工程開始幾年內令一帶水質污染達707次超標。《人民日報》一篇叫「大橋通三地協作添動力」報道，斷言大橋環保措施「史無前例」，係環境「零污染」、白海豚「零傷亡」。文章得到中聯辦轉載到中華人民共和國政府網站入面。