西表山貓以前被認為係豹貓嘅亞種，直到1967年，科學家經過頭骨同皮膚鑑別後，先將西表山貓分成另一類。近年，dna分析再次證實佢同豹貓親緣關係好近。豹貓有時會被人捉嚟當做野味，皮毛買賣或者同其他家貓雜交後再作非法貿易。