AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
Large-Eddy Simulations of boundary layers with coherent structures

[Lien vers la fiche source] Simulations of atmospheric boundary layers used in Brient et. al (2023). The model used is the MESO-NH model 4 simulations - BOMEX_sel_Ru0x0.1.V0301.008.nc4 The reference BOMEX marine cumulus case (Siebesma et al., 2003) at t=8h - BOMEX_sel_Ru0x0.1.V0301.008.nc4 The BOMEX case where horizontal large-scale winds are set to zero (t=8h) - FIRE_sel_Ls2x0.1.V0301.012.nc4 The reference FIRE marine stratocumulus case (Duynkerke et al., 2004) at t=12h - FIRE_sel_Ls2x0.1.V0301.021.nc4 The FIRE case at t=21h - IHOP_sel_Ru0x0.1.V0301.006.nc4 The reference IHOP clear-sky continental convective case (Couvreux et al., 2005) at t=12h (t+6h)
PLUi - Zones de vigilance liées aux lignes électriques Haute et Très Haute Tension (HT/THT)

Ces secteurs recensent les zones de vigilance au regard de la qualité de l'air et de nuisances sonores. Des zones de vigilance liées aux lignes électriques Hautes et Très Haute tension (HT/THT) sont définies pour prendre en compte trois enjeux : l'exploitation et la maintenance des ouvrages, les champs électro-magnétiques et le risque électrique. On recense : (1) les zones de vigilance liée aux lignes électriques de haute et très haute tension (HT/THT), souterraines ou aériennes, de type 63-90 kV (emprise de 25m. de part et d'autre de l'axe pour les lignes aériennes et de 5m. pour les souterraines) ; (2) les zones de vigilance liée aux lignes électriques de haute et très haute tension (HT/THT), souterraines ou aériennes, de type 225 kV (emprise de 50m. de part et d'autre de l'axe pour les lignes aériennes et de 10m. pour les souterraines) ; (3) les zones de vigilance liée aux lignes électriques de haute et très haute tension (HT/THT), souterraines ou aériennes, de type 400 kV (emprise de 75m. de part et d'autre de l'axe). Les périmètres concernés sont reportés sur le plan thématique "Santé/Risques/Sécurité/Air-Bruit/HT-THT" du règlement graphique. Les règles qui s'appliquent aux parcelles sur ces secteurs sont indiquées dans le règlement graphique (cf. plans thématiques) et précisées dans les prescriptions du règlement littéral du PLUi. Des recommandations sont précisées dans l'orientation d'aménagement et de programmation "Santé-Climat-Énergie". Codes des objets du PLUi concernés : urba_foncier.v_plui_prescription_surf = "code_rm" in ('psc_vigiltht1_s','psc_vigiltht2_s','psc_vigiltht3_s') urba_foncier.v_plui_prescription_lin = "code_rm" IN ('psc_vigiltht1a_l', 'psc_vigiltht2a_l', 'psc_vigiltht3a_l')
PLUi - Classement sonore des infrastructures routières et ferroviaires

Ces secteurs recensent les secteurs affectés par le bruit au regard des infrastructures terrestres (voies routières et ferrées) ayant un impact sur la qualité de l'air et de nuisances sonores. Des zones de vigilance aux abords des axes routiers et ferrés à fort trafic, en appui du classement sonore des voies sont définies afin de limiter l'exposition des personnes sensibles à la pollution de l'air : secteur de catégorie 1 (largeur : 300m) ; vecteur de catégorie 2 (largeur : 2500m) ; secteur de catégorie 3 (largeur : 100m) ; secteur de catégorie 4 (largeur : 30m) ; secteur de catégorie 5 (largeur : 10m) Les périmètres concernés sont reportés sur le plan des annexes du PLUi. Les règles qui s'appliquent aux parcelles sur ces secteurs sont indiquées dans les annexes (cf. "classement sonore des infrastructures de transport terrestre") et précisées dans le règlement littéral du PLUi. Des recommandations sont précisées dans l'orientation d'aménagement et de programmation "Santé-Climat-Énergie". Codes des objets du PLUi concernés : urba_foncier.v_plui_info_surf = "code_rm" IN ('inf_bruit1_s','inf_bruit2_s','inf_bruit3_s','inf_bruit4_s','inf_bruit5_s')
Passages piétons sur Rennes Métropole

Cette couche de points localise les passages piétons sur le territoire de Rennes Métropole et a pour objet de faciliter le suivi des travaux de mise en conformité des traversées. La qualification de la base de donnée n'est aujourd'hui pas exhaustive sur le territoire métropolitain. Elle se fera au fil de l'eau par des relevés de terrain. Définition des attributs de la couche de données : => Données générales : - auteur_rel : auteur du relevé - date_relev : date de saisie du point - photo : photo de la traversée piétonne - commentaire : commentaire métier - signal_lum : présence de signalisation lumineuse => Volet visibilité ; - conform_vis : conformité de la traversée (conforme/non conforme) - vis_mob : présence de mobilier gênant - vis_veg : présence végétation gênante - vis_sta : présence stationnement gênant - date_tvx_vis : date des travaux de mise en conformité => Volet accessibilité : - conformite_pmr : conformité de la traversée - surbaisse : présence d'un surbaissé - bev : présence de bande d'aide à la vigilance - bao : présence bande de guidage relevé 2013/14 - date_tvx_acess : date des travaux de mise en conformité La loi « handicap » n°2005-102 du 11 février 2005 a renforcé les obligations de mise en accessibilité de la voirie et des espaces publics. Son décret n° 2006-1658 du 21 décembre 2006 prévoit notamment le repérage des passages piétons et des équipements de sécurité pour les personnes aveugles et malvoyantes, la détection des obstacles et des équipements sur les cheminements, la meilleure lisibilité de la signalétique et des systèmes d’information. La loi LOM (Loi n° 2019-1428 du 24/12/2019) a introduit l'obligation de neutraliser les places de stationnement motorisé et les masques de visibilité 5 mètres en amont des passages piétons, afin d'assurer la sécurité des cheminements des piétons. Des distances de neutralisations doivent désormais être respectées en fonction des configurations (5 m étant la valeur légale minimale), afin que le piéton s’apprêtant à traverser puisse être vu par un véhicule à l'approche. La visibilité peut être réduite par la présence de véhicules stationnés en amont du passage piéton, par du mobilier urbain (bac à verres,panneaux…) ou par de végétation haute. La loi LOM prévoit la résorption de ces masques de visibilité lors de la réalisation de travaux d'aménagement, de réhabilitation et de réfection des chaussées, et au plus tard d'ici le 31 décembre 2026.» (Article 52)
PLUi - Zones de vigilance Air/Bruit

Ces secteurs recensent les zones de vigilance au regard de la qualité de l'air et de nuisances sonores. Des zones de vigilance aux abords des axes routiers et ferrés à fort trafic, en appui du classement sonore des voies sont définies afin de limiter l'exposition des personnes sensibles à la pollution de l'air : voies de catégorie 1 (rocade, N137 vers Nantes, N157 vers Paris, N12) pour lesquelles une zone de vigilance de 100 m de part et d'autre de l'axe est définie ; voies de catégorie 2 (autres voies à fort trafic : ex. seconde couronne…) pour lesquelles une zone de vigilance de 75 m de part et d'autre de l'axe est définie ; voie de catégorie 3 (certaines RD) pour lesquelles une zone de vigilance de 50 m de part et d'autre de l'axe est définie. Les périmètres concernés sont reportés sur le plan thématique "Santé/Risques/Sécurité/Air-Bruit/HT-THT" du règlement graphique. Les règles qui s'appliquent aux parcelles sur ces secteurs sont indiquées dans le règlement graphique (cf. plans thématiques) et précisées dans les prescriptions du règlement littéral du PLUi. Des recommandations sont précisées dans l'orientation d'aménagement et de programmation "Santé-Climat-Énergie". Codes des objets du PLUi concernés : urba_foncier.v_plui_prescription_surf = "code_rm" in ('psc_vigilbruit1_s','psc_vigilbruit2_s','psc_vigilbruit3_s') urba_foncier.v_plui_prescription_lin = "code_rm" IN ('psc_vigilbruit1a_l','psc_vigilbruit2a_l','psc_vigilbruit3a_l')
Dataset for genetic and transcriptome variation of ovary tomato response to heat stress

[Lien vers la fiche source] Six tomato accessions with contrasted responses to high temeprature (HT) were selected and the ovary transcriptomes of plants grown under HT and control conditions were analyzed and differentially expressed genes identified. Plant Materials : For RNAseq study, six accessions were used, three tolerant to heat stress : Cervil (one of the parents of the MAGIC population), the F1 hybrid Cervil x Levovil (CerLev) and Nagcarlan, which is known as tolerant to heat stress (Xu et al 2017a), and three susceptible to heat stress, chosen among the MAGIC lines (MT102, MT54) and their parental lines (Levovil). Plants were grown in greenhouse in Avignon in 2018, in the same conditions as the core collection (control and HT conditions) described in Bineau et al (submitted). RNA extraction Ovaries were collected on flowers from the six accessions just before petals fully open (1-2 days after pollination) and immediately frozen in liquid nitrogen. Sampling was performed over three weeks, each week sample corresponding to a biological replicate. The three biological replicates per accession (corresponding to a minimum of 5 ovaries) were separately ground to get biological replicates. RNA was extracted using the Spectrum Plant Total RNA kit (Sigma‐Aldrich, Saint‐Quentin Fallavier, France) following the manufacturer's protocol and treated with On‐Column DNase I Digestion Set (Sigma‐Aldrich) to remove any remaining genomic DNA. RNA purity and integrity were assessed on a NanoDrop 1000 spectrophotometer (Thermo Fisher Scientific, Illkirch, France) and a Bioanalyser 2100 spectrophotometer (Agilent Technologies, Les Ulis, France), respectively. RNAseq Library construction and sequencing (100 bp pair end) were subcontracted to BGI. The minimal, maximal, and average amounts of raw sequencing data per sample were estimated to be 12.2 × 10⁹ bp, 13.6 × 10⁹ bp, and 12.56 × 10⁹ bp, respectively. Raw sequencing data quality was assessed using FASTQC v.0.11.8 software (Andrews, 2011) and aggregated with MULTIQC v.1.7 (Ewels et al., 2016). Sequences were trimmed using FASTP v.0.20.0 (Chen et al., 2018). On average, cleaning steps removed 4.06% of the data (min = 4.04%, max = 4.08%). Remaining data were aligned to the tomato reference genome (Heinz 1706, v.4.0) using STAR v.2.6.1b with two passes and providing the tomato gene model (annotation v4.1) to support the mapping process. Alignments were filtered to keep only concordantly mapped reads using Samtools v.1.9 (Li et al., 2009) and read counts per gene were generated for each library using HTSEQ v.0.11.2 (Anders et al., 2015). On average, 94.8% of read pairs were uniquely mapped per library (min = 91.5%, max = 96.2%) and 2.1% multi-mapped (min = 1.7%, max = 2.7%). The differential gene analysis was performed using the workspace DiCoExpres (Lambert et al, 2020). For further explanations, we refer to the manual of DiCoExpress. The Dataset contains the raw data and R script used and the main results provided by the analysis. For specific contrast for one accession, the scripts must be run again.
Handlungsfelder Stadt St.Gallen

Der Stadtrat der Stadt St.Gallen bestimmt und veröffentlicht Legislatur- und Jahresziele, welche den Handlungsfeldern der Vision 2030 zugeordnet werden. Diese Ziele werden jeweils am Ende des Jahres, bzw. der Legislatur bewertet und im Geschäftsbericht der Stadt St.Gallen veröffentlicht. Der Datensatz zeigt die Handlungsfelder der Vision 2030. Mehr Informationen und die jeweiligen PDF-Dokumente finden Sie hier: [Stadtrat: Vision 2030 und Legislaturziele] [Geschäftsbericht: Legislatur- und Jahresziele, inkl. Bewertung]
Replication Data for: Unravelling the Dark Web: explainable inference of the diversity of microbial interactions

[Lien vers la fiche source] The functional diversity of microbial communities emerges from a combination of the great number of species and the many interaction types, such as competition, mutualism, predation or parasitism, in microbial ecological networks. Understanding the relationship between microbial networks and the services and functions delivered by the microbial communities is a key challenge for Microbial Ecology, particularly as so many of these interactions are difficult to observe and characterize. We believe that this 'Dark Web' of interactions could be unravelled using an explainable machine learning approach, called Abductive/Inductive Logic Programming (A/ILP) in the R package InfIntE, which uses mechanistic rules (interaction hypotheses) to infer directly the network structure and interaction types. Here we attempt to unravel the dark web of the plant microbiome embodied in metabarcoding data sampled from the grapevine foliar microbiome. Using synthetic, simulated data, we first show that it is possible to satisfactorily reconstruct microbial networks using explainable machine learning. Then we confirm that the dark web of the grapevine microbiome is diverse, being composed of a range of interaction types consistent with the literature. This first attempt to use explainable machine learning to infer microbial interaction networks advances our understanding of the ecological processes that occur in microbial communities and allows us to infer specific types of interaction within the grapevine microbiome that could be validated through experimentation. This work will have potentially valuable applications, such as the discovery of antagonistic interactions that might be used to identify potential biological control agents within the microbiome.
Répertoire National des Associations - Bagnères de Bigorre

### Que contient le RNA ? Le RNA répertorie l’ensemble des associations relevant de la [loi du 1er juillet 1901 relative au contrat d’association], dont le siège est en France (métropole et outre-mer) à l’exclusion des départements de la Moselle (57), du Bas-Rhin (67) et du Haut-Rhin (68) qui relèvent d’un régime spécifique. Le RNA contient également, dans les mêmes conditions, les associations reconnues d’utilité publique. Le RNA est alimenté après instruction du dossier par le greffe des associations lors d’une création, d’une modification ou d’une dissolution. Les déclarations de création sont ensuite publiées au [Journal Officiel des Associations et Fondations d’Entreprise (JOAFE)]. ### Modalités de diffusion des données du RNA Conformément aux dispositions de la [loi pour une République numérique du 7 octobre 2016] les données du RNA mises à disposition par le [ministère de l’Intérieur] et font partie des données accessibles en consultation et téléchargeables en données ouvertes. Le contenu des données téléchargeables est scindé en deux extractions : RNA_waldec : liste des associations disposant d’un numéro RNA. Toutes les associations créées ou ayant déclaré un changement de situation depuis 2009 disposent d’un numéro RNA. RNA_import : liste des associations créées depuis 1901 et qui n’ont pas effectué de déclaration de changement de situation depuis 2009. Une version rénovée du RNA est en cours d’élaboration par le ministère de l’Intérieur ; elle permettra à terme d’harmoniser le suivi des greffes sur l’ensemble du territoire national. Contenu des extractions : * le cas échéant, le n° RNA * le nom de l’association et son sigle * l’objet de l’association et son objet social * l’adresse du siège * le cas échéant, l’adresse de gestion * le cas échéant, le site internet de l’association ### Mise en place d’une [FAQ] relative au RNA En cas d’erreur constatée sur la base RNA, les réclamations doivent être adressées au greffe territorialement compétent, lieu d’implantation du siège social (préfecture, sous-préfecture ou direction départementale de la cohésion sociale). ### Enrichissement * géocodage du siège de l'association: * ajout des départements/régions/epci/code iso 3166-3 des zones.
Modified nest architecture and increased bioturbation in response to rise in temperature. A laboratory experiment with the ant species Lasius niger

[Lien vers la fiche source] Ants are one of the most significant bioturbators and they are likely to be affected by the current worldwide increase in temperatures, hence there could be a cascading effect on their contributions to soil functioning. Data presented here correspond to an experimental work under controlled laboratory conditions, that aimed to investigate the effects of increased surface temperatures on ants' nest architecture and its potential as extended plastic phenotype, and further consequences on bioturbation. Data include: 1) weekly excavated humid and dry soil, and water evaporation per column of soil. It includes: a) Identification of columns and weights of tubes at the start of the experiment, and b) humid excavated soil, dry excavated soil, actual weight of the column, calculated weight of the column (all in g), and calculated evaporated water in mL. 2) temperature on the surface of columns of soil where ants built their nests, per hour. Data include a) day and time, b) temperature in °C. 3) underground temperature of columns of soil where ants built their nests, every three hours. Data include a) day and time, b) temperature in °C. 4) nest morphological describers for each column of soil during four dates. Data were obtained from CT-scan images on DICOM format using a combination of Avizo and ImageJ softwares. It includes: a) unitless traits (sphericity, ellipse elevation, number of pores, Euler number, gamma, tortuosity); b) traits in mm (biggest ball radius, centroid Z, chamber thickness, tunnels thickness) ; c) traits in mm3 (total volume, tunnels volume, chambers volume, refilled volume); d) traits in percentage (tunnels volume, chambers volume, refilled volume). 5) profile of porosity of full nests in the column of soil. Data were obtained from the same CT-scan images and include slice (image) and its depth in mm, area of the pore and of the matrix in pixels, and percentage of pore area compared to total matrix area. 6) profile of porosity of refilled chambers in the column of soil. Data include slice (image) and its depth in mm, area of the refilled chamber and of the matrix in pixels, and percentage of refilled area compared to total matrix area. 7) number of workers during the experiment. Data includes number of individuals on days 0 and 100, number of new workers and percentage on new workers compared to the number of individuals at T100. 8) Size and weight of 10 ants per colony at the end of the experiment. Data include a) traits measured in mm: length of head, Weber's length (i.e. thorax length), and total length (head + thorax length); b) dry weight measured in mg. Note that, due to methodological constraints, the size and the weight do not correspond to the same individual, and we included them on the same database to facilitate its analyses exclusively.
Parkings sur Rennes Métropole

Cette couche localise les parkings référencés par le Service Mobilité Urbaine (SMU) et la Direction de la voirie sur le territoire de Rennes Métropole. Parmi les attributs décrivant les parkings : - nom_voie = nom de la voie la plus proche ; - nom = nom du parking ; - code_insee = insee de la commune concernée par le parking ; - type = type de parking - parmi les valeurs possibles : => Parking souterrain => Parking sur dalle => Parc relais => Parking de covoiturage => Parking usuel (tous les autres parkings) - domaine = propriétaire du parking ; - nb_pl = nombre de places ; - payant = payant (oui/non) ; - handicape = présence d'au moins une place handicapée (oui/non). En 2023, les parkings ont été pré-analysés pour être mis en conformité avec les exigences de la Loi Climat et Résilience (2021) appliquée aux constructions ou rénovations lourdes et la Loi d'accélération EnR (2023) appliquée aux constructions et aux parcs existants. Le résultat de cette pré-analyse a permis de renseigner des attributs ci-dessous : - projet_final : projet envisagé suite à l'application de l'arbre de décisions pour trouver le meilleur compromis entre les enjeux de production d'énergie, de préservation de la biodiversité et du cycle de l'eau, de lutte contre les îlots de chaleur urbains et de préservation des réserves foncières ; - tranche_icu : tranche de différentiel de température modélisée la nuit entre ville et campagne, du fait du phénomène d'Ilot de Chaleur Urbain (ICU) ; - potentiel_photovoltaique : tranche de potentiel photovoltaïque estimé dans le cadre de l'étude conduite par l'Audiar ; - audiar_score_simple : scoring établi par l'Audiar, sur une échelle de 1 à 10, situant le potentiel photovoltaïque du moins intéressant au plus intéressant sur la base d'une analyse multicritères (surface disponible, ensoleillement, distance de raccordement, présence d'arbres ou de candélabres, contraintes d'urbanisme…). Le projet est jugé intéressant à partir d'un score de 5 ; - planification : priorisation des sites à étudier lors l’analyse plus fine à venir / stade d’avancement du projet. Ces études plus poussées conduiront à faire évoluer les attributs de la couche, elles permettront de confirmer la mise en place d'ombrières ou d’abandonner cette hypothèse. Les styles de représentation nommés « Types d'aménagement sur parkings communaux et métropolitains » et « Planification des ombrières photovoltaïques sur parkings communaux et métropolitains » présentent les aménagements envisagés et la priorisation des projets.
transfR: Transfer of Hydrograph from Gauged to Ungauged Catchments. R package version 1.0.11

[Lien vers la fiche source] A geomorphology-based hydrological modelling for transferring streamflow measurements from gauged to ungauged catchments. Inverse modelling enables to estimate net rainfall from streamflow measurements following Boudhraâ et al. (2018) . Resulting net rainfall is then estimated on the ungauged catchments by spatial interpolation in order to finally simulate streamflow following de Lavenne et al. (2016) .
Carbon and thiol composition of dissolved organic matter in the Pacific Ocean.

[Lien vers la fiche source] It remains unclear how marine dissolved organic matter (DOM) becomes refractory, trapping large amounts of carbon in the ocean. Sulfurization is suspected to be involved in DOM refractability. Low molecular weight (LMW) compounds are often considered as less labile DOM. Thiols are involved in many metabolic pathways to prevent metal and oxidative stress. The LMW thiols composition of DOM was examined along the GEOTRACES US-GP15 section in the Eastern Pacific Ocean. We provide here dissolved organic carbon (DOC) and thiols concentrations along the water column.
CANOPY-A_Grignon_2013-2014_AGRONOMIE

[Lien vers la fiche source] Données expérimentales issues de l'essai CANOPY-A conduit à Grignon en 2013-2014 par l'UMR AGRONOMIE sur 4 génotypes de colza x 2 doses d'azote. L'essai était commun avec l'UMR ECOSYS.
CMEMS L4 Arctic Ocean - Sea and Ice Surface Temperature Reprocessed

[Lien vers la fiche source] This dataset provides time series of daily multi-sensor gap-free fields (referred to as L4) of Arctic Sea Surface Temperature (SST) and Sea Ice Surface Temperature (IST) at a 0.05 x 0.05 degree grid of the open ocean, sea ice and the marginal ice zone. The IST represents the skin temperature, while the SST represents the daily mean at 20 cm depth. The dataset is based on reprocessed AVHRR, (A)ATSR and SLSTR SST observations from the ESA CCI project, the Copernicus C3S project and the AASTI dataset. The data is inter-calibrated and bias corrected before being merged and interpolated using an optimal interpolation scheme to provide daily gap-free fields. The optimal interpolation scheme uses the previous days analysis as a background field. The product is produced in the frame of Copernicus Marine Environment Monitoring Service (CMEMS) and the data available through various tools and protocols with a simple user registration from this service (product identifier: SEAICE_ARC_PHY_CLIMATE_L4_MY_011_016).