沙巴海岸亦有好多有豐富珊瑚礁嘅島嶼，例如利吉丹島、西巴丹島、selingaan島、迪加島同埋拉央拉央島。其他主要島嶼包括詹文安島、丁文馬達島、汶汶島同埋北部屬馬來西亞沙巴州管轄，南部屬印尼東加里曼丹省管轄嘅石巴迪島。