《eva》的漫畫版由動畫版人物設計貞本義行所繪畫，並由角川書店發行。故事的大綱與動畫版大致相同，但使用了真嗣的視角去進行。真嗣本人的性格設定亦有細微的改變，變得更有主見。其餘的改變包括使徒的刪減，小幅度的情節的增刪及更改等。