同其他馬來西亞半島城市一樣，莎阿南屬於熱帶雨林氣候。全年氣温相對平均，平均高温係31.9°c，平均低温係23.2°c。莎阿南最熱嘅月份係3月，而大雨主要集中喺11月，當東北季候風喺10月至第二年3月有影響當地。