雲層大約有50公里深，由至少兩層氨雲組成，頂部薄啲同清啲，下層就厚啲。喺木星大氣入面檢測到嘅閃電表明，氨雲下面可能有一層薄水雲。呢啲放電嘅威力可能係地球閃電嘅一千倍。水雲假定會由內部上升嘅熱量驅動，同地球雷暴一樣噉產生雷暴。