2005年至2006年，行政長官辦公室常任秘書長編外職位薪級係d8，之後改為常額職位並將薪級降至d6。2003年至2007年，政制事務局同保安局常任秘書長職級由d8降至d6，之後改返d8。目前每個決策局入面設有一至兩個常任秘書長，負責管理屬下嘅副秘書長、首席助理秘書長、助理秘書長。