AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
Dataset SYNERGY

[Lien vers la fiche source] Agricultural specialization is linked with negative environmental impact. The SYNERGY bio-economic model studies promising levers to limit these impacts: expand of legumes production and exchanges of crops and manure between farms. SYNERGY is a regional model that includes specialized farm types and models exchanges of crops (including legumes) and manure between them. To build this model, a large variety of data were collected. The aim of this paper is to present these data and specify their sources. The data implemented in SYNERGY were secondary data collected from a variety of sources or primary data generated thanks to different tools. It encompasses several domains (crop, livestock, feed, fertilization), and several scales, from national data (France), to local data (administrative regions). The data set presents three specific features. First, it includes data on feed costs that are differentiated according to their origin. Secondly, it includes detailed data on legumes, from their production to their use in feed. Thirdly, it includes data to calculate two environmental indicators on nitrogen efficiency and nitrogen losses. Thus, the data set of the SYNERGY model represents a valuable collection of agronomic, economic and environmental data to develop further research on the production of legumes, the different feeding strategies and their related environmental and economic impacts of agroecosystems.
Cours de marchandises accessibles après diagnostic

Liste des cours de marchandise accessibles après diagnostic du Réseau Ferré National. Les cours de marchandises permettent le chargement et le déchargement de wagons ainsi que le transbordement de marchandises de la voie ferrée à un autre mode de transport et vice versa. Elles sont composées d’une ou de plusieurs voies de service, le cas échéant de halles, quais ou bâtiments, et d’un accès routier permettant aux camions d’accéder au site. Ce jeu publie les données en l’état des bases, à jour à la date de publication.
Données de réplication pour : Reduced microbial diversity induces larger volatile organic compound emissions from soils.

[Lien vers la fiche source] These data concern the study "Reduced microbial diversity induces larger volatile organic compound emissions from soils". It is our intention to publish all the raw data and the data filtered during the statistical analysis in order to make them available for any further study. The data could be complex to analyze for this reason we are always available for further clarification at letizia.abis@tu-berlin.de. The data concern the following study: Microorganisms in soil are known to be a source and a sink of volatile organic compounds (VOCs). The role of the microbial VOCs on soil ecosystem regulation has been increasingly demonstrated in the recent years. Nevertheless, little is known about the influence of the microbial soil community structure and diversity on VOC emissions. This novel study analyzed the effect of reduced microbial diversity in soil on VOC emissions. We found that reduced levels of microbial diversity in soil increased VOC emissions from soils, while the number of different VOCs emitted decreased. Furthermore, we found that Proteobacteria, Bacteroidetes and fungi phyla were positively correlated to VOC emissions, and other prokaryotic phyla were either negatively correlated or very slightly positively correlated to VOCs emissions. Our interpretation is that Proteobacteria, Bacteroidetes and fungi were VOC producers while the other prokaryotic phyla were consumers. Finally, we discussed the possible role of VOCs as mediators of microbial interactions in soil.
Dataset for QTL detection in a Tomato MAGIC population analysed in a multi-environment experiment

[Lien vers la fiche source] Description of the data The data described here were produced from the ANR projects ADAPTOM (ANR-13-ADAP-0013) and TomEpiSet (ANR-16-CE20-0014). An 8-way tomato MAGIC population was phenotyped over 12 environments including three geographical location (France, Israel and Morocco) and four conditions (control, and water-deficit, high-temperature and salinity stress). A set of 397 MAGIC lines were genotyped for 1345 markers, used together with the phenotypic traits for linkage mapping analysis. Genotype-by-environment interaction (GxE) was evaluated and phenotypic plasticity computed through different statistical models. Each file in the dataset has its own description below. • Phenotype files The Phenotypes files contain the 10 phenotypic traits that were evaluated. Phenotypic data averaged per genotype and environment are in the file “Phenotype_per_Environment”. The input phenotypes for the linkage mapping analysis are in the file “Pheno_Input_QTL_detection”. They represent for each trait the estimated average performance, slope and variance from the Finlay & Wilkinson regression model and sensitivity to environmental covariates from the factorial regression model, respectively. • MAGIC Genotyping information This file presents the genetic map with 1345 SNP markers used in linkage mapping analyses. The genotypic information of the eight founders and 397 MAGIC lines are also presented • Daily recorded climactic parameters This file presents the daily climatic parameters recorded within the greenhouses. The different parameters were computed over 24 hours. • Custom R script for the two-stage analysis of GxE The file “Two-stage-analysis_magicMET.txt” contains the custom R script used for analysis of factorial regression and Finlay-Wilkinson regression models. Average performance and plasticity parameters were derived from these analyses. Example have been given for fruit weight phenotype averaged per genotype and environment. The input file “Var_environment_P2P3” presents the average climatic parameters used particularly for the factorial regression model. • Custom R script for QEI modelling The files “QEI_Glbal_marker_effect_model5.txt” and “QEI_main_plus_interactive_effect_model6.txt” describe the custom R script used for the detection of interactive QTLs (QEI). Example of fruit weight phenotype have been developed. The input files for the script are “FW_pheno_GxE.csv”, the average phenotypic data per genotype and environment for fruit weight example and the parental haplotype probabilities “Proba_parents.txt” that were computed from R/qtl2 package with the function calc_genoprob. The “Geno_ID.csv” file gives the correspondence between genotype name and ID.
Contributions de la concertation relative au projet de l'axe Nantes-Pornic conduit par le Département de Loire-Atlantique

Contributions recueillies en ligne, dans les registres papier et par mail au cours de la concertation publique intitulée : Nantes-Pornic : quelle route pour demain ? Relative au projet d’aménagement à 2X2 voies de la RD 751, cette concertation préalable a été organisée par le Département de Loire-Atlantique, entre le 21 septembre et le 4 novembre 2020. Conduite sous l’égide de deux garants de la CNDP, elle avait pour but de collecter les questions, remarques et avis des citoyen·ne·s tant sur l’opportunité d’aménager l’itinéraire que sur les options d’aménagement à privilégier, le cas échéant. Sur [la plateforme de participation du Département], il était ainsi possible de : * déposer des contributions sous forme d’avis, remarques, et idées et d’adjoindre une pièce jointe ; * de consulter les contributions rédigées sur registres-papiers en mairie, lesquelles ont été retranscrites sur la plateforme ; * déposer des questions sur la plateforme de participation ; * consulter les réponses apportées par le Département ou les garants de la CNDP. Ces questions, réponses, et contributions déposées en ligne et sur registres-papiers constituent le présent jeu de données.
Compilation of diagnostic horizons data

[Lien vers la fiche source] This dataset corresponds to a datamart produced by the WP2 team of the Landmark H2020 project. The database was developed by using a decision tree based script which determines the presence or absence of selected WRB diagnostic units (horizons, properties and materials) based on the harmonized soil profile dataset. The python-based code was developed based on the criteria defined by the World Reference Base for Soil Resources 2014 for the selected diagnostic units, by considering the difference in the information content of the input soil profile databases. Besides the presence/absence information, the code returns a percentage of reliability which provides an estimation on the reliability of the prediction of a certain diagnostic unit. The attributes are presented in the "dh_dictionary" file.
Ensemble de statistiques sommaires issues de la Base de Données d'Analyse de Terre (BDAT)

[Lien vers la fiche source] La base de données des analyses de terre regroupe les résultats d’analyses des parcelles agricoles effectuées à la demande des agriculteurs sur l’ensemble du territoire national par les laboratoires agréés du Ministère. Les données sont définies par le lieu et la date de prélèvement. L’ensemble de la base de données permet d’avoir un suivi sur la variabilité des caractéristiques de l’horizon de surface des sols cultivés et leur évolution au cours du temps. Ce jeu de données rassemble des tableaux statistiques sommaires calculées sur l'ensemble du territoire pour plusieurs périodes temporelles de 5 ans (1990, 1995, 2000, 2005, 2010 et 2014)
Participation au second tour des élections régionales du 27 juin 2021 à Ville-d'Avray

Ce jeu de données continent les taux de participation pour les élections régionales du 20 juin 2021 à Ville-d'Avray. Les taux sont indiqués pour le 2e tour à différentes heures de la journée: 9h, 10h, 11h, 12h, 13h, 14h, 15h, 16h, 17h, 18h, 19h et 20h (pas de 2nd tour pour ce scrutin).
Participation au second tour des élections départementales du 27 juin 2021 à Ville-d'Avray

Ce jeu de données continent les taux de participation pour les élections régionales du 27 juin 2021 à Ville-d'Avray. Les taux sont indiqués pour le 2e tour à différentes heures de la journée: 9h, 10h, 11h, 12h, 13h, 14h, 15h, 16h, 17h, 18h, 19h et 20h (pas de 2nd tour pour ce scrutin).
Résultats des élections départementales par canton

Résultats des élections départementales par canton dans le département des Hauts-de-Seine Les élections départementales (ex-cantonales) désignent les membres du conseil départemental (ex-général) dans le cadre du canton. C'est avec la loi n° 2013-403 du 17 mai 2013 relative à l'élection des conseillers départementaux, des conseillers municipaux et des conseillers communautaires, que l'assemblée qui dirige le département prend le nom de Conseil départemental (en remplacement de la précédente appellation de Conseil général). Le mode d'élection des conseillers départementaux (ex-conseillers généraux) est également modifié. Lors des élections départementales de mars 2015, le nouveau mode de scrutin s'applique pour la première fois : deux conseillers départementaux sont élus dans chaque canton au scrutin binominal à deux tours. Les candidats doivent se présenter en binôme composé d'une femme et d'un homme. Lexique [Nuances politiques] Données connexes Légifrance.gouv.fr - Élection des conseillers départementaux [Loi n° 2013-403 du 17 mai 2013 relative à l'élection des conseillers départementaux, municipaux, communautaires] vie-publique.fr [Quel est le mode de scrutin pour les élections départementales ?] Cantons des Hauts-de-Seine [Accéder au jeu de données des cantons (réaliser des cartes, …]
Elections départementales 2021 - second tour - Ville de Toulouse (Résultats)

Liste des résultats, ainsi que la participation pour le second tour des élections départementales du 27 juin 2021, par bureau de vote. N.B. Jeux liés : - [Elections départementales 2021 - second tour - liste des binômes candidats] - [Elections 2021 - découpage des bureaux de Vote]
Angelica microsatellite genotype for marker development

[Lien vers la fiche source] Genpop Angelica microsatellite data for marker development paper Revardel & Lepais 2021 ; pop1 = A. sylvestris Aurice (40) (38 individus) ; pop2 = A. sylvestris Saucats (33) (30 individus) ; pop3 = A. sylvestris Vosges (68) (30 individus) ; pop4 = A. heterocarpa Rézé (44) (40 individus) ; pop5 = A. heterocarpa Garonne (33) (38 individus) ; pop6 = A. razuli bagnères (33) (50 individus) ; pop7 = A. archangelica Hambourg (3 individus).
Système aquifère - BDLISA Niveau local NV3

## Découpage de l'ensemble du territoire national en entités hydrogéologiques ## Cette base de données a été définie et élaborée au 1/50000 (échelle dite "locale"). A cette échelle, l'ensemble des objets hydrogéologiques du territoire français ont donc été cartographiés et décrits. Ces objets hydrogéologiques et leurs caractéristiques constituent les informations unitaires de la base de données et sont nommés des entités hydrogéologiques NV3. Il est possible d'obtenir des représentations à des échelles plus petites (échelles régionale = 1/200000 ou nationale = 1/1000000), par des mécanismes d'agrégation de l'information initialement au 1/50 000. C'est le concept de niveau de représentation NV1 et NV2. Une masse d'eau souterraine est un volume distinct d'eau souterraine à l'intérieur d'un ou de plusieurs aquifères Le référentiel BD LISA (Base de Données des Limites des Systèmes Aquifères) est diffusée gratuitement pour tout tiers sous condition d'une utilisation non commerciale. Pour découvrir la BDLISA : [Découvrir la BDLISA | BDLISA (eaufrance.fr)] 3 niveaux : Niveau d’utilisation national NV1 : grand système aquifère et grand domaine hydrogéologique, Niveau d’utilisation régional NV2 : système aquifère et domaine hydrogéologique, Niveau d’utilisation local NV3 : unité aquifère, unité semi-perméable et unité imperméable, Dans cette plateforme, sera mis en avant uniquement le niveau d’utilisation local 3. Pour télécharger les deux autres niveaux : [Télécharger | BDLISA (eaufrance.fr)] Description colonne du niveau NV3 : NiveauEH : toujours 3 ici car couche NV3 EtatEH : de 1 à 7, nomenclature et définition ici è [Etat de l'entité hydrogéologique - Referentiels - Nomenclatures (eaufrance.fr)] MilieuEH : de 1 à 11, nomenclature et définition ici è [Type de milieu pour une entité hydrogéologique - Referentiels - Nomenclatures (eaufrance.fr)] NatureEH : de 1 à 12, nomenclature et définition ici è [Nature de l'entité hydrogéologique - Referentiels - Nomenclatures (eaufrance.fr)] ThèmeEH : de 1 à 6, nomenclature et définition ici è [Thème de l'entité hydrogéologique - Referentiels - Nomenclatures (eaufrance.fr)]
Elections - Régionales 2021 - 1erTour

Résultats du 1er tour des élections régionales du 20 Juin 2021 par bureau de vote, quartier, arrondissement et circonscription. Vous retrouverez : * Nombre de procurations * Nombre d’inscrits * Nombre d’émargements * Nombre de votants * Nombre de blancs * Nombre de nuls * Nombre d’exprimés * Les résultats pour chaque candidat Un identifiant ID_BVOTE permet de réaliser une jointure avec [les jeux de données géographiques des secteurs de bureaux de vote] Ces résultats correspondent aux extraits le soir de scrutin du Système d'information élection de la Ville de Paris ( "Sigles résultats" jusqu'en 2015 et de "Paris Vote" à partir de 2017). Nous attirons l'attention des utilisateurs sur le fait que des écarts peuvent exister entre les résultats de ces fichiers et ceux publiés par le Ministère de l’Intérieur. Ces résultats ne prennent pas en compte d’éventuelles rectifications effectuées par les organismes de contrôle ou le juge de l’élection.
Elections - Régionales 2021 - 2èmeTour

Résultats du 2ème tour des élections régionales du 27 Juin 2021 par bureau de vote, quartier, arrondissement et circonscription. Vous retrouverez : * Nombre de procurations * Nombre d’inscrits * Nombre d’émargements * Nombre de votants * Nombre de blancs * Nombre de nuls * Nombre d’exprimés * Les résultats pour chaque candidat Un identifiant ID_BVOTE permet de réaliser une jointure avec [les jeux de données géographiques des secteurs de bureaux de vote] Ces résultats correspondent aux extraits le soir de scrutin du Système d'information élection de la Ville de Paris ( "Sigles résultats" jusqu'en 2015 et de "Paris Vote" à partir de 2017). Nous attirons l'attention des utilisateurs sur le fait que des écarts peuvent exister entre les résultats de ces fichiers et ceux publiés par le Ministère de l’Intérieur. Ces résultats ne prennent pas en compte d’éventuelles rectifications effectuées par les organismes de contrôle ou le juge de l’élection.
Size-density data from pure even-aged stands of sycamore maple (Acer pseudoplatanus L.) growing at maximum density

[Lien vers la fiche source] For sycamore, data from unthinned long-term permanent plots were not available (Le Goff et al, 2011). The establishment of the maximum size–density relationship for sycamore relied only on temporary plots installed in spring 2006 in fully stocked stands with no sign of recent cleaning or thinning treatment and presenting natural mortality, in Lorraine and Alsace regions (NE France). In these plots live trees were generally inventoried at two dates for the purpose of this study, in years 2006 and 2007. Dead trees at plot installation were also inventoried by sorting them by “age” class (see Le Goff et al. 2011). In the sample plots, sycamore trees appeared often mixed with other tree species (most often ash and beech) and may be also over-topped by an upper layer of older trees reducing significantly the transmitted radiation. Selection criteria were then defined to ensure homogeneous growing conditions among selected plots: 1) stands relatively pure, sycamore trees representing more than 80% of the stand, in terms of number of trees and total basal area 2) minimum annual mortality rate of 1%, so that stands were close to maximum density 3) trees not completely covered by an upper layer. Moreover, the data from plot 5 of “Matstall” in 2007 were discarded, an over-topping tree being removed at the end of 2006. The selection criteria are notified for each plot in Table 2 of the related publication, but they also appear in the dataset. Inventories were extended for one or more years beyond the year 2007, depending on the plot (variable “Sel-data” = “extra” in the data set), allowing representing a part of the size-density trajectory of sycamore at maximum density, with an insight into the possible impacts of species mixture and upper layer cover on the trajectory. The following data appear for each inventoried plot in the sycamore dataset: “Plot” (name of plot location), “Dep” (department number), NoPlot (plot number), “Cover“ (upper layer cover: “none”, “half-covered gap”, “whole covered gap”), “Mixed” (other species present: “no”, “yes”), “Mixed-species” (species in mixture, if any), “Sel-data” (“yes”, if inventory year data were selected for maximum size-density line fitting in the related publication, “no” or “extra data” if not), “Year“ (year of inventory), “Age“ (stand age, in years), “Ntot” (total number of live trees per ha), “Nsyc%” (relative number of sycamore live trees, in %), “Gtot” (total basal area of live trees, m2 ha-1), “Gsyc%” (sycamore basal area, in %), “Cg” (quadratic mean girth at breast height of all live trees, cm), “Hg” (mean height of sycamore trees at the date of plot installation, m).
Biogas production channels in Europe

Ce jeu de donnée donne la production de biogaz pour les principaux pays producteurs européens, selon les procédés utilisés. Les données proviennent de Eurobserv'ER ([https://www.eurobserv-er.org/])* Une réutilisation des données est faîte sur Gas in Focus : [https://www.gasinfocus.com/fili%C3%A8res-de-production]
New scale analyses reveal centenarian coelacanths Latimeria chalumnae - Datasets and R scripts

[Lien vers la fiche source] Datasets and R scripts used in the publication « New scale analyses reveal centenarian coelacanths Latimeria chalumnae”. Datasets include catch information (identifier, catch year and month), biometric (total length, sex, weight) and ageing (circuli and macro-circuli numbers and corresponding marginal increments) data for the 27 coelacanth specimens used in this study, the extraction of Von Bertalanffy growth parameters (rate coefficient and asymptotic total length) and of life-history traits (age at maturity, maximum longevity, spawning frequency) in marine fish from Fishbase (June 2020). R scripts describe (i) the marginal increment analysis, i.e. the analysis of the periodicity of circuli and macro-circuli formation, on the African coelacanth scales to validate ageing based on circuli, (ii) the body growth patterns of the African coelacanth according to the different ageing hypotheses and the fitting of the Von Bertalanffy, Gompertz and logistic growth models to the corresponding length-at-age data, (iii) the comparison of the African coelacanth’s growth characteristics obtained with other marine fish through auximetric analysis and (iv) the location the African coelacanth along the slow-fast life-history continuum in marine fish.
Hydrothermal faunal communities of the Snake Pit vent field

[Lien vers la fiche source] This video illustrates the different hydrothermal communities found at 3500 m depth on the Snake Pit vent field including swarms of the shrimp Rimicaris exoculata found in the hottest habitats, in the vicinity of black smokers, assemblages of the mussels Bathymodiolus puteoserpentis on the Elan sulfide structure in low-temperature habitats and a new assemblage of small Peltospira smaragdina gastropods, also associated to high temperature habitats. Video sequences were acquired during the BICOSE2 cruise (2018) with the HOV Nautile.
Observation météorologique historiques - Tours Métropole Val de Loire

Données d'observations issues des messages internationaux d’observation en surface (SYNOP) circulant sur le système mondial de télécommunication (SMT) de l’Organisation Météorologique Mondiale (OMM). Paramètres atmosphériques mesurés (température, humidité, direction et force du vent, pression atmosphérique, hauteur de précipitations) ou observés (temps sensible, description des nuages, visibilité) depuis la surface terrestre. Selon instrumentation et spécificités locales, d'autres paramètres peuvent être disponibles (hauteur de neige, état du sol, etc.)
Bioinformatic scripts used to analyze fungal metabarcoding data obtained from Vitis vinifera leaves

[Lien vers la fiche source] Bioinformatic scripts used to sort, filter and analyze fungal raw sequence data obtained by metabarcoding foliar, bark and ground cover samples collected in an untreated vineyard at INRA Villenave d'Ornon (France). Amplicon sequence variant (ASV) tables obtained for vine leaves and environmental sources (senescing leaves, bark and ground cover).
Differential Adaptation of Propionibacterium freudenreichii CIRM-BIA to cow's milk versus soymilk envirnments modulates its stress tolerance and proteome

[Lien vers la fiche source] Propionibacterium freudenreichii adaptation to cow milk versus soymilk environments was studied thanks to proteomics. Bacteria were harvested at the begining of stationary phase. Protein trypsin digestion were performed in solution. The data set contains 19 files of NanoLC-MS/MS analysis, acquired on a Qexactive mass spectrometer. Design: 2 classes (cow milk:"lait", soymilk: "soja"), 3 biological replicates. All samples were injected 3 times
Data set - Collembola abundances and traits in various land uses

[Lien vers la fiche source] This dataset is composed by an excel files with 6 sheets: (i) "abundance" is a data table that groups the collembolan communities in 758 sampled sites (minimum of 3 replicates by site), (ii) "trait" provides information on the functional traits of several collembolan species. These data are largely extracted from the BETSI trait database (https://portail.betsi.cnrs.fr/), (iv) "site" is a table giving information on the different characteristics of the sites and (v) a table summarising the origin of the data (13 different projects) and (vi) list of abbreviations.