AndreaBozzo/ceres-open-data-index huggingface dataset:
Descriptors of the cellulose particles detected in the 3D microtomography images of composites PP/cellulose

[Lien vers la fiche source] Values of several descriptors of all the real particles detected in the 12 core samples extracted from 3D microtomography images of composites PP/cellulose of particles volume fraction of 2.96%v/v (5%wt). - 21570 particles - The detection of particles is performed by binarization of the grayscale images. The value of the threshold value is 105
Composition-based statistical model for predicting CO2 solubility in Modified Atmosphere Packaging application

[Lien vers la fiche source] Carbon dioxide (CO2) is an important gas used in modified atmosphere packaging of non-respiring foods where it solubilizes into the aqueous and lipid phases of food and exerts an antimicrobial effect. Prediction of CO2 solubility within food is thus of paramount importance to anticipate its benefit on food preservation. In the present study, machine learning algorithms were applied on a set of 362 values of CO2 solubilities collected from the scientific literature to tentatively predict the solubility as a function of food composition (water, protein, fat and salt content) and temperature. The best option kept was a random forest algorithm that was used to predict CO2 solubility in four food case studies (ham, salmon, cheese and pâté) that were further used as input parameters in the MAP’ OPT tool, predicting the evolution of headspace gas composition. Predicted CO2 solubilities used as input parameters succeeded in representing the CO2 headspace dynamic as a function of time in the four case studies.
BD Sol - gestion dynamique des potentialités agricoles (GDPA)- Hérault

Les potentiels agricoles représentent les capacités d’un sol à accueillir des productions végétales en fonction des conditions pédoclimatiques. Ces potentiels peuvent être également gérés en prenant en compte d’autres paramètres (par exemple les réseaux d’irrigation, les données socio-économiques, foncières...). Une visualisation des données est également disponible au lien suivant : [Cartographie régionale] L’outil GDPA s’appuie sur l’étude de trois potentiels culturaux des sols : grandes cultures, viticulture quantitative (base IGP) et maraîchage. Synthèse des trois, le potentiel cultural global permet d’appréhender la capacité de diversification culturale d’un sol. Ainsi, les sols les plus propices à la diversification (potentiel global fort) permettent le développement d’un grand nombre de cultures. L’outil d’aide à la décision GDPA a été établi en partenariat avec l’Association Climatologique de l’Hérault (aujourd’hui intégrée au Département), le Département de l’Hérault, la Chambre d’Agriculture de l’Hérault et l’INRAE en 2012/2013. Il résulte de l’analyse et du traitement des données agropédologiques de la base de données sol, établie et numérisée en 2011. L’outil est à ce jour maintenu par le Département de l’Hérault. Il a notamment fait l’objet d’une mise à jour suite à un travail de complément de la base de données sol réalisé par la Métropole de Montpellier en 2018 / 2019. Limites d’exhaustivité : La cartographie ne couvre pas l’ensemble des communes héraultaises, ni la superficie totale de chaque commune. En conséquence, un sol non inventorié signifie une absence de donnée, aucune conclusion quant à la potentialité de ce sol ne peut en être déduite. Limites de précision cartographique : La cartographie des potentiels culturaux est à l’échelle 1/10 000ème (dite échelle « communale »). Ainsi, la superposition avec des plans cadastraux réalisés à des échelles plus grandes est déconseillée par les experts. Différents indices de confiance permettent de traduire l’incertitude des limites cartographiques. Les données mises à disposition doivent donc être utilisées avec circonspection en fonction des limites de précision. Le département de l’Hérault et ses partenaires techniques et scientifiques ne sauraient être tenus pour responsables des inexactitudes dans les bases de données et des utilisations inappropriées des dites bases. Pour plus d’informations, se référer à la documentation
BD Sol - Propriétés - Hérault

Cartographie des unités agropédologiques du département de l’Hérault et de leurs propriétés : roche, position, profondeur, texture, pierrosité, réserve utile, pH. Cette donnée est une composante de la base de données sol du Département de l’Hérault, qui comprend également la donnée cartographique de [géologie] et des [terroirs.] Même si ces données fournissent de nombreuses informations sur les sols, elles ne constituent pas des données pédologiques à proprement parler : aucun nom scientifique de sol n’est indiqué, seules les roches mères sont précisées. L’objectif est ici la constitution d’une base de données agropédologiques avec une finalité pratique forte. Les données sont issues des programmes de zonages des potentialités viticoles du Languedoc-Roussillon, dans le cadre des plans Etat-Région pour une meilleure adaptation cépage terroirs entre 1980 et 1996 et du Programme départemental de connaissance et de valorisation des terroirs entre 2000 et 2006. Les données ont été numérisées dans le cadre du Programme de Numérisation des Sols de l'Association Climatologique de l’Hérault (aujourd’hui intégrée au Département) mené en partenariat avec la Chambre d'Agriculture de l'Hérault et le Conseil Départemental de l'Hérault de 2009 à 2011. La méthodologie de cartographie agropédologique du département de l'Hérault a été élaborée sur des bases scientifiques en collaboration avec les Professeurs P. Bonfils et G. Labau du Laboratoire de Géologie et Science du Sol de l'INRA Montpellier, à partir des années 80. La base est à ce jour corrigée et maintenue par le Département de l’Hérault. Elle a également été complétée sur son territoire par la Métropole de Montpellier en 2018 / 2019. Limites d’exhaustivité : La cartographie ne couvre pas l’ensemble des communes héraultaises, ni la superficie totale de chaque commune. En conséquence, un sol non inventorié signifie une absence de donnée. Limites de précision cartographique : La cartographie des propriétés des sols est à l’échelle 1/10 000ème (dite échelle « communale »). Elles ne doivent pas être utilisées à une échelle supérieure. Ainsi, la superposition avec des plans cadastraux réalisés à des échelles plus grandes est déconseillée par les experts. Différents indices de confiance permettent de traduire l’incertitude des limites cartographiques. Certains attributs comme la profondeur ou la texture sont des estimations réalisées à partir des relevés de terrain. Dans le cadre d'études environnementales, ces données sols à elles seules ne suffisent pas à comprendre un territoire. Elles nécessitent d'être croisées avec d'autres types de données comme la climatologie. Les données mises à disposition doivent donc être utilisées avec circonspection en fonction des limites de précision. Le département de l’Hérault et ses partenaires techniques et scientifiques ne sauraient être tenus pour responsables des inexactitudes dans les bases de données et des utilisations inappropriées des dites bases. Une visualisation des données est également disponible au lien suivant : [Cartographie régionale] Pour plus d’informations, se référer à la documentation
Dataset on the selection between healthy or Fusarium wilt diseased banana plant material by Cosmopolites sordidus, experiments in Costa Rica

[Lien vers la fiche source] This dataset is corresponding to an experiement that aimed at understanding whether Cosmopolites sordidus is preferentially attracted by Fusarium oxysporum f‧sp. cubense race 1 contaminated banana plants material than Foc-free ones. The relative attraction of healthy and Foc contaminated Gros Michel banana bulbs and pseudostems, as well as pure culture of Foc was measured using four-armed olfactometers. Males and females were studied separately. After storage in a dark room, weevils where were introduced in the central chamber of olfactometers. At 15 minutes, the orientation of each of the weevils was determined according to the food source placed in each of the chambers of the olfactometer. Overall, 560 olfactometer experiments were carried out.
Transcriptomic analysis of Faecalibacterium prausnitzii A2-165 grown in acetate poor vs rich conditions

[Lien vers la fiche source] The bacterial strain Faecalibacterium prausnitzii (DSM No. 17677, DSMZ collection, Braunschweig, Germany) was cultured under anaerobic conditions (anaerobic chamber: N2 = 90%, CO2 = 5% and H2 = 5%) at 37°C, in brain heart infusion broth (BHI, 37g/L, Difco) supplemented with yeast-extract (5g/L, Difco) cellobiose (1mg/mL, Sigma), maltose (1 mg/mL, Sigma) and cysteine (0.5 mg/mL, Sigma), namely the BHIS medium. The strain was defrosted and cultivated at a 10% inoculation in 10 mL BHIS for 24 hours at 37°C, followed by a 1% inoculation in 10mL BHIS for overnight growth (16-18 hours). The experimental cultures were then made at 2% inoculation in 50 mL BHIS medium with or without supplemented sodium-acetate solution (20 mM, Sigma, (10, 11)), namely the BHISA medium, at the time of inoculation.
Attractivité dans la voie professionnelle à La Réunion

Vœux vers les formations de la voie professionnelle à La Réunion, selon le rang, des apprenants, selon le genre, rapporté à la capacité théorique en formation de la carte scolaire. Les données sont disponibles depuis la rentrée 2019, à l'échelle académique. Source : Affelnet Champ : secteur public, élèves sous statut scolaire
La démission pour projet professionnel - septembre 2022

Note (décembre 2024) : les données sur les bénéficiaires indemnisés au titre de l’ARE pour projet professionnel présentées dans cette publication se sont avérées sous-estimées. Elles ont été corrigées dans [la publication diffusée en décembre 2024]. Ce fichier Excel contient les tableaux et les graphiques accompagnant la publication ["La démission pour projet professionnel",] diffusée par l'Unédic en septembre 2022. Ces données informent sur le nombre d'ouvertures de droit, le nombre d'indemnisés et les dépenses d'allocation de demandeurs d'emploi ayant démissionné pour un projet professionnel. Quelques données régionales sont également présentées.
Meta-analysis - EC50 and LC50 for Collembola and others soil fauna taxa

[Lien vers la fiche source] We performed a meta-analysis of the sensitivity of several soil fauna species to pesticides in order to study the sensitivity of Collembola to pesticides compared to the sensitivity of other soil invertebrates groups. Data from 22 selected publications were entered into a database including several variables: author(s), year of the study, taxonomic group, species, active substance name, type of pesticide, pesticide addition method, soil type and LC50 value or EC50 value with their standard error and replicates number.
Data from "Little impact of NaCl reduction in Swiss-type cheese" submitted to Frontiers in Nutrition, section Food Chemistry

[Lien vers la fiche source] Raw mass spectrometry data supporting the manuscript "Little impact of NaCl reduction in Swiss-type cheese" submitted to Frontiers in Nutrition, section Food Chemistry. Authors: Valérie Gagnaire, Xavier Lecomte, Romain Richoux, Magali Genay, Julien Jardin, Valérie Briard-Bion, Jean-René Kerjean, Anne Thierry Data were transformed in open format .mzML.
Metabarcoding data analysis of fungal communities associated with 203 full-sib oak trees (Quercus robur) located in Bourran (France).

[Lien vers la fiche source] In this study, we consider the diversity and composition of the fungal communities collected on 203 full-sib Quercus robur individuals. Adult trees are located in the Bourran INRAe experimental site (44.34225 N ; 0.38672 W) in Lot-et-Garonne, France. Following fungal ITS1 amplification with ITS1F-ITS2 primers, 11 runs of single-end 454 sequencing were performed (Roche GS junior).The metabarcoding data we obtained have been analyzed using Bioinformatics scripts. Raw and filtered ASV Tables are available here. This work complements Boris Jakuschkin’s PhD available here https://www.theses.fr/2015BORD0170 (see Chapter 3).
Approximate Bayesian Computation with Random Forest and Sensitivity Analysis for the calibration of a complex aquatic ecological model

[Lien vers la fiche source] This dataset gather scripts and data files that are related to the calibration of the model Delft3D-BLOOM on the case study of Lake Champs-sur-Marne with the ABC-RF (Approximate Bayesian Computation – Random Forest) method coupled with sensitivity analysis. There are several types of files: (1) observed and simulated data, that is the data coming from the set of 30000 simulations that have been performed to make the calibration; (2) R and matlab scripts for the application of the calibration strategy and the analysis/plot of the results; (3) files with results of the calibration runs performed for the calibration of the model BLOOM on the case study of Lake Champs-sur-Marne.
Metabarcoding data analysis of fungal communities associated with pedunculate oak (Quercus robur) and maritime pine (Pinus pinaster) in the ORPHEE experimental site.

[Lien vers la fiche source] In this study, we analyzed the diversity and composition of fungal communities collected from leaves of pedunculate oak (Quercus robur) and needles of maritime pine (Pinus pinaster) in 48 experimental forest plots. These plots were part of the ORPHEE experimental site (44.73742 N, 0,77504 E Cestas, France) and were planted in monocultures or in mixtures of 2 to 5 tree species. Following fungal ITS1 amplification with ITS1F-ITS2 primers, 3/16th runs of single-end 454 sequencing were performed (Roche GS junior). The metabarcoding data we obtained were analyzed using QIIME. Raw and filtered ASV Tables are available here. Sample ID corresponds to species_block_plot (https://treedivnet.ugent.be/ExpORPHEE.html)
Projet Artisols - Indice de compacité des taches urbaines - 2019

[Lien vers la fiche source] Le projet ArtiSols, soutenu par la Région Occitanie et le Fonds Européen de Développement Régional (FEDER), s’inscrit dans une démarche d’évaluation et de qualification du processus d’artificialisation des sols en région Occitanie. Piloté par INRAE (UMR TETIS), ce projet rassemble des établissements de recherche (INRAE, CNRS, INPT), des services de l’État (DRAAF Occitanie) et de la Région Occitanie (Direction de l’Aménagement, du Foncier et de l’Urbanisme), et les aménageurs BRL et CACG. Les taches urbaines distribuées sont caractérisées par des formes très variées. Ces formes peuvent aller d’un aspect très compacte (proche d’un disque, forme de compacité maximale sur un plan) à celui de formes très digitées ou de filaments, s’approchant de lignes plus ou moins sinueuses. Le suivi de cette dimension de compacité morphologique permet d’estimer si l’artificialisation due aux taches urbaines suit des extensions homogènes ou des extensions hétérogènes. Cet indice est calculé à l'échelle des EPCI d'Occitanie et pour l'année 2019.
Metabarcoding data analysis of foliar fungal communities associated with 84 woody species.

[Lien vers la fiche source] These metabarcoding data describe foliar fungal communities collected on 84 woody species planted at the Arboretum des Barres (Nogent-sur-Vernisson, France, 47.83819 N , 2.75792 E). Following fungal ITS1 amplification with ITS1F-ITS2 primers, two runs of single-end 454 sequencing were performed (Roche GS Junior). In total, 90 samples were sequenced : 88 environmental samples (i.e. leaf samples), one technical replicate corresponding to the same leaf sample (collected on Fagus sylvatica) sequenced twice, and one negative control for DNA extraction. The 88 environmental samples correspond to 84 samples collected on trees in the Arboretum des Barres and 4 samples simultaneously collected on trees in the Pierroton Iresearch station (INRAe, Cestas, France, 44.73734 N ; 0.77492 W). Bioinformatics scripts as well as raw and filtered ASV Tables are provided. Protocols and preliminary analyses are described in Quention Baillavoine's Master thesis (https://corinnevacher.files.wordpress.com/2014/11/baillavoine-quentin-rapport-de-stage-m2-fet.pdf).
TCGA case study for ASTERICS

[Lien vers la fiche source] This dataset is issued from the public repository TCGA (https://portal.gdc.cancer.gov/) and contain several files, each corresponding to a given omic on the same individuals with breast cancer. Raw data have been obtained from the mixOmics case study described in http://mixomics.org/mixdiablo/case-study-tcga/ [link accessed on August 18, 2021] and were made available by the package authors at http://mixomics.org/wp-content/uploads/2016/08/TCGA.normalised.mixDIABLO.RData_.zip (R data format). Data in the zip file had been normalised for technical biases by the package authors. Data from the train and test sets were exported as TXT/CSV files and completed with miRNA expression on the smae individuals and toy datasets to handle missing value cases and alike. They serve as a basis for the illustration of the web data analysis tool ASTERICS (Project 20008788 funded by Région Occitanie).
RPG complété 2019 département 32

[Lien vers la fiche source] RPG complété 2019. Complète le RPG campagne 2019 pour le département 32. (contient les parcelles agricoles hors RPG) Données géographiques (vectorielles, shapefile), parcellaires. Sources : IGN, OSO/Cesbio. Traitements : INRAE US ODR, 2021.
Canopy height in French Guiana

[Lien vers la fiche source] A canopy height for French Guiana obtained using the data fusion of LiDAR, optical and other environmental datasets (spatial resolution = 250 m x 250 m). The precision of the map by comparison to a high precision airborne LiDAR canopy height estimates was evaluated at around 3 m (mean canopy height of 30 m). Data years: Lidar spaceborne data (GLAS-ICESat): 2003-2009 Airborne lidar data provided by BRGM: 1996 Airborne lidar data provided by Altoa: 2004-2009 Optical data: 2003-2013 SRTM DEM: 2000 Geological map: 2001
Forest biomass map in French Guiana

[Lien vers la fiche source] A forest biomass map for French Guiana obtained using the data fusion of LiDAR, radar, optical and other environmental datasets. The precision of the map by comparison to field estimates is around 50 Mg/ha (Mean absolute percentage error = 12%). Lidar spaceborne data (GLAS-ICESat): 2003-2009 Airborne lidar data provided by BRGM: 1996 Airborne lidar data provided by Altoa: 2004-2009 Optical data: 2003-2013 SRTM DEM: 2000 Geological map: 2001
Forest biomass for Madagascar

[Lien vers la fiche source] A biomass map for Madagascar obtained using the data fusion of LiDAR, optical and other climatic datasets (spatial resolution = 250 m x 250 m). The precision of the map by comparison to field estimates is around 74 Mg/ha. Data years : Lidar spaceborne data (GLAS-ICESat): 2003-2009 Optical data: 2000-2010 SRTM DEM: 2000 Field inventories: 1995-2013
Life Cycle Assessment of fructo- and galacto-oligosaccharides (FOS and GOS) produced by synthesis or hydrolysis

[Lien vers la fiche source] This dataset presents Life Cycle Assessment (LCA) of the production of FOS and GOS by enzymatic synthesis from glucose (to get FOS) or lactose (to get GOS) and hydrolytic production from extraction of yacon potato (to get FOS) or chickpea (to get GOS). A cradle-to-gate approach was considered in the two scenarios under assessment (the phases of use and/or final disposal of FOS/GOS were not considered). The functional unit was defined as 100 g of FOS/GOS produced. LCAs were performed using data collected at the laboratory scale, supplemented with data from Ecoinvent database. SimaPro was used for the LCA modeling with the midpoint impact EF2.0 characterization method. For each scenario (FOS produced by synthesis, FOS produced by hydrolysis, GOS produced by synthesis, GOS produced by hydrolysis), the Life Cycle Inventory (LCI) and the Life Cycle Impact Assessment (LCIA) are provided.
Genotyping dataset (medium-density SNPs) used to analyse the genetic diversity and population structure of four Senegalese sheep breeds

[Lien vers la fiche source] This dataset includes genotypes of 47 sheeps for 44,321 variants (SNPs). Animals belong to four sheep populations from Senegal. The compressed archive contains two files (in plink format): i) a genotyping data file named "sheep_44321variants_47individuals.ped" (47 rows, 88,448 columns) that contains, for each individual, six information columns (breed ID, animal ID and four columns with data coded 0 or U) and the genotypes (alleles 1 and 2) for the 44,321 SNPs (ACGT, Illumina TOP format) ; and ii) a map file named " sheep_44321variants_47individuals.map" (44,321 rows, 4 columns) that contains for each SNP, the autosome number, the SNP name, a column with data coded 0 and the SNP position on autosome (OAR3.1 assembly).
Dataset on the Life Cycle Assessment of 44 artisanally produced French Protected Designation of Origin (PDO) cheeses

[Lien vers la fiche source] We used Life Cycle Assessment (LCA) to evaluate the environmental impacts of 44 French cheeses that benefit from Protected Designation of Origin (PDO) certification. Our assessments took into account all steps from milk production to the end of the ripening period and the functional unit used was 1 kg of fully ripened cheese. For each cheese, data were collected on all aspects of the process using PDO specifications, technical datasheets, scientific literature, and three expert opinions. Inventories for milk production were obtained from AGRIBALYSE 3.0 and background inventories (electricity mix, gas production, materials, transport, water, cleaning products) were obtained from the Ecoinvent 3.6 database. Simapro software was used to perform all LCAs, using the characterization method "EF 3.0 Method (adapted) V1.00 / EF 3.0 normalisation and weighting set". Our final dataset contains details on products, life cycle inventories (LCI), and LCIA results.
Gridded bathymetric data along the ultraslow spreading Southwest Indian Ridge between the Gallieni TF and the Rodrigues triple Junction

[Lien vers la fiche source] Six large grids were obtained by merging multibeam bathymetric data from several international cruises along the Southwest Indian Ridge from the Gallieni Transform Fault (54°E) to the Rodrigues Triple Junction (70°E). The spatial resolution is about 150 m. This dataset was used in several scientific papers.
RTM_ETRS89

La red topográfica municipal consta de120 vértices aproximadamente, materializados en el terreno. En 2022 se ha revisado en su totalidad y se ha densificado para abarcar los nuevos desarrollos urbanísticos. A partir de este momento se actualiza anualmente.Los vértices se han observado por GNSS mediante el método estático. Comprende el término municipal. Se apoya en la infraestructura geodésica nacional mediante la red de estaciones de referencia GNSS (ERGNSS).
CDC-Cunsultazione citatina in quantu à a 5G in Corsica / Consultation citoyenne relative au déploiement de la 5G en Corse

La Collectivité de Corse a mené de janvier à mars 2022 une consultation citoyenne en ligne relative au déploiement de la 5G en Corse. Cette démarche vise à recueillir les avis de toute la société insulaire, ainsi des Corses résidant à l'extérieur et plus largement de toutes les personnes se sentant, de près ou de loin, concernées par ce sujet dans l’île. La consultation a recueilli plus de 1000 participations, et la technologie utilisée a permis d’identifier des « groupes sémantiques » à partir des contributions aux questions ouvertes. Les données recueillies via le formulaire dédié au recueil des contributions vous sont mises à disposition à travers cette page.
RPG complété 2020 Région Provence-Alpes-Côte d'Azur

[Lien vers la fiche source] RPG complété 2020. Complète le RPG campagne 2020 pour les départements de la région Provence-Alpes-Côte d'Azur (04, 05, 06, 13, 83, 84). (contient les parcelles agricoles hors RPG) Données géographiques (vectorielles, shapefile), parcellaires. Sources : IGN, OSO/Cesbio. Traitements : INRAE US ODR, 2022.