Ing ngisor iki kapacak  sing kabawah Kementerian Pendidikan Nasional Indonesia. Pratélan iki ora kalebu pawiyatan luhur Islam swasta sing kabawah Kementerian Agama Indonesia.

Universitas
 Universitas Islam Indonésia, Yogyakarta
 Universitas Sarjanawiyata Tamansiswa, Yogyakarta
 Universitas Janabadra, Yogyakarta
 Universitas Proklamasi 45, Yogyakarta
 Universitas Atma Jaya Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Cokroaminoto Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Muhammadiyah Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Widya Mataram, Yogyakarta
 Universitas Wangsa Manggala, Yogyakarta
 Universitas Kristen Immanuel, Yogyakarta
 Universitas Kristen Duta Wacana, Yogyakarta
 Universitas Sanata Dharma, Yogyakarta
 Universitas Ahmad Dahlan, Yogyakarta
 Universitas Pembangunan Nasional "Veteran" Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas PGRI Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Gunungkidul, Wonosari
 Universitas Teknologi "Yogyakarta", Yogyakarta
 Universitas Respati Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Dirgantara Indonésia, Yogyakarta
 Universitas Mercu Buana Yogyakarta, Yogyakarta

Institut 
 IKIP PGRI Wates, Yogyakarta
 Institut Pertanian Intan, Yogyakarta
 Institut Sains & Teknologi AKPRIND, Yogyakarta
 Institut Pertanian Stiper, Sléman

Sekolah Tinggi 
 Sekolah Tinggi Basa Asing LIA, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Profesi YKM, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Administrasi AAN, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Keséhatan Madani, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Keséhatan Aisyiyah, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Keséhatan Respati, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Keséhatan Surya Global, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Keséhatan Wira Husada, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Pariwisata AMPTA Yogyakarta, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Pembangunan Masarakat Désa APMD, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Psikologi Yogyakarta, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Teknik Lingkungan Yayasan Lingkungan Hidup, Bantul
 Sekolah Tinggi Teknologi Adisutjipto, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Teknologi Informasi Respati, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Teknologi Kedirgantaraan STTKD, Bantul
 Sekolah Tinggi Teknologi Nasional, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Bank, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ékonomi Islam Hamfara, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Isti Ekatana Upaweda, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Mitra Indonésia, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Nusa Megar Kencana, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Pariwisata API, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi SBI, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi Widya Wiwaha, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi YKP, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Ékonomi YKPN, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Manajemen YKPN, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Ilmu Sosial dan Pulitik Kartika Bangsa, Yogyakarta
 STIKIP Catur Sakti, Bantul
 Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer Akakom, Yogyakarta
 STMIK AMIKOM, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer Pelita Nusantara, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer Proactive, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer EL RAHMA, Yogyakarta
 Sekolah Tinggi Multimedia MMTC, Yogyakarta

Politeknik 
 Politeknik API, Yogyakarta
 Politeknik Keséhatan Bhakti Setya Indonésia, Yogyakarta
 Politeknik LPP, Yogyakarta
 Politeknik Muhammadiyah Yogyakarta, Yogyakarta
 Politeknik PPKP, Yogyakarta
 Politeknik Kagunan Yogyakarta, Yogyakarta
 Politeknik YDHI, Yogyakarta

Akademi 
 Akademi Akuntansi Sapta Widya Tama, Yogyakarta
 Akademi Akuntansi YKPN, Yogyakarta
 Akademi Analis Farmasi Al Islam, Yogyakarta
 Akademi Analisis Keséhatan Manggala Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Basa Asing Primagama, Yogyakarta
 Akademi Basa Asing Yappindo, Yogyakarta
 Akademi Basa Asing YIPK, Yogyakarta
 Akademi Désain Visi Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Fisioterapi YAB Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Kebidanan Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Kebidanan Ummi Khasanah, Yogyakarta
 Akademi Keperawatan Al Islam Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Keperawatan Bethesda YAKKUM, Yogyakarta
 Akademi Keperawatan Karya Bakti Husada Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Keperawatan Wiyata Husada Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Keperawatan YKY Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Kesejahteraan Sosial AKK, Yogyakarta
 Akademi Kesejahteraan Sosial Tarakanita, Sléman
 Akademi Ketatalaksanaan Pelayaran Niaga Bahtera, Yogyakarta
 Akademi Keuangan Dan Perbankan YIPK, Yogyakarta
 Akademi Komunikasi Indonésia YPK, Yogyakarta
 Akademi Komunikasi Radya Binatama, Yogyakarta
 Akademi Komunikasi Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Administrasi Dharmala, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Administrasi Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Administrasi YPK Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Perusahaan YKPN, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Putra Jaya, Yogyakarta
 Akademi Maritim Ganesha Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Maritim Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Ambarukmo Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata BSI Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Buana Wisata, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Dharma Nusantara Sakti, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Indraprasta, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Stipary, Yogyakarta
 Akademi Pariwisata Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Perikanan Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Pertanian Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Peternakan Brahma Putra, Yogyakarta
 Akademi Sekretari dan Manajemen Désanta, Yogyakarta
 Akademi Sekretari dan Manajemen Indonésia, Yogyakarta
 Akademi Sekretari dan Manajemen Santa Maria, Yogyakarta
 Akademi Manajemen Informatika dan Komputer Kartika Yani, Yogyakarta
 Akademi Kagunan Rupa dan Désain ADA Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Kagunan Rupa dan Désain Akseri, Yogyakarta
 Akademi Kagunan Rupa dan Désain MSD, Yogyakarta
 Akademi Teknik PIRI, Yogyakarta
 Akademi Teknik Arsitektur YKPN, Yogyakarta
 Akademi Teknologi Otomotif Nasional, Yogyakarta
 Akademi Telekomunikasi Indonésia, Yogyakarta
 AMIK Aster, Yogyakarta
 AMIK BSI Yogyakarta, Yogyakarta
 AMIK Kartika Yani, Yogyakarta
 AMIK Wira Setya Mulya, Yogyakarta
 AMIK Yappindo, Yogyakarta
 ATMIK El Rahma, Yogyakarta
 AKRB, Yogyakarta

Lembaga Profesional 
 ESI, Wonosari
 English Course Training Yess, Panggang Wonosari
 TREX, Bantul
 POBBAYO, Bantul
 BINA MULYA, Wonosari
 IEB, Sléman
 Lembaga Pendidikan Perkebunan (LPP), Yogyakarta
 Aviation Training Centre, Yogyakarta

Daerah Istimewa Yogyakarta