喺某啲城市，區域鐵路同一般城市軌道交通系統之間嘅分別變得模糊。區域鐵路列車到咗市中心會喺高架或地下嘅路軌上行駛，到咗市郊路段就去返地面。例子有西班牙馬德里嘅cercanias，法國巴黎嘅rer，澳洲悉尼及墨爾本嘅近郊鐵路。