Patent ID: 9624293
Date: 2017-04-18
CPC Classifications: C07K,C12N,C40B

Claim:
1. A method of identifying an antibody or antibody fragment thereof specific for an immunogen comprising a) generating a collection of antibodies or functional fragments thereof comprising variable heavy chain and variable light chain framework regions, wherein said variable heavy chain framework regions and variable light chain framework regions comprise germline protein sequences of a germline protein pair, wherein said germline protein pair comprises the following properties: wherein said collection of antibodies or functional fragments thereof comprises germline protein sequences of at least two different germline protein pairs, wherein the germline protein pairs are selected from IGHV1-18 (SEQ ID NO: 65)/IGKV1-05 (SEQ ID NO: 118); IGHV1-18 (SEQ ID NO: 65)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV1-46 (SEQ ID NO: 68)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV1-46 (SEQ ID NO:68)/IGKV1-39 (SEQ ID NO: 129); IGHV1-46 (SEQ ID NO: 68)1IGKV3-15 (SEQ ID NO:153); IGHV1-69*01 (SEQ ID NO: 70)/IGKV1-05 (SEQ ID NO: 118); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGKV1-(SEQ ID NO: 122); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGKV1-(SEQ ID NO: 126); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)1IGKV3-(SEQ ID NO: 153); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGLV1-(SEQ ID NO: 167); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGLV2-(SEQ ID NO: 174); IGHV3-07 (SEQ ID NO: 77)/IGLV3-(SEQ ID NO: 175); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGKV1-(SEQ ID NO: 118); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGKV1-(SEQ ID NO: 119); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGKV1-(SEQ ID NO: 122); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGKV1-(SEQ ID NO: 124); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGKV3-(SEQ ID NO: 153); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGLV1-47 (SEQ ID NO: 167); IGHV3-11 (SEQ ID NO: 79)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-05 (SEQ ID NO: 118); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-06 (SEQ ID NO: 119); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-12 (SEQ ID NO: 122); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-16 (SEQ ID NO: 124); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-27 (SEQ ID NO: 126); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV1-39 (SEQ ID NO: 129); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGKV3-15 (SEQ ID NO: 153); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGLV1-40 (SEQ ID NO: 165); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGLV1-51 (SEQ ID NO: 169); IGHV3-15 (SEQ ID NO: 81)/IGLV2-11 (SEQ ID NO: 171); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGKV1-06 (SEQ ID NO: 119); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGKV 1-12 (SEQ ID NO: 122); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGKV 1-27 (SEQ ID NO: 126); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGKV 1-39 (SEQ ID NO: 129); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGLV2-14 (SEQ ID NO: 172); IGHV3-21 (SEQ ID NO: 84)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV3-30 (SEQ ID NO: 86)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV3-30 (SEQ ID NO: 86)/IGLV3-1 (SEQ ID NO: 175); IGHV3-33 (SEQ ID NO: 89)/IGKV3-15 (SEQ ID NO: 153); IGHV3-33 (SEQ ID NO: 89)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV3-48 (SEQ ID NO: 93)/IGKV 1-27 (SEQ ID NO: 126); IGHV3-53 (SEQ ID NO: 95)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV3-53 (SEQ ID NO: 95)/IGKV1-12 (SEQ ID NO: 122); IGHV3-53 (SEQ ID NO: 95)/IGLV1-51 (SEQ ID NO: 169); IGHV3-53 (SEQ ID NO: 95)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV3-53 (SEQ ID NO: 95)/IGLV3-1 (SEQ ID NO: 175); IGHV3-74 (SEQ ID NO: 100)/IGKV1-06 (SEQ ID NO: 119); IGHV3-74 (SEQ ID NO: 100)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV3-74 (SEQ ID NO: 100)/IGKV1-27 (SEQ ID NO: 126); IGHV3-74 (SEO ID NO: 100)/IGKV3-15(SEQ ID NO: 153); IGHV3-74 (SEQ ID NO: 100)/IGLV1-51 (SEQ ID NO: 169); IGHV4-04 (SEQ ID NO: 102)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV4-04 (SEQ ID NO: 102)/IGLV3-1 (SEQ ID NO: 175); IGHV4-04 (SEQ ID NO: 102)/IGLV3-21 (SEQ ID NO: 182); IGHV4-39 (SEQ ID NO: 109)/IGLV2-14 (SEQ ID NO: 172); IGHV4-39 (SEQ ID NO: 109)/IGLV3-1 (SEQ ID NO: 175); IGHV5-51 (SEQ ID NO:113)/IGKV1-09 (SEQ ID NO: 121); IGHV5-51 (SEQ ID NO: 113)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174); IGHV5-51 (SEQ ID NO: 113)/IGLV3-1 (SEQ ID NO: 175); IGHV6-1 (SEQ ID NO:115)/IGKV1-06 (SEQ ID NO: 119); and IGHV6-1 (SEQ ID NO: 115)/IGLV2-23 (SEQ ID NO: 174), b) screening the collection against a specific immunogen; and c) selecting one or more antibodies or fragments thereof specific for said immunogen.