ANR-MALADES/MediQAl huggingface dataset:
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Madame Laure C., 32 ans, est enceinte de 5 mois. Elle est séronégative pour la toxoplasmose et suit les recommandations d’hygiène pour la prévention de la toxoplasmose. Elle ne possède pas de chat et habite un appartement à Paris. Elle est vaccinée contre la rubéole.\n Brusquement elle présente une fièvre à 38,5°C accompagnée d’asthénie et d’adénopathies cervicales.\n Le médecin prescrit un bilan biologique dont les résultats sont les suivants : - Hémogramme :\n -  Sg Érythrocytes : 4,7 T/L\n -  Sg Hématocrite : 0,42\n -  Sg Hémoglobine : 130 g/L\n -  Sg Leucocytes : 12 G/L\n \n Formule leucocytaire (valeur relative) :\n -  Polynucléaires neutrophiles : 0,33\n -  Polynucléaires éosinophiles : 0,07\n -  Polynucléaires basophiles : 0\n -  Lymphocytes : 0,38\n -  Monocytes : 0,22\n \n Sg Vitesse de sédimentation érythrocytaire (1 h) : 45 mm\n Sérologie CMV : positive mais évoquant une infection ancienne.\n La dernière sérologie toxoplasme, effectuée 15 jours auparavant était négative.\n \n Une nouvelle détermination, traitée en parallèle, donne les résultats suivants sur le nouveau sérum\n -  IgG anti- Toxoplasma gondii (technique ELISA) : 10 UI (seuil significatif 10 UI)\n -  IgM anti- Toxoplasma gondii (technique ISAGA par immunocapture) : positif 9+ (seuil\n significatif> 6+)\n -  Conclusion : présence d’lgM évoquant une séroconversion. Toxoplasmose évolutive.\n Résultat à confirmer.\n \n La patiente est alors immédiatement traitée par la spiramycine (ROVAMYCINE@) 3 x 3 M UI/jour et dirigée vers un centre de diagnostic anténatal.\n Un examen sérologique de contrôle, réalisé 15 jours plus tard montre, avec les mêmes techniques, une augmentation des IgG (30 UI) et des IgM (12+).\n L’interrogatoire de la patiente révèle une stricte observation des mesures d’hygiène alimentaire à la maison mais quelques repas pris dans un restaurant d’entreprise.
Question : Les échographies étant normales, la grossesse est poursuivie jusqu’au terme. La patiente accouche à 39 semaines d’aménorrhée d’une fille apparemment cliniquement saine. Quels examens biologiques peuvent être pratiqués à la naissance pour confirmer l’absence de contamination du nouveau-né ?
Réponse : -  examen du placenta (pour la mise en évidence du parasite) : inoculation à la souris,\n -  sérologie du sang de cordon (lgG non contributive, IgM et/ou IgA) ou du sang du nouveau-né,\n -  comparaison des anticorps dans le sang de la mère et du nouveau-né par Western-blot ou PIC-ELIFA.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Madame Laure C., 32 ans, est enceinte de 5 mois. Elle est séronégative pour la toxoplasmose et suit les recommandations d’hygiène pour la prévention de la toxoplasmose. Elle ne possède pas de chat et habite un appartement à Paris. Elle est vaccinée contre la rubéole.\n Brusquement elle présente une fièvre à 38,5°C accompagnée d’asthénie et d’adénopathies cervicales.\n Le médecin prescrit un bilan biologique dont les résultats sont les suivants : - Hémogramme :\n -  Sg Érythrocytes : 4,7 T/L\n -  Sg Hématocrite : 0,42\n -  Sg Hémoglobine : 130 g/L\n -  Sg Leucocytes : 12 G/L\n \n Formule leucocytaire (valeur relative) :\n -  Polynucléaires neutrophiles : 0,33\n -  Polynucléaires éosinophiles : 0,07\n -  Polynucléaires basophiles : 0\n -  Lymphocytes : 0,38\n -  Monocytes : 0,22\n \n Sg Vitesse de sédimentation érythrocytaire (1 h) : 45 mm\n Sérologie CMV : positive mais évoquant une infection ancienne.\n La dernière sérologie toxoplasme, effectuée 15 jours auparavant était négative.\n \n Une nouvelle détermination, traitée en parallèle, donne les résultats suivants sur le nouveau sérum\n -  IgG anti- Toxoplasma gondii (technique ELISA) : 10 UI (seuil significatif 10 UI)\n -  IgM anti- Toxoplasma gondii (technique ISAGA par immunocapture) : positif 9+ (seuil\n significatif> 6+)\n -  Conclusion : présence d’lgM évoquant une séroconversion. Toxoplasmose évolutive.\n Résultat à confirmer.\n \n La patiente est alors immédiatement traitée par la spiramycine (ROVAMYCINE@) 3 x 3 M UI/jour et dirigée vers un centre de diagnostic anténatal.\n Un examen sérologique de contrôle, réalisé 15 jours plus tard montre, avec les mêmes techniques, une augmentation des IgG (30 UI) et des IgM (12+).\n L’interrogatoire de la patiente révèle une stricte observation des mesures d’hygiène alimentaire à la maison mais quelques repas pris dans un restaurant d’entreprise.
Question : Pendant combien de temps devra-t-on suivre cet enfant apparemment exempt de toxoplasmose congénitale ?
Réponse : Pendant au moins 1 an :\n -  sur le plan sérologique (disparition des anticorps maternels transmis en 6 à 9 mois), - sur le plan clinique : fond d’œil, périmètre crânien,\n -  sur le plan radiologique : calcifications cérébrales.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Madame Laure C., 32 ans, est enceinte de 5 mois. Elle est séronégative pour la toxoplasmose et suit les recommandations d’hygiène pour la prévention de la toxoplasmose. Elle ne possède pas de chat et habite un appartement à Paris. Elle est vaccinée contre la rubéole.\n Brusquement elle présente une fièvre à 38,5°C accompagnée d’asthénie et d’adénopathies cervicales.\n Le médecin prescrit un bilan biologique dont les résultats sont les suivants : - Hémogramme :\n -  Sg Érythrocytes : 4,7 T/L\n -  Sg Hématocrite : 0,42\n -  Sg Hémoglobine : 130 g/L\n -  Sg Leucocytes : 12 G/L\n \n Formule leucocytaire (valeur relative) :\n -  Polynucléaires neutrophiles : 0,33\n -  Polynucléaires éosinophiles : 0,07\n -  Polynucléaires basophiles : 0\n -  Lymphocytes : 0,38\n -  Monocytes : 0,22\n \n Sg Vitesse de sédimentation érythrocytaire (1 h) : 45 mm\n Sérologie CMV : positive mais évoquant une infection ancienne.\n La dernière sérologie toxoplasme, effectuée 15 jours auparavant était négative.\n \n Une nouvelle détermination, traitée en parallèle, donne les résultats suivants sur le nouveau sérum\n -  IgG anti- Toxoplasma gondii (technique ELISA) : 10 UI (seuil significatif 10 UI)\n -  IgM anti- Toxoplasma gondii (technique ISAGA par immunocapture) : positif 9+ (seuil\n significatif> 6+)\n -  Conclusion : présence d’lgM évoquant une séroconversion. Toxoplasmose évolutive.\n Résultat à confirmer.\n \n La patiente est alors immédiatement traitée par la spiramycine (ROVAMYCINE@) 3 x 3 M UI/jour et dirigée vers un centre de diagnostic anténatal.\n Un examen sérologique de contrôle, réalisé 15 jours plus tard montre, avec les mêmes techniques, une augmentation des IgG (30 UI) et des IgM (12+).\n L’interrogatoire de la patiente révèle une stricte observation des mesures d’hygiène alimentaire à la maison mais quelques repas pris dans un restaurant d’entreprise.
Question : Quels sont les autres médicaments susceptibles d’être donnés à une femme subissant une séroconversion en fin de grossesse et chez laquelle le liquide amniotique et les échographies sont en faveur d’une toxoplasmose congénitale ?
Réponse : Pyriméthamine (MALOCIDE®) et sulfadiazine (ADIAZINE®).
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : Quels sont les caractères bactériologiques ayant permis d’orienter le diagnostic vers une infection à Staphylococcus aureus ?
Réponse : -  Examen microscopique montrant des cocci à Gram positif, présentant des groupements en grappe de raisin (sur milieu gélosé).
-  Recherche de la catalase (positive, contrairement aux bactéries du genre Streptococcus), recherche d’une activité coagulase libre ou coagulase liée.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : Justifier le choix de cette antibiothérapie en fonction du type de pathologie et de l’espèce bactérienne en cause. Préciser les mécanismes d’action des 2 antibiotiques.
Réponse : Le traitement d’une endocardite bactérienne doit être un traitement bactéricide car les bactéries sont localisées au niveau des végétations bactériennes, à l’abri des cellules phagocytaires. Il faut donc faire appel à des antibiotiques bactéricides comme les bêtalactamines (cloxacilline) ou les aminosides (nétilmicine) dont l’association est synergique.
Les souches de Staphylococcus aureus produisent le plus souvent une pénicillinase, codée par un gène plasmidique, inactivant la pénicilline G et l’amoxicilline. Il faut donc utiliser la cloxacilline, pénicilline du groupe M résistant à l’inactivation par la pénicillinase.
-  La cloxacilline agit sur la paroi bactérienne en inhibant la synthèse du peptidoglycane.
-  La nétilmicine inhibe la synthèse des protéinès en agissant sur les fractions ribosomales 30S.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : L’antibiogramme réalisé sur la souche de Staphylococcus aureus montre le phénotype suivant :
pénicilline G : résistant
méticilline : résistant
nétilmicine : sensible
ciprofloxacine : résistant
vancomycine : sensible

Quels sont les mécanismes de résistance de cette souche de Staphylococcus aureus aux antibiotiques testés ? Le traitement initial doit-il être modifié ?
Réponse : Cette souche est résistante à la pénicilline G par production de pénicillinase, et résistante à la méticilline (résistance croisée à l’ensemble des bêtalactamines) par synthèse d’une protéine de liaison aux pénicillines additionnelles, la PLP2a, de faible affinité pour des bêtalactamines. Elle est résistante aux fluoroquinolones (ciprofloxacine) par mutation du gène codant l’ADN-gyrase.
La souche n’étant sensible à aucune bêtalactamine, il faut remplacer la cloxacilline par la vancomycine, glycopeptide présentant également une activité bactéricide, et pouvant être associé à la nétilmicine.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : Quels sont les principaux paramètres biologiques d’efficacité et de surveillance du traitement ?
Réponse : -  Négativation des hémocultures prélevées, par exemple après 48-72 heures et 7 jours de traitement.
-  La nétilmicine et la vancomycine étant des antibiotiques néphrotoxiques, il faut pratiquer des dosages sérique afin d’ajuster la posologie, et surveiller les fonctions rénales (urémie, créatininémie, clairance de la créatinine).
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : Un bilan virologique est pratiqué chez ce patient toxicomane pour le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), le virus de l’hépatite B (VHB), le virus de l’hépatite C (VHC). Les sérologies VIH et VHB sont négatives, mais la sérologie VHC est positive. Quel est d’une manière générale, le risque évolutif d’une hépatite à VHC et comment l’évaluer sur le plan biologique ?
Réponse : -  L’hépatite aiguë à VHC évolue dans 80 à 90 % des cas vers une forme chronique, symptomatique, mais pouvant elle-même permettre le développement d’une cirrhose, voire d’un hépatocarcinome.
-  La surveillance de l’évolution d’une hépatite chronique est fondée sur le dosage des transaminases hépatique (ALAT), la recherche qualitative et quantitative de l’ARN viral (charge virale). La ponction biopsie hépatique est également justifiée. Un génotypage de la souche a une valeur indicatrice de la réponse au traitement.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : Un homme de 32 ans, toxicomane, est hospitalisé pour fièvre, altération de l’état général, splénomégalie. Trois hémocultures sont pratiquées dans la première journée d’hospitalisation, dont deux sont positives dès le lendemain à Staphylococcus aureus. Une échographie transœsophagienne révèle une végétation au niveau de la valve tricuspide, permettant de poser le diagnostic d’endocardite bactérienne. Une échographie abdominale montre une hépatosplénomégalie. Une bithérapie par voie intraveineuse est instaurée par cloxacilline (ORBENINE ®). (150 mg/kg/24 h) + nétilmicine (NÉTROMYCINE® (+4 mg/kg/24 h).
Question : Le diagnostic d’hépatite chronique à VHC est établi. Quel traitement doit être proposé ? Quelles sont les modalités de suivi de la réponse à ce traitement ? Quels sont les principaux effets indésirables attendus ?
Réponse : Le traitement préconisé pour une hépatite chronique à VHC est basé sur l’association interféron alpha pégylé associé à la ribavirine, pour une durée habituelle d’au moins 6 mois. L’efficacité du traitement est suivie par le dosage des transaminases et la détermination de la charge virale . Les principaux effets indésirables dus au traitement par interféron sont :
-  Syndrome pseudo-grippal, prévenu par la prise de paracétamol.
-  Troubles digestifs (nausées, vomissements).
-  Syndrome dépressif, notamment chez des patients ayant ce type d’antécédent.
-  Le principal effet indésirable dû au traitement par la ribavirine est la survenue d’une anémie hémolytique.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Quelles sont les infections respiratoires pouvant être rencontrées chez un patient au stade SIDA de l’infection à VIH ?
Réponse : Pneumocystose, tuberculose ou mycobactérioses atypiques, toxoplasmose, pneumopathies à cytomégalovirus ou à herpès simplex.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Quels sont les prélèvements à effectuer pour le diagnostic de tuberculose pulmonaire ?
Quels examens biologiques spécifiques seront à effectuer ? Quels en sont les principes ?
Réponse : -  Prélèvement d’échantillons biologiques provenant de crachats, de tubages gastriques réalisés le matin à jeun (à répéter 3 fois), de liquide de lavage alvéolaire.
-  Réalisation sur les échantillons biologiques d’un examen direct après coloration de Ziehl-Neelsen ou à l’auramine, isolement de Mycobacterium tuberculosis (ou autres mycobactéries) par culture sur milieux spécifiques (Lowenstein-Jensen, Coletsos), après décontamination des prélèvements (soude, détergents anioniques ou cationiques) pour inhiber la contamination des milieux de culture par la flore commensale.
-  Détection du génome bactérien par PCR.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Quel est le protocole thérapeutique habituel d’une tuberculose ? Justifier ce protocole.
Réponse : Quadrithérapie associant la rifampicine, le pyrazinamide, l’éthambutol et l’isoniazide pendant 2 mois puis bithérapie (rifampicine et isoniazide) pendant au moins 4 mois (6 mois au total).
La quadrithérapie initiale permet de réduire la taille de population bactérienne en réduisant le risque d’émergence de bactéries résistantes. Statistiquement dans une population bactérienne importante des mutants résistants à 1 ou 2 antituberculeux existent. L’utilisation de 4 antibiotiques empêche leur sélection. Ceci ne se justifie plus après 2 mois de traitement car les bactéries résiduelles sont peu nombreuses.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Quelles recommandations et autres informations pourriez-vous donner au patient concernant ce traitement ?
Réponse : -  prise à jeun le matin, compliance indispensable du fait du risque de résistance bactérienne
-  coloration systématique des urines et autres liquides corporels en rouge (rifampicine)
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Quels sont les principaux effets indésirables du traitement antituberculeux et quelles sont les modalités du suivi biologique ?
Réponse : -  Rifampicine : réactions d’origine immunoallergique, accidents hépatiques et hématologiques.
-  Isoniazide : toxicité hépatique type cytolytique, troubles neuro-psychiques (neuropathies périphériques, convulsions...), accidents d’hypersensibilité.
-  Ethambutol : troubles oculaires à type de névrite optique.
-  Pyrazinamide : toxicité hépatique type cytolytique, hyperuricémie et arthralgies.
Il est nécessaire de surveiller la fonction hépatique, la fonction rénale (risque d’accumulation de pyrazinamide et d’isoniazide), la concentration d’acide urique.
Spécialité : Pharmacy
Cas clinique : François, 42 ans, est infecté par le VIH-l depuis 11 ans. Il n’a jamais eu de traitement antirétroviral ni de suivi clinique et biologique depuis 3 ans. Il présente une altération de l’état général importante avec un amaigrissement de 10 kg en 6 mois, une asthénie, une fièvre à 38°C persistante et une toux.
L’examen retrouve une hépato-splénomégalie et de multiples adénopathies.
La charge virale VIH-l réalisée le jour de la consultation est de 5,8 Log copies d’ARN VIH-l/mL de plasma et le taux de lymphocytes CD4+ à 0,24 G/L. Une tuberculose est suspectée chez ce patient.
Question : Les paramètres clinico-biologiques de François justifient sa mise sous traitement antirétroviral.
Quelle est la principale interaction médicamenteuse entre le traitement antituberculeux et les antirétroviraux ?
Réponse : La rifampicine est un puissant inducteur du cytochrome p450 (isoforme 3A4) et va donc accélérer le métabolisme des antirétroviraux métabolisés par cette voie, en particulier des antiprotéases et à un moindre niveau des inhibiteurs non nucléosidiques de la transcriptase inverse. L’association rifampicine et antiprotéases est donc en principe contre-indiquée. Elle peut être substituée par une autre rifamycine, la rifabutine, sous réserve d’un dosage de ces substances. Il y a en effet augmentation des concentrations de la rifamycine (inhibition compétitive du métabolisme) et baisse de celle de l’antiprotéase.
En pratique :
-  soit utilisation d’une trithérapie d’inhibiteurs nucléosidiques
-  soit augmenter les doses d’antiprotéases et ajouter du ritonavir comme booster en
diminuant les doses de rifamycine.