pseudozyma vetiver
原題: Pseudozyma vetiver sp. nov., a novel anamorphic ustilaginomycetous yeast species isolated from the phylloplane in Thailand（Antonie van Leeuwenhoek, 2013）
タイでイネ科の植物、ベチバーおよびサトウキビの葉面から分離された3菌株を基に、新種Pseudozyma vetiverを記載した。
本種は、D1/D2領域およびITS領域に基づく分子系統解析で近縁とされた種とは、塩基配列にある程度の違いが見られた。
また、形態観察および生化学的・生理学的試験を行い、本種と近縁種を比較した。
報告種: Pseudozyma vetiver★
比較種: Anomalomyces yakirrae / Pseudozyma fusiformata / Pseudozyma pruni
分類群: クロボキン亜門/Ustilaginomycotina, クロボキン目/Ustilaginales, クロボキン科/Ustilaginaceae, クロボキン綱/Ustilaginomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Antonie van Leeuwenhoek, Vetiveria属, アナモルフ酵母/anamorphic yeast, イネ科/Poaceae, サトウキビ属/Saccharum, タイ/Thailand, ビタミン要求性/vitamin requirement, ラーチャブリー県/Ratchaburi, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 抗生物質耐性試験/antibiotic resistance test, 担子菌酵母/basidiomycetous yeast, 新種記載/new species, 浸透圧耐性試験/osmotic tolerance test, 温度適性/temperature aptitude, 葉面菌/leaf surface fungi, 資化試験/assimilation test, 酵母/yeast
トーゴのファザオ・マルファカッサ国立公園産のLactifluus属の2新種
原題: Two New Lactifluus species (Basidiomycota, Russulales) from Fazao Malfakassa National Park (Togo, West Africa)（Mycological Progress, 2013）
ITS領域を用いた分子系統解析の結果に基づき、トーゴのファザオ・マルファカッサ国立公園から2種のLactifluus属菌を新種記載した。
Lactifluus fazaoensisはEdules亜属に含まれ、本種は他の本属菌には稀な、盛んに屈曲し枝分かれする縁シスチジアを持つことで特徴づけられた。
Lactifluus sudanicusはLactifluus亜属に含まれ、近縁種とは肉眼的・顕微鏡的形質の組み合わせが一致するものはなかった。
報告種: Lactifluus fazaoensis★ / Lactifluus sudanicus★
比較種: Lactifluus aureifolius / Lactifluus edulis / Lactifluus flammans / Lactifluus longisporus / Lactifluus medusae / Lactifluus nodosicystidiosus / Lactifluus ruvubuensis / Lactifluus volemoides
分類群: ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, ベニタケ目/Russulales, ベニタケ科/Russulaceae, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, トーゴ/Togo, 中央州（トーゴ）/Central Province (Togo), 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 菌根菌/mycorrhizal fungi, 走査型電子顕微鏡/SEM
淡水の子嚢菌類：ペルーのアマゾンで発見された新種Natipusilla bellasporaを含む熱帯生菌類の新科、ナティプシラ科
原題: Freshwater ascomycetes: Natipusillaceae, a new family of tropical fungi, including Natipusilla bellaspora sp. nov. from the Peruvian Amazon（Mycologia, 2012）
ペルーで小川に沈んだ木質残渣に発生した菌をNatipusilla bellasporaとして新種記載した。
また、同属のNatipusilla limonensisをペルーから初めて報告した。
Natipusilla属の独特な形態とおよびFerrer et al. (2011) の分子系統解析の結果に基づき、本属に対して新科Natipusillaceaeを設けた。
報告種: Natipusilla bellaspora★ / Natipusilla limonensis■
比較種: Natipusilla bellaspora / Natipusilla decorospora / Natipusilla limonensis
分類群: Natipusillaceae, Natipusillales, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycologia, ペルー/Peru, マードレ・デ・ディオス県/Madre de Dios, 新産種報告/new record, 新科提唱/new family, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 水生菌/aquatic fungi, 熱帯域/tropics
スペイン産のコツブタケ属の新種
原題: A new species of Pisolithus from Spain（Mycotaxon, 2013）
ヨーロッパ産のコツブタケ属菌の分子系統解析 (Phosri et al., 2012) では、スペイン産の標本が3つのクレードに分かれた。
そのうち2つは既知種であったが、残りの1つについて形態および分子系統解析の結果に基づき、Pisolithus calongeiとして新種記載した。
本種はハンニチバナ科ゴジアオイ属のCistus ladaniferと関係を持つ外生菌根菌と見られる。
報告種: Pisolithus calongei★
比較種: Pisolithus arhizus / Pisolithus marmoratus / Pisolithus tinctorius
分類群: イグチ目/Boletales, ニセショウロ科/Sclerodermataceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, カスティーリャ・レオン州/Castilla y León, ゴジアオイ属/Cistus, シクエストレート菌/sequestrate fungus, スペイン/Spain, ハンニチバナ科/Cistaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 腹菌類/gastromycetes, 菌根菌/mycorrhizal fungi
Exophiala属菌感染の臨床スペクトルおよびExophiala属の新種、Exophiala hongkongensis
原題: Clinical spectrum of Exophiala infections and a novel Exophiala species, Exophiala hongkongensis（Journal of Clinical Microbiology, 2013）
1998年から15年間にわたる調査で、患者から12菌株のExophiala属菌を分離した。
ITSおよびRpb1に基づく分子系統解析の結果、そのうち11菌株は既知種であったが、残り1菌株は未記載種だと考えられた。
本種についてさらにチューブリンとアクチンの遺伝子を用いた解析を行い、Exophiala hongkongensisとして新種記載した。
報告種: Exophiala hongkongensis★
比較種: Exophiala jeanselmei / Exophiala nishimurae / Exophiala oligosperma / Exophiala spinifera / Exophiala xenobiotica
分類群: ケートチリウム亜綱/Chaetothyriomycetidae, ケートチリウム目/Chaetothyriales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ヘルポトリキエラ科/Herpotrichiellaceae, ユーロチウム綱/Eurotiomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Journal of Clinical Microbiology, アナモルフ菌/anamorphic fungi, アピザイム/API ZYM, ヒト病原菌/human pathogen, 中国/China, 二型性/dimorphism, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 動物寄生菌/animal parasitic fungus, 動物病原菌/animal pathogen, 医真菌学/medical mycology, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 新種記載/new species, 温度適性/temperature aptitude, 爪真菌症/onychomycosis, 皮膚真菌症/dermatomycosis, 酵母/yeast, 酵素/enzyme, 酵素活性/enzyme activity, 香港/Hong Kong
南欧の山地においてSilene saxifragaの葯に胞子形成する新種Microbotryum silenes-saxifragae
原題: Microbotryum silenes-saxifragae sp. nov. sporulating in the anthers of Silene saxifraga in southern European mountains（IMA fungus, 2013）
マンテマ属のSilene saxifragaの葯に寄生するMicrobotryum silenes-saxifragaeを新種記載した。
走査型電子顕微鏡では、胞子の網状装飾の内部の空間に瘤状突起が見出され、この特徴はナデシコ科植物の葯に発生するMicrobotryum属菌としては独特のものであった。
分子系統解析では本種を含むクレードに、宿主の系統や生息環境が異なる菌が含まれたことから、宿主のニッチの変化に伴うホストシフトが本属の種分化要因となった可能性が示唆された。
報告種: Microbotryum silenes-saxifragae★
比較種: Microbotryum coronariae / Microbotryum silenes-inflatae / Microbotryum violaceum
分類群: サビキン亜門/Pucciniomycotina, ミクロボトリウム目/Microbotryales, ミクロボトリウム科/Microbotryaceae, ミクロボトリウム菌亜綱/Microbotryomycetidae, ミクロボトリウム菌綱/Microbotryomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, IMA fungus, アルプス山脈/Alps, イタリア/Italy, オーストリア/Austria, オート＝ピレネー県/Hautes-Pyrénées, ケルンテン州/Kärnten, スロベニア/Slovenia, トレンティーノ＝アルト・アディジェ州/Trentino-Alto Adige, ドイツ/Germany, ナデシコ科/Caryophyllaceae, バーデン＝ヴュルテンベルク州/Baden-Württemberg, ピレネー山脈/Pyrenees, フランス/France, マンテマ属/Silene, モンテネグロ/Montenegro, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 寄生菌/parasite, 山地/mountains, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 疑似隠蔽種/pseudo-cryptic species, 走査型電子顕微鏡/SEM, 黒穂菌/smut fungi
イベリア半島産のTerfezia属の5新種
原題: Five new Terfezia species from the Iberian Peninsula（Mycotaxon, 2013）
イベリア半島産のTerfezia属は分子系統解析の結果8クレードに分かれ、そのうち3クレードは既知種に相当したが、残り5クレードは未記載種であった。
本論文では、形態比較と分子系統解析の結果を基に、未記載種であった5種を新種記載した。
また、5新種を含むTerfezia属の検索表を掲載した。
報告種: Terfezia albida★ / Terfezia alsheikhii / Terfezia eliocrocae★ / Terfezia extremadurensis★ / Terfezia fanfani / Terfezia olbiensis / Terfezia pini★ / Terfezia pseudoleptoderma★
比較種: Terfezia albida / Terfezia alsheikhii / Terfezia arenaria / Terfezia berberiodora / Terfezia cadevalli / Terfezia claveryi / Terfezia eliocrocae / Terfezia extremadurensis / Terfezia fanfani / Terfezia goffartii / Terfezia hafizi / Terfezia leptoderma / Terfezia lutescens / Terfezia olbiensis / Terfezia pini / Terfezia pseudoleptoderma
分類群: イモタケ科/Terfeziaceae, チャワンタケ亜綱/Pezizomycetidae, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, チャワンタケ目/Pezizales, チャワンタケ綱/Pezizomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, エストレマドゥーラ州/Extremadura, カスティーリャ・ラ・マンチャ州/Castilla-La Mancha, カスティーリャ・レオン州/Castilla y León, コナラ属/Quercus, スペイン/Spain, ハンニチバナ科/Cistaceae, ブナ科/Fagaceae, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, ムルシア州/Murcia, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 地下生菌/hypogeous fungi, 外生菌根菌/ectomycorrhizal fungus, 新種記載/new species, 検索表/identification key, 焼け跡菌/carbonicolous fungus, 砂漠/desert, 砂漠生菌類/desert fungus, 砂質土壌/sandy soil, 菌根菌/mycorrhizal fungi
中国産の新種Lyophyllum rhombisporum
原題: Lyophyllum rhombisporum sp. nov. from China（Mycotaxon, 2013）
中国雲南省で採集された菌をLyophyllum rhombisporumとして新種記載した。
本種は肉眼的・顕微鏡的形質がともにカクミノシメジおよびL. transformeに類似するが、胞子の形状が菱形である点が顕著に異なっていた。
ITS領域に基づく分子系統解析でも、本種は近縁種と明瞭に区別された。
報告種: Lyophyllum rhombisporum★
比較種: Lyophyllum sykosporum / Lyophyllum transforme
分類群: シメジ科/Lyophyllaceae, ハラタケ亜綱/Agaricomycetidae, ハラタケ亜門/Agaricomycotina, ハラタケ目/Agaricales, ハラタケ綱/Agaricomycetes, 担子菌門/Basidiomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycotaxon, マツ属/Pinus, マツ科/Pinaceae, 中国/China, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 呈色反応/chemical reaction, 新種記載/new species, 雲南省/Yunnan
インド北東部でCapsicum assamicumの葉に病斑を生じるCercospora属新種の同定
原題: Identification of a new species of Cercospora causing leaf spot disease in Capsicum assamicum in northeastern India（Research in microbiology, 2013）
インド北東部でブート・ジョロキア (Capsicum assamicum) の葉から分離された菌をCercospora tezpurensisとして新種記載した。
アクチン、カルモジュリン、ヒストンH3、EF-1αの4遺伝子を用いた分子系統解析で、本種は他のどの同属菌とも異なる新規系統をなした。
本種は毒素のサーコスポリンを産生することが示唆され、ブート・ジョロキアの葉への接種試験では本種がコッホの原則を満たすことが確認された。
報告種: Cercospora tezpurensis★
比較種: Cercospora apii / Cercospora capsici / Cercospora capsicigena / Cercospora physalidis / Cercospora rodmanii / Cercospora sp. N
分類群: Mycosphaerellales, クロイボタケ亜綱/Dothideomycetidae, クロイボタケ綱/Dothideomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, マイコスフェレラ科/Mycosphaerellaceae, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Research in microbiology, SNP解析/SNP genotyping, アッサム州/Assam, アナモルフ菌/anamorphic fungi, インド/India, コッホの原則/Koch_s postulation, サーコスポロイド/cercosporoid fungi, トウガラシ属/Capsicum, ナス科/Solanaceae, マイコトキシン/mycotoxin, 二次代謝産物/secondary metabolite, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 培養性状/colony characteristics, 寄生菌/parasite, 接種試験/inoculation test, 斑点病/spot disease, 新種記載/new species, 植物病原菌/plant pathogenic fungi, 色素産生/pigment production
揮発性の抗生物質を産生するエンドファイトの新種、Muscodor sutura
原題: Muscodor sutura, a novel endophytic fungus with volatile antibiotic activities（Mycoscience, 2012）
キョウチクトウ科のPrestonia trifidaの枝からエンドファイトとして分離された菌をMuscodor suturaとして新種記載した。
本種は暗所でPDA培地で培養すると赤い色素を産生し、他の本属菌と同様、胞子は形成しなかった。
また、本種はツジョプセン・カミグレン・イソカリオフィレン・酪酸などの、他の本属菌に見られない揮発性の有機化合物を産生し、その混合物は抗真菌活性を示した。
報告種: Muscodor sutura★
比較種: Muscodor albus / Muscodor cinnamomi / Muscodor crispans / Muscodor fengyangensis / Muscodor vitigenus / Muscodor yucatanensis
分類群: Induratiaceae, クロサイワイタケ亜綱/Xylariomycetidae, クロサイワイタケ目/Xylariales, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, フンタマカビ綱/Sordariomycetes, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycoscience, エンドファイト/endophyte, ガスクロマトグラフィー/gas chromatography, コロンビア/Columbia, チョコ県/Chocó, 不稔菌糸/sterile mycelium, 二次代謝産物/secondary metabolite, 培養性状/colony characteristics, 抗生物質/antibiotic, 抗真菌活性/antifungal activity, 揮発性有機化合物/volatile organic compound, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 樹木エンドファイト/tree endophyte, 色素産生/pigment production, 質量分析法/mass spectrometry, 走査型電子顕微鏡/SEM, 配列決定/sequencing
メキシコの水没した植物基質から発生した新属新種Minteriella cenotigena
原題: Minteriella cenotigena anam. gen. & sp. nov. from submerged plant material in Mexico（Mycological Progress, 2013）
メキシコ南部の石灰岩地帯のセノーテの中で、水没した腐朽樹皮上に見出された菌をMinteriella cenotigenaとして新種記載した。
本種は他のアナモルフ菌の属と形態が顕著に異なることから、新属Minteriellaに含められた。
報告種: Minteriella cenotigena★
比較種: Chikaneea spp. / Cylindrosympodium spp. / Pleurotheciopsis spp. / Polyscytalum spp. / Subulispora spp. / Sympodioplanus spp. / Thedgonia spp.
分類群: ?
タグ: 2013年の論文/published in 2013, Mycological Progress, シンネマ形成菌/synnematous fungus, メキシコ/Mexico, ユカタン州/Yucatan, 新属提唱/new genus, 新種記載/new species, 材生息菌/lignicolous fungus, 石灰岩/limestone
Erysiphe havrylenkoanaおよびE. prunastri var. japonica: Erysiphe属Uncinula節の新種および新変種
原題: Erysiphe havrylenkoana and E. prunastri var. japonica: a new species and a new variety of Erysiphe sect. Uncinula (Erysiphaceae, Ascomycota)（Mycological Progress, 2012）
アルゼンチンでナンキョクブナ属樹木2種に発生したErysiphe havrylenkoanaと、日本でミヤマザクラに発生したE. prunastri var. japonicaを記載した。
rDNAを用いた分子系統解析では、ナンキョクブナ属に発生するうどんこ病菌の種レベルの分類形質としての、付属糸のらせんのパターンの重要性が示された。
E. prunastri var. japonicaは、中東からヨーロッパに分布する原種とは、子嚢の数と付属糸の形態やrDNAの塩基配列によって区別された。
報告種: Erysiphe havrylenkoana★ / Erysiphe prunastri var. japonica★
比較種: Erysiphe magellanica / Erysiphe nothofagi / Erysiphe patagoniaca / Erysiphe prunastri var. prunastri
分類群: ウドンコカビ科/Erysiphaceae, ズキンタケ亜綱/Leotiomycetidae, ズキンタケ綱/Leotiomycetes, チャワンタケ亜門/Pezizomycotina, ビョウタケ目/Helotiales, 子嚢菌門/Ascomycota, 菌界/Fungi
タグ: 2012年の論文/published in 2012, Mycological Progress, うどんこ病/powdery mildew, アルゼンチン/Argentina, サクラ属/Prunus, ナンキョクブナ属/Nothofagus, ナンキョクブナ科/Nothofagaceae, ネウケン州/Neuquén, バラ科/Rosaceae, 分子系統解析/molecular phylogenetic analysis, 北海道/Hokkaido, 寄生菌/parasite, 新変種記載/new variety, 新種記載/new species, 日本/Japan, 植物病原菌/plant pathogenic fungi