AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing

[Lien vers la fiche source] This repository contains all the files needed to reproduce the results of the article "ViroSeek: a viral detection pipeline for second-generation sequencing", including the files needed to run the ViroSeek pipeline. ViroSeek is a simplified bioinformatics pipeline for the taxonomic analysis of second-generation sequencing data. It contains: * Main pipeline scripts (bash or nextflow) for automated execution of the steps * Installation instructions and README file describing the software prerequisites (FastQC, TrimGalore, BBTools, SPAdes, Samtools, TaxonKit), as well as the yml file for setting up the conda environment. * Bash script for generating simulated data with CASIMIM, used as a positive sample in the article. * R script used for downstream pipeline analysis
ASO #1297 - Mammifères marins échantilloneurs du milieu océanique

[Lien vers la fiche source] Depuis 2003, les éléphants de mer de Kerguelen sont suivis dans l’océan Austral grâce à l’utilisation de balises haute performance. Ces dispositifs enregistrent simultanément leurs mouvements en mer et différents paramètres océanographiques. En effectuant des plongées répétées à grande profondeur, ces animaux collectent des profils verticaux de température et de salinité dans des zones éloignées et encore peu échantillonnées de l’océan mondial. Ce programme repose sur un suivi individuel à long terme d’animaux équipés de balises Argos ou GPS, associées à des capteurs de pression et des accéléromètres. Ces instruments permettent de reconstituer précisément les trajectoires en mer, de décrire les caractéristiques des plongées (profondeur, durée, fréquence) et d’identifier des comportements spécifiques, notamment les tentatives de capture de proies. Ces données comportementales à fine échelle offrent une description quantitative des stratégies de recherche alimentaire, des rythmes d’activité, de l’utilisation verticale et horizontale de l’habitat, ainsi que des réponses individuelles aux conditions océanographiques. Les balises fournissent en parallèle des paramètres environnementaux (température, salinité, fluorescence, lumière…) permettant de relier directement comportement et structure physique de l’océan Austral. Les données environnementales sont labellisées Suivi National d’Observation par l’INSU (SNO-MEMO, https://sextant.ifremer.fr/record/8c8c52b3-4b00-4d11-9dad-37edf6395d82/). À ces informations en mer s’ajoute un suivi démographique continu réalisé depuis les îles Kerguelen, comprenant l’identification individuelle, la mesure de la masse et de la taille, l’estimation de la survie d’environ 150 petits par an au moment du sevrage. Cette approche longitudinale permet de relier les performances individuelles en mer à la condition corporelle, à la croissance des jeunes et à la dynamique de population sur plusieurs décennies. Le jeu de données intègre également des mesures annuelles de signatures isotopiques stables (δ¹³C et δ¹⁵N) réalisées chez les adultes et les jeunes. Ces marqueurs isotopiques renseignent sur la position trophique et les zones d’alimentation exploitées, et permettent de détecter des variations interannuelles des régimes alimentaires en lien avec la variabilité environnementale. L’articulation entre données comportementales à haute résolution, suivi démographique à long terme et indicateurs isotopiques permet d'analyser les liens entre environnement, stratégies individuelles, succès reproducteur et trajectoires de population.
Organic and Inorganic carbon calcareous soil data - EJP-Soil, SIC-SOC-DYN project

[Lien vers la fiche source] This dataset contains data and metadata of the calcareous soil collection used in the EJP-Soil SIC-SOC-DYN project. This dataset is linked to 2 articles submitted for publication into Biogeosciences journal and into Journal of Arid Environment Data focused on the characterisation of the organic and inorganic carbon of calcareous soils obtained by elemental analysis, by Rock-Eval® thermal analysis and by isotope ratio mass spectrometer. The Publication submitted into Biogeosciences is entitled "Technical note: Further adjustments to the Rock-Eval® thermal analysis for soil organic and inorganic carbon quantification to avoid post-hoc corrections" and focused on Rock-Eval data. The Publication submitted into Journal of Arid Environment is entitled "Analytical distinction between soil organic and inorganic carbon contents and 13C natural abundances: Evaluation of a heating pretreatment" and focused on isotopic data.
Montant global de la retraite attribuée par type de droit et par genre

Montant global mensuel moyen servi par le régime général aux retraités ayant eu une attribution de pension au cours de l'année. Ce montant est fourni pour les nouveaux retraités bénéficiaires d'un droit direct servi seul (servi sans droit dérivé au régime général), pour les nouveaux retraités bénéficiaires d'un droit dérivé servi seul (sans droit direct au régime général), pour les retraités déjà bénéficiaires d'un droit auxquels un second droit a été attribué dans l'année (le montant global fourni correspond alors à la somme des deux droits). Il s’agit du montant de base après application des règles de minimum (minimum contributif ou minimum des pensions de réversion) et maximum (écrêtement au plafond de la Sécurité sociale) + compléments de pensions éventuels. Montant brut avant prélèvements sociaux et hors régimes complémentaires. A partir de 2006 sont dénombrés les seconds droits (deuxième attribution quand un assuré est déjà bénéficiaire d'une retraite au régime général). * Obtenu par application du convertisseur franc-euro de l’Insee, il exprime le pouvoir d'achat d'un montant en euros ou en francs d'une année en un montant équivalent en euros de l'année 2019. ** Rupture de série en 2006 suite au dénombrement des seconds droits (deuxième attribution quand un assuré est déjà bénéficiaire d'une retraite au régime général).
Les bénéficiaires de l'aide sociale départementale aux personnes âgées ou handicapées (APA, PCH, ASH, Aides ménagères, …)

Des séries historiques nationales et départementales sur les effectifs des bénéficiaires de l'aide sociale départementale aux personnes âgées ou personnes handicapées depuis 1996 sont mises à disposition ici. Ces données sont issues de l’[enquête Aide sociale], enquête annuelle réalisée auprès des collectivités en charge de l’aide sociale départementale, qui recueille des données agrégées sur les bénéficiaires et les dépenses des prestations d'aide sociale. L’ensemble de ces données, telles que déclarées par les conseils départementaux lors des différentes collectes, sont mises à disposition dans le jeu de données « [Bases de données brutes de l’enquête Aide sociale – Volet Aides sociales aux personnes âgées ou handicapées ]». Des données complémentaires sur l’aide sociale départementale sont disponibles dans d’autres jeux de données sur les thématiques suivantes : - [les caractéristiques des bénéficiaires de l'aide sociale départementale aux personnes âgées ou handicapées] (2014-2024) - [les dépenses couvertes par l’APA à domicile et les montants versés et personnes payées par éléments de la PCH] (2010-2024) - [les dépenses d’aide sociale départementale] (1999-2024)
CaDDiAcS - Base dijonnaise de données calculées pour les spectres atomiques

[Lien vers la fiche source] The CaDDiAcS base contains spectroscopic data for some complex atoms and ions, in particular lanthanides. For many transitions, it gives the wavelengths, the spontaneous-emission Einstein coefficients, and the absorption oscillator strengths, calculated in ICB (Dijon) and Aimé Cotton (Orsay) Laboratories. The database also presents some characteristics of energy levels, like the Landé factors or leading electronic configurations and terms.
Liste des API Ecovélo pour les stations du Vélo Baulois - Vélos électriques en libre service sur La Baule-Escoublac GBFS

Liste des API fournies par Ecovélo pour Vélo Baulois en libre-service sur la Baule-Escoublac. Localisation et disponibilité des vélos électriques en libre service La Baule-Escoublac. Les données sont disponibles au format [GBFS] et permettent de connaitre : * Les types de véhicules * La version du gbfs * Le statut de chaque véhicule * la geofencing zone (date de dernière mise à jour du système) * Les informations statiques et dynamiques de chaque station Ces données au format "GBFS" (General Bikeshare Feed Specification) nous sont transmises par Ecovélo, fournisseur du service.
Stikstofdioxide concentratiemetingen 2019 en 2020 Den Haag

Beschrijving: Jaarraportage concentraties stikstofdioxide (NO2) in Den Haag in 2019 en 2020. Metingen met de diffusiebuis methode. Bron: Buro Blauw Viewer: [https://arcg.is/10iK1H]
Zones de préemption des espaces naturels sensibles (ENS) en Maine-et-Loire

Localisation des zones de préemption au titre des espaces naturels sensibles dans le département de Maine-et-Loire. Une Zone de Préemption au titre des Espaces naturels sensibles est un outil foncier de préservation, de restauration ou bien encore de valorisation des espaces naturels remarquables de notre territoire, régi par le Code de l’Urbanisme. [En savoir plus sur les zones de préemption en Maine-et-Loire sur le site maine-et-loire.fr].
Local Stories of Change

[Lien vers la fiche source] Why Forest Policies Should Acknowledge Local Perspectives to Incentivize Climate Adaptation Forest adaptation policies are often lost in translation concerning their implementation on the local level, varying across national contexts. The global, objectified concept of climate change, transported through those policies, tends to mismatch with individual experiences of change on the local level. While forest experts across Europe are aware of climate-related challenges, the complexity of human-forest relations is rarely addressed. In this context, understanding how change is experienced is crucial to incentivize climate adaptation.
Spatial clogging measurements in the Old Rhône of Miribel-Jonage

[Lien vers la fiche source] This dataset gather all the field measurements performed by Hernandez et al. (2025) for their spatial riverbed clogging assessment of the Old-Rhône of Miribel-Jonage. The data deposit is composed of : * K_brut_i.csv : raw clogging measurments data along the Old-Rhône reach, the Miribel canal and the South canal in the csv format. * README.txt : Description of the dataset
Energy consumption in Geographical area 0612 (part of  Backen)

Anonymiserad förbrukningsdata från Umeå Energi per nyckelkodsområde i Umeå Kommun. Detta data bör inte ses som exakta och kompletta förbrukningsvärden utan mer som en kvalificerad uppskattning av förbrukningen i syfte att se trender och indikationer. Datafilerna kommer endast innehålla värden för fastigheter i Umeå kommun där Umeå Energi är nätägare och informationen inte anses vara olämplig för distribution. Uppdateras normalt en gång varje månad med nytillkomna värden. Frågor kring detta förbrukningsdata hänvisas till matdata.datalager@umeaenergi.se
Lagoon temperature and hydrodynamics of Reao atoll (Tuamotu Archipelago)

[Lien vers la fiche source] As part of the GAIA (ManaGement strAtegy evaluatIon for small-scale fisheries in Atoll lagoons) project, which evaluates the sustainability of socio-ecosystems in semi-enclosed atolls based on the exploitation of clam resources within the context of climate change, several environmental sensors were deployed in Reao Atoll, a semi-enclosed atoll lagoon without reef pass but connected to ocean through numerous shallow spillways (known locally as "hoa") along its southern rim. The lagoon of Reao is composed of three basins with varying depths (the NW basin being the shallowest and the SE basin the deepest). Autonomous oceanographic equipment was deployed at bottom-moored stations, enabling high-frequency sampling and detailed measurements of the lagoon's physical and thermal characteristics. The lagoon was first instrumented with a temperature and pressure logger from mid-December 2016 to late June 2017 at a single location within the intermediate basin. Subsequently, from August 2021 to early April 2024, temperature, pressure, and current loggers were deployed on multiple locations distributed across the three basins, including areas within the lagoon, the "hoa", and the internal reef slope. Temperature sensors were deployed to characterize temporal and spatial variations in lagoon temperature, whereas water level fluctuations, wave climate and ocean-lagoon exchanges through the "hoa", were investigated to provide a more comprehensive understanding of processes driving temperature dynamics. Additionally, CTDs (conductivity, temperature, depth) profiles were conducted to observe temperature stratification across the three basins. Every data collection underwent quality verification, post-processing, and conversion to NetCDF format.
Meiofaunal Communities from Three Contrasting Habitats at the Lucky Strike Vent Field, Northern Mid-Atlantic Ridge

[Lien vers la fiche source] Meiofaunal community composition, with emphasis on nematode genera and their functional traits, collected within an induced-disturbance experiment at the Lucky Strike vent field (Northern Mid-Atlantic Ridge). This study builds on the disturbance experiment initiated in 2017 at the Montségur active edifice (Marticorena et al., 2021) during the Momarsat 2017, 2018, and 2019 cruises conducted within the framework of the MERCES H2020 European project. Twelve stainless-steel quadrats (50 × 50 cm) were deployed at the Montségur edifice in 2017 using the ROV Victor6000. Four quadrats (R0a, R0b, R1, R2) served as reference samples to characterize baseline meiofaunal assemblages and assess natural temporal variability. Eight experimental quadrats were subjected to induced faunal clearance to monitor recolonization dynamics. At the active site, four quadrats were defaunated in 2017 and sampled after one year (C1a, C1b; 2018) and two years (C2a, C2b; 2019) to evaluate recovery trajectories. In 2018, the experimental design was extended to two additional habitats: a sedimented peripheral area (P1, P2) located approximately 30 m from Montségur and a visually inactive sulfide structure (I1, I2) located approximately 400 m north of Montségur. At these habitats, quadrats were defaunated in 2018 and sampled after one year to assess recolonization patterns. Faunal removal and sampling were conducted using the mechanical arm and suction sampler of the ROV Victor6000 (2017–2018) and the Nautile submersible (2019). In contrast to previous studies focusing on macrofauna retained on a 300 µm sieve, this dataset targets the meiofaunal fraction retained on a 32 µm mesh (32 µm–1 mm). Meiofauna were extracted by Ludox centrifugation, sorted into major taxonomic groups, and fixed in 4% formalin. For nematodes, 150 individuals per sample were randomly subsampled, cleared, mounted on permanent slides, and identified to genus level using standard pictorial keys. The dataset includes meiofaunal abundances per quadrat, nematode genus-level composition, and genus-based functional trait assignments (feeding type, body shape, tail morphology, and maturity index based on the c–p scale), together with associated environmental variables. This dataset enables analyses of meiofaunal community structure, functional composition, and post-disturbance recolonization dynamics across active, peripheral, and inactive hydrothermal habitats.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2021-II

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal II des Jahres 2021. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2021-III

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal III des Jahres 2021. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2021-IV

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal IV des Jahres 2021. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2022-I

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal I des Jahres 2022. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2022-II

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal II des Jahres 2022. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.
Wetterdaten - Projekt iResilience 2021-I

Sensorwetterdaten des nordwärts-Projektes iResilience des Quartal I des Jahres 2021. Die Sensorwetterdaten des gesamten Projektes stehen in einer Datei als Alternativer Export unter Exporte zur Verfügung. Projektzeitraum vom 01.10.20 - 30.09.22. Was ist iResilience? iResilience ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung in der Initiative Zukunftsstadt unter dem Titel Soziale Innovationen und intelligente Stadtinfrastrukturen für die resiliente Stadt der Zukunft über den Zeitraum von drei Jahren gefördert wird. Ein interdisziplinäres Team aus Forschung und Praxis begleitet den Prozess. TEAM Der Forschungsverbund stellt sich vor Das iResilience-Team setzt sich aus einem interdisziplinären Team aus Wissenschaft und Praxis zusammen. Die Koordination des Gesamtvorhabens liegt bei der Sozialforschungsstelle der Technischen Universität Dortmund (sfs). Co-Koordinator für die Aktivitäten in Köln ist das Deutsche Institut für Urbanistik (Difu) in Köln. Das iResilience-Projektteam unterstützt die Pilotquartiere mit Fachwissen und Methoden, moderiert und dokumentiert Veranstaltungen und andere Formate und fördert die Kommunikation zwischen den aktiven Akteuren. Gefördert vom Bundesministerium für Bildung und Forschung.