AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
NIRS Database on raw fresh sweetpotato for texture & cooking time at CIP, Uganda

[Lien vers la fiche source] NIRS spectra were taken of 61 sweetpotatoe genotypes. Three fresh roots per genotype were cut hoizontally and scanned by NIRS XDS in the middle of the root. Scans were used for calibration development by single root but also averaged by genotype. Spectra databases and lab values are presented in two seperated sheets. Reference analysis was done in Uganda directly after scanning by cutting two cubes of each root for cooking time and texture parameters. For texture parameters, the method needed to be changed after sample 17, which means that samples with IDs 02 to 17 were not considered for calibration development.
Zones humides - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame milieux humides du SRCE en région Centre-Val de Loire. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Base Permanente des Equipements (ensemble) géolocalisée de la Mayenne

L'objectif de la Base Permanente des Équipements (BPE) est de proposer annuellement une base d'équipements géolocalisés construite à partir de sources administratives diverses. La Base Permanente des Équipements est réparti en 7 grands domaines : services aux particuliers ; commerces ; enseignement ; santé ; transports et déplacements ; sports, loisirs et culture ; tourisme. À partir de la BPE 2021, la source SIRUS remplace la source SIRENE. Suite à ce changement de source, les unités « cessées statistiques » sont exclues de la BPE, on observe donc une baisse notable de 460 000 du nombre d’équipements de la BPE 2021. La constitution des gammes d'équipements La classification des équipements en gammes a pour objectif de réunir des équipements qui présentent des logiques d'implantation voisines, en ce sens qu'ils sont fréquemment présents dans les mêmes communes. Ces regroupements permettent d'élaborer des indicateurs synthétiques reflétant l'organisation hiérarchisée des territoires en termes de services à la population. Les gammes d’équipements sont actualisées chaque année pour une nouvelle version de la Base Permanente des Équipements. En effet, d’une part de nouveaux équipements peuvent être introduits dans la base et, d’autre part, l’implantation des équipements dans les communes peut être modifiée, tout cela pouvant avoir des conséquences sur la composition des gammes. Pour constituer les gammes d’équipements, trois opérations successives sont réalisées. Constitution des gammes d'équipements La méthode mise en œuvre pour aboutir à une partition des équipements en gammes résulte principalement d'une analyse de leur présence simultanée dans les communes. Pour ce faire, une classification automatique des équipements figurant dans la BPE est réalisée sur la matrice indiquant la présence de chaque type d'équipement dans chaque commune de France. Les communes n'ayant aucun équipement ou un seul type d'équipement sont éliminées car elles n'apportent aucune information sur la présence simultanée des équipements dans les communes. Compte tenu du volume de données traitées, la méthode dite des "nuées dynamiques" est utilisée. Elle optimise la co-présence dans les communes des équipements appartenant à la même gamme, tout en assurant un nombre suffisant de types d'équipements dans chaque gamme. Cette méthode d'analyse typologique permet de traiter rapidement un volume très important de données. Granularité 1 enregistrement = 1 équipement Couverture France Métropolitaine et DROM Enrichissement * Noms/Codes des divisions administratives * Codes ISO 3166-3 IMPORTANT: Il existe des erreurs de géocodages sur certains points. Autres jeux liés * [https://public.opendatasoft.com/explore/dataset/buildingref-france-bpe-all-millesime/] * [https://public.opendatasoft.com/explore/dataset/buildingref-france-bpe-all/] * [https://public.opendatasoft.com/explore/dataset/buildingref-france-bpe-all-geolocated]
Zones humides - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame milieux humides du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Zones humides - Corridors écologiques (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents corridors écologiques potentiels pour la sous-trame milieux humides du SRCE en région Centre-Val de Loire. Ces corridors assurent des connexions entre des réservoirs de biodiversité, offrant aux espèces des conditions favorables à leur déplacement et à l’accomplissement de leur cycle de vie. (article R.317-19 III du code de l’environnement). Deux niveaux d’intervention sont possible dans le cadre du SRCE : les corridors à restaurer et ceux à préserver. Une emprise indicative de 3 km est à prendre en considération de part et d’autre de l’axe du corridor, de manière à bien signifier qu’il s’agit de fuseaux de déplacement imprecis qu’il conviendra d’affiner à partir des connaissances locales au moment de la déclinaison du SRCE. La réglementation autorise que tous les réservoirs de biodiversité ne soient pas forcément reliés par des corridors écologiques (article R.317-19 II du code l’environnement) . Ce cas de figure devrait être limité et concerner principalement des réservoirs de biodiversité au regard : * a) de la pertinence de connecter ou de garder l’isolement naturel de ces espaces (en particulier : cas d’isolement pour permettre d’éviter la propagation d’espèces exotiques envahissantes ou d’éventuels problèmes sanitaires posés par la faune sauvage véhiculant des maladies pouvant se transmettre à des espèces domestiques (ex : fièvre porcine) ou même à l’homme (ex : rage)). * b) d’enjeu de préservation de certains espaces qui constituent un réseau écologique en « pas japonais » pour les espèces associées (ex : des étangs et lacs, des mares, des tourbières) ou de certains espaces non connectés aujourd’hui mais qui pourront servir demain de « relais » ou de nouveau point du maillage écologique du territoire (face à des changements tels que le changement climatique, l’évolution de l’aire de répartition, les incendies, la disparition de réservoirs via un projet d’aménagement ...). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Zones humides - Corridors écologiques (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents corridors écologiques potentiels pour la sous-trame milieux humides du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. Ces corridors assurent des connexions entre des réservoirs de biodiversité, offrant aux espèces des conditions favorables à leur déplacement et à l’accomplissement de leur cycle de vie. (article R.317-19 III du code de l’environnement). Deux niveaux d’intervention sont possible dans le cadre du SRCE : les corridors à restaurer et ceux à préserver. Une emprise indicative de 3 km est à prendre en considération de part et d’autre de l’axe du corridor, de manière à bien signifier qu’il s’agit de fuseaux de déplacement imprecis qu’il conviendra d’affiner à partir des connaissances locales au moment de la déclinaison du SRCE. La réglementation autorise que tous les réservoirs de biodiversité ne soient pas forcément reliés par des corridors écologiques (article R.317-19 II du code l’environnement) . Ce cas de figure devrait être limité et concerner principalement des réservoirs de biodiversité au regard : * a) de la pertinence de connecter ou de garder l’isolement naturel de ces espaces (en particulier : cas d’isolement pour permettre d’éviter la propagation d’espèces exotiques envahissantes ou d’éventuels problèmes sanitaires posés par la faune sauvage véhiculant des maladies pouvant se transmettre à des espèces domestiques (ex : fièvre porcine) ou même à l’homme (ex : rage)). * b) d’enjeu de préservation de certains espaces qui constituent un réseau écologique en « pas japonais » pour les espèces associées (ex : des étangs et lacs, des mares, des tourbières) ou de certains espaces non connectés aujourd’hui mais qui pourront servir demain de « relais » ou de nouveau point du maillage écologique du territoire (face à des changements tels que le changement climatique, l’évolution de l’aire de répartition, les incendies, la disparition de réservoirs via un projet d’aménagement ...). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Zones humides - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Cette table liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame zones humides du SRCE en région Centre-Val de Loire. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Zones humides - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Cette table liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame zones humides du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Pelouses et lisières sèches sur sols calcaires - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame pelouses et lisières sèches sur sols calcaires du SRCE en région Centre-Val de Loire. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie : 1/100.000 ème.
Pelouses et lisières sèches sur sols calcaires - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame pelouses et lisières sèches sur sols calcaires du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie : 1/100.000 ème.
Pelouses et lisières sèches sur sols calcaires - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame pelouses et lisières sèches sur sols calcaires du SRCE en région Centre-Val de Loire. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saisie : 1/100.000 ème.
Pelouses et lisières sèches sur sols calcaires - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame pelouses et lisières sèches sur sols calcaires du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saisie : 1/100.000 ème.
A dataset of well-based regional groundwater storage variations in France

[Lien vers la fiche source] Groundwater comprises approximately 30 percent of the Earth’s total freshwater, serving as a vital resource for both humans and ecosystems. As an essential source of drinking water for humans and sustenance for vegetation, groundwater plays a key role in the terrestrial water cycle. It acts as a buffer, enabling adaptation to climate variability and extreme events like floods and droughts. Therefore, understanding groundwater storage is important for both ecological and15 societal reasons.
QTL mapping of modeled metabolic fluxes reveals gene variants impacting yeast central carbon metabolism

[Lien vers la fiche source] The yeast Saccharomyces cerevisiae is an attractive industrial host for the production of a wide range of bulk and fine chemicals, such as biofuels, flavors and fragrances or pharmaceutical products. The intermediates of yeast central carbon metabolism (CCM) are the building blocks of these biosynthetic pathways. Their production kinetics and intracellular availability depend on the balance of numerous single intracellular reactions, which together form intracellular fluxes. Therefore, efficient product biosynthesis is influenced by the distribution of these fluxes. We recently demonstrated great variations in the metabolic fluxes of CCM between yeast strains of different origins. However, due to the complexity of flux regulatory mechanisms, we have a limited understanding of how fluxes are modulated and even less knowledge about the genetic basis of variations in flux distributions. In this study, we investigated the potential of quantitative trait locus (QTL) mapping to elucidate the genetic variations responsible for differences in metabolic flux distributions (fQTL) using a population of 130 F2-segregants from a cross of two wine yeast strains. Intracellular metabolic fluxes were estimated by constraint-based modeling and used as quantitative phenotypes, and differences in fluxes were linked to genomic variations in the progeny population. Using this approach, we detected four fQTLs that influence metabolic pathways. The molecular dissection of these QTLs revealed the contribution of two allelic gene variants, PDB1 and VID30, which have an influence on glycolysis, glycerol synthesis, ethanol synthesis, tricarboxylic acid cycle fluxes and transport and excretion of main metabolites. The elucidation of genetic determinants influencing metabolic fluxes, as reported here for the first time, creates new opportunities for the development of strains with optimized metabolite profiles for various applications using metabolic engineering or breeding strategies.
Référentiel des données naturalistes sensibles à la diffusion

[Lien vers la fiche source] Les données naturalistes sensibles constituent une exception à la libre diffusion des données. La notion est définie dans le cadre du SINP, en référence à l’article L.124-4 du code de l'environnement : ce sont des données qui ne doivent pas être largement diffusées pour éviter de porter atteintes aux éléments qu’elles concernent. Données gérées dans le cadre du SINP.
Milieux boisés - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame Milieux boisés du SRCE en région Centre-Val de Loire. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Milieux boisés - Corridors diffus (SRCE)

Ce jeu de données liste les différentes zones de corridors diffus à préciser localement pour la sous-trame Milieux boisés du SRCE dans l'Agglo du Pays de Dreux. Ces zones correspondent à des espaces périphériques aux réservoirs de biodiversité, au sein desquels l’identification d’axes de corridors n’a pas été possible à l’échelle de travail du SRCE. Une précision de ces informations devra être apportée lors de la déclinaison du SRCE dans le cadre de la planification locale du territoire (documents d’urbanisme). Echelle de saisie: 1/100.000 ème.
Observatoire des Mairies de quartiers à Roubaix - INSEE 2019

# La municipalité de Roubaix met à disposition des données de l'INSEE qui ont été traitées et regroupées selon les quartiers de la ville de Roubaix. # # Vous pouvez accéder à ces données sur le lien suivant : [Lien vers les données]. # # # Ces informations seront mises à jour annuellement en fonction des mises à jour effectuées par l'INSEE. Pour accéder aux données détaillées sur la population par exemple, il vous suffit de cliquer [ici] pour suivre le lien vers le site de l'INSEE.
Catalogue d'identification photographique des orques de Terre Adélie - Photo-ID catalog of killer whales from Adelie Land, Antarctica

[Lien vers la fiche source] Catalogue d'identification photographique des orques observés pendant les campagnes CETA, Terre Adélie, Antarctique - Photo-ID catalog of killer whales from Adelie Land, Antarctica (Programme CETA IPEV 1014)
DATA from Saclay's Divergent Selection Experiments analysed in Desbiez-Piat et al. 2023

[Lien vers la fiche source] Empirical description of phenotypic shifts in selection experiments have nourished quantitative genetics models. These models have shown that long-term selection responses depend both on the initial standing variance as well as the flux of incoming mutations, and that quantifying the proportion of genetic variance due to latter is essential to understanding the seeming absence of selection limits. There are however at least two important things to keep in mind when interpreting selection experiments: first correlative responses to selection on non-focal traits can perturb the selection response on the focal trait and second, generations and selection environments are confounded so that genotype by environment interactions are ignored. Here we used the Saclay Divergent Selection Experiments (DSE) on maize flowering time that display striking selection responses over 18 generations and combined yearly measurements of flowering time (DSEYM), measurements of 11 traits on a subset of 308 DSE genotypes measured for two consecutive years in common gardens (DSECG), as well as genotyping data to track the fate of individual mutations in pedigrees, with four main objectives: (1) to quantify the relative contribution of standing variation and de novo mutational variance to the selection response; (2) to approximate the distribution of phenotypic effects of de novo mutations; (3) to study the impact of GxE interactions in the observed selection response; (4) to describe how trait correlations modulate the exploration of the phenotypic space. In agreement with theoretical predictions, we experimentally validated two successive phases in the selection response: one governed by the fixation of standing variants whose contribution quickly reached a plateau, and the second governed by the fixation of de novo mutations sustaining the selection response. The distribution of selected phenotypic effects confirmed the expected enrichment of fixation of beneficial mutations with an average effect of +0.278 and +0.299 days to flowering, depending on the genetic background; but also revealed fixation of unfavorable mutations reaching up to 25% of incoming mutations. Accumulation of genetic load may be due to antagonistic pleiotropy whereby mutations that were fixed in the selection environment (DSEYM) turn to be unfavorable in evaluation environment (DSECG). Finally, we found that global patterns of correlations between-traits are conserved across genetic backgrounds but exhibit a temporal pattern. Traits that are weakly or uncorrelated with flowering time allow stochastic exploration of the phenotypic space, owing to the microenvironment-specific fixation of standing variants and a pleiotropic mutational input.
Espaces cultivés - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame espaces cultivés du SRCE en région Centre-Val de Loire. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saise: 1/100.000 ème.
Milieux boisés - Réservoirs de biodiversité (SRCE)

Ce jeu de données liste les différents réservoirs de biodiversité pour la sous-trame milieux boisés du SRCE en région Centre-Val de Loire. En application de l’article R.371-19 II du code de l’environnement, les réservoirs de biodiversité sont des espaces dans lesquels la biodiversité, rare ou commune, menacée ou non menacée, est la plus riche ou la mieux représentée, où les espèces peuvent effectuer tout ou partie de leur cycle de vie (alimentation, reproduction, repos) et où les habitats naturels peuvent assurer leur fonctionnement en ayant notamment une taille suffisante. Ce sont des espaces pouvant abriter des noyaux de populations d’espèces à partir desquels les individus se dispersent, ou susceptibles de permettre l’accueil de nouvelles populations d’espèces. Echelle de saisie: 1/100.000 ème.