AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
RPG complété 2023 Région Bretagne

[Lien vers la fiche source] RPG complété 2023. Complète le RPG campagne 2023 pour la région Bretagne (départements 22, 29, 35 et 56 ; combinés). Contient les parcelles agricoles hors RPG. Données géographiques (vectorielles, shapefile), parcellaires. Sources : IGN, OSO/Cesbio. Traitements : INRAE US ODR, 2025.
Site patrimoine remarquable de Clermont Auvergne Métropole

Liste des Sites Patrimoniaux Remarquables de Clermont Auvergne Métropole. Les sites patrimoniaux remarquables sont « les villes, villages ou quartiers dont la conservation, la restauration, la réhabilitation ou la mise en valeur présentent, au point de vue historique, architectural, archéologique, artistique ou paysager, un intérêt public. » Les espaces ruraux et les paysages qui forment avec ces villes, villages ou quartiers un ensemble cohérent ou qui sont susceptibles de contribuer à leur conservation ou à leur mise en valeur peuvent être classés au même titre. Les sites patrimoniaux remarquables ont été créés pour clarifier la protection en faveur du patrimoine urbain et paysager. [https://atlas.patrimoines.culture.fr]
Biomfile and metadata of study on microbial electrosynthesis for biogas upgrading and desulfurisation

[Lien vers la fiche source] The data files support the study “Electromethanogenesis from H₂S-containing biogas: H₂S and cathode potential drive microbial selection and methane yields.” They correspond to two H-type microbial electrosynthesis (MES) reactors (1 L cathodic volume) equipped with stainless steel mesh cathodes and operated for bioelectrochemical biogas upgrading and desulfurization. The reactors were run in fed-batch mode—initially with 99.9% CO₂ to establish electromethanogenesis, followed by synthetic biogas mixtures (CO₂ 40%/CH₄ 60%) and CO₂/CH₄/H₂S (1%) to assess upgrading and H₂S tolerance. Cathode potentials were stepwise lowered during CO₂ operation (–0.85, –0.90, –0.95 V vs Ag/AgCl) and maintained at –0.95 V vs Ag/AgCl thereafter. The uploaded datasets include: 1) Bioinformatics outputs: microbial community composition and diversity across the distinct operational phases of each reactor. 2) Metadata files: physicochemical parameters corresponding to each sequenced microbial sample (e.g., pH, sulfide concentration, gas composition, applied potential, and cycle information).
Cours d'eau du bassin versant de la Sélune - Observatoire Sélune

[Lien vers la fiche source] L’effacement des barrages de la Sélune fait l’objet d’un programme scientifique initié en 2012 dans lequel des paramètres environnementaux sont suivis afin de fournir un réel retour d’expérience sur cette opération de restauration. En 2019 s’est mis en place un observatoire de données, chargé d’assurer la collecte et le traitement de ces paramètres (biotiques et abiotiques). Les données acquises à partir de 2012 et au moins jusqu’en 2027, seront centralisées grâce à un système d’information (SI), appelé SISelune. SISelune vise à aider les scientifiques associés au programme Sélune et à rendre les données accessibles à tous. Les cours d'eau sont des entités hydrographique linéaires, liés à un toponyme principal, et décomposés en tronçons hydrographiques. Ces cours d'eau sont extraits de la BD Topage sur l'emprise de la zone d'étude. Des codes, utilisables dans le cadre du programme Sélune ont été ajoutés, ainsi que les codes issus de l'ancien référentiel hydrographique (BD Carthage).
Data associated to the paper: "Farmer's own decisions outweigh management strategies in reducing pesticide use in apple orchards"

[Lien vers la fiche source] These data are provided as supplementary material of the following article: Poinas I., Gauffre B., Papaïx J., Denis M., Said X., Lavigne C. (2025). Farmer’s own decisions outweigh management strategies in reducing pesticide use in apple orchards. Agricultural Systems. The study aimed to identify orchard management strategies associated with reduced insecticide and fungicide use in apple orchards in south-eastern France. The dataset includes farming practices (irrigation, variety...), orchard features (area, length of adjacent hedges...), treatment frequency indices (by product type, target and specificity...) and pest and fungal disease levels (codling moth, scab...) for 171 apple orchards, located in the Lower Durance Valley, which is the main apple and pear production area in southern France
Les revenus des travailleurs indépendants, par département x secteur

Données annuelles sur les revenus des travailleurs indépendants entre 2004 et 2023, par département, par secteur et par type de travailleur indépendant. Source : Urssaf, données arrêtées fin mai 2025 Précisions méthodologiques : * Ces données n’intègrent pas les exploitants agricoles, lesquels sont suivis par la Caisse centrale de la Mutualité sociale agricole (CCMSA). Par ailleurs, elles concernent l’ensemble des travailleurs indépendants relevant de la protection sociale des indépendants, ce qui exclut les indépendants qui ne sont pas des travailleurs non-salariés au sens de la protection sociale : dirigeants de certaines sociétés (SA, SAS/SASU), mandataires sociaux ou gérants minoritaires de SARL, et qui sont considérés comme assimilés salariés (rattachés au régime général par l’article L311-3 du CSS). * Pour l’exercice professionnel de son activité économique, le travailleur indépendant (TI) peut opter pour le statut dit « classique » ou celui d’auto-entrepreneur (AE). Ce choix conditionne le mode de déclaration et de calcul de cotisations. A l’intérieur des deux statuts, plusieurs catégories sont identifiées, au sens de la sécurité sociale : les artisans, les commerçants, les professions libérales. * Le revenu des AE est calculé à partir du chiffre d'affaires déclaré. Le passage du chiffre d’affaires au revenu s’obtient en appliquant au chiffre d’affaires annuel un abattement forfaitaire défini en fonction du type d’activité (34% pour les BNC, 50 % pour les BIC prestations, 71 % pour les BIC achat/vente). Le nombre d'AE correspond aux AE économiquement actifs, c'est à dire ceux ayant déclaré un chiffre d'affaires strictement positif dans l'année. * A la différence de l’AE, le TI classique déclare annuellement son revenu dans la déclaration sociale des indépendants (DSI). Il cotise sur ce revenu annuel, généralement le résultat comptable de l’exercice, assez proche du revenu fiscal. En cas d’absence de déclaration, un revenu appelé « taxation d’office », fonction d’un revenu antérieur connu ou du plafond de sécurité sociale (PASS) en vigueur majoré, est retenu pour le calcul des cotisations. * Le nombre de travailleurs indépendants comptabilise des comptes de cotisants et non des individus. Il porte sur les seuls TI ayant dégagé un revenu. * Les TI taxés d'office ne sont pas ici pris en compte, tant au niveau du nombre de TI que du montant des revenus.
Nombre de travailleurs indépendants, par département x secteur

Nombre annuel de travailleurs indépendants au 31/12 entre 2004 et 2023 par département, par secteur, par type de travailleur et par groupe professionnel. Source : Urssaf Précisions méthodologiques : * Ces données comptabilisent des comptes de cotisants et non des individus. Elles n’intègrent pas les exploitants agricoles, lesquels sont suivis par la Caisse centrale de la Mutualité sociale agricole (CCMSA). Par ailleurs, elles concernent l’ensemble des travailleurs indépendants relevant de la protection sociale des indépendants, ce qui exclut les indépendants qui ne sont pas des travailleurs non-salariés au sens de la protection sociale : dirigeants de certaines sociétés (SA, SAS/SASU), mandataires sociaux ou gérants minoritaires de SARL, et qui sont considérés comme assimilés salariés (rattachés au régime général par l’article L311-3 du CSS). * Pour l’exercice professionnel de son activité économique, le travailleur indépendant (TI) peut opter pour le statut dit « classique » ou celui d’auto-entrepreneur (AE). Ce choix conditionne le mode de déclaration et de calcul de cotisations. A l’intérieur des deux statuts, plusieurs catégories sont identifiées, au sens de la sécurité sociale : les artisans, les commerçants, les professions libérales. * Est considéré comme administrativement actif un TI ayant été immatriculé avant ou pendant l'année étudiée, qu’il ait déclaré ou pas un revenu ou un chiffre d’affaires positif, et encore inscrit au 31 décembre de l'année. * Est considéré comme économiquement actif un AE ayant déclaré un chiffre d’affaires strictement positif sur l'année étudiée.
Nombre de travailleurs indépendants, par département

Nombre annuel de travailleurs indépendants au 31/12 entre 2004 et 2024 par département, par type de travailleur et par groupe professionnel. Source : Urssaf Précisions méthodologiques : * Ces données comptabilisent des comptes de cotisants et non des individus. Elles n’intègrent pas les exploitants agricoles, lesquels sont suivis par la Caisse centrale de la Mutualité sociale agricole (CCMSA). Par ailleurs, elles concernent l’ensemble des travailleurs indépendants relevant de la protection sociale des indépendants, ce qui exclut les indépendants qui ne sont pas des travailleurs non-salariés au sens de la protection sociale : dirigeants de certaines sociétés (SA, SAS/SASU), mandataires sociaux ou gérants minoritaires de SARL, et qui sont considérés comme assimilés salariés (rattachés au régime général par l’article L311-3 du CSS). * Pour l’exercice professionnel de son activité économique, le travailleur indépendant (TI) peut opter pour le statut dit « classique » ou celui d’auto-entrepreneur (AE). Ce choix conditionne le mode de déclaration et de calcul de cotisations. A l’intérieur des deux statuts, plusieurs catégories sont identifiées, au sens de la sécurité sociale : les artisans, les commerçants, les professions libérales. * Est considéré comme administrativement actif un TI ayant été immatriculé avant ou pendant l'année étudiée, qu’il ait déclaré ou pas un revenu ou un chiffre d’affaires positif, et encore inscrit au 31 décembre de l'année. * Est considéré comme économiquement actif un AE ayant déclaré un chiffre d’affaires strictement positif sur l'année étudiée.
Nombre de travailleurs indépendants, par secteur d'activité

Nombre annuel de travailleurs indépendants au 31/12 entre 2004 et 2024 par secteur d'activité, par type de travailleur et par groupe professionnel. Source : Urssaf Précisions méthodologiques : * Ces données dénombrent des comptes de cotisants et non des individus. Elles n’intègrent pas les exploitants agricoles, lesquels sont suivis par la Caisse centrale de la Mutualité sociale agricole (CCMSA). Par ailleurs, elles concernent l’ensemble des travailleurs indépendants relevant de la protection sociale des indépendants, ce qui exclut les indépendants qui ne sont pas des travailleurs non-salariés au sens de la protection sociale : dirigeants de certaines sociétés (SA, SAS/SASU), mandataires sociaux ou gérants minoritaires de SARL, et qui sont considérés comme assimilés salariés (rattachés au régime général par l’article L311-3 du CSS). * Pour l’exercice professionnel de son activité économique, le travailleur indépendant (TI) peut opter pour le statut dit « classique » ou celui d’auto-entrepreneur (AE). Ce choix conditionne le mode de déclaration et de calcul de cotisations. A l’intérieur des deux statuts, plusieurs catégories sont identifiées, au sens de la sécurité sociale : les artisans, les commerçants, les professions libérales. * Est considéré comme administrativement actif un TI ayant été immatriculé avant ou pendant l'année étudiée, qu’il ait déclaré ou pas un revenu ou un chiffre d’affaires positif, et encore inscrit au 31 décembre de l'année. * Est considéré comme économiquement actif un AE ayant déclaré un chiffre d’affaires strictement positif sur l'année étudiée. * Le Groupe professionnel "nca _non_classé_ailleurs_" regroupe les TI dont le groupe professionnel est inconnu et, plus marginalement, les TI dont le croisement Type de TI x Secteur x Groupe professionnel ne respecte pas le secret statistique. * Le secteur "_calage_" permet de recaler le nombre total de TI classique et d'AE par groupe professionnel compte tenu du reclassement de certains TI en groupe professionnel "nca _non_classé_ailleurs_" du fait du non respect du secret statistique.
Plan d'échantillonnage pour l'évaluation l'état écologique du peuplement benthique des écosystèmes récifaux de La Réunion / Méthode CORRAM (2025)

[Lien vers la fiche source] Ce plan d'échantillonnage permet de réaliser une carte de l’état écologique de différents écosystèmes coralliens de La Réunion à l’aide de la méthode CORRAM (Coral Reef Rapid Assessment Method). Il a été mis en œuvre lors de différentes campagnes sur différents secteurs au cours des dernières années (cf. généalogie) et a vocation a servir de référence pour des campagnes ultérieures.
Changes in ecosystem nitrogen and carbon allocation with black mangrove (Avicennia germinans) encroachment into Spartina alterniflora salt marsh

[Lien vers la fiche source] Increases in temperature are expected to facilitate encroachment of tropical mangrove forests into temperate salt marshes, yet the effects on ecosystem services are understudied. Our work was conducted along a mangrove expansion front in Louisiana (USA), an area where coastal wetlands are in rapid decline due to compounding factors, including reduced sediment supply, rising sea level, and subsidence. Marsh and mangrove ecosystems are each known for their ability to adjust to sea-level rise and support numerous ecosystem services, but there are some differences in the societal benefits they provide. Here we compare carbon and nitrogen stocks and relate these findings to the expected effects of mangrove encroachment on nitrogen filtration and carbon sequestration in coastal wetlands. We specifically evaluate the implications of black mangrove (Avicennia germinans) encroachment into Spartina alterniflora-dominated salt marsh. Our results indicate that black mangrove encroachment will lead to increased aboveground carbon and nitrogen stocks. However, we found no differences in belowground (i.e., root and sediment) nitrogen or carbon stocks between marshes and mangroves. Thus, the shift from marsh to mangrove may provide decadal-scale increases in aboveground nitrogen and carbon sequestration, but belowground nitrogen and carbon sequestration (i.e., carbon burial) may not be affected. We measured lower pore water nitrogen content beneath growing mangroves, which we postulate may be due to greater nitrogen uptake and storage in mangrove aboveground tissues compared to marshes. However, further studies are needed to better characterize the implications of mangrove encroachment on nitrogen cycling, storage, and export to the coastal ocean.
Dynamic epimarks in sex-related genes predict gonad phenotype in seabass, a fish with mixed genetic and environmental sex determination

[Lien vers la fiche source] The integration of genomic and environmental influences into methylation patterns to bring about a phenotype is of central interest in developmental epigenetics, but many details are still unclear. The sex ratios of the species used here, the European sea bass, are determined by genetic and temperature influences. We created four families from parents known to produce offspring with different sex ratios, exposed larvae to masculinizing temperatures and examined, in juvenile gonads, the DNA methylation of seven genes related to sexual development by a targeted sequencing approach. The genes most affected by both genetics and environment were cyp19a1a and dmrt1, with contrasting sex-specific methylation and temperature responses. The relationship between cyp19a1a methylation and expression is relevant to the epigenetic regulation of sex, and we report the evidence of such relationship only below a methylation threshold, ~80%, and that it was sex-specific: negatively correlated in females but positively correlated in males. From parents to offspring, the methylation in gonads was midway between oocytes and sperm, with bias towards oocytes for amh-r2, er-β2, fsh-r and cyp19a1a. In contrast, dmrt1 levels resembled those of sperm. The methylation of individual CpGs from foxl2, er-β2 and nr3c1 were conserved from parents to offspring, whereas those of cyp19a1a, dmrt1 and amh-r2 were affected by temperature. Utilizing a machine-learning procedure based on the methylation levels of a selected set of CpGs, we present the first, to our knowledge, system based on epigenetic marks capable of predicting sex in an animal with ~90% accuracy and discuss possible applications.
Diadromous species sampling in Adour river-France

[Lien vers la fiche source] Data were collected by the Laboratoire de Ressources Halieutiques d'Aquitaine (Ifremer). The observations were carried out between April 1992 and July 2006. Observations and measures were made on board commercial vessels, practicing on Adour River generally in springtime and in summer. Sampling of catches took place on the river between March and July; The researchers took scales, a blood sample, took measurements of length and weight on the fish caught by the fishermen during the observed fishing trips. Sampling was of sampling-by-opportunity type. The driftnet is an emblematic and very old métier in this area, targeting different species as atlantic salmon (Salmo salar), sea trout (Salmo trutta), sea Lamprey (Pétromyzon marinus) and also allis shad (Alosa alosa). This activity is framed by particular regulation as quota of fishing days and licenses. Between 15 and 20 costal boats practice this métier during the year and the fleet characteristics are homogenous. The boats put the net in the water (around 100 m long) and let it drift with the surface current (downstream) while the tide is rising; the fish swimming upstream the river are then trapped in the water column. Different meshes can be used.
A Profile Classification Model from North-Atlantic Argo temperature data

[Lien vers la fiche source] A quantitative understanding of the integrated ocean heat content depends on our ability to determine how heat is distributed in the ocean and what are the associated coherent patterns. This dataset contains the results of the Maze et al., 2017 (Prog. Oce.) study demonstrating how this can be achieved using unsupervised classification of Argo temperature profiles. The dataset contains: - A netcdf file with classification~results (labels and probabilities) and coordinates (lat/lon/time) of 100,684 Argo temperature profiles in North Atlantic. - A netcdf file with a Profile Classification Model (PCM) that can be used to classify new temperature profiles from observations or numerical models. The classification method used is a Gaussian Mixture Model that decomposes the Probability Density Function of the dataset into a weighted sum of Gaussian modes. North Atlantic Argo temperature profiles between 0 and 1400m depth were interpolated onto a regular 5m grid, then compressed using Principal Component Analysis and finally classified using a Gaussian Mixture Model. To use the netcdf PCM file to classify new data, you can checkout our PCM Matlab and Python toolbox here: https://github.com/obidam/pcm
Deep water Decapoda collected during the BENTHEDI Expedition in Mayotte region (17/03 to 15/04/1977, R/V Suroît)

[Lien vers la fiche source] The BENTHEDI 1977 Expedition took place in Mayotte region from March 17 to April 15, 1997, on board the Research Vessel R/V Suroît (SISMER, 2015). Trawls and dredges were operated from 150-3716 m (mean depth prospected 524 m), with a few shallow waters collections between 3-50 m. The Crustacea Decapoda of this cruise are deposited in the Muséum national d’Histoire naturelle, Paris (MNHN). They have been studied later after the cruise and appear sporadically in taxonomic revisions published between 1985 and 2012. A compilation of these results is presented herein with a list à 47 Decapoda extracted on December 2, 2015 from the CRUSTA a database maintained online by Legall & Poupin (2015). Taxonomic classification follows De Grave et al. (2009) and WoRMS (2015).
Multi-resolution X-ray tomography of a lattice structure for super-resolution using deep learning

[Lien vers la fiche source] Data originally supporting the article: Klos, A., Salvo, L. & Lhuissier, P. Super-resolution X-ray tomography using deep learning applied to the 3D quantification of defects in lattice structures. Sci Rep 15, 36664 (2025). https://doi.org/10.1038/s41598-025-20372-4 This includes registered X-ray tomography volumes used for performing the deep-learning super-resolution training, validation and test.
SLA - Déchetteries

Localisation des déchetteries sur le territoire de Saint-Louis Agglomération. Pour chaque déchetterie, le dernier champs permet d'accéder à plus d'informations via le lien affiché. Ce jeu de données respecte à plus de 80% le Socle Commun des Données Locales (SCDL) pour le format du contenu et à 100% pour la structure. Services référents des données : Service Open Data - 03.89.70.46.67 Service déchets ménagers - 03.89.70.90.70
French PIRATA cruises: CTD-O2 data

[Lien vers la fiche source] CTD-O2 (Conducticity-Temperature-Depth-Oxygen) data were collected with a SEA-BIRD SBE911+ (SBE19 for FR6-8) CTD in the Gulf of Guinea during cruises carried out from 1997 in the framework of the programs «Prediction and Research morred Array in the Tropical Atlantic» (PIRATA ; Bourlès et al., 2008).