香港站設有9個出口，其中a同e出口位於國際金融中心商場第一層，連接中區行人天橋系統，方便乘客穿梭中區主要建築物同購物中心，以及去中環碼頭或其他交通工具車站，而b同c出口喺市區預辦登機大堂旁邊，f出口就位於國際金融中心商場地面，方便乘客前往香港站上落客區及鄰近街道。