跟質量來計嘅話木星嘅大氣大約由76%氫同24%氦組成，但氦原子質量大過氫分子，所以跟體積計嘅話，木星嘅高層大氣大約由90%氫同10%氦組成。大氣入面仲有微量甲烷、水蒸氣、氨同矽基化合物，以及少量碳、乙烷、硫化氫、氖、氧、磷化氫同硫。